JP2000228988A - Dnaヘリケース - Google Patents
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Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/90—Isomerases (5.)
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Abstract
(57)【要約】
【課題】 TIP49の一部分との相同性を有する新規
蛋白質を提供すること。また、前記蛋白質をコードする
遺伝子を提供することを目的とするものである。 【解決手段】 TIP49の一部と相同性を有する蛋白
質をコードするcDNAをcDNAライブラリーからス
クリーニングして得た。このcDNAの塩基配列を決定
し、該cDNAがコードするアミノ酸配列を決定した。
さらに、このcDNAがコードする組み換え蛋白質を作
製し、該組み換え蛋白質の分子量が50kDであること
を確認した。さらに、この蛋白質がDNAヘリケース活
性を有することを確認した。
蛋白質を提供すること。また、前記蛋白質をコードする
遺伝子を提供することを目的とするものである。 【解決手段】 TIP49の一部と相同性を有する蛋白
質をコードするcDNAをcDNAライブラリーからス
クリーニングして得た。このcDNAの塩基配列を決定
し、該cDNAがコードするアミノ酸配列を決定した。
さらに、このcDNAがコードする組み換え蛋白質を作
製し、該組み換え蛋白質の分子量が50kDであること
を確認した。さらに、この蛋白質がDNAヘリケース活
性を有することを確認した。
Description
【0001】
【発明の属する技術分野】本発明は、DNAヘリケース
活性を有する蛋白質、該蛋白質をコードするポリヌクレ
オチド、該ポリヌクレオチドに対するアンチセンスポリ
ヌクレオチドおよび該蛋白質を認識する抗体に関するも
のである。
活性を有する蛋白質、該蛋白質をコードするポリヌクレ
オチド、該ポリヌクレオチドに対するアンチセンスポリ
ヌクレオチドおよび該蛋白質を認識する抗体に関するも
のである。
【0002】
【従来の技術】遺伝子転写における中心的な因子として
は、TBP(TATA binding protei
n)が、生物の全遺伝子の転写に関わっていることが知
られている。具体的には、DNAからmRNAへの翻訳
が行われるときにTBPが該DNAのプロモーター領域
に結合することで遺伝子の転写制御が行われている。T
BPが他の多様な蛋白質と複合体を形成することで、そ
の相手の蛋白質や複合体の構造により、該複合体が、各
遺伝子のそれぞれ異なる転写制御に対応するだけの機能
を持つことになると考えられている。
は、TBP(TATA binding protei
n)が、生物の全遺伝子の転写に関わっていることが知
られている。具体的には、DNAからmRNAへの翻訳
が行われるときにTBPが該DNAのプロモーター領域
に結合することで遺伝子の転写制御が行われている。T
BPが他の多様な蛋白質と複合体を形成することで、そ
の相手の蛋白質や複合体の構造により、該複合体が、各
遺伝子のそれぞれ異なる転写制御に対応するだけの機能
を持つことになると考えられている。
【0003】本発明者らは、TBPと結合する蛋白質と
してTIP49蛋白質、それをコードする遺伝子を単離
同定した(Biochem. Biophys. Re
s.Commun.,235,64−68)。
してTIP49蛋白質、それをコードする遺伝子を単離
同定した(Biochem. Biophys. Re
s.Commun.,235,64−68)。
【0004】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、TIP49
の一部分との相同性を有する新規蛋白質を提供すること
を目的とする。また、本発明は、前記蛋白質をコードす
るポリヌクレオチドを提供することを目的とするもので
ある。また、本発明は、前記蛋白質を認識する抗体を提
供することを目的とするものである。
の一部分との相同性を有する新規蛋白質を提供すること
を目的とする。また、本発明は、前記蛋白質をコードす
るポリヌクレオチドを提供することを目的とするもので
ある。また、本発明は、前記蛋白質を認識する抗体を提
供することを目的とするものである。
【0005】
【課題を解決するための手段】本発明者は、TIP49
の一部と相同性を有する蛋白質をコードするcDNAを
単離し、その塩基配列を決定した。そして、該cDNA
がコードするアミノ酸配列を決定した。さらに、本発明
者は、このcDNAがコードする組み換え蛋白質を作製
し、該組み換え蛋白質の分子量が50kDであることを
確認した。本発明者は、この蛋白質をHEL50と名付
けた。さらに、本発明者は、HEL50がDNAヘリケ
ース活性を有することを確認した。なお、HEL50が
由来する動物を明示する場合は、例えばヒトHEL50
のように、HEL50の前に由来する動物名を付けて表
記する。HEL50と表記した場合は、真核生物である
生物に由来するHEL50を意味する。
の一部と相同性を有する蛋白質をコードするcDNAを
単離し、その塩基配列を決定した。そして、該cDNA
がコードするアミノ酸配列を決定した。さらに、本発明
者は、このcDNAがコードする組み換え蛋白質を作製
し、該組み換え蛋白質の分子量が50kDであることを
確認した。本発明者は、この蛋白質をHEL50と名付
けた。さらに、本発明者は、HEL50がDNAヘリケ
ース活性を有することを確認した。なお、HEL50が
由来する動物を明示する場合は、例えばヒトHEL50
のように、HEL50の前に由来する動物名を付けて表
記する。HEL50と表記した場合は、真核生物である
生物に由来するHEL50を意味する。
【0006】また、本発明は、HEL50を認識する抗
体を開示する。
体を開示する。
【0007】具体的には、本発明は、以下の蛋白質を提
供する。 1.配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列からなる
蛋白質。この蛋白質はDNAヘリケース活性を有する。
この蛋白質がヒトHEL50である。 2.配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列において
一または複数のアミノ酸が置換、欠失または付加された
アミノ酸配列からなり、かつDNAヘリケース活性を有
する蛋白質。以下、この蛋白質をヒトHEL50変異体
という。配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列の一
部からなり、かつDNAヘリケース活性を有する蛋白質
は、ヒトHEL50変異体の一態様である。 3.配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列と65%
以上のホモロジーを有し、かつDNAヘリケース活性を
有する蛋白質。この蛋白質は、真核生物のHEL50で
ある。 4.配列表の配列番号12に記載のアミノ酸配列からな
る蛋白質。この蛋白質は、酵母HEL50であり、前記
第4項に記載の真核生物のHEL50の一態様である。
供する。 1.配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列からなる
蛋白質。この蛋白質はDNAヘリケース活性を有する。
この蛋白質がヒトHEL50である。 2.配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列において
一または複数のアミノ酸が置換、欠失または付加された
アミノ酸配列からなり、かつDNAヘリケース活性を有
する蛋白質。以下、この蛋白質をヒトHEL50変異体
という。配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列の一
部からなり、かつDNAヘリケース活性を有する蛋白質
は、ヒトHEL50変異体の一態様である。 3.配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列と65%
以上のホモロジーを有し、かつDNAヘリケース活性を
有する蛋白質。この蛋白質は、真核生物のHEL50で
ある。 4.配列表の配列番号12に記載のアミノ酸配列からな
る蛋白質。この蛋白質は、酵母HEL50であり、前記
第4項に記載の真核生物のHEL50の一態様である。
【0008】また、本発明は、以下のポリヌクレオチド
を提供するものである。なお、本明細書においては、ポ
リヌクレオチドとは、DNAやRNA、またはそれらに
塩基、リン酸、糖からなるヌクレオチドが複数結合した
ものを、天然には存在しないものを含めていう。 5.前記第1項ないし第4項のいずれか一項に記載の蛋
白質をコードするポリヌクレオチド。 6.配列表の配列番号2に記載の塩基配列の1番目のA
から1389番目のCまでの塩基配列を有するDNA。
配列表の配列番号2に記載の塩基配列の1番目のAから
1389番目のCまでの塩基配列は、ヒトHEL50の
コード領域の塩基配列であり、この塩基配列を有するD
NAを、以下ではヒトHEL50DNAという。なお、
cDNAはDNAに含まれるが、本明細書では、当該D
NAがcDNAであることを特に明示する場合には、c
DNAと表記する。 7.配列表の配列番号2に記載の塩基配列からなるDN
A。このDNAは前記第6項に記載のDNAの一態様で
ある。 8.配列表の配列番号12に記載の塩基配列からなるD
NA。このDNAは、酵母HEL50DNAである。 9.前記第6項ないし第8項のいずれか一項に記載のD
NAがコードするRNA。以下、ヒトHEL50DNA
がコードするRNAをヒトHEL50RNAという。な
お、mRNAはRNAに含まれるが、本明細書では、当
該RNAがmRNAであることを特に明示する場合に
は、mRNAと表記する。 10.前記第6項ないし第8項のいずれか一項に記載の
DNAのアンチセンスDNA、前記第9項に記載のRN
AのアンチセンスRNAまたはそれらの誘導体からなる
アンチセンスポリヌクレオチド。なお、アンチセンスポ
リヌクレオチドは、ポリヌクレオチドに含まれるが、本
明細書では、当該ポリヌクレオチドがアンチセンス鎖で
あることを特に明示するときには、アンチセンスポリヌ
クレオチドと表記する。 11.前記第5項ないし第10項のいずれか一項に記載
のポリヌクレオチドうちの一部であって、連続する12
塩基以上からなるポリヌクレオチド。 12.化学修飾された前記第5項ないし第11項のいず
れか一項に記載のポリヌクレオチド。
を提供するものである。なお、本明細書においては、ポ
リヌクレオチドとは、DNAやRNA、またはそれらに
塩基、リン酸、糖からなるヌクレオチドが複数結合した
ものを、天然には存在しないものを含めていう。 5.前記第1項ないし第4項のいずれか一項に記載の蛋
白質をコードするポリヌクレオチド。 6.配列表の配列番号2に記載の塩基配列の1番目のA
から1389番目のCまでの塩基配列を有するDNA。
配列表の配列番号2に記載の塩基配列の1番目のAから
1389番目のCまでの塩基配列は、ヒトHEL50の
コード領域の塩基配列であり、この塩基配列を有するD
NAを、以下ではヒトHEL50DNAという。なお、
cDNAはDNAに含まれるが、本明細書では、当該D
NAがcDNAであることを特に明示する場合には、c
DNAと表記する。 7.配列表の配列番号2に記載の塩基配列からなるDN
A。このDNAは前記第6項に記載のDNAの一態様で
ある。 8.配列表の配列番号12に記載の塩基配列からなるD
NA。このDNAは、酵母HEL50DNAである。 9.前記第6項ないし第8項のいずれか一項に記載のD
NAがコードするRNA。以下、ヒトHEL50DNA
がコードするRNAをヒトHEL50RNAという。な
お、mRNAはRNAに含まれるが、本明細書では、当
該RNAがmRNAであることを特に明示する場合に
は、mRNAと表記する。 10.前記第6項ないし第8項のいずれか一項に記載の
DNAのアンチセンスDNA、前記第9項に記載のRN
AのアンチセンスRNAまたはそれらの誘導体からなる
アンチセンスポリヌクレオチド。なお、アンチセンスポ
リヌクレオチドは、ポリヌクレオチドに含まれるが、本
明細書では、当該ポリヌクレオチドがアンチセンス鎖で
あることを特に明示するときには、アンチセンスポリヌ
クレオチドと表記する。 11.前記第5項ないし第10項のいずれか一項に記載
のポリヌクレオチドうちの一部であって、連続する12
塩基以上からなるポリヌクレオチド。 12.化学修飾された前記第5項ないし第11項のいず
れか一項に記載のポリヌクレオチド。
【0009】また、本発明は、前記第1項ないし第3項
のいずれか一項に記載の蛋白質を認識する抗体およびモ
ノクローナル抗体の活性フラグメントを提供するもので
ある。本明細書では、抗体とは、抗血清、ポリクローナ
ル抗体またはモノクローナル抗体の全てを含み、さらに
抗体の活性フラグメントも含む。
のいずれか一項に記載の蛋白質を認識する抗体およびモ
