ES2773725T3 - Unidades estructurales de unión anti-C5a con actividad bloqueadora alta - Google Patents
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Abstract
Un anticuerpo C5a o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende un conjunto de secuencias de CDR3 de cadena pesada, CDR2 de cadena pesada y CDR1 de cadena pesada y un conjunto de secuencias de CDR3 de cadena ligera, CDR2 de cadena ligera y CDR1 de cadena ligera seleccionados de uno de los siguientes conjuntos: (i) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 6, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 10, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 14; y una secuencia CDR3 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 8, una secuencia CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 12, y una secuencia CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 16; o (ii) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 7, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 11, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 15 y una secuencia de CDR3 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 9, una secuencia de CDR2 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 12 y una secuencia de cadena ligera de CDR1 de acuerdo con SEQ ID NO: 17; en donde dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo tiene una constante de unión a C5a con un valor de Kd de 10 nM o menos.
Description
DESCRIPCIÓN
Unidades estructurales de unión anti-C5a con actividad bloqueadora alta
La presente divulgación se refiere a unidades estructurales de unión que se unen específicamente a un epítopo conformacional de C5a, en particular C5a humano. Las unidades estructurales de unión preferidas son anticuerpos anti-C5a que se unen a este epítopo conformacional. Las unidades estructurales de unión descritas en la presente memoria son útiles como agentes activos en composiciones farmacéuticas para el tratamiento y prevención de diversas enfermedades agudas y crónicas, en particular enfermedades inflamatorias agudas, tales como el síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS) y diferentes grados de sepsis incluyendo sepsis, sepsis severa y choque séptico.
Antecedentes de la invención
C5a se escinde de C5 tras la activación del complemento. Entre los productos de activación del complemento, C5a es uno de los péptidos inflamatorios más potentes, con un amplio espectro de funciones (Guo y Ward, 2005). C5a es una glicoproteína presente en la sangre de seres humanos sanos con un peso molecular de 11,2 kDa. La porción polipeptídica de C5a contiene 74 aminoácidos, lo que representa un peso molecular de 8,2 kDa mientras que la parte del carbohidrato representa aproximadamente 3 kDa. C5a ejerce sus efectos a través de los receptores C5a de alta afinidad (C5aR y C5L2) (Ward 2009). C5aR pertenece a la familia del tipo de la rodopsina de receptores acoplados a proteína G con siete segmentos transmembrana; C5L2 es similar pero no está acoplado a proteína G. Actualmente se cree que C5a ejerce sus funciones biológicas principalmente a través de la interacción C5a-C5aR, ya que se han encontrado pocas respuestas biológicas para la interacción C5a-C5L2. C5aR se expresa ampliamente en células mieloides incluyendo neutrófilos, eosinófilos, basófilos y monocitos, y células no mieloides en muchos órganos, especialmente en el pulmón y el hígado, lo que indica la importancia de la señalización de C5a/C5aR. C5a tiene una variedad de funciones biológicas (Guo y Ward 2005). C5a es un quimioatrayente fuerte para neutrófilos y también tiene actividad quimiotáctica para monocitos y macrófagos. C5a provoca una explosión oxidativa (consumo de O2) en neutrófilos y mejora la fagocitosis y la liberación de enzimas granulares. También se ha encontrado que C5a es un vasodilatador. Se ha demostrado que C5a está implicada en la modulación de la expresión de citoquinas de diversos tipos de células, para reforzar la expresión de moléculas de adhesión sobre los neutrófilos. Se ha encontrado que C5a se convierte en altamente perjudicial cuando se produce excesivamente en la configuración de la enfermedad, ya que es un fuerte inductor y reforzador de las respuestas inflamatorias que actúan en dirección opuesta a la cadena de reacción inflamatoria. Altas dosis de C5a pueden conducir a "desensibilización" quimiotáctica no específica para los neutrófilos, causando así disfunción generalizada (Huber-Lang y colaboradores, 2001a).
Se ha reportado que C5a ejerce numerosas respuestas proinflamatorias, y se ha reportado que es perjudicial durante la sepsis. Se ha demostrado que la inhibición de C5a o del receptor de C5a (C5aR) por anticuerpos mejora dramáticamente la supervivencia en diversos modelos de sepsis en ratones y ratas (Czermak y colaboradores, 1999, Huber-Lang y colaboradores, 2001b; Riedemann y colaboradores, 2002a). Además, varios reportes han demostrado los efectos nocivos de C5a para las funciones innatas intactas inmunes y de órganos durante la sepsis experimental (Guo y colaboradores, 2000, Huber-Lang y colaboradores, 2002, Huber-Lang y colaboradores, 2002, Laudes y colaboradores, 2002, Riedemann y colaboradores, 2003, Riedemann y colaboradores, 2004a, Riedemann y colaboradores, 2004b). C5a actúa como una anafilatoxina y se ha reportado que ejerce numerosos efectos proinflamatorios. En humanos, se ha reportado que altos niveles de sepsis de C5a se asocian con resultados significativamente desmejorados en diversos estudios (Bengtson y Heideman 1988, Nakae y colaboradores, 1996).
En el establecimiento experimental de la sepsis, la exposición de los neutrófilos a C5a puede conducir a la disfunción de los neutrófilos y parálisis de las vías de señalización, lo que conduce a una configuración defectuosa de la NADPH oxidasa, parálisis de las cascadas de señalización MAPK, a una ráfaga oxidativa, fagocitosis y quimiotaxis muy deprimidas. Guo y colaboradores, 2006a, Huber-Lang y colaboradores, 2002). La apoptosis de timocitos y la apoptosis retardada de los neutrófilos son dos eventos patógenos importantes para el desarrollo de la sepsis, que dependen de la presencia de C5a (Guo y colaboradores, 2000, Guo y colaboradores, 2006b). Durante la sepsis experimental, C5a sobrerregula la expresión de la integrina p2 en los neutrófilos para promover la migración celular hacia los órganos (Guo y colaboradores, 2002), una de las principales causas de insuficiencia multiorgánica (MOF). También se encuentra que C5a es atribuible a la activación de la ruta de coagulación que se produce en la sepsis experimental (Laudes y colaboradores, 2002). C5a estimula la síntesis y liberación de leucocitos humanos de las citoquinas proinflamatorias tales como TNF-a, IL-p, IL-6, IL-8 y el factor inhibidor de la migración de macrófagos (MIF) (Hopken y colaboradores, 1996; Riedemann y colaboradores, 2004a; Strieter y colaboradores, 1992). C5a produce un fuerte efecto sinérgico con LPS en la producción de TNF-a, proteína inflamatoria de macrófagos (MIP)-2, quimioatrayente de neutrófilos inducido por citoquina (CINC)-1 e IL-1p en células epiteliales alveolares (Riedemann y colaboradores, 2002b; Rittirsch y colaboradores, 2008). Dado que la activación del complemento es un evento que ocurre durante el inicio de la sepsis, C5a puede entrar en juego antes de la aparición de la "tormenta de citoquinas inflamatorias". Parece que C5a desempeña un papel clave en la orquestación del desempaño de la red de citoquinas y la formación de síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS). El bloqueo de C5a en el marco de la sepsis experimental atenúa dramáticamente MOF y SIRS. La sobrerregulación extendida de la expresión de C5aR se produce durante el inicio de la sepsis y el bloqueo de la interacción C5a/C5aR por anticuerpos anti-C5a o anti-C5aR o los antagonistas de C5aR
producen efectos altamente protectores en modelos de roedores de sepsis (Czermak y colaboradores, 1999; Huber-Lang y colaboradores, 2001b; Riedemann y colaboradores, 2002a).
Además de la indicación de sepsis, también se ha demostrado que el bloqueo de C5a es protector en muchos otros modelos de inflamación tales como lesión por isquemia/reperfusión, enfermedad renal, rechazo de injerto, malaria, artritis reumatoide, enfermedad intestinal infecciosa, enfermedad de pulmón inflamatorio (Klos y colaboradores, 2009) y Allegretti M. y colaboradores. (Allegretti y colaboradores, 2005). Además, se ha descubierto recientemente que el bloqueo de C5a ha mostrado un fuerte beneficio terapéutico en un modelo de tumor en ratones (Markiewski y colaboradores, 2008).
Problemas técnicos subyacentes de la presente invención
Los anticuerpos que se unen específicamente a la parte C5a pero no a la parte C5b de C5 son conocidos a partir de la técnica anterior (Klos y colaboradores (1998) J. Immunol Meth. 111: 241-252; WO 01/15731; WO 03/015819).
Sin embargo, los anticuerpos anti-C5a generados previamente exhibían solamente actividades de bloqueo moderadas sobre los efectos biológicos inducidos por C5a. En consecuencia, los anticuerpos anti-C5a de la técnica anterior no eran capaces de lograr un bloqueo completo de los efectos biológicos inducidos por C5a o tenían que usarse en cantidades superestequiométricas para alcanzar un bloqueo razonablemente alto de la actividad de C5a.
Por lo tanto, especialmente teniendo en cuenta un posible uso clínico en pacientes, seguía existiendo en la técnica anterior la necesidad de anticuerpos anti-C5a u otras unidades estructurales de unión que mostraran una actividad de bloqueo más fuerte para efectos biológicos inducidos por C5a mientras que se unen específicamente a C5a con alta afinidad. Además, preferiblemente dichos anticuerpos no deben unirse a C5b y, en consecuencia, no deben afectar las actividades biológicas de C5b.
Muy sorprendentemente, los inventores de la presente invención fueron capaces de identificar un nuevo epítopo de unión conformacional con anticuerpos de unión correspondientes que cumplen los requisitos avanzados antes mencionados y otros. En experimentos tediosos subyacentes a la presente invención, podrían generarse dos anticuerpos anti-C5a de los más de 2000 que exhiben una actividad de bloqueo sin precedentes frente a los efectos biológicos inducidos por C5a cuando se emplean en cantidades estequiométricas, es decir, 0,5 moles de un anticuerpo bivalente por mol de C5a.
La visión de conjunto anterior no describe necesariamente todos los problemas resueltos por la presente invención. Sumario de la invención
En un primer aspecto, la presente invención se refiere a un anticuerpo C5a o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende un conjunto de secuencias de CDR3 de cadena pesada, CDR2 de cadena pesada y CDR1 de cadena pesada y un conjunto de CDR3 de cadena ligera, CDR2 de cadena ligera, y secuencias de CDR1 de cadena ligera seleccionadas de uno de los siguientes conjuntos:
(i) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 6, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 10, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 14; y una secuencia CDR3 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 8, una secuencia CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 12, y una secuencia CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 16; o
(ii) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 7, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 11, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 15 y una secuencia de CDR3 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 9, una secuencia de CDR2 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 12 y una secuencia de cadena ligera de CDR1 de acuerdo con SEQ ID NO: 17;
en donde dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo tiene una constante de unión a C5a con un valor de Kd de 10 nM o menos.
En un segundo aspecto, la presente invención se refiere a una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo C5a o fragmento de unión del mismo a antígeno de acuerdo con el primer aspecto y que comprende además uno o más portadores, diluyentes, excipientes, rellenos, aglutinantes, lubricantes, deslizantes, desintegrantes, adsorbentes, y/o conservantes farmacéuticamente aceptables.
En un tercer aspecto, la presente invención se refiere al uso de anticuerpo C5a o fragmento de unión del mismo de acuerdo con el primer aspecto para la preparación de una composición farmacéutica para la prevención y/o tratamiento de diversas enfermedades que implican inflamación aguda tal como el síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS), sepsis, sepsis grave, choque séptico, lesiones relacionadas con isquemia/reperfusión tales como cardiopatía isquémica, lesión pulmonar aguda, neumonía, rechazo agudo y crónico de injerto en pacientes trasplantados, reacciones de injerto contra huésped, pero también enfermedades que implican un tipo crónico de inflamación tales como enfermedades glomerulares renales tales como glomerulonefritis y otras entidades de insuficiencia renal, artritis
reumatoide y enfermedades autoinmunes similares tales como enfermedad de Bechterew, enfermedades del tipo lupus, enfermedad inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn, crecimiento tumoral o cáncer de órganos sólidos.
Descripción detallada de la invención
Definiciones
Antes de describir la presente invención en forma detallada más adelante, debe entenderse que esta invención no se limita a la metodología, protocolos y reactivos particulares descritos en la presente memoria, ya que pueden variar. También debe entenderse que la terminología utilizada en la presente memoria tiene como propósito describir únicamente realizaciones particulares y no pretende limitar el alcance de la presente invención que estará limitada solamente por las reivindicaciones adjuntas. A menos que se defina lo contrario, todos los términos técnicos y científicos usados en la presente memoria tienen los mismos significados que comúnmente entienden los expertos en la técnica.
Preferiblemente, los términos usados en la presente memoria se definen como se describe en "A multilingual glossary of biotechnological terms: (Recomendaciones de la IUPAC)", Leuenberger, H.G.W, Nagel, B. y Kolbl, H. eds. (1995), Helvetica Chimica Acta, CH-4010 Basilea, Suiza).
A lo largo de esta memoria descriptiva y de las reivindicaciones que siguen, a menos que el contexto lo exija de otro modo, se entenderá que la palabra "comprende" y variaciones tales como "comprendiendo" y "que comprende" se entenderá que implican la inclusión de un número entero o etapa o grupo de números enteros o etapas pero no la exclusión de cualquier otro número entero o etapa o grupo de números enteros o etapas.
Nada en este documento debe interpretarse como una admisión de que la invención no tiene derecho a anteceder tal divulgación en virtud de una invención anterior.
Tal como se usa en la presente memoria, "C5a humana" se refiere al siguiente péptido de 74 aminoácidos:
TLQKKIEEIA AKYKHSVVKK CCYDGACVNN DETCEQRAAR ISLGPRCIKA
FTECCVVASQ LRANISHKDM QLGR (SEQ ID NO: 1).
El término "unidad estructural de unión", tal como se utiliza aquí, se refiere a cualquier molécula o parte de una molécula que se puede unir específicamente a una molécula objetivo o epítopo objetivo. Las unidades estructurales de unión preferidas en el contexto de la presente solicitud son (a) anticuerpos o fragmentos de los mismos de unión al antígeno; o (b) oligonucleótidos; (c) proteínas similares a anticuerpos; o (d) peptidomiméticos. Las "unidades estructurales de unión" que pueden usarse para practicar la presente invención son capaces de unirse a un epítopo conformacional de C5a de mamífero que está formado por las dos secuencias de aminoácidos X1X2ETCEX3RX4 (SEQ ID NO: 18) y X5X6KX7X8X9L (SEQ ID NO: 19), en donde X1 se selecciona del grupo que consiste en N, H, D, F, K, Y, y T; X2 se selecciona del grupo que consiste en D, L, Y, y H; X3 se selecciona del grupo que consiste en Q, E, y K; X4 se selecciona del grupo que consiste en A, V, y L; X5 se selecciona del grupo que consiste en S, H, P, y N; X6 se selecciona del grupo que consiste en H y N; X7 se selecciona del grupo que consiste en D, N, H, P, y G; X8 se selecciona del grupo que consiste en M, L, I, y V; y X9 se selecciona del grupo que consiste en Q, L, y I. Las “unidades estructurales de unión” que son particularmente adecuadas para practicar la presente invención son capaces de unirse a un epítopo conformacional de C5a humano que está formado por las dos secuencias de aminoácidos NDETCEQRA (SEQ ID NO: 2) y SHKDMQL (SEQ ID NO: 3).
Como se usa en la presente memoria, se considera que un primer compuesto (por ejemplo, un anticuerpo) se "une" a un segundo compuesto (por ejemplo, un antígeno, tal como una proteína objetivo), si tiene una constante de disociación Kd para dicho segundo compuesto de 1 mM o menos, preferiblemente 100 ^M o menos, preferiblemente 50 ^M o menos, preferiblemente 30 ^M o menos, preferiblemente 20 ^M o menos, preferiblemente 10 ^M o menos, preferiblemente 5 ^M o menos, más preferiblemente 1 ^M o menos, más preferiblemente 900 nM o menos, más preferiblemente 800 nM o menos, más preferiblemente 700 nM o menos, más preferiblemente 600 nM o menos, más preferiblemente 500 nM o menos, más preferiblemente 400 nM o menos, más preferiblemente 300 nM o menos, más preferiblemente 200 nM, incluso más preferiblemente 100 nM o menos, incluso más preferiblemente 90 nM o menos, incluso más preferiblemente 80 nM o menos, incluso más preferiblemente 70 nM o menos, incluso más preferiblemente 60 nM o menos, incluso más preferiblemente 50 nM o menos, incluso más preferiblemente 40 nM o menos, incluso más preferiblemente 30 nM o menos, incluso más preferiblemente 20 nM o menos, e incluso más preferiblemente 10 nM o menos.
El término "unión" de acuerdo con la invención se refiere preferiblemente a una unión específica. "Unión específica" significa que una unidad estructural de unión (por ejemplo, un anticuerpo) se une más fuerte a un objetivo tal como un epítopo para el cual es específico en comparación con la unión a otro objetivo. Una unidad estructural de unión se une más fuerte a un primer objetivo comparado con un segundo objetivo si se une al primer objetivo con una constante de disociación (Kd) que es inferior a la constante de disociación para el segundo objetivo. Preferiblemente, la constante de disociación (Kd) para el objetivo al que se une específicamente la unidad estructural de unión es más de 10 veces, preferiblemente más de 20 veces, más preferiblemente más de 50 veces, incluso más preferiblemente más de 100
veces, 200 veces, 500 veces o 1000 veces menor que la constante de disociación (Kd) para el objetivo al que la unidad estructural de unión no se une específicamente.
