ES2523972T3 - Nuevos epítopos de linfocitos T citotóxicos del citomegalovirus humano (HCMV), poliepítopos, composiciones que los comprenden, y usos de diagnóstico y profilácticos y terapéuticos para ellos - Google Patents
Nuevos epítopos de linfocitos T citotóxicos del citomegalovirus humano (HCMV), poliepítopos, composiciones que los comprenden, y usos de diagnóstico y profilácticos y terapéuticos para ellos Download PDFInfo
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Abstract
Un péptido aislado que comprende un epítopo de linfocitos T citotóxicos (CTL) de un antígeno pp50 de un citomegalovirus de seres humanos (HCMV), en el que dicho péptido tiene una secuencia de aminoácidos que consiste en 9 a 20 aminoácidos contiguos de dicho antígeno pp50, y en el que el epítopo de CTL consiste en la secuencia expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY), o un lipopéptido que comprende dicho péptido.
Description
Nuevos epítopos de linfocitos T citotóxicos del citomegalovirus humano (HCMV), poliepítopos, composiciones que los comprenden, y usos de diagnóstico y profilácticos y terapéuticos para ellos
Campo de la invención
La presente invención se refiere a epítopos de péptidos aislados y composiciones que los comprenden para uso para provocar respuestas de CTL frente a citomegalovirus (CMV). En particular, la presente invención se refiere a péptidos aislados que comprenden uno o más epítopos de CTL del citomegalovirus humano (HCMV), y a composiciones de vacuna que los comprenden, para uso en el tratamiento profiláctico o terapéutico de infección por CMV frente a seres humanos. La presente invención también proporciona métodos para producir linfocitos T aislados capaces de reconocer epítopos del péptido HCMV, y métodos para producir tales linfocitos T. Los epítopos de péptidos aislados y los linfocitos T son particularmente útiles en la monitorización de respuestas inmunitarias en diversos marcos clínicos (por ejemplo transplante) y en el diagnóstico de infección por HCMV.
Antecedentes de la invención
1. Información general
Esta memoria descriptiva contiene información de secuencia de aminoácidos preparada usando Patentin Version 3.1, presentada aquí después del Resumen. Cada secuencia se identifica en el listado de secuencias mediante el indicador numérico <210>, seguido del identificador de la secuencia (por ejemplo <210>1, <210>2, etc.). La longitud de cada secuencia y el organismo fuente se indican mediante la información proporcionada en los campos de los indicadores numéricos <211> y <213>, respectivamente. Las secuencias citadas en la memoria descriptiva se definen mediante el término “SEC ID NO: ”, seguido del identificador de la secuencia (por ejemplo, SEC ID NO: 1 se refiere a la secuencia designada <400>1).
Como se usa aquí, la expresión “derivado de” se debe tomar para indicar que un número entero especificado se puede obtener de una fuente particular, sin embargo no necesariamente de forma directa de esa fuente.
Excepto que el contexto lo requiera de otro modo o se señale específicamente lo contrario, los números enteros, etapas, o elementos de la invención citados aquí como números enteros, etapas o elementos singulares engloban claramente tanto las formas singular como plural de los números enteros, etapas o elementos citados.
A lo largo de esta memoria descriptiva, excepto que el contexto lo requiera de otro modo, la palabra “comprender”, o variaciones tales como “que comprende” o “comprendiendo”, se entenderá que implica la inclusión de una etapa o elemento o número entero señalado, o grupo de etapas o elementos o números enteros, pero no la exclusión de cualquier otra etapa o elemento o número entero, o grupo de elementos o números enteros.
La presente invención se lleva a cabo sin experimentación innecesaria usando, excepto que se indique de otro modo, técnicas convencionales de biología molecular, microbiología, virología, tecnología de ADN recombinante, síntesis peptídica en disolución, síntesis peptídica en fase sólida, e inmunología. Tales procedimientos se describen, por ejemplo, en los siguientes textos.
- 1.
- Sambrook, Fritsch y Maniatis, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratories, Nueva York, Segunda edición (1989), todos los Vols I, II, y III;
- 2.
- DNA Cloning: A Practical Approach, Volúmenes. I y II (D. N. Glover, ed., 1985), IRL Press, Oxford, todo el texto;
- 3.
- Oligonucleotide Synthesis: A Practical Approach (M. J. Gait, ed., 1984) IRL Press, Oxford, todo el texto, y particularmente los documentos en él por Gait, p. 1-22; Atkinson et al., p. 35-81; Sproat et al., p. 83-115; y Wu et al., p. 135-151;
- 4.
- Nucleic Acid Hybridization: A Practical Approach (B. D. Hames & S. J. Higgins, eds., 1985) IRL Press, Oxford, todo el texto;
- 5.
- Animal Cell Culture: Practical Approach, Tercera edición (John R.W. Masters, ed., 2000), ISBN 0199637970, todo el texto;
- 6.
- Immobilized Cells and Enzymes: A Practical Approach (1986) IRL Press, Oxford, todo el texto;
- 7.
- Perbal, B., A Practical Guide to Molecular Cloning (1984);
- 8.
- Methods In Enzymology (S. Colowick y N. Kaplan, eds., Academic Press, Inc.), toda la serie;
- 9.
- J.F. Ramalho Ortigao, “The Chemistry of Peptide Synthesis” En: Knowledge database of Access to Virtual Laboratory website (Interactiva, Alemania);
- 10.
- Sakakibara, D., Teichman, J., Lien, E. Land y Fenichel, R.L. (1976). Biochem. Biophys. Res. Commun. 73 336-342
- 11.
- Merrifield, R.B. (1963). J. Am. Chem. Soc. 85, 2149-2154.
- 12.
- Barany, G. y Merrifield, R.B. (1979) en The Peptides (Gross, E. y Meienhofer, J. eds.), vol. 2, p. 1-284, Academic Press, New York.
- 13.
- Wünsch, E., ed. (1974) Synthese von Peptiden en Houben-Weyls Metoden der Organischen Chemie (Müler, E., ed.), vol. 15, 4ª ed., Partes 1 y 2, Thieme, Stuttgart.
- 14.
- Bodanszky, M. (1984) Principles of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Heidelberg.
- 15.
- Bodanszky, M. & Bodanszky, A. (1984) The Practice of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Heidelberg.
- 16.
- Bodanszky, M. (1985) Int. J. Peptide Protein Res. 25, 449-474.
- 17.
- Handbook of Experimental Immunology, Vols. I-IV (D. M. Weir y C. C. Blackwell, eds., 1986, Blackwell Scientific Publications).
2. Descripción de la técnica relacionada
HCMV pertenece a la subfamilia del grupo del virus del herpes, que son grandes virus de ADN estrictamente específicos de especies hospedantes, que codifican alrededor de 170-200 polipéptidos antigénicamente distintos. HCMV se encuentra universalmente en todas las localizaciones geográficas y grupos socioeconómicos, e infecta entre 50 y 85% de adultos (Alford y Brief, en: Virology, 2ª Edición, Fields et. al. eds, Raven Press, 1990).
Para la mayoría de las personas sanas que adquieren infección primaria por HCMV después del nacimiento, hay pocos síntomas y ninguna consecuencia de salud a largo plazo. Ocasionalmente, algunos adultos con infección primaria por HCMV presentan síntomas de un síndrome semejante a la mononucleosis, con fiebre prolongada y una hepatitis leve. Una vez infectado con HCMV, el virus permanece dormido estableciendo un depósito de células infectadas latentemente a partir de las cuales se produce la reactivación crónica de bajo grado en el ciclo productivo (lítico) del virus a lo largo de la vida. Aunque los factores que controlan la latencia y reactivación no están completamente comprendidos, la alteración del sistema inmunitario mediado por las células del cuerpo, ya sea por inmunosupresión inducida por fármacos o infección por ciertos patógenos, puede reactivar consistentemente el virus (Zaia y Forman, Infect Dis Clin North Am 9, 879-900, 1995).
Hay situaciones clínicas en las que la infección por HCMV es una causa significativa de morbimortalidad. Por ejemplo, la infección por HCMV plantea riesgos de salud importantes al feto en el útero, a personas que trabajan con niños, y a individuos que tienen un sistema inmunitario comprometido, tales como, por ejemplo, aquellos infectados con HIV-1 o que han sufrido transplante de órganos (Britt, Trends Microbiol 4, 34-81, 1996; Plotkin, Pediatr Infect Dis J 18, 313-325,1999).
Con respecto particular a los riesgos de salud para un feto en el útero, esos riesgos parecen estar casi exclusivamente asociados co mujeres no inmunitarias que se infectan durante el embarazo (Fowler et. al, New Engl J Med 326, 663-667, 1992; Murph et. al., en: Epidemiology of congenital cytomegalovirus infection: maternal risk factors and molecular analysis cytomegalovirus strains. 1998). Los estudios epidemiológicos han mostrado que 80%90% de bebés no nacidos en desarrollo que adquieren infección por HCMV congénita presentan un patrón variable de secuelas patológicas en los primeros pocos años de vida, que pueden incluir pérdida de audición, alteración de la visión, y retraso mental. Otro 5% a 10% de infantes que están infectados pero sin síntomas en el nacimiento tendrán subsiguientemente grados variables de problemas de audición y mentales o de coordinación. En 1996 solo, se estimaron más de 17.000 casos de secuelas o muerte inducida por HCMV en Europa y en los Estados Unidos de América (Plotkin, Pediatr Infect Dis J 18, 313-325, 1999).
Adicionalmente, estudios recientes sugieren que individuos seropositivos a HCMV que han sufrido angioplastia coronaria desarrollan restenosis más frecuentemente que los pacientes seronegativos (Field, Antivir Chem Chemother 10, 219-232, 1999), aunque aún se ha de demostrar una relación de causa-efecto.
Hay también una probabilidad de que exista un beneficio terapéutico significativo a derivar para individuos que pertenecen a esos grupos de alto riesgo, reduciendo su carga de HCMV. En consecuencia, existe la necesidad de una vacuna eficaz para proporcionar tal reducción en la carga de HCMV.
Ha habido un número de intentos en el diseño de una vacuna frente al HCMV (para una revisión, véanse Britt, Trends Microbiol 4, 34-81, 1996; Plotkin, Pediatr Infect Dis J 18, 313-325, 1999), usando cepas de HCMV atenuadas
o vacunas de subunidades.
Las primeras vacunas contra HCMV se basaron en la inmunización usando cepas atenuadas de HCMV, tales como, por ejemplo, la cepa Towne y la cepa AD-169 (Elek y Stern, Lancet 1, 1-5, 1974; Neff et. al., Proc Soc Exp Biol Med 160, 32-37, 1979). Aunque se mostró que ambos virus atenuados provocan respuestas celulares y humorales,
ninguna de las vacunas evitó la infección fetal en mujeres embarazadas que experimentan una infección primaria por HCMV. Además, los voluntarios normales vacunados mostraron protección limitada frente a la exposición vírica usando la cepa Toledo de HCMV (Quinnan et. al., Ann Infern Med 101, 478-483, 1984; Adler et. al., Pediatr Infect Dis J. 17, 200-206, 1998). Las vacunas de subunidades se han basado en formulaciones de un solo antígeno de HCMV, tales como, por ejemplo, el polipéptido de glicoproteína B (gB) de longitud completa en combinación con el adyuvante MF59 (Chiron), o como alternativa, un polipéptido de gB de longitud completa recombinante expresado usando un vector vírico (Pass et. al., J Infect Dis 180, 970-975, 1999; Adler et. al. J Infect Dis 180, 843-846, 1999). Adicionalmente, recientemente se ha probado en un ensayo clínico un virus de la viruela del canario que expresa un polipéptido de pp65 de HCMV recombinante de longitud completa, y se ha mostrado que provoca una fuerte respuesta CTL y de anticuerpos frente a este antígeno (Gyulai et. al., Proceedings of the Seventh International Cytomegalovirus Workshop, Brighton, UK, 7-9 de marzo de 1999, resumen).
Sin embargo, es probable que las formulaciones de vacunas basadas en uno o más antígenos de HCMV de longitud completa presenten un número de limitaciones. Por ejemplo, la expresión de proteínas de HCMV tales como pp65 puede inhibir el procesamiento proteosómico de IE-1 a través de una actividad de cinasa asociada (Gilbert et al., Nature 383, 720, 1996). Además, también se sabe que otros genes asociados con la fase temprana de infección por HCMV interfieren en diversas etapas de la ruta del procesamiento del MHC clase I y su presentación (Reddehase, Curr. Opin. Immunol. 12, 390-396, 2000).
Las vacunas a base de epítopos de CTL proporcionan una tecnología alternativa para superar las limitaciones potenciales asociadas con el uso de antígenos de HCMV de longitud completa. Sin embargo, el grado elevado de polimorfismo de HLA en poblaciones humanas presenta un obstáculo importante para la aplicación práctica de epítopos de CTL definidos como vacunas. Se encuentra bajo investigación una vacuna basada en un único epítopo de CTL específico de pp65 de HCMV (NLVPMVATV; SEC ID NO: 5) enlazado al epítopo de linfocitos T auxiliares de unión a pan-HLA-DR y una o dos moléculas de ácido palmítico (Zaia et al., Hematol. (Am. Soc. Hematol. Educat. Program.) 339-355, 2000; La Rosa et al., Blood 97, 1776-1786, 2001).
Para cualquier vacuna de subunidades frente a HCMV, se supone que la protección frente a HCMV se puede lograr induciendo inmunidad celular frente a un antígeno viriónico individual. Hay pruebas de que, en portadores sanos del virus HCMV, las respuestas de linfocitos T subdominantes también están dirigidas contra otros antígenos viriónicos, tales como, por ejemplo, pp150, IE-1, y gH, que también pueden desempeñar un papel crucial a la hora de controlar la reactivación de HCMV (para un repaso, véanse Trends Microbiol 4, 34-38, 1996; Ito, Nippon Rinsho 56, 62-68, 1998).
Claramente, el desarrollo de una vacuna eficaz frente a HCMV requiere la elucidación de antígenos víricos que activan una respuesta de linfocitos T citotóxicos (CTL) protectora y la determinación de epítopos de CTL inmunodominantes en esos antígenos.
Los epítopos de CTL se han descrito para dos polipéptidos de HCMV inmunodominantes, en particular pp65 e IE-1 (Borysiewicz et al., J. Exp. Med. 168, 919, 1988; Sissons, J. Royal. Coll. Phys., Lond. 20, 40, 1986; Wills et al., J. Virol. 70, 7569, 1996; Kern et al., Intervirology 42, 322, 1999; Weekes et al., J. Virol. 73, 2099, 1999; Reddehase, Curr. Opin. Immunol. 12, 390-396, 2000).
Los epítopos de CTL conocidos ejemplares derivados de pp65 de HCMV se describen aquí con referencia a las SEC ID Nos: 1-17 y 55. Se describen epítopos enunciados como SEC ID Nos: 1-17 que tienen las siguientes restricciones de HLA:
- 1.
- SVLGPISGHVLK (SEC ID NO: 1) está restringida a HLA A*11xx (Diamond, USSN 6.074.645, 13 de junio de 2000);
- 2.
- FTSQYRIQGKL (SEC ID NO: 2) está restringida a HLA A*2402 (Longmate et al., Immunogenet. 52, 165173, 2000);
- 3.
- FVFPTKDVALR (SEC ID NO: 3) está restringida a HLA A*68xx (Longmate et al., Immunogenet. 52, 165173, 2000);
- 4.
- FPTKDVAL (SEC ID NO: 4) está restringida a HLA B*35xx (Diamond USSN 6.074.645, 13 de junio de 2000);
- 5.
- NLVPMVATV (SEC ID NO: 5) está restringida a HLA A*02xx (Wills et al., J. Virol. 70, 7569-7579, 1996);
- 6.
- MLNIPSINV (SEC ID NO: 6) está restringida a HLA A*0201 (Solache et al., J. Immunol. 163, 5512-5518, 1999);
- 7.
- RIFAELEGV (SEC ID NO: 7) está restringida a HLA A*0201 (Diamond et al., Blood 90, 1751-1767, 1997);
- 8.
- TPRVTGGGGAM (SEC ID NO: 8) está restringida a HLA B*07xx (Wills et al., J. Virol. 70, 7569-7579, 1996; Kern et al., Nature Med. 4, 975-978, 1998; Diamond USSN 6.074.645, 13 de junio de 2000);
- 9.
- RPHERNGFTVL (SEC ID NO: 9) está restringida a HLA B*07xx (Weekes et al., J. Virol. 73, 2099-2108, 1999; Diamond USSN 6.074.645, 13 de junio 2000);
- 10.
- RLLQTGIHV (SEC ID NO: 10) está restringida a HLA A*0201 (Solache et al., J. Immunol. 163, 5512-5518, 1999);
- 11.
- VIGDQYVKV (SEC ID NO: 11) está restringida a HLA A*0201 (Solache et al., J. Immunol. 163, 55125518, 1999);
- 12.
- ALFFFDIDL(SEC ID NO: 12) está restringida a HLA A*0201 (Solache et al., J. Immunol. 163, 5512-5518, 1999);
- 13.
- YSEHPTFTSQY (SEC ID NO: 13) está restringida a HLA A*01xx (Diamond, USSN 6.074.645, 13 de junio de 2000);
- 14.
- VLCPKNMII (SEC ID NO: 14) está restringida a HLA A*0201 (Solache et al., J. Immunol. 163, 5512-5518, 1999);
- 15.
- DIYRIFAEL (SEC ID NO: 15) está restringida a HLA A*0201 (Solache et al., J. Immunol. 163, 5512-5518, 1999);
- 16.
- ILARNLVPMV (SEC ID NO: 16) está restringida a HLA A*0201 (Diamond et al., Blood 90, 1751-1767, 1997; Solache et al., J. Immunol. 163, 5512-5518, 1999); y
- 17.
- EFFWDANDIY (SEC ID NO: 17) está restringida a HLA B*44xx (Longmate et al., Immunogenet. 52, 165173, 2000).
El epítopo enunciado en SEC ID NO: 55 (IPSINVHHY) fue descrito por Gavin et al., J Immunol. 151, 3971-3980, 1993.
Los epítopos de CTL conocidos ejemplares derivados de IE-1 de HCMV se describen aquí con referencia a SEC ID Nos: 18-20. Respectivamente, esos epítopos se describen por tener las siguientes restricciones de HLA:
- 1.
- YILEETSVM (SEC ID NO: 18) está restringida a HLA A*02xx (Retiere et al., J. Virol. 74, 3948-3952, 2000);
- 2.
- CVETMCNEY (SEC ID NO: 19) está restringida a HLA B*18xx (Retiere et al., J. Virol. 74, 3948-3952, 2000); y
- 3.
- RRIEEICMK (SEC ID NO: 20) está restringida a HLA B*27xx (Salquin et al., Eur. J. Immunol. 30, 25312539, 2000).
Aunque hay ciertas pruebas que sugieren que los antígenos de HCMV distintos de pp65 o IE-1 también pueden ser útiles para provocar el control mediante CTL de la infección por HCMV, tales como, por ejemplo, pp150 de HCMV y gB de HCMV, la información sobre la utilidad de esos antígenos es limitada (Gyulai et al., J. Infect. Dis. 181, 537546, 2000). Un epítopo de CTL conocido ejemplar procedente de pp150 de HCMV se describe aquí con referencia a SEC ID NO: 21, que tiene la siguiente restricción de HLA:
1. TTVYPPSSTAK (SEC ID NO: 21) está restringida a HLA A*0301 (Longmate et al., Immunogenet. 52, 165173, 2001).
La solicitud de patente WO 98/02746 ya describe péptidos que derivan del antígeno pp50 de HCMV.
Sumario de la invención
En el trabajo que condujo a la presente invención, se buscó cartografiar de forma exhaustiva respuestas de CTL frente a una amplia variedad de antígenos de HCMV que son expresados en diferentes etapas de la infección y desempeñan un papel importante en la patogénesis global de enfermedades asociadas a HCMV, en particular pp28, pp50, pp65, pp150, pp71, gH, gB, IE-1, IE-2, US2, US3, US6, US11, y UL18.
Se empleó una estrategia muy eficiente y rápida, basada en el uso de algoritmos predictivos, ELISPOT y ensayos de citotoxicidad, para realizar de forma exhaustiva el perfil de respuestas de CTL restringidas a HLA clase I frente a HCMV en una cohorte de veinticuatro portadores sanos del virus. Los análisis preliminares de estas secuencias antigénicas de HCMV, usando algoritmos a base de ordenador y ensayos de estabilización de péptidos, sugiere fuertemente que estos antígenos contenían epítopos de CTL. Los péptidos sintéticos se evaluaron subsiguientemente para determinar su capacidad para inducir actividad de CTL en linfocitos T de sangre periférica procedentes de donantes seropositivos, según se mide mediante producción de IFN- en ELISPOT.
La invención, en su forma más amplia, se define por las reivindicaciones independientes. Las realizaciones preferidas se definen en las reivindicaciones dependientes. El epítopo que consiste en la secuencia expuesta en SEC ID NO: 165 representa una característica técnica especial de la invención reivindicada:
- 1.
- Un péptido aislado que comprende un epítopo de linfocitos T citotóxicos (CTL) de un antígeno pp50 de un citomegalovirus de seres humanos (HCMV), en el que dicho péptido tiene una secuencia de aminoácidos que consiste en 9 a 20 aminoácidos contiguos de dicho antígeno pp50, y en el que el epítopo de CTL consiste en la secuencia expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY), o un lipopéptido que comprende dicho péptido.
- 2.
- El péptido o lipopéptido aislado de la reivindicación 1, en el que dicho péptido o lipopéptido se une a una célula de MHC Clase I que expresa CD8+.
- 3.
- El péptido o lipopéptido aislado según la reivindicación 1, en el que dicho péptido o lipopéptido se une a una célula de MHC Clase I que expresa HLA A1.
- 4.
- El péptido o lipopéptido aislado según la reivindicación 3, en el que dicho péptido o lipopéptido se une a una célula CD8+ que expresa HLA A1.
- 5.
- El péptido o lipopéptido aislado según la reivindicación 4, en el que dicho péptido consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY).
- 6.
- Un péptido de poliepítopo aislado que comprende dos o más epítopos de linfocitos T citotóxicos (CTL), en el que uno de dichos epítopos de CTL consiste en una secuencia expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY), y uno o más de dichos epítopos de CTL consiste en una secuencia seleccionada del grupo que consiste en:
SEC ID NO: 46 (YSEHPTFTSQY);
SEC ID NO: 5 (NLVPMVATV);
SEC ID NO: 101 (VLEETSVML);
SEC ID NO: 7 (RIFAELEGV);
SEC ID NO: 254 (IIYTRNHEV);
SEC ID NO: 135 (IMREFNSYK);
SEC ID NO: 21 (TTVYPPSSTAK);
SEC ID NO: 1 (SVLGPISGHVLK);
SEC ID NO: 116 (AYAQKIFKIL);
SEC ID NO: 33 (QYDPVAALF);
SEC ID NO: 2 (FTSOYRIQGKL);
SEC ID NO: 37 (YVKYVYESF);
SEC ID NO: 15 (DIYRIFAEL);
SEC ID NO: 3 (FVFPTKDVALR);
SEC ID NO: 134 (NVRRSWEEL);
SEC ID NO: 132 (KARDHLAVL);
SEC ID NO: 41 (QARLTVSGL);
SEC ID NO: 8 (TPRVTGGGAM);
SEC ID NO: 109 (KARAKKDEL);
SEC ID NO: 113 (QIKVRVDMV);
SEC ID NO: 112 (ELRRKMMYM);
SEC ID NO: 42 (RRRHRQDAL);
SEC ID NO: 162 (ARVYEIKCR);
SEC ID NO: 66 (CPSQEPMSIYVY);
SEC ID NO: 4 (FPTKDVAL);
SEC ID NO: 55 (IPSINVHHY);
SEC ID NO: 260 (FEQPTETPP);
SEC ID NO: 189 (YAYIYTTYL);
SEC ID NO: 56 (QEFFWDANDIY);
SEC ID NO: 170 (YEQHKITSY);
SEC ID NO: 51 (QEPMSIYVY);
SEC ID NO: 47 (SEHPTFTSQY); y
SEC ID NO: 63 (QAIRETVEL).
- 7.
- El péptido de poliepítopo aislado según la reivindicación 6, en el que dicho péptido de poliepítopo se une a células que expresan un alelo de MHC Clase I seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A11, HLA A23, HLA A24, HLA A26, HLA A29, HLA A30, HLA A68, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B41, HLA B44, HLA B57, y HLA B58.
- 8.
- El péptido de poliepítopo aislado según la reivindicación 6, en el que un epítopo de dicho péptido de poliepítopo tiene especificidad por el supertipo de HLA.
- 9.
- El péptido de poliepítopo aislado según la reivindicación 6, que tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 309; SEC ID NO: 310; SEC ID NO: 311; SEC ID NO: 312; SEC ID NO: 313; SEC ID NO: 314; SEC ID NO: 315; SEC ID NO: 316; SEC ID NO: 317; y SEC ID NO:
318.
- 10.
- Una composición de vacuna profiláctica o terapéutica para provocar una respuesta inmunitaria celular en un sujeto humano frente a HCMV, comprendiendo dicha composición una cantidad eficaz del péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o del péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, en combinación con un vehículo, excipiente, diluyente o adyuvante farmacéuticamente aceptable.
- 11.
- La composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10, en la que el adyuvante comprende un adyuvante saponificado que comprende una saponina o una fracción de saponina.
- 12.
- Uso del péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o del péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o de la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10 u 11, en la preparación de un medicamento para potenciar la inmunidad mediada por células específicas de HCMV de un sujeto humano, o para proporcionar memoria inmunológica en un sujeto no infectado contra una futura infección por HCMV.
- 13.
- El uso según la reivindicación 12, en el que el sujeto se selecciona del grupo que consiste en: (i) un sujeto que posee una infección por HCMV latente; (ii) un sujeto que posee una infección por HCMV activa; (iii) un sujeto que está inmunosuprimido; (iv) un sujeto que está inmunocomprometido; (v) un receptor de transplante; y (vi) un sujeto en riesgo de sufrir una complicación que surge de infección por HCMV.
- 14.
- El uso según la reivindicación 13, en el que el sujeto es una mujer que tiene capacidad reproductora, o una mujer embarazada, o un receptor de transplante de médula ósea.
- 15.
- El uso según una cualquiera de las reivindicaciones 12 a 14, en el que la composición comprende una cantidad del péptido o lipopéptido suficiente para activar un CTL o un precursor de CTL en un sujeto.
- 16.
- El uso según una cualquiera de las reivindicaciones 12 a 14, en el que la composición comprende una cantidad del péptido o lipopéptido suficiente para provocar o potenciar la expansión de linfocitos T CD8+, o potenciar la inmunidad mediada por células (CMI) específicas de HCMV en un sujeto.
- 17.
- El uso según una cualquiera de las reivindicaciones 12 a 16, en el que la composición es inyectable.
- 18.
- Un método para preparar un linfocito T reactivo a HCMV, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido previamente de un sujeto humano con una cantidad eficaz del péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o del péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o de la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10 u 11, suficiente para conferir reactividad con HCMV a dichos linfocitos T.
- 19.
- Un método para determinar si un sujeto ha sido previamente infectado o no con HCMV, o el nivel de inmunidad mediada por células específicas de HCMV en un sujeto, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido previamente del sujeto con una célula presentadora de antígeno (APC) sensibilizada con el péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o con el péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o con la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10 u 11, y determinar la activación de un CTL o un CTL precursor, en el que dicha activación de un CTL o un CTL precursor indica que el sujeto ha sido infectado previamente con HCMV, y en el que el nivel de activación de un CTL o un CTL precursor está correlacionado con el nivel de inmunidad mediada por células específicas de HCMV del sujeto.
- 20.
- El método de la reivindicación 19, en el que la activación de un CTL o un CTL precursor se realiza mediante un procedimiento que comprende un ensayo seleccionado del grupo que consiste en: ensayo de tetrámeros de MHC clase 1, ensayo de citotoxicidad, ensayo para determinar la producción de IFN-, ensayo de citocinas, ensayo de liberación de cromo, y ELISPOT.
- 21.
- El método según la reivindicación 20, en el que el linfocito T está contenido en una muestra biológica obtenida previamente de un sujeto humano.
- 22.
- El método según la reivindicación 21, en el que la muestra biológica obtenida previamente de un sujeto es médula ósea, timo, o una muestra que comprende sangre, células mononucleares de sangre periférica (PBMC) o una capa leuco-plaquetaria.
- 23.
- Un método para producir un CTL específico de HCMV, que comprende: (i) poner en contacto un linfocito T ex vivo con el péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o con el péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o con la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 11 ó 12, o una célula presentadora de antígeno (APC), o una estirpe celular linfoblastoide autóloga (LCL) sensibilizada con dicho péptido o lipopéptido o dicha vacuna; (ii) cultivar el linfocito T; y (iii) seleccionar linfocitos T que proliferan.
- 24.
- El método de la reivindicación 23, en el que la puesta en contacto en (i) es en presencia de una citocina.
- 25.
- El método de la reivindicación 24, en el que la citocina es IL-2.
- 26.
- El método según una cualquiera de las reivindicaciones 23 a 25, que comprende estimular ex vivo células mononucleares de sangre periférica (PBMCs) procedentes de un donante sano seropositivo a HCMV con una estirpe celular linfoblastoide autóloga (LCL) que se ha sensibilizado con el péptido o lipopéptido.
También se han aislado CTLs tanto policlonales como clonados a partir de donantes seropositivos que mostraron fuertes respuestas en ensayos de citotoxicidad, confirmando de ese modo una fuerte actividad citolítica frente a células diana que se sensibilizaron con péptidos sintéticos, o, como alternativa, se infectaron con virus de la vacuna recombinante que codifica antígenos de HCMV individuales.
Usando los enfoques anteriores, se identificó un gran número de nuevos epítopos de CTL de HCMV que tienen utilidad en la formación de vacunas frente a HCMV, o de otro modo que modulan el control inmunitario de HCMV, o como reactivos de diagnóstico para ensayar HCMV o la recuperación de la inmunidad mediada por linfocitos T específicos de HCMV tras el transplante o durante el embarazo. También se confirmó la identificación de ciertos epítopos de CTL descritos previamente. Se mostró que respuestas de CTL CD8+ a HCMV contenían a menudo múltiples actividades específicas de antígenos que no se constreñían simplemente a pp65, IE-1, o pp150. De hecho, más del 40% de los epítopos de CTL están situados en antígenos distintos de pp65 e IE-1, que se consideraron previamente que eran los antígenos principales para el control de CTL. Se identificó un número de antígenos de HCMV por primera vez como dianas para la inmunidad celular específica de HCMV. De forma interesante, estas actividades también incluyeron respuestas de linfocitos T subdominantes frente a inmunomoduladores codificados por HCMV, tales como, por ejemplo, US2, US3, y UL18. El análisis clonal reveló nuevas respuestas individuales a antígenos tales como, por ejemplo, pp28, pp50, pp65, pp150, gB, gH, US2, IE-1 e IE-2. El repertorio global de respuestas de CTL específico de HCMV a partir de un espectro de portadores sanos del virus se distribuye a lo largo de la mayoría de los antígenos ensayados.
Se han definido varios determinantes que restringen HLA reconocidos por los nuevos epítopos de CTL, además de nuevos determinantes que restringen HLA para ciertos epítopos de CTL de HCMV descritos previamente.
También se diseñaron nuevos poliepítopos que comprenden múltiples epítopos de HCMV para uso en preparaciones de vacuna.
También se han diseñado preparaciones de vacuna basándose en los nuevos epítopos y poliepítopos de la invención. Preferiblemente, una vacuna eficaz contra HCMV basada en el epítopo de CTL, que proporciona protección generalizada frente a HCMV en una población humana, comprende no sólo epítopos derivados de proteínas pp65 e IE-1, sino también otras regiones del genoma expresadas durante la infección temprana, tardía y latente.
En consecuencia, un aspecto de la presente invención se refiere a un péptido inmunológicamente activo que comprende uno o más epítopos de CTL de un antígeno de HCMV o un derivado del mismo o una variante funcionalmente equivalente del mismo, en el que dicho péptido es preferiblemente capaz de provocar una respuesta inmunitaria celular frente a HCMV en un sujeto humano. Preferiblemente, el péptido dirige CTLs de un sujeto humano para reconocer y lisar células humanas infectadas con HCMV, proporcionando o potenciando de ese modo la inmunidad celular frente a HCMV. Preferiblemente, el péptido inmunológicamente activo, en asociación con una molécula de MCH Clase I, es reconocido por los CTLs de un sujeto sano seropositivo a HCMV, o un sujeto que tiene una infección latente o inactiva por HCMV.
Preferiblemente, el péptido inmunológicamente activo de la invención presenta especificidad por el supertipo de HLA. Tal epítopo es claramente preferido para uso en formulaciones de vacuna, debido a que reduce el número total de epítopos requeridos para cubrir una proporción significativa de la población independientemente de la etnicidad, minimizando de ese modo las dificultades de formulación.
Preferiblemente, el péptido inmunológicamente activo de la invención comprende adicionalmente uno o más determinantes CD4+ suficientes para facilitar una función de linfocito T auxiliar en el contexto de una molécula de MHC clase II en la superficie de una célula presentadora de antígeno (APC) de un sujeto humano infectado con HCMV. Por ejemplo, se proporcionan aquí varios péptidos 20-meros que comprenden epítopos de CTL contiguos o que solapan y funciones epitópicas de linfocitos T auxiliares según se evidencia por tener la capacidad de unirse tanto a células CD4+ como a CD8+. Tal péptido tiene una ventaja con respecto de un epítopo de CTL mínimo de no requerir necesariamente la inclusión de un epítopo de linfocito T auxiliar exógeno en una formulación de vacuna.
En un segundo aspecto, la presente invención se refiere a un péptido inmunológicamente activo que comprende un poliepítopo (es decir, dos o más epítopos distintos) de un antígeno de HCMV o un derivado del mismo o una variante funcionalmente equivalente del mismo, en el que dicho péptido es preferiblemente capaz de provocar una respuesta inmunitaria celular frente a HCMV en un sujeto humano.
