ES3018383T3 - Compuestos, composiciones y métodos - Google Patents

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ES3018383T3 ES20787582T ES20787582T ES3018383T3 ES 3018383 T3 ES3018383 T3 ES 3018383T3 ES 20787582 T ES20787582 T ES 20787582T ES 20787582 T ES20787582 T ES 20787582T ES 3018383 T3 ES3018383 T3 ES 3018383T3
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Anthony A Estrada
Jianwen A Feng
Zachary K Sweeney
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Abstract

La presente divulgación se refiere en general a inhibidores de LRRK2, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, mezcla de estereoisómeros, profármaco o composición farmacéutica de los mismos, y métodos de elaboración y uso de los mismos. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)

Description

DESCRIPCIÓN
Compuestos, composiciones y métodos
Campo
La presente descripción se refiere en general a nuevas pirimidinas sustituidas con heteroarilo y a su uso como agentes terapéuticos, por ejemplo, como inhibidores de LRRK2.
Descripción
La cinasa con repetición rica en leucina 2 (LRRK2) desempeña un papel importante en el tráfico vesicular y la función inmunitaria, y se ha asociado genéticamente a varias enfermedades humanas. LRRK2 es un miembro de la familia de proteínas ROCO y comparte cinco dominios conservados con todos los otros miembros de la familia. Muchas mutaciones de sentido alterado en el gen LRRK2 se ligaron con la enfermedad de Parkinson autosómica dominante en estudios de familias (Trinh y Farrar,Nature Reviews in Neurology,Vol. 9, 2013, 445-454; Paisan-Ruiz et ál.,J. Parkinson’s Disease,Vol. 3, 2013, 85-103) y para enfermedades inflamatorias intestinales (IBD), tales como enfermedad de Crohn y colitis ulcerosa (UC) (Hui et ál.,Sci. Transí. Med,2018, 10, 7795).
La mutación patogénica más común, G2019S, se produce en el dominio de cinasa altamente conservado de LRRK2 (ver Gilks et ál.,Lancet,Vol 365, 2005, 415-416). Estudios invitroindican que la mutación asociada con la enfermedad de Parkinson lleva a mayor actividad de LRRK2 y una tasa reducida de hidrólisis de GTP (Guo et ál.,Experimental Cell Research,Vol. 313(16), 2007, 3658-3670). Esta evidencia sugiere que las actividades de cinasa y GTPasa de LRRK2 son importantes para la patogénesis y que el dominio de LRRK2 cinasa puede regular la función general de LRRK2 (ver Cookson,Nat. Rev. Neurosa.,Vol. 11, 2010, 791 797).
La mutación LRRK2 N2081D se ha identificado como un alelo de riesgo de la enfermedad de Crohn. Esta mutación se localiza en el mismo dominio quinasa que G2019S y se asocia con un aumento de la actividad quinasa como los mutantes G2019S. La mutación LRRK2 N2081D también se encuentra en algunos pacientes con enfermedad de Parkinson (Hui et al., Sci. Transl. Med., 2018, 10, 7795). Otros estudios han relacionado la inflamación gastrointestinal como precursora de la inflamación cerebral y la enfermedad de Parkinson (Kishimoto, Y. et. al., Neuromolecular Med. 2019, 21(3): 239-249); Grathwohl, S. et. al., bioRxiv, 22 de diciembre de 2018 -11:51).
El documento US 2018/208582 divulga pirimidinas sustituidas por heteroarilo como inhibidores de LRRK2. Si bien se han hecho progresos en este campo, aún persiste una necesidad de inhibidores mejorados de LRRK2 que sean de utilidad para el tratamiento de diversas enfermedades neurodegenerativas, tales como enfermedad de Parkinson, enfermedad de Alzheimer y esclerosis lateral amiotrófica, así como para el tratamiento de trastornos periféricos, tales como enfermedades inflamatorias intestinales (IBD), lo que incluye enfermedad de Crohn (CD) y colitis ulcerosa (UC).
Se proporcionan en el presente documento compuestos, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o mezcla de estereoisómeros de estos, que son de utilidad como inhibidores de LRRK2. La descripción también proporciona composiciones, lo que incluye composiciones farmacéuticas, kits que incluyen los compuestos y los métodos de uso (o administración) y preparación de los compuestos., o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o mezcla de estereoisómeros de estos. La descripción también proporciona compuestos o composiciones de estos para usar en un método de tratamiento de una enfermedad, trastorno o afección mediados, al menos en parte, por LRRK2. Más aún, la descripción proporciona usos de los compuestos o sus composiciones en la preparación de un medicamento para el tratamiento de una enfermedad, trastorno o afección mediados, al menos en parte, por LRRK2.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula I, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
Se divulga aquí, pero no se reivindica, una composición farmacéutica que comprende un compuesto de Fórmula I, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
Se divulga en el presente documento, pero no se reivindica, un método para tratar una enfermedad o afección mediada, al menos en parte, por LRRK2, comprendiendo el método administrar una cantidad eficaz de la composición farmacéutica que comprende un compuesto de Fórmula I, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo enriquecido isotópicamente, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable, a un sujeto que lo necesite.
Se proporciona un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
En otra realización, se proporciona una composición farmacéutica que comprende un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable.
En otra realización, se proporciona un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2 para su uso en un método para tratar una enfermedad o afección mediada, al menos en parte, por LRRK2, comprendiendo el método administrar una cantidad eficaz de la composición farmacéutica que comprende un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2 o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable, a un sujeto que lo necesite, en donde la enfermedad o afección es una enfermedad neurodegenerativa, un cáncer o una enfermedad inflamatoria. La descripción en el presente documento establece realizaciones de ejemplo de la presente tecnología. Se ha de reconocer, sin embargo, que esta descripción no pretende ser una limitación del alcance de la presente divulgación, pero en vez de ello se proporciona como una descripción de ejemplos de realizaciones.
1. Definiciones
Como se usa en el presente documento memoria descriptiva, se pretende que las siguientes palabras, frases y símbolos tengan en general los significados que se establecen más adelante, excepto en la medida en que el contexto en el que se usan indique otra cosa.
Un guion (“- ”) que no está entre dos letras o símbolos se usa para indicar un punto de unión para un sustituyente. Por ejemplo, -C(O)NH<2>se une a través del átomo de carbono Un guión al principio o al final de un grupo químico es una cuestión de conveniencia; los grupos químicos pueden representarse con o sin uno o más guiones sin perder su significado ordinario. Una línea ondulada o discontinua trazada a través de una línea en una estructura indica un punto específico de unión de un grupo. A menos que sea necesario desde el punto de vista químico o estructural, el orden en que se escribe o nombra un grupo químico no indica ni implica direccionalidad o estereoquímica. En las estructuras de los compuestos, las barras continuas y discontinuas representan la estereoquímica relativa, como las orientaciones cis o trans relativas de dos sustituyentes en un anillo, mientras que las cuñas continuas y discontinuas representan la configuración absoluta relativa a un plano definido por dos líneas continuas.
El prefijo “Cu-v” indica que el siguiente grupo tiene deuavátomos de carbono. Por ejemplo, “alquilo C-i-a” indica que el grupo alquilo tiene de 1a 6 átomos de carbono.
La referencia a “aproximadamente” un valor o parámetro incluye en el presente documento (y describe) realizaciones que se refieren a ese valor o parámetroper se.En ciertas realizaciones, el término “aproximadamente” incluye la cantidad indicada ± 10 %. En ciertas realizaciones, el término “aproximadamente” incluye la cantidad indicada ± 5 %. En ciertas realizaciones, el término “aproximadamente” incluye la cantidad indicada ± 1 %. Además, la expresión “aproximadamente X” incluye la descripción de “X”. Además, las formas singulares “un”, “una”, “el” y “la” incluyen las referencias plurales a menos que el contexto dictamine claramente otra cosa. De esta manera, por ejemplo, la referencia al “compuesto” incluye una pluralidad de tales compuestos y la referencia al “ensayo” incluye la referencia a uno o varios ensayos y sus equivalentes conocidos por los expertos en la técnica.
“Alquilo” se refiere a una cadena hidrocarbonada saturada no ramificada o ramificada. Como se usa en el presente documento, “alquilo tiene” 1 a 20 átomos de carbono (es decir, alquilo C<1-20>), 1 a 8 átomos de carbono (es decir, alquilo C<1 -8>), 1 a 6 átomos de carbono (es decir, alquilo C<1>-a) o 1a 4 átomos de carbono (es decir, alquilo C<1 -4>). Los ejemplos de grupos alquilo incluyen metilo, etilo, propilo, isopropilo, n-butilo, secbutilo, iso-butilo, terc-butilo, pentilo, 2-pentilo, isopentilo, neopentilo, hexilo, 2-hexilo, 3-hexilo y 3-metilpentilo. Cuando un residuo de alquilo que tiene una cantidad específica de carbonos es denominado por el nombre químico o identificado por la fórmula molecular, pueden estar comprendidos todos los isómeros posicionales que tienen esa cantidad de carbonos; de esta manera, por ejemplo, “butilo” incluye n-butilo (es decir, -(CH<2>)<3>CH<3>), sec-butilo (es decir, -CH(CH<3>)CH<2>CH<3>), isobutilo (es decir, -CH<2>CH(CH<3>)<2>) y terc-butilo (es decir, -C(CH<3>)<3>); y “propilo” incluye n-propilo (es decir, -(CH<2>)<2>CH<3>) e isopropilo (es decir, -CH(CH<3>)<2>).
Se pueden usar ciertos nombres químicos alternativos comúnmente utilizados. Por ejemplo, un grupo divalente tal como un grupo “alquilo” divalente, un grupo “arilo” divalente, etc., también se puede mencionar como un grupo “alquileno” o un grupo “alquilenilo”, un grupo “arileno” o un grupo “arilenilo”, respectivamente. Además, a menos que se indique explícitamente otra cosa, en donde las combinaciones de grupos se mencionan como un resto, por ejemplo, arilalquilo o aralquilo, el último grupo mencionado contiene el átomo por el que el resto está unido con el resto de la molécula.
“Alquenilo” se refiere a un grupo alquilo que contiene al menos un enlace doble de carbono-carbono y que tiene de 2 a 20 átomos de carbono (es decir, alquenilo C<2-20>), 2 a 8 átomos de carbono (es decir, alquenilo C<2 -8>), 2 a 6 átomos de carbono (es decir, alquenilo C<2 -6>) o 2 a 4 átomos de carbono (es decir, alquenilo C<2 -4>). Los ejemplos de grupos alquenilo incluyen etenilo, propenilo, butadienilo (lo que incluye 1,2-butadienilo y 1,3—butadienilo).
“Alquinilo” se refiere a un grupo alquilo que contiene al menos un enlace triple de carbono-carbono y que tiene de 2 a 20 átomos de carbono (es decir, alquinilo C<2 -20>), 2 a 8 átomos de carbono (es decir, alquinilo C<2>-<8>), 2 a 6 átomos de carbono (es decir, alquinilo C<2 -6>) o 2 a 4 átomos de carbono (es decir, alquinilo C<2 -4>). El término “alquinilo” también incluye aquellos grupos que tienen un enlace triple y un enlace doble.
“Alcoxi” se refiere al grupo “alquil-O-”. Los ejemplos de grupos alcoxi incluyen metoxi, etoxi, n-propoxi, isopropoxi, n-butoxi, terc-butoxi, sec-butoxi, n-pentoxi, n-hexoxi y 1,2-dimetilbutoxi.
“Alcoxialquilo” se refiere al grupo “alquil-O-alquilo”.
“Alquiltio” se refiere al grupo “alquil-S-”.
“Alquilsulfinilo” se refiere al grupo “alquil-S(O)-”.
“Alquilsulfonilo” se refiere al grupo “alquil-S(O)<2>- ”.
“Alquilsulfonilalquilo” se refiere a -alquil-S(O)<2>-alquilo.
“Acilo” se refiere a un grupo -C(O)Ry, en donde Ry es hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento. Los ejemplos de acilo incluyen formilo, acetilo, ciclohexilcarbonilo, ciclohexilmetil-carbonilo y benzoílo.
“Amido” se refiere tanto a un grupo “C-amido” que se refiere al grupo -C(O)NRyRz como a un grupo “N-amido” que se refiere al grupo -NRyC(O)Rz, en donde Ry y Rz son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento, o Ry y Rz se toman juntos para formar un cicloalquilo o heterociclilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Amidoalquilo” se refiere a un grupo alquilo como se definió con anterioridad, en donde uno o varios átomos de hidrógeno se reemplazan por un grupo amido.
“Amino” se refiere al grupo -NRyRz en donde Ry y Rz son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Aminoalquilo” se refiere al grupo “-alquil-NRyRz,” en donde Ry y Rz son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Amidino” se refiere a -C(NRy)(NR<z2>), en donde Ry y Rz son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Arilo” se refiere a un grupo carbocíclico aromático que tiene un anillo simple (por ejemplo, monocíclico) o anillos múltiples (por ejemplo, bicíclico o tricíclico) que incluyen sistemas fusionados. Como se usa en el presente documento, “arilo” tiene 6 a 20 átomos de carbono del anillo (es decir, arilo C<6 -20>), 6 a 12 átomos de carbono del anillo (es decir, arilo C<6 -12>) o 6 a 10 átomos de carbono del anillo (es decir, arilo C<6 -10>). Algunos ejemplos de grupos arilo son fenilo naftilo, fluorenilo y antrilo. El arilo, sin embargo, no engloba ni se solapa en modo alguno con el heteroarilo definido a continuación. Si uno o más grupos arilo se fusionan con un heteroarilo, el sistema de anillos resultante es heteroarilo. Si uno o más grupos arilo se fusionan con un heterociclilo, el sistema de anillos resultante es heterociclilo.
“Arilalquilo” o “aralquilo” se refiere al grupo “aril-alquil-”.
“Carbamoílo” se refiere tanto a un grupo “O-carbamoílo” que se refiere al grupo -O-C(O)NRyRz como a un grupo “N-carbamoilo” que se refiere al grupo -NRyC(O)ORz, en donde Ry y Rz son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Éster carboxílico” o “éster” se refieren tanto a -OC(O)Rx como a -C(O)ORx, en donde Rx es alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo, cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Cianoalquilo” se refiere a un grupo alquilo como se definió con anterioridad, en donde uno o varios átomos de hidrógeno (por ejemplo, uno a tres) se reemplazan por un grupo ciano.
“Cicloalquilo” se refiere a un grupo alquilo cíclico saturado o parcialmente insaturado que tiene un anillo simple o anillos múltiples que incluyen sistemas de anillos fusionados, con puente y espiro. El término “cicloalquilo” incluye grupos cicloalquenilo (es decir, el grupo cíclico que tiene al menos un enlace doble) y sistemas de anillos fusionados carbocíclicos que tienen al menos un átomo de carbono sp3 (es decir, al menos un anillo no aromático). Como se usa en el presente documento, el cicloalquilo tiene de 3 a 20 átomos de carbono del anillo (es decir, cicloalquilo C<3 -20>), 3 a 12 átomos de carbono del anillo (es decir, cicloalquilo C<3 -12>), 3 a 10 átomos de carbono del anillo (es decir, cicloalquilo C<3 -10>), 3 a 8 átomos de carbono del anillo (es decir, cicloalquilo C<3 -8>) o 3 a 6 átomos de carbono del anillo (es decir, cicloalquilo C<3 -6>). Los grupos monocíclicos incluyen, por ejemplo, ciclopropilo, ciclobutilo, ciclopentilo, ciclohexilo, cicloheptilo y ciclooctilo. Los grupos policíclicos incluyen, por ejemplo, biciclo[2,2,1]heptanilo, biciclo[2,2,2]octanilo, adamantilo, norbornilo, decalinilo, 7,7-dimetil-biciclo[2,2,1]heptanilo y similares. Además, el término “cicloalquilo” pretende comprender cualquier anillo no aromático que se puede fusionar con un anillo arilo independientemente de la unión con el resto de la molécula. Además, cicloalquilo también incluye “espirocicloalquilo” cuando hay dos posiciones para la sustitución en el mismo átomo de carbono, por ejemplo, espiro[2,5]octanilo, espiro[4,5]decanilo o espiro[5,5]undecanilo.
“Cicloalcoxi” se refiere a “-O-cicloalquilo”.
“Cicloalquilalquilo” se refiere al grupo “cicloalquil-alquil-”.
“ Imino” se refiere a un grupo -C(NRy)Rz, en donde Ry y Rz son cada uno independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Imido” se refiere a un grupo -C(O)NRyC(O)Rz, en donde Ry y Rz son cada uno independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Halógeno” o “halo” se refiere a átomos que ocupan el grupo VIIA de la tabla periódica tales como flúor, cloro, bromo o yodo.
“Haloalquilo” se refiere a un grupo alquilo no ramificado o ramificado como se definió con anterioridad, en donde uno o varios átomos de hidrógeno (por ejemplo, uno a tres) se reemplazan por un halógeno. Por ejemplo, cuando un residuo está sustituido con más de un halógeno, se puede hacer referencia a él mediante el uso de un prefijo correspondiente a la cantidad de restos de halógeno unidos. Dihaloalquilo y trihaloalquilo se refieren a alquilo sustituido con dos (“di”) o tres (“tri”) grupos halo que pueden ser, pero no necesariamente lo son, el mismo halógeno. Los ejemplos de haloalquilo incluyen trifluorometilo, difluorometilo, fluorometilo, triclorometilo, 2,2,2-trifluoroetilo, 1,2-difluoroetilo, 3-bromo-2-fluoropropilo, 1,2-dibromoetilo, y similares. “Haloalcoxi” se refiere a un grupo alcoxi como se definió con anterioridad, en donde uno o varios átomos de hidrógeno (por ejemplo, uno a tres) se reemplazan por un halógeno.
“Hidroxialquilo” se refiere a un grupo alquilo como se definió con anterioridad, en donde uno o varios átomos de hidrógeno (por ejemplo, uno a tres) se reemplazan por un grupo hidroxi.
“Heteroalquilo” se refiere a un grupo alquilo en donde uno o varios (por ejemplo, uno a tres) de los átomos de carbono (y cualquier átomo de hidrógeno asociado) están reemplazados cada uno independientemente con el mismo grupo heteroatómico o uno diferente, siempre que el punto de unión con el resto de la molécula sea a través de un átomo de carbono. El término “heteroalquilo” incluye una cadena no ramificada o ramificada saturada que tiene carbono y heteroátomos. A modo de ejemplo, 1, 2 o 3 átomos de carbono se pueden reemplazar independientemente con el mismo grupo heteroatómico o uno diferente. Los grupos heteroatómicos incluyen, de modo no taxativo, -NRy-, -O -, -S -, -S(O)-, -S(O)<2>- y similares, en donde Ry es hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento. Los ejemplos de grupos heteroalquilo incluyen éteres (por ejemplo, -CH<2>OCH<3>, -CH(CH<3>)OCH<3>, -CH<2>CH<2>OCH<3>, -CH<2>CH<2>OCH<2>CH<2>OCH<3>, etc.), tioéteres (por ejemplo, -CH<2>SCH<3>, -CH(CH<3>)SCH<3>, -CH<2>CH<2>SCH<3>, -CH<2>CH<2>SCH<2>CH<2>SCH<3>, etc.), sulfonas (por ejemplo, -CH<2>S(O)<2>CH<3>, -CH(CH<3>)S(O)<2>CH<3>, -CH<2>CH<2>S(O)<2>CH<3>, -CH<2>CH<2>S(O)<2>CH<2>CH<2>OCH<3>, etc.) y aminas (por ejemplo, -CH<2>NRyCH<3>, -CH(CH<3>)NRyCH<3>, -CH<2>CH<2>NRyCH<3>, -CH<2>CH<2>NRyCH<2>CH<2>NRyCH<3>, etc., en donde Ry es hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento ). Como se usa en el presente documento, “heteroalquilo” incluye 1a 10 átomos de carbono, 1 a 8 átomos de carbono o 1a 4 átomos de carbono; y 1a 3 heteroátomos, 1 a 2 heteroátomos o 1 heteroátomo.