Tal como se utiliza en la presente memoria, el término "Kd" (medido en "mol/L", a veces abreviado como "M") se refiere a la constante de equilibrio de disociación de la interacción particular entre una unidad estructural de unión (por ejemplo, un anticuerpo o fragmento del mismo) y una molécula objetivo (por ejemplo, un antígeno o un epítopo del mismo).
Un "epítopo", también conocido como determinante antigénico, es la parte de una macromolécula que es reconocida por el sistema inmunológico, específicamente por anticuerpos, células B o células T. Como se usa en la presente memoria, un "epítopo" es la parte de una macromolécula capaz de unirse a una unidad estructural de unión (por ejemplo, un anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno) como se describe en el presente documento. En este contexto, el término "unión" se refiere preferiblemente a una unión específica. Los epítopos consisten usualmente en agrupaciones superficiales químicamente activas de moléculas tales como aminoácidos o cadenas laterales de azúcar y suelen tener características estructurales tridimensionales específicas, así como características de carga específicas. Los epítopos conformacionales y no conformacionales se distinguen por el hecho de que la unión al primero pero no al último se pierde en presencia de disolventes desnaturalizantes.
Tal como se utiliza en la presente memoria, un "epítopo conformacional" se refiere a un epítopo de una macromolécula lineal (por ejemplo, un polipéptido) que está formado por la estructura tridimensional de dicha macromolécula. En el contexto de la presente solicitud, un "epítopo conformacional" es un "epítopo discontinuo", es decir, el epítopo conformacional en la macromolécula (por ejemplo, un polipéptido) que se forma a partir de al menos dos regiones separadas en la secuencia primaria de la macromolécula (por ejemplo, la secuencia de aminoácidos de un polipéptido). En otras palabras, se considera que un epítopo es un "epítopo conformacional" en el contexto de la presente invención, si el epítopo consta de al menos dos regiones separadas en la secuencia primaria a la que una unidad estructural de unión de la invención (por ejemplo, un anticuerpo o un fragmento del mismo de unión al antígeno) se une simultáneamente, en donde estas al menos dos regiones separadas están interrumpidas por una región más en la secuencia primaria a la que no se une una unidad estructural de unión de la invención. Preferiblemente, dicho "epítopo conformacional" está presente en un polipéptido, y las dos regiones separadas en la secuencia primaria son dos secuencias separadas de aminoácidos a las que se une una unidad estructural de unión de la invención (por ejemplo, un anticuerpo o un fragmento del mismo de unión al antígeno), en donde estas al menos dos secuencias separadas de aminoácidos están interrumpidas por una secuencia más de aminoácidos en la secuencia primaria a la que no se une una unidad estructural de unión de la invención. Preferiblemente, la secuencia de interrupción de aminoácidos es una secuencia de aminoácidos contigua que comprende dos o más aminoácidos a los que la unidad estructural de unión no se une. Las al menos dos secuencias separadas de aminoácidos a las que se une una unidad estructural de unión de la invención no están particularmente limitadas con respecto a su longitud. Tal secuencia separada de aminoácidos puede consistir en sólo un aminoácido siempre y cuando el número total de aminoácidos dentro de dichas al menos dos secuencias separadas de aminoácidos sea suficientemente grande para efectuar la unión específica entre la unidad estructural de unión y el epítopo conformacional.
Un "parátopo" es la parte de un anticuerpo que reconoce el epítopo. En el contexto de la presente invención, un "parátopo" es la parte de una unidad estructural de unión (por ejemplo, un anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno) como se describe en la presente memoria que reconoce al epítopo.
El término "anticuerpo" se refiere típicamente a una glicoproteína que comprende al menos dos cadenas pesadas (H) y dos cadenas ligeras (L) interconectadas por enlaces disulfuro, o una porción del mismo de unión a antígeno. El término "anticuerpo" también incluye todas las formas recombinantes de anticuerpos, en particular de los anticuerpos descritos en el presente documento, por ejemplo anticuerpos expresados en procariotas, anticuerpos no glicosilados y cualquier fragmento de anticuerpo de unión al antígeno y derivados como se describe a continuación. Cada cadena pesada está compuesta por una región variable de cadena pesada (abreviada en este documento como VH o Vh) y una región constante de cadena pesada. Cada cadena ligera está compuesta por una región variable de cadena ligera (abreviada en este documento como VL o Vl) y una región constante de cadena ligera. Las regiones VH y VL pueden subdividirse además en regiones de hipervariabilidad, denominadas regiones determinantes de complementariedad (CDR), intercaladas con regiones que están más conservadas, denominadas regiones marco (FR). Cada VH y VL está compuesta por tres CDR y cuatro FR, dispuestas desde el extremo terminal amino hasta el extremo terminal carboxilo en el siguiente orden: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. Las regiones variables de las cadenas pesada y ligera contienen un dominio de unión que interactúa con un antígeno. Las regiones constantes de los anticuerpos pueden mediar la unión de la inmunoglobulina a tejidos o factores huésped, incluyendo diversas células del sistema inmune (por ejemplo, células efectoras) y el primer componente (C1q) del sistema clásico de complemento.
El término "fragmento de unión al antígeno" de un anticuerpo (o simplemente "porción de unión"), tal como se usa en la presente memoria descriptiva, se refiere a uno o más fragmentos de un anticuerpo que retienen la capacidad de unirse específicamente a un antígeno. Se ha demostrado que la función de unión al antígeno de un anticuerpo puede realizarse mediante fragmentos de un anticuerpo de longitud completa. Ejemplos de fragmentos de unión abarcados dentro del término "porción de unión al antígeno" de un anticuerpo incluyen (i) fragmentos Fab, fragmentos monovalentes que consisten en los dominios VL, VH, CL y CH; (ii) fragmentos F(ab')2, fragmentos bivalentes que comprenden dos fragmentos Fab unidos por un puente disulfuro en la región bisagra; (iii) fragmentos Fd que consisten en los dominios VH y CH; (iv) fragmentos Fv que consisten en los dominios VL y VH de un solo brazo de un anticuerpo,
(v) fragmentos dAb (Ward y colaboradores, (1989) Nature 341: 544-546), que consisten en un dominio VH; (vi) regiones aisladas determinantes de complementariedad (CDR), y (vii) combinaciones de dos o más CDR aisladas que pueden estar opcionalmente unidas por un enlazador sintético. Además, aunque los dos dominios del fragmento Fv, VL y VH, están codificados por genes separados, se pueden unir, utilizando métodos recombinantes, mediante un enlazador sintético que les permite ser elaborados como una única cadena proteica en la que las regiones VL y VH se unen para formar moléculas monovalentes (conocidas como Fv de cadena sencilla (scFv); véase, por ejemplo, Bird y colaboradores (1988) Science 242: 423-426; y Huston y colaboradores (1988) Proc. Natl. Acad. USA 85: 5879 - 5883). Tales anticuerpos de cadena única también están abarcados en el término "fragmento de unión al antígeno" de un anticuerpo. Un ejemplo adicional es una proteína de fusión de inmunoglobulina de dominio de unión que comprende (i) un polipéptido de dominio de unión que está fusionado a un polipéptido de la región de bisagra de inmunoglobulina, (ii) una región constante CH2 de cadena pesada de inmunoglobulina fusionada a la región bisagra y (iii) una región constante CH3 de cadena pesada de inmunoglobulina fusionada a la región constante CH2. El polipéptido de dominio de unión puede ser una región variable de cadena pesada o una región variable de cadena ligera. Las proteínas de fusión de inmunoglobulina de dominio de unión se describen adicionalmente en los documentos US 2003/0118592 y US 2003/0133939. Estos fragmentos de anticuerpo se obtienen usando técnicas convencionales conocidas por los expertos en la técnica, y los fragmentos se seleccionan por su utilidad en la misma forma que los anticuerpos intactos. Otros ejemplos de "fragmentos de unión al antígeno" son los llamados microanticuerpos, que son derivados de CDR individuales. Por ejemplo, Heap y colaboradores, 2005, describen un microanticuerpo de 17 residuos de aminoácidos derivado de un CDR3 de cadena pesada de un anticuerpo dirigido contra la glicoproteína de la envoltura de gp120 de HIV-1. Otros ejemplos incluyen pequeños miméticos de anticuerpos que comprenden dos o más regiones de CDR que se fusionan entre sí, preferiblemente por regiones marco afines. Tal mimético de anticuerpo pequeño que comprende CDR1 de Vh y CDR3 de Vl unidas por el FR2 de Vh afín ha sido descrito por Qiu y colaboradores, 2007.
Por lo tanto, el término "anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno", como se usa en el presente documento, se refiere a moléculas de inmunoglobulina y porciones inmunológicamente activas de moléculas de inmunoglobulina, es decir, moléculas que contienen un sitio de unión al antígeno que se une inmunoespecíficamente a un antígeno. También están comprendidas proteínas de tipo inmunoglobulina que se seleccionan a través de técnicas que incluyen, por ejemplo, expresión en fagos para unirse específicamente a una molécula objetivo o epítopo objetivo, por ejemplo, al epítopo conformacional de C5a formado por las secuencias de aminoácidos X1X2ETCEX3RX4 (s Eq ID NO: 18) y X5X6KX7X8X9L (SEQ ID NO: 19), en donde X1 se selecciona del grupo que consiste en N, H, D, F, K, Y, y T; X2 se selecciona del grupo que consiste en D, L, Y, y H; X3 se selecciona del grupo que consiste en Q, E, y K; X4 se selecciona del grupo que consiste en A, V, y L; X5 se selecciona del grupo que consiste en S, H, P, y N; X6 se selecciona del grupo que consiste en H y N; X7 se selecciona del grupo que consiste en D, N, H, P, y G; Xa se selecciona del grupo que consiste en M, L, I, y V; y Xg se selecciona del grupo que consiste en Q, L, y I; o al epítopo conformacional de C5a humana formada por las secuencias de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 2 y la SEQ ID NO: 3, o el epítopo conformacional de C5a humana formado por las secuencias de aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4) y KDM. Las moléculas de inmunoglobulina de la invención pueden ser de cualquier tipo (por ejemplo, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA e IgY), clase (por ejemplo IgG1, IgG2, preferiblemente IgG2a e IgG2b, IgG3, IgG4, IgA1 e IgA2) o una subclase de la molécula de inmunoglobulina.
Los anticuerpos y fragmentos de los mismos de unión al antígeno utilizables en la invención pueden ser de cualquier origen animal incluyendo aves y mamíferos. Preferiblemente, los anticuerpos o fragmentos son de origen humano, chimpancé, roedor (por ejemplo, ratón, rata, conejillo de indias o conejo), pollo, pavo, cerdo, oveja, cabra, camello, vaca, caballo, burro, gato o perro). Se prefiere particularmente que los anticuerpos sean de origen humano o murino. Los anticuerpos de la invención también incluyen moléculas quiméricas en las que una región constante de anticuerpo derivada de una especie, preferiblemente humana, se combina con el sitio de unión al antígeno derivado de otra especie, por ejemplo de ratón. Además, los anticuerpos de la invención incluyen moléculas humanizadas en las que los sitios de unión al antígeno de un anticuerpo derivado de una especie no humana (por ejemplo, de ratón) se combinan con regiones constantes y marco de origen humano.
Como se ejemplifica en la presente memoria, los anticuerpos de la invención se pueden obtener directamente a partir de hibridomas que expresan el anticuerpo, o se pueden clonar y expresar de forma recombinante en una célula huésped (por ejemplo, una célula CHO o una célula linfocítica). Otros ejemplos de células huésped son microorganismos, tales como E. coli, y hongos, tales como levadura. Alternativamente, pueden producirse de forma recombinante en un animal no humano o planta transgénicos.
El término "anticuerpo quimérico" se refiere a aquellos anticuerpos en los que una porción de cada una de las secuencias de aminoácidos de cadenas pesada y ligera es homóloga a secuencias correspondientes en anticuerpos derivados de una especie particular o pertenecientes a una clase particular, mientras que el segmento restante de la cadena es homólogo a las secuencias correspondientes en otra especie o clase. Típicamente, la región variable de las cadenas tanto ligera como pesada imita las regiones variables de anticuerpos derivados de una especie de mamíferos, mientras que las porciones constantes son homólogas a secuencias de anticuerpos derivadas de otra. Una clara ventaja de tales formas quiméricas es que la región variable puede derivarse convenientemente de fuentes actualmente conocidas utilizando células B o hibridomas fácilmente disponibles de organismos huéspedes no humanos en combinación con regiones constantes derivadas, por ejemplo, de preparaciones celulares humanas. Aunque la región variable tiene la ventaja de la facilidad de preparación y la especificidad no es afectada por la fuente, la región constante
que es humana es menos probable que provoque una respuesta inmune de un sujeto humano cuando se inyectan los anticuerpos que lo que sería la región constante de una fuente no humana. Sin embargo, la definición no se limita a este ejemplo particular.
El término "anticuerpo humanizado" se refiere a una molécula que tiene un sitio de unión al antígeno que se deriva sustancialmente de una inmunoglobulina de una especie no humana, en donde la estructura restante de inmunoglobulina de la molécula se basa en la estructura y/o secuencia de una inmunoglobulina humana. El sitio de unión al antígeno puede comprender tanto dominios variables completos fusionados en dominios constantes o sólo las regiones determinantes de complementariedad (CDR) injertadas sobre regiones marco apropiadas en los dominios variables. Los sitios de unión al antígeno pueden ser de tipo silvestre o modificados por una o más sustituciones de aminoácidos, por ejemplo, modificados para parecerse más a las inmunoglobulinas humanas. Algunas formas de anticuerpos humanizados preservan todas las secuencias de CDR (por ejemplo, un anticuerpo de ratón humanizado que contiene todas las seis CDR del anticuerpo de ratón). Otras formas tienen una o más CDR que se alteran con respecto al anticuerpo original.
Diferentes métodos para humanizar los anticuerpos son conocidos por el experto en la materia, según lo revisado por Almagro & Fransson, 2008. El artículo de revisión de Almagro & Fransson se resume brevemente a continuación. Almagro & Fransson distinguen entre enfoques racionales y enfoques empíricos. Los enfoques racionales se caracterizan por generar pocas variantes del anticuerpo manipulado y evaluar su unión o cualquier otra propiedad de interés. Si las variantes diseñadas no producen los resultados esperados, se inicia un nuevo ciclo de diseño y evaluación de la unión. Los enfoques racionales incluyen injerto de CDR, renovación de la superficie, superhumanización y optimización del contenido de hebras humanas. Por el contrario, los enfoques empíricos se basan en la generación de grandes bibliotecas de variantes humanizadas y en la selección de los mejores clones utilizando tecnologías de enriquecimiento o cribado de alto rendimiento. Por consiguiente, los enfoques empíricos dependen de un sistema de selección y/o cribado confiable que sea capaz de buscar a través de un vasto espacio de variantes de anticuerpos. Las tecnologías de expresión in vitro, tales como expresión en fagos y expresión en ribosomas, cumplen estos requisitos y son bien conocidas por el experto en la materia. Los enfoques empíricos incluyen las bibliotecas de FR, selección guiada, transposición del marco y la manipulación humana.
Injerto de CDR
Un protocolo de injerto de CDR típicamente comprende tres puntos de toma de decisión: (1) definición de regiones que determinan la especificidad del anticuerpo donante, es decir, el objetivo para el injerto, (2) la identificación de una fuente de secuencias humanas que se utilizan como donantes de FR, y (3) selección de residuos fuera de la región que define la especificidad, es decir, determinación de las posiciones de los aminoácidos que son objetivos para la nueva mutación para restaurar o mejorar la afinidad del anticuerpo humanizado.
(1) Regiones que determinan la especificidad del anticuerpo
La estructura experimental del anticuerpo no humano en complejo con el antígeno proporciona un mapa detallado de residuos en contacto con el antígeno y por lo tanto los responsables de determinar su especificidad. La información estructural se puede complementar con mutagénesis de barrido de alanina y/o mutagénesis combinatoria para identificar los residuos que contribuyen más a la energía de unión o al parátopo funcional. Dado que el parátopo funcional es un subconjunto de los residuos en contacto, injertar sólo el parátopo funcional reduciría el número de residuos no humanos en el producto humanizado. Sin embargo, sólo en casos raros la estructura experimental del complejo antígeno-anticuerpo y/o el parátopo funcional están disponibles al inicio de un protocolo de humanización. En ausencia de una definición precisa de residuos responsables de una determinada especificidad de anticuerpo, a menudo se emplean CDR como regiones que definen la especificidad. También es posible utilizar una combinación de CDR y un bucle de HV como objetivos para el injerto. Para reducir el número de residuos a injertar en las FR humanas, se ha descrito el injerto de SDR, es decir, el injerto de residuos determinantes de especificidad (SDR).
(2) Fuente de FR humanas
La segunda etapa en un protocolo de injerto de CDR típico es identificar donantes de FR humanas. Los trabajos iniciales utilizaron FR de anticuerpos humanos de estructura conocida, independientemente de su homología con el anticuerpo no humano. Este enfoque es conocido como "método de FR Fija". Trabajos posteriores usaron secuencias humanas que tenían la homología más alta con el anticuerpo no humano. Este enfoque se ha denominado "Mejor Ajuste". Mientras que las estrategias de "mejor ajuste" tienden a producir anticuerpos con mayor afinidad, otros parámetros tales como la baja inmunogenicidad y los rendimientos de producción también deben tenerse en cuenta al escoger una FR para humanización. Por lo tanto, también son posibles combinaciones de "mejor ajuste" y "FR fija". Por ejemplo, la parte Vl puede ser humanizada de acuerdo con el método de FR fija y la parte Vh puede humanizarse de acuerdo con el método de mejor ajuste, o viceversa.