ノクローナル抗体の活性フラグメントを提供するもので
ある。本明細書では、抗体とは、抗血清、ポリクローナ
ル抗体またはモノクローナル抗体の全てを含み、さらに
抗体の活性フラグメントも含む。
【0010】
【発明の実施の形態】本発明のHEL50およびHEL
50変異体は、DNAヘリケース活性を有することを特
徴とするが、これらについては、例えば実施例4で開示
した方法を用いて確認すればよい。HEL50変異体は
公知の方法を使用して作製できる。例えば、HEL50
変異体をコードするDNAを作製して、該DNAを適当
な宿主に組み込み、得られる形質転換体にHEL50を
発現させることができる。HEL50変異体をコードす
るDNAは、例えば、制限酵素を利用して、HEL50
DNAの所望の部位の塩基を欠失もしくは他の塩基に置
換し、または所望の部位に塩基を挿入して得られる。ま
た、サイトディレクトミュータジェネシスの方法によっ
てもHEL50変異体を作製することができる。また、
ハイブリダイズの条件を緩くしたPCRによりランダム
ミュータジェネシスを起こすこともできる。
50変異体は、DNAヘリケース活性を有することを特
徴とするが、これらについては、例えば実施例4で開示
した方法を用いて確認すればよい。HEL50変異体は
公知の方法を使用して作製できる。例えば、HEL50
変異体をコードするDNAを作製して、該DNAを適当
な宿主に組み込み、得られる形質転換体にHEL50を
発現させることができる。HEL50変異体をコードす
るDNAは、例えば、制限酵素を利用して、HEL50
DNAの所望の部位の塩基を欠失もしくは他の塩基に置
換し、または所望の部位に塩基を挿入して得られる。ま
た、サイトディレクトミュータジェネシスの方法によっ
てもHEL50変異体を作製することができる。また、
ハイブリダイズの条件を緩くしたPCRによりランダム
ミュータジェネシスを起こすこともできる。
【0011】本発明のHEL50またはHEL50変異
体をコードするDNAまたはRNAは、縮重により存在
しうる全ての塩基配列からなるものである。
体をコードするDNAまたはRNAは、縮重により存在
しうる全ての塩基配列からなるものである。
【0012】DNAのセンス鎖またはRNAについて
は、その塩基配列と相補的な塩基配列からなるアンチセ
ンスDNAまたはアンチセンスRNAがそれぞれ存在す
る。本明細書では、特に断りがない限り、DNA(cD
NAを含む)はセンス鎖とアンチセンス鎖の二本鎖から
なるものを指し、RNAは一本鎖からなるものを指し、
アンチセンスDNAまたはアンチセンスRNAは一本鎖
からなるものを指す。本発明は、アンチセンスポリヌク
レオチドの誘導体を全て含む。誘導体は、例えば、アン
チセンスポリヌクレオチドの3’末端もしくは5’末端
に他の物質が結合したものやアンチセンスポリヌクレオ
チドの塩基、糖、リン酸の少なくともいずれか一部にお
いて、置換や欠失や付加といった修飾が生じた物質、あ
るいは天然に存在しないような塩基、糖、リン酸を有す
るものや、糖−リン酸骨格以外の骨格を有するものであ
る。本発明のアンチセンスポリヌクレオチドまたはその
誘導体は、HEL50をコードするポリヌクレオチドの
コード領域のいかなる部分にハイブリダイズするもので
あってもよい。mRNAの一部に対して相補的な塩基配
列を有し、該mRNAにハイブリダイズするものが好ま
しい。
は、その塩基配列と相補的な塩基配列からなるアンチセ
ンスDNAまたはアンチセンスRNAがそれぞれ存在す
る。本明細書では、特に断りがない限り、DNA(cD
NAを含む)はセンス鎖とアンチセンス鎖の二本鎖から
なるものを指し、RNAは一本鎖からなるものを指し、
アンチセンスDNAまたはアンチセンスRNAは一本鎖
からなるものを指す。本発明は、アンチセンスポリヌク
レオチドの誘導体を全て含む。誘導体は、例えば、アン
チセンスポリヌクレオチドの3’末端もしくは5’末端
に他の物質が結合したものやアンチセンスポリヌクレオ
チドの塩基、糖、リン酸の少なくともいずれか一部にお
いて、置換や欠失や付加といった修飾が生じた物質、あ
るいは天然に存在しないような塩基、糖、リン酸を有す
るものや、糖−リン酸骨格以外の骨格を有するものであ
る。本発明のアンチセンスポリヌクレオチドまたはその
誘導体は、HEL50をコードするポリヌクレオチドの
コード領域のいかなる部分にハイブリダイズするもので
あってもよい。mRNAの一部に対して相補的な塩基配
列を有し、該mRNAにハイブリダイズするものが好ま
しい。
【0013】アンチセンスポリヌクレオチドは、 遺伝子からpre−mRNAへの転写段階、 pre−mRNAから成熟mRNAへのプロセッシン
グ段階、 mRNAが核膜通過する段階、 mRNAから蛋白質への翻訳段階 のいずれかで、遺伝情報を担うDNAまたはRNAにハ
イブリダイズし、遺伝情報の伝達の正常な流れに影響を
与えて蛋白質の生合成を阻害することにより該蛋白質の
発現を調節すると考えられている。
グ段階、 mRNAが核膜通過する段階、 mRNAから蛋白質への翻訳段階 のいずれかで、遺伝情報を担うDNAまたはRNAにハ
イブリダイズし、遺伝情報の伝達の正常な流れに影響を
与えて蛋白質の生合成を阻害することにより該蛋白質の
発現を調節すると考えられている。
【0014】アンチセンスポリヌクレオチドがRNAに
ハイブリダイズし易くするために、一般的には、RNA
のループ領域の塩基配列に相補的な塩基配列を有するア
ンチセンスポリヌクレオチドを設計するとよいとされて
いる。また、RNAの翻訳開始コドン付近、リボソーム
結合部位、キャッピング部位またはスプライス部位の配
列に相補的な配列を有するようなアンチセンスポリヌク
レオチドは、一般に生合成を阻害する効果が大きいこと
が期待できる。したがって、本発明のアンチセンスポリ
ヌクレオチドまたはその誘導体であって、HEL50R
NAのループ領域、翻訳開始コドン付近、リボソーム結
合部位、キャッピング部位またはスプライス部位の塩基
配列に相補的な塩基配列を持つものは、生合成を阻害す
る効果が大きいことが期待される。
ハイブリダイズし易くするために、一般的には、RNA
のループ領域の塩基配列に相補的な塩基配列を有するア
ンチセンスポリヌクレオチドを設計するとよいとされて
いる。また、RNAの翻訳開始コドン付近、リボソーム
結合部位、キャッピング部位またはスプライス部位の配
列に相補的な配列を有するようなアンチセンスポリヌク
レオチドは、一般に生合成を阻害する効果が大きいこと
が期待できる。したがって、本発明のアンチセンスポリ
ヌクレオチドまたはその誘導体であって、HEL50R
NAのループ領域、翻訳開始コドン付近、リボソーム結
合部位、キャッピング部位またはスプライス部位の塩基
配列に相補的な塩基配列を持つものは、生合成を阻害す
る効果が大きいことが期待される。
【0015】アンチセンスポリヌクレオチドは、特定の
蛋白質の生合成を阻害する点で、特定の遺伝子やRNA
にハイブリダイズするものが好ましい。このため、12
以上の塩基からなるものが好ましく、16以上の塩基か
らなるものが特に好ましい。一方、細胞膜透過性の点で
は35以下の塩基からなるものが好ましい。
蛋白質の生合成を阻害する点で、特定の遺伝子やRNA
にハイブリダイズするものが好ましい。このため、12
以上の塩基からなるものが好ましく、16以上の塩基か
らなるものが特に好ましい。一方、細胞膜透過性の点で
は35以下の塩基からなるものが好ましい。
【0016】アンチセンスポリヌクレオチド誘導体は、
ヌクレアーゼ耐性、組織選択性、細胞膜透過性または結
合力の少なくとも一つが高められた誘導体であることが
好ましい。当該誘導体が、フォスフォロチオエート結合
を骨格構造として有する誘導体であると特に好ましい。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチド誘導体について
も、これらの機能または構造を有する誘導体が含まれ
る。
ヌクレアーゼ耐性、組織選択性、細胞膜透過性または結
合力の少なくとも一つが高められた誘導体であることが
好ましい。当該誘導体が、フォスフォロチオエート結合
を骨格構造として有する誘導体であると特に好ましい。
本発明のアンチセンスポリヌクレオチド誘導体について
も、これらの機能または構造を有する誘導体が含まれ
る。
【0017】本発明のアンチセンスポリヌクレオチドお
よびその誘導体の製造方法としては、例えば、天然型の
DNAやRNAであれば、化学合成機を使用して合成し
たり、HEL50cDNAを鋳型としてPCR法を行う
ことが挙げられる。また、メチルフォスフォネート型や
フォスフォロチオエート型等、誘導体の中には、化学合
成機(例えば、ABI社製394型)を使用して合成で
きるものもある。この場合には、化学合成機に添付され
ている説明書にしたがって操作を行い、得られた合成産
物を逆相クロマトグラフィー等を用いたHPLC法によ
り精製することによっても、目的のアンチセンスポリヌ
クレオチドまたはその誘導体を得ることができる。
よびその誘導体の製造方法としては、例えば、天然型の
DNAやRNAであれば、化学合成機を使用して合成し
たり、HEL50cDNAを鋳型としてPCR法を行う
ことが挙げられる。また、メチルフォスフォネート型や
フォスフォロチオエート型等、誘導体の中には、化学合
成機(例えば、ABI社製394型)を使用して合成で
きるものもある。この場合には、化学合成機に添付され
ている説明書にしたがって操作を行い、得られた合成産
物を逆相クロマトグラフィー等を用いたHPLC法によ
り精製することによっても、目的のアンチセンスポリヌ
クレオチドまたはその誘導体を得ることができる。
【0018】本発明のポリヌクレオチドまたはアンチセ
ンスポリヌクレオチドの全長またはその一部はHEL5
0遺伝子やHEL50cDNAあるいはHEL50mR
NAを検出するためのプローブまたはPCRのプライマ
ーとして用いることができる。さて、ヒトの蛋白質の種
類は3×109 個といわれている。16塩基のDNAは
416種類存在するので、この長さのDNAがあればヒト
の蛋白質を全て識別できる。すなわち、プローブまたは
プライマーとして必要な長さは理論的には16塩基であ
る。実用上もこの長さ以上であることが望ましいことは
言うまでもないが、実用的には12塩基以上で用いられ
ることが多い。また、プローブまたはプライマーとして
用いる箇所は、非コード領域、コード領域のいずれも使
用可能である。GC含有率が30ないし70%であるも
のは、ポリヌクレオチドの立体構造の問題が生じにくく
ハイブリダイズし易いので、好ましい。
ンスポリヌクレオチドの全長またはその一部はHEL5
0遺伝子やHEL50cDNAあるいはHEL50mR
NAを検出するためのプローブまたはPCRのプライマ
ーとして用いることができる。さて、ヒトの蛋白質の種
類は3×109 個といわれている。16塩基のDNAは
416種類存在するので、この長さのDNAがあればヒト
の蛋白質を全て識別できる。すなわち、プローブまたは
プライマーとして必要な長さは理論的には16塩基であ
る。実用上もこの長さ以上であることが望ましいことは
言うまでもないが、実用的には12塩基以上で用いられ
ることが多い。また、プローブまたはプライマーとして
用いる箇所は、非コード領域、コード領域のいずれも使
用可能である。GC含有率が30ないし70%であるも
のは、ポリヌクレオチドの立体構造の問題が生じにくく
ハイブリダイズし易いので、好ましい。
【0019】HEL50遺伝子を検出する方法としては
具体的には、ノーザンブロットハイブリダイゼーション
法やRT−PCR法(『Current Protoc
ols in Molecular Biology』
(Greeue Publishing Associ
ates and Wiley−Juter Scie
nce)Chapter15.1.1−15.1.9お
よび同書15.4.1−15.4.6)またはインサイ
チュハイブリダイゼーション法(同書Chapter1
4.3.1−14.3.14)が挙げられる。なお、ハ
イブリダイズの条件は、プローブの長さや使用するメン
ブランにより最適な条件が異なる。つまり、ハイブリダ
イズ条件は自ずから或る幅をもつものである。本発明の
実施例では、使用したメンブランの性質とプローブの長
さにおける最適な条件を開示するものであり、メンブラ
ンやプローブの長さが異なれば当然異なるハイブリダイ
ズ条件でもハイブリダイズし得る。
具体的には、ノーザンブロットハイブリダイゼーション
法やRT−PCR法(『Current Protoc
ols in Molecular Biology』
(Greeue Publishing Associ
ates and Wiley−Juter Scie
nce)Chapter15.1.1−15.1.9お
よび同書15.4.1−15.4.6)またはインサイ
チュハイブリダイゼーション法(同書Chapter1
4.3.1−14.3.14)が挙げられる。なお、ハ
イブリダイズの条件は、プローブの長さや使用するメン
ブランにより最適な条件が異なる。つまり、ハイブリダ
イズ条件は自ずから或る幅をもつものである。本発明の
実施例では、使用したメンブランの性質とプローブの長
