ES2692363T3 - Composiciones terapéuticas de ARNm y su uso para tratar enfermedades y trastornos - Google Patents

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Abstract

Una composición para su uso en un método para tratar a un sujeto que tiene una enfermedad que es el resultado de una deficiencia en una proteína, en donde la composición comprende (a) por lo menos una molécula de ARNm, por lo menos una porción de la cual codifica una proteína de fusión que comprende una proteína terapéutica y un polipéptido capaz de unirse a un receptor Fc; y (b) un vehículo de administración, en donde el vehículo de administración es polietilenimina (PEI) o una nanopartícula lipídica, en donde la composición se administra al sujeto mediante suministro pulmonar, y la enfermedad: (a) se selecciona de un trastorno de almacenamiento lisosomal, un trastorno metabólico del ciclo de la urea, enfermedad de Pompe, enfermedad de Gaucher, beta-talasemia, enfermedad de Huntington; enfermedad de Parkinson; distrofias musculares (como por ejemplo, Duchenne y Becker); enfermedades de la hemofilia (como por ejemplo, hemofilia B, hemofilia A, atrofia muscular espinal relacionada con SMN1 (SMA), esclerosis lateral amiotrófica (ELA), galactosemia relacionada con GALT, trastornos relacionados con SLC3A1 incluyendo cistinuria, trastornos relacionados con COL4A5 incluyendo síndrome de Alport deficiencias de galactocerebrosidasa, adrenoleucodistrofia y adrenomieloneuropatía ligada a X; ataxia de Friedreich; enfermedad de Pelizaeus-Merzbacher; esclerosis tuberosa relacionada con TSC1 y TSC2; síndrome de Sanfilippo bB (MPS IIIB); cistinosis relacionada con el CTNS; trastornos relacionados con FMR1 que incluyen Síndrome X frágil, Síndrome de temblor/ataxia asociado con X frágil y Síndrome de insuficiencia ovárica prematura X frágil; Síndrome de Prader-Willi; telangiectasia hemorrágica hereditaria (AT); enfermedad de Niemann-Pick Tipo C1; las enfermedades relacionadas con lipofuscinosis ceroides neuronales incluyendo la lipofuscinosis ceroide neuronal juvenil (JNCL), la enfermedad de Batten juvenil, la enfermedad de Santavuori-Haltia, la enfermedad de Jansky-Bielschowsky y deficiencias de PTT-1 y TPP1; ataxia infantil relacionada con EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4 y EIF2B5 con hipomielinización/desaparición de la materia blanca del sistema nervioso central; Ataxia Episódica Tipo 2 relacionada con CACNA1A y CACNB4; trastornos relacionados con MECP2, incluyendo el síndrome de Rett clásico, encefalopatía neonatal grave relacionada con MECP2 y el síndrome de PPM-X; síndrome de Rett atípico relacionado con CDKL5; enfermedad de Kennedy (SBMA); arteriopatía cerebral autosómica dominante relacionada con Notch-3 con infartos subcorticales y leucoencefalopatía (CADASIL); trastornos convulsivos relacionados con SCN1A y SCN1B; trastornos relacionados con la Polimerasa G incluyendo síndrome de Alpers-Huttenlocher, 30 neuropatía atáxica sensorial relacionada con POLG, disartria y oftalmoparesia, y oftalmoplejía externa progresiva autosómica dominante y recesiva con deleciones de ADN mitocondriales; hipoplasia adrenal ligada a X; agammaglobulinemia ligada a X; enfermedad de Wilson; y enfermedad de Fabry, o (b) es el resultado de una deficiencia en una proteína seleccionada de α-galactosidasa, eritropoyetina (EPO), α-1-antitripsina (A1AT), folistatina, glucocerebrosidasa, interferón-ß, hemoglobina, colágeno tipo 4 (COL4A5), receptor de liproteína de baja densidad (LDL), Factor VIII, Factor IX, α-L-iduronidasa, iduronato sulfatasa, heparina-N-sulfatasa, α-N-acetilglucosaminidasa, galactosa-6-sulfatasa, ácido lisosomal lipasa, arilsulfatasa- A, factor estimulante de colonias de granulocitos (GCSF), factor de crecimiento endotelial antivascular (VEGF), interleucina 12 (IL-12), interleucina 23 (IL-23), arginosuccinato sintasa (AS), metilmalonil-coA mutasa (MCM), proprionil-coA carboxilasa (PCC), fenilalanina hidroxilasa (PAH), apolipoproteína E (APOE), glucosa- 6-fosfatasa (G6P), hormona del crecimiento humano (hGH) y urato oxidasa.

Description

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DESCRIPCION
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Composiciones terapeuticas de ARNm y su uso para tratar enfermedades y trastornos ANTECEDENTES DE LA INVENClON
La terapia genica convencional implica el uso de ADN para la insercion de la informacion genetica deseada en las celulas huesped. El ADN introducido en la celula habitualmente se integra en el genoma de una o mas celulas transfectadas, permitiendo una accion duradera del material genetico introducido en el huesped. Aunque puede haber beneficios percibidos para dicha accion sostenida, la integracion de ADN exogeno en el genoma del huesped tambien puede tener muchos efectos perjudiciales. Por ejemplo, es posible que el ADN introducido se inserte en un gen intacto, lo que da como resultado una mutacion que impide o incluso elimina totalmente la funcion del gen endogeno. Por tanto, la terapia genica con ADN puede dar como resultado el deterioro de una funcion genetica vital en el huesped tratado, como por ejemplo, la eliminacion o la produccion perjudicialmente reducida de una enzima esencial o la interrupcion de un gen cntico para la regulacion del crecimiento celular, lo que da como resultado una proliferacion celular no regulada o cancerosa. Ademas, con la terapia genica basada en el ADN convencional es necesario que la expresion efectiva del producto genico deseado incluya una secuencia promotora fuerte, que de nuevo puede llevar a cambios no deseables en la regulacion de la expresion genica normal en la celula. Tambien es posible que el material genetico basado en ADN de como resultado a la induccion de anticuerpos anti-ADN no deseados, que a su vez, pueden activar una respuesta inmune posiblemente fatal.
Al contrario que el ADN, el uso del ARN como un agente de terapia genica es sustancialmente mas seguro ya que el ARN no esta integrado en el genoma de la celula transfectada, eliminando por tanto la preocupacion de que el material genetico introducido altere el funcionamiento normal de un gen esencial, o provoque una mutacion que de como resultado efectos nocivos u oncogenicos. La terapia de ARN tampoco requiere un promotor extrano para la traduccion efectiva de la protema codificada, evitando de nuevo posibles efectos secundarios nocivos. Ademas, cualquier efecto perjudicial que resulte del ARNm basado en la terapia genica sena de una duracion limitada debido a la vida media relativamente corta. En consecuencia, para muchas aplicaciones, pueden ser deseables la naturaleza transitoria del ARNm y la corta vida util de la protema resultante, en comparacion con la integracion estable mas duradera lograda usando terapia genica basada en ADN.
Sin embargo, en algunos casos, la inestabilidad del ARNm y la vida media corta limitan sus efectos terapeuticos. Por lo tanto, existe la necesidad de mejorar la estabilidad del ARNm y prolongar la vida media para un uso terapeutico mas efectivo y exitoso. La WO 2006/000448 describe protemas de fusion Fc-interferon-beta (Fc- IFN-p) y moleculas de acido nucleico que las codifican. La WO 00/69913 describe secuencias de acido nucleico, por ejemplo, secuencias de ADN o ARN, que codifican una protema de fusion Fc-Interferon-alfa de inmunoglobulina.
SUMARIO DE LA INVENClON
La invencion se basa en un ARNm que codifica una protema terapeutica fusionada con un polipeptido que es capaz de unirse a un receptor Fc ("Protema de Fusion Terapeutica"), para su administracion a una o mas celulas objetivo para la produccion de niveles terapeuticos de protema funcional. Sin desear estar ligado por ninguna teona, se contempla que dicha protema de fusion terapeutica se transporta facilmente desde la celula objetivo a la circulacion sistemica a traves de un receptor Fc y/o se secreta desde la celula, se recaptura por un receptor Fc y luego se transcitosa en la circulacion sistemica. En ciertas realizaciones, la protema terapeutica codificada se secreta de manera natural y, por tanto, se asocia naturalmente con una secuencia senal apropiada. En otras realizaciones, el ARNm que codifica una protema que no se secreta normalmente puede ligarse operativamente a una secuencia senal apropiada que da como resultado la secrecion de la protema traducida. En particular, la invencion proporciona una composicion para su uso en un metodo para tratar a un sujeto que tiene una enfermedad que es el resultado de una deficiencia en una protema, en donde la composicion comprende (a) por lo menos una molecula de ARNm, por lo menos una porcion de la cual codifica una protema de fusion que comprende una protema terapeutica y un polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc; y (b) un vehmulo de administracion, en donde el vehmulo de administracion es polietilenimina (PEI) o una nanopartmula lipfdica, en donde la composicion se administra al sujeto mediante administracion pulmonar, y la enfermedad:
(a) se selecciona de un trastorno de almacenamiento lisosomal, un trastorno metabolico del ciclo de la urea, enfermedad de Pompe, enfermedad de Gaucher, beta-talasemia, enfermedad de Huntington; Enfermedad de Parkinson; distrofias musculares (como por ejemplo, Duchenne y Becker); enfermedades de la hemofilia (como por ejemplo, hemofilia B, hemofilia A, atrofia muscular espinal relacionada con SMN1 (SMA), esclerosis lateral amiotrofica (ALS), galactosemia relacionada con GALT, trastornos relacionados con SLC3A1 incluyendo cistinuria, trastornos relacionados con COL4A5 incluyendo smdrome de Alport deficiencias de galactocerebrosidasa, adrenoleucodistrofia y adrenomieloneuropatfa ligadas al cromosoma X; ataxia de Friedreich; enfermedad de Pelizaeus-Merzbacher; esclerosis tuberosa relacionada con TSC1 y TSC2; smdrome de Sanfilippo bB (MPS IIIB); cistinosis relacionada con el CTNS; trastornos relacionados con FMR1 que incluyen Smdrome X fragil, Smdrome de temblor/ataxia asociado con X fragil y Smdrome de
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insuficiencia ovarica prematura X fragil; Smdrome de Prader-Willi; telangiectasia hemorragica hereditaria (AT); enfermedad de Niemann-Pick tipo C1; enfermedades relacionadas con lipofuscinosis ceroides neuronales incluyendo la lipofuscinosis ceroide neuronal juvenil (JNCL), la enfermedad de Batten juvenil, la enfermedad de Santavuori-Haltia, la enfermedad de Jansky-Bielschowsky y deficiencias de PTT-1 y TPP1; ataxia infantil relacionada con EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4 y EIF2B5 con hipomielinizacion/desaparicion de la sustancia blanca del sistema nervioso central; Ataxia Episodica Tipo 2 relacionada con CACNA1A y CACNB4; trastornos relacionados con MECP2, incluido el smdrome de Rett clasico, encefalopatfa neonatal grave relacionada con MECP2 y el smdrome de PPM-X; smdrome de Rett atipico relacionado con CDKL5; enfermedad de Kennedy (SBMA); arteriopatfa cerebral autosomica dominante relacionada con Notch-3 con infartos subcorticales y leucoencefalopatfa (CADASIL); trastornos convulsivos relacionados con SCN1A y SCN1B; trastornos relacionados con la Polimerasa G que incluyen smdrome de Alpers-Huttenlocher, neuropatfa ataxica sensorial relacionada con POLG, disartria y oftalmoparesia, y oftalmoplejfa externa progresiva autosomica dominante y recesiva con deleciones de ADN mitocondriales; hipoplasia adrenal ligada a X; agammaglobulinemia ligada a X; enfermedad de Wilson; y enfermedad de Fabry, o
(b) es el resultado de una deficiencia en una protema seleccionada de a-galactosidasa, eritropoyetina (EPO), a-1-antitripsina (A1AT), folistatina, glucocerebrosidasa, interferon-p, hemoglobina, colageno tipo 4 (COL4A5), receptor de liprotema de baja densidad (LDL), Factor VIII, Factor IX, a-L-iduronidasa, iduronato sulfatasa, heparina-N-sulfatasa, a-N-acetilglucosaminidasa, galactosa-6-sulfatasa, acido lisosomal lipasa, arilsulfatasa- A, factor estimulante de colonias de granulocitos (GCSF), factor de crecimiento endotelial antivascular (VEGF), interleucina 12 (IL-12), interleucina 23 (IL-23), arginosuccinato sintasa (AS), metilmalonil-coA mutasa (MCM), proprionil-coA carboxilasa (PCC), fenilalanina hidroxilasa (PAH), apolipoprotema E (APOE), glucosa- 6-fosfatasa (G6P), hormona del crecimiento humano (hGH) y urato oxidasa.
Las celulas en las que se deposita el ARNm pueden actuar como un deposito para la produccion de protema terapeutica, que luego se transporta facilmente fuera de las celulas de deposito a la circulacion sistemica a traves de un receptor Fc.
En algunas realizaciones, las composiciones de la invencion se administran al pulmon mediante inhalacion, aerosolizacion, nebulizacion o instilacion. La administracion pulmonar proporciona ventajas significativas sobre las infusiones intravenosas o inyecciones locales. Elimina el sitio de la inyeccion o las reacciones a la infusion y debe reducir el dolor en la administracion
Por tanto, la invencion proporciona composiciones y metodos para la administracion de protemas terapeuticas a traves de aplicaciones pulmonares no invasivas que dan como resultado la produccion de niveles terapeuticamente eficaces de protema en celulas tanto pulmonares como no pulmonares, que luego se transportan facilmente a la circulacion sistemica a traves de un receptor Fc. Esto da como resultado la acumulacion de concentraciones sistemicas terapeuticamente eficaces de la protema codificada mediante inhalacion simple de las composiciones de ARNm sintetico de la invencion. Ademas de facilitar la administracion de la protema de fusion al sistema circulatorio, el polipeptido que es capaz de unirse a un receptor Fc tambien mejora la exposicion sistemica prolongando la vida media de la protema.
Las composiciones de la invencion son utiles en la gestion y tratamiento de enfermedades que resultan de deficiencias o mal funcionamiento de protemas y/o enzimas. En algunas realizaciones, los individuos que padecen tales enfermedades pueden tener defectos geneticos subyacentes que conducen a la expresion comprometida de una protema o enzima, incluyendo, por ejemplo, la no smtesis de la protema secretada, la smtesis reducida de la protema secretada o la smtesis. de una protema secretada que carece o tiene actividad biologica disminuida. En algunas realizaciones, las composiciones de la invencion son utiles para el tratamiento de trastornos de almacenamiento lisosomal y/o trastornos metabolicos del ciclo de la urea que tienen lugar como resultado de uno o mas defectos en la biosmtesis de las enzimas secretadas implicadas en el ciclo de la urea.
Las composiciones de la invencion comprenden un ARNm que codifica una protema terapeutica fusionada con un polipeptido que es capaz de unirse a un receptor Fc (es decir, un ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica). Opcionalmente, el ARNm puede incluir una o mas regiones no traducidas. Las composiciones de la invencion comprenden ademas un vehmulo de transferencia, que es una nanopartmula lipfdica o un portador polimerico (es decir, PEI). El ARNm puede codificar cualquier protema secretada clmicamente util o cualquier protema clmicamente util como se define en las reivindicaciones que se haya disenado para incluir una secuencia senal que permita que se secrete la protema. En un aspecto de la invencion, la protema terapeutica se elige de las protemas enumeradas en las Tablas 1-3, homologos de mairuferos de las mismas y homologos de animales de interes veterinario o industrial de las mismas, para el tratamiento de enfermedades definidas en las reivindicaciones. El polipeptido que se une a un receptor Fc puede ser, por ejemplo, un dominio Fc de inmunoglobulina o un peptido de union a FcRn.
Las Protemas de Fusion Terapeuticas producidas a partir de ARNm in vivo proporcionan ventajas significativas sobre la administracion de protemas recombinantes. Las protemas producidas a partir de ARNm en
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celulas endogenas, como por ejemplo, celulas epiteliales endogenas, reflejan modificaciones postraduccionales presentes normalmente en el cuerpo en oposicion a de protemas fabricadas en sistemas de huespedes no humanos comercialmente comunes como Ovario de Hamster Chino, celulas, celulas bacterianas o celulas de levadura. Los patrones de glicosilacion humanos endogenos, el plegamiento de protemas u otras modificaciones postraduccionales nativas pueden mejorar la tolerabilidad, la potencia y reducir la inmunogenicidad.
Ademas, el proceso de produccion de ARNm se simplifica y mejora en comparacion con la produccion de protemas recombinantes tipica. Se mejoro el desarrollo del proceso, la fabricacion y el perfil de costos en comparacion con la fabricacion de protemas tipica. El proceso de ARNm es intercambiable entre constructos; solo cambia la secuencia del ARNm. La fabricacion de ARNm tambien elimina la necesidad de una fermentacion costosa en biorreactores y en instalaciones y personal de fabricacion de gran tamano.
Las caractensticas tratadas anteriormente y muchas otras caractensticas y ventajas asociadas de la presente invencion se entenderan mejor haciendo referencia a la siguiente descripcion detallada de la invencion cuando se toma junto con los ejemplos acompanantes. Las varias realizaciones descritas en la presente son complementarias y pueden combinarse o usarse juntas de una manera entendida por los expertos en la tecnica a la vista de las ensenanzas contenidas en la presente.
BREVE DESCRIPCION DE LOS DIBUJOS
La FIG. 1A es una secuencia de nucleotidos de una secuencia no traducida de 5' CMV (SEQ ID NO: 1), en la que X, si esta presente, es GGA. La FIG. 1B es una secuencia de nucleotidos de una secuencia de 3' hGH (SEQ ID NO: 2).
La FIG. 2A muestra una secuencia de nucleotidos que codifica el ARNm de la eritropoyetina humana (EPO) fusionada a un dominio Fc de IgG humana y flanqueada en el extremo 5' con CMV UTR y en el extremo 3' con hGH UTR (SEQ ID NO: 3). La FIG. 2B es una representacion grafica del constructo de ARNm mostrado en la FIG. 2A.
La FIG. 3 muestra un ARNm que codifica alfa-galactosidasa humana (GLA) fusionada a un peptido de union a FcRn (SEQ ID NO: 4). Este constructo de ARNm puede estar opcionalmente flanqueado en el extremo 5' con la SeQ ID NO: 1 y en el extremo 3' con la SEQ ID NO: 2.
La FIG. 4 muestra un ARNm que codifica alfa-1 antitripsina humana (A1AT) fusionado a un peptido de union a FcRn (SEQ ID NO: 5). Este constructo de ARNm puede estar opcionalmente flanqueado en el extremo 5' con la sEq ID NO: 1 y en el extremo 3' con la SEQ iD NO: 2.
La FIG. 5 muestra un ARNm que codifica el Factor IX humano (FIX) fusionado a un peptido de union a FcRn (SEQ ID NO: 6). Esta secuencia puede estar flanqueada en el extremo 5' con la SEQ ID NO: 1 y en el extremo 3' con la SEQ ID NO: 2.
La FIG. 6 es una representacion grafica de ARNm en aerosol e inhalado que codifica una Protema de Fusion Terapeutica administrada a las celulas epiteliales de pulmon y la protema de fusion codificada se transporta a traves del epitelio pulmonar al torrente sangumeo.
DESCRIPCION DE LAS REALIZACIONES EJEMPLARES
La invencion proporciona composiciones para la administracion intracelular de ARNm que codifica una protema de fusion terapeutica para la produccion de niveles terapeuticos de protema funcional in vivo. Estas composiciones son para su uso en metodos de tratamiento de varias enfermedades y afecciones administrando las composiciones de la invencion, como se define adicionalmente en las reivindicaciones.
La administracion de las composiciones de la invencion da como resultado la produccion de protema funcional in vivo. El termino "funcional", como se usa en la presente para calificar una protema o enzima, significa que la protema o enzima tiene actividad biologica, o alternativamente es capaz de realizar la misma funcion, o una similar a la protema o enzima nativa o que funciona normalmente. Como se define en las reivindicaciones, las composiciones de ARNm de la invencion son utiles para el tratamiento de diversos trastornos metabolicos o geneticos, y en particular aquellos trastornos geneticos o metabolicos que implican la no expresion, expresion erronea o deficiencia de una protema o enzima.
El termino "niveles terapeuticos" se refiere a los niveles de protema detectados en la sangre o tejidos que estan por encima de los niveles de control, en donde el control puede ser niveles fisiologicos normales, o los niveles en el sujeto antes de la administracion de la composicion del ARNm.
Como se proporcionan en la presente, las composiciones incluyen un vehmulo de transferencia. Las
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composiciones y, en particular, los vehmulos de transferencia descritos en la presente son capaces de administrar ARNm a la celula objetivo. De acuerdo con la invencion, el vehmulo de transferencia es una nanopartmula lipfdica o un portador polimerico (es decir, polietilenimina).
ARNm
El ARNm en las composiciones de la invencion codifica una protema terapeutica, (incluyendo un polipeptido o peptido funcional), como por ejemplo, una hormona, enzima o receptor como se define en las reivindicaciones. La protema terapeutica de interes puede ser una que normalmente se secreta o se excreta. En realizaciones alternativas, el ARNm esta disenado para codificar una protema que normalmente no se secreta o excreta, ligada operativamente a una secuencia senal que permitira que la protema se secrete cuando se expresa en las celulas.
En algunas realizaciones de la invencion, el ARNm puede tener opcionalmente modificaciones qrnmicas o biologicas que, por ejemplo, mejoran la estabilidad y/o la vida media de dicho ARNm o que mejoran o facilitan de otra manera la produccion de protemas. Tras la transfeccion, un ARNm natural en las composiciones de la invencion puede decaer con una vida media de entre 30 minutos y varios dfas. Los ARNm en las composiciones de la invencion retienen preferiblemente por lo menos cierta capacidad de traduccion, produciendo de este modo una protema o enzima funcional. Por consiguiente, la invencion proporciona composiciones que comprenden y metodos para administrar un ARNm estabilizado. En algunas realizaciones de la invencion, la actividad del ARNm se prolonga durante un penodo de tiempo extendido. Por ejemplo, la actividad del ARNm puede prolongarse de tal manera que las composiciones de la presente invencion se administren a un sujeto dos veces por semana o cada dos semanas, o mas preferiblemente de forma mensual, bimensual, trimestral o anual. La actividad extendida o prolongada del ARNm de la presente invencion esta directamente relacionada con la cantidad de protema o enzima producida a partir de dicho ARNm. De manera similar, la actividad de las composiciones de la presente invencion puede extenderse o prolongarse adicionalmente mediante modificaciones realizadas para mejorar o aumentar la traduccion del ARNm. Ademas, la cantidad de protema o enzima funcional producida por la celula objetivo es una funcion de la cantidad de ARNm administrada a las celulas objetivo y la estabilidad de dicho ARNm. En la medida en que la estabilidad del ARNm de la presente invencion se pueda mejorar o aumentar, la vida media, la actividad de la protema o enzima producidas y la frecuencia de dosificacion de las composiciones puede extenderse adicionalmente.
Por consiguiente, en algunas realizaciones, el ARNm en las composiciones de la invencion comprende por lo menos una modificacion que confiere estabilidad incrementada o aumentada al acido nucleico, incluyendo, por ejemplo, resistencia mejorada a la digestion con nucleasa in vivo. Como se usan en la presente, los terminos "modificacion" y "modificado" como tales terminos se refieren a los acidos nucleicos proporcionados en la presente, incluyen por lo menos una alteracion que preferiblemente aumenta la estabilidad y hace que el ARNm sea mas estable (por ejemplo, resistente a la digestion con nucleasas) que la version del tipo salvaje o natural del ARNm. Como se usan en la presente, los terminos "estable" y "estabilidad" como tales se refieren a los acidos nucleicos de la presente invencion, y en particular con respecto al ARNm, se refieren a una resistencia incrementada o aumentada a la degradacion por, por ejemplo, nucleasas (es decir, endonucleasas o exonucleasas) que normalmente son capaces de degradar tal ARNm. La estabilidad aumentada puede incluir, por ejemplo, menos sensibilidad a la hidrolisis u otra destruccion por enzimas endogenas (por ejemplo, endonucleasas o exonucleasas) o condiciones dentro de la celula o tejido objetivo, incrementando o aumentando de este modo la residencia de dicho ARNm en la celula, tejido, sujeto y/o citoplasma objetivo. Las moleculas de ARNm estabilizadas proporcionadas en la presente demuestran vidas medias mas largas en relacion a sus contrapartidas no modificadas de origen natural (por ejemplo, la version de tipo salvaje del ARNm). Tambien se contemplan por los terminos "modificacion" y "modificado", como se refieren tales terminos al ARNm de la presente invencion, son alteraciones que mejoran o aumentan la traduccion de los acidos nucleicos del ARNm, incluyendo, por ejemplo, la inclusion de secuencias que funcionan en el inicio de la traduccion de protemas (por ejemplo, la secuencia de consenso de Kozak). (Kozak, M., Nucleic Acids Res 15 (20): 8125-48 (1987)).
En algunas realizaciones, los ARNm usados en las composiciones de la invencion se han sometido a una modificacion qmmica o biologica para hacerlos mas estables. Las modificaciones ejemplares de un ARNm incluyen el agotamiento de una base (por ejemplo, mediante la delecion o mediante la sustitucion de un nucleotido por otro) o la modificacion de una base, por ejemplo, la modificacion qmmica de una base. La frase "modificaciones qrnmicas", como se usa en la presente, incluye modificaciones que introducen una qmmica que difiere de las observadas en el ARNm de origen natural, por ejemplo, modificaciones covalentes como la introduccion de nucleotidos modificados (por ejemplo, analogos de nucleotidos o la inclusion de grupos colgantes) que no se encuentran naturalmente en tales moleculas de ARNm).
Ademas, las modificaciones adecuadas incluyen alteraciones en uno o mas nucleotidos de un codon de tal manera que el codon codifica el mismo aminoacido pero es mas estable que el codon encontrado en la version de tipo salvaje del ARNm. Por ejemplo, se ha demostrado una relacion inversa entre la estabilidad del ARN y un numero mas alto de residuos de citidinas (C) y/o de uridinas (U), y se ha descubierto que el ARN sin residuos de C y U es estable para la mayona de las RNasas (Heidenreich, et al. J Biol Chem 269, 2131-8 (1994)). En algunas realizaciones, el numero de residuos C y/o U en una secuencia de ARNm se reduce. En otra realizacion, el numero
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de residuos C y/o U se reduce mediante la sustitucion de un codon que codifica un aminoacido particular por otro codon que codifica el mismo aminoacido o uno relacionado. Las modificaciones contempladas en los acidos nucleicos de ARNm de la presente invencion tambien incluyen la incorporacion de pseudouridinas. La incorporacion de pseudouridinas en los acidos nucleicos de ARNm de la presente invencion puede mejorar la estabilidad y la capacidad de traduccion, asf como disminuir la inmunogenicidad in vivo. Ver, por ejemplo, Kariko, K., et al., Molecular Therapy 16 (11): 1833-1840 (2008). Las sustituciones y modificaciones al ARNm de la presente invencion pueden realizarse mediante metodos facilmente conocidos por un experto en latecnica.
Las restricciones para reducir el numero de residuos C y U en una secuencia pueden ser mayores dentro de la region codificante de un ARNm, en comparacion con una region no traducida (es decir, es probable que no sea posible eliminar todos los residuos C y U presentes en el mensaje a la vez que se retiene la capacidad del mensaje para codificar la secuencia de aminoacidos deseada). Sin embargo, la degeneracion del codigo genetico presenta una oportunidad para permitir que se reduzca el numero de residuos C y/o U que estan presentes en la secuencia, a la vez que se mantiene la misma capacidad de codificacion (es decir, dependiendo de que aminoacido esta codificado por un codon, pueden ser posibles varias posibilidades diferentes para la modificacion de secuencias de ARN). Por ejemplo, los codones para Gly pueden alterarse a GGA o GGG en lugar de GGU o GGC.