Se han utilizado dos fuentes de secuencias humanas: secuencias maduras y germinales. Las secuencias maduras, que son productos de respuestas inmunes, portan mutaciones somáticas generadas por procesos aleatorios y no están bajo la selección de especies, dando como resultado residuos inmunogénicos potenciales. Por lo tanto, para evitar residuos inmunogénicos, los genes de la línea germinal humana han sido cada vez más utilizados como fuente de donantes de
FR. Las secuencias de nucleótidos de FR de la línea germinal humana se describen por ejemplo en los Apéndices A y B del artículo de Dall'Acqua y colaboradores, 2005. Además, los anticuerpos basados en genes de línea germinal tienden a ser más flexibles en comparación con los anticuerpos maduros. Se cree que esta mayor flexibilidad acomoda mejor las diversas CDR con menos o ninguna retromutaciones en la FR para restablecer la afinidad del anticuerpo humanizado
(3) Retromutaciones para restaurar o mejorar la afinidad
Comúnmente, la afinidad disminuye después del injerto de CDR como consecuencia de las incompatibilidades entre las CDR no humanas y las FR humanas. Por lo tanto, la tercera etapa en un protocolo típico de injerto de CDR es definir mutaciones que restaurarían o evitarían pérdidas de afinidad. Las retromutaciones tienen que ser cuidadosamente diseñadas con base en la estructura o un modelo del anticuerpo humanizado y probadas experimentalmente. Un sitio web para el modelado automatizado de anticuerpos llamado WAM puede encontrarse en la URL http://antibody.bath.ac.uk. El software para el modelado de estructuras de proteína se puede descargar en los sitios http://salilab.org/modeller/modeller.html (Modeller) y http://spdbv.vital-it.ch (Swiss PdbViewer).
Renovación de la superficie
La renovación de la superficie es similar al injerto de CDR y comparte los dos primeros puntos de toma de decisiones. En contraste con el injerto de CDR, la renovación de la superficie retiene los residuos no expuestos del anticuerpo no humano. Sólo los residuos superficiales en el anticuerpo no humano se cambian por residuos humanos.
Superhumanización
Mientras que el injerto de CDR se basa en la comparación de FR entre las secuencias humanas y no humanas, la superhumanización se basa en una comparación de CDR de modo que la homología de FR es irrelevante. El enfoque incluye una comparación de la secuencia no humana con el repertorio de genes de la línea germinal humana funcional. A continuación se seleccionan los genes que codifican las mismas estructuras canónicas o estrechamente relacionadas con las secuencias murinas. A continuación, dentro de los genes que comparten las estructuras canónicas con el anticuerpo no humano, los que tienen mayor homología dentro de las CDR se eligen como donantes de FR. Finalmente, se injertan las CDR no humanas en estas FR.
Optimización del contenido de hebras humanas
Este enfoque se basa en una métrica de "humanidad" de los anticuerpos, denominada contenido de hebras humanas (HSC). En resumen, este enfoque compara la secuencia del ratón con el repertorio de genes de la línea germinal humana. Las diferencias se califican como HSC. La secuencia objetivo se humanizan luego mediante la maximización de su HSC en lugar de utilizar una medida de identidad global para generar múltiples variantes humanizadas diversas. Bibliotecas de marcos (abreviadas: bibliotecas de FR)
En el enfoque de la biblioteca de FR, se introduce una colección de variantes de residuos en posiciones específicas en la FR, seguido por la exploración de la biblioteca para seleccionar la FR que mejor soporte la CDR injertada. Por lo tanto, este enfoque se asemeja al injerto de CDR, pero en lugar de crear algunas retromutaciones en la FR, se construye una biblioteca combinatoria de típicamente más de 100 variantes mutacionales.
Selección Guiada
Este enfoque incluye combinar el dominio Vh o Vl de un anticuerpo no humano específico dado para un antígeno particular con una biblioteca de Vh y Vl humana. Posteriormente, se seleccionan dominios V humanos específicos contra el antígeno de interés. Por ejemplo, un anticuerpo no humano puede humanizarse combinando primero el Vh no humano con una biblioteca de cadenas ligeras humanas. La biblioteca se selecciona luego contra el antígeno objetivo mediante expresión en fagos y la Vl seleccionada se clona en una biblioteca de cadenas Vh humanas y se selecciona contra el antígeno objetivo. También es posible comenzar con la combinación de la Vl no humana con una biblioteca de cadenas pesadas humanas. La biblioteca se selecciona luego contra el antígeno objetivo por expresión en fagos y se clona la Vh seleccionada en una biblioteca de cadenas Vl humanas y se selecciona contra el antígeno objetivo. En consecuencia, se puede aislar un anticuerpo totalmente humano con afinidad similar a la del anticuerpo no humano. Para evitar la aparición de una deriva de epítopos, es posible implementar la denominada ELISA de inhibición, que permite la selección de clones que reconocen el mismo epítopo que el anticuerpo progenitor. Alternativamente, la retención de CDR se puede aplicar para evitar una deriva de epítopos. En la retención de CDR, se conservan una o más CDR no humanas, preferiblemente la CDR3 de cadena pesada, ya que esta CDR está en el centro del sitio de unión al antígeno.
Transposición del marco (abreviado: transposición de FR)
En el enfoque de transposición de FR, las FR completas se combinan con las CDR no humanas. Utilizando transposición de FR, Dall'Acqua y colaboradores humanizaron un anticuerpo murino. Las seis CDR del anticuerpo murino se clonaron en una biblioteca que contenía todos los FR del gen de la línea germinal humana (Dall'Acqua y
colaboradores, 2005). Las bibliotecas se cribaron para la unión en un proceso de selección en dos etapas, primero humanizando Vl, seguido por Vh. En un estudio posterior, se utilizó con éxito un proceso de transposición de FR de una etapa (Damschroder y colaboradores, 2007). Las secuencias de oligonucleótidos que codifican todos los marcos conocidos de cadena ligera germinal humana (k) se describen en Dall'Acqua y colaboradores, 2005, como Apéndice A. Las secuencias de oligonucleótidos que codifican todos los marcos conocidos de cadena pesada de línea germinal humana se describen en Dall'Acqua y colaboradores, 2005, en el Apéndice B.
Humanización de anticuerpos
La humanización de anticuerpos permite el aislamiento de anticuerpos que son 91-96% homólogos a los anticuerpos del gen de línea germinal humana. El método se basa en la identificación experimental de determinantes esenciales de especificidad mínima (MSD) y en el reemplazo secuencial de fragmentos no humanos en bibliotecas de FR humanas y en la evaluación de la unión. Comienza con regiones de la CDR3 de cadenas Vh y Vl no humanas y reemplaza progresivamente otras regiones del anticuerpo no humano en las FR humanas, incluyendo CDR1 y CDR2 tanto de Vh como de Vl.
Los métodos para humanización de anticuerpos explicados anteriormente son preferidos cuando se generan anticuerpos humanizados que se unen específicamente a los epítopos conformacionales descritos en la presente memoria. No obstante, la presente invención no se limita a los métodos antes mencionados para humanización de anticuerpos.
Algunos de los métodos de humanización antes mencionados pueden realizarse sin información sobre las secuencias de FR en el anticuerpo donante, concretamente el "método de FR fijo" (una variante del injerto de CDR), superhumanización, transposición del marco y humanización de anticuerpos. Las variaciones del "método de FR fijo" fueron llevadas a cabo con éxito por Qin y colaboradores, 2007 y Chang y colaboradores, 2007. En particular, Qin y colaboradores construyeron un fragmento de anticuerpo que comprende una región variable de cadena pesada humana en la que las tres regiones CDR fueron reemplazadas por péptidos antigénicos, que se derivaron de las secuencias de CDR de un anticuerpo murino. Chang y colaboradores continuaron estos experimentos y construyeron un fragmento scFv, en el que todas las CDR de la parte Vh y CDR3 de la parte Vl fueron reemplazadas por péptidos antigénicos, que se derivaron de las secuencias de CDR de un anticuerpo murino.
Tal como se usa en la presente memoria, los "anticuerpos humanos" incluyen anticuerpos que tienen regiones variables y constantes derivadas de secuencias de inmunoglobulina de línea germinal humana. Los anticuerpos humanos de la invención pueden incluir residuos de aminoácidos no codificados por secuencias de inmunoglobulina de línea germinal humana (por ejemplo, mutaciones introducidas por mutagénesis aleatoria o específica del sitio in vitro o por mutación somática in vivo). Los anticuerpos humanos de la invención incluyen anticuerpos aislados de bibliotecas de inmunoglobulina humana o de animales transgénicos para una o más inmunoglobulinas humanas y que no expresan inmunoglobulinas endógenas, como se describe por ejemplo en la patente estadounidense No. 5.939.598 de Kucherlapati y Jakobovits.
El término "anticuerpo monoclonal" tal como se utiliza en la presente memoria se refiere a una preparación de moléculas de anticuerpo de composición molecular única. Un anticuerpo monoclonal muestra una única especificidad de unión y afinidad por un epítopo particular. En una realización, los anticuerpos monoclonales se producen mediante un hibridoma que incluye una célula B obtenida de un animal no humano, por ejemplo ratón, fusionado a una célula inmortalizada. El término "anticuerpo recombinante", tal como se utiliza aquí, incluye todos los anticuerpos que se preparan, expresan, crean o aíslan por medios recombinantes, tales como (a) anticuerpos aislados de un animal (por ejemplo, un ratón) que es transgénico o transcromosómico con respecto a los genes de inmunoglobulina o un hibridoma preparado a partir de los mismos, (b) anticuerpos aislados de una célula huésped transformada para expresar el anticuerpo, por ejemplo de un transfectoma, (c) anticuerpos aislados a partir de una biblioteca combinatoria recombinante de anticuerpos, y (d) anticuerpos preparados, expresados, creados o aislados por cualquier otro medio que implique el empalme de secuencias de genes de inmunoglobulina a otras secuencias de ADN.
El término "transfectoma", tal como se usa en la presente memoria, incluye células huésped eucariotas recombinantes que expresan un anticuerpo, tales como células CHO, células NS/0, células HEK293, células HEK293T, células vegetales u hongos, incluyendo células de levadura.
Tal como se utiliza en la presente memoria, un "anticuerpo heterólogo" se define en relación con un organismo transgénico que produce tal anticuerpo. Este término se refiere a un anticuerpo que tiene una secuencia de aminoácidos o una secuencia de ácido nucleico codificante correspondiente a la encontrada en un organismo que no consiste en un organismo transgénico, y que generalmente se deriva de una especie distinta del organismo transgénico.
Como se usa en la presente memoria, un "anticuerpo heterohíbrido" se refiere a un anticuerpo que tiene cadenas ligera y pesada de diferentes orígenes de organismos diferentes. Por ejemplo, un anticuerpo que tiene una cadena pesada humana asociada con una cadena ligera de murino es un anticuerpo heterohíbrido.
Por lo tanto, "anticuerpos y fragmentos de los mismos de unión al antígeno" adecuados para uso en la presente invención incluyen, pero no se limitan a, anticuerpo policlonales, monoclonales, monovalentes, biespecíficos,
heteroconjugados, multiespecíficos, recombinantes, heterólogos, heterohíbridos, quiméricos, humanizados (en particular injertados a CDR), desinmunizados, o humanos, fragmentos Fab, fragmentos Fab', fragmentos F(ab')2, fragmentos producidos por una biblioteca de expresión de Fab, Fd, Fv, Fv unidos a disulfuro (dsFv), anticuerpos de una sola cadena (por ejemplo, ScFv), diacuerpos o tetracuerpos (Holliger P. y colaboradores, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (14), 6444 6448), nanocuerpos (también conocidos como anticuerpos de un solo dominio), anticuerpos antiidiotípicos (anti-id) (incluyendo, por ejemplo, anticuerpos anti-id a anticuerpos de la invención), y fragmentos de unión a epítopos de cualquiera de los anteriores.
Los anticuerpos descritos en la presente memoria están preferiblemente aislados. Un "anticuerpo aislado" tal como se usa en el presente documento, se refiere a un anticuerpo que está sustancialmente libre de otros anticuerpos que tienen diferentes especificidades antigénicas (por ejemplo, un anticuerpo aislado que se une específicamente a C5a está sustancialmente libre de anticuerpos que se unen específicamente a antígenos distintos de C5a). Un anticuerpo aislado que se une específicamente a un epítopo, isoforma o variante de C5a humana puede, sin embargo, tener reactividad cruzada con otros antígenos relacionados, por ejemplo de otras especies (por ejemplo, homólogos de especies C5a, tales como C5a de rata). Además, un anticuerpo aislado puede estar sustancialmente libre de otro material celular y/o productos químicos. En una realización de la invención, una combinación de anticuerpos monoclonales "aislados" se refiere a anticuerpos que tienen diferentes especificidades y que se combinan en una composición bien definida.
El término "de origen natural", tal como se usa en la presente memoria, aplicado a un objeto, se refiere al hecho de que un objeto puede encontrarse en la naturaleza. Por ejemplo, una secuencia de polipéptido o de polinucleótidos que está presente en un organismo (incluyendo virus) que puede ser aislada de una fuente en la naturaleza y que no ha sido intencionalmente modificada por el hombre en el laboratorio, es de origen natural.
Como se usa en el presente documento, el término "aptámero de ácido nucleico" se refiere a una molécula de ácido nucleico que se ha diseñado mediante rondas repetidas de selección in vitro o SELEX (evolución sistemática de ligandos por enriquecimiento exponencial) para unirse a una molécula objetivo (para una revisión véase: Brody EN y Gold L. (2000), Aptamers as therapeutic and diagnostic agents. J. Biotechnol. 74(1):5-13). El aptámero de ácido nucleico puede ser una molécula de ADN o ARN. Los aptámeros pueden contener modificaciones, por ejemplo nucleótidos modificados tales como pirimidinas sustituidas con flúor 2'.
Tal como se usa en la presente memoria, el término "proteína similar a un anticuerpo" se refiere a una proteína que ha sido modificada genéticamente (por ejemplo por mutagénesis de bucles) para unirse específicamente a una molécula objetivo. Típicamente, tal proteína similar a un anticuerpo comprende al menos un bucle peptídico variable unido en ambos extremos a un andamiaje de proteína. Esta doble restricción estructural aumenta en gran medida la afinidad de unión de la proteína similar a anticuerpo a niveles comparables a los de un anticuerpo. La longitud del bucle peptídico variable típicamente consiste en 10 a 20 aminoácidos. La proteína de andamiaje puede ser cualquier proteína que tenga buenas propiedades de solubilidad. Preferiblemente, la proteína de andamiaje es una proteína globular pequeña. Las proteínas similares a anticuerpos incluyen, sin limitación, aficuerpos, anticalinas y proteínas diseñadas de repeticiones de anquirina (para revisión véase: Binz HK y colaboradores (2005). Engineering novel binding proteins from nonimmunoglobulin domains. Nat. Biotechnol. 23 (10): 1257-1268). Las proteínas similares a anticuerpos pueden derivarse de grandes bibliotecas de mutantes, por ejemplo, se pueden extraer de grandes bibliotecas de expresión en fagos y se pueden aislar en analogía con anticuerpos regulares. También, se pueden obtener proteínas de unión similares a anticuerpos mediante mutagénesis combinatoria de residuos expuestos de la superficie en proteínas globulares. Las proteínas similares a anticuerpos se denominan a veces "aptámeros peptídicos".
Como se usa en el presente documento, un "peptidomimético" es una pequeña cadena similar a una proteína diseñada para imitar un péptido. Los peptidomiméticos típicamente surgen de la modificación de un péptido existente para alterar las propiedades de la molécula. Por ejemplo, pueden surgir de modificaciones para cambiar la estabilidad de la molécula o la actividad biológica. Esto puede tener un papel en el desarrollo de compuestos similares a fármacos a partir de péptidos existentes. Estas modificaciones implican cambios en el péptido que no ocurrirán naturalmente (tal como alteraciones en la columna vertebral y la incorporación de aminoácidos no naturales).
Las "sustituciones conservadoras" pueden hacerse, por ejemplo, con base en la similitud en polaridad, carga, tamaño, solubilidad, hidrofobicidad, hidrofilicidad y/o naturaleza anfipática de los residuos de aminoácidos implicados. Los aminoácidos pueden agruparse en los siguientes seis grupos de aminoácidos estándar:
(1) hidrófobo: Met, Ala, Val, Leu, Ile;
(2) hidrofílico neutro: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) ácido: Asp, Glu;
(4) básico: His, Lys, Arg;
(5) residuos que influyen en la orientación de la cadena: Gly, Pro; y
(6) aromático: Trp, Tyr, Phe.
Como se usa en la presente memoria, las "sustituciones conservadoras" se definen como intercambios de un aminoácido por otro aminoácido listado dentro del mismo grupo de los seis grupos de aminoácidos estándar mostrados anteriormente. Por ejemplo, el intercambio de Asp por Glu retiene una carga negativa en el polipéptido así modificado. Además, la glicina y la prolina pueden sustituirse entre sí con base en su capacidad para interrumpir las hélices a. Algunas sustituciones conservadoras preferidas dentro de los seis grupos anteriores son intercambios dentro de los siguientes subgrupos: (i) Ala, Val, Leu e Ile; (ii) Ser y Thr; (iii) Asn y Gln; (iv) Lys y Arg; y (v) Tyr y Phe. Dado el conocimiento del código genético y las técnicas de ADN recombinante y sintético, el experto en la materia puede fácilmente construir ADN que codifiquen las variantes conservadoras de aminoácidos.
