ES3030736T3 - Cdk inhibitors and uses thereof - Google Patents

Cdk inhibitors and uses thereof

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ES3030736T3
ES3030736T3 ES19841123T ES19841123T ES3030736T3 ES 3030736 T3 ES3030736 T3 ES 3030736T3 ES 19841123 T ES19841123 T ES 19841123T ES 19841123 T ES19841123 T ES 19841123T ES 3030736 T3 ES3030736 T3 ES 3030736T3
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ES
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fluoro
mmol
alkyl
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ES19841123T
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English (en)
Inventor
Brendan M O'boyle
Justin A Hilf
Scott C Virgil
Alexander W Sun
Brian M Stoltz
Dylan Conklin
Martina Mcdermott
Neil A O'brien
Michael J Palazzolo
Dennis Slamon
Michael D Bartberger
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California Institute of Technology
University of California Berkeley
University of California San Diego UCSD
1200 Pharma LLC
Original Assignee
California Institute of Technology
University of California Berkeley
University of California San Diego UCSD
1200 Pharma LLC
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Abstract

La presente divulgación proporciona compuestos y composiciones que son inhibidores de CDK selectivos para CDK4 y/o CDK6, y métodos de uso de los mismos. (Traducción automática con Google Translate, sin valor legal)

Description

DESCRIPCIÓN
Inhibidores de CDK y usos de los mismos
Antecedentes
CDK4 y CDK6 son quinasas dependientes de ciclina que controlan la transición entre las fases G1 y S del ciclo celular. La fase S es el período durante el cual la célula sintetiza nuevo ADN y se prepara para dividirse durante el proceso de mitosis. La actividad de CDK4/6 normalmente es desregulada e hiperactiva en las células cancerosas. Puede haber amplificación o sobreexpresión de los genes que codifican las ciclinas o de los genes que codifican las propias CDK. Adicionalmente, la pérdida de inhibidores endógenos de CDK4 (también conocidos como inhibidores INK4) por supresión de genes, mutación, o hipermetilación del promotor también puede conducir a una hiperactividad de CDK4 y CDK6.
Se han realizado intentos para preparar compuestos que inhiban la actividad de CDK4/6, y varios de dichos compuestos se han divulgado en la técnica. Por ejemplo, la Publicación de Patente Internacional No. WO2016015605 describe compuestos de 2-aminopiridina sustituidos que son inhibidores de la quinasa dependiente de ciclina 4 (CDK 4) o de la quinasa dependiente de ciclina 6 (CDK 6), y que tienen utilidad potencial en el tratamiento de enfermedades inflamatorias y de proliferación celular.
Sin embargo, en vista del número de respuestas patológicas que son mediadas por CDK4/6, sigue subsistiendo la necesidad de inhibidores de CDK4/6 que se puedan utilizar en el tratamiento de una variedad de afecciones, que incluyen el cáncer.
Resumen de la invención
En un aspecto, la presente invención proporciona compuestos que tienen las Fórmulas estructurales (IIb), (IIa), o (II) mostradas a continuación:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos,
en la que:
R1 es alquilo; y
R2 es aminoalquilo opcionalmente sustituido; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido.
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (I):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que:
X es, independientemente para cada ocurrencia, halo, preferiblemente fluoro;
XI es O o NRX1, preferiblemente X1 es O;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R1 es alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, aminoalquilo opcionalmente sustituido, o amidoalquilo opcionalmente sustituido; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido (por ejemplo, un anillo de pirrolidina, una anillo de piperidina, un anillo de piperazina, un anillo de pirrolidina, un anillo de tetrahidropirano, un anillo de tetrahidrofurano, o un anillo de morfolina, cada uno de los cuales puede estar opcionalmente sustituido).
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (la):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que:
X es, independientemente para cada ocurrencia, halo, preferiblemente fluoro;
R1 es alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, aminoalquilo opcionalmente sustituido, o amidoalquilo opcionalmente sustituido; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido.
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (Ib):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que:
X es, independientemente para cada ocurrencia, halo, preferiblemente fluoro;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, aminoalquilo opcionalmente sustituido, o amidoalquilo opcionalmente sustituido.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, R1 es alquilo C1-C4 (por ejemplo, metilo, etilo). En algunos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido o (CH2)nR2a, en el que:
R2a es alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, haloalquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, alquenilo C2-C4 opcionalmente sustituido, o hidroxialquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, alcoxi Ci-C4-alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, alquilamino C1-C4-alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, o alquilamino C1-C4-haloalquilo C1-C4 opcionalmente sustituido; y
n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, o aminoalquilo opcionalmente sustituido.
Por ejemplo, en ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo C1-C4 sustituido. En otros compuestos, R2es metilo, etilo, propilenilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, sec-butilo, tert-butilo, (CH2)2OH, -(CH2CH(CHa))OH, (CH2)2O(CH2CHs), -(CH2)2OCH2CH3, -(CH2)2N(H)(CHs), -(CH2)2N(H)(C(CHa)a), -(CH2)2N(H)(C(O)CHa), -(CH2)2N(H)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, -(CH2CH(CH3))N(CH3)2, -CH2C(O)-NHCH3, -CH2C(0)-N(CH3)2, -CH2C(O)-N(CH2CH3)2, o -CH2C(O)-heterociclilo, tal como -heterociclilo ligado a -CH2C(O)-N.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, R2 es (CH2)nC(O)NR2aR2b o (CH2)nNR2aR2b, en el que:
R2a y R2b son cada uno independientemente H, alquilo, haloalquilo, alquenilo, (CRcRd)mOR2e, o -C(O)alquilo; Rc, Rd, y Re son cada uno independientemente H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2 ; y
m es un número entero que tiene un valor de 2 a 5.
Alternativamente, en algunos compuestos descritos en el presente documento, R2 es (CH2)nC(O)NR2aR2b o (CH2)nNR2aR2b, en el que:
R2a y R2b, junto con el átomo de nitrógeno a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 3 a 6 miembros opcionalmente sustituido; y
n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2.
Por ejemplo, R2a y R2b, junto con el átomo de nitrógeno a través del cual se unen, pueden formar un anillo heterocíclico opcionalmente sustituido seleccionado de:
en el que:
cada Rab es independientemente halo, hidroxilo, alquilo, haloalquilo, o alcoxi;
X2 es O, NRx1 o CRx2Rx3;
Rx1, Rx2, y Rx3 son cada uno independientemente H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
z es un número entero que tiene un valor de 0 a 2.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento de la Fórmula (I) o Fórmula (la), R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico que tiene la estructura:
en la que:
X3 es NRY1ao CRY1bRY1c;
X4 es O o CRY2aRY2b;
RY1a es H, alquilo, -C(O)RY1aa; o -S(O)2alquilo;
RY1aa es alquilo o alcoxi; y
RY1b, RY1c, RY2a, y RY2b son cada uno independientemente H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el anillo heterocíclico se selecciona de:
También se describen en el presente documento los compuestos de la Fórmula (I) que se seleccionan de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (IVa) o (IVb):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos,
en la que:
X' en cada caso es independientemente halo, preferiblemente F;
RX1' en cada caso es independientemente H o alquilo inferior;
R1' es alquilo C1-C3;
R2' es hidroxialquilo o (CR2c2)nNR2a'R2b';
R2a' es H, alquilo inferior, acilo o haloalquilo;
R2b' es H, alquilo inferior, acilo o haloalquilo; o
R2a' y R2b' juntos a través del átomo de N a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 4, 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido con Rab'z'; o
R1' y R2' juntos a través del átomo de C a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido con aciloxi;
Rab', cuando está presente, en cada caso es independientemente halo, hidroxi, alquilo inferior o alcoxi; cada R2c' es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo;
n' es un número entero que tiene un valor de 1 o 2 ;
z' es un número entero que tiene un valor de 0 , 1 o 2 ; y
en el que el compuesto tiene un Ki de CDK4 de aproximadamente 0.960 nM o menor.
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (V):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos,
en la que:
R3a y R3b, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman una fracción espirocíclica [3.3] opcionalmente sustituida, en la que la fracción espirocíclica [3.3] opcionalmente sustituida comprende opcionalmente al menos un heteroátomo adicional seleccionado de O, S, y SO2, siempre que el compuesto no sea
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (Va):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos,
en la que:
R3a’ y R3b’, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman una estructura seleccionada de:
en la que
cada Rab es independientemente halo, hidroxilo, alquilo, haloalquilo, o alcoxi; y
z es 0, 1, o 2.
En los compuestos descritos en el presente documento, R3a’ y R3b’, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman
cada Rab es independientemente halo; y
z es 2.
En los compuestos descritos en el presente documento, R3a’ y R3b’, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman
en la que Rab es fluoro.
También se describen en el presente documento composiciones (por ejemplo, composiciones farmacéuticas) que comprenden un compuesto de la Fórmula (I), Fórmula (IVa), Fórmula (iVb), Fórmula (V), o Fórmula (Va), y un portador (por ejemplo, un portador farmacéuticamente aceptable, tal como un diluyente o excipiente). También se describen en el presente documento métodos para tratar una afección o trastorno en un sujeto que lo necesita, que comprenden administrar al sujeto un compuesto de Fórmula (I), Fórmula (la), Fórmula (Ib), Fórmula (IVa), Fórmula (IVb), Fórmula (V) o Fórmula (Va), o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. Dichas afecciones y trastornos incluyen, pero no se limitan a, cánceres, infecciones virales, enfermedades inflamatorias, enfermedades cardiovasculares, trastornos neurodegenerativos, glomerulonefritis, síndromes de mielodisplasia, infartos de miocardio asociados a lesión isquémica, accidente cerebrovascular y lesión por reperfusión, arritmia, aterosclerosis, enfermedades hepáticas inducidas por toxinas o relacionadas con el alcohol, enfermedades hematológicas, enfermedades degenerativas del sistema musculoesquelético, y enfermedades oftálmicas.
También se describen en el presente documento métodos para sensibilizar células cancerosas y/o tumorales en un sujeto que lo necesita a un agente quimioterapéutico o a radiación que comprenden administrar al sujeto un inhibidor de CDK4 y/o CDK en una cantidad suficiente para detener el ciclo celular canceroso y/o tumoral, y de ese modo sensibilizar las células cancerosas y/o tumorales en el mamífero a un agente quimioterapéutico o a radiación, en el que el inhibidor de CDK4 y/o CDK6 es un compuesto de Fórmula (I), Fórmula (Ia), Fórmula (Ib), Fórmula (IVa), Fórmula (IVb), Fórmula (V) o Fórmula (Va), o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
También se describen en el presente documento métodos para inhibir CDK4 y/o CDK6 en una célula que comprenden poner en contacto dicha célula con un compuesto de Fórmula (I), Fórmula (Ia),
Fórmula (Ib), Fórmula (IVa), Fórmula (IVb), Fórmula (V) o Fórmula (Va), o una sal farmacéuticamente aceptable de las mismas, de tal manera que las enzimas CDK4 y/o CDK6 se inhiben en dicha célula.
Breve descripción de los dibujos
La FIG. 1 muestra la distribución IC50 de Abemaciclib por tipo de cáncer.
La FIG. 2 muestra la distribución IC50 del compuesto A1 (sal mesilato) por tipo de cáncer.
La FIG. 3 muestra la distribución IC50 del compuesto A22 (sal mesilato) por tipo de cáncer.
La FIG. 4 muestra la distribución IC50 del compuesto A23 (sal mesilato) por tipo de cáncer.
La FIG. 5 muestra la distribución IC50 del compuesto A2 (sal mesilato) por tipo de cáncer.
La FIG. 6 muestra la selectividad relativa de los inhibidores de CDK4/6 palbociclib (200 nM), ribociclib (200 nM) y abemaciclib (200 nM). En comparación con palbociclib y ribociclib, el abemaciclib ataca quinasas adicionales: CDK16, CDK7, DYRK1B, GSK3B, JNK1/2/3, PIM1, ROCK2, PRKCE; el ribociclib es el más limpio, pero ataca a ULK2.
La FIG. 7 muestra un cribado de inhibición de quinasa de ciertos compuestos a 200 nM en comparación con abemaciclib a 200 nM.
La FIG. 8 muestra un cribado de inhibición de quinasa de ciertos compuestos a 2000 nM en comparación con abemaciclib a 2000 nM.
La FIG. 9 muestra un experimento PK con dosis únicas de 8.3 mg/kg que exploró PO frente a IP y la exposición comparativa con Abemaciclib. Este estudio exploratorio de PK en ratones sugirió variaciones en la PK de los compuestos probados. Por ejemplo, los compuestos A1 y A2 administrados por PO tienen una Cmáx baja, con un metabolismo lento y una vida media más larga en comparación con abemaciclib. El compuesto A49 administrado por PO tiene una Cmáx alta, seguido de un metabolismo rápido. Los compuestos A1 y A2 administrados por IP alcanzaron una biodisponibilidad similar a la de abemaciclib.
Las FIGS. 10 y 11 muestran datos de eficacia del primer estudio de xenoinjerto de estirpe celular de cáncer de mama ER+ durante 26 días de dosificación de ciertos compuestos de la invención. El compuesto A1 se administró por IP a 60 mg/kg, con un descanso de 2 días y se reinició con 20 mg/kg QD a partir del día 5 en adelante. El compuesto A22 se administró por PO y se aumentó a 120 mg/kg a partir del día 12 en adelante. El compuesto A49 se administró por PO y la dosificación se interrumpió el día 19. Para este estudio se utilizó la estirpe celular ZR751.
Las FIGS. 12A y 12B muestran los resultados del primer estudio de xenoinjerto de estirpe celular de cáncer de mama ER+.
La FIG. 13 muestra los resultados de un estudio PK de seguimiento para ciertos compuestos de la invención, cada uno dosificado a 100 mg/kg por PO.
La FIG. 14 muestra un plan de tratamiento de ejemplo para el 2° estudio de xenoinjerto de estirpe celular de cáncer de mama ER+. Para este estudio se utilizó la estirpe celular ZR751.
Las FIGS. 15 y 16 muestran los resultados del segundo estudio de eficacia del xenoinjerto en el día 22.
La FIG. 17 muestra los resultados de PK del segundo estudio de eficacia del xenoinjerto, que se determinaron a partir del plasma recolectado a los 240 y 1,440 minutos después de la dosis en el día 10 del estudio.
La FIG. 18A muestra mediciones comparativas del AUC para los Compuestos A2, A1, A23, y abemaciclib en dosis de 100 a 1000 mg/kg.
La FIG. 18B muestra curvas PK comparativas para los Compuestos A2, A1, A23, y abemaciclib en dosis de 100 a 1000 mg/kg.
La FIG. 19 muestra un diseño de ejemplo de un estudio de reducción progresiva de dosis de 14 días.
Las FIGS. 20 y 21 muestran los resultados de un estudio de reducción progresiva de dosis de 14 días para el Compuesto A2. La dosis máxima tolerada para el Compuesto A2 fue entre aproximadamente 278 y aproximadamente 399 mg/kg QD.
Las FIGS. 22 y 23 muestran los resultados de un estudio de reducción progresiva de dosis de 14 días para el Compuesto A1. La dosis máxima tolerada para el Compuesto A1 fue menor de aproximadamente 400 mg/kg QD.
Las FIGS. 24 y 25 muestran los resultados de un estudio de reducción progresiva de dosis de 14 días para el Compuesto a 23. La dosis máxima tolerada para el Compuesto A23 fue de aproximadamente 200 mg/kg QD. Las FIGS. 26 y 27 muestran los resultados de un estudio de reducción progresiva de dosis de a 14 días para bemaciclib. La dosis máxima tolerada para el abemaciclib fue entre aproximadamente 100 y aproximadamente 150 mg/kg QD.
La FIG. 28 muestra un plan de tratamiento de ejemplo para un estudio de xenoinjerto que involucra a 8 ratones por grupo experimental. Se tomaron extracciones de sangre el primer y el último día de tratamiento.
Las FIGS. 29 y 30 muestran los datos de eficacia del xenoinjerto durante el estudio de 26 días y en el último día (día 26), respectivamente.
La FIG. 31 es una representación gráfica de los datos del peso corporal del animal durante los 26 días del estudio de xenoinjerto.
La FIG. 32 muestra los datos PK de los Compuestos A1, A2, A23, y abemaciclib en la extracción de sangre del día 25 del estudio de xenoinjerto.
La FIG. 33 muestra la acumulación de compuestos de la invención frente a abemaciclib durante un estudio de xenoinjerto de 26 días.
La FIG. 34 tabula los datos del peso corporal durante los 25 días de dosificación en el estudio de xenoinjerto. Las FIGS. 35A y 35B tabulan los datos del peso corporal del animal el día 26 (día final) del estudio de xenoinjerto.
La FIG. 36 muestra un resumen de los resultados del estudio de eficacia del xenoinjerto.
La FIG. 37 muestra un resumen de las diferencias logarítmicas en el IC50 promedio para ciertos compuestos en estirpes celulares resistentes y estirpes celulares sensibles.
Descripción detallada de la invención
El Abemaciclib (nombre comercial Verzenio™):
inhibe las enzimas quinasa dependiente de ciclina 4 (CDK4) y quinasa dependiente de ciclina 6 (CDK6 ). Estas enzimas son responsables de fosforilar y por lo tanto activar la proteína del retinoblastoma, que desempeña una función en la progresión del ciclo celular desde la fase G1 (primera brecha) hasta la fase S (síntesis). El bloqueo de esta ruta impide que las células progresen a la fase S, lo que induce la apoptosis (muerte celular). Los compuestos divulgados en el presente documento comparten ciertas características estructurales del abemaciclib y también pueden actuar como inhibidores de CDK selectivos para CDK4 y/o CDK6.
Definiciones
A menos que se defina lo contrario en el presente documento, los términos científicos y técnicos utilizados en esta solicitud tendrán los significados que comúnmente entienden aquellos expertos con conocimientos básicos en la técnica. En general, la nomenclatura utilizada en relación con, y las técnicas de, química, cultivo de células y tejidos, biología molecular, biología celular y del cáncer, neurobiología, neuroquímica, virología, inmunología, microbiología, farmacología, genética y química de proteínas y ácidos nucleicos, descritas en el presente documento, son aquellas bien conocidas y comúnmente utilizadas en la técnica.
Los métodos y técnicas de la presente divulgación se realizan generalmente, a menos que se indique lo contrario de acuerdo con métodos convencionales bien conocidos en la técnica y como se describe en varias referencias generales y más específicas que se citan y discuten a lo largo de esta especificación. Véase, por ejemplo, “Principles of Neural Science”, McGraw-Hill Medical, New York, N.Y (2000); Motulsky, “ Intuitive Biostatistics”, Oxford University Press, Inc. (1995); Lodish et al., “Molecular Cell Biology, 4th ed.”, W. H. Freeman & Co., New York (2000); Griffiths et al., “ Introduction to Genetic Analysis, 7th ed.”, W. H. Freeman & Co., N.Y (1999); y Gilbert et al., “Developmental Biology, 6th ed.”, Sinauer Associates, Inc., Sunderland, MA (2000).
Los términos químicos utilizados en el presente documento, a menos que se definan de otro modo, se utilizan de acuerdo con el uso convencional en la técnica, como se ejemplifica en “The McGraw-Hill Dictionary of Chemical Terms”, Parker S., Ed., McGraw-Hill, San Francisco, C.A. (1985).
Todo lo anterior, y cualesquier otras publicaciones, patentes y solicitudes de patente publicadas a que se hace referencia en esta solicitud se incorporan específicamente por referencia en el presente documento. En caso de conflicto, prevalecerá la presente especificación, que incluyen sus definiciones específicas.
Un “paciente”, “sujeto”, o “ individuo” se utilizan indistintamente y se refieren a un humano o a un animal no humano. Estos términos incluyen mamíferos, tales como humanos, primates, animales de ganado (que incluyen bovinos, porcinos, etc.), animales de compañía (por ejemplo, caninos, felinos, etc.) y roedores (por ejemplo, ratones y ratas).
“Tratar” una afección o un paciente se refiere a tomar medidas para obtener resultados beneficiosos o deseados, que incluyen resultados clínicos. Como se utiliza en el presente documento, y como se entiende bien en la técnica, “tratamiento” es un enfoque para obtener resultados beneficiosos o deseados, que incluyen resultados clínicos. Los resultados clínicos beneficiosos o deseados pueden incluir, pero no se limitan a, el alivio o mejora de uno o más síntomas o afecciones, la disminución de la extensión de la enfermedad, la estabilización (es decir no empeoramiento) del estado de la enfermedad, prevención de la propagación de la enfermedad, retraso o desaceleración de la progresión de la enfermedad, mejora o paliación del estado de la enfermedad, y remisión (ya sea parcial o total), ya sea detectable o indetectable. “Tratamiento” también puede significar prolongar la supervivencia en comparación con la supervivencia esperada si no se recibe tratamiento.
El término “prevenir” es reconocido en la técnica y cuando se utiliza en relación con una afección, tal como una recurrencia local (por ejemplo, dolor), una enfermedad tal como el cáncer, un complejo de síndrome tal como insuficiencia cardíaca o cualquier otra afección médica, se entiende bien en la técnica, e incluye la administración de una composición que reduce la frecuencia de, o retrasa el inicio de los síntomas de una condición médica en un sujeto en relación con un sujeto que no recibe la composición. Por lo tanto, la prevención del cáncer incluye, por ejemplo, reducir el número de crecimientos cancerosos detectables en una población de pacientes que reciben un tratamiento profiláctico en relación con una población de control no tratada, y/o retrasar la aparición de crecimientos cancerosos detectables en una población tratada frente a una población de control no tratada, por ejemplo, en una cantidad estadística y/o clínicamente significativa.
“Administrar” o “administración de” una sustancia, un compuesto o un agente a un sujeto se puede llevar a cabo utilizando uno de una variedad de métodos conocidos por los expertos en la técnica. Por ejemplo, un compuesto o un agente se puede administrar por vía intravenosa, arterial, intradérmica, intramuscular, intraperitoneal, subcutánea, ocular, sublingual, oral (por ingestión), intranasal (por inhalación), intraespinal, intracerebral y transdérmica (por absorción, por ejemplo, a través de un conducto cutáneo). Un compuesto o agente también se puede introducir apropiadamente mediante dispositivos poliméricos recargables o biodegradables u otros dispositivos, por ejemplo, parches y bombas, o formulaciones, que proporcionen la liberación prolongada, lenta o controlada del compuesto o agente. La administración también se puede realizar, por ejemplo, una vez, una pluralidad de veces y/o durante uno o más períodos prolongados.
Los métodos apropiados para administrar una sustancia, un compuesto o un agente a un sujeto también dependerán, por ejemplo, de la edad y/o la condición física del sujeto y de las propiedades químicas y biológicas del compuesto o agente (por ejemplo, solubilidad, digestibilidad, biodisponibilidad, estabilidad y toxicidad). En algunas realizaciones, un compuesto o un agente se administra por vía oral, por ejemplo, a un sujeto por ingestión. En algunas realizaciones, el compuesto o agente administrado por vía oral está en una formulación de liberación prolongada o de liberación lenta, o se administra utilizando un dispositivo para dicha liberación lenta o prolongada.
Como se utiliza en el presente documento, la frase “administración conjunta” se refiere a cualquier forma de administración de dos o más agentes terapéuticos diferentes, de tal manera que el segundo agente se administra mientras el agente terapéutico administrado previamente todavía es eficaz en el cuerpo. (por ejemplo, los dos agentes son simultáneamente eficaces en el paciente, lo que puede incluir efectos sinérgicos de los dos agentes). Por ejemplo, los diferentes compuestos terapéuticos se pueden administrar en la misma formulación o en formulaciones separadas, ya sea de forma concomitante o secuencial. De esta forma, un individuo que recibe dicho tratamiento se puede beneficiar de un efecto combinado de diferentes agentes terapéuticos.
El término “acilo” está reconocido en la técnica y se refiere a un grupo representado por la fórmula general hidrocarbilC(O)-, preferiblemente alquilC(O)-.
El término “acilamino” está reconocido en la técnica y se refiere a un grupo amino sustituido con un grupo acilo y se puede representar, por ejemplo, mediante la fórmula hidrocarbilC(O)NH-.
El término “aciloxi” está reconocido en la técnica y se refiere a un grupo representado por la fórmula general hidrocarbilC(O)O-, preferiblemente alquilC(O)O-.
El término “alcoxi” se refiere a un grupo alquilo, preferiblemente un grupo alquilo inferior, que tiene un oxígeno unido al mismo. Los grupos alcoxi representativos incluyen metoxi, trifluorometoxi, etoxi, propoxi, tert-butoxi y similares.
El término “alcoxialquilo” se refiere a un grupo alquilo sustituido con un grupo alcoxi y se puede representar por la fórmula general alquil-O-alquilo.
El término “alquenilo”, como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo alifático que contiene al menos un doble enlace y pretende incluir tanto “alquenilos no sustituidos” como “alquenilos sustituidos”, el último de los cuales se refiere a fracciones alquenilo que tienen sustituyentes que reemplazan un hidrógeno en uno o más carbonos del grupo alquenilo. Dichos sustituyentes pueden aparecer en uno o más carbonos que estén incluidos o no incluidos en uno o más enlaces dobles. Más aún, dichos sustituyentes incluyen todos aquellos contemplados para los grupos alquilo, como se discute a continuación, excepto cuando la estabilidad sea prohibitiva. Por ejemplo, se contempla la sustitución de grupos alquenilo por uno o más grupos alquilo, carbociclilo, arilo, heterociclilo o heteroarilo.
Un grupo “alquilo” o “alcano” es un hidrocarburo no aromático de cadena lineal o ramificada que está completamente saturado. Normalmente, un grupo alquilo de cadena lineal o ramificada tiene desde 1 hasta aproximadamente 20 átomos de carbono, preferiblemente desde 1 hasta aproximadamente 10, a menos que se defina lo contrario. Los ejemplos de grupos alquilo de cadena lineal y ramificada incluyen metilo, etilo, npropilo, iso-propilo, n-butilo, sec-butilo, tert-butilo, pentilo, hexilo, pentilo y octilo. Un grupo alquilo de cadena lineal o ramificada C1-C6también se denomina grupo “alquilo inferior”.