Otras modificaciones de polinucleotidos adecuadas que pueden incorporarse en el ARNm usado en las composiciones de la invencion incluyen, pero no estan limitadas a, bases 4'-tio-modificadas: 4'-tio-adenosina, 4'-tio- guanosina, 4'-tio-citidina, 4'-tio-uridina, 4'-tio-5-metil-citidina, 4'-tio-pseudouridina y 4'- tio-2-tiouridina, piridin-4-ona ribonucleosido, 5-aza-uridina, 2-tio-5-aza-uridina, 2-tiouridina, 4-tio-pseudouridina, 2-tio-pseudouridina, 5- hidroxiuridina, 3-metiluridina, 5-carboximetil-uridina, 1-carboximetil-pseudouridina, 5-propinil-uridina, 1 -propinil- pseudouridina, 5-taurinometiluridina, 1-taurinometil-pseudouridina, 5-taurinometil-2-tio-uridina, 1-taurometil-4-tio- uridina, 5-metil-uridina, 1-metil-pseudouridina, 4-tio-1-metil-pseudouridina, 2-tio-1-metil-pseudouridina, 1 -metil-1- desosa-pseudouridina, 2-tio-1-metil-1-desaza-pseudouridina, dihidrouridina, dihidropseudouridina, 2-tio- dihidrouridina, 2-tio-dihidropseudouridina, 2-metoxiuridina, 2-metoxi-4-tio-uridina, 4-metoxi-pseudouridina, 4-metoxi- 2-tio-pseudouridina, 5-aza-citidina, pseudoisocitidina, 3-metil-citidina, N4-acetilcitidina, 5-formilcitidina, N4-metilcicida tidina, 5-hidroximetilcitidina, 1-metil-pseudoisocitidina, pirrolo-citidina, pirrolo-pseudoisocitidina, 2-tio-citidina, 2-tio-5- metil-citidina, 4-tio-pseudoisocitidina, 4-tio-1-metil-pseudoisocitidina, 4-tio-1-metil-1-desaza-pseudoisocitidina, 1- metil-1-desaza-pseudoisocitidina, zebularina, 5-aza-zebularina, 5-metil-zebularina, 5-aza-2-tio-zebularina 2-tio- zebularina, 2-metoxi-citidina, 2-metoxi-5-metil-citidina, 4-metoxi-pseudoisocitidina, 4-metoxi-1-metil- pseudoisocitidina, 2-aminopurina, 2,6-diaminopurina, 7-dseaza-adenina, 7-desaza-8-aza-adenina, 7-desaza-2- aminopurina, 7-desaza-8-aza-2-aminopurina, 7-desaza-2,6-diaminopurina, 7-desaza-8-aza-2,6-diaminopurina, 1- metiladenosina, N6-metiladenosina, N6-isopenteniladenosina, N6-(cis-hidroxiisopentenil)adenosamaltina, 2-metiltio- N6-cis-hidroxiisopentenil)adenosina, N6-glicinilcarbamoiladenosina, N6-treonilcarbamoiladenosina, 2-metiltio-N6- treonil-carbamoiladenosina, N6,N6-dimetiladenosina, 7-metiladenina, 2-metiltio-adenina, y 2-metoxi-adenina, inosina, 1-metil-inosina, wiosina, wibutosina, 7-desaza-guanosina, 7-desaza-8-aza-guanosina, 6-tio-guanosina, 6-tio-7- desaza-guanosina, 6-tio-7-desaza-8-aza-guanosina, 7-metil-guanosina, 6-tio-7-metil-guanosina, 7-metilinosina, 6- metoxi-guanosina, 1-metilguanosina, N2- metilguanosina, N2,N2-dimetilguanosina, 8-oxo-guanosina, 7-metil-8-oxo- guanosina, 1-metil-6-tio-guanosina, N2-metil-6-tio-guanosina, y N2,N2-dimetilo -6-tio-guanosina, y combinaciones de los mismos. El termino modificacion tambien incluye, por ejemplo, la incorporacion de enlaces no de nucleotidos o nucleotidos modificados en las secuencias de ARNm de la presente invencion (por ejemplo, modificaciones en uno o ambos extremos 3' y 5' de una molecula de ARNm que codifica una protema o enzima funcional). Tales modificaciones incluyen la adicion de bases a una secuencia de ARNm (por ejemplo, la inclusion de una cola poli A o una cola poli A mas larga), la alteracion de 3' UTR o 5' UTR, complejando el ARNm con un agente (por ejemplo, una protema o una molecula de acido nucleico complementaria), y la inclusion de elementos que cambian la estructura de una molecula de ARNm (por ejemplo, que forman estructuras secundarias).
Estructura de caperuza
En algunas realizaciones, los ARNm incluyen una estructura de caperuza 5'. Una caperuza 5' se anade tfpicamente de la siguiente manera: primero, una fosfatasa terminal de ARN elimina uno de los grupos fosfato terminales del nucleotido 5', dejando dos fosfatos terminales; luego se anade trifosfato de guanosina (GTP) a los fosfatos terminales a traves de una guanilil transferasa, produciendo un enlace 5'5'5 trifosfato; y el 7-nitrogeno de la guanina se metila luego por una metiltransferasa. Los ejemplos de estructuras de caperuza incluyen, pero no estan limitados a, m7G(5')ppp (5'(A,G(5')ppp(5')A y G(5')ppp(5')G.
Las estructuras de caperuza de origen natural comprenden una 7-metil guanosina que esta enlazada a traves de un puente de trifosfato al extremo 5' del primer nucleotido transcrito, lo que da como resultado una caperuza de dinucleotido de m7G(5')ppp(5')N, donde N es Cualquier nucleosido. In vivo, la caperuza se anade enzimaticamente. La caperuza se anade en el nucleo y se cataliza por la enzima guanilil transferasa. La adicion de la caperuza al extremo 5' terminal del ARN se produce inmediatamente despues del inicio de la transcripcion. El nucleosido terminal es tfpicamente una guanosina, y esta en la orientacion inversa a todos los otros nucleotidos, es decir, G(5')ppp(5')GpNpNp.
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Una caperuza comun para el ARNm producido por transcripcion in vitro es m7G(5')ppp(5')G, que se ha usado como la caperuza de dinucleotido en la transcripcion con ARN polimerasa T7 o SP6 in vitro para obtener ARN que tienen una estructura de caperuza en sus extremos terminales 5'. El metodo predominante para la smtesis in vitro de ARNm con caperuza emplea un dinucleotido preformado de la forma m7G(5')ppp(5')G ("m7GpppG") como iniciador de la transcripcion.
Hasta la fecha, una forma habitual de una caperuza de dinucleotido sintetico usado en experimentos de traduccion in vitro es el Analogo de Caperuza Anti-Inverso ("ARCA") o ARCA modificado, que generalmente es un analogo de caperuza modificado en el que el grupo 2' o 3' OH se reemplaza por -OCH3.
Los analogos de caperuzas adicionales incluyen, pero no estan limitados a, estructuras qrnmicas seleccionadas del grupo que consiste de m7GpppG, m7GpppA, m7GpppC; analogos de caperuza no metilados (por ejemplo, GpppG); analogo de caperuza dimetilada (por ejemplo, m2,7GpppG), analogo de caperuza trimetilada (por ejemplo, m2,2,7GpppG), analogos de caperuza simetricos dimetilados (por ejemplo, m7Gpppm7G), o analogos de caperuza anti inversos (por ejemplo, ARCA; m7,2'OmeGpppG, m72'dGpppG, m7,3'OmeGpppG, m7,3'dGpppG y sus derivados de tetrafosfato (ver, por ejemplo, Jemielity, J. et al., "Novel 'anti-reverse' cap analogs with superior translational properties", RNA, 9: 1108-1l22 (2003)).
En algunas realizaciones, una caperuza adecuada es un guanilato de 7-metilo ("m7G") enlazado mediante un puente trifosfato al extremo 5' del primer nucleotido transcrito, resultando en m7G(5')ppp(5')N, donde N es cualquier nucleosido. Una realizacion preferida de una caperuza m7G utilizada en realizaciones de la invencion es m7G(5')ppp(5')G.
En algunas realizaciones, la caperuza es una estructura de CapO. Las estructuras de CapO carecen de un residuo de 2'-O-metilo de la ribosa unida a las bases 1 y 2. En algunas realizaciones, la caperuza es una estructura Cap1. Las estructuras Cap1 tienen un residuo de 2'-O-metilo en la base 2. En algunas realizaciones, la caperuza es una estructura Cap2. Las estructuras Cap2 tienen un residuo de 2'-O-metilo unido a ambas bases 2 y 3.
En la tecnica se conocen una variedad de analogos de caperuza m7G, muchos de los cuales estan disponibles comercialmente. Estos incluyen el m7GpppG descrito anteriormente, asf como los analogos de caperuzas ARCA 3'-OCH3 y 2'-OCH3 (Jemielity, J. et al., RNA, 9: 1108-1122 (2003)). Los analogos de caperuzas adicionales para su uso en realizaciones de la invencion incluyen analogos de tetrafosfato de dinucleosido N7- bencilado (descritos en Grudzien, E. et al., RNA, 10: 1479-1487 (2004)), analogos de caperuzas de fosforotioato (descritos en Grudzien-Nogalska, E., et al., RNA, 13: 1745-1755 (2007)), y analogos de caperuzas (incluyendo los analogos de caperuzas biotinilados) descritos en las Patentes de Estados Unidos 8.093.367 y 8.304.529.
Estructura de cola
Tfpicamente, la presencia de una "cola" sirve para proteger el ARNm de la degradacion por exonucleasas. Se piensa que una cola de poli A o poli U estabiliza los mensajeros naturales y el ARN de sentido sintetico. Por lo tanto, en ciertas realizaciones, se puede anadir una cola larga de poli A o poli U a una molecula de ARNm haciendo el ARN mas estable. Las colas de poli A o poli U pueden anadirse usando una variedad de tecnicas reconocidas en la tecnica. Por ejemplo, pueden anadirse colas largas de poli A al ARN sintetico o transcrito in vitro usando polimerasa de poli A (Yokoe, et al. Nature Biotechnology. 1996; 14: 1252-1256). Un vector de transcripcion tambien puede codificar colas largas de poli A. Ademas, las colas de poli A se pueden anadir por transcripcion directamente de los productos de PCR. La poli A tambien se puede ligar al extremo 3' de un ARN de sentido con ARN ligasa (ver, por ejemplo, Molecular Cloning A Laboratory Manual, 2a ed., Ed. por Sambrook, Fritsch y Maniatis (Cold Spring Harbor Laboratory Press: edicion de 1991)).
Tfpicamente, la longitud de una cola de poli A o poli U puede ser de por lo menos aproximadamente 10, 50, 100, 200, 300, 400 por lo menos 500 nucleotidos. En algunas realizaciones, una cola de poli-A en el extremo terminal 3' del ARNm incluye tipicamente aproximadamente de 10 a 300 nucleotidos de adenosina (por ejemplo, aproximadamente de 10 a 200 nucleotidos de adenosina, aproximadamente de 10 a 150 nucleotidos de adenosina, aproximadamente de 10 a 100 nucleotidos de adenosina, aproximadamente de 20 a 70 nucleotidos de adenosina, o aproximadamente de 20 a 60 nucleotidos de adenosina). En algunas realizaciones, los ARNm incluyen una estructura de cola de poli(C) 3'. Una cola de poli-C adecuada en el extremo terminal 3' del ARNm incluye tfpicamente de aproximadamente 10 a 200 nucleotidos de citosina (por ejemplo, aproximadamente de 10 a 150 nucleotidos de citosina, aproximadamente de 10 a 100 nucleotidos de citosina, aproximadamente de 20 a 70 nucleotidos de citosina, aproximadamente de 20 a 60 nucleotidos de citosina, o aproximadamente de 10 a 40 nucleotidos de citosina). La cola de poli-C se puede anadir a la cola de poli-A o poli U o puede sustituir a la cola de poli-A o poli U.
En algunas realizaciones, la longitud de la cola de poli A o poli C se ajusta para controlar la estabilidad de una molecula de ARNm de sentido modificada de la invencion y, por tanto, la transcripcion de la protema. Por ejemplo, como la longitud de la cola de poli A puede influir en la vida media de una molecula de ARNm de sentido, la longitud de la cola de poliA puede ajustarse para modificar el nivel de resistencia del ARNm a las nucleasas y
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controlar de este modo el curso temporal de la expresion de polinucleotidos y/o la produccion de polipeptidos en una celula objetivo.
Secuencia de Peptido Senal
En algunas realizaciones, un ARNm de acuerdo con la presente invencion incorpora una secuencia de nucleotidos que codifica un peptido senal. Como se usa en la presente, el termino "peptido senal" se refiere a un peptido presente en una protema recien sintetizada que puede dirigir la protema hacia la via secretora. En algunas realizaciones, el peptido senal se escinde despues de la translocacion en el retmulo endoplasmatico despues de la traduccion del ARNm. El peptido senal tambien se conoce como secuencia senal, secuencia lfder o peptido lfder. ^picamente, un peptido senal es un peptido corto (por ejemplo, de 5-30, 5-25, 5-20, 5-15 o 5-10 aminoacidos de longitud). Un peptido senal puede estar presente en el extremo N terminal de una protema recien sintetizada. Sin querer estar sujeto por ninguna teona particular, la incorporacion de un peptido senal que codifica la secuencia en un ARNm puede facilitar la secrecion y/o produccion de la protema codificada in vivo.
Un peptido senal adecuado para la presente invencion puede ser una secuencia heterogenea derivada de varias protemas eucariotas y procariotas, en particular protemas secretadas. En algunas realizaciones, un peptido senal adecuado es una secuencia rica en leucina. Ver Yamamoto Y et al. (1989), Biochemistry, 28:2728-2732 . Un peptido senal adecuado puede derivarse de una hormona de crecimiento humana (hGH), preprotema de albumina serica, precursor de la cadena ligera kappa de Ig, preprotema de azurocidina, precursor de cistatina-S, precursor de tripsinogeno 2, bloqueador del canal de potasio, alfa conotoxina lp1.3, alfa conotoxina, alfa-galactosidasa, celulosa, proteinasa aspartica nepentesina-1, quitinasa de acido, prepro-toxina K28, precursor de cigocina de toxina asesina, y toxina del colera. Las secuencias de peptido senal ejemplares se describen en Kober, et al., Biotechnol. Bioeng., 110: 1164-73, 2012 .
En algunas realizaciones, un ARNm de acuerdo con la presente invencion puede incorporar una secuencia que codifica un peptido senal derivado de la hormona de crecimiento humana (hGH), o un fragmento de la misma. Una secuencia de nucleotidos no limitativa que codifica un peptido senal de hGH se muestra a continuacion.
Secuencia de la hormona del crecimiento humana (hGH) 5' (SEQ ID NO: 7):
AU GGC C ACU GG AU C AAG AAC CU C ACU GCU GCUCGCUUUU GG ACU GCUUU
GCCUGCCCUGGUUGCAAGAAGGAUCGGCUUUCCCGACCAUCCCACUCUC
C
Secuencia de hormona de crecimiento humana (hGH) 5' alternativa (SEQ ID NO: 8):
AUGGCAACUGGAUCAAGAACCUCCCUCCUGCUCGCAUUCGGCCUGCUCU
GUCUCCCAUGGCUCCAAGAAGGAAGCGCGUUCCCCACUAUCCCCCUCUC
G
En algunas realizaciones, un ARNm de acuerdo con la presente invencion puede incorporar una secuencia codificante de peptido senal que tiene por lo menos un 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% o mas de identidad con la SEQ ID NO: 7 o la SEQ ID NO: 8.
Region no traducida de 5' y 3'
En una realizacion, un ARNm puede modificarse mediante la incorporacion de secuencias no traducidas 3 ' y/o 5' (UTR) que no se encuentran de manera natural en el ARNm de tipo salvaje. En una realizacion, una secuencia flanqueante 3' y/o 5' que flanquea de manera natural un ARNm y codifica una segunda protema no relacionada puede incorporarse en la secuencia de nucleotidos de una molecula de ARNm que codifica una protema terapeutica o funcional para modificarla. Por ejemplo, las secuencias 3' o 5' de moleculas de ARNm que son estables (por ejemplo, enzimas del ciclo de globina, actina, GAPDH, tubulina, histona o del acido cftrico) pueden incorporarse en la region 3' y/o 5' de una molecula de acido nucleico de ARNm de sentido para aumentar la estabilidad de la molecula de ARNm de sentido. Ver, por ejemplo, la US2003/0083272.
En algunas realizaciones, el ARNm en las composiciones de la invencion incluye la modificacion del extremo 5' del ARNm para incluir una secuencia parcial de un gen de CMV inmediato-temprano 1 (IE1), o un fragmento del mismo (por ejemplo, SEQ ID NO: 1) para mejorar la resistencia a las nucleasas y/o mejorar la vida media del ARNm. Ademas de aumentar la estabilidad de la secuencia de acido nucleico del ARNm, se ha descubierto sorprendentemente que la inclusion de una secuencia parcial de un gen de CMV inmediato-temprano 1 (IE1) mejora la traduccion del ARNm y la expresion de la protema o enzima funcional. Tambien se contempla la inclusion de una secuencia del gen de la hormona del crecimiento humana (hGH), o un fragmento de la misma (por
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ejemplo, la SEQ ID NO: 2) en los extremos 3' del acido nucleico (por ejemplo, ARNm) para estabilizar adicionalmente el ARNm. En general, las modificaciones preferidas mejoran la estabilidad y/o las propiedades farmacocineticas (por ejemplo vida media) del ARNm en relacion a sus contrapartidas no modificadas e incluyen, por ejemplo, modificaciones realizadas para mejorar la resistencia de tal ARNm a la digestion por nucleasa in vivo .
Tambien se contemplan las variantes de la secuencia de acido nucleico de la SEQ ID NO: 1 y/o la SEQ ID
NO: 2, en las que las variantes mantienen las propiedades funcionales de los acidos nucleicos incluyendo la
estabilizacion del ARNm y/o propiedades farmacocineticas (por ejemplo, la vida media). Las variantes pueden tener por lo menos un 80%, por lo menos un 85%, por lo menos un 90%, por lo menos un 95%, por lo menos un 98%, o
por lo menos un 99% de identidad de secuencia con la SEQ ID NO: 1 o la SEQ ID NO: 2.
En algunas realizaciones, la composicion puede comprender un reactivo estabilizador. Las composiciones pueden incluir uno o mas reactivos de formulacion que se unen directa o indirectamente, y estabilizan el ARNm, mejorando de este modo el tiempo de residencia en la celula objetivo. Tales reactivos llevan preferiblemente a una vida media mejorada del ARNm en las celulas objetivo. Por ejemplo, la estabilidad de un ARNm y la eficiencia de su traduccion pueden aumentarse mediante la incorporacion de "reactivos estabilizadores" que forman complejos con el ARNm que tienen lugar de manera natural dentro de una celula (ver, por ejemplo, Patente de Estados Unidos N° 5.677.124). La incorporacion de un reactivo estabilizador se puede lograr, por ejemplo, combinando la poli A y una protema con el ARNm a ser estabilizado in vitro antes de cargar o encapsular el ARNm dentro de un vehmulo de transferencia. Los reactivos estabilizadores ejemplares incluyen una o mas protemas, peptidos, aptameros, protemas accesorias de traduccion, protemas de union a ARNm y/o factores de iniciacion de la traduccion.
La estabilizacion de las composiciones tambien puede mejorarse mediante el uso de fracciones inhibidoras de la opsonizacion, que son tfpicamente polfmeros hidrofilos grandes que estan unidos qrnmica o ffsicamente al vehmulo de transferencia (por ejemplo, mediante la intercalacion de un anclaje soluble en lfpidos en la misma membrana, o uniendose directamente a grupos activos de lfpidos de membrana). Estos polfmeros hidrofilos inhibidores de la opsonizacion forman una capa superficial protectora que disminuye significativamente la captacion de los liposomas por el sistema de macrofagos-monocitos y el sistema retmulo-endotelial (por ejemplo, como se describe en la Patente de Estados Unidos 4.920.016). Los vehmulos de transferencia modificados con fracciones de inhibicion de la opsonizacion permanecen por tanto en la circulacion mucho mas tiempo que sus homologos no modificados.
Cuando el ARN se hibrida con una molecula de acido nucleico complementaria (por ejemplo, ADN o ARN), puede protegerse de las nucleasas. ((Krieg, et al. Melton. Methods in Enzymology. 1987; 155, 397-415). La estabilidad del ARNm hibridado se debe probablemente a la especificidad de la cadena sencilla inherente de la mayona de las RNasas. En algunas realizaciones, el reactivo estabilizador seleccionado para complejar un ARNm es una protema eucariota (por ejemplo, una protema de mamffero). En otra realizacion mas, el ARNm puede modificarse por hibridacion con una segunda molecula de acido nucleico. Si una molecula de ARNm completa se hibridara con una molecula de acido nucleico complementaria puede reducirse el inicio de la traduccion. En algunas realizaciones, la region no traducida 5' y la region de inicio AUG de la molecula de ARNm pueden dejarse opcionalmente sin hibridar. Tras el inicio de la traduccion, la actividad de desenrollado del complejo de ribosoma puede funcionar incluso en duplex de alta afinidad para que la traduccion pueda continuar. (Liebhaber. J. Mol. Biol. 1992; 226: 2-13; Monia, et al. J Biol Chem. 1993; 268: 14514-22).
Se entendera que cualquiera de los metodos descritos anteriormente para mejorar la estabilidad del ARNm puede usarse solo o en combinacion con uno o mas de cualquier otro de los metodos y/o composiciones descritos anteriormente.
El ARNm de la presente invencion puede combinarse opcionalmente con un gen informador (por ejemplo, secuencia arriba o secuencia abajo de la region codificante del ARNm) que, por ejemplo, facilita la determinacion de la administracion del ARNm a las celulas o tejidos objetivo. Los genes informadores adecuados pueden incluir, por ejemplo, ARNm de Protema Fluorescente Verde (ARNm de GFP), ARNm de luciferasa de Renilla (ARNm de luciferasa), ARNm de Luciferasa de Luciernaga, o cualquier combinacion de los mismos. Por ejemplo, el ARNm de GFP se puede fusionar con un ARNm que codifica una protema secretable para facilitar la confirmacion de la localizacion del ARNm en las celulas objetivo que actuara como un deposito para la produccion de protemas.
Sintesis de ARNm
Los ARNm de acuerdo con la presente invencion pueden sintetizarse de acuerdo con cualquiera de una variedad de metodos conocidos. Por ejemplo, los ARNm de acuerdo con la presente invencion pueden sintetizarse mediante transcripcion in vitro (IVT). En resumen, la IVT se realiza tfpicamente con una plantilla de ADN lineal o circular que contiene un promotor, una agrupacion de trifosfatos de ribonucleotidos, un sistema de tampon que puede incluir DTT e iones de magnesio, y una ARN polimerasa apropiada (por ejemplo, ARN polimerasa T3, t7 o SP6), ADNasa I, pirofosfatasa y/o inhibidor de ARNasa. Las condiciones exactas variaran de acuerdo con la aplicacion espedfica.
5
10
15
20
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65
En algunas realizaciones, para la preparacion de ARNm de acuerdo con la invencion, una plantilla de ADN se transcribe in vitro. Una plantilla de ADN adecuada tiene tipicamente un promotor, por ejemplo un promotor T3, T7 o SP6, para la transcripcion in vitro, seguido de la secuencia de nucleotidos deseada para el ARNm deseado y una senal de terminacion.
La secuencia(s) de ARNm deseada de acuerdo con la invencion puede determinarse e incorporarse a una plantilla de ADN usando metodos estandar. Por ejemplo, partiendo de una secuencia de aminoacidos deseada (por ejemplo, una secuencia enzimatica), se realiza una traduccion inversa virtual basada en el codigo genetico degenerado. Pueden usarse luego algoritmos de optimizacion para seleccionar los codones adecuados. Tfpicamente, el contenido de G/C puede optimizarse para lograr el contenido de G/C mas alto posible por un lado, teniendo en cuenta la mejor manera posible la frecuencia de los ARNt de acuerdo con el uso del codon por otro lado. La secuencia de ARN optimizada puede establecerse y mostrarse, por ejemplo, con la ayuda de un dispositivo de visualizacion apropiado y compararse con la secuencia original (tipo salvaje). Tambien se puede analizar una estructura secundaria para calcular las propiedades de estabilizacion y desestabilizacion o, respectivamente, las regiones del ARN.
Protemas De Fusion Terapeuticas
Las composiciones de la invencion comprenden ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica. Una Protema de Fusion Terapeutica comprende una protema terapeutica fusionada con un polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc. La Protema de Fusion Terapeutica puede comprender opcionalmente una secuencia enlazadora entre la protema terapeutica y el polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc. Tras la entrega de las composiciones de la invencion a celulas objetivo, el ARNm se traduce para producir la Protema de Fusion Terapeutica codificada, que se secreta y absorbe de nuevo por las celulas y se transporta al sistema circulatorio a traves del receptor Fc.
Proteina Terapeutica
La porcion de protema terapeutica de la Protema de Fusion Terapeutica puede elegirse de cualquier protema o polipeptido que pueda expresarse para proporcionar un efecto terapeutico, como se define adicionalmente en las reivindicaciones. En algunas realizaciones, la protema terapeutica puede ser una protema o enzima funcional que se secreta normalmente en el espacio extracelular. Por ejemplo, tales protemas secretadas incluyen factores de coagulacion, componentes de la via del complemento, citoquinas, hormonas proteicas, componentes proteicos del suero y otros. En algunas realizaciones, la protema terapeutica es eritropoyetina, a1 -antitripsina, u hormona del crecimiento humana. En algunas realizaciones, la protema terapeutica es una que normalmente no se secreta. En tales casos, el ARNm en las composiciones de la invencion puede disenarse para que comprenda una secuencia lfder secretora operativamente ligada a la secuencia que codifica la Protema de Fusion Terapeutica para dirigir la secrecion de la protema codificada. Las secuencias lfder secretoras adecuadas se describen, por ejemplo, en la US 2008/0286834.
En algunas realizaciones, la protema terapeutica en la Protema de Fusion Terapeutica se elige de las protemas secretadas enumeradas en la Tabla 1 para el tratamiento de enfermedades definidas en las reivindicaciones; por tanto, las composiciones de la invencion pueden comprender un ARNm que codifica una protema enumerada en la Tabla 1 (o un homologo de las mismas, como se describe a continuacion) para el tratamiento de enfermedades definidas en las reivindicaciones, junto con otros componentes expuestos en la presente.