Preferiblemente, el poliepítopo no está restringido a un único haplotipo de MHC Clase I. Incluso más preferiblemente, el poliepítopo es específico para un número suficiente de moléculas de MHC Clase I para proporcionar cobertura para al menos alrededor de 35% de la población general, preferiblemente al menos alrededor de 55% de la población general, más preferiblemente al menos alrededor de 75% de la población general, y todavía más preferiblemente al menos alrededor de 95% de la población general, independientemente del origen racial o etnicidad. Los expertos en la técnica estarán fácilmente en posición de determinar el número de epítopos de CTL de HCMV individuales requeridos para proporcionar cobertura de cualquier población dada a partir de los datos de especifididad de HLA proporcionados aquí. Al igual que con epítopos individuales, el poliepítopo de la invención presenta preferiblemente especificidad por el supertipo de HLA, y/o comprende preferiblemente uno o más determinantes CD4+ suficientes para facilitar una función de linfocito T auxiliar en un sujeto humano infectado con HCMV.
Otro aspecto de la invención se refiere a una composición de vacuna profiláctica o terapéutica para provocar una respuesta inmunitaria celular en un sujeto humano frente a HCMV, comprendiendo dicha composición un péptido inmunológicamente activo de la invención (es decir, un epítopo o poliepítopo) en combinación con un vehículo, excipiente, diluyente y/o un adyuvante farmacéuticamente aceptables. La composición de vacuna puede comprender más de un epítopo o poliepítopo. La composición de vacuna de la invención puede ser una vacuna de subunidades que comprende el péptido o péptidos inmunológicamente activos o un derivado de los mismos o una variante funcionalmente equivalente de los mismos, o como alternativa, una vacuna a base de ácido nucleico que comprende ácido nucleico, tal como, por ejemplo, ADN o ARN, que codifica el péptido o polipéptido inmunológicamente activo o derivado o variante, y que se clona en un vector adecuado (por ejemplo, vector de virus de la vacuna, de la viruela del canario, de adenovirus, u otro vector de virus eucariota). Como alternativa, el péptido o derivado o variante se formula como una vacuna celular vía la administración de una célula presentadora de antígeno (APC) autóloga o alogeneica, o una célula dendrítica que se ha tratado in vitro para presentar el péptido sobre su superficie.
En una realización relacionada, la presente invención proporciona el uso de un péptido inmunológicamente activo de la invención, o una variante o derivado del mismo, en la preparación de una composición de vacuna para uso en el tratamiento profiláctico o terapéutico de infección por HCMV en un sujeto humano, que incluye el tratamiento terapéutico de una infección latente por HCMV en un sujeto humano.
En una realización relacionada, la presente invención proporciona el uso de un péptido inmunológicamente activo de la invención, o una variante o derivado del mismo, en la preparación de una composición de vacuna para uso para provocar la función inmunitaria de un sujeto humano antes o durante o después del transplante, en el que dicho sujeto posee una infección latente por HCMV o está en riesgo de ser infectado con HCMV.
Otro aspecto de la presente invención se refiere a un método para potenciar el sistema inmunitario de un sujeto humano, que comprende administrar un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido
o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para activar un CTL y/o un precursor de CTL de dicho sujeto.
En una realización relacionada, la invención se refiere a un método para potenciar la inmunidad mediada por células específicas de HCMV de un sujeto humano, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido de un sujeto humano con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido
o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para conferir actividad frente a HCMV a dichos linfocitos T.
Otro aspecto de la invención se refiere a un método para proporcionar o potenciar la inmunidad frente a HCMV en un sujeto humano no infectado, que comprende administrar a dicho sujeto un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para proporcionar memoria inmunológica frente a una infección futura por HCMV.
Otro aspecto de la invención se refiere a un método para potenciar o conferir inmunidad frente a HCMV en un sujeto humano no infectado, que comprende poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido de un sujeto humano con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para conferir actividad frente a HCMV a dichos linfocitos T.
Como será manifiesto a partir de la descripción aquí, el péptido inmunológicamente activo de la invención, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, es útil para estimular directamente un CTL o un CTL precursor in vitro. Usando tecnología de ensayo apropiado conocida por el experto, el péptido de la invención, o un derivado o variante funcionalmente equivalente del mismo, o una composición que comprende dicho péptido o derivado o variante, es útil para determinar el nivel de inmunidad específica de HCMV en un sujeto humano que sufre una infección primaria por HCMV o está en riesgo de infección por HCMV o la reactivación de la infección por HCMV, tal como, por ejemplo, un paciente de transplante, un individuo infectado con HIV, una mujer que tiene capacidad reproductora o una mujer embarazada. En una realización relacionada, el péptido o composición de la invención es útil también para distinguir un individuo que es seropositivo de un individuo que no se ha expuesto a HCMV (es decir, un individuo seronegativo).
En consecuencia, otro aspecto de la invención se refiere a un método de diagnóstico para monitorizar cuantitativa o cualitativamente la inmunidad de linfocitos T específicos de HCMV en un sujeto humano, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido de un sujeto humano con una APC sensibilizada con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, y determinar la activación de un CTL o CTL precursor, en el que dicha activación de un CTL o CTL precursor indica que el sujeto ha sido infectado previamente con HCMV.
Otro aspecto de la presente invención se refiere a un método para producir un CTL aislado o CTL precursor capaz de unirse a o lisar una célula humana infectada con HCMV, comprendiendo dicho método poner en contacto un linfocito T con un péptido aislado de la presente invención o una APC sensibilizada con un péptido aislado de la invención, cultivar el linfocito T, y seleccionar los linfocitos T que proliferan. Opcionalmente, el linfocito T se pone en contacto con péptido en presencia de una citocina, tal como, por ejemplo, IL-2.
La presente invención se extiende claramente a los clones de linfocitos T producidos usando un nuevo péptido inmunológicamente activo descrito aquí, y al uso de tales clones de linfocitos T en cualesquiera procedimientos de diagnóstico, profilácticos o terapéuticos para monitorizar la infección por HCMV, la latencia de infección por HCMV, la probabilidad de infección por HCMV en un sujeto humano, tal como, por ejemplo, antes, durante o después del transplante de órganos (por ejemplo BMT), o durante el embarazo.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1a es una representación gráfica que muestra la estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV pp65. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 6, 53, 10, 12, 52, 11, 54, 7, y 5, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron inicialmente con 100 l de cada péptido (100 g/ml) durante 14-16 h a 26ºC, seguido de la incubación a 37ºC durante 2-3 h. La expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2. La intensidad de la fluorescencia se indica como un porcentaje de la intensidad de fluorescencia para HLA A2 en células T2 incubadas a 26ºC sin péptido. La línea punteada indica la media + 3 S.E.M. de la intensidad de la fluorescencia para HLA A2 en células T2 incubadas a 26ºC sin péptido.
La Figura 1b es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV pp71. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 177, 176, 175, y 174, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en
la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1c es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV pp150. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 140, 141, 122, 138, 139, 142, 145, 144, y 143, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1d es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV IE-1. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 98, 102, 96, 101, 100, 103, 97, y 99, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1e es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV gB. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 183, 188, 181, 187, 186, 182, 185, y 184, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1f es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados de los antígenos de HCMV pp50 y pp28. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 164 y 163 para péptidos derivados de pp50, respectivamente, desde arriba hacia abajo; y SEC ID Nos: 155, 154, 153, 152, 151 y 150 para péptidos derivados de pp28, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1g es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV gH. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 216, 206, 205, 201, 200, 204, 203, 198, 202, 197, 199, y 196, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1h es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados del antígeno de HCMV IE-2. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 256, 254, 253, 252, y 251, respectivamente, desde arriba hacia abajo). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 1i es una representación gráfica que muestra estabilización de MHC en células T2 para diversos péptidos que se unen a HLA A2 derivados de los antígenos de HCMV US3, US2, y UL18. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas a la derecha de la gráfica (es decir, SEC ID Nos: 300, 298, y 299 para péptidos derivados de US3, respectivamente, desde arriba hacia abajo; SEC ID Nos: 296, 294, y 295 para péptidos derivados de US2, respectivamente, desde arriba hacia abajo; y SEC ID NO: 293, para el péptido derivados de UL18 en la parte inferior de la gráfica). Las células T2 se incubaron con péptido, y la expresión de HLA A2 en estas células se analizó mediante citometría de flujo usando el anticuerpo BB7.2 como se describe en la leyenda de la Figura 1a. La intensidad de la fluorescencia se indica como se describe en la leyenda de la Figura 1a.
La Figura 2a es una representación gráfica que muestra el análisis funcional ex vivo de respuestas de CTL específicos de HCMV frente a péptidos derivados de pp65 de HCMV o péptidos derivados de IE-1 de HCMV en una cohorte de ocho individuos seropositivos sanos positivos a HLA A2. Los péptidos del epítopo de CTL derivados de pp65 de HCMV (panel A) o de IE-1 de HCMV (panel B) se ensayaron usando ensayos ELISPOT. Los péptidos pp65 de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del
panel A (es decir, SEC ID Nos: 10, 54, 5, 53, 6, y 7 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). Los péptidos IE-1 de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del panel B (es decir, SEC ID Nos: 97, 96, 102, 101, y 18 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). Células mononucleares de sangre periférica (PBMC) procedentes de individuos seropositivos sanos se estimularon con péptidos sintéticos individuales (10 g/ml) procedentes de estos antígenos, y se midió la producción de IFN- en ensayos ELISPOT como se describe en la secciones de Material y Métodos. Los resultados se expresan como células formadoras de manchas (SFC) por 106 PBMC en la ordenada.
La Figura 2b es una representación gráfica que muestra el análisis funcional ex vivo de respuestas de CTL específicos de HCMV frente a péptidos derivados de pp150 de HCMV (panel C), péptidos derivados de pp28 (panel D), péptidos derivados de US2 (panel E), péptidos derivados de US3 (panel F), o péptidos derivados de pp50 (panel G), en una cohorte de ocho individuos seropositivos sanos positivos a HLA A2. Los péptidos del epítopo de CTL se ensayaron usando ensayos ELISPOT como se describe en la leyenda de la Figura 2a. Los datos se muestran como se describe en la leyenda de la Figura 2a. Los péptidos pp150 de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del panel C (es decir, SEC ID Nos: 122, 141, 143, 144, y 140 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). El péptido pp28 de HCMV tuvo la secuencia de aminoácidos indicada en el eje X del panel D (es decir, SEC ID NO: 150). Los péptidos US2 de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del panel E (es decir, SEC ID Nos: 294, 296 y 295 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). Los péptidos US3 de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicada en el eje X del panel F (es decir, SEC ID Nos: 298 y 300 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). El péptido pp50 de HCMV tuvo la secuencia de aminoácidos indicada en el eje X del panel G (es decir, SEC ID NO: 163).
La Figura 2c es una representación gráfica que muestra el análisis funcional ex vivo de respuestas de CTL específicos de HCMV frente a péptidos derivados de gB de HCMV (panel H), péptidos derivados de gH (panel I), o péptidos derivados de IE-2 (panel J), en una cohorte de ocho individuos seropositivos sanos positivos a HLA A2. Los péptidos del epítopo de CTL se ensayaron usando ensayos ELISPOT como se describe en la leyenda de la Figura 2a. Los datos se muestran como se describe en la leyenda de la Figura 2a. Los péptidos gB de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del panel H (es decir, SEC ID Nos: 181 y 187 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). Los péptidos gH de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del panel I (es decir, SEC ID Nos: 206, 216, y 202 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura). Los péptidos IE-2 de HCMV tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en el eje X del panel J (es decir, SEC ID Nos: 254 y 251 respectivamente, de izquierda a derecha de la figura).
La Figura 3a es una representación gráfica que muestra el análisis funcional ex vivo de respuestas de linfocitos T específicos de HCMV frente a epítopos de CTL restringidos a HLA B8 derivados de antígenos pp65 de HCMV (panel izquierdo) o IE-1 de HCMV (panel derecho). Los epítopos del péptido se ensayaron usando ensayos ELISPOT. PBMC procedentes de individuos seropositivos sanos se estimularon con péptidos sintéticos individuales procedentes de estos antígenos, y se midió la producción de IFN- en ensayo ELISPOT como se describe aquí. Los péptidos y sus restricciones por HLA se indican en el eje X. Los péptidos pp65 de HCMV ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas (es decir, SEC ID Nos: 43, 14, y 44 respectivamente, desde la izquierda de la figura). Los péptidos IE-1 de HCMV ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas (es decir, SEC ID Nos: 109, 110, 111, 112, y 114 respectivamente, desde la izquierda de la figura). Las respuestas de linfocitos T, según se indican mediante células formadoras de manchas (SFC) por 106 PBMC, se indican en la ordenada.
La Figura 3b es una representación gráfica que muestra el análisis funcional ex vivo de respuestas de linfocitos T específicos de HCMV frente a epítopos de CTL restringidos a HLA B7 derivados de antígenos pp65 de HCMV (panel izquierdo) IE-1 (panel central), o pp150 de HCMV (panel derecho). Los epítopos del péptido se ensayaron usando ensayos ELISPOT. PBMC procedentes de individuos seropositivos sanos se estimularon con péptidos sintéticos individuales procedentes de estos antígenos, y se midió la producción de IFN- en ensayo ELISPOT como se describe aquí. Los péptidos y sus restricciones por HLA se indican en el eje X. Los péptidos pp65 de HCMV ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas (es decir, SEC ID Nos: 40 y 41 respectivamente, desde la izquierda de la figura). El péptido IE-1 de HCMV ensayado tuvo la secuencia de aminoácidos indicada (es decir, SEC ID NO: 109). Los péptidos pp150 de HCMV ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas (es decir, SEC ID Nos: 134, 132, 131 y 130 respectivamente, desde la izquierda de la figura). Las respuestas de linfocitos T, según se indican mediante células formadoras de manchas (SFC) por 106 PBMC, se indican en la ordenada.
La Figura 3c es una representación gráfica que muestra el análisis funcional ex vivo de respuestas de linfocitos T específicos de HCMV frente a epítopos de CTL que tienen restricciones por HLA A24, HLA B27, HLA A3, HLA B44 o HLA A1, derivándose dichos epítopos de CTL de los antígenos gH de HCMV (panel izquierdo), pp28 (panel central), o pp50 de HCMV (panel derecho). Los epítopos del péptido se ensayaron usando ensayos ELISPOT. PBMC procedentes de individuos seropositivos sanos se estimularon con péptidos sintéticos individuales procedentes de estos antígenos, y se midió la producción de IFN- en ensayo
ELISPOT como se describe aquí. Los péptidos y sus restricciones por HLA se indican en el eje X. Los péptidos gH de HCMV ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas (es decir, SEC ID Nos: 227, 243, 217, y 220 respectivamente, desde la izquierda de la figura). El péptido pp28 de HCMV ensayado estaba restringido a HLA B27, y tuvo la secuencia de aminoácidos indicada (es decir, SEC ID NO: 162). Los péptidos pp50 de HCMV ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas (es decir, SEC ID Nos: 170 y 165 respectivamente, desde la izquierda de la figura). Las respuestas de linfocitos T, según se indican mediante células formadoras de manchas (SFC) por 106 PBMC, se indican en la ordenada.
La Figura 4a es una representación gráfica que muestra el reconocimiento de epítopos de CTL de HCMV restringidos a HLA A2 por CTLs procedentes de un donante seropositivo sano designado SB. PBMC procedentes del donante se cocultivaron con PBMC autólogas sensibilizadas con péptidos (20 g/ml), a una relación de 2:1, durante 7 días. En el día 7, los cultivos se volvieron a estimular con LCLs transformadas con el EBV irradiadas con radiación autólogas sensibilizadas con epítopos de péptido. En el día 10, estas estirpes de linfocitos T se usaron como efectores policlonales en un ensayo estándar de liberación de 51Cr frente a blastos de fitohemaglutinina (PHA) autólogos sensibilizados con péptido. En estos ensayos se usó una relación efector:diana de 10:1. El porcentaje de lisis específica se indica en el eje X. Las secuencias de los epítopos de CTL completas (es decir, SEC ID Nos: 187, 18, 101, 97, 5, 122, y 254 respectivamente, desde arriba hacia abajo de la figura), los antígenos a partir de los cuales se derivan los péptidos (es decir, gB, IE-1, IE-1, IE-1, pp65, pp150 y IE-2 respectivamente, desde arriba hacia abajo de la figura), y la restricción por HLA (HLA A2) para cada epítopo se muestran en el eje Y. También se indica el donante respondedor (SB).
La Figura 4b es una representación gráfica que muestra el reconocimiento de epítopos de CTL de HCMV por CTLs de cuatro donantes seropositivos sanos designados CS, SE, SC y PP. PBMC procedentes de cada donante se cocultivaron con PBMC autólogas sensibilizadas con péptido (20 g/ml), se volvieron a estimular con LCLs transformadas con el EBV irradiadas con radiación autólogas sensibilizadas con epítopos de péptido, y se llevaron a cabo ensayos de liberación de 51Cr como se describe en la leyenda de la Figura 4A. El porcentaje de lisis específica se indica en el eje X. Las secuencias de los epítopos de CTL completas (es decir, SEC ID Nos: 292, 295, 113, 114, 112, 303, y 165 respectivamente, desde arriba hacia abajo de la figura), los antígenos a partir de los cuales se derivaron los péptidos (es decir, UL18, pp50, US2, IE-1, IE-1, IE-1, US6 y pp50 respectivamente, desde arriba hacia abajo de la figura), y las restricciones por HLA (HLA B44, HLA B44, HLA A2, HLA B8, HLA B8, HLA B8, HLA A24, y HLA A1 respectivamente, desde arriba hacia abajo de la figura) para cada epítopo se muestran en el eje Y. También se indican los donantes respondedor (es decir, CS, SE, SC, y PP) para cada péptido.
La Figura 5a es una representación gráfica que muestra el porcentaje de lisis específica a diferentes concentraciones de epítopos de CTL de HCMV, usando clones de CTL específicos de virus procedentes de portadores sanos de virus. Los clones de CTL procedentes de portadores sanos de virus se aislaron como se describe aquí y se incubaron con un epítopo de péptido derivado de IE-1 de HCMV y que tiene restricción por HLA A2, y que consiste en la secuencia VLEETSVML (SEC ID NO: 101; ), o la secuencia YILEETSVM (SEC ID NO: 18; ■). Los clones de CTL específicos para cada epítopo de péptido se ensayaron frente a blastos de PHA autólogos previamente sensibilizados con concentraciones variables de péptido sintético (eje X).
La Figura 5b es una representación gráfica que muestra el porcentaje de lisis específica a diferentes concentraciones de un epítopo de CTL derivado de pp65 de HCMV restringido a HLA A2 que tiene una secuencia de aminoácidos NLVPMATV (SEC ID NO: 5), usando clones de CTL específicos de virus procedentes de portadores sanos de virus. Los clones de CTL procedentes de portadores sanos de virus se aislaron como se describe aquí y se incubaron con el péptido. Los clones de CTL específicos para el epítopo del péptido se ensayaron frente a blastos de PHA autólogos sensibilizados previamente con concentraciones variables de péptido sintético (eje X). Los resultados se expresan como porcentaje de lisis específica.
La Figura 5c es una representación gráfica que muestra el porcentaje de lisis específica a diferentes concentraciones de un epítopo de CTL derivado de IE-2 de HCMV restringido a HLA A2 que tiene una secuencia de aminoácidos IIYTRNHEV (SEC ID NO: 254), usando clones de CTL específicos de virus procedentes de portadores sanos de virus. Los clones de CTL procedentes de portadores sanos de virus se aislaron como se describe aquí y se incubaron con el péptido. Los clones de CTL específicos para el epítopo del péptido se ensayaron frente a blastos de PHA autólogos sensibilizados previamente con concentraciones variables de péptido sintético (eje X). Los resultados se expresan como porcentaje de lisis específica.
La Figura 5d es una representación gráfica que muestra el porcentaje de lisis específica a diferentes concentraciones de un epítopo de CTL derivado de IE-1 de HCMV restringido a HLA B8 que tiene una secuencia de aminoácidos QIKVRVDMV (SEC ID NO: 113), usando clones de CTL específicos de virus procedentes de portadores sanos de virus. Los clones de CTL procedentes de portadores sanos de virus se aislaron como se describe aquí y se incubaron con el péptido. Los clones de CTL específicos para el epítopo del péptido se ensayaron frente a blastos de PHA autólogos sensibilizados previamente con concentraciones variables de péptido sintético (eje X). Los resultados se expresan como porcentaje de lisis específica.
La Figura 6 es una representación gráfica que muestra la lisis específica por CTLs específicos de HCMV procedentes de donantes seropositivos a HCMV sanos designados SB (panel superior marcado SB CTL 62.3 y panel central marcado SB CTL 75.20) o SC (panel inferior marcado SC CTL ELRR) de LCLs autólogas infectadas con virus de la vacuna recombinante que expresa los antígenos de HCMV pp65 (Vacc.pp65), IE-1 (Vacc.IE-1), gB (Vacc.gB), gH (Vacc.gH), pp150 (Vacc.pp150) o pp28 (Vacc.pp28). Las LCLs se infectaron con constructos del virus de la vacuna durante 12-14 h a una multiplicidad de infección (MOI) de 10:1, y se procesaron para el ensayo estándar de liberación de 51Cr. Los resultados se expresan como porcentaje de lisis específica observada en un ensayo estándar de liberación de cromo de 4 h. A lo largo del ensayo se usó una relación de efector a diana de 5:1.
La Figura 7a es una representación gráfica que muestra respuestas de linfocitos T específicos de HCMV ex vivo frente a conjuntos solapantes de péptidos derivados del antígeno de HCMV gB. Se ensayó un conjunto de 92 péptidos solapantes en una cohorte de cinco portadores sanos no relacionados de HCMV, designados RK (negro), SB (sombreado hacia delante), MB (punteado), SE (sombreado con líneas cruzadas) y MW (sombreado hacia atrás), usando ensayos ELISPOT. PBMC procedentes de estos donantes se estimularon con péptidos sintéticos individuales, y se midió la producción de IFN- en ensayo ELISPOT como se describe aquí. Los resultados se expresan en la ordenada como células formadoras de manchas (SFC) por 106 PBMC. El número de péptido se indica en el eje X y en la parte superior de cada columna.
La Figura 7b es una representación gráfica que muestra respuestas de linfocitos T específicos de HCMV ex vivo frente a conjuntos solapantes de péptidos derivados del antígeno de HCMV pp65. Se ensayó un conjunto de 56 péptidos solapantes como se describe en la leyenda de la Figura 7a.
La Figura 7c es una representación gráfica que muestra respuestas de linfocitos T específicos de HCMV ex vivo frente a conjuntos solapantes de péptidos derivados del antígeno de HCMV IE-1. Se ensayó un conjunto de 49 péptidos solapantes como se describe en la leyenda de la Figura 7a.
La Figura 7d es una representación gráfica que muestra respuestas de linfocitos T específicos de HCMV ex vivo frente a conjuntos solapantes de péptidos derivados del antígeno de HCMV IE-2. Se ensayó un conjunto de 41 péptidos solapantes como se describe en la leyenda de la Figura 7a.
La Figura 7b es una representación gráfica que muestra respuestas de linfocitos T específicos de HCMV ex vivo frente a conjuntos solapantes de péptidos derivados del antígeno de HCMV gH. Se ensayó un conjunto de 74 péptidos solapantes como se describe en la leyenda de la Figura 7a.
La Figura 7f es una representación gráfica que muestra respuestas de linfocitos T específicos de HCMV ex vivo frente a conjuntos solapantes de péptidos derivados del antígeno de HCMV pp150. Se ensayó un conjunto de 104 péptidos solapantes como se describe en la leyenda de la Figura 7a.
La Figura 8 es una representación gráfica que muestra el reconocimiento por CTL de péptidos 20-meros procedentes de antígenos de HCMV mediante efectores policlonales de donantes seropositivos sanos. PBMC de donantes seropositivos a HCMV sanos, designados RK, JW, MB, CS y SE, se cocultivaron durante 7 días con PBMC autólogas sensibilizadas con cada epítopo de péptido específico (20 g/ml) a una relación de 2:1. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos indicadas en la ordenada (es decir, SEC ID Nos: 75, 193, 117, 72, 92, 77, 90, 269, 70, 249, y 192 respectivamente, desde arriba hacia abajo de la figura). En el día 7, estos cultivos se volvieron a estimular con LCLs transformadas con EBV irradiadas con radiación autólogas sensibilizadas con epítopos de péptido. En el día 10, estas estirpes de linfocitos T se usaron como efectores policlonales en un ensayo estándar de liberación de 51Cr frente a blastos de PHA autólogos sensibilizados con péptido. En estos ensayos se usó una relación de efector:diana de 10:1. Los resultados se expresan en el eje X como porcentaje de lisis específica.
La Figura 9 es una representación gráfica que muestra la función de clones de CTL específicos de HCMV derivados de donantes seropositivos a HCMV sanos designados RK (es decir, panel A; clones RK CTL OB6.13 y RK CTL 1C9.28), MB (es decir, panel B; clones MB CTL OB12.3 y MB CTL 1D9.7), y SB (es decir, panel C; clon SB CTL 1C7) generados mediante estimulación in vitro con péptidos 20-meros. Los clones se ensayaron en LCLs autólogas infectadas con virus de la vacuna recombinante que codifica antígenos de HCMV individuales (Vacc.pp28, Vacc.pp150, Vacc.gH, Vacc.gB, Vacc.IE-1 y Vacc.pp65 respectivamente, desde arriba hacia abajo en cada panel). Las LCLs se infectaron con constructos del virus de la vacuna durante 12-14 h (MOI de 10:1), y se procesaron para el ensayo estándar de liberación de 51Cr. Los resultados se expresan en el eje X como porcentaje de lisis específica observada en un ensayo estándar de liberación de cromo de 4 h. A lo largo del ensayo se usó una relación de efector a diana de 5:1.
La Figura 10a es una representación que muestra la secreción de IFN- por poblaciones de linfocitos T CD4+ en ausencia de péptido (paneles marcados “Sin péptido”) o en respuesta a péptidos 20-meros derivados de los antígenos pp65 de HCMV o gH de HCMV (paneles marcados “+ péptido”). Los péptidos 20-meros fueron un péptido 20-mero derivado de pp65 que tiene la secuencia SICPSQEPMSIYVYALPLKM (SEC ID NO: 90; designado SIC en la figura; panel izquierdo) y un péptido 20-mero derivado de gH que tiene la secuencia
RQTEKHELLVLVKKAQLNRH (SEC ID NO: 249; designado RQT en la figura; panel derecho). Las células se acotaron progresivamente mediante dispersión hacia delante y lateral para linfocitos y CD3+ para linfocitos T. Las poblaciones acotadas se representan gráficamente en gráficas de contorno de probabilidad como tinción de CD4 (eje horizontal) frente a tinción de IFN- (eje vertical). Encima de cada caja se muestran las frecuencias de células positivas a CD4+ y a IFN- específicas de antígenos (en los linfocitos T CD4+ totales).
La Figura 10b es una representación que muestra la secreción de IFN- por poblaciones de linfocitos T CD8+ en ausencia de péptido (paneles marcados “Sin péptido”) o en respuesta a péptidos 20-meros derivados de los antígenos pp65 de HCMV o gH de HCMV (paneles marcados “+ péptido”). Los péptidos 20-meros fueron un péptido 20-mero derivado de pp65 que tiene la secuencia SICPSQEPMSIYVYALPLKM (SEC ID NO: 90; designado SIC en la figura; panel izquierdo) y un péptido 20-mero derivado de gH que tiene la secuencia RQTEKHELLVLVKKAQLNRH (SEC ID NO: 249; designado RQT en la figura; panel derecho). Las células se acotaron progresivamente mediante dispersión hacia delante y lateral para linfocitos y CD3+ para linfocitos T. Las poblaciones acotadas se representan gráficamente en gráficas de contorno de probabilidad como tinción de CD8 (eje horizontal) frente a tinción de IFN- (eje vertical). Encima de cada caja se muestran las frecuencias de células positivas a CD8+ y a IFN- específicas de antígenos (en los linfocitos T CD8+ totales).
La Figura 11a es una representación gráfica que muestra el cartografiado de secuencias epitópicas mínimas usando el ensayo ELISPOT. PBMC procedentes de un donante seropositivo sano, designado RK, se estimularon con péptidos solapantes derivados de antígeno IE-2 de HCMV, y se midió la producción de IFN- en ensayos ELISPOT como se describe aquí. Los péptidos ensayados tuvieron las secuencias de aminoácidos FEQPTETP (SEC ID NO: 261), FEQPTETPP (SEC ID NO: 260), EQPTETPPE (SEC ID NO: 263), FEQPTETPPE (SEC ID NO: 262), QFEQPTETPPE (SEC ID NO: 264), o TAAKAYAVGQFEQPTETPPE (SEC ID NO: 269). Los datos se expresan como células formadoras de manchas (SFC) por 106 PBMC.
La Figura 11b es una representación gráfica que muestra el cartografiado de secuencias epitópicas mínimas usando un ensayo de CTL. Se ensayó un clon de CTL específico para el péptido derivado de IE-2 de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos TAAKAYAVGQFEQPTETPPE (SEC ID NO: 269) frente a blasto de PHA autólogo sensibilizado previamente con concentraciones variables de péptidos sintéticos solapantes que tiene la secuencia de aminoácidos FEQPTETPPE (SEC ID NO: 262; ). FEQPTETPP (SEC ID NO: 260; ■),
o FEQPTETP (SEC ID NO: 261; ▲). La concentración de péptido se indica en el eje X. El porcentaje de lisis específicas se indica en la ordenada.
La Figura 12a es una representación gráfica que muestra el análisis de restricción por HLA clase I de epítopos de CTL de HCMV derivados del antígeno IE-2 de HCMV frente a una estirpe de CTL restringida a HLA B41 de un donante seropositivo sano designado RK. El clon de CTL del donante RK se expuso a LCLs autólogas sensibilizadas con péptido procedentes del donante RK (Auto RK LCL) o a LCLs alogeneicas de donantes seropositivos sanos designados WS (es decir, WS LCL), MB (es decir, MB LCL), CS (es decir, CS LCL), BM21 (es decir, BM21 LCL) o SB (es decir, SB LCL), en un ensayo estándar de liberación de 51Cr. Los alelos de HLA clase I compartidos por LCLs individuales con el donante RK (a partir del cual se estableció la línea de CTL) se muestran en el eje Y. Los datos se muestran como porcentaje de lisis específica en el eje X.
La Figura 12b es una representación gráfica que muestra el análisis de restricción por HLA clase I de epítopos de CTL de HCMV derivados del antígeno IE-1 de HCMV frente a una línea de CTL de un donante seropositivo sano designado CS que reconoce células diana revestidas con péptido que expresan HLA A23, HLA A24 y HLA A30. El clon de CTL del donante CS se expuso a LCLs autólogas sensibilizadas con péptido (Auto CS LCL) o a LCLs alogeneicas de donantes seropositivos sanos designados JW (es decir, JW LCL), PP (es decir, PP LCL), CSt (es decir, CSt LCL), DUCAF (es decir, DUCAF LCL) o WS (es decir, WS LCL), en un ensayo estándar de liberación de 51Cr. Los alelos de HLA clase I compartidos por LCLs individuales con el donante CS (a partir del cual se estableció la línea de CTL) se muestran en el eje Y. Los datos se muestran como porcentaje de lisis específica en el eje X.
