ES2566496T3 - Bifidobacterium longum - Google Patents

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ES2566496T3
ES2566496T3 ES09753220.4T ES09753220T ES2566496T3 ES 2566496 T3 ES2566496 T3 ES 2566496T3 ES 09753220 T ES09753220 T ES 09753220T ES 2566496 T3 ES2566496 T3 ES 2566496T3
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Douwe Van Sinderen
Jun Xu
Wenzhu Steven Zhao
Raymond A. Grant
Yuli Song
Charles Bascom
Duane Larry Charbonneau
Liam O'mahony
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Procter and Gamble Co
Original Assignee
Alimentary Health Ltd
Procter and Gamble Co
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Abstract

Una cepa aislada de Bifidobacterium longum BL1207 (PTA-9608).

Description

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Como se usa en la presente memoria, se puede interpretar que la expresión “expresa un exopolisacárido”, significa que una cepa bacteriana contiene una secuencia de ADN que codifica un exopolisacárido, por ejemplo, una secuencia de ADN que codifica al menos un gen de la SEC ID N.° 2 y/o al menos un gen de la SEC ID N.°3
5 o un fragmento funcional o variante de las mismas.
Como se usa en la presente memoria, la expresión “homología de secuencia” abarca la homología de secuencia en un ácido nucleico y/o un aminoácido (proteína). La homología de secuencia se indica como el porcentaje global de identidad para la totalidad de la secuencia del ácido nucleico y/o el aminoácido. La homología de secuencia se puede determinar 10 utilizando técnicas convencionales conocidas por los expertos en la técnica. Por ejemplo, la homología de secuencia se puede determinar empleando el programa “BLAST” de algoritmo de homología en línea públicamente disponible en http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/. Una secuencia puede tener una homología de secuencia de al menos 86% o al menos 87% o al menos 88% o al menos 89% o al menos 90% o al menos 91% o al menos 92% o al menos 93% o al menos 94% o al menos 95% o al menos 96% o al menos 97% o al menos 98% o al menos 99% con las secuencias de
15 ácido nucleico descritas en la presente memoria los aminoácidos (proteína) codificados por las mismas.
La presente invención está basada en la secuencia del genoma completo de Bifidobacterium longum biotipo infantis UCC 35624. La secuencia del genoma se relaciona en la SEC ID N.°1 del listado de secuencias adjunto, y comprende 2.264.374 pares de bases. El análisis de la secuencia del genoma identificó 1.836 genes que tienen
20 los marcos de lectura abiertos definidos en la Tabla 1 siguiente.
Tabla 1 – Marcos de lectura abiertos del genoma de UCC 35624.
ID Gen
Inicio Fin Hebra Descripción
BI00001
1667321 1667608 - proteína Cas2 asociada a CRISPR
BI00002
1667697 1668593 - proteína Cas1 asociada a CRISPR
BI00002a
1668725 1669423 - proteína Cas4 asociada a CRISPR
BI00003
1669465 1670313 - proteína asociada a CRISPR, familia TM1801
BI00005
1670320 1672275 - proteína asociada a CRISPR, familia CT1133
BI00006
1672281 1672982 - proteína asociada a CRISPR, familia CT1134
BI00007
1672992 1675427 - helicasa Cas3 asociada a CRISPR
BI00008
1676109 1676426 - COG3464: Transposasa y derivados inactivados
BI00009
1677053 1680283 - isoleucil-ARNt sintetasa
BI00010
1680955 1682163 + aminotransferasa, clase I, posible
BI00011
1682280 1683785 - simport de galactósido
BI00012
1684111 1687299 + beta-galactosidasa, posible
BI00013
1687365 1688372 - regulador transcripcional de unión a azúcar, familia LacI, posible
BI00014
1688522 1689889 - posible proteína de resistencia a antibiótico (proteína de membrana)
BI00015
1690007 1690906 - carbohidrato quinasa teórica de la familia pfkB
BI00016
1690909 1692111 - alcohol deshidrogenasa, contiene hierro
BI00017
1692111 1692794 - hidrolasa de tipo halohácido deshalogenasa teórica
BI00018
1692921 1693901 - nucleósido hidrolasa que prefiere inosina-uridina
BI00019
1693960 1694913 - carbohidrato quinasa teórica de la familia pfkB
BI00020
1694909 1695553 - N-(5'fosforribosil)antranilato isomerasa teórica
BI00021
1695603 1696415 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00022
1696415 1697242 - proteína teórica conservada
BI00023
1697246 1698055 - proteína transportadora de cobalto teórica
BI00024
1698062 1698712 - proteína teórica conservada
BI00025
1698969 1700846 + regulador transcripcional, familia LacI/carbohidrato quinasa, proteína de la familia PfkB
BI00026
1700977 1702989 - transportador ABC, proteína de unión a ATP/permeasa
BI00027
1702989 1704944 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00028
1704944 1705402 - regulador transcripcional, familia MarR, posible
BI00029
1705699 1706610 - COG1472: Glicosidasas relacionadas con betaglucosidasa
BI00030
1706029 1706937 + COG1309: Regulador transcripcional
BI00031
1707015 1708373 - producto de proteína sin nombre
BI00032
1708509 1710902 - xilosidasa/arabinosidasa [importada]
BI00033
1710937 1711287 - proteína teórica
BI00034
1711383 1712762 - glutamato-cisteína ligasa, posible
BI00035
1712905 1718037 + proteína de dominio conservado
BI00036
1718044 1718883 + proteína teórica
BI00037
1719052 1724187 - familia BadF/BadG/BcrA/BcrD de la familia de la ATPasa
BI00038
1724418 1725143 - proteína activadora de la ribonucleósido-trifosfato reductasa anaerobia
BI00039
1725294 1727699 - ribonucleósido-trifosfato reductasa anaerobia
BI00040
1728167 1729534 + exodesoxirribonucleasa VII, subunidad grande
BI00041
1729587 1729886 + exodesoxirribonucleasa VII, subunidad pequeña
BI00042
1730013 1730534 + NADP(H) oxidorreductasa CC0205 [importada]
BI00043
1730676 1732529 - ácido-graso-de-cadena-larga-CoA ligasa, posible
BI00044
1732662 1732787 - COG1970: Canal mecanosensible de conductancia alta
BI00045
1732765 1733166 - canal mecanosensible de conductancia alta teórico, MscL
BI00046
1733337 1733762 - PROTEÍNA DESCONOCIDA, posible
BI00047
1733887 1734102 - COG0454: Histona acetiltransferasa HPA2 y acetiltransferasas relacionadas
BI00048
1734587 1735696 + proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI00049
1735718 1736683 - exopolifosfatasa, posible
BI00050
1736864 1737967 - aminotransferasa, clase I,
BI00051
1738178 1739230 + oxidorreductasa, familia Gfo/Idh/MocA, posible
BI00052
1739267 1739779 - proteína reparadora de parche [importada]
BI00053
1739931 1740377 + acetiltransferasa, familia GNAT
BI00054
1740356 1740841 - proteína teórica conservada
BI00055
1741026 1745207 - helicasa, familia Snf2
BI00056
1745285 1746367 + proteína teórica conservada
BI00057
1746358 1746504 - proteína teórica
BI00058
1746604 1747620 + tetrahidrodipicolinato N-succiniltransferasa (dapD)
BI00059
1747840 1749129 - citrato sintasa I
BI00060
1749406 1750242 - metionina aminopeptidasa, tipo I
BI00061
1750378 1751355 - proteína de membrana, posible
BI00062
1751532 1753703 + pertenece a la familia de la peptidasa M13
BI00063
1753792 1754526 - subfamilia de la proteína de unión al ADN monocatenario (ssb)
BI00064
1754805 1756616 - prolil-ARNt sintasa
BI00065
1757008 1757361 + proteína teórica
BI00066
1757392 1758561 - pflA
BI00067
1758551 1760338 - Proteína de una familia de función desconocida
BI00068
1760391 1761806 - proteína de dominio TPR
BI00069
1761858 1762505 - oligorribonucleasa
BI00070
1762676 1764259 - inosina-5'-monofosfato deshidrogenasa
BI00071
1764282 1765562 - undecaprenil-fosfato alfa-Nacetilglucosaminiltransferasa
BI00072
1765562 1766233 - proteína de la familia Sua5/YciO/YrdC/YwlC
BI00073
1766408 1767082 + maltosa O-acetiltransferasa
BI00074
1767220 1767921 - transportador ABC de aminoácido ramificado, proteína de unión al ATP
BI00075
1767924 1768781 - transportador ABC de aminoácido ramificado, proteína de unión al ATP
BI00076
1768781 1769854 - transportador ABC de aminoácido ramificado, proteína permeasa
BI00077
1769874 1770797 - transportador ABC de aminoácido ramificado, proteína permeasa
BI00078
1771042 1772226 - transportador ABC de aminoácido ramificado, proteína de unión al aminoácido, posible
BI00079
1772502 1773407 - N-metilasa PapM
BI00080
1773473 1774492 - factor 1 de liberación de cadena peptídica
BI00003g
1774715 1774924 - proteína ribosómica L31
BI00081
1775256 1776482 - familia VC2007 del regulador de la transcripción ROK [importada], posible
BI00082
1776702 1778219 + xiluloquinasa
BI00083
1778416 1778760 + lipoproteína, posible
BI00084
1778773 1779114 + proteína teórica
BI00085
1779393 1779737 - posible permeasa de azúcar
BI00086
1779656 1780930 - transposasa, familia Mutator
BI00087
1781199 1782545 - xilosa isomerasa
BI00088
1782842 1783072 + transportador de resistencia a fármaco, subfamilia EmrB/QacA
BI00089
1783095 1783409 + transportador de resistencia a fármaco, subfamilia EmrB/QacA
BI00090
1783425 1784222 - proteína teórica conservada
BI00091
1785149 1785661 - polipéptido deformilasa
BI00092
1785576 1786421 - superfamilia oxidoreductasa, familia aldo/ceto reductasa
BI00093
1786497 1786673 - COG0477: Permeasas de la superfamilia del facilitador mayor
BI00094
1786761 1787264 - COG0477 teórica: Permeasas de la superfamilia del facilitador mayor
BI00095
1787291 1787791 - posible regulador transcripcional de tipo MarR
BI00011g
1787998 1788333 - proteína Blon021361 teórica
BI00096
1788358 1789572 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa
BI00097
1789575 1791125 - transportador ABC de azúcar, proteína de unión a ATP
BI00098
1791229 1792383 - transportador ABC de azúcar, proteína de unión a azúcar periplásmico
BI00099
1792462 1792608 - proteína teórica
BI00100
1792854 1793801 + familia de una proteína represora probable en (NagC/XylR)
BI00101
1793842 1794705 + transportador ABC de azúcar, proteína de unión a ATP, posible
BI00102
1794736 1795683 - glucoquinasa, posible
BI00103
1796537 1798192 + proteína de unión a ATP del transportador ABC
BI00104
1798507 1799409 + acil-CoA tioesterasa II
BI00105
1799511 1800035 - proteína de membrana teórica con función desconocida
BI00106
1800213 1801622 - dihidroneopterina aldolasa
BI00107
1801736 1802608 - dihidropteroato sintasa
BI00108
1802699 1803295 - GTP ciclohidrolasa I
BI00109
1803391 1805478 - proteína de división celular FtsH
BI00110
1805478 1806038 - hipoxantina fosforribosiltransferasa
BI00111
1806028 1807191 - COG0037: implicación prevista de la ATPasa de la superfamilia del bucle PP
BI00112
1807285 1808772 - D-alanil-D-alanina carboxipeptidasa/D-alanil-D-alaninaendopeptidasa
BI00113
1808798 1810468 - proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI00114
1810468 1811421 - proteína de unión a ATP del sistema transportador ABC
BI00115
1811519 1812739 - proteína de dominio glicosil transferasa, posible
BI00116
1812742 1814496 - proteína de integridad de membrana teórica en upfo118
BI00117
1814587 1815252 + glicosiltransferasa probable
BI00118
1815481 1816629 - alcohol deshidrogenasa, contiene hierro
BI00119
1817069 1818370 + ciclopropano-acilo-graso-fosfolípido sintasa
BI00120
1818383 1819687 + COG0477 teórica: Permeasas de la superfamilia del facilitador mayor
BI00121
1820205 1821215 - UDP-glucosa 4-epimerasa
BI00122
1821585 1822400 + metiltransferasa, posible
BI00123
1822698 1823195 - proteína teórica
BI00124
1823244 1823708 - Orf2
BI00125
1823795 1824079 + hélice-giro-hélice teórica
BI00126
1824492 1824788 - proteína teórica
BI00127
1825086 1826453 - gp22
BI00128
1827148 1827699 - proteína teórica
BI00170t
1827699 1828901 - familia de la integrasa de fago, teórica
BI00129
1829429 1830229 + proteína azlC, posible
BI00130
1830229 1830558 + aminoácido de cadena ramificada permeasa
BI00131
1830743 1831258 - proteína fosfotirosina fosfatasa, posible
BI00132
1831385 1832044 - dihidrofolato reductasa
BI00133
1832157 1832936 - timidilato sintasa
BI00134
1833154 1833564 + proteína teórica conservada
BI00135
1833629 1834663 - demannu, posible
BI00136
1834835 1835572 - proteína extracelular P60, proteína Iap asociada a la invasión
BI00137
1835733 1836476 - proteína de dominio de la familia NLP/P60
BI00138
1836692 1837645 - proteína de dominio de N-acetilmuramoil-L-alanina amidasa
BI00139
1838255 1839178 + fosfoserina aminotransferasa, posible
BI00140
1839305 1839562 + proteína teórica conservada
BI00141
1839693 1840874 - quinasa sensible a histidina, posible
BI00142
1841128 1841745 + proteína PhoU reguladora del sistema de transporte del fosfato, posible
BI00143
1842110 1842847 - fosfoglicerato mutasa
BI00144
1842910 1843872 - 1,4-dihidroxi-2-naftoato octapreniltransferasa
BI00145
1843937 1845412 - lisil-ARNt sintetasa
BI00146
1846534 1847304 + proteína de tipo AraJ probablemente implicada en el transporte de polímeros de arabinosa
BI00147
1847394 1849754 + proteína de dominio del dominio TPR
BI00148
1849833 1850462 + proteína teórica conservada
BI00149
1850618 1852216 - proteína de membrana teórica posiblemente implicada en el transporte
BI00150
1852325 1853029 - proteína teórica conservada
BI00151
1853062 1854903 - proteína teórica conservada
BI00152
1854930 1856174 + posible sensor histidina quinasa de sistema bicomponente
BI00153
1856174 1856866 + familia NMB1250 del regulador de la transcripción LuxR [importada]
BI00154
1856920 1857939 - UDP-glucosa 4-epimerasa
BI00155
1858012 1859556 - galactosa-1-fosfato uridililtransferasa
BI00156
1859606 1860682 - posible desulfatasa, posiblemente para la mucina
BI00157
1860713 1862965 - proteína teórica conservada
BI00158
1863426 1864382 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa
BI00159
1864382 1865278 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa, posible
BI00160
1865546 1866859 - proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC para azúcares
BI00161
1867217 1867369 - proteína teórica
BI00162
1867867 1868856 - seril-ARNt sintetasa
BI00163
1869384 1870562 + proteína del dominio catalítico de la diacilglicerol quinasa (supuesta)
BI00164
1870573 1871409 - antiterminador de la transcripción, familia BglG, posible
BI00165
1871430 1873829 - componente del sistema PTS, posible
BI00166
1874293 1875843 + transportador CC0814 de la familia del facilitador mayor [importado], posible
BI00167
1875934 1877607 + fosfoglucomutasa, específica de alfa-D-glucosa fosfato
BI00222t
1878343 1879437 - proteína teórica conservada
BI00168
1879668 1880087 + proteína teórica conservada
BI00169
1880224 1881837 + oxidoreductasa, disulfuro del nucleótido piridina, clase I
BI00170
1882002 1882151 - proteína teórica
BI00171
1882305 1883360 + ARNasa H
BI00172
1883494 1884189 + ribosa 5-fosfato isomerasa
BI00173
1884629 1885258 - proteína teórica conservada
BI00174
1885386 1886921 + proteína RadA de reparación del ADN
BI00175
1886942 1888063 - proteína RibF de biosíntesis de riboflavina
BI00176
1888164 1889324 - ARNt pseudouridina sintasa B
BI00177
1889329 1889799 - factor A de unión a ribosoma
BI00178
1889953 1892799 - factor de inicio de la traducción IF-2
BI00179
1893150 1894214 - proteína NusA de la terminación/antiterminación de la transcripción
BI00180
1894422 1895147 + lipoproteína, posible
BI00181
1895194 1896234 - regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI00182
1896528 1896629 - proteína teórica
BI00183
1896770 1897798 - teórica
BI00184
1897936 1898568 - alfa-L-arabinosidasa
BI00185
1899147 1899917 - Proteína de dominio de la superfamilia análoga a transglutaminasa
BI00186
1900154 1902331 - Dominio de una familia de función desconocida (DUF404)
BI00187
1902473 1902586 - proteína teórica
BI00188
1902727 1903515 + ARNt pseudouridina sintasa A
BI00189
1903603 1904142 - proteína ribosómica L17
BI00190
1904245 1905237 - ARN polimerasas L / subunidad de 13 a 16 kDa
BI00191
1905321 1905716 - proteína ribosómica S11
BI00192
1905807 1906181 - proteína ribosómica S13p/S18e
BI00193
1906333 1906443 - proteína ribosómica L36
BI00194
1906470 1906685 - factor de inicio de la traducción IF-1
BI00195
1906865 1907422 - adenilato quinasa
BI00196
1907595 1908722 - preproteína translocasa, subunidad SecY
BI00197
1909207 1909656 - proteína ribosómica L15
BI00198
1909662 1909844 - proteína ribosómica L30
BI00199
1909853 1910581 - proteína ribosómica S5
BI00200
1910581 1910991 - proteína ribosómica L18
BI00201
1910954 1911490 - proteína ribosómica L6
BI00202
1911511 1911906 - proteína ribosómica S8
BI00203
1911999 1912181 - proteína ribosómica S14p/S29e
BI00204
1912186 1912755 - proteína ribosómica L5 VC2584 [importada]
BI00205
1912755 1913087 - proteína ribosómica L24
BI00206
1913092 1913457 - proteína ribosómica L14
BI00207
1913555 1913812 - proteína ribosómica S17
BI00208
1913818 1914066 - proteína ribosómica L29
BI00209
1914069 1914485 - proteína ribosómica L16
BI00210