Tabla 1: Protemas Secretadas
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
A1E959
Protema asociada a ameloblastos odontogenicos ODAM
A1KZ92
Protema similar a la peroxidasina PXDNL
A1L453
Serina proteasa 38 PRSS38
A1L4H1
Protema SSC5D que contiene el dominio rico en cistema del receptor del secuestrante soluble SSC5D
A2RUU4
Protema similar a colipasa 1 CLPSL1
A2VDF0
Mutarotase fucosa FUOM
A2VEC9
SCO-espondina SSPO
A3KMH1
Protema 8 que contiene el dominio A del Factor de von Willebrand VWA8
A4D0S4
Laminina subunidad beta-4 LAMB4
A4D1T9
Serina proteasa inactiva probable 37 PRSS37
5
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65
A5D8T8
A6NC86
A6NCI4
A6ND01
A6NDD2
A6NE02
A6NEF6
A6NF02
A6NFB4
A6NFZ4
A6NG13
A6NGN9
A6NHN0
A6NHN6
A6NI73
A6NIT4
A6NJ69
A6NKQ9
A6NMZ7
A6NNS2
A6XGL2
A8K0G1
A8K2U0
A8K714
A8MTL9
A8MV23
A8MZH6
A8TX70
BOZBE8
B1A4G9
B1A4H2
B1A4H9
B1AJZ6
B1AKI9
B2RNN3
B2RUY7
B3GU2
B4DI03
B4DJF9
B4DUL4
B5MCC8
B8A595
B8A597
B8A598
B9A064
C9J3H3
C9J8I8
Familia de dominios de lectina tipo C 18 miembro A
Inhibidor de la fosfolipasa A2 y protema que contiene el dominio Ly6/PLAUR
Protema 3A que contiene el dominio A del Factor de von Willebrand
Receptor dl folato probable delta
Similar a Beta-defensina 108B
Protema 17que contiene el dominio BTB/POZ
Hormona de crecimiento 1
Protema similar a NPIP LOC730153
HCG1749481, isoforma CRA_k______________________________________
Protema FAM24A
Protema que contiene el dominio de glicosiltransferasa 54 Miembro 5 de la familia IgLON
Otol-1___________________________________________________________
Similar a protema 2 que interactua con el complejo de poros nucleares
Miembro 5 de la subfamilia A del receptor similar a inmunoglobulina leucocitaria
Isoforma 2 de la hormona 2 somatomamotropina corionica
Homologo de la protema inductora de IgA
Variante 1 de la subunidad beta de coriogonadotropina
Cadena de colageno alfa-6 (VI)
Miembro 7C de la familia SDR de deshidrogenasa/reductasa Cadena de insulina A Protemas Wnt
Protema 1 similar a alfa-2-macroglobulina Regulador de canal de cloruro activado por calcio 1 Protema similar a Serpina AHMSD Serpina AE3
Homologo de protema 1 secretada por ovocitos Cadena de colageno alfa-5 (VI)
Peptido natriuretico Somatotropina
HCG1749481, isoforma CRA_d______________________________________
Somatomammotropina hormona corionica
Protema Wnt
Isthmin-1
Complemento C1q y protema 9B relacionada con el factor de necrosis tumoral Similar a protema 2 que contiene el dominio C del Factor de von Willebrand Protema 3 expresada en la prostata y testfculos Similar a SEC11 3 (S. cerevisiae), isoforma CRA_a Protemas Wnt
Similar a SEC11 1 (S. cerevisiae), isoforma CRA_d
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Polipeptido 5 similar a inmunoglobulina lambda Protemas Wnt Protemas Wnt
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
C9JAF2
C9JCI2
C9JL84
C9JNR5
C9JU12
D6RF47
D6RF94
E2RYF7
E5RFR1
E7EML9
E7EPC3
E7EVP0
E9PD02
E9PH60
E9PJL6
F5GYM2
F5H034
F5H364
F5H7Q6
F8WCM5
F8WDR1
H0Y663
H0YK72
H0YK83
H0YM39
H0YMT7
H0YN17
H0YNA5
H0YNG3
H0YNX5
H7BZB8
H9KV56
I3L0L8
J3KNZ1
J3KP00
J3QT02
O00175
O00182
O00187
O00230
O00253
O00270
O00292
000294
000295 O00300 O00339
Factor de crecimiento similar a la insulina II Ala-25 Del Protemas Wnt
Protema 1 asociada a HERV-H LTR
Cadena de insulina A
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protema PBMUCL2___________________________________________
PENK (114-133)______________________________________________
Serina proteasa 44 Protemas Wnt Nociceptina
Factor de crecimiento I similar a insulina
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Protemas Wnt
Proteina INS-IGF2____________________________________________
Protemas Wnt Protemas Wnt
Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11A Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11A Hormona de Somatomammotropina corionica Hormona de Somatomammotropina corionica Hormona de Somatomammotropina corionica Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11A Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11A Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11A Protemas Wnt
Subunidad beta de coriogonadotropina variante 2 Protemas Wnt
Subunidad beta de coriogonadotropina variante 1 Subunidad beta de coriogonadotropina Subunidad beta de coriogonadotropina variante 1 Quimiocina de motivo C-C 24 Galectina-9
Serina proteasa de lectina de union a manano 2 Cortistatina
Proteina relacionada con el agutf
Receptor del acido 12-(S)-hidroxi-5,8,10,14-eicosatetraenoico Factor de determinacion izquierda-derecha 2 Proteina 1 relacionada con Tubby Proteina 2 relacionada con Tubby
Miembro 11B de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral Matrilin-2
5
10
15
20
25
30
35
40
45
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55
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65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
000391
Sulfhidril oxidasa 1 QS0X1
000468
Agrin AGRN
000515
Ladinin-1 LAD1
000533
Protema similar a la molecula de adhesion de celulas neurales procesadas L1 CHL1
000584
Ribonucleasa T2 RNASET2
000585
Quimiocina motivo C-C 21 CCL21
000602
Ficolin-1 FCN1
000622
Protema CYR61 CYR61
000626
MDC (5-69) CCL22
000634
Netrin-3 NTN3
000744
Protema Wnt-10b WNT10B
000755
Protema Wnt-7a WNT7A
014498
Superfamilia de inmunoglobulinas que contiene protemas repetidas ricas en leucina ISLR
014511
Pro-neuregulin-2, isoforma unida a membrana NRG2
014594
Protema de nucleo neurocan NCAN
014625
Quimiocina motivo C-X-C 11 CXCL11
014638
Miembro 3 de la familia de ectonucleotido pirofosfatasa/fosfodiesterasa ENPP3
014656
Torsin-1A T0R1A
014657
Torsin-1B T0R1B
014786
Neuropilina-1 NRP1
014788
Miembro 11 de la superfamilia del ligando del factor de necrosis tumoral, forma de membrana TNFSF11
014791
Apolipoprotema L1 AP0L1
014793
Factor de crecimiento/diferenciacion 8 de MSTN
014904
Protema Wnt-9a WNT9A
014905
Protema Wnt-9b WNT9B
014944
Proepiregulina EREG
014960
Quimotaxina-2 derivada de celulas leucocitarias LECT2
015018
Protema 2 que contiene el dominio PDZ 2 procesado PDZD2
015041
Semaforina-3E SEMA3E
015072
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 3 ADAMTS3
015123
Angiopoyetina-2 ANGPT2
015130
Neuropeptido FF NPFF
015197
Receptor 6 tipo B de efrina EPHB6
015204
ADAM DEC1 ADAMDEC1
015230
Subunidad de laminina alfa-5 LAMA5
015232
Matrilin-3 MATN3
015240
Peptido 1 regulador neuroendocrin VGF
015263
Beta-defensina 4A DEFB4A
015335
Condroadherina CHAD
015393
Cadena catalttica de proteasa transmembrana serina 2 TMPRSS2
015444
Quimiocina motivo C-C 25 CCL25
015467
Quimiocina motivo C-C 16 CCL16
015496
Fosfolipasa secretora A2 de grupo 10 PLA2G10
015520
Factor de crecimiento de fibroblastos 10 FGF10
015537
Retinoschisin RS1
043157
Plexin-B1 PLXNB1
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
O43184
Desintegrina y protema 12 que contiene el dominio metaloproteinasa ADAM12
O43240
Calicrema-10 KLK10
O43278
Inhibidor de proteasa tipo Kunitz 1 SPINT1
O43320
Factor de crecimiento de fibroblastos 16 FGF16
O43323
Producto de protema C Desert hedgehog DHH
O43405
Cochlin C0CH
O43508
Miembro 12 de la superfamilia del ligando del factor de necrosis tumoral, forma de membrana TNFSF12
O43555
Progonadoliberin-2 GNRH2
O43557
Miembro 14 de la superfamilia del ligando del factor de necrosis tumoral, forma soluble TNFSF14
O43692
Inhibidor la peptidasa 15 PI15
O43699
Lectina 6 similar a Ig que se une al acido sialico SIGLEC6
O43820
Hialuronidasa-3 HYAL3
O43827
Protema relacionada con la angiopoyetina 7 ANGPTL7
O43852
Calumenina CALU
O43854
Repeticion similar a EGF y protema 3 que contiene el dominio similar a Discoidina I EDIL3
O43866
Similar a antigeno CD5 CD5L
O43897
Protema 1 similar a tolloide TLL1
O43915
Factor de crecimiento endotelial vascular D FIGF
O43927
Quimiocina motivo C-X-C 13 CXCL13
O60218
Aldo-ceto reductasa familia 1 miembro B10 AKR1B10
O60235
Proteasa transmembrana serina 11D TMPRSS11D
O60258
Factor de crecimiento de fibroblastos 17 FGF17
O60259
Calicrema-8 KLK8
O60383
Factor de crecimiento/diferenciacion 9 GDF9
O60469
Molecula de adhesion celular de smdrome de Down DSCAM
O60542
Persefina PSPN
O60565
Gremlin-1 GREM1
O60575
Kazal inhibidor de serina proteasa -tipo 4 SPINK4
O60676
Cistatina-8 CST8
O60687
Protema SRPX2 que contiene repeticion de Sushi SRPX2
O60844
Protema 16 de membrana de granulo de zimogeno ZG16
O60882
Metaloproteinasa de matriz 20 MMP20
O60938
Queratocano KERA
O75015
Receptor III-B de la region Fc de gamma inmunoglobulina de baja afinidad FCGR3B
O75077
Desintegrina y protema que contiene el dominio metaloproteinasa 23 ADAM23
O75093
Protema de homologo de Slit 1 SLIT1
O75094
Protema de homologo de Slit 3 SLIT3
O75095
Protema 6 de dominios similar a factor de crecimiento epidermico multiple MEGF6
O75173
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 4. ADAMTS4
075200
Similar a protema que interactua con complejo de poros nucleares 1 NPIPL1
075339
Protema 1 C1 de de la capa intermedia de cartflago CILP
075354
Ectonucleosido trifosfato difosfohidrolasa 6 ENTPD6
075386
Protema 3 relacionada con Tubby TULP3
075398
Homologo del factor 1 de autorregulacion epidermico deformado DEAF1
O75443
Alfa-tectorin TECTA
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
O75445
O75462
O75487
O75493
O75594
O75596
075610
O75629
O75636
O75711
O75715
O75718
075829
075830 O75882 O75888 O75900 O75951 O75973 O76038 076061 O76076 O76093 O76096 O94769 O94813 O94907 O94919 O94964 O95025 O95084 O95150
095156
095157
095158
095388
095389
095390 O95393 O95399 O95407 O95428 O95445 O95450 O95460 O95467 O95631
Usherin
Factor 1 similar al receptor de citoquinas Glipicano-4
Protema 11 relacionada con la anhidrasa carbonica Protema 1 de reconocimiento de peptidoglicano Miembro A de la familia 3 del dominio de lectinas tipo C Factor de determinacion izquierda-derecha 1 Protema CREG1 Ficolin-3
Protema 1 sensible a Scrapie
Glutation peroxidasa secretora de epidfdimo
Protema asociada al cartflago
Protema condrosurfactante
Serpina I2
Atractina
Miembro 13 de la superfamilia del ligando del factor de necrosis tumoral
Metaloproteinasa de matriz-23
Protema 6 similar a la lisozima
Factor relacionado con C1q
Secretagogina
Stanniocalcina-2
Protema 2 de la via de senalizacion inducible de WNT1 Factor de crecimiento de fibroblastos 18 Cistatina F
Protema 2 de la matriz extracelular
Producto C de la protema del homologo de Slit 2
Protema 1 relacionada con Dickkopf
Protema 1 que contiene dominio de endonucleasa
Forma N-terminal
Semaforina-3D
Serina proteasa 23
Miembro 15 de la superfamilia del ligando del factor de necrosis tumoral
Neurexofilina-2
Neurexofilina-3
Neurexofilina-4
Protema 1 de la via de senalizacion inducible WNT1 Protema 3 de la via de senalizacion inducible WNT1 Factor de crecimiento/diferenciacion 11 Protema morfogenetica osea 10 Urotensina-2
Miembro 6B de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral Papilina
Apolipoprotema m
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 2.
Matrilin-4___________________________________________________
Tetrapeptido LHAL Netrin-1
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
O95633
O95711
O95715
O95750
O95760
O95813
O95841
O95897
O95925
O95965
095967
095968
095969
095970 O95972 O95994 O95998 O96009 O96014 P00450 P00451 P00488 P00533 P00709 P00734 P00738 P00739 P00740 P00742 P00746 P00747 P00748 P00749 P00750 P00751 P00797 P00973 P00995 P01008 P01009 P01011 P01019 P01023 P01024 P01031 P01033 P01034
Protema 3 relacionada con la folistatina
Antigeno Linfocftico 86
Quimiocina 14 de motivo C-X-C
Factor de crecimiento de fibroblastos 19
Interleucina-33
Cerberus
Protema 1 relacionada con la angiopoyetina
Noelin-2
Eppina
Protema 1 similar a Integrina beta
Protema 2 de la matriz extracelular similar a fibulina que contiene EGF
Miembro 1 de la Familia de secretoglobina 1D
Miembro 2 de la Familia de secretoglobina 1D
Protema 1 inactivada por glioma rica en leucina
Protema morfogenetica osea 15
Homolog de protema 2 de gradiente anterior
Protema de union a interleucina-18
Napsina-A
Protema Wnt-11___________________________________________
Ceruloplasmina
cadena ligera del Factor Villa
cadena del factor de coagulacion XIII A
Receptor del factor de crecimiento epidermico
Alfa-lactoalbumina
Protrombina
Cadena beta de haptoglobina
Proteina relacionada con la haptoglobina
Cadena pesada del Factor de coagulacion IXa
Cadena pesada del Factor X
Factor de complemento D
Cadena ligera de plasmina B
Cadena ligera del factor de coagulacion XIIa
Cadena larga A del activador de plasminogeno tipo uroquinasa
Activador de plasminogeno de tipo tisular
Fragmento Ba del factor B del complemento
Renina
2'-5'-oligoadenilato sintasa 1
Inhibidor de la tripsina secretora pancreatica
Antitrombina III
Alfa-1-antitripsina
Alpha-1-antichymotrypsin His-Pro-less
Angiotensina-1
Alfa-2-macroglobulina
Proteina estimulante de la acilacion
Cadena beta del complemento C5
Inhibidor de metaloproteinasa 1
Cistatina-C
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P01036
P01037
P01042
P01127
P01135
P01137
P01138
P01148
P01160
P01178
P01185
P01189
P01210
P01213
P01215
P01222
P01225
P01229
P01233
P01236
P01241
P01242
P01243
P01258
P01266
P01270
P01275
P01282
P01286
P01298
P01303
P01308
P01344
P01350
P01374
P01375
P01562
P01563
P01566
P01567
P01568
P01569
P01570
P01571
P01574
P01579
P01583
Cistatina-S
Cistatina-SN
Cadena ligera de Cininogeno-1
Subunidad B del factor de crecimiento derivado de plaquetas
Factor de crecimiento transformante alfa
Factor de crecimiento transformante beta-1
Factor de crecimiento de nervios beta
Gonadoliberina-1
Factor natriuretico auricular
Oxitocina
Vasopresina-neurofisina 2-copeptina Corticotropina
PENC (237-258)___________________________________
Alfa-neoendorfina
Cadena alfa de las hormonas glicoproteicas
Subunidad beta de tirotropina
Subunidad beta folitropina
Subunidad beta de lutropina
Subunidad beta de coriogonadotropina
Prolactina
Somatotropina
Variante de hormona de crecimiento
Hormona de somatomammotropina corionica
Catacalcina
Tiroglobulina
Hormona paratiroidea
Glucagon
Peptido intestinal PHM-27 Somatoliberina Prohormona pancreatica Peptido C-flanqueante de NPY Insulina
Factor de crecimiento similar a la insulina II
Gran gastrina
Linfotoxina alfa
Dominio C 1
Interferon alfa-1/13
Interferon alfa-2
Interferon alfa-10
Interferon alfa-7
Interferon alfa-21
Interferon alfa-5
Interferon alfa-14
Interferon alfa-17
Interferon beta
Interferon gamma
Interleucina-1 alfa
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P01584
P01588
P01591
P01732
P01833
P01857
P01859
P01860
P01861
P01871
P01880
P02452
P02458
P02461
P02462
P02647
P02649
P02652
P02654
P02655
P02656
P02671
P02675
P02679
P02741
P02743
P02745
P02746
P02747
P02748
P02749
P02750
P02751
P02753
P02760
P02763
P02765
P02766
P02768
P02771
P02774
P02775
P02776
P02778
P02786
P02787
P02788
Interleucina-1 beta Eritropoyetina
Cadena J de inmunoglobulina
cadena de glucoprotema de superficie de celulas T CD8 alfa
Receptor de inmunoglobulina polimerica
Region C de cadena de Ig gamma-1
Region C de cadena de Ig gamma-2
Region C de cadena de Ig gamma-3
Region C de cadena de Ig gamma-4
Region C de cadena de Ig mu
Region C de cadena Ig delta
Cadena de colageno alfa-1 (I)
Condrocalcina
Cadena de colageno alfa-1 (III)
Cadena de colageno alfa-1 (IV)
Apolipoprotema A-I Apolipoprotema E Apolipoprotema A-II Apolipoprotema CI Apolipoprotema C-II Apolipoprotema C-III Cadena alfa de fibrinogeno Fibrinopeptido B Cadena gamma de fibrinogeno Protema C-reactiva
Componente P de amiloide serico (1-203)
Subunidad A del subcomponente del ComplementoC1q Subunidad B del subcomponente del ComplementoC1q Subunidad C del subcomponente del ComplementoC1q Componente C9b del complemento Beta-2-glicoprotema 1 Alfa-2-glicoprotema rica en leucina
UGl-Y2__________________________________________
Protema de union al retinol 4 Tripstatina
Glicoprotema 1 de acido alfa-1 Cadena A de Alfa-2-HS-glicoprotema Transtiretina Albumina de suero Alfafetoprotema
Protema de union a la vitamina D Peptido III que activa el tejido conectivo Factor plaquetario 4
CXCL10 (1-73)____________________________________
Protema 1 del receptor de transferrina
Serotransferrina
Lactoferroxina-C
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P02790
P02808
P02810
P02812
P02814
P02818
P03950
P03951
P03952
P03956
P03971
P03973
P04003
P04004
P04054
P04085
P04090
P04114
P04118
P04141
P04155
P04180
P04196
P04217
P04275
P04278
P04279
P04280
P04628
P04745
P04746
P04808
P05000
P05013
P05014
P05015
P05019
P05060
P05090
P05109
P05111
P05112
P05113
P05120
P05121
P05154
P05155
Hemopexina
Estaterina
Fosoprotema 1/2 rica en prolina acida salival
Protema 2 salival rica en prolina salival basica
Peptido D1A
Osteocalcina
Angiogenina
Cadena pesada del Factor de coagulacion XIa Calicrema plasmatica Colagenasa intersticial de 27 kDa Factor inhibidor de Muellerian Antileucoproteinasa
Cadena alfa de protema de union a C4b
Somatomedina-B
Fosfolipasa A2
Subunidad A del factor de crecimiento derivado de plaquetas Cadena de relaxina A Apolipoprotema B-100 Colipasa
Factor estimulante de colonias de granulocitos y macrofagos Factor 1 de trebol
Fosfatidilcolina-esterol aciltransferasa Glicoprotema rica en histidina Glicoprotema alfa-1B Antigeno de von Willebrand 2 Globulina de union a hormonas sexuales Alfa-inhibina-31
Protema 1 rica en prolina salival basica
Protooncogen Wnt-1
Alfa-amilasa 1
Alfa-amilasa pancreatica
Prorelaxina H1
Interferon omega-1
Interferon alfa-6
Interferon alfa-4
Interferon alfa-16
Factor I de crecimiento similar a insulina
Peptido GAWK____________________________________
Apolipoprotema d Protema S100-A8 Cadena alfa de inhibina Interleucina-4 Interleucina-5
Inhibidor del activador de plasminogeno 2 Inhibidor del activador de plasminogeno 1 Inhibidor de la serina proteasa de plasma Inhibidor de la proteasa de plasma C1
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P05156
P05160
P05161
P05230
P05231
P05305
P05408
P05451
P05452
P05543
P05814
P05997
P06276
P06307
P06396
P06681
P06702
P06727
P06734
P06744
P06850
P06858
P06881
P07093
P07098
P07225
P07237
P07288
P07306
P07355
P07357
P07358
P07360
P07477
P07478
P07492
P07498
P07585
P07911
P07942
P07988
P07998
P08118
P08123
P08185
P08217
P08218
Cadena pesada del factor de complemento I
Cadena B del factor de coagulacion XIII
Protema ISG15 similar a ubiquitina
Factor de crecimiento de fibroblastos 1
Interleucina-6
Endotelina-1 grande
Peptido C-terminal
Litostatina-1-alfa
Tetranectina
Globulina de union a tiroxina Beta-casema
Cadena de colageno alfa-2 (V)
Colinesterasa Colecistocinina-12 Gelsolina Complemento C2 Protema S100-A9 Apolipoprotema A-IV
Forma soluble del receptor epsilon Fc de inmunoglobulina de baja afinidad Glucosa-6-fosfato isomerasa Corticoliberina Lipoprotema lipasa
Peptido 1 relacionado con el gen de calcitonina Nexina derivada de glfa Triacilglicerol lipasa gastrica Protema S dependiente de la vitamina K Protema disulfuro-isomerasa Antfgeno espedfico de la prostata Receptor de asialoglicoprotema 1 Anexina A2
Cadena alfa del componente C8 del complemento
Cadena beta del componente C8 del complemento
Cadena gamma del componente C8 del complemento
Cadena de alfa-tripsina 2
Tripsina-2
Neuromedina-c
Kappa-casema
Decorina
Uromodulina
Laminina subunidad beta-1
Protema B asociada al surfactante pulmonar
Ribonucleasa pancreatica
Beta-microseminoprotema
Cadena alfa-2 (I) de colageno
Globulina de union a corticosteroides
Miembro 2A de la familia de elastasa tipo quimotripsina
Miembro 2B de la familia de elastasa tipo quimotripsina
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P08253
P08254
P08294
P08476
P08493
P08572
P08581
P08603
P08620
P08637
P08697
P08700
P08709
P08833
P08887
P08949
P08F94
P09038
P09228
P09237
P09238
P09341
P09382
P09466
P09486
P09529
P09544
P09603
P09681
P09683
P09919
P0C091
P0C0L4
P0C0L5
P0C0P6
P0C7L1
P0C862
P0C8F1
P0CG01
P0CG36
P0CG37
P0CJ68
P0CJ69
P0CJ70
P0CJ71
P0CJ72
P0CJ73
Colagenasa tipo IV de 72 kDa Estromelisina-1
Superoxido dismutasa extracelular [Cu-Zn] cadena de inhibina beta A Protema Gla de la Matriz Cadena de colageno alfa-2 (IV)
Receptor del factor de crecimiento de hepatocitos
Factor de complemento H
Factor de crecimiento de fibroblastos 4
Receptor III-A de la region Fc de gamma inmunoglobulina de baja afinidad
Alfa-2-antiplasmina
Interleucina-3
Factor de coagulacion VII
Protema 1 de union al factor de crecimiento similar a la insulina Subunidad alfa del receptor de interleucina-6 Neuromedina-B-32 Fibrocistina
Factor de crecimiento de fibroblastos 2
Cistatina-SA
Matrilisina
Estromelisina-2
Protema alfa regulada por el crecimiento
Galectina-1
Glicodelina
SPARC__________________________________________________________
cadena B de beta inhibina Protema Wnt-2
Factor 1 estimulante de colonias de macrofagos
Polipeptido inhibidor gastrico
Secretina
Factor estimulante de colonias de granulocitos
Protema 3 de la matriz extracelular relacionada con FRAS1
C4d-A___________________________________________________________
Cadena C4-B alfa del complemento Neuropeptido S
Kazal tipo 8 inhibidor de la serina proteasa
Protema 9A relacionada con el Complemento C1q y el factor de necrosis tumoral Protema 4 expresada en larostata y testmulos Gastroquina 3
Protema 1B de la familiar cnptica Protema cnptica Protema similar a la humanina 1 Protema similar a la humanina 2 Protema similar a la humanina 3 Protema similar a la humanina 4 Protema similar a la humanina 5 Protema similar a la humanina 6
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P0CJ74
P0CJ75
P0CJ76
P0CJ77
P0DJD7
P0DJD8
P0DJD9
P0DJI8
P0DJI9
P10082
P10092
P10124
P10145
P10147
P10163
P10451
P10599
P10600
P10643
P10645
P10646
P10720
P10745
P10767
P10909
P10912
P10915
P10966
P10997
P11047
P11150
P11226
P11464
P11465
P11487
P11597
P11684
P11686
P12034
P12107
P12109
P12110
P12111
P12259
P12272
P12273
P12544
Protema similar a la humanina 7 Protema similar a la humanina 8 Protema similar a la humanina 9 Protema similar a la humanina 10 Pepsina A-4 Pepsina A-3 Pepsina A-5 Protema amiloide A Protema amiloide A-2 serica
Peptido YY (3-36)__________________________________
Peptido 2 relacionado con el gen de la calcitonina Serglicina
MDNCF-a________________________________________
MIP-1-alfa (4-69)___________________________________
Peptido P-D
Osteopontina
Tiorredoxina
Factor de crecimiento transformante beta-3 Componente C7 del complemento Vasostatina-2
Inhibidor de la via del factor tisular Variante 4del factor plaquetario (4-74)
Protema 3 de union al retinol
Factor de crecimiento de fibroblastos 6
Cadena alfa de clusterina
Receptor de hormona de crecimiento
Hialuronano y protema 1de enlace a proteoglicano
Cadena beta de glicoprotema CD8 de superficie de celulas T
Polipeptido amiloide de los islotes
Subunidad gamma-1 de laminina
Triacilglicerol lipasa hepatica
Protema C de union a manosa
Glicoprotema 1 beta-1 espedfica del embarazo
Glicoprotema 2 beta-1 espedfica del embarazo
Factor de crecimiento de fibroblastos 3
Protema de transferencia de ester de colesterilo
Uteroglobina
Protema C asociada al surfactante pulmonar Factor de crecimiento de fibroblastos 5 Cadena de colageno alfa-1 (XI)
Cadena de colageno alfa-1 (VI)
Cadena de colageno alfa-2 (VI)
Cadena de colageno alfa-3 (VI)
Factor de coagulacion V
PTHrP [1-36]______________________________________
Protema inducible por prolactina Granzima A
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P12643
P12644
P12645
P12724
P12821
P12838
P12872
P13232
P13236
P13284
P13500
P13501
P13521
P13591
P13611
P13671
P13688
P13725
P13726
P13727
P13942
P13987
P14138
P14174
P14207
P14222
P14543
P14555
P14625
P14735
P14778
P14780
P15018
P15085
P15086
P15151
P15169
P15248
P15291
P15309
P15328
P15374
P15502
P15509
P15515
P15516
Protema morfogenetica osea 2 Protema morfogenetica osea 4 Protema morfogenetica osea 3 Protema cationica de eosinofila Enzima convertidora de angiotensina, forma soluble.
Defensina de neutrofilos 4 Motilina Interleucina-7 Quimiocina 4 motivo C-C
tiol rojo uctasa lisosomal inducible por Gamma-interferon Quimiocina 2 motivo C-C Quimiocina 5 motivo C-C Secretogranina-2
Molecula de adhesion celular neural 1 Protema central de Versican Componente C6 del complemento
Molecula de adhesion celular relacionada con el antigeno carcinoembrionario 1
Oncostatina-m
Factor tisular
Protema basica principal del granulo de eosinofilos Cadena de colageno alfa-2 (XI)
Glicoprotema CD59 Endotelina-3
Factor inhibidor de la migracion de macrofagos
Receptor de folato beta
Perforina-1
Nidogen-1
Fosfolipasa A2, asociada a membrana.