Tal como se usa en la presente memoria, las "sustituciones no conservadoras" o "intercambios no conservadores de aminoácidos" se definen como intercambios de un aminoácido por otro aminoácido listado en un grupo diferente de los seis grupos de aminoácidos estándar (1) a (6) mostrados anteriormente.
Una "actividad biológica" tal como se utiliza en la presente memoria, se refiere a cualquier actividad que un polipéptido pueda exhibir, incluyendo sin limitación: actividad enzimática; actividad de unión a otro compuesto (por ejemplo, unión a otro polipéptido, en particular unión a un receptor, o unión a un ácido nucleico); actividad inhibidora (por ejemplo actividad inhibidora de la enzima); actividad activadora (por ejemplo actividad activadora de enzimas); o efectos tóxicos. Con respecto a las variantes y derivados de un polipéptido, no se requiere que la variante o derivado exhiba tal actividad en la misma extensión que el polipéptido progenitor. Una variante se considera como una variante dentro del contexto de la presente solicitud, si exhibe la actividad relevante hasta un grado de al menos 10% de la actividad del polipéptido progenitor. Del mismo modo, un derivado se considera como un derivado dentro del contexto de la presente solicitud, si exhibe la actividad biológica relevante hasta un grado de al menos 10% de la actividad del polipéptido progenitor. La "actividad biológica" relevante en el contexto de la presente invención es una actividad de unión a un epítopo conformacional de C5a formado por secuencias de aminoácidos X1X2ETCEX3RX4 (SEQ ID NO: 18) y X5X6KX7X8X9L (SEQ ID NO: 19), en donde X1 se selecciona del grupo que consiste en N, H, D, F, K, Y, y T; X2 se selecciona del grupo que consiste en D, L, Y, y H; X3 se selecciona del grupo que consiste en Q, E, y K; X4 se selecciona del grupo que consiste en A, V, y L; X5 se selecciona del grupo que consiste en S, H, P, y N; X6 se selecciona del grupo que consiste en H y N; X7 se selecciona del grupo que consiste en D, N, H, P, y G; X8 se selecciona del grupo que consiste en M, L, I, y V; y X9 se selecciona del grupo que consiste en Q, L, y I. Una "actividad biológica" particularmente relevante en el contexto de la presente invención es una actividad de unión al epítopo conformacional de C5a humano formado por las secuencias de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 2 y la SEQ ID NO: 3. Preferiblemente, la "actividad biológica" relevante en el contexto de la presente invención es una actividad de unión a un epítopo conformacional de C5a humana formado por las secuencias de aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4) y KDM. Los ensayos para determinar la actividad de unión son conocidos por una persona experta en la técnica e incluyen ELISA tales como el descrito en la sección de Ejemplos.
Como se usa en la presente memoria, un "paciente" significa cualquier mamífero o ave que pueda beneficiarse de un tratamiento con la unidad estructural de unión al objetivo descrita en el presente documento. Preferiblemente, un "paciente" se selecciona del grupo que consiste en animales de laboratorio (por ejemplo, ratón o rata), animales domésticos (incluyendo, por ejemplo, conejillo de indias, conejo, pollo, pavo, cerdo, oveja, cabra, camello, vaca, caballo, asno, gato o perro), o primates incluyendo chimpancés y seres humanos. Se prefiere particularmente que el "paciente" sea un ser humano.
De acuerdo con el American College of Chest Physicians y la Society of Critical Care Medicine (Bone RC y colaboradores, 1992), "Definitions for sepsis and organ failure and guidelines for the use of innovative therapies in sepsis. The ACCP/SCCM Consensus Conference Committee. American College of Chest Physicians/Society of Critical Care Medicine". Chest 101 (6): 1644-55)), hay diferentes niveles de sepsis:
Síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS): Definido por la presencia de dos o más de los siguientes hallazgos:
- Temperatura corporal <36°C (97°F) o > 38°C (hipotermia o fiebre).
- Frecuencia cardíaca > 100 latidos por minuto (taquicardia).
- Frecuencia respiratoria > 20 respiraciones por minuto o, en gas de la sangre, una Pa de CO2 menor de 32 mm Hg (4,3 kPa) (taquipnea o hipocapnia por hiperventilación).
- Recuento de glóbulos blancos < 4.000 células/mm3 o > 12.000 células/mm3 (< 4 x 109 o 12 x 109 células/L), o mayor de 10% de formas de bandas (glóbulos blancos inmaduros) (Leucopenia, leucocitosis o bandemia).
Sepsis: Se define como SIRS en respuesta a un proceso infeccioso confirmado. Se puede sospechar o probar la infección (por cultivo, tinción o reacción en cadena de la polimerasa (PCR)), o un síndrome clínico patognomónico para la infección. La evidencia específica de la infección incluye los glóbulos blancos (WBC) en fluidos normalmente estériles (como la orina o el líquido cefalorraquídeo (CSF), la evidencia de una víscera perforada (aire libre en la radiografía abdominal o tomografía computarizada, signos de peritonitis aguda), rayos X anormales del pecho (CXR) consistente con neumonía (con opacificación focal), o petequias, púrpura o púrpura fulminante.
Sepsis severa: Se define como sepsis con disfunción orgánica, hipoperfusión o hipotensión.
Choque séptico: Se define como sepsis con hipotensión arterial refractaria o anomalías de hipoperfusión a pesar de una reanimación con fluido adecuada. Los signos de hipoperfusión sistémica pueden ser o bien disfunción de órganos terminales o lactato sérico mayor de 4 mmol/dL. Otros signos incluyen oliguria y alteración del estado mental. Los pacientes se definen por tener shock séptico si tienen sepsis más hipotensión después de la resucitación agresiva del fluido (típicamente más de 6 litros o 40 mL/kg de cristaloide).
Por "tumor" se entiende un grupo anormal de células o tejido que crece por medio de una proliferación celular rápida no controlada y continúa creciendo después de que cesen los estímulos que iniciaron el nuevo crecimiento. Los tumores muestran parcial o total falta de organización estructural y coordinación funcional con el tejido normal, y por lo general forman una masa distinta de tejido, que puede ser benigno o maligno.
Por "metástasis" se entiende la diseminación de células cancerosas desde su sitio original a otra parte del cuerpo. La formación de metástasis es un proceso muy complejo y depende del desprendimiento de células malignas del tumor primario, la invasión de la matriz extracelular, la penetración de las membranas basales endoteliales para entrar en la cavidad corporal y los vasos sanguíneos, y luego, después de ser transportadas por la sangre, la infiltración de los órganos objetivo. Finalmente, el crecimiento de un nuevo tumor en el sitio objetivo depende de la angiogénesis. La metástasis tumoral a menudo ocurre incluso después de la extirpación del tumor primario porque las células tumorales o componentes pueden permanecer y desarrollar potencial metastásico. En una realización, el término "metástasis" de acuerdo con la invención se refiere a "metástasis a distancia" que se refiere a una metástasis que está alejada del tumor primario y del sistema de ganglios linfáticos regionales.
Tal como se usa en la presente memoria descriptiva, "trato", "tratar" o "tratamiento" de una enfermedad o trastorno significa lograr uno o más de lo siguiente: (a) reducción de la gravedad y/o duración del trastorno; (b) limitar o prevenir el desarrollo de síntomas característicos del trastorno o los trastornos que están siendo tratados; (c) inhibición del empeoramiento de los síntomas característicos del trastorno o los trastornos que están siendo tratados; (d) limitar o prevenir la recurrencia del trastorno o los trastornos en pacientes que han tenido previamente el trastorno o los trastornos; y (e) limitar o prevenir la recurrencia de los síntomas en pacientes que anteriormente eran sintomáticos para el trastorno o los trastornos.
Tal como se usa en la presente memoria, "prevenir", "que previene", "prevención" o "profilaxis" de una enfermedad o trastorno significa impedir que se produzca un trastorno en el sujeto.
Tal como se utiliza en la presente memoria, la "administración" incluye la administración in vivo, así como la administración directamente al tejido ex vivo, tal como injertos de venas.
Una "cantidad eficaz" es una cantidad de un agente terapéutico suficiente para lograr el propósito pretendido. La cantidad eficaz de un agente terapéutico determinado variará con factores tales como la naturaleza del agente, la vía de administración, el tamaño y la especie del animal para recibir el agente terapéutico, y el propósito de la administración. La cantidad eficaz en cada caso individual puede ser determinada empíricamente por un experto en la técnica según métodos establecidos en la técnica.
"Farmacéuticamente aceptable" significa aprobado por un organismo regulador del gobierno federal o estatal o listado en la Farmacopea de los Estados Unidos u otra farmacopea generalmente reconocida para uso en animales, y más particularmente en seres humanos.
El término "portador", tal como se utiliza en la presente memoria, se refiere a un diluyente, adyuvante, excipiente o vehículo con el que se administra el agente terapéutico. Tales portadores farmacéuticos pueden ser líquidos estériles, tales como soluciones salinas en agua y aceites, incluyendo los de petróleo, origen animal, vegetal o sintético, tales como aceite de cacahuete, aceite de soja, aceite mineral, aceite de sésamo y similares. Una solución salina es un portador preferido cuando la composición farmacéutica se administra en forma intravenosa. También se pueden emplear soluciones salinas y soluciones acuosas de dextrosa y glicerol como portadores líquidos, particularmente para soluciones inyectables. Los excipientes farmacéuticos adecuados incluyen almidón, glucosa, lactosa, sacarosa, gelatina, malta, arroz, harina, tiza, gel de sílice, estearato sódico, monoestearato de glicerol, talco, cloruro sódico, leche desnatada seca, glicerol, propileno, glicol, agua, etanol y similares. La composición, si se desea, puede contener también cantidades menores de agentes humectantes o emulsionantes, o agentes reguladores de pH. Estas composiciones pueden adoptar la forma de soluciones, suspensiones, emulsiones, comprimidos, pastillas, cápsulas, polvos, formulaciones de liberación sostenida y similares. La composición se puede formular como un supositorio, con aglutinantes y portadores tradicionales tales como triglicéridos. Los compuestos de la invención se pueden formular como formas neutras o de sales. Las sales farmacéuticamente aceptables incluyen aquellas formadas con grupos amino libres tales como los derivados de ácidos clorhídrico, fosfórico, acético, oxálico, tartárico, etc., y los formados con grupos carboxilo libres tales como los derivados de sodio, potasio, amonio, calcio, hidróxidos férricos, isopropilamina, trietilamina, 2-etilamino etanol, histidina, procaína, etc. Ejemplos de portadores farmacéuticos adecuados se describen en "Remington's Pharmaceutical Sciences" por EW Martin. Dichas composiciones contendrán una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto, preferiblemente en forma purificada, junto con una cantidad adecuada de
portador para proporcionar la forma para la administración apropiada al paciente. La formulación debe adecuarse al modo de administración.
Los métodos generalmente conocidos y practicados en los campos de biología molecular, biología celular, química de proteínas y técnicas de anticuerpos se describen completamente en las publicaciones actualizadas continuamente "Molecular Cloning: A Laboratory Manual" (Sambrook y colaboradores, Cold Spring Harbor); Current Protocols in Molecular Biology (F. M. Ausubel y colaboradores, Eds., Wiley & Sons); Current Protocols in Protein Science (J. E. Colligan y colaboradores eds., Wiley & Sons); Current Protocols in Cell Biology (J.S. Bonifacino y col., Wiley & Sons) y Current Protocols in Immunology (J. E. Colligan y colaboradores, Eds., Wiley & Sons). Se describen técnicas conocidas relacionadas con cultivo y los medios celulares en "Large Scale Mammalian Cell Culture" (Hu y colaboradores, Curr. Opin., Biotechnol., 8: 148, 1997), "Serum free Media" (K. Kitano, Biotechnol. 17:73, 1991) y "Suspension Culture of Mammalian Cells" (Birch y colaboradores, Bioprocess Technol. 19: 251, 1990).
Realizaciones de la divulgación
La presente divulgación divulga además una unidad estructural de unión que se une a un epítopo conformacional formado por las secuencias de aminoácidos X1X2ETCEX3RX4 (SEQ ID NO: 18) y XsXaKXzXgXgL (SEQ ID NO: 19) de C5a, en el que X1 se selecciona del grupo que consiste en N, H, D, F, K, Y y T; X2 se selecciona del grupo que consiste en D, L, Y y H; X3 se selecciona del grupo que consiste en Q, E y K; X4 se selecciona del grupo que consiste en A, V y L; X5 se selecciona del grupo que consiste en S, H, P y N; X6 se selecciona del grupo que consiste en H y N; X7 se selecciona del grupo que consiste en D, N, H, P y G; Xa se selecciona del grupo que consiste en M, L, I y V; y X9 se selecciona del grupo que consiste en Q, L e I. En otras palabras, una unidad estructural de unión divulgado en la presente memoria puede unirse al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 18 y al menos a un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 19.
La SEQ ID NO: 18 es una secuencia de consenso determinada mediante la comparación de los aminoácidos 30-38 de C5a humano con las secuencias de aminoácidos correspondientes en Pan troglodytes, Macaca mulatta, Sus scrofa, Equus caballus, Bos Taurus, Mus musculus, Rattus norvegicus, Canis lupus y Monodelphis domestica. La SEQ ID NO: 19 es una secuencia consenso determinada mediante la comparación de los aminoácidos 66-72 del C5a humano con las secuencias de aminoácidos correspondientes en Pan troglodytes, Macaca mulatta, Sus scrofa, Equus caballus, Bos Taurus, Mus musculus, Rattus norvegicus, Canis lupus y Monodelphis domestica.
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión se une a al menos un aminoácido de la secuencia de aminoácidos X2ETCEX3R (SEQ ID NO: 20), en donde X2 y X3 se definen como anteriormente. La SEQ ID NO: 20 es una versión más corta de la secuencia consenso de acuerdo con la SEQ ID NO: 18 y corresponde a los aminoácidos 31-37 de la C5a humano.
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión se une a al menos un aminoácido de la secuencia de aminoácidos X6KX7X8X9 ( (SEQ ID N°: 21), preferiblemente KX7X8 en donde X6 , X7 , Xs , y X9 se definen como anteriormente. La SEQ ID NO: 21 es una versión más corta de la secuencia de consenso de acuerdo con la SEQ ID NO: 19 y corresponde a los aminoácidos 67-71 de C5a humano. KX7X8 es una versión más corta de la secuencia consenso de acuerdo con la SEQ ID NO: 21 y corresponde a los aminoácidos 68-70 de C5a humano.
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión se une al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos X2ETCEX3R (SEQ ID NO: 20) y a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos KX7X8, en donde X2 , X3, X7, y X8 se definen como anteriormente.
La divulgación divulga que, el epítopo conformacional está formado por (a) secuencias de aminoácidos NDETCEQRA (SEQ ID N°: 2) y SHKd Mq L (SEQ ID N°: 3) de C5a (secuencias de Homo sapiens y Pan trogloditas); (b) secuencias de aminoácidos h DeTCEQRA (SeQ ID NO: 22) y SHk DlQL (SEQ ID NO: 23) de C5a (secuencias de Macaca mulatta); (c) secuencias de aminoácidos DDETCEERA (SEQ ID NO: 24) y SHKNIQL (SEQ ID No : 25) de C5a (secuencias de Sus scrofa); (d) secuencias de aminoácidos DLETCEQRA (SEQ ID NO: 26) y SHKHIQL (SEQ ID NO: 27) de C5a (secuencias de Equus caballus); (e) secuencias de aminoácidos DDETCEQrA (SEQ ID NO: 28) y HHKNMq L (SEQ ID NO: 29) de C5a (secuencias de Bos taurus); (f) secuencias de aminoácidos FYETCEERV (SEQ ID NO: 30) y PHKPVQL (SEQ iD NO: 31) de C5a (secuencias de Mus musculus); (g) secuencias de aminoácidos KYETCEQRV (SeQ ID NO: 32) y HHKGMLL (SEQ ID NO: 33) de C5a (secuencias de Rattus norvegicus); (h) secuencias de aminoácidos YDETCEQRA (Se Q ID NO: 34) y SNKPLQL (SEQ ID NO: 35) de C5a (secuencias de Canis lupus); o (i) secuencias de aminoácidos THETCEKRL (SEQ ID NO: 36) y NHKPVIL (SEQ ID NO: 37) de C5a (secuencias de Monodelphis domestica).
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión se une a al menos un aminoácido de una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en (a) DETCEQR (SEQ ID NO: 4); (b) DETCEER (SEQ ID NO: 38); (c) LETCEQR (SEQ ID NO: 39); (e) YETCEER (SEQ ID NO: 40); (f) YETCEQR (SEQ ID NO: 41); y (g) HETCEKR (SEQ ID NO: 42).
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión se une a al menos un aminoácido de una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en (a) HKDMQ (SEQ ID NO: 5), preferiblemente KDM; (b) HKDLQ
(SEQ ID NO: 43), preferiblemente KDL; (c) HKNIQ (SEQ ID NO: 44), preferiblemente KNI; (d) HKHIQ (SEQ ID NO: 45), preferiblemente KHI; (e) HKNMQ (SEQ ID NO: 46), preferiblemente KNM; (f) HKPVQ (SEQ ID NO: 47), preferiblemente KPV; (g) HKGML (SEQ ID NO: 48), preferiblemente KGM; (h) NKPLQ (SEQ ID NO: 49), preferiblemente KPL; y (i) HKPVI (SEQ ID NO: 50), preferiblemente KPV.