“Heteroarilo” se refiere a un grupo aromático que tiene un anillo simple, anillos múltiples o anillos fusionados múltiples, con uno o varios heteroátomos de anillo independientemente seleccionados de nitrógeno, oxígeno y azufre. Como se usa en el presente documento, “heteroarilo” incluye 1 a 20 átomos de carbono del anillo (es decir, heteroarilo C<1-20>), 3 a 12 átomos de carbono del anillo (es decir, heteroarilo C<3-12>) o 3 a 8 átomos de carbono del anillo (es decir, heteroarilo C<3 -8>); y 1a 5 heteroátomos de anillo, 1 a 4 heteroátomos de anillo, 1 a 3 heteroátomos de anillo, 1 a 2 heteroátomos de anillo o 1 heteroátomo de anillo seleccionado de modo independiente de nitrógeno, oxígeno y azufre. En ciertas instancias, “heteroarilo” incluye sistemas de anillos de 5-10 miembros, sistemas de anillos de 5-7 o sistemas de anillos de 5-6, cada uno independientemente con 1 a 4 heteroátomos de anillo, 1 a 3 heteroátomos de anillo, 1 a 2 heteroátomos de anillo o 1 heteroátomo de anillo independientemente seleccionados de nitrógeno, oxígeno y azufre. Los ejemplos de grupos heteroarilo incluyen acridinilo, bencimidazolilo, benzotiazolilo, benzindolilo, benzofuranilo, benzotiazolilo, benzotiadiazolilo, benzonaftofuranilo, benzoxazolilo, benzotienilo (benzotiofenilo), benzotriazolilo, benzo[4,6]imidazo[1,2-a]piridilo, carbazolilo, cinolinilo, dibenzofuranilo, dibenzotiofenilo, furanilo, isotiazolilo, imidazolilo, indazolilo, indolilo, indazolilo, isoindolilo, isoquinolilo, isoxazolilo, naftiridinilo, oxadiazolilo, oxazolilo, 1 -oxidopiridinilo, 1 -oxidopirimidinilo, 1 -oxidopirazinilo, 1 -oxidopiridazinilo, fenazinilo, ftalazinilo, pteridinilo, purinilo, pirrolilo, pirazolilo, piridinilo, pirazinilo, pirimidinilo, piridazinilo, quinazolinilo, quinoxalinilo, quinolinilo, quinuclidinilo, isoquinolinilo, tiazolilo, tiadiazolilo, triazolilo, tetrazolilo y triazinilo. Los ejemplos de los anillos heteroarilo fusionados incluyen, de modo no taxativo, benzo[d]tiazolilo, quinolinilo, isoquinolinilo, benzo[b]tiofenilo, indazolilo, benzo[d]imidazolilo, pirazolo[1,5-a]piridinilo e imidazo[1,5-a]piridinilo, en donde el heteroarilo se puede ligar por medio de cada anillo del sistema fusionado. Cualquier anillo aromático que tiene un anillo simple o múltiples anillos fusionados y que contiene al menos un heteroátomo, se considera un heteroarilo, sin tener en cuenta la unión con el resto de la molécula (es decir, a través de cualquier de los anillos fusionados). “Heteroarilo” no comprende o se superpone con arilo como se definió con anterioridad.
“Heteroarilalquilo” se refiere al grupo “heteroaril-alquil-”.
“Heterociclilo” se refiere a un grupo alquilo cíclico saturado o parcialmente insaturado, con uno o varios (por ejemplo, uno a tres) heteroátomos de anillo independientemente seleccionados de nitrógeno, oxígeno y azufre. El término “heterociclilo” incluye grupos heterocicloalquenilo (es decir, el grupo heterociclilo que tiene al menos un enlace doble), grupos heterociclilo en puente, grupos heterociclilo fusionados y grupos espiroheterociclilo. Un heterociclilo puede ser un anillo simple o anillos múltiples, en donde los anillos múltiples pueden ser fusionados, en puente o espiro y pueden comprender uno o varios restos oxo (=O) o N-óxido ( O-). Cualquier anillo no aromático que contiene al menos un heteroátomo es considerado un heterociclilo, sin tener en cuenta la unión (es decir, se puede ligar a través de un átomo de carbono o a heteroátomo). Además, el término heterociclilo pretende comprender cualquier anillo no aromático que contiene al menos un heteroátomo, cuyo anillo se puede fusionar con un anillo arilo o heteroarilo, sin tener en cuenta la unión con el resto de la molécula. Como se usa en el presente documento, el heterociclilo tiene 2 a 20 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<2 -20>), 2 a 12 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<2>-<12>), 2 a 10 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<2 -10>), 2 a 8 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<2 -8>), 3 a 12 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<3 -12>), 3 a 8 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<3 -8>) o 3 a 6 átomos de carbono del anillo (es decir, heterociclilo C<3>-<6>); que tiene 1 a 5 heteroátomos de anillo, 1 a 4 heteroátomos de anillo, 1 a 3 heteroátomos de anillo, 1 a 2 heteroátomos de anillo o 1 heteroátomo de anillo independientemente seleccionados de nitrógeno, azufre u oxígeno. Los ejemplos de grupos heterociclilo incluyen azetidinilo, azepinilo, benzodioxolilo, benzo[b][1,4]dioxepinilo, 1,4-benzodioxanilo, benzopiranilo, benzodioxinilo, benzopiranonilo, benzofuranonilo, dioxolanilo, dihidropiranilo, hidropiranilo, tienil[1,3]ditianilo, decahidroisoquinolilo, furanonilo, imidazolinilo, imidazolidinilo, indolinilo, indolizinilo, isoindolinilo, isotiazolidinilo, isoxazolidinilo, morfolinilo, octahidroindolilo, octahidroisoindolilo, 2-oxopiperazinilo, 2-oxopiperidinilo, 2-oxopirrolidinilo, oxazolidinilo, oxiranilo, oxetanilo, fenotiazinilo, fenoxazinilo, piperidinilo, piperazinilo, 4-piperidonilo, pirrolidinilo, pirazolidinilo, quinuclidinilo, tiazolidinilo, tetrahidrofurilo, tetrahidropiranilo, tritianilo, tetrahidroquinolinilo, tiofenilo (es decir, tienilo), tetrahidropiranilo, tiomorfolinilo, tiamorfolinilo, 1-oxo-tiomorfolinilo y 1,1-dioxo-tiomorfolinilo. El término “heterociclilo” también incluye “espiroheterociclilo” cuando hay dos posiciones para la sustitución en el mismo átomo de carbono. Los ejemplos de los anillos espiro-heterociclilo incluyen sistemas de anillos bicíclicos y tricíclicos, tales como 2-oxa-7-azaespiro[3,5]nonanilo, 2-oxa-6-azaespiro[3,4]octanilo y 6-oxa-1-azaespiro[3,3]heptanilo. Los ejemplos de los anillos heterociclilo fusionados incluyen, de modo no taxativo, 1,2,3,4-tetrahidroisoquinolinilo, 4,5,6,7-tetrahidrotieno[2,3-c]piridinilo, indolinilo e isoindolinilo, en donde el heterociclilo se puede enlazar por cualquier anillo del sistema fusionado.
“Heterociclilalquilo” se refiere al grupo “heterociclil-alquil-”.
La expresión “grupo saliente” se refiere a un átomo o un grupo de átomos que está desplazado en una reacción química como especie estable que toma los electrones de unión. Los ejemplos no limitativos de un grupo saliente incluyen halo, metansulfoniloxi, p-toluensulfoniloxi, trifluorometansulfoniloxi, nonafluorobutansulfoniloxi, (4-bromo-bencen)sulfoniloxi, (4-nitro-bencen)sulfoniloxi, (2-nitro-bencen)-sulfoniloxi, (4-isopropil-bencen)sulfoniloxi, (2,4,6-tri-isopropil-bencen)-sulfoniloxi, (2,4,6-trimetilbencen)sulfoniloxi, (4-ferc-butil-bencen)sulfoniloxi, bencensulfoniloxi, (4-metoxi-bencen)sulfoniloxi, y similares.
“Oxima” se refiere al grupo -CRy(=NOH), en donde Ry es hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
“Sulfonilo” se refiere al grupo -S(O)<2>Ry, en donde Ry es hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento. Los ejemplos de sulfonilo son metilsulfonilo, etilsulfonilo, fenilsulfonilo y toluensulfonilo.
“Sulfinilo” se refiere al grupo -S(O)Ry, en donde Ry es hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento. Los ejemplos de sulfinilo son metilsulfinilo, etilsulfinilo, fenilsulfinilo y toluensulfinilo.
“Sulfonamido” se refiere a los grupos -SO<2>NRyRz y -NRySO<2>Rz, en donde Ry y Rz son cada uno independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, cicloalquilo, heterociclilo, arilo, heteroalquilo o heteroarilo; cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido, como se define en el presente documento.
Los términos “opcional” u “opcionalmente” significan que el suceso o circunstancia descrito posteriormente puede ocurrir o no y que la descripción incluye casos en los que dicho suceso o circunstancia ocurre y casos en los que no. Además, el término “opcionalmente sustituido” se refiere a que uno o más (por ejemplo, de uno a cinco o de uno a tres) átomos de hidrógeno del átomo o grupo designado pueden o no sustituirse por una fracción distinta del hidrógeno.
El término “sustituido” usado en el presente documento significa cualquiera de los grupos anteriores (es decir, alquilo, alquenilo, alquinilo, alquileno, alcoxi, haloalquilo, haloalcoxi, cicloalquilo, arilo, heterociclilo, heteroarilo, y/o heteroalquilo), en donde al menos un átomo de hidrógeno se sustituye por un enlace a un átomo distinto del hidrógeno, como por ejemplo, pero no limitado a, alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, alquiltio, acilo, amido, amino, amidino, arilo, aralquilo, azido, carbamoílo, carboxilo, carboxiléster, ciano, cicloalquilo, cicloalquilalquilo, guanadino, halo, haloalquilo, haloalcoxi, hidroxialquilo, heteroalquilo, heteroarilo, heteroarilalquilo, heterociclilo, heterociclilalquilo, hidrazina, hidrazona, imino, imido, hidroxi, oxo, oxima, nitro, sulfonilo, sulfinilo, alquilsulfonilo, alquilsulfinilo, tiocianato, ácido sulfínico, ácido sulfónico, sulfonamido, tiol, tioxo, N-óxido o -Si(Ry)<3>en donde cada Ry es independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, heteroalquilo, cicloalquilo, arilo, heteroarilo o heterociclilo.
En ciertas realizaciones, “sustituido” incluye cualquiera de los grupos anteriores (por ejemplo, alquilo, alquenilo, alquinilo, alquileno, alcoxi, haloalquilo, haloalcoxi, cicloalquilo, arilo, heterociclilo, heteroarilo, y/o heteroalquilo) en donde uno o varios átomos de hidrógeno (por ejemplo, uno a cinco o uno a tres) están reemplazados por -NRgRh, -NRgC(=O)Rh, -NRgC(=O)NRgRh, -NRgC(=O)ORh, -NRgSO<2>Rh, -OC(=O)NRgRh, -ORg, -SRg, -SORg, -SO<2>Rg, -OSO<2>Rg, -SO<2>ORg, =NSO<2>Rg y -SO<2>NRgRh. “Sustituido” también significa cualquiera de los grupos anteriores en los que uno o varios átomos de hidrógeno (por ejemplo, uno a cinco o uno a tres) están reemplazados por -C(=O)Rg, -C(=O)ORg, -C(=O)NRgRh, -CH<2>So<2>Rg, -CH<2>SO<2>NRgRh. En lo precedente, Rg y Rh son iguales o diferentes y son independientemente hidrógeno, alquilo, alquenilo, alquinilo, alcoxi, tioalquilo, arilo, aralquilo, cicloalquilo, cicloalquilalquilo, haloalquilo, heterociclilo, heterociclilalquilo, heteroarilo y/o heteroarilalquilo. “Sustituido” significa además cualquiera de los grupos anteriores en los que uno o más (por ejemplo, de uno a cinco o de uno a tres) átomos de hidrógeno se sustituyen por un enlace a un átomo de amino, ciano, hidroxilo, imino, nitro, oxo, tioxo, halo, alquilo, alcoxi, alquilamino, tioalquilo, arilo, aralquilo, cicloalquilo, cicloalquilalquilo, haloalquilo, heterociclilo, N-heterociclilo, heterociclilalquilo, heteroarilo, y/o heteroarilalquilo. Además, cada uno de los anteriores sustituyentes también puede estar opcionalmente sustituido con uno o varios (por ejemplo, uno a cinco o uno a tres) de los sustituyentes anteriores. En ciertas realizaciones, el término “sustituido” significa que uno o varios átomos de hidrógeno del átomo o grupo designado se sustituyen por uno o varios sustituyentes distintos del hidrógeno, siempre que no se supere la valencia normal de un átomo designado en el grupo.
No se pretende incluir en el presente documento los polímeros o estructuras indefinidas similares a los que se llega por definición de los sustituyentes con otros sustituyentes anexosad infinitum(por ejemplo, un arilo sustituido que tiene un alquilo sustituido que en sí está sustituido con un grupo arilo sustituido, que también está sustituido con un grupo heteroalquilo sustituido, etc.). A menos que se indique otra cosa, la cantidad máxima de sustituciones seriales en compuestos divulgados en el presente documento es tres. Por ejemplo, las sustituciones seriales de grupos arilo sustituidos con otros dos grupos arilo sustituidos están limitadas a ((aril sustituido)aril sustituido) arilo sustituido. De modo similar, no se pretende que las definiciones anteriores incluyan patrones de sustitución no admisibles (por ejemplo, metilo sustituido con 5 fluoros o grupos heteroarilo con dos átomos de oxígeno anulares adyacentes). Estos patrones de sustitución no admisibles son conocidos por los expertos en la técnica. Cuando se usan para modificar un grupo químico, el término “sustituido” puede describir otros grupos químicos definidos en el presente documento. A menos que se especifique otra cosa, cuando un grupo se describe como opcionalmente sustituido, cualquier sustituyente del grupo no se encuentra sustituido. Por ejemplo, en ciertas realizaciones, la expresión “alquilo sustituido” se refiere a un grupo alquilo que tiene uno o varios (por ejemplo, uno a cinco o uno a tres) sustituyentes que incluyen hidroxi, halo, alcoxi, acilo, oxo, amino, cicloalquilo, heterociclilo, arilo y heteroarilo. En ciertas realizaciones, los uno o varios (por ejemplo, uno a cinco o uno a tres) sustituyentes pueden estar también sustituidos con halo, alquilo, haloalquilo, hidroxi, alcoxi, cicloalquilo, heterociclilo, arilo o heteroarilo, cada uno de los cuales está sustituido. En ciertas realizaciones, los sustituyentes pueden estar también sustituidos con halo, alquilo, haloalquilo, alcoxi, hidroxi, cicloalquilo, heterociclilo, arilo o heteroarilo, cada uno de los cuales no está sustituido.
En ciertas realizaciones, tal como se usa en el presente documento, la expresión “uno o más” hace referencia a uno a cinco. En ciertas realizaciones, tal como se usa en el presente documento, la expresión “uno o más” hace referencia a uno a tres.
Cualquier compuesto o estructura dada en el presente documento también pretende representar formas no marcadas, así como formas isotópicamente marcadas de los compuestos. También se puede hacer referencia a estas formas de compuestos como “análogos isotópicamente enriquecidos”. Los compuestos isotópicamente marcados tienen estructuras representadas en el presente documento, excepto por el reemplazo de uno o varios átomos por un átomo que tiene una masa atómica o número másico seleccionado. Los ejemplos de isótopos que se pueden incorporar en los compuestos divulgados incluyen isótopos de hidrógeno, carbono, nitrógeno, oxígeno, fósforo, flúor, cloro y yodo, tales como 2H, 3H, 11C, 13C, 14C, 13N, 15N, 15O, 17O, 18O, 31P, 32P, 35S, 18F, 36Cl, 123I y 125I, respectivamente. Varios compuestos isotópicamente marcados de la presente divulgación, por ejemplo, aquellos en los que se incorporan isótopos radioactivos tales como 3H y 14C. Estos compuestos isotópicamente marcados pueden ser de utilidad en estudios metabólicos, estudios cinéticos de reacción, detección o técnicas de obtención de imágenes, tales como tomografía por emisión de positrones (PET) o tomografía computada por emisión de fotones simples (SPECT), lo que incluye ensayos de distribución en tejidos de fármaco o sustrato o en un tratamiento radioactivo de pacientes.
La expresión “análogos isotópicamente enriquecidos” incluye “análogos deuterados” de compuestos divulgados en el presente documento, en donde uno o más hidrógenos se reemplazan por deuterio, tal como un hidrógeno en un átomo de carbono. Estos compuestos exhiben mayor resistencia al metabolismo y, por lo tanto, son de utilidad para incrementar la vida media de cualquier compuesto cuando se administra a un mamífero, en particular un ser humano. Ver, por ejemplo, Foster, “Deuterium Isotope Effects in Studies of Drug Metabolism”,Trends Pharmacol. Sci.5(l2):524-527 (1984). Estos compuestos se sintetizan por medios conocidos en la técnica, por ejemplo, empleando materiales de partida en los que uno o varios hidrógenos fueron reemplazados por deuterio.
Los compuestos terapéuticos marcados o sustituidos con deuterio de la divulgación pueden tener mayores propiedades de DMPK (metabolismo farmacológico y farmacocinética) con respecto a la distribución, metabolismo y excreción (ADME). La sustitución con isótopos más pesados tales como deuterio pueden ofrecer ciertas ventajas terapéuticas derivadas de una mayor estabilidad metabólica, por ejemplo, mayor vida mediain vivo,menores requerimientos de dosificación y/o una mejora del índice terapéutico. Un compuesto marcado con 18F, 3H, 11C puede ser útil para PET o SPECT u otros estudios de imagen. Los compuestos marcados isotópicamente de la presente divulgación y los profármacos de los mismos pueden prepararse generalmente llevando a cabo los procedimientos divulgados en los esquemas o en los ejemplos y preparaciones divulgados a continuación sustituyendo un reactivo marcado isotópicamente fácilmente disponible por un reactivo no marcado isotópicamente. Se entiende que, en este contexto, el deuterio se considera un sustituyente en un compuesto descrito en el presente documento.
La concentración de tal isótopo más pesado, específicamente deuterio, puede ser definida por un factor de enriquecimiento isotópico. En los compuestos de la presente divulgación, cualquier átomo que no se designe específicamente como un isótopo concreto representa cualquier isótopo estable de dicho átomo. A menos que se establezca otra cosa, cuando una posición se designa específicamente como “H” o “hidrógeno”, se entiende que la posición tiene hidrógeno en su composición isotópica de abundancia natural. Por consiguiente, en los compuestos de la presente divulgación, cualquier átomo específicamente designado como un deuterio (D) se entiende que representa al deuterio.
En muchos casos, los compuestos de la presente divulgación tienen la capacidad de formar sales ácidas y/o básicas en virtud de la presencia de grupos amino y/o carboxilo o grupos similares a estos.
También se proporcionan una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un análogo deuterado, un estereoisómero, una mezcla de estereoisómeros y profármacos de los compuestos divulgados en el presente documento. “Farmacéuticamente aceptable” o “fisiológicamente aceptable” hacen referencia a compuestos, sales, composiciones, formas de dosificación y otros materiales útiles para elaborar una composición farmacéutica adecuada para uso farmacéutico veterinario o humano. En muchos casos, los compuestos de esta divulgación son capaces de formar sales ácidas y/o básicas en virtud de la presencia de grupos amino y/o carboxilo o grupos similares a estos.
También se proporcionan sales, hidratos, solvatos, formas tautoméricas, estereoisómeros y profármacos farmacéuticamente aceptables de los compuestos divulgados en el presente documento. “Farmacéuticamente aceptable” o “fisiológicamente aceptable” se refieren a compuestos, sales, composiciones, formas de dosis y otros materiales que son de utilidad para la preparación de una composición farmacéutica que es apropiada para uso farmacéutico veterinario o humano.
La expresión “sal farmacéuticamente aceptable” de un compuesto dado se refiere a sales que retienen la eficacia biológica y propiedades del compuesto dado y que no son biológicamente indeseables o no se desean de otro modo. “Sales farmacéuticamente aceptables” o “sales fisiológicamente aceptables” incluyen, por ejemplo, sales con ácidos inorgánicos y sales con un ácido orgánico. Además, si los compuestos divulgados en el presente documento se obtienen como una sal de adición de ácidos, la base libre se puede obtener alcalinizando una solución de la sal ácida. Por el contrario, si el producto es una base libre, una sal de adición, en particular, una sal farmacéuticamente aceptable de adición se puede producir disolviendo esta base libre en un solvente orgánico apropiado y tratando la solución con un ácido, según los procedimientos convencionales para preparar sales de adición de ácidos a partir de compuestos básicos. Los expertos en la técnica reconocerán varias metodologías de síntesis que se pueden usar para preparar sales no tóxicas de adición farmacéuticamente aceptables. Las sales de adición de ácidos farmacéuticamente aceptables se pueden preparar a partir de ácidos inorgánicos y ácidos orgánicos. Las sales derivadas de ácidos inorgánicos incluyen ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido sulfúrico, ácido nítrico, ácido fosfórico, y similares. Las sales derivadas de ácidos orgánicos incluyen ácido acético, ácido propiónico, ácido glucónico, ácido glicólico, ácido pirúvico, ácido oxálico, ácido málico, ácido malónico, ácido succínico, ácido maleico, ácido fumárico, ácido tartárico, ácido cítrico, ácido benzoico, ácido cinámico, ácido mandélico, ácido metansulfónico, ácido etansulfónico, ácido p-toluensulfónico, ácido salicílico, y similares. Del mismo modo, pueden prepararse sales de adición de bases farmacéuticamente aceptables a partir de bases inorgánicas y orgánicas. Las sales derivadas de bases inorgánicas incluyen, a modo de ejemplo únicamente, sales de sodio, potasio, litio, aluminio, amonio, calcio y magnesio. Las sales derivadas de bases orgánicas incluyen, entre otras, sales de aminas primarias, secundarias y terciarias, tales como alquilaminas (es decir, NH<2>(alquilo)), dialquilaminas (es decir, HN(alquilo)<2>), trialquilaminas (es decir, N(alquilo)s), alquilaminas sustituidas (es decir, NH<2>(alquilo sustituido)), di(alquil sustituido)aminas (es decir, HN(alquil sustituido^), tri(alquil sustituido)aminas (es decir, N(alquilo sustituido^), alquenilaminas (es decir, NH<2>(alquenilo)), dialquenilaminas (es decir, HN(alquenilo)<2>), trialquenilaminas (es decir, N(alquenilo)<3>), alquenilaminas sustituidas (es decir, NH<2>(alquenilo sustituido)), di(alquenil sustituido)aminas (es decir, HN(alquenilo sustituido)<2>), tri(alquenil sustituido)aminas (es decir, N(alquenilo sustituido^, mono-, di- o tri-cicloalquilaminas (es decir, NH<2>(cicloalquilo), HN(cicloalquilo)<2>, N(cicloalquilo)<3>), mono-, di- o tri-arilaminas (es decir, NH<2>(arilo), HN(arilo)<2>, N(arilo)<3>) o aminas mixtas, etc. Los ejemplos específicos de aminas apropiadas incluyen, solo a modo de ejemplo, isopropilamina, trimetilamina, dietilamina, tri(iso-propil)amina, tri(n-propil)amina, etanolamina, 2-dimetilaminoetanol, piperazina, piperidina, morfolina, N-etilpiperidina, y similares.