Endoplasmina
Enzima degradante de insulina
Receptor tipo 1 de interleucina, forma soluble
Metaloproteinasa 9 de matriz de 82 kDa
Factor inhibidor de la leucemia
Carboxipeptidasa A1
Carboxipeptidasa B
Receptor de poliovirus
Cadena catalftica de la carboxipeptidasa N
Interleucina-9
N-acetillactosamina sintasa
PAPf39_________________________________________________________
Receptor alfa de folato
Ubiquitina carboxilo terminal hidrolasa isozima L3 Elastina
Subunidad alfa del receptor del factor estimulante de colonias de granulocitos y
macrofagos
Histatina-1
His3- (31-51) -peptido
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P15692
P15814
P15907
P15941
P16035
P16112
P16233
P16442
P16471
P16562
P16619
P16860
P16870
P16871
P17213
P17538
P17931
P17936
P17948
P18065
P18075
P18428
P18509
P18510
P18827
P19021
P19235
P19438
P19652
P19801
P19823
P19827
P19835
P19875
P19876
P19883
P19957
P19961
P20061
P20062
P20142
P20155
P20231
P20333
P20366
P20382
P20396
Factor de crecimiento endotelial vascular A Polipeptido 1 similar a inmunoglobulina lambda Beta-galactosido alfa-2,6-sialiltransferasa 1 Subunidad beta de Mucin-1 Inhibidor de metaloproteinasa 2 Protema 2 del nucleo agrecano Triacilglicerol lipasa pancreatica
Transferasa del sistema ABO del grupo sangumeo Histo
Receptor de prolactina
Protema secretora rica en cistema 2
Similar a Quimiocina 3 de motivo C-C 1
BNP (3-29)_________________________________________________
Carboxipeptidasa E
Subunidad alfa del receptor de interleucina 7 Protema que aumenta la permeabilidad bactericida Quimotripsinogeno B Galectina-3
Protema de union al factor de crecimiento similar a la insulina 3
Receptor 1 del factor de crecimiento endotelial vascular
Protema de union al factor de crecimiento similar a la insulina 2
Protema morfogenetica osea 7
Protema de union a lipopolisacaridos
Peptido relacionado con PACAP
Protema antagonista del receptor de interleucina 1
Sindecan-1
Monooxigenasa de alfa-hidroxilacion de peptidilglicina Receptor de eritropoyetina Protema de union al factor de necrosis tumoral 1 Glicoprotema 2 alfa-1-acido
Amina oxidasa sensible a amilorida [que contiene cobre]
Cadena pesada H2 del Inhibidor de inter-alfa-tripsina
Cadena pesada H1 del Inhibidor de inter-alfa-tripsina
Lipasa activada por sales biliares
Quimiocina 2 motivo C-X-C
Quimiocina 3 motivo C-X-C
Folistatina
Elafina
Alfa-amilasa 2B Transcobalamina-1 Transcobalamina-2 Gastricsina
Kazal-tipo 2 inhibidor de serina proteasa Triptasa beta-2
Miembro 1B de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral Sustancia P
Hormona concentradora de melanina Tiroliberina
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P20742
P20774
P20783
P20800
P20809
P20827
P20849
P20851
P20908
P21128
P21246
P21583
P21741
P21754
P21781
P21802
P21810
P21815
P21860
P21941
P22003
P22004
P22079
P22105
P22301
P22303
P22352
P22362
P22455
P22466
P22692
P22749
P22792
P22891
P22894
P23142
P23280
P23352
P23435
P23560
P23582
P23946
P24043
P24071
P24347
P24387
P24592
Protema de la zona de embarazo
Mimecan
Neurotrofina-3
Endotelina-2
Interleucina-11
Efrina-A1___________________________________________
Cadena de colageno alfa-1(IX)
Cadena beta de protema de union a C4b Cadena de colageno alfa-1(V)
Endoribonucleasa espedfica de poli(U)
Pleiotrofina Kit ligando Midquina
Protema 3 de union a esperma de zona pelucida Factor de crecimiento de fibroblastos 7 Receptor 2 del factor de crecimiento de fibroblastos Biglicano
Sialoprotema osea 2
Receptor tirosina-protema quinasa erbB-3
Protema de la matriz del cartflago
Protema morfogenetica osea 5
Protema morfogenetica osea 6
Lactoperoxidasa
Tenascina-X
Interleucina-10
Acetilcolinesterasa
Glutation peroxidasa 3
Quimiocina 1 motivo C-C
Receptor 4 del factor de crecimiento de fibroblastos
Peptido asociado a mensaje de Galanina
Protema de union al factor de crecimiento similar a la insulina 4
Granulisina
Subunidad 2 de carboxipeptidasa N Protema Z dependiente de la vitamina K Colagenasa de neutrofilos Fibulin-1
Anhidrasa carbonica 6
Anosmina-1
Cerebelina-1
Factor neurotrofico derivado del cerebro
Peptido natriuretico tipo C
Quimasa
Subunidad alfa-2 de laminina Receptor de inmunoglobulina alfa Fc Estromelisina-3
Protema de union al factor de liberacion de corticotropina Protema de union al factor de crecimiento similar a la insulina 6
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P24593
P24821
P24855
P25067
P25311
P25391
P25445
P25940
P25942
P26022
P26927
P27169
P27352
P27487
P27539
P27658
P27797
P27918
P28039
P28300
P28325
P28799
P29122
P29279
P29320
P29400
P29459
P29460
P29508
P29622
P29965
P30990
P31025
P31151
P31371
P31431
P31947
P32455
P32881
P34096
P34130
P34820
P35030
P35052
P35070
P35225
P35247
Protema de union al factor de crecimiento similar a la insulina 5 Tenascina
Desoxirribonucleasa-1 Cadena de colageno alfa-2 (VIII)
Glicoprotema de zinc-alfa-2 Subunidad alfa-1 de laminina
Miembro 6 de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral Cadena de colageno alfa-3 (V)
Miembro 5 de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral Protema PTX3 relacionada con la pentraxina
Cadena beta de protema similar al tipo factor de crecimiento de hepatocitos
Suero paraoxonasa/arilesterasa 1
Factor intrmseco gastrico
Forma de membrana dipeptidil peptidasa 4
Factor de diferenciacion/crecimiento embrionario 1
Vastatina
Calreticulina
Properdina
Aciloxiacil hidrolasa
Protema-lisina 6-oxidasa
Cistatina D
Granulina-1
Proprotein subtilisina/kexin tipo 6 de proprotema convertasa Factor de crecimiento del tejido conectivo Receptor 3 de efrina tipo A Cadena de colageno alfa-5 (IV)
Subunidad alfa de interleucina-12 Subunidad beta de interleucina-12 Serpina AB3 Kallistatina
Ligando CD40, forma soluble Neurotensina/neuromedina N Lipocalina-1 Protema S100-A7
Factor de crecimiento de fibroblastos 9
Sindecan-4
14-3-3 protema sigma
Protema 1 de union a guanilato inducida por interferon Interferon alfa-8 Ribonucleasa 4 Neurotrofina-4
Protema morfogenetica osea 8B Tripsina-3
Glipican-1 secretado
Betacelulina
Interleucina-13
Protema D asociada a surfactante pulmonar
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P35318
P35542
P35555
P35556
P35625
P35858
P35916
P35968
P36222
P36952
P36955
P36980
P39059
P39060
P39877
P39900
P39905
P40225
P40967
P41159
P41221
P41222
P41271
P41439
P42127
P42702
P42830
P43026
P43251
P43652
P45452
P47710
P47929
P47972
P47989
P47992
P48023
P48052
P48061
P48304
P48307
P48357
P48594
P48645
P48740
P48745
ADM____________________________________________________________
Protema amiloide A-4 serica
Fibrilina-1
Fibrilina-2
Inhibidor de metaloproteinasa 3
Subunidad labil de acido del complejo de protemas de union al factor de
crecimiento similar a la insulina_______________________________________
Receptor 3 del factor de crecimiento endotelial vascular Receptor 2 del factor de crecimiento endotelial vascular Protema 1 similar a Quitinasa-3 Serpina B5
Factor derivado del epitelio del pigmento
Protema 2 relacionada con el factor H del complemento
Cadena de colageno alfa-1 (XV)
Cadena de colageno alfa-1 (XVIII)
Fosfolipasa A2 dependiente de calcio Metalooelastasa de macrofagos Factor neurotrofico derivado de la lmea celular glial Trombopoyetina
M-alfa___________________________________________________________
Leptina
Protema Wnt-5a
Prostaglandina-H2 D-isomerasa
Neuroblastoma supresor de tumorigenicidad 1
Receptor de folato gamma
Protema de senalizacion agutf
Receptor del factor inhibidor de la leucemia
ENA-78 (9-78)_____________________________________________________
Factor de crecimiento/diferenciacion 5
Biotinidasa
Afamina
Colagenasa 3
Casoxina-D
Galectina-7
Pentraxina-2 neuronal
Xantina oxidasa
Linfotactina
Miembro 6 de la superfamilia del ligando del factor de necrosis tumoral, forma de
membrana________________________________________________________
Carboxipeptidasa A2
Factor 1 derivado de celulas estromales
Litostatino-1-beta
Inhibidor 2 de la via del factor tisular Receptor de leptina Serpina AB4 Neuromedina-U-25
Serina proteasa de lectina de union a manano 1 Homologo de protema NOV
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P48960
P49223
P49747
P49763
P49765
P49767
P49771
P49862
P49863
P49908
P49913
P50607
P51124
P51512
P51654
P51671
P51884
P51888
P52798
P52823
P53420
P53621
P54108
P54315
P54317
P54793
P55000
P55001
P55056
P55058
P55075
P55081
P55083
P55107
P55145
P55259
P55268
P55773
P55774
P55789
P56703
P56704
P56705
P56706
P56730
P56851
P56975
Subunidad beta del antigeno CD97
Inhibidor de proteasa tipo Kunitz 3
Carfflago oligomerico de la matriz
Factor de crecimiento de la placenta
Factor de crecimiento endotelial vascular B
Factor de crecimiento endotelial vascular C
Ligando de tirosina quinasa 3 relacionado con Fms
Calicrema-7
Granzima k
Selenoprotema P
Protema antibacteriana FALL-39
Homologo de protemas Tubby
Granzima m
Metaloproteinasa de matriz 16
Glipicano-3
Eotaxina
Lumican
Prolargina
Efrina-A4______________________________________________
Stanniocalcina-1
Cadena de colageno alfa-4 (IV)
Subunidad de Coatomer alfa Protema secretora rica en cistema 3 Protema 1 relacionada con la lipasa pancreatica Protema 2 relacionada con la lipasa pancreatica Arilsulfatasa F
Protema 1 relacionada con Ly-6/uPAR secretada Protema asociada a microfibrillas 2 Apolipoprotema C-IV Protema de transferencia de fosfolfpidos Factor de crecimiento de fibroblastos 8 Protema asociada a microfibrillas 1 Glicoprotema asociada a microfibrillas 4 Protema morfogenetica osea 3B
Factor neurotrofico derivado de astrocitos mesencefalicos Glicoprotema GP2 principal de la membrana secretora pancreatica Subunidad beta-2 de laminina
CCL23 (30-99)_________________________________________
Quimiocina 18 motivo C-C
Sulfhidril oxidasa ALR ligada a FAD
Protooncogen Wnt-3
Protema Wnt-3a
Protema Wnt-4
Protema Wnt-7b
Neurotripsina
Protema secretora del epidfdimo E3-beta Neuregulina-3
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
P58062
P58215
P58294
P58335
P58397
P58417
P58499
P59510
P59665
P59666
P59796
P59826
P59827
P59861
P60022
P60153
P60827
P60852
P60985
P61109
P61278
P61366
P61626
P61769
P61812
P61916
P62502
P62937
P67809
P67812
P78310
P78333
P78380
P78423
P78509
P78556
P80075
P80098
P80108
P80162
P80188
P80303
P80511
P81172
P81277
P81534
P81605
Kazal inhibidor de serina proteasa -tipo 7
Homologo 3 de Lisil oxidasa
Proquineticina-1
Receptor de toxina del antrax 2
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 12
Neurexofilina-1
Protema FAM3B
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 20 Defensa de neutrofilos 1 Defensa de neutrofilos 3 Glutation peroxidasa 6
Miembro 3 de la familia B que contiene pliegues BPI Miembro 4 de la familia B que contiene pliegues BPI Beta-defensina 131 Beta-defensina 1
Protema 9 similar a la ribonucleasa inactiva
Preotema 8 relacionada con el factor de necrosis tumoral C1q del complemento
Protema 1 de union a espermatozoides de zona pelucida
Protema asociada a la diferenciacion de queratinocitos
Protema regulada por androgenos en el rinon
Somatostatina-14
Osteocrina
Lisozima c
Beta-2-microglobulina
Factor de crecimiento transformante beta-2
Protema secretora del epidfdimo El
Lipocalina-6 espedfico de epidfdimo
Peptidil-prolil cis-trans isomerasa A
Protema 1 de union a elemento sensible a la nucleasa
Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11A
Receptor de coxsackievirus y adenovirus
Glipican Secretado-5
Receptor de lipoprotemas de baja densidad oxidadas 1
Fractalkine procesado
Reelina
CCL20 (2-70)_____________________________________________________
MCP-2 (6-76)_____________________________________________________
Quimiocina 7 motivo C-C
Fosfatidilinositol-glucano-fosfolipasa D espedfica
Quimiocina 6 motivo C-X-C
Lipocalina asociada a gelatinasa de neutrofilos
Nucleobindin-2
Calcitermina
Hepcidina-25
Peptido de liberacion de prolactina
Beta-defensina 103
Dermidina
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
P82279
Homologo 1 de porciones de protemas CRB1
P82987
Protema 3 similar a ADAMTS ADAMTSL3
P83105
Serina proteasa HTRA4 HTRA4
P83110
Serina proteasa HTRA3 HTRA3
P83859
Neuropeptido orexigenico QRFP QRFP
P98088
Mucin-5AC MUC5AC
P98095
Fibulina-2 FBLN2
P98160
Protema de nucleo proteoglicano de heparan sulfato espedfico de membrana basal HSPG2
P98173
Protema FAM3A FAM3A
Q00604
Norrin NDP
Q00796
Sorbitol deshidrogenasa SORDO
Q00887
Glicoprotema beta-1 espedfica para el embarazo 9 PSG9
Q00888
Glicoprotema beta-1 espedfica para el embarazo 4 PSG4
Q00889
Glicoprotema beta-1 espedfica del embarazo 6 PSG6
Q01523
HD5 (56-94) DEFA5
Q01524
Defensina-6 DEFA6
Q01955
Cadena de colageno alfa-3 (IV) COL4A3
Q02297
Pro-neuregulin-1, isoforma unida a membrana NRG1
Q02325
Protema B similar a plasminogeno PLGLB1
Q02383
Semenogelina-2 SEMG2
Q02388
Cadena de colageno alfa-1 (VII) COL7A1
Q02505
Mucina-3A MUC3A
Q02509
Otoconin-90 OC90
Q02747
Guanilina GUCA2A
Q02763
Receptor de angiopoyetina-1 TEK
Q02817
Mucin-2 MUC2
Q02985
Preotema 3 relacionada con el factor H del complemento CFHR3
Q03167
Beta receptor tipo 3T del factor de crecimiento transformante TGFBR3
Q03403
Factor de trebol 2 TFF2
Q03405
Receptor de superficie del activador de uroquinasa plasminogeno PLAUR
Q03591
Protema 1 relacionada con el factor H del complemento CFHR1
Q03692
Cadena de colageno alfa-1 (X) COL10A1
Q04118
Protema 3 rica en prolina salival basica PRB3
Q04756
Cadena corta del activador del factor de crecimiento de hepatocitos HGFAC
Q04900
Protema de nucleo de sialomucina 24 CD164
Q05315
Eosinofilos lisofosfolipasa CVX
Q05707
Cadena de colageno alfa-1 (XIV) COL14A1
Q05996
Protema 2 de union a esperma de la zona pelucida procesada ZP2
Q06033
Cadena pesada H3 del inhibidor de inter-alfa-tripsin ITIH3
Q06141
Protema 3-alfa derivada de los islotes de regeneracion REG3A
Q06828
Fibromodulina FMOD
Q07092
Cadena de colageno alfa-1 (XVI) COL16A1
Q07325
Quimiocina 8 motivo C-X-C motivo 9 CXCL9
Q07507
Dermatopontina DPT
Q075Z2
Aglutinante de homologo 1 de protema espermatica BSPH1
Q07654
Factor de trebol 3 TFF3
Q07699
Subunidad de canal de sodio beta-1 SCN1B
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q08345
Q08380
Q08397
Q08431
Q08629
Q08648
Q08830
Q10471
Q10472
Q11201
Q11203
Q11206
P12794
P12805
P12836
P12841
P12904
Q13018
Q13072
Q13093
Q13103
Q13162
Q13201
Q13214
Q13219
Q13231
Q13253
Q13261
Q13275
Q13291
Q13316
Q13361
Q13410
Q13421
Q13429
Q13443
Q13519
Q13751
Q13753
Q13790
Q13822
Q14031
Q14050
Q14055
Q14112
Q14114
Q14118
Receptor 1 que contiene el dominio de discoidina epitelial
Protema de union a la galectina-3
Homologo 1 de Lisil oxidasa
Lactaderina
Testican-1
Antigeno 11B asociado a esperma Protema 1 similar a fibrinogeno Polipeptido N-acetilgalactosaminiltransferasa 2 Polipeptido N-acetilgalactosaminiltransferasa 1
CMP-N-acetilneuraminato-beta-galactosamida-alfa-2,3-sialiltransferasa 1 CMP-N-acetilneuraminato-beta-1,4-galactosida alfa-2,3-sialiltransferasa CMP-N-acetilneuraminato-beta-galactosamida-alfa-2,3-sialiltransferasa 4 Hialuronidasa-1
Protema 1 de la matriz extracelular tipo fibulina que contiene EGF protema de union a esperma 4 de zona pelucida Protema 1 relacionada con la folistatina
Protema multifuncional 1 que interactua con el complejo Aminoacil ARNt sintasa
Receptor A2 de fosfolipasa secretora soluble
Antfgeno 1 de melanoma B
Factor de activacion plaquetaria acetilhidrolasa
Fosfoprotema secretada 24
Peroxiredoxina-4
Glucoprotema plaquetaria la *
Semaforina-3B
Pappalisina-1
Quitotriosidasa-1
Noggin
Subunidad alfa del receptor de interleucina-15 Semaforina-3F
Molecula de activacion linfocftica de senalizacion
Fosfoprotema acida de la matriz de dentina 1
Protema asociada a microfibrillas 5
Miembro A1 de la subfamilia de butirofilina 1
Mesotelina, forma escindida
Factor de crecimiento similar a insulina I
Preotema 9 que contiene el dominio de desintegrina y metaloproteinasa Neuropeptido 1 Subunidad beta-3 de laminina Subunidad gamma-2 de laminina Apolipoprotema f
Miembro 2 de la familia de ectonucleotidso pirofosfatasa/fosfodiesterasa Cadena de colageno alfa-6 (IV)
Cadena de colageno alfa-3 (IX)
Cadena de colageno alfa-2 (IX)
Nidogeno-2
Protema 8 relacionada con el receptor de lipoprotemas de baja densidad Distroglicano
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q14314
Q14393
Q14406
Q14507
Q14508
Q14512
Q14515
Q14520
Q14563
Q14623
Q14624
Q14667
Q14703
Q14766
Q14767
Q14773
Q14993
Q14CN2
Q15046
Q15063
Q15109
Q15113
Q15166
Q15195
Q15198
Q15223
Q15238
Q15363
Q15375
Q15389
Q15465
Q15485
Q15517
Q15582
Q15661
Q15726
Q15782
Q15828
Q15846
Q15848
Q16206
Q16270
P16363
Q16378
Q16557
Q16568
Q16610
Fibroleucina
Protema 6 espedfica de detencion del crecimiento Similar a la hormona 1 de somatomammotropina corionica Protema E3-alfa secretora del epidfdimo Protema 2 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP Protema 1 de union al factor de crecimiento de fibroblastos Protema 1 similar a SPARC
Cadena ligera de Protema 2 de union a hialuronano de 27 kDa
Semaforina-3A
Protema hedgehog indio
Cadena pesada H4 del inhibidor de inter-alfa-tripsina
UPF0378 protema KIAA0100_______________________________________
Proteasa del sitio 1 del factor de transcripcion unido a membrana Proteina 1 de union a factor beta de crecimiento de transformacion latente Proteina 2 de union a factor beta de crecimiento de transformacion latente Molecula de adhesion intercelular 4 Cadena de colageno alfa-1 (XIX)
Regulador de canal de cloruro activado por calcio 4, forma de 110 kDa
Lisina - ARNt ligasa
Periostina
Receptor espedfico del producto final de glicosilacion avanzada Potenciador 1 del procolageno C-endopeptidasa Suero paraoxonasa/lactonasa 3 Proteina A similar a plasminogeno
Proteina similar al receptor del factor de crecimiento derivado de las plaquetas
Proteina 1 relacionada con el receptor de poliovirus
beta-1-glicoprotema 5 espedfica para el embarazo
Proteina 2 que contiene el dominio de transmembrana emp24
Receptor 7 de efrina tipo A
Angiopoyetina-1
Proteina Sonic Hedgehog
Ficolin-2
Corneodesmosina
Proteina ig-h3 inducida por el factor beta de crecimiento transformante
Triptasa alfa/beta-1
Metastina
Proteina 2 similar a Quitinasa-3 Cistatina-M
Proteina 1 similar a clusterina Adiponectina
Proteina disulfuro-tiol oxidorreductasa
Proteina 7 de union al factor de crecimiento similar a la insulina Subunidad alfa-4 de laminina Proteina rica en prolina 4 beta-1-glicoprotema 3 espedfica del embarazo
CART42-89)____________________________________________________
Proteina 1 de matriz extracelular
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
Q16619
Cardiotrofina-1 CTF1
Q16623
Sintaxina-la STX1A
Q16627
HCC-1(9-74) CCL14
Q16651
Cadena ligera de protasina PRSS8
P16661
Peptido 2 de C-activacinon de ciclasa de guanilato GUCA2B
P16663
CCL15(29-92) CCL15
Q16674
Protema reguladora del crecimiento derivada del melanoma MIA
Q16769
Glutaminil-peptido ciclotransferasa QPCT
Q16787
Subunidad alfa-3 de laminina LAMA3
P16842
CMP-N-acetilneuraminato-beta-galactosamida-alfa-2,3-sialiltransferasa 2 ST3GAL2
Q17RR3
Protema 3 relacionada con la lipasa pancreatica PNLIPRP3
Q17RW2
Cadena de colageno alfa-1 (XXIV) COL24A1
Q17RY6
Antfgeno de linfocitos 6K LY6K
Q1L6U9
Microseminoprotema asociada a la prostata MSMP
Q1W4C9
KAzal-tipo 13 inhibidor de serina proteasa SPINK13
Q1ZYL8
Protema de fusion 4 esperma-huevo Izumo IZUMO4
Q29960
Antfgeno de histocompatibilidad HLA clase I, cadena alfa Cw-16 HLA-C
Q2I0M5
R-espondina-4 RSPO4
Q2L4Q9
Serina proteasa 53 PRSS53
Q2MKA7
R-espondina-1 RSPO1
Q2MV58
Tectonica-1 TCTN1
Q2TAL6
Brorin VWC2
Q2UY09
Cadena de colageno alfa-1 (XXVIII) COL28A1
Q2VPA4
Protema similar a receptor 1 del componente del complemento CR1L
Q2WEN9
Molecula 16 de adhesion celular relacionada con el antfgeno carcinoembrionario CEACAM16
Q30KP8
Beta-defensina 136 DEFB136
Q30KP9
Beta-defensina 135 DEFB135
Q30KQ1
Beta-defensina 133 DEFB133
Q30KQ2
Beta-defensina 130 DEFB130
Q30KQ4
Beta-defensina 116 DEFB116
Q30KQ5
Beta-defensina 115 DEFB115
Q30KQ6
Beta-defensina 114 DEFB114
Q30KQ7
Beta-defensina 113 DEFB113
Q30KQ8
Beta-defensina 112 DEFB112
Q30KQ9
Beta-defensina 110 DEFB110
Q30KR1
Beta-defensina 109 DEFB109P1
P32P28
Prolil 3-hidroxilasa 1 LEPRE1
Q3B7J2
Protema 2 que contiene el dominio de la glucosa-fructosa oxidorreductasa GFOD2
Q3SY79
Protemas Wnt WNT3A
Q3T906
Subunidades alfa/beta de N-acetilglucosamina-1-fosfotransferasa GNPTAB
Q495T6
Similar a metalo-endopeptidasa de membrana 1 MMEL1
Q49AH0
Factor neurotrofico de la dopamina cerebral CDNF
Q4G0G5
Miembro 2 de la familia 2B de secretoglobina SCGB2B2
Q4G0M1
Protema FAM132B FAM132B
Q4LDE5
Protema 1 que contiene dominio de Sushi, factor de von Willebrand tipo A, EGF y o pentraxina SVEP1
Q4QY38
Beta-defensina 134 DEFB134
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q4VAJ4
Q4W5P6
Q4ZHG4
Q53H76
Q53RD9
Q53S33
Q5BLP8
Q5DT21
Q5EBL8
Q5FYB0
Q5FYB1
Q5GAN3
Q5GAN4
Q5GAN6
Q5GFL6
Q5H8A3
Q5H8C1
Q5IJ48
Q5J5C9
Q5JS37
Q5JTB6
Q5JU69
Q5JXM2
Q5JZY3
Q5K4E3
Q5SRR4
Q5T1H1
Q5T4F7
Q5T4W7
Q5T7M4
Q5TEH8
Q5TIE3
Q5UCC4
Q5VST6
Q5VTL7
Q5VUM1
Q5VV43
Q5VWW1
Q5VXI9
Q5VXJ0
Q5VXM1
Q5VYX0
Q5VYY2
Q5W186
Q5W5W9
Q5XG92
Q63HQ2
Protemas Wnt
Protema TMEM155_______________________________________
Protema 1 que contiene dominio de fibronectina tipo III
Fosfolipasa A1 miembro A
Fibulin-7
Proteina 3 similar a BolA Proteina similar a neuropeptido C4orf48 Kazal-tipo 9 inhibidor de serina proteasa Proteina 11 que contiene el dominio PDZ Arilsulfatasa J Arilsulfatasa I
Proteina 13 similar a la ribonucleasa Proteina 12 similar a la ribonucleasa Proteina 10 similar a la ribonucleasa
Proteina 2 que contiene el dominio A del Factor de von Willebrand Neuromedina-S
Proteina 1 de la matriz extracelular relacionada con FRAS1 Homologo 2 de porciones de proteina Beta-defensina 121
Proteina 3 que contiene repeticion de NHL Proteina 9 espedfica de la placenta Torsina-2A
Proteina 24 similar a la metiltransferasa Receptor 10 de efrina tipo A Poliserasa-2
Proteina G5c del locos del complejo de antfgeno linfocftico 6 Homologo de proteina de ojo cerrado Proteina 5 relacionada con frizzled secretada Artemina
Protema FAM132A Protemas Wnt
Proteina 5B1 que contiene el dominio A del Factor de von Willebrand
Subunidad 10 del complejo ER membrana proteina
Proteina FAM108B1 que contiene el dominio abhidrolasa
Fibronectina tipo III proteina que contiene el dominio 7
UPF0369 proteina C6orf57
Proteina KIAA0319 asociada a la dislexia
Proteina 3 similar a C1 q de Complemento
Miembro N de la lipasa
Miembro K de la lipasa
Proteina 2 que contiene el dominio CUB
Renalasa
Miembro M de la lipasa Cistatina-9
Proteina 18 espedfica endocrina regulada
Carboxilesterasa 4A
Pikachurina
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q641Q3
Q66K79
Q685J3
Q68BL7
Q68BL8
Q68DV7
Q6B9Z1
Q6BAA4
Q6E0U4
Q6EMK4
Q6FHJ7
Q6GPI1
Q6GTS8
Q6H9L7
Q6IE36
Q6IE37
Q6IE38
Q6ISS4
Q6JVE5
Q6JVE6
Q6JVE9
Q6KF10
Q6MZW2
Q6NSX1
Q6NT32
Q6NT52
Q6NUI6
Q6NUJ1
Q6P093
Q6P4A8
Q6P5S2
Q6P988
Q6PCB0
Q6PDA7
Q6PEW0
Q6PEZ8
Q6PKH6
Q6Q788
Q6SPF0
Q6UDR6
Q6URK8
Q6UW01
Q6UW10
Q6UW15
Q6UW32
Q6UW78
Q6UW88
Protema similar a la meteorina Carboxipeptidasa Z
Mucin-17_________________________________________________
Protema 2A similar a la olfactomedina Protema 2B similar a la olfactomedina E3 ubiquitina-protema ligasa RNF43
Miembro 4 de la familia similar al factor de crecimiento de insulina
similar a receptor Fc B
Dermokina
Vasorina
Protema 4 relacionada con frizzled secretada Cadena B de quimotripsina B2 Probable carboxipeptidasa PM20D1 Isthmin-2
Homologo 2 de ovostatina
Homologo 1 de ovostatina
Kazal-tipo 14 inhibidor de serina proteasa
Receptor 2 similar a inmunoglobulina asociado a leucocitos
Lipocalina-12 espedfica del epidfdimo
Lipocalina-10 espedfica del epidfdimo
Lipocalina-8 espedfica del epidfdimo
Factor crecimiento/diferenciacion 6
Protema 4 relacionada con la folistatina
Protema 70 que contiene el dominio de superhelice
Carboxilesterasa 5A
Variante 2 de subunidad beta de coriogonadotropina
Protema similar a condterherina
Similar a saposina A
Similar a deacetilasa arilacetamida 2
Similar a Fosfolipasa B 1
UPF0762 protema C6orf58
Homologo de protema notum
Protema 1 que contiene el dominio A del Factor de von Willebrand Antfgeno asociado al esperma 11A Serina proteasa inactiva 54 Protema 1 similar a podocan
Similar al miembro 4 de la familia SDR de deshidrogenasa/reductasa 2
Apolipoprotema AV
Aterina
Inhibidor de proteasa 4 tipo Kunitz
Protema expresada en testmulos, prostata y placenta.