La divulgación divulga que la C5a es C5a humana. Por lo tanto, la unidad estructural de unión se una a un epítopo conformacional formado por los aminoácidos NDETCEQRA (SEQ ID NO: 2) y SHKDMQL (SEQ ID NO: 3) de C5a humana. En otras palabras, una unidad estructural de unión se puede unir al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 2 y a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 3. La SEQ ID NO: 2 corresponde a los aminoácidos 30-38 de C5a humana. La SEQ ID NO: 3 corresponde a los aminoácidos 66-72 de C5a humana. La secuencia de aminoácidos de C5a humana se representa en la SEQ ID NO: 1. La presente invención divulga que la unidad estructural de unión se une a al menos uno de los aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4). La SEQ ID NO: 4 corresponde a los aminoácidos 31-37 de C5a humana. La invención divulga además que la unidad estructural de unión se une a al menos uno de los aminoácidos HKDMQ (SEQ ID NO: 5), más preferiblemente a al menos uno de los aminoácidos KDM. La SEQ ID NO: 5 corresponde a los aminoácidos 67-71 de C5a humana; la secuencia KDM corresponde a los aminoácidos 68-70 de C5a humana. En realizaciones particularmente preferidas, la unidad estructural de unión se une al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4) ya al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos KDM.
La divulgación divulga además que las dos secuencias que forman el epítopo conformacional (por ejemplo, pares de secuencias de acuerdo con la SEQ ID NO: 18 y 19, SEQ ID NO: 2 y 3, SEQ ID NO: 22 y 23; SEQ ID NO: 24 y 25; SEQ ID NO: 26 y 27; SEQ ID NO: 28 y 29; SEQ ID NO: 30 y 31; SEQ ID NO: 32 y 33; SEQ ID NO: 34 y 35; SEQ ID NO: 36 y 37) están separadas por 1-50 aminoácidos contiguos que no participan en la unión la unidad estructural de unión de la divulgación. A continuación, dichos aminoácidos que no participan en la unión con la unidad estructural de unión de la divulgación se denominarán como "aminoácidos que no participan de la unión". Las dos secuencias que forman el epítopo conformacional están preferiblemente separadas por 6-45 aminoácidos contiguos que no participan en la unión, más preferiblemente por 12-40 aminoácidos contiguos que no participan en la unión, más preferiblemente por 18-35 aminoácidos contiguos que no participan en la unión, más preferiblemente por 24-30 aminoácidos contiguos que no participan en la unión, más preferiblemente por 25-29 aminoácidos contiguos que no participan en la unión, aún más preferiblemente por 26-28 aminoácidos contiguos que no participan en la unión, y lo más preferiblemente por 27 aminoácidos contiguos que no participan en la unión.
La divulgación divulga además que la unidad estructural de unión tiene una constante de unión a C5a, preferiblemente C5a humana, con un valor de Kd de 10nM o menor, preferiblemente 9 nM o menos, más preferiblemente 8 nM o menos, más preferiblemente 7 nM o menos, más preferiblemente 6 nM o menos, más preferiblemente 5 nM o menos, más preferiblemente 4 nM o menos, más preferiblemente 3 nM o menos, más preferiblemente 2 nM o menos, e incluso más preferiblemente 1 nM o menos.
La divulgación divulga además que una unidad estructural de unión puede presentar al menos 75% de actividad de bloqueo, preferiblemente al menos 80% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 85% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 90% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 95% de actividad de bloqueo, para efectos biológicos inducidos por una molécula de C5a, preferiblemente C5a humana. Estas actividades de bloqueo divulgadas se refieren a unidades estructurales de unión que comprenden un único parátopo que se une a C5a, preferiblemente C5a humana. En donde la unidad estructural de unión se divulga por comprender dos o más parátopos específicos de C5a, se logran dichas actividades de bloqueo de al menos 75%, preferiblemente al menos 80%, preferiblemente al menos 85%, etc., cuando una molécula de la unidad estructural de unión se pone en contacto con una cantidad de moléculas de C5a igual a la cantidad de parátopos específicos de C5a presentes en la unidad estructural de unión. En otras palabras, cuando los parátopos de la unidad estructural de unión divulgados aquí y C5a están presentes en concentraciones equimolares, la unidad estructural de unión divulgada aquí exhibe al menos 75% de actividad de bloqueo, preferiblemente al menos 80% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 85% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 90% de actividad de bloqueo, y más preferiblemente al menos 95% de actividad de bloqueo para efectos biológicos inducidos por C5a. Un efecto biológico preferido divulgado para ser bloqueado es la liberación de lisozima inducida por C5a de células de sangre humana. Los ensayos para determinar esta liberación de lisozima inducida por C5a y su bloqueo se describen en la sección de ejemplos.
La divulgación divulga que, la unidad estructural de unión no inhibe la actividad de CH50 en plasma humano. Los ensayos para determinar la actividad de CH50 son conocidos por el experto en la materia y se describen a continuación en la sección de ejemplos.
La presente divulgación divulga que la unidad estructural de unión no exhibe una actividad de bloqueo sobre al menos un efecto biológico inducido por C5b, preferiblemente la unidad estructural de unión no exhibe una actividad de bloqueo sobre ningún efecto biológico inducido por C5b.
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión es capaz de reducir la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre humana completa. Los ensayos para medir la producción de IL-8 en sangre completa son conocidos por el experto en la materia y se describirán más adelante en la sección de ejemplos.
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión se puede seleccionar de:
(a) anticuerpos o fragmentos de los mismos de unión al antígeno; (b) oligonucleótidos; (c) proteínas similares al anticuerpo; o (d) peptidomiméticos.
La presente divulgación divulga que, la unidad estructural de unión es un anticuerpo o un fragmento del mismo de unión al antígeno, siendo dicho anticuerpo seleccionado del grupo que consiste de anticuerpos policlonales, anticuerpos monoclonales, anticuerpos monovalentes, anticuerpos biespecíficos, anticuerpos heteroconjugados, anticuerpos multiespecíficos, anticuerpos desinmunizados, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados (en particular injertados en CDR), y anticuerpos humanos.
La presente divulgación divulga que, la unidad estructural de unión es un fragmento de unión al antígeno de un anticuerpo, siendo dicho fragmento seleccionado del grupo que consiste en fragmentos Fab, fragmentos Fab', fragmentos F(ab')2, fragmentos Fd , Fragmentos Fv, Fs enlazados por disulfuro (dsFv), anticuerpos de un solo dominio (también conocidos como nanocuerpos) y anticuerpos Fv de cadena sencilla (scFv).
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión es un anticuerpo o un fragmento del mismo de unión al antígeno que comprende: (i) una secuencia de CDR3 de cadena pesada como se expone en la SEQ ID NO: 6; o (ii) una secuencia CDR3 de cadena pesada como se expone en la SEQ ID NO: 7; en donde la secuencia de CDR3 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservadores, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1,2 o 3 adiciones de aminoácidos.
La divulgación divulga que, el anticuerpo o fragmento del mismo comprende además: (i) una secuencia de CDR3 de cadena ligera como se expone en la s Eq ID NO: 8; o (ii) una secuencia de CDR3 de cadena ligera como se expone en la SEQ ID NO: 9; en el donde la secuencia de CDR3 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos.
La divulgación divulga además que, el anticuerpo o fragmento comprende además al menos una de las siguientes secuencias: (i) una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 10; (ii) una secuencia CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 11; (iii) una secuencia CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 12; (iv) una secuencia CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 13; (v) una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 14; (vi) una secuencia CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 15; (vii) una secuencia de CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 16; o (viii) una secuencia de CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 17; en donde la secuencia de CDR2 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde la secuencia de CDR2 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservadores, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde la secuencia CDR1 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferentemente intercambios de aminoácidos conservadores, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde la secuencia de CDR1 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservadores, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos. Preferiblemente, el número total de estos cambios opcionales en cada una de las secuencias de aminoácidos de acuerdo con las SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16 y SEQ ID NO: 17, es decir, el número total de intercambios, supresiones y adiciones en cada secuencia, es 1 o 2.
La divulgación divulga además que la unidad estructural de unión puede ser un oligonucleótido. El oligonucleótido puede ser un aptámero de ácido nucleico, tal como un aptámero de ADN o un aptámero de ARN o un aptámero mixto que comprende nucleótidos de ADN y ARN. Uno o más nucleótidos pueden ser reemplazados por nucleótidos modificados tales como pirimidinas sustituidas con 2'flúor. Los aptámeros de ácido nucleico también se pueden conjugar con moléculas indicadoras fluorescentes, etiquetas de afinidad y/o macromoléculas. Por ejemplo, conjugar el aptámero con polietilenglicol (PEG) o con una macromolécula comparable aumentará la vida media biológica del aptámero.
La divulgación divulga además que la unidad estructural de unión puede ser una proteína similar a un anticuerpo, por ejemplo, una proteína similar a un anticuerpo como se ejemplificó anteriormente en la sección "Definiciones".
La divulgación divulga que la unidad estructural de unión puede ser un peptidomimético. Los peptidomiméticos divulgados en la presente divulgación se basan en proteínas similares a anticuerpos como se describió anteriormente. La divulgación divulga además que la unidad estructural de unión puede ser usada para la prevención y/o tratamiento de diversas enfermedades que implican inflamación aguda tales como síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS), sepsis, sepsis grave, choque séptico, lesiones relacionadas con isquemia/reperfusión tales como cardiopatía isquémica, lesión pulmonar aguda, neumonía, rechazo agudo y crónico de injerto en pacientes trasplantados, reacciones de injerto contra huésped, pero también enfermedades que implican tipos crónicos de inflamación tales como enfermedades glomerulares renales tales como glomerulonefritis y otras entidades de insuficiencia renal, Artritis
reumatoide y enfermedades autoinmunes similares tales como la enfermedad de Bechterew, enfermedades tipo lupus, enfermedad inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn, crecimiento de tumores o cáncer de órganos sólidos.
En un primer aspecto, la presente invención se refiere a un anticuerpo C5a o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende un conjunto de secuencias de CDR3 de cadena pesada, CDR2 de cadena pesada y CDR1 de cadena pesada y un conjunto de CDR3 de cadena ligera, CDR2 de cadena ligera, y secuencias de CDR1 de cadena ligera seleccionadas de uno de los siguientes conjuntos:
(i) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 6, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 10, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 14; y una secuencia CDR3 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 8, una secuencia CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 12, y una secuencia CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 16; o
(ii) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 7, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 11, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 15 y una secuencia de CDR3 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 9, una secuencia de CDR2 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 12 y una secuencia de cadena ligera de CDR1 de acuerdo con SEQ ID NO: 17;
en donde dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo tiene una constante de unión a C5a con un valor de Kd de 10 nM o menos.
La presente divulgación divulga además un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo que comprende: (i) una secuencia de CDR3 de cadena pesada como se establece en la SEQ ID NO: 6; o (ii) una secuencia de CDR3 de cadena pesada como se establece en SEQ ID NO: 7; en donde la secuencia CDR3 de la cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios conservativos de aminoácidos, deleciones de 1, 2 o 3 aminoácidos y/o adiciones de 1, 2 o 3 aminoácidos. El número total de estos cambios opcionales en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 6, es decir, el número total de intercambios, deleciones y adiciones, es 1 o 2. El número total de estos cambios opcionales en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 7, es decir, el número total de intercambios, eliminaciones y adiciones, es 1 o 2.
La divulgación divulga además que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo comprende además: (i) una secuencia de CDR3 de cadena ligera como se expone en la SEQ ID NO: 8; o (ii) una secuencia de CDR3 de cadena ligera como se expone en la SEQ ID NO: 9; en donde la secuencia de CDR3 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservativos,1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos. El número total de estos cambios opcionales en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 8, es decir, el número total de intercambios, supresiones y adiciones, es 1 o 2. El número total de estos cambios opcionales en la secuencia de aminoácidos de la SEQ ID NO: 9, es decir, el número total de intercambios, supresiones y adiciones, es 1 o 2.
La presente divulgación también divulga un anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo que comprende: (i) una secuencia de CDR3 de cadena ligera como se establece en SEQ ID NO: 8; o (ii) una secuencia de CDR3 de cadena ligera como se establece en SEQ ID NO: 9; en donde la secuencia CDR3 de la cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, 1, 2 o 3 deleciones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos. El número total de estos cambios opcionales en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 8, es decir, el número total de intercambios, deleciones y adiciones, es 1 o 2. El número total de estos cambios opcionales en la secuencia de aminoácidos de SEQ ID NO: 9, es decir, el número total de intercambios, eliminaciones y adiciones, es 1 o 2.
La presente divulgación divulga un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo que comprende además al menos una de las siguientes secuencias: (i) una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 10; (ii) una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 11; (iii) una secuencia de CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 12; (iv) una secuencia de CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 13; (v) una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 14; (vi) una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 15; (vii) una secuencia de CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 16; o (viii) una secuencia de CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 17; en donde la secuencia de CDR2 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde la secuencia de CDR2 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde la secuencia CDR1 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde la secuencia de CDR1 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos. El número total de estos cambios opcionales en cada una de las secuencias de aminoácidos de acuerdo con las SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 11, SEQ ID No : 13, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 16 y SEQ ID NO: 17, es decir, el número total de intercambios, supresiones y adiciones en cada secuencia, es 1 o 2.
La divulgación divulga además que el anticuerpo se selecciona del grupo que consiste en anticuerpos policlonales, anticuerpos monoclonales, anticuerpos monovalentes, anticuerpos biespecíficos, anticuerpos heteroconjugados, anticuerpos multiespecíficos, anticuerpos desinmunizados, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados (en particular, injertados con CDR) y anticuerpos humanos.
La invención divulga además que el fragmento de unión a antígeno de un anticuerpo se selecciona del grupo que consiste en fragmentos Fab, fragmentos Fab', fragmentos F(ab')2, fragmentos Fd, fragmentos Fv, Fvs unidos por disulfuro (dsFv), anticuerpos de dominio individual (también conocidos como nanocuerpos) y anticuerpos de cadena sencilla Fv (scFv).
La divulgación divulga además que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a un epítopo conformacional formado por secuencias de aminoácidos X1X2ETCEX3RX4 (SEQ ID NO: 18) y X5X6KX7X8X9L (SEQ ID NO: 19) of C5a, en donde X1 se selecciona del grupo que consiste en N, H, D, F, K, Y, y T; X2 se selecciona del grupo que consiste en D, L, Y, y H; X3 se selecciona del grupo que consiste en Q, E, y K; X4 se selecciona del grupo que consiste en A, V, y L; X5 se selecciona del grupo que consiste en S, H, P, y N; X6 se selecciona del grupo que consiste en H y N; X7 se selecciona del grupo que consiste en D, N, H, P, y G; X8 se selecciona del grupo que consiste en M, L, I, y V; y X9 se selecciona del grupo que consiste en Q, L, y I. En otras palabras, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno se une al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con SEQ ID NO: 18 y con al menos a un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con SEQ ID NO: 19. La divulgación divulga que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido de la secuencia de aminoácidos X2ETCEX3R (SEQ ID NO: 20), en donde X2 y X3 se definen como arriba. La divulgación divulga que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido de la secuencia de aminoácidos X6KX7X8X9 (SEQ ID NO: 21), más preferiblemente KX7X8 , en donde X6, X7, X8, y X9 se definen como arriba. La divulgación divulga además que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos X2ETCEX3R (SEQ ID NO: 20) y al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos KX7X8, en donde X2, X3, X7 , y X8 se definen como arriba.
En realizaciones preferidas del primer aspecto, el epítopo conformacional está formado por (a) secuencias de aminoácidos NDeTc EQRA (SEQ ID NO: 2) y SHKDMQL (SEQ ID NO: 3) de C5a (secuencias de Homo sapiens y Pan troglodytes). La divulgación describe además que el epítopo conformacional está formado por (a) secuencias de aminoácidos HDETCEQRA (SEQ ID NO: 22) y s Hk DLQL (SEQ ID NO: 23) de C5a (secuencias de Macaca mulatta); (b) secuencias de aminoácidos DDETCEERA (SEQ ID NO: 24) y SHKNIQL (SEQ ID No : 25) de C5a (secuencias de Sus scrofa); (c) secuencias de aminoácidos DLETCEQRA (SEQ ID NO: 26) y SHKHIQL (SEQ ID NO: 27) de C5a (secuencias de Equus caballus); (d) secuencias de aminoácidos DDETCEQrA (SEQ ID NO: 28) y HHKNMq L (SEQ ID NO: 29) de C5a (secuencias de Bos taurus); (e) secuencias de aminoácidos FYETCEErV (SEQ ID nO: 30) y PHKPVQL (SEQ ID NO: 31) de C5a (secuencias de Mus musculus); (f) secuencias de aminoácidos KYETCEQRV (SeQ ID NO: 32) y HHKGMLL (SEQ ID NO: 33) de C5a (secuencias de Rattus norvegicus); (g) secuencias de aminoácidos YDETCEQRA (SEQ ID nO: 34) y SNKPlQl (SEQ iD NO: 35) de C5a (secuencias de Canis lupus); o (h) secuencias de aminoácidos THETCEKRL (SEQ ID NO: 36) y NHKPVIL (SEQ ID NO: 37) de C5a (secuencias de Monodelphis domestica). En realizaciones más preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido dentro de una secuencia de aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4). La divulgación describe además que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo puede unirse a al menos un aminoácido dentro de una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en (a) DETCEER (SEQ ID NO: 38); (b) LETCEQR (SEQ ID NO: 39); (c) YETCEER (SEQ ID NO: 40); (d) YETCEQR (SEQ ID NO: 41); y (e) HETCEKR (SEQ ID NO: 42). En realizaciones aún más preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido dentro de una secuencia de aminoácidos HKDMQ (SEQ ID NO: 5), preferiblemente KDM. La divulgación describe además que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo puede unirse a al menos un aminoácido dentro de una secuencia de aminoácidos seleccionada del grupo que consiste en (a) HKDLQ (SEQ ID NO: 43), preferiblemente KDL; (b) HKNIQ (SEQ ID NO: 44), preferiblemente KNI; (c) HKHIQ (SEQ ID NO: 45), preferiblemente KHI; (d) HKNMQ (SEQ ID NO: 46), preferiblemente KNM; (e) HKPVQ (SEQ ID NO: 47), preferiblemente KPV; (f) HKGML (SEQ ID NO: 48), preferiblemente KGM; (g) NKPLQ (SEQ ID NO: 49), preferiblemente KPL; y (h) HKPVI (SEQ ID nO: 50), preferiblemente KPV.