Algunos de los compuestos existen como tautómeros. Los tautómeros están en equilibrio entre sí. Por ejemplo, los compuestos que contienen amida pueden existir en equilibrio con los tautómeros de ácido imídico. Independientemente de qué tautómero se muestre y sin tener en cuenta la naturaleza del equilibrio entre los tautómeros, los expertos en la técnica entenderán que los compuestos comprenden tanto tautómeros de amida como de ácido imídico. De esta manera, se entiende que los compuestos que contienen amida incluyen sus tautómeros de ácido imídico. Del mismo modo, se entiende que los compuestos que contienen ácido imídico incluyen sus tautómeros de amida.
Los compuestos de la invención o sus sales farmacéuticamente aceptables incluyen un centro asimétrico y, por lo tanto, pueden dar origen a enantiómeros, diastereómeros y otras formas estereoisoméricas que se pueden definir, en términos de estereoquímica absoluta, como (R)- o (S)- o como (D)- o (L)- para aminoácidos. La presente invención pretende incluir todos los posibles isómeros, así como sus formas racémicas y ópticamente puras. Los isómeros ópticamente activos (+) y (-), (R)- y (S)- o (D)- y (L)- se pueden preparar usando sintones quirales o reactivos quirales o se pueden resolver usando técnicas convencionales, por ejemplo, cromatografía y cristalización por fraccionamiento. Las técnicas convencionales para la preparación o el aislamiento de enantiómeros individuales incluyen síntesis quiral de un precursor ópticamente puro apropiado o resolución del racemato (o el racemato de una sal o derivado) usando, por ejemplo, cromatografía líquida de alta presión quiral (HPLC). Cuando los compuestos divulgados en el presente documento contienen enlaces olefínicos dobles u otros centros de asimetría geométrica y a menos que se especifique otra cosa, se pretende que los compuestos incluyan isómeros geométricos tanto E como Z.
Un “estereoisómero” se refiere a un compuesto conformado por los mismos átomos unidos por los mismos enlaces, pero que tienen diferentes estructuras tridimensionales que no son intercambiables. La presente invención contempla varios estereoisómeros y sus mezclas e incluye “enantiómeros” que se refieren a dos estereoisómeros cuyas moléculas no son imágenes especulares superponibles.
“Diastereómeros” son estereoisómeros que tienen al menos dos átomos asimétricos, pero que no son imágenes especulares uno de otro.
Como se usa en el presente documento, “portador farmacéuticamente aceptable” o “excipiente farmacéuticamente aceptable” o “excipiente” incluye todos y cada uno de los solventes, medios de dispersión, revestimientos, agentes antibacterianos y antifúngicos, agentes isotónicos y que retrasan la absorción, y similares. El uso de tales medios y agentes para las sustancias farmacéuticamente activas es conocido en la técnica. Excepto en la medida en que cualquier medio o agente convencional sea incompatible con el principio activo, se contempla su uso en las composiciones terapéuticas. Los principios activos suplementarios también se pueden incorporar en las composiciones.
2. Compuestos
Se proporcionan en el presente documento compuestos, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o mezcla de estereoisómeros de estos, que son de utilidad como inhibidores de LRRK2.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula I:
o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, mezcla de estereoisómeros de este, en donde:
n es 0, 1, 2 o 3;
R<1>es halo, ciano, alquilo C<1 -6>, alquenilo C<1 -6>, alquinilo C<1 -6>, cicloalquilo, alcoxi C<1 -6>, cicloalcoxi, alquiltio C<1 -6>, alquil C<1-6>-sulfonilo, -C(O)R<10>o -C(O)N(R<11>)(R<12>), en donde cada alquilo C<1-6>, alquenilo C<1-6>, alquinilo C<1-6>, cicloalquilo, alcoxi C<1-6>, cicloalcoxi, alquiltio C<1-6>y alquilsulfonilo C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
R<2>es alcoxi C<1-6>, cicloalquilo, cicloalquiloxi, alquiltio C<1-6>, alquilsulfonilo C<1-6>o -N(R<13>)(R<14>), en donde cada alcoxi C<1-6>, cicloalquilo, cicloalcoxi, alquiltio C<1-6>y alquilsulfonilo C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
R<3>es hidrógeno o halo;
R4 es hidrógeno, halo, ciano, alquilo C<1-6>, alquenilo C<1-6>, alquinilo C<1-6>, cicloalquilo, heterociclilo, heteroarilo, alquiltio C<1-6>, alquilsulfonilo C<1-6>, -C(O)R10 o -C(O)N(R11)(R12), en donde cada alquilo C<1-6>, alquenilo C<1-6>, alquinilo C<1-6>, cicloalquilo, heterociclilo, heteroarilo, alquiltio C<1-6>y alquilsulfonilo C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
cada R5 y R6 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1-6>o cicloalquilo, o R5 y R6 forman juntos un heterociclilo, en donde cada alquilo C<1-6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
R7 es halo o alquilo C<1-6>, en donde cada alquilo C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
cada R10 es independientemente alquilo C<1-6>o alcoxi C<1 -6>, en donde cada alquilo C<1-6>y alcoxi C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
cada R11 y R12 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1 -6>, cicloalquilo o R11 y R12 forman juntos un grupo heterociclilo, en donde cada alquilo C<1-6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente, y
cada uno de R13 y R14 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1-6>, cicloalquilo, o R13 y R14 forman juntos un heterociclilo, en donde cada alquilo C<1-6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente.
En ciertas realizaciones, R2es alcoxi C<1-6>opcionalmente sustituido, cicloalquilo opcionalmente sustituido o -N(R13)(R14).
En ciertas realizaciones, R2es -N(R13)(R14).
En ciertas realizaciones, R2 es -N(R13)(R14) y cada uno de R13 y R14 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido o cicloalquilo opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R2es -N(R13)(R14), R13 es hidrógeno y R14 es hidrógeno, alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido o cicloalquilo opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R2 es ciclopropilamino, (1-metilciclopropil)amino, -NH(CH<3>) o -NH(CH<2>CH<3>).
En ciertas realizaciones, R2es -NH(CH<3>) o -NH(CH<2>CH<3>).
En ciertas realizaciones, R2es ciclopropilamino o (1-metilciclopropil)amino.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula I:
o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, una mezcla de estereoisómeros de este, en donde:
n es 0, 1, 2 o 3;
R1 es halo, ciano o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno o más halo;
R2es -N(R13)(R14), en donde R13 es hidrógeno y R14 es hidrógeno, alquilo C<1>-<6>O cicloalquilo;
R3 es hidrógeno o halo;
R4 es metilo o cicloalquilo;
cada uno de R5y R6 es independientemente hidrógeno, alquilo C ^ o cicloalquilo; y
R7 es halo o alquilo C<1>-<6>.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula I, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, en donde:
n es 0;
R1 es halo, ciano o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno o más halo;
R2es -N(R13)(R14), en donde R13 es hidrógeno y R14 es hidrógeno, alquilo C ^ o cicloalquilo;
R3 es hidrógeno o halo;
R4 es metilo o cicloalquilo; y
cada uno de R5y R6 es independientemente hidrógeno, alquilo C ^ o cicloalquilo.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula IA:
o
una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, en donde:
n es 0, 1, 2 o 3;
R1 es halo o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido;
R4 es hidrógeno, halo, ciano, alquilo C<1>-<6>, alquenilo C<1>-<6>, alquinilo C<1>-<6>, cicloalquilo, heterociclilo, heteroarilo, alquiltio C<1>-<6>, alquilsulfonilo C<1>-<6>, -C(O)R10 o -C(O)N(R11)(R12), en donde cada alquilo C<1>-<6>, alquenilo C<1>.<6>, alquinilo C<1>.<6>, cicloalquilo, heterociclilo, heteroarilo, alquiltio C<1-6>y alquilsulfonilo C<1.6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
cada uno de R5 y R6 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1-6>o cicloalquilo, o R5 y R6 forman juntos un heterociclilo, en donde cada alquilo C<1>-<6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
R7 es halo o alquilo C<1>-<6>, en donde cada alquilo C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
cada R10 es independientemente alquilo C<1.6>o alcoxi C<1>-<6>, en donde cada alquilo C<1.6>y alcoxi C<1-6>se encuentra opcionalmente sustituido;
cada uno de R11 y R12 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1>-<6>, cicloalquilo, o R11 y R12 forman juntos un grupo heterociclilo, en donde cada alquilo C<1>-<6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido; y
R14 es alquilo C<1-6>o cicloalquilo, en donde cada alquilo C<1-6>y cicloalquilo se encuentra opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R4 es diferente de cicloalquilo opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R4 es metilo.
En ciertas realizaciones, n es 0.
En ciertas realizaciones, n es 1.
En ciertas realizaciones, n es 1 o 2.
En ciertas realizaciones, n es 0 o 1.
En ciertas realizaciones, R7 es alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R7 es halo.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula IB:
o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, en donde:
R1 es halo o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido;
cada uno de R5 y R6 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1-6>o cicloalquilo, o R5 y R6 forman juntos un heterociclilo, en donde cada alquilo C<1>-<6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
R14 es alquilo C<1-6>o cicloalquilo, en donde cada alquilo C<1-6>y cicloalquilo se encuentra opcionalmente sustituido; y
R17es hidrógeno, halo o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En el presente documento se divulga, pero no se reivindica, un compuesto de Fórmula IC:
IC
o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, en donde:
R1 es halo o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido;
cada uno de R5 y R6 es independientemente hidrógeno, alquilo C<1-6>o cicloalquilo, o R5 y R6 forman juntos un heterociclilo, en donde cada alquilo C<1-6>, cicloalquilo y heterociclilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente;
R14 es alquilo C<1-6>o cicloalquilo, en donde cada alquilo C<1-6>y cicloalquilo se encuentra opcionalmente sustituido de forma independiente; y
R17es hidrógeno, halo o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R1 es halo, ciano o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R1 es halo, ciano o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno o más halo.
En ciertas realizaciones, R1 es halo, ciano o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno a cinco halo. En ciertas realizaciones, R1 es halo, ciano o alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno a tres halo.
En ciertas realizaciones, R1 es halo.
En ciertas realizaciones, R1 bromo.
En ciertas realizaciones, R1 alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R1 alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno o más halo.
En ciertas realizaciones, R1 alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno a cinco halo.
En ciertas realizaciones, R1 alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido con uno a tres halo.
En ciertas realizaciones, R1 es haloalquilo C<1-6>.
En ciertas realizaciones, R1 es -CF<3>.
En ciertas realizaciones, R14 es alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R14 es alquilo C<1-6>.
En ciertas realizaciones, R14 es metilo o etilo.
En ciertas realizaciones, R14 es cicloalquilo opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R14 es cicloalquilo.
En ciertas realizaciones, R14 es ciclopropilo.
En ciertas realizaciones, R14 es metilciclopropilo.
En ciertas realizaciones, R17 es hidrógeno.
En ciertas realizaciones, R17 es halo.
En ciertas realizaciones, R17 es alquilo C<1-6>opcionalmente sustituido.
En ciertas realizaciones, R17 es alquilo C<1>-<6>.
En ciertas realizaciones, R17 es metilo.
Se proporciona un compuesto tal como se muestra en la Tabla 1 o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
Tabla 1
En ciertas realizaciones, un compuesto puede seleccionarse de entre los compuestos de la Tabla 1. También se incluyen en la deuterados, tautómeros, estereoisómeros o una mezcla de estereoisómeros de un compuesto de la divulgación. estereoisómeros de un compuesto de la divulgación. En ciertas realizaciones, se proporcionan compuestos de la Tabla 1 para su uso en los métodos descritos en el presente documento.
Los estereoisómeros específicos contemplados incluyen los siguientes en la Tabla 2.
Tabla 2
(continuación)
(continuación)
En ciertas realizaciones, un compuesto puede seleccionarse entre los compuestos de la Tabla 2. También se incluyen dentro de la divulgación sales farmacéuticamente aceptables, análogos deuterados, tautómeros, estereoisómeros o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. En ciertas realizaciones, se proporcionan compuestos de la Tabla 2 para su uso en los métodos descritos en el presente documento.
3. Métodos de tratamiento y usos
“Tratamiento” o “tratar” es un método para obtener resultados beneficiosos o deseados que incluyen resultados clínicos. Los resultados clínicos beneficiosos o deseados pueden incluir uno o varios de los siguientes: a) inhibir la enfermedad o afección (por ejemplo, reducir uno o varios síntomas resultantes de la enfermedad o la afección, y/o disminuir la extensión de la enfermedad o afección); b) lentificar o detener el desarrollo de uno o varios síntomas clínicos asociados con la enfermedad o afección (por ejemplo, estabilizar la enfermedad o la afección, prevenir o demorar el empeoramiento o la progresión de la enfermedad o la afección, y/o prevenir o demorar la propagación (por ejemplo, metástasis) de la enfermedad o afección); y/o c) aliviar la enfermedad, es decir, causar la regresión de los síntomas clínicos (por ejemplo, mejorar el estado patológico, proporcionar una remisión parcial o total de la enfermedad o la afección, mejorar el efecto de otra medicación, demorar la progresión de la enfermedad, mejorar la calidad de vida y/o prolongar la supervivencia.
“Prevención” o “prevenir” significa cualquier tratamiento de una enfermedad o afección que causa que los síntomas clínicos de la enfermedad o la afección no se desarrollen. Los compuestos se pueden administrar, en ciertas realizaciones, a un sujeto (lo que incluye un ser humano) que está en riesgo o tiene una historia familiar de la enfermedad o afección.
“Sujeto” se refiere a un animal, como un mamífero (lo que incluye un ser humano), que fue o será el objeto de tratamiento, observación o experimento. Los métodos divulgados en el presente documento pueden ser de utilidad en terapia humana y/o aplicaciones veterinarias. En ciertas realizaciones, el sujeto es un mamífero. En ciertas realizaciones, el sujeto es un ser humano.
La expresión “cantidad terapéuticamente eficaz” o “cantidad eficaz” de un compuesto descrito en el presente documento o una sal farmacéuticamente aceptable, análogos isotópicamente enriquecido, tautómeros, estereoisómeros, mezcla de estereoisómeros o profármacos significa una cantidad eficaz para efectuar el tratamiento cuando se administran a un sujeto, para proporcionar un beneficio terapéutico como mejora de los síntomas o lentificación del avance. Por ejemplo, una cantidad terapéuticamente eficaz puede ser una cantidad suficiente para reducir un síntoma de una enfermedad o afección como se describe en el presente documento. La cantidad terapéuticamente eficaz puede variar según el sujeto y la enfermedad o la afección tratada, el peso y la edad del sujeto, la gravedad de la enfermedad o afección y la forma de administración, lo que puede ser determinado con facilidad por un experto en la técnica.
Los métodos divulgados en el presente documento se pueden aplicar a poblaciones celularesin vivooex vivo. “In vivo"significa dentro de un individuo vivo, como dentro de un animal o ser humano. En este contexto, los métodos divulgados en el presente documento se pueden usar terapéuticamente en un individuo.“Ex vivo"significa fuera de un individuo vivo. Los ejemplos de poblaciones celularesex vivoincluyen cultivos celularesin vitroy muestras biológicas que incluyen muestras de fluido o de tejidos obtenidas de los individuos. Estas muestras se pueden obtener por medio de métodos conocidos en la técnica. Las muestras de fluido biológico de ejemplo incluyen sangre, líquido cefalorraquídeo, orina y saliva. En este contexto, los compuestos y composiciones divulgados en el presente documento se pueden usar para una variedad de fines, lo que incluye fines terapéuticos y experimentales. Por ejemplo, los compuestos y composiciones divulgados en el presente documento se pueden usarex vivopara determinar el cronograma óptimo y/o la dosis de administración óptima de un compuesto de la presente divulgación para una indicación, tipo celular, individuo y otros parámetros dados. La información recopilada de ese uso se puede emplear para fines experimentales o en la clínica para establecer protocolos para el tratamientoin vivo.Otros usosex vivoa los que se pueden adaptar los compuestos y las composiciones divulgados en el presente documento se describen más adelante o serán evidentes para los expertos en la técnica. Los compuestos seleccionados pueden caracterizarse adicionalmente para examinar la dosis de seguridad o tolerancia en sujetos humanos o no humanos. humanos o no humanos. Tales propiedades pueden examinarse utilizando métodos comúnmente conocidos por los expertos en la materia.
LRRK2 se asoció con la transición de alteración cognitiva moderada a enfermedad de Alzheimer; discinesia inducida por L-Dopa (Hurley et ál.,Eur. J, Neurosa.,Vol. 26, 2007, 171-177); trastornos del SNC asociados con la proliferación y la migración celular neuroprogenitora, y la regulación de LRRK2 puede tener utilidad en la mejora de los resultados neurológicos después de lesión isquémica y la estimulación de la restauración de la función del SNC después de una lesión neuronal tal como ataque isquémico, lesión cerebral traumática o lesión de la médula espinal (Milosevic et ál.,Neurodegen.,Vol. 4, 2009, 25; ver Zhang et ál.,J. Neurosa. Res.Vol. 88, 2010, 3275-3281); enfermedad de Parkinson, enfermedad de Alzheimer, esclerosis múltiple y demencia inducida por VIH (ver Milosevic et ál.,Mol. Neurodegen.,Vol. 4, 2009, 25); cáncer renal, de mama, de próstata (por ejemplo, tumor sólido), hematológico y de pulmón y leucemia mieológena aguda (AML); linfomas y leucemias (ver Ray et ál.,J. Immunolo.,Vol. 230, 2011, 109); mieloma múltiple (Chapman et ál.,Nature,Vol. 471, 2011, 467-472); carcinoma renal papilar y de tiroides; mieloma múltiple (Chapman et ál.,Nature,Vol. 471, 2011, 467-472); enfermedades del sistema inmunitario, lo que incluye artritis reumatoidea, lupus eritematoso sistémico, anemia hemolítica autoinmunitaria, aplasia de glóbulos rojos pura, púrpura idiopática trombocitopénica (ITP), síndrome de Evans, vasculitis, trastornos bullosos de la piel, diabetes de tipo 1, síndrome de Sjogren, enfermedad de Delvic y miopatías inflamatorias (Nakamura et ál.,DNA Res. Vol.
13(4), 2006, 169-183; ver Engel et ál.,Pharmacol. Rev.Vol. 63, 2011, 127-156; Homam et ál.,J. Clin. Neuromuscular Disease,Vol. 12, 2010, 91-102); espondilitis anquilosante e infección por lepra (DAnoy et ál.,PLoS Genetics,Vol. 6(12), 2010, e1001195, 1-5; ver Zhang et ál.,N. Eng. J. Med.Vol. 361, 2009, 2609 2618); alfa-sinucleinopatías, taupatías (ver Li et ál., 2010Neurodegen. Dis.Vol. 7, 2010, 265-271); enfermedad de Gaucher (ver Westbroek et ál.,Trends. Mol. Med.Vol. 17, 2011, 485-493); enfermedades de taupatía caracterizadas por hiperfosforilación de Tau como enfermedad de grano argirofílica, enfermedad de Pick, degeneración corticobasal, parálisis supranuclear progresiva y demencia frontotemporal hereditaria y parkinsonismo ligado al cromosoma 17 (ver Goedert, M y Jakes, R,Biochemica et Biophysica Acta,Vol.