さにおける最適な条件を開示するものであり、メンブラ
ンやプローブの長さが異なれば当然異なるハイブリダイ
ズ条件でもハイブリダイズし得る。
【0020】DNAまたはRNAを化学合成するとき
に、標識すること、ビオチン化すること、側鎖をメチル
化することまたはリン酸基部分のOをSに置換すること
等の化学修飾することはよく知られている。例えば、配
列表の配列番号2に記載のDNAを化学合成するとき
に、前記の化学修飾をして、配列表に示されたDNAそ
のものと異なるものを合成することが可能である。ま
た、cDNAライブラリーから取得されたcDNAであ
っても放射性同位体で標識することが可能である。した
がって、本発明のDNAおよびRNAは、上記の化学修
飾されたDNA、RNAまたはアンチセンスポリヌクレ
オチドをその範囲に含むものである。本発明の化学修飾
されたDNAまたはRNAは、蛋白質をコードする機能
またはプローブとしての機能いずれも発揮可能なもので
あり、本発明の化学修飾されたアンチセンスポリヌクレ
オチドは、蛋白質の生合成を阻害する機能またはプロー
ブとしての機能いずれも発揮可能なものである。
に、標識すること、ビオチン化すること、側鎖をメチル
化することまたはリン酸基部分のOをSに置換すること
等の化学修飾することはよく知られている。例えば、配
列表の配列番号2に記載のDNAを化学合成するとき
に、前記の化学修飾をして、配列表に示されたDNAそ
のものと異なるものを合成することが可能である。ま
た、cDNAライブラリーから取得されたcDNAであ
っても放射性同位体で標識することが可能である。した
がって、本発明のDNAおよびRNAは、上記の化学修
飾されたDNA、RNAまたはアンチセンスポリヌクレ
オチドをその範囲に含むものである。本発明の化学修飾
されたDNAまたはRNAは、蛋白質をコードする機能
またはプローブとしての機能いずれも発揮可能なもので
あり、本発明の化学修飾されたアンチセンスポリヌクレ
オチドは、蛋白質の生合成を阻害する機能またはプロー
ブとしての機能いずれも発揮可能なものである。
【0021】本発明は、HEL50をヒト以外の動物に
免疫感作することにより得られる抗体であって、本発明
のHEL50を認識することがウェスタンブロット法、
ELISA法や免疫染色法(例えばFACSでの測定)
等により確認される抗体をその範囲内に含む。なお、免
疫感作する動物は、免疫原として投与するHEL50が
由来する動物以外かつヒト以外の動物から選択すること
が好ましい。例えば、ラットHEL50であれば、ラッ
ト以外かつヒト以外の動物(例を挙げれば、ウサギやマ
ウス等)に免疫感作することが好ましい。
免疫感作することにより得られる抗体であって、本発明
のHEL50を認識することがウェスタンブロット法、
ELISA法や免疫染色法(例えばFACSでの測定)
等により確認される抗体をその範囲内に含む。なお、免
疫感作する動物は、免疫原として投与するHEL50が
由来する動物以外かつヒト以外の動物から選択すること
が好ましい。例えば、ラットHEL50であれば、ラッ
ト以外かつヒト以外の動物(例を挙げれば、ウサギやマ
ウス等)に免疫感作することが好ましい。
【0022】また、免疫原として、蛋白質の一部分をウ
シ血清アルブミンなどの他のキャリアー蛋白質に結合さ
せたものを用いることは、よく用いられる方法である。
蛋白質の一部分は、例えばペプチド合成機を用いて合成
してもよい。なお、蛋白質の一部分は、8以上のアミノ
酸残基からなるものであることが好ましい。免疫感作し
た動物から採血した血液から免疫グロブリンを精製して
抗血清やポリクローナル抗体が得られるならば、該免疫
した動物のリンパ球をミエローマ細胞等と細胞融合させ
て得られたハイブリドーマによりモノクローナル抗体が
産生されることはよく知られている(『Antibod
ies A Laboratory Manual』
(Cold Spring Harbor Labor
atory Press、1988)、141−14
7)。
シ血清アルブミンなどの他のキャリアー蛋白質に結合さ
せたものを用いることは、よく用いられる方法である。
蛋白質の一部分は、例えばペプチド合成機を用いて合成
してもよい。なお、蛋白質の一部分は、8以上のアミノ
酸残基からなるものであることが好ましい。免疫感作し
た動物から採血した血液から免疫グロブリンを精製して
抗血清やポリクローナル抗体が得られるならば、該免疫
した動物のリンパ球をミエローマ細胞等と細胞融合させ
て得られたハイブリドーマによりモノクローナル抗体が
産生されることはよく知られている(『Antibod
ies A Laboratory Manual』
(Cold Spring Harbor Labor
atory Press、1988)、141−14
7)。
【0023】本発明の抗体は活性フラグメントをも含
む。活性フラグメントとは、抗原抗体反応活性を有する
抗体のフラグメントを意味し、具体的には、F(a
b′)2 、Fab′、Fab、Fvなどを挙げることが
できる。 例えば、本発明の抗体をペプシンで分解する
とF(ab’)2 が得られ、パパインで分解するとFa
bが得られる。F(ab’)2 を2−メルカプトエタノ
ールなどの試薬で還元して、モノヨード酢酸でアルキル
化するとFab’が得られる。Fvは重鎖可変領域と軽
鎖可変領域とをリンカーで結合させた一価の抗体活性フ
ラグメントである。これらの活性フラグメントを保持
し、その他の部分を他の動物のフラグメントに置換する
ことでキメラ抗体が得られる。
む。活性フラグメントとは、抗原抗体反応活性を有する
抗体のフラグメントを意味し、具体的には、F(a
b′)2 、Fab′、Fab、Fvなどを挙げることが
できる。 例えば、本発明の抗体をペプシンで分解する
とF(ab’)2 が得られ、パパインで分解するとFa
bが得られる。F(ab’)2 を2−メルカプトエタノ
ールなどの試薬で還元して、モノヨード酢酸でアルキル
化するとFab’が得られる。Fvは重鎖可変領域と軽
鎖可変領域とをリンカーで結合させた一価の抗体活性フ
ラグメントである。これらの活性フラグメントを保持
し、その他の部分を他の動物のフラグメントに置換する
ことでキメラ抗体が得られる。
【0024】HEL50の検出については、抗体を用い
る方法や抗体と酵素反応とを利用する方法が挙げられ
る。抗体を用いる方法としては具体的には、HEL5
0を認識する抗体を用いてHEL50を検出する方法、
HEL50を認識する抗体および該抗体の標識二次抗
体を用いてHEL50を検出する方法が挙げられる。標
識としては、例えば放射性同位元素(RI)、酵素、ア
ビジンまたはビオチン、もしくは蛍光物質(FITCや
ローダミン等)が利用される。
る方法や抗体と酵素反応とを利用する方法が挙げられ
る。抗体を用いる方法としては具体的には、HEL5
0を認識する抗体を用いてHEL50を検出する方法、
HEL50を認識する抗体および該抗体の標識二次抗
体を用いてHEL50を検出する方法が挙げられる。標
識としては、例えば放射性同位元素(RI)、酵素、ア
ビジンまたはビオチン、もしくは蛍光物質(FITCや
ローダミン等)が利用される。
【0025】抗体と酵素反応とを利用する方法として
は、例えば、ELISAが挙げられる。
は、例えば、ELISAが挙げられる。
【0026】
【実施例】以下に実施例を示し、本発明をさらに詳述す
るが、本発明はこの例に限定されるものではない。 <実施例1>HEL50cDNAの単離およびHEL5
0のアミノ酸配列の決定 I.ESTデータベースの検索 インターネットのESTデータベース(mRNAの断片
の配列を登録してあるデータベース、http://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov./dbES
T)に登録された配列(EST)から、TIP49遺伝
子がコードするアミノ酸配列とホモロジーのあるアミノ
酸配列をコードする塩基配列を、インターネットのゲノ
ムネットWWWサーバー中のTBLASTN(htt
p://www.blast.genome.ad.j
p)を使用して、dbESTから検索した。その結果、
R19091の番号で登録されているESTおよびAA
374580の番号で登録されているESTを抽出し
た。
るが、本発明はこの例に限定されるものではない。 <実施例1>HEL50cDNAの単離およびHEL5
0のアミノ酸配列の決定 I.ESTデータベースの検索 インターネットのESTデータベース(mRNAの断片
の配列を登録してあるデータベース、http://w
ww.ncbi.nlm.nih.gov./dbES
T)に登録された配列(EST)から、TIP49遺伝
子がコードするアミノ酸配列とホモロジーのあるアミノ
酸配列をコードする塩基配列を、インターネットのゲノ
ムネットWWWサーバー中のTBLASTN(htt
p://www.blast.genome.ad.j
p)を使用して、dbESTから検索した。その結果、
R19091の番号で登録されているESTおよびAA
374580の番号で登録されているESTを抽出し
た。
【0027】II.HEL50DNAの単離および塩基
配列の決定 1.プライマーの合成 以下のアンカープライマーならびにR19091の塩基
配列から以下のプライマーP1およびAA374580
の塩基配列から以下のプライマーP2をDNA合成機
(ABI社製、392型)を使用して作製した。 アンカープライマー:5’−CTGGTTCGGC C
CA−3’(配列表の配列番号3に記載の塩基配列) P1:5’−GAGATCCGTG ATGTAACA
AG GATTGAG−3’(配列表の配列番号4に記
載の塩基配列) P2:5’−CTTGGTCTGG GAGCCCAT
AG CGTCG−3’(配列表の配列番号5に記載の
塩基配列) 合成したプライマーは、蒸留水で20pmol/μlに
調製した。これをPCRプライマーとして用いて、以下
のPCR操作を行った。
配列の決定 1.プライマーの合成 以下のアンカープライマーならびにR19091の塩基
配列から以下のプライマーP1およびAA374580
の塩基配列から以下のプライマーP2をDNA合成機
(ABI社製、392型)を使用して作製した。 アンカープライマー:5’−CTGGTTCGGC C
CA−3’(配列表の配列番号3に記載の塩基配列) P1:5’−GAGATCCGTG ATGTAACA
AG GATTGAG−3’(配列表の配列番号4に記
載の塩基配列) P2:5’−CTTGGTCTGG GAGCCCAT
AG CGTCG−3’(配列表の配列番号5に記載の
塩基配列) 合成したプライマーは、蒸留水で20pmol/μlに
調製した。これをPCRプライマーとして用いて、以下
のPCR操作を行った。
【0028】2.PCR cDNAライブラリーには、マラソン(登録商標)ヒト
肝臓cDNAライブラリー(クローンテック社製)を用
いて、以下の条件でPCRを行った。まず、プライマー
としてアンカープライマーとP2プライマーを使用し、
Takara Taq (登録商標、宝酒造社製)を使
用して以下の条件で行った。94℃に1分間おいた。次
いで「94℃で45秒間、続いて60℃で2分間、続い
て72℃で2分間」のサイクルを30回繰り返した。そ
の後、4℃に置いてPCR操作を完了した。PCRの反
応液の組成は下記の通りとした。 0.5ng/μl HEL50 1μl Taq pol(宝酒造社製) 0.1μl 10倍濃度PCR緩衝液(宝酒造社製) 2μl dNTP mix(宝酒造社製) 1.6μl アンカープライマー 2μl プライマーP2 2μl 滅菌蒸留水 11.3μl 合計 20μl
肝臓cDNAライブラリー(クローンテック社製)を用
いて、以下の条件でPCRを行った。まず、プライマー
としてアンカープライマーとP2プライマーを使用し、
Takara Taq (登録商標、宝酒造社製)を使
用して以下の条件で行った。94℃に1分間おいた。次
いで「94℃で45秒間、続いて60℃で2分間、続い
て72℃で2分間」のサイクルを30回繰り返した。そ
の後、4℃に置いてPCR操作を完了した。PCRの反
応液の組成は下記の通りとした。 0.5ng/μl HEL50 1μl Taq pol(宝酒造社製) 0.1μl 10倍濃度PCR緩衝液(宝酒造社製) 2μl dNTP mix(宝酒造社製) 1.6μl アンカープライマー 2μl プライマーP2 2μl 滅菌蒸留水 11.3μl 合計 20μl
【0029】その後、前記で得たPCR産物を鋳型とし
て、P1プライマーとP2プライマーを用いて2度目の
PCR操作を行った。2度目のPCR操作は、前記と同
様に行った。
て、P1プライマーとP2プライマーを用いて2度目の
PCR操作を行った。2度目のPCR操作は、前記と同
様に行った。
【0030】3.DNAプローブの作製 前記のPCR操作で増幅したDNA断片(以降、フラグ
メントAということがある)をミニゲル電気泳動(0.
75%アガロースゲル)させて、フラグメントAのバン
ドをゲルから切り出した。GeneClean(バイオ
101社製)でフラグメントAを回収して、ミニゲル電
気泳動でバンドをチェックした。
メントAということがある)をミニゲル電気泳動(0.