Descripción detallada de las realizaciones preferidas
1. Epítopos de HCMV aislados
Un aspecto de la presente invención proporciona un péptido aislado que comprende un epítopo de linfocito T citotóxico (CTL) de un antígeno de un citomegalovirus de seres humanos (HCMV) seleccionado del grupo que consiste en pp28, pp50, pp65, pp71, pp150, gB, gH, IE-1, IE-2, US2, US3, US6, US11, y UL18, o un derivado o variante funcionalmente equivalente de dicho péptido, en el que dicho péptido consiste en una secuencia de aminoácidos que tiene alrededor de 9 a alrededor de 20 aminoácidos contiguos de dicho antígeno, y en el que:
(i) dicho epítopo de CTL de pp65 consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEC ID NO: 22 (SQEPMSIYVY); SEC ID NO: 23 (ATVQGQNLKY); SEC ID NO: 24 (IRETVELRQY); SEC ID NO: 25 (IGDQYVKVY); SEC ID NO: 26 (TVQGQNLKY); SEC ID NO: 27 (YRIQGKLEY); SEC ID NO: 28 (QVIGDQYVK); SEC ID NO: 29 (LLLQRGPQY); SEC ID NO: 30 (RVTGGGAMA); SEC ID NO: 31 (GVMTRGRLK); SEC ID NO: 32 (VYALPLKML); SEC ID NO: 33
(QYDPVAALF); SEC ID NO: 34 (VYYTSAFVF); SEC ID NO: 35 (DVPSGKLFM); SEC ID NO: 36 (DIDLLLQRG); SEC ID NO: 37 (YVKVYLESF); SEC ID NO: 38 (TVQGQNLKY); SEC ID NO: 39 (EPMSIYVYAL); SEC ID NO: 40 (HVRVSQPSL); SEC ID NO: 41 (QARLTVSGL); SEC ID NO: 42 (RRRHRQDAL); SEC ID NO: 43 (QPKRRRHRQ); SEC ID NO: 44 (LCPKSIPGL); SEC ID NO: 45 (YRIQGKLEY); SEC ID NO: 46 (YSEHPTFTSQY); SEC ID NO: 47 (SEHPTFTSQY); SEC ID NO: 48 (CEDVPSGKLF); SEC ID NO: 49 (NEIHNPAVF); SEC ID NO: 50 (RETVELRQY); SEC ID NO: 51 (QEPMSIYVY); SEC ID NO: 52 (QMWQARLTV); SEC ID NO: 53 (LMNGQQIFL); SEC ID NO: 54 (ILARNLVPM); SEC ID NO: 56 (QEFFWDANDIY); SEC ID NO: 57 (QEFFWDANDI); SEC ID NO: 58 (QYRIQGKLE); SEC ID NO: 59 (RKHRHLPVADAV); SEC ID NO: 60 (DPVAALFFF); SEC ID NO: 61 (PGKISHIMLDVA); SEC ID NO: 62 (TRATKMQVI); SEC ID NO: 63 (QAIRETVEL); SEC ID NO: 64 (YHRTWDRHEGA); SEC ID NO: 65 (FMRPHERNGFTV); SEC ID NO: 66 (CPSQEPMSIYVY); SEC ID NO: 67 (LNIPSINVHHYPSAAERKHR); SEC ID NO: 68 (ATVQGQNLKYQEFFWDANDI); SEC ID NO: 69 (QEFFWDANDIYRIFAELEGV); SEC ID N0:70 (PQYSEHPTFTSQYRIQGKLE); SEC ID NO: 71 (SQYRIQGKLEYRHTWDRHDE); SEC ID NO: 72 (VFTWPPWQAGILARNLVPMV); SEC ID NO: 73 (ILARNLVPMVATVQGQNLKY); SEC ID NO: 74 (DQYVKVYLESFCEDVPSGKL); SEC ID NO: 75 (YPSAAERKHRHLPVADAVIH); SEC ID NO: 76 (QYDPVAALFFFDIDLLLQRG); SEC ID NO: 77 (IIKPGKISHIMLDVAFTSHE); SEC ID NO: 78 (AHELVCSMENTRATKMQVIG); SEC ID NO: 79 (TRATKMQVIGDQYVKVYLES); (SEC ID NO: 80 (MNGQQIFLEVQAIRETVELR); SEC ID NO: 81 (QAIRETVELRQYDPVAALFF); SEC ID NO: 82 (LTVSGLAWTRQQNQWKEPDV); SEC ID NO: 83 (WQPAAQPKRRRHRQDALPGP); SEC ID NO: 84 (YRHTWDRHDEGAAQGDDDVW); SEC ID NO: 85 (TSAGRKRKSASSATACTSGV); SEC ID NO: 86 (HRQDALPGPCIASTPKKHRG); SEC ID NO: 87 (YYTSAFVFPTKDVALRHVVC); SEC ID NO: 88 (VTTERKTPRVTGGGAMAGAS); SEC ID NO: 89 (QPFMRPHERNGFTVLCPKNM); SEC ID NO: 90 (SICPSQEPMSIYVYALPLKM); SEC ID NO: 91 (IYVYALPLKMLNIPSINVHH); SEC ID NO: 92 (QQNQWKEPDVYYTSAFVFPT); SEC ID NO: 93 (GAAQGDDDVWTSGSDSDEEL); SEC ID NO: 94 (TGGGAMAGASTSAGRKRKSA); y SEC ID NO: 95 (KDVALRHVVCAHELVCSMEN);
(ii) dicho epítopo de CTL de IE-1 consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 96 (SLLSEFCRV); SEC ID NO: 97 (VLAELVKQI); SEC ID NO: 98 (ILGADPLRV); SEC ID NO: 99 (TMYGGISLL); SEC ID NO: 100 (LLSEFCRVL); SEC ID NO: 101 (VLEETSVML); SEC ID NO: 102 (CLQNALDIL); SEC ID NO: 103 (ILDEERDKV); SEC ID NO: 104 (IKEHMLKKY); SEC ID NO: 105 (DEEEAIVAY); SEC ID NO: 106 (KLGGALQAK); SEC ID NO: 107 (QYILGADPL); SEC ID NO: 108 (KYTQTEEKF); SEC ID NO: 109 (KARAKKDEL); SEC ID NO: 110 (VMKRRIEEI); SEC ID NO: 111 (RHRIKEHML); SEC ID NO: 112 (ELRRKMMYM); SEC ID NO: 113 (QIKVRVDMV); SEC ID NO: 114 (ELKRKMMYM); SEC ID NO: 115 (RRKMMYMCY); SEC ID NO: 116 (AYAQKIFKIL); SEC ID NO: 117 (CSPDEIMAYAQKIFKILDEE); SEC ID NO: 118 (SEPVSEIEEVAPEEEEDGAE); SEC ID NO: 119 (VLCCYVLEETSVMLAKRPLI); SEC ID NO: 120 (RRKMMYMCYRNIEFFTKNSA); y SEC ID NO: 121 (NIEFFTKNSAFPKTTNGCSQ); y
(iii) dicho epítopo de CTL de pp150 consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEC ID NO: 122 (GQTEPIAFV); SEC ID NO: 130 (RPSTPRAAV); SEC ID NO: 131 (SPWAPTAPL); SEC ID NO: 132 (KARDHLAVL); SEC ID NO: 133 (WPRERAWAL); SEC ID NO: 134 (NVRRSWEEL); SEC ID NO: 138 (RIEENLEGV); SEC ID NO: 139 (PLIPTTAVI); SEC ID NO: 140 (LIEDFDIYV); SEC ID NO: 141 (KMSVRETLV); SEC ID NO: 142 (FLGARSPSL); SEC ID NO: 143 (ALVNAVNKL); SEC ID NO: 144 (ALVNFLRHL); SEC ID NO: 145 (NILQKIEKI); SEC ID NO: 146 (ERAWALKNPHLA); SEC ID NO: 147 (WPRERAWALKNPHLAYNPFR); SEC ID NO: 148 (STSQKPVLGKRVATPHASAR); y SEC ID NO: 149 (HANTALVNAVNKLVYTGRLI).
En una realización particularmente preferida, el péptido de la invención consiste en alrededor de 8-12 aminoácidos de longitud, o alrededor de 19-21 aminoácidos de longitud, más preferiblemente 9 ó 10 u 11 o 20 restos de longitud.
Como se usa aquí, la expresión “epítopo de CTL” se debe tomar para que signifique un péptido o polipéptido o antígeno de origen no natural de al menos alrededor de 9 aminoácidos de longitud y que tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:
- (i)
- una secuencia que interacciona en un nivel significativo con un alelo de MHC Clase I según se determina usando un algoritmo predictivo para determinar epítopos que se unen a MHC Clase I, tal como, por ejemplo, el algoritmo SYFPEITHI de la Universidad de Tuebingen, Alemania, o el algoritmo del programa de Predicciones de Unión a Péptidos de HLA de la BioInformatics and Molecular Analysis Section (BIMAS) del National Institutes of Health del Gobierno de los Estados Unidos de América;
- (ii)
- una secuencia que se une a y/o estabiliza una molécula de MHC Clase I en la superficie de una célula que presenta antígeno (APC), independientemente de si dicha APC está o no en una forma sustancialmente aislada, tal como, por ejemplo, en la fracción de PBMC o en la fracción de capa leuco-plaquetaria de una muestra obtenida de un sujeto humano, o como alternativa, en su estado natural;
(iii) una secuencia que induce una respuesta de CTL de memoria o provoca la expresión de IFN- por un
linfocito T, tal como, por ejemplo, linfocito T CD8+, linfocito T citotóxico (CTL) o linfocito T efector o linfocito T de memoria, independientemente de si dicho linfocito T está o no en una forma sustancialmente aislada, tal como, por ejemplo, en la fracción de PBMC o en la fracción de capa leuco-plaquetaria de una muestra obtenida de un sujeto humano, o como alternativa, en su estado natural; y
(iv) una secuencia que estimula la actividad de CTL en un ensayo estándar de citotoxicidad.
Preferiblemente, un epítopo de CTL como se define aquí comprende una secuencia que satisface al menos, preferiblemente al menos dos, y más preferiblemente al menos tres criterios funcionales citados en los párrafos (ii) a
(iv) más arriba. Incluso más preferiblemente, un epítopo de CTL como se define aquí comprende una secuencia que satisface adicionalmente el criterio (i) más arriba.
Los epítopos de CTL particularmente preferidos de la invención son capaces de provocar una respuesta inmunitaria celular frente a HCMV intacto en células o tejidos humanos, tales como, por ejemplo, reconociendo y lisando células humanas infectadas con HCMV, proporcionando o potenciando de ese modo la inmunidad celular frente a HCMV.
Como se usa aquí, la expresión “pp28” o “pp28 de HCMV” o “antígeno pp28”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene una secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI NC 001347 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; y Bankier et al., DNA Seq 2, 1-12, 1991), y que tiene preferiblemente la función de una ADNasa, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido pp28 de HCMV también se denomina “UL98”.
“NCBI” significa la base de datos del National Center for Biotechnology Information en la National Library of Medicine en el National Institutes of Health del gobierno de los Estados Unidos de América, Bethesda, MD 20894.
Un epítopo preferido de pp28 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 150 (LLIDPTSGL); SEC ID NO: 151 (LLVEPCARV); SEC ID NO: 152 (LLLIVTPVV); SEC ID NO: 153 (FLLSHDAAL); SEC ID NO: 154 (PLREYLADL); SEC ID NO: 155 (GLLGASMDL); SEC ID NO: 156 (LVEPCARVY); SEC ID NO: 157 (GIKHEGLVK); SEC ID NO: 158 (ELLAGGRVF); SEC ID NO: 159 (RLLDLAPNY); SEC ID NO: 160 (ELLGRLNVY); SEC ID NO: 161 (CRYKYLRKK); y SEC ID NO: 162 (ARVYEIKCR).
Incluso más preferiblemente, un epítopo de CTL de pp28 tiene una secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 150 (LLIDPTSGL) o SEC ID NO: 162 (ARVYEIKCR), y todavía más preferiblemente tiene una secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 162.
Como se usa aquí, la expresión “pp50” o “pp50 de HCMV” o “antígeno pp50”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI QQBEV2 o P16790 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125169, 1990), y que tiene preferiblemente la función de un factor de procesabilidad de ADN polimerasa o de una proteína accesoria de polimerasa como se describe por Leach y Mocarski, J. Virol., 63, 1783-1791, 1989, o un polipéptido relacionado de HCMV o de otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido pp50 de HCMV también se denomina “UL44”.
Un epítopo preferido de pp50 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 163 (LLNCAVTKL); SEC ID NO: 164 (QLRSVIRAL); SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY); SEC ID NO: 166 (RGDPFDKNY); SEC ID NO: 167 (GLDRNSGNY); SEC ID NO: 168 (TLLNCAVTK); SEC ID NO: 169 (TVRSHCVSK); SEC ID NO: 170 (YEQHKITSY); SEC ID NO: 171 (TRVKRNVKK); SEC ID NO: 172 (SEDSVTFEF); y SEC ID NO: 173 (TRLSEPPTL).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de pp50 consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 163 (LLNCAVTKL); SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY); SEC ID NO: 166 (RGDPFDKNY); SEC ID NO: 167 (GLDRNSGNY); y SEC ID NO: 170 (YEQHKITSY). Todavía más preferiblemente, el epítopo de pp50 tiene la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 165.
Como se usa aquí, la expresión “pp65” o “pp65 de HCMV” o “antígeno pp65”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI WMBETW (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; y Pande et al., Virol., 82, 220-228, 1991), y que tiene preferiblemente la función de una fosfoproteína de matriz inferior o proteína de tegumento como se describe por Pande et al., Virol., 82, 220-228, 1991, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Epítopos particularmente preferidos de pp65 consistirán en una secuencia de aminoácidos enumerada aquí anteriormente, y más preferiblemente una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 25 (IGDQYVKVY); SEC ID NO: 26 (TVQGQNLKY); SEC ID NO: 27 (YRIQGKLEY); SEC ID NO: 40
(HVRVSQPSL); SEC ID NO: 41 (QARLTVSGL); SEC ID NO: 42 (RRRHRQDAL); SEC ID NO: 53 (LMNGQQIFL); SEC ID NO: 54 (ILARNLVPM); SEC ID NO: 56 (QEFFWDANDIY); SEC ID NO: 57 (QEFFWDANDI); SEC ID NO: 58 (QYRIQGKLE); SEC ID NO: 59 (RKHRHLPVADAV); SEC ID NO: 60 (DPVAALFFF); SEC ID NO: 61 (PGKISHIMLDVA); SEC ID NO: 63 (QAIRETVEL); SEC ID NO: 66 (CPSQEPMSIYVY); SEC ID NO: 67 (LNIPSINVHHYPSAAERKHR); SEC ID NO: 68 (ATVQGQNLKYQEFFWDANDI); SEC ID NO: 69 (QEFFWDANDIYRIFAELEGV); SEC ID NO: 70 (PQYSEHPTFTSQYRIQGKLE); SEC ID NO: 71 (SQYRIQGKLEYRHTWDRHDE); SEC ID NO: 72 (VFTWPPWQAGILARNLVPMV); SEC ID NO: 73 (ILARNLVPMVATVQGQNLKY); SEC ID NO: 75 (YPSAAERKHRHLPVADAVIH); SEC ID NO: 76 (QYDPVAALFFFDIDLLLQRG); SEC ID NO: 77 (IIKPGKISHIMLDVAFTSHE); SEC ID NO: 80 (MNGQQIFLEVQAIRETVELR); SEC ID NO: 81 (QAIRETVELRQYDPVAALFF); SEC ID NO: 87 (YYTSAFVFPTKDVALRHVVC); SEC ID NO: 90 (SICPSQEPMSIYVYALPLKM); y SEC ID NO: 92 (QQNQWKEPDVYYTSAFVFPT).
Como se usa aquí, la expresión “pp71” o “pp71 de HCMV” o “antígeno pp71”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con los números de acceso NCBI NP 040017 o WMBES1 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Ruger et al., J. Virol., 61, 446-453, 1987; y Bankier et al., DNA Seq 2, 1-12, 1991), y que tiene preferiblemente la función de una fosfoproteína de la matriz superior como se describe por Ruger et al., J. Virol., 61, 446-453, 1987, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido pp71 de HCMV también se denomina “UL82”.
Un epítopo particularmente preferido de pp71 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 174 (QLLIPKSFTL); SEC ID NO: 175 (TLVIPSWHV); SEC ID NO: 176 (LLIPKSFTL); SEC ID NO: 177 (DLVPLTVSV); SEC ID NO: 178 (CSDPNTYIHK); SEC ID NO: 179 (EYIVQIQNAF); y SEC ID NO: 180 (AEVVARHNPY).
Como se usa aquí, la expresión “pp150” o “pp150 de HCMV” o “antígeno pp150”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI XPBEA9 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990), y que tiene preferiblemente la función de una fosfoproteína estructural grande (aproximadamente 150 kDa) como se describe por Jahn et al., J. Virol., 61, 1358-1367, 1987, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Epítopos particularmente preferidos de pp150 consistirán en una secuencia de aminoácidos enumerada aquí anteriormente, y más preferiblemente la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 146 (ERAWALKNPHLA) o SEC ID NO: 147 (WPRERAWALKNPHLAYNPFR).
Como se usa aquí, la expresión “gB” o “gB de HCMV” o “antígeno gB”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI P06473 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Cranage et al., EMBO J. 5, 3057-3063, 1986; Kouzarides et al., Virol., 157, 397-413, 1987; Kouzarides et al., J. Virol., 61, 125-133, 1987), y que tiene preferiblemente la función de una ADN polimerasa o que es una glicoproteína como se describe por Kouzarides et al., J. Virol., 61, 125-133, 1987, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido gB de HCMV también se denomina “UL55”.
Un epítopo particularmente preferido de gB tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 123 (AYEYVDYLF); SEC ID NO: 124 (SYENKTMQL); SEC ID NO: 125 (AYIYTTYLL); SEC ID NO: 126 (NTDFRVLEL); SEC ID NO: 127 (ATSTGDVVY); SEC ID NO: 128 (LDEGIMVVY); SEC ID NO: 129 (VKESPGRCY); SEC ID NO: 135 (IMREFNSYK); SEC ID NO: 136 (KMTATFLSK); SEC ID NO: 137 (CYSRPVVIF); SEC ID NO: 181 (RIWCLVVCV); SEC ID NO: 182 (QMLLALARL); SEC ID NO: 183 (GLDDLMSGL); SEC ID NO: 184 (IILVAIAVV); SEC ID NO: 185 (DLDEGIMVV); SEC ID NO: 186 (NLFPYLVSA); SEC ID NO: 187 (AVGGAVASV); SEC ID NO: 188 (YINRALAQI); SEC ID NO: 189 (YAYIYTTYL); SEC ID NO: 190 (VFETSGGLVV); SEC ID NO: 191 (DDYSNTHSTRYV); SEC ID NO: 192 (RSYAYIYTTYLLGSNTEYVA); SEC ID NO: 193 (TYEKYGNVSVFETSGGLWF); SEC ID NO: 194 (FETSGGLVVFWQGIKQKSLV); y SEC ID NO: 195 (MQLIPDDYSNTHSTRYVTVK).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de gB consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 187 (AVGGAVASV); SEC ID NO: 189 (YAYIYTTYL); SEC ID NO: 190 (VFETSGGLVV); SEC ID NO: 191 (DDYSNTHSTRYV); SEC ID NO: 192 (RSYAYIYTTYLLGSNTEYVA); SEC ID NO: 193 (TYEKYGNVSVFETSGGLWF); y SEC ID NO: 195 (MQLIPDDYSNTHSTRYVTVK).
Como se usa aquí, la expresión “gH” o “gH de HCMV” o “antígeno gH”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con
el número de acceso NCBI P12824 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Cranage et al.,
J. Virol., 62, 1416-1422, 1988), y que es preferiblemente una glicoproteína como se describe por Cranage et al., J. Virol., 62, 1416-1422, 1988, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido gH de HCMV también se denomina “UL75”.
Un epítopo particularmente preferido de gH tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 196 (YLMDELRYV); SEC ID NO: 197 (YLTVFTVYL); SEC ID NO: 198 (TLTEDFFVV); SEC ID NO: 199 (LLMMSVYAL); SEC ID NO: 200 (YLLYRMLKT); SEC ID NO: 201 (ILFDGHDLL); SEC ID NO: 202 (LIFGHLPRV); SEC ID NO: 203 (SLVRLVYIL); SEC ID NO: 204 (LLYPTAVDL); SEC ID NO: 205 (ALDPYNEW); SEC ID NO: 206 (LMLLKNGTV); SEC ID NO: 207 (SAIIGIYLL); SEC ID NO: 208 (ITSLVRLVY); SEC ID NO: 209 (HHEYLSDLY); SEC ID NO: 210 (AIIGIYLLY); SEC ID NO: 211 (QTEKHELLV); SEC ID NO: 212 (ATDSRLLMM); SEC ID NO: 213 (FLDAALDFNY); SEC ID NO: 214 (DTQGVINIMY); SEC ID NO: 215 (LRENTTQCTY); SEC ID NO: 216 (SAIIGIYLLY); SEC ID NO: 217 (SLRNSTVVR); SEC ID NO: 218 (ALALFAAAR); SEC ID NO: 219 (QLNRHSYLK); SEC ID NO: 220 (RLFPDATVP); SEC ID NO: 221 (RLNTYALVSK); SEC ID NO: 222 (LVRLVYILSK); SEC ID NO: 223 (YLMDELRYVK); SEC ID NO: 224 (ELYLMGSLVH); SEC ID NO: 225 (ALTVSEHVSY); SEC ID NO: 226 (NYLDLSALL); SEC ID NO: 227 (SYVVTNQYL); SEC ID NO: 228 (SYLKDSDFL); SEC ID NO: 229 (TYALVSKDL); SEC ID NO: 230 (SYRSFSQQL); SEC ID NO: 231 (TYGRPIRFL); SEC ID NO: 232 (YYVFHMPRCL); SEC ID NO: 233 (MYMHDSDDVL); SEC ID NO: 234 (ETFPDLFCL); SEC ID NO: 235 (DLTETLERY); SEC ID NO: 236 (SPRTHYLML); SEC ID NO: 237 (FPDLFCLPL); SEC ID NO: 238 (SPRTHYLMLL); SEC ID NO: 239 (MPRCLFAGPL); SEC ID NO: 240 (TPMLLIFGHL); SEC ID NO: 241 (APYQRDNFIL); SEC ID NO: 242 (GRCQMLDRR); SEC ID NO: 243 (RRDHSLERL); SEC ID NO: 244 (SEALDPHAF); SEC ID NO: 245 (RENTTQCTY); SEC ID NO: 246 (DDVLFALDPY); SEC ID NO: 247 (HELLVLVKKAQL); SEC ID NO: 248 (LTVSEHVSYVVT); SEC ID NO: 249 (RQTEKHELLVLVKKAQLNRH); y SEC ID NO: 250 (ALTVSEHVSYVVTNQYLIKG).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de gH consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 247 (HELLVLVKKAQL) o SEC ID NO: 249 (RQTEKHELLVLVKKAQLNRH).
Como se usa aquí, la expresión “IE-1” o “IE-1 de HCMV” o “antígeno IE-1”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI EDBEM5 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990), y que tiene preferiblemente el perfil de expresión de una proteína de HCMV inmediata temprana, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido IE-1 de HCMV también se denomina “UL123”.
Los epítopos particularmente preferidos de IE-1 consistirán en una secuencia de aminoácidos enumerada aquí anteriormente, y más preferiblemente la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 97 (VLAELVKQI); SEC ID NO: 101 (VLEETSVML); SEC ID NO: 112 (ELRRKMMYM); SEC ID NO: 113 (QIKVRVDMV); SEC ID NO: 114 (ELKRKMMYM); SEC ID NO: 116 (AYAQKIFKIL); SEC ID NO: 117 (CSPDEIMAYAQKIFKILDEE); SEC ID NO: 118 (SEPVSEIEEVAPEEEEDGAE); y SEC ID NO: 119 (VLCCYVLEETSVMLAKRPLI).
Como se usa aquí, la expresión “IE-2” o “IE-2 de HCMV” o “antígeno IE-2”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI NC 001347 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Bankier et al., DNA Seq 2, 1-12, 1991), y que tiene preferiblemente el perfil de expresión de una proteína de HCMV inmediata temprana, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia. Los expertos en la técnica estarán al tanto de que el polipéptido IE-2 de HCMV también se denomina “UL122”.
Un epítopo particularmente preferido de IE-2 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 251 (FLMEHTMPV); SEC ID NO: 252 (LMQKFPKQV); SEC ID NO: 253 (NLALSTPFL); SEC ID NO: 254 (IIYTRNHEV); SEC ID NO: 255 (IIYTRNHEVK); SEC ID NO: 256 (LLGALNLCL); SEC ID NO: 257 (KPEPDFTIQY); SEC ID NO: 258 (IMKDKNTPF); SEC ID NO: 259 (PRKKKSKRI); SEC ID NO: 260 (FEQPTETPP); SEC ID NO: 261 (FEQPTETP); SEC ID NO: 262 (FEQPTETPPE); SEC ID NO: 263 (EQPTETPPE); SEC ID NO: 264 (QFEQPTETPPE); SEC ID NO: 265 (SDYNMIIHA); SEC ID NO: 266 (YRNMIIHAAT); SEC ID NO: 267 (CLPLMQKFP); SEC ID NO: 268 (IDEVSRMFRNTNRS); SEC ID NO: 269 (TAAKAYAVGQFEQPTETPPE); (SEC ID NO: 270 (FEQPTETPPEDLDTLSLAIE); SEC ID NO: 271 (MLPLIKQEDIKPEPDFTIQY); SEC ID NO: 272 (THQLCPRSSDYRNMIIHAAT); SEC ID NO: 273 (YRNMIIHAATPVDLLGALNL); SEC ID NO: 274 (TGPRKKKSKRISELDNEKVR); SEC ID NO: 275 (PVDLLGALNLCLPLMQKFPK); SEC ID NO: 276 (IQIIYTRNHEVKSEVDAVRC); SEC ID NO: 277 (VKSEVDAVRCRLGTMCNLAL); SEC ID NO: 278 (RVKIDEVSRMFRNTNRSLEY); SEC ID NO: 279 (SSSSSSCSSASDSESESEEM); SEC ID NO: 280 (ASSPSTGSGTPRBTSPTHPL); SEC ID NO: 281 (PRVTSPTHPLSQMNHPPLPD); SEC ID NO: 282 (PLGRPDEDSSSSSSSSCSSA); SEC ID NO: 283 (SDSESESEEMKCSSGGGASV); SEC ID NO: 284 (KCSSGGGASVTSSHHGRGGF); SEC ID NO: 285 (CTPNVQTRRGRVKIDEVSRM); SEC ID NO: 286 (FRNTNRSLEYKNLPFTIPSM); SEC ID NO: 287 (HQVLDEAIKACKTMQVNNKG); SEC ID NO: 288
(CKTMQVNNKGIQIIYTRNHE); SEC ID NO: 289 (KAAWSLKELHTHQLCPRSSD); y SEC ID NO: 290 (CLPLMQKFPKQVMVRIFSTN).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de IE-2 consiste en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 254 (IIYTRNHEV); SEC ID NO: 255 (IIYTRNHEVK); SEC ID NO: 260 (FEQPTETPP); SEC ID NO: 261 (FEQPTETP); SEC ID NO: 262 (FEQPTETPPE); SEC ID NO: 263 (EQPTETPPE); SEC ID NO: 264 (QFEQPTETPPE); SEC ID NO: 269 (TAAKAYAVGQFEQPTETPPE); SEC ID NO: 270 (FEQPTETPPEDLDTLSLAIE); y SEC ID NO: 276 (IQIIYTRNHEVKSEVDAVRC).
Como se usa aquí, la expresión “UL18” o “UL18 de HCMV” o “antígeno UL18”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI P08560 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Beck y Barrell, Nature 331, 269-272, 1988), y que es preferiblemente una glicoproteína que tiene al menos una región de transmembrana, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Un epítopo particularmente preferido de UL18 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 291 (GEINITFIHY); SEC ID NO: 292 (TENGSFVAGY); SEC ID NO: 293 (TMWCLTLFV); y SEC ID NO: 308 (LELEIALGY).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de UL18 consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 292 (TENGSFVAGY).
Como se usa aquí, la expresión “US2” o “US2 de HCMV” o “antígeno US2”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI QQBEC5 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Weston y Barrell, J. Mol. Biol. 192, 177-208, 1986), y que es preferiblemente una glicoproteína que tiene al menos una región de transmembrana, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Un epítopo particularmente preferido de US2 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 294 (LLVLFIVYV); SEC ID NO: 295 (SMMWMRFFV); SEC ID NO: 296 (TLLVLFIVYV); y SEC ID NO: 297 (VYVTVDCNL).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de US2 consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 295 (SMMWMRFFV).
Como se usa aquí, la expresión “US3” o “US3 de HCMV” o “antígeno US3”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con los números de acceso NCBI QQBEC6 o P09712 o AAA45955 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Weston y Barrell, J. Mol. Biol. 192, 177-208, 1986; y Weston Virol. 162, 406-416, 1988), y que es preferiblemente una glicoproteína que se expresa tempranamente durante la infección, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Un epítopo particularmente preferido de US3 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 298 (YLFSLVVLV); SEC ID NO: 299 (TLLVYLFSL); SEC ID NO: 300 (LLFRTLLVYL); y SEC ID NO: 301 (VYLFSLVVL).
Incluso más preferiblemente, el epítopo de US3 consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 298 (YLFSLVVLV).
Como se usa aquí, la expresión “US6” o “US6 de HCMV” o “antígeno US6”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI QQBEC7 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Weston y Barrell, J. Mol. Biol. 192, 177-208, 1986), y que es preferiblemente una glicoproteína que tiene al menos una región de transmembrana, o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Incluso más preferiblemente, el epítopo de US6 consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 303 (LYLCCGITL).
Como se usa aquí, la expresión “US11” o “US11 de HCMV” o “antígeno US11”, o expresión similar, se debe tomar para que signifique un polipéptido de HCMV que tiene la secuencia de aminoácidos públicamente disponible depositada con el número de acceso NCBI NC 001347 (Chee et al., Curr. Top. Microbiol. Immunol 154, 125-169, 1990; Bankier et al., DNA Seq 2, 1-12; 1991), o un polipéptido relacionado de HCMV u otro virus del herpes de seres humanos que tiene al menos alrededor de 80% de identidad de secuencia de aminoácidos con dicha secuencia.
Un epítopo particularmente preferido de US11 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 302 (YYVECEPRC); SEC ID NO: 304 (TLFDEPPPLV); SEC ID NO: 305 (TPRVYYQTL); SEC ID NO: 306 (APVAGSMPEL); y SEC ID NO: 307 (SESLVAKRY).
Como será conocido por los expertos en la técnica, un epítopo de CTL mínimo está restringido a linfocitos T CD8+ que expresan subconjuntos particulares de moléculas de HLA Clase I. Preferiblemente, el epítopo de CTL de la presente invención está restringido a alelos de HLA seleccionados del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A23, HLA A24, HLA A26, HLA A29, HLA A30, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B41, HLA B44, HLA B57, y HLA B58. En las Tablas 1, 3 y 4 aquí se proporcionan restricciones particulares a HLA para los epítopos de la invención.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de pp28 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, y HLA B27.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de pp50 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA B27 y HLA B44.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de pp65 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A24, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B44, HLA B57, y HLA B58.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de pp71 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A24, y HLA B44.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de pp150 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA B7 y HLA B8.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de gB está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A24, HLA A29, HLA B41, HLA DR7 y HLA DR*.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de gH está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A24, HLA A26, HLA B7, HLA B27, y HLA B44.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de IE-1 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A23, HLA A24, HLA A30, HLA B7, HLA B8 y HLA B27.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de IE-2 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA B8, HLA B35 y HLA B41.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de UL18 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A2 y HLA B44.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de US2 está restringido a HLA A2 o HLA A24.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de US3 está restringido a HLA A2 o HLA A24.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de US6 está restringido a HLA A24.
En una realización particularmente preferida, el epítopo de la invención derivado de US11 está restringido a un alelo de HLA seleccionado del grupo que consiste en: HLA A2, HLA A24, HLA B7, y HLA B44.
Preferiblemente, los péptidos inmunológicamente activos de la invención presentan especificidad por el supertipo de HLA. Tales epítopos se prefieren claramente en formulaciones de vacuna, debido a que reducen el número total de epítopos requeridos para cubrir una proporción significativa de la población independientemente de la etnicidad, minimizando de ese modo las dificultades de la formulación. Por ejemplo, los CTLs específicos para el epítopo de IE-1 de HCMV restringido a HLA A23 expuesto en SEC ID NOs: 116 ó 117 reconocen células diana que expresan HLA A23, HLA A24, y HLA A30 sensibilizadas con péptido. Adicionalmente, el epítopo de IE-1 de HCMV expuesto en SEC ID NO: 109 está restringido tanto a HLA B7 como a HLA B8. Adicionalmente, los CTLs específicos para el epítopo de pp65 de HCMV expuesto en SEC ID NOs: 57 ó 69 reconocen células diana que expresan HLA A1 y HLA A24 sensibilizadas con péptidos. Adicionalmente, los CTLs específicos para el epítopo de pp65 de HCMV expuesto en SEC ID NOs: 63, 80 u 81 reconocen células diana que expresan HLA B57 y HLA B58 sensibilizadas con péptidos.
Preferiblemente, el péptido inmunológicamente activo de la invención comprende adicionalmente uno o más
determinantes CD4+ suficientes para facilitar una función de linfocito T auxiliar en el contexto de una molécula de MHC clase II en la superficie de una célula presentadora de antígeno (APC) de un sujeto humano infectado con HCMV. Por ejemplo, se proporcionan aquí varios péptidos 20-meros que comprenden epítopos de CTL contiguos o solapantes y funciones de epítopos de linfocitos T auxiliares, como se evidencia por tener la capacidad para unirse
5 tanto a células CD4+ como a células CD8+. Tal péptido tiene una ventaja con respecto a un epítopo de CTL mínimo al no requerir necesariamente la inclusión de un epítopo de linfocito T auxiliar exógeno en una formulación de vacuna.
Por ejemplo, un epítopo preferido de pp65 que comprende tanto epítopos de CTL como de linfocitos T auxiliares tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO:70
10 (PQYSEHPTFTSQYRIQGKLE); SEC ID NO: 76 (QYDPVAALFFFDIDLLLQRG); SEC ID NO: 77 (IIKPGKISHIMLDVAFTSHE); SEC ID NO: 80 (MNGQQIFLEVQAIRETVELR); SEC ID NO: 81 (QAIRETVELRQYDPVAALFF); SEC ID NO: 87 (YYTSAFVFPTKDVALRHVVC); SEC ID NO: 88 (VTTERKTPRVTGGGAMAGAS); SEC ID NO: 90 (SICPSQEPMSIYVYALPLKM); SEC ID NO: 92 (QQNQWKEPDVYYTSAFVFPT); y SEC ID NO: 94 (TGGGAMAGASTSAGRKRKSA).
15 Un epítopo particularmente preferido de pp150 que comprende tanto epítopos de CTL como de linfocitos T auxiliares tiene la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 147 (WPRERAWALKNPHLAYNPFR).
Un epítopo particularmente preferido de gB que comprende tanto epítopos de CTL como de linfocitos T auxiliares tiene una secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 192 (RSYAYIYTTYLLGSNTEYVA) o SEC ID NO: 195 (MQLIPDDYSNTHSTRYVTVK).
20 Un epítopo particularmente preferido de gH que comprende tanto epítopos de CTL como de linfocitos T auxiliares tiene la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 249 (RQTEKHELLVLVKKAQLNRH).
Un epítopo particularmente preferido de IE-1 que comprende tanto epítopos de CTL como de linfocitos T auxiliares consistirá en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 117 (CSPDEIMAYAQKIFKILDEE).
Un epítopo particularmente preferido de IE-2 que comprende tanto epítopos de CTL como de linfocitos T auxiliares
25 tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 269 (TAAKAYAVGQFEQPTETPPE); SEC ID NO: 270 (FEQPTETPPEDLDTLSLAIE); SEC ID NO: 279 (SSSSSSCSSASDSESESEEM); y SEC ID NO: 283 (SDSESESEEMKCSSGGGASV).
Por “variante funcionalmente equivalente” de un epítopo ejemplificado aquí se quiere decir un péptido de la misma longitud que dicho epítopo y especificidad por HLA similar, y que tiene sustancialmente la misma secuencia de
30 aminoácidos que dicho epítopo. El péptido o las variantes estructurales descritas aquí también pueden ser una parte funcional de un epítopo de péptido más largo que produce los efectos inmunológicos descritos aquí, con la condición de que el péptido más largo no tenga una especificidad por HLA diferente con respecto al péptido base del que deriva, y no sea un epítopo previamente conocido.