1914495 1915295 - proteína ribosómica S3
BI00211
1915301 1915657 - proteína ribosómica L22
BI00212
1915677 1915952 - proteína ribosómica S19
BI00213
1915971 1916798 - proteína ribosómica L2
BI00214
1916838 1917131 - proteína ribosómica L23
BI00215
1917140 1917793 - familia de la proteína ribosómica L4/L1
BI00216
1917803 1918441 - proteína ribosómica L3
BI00217
1918461 1918766 - proteína ribosómica S10
BI00218
1919023 1920027 + proteína de membrana, posible
BI00219
1920366 1923092 - Desconocido
BI00220
1923607 1924797 + probable represor de la familia Rok (NagC/XylR)
BI00221
1924797 1927334 + operón de la proteína GlgX del glucógeno
BI00222
1927431 1927919 - proteína ribosómica S9
BI00223
1927945 1928391 - proteína ribosómica L13
BI00224
1928792 1930954 - 4-alfa-glucanotransferasa
BI00225
1931125 1931931 - variante de repetición rica en leucina, teórica
BI00226
1931876 1932514 - proteína TIGR00257 conservada teórica
BI00227
1932579 1933592 - posible 2-hidroxiácido deshidrogenasa
BI00228
1933669 1935009 - proteína capA, posible
BI00229
1935547 1936608 - COG0697: Permeasas de la superfamilia del transportador de fármaco/metabolito (DMT)
BI00230
1936648 1937991 + Proteína P inducible por daño en el ADN
BI00231
1938024 1939256 - aminotransferasa, posible
BI00232
1939374 1939691 - fdxC
BI00233
1939755 1941278 - posible transportador de aminoácidos catiónicos
BI00234
1941433 1942398 - UDP-N-acetilenolpiruvoilglucosamina reductasa
BI00235
1942930 1943094 - proteína ribosómica L33
BI00236
1943529 1944245 + posible cistationina gamma liasa
BI00237
1944924 1945214 - chaperonina, 10 kDa
BI00238
1945390 1946604 - proteína teórica conservada
BI00239
1946895 1947557 - rimJ
BI00240
1947644 1948360 + proteína relacionada con la 5-formiltetrahidrofolato ciclo-ligasa
BI00241
1948527 1948709 + proteína teórica conservada
BI00242
1948950 1949516 + proteína teórica conservada
BI00243
1949617 1949814 - proteína Blon021580 teórica
BI00244
1949820 1953440 - proteína teórica conservada
BI00245
1953452 1954999 - proteína teórica conservada
BI00246
1955200 1955577 - proteína ribosómica L7/L12
BI00247
1955689 1956207 - proteína ribosómica L10
BI00248
1956479 1957222 - proteína teórica conservada
BI00249
1957561 1958952 + Desconocido
BI00250
1959385 1962123 - polirribonucleótido nucleotidil transferasa
BI00251
1962444 1962710 - proteína ribosómica S15
BI00252
1962882 1963562 - proteína teórica conservada
BI00253
1963721 1963951 - proteína teórica
BI00254
1964091 1966964 - posible exo-xilanasa extracelular
BI00255
1967190 1969712 - endo-1,4-beta-xilanasa D
BI00256
1970329 1971432 + familia IS30, transposasa [importado]
BI00257
1971591 1972274 - proteína teórica conservada
BI00334t
1972174 1972389 + proteína teórica conservada
BI00258
1972411 1973094 - proteína Blon021028 teórica
BI00259
1973553 1974914 - posible proteína de la superficie celular
BI00260
1974994 1977351 - proteína de dominio del factor de von Willebrand de tipo A
BI00261
1978150 1978326 - proteína Blon021305 teórica
BI00262
1978353 1978820 - proteína fosfopantetieno transferasa
BI00263
1979459 1988974 - proteína de dominio de tipo MaoC
BI00264
1989016 1990635 - propionil-CoA carboxilasa, cadena beta
BI00265
1990631 1992514 - accA3
BI00266
1993105 1993701 + proteína bioY
BI00267
1993739 1994710 - biotina-acetil-CoA-carboxilasa ligasa
BI00268
1994853 1996895 + proteína de membrana, posible
BI00269
1996904 1997731 + proteína teórica conservada
BI00270
1997829 1998524 - regulador transcripcional, posible
BI00350t
1998629 1999459 - regulador transcripcional teórico, familia IclR
BI00271
2011598 2011726 - proteína teórica
BI00272
2011797 2012486 - proteína ribosómica L1
BI00273
2012505 2012933 - proteína ribosómica L11
BI00274
2013199 2014089 - factor NusG de terminación/antiterminación de la transcripción
BI00275
2014122 2014346 - preproteína translocasa, subunidad SecE
BI00276
2014593 2015795 - aspartato aminotransferasa [importado]
BI00277
2015889 2016986 - glutamato 5-quinasa
BI00278
2017023 2018711 - proteína de unión a GTP
BI00279
2018783 2019028 - proteína ribosómica L27
BI00280
2019054 2019359 - proteína ribosómica L21
BI00281
2019502 2022534 - ribonucleasa teórica, familia Rne/Rng
BI00282
2022850 2024121 - succinil-diaminopimelato desuccinilasa
BI00283
2024159 2025100 + transportador, posible
BI00284
2025282 2026727 - permeasa, posible proteína de dominio
BI00285
2026727 2027818 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00286
2027996 2029441 - proteína de tipo Maf
BI00287
2029581 2030690 - homoserina quinasa
BI00288
2030800 2032113 - homoserina deshidrogenasa
BI00289
2032276 2033865 - diaminopimelato descarboxilasa
BI00290
2033871 2035541 - arginil-ARNt sintetasa
BI00291
2035944 2036606 + posible regulador transcripcional de tipo TetR
BI00292
2036606 2037880 + permeasa, posible
BI00293
2037742 2038899 + familia VC1588 del regulador de la transcripción LysR [importada], posible
BI00294
2038996 2040246 + probable aminotransferasa
BI00295
2040298 2041521 - UDP-N-acetilglucosamina 1-carboxiviniltransferasa
BI00296
2041869 2043212 + NADH oxidasa
BI00297
2043424 2044548 - proteína de la familia de hidroorotato deshidrogenasa, posible
BI00298
2044591 2046468 - proteína de la familia CAAX de la familia de proteasas aminoterminales
BI00299
2046594 2047283 - 3-isopropilmalato deshidratasa, subunidad pequeña
BI00300
2047369 2048769 - 3-isopropilmalato deshidratasa, subunidad grande
BI00301
2049087 2049860 + regulador transcripcional, familia IclR
BI00302
2050021 2051391 - familia de la Ser/Thr proteína fosfatasa
BI00303
2051896 2054130 + polifosfato quinasa
BI00304
2054291 2055487 + mutT1
BI00305
2055480 2056298 + proteína Blon021115 teórica
BI00306
2056564 2057871 - proteína teórica conservada
BI00307
2057963 2058121 - proteína teórica
BI00308
2058175 2058813 + uracil fosforibosiltransferasa
BI00309
2058864 2059340 + proteína TIGR00246 conservada teórica
BI00310
2059542 2060648 - posible fosfodiesterasa
BI00311
2060677 2061747 - proteína de dominio de la glutamil-ARNt-sintetasa
BI00312
2061933 2064599 - proteasa Clp dependiente de ATP, subunidad ClpB de unión a ATP
BI00313
2064821 2066371 - histidina amoniaco-liasa
BI00314
2066617 2067489 + regulador transcripcional, familia IclR, posible
BI00315
2067489 2067662 + proteína teórica conservada
BI00316
2067741 2068559 - posible 2-hidroxihepta-2,4-dieno-1,7-dioato isomerasa de la familia de la fumarilacetoacetato hidrolasa
BI00317
2068665 2069873 - proteína de membrana teórica con función desconocida
BI00318
2070097 2071272 - UDP-galactopiranosa mutasa
BI00319
2071426 2072670 + dTDP-glucosa 4,6-deshidratasa
BI00320
2072827 2074311 + proteína teórica conservada
BI00321
2074367 2075068 + proteína teórica conservada
BI00423t
2075382 2075687 + posible transposasa
BI00322
2075763 2076530 - IS1533, OrfB
BI00323
2076530 2077987 - transposasa (25) BH3998 [importado], posible
BI00324
2078280 2078996 - glicosiltransferasa, posible
BI00325
2079313 2079666 - 9-O-acetilesterasa específica de ácido siálico
BI00326
2080049 2081173 + familia de la acilo transferasa teórica
BI00327
2081181 2082893 - proteína de membrana teórica con función desconocida
BI00328
2082902 2085811 - familia 8 de la glicosil transferasa teórica
BI00329
2085935 2087170 - glicosilo transferasa teórica, familia de la proteína del grupo 2
BI00330
2087259 2088509 - transportador ABC de polisacárido, proteína de unión a ATP
BI00331
2088515 2089351 - transportador ABC de polisacárido, proteína permeasa, posible
BI00332
2089580 2091367 + familia 8 de la glicosil transferasa teórica
BI00333
2091457 2092698 - UDP-glucosa 6-deshidrogenasa
BI00334
2092974 2093636 + familia de epimerasa/deshidratasa dependiente de NAD teórica
BI00335
2093654 2094844 - proteína de membrana, posible
BI00336
2094847 2097099 - proteína teórica conservada
BI00337
2097441 2098844 + proteína de membrana teórica con función desconocida
BI00338
2098844 2099962 + posible proteína de unión a ATP del transportador ABC
BI00339
2100089 2100790 + proteína de dominio HDIG
BI00340
2100871 2101728 - proteína teórica conservada
BI00341
2101825 2104335 - proteína de captación del potasio del sistema Kup [importado]
BI00342
2104481 2105188 - hidrolasa, familia TatD
BI00343
2105717 2106784 + familia de familia de la proteína Fic
BI00344
2106816 2108621 - transportador ABC, proteína de unión a ATP/permeasa
BI00345
2108635 2110542 - transportador ABC, proteína de unión a ATP/permeasa
BI00346
2110935 2111099 - proteína teórica
BI00347
2111297 2112703 - posible alfa-galactosidasa
BI00348
2113077 2114231 + regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI00349
2114409 2115356 - probable regulador de la transcripción de tipo AraC/XylS
BI00350
2115401 2117626 - proteína teórica conservada
BI00351
2117851 2119374 + aminopeptidasa C
BI00352
2119555 2120628 + proteína teórica conservada
BI00353
2121673 2123403 - metionil-ARNt sintetasa
BI00354
2123873 2124496 + proteína teórica conservada
BI00466t
2124496 2124864 + proteína teórica conservada
BI00355
2124897 2125922 - proteína TIGR00096 conservada teórica
BI00356
2126487 2127902 - posible simport
BI00357
2127864 2129027 + proteína teórica conservada
BI00358
2129186 2131012 - transportador ABC, proteína de unión a ATP/permeasa
BI00359
2131231 2133099 - transportador ABC, proteína de unión a ATP/permeasa
BI00360
2133289 2133684 - regulador transcripcional, familia MarR, posible
BI00475t
2134267 2134506 + proteína P inducible por daño en el ADN de Escherichia coli
BI00361
2135008 2138841 - proteína de dominio de anclado de la pared celular al motivo LPXTG
BI00362
2139056 2139151 - proteína teórica
BI00363
2139209 2143594 - proteína secretada
BI00364
2143901 2145394 - ADN helicasa recG dependiente de ATP
BI00365
2145737 2147257 - aminoácido permeasa
BI00366
2147448 2151185 - permeasa, posible
BI00367
2151199 2151897 - Transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00368
2152041 2152607 + probable regulador transcripcional de tipo TetR
BI00369
2152832 2154310 + proteína transportadora AroP de aminoácidos aromáticos
BI00370
2154575 2155774 + posible invertasa/transposasa
BI00371
2155961 2160952 - familia 43 de las glicosil hidrolasas, teórica
BI00372
2161359 2164649 - teórica
BI00373
2164997 2168173 - posible arabinosidasa
BI00374
2168529 2169131 - proteína teórica conservada
BI00375
2169340 2170179 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa, posible
BI00376
2170182 2171033 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa, posible
BI00377
2171416 2172429 + regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00378
2172690 2174015 - posible proteína de unión a soluto del transportador ABC
BI00379
2174424 2175134 - proteína de la familia de la fosfoglicerato mutasa
BI00380
2175226 2175600 + COG0531 teórica: Transportadores de aminoácidos
BI00381
2175612 2176550 + proteína de la familia de la nitrorreductasa, teórica
BI00382
2176846 2179572 + infección de fago, posible
BI00383
2179572 2181908 + proteína de infección de fago, posible
BI00384
2188511 2189263 + proteína reguladora, familia SIR2
BI00385
2189415 2190791 - treonina deshidratasa
BI00386
2190928 2192745 - glucano 1,6-alfa-glucosidasa
BI00387
2192872 2194731 - Rafinosa sintasa teórica, o proteínas de inclusión en semilla Sip1
BI00388
2194766 2196433 - proteína de la familia de alfa-amilasa
BI00389
2196537 2197358 - transportador ABC de la proteína permeasa yurm, teórico. {bacilo
BI00390
2197364 2198383 - sistemas de transporte dependientes de la proteína de unión del componente de la membrana interna, teóricos
BI00391
2198408 2199730 - proteína de unión al soluto extracelular bacteriano, teórica
BI00392
2199980 2201095 - proteína Efae022644 teórica
BI00393
2201159 2202484 - proteína de unión al soluto extracelular bacteriano, teórica
BI00394
2202692 2203717 + regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00395
2203838 2204854 + regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00396
2204919 2205782 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa
BI00397
2205804 2206730 - transportador ABC de azúcar, proteína permeasa
BI00398
2206755 2208041 - transportador ABC de azúcar, proteína de unión a azúcar, posible
BI00399
2208215 2209420 + familia VC2007 del regulador de la transcripción ROK [importada], posible
BI00400
2209591 2211894 - alfa-galactosidasa
BI00401
2212017 2212445 - región de unión a cinc de la citidina y desoxicitidilato desaminasa, teórica
BI00402
2212589 2214658 + antiportador Na+/H+
BI00403
2214858 2215613 - serina esterasa, posible
BI00404
2215613 2215714 - proteína teórica
BI00405
2215735 2216592 - proteína teórica conservada
BI00406
2216949 2217527 + desoxicitidina trifosfato desaminasa
BI00407
2217593 2219320 + proteína de la familia de anclaje a la superficie de la pared celular, posible
BI00408
2219543 2222527 - ATPasa calcio de tipo E1-E2
BI00409
2222713 2223447 - proteína probablemente implicada en la degradación de xilano, posible esterasa de xilano
BI00410
2223622 2225049 - proteína de la superfamilia del facilitador mayor, teórica
BI00411
2225005 2225994 + ARN metiltransferasa, familia TrmH, grupo 3
BI00412
2226107 2227516 - proteína teórica conservada
BI00413
2227740 2228864 - proteína de unión a ATP del sistema transportador ABC para azúcares
BI00414
2229226 2230419 - proteína de dominio glicosil transferasa
BI00415
2230486 2231475 - Ribonucleótido reductasa, subunidad beta
BI00416
2231704 2233896 - ribonucleósido-difosfato reductasa, subunidad alfa
BI00417
2234015 2234470 - proteína nrdI
BI00418
2234470 2234733 - COG0695: Glutaredoxina y proteínas relacionadas
BI00419
2235324 2235767 - Hélice-giro-hélice teórica
BI00420
2235958 2236635 - proteína teórica conservada
BI00421
2236828 2237592 + transportador de iones
BI00422
2237788 2238891 + proteína teórica conservada
BI00423
2239035 2239349 - glicosidasa relacionada con beta-glucosidasa
BI00424
2239828 2241951 + proteína ampliamente conservada con un dominio de proteína quinasa eucariota
BI00425
2242132 2243106 + proteína teórica conservada
BI00426
2243627 2245111 + proteína teórica conservada
BI00427
2245147 2246067 + dimetiladenosina transferasa
BI00428
2246067 2247014 + quinasa, familia GHMP, grupo 2
BI00429
2246860 2247690 + proteína BL0655 teórica
BI00430
2247781 2249193 - pcnA
BI00431
2249280 2250569 + proteína de dominio NUDIX
BI00432
2250569 2252836 + proteína de la familia de anclaje a la superficie de la pared celular, posible
BI00433
2252836 2254560 + proteína de membrana teórica conservada de la familia MviN
BI00434
2254646 2256706 + proteína teórica conservada
BI00435
2256829 2257845 + tioredoxina reductasa
BI00436
2258158 2259516 - proteína ParB de reparto del cromosoma
BI00437
2259519 2260487 - proteína de la familia Soj
BI00438
2260741 2261403 - metiltransferasa GidB
BI00439
2261558 2262088 - proteína de dominio R3H
BI00440
2262215 2263219 - proteína de la membrana interna, 60 kDa VC0004 [importada]
BI00143g
2263219 2263533 - proteína TIGR00278 conservada teórica
BI00576t
2263533 2264063 - componente de proteína de la ribonucleasa P
BI00441
2263925 2264056 - proteína ribosómica L34
BI00442
1 1500 + proteína AdnA iniciadora de la replicación cromosómica
BI00443
2239 3360 + ADN polimerasa III, subunidad beta
BI00444
3442 4626 + proteína recF
BI00445
4626 5093 + proteína teórica conservada
BI00446
5229 7364 + ADN girasa, subunidad B
BI00447
7534 10083 + ADN girasa, subunidad A
BI00448
10156 10719 + proteína teórica conservada
BI00449
11406 12116 + proteína teórica
BI00450
12179 13699 + pectinesterasa teórica
BI00451
14103 15446 - glutamato deshidrogenasa específica de NADP
BI00452
15768 16199 - regulador transcripcional de tipo AsnC
BI00453
16405 17736 + aspartato aminotransferasa
BI00454
17757 18746 - proteína Blon021073 teórica
BI00455
19007 19600 + proteína BL0627 teórica
BI00456
19770 20462 + proteína Blon021075 teórica
BI00457
20579 20821 + Posible proteína reguladora represora de la transcripción del operón acrab
BI00599t
21403 21735 - IS1557, transposasa, posible
BI00146g
21834 22397 - proteína teórica conservada
BI00458
22130 23497 - COG1167 teórica: Reguladores transcripcionales que contienen un dominio HTH de unión a ADN y un domino de aminotransferasa (familia MocR) y sus ortólogos eucariotas
BI00459
24132 25454 + aminotransferasa, superfamilia de clase III
BI00460
25495 26397 + Metaloproteasa de cinc
BI00461
26414 26509 - proteína teórica
BI00462
26487 26849 + COG3265: Gluconato quinasa
BI00463
27114 28424 - proteína teórica conservada
BI00464
28662 29138 - proteína de la familia Dps, posible
BI00465