Más aún, el término “alquilo” (o “alquilo inferior”) como se utiliza en toda la especificación, los ejemplos y las reivindicaciones pretende incluir tanto “alquilos no sustituidos” como “alquilos sustituidos”, los últimos de los cuales se refieren a fracciones de alquilo que tienen sustituyentes que reemplazan un hidrógeno en uno o más carbonos de la cadena principal del hidrocarburo. Dichos sustituyentes, si no se especifica lo contrario, pueden incluir, por ejemplo, un halógeno (por ejemplo, fluoro), un hidroxilo, un carbonilo (tal como un carboxilo, un alcoxicarbonilo, un formilo o un acilo), un tiocarbonilo (tal como un tioéster, un tioacetato o un tioformiato), un alcoxi, un fosforilo, un fosfato, un fosfonato, un fosfinato, un amino, un amido, una amidina, una imina, un ciano, un nitro, un azido, un sulfhidrilo, un alquiltio, un sulfato, un sulfonato, un sulfamoílo, un sulfonamido, un sulfonilo, un heterociclilo, un aralquilo o una fracción aromática o heteroaromática. En realizaciones preferidas, los sustituyentes en alquilos sustituidos se seleccionan de alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C6, halógeno, carbonilo, ciano o hidroxilo. En realizaciones más preferidas, los sustituyentes en alquilos sustituidos se seleccionan de fluoro, carbonilo, ciano o hidroxilo. Los expertos en la técnica comprenderán que los grupos sustituidos en la cadena de hidrocarburos se pueden sustituir ellos mismos, si es apropiado. Por ejemplo, los sustituyentes de un alquilo sustituido pueden incluir formas sustituidas y no sustituidas de grupos amino, azido, imino, amido, fosforilo (que incluyen fosfonato y fosfinato), sulfonilo (que incluyen sulfato, sulfonamido, sulfamoílo y sulfonato) y sililo, así como éteres, alquiltios, carbonilos (que incluyen cetonas, aldehídos, carboxilatos y ésteres), -CF3, -CN y similares. A continuación se describen alquilos sustituidos de ejemplo. Los cicloalquilos se pueden sustituir además con alquilos, alquenilos, alcoxis, alquiltios, aminoalquilos, alquilos sustituidos con carbonilo, -CF3, -CN, y similares.
El término “Cx-Cy”, cuando se utiliza junto con una fracción química, tal como acilo, aciloxi, alquilo, alquenilo, alquinilo o alcoxi, pretende incluir grupos que contienen de x a y carbonos en la cadena. Por ejemplo, el término “alquilo Cx-Cy” se refiere a grupos hidrocarburos saturados sustituidos o no sustituidos, que incluyen grupos alquilo de cadena lineal y grupos alquilo de cadena ramificada que contienen desde x hasta y carbonos en la cadena, que incluyen grupos haloalquilo. Los grupos haloalquilo preferidos incluyen trifluorometilo, difluorometilo, 2,2,2-trifluoroetilo y pentafluoroetilo. Alquilo C<q>indica un hidrógeno donde el grupo está en una posición terminal, un enlace si es interno. Los términos “alquenilo C2-Cy" y “alquinilo C2-Cy" se refiere a grupos alifáticos insaturados sustituidos o no sustituidos análogos en longitud y posible sustitución a los alquilos descritos anteriormente, pero que contienen al menos un enlace doble o triple respectivamente.
El término “alquilamino", como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo amino sustituido con al menos un grupo alquilo.
El término “alquiltio", como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo tiol sustituido con un grupo alquilo y se puede representar por la fórmula general alquilS-.
El término “alquinilo", como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo alifático que contiene al menos un triple enlace y pretende incluir tanto “alquinilos no sustituidos" como “alquinilos sustituidos", los últimos de los cuales se refieren a fracciones alquinilo que tienen sustituyentes que reemplazan un hidrógeno en uno o más carbonos del grupo alquinilo. Dichos sustituyentes pueden aparecer en uno o más carbonos que estén incluidos o no incluidos en uno o más enlaces triples. Más aún, dichos sustituyentes incluyen todos aquellos contemplados para los grupos alquilo, como se discutió anteriormente, excepto cuando la estabilidad es prohibitiva. Por ejemplo, se contempla la sustitución de grupos alquinilo por uno o más grupos alquilo, carbociclilo, arilo, heterociclilo o heteroarilo.
El término “amida", como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo
en la que cada RA representa independientemente un grupo hidrógeno o hidrocarbilo, o dos RA se toman junto con el átomo de N al que están unidos y completan un heterociclo que tiene desde 4 hasta 8 átomos en la estructura del anillo.
Los términos “amina" y “amino" están reconocidos en la técnica y se refieren tanto a aminas sustituidas como no sustituidas y a sales de las mismas. por ejemplo, una fracción que puede estar representada por
en la que cada RA representa independientemente un hidrógeno o un grupo hidrocarbilo, o dos RA se toman junto con el átomo de N al que están unidos y completan un heterociclo que tiene desde 4 hasta 8 átomos en la estructura del anillo.
El término “aminoalquilo", como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo alquilo sustituido con un grupo amino.
El término “arilo" como se utiliza en el presente documento incluye grupos aromáticos de anillo único sustituidos o no sustituidos en los que cada átomo del anillo es carbono. Preferiblemente, el anillo es un anillo de 6 o 10 miembros, más preferiblemente un anillo de 6 miembros. El término “arilo" también incluye sistemas de anillos policíclicos que tienen dos o más anillos cíclicos en los que dos o más carbonos son comunes a dos anillos contiguos en los que al menos uno de los anillos es aromático, por ejemplo, los otros anillos cíclicos pueden ser cicloalquilos, cicloalquenilos, cicloalquinilos, arilos, heteroarilos y/o heterociclilos. Los grupos arilo incluyen benceno, naftaleno, fenantreno, fenol, anilina y similares.
Un grupo “cicloalquilo" es un hidrocarburo cíclico que está completamente saturado. “Cicloalquilo" incluye anillos monocíclicos y bicíclicos. Normalmente, un grupo cicloalquilo monocíclico tiene desde 3 hasta aproximadamente 10 átomos de carbono, más normalmente de 3 a 8 átomos de carbono a menos que se defina lo contrario. El segundo anillo de un cicloalquilo bicíclico se puede seleccionar de anillos saturados, insaturados y aromáticos. El cicloalquilo incluye moléculas bicíclicas en las que uno, dos o tres o más átomos se comparten entre los dos anillos. (por ejemplo, compuestos bicíclicos fusionados, compuestos bicíclicos puenteados y compuestos espirocíclicos).
El término “compuesto bicíclico fusionado" se refiere a una molécula bicíclica en la que dos anillos comparten dos átomos adyacentes. En otras palabras, los anillos comparten un enlace covalente, es decir, Los llamados átomos cabeza de puente están conectados directamente (por ejemplo, a-tuyeno y decalina). Por ejemplo, en un cicloalquilo fusionado, cada uno de los anillos comparte dos átomos adyacentes con el otro anillo, y el segundo anillo de un cicloalquilo bicíclico fusionado se puede seleccionar de anillos saturados, insaturados y aromáticos. Un grupo “cicloalquenilo" es un hidrocarburo cíclico que contiene uno o más enlaces dobles.
El término “compuesto bicíclico puenteado” se refiere a una molécula bicíclica en la que los dos anillos comparten tres o más átomos, separando los dos átomos de cabeza de puente por un puente que contiene al menos un átomo. Por ejemplo, el norbornano, también conocido como biciclo[2.2.1]heptano, se puede considerar como un par de anillos de ciclopentano que comparten cada uno tres de sus cinco átomos de carbono.
El término “compuesto espirocíclico” se refiere a una molécula bicíclica en la que los dos anillos tienen un solo átomo, el átomo espiro, en común.
Los términos “halo” y “halógeno” como se utilizan en el presente documento significan halógeno e incluyen cloro, flúor, bromo y yodo.
El término “heteroalquilo”, como se utiliza en el presente documento, se refiere a una cadena saturada o insaturada de átomos de carbono y al menos un heteroátomo, en el que no hay dos heteroátomos adyacentes.
Los términos “heteroarilo” y “hetarilo” incluyen estructuras de anillo único aromático sustituido o no sustituido, preferiblemente anillos de 5 a 7 miembros, más preferiblemente anillos de 5 a 6 miembros, cuyas estructuras de anillo incluyen al menos un heteroátomo, preferiblemente de uno a cuatro heteroátomos, más preferiblemente uno o dos heteroátomos. Los términos “heteroarilo” y “hetarilo” también incluyen sistemas de anillos policíclicos que tienen dos o más anillos cíclicos en los que dos o más carbonos son comunes a dos anillos contiguos en los que al menos uno de los anillos es heteroaromático, por ejemplo, los otros anillos cíclicos pueden ser cicloalquilos, cicloalquenilos, cicloalquinilos, arilos, heteroarilos y/o heterociclilos. Los grupos heteroarilo incluyen, por ejemplo, pirrol, furano, tiofeno, imidazol, oxazol, tiazol, pirazol, piridina, pirazina, piridazina y pirimidina, y similares.
El término “heteroátomo” como se utiliza en el presente documento significa un átomo de cualquier elemento distinto del carbono o el hidrógeno. Los heteroátomos preferidos son nitrógeno, oxígeno y azufre.
Los términos “heterociclilo”, “heterociclo” y “heterocíclico” se refieren a estructuras de anillo no aromáticas sustituidas o no sustituidas, preferiblemente anillos de 3 a 10 miembros, más preferiblemente anillos de 3 a 7 miembros, cuyas estructuras de anillo incluyen al menos un heteroátomo, preferiblemente de uno a cuatro heteroátomos, más preferiblemente uno o dos heteroátomos. Los términos “heterociclilo” y “heterocíclico” también incluyen sistemas de anillos policíclicos que tienen dos o más anillos cíclicos en los que dos o más carbonos son comunes a dos anillos contiguos en los que al menos uno de los anillos es heterocíclico, por ejemplo, los otros anillos cíclicos pueden ser cicloalquilos, cicloalquenilos, cicloalquinilos, arilos, heteroarilos y/o heterociclilos. Los grupos heterociclilo incluyen, por ejemplo, pirrolidina, piperidina, piperazina, pirrolidina, tetrahidropirano, tetrahidrofurano, morfolina, lactonas, lactamas y similares.
El término “hidroxialquilo”, como se utiliza en el presente documento, se refiere a un grupo alquilo sustituido con un grupo hidroxi.
El término “ inferior” cuando se utiliza junto con una fracción química, tal como acilo, aciloxi, alquilo, alquenilo, alquinilo o alcoxi, pretende incluir grupos en los que hay diez o menos átomos que no sean hidrógeno en el sustituyente, preferiblemente seis o menos. Un “alquilo inferior”, por ejemplo, se refiere a un grupo alquilo que contiene diez o menos átomos de carbono, preferiblemente seis o menos. En ciertas realizaciones, los sustituyentes acilo, aciloxi, alquilo, alquenilo, alquinilo o alcoxi definidos en el presente documento son respectivamente acilo inferior, aciloxi inferior, alquilo inferior, alquenilo inferior, alquinilo inferior o alcoxi inferior, ya aparezcan solos o en combinación con otros sustituyentes, tales como en las menciones hidroxialquilo y aralquilo (en cuyo caso, por ejemplo, los átomos dentro del grupo arilo no se cuentan cuando se cuentan los átomos de carbono en el sustituyente alquilo).
El término “sustituido” se refiere a fracciones que tienen sustituyentes que reemplazan un hidrógeno en uno o más carbonos de la cadena principal. Se entenderá que “sustitución” o “sustituido con” incluye la condición implícita de que dicha sustitución esté de acuerdo con la valencia permitida del átomo sustituido y el sustituyente, y que la sustitución dé como resultado un compuesto estable, por ejemplo, que no experimente espontáneamente una transformación como por ejemplo, reordenamiento, ciclización, eliminación, etc. Como se utiliza en el presente documento, se contempla que el término “sustituido” incluye todos los sustituyentes permisibles de compuestos orgánicos. En un aspecto amplio, los sustituyentes permisibles incluyen sustituyentes acíclicos y cíclicos, ramificados y no ramificados, carbocíclicos y heterocíclicos, aromáticos y no aromáticos de compuestos orgánicos. Los sustituyentes permisibles pueden ser uno o más y los mismos o diferentes para los compuestos orgánicos apropiados. Para los fines de esta invención, los heteroátomos tales como nitrógeno pueden tener sustituyentes de hidrógeno y/o cualquier sustituyente permisible de los compuestos orgánicos descritos en el presente documento que satisfagan las valencias de los heteroátomos. Los sustituyentes pueden incluir cualesquier sustituyentes descritos en el presente documento, por ejemplo, un halógeno, un hidroxilo, un carbonilo (tal como un carboxilo, un alcoxicarbonilo, un formilo o un acilo), un tiocarbonilo (tal como un tioéster, un tioacetato o un tioformiato), un alcoxi, un fosforilo, un fosfato, un fosfonato, un fosfinato, un amino, un amido, una amidina, una imina, un ciano, un nitro, un azido, un sulfhidrilo, un alquiltio, un sulfato, un sulfonato, un sulfamoílo, un sulfonamido, un sulfonilo, un heterociclilo, un aralquilo o una fracción aromática o heteroaromática. En realizaciones preferidas, los sustituyentes en alquilos sustituidos se seleccionan de alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C6, halógeno, carbonilo, ciano o hidroxilo. En realizaciones más preferidas, los sustituyentes en alquilos sustituidos se seleccionan de fluoro, carbonilo, ciano o hidroxilo. Los expertos en la técnica comprenderán que los sustituyentes se pueden sustituir a su vez, si es apropiado. A menos que se indique específicamente como “no sustituido”, se entiende que las referencias a fracciones químicas en el presente documento incluyen variantes sustituidas. Por ejemplo, la referencia a un grupo o fracción “arilo” incluye implícitamente variantes sustituidas y no sustituidas.
“Grupo protector” se refiere a un grupo de átomos que, cuando se unen a un grupo funcional reactivo en una molécula, enmascaran, reducen o previenen la reactividad del grupo funcional. Normalmente, un grupo protector se puede eliminar selectivamente según se desee durante el curso de una síntesis. Se pueden encontrar ejemplos de grupos protectores en Greene and Wuts, Protective Groups in Organic Chemistry, 3rd Ed., 1999, John Wiley & Sons, NY and Harrison et al., Compendium of Synthetic Organic Methods, Vols. 1-8, 1971-1996, John Wiley & Sons, NY Los grupos protectores de nitrógeno representativos incluyen, pero no se limitan a, grupos formilo, acetilo, trifluoroacetilo, bencilo, benciloxicarbonilo (“CBZ”), tert-butoxicarbonilo (“Boc”), trimetilsililo (“TMS”), 2-trimetilsilil-etanosulfonilo (“TES”), tritilo y tritilo sustituido, aliloxicarbonilo, 9-fluorenilmetiloxicarbonilo (“FMOC”), nitro-veratriloxicarbonilo (“NVOC”) y similares. Los grupos protectores de hidroxilo representativos incluyen, pero no se limitan a, aquellos en los que el grupo hidroxilo está acilado (esterificado) o alquilado tal como los éteres de bencilo y tritilo, así como los éteres de alquilo, éteres de tetrahidropiranilo y éteres de trialquilsililo. (por ejemplo, grupos TMS o TIPS), éteres de glicol, tales como derivados de etilenglicol y propilenglicol y éteres alílicos.
El término “modular” como se utiliza en el presente documento incluye la inhibición o supresión de una función o actividad (tal como la proliferación celular) así como la mejora de una función o actividad.
La frase “farmacéuticamente aceptable” está reconocida en la técnica. En ciertas realizaciones, el término incluye composiciones, excipientes, adyuvantes, polímeros y otros materiales y/o formas de dosificación que, dentro del alcance del sólido criterio médico, son adecuados para uso en contacto con los tejidos de humanos y animales sin toxicidad excesiva, irritación, respuesta alérgica u otro problema o complicación, acorde con una relación beneficio/riesgo razonable.
“Sal farmacéuticamente aceptable” o “sal” se utiliza en el presente documento para referirse a una sal de adición ácida o una sal de adición básica que es adecuada o compatible con el tratamiento de pacientes.
El término “sal de adición de ácido farmacéuticamente aceptable” como se utiliza en el presente documento significa cualquier sal orgánica o inorgánica no tóxica de cualquiera de los compuestos base divulgados en el presente documento. Los ácidos inorgánicos ilustrativos que forman sales adecuadas incluyen los ácidos clorhídrico, bromhídrico, sulfúrico y fosfórico, así como sales metálicas tales como el monohidrogenoortofosfato de sodio y el hidrogenosulfato de potasio. Los ácidos orgánicos ilustrativos que forman sales adecuadas incluyen ácidos mono-, di- y tricarboxílicos tales como ácidos glicólico, láctico, pirúvico, malónico, succínico, glutárico, fumárico, málico, tartárico, cítrico, ascórbico, maleico, benzoico, fenilacético, cinámico y salicílico, así como ácidos sulfónicos tales como ácidos p-toluenosulfónico y metanosulfónico. Se pueden formar sales mono o diácidas, y dichas sales pueden existir en forma hidratada, solvatada o sustancialmente anhidra. En general, las sales de adición de ácido de los compuestos divulgados en el presente documento son más solubles en agua y en diversos solventes orgánicos hidrófilos, y generalmente presentan puntos de fusión más altos en comparación con sus formas de base libre. La selección de la sal apropiada será conocida por un experto en la técnica. Otras sales no farmacéuticamente aceptables, por ejemplo, Los oxalatos se pueden utilizar, por ejemplo, en el aislamiento de compuestos de la invención para uso en laboratorio o para su posterior conversión en una sal de adición de ácido farmacéuticamente aceptable.
El término “sal de adición básica farmacéuticamente aceptable” como se utiliza en el presente documento significa cualquier sal de adición de base orgánica o inorgánica no tóxica de cualesquier compuestos ácidos de la invención, o cualquiera de sus intermedios. Las bases inorgánicas ilustrativas que forman sales adecuadas incluyen hidróxido de litio, sodio, potasio, calcio, magnesio o bario. Las bases orgánicas ilustrativas que forman sales adecuadas incluyen aminas orgánicas alifáticas, alicíclicas o aromáticas como metilamina, trimetilamina y picolina o amoníaco. La selección de la sal adecuada será conocida por un experto en la técnica.
Muchos de los compuestos útiles en los métodos y composiciones de esta divulgación tienen al menos un centro estereogénico en su estructura. Este centro estereogénico puede estar presente en una configuración R o S, dicha notación R y S se utiliza en correspondencia con las reglas descritas en Pure Appl. Chem. (1976), 45, 11-30. La divulgación contempla todas las formas estereoisómeras, tales como las formas enantioméricas y diastereoisoméricas de los compuestos, sales, profármacos o mezclas de los mismos (que incluyen todas las posibles mezclas de estereoisómeros). Véase, por ejemplo, documento WO 01/062726.
Además, ciertos compuestos que contienen grupos alquenilo pueden existir como isómeros Z (zusammen) o E (entgegen). En cada caso, la divulgación incluye tanto mezclas como isómeros individuales separados.
Algunos de los compuestos también pueden existir en formas tautoméricas. Dichas formas, aunque no se indiquen explícitamente en las fórmulas descritas en el presente documento, están destinadas a estar incluidas dentro del alcance de la presente divulgación.
“Profármaco” o “profármaco farmacéuticamente aceptable” se refiere a un compuesto que se metaboliza, por ejemplo se hidroliza o se oxida, en el huésped después de la administración para formar el compuesto de la presente divulgación (por ejemplo, compuestos de la invención). Los ejemplos típicos de profármacos incluyen compuestos que tienen grupos biológicamente lábiles o escindibles (protectores) en una fracción funcional del compuesto activo. Los profármacos incluyen compuestos que se pueden oxidar, reducir, aminar, desaminar, hidroxilar, deshidroxilar, hidrolizar, deshidrolizar, alquilar, desalquilar, acilar, desacilar, fosforilar o desfosforilar para producir el compuesto activo. Se describen ejemplos de profármacos que utilizan éster o fosforamidato como grupos biológicamente lábiles o escindibles (protectores) en las Patentes de EE. UU. 6,875,751, 7,585,851, y 7,964,580, cuyas divulgaciones se incorporan en el presente documento como referencia. Los profármacos de esta divulgación se metabolizan para producir un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. La presente divulgación incluye dentro de su alcance, profármacos de los compuestos descritos en el presente documento. Los procedimientos convencionales para la selección y preparación de profármacos adecuados se describen, por ejemplo, en “Design of Prodrugs” Ed. H. Bundgaard, Elsevier, 1985
La frase “portadorfarmacéuticamente aceptable” como se utiliza en el presente documento significa un material, composición o vehículo farmacéuticamente aceptable, tal como un filtro líquido o sólido, diluyente, excipiente, solvente o material encapsulante útil para formular un fármaco para uso medicinal o terapéutico.
Como se utiliza en el presente documento, “un inhibidor de CDK4/6” o “terapia con inhibidor de CDK4/6” se refiere a un compuesto o composición que inhibe la actividad de CDK4/6, por ejemplo, para fosforilar un residuo de serina o treonina en proteínas, o inhibe la interacción de CDK4/6 con otras proteínas que pueden estar en la ruta de señal.
Como se utiliza en el presente documento, “sensible al inhibidor de la quinasa dependiente de ciclina 4/6 (CDK4/6)” o “cáncer sensible a CDK4/6 i” se refiere a una célula o cáncer que tiene un crecimiento reducido en presencia de un inhibidor de CDK4/6 en comparación con la ausencia de dicho inhibidor. La sensibilidad puede referirse a un efecto citotóxico o citostático del inhibidor de CDK4/6 en la célula. Se contempla que una estirpe celular sensible puede tener un cambio de 1.5, 2, 3, 4, 5, 6 , 7, 8, 9, 10, 15, 20, 25 veces o más en la tasa de crecimiento en presencia de un inhibidor de CDK4/6. La sensibilidad también se puede medir mediante el cambio en la secuencia del genoma o el número de copias de un gen, el aumento o la reducción en la expresión de una proteína particular o la expresión de ARNm, u otra medición divulgada en el presente documento como una medida de sensibilidad.
El término “respuesta a los inhibidores de CDK4 y/o CDK6” se relaciona con cualquier respuesta del trastorno hiperproliferativo (por ejemplo, cáncer) a un agente que inhibe CDK4 o CDK6 , preferiblemente a un cambio en la masa y/o volumen del tumor después del inicio de la quimioterapia. La respuesta al trastorno hiperproliferativo se puede evaluar, por ejemplo, para evaluar la eficacia o en una situación neoadyuvante o adyuvante, donde el tamaño de un tumor después de una intervención sistémica se puede comparar con el tamaño y las dimensiones iniciales medidos por CT, PET, mamografía, ecografía o palpación. Las respuestas también se pueden evaluar mediante una medición con calibrador o un examen patológico del tumor después de una biopsia o resección quirúrgica. La respuesta puede registrarse de forma cuantitativa, como el cambio porcentual en el volumen del tumor, o de forma cualitativa, como “respuesta patológica completa” (pCR), “remisión clínica completa” (cCR), “remisión clínica parcial” (cPR), “enfermedad clínica estable” (cSD), “enfermedad clínica progresiva” (cPD) u otros criterios cualitativos. La evaluación de la respuesta al trastorno hiperproliferativo se puede realizar poco después del inicio de la terapia neoadyuvante o adyuvante, por ejemplo, después de algunas horas, días, semanas o, preferiblemente, después de algunos meses. Un criterio de valoración típico para la evaluación de la respuesta es la finalización de la quimioterapia neoadyuvante o la extirpación quirúrgica de las células tumorales residuales y/o del lecho tumoral. Por lo general, esto ocurre tres meses después del inicio de la terapia neoadyuvante. En algunas realizaciones, la eficacia clínica de los tratamientos terapéuticos descritos en el presente documento se puede determinar al medir la tasa de beneficio clínico (CBR). La tasa de beneficio clínico se mide al determinar la suma del porcentaje de pacientes que están en remisión completa (CR), el número de pacientes que están en remisión parcial (PR) y el número de pacientes que tienen enfermedad estable (SD) en un momento al menos 6 meses después del final de la terapia. La abreviatura de esta fórmula es CBR=CR+PR+SD durante 6 meses. En algunas realizaciones, la CBR para un régimen terapéutico contra el cáncer particular es al menos 25 %, 30 %, 35 %, 40 %, 45 %, 50 %, 55 %, 60 %, 65 %, 70 %, 75 %, 80 %, 85 % o más. Los criterios adicionales para evaluar la respuesta a las terapias contra el cáncer están relacionados con la “supervivencia”, que incluye todo lo siguiente: supervivencia hasta la mortalidad, también conocida como supervivencia global (en la que dicha mortalidad puede ser independiente de la causa o estar relacionada con el tumor); “supervivencia sin recurrencia” (en la que el término recurrencia incluirá tanto la recurrencia localizada como la distante); supervivencia sin metástasis; supervivencia sin enfermedad (en la que el término enfermedad incluirá el cáncer y las enfermedades asociadas con él). La duración de dicha supervivencia se puede calcular con referencia a un punto de inicio definido. (por ejemplo, momento del diagnóstico o inicio del tratamiento) y punto final (por ejemplo, muerte, recurrencia o metástasis). Además, los criterios de eficacia del tratamiento pueden ampliarse para incluir la respuesta a la quimioterapia, la probabilidad de supervivencia, la probabilidad de metástasis dentro de un período de tiempo determinado y la probabilidad de recurrencia del tumor. Por ejemplo, para determinar valores umbral apropiados, se puede administrar un régimen terapéutico particular contra el cáncer a una población de sujetos y el resultado se puede correlacionar con mediciones de biomarcadores que se determinaron antes de la administración de cualquier terapia contra el cáncer. La medición del resultado puede ser la respuesta patológica a la terapia administrada en el entorno neoadyuvante. Alternativamente, las medidas de resultados, tales como la supervivencia general y la supervivencia libre de enfermedad, se pueden monitorizar durante un período de tiempo para sujetos después de una terapia contra el cáncer para quienes se conocen los valores de medición de biomarcadores. En ciertas realizaciones, las dosis administradas son dosis estándar conocidas en la técnica para agentes terapéuticos contra el cáncer. El período de tiempo durante el cual se monitoriza a los sujetos puede variar. Por ejemplo, los sujetos se pueden monitorizar durante al menos 2,4, 6 , 8, 10, 12, 14, 16, 18, 20, 25, 30, 35, 40, 45, 50, 55 o 60 meses.
El término “supervivencia” incluye todo lo siguiente: supervivencia hasta la mortalidad, también conocida como supervivencia general (en la que dicha mortalidad puede ser independiente de la causa o estar relacionada con un tumor); “supervivencia sin recurrencia” (en la que el término recurrencia incluirá tanto la recurrencia localizada como la distante); supervivencia sin metástasis; supervivencia sin enfermedad (en la que el término enfermedad incluirá el cáncer y las enfermedades asociadas con él). La duración de dicha supervivencia se puede calcular con referencia a un punto de inicio definido (por ejemplo momento del diagnóstico o inicio del tratamiento) y punto final (por ejemplo muerte, recurrencia o metástasis). Además, los criterios de eficacia del tratamiento se pueden ampliar para incluir la respuesta a la quimioterapia, la probabilidad de supervivencia, la probabilidad de metástasis dentro de un período de tiempo determinado y la probabilidad de recurrencia del tumor.
Como se utiliza en el presente documento, “resistente a un inhibidor de quinasa dependiente de ciclina 4/6 (CDK4/6)” o “cáncer resistente a CDK4/6” se refiere a una célula o cáncer que tiene un crecimiento normal (o de referencia) en presencia de un inhibidor de CDK4/6 y es sustancialmente similar al que tiene en ausencia de dicho inhibidor. La resistencia se puede medir por un mantenimiento relativo de la tasa de crecimiento celular en presencia de un inhibidor de CDK4/6, o por un cambio en la secuencia del genoma o el número de copias de un gen, un aumento o una reducción en la expresión de una proteína particular o en la expresión de ARNm, u otra medición divulgada en el presente documento como una medida de resistencia.