Las variantes de secuencias funcionalmente equivalentes se pueden diseñar y/o construir por los expertos en la
35 técnica basándose en la presente descripción sin experimentación innecesaria. Por ejemplo, se ha establecido que moléculas individuales de MHC Clase I se unen preferentemente a péptidos que tienen una secuencia de aminoácidos que incluye una o más “posiciones de anclaje” invariantes que permiten al péptido unirse a moléculas de MHC Clase I con una afinidad elevada (K. Falk et al., Nature 351, 290-296, 1991). Adicionalmente, los aminoácidos distintos de aquellos en las posiciones de anclaje también contribuyen a la especificidad de la unión del
40 péptido a moléculas de MHC Clase I. Las variantes preferidas de los péptidos ejemplificados retendrán tales restos de los péptidos base.
Preferiblemente, el péptido variante, con las posiciones de anclaje intactas del péptido base, también consistirá en una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en:
(i) una secuencia que interacciona en un nivel significativo con un alelo de MHC Clase I según se determina
45 usando un algoritmo predictivo para determinar epítopos que se unen a MHC Clase I, tal como, por ejemplo, el algoritmo SYFPEITHI de la Universidad de Tuebingen, Alemania, o el algoritmo del programa de Predicciones de Unión a Péptidos de HLA de la BioInformatics and Molecular Analysis Section (BIMAS) del National Institutes of Health del Gobierno de los Estados Unidos de América;
(ii) una secuencia que se une a y/o estabiliza una molécula de MHC Clase I en la superficie de un APC,
50 independientemente de si dicho linfocito T está o no en una forma sustancialmente aislada, tal como, por ejemplo, en la fracción de PBMC o en la fracción de capa leuco-plaquetaria de una muestra obtenida de un sujeto humano; o como alternativa, en su estado natural;
(iii) una secuencia que induce una respuesta de CTL de memoria o provoca la expresión de IFN- por un linfocito T, tal como, por ejemplo, linfocito T CD8+, linfocito T citotóxico (CTL) o linfocito T efector,
55 independientemente de si dicho linfocito T está o no en una forma sustancialmente aislada, tal como, por ejemplo, en la fracción de PBMC o en la fracción de capa leuco-plaquetaria de una muestra obtenida de un
sujeto humano, o como alternativa, en su estado natural; y
(iv) una secuencia que estimula la actividad de CTL en un ensayo estándar de citotoxicidad.
La determinación de tales criterios es fácilmente lograble a partir de la descripción proporcionada aquí.
Incluso más preferiblemente, una variante funcionalmente equivalente comprende una secuencia que satisface al menos , preferiblemente al menos dos, y más preferiblemente al menos tres criterios funcionales citados en los párrafos (ii) a (iv) más arriba. Incluso más preferiblemente, un epítopo de CTL como se define aquí comprende una secuencia que satisface adicionalmente el criterio (i) más arriba.
Las variantes preferidas incluirán típicamente sustituciones de aminoácidos conservativas con respecto a la secuencia del péptido base, tal como, por ejemplo, que consisten en la sustitución de un aminoácido por otro resto de hidrofobia, tamaño, carga, antigenicidad, etc., similar. Las sustituciones de aminoácidos conservativas particularmente preferidas se seleccionan del grupo que consiste en:
- (i)
- una sustitución que implica cualesquiera dos de glicina, alanina y prolina;
- (ii)
- una sustitución que implica cualesquiera dos de isoleucina, leucina y valina;
(iii) una sustitución que implica cualesquiera dos de metionina, treonina, serina, y cistina;
- (iv)
- una sustitución que implica asparagina y glutamina;
- (v)
- una sustitución que implica aspartato y glutamato;
- (vi)
- una sustitución que implica lisina y arginina; y
(vii) una sustitución que implica cualesquiera dos de histidina, fenilalanina, triptófano y tirosina.
También se entiende en la técnica que la sustitución de aminoácidos similares se realiza efectivamente en base a la hidrofilia, particularmente cuando la proteína o péptido equivalente funcional biológico creado de ese modo está destinado al uso en realizaciones inmunológicas, como en el presente caso (por ejemplo patente US nº 4.554.101). De hecho, la hidrofilia promedio local más grande de una proteína, según está gobernada por la hidrofilia de sus aminoácidos adyacentes, se correlaciona con su inmunogenicidad y antigenicidad. Como se detalla en la patente US nº 4.554.101, se han asignado los siguientes valores de hidrofilia a los restos de aminoácidos: arginina (+3,0); lisina (+3,0); aspartato (+3,0 +/-0,1); glutamato (+3,0 +/-0,1); serina (+0,3); asparagina (+0,2); glutamina (+0,2); glicina (0); treonina (-0,4); prolina (-0,5 +/-0,1); alanina (-0,5); histidina (-0,5); cisteína (-1,0); metionina (-1,3); valina (-1,5); leucina (-1,8); isoleucina (-1,8); tirosina (-2,3); fenilalanina (-2,5); triptófano (-3,4). Al realizar cambios basándose en valores de hidrofilia similares, se prefiere sustituir aminoácidos que tengan valores de hidrofilia en alrededor de +/0,2 entre sí, más preferiblemente en alrededor de +/-0,1, e incluso más preferiblemente en alrededor de +/-0,05.
Los derivados preferidos de los presentes péptidos incluyen lipopéptidos, en los que un resto lipídico se conjuga a la secuencia de aminoácidos, actuando dicho resto lipídico como un adyuvante (Jung et al., Angew Chem, Int Ed Engl 10, 872, 1985; Martinon et al., J Immunol 149, 3416, 1992; Toyokuni et al., J Am Chem Soc 116, 395, 1994; Deprez, et al., J Med Chem 38, 459, 1995; Sauzet et al., Vaccine 13, 1339, 1995; BenMohamed et al., Eur. J. Immunol. 27, 1242, 1997; Wiesmuller et al., Vaccine 7, 29, 1989; Nardin et al., Vaccine 16, 590, 1998; Benmohamed, et al. Vaccine 18, 2843, 2000; y Obert, et al., Vaccine 16, 161, 1998). Los lipopéptidos adecuados no muestran ninguno de los efectos secundarios perjudiciales asociados con formulaciones adyuvantes, y se han observado tanto respuestas de anticuerpos como celulares frente a lipopéptidos. Se conocen varios restos lipídicos diferentes para uso en constructos lipopeptídicos. Los restos lipídicos ejemplares incluyen, pero no se limitan a, grupos palmitoílo, miristoílo, estearoílo y decanoílo, o, más generalmente, se piensa que es útil cualquier grupo acilo graso saturado, monoinsaturado, o poliinsaturado, de C2 a C30.
El lipoaminoácido S-[2,3-bis(palmitoiloxi)propil]cisteína, también conocido como Pam3Cys-OH (Wiesmuller et al., Z. Physiol. Chem. 364 593, 1983), es una versión sintética del resto N-terminal de la lipoproteína de Braun que abarca las membranas interna y externa de bacterias gramnegativas. La patente de los Estados Unidos de América nº
5.700.910 de Metzger et al (23 de diciembre de 1997), describe varias N-acil-S-(2-hidroxialquil)cisteínas para uso como intermedios en la preparación de lipopéptidos que se usan como adyuvantes sintéticos, estimulantes de linfocitos B, estimulantes de macrófagos, o vacunas sintéticas. Metzger et al. también enseñan el uso de tales compuestos como intermedios en la síntesis de Pam3Cys-OH (Wiesmuller et al., Z. Physiol. Chem. 364, 593, 1983), y de lipopéptidos que comprenden este lipoaminoácido o un análogo del mismo en el término N. Según Metzger et al., el resto peptídico de los lipopéptidos se conjugan al resto de lipoaminoácido mediante eliminación de los grupos protectores C-terminales en el lipoaminoácido, y usando después el compuesto resultante como un sustrato para la síntesis de lipopéptidos, tal como en la síntesis peptídica en fase sólida. Se ha mostrado que Pam3Cys es capaz de estimular respuestas de linfocitos T citotóxicos (CTL) específicos de virus frente a células infectadas con el virus de la gripe (Deres et al., Nature 342, 561, 1989), y de provocar anticuerpos protectores frente a la glosopeda (Wiesmuller et al., Vaccine 7, 29, 1989; patente de los Estados Unidos nº 6.024.964 de Jung et al., 15 de febrero de
2000) cuando se acopla a los epítopos de CTL sintéticos apropiados. La ventaja de usar Pam3Cys en tales vacunas es que el compuesto es un compuesto de anclaje a la membrana (es decir, puede penetrar en la membrana plasmática de una célula para potenciar la inducción de linfocitos T citotóxicos en respuesta a epítopos de CTL específicos fijados vía sus términos N al lipoaminoácido.
Pam2Cys, un lipoaminoácido sintético que comprende un resto lipídico de lipopéptido activante de macrófagos (es decir, MALP-2), se ha sintetizado recientemente (Metzger et al., J Pept. Sci 1, 184, 1995). Se da a conocer que Pam2Cys es un estimulante más potente de esplenocitos y macrófagos que Pam3Cys (Metzger et al., J Pept. Sci 1, 184, 1995; Muhlradt et al., J Exp Med 185, 1951, 1997; y Muhlradt et al., Infect Immun 66, 4804,1998).
Como alternativa, o además de la conjugación de uno o más restos lipídicos al epítopo de la invención, los epítopos se modifican mediante la adición de uno o más epítopos adicionales, tales como, por ejemplo, uno o más epítopos de linfocitos B de HCMV, epítopos de linfocitos T auxiliares de HCMV, o epítopos de linfocitos T auxiliares promiscuos/permisivos. A este respecto, la generación de una respuesta de anticuerpo frente a un antígeno dado requiere la generación de una fuerte respuesta de linfocitos T auxiliares (Vitiello et al, J. Clin. Invest. 95, 341-349, 1995; Livingston et al, J. Immunol. 159, 1383-1392, 1997). En consecuencia, es particularmente preferido derivatizar de esta manera los presentes epítopos de CTL. Como alternativa, los péptidos que contienen epítopos de linfocitos T promiscuos o permisivos se administran conjuntamente con el antígeno. Los ejemplos de epítopos de linfocitos T promiscuos o permisivos son el péptido de toxoide tetánico, pfg27 de Plasmodium falciparum, lactato deshidrogenasa, y gp120 de HIV (Contreas et al., Infect. Immun, 66, 3579-3590, 1998; Gaudebout et al., J. A.I.D.S. Human Retrovirol 14, 91-101, 1997; Kaumaya et al., J. Mol. Recog. 6, 81-94, 1993; y Fern y Good J. Immunol. 148, 907-913, 1992). Ghosh et al., Immunol 104, 58-66, 2001 y la Solicitud de Patente Internacional nº PCT/AU00/00070 (WO 00/46390) también describen epítopos de linfocitos T auxiliares procedentes de la proteína de fusión del virus del moquillo (CDV-F). Ciertos epítopos de linfocitos T auxiliares promiscuos inducen fuerte respuestas de linfocitos B frente a un antígeno dado, y pueden evitar ciertas respuestas inmunitarias restringidas por haplotipos (Kaumaya et al., J. Mol. Recog. 6, 81-94, 1993).
Como alternativa, o además, el péptido se derivatiza mediante enlace covalente a un adyuvante que es conocido para fines de inmunización, tal como, por ejemplo, dipéptido de muramilo, lípido o lipopolisacárido.
El péptido de la invención se sintetiza fácilmente usando técnicas estándar, tales como el método de síntesis de Merrifield (Merrifield, J Am Chem Soc, 85,:2149-2154, 1963), y la miríada de mejoras disponibles en esa tecnología (véanse, por ejemplo, Synthetic Peptides: A User’s Guide, Grant, ed. (1992) W.H. Freeman & Co., Nueva York, p. 382; Jones (1994) The Chemical Synthesis of Peptides, Clarendon Press, Oxford, p. 230.); Barany, G. y Merrifield,
R.B. (1979) en The Peptides (Gross, E. y Meienhofer, J. eds.), vol. 2, p. 1-284, Academic Press, Nueva York; Wunsch, E., ed. (1974) Synthese von Peptiden in Houben-Weyls Metoden der Organischen Chemie (Müler, E., ed.), vol. 15, 4ª ed., Partes 1 y 2, Thieme, Stuttgart; Bodanszky, M. (1984) Principles of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Heidelberg; Bodanszky, M. y Bodanszky, A. (1984) The Practice of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Heidelberg; Bodanszky, M. (1985) Int. J. Peptide Protein Res. 25, 449-474.
Preferiblemente, el péptido se sintetiza sobre un soporte de fase sólida, tal como, por ejemplo, una perla de gel de poliestireno que comprende poliestireno reticulado con divinilbenceno, preferiblemente 1% (p/p) de divinilbenceno que se hincha adicionalmente usando disolvente lipófilo, tal como, por ejemplo, diclorometano o dimetilformamida (DMF). El poliestireno se puede funcionalizar mediante adición de clorometano o grupos aminometilo. Como alternativa, el gel de polidimetilacrilamida reticulada y funcionalizada se puede usar una vez hinchado y solvatado usando DMF o disolvente aprótico dipolar. También se pueden usar para la síntesis de péptidos otros soportes de fase sólida conocidos por los expertos en la técnica, tales como, por ejemplo, perla derivada de polietilenglicol producida injertando polietilenglicol en la superficie de perlas de poliestireno inerte. Los soportes de fase sólida preferidos comercialmente disponibles incluyen PAL-PEG-PS, PAC-PEG-PS, KA, KR, o TGR (Applied Biosystems, CA 94404, USA).
Para la síntesis peptídica en fase sólida, los grupos bloqueantes que son estables a los tratamientos repetidos necesarios para la eliminación del grupo bloqueante de amino de la cadena peptídica en crecimiento y para los acoplamientos repetidos de aminoácidos se usan para proteger las cadenas laterales de aminoácidos durante la síntesis y para enmascarar la reactividad indeseada de los grupos funcionales -amino, carboxilo o de cadena lateral. Los grupos bloqueantes (también denominados grupos protectores o grupos enmascarantes) protegen así al grupo amino del aminoácido que tiene un grupo carboxilo activado que está implicado en la reacción de acoplamiento, o protegen al grupo carboxilo del aminoácido que tiene un grupo amino acilado que está implicado en la reacción de acoplamiento.
Durante la síntesis, el acoplamiento se produce tras la eliminación de un grupo bloqueante sin la destrucción de un enlace peptídico, o cualquier grupo protector unido a otra parte del péptido. Adicionalmente, el anclaje de péptidoresina que protege el término C del péptido está protegido mediante el procedimiento sintético hasta que se requiere la escisión desde la resina. En consecuencia, mediante la selección juiciosa de -aminoácidos ortogonalmente protegidos, los aminoácidos se añaden en localizaciones deseadas a un péptido en crecimiento mientras todavía está unido a la resina.
Los grupos bloqueantes de amino preferidos son fácilmente eliminables pero suficientemente estables para sobrevivir a las condiciones para la reacción de acoplamiento y otras manipulaciones, tales como, por ejemplo, modificaciones a los grupos de la cadena lateral.
Los grupos bloqueantes de amino preferidos se seleccionan del grupo que consiste en: (i) un grupo benciloxicarbonilo (Z o carbobenzoxi) que se elimina fácilmente mediante hidrogenación catalítica a temperatura ambiente y presión normal, o usando sodio en amoníaco líquido y ácido bromhídrico en ácido acético; (ii) un derivado de uretano; (iii) un grupo t-butoxicarbonilo (Boc) que se introduce usando azida de t-butoxicarbonilo o dicarbonato de di-terc-butilo, y se elimina usando ácido suave tal como, por ejemplo, ácido trifluoroacético (TFA al 50% en diclorometano) o HCl en ácido acético/dioxano/acetato de etilo; (iv) un grupo 9-fluorenilmetiloxicarbonilo (Fmoc) que se escinde en condiciones suavemente básicas, no hidrolíticas, tales como, por ejemplo, usando una amina primaria o secundaria (por ejemplo piperidina al 20% en dimetilformamida); (v) un grupo 2-(4bifenilil)propil(2)oxicarbonilo (Bpoc); (vi) un grupo 2-nitro-fenilsulfenilo (Nps); y (vii) un grupo ditia-succinilo (Dts).
Boc se usa ampliamente para proteger el término N en la química de Fmoc, o Fmoc se usa ampliamente para proteger el término N en la química de Boc.
Los grupos protectores de la cadena lateral variarán para las cadenas laterales funcionales de los aminoácidos que forman el péptido que se está sintetizando. Los grupos protectores de la cadena lateral se basan generalmente en el grupo Bzl o el grupo tBu. Los aminoácidos que tienen alcoholes o ácidos carboxílicos en la cadena lateral se protegen como éteres de Bzl, ésteres de Bzl, ésteres de cHex, éteres de tBu, o ésteres de tBu. La protección de la cadena lateral de Fmoc aminoácidos requiere bloquear grupos que son idealmente estables a bases y lábiles a ácidos débiles (TFA). Por ejemplo, el grupo épsilon-amino de lisina se protege usando Mtt (por ejemplo, Fmoclisina(Mtt)-OH). Como alternativa, un derivado bencílico halogenado, tal como ClZ, se usa para proteger lisina si se requiere estabilidad potenciada a ácidos. El grupo tiol de cistina, el imidazol de histidina, o el grupo guanidina de arginina requieren generalmente una protección especializada. Se han descrito muchos grupos protectores diferentes para la síntesis peptídica (véase The Peptides, Gross et al. eds., Vol. 3, Academic Press, Nueva York, 1981). Por ejemplo, el grupo 4-metoxi-2,3,6-trimetilfenilsulfonilo (Nd-Mtr) es útil para la protección de la cadena lateral de arginina; sin embargo, la desprotección de Arg(Mtr) requiere el tratamiento prolongado con TFA. Para proteger cistina se usa un número de grupos lábiles a ácidos suaves (TFA, trifluoroacetato de talio (III)/TFA), o grupos estables a TFA pero lábiles a trifluoroacetato de talio (III)/TFA, o grupos estables a ácidos suaves.
Las dos estrategias de protección más ampliamente usadas son las estrategias de Boc/Bzl y la Fmoc/tBu. En Boc/Bzl, se usa Boc para la protección de amino, y las cadenas laterales de los diversos aminoácidos se protegen usando grupos protectores a base de Bzl o cHex. Un grupo Boc es estable en condiciones de hidrogenación catalítica, y se usa ortogonalmente junto con un grupo Z para la protección de muchos grupos de cadenas laterales. En Fmoc/tBu, Fmoc se usa para la protección de amino, y las cadenas laterales se protegen con grupos protectores a base de tBu.
Como alternativa, el péptido de la invención se produce mediante la expresión recombinante de ácido nucleico que codifica la secuencia de aminoácidos de dicho péptido. La secuencia nucleotídica apropiada de dicho ácido nucleico deriva fácilmente de los datos de secuencias de aminoácidos proporcionados aquí, usando el código genético en combinación con tablas de preferencias de codones para el organismo en el que se ha de llevar a cabo la expresión del péptido. Tales métodos son bien conocidos por los expertos en la técnica. En consecuencia, una realización adicional de la invención se extiende claramente a un ácido nucleico aislado que comprende una secuencia nucleotídica que codifica un péptido de la invención que tiene una secuencia de aminoácidos como se describe aquí en una cualquiera de SEC ID Nos: 22-318.
Una vez que se ha determinado la secuencia nucleotídica apropiada que codifica el epítopo de péptido, el ácido nucleico que codifica los epítopos descritos aquí se produce mediante síntesis oligonucleotídica estándar. Preferiblemente, el oligonucleótido se sintetiza con secuencias ligadoras o adaptadoras en los extremos 5’ y 3’ para facilitar la clonación subsiguiente en un sistema de vector adecuado usando técnicas estándar. Para expresar un péptido por medios recombinantes, el ácido nucleico que codifica dicho péptido se coloca en conexión operable con un promotor u otra secuencia reguladora capaz de regular la expresión en un sistema libre de células o en un sistema celular.
Colocar una molécula de ácido nucleico bajo el control regulador de, es decir, “en conexión operable con”, una secuencia promotora significa situar dicha molécula de manera que la expresión está controlada por la secuencia promotora, generalmente situando el promotor 5’ (en dirección 5’) de la secuencia que codifica el péptido.
El prerrequisito para producir polipéptidos y péptidos intactos en bacterias tales como E. coli es el uso de un promotor fuerte con un sitio de unión a ribosoma eficaz. Los promotores típicos adecuados para la expresión en células bacterianas tales como E. coli incluyen, pero no se limitan a, el promotor lacz, los promotores Lo R sensibles a la temperatura, el promotor T7 o el promotor tac inducible por IPTG. En la técnica se conoce y se describe un número de otros sistemas de vectores para expresar la molécula de ácido nucleico de la invención en E. coli, por ejemplo en Ausubel et al (en: Current Protocols in Molecular Biology. Wiley Interscience, ISBN 047150338, 1987) o Sambrook et al (en: Molecular cloning, A laboratory manual, segunda edición, Cold Spring Harbor
Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989). Se han descrito numerosos plásmidos con secuencias promotoras adecuadas para la expresión en bacterias y sitios de unión a ribosoma eficientes, tales como, por ejemplo, pKC30 (L: Shimatake y Rosenberg, Nature 292, 128, 1981); pKK173-3 (tac: Amann y Brosius, Gene 40, 183, 1985), pET-3 (T7: Studier y Moffat, J. Mol. Biol. 189, 113, 1986); la serie de vectores pBAD/TOPO o pBAD/Thio-TOPO que contienen un promotor inducible por arabinosa (Invitrogen, Carlsbad, CA), el último de los cuales se diseña también para producir proteínas de fusión con tiorredoxina para potenciar la solubilidad de la proteína expresada; la serie de vectores de expresión pFLEX (Pfizer Inc., CT, USA); o la serie de vectores de expresión pQE (Qiagen, CA), entre otros.
Los promotores típicos adecuados para la expresión en virus de células eucariotas y células eucariotas incluye el promotor tardío de SV40, el promotor temprano de SV40 y el promotor de citomegalovirus (CMV), el promotor IE de CMV (temprano inmediato de citomegalovirus), entre otros. Los vectores preferidos para la expresión en células de mamíferos (por ejemplo, 293, COS, CHO, células 10T, células 293T) incluyen, pero no se limitan a, el conjunto de vectores pcDNA suministrado por Invitrogen, en particular pcDNA 3.1 myc-His-tag que comprende el promotor de CMV y que codifica una etiqueta 6xHis y MYC C-terminal; y el vector retrovírico pSRtkneo (Muller et al., Mol. Cell. Biol., 11, 1785, 1991). El vector pcDNA 3.1 myc-His (Invitrogen) se prefiere particularmente para expresar una forma segregada del polipéptido de la invención o un derivado del mismo en células 293T, en el que el péptido o proteína expresada se puede purificar libre de proteínas conespecíficas, usando técnicas de afinidad estándar que emplean una columna de Níquel para la unión de la proteína vía la etiqueta His.
Existe públicamente un amplio intervalo de sistemas adicionales de hospedantes/vectores adecuados para expresar el péptido de la invención o un derivado inmunológico del mismo, y se describe, por ejemplo, en Sambrook et al (en: Molecular cloning, A laboratory manual, segunda edición, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N.Y., 1989).
Los medios para introducir el ácido nucleico que codifica el péptido, o un constructo génico que lo comprende, en una célula para la expresión son bien conocidos por los expertos en la técnica. La técnica usada para un organismo dado depende de las técnicas exitosas conocidas. Los medios para introducir ADN recombinante en células de animales incluyen microinyección, transfección mediada por DEAE-dextrano, transfección mediada por liposomas tales como usando lipofectamina (Gibco, MD, USA), y/o celfectina (Gibco, MD, USA), captación de ADN mediada por PEG, electroporación y bombardeo con micropartículas, tal como usando partículas de volframio u oro revestidas con ADN (Agracetus Inc., WI, USA), entre otros.
2. Poliepítopos de HCMV aislados
Un segundo aspecto de la presente invención proporciona un péptido poliepitópico inmunológicamente activo que comprende dos o más de los epítopos de linfocitos T citotóxicos (CTL) de la invención descritos aquí anteriormente.
El número de epítopos de CTL contenidos en un único péptido poliepitópico se puede determinar fácilmente por los expertos en la técnica.
En el caso de péptidos sintéticos, el número máximo de epítopos de CTL a incluir en un único péptido poliepitópico está constreñido por la eficiencia de la síntesis peptídica, y, en general, se sintetiza fácilmente un péptido de hasta 400 aminoácidos, preferiblemente hasta 350 aminoácidos, más preferiblemente hasta 300 aminoácidos, incluso más preferiblemente hasta 250 ó 200 ó 150 ó 100 ó 50 aminoácidos de longitud. Esto significa que en un péptido poliepitópico sintético se incluyen fácilmente tantos como alrededor de 45 epítopos de CTL distintos de la presente invención. Como será bien conocido por los expertos en la técnica, la eficiencia de la síntesis peptídica está potenciada por péptidos más cortos. En una realización particularmente preferida de la invención, un péptido poliepitópico sintético comprende alrededor de 30-35 de los epítopos de CTL descritos aquí.
Para péptidos poliepitópicos recombinantes expresados en células aisladas que se han transfectado con un vector de expresión que comprende ácido nucleico que codifica el péptido poliepitópico, se puede incluir en un único péptido poliepitópico un número mucho más grande de epítopos de CTL distintos. Como será conocido por los expertos en la técnica, se pueden realizar fácilmente manipulaciones de ácidos nucleicos en un ácido nucleico que consiste en hasta varias kilobases de nucleótidos. Los métodos para la producción de péptidos recombinante se describen con detalle aquí más arriba y en los textos generales citados en la página 2.
ara ácido nucleico sintético que codifica el poliepítopo de la invención, se producen fácilmente con eficiencia elevada oligonucleótidos sintéticos de hasta alrededor de 50-110 nucleótidos de longitud, cada uno con una capacidad codificante de alrededor de 3-4 epítopos de CTL contiguos, y estos se pueden clonar en tándem en un vector adecuado sin experimentación excesiva para proporcionar el número necesario de epítopos de CTL contiguos.
Preferiblemente, el péptido poliepitópico de la invención comprende alrededor de 5-10 epítopos de CTL, más preferiblemente alrededor de 10-15 epítopos de CTL, incluso más preferiblemente alrededor de 15-20 epítopos de CTL, incluso aún más preferiblemente alrededor de 20-25 epítopos de CTL, incluso todavía más preferiblemente alrededor de 25-30 epítopos de CTL. En una realización particularmente preferida ejemplificada aquí, se proporciona un péptido poliepitópico aislado que comprende 26 ó 27 epítopos de CTL distintos de la invención.
Como será conocido por los expertos en la técnica de producción de poliepítopos, no es necesario introducir ningún espaciamiento entre los monómeros de epítopos individuales de un poliepítopo, o como alternativa, entre el resto peptídico y cualquier resto lipídico introducido al epítopo o poliepítopo.
Preferiblemente, el poliepítopo de la invención no está restringido a un único haplotipo de MHC Clase I. Incluso más preferiblemente, los poliepítopos están restringidos a un número suficiente de moléculas de MHC Clase I para proporcionar cobertura para una proporción significativa de la población general independientemente del origen racial o etnicidad. Los expertos en la técnica estarán fácilmente en posición de determinar el número de epítopos de CTL de HCMV individuales requerido para proporcionar cobertura de cualquier población dada a partir de los datos de especificidad por HLA proporcionados aquí.
Preferiblemente, un péptido poliepitópico comprende al menos secuencia de aminoácidos que están restringidas a alelos de MHC Clase I seleccionados del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A11, HLA A23, HLA A24, HLA A26, HLA A29, HLA A30, HLA A68, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B41, HLA B44, HLA B57, y HLA B58. Los expertos en la técnica serán capaces fácilmente de lograr tal restricción amplia basándose en los datos de restricción por HLA proporcionados aquí para los epítopos de la invención y aquellos epítopos de la técnica anterior, siendo la única condición que al menos un epítopo de CTL de dicho poliepítopo sea distinto de un epítopo seleccionado del grupo que consiste en SEC ID Nos: 1-21.
Más preferiblemente, el péptido poliepitópico está restringido a alelos de MHC Clase I seleccionados del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A11, HLA A23, HLA A24, HLA A26, HLA A30, HLA A68, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B41, HLA B44, HLA B57 y HLA B58. Tal restricción amplia por HLA se logra fácilmente usando epítopos de CTL que tienen secuencias de aminoácidos seleccionadas del grupo que consiste en: SEC ID NO: 13 (YSEHPTFTSQY; HLA A1); SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY; HLA A1); SEC ID NO: 5 (NLVPMVATV; HLA A2); SEC ID NO: 101 (VLEETSVML; HLA A2); SEC ID-NO: 7 (RIFAELEGV; HLA A2); SEC ID NO: 254 (IIYTRNHEV; HLA A2); SEC ID NO: 135 (IMREFNSYK; HLA A3); SEC ID NO: 21 (TTVYPPSSTAK; HLA A3); SEC ID NO: 1 (SVLGPISGHVLK; HLA A11); SEC ID NO: 116 (AYAQKIFKIL; HLA A23/A24/A30); SEC ID NO: 33 (QYDPVAALF; HLA A24); SEC ID NO: 2 (FTSQYRIQGKL; HLA A24); SEC ID NO: 37 (YVKYVYESF; HLA A26); SEC ID NO: 15 (DIYRIFAEL; HLA A26); SEC ID NO: 3 (FVFPTKDVALR; HLA A68); SEC ID NO: 134 (NVRRSWEEL; HLA B7); SEC ID NO: 132 (KARDHLAVL; HLA B7); SEC ID NO: 41 (QARLTVSGL; HLA B7); SEC ID NO: 8 (TPRVTGGGAM; HLA B7); SEC ID NO: 109 (KARAKKDEL; HLA B7/B8); SEC ID NO: 113 (QIKVRVDMV; HLA B8); SEC ID NO: 112 (ELRRKMMYM; HLA B8); SEC ID NO: 42 (RRRHRQDAL; HLA B8); SEC ID NO: 162 (ARVYEIKCR; HLA B27); SEC ID NO: 66 (CPSQEPMSIYVY; HLA B35); SEC ID NO: 4 (FPTKDVAL; HLA B35); SEC ID NO: 55 (IPSINVHHY; HLA B35); SEC ID NO: 260 (FEQPTETPP; HLA B41); SEC ID NO: 189 (YAYIYTTYL; HLA B41); SEC ID NO: 56 (QEFFWDANDIY; HLA B44); SEC ID NO: 170 (YEQHKITSY; HLA B44); SEC ID NO: 51 (QEPMSIYVY; HLA B44); SEC ID NO: 47 (SEHPTFTSQY; HLA B44); y SEC ID NO: 63 (QAIRETVEL; HLA B57/B58), con la condición de que al menos una de dichas secuencias en el péptido poliepitópico sea distinta de una secuencia seleccionada del grupo que consiste en SEC ID NO: 1 (SVLGPISGHVLK; HLA A11); SEC ID NO: 2 (FTSQYRIQGKL; HLA A24); SEC ID NO: 3 (FVFPTKDVALR; HLA A68); SEC ID NO: 4 (FPTKDVAL; HLA B35); SEC ID NO: 5 (NLVPMVATV; HLA A2); SEC ID NO: 7 (RIFAELEGV; HLA A2); SEC ID NO: 8 (TPRVTGGGAM; HLA B7); SEC ID NO: 13 (YSEHPTFTSQY; HLA A1); SEC ID NO: 15 (DIYRIFAEL; HLA A26); SEC ID NO: 21 (TTVYPPSSTAK; HLA A3); y SEC ID NO: 55 (IPSINVHHY).
Aún más preferiblemente, el péptido poliepitópico está restringido a alelos de MHC Clase I seleccionados del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A23, HLA A24, HLA A26, HLA A30, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B41, HLA B44, HLA B57 y HLA B58. Tal restricción amplia por HLA se logra fácilmente usando epítopos de CTL que tienen secuencias de aminoácidos seleccionadas del grupo que consiste en: SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY; HLA A1); SEC ID NO: 101 (VLEETSVML; HLA A2); SEC ID NO: 254 (IIYTRNHEV; HLA A2); SEC ID NO: 135 (IMREFNSYK; HLA A3); SEC ID NO: 116 (AYAQKIFKIL; HLA A23/A24/A30); SEC ID NO: 33 (QYDPVAALF; HLA A24); SEC ID NO: 37 (YVKYVYESF; HLA A26); SEC ID NO: 134 (NVRRSWEEL; HLA B7); SEC ID NO: 132 (KARDHLAVL; HLA B7); SEC ID NO: 41 (QARLTVSGL; HLA B7); SEC ID NO: 109 (KARAKKDEL; HLA B7/B8); SEC ID NO: 113 (QIKVRVDMV; HLA B8); SEC ID NO: 112 (ELRRKMMYM; HLA B8); SEC ID NO: 42 (RRRHRQDAL; HLA B8); SEC ID NO: 162 (ARVYEIKCR; HLA B27); SEC ID NO: 66 (CPSQEPMSIYVY; HLA B35); SEC ID NO: 260 (FEQPTETPP; HLA B41); SEC ID NO: 189 (YAYIYTTYL; HLA B41); SEC ID NO: 56 (QEFFWDANDIY; HLA B44); SEC ID NO: 170 (YEQHKITSY; HLA B44); SEC ID NO: 51 (QEPMSIYVY; HLA B44); SEC ID NO: 47 (SEHPTFTSQY; HLA B44); y SEC ID NO: 63 (QAIRETVEL; HLA B57/B58).
Al igual que con los epítopos individuales, los poliepítopos de la invención presentan preferiblemente especificidad por el supertipo de HLA, y/o comprenden preferiblemente uno o más determinantes CD4+ suficientes para facilitar una función de linfocito T auxiliar en un sujeto humano infectado con HCMV. Preferiblemente, el péptido poliepitópico comprenderá al menos un epítopo que tiene especificidad por el supertipo de HLA, y más preferiblemente dos o tres o cuatro o cinco de tales epítopos. Preferiblemente, un péptido poliepitópico que tiene especificidad por el supertipo de HLA comprende una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en SEC ID NO: 116; SEC ID NO: 117; SEC ID NO: 109; SEC ID NO: 195; SEC ID NO: 57; SEC ID NO: 69; SEC ID NO: 63; SEC ID NO: 80; y SEC ID NO: 81.