Cerebelina-3
Protema 2 asociada a surfactante
Protema 3-gamma derivada de islotes de regeneracion
Miembro 1 de la familia similar al factor de crecimiento de insulina
UPF0723 protema C11orf83__________________________________
Epigen
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q6UWE3
Q6UWF7
Q6UWF9
Q6UWM5
Q6UWN8
Q6UWP2
Q6UWP8
Q6UWQ5
Q6UWQ7
Q6UWR7
Q6UWT2
Q6UWU2
Q6UWW0
Q6UWX4
Q6UWY0
Q6UWY2
Q6UWY5
Q6UX06
Q6UX07
Q6UX39
Q6UX46
Q6UX73
Q6UXB0
Q6UXB1
Q6UXB2
Q6UXF7
Q6UXH0
Q6UXH1
Q6UXH8
Q6UXH9
Q6UXI7
Q6UX19
Q6UXN2
Q6UXS0
Q6UXT8
Q6UXT9
Q6UXV4
Q6UXX5
Q6UXX9
Q6UY14
Q6UY27
Q6W4X9
Q6WN34
Q6WRI0
Q6X4U4
Protema 2 similar a colipasa Miembro 4 de la familia NXPE
Protema FAM180A________________________________________
Protema 1 similar a GLIPR1
Kazal-tipo 6 inhibidor de serina proteasa
Miembro 11 de la familia SDR de deshidrogenasa/reductasa
Suprabasina
Proteina similar a la lisozima 1
Miembro 2 de la familia similar al factor de crecimiento de insulina Forma soluble del miembro 6 de la familia de ectonucleotido
pirofosfatasa/fosfodiesterasa_________________________________
Adropina
Proteina similar a beta-galactosidasa-1
Lipocalina-15
Proteina 2 similar a HHIP
Arilsulfatasa K
Serina proteasa 57
Proteina 1 similar a olfactomedina
Olfactomedina-4
Miembro 13 de la familia SDR de deshidrogenasa/reductasa
amelotina
Proteina FAM150B
UPF0764 proteina C16orf89_________________________________
Proteina FAM131A________________________________________
Miembro 3 de la familia similar a factor de crecimiento de insulina
Quimiocina 1 co-regulada con VEGF
Miembro B de la familia 18 de dominio de lectina tipo C
Proteina TD26 asociada a carcinoma hepatocelular
Proteina 2 rica en cistema del dominio similar EGF 2
Proteina 1 que contiene dominio de EGF de union a calcio y colageno
Serina proteasa inactiva PAMR1
Vitrina
Nefronectina
proteina de transcrito 4 similar a Trem
Miembro A de la familia 19 de dominio de lectina tipo C
Proteina FAM150A
Proteina 15 que contiene el dominio de la abhidrolasa Apolipoprotema O
Cadena pesada H6 del Inhibidor de inter-alfa-tripsina
R-espondina-2
Proteina 4 similar a ADAMTS
Proteina 2 expresada en prostata y testmulos
Mucin-6
Proteina 2 similar a Chordin Miembro 10 de la superfamilia de inmunoglobulina Proteina 1 que contiene el dominio de esclerostina Proteina 2 de union a zona pelucida
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q6XE38
Q6XPR3
Q6XZB0
Q6ZMM2
Q6ZMP0
Q6ZNF0
Q6ZRI0
Q6ZRP7
Q6ZWJ8
Q75N90
Q765I0
Q76B58
Q76LX8
Q76M96
Q7L1S5
Q7L513
Q7L8A9
Q7RTM1
Q7RTW8
Q7RTY5
Q7RTY7
Q7RTZ1
Q7Z304
Q7Z3S9
Q7Z4H4
Q7Z4P5
Q7Z4R8
Q7Z4W2
Q7Z5A4
Q7Z5A7
Q7Z5A8
Q7Z5A9
Q7Z5J1
Q7Z5L0
Q7Z5L3
Q7Z5L7
Q7Z5P4
Q7Z5P9
Q7Z5Y6
Q7Z7B7
Q7Z7B8
Q7Z7C8
Q7Z7H5
Q86SG7
Q86SI9
Q86TE4
Q86TH1
Miembro 4 de la familia 1D de secretoglobina Repetina
Miembro de lipasa I Protema 5 similar a ADAMTS
Protema 4 que contiene el dominio tipo 1 de trombospondina protema similar a fosfatasa de acido hierro/zinc purpura Otogelm
Sulfhidril oxidasa 2
Protema similar a Kielin/Chordin
Fibrilina-3
Urotensina-2B
Protema FAM5C
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 13
Protema 80 que contiene el dominio de superhelice
Sulfotransferasa 9 de Carbohidratos
Similar a receptor Fc A
Vasohibina-1
Otopetrina-1
Otoancorin
Serina proteasa 48
Ovocimasa-1
Ovocimasa-2
Protema 2 que contiene el dominio MAM Protema similar a 2 N-terminal de homologo Notch Intermedina-corta
Factor de crecimiento/diferenciacion 7
UPF0669 protema C6orf120_________________________________
Protema similar a la lisozima 2 Serina proteasa 42 Proteina FAM19A5 Proteina FAM19A3
Proteina FAM19A1_________________________________________
Proteina similar 11-beta-deshidrogenasa de hidroxiesteroide Homologo de proteina 1 de la capa externa de la membrana vitelina Proteina 2 similar a Complemento C1q 2 Podocan
17-beta-hidroxiesteroide deshidrogenasa 13
Mucin-19________________________________________________
Proteina morfogenetica osea 8A Beta-defensina 132 Beta-defensina 128
Subunidad 8 del factor TFIID de inicio de la transcripcion Proteina 4 que contiene el dominio de transmembrana emp24 Proteina 2 similar a lisozima g Proteina CEI
Proteina 2 de cremallera de leucina Proteina 2 similar a ADAMTS
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
Q86U17
Serpina A11 SERPINA11
Q86UU9
Endoquinina-A TAC4
Q86UW8
Protema 4 de enlace a hialuronano y proteoglicano HAPLN4
Q86UX2
Cadena pesada H5 del inhibidor de la inter-alfa-tripsina ITIH5
Q86V24
Protema 2 del receptor de adiponectina ADIPOR2
Q86VB7
CD163 soluble CD163
Q86VR8
Protema 1 de caja de cuatro articulaciones FJX1
Q86WD7
Serpina AA9 SERPINA9
Q86WN2
Interferon epsilon IFNE
Q86WS3
Protema similar a espedfica de placenta 1 PLAC1L
Q86X52
Condroitin sulfato sintasa 1 CHSY1
Q86XP6
Gastroquina-2 GKN2
Q86XS5
Protema 5 relacionada con la angiopoyetina ANGPTL5
Q86Y27
Antfgeno 5 de melanoma B BAGE5
Q86Y28
Antfgeno 4 de melanoma B BAGE4
Q86Y29
Antfgeno 3 de melanoma B BAGE3
Q86Y30
Antfgeno 2 del melanoma B BAGE2
Q86Y38
Xilosiltransferasa 1 XYLT1
Q86Y78
Protema 6 que contiene el dominio de Ly6/PLAUR LYPD6
Q86YD3
Protema de transmembrana 25 TMEM25
Q86YJ6
Similar a treonina sintasa 2 THNSL2
Q86YW7
Hormona beta-5 de glicoprotema GPHB5
Q86Z23
Protema 4 similar al complemento C1q 4 C1QL4
Q8IU57
Subunidad alfa del receptor de interleucina-28 IL28RA
Q8IUA0
Protema 8 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP WFDC8
Q8IUB2
Protema 3 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP WFDC3
Q8IUB3
Protema WFDC10B WFDC10B
Q8IUB5
Protema 13 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP WFDC13
Q8IUH2
Protema CREG2 CREG2
Q8IUK5
Protema 1 que contiene el dominio de plexina PLXDC1
Q8IUL8
Protema 2 C2 de la capa intermedia del cartflago CILP2
Q8IUX7
Protema 1 de union al potenciador de adipocitos AEBP1
Q8IUX8
Protema 6 similar al factor de crecimiento epidermico EGFL6
Q8IVL8
Carboxipeptidasa O CPO
Q8IVN8
Protema que contiene el dominio tipo 1 de somatomedina B y trombospondina SBSPON
Q8IVW8
Homologo 2 de protema spinster SPNS2
Q8IW75
Serpina A12 SERPINA12
Q8IW92
Protema 2 similar a beta-galactosidasa-1 GLB1L2
Q8IWL1
Protema A2 asociada al surfactante pulmonar SFTPA2
Q8IWL2
Protema A1 asociada al surfactante pulmonar SFTPA1
Q8IWV2
Contactina-4 CNTN4
Q8IWY4
Protema 1 que contiene dominio similar a peptido senal, CUB y EGF SCUBE1
Q8IX30
Protema 3 que contiene dominio similar a peptido senal, CUB y EGF SCUBE3
Q8IXA5
Protema 3 asociada a la membrana de acrosoma de esperma, forma de membrana SPACA3
Q8IXB1
Miembro 10 de la subfamilia C de homologo de DnaJ DNAJC10
Q8IXL6
Protema quinasa Fam20C de serina/treonina extracelular FAM20C
Q8IYD9
Protema 2 de susceptibilidad al adenoma de pulmon LAS2
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q8IYP2
Q8IYS5
Q8IZC6
Q8IZJ3
Q8IZN7
Q8N0V4
Q8N104
Q8N119
Q8N129
Q8N135
Q8N145
Q8N158
Q8N1E2
Q8N2E2
Q8N2E6
Q8N2S1
Q8N302
Q8N307
Q8N323
Q8N387
Q8N3Z0
Q8N436
Q8N474
Q8N475
Q8N4F0
Q8N4T0
Q8N5W8
Q8N687
Q8N688
Q8N690
Q8N6C5
Q8N6C8
Q8N6G6
Q8N6Y2
Q8N729
Q8N8U9
Q8N907
Q8NAT1
Q8NAU1
Q8NB37
Q8NBI3
Q8NBM8
Q8NBP7
Q8NBQ5
Q8NBV8
Q8NCC3
Q8NCF0
Serina proteasa 58
Receptor similar a inmunoglobulina asociado a osteoclastos Cadena de colageno alfa-1 (XXVII)
Protema 8 que contiene el dominio alfa-2-macroglobulina similar a C3 y PZP Beta-defensina 107
Miembro 2 de la familia LGI de repeticion rico en leucina
Beta-defensina 106
Metaloproteinasa de matriz-21
Homologo 4 de cubierta de protema
Miembro 4 de la familia LGI de repeticion rico en leucina
Miembro 3 de la familia LGI de repeticion rico en leucina
Glipicano-2
Protema 1 similar a lisozima g
Protema que contiene el dominio D y EGF del factor de Willebrand Prosalusina
Protema 4 de union al factor beta de crecimiento de transformacion latente
Factor angiogenico con parche G y dominios FHA 1
Mucin-20
Miembro 1 de la familia NXPE Mucin-15
Serina proteasa inactiva 35
Protema X2 similar a la carboxipeptidasa inactiva
Protema 1 relacionada con frizzled secretada
Proteina 5 relacionada con la folistatina
Miembro 2 e la familia B que contiene pliegues BPI
Carboxipeptidasa A6
Proteina FAM24B
Beta-defensina 125
Beta-defensina 123
Beta-defensina 119
Miembro 1 e la superfamilia de inmunoglobulinas
Miembro 3 de la subfamilia A del receptor similar a inmunoglobulina leucocitaria Proteina 1 similar a ADAMTS
Proteina 17 que contiene repeticiones ricas en leucina Neuropeptido W-23
Proteina reguladora endotelial de union a BMP Miembro 5 de la familia dominio DAN
Proteina 2 que contiene el dominio similar a glicosiltransferasa
Fibronectina tipo III proteina que contiene el dominio 5
Proteina 1 que contiene el dominio 7 de la Enfermedad de Parkinson
Draxina
Prenilcistema oxidasa
Proproteina convertasa subtilisina/kexin tipo 9 Estradiol 17-beta-deshidrogenasa 11 Sinaptotagmina-8 Grupo XV fosfolipasa A2
Miembro C de la familia 18 del dominio de lectina tipo C
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q8NCW5
Q8NDA2
Q8NDX9
Q8NDZ4
Q8NEB7
Q8NES8
Q8NET1
Q8NEX5
Q8NEX6
Q8NF86
Q8NFM7
Q8NFQ5
Q8NFQ6
Q8NFU4
Q8NFW1
Q8NG35
Q8NG41
Q8NHW6
Q8NI99
Q8TAA1
Q8TAG5
Q8TAL6
Q8TAT2
Q8TAX7
Q8TB22
Q8TB73
Q8TB96
Q8TC92
Q8TCV5
Q8TD06
Q8TD33
Q8TD46
Q8TDE3
Q8TDF5
Q8TDL5
Q8TE56
Q8TE57
Q8TE58
Q8TE59
Q8TE60
Q8TE99
Q8TER0
Q8TEU8
Q8WTQ1
Q8WTR8
Q8WTU2
NAD(P)H-hidrato epimerasa Hemicentina-2
Protema G5b del locus del complejo de linfocito antfgeno 6
Protema 1 delecionada en autismo
Protema de union a la acrosina
Beta-defensina 124
Beta-defensina 108B
Protema WFDC9
Protema WFDC11__________________________________________________
Serina proteasa 33
Receptor D de interleucina-17
Miembro 6 de la familia B que contiene pliegues BPI
Proteina de la familia C que contiene pliegues BPI
Peptido secretado de celulas dendnticas foliculares
Cadena de colageno alfa-1 (XXII)
Beta-defensina 105 Neuropeptido B-23 Otospiralina
Proteina 6 relacionada con la angiopoyetina Ribonucleasa probable 11
Proteina 2a que contiene el dominio V-set y de transmembrana Homologo del factor de inicio de la yema de la aleta.
Proteina 3 de union al factor de crecimiento de fibroblastos Mucin-7
Proteina 20 asociada a la espermatogenesis Proteina NDNF
Proteina inmunomoduladora de celulas T
Proteina disulfuro-tiol oxidorreductasa
Proteina 5 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP
Homolog de proteina 3 de gradiente anterior
Miembro 1 de la familia 1C de secretoglobina
Receptor 1 de glicoprotema CD200 de superficie celular
Ribonucleasa 8
Proteina 1 similar a neuropilina y tolloide Miembro 1 de la familia B que contiene pliegues BPI 1 Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 17 Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 16 Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 15 Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 19 Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 18 Proteina 2 similar a la fosfatasa de acido
Proteina 1 que contiene dominio similar a sushi, nidogeno y EGF Proteina 2 que contiene dominio WAP, kazal, inmunoglobulina, kunitz y NTR Beta-defensina 104 Netrin-5
Proteina del grupo B que contiene el dominio rico en cistema receptor Scavenger Proteina TSPEAR
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q8WUA8
Q8WUF8
Q8WUJ1
Q8WUY1
Q8WVN6
Q8WVQ1
Q8WWA0
Q8WWG1
Q8WWQ2
Q8WWU7
Q8WWY7
Q8WWY8
Q8WWZ8
Q8WX39
Q8WXA2
Q8WXD2
Q8WXF3
Q8WXI7
Q8WXQ8
Q8WXS8
Q92484
Q92485
Q92496
Q92520
Q92563
Q92583
Q92626
Q92743
Q92752
Q92765
Q92819
Q92820
Q92824
Q92832
Q92838
Q92874
Q92876
Q92913
Q92954
Q93038
Q93091
Q93097
Q93098
Q95460
Q969D9
Q969E1
Tsukushin Protema FAM172A Neuferricina
UPF0670 protema THEM6_________________________________________
Protema 1 secretada y de transmembrana
Nucleotidasa 1 activada por calcio soluble
Intelectina-1
Neuregulina-4
Heparanasa-2 inactiva
Intelectina-2
Proteina 12 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP Miembro H de lipasa
Proteina del transcrito 3 inducido por oncoprotema
Lipocalina-9 espedfica del epidfdimo
Protema 1 expresada en prostata y testmulos
Secretogranina-3
Cadena de Relaxina-3 A
Mucin-16
Carboxipeptidasa A5
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 14 Fosfodiesterasa 3a similar a la esfingomielinasa de acido Fosfodiesterasa 3b similar a la esfingomielinasa de acido Proteina 4 relacionada con el factor H del complemento Proteina FAM3C Testican-2
Quimiocina 17de motivo C-C Homologo de peroxidasina Serina proteasa HTRA1 Tenascina-R
Proteina 3 relacionada con frizzled secretada Hialuronan sintasa 2 Gamma-glutamil hidrolasa Proprotema convertasa subtilisina/kexin type 5 Proteina NELL1 de union a proteina quinasa C Ectodisplasina A, forma de membrana similar a Desoxirribonucleasa 1 2 Calicrema-6
Factor de crecimiento de fibroblastos 13 Parte C-terminal de proteoglicano 4
Miembro 25 de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral Ribonucleasa K6 Proteina Wnt-2b Proteina Wnt-8b
Proteina genica relacionada con la clase I del complejo de histocompatibilidad principal
Linfopoyetina del estroma timico
Peptido antimicrobiano 2 expresado en el tngado
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q969H8
Q969Y0
Q96A54
Q96A83
Q96A84
Q96A98
Q96A99
Q96BH3
Q96BQ1
Q96CG8
Q96DA0
Q96DN2
Q96DR5
Q96DR8
Q96DX4
Q96EE4
Q96GS6
Q96GW7
Q96HF1
Q96I82
Q96ID5
Q96II8
Q96IY4
Q96JB6
Q96JK4
Q96KN2
Q96KW9
Q96KX0
Q96L15
Q96LB8
Q96LB9
Q96LC7
Q96LR4
Q96MK3
Q96MS3
Q96NY8
Q96NZ8
Q96NZ9
Q96P44
Q96PB7
Q96PC5
Q96PD5
Q96PH6
Q96PL1
Q96PL2
Q96QH8
UPF0556 protema C19orf10___________________________________________
Miembro 3 de la familia NXPE Protema 1 del receptor de adiponectina Cadena de colageno alfa-1 (XXVI)
Protema 1 que contiene el dominio EMI Peptido tuberoinfundibular de 39 residuos Pentraxina-4
Protema 1 de union a esperma epididimal Protema FAM3D
Protema 1 que contiene repeticion de triple helice de colageno
Homologo B de protema 16 de granulo de Zymogen
Protema que contiene el dominio C y EGF del Factor von Willebrand
Miembro 2 de la familia A que contiene pliegues BPI
Protema 1 similar a la mucina
Protema 1 que contiene el dedo RING y el dominio SPRY Protema 126 que contiene el dominio de superhelice Protema FAM108A1que contiene el dominio abhidrolasa Protema de nucleo de brevican Protema 2 relacionada con frizzled secretada
Protema 1 que contiene el dominio del inhibidor de la serina proteasa tipo Kazal Miembro 21 de la superfamilia de inmunoglobulina
Protema 3 que contiene el dominio de homologfa de calponina y repeticion rica en
leucinas___________________________________________________________
Carboxipeptidasa B2
Homolog 4 de Lisil oxidasa
Protema 1 similar a HHIP
Beta-ala-his dipeptidasa
Protema SPACA7
Protema 4 similar a la lisozima
Ecto-ADP-ribosiltransferasa 5
Protema 4 de reconocimiento de peptidoglicano
Protema 3 de reconocimiento de peptidoglicano
Lectina 10 similar a Ig de union a acido sialico
Protema FAM19A4
Protema FAM20A
Protema 1 que contiene el dominio de glicosiltransferasa 1
Protema 4 relacionada con el receptor de poliovirus procesado
WAP, kazal, inmunoglobulina, kunitz y protema que contiene el dominio NTR 1
Protema acida rica en prolina 1
Cadena de colageno alfa-1 (XXI)
Noelina-3
Protema 2 de la actividad inhibitoria del melanoma N-acetilmuramoil-L-alanina amidasa Beta-defensina 118
Miembro 2 de la familia 3A de secretoglobina Beta-tectorina
Protema 5 asociada a acrosoma de esperma
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q96QR1
Q96QU1
Q96QV1
Q96RW7
Q96S42
Q96S86
Q96SL4
Q96SM3
Q96T91
Q99062
Q99102
Q99217
Q99218
Q99435
Q99470
Q99542
Q99574
Q99584
Q99616
Q99645
Q99674
Q99715
Q99727
Q99731
Q99748
Q99935
Q99942
Q99944
Q99954
Q99969
Q99972
Q99983
Q99985
Q99988
Q9BPW4
Q9BQ08
Q9BQ16
Q9BQ51
Q9BQB4
Q9BQI4
Q9BQP9
Q9BQR3
Q9BQY6
Q9BRR6
Q9BS86
Q9BSG0
Miembro 1 de la familia 3A de secretoglobina Protocadherina-15
Protema que interactua con Hedgehog
Hemicentina-1
Homologo nodal
Protema 3 de enlace a hialuronano y proteoglicano Glutation peroxidasa 7 Carboxipeptidasa X1 probable hormona alfa-2 de glicoprotema
Receptor del factor estimulante de colonias de granulocitos
Cadena alfa de mucin-4
Amelogenina, Isoforma X
Amelogenina, isoforma Y
Protema NELL2 de union a protema quinasa C
Factor 2 derivado de celulas estromales
Metaloproteinasa 19 de matri
Neuroserpina
Protema S100-A13
Quimiocina 13 motivo C-C
Epifino
Protema 1 del regulador de crecimiento celular con dominio de mano EF Cadena de colageno alfa-1 (XII)
Inhibidor 4 de metaloproteinasa Quimiocina 19 Motivo C-C Neurturina
Protema 1 rica en prolina
E3 ubiquitina-protema ligasa RNF5
Protema 8 similar a factor de crecimiento epidermico
Protema 3A regulada por androgenos de la glandula submaxilar
Protema 2 responsiva al receptor del acido retinoico
Miocilina
Osteomodulina
Semaforina-3C
Factor crecimiento/diferenciacion 15 Apolipoprotema L4 Beta similar a resistina Testican-3
Ligando 2 de muerte celular programada 1 Esclerostina
Protema 3 que contiene el dominio de superhelice Miembro 3 de la familia A que contiene pliegues BPI Serina proteasa 27
Protema 6 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP
Glucocinasa dependiente de ADP
Protema 1 de union a zona pelucida
Protema 1 que contiene el dominio asociado a proteasa
Retbindina
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q9BT30
Q9BT56
Q9BT67
Q9BTY2
Q9BU40
Q9BUD6
Q9BUN1
Q9BUR5
Q9BV94
Q9BWP8
Q9BWS9
Q9BX67
Q9BX93
Q9BXI9
Q9BXJ0
Q9BXJ1
Q9BXJ2
Q9BXJ3
Q9BXJ4
Q9BXJ5
Q9BXN1
Q9BXP8
Q9BXR6
Q9BXS0
Q9BXX0
Q9BXY4
Q9BY15
Q9BY50
Q9BY76
Q9BYF1
Q9BYJ0
Q9BYW3
Q9BYX4
Q9BYZ8
Q9BZ76
Q9BZG9
Q9BZJ3
Q9BZM1
Q9BZM2
Q9BZM5
Q9BZP6
Q9BZZ2
Q9C0B6
Q9GZM7
Q9GZN4
Q9GZP0
Dioxigenasa ABH7 dependiente de alfa-cetoglutarato probable Espexina
Protema 1 que interactua con la familia NEDD4
Alfa-L-fucosidasa plasmatica
Protema 1 similar a Cordina
Espondina-2
Protema MENT
Apolipoprotema o
2 similar a alfa-manosidasa que mejora la degradacion de ER 2 Colectina-11
Protema 1 que contiene el dominio quitinasa Molecula C de adhesion de union
Protema similar a la fosfolipasa A2 secretora del grupo XIIB

Protema 6 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q

Protema 5 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q

Protema 1 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q

Protema 7 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q

Protema 4 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q

Protema 3 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q

Protema 2 relacionada con el factor de necrosis tumoral del complemento C1q
asporina
Papalisina-2
Protema 5 relacionada con el factor H del complemento Cadena de colageno alfa-1 (XXV)
EMILIN-2________________________________________________________
R-espondina-3
Subunidad beta 3 similar al receptor de hormonas similar a mucina que contiene
modulo similar a EGF_______________________________________________
Subunidad catalttica del complejo senal peptidasa SEC11C Protema 4 relacionada con la angiopoyetina Enzima 2 convertidora de angiotensina procesada Protema 2 de union al factor de crecimiento de fibroblastos Beta-defensina 126
Protema 1 que contiene el dominio C de helicasa inducida por interferon
Protema 4 derivada de islotes de regeneracion
Similar a protema 3 asociada a contactina
Protema 1 similar a Ly-6/neurotoxina
Triptasa delta
Fosfolipasa A2 secretora de grupo XIIA Fosfolipasa A2 secretora de grupo IIF
Ligando 2 de NKG2D_______________________________________________
Quitinasa de mairnferos acida
Sialoadhesina
Protema FAM5B
Similar a antfgeno de nefritis tubulointersticial Serina proteasa 4 espedfica del cerebro
Factor de crecimiento D derivado de las plaquetas, forma de union al receptor
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q9GZT5
Q9GZU5
Q9GZV7
Q9GZV9
Q9GZX9
Q9GZZ7
Q9GZZ8
Q9H0B8
Q9H106
Q9H114
Q9H173
Q9H1E1
Q9H1F0
Q9H1J5
Q9H1J7
Q9H1M3
Q9H1M4
Q9H1Z8
Q9H239
Q9H2A7
Q9H2A9
Q9H2R5
Q9H2X0
Q9H2X3
Q9H306
Q9H324
Q9H336
Q9H3E2
Q9H3R2
Q9H3U7
Q9H3Y0
Q9H4A4
Q9H4F8
Q9H4G1
Q9H5V8
Q9H6B9
Q9H6E4
Q9H741
Q9H772
Q9H7Y0
Q9H8L6
Q9H9S5
Q9HAT2
Q9HB40
Q9HB63
Q9HBJ0
Protema Wnt-10a Nictalopina
Protema 2 de enlace a hialuronano y proteoglicano Factor de crecimiento de fibroblastos 23 Homologo 1 de protema de gastrulacion torcida Receptor alfa-4 de la familia GDNF Lacritina de glicoprotema extracelular
Protema secretora rica en cistema que contiene el dominio LCCL 2 Protema delta reguladora de senal Similar a cistatina 1
Factor SIL1de intercambio de nucleotidos Ribonucleasa 7
Protema 10A de dominio de nucleol de cuatro disulfuros WAP
Protema Wnt-8a
Protema Wnt-5b
Beta-defensina 129
Beta-defensina 127
Augurina
Metaloproteinasa-28 de matriz Quimiocina 16 motivo C-X-C Sulfotransferasa 8 de carbohidratos Calicrema-15 Cordina
Miembro M de la familia 4 del dominio de lectina tipo-C Metaloproteinasa 27 de matriz
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 10 Que contiene del dominio de LCCL de protema secretora rica en cistema 1 Nexina de calsificacion-25 Mucin-13
Protema 2 de union al calcio modular relacionada con SPARC Inhibidor de la peptidasa R3HDML Aminopeptidasa B
Protema 1 de union al calcio modular relacionada con SPARC similar a cistatina-9
Protema 1 que contiene el dominio CUB Epoxido hidrolasa 3
Protema 134 que contiene el dominio de superhelice
UPF0454 protema C12orf49_____________________________________
Gremlin-2
Delecionada en proteina 1 relacionada con el autismo Multimerina-2
Proteina relacionada con Fukutina Sialato O-acetilesterasa
Serina carboxipeptidasa inducible por retinoides
Netrin-4_____________________________________________________
Proteina 1 espedfica de la placenta Prokineticina-2
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q9HC57
Q9HC73
Q9HC84
Q9HCB6
Q9HCQ7
Q9HCT0
Q9HD89
Q9NNX1
Q9NNX6
Q9NP55
Q9NP70
Q9NP95
Q9NP99
Q9NPA2
Q9NPE2
Q9NPH0
Q9NPH6
Q9NQ30
Q9NQ36
Q9NQ38
Q9NQ76
Q9NQ79
Q9NR16
Q9NR23
Q9NR71
Q9NR99
Q9NRA1
Q9NRC9
Q9NRE1
Q9NRJ3
Q9NRM1
Q9NRN5
Q9NRR1
Q9NS15
Q9NS62
Q9NS71
Q9NS98
Q9NSA1
Q9NT22
Q9NTU7
Q9NVR0
Q9NWH7
Q9NXC2
Q9NY56
Q9NY84
Q9NZ20
Q9NZC2
Protema 1 del dominio del nucleo de cuatro disulfuros WAP
Factor 2 similar al receptor de citoquinas
Mucin-5B
Espondina-1
Neuropeptido NPSF
Factor de crecimiento de fibroblastos 22
Resistina
Tuftelina
Antfgeno CD209
Miembro 1 de la familia A que contiene pliegues BPI Ameloblastina
Factor de crecimiento de fibroblastos 20
Receptor de activacion expresado en celulas mieloides 1
Metaloproteinasa 25 de la matriz
Neugrina
Fosfatasa acida lisofosfatfdica tipo 6
Protema 2b de union al olorizante
Molecula 1 espedfica de celulas endoteliales
Protema 2 que contiene dominio similar a peptido senal, CUB y EGF
Kazal-tipo 5 inhibidor de serina proteasa
Fosfoglicoproteina de la matriz de extracelular
Protema acida del cartflago 1
Protema M160 del receptor de Scavenger rico en cistema tipo 1 Factor crecimiento/diferenciacion 3 Ceramidasa neutra
Protema 5 asociada la remodelacion de la matriz Factor de crecimiento derivado de plaquetas C Otoraplina
Metaloproteinasa de la matriz 26 Quimiocina 28 motivo C-C Enamelina
Protema 3 similar olfactomedina Protema 1 similar a citoquina
Protema 3de union a factor beta de crecimiento de transformacion latente Protema que contiene del dominio tipo 1 de trombospondina Gastroquina-1 Semaforina-3G
Factor de crecimiento de fibroblastos 21
EMILIN-3___________________________________________________
Cerebelina-4
Protema 11 similar a Kelch
Protema 6 asociada a espermatogenesis
Protema 1 que contiene el dominio de la glucosa-fructosa oxidorreductasa
Protema de union al olorizante 2a
Molecula vascular no inflamatoria 3
Fosfolipasa A2 secretora del Grupo 3
Receptor de activacion expresado en celulas mieloides 2
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
Q9NZK5
Q9NZK7
Q9NZP8
Q9NZV1
Q9NZW4
Q9P0G3
Q9P0W0
Q9P218
Q9P2C4
Q9P2K2
Q9P2N4
Q9UBC7
Q9UBD3
Q9UBD9
Q9UBM4
Q9UBP4
Q9UBQ6
Q9UBR5
Q9UBS5
Q9UBT3
Q9UBU2
Q9UBU3
Q9UBV4
Q9UBX5
Q9UBX7
Q9UEF7
Q9UFP1
Q9UGM3
Q9UGM5
Q9UGP8
Q9UHF0
Q9UHF1
Q9UHG2
Q9UH18
Q9UHL4
Q9UI42
Q9UIG4
Q9UIK5
Q9UIQ6
Q9UJA9
Q9UJH8
Q9UJJ9
Q9UJW2
Q9UK05
Q9UK55
Q9UK85
Q9UKJ1
Adenosina desaminasa CECR1
Fosfolipasa secretora A2 del grupo IIE
Protema similar al subcomponente C1r del complemento
Protema de la neurona motora 1 rica en cistema
Sialoprotema dentina
Calicrema-14
Interferon kappa
Cadena de colageno alfa-1 (XX)
Protema transmembrana 181
Protema 16 que contiene el dominio tiorredoxina
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 9.