75%アガロースゲル)させて、フラグメントAのバン
ドをゲルから切り出した。GeneClean(バイオ
101社製)でフラグメントAを回収して、ミニゲル電
気泳動でバンドをチェックした。
【0031】前記で回収したフラグメントAを、pGE
M−T Easy(プロメガ社製)を用いてプラスミド
ベクターpGEM−T Easyに入れた。その後、フ
ラグメントAを入れたpGEM−T Easyを大腸菌
に導入し、該大腸菌を培養し、現れた白色コロニーの大
腸菌からMidiキット(キアゲン社製)を用いてプラ
スミドDNAすなわちフラグメントAを調製した。この
フラグメントAについて、ダイターミネーター法によ
り、オートシークエンサー(ABI社製、373A型)
を用いて、DNAシークエンスを行い、その塩基配列を
確認した。
M−T Easy(プロメガ社製)を用いてプラスミド
ベクターpGEM−T Easyに入れた。その後、フ
ラグメントAを入れたpGEM−T Easyを大腸菌
に導入し、該大腸菌を培養し、現れた白色コロニーの大
腸菌からMidiキット(キアゲン社製)を用いてプラ
スミドDNAすなわちフラグメントAを調製した。この
フラグメントAについて、ダイターミネーター法によ
り、オートシークエンサー(ABI社製、373A型)
を用いて、DNAシークエンスを行い、その塩基配列を
確認した。
【0032】前記白色コロニーを形成した大腸菌から調
製したフラグメントAをEcoRIで切り出し、得られ
たDNA断片をランダムラベリングキット(ベーリンガ
マンハイム社製)を使用して、下記の組成の液中に37
℃に30分間おいた後、65℃に10分間おいて標識し
た。 フラグメントA 9μl dA,G,TTP mix(ベーリンガーマンハイム社製) 3μl 反応液 mix(ベーリンガーマンハイム社製) 2μl d−32P−dCTP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl クレノウ液(ベーリンガーマンハイム社製) 1μl 合計 20μl この液から標識フラグメントAをG−50マイクロスピ
ンカラムで精製した。スウィングローターでカラムを3
000rpmで1分間回転させ、パッキングを行った。
そのカラムに標識フラグメントA液を20μl添加し、
3000rpmで2分間カラムを回転させ、T50Eで
溶出して標識フラグメントAを分離した。
製したフラグメントAをEcoRIで切り出し、得られ
たDNA断片をランダムラベリングキット(ベーリンガ
マンハイム社製)を使用して、下記の組成の液中に37
℃に30分間おいた後、65℃に10分間おいて標識し
た。 フラグメントA 9μl dA,G,TTP mix(ベーリンガーマンハイム社製) 3μl 反応液 mix(ベーリンガーマンハイム社製) 2μl d−32P−dCTP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl クレノウ液(ベーリンガーマンハイム社製) 1μl 合計 20μl この液から標識フラグメントAをG−50マイクロスピ
ンカラムで精製した。スウィングローターでカラムを3
000rpmで1分間回転させ、パッキングを行った。
そのカラムに標識フラグメントA液を20μl添加し、
3000rpmで2分間カラムを回転させ、T50Eで
溶出して標識フラグメントAを分離した。
【0033】4.ハイブリダイゼーション このDNAプローブを、ヒト肝臓cDNAライブラリー
λgt10(クローンテック社製)にハイブリダイズ
させ、該DNAプローブにハイブリダイズするcDNA
をスクローニングした。ハイブリダイズ条件は以下のよ
うにした。 プレハイブリダイゼーション 6倍SSC 0.05倍BLOTTO(2.5%脱脂粉乳、0.01
%アジ化ナトリウム) 0.1%NP40 100μg/ml 変性サケ精子DNA 総液量 50ml 反応温度60℃ 反応時間1時間 ハイブリダイゼーション 6倍SSC 0.05倍BLOTTO 0.1%NP40 100μg/ml 変性サケ精子DNA 1×106 cpm/ml DNAプローブ 総液量50ml 反応温度60℃ 反応時間12時間
λgt10(クローンテック社製)にハイブリダイズ
させ、該DNAプローブにハイブリダイズするcDNA
をスクローニングした。ハイブリダイズ条件は以下のよ
うにした。 プレハイブリダイゼーション 6倍SSC 0.05倍BLOTTO(2.5%脱脂粉乳、0.01
%アジ化ナトリウム) 0.1%NP40 100μg/ml 変性サケ精子DNA 総液量 50ml 反応温度60℃ 反応時間1時間 ハイブリダイゼーション 6倍SSC 0.05倍BLOTTO 0.1%NP40 100μg/ml 変性サケ精子DNA 1×106 cpm/ml DNAプローブ 総液量50ml 反応温度60℃ 反応時間12時間
【0034】ハイブリダイズの終了したニトロセルロー
ス膜を以下の条件で洗浄した。 2倍SSC、0.1%SDSの洗浄液で室温で5分間
洗浄することを2回 0.2%SSC、0.1%SDSの洗浄液で室音で1
0分間洗浄することを3回 X線フィルム(富士写真フィルム社製)を洗浄したニト
ロセルロース膜に−80℃で一晩曝し、オートラジオグ
ラフとした。得られたオートラジオグラフから、陽性の
プラークの位置を決定した。「対応するプラークからフ
ァージを回収してSM溶液に懸濁し、続いてSM溶液か
らファージを回収し、常法により再度NZY寒天培地上
にプラーク形成を行わせ、ニトロセルロース膜上に固定
すること」を3回繰り返した。その結果、陽性のプラー
クは単一なものとなった。該プラークからファージを回
収し、100μlのSM溶液に懸濁し、ファージを安定
化させた。
ス膜を以下の条件で洗浄した。 2倍SSC、0.1%SDSの洗浄液で室温で5分間
洗浄することを2回 0.2%SSC、0.1%SDSの洗浄液で室音で1
0分間洗浄することを3回 X線フィルム(富士写真フィルム社製)を洗浄したニト
ロセルロース膜に−80℃で一晩曝し、オートラジオグ
ラフとした。得られたオートラジオグラフから、陽性の
プラークの位置を決定した。「対応するプラークからフ
ァージを回収してSM溶液に懸濁し、続いてSM溶液か
らファージを回収し、常法により再度NZY寒天培地上
にプラーク形成を行わせ、ニトロセルロース膜上に固定
すること」を3回繰り返した。その結果、陽性のプラー
クは単一なものとなった。該プラークからファージを回
収し、100μlのSM溶液に懸濁し、ファージを安定
化させた。
【0035】5.塩基配列の決定 該ファージからEcoRIでcDNAを切り出し、得ら
れたcDNAをpBluescript SK+ベクタ
ー(ストラタジーン社製)に挿入して、クローニングし
た。クローニングの結果得られたcDNAをダイターミ
ネーター法により、オートシークエンサー(ABI社
製、373A型および310型)を用いて、DNAシー
クエンスを行い、その塩基配列を決定した。その結果、
コード領域を全て含むcDNAであることが分かった。
すなわち全長のHEL50cDNAが単離され、その塩
基配列が決定された。HEL50cDNAの塩基配列を
配列表の配列番号2に示す。なお、HEL50cDNA
を挿入したpBluescriptSK+ベクターをH
EL50SK+と名付けた。
れたcDNAをpBluescript SK+ベクタ
ー(ストラタジーン社製)に挿入して、クローニングし
た。クローニングの結果得られたcDNAをダイターミ
ネーター法により、オートシークエンサー(ABI社
製、373A型および310型)を用いて、DNAシー
クエンスを行い、その塩基配列を決定した。その結果、
コード領域を全て含むcDNAであることが分かった。
すなわち全長のHEL50cDNAが単離され、その塩
基配列が決定された。HEL50cDNAの塩基配列を
配列表の配列番号2に示す。なお、HEL50cDNA
を挿入したpBluescriptSK+ベクターをH
EL50SK+と名付けた。
【0036】6.HEL50のアミノ酸配列の決定 前記5の工程で決定した塩基配列から、HEL50cD
NAがコードする蛋白質であるHEL50のアミノ酸配
列を決定した。結果を配列表の配列番号1に示す。ま
た、配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列の77番
目のGlyから84番目のThrまでの部分および29
9番目のAspから302番目のHisまでの部分が、
ATPaseおよびDNAヘリケースに特徴的な配列の
部位である。
NAがコードする蛋白質であるHEL50のアミノ酸配
列を決定した。結果を配列表の配列番号1に示す。ま
た、配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列の77番
目のGlyから84番目のThrまでの部分および29
9番目のAspから302番目のHisまでの部分が、
ATPaseおよびDNAヘリケースに特徴的な配列の
部位である。
【0037】<実施例2> ノーザンブロッティング 1.プローブの作製 配列表の配列番号2に塩基配列を示すHEL50cDN
Aの387番目のTから796番目のGまでの部分をP
CRにより増幅し、標識してノーザンブロッティングの
プローブとした。以下に操作を示す。 (1)プライマーの合成 HEL50の塩基配列から以下のプライマーP3および
プライマーP4をDNA合成機(ABI社製、392
型)を使用して作製した。 P3:5’−TCGCATCAAG GAGGAGAC
−3’(配列表の配列番号6に記載の塩基配列) P4:5’−CTGAGAAGAG CGCCAGG−
3’(配列表の配列番号7に記載の塩基配列) 合成したプライマーは、蒸留水で20pmol/μlに
調製した。これをPCRプライマーとして用いて、以下
のPCR操作を行った。
Aの387番目のTから796番目のGまでの部分をP
CRにより増幅し、標識してノーザンブロッティングの
プローブとした。以下に操作を示す。 (1)プライマーの合成 HEL50の塩基配列から以下のプライマーP3および
プライマーP4をDNA合成機(ABI社製、392
型)を使用して作製した。 P3:5’−TCGCATCAAG GAGGAGAC
−3’(配列表の配列番号6に記載の塩基配列) P4:5’−CTGAGAAGAG CGCCAGG−
3’(配列表の配列番号7に記載の塩基配列) 合成したプライマーは、蒸留水で20pmol/μlに
調製した。これをPCRプライマーとして用いて、以下
のPCR操作を行った。
【0038】(2)PCR HEL50cDNAが導入されたベクターHEL50S
K+をPCRの鋳型とし、プライマーP3およびプライ
マーP4を使用して、Takara Taqpol(登
録商標、宝酒造社製)を使用して以下の条件で行った。
94℃に1分間おいた。次いで「94℃で45秒間、続
いて60℃で2分間、続いて72℃で2分間」のサイク
ルを30回繰り返した。その後、4℃に置いてPCR操
作を完了した。PCRの反応液の組成は下記の通りとし
た。 0.5ng/μl HEL50SK+ 1μl Taq pol(宝酒造社製) 0.1μl 10倍濃度PCR緩衝液(宝酒造社製) 2μl dNTP mix(宝酒造社製) 1.6μl プライマーP3 2μl プライマーP4 2μl 滅菌蒸留水 11.3μl 合計 20μl PCR産物を0.7%アガロースゲル上で電気泳動し
た。ゲルからPCR産物(以下、フラグメントBとい
う)を切り出し、GeneClean(バイオ101社
製)でフラグメントBを回収して、ミニゲル電気泳動で
バンドをチェックした。その結果、フラグメントBのD
NA液の濃度は、25ng/μlと推定された。
K+をPCRの鋳型とし、プライマーP3およびプライ
マーP4を使用して、Takara Taqpol(登
録商標、宝酒造社製)を使用して以下の条件で行った。
94℃に1分間おいた。次いで「94℃で45秒間、続
いて60℃で2分間、続いて72℃で2分間」のサイク
ルを30回繰り返した。その後、4℃に置いてPCR操
作を完了した。PCRの反応液の組成は下記の通りとし
た。 0.5ng/μl HEL50SK+ 1μl Taq pol(宝酒造社製) 0.1μl 10倍濃度PCR緩衝液(宝酒造社製) 2μl dNTP mix(宝酒造社製) 1.6μl プライマーP3 2μl プライマーP4 2μl 滅菌蒸留水 11.3μl 合計 20μl PCR産物を0.7%アガロースゲル上で電気泳動し
た。ゲルからPCR産物(以下、フラグメントBとい
う)を切り出し、GeneClean(バイオ101社
製)でフラグメントBを回収して、ミニゲル電気泳動で
バンドをチェックした。その結果、フラグメントBのD
NA液の濃度は、25ng/μlと推定された。
【0039】(3)標識 フラグメントBのDNA液5μlに滅菌蒸留水4μlを
加えて98℃に10分間おいた。その後、氷上で冷却
し、フラグメントBを変性させた。この変性フラグメン
トBをランダムラベリングキット(ベーリンガーマンハ
イム社製)を使用して、下記の組成の液中に37℃に3
0分間おいた後、65℃に10分間おいて標識した。 変性フラグメントB 9μl dA,G,TTP mix(ベーリンガーマンハイム社製) 3μl 反応液 mix(ベーリンガーマンハイム社製) 2μl d−32P−dCTP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl クレノウ液(ベーリンガーマンハイム社製) 1μl 合計 20μl この液から標識フラグメントBをG−50マイクロスピ
ンカラムで精製した。スウィングローターでカラムを3
000rpmで1分間回転させ、パッキングを行った。
そのカラムに標識フラグメントB液を20μl添加し、
3000rpmで2分間カラムを回転させ、T50Eで
溶出して標識フラグメントBを分離した。
加えて98℃に10分間おいた。その後、氷上で冷却
し、フラグメントBを変性させた。この変性フラグメン
トBをランダムラベリングキット(ベーリンガーマンハ
イム社製)を使用して、下記の組成の液中に37℃に3
0分間おいた後、65℃に10分間おいて標識した。 変性フラグメントB 9μl dA,G,TTP mix(ベーリンガーマンハイム社製) 3μl 反応液 mix(ベーリンガーマンハイム社製) 2μl d−32P−dCTP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl クレノウ液(ベーリンガーマンハイム社製) 1μl 合計 20μl この液から標識フラグメントBをG−50マイクロスピ
ンカラムで精製した。スウィングローターでカラムを3
000rpmで1分間回転させ、パッキングを行った。
そのカラムに標識フラグメントB液を20μl添加し、
3000rpmで2分間カラムを回転させ、T50Eで
溶出して標識フラグメントBを分離した。
【0040】2.ハイブリダイゼーション (1)プレハイブリダイゼーション mRNAを固定したメンブラン(ヒトMTN(登録商
標)ブロットII(クローンテック社製)、ラットMT
N(登録商標)No.3(クローンテック社製)および
マウス胎児(クローンテック社製))を、下記組成のハ
イブリダイゼーション液10mlに入れて、42℃で1
50分おき、変性サケ精子DNAでメンブラン上をブロ
ッキングした。 ハイブリダーゼーション液 5倍濃度SSPE 10倍濃度Denhartd’s液 2%SDS、50%ホルムアミド 100μg/ml変性サケ精子DNA
標)ブロットII(クローンテック社製)、ラットMT
N(登録商標)No.3(クローンテック社製)および
マウス胎児(クローンテック社製))を、下記組成のハ
イブリダイゼーション液10mlに入れて、42℃で1
50分おき、変性サケ精子DNAでメンブラン上をブロ
ッキングした。 ハイブリダーゼーション液 5倍濃度SSPE 10倍濃度Denhartd’s液 2%SDS、50%ホルムアミド 100μg/ml変性サケ精子DNA
【0041】(2)ハイブリダイゼーション 前記ハイブリダイゼーション液20mlに標識フラグメ
ントB液を7μl加え、よくかき混ぜた。角形シャーレ
にハイブリダイゼーション液を5mlずつ加え、上記メ
ンブランをシャーレに1枚ずつ入れ、各メンブランの上
にビニールシートを置き、42℃で一晩(約15時間)
ハイブリダイズさせた。ハイブリダイゼーション液を捨
て、洗浄液(2倍濃度SSC、0.1% SDS)をシ
ャーレに加え、室温で5分間洗浄することを4回繰り返
した。
ントB液を7μl加え、よくかき混ぜた。角形シャーレ
にハイブリダイゼーション液を5mlずつ加え、上記メ
ンブランをシャーレに1枚ずつ入れ、各メンブランの上
にビニールシートを置き、42℃で一晩(約15時間)
ハイブリダイズさせた。ハイブリダイゼーション液を捨
て、洗浄液(2倍濃度SSC、0.1% SDS)をシ
ャーレに加え、室温で5分間洗浄することを4回繰り返
した。
【0042】(3)オートラジオグラム このメンブランを放射線感光紙に16時間さらして、オ
ートラジオグラフを取った。ヒトMTNメンブランにつ
いての結果を図1に示す。ヒト各組織でHEL50mR
NAが発現していたが、精巣での発現が最も多かった。
ラットのmRNAおよびマウスのmRNAにもフラグメ
ントBがハイブリダイズし、ラットについてもヒトと同
様の結果であった。マウス胎児でもHEL50mRNA
の発現がみられ、一番多く発現しているのは胎生11日
目のマウス胎児であることが観察された。
ートラジオグラフを取った。ヒトMTNメンブランにつ
いての結果を図1に示す。ヒト各組織でHEL50mR
NAが発現していたが、精巣での発現が最も多かった。
ラットのmRNAおよびマウスのmRNAにもフラグメ
ントBがハイブリダイズし、ラットについてもヒトと同
様の結果であった。マウス胎児でもHEL50mRNA
の発現がみられ、一番多く発現しているのは胎生11日
目のマウス胎児であることが観察された。
【0043】<実施例3>HEL50の大量調整 1.HEL50cDNAの大量調整 1)組み換えベクターの作製 HEL50cDNAの第一メチオニン部分をEcoRI
サイトが隣接するようにPCRで改変し、図2に示すp
ET FLAG−HisベクターのEcoRIサイトに
組み込んだ。HEL50cDNAを組み込んだベクター
をJM109コンピテントセル(宝酒造社製)に、取扱
説明書に従って導入し、800mlのアンピシリンを含
むLB培地で一晩培養し、回収したJM109コンピテ
ントセルからアルカリ法(前掲のMolecular
Cloning Second Edition、1.