29238 30608 - proteína de dominio CBS, posible
BI00466
30841 31521 - Anhidrasa carbónica de tipo procariota
BI00467
31727 32287 + alquil peróxido de hidrógeno reductasa
BI00468
32458 34371 + tioredoxina reductasa
BI00469
34494 35963 - antiportador oxalato:formiato
BI00470
35948 36094 + proteína teórica
BI00471
36333 37328 + regulador transcripcional de tipo LacI
BI00472
37558 40308 - fosfoenolpiruvato carboxilasa
BI00473
40594 42471 + proteína de membrana, posible
BI00474
42737 44344 + posible simport sodio/prolina
BI00475
44680 45663 - proteína teórica fuertemente conservada
BI00476
45917 47533 + proteína teórica conservada
BI00477
47717 48805 - triptofanil-ARNt sintetasa
BI00478
49056 49325 + proteína teórica
BI00479
49437 49967 - proteína teórica conservada
BI00480
49986 52505 + glicógeno fosforilasa
BI00481
52725 52940 - proteína BL0595 teórica
BI00482
53195 53887 + proteína de la familia romboide
BI00483
54562 55029 - proteína teórica conservada
BI00484
55119 55907 + proteína teórica conservada
BI00485
55907 57142 + proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI00486
57196 57837 + pabA
BI00487
58067 60136 - proteína quinasa serina/treonina
BI00488
60136 60942 - proteína quinasa serina/treonina
BI00489
61083 62546 - pbpA
BI00490
62546 64204 - Desconocida, posible
BI00491
64204 65895 - posible fosfoproteína fosfatasa
BI00492
65903 66430 - proteínas que contienen el dominio FHA
BI00493
66463 67161 - proteína de dominio FHA
BI00494
67349 69790 - dipeptidil peptidasa IV, posible
BI00495
69951 70997 + lisofosfolipasa L2, posible
BI00496
71080 72228 + proteína de dominio del factor de von Willebrand de tipo A
BI00497
72231 72947 + proteína teórica conservada
BI00498
72947 73348 + proteína Blon021556 teórica
BI00654t
73348 73497 + proteína Blon021556 teórica
BI00499
73873 74724 + proteína de resistencia a telurita
BI00500
75108 75608 + proteína del choque térmico, familia Hsp20
BI00501
75938 76891 + Probable proteína transmembrana
BI00502
77065 77520 - proteína teórica conservada
BI00503
77753 79132 + COG0627: Esterasa prevista
BI00504
79132 81702 + COG2898:BCR no caracterizada
BI00505
82241 83212 + péptido metionina sulfóxido reductasa
BI00506
83218 83304 + proteína BL0567 teórica
BI00668t
83341 83496 + COG0463: Glicosiltransferasas implicadas en la biogénesis de la pared celular
BI00507
83506 86709 - proteína relacionada con helicasa
BI00509
86785 87195 - proteína MutT mutadora, posible
BI00510
87337 88587 + Dominio teórico de función desconocida
BI00511
88678 89139 + familia de la acetiltransferasa, familia GNAT
BI00512
89226 90080 - teórica
BI00513
90187 90420 - proteína teórica
BI00514
90480 90842 + proteína teórica conservada
BI00515
91329 92639 - queuina ARNt-ribosiltransferasa
BI00516
93056 95065 + proteína del choque térmico HtrA
BI00517
95480 97636 + ATPasa transportadora de cationes, familia E1-E2
BI00684t
97816 98862 + regulador transcripcional, familia LacI
BI00518
98874 99131 - familia teórica mttA/Hcf106
BI00519
99136 100215 - proteína translocasa TatC independiente de sec
BI00687t
100215 100730 - proteína de translocación de arginina doble teórica, familia TatA/E
BI00520
101182 103581 + secuencia señal de la ruta teórica Tat (translocación de arginina doble)
BI00521
103674 106151 + teórica
BI00522
106547 107707 - proteína teórica conservada
BI00523
107911 109359 + ferredoxina/ferredoxina-NADP reductasa, posible
BI00524
109452 110450 + proteína del choque térmico HtpX
BI00525
110667 111731 - fructosa-bifosfato aldolasa, clase II
BI00526
111947 113230 + adenilosuccinato sintetasa
BI00527
113524 114837 + canal del cloruro
BI00528
115027 116094 + proteína de la familia análoga a CrcB
BI00700t
116097 116489 + proteína con similitud a CrcB
BI00529
116581 116691 + proteína teórica
BI00530
116767 117849 + regulador transcripcional de unión a azúcar, familia LacI, posible
BI00531
118274 119842 + proteína de captación del potasio del sistema Kup [importado]
BI00532
120262 121806 + alfa-L-arabinofuranosidasa
BI00533
121981 123012 + regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00534
123104 124012 - glicosil hidrolasa, familia 31
BI00535
124149 124370 - IS861, transposasa OrfB
BI00711t
124604 125803 + probable integrasa/recombinasa
BI00712t
125878 126765 + probable integrasa/recombinasa
BI00536
126765 127817 + integrasa/recombinasa XerC, probable [importada], posible
BI00537
127910 128956 - familia de la transposasa IS3
BI00538
129291 130814 + sacarosa fosforilasa
BI00539
131035 132669 + proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI00540
132736 133776 + regulador transcripcional de unión a azúcar, familia LacI, posible
BI00541
134407 135771 + transportador de la familia del facilitador mayor
BI00542
135971 137020 + cetol-ácido reductoisomerasa
BI00543
137452 138501 + cetol-ácido reductoisomerasa
BI00544
138689 140500 - proteína de la familia de alfa-amilasa
BI00545
140663 141694 - regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00546
142008 144242 - 4-alfa-glucanotransferasa
BI00547
144506 144784 - proteína Blon021648 teórica
BI00548
144856 145482 + proteína teórica conservada
BI00549
145500 146507 - regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00550
146777 147490 + transportador ABC de azúcar, proteína permeasa
BI00551
147605 150139 + glicosil hidrolasa, familia 31
BI00552
151125 153002 + proteína dnaK
BI00553
153005 153658 + cochaperona GrpE
BI00554
153753 154769 + proteína AdnJ [importada]
BI00555
154787 155371 + hspR
BI00556
155647 156996 + xantina permeasa, posible
BI00557
157036 158154 + posible proteína análoga a acil proteína sintasa/acil-CoA reductasa
BI00558
158144 159640 + posible acil-CoA reductasa
BI00559
159715 160497 + proteína transportadora de 3-oxoacil-acil reductasa
BI00560
160553 161281 + beta-fosfoglucomutasa, posible
BI00561
161435 162157 + proteína DedA
BI00749t
162383 163330 + proteína teórica conservada
BI00562
163340 164404 + trbB
BI00751t
164410 165060 + proteína teórica conservada
BI00752t
165060 165659 + proteína de membrana teórica con función desconocida
BI00563
165947 166231 + proteína BL0505 teórica
BI00754t
166240 166614 + proteína teórica conservada
BI00564
166715 167041 + proteína teórica conservada
BI00565
167093 168220 + proteína BmrU, posible
BI00566
168424 169020 - posible regulador transcripcional de tipo TetR
BI00567
169297 172125 + ADN polimerasa III, subunidad tau/gamma
BI00568
172154 172753 + recombinación de la proteína RecR
BI00569
172756 173886 - proteína de la familia de las sortasas
BI00570
174774 176054 + proteína teórica conservada
BI00571
176649 177179 + familia de aminoácido quinasas, teórica
BI00572
177262 177801 + aspartoquinasa, subunidades alfa y beta
BI00573
177889 178980 - aspartato-semialdehído deshidrogenasa
BI00574
179055 179765 + proteína teórica conservada
BI00575
179774 181351 - familia de la Ser/Thr proteína fosfatasa
BI00576
182040 183953 + 2-isopropilmalato sintasa
BI00577
184031 186493 - proteína de unión a penicilina, posible
BI00578
186772 187959 + posible pre-pilina peptidasa
BI00579
188086 191169 + ADN topoisomerasa I
BI00580
191549 192067 + timidilato quinasa
BI00581
192067 193215 + ADN polimerasa III, subunidad delta
BI00582
193337 193888 + proteína TIGR00481 conservada teórica
BI00583
194034 195632 + Desconocido
BI00584
195767 197281 + formiato-tetrahidrofolato ligasa
BI00585
197684 198028 - proteína teórica conservada
BI00586
198149 198763 + proteína de membrana teórica fuertemente conservada
BI00587
198817 200226 - proteína de membrana teórica con función desconocida
BI00588
200521 201177 + proteína de la familia de la fosfoglicerato mutasa
BI00589
201278 202228 + proteína teórica conservada
BI00590
202352 203224 + transglicolasa, epimerasa
BI00591
203348 204496 - precursor de extensina (glicoproteína rica en hidroxiprolina de la pared celular)
BI00790t
204684 204866 + proteína BL0470 teórica
BI00592
205053 206570 + glutaminil-ARNt sintetasa
BI00593
207503 207988 + proteína Blon021299 teórica
BI00594
207946 208221 - proteína BL0466 teórica
BI00595
208388 214285 + proteína de la familia de anclaje a la superficie de la pared celular, cambio de marco auténtico
BI00596
214390 215208 - teórica
BI00597
216652 218460 + proteína de integridad de membrana teórica conservada
BI00598
218637 219317 + antígeno de membrana, posible
BI00599
219470 220744 + proteína de integridad de membrana
BI00600
220769 222070 + posible proteína permeasa del sistema transportador ABC
BI00601
222107 223327 + posible proteína permeasa del sistema transportador ABC
BI00602
223346 224140 + transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00603
224259 224819 + lipoproteína, posible
BI00604
224831 225427 - regulador transcripcional, familia TetR, posible
BI00605
225545 227704 - proteína de infección de fago, posible
BI00606
227704 230250 - proteína de infección de fago, posible
BI00607
230686 231969 + proteína de membrana, posible
BI00608
232037 233602 + 6-fosfogluconato deshidrogenasa, descarboxiladora
BI00609
233756 234595 - 6-fosfogluconolactonasa
BI00610
234825 235847 - oxociclo proteína OpcA
BI00611
235847 237499 - glucosa-6-fosfato 1-deshidrogenasa
BI00612
237652 239337 + Desconocido
BI00613
239417 240448 - Glicosiltransferasa implicada en la biogénesis de la pared celular
BI00614
240475 241311 - regulador transcripcional, familia TetR
BI00615
241407 242675 + proteína FtsY de anclaje a la partícula de reconocimiento de la señal
BI00616
243046 244338 + transportador de amonio
BI00617
244343 244678 + proteína P-II reguladora de nitrógeno
BI00618
244832 246613 + proteína-pII, uridililtransferasa
BI00619
246653 248095 - Proteína F inducible por daño en el ADN, posible
BI00620
248301 249827 + ADN helicasa replicativa
BI00621
249830 251299 + UDP-N-acetilmuramil tripéptido sintasa
BI00622
251405 252154 + ácido cobírico sintasa
BI00623
252306 252590 + proteína teórica conservada
BI00624
252590 254407 + familia de familia ABC1
BI00625
254428 255447 - regulador transcripcional, familia LacI
BI00626
255933 257255 + proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC
BI00627
257546 258469 + transportador ABC de azúcar, proteína permeasa, posible
BI00628
258493 259308 + transportador ABC, proteína permeasa, familia MalFG
BI00629
259473 261446 + proteína teórica conservada
BI00630
262147 267966 + teórica
BI00631
268074 271778 + proteína de la familia de anclaje a la superficie de la pared celular, posible
BI00632
271911 272741 + proteína TIGR00044 conservada teórica
BI00633
272825 273835 - prsA
BI00634
273960 274439 - COG3210 teórica: Exoproteínas grandes implicadas en la utilización o adhesión al grupo hemo
BI00635
274604 274891 + proteína ribosómica S6
BI00636
274951 275604 + proteína de unión al ADN monocatenario, teórica
BI00637
275668 275913 + proteína ribosómica S18
BI00638
275936 276379 + proteína ribosómica L9
BI00639
276769 277026 + ptsH
BI00640
277029 278705 + fosfoenolpiruvato-proteína fosfotransferasa
BI00641
278942 279673 + proteína facilitadora de la captación de glicerol
BI00642
279763 282468 - ATPasa de tipo P de translocación del cobre
BI00643
282580 282858 + proteína de la familia COG1937
BI00644
283012 284325 + BCR sin caracterizar, familia YigN, familia COG1322
BI00645
284325 284951 + proteína teórica conservada
BI00646
285048 285893 + COG0566:ARNr metiladas
BI00647
285787 286359 + glutamil-ARNt(Gln) amidotransferasa, subunidad C
BI00648
286366 287904 + glutamil-ARNt(Gln) amidotransferasa, subunidad A
BI00649
287933 289429 + glutamil-ARNt(Gln) amidotransferasa, subunidad B
BI00650
289728 290789 + posible acetiltransferasa
BI00651
290803 291114 + proteína teórica conservada
BI00652
291501 293141 + proteína teórica conservada
BI00653
293363 294973 + BarJ
BI00654
295245 297248 + factor Rho de finalización de la transcripción
BI00655
297358 297501 + proteína teórica
BI00656
297559 297945 + corismato mutasa
BI00657
298070 300151 + proteína de la familia de anclaje a la superficie de la pared celular, posible
BI00658
300383 303220 - valil-ARNt sintetasa, posible
BI00659
303262 304686 - transportador ABC, proteína de unión al sustrato periplásmico, posible
BI00660
304850 305533 - endonucleasa III
BI00661
305595 306374 - regulador transcripcional
BI00662
306556 307212 - proteína de membrana, posible
BI00663
307369 307950 - proteína de integridad de membrana en upf0059
BI00664
308187 308678 - pirofosfatasa inorgánica
BI00665
308908 311145 - proteína de la familia de alfa-amilasa
BI00666
311386 313377 + proteína teórica conservada
BI00667
313988 315019 + homoserina O-succiniltransferasa
BI00668
315484 316293 + ATP sintasa F0, subunidad A
BI00669
316400 316624 + ATP sintasa F0, subunidad C
BI00670
316684 317199 + ATP sintasa F0, subunidad B
BI00671
317237 318070 + ATP sintasa F1, subunidad delta
BI00672
318149 319777 + ATP sintasa F1, subunidad alfa
BI00673
319784 320704 + ATP sintasa F1, subunidad gamma
BI00674
320716 322185 + ATP sintasa F1, subunidad beta
BI00675
322188 322478 + ATP sintasa F1, subunidad épsilon, posible
BI00676
322539 323336 + nucleasa prevista de la familia RecB
BI00677
323388 324374 - posible proteína peptidil-prolil cis-trans isomerasa secretada
BI00678
324455 325531 + proteína teórica conservada
BI00679
325534 326538 + proteína teórica conservada
BI00680
326790 327761 + tiorredoxina [importada], posible
BI00681
327850 328473 - Adenilato ciclasa
BI00682
329012 329398 + endorribonucleasa L-PSP, posible
BI00683
329536 330498 + proteína de dominio de aciltransferasa
BI00684
330595 331593 + glicerol-3-fosfato deshidrogenasa, dependiente de NAD
BI00685
331783 332967 + D-ala D-ala ligasa
BI00686
333223 334386 + transportador ABC, proteína de unión al sustrato periplásmico
BI00687
334206 335348 + transportador ABC de espermidina/putrescina, proteína permeasa, posible
BI00688
335348 336199 + transportador ABC de espermidina/putrescina, proteína permeasa, posible
BI00689
336207 337481 + transportador ABC de espermidina/putrescina, proteína de unión a ATP
BI00690
337788 338828 + proteína de la familia CAAX de la familia de proteasas aminoterminales
BI00691
338873 339667 - familia del canal de iones mecanosensible
BI00692
339751 341181 - aspartato amoniaco-liasa
BI00693
341302 342030 - regulador transcripcional, proteína de dominio de la familia TetR
BI00694
342124 343527 - proteína teórica conservada
BI00695
343852 344400 - ADN metilado-proteína-cisteína metiltransferasa
BI00696
345228 346055 + proteína teórica con motivo de hélice de giro de hélice
BI00697
345928 347202 - proteína de la familia del transportador MFS, posible
BI00698
347393 348406 - riboquinasa [importada]
BI00939t
348735 349001 + proteína ribosómica L28
BI00699
349116 351944 + ADN helicasa RecG dependiente de ATP
BI00700
352204 352782 + metiltransferasa, posible
BI00701
352812 353624 - ARNt (guanina-N1)-metiltransferasa
BI00702
353623 355341 + Desconocido
BI00703
355422 356399 + proteína teórica conservada
BI00704
356482 357354 + 4-difosfocitidil-2C-metil-D-eritritol sintasa, posible
BI00705
357367 358041 + pirrolidona-carboxilato peptidasa, posible
BI00706
358303 359766 + serina endopeptidasa específica de IgA, posible
BI00707
359884 361224 + aminopeptidasa C
BI00708
361519 362649 + fosfo-2-deshidro-3-desoxiheptanoato aldolasa
BI00709
362781 364010 + fosfo-2-deshidro-3-desoxiheptanoato aldolasa
BI00710
364141 364845 + MTA/SAH nucleosidasa
BI00711
365444 366427 + proteína de dominio análoga a ATPasa teórica, histidina quinasa-, ADN girasa B-, y HSP90
BI00712
366563 367330 + regulador RegX3 de la respuesta de unión a ADN
BI00713
367583 368713 + transportador ABC de fosfato, proteína de unión a fosfato
BI00714
368927 369877 + pstC2
BI00715
369997 370875 + transportador ABC de fosfato, proteína permeasa
BI00716
370931 371707 + phoT
BI00717
372005 372580 + proteína lemA
BI00718
372647 374902 + proteína teórica conservada
BI00719
374971 375831 + oxidoreductasa, familia aldo/ceto reductasa
BI00720
375932 376981 + nucleósido hidrolasa que prefiere inosina-uridina
BI00721
377109 377729 - proteína RimM de procesamiento del ARNr 16S
BI00722
377755 377985 - proteína de dominio KH
BI00723
378009 378467 - proteína ribosómica S16
BI00724
378703 379809 - familia de la endonucleasa/exonucleasa/familia de la fosfatasa
BI00725
379889 381634 - proteína de partícula de reconocimiento de la señal
BI00726
381843 382748 + superfamilia de salida de cationes de la familia de proteínas
BI00727
382773 384488 - cisteinil-ARNt sintetasa
BI00728
384518 385363 + posible amidotransferasa
BI00729
385627 387687 + transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00730