En una realización particularmente preferida de la invención, se proporciona un péptido poliepitópico que tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 309; SEC ID NO: 310; SEC ID NO: 311; SEC ID NO: 312; SEC ID NO: 313; SEC ID NO: 314; SEC ID NO: 315; SEC ID NO: 316; SEC ID NO: 317; y SEC ID NO: 318.
Este aspecto de la invención engloba claramente un derivado o variante funcionalmente equivalente del péptido poliepitópico.
Como se usa aquí, la expresión “derivado o variante funcionalmente equivalente del péptido poliepitópico” se debe tomar para que incluya un derivado o variante funcionalmente equivalente de uno cualquiera o más epítopos de CTL contenidos en dicho péptido poliepitópico, o un derivado o variante como se describe aquí anteriormente y aplicado a un péptido poliepitópico (es decir, una variante de secuencia o lipopéptido de un péptido poliepitópico o un péptido poliepitópico que tiene epítopos de linfocitos B adicionales o epítopos de linfocitos T auxiliares conjugados a ellos).
La presente invención contempla claramente derivados de los presentes epítopos o poliepítopos que comprenden una molécula espaciadora, tal como, por ejemplo, un espaciador que comprende carbono o un resto de aminoácido. Para este fin, se prefieren particularmente dímeros, trímeros, tetrámeros, etc. de serina. Convenientemente, se usa un espaciador que comprende uno o más alfa-alquilaminoácidos que estabilizan la conformación (por ejemplo Aib) para prevenir que la hélice alfa se desestabilice. Se prefieren particularmente espaciadores del tipo X-(Ala-Aib-AlaAib-Ala)n-Y, en el que n es un número entero que es 2 ó 4, y X e Y son grupos protectores, hidrógeno, hidroxilo, o grupos amino. Preferiblemente, tales espaciadores se añaden a una estructura lipídica antes de su adición al péptido, e incluyen un resto de aminoácido protegido terminal para facilitar la conjugación posterior del lipoaminoácido modificado al polipéptido.
3. Composiciones de vacuna
Otro aspecto de la invención proporciona una composición para provocar una respuesta inmunitaria celular en un sujeto humano frente a HCMV, comprendiendo dicha composición una cantidad eficaz de uno o más péptidos inmunológicamente activos de la invención (es decir, epítopos individuales o poliepítopos), o un derivado o variante funcionalmente equivalente de los mismos, en combinación con un vehículo, excipiente, diluyente farmacéuticamente aceptable y/o un adyuvante.
Como se usa aquí, la expresión “cantidad eficaz” significa una cantidad suficiente del presente péptido para producir activación de linfocitos T específicos de HCMV, y preferiblemente para provocar inmunidad mediada por células en el sujeto.
Las composiciones de vacuna de la invención pueden ser vacunas de subunidades que comprenden los péptidos inmunológicamente activos o un lipopéptido derivado de ellos.
Para las vacunas de subunidades, el epítopo o poliepítopo de péptido de la invención, o derivado o variante del mismo, se formula convenientemente en un excipiente o diluyente farmacéuticamente aceptable, tal como, por ejemplo, un disolvente acuoso, disolvente no acuoso, excipiente no tóxico, tal como una sal, conservante, tampón, y similar. Los ejemplos de disolventes no acuosos son propilenglicol, polietilenglicol, aceite vegetal, y ésteres orgánicos inyectables tales como oleato de etilo. Los disolventes acuosos incluyen agua, disoluciones alcohólicas/acuosas, disoluciones salinas, vehículos parenterales tales como cloruro de sodio, dextrosa de Ringer, etc. Los conservantes incluyen agentes antimicrobianos, antioxidantes, agentes quelantes, y gases inertes. El pH y la concentración exacta de los diversos componentes de la composición de vacuna se ajustan según las pericias normales en la técnica.
Opcionalmente, la formulación de vacuna también incluirá un vehículo. Aunque no estrictamente necesario para lograr la producción de anticuerpos, el uso de una molécula vehículo de peso molecular está claramente englobado por la presente invención. Las moléculas vehículo usadas habitualmente son seroalbúmina bovina (BSA), hemocianina de lapa californiana (KLH), ovoalbúmina, seroalbúmina de ratón, seroalbúmina de conejo, y similares. Los vehículos sintéticos también se usan y están fácilmente disponibles. Los medios para conjugar péptidos a proteínas vehículo son también bien conocidos en la técnica, e incluyen glutaraldehído, éster de mmaleimidobenzoil-N-hidroxisuccinimida, carbodiimida, y bis-bencidina diazotada.
En ciertas situaciones, también puede ser deseable formular el péptido, o derivado o variante del mismo, con un adyuvante para potenciar la respuesta inmunitaria frente al epítopo de CTL. Nuevamente, esto no es estrictamente esencial. Tales adyuvantes incluyen todos los compuestos inmunoestimulantes aceptables, tales como, por ejemplo, una citocina, toxina, o una composición sintética. Los adyuvantes ejemplares incluyen escualeno u otro aceite de origen animal; un copolímero de bloques; detergente, tal como Tween-80 u otro detergente no iónico; aceites, tales como, por ejemplo, Drakeol o Marcol; aceite vegetal tal como, por ejemplo, aceite de cacahuete; adyuvante derivado de Corynebacterium, tal como, por ejemplo, C. parvum; adyuvante derivado de Propionibacterium, tal como, por ejemplo, P. acne; adyuvante derivado de Mycobacterium, tal como, por ejemplo, M. bovis; proteína de poxvirus, tal como, por ejemplo, derivado del virus de la vacuna; componente vírico, tal como, por ejemplo, toxina de Cholera; citocina (monocina o interleucina) tal como, por ejemplo, IL-1, IL-2, o IL-12; factor de necrosis tumoral (TNF); interferón (IFN) tal como, por ejemplo, IFN-; BCG; hidróxido de aluminio; glicopéptidos sintéticos, tales como un
dipéptido de muramilo o derivado del mismo, incluyendo N-acetil-muramil-L-treonil-D-isoglutamina (tur-MDP), Nacetil-nor-muramil-L-alanil-D-isoglutamina (CGP 11637, denominado como nor-MDP), o N-acetilmuramil-L-alanil-Disoglutaminil-L-alanina-2-(1’-2’-dipalmitoil-sn-glicero-3-hidroxifosforiloxi)-etilamina (CGP) 1983A, (denominado como MTP-PE); avridina; lípido A o derivado del mismo, tal como, por ejemplo, lípido A monofosforílico; sulfato de dextrano; DEAE-dextrano opcionalmente combinado con fosfato de aluminio; carboxi-polimetileno, tal como, por ejemplo Carbopol’EMA; emulsión de copolímero acrílico tal como, por ejemplo, Neocyl A640 (patente US nº 5.047.238); MPL; RIBI, que contiene tres componentes extraídos de bacterias, dimicolato de trehalosa; extracto de la pared celular o esqueleto, tal como, por ejemplo, una combinación de MPL y TDM y CWS en una emulsión al 2% de escualeno/Tween 80; o una composición de adyuvante saponificada que comprende una saponina o una fracción de la misma, tal como, por ejemplo, QuilA, ISCOMATRIX, o ISCOM en combinación con uno o más de los adyuvantes descritos aquí u otro adyuvante conocido.
Un adyuvante particularmente preferido comprende un ISCOM y/o ISCOMATRIX (CSL Limited, Parkville, Australia) para potenciar la respuesta inmunitaria eficaz obtenida usando el epítopo o poliepítopo de la invención, y preferiblemente para potenciar la inducción de una respuesta de linfocito T citotóxico en un sujeto humano. ISCOM e ISCOMATRIX pueden potenciar las respuestas inmunitarias celular y humoral frente a los péptidos descritos aquí.
ISCOMATRIX son partículas de ISCOM que no tienen un antígeno incorporado o asociado. Un adyuvante de ISCOMATRIX contiene saponinas derivadas de Quillaja saponaria molina complejadas con lípidos, tales como, por ejemplo, colesterol y fosfolípidos. En condiciones definidas, este complejo puede formar partículas que tienen un diámetro promedio de 40 nm. Las propiedades inmunoestimulantes de este adyuvante son idealmente adecuadas a aplicaciones que requieren respuestas inmunitarias mediadas por células. En consecuencia, las partículas de ISCOMATRIX proporcionan propiedades tanto adyuvantes como de suministro de antígenos.
Cuando se incorporan antígenos en una partícula de ISCOMATRIX, o se asocian con una partícula de ISCOMATRIX previamente formada, se produce un ISCOM. Un ISCOM se puede preparar usando Quil A (una preparación semipurificada de saponinas) o fracciones de saponina purificadas. Las preparaciones de saponina preferidas incluyen, por ejemplo, ISCOPREP703 (CSL Limited) que comprende una mezcla de las fracciones de saponina purificadas.
Además de los adyuvantes, puede ser deseable coadministrar modificadores de la respuesta biológica (BRM) con el péptido o variante o derivado, para disminuir la actividad de linfocitos T supresores. Los BRM ejemplares incluyen, pero no se limitan a, cimetidina (CIM; 1200 mg/d) (Smith/Kline, PA, USA); indometacina (IND; 150 mg/d) (Lederle, NJ, USA); o ciclofosfamida de dosis baja (CYP; 75, 150 o 300 mg/m2) (Johnson/Mead, NJ, USA).
Los vehículos preferidos para la administración de la formulación de vacuna incluyen liposomas. Los liposomas son vesículas microscópicas que consisten en una o más bicapas lipídicas que rodean compartimentos acuosos. (Bakker-Woudenberg et al., Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 12 (Supl. 1), S61 (1993); y Kim, Drugs 46, 618 (1993)). Los liposomas son similares en composición a las membranas celulares, y, como resultado, los liposomas se administran generalmente de forma segura y son biodegradables.
Las técnicas para la preparación de liposomas, y la formulación (por ejemplo, encapsulamiento) de diversas moléculas, incluyendo péptidos y oligonucleótidos, con liposomas son bien conocidas por el experto.
Dependiendo del método de preparación, los liposomas pueden ser unilaminares o multilaminares, y pueden variar de tamaño con diámetros que oscilan desde 0,02 m hasta más de 10 m. En los liposomas se encapsula una variedad de agentes. Los agentes hidrófobos se reparten en las bicapas, y los agentes hidrófilos se reparten en el espacio o espacios acuosos internos (Machy et al., LIPOSOMES IN CELL BIOLOGY y PHARMACOLOGY (John Libbey 1987), y Ostro et al., American J. Hosp. Pharm. 46, 1576, 1989).
Los liposomas también se pueden adsorber a virtualmente cualquier tipo de célula y liberar entonces el agente encapsulado. Como alternativa, el liposoma se fusiona con la célula diana, con lo que los contenidos del liposoma se vacían en la célula diana. Como alternativa, un liposoma absorbido puede ser endocitosado por células que son fagocíticas. La endocitosis es seguida de la degradación intralisosómica de lípidos liposómicos, y la liberación de los agentes encapsulados (Scherphof et al., Ann. N.Y. Acad. Sci. 446, 368 (1985)). En el presente contexto, el péptido,
o derivado o variante del mismo, se puede localizar en la superficie del liposoma, para facilitar la presentación del antígeno sin destrucción del liposoma o endocitosis. Independientemente del mecanismo de suministro, sin embargo, el resultado es la disposición intracelular del péptido asociado o su derivado o variante.
Los vectores liposómicos pueden ser aniónicos o catiónicos. Los vectores liposómicos aniónicos incluyen liposomas sensibles al pH que destruyen o se fusionan con la membrana endosómica tras la endocitosis y acidificación del endosoma. Los liposomas catiónicos son preferidos para mediar la transfección de células de mamíferos in vitro, o para el suministro general de ácidos nucleicos, pero se usan para el suministro de otras sustancias terapéuticas, tales como péptidos.
Las preparaciones de liposomas catiónicos se obtienen mediante metodologías convencionales (Feigner et al, Proc. Nat’l Acad. Sci USA 84, 7413 (1987); Schreier, Liposome Res. 2, 145 (1992)). Existen fácilmente preparaciones
comerciales, tales como Lipofectina (Life Technologies, Inc., Gaithersburg, Md. USA). La cantidad de liposomas a administrar se optimizan basándose en una curva de respuesta frente a la dosis. Feigner et al., más arriba.
Otros liposomas adecuados que se usan en los métodos de la invención incluyen vesículas multilaminares (MLV), vesículas oligolaminares (OLV), vesículas unilaminares (UV), vesículas unilaminares pequeñas (SUV), vesículas unilaminares de tamaño medio (MUV), vesículas unilaminares grandes (LUV), vesículas unilaminares gigantes (GUV), vesículas multivesiculares (MVV), vesículas individuales u oligolaminares obtenidas mediante método de evaporación de fase inversa (REV), vesículas multilaminares obtenidas mediante el método de evaporación de fase inversa (MLV-REV), vesículas plurilaminares estables (SPLV), MLV congeladas y descongeladas (FATMLV), vesículas preparadas mediante métodos de extrusión (VET), vesículas preparadas mediante prensa francesa (FPV), vesículas preparadas mediante fusión (FUV), vesículas de deshidratación-rehidratación (DRV), y vesículas ampollosas (BSV). El experto reconocerá que las técnicas para preparar estos liposomas son bien conocidas en la técnica (véase COLLOIDAL DRUG DELIVERY SYSTEMS, vol. 66, J. Kreuter, ed., Marcel Dekker, Inc. 1994).
Otras formas de partícula de suministro, por ejemplo microesferas y similares, también se contemplan para el suministro de los epítopos o poliepítopos de péptido.
En REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCES, capítulos 83-92, páginas 1519-1714 (Mack Publishing Company 1990) (Remington’s) se encuentra, por ejemplo, una guía para preparar formulaciones adecuadas y vehículos farmacéuticamente eficaces.
Como alternativa, se producen vacunas a base de ácido nucleico que comprenden ácido nucleico, tal como, por ejemplo, ADN o ARN, que codifica el epítopo o poliepítopo de péptido inmunológicamente activo y se clonan en un vector adecuado (por ejemplo, virus de la vacuna, viruela del canario, adenovirus, u otro vector vírico eucariota).
Como alternativa, el péptido se administra en forma de una vacuna celular vía la administración de APCs autólogas
o alogeneicas o células dendríticas que se han tratado in vitro para presentar el péptido en su superficie.
4. Métodos para potenciar la inmunidad específica de HCMV
Otro aspecto de la presente invención proporciona un método para potenciar la inmunidad mediada por células específica de HCMV de un sujeto humano, que comprende administrar al menos un péptido epitópico o péptido poliepitópico inmunológicamente activo de la invención, o un derivado o una variante funcionalmente equivalente de dicho péptido, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o variante o derivado, durante un tiempo y en condiciones suficientes para activar un CTL y/o un precursor de CTL de dicho sujeto.
Por “precursor de CTL” se quiere decir un linfocito T sin tratamiento previo (es decir, un linfocito T que expresa uno o más receptores de linfocitos T en su superficie y que es capaz de proliferar y diferenciarse en un linfocito T de memoria o linfocito T efector).
Preferiblemente, el péptido o vacuna se administra a un sujeto que posee una infección latente o activa por HCMV, o está de otro modo inmunosuprimido o inmunocomprometido, tal como, por ejemplo, un receptor de transplante, o está en riesgo de complicaciones que surgen de una infección por HCMV, tal como, por ejemplo, una mujer que tiene capacidad reproductiva o una mujer embarazada. Preferiblemente, el receptor del transplante es un receptor de transplante de médula ósea (BMT).
En el presente contexto, el término “activar” significa la capacidad de un linfocito T para reconocer y lisar una célula que posee HCMV, o que la capacidad de un linfocito T para reconocer un epítopo de linfocito T de un antígeno de HCMV está potenciada, ya sea transitoriamente o de una manera sostenida. El término “activar” se debe tomar también para que incluya una reactivación de una población de linfocitos T tras la activación de una infección latente por HCMV, o tras la reinfección con HCMV, o tras la inmunización con un péptido o composición de la invención de un sujeto infectado previamente.
Los expertos en la técnica están al tanto que la activación óptima de linfocitos T requiere el reconocimiento semejante de antígeno/MHC por el receptor de linfocito T (TcR), y una coestimulación que implica la ligación de una variedad de moléculas de la superficie celular en el linfocito T con aquellas en una célula presentadora de antígeno (APC). Se prefieren las interacciones coestimulantes CD28/B7, CD40L/CD40 y OX40/OX40L, aunque no son esenciales, para la activación de linfocitos T. Pueden funcionar otras rutas de coestimulación.
Los métodos estándar se usan para determinar si se ha producido o no la activación de CTL en el sujeto, tal como, por ejemplo, usando ensayos de citotoxicidad, ELISPOT, o determinando la producción de IFN- en PBMC del sujeto, esencialmente como se describe aquí.
Preferiblemente, el péptido o derivado o variante o composición de vacuna se administra durante un tiempo y en condiciones suficientes para provocar o potenciar la expansión de linfocitos T CD8+.
Además de apoyar a la inmunidad humoral, los linfocitos T auxiliares CD4+ funcionan en CMI como productores de citocinas, que median la hipersensibilidad de tipo retrasada y apoyan CTLs y que como tales son componentes
críticos de las respuestas de CMI frente a patógenos intracelulares. Por ejemplo, las respuestas de CTL restringidas al complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) están soportadas por células Th1. En algunos casos, también se pueden necesitar linfocitos T auxiliares CD4+ para segregar suficiente citocina, tal como, por ejemplo, IL-2, para facilitar de ese modo la expansión de linfocitos T CD8+ o para interaccionar con la APC, haciéndola de ese modo más competente para activar linfocitos T CD8+. En tales circunstancias, se prefiere el uso de un péptido 20-mero que comprende epítopos tanto de CD4+ como de CD8+, o como alternativa, el uso de un epítopo de CD8+ de la invención en combinación con un epítopo de CD4+ permisivo conocido.
Aún más preferiblemente, el péptido o derivado o variante o composición de vacuna se administra durante un tiempo y en condiciones suficientes para que se potencie en el sujeto la inmunidad mediada por células (CMI) específica de HCMV.
Por “CMI específica de HCMV” se quiere decir que los CTLs activados y expandidos clonalmente están restringidos por MHC y son específicos para un epítopo de CTL de la invención. Los CTLs se clasifican basándose en la especificidad por el antígeno y en la restricción por MHC (es decir, CTLs no específicos y CTLs específicos del antígeno, restringidos a MHC). Los CTLs no específicos están compuestos de diversos tipos celulares, incluyendo células NK y citotoxicidad dependiente de anticuerpos, y pueden funcionar muy tempranamente en la respuesta inmunitaria para disminuir la carga de patógeno, mientras que todavía se están estableciendo respuestas específicas del antígeno. Por el contrario, los CTLs restringidos a MHC logran actividad óptima más tarde que los CTL no específicos, generalmente antes de la producción de anticuerpos. Los CTLs específicos del antígeno inhiben
o reducen la diseminación de HCMV, y preferiblemente terminan la infección.
La activación de CTL, la expansión clonal, o CMI se puede inducir sistémicamente, o se puede localizar compartimentalmente. En el caso de efectos localizados compartimentalmente, se prefiere utilizar una composición de vacuna formulada adecuadamente para la administración a ese compartimiento. Por otro lado, no hay tales requisitos restrictivos para inducir activación de CTL, expansión o CMI sistémicamente en el sujeto.
La cantidad eficaz de péptido a administrar, ya sea solo o en una composición de vacuna para provocar la activación de CTL, la expansión clonal o CMI, varía con la naturaleza del epítopo inmunogénico, la vía de administración, el peso, edad, sexo, o salud general del sujeto inmunizado, y la naturaleza de la respuesta de CTL buscada. Todas estas variables se determinan empíricamente por medios reconocidos en la técnica.
El péptido, opcionalmente formulado con cualquier vehículo, adyuvante, BRM, o excipiente farmacéuticamente aceptable adecuado o deseado, se administra convenientemente en forma de una composición inyectable. La inyección puede ser intranasal, intramuscular, subcutánea, intravenosa, intradérmica, intraperitoneal, o por cualquier vía conocida. Para inyección intravenosa, es deseable incluir uno o más reponedores de fluidos y nutrientes.
La dosis óptima a administrar y la vía preferida para la administración se establecen usando modelos de animales, tales como, por ejemplo, inyectando un ratón, rata, conejo, cobaya, perro, caballo, vaca, cabra o cerdo, con una formulación que comprende el péptido, y monitorizando entonces la respuesta inmunitaria de CTL frente al epítopo usando cualquier ensayo convencional como se describe en los Ejemplos.
El uso de ratones transgénicos HLA A2/Kb que poseen un locus del complejo mayor de histocompatibilidad (MHC) Clase I quimérico humano-de ratón, compuesto de los dominios 1 y 2 del alelo de HLA A*0201 humano y el dominio 3 de las moléculas de H-2Kb Clase I de ratón (Vitiello et al., J. Exp. Med. 173, 1007, 1991) es particularmente preferido para ensayar respuestas de CTL a las composiciones de vacuna de la invención que comprenden epítopos o poliepítopos de péptido restringidos a HLA A2 in vivo.
En una realización relacionada, la invención proporciona un método para potenciar la inmunidad mediada por células específica de HCMV de un sujeto humano, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido de un sujeto humano con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido
o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para conferir actividad frente a HCMV a dichos linfocitos T.
En una realización preferida, la invención proporciona un método para potenciar la inmunidad mediada por células específica de HCMV de un sujeto humano, comprendiendo dicho método:
- (i)
- poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido de un sujeto humano con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para conferir actividad frente a HCMV a dichos linfocitos T; y
- (ii)
- introducir los linfocitos T activados autólogamente en el sujeto, o alogeneicamente a otro sujeto humano.
El linfocito T puede ser un CTL o una célula precursora de CTL.
El sujeto humano del que se obtiene el linfocito T puede ser el mismo sujeto o un sujeto diferente al sujeto que se está tratando. El sujeto que se está tratando puede ser cualquier sujeto humano que posea una infección latente o activa por HCMV, o en riesgo de infección por HCMV o reactivación de infección por HCMV (por ejemplo, una mujer que tiene capacidad reproductora o una mujer embarazada o un paciente de transplante, incluyendo un paciente de transplante de médula ósea), o una persona que de otro modo necesita obtener vacunación frente a HCMV o deseosa de obtener vacunación frente a HCMV.
Tal transferencia adoptiva se lleva a cabo preferiblemente y la reactividad de HCMV se evalúa esencialmente como se describe por Einsele et al., Blood 99, 3916-3922, 2002.
Por “actividad frente a HCMV” se quiere decir que al linfocito T se le hace capaz de ser activado como se define aquí anteriormente (es decir, el linfocito T reconocerá y lisará una célula que posea HCMV o capaz de reconocer un epítopo de linfocito T de un antígeno de HCMV, ya sea transitoriamente o de manera sostenida). En consecuencia, se prefiere particularmente que el linfocito T sea un precursor de CTL que mediante el procedimiento de la invención se le hace capaz de reconocer y lisar una célula que posee HCMV o capaz de reconocer un epítopo de linfocito T de un antígeno de HCMV, ya sea transitoriamente o de manera sostenida.
Para tal aplicación ex vivo, el linfocito T está contenido preferiblemente en una muestra biológica obtenida de un sujeto humano, tal como, por ejemplo, una muestra de biopsia que comprende un órgano linfoide primario o central (por ejemplo, médula ósea o timo) o un órgano linfoide secundario o periférico (por ejemplo sangre, PBMC o una fracción de capa leuco-plaquetaria derivada de ella).
Preferiblemente, el linfocito T o muestra que contiene el linfocito T se obtuvo previamente de un sujeto humano tal como, por ejemplo, consultando a un médico que ha enviado la muestra para análisis a un laboratorio de patología.
Preferiblemente, el presente método comprende además obtener una muestra que comprende el linfocito T del sujeto, y más preferiblemente obtener dicha muestra de dicho sujeto.
Otro aspecto de la invención proporciona un método para proporcionar o potenciar inmunidad frente a HCMV en un sujeto humano no infectado, que comprende administrar a dicho sujeto un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para proporcionar memoria inmunológica frente a una infección futura por HCMV.
En una realización relacionada, la invención proporciona un método para potenciar o conferir inmunidad frente a HCMV en un sujeto humano no infectado, que comprende poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido de dicho sujeto con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, durante un tiempo y en condiciones suficientes para conferir reactividad frente a HCMV a dichos linfocitos T.
En consecuencia, este aspecto de la invención proporciona la administración de una vacuna profiláctica al sujeto, en el que el sustituyente activo de dicha vacuna (es decir, el epítopo o poliepítopo de la invención) induce memoria inmunológica vía linfocitos T de memoria en un individuo no infectado. Las realizaciones preferidas de protocolos de vacunación descritos aquí para potenciar la inmunidad mediada por células específica de HCMV de un sujeto humano se aplica, cambiando lo que sea necesario, a la inducción de memoria inmunológica frente a HCMV en un sujeto humano.
5. Aplicaciones de diagnóstico
Un aspecto adicional de la invención proporciona un método para determinar si un sujeto ha sido infectado previamente o no con HCMV, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido del sujeto con una célula presentadora de antígeno (APC) sensibilizada con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, y determinar la activación de un CTL o CTL precursor, en el que dicha activación de un CTL o CTL precursor indica que el sujeto ha sido infectado previamente con HCMV.
El procedimiento del presente método es útil también para monitorizar el grado de inmunidad en un individuo que sufre una infección por HCMV o que posee una infección latente por HCMV. En consecuencia, el presente método es útil tanto para un análisis cuantitativo (es decir, el grado de inmunidad) como un análisis cualitativo (es decir, infectado frente a no infectado) de la inmunidad de linfocitos T específicos de HCMV.
En una realización relacionada, la invención proporciona un método para determinar el nivel de inmunidad mediada por células específica de HCMV en un sujeto humano, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido del sujeto con una célula presentadora de antígeno (APC) sensibilizada con un péptido inmunológicamente activo que comprende un epítopo de CTL de un antígeno de HCMV, o un derivado o variante del mismo, o una composición de vacuna que comprende dicho péptido o derivado o variante, y determinar el nivel de activación de un CTL o CTL precursor, en el que el nivel de activación de un CTL o CTL precursor está correlacionado con el nivel de inmunidad mediada por células específica de HCMV del sujeto.
El sujeto humano del que se obtiene el linfocito T puede ser el mismo sujeto o un sujeto diferente al sujeto que se esté diagnosticando. El sujeto que se está diagnosticando puede ser cualquier sujeto humano que posea una infección latente o activa por HCMV, o en riesgo de una infección por HCMV o reactivación de infección por HCMV (por ejemplo, una mujer que tiene capacidad reproductora, o una mujer embarazada, o un paciente de transplante, incluyendo un paciente de transplante de médula ósea), o una persona que de otro modo necesita obtener una determinación de su estado de HCMV o está deseosa de obtener su estado de HCMV.
Para tal aplicación ex vivo, el linfocito T está contenido preferiblemente en una muestra biológica obtenida de un sujeto humano, tal como, por ejemplo, una muestra de biopsia que comprende un órgano linfoide primario o central (por ejemplo médula ósea o timo) o un órgano linfoide secundario o periférico (por ejemplo sangre, PBMC o una fracción de capa leuco-plaquetaria derivada de ella).
Preferiblemente, el linfocito T o muestra que comprende el linfocito T se obtuvo previamente de un sujeto humano, tal como, por ejemplo, consultando a un médico que ha enviado la muestra a un laboratorio de patología para el análisis.
Preferiblemente, el presente método comprende además obtener una muestra que comprende el linfocito T del sujeto, y más preferiblemente, obtener dicha muestra de dicho sujeto.
Para determinar la activación de un CTL o CTL precursor, o el nivel de inmunidad mediada por células específica de HCMV en un sujeto humano, se pueden usar métodos estándar para evaluar el número de linfocitos T en una muestra que son específicos de HCMV, o para determinar la capacidad de los linfocitos T en una muestra para ser activados de una manera específica de HCMV. Los formatos de ensayo preferidos incluyen un ensayo de citotoxicidad, ensayo para la producción de IFN-, tal como, por ejemplo, el ensayo estándar de liberación de cromo,
o ensayo ELISPOT como se describe aquí.
También se pueden utilizar ensayos de tetrámeros de MHC clase 1, particularmente para la cuantificación de linfocitos T CD8+ específica del epítopo de HCMV (Altman et al., Science 274, 94-96, 1996; Ogg et al., Curr Opin Immunol. 10, 393-396, 1998). Para producir tetrámeros, el término carboxilo de una molécula de MHC, tal como, por ejemplo, la cadena pesada de HLA A2, se asocia con un epítopo o poliepítopo de péptido específico, y se trata para formar un complejo tetrámero que tiene unido a él una molécula informadora adecuada, preferiblemente un fluorocromo tal como, por ejemplo, isotiocianato de fluoresceína (FITC), ficoeritrina, ficocianina o aloficocianina. La formación del tetrámero se logra, por ejemplo, produciendo la proteína de fusión de MHC-péptido como una molécula biotinilada, y mezclando entonces el MHC-péptido biotinilado con avidina desglicosilada que se ha marcado con un fluoróforo, en una relación molar de 4:1. Los tetrámeros producidos se unen a un conjunto distinto de receptores de linfocitos T CD8+ (TcRs) en un subconjunto de linfocitos T CD8+ derivados del sujeto (por ejemplo en sangre completa o en una muestra de PBMC), al que el péptido está restringido por HLA. No hay ningún requisito para la activación o expansión in vitro de linfocitos T. Tras la unión, y el lavado de los linfocitos T para eliminar el tetrámero no unido o el tetrámero unido no específicamente, el número de células CD8+ que se unen específicamente al tetrámero de HLA-péptido se cuantifica fácilmente mediante métodos de citometría de flujo estándar, tales como, por ejemplo, usando un citómetro de flujo FACSCalibur (Becton Dickinson). Los tetrámeros también se pueden fijar a partículas paramagnéticas o a perlas magnéticas, para facilitar la eliminación del informador unido no específicamente y la clasificación celular. Tales partículas están fácilmente disponibles de fuentes comerciales (por ejemplo Beckman Coulter, Inc., San Diego, CA, USA). La tinción del tetrámero no extermina las células marcadas; por lo tanto, la integridad celular se mantiene para el análisis posterior. Los tetrámeros de MHC permiten los análisis cuantitativos exactos de respuestas inmunitarias celulares específicas, incluso para sucesos extremadamente raros que se producen a menos de 1% de linfocitos T CD8+ (Bodinier et al., Nature Med. 6, 707-710, 2000; Ogg et al., Curr Opin Immunol. 10, 393-396, 1998).
El número total de células CD8+ en una muestra también se puede determinar fácilmente, tal como, por ejemplo, incubando la muestra con un anticuerpo monoclonal contra CD8 conjugado a una molécula informadora diferente a aquella usada para detectar el tetrámero. Tales anticuerpos están fácilmente disponibles (por ejemplo Becton Dickinson). Las intensidades relativas de las señales procedentes de las dos moléculas informadoras usadas permiten la cuantificación de tanto el número total de células CD8+ como los linfocitos T unidos al tetrámero, y una determinación de la proporción de linfocitos T totales unidos al tetrámero.
También se pueden usar ensayos de citocinas para determinar la activación de un CRL o CTL precursor, o el nivel de inmunidad mediada por células específica de HCMV en un sujeto humano. En tales ensayos, se detecta una citocina tal como, por ejemplo, IL-2, o se determina la producción de una citocina como un indicador del nivel de linfocitos T reactivos con el antígeno de HCMV. Como se explica aquí anteriormente, los linfocitos T auxiliares CD4+ funcionan en CMI como productores de citocinas, tales como, por ejemplo, IL-2, para facilitar la expansión de linfocitos T CD8+ o para interaccionar con la APC, haciéndola de ese modo más competente para activar linfocitos T CD8+. En consecuencia, la producción de citocinas es una medida indirecta de la activación de linfocitos T.
Preferiblemente, el formato de ensayo de citocinas usado para determinar el nivel de una citocina o la producción de una citocina es esencialmente como se describe por Petrovsky y Harrison, J. Immunol. Methods 186, 37-46, 1995.
Preferiblemente, el ensayo de citocina se realiza en sangre completa o PBMC o capa leuco-plaquetaria.
6. Producción de linfocitos T específicos de HCMV para aplicaciones terapéuticas/de diagnóstico
Otro aspecto de la presente invención se refiere a un método para producir un CTL específico de HCMV, que comprende poner en contacto un linfocito T con un péptido aislado de la presente invención o una APC sensibilizada con un péptido aislado de la invención, cultivar el linfocito T y seleccionar linfocitos T que proliferan.
Por “CTL específico de HCMV” se quiere decir un linfocito T o linfocito T precursor que es capaz de reconocer un epítopo de CTL de HCMV, o un poliepítopo que comprende dicho epítopo, o lisar una célula humana infectada con HCMV.
El linfocito T puede ser una célula humana o no humana, tal como, por ejemplo, un linfocito T efector o linfocito T de memoria o precursor de CTL. El linfocito T incluye (a) una célula que posee moléculas de MHC clase I capaz de reconocer el epítopo o poliepítopo de péptido, y (b) células capaces de ser convertidas en CTLs que tienen el potencial de células (a).
Los CTLs se producen in vivo o ex vivo. Para la producción in vivo de CTL, el péptido o composición que lo comprende se administra a un animal durante un tiempo y en condiciones suficientes para que se produzcan CTLs específicos de HCMV. Para la producción ex vivo, las células que se han retirado del cuerpo animal se ponen en contacto con el péptido o una APC que presenta el péptido o una LCL sensibilizada autóloga.
Preferiblemente, los CTLs específicos de HCMV monoclonales o policlonales se generan estimulante PBMCs de donantes seropositivos sanos con LCLs autólogas que se han sensibilizado previamente usando un péptido epitópico o péptido poliepitópico de la invención aislado, o una composición de vacuna de la invención que comprende dicho péptido epitópico o péptido poliepitópico. En una realización particularmente preferida, un virus recombinante que expresa un antígeno de HCMV o un péptido epitópico o un péptido poliepitópico, tal como, por ejemplo, un virus de la vacuna recombinante, se usa para sensibilizar la LCL. Los medios para sensibilizar LCLs serán bien conocidos por los expertos en la técnica.