El término “sensibilizar” significa alterar las células cancerosas o las células tumorales de una manera que permita un tratamiento más eficaz del cáncer asociado con una terapia contra el cáncer (por ejemplo, punto de control antiinmunitario , quimioterapia y/o radioterapia). En algunas realizaciones, las células normales no se ven afectadas hasta un punto que provoque que la terapia de punto de control inmunitario las dañe indebidamente. Una mayor sensibilidad o una sensibilidad reducida a un tratamiento terapéutico se mide de acuerdo con un método conocido en la técnica para el tratamiento particular y los métodos descritos a continuación, que incluyen, pero no se limitan a, ensayos de proliferación celular (Tanigawa N, Kern D H, Kikasa Y, Morton D L, Cancer Res 1982; 42: 2159-2164), y ensayos de muerte celular (Weisenthal L M, Shoemaker R H, Marsden J A, Dill P L, Baker J A, Moran E M, Cancer Res 1984; 94: 161-173; Weisenthal L M, Lippman M E, Cancer Treat Rep 1985; 69: 615-632; Weisenthal L M, In: Kaspers G J L, Pieters R, Twentyman P R, Weisenthal L M, Veerman A J P, eds. Drug Resistance in Leukemia and Lymphoma. Langhorne, P A: Harwood Academic Publishers, 1993: 415-432; Weisenthal L M, Contrib Gynecol Obstet 1994; 19: 82-90). La sensibilidad o resistencia también se puede medir en un animal al medir la reducción del tamaño del tumor durante un período de tiempo, por ejemplo, 6 meses para un humano y 4-6 semanas para un ratón. Una composición o un método sensibiliza la respuesta a un tratamiento terapéutico si el aumento en la sensibilidad al tratamiento o la reducción en la resistencia es del 25 % o más, por ejemplo, 30 %, 40 %, 50 %, 60 %, 70 %, 80 % o más, a 2 veces, 3 veces, 4 veces, 5 veces, 10 veces, 15 veces, 20 veces o más, en comparación con la sensibilidad o resistencia al tratamiento en ausencia de dicha composición o método. La determinación de la sensibilidad o resistencia a un tratamiento terapéutico es una práctica habitual en la técnica y está dentro de las habilidades de un experto con conocimientos básicos. Se debe entender que cualquier método descrito en el presente documento para mejorar la eficacia de una terapia contra el cáncer se puede aplicar igualmente a métodos para sensibilizar células hiperproliferativas o cancerosas de otro modo (por ejemplo, células resistentes) a la terapia del cáncer.
Compuestos de la invención
Los compuestos de la presente invención tienen la estructura de la Fórmula (IIb), (IIa), o (II) mostrada a continuación:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos, en la que:
R1 es alquilo; y
R2 es aminoalquilo opcionalmente sustituido; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido.
En una realización, R1 es alquilo C1-C4, preferiblemente metilo o etilo. En una realización adicional, R2 es -(CH2)2N(H)(CH3), -(CH2)2N(H)(C(CH3)3),-(CH2)2N(H)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, y -(CH2CH(CH3))N(CH3)2. En una realización adicional, R2 es (CH2)nNR2aR2b, en el que: R2a y R2b son cada uno independientemente H, alquilo, haloalquilo, alquenilo o (CRcRd)mORe; Rc, Rd, y Re son cada uno independientemente H o alquilo; n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2; y m es un número entero que tiene un valor de 2 a 5.
Los compuestos particulares de la invención se seleccionan de:
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
En una realización particular, de la invención, los compuestos tienen la estructura de la Fórmula (IVa):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo,
en la que:
X' es fluoro;
R1' es alquilo C1-C3;
R2' es (CR2c2)n NR2a'R2b';
R2a' es H, alquilo inferior o haloalquilo;
R2b' es H, alquilo inferior o haloalquilo
cada R2c' es independientemente H o alquilo;
n' es un número entero que tiene un valor de 1 o 2 ; y
en el que el compuesto tiene un Ki de CDK4 de aproximadamente 0.960 nM o menor.
Los compuestos adicionales de la invención se seleccionan de:
o una sal farmacéuticamente de los mismos.
Compuestos de la divulgación
Se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (I):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que:
X1 es O o NRX1;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R1 es alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, aminoalquilo opcionalmente sustituido o amidoalquilo opcionalmente sustituido; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido o aminoalquilo opcionalmente sustituido.
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (Ia):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que:
X es, independientemente para cada ocurrencia, halo, preferiblemente fluoro;
R1 es alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, aminoalquilo opcionalmente sustituido o amidoalquilo opcionalmente sustituido; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido o aminoalquilo opcionalmente sustituido.
También se describen en el presente documento compuestos que tienen la estructura de la Fórmula (Ib):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que:
X es, independientemente para cada ocurrencia, halo, preferiblemente fluoro;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, aminoalquilo opcionalmente sustituido o amidoalquilo opcionalmente sustituido.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo opcionalmente sustituido, haloalquilo opcionalmente sustituido, alquenilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido o aminoalquilo opcionalmente sustituido.
También se describen en el presente documento los compuestos de la Fórmula (I) que tienen la estructura de la Fórmula (II):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
También se describen en el presente documento los compuestos de la Fórmula (II) que tienen la estructura de la Fórmula (IIa):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos. Alternativamente, los compuestos de la Fórmula (II) tienen la estructura de la Fórmula (IIb):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
También se describen en el presente documento los compuestos de la Fórmula (I) que tienen la estructura de la Fórmula (III):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
También se describen en el presente documento los compuestos de la Fórmula (III) que tienen la estructura de la Fórmula (IIIa):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos. Alternativamente, los compuestos de la Fórmula (III) tienen la estructura de la Fórmula (IIIb):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento de las Fórmulas (I), (Ia), (Ib), (III), (IIIa) y (IIIb), RX1 es H o metilo. En los compuestos preferidos RX1 es H.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R1 es alquilo C1-C4. En algunos de dichos compuestos, R1 es metilo o etilo. En ciertos compuestos, R1 es metilo.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido o (CH2)nR2a, en el que R2a es alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, haloalquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, alquenilo C2-C4 opcionalmente sustituido, o hidroxialquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, alcoxi C1-C4-alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, alquilamino C1-C4-alquilo C1-C4 opcionalmente sustituido, o alquilamino C1-C4-haloalquilo C1-C4 opcionalmente sustituido; y n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2. En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es alquilo C1-C4 sustituido. En ciertos otros compuestos descritos en el presente documento, R2 es metilo, etilo, propilenilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, sec-butilo, tert-butilo, (CH2)2OH, -(CH2CH(CH3))OH, (CH2)2O(CH2CH3), -(CH2)2OCH2CH3, -(CH2)2N(H)(CH3), -(CH2)2N(H)(C(CH3)3), -(CH2)2N(H)(C(O)CH3), -(CH2)2N(H)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)(CH2CH2F), (CH2)2N(CHa)2, -(CH2)2N(CH2CHs)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, -(CH2CH(CHa))N(CHa)2, -CH2C(O)-NHCH3, -CH2C(O)-N(CH3)2, -CH2C(O)-N(CH2CH3)2, o -CH2C(O)-heterociclilo, tal como heterociclilo ligado a -CH2C(O)-N-. En ciertos otros compuestos descritos en el presente documento, R2 es metilo, etilo, propilenilo, n-propilo, isopropilo, n-butilo, sec-butilo, tert-butilo, (CH2)2OH, -(CH2CH(CH3))OH, (CH2)2O(CH2CH3), -(CH2)2OCH2CH3, -(CH2)2N(H)(CH3), -(CH2)2N(H)(C(CH3)3), -(CH2)2N(H)(C(O)CH3), -(CH2)2N(H)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3) (CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, o -(CH2CH(CH3))N(CH3)2.
En otros compuestos descritos en el presente documento, R2 es (CH2)nC(O)NR2aR2b, en el que R2a y R2b son cada uno independientemente H, alquilo, haloalquilo, alquenilo, (CRcRd)mORe, o -C(O)alquilo; Rc, Rd, y Re son cada uno independientemente H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior; n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2; y m es un número entero que tiene un valor de 2 a 5.
En otros compuestos descritos en el presente documento, R2 es (CH2)nNR2aR2b, en el que R2a y R2b son cada uno independientemente H, alquilo, haloalquilo, alquenilo, (CRcRd)mORe, o -C(O)alquilo; Rc, Rd, y Re son cada uno independientemente H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior; n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2; y m es un número entero que tiene un valor de 2 a 5.
En todavía otros compuestos descritos en el presente documento, R2 es (CH2)nC(O)NR2aR2b, en el que R2a y R2b, junto con el átomo de nitrógeno a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 3 a 6 miembros opcionalmente sustituido; y n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2. En algunos de dichos compuestos descritos en el presente documento, R2a y R2b, junto con el átomo de nitrógeno a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico opcionalmente sustituido seleccionado de:
en el que:
cada Rab es independientemente halo, hidroxilo, alquilo, haloalquilo, o alcoxi;
X2 es O, NRx1 o CRx2Rx3;
Rx-i, rx2, y rx3 son cada uno independientemente H, halo, alquilo, preferiblemente alquilo inferior, o alcoxi; y
z es un número entero que tiene un valor de 0 a 2.
En todavía otros ciertos compuestos descritos en el presente documento, R2 es (CH2)nNR2aR2b, en el que R2a y R2b, junto con el átomo de nitrógeno a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 3 a 6 miembros opcionalmente sustituido; y n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2. En algunos de dichos compuestos descritos en el presente documento, R2a y R2b, junto con el átomo de nitrógeno a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico opcionalmente sustituido seleccionado de:
en el que:
cada Rab es independientemente halo, hidroxilo, alquilo, haloalquilo, o alcoxi;
X2 es O, NRx1 o CRx2Rx3;
Rx-i,<r>x2, y<r>x3 son cada uno independientemente H, halo, alquilo, preferiblemente alquilo inferior, o alcoxi; y
z es un número entero que tiene un valor de 0 a 2.
Por ejemplo, el anillo heterocíclico opcionalmente sustituido se puede seleccionar de:
En algunos compuestos descritos en el presente documento, R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico que tiene la estructura:
en la que:
X3 es NRY1ao CRY1bRY1c;
X4 es O CRY2aRY2b;
RY1a es H, alquilo, -C(O)RY1aa; o -S(O)2alquilo;
RY1aa es alquilo o alcoxi; y
RY1b, RY1c, RY2a, y RY2b son cada uno independientemente H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior.
En algunos de dichos compuestos descritos en el presente documento, el anillo heterocíclico se selecciona de:
y
En algunos de ciertos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O o NRX1;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R1 es metilo; y
R2 es alquilo opcionalmente sustituido, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, o (CR2c2)nNR2aR2b; o R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros que tiene un átomo de N y el átomo de N es opcionalmente sustituido con alquilo inferior;
R2a es H, metilo, o etilo;
R2b es H, metilo, o etilo;
cada R2c es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo; y
n es un número entero que tiene un valor de 1 a 4.
En algunos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O o NRX1;
RX1 es H, metilo o etilo;
R1 es metilo;
R2 es (CR2c2)nNR2aR2b;
R2a es H, metilo, o etilo;
R2b es H, metilo, o etilo;
cada R2c es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo; y
n es un número entero que tiene un valor de 1 a 4.
En algunos de ciertos compuestos descritos en el presente documento, cada R2c es H. En otros compuestos descritos en el presente documento, al menos un R2c es alquilo, preferiblemente metilo, y el resto son H. En ciertos compuestos descritos en el presente documento, X1 es O. En algunos compuestos descritos en el presente documento, (CR2c2)nNR2aR2b, en el que al menos un R2c es opcionalmente alquilo y el resto son H. En otros compuestos descritos en el presente documento, en el que X1 es NRX1. En algunos de ciertos compuestos descritos en el presente documento, (CR2c2)nNR2aR2b, en el que al menos un R2c es opcionalmente metilo y el resto son H.
En los compuestos particulares descritos en el presente documento, R2a y R2b no son ambos H.
En algunos de ciertos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O;
R1 es metilo;
R2 es hidroxialquilo opcionalmente sustituido o alquilo C1-C4-NHR2a opcionalmente sustituido, en el que R2a es metilo o etilo; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros que tiene un átomo de N opcionalmente sustituido con alquilo inferior.
En algunos de ciertos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O o NRX1;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R1 es metilo o etilo;
R2 es alquilo inferior, (CH2)nOH o (CR2c2)nNR2aR2b; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros que tiene un átomo de N sustituido con -C(O)oxialquilo;
R2a es H o alquilo inferior opcionalmente sustituido con uno o más halógenos;
R2b es H o alquilo inferior opcionalmente sustituido con uno o más halógenos; y
R2a y R2b juntos a través del átomo de N a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 3, 4 o 5 miembros opcionalmente sustituido con Rabz, en el que:
Rab es halógeno, hidroxilo, alquilo inferior, haloalquilo, oxialquilo;
cada R2c es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo;
z es un número entero que tiene un valor de 0 a 2 ; y
n es un número entero que tiene un valor de 2 a 4.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, R2a y R2b no son ambos H.
En algunos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O o NRX1;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R1 es metilo;
R2 es alquilo C1-C2 o (CH2)nNR2aR2b; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros que tiene un átomo de N opcionalmente sustituido con - C(O)alquilo;
R2a es alquilo inferior no sustituido;
R2b es alquilo inferior no sustituido;
n es un número entero que tiene un valor de 2 a 4.
En algunos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O o NRX1;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R1 es metilo;
R2 es alquilo C1-C2 o (CR2c2)nNR2aR2b;
R2a es alquilo inferior no sustituido;
R2b es alquilo inferior no sustituido;
cada R2c es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo; y
n es un número entero que tiene un valor de 2 a 4.
En algunos compuestos descritos en el presente documento,
X1 es O o NRX1;
RX1 es H o alquilo, preferiblemente alquilo inferior; R1 es alquilo, preferiblemente alquilo inferior;
R2 es alquilo C1-C3, es alquenilo C1-C3, hidroxialquilo opcionalmente sustituido, alcoxialquilo opcionalmente sustituido, o (CR2c2)nNR2aR2b; o
R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros que tiene un heteroátomo seleccionado de N y O y es opcionalmente sustituido con alquilo inferior, carbonilo, tert-butiloxicarbonilo, -C(O)oxialquilo, o -S(O)2alquilo;
R2a y R2b son cada uno independientemente H, alquilo, o -C(O)alquilo; o
R2a y R2b juntos a través del átomo de N a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 3 a 6 miembros que tiene opcionalmente un C reemplazado con O, en el que el anillo heterocíclico es opcionalmente sustituido con (Rab)z,
cada Rab es independientemente halógeno, hidroxilo, o alquilo inferior; cada R2c es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo;
z es un número entero que tiene un valor de 1 o 2;
n es un número entero que tiene un valor de 2 a 4.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
5
5
5
5
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
5
5
5
5
y
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En ciertos compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En todavía otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En aún otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
y
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
En todavía otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En aún otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En otros compuestos preferidos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (I) se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto es una sal de mesilato.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto tiene la estructura de la Fórmula (IVa) o (IVb):
o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos,
en la que:
X' en cada caso es independientemente halo, preferiblemente F;
Rx1' en cada caso es independientemente H o alquilo inferior;
R1' es alquilo C1-C3;
R2' es hidroxialquilo o (CR2c2)nNR2a'R2b';
R2a' es H, alquilo inferior, acilo o haloalquilo;
R2b' es H, alquilo inferior, acilo o haloalquilo; o
R2a' y R2b' juntos a través del átomo de N a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 4, 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido con Rab'z'; o
R1' y R2' juntos a través del átomo de C a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido con aciloxi;
Rab’, cuando está presente, en cada caso es independientemente halo, hidroxi, alquilo inferior o alcoxi; cada R2c’ es independientemente H o alquilo, preferiblemente metilo;
n’ es un número entero que tiene un valor de 1 o 2;
z’ es un número entero que tiene un valor de 0, 1 o 2; y
en el que el compuesto tiene un Ki de CDK4 de aproximadamente 0.960 nM o menor.
En algunos compuestos descritos en el presente documento s, el compuesto de la Fórmula (IVa) o (IVb) tiene una IC50 promedio de 150 nM o menor para las estirpes celulares sensibles a los fármacos de la Tabla 2. En ciertos compuestos descritos en el presente documento, la IC50 promedio del compuesto de la Fórmula (IVa) o (IVb) para las estirpes celulares sensibles al fármaco de la Tabla 2 es al menos aproximadamente 5 veces más potente que la 1C50 promedio del mismo compuesto de la Fórmula (IVa) o (IVb) para las estirpes celulares resistentes a los fármacos de la Tabla 2.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (IVa) o (IVb) tiene una puntuación de A a B de Papp de aproximadamente 0.07 o mayor.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (IVa) o (IVb) tiene una vida media de aproximadamente 25 minutos o mayor.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto de la Fórmula (IVa) o (IVb) se selecciona de:
, o una sal farmacéuticamente del mismo.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto tiene la estructura de la Fórmula (V):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo,
en la que:
R3a y R3b, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman una fracción espirocíclica [3.3] opcionalmente sustituida, en la que la fracción espirocíclica [3.3] opcionalmente sustituida comprende opcionalmente al menos un heteroátomo adicional seleccionado de O, S, y SO2,
siempre que el compuesto no sea
En algunos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto tiene la estructura de la Fórmula (Va):
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo,
en la que:
R3a’ y R3b’, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman una estructura seleccionada de:
en la que
cada Rab es independientemente halo, hidroxilo, alquilo, haloalquilo o alcoxi; y
z es 0, 1, o 2.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, R3a’ y R3b’, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman
cada Rab es independientemente halo; y
z es 2.
En algunos compuestos descritos en el presente documento, R3a’ y R3b’, tomados junto con el átomo de nitrógeno al que están unidos, forman
en el que Rab es fluoro.
En ciertos compuestos descritos en el presente documento, el compuesto se selecciona de:
o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
Métodos de tratamiento
Los compuestos de la presente invención y descritos en el presente documento son inhibidores de CDK4/6 y, por lo tanto, pueden ser útiles para tratar enfermedades en las que la patología subyacente está (al menos en parte) mediada por CDK4/6. Dichas enfermedades incluyen el cáncer y otras enfermedades en las que hay un trastorno de la proliferación, apoptosis o diferenciación celular.
Los ejemplos de cánceres que se pueden tratar con un compuesto de la presente invención incluyen, pero no se limitan a, carcinoma, por ejemplo, un carcinoma de vejiga, mama, colon (por ejemplo, carcinomas colorrectales tales como el adenocarcinoma de colon y el adenoma de colon), riñón, epidermis, hígado, pulmón (por ejemplo adenocarcinoma, cáncer de pulmón de células pequeñas y carcinomas de pulmón de células no pequeñas), esófago, vesícula biliar, ovario, páncreas (por ejemplo carcinoma pancreático exocrino), estómago, cuello uterino, tiroides, nariz, cabeza y cuello, próstata y piel (por ejemplo carcinoma de células epidermoides). Otros ejemplos de cánceres que se pueden tratar con un compuesto de la presente invención incluyen tumores hematopoyéticos de linaje linfoide (por ejemplo leucemia, leucemia linfocítica aguda, linfoma de células del manto, leucemia linfocítica crónica, linfoma de células B (tal como el linfoma difuso de células B grandes), linfoma de células T, mieloma múltiple, linfoma de Hodgkin, linfoma no Hodgkin, linfoma de células pilosas y linfoma de Burkett; tumores hematopoyéticos de linaje mieloide, por ejemplo leucemias mielógenas agudas y crónicas, síndrome mielodisplásico y leucemia promielocítica. Otros tipos de cáncer incluyen el cáncer folicular de tiroides; un tumor de origen mesenquimal, por ejemplo, fibrosarcoma o habdomiosarcoma; un tumor del sistema nervioso central o periférico, por ejemplo, astrocitoma, neuroblastoma, glioma o schwannoma; melanoma; seminoma; teratocarcinoma; osteosarcoma; xeroderma pigmentoso; retinoblastoma; queratoctomantoma; cáncer folicular de tiroides; y sarcoma de Kaposi.
Un grupo de cánceres incluye los cánceres de mama humanos (por ejemplo tumores primarios de mama, cáncer de mama sin afectación de ganglios linfáticos, adenocarcinomas de conductos invasivos de mama, cánceres de mama no endometrioides) y cánceres de endometrio. Otro subconjunto de cánceres en los que los compuestos que tienen actividad inhibidora de CDK4/6 pueden ser de particular beneficio terapéutico incluyen el glioblastoma multiforme, ALL de células T, sarcomas, melanoma familiar y melanoma. Los inhibidores de CDK4/6 también podrían ser útiles en el tratamiento de infecciones virales, por ejemplo, virus del herpes, virus de la viruela, virus de Epstein-Barr, virus Sindbis, adenovirus, VIH, HPV, h Cv , y HCMV; prevención del desarrollo del SIDA en individuos infectados por VIH; enfermedades inflamatorias crónicas, por ejemplo, lupus eritematoso sistémico, glomerulonefritis mediada autoinmunitaria, artritis reumatoide, psoriasis, enfermedad inflamatoria intestinal y diabetes mellitus autoinmunitaria; enfermedades cardiovasculares, por ejemplo, hipertrofia cardíaca, reestenosis, aterosclerosis; trastornos neurodegenerativos, por ejemplo, enfermedad de Alzheimer, demencia relacionada con el SIDA, enfermedad de Parkinson, esclerosis lateral amiotrópica, retinitis pigmentosa, atrofia muscular espinal y degeneración cerebelosa; glomerulonefritis; síndromes de mielodisplasia, infartos de miocardio asociados a lesión isquémica, accidente cerebrovascular y lesión por reperfusión, arritmia, aterosclerosis, enfermedades hepáticas inducidas por toxinas o relacionadas con el alcohol, enfermedades hematológicas, por ejemplo, anemia crónica y anemia aplásica; enfermedades degenerativas del sistema musculoesquelético, por ejemplo, osteoporosis y artritis, rinosinusitis sensible a aspirina, fibrosis quística, esclerosis múltiple, enfermedades renales, enfermedades oftálmicas que incluyen degeneración macular relacionada con la edad, uveítis y dolor por cáncer.
Más aún, los compuestos de la presente invención pueden ser útiles en el tratamiento de tumores con amplificaciones de los genes CDK4 y CDK6, así como tumores que sobreexpresan socios de ciclina de las quinasas dependientes de ciclina. En particular, los compuestos de la presente invención pueden ser útiles en el tratamiento de tumores RB+ve (proteína del retinoblastoma positiva), que incluyen tumores que albergan mutaciones en Ras, Raf, Receptores de Factores de Crecimiento o sobreexpresión de Receptores de Factores de Crecimiento. Además, los compuestos de la presente invención también pueden ser útiles en el tratamiento de tumores RB-ve.
Los compuestos de la presente invención también pueden ser útiles en el tratamiento de tumores con aberraciones genéticas que activan la actividad de la quinasa CDK4/6. Estos incluyen, pero no se limitan a, cánceres con translocaciones de D-ciclina, como el linfoma de células del manto y el mieloma múltiple, amplificaciones de D-ciclina tales como el cáncer de mama y cáncer de esófago de células epidermoides, amplificaciones de CDK4 tales como el liposarcoma, amplificaciones o sobreexpresiones de CDK6 tales como el linfoma de células T, e inactivación de p16 tal como melanoma, cáncer de pulmón de células no pequeñas y cáncer de páncreas. Los compuestos de la presente invención pueden ser útiles en el tratamiento de cánceres que tienen aberraciones genéticas en los reguladores en dirección ascendente de D-ciclinas, donde el defecto resulta en una mayor abundancia de D-ciclina, también se pueden considerar para el tratamiento. Estos incluyen, pero no se limitan a, leucemia mieloide aguda con activación de FLT3, cánceres de mama con sobreexpresión de Her2/neu, dependencia de ER o fenotipo triple negativo, cánceres de colon con mutaciones activadoras de la ruta MAPK, Pl3K o WNT, melanomas con mutaciones activadoras de la ruta MAPK, cánceres de pulmón de células no pequeñas con aberraciones activadoras de la ruta EGFR y cánceres de páncreas con aberraciones activadoras de la ruta MAPK, que incluyen mutaciones K-ras.
Los métodos de tratamiento descritos en el presente documento comprenden la administración de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, a un sujeto que lo necesite. Los métodos individuales descritos en el presente documento incluyen métodos para tratar uno cualquiera de los trastornos o enfermedades mencionados anteriormente al administrar una cantidad eficaz de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, a un sujeto que lo necesite.
La composición o combinación farmacéutica de la presente invención puede estar en una dosificación unitaria de aproximadamente 1-1000 mg de ingrediente(s) activo(s) para un sujeto de aproximadamente 50-70 kg, o aproximadamente 1-500 mg o aproximadamente 1-250 mg o aproximadamente 1-150 mg o aproximadamente 0.5-100 mg, o aproximadamente 1-50 mg de ingredientes activos. La dosificación terapéuticamente efectiva de un compuesto, la composición farmacéutica o las combinaciones de los mismos depende de la especie del sujeto, el peso corporal, la edad y la condición individual, el trastorno o enfermedad o la gravedad del mismo que se esté tratando. Un médico, clínico o veterinario con conocimientos básicos puede determinar fácilmente la cantidad efectiva de cada uno de los ingredientes activos necesaria para prevenir, tratar o inhibir el progreso del trastorno o enfermedad. Las propiedades de dosificación citadas anteriormente son demostrables en pruebas in vitro e in vivo utilizando ventajosamente mamíferos. por ejemplo, ratones, ratas, perros, monos u órganos aislados, tejidos y preparaciones de los mismos. Los compuestos de la presente invención se pueden aplicar in vitro en forma de soluciones, por ejemplo, soluciones acuosas, e in vivo ya sea por vía enteral, parenteral, ventajosamente intravenosa, por ejemplo, como suspensión o en solución acuosa. La dosificación in vitro puede variar entre aproximadamente 10~-9 molar y 10-3 concentraciones molares. Una cantidad terapéuticamente eficaz in vivo puede variar, dependiendo de la ruta de administración, entre aproximadamente 0.1-500 mg/kg, entre aproximadamente 1-100 mg/kg o entre aproximadamente 100-300 mg/kg.
También se describe en el presente documento un método para modular la actividad de CDK4/6 en un sujeto que comprende administrar al sujeto un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. Adicionalmente, se describe en el presente documento un método para el tratamiento de un trastorno o una enfermedad mediada por CDK4/6 en un sujeto que lo necesita, que comprende administrar al sujeto el compuesto de fórmula (I), (Ia), (Ib), (IVa), (IVb), (V) o (Va), o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. También se describe en el presente documento un método para tratar un trastorno o una enfermedad mediada por CDK4/6, en un sujeto que necesita tratamiento del mismo, que comprende administrar un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en el que el trastorno o la enfermedad se selecciona de carcinomas con aberraciones genéticas que activan la actividad de la quinasa CDK4/6. Estos incluyen, pero no se limitan a, cánceres con translocaciones de D-ciclina, tales como el linfoma de células del manto y el mieloma múltiple, amplificaciones de D-ciclina tales como cáncer de mama y cáncer de esófago de células epidermoides, amplificaciones de CDK4 tales como liposarcoma, amplificaciones o sobreexpresiones de CDK6 tales como linfoma de células T e inactivación de p16 tales como melanoma, cáncer de pulmón de células no pequeñas y cáncer de páncreas.