387746 388162 - proteína StbB de estabilidad del plásmido
BI00731
388175 388450 - proteína teórica
BI00732
388609 389160 - acetolactato sintasa, subunidad pequeña
BI00733
389180 391144 - acetolactato sintasa, subunidad grande, tipo biosintético
BI00734
391308 392033 - ribonucleasa III
BI00735
392189 392380 - proteína ribosómica L32
BI00736
392472 393098 - ACR sin caracterizar, COG1399
BI00737
393191 394078 - proteína teórica conservada
BI00738
394089 394586 - panteteína-fosfato adenilil transferasa
BI00739
394860 395150 + proteína teórica conservada
BI00740
395198 396205 - canal K+, subunidad beta
BI00741
396379 396804 + familia NMB1303 del regulador de la transcripción MerR [importada], posible
BI00742
396910 397533 - proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI00743
397764 399083 + nicotinato fosforibosiltransferasa, posible
BI00744
399381 400142 + ribonucleasa PH
BI00745
400189 400944 + familia Ham1
BI00746
401106 402659 + familia FemAB teórica
BI00747
402736 404043 + proteína de la familia FemAB, posible
BI00748
404096 405373 + factor de resistencia a beta-lactama, posible
BI00749
405462 406460 - proteína de membrana, posible
BI00750
407182 408879 + glucosa-6-fosfato isomerasa
BI00751
409515 409877 + proteína ribosómica L19
BI00752
410047 410901 + lepB
BI00753
411024 411860 + ribonucleasa HII
BI00754
411990 413102 + regulador transcripcional, familia LacI [importado]
BI00755
413261 414904 + probable quinasa de azúcar
BI00756
414992 415681 + azúcar isomerasa
BI00757
416114 417430 + L-arabinosa isomerasa
BI00758
417620 418240 - glutamina amidotransferasa/dipeptidasa de tipo G
BI00759
418178 420178 + proteína de membrana, posible
BI00760
420330 421694 + permeasa, posible
BI00761
421694 422914 + proteína transmembrana Vexp1, posible
BI00762
422930 423562 + Vexp2
BI00763
423886 425706 - ácido-graso-de-cadena-larga-CoA ligasa, posible
BI00764
425820 426098 + fragmento de arabinosa permeasa
BI00765
426765 429890 + transportador ABC teórico
BI00766
430170 430436 - transportador CC0814 de la familia del facilitador mayor [importado], posible
BI00767
431272 432618 + proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC
BI00768
432750 433799 + transportador ABC de azúcar, proteína permeasa, posible
BI00769
433820 434809 + Desconocido
BI00770
435125 437128 + beta-D-galactosidasa, posible
BI00771
437175 438227 + regulador transcripcional, familia LacI [importado], posible
BI00772
438426 441116 + arabinogalactano endo-1,4-beta-galactosidasa, posible
BI00773
441755 442621 + oxidoreductasa, familia aldo/ceto reductasa
BI00774
442628 443368 + proteína teórica conservada
BI00775
443378 444745 - proteína teórica conservada
BI00776
445003 446367 + proteína transportadora de la familia NRAMP
BI00777
446472 448073 - transportador de resistencia a fármaco, subfamilia EmrB/QacA
BI00778
448424 450007 + glicosil transferasa CpsE
BI00779
450302 452029 + COG0840: proteína de quimiotaxis aceptora de metilo
BI00780
452064 453566 + posible tirosina quinasa análoga a Etk implicada en la biosíntesis de Eps
BI00781
453760 454725 + glicosilo transferasa teórica, familia de la proteína del grupo 1
BI00782
454725 456065 + posible proteína glicosiltransferasa
BI00783
456065 457126 + familia de epimerasa/deshidratasa dependiente de NAD
BI00784
457201 458448 + UDP-glucosa 6-deshidrogenasa
BI00785
458489 459550 + glicosilo transferasa teórica, familia de la proteína del grupo 1
BI00786
459581 460408 + Eps11I teórica
BI00787
460446 460952 + transferasa hexapeptidasa bacteriana teórica (tres repeticiones)
BI00788
460985 461998 + proteína de síntesis del polisacárido capsular, teórica
BI00789
462020 463360 + proteína teórica
BI00790
463363 464292 + Eps9K
BI00791
464362 465753 + proteína de la biosíntesis de polisacáridos, teórica
BI00792
465789 466280 + transferasa hexapeptidasa bacteriana teórica (tres repeticiones)
BI00793
466366 467514 - familia de epimerasa/deshidratasa dependiente de NAD, posible
BI00794
467785 468363 - transposasa, degenerada
BI00795
468615 468770 - COG2963 teórica: Transposasa y derivados inactivados
BI00796
469189 470208 + dTDP-glucosa 4,6-deshidratasa
BI00797
470347 471303 + dTDP-4-deshidroramnosa 3,5-epimerasa
BI00798
471349 472245 + glucosa-1-fosfato timidilil transferasa
BI00799
472858 473046 - proteína teórica
BI00800
473371 473802 - proteína teórica conservada
BI00801
474083 474640 - proteína fosfotirosina fosfatasa de bajo peso molecular, teórica
BI00802
474825 475331 - proteína teórica
BI00803
475655 475867 - hélice-giro-hélice teórica
BI00804
475860 476042 - proteína teórica
BI00805
475971 476312 + proteína teórica
BI00806
476415 477422 - proteína teórica conservada
BI00807
477471 478751 + proteína teórica fuertemente conservada
BI00808
477495 477866 - tiorredoxina
BI00809
478880 479734 + 3-oxoadipato enol-lactonasa, posible
BI00810
479747 481036 + proteína de la familia MutT/nudix
BI00811
481065 481475 + proteína H del sistema de escisión de la glicina
BI00812
481547 482875 + proteína teórica conservada
BI00813
482973 485453 + proteasa II
BI00814
485521 486549 + 3-isopropilmalato deshidrogenasa
BI00815
486610 487692 + lipoato proteína ligasa a
BI00817
487934 488650 + probable regulador transcripcional con dominio de unión a nucleótido cíclico
BI00818
488757 491069 + ponA, posible
BI00819
491264 492634 + flavina oxidoreductasa dependiente de NADH, posible
BI00820
492807 493955 - dihidroorotato deshidrogenasa, posible
BI00821
494409 495122 + represor del regulón de glicerol-3-fosfato
BI00822
495118 496365 + galactosa-1-fosfato uridililtransferasa
BI00823
496241 497632 + galactoquinasa
BI00824
497718 497987 + proteína de dominio ACT
BI00825
498201 499487 + similar a proteínas desconocidas
BI00826
499800 500516 - spoU
BI00827
500612 501463 + mutY
BI00828
501531 502250 + proteína teórica conservada
BI00829
502633 505968 + ARN polimerasa dirigida a ADN, subunidad beta
BI00830
506139 510173 + ARN polimerasa dirigida a ADN, subunidad beta prima
BI00831
510338 510967 - proteína de dominio FHA
BI00832
510986 511498 - proteína Blon020438 teórica
BI00833
511528 512457 - posible fosfoproteína fosfatasa
BI00834
512457 514967 - proteína de membrana, posible
BI00835
514967 516187 - proteína de una familia de función desconocida
BI00836
516215 517585 - moxR2
BI00837
517599 523580 - proteína de la familia de anclaje a la superficie de la pared celular, posible
BI00838
523750 525168 - proteína quinasa serina/treonina, posible
BI00839
525300 529592 + COG0210 teórica: Superfamilia I de ADN y ARN helicasas
BI00840
529427 533620 + proteína de dominio UvrD/REP de helicasa
BI00841
533962 535152 + posible proteína de transporte
BI00842
535527 536243 + dihidrodipicolinato reductasa
BI00843
536388 537311 + dihidrodipicolinato sintasa
BI00844
537585 539246 + superfamilia de la proteína metalo-beta-lactamasa
BI00845
539291 541897 + proteína de dominio M1 del a familia de las peptidasas
BI00846
542078 542971 + proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI00847
543164 543502 + proteína teórica conservada
BI00848
543954 545336 + fosfoglucosamina mutasa
BI00849
545362 546012 + polipéptido deformilasa
BI00850
546072 547472 + proteína teórica conservada
BI00851
547492 547620 + proteína teórica
BI00852
547858 548979 + factor 2 de liberación de cadena peptídica
BI00853
548991 550121 + ftsE
BI00854
550135 551055 + transportador ABC de la división celular, proteína permeasa FtsX, posible
BI00855
551161 552519 + autolisina, posible
BI00856
552673 553146 + proteína de unión a SsrA
BI00857
553192 554265 + transportador ABC de aminoácido, proteína permeasa
BI00858
554479 555420 + transportador ABC de aminoácido, proteína permeasa
BI00859
555554 556546 + transportador ABC de aminoácido, proteína permeasa
BI00860
556566 557393 + transportador ABC de glutamina, proteína de unión a ATP
BI00861
557604 559493 + glucosamina-fructosa-6-fosfato aminotransferasa, isomerización
BI00862
559699 560271 + COG0564: Pseudouridilato sintasas, específicas del ARN 23S
BI00863
560313 560525 - proteína Blon020898 teórica
BI00864
560565 561548 - regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI00865
561794 562717 + transportador ABC de azúcar, proteína permeasa, posible
BI00866
562776 563780 + Desconocido
BI00867
563975 566047 + beta-D-galactosidasa
BI00868
566259 567185 + regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI00869
567311 569008 - alfa-L-arabinofuranosidasa
BI00870
569168 570517 + proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC
BI00871
570852 572192 + proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC para azúcares, probable
BI00872
572449 573729 + proteína Sbp de unión a azúcar
BI00873
573795 574562 - activador de la transcripción, probable familia Baf [importado]
BI00874
574688 576304 + transportador ABC, proteína de unión al sustrato periplásmico, posible
BI00875
576372 577346 + proteína de membrana, posible
BI00876
577346 578245 + transportador ABC de péptido, proteína permeasa, posible
BI00877
578245 579033 + proteína de unión a nucleótido/ATPasa del transportador ABC
BI00878
579029 579811 + Transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00879
580296 581360 + cistationina beta-sintasa
BI00880
581455 582636 + cistationina beta-liasa
BI00881
582780 584501 - familia ErfK/YbiS/YcfS/YnhG
BI00882
584781 586613 + ADN helicasa RecQ dependiente de ATP
BI00883
586729 587220 + proteína LuxS de producción del autoinductor-2
BI00884
587453 587917 + acetilstransferasa, familia GNAT, posible
BI00885
588181 589638 - proteína Blon020876 teórica
BI00886
589890 591347 - aminoácido permeasa
BI00887
591542 592891 + alanina racemasa
BI00888
593087 594370 + desoxiguanosinatrifosfato trifosfohidrolasa, posible
BI00889
594546 596642 + ADN primasa, posible
BI00890
596961 597710 + proteínas de la biosíntesis de piridoxina
BI00891
597799 598434 + superfamilia SNO de la familia de la glutamina amidotransferasa
BI00892
598495 600156 + aminotransferasa, clase I, posible
BI00893
600514 601443 + proteína de la familia de la asparaginasa
BI00894
601476 601607 + proteína Blon020867 teórica
BI00895
601574 601897 - proteína teórica
BI00896
601995 603179 + posible proteína de transporte
BI00897
603210 603467 - proteína Blon020865 teórica
BI00898
603634 603723 + proteína teórica
BI00899
603651 605795 - similar a alfa-L-arabinofuranosidasa A
BI00900
605923 606921 + EF0065, posible
BI00901
607014 608087 - proteína teórica conservada
BI00902
608687 609373 + Transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00903
609373 610545 + proteína teórica conservada
BI00904
610560 612116 + Transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI00905
612106 614304 - 1-desoxixilulosa-5-fosfato sintasa
BI00906
614478 615467 + oxidoreductasa, unión a cinc, posible
BI00907
615572 616069 + fosforribosilaminoimidazol carboxilasa, subunidad catalítica
BI00908
616095 617231 + fosforribosilaminoimidazol carboxilasa, subunidad ATPasa
BI00909
617243 617668 + furB
BI00910
617709 617954 - proteína teórica conservada
BI00911
618183 619103 + posible proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC
BI00912
619367 621439 + proteína de membrana, posible
BI00913
621563 623197 + aldehído deshidrogenasa
BI00914
623577 624842 - fosforribosilamina-glicina ligasa
BI00915
624872 625702 - fosforibosilformilglicinamidina ciclo-ligasa
BI00916
626029 627537 - amidofosforribosil transferasa
BI00917
627944 628726 - transportador ABC de glutamina, proteína de unión a ATP
BI00918
628726 629610 - transportador ABC de aminoácido, proteína permeasa
BI00919
629723 630583 - transportador ABC de aminoácido, proteína de unión a aminoácidos periplásmicos
BI00920
630788 631255 - proteína teórica conservada
BI00921
631328 632698 - proteína de la familia Atz/Trz, posible
BI00922
632741 634240 - S-adenosil-L-homocisteína hidrolasa, dominio de unión a NAD
BI00923
634405 635991 + gen estructural de la resistencia al ultravioleta
BI00924
635991 636206 + proteína Blon020836 teórica
BI00925
636246 637220 - canal K+, subunidad beta
BI00926
637331 638293 - regulador transcripcional, familia HTH_1, posible
BI00927
638512 640023 + antiportador Na+/H+, posible
BI00928
640043 640699 - proteína de membrana, posible
BI00929
640699 642066 - proteína teórica conservada
BI00930
642042 643337 - posible carboxilesterasa o lipasa
BI00931
643478 647209 - fosforribosilformilglicinamidina sintasa
BI00932
647275 648024 - fosforribosilaminoimidazol-succinocarboxamida sintasa
BI00933
648113 648232 - proteína teórica
BI00934
648420 649754 - fosforribosilglicinamida formiltransferasa 2 VC1228 [importada]
BI00935
649928 651085 + proteína J de la biosíntesis del polisacárido capsular de tipo 1 (capJ)
BI00936
651238 652260 - proteína teórica conservada
BI00937
652822 653880 + transportador
BI00938
654695 654967 + proteína ribosómica S12
BI00939
654976 655443 + proteína ribosómica S7
BI00940
655478 657598 + factor G de alargamiento de la traducción
BI00941
657774 658970 + factor Tu de alargamiento de la traducción
BI00942
659184 659909 + proteína teórica conservada
BI00943
660169 660864 + regulador transcripcional, familia LysR, posible
BI00944
661085 662098 + proteína de membrana, posible
BI00945
662161 662637 - COG2246: Proteína de membrana prevista
BI00946
662721 663083 - proteína Crcb
BI00947
663086 663619 - proteína con similitud a CrcB
BI00948
663706 663987 + proteína teórica
BI00949
664023 665063 + alcohol deshidrogenasa, contiene cinc
BI00950
665437 665625 + proteína teórica
BI00951
665652 667028 - proteína teórica conservada
BI00952
667295 667462 - posible regulador transcripcional de tipo MarR
BI00953
667902 670487 + escinucleasa ABC, subunidad A
BI00954
670548 671903 + proteína de la familia de salida de MATE, posible
BI00955
671914 672603 + endonucleasa III, posible
BI00956
672783 673076 - proteína Blon020400 teórica
BI00957
673098 673766 + Desconocido
BI00958
673782 674042 - acetiltransferasa que contiene el hexapéptido repetido
BI00959
674207 675292 + posible proteína permeasa de integridad de la membrana
BI00960
675273 675902 + familia 2 de las glicosilo hidrolasas, dominio del cuerpo TIM
BI00961
676090 677316 - glutamina sintetasa, tipo I
BI00962
677846 678625 - proteína transmembrana teórica fuertemente conservada
BI00963
678712 680199 - dihidrolipoamida deshidrogenasa
BI00964
680351 680971 - proteína teórica conservada
BI00965
681063 682427 + proteína ampliamente conservada en la familia de la peptidasa o desacetilasa
BI00966
682730 683326 + proteína teórica conservada
BI00967
683329 684801 + transportador ABC, proteína de unión a ATP, posible
BI00968
684801 685625 + posible proteína permeasa del sistema transportador ABC para cobalto
BI00969
685824 686699 + proteína de la familia de spoU ARNr metilasa [importada]
BI00970
686891 687820 + fenilalanil-ARNt sintetasa, subunidad alfa
BI00971
687831 690437 + fenilalanil-ARNt sintetasa, subunidad beta
BI00972
690471 691154 + proteína teórica conservada
BI00973
691385 692347 + N-acetil-gamma-glutamil-fosfato reductasa
BI00974
692434 693519 + proteína ArgJ bifuncional de la biosíntesis de arginina
BI00013g
693503 693979 - proteína Magn025872 teórica
BI00975
693809 694612 + acetilglutamato quinasa
BI00976
694605 695897 + acetilornitina aminotransferasa
BI00977
695944 696906 + ornitina carbamoiltransferasa
BI00978
696906 697415 + represor de arginina
BI00979
697501 698736 + argininosuccinato sintasa
BI00980
699184 700653 + argininosuccinato liasa
BI01326t
701005 701196 + proteína ThiS de la biosíntesis de tiamina
BI00981
701211 702077 + proteína thiG
BI00982
702157 702963 + moeB
BI00983
703023 703376 + proteína de dominio análoga a rodanesa
BI00984
703541 704071 + proteína de dominio HD
BI00985
703978 704835 + teórica
BI00986
704964 706283 + tirosil-ARNt sintetasa
BI00987
706314 708086 + proteína BL1050 teórica
BI00988
708098 709135 + fosfatasas de azúcar previstas de la superfamilia HAD
BI00989
709395 710165 + hemolisina A
BI00990
710153 710719 - proteína teórica conservada
BI00991
710729 710881 + proteína teórica
BI00992
710965 711624 - similar al sistema de captación de K(+) bacteriano
BI00993
711678 713141 - proteína de dominio de la proteína transportadora de cationes
BI00994
713388 714407 + poli(P)/ATP-NAD quinasa
BI00995
714410 716233 + proteína RecN de reparación del ADN
BI00996
716266 716910 + hidrolasa, familia análoga a la haloácido deshalogenasa, posible
BI00997
717154 717525 + regulador transcripcional, familia GntR
BI00998
717550 718467 + transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01351t
718477 719091 + proteína de membrana, posible