En el presente contexto, “sensibilizar” incluye, por ejemplo, la transfección o transformación de una LCL con ácido nucleico que codifica dicho péptido (por ejemplo en forma de un fragmento subgenómico del virus o ácido nucleico sintético clonado en un vector de expresión adecuado, vector de vacuna, etc.), y la puesta en contacto de una LCL con un péptido aislado, o antígeno o proteína del virus.
En una realización particularmente preferida, los clones de linfocitos T procedentes de donantes individuales se generan mediante un procedimiento esencialmente como se describe en el Ejemplo 9.
Las células de animales no humanos son adecuadas para uso en aplicaciones de diagnóstico, tales como, por ejemplo, para la unión a epítopo de péptido o poliepítopos de péptido específicos para determinar la especificidad por HLA o la eficiencia de unión de dicho péptido. Como será manifiesto para los expertos en la técnica, tales clones de CTL son así útiles para ensayar epítopos de CTL recientemente sintetizados, incluyendo cualesquiera secuencias variantes de los epítopos descritos aquí, tales como, por ejemplo, mediante ensayo de tetrámeros de MHC clase 1, ensayo de citotoxicidad, ensayo para la producción de IFN- (por ejemplo ensayo de liberación de cromo), ensayo de citocinas, ELISPOT, etc.
En el caso de células humanas, los CTLs producidos de esta manera se usan entonces para la transferencia adoptiva a seres humanos (por ejemplo introduciéndolos en el mismo sujeto o en un sujeto diferente) como parte de un régimen terapéutico, o para aplicaciones de diagnóstico.
Opcionalmente, el linfocito T se pone en contacto con péptido en presencia de una citocina, tal como, por ejemplo, IL-2.
La presente invención se extiende claramente a los clones de linfocitos T producidos usando un nuevo péptido inmunológicamente activo descrito aquí, y al uso de tales clones de linfocitos T en cualesquiera procedimientos de diagnóstico, profilácticos o terapéuticos para monitorizar la infección por HCMV, la latencia de la infección por HCMV, la probabilidad de infección por HCMV en un sujeto humano, tal como, por ejemplo, antes, durante o después del transplante de órganos (por ejemplo BMT), o durante el embarazo.
A fin de que la naturaleza de la presente invención se pueda comprender más claramente, ahora se describirán formas preferidas con referencia a los siguientes Ejemplos no limitantes.
Ejemplo 1
Materiales y métodos
1. Establecimiento y mantenimiento de estirpes celulares
Se establecieron estirpes celulares linfoblastoides transformadas con el virus de Epstein Barr (LCLs) a partir de donantes seropositivos a HCMV mediante transformación vírica exógena de linfocitos B periféricos usando los aislados de virus B95.8 (Klein et al., Intervirology 3, 232-244, 1974) y QIMR-WIL (Pope et al., Int J Cancer 4, 255260, 1969). Además, para ensayos de estabilización de MHC, se usó la estirpe celular híbrida B x T negativa al transportador de péptido (TAP) 174 x CEM.T2 (denominada T2) (Salter et al, EMBO J. 5, 943, 1986). Todas las estirpes celulares se mantuvieron normalmente en RPMI 1640 suplementado con L-glutamina 2 mM, 100 UI/ml de penicilina y 100 g/ml de estreptomicina más 10% de suero fetal de ternera (FCS) (medio de crecimiento).
Para generar blastos de fitohemaglutinina (PHA), se estimularon células mononucleares de sangre periférica (PBMC) con PHA (Commonwealth Serum Laboratories, Melbourne, Australia) y, después de 3 días de cultivo, se añadió medio de cultivo que contiene sobrenadante de MLA 144 e IL-2 humana recombinante muy purificada (rIL-2) (Khanna et al, J. Exp Med 176, 169, 1992). Los blastos de PHA se propagaron mediante sustitución dos veces a la semana de rIL-2 y del sobrenadante de MLA (sin PHA añadido adicional) durante un tiempo de hasta 6 semanas.
Células T2 transfectadas con antígenos de HLA clase I individuales se usaron para ensayos de estabilización de MHC (véase más abajo). Las células T2 que expresan HLA B35, HLA B7 y HLA B27 se han descrito en otra parte (Takiguchi et al, Int. Immunol. 6, 1345, 1994; Smith y Lutz, J. Immunol. 156, 3755, 1996; y Zweerink et al, J. Immunol. 150, 1763, 1993). Las células T2 que expresan HLA A3, HLA A24 y HLA B8 se establecieron transfectando vectores de expresión que codifican alelos individuales de clase I como se describe previamente (Khanna et al, Eur. J. Immunol. 29, 1587, 1999). De forma breve, los ADNc para estos alelos de HLA clase I se amplificaron usando cebadores específicos de las secuencias, y se clonaron en un vector de expresión EGFP-N1 (Clontech). Las células T2 se transfectaron con estos vectores de expresión recombinantes y se cultivaron en medio de crecimiento suplementado con G418 (800 g/ml) durante tres semanas. Las células positivas a proteína fluorescente verde (GFP) se clasificaron usando el punto de vista de FACS, y las células purificadas se mantuvieron en medio de crecimiento suplementado con G418 (800 g/ml). La expresión de HLA clase I en estos transfectantes se confirmó usando anticuerpos específicos de alelos de HLA.
- 2.
- Predicciones de epítopos y síntesis peptídica
Se usaron algoritmos predictivos para predecir epítopos de CTL putativos restringidos a HLA clase I a partir de la secuencia de aminoácidos de antígenos de HCMV pp28, pp50, pp65, pp150, pp71, gH, gB, IE-1, IE-2, US2, US3, US6, US11 y UL18. Los algoritmos usados fueron: (i) el algoritmo de predicción de epítopos en la base de datos SYFPEITHI de ligandos de MHC y motivos peptídicos que se unen a moléculas de MHC Clase I de la Universidad de Tuebingen, Alemania (Rammensee et al, Immunogenetics 50, 213, 1999); y (ii) el algoritmo de predicciones de unión a péptidos de HLA de la Bioinformatics and Molecular Analysis Section (BIMAS) del National Institutes of Health del gobierno de los Estados Unidos de América (Parker et al, J. Immunol 152, 163, 1994). Estos algoritmos se usaron para identificar epítopos potenciales para los alelos de HLA A1, A2, A3, A24, A26, B7, B8, B27, B35, y B44. A cada péptido se le asignó una puntuación en base a la fortaleza de la interacción entre la molécula de MHC y el péptido. Los péptidos que puntuaron más de 24 en las predicciones del programa SYFPEITHI, y los péptidos que puntuaron más de 100 a partir de las predicciones del programa BIMAS, se sintetizaron usando el método de fase sólida de Merrifield (Valerio et al, Anal. Biochem 197, 168, 1991), o se adquirieron de Chiron Mimotopes (Melbourne, Australia). Además, también se sintetizaron conjuntos de péptidos solapantes (péptidos 20-meros derivados de los antígenos de longitud completa pp65, gB, gH, pp150, IE-1 e IE-2, en los que cada miembro de cada conjunto solapa con otro miembro del mismo conjunto en 10 restos de aminoácidos). Todos los péptidos se disolvieron en 10% (v/v) de dimetilsulfóxido (DMSO) y se diluyeron en medio RPMI 1640 libre de suero, para uso en ensayos que evaluaron su capacidad para unirse a moléculas de MHC e inducir tanto la producción de IFN- ELISPOT como la actividad de CTL en PBMC y clones de linfocitos T de donantes.
- 3.
- Ensayo de estabilización de MHC
La capacidad de los péptidos sintéticos para estabilizar moléculas de MHC en la superficie de la estirpe celular T2 se midió mediante inmunofluorescencia indirecta (Burrows et al, J. Virol 70, 4829, 1966). Se incubaron células T2 (2 x 105) en medio AIM-V libre de suero (GibcoBRL, Invitrogen™, Melbourne, Australia) en presencia de 5 M de péptido durante 1 h a 37ºC y 5% de CO2 en una atmósfera humidificada. Éstas se incubaron entonces durante otras 14-16 h a 26ºC, después de cuyo tiempo las células se devolvieron a 37ºC durante 2 h antes de la tinción inmunofluorescente. Las células se lavaron libres de péptido no unido con medio de crecimiento antes de la adición de anticuerpo primario. Se añadió anticuerpo monoclonal específico anti-alelo de HLA a las células T2, y se incubó a 4ºC durante 30 min. Los anticuerpos específicos de HLA usados en este estudio fueron MA2.1 (específico de HLA A2, nº de acceso ATCC HB54), SFR8-B6 (específico de HLA Bw6, nº de acceso ATCC HB152), TU109 (específico de HLA Bw4; Muller et al., Hum Immunol 14, 333-349, 1989). Después de lavaron con medio de crecimiento, estas células se incubaron con anticuerpo específico anti-Ig de ratón marcado con FITC o con PE (Silenus, AMRAD, Australia) a 4ºC durante 30 min. Finalmente, las células se lavaron y se resuspendieron en 500 l de PBS fría suplementada con 1% de FCS. Una muestra de células T2 se incubó con medio AIM-V solo a 26ºC durante 14-16 h, y sirvió como control negativo. El segundo control negativo comprendió una muestra de células T2 que se había cultivado en medio de crecimiento sin péptido a 37ºC. Las intensidades de fluorescencia se midieron entonces con un FACScan o FACScalibur (BD Biosciences, San José, CA). La Eficiencia de Estabilización de MHC (MSE) para
cada péptido se calculó como el porcentaje de potenciación de la fluorescencia promedio con respecto a la fluorescencia determinada para la muestra de control negativo.
- 4.
- Ensayo ELISPOT
Se usó el ensayo ELISPOT para evaluar si la estimulación de PBMC procedentes de un gran panel de donantes seropositivos con péptidos de HCMV podría inducir la expresión de IFN- en linfocitos T. De forma breve, una placa de nitrocelulosa de 96 pocillos (Multiscreen, Millipore) se revistió toda la noche a 4ºC con anticuerpo monoclonal de ratón anti-IFN- IgG1 (10 g/ml; Mabtech Nacka, Suecia). La placa se lavó entonces seis veces en disolución salina tamponada con fosfato (PBS) y se bloqueó durante 1 hora a 37ºC con PBS suplementada con 5% de FCS. La disolución de bloqueo se eliminó, y se añadió PBMC de donantes sanos seropositivos a HCMV a una concentración de 2,5 x 105 células por pocillo en medio de crecimiento. Estas células se incubaron durante 18 h a 37ºC en una atmósfera de CO2 al 5% en presencia de péptidos sintéticos de antígenos de HCMV (10 g/ml). Tras la incubación, la placa se lavó tres veces con PBS suplementada con 0,05% de Tween, seguido de tres lavados con PBS sola. Se añadió anticuerpo de detección biotinilado anti-IFN- (Mabtech Nacka, Suecia) a cada pocillo a una concentración final de 1 g/ml en PBS. Las placas se incubaron a temperatura ambiente en la oscuridad durante 4 h y después se lavaron, como se describió anteriormente. Se añadió a cada pocillo estreptavidina-fosfatasa alcalina (Sigma) a una concentración final de 1 g/ml en PBS, y se incubó a temperatura ambiente en la oscuridad durante 2 h. Después del lavado final con PBS, se añadió a cada pocillo el sustrato, fosfato de 5-bromo-4-cloro-3-indolilo y nitroazul de tetrazolio, y las placas se incubaron durante 30 min. a RT. Las células que produjeron IFN- en respuesta a la presencia de péptido se detectaron como manchas violáceas en la membrana de nitrocelulosa de cada pocillo. Las manchas se contaron automáticamente usando una cámara de circuito cerrado (CCD) y el software de análisis de imágenes ImagePro o un lector de ELISPOT automatizado (AID, Alemania). La frecuencia del precursor de linfocito T para cada péptido se basó en el número total de PBMC en el pocillo y el número de manchas específicas del péptido por pocillo, en un promedio de 3 pocillos. El número de manchas específicas de péptido también se calculó restando los valores del control negativo, que consistieron en PBMC sin péptido (un promedio de 3 pocillos), de los pocillos de ensayo.
- 5.
- Enriquecimiento de linfocitos T CD4+/CD8+ para el ensayo ELISPOT
Para determinar si un péptido 20-mero particular contenía un epítopo restringido a CD4+ o CD8+, o ambos, se llevaron a cabo ensayos ELISPOT de agotamiento de células CD4+/CD8+ en PBMC de portadores sanos del virus. Para cualquier experimento, se usan tres poblaciones de células: a) PBMC agotadas de CD8+, b) PBMC agotadas de CD4+, y c) PBMC no agotadas. Estas poblaciones de células se evaluaron concurrentemente con los mismos péptidos en un ensayo ELISPOT convencional como se describe aquí anteriormente. Para realizar el agotamiento esencialmente según las instrucciones del fabricante, se usaron DYNABEADS M-450 (Dynal, Oslo, Noruega) que se unen específicamente a células CD4+ o CD8+. Las perlas se lavaron dos veces en PBS fría suplementada con 2% de FCS usando aislamiento magnético. El número requerido de células se resuspendió en PBS fría suplementada con 2% de FCS, se añadió a las perlas, y después se incubó a 4ºC, en la oscuridad, durante 30 min. (perlas con CD8+) o 60 min. (perlas con CD4+). Las poblaciones se agotaron de células CD4+ o CD8+ usando separación magnética. Después del agotamiento, las células no fijadas se eliminaron y se lavaron una vez en medio de crecimiento, se contaron y se usaron en ensayo ELISPOT convencional. Las células agotadas se usaron a 1,7 x 105 células por pocillo, y la población no agotada se usó al número estándar de 2,5 x 105 células por pocillo. Después de la etapa de agotamiento, cada población celular respectiva se evaluó para determinar la pureza de linfocitos T CD4+ y CD8+ mediante citometría de flujo de tres colores. Las muestras de poblaciones celulares agotadas se tiñeron con anticuerpo anti-CD3 conjugado directamente a isotiocianato de fluoresceína (FITC), anticuerpo anti-CD4 conjugado con fluorocromo de ficoeritrina (PE), y anticuerpo anti-CD8 conjugado con fluorocromo Tricolor (descrito más abajo). El porcentaje de células CD3+/CD4+ presentes en la población agotada de CD8+, y el porcentaje de células CD3+/CD8+ presentes en las poblaciones agotadas de CD4+, se evaluaron en un citómetro FACSCalibur (Becton Dickinson). La pureza de cada población fue mayor que 90%, y los resultados de los ensayos ELISPOT se expresan como el porcentaje de células CD4+ o CD8+ en las poblaciones agotadas que respondieron frente a cada péptido al producir IFN-.
- 6.
- Tinción de citocina intracelular
Se incubaron PBMCs a 37ºC en RPMI + 10% de FCS con y sin 10 g/ml de péptidos durante 6 horas. Se añadió GolgiPlug™ (Pharmingen, San Diego, CA, USA) a las muestras según las instrucciones del fabricante durante la segunda hora de incubación, y las células activadas con 25 ng/ml de 12-miristato 13-acetato de forbol (PMA; Sigma-Aldrich Co, St. Louis MO) y 1 g/ml de ionomicina (Sigma) actuaron como control positivo. Tras la incubación, 1 x 106 células/muestra se lavaron y se resuspendieron en tampón de tinción que consiste en PBS con GolgiPlug™, 3% de FCS y azida sódica. Las células se tiñeron entonces con FITC anti-CD3 conjugado con FITC (UCHT1, Immunotech, Marsella, Francia), y anti-CD4 conjugado con Tricolor (TRI) (S3.5, Caltag, Burlingame, CA) o anti-CD8 (3B5, Caltag) durante 30 minutos, 4ºC en la oscuridad. Las células se fijaron durante 20 min. a 4ºC con Cytofix/Cytoperm™ (BD Biosciences) y se resuspendieron en tampón de permeabilización Perm/Wash™ (BD Biosciences) según el protocolo del fabricante. Las células fijadas se tiñeron con anti-IFN- humano conjugado con ficoeritrina (PE) (B27, Pharmingen) durante 30 min. a 4ºC en la oscuridad. Como control negativo, las células se
tiñeron con anticuerpos de control de isotipo parejo apropiados. Las células se lavaron dos veces en tampón de permeabilización y se resuspendieron en tampón de tinción antes del análisis mediante citometría de flujo de tres colores en un citómetro FACSCalibur (BD Biosciences). Todo el análisis de datos se llevó a cabo usando el software FlowJo (Tree Star, Inc. San Carlos, CA).
7. Generación de CTLs específicos de HCMV policlonales y clonales
Para generar CTLs policlonales, se cocultivaron durante siete días 2 x 106 PBMC procedentes de donantes sanos seropositivos a HCMV con 1 x 106 PBMC autólogas sensibilizadas con péptidos sintéticos (20 g/ml). En el día 7, estos linfocitos se volvieron a estimular con LCLs autólogas sensibilizadas con péptidos. Después de 10 días de cultivo en medio de crecimiento suplementado con rIL-2 (20 U/ml) y 30% de TCGF, las células se usaron como efectores policlonales en un ensayo estándar de liberación de 51Cr frente a blastos de PHA o LCLs autólogos sensibilizados con péptidos (Burrows et al., Eur. J. Immunol 22, 191, 1992).
Para generar clones de CTL específicos de HCMV, se cultivaron PBMC (106/ml) con PBMC autólogas sensibilizadas con péptidos (relación de respondedor a estimulador de 2:1) en pocillos de cultivo de 2 ml (Linbro) durante 3 días en medio de crecimiento. Los clones de CTL, generados sembrando en agarosa al 0,35%, se establecieron y mantuvieron en medio de crecimiento que contiene rIL2 (Burrows et al, Eur. J. Immunol. 22, 191, 1992), y se volvieron a estimular una vez a la semana con LCLs autólogas irradiadas con radiación sensibilizadas con péptidos. Estos clones de CTL se identificaron en un panel de células diana ya sea sensibilizadas con péptidos sintéticos o infectadas con virus de la vacuna recombinante que codifica antígenos de HCMV individuales (véase más abajo).
8. Recombinantes del virus de la vacuna
Constructos del virus de la vacuna recombinante que codifican antígenos de HCMV y un constructo del virus de la vacuna de control obtenido mediante inserción del vector pSC11 solo y negativo para timidina cinasa (Vacc.TK-) están públicamente disponibles (Riddell et al, Rev. Infect. Dis. 13 Supl. 11, S966-S973, 1991; Browne et al, Nature 347, 770, 1990; y Britt et al, J. Virol 64, 1079, 1990). Se infectaron células diana con virus de la vacuna recombinante a una multiplicidad de infección (MOI) de 10:1 durante 1 h a 37ºC, como se describe por Khanna et al,
J. Exp. Med. 176, 169, 1992 y Khanna et al, Immunol 74, 504, 1991. Después de la infección durante toda la noche, las células se lavaron con medio de crecimiento y se procesaron para los ensayos de CTL (Khanna et al, J. Immunol. Meth. 164, 41, 1993).
9. Ensayos de citotoxicidad
Células diana se infectaron con virus de la vacuna recombinantes o se presensibilizaron con epítopos de péptido sintético y se incubaron entonces con 51Cr durante 90 min. Tras la incubación, estas células se lavaron en medio de crecimiento y se usaron como dianas en un ensayo estándar de liberación de 51Cr de 4-6 h (Burrows et al, Eur. J. Immunol 22, 191, 1992).
EJEMPLO 2
Predicción del epítopo de HLA clase I y péptidos de unión a HLA procedentes de antígenos de HCMV
Los epítopos de CTL restringidos a HLA clase I se identificaron usando dos algoritmos a base de ordenador como se describe en el Ejemplo 1. Estos algoritmos predicen que secuencias de aminoácidos de 8, 9 ó 10-meros probablemente se unan con éxito a moléculas de MHC clase I (HLA A1, A2, A3, A24, A26, B7, B8, B27, B35 y B44) en base a la disociación de la interacción a mitad de tiempo. Los péptidos que se puntúan más de 24 en el programa SYFPEITHI y/o los péptidos que puntúan más de 100 en el programa BIMAS se dan en la Tabla 1.
Los péptidos enumerados en la Tabla 1 se usaron para identificar donantes seropositivos sanos. Todos los péptidos que se predijo que se unirían a alelos de HLA clase I también se analizaron para determinar su capacidad para unirse a moléculas MHC de HLA clase I y estabilizar su expresión en la superficie de células T2 transfectadas con alelos de HLA individuales. Los datos representativos para la estabilización de HLA A2 se muestran en las Figuras 1a a 1i. En la Tabla 1 también se proporciona un resumen de los datos de estabilización de MHC. Los péptidos que inducen una potenciación significativa de la intensidad de fluorescencia relativa en comparación con los controles negativos (es decir, mayor que la media + 3 S.E.M.) para cada alelo de HLA clase I se consideraron positivos. Los péptidos predictivos para HLA B44 y A26 no se evaluaron en estos ensayos, ya que los transfectantes de T2 para estos alelos no estuvieron disponibles para este estudio.
Los datos indican que un gran número de péptidos predichos por el enfoque bioinformático también mostraron fuerte unión a HLA Clase I.
Ejemplo 3
Ensayo ELISPOT en péptidos predictivos de HLA A2
Para determinar si se podrían detectar respuestas de CTL de memoria frente a los epítopos potenciales de HCMV predictivos en portadores seropositivos sanos del virus, se usó el ensayo ELISPOT, que permite la identificación rápida de epítopos de CTL sin el cultivo in vitro prolongado. PBMC aisladas de una cohorte de portadores sanos del virus positivos a HLA A2 (Tabla 2) se estimularon con los péptidos que dieron un resultado positivo en los ensayos de unión a HLA (Ejemplo 2), y se detectaron aquellas células que produjeron IFN-.
Los datos representativos en los ensayos ELISPOT de péptidos que se unen a HLA A2 se muestran en las Figuras 2a a 2c para péptidos derivados de pp65, IE-1, pp150, pp28, US2, US3, pp50, gB, gH, y IE-2 de HCMV.
En conjunto, las respuestas de linfocitos T para epítopos restringidos a HLA A2 en ensayos ELISPOT indicaron una jerarquía interesante entre los diferentes antígenos de HCMV. Como se da a conocer por Gyulai et al, J. Infect. Dis. 181, 1537-1546, 2000, pp65 fue claramente el antígeno más inmunodominante reconocido por todos los portadores del virus sanos (Figura 2a). La mayoría de los donantes reconoció dos o más epítopos en el antígeno pp65. Fue evidente un intervalo de frecuencias de CTL precursores para los epítopos de pp65 entre los diferentes donantes (Figura 2a), oscilando de 29 SFC/106 PBMC a 3752 SFC/106 PBMC.
Un epítopo de péptido conocido procedente de pp65 que tiene la secuencia NLVPMVATV (SEC ID NO: 5) fue el único epítopo reconocido por cada donante evaluado en este estudio. Otro epítopo conocido normalmente reconocido procedente de pp65 tiene la secuencia RIFAELEGV (SEC ID NO: 7), que fue reconocido por 5 de los 8 donantes evaluados. Para los epítopos de pp65, la frecuencia promedio del precursor fue la más elevada para NLVPMVATV (SEC ID NO: 5), seguido de LMNGQQIFL (SEC ID NO: 53), RIFAELEGV (SEC ID NO: 7) y MLNIPSINV (set ID NO: 6) respectivamente. De estos, el epítopo que tiene la secuencia expuesta en SEC ID NO: 53 no se ha descrito previamente. También se detectaron por dos donantes diferentes respuestas subdominantes ocasionales a otros epítopos, tales como, por ejemplo, RLLQTGIHV (SEC ID NO: 10) y ILARNLVPM (SEC ID NO: 54) en pp65.
IE-1 se consideró que es el segundo antígeno más inmunodominante tras pp65, seguido de pp150, gB, gH, IE-2, US2, pp28, US3 y pp50. Seis de los ocho donantes positivos a HLA A2 mostraron reactividad de CTL a al menos un epítopo de CTL en IE-1 (Figura 2b). De forma interesante, una de las respuestas de CTL más dominantes frente a cualquier epítopo se identificó en IE-1 (VLEETSVML; SEC ID NO: 101). Este epítopo mostró una frecuencia de precursor de 3752 SFC/106 PBMC en el donante SB. Este epítopo fue reconocido más eficientemente por tres donantes que un epítopo similar previamente descrito que tiene la secuencia YILEETSVM (SEC ID NO: 18; Retière et al, J. Virol 74, 3948-3952, 2000). Otros nuevos epítopos identificados a partir de IE-1 tuvieron las secuencias VLAELVKQI (SEC ID NO: 97), SLLSEFCRV (SEC ID NO: 96) y CLQNALDIL (SEC ID NO: 102), que mostraron una frecuencia comparativamente menor. Las frecuencias de CTL a epítopos en gB, gH, pp28, pp50, US2, US3, US11, IE-2 y pp150 fueron generalmente muy bajas, aunque los epítopos de CTL en gB y gH fueron más frecuentemente reconocidos por portadores del virus sanos cuando se compararon con pp150, pp28, US2, US3, US11 y pp50. Además, los antígenos IE-2, US2, US3 y US11 se identificaron por primera vez como dianas para las respuestas de linfocitos T. Aunque sólo se identificaron cuatro portadores del virus sanos positivos a HLA A2 como respondedores potenciales a los epítopos en estos cuatro antígenos, la identificación adicional para epítopos adicionales restringidos a través de otros alelos de HLA clase I identificó un número de otros epítopos dentro de estos antígenos (véase más abajo).
Una comparación de la reactividad de linfocitos T global frente a todos los antígenos evaluados entre la cohorte de portadores del virus sanos indicó que las respuestas de CTL no estaban generalmente constreñidas a un único antígeno de HCMV. La mayoría de los donantes positivos a HLA A2 evaluados en el estudio mostraron un amplio intervalo de respuestas de CTL a múltiples antígenos. Los donantes SB y CP mostraron el intervalo más amplio de reactividad de CTL, y reconocieron siete de los diez antígenos evaluados en nuestro estudio. Además, estos dos donantes reconocieron un mayor número de epítopos (11/30) que cualquier otro donante evaluado en nuestro estudio (Figuras 2a a 2c). De media, se dirigieron respuestas de CTL de nuestro panel de portadores del virus sanos de HLA A2 contra 6-7 epítopos diferentes. Estos resultados sugieren fuertemente que se requieren respuestas de CTL ampliamente dirigidas hacia múltiples epítopos para controlar eficientemente la replicación del HCMV. La amplia reactividad de linfocitos T permite a un individuo aclarar el HCMV más eficientemente que una respuesta de CTL muy enfocada contra un único antígeno, o un número limitado de epítopos. Estas observaciones destacan la importancia de diseñar una vacuna contra HCMV que combine, en un único régimen, todos aquellos antígenos que puedan proporcionar protección.
Ejemplo 4
Respuesta de linfocitos T a otros péptidos de HCMV predictivos de HLA clase I
Se evaluaron epítopos que se restringieron para HLA A1, A3, A24, A26, B7, B8, B27, B35 y B44 en ensayos ELISPOT, para determinar si se pudieron detectar respuestas de linfocitos T de memoria en portadores de virus de HLA parecidos sanos. Se estimularon PBMC de una cohorte de portadores del virus sanos (Tabla 2) con péptidos individuales, y se detectaron las células que produjeron IFN-. Se identificaron epítopos de CTL que se restringieron mediante HLA A1, A3, A24, A26, B7, B8 o B27.
En las Figuras 3a a 3c se muestran datos representativos que muestran respuestas de ELISPOT para cada uno de estos alelos. Como en el caso de respuestas de CTL restringidas a HLA A2, tanto pp65 como IE-1 fueron claramente los antígenos más inmunodominantes (Figura 3a). Sorprendentemente, las respuestas de CTL frente a epítopos de IE-1 constituyeron en algunos individuos un 5-10% de su población de linfocitos T CD8+ total (datos nos mostrados). Otros antígenos tales como pp150, gH, pp28, pp50, IE-2 y UL18 también se identificaron como dianas potenciales para la respuesta de CTL restringida a clase I (Por ejemplos 3b, 3c). Aunque pp28 y 9950 se han identificado como dianas potenciales para la respuesta de CTL, este es el primer informe que cartografía múltiples epítopos de CTL restringidos mediante HLA A1, A2 y B27.
Fue de particular interés un epítopo de CTL restringido a HLA A1 procedente de pp50 que tiene la secuencia VTEHDTTLY (SEC ID NO: 165), que fue reconocido consistentemente como una de las respuestas más dominantes en todos (es decir, 6/6) los portadores de virus sanos positivos a HLA A1. Además, la frecuencia y la intensidad de esta respuesta fue comparable a la respuesta de CTL medida frente al epítopo de NLVPMVATV (SEC ID NO: 5) en donantes positivos a HLA A2. También se cartografiaron nuevos epítopos en los antígenos IE-2 y UL18.
En la Tabla 3 se presenta una lista extensa de todos los epítopos identificados usando el ensayo ELISPOT.
Ejemplo 5
Análisis de respuestas de CTL específicos de HCMV usando ensayos de citotoxicidad
Para confirmar adicionalmente los epítopos de CTL identificados mediante ensayos ELISPOT, se generaron estirpes de CTL policlonales y clonales, específicas para estos epítopos. Se estimularon PBMC procedentes de donantes seropositivos sanos con epítopos de péptidos sintéticos, y se establecieron y evaluaron clones de CTL y estirpes policlonales en ensayos estándar de liberación de 51Cr.
En las Figuras 4a y 4b se muestran datos representativos de las estirpes de CTL policlonales establecidas a partir de los donantes SB, PP, CS, SE y SC. Para el donante SB (Figura 4a), se evaluaron siete epítopos representativos restringidos a HLA clase I procedentes de los antígenos IE-2, pp150, pp65, IE-1 y gB. Seis de estos siete epítopos evocaron fuertes respuestas de CTL, y se observó una menor actividad de CTL en la estirpe de CTL policlonal establecida contra el poliepítopo que tiene la secuencia GQTEPIAFV (SEC ID NO: 122).
De forma similar, las estirpes de CTL establecidas de otros donantes (PP, CS, SE y SC) también mostraron fuerte actividad citolítica frente a blastos de PHA autólogos sensibilizados por péptidos (Figura 4b).
La fortaleza global de la actividad de CTL observada en estos ensayos se correlaciona generalmente con el número de células productoras de IFN- detectadas. Por ejemplo, el epítopo de VLEETSVML (SEC ID NO: 101) procedente del antígeno IE-1 de HCMV fue el epítopo más dominante para el donante SB en los ensayos ELISPOT (Tabla 3), y mostró fuerte actividad de CTL en los ensayos de citotoxicidad (Figura 4a).
Se estableció una serie de clones de CTL para caracterizar adicionalmente estos epítopos. En las Figuras 5a a 5d se presentan datos representativos de cuatro epítopos diferentes.
De particular interés fue el clon de CTL específico para el epítopo de VLEETSVML (SEC ID NO: 101) derivado del antígeno IE-1 de HCMV. Retière et al, J. Virol 74, 3948-3952, 2000 han identificado otro epítopo de IE-1 de HCMV restringido a HLA A2 (YILEETSVM; SEC ID NO: 18), que tiene una secuencia similar aunque no idéntica a este epítopo. Para determinar si las respuestas de CTL a estos epítopos son similares, se titularon estos péptidos y se comparó la actividad citotóxica en un ensayo estándar de liberación. Los datos presentados en la Figura 5a muestran claramente una falta de reconocimiento cruzado significativo entre estos epítopos. Estas observaciones también se han confirmado mediante estirpes de CTL policlonales establecidas a partir de otros donantes positivos a HLA A2 (datos no mostrados). De este modo, VLEETSVML (SEC ID NO: 101) y YILEETSVM (SEC ID NO: 18) representan epítopos de CTL distintos.
Otros clones de CTL evaluados en este estudio fueron específicos para el epítopo de pp65 restringido a HLA A2 NLVPMVATV (SEC ID NO: 5), como se muestra en la Figura 5b; el epítopo de IE-2 restringido a HLA A2 IIYTRNHEV (SEC ID NO: 254; Figura 5c), o el epítopo IE-1 restringido a HLA B8 QIKVRVDMV (SEC ID NO: 113; Figura 5d). Una comparación de la reactividad global de CTL de clones específicos para IIYTRNHEV (SEC ID NO: 254) reveló que este epítopo fue generalmente poco reconocido a concentraciones limitantes (Figura 5c). La concentración de péptido requerida para la lisis semimáxima para el epítopo de IIYTRNHEV (SEC ID NO: 254) fue casi 100-500 veces mayor que los epítopos de NLVPMVATV (SEC ID NO: 5) y VLEETSVML (SEC ID NO: 101) respectivamente. También se observó un patrón idéntico de titulación de péptidos con otros cinco clones de CTL diferentes específicos para el epítopo IIYTRNHEV (SEC ID NO: 254) (datos no mostrados).
EJEMPLO 6
Reconocimiento por CTL de antígenos de HCMV codificados por el virus de la vacuna recombinante
Los datos presentados aquí muestran claramente que los epítopos predichos por los algoritmos a base de ordenador, y evaluados subsiguientemente mediante ensayos ELISPOT, fueron de hecho capaces de evocar una fuerte respuesta de linfocitos T. Para demostrar que estos efectores de CTL también fueron capaces de reconocer células diana que expresan antígenos de HCMV de longitud completa, se aislaron más de 100 estirpes celulares T clonales o policlonales a partir de una cohorte de 14 donantes sanos inmunes a HCMV, usando el protocolo de estimulación descrito aquí anteriormente. Esas estirpes de CTL que muestran fuerte reactividad frente a las dianas sensibilizadas por péptido se evaluaron frente a LCLs autólogas infectadas con vectores del virus de la vacuna recombinante que expresaron los antígenos pp28, pp65, pp150, gH, gB, o IE-1 de HCMV. En la Figura 6 se muestran las reactividades de dos clones de CTL diferentes procedentes de los donantes SB, y una estirpe de CTL policlonal procedente del donante SC. Uno de estos clones reconoció células diana infectadas con virus de la vacuna recombinante que codifican pp65 (denominado como Vacc.pp65; panel superior de la Figura 6). Las otras dos estirpes de CTL restantes reconocieron células diana infectadas por Vacc.IE-1 (paneles central e inferior de la Figura 6). De forma similar, los clones/estirpes de CTL específicos para otros epítopos de CTL que muestran fuerte reactividad específica de péptidos reconocieron eficientemente dianas infectadas con el virus de la vacuna recombinante (datos no mostrados). Estos resultados demuestran que los epítopos de CTL cartografiados usando la estrategia descrita aquí representan el repertorio global de respuestas de CTL frente a HCMV, y que estos epítopos son eficientemente procesados de forma endógena por células infectadas por el virus.