1739, 2005, 240-250); enfermedades caracterizadas por niveles disminuidos de dopamina tales como deprivación de los síntomas o recaída asociados con la adicción a las drogas (ver Rothman et ál.,Prog. Brain Res.,Vol. 172, 2008, 385); respuestas proinflamatorias microgliales (ver Moehle et ál.,J. NeuroscienceVol.
32, 2012, 1602-1611); patogénesis de la enfermedad de Crohn (ver Barrett et ál.,Nature Genetics,Vol. 40, 2008, 955-962); y esclerosis lateral amiotrófica (ELA).
El aumento de la actividad de LRRK2 también puede ser característico de la ELA. Se han observado niveles significativamente elevados de ARNm de LRRK2 en fibroblastos de pacientes con la enfermedad de Niemann-Pick Tipo C (NPC), lo que indica que la función anormal de LRRK2 puede desempeñar un papel en los trastornos lisosomales.
En otro aspecto, la presente divulgación se refiere a un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2 para su uso en un método de tratamiento de una enfermedad o afección mediada, al menos en parte, por LRRK2. En particular, la divulgación proporciona un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2 para su uso en un método para prevenir o tratar un trastorno asociado con LRRK2 en un mamífero, que comprende el paso de administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz de un compuesto de la Tabla 1 o Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, o una preparación terapéutica de la presente divulgación.
En ciertas realizaciones, la enfermedad o afección mediadas, al menos en parte, por LRRK2 es una enfermedad neurodegenerativa, por ejemplo, un trastorno del sistema nervioso central (SNC), tales como enfermedad de Parkinson (PD), enfermedad de Alzheimer (AD), demencia (lo que incluye demencia de cuerpos de Lewy y demencia vascular), esclerosis lateral amiotrófica (ELA), disfunción de la memoria relacionada con la edad, alteración cognitiva moderada (por ejemplo, lo que incluye la transición de alteración cognitiva moderada a la enfermedad de Alzheimer), enfermedad de grano argirofílica, trastornos lisosomales (por ejemplo, enfermedad de Niemann-Pick de tipo C, enfermedad de Gaucher), degeneración corticobasal, parálisis supranuclear progresiva, demencia frontotemporal hereditaria y parkinsonismo ligado con el cromosoma 17 (FTDP-17), síntomas de deprivación o recaída asociados con la adicción a las drogas, discinesia inducida por L-Dopa, enfermedad de Huntington (HD) y demencia asociada a VIH (HAD). En ciertas realizaciones, el trastorno es una enfermedad isquémica de órganos que incluyen, de modo no taxativo, cerebro, corazón, riñón e hígado.
Aunque no se limitan al mecanismo de tratamiento, en algunas realizaciones, los inhibidores de LRRK2, tales como los que no atraviesan la barrera hematoencefálica, pueden eliminar la inflamación periférica que desencadena la inflamación cerebral y, de esa forma, tratar enfermedades del SNC, tal como la enfermedad de Parkinson. La inflamación periférica puede incluir, por ejemplo, la inflamación intestinal (Kishimoto, Y. et. ál.,Neuromolecular Med.2019, 21(3): 239-249).
En algunas otras realizaciones, la enfermedad o afección mediadas, al menos en parte, por LRRK2 es cáncer. En ciertas realizaciones específicas, el cáncer es cáncer de tiroides, renal (lo que incluye renal papilar), de mama, de pulmón, hematológico y de próstata (por ejemplo, tumor sólido), leucemias (lo que incluye leucemia mielógena aguda (AML)) o linfomas. En ciertas realizaciones, el cáncer es cáncer renal, cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer hematológico, cáncer papilar, cáncer de pulmón, leucemia mielógena aguda o mieloma múltiple.
En ciertas realizaciones, un compuesto tal como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, una mezcla de estereoisómeros o profármaco de este, se usa para el tratamiento de trastornos inflamatorios. En ciertas realizaciones, el trastorno es una enfermedad inflamatoria de los intestinos, tales como enfermedad de Crohn o colitis ulcerosa (ambos conocidos en conjunto en general como enfermedad inflamatoria intestinal). En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es lepra, esclerosis lateral amiotrófica, artritis reumatoidea o espondilitis anquilosante. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es lepra, enfermedad de Crohn, enfermedad inflamatoria intestinal, colitis ulcerosa, esclerosis lateral amiotrófica, artritis reumatoidea o espondilitis anquilosante. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es lepra. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es enfermedad de Crohn. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es enfermedad inflamatoria intestinal. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es colitis ulcerosa. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es esclerosis lateral amiotrófica. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es artritis reumatoide. En ciertas realizaciones, la enfermedad inflamatoria es espondilitis anquilosante.
En ciertas realizaciones, un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, mezcla de estereoisómeros o profármaco de este, se usa en métodos para el tratamiento de esclerosis múltiple, lupus eritematoso sistémico, anemia hemolítica autoinmunitaria, aplasia de glóbulos rojos pura, púrpura trombocitopénica idiopática (ITP), síndrome de Evans, vasculitis, trastornos bullosos de la piel, diabetes de tipo 1, síndrome de Sjogren, enfermedad de Devic y miopatías inflamatorias.
En ciertas realizaciones, un compuesto tal como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, o una composición tal como se describe en el presente documento se usa en métodos para el tratamiento de tuberculosis.
En ciertas realizaciones, la presente divulgación se refiere a un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2 para su uso en un método de tratamiento de un trastorno de almacenamiento lisosómico que comprende la administración de una cantidad eficaz de un compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, o una composición como se divulga en el presente documento, a un sujeto que lo necesite. En ciertas realizaciones, el trastorno es enfermedad de Niemann-Pick de tipo A, enfermedad de Niemann-Pick de tipo B y enfermedad de Niemann-Pick de tipo C, enfermedad de Gaucher de tipo I, enfermedad de Gaucher de tipo II, enfermedad de Gaucher de tipo III, síndrome de Hurler (MPS I), síndrome de Hunter (MPS II), síndrome de Sanfilippo A, síndrome de Sanfilippo B, síndrome de Sanfilippo C, síndrome de Sanfilippo D, síndrome de Sly (MPS VII), enfermedad de Pompe, mucolipidosis IV, deficiencia múltiple de sulfatasa, gangliosidosis GM1, gangliosidosis GM2 variante AB, gangliosidosis GM2 (Tay-Sachs), gangliosidosis GM2 (Sandhoff), a-manosidosis, p-manosidosis, a-fucosidosis, sialidosis, enfermedad de células I (MLII), polidistrofia Pseudo-Hurler (ML III), enfermedad de Farber, aspartilglucosaminuria, enfermedad de Krabbe, cistinosis, enfermedad de Salla, enfermedad de Wolman, enfermedad de Schindler-Kanzaki, galactosialidosis, picnodisostosis, enfermedad de Batten (CLN1-10), enfermedad de Danon, síndrome de Chediak-Higashi, síndrome de Griscelli, síndrome de Fabry, síndrome de Hermansky-Pudlak, síndrome de Maroteaux-Lamy (MPS VI), deficiencia de hialuronidasa (MPS IX), enfermedad por almacenamiento de ésteres de colesterol, síndrome de Morquio A o síndrome de Morquio B.
En ciertas realizaciones, la presente divulgación se refiere a un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2 para su uso en un método de tratamiento de un trastorno relacionado con la autofagia que comprende administrar una cantidad eficaz de un compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, o una composición como la divulgada en el presente documento, a un sujeto que lo necesite. En ciertas realizaciones, el trastorno es enfermedad de Crohn, enfermedad de Parkinson, colitis ulcerosa, ELA, lupus eritematoso sistémico, ataxia infantil, esclerosis sistémica, paraparesia espástica hereditaria tipo 15, encefalopatía estática de la infancia con neurodegeneración en la edad adulta (SENDA), o síndrome de Vici). Otras realizaciones incluyen métodos para mejorar la memoria cognitiva de un sujeto, el método comprende administrar una cantidad eficaz de un compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, o una composición que comprende el compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, como se describe en el presente documento, a un sujeto que lo necesite.
En ciertas realizaciones, se proporciona el compuesto 7 como se muestra en la Tabla 1 para su uso en un método para prevenir o tratar un trastorno asociado con LRRK2 en un mamífero, que comprende el paso de administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, o una composición farmacéutica que comprende el mismo.
En ciertas realizaciones, se proporciona el compuesto 7 como se muestra en la Tabla 1 para su uso en un método para prevenir o tratar la enfermedad de Crohn en un mamífero, que comprende el paso de administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, o una composición farmacéutica que comprende el mismo.
En ciertas realizaciones, se proporciona el compuesto 7 como se muestra en la Tabla 1 para su uso en un método para prevenir o tratar la enfermedad inflamatoria intestinal en un mamífero, que comprende el paso de administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, o una composición farmacéutica que comprende el mismo.
En ciertas realizaciones, se proporciona el compuesto 7 como se muestra en la Tabla 1 para su uso en un método para prevenir o tratar la colitis ulcerosa en un mamífero, que comprende el paso de administrar a dicho mamífero una cantidad terapéuticamente eficaz del compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, o una composición farmacéutica que comprende el mismo.
Otras realizaciones incluyen el uso de un compuesto descrito en el presente documento en el presente documento en terapia. Algunas realizaciones incluyen su uso en el tratamiento de una enfermedad neurodegenerativa, cáncer o una enfermedad inflamatoria.
En ciertas realizaciones, se proporciona un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, para su uso en el tratamiento de la enfermedad de Alzheimer, discinesia inducida por L-Dopa, enfermedad de Parkinson, demencia, ELA, cáncer de riñón, cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer de la sangre, cáncer papilar, cáncer de pulmón, leucemia mielógena aguda, mieloma múltiple, lepra, enfermedad de Crohn, enfermedad inflamatoria intestinal, colitis ulcerosa, esclerosis lateral amiotrófica, artritis reumatoide o espondilitis anquilosante.
En ciertas realizaciones, se proporciona el uso de un compuesto mostrado en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, divulgado en el presente documento para la fabricación de un medicamento para tratar una enfermedad neurodegenerativa, un cáncer o una enfermedad inflamatoria. En ciertas realizaciones, se proporciona el uso de un compuesto mostrado en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, una mezcla de estereoisómeros o un profármaco de este, tal como se describe en el presente documento para la producción de un medicamento para el tratamiento de enfermedad de Alzheimer, discinesia inducida por L-Dopa, enfermedad de Parkinson, demencia, esclerosis lateral amiotrófica, cáncer renal, cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer hematológico, cáncer papilar, cáncer de pulmón, leucemia mielógena aguda, mieloma múltiple, lepra, enfermedad de Crohn, enfermedad inflamatoria intestinal, colitis ulcerosa, esclerosis lateral amiotrófica, artritis reumatoidea o espondilitis anquilosante.
El término “traumatismo” como se usa en el presente documento se refiere a cualquier daño físico al cuerpo causado por violencia, accidente, fractura, etc. El término “isquemia” se refiere a un trastorno cardiovascular caracterizado por un estado de oxígeno bajo usualmente debido a la obstrucción del suministro de sangre arterial o flujo sanguíneo inadecuado que lleva a hipoxia en el tejido. La expresión “accidente cerebrovascular” se refiere a trastornos cardiovasculares causados por un coágulo de sangre o sangrado en el cerebro, más comúnmente causado por una interrupción en el flujo de sangre en el cerebro porque el coágulo bloquea un vaso sanguíneo y, en ciertas realizaciones de la descripción, la expresión “accidente cerebrovascular” se refiere a ataque isquémico o ataque hemorrágico. La expresión “infarto de miocardio” se refiere a un trastorno cardiovascular caracterizado por la necrosis localizada provocada por la obstrucción del suministro de sangre.
En ciertas realizaciones, la presente divulgación se refiere a un compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, análogo isotópicamente enriquecido, tautómero, estereoisómero, o mezcla de estereoisómeros de los mismos, para su uso en la inhibición de la muerte celular, en donde los compuestos son como se muestra en la Tabla 1 o Tabla 2. En ciertas realizaciones, los compuestos de la presente divulgación son inhibidores de la muerte celular. En cualquier caso, los compuestos de la presente divulgación ejercen preferentemente su efecto en la inhibición de la muerte celular a una concentración inferior a aproximadamente 50 micromolar, o a una concentración inferior a aproximadamente 10 micromolar, o a una concentración inferior a 1 micromolar.
En ciertas realizaciones, la presente divulgación se refiere a una composición farmacéutica que comprende el compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo. En ciertas realizaciones, la presente divulgación se refiere a una composición farmacéutica que comprende el compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, para su uso en la inhibición de la quinasa LRRK2. En ciertas realizaciones, la presente divulgación se refiere a una composición farmacéutica que comprende el compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, para su uso en el tratamiento de la enfermedad de Crohn. En otras realizaciones, se proporciona una composición farmacéutica que comprende el compuesto 7, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, o un tautómero del mismo, para su uso en el tratamiento de la enfermedad de Parkinson.
En ciertas realizaciones, la presente descripción hace referencia a un compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, una mezcla de estereoisómeros o un profármaco de este, para inhibir la LRRK2 cinasa, en donde el compuesto es tal como se describe en el presente documento (por ejemplo, Tabla 1 o Tabla 2). En ciertas realizaciones, la LRRK2 cinasa es G2019S o N2081D. En ciertas realizaciones, el compuesto inhibe la LRRK2 cinasa, por ejemplo, G2019S, a una concentración IC<50>de menos de alrededor de 5 micromolar o menos de 1 micromolar. En ciertas realizaciones, el compuesto inhibe la LRRK2 cinasa, por ejemplo, G2019S, a una concentración IC<50>de menos de alrededor de 3 nanomolar. En ciertas realizaciones, el compuesto inhibe la LRRK2 cinasa según el ensayo del ejemplo biológico 4 a una concentración IC<50>de menos de alrededor de 11, 5, 4, 3 o 2 nanomolar.
4. Kits
También se proporcionan kits que incluyen un compuesto tal como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y un envase adecuado. En ciertas realizaciones, un kit incluye además instrucciones de uso. En un aspecto, un kit incluye un compuesto de la divulgación, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y una etiqueta y/o instrucciones para el uso de los compuestos en el tratamiento de las indicaciones, incluidas las enfermedades o afecciones, descritas en el presente documento.
También se proporcionan artículos de fabricación que incluyen un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos en un recipiente adecuado. El recipiente puede ser un vial, un frasco, una ampolla, una jeringa precargada o una bolsa intravenosa.
5. Composiciones farmacéuticas y modos de administración
Los compuestos aquí descritos, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, suelen administrarse en forma de composiciones farmacéuticas. Por lo tanto, en el presente documento también se proporcionan composiciones farmacéuticas que contienen uno o más de los compuestos divulgados en el presente documento o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y uno o más vehículos farmacéuticamente aceptables seleccionados entre portadores, adyuvantes y excipientes. Los vehículos farmacéuticamente aceptables adecuados pueden incluir, por ejemplo, diluyentes y cargas sólidas inertes, diluyentes, incluida una solución acuosa estéril y diversos disolventes orgánicos, potenciadores de la permeación, solubilizantes y adyuvantes. Tales composiciones se preparan de una manera bien conocida en el arte farmacéutico. Véase, por ejemplo, Remington's Pharmaceutical Sciences, Mace Publishing Co., Philadelphia,Pa. 17th Ed. (1985); y Modern Pharmaceutics, Marcel Dekker, Inc. 3rd Ed. (G.S. Banker & C.T. Rhodes, Eds.). En algunas realizaciones, la composición farmacéutica se presenta en una forma farmacéutica oral sólida.
Las composiciones farmacéuticas se pueden administrar en dosis simples o múltiples. La composición farmacéutica se puede administrar por medio de varios métodos que incluyen, por ejemplo, las vías rectal, bucal, intranasal y transdérmica. En ciertas realizaciones, la composición farmacéutica se puede administrar por inyección intraarterial, vía intravenosa, intraperitoneal, parenteral, intramuscular, subcutánea, oral, tópica o como un inhalante.
Un modo de administración es parenteral, por ejemplo, por inyección. Las formas en las que se pueden incorporar las composiciones farmacéuticas descritas en el presente documento para administración por inyección incluyen, por ejemplo, suspensiones o emulsiones acuosas u oleosas, con aceite de sésamo, aceite de maíz, aceite de semillas de algodón o aceite de maní, así como elíxires, manitol, dextrosa o una solución acuosa estéril y similares vehículos farmacéuticos.
La administración oral puede ser otra vía de administración de los compuestos aquí descritos. La administración puede realizarse, por ejemplo, mediante cápsulas o comprimidos con recubrimiento entérico. En la elaboración de las composiciones farmacéuticas que incluyen al menos un compuesto tal como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, el principio activo suele diluirse mediante un excipiente y/o encerrarse en un soporte de este tipo que puede tener forma de cápsula, sobre, papel u otro recipiente. Cuando el excipiente sirve como diluyente, puede tener la forma de un material sólido, semisólido o líquido, que actúa como vehículo, portador o medio para el principio activo. Así, las composiciones pueden presentarse en forma de comprimidos, píldoras, polvos, pastillas, bolsitas, cachés, elixires, suspensiones, emulsiones, soluciones, jarabes, aerosoles (como sólido o en un medio líquido), ungüentos que contengan, por ejemplo, hasta un 10% en peso del compuesto activo, cápsulas de gelatina blanda y dura, soluciones inyectables estériles y polvos envasados estériles.
Algunos ejemplos de excipientes apropiados incluyen lactosa, dextrosa, sacarosa, sorbitol, manitol, almidones, goma acacia, fosfato de calcio, alginatos, tragacanto, gelatina, silicato de calcio, celulosa microcristalina, polivinilpirrolidona, celulosa, agua estéril, jarabe y metilcelulosa. Las formulaciones pueden incluir adicionalmente agentes lubricantes tales como talco, estearato de magnesio y aceite mineral; agentes humectantes; agentes emulsionantes y de suspensión; agentes conservantes tales como propilhidroxibenzoatos y de metilo; agentes endulzantes; y agentes saborizantes.
Las composiciones que incluyen al menos un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, pueden formularse de modo que proporcionen una liberación rápida, sostenida o retardada del principio activo tras su administración al sujeto empleando procedimientos conocidos en la técnica. Los sistemas de liberación controlada de fármacos para administración oral incluyen sistemas de bomba osmótica y sistemas de disolución que contienen depósitos recubiertos de polímeros o formulaciones de matriz de fármaco-polímero. Los parches transdérmicos pueden utilizarse para proporcionar una infusión continua o discontinua de los compuestos de la Tabla 1 o la Tabla 2 en cantidades controladas. Los parches transdérmicos pueden construirse para la administración continua, pulsátil o a demanda de agentes farmacéuticos.
Para preparar composiciones sólidas como comprimidos, el principio activo principal puede mezclarse con un excipiente farmacéutico para formar una composición sólida de preformulación que contenga una mezcla homogénea de un compuesto como se muestra en la Tabla 1 o la Tabla 2, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. Cuando se hace referencia a estas composiciones de preformulación como homogéneas, el ingrediente activo puede dispersarse uniformemente por toda la composición, de modo que ésta pueda subdividirse fácilmente en formas de dosificación unitarias igualmente eficaces, como comprimidos, píldoras y cápsulas.
Los comprimidos o píldoras de los compuestos divulgados en el presente documento se pueden recubrir o componer de otro modo para proporcionar una forma de dosis para obtener la ventaja de una acción prolongada o para protección contra las condiciones ácidas del estómago. Por ejemplo, el comprimido o la píldora pueden incluir un componente de dosis interna y un componente de dosis externa, estando el último en forma de un sobre respecto del primero. Los dos componentes se pueden separar por medio de una capa entérica que sirve para resistir a la desintegración en el estómago y permiten que el componente interno pase intacto al duodeno o que se demore su liberación. Se puede usar una variedad de materiales para tales capas o revestimientos entéricos, en donde estos materiales incluyen una cantidad de ácidos poliméricos y mezclas de ácidos poliméricos con tales materiales como goma laca, alcohol cetílico y acetato de celulosa. Las composiciones para inhalación o insuflación pueden incluir soluciones y suspensiones en solventes acuosos u orgánicos farmacéuticamente aceptables o mezclas de ellos y polvos. Las composiciones líquidas o sólidas pueden contener excipientes farmacéuticamente aceptables apropiados como se describe en el presente documento. En ciertas realizaciones, las composiciones se administran por la vía respiratoria oral o nasal para efecto local o sistémico. En ciertas realizaciones, las composiciones en solventes farmacéuticamente aceptables se pueden nebulizar mediante el uso de gases inertes. Las soluciones nebulizadas se pueden inhalar directamente desde el dispositivo de nebulización o el dispositivo de nebulización se puede unir a una cámara con mascarilla o respirador intermitente de presión positiva. Las composiciones en solución, suspensión o polvo se pueden administrar, con preferencia, por vía oral o nasal, desde dispositivos que suministren la formulación de una manera apropiada.
