JP2000500158A - ユニバーサルな固体支持体およびその使用方法 - Google Patents

ユニバーサルな固体支持体およびその使用方法

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Abstract

(57)【要約】 ユニバーサルな固体支持体オリゴヌクレオチド合成試薬類、オリゴヌクレオチド合成プロセス、およびオリゴヌクレオチドを固体支持体から開裂するための試薬類が開示されている。オリゴヌクレオチド合成試薬は次の一般式であらわされる。SS−R6−O−R3(式中、SSは固体支持体であり、R6は(a)、(b)または(c)であり、ここでR5は水素またはアルキルであり、R4はホスフェート保護基であり、R3はビシナル基−XR1および−YR2を有する環状部分であり、ここでXおよびYはそれぞれO、S、およびNHからなる群から独立に選択され、R1およびR2の一方はブロッキング部分であり、他方は水素、またはヒドロキシ保護基である。オリゴヌクレオチド開裂試薬はメチルアミンおよび/または水酸化アンモニウムおよびトリメチルアミンを含む。

Description

【発明の詳細な説明】 ユニバーサルな固体支持体およびその使用方法 発明の背景 本発明は一般的には化学および生物学の分野に関するものである。より詳細に は、本発明はオリゴヌクレオチド類(例えばDNAおよびRNA配列)の合成に 使用する組成物および方法に関する。 オリゴヌクレオチド配列の作成のために種々の合成法が開発された。典型的に はオリゴヌクレオチドは、固体支持体(担体)に固定した成長するオリゴヌクレ オチド鎖にヌクレオチドを逐次付加することを含んでなるビルディングブロック 法を用いて合成される。あらゆるDNAオリゴヌクレオチドは4つの異なる最初 のヌクレオチドのいずれかを有するから、4つの異なるヌクレオシド(A,C, GおよびT)を担う固体支持体を供給し、所与のDNA配列の合成を維持するこ とが必要である。DNA合成の場合は、DNA配列の3’末端からの最初のヌク レオシドをエステル結合を介して固体支持体にあらかじめ担持させるのが普通で ある。例えば、合成すべき配列が3’末端にTヌクレオシドを含む場合、T支持 体を用い、DNA配列中のヌクレオチド類の残りをそれに加える(例えば、自動 DNA合成機を用いる)。全DNA合成が終わったとき、エステル結合を加水分 解してオリゴヌクレオチドを固体支持体から離脱させる。RNA合成法を考慮す ると、使用者はもう一つの4種類ヌクレオシドを担持する固体支持体を使用でき なければならない。もしも特別に改質したいずれかのヌクレオシドが3’末端に 所望である場 合、同様な考慮が払われる。 少なくとも8種類のあらかじめ誘導体化された固体支持体の供給を維持するこ とは不便であり、費用がかかる。もう一つの考慮はヌクレオシド誘導体化固体支 持体の比較的短い保存寿命である。典型的には貯蔵1年後には、そのような固体 支持体はもはや使用できない。誤って良くない支持体で合成を開始し、そのオリ ゴヌクレオチドの最終使用において悲惨な結果に導くという可能性もある。 これらの問題を軽減するために、若干の研究者は幾つかのタイプのユニバーサ ルな固体支持体を開発すべく研究を行っている。例えばデベア(deBear)らは、 2’(3’)−O−ベンゾイルウリジン5’−O−スクシニルでガラス支持体を 誘導体化し、その際ウリジン部分がエステル(スクシネート)結合によってガラ スに結合するようにした。[デベアら、ヌクレオシド類およびヌクレオチド類、6巻 、821−830ページ(1987)]。オリゴヌクレオチド合成はヌクレ オチドモノマーをウリジンの2’または3’位置に付加することによって行われ る。その合成後、1つの反応で、新しいオリゴヌクレオチドをそのガラスから離 し、保護を除去し、ウリジリル末端から開裂する。ウリジル官能性はこの開裂反 応で固体支持体から引き離されるから、その支持体はその後のオリゴヌクレオチ ド合成には使用できない。 クレア(Crea)およびホーン(Horn)は、二量体5’−O−p−クロロフェニ ルホスフォ−2’(3’)−O−アセチルウリジリル−[2’(3’)−3’] −5’−O−ジメトキシトリチルチミジンp−クロロフェニルエステルを作り、 その二量体をホスフェート結合によってセルロースに付着結合させることを含む 同様なアプロ ーチを示唆した。[クレア(R.Crea)及びホーン(T.Horn)、核酸研究、8巻、 2331ページ(1980)]。その後の濃アンモニア水の使用は、合成オリゴ ヌクレオチドをセルロースから放出し、そのセルロースに付着結合した二量体の ウリジン部分を残す。クレアおよびホーンがウリジンからオリゴヌクレオチドが 分離する部位としてウリジンの反応性ビシナル基を用いたとはいえ、この文献に 示唆される固体支持体はユニバーサルな固体支持体ではない、なぜならば最初の オリゴヌクレオチドが固体支持体試薬に挿入され、別の第1のヌクレオシドを挿 入するオリゴヌクレオチドには別の支持体が必要だからである。 より最近になって、シュワルツ(Schwartz)らは、アダプター、2’(3’) - O−ジメトキシトリチル−3’(2’)−O−ベンゾイルウリジン−5’−O −(2−シアノエチル N、N−ジイソプロピルホスフォルアミダイト、をチミ ジン誘導体化ポリスチレンに付着結合し、ウリジンのO−ジメトキシトリチル位 置からオリゴヌクレオチドを合成した。