BI00999
719985 722768 - ATPasa de tipo P translocadora de calcio, de tipo PMCA
BI01000
722966 723238 + proteína BL1037 teórica
BI01001
723291 724778 - treonina sintasa
BI01356t
725001 725699 + serina hidroximetiltransferasa
BI01002
726028 727116 + gamma-glutamil-fosfato reductasa
BI01003
727134 727694 + proteína teórica conservada
BI01004
727694 728476 + nucleótido nicotinato (nicotinamida) adenililtransferasa
BI01005
728580 729857 - glicosil hidrolasa, familia 3, posible
BI01006
729952 733203 + ACR sin caracterizar
BI01007
733340 733834 + fosfinotricina acetiltransferasa
BI01008
734033 734629 + peptidil-ARNt hidrolasa
BI01009
734622 738203 + factor de acoplamiento a la reparación de la transcripción
BI01010
738346 739290 + oxidoreductasa, posible
BI01011
739444 740739 + enolasa
BI01012
740809 741423 + iniciador de la formación del tabique, teórico
BI01013
741423 741986 + proteína teórica conservada
BI01014
742052 743050 + posible proteína análoga a la exopolifosfatasa
BI01015
743578 744711 + familia IS30, transposasa [importado]
BI01016
744846 747062 + L-serina deshidratasa 1
BI01018
747207 747611 + peptidil-prolil cis-trans isomerasa, tipo FKBP
BI01019
747713 748189 + factor GreA de alargamiento de la transcripción
BI01020
748250 749191 - hemolisina, posible
BI01021
749361 750086 + proteína teórica conservada
BI01022
750474 751736 + proteína análoga a histidina quinasa
BI01023
751815 752090 - factor de transcripción WhiB, teórico
BI01024
752207 753922 - toxina diarreica
BI01025
754203 755633 - regulador transcripcional
BI01389t
755884 756180 + whiB1
BI01026
756350 759319 + proteína de membrana, posible
BI01027
759319 760857 + proteína de dominio de anclado de la pared celular al motivo LPXTG, posible
BI01028
760966 761391 - proteína teórica conservada
BI01029
761660 762283 + proteína teórica conservada
BI01030
762332 763015 + proteína de dominio fosforribosil transferasa
BI00019g
762937 763509 - familia S24 de la peptidasa, teórica
BI01031
763391 764464 - recuadro sensorial histidina quinasa, posible
BI01032
764464 765183 - regulador MtrA de la respuesta de unión a ADN
BI01033
765222 767432 - enzima de ramificación 1,4-alfa-glucano
BI01034
767649 768239 + posible regulador transcripcional
BI01035
768351 768872 + 2C-metil-D-eritritol 2,4-ciclodifosfato sintasa
BI01036
768930 769760 - transportador ABC de cinc, proteína permeasa, posible
BI01037
769830 770834 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01038
770893 772419 - posible proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC
BI01039
772190 773062 + metilentetrahidrofolato deshidrogenasa/meteniltetrahidrofolato ciclohidrolasa
BI01040
773185 774657 + proteína ribosómica S1 [importada]
BI01041
774834 775448 + defosfo-CoA quinasa
BI01042
775463 777571 + escinucleasa ABC, subunidad B
BI01043
777887 778726 + familia de la proteína Terc [importada]
BI01044
778897 780336 + piruvato quinasa
BI01045
780490 781086 - posible NTP pirofosfatasa en la familia MutT
BI01046
781432 782214 + regulador de la respuesta
BI01047
782278 785127 + ADN polimerasa I
BI01048
785291 786217 + proteína TIGR00486 conservada teórica
BI01049
786266 786937 + familia de la proteína MutT/nudix, posible
BI01050
787135 789132 + operón de la proteína GlgX del glucógeno
BI01424t
789186 789413 + proteína teórica con motivo de hélice de giro de hélice
BI01051
789420 790067 + proteína teórica conservada
BI01052
790243 790794 - ADN-3-metiladenina glicosilasa I
BI01053
791884 792942 - proteína teórica
BI01054
793226 793780 + proteína teórica
BI01055
793761 794246 - proteína teórica
BI00021g
794049 794498 + transposasa B
BI00020g
794300 794749 + IS1601-D
BI01056
794665 794844 + transposasa subunidad B
BI01057
794937 795989 - integrasa/recombinasa XerC, probable [importada], posible
BI01434t
795989 796876 - probable integrasa/recombinasa
BI01058
796951 798150 - probable integrasa/recombinasa
BI01059
798284 799564 - IS3-Spn1, transposasa
BI01060
799635 800477 - posible subunidad de transposasa
BI01061
800762 802579 - proteína DUF262 teórica de función desconocida
BI01062
802742 803464 - proteína teórica
BI01063
803748 804065 - proteína teórica conservada
BI01064
804058 804405 - proteína teórica
BI01065
804667 808221 + ADN polimerasa III, cadena alfa VC2245 [importada]
BI01066
808312 808743 + proteína teórica conservada
BI01067
808952 810826 + antígeno, 67 kDa
BI01068
810916 811413 + NH2-acetiltransferasa
BI01069
817553 818377 - oxidoreductasa, familia aldo/ceto reductasa
BI01070
818538 819956 + azúcar quinasa, familia FGGY, posible
BI01451t
819972 820262 + Acilfosfatasa
BI01071
820382 821761 + histidinol deshidrogenasa
BI01072
821761 822918 + histidinol-fosfato aminotransferasa
BI01073
823007 823603 + imidazolglicerol-fosfato deshidratasa
BI01074
823606 824397 + proteína Blon020586 teórica
BI01075
824435 825079 + imidazol glicerol fosfato sintasa, subunidad glutamina amidotransferasa
BI01076
825152 825874 + proteína HisA/TrpF bifuncional
BI01077
825984 826103 - proteína teórica fuertemente conservada
BI01463t
826039 827637 - proteína teórica conservada
BI01078
827738 828898 + Glutamina sintetasa, dominio catalítico
BI01079
829137 829604 + transportador, posible
BI01080
829657 830625 - proteína teórica conservada
BI01081
830625 834758 - helicasa HrpA dependiente de ATP
BI01082
834751 835404 - proteína teórica conservada
BI01083
835647 837065 + proteína de unión a GTP
BI01084
837405 838208 + L-lactato deshidrogenasa
BI01085
838356 839291 - proteína del sistema de salida de cationes
BI01086
839460 840182 - represor LexA
BI01087
840333 840680 + proteína de dominio LysM
BI01088
840736 841173 + proteína TIGR00244 conservada teórica
BI01089
841314 842510 - D-3-fosfoglicerato deshidrogenasa
BI01090
842524 844800 - COG3973:Superfamilia I de ADN y ARN helicasas
BI01091
845133 845651 + proteína TIGR00242 conservada teórica
BI01092
845654 846730 + S-adenosil-metiltransferasa MraW
BI01093
846740 847186 + proteína Blon020568 teórica
BI01094
847186 848985 + proteína de unión a penicilina, posible
BI01095
849015 849884 + proteína teórica conservada
BI01096
849936 851384 + UDP-N-acetilmuramoilalanil-D-glutamil-2,6diaminopimelato-D-alanil-D-alanil ligasa
BI01097
851453 852535 + fosfo-N-acetilmuramoil-pentapéptido-transferasa
BI01098
852593 854035 + UDP-N-acetilmuramoilalanina-D-glutamato ligasa
BI01099
854025 855239 + proteína de división celular, familia FtsW/RodA/SpoVE, posible
BI01100
855258 856436 + UDP-N-acetilglucosamina-N-acetilmuramil-(pentapéptido) pirofosforil-undecaprenol N-acetilglucosamina transferasa
BI01101
856651 858075 + UDP-N-acetilmuramato-alanina ligasa
BI01102
858078 859139 + proteína de división celular FtsQ teórica
BI01103
859565 860983 + familia de la enzima procesadora de Appr-1-p, teórica
BI01104
861241 861813 + Desconocido
BI01105
861640 861885 - proteína teórica
BI01106
861906 862391 + D-tirosil-ARNt(Tyr) desacilasa
BI01107
862494 863735 - transportador glucosa/galactosa, posible
BI01108
863844 864230 - proteína de la familia de la glioxolasa, teórica
BI01109
864308 865201 - fructoquinasa, posible
BI01110
865277 866488 - familia VC2007 del regulador de la transcripción ROK [importada], posible
BI01111
866715 867626 + glucoquinasa, posible
BI01112
867792 868913 - regulador transcripcional de tipo NagC/XylR
BI01113
869251 870060 + glucosamina-6-fosfato isomerasa
BI01114
870119 871393 + N-acetilglucosamina-6-fosfato desacetilasa
BI01115
871646 873307 + transportador ABC de dipéptido, proteína de unión dipéptido
BI01116
873480 874568 + transportador ABC de oligopéptido, proteína permeasa
BI01117
874714 875739 + transportador ABC de dipéptido, proteína permeasa
BI01118
875746 877452 + proteína de unión a ATP del transportador ABC
BI01119
877508 878026 - proteína de la familia MutT/nudix
BI01120
878078 879670 - Xaa-Pro aminopeptidasa I
BI01121
879977 880954 - proteína teórica conservada
BI01122
882044 883672 + folC
BI01123
883736 887410 + familia SMC, familia del dominio del extremo C
BI01124
887535 888527 - proteína teórica conservada
BI01125
888652 890202 - UDP-N-acetilmuramoilalanil-D-glutamato-2,6diaminopimelato ligasa
BI01126
890377 891126 + factor sigma-70 de ARN polimerasa, subfamilia ECF
BI01127
891129 891446 + proteína teórica conservada
BI01128
891719 892660 - superfamilia Aldosa 1-epimerasa
BI01129
892788 893741 - superfamilia Aldosa 1-epimerasa
BI01130
894032 895021 + hidroximetilbutenil pirofosfato reductasa
BI01131
895067 895573 - regulador transcripcional, posible
BI01132
895670 896725 - gliceraldehído-3-fosfato deshidrogenasa, tipo I
BI01133
896968 897690 - Tiamina pirofosfoquinasa, familia del dominio catalítico
BI01134
897586 898923 + espermina/espermidina sintasa, teórica
BI01135
899364 899930 + factor IF-3 de inicio de la traducción, dominio del extremo C
BI00041g
899764 900105 + proteína ribosómica L35
BI01136
900161 900541 + proteína ribosómica L20
BI01137
900605 901537 + Integrasa
BI01138
901668 904511 + transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01139
904656 905612 + proteína de la familia Soj
BI01140
905634 906545 + ACR sin caracterizar, COG1354
BI01141
906675 907274 + proteína TIGR00281 conservada teórica
BI01142
907409 908233 + proteína de la familia MutT/nudix
BI01143
908296 909573 + complejo quinolinato sintetasa, subunidad A
BI01144
909668 911296 + L-aspartato oxidasa
BI01145
911303 912193 + nucleótido nicotinato pirofosforilasa
BI01146
912292 913443 + posible aminotransferasa dependiente de fosfato de piridoxal
BI01147
913478 914824 + transportador de la familia del facilitador mayor
BI01148
915142 917070 + proteína TypA de unión a GTP
BI01149
917197 917616 + proteína teórica conservada
BI01150
917699 918673 + prefenato deshidratasa, posible
BI01151
918670 919734 + prefenato deshidrogenasa
BI01152
919947 920201 + proteína teórica conservada
BI01153
920239 921303 + proteína de la familia de la integrasa de fago
BI01154
921559 923196 + proteína de unión a soluto del sistema transportador ABC posiblemente para péptidos
BI01155
923500 924423 + dppB
BI01156
924445 925446 + dppC
BI01157
925505 927478 + transportador de tipo ABC, componente ATPasa duplicado
BI01158
927793 928650 - exodesoxirribonucleasa III
BI01159
928775 929626 + proteína teórica conservada
BI01160
929645 930400 + proteína transmembrana teórica fuertemente conservada
BI01161
930393 931658 + ARN metiltransferasa, familia TrmA
BI01162
931673 932365 + lipoproteína, posible
BI01163
932483 935032 + ATPasa transportadora de cationes, familia E1-E2
BI01164
935156 937852 + aconitato hidratasa 1
BI01165
938001 938360 + proteína cinta-hélice-hélice, proteína de dominio de la familia copG
BI01166
938363 938851 + dominio PIN, posible
BI01167
938917 941019 - proteína de la familia DUF262 de función desconocida
BI01168
941112 941777 - familia de la acetiltransferasa, familia GNAT
BI01169
941793 942608 - regulador de la respuesta de unión a ADN, posible
BI01170
942553 943935 - sensor histidina quinasa atípico de sistema bicomponente
BI01171
944117 944959 + proteína teórica conservada
BI01172
945143 946039 + proteína de membrana, posible
BI01173
946326 947195 + proteína de membrana, posible
BI01174
947234 948073 - GTP pirofosfoquinasa [importado]
BI01175
948115 949554 + enzima MiaB ARNt-i(6)A37 tiotransferasa
BI01176
949568 950551 + ARNt delta(2)-isopentenilpirofosfato transferasa
BI01177
950591 951517 - familia de familia de la proteína Fic
BI01178
951663 954437 + proteína de división celular FtsK
BI01179
954635 955267 + CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3fosfatidiltransferasa
BI01180
955282 955812 + proteína del dominio CinA de la proteína inducible por competencia/lesión
BI01181
955881 956387 + posible proteína de unión al ADN
BI01182
956502 956732 + proteína teórica conservada
BI01183
957036 958226 + proteína recA
BI01184
958232 958822 + proteína reguladora RecX
BI01185
959702 960361 + proteína de la familia S30AE
BI01186
960556 963417 + preproteína translocasa, subunidad SecA
BI00044g
963734 963970 - COG3464: Transposasa y derivados inactivados
BI01187
963974 964096 - COG3464: Transposasa y derivados inactivados
BI00045g
964219 964602 + proteína BL0497 teórica
BI01188
964674 965717 + antranilato fosforribosil transferasa
BI01189
965964 966686 - proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI01190
966447 967418 + Aciltransferasa teórica
BI01191
967476 969722 - proteína quinasa serina/treonina, posible
BI01192
969893 970858 - idsA2
BI01193
971179 971838 + proteína teórica conservada
BI01194
972002 973465 + factor sigma principal de la ARN polimerasa, sigma 70
BI01195
973526 975799 + ADN girasa, subunidad B
BI01196
975969 977192 + proteína de membrana, posible
BI01197
977269 978228 + riboquinasa
BI01198
978247 982977 + proteína de dominio de la helicasa de la secuencia DEAD/DEAH
BI01199
982994 983779 - regulador de la respuesta de unión a ADN TcrA, posible
BI01200
983927 986953 - ADN girasa, subunidad A
BI01201
986925 988169 + proteína teórica conservada
BI01202
988185 989189 - proteína teórica conservada
BI01203
989432 989722 + proteína teórica conservada
BI01204
989725 990198 + desoxiuridina-5-trifosfato nucleotidohidrolasa
BI01205
990335 992656 + GTP pirofosfoquinasa
BI01206
992780 993058 - orfB
BI01207
993226 994425 + probable integrasa/recombinasa
BI01640t
994500 995387 + probable integrasa/recombinasa
BI01208
995387 996439 + integrasa/recombinasa XerC, probable [importada], posible
BI01209
996532 997095 - COG2801: Transposasa y derivados inactivados
BI00053g
997107 997619 - ASOPSNART-11OSRSI
BI01210
997719 998264 - posible peptidil-prolil cis-trans isomerasa
BI01211
998331 999296 - COG3391: Proteína conservada sin caracterizar
BI01212
999519 999623 - proteína teórica
BI01213
999683 1000615 - proteína de membrana, posible
BI01214
1000747 1001295 + proteína citosólica teórica
BI01215
1001329 1002621 - proteína teórica conservada
BI01216
1002648 1003532 + posible fosfoglicerato mutasa
BI01217
1003650 1004597 + transportador de magnesio, familia CorA
BI01218
1004615 1005538 + glnH, posible
BI01219
1005776 1008544 + leucil-ARNt sintetasa
BI01220
1008708 1009484 + proteína de dominio de la región hélice-horquilla-hélice de la proteína de competencia ComEA
BI01221
1009553 1011235 + proteína transmembrana teórica conservada relacionada con ComA
BI01222
1011378 1012721 + posible prolidasa (X-Pro dipeptidasa) o clorohidrolasa
BI01223
1012791 1013759 + proteína teórica conservada
BI01224
1013783 1014346 + proteína TIGR00150 conservada teórica
BI01225
1014411 1015289 + proteína teórica conservada
BI01226
1015308 1015859 + proteína ribosómica-alanina acetiltransferasa
BI01227
1015859 1016899 + O-sialoglicloproteína endopeptidasa
BI01228
1017438 1017539 - proteína teórica
BI01229
1017569 1018501 + probable integrasa/recombinasa
BI01230
1018564 1018887 - proteína teórica conservada
BI01231
1018909 1019787 - proteína teórica conservada
BI01232
1019849 1020361 - proteína teórica conservada
BI01233
1020474 1021376 - familia de familia de la proteína Fic
BI01234
1021357 1021929 - proteína BL1463 teórica
BI01235
1021949 1023763 - proteína teórica conservada
BI01236
1023782 1024864 - proteína teórica conservada
BI01237
1024893 1025600 - proteína teórica conservada
BI01238
1025761 1026843 - posible proteína relacionada con TraG
BI01239
1026843 1027799 - proteína Blon020262 teórica
BI01240
1027799 1028164 - proteína Blon020261 teórica
BI01242
1028379 1028669 + proteína Blon020260 teórica
BI01241
1028588 1030942 + ADN topoisomerasa III
BI01243
1030771 1031448 + proteína Blon020258 teórica
BI01244
1031753 1032193 + COG1758: ARN polimerasa dirigida a ADN, subunidad K/omega
BI01245
1032161 1032553 - proteína Blon020256 teórica
BI01246
1032621 1033400 - familia de familia de la proteína Fic
BI01247
1033518 1034822 + MC38, posible
BI01248
1034848 1036128 - POSIBLE PROTEÍNA HIPA REGULADORA DE LA TRANSCRIPCIÓN
BI01249
1036128 1036439 - proteína Blon020251 teórica
BI01250
1036545 1037675 - proteína teórica conservada
BI01251
1038618 1040387 - MC40
BI01252
1040507 1041145 - proteína teórica conservada
BI01253
1041250 1042281 - proteína teórica conservada
BI01254
1042389 1042865 - proteína teórica conservada
BI01255
1043244 1044842 - proteína análoga a la proteína de unión a ATP
BI01256
1044857 1046341 - proteína teórica conservada
BI01257
1046369 1048195 - lipoproteína, posible
BI01258
1048370 1048669 - proteína teórica conservada
BI01259
1048710 1049189 - MC47, posible
BI01713t
1049183 1050538 + proteína BL1487 teórica
BI01260
1049206 1050405 - proteína teórica
BI01261
1050435 1051070 - proteína Blon020236 teórica