En realizaciones particularmente preferidas del primer aspecto, el C5a es C5a humano. Por lo tanto, se prefiere que el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se una a un epítopo conformacional formado por los aminoácidos NDETCEQRA (SEQ ID NO: 2) y SHKDMQL (SEQ ID NO: 3) de C5a humano. En otras palabras, un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con esta realización preferida del primer aspecto se une al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 2 y al menos un aminoácido ácido dentro de la secuencia de aminoácidos según SEQ ID NO: 3. En realizaciones más preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4 ) En realizaciones más preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos HKDMQ (SEQ ID NO: 5), más preferiblemente a al menos un aminoácido dentro DE LA secuencia de aminoácidos KDM. En realizaciones particularmente preferidas, el anticuerpo o fragmento de unión a
antígeno del mismo se une al mismo tiempo a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos DETCEQR (SEQ ID NO: 4) y al menos a un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos KDM .
En realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo tiene una constante de unión a C5a, preferiblemente C5a humano, con un valor de Kd de 10 nM o menos, preferiblemente 9 nM o menos, más preferiblemente 8 nM o menos, más preferiblemente 7 nM o menos, más preferiblemente 6 nM o menos, más preferiblemente 5 nM o menos, más preferiblemente 4 nM o menos, más preferiblemente 3 nM o menos, más preferiblemente 2 nM o menos, e incluso más preferiblemente 1 nM o menos .
En realizaciones preferidas del primer aspecto, un anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno exhibe al menos 85% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 90% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 95% de actividad de bloqueo, para efectos biológicos inducidos por una molécula de C5a, preferiblemente C5a humana. Estas actividades de bloqueo preferidas se refieren a aquellas realizaciones, en donde el anticuerpo (o el fragmento del mismo de unión al antígeno) comprende un único parátopo que se une a C5a, preferiblemente C5a humana. En realizaciones, en donde el anticuerpo (o fragmento del mismo de unión al antígeno) comprende dos o más parátopos específicos de C5a, dichas actividades de bloqueo de al menos 85%, etc., se logran cuando se pone en contacto una molécula de una unidad estructural de unión con una cantidad de moléculas C5a igual al número de parátopos específicos de C5a presentes en el anticuerpo (o el fragmento del mismo de unión al antígeno). Por ejemplo, un anticuerpo anti-C5a típico del tipo IgG comprende dos parátopos capaces de unirse a C5a, mientras que un anticuerpo anti-C5a típico del tipo IgM comprende diez parátopos capaces de unirse a C5a. Por lo tanto, la actividad de bloqueo de un anticuerpo del tipo IgG debe determinarse poniendo en contacto dicho anticuerpo con C5a en una relación molar de 1:2. La actividad de bloqueo de un anticuerpo del tipo IgM debe determinarse poniendo en contacto dicho anticuerpo con C5a en una relación molar de 1:10. Al elegir estas relaciones molares, los parátopos dentro del anticuerpo y C5a están presentes en concentraciones equimolares. En otras palabras, cuando los parátopos de un anticuerpo (o fragmento del mismo de unión al antígeno) de acuerdo con el primer aspecto y C5a están presentes en concentraciones equimolares, el anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno exhibe al menos 80% de actividad de bloqueo, preferiblemente al menos 80% de actividad de bloqueo, más preferiblemente al menos 90% de actividad de bloqueo, y más preferiblemente al menos 95% de actividad de bloqueo para efectos biológicos inducidos por C5a. Un efecto biológico preferido que se bloquea es la liberación de lisozima inducida por C5a de células de sangre humana entera. Los ensayos para determinar esta liberación de lisozima inducida por C5a y su bloqueo se describen en la sección de ejemplos.
En realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo no inhibe la actividad de CH50 en plasma humano. Los ensayos para determinar la actividad de CH50 son conocidos por la persona experta y se describen a continuación en la sección de ejemplos.
En realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo no exhibe una actividad de bloqueo en al menos un efecto biológico inducido por C5b, preferiblemente el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo no exhibe una actividad de bloqueo en ningún efecto biológico inducido por C5b.
En realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo es capaz de reducir la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre entera humana. Los ensayos para medir la producción de IL-8 en sangre entera son conocidos por la persona experta y se describirán a continuación en la sección de ejemplos. La presente invención divulga un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo como se describe en las reivindicaciones para la prevención y/o el tratamiento de diversas enfermedades que involucran inflamación aguda tal como síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS), sepsis, sepsis grave, choque séptico, lesiones relacionadas con isquemia/reperfusión tales como cardiopatía isquémica, lesión pulmonar aguda, neumonía, rechazo agudo y crónico de injerto en pacientes trasplantados, reacciones de injerto contra huésped, pero también enfermedades que implican tipos crónicos de inflamación tales como enfermedades glomerulares renales tales como glomerulonefritis y otras entidades de insuficiencia renal, artritis reumatoide y enfermedades autoinmunes similares tales como enfermedad de Bechterew, enfermedades tipo lupus, enfermedad inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn, crecimiento de tumores o cáncer de órganos sólidos.
En las realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno comprende uno de (i) conjuntos A de secuencias de CDR3 de cadena pesada, CDR2 de cadena pesada y de CDR1 de cadena pesada como se enumera a continuación en la Tabla 1,
Tabla 1: Conjuntos de secuencias CDR de cadena pesada adecuadas para uso en los anticuerpos o fragmentos de los mismos de la presente invención
y comprende además el conjunto I de secuencias de CDR3 de cadena ligera, CDR2 de cadena ligera y CDR1 de cadena ligera como se enumeran en la Tabla 2 o (ii) conjunto H de secuencias de CDR3 de cadena pesada, CDR2 de cadena pesada y CDR1 de cadena pesada como se enumeran en la Tabla 1 y comprende además el conjunto IV de secuencias de CDR3 de cadena ligera, CDR2 de cadena ligera y CDR1 de cadena ligera como se enumeran en la Tabla 2.
Tabla 2: Conjuntos de secuencias de CDR de cadena ligera adecuadas para uso en los anticuerpos o fragmentos de los mismos de la presente invención
La presente divulgación divulga además que el anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno puede comprender uno de los conjuntos de CDR de cadena pesada A-H enumerados anteriormente en la Tabla 1 y uno de los conjuntos de CDR de cadena ligera I-IV enumerados anteriormente en la Tabla 2, es decir, una de las siguientes combinaciones de conjuntos: A-I, A-II, A-III, A-IV, BI, B-II, B-III, B-IV, C-I, C-II, C-III, C -IV, D-I, D-II, D-III, D-IV, E-I, E-II, E-III, E-IV, F-I, F-II, F-III, F-IV, GI, G-II , G-III, G-IV, H-I, H-II, H-III o H-IV, en donde cada secuencia de CDR3 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde cada secuencia de CDR2 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde cada secuencia de CDR1 de cadena pesada comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; en donde cada secuencia de CDR3 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2, o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; En el que cada secuencia de CDR2 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferiblemente intercambios de aminoácidos conservadores, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos; y en donde cada secuencia de CDR1 de cadena ligera comprende opcionalmente 1, 2 o 3 intercambios de aminoácidos, preferentemente intercambios de aminoácidos conservados, 1, 2 o 3 supresiones de aminoácidos y/o 1, 2 o 3 adiciones de aminoácidos.
En las realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento del mismo de unión a antígeno comprende un dominio VH que comprende, esencialmente consiste en o consiste en (i) el dominio VH de INab308 o (ii) el dominio VH de INab708.
Las secuencias de FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 y FR4 que definen los dominios VH de INab308 e INab708 se muestran más adelante en la Tabla 4.
En las realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento del mismo de unión a antígeno comprende un dominio VL que comprende, esencialmente consiste en o consiste en (i) el dominio VL de INab308 o (ii) el dominio VL de INab708.
Las secuencias de FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 y FR4 que definen los dominios VL de INab308 e INab708 se muestran más adelante en la Tabla 4.
En otras realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento del mismo de unión a antígeno comprende un dominio VH y un dominio VL, en donde
(i) dicho dominio VH comprende, esencialmente consiste en o consiste en el dominio VH de INab308 y dicho dominio VL comprende, esencialmente consiste en o consiste en el dominio VL de INab308; o
(ii) dicho dominio VH comprende, esencialmente consiste en o consiste en el dominio VH de INab708 y dicho dominio VL comprende, esencialmente consiste en o consiste en el dominio VL de INab708.
En realizaciones preferidas del primer aspecto, el anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno comprende una combinación de conjuntos de CDR tal como se describe en el presente documento, comprende dichas CDR en un marco de anticuerpo humano.
La referencia en la presente memoria a un anticuerpo que comprende con respecto a la cadena pesada del mismo una cadena particular, o una región o secuencia particular se refiere preferiblemente a la situación en la que todas las cadenas pesadas de dicho anticuerpo comprenden dicha cadena, región o secuencia particular. Esto se aplica correspondientemente a la cadena ligera de un anticuerpo.
Las enseñanzas dadas en la presente memoria con respecto a las secuencias específicas de ácido nucleico y aminoácidos, por ejemplo aquellas que se muestran en el listado de secuencias, deben ser interpretadas de modo que se refieran también a modificaciones de dichas secuencias específicas que dan como resultado secuencias que son funcionalmente equivalentes a dichas secuencias específicas, por ejemplo secuencias de aminoácidos que exhiben propiedades idénticas o similares a las de las secuencias de aminoácidos específicos y secuencias de ácidos nucleicos que codifican secuencias de aminoácidos que exhiben propiedades idénticas o similares a las de las secuencias de aminoácidos codificadas por las secuencias específicas de ácido nucleico. Una propiedad importante es retener la unión de un anticuerpo a su objetivo o mantener las funciones efectoras de un anticuerpo. Preferiblemente, una secuencia modificada con respecto a una secuencia específica, cuando reemplaza la secuencia específica en un anticuerpo retiene la unión de dicho anticuerpo a C5a, en particular al epítopo conformacional de C5a identificado en el presente documento, y preferiblemente retiene las funciones de dicho anticuerpo como se describe en la presente memoria , por ejemplo bloqueando la liberación de lisozima inducida por C5a de células de sangre entera humana y/o reduciendo la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre entera humana.
La presente divulgación divulga además que los expertos en la técnica apreciarán que en particular las secuencias de las regiones CDR, hipervariables y variables pueden modificarse sin perder la capacidad de unirse a C5a. Por ejemplo, las regiones CDR serán idénticas o altamente homólogas a las regiones especificadas en la presente memoria. Por "altamente homóloga" se contempla que de 1 a 5, preferiblemente de 1 a 4, tales como 1 a 3 o 1 o 2 sustituciones, supresiones o adiciones, se pueden hacer en las CDR. Además, las regiones hipervariables y variables pueden ser modificadas para que muestren una homología sustancial con las regiones específicamente descritas en la presente memoria.
Además, puede ser deseado, de acuerdo con la presente divulgación, modificar las secuencias de aminoácidos descritas en el presente documento, en particular las de las regiones constantes de la cadena pesada humana para adaptar la secuencia a un alotipo deseado, por ejemplo, un alotipo encontrado en la población caucásica.
La presente divulgación comprende además anticuerpos en los que se han realizado alteraciones en la región Fc con el fin de cambiar las propiedades funcionales o farmacocinéticas de los anticuerpos. Tales alteraciones pueden resultar en una disminución o aumento de la unión de C1q y CDC o de la unión de FcyR y ADCC. Las sustituciones se pueden hacer, por ejemplo, en uno o más de los residuos de aminoácidos de la región constante de la cadena pesada, causando de este modo una alteración en una función efectora mientras se conserva la capacidad de unirse al antígeno en comparación con el anticuerpo modificado, consultar las patentes estadounidenses Nos. 5.624.821 y 5.648.260.
La semivida in vivo de los anticuerpos se puede mejorar modificando el epítopo del receptor de salvamento del dominio constante de Ig o un dominio constante semejante al de Ig de modo que la molécula no comprende un dominio CH2 intacto o una región Fc de Ig intacta, consultar las patentes estadounidenses Nos. 6.121.022 y 6.194.551. La semivida in vivo puede además aumentarse haciendo mutaciones en la región Fc, por ejemplo, sustituyendo la treonina por la leucina en la posición 252, sustituyendo la treonina por la serina en la posición 254 o sustituyendo la treonina por la fenilalanina en la posición 256, consultar la patente estadounidense No. 6.227.375.
Además, el patrón de glicosilación de anticuerpos puede modificarse para cambiar la función efectora de los anticuerpos. Por ejemplo, los anticuerpos pueden expresarse en un transfectoma que no añade la unidad de fucosa normalmente unida a Asn en la posición 297 de la región Fc con el fin de aumentar la afinidad de la región Fc por los
receptores de Fc que, a su vez, resultará en una ADCC incrementada de los anticuerpos en presencia de células NK, consultar Shield y colaboradores (2002) JBC, 277: 26733. Además, puede hacerse la modificación de la galactosilación con el fin de modificar la CDC.
Alternativamente, la presente divulgación divulga que las mutaciones pueden introducirse aleatoriamente a lo largo de toda o parte de una secuencia codificante del anticuerpo anti-C5a, tal como por mutagénesis de saturación, y los anticuerpos anti-C5a modificados resultantes pueden ser cribados para determinar la actividad de unión.
En un segundo aspecto, la presente invención se refiere a una composición farmacéutica que comprende el anticuerpo o fragmento de unión del mismo de acuerdo con las reivindicaciones, y además comprende uno o más portadores, diluyentes, excipientes, rellenos, aglutinantes, lubricantes, deslizantes, desintegrantes, adsorbentes y/o conservantes farmacéuticamente aceptables.
En un tercer aspecto, la presente invención se refiere al uso de un anticuerpo o fragmento de unión del mismo de acuerdo con las reivindicaciones, para la preparación de una composición farmacéutica para la prevención y/o tratamiento de diversas enfermedades que implican inflamación aguda tal como síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS), sepsis, sepsis grave, choque séptico, lesiones relacionadas con isquemia/reperfusión tales como cardiopatía isquémica, lesión pulmonar aguda, neumonía, rechazo crónico y agudo de injerto en pacientes trasplantados, reacciones de injerto contra huésped, pero también enfermedades que implican tipos crónicos de inflamación tales como enfermedades glomerulares renales tales como glomerulonefritis y otras entidades de insuficiencia renal, artritis reumatoide y enfermedades autoinmunes similares tales como enfermedad de Bechterew, enfermedades del tipo lupus, enfermedad inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn, crecimiento tumoral o cáncer de órganos sólidos.
La presente divulgación divulga además un método para prevenir y/o tratar diversas enfermedades que implican inflamación aguda, tales como síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS), sepsis, sepsis severa, choque séptico, lesiones relacionadas con isquemia/reperfusión tales como enfermedad cardíaca isquémica, lesión pulmonar aguda, neumonía, rechazo de injerto agudo y crónico en pacientes trasplantados, reacciones de injerto contra huésped, pero también enfermedades que involucran tipos crónicos de inflamación, tales como enfermedades glomerulares renales tales como glomerulonefritis y otras entidades de insuficiencia renal, artritis reumatoide y enfermedades autoinmunes similares tales como la enfermedad de Bechterew, enfermedades de tipo lupus, enfermedad inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn, crecimiento tumoral o cáncer de órganos sólidos en un paciente que lo necesite, el método comprende administrar al paciente una cantidad efectiva de (a) una unidad estructural de unión de acuerdo con el primer aspecto o (b) un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con el segundo aspecto. En la práctica de cualquier aspecto de la presente invención, se puede administrar a un paciente una composición farmacéutica como la descrita anteriormente o un anticuerpo o fragmento del mismo de unión al antígeno mediante cualquier ruta establecida en la técnica que proporcione un nivel suficiente de la unidad estructural de unión en el paciente. Se puede administrar sistémica o localmente. Dicha administración puede ser en forma parenteral, transmucosa, por ejemplo, en forma oral, nasal, rectal, intravaginal, sublingual, submucosa, transdérmica o por inhalación. Preferiblemente, la administración es parenteral, por ejemplo, mediante inyección intravenosa o intraperitoneal, y también incluye, pero no se limita a, administración intraarterial, intramuscular, intradérmica y subcutánea. Si la composición farmacéutica de la presente invención se administra localmente, se puede inyectar directamente en el órgano o tejido a tratar, por ejemplo, en el órgano afectado por un tumor.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para administración oral pueden proporcionarse como cápsulas o tabletas; como polvos o gránulos; como soluciones, jarabes o suspensiones (en líquidos acuosos o no acuosos); como espumas o batidos comestibles; o como emulsiones. Los comprimidos o cápsulas de gelatina dura pueden comprender lactosa, almidón o derivados del mismo, estearato de magnesio, sacarina de sodio, celulosa, carbonato de magnesio, ácido esteárico o sus sales. Las cápsulas de gelatina blanda pueden comprender aceites vegetales, ceras, grasas, polioles semisólidos o líquidos, etc. Las soluciones y jarabes pueden comprender agua, polioles y azúcares.