También se describe en el presente documento el uso de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para el tratamiento de un trastorno o enfermedad mediada por CDK4.
También se describe en el presente documento un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, que se utiliza para el tratamiento de un trastorno o una enfermedad mediada por CDK4, en un sujeto en el que el trastorno o la enfermedad se selecciona de carcinomas con aberraciones genéticas que activan la actividad de la quinasa CDK4/6. Estos incluyen, pero no se limitan a, cánceres con translocaciones de D-ciclina tales como el linfoma de células del manto y el mieloma múltiple, amplificaciones de D-ciclina tales como el cáncer de mama y el cáncer de esófago de células epidermoides, amplificaciones de CDK4 tales como el liposarcoma, amplificaciones o sobreexpresiones de CDK6 tales como el linfoma de células T, e inactivación de p16 tal como el melanoma, el cáncer de pulmón de células no pequeñas y el cáncer de páncreas.
También se describe en el presente documento un compuesto de acuerdo con la Fórmula (I), (Ia), (Ib), (IVa), (IVb), (V) o (Va), o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para uso como un medicamento.
También se describe en el presente documento el uso de un compuesto de Fórmula (I), (Ia), (Ib), (IVa), (IVb), (V) o (Va), o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la fabricación de un medicamento para el tratamiento de un trastorno o enfermedad mediado por CDK4/6, en el que el trastorno o la enfermedad se selecciona de carcinomas con aberraciones genéticas que activan la actividad de la quinasa CDK4/6. Estos incluyen, pero no se limitan a, cánceres con translocaciones de D-ciclina tal como el linfoma de células del manto y el mieloma múltiple, amplificaciones de D-ciclina tal como el cáncer de mama y el cáncer de esófago de células epidermoides, amplificaciones de CDK4 tal como el liposarcoma, amplificaciones o sobreexpresiones de CDK6 tal como el linfoma de células T e inactivación de p16 tal como el melanoma, el cáncer de pulmón de células no pequeñas y el cáncer de páncreas.
Combinaciones
Los compuestos de la presente invención se pueden administrar conjuntamente, ya sea simultáneamente con, o antes o después de, uno o más otros agentes terapéuticos. Los compuestos de la presente invención se pueden administrar por separado, por la misma o diferente ruta de administración, o juntos en la misma composición farmacéutica que los otros agentes.
Se describe en el presente documento un producto que comprende un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, y al menos otro agente terapéutico como una preparación combinada para uso simultáneo, separado o secuencial en terapia. En algunos de dichos productos, la terapia es el tratamiento de una enfermedad o condición mediada por la inhibición de CDK4/6. Los productos proporcionados como una preparación combinada incluyen una composición que comprende el compuesto de la presente invención y el(los) otro(s) agente(s) terapéutico(s) juntos en la misma composición farmacéutica, o el compuesto de la presente invención y el(los) otro(s) agente(s) terapéutico(s) en forma separada, por ejemplo, en forma de kit. En ciertas realizaciones, la invención proporciona una composición farmacéutica que comprende un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, y otro(s) agente(s) terapéutico(s). Opcionalmente, la composición farmacéutica puede comprender un excipiente farmacéuticamente aceptable, como se describió anteriormente.
También se describe en el presente documento un kit que comprende dos o más composiciones farmacéuticas separadas, al menos una de las cuales contiene un compuesto de la invención o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. En algunos de estos kits, el kit comprende medios para retener por separado dichas composiciones, tales como un recipiente, una botella dividida o un paquete de papel aluminio dividido. Un ejemplo de dicho kit es un blíster, como los que se utilizan normalmente para empacar comprimidos, cápsulas y similares.
El kit se puede utilizar para administrar diferentes formas de dosificación, por ejemplo, oral y parenteral, para administrar las composiciones separadas en diferentes intervalos de dosificación o para titular las composiciones separadas entre sí. Para facilitar el cumplimiento, el kit normalmente incluye instrucciones de administración. En las terapias combinadas, el compuesto de la invención y el otro agente terapéutico pueden ser fabricados y/o formulados por el mismo fabricante o por diferentes fabricantes. Más aún, el compuesto de la invención y el otro agente terapéutico se pueden combinar en una terapia combinada: (i) antes de la liberación del producto combinado a los médicos (por ejemplo, en el caso de un kit que comprende el compuesto de la invención y el otro agente terapéutico); (ii) por el propio médico (o bajo la guía del médico) poco antes de la administración; (iii) en el propio paciente, por ejemplo, durante la administración secuencial del compuesto de la invención y el otro agente terapéutico. De acuerdo con lo anterior, se describe en el presente documento el uso de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para tratar una enfermedad o afección mediada por la inhibición de CDK4/6, en el que el medicamento se prepara para administración con otro agente terapéutico. También se describe en el presente documento el uso de otro agente terapéutico para tratar una enfermedad o afección mediada por la inhibición de CDK4/6, en el que el medicamento se administra con un compuesto de la presente invención. También se describe en el presente documento un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para uso en un método de tratamiento de una enfermedad o afección mediada por la inhibición de CDK4/6, en el que el compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, se prepara para administración con otro agente terapéutico. También se describe en el presente documento otro agente terapéutico para uso en un método de tratamiento de una enfermedad o afección mediada por la inhibición de CDK4/6, en el que el otro agente terapéutico se prepara para administración con un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. También se describe en el presente documento un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para uso en un método de tratamiento de una enfermedad o afección mediada por la inhibición de CDK4/6, en el que el compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, se administra con otro agente terapéutico. También se describe en el presente documento otro agente terapéutico para uso en un método de tratamiento de una enfermedad o afección mediada por la inhibición de CDK4/6, en el que el otro agente terapéutico se administra con un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. También se describe en el presente documento el uso de un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para tratar una enfermedad o afección mediada por CDK4/6, en el que el paciente ha sido previamente tratado (por ejemplo dentro de las 24 horas) con otro agente terapéutico. También se describe en el presente documento el uso de otro agente terapéutico para tratar una enfermedad o afección mediada por CDK4/6, en el que el paciente ha sido tratado previamente (por ejemplo, dentro de las 24 horas) con un compuesto de la invención, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo.
El otro agente terapéutico se selecciona de un agente antiinflamatorio, antiproliferativo, quimioterapéutico, inmunosupresor, anticancerígeno, agente citotóxico o inhibidor de quinasas distinto de un compuesto de la presente invención, o una sal del mismo. Ejemplos adicionales de agentes que se pueden administrar en combinación con los compuestos de la invención incluyen, pero no se limitan a, un inhibidor de PTK, ciclosporina A, CTLA4-Ig, anticuerpos seleccionados de anti-iCAM-3, receptor de anti-IL-2, anti-CD45RB, anti-CD2, anti-CD3, anti-CD4, anti-CD80, anti-CD86 y anticuerpo monoclonal OKT3, agentes que bloquean la interacción entre CD40 y gp39, proteínas de fusión construidas a partir de CD40 y gp39, inhibidores de la función de NF-kappa B, fármacos antiinflamatorios no esteroideos, esteroides, compuestos de oro, agentes antiproliferativos, FK506, micofenolato de mofetilo, fármacos citotóxicos, inhibidores de TNF-a, anticuerpos anti-TNF o receptor de TNF soluble, rapamicina, inhibidores de mTOR, leflunimida, inhibidores de la ciclooxigenasa-2, paclitaxel, cisplatino, carboplatino, doxorrubicina, Carminomicina, daunorrubicina, aminopterina, metotrexato, metopterina, mitomicina C, ecteinascidina 743, porfiromicina, 5-fluorouracii, 6-mercaptopurina, gemcitabina, arabinósido de citosina, podofilotoxina, etopósido, fosfato de etopósido, tenipósido, melfalán, vinblastina, vincristina, leurosidina, epotilona, vindesina, leurosina, inhibidor de B-Raf, inhibidor de MEK, inhibidor de PI3K, inhibidor de HSP90, inhibidor de CDK1, inhibidor de CDK2, inhibidor de CDK5, inhibidor de CDK7, inhibidor de CDK8, inhibidor de CDK9, inhibidor de EGFR, inhibidor de FGFR, inhibidor de PDGFR, inhibidor de Her2neu, inhibidor de FLT3, Antagonistas de los receptores de andrógenos, glucocorticoides y prosterona, inhibidor de S O, inhibidor de WNT, inhibidor de Bel, inhibidor de IAP, inhibidor de cl, inhibidor de MD 2, inhibidor de p52, inhibidores de proteosomas (Velcade) o derivados de los mismos.
Las combinaciones individuales específicas que pueden brindar beneficios de tratamiento particulares incluyen el cotratamiento de pacientes con linfoma de células del manto o cáncer de páncreas con inhibidores de mTOR, tales como everolimus.
Un compuesto de la presente invención también se puede utilizar en combinación con otros agentes, por ejemplo, un inhibidor de proteína quinasa adicional que es o no un compuesto de la invención, para el tratamiento de un trastorno asociado a la proteína quinasa en un sujeto. Por el término “combinación” se entiende una combinación fija en una forma de dosificación unitaria o un kit de partes para la administración combinada donde un compuesto de la presente invención y un compañero de combinación se pueden administrar independientemente al mismo tiempo o por separado dentro de intervalos de tiempo que permiten especialmente que los compañeros de combinación muestren una cooperación, por ejemplo, efecto sinérgico, o cualquier combinación de los mismos.
Los compuestos de la invención se pueden administrar, simultánea o secuencialmente, con un agente antiinflamatorio, antiproliferativo, quimioterapéutico, inmunosupresor, anticancerígeno, citotóxico o inhibidor de quinasas distinto de un compuesto de Fórmula I o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo. Ejemplos adicionales de agentes que se pueden administrar en combinación con los compuestos de la invención incluyen, pero no se limitan a, un inhibidor de PTK, ciclosporina A, CTLA4-Ig, anticuerpos seleccionados de anti-ICAM-3, receptor de anti-IL-2, anti-CD45RB, anti-CD2, anti-CD3, anti-CD4, anti-CD80, anti-CD86 y anticuerpo monoclonal OKT3, agentes que bloquean la interacción entre CD40 y gp39, proteínas de fusión construidas a partir de CD40 y gp39, inhibidores de la función de NF-kappa B, fármacos antiinflamatorios no esteroides, esteroides, compuestos de oro, agentes antiproliferativos, FK506, micofenolato de mofetilo, fármacos citotóxicos, inhibidores de TNF-ct, anticuerpos anti-TNF o receptor soluble de TNF, rapamicina, leflunimida, inhibidores de la ciclooxigenasa-2, paclitaxel, cisplatino, carboplatino, doxorrubicina, carminomicina, daunorrubicina, aminopterina, metotrexato, metopterina, mitomicina C, ecteinascidina 743, porfiromicina, 5-fluorouracilo, 6-mercaptopurina, gemcitabina, arabinósido de citosina, podofilotoxina, etopósido, fosfato de etopósido, tenipósido, melfalan, vinblastina, vincristina, leurosidina, epotilona, vindesina, leurosina o derivados de los mismos.
Un compuesto de la invención y cualquier agente adicional se pueden formular en formas de dosificación separadas. Alternativamente, para disminuir el número de formas de dosificación administradas a un paciente, el compuesto de la invención y cualquier agente adicional se pueden formular juntos en cualquier combinación. Por ejemplo, el compuesto inhibidor de la invención se puede formular en una forma de dosificación y el agente adicional se puede formular junto en otra forma de dosificación. Cualesquier formas de dosificación separadas se pueden administrar al mismo tiempo o en tiempos diferentes.
Alternativamente, una composición de esta invención puede comprender un agente adicional como se describe en el presente documento. Cada componente puede estar presente en composiciones individuales, composiciones combinadas o en una única composición.
Composiciones farmacéuticas y administración de las mismas
Las composiciones y métodos divulgados en el presente documento se pueden utilizar para tratar a un individuo que los necesite. En ciertas realizaciones, el individuo es un mamífero tal como un humano, o un mamífero no humano. Cuando se administra a un animal tal como un humano, la composición o el compuesto se administra preferiblemente como una composición farmacéutica que comprende, por ejemplo, un compuesto divulgado y un portador farmacéuticamente aceptable.
Los portadores farmacéuticamente aceptables son bien conocidos en la técnica e incluyen, por ejemplo, soluciones acuosas tales como agua o solución salina fisiológicamente tamponada u otros solventes o vehículos tales como glicoles, glicerol, aceites tales como aceite de oliva o ésteres orgánicos inyectables. En realizaciones preferidas, cuando dichas composiciones farmacéuticas son para administración humana, particularmente para rutas de administración invasivas (es decir, rutas, tales como la inyección o la implantación, que evitan el transporte o la difusión a través de una barrera epitelial), la solución acuosa está libre de pirógenos o sustancialmente libre de pirógenos. Los excipientes se pueden elegir, por ejemplo, para efectuar una liberación retardada de un agente o para dirigirse selectivamente a una o más células, tejidos u órganos. La composición farmacéutica puede estar en forma de unidad de dosificación, tal como como comprimido, cápsula (que incluye cápsula espolvoreable y cápsula de gelatina), gránulo, liofilizado para reconstitución, polvo, solución, jarabe, supositorio, inyección o similares. La composición también puede estar presente en un sistema de suministro transdérmico, por ejemplo, un parche cutáneo. La composición también puede estar presente en una solución adecuada para administración tópica, tal como un ungüento o crema.
Un portador farmacéuticamente aceptable puede contener agentes fisiológicamente aceptables que actúan, por ejemplo, para estabilizar, aumentar la solubilidad o aumentar la absorción de un compuesto tal como un compuesto de la invención. Dichos agentes fisiológicamente aceptables incluyen, por ejemplo, carbohidratos, tales como glucosa, sacarosa o dextranos, antioxidantes, tales como ácido ascórbico o glutatión, agentes quelantes, proteínas de bajo peso molecular u otros estabilizantes o excipientes. La elección de un portador farmacéuticamente aceptable, que incluye un agente fisiológicamente aceptable, depende, por ejemplo, de la ruta de administración de la composición. La preparación de la composición farmacéutica puede ser un sistema de suministro de fármacos autoemulsionante o un sistema de suministro de fármacos automicroemulsionante. La composición (preparación) farmacéutica también puede ser un liposoma u otra matriz polimérica, que puede tener incorporado en la misma, por ejemplo, un compuesto de la invención. Los liposomas, por ejemplo, que comprenden fosfolípidos u otros lípidos, son portadores no tóxicos, fisiológicamente aceptables y metabolizables que son relativamente simples de producir y administrar.
La frase “farmacéuticamente aceptable” se emplea en el presente documento para referirse a aquellos compuestos, materiales, composiciones y/o formas de dosificación que, dentro del alcance del criterio médico sólido, son adecuados para uso en contacto con los tejidos de humanos y animales sin toxicidad excesiva, irritación, respuesta alérgica u otro problema o complicación, acorde con una relación beneficio/riesgo razonable.
La frase “portadorfarmacéuticamente aceptable” como se utiliza en el presente documento significa un material, composición o vehículo farmacéuticamente aceptable, tal como un relleno líquido o sólido, diluyente, excipiente, solvente o material encapsulante. Cada portador debe ser “aceptable” en el sentido de ser compatible con los demás ingredientes de la formulación y no ser perjudicial para el paciente. Algunos ejemplos de materiales que pueden servir como portadores farmacéuticamente aceptables incluyen: (1) azúcares, tales como lactosa, glucosa y sacarosa; (2) almidones, tales como almidón de maíz y almidón de patata; (3) celulosa y sus derivados, tales como carboximetilcelulosa de sodio, etilcelulosa y acetato de celulosa; (4) tragacanto en polvo; (5) malta; (6) gelatina; (7) talco; (8) excipientes, tales como manteca de cacao y ceras para supositorios; (9) aceites, tales como aceite de cacahuete, aceite de semilla de algodón, aceite de cártamo, aceite de sésamo, aceite de oliva, aceite de maíz y aceite de soja; (10) glicoles, tales como propilenglicol; (11) polioles, tales como glicerina, sorbitol, manitol y polietilenglicol; (12) ésteres, tales como oleato de etilo y laurato de etilo; (13) agar; (14) agentes tampón, tales como hidróxido de magnesio e hidróxido de aluminio; (15) ácido algínico; (16) agua libre de pirógenos; (17) solución salina isotónica; (18) solución de Ringer; (19) alcohol etílico; (20) soluciones tampón de fosfato; y (21) otras sustancias compatibles no tóxicas empleadas en formulaciones farmacéuticas.
Una composición farmacéutica (preparación) se puede administrar a un sujeto mediante cualquiera de varias rutas de administración, que incluyen, por ejemplo, por vía oral (por ejemplo, soluciones o suspensiones acuosas o no acuosas, comprimidos, cápsulas (que incluyen las cápsulas para espolvorear y las cápsulas de gelatina), bolos, polvos, gránulos, pastas para aplicación en la lengua); absorción a través de la mucosa oral (por ejemplo, por vía sublingual); anal, rectal o vaginal (por ejemplo, como un pesario, crema o espuma); parenteral (que incluye por vía intramuscular, intravenosa, subcutánea o intratecal como, por ejemplo, una solución o suspensión estéril); nasal; intraperitoneal; subcutánea; transdérmica (por ejemplo como un parche aplicado a la piel); y tópica (por ejemplo, como una crema, ungüento o aerosol aplicado sobre la piel, o como una gota oftálmica). El compuesto también se puede formular para inhalación. En ciertas realizaciones, un compuesto puede simplemente disolverse o suspenderse en agua esterilizada. Los detalles de las rutas de administración apropiadas y las composiciones adecuadas para las mismas se pueden encontrar, por ejemplo, en las Patentes de EE.UU. Nos. 6,110,973, 5,763,493, 5,731,000, 5,541,231, 5,427,798, 5,358,970 y 4,172,896, así como en las patentes citadas en las mismas.
Las formulaciones se pueden presentar convenientemente en forma de dosificación unitaria y se pueden preparar mediante cualesquier métodos bien conocidos en la técnica de la farmacia. La cantidad de ingrediente activo que se puede combinar con un material portador para producir una forma de dosificación única variará dependiendo del huésped que se esté tratando y del modo particular de administración. La cantidad de ingrediente activo que se puede combinar con un material portador para producir una forma de dosificación única generalmente será la cantidad del compuesto que produce un efecto terapéutico. Generalmente, de un cien por ciento, esta cantidad variará desde aproximadamente 1 por ciento hasta aproximadamente noventa y nueve por ciento del ingrediente activo, preferiblemente desde aproximadamente 5 por ciento hasta aproximadamente 70 por ciento, más preferiblemente desde aproximadamente 10 por ciento hasta aproximadamente 30 por ciento.
Los métodos para preparar estas formulaciones o composiciones incluyen el paso de asociar un compuesto activo, tal como un compuesto de la invención, con el portador y, opcionalmente, uno o más ingredientes accesorios. En general, las formulaciones se preparan asociando de manera uniforme e íntima un compuesto de la presente invención con portadores líquidos o portadores sólidos finamente divididos, o ambos, y luego, si es necesario, dando forma al producto.
Las formulaciones de la invención adecuadas para administración oral pueden estar en forma de cápsulas (que incluyen cápsulas para espolvorear y cápsulas de gelatina), sellos, píldoras, comprimidos, pastillas (que utilizan una base saborizada, usualmente sacarosa y acacia o tragacanto), liofilizado, polvos, gránulos, o como una solución o una suspensión en un líquido acuoso o no acuoso, o como una emulsión líquida de aceite en agua o agua en aceite, o como un elixir o jarabe, o como pastillas (que utilizan una base inerte, tal como gelatina y glicerina, o sacarosa y acacia) y/o como enjuagues bucales y similares, cada uno conteniendo una cantidad predeterminada de un compuesto de la presente invención como ingrediente activo. Las composiciones o compuestos también se pueden administrar en forma de bolo, electuario o pasta.
Para preparar formas de dosificación sólidas para administración oral (cápsulas (que incluyen cápsulas para espolvorear y cápsulas de gelatina), comprimidos, píldoras, grageas, polvos, gránulos y similares), el ingrediente activo se mezcla con uno o más portadores farmacéuticamente aceptables, tales como citrato de sodio o fosfato dicálcico, y/o cualquiera de los siguientes: (1) rellenos o extensores, tales como almidones, lactosa, sacarosa, glucosa, manitol y/o ácido silícico; (2) aglutinantes, tales como, por ejemplo, carboximetilcelulosa, alginatos, gelatina, polivinilpirrolidona, sacarosa y/o acacia; (3) humectantes, tales como glicerol; (4) agentes desintegrantes, tales como agar-agar, carbonato de calcio, almidón de patata o tapioca, ácido algínico, ciertos silicatos y carbonato de sodio; (5) agentes retardantes de solución, tales como parafina; (6) aceleradores de absorción, tales como compuestos de amonio cuaternario; (7) agentes humectantes, tales como, por ejemplo, alcohol cetílico y monoestearato de glicerol; (8) absorbentes, tales como caolín y arcilla bentonita; (9) lubricantes, tales como talco, estearato de calcio, estearato de magnesio, polietilenglicoles sólidos, lauril sulfato de sodio y mezclas de los mismos; (10) agentes complejantes, tales como ciclodextrinas modificadas y no modificadas; y (11) agentes colorantes. En el caso de cápsulas (que incluyen las cápsulas para espolvorear y las cápsulas de gelatina), comprimidos y píldoras, las composiciones farmacéuticas también pueden comprender agentes tampón. También se pueden emplear composiciones sólidas de un tipo similar como rellenos en cápsulas de gelatina blandas y duras utilizando excipientes tales como lactosa o azúcares de la leche, así como polietilenglicoles de alto peso molecular y similares.
Un comprimido se puede fabricar por compresión o moldeo, opcionalmente con uno o más ingredientes accesorios. Los comprimidos comprimibles se pueden preparar utilizando un aglutinante (por ejemplo, gelatina o hidroxipropilmetilcelulosa), lubricante, diluyente inerte, conservante, desintegrante (por ejemplo, glicolato de almidón sódico o carboximetilcelulosa sódica reticulada), agente tensioactivo o dispersante. Los comprimidos moldeados se pueden fabricar al moldear en una máquina adecuada una mezcla del compuesto en polvo humedecido con un diluyente líquido inerte.
Los comprimidos y otras formas de dosificación sólidas de las composiciones farmacéuticas, tales como grageas, cápsulas (que incluyen cápsulas para espolvorear y cápsulas de gelatina), píldoras y gránulos, se pueden opcionalmente ranurar o preparar con recubrimientos y cubiertas, tales como recubrimientos entéricos y otros recubrimientos bien conocidos en la técnica de formulación farmacéutica. También se pueden formular de manera que proporcionen una liberación lenta o controlada del ingrediente activo que contienen utilizando, por ejemplo, hidroxipropilmetilcelulosa en proporciones variables para proporcionar el perfil de liberación deseado, otras matrices poliméricas, liposomas y/o microesferas. Se pueden esterilizar, por ejemplo, mediante filtración a través de un filtro que retenga bacterias, o al incorporar agentes esterilizantes en forma de composiciones sólidas estériles que se puedan disolver en agua estéril o en algún otro medio inyectable estéril inmediatamente antes de uso. Estas composiciones también pueden contener opcionalmente agentes opacificantes y pueden ser de una composición que libere el(los) ingrediente(s) activo(s) sólo, o preferentemente, en una cierta porción del tracto gastrointestinal, opcionalmente, de manera retardada. Los ejemplos de composiciones de incrustación que se pueden utilizar incluyen sustancias poliméricas y ceras. El principio activo también puede presentarse en forma microencapsulada, si procede, con uno o más de los excipientes anteriormente descritos.
Las formas de dosificación líquidas útiles para la administración oral incluyen emulsiones farmacéuticamente aceptables, liofilizados para reconstitución, microemulsiones, soluciones, suspensiones, jarabes y elixires. Además del ingrediente activo, las formas de dosificación líquidas pueden contener diluyentes inertes comúnmente utilizados en la técnica, tales como, por ejemplo, agua u otros solventes, ciclodextrinas y derivados de las mismas, agentes solubilizantes y emulsionantes, tales como alcohol etílico, alcohol isopropílico, carbonato de etilo, acetato de etilo, alcohol bencílico, benzoato de bencilo, propilenglicol, 1,3-butilenglicol, aceites (en particular, aceites de semilla de algodón, cacahuete, maíz, germen, oliva, ricino y sésamo), glicerol, alcohol tetrahidrofurílico, polietilenglicoles y ésteres de ácidos grasos de sorbitán, y mezclas de los mismos.
Además de diluyentes inertes, las composiciones orales también pueden incluir adyuvantes tales como agentes humectantes, agentes emulsionantes y de suspensión, agentes edulcorantes, saborizantes, colorantes, perfumantes y conservantes.
Las suspensiones, además de los compuestos activos, pueden contener agentes de suspensión como, por ejemplo, alcoholes isoestearílicos etoxilados, polioxietilensorbitol y ésteres de sorbitán, celulosa microcristalina, metahidróxido de aluminio, bentonita, agar-agar y tragacanto, y mezclas de los mismos.
Las formulaciones de las composiciones farmacéuticas para administración rectal, vaginal o uretral se pueden presentar como un supositorio, que se puede preparar al mezclar uno o más compuestos activos con uno o más excipientes o portadores no irritantes adecuados que comprenden, por ejemplo, manteca de cacao, polietilenglicol, una cera de supositorio o un salicilato, y que es sólido a temperatura ambiente, pero líquido a temperatura corporal y, por lo tanto, se derretirá en el recto o la cavidad vaginal y liberará el compuesto activo.
Las formulaciones de las composiciones farmacéuticas para administración en la boca se pueden presentar como un enjuague bucal, o un aerosol oral, o un ungüento oral.
Alternativamente o adicionalmente, se pueden formular composiciones para suministro a través de un catéter, un stent, un alambre u otro dispositivo intraluminal. El suministro a través de dichos dispositivos puede ser especialmente útil en casos de suministro a la vejiga, la uretra, el uréter, el recto o el intestino.
Las formulaciones que son adecuadas para la administración vaginal también incluyen pesarios, tampones, cremas, geles, pastas, espumas o formulaciones en aerosol que contienen portadores que se sabe en la técnica que son apropiados.
Las formas de dosificación para administración tópica o transdérmica incluyen polvos, aerosoles, ungüentos, pastas, cremas, lociones, geles, soluciones, parches e inhalantes. El compuesto activo se puede mezclar bajo condiciones estériles con un portador farmacéuticamente aceptable y con cualesquier conservantes, tampones o propulsores que se puedan requerir.
Los ungüentos, pastas, cremas y geles pueden contener, además de un compuesto activo, excipientes, tales como grasas animales y vegetales, aceites, ceras, parafinas, almidón, tragacanto, derivados de celulosa, polietilenglicoles, siliconas, bentonitas, ácido silícico, talco y óxido de zinc, o mezclas de los mismos.
Los polvos y aerosoles pueden contener, además de un compuesto activo, excipientes tales como lactosa, talco, ácido silícico, hidróxido de aluminio, silicatos de calcio y polvo de poliamida, o mezclas de estas sustancias. Los aerosoles pueden contener adicionalmente propulsores habituales, como clorofluorohidrocarburos e hidrocarburos volátiles no sustituidos, como butano y propano.