33−1.43ページに記載の方法)によりベクターを
回収した。ベクターの回収のための超遠心分離は3回行
った。
サイトが隣接するようにPCRで改変し、図2に示すp
ET FLAG−HisベクターのEcoRIサイトに
組み込んだ。HEL50cDNAを組み込んだベクター
をJM109コンピテントセル(宝酒造社製)に、取扱
説明書に従って導入し、800mlのアンピシリンを含
むLB培地で一晩培養し、回収したJM109コンピテ
ントセルからアルカリ法(前掲のMolecular
Cloning Second Edition、1.
33−1.43ページに記載の方法)によりベクターを
回収した。ベクターの回収のための超遠心分離は3回行
った。
【0044】2.HEL50の発現 1)大量調製したベクターを大腸菌BL21 pLys
S(ノバジェン社製)に導入した。 2)得られた大腸菌をアンピシリン100μg/mlを
含むLB培地で培養し、分光光度計(ベックマン社製)
で600nmの波長における濁度が0.6から0.7に
なった時点でIPTGを0.1mMになるように加え、
HEL50の発現誘導を行った。
S(ノバジェン社製)に導入した。 2)得られた大腸菌をアンピシリン100μg/mlを
含むLB培地で培養し、分光光度計(ベックマン社製)
で600nmの波長における濁度が0.6から0.7に
なった時点でIPTGを0.1mMになるように加え、
HEL50の発現誘導を行った。
【0045】3.HEL50の精製 1)2時間後、大腸菌を回収し、下記組成の溶解液30
mlで懸濁した。得られた懸濁液を4℃で超音波処理
し、超遠心分離器および45Tiロータ(いずれもベッ
クマン社製)を使用して50000rpm、4℃で1時
間超遠心分離した。 溶解液組成: 10mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.5M NaCl 0.1%NP40 5mM 2−メルカプトエタノール(ME) 1mM PMSF
mlで懸濁した。得られた懸濁液を4℃で超音波処理
し、超遠心分離器および45Tiロータ(いずれもベッ
クマン社製)を使用して50000rpm、4℃で1時
間超遠心分離した。 溶解液組成: 10mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.5M NaCl 0.1%NP40 5mM 2−メルカプトエタノール(ME) 1mM PMSF
【0046】2)得られた上清を取り、1Mイミダゾー
ル(pH7.5)を終濃度1mMになるように加え、N
i−NTAアガロースカラム(キアゲン社製)を用いて
非変性条件で取扱説明書に従って精製した。カラムのベ
ッドボリュームは、1mlとした。カラムは、下記組成
の第一洗浄液30mlで洗浄した後、下記組成の第二洗
浄液5mlで洗浄した。 第一洗浄液組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 20mM イミダゾール 第二洗浄液組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 40mM イミダゾール
ル(pH7.5)を終濃度1mMになるように加え、N
i−NTAアガロースカラム(キアゲン社製)を用いて
非変性条件で取扱説明書に従って精製した。カラムのベ
ッドボリュームは、1mlとした。カラムは、下記組成
の第一洗浄液30mlで洗浄した後、下記組成の第二洗
浄液5mlで洗浄した。 第一洗浄液組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 20mM イミダゾール 第二洗浄液組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 40mM イミダゾール
【0047】溶出時には、下記組成の溶出液を1mlず
つ5回カラムに流した。 溶出液組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 200mM イミダゾール
つ5回カラムに流した。 溶出液組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 200mM イミダゾール
【0048】3)溶出されたHEL50画分を下記組成
のリン酸緩衝液1で透析した後、HAP(ハイドロキシ
アパタイト)カラム(Bio−Rad社製)を使用し
て、FPLCシステムを使用して、リン酸緩衝液1およ
び下記組成のリン酸緩衝液2により0.01−0.3M
のグラジエントで精製した。ベッドボリュームは2ml
とした。 リン酸緩衝液1組成: 10mMリン酸緩衝液pH7.2 50mM KCl 5mM 2−ME 10%グリセロール リン酸緩衝液2組成: 300mMリン酸緩衝液pH7.2 50mM KCl 5mM 2−ME 10%グリセロール
のリン酸緩衝液1で透析した後、HAP(ハイドロキシ
アパタイト)カラム(Bio−Rad社製)を使用し
て、FPLCシステムを使用して、リン酸緩衝液1およ
び下記組成のリン酸緩衝液2により0.01−0.3M
のグラジエントで精製した。ベッドボリュームは2ml
とした。 リン酸緩衝液1組成: 10mMリン酸緩衝液pH7.2 50mM KCl 5mM 2−ME 10%グリセロール リン酸緩衝液2組成: 300mMリン酸緩衝液pH7.2 50mM KCl 5mM 2−ME 10%グリセロール
【0049】4)溶出されたHEL50画分を下記組成
の塩化カリウム緩衝液1で透析した後、イオン交換カラ
ムMonoQ(登録商標、ファルマシアアマシャム社
製)を使用して、FPLCシステムを使用して、塩化カ
リウム緩衝液1および下記組成の塩化カリウム緩衝液2
により0.05−0.5Mのグラジエントで精製した。
ベッドボリュームは1mlとした。 塩化カリウム緩衝液1組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 50mM KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 塩化カリウム緩衝液2組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.5M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF
の塩化カリウム緩衝液1で透析した後、イオン交換カラ
ムMonoQ(登録商標、ファルマシアアマシャム社
製)を使用して、FPLCシステムを使用して、塩化カ
リウム緩衝液1および下記組成の塩化カリウム緩衝液2
により0.05−0.5Mのグラジエントで精製した。
ベッドボリュームは1mlとした。 塩化カリウム緩衝液1組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 50mM KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 塩化カリウム緩衝液2組成: 20mM Tris−HCl pH7.9 10%グリセロール 0.5M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF
【0050】5)溶出されたHEL50画分を下記組成
のBC100で透析して、−80℃で保存した。 20mM Tris−HCl pH7.9 20%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 精製した蛋白質の電気泳動(クマシー染色)の結果を図
3に示す。いずれの画分にも50kDの位置にHEL5
0のバンドが確認された(タグの分だけやや大きめの位
置にバンドが現れている)。
のBC100で透析して、−80℃で保存した。 20mM Tris−HCl pH7.9 20%グリセロール 0.1M KCl 5mM 2−ME 0.5mM PMSF 精製した蛋白質の電気泳動(クマシー染色)の結果を図
3に示す。いずれの画分にも50kDの位置にHEL5
0のバンドが確認された(タグの分だけやや大きめの位
置にバンドが現れている)。
【0051】<実施例4> ヘリケース活性の測定 1.基質の作製 30塩基(CAGTCACGAC GTTGTAAAA
C GACGGCCAGT(配列表の配列番号8に記載
の塩基配列))からなる一本鎖DNAをDNA合成機を
使用して合成した。その5’末端をTakara ME
GA LABEL(登録商標)キット(宝酒造社製)を
使用して、取扱説明書に従って下記の組成の液中に37
℃で30分間おいた後、70℃に5分間おいて標識し
た。 5pmol/μl一本鎖DNA 2μl 10倍濃度リン酸化緩衝液(キットに付属のもの) 1μl γ−32P ATP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl T4キナーゼ(宝酒造社製) 1μl 滅菌蒸留水 1μl 合計 10μl
C GACGGCCAGT(配列表の配列番号8に記載
の塩基配列))からなる一本鎖DNAをDNA合成機を
使用して合成した。その5’末端をTakara ME
GA LABEL(登録商標)キット(宝酒造社製)を
使用して、取扱説明書に従って下記の組成の液中に37
℃で30分間おいた後、70℃に5分間おいて標識し
た。 5pmol/μl一本鎖DNA 2μl 10倍濃度リン酸化緩衝液(キットに付属のもの) 1μl γ−32P ATP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl T4キナーゼ(宝酒造社製) 1μl 滅菌蒸留水 1μl 合計 10μl
【0052】この標識した一本鎖DNAに、M13mp
18 ssDNA(宝酒造社製)を2μg加えて、75
℃に10分間、続いて37℃に1時間おいて両者をハイ
ブリダイズさせ、標識DNAを作製した。ハイブリダイ
ズした標識DNAをマイクロスピンカラムS400HR
(ファルマシアアマシャム社製)を使用して精製した。
まず、スウィングローターでカラムを3000rpmで
1分間回転させ、パッキングを行った。そのカラムに前
記標識DNA液を全量(約12μl)添加し、3000
rpmで2分間カラムを回転させ、標識DNAを分離し
た。得られた標識DNAを基質として以下の操作に用い
た。
18 ssDNA(宝酒造社製)を2μg加えて、75
℃に10分間、続いて37℃に1時間おいて両者をハイ
ブリダイズさせ、標識DNAを作製した。ハイブリダイ
ズした標識DNAをマイクロスピンカラムS400HR
(ファルマシアアマシャム社製)を使用して精製した。
まず、スウィングローターでカラムを3000rpmで
1分間回転させ、パッキングを行った。そのカラムに前
記標識DNA液を全量(約12μl)添加し、3000
rpmで2分間カラムを回転させ、標識DNAを分離し
た。得られた標識DNAを基質として以下の操作に用い
た。
【0053】2.ヘリケース活性の測定 実施例3で得られたMonoQの溶出画分のうち、第3
2、35、38、41、44、47、50番の各画分に
ついて、以下の操作を行い、各画分に含まれるHEL5
0のヘリケース活性を測定した。前記1の工程で作製し
た基質0.2μl(約3000cpmに相当)と、各M
onoQ溶出画分またはBC100(コントロール)2
μlとを下記組成の反応液に加え、37℃に30分間お
いて反応させた。 反応液(滅菌蒸留水で20μlに調製した。) 20mM Tris−HCl pH7.5 2mM DTT 50μg/μl BSA 1mM MgCl2 80mM KCl 1mM ATP その後、5μlの下記組成の停止液を加え、反応を停止
させた。 60mM EDTA 0.75%SDS 0.1%BPB 50%グリセロール
2、35、38、41、44、47、50番の各画分に
ついて、以下の操作を行い、各画分に含まれるHEL5
0のヘリケース活性を測定した。前記1の工程で作製し
た基質0.2μl(約3000cpmに相当)と、各M
onoQ溶出画分またはBC100(コントロール)2
μlとを下記組成の反応液に加え、37℃に30分間お
いて反応させた。 反応液(滅菌蒸留水で20μlに調製した。) 20mM Tris−HCl pH7.5 2mM DTT 50μg/μl BSA 1mM MgCl2 80mM KCl 1mM ATP その後、5μlの下記組成の停止液を加え、反応を停止
させた。 60mM EDTA 0.75%SDS 0.1%BPB 50%グリセロール
【0054】反応液を10%アクリルアミド/0.5倍
濃度TBE(Tris−borate/EDTA)ゲル
上に15μlずつのせ、100Vの電圧をかけて電気泳
動した。電気泳動終了後、ゲルを乾燥させ、X線フィル
ム(富士写真フィルム社製)を前記ゲルに一晩曝し、オ
ートラジオグラフを取った。
濃度TBE(Tris−borate/EDTA)ゲル
上に15μlずつのせ、100Vの電圧をかけて電気泳
動した。電気泳動終了後、ゲルを乾燥させ、X線フィル
ム(富士写真フィルム社製)を前記ゲルに一晩曝し、オ
ートラジオグラフを取った。
【0055】結果を図4に示す。レーン1とレーン2は
対照(コントロール)である。レーン1はMonoQ溶
出画分の代わりにBC100を添加したもの(ネガティ
ブコントロール)であり、レーン2はBC100を添加
して反応させた後3分間沸騰させたもの(ポジティブコ
ントロール)である。図中、32ないし50の数字がふ
られたレーンは当該数字のMonoQ溶出画分である。
各MonoQ溶出画分はポジティブコントロール(レー
ン2)と同じ位置にバンドが検出された。41画分およ
び44画分は特に強くバンドが現れ、これらの画分に含
まれるHEL50は特にヘリケース活性が大きいことが
確認された。
対照(コントロール)である。レーン1はMonoQ溶
出画分の代わりにBC100を添加したもの(ネガティ
ブコントロール)であり、レーン2はBC100を添加
して反応させた後3分間沸騰させたもの(ポジティブコ
ントロール)である。図中、32ないし50の数字がふ
られたレーンは当該数字のMonoQ溶出画分である。
各MonoQ溶出画分はポジティブコントロール(レー
ン2)と同じ位置にバンドが検出された。41画分およ
び44画分は特に強くバンドが現れ、これらの画分に含
まれるHEL50は特にヘリケース活性が大きいことが
確認された。
【0056】<実施例5>ヘリケース活性の方向性 1.方向性基質の調製 以下の操作を行い方向性基質を作製した。この概要を図
5に示す。図5中、☆は該部分が標識されていることを
示す。 1)5’末端標識プローブの作製 54塩基(ATGCCTGCAG GTCGACTCT
A GAGGATCCCC GGGTACCGAG C
TCGAATTCG TAAT(配列表の配列番号9に
記載の塩基配列))からなる一本鎖DNAをDNA合成
機を使用して合成した。その5’末端をTakara
MEGA LABEL(登録商標)キット(宝酒造社
製)を使用して、取扱説明書に従って下記の組成の液中
に37℃で30分間おいた後、70℃に5分間おいて標
識した。その後、TEを10μl加えた。 5pmol/μl一本鎖DNA 1μl 10倍リン酸化緩衝液(キットに付属のもの) 1μl γ−32P ATP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl T4キナーゼ(宝酒造社製) 1μl 滅菌蒸留水 2μl 合計 10μl 2)3’末端標識プローブの作製 配列表の配列番号9に記載の塩基配列からなる一本鎖D