6. Dosificación
El nivel de dosis específico de un compuesto de la presente solicitud para cualquier sujeto particular dependerá de una variedad de factores que incluyen la actividad del compuesto específico empleado, la edad, el peso corporal, el estado general de salud, el sexo, la dieta, el momento de administración, la vía de administración y la tasa de excreción, la combinación farmacológica y la gravedad de la enfermedad particular en el sujeto que se somete a terapia. Por ejemplo, una dosis se puede expresar como una cantidad de miligramos de un compuesto descrito en el presente documento por kilogramo del peso corporal del sujeto (mg/kg). Las dosis de entre aproximadamente 0,1 y 150 mg/kg pueden ser apropiadas. En ciertas realizaciones, pueden ser apropiados aproximadamente 0,1 y 100 mg/kg. En ciertas realizaciones, una dosis de entre 0,5 y 60 mg/kg puede ser apropiada. En ciertas realizaciones, puede ser apropiada una dosis de aproximadamente 0,0001 a aproximadamente 100 mg por kg de peso corporal por día, de aproximadamente 0,001 a aproximadamente 50 mg de compuesto por kg de peso corporal o de aproximadamente 0,01 a aproximadamente 10 mg de compuesto por kg de peso corporal. La normalización según el peso corporal del sujeto es particularmente útil cuando se ajustan las dosis entre sujetos de tamaños muy dispares, como ocurre cuando se usa el fármaco tanto en niños como en humanos adultos, o cuando se convierte una dosis eficaz en un sujeto no humano, como un perro, en una dosis apropiada para un sujeto humano.
La dosis diaria también se puede describir como una cantidad total de un compuesto descrito en el presente documento administrada por dosis o por día. La dosis diaria de un compuesto tal como se describe en el presente documento (por ejemplo, Tabla 1 o Tabla 2) puede ser de entre aproximadamente 1 mg y 4000 mg, de entre aproximadamente 2000 y 4000 mg/día, de entre aproximadamente 1 y 2000 mg/día, de entre aproximadamente 1 y 1000 mg/día, de entre aproximadamente 10 y 500 mg/día, de entre aproximadamente 20 y 500 mg/día, de entre aproximadamente 50 y 300 mg/día, de entre aproximadamente 75 y 200 mg/día o de entre aproximadamente 15 y 150 mg/día.
Cuando se administra por vía oral, la dosis diaria total para un sujeto humano puede ser de entre 1 mg y 1000 mg, de entre aproximadamente 1000-2000 mg/día, de entre aproximadamente 10-500 mg/día, de entre aproximadamente 50-300 mg/día, de entre aproximadamente 75-200 mg/día o de entre aproximadamente 100-150 mg/día.
Los compuestos de la presente solicitud o sus composiciones pueden administrarse una vez, dos veces, tres veces, cuatro veces o más veces por día mediante cualquier modo apropiado descrito con anterioridad. En una realización particular, el método comprende la administración al sujeto de una dosis diaria inicial de aproximadamente 1 a 800 mg de un compuesto descrito en el presente documento y el aumento progresivo de la dosis hasta lograr la eficacia clínica. Los incrementos de aproximadamente 5, 10, 25, 50 o 100 mg se pueden usar para aumentar la dosis. La dosis se puede aumentar día diario, cada dos vías, dos veces por semana o una vez por semana.
7. Terapia combinada
En otro aspecto de la descripción, los compuestos se pueden administrar en combinación con otros agentes, lo que incluye (de modo no taxativo) compuestos que son inhibidores de la apoptosis; inhibidores de la PARP poli(ADP-ribosa) polimerasa; inhibidores de Src; agentes para el tratamiento de trastornos cardiovasculares; hipertensión, hipercolesterolemia y diabetes de tipo II; agentes antiinflamatorios, agentes antitrombóticos; agentes fibrinolílicos; agentes antiplaquetarios, agentes de reducción de lípidos, inhibidores directos de trombina; inhibidores del receptor de glucoproteína Ilb/IIIa; bloqueadores del canal de calcio; agentes bloqueantes del receptor beta-adrenérgico; inhibidores de la ciclooxigenasa (por ejemplo, COX-1 y COX-2); inhibidor del sistema de angiotensina (por ejemplo, inhibidores de la enzima convertidora de la angiotensina (ACE)); inhibidores de renina; y/o agentes que se unen con la moléculas de adhesión celular e inhiben la capacidad de los glóbulos blancos de unirse con tales moléculas (por ejemplo, polipéptidos, anticuerpos policlonales y monoclonales).
En ciertas realizaciones, un compuesto, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, de la presente divulgación se puede administrar en combinación con un agente adicional que tiene actividad para el tratamiento de una enfermedad neurodegenerativa. Por ejemplo, en algunas realizaciones, los compuestos se administran en combinación con uno o varios agentes terapéuticos adicionales útiles para el tratamiento de enfermedad de Parkinson. En ciertas realizaciones, el agente terapéutico adicional es L-dopa (por ejemplo, Sinemet®), un agonista dopaminérgico (por ejemplo, Ropinerol o Pramipexol), un inhibidor de catecol-O-metiltransferasa (COMT) (por ejemplo, Entacapona), un inhibidor de L-monoamina oxidasa (MAO) (por ejemplo, selegilina o rasagilina) o un agente que incrementa la liberación de dopamina (por ejemplo, Zonisamida).
En algunas realizaciones, los compuestos se administran en combinación con uno o más agentes terapéuticos adicionales útiles para el tratamiento de la enfermedad de Crohn. En ciertas realizaciones, el agente terapéutico adicional es un corticosteroide (por ejemplo, prednisona y budesónida), un 5-aminosalicilato (por ejemplo, sulfasalazina, sulfa y mesalamina), un supresor del sistema inmunitario (por ejemplo, azatioprina, mercaptopurina, Infliximab, adalimumab, certolizumab pegol, metotrexato, natalizumab, vedolizumab y ustekinumab) y un antibiótico (por ejemplo, ciprofloxacina y metronidazol).
La presente divulgación también proporciona una combinación de dos o más compuestos, una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, que inhibe la necrosis celular (por ejemplo, un compuesto mostrado en la Tabla 1 o Tabla 2 y un agente adicional para inhibir la necrosis). La presente descripción también proporciona combinaciones de uno o varios compuestos que inhiben la necrosis celular al combinarse con uno o varios agentes adicionales o compuestos (por ejemplo, otros compuestos terapéuticos para el tratamiento de una enfermedad, afección o infección).
8. Síntesis de los compuestos
Los compuestos, o sales farmacéuticamente aceptables, análogos deuterados, tautómeros, estereoisómeros, o mezcla de estereoisómeros de los mismos pueden prepararse usando los métodos aquí divulgados y modificaciones rutinarias de los mismos, que serán evidentes dada la divulgación aquí contenida. La síntesis de los compuestos típicos divulgados en el presente documento puede llevarse a cabo como se describe en los siguientes ejemplos. Si están disponibles, los reactivos pueden adquirirse comercialmente, por ejemplo, de Sigma Aldrich u otros proveedores químicos.
Los compuestos de esta descripción se pueden preparar a partir de materiales de partida fácilmente asequibles usando, por ejemplo, los siguientes métodos y procedimientos generales. Se apreciará que, cuando se brindan condiciones de proceso típicas o preferidas (es decir, temperaturas de reacción, tiempos, relaciones molares de reactivos, solventes, presiones, etc.), también se pueden usar otras condiciones de proceso, a menos que se establezca otra cosa. Las condiciones óptimas de reacción pueden variar con los reactivos o el solvente particulares usados, pero tales condiciones pueden ser determinadas por un experto en la técnica.
Adicionalmente, como será evidente para los expertos en la técnica, pueden ser necesarios grupos protectores para evitar que ciertos grupos funcionales se sometan a reacciones no deseadas. Los grupos protectores apropiados para varios grupos funcionales, así como las condiciones apropiadas para proteger y desproteger grupos funcionales particulares son conocidos en la técnica. Por ejemplo, se describen numerosos grupos protectores en Wuts, P. G. M., Greene, T. W., & Greene, T. W. (2006).Greene's protective groups in organic synthesis.Hoboken, N.J., Wiley-Interscience y referencias citadas allí.
Asimismo, los compuestos de esta descripción pueden contener uno o varios centros quirales. Por consiguiente, si se desea, estos compuestos se pueden preparar o aislar como estereoisómeros puros, es decir, como enantiómeros o diastereómeros individuales, o como mezclas enriquecidas con estereoisómeros. Todos estos estereoisómeros (y mezclas enriquecidas) están incluidos dentro del alcance de esta descripción, a menos que se indique otra cosa. Los estereoisómeros puros (o mezclas enriquecidas) se pueden preparar usando, por ejemplo, materiales de partida ópticamente activos o reactivos estereoselectivos conocidos en la técnica. De modo alternativo, las mezclas racémicas de tales compuestos se pueden separar usando, por ejemplo, cromatografía en columna quiral, agentes de resolución quiral y similares.
Los materiales de partida para las siguientes reacciones son compuestos conocidos en general o se pueden preparar por medio de procedimientos conocidos o sus modificaciones obvias. Por ejemplo, muchos de los materiales de partida son asequibles de proveedores comerciales tales como Aldrich Chemical Co. (Milwaukee, Wisconsin, Estados Unidos), Bachem (Torrance, California, Estados Unidos), Emka-Chemce o Sigma (St. Louis, Missouri, Estados Unidos). Otros se pueden preparar por medio de procedimientos o sus modificaciones obvias, descritos en textos de referencia estándar comoFieser and Fieser's Reagents for Organic Synthesis,Volumes 1-15 (John Wiley and Sons, 1991),Rodd's Chemistry of Carbón Compounds,volúmenes 1-5 y complementos (Elsevier Science Publishers, 1989),organic Reactions,Vol. 1-40 (John Wiley and Sons, 1991),March's Advanced Organic Chemistry(John Wileiy and Sons, 5.a Ed., 2001) yLarock's Comprehensive Organic Transformations(VCH Publishers Inc., 1989).
Las expresiones “solvente”, “solvente orgánico inerte” o “solvente inerte” se refieren a un solvente inerte en las condiciones de la reacción descrita en conjunto (lo que incluye, por ejemplo, benceno, tolueno, acetonitrilo, tetrahidrofurano (“THF”), dimetilformamida (“DMF”), cloroformo, cloruro de metileno (o diclorometano), éter dietílico, metanol, piridina, y similares). A menos que se especifique lo contrario, los solventes usados en las reacciones de la presente divulgación son solventes orgánicos inertes y las reacciones se llevan a cabo bajo un gas inerte, con preferencia nitrógeno.
La expresión “q.s.” significa añadir una cantidad suficiente para obtener una función establecida, por ejemplo, para llevar una solución al volumen deseado (es decir, 100 %).
También se apreciará que, en cada uno de los esquemas anteriores, la adición de cualquier sustituyente pueda dar como resultado la producción de una cantidad de productos isoméricos (lo que incluye, de modo no taxativo, enantiómeros o uno o varios diastereómeros), todos o cada uno de los cuales se puede aislar y purificar usando técnicas convencionales. Cuando se desean compuestos enantioméricamente puros o enriquecidos, se pueden usar cromatografía quiral y/o materiales de partida enantioméricamente puros o enriquecidos según se usa de modo convencional en la técnica o como se describe en los ejemplos.
Síntesis general
El siguiente esquema de reacción general I ilustra un método general de preparación de un compuesto descrito en el presente documento.
Esquema I
Haciendo referencia al esquema de reacción general I, se pueden preparar los compuestos de la fórmula I por acoplamiento de una pirimidina sustituida de la fórmula I-1 con una amina de la fórmula I-2, en donde R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7 y n se definen como en cualquiera de las fórmulas proporcionadas en el presente documento o por los compuestos específicos ejemplificados en el presente documento (por ejemplo, Tabla 1 o Tabla 2) y X es un grupo saliente. En ciertas realizaciones, X es halo. Los compuestos apropiados de la fórmula I-1 o I-2 se pueden preparar según los métodos descritos a continuación o por métodos conocidos por un experto en la técnica. El acoplamiento de compuestos de fórmula I-1 y I-2 en presencia de un ácido proporciona un compuesto de la fórmula I. En ciertas realizaciones, el ácido es ácido toluensulfónico o ácido trifluoroacético. En ciertas realizaciones, el acoplamiento de compuestos de la fórmula I-1 y I-2 en presencia de una base proporciona un compuesto de la fórmula I. En ciertas realizaciones, la base es trietilamina. En ciertas realizaciones, se proporciona un método de preparación de un compuesto de la fórmula I que comprende el acoplamiento de un compuesto de la fórmula I-1 con un compuesto de la fórmula I-2 en condiciones para proporcionar el compuesto de la fórmula I, en donde R1, R2, R3, R4, R5, R6, R7 y n se definen como en cualquiera de las fórmulas proporcionadas en el presente documento o por los compuestos específicos ejemplificados en el presente documento (por ejemplo, Tabla 1 o Tabla 2) y X es un grupo saliente. En ciertas realizaciones, X es halo.
Cuando no son asequibles en comercios, las aminas de la fórmula I-2 se pueden preparar a partir de materiales de partida asequibles en comercios. Por ejemplo, en ciertas realizaciones, las aminas de la fórmula I-2 se pueden preparar a partir de la reducción del correspondiente compuesto con sustitución nitro. Las aminas de la fórmula I-2 se funcionalizan normalmente antes del acoplamiento con la pirimidina sustituida de la fórmula I-1. Cuando se desea cierto estereoisómero de fórmula I, se puede preparar un estereoisómero simple de la correspondiente amina antes de acoplar con la pirimidina sustituida de la fórmula I-1 y/o una mezcla resultante de estereoisómeros se pueden resolver mediante métodos conocidos (por ejemplo, cromatografía quiral).
Ejemplos de aminas de fórmula I-2 se pueden preparar por medio de reacciones de cicloadición 1,3-dipolar usando materiales de partida apropiadamente funcionalizados tal como se muestra en el esquema II.
Esquema II
Tal como se muestra anteriormente en el Esquema II, un sustituyente se puede instalar durante la formación del anillo ciclopropilo mediante el uso de un material de partida sustituido de forma adecuada, en donde R3, R4, R5, R6 y R17 son tal como se definió en el presente documento y R101 es alquilo. En ciertas realizaciones, R101 es metilo. Los pirazoles con sustitución adecuada de Fórmula II-1 se pueden acoplar con compuestos diazo con sustitución adecuada de Fórmula II-2 en presencia de un catalizador para proveer intermedios de ciclopropilo de Fórmula II-3. Se puede llevar a cabo una funcionalización o interconversión de grupos funcionales adicional mediante métodos conocidos en la técnica para proveer aminas de Fórmula II-4 para usar en el método del Esquema I
Ejemplos
Los siguientes ejemplos se incluyen para demostrar las realizaciones específicas de la descripción. Los expertos de la técnica apreciarán que las técnicas descritas en los ejemplos siguientes representan técnicas que funcionan en la práctica de la descripción y, por lo tanto, se puede considerar que constituyen modos específicos para su práctica. Sin embargo, los expertos en la técnica deberían apreciar, a la luz de la presente divulgación, que se pueden hacer varios cambios en las realizaciones específicas que se describen y obtener un resultado igual o similar sin apartarse del alcance de la descripción.
Métodos experimentales generales:
Todas las reacciones no acuosas se llevaron a cabo en material de vidrio secado en horno o a llama bajo una atmósfera de nitrógeno. Todos los productos químicos se adquirieron de proveedores comerciales y se usaron como tales, a menos que se especificara otra cosa. Las reacciones se agitaron de forma magnética y se controlaron por cromatografía de capa fina (TLC) con placas de gel de sílice prerrecubiertas de 250 pm, se visualizaron con UV o en una cámara de yodo. La cromatografía ultrarrápida en columna se llevó a cabo usando gel de sílice (100-200 mesh). Los desplazamientos químicos se informan respecto del cloroformo (8 7,26), el metanol (8 3,31) o el DMSO (8 2,50) para 1H RMN. El análisis de HPLC se llevó a cabo en un sistema de HPLC Shimadzu 20AB con un detector de fotodiodos y columna Luna-C18(2) 2,0*50mm, 5 pm a una velocidad de flujo de 1,2 mL/min con un solvente de gradiente de fase móvil A (MPA, H<2>O 0,037 % (v/v) TFA): fase móvil B (MPB, ACN 0,018 % (v/v) TFA) (0,01 minutos, 10 % de MPB; 4 minutos, 80 % de<M p B ;>4,9 minutos, 80 % de MPB; 4,92 minutos, 10 % de<M P b ;>5,5 minutos, 10 % de MPB). LCMS se detectó a 220 y 254 nm o se usó detección por dispersión de luz evaporativa (ELSD), así como ionización por electronebulización positiva (MS). La HPLC semipreparativa se llevó a cabo en condición ácida o neutra. Ácido: Luna C18 100*30 mm, 5 pm; MPA: HCl/H<2>O = 0,04 % o ácido fórmico/H<2>O = 0,2 % (v/v); MPB:ACN. Neutra: Waters Xbridge 150*25, 5 pm; MPA: NH<4>HCO<3>10 mM en H<2>O; MPB:ACN. Gradiente para ambas condiciones: 10% de MPB al 80% de MPB en un lapso de 12 minutos a una velocidad de flujo de 20 mL/min, luego 100 % de MPB durante 2 minutos, 10% de MPB durante 2 minutos, detector UV. El análisis de SFC se llevó a cabo en un sistema Thar analytical SFC con un detector UV/Vis y serie de columnas quirales que incluyen las columnas AD-3, ASH, OJ-3, OD-3, AY-3 e IC-3, 4,6*100 mm, columna 3 um a una velocidad de flujo de 4 mL/min con un solvente de gradiente de fase móvil A (MPA, CO<2>): fase móvil B (MPB, MeOH 0,05 % (v/v) IPAm) (0,01 minutos, 10% de MPB; 3 minutos, 40% de MPB; 3,5 minutos, 40% de MPB; 3,56-5 minutos, 10% de MPB). La SFC preparativa se llevó a cabo en un sistema Thar 80 preparative SFC con un detector UV/Vis y serie de columnas preparativas quirales que incluyen las columnas AD-H, AS-H, OJ-H, OD-H, AY-H e IC-H, 30*250 mm, columna 5 pm a una tasa de flujo de 65 mL/min con un gradiente de solvente de fase móvil A (MPA, CO<2>): fase móvil B (MPB, MeOH 0,1 % (v/v) de NH<3>H<2>O) (0,01 minutos, 10% de MPB; 5 minutos, 40% de MPB;<6>minutos, 40% de MPB; 6,1-10 minutos, 10% de<M p B ) .>Preparación del compuesto
Cuando no se describe la preparación de los materiales de partida, ellos son asequibles en comercios, conocidos de la bibliografía o fácilmente obtenibles por los expertos en la técnica usando procedimientos estándares conocidos en la bibliografía o que los expertos pueden obtener fácilmente mediante procedimientos estándares. Cuando se establece que los compuestos se preparaban análogamente a ejemplos anteriores o intermedios, el experto en la técnica apreciará que se pueden modificar el tiempo de reacción, la cantidad de equivalentes de reactivos y la temperatura para cada reacción específica y puede ser necesario o deseable emplear diferentes técnicas de elaboración o purificación. Cuando las reacciones se llevan a cabo usando irradiación por microondas, el dispositivo de microondas usada es un Biotage Initiator. La potencia real suministrada varía durante el curso de la reacción a fin de mantener una temperatura constante.
Ejemplo 1
Síntesis de (1,2-c/s)-1-metil-2-(3-metil-4-((4-((1-metilciclopropil)amino)-5-(trifluorometil)pirimidin-2-il)amino)-<1>H-pirazol-<1>-il)ciclopropanocarboxamida (<1>)
Se separó una mezcla racémica de (1,2-c/s)-1-metil-2-(3-metil-4-((4-((1-metilciclopropil)amino)-5-(trifluorometil)pirimidin-2-il)amino)-1H-pirazol-1-il)ciclopropanocarbonitrilo mediante SFC quiral (columna: IC (250 mm*30 mm, 10 pm); fase móvil: [Neu-IPA]; B%: 20 %-20 %, 3 minutos). Se agregó<U h P>(119 mg, 1,27 mmol) a 25 °C en N<2>a una solución del segundo isómero en elución de (1,2-c/s)-1-metil-2-(3-metil-4-((4-((1-metilciclopropil)amino)-5-(trifluorometil)pirimidin-2-il)amino)-1H-pirazol-1-il)ciclopropanocarbonitrilo (41,3 mg, 0,11 mmol) en DMSO (2 mL) y K<2>CO<3>acuoso saturado (0,7 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante<6>horas, se vertió en agua (20 mL) a 20 °C y se extrajo con EtOAc (3 * 10 mL). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (3 * 10 mL), se secaron en Na<2>SO<4>, se filtraron y se concentraron a presión reducida. El residuo se purificó mediante HPLC preparativa en las siguientes condiciones: columna: Waters Xbridge 150*25 5 pm; fase móvil: [agua (NH<4>HCO<3>10 mM)-ACN; B %: 20%-45%, 7 minutos para proporcionar el producto deseado. LC-MS, m/z = 410,1 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, MeOD):<8>8,24 (br s, 1H), 8,03 (s, 1H), 3,64 (dd,J= 5,3, 7,9 Hz, 1H), 2,24-2,17 (m, 4H), 1,49 (s, 3H), 1,47 (s, 3H), 1,30 (dd,J= 5,9, 7,7 Hz, 1H), 0,86 (br s, 2H), 0,78 (br s, 2H).