Los parches transdérmicos tienen la ventaja adicional de proporcionar un suministro controlado de un compuesto de la presente invención al cuerpo. Dichas formas de dosificación se pueden preparar al disolver o dispersar el compuesto activo en el medio adecuado. También se pueden utilizar potenciadores de la absorción para aumentar el flujo del compuesto a través de la piel. La tasa de dicho flujo se puede controlar al proporcionar una membrana controladora de tasa o dispersa el compuesto en una matriz de polímero o un gel.
Las formulaciones oftálmicas, ungüentos para los ojos, polvos, soluciones y similares, también se contemplan dentro del alcance de esta invención. Se describen formulaciones oftálmicas de ejemplo en las Publicaciones de EE. UU. No. 2005/0080056, 2005/0059744, 2005/0031697, y 2005/004074; y Patente de EE. UU. No.
6,583,124, cuyo contenido se incorpora en el presente documento por referencia. Si se desea, las formulaciones oftálmicas líquidas tienen propiedades similares a las de los fluidos lagrimales, el humor acuoso o el humor vítreo o son compatibles con dichos fluidos.
Las frases “administración parenteral” y “administrado por vía parenteral” como se utilizan en el presente documento significan modos de administración distintos de la administración enteral y tópica, usualmente por inyección, e incluyen, sin limitación, inyección e infusión intravenosa, intramuscular, intraarterial, intratecal, intracapsular, intraorbitaria, intracardíaca, intradérmica, intraperitoneal, transtraqueal, subcutánea, subcuticular, intraarticular, subcapsular, subaracnoidea, intraespinal e intraesternal.
Las composiciones farmacéuticas adecuadas para administración parenteral comprenden uno o más compuestos activos en combinación con una o más soluciones, dispersiones, suspensiones o emulsiones acuosas o no acuosas isotónicas estériles farmacéuticamente aceptables o polvos estériles que se pueden reconstituir en soluciones o dispersiones inyectables estériles justo antes de uso, que pueden contener antioxidantes, tampones, bacteriostáticos, solutos que hacen que la formulación sea isotónica con la sangre del receptor previsto o agentes de suspensión o espesantes.
Los ejemplos de portadores acuosos y no acuosos adecuados que se pueden emplear en las composiciones farmacéuticas de la invención incluyen agua, etanol, polioles (tales como glicerol, propilenglicol, polietilenglicol y similares) y mezclas adecuadas de los mismos, aceites vegetales, tales como aceite de oliva, y ésteres orgánicos inyectables, tales como oleato de etilo. La fluidez adecuada se puede mantener, por ejemplo, mediante el uso de materiales de recubrimiento, tales como la lecitina, mediante el mantenimiento del tamaño de partícula requerido en el caso de dispersiones y mediante el uso de tensioactivos.
Estas composiciones también pueden contener adyuvantes tales como conservantes, agentes humectantes, agentes emulsionantes y agentes dispersantes. La prevención de la acción de los microorganismos se puede garantizar mediante la inclusión de diversos agentes antibacterianos y antifúngicos, por ejemplo, parabeno, clorobutanol, ácido fenol sórbico y similares. También puede ser deseable incluir agentes isotónicos, tales como azúcares, cloruro de sodio y similares en las composiciones. Además, la absorción prolongada de la forma farmacéutica inyectable puede lograrse mediante la inclusión de agentes que retrasan la absorción, tales como el monoestearato de aluminio y la gelatina.
En algunos casos, para prolongar el efecto de un fármaco, es deseable retardar la absorción del fármaco mediante inyección subcutánea o intramuscular. Esto se puede lograr mediante el uso de una suspensión líquida de material cristalino o amorfo que tenga poca solubilidad en agua. La tasa de absorción del fármaco depende entonces de su tasa de disolución, que, a su vez, puede depender del tamaño y la forma cristalina. Alternativamente, la absorción retardada de una forma de fármaco administrada por vía parenteral se logra al disolver o suspender el fármaco en un vehículo oleoso.
Las formas de depósito inyectables se elaboran al formar matrices microencapsuladas de los compuestos en cuestión en polímeros biodegradables tales como polilactida-poliglicólido. Dependiendo de la relación de fármaco y polímero, y de la naturaleza del polímero particular empleado, se puede controlar la tasa de liberación del fármaco. Ejemplos de polímeros biodegradables incluyen poli(ortoésteres) y poli(anhídridos). Las formulaciones inyectables de depósito también se preparan al atrapar el fármaco en liposomas o microemulsiones que sean compatibles con el tejido corporal.
Para uso en los métodos descritos en el presente documento, los compuestos activos se pueden proporcionar per se o como una composición farmacéutica que contiene, por ejemplo, entre un 0.1 % y aproximadamente un 99.5% (más preferiblemente, entre un 0.5% y aproximadamente un 90.0%) de ingrediente activo en combinación con un portador farmacéuticamente aceptable.
Si bien se han divulgado realizaciones específicas de la invención en cuestión, la especificación anterior es ilustrativa y no restrictiva. A los expertos en la técnica les resultarán evidentes muchas variaciones de la invención tras revisar esta especificación y las reivindicaciones a continuación. El alcance completo de la invención se debe determinar mediante referencia a las reivindicaciones y la especificación.
Ejemplificación
Protocolos sintéticos
Tabla 1.
Ejemplo 1: Síntesis de los compuestos A1, A2, A3, A5, A6, A7, A8, A9, A10, A11, A12, A13, A14, A15, A16, A17, A18, A19, A20, A21, A22, A29, A45, A47, A49, A50, A52, A53, A54, A55, A56, A57, A58, A59, A60
A una solución enfriada (0 °C) de 4-benzoil-3-oxomorfolina-2-carboxilato de alilo (17.5 g, 60.5 mmol) en DMF (60 mL) se agregó yodometano (7.5 mL, 121 mmol), seguido de carbonato de cesio (29.6 g, 90.8 mmol). La reacción se agitó durante 2 horas, momento en el que se agregaron cloruro de amonio saturado (ac., 300 mL) y agua (200 mL). La mezcla se extrajo con Et2O (3 x 300 mL) y las capas orgánicas combinadas se secaron con MgSO4 y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-50%) para proporcionar 4-benzoil-2-metil-3-oxomorfolina-2-carboxilato de alilo (14.6 g, rendimiento del 80 %) como un sólido blanco.
MS: [M+H]+ m/z 304.1.
A un matraz Schlenk equipado con una barra agitadora se agregó Pd2(dba)3 (440 mg, 0.48 mmol), (S)-(p-CF3)3-t-BuPHOX (710 mg, 1.2 mmol) y MTBE (100 mL). La mezcla se agitó durante 30 min, después de lo cual se agregó 4-benzoil-2-metil-3-oxomorfolina-2-carboxilato de alilo (14.6 g, 48 mmol) como una solución en MTBE (220 mL). El matraz se selló y se calentó a 50 °C durante dos días. Una vez completada, la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se ventiló para liberar el CO2 evolucionado. La mezcla se filtró a través de celita, se lavó con EtOAc y se concentró en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-20 %) para proporcionar (S)-2-alil-4-benzoil-2-metilmorfolin-3-ona (12.1 g, rendimiento del 98 %, 98 % de ee) como un sólido blanco.
MS: [M+H]+ m/z 260.1.
A una mezcla de (S)-2-alil-4-benzoil-2-metilmorfolin-3-ona (12.1 g, 47 mmol) en THF/MeOH (2:1, 24 mL) se agregó carbonato de potasio (647 mg, 4.7 mmol). El matraz se equipó con un condensador de reflujo y la reacción se calentó a reflujo durante 3 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió, se filtró a través de celita y se lavó con CH2Cl2, y se concentró en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre S O 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar (S)-2-alil-2-metilmorfolin-3-ona (6.45 g, rendimiento del 89 %) como un aceite incoloro.
MS: [M+H]+ m/z 156.1.
A una solución enfriada (0 °C) de (S)-2-alil-2-metilmorfolin-3-ona (6.45 g, 42 mmol) en THF (210 mL) se agregó hidruro de litio y aluminio (4.73 g, 125 mmol). La mezcla se calentó a temperatura ambiente y se calentó a 60 °C durante 3 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a 0 °C y se agregó Et2O (300 mL). Se agregó lentamente agua (5.7 mL), seguida de una solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 5.7 mL), y la mezcla se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 15 min. La mezcla se secó con MgSO4, se filtró a través de celita y se concentró en vacío para proporcionar (S)-2-alil-2-metilmorfolina (5.29 g) como un aceite incoloro. El compuesto se utilizó inmediatamente sin purificación adicional.
Masa [M H] 142.1.
Compuesto A45
A una solución de (S)-2-alil-2-metilmorfolina (5.29 g, 38 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metiMH-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (12.75 g, 31 mmol) en DMSO (315 mL) se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (13.23 g, 62 mmol), seguido de ácido acético (18 mL, 312 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a 0°C y se agregó una solución acuosa de hidróxido de sodio (1 M, 630 mL), seguida de agua (200 mL). La mezcla heterogénea resultante se agitó durante 1 h, luego se filtró para recoger el sólido, se enjuagó con agua fría y finalmente se liofilizó para producir (S)-N-(5-((2-alil-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (15.82 g) como un sólido gris. El compuesto se utilizó sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 534.3.
Compuesto B1
A una solución de (S)-N-(5-((2-alil-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (15.82 g, 30 mmol) en THF/H2O (2:1, 750 mL) se agregó tetróxido de osmio (4 % en H2O, 9.4 mL, 1.48 mmol), seguido de peryodato de sodio (19.02 g, 90 mmol). La reacción se sonicó durante 2.5 h y luego se agitó durante 4.5 h. Una vez completada, se agregó tiosulfato de sodio saturado (ac., 600 mL), seguido de solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 400 mL), y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 800 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío para proporcionar (S)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (15.94 g) como un sólido marrón. El compuesto se utilizó sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 536.3.
Compuesto A1
A una solución enfriada (0 °C) de (S)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (15.94 g, 30 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 300 mL) se agregó dimetilamina (2 M en THF, 75 mL, 150 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (12.63 g, 60 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 600 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 500 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (S)-N-(5-((2-(2-(dimetilamino)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 12.6 g de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 58.70(d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.24 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.22 - 8.18 (m, 1H), 7.75 - 7.64 (m, 2H), 4.85 (hept, J = 7.0 Hz, 1H), 3.59 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 2.64 (s, 3H), 2.42 - 2.01 (m, 17H), 1.87 - 1.76 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.53 (ddd, J = 13.2, 10.4, 5.9 Hz, 1H), 1.11 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 565.3.
Compuesto B2
(R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído se preparó de la misma manera que el compuesto B1 (anterior) utilizando (R)-(p-CF3)3-t-BuPHOX como catalizador quiral. MS: [M+H]+ m/z 536.3.
Compuesto A2
(S)-N-(5-((2-(2-(dimetilamino)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina y su sal mesilato del compuesto B1 de la misma manera como se describe para el compuesto A1 (anterior).
Compuesto A5
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (90 mg, 0.17 mmol) en CHCl3 (2.1 mL) se agregó MgSO4 (120 mg) seguido de metilamina (2 M en MeOH, 0.84 mL, 1.7 mmol). Después de calentar a temperatura ambiente y agitar durante 20 h, se agregó borohidruro de sodio (13 mg, 0.34 mmol) y la reacción se agitó durante 4 h. Una vez completada, se agregaron agua (6 mL) y solución salina (2 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 4 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2% = 0-40%) para proporcionar (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-2-(2-(metilamino)etil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 28.3 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 58.70(d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.29 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.26 - 8.20 (m, 2H), 7.72 -7.67 (m, 2H), 4.85 (hept, J = 6.8 Hz, 1H), 3.61 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 2.64 (s, 3H), 2.60 - 2.53 (m, 4H), 2.37 - 2.27 (m, 9H), 2.20 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.11 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.05 - 1.91 (m, 1H), 1.63 (d, J = 7.0 Hz, 6H), 1.58 - 1.45 (m, 1H), 1.12 (s, 3H).
MS: [M+H]+ m/z 551.3.
Compuesto A22
(S)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-2-(2-(metilamino)etil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina y su sal mesilato del compuesto B1 de la misma manera como se describe para el compuesto A5 (anterior).
Compuesto A49
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (1.37 g, 2.13 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 30 mL) se agregó borohidruro de sodio (121 mg, 3.2 mmol) y la reacción se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó ácido clorhídrico acuoso (1 M, 20 mL) y la mezcla se agitó durante 15 min adicionales. Se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M, 200 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 150 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 de fase inversa C18 (gradiente de elución de H2O 0.1 % de AcOH con MeCN = 5-50%) para proporcionar (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etan-1-ol como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 400 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 58.70 (d, J = 2.8 Hz, 1H), 8.33 - 8.17 (m, 3H), 7.75 - 7.64 (m, 2H), 4.84 (p, J = 7.0 Hz, 1H), 3.65 - 3.55 (m, 2H), 3.49 - 3.39 (m, 2H), 2.65 (s, 3H), 2.39 - 2.25 (m, 6H), 2.24 - 2.07 (m, 2H), 1.97 - 1.83 (m, 1H), 1.69 - 1.52 (m, 8H), 1.14 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 538.2.
Compuesto A50
(S)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etan-1-ol y su sal mesilato del compuesto B1 de la misma manera como se describe para el compuesto A49 (anterior).
Compuesto A19
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (30 mg, 0.056 mmol) en CHCl3/MeOH (2:1, 1 mL) se agregó morfolina (50<j>L, 0.56 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (24 mg, 0.1l mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 3 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2% = 0-40%) para proporcionar (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-2-(2-morfolinoetil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 17.8 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.28 - 8.19 (m, 2H), 7.75 -7.65 (m, 2H), 4.85 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 3.60 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.52 (t, J = 4.7 Hz, 4H), 2.65 (s, 3H), 2.44 -2.17 (m, 13H), 2.10 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 1.85 (q, J = 13.3, 10.7 Hz, 1H), 1.71 - 1.51 (m, 8H), 1.12 (s, 3H). MS:
[M+H]+ m/z 607.3.
Compuesto A7
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (30 mg, 0.056 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 1 mL) se agregó MgSO4 (40 mg) seguido de t-butilamina (60<j>L, 0.56 mmol). Después de calentar a temperatura ambiente y agitar durante 18 h, se agregó borohidruro de sodio (5 mg, 0.11 mmol) y la reacción se agitó durante 4 h. Una vez completada, se agregaron agua (3 mL) y solución salina (1 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-(tert-butilamino)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 14.2 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.29 (d, J = 1.4 Hz, 1H), 8.27 - 8.20 (m, 2H), 7.73 -7.66 (m, 2H), 4.84 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.64 -3.59 (m, 2H), 2.64 (s, 3H), 2.60 -2.53 (m, 2H), 2.43 -2.28 (m, 7H), 2.23 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.10 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 1.95 (d, J = 8.3 Hz, 1H), 1.63 (dd, J = 6.9, 1.3 Hz, 6H), 1.59 - 1.42 (m, 1H), 1.14 (s, 3H), 1.07 (s, 9H). MS: [M+H]+ m/z 593.3.
Compuesto A8
A una solución de (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-2-(2-(metilamino)etil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina (17 mg, 0.031 mmol) en CHCl3 Se agregó cloruro de acetilo (4.5 pL, 0.062 mmol) seguido de trietilamina (20 pL, 0.12 mmol). Después de agitar durante 2 h, se agregó solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 3 mL) y la mezcla se agitó durante 1 h. Una vez completada, se agregó agua (3 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 1.5 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se agitó con solución de hidróxido de litio (1 M ac., 2 mL) en DMF/MeOH (2 mL) durante 2 h, antes de agregar agua (3 mL) y la mezcla se extrajo con CHCl3 (3 x 1.5 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-N-(2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etil)-N-metilacetamida como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 17.2 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
Reportado como una mezcla de rotámeros de amida RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (s, 1H), 8.28 - 8.20 (m, 2H), 7.73 - 7.65 (m, 2H), 4.85 (pd, J = 6.8 , 2.2 Hz, 1H), 3.74 -3.75 (m, 2H), 3.39 -3.12 (m, 4H), 2.91 (s, 1.5H), 2.76 (s, 1.5H), 2.65 (s, 3H), 2.44 -2.19 (m, 7H), 2.16 -2.04 (m, 1H), 1.97 (s, 1.5H), 1.94 (s, 1.5H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.55 - 1.43 (m, 1H), 1.15 (s, 1.5H), 1.12 (s, 1.5H). MS: [M+H]+m/z 593.3.
Compuesto A54
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etan-1-ol (30 mg, 0.056 mmol) en DMF (0.6 mL) se agregó hidruro de sodio (5 mg, 0.11 mmol). Después de agitar durante 30 minutos, la mezcla se enfrió a 0 °C y se agregó yodoetano (7 pL, 0.084 mmol). La mezcla se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 15 h. Una vez completada, se agregó agua (3 mL) y la mezcla se extrajo con CHCI3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre S O 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-etoxietil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 15.0 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.65 (s, 1H), 8.41 - 8.29 (m, 1H), 8.15 (s, 1H), 7.96 - 7.52 (m, 3H), 4.81 (p, J = 7.0 Hz, 1H), 4.48 -4.17 (m, 3H), 3.71 -3.51 (m, 2H), 2.63 (s, 3H), 2.44 -2.12 (m, 8H), 2.03 - 1.87 (m, 1H), 1.76 - 1.43 (m, 8H), 1.42 - 1.06 (m, 7H). MS: [M+H]+ m/z 566.3.
Compuesto A12
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (30 mg, 0.056 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 1 mL) se agregó 3,3-difluoroazetidina^HCl (37 mg, 0.28 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (24 mg, 0.11 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 4 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 3 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-NORTE-(5-((2-(2-(3,3-difluoroazetidin-1-il)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 21.8 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.31 (d, J = 1.4 Hz, 1H), 8.25 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 8.22 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.70 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.59 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 3.54 - 3.45 (m, 7H), 2.65 (s, 3H), 2.40 -2.25 (m, 6H), 2.21 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 2.10 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 1.85 - 1.69 (m, 1H), 1.64 (d, J = 6.8 Hz, 6H), 1.45 - 1.35 (m, 1H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 613.3.
Compuesto A9
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (30 mg, 0.056 mmol) en CHCl3/MeOH (2:1, 1 mL) se agregó MgSO4 (40 mg) seguido por 2,2,2-trifluoroetilamina (28 mg, 0.28 mmol). Después de calentar a temperatura ambiente y agitar durante 15 h, se agregó borohidruro de sodio (5 mg, 0.11 mmol) y la reacción se agitó durante 1 h. Una vez completada, se agregaron agua (3 mL) y solución salina (1 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SÍO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-2-(2-((2,2,2-trifluoroetil)amino)etil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 15.0 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.28 - 8.19 (m, 2H), 7.73 -7.66 (m, 2H), 4.85 (p, J = 6.8 Hz, 1H), 3.60 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.16 (q, J = 10.3 Hz, 2H), 2.66 -2.54 (m, 6 H), 2.37 -2.29 (m, 6H), 2.19 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.11 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 1.95 - 1.78 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.8 Hz, 6H), 1.48 (ddd, J = 13.5, 9.7, 6.1 Hz, 1H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 619.3.
Compuesto A10
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (30 mg, 0.056 mmol) en CHCl3/MeOH (2:1, 1 mL) se agregó 3-hidroxi-3-metilazetidina^HCl (35 mg, 0.28 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (24 mg, 0.11 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 4 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 3 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-1-(2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etil)-3-metilazetidin-3-ol como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 15.9 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.29 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.27 - 8.19 (m, 2H), 7.74 -7.65 (m, 2H), 4.85 (hept, J = 6.8 Hz, 1H), 3.65 - 3.38 (m, 4H), 3.35 - 3.10 (m, 2H), 2.86 - 2.59 (m, 5H), 2.40 -2.25 (s, 7H), 2.21 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 2.13 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 1.94 -1.78 (m, 1H), 1.63 (dd, J = 6.8 , 6H), 1.46 - 1.30 (m, 4H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+m/z 607.3.
Compuesto A21
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (30 mg, 0.056 mmol) en CHCl3 (0.7 mL) se agregó MgSO4 (20 mg) seguido de amoniaco (7 M en MeOH, 0.16 mL, 1.12 mmol). Después de calentar a temperatura ambiente y agitar durante 15 h, se agregó borohidruro de sodio (5 mg, 0.11 mmol) y la reacción se agitó durante 4 h. Una vez completada, se agregaron agua (3 mL) y solución salina (1 mL) y la mezcla se extrajo con CHCI3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-aminoetil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 3.9 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.29 (d, J = 1.4 Hz, 1H), 8.26 - 8.19 (m, 2H), 7.74 -7.65 (m, 2H), 4.85 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.61 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 2.66 - 2.57 (m, 5H), 2.39 - 2.26 (m, 7H), 2.18 (d, J= 11.2 Hz, 1H), 2.10 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 2.03 - 1.87 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.47 (dt, J = 13.5, 8.0 Hz, 1H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 537.2.
Compuesto A13
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (60 mg, 0.11 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 2 mL) se agregó 3-fluoroazetidina^HCl (63 mg, 0.56 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (48 mg, 0.22 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 3 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 6 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 4 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeoH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-1-(2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etil)-3-metilazetidin-3-ol como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 44.8 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.69 (d, J = 3.9 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.24 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.22 - 8.17 (m, 1H), 7.74 - 7.65 (m, 2H), 5.09 (dddd, J = 57.7, 10.3, 5.7, 4.7 Hz, 1H), 4.85 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.58 (t, J = 5.1 Hz, 2H), 3.48 - 3.32 (m, 2H), 3.04 - 2.89 (m, 2H), 2.64 (s, 3H), 2.42 - 2.25 (s, 8H), 2.20 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.08 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 1.77 - 1.60 (m, 8H), 1.44 - 1.31 (m, 1H), 1.10 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 595.3.
Compuesto A15
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCl3/MeOH (2:1, 1.5 mL) se agregó (R)-(-)-3-fluoropirrolidina •HCl (53 mg, 0.42 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 3 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar 5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-(((R)-2-(2-((R)-3-fluoropirrolidin-1-il)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 32.3 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.73 - 8.67 (m, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.25 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 8.22 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 7.74 - 7.66 (m, 2H), 5.30 - 5.03 (m, 1H), 4.85 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 3.59 (d, J = 5.1 Hz, 2H), 2.98 -2.59 (m, 6H), 2.55 -2.00 (m, 13H), 1.99 - 1.72 (n, 2H), 1.69 - 1.49 (m, 7H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 609.3.
Compuesto A14
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 1.5 mL) se agregó (S)-(+)-3-fluoropirrolidina •HCl (53 mg, 0.42 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 3 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar 5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-(((R)-2-(2-((S)-3-fluoropirrolidin-1-il)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 33.7 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.31 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.25 (dt, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.22 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.74 - 7.66 (m, 2H), 5.15 (dt, J = 55.9, 5.9 Hz, 1H), 4.85 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 3.60 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 2.86 - 2.71 (m, 2H), 2.65 (s, 3H), 2.53 - 2.17 (m, 11H), 2.17 -1.98 (m, 2H), 1.97 -1.71 (m, 2H), 1.71 -1.51 (m, 8H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 609.3.
Compuesto A6
A una solución de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-14-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCh (1 mL) se agregó 2,2difluoroetilamina (30 j L, 0.42 mmol) seguido por ácido acético (24 j L, 0.84 mmol). Después de 10 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 18 h. Una vez completada, se agregó una solución de bicarbonato de sodio (sat. ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCl3 (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-25 %) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-((2,2-difluoroetil)amino)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 35.5 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.27 - 8.19 (m, 2H), 7.73 -7.66 (m, 2H), 6.01 (tt, J = 56.0, 4.1 Hz, 1H), 4.86 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.60 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 2.93 (t, J = 16.2 Hz, 2H), 2.67 -2.57 (m, 5H), 2.32 (s, 6H), 2.20 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 2.11 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 2.01 - 1.86 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.56 - 1.44 (m, 1H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 601.3.
Compuesto A29
A una solución de 5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-(((R)-2-(2-((R)-3-fluoropirrolidin-1 -il)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2- (30 mg, 0.05 mmol) en cHCh/MeoH (2:1, 1 mL) se agregó formaldehído (37 % en H2O, 5<j>L, 0.06 mmol). Después de 5 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (22 mg, 0.10 mmol) y la reacción se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó una solución de bicarbonato de sodio (sat. ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0 10 %) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-((2,2-difluoroetil)(metil)amino)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 25.2 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.4 Hz, 1H), 8.27 - 8.20 (m, 2H), 7.74 -7.65 (m, 2H), 6.06 (t, J = 55.8 Hz, 1H), 4.85 (hept, J = 6.8 Hz, 1H), 3.67 - 3.54 (m, 2H), 2.83 - 2.60 (s, 6H), 2.49 -2.17 (m, 12H), 2.17 -2.03 (m, 1H), 1.95 - 1.77 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.61 -1.50 (m, 1H), 1.12 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 615.3.
Compuesto A20
A una solución enfriada (0 °C) de 4-benzoil-3-oxomorfolina-2-carboxilato de alilo (2.0 g, 6.9 mmol) en DMF (7 mL) se agregó yodoetano (1.45 mL, 13.8 mmol), seguido de carbonato de cesio (4.5 g, 13.8 mmol). La reacción se agitó durante 2 horas, momento en el que se agregó cloruro de amonio saturado (ac., 20 mL) y agua (20 mL). La mezcla se extrajo con Et2O (3 x 20 mL) y las capas orgánicas combinadas se secaron con Na2SO4 y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre S O 2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-50 %) para proporcionar 4-benzoil-2-etil-3-oxomorfolina-2-carboxilato de alilo (1.7 g, rendimiento del 78 %) como un sólido blanco.
MS: [M+H]+ m/z 317.1.
A un matraz Schlenk equipado con una barra agitadora se agregó Pd(OAc)2 (6 mg, 0.027 mmol), (R)-(p-CF3)3-t-BuPHOX (80 mg, 0.134 mmol) y MTBE (40 mL). la mezcla se agitó durante 30 min, después de lo cual se agregó 4-benzoil-2-etil-3-oxomorfolina-2-carboxilato de alilo (1.7 g, 5.4 mmol) como una solución en MTBE (15 mL). El matraz se selló y se calentó a 55 °C durante 4 días. Una vez completada, la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se ventiló para liberar el CO2 evolucionado. La mezcla se filtró a través de celita, se lavó con EtOAc y se concentró en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-20 %) para proporcionar (R)-2-alil-4-benzoil-2-etilmorfolin-3-ona (1.3 g, rendimiento del 90 %, 98 % de ee) como un sólido blanco.
MS: [M+H]+ m/z 274.1.
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-alil-4-benzoil-2-etilmorfolin-3-ona (1.3 g, 4.8 mmol) en iPrOH (100 mL) se agregó hidróxido de litio (4 M en H2O, 1.8 mL, 7.1 mmol). La reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 8 h. Una vez completada, se agregó MgSO4y la mezcla se filtró a través de celita, se lavó con CH2Cl2, y se concentró en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-30 %) para proporcionar (R)-2-alil-2-etilmorfolin-3-ona (367 mg, rendimiento del 45 %) como un aceite incoloro.