BI01262
1051396 1056213 - COG2217 teórica: ATPasa transportadora de cationes
BI01263
1056508 1057458 - proteína Blon020231 teórica
BI01264
1057844 1058440 - COG1192 teórica: ATPasas implicadas en el reparto del cromosoma
BI01265
1059167 1059430 - COG1192: ATPasas implicadas en el reparto del cromosoma
BI01266
1059569 1060042 - posible factor de transcripción análogo a WhiB
BI01267
1060036 1061400 - proteína teórica conservada
BI01727t
1061400 1061597 - proteína Blon020220 teórica
BI01268
1061748 1061894 - proteína teórica
BI01730t
1061882 1062055 - proteína Blon020217 teórica
BI01269
1062779 1062997 - proteína teórica conservada
BI01270
1063127 1063546 + proteína de dominio hélice-giro-hélice
BI01733t
1064092 1064778 + proteína teórica conservada
BI01271
1064862 1066490 - lipoproteína, posible
BI01272
1066742 1067959 - isocitrato deshidrogenasa, dependiente de NADP
BI01273
1068051 1069208 + familia de la proteína IMP deshidrogenasa
BI01274
1069373 1069861 + proteína Blon020211 teórica
BI01275
1069955 1072039 + ácido-graso-de-cadena-larga-CoA ligasa, posible
BI01276
1072049 1072534 + polipéptido deformilasa
BI01277
1072876 1073736 + proteína ribosómica S2
BI01278
1073818 1074666 + factor Ts de alargamiento de la traducción
BI01279
1074978 1075580 + uridilato quinasa
BI01280
1075660 1076208 + factor de reciclado de ribosomas
BI01281
1076309 1077217 + fosfatidato citidiltransferasa
BI01282
1077557 1078597 + enzima del radical SAM, familia Cfr
BI01283
1078604 1079149 - proteasa I
BI01284
1079324 1080091 + imidazolglicerol fosfato sintasa, subunidad ciclasa
BI01285
1080228 1080620 + fosforribosil-AMP ciclohidrolasa
BI01286
1080704 1082257 + componente I de la antranilato sintasa
BI01287
1082328 1082564 - proteína teórica conservada
BI01288
1082576 1084174 + proteína de unión a ATP del transportador ABC
BI01289
1084221 1084925 + oxidorreductasa, familia de la deshidrogenasa/reductasa de cadena corta, posible
BI01290
1084999 1085364 + proteína fuertemente conservada con función desconocida
BI01291
1085423 1086091 - proteína teórica conservada
BI01292
1086091 1087701 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01293
1087704 1088600 - posible permeasa del sistema transportador ABC para cobalto
BI01294
1088405 1089049 - proteína fuertemente conservada con función desconocida
BI01295
1089261 1090877 + proteína teórica conservada
BI01296
1090916 1091548 + proteína teórica conservada
BI01297
1091551 1095093 + proteína teórica con función desconocida análoga a miosina
BI01298
1095170 1096351 + proteína teórica conservada
BI01299
1096680 1097084 + proteína BL0701 teórica
BI01300
1097367 1100384 + escinucleasa ABC, subunidad A
BI01301
1100532 1102895 + escinucleasa ABC, subunidad C
BI01302
1103007 1103975 + aroE
BI01303
1103978 1104961 + quinasa que contiene el bucle P prevista
BI01304
1105247 1106110 + BCR sin caracterizar, COG1481
BI01305
1106282 1107484 + fosfoglicerato quinasa
BI01306
1107546 1108346 + triosafosfato isomerasa
BI01307
1108365 1108658 + preproteína translocasa, subunidad SecG
BI01308
1108763 1109710 + L-lactato deshidrogenasa
BI01309
1109710 1110558 + familia de la proteína Cof
BI01310
1110672 1112225 + aminotransferasa, clase I,
BI01311
1112360 1113466 - proteína de membrana, posible
BI01312
1113642 1114943 - proteína transportadora del sistema transportador II de aminoácidos ramificados
BI01313
1115108 1116208 - transaldolasa
BI01314
1116332 1118392 - transcetolasa
BI01315
1118812 1119927 + represor de la transcripción HrcA inducible por calor
BI01316
1119986 1121128 + proteínas dnaJ
BI01317
1121180 1121968 - COG3001:BCR no caracterizada
BI01318
1122113 1122994 + undecaprenol quinasa, posible
BI01319
1123157 1124146 - proteína teórica conservada
BI01320
1124807 1126837 + treonil-ARNt sintetasa
BI01321
1127061 1127561 + familia de la proteína HIT
BI01322
1127703 1128455 + proteína TIGR01033 conservada teórica
BI01323
1128464 1129045 + endodesoxirribonucleasa RuvC de la unión cruzada
BI01324
1129106 1129729 + ADN helicasa RuvA de la unión de Holliday
BI01325
1129732 1130793 + ADN helicasa RuvB de la unión de Holliday
BI01326
1130876 1131292 + preproteína translocasa, subunidad YajC
BI01327
1131359 1131937 + adenina fosforribosiltransferasa
BI01328
1132037 1133236 + succinil-CoA sintetasa, subunidad beta
BI01329
1133239 1134147 + succinil-CoA sintasa, subunidad alfa
BI01330
1133954 1135546 + proteína de membrana, posible
BI01331
1135497 1137131 + fosforribosilaminoimidazolcarboxamida formiltransferasa/IMP ciclohidrolasa
BI01332
1137280 1137579 + proteína teórica
BI01333
1137484 1138449 - acuaporin Z, posible
BI01334
1138645 1139412 + pseudouridina sintasa B, subunidad ribosómica grande
BI01335
1139514 1141538 + posible proteína de unión al GTP
BI01336
1141896 1143422 + UDP-glucosa pirofosforilasa
BI01337
1143565 1145475 + proteína teórica conservada
BI01338
1145489 1145803 + proteína Blon020144 teórica
BI01339
1145819 1148407 + helY
BI01340
1148524 1148868 + proteína teórica conservada
BI01341
1149001 1149717 + hidrolasa, familia análoga a la haloácido deshalogenasa
BI01833t
1149744 1149995 + proteína teórica conservada
BI01342
1150135 1150497 - proteína Blon020140 teórica
BI01343
1150673 1151302 - COG0789:Reguladores transcripcionales previstos
BI01344
1151406 1151846 - posible proteína de transducción de la señal
BI01345
1151856 1152596 - proteína teórica conservada
BI01346
1152693 1153022 - proteína básica pequeña
BI01347
1153025 1153999 - proteína teórica conservada
BI01348
1153992 1154684 - CDP-diacilglicerol-glicerol-3-fosfato 3fosfatidiltransferasa, posible
BI01349
1154623 1155471 - ATP fosforribosiltransferasa
BI01350
1155486 1155746 - fosforribosil-ATP pirofosfohidrolasa
BI01351
1155812 1156477 - ribulosa-fosfato 3-epimerasa
BI01352
1156556 1157500 - prolipoproteína diacilgliceril transferasa
BI01353
1157614 1158480 - triptófano sintasa, subunidad alfa
BI01354
1158507 1160591 - triptófano sintasa, subunidad beta
BI01355
1161120 1161968 - endonucleasa IV
BI00066g
1161414 1162400 + aminoácido permeasa
BI01356
1162340 1162834 + aminoácido permeasa
BI01357
1162503 1162667 + aminoácido permeasa
BI01358
1163206 1164216 - proteína de membrana teórica con función desconocida
BI01359
1164333 1164536 - proteína teórica
BI01360
1164570 1164860 - proteína AbiGI de aborto por infección, posible
BI01361
1164981 1165262 + proteína teórica
BI01362
1165260 1165715 - lin2984
BI01363
1165903 1166406 + acetilstransferasa, familia GNAT, posible
BI01364
1166567 1166746 + lin0863
BI01365
1166793 1167323 - acetiltransferasa, familia GNAT
BI01366
1167392 1167961 - acetiltransferasa, familia GNAT
BI01367
1168315 1168992 - proteína teórica
BI01368
1169017 1169823 - proteína teórica
BI01369
1169832 1170527 - Transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01370
1170352 1171263 + dominio del receptor del regulador de la respuesta, teórico
BI01371
1171317 1172225 + proteína teórica
BI01372
1172194 1172631 - proteína de integridad de membrana, teórica
BI01373
1172956 1173576 - proteína teórica
BI01374
1173576 1174301 - proteína teórica
BI01873t
1174309 1174962 - transportador ABC de bacteriocina, proteína de unión a ATP, posible
BI01375
1175274 1176518 + familia IS30, transposasa [importado]
BI01376
1176714 1177379 - regulador de la respuesta de unión a ADN
BI01377
1177379 1179001 - proteína de dominio análoga a ATPasa teórica, histidina quinasa-, ADN girasa B-, y HSP90
BI01378
1179039 1179881 - permeasa teórica, posible
BI01379
1180057 1180956 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01380
1181077 1181259 + proteína teórica
BI01381
1181154 1181684 - proteína teórica
BI01382
1182016 1182315 + BlsA
BI01383
1182321 1182662 + proteína teórica
BI01384
1182847 1183050 - proteína teórica
BI01385
1183324 1183446 + proteína BL0771 teórica
BI01386
1183489 1183932 + proteína Blon020116 teórica
BI01387
1183955 1184314 - COG0388: Amidohidrolasa prevista
BI01388
1184376 1184531 - proteína teórica
BI01389
1184840 1185853 - proteína de la membrana interna, 60 kDa VC0004 [importada]
BI01390
1186097 1186555 - proteína teórica
BI01391
1186942 1187067 + proteína teórica
BI01392
1187122 1188783 + aminoácido permeasa
BI01393
1188993 1189640 - peptidasa I de la señal
BI00067g
1189800 1190303 + proteína teórica conservada
BI01394
1189721 1190146 - proteína Blon020104 teórica
BI01395
1190467 1191420 + lin0466
BI01396
1191479 1191799 + proteína teórica fuertemente conservada
BI01397
1191887 1192165 + proteína teórica fuertemente conservada
BI01398
1192540 1193727 + Desconocida, posible
BI01399
1193770 1195530 + proteína de la familia YjeF
BI01400
1195635 1196261 + posible alfa beta hidrolasa
BI01401
1196417 1197286 + regulador transcripcional, familia LysR
BI01402
1197447 1198565 - proteína teórica conservada
BI01403
1198783 1198932 - proteína teórica
BI01404
1199044 1199736 - orotato fosforribosiltransferasa
BI01405
1199748 1200716 - dihidroorotato deshidrogenasa
BI01406
1200722 1201543 - dihidroorotato deshidrogenasa, subunidad de transferencia de electrones
BI01407
1201682 1202632 - orotidina 5`-fosfato descarboxilasa
BI01408
1202653 1203939 - dihidroorotasa
BI01921t
1204146 1204562 - cadena reguladora de la aspartato carbamoil transferasa, dominio alostérico
BI01409
1204565 1205524 - aspartato carbamoil transferasa
BI01410
1205669 1208896 - familia de la adenilil tranferasa de la glutamatoamoniaco ligasa
BI01411
1208955 1209905 - EF0040
BI01412
1210042 1210893 - 5,10-metilenetetrahidrofolato reductasa
BI01413
1210955 1213255 - 5-metiltetrahidropteroiltriglutamato-homocisteína Smetiltransferasa
BI01414
1213369 1213923 - fosfohistidina fosfatasa SixA, posible
BI01415
1214024 1215091 - proteína teórica conservada
BI01416
1215168 1215803 + serina esterasa, posible
BI01417
1215850 1216806 - oxidorreductasa, familia 2 de la aldo/ceto reductasa
BI01418
1217063 1217995 + lipC, posible
BI01419
1218234 1219178 + oxidoreductasa teórica, familia de la deshidrogenasa de unión a cinc
BI01420
1219340 1219642 - probable proteína de unión a ATP del transportador ABC
BI01421
1220459 1221484 + transposasa (25) BH3998 [importado], posible
BI00069g
1221277 1221948 + proteína teórica
BI01422
1221948 1222706 + Tpase2
BI01423
1222896 1223972 + proteína teórica
BI01424
1224236 1224811 + proteína teórica
BI01425
1224888 1225190 - regulador transcripcional, familia HTH_3
BI01426
1225221 1226144 - proteína teórica
BI01427
1226238 1227140 - proteína teórica
BI01428
1227158 1228765 - proteína teórica
BI01429
1229279 1230097 - ADP-ribosilglicohidrolasa teórica
BI01430
1231271 1231726 - proteína teórica
BI01431
1232085 1232906 + proteína teórica conservada
BI01432
1233000 1233539 - bcp
BI01433
1233681 1234511 - probable amidasa [importada]
BI01434
1234511 1235365 - hidrolasa, familia análoga a la haloácido deshalogenasa, posible
BI01435
1235520 1236365 - proteína transportadora de aminoácidos
BI01436
1236462 1237709 - posible glicosiltransferasa
BI01437
1237841 1238302 - proteína teórica conservada
BI01438
1238382 1239917 - gltD
BI01439
1239922 1244265 - Región conservada en la familia de la glutamato sintasa
BI01440
1244835 1245116 + regulador transcripcional, familia LacI [importado]
BI01441
1245175 1246197 - proteína teórica conservada
BI01442
1246656 1246979 + proteína teórica conservada
BI01443
1247042 1247227 - proteína teórica
BI01444
1247493 1248536 - regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI01445
1249246 1250073 + proteína teórica conservada
BI01446
1250275 1250571 - proteína teórica
BI00071g
1250541 1250888 - proteína teórica conservada
BI01447
1250658 1250807 + proteína teórica
BI01448
1251252 1252538 + proteína de la familia de salida de MATE, posible
BI01449
1252678 1252794 - proteína teórica
BI01450
1253083 1254216 + familia IS30, transposasa [importado]
BI01451
1254323 1255327 - glicerato quinasa
BI01452
1255679 1256734 + regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI01453
1256820 1258094 - coproporifinógeno III oxidasa independiente de oxígeno, posible
BI01454
1258229 1259890 - proteína LepA de unión a GTP
BI01455
1260253 1260510 + proteína ribosómica S20
BI01456
1260768 1261556 - proteína transmembrana teórica con función desconocida conservada
BI01457
1261807 1262703 - regulador transcripcional, familia MazG
BI01458
1262903 1264027 - aminotransferasa de aminoácido de cadena ramificada
BI01459
1264254 1264871 - proteína Ctc/L25/TL5 de unión al bucle E del ARNr 5S
BI01460
1265298 1266332 + proteína teórica conservada
BI01461
1266474 1267895 - NAD(P) transhidrogenasa, subunidad beta [importada]
BI01462
1267898 1268200 - NAD(P) transhidrogenasa, subunidad alfa
BI01463
1268219 1269379 - NAD(P) transhidrogenasa, subunidad alfa [importada]
BI01464
1269798 1271828 + ácido-graso-de-cadena-larga-CoA ligasa
BI01465
1271887 1272948 - proteína Era de unión a GTP
BI01466
1272953 1274383 - proteína de dominio CBS
BI01467
1274462 1275052 - proteína TIGR00043 conservada teórica
BI01468
1275000 1276172 - familia de la proteína PhoH
BI01469
1276194 1276529 - familia de la proteína Hit
BI01470
1276581 1277375 - proteína TIGR00046 conservada teórica
BI01471
1277619 1278494 + proteína de la familia de spoU ARNr metilasa
BI01472
1278758 1279939 + glucosa-1-fosfato adenililtransferasa
BI01473
1280035 1280532 - proteína homóloga a mrp
BI01474
1280635 1281171 - proteína de ensamblaje de FeS del sistema SUF, familia NifU
BI01475
1281201 1282472 - aminotransferasa, clase V
BI01476
1282614 1283390 - ATPasa de ensamblaje de FeS SufC
BI01477
1283419 1284651 - proteína de ensamblaje de FeS SufD
BI01478
1284660 1286156 - proteína de ensamblaje de FeS SufB
BI01479
1286383 1287849 - proteína teórica conservada
BI01480
1288225 1289883 - CTP sintasa
BI01481
1290032 1291585 - dipeptidasa, posible
BI01482
1291684 1292127 - 3-deshidroquinato deshidratasa, tipo II
BI01483
1292294 1293835 - 3-deshidroquinato sintasa
BI01484
1293999 1295132 - corismato sintasa
BI01485
1295247 1295717 + COG0477: Permeasas de la superfamilia del facilitador mayor
BI01486
1295891 1297003 - BCR sin caracterizar, familia YceG, familia COG1559
BI01487
1297083 1297535 - proteína TIGR00250 conservada teórica
BI01488
1297550 1300228 - alanil-ARNt sintetasa
BI01489
1300359 1300592 - proteína Blon020010 teórica
BI01490
1300595 1300990 - proteína teórica conservada
BI01491
1301196 1301921 - fosfoglicerato mutasa
BI01492
1302158 1304008 + proteína de dominio de la familia de la aciltransferasa
BI01493
1304105 1304728 - proteína ribosómica S4
BI01494
1304930 1305895 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01495
1305900 1307114 - proteína transmembrana teórica con función desconocida
BI01496
1307208 1307603 - proteína teórica conservada
BI01497
1307751 1310450 - helicasa UvrD/REP teórica
BI01498
1310567 1311145 + xantina fosforribosiltransferasa
BI01499
1311199 1312560 + familia de la proteína xantina/uracil permeasa
BI01500
1312696 1312902 - regulador de la transcripción, proteína relacionada con la familia Cro/CI [importado]
BI01501
1312912 1313169 - proteína teórica
BI01502
1313326 1314144 - hidrolasa, familia del pliegue alfa/beta, posible
BI01503
1314432 1315367 + proteína teórica conservada
BI01504
1315462 1315860 - familia de la proteína glioxalasa
BI01505
1316019 1316630 + isocorismatasa
BI01506
1316885 1318360 + proteína teórica conservada
BI01507
1318371 1319780 - proteína de membrana, posible
BI01508
1319770 1321005 - proteína de membrana, posible
BI01509
1321109 1322089 - proteína de unión a ATP de resistencia a daunorrubicina
BI01510
1322192 1322296 - proteína teórica
BI01511
1322475 1323824 + sensor histidina quinasa de sistema bicomponente
BI01512
1323917 1324477 + regulador de la respuesta de unión a ADN
BI01513
1324667 1325287 - proteína de una subfamilia de función desconocida
BI01514
1325308 1326324 - familia de la proteína del transportador de fosfato
BI01515
1326480 1326674 - proteína teórica conservada
BI01516
1326735 1329005 - proteína A de privación de carbono
BI01517
1329406 1330668 + glicosil hidrolasa, familia 13, posible
BI01518
1330703 1331404 - regulador transcripcional, familia TetR, posible
BI01519
1331486 1333669 - posible ARN helicasa dependiente de ATP
BI01520
1334052 1335338 - uracil-xantina permeasa
BI01521
1335446 1336273 - proteína de dominio de la familia de la fosfoglicerato mutasa
BI01522
1336327 1336905 - proteína teórica conservada
BI01523
1337061 1337612 + proteína teórica conservada
BI01524
1337738 1338898 - proteína teórica conservada
BI01525
1339275 1340816 - proteína teórica conservada
BI01526