Ejemplo 2
Síntesis de (1,2-c/s)-2-(3-ciclopropil-4-((4-(metilamino)-5-(trifluorometil)pirimidin-2-il)amino)-1H-pirazol-1-il)ciclopropanocarboxamida (<2>)
Se separó una mezcla racémica de (1,2-c/s)-2-(3-ciclopropil-4-((4-(metilamino)-5-(trifluorometil)pirimidin-2-il)amino)-1H-pirazol-1-il)ciclopropanocarbonitrilo mediante<s F c>quiral (Instrumento: Thar SFC80 preparative SFC; Columna: Chiralpak AD-H 250*30 mm i.d. 5 pm; fase móvil: A para CO<2>y B para EtoH (NH<3>H<2>O 0,1 %); Gradiente: B %=42 %; Velocidad de flujo: 70 g/min; Longitud de onda: 220 nm; Temperatura de columna: 40 °C; Contrapresión del sistema: 100 bar). Se agregaron K<2>CO<3>acuoso saturado (0,9 mL) y UHP (160 mg, 1,70 mmol) a 25 °C en N<2>a una solución del primer isómero en elución (1,2-c/s)-2-(3-ciclopropil-4-((4-(metilamino)-5-(trifluorometil)pirimidin-2-il)amino)-1H-pirazol-1-il)ciclopropanocarbonitrilo (51 mg, 0,14 mmol) en DMSO (3 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 12 horas, se vertió en agua (20 mL) a 20 °C y se extrajo con EtOAc (3 * 10 mL). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (30 mL), se secaron en Na<2>SO<4>, se filtraron y se concentraron a presión reducida. El residuo se purificó mediante HPLC preparativa en las siguientes condiciones: columna: Waters Xbridge 150*25 5 pm; fase móvil: [agua (NH<4>HCO<3>10 mM)-ACN; B %: 10%-40%, 7 min para proveer el producto deseado. LC-MS, m/z = 382,1 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, MeOD):<8>8,02 (s, 1H), 7,96 (br s, 1H), 3,87-3,77 (m, 1H), 3,02 (s, 3H), 2,19-2,07 (m, 1H), 1,95 (q,J= 5,7 Hz, 1H), 1,87-1,74 (m, 1H), 1,46 (dt,J= 5,9, 8,0 Hz, 1H), 0,93-0,74 (m, 4H).
Ejemplo 3
Síntesis de (1,2-c/s)-2-(4-((5-bromo-4-(etilamino)pirimidin-2-il)amino)-3-metil-1H-pirazol-1-il)-1-metilciclopropanocarboxamida (3)
Una mezcla racémica de (1,2-c/s)-2-(4-((5-bromo-4-(et¡lam¡no)p¡r¡m¡d¡n-2-il)am¡no)-3-met¡l-1H-p¡razol-1-¡l)-1-metilciclopropanocarbonitrilo se separó med¡ante SCF qu¡ral (columna: IC(250 mm*30 mm,10 um); fase móv¡l: [Neu-IPA]; B %: 33 %-33 %, 5 minutos). Se agregaron K<2>CO<3>acuoso saturado (0,9 mL) y UHP (182 mg, 1,94 mmol) a 25 °C en N<2>a una solución del primer isómero en elución (1,2-c/s)-2-(4-((5-bromo-4-(et¡lam¡no)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-3-met¡l-1H-p¡razol-1-¡l)-1-met¡lc¡clopropanocarbonitr¡lo (60,70 mg, 0,16 mmol) en DMSO (3 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 12 horas. La mezcla de reacción se vertió en agua (10 mL) a 20 °C y se extrajo con EtOAc (3 * 5 mL). Las capas orgánicas combinadas se lavaron con salmuera (3 x 5 mL), se secaron en Na<2>SO<4>, se filtraron y se concentraron a presión reducida. El residuo se purificó mediante HPLC preparativa en las siguientes condiciones: columna: Waters Xbridge 150*25 5 pm; fase móvil: [agua (NH<4>HCO<3>10 mM)-ACN; B %: 10%-40%, 7 minutos para proporcionar el producto deseado. LC-MS, m/z = 394,0, 396,0 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, MeOD):<8>7,83-7,78 (m, 2H), 3,62 (dd,J= 5,3, 7,9 Hz, 1H), 3,50 (q,J= 7,2 Hz, 2H), 2,20 (t,J= 5,5 Hz, 1H), 2,15 (s, 3H), 1,47 (s, 3H), 1,29 (dd,J= 5,7, 7,9 Hz, 1H), 1,24 (t,J= 7,2 Hz, 3H).
Ejemplo 4
Síntesis de (1,2-c/s)-1-met¡l-2-(3-met¡l-4-((4-((1-met¡lc¡cloprop¡l)amino)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-1 H-pirazol-1 -il)ciclopropanocarboxam¡da (4)
Se separó una mezcla racémica de (1,2-c/s)-1-metil-2-(3-met¡l-4-((4-((1-met¡lcicloprop¡l)am¡no)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarbonitr¡lo mediante SFC quiral (columna: IC (250 mm*30 mm, 10 pm); fase móvil: [Neu-IPA]; B %: 20 %-20 %, 3 minutos). Se agregó UHP (58 mg, 0,61 mmol) a 25 °C en N<2>a una solución del primer isómero en elución de (1,2-c/s)-1-metil-2-(3-metil-4-((4-((1-met¡lc¡cloprop¡l)am¡no)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarbonitr¡lo (20 mg, 0,05 mmol) en DMSO (1 mL) y K<2>CO<3>acuoso saturado (3 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 15 horas y se vertió en agua (10 mL). La fase acuosa se extrajo con EtOAc (4 x 3 mL). La fase orgánica combinada se lavó con salmuera (3 mL), se secó en Na<2>SO<4>anhidro, se filtró y se concentró a presión reducida. El residuo se purificó mediante HPLC preparativa (neutra) según las siguientes condiciones: columna: Welch Xtimate C<18>150*25 mm*5 pm; fase móvil: [agua (NH<4>HCO<3>10 mM)-ACN; B %: 25 %-55 %, 10 minutos para proveer el producto deseado. LC-MS: m/z: 409,9 [M+H]+. 1H-RMN (400 MHz, CDCla):<8>8,27 (br s, 1H), 8,10 (br s, 1H), 6,77 (br s, 1H), 5,76 (br s, 1H), 5,53 (br s, 1H), 5,20 (br s, 1H), 3,66 (dd,J= 5,2, 8,0 Hz, 1H), 2,24 (s, 3H), 2,19 (t,J= 5,6 Hz, 1H), 1,57-1,51 (m, 1H), 1,53 (s, 2H), 1,49 (s, 3H), 1,31 (dd,J= 6,2, 7,9 Hz, 1H), 0,97 0,74 (m, 4H).
Ejemplo 5
Síntesis de (1R,2S)- y (1S,2R)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-((4-(et¡lam¡no)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡rim¡d¡n-2-¡l)am¡no)-1H-p¡razol-1-¡l)-1-met¡lc¡clopropanocarbon¡tr¡lo (5)
2,2-Dibromo-1-metil-ciclopropanocarboxilato de metilo:Se agregó bromoformo (557,44 g, 2,21 mol) gota a gota a 0 °C a una mezcla de 2-metilprop-2-enoato de metilo (110,28 g, 1,10 mol), cloruro de bencil(triet¡l)amon¡o (30,01 g, 131,75 mmol) y NaOH (449,88 g, 11,25 mol) en H<2>O (443,5 mL). Luego, la mezcla se agitó a 25 °C durante 12 horas. La mezcla de reacción se filtró y luego se diluyó con agua (500 mL) y se extrajo con MTBE (3 * 500 mL). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (2 * 300 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice (PE:EtOAc= 30:1 a 1:1) para proporcionar 2,2-dibromo-1-metilciclopropanocarboxilato de metilo. 1H RMN (400 MHz, CDCla):<8>ppm 3,80 (s, 3 H), 2,43 (d, J=7,94 Hz, 2 H), 1,59 (d, J=7,94 Hz, 3 H).
Cis y trans-2-bromo-1-metil-ciclopropanocarboxilato de metilo:Se agregó /-PrMgCl (230,57 mL, 2 M) gota a gota a -78 °C en N<2>a una solución de 2,2-dibromo-1-metil-c¡clopropanocarbox¡lato de metilo (114 g, 419,22 mmol) en THF (500 mL). La mezcla se agitó durante 5 minutos. La mezcla de reacción se inactivó con NH<4>Cl saturado (100 mL) a 20 °C y luego se diluyó con agua (200 mL). La fase orgánica se separó y la fase acuosa se extrajo con EtOAc (2 * 500 mL). La fase orgánica combinada se lavó con salmuera (500 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró para producir una mezcla de cis y trans-<2>-bromo-<1>-metilciclopropanocarboxilato de metilo. El producto en bruto se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional.
1H RMN (400 MHz, CDCh):<8>ppm 3,77 (s, 3 H), 3,69 (s, 3 H), 3,52 (dd, J=8,16, 5,29 Hz, 1 H), 2,96 (dd, J=7,72, 5,51 Hz, 1 H), 1,79 - 1,88 (m, 2 H), 1,40 (s, 3 H), 1,48 (s, 3 H), 1,23 - 1,27 (m, 1 H), 1,02 (t, J=5,62 Hz, 1 H).
Ácido cis y trans-2-bromo-1-metil-ciclopropanocarboxílico:Se agregó NaOH (44,12 g, 1,10 mol) a una solución de 2-bromo-1-metil-ciclopropanocarboxilato de metilo (71 g, 367,80 mmol) en MeOH (500 mL) y H<2>O (50 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 16 horas y se concentró a presión reducida. El residuo se diluyó con agua (500 mL). La fase acuosa se extrajo con MTBE (300 mL) para eliminar las impurezas, luego se ajustó supH a 3 con HCl acuoso (2 M) y se extrajo con DCM (400 mL * 2). La fase orgánica combinada se lavó con salmuera (300 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida para obtener una mezcla de ácido cis y trans-2-bromo-1-metil-cidopropanocarboxílico. El producto en bruto se usó en la siguiente etapa sin purificación adicional. 1H RMN (400 MHz, CDCh): 8 ppm 3,58 (dd, J=8,53, 5,52 Hz, 1 H), 3.02 (dd, J=7,78, 5,77 Hz, 1 H), 1,92 (dd, J=8,03, 6,02 Hz, 1 H), 1,81 (t, J=6,02 Hz, 1 H), 1,41 (s, 3 H), 1,32 (dd, J=7,53, 6,53 Hz, 1 H), 1,21 (s, 3 H), 1,09 (t, J=5,77 Hz, 1 H).
Cis y trans-2-bromo-W-terc-butiM-metN-ddopropanocarboxamida:Se calentó una solución de ácido 2-bromo-1-metil-ciclopropanocarboxílico (60 g, 335,17 mmol) en SOCh (370 mL) a 80 °C y se agitó durante 2 horas. Luego, la mezcla se concentró a presión reducida. El residuo se disolvió en THF (200 mL). Se agregó la solución gota a gota a una mezcla de TEA (74,22 g, 733,46 mmol) y 2-metilpropan-2-amina (30,09 g, 411,42 mmol) en THF (500 mL) a 0°C en N<2>. La mezcla se calentó a 25 °C y se agitó durante 1 hora, se inactivó con HCl (500 mL, 2 M) y luego se ajustó el pH a 7 con NaHCO<3>saturado. La fase orgánica se separó y la fase acuosa se extrajo con EtOAc (500 mL * 2). La fase orgánica se lavó con salmuera (500 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida para obtener cis y trans-2-bromo-N-terc-butil-1-metil-ciclopropanocarboxamida. LCMS: RT 1,365 minutos, m/z = 235,1 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, CDCh): 8 ppm 5,43 - 5,68 (m, 1 H), 3,47 (dd, J=8,03, 5,02 Hz, 1 H), 2,86 (dd, J=7,53, 4,52 Hz, 1 H), 1,83 (dd, J=8,03, 6.02 Hz, 1 H), 1,63 (dd, J=6,78, 4,77 Hz, 1 H), 1,47 (s, 3 H), 1,34- 1,40 (m, 12 H), 1,11 - 1,16 (m, 1 H), 0,83 0,87 (m, 1 H).
W-terc-butiM-metN-ddoprop-2-eno-1-carboxamida:Se agregaron KOH (2,64 g, 46,98 mmol) y 18-corona-6 (621 mg, 2,35 mmol) a 25 °C a una mezcla de 2-bromo-N-terc-butil-1-metil-ciclopropanocarboxamida (5,5 g, 23,49 mmol) en DMSO (15 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 72 horas. La mezcla de reacción se diluyó con agua (50 mL) y se extrajo con DCM:i-PrOH (3 * 50 mL, v:v = 3:1). Luego, la capa orgánica combinada se lavó con salmuera (3 * 10 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice (PE:EtOAc= 20:1 a 5:1) para proporcionar N-terc-butil-1-metil-cicloprop-2-eno-1-carboxamida. LCMS: RT 1,027 minutos, m/z = 154,2 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, CDCh): 8 ppm 7,09 (s, 2H), 1,36 (s, 3H), 1,29 (s, 9 H).
(1,2-c/s)-N-(terc-butM)-2-(3-ddopropiMH-pirazoM-M)-1-metNcidopropanocarboxamida: Se agregó 18-corona-6 (690 mg,<2 , 61>mmol) y NaH (2,09 g, 52,21 mmol, 60 % de pureza) a una mezcla de 3-ciclopropil-1H-pirazol (2,82 g, 26,11 mmol) en THF (30 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 0,5 horas. Se agregó N-terc-butil-1-metil-cicloprop-2-eno-1-carboxamida (4 g, 26,11 mmol) a la solución de reacción. Entonces, la mezcla se agitó a 80 °C durante 16 horas más. La mezcla de reacción se diluyó con agua (100 mL) y se extrajo con MTBE (3 * 100 mL). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (2 * 20 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice (PE:EtOAc = 10:1 a 1:1) y HPLC preparativa (TFA) para obtener (1,2-cis)-N-(terc-butil)-2-(3-ciclopropil-1H-pirazol-1-il)-1-metilciclopropanocarboxamida. LCMS: RT 1,248 minutos, m/z = 262,18 [M+H]+.
1H RMN (400 MHz, CDCla): 8 ppm 7,26 (d, J=2,4 Hz, 1H), 5,80 (d, J=2,4 Hz, 1H), 5,72 (br.s, 1H), 3,56 (dd, J=5,1, 7,9 Hz, 1H), 2,02 (dd, J=5,1, 6,4 Hz, 1H), 1,95 - 1,88 (m, 1H), 1,43 (s, 3H), 1,13 (s, 9H), 0,90 (dd, J=2,2, 8,6 Hz, 2H), 0,75 - 0,60 (m, 3H).
(1,2-c/s)-N-(terc-butM)-2-(3-ddopropN-4-mtro-1H-pirazoM-M)-1-metNddopropanocarboxamida:Se agregó (1,2-cis)-N-terc-butil-2-(3-ciclopropilpirazol-1-il)-1-metil-ciclopropanocarboxamida (1,95 g, 7,46 mmol) a una mezcla de Cu(NO3)23H2O (18,03 g, 74,61 mmol) en Ac<2>O (30 mL). La mezcla se agitó a 25 °C durante 16 horas. La mezcla de reacción se diluyó con H<2>O (100 mL) y se extrajo con EtOAc (3 * 100 mL). La capa orgánica se lavó con salmuera (3 * 20 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida para obtener (1,2-c/s)-N-(terc-butil)-2-(3-ciclopropil-4-nitro-1H-pirazol-1-il)-1-metilciclopropanocarboxamida. El producto bruto se usó en el siguiente paso sin purificación. LCMS: RT 1,245 minutos, m/z = 307,2 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, CDCh): 8 ppm 8,08 (s, 1H), 5,60 (br s, 1H), 3,68 - 3,40 (m, 1H), 2,61 - 2,51 (m, 1H), 2,25 -2,22 (m, 1H), 1,46 (s, 3H), 1,19 (s, 9H), 1,07-0,91 (m, 4H).
(1,2-c/s)-2-(3-ddopropN-4-mtro-1H-pirazoM-M)-1-metNddopropanocarbomtrMo: Se agitó (1,2-c/s)-N-terc-butil-2-(3-ciclopropil-4-nitro-pirazol-1-il)-1-metil-ciclopropanocarboxamida (2,2 g, 7,18 mmol) en T3P (30 mL, 50 % en EtOAc) a 80 °C durante 4 horas. La mezcla de reacción se diluyó con H<2>O (50 mL) y se extrajo con EtOAc (3 * 50 mL). La capa orgánica combinada se lavó con salmuera (2 * 20 mL), se secó en Na<2>SO<4>, se filtró y se concentró a presión reducida. El residuo se purificó mediante cromatografía en columna de gel de sílice (PE:EtOAc = 20:1 a 5:1) para proporcionar (1,2-c/s)-2-(3-ciclopropil-4-nitro-1H-pirazol-1-il)-1-metilciclopropanocarbonitrilo. LCMS: RT 1,142 minutos, m/z = 233,1 [M+H]+. 1H RMN (400 MHz, CDCh): 8 ppm 8,22 (s, 1H), 3,71 (dd, J=5,1, 7,7 Hz, 1H), 2,64 - 2,57 (m, 1H), 2,22 (dd, J=5,2, 7,0 Hz, 1H), 1,55 (s, 3H), 1,52 (s, 1H), 1,06-1,02 (m, 4H).
(1,2-c/s)-2-(4-ammo-3-ddopropiMH-pirazoM-M)-1-metNddopropanocarbomtrMo:Se agregó Fe (721 mg, 12,92 mmol) y NH<4>Cl (691 mg, 12,92 mmol) a una mezcla de (1,2-c/s)-2-(3-ciclopropil-4-nitro-pirazol-1-il)-1-metil-ciclopropanocarbonitrilo (1 g, 4,31 mmol) en EtOH (10 mL) y H<2>O (1 mL). La mezcla se agitó a 80 °C durante 4 horas. La mezcla de reacción se filtró a través de una almohadilla de celite, el filtrado se concentró a presión reducida. El residuo se extrajo con EtOAc (3 * 50 mL). La capa orgánica se lavó con salmuera (2 * 10 m L ) , s e s e c ó e n N a 2S O 4 , s e f i l t r ó y s e c o n c e n t r ó a p r e s i ó n r e d u c i d a p a r a o b t e n e r ( 1 , 2 - c / s ) - 2 - ( 4 - a m i n o - 3 -<c i c l o p r o p i l ->1<H - p i r a z o l ->1<- i l ) ->1<- m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o , e l q u e s e u s ó e n l a e t a p a s i g u i e n t e s i n p u r i f i c a c i ó n a d i c i o n a l . L C M S : R T 0 , 7 7 9 m i n u t o s , m / z = 2 0 3 , 1 [ M H ]>+<. 1H R M N ( 4 0 0 M H z , C D C h ) : 8 p p m 7 , 0 2 ( s , 2 H ) , 3 , 5 7>( d d , J = 5 , 3 , 7 , 5 H z , 1 H ) , 2 , 13 ( b r t , J = 5 , 8 H z , 1 H ) , 1 , 74 - 1 , 63 ( m , 1 H ) , 1 , 48 ( s , 3 H ) , 1 , 37 ( b r t , J = 7 , 2 H z , 1 H ) , 0 , 8 9 - 0 , 8 0 ( m , 4 H ) .