MS: [M+H]+ m/z 170.1.
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-alil-2-etilmorfolin-3-ona (367 mg, 2.2 mmol) en THF (11 mL) se agregó hidruro de litio y aluminio (250 mg, 6.5 mmol). La mezcla se calentó a temperatura ambiente y a 60 °C durante 2 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a 0 °C y se agregó Et2O (11 mL). Se agregó lentamente agua (0.3 mL), seguida de una solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 0.3 mL), y la mezcla se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 15 min. La mezcla se secó con MgSO4, se filtró través de celita y se concentró en vacío para proporcionar (R)-2-alil-2-etilmorfolina (336 mg) como aceite incoloro. El compuesto se utilizó inmediatamente sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 156.2.
A una solución de (R)-2-alil-2-etilmorfolina (336 mg, 2.2 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (739 mg, 1.8 mmol) en DMSO (18 mL) se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (770 mg, 3.6 mmol), seguido de ácido acético (1.1 mL, 18 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a 0°C y se agregó una solución acuosa de hidróxido de sodio (1 M ac., 40 mL), seguida de agua (15 mL). La mezcla heterogénea resultante se agitó durante 1 h, luego se filtró para recoger el sólido, se enjuagó con agua fría y finalmente se liofilizó para producir (R)-N-(5-((2-alil-2-etilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (862 mg) como un sólido gris. El compuesto se utilizó sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 548.3.
A una solución de (R)-N-(5-((2-alil-2-etilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metiMH-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (862 mg, 1.6 mmol) en THF/H2O (2:1, 39 mL) se agregó tetróxido de osmio (4 % en H2O, 0.5 mL, 0.08 mmol), seguido de peryodato de sodio (1.00 g, 4.7 mmol). La reacción se sonicó durante 2.5 h y luego se agitó durante 4.5 h. Una vez completada, se agregó tiosulfato de sodio saturado (ac., 80 mL), seguido de solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 50 mL), y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 50 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío para proporcionar (R)-2-(2-etil-4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)morfolin-2-il)acetaldehído (815 mg) como un sólido negro. El compuesto se utilizó sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 550.3.
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(2-etil-4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)morfolin-2-il)acetaldehído (70 mg, 0.13 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 2 mL) se agregó dimetilamina (2 M en THF, 0.64 mL, 1.3 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (55 mg, 0.25 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 6 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2CI2 con MeOH NH3 al 2% =0-40 %) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-(dimetilamino)etil)-2-etilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 25.3 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.27 - 8.19 (m, 2H), 7.73 -7.65 (m, 2H), 4.85 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 3.59 (m, 2H), 2.65 (s, 3H), 2.42 - 2.03 (m, 17H), 1.85 - 1.71 (m, 1H), 1.70 -1.51 (m, 8H), 1.49 - 1.36 (m, 1H), 0.74 (t, J = 7.5 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 579.3.
Compuesto A3
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (303 mg, 0.57 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 7 mL) se agregó dietilamina (0.3 mL, 2.83 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (242 mg, 1.14 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 14 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 10 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (S)-N-(5-((2-(2-(dietilamino)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 230 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.9 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.24 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.21 (dd, J = 2.4, 0.8 Hz, 1H), 7.74 - 7.65 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.8 Hz, 1H), 3.60 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 2.71 - 2.51 (m, 4H), 2.47 - 2.26 (m, 12H), 2.23 (d, J = 11.0 Hz, 1H), 2.08 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 1.87 - 1.72 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.53 (ddd, J= 13.3, 10.3, 5.9 Hz, 1H), 1.11 (s, 3H), 0.90 (t, J = 7.1 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 593.3.
Compuesto A16
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 1.5 mL) se agregó pirrolidina (35 pL, 0.42 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCI3 (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2% = 0-40%) para proporcionar (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-2-(2-(pirrolidin-1-il)etil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 29.7 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.24 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.21 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.74 - 7.65 (m, 2H), 4.85 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.59 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 2.64 (s, 4H), 2.47 - 2.26 (m, 12H), 2.23 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.09 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 1.99 - 1.78 (m, 1H), 1.69 - 1.53 (m, 11H), 1.11 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 591.3.
Compuesto A11
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 1.5 mL) se agregó 2-metilaziridina (30 pL, 0.42 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2 % = 0-40%) para proporcionar 5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-(((2R)-2-metil-2-(2-(2-metilaziridin-1-il)etil)morfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 15.1 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.28 - 8.14 (m, 2H), 7.81 -7.60 (m, 2H), 5.80 (ddt, J = 17.3, 10.3, 5.8 Hz, 1H), 5.13 (dq, J = 17.2, 1.7 Hz, 1H), 5.02 (ddt, J = 10.2, 2.4, 1.3 Hz, 1H), 4.85 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 3.60 (t, J = 5.0 Hz, 2H), 3.12 (dt, J = 5.9, 1.5 Hz, 2H), 2.70 - 2.60 (m, 4H), 2.47 (m, 2H), 2.38 -2.27 (m, 7H), 2.19 (d, J = 11.0 Hz, 1H), 2.10 (d, J = 11.0 Hz, 1H), 1.98 - 1.77 (m, 1H), 1.63 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.50 (ddd, J = 13.6, 9.9, 6.1 Hz, 1H), 1.11 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 577.3.
Compuesto A17
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCl3/MeOH (2:1, 1.5 mL) se agregó azetidina^HCl (40 mg, 0.42 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2% = 0-40%) para proporcionar (R)-N-(5-((2-(2-(azetidin-1-il)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 29.7 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.24 (dd, J = 8.6 , 0.9 Hz, 1H), 8.22 - 8.19 (m, 1H), 7.73 - 7.65 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.58 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 3.15 - 3.02 (m, 4H), 2.65 (s, 3H), 2.32 (s, 8H), 2.20 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.08 (d, J = 11.3 Hz, 1H), 1.92 (p, J = 6.9 Hz, 2H), 1.75 -1.57 (m, 8H), 1.40 - 1.29 (m, 1H), 1.09 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 577.3.
Compuesto A18
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (45 mg, 0.084 mmol) en CHCh/MeOH (2:1, 1.5 mL) se agregó 3-metoxi-3-metilazetidina^HCl (58 mg, 0.42 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (36 mg, 0.17 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 2 h. Una vez completada, se agregó solución de hidróxido de sodio (0.5 M ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-40 %) para proporcionar (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-(2-(3-metoxi-3-metilazetidin-1-il)etil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 32.8 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 88.70 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.25 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.22 - 8.19 (m, 1H), 7.74 - 7.65 (m, 2H), 4.85 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.58 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 3.11 - 3.04 (m, 5H), 2.83 (d, J = 7.1 Hz, 2H), 2.64 (s, 3H), 2.43 - 2.25 (m, 8H), 2.21 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.07 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 1.77 - 1.58 (m, 7H), 1.44 - 1.26 (m, 5H), 1.10 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 621.3.
Compuestos A52 y A53
A un matraz que contiene (S)-2-alil-4-benzoil-2-metilmorfolin-3-ona (1.13 g, 4.4 mmol) se agregó PdCh(CH3CN)3 (34 mg, 0.13 mmol) y p-benzoquinona (0.71 g, 6.5 mmol). El matraz se evacuó y se volvió a llenar con gas nitrógeno 3 veces antes se agregaron t-BuOH/MeOH (1:1, 22 mL) y H2O (0.2 mL). La reacción se calentó a 50 °C y se agitó durante 4 h. Al completar, la mezcla se enfrió a temperatura ambiente y se eliminó el solvente en vacío. Luego se agregó una solución de carbonato de sodio (1 M ac., 100 mL) y la mezcla se extrajo utilizando EtOAc (3 x 100 mL). Las capas orgánicas combinadas se secaron con Na2SO4 y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-30 %) para proporcionar (S)-4-benzoil-2-metil-2-(2-oxopropil)morfolin-3-ona (820 mg, rendimiento del 68 %) como un aceite incoloro.
MS: [M+H]+ m/z 276.1.
A una solución enfriada (0 °C) de (S)-4-benzoil-2-metil-2-(2-oxopropil)morfolin-3-ona (43 mg, 0.16 mmol) en THF (1.6 mL) se agregó hidruro de litio y aluminio (59 mg, 1.6 mmol). La mezcla se calentó a temperatura ambiente y a 50 °C durante 22 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a 0 °C y se agregó Et2O (2 mL). Se agregó lentamente agua (0.071 mL), seguida de una solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 0.071 mL), y la mezcla se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 15 min. La mezcla se secó con MgSO4 se filtró a través de celita y se concentró en vacío para proporcionar 1-((S)-2-metilmorfolin-2-il)propan-2-ol (25 mg) como un aceite incoloro y mezcla de diastereoisómeros en el alcohol. El compuesto se utilizó inmediatamente sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 160.1.
A una solución de 1-((S)-2-metilmorfolin-2-il)propan-2-ol (25 mg, 0.16 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (26 mg, 0.06 mmol) en DMSO (1.7 mL) se le agregó triacetoxiborohidruro de sodio (41 mg, 0.19 mmol), seguido de ácido acético (37 pL, 0.64 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 16 h. Una vez completada, la mezcla se filtró y se purificó utilizando HPLC preparativa (gradiente de elución de H2O 0.25 % de TFA con MeCN = 10-24 %) para producir 1-((S)-4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)propan-2-ol (8 mg de diastereómero mayor, 6 mg de diastereómero menor) como sólidos de color marrón claro.
Espectros de base libre
Compuesto A52: Pico 1, diastereómero menor
RMN 1H (400 MHz, Cloroformo-d) 88.47 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.44 (dd, J = 8.6, 0.8 Hz, 1H), 8.36 (s, 1H), 8.31 -8.26 (m, 1H), 8.21 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.82 (dd, J = 11.6, 1.4 Hz, 1H), 7.72 (dd, J = 8.6, 2.3 Hz, 1H), 4.76 (hept, J = 7.0 Hz, 1H), 4.25 (dtt, J = 12.8, 6.6, 3.2 Hz, 1H), 4.09 (s, 1H), 3.86 -3.77 (m, 2H), 3.45 (q, J = 12.2 Hz, 2H), 2.72 (s, 3H), 2.55 (dt, J = 10.6, 3.9 Hz, 1H), 2.41 - 2.29 (m, 2H), 2.15 (d, J = 11.2 Hz, 1H), 1.90 (dd, J = 14.7, 10.5 Hz, 1H), 1.74 (d, J = 7.0 Hz, 6H), 1.40 (s, 3H), 1.32 (dd, J = 14.5, 1.4 Hz, 1H), 1.17 (d, J = 6.1 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 552.3.
Compuesto A53: Pico 1, diastereómero mayor
RMN 1H (400 MHz, Cloroformo-d) 88.71 - 8.14 (m, 5H), 7.82 (dd, J = 11.5, 1.2 Hz, 1H), 7.73 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 4.76 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 4.23 -4.10 (m, 1H), 3.88 (ddd, J = 12.2, 9.4, 2.8 Hz, 1H), 3.75 (dt, J = 11.9, 3.4 Hz, 1H), 3.56 (d, J = 13.1 Hz, 1H), 3.39 (d, J = 13.2 Hz, 1H), 2.72 (s, 3H), 2.59 (d, J = 11.3 Hz, 1H), 2.44 (d, J = 11.4 Hz, 1H), 2.38 -2.22 (m, 2H), 1.86 - 1.68 (m, 8H), 1.52 (dd, J = 14.9, 1.6 Hz, 1H), 1.35 (s, 3H), 1.16 (d, J = 6.2 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 552.3.
C o m p u e s to A 47
A una solución enfriada (0 °C) de 4-benzoil-1-(4-metoxibencil)-3-oxopiperazina-2-carboxilato de alilo (1.2 g, 3.0 mmol) en THF (30 mL) se agregó hidruro de sodio (dispersión en aceite mineral al 60 %, 0.14 g, 3.5 mmol). Después de 45 min de agitación, se agregó yodometano (0.3 mL, 4.4 mmol) y la reacción se calentó a temperatura ambiente, agitando durante 20 h. Una vez completada, se agregaron cloruro de amonio acuoso saturado (30 mL) y bicarbonato de sodio acuoso saturado (30 mL). La mezcla se extrajo con CH2Ch (2 x 50 mL) y las capas orgánicas combinadas se secaron con Na2SO4 y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-50 %) para proporcionar 4-benzoil-1-(4-metoxibencil)-2-metil-3-oxopiperazina-2-carboxilato de alilo (141 mg, rendimiento del 11 %) como un aceite incoloro.
MS: [M+H]+ m/z 423.2.
A un matraz Schlenk equipado con una barra agitadora se agregó Pd(OAc)2 (3.7 mg, 0.017 mmol), (S)-(p-CF3)3-t-BuPHOX (25 mg, 0.041 mmol) y THF (7 mL). La mezcla se agitó durante 30 min, después de lo cual se agregó 4-benzoil-1-(4-metoxibencil)-2-metil-3-oxopiperazina-2-carboxilato de alilo (141 mg, 0.33 mmol) como una solución en THF (4 mL). El matraz se selló y se calentó a 50 °C durante 3 días. Una vez completada, la reacción se enfrió a temperatura ambiente y se ventiló para liberar el CO2 evolucionado. La mezcla se filtró a través de celita, se lavó con EtOAc y se concentró en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de hexanos con EtOAc = 0-30 %) para proporcionar (S)-3-alil-1-benzoil-4-(4-metoxibencil)-3-metilpiperazin-2-ona (78 mg, rendimiento del 62 %, 90 % de ee) como un aceite incoloro.
MS: [M+H]+ m/z 379.2.
A una solución enfriada (0 °C) de (S)-3-alil-1-benzoil-4-(4-metoxibencil)-3-metilpiperazin-2-ona (78 mg, 0.21 mmol) en THF (2.2 mL) se agregó hidruro de litio y aluminio (78 mg, 2.1 mmol). La mezcla se calentó a temperatura ambiente y se calentó a 50 °C durante 18 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a 0 °C y se agregó Et2O (3 mL). Se agregó lentamente agua (0.1 mL), seguida de una solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 0.1 mL), y la mezcla se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 15 min. La mezcla se secó con MgSO4 se filtró a través de celita y se concentró en vacío para proporcionar (S)-2-alil-4-bencil-1-(4-metoxibencil)-2-metilpiperazina (18 mg) como un aceite incoloro. El compuesto se utilizó inmediatamente sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 351.2.
A una solución de (S)-2-alil-4-bencil-1-(4-metoxibencil)-2-metilpiperazina (18 mg, 0.051 mmol) en EtOH/CH2Cl2 (4:1, 1.25 mL) se agregó 10 % de paladio sobre carbono (10 mg). El recipiente de reacción se colocó en una bomba de presión y se cargó con 1000 psi de gas hidrógeno. El sistema se calentó a 60 °C durante 2 días. Una vez completada la mezcla se filtró a través de celita, se lavó con CH2Ch/MeOH (1:1) y se concentró en vacío para proporcionar (S)-2-metil-2-propilpiperazina (7 mg) como aceite incoloro. El compuesto se utilizó inmediatamente sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 143.2.
A una solución de (S)-2-metil-2-propilpiperazina (7 mg, 0.05 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (10 mg, 0.025 mmol) en DMSO (0.5 mL) se le agregó triacetoxiborohidruro de sodio (16 mg, 0.075 mmol), seguido de ácido acético (14<j>L, 0.25 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se filtró y se purificó utilizando HPLC preparativa (gradiente de elución de H20 0.1 % de AcOH con MeCN = 10-50%) para proporcionar (S)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((3-metil-3-propilpiperazin-1 -il)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina (10 mg) como un sólido blanco.
Espectros de base libre
RMN 1H (400 MHz, Cloroformo-d) 88.46 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.42 (dd, J = 8.6, 0.8 Hz, 1H), 8.31 - 8.24 (m, 2H), 8.23 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.85 - 7.78 (m, 1H), 7.72 (dd, J = 8.6, 2.3 Hz, 1H), 4.76 (hept, J = 7.0 Hz, 1H), 3.45 (s, 2H), 2.95 (d, J = 5.4 Hz, 2H), 2.72 (s, 3H), 2.52 - 2.33 (m, 2H), 2.28 - 2.10 (m, 2H), 1.74 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.68 - 1.49 (m, 1H), 1.47 -1.19 (m, 4H), 1.13 (s, 3H), 0.93 (t, J = 6.9 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 535.3.
Compuesto B3
A una solución enfriada (0 °C) de (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acetaldehído (B2) (30 mg, 0.056 mmol) en tBuOH/MeCN (1:1, 1 mL) se agregó 2-metil-2-buteno (0.12 mL, 1.12 mmol), seguido de la adición gota a gota de una solución de clorito de sodio (50 mg, 0.56 mmol) y fosfato monosódico de sodio (87 mg, 0.56 mmol) en agua (1 mL). La reacción se calentó a temperatura ambiente y se agitó durante 5 h. Una vez completada, se agregó agua (1 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío para proporcionar ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético
(31 mg) como un sólido marrón. El compuesto se utilizó sin purificación adicional.
MS: [M+H]+ m/z 552.3.
C o m p u e s to A 55
A una solución enfriada (0 °C) de ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético (31 mg, 0.056 mmol) en DMF (2.5 mL) se agregó N,N-diisopropiletilamina (50<j>L, 0.28 mmol), seguido de HATU (32 mg, 0.084 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó dimetilamina (2 M en THF, 84 j L, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 1.5 h. Una vez completada, se agregó bicarbonato de sodio saturado (ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCl3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)-N,N-dimetilacetamida como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 7.2 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato (señales ampliadas por rotámeros de amida)
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6 ) 8 10.42 (s, 1H), 8.70 (d, J = 3.6 Hz, 1H), 8.36 (s, 1H), 8.29 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 8.23 (s, 1H), 7.86 (d, J = 8.9 Hz, 1H), 7.66 (d, J = 12.0 Hz, 1H), 4.80 (hept, J = 6.9 Hz, 1H), 4.31 (d, J = 22.5 Hz, 2H), 3.85 - 3.74 (m, 2H), 3.20 - 3.04 (m, 2H) 2.96 - 2.89 (m, 3H), 2.77 - 2.69 (m, 3H), 2.63 - 2.52 (m, 5H), 2.23 (s, 3H), 1.57 (d, J = 6.8 Hz, 6H), 1.36 (s, 2H), 1.28 - 1.06 (m, 3H). MS: [M+H]+ m/z 579.3.
Compuesto A56
A una solución enfriada (0 °C) de ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético (31 mg, 0.056 mmol) en DMF (2.5 mL) se agregó N,N-diisopropiletilamina (50 j L, 0.28 mmol), seguido de Ha Tu (32 mg, 0.084 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó 3,3-difluoroazetidina^HCl (22 mg, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 1.5 h. Una vez completada, se agregó bicarbonato de sodio saturado (ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCl3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2% = 0-20%) para proporcionar (R)-1-(3,3-difluoroazetidin-1-il)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etan-1-ona como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 7.2 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato (señales ampliadas por rotámeros de amida)
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 510.43 (s, 1H), 8.70 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.36 (s, 1H), 8.28 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 8.23 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.92 - 7.82 (m, 1H), 7.72 - 7.62 (m, 1H), 4.80 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 4.65 - 4.45 (m, 2H), 4.43 - 4.12 (m, 4H), 3.88 - 3.71 (m, 2H), 3.25 - 3.08 (m, 2H), 3.08 - 2.74 (m, 2H), 2.60 (s, 3H), 2.49 - 2.36 (m, 2H), 2.23 (s, 3H), 1.57 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.17 (d, J = 6.1 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 627.3.
Compuesto A57
A una solución enfriada (0 °C) de ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético (31 mg, 0.056 mmol) en DMF (2.5 mL) se agregó N,N-diisopropiletilamina (50 pL, 0.28 mmol), seguido de HATU (32 mg, 0.084 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó dietilamina (18 pL, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 1 h. Una vez completada, se agregó bicarbonato de sodio saturado (ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCh (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2% = 0-20%) para proporcionar (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)-N,N-dietilacetamida como un aceite de color tostado. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 10.4 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato (señales ampliadas por rotámeros de amida)
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6 ) 510.45 (s, 1H), 8.70 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.37 (s, 1H), 8.33 - 8.18 (m, 2H), 7.93 - 7.82 (m, 1H), 7.67 (d, J = 11.9 Hz, 1H), 4.80 (p, J = 7.0 Hz, 1H), 4.44 -4.18 (m, 2H), 3.89 -3.70 (m, 2H), 3.68 - 3.58 (m, 2H), 3.23 - 3.09 (m, 4H), 3.06 - 2.77 (m, 2H), 2.60 (s, 3H), 2.56 - 2.43 (m, 2H), 2.23 (s, 3H), 1.57 (d, J = 6.9, 6H), 1.16 (d, J = 6.6 Hz, 3H), 1.06 - 0.98 (m, 3H), 0.96 - 0.86 (m, 3H). MS: [M+H]+ m/z 579.3.
Compuesto A58
A una solución enfriada (0 °C) de ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético (31 mg, 0.056 mmol) en DMF (2.5 mL) se agregó N,N-diisopropiletilamina (50 pL, 0.28 mmol), seguido de H<a>T<u>(32 mg, 0.084 mmol). Después de 15 min de agitación, se agregó azetidina^HCl (16, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 1 h. Una vez completada, se agregó bicarbonato de sodio saturado (ac. 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCl3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Cl2 con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar (R)-1 -(azetidin-1 -il)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)etan-1-ona como un aceite de color naranja pálido. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 6.7 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato (señales ampliadas por rotámeros de amida)
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6 ) 810.46 (s, 1H), 8.71 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.43 -8.16 (m, 3H), 7.87 (d, J = 8.8 Hz, 1H), 7.68 (d, J = 12.0 Hz, 1H), 4.81 (p, J = 6.8 Hz, 1H), 4.45 -4.18 (m, 2H), 4.13 -4.01 (m, 2H), 3.86 -3.70 (m, 4H), 3.49 - 3.33 (m, 2H), 3.25 - 3.12 (m, 2H), 3.05 - 2.77 (m, 2H), 2.60 (s, 3H), 2.24 (s, 3H), 2.14 - 2.03 (m, 2H), 1.57 (d, J = 6.7 Hz, 6H), 1.16 (d, J = 6.0 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 591.3.
Compuesto A59
A una solución enfriada (0 °C) de ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético (31 mg, 0.056 mmol) en DMF (2.5 mL) se agregó N,N-diisopropiletilamina (50 pL, 0.28 mmol), seguido de HATU (32 mg, 0.084 mmol).
Después de 15 min de agitación, se agregó metilamina (2 M en MeOH, 84 pL, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 1 h. Una vez completada, se agregó bicarbonato de sodio saturado (ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCl3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)-N-metilacetamida como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 8.9 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato (señales ampliadas por rotámeros de amida)
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6) 8 10.41 (s, 1H), 8.70 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.36 (s, 1H), 8.29 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 8.23 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.86 (d, J = 9.2 Hz, 1H), 7.66 (dd, J = 11.9, 1.3 Hz, 1H), 4.80 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 4.42 - 4.20 (m, 2H), 3.86 - 3.70 (m, 2H), 3.69 - 3.51 (m, 2H), 3.07 - 2.43 (m, 2H), 2.59 (s, 3H), 2.54 - 2.43 (m, 4H), 2.34 -2.19 (m, 6H), 1.57 (d, J = 6.8 Hz, 6H), 1.14 (d, J = 22.9 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 565.3.
Compuesto A60
A una solución enfriada (0 °C) de ácido (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)acético (31 mg, 0.056 mmol) en DMF (2.5 mL) se agregó N,N-diisopropiletilamina (50 pL, 0.28 mmol), seguido de H<a>T<u>(32 mg, 0.084 mmol).
Después de 15 min de agitación, se agregó pirrolidina (15 j L, 0.17 mmol) y la reacción se agitó durante 1 h. Una vez completada, se agregó bicarbonato de sodio saturado (ac., 5 mL) y la mezcla se extrajo con CHCI3 (3 x 2 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2% = 0-20%) para proporcionar (R)-2-(4-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-metilmorfolin-2-il)-1-(pirrolidin-1-il)etan-1-ona como un aceite de color naranja claro. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 7.9 mg de la sal mesilato como un sólido de color tostado.
Espectros de la sal de mesilato (señales ampliadas por rotámeros de amida)
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 8 10.39 (s, 1H), 8.69 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.36 (s, 1H), 8.29 (d, J = 8.6 Hz, 1H), 8.22 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.85 (d, J = 8.9 Hz, 1H), 7.65 (d, J = 11.9 Hz, 1H), 4.79 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 4.41 -4.20 (m, 2H), 3.87 - 3.72 (m, 2H), 3.69 - 3.55 (m, 2H), 3.23 - 3.08 (m, 4H), 3.04 - 2.76 (m, 2H), 2.59 (s, 3H), 2.52 -2.46 (m, 2H), 2.23 (s, 3H), 1.86 - 1.74 (m, 2H), 1.74 - 1.63 (m, 2H), 1.57 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.17 (s, 3H). MS:
[M+H]+ m/z 605.3.
Ejemplo 2: Síntesis de los compuestos A43 y A44
Se cargó un matraz de fondo redondo seco con 2,2-dimetilpiperazina (896 mg, 7.8 mmol) seguido de diclorometano (40 mL) y trietilamina (1.63 mL, 11.8 mmol). El matraz de reacción se enfrió a -78 °C y se inyectó cloroformiato de bencilo (1.23 mL, 8.6 mmol), se dejó calentar la reacción a temperatura ambiente durante tres horas. Se eliminó el solvente en vacío y la reacción se purificó utilizando cromatografía en gel de sílice (0-10 % metanol/diclorometano). La fracción mayor se recolectó para producir, después de la eliminación del solvente 3,3-dimetilpiperazina-1-carboxilato de bencilo (1.96 g, cuant.). MS: [M+H]+ m/z 249.
Se disolvió 3,3-dimetilpiperazina-1-carboxilato de bencilo (3.77 g, 15.0 mmol) en diclorometano (75 mL) bajo nitrógeno y se inyectó trietilamina (6.2 mL, 45.0 mmol), seguido de di-tert-dicarbonato de butilo (3.98 g, 18.2 mmol). Después de dos horas, la conversión fue incompleta según el análisis por TLC y se agregó una segunda porción de dicarbonato de tert-butilo (2.00 g, 9.1 mmol) y la reacción se agitó durante 16 horas. La reacción se concentró en vacío y se purificó por cromatografía en gel de sílice (acetato de etilo/hexanos 0-100%) para proporcionar 2,2-dimetilpiperazina-1,4-dicarboxilato de 4-bencilo 1 -(tert-butilo) como un aceite transparente (4.95 g, 95 %). MS: [M+H]+ m/z 349.