Ejemplo 7
Ensayos ELISPOT y de CTL usando péptidos solapantes de antígenos de HCMV
Estudios previos tanto del grupo de nuestro laboratorio como de otros grupos han indicado que, aunque se pueden emplear con éxito algoritmos a base de ordenador para cartografiar un gran panel de nuevos epítopos, este enfoque está limitado por la disponibilidad de los motivos específicos para alelos de HLA individuales. Además, los epítopos restringidos a clase I que no se ajustan a las restricciones especificadas por los algoritmos a base de ordenador, con respecto a la longitud del epítopo y los restos de anclaje de unión a MHC potenciales, a menudo no se seleccionan por tales métodos predictivos. Para superar estas limitaciones potenciales, se seleccionaron seis de los antígenos de HCMV más dominantes (gB, gH, IE-1, IE-2, pp150 y pp65), y se sintetizaron conjuntos completos de péptidos solapantes (20 aminoácidos de longitud, solapando cada miembro con otro miembro del mismo conjunto en 10 aminoácidos) abarcando la longitud completa de cada antígeno. De este modo, se produjo un total de 450 péptidos. Los ensayos ELISPOT se usaron para determinar si se pudieron detectar respuestas de linfocitos T de memoria ex vivo en una cohorte de 14 portadores de virus sanos (Tabla 2). Se estimularon PBMC con péptidos individuales y se seleccionaron células que produjeron IFN-. Los datos representativos de un subconjunto de cinco portadores de virus sanos se muestran en las Figuras 7a a 7f. Se detectaron fuertes respuestas ELISPOT a múltiples péptidos procedentes de diferentes antígenos de HCMV. Consistente con nuestro análisis previo, los péptidos de pp65 fueron los epítopos más frecuentemente reconocidos en los ensayos ELISPOT. El análisis con péptidos 20-meros también indicó que el antígeno IE-2 fue más reconocido a menudo cuando se comparó con IE-1, gB, gH y pp150.
El repertorio global de respuestas de linfocitos T a HCMV no estuvo constreñido a un único antígeno. En cada donante respondedor, se reconocieron consistentemente dos o más antígenos como dianas para el control de CTL. A pesar de la diversidad de estas respuestas, una repuesta dominante a uno o dos epítopos fue siempre evidente en donantes respondedores.
Además de la identificación de los epítopos mediante ELISPOT, su validez se confirmó adicionalmente estimulando específicamente linfocitos T con péptidos para generar estirpes de CTL policlonales y clonales. Los datos de uno de tales análisis basado en seis donantes diferentes (RK, JW, MB, CS, SB y SE) se presentan en la Figura 8.
La especificidad del antígeno de los efectores generados se confirmó subsiguientemente usando dianas LCLs autólogas infectadas con virus de la vacuna que expresó antígenos de HCMV individuales en un ensayo de liberación de 51Cr. Los datos presentados en la Figura 9, muestran que los clones de CTL procedentes de los donantes RK (panel A) y MB (panel B) reconocieron Vacc.gB (OB6.13, OB12.3) y Vacc.pp65 (1C9.28, ID9.7), respectivamente, mientras que una estirpe policlonal del donante SB (panel C) reconoció Vacc.pp65 (IC7 CTL).
El análisis de péptidos 20-meros solapantes identificó numerosas secuencias nuevas de proteínas de HCMV que no se identificaron usando algoritmos predictivos. Estos subraya la necesidad de combinar ambos enfoques para cartografiar de forma amplia los epítopos de CTL con antígenos codificados víricamente.
Cuando se usan péptidos 20-meros para cartografiar epítopos mediante ELISPOT, es posible que algunas respuestas pueden estar restringidas a MHC clase II, y no necesariamente restringidas a través de alelos de HLA clase I. Fue evidente a través de este estudio que algunos epítopos identificados usando ELISPOT no se pudieron confirmar usando análisis de citotoxicidad. En este caso, se investigó la existencia de un epítopo restringido a clase II en las secuencias de 20-meros usando tanto técnicas detención de IFN- intracelular como ELISPOT de IFN-. PBMC ser co-tiñeron con CD4, CD8, CD3 e IFN- tras la estimulación con diversos péptidos 20-meros, y la proporción de poblaciones de CD4+ y CD8+ que respondió al péptido se analizó mediante citometría de flujo (Figuras 10a a 10b).
Para ensayo ELISPOT de IFN-, se prepararon poblaciones tanto de PBMC agotadas en linfocitos T CD4+ como agotadas en linfocitos T CD8+, se estimularon con péptidos 20-meros, y se evaluó el número de linfocitos T CD4+ o CD8+ que respondieron al péptido produciendo IFN-. Ambas de estas técnicas demostraron ser valiosas a la hora de caracterizar la presencia de epítopos restringidos a MHC clase II procedentes de antígenos de HCMV.
Además, se identificaron epítopos restringidos a MHC clase II a partir de secuencias de 20-meros que se pensaba que contenían solamente un epítopo restringido a MHC clase I. Por ejemplo, el péptido de pp65 de HCMV SICPSQEPMSIYVYALPLKM (SEC ID NO: 90) (denominado SIC en las Figures 10a y 10b) estimuló la producción de IFN- en células 3178 por 106 de PBMC procedentes del donante JW (véase la Tabla 4). Sin embargo, también se detectó producción sustancial de IFN- en la población de CD3+/CD4+ de PBMC procedentes del mismo donante tras el análisis de IFN- intracelular. Además, el porcentaje de las células CD3+/CD4+ que respondió a la secuencia de 20-meros (1,18%) fue comparable al porcentaje de población de CD3+/CD8+ de células que respondió (1,36%). Esto indicó que, no sólo esta secuencia contiene un epítopo de CTL restringido a clase I, sino también un epítopo restringido a MHC clase II. También se encontró que un segundo péptido 20-mero, que demostró ser difícil de caracterizar como un epítopo de CTL de CD8+, contiene un epítopo restringido a clase II. Los intentos repetidos de generar estirpes de linfocitos T citotóxicos tanto policlonales como clonales específicas para el péptido gH que tiene la secuencia RQTEKHELLVLVKKAQLNRH (SEC ID NO: 249) no tuvo éxito. Los resultados del análisis citométrico de flujo de la producción de IFN- intracelular mostraron que 1,52% de linfocitos T CD3+/CD4+ produjeron IFN- en respuesta a este péptido, mientras que sólo lo hizo el 0,57% de la población de CD3+/CD8+ (Figuras 10a y 10b). Por lo tanto, el conjunto peptídico expuesto en SEC ID NO: 249 indujo una respuesta más sustancial desde linfocitos T CD4+ que desde linfocitos T CD8+.
Cuando la frecuencia del precursor de la células que responden a péptidos 20-meros fue demasiado baja para ser detectada mediante citometría de flujo, se llevaron a cabo ensayo ELISPOT de IFN- usando poblaciones de PBMC agotadas en linfocitos T CD4+ y linfocitos T CD8+. Esta técnica permitió tanto la visualización como la enumeración del número de células que producen IFN- en respuesta a un péptido dado. Los resultados detallados del análisis de CD4+/CD8+ de los péptidos 20-meros se presentan en la Tabla 4. El uso de estas dos técnicas ha resaltado la presencia de epítopos restringidos a MHC clase II no sólo en los antígenos diana de HCMV convencionales gB y gH (Plotkin et al, Pediatr. Infect. Dis. J. 18, 313, 1999; y Britt et al, Intervirol. 39, 401, 1996), sino así mismo en otros antígenos de HCMV. Este hallazgo puede tener implicaciones importantes para el diseño futuro de candidatos de vacuna que promuevan respuesta inmunitarias tanto citotóxicas como auxiliares para la protección frente a HCMV.
Para identificar las secuencias mínimas en los péptidos 20-meros cartografiados mediante ensayos ELISPOT, se sintetizaron péptidos 12-meros y/o 9-meros solapantes y se evaluaron en los ensayos ELISPOT y/o de CTL. Los datos de un estudio representativo se muestran en las Figuras 11a y 11b. Como se muestra más arriba en la Tabla 4, los ensayos ELlSPOT en péptidos 20-meros indicaron una fuerte respuesta a los péptidos solapantes TAAKAYAVGQFEQPTETPPE (SEC ID NO: 269) y FEQPTETPPEDLDTLSLAIE (SEC ID NO: 270) por el donante RK, que se confirmó subsiguientemente mediante ensayos de citotoxicidad in vitro (Tabla 4). Ambos ensayos indicaron que la secuencia FEQPTETPP (SEC ID NO: 260) fue la secuencia minima requerida para inducir fuerte actividad lítica por linfocitos T procedentes del donante RK (Figuras 11a y 11b).
Un resumen de este análisis se presenta en la Tabla 4.
La restricción por HLA clase I de los epítopos de CTL se determinó comparando la lisis de blastos de PHA o LCLs autólogos sensibilizados por péptido y blastos de PHA o LCLs alogeneicos sensibilizados por péptido que comparten uno o más alelos. Por ejemplo, el análisis de restricción por HLA para las estirpes de CTL específicas para epítopos en los antígenos IE-2 e IE-1 se presentan en las Figuras 12a y 12b. Una estirpe de CTL específica de IE-2 procedente del donante RK reconoció las células diana positivas a HLA B41, indicando que este epítopo estaba restringido mediante el alelo de HLA B41 (Figura 12a). Fue de interés la reactividad de una estirpe de CTL específica de IE-1 procedente del donante CS, que reconoció células diana positivas tanto a HLA A23, A24 y A30 sensibilizadas con epítopo de péptido sintético (Figura 12b). Estos datos sugieren que este epítopo de IE-1 se puede unir eficientemente a múltiples alelos del supertipo HLA A24 (Sette y Sidney, Immunogenetics 50, 201, 1999).
En la Tabla 4 se presenta un resumen global del análisis de restricción por HLA para las secuencias de 20-meros.
Ejemplo 8
Péptidos poliepitópicos
Según los procedimientos descritos aquí, se diseñaron péptidos que comprenden múltiples epítopos de HCMV que son específicos para los mismos elementos de restricción por HLA Clase I o para elementos diferentes. Los epítopos se diseñaron para maximizar la cobertura de la población lograda mediante la vacunación con ellos. En consecuencia, los epítopos de CTL que están restringidos por alelos de HLA expresados frecuentemente (véanse las Tablas 1, 3 y 4) se prefirieron para la inclusión en tales vacunas de poliepítopos, y se incluyeron los epítopos procedentes tanto de proteínas pp65, IE-1, y pp150 inmunodominantes, así como procedentes de antígenos subdominantes. En SEC ID Nos: 309-319 se presentan las secuencias de aminoácidos de diez (10) péptidos poliepitópicos representativos.
EJEMPLO 9
Generación de CTLs
- 1.
- Generación de CTLs policlonales
Los efectores de CTL policlonales se generan estimulando PBMCs procedentes de donantes seropositivos sanos con estirpes celulares linfoblastoides (LCLs) autólogas transformadas con HCMV, en los días 0 y 7.
- 2.
- Clonación en agar de linfocitos T
Los clones de linfocitos T procedentes de donantes individuales se generaron según lo siguiente. Se aislaron PBMCs y se suspendieron en medio a una concentración de 2 x 106 células en placas de 24 pocillos (Costar, Cambridge, Mass.). Se añaden PBMC sensibilizadas por péptido procedentes del mismo donante a cada uno de estos pocillos a 106 células/pocillo. Después de tres días, las células se dispersan y se siembran en placas de cultivo de 3,5 cm de diámetro en agarosa al 0,35% (p/v) (Seaplaque, FMC Corp., Rockland, Me.) que contiene RPMI 1640, 20% de 2 x RPMI 1640, 20% de FCS, 16% de sobrenadante de MLA, y 50 U/ml de IL-2 recombinante (rIL-2). Las colonias aparecen en el agar después de cinco días. Éstas se identifican bajo el microscopio invertido (aumento 25X) como agrupamientos o cadenas de células discretas. Estas colonias se cosechan bajo el microscopio en una cabina de flujo laminar mediante succión en una pipeta de Gilson. Las colonias cosechadas se dispersan en medio de crecimiento de linfocitos T (RPMI 1640, 20% de FCS, 30% de sobrenadante de MLA y 20 U/ml de rIL-2), y se transfieren a una bandeja de microtitulación de 96 pocillos que contiene LCLs irradiadas con radiación sensibilizadas con péptido procedentes del mismo donante (103 células/pocillo). Estas colonias continúan expandiéndose y se almacenan en nitrógeno líquido (aproximadamente 5 x 106 células/ampolla).
EJEMPLO 10
Procedimientos de diagnóstico usando clones de CTL
- 1.
- Identificación de clones de CTL en busca de la reactividad frente a virus de la vacuna recombinante de HCMV
Las LCLs se infectan con virus de la vacuna recombinantes a una multiplicidad de infección de 10:1 durante 1 hora a 37ºC. Después de 14-16 horas, las células se lavan con medio de cultivo básico y se incuban con 51Cr durante 90 minutos, se lavan tres veces, y se usan como dianas en un ensayo estándar de liberación de cromo de 4-6 horas como se describe más abajo.
- 2.
- Identificación de péptido
Se lleva a cabo un ensayo estándar de liberación de cromo de 4-6 h en efectores de linfocitos T policlonales o clones de linfocitos T, para evaluar la especificidad por el epítopo del péptido. De forma breve, se añaden (104 células/pocillo en 40 l) células diana (blastos de PHA autólogos) marcadas (60 minutos, 37ºC) con 51Cr (Amersham International, Inglaterra) y lavadas a 10 l de péptido (concentración final 10 M) en una placa de 96 pocillos con pocillos en U (Nunc, Dinamarca). Después de una incubación durante 30 minutos a 37ºC, se añaden entonces por pocillo en 150 l entre 104 y 50 x 104 linfocitos T efectores (CTLs clonados o en bruto), por triplicado, para obtener una relación final de efector a diana de 10:1 ó 5:1. Se añaden dos controles: (i) medios y diana (liberación de fondo), y (ii) dianas (liberación total) para la adición de SDS, preferiblemente 100 l de SDS al 0,5%. La placa se centrifuga entonces a 500 rpm durante cinco minutos y se incuba a 37ºC durante cinco horas. Tras la incubación, se retiran 20 l de sobrenadantes para el recuento gamma. Los resultados se expresan como % de lisis específica calculada como:
recuentos medios (pocillos experimentales)-recuentos medios (pocillos de control)
recuentos totales para la solubilización de SDS -recuentos medios (pocillos de control).
TABLA 1: Lista de epítopos de CTL predictivos restringidos a HLA clase I a partir de proteínas de HCMV, y eficiencia de la estabilización de MHC
- pp28
- (HLA) MSE*
- LLIDPTSGL
- (SEC ID NO: 150) (A2) +
- LLVEPCARV
- (SEC ID NO: 151) (A2) ++
- LLLIVTPW
- (SEC ID NO: 152) (A2) ++
- FLLSHDAAL
- (SEC ID NO: 153) (A2) ++
- PLREYLADL
- (SEC ID NO: 154) (A2) -
- GLLGASMDL LVEPCARVY GIKHEGLVK ELLAGGRVF RLLDLAPNY ELLGRLNVY CRYKYLRKK ARVYEIKCR
- (SEC ID NO: 155) (SEC ID NO: 156) (SEC ID NO: 157) (SEC ID NO: 158) (SEC ID NO: 159) (SEC ID NO: 160) (SEC ID NO: 161) (SEC ID NO: 162) (A2) (A1/A3) (A3) (A3) (A3) (A3) (B27) (B27) -NT/++ +++ -+++ ---
- pp50
- (HLA) MSE*
- LLNCAVTKL QLRSVIRAL VTEHDTLLY RGDPFDKNY GLDRNSGNY TLLNCAVTK TVRSHCVSK TRVKRNVKK YEQHKITSY SEDSVTFEF TRLSEPPTL
- (SEC ID NO: 163) (SEC ID NO: 164) (SEC ID NO: 165) (SEC ID NO: 166) (SEC ID NO: 167) (SEC ID NO: 168) (SEC ID NO: 169) (SEC ID NO: 171) (SEC ID NO: 170) (SEC ID NO: 172) (SEC ID NO: 173) (A2) (A2) (A1) (A1) (A1) (A3) (A3) (B27) (B44) (B44) (B27) ++ -NT NT NT +++ +++ -NT NT NT
- US3
- (HLA) MSE*
- YLFSLVVLV TLLVYLFSL LLFRTLLVYL VYLFSLVVL
- (SEC ID NO: 298) (SEC ID NO: 299) (SEC ID NO: 300) (SEC ID NO: 301) (A2) (A2) (A2) (A24) + ++ +++ -
- IE-2
- (HLA) MSE*
- FLMEHTMPV LMQKFPKQV NLALSTPFL IIYTRNHEV LLGALNLCL KPEPDFTIQY IIYTRNHEVK IMKDKNTPF PRKKKSKRI
- (SEC ID NO: 251) (SEC ID NO: 252) (SEC ID NO: 253) (SEC ID NO: 254) (SEC ID NO: 256) (SEC ID NO: 257) (SEC ID NO: 255) (SEC ID NO: 258) (SEC ID NO: 259) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A1) (A3) (B8) (B8) ++ + ++ + ++ NT +++ +++ -
- pp71
- (HLA) MSE*
- QLLIPKSFTL TLVIPSWHV LLIPKSFTL DLVPLTVSV CSDPNTYIHK EYIVQIQNAF AEVVARHNPY
- (SEC ID NO: 174) (SEC ID NO: 175) (SEC ID NO: 176) (SEC ID NO: 177) (SEC ID NO: 178) (SEC ID NO: 179) (SEC ID NO: 180) (A2) (A2) (A2) (A2) (A1) (A24) (B44) -++ -+ NT +++ NT
- pp150
- (HLA) MSE*
- GQTEPIAFV KMSVRETLV FLGARSPSL ALVNAVNKL ALVNFLRHL NILQKIEKI LIEDFDIYV PLIPTTAVI RIEENLEGV NVRRSWEEL WPRERAWAL KARDHLAVL SPWAPTAPL RPSTPRAAV
- (SEC ID NO: 122) (SEC ID NO: 141) (SEC ID NO: 142) (SEC ID NO: 143) (SEC ID NO: 144) (SEC ID NO: 145) (SEC ID NO: 140) (SEC ID NO: 139) (SEC ID NO: 138) (SEC ID NO: 134) (SEC ID NO: 133) (SEC ID NO: 132) (SEC ID NO: 131) (SEC ID NO: 130) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (B7) (B7/B8) (B7) (B7) (A1) + ++ ++ ++ ++ + ++ -+ ++ +++/++ +++ +++ NT
- UL18
- (HLA) MSE*
- GEINITFIHY TENGSFVAGY TMWCLTLFV LELEIALGY
- (SEC ID NO: 291) (SEC ID NO: 292) (SEC ID NO: 293) (SEC ID NO: 308) (B44) (B44) (A2) (B44) NT NT ++ NT
- US6
- (HLA) MSE*
- LYLCCGITL
- (SEC ID NO: 303) (A24) -
- pp65
- (HLA) MSE*
- SQEPMSIYVY ATVQGQNLKY IRETVELRQY IGDQYVKVY TVQGQNLKY YRIQGKLEY
- (SEC ID NO: 22) (SEC ID NO: 23) (SEC ID NO: 24) (SEC ID NO: 25) (SEC ID NO: 26) (SEC ID NO: 27) (A1) (A1) (A1) (A1) (A1) (A1) NT NT NT NT NT NT
- QVIGDQYVK
- (SEC ID NO: 28) (A3) ++
- LLLQRGPQY
- (SEC ID NO: 29) (A3) +++
- RVTGGGAMA
- (SEC ID NO: 30) (A3) -
- GVMTRGRLK
- (SEC ID NO: 31) (A3) +++
- VYALPLKML
- (SEC ID NO: 32) (A24) -
- QYDPVAALF
- (SEC ID NO: 33) (A24) -
- VYYTSAFVF
- (SEC ID NO: 34) (A24) -
- DIYRIFAEL
- (SEC ID NO: 15) (A24) NT
- DVPSGKLFM
- (SEC ID NO: 35) (A26) NT
- DIDLLLQRG
- (SEC ID NO: 36) (A26) NT
- YVKVYLESF
- (SEC ID NO: 37) (A26) NT
- TVQGQNLKY
- (SEC ID NO: 38) (A26) NT
- EPMSIYVYAL
- (SEC ID NO: 39) (B7) +
- HVRVSQPSL
- (SEC ID NO: 40 (B7) ++
- QARLTVSGL
- (SEC ID NO: 41) (B7) +++
- RRRHRQDAL
- (SEC ID NO: 42) (B27/B8) ++/+
- QPKRRRHRQ
- (SEC ID NO: 43) (B8) -
- LCPKSIPGL
- (SEC ID NO: 44) (B8) -
- VLCPKNMII
- (SEC ID NO: 14) (B8) -
- YRIQGKLEY
- (SEC ID NO: 27) (B27) -
- SEHPTFTSQY
- (SEC ID NO: 47) (B44) NT
- CEDVPSGKLF
- (SEC ID NO: 48) (B44) NT
- NEIHNPAVF
- (SEC ID NO: 49) (B44) NT
- RETVELRQY
- (SEC ID NO: 50) (B44) NT
- QEPMSIYVY
- (SEC ID NO: 51) (B44) NT
- QMWQARLTV
- (SEC ID NO: 52) (A2) +
- ALFFFDIDL
- (SEC ID NO: 12) (A2) ++
- RLLQTGIHV
- (SEC ID NO: 10) (A2) ++
- NLVPMVATV
- (SEC ID NO: 5) (A2) ++
- LMNGQQIFL
- (SEC ID NO: 53) (A2) ++
- MLNIPSINV
- (SEC ID NO: 6) (A2) ++
- RIFAELEGV
- (SEC ID NO: 7) (A2) ++
- ILARNLVPM
- (SEC ID NO: 54) (A2) ++
- VIGDQYVKV
- (SEC ID NO: 11) (A2) ++
- TPRVTGGGGAM
- (SEC ID NO: 8) (B7)
- RPHERNGFTVL
- (SEC ID NO: 9) (B7)
- gH
- (HLA) MSE*
- YLMDELRYV
- (SEC ID NO: 196) (A2) ++
- YLTVFTVYL
- (SEC ID NO: 197) (A2) ++
- TLTEDFFVV
- (SEC ID NO: 198) (A2) ++
- LLMMSVYAL
- (SEC ID NO: 199) (A2) ++
- YLLYRMLKT
- (SEC ID NO: 200) (A2) -
- ILFDGHDLL
- (SEC ID NO: 201) (A2) +++
- LIFGHLPRV
- (SEC ID NO: 202) (A2) ++
- SLVRLVYIL
- (SEC ID NO: 203) (A2) +
- LLYPTAVDL
- (SEC ID NO: 204) (A2) +++
- ALDPYNEVV
- (SEC ID NO: 205) (A2) +++
- LMLLKNGTV
- (SEC ID NO: 206) (A2) -
- SAIIGIYLL
- (SEC ID NO: 207) (A2) -
- ITSLVRLVY
- (SEC ID NO: 208) (A1) NT
- HHEYLSDLY
- (SEC ID NO: 209) (A1) NT
- AIIGIYLLY
- (SEC ID NO: 210) (A1/A3) NT/+++
- QTEKHELLV
- (SEC ID NO: 211) (A1) NT
- ATDSRLLMM
- (SEC ID NO: 212) (A1) NT
- FLDAALDFNY
- (SEC ID NO: 213) (A1) NT
- DTQGVINIMY
- (SEC ID NO: 214) (A1) NT
- LRENTTQCTY
- (SEC ID NO: 215) (A1) NT
- SAIIGIYLLY
- (SEC ID NO: 216) (A1) NT
- SLRNSTVVR
- (SEC ID NO: 217) (A3) +++
- ALALFAAAR
- (SEC ID NO: 218) (A3) -
- QLNRHSYLK
- (SEC ID NO: 219) (A3) +++
- RLFPDATVP
- (SEC ID NO: 220) (A3) -
- RLNTYALVSK
- (SEC ID NO: 221) (A3) +++
- LVRLVYILSK
- (SEC ID NO: 222) (A3) +++
- YLMDELRYVK
- (SEC ID NO: 223) (A3) -
- ELYLMGSLVH
- (SEC ID NO: 224) (A3) -
- ALTVSEHVSY
- (SEC ID NO: 225) (A3) ++
- NYLDLSALL
- (SEC ID NO: 226) (A24) -
- SYVVTNQYL
- (SEC ID NO: 227) (A24) -
- SYLKDSDFL
- (SEC ID NO: 228) (A24) -
- TYALVSKDL
- (SEC ID NO: 229) (A24) -
- SYRSFSQQL
- (SEC ID NO: 230) (A24) -
- TYGRPIRFL YYVFHMPRCL MYMHDSDDVL ETFPDLFCL DLTETLERY SPRTHYLML FPDLFCLPL SPRTHYLMLL MPRCLFAGPL TPMLLIFGHL APYQRDNFIL GRCQMLDRR RRDHSLERL SEALDPHAF RENTTQCTY DDVLFALDPY
- (SEC ID NO: 231) (SEC ID NO: 232) (SEC ID NO: 233) (SEC ID NO: 234) (SEC ID NO: 235) (SEC ID NO: 236) (SEC ID NO: 237) (SEC ID NO: 238) (SEC ID NO: 239) (SEC ID NO: 240) (SEC ID NO: 241) (SEC ID NO: 242) (SEC ID NO: 243) (SEC ID NO: 244) (SEC ID NO: 245) (SEC ID NO: 246) (A24) (A24) (A24) (A26) (A26) (B7) (B7) (B7) (B7) (B7) (B7) (B27) (B27) (B44) (B44) (B44) ---NT NT +++ +++ +++ +++ ++ +++ --NT NT NT
- IE-1
- (HLA) MSE*
- SLLSEFCRV VLAELVKQI ILGADPLRV TMYGGISLL LLSEFCRVL VLEETSVML YILEETSVM CLQNALDIL ILDEERDKV IKEHMLKKY DEEEAIVAY CVETMCNEY KLGGALQAK QYILGADPL KYTQTEEKF KARAKKDEL VMKRRIEEI RHRIKEHML ELRRKMMYM
- (SEC ID NO: 96) (SEC ID NO: 97) (SEC ID NO: 98) (SEC ID NO: 99) (SEC ID NO: 100) (SEC ID NO: 101) (SEC ID NO: 18) (SEC ID NO: 102) (SEC ID NO: 103) (SEC ID NO: 104) (SEC ID NO: 105) (SEC ID NO: 19) (SEC ID NO: 106) (SEC ID NO: 107) (SEC ID NO: 108) (SEC ID NO: 109) (SEC ID NO: 110) (SEC ID NO: 111) (SEC ID NO: 112) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A1) (A1) (A1) (A3) (A24) (A24) (B7/B8) (B8) (B8) (B8) +++ ++ ++ ++ ++ ++ ++ ++ ++ NT NT NT +++ +++ --/+ -++
- QIKVRVDMV ELKRKMMYM RRKMMYMCY RRIEEICMK
- (SEC ID NO: 113) (SEC ID NO: 114) (SEC ID NO: 115) (SEC ID NO: 20) (B8) (B8) (B27) (B27) + -+ -
- US2
- (HLA) MSE*
- LLVLFIVYV SMMWMRFFV TLLVLFIVYV VYVTVDCNL
- (SEC ID NO: 294) (SEC ID NO: 295) (SEC ID NO: 296) (SEC ID NO: 297) (A2) (A2) (A2) (A24) -++ --
- gB
- (HLA) MSE*
- RIWCLVVCV QMLLALARL GLDDLMSGL IILVAIAVV DLDEGIMVV NLFPYLVSA AVGGAVASV YINRALAQI CYSRPVVIF KMTATFLSK IMREFNSYK VKESPGRCY LDEGIMVVY ATSTGDVVY NTDFRVLEL AYIYTTYLL SYENKTMQL AYEYVDYLF
- (SEC ID NO: 181) (SEC ID NO: 182) (SEC ID NO: 183) (SEC ID NO: 184) (SEC ID NO: 185) (SEC ID NO: 186) (SEC ID NO: 187) (SEC ID NO: 188) (SEC ID NO: 137) (SEC ID NO: 136) (SEC ID NO: 135) (SEC ID NO: 129) (SEC ID NO: 128) (SEC ID NO: 127) (SEC ID NO: 126) (SEC ID NO: 125) (SEC ID NO: 124) (SEC ID NO: 123) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A2) (A24) (A3) (A3) (A1) (A1) (A1) (A1) (A24) (A24) (A24) -+ ++ + -++ -++ -+++ +++ NT NT NT NT ---
- US11
- (HLA) MSE*
- YYVECEPRC TLFDEPPPLV TPRVYYQTL APVAGSMPEL SESLVAKRY
- (SEC ID NO: 302) (SEC ID NO: 304) (SEC ID NO: 305) (SEC ID NO: 306) (SEC ID NO: 307) (A24) (A2) (B7) (B7) B44) NT NT +++ +++ NT
*MSE: La eficiencia de la estabilización del MHC se evaluó usando células T2 transfectadas con alelos de HLA clase I individuales. Los niveles de HLA en presencia de péptido se expresan con respecto a la expresión en células T2 en ausencia de péptido a 26ºC: +++ = 200-300%, ++ = 100-199%, + = 51-99%, -= 0-50%, incremento relativo en la expresión de HLA. NT: No evaluado
TABLA 2: Tipo de antígeno de HLA (clase I) de los donantes inmunes a HCMV incluidos en este estudio
- Donante
- Tipaje de HLA
- MB
- A1 A24 B8 B58
- SB
- A2 B35 B57
- SC
- A1 B8
- JDu
- A31 A33 B35 B58
- JDa
- A28 A31 B27 B18
- JG
- A1 A2 B7 B37
- TD
- A24 A26 B15 B62
- RE
- A11 A24 B35 B60
- SE
- A2 A29 B44 B60
- TF
- A2 A24 B40 B60
- PH
- A1 A2 B8 B44
- CJ
- A2 A3 B8 B60
- RK
- A23 A24 B27 B41
- TK
- A3 A25 B35 B44
- MM
- A1 A3 B50 B57
- PP
- A1 A24 B8 B14
- CP
- A2 A32 B7 B50
- JP
- A2 A28 B8 B62
- CR
- A1 A3 B35 B57
- BS
- A2 A11 B13 B27
- CS
- A3 A23 B35 B44
- WS
- A2 A32 B27 B60
- JT
- A2 A32 B44 B62
- JW
- A23 A32 B35 B49
- MW
- A1 A3 B8 B35
- TC
- A1 A11 B8 B35
- CSt
- A2 A26 B44 B35
TABLA 3
- Lista completa de epítopos de CTL restringidos a HLA Clase I procedentes de antígenos de HCMV cartografiados mediante ensayos ELlSPOT y de CTL
- Antígeno
- Secuencia peptídica Donante(s) y respuestas ELISPOT (SFC/106 PBMC) Restricción por HLA Respuesta de CTL *
- gB
- RIWCLWCV (SEC ID NO: 181) JP(108), CP(105) HLA A2 ND
- AVGGAVASV
- (SEC ID NO: 187) SB(192) HLA A2 Y
- IMREFNSYK
- (SEC ID NO: 135) MB(202) HLA A3 NT
- VKESPGRCY
- (SEC ID NO: 129) TC(51) HLA A1 NT
- LDEGIMVVY
- (SEC ID NO: 128) TC(239) HLAA1 NT
- ATSTGDVVY
- (SEC ID NO: 127) TC(239) HLA A1 NT
- NTDFRVLEL
- (SEC ID NO: 126) TC(1631) HLA A1 NT
- gH
- LIFGHLPRV (SEC ID NO: 202) SE (84) HLA A2 NT
- LMLLKNGTV
- (SEC ID NO: 206) CJ(80) HLA A2 NT
- IE-1
- SLLSEFCRV (SEC ID NO: 96) WS (471) HLA A2 ND
- VLAELVKQI
- (SEC ID NO: 97) SB(276) HLA A2 Y
- VLEETSVML
- (SEC ID NO: 101) SB(3752), CP(245) HLA A2 Y
- YILEETSVM
- (SEC ID NO: 18) SB(764) HLA A2 ND
- CLQNALDIL
- (SEC ID NO: 102) SE (490) HLA A2 NT
- KARAKKDEL
- (SEC ID NO: 109) MB(231), PH(235) HLA B7/B8 ND
- QIKVRVDMV
- (SEC ID NO: 113) SC(2848), JP(475), PH(2425), TC(2251) HLA B8 Y
- ELRRKMMYM
- (SEC ID NO: 112) SC(1243), JP(145), PH(430), TC(4999) HLA B8 Y
- ELKRKMMYM
- (SEC ID NO: 114) SC(1000), MW(1992), PH(300), PP(100), TC(4999) HLA B8 Y
- IKEHMLKKY
- (SEC ID NO: 104) TC(4232) HLA A1 NT
- DEEEAIVAY
- (SEC ID NO: 105) TC(3903) HLA A1 NT
- CVETMCNEY
- (SEC ID NO: 19) TC(4187) HLA A1 NT
- IE-2
- IIYTRNHEV (SEC ID NO: 254) SB(369),CP(80),SE (137) HLA A2 HLA A2 Y NT
- FLMEHTMPV
- (SEC ID NO: 251) WS(137)
- pp28
- LLIDPTSGL (SEC ID NO: 150) SB(270), NS (77) HLA A2 NT
- ARVYEIKCR
- (SEC ID NO: 162) RK(148) HLA B27 Y
- pp50
- LLNCAVTKL (SEC ID NO: 163) SE(59) HLA A2 NT
- VTEHDTLLY
- (SEC ID NO: 165) MB(925), SC(902), MW(975), PP(230), Y
- PH(1290), TC(2531), JG(1070)
- YEQHKITSY
- (SEC ID NO: 170) CS(67) HLA B44 ND
- RGDPFDKNY
- (SEC ID NO: 166) JG (720), TC(2739) HLA A1 NT
- GLDRNSGNY
- (SEC ID NO: 167) MW(345), TC(507) HLA A1 NT
- pp150
- KMSVRETLV (SEC ID NO: 141) SE(69) HLAA2 NT
- ALVNAVNKL
- (SEC ID NO: 143) WS(60) HLAA2 NT
- ALVNFLRHL
- (SEC ID NO: 144) WS(57) HLA A2 NT
- LIEDFDIYV
- (SEC ID NO: 140) WS(88) HLA A2 NT
- NVRRSWEEL
- (SEC ID NO: 134) MB(1431), CS(274) HLA B7 ND
- KARDHLAVL
- (SEC ID NO: 132) MB(975) HLA B7 ND
- SPWAPTAPL
- (SEC ID NO: 131) MB(180) HLA B7 ND
- RPSTPRAAV
- (SEC ID NO: 130) MB(306) HLA B7 ND
- WPRERAWAL
- (SEC ID NO: 133) TC(67) HLAB8 NT
- pp65
- RLLQTGIHV (SEC ID NO: 10) BS(57) HLA A2 ND
- NLVPMVATV
- (SEC ID NO: 5) SB(1202), JP(1201), WS(1102), CJ(271), JT(1195), BS(161), CP(671), SE(170) CP(356), WS (335) HLA A2 Y
- LMNGQQIFL
- (SEC ID NO: 53) CP(217), WS (751) HLA A2 HLA ND
- MLNIPSINV
- (SEC ID NO: 6) SB(65), JP(178), A2 HLA A2 ND
- RIFAELEGV
- (SEC ID NO: 7) WS(236), JT(170), CP(275) ND
- pp65
- ILARNLVPM (SEC ID NO: 54) SE(170) HLA A2 ND
- HVRVSQPSL
- (SEC ID NO: 40) MB(783) HLA B7 ND
- QARLTVSGL
- (SEC ID NO: 41) MB(1116) HLA B7 ND
- IGDQYVKVY
- (SEC ID NO: 25) PH(565), TC (67) HLA A1 NT
- TVQGQNLKY
- (SEC ID NO: 26) PH(385), TC(251) HLA A1 NT
- YRIQGKLEY
- (SEC ID NO: 27) TC(307) HLA 1/B27 NT
- FPTKDVAL
- (SEC ID NO: 4) MW(445) HLA B35 Y
- RRRHRQDAL
- (SEC ID NO: 42) PH(215), TC(71) HLA B8 NT
- YSEHPTFTSQY
- (SEC ID NO: 13) MW(310), TC(359) HLA-A1 NT
- US2
- SMMWMRFFV (SEC ID NO: 295) SE(393) HLA A2 Y
- TLLVLFIVYV
- (SEC ID NO: 296) SE(46) HLA A2 NT
- LLVLFIVYV
- (SEC ID NO: 294) WS(92) HLA A2 NT
- US3
- YLFSLVVLV (SEC ID NO: 298) WS(73) HLA A2 NT
- LLFRTLLVYL
- (SEC ID NO: 300) SB(76), WS(77) HLA A2 ND
- UL18
- TENGSFVAGY (SEC ID NO: 292) CS(283) B44 ND
- **La respuesta de CTL para cada uno de los péptidos se detectó usando el protocol descrito en la sección “Material y métodos”. Y: Sí; NT: No evaluado; ND: No detectado
TABLA 4
- Resumen de análisis ELISPOT basado en péptidos 20meros solapantes procedentes de antígenos de HCMV
- Antígeno
- Secuencia peptídica Donante(s) y ELISPOT (SFC/106 PBMC) Célulasrespondedoras(%CD4/ %CD8) Secuencia mínima definida Restricción de HLA Respuesta de CTL*
- gB
- RSYAYIYTTYLLGSNTEYVA(SEC ID NO: 192) RK(170) RK(0,39/0,58) YAYIYTTYL (SEC ID NO: 189) HLA B41 Y
- TYEKYGNVSVFETSGGLWF(SEC ID NO: 193)
- SE(75) SE(0/0,097) VFETSGGLW (SEC ID NO: 190) HLA A29 Y
- FETSGGLVVFWQGIKQKSLV(SEC ID NO: 194)
- MB(23), SB(185) NT ND
- MQLIPDDYSNTHSTRYVTVK (SEC ID NO: 195)
- MB(238), MB(302), SB(157) MB(0,06/0,03) DDYSNTHSTRYV(SEC ID NO: 191) HLA DR7 Y
- gH
- RQTEKHELLVLVKKAQLNRH(SEC ID NO: 249) RK(313) RK(1,52/0,57) HELLVLVKKAQL(SEC ID NO: 247) HLA DR* Y
- ALTVSEHVSYVVTNQYLIKG(SEC ID NO: 250)
- MB(23) NT LTVSEHVSYVVT(SEC ID NO: 248) NT
- IE-1
- CSPDEIMAYAQKIFKILDEE (SEC ID NO: 117) CS(1532) CS(0,53/0,4) AYAQKIFKIL (SEC ID NO: 116) HLA A23, A24 y A30 Y
- SEPVSEIEEVAPEEEEDGAE(SEC ID NO: 118)
- SE(200) SE(0/0,097) VLEETSVML (SEC ID NO: 101) - NT
- VLCCYVLEETSVMLAKRPLI(SEC ID NO: 119)
- SB(2171) NT HLA A2 Y
- RRKMMYMCYRNIEFFTKNSA(SEC ID NO: 120)
- CP(632) NT - NT
- NIEFFTKNSAFPKTTNGCSQ(SEC ID NO: 121)
- CP(1767) NT - ND
- IE-2
- TAAKAYAVGQFEQPTETPPE(SEC ID NO: 269) RK(859), SB(326) RK(0,2/0,35) FEQPTETPP (SEC ID NO: 260) HLA B41 Y
- FEQPTETPPEDLDTLSLAIE(SEC ID NO: 270)
- RK(791) RK(0,2/0,35) FEQPTETPP (SEC ID NO: 260) HLA B41 Y
- MLPLIKQEDIKPEPDFTIQY (SEC ID NO: 271)
- SB(132) NT - NT
- THQLCPRSSDYRNMIIHAAT(SEC ID NO: 272)
- SC(173), TC(124) NT SDYNMIIHA (SEC ID NO: 265) HLA A1/B8 ND
- YRNMIIHAATPVDLLGALNL(SEC ID NO: 273)
- SC(229), JW(132), TC(137) NT YRNMIIHAAT (SEC ID NO: 266) HLA A1/B8/B35HLA A2 ND
- TGPRKKKSKRISELDNEKVR(SEC ID NO: 274)
- SB(148), SE(162) SB(0,02/0,02) ND
- IE-2
- PVDLLGALNLCLPLMQKFPK (SEC ID NO: 275) SC(111), TC(169) NT CLPLMQKFP (SEC ID NO: 267) HLA A1/B8 ND
- IQIIYTRNHEVKSEVDAVRC (SECID NO: 276)
- SE(203), SB(288) SE(0/0,19) IIYTRNHEVK (SEC ID NO: 255) HLA A2 Y
- VKSEVDAVRCRLGTMCNLAL(SEC ID NO: 277)
- SE(253), SB(320) SE(0/0,06) HLA A2 NT
- RVKIDEVSRMFRNTNRSLEY(SEC ID NO: 278)
- SC(306), TC(194) NT IDEVSRMFRNTNRS(SEC ID NO: 268) HLA A1/B8 NT
- SSSSSSCSSASDSESESEEM(SEC ID NO: 279)
- JW(125), TC(93) JW(0/0,01), TC(0/0,05) HLA B35 ND
- ASSPSTGSGTPRBTSPTHPL(SEC ID NO: 280)
- JW(95) NT - NT
- PRVTSPTHPLSQMNHPPLPD(SEC ID NO: 281)
- JW(52), TC(96) NT HLA B35 NT
- PLGRPDEDSSSSSSSSCSSA(SEC ID NO: 282)
- TC(46) NT - NT
- SDSESESEEMKCSSGGGASV(SEC ID NO: 283)
- TC(147) TC(0,01/0,22) - NT
- KCSSGGGASVTSSHHGRGGF(SEC ID NO: 284)
- TC(54) NT - NT
- IE-2
- CTPNVQTRRGRVKIDEVSRM(SEC ID NO: 285) TC(89) NT - NT
- FRNTNRSLEYKNLPFTIPSM(SEC ID NO: 286)
- TC(187) TC(0/0,25) - NT
- HQVLDEAIKACKTMQVNNKG(SEC ID NO: 287)
- TC(234) TC(0/0,18) - NT
- CKTMQVNNKGIQIIYTRNHE(SEC ID NO: 288)
- TC(154) TC(0/0,14) - NT
- KAAWSLKELHTHQLCPRSSD(SEC ID NO: 289)
- TC(162) TC(0/0,08) - NT
- CLPLMQKFPKQVMVRIFSTN(SEC ID NO: 290)
- TC(256) TC(0/0,15) CLPLMQKFP (SEC ID NO: 267) - NT
- pp150
- WPRERAWALKNPHLAYNPFR (SEC ID NO: 147) RE(83) RE(0,03/0,27) ERAWALKNPHLA (SEC ID NO: 146) - Y
- STSQKPVLGKRVATPHASAR(SEC ID NO: 148)
- MW(215) NT - - ND
- HANTALVNAVNKLVYTGRLI(SEC ID NO: 149)
- MW(122) NT - - ND
- pp65
- LNIPSINVHHYPSAAERKHR(SEC ID NO: 67) RE(285), TC(222) NT IPSINVHHY (SEC ID NO: 55) HLA B35 Y
- ATVQGQNLKYQEFFWDANDI (SEC ID NO: 68)
- CS(226), PP(202), SC(687) RE(0,03/0) QEFFWDANDIY (SEC ID NO: 56) HLA B44 Y
- MW(189), RE(25)
- QEFFWDANDIYRIFAELEGV (SEC ID NO: 69)
- CS(107) NT QEFFWDANDI (SEC ID NO: 57) HLA B44 Y
- RE(30), PP(295), SC(704)
- NT QEFFWDANDI (SEC ID NO: 57) HLA A1/A24 Y
- PQYSEHPTFTSQYRIQGKLE(SEC ID NO: 70)
- RK(1393), SE(980), MB(413) RK(1,69/0,96) FTSQYRIQGKL(SEC ID NO: 2) HLAA24 Y
- MB(0,05/0)
- YSEHPTFTSQY(SEC ID NO: 13) HLA A1 NT
- SE(0/0,87)
- SQYRIQGKLEYRHTWDRHDE(SEC ID NO: 71)
- SE(1203) SE(0/2,0) QYRIQGKLE (SEC ID NO: 58) - Y
- VFTWPPWQAGILARNLVPMV(SEC ID NO: 72)
- SE(533), MB(420) SE(0/0,45) ILARNLVPMV (SEC ID NO: 16) HLA A2 Y
- ILARNLVPMVATVQGQNLKY(SEC ID NO: 73)
- MB(500), SB(216), MW(229) NT NLVPMVATV (SEC ID NO: 5) HLA A2 Y
- DQYVKVYLESFCEDVPSGKL(SEC ID NO: 74)
- SE(265) SE(0/0,23) - - ND
- pp65
- YPSAAERKHRHLPVADAVIH(SEC ID NO: 75) SE(350) SE(0/0,313) RKHRHLPVADAV(SEC ID NO: 59) - Y
- QYDPVAALFFFDIDLLLQRG(SEQ ID NO: 76)
- SB(97) SB(0,22/0,03) DPVAALFFF (SEC ID NO: 60) HLA B35 Y
- IIKPGKISHIMLDVAFTSHE(SECID NO: 77)
- SC(691), PP(177),SB(155), JW(370) JW(0,04/0,05) PGKISHIMLDVA(SEC ID NO: 61) HLA B35 Y
- SB(0,02/0,03)
- AHELVCSMENTRATKMQVIG(SEC ID NO: 78)
- MM(169), SB(231) SB(0,04/0,01) TRATKMQVI (SEC ID NO: 62) HLA B57 ND
- TRATKMQVIGDQYVKVYLES(SEC ID NO: 79)
- MM(139), SB(346) SB(0,09/0,01) TRATKMQVI (SEC ID NO: 62) HLA B57 ND
- MNGQQIFLEVQAIRETVELR(SEC ID NO: 80)
- MM(277), JD(2985) JD(0,26/0,48) QAIRETVEL (SEC ID NO: 63) HLA B57 y B58 HLA B57 y B58 Y
- QAIRETVELRQYDPVAALFF(SEC ID NO: 81)
- MM(102), SB(241), JD(2593) JD(0,28/0,33) QAIRETVEL (SEC ID NO: 63) - Y
- LTVSGLAWTRQQNQWKEPDV (SEC ID NO: 82)
- SC(695) NT HLA B8 NT
- WQPAAQPKRRRHRQDALPGP(SEC ID NO: 83)
- SC(615) NT RRRHRQDAL (SEC ID NO: 42) - ND
- YRHTWDRHDEGAAQGDDDVW (SEC ID NO: 84)
- SC(295) NT YHRTWDRHEGA (SEC ID NO: 64) ND
- pp65
- TSAGRKRKSASSATACTSGV(SEC ID NO: 85) SC(138) NT - - NT
- HRQDALPGPCIASTPKKHRG(SEC ID NO: 86)
- SC(109) NT - - NT
- YYTSAFVFPTKDVALRHWC(SEC ID NO: 87)
- JD(358), SB(775), JW(858) JD(0,05/0,04) FPTKDVAL (SEC ID NO: 4) HLA B35 Y
- VTTERKTPRVTGGGAMAGAS(SEC ID NO: 88)
- JW(285), SC(322), JD(319) JW(0,17/0,24) - - ND
- QPFMRPHERNGFTVLCPKNM(SEC ID NO: 89)
- SE(783) JD(0,05/0) FMRPHERNGFTV(SEC ID NO: 65) - ND
- SICPSQEPMSIYVY ALPLKM (SEC ID NO: 90)
- SB(1044), JW(3178) SB(76) JW(1,18/1,36) CPSQEPMSIYVY(SEC ID NO: 66) HLA B35 Y
- IYVYALPLKMLNIPSINVHH (SEC ID NO: 91)
- NT - - NT
- QQNQWKEPDVYYTSAFVFPT(SEC ID NO: 92)