Un agente activo destinado a la administración oral puede ser recubierto o mezclado con un material que retrasa la desintegración y/o absorción del agente activo en el tracto gastrointestinal (por ejemplo, se pueden utilizar monoestearato de glicerilo o diestearato de glicerilo). De este modo, la liberación sostenida de un agente activo se puede conseguir durante muchas horas y, si es necesario, el agente activo puede protegerse de ser degradado dentro del estómago. Las composiciones farmacéuticas para administración oral pueden formularse para facilitar la liberación de un agente activo en una localización gastrointestinal particular debido al pH específico o a condiciones enzimáticas. Las composiciones farmacéuticas adaptadas para administración transdérmica pueden proporcionarse como parches discretos destinados a permanecer en contacto íntimo con la epidermis del receptor durante un período de tiempo prolongado. Las composiciones farmacéuticas adaptadas para administración tópica pueden proporcionarse como ungüentos, cremas, suspensiones, lociones, polvos, soluciones, pastas, geles, atomizadores, aerosoles o aceites. Para la administración tópica a la piel, boca, ojos u otros tejidos externos se usa preferentemente un ungüento o crema tópica. Cuando se formula en un ungüento, el ingrediente activo se puede emplear ya sea con una base de ungüento parafínico o miscible con agua. Alternativamente, el ingrediente activo puede formularse en una crema con una base de aceite en agua o una base de agua en aceite. Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la administración
tópica a los ojos incluyen gotas para los ojos. En estas composiciones, el ingrediente activo puede disolverse o suspenderse en un portador adecuado, por ejemplo, en un disolvente acuoso. Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la administración tópica en la boca incluyen grageas, pastillas y enjuagues bucales.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para administración nasal pueden comprender portadores sólidos tales como polvos (preferiblemente con un tamaño de partícula en el intervalo de 20 a 500 micrómetros). Los polvos se pueden administrar en la forma en que se aspira el rapé, es decir, por inhalación rápida a través de la nariz desde un contenedor para polvo mantenido cerca de la nariz. Alternativamente, las composiciones adoptadas para administración nasal pueden comprender portadores líquidos, por ejemplo, aerosoles nasales o gotas nasales. Estas composiciones pueden comprender soluciones acuosas u oleosas del ingrediente activo. Las composiciones para la administración por inhalación pueden suministrarse en dispositivos especialmente adaptados que incluyen, pero no limitados a, aerosoles presurizados, nebulizadores o insufladores, que pueden construirse de manera que proporcionen dosificaciones predeterminadas del ingrediente activo. En una realización preferida, las composiciones farmacéuticas de la invención se administran a través de la cavidad nasal a los pulmones.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la administración rectal pueden proporcionarse como supositorios o enemas. Las composiciones farmacéuticas adaptadas para la administración vaginal pueden proporcionarse como pesarios, tampones, cremas, geles, pastas, espumas o formulaciones en aerosol.
Las composiciones farmacéuticas adaptadas para administración parenteral incluyen soluciones o suspensiones inyectables estériles acuosas y no acuosas, que pueden contener antioxidantes, reguladores, bacteriostáticos y solutos que hacen que las composiciones sean sustancialmente isotónicas con la sangre de un receptor deseado. Otros componentes que pueden estar presentes en tales composiciones incluyen agua, alcoholes, polioles, glicerina y aceites vegetales, por ejemplo. Las composiciones adaptadas para administración parenteral pueden presentarse en recipientes de dosis unitaria o múltiples, por ejemplo ampollas y viales sellados, y pueden almacenarse en una condición secada por congelación (liofilizada) que requiere solamente la adición de un vehículo líquido estéril, por ejemplo, solución salina estéril para inyecciones, inmediatamente antes del uso. Las soluciones y suspensiones inyectables extemporáneas pueden prepararse a partir de polvos, gránulos y comprimidos estériles.
La divulgación divulga que la composición se puede formular de acuerdo con procedimientos rutinarios como una composición farmacéutica adaptada para administración intravenosa a seres humanos. Típicamente, las composiciones para administración intravenosa son soluciones en reguladores acuosos isotónicos estériles. Cuando sea necesario, la composición puede incluir también un agente de solubilización y un anestésico local tal como lidocaína para aliviar el dolor en el sitio de la inyección. Generalmente, los ingredientes se suministran por separado o se mezclan juntos en forma de dosificación unitaria, por ejemplo, como un polvo seco liofilizado o concentrado sin agua en un recipiente sellado herméticamente tal como una ampolla o bolsita que indica la cantidad de agente activo. Cuando la composición se va a administrar por infusión, se puede dispensar con una botella de infusión que contiene agua estéril de calidad farmacéutica o solución salina. Cuando la composición se administra por inyección, se puede proporcionar una ampolla de solución salina estéril para que los ingredientes se puedan mezclar antes de la administración.
La divulgación divulga que puede administrarse un inhibidor de quimioatracción en un sistema de liberación controlada. Por ejemplo, el inhibidor puede administrarse mediante infusión intravenosa, una bomba osmótica que puede ser implantada, un parche transdérmico, liposomas u otros modos de administración. Se puede usar una bomba (véase Sefton (1987) C1-C Crit. Ref. Biomed Eng. 14: 201 Buchwald y colaboradores (1980) Surgery 88: 507 Saudek. y colaboradores (1989) N. Eng. J. Med. 321: 574). El compuesto puede administrarse en una vesícula, en particular un liposoma (véase Langer (1990) Science 249: 1527-1533, Treat y colaboradores, (1989) en liposomes in the therapy of infectious disease and cancer, López- Berestein y Fidler (eds.), Liss, NY, 353-365, el documento WO 91/04014, patente estadounidense No. 4.704.355). Se pueden usar materiales poliméricos (véase Medical Applications of Controlled Release(1974) Langer y Wise (eds.), CRC Press: Boca Raton, FL., Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance, (1984) Smolen y Ball (eds.), Wiley: N.Y.; Ranger y Peppas (1953) J. Macromol. Sci. Rev. Macromol. Chem. 23: 61; véase también Levy y colaboradores (1985) Science 228:190; During y colaboradores (1989) Ann. Neurol. 25: 351; Howard y colaboradores (1989) J. Neurosurg. 71: 105).
Se divulga además que puede colocar un sistema de liberación controlada en la proximidad del objetivo terapéutico, es decir, las células, tejido u órgano objetivo, requiriendo de este modo sólo una fracción de la dosis sistémica (véase, por ejemplo, Goodson (1984) 115-138 en Medical Applications of Controlled Release, vol. 2). Otros sistemas de liberación controlada se discuten en la revisión de Langer (1990, Science 249: 1527-1533).
Se divulga además que puede ser deseable administrar las composiciones farmacéuticas de la invención localmente a la zona que necesita tratamiento; esto puede lograrse, por ejemplo, y no a manera de limitación, por infusión local durante la cirugía, aplicación tópica, por ejemplo, junto con un vendaje para heridas después de la cirugía, por inyección, mediante un catéter, por medio de un supositorio, o por medio de un implante, siendo dicho implante de un material poroso, no poroso o gelatinoso, incluyendo membranas, tales como membranas silásticas, o fibras.
La selección de la dosis eficaz preferida será determinada por un experto en la materia con base en la consideración de diversos factores que serán conocidos por un experto en la técnica. Tales factores incluyen la forma particular de la composición farmacéutica, por ejemplo, un polipéptido o vector, y sus parámetros farmacocinéticos tales como
biodisponibilidad, metabolismo, semivida, etc., que se habrán establecido durante los procedimientos habituales de desarrollo empleados típicamente en la obtención de la aprobación reguladora para un compuesto farmacéutico. Otros factores en la consideración de la dosis incluyen la afección o enfermedad que debe prevenirse o tratarse o el beneficio que se debe conseguir en un individuo normal, la masa corporal del paciente, la vía de administración, si la administración es aguda o crónica, medicamentos concomitantes, y otros factores bien conocidos que afectan la eficacia de los agentes farmacéuticos administrados. Por lo tanto, la dosis precisa debe decidirse de acuerdo con el juicio del médico y las circunstancias de cada paciente, por ejemplo, dependiendo de la condición y el estado inmunitario del paciente individual, de acuerdo con técnicas clínicas estándar.
En la práctica de la presente divulgación en relación con la prevención y/o el tratamiento del crecimiento de tumores o cáncer de órganos sólidos, el sujeto al que se le administra la unidad estructural de unión o anticuerpo de la invención se trata adicionalmente con un agente quimioterapéutico, radiación, o un agente que modula, por ejemplo, aumenta o inhibe, la expresión o actividad de un receptor de Fc, por ejemplo un receptor de Fc-gamma, tal como una citoquina. Las citoquinas típicas para la administración durante el tratamiento incluyen factor estimulante de colonias de granulocitos (G-CSF), factor estimulante de colonias de granulocitos-macrófagos (GM-CSF), interferón y (IFN-y) y factor de necrosis tumoral (TNF). Los agentes terapéuticos típicos incluyen, entre otros, agentes antineoplásicos tales como doxorubicina, cisplatino, taxotere, 5-fluoruracilo, metotrexato, gemzitabina y ciclofosfamida.
Las siguientes figuras y ejemplos son meramente ilustrativos de la presente invención y no deben interpretarse de ninguna manera como limitantes del alcance de la invención como se indica por las reivindicaciones adjuntas.
Breve descripción de las figuras
La Fig. 1 muestra el efecto de mutantes de C5a en la liberación de enzimas a partir de células sanguíneas
Los aminoácidos potenciales en las moléculas de C5a para constitución de epítopos de anticuerpo fueron mutados en alanina, y estos mutantes C5a se ensayaron en cuanto a su bioactividad para inducir liberaciones de lisozima de células de sangre humana entera. La mutación en el sitio de C5a que da como resultado una pérdida de bioactividad de más del 50% en comparación con la C5a humana fue considerada como un sitio crítico para la función biológica de C5a. Estos sitios son 24, 29, 31, 37, 68 y 69.
La Fig. 2 muestra la capacidad de unión de INab308 a mutantes de C5a
C5a y mutantes de C5a fueron colocados en una placa de 96 pozos. Las capacidades de unión de lNab308 a estas proteínas se evaluaron mediante el método ELISA. La pérdida de capacidad de unión superior al 50% se considera significativa. Los datos indican que INab308 se une a dos regiones, 31-37 y 68-69.
La Fig. 3 muestra la capacidad de unión de INab708 a mutantes de C5a
C5a y mutantes de C5a se colocaron en una placa de 96 pozos. Las capacidades de unión de INab708 a estas proteínas se evaluaron mediante un procedimiento ELISA. La pérdida de capacidad de unión superior al 50% se considera significativa. Los datos indican que INab708 se une a dos regiones, 31-37 y 68-70.
Fig. 4: INab308 e INab708 no afectan la actividad de CH50 en plasma humano
La actividad hemolítica en plasma humano se determinó mediante el ensayo clásico de CH50. Los Mab para C5a humana que incluyen INab708, INab308 y F20, fueron incubados previamente con plasma humano, y luego se realizó posteriormente el ensayo de CH50. Entre estos anticuerpos, F20 inhibe fuertemente la actividad de c H50, mientras que INab708 e INab308 no tienen influencia cuando se usan a una concentración de aprox. 5 pM, que es significativamente mayor que la concentración de C5 que se presenta en sangre humana entera (aproximadamente 0,4 pM).
La Fig. 5 muestra una comparación de los efectos de bloqueo de INab308, INab708 y L2B23 sobre la bioactividad de C5a
La actividad de bloqueo de INab308, INab708 y L2B23 se evaluó mediante el ensayo de liberación de lisozima inducida por C5a. La relación molar de anticuerpo con respecto a C5a se ajustó en 1:2 para evaluar la actividad de bloqueo de un anticuerpo con respecto al efecto biológico provocado por dos moléculas de C5a. Los datos muestran que INab308 e INab708 poseen una actividad de bloqueo muy alta (> 90%) para la bioactividad de C5a, mientras que L2B23 sólo muestra un efecto mínimo.
La Fig. 6 muestra el efecto inhibidor de INab308 e INab708 sobre la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre entera humana
Se incubó E. coli con sangre entera durante 4 horas, y se evaluaron los niveles de IL-8 mediante ELISA. En presencia de INab308 e INab708 durante la incubación, se atenuaron significativamente los niveles de IL-8 (P <0,01), mientras que no hubo reducción significativa con la presencia de L2B23.
Ejemplos
1. Métodos
1.1 Preparación de C5a recombinante y mutante de C5a:
Se obtuvieron secuencias de ADN que codifican C5a humana mediante reacción en cadena de polimerasa de transcriptasa inversa (RT-PCR) usando ARN aislado de leucocitos de sangre periférica. Se generaron mutantes de C5a usando métodos de PCR mediante introducción del GCT (alanina) en el sitio de mutación. Se ligó luego el ADN de C5a con pET-32a (Novagen, Gibbstown, NJ) y se usó la mezcla de ligación para transformar células competentes JM109. Los plásmidos de expresión se transformaron en BL21 usando un método estándar de cloruro de calcio. Se recogió una sola colonia de una placa de cultivo Luria-Bertani (LB), se inoculó en medio LB con ampicilina y se incubó a 37°C durante la noche. El cultivo se transfirió a 2 litros de medio LB y se incubó a 37°C hasta fase exponencial media (A600 = 0,6), y después se añadió isopropil-p-D-tiogalactopiranósido (IPTG) hasta una concentración final de 0,1 mM. Se dejó que las células continuaran creciendo a 30°C durante la noche y se recogieron mediante centrifugación del cultivo a 7.000 rpm, 4°C, durante 15 min. Después de lavar con solución salina regulada con fosfato (PBS; PB 10 mM, NaCl 150 mM [pH 7,4]) una vez, el sedimento de bacterias se resuspendió en PBS y se sonicó sobre hielo. Después de la centrifugación a 12.000 rpm, 4°C, durante 15 min, la fracción soluble se separó del sedimento insoluble. Para purificar C5a humana recombinante, el sobrenadante de lisado celular se cargó en una columna de afinidad quelada con níquel equilibrada previamente con PBS. A continuación, la columna se lavó con imidazol 50 mM e imidazol 200 mM en PBS, respectivamente. Finalmente, las proteínas unidas se eluyeron con imidazol 500 mM, se dializaron contra PBS durante la noche y se analizaron mediante electroforesis en gel de poliacrilamida de dodecil sulfato de sodio (SDS-PAGE). 1.2 Inmunización y cribado de hibridomas mediante ELISA:
Los anticuerpos monoclonales se prepararon usando métodos de hibridoma. La inmunización y producción de MAb se llevaron a cabo utilizando protocolos estándar. Cinco ratones hembra BALB/c de 4 semanas de edad se inmunizaron subcutáneamente con 100 |jg de C5a recombinante purificada en adyuvante de Freund completo por animal. Los animales fueron reforzados dos veces a intervalos de 4 semanas utilizando 100 jg de antígeno en adyuvante incompleto de Freund. Tres días después del refuerzo final, los ratones fueron sacrificados, y sus esplenocitos se fusionaron con NS-1 en una relación de 5:1, y se sembraron en 5 placas de 96 pozos 200 jL de células en cada pozo. Los híbridos se seleccionaron en un medio Eagle modificado de Dulbecco (DMEM) suplementado con suero fetal de ternera al 20% y hipoxantina 5 x 10' 3 M, aminopterina 2 x 10' 5 M, y timidina 8 x 10' 4 M (hAt ).
Después de 8 días, se cribaron clones celulares que secretan anticuerpos contra C5a humana mediante ensayo inmunoabsorbente ligado a enzima (ELISA). Brevemente, se revistió una placa de 96 pozos con 2 pg/mL de C5a humana recombinante a 4°C durante la noche. Después de ser bloqueada con leche desnatada al 5% en PBS a 37°C durante 1 h, se añadieron 50 jL de medio de cultivo de los clones en crecimiento a cada pozo y se incubaron a 37°C durante 1 h, seguido de 100 jL de anticuerpo antirratón de cabra marcado con peroxidasa de rábano picante (HRP) durante 1 h. La reacción de peroxidasa se desarrolló con una solución para desarrollo de color que contenía clorhidrato de o-fenilendiamina (OPD) 5,5 mM y H2O28,5 mM. Se midió la absorbancia de luz a 492 nm con un lector de ELISA (Anthos, Wals/Salzburgo, Austria).
1.3 Producción y purificación de anticuerpos monoclonales:
Para producir el Mab en grandes cantidad, se inyectaron 5x106 células de hibridoma en la cavidad peritoneal de ratones. Después de 14 días, se retiró la ascitis y se centrifugó a 1500 rpm, 4°C, durante 5 min. El sobrenadante se recogió y se aplicó a una columna de proteína A-Sefarosa 4B, que había sido previamente equilibrada en PBS. Se eluyó el Mab enlazado con ácido cítrico (pH 4,0) y se dializó contra PBS durante la noche. Las proteínas purificadas se analizaron por SDS-PAGE.
1.4 Ensayo de liberación de enzimas para la bioactividad de C5a
La inducción de liberación de enzima por desgranulación es una característica biológica importante de C5a. En nuestro estudio, se uso sangre entera humana fresca de voluntarios sanos para evaluar el efecto de C5a en las liberaciones de lisozima. Los niveles de lisozima liberados por células de sangre entera se analizaron mediante el kit de ensayo de lisozima EnzChek® (Invitrogen, CA, EE.UU.). Para estudiar la actividad de bloqueo de anticuerpos anti-C5a, se mezcló rhC5a (100 nM) con diferentes concentraciones de anticuerpo. A continuación, se añadieron inmediatamente células de sangre entera para evitar la incubación previa de anticuerpos con C5a. Después de la incubación, se añadieron 50 pL de los sobrenadantes de la muestra a 50 pL de solución diluida de sustrato. Se incubó la placa a 37°C durante 30 minutos en la oscuridad y se leyó después con un contador de etiquetas múltiples Perkin Elmer 1420 (Massachusetts, EE.UU.). Se midió la intensidad de la fluorescencia con una excitación a 490 nm y una emisión a 525 nm y se retó el valor del estándar cero (blanco) de todas las muestras. Se calculó la actividad de bloqueo del anticuerpo después de restar la intensidad de fluorescencia de la liberación de lisozima independiente de rhC5a (control del regulador) de la intensidad de la fluorescencia de la liberación de lisozima inducida por rhC5a. Se calculó la actividad de bloqueo con la siguiente fórmula, actividad de bloqueo = C5a Fluorescencia -(C5a+Ab) Fluorescencia/C5a Fluorescencia - Control del regulador Fluorescencia.