Un matraz que contenía 2,2-dimetilpiperazina-1,4-dicarboxilato de 4-bencilo 1 -(tert-butilo) (4.95 g, 14.2 mmol) se cargó con acetato de etilo (100 mL), seguido de paladio sobre carbono (10 %, 376 mg). Se burbujeó gas hidrógeno a través de la mezcla de reacción durante 10 minutos y se continuó agitando bajo una atmósfera de hidrógeno durante 5 horas. En este momento el análisis por TLC indicó que la reacción se había completado (diclorometano/metanol al 10 %). La reacción se filtró a través de celita y el filtrado se concentró en vacío para producir 2,2-dimetilpiperazina-1-carboxilato de tert-butilo (3.01 g, 99 %) como un aceite ligeramente amarillo. MS: [M+H]+ m/z 215.
C o m p u e s to A 44
Se disolvió 2,2-dimetilpiperazina-1-carboxilato de tert-butilo (352 mg, 1.6 mmol) en dimetilsulfóxido (16.5 mL) y ácido acético (0.45 mL). Se agregó 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (336 mg, 0.8 mmol) y la reacción se agitó durante 30 minutos, seguido de la adición de triacetoxiborohidruro de sodio (694 mg, 3.3 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se calentó durante 17 horas antes de enfriar a temperatura ambiente y verterla en una mezcla de cloroformo e hidróxido de sodio 1 N (porciones de 100 mL). La fase orgánica se separó, se secó sobre sulfato de sodio, se filtró y se concentró hasta secado. El producto crudo se disolvió en diclorometano y ácido trifluoroacético (porciones de 5 mL) y se agitó durante 2 horas. La reacción se concentró en vacío y se disolvió en dimetilsulfóxido. Después de la filtración, el filtrado se purificó mediante HPLC de fase inversa (acetonitrilo/agua al 10-60%, ácido trifluoroacético al 0.25% durante 15 minutos). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron en el Genevac para producir un sólido blanco que se sometió a partición entre acetato de etilo y bicarbonato de sodio saturado para producir después de la concentración de la fase orgánica, N-(5-((3,3-dimetilpiperazin-1-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (241 mg, 58 %) como un sólido blanco. La sal de mesilato se preparó mediante tratamiento con una solución de acetonitrilo del compuesto con ácido metanosulfónico acuoso y luego se congeló la solución y se concentró hasta producir un sólido blanco en el liofilizador. RMN 1H (500 MHz, Metanol-d4) 88.60 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.40 (dd, J = 8.6, 0.8 Hz, 1H), 8.37 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.28 (dd, J = 2.4, 0.8 Hz, 1H), 7.89 -7.82 (m, 2H), 5.01 -4.96 (m, 1H), 3.65 (s, 2H), 3.32 (t, J = 5.2 Hz, 2H), 2.76 (s, 5H), 2.52 (s, 2H), 1.78 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.46 (s, 6H). MS: [M+H]+ m/z 507.
Compuesto A43
Un matraz que contenía la base libre N-(5-((3,3-dimetilpiperazin-1-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (63 mg, 0.1 mmol) se disolvió en cloroformo:metanol (9:1, 1 mL) y se agregó formaldehído al 37% (0.014 mL, 0.2 mmol) seguido de triacetoxiborohidruro de sodio (87.3 mg, 0.4 mmol). Después de dos horas, la reacción completa se vertió en diclorometano e hidróxido de sodio (porciones de 50 mL, 1 N). La fase orgánica se separó y se concentró en vacío. El residuo se purificó utilizando HPLC de fase inversa (acetonitrilo/agua al 10-50 % ácido acético a 0.25 % durante 15 minutos). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron en el Genevac y el residuo se disolvió en acetonitrilo y se trató con ácido metanosulfónico (1.05 equiv.). La solución resultante se congeló y se concentró en el liofilizador para proporcionar 5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((3,3,4-trimetilpiperazin-1 -il)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina (23 mg, 42% ) como la sal mesilato correspondiente.
RMN 1H (500 MHz, M e tano l^) 88.68 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.38 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.31 (d, J = 2.1 Hz, 1H), 8.25 - 8.15 (s, 1H), 8.00 (s, 1H), 7.93 - 7.84 (m, 1H), 4.99 (q, J = 6.9 Hz, 1H), 3.68 (q, J = 13.5 Hz, 2H), 3.50 -3.40 (m, 2H), 3.15 (d, J = 12.7 Hz, 1H), 2.92 (t, J = 14.0 Hz, 1H), 2.87 (s, 3H), 2.76 (s, 3H), 2.75 (s, 3H), 2.51 (s, 1H), 2.35 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 1.78 (d, J = 6.9 Hz, 6H), 1.51 (s, 3H), 1.44 (s, 3H). MS: [M+H]+ m/z 521.
Ejemplo 3: Síntesis de los compuestos A30, A31, A34, A37, A39 y A41
Una solución de tert-butil-8-oxo-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato (450 mg) en metanol se purificó por SFC. La separación retornó (S)-8-oxo-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tert-butilo (160.5 mg) y (R)-8-oxo-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tert-butilo (209.3 mg) como sólidos blancos. Las reacciones siguientes se llevaron a cabo en ambos enantiómeros, pero se informa el rendimiento y el procedimiento exacto a partir del primer pico.
Se cargó un matraz de fondo redondo con (S)-8-oxo-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tertbutilo (160.5 mg, 0.63 mmol) y se inyectó tetrahidrofurano para producir una solución transparente (4 mL). Se inyectó borano en tetrahidrofurano bajo una atmósfera de nitrógeno (1 M, 1.9 mL, 1.9 mmol) y la reacción se agitó a temperatura ambiente durante tres horas. El solvente se eliminó bajo presión reducida y el residuo se disolvió en metanol (5 mL). A la solución resultante se agregó paladio sobre carbón (10%, 10 mg) y la suspensión se agitó durante una hora y se filtró a través de celita. La torta de filtro se lavó con diclorometano. La concentración en vacío dio (S)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tert-butilo (112 mg, 73 %). MS: [M+H]+ m/z 243.
Compuesto A41
Se cargó un matraz de fondo redondo con (S)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tert-butilo (112 mg, 0.45 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (226 mg, 0.55 mmol). Se inyectaron dimetilsulfóxido (10 mL) y ácido acético (1 mL) bajo nitrógeno y la reacción se calentó a 60 °C durante un período de 18 horas. La reacción se dejó enfriar y se diluyó con hidróxido de sodio (1 N ac., 20 mL) y agua (100 mL). Se formó un precipitado blanco turbio que se agitó durante una hora y luego se filtró. El sólido blanco se lavó con varias porciones de agua (5 mL cada una) y se secó en el liofilizador para producir (S)-9-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tert-butilo (265 mg, 90 %).
RMN 1H (500 MHz, DMSO-d6) 88.71 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.31 (s, 1H), 8.26 (d, J = 8.5 Hz, 1H), 8.21 (d, J = 2.2 Hz, 1H), 7.73 -7.67 (m, 2H), 4.86 (p, J = 7.0 Hz, 1H), 3.74 -3.58 (m, 4H), 3.32 -3.11 (m, 4H), 2.66 (s, 3H), 2.50 - 2.22 (m, 4H), 1.99 (d, J = 11.8 Hz, 1H), 1.82 (s, 1H), 1.65 (dd, J = 7.0, 3.1 Hz, 6H), 1.38 (s, 9H). MS: [M+H]+ m/z 635.
Compuesto A34
(S)-9-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de tert-butilo (248 mg, 0.46 mmol) se disolvió en cloroformo (6 mL) y se agregó ácido trifluoroacético mediante una pipeta (3 mL). La solución de color naranja resultante se agitó durante treinta minutos y se concentró para producir (R)-N-(5-((6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como una sal de trifluoroacetato que se utilizó sin purificación adicional (301 mg, cuant.).
Una porción de esta muestra se liberó con bicarbonato de sodio acuoso y diclorometano y se purificó por HPLC preparativa (acetonitrilo/agua al 10-35% ácido acético al 0.25% durante 15 minutos). Esto produjo una muestra analítica (3.9 mg) que se utilizó para análisis por RMN y en ensayos bioquímicos y basados en células.
RMN 1H (500 MHz, DMSO-da) 88.70 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.30 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 8.28 - 8.18 (m, 2H), 7.75 -7.64 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.58 - 3.55 (m, 2H), 3.46 (m, 2H), 2.77 (d, J = 11.2 Hz, 2H), 2.66 - 2.60 (m, 5H), 2.42 - 2.33 (m, 2H), 2.28 (d, J = 12.8 Hz, 1H), 1.76 (s, 1H), 1.68 - 1.59 (m, 6H). MS: [M+H]+
m/z 535.
Compuesto A39
2,2,2-trifluoroacetato de (R)-N-(5-((6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (32 mg, 0.049 mmol) se disolvió en dimetilformamida (3 mL) y se trató con formaldehído (0.10 mL, 37% en agua, 1.68 mmol) seguido de triacetoxiborohidruro de sodio (32 mg, 0.15 mmol). La reacción se agitó durante tres horas y se filtró a través de celita. El filtrado se purificó directamente por HPLC (acetonitrilo/agua la 10-35 % ácido acético al 0.25 % durante 15 minutos). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron en el liofilizador para producir (R)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-metil-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina (4.7 mg, 18 %) como un sólido blanco.
RMN 1H (500 MHz, DMSO-d6) 88.71 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.31 (d, J = 1.2 Hz, 1H), 8.27 - 8.21 (m, 2H), 7.74 -7.67 (m, 2H), 4.87 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.81 -3.48 (m, 4H), 2.70 -2.65 (m, 5H), 2.50 -2.27 (m, 5H), 2.17 (s, 3H), 1.74 (q, J = 7.0, 6.3 Hz, 1H), 1.65 (d, J = 6.8 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 549.
Compuesto A37
Se disolvió 2,2,2-trifluoroacetato de (R)-N-(5-((6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (32 mg, 0.049 mmol) en dimetilformamida (3 mL) y se trató con trietilamina (0.05 mL, 0.36 mmol) y cloruro de acetilo (10 pL, 0.18 mmol). La reacción se agitó durante tres horas y se detuvo con varias gotas de metanol. Después de la filtración a través de celita, el filtrado se purificó mediante HPLC de fase inversa (acetonitrilo/agua al 10-60 % ácido acético al 0.25 % durante 15 minutos). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron en el liofilizador para producir (S)-1-(9-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-2-il)etan-1-ona (4.0 mg, 14 %) como un sólido blanco.
RMN 1H (500 MHz, DMSO-d6) 88.71 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.33 - 8.28 (m, 1H), 8.28 - 8.20 (m, 2H), 7.76 - 7.65 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.76 -3.50 (m, 4H), 2.66 (s, 3H), 2.50 -2.25 (m, 4H), 2.14 -1.95 (m, 2H), 1.94 - 1.90 (m, 3H), 1.67 - 1.63 (m, 6H). MS: [M+H]+ m/z 577.
C o m p u e s to A31
El 2,2,2-trifluoroacetato de (R)-N-(5-((6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (32 mg, 0.049 mmol) se disolvió en dimetilformamida (3 mL) y se trató con trietilamina (0.05 mL, 0.36 mmol) y cloruro de mesilo (10<j>L). La reacción se agitó durante tres horas y se detuvo con varias gotas de metanol. Después de la filtración a través de celita el filtrado se purificó utilizando HPLC de fase inversa (acetonitrilo/agua al 10-60 % ácido acético al 0.25 % durante 15 minutos). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron en el liofilizador para producir (S)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)-N-(5-((2-(metilsulfonil)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)pirimidin-2-amina (3.8 mg, 13 %) como un sólido blanco.
RMN 1H (500 MHz, DMSO-da) 88.71 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.31 (d, J = 1.2 Hz, 1H), 8.28 - 8.17 (m, 2H), 7.76 -7.67 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 3.69 (t, J = 4.8 Hz, 2H), 3.50 - 3.45 (m, 3H), 3.28 (dd, J = 8.8 , 5.3 Hz, 2H), 3.23 - 3.14 (m, 1H), 2.85 (s, 3H), 2.66 (s, 3H), 2.50 - 2.46 (m, 2H), 2.31 (d, J = 11.4 Hz, 2H), 2.09 - 1.96 (m, 1H), 1.87 (dt, J = 13.1, 8.8 Hz, 1H), 1.65 (d, J = 6.8 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 613.
Compuesto A30
Se disolvió 2,2,2-trifluoroacetato de (R)-N-(5-((6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decan-9-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (32 mg, 0.049 mmol) en dimetilformamida (3 mL) y se trató con trietilamina (0.05 mL, 0.36 mmol) y cloroformiato de metilo (10<j>L). La reacción se agitó durante tres horas y se detuvo con varias gotas de metanol. Después de la filtración a través de celita, el filtrado se purificó mediante HPLC de fase inversa (acetonitrilo/agua al 10-60 % ácido acético al 0.25% durante 15 minutos). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron en el liofilizador para producir (S)-9-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-6-oxa-2,9-diazaspiro[4.5]decano-2-carboxilato de metilo (5.0 mg, 18 %) como un sólido blanco. RMN 1H (500 MHz, DMSO-d6) 88.71 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.35 -8.16 (m, 3H), 7.78 -7.62 (m, 2H), 4.86 (p, J = 6.8 Hz, 1H), 3.73 - 3.60 (m, 2H), 3.57 (s, 3H), 3.48 (s, 2H), 3.37 - 3.11 (m, 4H), 2.66 (s, 3H), 2.49 - 2.22 (m, 4H), 2.11 -1.77 (m, 2H), 1.65 (d, J = 6.9 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 593.
Ejemplo 4: Síntesis de los compuestos A23 y A28
A una solución enfriada de (S)-2-alil-2-metilmorfolina (6.74 g, 47.8 mmol) en diclorometano (120 mL, 0.4 M) bajo nitrógeno se agregó trietilamina (9.80 mL, 71.7 mmol) y la mezcla se enfrió en un baño de hielo/agua. Se agregó cloruro de 4-toluenosulfonilo (10.03 g, 52.3 mmol) en varias porciones, la reacción se agitó durante 30 minutos y se dejó calentar a temperatura ambiente durante un período de 90 minutos. El exceso de reactivo se detuvo mediante la adición de agua (50 mL) y bicarbonato de sodio saturado (50 mL). La mezcla se transfirió a un embudo de decantación. La fase orgánica se separó y la fase acuosa se lavó con dos porciones adicionales de diclorometano (30 mL). Las fases orgánicas combinadas se concentraron sobre gel de sílice y el residuo se cargó en seco en una columna flash de sílice (gradiente de hexanos/diclorometano acetato de etilo al 2 %: 0100 %). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron para producir (S)-2-alil-2-metil-4-tosilmorfolina (11.95 g, 85 %) como un sólido blancuzco.<m>S: [M+H]+ m/z 296.
Un matraz que contiene (S)-2-alil-2-metil-4-tosilmorfolina (11.95 g, 40.48 mmoles) se cargó con alcohol tertbutílico, metanol y agua (125 mL: 75 mL: 2 mL) y se purgó con nitrógeno. A la solución resultante se agregó 1,4-benzoquinona (6.56 g, 60.72 mmoles) y PdCh(CH3CN)2 (313 mg, 1.21 mmoles). La reacción se calentó suavemente a 50 °C y se dejó enfriar después de tres horas. La solución resultante se detuvo con ácido clorhídrico 1 N (15 mL) y se diluyó después de 30 minutos con acetato de etilo (300 mL). La fase acuosa se separó y la porción orgánica restante se lavó varias veces con solución de hidróxido de sodio (1 N, porciones de 50 mL) y bicarbonato de sodio saturado (50 mL). La porción orgánica se concentró sobre gel de sílice y se cargó en seco en una columna flash de sílice (gradiente de hexanos/acetato de etilo: 0-100 %). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron para producir (S)-1-(2-metil-4-tosilmorfolin-2-il)propan-2-ona (10.55 g, 85 %) como un sólido blancuzco. MS: [M+H]+ m/z 312.
Una botella de vidrio instalada en un reactor de bomba se cargó con paladio sobre carbono (10 %, 4.11 g) y se purgó suavemente gas nitrógeno para cubrir el lecho del catalizador. Bajo nitrógeno se agregó tetrahidrofurano (50 mL) con una pipeta y la mezcla se agitó vigorosamente. Se mezcló dimetilamina en tetrahidrofurano (100 mL, 2 M) con ácido acético (5.77 mL, 100 mmol) y la solución resultante se transfirió a la solución de catalizador mediante una pipeta. Finalmente, (S)-1-(2-metil-4-tosilmorfolin-2-il)propan-2-ona (8.23 g, 26.4 mmol) se disolvió en tetrahidrofurano (50 mL) y se transfirió a la solución catalizadora. El reactor de la bomba estaba sellado bajo una atmósfera de nitrógeno y conectado a un tanque de hidrógeno de alta presión. El reactor se presurizó a 1000 psi y se liberó la presión tres veces. Luego, la reacción presurizada se selló y se calentó a 60 °C durante un período de 38 horas. Se dejó enfriar la reacción y se liberó el exceso de gas hidrógeno. La solución de catalizador se filtró a través de celita y la torta se lavó con acetato de etilo sin dejar secar el paladio. Precaución: el catalizador de paladio restante puede ser pirofórico y se mantuvo húmedo con acetato de etilo y luego con agua antes de transferirlo a un contenedor de desechos. Después de la filtración, el filtrado se diluyó con acetato de etilo (300 mL) y se transfirió a un embudo de decantación. La fase orgánica se lavó con solución de hidróxido de sodio (2 N, 200 mL) y bicarbonato de sodio saturado. Los lavados orgánicos combinados se concentraron sobre gel de sílice y el residuo se cargó en seco en una columna flash de sílice (gradiente de diclorometano/metanol: 0-25 %). Se recolectaron tres fracciones, la primera que contiene el material de partida, seguido de (S)-N,N-dimetil-1-((R)-2-metil-4-tosilmorfolin-2-il)propan-2-amina (2.33 g, 26% ) y finalmente por el producto (S)-N,N-dimetil-1-((S)-2-metil-4-tosilmorfolin-2-il)propan-2-amina (3.25 g, 36 %). MS: [M+H]+ m/z 341.
Se cargó un matraz de fondo redondo con (S)-N,N-dimetil-1-((S)-2-metil-4-tosilmorfolin-2-il)propan-2-amina (2.84 g, 8.35 mmol). Se inyectó tetrahidrofurano bajo nitrógeno (42 mL) y la solución resultante se enfrió a -78 °C. Se agregó hidruro de litio y aluminio (2.14 g, 56.36 mmol) en una sola porción y se dejó calentar la reacción hasta temperatura ambiente. La reacción se calentó a 60 °C durante un período de 50.5 horas. En este momento la reacción se enfrió nuevamente en un baño de hielo seco/acetona, se agregaron gota a gota hidróxido de sodio (1 N, 2.5 mL) y agua (2.5 mL) con un vigoroso desprendimiento de gas hidrógeno. Después de calentar durante treinta minutos, se agregó sulfato de magnesio (20.0 g) y la reacción se diluyó con un volumen de éter dietílico y se agitó vigorosamente. Después de 30 minutos, la mezcla se filtró a través de celita y la torta de filtro se lavó con diclorometano. El filtrado se concentró para producir (S)-N,N-dimetil-1-((S)-2-metilmorfolin-2-il)propan-2-amina (1.51 g, 97 % crudo) como un aceite amarillo puro. MS: [M+H]+ m/z 187.
C o m p u e s to A 23
Se transfirió (S)-N,N-dimetil-1-((S)-2-metilmorfolin-2-il)propan-2-amina (1.51 g, 8.35 mmol) a un matraz de fondo redondo y se disolvió en DMSO (80 mL) y ácido acético (4.58 mL, 79.5 mmol). Se agregó 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (3.24 g, 7.95 mmol) para obtener una suspensión de color blanco lechoso. Después de 30 minutos, se agregó triacetoxiborohidruro de sodio (5.05 g, 23.85 mmol) y la reacción se calentó a 60 °C durante 14.5 h. Después de enfriar, la solución amarilla transparente resultante se vertió en hidróxido de sodio (0.5 N, 1 L) y la fase acuosa se lavó con tres porciones de cloroformo (600 mL cada una). Los lavados orgánicos combinados se secaron sobre sulfato de sodio, se filtraron y se concentraron sobre gel de sílice. El residuo se cargó en seco en una columna flash de sílice (gradiente de diclorometano/metanol con de metanol 17 N/amoníaco al 3 %: 0-50 % - seguido de cambio de la fase fuerte a metanol hidróxido de amonio al 4 %). Las fracciones activas se agruparon y se concentraron para producir N-(5-(((S)-2-((S)-2-(dimetilamino)propil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina (3.30 g, 67%). La base libre se analizó por RMN de protones y LC/MS indicando el producto deseado. La porción entera se disolvió en acetonitrilo y se agregó ácido metansulfónico acuoso (0.23 M, 26 mL). La solución salina se congeló en un baño de acetona con hielo seco y se concentró en el liofilizador durante varios días.
RMN 1H (500 MHz, Cloroformo-d) 88.43 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.39 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.25 (dd, J = 2.3, 0.8 Hz, 1H), 8.22 (s, 1H), 8.19 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.79 (dd, J = 11.5, 1.3 Hz, 1H), 7.69 (dd, J = 8.6 , 2.3 Hz, 1H), 4.74 (p, J = 7.0 Hz, 1H), 3.76 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 3.42 (s, 2H), 2.90 - 2.62 (m, 4H), 2.47 - 2.39 (m, 1H), 2.36 (q, J = 5.3 Hz, 1H), 2.33 -2.25 (m, 1H), 2.25 -2.18 (m, 1H), 2.18 (s, 6H), 1.90 (dd, J = 14.1, 3.8 Hz, 1H), 1.72 (d, J = 7.0 Hz, 6H), 1.39 (dd, J = 14.1,6.9 Hz, 1H), 1.27 (s, 3H), 0.99 (d, J = 6.5 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 579.
Compuesto A28
(S)-N,N-dimetil-1-((R)-2-metil-4-tosilmorfolin-2-il)propan-2-amina participó en la secuencia final de dos etapas de manera idéntica para proporcionar N-(5-(((S)-2-((R)-2-(dimetilamino)propil)-2-metilmorfolino)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina metanosulfonato.
RMN 1H (500 MHz, Cloroformo-d) 88.44 (d, J = 3.8 Hz, 1H), 8.40 (dd, J = 8.5, 0.8 Hz, 1H), 8.30 (s, 1H), 8.25 (dd, J = 2.3, 0.8 Hz, 1H), 8.19 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.82 - 7.77 (m, 1H), 7.69 (dd, J = 8.6 , 2.3 Hz, 1H), 4.73 (td, J = 14.0, 7.1 Hz, 1H), 3.71 (t, J = 4.9 Hz, 2H), 3.51 - 3.31 (m, 2H), 2.83 (q, J = 6.3, 5.7 Hz, 1H), 2.69 (s, 3H), 2.38 - 2.34 (m, 2H), 2.24 (d, J = 11.1 Hz, 1H), 2.19 (s, 6H), 1.71 (d, J = 7.0 Hz, 6H), 1.60 (dd, J = 14.2, 7.1 Hz, 1H), 1.25 (s, 3H), 1.02 (d, J = 6.6 Hz, 3H). MS: [M+H]+ m/z 579.
Ejemplo 5: Síntesis de los compuestos A61-A64
C o m p u e s to A61
A una solución de hemioxalato de 6-oxa-1-azaespiro[3.3]heptano (22 mg, 0.073 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (50 mg, 0.12 mmol) en DMSO (1.5 mL), se agregó ácido acético (70 j L, 1.2 mmol), seguido de triacetoxiborohidruro de sodio (52 mg, 0.25 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a temperatura ambiente y se agregó una solución de hidróxido de sodio (1 M ac., 2 mL), seguida de agua (2 mL). La mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar N-(5-((6-oxa-1-azaespiro[3.3]heptan-1-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite transparente. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 42 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 810.35 (s, 1H), 10.28 (bs, 1H), 8.68 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.38 (s, 1H), 8.27 (d, J = 8.7 Hz, 1H), 8.22 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.86 (dd, J = 8.8, 2.4 Hz, 1H), 7.65 (dd, J = 11.9, 1.2 Hz, 1H), 5.28 (d, J = 9.3 Hz, 1H), 4.93 -4.58 (m, 5H), 4.39 -4.27 (m, 1H), 3.96 -3.81 (m, 1H), 3.68 - 3.54 (m, 1H), 2.70 -2.55 (m, 5H), 2.23 (s, 3H), 1.57 (d, J = 6.9 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 492.2.
Compuesto A62
A una solución de clorhidrato de 2-tia-6-azaspiro[3.3]heptano-2,2-dióxido (27 mg, 0.15 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (50 mg, 0.12 mmol) en DMSO (1.5 mL), se agregó ácido acético (70 j L, 1.2 mmol), seguido de triacetoxiborohidruro de sodio (52 mg, 0.25 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a temperatura ambiente y se agregó una solución acuosa de hidróxido de sodio (1 M, 2 mL), seguida de agua (2 mL). La mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SO 2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar 2,2-dióxido de 6-((6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)piridin-3-il)metil)-2-tia-6-azaespiro[3.3]heptano como un aceite transparente. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 8.5 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 510.36 (s, 1H), 10.13 (bs, 1H), 8.68 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.32 (d, J = 2.4 Hz, 1H), 8.26 (d, J = 8.7 Hz, 1H), 8.22 (d, J = 1.3 Hz, 1H), 7.78 (dd, J = 8.7, 2.4 Hz, 1H), 7.65 (dd, J = 11.9, 1.3 Hz, 1H), 4.79 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 4.53 -4.37 (m, 6H), 4.31 (d, J = 5.6 Hz, 2H), 4.27 -4.16 (m, 2H), 2.59 (s, 3H), 2.23 (s, 3H), 1.57 (d, J = 6.9 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 540.2.
Compuesto A63
A una solución de hemioxalato de 2-azaspiro[3.3]heptano (21 mg, 0.075 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (50 mg, 0.12 mmol) en DMSO (1.5 mL), se le agregó ácido acético (70 pL, 1.2 mmol), seguido de triacetoxiborohidruro de sodio (52 mg, 0.25 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a temperatura ambiente y se agregó una solución de hidróxido de sodio (1 M ac, 2 mL), seguida de agua (2 mL). La mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SiO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar N-(5-((2-azaespiro[3.3]heptan-2-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite transparente. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 42 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-d6 ) 510.35 (s, 1H), 9.85 (bs, 1H), 8.68 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.31 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.28 - 8.17 (m, 2H), 7.79 (dd, J = 8.7, 2.4 Hz, 1H), 7.65 (dd, J = 11.9, 1.3 Hz, 1H), 4.80 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 4.23 (d, J = 6.0 Hz, 2H), 4.12 - 4.00 (m, 2H), 4.00 - 3.90 (m, 2H), 2.59 (s, 3H), 2.23 (s, 3H), 2.15 (dd, J = 8.8 , 6.6 Hz, 2H), 2.12 - 2.04 (m, 2H), 1.76 - 1.63 (m, 2H), 1.57 (d, J = 6.9 Hz, 6H). MS: [M+H]+ m/z 490.3.