NAをDNA合成機を使用して合成し、その3’末端を
TdTキット(和光純薬社製)を使用して、取扱説明書
に従って下記の組成の液中に37℃で30分間おいた
後、70℃に5分間おいて標識した。 5pmol/μl一本鎖DNA 1μl 5倍TdT緩衝液(キットに付属のもの) 4μl α−32P ddATP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl TdT 1μl 滅菌蒸留水 9μl 合計 20μl
5に示す。図5中、☆は該部分が標識されていることを
示す。 1)5’末端標識プローブの作製 54塩基(ATGCCTGCAG GTCGACTCT
A GAGGATCCCC GGGTACCGAG C
TCGAATTCG TAAT(配列表の配列番号9に
記載の塩基配列))からなる一本鎖DNAをDNA合成
機を使用して合成した。その5’末端をTakara
MEGA LABEL(登録商標)キット(宝酒造社
製)を使用して、取扱説明書に従って下記の組成の液中
に37℃で30分間おいた後、70℃に5分間おいて標
識した。その後、TEを10μl加えた。 5pmol/μl一本鎖DNA 1μl 10倍リン酸化緩衝液(キットに付属のもの) 1μl γ−32P ATP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl T4キナーゼ(宝酒造社製) 1μl 滅菌蒸留水 2μl 合計 10μl 2)3’末端標識プローブの作製 配列表の配列番号9に記載の塩基配列からなる一本鎖D
NAをDNA合成機を使用して合成し、その3’末端を
TdTキット(和光純薬社製)を使用して、取扱説明書
に従って下記の組成の液中に37℃で30分間おいた
後、70℃に5分間おいて標識した。 5pmol/μl一本鎖DNA 1μl 5倍TdT緩衝液(キットに付属のもの) 4μl α−32P ddATP(ファルマシアアマシャム社製) 5μl TdT 1μl 滅菌蒸留水 9μl 合計 20μl
【0057】3)標識した一本鎖DNAそれぞれに、M
13mp18 ssDNA(宝酒造社製)を2μg加え
て、75℃に5分間、続いて37℃に1時間から2時間
おいて両者をハイブリダイズさせ、標識DNAを作製し
た。 4)ハイブリダイズした標識DNAをマイクロスピンカ
ラムS400HR(ファルマシアアマシャム社製)を使
用して、実施例4の場合と同様に精製した。 5)精製した標識DNAを以下の組成の反応液中に37
℃で2時間おきSmaIサイトで標識DNA開裂した。 標識DNA溶液 15μl 10倍T緩衝液(SmaI酵素に付属のもの) 3μl BSA 3μl SmaI酵素(宝酒造社製) 2μl 滅菌蒸留水 7μl 合計 30μl 6)開裂した標識DNAをフェノール/CHCl3 に溶
かし、エタノール沈殿させた。沈殿物を10μlのTE
に溶かし、ヘリケース活性測定の基質として用いた。
13mp18 ssDNA(宝酒造社製)を2μg加え
て、75℃に5分間、続いて37℃に1時間から2時間
おいて両者をハイブリダイズさせ、標識DNAを作製し
た。 4)ハイブリダイズした標識DNAをマイクロスピンカ
ラムS400HR(ファルマシアアマシャム社製)を使
用して、実施例4の場合と同様に精製した。 5)精製した標識DNAを以下の組成の反応液中に37
℃で2時間おきSmaIサイトで標識DNA開裂した。 標識DNA溶液 15μl 10倍T緩衝液(SmaI酵素に付属のもの) 3μl BSA 3μl SmaI酵素(宝酒造社製) 2μl 滅菌蒸留水 7μl 合計 30μl 6)開裂した標識DNAをフェノール/CHCl3 に溶
かし、エタノール沈殿させた。沈殿物を10μlのTE
に溶かし、ヘリケース活性測定の基質として用いた。
【0058】2.ヘリケース活性測定 実施例4と同様の操作で、上記で作製した各基質1μl
ずつを、それぞれヒトHEL50またはラットTIP4
9で分解し、反応液を電気泳動した。結果を図6に示
す。レーン1および5はポジティブコントロール、レー
ン2および6はネガティブコントロールである。レーン
3および7がHEL50であり、レーン4および8がT
IP49である。30bの位置にバンドが現れるのは
3’末端から5’末端方向にヘリーケスが作用する場合
であり、24bの位置にバンドが現れるのは5’末端か
ら3’末端方向にヘリケースが作用する場合である。図
6からHEL50はヘリケース活性の方向性が5’末端
から3’末端であることが分かる。一方、TIP49の
ヘリケース活性の方向性は3’末端から5’末端であっ
た。
ずつを、それぞれヒトHEL50またはラットTIP4
9で分解し、反応液を電気泳動した。結果を図6に示
す。レーン1および5はポジティブコントロール、レー
ン2および6はネガティブコントロールである。レーン
3および7がHEL50であり、レーン4および8がT
IP49である。30bの位置にバンドが現れるのは
3’末端から5’末端方向にヘリーケスが作用する場合
であり、24bの位置にバンドが現れるのは5’末端か
ら3’末端方向にヘリケースが作用する場合である。図
6からHEL50はヘリケース活性の方向性が5’末端
から3’末端であることが分かる。一方、TIP49の
ヘリケース活性の方向性は3’末端から5’末端であっ
た。
【0059】<実施例6>酵母HEL50のクローニン
グ I.データベースの検索 HEL50とホモロジーを有する酵母のDNAの塩基配
列を、インターネットのゲノムネットWWWサーバー中
のTBLASTX(http://www.blas
t.genome.ad.jp)を使用して、検索し
た。その結果、YPL235wの番号で登録されている
塩基配列が抽出された。この塩基配列から以下のプライ
マーをDNA合成機(ABI社製、392型)を使用し
て作製した。 プライマーY1(メチオニン側):5’−CGGAAT
TCAT GTCGATTCAA ACTAGTG−
3’(配列表の配列番号10に記載の塩基配列) プライマーY2(3’末端側):5’−CGGAATT
CTT ATTCCGTAGT ATCCATGGC
(配列表の配列番号11に記載の塩基配列) これをPCRプライマーとして用いて、以下のPCR操
作を行った。
グ I.データベースの検索 HEL50とホモロジーを有する酵母のDNAの塩基配
列を、インターネットのゲノムネットWWWサーバー中
のTBLASTX(http://www.blas
t.genome.ad.jp)を使用して、検索し
た。その結果、YPL235wの番号で登録されている
塩基配列が抽出された。この塩基配列から以下のプライ
マーをDNA合成機(ABI社製、392型)を使用し
て作製した。 プライマーY1(メチオニン側):5’−CGGAAT
TCAT GTCGATTCAA ACTAGTG−
3’(配列表の配列番号10に記載の塩基配列) プライマーY2(3’末端側):5’−CGGAATT
CTT ATTCCGTAGT ATCCATGGC
(配列表の配列番号11に記載の塩基配列) これをPCRプライマーとして用いて、以下のPCR操
作を行った。
【0060】2.PCR 酵母ゲノム(国立遺伝学研究所から入手)を鋳型として
用いて、KODポリメラーゼ(東洋紡社製)を使用し
て、以下の条件でPCRを行った。95℃に5分間おい
た。次いで「94℃で30秒間、続いて55℃で30秒
間、続いて72℃で1分間」のサイクルを45回繰り返
した。その後、72℃に5分間おいた後、4℃において
PCR操作を完了した。PCRの反応液の組成は下記の
通りとした。 酵母ゲノム 500ng プライマーY1 10pmol プライマーY2 10pmol KOD pol(東洋紡社製) 2μl 10倍濃度PCR緩衝液(東洋紡社製) 5μl 2mM dNTP mix(東洋紡社製) 5μl 25mM MgCl2 2μl 滅菌蒸留水で50μlに調製した。
用いて、KODポリメラーゼ(東洋紡社製)を使用し
て、以下の条件でPCRを行った。95℃に5分間おい
た。次いで「94℃で30秒間、続いて55℃で30秒
間、続いて72℃で1分間」のサイクルを45回繰り返
した。その後、72℃に5分間おいた後、4℃において
PCR操作を完了した。PCRの反応液の組成は下記の
通りとした。 酵母ゲノム 500ng プライマーY1 10pmol プライマーY2 10pmol KOD pol(東洋紡社製) 2μl 10倍濃度PCR緩衝液(東洋紡社製) 5μl 2mM dNTP mix(東洋紡社製) 5μl 25mM MgCl2 2μl 滅菌蒸留水で50μlに調製した。
【0061】その後、前記で得たPCR産物を、制限酵
素を使用してEcoRIサイトで切断してDNA断片を
得た。得られたDNA断片をpBluescriptI
ISK+のEcoRIサイトに挿入してサブクローニン
グした。その結果得られたDNA断片について、ダイタ
ーミネーター法により、オートシークエンサー(ABI
社製、373A型)を用いて、DNAシークエンスを行
い、その塩基配列を決定した。この塩基配列が酵母HE
L50cDNAの塩基配列である。この塩基配列を配列
表の配列番号13に示す。また、この塩基配列から決定
されたアミノ酸配列が酵母HEL50のアミノ酸配列で
ある。このアミノ酸配列を配列表の配列番号12に示
す。決定された塩基配列は、酵母のゲノムとしてYPL
235wの番号でデータベースに登録されている塩基配
列全く同じであった。
素を使用してEcoRIサイトで切断してDNA断片を
得た。得られたDNA断片をpBluescriptI
ISK+のEcoRIサイトに挿入してサブクローニン
グした。その結果得られたDNA断片について、ダイタ
ーミネーター法により、オートシークエンサー(ABI
社製、373A型)を用いて、DNAシークエンスを行
い、その塩基配列を決定した。この塩基配列が酵母HE
L50cDNAの塩基配列である。この塩基配列を配列
表の配列番号13に示す。また、この塩基配列から決定
されたアミノ酸配列が酵母HEL50のアミノ酸配列で
ある。このアミノ酸配列を配列表の配列番号12に示
す。決定された塩基配列は、酵母のゲノムとしてYPL
235wの番号でデータベースに登録されている塩基配
列全く同じであった。
【0062】ヒトHEL50と酵母HEL50とのホモ
ロジーは、全体を通じては65%、ウォーカーAモチー
フ(配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列の77番
目のGlyから84番目のThrまでの部分)では69
%、ウォーカーBモチーフ(配列表の配列番号1に記載
のアミノ酸配列の299番目のAspから302番目の
Hisまでの部分)では71%であった。ヒトTIP4
9とヒトHEL50のホモロジーが41%であるので、
真核生物におけるヒトHEL50と酵母HEL50のホ
モロジーは、ヒトHEL50とヒトTIP49とのホモ
ロジーよりもはっきりと高い。真核生物のHEL50は
ヒトHEL50とのホモロジーが65%以上であると考
えられる。他の真核生物のHEL50cDNAも、目的
とする種の真核生物のcDNAライブラリーからPCR
により適当なプローブを作製し、そのプローブを使用し
たプラークハイブリダイゼーション法により単離するこ
とができると考えられる。また、酵母HEL50のクロ
ーニングで例示したようにPCRにより完全長のcDN
Aを得ることもできる。PCRやハイブリダイゼーショ
ンの条件は、すでに示した条件を参考に決定できる。
ロジーは、全体を通じては65%、ウォーカーAモチー
フ(配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配列の77番
目のGlyから84番目のThrまでの部分)では69
%、ウォーカーBモチーフ(配列表の配列番号1に記載
のアミノ酸配列の299番目のAspから302番目の
Hisまでの部分)では71%であった。ヒトTIP4
9とヒトHEL50のホモロジーが41%であるので、
真核生物におけるヒトHEL50と酵母HEL50のホ
モロジーは、ヒトHEL50とヒトTIP49とのホモ
ロジーよりもはっきりと高い。真核生物のHEL50は
ヒトHEL50とのホモロジーが65%以上であると考
えられる。他の真核生物のHEL50cDNAも、目的
とする種の真核生物のcDNAライブラリーからPCR
により適当なプローブを作製し、そのプローブを使用し
たプラークハイブリダイゼーション法により単離するこ
とができると考えられる。また、酵母HEL50のクロ
ーニングで例示したようにPCRにより完全長のcDN
Aを得ることもできる。PCRやハイブリダイゼーショ
ンの条件は、すでに示した条件を参考に決定できる。
【0063】
【発明の効果】本発明のHEL50およびHEL50変
異体はヘリケースとして使用可能である。
異体はヘリケースとして使用可能である。
【0064】本発明のHEL50DNAまたはHEL5
0mRNAは、それを適当な宿主に導入し、得られた形
質転換体を培養することによりHEL50を製造するこ
とに利用できる。HEL50変異体をコードするDNA
またはmRNAについても、同様にHEL50変異体を
製造することに利用できる。
0mRNAは、それを適当な宿主に導入し、得られた形
質転換体を培養することによりHEL50を製造するこ
とに利用できる。HEL50変異体をコードするDNA
またはmRNAについても、同様にHEL50変異体を
製造することに利用できる。
【0065】連続する12塩基以上からなるHEL50
をコードするポリヌクレオチド(アンチセンスポリヌク
レオチドを含む)は、プローブとしてHEL50の発現
を調べるのに利用できる。また、PCRのプライマーと
して使用できる。アンチセンスポリヌクレオチドは、H
EL50の生合成を阻害することにも利用できる。HE
L50変異体をコードするポリヌクレオチド(アンチセ
ンスポリヌクレオチドを含む)についても同様である。
をコードするポリヌクレオチド(アンチセンスポリヌク
レオチドを含む)は、プローブとしてHEL50の発現
を調べるのに利用できる。また、PCRのプライマーと
して使用できる。アンチセンスポリヌクレオチドは、H
EL50の生合成を阻害することにも利用できる。HE
L50変異体をコードするポリヌクレオチド(アンチセ
ンスポリヌクレオチドを含む)についても同様である。
【0066】本発明のHEL50を認識する抗体は、H
EL50の検出や精製に利用できる。精製のためには、
抗体を結合させたカラムを利用するアフィニティークロ
マトグラフィーや、免疫沈降法が利用できる
EL50の検出や精製に利用できる。精製のためには、
抗体を結合させたカラムを利用するアフィニティークロ
マトグラフィーや、免疫沈降法が利用できる
【0067】本発明のHEL50は、その一部において
TIP49との相同性があるので、TBPとの相互作用
があると考えられる。TBPは生物の全遺伝子の転写に
関わっているので、本発明のHEL50、HEL50を
コードするポリヌクレオチド、HEL50を認識する抗
体によりTBPの転写制御機能の究明の一手段が供せら
れることが強く期待できる。
TIP49との相同性があるので、TBPとの相互作用
があると考えられる。TBPは生物の全遺伝子の転写に
関わっているので、本発明のHEL50、HEL50を
コードするポリヌクレオチド、HEL50を認識する抗
体によりTBPの転写制御機能の究明の一手段が供せら
れることが強く期待できる。
【0068】ある種の遺伝病はヘリケースの異常が原因
することが知られている。したがって、本発明のポリヌ