1341250 1341687 + COG0653 teórica: Preproteína de la subunidad SecA de la translocasa (ATPasa, ARN helicasa)
BI01527
1341752 1343449 + proteína de dominio de proteína quinasa
BI01528
1343493 1344980 - permeasa, posible
BI01529
1345295 1347565 - transportador de resistencia a fármaco, subfamilia EmrB/QacA
BI01530
1347576 1347776 - proteína teórica
BI01531
1347947 1348309 + Dominio teórico de función desconocida (DUF307)
BI01532
1348405 1349910 - proteína teórica
BI01533
1349906 1351072 - proteína teórica
BI01534
1351166 1351474 - proteína teórica
BI02085t
1351280 1351477 + proteína Blon021394 teórica
BI01535
1351807 1352478 + COG4186: Fosfoesterasa o fosfohidrolasa previstas
BI01536
1352565 1354004 + proteína teórica conservada
BI01537
1354044 1354253 + proteína BL0925 teórica
BI01538
1354253 1354612 + proteína BL0925 teórica
BI01539
1354729 1355193 + proteína teórica
BI01540
1355496 1356380 - proteína teórica
BI01541
1356380 1357450 - familia de la integrasa de fago, teórica
BI01542
1357650 1358675 + transposasa (25) BH3998 [importado], posible
BI00076g
1358468 1359139 + proteína teórica
BI01543
1359139 1359897 + Tpase2
BI01544
1360305 1361546 - proteína YchF de unión a GTP
BI01545
1361533 1362351 - pirrolina-5-carboxilato reductasa
BI01546
1362416 1363891 - prolina iminopeptidasa
BI01547
1363977 1366433 + sensor histidina quinasa de sistema bicomponente
BI01548
1366551 1367345 + regulador de la respuesta de unión a ADN
BI01549
1367384 1370233 - posible proteína de transporte
BI01550
1370265 1371176 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01551
1371528 1372841 - O-acetilhomoserina sulfhidrilasa
BI01552
1373315 1374184 + piridoxal quinasa, posible
BI01553
1374424 1374924 + proteína TIGR00252 conservada teórica
BI01554
1374983 1376515 + proteína relacionada con Mg quelatasa
BI01555
1376515 1378212 + proteína DprA para el procesamiento de ADN, posible
BI01556
1378272 1380134 + sdhA
BI01557
1380233 1381195 + sdhB
BI01558
1381277 1381954 + probable metiltransferasa
BI01559
1382006 1382944 - proteína TIGR00730 conservada teórica
BI01560
1383180 1384595 - antiportador Na+/H+, [importado]
BI01561
1385070 1386485 - proteasa Clp dependiente de ATP, subunidad ClpX de unión a ATP
BI01562
1386610 1387308 - proteasa Clp dependiente de ATP, subunidad ClpP proteolítica
BI01563
1387317 1387907 - proteasa Clp dependiente de ATP, subunidad ClpP proteolítica
BI01564
1388046 1388423 - proteína Blon021418 teórica
BI01565
1388538 1390001 - familia de la proteína del canal del cloruro regulado por tensión, posible
BI01566
1390189 1391565 - factor disparador
BI01567
1391623 1392921 - proteína de dominio de la 3-5 exonucleasa
BI01568
1392921 1393730 - COG0477: Permeasas de la superfamilia del facilitador mayor
BI01569
1393622 1394500 - enzima activadora de la piruvato formiato-liasa 1
BI01570
1394613 1396985 - formiato acetiltransferasa
BI01571
1397254 1397475 - proteína teórica conservada
BI01572
1397531 1399093 - NAD+ sintetasa dependiente de NH(3)
BI01573
1399577 1400725 - Peptidasa, familia M20/M25/M40
BI01574
1400817 1401500 - proteína permeasa del sistema transportador ABC
BI01575
1401500 1402702 - transportador ABC, proteína de unión a ATP
BI01576
1402839 1403816 - lipoproteína, familia YaeC
BI01577
1404020 1404847 + hidrolasa, familia análoga a la haloácido deshalogenasa
BI01578
1404975 1407449 - D-xilulosa 5-fosfato/D-fructosa 6-fosfato fosfocetolasa
BI01579
1407895 1409454 + GMP sintasa
BI01580
1409723 1410304 + COG0798: Bomba ACR3 de la salida de arsenito y permeasas relacionadas
BI01581
1410343 1410720 + proteína de resistencia al arsénico/arseniato reductasa
BI01582
1411265 1411771 + familia de la transposasa IS66 teórica
BI00078g
1411579 1412214 + proteína Blon021471 teórica
BI01583
1412111 1413136 + transposasa (25) BH3998 [importado], posible
BI00079g
1412929 1413600 + proteína teórica
BI01584
1413600 1414358 + Tpase2
BI01585
1414423 1414911 + COG3436 teórica: Transposasa y derivados inactivados
BI02159t
1415037 1416323 - COG0477: Permeasas de la superfamilia del facilitador mayor
BI01586
1416510 1417160 + posible proteína de unión a ATP
BI01587
1417164 1418444 + proteína conservada sin caracterizar
BI01588
1418440 1418820 + proteína Blon021466 teórica
BI01589
1418965 1420548 + proteína teórica conservada
BI01590
1420796 1422598 + aciltransferasa, posible
BI01591
1422687 1423706 + prsA
BI01592
1423991 1425370 + UDP-N-acetilglucosamina pirofosforilasa
BI01593
1425377 1425787 + proteína relacionada con iojap
BI01594
1425942 1426637 + fosfoglicerato mutasa, posible
BI01595
1427363 1428961 + fosfato acetiltransferasa
BI01596
1429099 1429695 + acetato quinasa
BI01597
1429811 1430326 + COG0282 teórica: Acetato quinasa
BI01598
1430503 1431867 - 3-fosfoshikimato 1-carboxiviniltransferasa
BI01599
1431867 1433036 - proteína de membrana, posible
BI01600
1433757 1434125 - COG2217 teórica: ATPasa transportadora de cationes
BI01601
1434688 1436172 - simport de galactósido
BI01602
1436515 1439583 + beta-galactosidasa, posible
BI01603
1440389 1441246 + proteína teórica
BI01604
1441301 1441966 - proteína Blon020709 teórica
BI01605
1442167 1442559 - proteína teórica
BI01606
1442574 1442990 - proteína teórica
BI01607
1442990 1444792 - proteína teórica
BI01608
1444688 1445566 + COG3757: Lisozima M1 (1,4-beta-N-acetilmuramidasa)
BI01609
1445667 1445948 + proteína teórica
BI01610
1446119 1446796 + proteína teórica
BI01611
1447212 1448801 + ADN metilasa específica de C-5 citosina teórica
BI01612
1448804 1449997 - proteína Psyc022392 teórica
BI01613
1450130 1450393 + proteína teórica
BI01614
1450514 1450891 - proteína teórica
BI01615
1451253 1452203 - proteína teórica
BI01616
1452503 1452802 - TnpB
BI01617
1452909 1453127 + IS861, transposasa OrfB
BI01618
1453248 1453586 + posible subunidad de transposasa
BI01619
1455179 1455604 - proteína de división celular FtsZ
BI01620
1455752 1459864 - helicasa UvrD/REP teórica
BI01621
1459861 1463163 - COG3857: nucleasa dependiente de ATP, subunidad B
BI01622
1463295 1465877 - ADN polimerasa III, subunidad alfa, teórica
BI01623
1466012 1467055 + proteína teórica conservada
BI01624
1467089 1467886 - proteína de membrana teórica fuertemente conservada
BI01625
1468160 1468507 - proteína BL0124 teórica
BI01626
1468949 1469908 - Pseudouridilato sintasas, específicas del ARN 23S
BI01627
1469911 1470456 - peptidasa de la lipoproteína señal
BI01628
1470481 1471857 - proteína teórica conservada
BI01629
1472000 1472299 - COG0762:proteína de integridad de membrana prevista
BI01630
1472424 1472900 - proteína teórica conservada
BI01631
1472916 1473830 - familia de la tubilina/FtsZ, dominio del extremo C, teórica
BI01632
1474239 1475480 - proteína NifR3 del barril TIM
BI01633
1475628 1476938 - glicidil-ARNt sintetasa
BI01634
1477533 1478474 + hidroxietiltiazol quinasa
BI01635
1478743 1481310 + proteína ThiC de la biosíntesis de tiamina
BI01636
1481353 1481679 - proteína teórica
BI01637
1481820 1482626 + fosfometilpirimidina quinasa
BI01638
1482680 1483054 + COG0011:ACR sin caracterizar
BI01639
1483563 1484939 + permeasa, posible
BI02235t
1485571 1485978 + proteína teórica conservada
BI01640
1486039 1487433 + superfamilia de las serpinas (inhibidores de la serina proteasa)
BI01641
1487717 1488517 + regulador transcripcional, familia LacI, posible
BI01642
1488728 1490068 + proteína de transporte de la sacarosa
BI01643
1490082 1491635 + sacarosa-6-fosfato hidrolasa, posible
BI01644
1491833 1492612 + transportador ABC, proteína permeasa, familia cysTW, posible
BI01645
1492927 1493943 + enzima precursora de la síntesis de pirimidina, posible
BI02246t
1494070 1495254 + nucleósido hidrolasa que prefiere inosina-uridina
BI01646
1495416 1496207 - undecaprenil difosfato sintasa
BI01647
1496207 1496923 - proteína RecO de reparación del ADN
BI01648
1496975 1498684 - proteína teórica conservada
BI01649
1498808 1500028 - 1-hidroxi-2-metil-2-(E)-butenil 4-difosfato sintasa
BI01650
1500028 1501215 - 1-desoxi-D-xilulosa 5-fosfato reductoisomerasa
BI01651
1501215 1502915 - proteína teórica conservada
BI01652
1503387 1503809 - proteína teórica conservada
BI01653
1503919 1504797 - familia de la proteína del dominio PDZ
BI01654
1505129 1506760 + proteína teórica conservada
BI01655
1506836 1508407 - ADN helicasa PcrA dependiente de ATP
BI01656
1508553 1510205 + proteína teórica conservada
BI01657
1510357 1510578 + posible proteína de unión a ATP
BI01658
1510645 1511535 - familia de la región del extremo N del dominio PHP
BI01659
1511673 1512407 + proteína transmembrana teórica fuertemente conservada
BI01660
1512419 1513309 - diaminopimelato epimerasa
BI01661
1513417 1514208 + glutamato racemasa
BI01662
1514340 1515182 + familia de la patatina
BI01663
1515255 1516151 - Desconocido
BI01664
1516314 1516580 - enzima de trans-sulfuración
BI00087g
1516749 1517024 - transportador ABC, proteína de unión a ATP, posible
BI00086g
1517139 1517573 + proteína conservada teórica en upf0074
BI01665
1517692 1517940 - proteína teórica conservada
BI01666
1518187 1519422 - cistationina beta-liasa
BI01667
1519661 1520560 - transportador ABC de glutamina, proteína de unión a glutamina periplásmica (glnH)
BI01668
1520629 1521417 - transportador ABC de aminoácido, proteína de unión al ATP
BI01669
1521413 1521952 - transportador ABC de aminoácido, proteína permeasa SP0710 [importado]
BI01670
1522074 1522730 - transportador ABC de aminoácido, proteína permeasa
BI01671
1522793 1523605 + fosfolipasa/carboxilesterasa teórica
BI01672
1523620 1525872 - Tn916, proteína de resistencia a tetraciclina, posible
BI01673
1526091 1526723 + ADN polimerasa III, subunidad épsilon
BI01674
1526731 1527318 - guanilato quinasa
BI01675
1527501 1528418 - orotidina 5`-fosfato descarboxilasa, posible
BI01676
1528421 1531801 - carbamoil-fosfato sintasa, subunidad grande
BI01677
1531806 1533176 - carbamoil-fosfato sintasa, subunidad pequeña
BI01678
1533219 1533788 - factor NusB de antiterminación de la transcripción
BI01679
1533846 1534154 - factor P de alargamiento (EF-P)
BI01680
1534514 1535248 + Desconocida, posible
BI01681
1535248 1536033 + proteína TIGR00245 conservada teórica
BI01682
1536066 1536770 - Desconocido
BI01683
1536878 1539436 - dominio EAL teórico
BI01684
1539444 1540751 - Probable proteína transmembrana hidrolasa
BI01685
1541332 1543257 + glicosiltransferasa
BI01686
1543387 1543551 - proteína teórica
BI01687
1543710 1544600 - 3-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa
BI01688
1544959 1546782 - alfa-xilosidasa
BI01689
1546897 1547199 - COG1653 teórica: sistema de transporte de azúcar tipo ABC, componente periplásmico
BI01690
1547359 1549491 - posible beta-hexosaminidasa A
BI01691
1549605 1550417 - transportador ABC, proteína permeasa, familia MalFG
BI01692
1551035 1551862 + proteína teórica conservada
BI01693
1552142 1553254 - mrp
BI01694
1553434 1556193 - ADN ligasa, dependiente de NAD
BI01695
1556261 1559881 - proteína teórica conservada
BI01696
1560102 1562237 + proteína de membrana, posible
BI01697
1562555 1564141 + proteína Blon021196 teórica
BI01698
1564204 1564977 - transportador ABC, proteína de unión a ATP, posible
BI01699
1565037 1566299 - aminotransferasa, clase I, posible
BI01700
1566573 1567337 - familia de la proteína ROK
BI01701
1567583 1568365 + familia de la proteína nitrorreductasa
BI01702
1568413 1569423 - glicosiltransferasa probable
BI01703
1569675 1570325 + proteína teórica conservada
BI01704
1570459 1572888 + transportador ABC, proteína de unión a ATP, posible
BI01705
1572963 1573265 + proteína de unión a ARN prevista que contiene un dominio KH
BI01706
1573370 1573732 - proteína teórica conservada
BI01707
1573842 1574456 + dominio TM2 teórico
BI01708
1574885 1575301 + proteína Blon021592 teórica
BI01709
1575432 1576415 - familia de la proteína 2-hidroxiácido deshidrogenasa específica del isómero D
BI01710
1576714 1578168 + transportador de resistencia a fármaco, familia EmrB/QacA, posible
BI01711
1578399 1579418 - transportador ABC de ribosa, proteína permeasa VCA0129 [importada], posible
BI01712
1579418 1580485 - transportador ABC de ribosa, proteína permeasa VCA0129 [importada], posible
BI01713
1580490 1582028 - proteína de unión a ATP del transportador ABC
BI01714
1582172 1583152 - transportador ABC de ribosa, proteína de unión D-ribosa periplásmica
BI01715
1583472 1585199 - lipoproteína, posible
BI01716
1585199 1586752 - quinasa MtrB sensible a histidina
BI01717
1586893 1587837 - dominio del receptor del regulador de la respuesta, teórico
BI01718
1587674 1589005 - proteína de unión a ATP/GTP conservada
BI01719
1589136 1591535 - COG0513:Superfamilia II de ADN y ARN helicasas
BI01720
1591837 1592907 - Dominio de una familia de función desconocida (DUF344)
BI02350t
1592976 1593215 - proteína teórica conservada
BI01721
1593208 1593801 - COG0737: 5'-nucleotidasa/2',3'-nucleótido cíclico fosfodiesterasa y esterasas relacionadas
BI01722
1593841 1595364 - proteína secretada teórica con un probable dominio de fosfatasa ácida
BI01723
1595471 1596568 - transportador ABC de glutamina, proteína de unión a glutamina/proteína permeasa, posible
BI01724
1596577 1597251 - transportador ABC de glutamina, proteína permeasa
BI01725
1597254 1598090 - transportador ABC de aminoácido, proteína de unión al aminoácido, posible
BI01726
1598125 1598964 - transportador ABC de aminoácido, proteína de unión al ATP
BI01727
1599401 1600468 + proteína teórica conservada
BI01728
1600932 1602728 - aspartil-ARNt sintetasa
BI01729
1602767 1604107 - histidil-ARNt sintetasa
BI01730
1604264 1605721 + proteína teórica conservada
BI01731
1605933 1607723 - familia de la proteína 5`-nucleotidasa, posible
BI01732
1607898 1608653 - creatinina amidohidrolasa, creatininasa
BI01733
1608742 1610115 - transportador de prolina/betaína
BI01734
1610158 1610328 + proteína teórica
BI01735
1610308 1611378 - proteína teórica, ligeramente similar a los reguladores transcripcionales posibles derivados de Streptomyces
BI01736
1611950 1613266 + familia de la proteína N-acil-D-aminoácido desacilasa, posible
BI01737
1613452 1616058 - proteasa Clp dependiente de ATP, subunidad ClpC de unión a ATP
BI01738
1616208 1617170 + demannu, posible
BI01739
1617288 1618208 - proteína Blon021510 teórica
BI01740
1618484 1618870 - cspB
BI01741
1618943 1620931 - quinasa sensible a histidina
BI01742
1620965 1621738 - regulador de la respuesta de unión a ADN
BI01743
1621689 1622492 - proteína teórica conservada
BI01744
1622567 1622854 + proteína teórica conservada
BI01745
1622957 1624579 - chaperona
BI01746
1624820 1625056 - familia de la proteína del dominio de choque térmico
BI01747
1625289 1625870 - proteína Blon020592 teórica
BI01748
1626163 1626771 + uracil-ADN glicosilasa
BI01749
1626814 1627890 + ATPasa, familia MoxR
BI01750
1628022 1628837 + proteína de una familia de función desconocida
BI01751
1628840 1629388 + proteína teórica conservada
BI01752
1629388 1630443 + proteína teórica conservada
BI01753
1630443 1631471 + proteína teórica conservada
BI01754
1631444 1632070 + proteína GspB de unión a plaquetas, posible
BI01755
1632316 1632660 + proteína teórica conservada
BI01756
1632660 1634261 + proteína teórica conservada
BI01757
1634531 1634893 + proteína teórica conservada
BI01758
1635034 1635672 - proteína de membrana teórica con función desconocida
BI01759
1635805 1637238 + adenilosuccinato liasa VC1126 [importado]
BI01760
1637373 1639931 + proteína de membrana teórica fuertemente conservada
BI01761
1640080 1640358 + proteína HU de unión al ADN
BI01762
1640480 1641937 - posible proteína de unión al ADN
BI01763
1641940 1642203 - proteína teórica de función desconocida (DUF797)
BI01764
1642234 1643133 - posible inositol monofosfatasa
BI01765
1643139 1644803 - proteína teórica asociada al proteosoma
BI01766
1644828 1646390 - proteína 48 de control de la división celular, familia AAA
BI01767
1646454 1647149 - familia de la proteína DedA
BI01768
1647410 1647919 + fosfoserina fosfatasa SerB
BI01769
1648166 1650271 + proteína N primosómica
BI01770
1650333 1651034 + posible alfa beta hidrolasa
BI01771
1651061 1652044 + metionil-ARNt formil transferasa
BI01772
1652142 1653908 - dihidroxiácido deshidratasa
BI01773
1654203 1654484 + ARN polimerasa dirigida a ADN, subunidad omega
BI01774
1654765 1655982 + S-adenosilmetionina sintetasa
BI02420t
1656352 1657425 + proteína CV1232 teórica
Los marcos de lectura abiertos (ORF) relacionados en la Tabla 1 se han definido con respecto a su posición en la secuencia genómica de la SEC ID N.° 1. Por ejemplo, BI00001 está definido por la secuencia de nucleótidos con los números de base 1667321 y 1667608 (inclusive) de la SEC ID N.°1.