(1R,2S)- y (1S,2R)-2-(3-cidopropN-4-((4-(etNammo)-5-(trifluorometM)pmmidm-2-N)ammo)-1H-pirazoM-il)-1-metilciclopropanocarbonitrilo:<S e a g r e g ó p - T s O H . H 2O ( 6 11 m g , 3 , 2 1 m m o l ) a 2 5 ° C a l a m e z c l a d e>( 1 , 2 - c / s ) - 2 - ( 4 - a m i n o - 3 - c i c l o p r o p i l - p i r a z o l - 1 - i l ) - 1 - m e t i l - c i d o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o ( 650 m g , 3 , 21 m m o l ) y 2 - c l o r o -W - e t i l - 5 - ( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 4 - a m i n a ( 653 m g , 2 , 89 m m o l ) e n 1 , 4 - d i o x a n o ( 40 m L ) . L a s o l u c i ó n d e m e z c l a s e a g i t ó a 90 ° C d u r a n t e 4 h o r a s . L a m e z c l a d e r e a c c i ó n s e d i l u y ó c o n H 2O ( 50 m L ) , s e a j u s t ó a p H = 7 m e d i a n t e N a H C O 3 s a t u r a d o y l u e g o s e e x t r a j o c o n E t O A c ( 2 * 50 m L ) . L a c a p a o r g á n i c a c o m b i n a d a s e l a v ó c o n s a l m u e r a ( 2 * 10 m L ) , s e s e c ó e n N a 2S O 4 , s e f i l t r ó y s e c o n c e n t r ó a p r e s i ó n r e d u c i d a . E l r e s i d u o s e p u r i f i c ó m e d i a n t e c r o m a t o g r a f í a e n c o l u m n a d e g e l d e s í l i c e ( P E : E t O A c = 20 : 1 a 5 : 1 ) p a r a p r o p o r c i o n a r ( 1 , 2 -c / s ) - 2 - ( 3 - c i c l o p r o p i l - 4 - ( ( 4 - ( e t i l a m i n o ) - 5 - ( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 2 - i l ) a m i n o ) - 1 H - p i r a z o l - 1 - i l ) - 1 -m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o c o m o u n r a c e m a t o . E l p r o d u c t o s e s e p a r ó a d i c i o n a l m e n t e m e d i a n t e S F C q u i r a l ( c o l u m n a : a D ( 250 m m * 30 m m , 5 p m ) ; f a s e m ó v i l : [ 0 , 1 % d e N H 3 H 2O M E O H ] ; B % : 30 % - 30 % , 5 , 5 m i n u t o s ) p a r a p r o p o r c i o n a r ( 1 R , 2 S ) - y ( 1 S , 2 R ) - 2 - ( 3 - c i c l o p r o p i l - 4 - ( ( 4 - ( e t i l a m i n o ) - 5 - ( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 2 - i l ) a m i n o ) -1<H - p i r a z o l ->1<- i l ) ->1<- m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o :>
P r i m e r i s ó m e r o d e e l u c i ó n m e d i a n t e S F C : S e a g r e g ó M T B E ( 3 m L ) a l p r o d u c t o o b t e n i d o d e S F C y s e c a l e n t ó l a m e z c l a h a s t a 60 ° C h a s t a d i s o l v e r s e . L a s o l u c i ó n s e f i l t r ó . S e a g r e g ó n - h e p t a n o ( 20 m L ) a l f i l t r a d o e n a g i t a c i ó n h a s t a q u e s e v o l v i ó t u r b i o . L u e g o , l a m e z c l a s e a g i t ó a 25 ° C d u r a n t e 12 h o r a s . S e r e c o g i ó e l p r o d u c t o p r e c i p i t a d o m e d i a n t e f i l t r a c i ó n y s e s e c ó a p r e s i ó n r e d u c i d a . L C M S : R T 1 , 083 m i n u t o s , m / z = 392 , 2<[ M H ]>+<. 1H R M N ( 4 0 0 M H z , C D C l>a<): 8 p p m 8 , 1 5 ( b r s , 1 H ) , 8 , 0 0 ( s , 1 H ) , 7 , 0 7 - 6 , 8 2 ( m , 1 H ) , 5 , 1 5 ( b r d , J = 1 6 , 1>H z , 1 H ) , 3 , 68 ( d d , J = 5 , 2 , 7 , 7 H z , 1 H ) , 3 , 59 ( b r s , 2 H ) , 2 , 17 ( b r s , 1 H ) , 1 , 77 - 1 , 68 ( m , 1 H ) , 1 , 52 ( s , 3 H ) , 1 , 44 ( b r t , J = 7 , 2 H z , 1 H ) , 1 , 32 ( b r s , 3 H ) , 0 , 96 - 0 , 90 ( m , 2 H ) , 0 , 90 - 0 , 84 ( m , 2 H ) .
S e g u n d o i s ó m e r o d e e l u c i ó n m e d i a n t e S F C : S e a g r e g ó M T B E ( 3 m L ) a l p r o d u c t o o b t e n i d o d e S F C y s e c a l e n t ó l a m e z c l a h a s t a 60 ° C h a s t a d i s o l v e r s e . S e f i l t r ó l a s o l u c i ó n . S e a g r e g ó n - h e p t a n o ( 20 m L ) a l f i l t r a d o e n a g i t a c i ó n h a s t a q u e s e v o l v i ó t u r b i o . L u e g o , l a m e z c l a s e a g i t ó a 25 ° C d u r a n t e 12 h o r a s . S e r e c o g i ó e l p r o d u c t o p r e c i p i t a d o m e d i a n t e f i l t r a c i ó n y s e s e c ó a p r e s i ó n r e d u c i d a . L C M S : R T 1 , 084 m i n u t o s , m / z = 392 , 2<[ M H ]>+<. 1H R M N ( 4 0 0 M H z , C D C h ) : 8 p p m 8 , 1 5 ( b r s , 1 H ) , 8 , 01 ( s , 1 H ) , 7 , 1 5 - 6 , 6 2 ( m , 1 H ) , 5 , 4 1 - 4 , 8 0 ( m ,>1 H ) , 3 , 68 ( d d , J = 5 , 1 , 7 , 7 H z , 1 H ) , 3 , 59 ( b r s , 2 H ) , 2 , 17 ( b r s , 1 H ) , 1 , 77 - 1 , 68 ( m , 1 H ) , 1 , 59 ( s , 3 H ) , 1 , 44 ( b r t , J = 7 , 1 H z , 1 H ) , 1 , 32 ( b r s , 3 H ) , 0 , 9 7 - 0 , 90 ( m , 2 H ) , 0 , 9 0 - 0 , 8 3 ( m , 2 H ) .
(1,2-c/s)-2-(3-cidopropN-4-((4-(etNammo)-5-(trifluorometM)pmmidm-2-N)ammo)-1H-pirazoM -il)-1-metilciclopropanocarboxamida:<S e a g r e g ó K 2C O 3 a c u o s o s a t u r a d o ( 0 , 3 m L ) y U H P ( 4 3 2 m g , 4 , 5 9 m m o l ) a>25 ° C e n N 2 a u n a s o l u c i ó n d e l p r i m e r e n a n t i ó m e r o e n e l u d i r d e S F C d e ( 1 , 2 - c / s ) - 2 - ( 3 - c i c l o p r o p i l - 4 - ( ( 4 -( e t i l a m i n o ) - 5 - ( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 2 - i l ) a m i n o ) - 1 H - p i r a z o l - 1 - i l ) - 1 - m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o ( 150 m g , 0 , 38 m m o l ) e n D M S O ( 5 m L ) . L a m e z c l a s e a g i t ó a 25 ° C d u r a n t e 12 h o r a s , s e v e r t i ó e n a g u a ( 20 m L ) a 20 ° C y s e e x t r a j o c o n E t O A c ( 3 * 10 m L ) . L a s c a p a s o r g á n i c a s c o m b i n a d a s s e l a v a r o n c o n s a l m u e r a ( 3 * 10 m L ) , s e s e c a r o n e n N a 2S O 4 , s e f i l t r a r o n y s e c o n c e n t r a r o n a p r e s i ó n r e d u c i d a . E l r e s i d u o s e p u r i f i c ó m e d i a n t e H P L C p r e p a r a t i v a e n l a s s i g u i e n t e s c o n d i c i o n e s : c o l u m n a : X t i m a t e C 18 150 * 40 m m * 10 p m ; f a s e m ó v i l : [ a g u a ( N H H C O 3 10 m M ) - A C N ] ; B % : 35 % - 65 % , 7 m i n u t o s p a r a p r o v e e r e l p r o d u c t o d e s e a d o . L C - M S , m / z = 410 , 1<[ M H ]>+<. 1H R M N ( 4 0 0 M H z , C D C>h<) : 8 8 , 1 2 ( b r s , 1 H ) , 7 , 9 1 ( s , 1 H ) , 6 , 9 8 ( b r d ,>J<= 18 , 1 H z , 1 H ) , 5 , 8 1 ( b r s , 1 H ) , 5 , 3 5 - 5 , 0 2 ( m , 2 H ) , 3 , 6 3 ( d d ,>J<= 5 , 1 , 7 , 9 H z , 1 H ) , 3 , 6 0 - 3 , 5 2 ( m , 2 H ) , 2 , 1 3 ( b r t ,>J<= 5 , 6 H z , 1 H ) , 1 , 7 5 - 1 , 6 6 ( m , 1 H ) , 1 , 4 6 ( s , 3 H ) , 1 , 3 5 - 1 , 2 7 ( m , 3 H ) , 1 , 2 6 ( s , 1 H ) , 0 , 9 0 ( d d ,>J<= 1 , 8 , 8 , 3 H z , 2 H ) , 0 , 8 5 - 0 , 7 3 ( m , 2 H ) .>
<E j e m p l o>6
S í n t e s i s d e ( 1 , 2 - c / s ) - 2 - ( 4 - ( ( 4 - ( c i c l o p r o p i l a m i n o ) - 5 - ( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 2 - i l ) a m i n o ) - 3 - m e t i l - 1 H - p i r a z o l - 1 - i l ) - 1 -<m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o x a m i d a (>6<)>
U n a m e z c l a r a c é m i c a d e ( 1 , 2 - c / s ) - 2 - ( 4 - ( ( 4 - ( c i c l o p r o p i l a m i n o ) - 5 - ( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 2 - i l ) a m i n o ) - 3 - m e t i l - 1 H -p i r a z o l - 1 - i l ) - 1 - m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o s e s e p a r ó m e d i a n t e S C F q u i r a l ( c o l u m n a : A D ( 250 m m * 30 m m , 5 p m ) ; f a s e m ó v i l : [ 0 , 1 % N H 3 H 2O M E O H ] ; B % : 40 % - 40 % , 5 m i n ) . S e a g r e g ó U H P ( 57 m g , 0 , 6 m m o l ) a 25 ° C e n N 2 a u n a s o l u c i ó n d e l p r i m e r i s ó m e r o d e e l u s i ó n d e ( 1 , 2 - c / s ) - 2 - ( 4 - ( ( 4 - ( c i c l o p r o p i l a m i n o ) - 5 -( t r i f l u o r o m e t i l ) p i r i m i d i n - 2 - i l ) a m i n o ) - 3 - m e t i l - 1 H - p i r a z o l - 1 - i l ) - 1 - m e t i l c i c l o p r o p a n o c a r b o n i t r i l o ( 19 m g , 0 , 05 m m o l ) e n D M S O ( 1 m L ) y K 2C O 3 a c u o s o s a t u r a d o ( 3 m L ) . L a m e z c l a s e a g i t ó a 25 ° C d u r a n t e 15 h o r a s y s e v e r t i ó e n a g u a h e l a d a ( 10 m L ) . L a f a s e a c u o s a s e e x t r a j o c o n E t O A c ( 4 x 3 m L ) . L a f a s e o r g á n i c a c o m b i n a d a s e l a v ó c o n s a l m u e r a ( 3 m L ) , s e s e c ó e n N a 2S O 4 a n h i d r o , s e f i l t r ó y s e c o n c e n t r ó a p r e s i ó n r e d u c i d a . E l r e s i d u o s e p u r i f i c ó m e d i a n t e H P L C p r e p a r a t i v a ( n e u t r a ) s e g ú n l a s s i g u i e n t e s c o n d i c i o n e s : c o l u m n a : X t i m a t e C 18 150<* 2 5 m m * 5 p m ; f a s e m ó v i l : [ a g u a ( N H 4 H C O 3>10<m M ) - A C N ; B % : 2 0 % - 5 0 % ,>10<m i n u t o s p a r a p r o p o r c i o n a r e l p r o d u c t o d e s e a d o . L C - M S : m / z : 3 9 5 , 9 [ M H ]>+<. 1H - R M N ( 4 0 0 M H z , C D C>h<): 8 8 , 2 3 ( b r s , 1 H ) , 8 , 1 2 ( b r s , 1 H ) , 6 , 9 1 ( b r s , 1 H ) , 5 , 7 2 ( b r s , 1 H ) , 5 , 4 1 ( b r s , 1 H ) , 5 , 1 3 ( b r s , 1 H ) , 3 , 6 6 ( d d ,>J<= 5 , 2 , 8 , 0 H z , 1 H ) , 2 , 9 2 ( b r s , 1 H ) ,>2,25 (s, 3H), 2,17 (br s, 1H), 1,48 (s, 3H), 1,31 (dd,J = 6,4,8,0 Hz, 1H), 0,93 (br s, 2H), 0,67 (br s, 2H).
Ejemplos 7 y<8>
Síntesis de (1,2-c/s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-((4-(et¡lam¡no)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-1H-p¡razol-1-il)ciclopropanocarboxamida (7 y<8>)
3-ciclopropil-4-nitro-1-vinil-pirazol:A una mezcla de 3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol (7 g, 45,71 mmol) y BETAC (1,04 g, 4,57 mmol) en 1,2-d¡cloroetano (50 mL) se añad¡ó NaOH (9,14 g, 228,55 mmol) y agua (9 mL) a 20 °C bajo N2. La mezcla se ag¡tó a 80 °C durante<8>h. La mezcla de reacc¡ón se f¡ltró y el f¡ltrado se concentró. El producto bruto se pur¡f¡có med¡ante cromatografía en columna de gel de síl¡ce (PE: EtOAc= 100:1 a 1:1) para dar 3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1-v¡n¡l-p¡razol. RMN 1H (400 MHz, CDCl3):<8>ppm 8,23 (s, 1 H), 6,87 (dd, J = 15,55, 8,71 Hz, 1 H), 5,70, (d, J = 15,66 Hz, 1 H), 5,06 (d, J = 8,60 Hz, 1 H), 2,53-2,68 (m, 1 H), 0,97-1,11 (m, 4 H).
(1,2-c/s)-et¡l-2-(3-c¡cloprop¡l-4-mtro-1H-p¡razoM-¡l)c¡clopropanocarbox¡lato:A una soluc¡ón de 3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1-v¡n¡l-p¡razol (7,6 g, 42,42 mmol) en DCM (114 mL) se agregó ác¡do 3-[3-(2-carbox¡-2-met¡l-prop¡l)fen¡l]-2,2-d¡met¡l-propano¡co; acetato de rod¡o (II) (0,32 g, 0,42 mmol) a 25 °C en N<2>. Luego se agregó una soluc¡ón de 2-d¡azoacetato de et¡lo (29,04 g, 254,50 mmol) en DCM (61 mL) gota a gota a 25 °C en el transcurso de 10 horas. Tras la ad¡c¡ón, la mezcla se ag¡tó a 25 °C durante 2 horas. Se concentró la mezcla a pres¡ón reduc¡da. El res¡duo se pur¡f¡có med¡ante cromatografía en columna de gel de síl¡ce (PE:EtOAc = 10:1 a 1:1) para proporc¡onar (1,2-c/s)-et¡l 2-(3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarbox¡lato. 1H RMN (400 MHz, CDCh):<8>8,24-8,08 (m, 1H), 4,10-3,95 (m, 2H), 3,90 (dt,J= 5,6, 7,5 Hz, 1H), 2,58 (tt,J= 5,2, 8,1 Hz, 1H), 2,31-2,15 (m, 1H), 2,04-1,95 (m, 1H), 1,64-1,58 (m, 1H), 1,18 (t,J= 7,2 Hz, 3H), 1,03-0,87 (m, 4H).
Ácido (1,2-c/s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-mtro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxfl¡co:A una soluc¡ón de 2-(3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarbox¡lato de (1,2-c/s)-et¡lo (2,9 g, 10,93 mmol) en 1,4-d¡oxano (9 mL) se agregó HCl (2 M, 72,48 mL) a 25 °C en N<2>. La mezcla se calentó hasta 60 °C y se ag¡tó durante 15 horas. La mezcla se concentró a pres¡ón reduc¡da para proporc¡onar ác¡do (1,2-c¡s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxíl¡co. 1H RMN (400 MHz, CDCla):<8>8,15 (s, 1H), 4,12-3,92 (m, 2H), 2,64 2,51 (m, 1H), 2,29-2,18 (m, 1H), 2,05-1,94 (m, 1H), 1,60 (dt,J= 6,4, 8,0 Hz, 1H), 1,08-0,79 (m, 4H).
(1,2-c/s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-mtro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropancarboxam¡da:A una soluc¡ón de ác¡do (1,2-c/s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxíl¡co (2,8 g, 11,8 mmol) en DMF (30 mL) se agregó NH<4>Cl (3,79 g, 70,82 mmol) y DIPEA (9,15 g, 70,82 mmol, 12,34 mL) a 25 °C en N<2>. La mezcla se ag¡tó durante 10 m¡n, luego se agregó HATU (8,98 g, 23,61 mmol) y la mezcla se ag¡tó durante 2 horas. La mezcla se vert¡ó en agua (150 mL). La fase acuosa se extrajo con EtOAc (4 * 50 mL). La fase orgán¡ca comb¡nada se lavó con salmuera (50 mL), se secó en Na<2>SO<4>anh¡dro, se f¡ltró y se concentró a pres¡ón reduc¡da. El res¡duo se pur¡f¡có med¡ante p-TLC (PE: EtOAc = 100: 1 a 0:1) para proporc¡onar (1,2-c¡s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxam¡da.
(1,2-c/s)-2-(4-ammo-3-c¡cloprop¡MH-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxam¡da:A una soluc¡ón de (1,2-c/s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-n¡tro-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxam¡da (0,8 g, 3,39 mmol) en EtOH (16 mL) y H<2>O (4 mL) se agregó NH<4>Cl (905,8 mg, 16,93 mmol) y Fe (945,6 mg, 16,93 mmol) a 25 °C. La mezcla se calentó hasta 80 °C y se ag¡tó durante 2 horas. La mezcla se f¡ltró y se concentró a pres¡ón reduc¡da. El res¡duo se lavó con f¡ltro de DCM: MeOH (10 mL, v:v =10:1) y el f¡ltrado se concentró a pres¡ón reduc¡da para proporc¡onar (1,2-c/s)-2-(4-am¡no-3-c¡cloprop¡l-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxam¡da. 1H RMN (400 MHz, CDCh):<8>7,32 (s, 1H), 3,80-3,75 (m, 1H), 2,13-2,05 (m, 1H), 1,93-1,87 (m, 1H), 1,76 (tt,J= 5,2, 8,3 Hz, 1H), 1,47-1,42 (m, 1H), 0,92-0,73 (m, 4H).
(1,2-c/s)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-((4-(et¡lammo)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡dm-2-¡l)ammo)-1H-p¡razol-1-¡l)c¡clopropanocarboxam¡da:A una mezcla de (1,2-c/s)-2-(4-am¡no-3- c¡cloprop¡l-1H-p¡razol- 1-¡l)c¡clopropanocarboxam¡da (230 mg, 1,12 mmol) y 2-cloro-W-et¡l-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡d¡n-4-am¡na (251 mg, 1,12 mmol) en 1,4-d¡oxano (10 mL) se agregó p-TsOH (63 mg, 0,33 mmol) a 25 °C en N2. La mezcla se calentó hasta 90 °C y se ag¡tó durante 2 horas. La mezcla se vert¡ó en agua (10 mL) y se ajustó hasta pH = 7-8 con NaHCO<3>saturado y se extrajo con EtOAc (3 * 5 mL). Las capas orgán¡cas comb¡nadas se lavaron con salmuera (5 mL), se secaron en Na<2>SO<4>, se f¡ltraron y se concentraron a pres¡ón reduc¡da. La mezcla se pur¡f¡có med¡ante HPLC preparat¡va en las s¡gu¡entes cond¡c¡ones: columna: Waters Xbr¡dge 150*25 5 pm; fase móv¡l: [agua<( 1 0>mM NH<4>HCO<3>)-ACN]; B %:<20>%-40 %,<10>m¡nutos para proporc¡onar el compuesto deseado que se separó ad¡c¡onalmente med¡ante SFC (DAICEL CHIRALPAK AD-H (250 mm*30 mm, 5 pm); fase móv¡l: [0,1 % de N ^H<2>O MEOH]; B %: 40 %-40 %,<8>m¡nutos) para proporc¡onar (1R,2S)- y (1S,2R)-2-(3-c¡cloprop¡l-4-((4-(et¡lam¡no)-5-(tr¡fluoromet¡l)p¡r¡m¡d¡n-2-¡l)am¡no)-1H-p¡razol-1-¡l).
Pr¡mer ¡sómero de eluc¡ón med¡ante SFC(8): T¡empo de retenc¡ón: 3,450 m¡nutos. LC-MS: m/z: 396,2 [M+H]+.<1>H-RMN (400 MHz, CDCh):<8>8,11 (br s, 1 H), 7,93 (s, 1 H), 6,43-7,04 (m, 1 H), 5,79 (br s, 1 H), 5,24 ( b r s , 2 H ) , 3 , 88 ( q , J = 7 , 06 H z , 1 H ) , 3 , 60 ( b r s , 2 H ) , 1 , 96 - 2 , 13 ( m , 2 H ) , 1 , 66 - 1 , 70 ( m , 1 H ) , 1 , 50 ( t d , J = 7 , 77 , 5 , 62 H z , 1 H ) , 1 , 32 ( b r s , 3 H ) , 0 , 77 - 0 , 95 ( m , 4 H ) .