1.5 Análisis ELISA de la capacidad de unión de INab308 e INab708 con C5a humana o mutantes de C5a
Se llevó a cabo un ELISA de unión para determinar las actividades de unión de INab308 e INab708 con C5a humana o mutantes de C5a. Se produjeron mutantes de C5a sustituyendo el aminoácido correspondiente por alanina mediante la introducción de GCT en el sitio de mutación a partir del nivel de ADNc. Estos mutantes de C5a incluyen la mutación en el sitio 24, 29, 30, 31, 32, 35, 36, 37, mutación doble 30/37, 40, 53, 64, 65, 66, 68, 64/68, 66/68, 69, 70 y C-del (se suprimieron 12 aminoácidos del extremo terminal C de 5aC).
Se colocaron C5a humana (Sigma C5788), C5a recombinante y mutantes de C5a (2 pg/ml) en una placa EIA de 96 pozos (Costar 9018) a 4°C durante la noche. Después de ser bloqueada con leche desnatada al 5% en PBS a 37°C durante 1 h, se añadieron 0,08; 0,4; 2 pg/mL de anticuerpos anti-C5a (INab308 e INab708) preparados con regulador de dilución a cada pozo y se incubó a 37°C durante 1 h, seguido de 100 pL de anticuerpo antirratón de cabra marcado con peroxidasa de rábano picante (HRP) durante 1 h. Se desarrolló la reacción de peroxidasa con una solución para desarrollo de color que contenía clorhidrato de o-fenilendiamina (OPD) 5,5 mM y H2O28,5 mM. Se midió la absorbancia de luz a 492 nm con un lector de ELISA (Anthos, Wals/Salzburgo, Austria). Se fijo el valor de OD para C5a recombinante como 100% de actividad de unión. La capacidad de unión de mutantes C5a se calcula mediante ODmutante de C5a /ODc5 a .
1.6 Actividad hemolítica en plasma (CH50):
En resumen, se prepararon glóbulos rojos de oveja (sRBC) a partir de sangre entera fresca de oveja por centrifugación, y luego se sensibilizaron con anti-sRBC. Se diluyeron en forma seriada muestras de plasma de voluntarios sanos y se incubaron con sRBC sensibilizado. Media hora después de la incubación, las células no lisadas se centrifugaron y los sobrenadantes se leyeron a 542 nm en un lector de placas. Para determinar el efecto de los anticuerpos anti-C5a sobre la activación de C5, se incubaron previamente volúmenes iguales de anticuerpo anti-C5a y plasma durante 1 hora antes de la adición de sRBC sensibilizado.
1.7 Producción de IL-8 en el modelo de sangre entera de infección por E. coli:
Para evaluar la eficacia de los anticuerpos anti-C5a en el entorno cercano a la sepsis clínica, se colocaron anticuerpos anti-C5a en 250 pL de sangre entera de voluntarios sanos y se añadieron luego 250 pL de E. coli diluido en regulador salino con una concentración de 1x107/ml. Después de 4 horas de incubación a 37°C, se centrifugaron los sobrenadantes y se recogieron para análisis mediante ELISA de IL-8. Se analizaron los niveles de IL-8 en los sobrenadantes mediante el kit de ELISA para IL-8 (BioLegend, EE.UU.).
1.8 Ensayo para cribar anticuerpos que se unen al nuevo epítopo conformacional:
En la estructura tridimensional de C5a obtenida a partir del método de modelación informática, se pueden observar los epítopos espaciales que contienen al péptido C5a 28-40 (VNNDETCEQRAAR, SEQ ID NO: 67) y al péptido C5a 65-70 (ISHKDM, SEQ ID NO: 68) como espirales aleatorias. Cuando los dos péptidos están enlazados por medio de un enlazador peptídico flexible, GGGGS (SEQ ID NO: 69), se reconstruyen los epítopos espaciales asemejándose a la conformación del antígeno progenitor, ya que la interacción hidrófoba débil de los dos péptidos asegura una conformación con forma de bolsillo. El análisis por modelación informática del péptido NH2-28-40-Enlazador(GGGGS)-65-70-COOH mantiene la misma conformación que el antígeno progenitor. Este nuevo péptido 24-AA puede ser sintetizado y conjugado con hemocianina de lapa (KLH) para formar un inmunógeno para inmunizar ratones, y puede aplicarse la tecnología de hibridoma tradicional posteriormente para obtener INab308 e INab708 usando el ELISA con base en el nuevo péptido 24-AA como herramienta de cribado.
Se recubre una placa de ELISA de 96 pozos con 1-2 pg/mL de péptidos sintéticos con el epítopo conformacional a 4°C durante la noche. Después de haber sido bloqueado con leche desnatada al 5% en PBS a 37°C durante 1 h, se añaden 50 pL de medio de cultivo de los clones de cultivo de hibridoma a cada pozo y se incubó a 37°C durante 1 h, seguido de 100 pL de anticuerpo antirratón de cabra marcado con peroxidasa de rábano picante (HRP) durante 1 h. La reacción de peroxidasa se desarrolla con una solución para desarrollo de color que contiene clorhidrato de o-fenilendiamina (OPD) 5,5 mM y H2O28,5 mM. La absorbancia de luz se mide a 492 nm con un lector de ELISA.
2. Resultados
2.1 Identificación de aminoácidos relevantes para la actividad de C5a
Varios aminoácidos dentro de la molécula de C5a que constituyen epítopos de anticuerpos posibles se mutaron en alanina. En particular, los mutantes de C5a incluyen mutaciones en el sitio en 24, 29, 30, 31, 32, 35, 36, 37, mutación doble 30/37, 40, 53, 64, 65, 66, 68, 64/68, 66/68, 69, 70 y C-del (se suprimieron 12 aminoácidos del extremo terminal C de C5a). Los mutantes C5a se ensayaron en cuanto a su bioactividad para inducir la liberación de lisozima de células de sangre entera humana (Figura 1).
La mutación en el sitio de C5a que resulta en una pérdida de bioactividad de más del 50% en comparación con la C5a humana se consideró como un sitio crítico para la función biológica de C5a. Así, los residuos de aminoácidos 24, 29, 31, 37, 68 y 69 se identificaron como sitios críticos para la función (Figura 1).
2.2 Caracterización de los epítopos sobre C5a unido mediante los anticuerpos INab308 e INab708
Se cribaron 2000 clones de células que secretan anticuerpos contra C5a humana con el ensayo funcional (liberación de enzima. Únicamente dos anticuerpos exhibieron actividad superior.
Estos dos anticuerpos, INab308 e INab708, fueron después caracterizados con respecto a los aminoácidos particulares sobre C5a reconocidos por los dos anticuerpos.
En particular, se generaron varios mutantes de C5a en los cuales se reemplazaron uno o más aminoácidos por alanina. Los anticuerpos INab308 e INab708 se pusieron en contacto con estos mutantes y se determinó el grado de unión mediante ELISA (véase la sección 1.5 anterior). Se consideró significativa una pérdida de capacidad de unión superior al 50% (en comparación con C5a de tipo silvestre).
Los datos indican que INab308 se une a dos regiones, 31-37 y 68-69 (Figura 2). Del mismo modo, INab708 se une a dos regiones, 31-37 y 68-70 (Fig. 3).
Notablemente, las regiones identificadas para ambos anticuerpos cubren cuatro residuos de aminoácidos (31, 37, 68 y 69) que se identificaron como sitios críticos para la función de C5a en la sección 2.1 anterior.
2.3 Efecto de los anticuerpos INab308, INab708 y F20 en la actividad hemolítica en plasma humano
El título de complemento hemolítico total (CH50) es un método convencional para la determinación de la activación de la vía clásica del complemento (véase la sección 1.6).
Los anticuerpos monoclonales para C5a (INab708, INab308 y F20) se incubaron previamente con plasma humano a una concentración de aproximadamente 5 j M, y luego se realizó el ensayo de CH50. Entre estos anticuerpos, F20 inhibe fuertemente la actividad de CH50, mientras que INab708 e INab308 no tienen influencia (Fig. 4).
Estos resultados demuestran que INab708 e INab308 no interfieren con la activación del complemento mediada por C5b.
2.4 Efecto de los anticuerpos INab308, INab708 y L2B23 sobre la bioactividad de C5a
La actividad de bloqueo de los anticuerpos INab308, INab708 y L2B23 en C5a se evaluó mediante ensayo de liberación de lisozima inducida por C5a (véase la sección 1.4). La relación molar de anticuerpo con respecto a C5a se ajustó en 1: 2 para evaluar la actividad de bloqueo de un anticuerpo con respecto al efecto biológico provocado por dos moléculas de C5a. Estos anticuerpos son anticuerpos bivalentes. Por consiguiente, eligiendo la relación molar anterior de 1:2, los parátopos de los anticuerpos, por una parte, y C5a, por otra parte, están presentes en concentraciones equimolares. Los datos de la Fig. 5 muestran que INab308 e INab708 poseen una actividad de bloqueo muy alta con respecto a la bioactividad de C5a (94% y 100%, respectivamente), mientras que L2B23 sólo muestra un efecto mínimo (aproximadamente 12%).
2.5 Efecto de los anticuerpos INab308 e INab708 sobre la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre entera humana
Para evaluar la eficacia de anticuerpos anti-C5a en un entorno cercano a la sepsis clínica, se determinó la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre entera. Este ensayo puede considerarse como un modelo de infección por E. coli (véase también la sección 1.7).
En presencia de INab308 e INab708 durante la incubación, los niveles de IL-8 se atenuaron significativamente (P <0,01), mientras que no hubo reducción significativa en presencia de L2B23 (Figura 6).
3. Resumen
Las propiedades importantes de los anticuerpos preferidos de la invención INab308 e INab708 se resumen en la Tabla 3 a continuación. Se incluyen además anticuerpos comparativos 8g8, MAb 137-26, Ab11876, G57, F20, L2B23 y G13 que no se unen simultáneamente a ambas secuencias amino del epítopo conformacional identificado en la presente invención, es decir, secuencias de aminoácidos de la SEQ ID NO: 2 y la SEQ ID NO: 3. Los anticuerpos comparativos 8g8, MAb 137-26, F20, G57, L2B23 y G13 se unen a sólo una de estas dos secuencias de aminoácidos (8g8, MAb 137 26, F20, G57 y G13) o a una secuencia de aminoácidos diferente (L2B23). El epítopo objetivo de Ab11876 no se conoce.
Tabla 3: Los anticuerpos neutralizantes para C5a y los epítopos
Como se muestra en la Tabla 3, algunos anticuerpos comparativos (8g8, MAb 137-26) muestran mayores afinidades de unión a C5a que los anticuerpos preferidos de la invención, INab308 e INab708. Sin embargo, INab308 e INab708 exhiben mayores actividades de bloqueo que cualquier anticuerpo comparativo estudiado. Más específicamente, cada uno de INab308 e INab708 exhibe una actividad de bloqueo muy alta (> 90%), incluso cuando se usa en cantidades estequiométricas, es decir, en una relación de 1 parátopo por 1 epítopo; es decir 0,5 moléculas de anticuerpo por 1 molécula objetivo. Los anticuerpos de la técnica anterior (MAb 137-26, Ab11876) alcanzaron actividades de bloqueo razonables solamente cuando se usan en cantidades superestequiométricas. Estos hallazgos demuestran que una alta afinidad de unión no siempre se puede equiparar con alta actividad de bloqueo.
Resumiendo, la presente divulgación proporciona por primera vez anticuerpos que exhiben una actividad de bloqueo extremadamente alta, incluso cuando se utiliza sólo en cantidades estequiométricas.
Las secuencias de aminoácidos de las regiones determinantes de complementariedad de las cadenas pesada y ligera de los anticuerpos INab308 e INab708 se enumeran a continuación en la Tabla 4.
Tabla 4: Secuencias de CDR y FR de los anticuerpos INab308 e INab708 (modo de clasificación de Chothia)
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Información del texto sin listado de secuencias
SEQ ID NO: 6 INab308 CDR3 cadena pesada
SEQ ID NO: 7 INab708 CDR3 cadena pesada
SEQ ID NO: 8 INab308 CDR3 cadena ligera
SEQ ID NO: 9 INab708 CDR3 cadena ligera
SEQ ID NO: 10 INab308 CDR2 cadena pesada
SEQ ID NO: 11 INab708 CDR2 cadena pesada
SEQ ID NO: 12 INab308 CDR2 cadena ligera
SEQ ID NO: 13 INab708 CDR2 cadena ligera
SEQ ID NO: 14 INab308 CDR1 cadena pesada
SEQ ID NO: 15 INab708 CDR1 cadena pesada
SEQ ID NO: 16 INab308 CDR1 cadena ligera
Claims (10)
1. Un anticuerpo C5a o un fragmento de unión a antígeno del mismo, que comprende un conjunto de secuencias de CDR3 de cadena pesada, CDR2 de cadena pesada y CDR1 de cadena pesada y un conjunto de secuencias de CDR3 de cadena ligera, CDR2 de cadena ligera y CDR1 de cadena ligera seleccionados de uno de los siguientes conjuntos: (i) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 6, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 10, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con la SEQ ID NO: 14; y una secuencia CDR3 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 8, una secuencia CDR2 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 12, y una secuencia CDR1 de cadena ligera de acuerdo con la SEQ ID NO: 16; o
(ii) una secuencia de CDR3 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 7, una secuencia de CDR2 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 11, y una secuencia de CDR1 de cadena pesada de acuerdo con SEQ ID NO: 15 y una secuencia de CDR3 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 9, una secuencia de CDR2 de cadena ligera de acuerdo con SEQ ID NO: 12 y una secuencia de cadena ligera de CDR1 de acuerdo con SEQ ID NO: 17;
en donde dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo tiene una constante de unión a C5a con un valor de Kd de 10 nM o menos.
2. El anticuerpo C5a o el fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con la reivindicación 1 que tiene una constante de unión a C5a con un valor de Kd de 5 nM o menos.
3. El anticuerpo C5a o el fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 2, en donde un anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo exhibe al menos un 85% de actividad de bloqueo para los efectos biológicos inducidos por una molécula C5a.
4. El anticuerpo C5a o el fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3,
- en donde dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo no inhibe la actividad de CH50 en plasma humano; y/o
- en donde dicho anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo es capaz de reducir la producción de IL-8 inducida por E. coli en sangre entera humana.
5. El anticuerpo C5a o el fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 4, en donde dicho anticuerpo o un fragmento de unión a antígeno del mismo se une a un epítopo conformacional formado por secuencias de aminoácidos NDETCEQRA (SEQ ID NO: 2) y SHKDMQL (SEQ ID NO: 3) de C5a,
en donde el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 2 y a al menos un aminoácido dentro de la secuencia de aminoácidos de acuerdo con la SEQ ID NO: 3;
6. El anticuerpo C5a o el fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con la reivindicación 5, en donde - el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido de una secuencia de aminoácidos de acuerdo con DETCEQR (SEQ ID NO: 4); y/o
- el anticuerpo o fragmento de unión a antígeno del mismo se une a al menos un aminoácido de una secuencia de aminoácidos de acuerdo con HKDMQ (SEQ ID NO: 5), preferiblemente KDM.
7. El anticuerpo C5a de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6, en donde dicho anticuerpo se selecciona del grupo que consiste en anticuerpos monoclonales, anticuerpos quiméricos y anticuerpos humanizados.
8. El fragmento de unión al antígeno C5a de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, en donde dicho fragmento se selecciona del grupo que consiste en fragmentos Fab, fragmentos Fab', fragmentos F(ab')2, fragmentos Fd, fragmentos Fv, Fvs enlazados a disulfuro (dsFv) y anticuerpos de cadena sencilla Fv (scFv).
9. Composición farmacéutica que comprende el anticuerpo C5a o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 y que comprende además uno o más vehículos, diluyentes, excipientes, rellenos, aglutinantes, lubricantes, deslizantes, desintegrantes, adsorbentes farmacéuticamente aceptables y/o conservantes.
10. Uso de un anticuerpo C5a o fragmento de unión a antígeno del mismo de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 8 para la preparación de una composición farmacéutica para la prevención y/o tratamiento de diversas enfermedades que implican inflamación aguda tal como el síndrome de respuesta inflamatoria sistémica (SIRS) , sepsis, sepsis severa, choque séptico, lesiones relacionadas con isquemia/reperfusión, tal como cardiopatía isquémica, lesión pulmonar aguda, neumonía, rechazo de injerto agudo y crónico en pacientes trasplantados,
reacciones de injerto contra huésped, así como enfermedades que involucran tipos crónicos de inflamación, tales como enfermedades glomerulares renales tal como la glomerulonefritis y otras entidades de insuficiencia renal, artritis reumatoide y enfermedades autoinmunes similares tal como la enfermedad de Bechterew, enfermedades de tipo lupus, enfermedad inflamatoria intestinal, enfermedad de Crohn, crecimiento tumoral o cáncer de órganos sólidos.
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