Peptido parecido a la galanina
Citoquina SCM-1 beta
Factor 1 de citoquina similar a cardiotrofina
Opticina
Protema 3 relacionada con Dickkopf Similar a exostosina 2 Factor similar a la quimiocina
Subunidad 1 del receptor del tipo B del acido gamma-aminobutmco
Forma corta de protema 4 relacionada con Dickkopf
Protema 2 relacionada con Dickkopf
Ghrelin-28
Protema Wnt-16
Fibulina-5
Calicrema-11
Cloto____________________________________________________
Protema FAM198A_________________________________________
Delecionada en proteina de tumores cerebrales malignos 1 Fetuina-B
Homologo de proteina de translocacion SEC63 Neuroquinina-B
Proteina 7 similar al factor de crecimiento epidermico
ProSAAS_________________________________________________
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 1 Dipeptidil peptidasa 2 Carboxipeptidasa A4
Proteina del gen 2 candidato de susceptibilidad a la psoriasis 1 Tomoregulina-2
Leucil-cistinil aminopeptidasa, forma serica de embarazo
Miembro 5 de la familia de ectonucleotido pirofosfatasa/fosfodiesterasa
Meteorina
Subunidad gamma de N-acetilglucosamina-1-fosfotransferasa Antfgeno de nefritis tubulointersticial.
Factor de crecimiento/diferenciacion 2
Inhibidor de la proteasa dependiente de la proteina Z
Proteina 1 similar Dickkopf
Receptor alfa tipo similar a inmunoglobulina emparejada
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
Q9UKP4
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 7 ADAMTS7
Q9UKP5
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 6 ADAMTS6
Q9UKQ2
Desintegrina y protema que contiene el dominio metaloproteinasa 28 ADAM28
Q9UKQ9
Calicrema-9 KLK9
Q9UKR0
Calicrema-12 KLK12
Q9UKR3
Calicrema-13 KLK13
Q9UKU9
Protema relacionada con la angiopoyetina 2 ANGPTL2
Q9UKZ9
Potenciador 2 de procolageno C-endopeptidasa PCOLCE2
Q9UL52
Cadena no catalftica de proteasa serina 11E de transmembrana TMPRSS11E
Q9ULC0
Endomucina EMCN
Q9ULI3
Homologo 1 de protema HEG HEG1
Q9ULZ1
Apelina-13 APLN
Q9ULZ9
Metaloproteinasa de matriz-17 MMP17
Q9UM21
Forma soluble de alfa-1,3-manosil-glicoprotema 4-beta-N- acetilglucosaminiltransferasa A MGAT4A
Q9UM22
Protema 1 relacionada con ependimina de mairnfero EPDR1
Q9UM73
Receptor de tirosina quinasa ALK ALK
Q9UMD9
Antigeno de la enfermedad de IgA lineal de 97 kDa. COL17A1
Q9UMX5
Neudesina NENF
Q9UN73
Protocadherina alfa-6 PCDHA6
Q9UNA0
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 5 ADAMTS5
Q9UNI1
Miembro 1 de la familia de la elastasa similar a la quimotripsina CELA1
Q9UNK4
Fosfolipasa A2 secretora de Grupo IID PLA2G2D
Q9UP79
Desintegrina A y metaloproteinasa con motivos de trombospondina 8 ADAMTS8
Q9UPZ6
Protema 7A que contiene el dominio tipo 1 de trombospondina THSD7A
Q9UQ72
beta-1-glicoprotema 11 espedfica para el embarazo PSG11
Q9UQ74
beta-1-glicoprotema 8 espedfica para el embarazo PSG8
Q9UQC9
Regulador 2 de canal de cloruro activado por calcio CLCA2
Q9UQE7
Mantenimiento estructural de protema 3 de cromosomas SMC3
Q9UQP3
Tenascia TNN
Q9Y223
UDP-N-acetilglucosamina 2-epimerasa GNE
Q9Y240
Miembro A de la familia 11 del dominio de lectina tipo C CLEC11A
Q9Y251
Subunidad de heparanasa de 8 kDa HPSE
Q9Y258
Quimiocina 26 Motivo C-C CCL26
Q9Y264
Angiopoyetina-4 ANGPT4
Q9Y275
Miembro 13b de la superfamilia del ligando de factor de necrosis tumoral, forma de membrana TNFSF13B
Q9Y287
Dominio intracelular BRI2 ITM2B
Q9Y2E5
Alfa-manosidasa espedfica del epididimio MAN2B2
Q9Y334
Protema 7 que contiene el dominio A del factor de von Willebrand VWA7
Q9Y337
Calicrema-5 KLK5
Q9Y3B3
Protema 7 que contiene el dominio emp24 de la transmembrana TMED7
Q9Y3E2
Protema 1 similar a BolA BOLA1
Q9Y426
Protema 2 que contiene el dominio C2 C2CD2
Q9Y4K0
Homologo 2 de lisil oxidasa LOXL2
Q9Y4X3
Quimiocina 27 motivo C-C CCL27
Q9Y5C1
Protema 3 relacionada con la angiopoyetina ANGPTL3
Q9Y512
Protocadherina alfa-10 PCDHA10
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la Protema Nombre del Gen
Q9Y513
Protocadherina alfa-1 PCDHA1
Q9Y5K2
Calicrema-4 KLK4
Q9Y5L2
Protema asociada a la gota de lfpidos inducible por hipoxia HILPDA
Q9Y5Q5
Enzima convertidora del peptido natriuretico auricular CORIN
Q9Y5R2
Metaloproteinasa-24 de la matriz MMP24
Q9Y5U5
Miembro 18 de la superfamilia del receptor del factor de necrosis tumoral TNFRSF18
Q9Y5W5
Factor 1 inhibidor de Wnt WIF1
Q9Y5X9
Lipasa endotelial LIPG
Q9Y625
Glipicano-6 secretado GPC6
Q9Y646
Carboxipeptidasa Q CPQ
Q9Y6C2
EMILIN-1 EMILIN1
Q9Y6F9
Protema Wnt-6 Wnt6
Q9Y6I9
Protema de la secuencia 264 expresada en los testmulos TEX264
Q9Y6L7
Protema 2 similar a Tolloide TLL2
Q9Y6N3
Miembro 3 de la familia del regulador del canal de cloruro activado por calcio CLCA3P
Q9Y6N6
Subunidad gamma-3 de laminina LAMC3
Q9Y6R7
Protema de union a IgGFc FCGBP
Q9Y6Y9
Antfgeno de linfocitos 96 LY96
Q9Y6Z7
Collectina-10 COLEC10
Las ID de Uniprot expuestas en la Tabla 1 se refieren a las versiones humanas de las protemas enumeradas y las secuencias de cada una estan disponibles en la base de datos de Uniprot. Las secuencias de las protemas enumeradas tambien estan generalmente disponibles para varios animales, incluyendo varios mairnferos y animales de interes veterinario o industrial. Por consiguiente, en algunas realizaciones, las composiciones de la invencion proporcionan la administracion de uno o mas ARNm que codifican una Protema de Fusion Terapeutica, en donde la protema terapeutica codificada se elige de homologos de mamfferos u homologos de un animal de interes veterinario o industrial de las protemas secretadas enumeradas en la Tabla 1 para el tratamiento de las enfermedades definidas en las reivindicaciones. En algunas realizaciones, los homologos de mamffero se eligen de homologos de raton, rata, hamster, jerbo, caballo, cerdo, vaca, llama, alpaca, vison, perro, gato, huron, oveja, cabra, o camello. En algunas realizaciones, el animal de interes veterinario o industrial se elige de los mamfferos enumerados anteriormente y/o pollo, pato, pavo, salmon, bagre o tilapia.
En algunas realizaciones, la protema terapeutica se elige de las protemas secretadas supuestas enumeradas en la Tabla 2; portanto, las composiciones de la invencion pueden comprender un ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica, en donde la protema terapeutica codificada es una enumerada en la Tabla 2 (o un homologo de la misma, como se trata a continuacion) para tratar enfermedades definidas en las reivindicaciones, junto con otros componentes expuestos en la presente.
Tabla 2: Protemas secretadas supuestas.
ID de Uniprot
Nombre de la protema Nombre del gen
A6NGW2
Protema similar a estereocilina supuesta STRCP1
A6NIE9
Serina proteasa 29 Supuesta PRSS29P
A6NJ16
Protema IGHV4OR15-8 similar a dominio que contiene V-set e inmunoglobulina supuesta IGHV4OR15-8
A6NJS3
Protema IGHV1OR21-1imilar a dominio que contiene V-set e inmunoglobulina supuesta IGHV1OR21-1
A6NMY6
Protema similar a anexina A2 supuesta ANXA2P2
A8MT79
Similar a zinc-alfa-2-glicoprotema 1 supuesta
A8MWS1
Protema KIR3DP1 similar a receptor similar a inmunoglobulina de celulas asesina supuesta KIR3DP1
A8MXU0
beta-defensina 108a supuesta DEFB108P1
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
ID de Uniprot
Nombre de la protema Nombre del gen
C9JUS6
Protema similar a adrenomedulina-5 supuesta ADM5
P0C7V7
Subunidad catalftica SEC11B del complejo de senal peptidasa supuesta SEC11B
P0C854
Protema de la region cntica del smdrome del ojo de gato supuesta CECR9
Q13046
beta-1-glicoprotema espedfica del embarazo 7 supuesta PSG7
Q16609
Protema 2 similar a apolipoprotema(a), supuesta LPAL2
Q2TV78
protema estimulante MSTP9 de macrofagos supuesta MST1P9
Q5JQD4
Peptido YY-3 supuesto PYY3
Q5R387
Fosfolipasa A" secretora del grupo IIC inactivo supuesta PLA2G2C
Q5VSP4
Protema 1 similar a lipocalina 1 supuesta LCN1P1
Q5W188
Protema CST9LP1 similar a cistatina 9 supuesta CST9LP1
Q6UXR4
Serpina AA13 supuesta SERPINA13P
Q86SH4
Protema prionica espedfica de testmulo supuesta PRNT
Q86YQ2
Laterina supuesta LISTON
Q8IVG9
Peptido de humanina supuesto MT-RNR2
Q8NHM4
Tripsina-6 Supuesta TRY6
Q8NHW4
Similar a quimiocina 4 motivo C-C CCL4L2
Q9H7L2
Protema KIR3DX1 similar a receptor similar a inmunoglobulina de celulas asesinas supuesta KIR3DX1
Q9NRI6
Peptido YY-2 supuesto PYY2
Q9UF72
Protema del gen antisentido TP73 1 supuesta TP73-AS1
Q9UKY3
Carboxilesterasa inactiva 4 supuesta CES1P1
Las ID de Uniprot expuestas en la Tabla 2 se refieren a las versiones humanas de las protemas supuestas enumeradas y las secuencias de cada una estan disponibles en la base de datos de Uniprot. Las secuencias de las protemas enumeradas tambien estan disponibles para varios animales, incluyendo varios mairnferos y animales de interes veterinario o industrial. Por consiguiente, en algunas realizaciones, las composiciones de la invencion proporcionan la administracion de uno o mas ARNm que codifican una Protema de Fusion Terapeutica, en donde la protema terapeutica se elige de homologos de mai^eras u homologos de un animal de interes veterinario o industrial de una protema enumerada en la Tabla 2 para el tratamiento de enfermedades definidas en las reivindicaciones. En algunas realizaciones, los homologos de mamfferos se eligen de homologos de raton, rata, hamster, jerbo, caballo, cerdo, vaca, llama, alpaca, vison, perro, gato, huron, oveja, cabra o camello. En algunas realizaciones, el animal de interes veterinario o industrial se elige de los mamfferos enumerados anteriormente y/o pollo, pato, pavo, salmon, bagre o tilapia.
En algunas realizaciones, la protema terapeutica se elige de las protemas lisosomales y relacionadas enumeradas en la Tabla 3; portanto, las composiciones de la invencion pueden comprender un ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica, en donde la protema terapeutica es una enumerada en la Tabla 3 (o un homologo de las mismas, como se trata mas adelante) para el tratamiento de enfermedades definidas en las reivindicaciones, junto con otros componentes expuestos en la presente
_________________Tabla 3: Protemas lisosomales y relacionadas.__________________
a-fucosidasa
a-galactosidasa
a-glucosidasa
a-iduronidasa
a-manosidasa
a-N-acetilgalactosammidasa (a-galactosidasa B)
p-galactosidasa
p-glucuronidasa
p-hexosaminidasa
p-manosidasa
5
10
15
20
25
30
35
40
45
50
55
60
65
_______________________________(continuacion)_______________________________
3-hidroxi-3-metilglutaril-CoA (HMG-CoA) liasa 3-metilcrotonil-CoA carboxilasa
3-O-sulfogalactosol cerebroside sulfatasa (arilsulfatasa A)
acetil-CoA transferasa
alfa-glucosidasa acida
ceramidasa acida
lipasa acida
fosfatasa acida
esfingomielinasa acida
alfa-galactosidasa A
arilsulfatasa A
beta-galactosidasa
beta-glucocerebrosidasa
beta-hexosaminidasa
biotinidasa
catepsina A
catepsina K
CLN3____________________________________________________________________
CLN5____________________________________________________________________
CLN6____________________________________________________________________
CLN8____________________________________________________________________
CLN9____________________________________________________________________
transportador de cistina (cistinosina)
Subunidad beta3A de protema citosolica del complejo adaptador protema-3, AP3
enzima generadora de formilglicina (FGE)
galactocerebrosidasa
galactosa-1-fosfato uridiltransferasa (GALT)
galactosa 6-sulfato sulfatasa (tambien conocida como N-acetilgalactosamina-6-sulfatasa)
glucocerebrosidasa
glucuronato sulfatasa
glucuronidasa
enzimas de escision de glicoprotemas enzimas de escision de glicosaminoglicanos glicosilasparaginasa (aspartilglucosaminidasa)
GM2-AP__________________________________________________________________
Heparina-alfa-glucosaminida N-acetiltransferasa (HGSNAT, TMEM76)
Heparan sulfatasa
hexosaminidasa A proteasas lisosomales metilmalonil-CoA mutasa
hialuronidasa
Iduronato sulfatasa
LAMP-2__________________________________________________________________
a-manosidasa lisosomal p40 lisosomal(C2orf18)
Dominio de la superfamilia de facilitadores principal que contiene 8 protemas (MFSD8 o
CLN7)____________________________________________________________________
N-acetilgalactosamina 4-sulfatasa N-acetil glucosamina 6-sulfatasa N-acetil glucosaminidasa N-acetilglucosamina-1-fosfato transferasa
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_______________________________(continuacion)
NPC1______________________________________
NPC2_____________________________________
palmitoil-protema tioesterasa palmitoil-protema tioesterasa (CLN1)
Saposina A (protema activadora de esfingoKpido A)
Saposina B (protema activadora de esfingolfpido B)
Saposina C (protema activadora del esfingolfpido C)
Saposina D (protema activadora de esfingolfpido D)
transportador de acido sialico (sialina)
sialidasa
sialina
sulfatasa
Protema transmembrana 74 (TMEM74) tripeptidil-peptidasa tripeptidil-peptidasa I (CLN2) UDP-N-acetilglucosamina-fosfotransferasa
La informacion sobre las protemas lisosomicas esta disponible en Lubke et al., "Proteomics of the Lysosome", Biochim Biophys Acta. (2009) 1793: 625-635. En algunas realizaciones, las protemas enumeradas en la Tabla 3 y codificadas por el ARNm en las composiciones de la invencion es una protema humana. Las secuencias de las protemas enumeradas tambien estan disponibles para varios animales, incluyendo varios marnfferos y animales de interes veterinario o industrial. Por consiguiente, en algunas realizaciones, las composiciones de la invencion proporcionan la administracion de uno o mas ARNm que codifican una Protema de Fusion Terapeutica, en donde la protema terapeutica elegida de homologos de mairnferos u homologos de un animal de interes veterinario o industrial de una protema enumerada en la Tabla 3 para el tratamiento de las enfermedades definidas en las reivindicaciones. En algunas realizaciones, los homologos de mamfferos se eligen de homologos de raton, rata, hamster, jerbo, caballo, cerdo, vaca, llama, alpaca, vison, perro, gato, huron, oveja, cabra o camello. En algunas realizaciones, el animal de interes veterinario o industrial se elige de los mamfferos enumerados anteriormente y/o pollo, pato, pavo, salmon, bagre otilapia
En algunas realizaciones, la protema terapeutica es eritropoyetina, a-galactosidasa, receptor de lipoprotemas de baja densidad (LDLR), Factor VIII, Factor IX, a-L-iduronidasa, iduronato sulfatasa, heparina-N- sulfatasa, a-N-acetilglucosaminidasa, galactosa 6-sulfatasa, lipasa de acido lisosomal, arilsulfatasa-A, IL-12, IL-23, a-galactosidasa, eritropoyetina (EPO), a-1-antitripsina (A1AT), folistatina, glucocerebrosidasa, interferon-p, hemoglobina, colageno tipo 4 (COL4A5), arginosuccinato sintasa (AS), metilmalonil-coA mutasa (MCM), propionil- coA carboxilasa (PCC), fenilalanina hidroxilasa (PAH), apolipoprotema E (APOE), glucosa-6-fosfatasa (G6P), hormona de crecimiento humana (hGH), urato oxidasa, o factor estimulante de colonias de granulocitos (GCSF).
Polipeptidos Capaces de Unirse a un Receptor Fc
Las Protemas de Fusion Terapeuticas de la invencion comprenden una protema terapeutica fusionada con un polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc. En algunas realizaciones, el polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc comprende una porcion de una region constante de inmunoglobulina que incluye un fragmento Fc. Un fragmento Fc puede comprender los dominios CH2 y CH3 de una inmunoglobulina y la region bisagra de la inmunoglobulina. La inmunoglobulina puede ser IgG, IgM, IgA, IgD o IgE. En ciertas realizaciones, el polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc comprende un fragmento Fc de una IgG1, una IgG2, una IgG3 o una IgG4. En una realizacion, la inmunoglobulina es un fragmento Fc de una IgG1. En una realizacion, la inmunoglobulina es un fragmento Fc de una IgG2.
La porcion de una region constante de inmunoglobulina puede incluir una variante de Fc. "Variante de Fc" se refiere a un polipeptido o secuencia de aminoacidos que se modifica a partir de un Fc nativo pero que aun comprende un sitio de union para un receptor Fc, como, por ejemplo, el FcRn. (Ver, por ejemplo, WO 97/34631). "Fc nativo" se refiere a un Fc que no se ha modificado. La WO 96/32478 describe variantes de Fc ejemplares, asf como la interaccion con un receptor Fc. Por tanto, el termino "variante de Fc" incluye un polipeptido o secuencia de aminoacidos que se humaniza a partir de un Fc nativo no humano. Ademas, un Fc nativo comprende sitios que pueden y/o deben eliminarse ya que proporcionan caractensticas estructurales o actividad biologica que no se requieren para las moleculas de fusion de la presente invencion. Por tanto, la variante de Fc puede comprender un polipeptido o secuencia de aminoacidos que carece de uno o mas sitios Fc nativos o residuos que afectan o estan involucrados en (1) la formacion de enlaces disulfuro, (2) incompatibilidad con una celula objetivo (3) heterogeneidad
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N-terminal tras la expresion en una celula objetivo, (4) glicosilacion, (5) interaccion con el complemento, (6) union a un receptor Fc distinto de FcRn, o (7) citotoxicidad celular dependiente de anticuerpos (ADCC).
En algunas realizaciones, el polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc se une al receptor Fc neonatal, FcRn. El FcRn es activo en el tejido epitelial adulto y se expresa en la luz de los intestinos, las vfas respiratorias pulmonares, las superficies nasales, las superficies vaginales, las superficies de colon y rectales (Patente de Estados Unidos 6.485.726). Las protemas quimericas compuestas de los companeros de union a FcRn (por ejemplo, fragmentos de IgG-Fc) pueden ser efectivamente transportadas a traves de las barreras epiteliales por FcRn, proporcionando de este modo un medio no invasivo para administrar la protema terapeutica deseada. Adicionalmente, las Protemas de Fusion Terapeutica que comprenden un companero de union a FcRn seran endocitadas por celulas que expresan el FcRn. Pero en lugar de marcarse para la degradacion, las protemas unidas al FcRn se reciclan nuevamente en circulacion, aumentando la vida media in vivo de estas protemas.
Por tanto, en algunas realizaciones, el polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc es un companero de union a FcRn. Un companero de union a FcRn es cualquier polipeptido, peptido o secuencia de aminoacidos que se une espedficamente al receptor FcRn con el consiguiente transporte activo por el receptor FcRn del companero de union a FcRn y cualquier protema terapeutica asociada. El receptor FcRn se ha aislado de varias especies de mairnferos, incluyendo los humanos. Las secuencias de FcRn humano, FcRn de rata y FcRn de raton son conocidas (Story et al. 1994, J. Exp. Med. 180:2377). El receptor FcRn se une a IgG (pero no a otras clases de inmunoglobulinas como IgA, IgM, IgD e IgE) a un pH relativamente bajo, transporta activamente la IgG transcelularmente en una direccion luminal a serosal, y luego libera la IgG a un pH relativamente mas alto al encontrado en los fluidos intersticiales. Se expresa en tejido epitelial adulto (Patentes de Estados Unidos 6.030.613 y 6.086.875) incluyendo epitelio pulmonar e intestinal (Israel et al. 1997, Immunology 92:69) epitelio tubular proximal renal (Kobayashi et al. 2002, Am. J. Physiol. Renal Physiol. 282:F358) asf como epitelio nasal, superficies vaginales , y superficies de arboles biliares.
Los companeros de union a FcRn utiles en las Protemas de Fusion Terapeutica en las composiciones de la invencion pueden abarcar cualquier polipeptido, peptido o secuencia de aminoacidos que pueda unirse espedficamente por el receptor FcRn, incluyendo la IgG completa, el fragmento Fc de IgG, y otros fragmentos que incluyen la region de union completa del receptor FcRn. La region de la porcion Fc de IgG que se une al receptor FcRn se ha descrito en base a la cristalograffa de rayos X (Burmeister et al. 1994, Nature 372:379).). El area de contacto principal de Fc con FcRn esta cerca de la union de los dominios CH2 y CH3. Los contactos Fc-FcRn estan todos dentro de una sola cadena pesada de Ig. Los companeros de union a FcRn incluyen IgG completa, el fragmento Fc de IgG y otros fragmentos de IgG que incluyen la region de union completa de FcRn. Los sitios de contacto principales incluyen los residuos de aminoacidos 248, 250-257, 272, 285, 288, 290-291, 308-311 y 314 del dominio CH2 y los residuos de aminoacidos 385-387, 428 y 433-436 del dominio CH3. Las referencias hechas a la numeracion de aminoacidos de inmunoglobulinas o fragmentos de inmunoglobulina, o regiones, se basan todos en Kabat et al. 1991, Sequencesof Proteins of Immunological Interest, U.S. Department of Public Health, Bethesda, MD-
La region Fc de IgG se puede modificar de acuerdo con procedimientos bien reconocidos, como mutagenesis dirigida al sitio y similares, para producir fragmentos de IgG o Fc modificados o porciones de los mismos que se uniran por FcRn. Tales modificaciones incluyen modificaciones alejadas de los sitios de contacto de FcRn, asf como modificaciones dentro de los sitios de contacto que preservan o incluso mejoran la union con FcRn. Por ejemplo, los siguientes residuos de aminoacidos individuales en IgG1 Fc (Fcy1) humana pueden sustituirse sin una perdida significativa de la afinidad de union de Fc por FcRn: P238A, S239A, K246A, K248A, D249A, M252A, T256A, E258A, T260A, D265A, S267A, H268A, E269A, D270A, E272A, L274A, N276A, Y278A, D280A, V282A,
E283A, H285A, N286A, T289A, K290A, R292A, E293A, E294A, Q295A, Y296F, N297A, S298A, Y300F, R301A,
V303A, V305A, T307A, L309A, Q311A, D312A, N315A, K317A, E318A, K320A, K322A, S324A, K326A, A327Q,
P329A, A330Q, A330S, P331A, P331S, E333A, K334A, T335A, S337A, K338A, K340A, Q342A, R344A, E345A,
Q347A, R355A, E356A, M358A, T359A, K360A, N361A, Q362A, Y373A, S375A, D376A, A378Q, E380A, E382A,
S383A, N384A, Q386A, E388A, N389A, N390A, Y391F, K392A, L398A, S400A, D401A, D413A, K414A, R416A,
Q418A, Q419A, N421A, V422A, S424A, E430A, N434A, T437A, Q438A, K439A, S440A, S444A, y K447A, donde, por ejemplo, P238A representa prolina de tipo salvaje sustituida por alanina en la posicion numero 238. Ademas de la alanina, otros aminoacidos pueden ser sustituidos por aminoacidos del tipo salvaje en las posiciones especificadas anteriormente. Las mutaciones pueden introducirse individualmente en Fc, dando lugar a mas de cien companeros de union a FcRn distintas de la Fc nativa. Adicionalmente, combinaciones de dos, tres, o mas de estar mutaciones individuales pueden introducirse juntas, dando lugar a cientos mas de companeros de union a FcRn.
Ciertas de las mutaciones anteriores pueden conferir nueva funcionalidad al companero de union a FcRn. Por ejemplo, una realizacion incorpora N297A, eliminando un sitio de N-glicosilacion altamente conservado. El efecto de esta mutacion es reducir la inmunogenicidad, mejorando de este modo la vida media en circulacion del companero de union a FcRn, y haciendo que el companero de union a FcRn sea incapaz de unirse a FcyRI, FcyRiIA, FcyRIIB y FcyRIIIA, sin comprometer la afinidad para FcRn (Routledge et al. 1995, Transplantation 60:847; Friend et al. 1999, Transplantation 68:1632; Shields et al. 1995, J. Biol. Chem. 276:6591). Adicionalmente, por lo menos tres receptores gamma Fc humanos parecen reconocer un sitio de union en IgG dentro de la region bisagra
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inferior, generalmente los aminoacidos 234-237. Por lo tanto, otro ejemplo de nueva funcionalidad y disminucion de la inmunogenicidad potencial puede surgir de las mutaciones de esta region, como por ejemplo reemplazando los aminoacidos 233-236 de IgG1 humana "ELLG" a la secuencia correspondiente de IgG2 "PVA" (con una delecion de aminoacidos). Se ha demostrado que FcyRI, FcyRII y FcyRIII, que median varias funciones efectoras no se uniran a IgG1 cuando se hayan introducido tales mutaciones (Ward y Ghetie 1995, Therapeutic Immunology 2:77 y Armour et al. 1999, Eur. J. Immunol. 29: 2613). Como un ejemplo adicional de la nueva funcionalidad que surge de las mutaciones descritas anteriormente, la afinidad por FcRn puede incrementarse mas alla de la del tipo salvaje en algunos casos. Esta afinidad aumentada puede reflejar una tasa "on" aumentada, una tasa "off"' disminuida o una tasa "on" y una tasa "off" disminuidas. Las mutaciones que se cree que imparten una afinidad aumentada para FcRn incluyen T256A, T307A, E380A, y N434A (Shields et al. 2001, J. Biol. Chem. 276: 6591).
En una realizacion, el companero de union a FcRn es un polipeptido que incluye la secuencia PKNSSMISNTP y opcionalmente que incluye ademas una secuencia seleccionada de HQSLGTq, HQNLSDGK, HQNISDGK, o VISSHLGQ (Ver, Patente de Estados Unidos 5.739.277).
Conectores Opcionales
La Protema de Fusion Terapeutica codificada por el ARNm en las composiciones de la invencion puede comprender opcionalmente una o mas secuencias conectoras. En ciertas realizaciones, el conector puede comprender 1-5 aminoacidos, 1-10 aminoacidos, 1-15 aminoacidos, 1-20 aminoacidos, 10-50 aminoacidos, 50-100 aminoacidos o 100-200 aminoacidos . En una realizacion, el conector puede comprender solamente residuos de glicina. En otras realizaciones, el conector puede comprender la secuencia (GGS)n, en donde n es 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 o 10. Los ejemplos de conectores adecuados incluyen, pero no estan limitados a, GGG,SGGSGGS, GGSGGSGGSGGSGGG, GGSGGSGGSGGSGGSGGS. En algunas realizaciones, el conector esta codificado por la secuencia ccc aag agc ugu gac aag acc cac acc ugc ccu ccg ugu ccc.