E n s a y o s b i o q u í m i c o s d e l o s c o m p u e s t o s
E j e m p l o b i o l ó g i c o 1
M a t e r i a l e s :
e n z i m a L R R K 2 G 2019 S
s u s t r a t o ( L R R K t i d e )
A T P
a m o r t i g u a d o r d e d i l u c i ó n T R - F R E T
a n t i c u e r p o p L R R K t i d e
p l a c a d e e n s a y o d e 384 p o c i l l o s
D M S O
C o n d i c i o n e s d e r e a c c i ó n e n z i m á t i c a s
T r i s 50 m M p H 7 , 5 , M g C h 10 m M , E G T A 1 m M , B r i j - 35 a l 0 , 01 % , D T T 2 m M
L R R K 2 5 n M
A T P 134 | J M
60 m i n u t o s d e t i e m p o d e r e a c c i ó n
23 ° C d e t e m p e r a t u r a d e r e a c c i ó n
10 j L d e v o l u m e n d e r e a c c i ó n t o t a l
C o n d i c i o n e s d e r e a c c i ó n d e d e t e c c i ó n
1 * a m o r t i g u a d o r d e d i l u c i ó n T R - F R E T
E D T A 10 m M
a n t i c u e r p o 2 n M
23 ° C d e t e m p e r a t u r a d e r e a c c i ó n
10 j L d e v o l u m e n d e r e a c c i ó n t o t a l
L o s c o m p u e s t o s s e p r e p a r a n d i l u y e n d o i n i c i a l m e n t e a 1 m M c o n D M S O . 35 j L d e s o l u c i ó n d e c o m p u e s t o d e r e f e r e n c i a , 35 j L d e s o l u c i ó n d e c o m p u e s t o d e e n s a y o y 35 j L d e H P E s e a ñ a d e n s u c e s i v a m e n t e a l a p l a c a f u e n t e ( p l a c a d e e n s a y o d e 384 p o c i l l o s , L a b c y t e ) . L a s p l a c a s s e c e n t r i f u g a n a 2500 r p m d u r a n t e 1 m i n u t o y s e s e l l a r o n c o n p a p e l m e t a l i z a d o . S e u s a P O D p a r a r e a l i z a r u n a d i l u c i ó n s e r i a l d e 3 , 162 v e c e s y s e t r a n s f i e r e n a l a s p l a c a s d e e n s a y o 100 n L d e s o l u c i ó n d e c o m p u e s t o d e r e f e r e n c i a , s o l u c i ó n d e l c o m p u e s t o d e e n s a y o , H P E y Z P E . L a p l a c a d e e n s a y o s e c e n t r i f u g a a 2500 r p m d u r a n t e 1 m i n u t o y s e s e l l a c o n p a p e l m e t a l i z a d o .
P a r a r e a l i z a r l a r e a c c i ó n e n z i m á t i c a , s e a ñ a d e n 5 j L d e s u s t r a t o L R R K t i d e y m e z c l a d e c i n a s a s e n a m o r t i g u a d o r d e e n s a y o a t o d o s l o s p o c i l l o s d e l a p l a c a d e e n s a y o . L a p l a c a s e c e n t r i f u g a p a r a c o n c e n t r a r l a m e z c l a e n l a p a r t e i n f e r i o r d e l o s p o c i l l o s . L a p l a c a d e e n s a y o s e i n c u b a a 23 ° C d u r a n t e 20 m i n u t o s .
D e s p u é s d e l a i n c u b a c i ó n , s e a ñ a d e n 5 p L d e 2 * A T P e n a m o r t i g u a d o r d e e n s a y o a c a d a p o c i l i o y l a s p l a c a s s e c e n t r i f u g a n p a r a c o n c e n t r a r l a m e z c l a e n l a p a r t e i n f e r i o r d e l o s p o c i l l o s . L a p l a c a s e i n c u b a a 23 ° C d u r a n t e 60 m i n u t o s .
P a r a r e a l i z a r l a d e t e c c i ó n d e l a r e a c c i ó n , s e a ñ a d e E D T A c o m p l e t a m e n t e m e z c l a d o e n a m o r t i g u a d o r d e d i l u c i ó n T R - F R E T a l r e a c t i v o d e a n t i c u e r p o . S e a g r e g a n 10 p L d e r e a c t i v o d e d e t e c c i ó n a t o d o s l o s p o c i l l o s d e c a d a p o c i l l o d e l a p l a c a d e e n s a y o y l a p l a c a s e c e n t r i f u g a p a r a c o n c e n t r a r l a m e z c l a e n l a p a r t e i n f e r i o r d e l o s p o c i l l o s . L a p l a c a l u e g o s e i n c u b a a 23 ° C d u r a n t e 60 m i n u t o s . L a s p l a c a s s e l e e n e n u n i n s t r u m e n t o P e r k i n E l m e r E n v i s i o n 2104 e n m o d o T R - F R E T u s a n d o u n f i l t r o d e e x c i t a c i ó n d e 340 n m , f i l t r o d e e m i s i ó n d e f l u o r e s c e n c i a d e 520 n m y f i l t r o d e e m i s i ó n d e t e r b i o d e 490 o 495 n m .
E j e m p l o b i o l ó g i c o 2
E s t a b i l i d a d m e t a b ó l i c a
E j e m p l o b i o l ó g i c o 3
P e r m e a b i l i d a d d e M D R 1 - M D C K
E s p r o b a b l e q u e l o s c o m p u e s t o s c o n u n a r e l a c i ó n d e e f l u j o d e M D R 1 - M D C K d e m e n o s d e c i n c o o i g u a l a c i n c o d e m u e s t r e n l a c a p a c i d a d d e c r u z a r l a b a r r e r a h e m a t o e n c e f á l i c a . N o s e e s p e r a q u e l o s c o m p u e s t o s c o n u n a r e l a c i ó n d e e f l u j o d e M D R 1 - M D C K p o r e n c i m a d e 20 c r u c e n l a b a r r e r a h e m a t o e n c e f á l i c a . L o s d a t o s d e l o s c o m p u e s t o s p r o b a d o s e n e s t e e n s a y o s e m u e s t r a n e n l a T a b l a 3.
E j e m p l o b i o l ó g i c o 4
I n h i b i c i ó n d e p S e r 935 e n c é l u l a s H E K 293 c o n e x p r e s i ó n d e G 2019 S L R R K 2
E s t e e n s a y o m u e s t r a l a a c t i v i d a d i n h i b i d o r a d e l c o m p u e s t o d e e n s a y o d e l a a u t o f o s f o r i l a c i ó n d e L R R K 2 c o m o u n m a r c a d o r d i r e c t o d e i n h i b i c i ó n d e c i n a s a .
L R R K 2 c o d i f i c a u n a p r o t e í n a d e m ú l t i p l e s d o m i n i o s q u e c o n t i e n e u n d o m i n i o d e G T P a s a , u n d o m i n i o d e c i n a s a y v a r i o s d o m i n i o s d e i n t e r a c c i ó n p r o t e í n a - p r o t e í n a p o t e n c i a l e s . L a m a y o r í a d e l a s m u t a c i o n e s p a t ó g e n a s i d e n t i f i c a d a s e n L R R K 2 s e u b i c a n d e n t r o d e s u s d o m i n i o s c a t a l í t i c o s , l o s q u e i n c l u y e n l a m u t a c i ó n m á s c o m ú n a s o c i a d a a L R R K 2 ( G 2019 S , a s í c o m o N 2081 D ) . S e i n f o r m a q u e e s t a s m u t a c i o n e s a u m e n t a n l a a c t i v i d a d d e c i n a s a d e L R R K 2 , y a s e a a t r a v é s d e m u t a c i o n e s d i r e c t a s e n e l d o m i n i o d e c i n a s a e n s í m i s m o o a t r a v é s d e m e c a n i s m o s i n d i r e c t o s . S e h a p r o p u e s t o q u e l a m a y o r a c t i v i d a d d e c i n a s a c o n t r i b u y a a l a p a t o g é n e s i s m e d i a d a p o r L R R K 2 , l o q u e f a v o r e c e e l p o t e n c i a l t e r a p é u t i c o d e l o s c o m p u e s t o s d i v u l g a d o s e n e l p r e s e n t e d o c u m e n t o .
L a f o s f o r i l a c i ó n d e L R R K 2 e n e l r e s i d u o s e r i n a 935 ( p S 935 ) e s u n b i o m a r c a d o r d e l a a c t i v i d a d d e c i n a s a b i e n e s t a b l e c i d o q u e s e h a d e m o s t r a d o p r e v i a m e n t e q u e e s s e n s i b l e a l a i n h i b i c i ó n f a r m a c o l ó g i c a d e l a a c t i v i d a d d e c i n a s a d e L R R K 2 y s e p u e d e d e t e c t a r e n n i v e l e s e n d ó g e n o s e n c é l u l a s y t e j i d o s . S e h a d e m o s t r a d o q u e e l t r a t a m i e n t o c o n i n h i b i d o r e s d e c i n a s a d e m o l é c u l a p e q u e ñ a d e s f o s f o r i l a r á p i d a m e n t e S e r 935 l u e g o d e l a i n h i b i c i ó n d e L R R K 2 . E n e s t e e n s a y o , l a i n h i b i c i ó n d e l a f o s f o r i l a c i ó n d e L R R K 2 e n e l r e s i d u o s e r i n a 935 ( p S 935 ) m e d i a n t e e l c o m p u e s t o d e e n s a y o s e d e t e r m i n ó e n l a s c é l u l a s H E K 293.
(continuación)
Protocolo de ensayo:
(Día 1) Siembra de células 293T:Se sembraron las células 293T (1,4x10<6>/pociNo) en cada pocilio de una placa de<6>pocillos. Luego de dos días en cultivo, la cantidad de células puede crecer 5x10<6>/pocillo, así que se sembraron N+1 pocillos (suficiente para N placas de ensayo de 96 pocillos).
(Día 2) Transfección de células 293T:Se agregaron 5 pL de pCMV-FLAG-G2019S o pCMV-FLAG-WT LRRK2 (0,5 pg/pL) en 145 pL de medio DMEM y se mezcló exhaustivamente mediante varias instancias de pipeteo de forma ascendente y descendente. Se agregaron 15 pL de reactivo de transfección SuperFect en muestras, se mezcló exhaustivamente mediante varias instancias de pipeteo ascendente y descendente, y fue posible equilibrarlo a temperatura ambiente durante 5-10 minutos. Se agregaron 0,5 mL de medio de cultivo de células precalentado a muestras y se mezcló de forma exhaustiva mediante varias instancias de pipeteo ascendente y descendente. Se agregaron 650 pL de la mezcla gota a gota en cada pocillo de la placa de<6>pocillos, la placa se hace girar para que se mezcle de forma exhaustiva y se incuba en una incubadora a 37 °C con una atmósfera humidificada con CO<2>al 5 % durante 20-24 horas.
(Día 3) Siembra de células 293T en placas de 96 pocillos:Se recogieron las células y se resuspendieron en un medio de cultivo celular a una densidad de 0,96*10® células/mL. Se colocaron 50 pL/pocillo de células en placas de cultivo celular de 96 pocillos (48000 células/pocillo) y las placas se incubaron en una incubadora a 37 °C con una atmósfera humidificada con CO<2>al 5 % durante 20-24 horas.
(Día 4) Tratamiento con inhibidor y lisis celular:Las placas de destino del compuesto se descongelaron a temperatura ambiente y se centrifugaron a 2000 rpm. Se agregaron 55 pL del medio de cultivo de células en la placa de destino del compuesto y la placa se calentó a 37 °C.
Se transfirieron 50 pL del medio de cultivo de células que contiene compuestos a la placa de cultivo de células. Las placas se incubaron en una incubadora a 37 °C con una atmósfera humidificada con CO<2>al 5 % durante 90 minutos, luego de lo cual la totalidad del medio que contiene el compuesto se aspiró completamente de forma manual con una pipeta de 300 pL. Se agregaron 100 pL/pocillo de amortiguador de lisis y se sellaron las placas, se agitaron a 4°C durante 30 minutos y se almacenaron a -20 °C hasta su uso.
(Día 5) Procedimiento de MSD:Se agregaron 2 pg/25 pL/pocillo de anticuerpo FLAG diluido en PBS en la placa de MSD, se incubaron durante dos horas a temperatura ambiente o durante la noche a 4 °C (en el día 4). 50 pL (3,9 pg/pL) de anticuerpo FLAG más 2,5 mL de PBS, por placa de 96 pocillos o 50 pL (3,9 pg/pL) de anticuerpo anti-FLAG más 5 mL de PBS por placa de 384 pocillos. Las placas se centrifugaron a 1000 rpm durante<10>segundos y se agitaron con un agitador de placas durante<10>segundos.
Se eliminó el anticuerpo anti-FLAG y se lavaron los pocillos con Multidrop, a baja velocidad, dos veces con 300 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 96 pocillos o tres veces con 70 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 384 pocillos. Se agregaron 50 pL/pocillo de amortiguador de bloqueo para una placa de 96 pocillos o 25 pL/pocillo de amortiguador de bloqueo para una placa de 384 pocillos y las placas se incubaron durante dos horas a temperatura ambiente. Luego, se eliminó el amortiguador de bloqueo y se lavaron los pocilios dos veces con Multidrop, a baja velocidad, con 300 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 96 pocillos o tres veces con 70 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 384 pocillos.
Se transfirieron 25 pL de lisado de células a una placa de MSD de 96 pocillos o 12,5 pL de lisado de células a una placa de MSD de 384 pocillos, y las placas se incubaron durante una hora a temperatura ambiente. Nota: El lisado de células se debería descongelar una hora antes de esta etapa. La placa se centrifugó a 1000 rpm durante un minuto, se agitó durante 30 segundos y luego se retiró el sellado para la transferencia de lisados.
Luego, se eliminó el lisado y se lavaron los pocillos tres veces con Multidrop, a baja velocidad, con 300 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 96 pocillos o cuatro veces con 70 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 384 pocillos.
Se diluyó el anticuerpo pS935 anti-LRRK2 (1:200) en amortiguador de bloqueo, se agregó a cada pocillo (25 pL/pocillo de anticuerpo en la placa de 96 pocillos, 12,5 pL/pocillo de anticuerpo en la placa de 384 pocillos) y la placa se incubó a temperatura ambiente. Luego de una hora, se eliminó el anticuerpo y se lavaron los pocillos con amortiguador de lavado mediante el uso de Multidrop, a baja velocidad, tres veces con 300 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 96 pocillos o cuatro veces con 70 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 384 pocillos.
Se diluyó el anticuerpo anticonejo de cabra con etiqueta SULFO (1:500) con amortiguador de bloqueo, se agregó a cada pocillo (25 pL/pocillo de anticuerpo en la placa de 96 pocillos, 12,5 pL/pocillo de anticuerpo en la placa de 384 pocillos) y la placa se incubó a temperatura ambiente. Luego de una hora, se eliminó el anticuerpo y se lavaron los pocillos con amortiguador de lavado mediante el uso de Multidrop, a baja velocidad, tres veces con 300 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 96 pocillos o cuatro veces con 70 pL/pocillo de amortiguador de lavado para una placa de 384 pocillos. La alícuota de amortiguador de lavado final no se eliminó hasta que se agregó el amortiguador de lectura.
Se preparó amortiguador de lectura nuevo (dilución 1:1 de amortiguador de lectura 4X con agua MilliQ) y se protegió de la luz. Luego, se eliminó el amortiguadora de lavado y se agregaron 150 pL/pocillo de amortiguador de lectura 2 veces en cada pocillo (placa de 96 pocillos) o 50 pL/pocillo de amortiguador de lectura 2 veces en cada pocillo (placa de 384 pocillos). Luego, las placas se incubaron durante tres minutos y se leyeron tras 15 minutos con un lector del sector MSD (MSD6000). Se utilizó Dotmatics para el análisis de datos. Factor Z >0,5. Ventana de ensayo=3-6 veces. La tasa de inhibición porcentual se calculó de la siguiente manera:
% tasa de inhibición = (muestras tratadas-ZPE)/(HPE-ZPE)*100
Los datos de los compuestos probados en este ensayo se muestran en la Tabla 3.
Tabla 3
(continuación)
(continuación)
Los valores de IC<50>del ensayo celular del Ejemplo biológico 4 (HEK293T LRRK2 G2019S pS935) son, en líneas generales, diez veces mayores que los valores del ensayo bioquímico del Ejemplo biológico 1 (LRRK2 G2019S TR-FRET), lo que implica una reducción de la diferencia de diez veces a medida que los valores de IC<50>se acercan a<10>nM o menos. En concentraciones IC<50>nanomolares de una sola cifra, se descubrió que el ensayo celular es más sensible que el ensayo bioquímico y, por lo tanto, resuelve de forma más precisa los valores de IC<50>de compuestos en este intervalo.
Como se muestra en la tabla anterior, se descubrió sorprendentemente que los Compuestos 1-8 eran inhibidores de LRRK2 más activos que el Ejemplo comparativo A cuando se probaron según el ensayo celular del Ejemplo biológico 4.
Se espera que los Compuestos 1-8 sean sustratos de la glicoproteína P (P-gp) y tengan una penetración cerebral muy pobre (Hitchcock, J. Med. Chem. 2012, 55, 4877-4895) basándose en su superficie polar total calculada de 110 (Ertl et ál., J. Med. Chem. 2000, 43, 3714-3717). El compuesto 7 se sometió a más pruebas in vitro (ejemplo biológico 3, ensayo de eflujo MDR) y resultó ser un claro sustrato de la P-gp (coeficiente de eflujo = 110), lo que sugiere una penetración cerebral muy deficiente. Así, los Compuestos 1-8 serían ventajosos para evitar los efectos secundarios relacionados con el SNC en el tratamiento de enfermedades no relacionadas con el SNC en comparación con los inhibidores de LRRK2 que pueden atravesar la barrera hematoencefálica.
En particular, el Compuesto 7 sorprendentemente resultó ser un inhibidor de LRRK2 altamente potente, estable y no penetrante en el cerebro. Se descubrió que el Compuesto 7 era aproximadamente 6,4 veces más potente que el Ejemplo Comparativo A.
A menos que se defina lo contrario, todos los términos técnicos y científicos utilizados en el presente documento tienen el mismo significado que comúnmente se entiende por un experto en la técnica a la que pertenece esta invención.
Además, cuando las características o aspectos de la invención se describen en términos de grupos de Markush, Los expertos en la técnica reconocerán que la invención también se describe de este modo en términos de cualquier miembro individual o subgrupo de miembros del grupo Markush.

Claims (5)

  1. REIVINDICACIONES 1. Un compuesto seleccionado de:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
  2. 2. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
  3. 3. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
  4. 4. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos.
  5. 5. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. <6>. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. 7. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. <8>. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. 9. Un compuesto según la reivindicación 1 que tenga la estructura:
    o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos. 10. Una composición farmacéutica que comprende un compuesto de cualquier reivindicación precedente, o una sal farmacéuticamente aceptable, un análogo isotópicamente enriquecido, un tautómero, un estereoisómero o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, y un portador, diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable. 11. Un compuesto de la reivindicación 1 para uso en terapia. 12. Un compuesto de las reivindicaciones 1-9 o una composición farmacéutica de la reivindicación 10 para su uso en el tratamiento de una enfermedad neurodegenerativa, cáncer o una enfermedad inflamatoria. 13. Un compuesto de las reivindicaciones 1-9 o una composición farmacéutica de la reivindicación 10 para su uso en un método para tratar una enfermedad o afección mediada, al menos en parte, por LRRK2, comprendiendo el método administrar una cantidad eficaz del compuesto de cualquiera de las reivindicaciones 1-9 o una sal farmacéuticamente aceptable, un estereoisómero, o una mezcla de estereoisómeros de los mismos, o la composición farmacéutica de la reivindicación<10>a un sujeto que lo necesite, en donde la enfermedad o afección es una enfermedad neurodegenerativa, un cáncer, o una enfermedad inflamatoria. 14. El compuesto o composición farmacéutica para su uso según la reivindicación 12 o 13, en el que la enfermedad o afección es un cáncer; preferentemente, en el que el cáncer es cáncer de riñón, cáncer de mama, cáncer de próstata, cáncer de sangre, cáncer papilar, cáncer de pulmón, leucemia mielógena aguda o mieloma múltiple. 15. El compuesto o composición farmacéutica para su uso según la reivindicación 12 o 13, en el que la enfermedad o afección es una enfermedad inflamatoria; preferentemente, en el que la enfermedad inflamatoria es lepra, enfermedad de Crohn, enfermedad inflamatoria intestinal, colitis ulcerosa, esclerosis lateral amiotrófica, artritis reumatoide o espondilitis anquilosante. 16. El compuesto o composición farmacéutica para su uso según la reivindicación 12 o 13, en el que la enfermedad es una enfermedad neurodegenerativa; preferentemente en el que la enfermedad es la enfermedad de Parkinson. 17. El compuesto o composición farmacéutica para su uso según la reivindicación 15, en el que la enfermedad inflamatoria es la enfermedad de Crohn.
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