クレオチドはプローブとして、あるいはPCRのプライ
マーとしてそのような遺伝病の診断に利用できることが
期待できる。また、本発明の抗体を遺伝病の診断に利用
できることが期待できる。また、本発明のHEL50や
ポリヌクレオチドや抗体を利用して、ヘリケースの異常
を回復すること、すなわち前記遺伝病を治療することが
期待できる。
することが知られている。したがって、本発明のポリヌ
クレオチドはプローブとして、あるいはPCRのプライ
マーとしてそのような遺伝病の診断に利用できることが
期待できる。また、本発明の抗体を遺伝病の診断に利用
できることが期待できる。また、本発明のHEL50や
ポリヌクレオチドや抗体を利用して、ヘリケースの異常
を回復すること、すなわち前記遺伝病を治療することが
期待できる。
【0069】
【配列表】 SEQUENCE LISTING <110> Sumitomo Electric Industries,Ltd. <120> DNA helicase <130> 098Y0518 <160> 13 <210> 1 <211> 463 <212> PRT <213> Homo sapience <400> 1 Met Ala Thr Val Thr Ala Thr Thr Lys Val Pro Glu Ile Arg Asp Val 1 5 10 15 Thr Arg Ile Glu Arg Ile Gly Ala His Ser His Ile Arg Gly Leu Gly 20 25 30 Leu Asp Asp Ala Leu Glu Pro Arg Gln Ala Ser Gln Gly Met Val Gly 35 40 45 Gln Leu Ala Ala Arg Arg Ala Ala Gly Val Val Leu Glu Met Ile Arg 50 55 60 Glu Gly Lys Ile Ala Gly Arg Ala Val Leu Ile Ala Gly Gln Pro Gly 65 70 75 80 Thr Gly Lys Thr Ala Ile Ala Met Gly Met Ala Gln Ala Leu Gly Pro 85 90 95 Asp Thr Pro Phe Thr Ala Ile Ala Gly Ser Glu Ile Phe Ser Leu Glu 100 105 110 Met Ser Lys Thr Glu Ala Leu Thr Gln Ala Phe Arg Arg Ser Ile Gly 115 120 125 Val Arg Ile Lys Glu Glu Thr Glu Ile Ile Glu Gly Glu Val Val Glu 130 135 140 Ile Gln Ile Asp Arg Pro Ala Thr Gly Thr Gly Ser Lys Val Gly Lys 145 150 155 160 Leu Thr Leu Lys Thr Thr Glu Met Glu Thr Ile Tyr Asp Leu Gly Thr 165 170 175 Lys Met Ile Glu Ser Leu Thr Lys Asp Lys Val Gln Ala Gly Asp Val 180 185 190 Ile Thr Ile Asp Lys Ala Thr Gly Lys Ile Ser Lys Leu Gly Arg Ser 195 200 205 Phe Thr Arg Ala Arg Asp Tyr Asp Ala Met Gly Ser Gln Thr Lys Phe 210 215 220 Val Gln Cys Pro Asp Gly Glu Leu Gln Lys Arg Lys Glu Val Val His 225 230 235 240 Thr Val Ser Leu His Glu Ile Asp Val Ile Asn Ser Arg Thr Gln Gly 245 250 255 Phe Leu Ala Leu Phe Ser Gly Asp Thr Gly Glu Ile Lys Ser Glu Val 260 265 270 Arg Glu Gln Ile Asn Ala Lys Val Ala Glu Trp Arg Glu Glu Gly Lys 275 280 285 Ala Glu Ile Ile Pro Gly Val Leu Phe Ile Asp Glu Val His Met Leu 290 295 300 Asp Ile Glu Ser Phe Ser Phe Leu Asn Arg Ala Leu Glu Ser Asp Met 305 310 315 320 Ala Pro Val Leu Ile Met Ala Thr Asn Arg Gly Ile Thr Arg Ile Arg 325 330 335 Gly Thr Ser Tyr Gln Ser Pro His Gly Ile Pro Ile Asp Leu Leu Asp 340 345 350 Arg Leu Leu Ile Val Ser Thr Thr Pro Tyr Ser Glu Lys Asp Thr Lys 355 360 365 Gln Ile Leu Arg Ile Arg Cys Glu Glu Glu Asp Val Glu Met Ser Glu 370 375 380 Asp Ala Tyr Thr Val Leu Thr Arg Ile Gly Leu Glu Thr Ser Leu Arg 385 390 395 400 Tyr Ala Ile Gln Leu Ile Thr Ala Ala Ser Leu Val Cys Arg Lys Arg 405 410 415 Lys Gly Thr Glu Val Gln Val Asp Asp Ile Lys Arg Val Tyr Ser Leu 420 425 430 Phe Leu Asp Glu Ser Arg Ser Thr Gln Tyr Met Lys Glu Tyr Gln Asp 435 440 445 Ala Phe Leu Phe Asn Glu Leu Lys Gly Glu Thr Met Asp Thr Ser 450 455 460 <210> 2 <211> 1512 <212> DNA <213> Homo sapience <220> <221> CDS <222> (1)...(1389) <400> 2 atg gca acc gtt aca gcc aca acc aaa gtc ccg gag atc cgt gat gta 48 aca agg att gag cga atc ggt gcc cac tcc cac atc cgg gga ctg ggg 96 ctg gac gat gcc ttg gag cct cgg cag gct tcg caa ggc atg gtg ggt 144 cag ctg gcg gca cgg cgg gcg gct ggc gtg gtg ctg gag atg atc cgg 192 gaa ggg aag att gcc ggt cgg gca gtc ctt att gct ggc cag ccg ggc 240 acg ggg aag acg gcc atc gcc atg ggc atg gcg cag gcc ctg ggc cct 288 gac acg cca ttc aca gcc atc gcc ggc agt gaa atc ttc tcc ctg gag 336 atg agc aag acc gag gcg ctg acg cag gcc ttc cgg cgg tcc atc ggc 384 gtt cgc atc aag gag gag acg gag atc atc gaa ggg gag gtg gtg gag 432 atc cag att gat cga cca gca aca ggg acg ggc tcc aag gtg ggc aaa 480 ctg acc ctc aag acc aca gag atg gag acc atc tac gac ctg ggc acc 528 aag atg att gag tcc ctg acc aag gac aag gtc cag gcc ggg gac gtg 576 atc acc atc gac aag gcg acg ggc aag atc tcc aag ctg ggc cgc tcc 624 ttc aca cgc gcc cgc gac tac gac gct atg ggc tcc cag acc aag ttc 672 gtg cag tgc cca gat ggg gag ctc cag aaa cgc aag gag gtg gtg cac 720 acc gtg tcc ctg cac gag atc gac gtc atc aac tct cgc acc cag ggc 768 ttc ctg gcg ctc ttc tca ggt gac aca ggg gag atc aag tca gaa gtc 816 cgt gag cag atc aat gcc aag gtg gct gag tgg cgc gag gag ggc aag 864 gcg gag atc atc cct gga gtg ctg ttc atc gac gag gtc cac atg ctg 912 gac atc gag agc ttc tcc ttc ctc aac cgg gcc ctg gag agt gac atg 960 gcg cct gtc ctg atc atg gcc acc aac cgt ggc atc acg cga atc cgg 1008 ggc acc agc tac cag agc cct cac ggc atc ccc ata gac ctg ctg gac 1056 cgg ctg ctt atc gtc tcc acc acc ccc tac agc gag aaa gac acg aag 1104 cag atc ctc cgc atc cgg tgc gag gaa gaa gat gtg gag atg agt gag 1152 gac gcc tac acg gtg ctg acc cgc atc ggg ctg gag acg tca ctg cgc 1200 tac gcc atc cag ctc atc aca gct gcc agc ttg gtg tgc cgg aaa cgc 1248 aag ggt aca gaa gtg cag gtg gat gac atc aag cgg gtc tac tca ctc 1296 ttc ctg gac gag tcc cgc tcc acg cag tac atg aag gag tac cag gac 1344 gcc ttc ctc ttc aac gaa ctc aaa ggc gag acc atg gac acc tcc tga 1392 gttggatgtc atcccccgac cccaccctgt tttccaccag agttctgaca ctgtgactct 1452 gtataaaatg gttgggaagc tgcaaaaaaa aaaaaaaaaa 1512 <210> 3 <211> 13 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 3 ctggttcggc cca 13 <210> 4 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 4 gagatccgtg atgtaacaag gattgag 27 <210> 5 <211> 25 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 5 cttggtctgg gagcccatag cgtcg 25 <210> 6 <211> 18 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 6 tcgcatcaag gaggagac 18 <210> 7 <211> 17 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 7 ctgagaagag cgccagg 17 <210> 8 <211> 30 <212> DNA <213> Artificial Sequemce <220> <223> Synthesized DNA <400> 8 cagtcacgac gttgtaaaac gacggccagt 30 <210> 9 <211> 54 <212> DNA <213> Artificial Sequemce <220> <223> Synthesized DNA <400> 9 ATGCCTGCAG GTCGACTCTA GAGGATCCCC GGGTACCGAG CTCGAATTCG TAAT 54 <210> 10 <211> 27 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 10 CGGAATTCAT GTCGATTCAA ACTAGTG 27 <210> 11 <211> 29 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Primer <400> 11 CGGAATTCTT ATTCCGTAGT ATCCATGGC 29 <210> 12 <211> 471 <212> PRT <213> Yeast <400> 12 Met Ser Ile Gln Thr Ser Asp Pro Asn Glu Thr Ser Asp Leu Lys Ser 5 10 15 Leu Ser Leu Ile Ala Ala His Ser His Ile Thr Gly Leu Gly Leu Asp 20 25 30 Glu Asn Leu Gln Pro Arg Pro Thr Ser Glu Gly Met Val Gly Gln Leu 35 40 45 Gln Ala Arg Arg Ala Ala Gly Val Ile Leu Lys Met Val Gln Asn Gly 50 55 60 Thr Ile Ala Gly Arg Ala Val Leu Val Ala Gly Pro Pro Ser Thr Gly 65 70 75 80 Lys Thr Ala Leu Ala Met Gly Val Ser Gln Ser Leu Gly Lys Asp Val 85 90 95 Pro Phe Thr Ala Ile Ala Gly Ser Glu Ile Phe Ser Leu Glu Leu Ser 100 105 110 Lys Thr Glu Ala Leu Thr Gln Ala Phe Arg Lys Ser Ile Gly Ile Lys 115 120 125 Ile Lys Glu Glu Thr Glu Leu Ile Glu Gly Glu Val Val Glu Ile Gln 130 135 140 Ile Asp Arg Ser Ile Thr Gly Gly His Lys Gln Gly Lys Leu Thr Ile 145 150 155 160 Lys Thr Thr Asp Met Glu Thr Ile Tyr Glu Leu Gly Asn Lys Met Ile 165 170 175 Asp Gly Leu Thr Lys Glu Lys Val Leu Ala Gly