Vehiculo de Transferencia
La administracion del ARNm en las composiciones de la invencion se facilita por la inclusion de un portador adecuado. En ciertas realizaciones, el portador se selecciona en base a su capacidad para facilitar la transfeccion de una celula objetivo con uno o mas ARNm. Como se usa en la presente, los terminos "transfecto" o "transfeccion" significan la introduccion intracelular de un ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica en una celula, y preferiblemente en una celula objetivo. El ARNm introducido puede mantenerse de forma estable o transitoria en la celula objetivo. El termino "eficiencia de transfeccion" se refiere a la cantidad relativa de ARNm captada por la celula objetivo que se somete a transfeccion. En la practica, la eficiencia de la transfeccion puede estimarse por la cantidad de un producto de acido nucleico informador expresado por las celulas objetivo despues de la transfeccion. EL ARNm en las composiciones de la invencion se introduce en las celulas objetivo con vehmulo de transferencia.
En ciertas realizaciones, los portadores empleados en las composiciones de la invencion pueden comprender una vesmula liposomal, pero tambien se divulgan en la presente otros medios para facilitar la transferencia de un ARNm a celulas y/o tejidos objetivo. Las realizaciones preferidas incluyen composiciones con altas eficacias de transfeccion y, en particular, aquellas composiciones que minimizan los efectos adversos que estan mediados por la transfeccion de celulas no objetivo. Las composiciones de la presente invencion que demuestran eficacias de transfeccion altas mejoran la probabilidad de que se administren las dosificaciones apropiadas del ARNm a la celula objetivo, a la vez que minimizan los efectos adversos sistemicos potenciales. En una realizacion de la presente invencion, los vehmulos de transferencia de la presente invencion son capaces de administrar secuencias de ARNm grande (por ejemplo, ARNm de un tamano que vana de 0,2 kilobases (kb) a 10 kb o mas, por ejemplo, ARNm de un tamano mayor de o igual a 0,2 kb, 0,5 kb, 1 kb, 1,5 kb, 2 kb, 3 kb, 4 kb, o 4,5 kb, y o que tiene un tamano de hasta 5 kb, 5,5 kb, 6 kb, 7 kb, 8 kb, 9 kb, o 10 kb).
El ARNm puede formularse con uno o mas reactivos aceptables, que proporcionan un vehmulo para administrar dicho ARNm a celulas objetivo. Los reactivos apropiados se seleccionan generalmente con respecto a una serie de factores, que incluyen, entre otras cosas, las propiedades biologicas o qmmicas del ARNm, la via de administracion pretendida, el entorno biologico previsto al que se expondra dicho ARNm y las propiedades espedficas de las celulas objetivo pretendidas. En algunas realizaciones, los vehmulos de transferencia, como los liposomas, encapsulan el ARNm sin comprometer la actividad biologica. En algunas realizaciones, el vehmulo de transferencia demuestra una union preferencial y/o sustancial a una celula objetivo con respecto a las celulas no objetivo. En una realizacion preferida, el vehmulo de transferencia administra sus contenidos a la celula objetivo de tal manera que el ARNm se administra al compartimento subcelular apropiado, como el citoplasma.
En algunas realizaciones, las composiciones de la invencion emplean un portador polimerico solo o en combinacion con otros portadores, concretamente, polietilenimina (PEI), por ejemplo, PEI ramificado (25 kDa). Alternativamente, el portador es una nanopartmula lipfdica.
Nanoparticulas Lipidicas
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En ciertas realizaciones, el vehmulo de transferencia en las composiciones de la invencion es un vehmulo de transferencia liposomal, por ejemplo, una nanopartmula lipfdica o una nanopartmula lipidoide. En una realizacion, el vehmulo de transferencia puede seleccionarse y/o prepararse para optimizar la administracion del ARNm a una celula objetivo.
Se sabe que las nanopartmulas lip^dicas liposomales son particularmente para su uso como vehmulos de transferencia de compuestos diagnosticos o terapeuticos in vivo (Lasic, Trends Biotechnol., 16: 307-321, 1998; Drummond et al., Pharmacol. Rev., 51: 691-743, 1999) y se caracterizan habitualmente como vesmulas microscopicas que tienen un espacio acuoso interior secuestrado de un medio exterior por una membrana de una o mas bicapas. Las membranas bicapa de los liposomas estan formadas tipicamente por moleculas anfifflicas, como los lfpidos de origen sintetico o natural que comprenden dominios hidrofilos e hidrofobos espacialmente separados (Lasic, Trends Biotechnol., 16: 307-321, 1998). Las membranas bicapa de los liposomas tambien pueden formarse por polfmeros anfifflicos y surfactantes (por ejemplo, polimerosomas, niosomas, etc.).
En el contexto de la presente invencion, un vehmulo de transferencia liposomal sirve tfpicamente para transportar el ARNm a la celula objetivo. Para los propositos de la presente invencion, los vehmulos de transferencia liposomal se preparan para contener ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica. El proceso de incorporacion del ARNm deseado en un liposoma se denomina "carga" y se describe en Lasic, et al., FEBS Lett., 312: 255-258, 1992. Los acidos nucleicos incorporados en liposomas pueden estar total o parcialmente localizados en el espacio interior del liposoma, dentro de la membrana de bicapa del liposoma, o asociados con la superficie exterior de la membrana del liposoma. La incorporacion de un acido nucleico en liposomas tambien se denomina en la presente "encapsulacion", en donde el acido nucleico esta completamente contenido dentro del espacio interior del liposoma.
El proposito de incorporar un ARNm en un vehmulo de transferencia, como un liposoma, es a menudo proteger el acido nucleico de un entorno que puede contener enzimas o sustancias qmmicas que degradan los acidos nucleicos y/o sistemas o receptores que provocan la excrecion rapida de acidos nucleicos. Por consiguiente, en una realizacion preferida de la presente invencion, el vehmulo de transferencia seleccionado es capaz de mejorar la estabilidad del ARNm contenido en el mismo. El liposoma puede permitir que el ARNm encapsulado alcance la celula objetivo y/o puede permitir preferentemente que el ARNm encapsulado alcance la celula objetivo, o alternativamente, limitar la administracion de dicho ARNm a otros sitios o celulas donde la presencia del ARNm administrado puede ser inutil o indeseable. Ademas, incorporar el ARNm en un vehmulo de transferencia, como por ejemplo, un liposoma cationico, tambien facilita la administracion de tal ARNm en la celula objetivo.
Idealmente, los vehmulos de transferencia liposomal se preparan para encapsular el ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica de tal manera que las composiciones demuestren alta eficacia de transfeccion y estabilidad mejorada. Aunque los liposomas pueden facilitar la introduccion de acidos nucleicos en las celulas objetivo, la adicion de policationes (por ejemplo, poli L-lisina y protamina), como un copolfmero puede facilitar, y en algunos casos mejorar notablemente, la eficiencia de transfeccion de varios tipos de liposomas cationicos por 2-28 veces en una serie de lmeas celulares tanto in vitro como in vivo. (Ver N.J. Caplen, et al., Gene Ther. 1995; 2: 603; S. Li, et al., Gene Ther. 1997; 4, 891). Por tanto, en ciertas realizaciones de la presente invencion, el vehmulo de transferencia se formula como una nanopartmula lipfdica.
En ciertas realizaciones, el ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica se combina con una mezcla de lfpidos multi-componentes de proporciones variables que emplean uno o mas lfpidos cationicos, lfpidos no cationicos, lfpidos auxiliares y lfpidos PEG-modificados o PEGilados disenados para encapsular varios materiales a base de acidos nucleicos. Como se usa en la presente, la frase "lfpido cationico" se refiere a cualquiera de una serie de especies de lfpidos que llevan una carga positiva neta a un pH seleccionado, como el pH fisiologico. Varios lfpidos cationicos se han descrito en la bibliograffa, muchos de los cuales estan comercialmente disponibles.
Los lfpidos cationicos pueden incluir, pero no estan limitados a, ALNY-100 ((3aR,5s,6aS)-N,N-dimetil-2,2-di ((9Z,12Z)-octadeca-9,12-dienil)tetrahidro-3aH-ciclopenta[d][1,3]dioxol-5-amina)), DoDaP (1,2-dioleil-3-dimetilamonio propano), HGT4003 (WO 2012/170889), HGT5000 (Solicitud de Patente Provisional de Estados Unidos N° 61/617.468) o HGT5001 (cis o trans) (Solicitud de Patente Provisional N° 61/617.468), lipidoides de aminoalcohol como los divulgados en la WO2010/053572, DOTAP (1,2-dioleil-3-trimetilamonio propano), DOTMA (1,2-di-O- octadecenil-3-trimetilamonio propano), DLinDMA (1,2-dilinoleiloxi-N,N-dimetil-3-aminopropano))
(aminopropane)(Heyes, et al., J. Contr. Rel. 107:276-287(2005)), DLin-KC2-DMA (Semple, et al., Nature Biotech. 28:172-176 (2010)), C12-200 (Love, et al., Proc. Nat'1. Acad. Sci. 107:1864-1869(201)).
En algunas realizaciones, el DOTMA puede formularse solo o puede combinarse con el lfpido neutro, DOPE (dioleoilfosfatidil-etanolamina), u otros lfpidos cationicos o no cationicos en un vehmulo de transferencia liposomal o una nanopartmula lipfdica, y tales liposomas pueden usarse para mejorar la administracion de acidos nucleicos en las celulas objetivo. Otros lfpidos cationicos adecuados incluyen, por ejemplo, DOGS (5-carboxispermil glicinadioctadecilamida), DOSPA (2,3-dioleiloxi-N-[2(espermina-carboxamido)etil]-N,N-dimetil-1-propanaminio) (Behr
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et al. al. Proc. Nat'l Acad. Sci. 86, 6982 (1989); Patente de Estados Unidos N° 5.171.678; Patente de Estados Unidos N° 5.334.761), DOTAP (1,2-dioleoil-3-trimetilamonio-propano). Los l^pidos cationicos contemplados tambien incluyen DSDMA (1,2-diesteariloxi-N,N-dimetil-3-aminopropano, DODmA (1,2-dioleiloxi-N,N-dimetil-3-aminopropano), DLenDMA (1,2-dilinoleniloxi) N,N-dimetil-3-aminopropano), DODAC (cloruro de N-dioleil-N,N-dimetilamonio), DDAB (bromuro de N,N-diestearil-N,N-dimetilamonio), DMRIE bromuro de (N-(1,2-dimiristiloxiprop-3-il)-N,N-dimetil-N- hidroxietil amonio), CLinDMA (3-dimetilamino-2-(colest-5-en-3-beta-oxibutan-4-oxi)-1-(cis,cis-9,12- octadecadienoxi)propano), CpLinDMA (2- [5'-(colest-5-en-3-beta-oxi) -3'-oxapentoxi) -3-dimetil-1- (cis,cis-9',1-2'- octadecadienoxi) propano), DMOBA (N, N-dimetil-3,4-dioleiloxibencilamina), DOcarbDAP (1,2-N,N-diolilcarbamil-3- dimetilaminopropano), DLinDAP (2,3-dilinoleoiloxi-N,N-dimetilpropilamina), DLincarbDAP (1,2-dilinoleoilcarbamil-3- dimetilaminopropano, DLin-K-DMA (2,2-dilinoleil-4-dimetilaminometil-[1,3]-dioxolano), DLin-K-XTC2-DMA (2,2- dilinoleil-4)-dimetilaminoetil-[1,3]-dioxolano), o mezclas de los mismos
Los lfpidos biodegradables espedficos adecuados para su uso en las composiciones de la invencion
incluyen:
imagen1
y sus sales.
Lfpidos cationicos espedficos adicionales para su uso en las composiciones de la invencion son XTC (2,2- Dilinoleil-4-dimetilaminoetil-[1,3]-dioxolano) y, MC3 (((6Z,9Z,28Z,3IZ)-heptatriaconta-6,9,28,31-tetraen-19-il 4- (dimetilamino)butanoato):
imagen2
ambos de los cuales se describen en detalle en la US 20100267806.
Otro lfpido cationico que puede usarse en las composiciones de la invencion es NC98-5 (4,7,13-tris(3-oxo- 3- (undecilamino)propil)-N1,N16-diundecil-4,7,10,13-tetraazahexadecano-1,16-diamida):
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que se describe en la WO06138380A2 .
Los Upidos auxiliares adecuados incluyen, pero no estan limitados a, DSPC (1,2-diestearoil-sn-glicero-3- fosfocolina), DPPC (1,2-dipalmitoil-sn-glicero-3-fosfocolina), DOPE (1,2- dioleil-sn-glicero-3-fosfoetanolamina), DPPE (1,2-dipalmitoil-sn-glicero-3-fosfoetanolamina), DMPE (1,2-dimiristoil-sn-glicero-3-fosfoetanolamina), DOPG (2- dioleoil-sn-glicero-3-fosfo (1'-rac-glicerol), y colesterol. Se pueden usar Kpidos cationicos a base de colesterol, ya sea solos o en combinacion con otros Kpidos cationicos o no cationicos. Los lfpidos cationicos a base de colesterol adecuados incluyen, por ejemplo, DC-Chol (N,N-dimetil-N-etilcarboxamidocolesterol), 1,4-bis(3-N-oilamino- propil)piperazina (Gao, et al. Biochem. Biophys. Res. Comm. 179, 280 (1991); Wolf et al. BioTechniques 23, 139 (1997); Patente de Estados Unidos N° 5.744.335), o ICE (3S, 10R, 13R, 17R)-10, 13-dimetil-17-((R) -6-metilheptan- 2-il) -2, 3, 4, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17-tetradecahidro-1H-ciclopenta[a]fenantren-3-il 3 (1H-imidazol-4- il)propanoato) (WO/2011/068810).
Los l^pidos no cationicos tambien pueden usarse en las composiciones de la invencion. Como se usa en la presente, la frase "lfpido no cationico" se refiere a cualquier lfpido neutro, zwitterionico o anionico. '^pido anionico" se refiere a cualquiera de una serie de especies de lfpidos que llevan una carga negativa neta a un pH seleccionado, como pH fisiologico. Los lfpidos no cationicos incluyen, pero no estan limitados a, DSPC (diestaroilfosfatidil-colina), DOPC (dioleoilfosfatidilcolina), DPPC (dipalmitoilfosfatidilcolina), DOPG (dioleoilfosfatidilglicerol), DPpG
(dipalmitoilfosfatidilglicerol), DOPE (dioleoilfosfatidiletanolamina), POPC (palmitoiloleoil-fosfatidilcolina), POPE (palmitoiloleoil-fosfatidiletanolamina), DOPE-mal (dioleoil-fosfatidiletanolamina) 4-(N-maleimidometil)-ciclohexano-1- carboxilato), DDPE (dipalmitoil fosfatidil etanolamina), DMPE (dimiristoil-fosfoetanolamina), DSPE
(distearoilfosfatidiletanolamina), SOPE (16-O-monometil PE, 16-O-dimetil Pe, 18-1-trans PE, 1-stearoil-2-oleoil- fosfatidietanolamina, colesterol o una mezcla de los mimos. Tales lfpidos no cationicos pueden usarse solos, pero se usan preferiblemente en combinacion con otros excipientes, por ejemplo, lfpidos cationicos. Cuando se usan en combinacion con un lfpido cationico, el lfpido no cationico puede comprender una relacion molar del 5% a aproximadamente el 90%, o preferiblemente de aproximadamente el 10% a aproximadamente el 70% del total de lfpidos presentes en el vehuculo de transferencia.
Los fosfolfpidos modificados con polietilenglicol (PEG) y los lfpidos derivatizados para su uso en formulaciones de nanopartfculas incluyen, pero no estan limitados a, una cadena de poli(etilen)glicol de hasta 5 kDa de longitud unida covalentemente a un lfpido con un cadena(s) de alquilo de C6-C20de longitud, ceramidas derivadas de DMG-PEG2K, PEG-DSG, PEG-DMG y PEG (PEG-CEr), incluyendo N-octanoil-Esfingosina-1- [SuccinilMmetoxi Polietilenglicol) -2000], (ceramida C8 PEG-2000)). Se contempla el uso de lfpidos PEG-modificados para usar las composiciones de la invencion, ya sea solos o preferiblemente en combinacion con otros lfpidos que juntos comprenden el vehfculo de transferencia (por ejemplo, una nanopartfcula lipfdica). La adicion de tales componentes puede prevenir la agregacion compleja y tambien puede proporcionar un medio para aumentar la vida util de la circulacion y aumentar la administracion de la composicion de acido lipfdico-nucleico a la celula objetivo, (Klibanov et al. (1990) FEBS Letters, 268 (1): 235-237), o pueden seleccionarse para intercambiar rapidamente fuera de la formulacion in vivo (ver Patente de Estado Unidos N° 5.885.613). Lfpidos intercambiables particularmente utiles son PEG-ceramidas que tienen cadenas acilo mas cortas (por ejemplo, C14 o C18). El fosfolipido modificado con PEG y los lfpidos derivados de la presente invencion pueden comprender una relacion molar de aproximadamente el 0% a aproximadamente el 20%, de aproximadamente el 0,5% a aproximadamente el 20%, de aproximadamente el 1% a aproximadamente el 15%, de aproximadamente el 4% a aproximadamente el 10%, o de aproximadamente el 2% del total de lfpidos presentes en el vehuculo de transferencia liposomal.
Ademas, varios reactivos estan disponibles comercialmente para mejorar la eficacia de la transfeccion. Los ejemplos adecuados incluyen LIPOFECTlN (DOTMA:DOPE) (Invitrogen, Carlsbad, California), LIPOFECTAMINE
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(DOSPA:DOPE) (Invitrogen), LIPOFECTAMINE2000. (Invitrogen), FUGENE, TRANSFECTAM (DOGS), Y EFECTENO.
Preferiblemente, el vehnculo de transferencia (por ejemplo, una nanopartfcula lip^dica) se prepara combinando multiples componentes lipfdicos y/o poUmeros. Por ejemplo, un vehfculo de transferencia puede comprender C12-200, DSPC, CHOL y DMG-PEG o MC3, DSPC, chol, y DMG-PEG o C12-200, DOPE, chol, DMG- PEG2K. La seleccion de lfpidos cationicos, Kpidos no cationicos y/o Kpidos modificados con PEG que comprenden la nanopartfcula lipfdica, as^ como la relacion molar relativa de dichos Kpidos entre sf, se basa en las caractensticas de los Kpidos seleccionados. la naturaleza de las celulas objetivo deseadas, las caractensticas del ARNm que se va a administrar. Por ejemplo, un vehnculo de transferencia puede prepararse usando C12-200, DOPE, colesterol, DMG- PEG2K en una proporcion molar de 40:30:25:5; o DODAP, dOpE, colesterol, DMG-PEG2K a una relacion molar de 18:56:20:6; o HGT5000, DOPE, colesterol, DMG-PEG2K a una relacion molar de 40:20:35:5; o HGT5001, DOPE, colesterol, DMG-PEG2K a una relacion molar de 40:20:35:5; o XTC, DSPC, colesterol, PEG-DMG a una relacion molar de 57,5:7,5:31,5:3,5 o una relacion molar de 60:7,5:31:1,5; o MC3, DSPC, colesterol, PEG-DMG a una relacion molar de 50:10:38,5:1,5 o una relacion molar de 40:15:40:5; o MC3, DSPC, colesterol, PEG-DSG/GalNAc- PEGDSG a una relacion molar de 50:10:35:4,5:0,5; o ALNY-100, DSPC, colesterol, PEG-DSG.
Las consideraciones adicionales incluyen, por ejemplo, la saturacion de la cadena de alquilo, asf como el tamano, carga, pH, pKa, fusogenicidad y toxicidad de los lfpidos seleccionados. Por tanto, las relaciones molares pueden ajustarse en consecuencia. Por ejemplo, en realizaciones, el porcentaje de lfpido cationico en la nanopartfcula lipfdica puede ser mayor del 10%, mayor del 20%, mayor del 30%, mayor del 40%, mayor del 50%, mayor del 60% o mayor del 70%. El porcentaje de lfpidos no cationicos en la nanopartfcula lipfdica puede ser mayor del 5%, mayor del 10%, mayor del 20%, mayor del 30% o mayor del 40%. El porcentaje de colesterol en la nanopartfcula lipfdica puede ser mayor del 10%, mayor del 20%, mayor del 30% o mayor del 40%. El porcentaje de lfpidos PEG-modificados PEG en la nanopartfcula lipfdica puede ser mayor del 1%, mayor del 2%, mayor del 5%, mayor del 10%, o mayor del 20%.
En ciertas realizaciones preferidas, las nanopartfculas lipfdicas de la invencion comprenden por lo menos uno de los siguientes lfpidos cationicos: XTC, MC3, NC98-5, ALNY-100, C12-200, DLin-KC2-DMA, DODAP, HGT4003, ICE, HGT5000 , o HGT5001. En algunas realizaciones, el vehnculo de transferencia comprende colesterol y/o un lfpido PEG-modificado. En algunas realizaciones, los vehnculos de transferencia comprenden DMG-PEG2K.
Los vehnculos de transferencia liposomales para su uso en las composiciones de la invencion pueden prepararse mediante varias tecnicas que se conocen actualmente en la tecnica. Las vesfculas multilamelares (MLV) pueden prepararse mediante tecnicas convencionales, por ejemplo, depositando un lfpido seleccionado en la pared interior de un envase o recipiente adecuado disolviendo el lfpido en un solvente apropiado y luego evaporando el disolvente para dejar una pelfcula capa en el interior del recipiente o por secado por pulverizacion. Luego se puede anadir una fase acuosa al recipiente con un movimiento de vortice que da como resultado la formacion de MLV. Las vesfculas unilamelares (ULV) pueden entonces formarse por homogeneizacion, sonicacion o extrusion de las vesfculas multilamelares. Ademas, las vesfculas unilamelares pueden formarse mediante tecnicas de eliminacion de detergentes.
En ciertas realizaciones de esta invencion, las composiciones de la presente invencion comprenden un vehnculo de transferencia en el que el ARNm esta asociado tanto en la superficie del vehnculo de transferencia como encapsulado dentro del mismo vetnculo de transferencia. Por ejemplo, durante la preparacion de las composiciones de la presente invencion, los vehnculos de transferencia liposomal cationicos pueden asociarse con el ARNm mediante interacciones electrostaticas.
La seleccion del tamano apropiado de un vehnculo de transferencia liposomal debe tener en cuenta el sitio de la celula o tejido objetivo y en cierta medida la aplicacion para la cual se esta haciendo el liposoma. Generalmente, el tamano del vehnculo de transferencia esta dentro del intervalo de aproximadamente 25 a 250 nm, preferiblemente menos de aproximadamente 250nm, 175nm, 150nm, 125nm, 100nm, 75nm, 50nm, 25nm o 10nm.
Una variedad de metodos alternativos conocidos en la tecnica estan disponibles para dimensionar una poblacion de vehnculos de transferencia liposomal. Uno de estos metodos de dimensionamiento se describe en la Patente de Estados Unidos 4.737.323. La sonicacion de una suspension de liposomas, ya sea por sonicacion en bano o sonda, produce una reduccion de tamano progresiva hasta un ULV pequeno de menos de aproximadamente 0,05 micras de diametro. La homogeneizacion es otro metodo que se basa en la energfa de cizallamiento para fragmentar liposomas grandes en otros mas pequenos. En un procedimiento de homogeneizacion tfpico, los MLV se recirculan a traves de un homogeneizador de emulsion estandar hasta que se observan los tamanos de liposomas seleccionados, tfpicamente entre aproximadamente 0,1 y 0,5 micras. El tamano de las vesfculas liposomicas se puede determinar mediante dispersion de luz cuasi-electrica (QELS) como se describe en Bloomfield, Ann. Rev. Biophys. Bioeng., 10:421-450 (1981). El diametro de los liposomas medio puede reducirse por sonicacion de los liposomas formados. Los ciclos de sonicacion intermitentes pueden alternarse con evaluacion QELS para guiar la smtesis eficiente de liposomas.
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Celulas Objetivo
Como se usa en la presente, el termino "celula objetivo" se refiere a una celula o tejido al que se dirige o apunta una composicion de la invencion. Las celulas objetivo son celulas epiteliales encontradas en el pulmon, que contienen el receptor neonatal Fc.
Las celulas objetivo son deficientes en una protema o enzima de interes. En algunas realizaciones, las composiciones de la invencion transfectan las celulas objetivo de manera discriminatoria (es decir, no transfectan celulas no objetivo). Las composiciones de la invencion pueden prepararse para dirigirse preferentemente a celulas pulmonares.
En una realizacion, las composiciones de la invencion facilitan la produccion endogena de un sujeto de una o mas protemas y/o enzimas funcionales, y en particular la produccion de protemas y/o enzimas que demuestran menos inmunogenicidad en relacion con sus contrapartidas preparadas de forma recombinante. Tras la distribucion de tales composiciones a los tejidos objetivo y la posterior transfeccion de dichas celulas objetivo, el ARNm exogeno cargado en el vetnculo de transferencia liposomal (por ejemplo, una nanopartmula lipfdica) puede traducirse in vivo para producir una protema o enzima funcional codificada por el ARNm administrado de forma exogena (por ejemplo, una protema o enzima para la que el sujeto es deficiente). Por consiguiente, las composiciones de la presente invencion explotan la capacidad de un sujeto para traducir ARNm preparado de forma exogena o sintetica para producir una protema o enzima traducida de forma endogena, y de este modo producir (y cuando sea aplicable excretar) una protema o enzima funcional. Las protemas o enzimas expresadas o traducidas tambien pueden caracterizarse por la inclusion in vivo de modificaciones postraduccionales nativas que a menudo pueden estar ausentes en protemas o enzimas preparadas de forma recombinante, reduciendo de este modo la inmunogenicidad de la protema o enzima traducida.
La presente invencion tambien contempla la orientacion discriminatoria de celulas y tejidos objetivo por medios de seleccion tanto pasivos como activos. El fenomeno de la orientacion pasiva explota los patrones de distribucion naturales de un vetnculo de transferencia in vivo sin depender del uso de excipientes o medios adicionales para mejorar el reconocimiento del vetnculo de transferencia por las celulas objetivo.
Alternativamente, la presente invencion contempla la orientacion activa, que implica el uso de excipientes adicionales, referidos en la presente como "ligandos dirigidos" que pueden unirse (ya sea covalente o no covalentemente) al vetnculo de transferencia para fomentar la localizacion de dicho vehfculo de transferencia a ciertas celulas objetivo o tejidos objetivo. Por ejemplo, la orientacion puede estar mediada por la inclusion de uno o mas ligandos de orientacion endogenos en o sobre el vetnculo de transferencia para fomentar la distribucion a las celulas o tejidos objetivo. El reconocimiento del ligando dirigido por los tejidos objetivo facilita activamente la distribucion tisular y la captacion celular del vetnculo de transferencia y/o su contenido en las celulas y tejidos objetivo.
Como se proporciona en la presente, la composicion puede comprender un ligando capaz de mejorar la afinidad de la composicion a la celula objetivo. Los ligandos dirigidos pueden enlazarse a la bicapa exterior de la partmula lipfdica durante la formulacion o despues de la formulacion. Estos metodos son bien conocidos en la tecnica. Ademas, algunas formulaciones de partmulas lipfdicas pueden emplear polfmeros fusogenicos como PEAA, tiemagluttinina y otros lipopeptidos (ver Solicitudes de Patente de Estados Unidos N° de Serie 08/835.281 y 60/083.294) y otras caractensticas utiles para la administracion in vivo y/o intracelular. En algunas otras realizaciones, las composiciones de la presente invencion demuestran eficacias de transfeccion mejoradas y/o demuestran selectividad mejorada tiacia celulas o tejidos objetivo de interes. Por lo tanto, se contemplan composiciones que comprenden uno o mas ligandos (por ejemplo, peptidos, aptameros, oligonucleotidos, una vitamina u otras moleculas) que son capaces de mejorar la afinidad de las composiciones y sus contenidos de acido nucleico para las celulas o tejidos objetivo. Los ligandos adecuados pueden unirse o enlazarse opcionalmente a la superficie del vetnculo de transferencia. En algunas realizaciones, el ligando dirigido puede abarcar la superficie de un vetnculo de transferencia o estar encapsulado dentro del vetnculo de transferencia.
Los ligandos adecuados se seleccionan en funcion de sus propiedades ffsicas, qmmicas o biologicas (por ejemplo, afinidad selectiva y/o reconocimiento de marcadores o caractensticas de la superficie celular objetivo). Los sitios objetivo espedficos de la celula y su correspondiente ligando dirigido pueden variar ampliamente. Los ligandos dirigidos adecuados se seleccionan de tal manera que se exploten las caractensticas unicas de una celula objetivo, permitiendo por tanto que la composicion discrimine entre celulas objetivo y no objetivo. La presentacion de tales ligandos dirigidos que se tan conjugado con fracciones presentes en el vetnculo de transferencia (por ejemplo, una nanopartmula lipfdica) facilita, por lo tanto, el reconocimiento y la captacion de las composiciones de la presente invencion en celulas y tejidos objetivo. Los ejemplos de ligandos dirigidos adecuados incluyen uno o mas peptidos, protemas, aptameros, vitaminas y oligonucleotidos.
Metodos de administracion y tratamiento.