- JW(600) JW(0/0,03) - - Y
- GAAQGDDDVWTSGSDSDEEL (SEC ID NO: 93)
- JW(248) JW(0/0,01) - - ND
- TGGGAMAGASTSAGRKRKSA(SEC ID NO: 94)
- JW(441) JW(0,01/0,01) - - ND
- pp65
- KDVALRHWCAHELVCSMEN (SEC ID NO: 95) TC(50) NT - - NT
- * La respuesta de CTL para cada uno de los péptidos se detectó usando el protocol descrito en la sección “Material y métodos”. Y: Sí; NT: No evaluado; ND: No detectado
LISTADO DE SECUENCIAS
<110> The Council of the Queensland Institute of Medical Research
<120> Nuevos epítopos de linfocitos T citotóxicos del citomegalovirus humano (HCMV), poliepítopos, composiciones que los comprenden, y usos de diagnóstico y terapéuticos para ellos
<130> 500553 HCMV CTL epitope pct
<150> AU PR5931
<151> 2001-06-26
<160> 318
<170> PatentIn version 3.1
<210> 1
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 1
<210> 2
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 2
<210> 3
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 3
<210> 4
<211> 8
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 4
<210> 5
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 5
<210> 6
<211> 9
<212> PRT
<213> -péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 6
<210> 7
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 7
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<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 8
<210> 9
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 9
<210> 10
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 10
<210> 11
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 11
<210> 12
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 12
<210> 13
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 13
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<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 14
<210> 15
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 15
<210> 16
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 16
<210> 17
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 17
<210> 18
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 18
<210> 19
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 19
<210> 20
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 20
<210> 21
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 21
<210> 22
<211> 10 <212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 22
<210> 23
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 23
<210> 24
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 24
<210> 25
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 25
<210> 26
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 26
<210> 27
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 27
<210> 28
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 28
<210> 29
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 29
<210> 30
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 30
<210> 31
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 31
<210> 32
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 32
<210> 33
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 33
<210> 34
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 34
<210> 35
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 35
<210> 36
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 36
<210> 37
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 37
<210> 38
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 38
<210> 39 <211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 39
<210> 40
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 40
<210> 41
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 41
<210> 42
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 42
<210> 43
<211> 9
<212> PRT.
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 43
<210> 44
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 44 <210> 45
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 45
<210> 46
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 46
<210> 47
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 47
<210> 48
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 48
<210> 49
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 49
<210> 50
<211> 9 <212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 50
<210> 51
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 51
<210> 52
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 52
<210> 53
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 53
<210> 54
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 54
<210> 55
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 55 <210> 56
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 56
<210> 57
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 57
<210> 58
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 58
<210> 59
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 59
<210> 60
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 60
<210> 61
<211> 12 <212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 61
<210> 62
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 62
<210> 63
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 63
<210> 64
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 64
<210> 65
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 65
<210> 66
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 66
<210> 67
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 67
<210> 68
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 68
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 69
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 70
<210> 71 <211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 71
<210> 72
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano 10 <400> 72
<210> 73
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 73
<210> 74
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 74
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 75
<210> 76
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 76
10 <210> 77
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 77
<210> 78
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano 20 <400> 78
<210> 79
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 79 <210> 80
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 80
<210> 81
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 81
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 82
20 Glu Pro Asp Val 20
<210> 83
<211> 20
<212> PRT
- <213>
- péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano 25 <400> 83
<210> 84
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 84
<210> 85
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 85
<210> 86
<211> 20
<212> PRT
- <213>
- péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano 20 <400> 86
<210> 87
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 87 <210> 88
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 88
<210> 89
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 89
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 90
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 91 <210> 92
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 92
<210> 93
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 93
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 94
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp65 de citomegalovirus humano
<400> 95 <210> 96
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 96
<210> 97
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 97
<210> 98
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 98
<210> 99
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 99
<210> 100
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 100
<210> 101
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 101
<210> 102
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 102
<210> 103
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 103
<210> 104
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 104
<210> 105
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 105
<210> 106
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 106
<210> 107
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 107
<210> 108
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 108
<210> 109
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 109
<210> 110
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 110
<210> 111
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 111
<210> 112
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 112
<210> 113
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 113
<210> 114
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 114
<210> 115
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 115
<210> 116
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 116
<210> 117
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 117
<210> 118
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 118
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 119
<210> 120
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 120
<210> 121
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE1 de citomegalovirus humano
<400> 121 -<210> 122
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 122
<210> 123
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 123
<210> 124
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 124
<210> 125
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 125
<210> 126
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 126
<210> 127
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 127
<210> 128
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 128
<210> 129
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 129
<210> 130
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 130
<210> 131
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 131
<210> 132
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 132
<210> 133
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 133
<210> 134
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 134
<210> 135
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 135
<210> 136
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 136
<210> 137
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 137
<210> 138
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 138
<210> 139
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 139
<210> 140
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 140
<210> 141
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 141
<210> 142
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 142
<210> 143
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 143
<210> 144
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 144
<210> 145
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 145
<210> 146
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 146
<210> 147
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 147
<210> 148
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 148 <210> 149
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp150 de citomegalovirus humano
<400> 149
<210> 150
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 150
<210> 151
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 151
<210> 152
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 152
<210> 153
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 153
<210> 154
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 154
<210> 155
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 155
<210> 156
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 156
<210> 157
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 157
<210> 158
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 158
<210> 159
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 159
<210> 160
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 160
<210> 161
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 161
<210> 162
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp28 de citomegalovirus humano
<400> 162
<210> 163
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 163
<210> 164
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 164
<210> 165
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 165
<210> 166
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 166
<210> 167
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 167
<210> 168
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 168
<210> 169
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 169
<210> 170 <211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 170
<210> 171
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 171
<210> 172
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 172
<210> 173
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp50 de citomegalovirus humano
<400> 173
<210> 174
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 174
<210> 175
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 175 <210> 176
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 176
<210> 177
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 177
<210> 178
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 178
<210> 179
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 179
<210> 180
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de pp71 de citomegalovirus humano
<400> 180
<210> 181
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 181
<210> 182
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 182
<210> 183
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 183
<210> 184
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 184
<210> 185
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 185
<210> 186
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 186
<210> 187
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 187
<210> 188
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 188
<210> 189
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 189
<210> 190
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 190
<210> 191
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 191
<210> 192
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 192
<210> 193
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 193
<210> 194
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 194
<210> 195
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gB de citomegalovirus humano
<400> 195
<210> 196
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 196
<210> 197
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 197
<210> 198
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 198
<210> 199
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 199
<210> 200
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 200
<210> 201
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 201
<210> 202
<211> 9 <212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 202
<210> 203
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 203
<210> 204
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 204
<210> 205
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 205
<210> 206
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 206
<210> 207
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 207 <210> 208
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 208
<210> 209
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 209
<210> 210
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 210
<210> 211
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 211
<210> 212
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 212
<210> 213
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 213
<210> 214
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 214
<210> 215
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 215
<210> 216
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 216
<210> 217
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 217
<210> 218
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 218
<210> 219
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 219
<210> 220
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 220
<210> 221
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 221
<210> 222
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 222
<210> 223
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 223
<210> 224 <211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 224
<210> 225
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 225
<210> 226
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 226
<210> 227
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 227
<210> 228
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 228
<210> 229
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 229
<210> 230
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 230
<210> 231
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 231
<210> 232
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 232
<210> 233
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 233
<210> 234
<211> 9.
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 234
<210> 235 <211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 235
<210> 236
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 236
<210> 237
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 237
<210> 238
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 238
<210> 239
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 239
<210> 240
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 240 <210> 241
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 241
<210> 242
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 242
<210> 243
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 243
<210> 244
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 244
<210> 245
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 245
<210> 246 <211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 246
<210> 247
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 247
<210> 248
<211> 12
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 248
<210> 249
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 249
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de gH de citomegalovirus humano
<400> 250
<210> 251
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 251
<210> 252
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 252
<210> 253
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 253
<210> 254
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 254
<210> 255
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 255
<210> 256
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 256
<210> 257
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 257
<210> 258
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 258
<210> 259
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 259
<210> 260
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 260
<210> 261
<211> 8
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 261
<210> 262
<211> 10 <212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 262
<210> 263
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 263
<210> 264
<211> 11
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 264
<210> 265
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 265
<210> 266
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 266
<210> 267
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 267 <210> 268
<211> 14
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 268
<210> 269
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 269
Thr Pro Pro Glu 15 <210> 270
<211> 20
<212> PRT
- <213>
- péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano 20 <400> 270
<210> 271
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 271
<210> 272
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 272
<210> 273
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 273
<210> 274
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 274
<210> 275
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 275
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 276
<210> 277
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 277
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 278
<210> 279
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 279
<210> 280
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 280
<210> 281
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 281
<210> 282
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 282
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 283
<210> 284
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 284
<210> 285
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 285
<210> 286
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 286
<210> 287
<211> 20
<212> PRT
- <213>
- péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano 20 <400> 287
<210> 288
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 288 <210> 289
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 289
<210> 290
<211> 20
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de IE2 de citomegalovirus humano
<400> 290
<210> 291
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de UL18 de citomegalovirus humano
<400> 291
<210> 292
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de UL18 de citomegalovirus humano.
<400> 292
<210> 293 <211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de UL18 de citomegalovirus humano
<400> 293
<210> 294
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US2 de citomegalovirus humano
<400> 294
<210> 295
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US2 de citomegalovirus humano
<400> 295
<210> 296
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US2 de citomegalovirus humano
<400> 296
<210> 297
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US2 de citomegalovirus humano
<400> 297
<210> 298
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US3 de citomegalovirus humano
<400> 298 <210> 299
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US3 de citomegalovirus humano
<400> 299
<210> 300
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US3 de citomegalovirus humano
<400> 300
<210> 301
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US3 de citomegalovirus humano
<400> 301
<210> 302
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US11 de citomegalovirus humano
<400> 302
<210> 303
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US6 de citomegalovirus humano
<400> 303
<210> 304
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US11 de citomegalovirus humano
<400> 304
<210> 305
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US11 de citomegalovirus humano
<400> 305
<210> 306
<211> 10
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US11 de citomegalovirus humano
<400> 306
<210> 307
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de US11 de citomegalovirus humano
<400> 307
<210> 308
<211> 9
<212> PRT
<213> péptido de epítopo de CTL de UL18 de citomegalovirus humano
<400> 308
<210> 309
<211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 309 <210> 310
<211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 310
<210> 311
<211> 250 <212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 311
<210> 312
<211> 241 <212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 312
<210> 313 <211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 313
<210> 314 <211> 241
<212> PRT
<213> Péptido de poliepítopo sintético
<400> 314
<210> 315 <211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 315
<210> 316
<211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 316
<210> 317
<211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 317
<210> 318
<211> 241
<212> PRT
<213> péptido de poliepítopo sintético
<400> 318
Claims (26)
- REIVINDICACIONES
- 1.
- Un péptido aislado que comprende un epítopo de linfocitos T citotóxicos (CTL) de un antígeno pp50 de un citomegalovirus de seres humanos (HCMV), en el que dicho péptido tiene una secuencia de aminoácidos que consiste en 9 a 20 aminoácidos contiguos de dicho antígeno pp50, y en el que el epítopo de CTL consiste en la secuencia expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY), o un lipopéptido que comprende dicho péptido.
-
- 2.
- El péptido o lipopéptido aislado de la reivindicación 1, en el que dicho péptido o lipopéptido se une a una célula de MHC Clase I que expresa CD8+.
-
- 3.
- El péptido o lipopéptido aislado según la reivindicación 1, en el que el péptido o lipopéptido se une a una célula de MHC Clase I que expresa HLA A1.
-
- 4.
- El péptido o lipopéptido aislado según la reivindicación 3, en el que el péptido o lipopéptido se une a una célula CD8+ que expresa HLA A1.
-
- 5.
- El péptido o lipopéptido aislado según la reivindicación 4, en el que dicho péptido consiste en la secuencia de aminoácidos expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY).
-
- 6.
- Un péptido de poliepítopo aislado que comprende dos o más epítopos de linfocitos T citotóxicos (CTL), en el que uno de dichos epítopos de CTL consiste en una secuencia expuesta en SEC ID NO: 165 (VTEHDTLLY), y uno o más de dichos epítopos de CTL consiste en una secuencia seleccionada del grupo que consiste en:
SEC ID NO: 46 (YSEHPTFTSQY); SEC ID NO: 5 (NLVPMVATV); SEC ID NO: 101 (VLEETSVML); SEC ID NO: 7 (RIFAELEGV); SEC ID NO: 254 (IIYTRNHEV); SEC ID NO: 135 (IMREFNSYK); SEC ID NO: 21 (TTVYPPSSTAK); SEC ID NO: 1 (SVLGPISGHVLK); SEC ID NO: 116 (AYAQKIFKIL); SEC ID NO: 33 (QYDPVAALF); SEC ID NO: 2 (FTSOYRIQGKL); SEC ID NO: 37 (YVKYVYESF); SEC ID NO: 15 (DIYRIFAEL); SEC ID NO: 3 (FVFPTKDVALR); SEC ID NO: 134 (NVRRSWEEL); SEC ID NO: 132 (KARDHLAVL); SEC ID NO: 41 (QARLTVSGL); SEC ID NO: 8 (TPRVTGGGAM); SEC ID NO: 109 (KARAKKDEL); SEC ID NO: 113 (QIKVRVDMV); SEC ID NO: 112 (ELRRKMMYM); SEC ID NO: 42 (RRRHRQDAL); SEC ID NO: 162 (ARVYEIKCR); SEC ID NO: 66 (CPSQEPMSIYVY); SEC ID NO: 4 (FPTKDVAL);SEC ID NO: 55 (IPSINVHHY);SEC ID NO: 260 (FEQPTETPP);SEC ID NO: 189 (YAYIYTTYL);SEC ID NO: 56 (QEFFWDANDIY);SEC ID NO: 170 (YEQHKITSY);SEC ID NO: 51 (QEPMSIYVY);SEC ID NO: 47 (SEHPTFTSQY); ySEC ID NO: 63 (QAIRETVEL). -
- 7.
- El péptido de poliepítopo aislado según la reivindicación 6, en el que dicho péptido de poliepítopo se une a células que expresan un alelo de MHC Clase I seleccionado del grupo que consiste en: HLA A1, HLA A2, HLA A3, HLA A11, HLA A23, HLA A24, HLA A26, HLA A29, HLA A30, HLA A68, HLA B7, HLA B8, HLA B27, HLA B35, HLA B41, HLA B44, HLA B57, y HLA B58.
-
- 8.
- El péptido de poliepítopo aislado según la reivindicación 6, en el que un epítopo de dicho péptido de poliepítopo tiene especificidad por el supertipo de HLA.
-
- 9.
- El péptido de poliepítopo aislado según la reivindicación 6, que tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en: SEC ID NO: 309; SEC ID NO: 310; SEC ID NO: 311; SEC ID NO: 312; SEC ID NO: 313; SEC ID NO: 314; SEC ID NO: 315; SEC ID NO: 316; SEC ID NO: 317; y SEC ID NO: 318.
-
- 10.
- Una composición de vacuna profiláctica o terapéutica para provocar una respuesta inmunitaria celular en un sujeto humano frente a HCMV, comprendiendo dicha composición una cantidad eficaz del péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o del péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, en combinación con un vehículo, excipiente, diluyente o adyuvante farmacéuticamente aceptable.
-
- 11.
- La composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10, en la que el adyuvante comprende un adyuvante saponificado que comprende una saponina o una fracción de saponina.
-
- 12.
- Uso del péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o del péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o de la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10 u 11, en la preparación de un medicamento para potenciar la inmunidad mediada por células específicas de HCMV de un sujeto humano, o para proporcionar memoria inmunológica en un sujeto no infectado contra una futura infección por HCMV.
-
- 13.
- El uso según la reivindicación 12, en el que el sujeto se selecciona del grupo que consiste en: (i) un sujeto que posee una infección por HCMV latente; (ii) un sujeto que posee una infección por HCMV activa; (iii) un sujeto que está inmunosuprimido; (iv) un sujeto que está inmunocomprometido; (v) un receptor de transplante; y (vi) un sujeto en riesgo de sufrir una complicación que surge de infección por HCMV.
-
- 14.
- El uso según la reivindicación 13, en el que el sujeto es una mujer que tiene capacidad reproductora, o una mujer embarazada, o un receptor de transplante de médula ósea.
-
- 15.
- El uso según una cualquiera de las reivindicaciones 12 a 14, en el que la composición comprende una cantidad del péptido o lipopéptido suficiente para activar un CTL o un precursor de CTL en un sujeto.
-
- 16.
- El uso según una cualquiera de las reivindicaciones 12 a 14, en el que la composición comprende una cantidad del péptido o lipopéptido suficiente para provocar o potenciar la expansión de linfocitos T CD8+, o potenciar la inmunidad mediada por células (CMI) específicas de HCMV en un sujeto.
-
- 17.
- El uso según una cualquiera de las reivindicaciones 12 a 16, en el que la composición es inyectable.
-
- 18.
- Un método para preparar un linfocito T reactivo a HCMV, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido previamente de un sujeto humano con una cantidad eficaz del péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o del péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o de la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10 u 11, suficiente para conferir reactividad con HCMV a dichos linfocitos T.
-
- 19.
- Un método para determinar si un sujeto ha sido previamente infectado o no con HCMV, o el nivel de inmunidad mediada por células específicas de HCMV en un sujeto, comprendiendo dicho método poner en contacto ex vivo un linfocito T obtenido previamente del sujeto con una célula presentadora de antígeno (APC) sensibilizada con el péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o con el péptido de poliepítopo
aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o con la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 10 u 11, y determinar la activación de un CTL o un CTL precursor, en el que dicha activación de un CTL o un CTL precursor indica que el sujeto ha sido infectado previamente con HCMV, y en el que el nivel de activación de un CTL o un CTL precursor está correlacionado con el nivel de inmunidad mediada por células específicas de HCMV del sujeto. -
- 20.
- El método de la reivindicación 19, en el que la activación de un CTL o un CTL precursor se realiza mediante un procedimiento que comprende un ensayo seleccionado del grupo que consiste en: ensayo de tetrámeros de MHC clase 1, ensayo de citotoxicidad, ensayo para determinar la producción de IFN-, ensayo de citocinas, ensayo de liberación de cromo, y ELISPOT.
-
- 21.
- El método según la reivindicación 20, en el que el linfocito T está contenido en una muestra biológica obtenida previamente de un sujeto humano.
-
- 22.
- El método según la reivindicación 21, en el que la muestra biológica obtenida previamente de un sujeto es médula ósea, timo, o una muestra que comprende sangre, células mononucleares de sangre periférica (PBMC) o una capa leuco-plaquetaria.
-
- 23.
- Un método para producir un CTL específico de HCMV, que comprende: (i) poner en contacto un linfocito T ex vivo con el péptido o lipopéptido aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 5, o con el péptido de poliepítopo aislado según una cualquiera de las reivindicaciones 6 a 9, o con la composición de vacuna profiláctica o terapéutica según la reivindicación 11 ó 12, o una célula presentadora de antígeno (APC), o una estirpe celular linfoblastoide autóloga (LCL) sensibilizada con dicho péptido o lipopéptido o dicha vacuna; (ii) cultivar el linfocito T; y
(iii) seleccionar linfocitos T que proliferan. -
- 24.
- El método de la reivindicación 23, en el que la puesta en contacto en (i) es en presencia de una citocina.
-
- 25.
- El método de la reivindicación 24, en el que la citocina es IL-2.
-
- 26.
- El método según una cualquiera de las reivindicaciones 23 a 25, que comprende estimular ex vivo células mononucleares de sangre periférica (PBMCs) procedentes de un donante sano seropositivo a HCMV con una estirpe celular linfoblastoide autóloga (LCL) que se ha sensibilizado con el péptido o lipopéptido.
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