Asp Val Ile Ser Ile 180 185 190 Asp Lys Ala Ser Gly Lys Ile Thr Lys Leu Gly Arg Ser Phe Ala Arg 195 200 205 Ser Arg Asp Tyr Asp Ala Met Gly Ala Asp Thr Arg Phe Val Gln Cys 210 215 220 Pro Glu Gly Glu Leu Gln Lys Arg Lys Thr Val Val His Thr Val Ser 225 230 235 240 Leu His Glu Ile Asp Val Ile Asn Ser Arg Thr Gln Gly Phe Leu Ala 245 250 255 Leu Phe Thr Gly Asp Thr Gly Glu Ile Arg Ser Glu Val Arg Asp Gln 260 265 270 Ile Asn Thr Lys Val Ala Glu Trp Lys Glu Glu Gly Lys Ala Glu Ile 275 280 285 Val Pro Gly Val Leu Phe Ile Asp Glu Val His Met Leu Asp Ile Glu 290 295 300 Cys Phe Ser Phe Ile Asn Arg Ala Leu Glu Asp Glu Phe Ala Pro Ile 305 310 315 320 Val Met Met Ala Thr Asn Arg Gly Val Ser Lys Thr Arg Gly Thr Asn 325 330 335 Tyr Lys Ser Pro His Gly Leu Pro Leu Asp Leu Leu Asp Arg Ser Ile 340 345 350 Ile Ile Thr Thr Lys Ser Tyr Asn Glu Gln Glu Ile Lys Thr Ile Leu 355 360 365 Ser Ile Arg Ala Gln Glu Glu Glu Val Glu Leu Ser Ser Asp Ala Leu 370 375 380 Asp Leu Leu Thr Lys Thr Gly Val Glu Thr Ser Leu Arg Tyr Ser Ser 385 390 395 400 Asn Leu Ile Ser Val Ala Gln Gln Ile Ala Met Lys Arg Lys Asn Asn 405 410 415 Thr Val Glu Val Glu Asp Val Lys Arg Ala Tyr Leu Leu Phe Leu Asp 420 425 430 Ser Ala Arg Ser Val Lys Tyr Val Gln Glu Asn Glu Ser Gln Tyr Ile 435 440 445 Asp Asp Gln Gly Asn Val Gln Ile Ser Ile Ala Lys Ser Ala Asp Pro 450 455 460 Asp Ala Met Asp Thr Thr Glu 465 470 <210> 13 <211> 1416 <212> DNA <213> Yeast <220> <221> CDS <222> (1)...(1413) <400> 13 atg tcg att caa act agt gat cca aat gaa aca tca gat tta aag tcg 48 tta tct tta att gct gcc cac tcc cat att aca ggt tta ggt cta gat 96 gaa aac ttg caa cca cgt ccc aca tcc gaa ggt atg gtt ggg caa ttg 144 caa gcc cgt cgt gct gct ggt gtg ata ttg aaa atg gtt caa aat ggc 192 acc ata gca ggt agg gct gtt ttg gta gcg ggc ccc cct tca act ggt 240 aag acc gct ctt gcc atg ggt gtt tcc cag tct ctg ggt aaa gat gta 288 cca ttc act gct att gcg ggc tca gaa atc ttt tct tta gaa ttg agt 336 aaa act gaa gca cta act caa gct ttt agg aaa tcc atc ggt atc aaa 384 atc aag gag gag aca gaa ttg att gaa ggt gaa gtc gtg gaa att caa 432 att gat aga tct att act ggt gga cac aaa caa gga aaa ttg act att 480 aaa act acc gat atg gaa aca att tat gaa tta ggc aat aaa atg att 528 gat ggc cta act aaa gaa aag gta ttg gct ggc gat gtt att tct att 576 gat aaa gct agt ggg aag att acc aag cta ggc aga tcc ttt gct aga 624 tct agg gat tat gat gcc atg ggt gct gat acc aga ttt gtt caa tgt 672 ccg gaa ggc gaa ctg caa aaa agg aaa aca gtg gtt cac acg gtg tca 720 ctg cat gaa att gat gtt att aat tca aga aca caa gga ttt ttg gca 768 tta ttt act ggt gac acc ggt gaa att agg tca gag gta aga gac cag 816 ata aac aca aaa gtg gca gaa tgg aaa gaa gaa ggt aaa gca gaa att 864 gtt cct ggt gta tta ttt atc gac gaa gtc cac atg ttg gat ata gaa 912 tgt ttt tcc ttt ata aat agg gct ttg gaa gat gag ttt gcc cca atc 960 gtc atg atg gct aca aat aga gga gtt tcc aaa acc aga ggg act aat 1008 tac aaa tct cca cat ggg tta cct ctc gat ctt ttg gat agg tca att 1056 att att aca act aaa agt tat aat gag cag gag att aag aca att tta 1104 tct ata aga gca caa gag gag gaa gtt gaa ctg tca tcc gat gcc tta 1152 gat cta ttg acc aaa aca ggt gtg gaa act agt ttg cgt tac agc agt 1200 aat tta atc tct gtt gct cag caa att gca atg aag aga aaa aac aac 1248 act gtt gaa gtg gaa gat gtc aaa agg gct tat ttg cta ttt ttg gac 1296 agc gct aga tct gtt aag tat gtt caa gag aac gag tca caa tat att 1344 gat gat cag ggc aac gtt caa ata tcc att gct aaa tca gca gac cct 1392 gat gcc atg gat act acg gaa taa 1416
【図1】ヒト各組織由来のmRNAについてHEL50
遺伝子の一部をプローブとしてノーザンブロットハイブ
リダイゼーションした結果を示す電気泳動写真である。
遺伝子の一部をプローブとしてノーザンブロットハイブ
リダイゼーションした結果を示す電気泳動写真である。
【図2】pET−3a Hisベクターを示す図であ
る。
る。
【図3】MonoQで精製したHEL50の電気泳動の
結果を示す写真である。
結果を示す写真である。
【図4】MonoQで精製したHEL50とDNAとを
反応させた反応物を電気泳動した結果を示す電気泳動写
真である。
反応させた反応物を電気泳動した結果を示す電気泳動写
真である。
【図5】方向性基質の作製の概要を示す図である。
【図6】方向性基質とHEL50またはTIP49とを
反応させた反応物を電気泳動した結果を示す電気泳動写
真である。
反応させた反応物を電気泳動した結果を示す電気泳動写
真である。
─────────────────────────────────────────────────────
【手続補正書】
【提出日】平成11年2月15日(1999.2.1
5)
5)
【手続補正1】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図1
【補正方法】変更
【補正内容】
【図1】
【手続補正2】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図3
【補正方法】変更
【補正内容】
【図3】
【手続補正3】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図4
【補正方法】変更
【補正内容】
【図4】
【手続補正4】
【補正対象書類名】図面
【補正対象項目名】図6
【補正方法】変更
【補正内容】
【図6】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) // A61K 48/00 A61K 48/00 4H045 Fターム(参考) 4B024 AA20 BA80 CA04 DA06 EA04 GA11 GA19 HA01 HA12 4B050 CC03 DD11 LL03 4B063 QA12 QA18 QQ21 QR32 QR55 QR62 QS03 QS34 4B064 AG27 CA10 CA20 DA13 4C084 AA13 ZC192 4H045 AA11 CA40 DA76 DA86 DA89 FA72
Claims (13)
- 【請求項1】 配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配
列からなる蛋白質。 - 【請求項2】 配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配
列において一または複数のアミノ酸が置換、欠失または
付加されたアミノ酸配列からなり、かつDNAヘリケー
ス活性を有する蛋白質。 - 【請求項3】 配列表の配列番号1に記載のアミノ酸配
列と65%以上のホモロジーを有し、かつDNAヘリケ
ース活性を有する蛋白質。 - 【請求項4】 配列表の配列番号12に記載のアミノ酸
配列からなる蛋白質。 - 【請求項5】 請求項1ないし4のいずれか一項に記載
の蛋白質をコードするポリヌクレオチド。 - 【請求項6】 配列表の配列番号2に記載の塩基配列の
1番目のAから1389番目のCまでの塩基配列を有す
るDNA。 - 【請求項7】 配列表の配列番号2に記載の塩基配列か
らなる請求項6に記載のDNA。 - 【請求項8】 配列表の配列番号13に記載の塩基配列
からなるDNA。 - 【請求項9】 請求項6ないし8のいずれか一項に記載
のDNAがコードするRNA。 - 【請求項10】 請求項6ないし8のいずれか一項に記
載のDNAのアンチセンスDNA、請求項9に記載のR
NAのアンチセンスRNAまたはそれらの誘導体からな
るアンチセンスポリヌクレオチド。 - 【請求項11】 請求項5ないし10のいずれか一項に
記載のポリヌクレオチドの連続する12以上の塩基から
なる部分からなるポリヌクレオチド。 - 【請求項12】 化学修飾された請求項5ないし11の
いずれか一項に記載のポリヌクレオチド。 - 【請求項13】 請求項1ないし4のいずれか一項に記
載の蛋白質を認識する抗体。
Priority Applications (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP11033062A JP2000228988A (ja) | 1999-02-10 | 1999-02-10 | Dnaヘリケース |
| PCT/JP1999/006519 WO2000047731A1 (fr) | 1999-02-10 | 1999-11-22 | Proteine a activite helicase d'adn, polynucleotide codant cette proteine, polynucleotide antisens et anticorps associes |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP11033062A JP2000228988A (ja) | 1999-02-10 | 1999-02-10 | Dnaヘリケース |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JP2000228988A true JP2000228988A (ja) | 2000-08-22 |
Family
ID=12376263
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP11033062A Pending JP2000228988A (ja) | 1999-02-10 | 1999-02-10 | Dnaヘリケース |
Country Status (2)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP2000228988A (ja) |
| WO (1) | WO2000047731A1 (ja) |
Families Citing this family (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| AU1955201A (en) * | 1999-12-08 | 2001-06-18 | Genoptera, Llc | Insecticide targets and methods of use |
| JP2005511026A (ja) * | 2001-10-01 | 2005-04-28 | ザ ジェネラル ホスピタル コーポレーション | 心臓または消化器系の疾病および病態、ならびに癌の診断ならびに治療の方法 |
-
1999
- 1999-02-10 JP JP11033062A patent/JP2000228988A/ja active Pending
- 1999-11-22 WO PCT/JP1999/006519 patent/WO2000047731A1/ja not_active Ceased
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2000047731A1 (fr) | 2000-08-17 |
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