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Como se usa en la presente, el termino "sujeto" se refiere a cualquier animal (por ejemplo, un mairnfero), incluyendo, pero no limitado a, humanos, primates no humanos, roedores, y similares, a los que se administran las composiciones de la presente invencion. ^picamente, los terminos "sujeto" y "paciente" se usan indistintamente en la presente en referencia a un sujeto humano.
Las composiciones de la invencion proporcionan la administracion de ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica para tratar una serie de trastornos. En algunas realizaciones, las composiciones de la presente invencion son adecuadas para el tratamiento de enfermedades o trastornos relacionados con la deficiencia de protemas y/o enzimas que son excretadas o secretadas por la celula objetivo al fluido extracelular circundante (por ejemplo, ARNm que codifica hormonas y neurotransmisores). La enfermedad implica un defecto o deficiencia en una protema secretada (por ejemplo, enfermedad de Fabry o ELA). En ciertas realizaciones divulgadas, la enfermedad puede no estar provocada por un defecto o deficit en una protema secretada, pero puede beneficiarse de proporcionar una protema secretada. Por ejemplo, los smtomas de una enfermedad pueden mejorarse proporcionando las composiciones de la invencion. Los trastornos para los cuales la presente invencion es util incluyen, pero no estan limitados a, trastornos como la enfermedad de Pompe, enfermedad de Gaucher, beta- talasemia, enfermedad de Huntington; enfermedad de Parkinson; distrofias musculares (como por ejemplo, Duchenne y Becker); enfermedades de la hemofilia (como por ejemplo, hemofilia B (FIX), hemofilia A (FVIII); atrofia muscular espinal relacionada con SMN1 (SMA); esclerosis lateral amiotrofica (ELA); galactosemia relacionada con GALT; trastornos relacionados con SLC3A1 incluyendo la cistinuria; trastornos relacionados con COL4A5 que incluyen el smdrome de Alport, deficiencias de galactocerebrosidasa, adrenoleucodistrofia y adrenomielonexia ligada a X, ataxia de Friedreich, enfermedad de Pelizaeus-Merzbacher, esclerosis tuberosa relacionada con TSC1 y TSC2, smdrome de Sanfilippo B (MPS IIIB); cistinosis relacionada con CTNS; trastornos relacionados con FMR1 que incluyen el smdrome de X fragil, el smdrome de temblor/ataxia asociado con X fragil y el smdrome de insuficiencia ovarica prematura de X fragil; smdrome de Prader-Willi; telangiectasia hemorragica hereditaria (AT); enfermedad de Niemann-Pick Tipo C1; las enfermedades relacionadas con las lipofuscinosis ceroides neuronales incluyendo Lipofuscinosis Neuronal Ceroide Juvenil (JNCL), la enfermedad de Batten juvenil, la enfermedad de Santavuori- Haltia, la enfermedad de Jansky-Bielschowsky y las deficiencias de PTT-1 y TPP1; ataxia infantil relacionada con EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4 y EIF2B5 con hipomielinizacion/desaparicion de la materia blanca del sistema nervioso central; Ataxia Episodica Tipo 2 relacionada con CACNA1A y CACNB4; trastornos relacionados con MECP2, incluyendo el smdrome de Rett clasico, la encefalopatfa neonatal grave relacionada con MECP2 y el smdrome de PPM-X; smdrome de Rett atfpico relacionado con CDKL5; enfermedad de Kennedy (SBMa); arteriopatfa cerebral autosomica dominante relacionada con Notch-3 con infartos subcorticales y leucoencefalopatfa (CADASIL); trastornos convulsivos relacionados con SCN1A y SCNIB; trastornos relacionados con la polimerasa G incluyendo el smdrome de Alpers-Huttenlocher, la neuropatfa ataxica sensorial relacionada con POLG, la disartria y la oftalmoparesia, y la oftalmoplejfa externa progresiva autosomica dominante y recesiva con deleciones mitocondriales de aDN; hipoplasia suprarrenal ligada a X; agammaglobulinemia ligada a X; enfermedad de Wilson; y la enfermedad de Fabry. En algunas realizaciones, las composiciones de la invencion proporcionan la administracion in vivo de uno o mas de alfa 1 -antitripsina (A1AT), folistatina (por ejemplo, para el tratamiento de la distrofia muscular de Duchenne o deficiencia de AlAt), acido alfa-glucosidasa (GAA) (por ejemplo, para el tratamiento de la enfermedad de Pompe), glucocerebrosidasa (por ejemplo, para el tratamiento de la enfermedad de Gaucher), Interferon Beta (IFN-p), hemoglobina (por ejemplo, para el tratamiento de la beta-talasemia), Colageno Tipo 4 (COL4A5) (por ejemplo, para el tratamiento del smdrome de Alport) y factor estimulante de colonias de granulocitos (GCSF).
Las composiciones de la presente invencion pueden administrarse y dosificarse de acuerdo con la practica medica actual, teniendo en cuenta el estado clmico del sujeto, el sitio y el metodo de administracion, la programacion de la administracion, la edad, el sexo, el peso corporal del sujeto, y otros factores relevantes para los practicantes clmicos expertos en la tecnica. La "cantidad eficaz" para los propositos de la presente puede determinarse por las consideraciones relevantes que conocen los expertos las tecnicas de investigacion clmica experimental, farmacologica, clmica y medica. En algunas realizaciones, la cantidad administrada es eficaz para lograr por lo menos cierta estabilizacion, mejora o eliminacion de los smtomas y otros indicadores que se seleccionan como medidas apropiadas de progreso, regresion o mejora de la enfermedad por los expertos en la tecnica. Por ejemplo, una cantidad y regimen de dosificacion eficaz es uno que provoca por lo menos la produccion de protemas transitoria
La administracion pulmonar por aerosolizacion o nebulizacion es particularmente preferida por sus caractensticas no invasivas y por la capacidad de la Protema de Fusion Terapeutica de sertransportada facilmente a traves del epitelio pulmonar hacia el sistema circulatorio.
Los aerosoles que contienen composiciones de la presente invencion se pueden inhalar (para administracion nasal, traqueal o bronquial).
En una realizacion, las composiciones de la invencion se formulan de tal manera que sean adecuadas para la liberacion prolongada del ARNm contenido en las mismas. Tales composiciones de liberacion prolongada pueden administrarse convenientemente a un sujeto a intervalos de dosificacion prolongados. Por ejemplo, en una
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realizacion, las composiciones de la presente invencion se administran a un sujeto dos veces al dfa, diariamente o cada dos dfas. En una realizacion preferida, las composiciones de la presente invencion se administran a un sujeto dos veces a la semana, una vez a la semana, cada diez dfas, cada dos semanas, cada tres semanas, o mas preferiblemente cada cuatro semanas, una vez al mes, cada seis semanas , cada ocho semanas, cada dos meses, cada tres meses, cada cuatro meses, cada seis meses, cada ocho meses, cada nueve meses o anualmente. Tambien se contemplan composiciones y vehmulos liposomicos que se formulan para la administracion de depositos (por ejemplo, por via intramuscular, por via subcutanea, por via intravftrea) para o administrar o liberar un ARNm durante penodos de tiempo prolongados. Preferiblemente, los medios de liberacion prolongada empleados se combinan con modificaciones hechas al ARNm para mejorar la estabilidad.
Tambien se contemplan en la presente composiciones farmaceuticas liofilizadas que comprenden una o mas de las nanopartmulas liposomales descritas en la presente y metodos relacionados para el uso de tales composiciones liofilizadas como se describe, por ejemplo, en la Publicacion de Solicitud de PCT N° WO 2012/170889. Por ejemplo, las composiciones farmaceuticas liofilizadas de acuerdo con la invencion pueden reconstituirse antes de la administracion o pueden reconstituirse in vivo. Por ejemplo, una composicion farmaceutica liofilizada puede formularse en una forma de dosificacion apropiada y administrarse de tal manera que la forma de dosificacion se rehidrate con el tiempo in vivo por los fluidos corporales del individuo.
Aparatos cargados con una composicion farmaceutica.
En algunas realizaciones, las composiciones de la invencion, tales como una composicion basada en lfpidos o basada en PEI cationica que comprende un ARNm que codifica una Protema de Fusion Terapeutica, se proporcionan dentro de un aparato para la administracion al sistema respiratorio de un sujeto. El aparato puede ser, por ejemplo, un aparato de instilacion, aerosolizacion o nebulizacion. Los aparatos adecuados incluyen, por ejemplo, un nebulizador de chorro PARI Boy, un nebulizador Aeroneb®Lab, un microSprayer® o un nebulizador de malla EFlow. Alternativamente, pueden usarse inhaladores de polvo seco o aparatos de aerosolizacion como inhaladores portatiles.
Aunque se han descrito ciertos compuestos, composiciones de la presente invencion con especificidad de acuerdo con ciertas realizaciones, los siguientes ejemplos sirven solo para ilustrar los compuestos de la invencion y no se pretende que limiten la misma.
Debe entenderse que los artmulos "un" y "una" como se usan en la presente en la especificacion y en las reivindicaciones, a menos que se indique claramente lo contrario, incluyen los referentes plurales. Las descripciones que incluyen "o" entre uno o mas miembros de un grupo se consideran satisfechas si uno, mas de uno, o todos los miembros del grupo estan presentes, empleados, o son de otro modo relevantes para un producto o proceso dado a menos que se indique lo contrario o sea evidente de otra manera del contexto.
Cuando los elementos se presentan como listas (por ejemplo, en el grupo de Markush o en un formato similar), debe entenderse que tambien se divulga cada subgrupo de los elementos, y cualquier elemento puede eliminarse del grupo. Debe entenderse que, en general, cuando se hace referencia a la invencion, o aspectos de la invencion, que comprenden elementos, caractensticas, etc. particulares, ciertas realizaciones de la invencion o aspectos de la invencion consisten, o consisten esencialmente de , tales elementos, caractensticas, etc. Para propositos de simplicidad, esas realizaciones no se han expuesto espedficamente en todos los casos con tantas palabras en la presente.
EJEMPLOS
Ejemplo 1: Formulaciones de Nanopartculas de ARN Mensajero y Upidos
ARNm que codifican eritropoyetina humana - IgG Fc (SEQ ID NO: 3; FIG. 2A), alfa-galactosidasa - IgG Fc (SEQ ID NO: 4; Fig. 3), alfa-1 antitripsina humana - IgG Fc (SEQ ID NO: 5; FIG. 4), y el factor humano IX - IgG Fc (SEQ ID NO: 6; FIG. 5) se sintetizaron mediante transcripcion in vitro a partir de una plantilla de ADN plasmfdica que codifica la protema de fusion, con la posterior adicion de una estructura de caperuza 5 '(Cap1) (Fechter & Brownlee, J. Gen. Virology 86: 1239-1249 (2005)) y una cola poli(A) 3' de aproximadamente 200 nucleotidos de longitud. La longitud de la cola poli(A) se determina mediante electroforesis en gel. Regiones no traducidas 5' y 3' como se definen por las SEQ ID NO 1 y 2 (FIG. 1A y la FIG. 1B) estan presentes en cada constructo de ARNm.
Formulacion 1: Se mezclan almuotas de soluciones etanolicas de 50 mg/ml de C12-200, DOPE, Chol y DMG- PEG2K (40:30:25:5) y se diluyen con etanol hasta un volumen final de 3 ml. Por separado, se prepara una solucion tamponada acuosa (citrato 10 mM/NaCl 150 mM, pH 4,5) de ARNm a partir de un stock de 1 mg/ml. La solucion lipfdica se inyecta rapidamente en la solucion de ARNm acuosa y se agita para producir una suspension final en etanol al 20%. La suspension de nanopartmulas resultante se filtra, se diafiltra con 1x PBS (pH 7,4), se concentra y se almacena a 2-8° C.
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Formulacion 2: Se mezclan alfcuotas de soluciones etanolicas de 50 mg/ml de DODAP, DOPE, colesterol y DMG-PEG2K (18:56:20:6) y se diluyen con etanol hasta un volumen final de 3 ml. Por separado, se prepara una solucion tamponada acuosa (citrato 10 mM/NaCl 150 mM, pH 4,5) de ARNm a partir de un stock de 1 mg/ml. La solucion lipfdica se inyecta rapidamente en la solucion de ARNm acuosa y se agita para producir una suspension final en etanol al 20%. La suspension de nanoparriculas resultante se filtra, se diafiltra con 1x PBS (pH 7,4), se concentra y se almacena a 2-8° C. Concentracion final = 1,35 mg/ml de ARNm de EPO (encapsulado). Zave = 75,9 nm (Dv(50) = 57,3 nm; Dv(90) = 92,1 nm).
Formulacion 3 : Se mezclan alfcuotas de soluciones etanolicas de 50 mg/ml de HGT4003, DOPE, colesterol y DMG-PEG2K (50:25:20:5) y se diluyen con etanol hasta un volumen final de 3 ml. Por separado, se prepara una solucion acuosa tamponada (citrato 10 mM/NaCl 150 mM, pH 4,5) de ARNm a partir de un stock de 1 mg/ml. La solucion lipfdica se inyecta rapidamente en la solucion de ARNm acuosa y se agita para producir una suspension final en etanol al 20%. La suspension de nanoparriculas resultante se filtra, se diafiltra con 1x PBS (pH 7,4), se concentra y se almacena a 2-8° C.
Formulacion 4 : Se mezclan alfcuotas de soluciones etanolicas de 50 mg/ml de ICE, DOPE y DMG-PEG2K (70:25:5) y se diluyen con etanol hasta un volumen final de 3 ml. Por separado, se prepara una solucion acuosa tamponada (citrato 10 mM/NaCl 150 mM, pH 4,5) de ARNm a partir de un stock de 1 mg/ml. La solucion lipfdica se inyecta rapidamente en la solucion de ARNm acuosa y se agita para producir una suspension final en etanol al 20%. La suspension de nanoparriculas resultante se filtra, se diafiltra con 1x PBS (pH 7,4), se concentra y se almacena a 2-8° C.
Formulacion 5 : Se mezclan alfcuotas de soluciones etanolicas de 50 mg/ml de HGT5000, DOPE, colesterol y DMG-PEG2K (40:20:35:5) y se diluyen con etanol hasta un volumen final de 3 ml. Por separado, se prepara una solucion acuosa tamponada (citrato 10 mM/NaCl 150 mM, pH 4.5) de ARNm a partir de un stock de 1 mg/ml. La solucion lipfdica se inyecta rapidamente en la solucion de ARNm acuosa y se agita para producir una suspension final en etanol al 20%. La suspension de nanoparriculas resultante se filtra, se diafiltra con 1x PBS (pH 7,4), se concentra y se almacena a 2-8° C. Concentracion final = 1,82 mg/ml de ARNm de EPO (encapsulado). Zave = 105,6 nm (Dv(50) = 53,7 nm; Dv(90)= 157 nm).
Formulacion 6 : Se mezclan alfcuotas de soluciones etanolicas de 50 mg/ml de HGT5001, DOPE, colesterol y DMG-PEG2K (40:20:35:5) y se diluyen con etanol hasta un volumen final de 3 ml. Por separado, se prepara una solucion acuosa tamponada (citrato 10 mM/NaCl 150 mM, pH 4,5) de ARNm a partir de un stock de 1 mg/ml. La solucion lipfdica se inyecta rapidamente en la solucion de ARNm acuosa y se agita para producir una suspension final en etanol al 20%. La suspension de nanoparriculas resultante se filtra, se diafiltra con 1x PBS (pH 7,4), se concentra y se almacena a 2-8° C.
Ejemplo 2: Administracion de ARNm y Muestras de Recoleccion para Analisis
Los estudios se realizan usando o ratones BALB/C hembra o ratones KO (deficientes en protemas terapeuticas). Las muestras se introducen mediante o instilacion directa (MicroSprayer®) o nebulizacion (PARI Boy o Aeroneb) de la dosis respectiva de ARNm de FFL encapsulado. Los ratones se sacrifican y se perfunden con solucion salina en los puntos temporales designados.
Administracion intratraqueal. Los materiales de prueba se administran mediante una unica administracion de aerosol intratraqueal mediante de MicrosprayerTM (50 pl/animal) mientras que los animales se anestesian con inyeccion intraperitoneal de una mezcla de ketamina 50-100 mg/kg y xilacina 5-15 mg/kg.
Administracion de Nebulizacion (Aerosol). Los materiales de prueba de FFL se administran a todos los animales mediante una sola inhalacion de aerosol mediante un nebulizador Aeroneb® Lab (volumen de dosis nominal de hasta 8 ml/grupo). El material de prueba se administra una caja que contiene el grupo de animales completo (n = 4) y se conecta al sistema de flujo de oxfgeno y depurador.
Eutanasia. Los animales se someten a eutanasia por asfixia con CO2 en los tiempos representativos despues de la administracion de la dosis (± 5%), seguidos de toracotoirna y exsanguinaciones. La sangre completa (volumen maximo obtenible) se recoge mediante puncion cardfaca.
Perfusion. Despues de la exanguinacion, los animales se someten a perfusion cardfaca con solucion salina. Brevemente, la perfusion intracardfaca corporal completa se realiza mediante insertando una aguja de calibre 23/21 unida a una jeringuilla de 10 ml que contiene solucion salina en la luz del ventriculo izquierdo para la perfusion. La auricula derecha se corta para proporcionar una salida de drenaje para la perfusion. Se aplica una presion suave y constante al embolo para perfundir al animal despues de que la aguja se haya colocado en el corazon. El flujo adecuado de la solucion de lavado se garantiza cuando el perfundido saliente fluye de forma transparente (sin sangre visible), indicando que el cuerpo esta saturado de solucion de lavado y el procedimiento ha finalizado.
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Recoleccion de tejidos. Despues de la perfusion, se recolectan el hngado, los pulmones (derecho e izquierdo) y el bazo de cada animal, se congelan instantaneamente y se almacenan a -80° C o se almacenan en formalina tamponada neutra al 10% para su analisis.
Aislamiento de suero para analisis. Se extrae sangre completa (volumen maximo obtenible) de animales sometidos a eutanasia por asfixia con CO2 48 horas despues de la administracion de la dosis (± 5%), seguido de toracotoirna y extraccion de sangre ca^aca terminal mediante puncion ca^aca en animales sacrificados en tubos separadores de suero, que se pueden coagular a temperatura ambiente durante por lo menos 30 minutos, se centrifuga a 22° C ± 5° C a 9300 g durante 10 minutos y se extrae el suero. Para las recolecciones de sangre provisionales, se recolectan aproximadamente 40-50 pl de sangre completa mediante puncion de la vena facial o corte de cola. Las muestras recolectadas de animales sin tratamiento se usan como referencia para la comparacion con los animales de estudio.
Ejemplo 3: Analisis de Ensayo de Inmunoabsorcion Ligado a Enzimas (ELISA)
ELISA EPO: La cuantificacion de la protema EPO se realiza siguiendo los procedimientos informados para el kit ELISA EPO humano (Quantikine IVD, R&D Systems, N° de catalogo Dep-00). Los controles positivos son protema eritropoyetina humana recombinante ultrapura y de grado de cultivo de tejidos (R&D Systems, N° de catalogo 286-Ep y 287-TC, respectivamente). La deteccion se monitoriza mediante absorcion (450 nm) en un instrumento Molecular Device Flex Station.
ELISA GLA: Se siguen los procedimientos ELISA estandar empleando IgG anti-alfa-galactosidasa G-188 de oveja como el anticuerpo de captura con IgG TK-88 anti-alfa-galactosidasa de conejo como anticuerpo secundario (deteccion) (Shire Human Genetic Therapies). La IgG anti-conejo de cabra conjugada con peroxidasa de rabano picante (HRP) se usa para la activacion de la solucion de sustrato de 3,3',5,5'-tetrametilbencidina (TMB). La reaccion se inactiva usando 2N H2SO4 despues de 20 minutos. La deteccion se monitoriza mediante absorcion (450 nm) en un instrumento Molecular Device Flex Station. El suero de raton no tratado y la protema alfa-galactosidasa humana se usan como controles negativos y positivos, respectivamente.
ELISA FIX: La cuantificacion de la protema FIX se realiza siguiendo los procedimientos informados para el kit ELISA FIX humano (AssayMax, Assay Pro, N° de catalogo EF1009-1).
ELISA A1AT: La cuantificacion de la protema A1AT se realiza siguiendo los procedimientos informados para el kit ELISA A1AT humano (Innovative Research, N° de catalogo IRAPKT015).
Analisis de transferencia Western (EPO): las muestras tambien se pueden analizar mediante transferencia Western. Por ejemplo, los analisis de transferencia Western de la protema de fusion de EPO se realizan usando un anticuerpo anti-hEPo (R&D Systems N° MAB2871) y una protema de EPO humana ultrapura (R&D Systems N° 286- EP) como control.
Resultados: Los resultados demostraran que la administracion de ARNm que codifica las Protemas de Fusion Terapeuticas da como resultado la produccion de protemas in vivo y la administracion de niveles significativos de protema terapeutica en el sistema circulatorio. Dicho efecto de deposito puede lograrse en multiples sitios dentro del cuerpo (es decir, pulmon, fngado, rinon, bazo y musculo).

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    1. Una composicion para su uso en un metodo para tratar a un sujeto que tiene una enfermedad que es el resultado de una deficiencia en una protema, en donde la composicion comprende (a) por lo menos una molecula de ARNm, por lo menos una porcion de la cual codifica una protema de fusion que comprende una protema terapeutica y un polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc; y (b) un vehroulo de administracion, en donde el vehmulo de administracion es polietilenimina (PEI) o una nanopartmula lipfdica, en donde la composicion se administra al sujeto mediante suministro pulmonar, y la enfermedad:
    (a) se selecciona de un trastorno de almacenamiento lisosomal, un trastorno metabolico del ciclo de la urea, enfermedad de Pompe, enfermedad de Gaucher, beta-talasemia, enfermedad de Huntington; enfermedad de Parkinson; distrofias musculares (como por ejemplo, Duchenne y Becker); enfermedades de la hemofilia (como por ejemplo, hemofilia B, hemofilia A, atrofia muscular espinal relacionada con SMN1 (SMA), esclerosis lateral amiotrofica (ELA), galactosemia relacionada con GALT, trastornos relacionados con SLC3A1 incluyendo cistinuria, trastornos relacionados con COL4A5 incluyendo smdrome de Alport deficiencias de galactocerebrosidasa, adrenoleucodistrofia y adrenomieloneuropatfa ligada a X; ataxia de Friedreich; enfermedad de Pelizaeus-Merzbacher; esclerosis tuberosa relacionada con TSC1 y TSC2; smdrome de Sanfilippo bB (MPS IIIB); cistinosis relacionada con el CTNS; trastornos relacionados con FMR1 que incluyen Smdrome X fragil, Smdrome de temblor/ataxia asociado con X fragil y Smdrome de insuficiencia ovarica prematura X fragil; Smdrome de Prader-Willi; telangiectasia hemorragica hereditaria (AT); enfermedad de Niemann-Pick Tipo C1; las enfermedades relacionadas con lipofuscinosis ceroides neuronales incluyendo la lipofuscinosis ceroide neuronal juvenil (JNCL), la enfermedad de Batten juvenil, la enfermedad de Santavuori-Haltia, la enfermedad de Jansky-Bielschowsky y deficiencias de PTT-1 y TPP1; ataxia infantil relacionada con EIF2B1, EIF2B2, EIF2B3, EIF2B4 y EIF2B5 con hipomielinizacion/desaparicion de la materia blanca del sistema nervioso central; Ataxia Episodica Tipo 2 relacionada con CACNA1A y CACNB4; trastornos relacionados con MECP2, incluyendo el smdrome de Rett clasico, encefalopatfa neonatal grave relacionada con MECP2 y el smdrome de PPM-X; smdrome de Rett atfpico relacionado con CDKL5; enfermedad de Kennedy (SBMA); arteriopatfa cerebral autosomica dominante relacionada con Notch-3 con infartos subcorticales y leucoencefalopatfa (CADASIL); trastornos convulsivos relacionados con SCN1A y SCN1B; trastornos relacionados con la Polimerasa G incluyendo smdrome de Alpers-Huttenlocher, neuropatfa ataxica sensorial relacionada con POLG, disartria y oftalmoparesia, y oftalmoplejfa externa progresiva autosomica dominante y recesiva con deleciones de ADN mitocondriales; hipoplasia adrenal ligada a X; agammaglobulinemia ligada a X; enfermedad de Wilson; y enfermedad de Fabry, o
    (b) es el resultado de una deficiencia en una protema seleccionada de a-galactosidasa, eritropoyetina (EPO), a-1-antitripsina (A1AT), folistatina, glucocerebrosidasa, interferon-p, hemoglobina, colageno tipo 4 (COL4A5), receptor de liprotema de baja densidad (LDL), Factor VIII, Factor IX, a-L-iduronidasa, iduronato sulfatasa, heparina-N-sulfatasa, a-N-acetilglucosaminidasa, galactosa-6-sulfatasa, acido lisosomal lipasa, arilsulfatasa- A, factor estimulante de colonias de granulocitos (GCSF), factor de crecimiento endotelial antivascular (VEGF), interleucina 12 (IL-12), interleucina 23 (IL-23), arginosuccinato sintasa (AS), metilmalonil-coA mutasa (MCM), proprionil-coA carboxilasa (PCC), fenilalanina hidroxilasa (PAH), apolipoprotema E (APOE), glucosa- 6-fosfatasa (G6P), hormona del crecimiento humano (hGH) y urato oxidasa.
  2. 2. La composicion para el uso de acuerdo con la reivindicacion 1, en donde el polipeptido capaz de unirse a un receptor Fc es (a) un peptido de union a FcRn, o (b) un dominio Fc de inmunoglobulina, opcionalmente en donde el dominio Fc de inmunoglobulina es de IgG, opcionalmente en donde el receptor Fc es el receptor Fc neonatal, FcRn.
  3. 3. La composicion para el uso de acuerdo con la reivindicacion 1 o 2, en la que la molecula de ARNm comprende
    (i) una region no traducida 5', opcionalmente en la que una region no traducida 5' es de CMV IE1; y/o
    (ii) una estructura Cap1 o una caperuza m7GpppG; y/o
    (iii) una region no traducida 3', opcionalmente en la que la region no traducida 3' es de hGH; y/o
    (iv) comprende una cola poli A; y/o
    (v) uno o mas nucleosidos modificados, opcionalmente en donde los nucleosidos modificados se seleccionan de pseudouridina, 5-metilcitidina, 2'-O-metiluridina, 5-metiluridina, 2-tio-uridina, 5-metilcitosina, isocitosina, pseudoisocitosiba, 5- bromouracilo, 5-propiniluracilo, 6-aminopurina, 2-aminopurina, inosina, diaminopurina, 2-cloro-6-aminopurina citosina, 4'-tio-adenosina, 4'-tio-guanosina, 4'-tio-citidina, 4'-tio-uridina, 4'tio-5- metilcitidina, 4'-tio-pseudouridina y 2,4'-ditiouridina.
  4. 4. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-3, en la que la molecula de ARNm se ha modificado para reducir o eliminar motivos CpG, secuencias repetidas, secuencias invertidas, secuencias promotoras cnpticas, y para asegurar un contenido de GC menor que el contenido de GC de la secuencia de tipo salvaje.
  5. 5. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-4, en la que dicha composicion es una composicion que contiene aerosoles.
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  6. 6. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-5, en la que la PEI tiene un peso molecular de entre 20 y 30 kD.
  7. 7. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 - 5, en la que la nanopartmula lipfdica comprende:
    (i) uno o mas lfpidos cationicos, opcionalmente en donde el uno o mas lfpidos cationicos se seleccionan de: C12-200, XTC, MC3, NC98-5, DLinDMA, HGT5001cis, HGT5001trans, HGT5000, HGT4003, DLinKC2DMA, ALNY100, ICE, DOTAP, DODAP, DOTMA; y/o
    (ii) uno o mas lfpidos no cationicos; y/o
    (iii) uno o mas lfpidos PEG-modificados; y/o
    (iv) un colesterol; y/o (vii) un lfpido escindible;
    opcionalmente, en la que la nanopartfcula lipfdica comprende un lfpido cationico, un lfpido neutro, colesterol y un lfpido PEG-modificado.
  8. 8. La composicion para el uso de acuerdo con la reivindicacion 7, en la que la nanopartmula lipfdica comprende:
    (i) C12-200;
    (ii) DLinKC2DMA, CHOL, DOPE y DMG-PEG-2000; o
    (iii) C12-200, DOPE, CHOL y DMG-PEG-2000.
  9. 9. La composicion para el uso de acuerdo con la reivindicacion 1, en la que el vehfculo de administracion comprende una nanopartmula iipfdica o una nanopartmula lipidoide, en la que la protema terapeutica es una protema lisosomal elegida de las protemas enumeradas en la Tabla 3.
  10. 10. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1-9, en la que dicha composicion esta liofilizada o es una composicion liofilizada reconstituida.
  11. 11. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en la que la protema terapeutica es una enzima anormalmente deficiente en un individuo con un trastorno de almacenamiento lisosomal.
  12. 12. La composicion para el uso de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones anteriores, en la que la composicion se administra mediante nebulizacion, aerosolizacion o instilacion.
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