5
Ejemplos
Los siguientes ejemplos describen y demuestran adicionalmente realizaciones dentro del alcance de la invención. Los ejemplos se presentan solamente con fines ilustrativos y no están concebidos como limitaciones de la presente invención,
10 ya que son posibles muchas variaciones de los mismos sin apartarse del espíritu y del alcance de la invención.
Ejemplo 1 -Aislamiento de Bifidobacterium longum biotipo infantis UCC 35624
Apéndices y secciones del intestino grueso y delgado del TGI humano, obtenidos durante la cirugía reconstructiva, se
15 cribaron para obtener cepas bacterianas probióticas. Todas las muestras se almacenaron inmediatamente tras la cirugía a -80 °C en recipientes estériles. Los tejidos congelados se descongelaron, se pesaron y se introdujeron en solución de Ringer cisteinada (0,05%) de un cuarto de concentración. Cada muestra se agitó suavemente para eliminar los microorganismos poco adheridos. Después de la transferencia a un segundo volumen de solución de Ringer, la muestra se sometió a vortización durante 7 min para eliminar las bacterias fuertemente adheridas. Para aislar las
20 bacterias integradas en tejidos, las muestras se homogeneizaron también en un mezclador Braun. Las soluciones se diluyeron en serie y se extendieron en placas (100 µl) sobre los siguientes medios de agar: RCM (medio de clostridios reforzado) y se ajustó el RCM a pH 5,5 utilizando ácido acético; TPY (tripticasa, peptona y extracto de levaduras),
imagen8
(Griffiths-Jones et al., 2005) que utiliza el paquete de software INFERNAL (Eddy, 2002). Se identificaron elementos de inserción de secuencias Repeatfinder (Volfovsky et al., 2001), Reputer (Kurtz & Schleiermcher, 1999) y BLAST (Altschul et al., 1990) y se anotaron manualmente. Se asignaron familias IS utilizando ISFinder (http://www-is.biotoul.fr/is.html). Se identificaron enzimas activas frente a hidratos de carbono basándose en la similitud con las entradas de bases de 5 datos de enzimas activas frente a hidratos de carbono (CAZy) (Coutinho & Henrissat, 1999), y COG y se anotaron las clases PFAM con la actividad de la enzima frente a hidratos de carbono. Se llevó a cabo la clasificación de transportadores de acuerdo con el esquema TC-DB (Busch y Saier, 2002).
Los inventores identificaron una región desde los números de bases 44824 a 472245 (inclusive) de la SEC ID N.°
10 1 que los inventores designaron como región 1 de exopolisacáridos (EPS) (SEC ID N.° 2). La región 1 de EPS codifica los siguientes genes:
Tabla 2 – Marcos de lectura abiertos de la región 1 de EPS del genoma de UCC 35624
ID de gen
Hebra Descripción Secuencia de ADN Secuencia de proteína
BI00778
+ glicosil transferasa CpsE SEC ID N.°93 SEC ID N.°133
BI00779
+ COG0840: proteína de quimiotaxis aceptora de metilo SEC ID N.°94 SEC ID N.°134
BI00780
+ posible tirosina quinasa análoga a Etk implicada en la biosíntesis de Eps SEC ID N.°95 SEC ID N.°135
BI00781
+ glicosilo transferasa teórica, familia de la proteína del grupo 1 SEC ID N.°96 SEC ID N.°136
BI00782
+ posible proteína glicosiltransferasa SEC ID N.°97 SEC ID N.°137
BI00783
+ familia de epimerasa/deshidratasa dependiente de NAD SEC ID N.°98 SEC ID N.°138
BI00784
+ UDP-glucosa 6-deshidrogenasa SEC ID N.°99 SEC ID N.°139
BI00785
+ glicosilo transferasa teórica, familia de la proteína del grupo 1 SEC ID N.°100 SEC ID N.°140
BI00786
+ Eps11I teórica SEC ID N.°101 SEC ID N.°141
BI00787
+ transferasa hexapeptidasa bacteriana teórica (tres repeticiones) SEC ID N.°102 SEC ID N.°142
BI00788
+ proteína de síntesis del polisacárido capsular, teórica SEC ID N.°103 SEC ID N.°143
BI00789
+ proteína teórica SEC ID N.°104 SEC ID N.°144
BI00790
+ Eps9K SEC ID N.°105 SEC ID N.°145
BI00791
+ proteína de la biosíntesis de polisacáridos, teórica SEC ID N.°106 SEC ID N.°146
BI00792
+ transferasa hexapeptidasa bacteriana teórica (tres repeticiones) SEC ID N.°107 SEC ID N.°147
BI00793
- familia de epimerasa/deshidratasa dependiente de NAD, posible SEC ID N.°108 SEC ID N.°148
BI00794
- transposasa, degenerada SEC ID N.°109 SEC ID N.°149
BI00795
- COG2963 teórica: Transposasa y derivados inactivados SEC ID N.°110 SEC ID N.°150
BI00796
+ dTDP-glucosa 4,6-deshidratasa SEC ID N.°111 SEC ID N.°151
BI00797
+ dTDP-4-deshidroramnosa 3,5-epimerasa SEC ID N.°112 SEC ID N.°152
BI00798
+ glucosa-1-fosfato timidilil transferasa SEC ID N.°113 SEC ID N.°153
15
Los inventores han identificado también una región desde los números de base 2071426 a 2097099 (inclusive) de la SEC ID N.° 1 que los inventores han designado región 2 de EPS (SEC ID N.° 3). La región 2 de EPS codifica los siguientes genes:
20 Tabla 3 – Marcos de lectura abiertos de la región 2 de EPS del genoma de UCC 35624
ID de gen
Hebra Descripción Secuencia de ADN Secuencia de proteína
BI00319
+ dTDP-glucosa 4,6-deshidratasa SEC ID N.°114 SEC ID N.°154
BI00320
+ proteína teórica conservada SEC ID N.°115 SEC ID N.°155
BI00321
+ proteína teórica conservada SEC ID N.°116 SEC ID N.°156
BI00423t
+ presunta transposasa conservada SEC ID N.°117 SEC ID N.°157
BI00322
- IS1533, OrfB SEC ID N.°118 SEC ID N.°158
BI00323
- transposasa (25) BH3998 [importado], posible SEC ID N.°119 SEC ID N.°159
BI00324
- glicosiltransferasa, posible SEC ID N.°120 SEC ID N.°160
imagen9
imagen10
imagen11
BI00779
1.02 R aat aac cgc tgc agg aac ac SEC ID N.°16
BI00780
1.03 L gtg cag gac ggt aat gga gt SEC ID N.°17
BI00780
1.03 R gct tcg ggt ctg gat cat ta SEC ID N.°18
BI00781
1.04 L tgc tga caa gtg gag tct gg SEC ID N.°19
BI00781
1.04 R cca cgt cta cga gca act ca SEC ID N.°20
BI00782
1.05 L gaa agc gaa gag tgg tct gg SEC ID N.°21
BI00782
1.05 R ccg gct gat ttg atg aga tt SEC ID N.°22
BI00783
1.06 L tgc cgc tgt act ggt cac SEC ID N.°23
BI00783
1.06 R gca tgt gcc aac agc tca SEC ID N.°24
BI00784
1.07 L cca aca cgt atc tgg cac tg SEC ID N.°25
BI00784
1.07 R tcg gag cca aag aag gta ga SEC ID N.°26
BI00785
1.08 L ata ccg cgt atg ctt tgg ac SEC ID N.°27
BI00785
1.08 R aaa cgg taa cca ctc gct tg SEC ID N.°28
BI00786
1.09 L atg gga tcg atg cat gaa at SEC ID N.°29
BI00786
1.09 R ttc tcg gca ata aac cgt tc SEC ID N.°30
BI00787
1.10 L cca gcg gtt att tcg ttg tt SEC ID N.°31
BI00787
1.10 R ggt ggc atg atc ctt atg ct SEC ID N.°32
BI00788
1.11 L gct atc ttc acc gca ttg gt SEC ID N.°33
BI00788
1.11 R cca gtc agg gaa ggt cac at SEC ID N.°34
BI00789
1.12 L tga aat aca cgc aac ccg ta SEC ID N.°35
BI00789
1.12 R aatgcgtcaaaaccgatacc SEC ID N.°36
BI00790
1.13 L gga aag caa tga gga agc tg SEC ID N.°37
BI00790
1.13 R gat ttg atg caa agc aag ca SEC ID N.°38
BI00791
1.14 L gtg agt acc gtt tcc gca at SEC ID N.°39
BI00791
1.14 R ttc ctt ggt tcc cgt gat ag SEC ID N.°40
BI00792
1.15 L gct ggg att ttg gaa gtg aa SEC ID N.°41
BI00792
1.15 R tgt tac ccc cgg cat aat aa SEC ID N.°42
BI00793
1.16 L acc ggt aac gtt cag att gc SEC ID N.°43
BI00793
1.16 R gca ata ccg cct tga cct ta SEC ID N.°44
BI00794
1.17 L ttg tac cac cac acg tac cg SEC ID N.°45
BI00794
1.17 R cgc gag ttc aat ggc tat g SEC ID N.°46
BI00795
1.18 L aca tcg acc tcc atc tcc ag SEC ID N.°47
BI00795
1.18 R ata cgt aac agc ggc tcc ac SEC ID N.°48
BI00796
1.19 L aag tac gat gtg cgc tac ca SEC ID N.°49
BI00796
1.19 R cat cac ggt cag gat gtc ac SEC ID N.°50
BI00797
1.20 L cga ata cac gga cat caa cg SEC ID N.°51
BI00797
1.20 R gag aat cga gca gct gga ac SEC ID N.°52
BI00798
1.21 L tgg gag agg agt tca tcg ac SEC ID N.°53
BI00798
1.21 R gta tcc agc cat gcg taa cc SEC ID N.°54
Tabla 6 – Cebadores para el cribado de cepas bacterianas para determinar la presencia de genes de la agrupación 2 de EPS
ID de gen
Nombre del cebador LRFR Secuencia SEC ID N.°
BI00319
2.01 L acg gac tca aaa cca cca tc SEC ID N.°55
BI00319
2.01 R acc ctg ctt ccg gta ctt tt SEC ID N.°56
BI00320
2.02 L gcc tac gca aga cct tat gc SEC ID N.°57
BI00320
2.02 R cgt tat acg cgt gct tga ga SEC ID N.°58
BI00321
2.03 L tgg aac gca ata ttc aac ga SEC ID N.°59
BI00321
2.03 R cca agt atg gct cca cga at SEC ID N.°60
BI00423t
2.04 L acg cct gtc tat ggt tgg aa SEC ID N.°61
BI00423t
2.04 R cgg tag gac tcg ttc tcg tc SEC ID N.°62
BI00322
2.05 L tcg agg ttc gag gtg aag at SEC ID N.°63
BI00322
2.05 R cct gtt cga gaa gga gaa cg SEC ID N.°64
BI00323
2.06 L atg gaa gca tgt ggt cct tc SEC ID N.°65
BI00323
2.06 R att tcc tgg tgg tgt cgt tc SEC ID N.°66
BI00324
2.07 L atg gcg aaa ctg ttg gac tc SEC ID N.°67
BI00324
2.07 R gct acc gtg cct tct cat tc SEC ID N.°68
BI00325
2.08 L gcc gaa tcg ctt ttg aaa ta SEC ID N.°69
BI00325
2.08 R aaa tcc tca tcg ggg aaa ac SEC ID N.°70
BI00326
2.09 L gtt tat ttt cgc cgt gcc ta SEC ID N.°71
BI00326
2.09 R aat tcc aat ggc ttt tgc tg SEC ID N.°72
BI00327
2.10 L atg tgc gaa tcc gac ata ca SEC ID N.°73
BI00327
2.10 R tgc tta tct cgt ccc cat tc SEC ID N.°74
BI00328
2.11 L gca aaa tgc ttg gct tct tc SEC ID N.°75
BI00328
2.11 R ctg gat tcc gat gat gct tt SEC ID N.°76
BI00329
2.12 L ctg cac gta tcg gga ttt tt SEC ID N.°77
BI00329
2.12 R ctc ggc aga gga cag gat ag SEC ID N.°78
BI00330
2.13 L gat cat cga cac gca atg ac SEC ID N.°79
BI00330
2.13 R taa ggc cat cct cat caa gg SEC ID N.°80
BI00331
2.14 L tct ggg gaa agc agg tta tg SEC ID N.°81
BI00331
2.14 R ctg tgc ggt acc tgt ttg tg SEC ID N.°82
BI00332
2.15 L aat tac gtc ccg atg ctc ac SEC ID N.°83
BI00332
2.15 R caa tac acc ggc ttg gaa gt SEC ID N.°84
BI00333
2.16 L tgt aga cct tgt cgc tca cg SEC ID N.°85
BI00333
2.16 R gca tcg gtg acg gct ata at SEC ID N.°86
BI00334
2.17 L gtg ctc gac aag ctg acg ta SEC ID N.°87
BI00334
2.17 R gtg ttc cgc ata cca atc g SEC ID N.°88
BI00335
2.18 L ggc gag tgc acc aaa taa at SEC ID N.°89
BI00335
2.18 R cga ttc cgt cta ttg gtt cg SEC ID N.°90
BI00336
2.19 L ata agt ccg gtg gca atc ag SEC ID N.°91
BI00336
2.19 R caa tgg atg ata cgg tgc tg SEC ID N.°92
Tabla 7 – Resultados del cribado de genes de la agrupación 1 de EPS
ID de gen
Conjunto de cebadores B. longum 35624 B. longum 1207 B. longum AH121A B. longum 1714
BI00778
1.01 SÍ SÍ NO SÍ
BI00779
1.02 SÍ SÍ NO SÍ
BI00780
1.03 SÍ SÍ NO SÍ
BI00781
1.04 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00782
1.05 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00783
1.06 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00784
1.07 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00785
1.08 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00786
1.09 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00787
1.10 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00788
1.11 SÍ SÍ SÍ NO
BI00789
1.12 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00790
1.13 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00791
1.14 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00792
1.15 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00793
1.16 SÍ SÍ NO SÍ
BI00794
1.17 SÍ SÍ NO SÍ
BI00795
1.18 SÍ SÍ NO SÍ
BI00796
1.19 SÍ SÍ SÍ SÍ
BI00797
1.20 SÍ NO NO NO
BI00798
1.21 SÍ SÍ SÍ SÍ
En la que SÍ indica la presencia y NO indica la ausencia de un producto de la PCR de 500 pb.
48
Tabla 8 – Resultados del cribado de genes de la agrupación 1 de EPS
ID de gen
Conjunto de cebadores B. longum 35624 B. longum 1207 B. longum AH121A B. longum 1714
BI00319
2.01 SÍ NO NO NO
BI00320
2.02 SÍ NO NO NO
BI00321
2.03 SÍ NO NO NO
BI00423t
2.04 SÍ NO NO NO
BI00322
2.05 SÍ NO NO NO
BI00323
2.06 SÍ NO NO NO
BI00324
2.07 SÍ NO NO NO
BI00325
2.08 SÍ NO NO NO
BI00326
2.09 SÍ NO NO NO
BI00327
2.10 SÍ NO NO NO
BI00328
2.11 SÍ NO NO NO
BI00329
2.12 SÍ NO NO NO
BI00330
2.13 SÍ NO NO NO
BI00331
2.14 SÍ NO NO NO
BI00332
2.15 SÍ NO NO NO
BI00333
2.16 SÍ NO NO NO
BI00334
2.17 SÍ NO NO NO
BI00335
2.18 SÍ SÍ NO SÍ
BI00336
2.19 SÍ SÍ SÍ SÍ
En la que SÍ indica la presencia y NO indica la ausencia de un producto de la PCR de 500 pb.
5 Cribado en agar rojo Congo
Se usó un cribado en agar rojo Congo para seleccionar fenotípicamente las cepas bacterianas que expresan EPS. En resumen, 10 ml de medio de caldo Rogosa modificado (+ 0,05% de cisteína) se inoculó asépticamente con una colonia en crecimiento reciente de la cepa bacteriana y se incubó anaerobiamente a 37 °C hasta que se volvió turbia (de 10 aproximadamente 16 a aproximadamente 24 horas). Los cultivos del caldo se extendieron asépticamente sobre placas de agar rojo Congo y se incubaron de forma anaerobia a 37 °C durante 48 horas. Se cree que el EPS producido como subproducto del crecimiento y/o el metabolismo de determinadas cepas evita la captación de la tinción rojo Congo dando como resultado una morfología de colonia de color crema/blanco. Las cepas que producen menos EPS capturan la tinción rojo Congo fácilmente, dando como resultado una morfología de colonia de color rosa/rojo. Las cepas que no
15 producen EPS se tiñen de color rojo y tienen un aspecto casi transparente en el fondo de agar rojo.
En referencia a las Figs. 6 a 12, se observaron las siguientes morfologías de colonias:
Tabla 9 – Morfologías de colonias a partir del cribado del agar rojo Congo
20
Cepas bacterianas
Morfología de colonias
B. longum 35624 (Fig. 6)
Colonias blancas brillantes, mucoides, convexas
B. longum AH121A (Fig. 7)
Colonias blancas brillantes, mucoides, convexas
B. longum AH1714 (Fig. 8)
Colonias blancas brillantes, mucoides, convexas
B. longum AH0119 (Fig. 9)
Colonias de color rosa pálido / blanquecino, mucoides
B. breve UCC2003 (Fig. 10)
Colonias de color rosa pálido / blanquecino, mucoides
L. rhamnosus AH308 (Fig. 11)
Colonias de color rosa pálido / blanquecino, semimucoides, planas
L. salivarius UCC1 (Fig. 12)
Colonias claras /transparentes, no mucoides, planas
Ejemplo 8 -B. infantis 35624 y BL1207 inducen perfiles de citoquinas prácticamente idénticos en PBMC.
Se aislaron células mononucleares de sangre periférica (PBMC) procedentes de sangre periférica humana reciente
25 utilizando tubos CPT Vacutainer BD (n.° catálogo BD 362761), según las instrucciones del fabricante. Se lavaron las PBMC y se volvieron a suspender en MEM de Dulbecco (n.°de catálogo Gibco 10569-010) más HEPES 25 mM, suero de feto de bovino al 10% (N.° de catálogo de Sigma F4135), y penicilina/estreptomicina al 1% (N.° de catálogo de Sigma P0781). Se sembraron 2 x 105 PBMC (en 200 µl de DMEM) en cada pocillo de una placa de cultivo de 96 pocillos.
30 Se hicieron crecer las bacterias en medio MRS de Difco y se recogieron justo después de entrar en fase estacionaria. Todas las células se hicieron crecer en condiciones anaerobias a 37 °C. Se trazaron las curvas de
imagen12
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