Compuesto A64
A una solución de trifluoroacetato de 6,6-difluoro-2-aza-espiro[3.3]heptano (37 mg, 0.15 mmol) y 6-((5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-il)amino)nicotinaldehído (50 mg, 0.12 mmol) en DMSO (1.5 mL), se le agregó ácido acético (70 pL, 1.2 mmol), seguido de triacetoxiborohidruro de sodio (52 mg, 0.25 mmol). La reacción se calentó a 60 °C y se agitó durante 24 h. Una vez completada, la mezcla se enfrió a temperatura ambiente y se agregó una solución acuosa de hidróxido de sodio (1 M, 2 mL), seguida de agua (2 mL). La mezcla se extrajo con CHCh (3 x 3 mL). Las capas orgánicas se combinaron y se secaron con Na2SO4, y se concentraron en vacío. El compuesto crudo se purificó utilizando cromatografía flash sobre SÍO2 (gradiente de elución de CH2Ch con MeOH NH3 al 2 % = 0-20 %) para proporcionar N-(5-((6,6-difluoro-2-azaespiro[3.3]heptan-2-il)metil)piridin-2-il)-5-fluoro-4-(4-fluoro-1-isopropil-2-metil-1H-benzo[d]imidazol-6-il)pirimidin-2-amina como un aceite transparente. El aceite se disolvió en agua que contenía ácido metanosulfónico (1.05 equiv.) y la solución se liofilizó para producir 45 mg de la sal mesilato como un sólido blanco.
Espectros de la sal de mesilato
RMN 1H (400 MHz, DMSO-da) 810.36 (s, 1H), 9.99 (bs, 1H), 8.68 (d, J = 3.7 Hz, 1H), 8.32 (d, J = 2.3 Hz, 1H), 8.28 - 8.19 (m, 2H), 7.79 (dd, J = 8.7, 2.4 Hz, 1H), 7.65 (dd, J = 11.9, 1.3 Hz, 1H), 4.80 (p, J = 6.9 Hz, 1H), 4.32 -4.21 (m, 4H), 4.14 -4.02 (m, 2H), 2.92 -2.77 (m, 4H), 2.59 (s, 3H), 2.23 (s, 3H), 1.57 (d, J = 6.9 Hz, 6H). MS:
[M+H]+ m/z 492.2
Experimentos biológicos
Métodos generales
Ensayo de retraso del crecimiento de estirpe celular
Las células se sembraron a densidades de 1,000-5,000 células por pocillo en placas de cultivo de tejidos de 48 pocillos. Después de un período de descanso de 24 horas, las células fueron tratadas con el compuesto a 10|jM, 2|jM, 0.4|jM, 0.08|jM, 0.016|jM y 0.0032|jM. Se trató un grupo de células con el vehículo en el que se preparó el compuesto y sirvió como control. Las células se cultivaron en presencia de compuestos durante 6 días y se contaron el día 0 y el día 6. Todo el recuento de células se realizó utilizando un generador de imágenes de placa Synentec Cellavista. Las células que no recibieron el compuesto se contaron el día 1 y este recuento se utilizó como valor de referencia para el cálculo de la inhibición del crecimiento. La inhibición del crecimiento se calculó como una relación entre la duplicación de la población celular en presencia del compuesto y la ausencia del mismo. Si el tratamiento dio como resultado una pérdida neta de células con respecto al valor inicial, el porcentaje de letalidad se definió como la disminución en el número de células en los pocillos tratados en comparación con los recuentos en el día 1 de los pocillos no tratados después de la siembra. Los valores IC50 para cada compuesto (véase Tabla 3; informados en<ji>M) se calcularon al ajustar las curvas a los puntos de datos de cada ensayo de dosis-respuesta utilizando la función Proc NLIN en SAS para Windows versión 9.2 (SAS Institute, Inc.).
Ensayo de inhibición enzimática de Cdk4 y 6
Para el ensayo de determinación Ki, las soluciones madre de 200 jiM de compuestos se sometieron a una dilución semilogarítmica en serie utilizando DMSO al 100% como un solvente. Se prepararon 10 concentraciones distintas, con un criterio de valoración de dilución de 6 x 10'9 M en DMSO al 100 %. Se utilizó DMSO al 100 % como un control. Se formaron alícuotas de 10<j>L de cada una de las diluciones seriadas en pocillos separados de una placa de 96 pocillos y se agregaron 90 jiL de agua a cada uno de esos pocillos. La placa se agitó completamente y se transfirieron 5 jiL de cada uno de los pocillos de la placa a los pocillos de la placa de ensayo. El volumen final de los pocillos en la placa de ensayo fue de 50<ji>L. Todos los compuestos se probaron en 10 concentraciones de ensayo en el rango de 2 x 10'6 M a 6 x 10'11 M. La concentración final de DMSO en los pocillos de la placa de ensayo fue del 1 % en todos los casos. Los Ki para los compuestos se presentan en la Tabla 3 en nM.
Un ensayo radiométrico de proteína quinasa (Ensayo de Actividad 33PanQinase®) se utilizó para medir la actividad quinasa de seis proteínas quinasas. Todos los ensayos de quinasa se realizaron en FlashPlates™ de 96 pocillos de PerkinElmer (Boston, MA, EE. UU.). El ensayo para todas las proteínas quinasas contenía HEpES-NaOH 70 mM pH 7.5, MgCh 3 mM, MnCh3 mM, ortovanadato de Na 3<ji>M, DTT 1.2 mM, 50 jig/mL de PEG20000, ATP [y-33P]-ATP (aprox. 9 x 1005 cpm por pocillo), proteína quinasa y sustrato. Los cócteles de reacción se incubaron a 30 °C durante 60 minutos. La reacción se detuvo con 50<ji>L de H3PO4 al 2 % (v/v), y las placas se aspiraron y lavaron dos veces con 200<ji>L de NaCl al 0.9 % (p/v). La incorporación del 33Pi se determinó con un contador de centelleo de microplaca (Microbeta, Wallac).
Ensayo Caco-2 (Papp A a B)
El grado de permeabilidad intestinal humana bidireccional para los compuestos se estimó utilizando un ensayo de permeabilidad de células Caco-2. Las células Caco-2 se sembraron en membranas de polietileno en placas de 96 pocillos. El medio de crecimiento se renovó cada 4 a 5 días hasta que las células formaron una monocapa celular confluente. Se utilizó HBSS con HEPES 10 mM a pH 7.4 como tampón de transporte. Los compuestos se probaron a 2<ji>M bidireccionalmente por duplicado. Se incluyeron como estándares digoxina, nadolol y metoprolol. La digoxina se probó a 10 jiM bidireccionalmente por duplicado, mientras que el nadolol y el metoprolol se probaron a 2<ji>M en la dirección A a B por duplicado. La concentración final de DMSO se ajustó a menos del 1 % para todos los experimentos. La placa se incubó durante 2 horas en una incubadora CO2 a 37 °C, con 5 % de CO2 en humedad saturada. Después de la incubación, todos los pocillos se mezclaron con acetonitrilo que contenía un estándar interno y la placa se centrifugó a 4,000 rpm durante 10 minutos. Se recolectaron 100 pL de sobrenadante de cada pocilio y se diluyeron con 100 pL de agua destilada para el análisis LC/MS/MS. Las concentraciones de compuestos de prueba y de control en la solución de partida, la solución donante y la solución receptora se cuantificaron mediante LC/MS/MS, utilizando la relación del área de pico del analito/estándar interno. El coeficiente de permeabilidad aparente Papp (cm/s) se calculó utilizando la ecuación:
Papp = (dCr/dt)XVr/(AxCu)
Dónde dCr/dt es la concentración acumulada del compuesto en la cámara receptora en función del tiempo (pM/s); Vr es el volumen de la solución en la cámara receptora (0.075 mL en el lado apical, 0.25 mL en el lado basolateral); A es el área superficial para el transporte, que es 0.0804 cm2 para el área de la monocapa; C0 es la concentración inicial en la cámara donante (pM). Las puntuaciones Papp se presentan en la Tabla 3 para los compuestos.
La relación de eflujo se calculó utilizando la ecuación:
Relación de Eflujo = Papp(BA)/ Papp(AB)
El porcentaje de recuperación se calculó utilizando la ecuación:
%de Recuperación = 100 x [(Vr x Cr) (Vd x Cd)] / (Vd x C0)
Donde Vd es el volumen en las cámaras del donante, que son 0.075 mL en el lado apical y 0.25 mL en el lado basolateral; Cd y Cr son las concentraciones finales del compuesto de transporte en las cámaras donante y receptora, respectivamente.
Ensayo de inhibición enzimática del CYP
Se midió la inhibición de varias isoenzimas CYP para cada compuesto utilizando un ensayo de inhibición de la enzima CYP en microsomas hepáticos humanos (HLM). Los compuestos e inhibidores estándar se prepararon en soluciones de trabajo 100x. Se agregaron sustratos o PBS a los pocillos correspondientes, seguido de la adición de compuestos, solvente o solución de trabajo de control positivo a los pocillos correspondientes. Se agregaron los HLM a la placa precalentada (37 °C) y se mezclaron con el cofactor NADPH durante 10 minutos a 37 °C. La reacción se detuvo al agregar 400 pL de solución de detención fría (200 ng/mL de Tolbutamida y 200 ng/mL de Labetalol en ACN). La placa se centrifugó a 4,000 rpm durante 20 minutos y el sobrenadante se transfirió a 100 pL de agua HPLC seguido por análisis LC/MS/MS. Se promediaron los IC50 de las isoenzimas CYP para cada compuesto y se presentan en la Tabla 3 en pM.
Medición de la estabilidad metabólica de los compuestos
Se determinó la estabilidad metabólica de los compuestos en hepatocitos de ratones y ratas. Las vidas medias de los compuestos se presentan en la Tabla 3 en minutos. Los compuestos se diluyeron a 5 pM en medio Williams E a partir de soluciones madre de 10 mM. Se formaron alícuotas de 10 pL de cada compuesto en un pocillo de una placa de 96 pocillos y las reacciones se iniciaron al formar alícuotas 40 pL de una suspensión de 625,000 células/mL en cada pocillo. La placa se incubó a 37 °C con 5 % de CO2. En cada punto de tiempo correspondiente, la reacción se detuvo al apagar con ACN que contenía estándares internos (IS) en una 1:3. Las placas se agitaron a 500 rpm durante 10 min y luego se centrifugaron a 3,220 x g durante 20 minutos. Los sobrenadantes se transfirieron a otra placa de 96 pocillos que contenía una solución de dilución. Los sobrenadantes se analizaron mediante LC/MS/MS. La vida media del compuesto se estimó utilizando la siguiente ecuación:
% del CompuestoRestante =
Relaciones de Área Pico del Compuesto Probado vs. Estándar Interno en Punto Final Relaciones de Área Pico del Compuesto Probado vs. Estándar Interno en Punto Inicial
Ensayo de inhibición de hERG
Los efectos de los compuestos sobre la conductancia del canal de potasio hERG se evaluaron utilizando el método de fijación de parche automatizado QPatchHTX. Los compuestos se prepararon en soluciones madre de 10 mM. Para este ensayo se utilizaron células CHO que expresaban de forma estable canales de potasio hERG. Las células se cultivaron en un ambiente humidificado y con aire controlado al 5 % de CO2) incubadora a 37 °C. Las soluciones madre y el control positivo amitriptilina se disolvieron en DMSO al 100 % para preparar diversas concentraciones de solución. Estas soluciones se diluyeron además en una solución extracelular para lograr concentraciones finales para la prueba. La concentración final de DMSO en solución extracelular fue del 0.30 %. El ensayo hERG QPatchHTX se realizó a temperatura ambiente.
Se utilizó el siguiente protocolo de comando de voltaje:
• Desde el potencial de mantenimiento de -80 mV, el voltaje se incrementó primero a -50 mV durante 80 ms para sustracción de fuga, y luego a 20 mV durante 4,800 ms para abrir los canales hERG.
• Después de esto, el voltaje se redujo a -50 mV durante 5,000 ms, lo que provocó un “rebote” o corriente de cola, que se midió y recolectó para el análisis de datos.
• Finalmente, el voltaje se redujo al potencial de mantenimiento de -80 mV durante 3,100 ms.
Para cada experimento, se aplicaron tres adiciones de 5 |jL del vehículo, seguidas de 30 ejecuciones del protocolo de comando de voltaje durante un período de referencia. Luego, se agregaron las dosis ascendentes de cada compuesto con tres repeticiones (5 j L de compuesto cada vez). Los valores porcentuales de control se calcularon para los compuestos al tomar la relación de la respuesta de corriente en presencia del compuesto sobre la corriente pico en presencia del control del vehículo y multiplicar por 100 % (véase Tabla 3).
Ensayo de solubilidad de compuestos
La solubilidad cinética relativa de cada compuesto se determinó tanto a pH bajo (1.2) como neutro (7.4). Los compuestos se prepararon en soluciones madre de 10 mM. La solubilidad cinética se determinó mediante UV y se calibró utilizando una curva de 3 estándares (1, 20 y 200<j>M). Los compuestos se dejaron agitar a temperatura ambiente durante 24 horas en un tampón de fosfato 50 mM pH 7.4, o en tampón SGF pH 1.2 a 37 °C durante 24 horas. Las solubilidades de los compuestos se informan en la Tabla 3 en<j>M.
Análisis del kinome
Las quinasas recombinantes se produjeron y purificaron a partir de células E. coli o HEK-293 de la cepa BL21. Posteriormente, las quinasas se etiquetaron con ADN para su detección mediante qPCR. Las perlas magnéticas recubiertas de estreptavidina se trataron con ligandos de moléculas pequeñas biotinilados durante 30 minutos a temperatura ambiente para generar resinas de afinidad para ensayos de quinasas. Las perlas ligadas se bloquearon con exceso de biotina y se lavaron con tampón de bloqueo (SeaBlock con BSAal 1 %, Tween 20 al 0.05 % y DTT 1 mM) para eliminar el ligando no unido y reducir la unión no específica del fago. Las reacciones de unión se ensamblaron al combinar quinasas, perlas de afinidad ligadas y compuestos en un tampón de unión (SeaBlock al 20 %, 0.17x PBS, 0.05 % Tween 20, 6 mM DTT). Los compuestos se prepararon como soluciones 40x en DMSO al 100 % y se diluyeron directamente en el ensayo. Todas las reacciones se realizaron en placas de polipropileno de 384 pocillos en un volumen final de 0.02 mL. Las placas de ensayo se incubaron a temperatura ambiente con agitación durante 1 hora y las perlas de afinidad se lavaron con tampón de lavado (1x PBS y 0.05 % de Tween 20). Luego, las perlas se resuspendieron en un tampón de elución (1x PBS, Tween 20 al 0.05 %, ligando de afinidad no biotinilado 0.5 j M) y se incubaron a temperatura ambiente con agitación durante 30 minutos. La concentración de quinasa en los eluatos se midió mediante qPCR. Los resultados de las interacciones de unión del cribado primario se informan como “ % de Ctrl”, donde los números más bajos indican una afinidad más fuerte por un compuesto probado.
Estudios de xenoinjertos en roedores
Se establecieron modelos de xenoinjerto de estirpes celulares de cáncer humano en ratones sin pelaje atímicos CD-1 de seis semanas de edad mediante inyección subcutánea de 1.0-3.0 x 107 células con o sin matrigel al 50 %. Cuando los tumores alcanzaron un tamaño promedio de 150-300 mm3, los ratones (n = 8) se asignaron aleatoriamente a grupos de tratamiento. Los xenoinjertos tumorales se midieron con calibradores tres veces por semana y el volumen del tumor (en mm3) se determinó al multiplicar alto x ancho x largo. Para los estudios de ER+, se implantaron por vía subcutánea en el flanco izquierdo gránulos de liberación de 60 días de 17-pestradiol siete días antes de la inoculación del tumor. Las diferencias estadísticas entre los brazos de tratamiento en puntos de tiempo específicos se realizaron mediante una prueba t de Student pareada de dos colas. Las diferencias entre los grupos se consideraron estadísticamente significativas con p < 0.05. Los compuestos se formularon en HEC al 1 % en tampón de fosfato 25 mM (pH = 2) y se dosificaron mediante sonda oral diaria (PO). Los datos se analizaron utilizando el software StudyLog de StudyDirector (San Francisco, CA).
Estudios farmacocinéticos y de saturación de dosis única en roedores
Para el análisis farmacocinético (PK) de los compuestos, ratones sin pelaje atímicos CD-1 de seis semanas de edad, sin tumores, recibieron una dosis PO única del compuesto seguida de una extracción de sangre de la vena safena en los siguientes puntos de tiempo posteriores a la dosificación: 15, 30, 60, 120, 240, 480 y 1,440 minutos. Ningún ratón sangró más de dos veces en el período de 1,440 minutos. Se recolectaron muestras no tratadas de animales de control del vehículo. Para la preparación del plasma, se recolectó sangre entera en tubos tratados con EDTA. Las células se eliminaron del plasma mediante centrifugación durante 10 minutos a 1,000-2,000 x g utilizando una centrífuga refrigerada. La fracción de plasma se extrajo y se almacenó a -80 °C.
Para determinar la concentración en la que la exposición al fármaco se satura, se dosificó a los ratones como se describió anteriormente con concentraciones crecientes del compuesto que cubrían un rango de concentración logarítmica (100mg/kg a 1,000 mg/kg). Se utilizaron ratones triplicados para cada punto de tiempo de recolección y dosis.
Para determinar la cantidad (ng/ml) del compuesto en la circulación periférica, se analizaron muestras de plasma mediante espectrometría de masas (HPLC). Para este análisis, se mezclaron 20 pL de muestra de plasma con dos volúmenes de solución estándar interna helada (ISS) y se centrifugaron a 6,100 g durante 30 minutos. ISS contenía acetonitrilo con 100 ng/mL del compuesto, 50 ng/mL de dextrometorfano y 50 ng/mL de imipramina. Se transfirieron alícuotas del sobrenadante a una placa de muestreador automático y se diluyeron con dos volúmenes de ácido fórmico al 0.2 % en agua. Las concentraciones específicas de analito se determinaron frente a una curva estándar (10,000 - 5 ng/ml) y se calcularon las concentraciones medias /-desviación estándar.
Estudios de dosis máxima tolerada en roedores
Para los estudios de determinación de la dosis máxima tolerada (MTD), los ratones sin pelaje atímicos CD-1 sin tumores se distribuyeron aleatoriamente en 5 grupos de tratamiento (5 ratones por grupo) y se trataron con 500, 400, 300, 200 o 100 mg/kg de compuesto por Po diariamente. Los ratones se pesaron diariamente y se calculó el porcentaje de pérdida de peso corporal en relación con el peso corporal individual de los ratones al comienzo del tratamiento. Los estudios continuaron durante 14 días o hasta que se observó una pérdida de peso corporal promedio del grupo > 10 % en los animales. La MTD se determinó como la dosis más alta en la que se observó una pérdida de peso corporal media de < 10 % durante 14 días de dosificación.
Designación de cohortes de sensibilidad y resistencia y cálculo de los valores IC50
Las estirpes de células de cáncer humano se agruparon como “sensibles” o “resistentes” a la inhibición de CDK4/6 en base a si su crecimiento era retardado por ribociclib, palbociclib y abemaciclib (véase Tabla 2). Se interrogaron a estas cohortes sensibles y resistentes para determinar su respuesta a cada compuesto y se calcularon los IC50 s para cada estirpe celular utilizando la misma técnica descrita anteriormente. Los IC50 promedio para las cohortes sensibles y resistentes se calcularon como medias geométricas del grupo. La “ventana terapéutica” para cada compuesto se calculó al dividir el IC50 promedio para el grupo resistente a los fármacos por el IC50 promedio para el grupo sensible a los fármacos.
Tabla 2. Cohortes de estirpes celulares
Ejemplo 6: PK de tratamiento único para identificar la dosis de saturación
• Plasma recolectado en 6 puntos de tiempo (30 min, 60 min, 2 h, 4 h, 8 h y 24 h).
• Se determinó el AUC y la dosis para la saturación de la exposición.
• Se utilizaron 3 ratones por punto de tiempo y se sangró a los mismos ratones dos veces.
° 30 min y 4 h
° 60 min y 8 h
o 2 h y 24 h
° 9 ratones por concentración
o 5 concentraciones (dilución 1.78 veces, 1000 mg/kg a 100)
Ejemplo 7: Desescalada de dosis MTD de 14 días
• Se inició con 500 mg/kg, dosis hasta >0.10 % BWL, luego se redujo a 400 mg/kg con 4 nuevos ratones, y así sucesivamente.
• También se define abemaciclib MTD (250, 200, 150, 100 mg/kg).
Ejemplo 8 - Selección guiada por actividades de inhibidores
Se identificaron subgéneros de inhibidores de CDK4/6 con propiedades deseables utilizando una combinación de datos in vitro.
En particular, los resultados de los ensayos descritos anteriormente (por ejemplo, Ensayo de Retraso del Crecimiento de Estirpes Celulares, Ensayo de Inhibición Enzimática de Cdk4 y 6 , Ensayo Caco-2 (PappA a B), Medición de la Estabilidad Metabólica de los Compuestos y Designación de Cohortes de Sensibilidad y Resistencia y Cálculo de los Valores IC50 Promedio) se utilizaron para seleccionar compuestos que tuvieran características estructurales y funcionales definidas en los subgéneros de la Fórmula (IVa) y Fórmula (IVb). En particular, se examinaron compuestos seleccionados en estirpes celulares sensibles y resistentes, como se describió anteriormente. Las diferencias logarítmicas entre cohortes sensibles y resistentes para compuestos seleccionados se representan en la Figura 37.
En general, la Ki para CDK4 se correlacionó con la magnitud de la ventana terapéutica (es decir, la diferencia de potencia entre cohortes de estirpes celulares sensibles y resistentes), donde una Ki menor para CDK4 se asocia con una ventana terapéutica más amplia. Esta correlación termina cuando la Ki CDK4 es de aproximadamente 0.960 nM o más.
El técnico experto reconocería fácilmente que los resultados de ensayos adicionales (por ejemplo, Ensayo de Inhibición Enzimática de CYP, Ensayo de Inhibición de hERG, Ensayo de Solubilidad de Compuestos, Análisis de Kinome, Estudios de Xenoinjerto en Roedores, Estudios Farmacocinéticos y de Saturación de Dosis Única en Roedores, Estudios de Dosis Máxima Tolerada en Roedores y ensayo de Biodisponibilidad Oral) se podría utilizar para identificar otros subgéneros de inhibidores de CDK4/6, o para limitar los subgéneros determinados utilizando otros resultados, por ejemplo, los subgéneros de las Fórmulas IVa y IVb.
Tabla 4. PK de tratamiento único multidosis
Molécula<Dosis>
(mg/kg)# de ratones peso del
ratón# de dosis cantidad de molécula<Total>A1 100.0 9 0.03 1 27.00
A1 178.0 9 0.03 1 48.06
A1 316.8 9 0.03 85.55
A1 564.0 9 0.03 1 1 152.27
A1 1003.9 9 0.03 1 271.05 583.93
A2 100.0 9 0.03 1 27.00
A2 178.0 9 0.03 1 48.06
A2 316.8 9 0.03 1 85.55
A2 564.0 9 0.03 1 152.27
A2 1003.9 9 0.03 1 271.05 583.93
peso del número de cantidad de Molécula<Dosis>
(mg/kg)# ratones ratón dosis molécula<Total>A23 100.0 9 0.03 1 27.00
A23 178.0 9 0.03 1 48.06
A23 316.8 9 0.03 1 85.55
A23 564.0 9 0.03 1 152.27
A23 1003.9 9 0.03 1 271.05 583.93
Molécula<Dosis>número de cantidad de(mg/kg)# ratones peso del
ratón dosis molécula<Total>Abemaciclib 100.0 9 0.03 1 27.00 Abemacilib 178.0 9 0.03 1 48.06 Abemacilib 316.8 9 0.03 1 85.55 Abemacilib 564.0 9 0.03 1 152.27 Abemaciclib 1003.9 9 0.03 1 271.05 583.93

Claims (13)

  1. REIVINDICACIONES 1. Un compuesto que tiene la estructura de la Fórmula (IIb), (IIa), o (II):
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que: R1 es alquilo; y R2 es aminoalquilo opcionalmente sustituido; o R1 y R2, junto con el átomo de carbono a través del cual se unen, forman un anillo heterocíclico de 5 o 6 miembros opcionalmente sustituido.
  2. 2. El compuesto de la reivindicación 1, en el que R1 es alquilo C1-C4, preferiblemente metilo o etilo.
  3. 3. El compuesto de la reivindicación 1 o 2, en el que R2 es -(CH2)2N(H)(CH3), -(CH2)2N(H)(C(CH3)3),-(CH2)2N(H)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)(CH2CH2F), -(CH2)2N(CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, -(CH2)2N(CH2CH3)2, y -(CH2CH(CH3))N(CH3)2.
  4. 4. El compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1 o 2, en el que R2 es (CH2)nNR2aR2b, en el que: R2a y R2b son cada uno independientemente H, alquilo, haloalquilo, alquenilo o (CRcRd)mORe; Rc, Rd, y Re son cada uno independientemente H o alquilo; n es un número entero que tiene un valor de 1 o 2 ; y m es un número entero que tiene un valor de 2 a 5.
  5. 5. Un compuesto de la reivindicación 1 seleccionado de:
    o una sal farmacéuticamente aceptable de los mismos.
  6. 6. El compuesto de la reivindicación 1, que tiene la estructura de la Fórmula (IVa):
    o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, en la que: X' es fluoro; R1' es alquilo C1-C3; R2' es (CR2c2)nNR2a'R2b'; R2a' es H, alquilo inferior o haloalquilo; R2b' es H, alquilo inferior o haloalquilo cada R2c' es independientemente H o alquilo; n' es un número entero que tiene un valor de 1 o 2 ; y en el que el compuesto tiene un Ki de CDK4 de aproximadamente 0.960 nM o menor.
  7. 7. El compuesto de la reivindicación 6 , en el que el compuesto tiene una IC50 promedio de 150 nM o menor para las estirpes celulares sensibles a los fármacos de la siguiente tabla
  8. 8. El compuesto de la reivindicación 6 , en el que la IC50 promedio del compuesto para las estirpes celulares sensibles a los fármacos de la siguiente tabla:
    es al menos aproximadamente 5 veces más potente que la IC50 promedio del compuesto para las estirpes celulares resistentes a los fármacos de la siguiente tabla:
  9. 9. El compuesto de cualquiera de las reivindicaciones 6-8 , en el que el compuesto tiene una puntuación de coeficiente de permeabilidad aparente (Papp) para el transporte de la sustancia de prueba desde el lado apical hasta el basolateral (A a B) de aproximadamente 0.07 o mayor.
  10. 10. El compuesto de cualquiera de las reivindicaciones 6-9, en el que el compuesto tiene una vida media de aproximadamente 25 minutos o mayor.
  11. 11. El compuesto de la reivindicación 6 , en el que el compuesto se selecciona de:
    o una sal farmacéuticamente de los mismos.
  12. 12. Una composición farmacéutica que comprende un compuesto de una cualquiera de las reivindicaciones 1 11 y un diluyente o excipiente farmacéuticamente aceptable.
  13. 13. Un compuesto seleccionado de una cualquiera de las reivindicaciones 1-11, o una sal farmacéuticamente aceptable del mismo, para uso en el tratamiento del cáncer en un sujeto que lo necesita, o para uso en la sensibilización de células cancerosas y/o tumorales en un sujeto que lo necesita a un agente quimioterapéutica o a la radiación.
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