[シュワルツ(M.E.Schwartz)、ブリー カー(R.R.Breaker)、アステリアディス(G.T.Asteriadis)およびゴー(G.R.G ough)、テトラヘドロンレターズ(Tetrahedron Letters)、36巻、1号、2 7−30ページ、1995]。このアプローチはオリゴヌクレオチド合成のため のユニバーサルな固体支持体を提供する一方、開裂段階はアダプターおよびチミ ジンを支持体から放出し、その後合成されたオリゴヌクレオチドをウリジンから 切り離した。こうして精製過程はチミジンリンカーの除去を必要とし、その開裂 プロセスはその後の固体支持体の使用を不可能にする。 上記の固体支持体およびそれらの使用法は、その後のオリゴヌクレオチド開裂 工程の好適性および効率の点で不都合である。DNA合成の安全な試薬として広 く受け入れられているアンモニアを、デベアの教示により、開裂のために使用す るとき、開裂時間は65℃で24時間にもなる。オリゴヌクレオチドをできるだ け速く生成しようとする傾向が増えていることを考慮すると、これは許容できな いほど長時間である。ウリジリルをオリゴヌクレオチドからウリジン3’位置で 開裂するために必要な時間を減らすためには、普通は鉛(II)イオン触媒系ま たは強アルカリ水酸化物の作用を用いる。必然的にこれらのプロセスは鉛イオン を除去するための別個の分離工程を必要とする。その上、強アルカリ塩基を開裂 工程に用いるとき、シトシン脱アミノ反応の形のかなりの副反応がおきる。 同時複数オリゴヌクレオチド合成(数種類のオリゴヌクレオチドを同時に合成 する)の自動化の最近の進歩は、オリゴヌクレオチド類の合成のために単一のユ ニバーサルな固体支持体を用いる好適性をさらに強調する。DNA合成機に幾つ かの異なるヌクレオシド予備的担持固体支持体を供給する要求はすべて合成自動 化を複雑にする。そのため、どんな核酸でも合成できるユニバーサルな固体支持 体を提供することが非常に望まれる。 本発明の目的は、先行技術の方法および組成物において遭遇する諸問題の幾つ かを軽減するオリゴヌクレオチド合成に使用するための方法および組成物を提供 することである。より詳細に述べるならば、最初のヌクレオシドの如何にかかわ らず種々のオリゴヌクレオチドを合成するために使用できる再利用可能オリゴヌ クレオチド合成試薬を提供することが本発明の目的である。合成後のオリゴヌク レオチドを離脱させるために必要な時間を実質的に短縮する開裂試薬および開裂 方法を提供することがもう一つの目的である。 発明の概要 本発明はオリゴヌクレオチド類の固体支持体合成に関連する先行技術の諸問題 を克服する方法および組成物を提供する。本発明の方法および組成物は段階的オ リゴヌクレオチド合成およびその後の合成されたオリゴヌクレオチドの単一工程 の開裂および脱保護に使用するのに適した単一の再利用可能なユニバーサルな固 体支持体を提供する。他の一面において、本発明はオリゴヌクレオチド類を、そ れらを合成した固体支持体から離脱させるのに適した開裂試薬を提供する。本発 明の開裂試薬は揮発性で、したがってその後試薬除去プロセスに時間を消費する 必要がない。その上、本発明の開裂試薬は合成したオリゴヌクレオチドを実質的 により短い時間で取り出す。 より詳細に述べるならば、本発明は下記の一般式を有するオリゴヌクレオチド 合成試薬を提供する: SS - R6 - O -R3 I はホスフェート保護基;およびR3はビシナル基−XR1および− YR2を有する環状部分であり、ここでXおよびYはそれぞれ、O、S、および NHからなる群から独立に選択され、R1およびR2の1方はブロッキング(遮断 )部分であり、他方は水素、またはヒドロキシ保護基である。)R3は糖環の第 2および第3炭素位置を占める−XR1および−YR2を有する糖部分であるのが 好ましい。最も好ましいのはR3が以下の構造をもつことである(式中、Bはプリンまたはピリミジン塩基であり、XおよびY並びにR1および R2はそれぞれ上記のようである。好ましいR1またはR2ブロッキング部分は、 2つのビシナルヒドロキシ官能基の1つにエステルブロッキング基を形成するこ とによって作ることができるアルキルカルボニルまたはアリールカルボニルであ る。R6の好ましい態様はホスフォルアミダイト結合および酸化型、ホスフォ 分であることである。)好都合なことに、これらの試薬はオリゴヌクレオチド合 成におけるユニバーサルな固体支持体として有用であり、この場合合成はヒドロ キシ保護基を有するビシナルR1またはR2の位置で起きる。他方のR1またはR2 位置はアリールカルボ ニルまたはアルキルカルボニルブロッキング部分でブロックされる。驚くべきこ とに、本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬を用いて合成したオリゴヌクレオチ ドの合成後の放出は、従来技術の固体支持体試薬を用いたオリゴヌクレオチドの 放出よりも実質的に速い。その上、それらのオリゴヌクレオチドは環状部分のビ シナル基の位置で分離する。環状部分と固体支持体との結合がホスフォルアミデ ートまたはホスフォルアミダイトであるとき、その分離は固体支持体接着をおこ さず、オリゴヌクレオチド試薬は合成操作の反復に適する。 本発明のもう一つの面において、オリゴヌクレオチドを固体支持体から離脱さ せるための開裂方法および開裂試薬が提供される。ここに記載される開裂試薬お よび開裂法は、種々の固体支持体に付着結合したオリゴヌクレオチド類、例えば エステル結合オリゴヌクレオチド、ホスフェート結合オリゴヌクレオチド、およ びホスフォルアミデートまたはホスフォルアミダイト結合オリゴヌクレオチド類 に適用できる。本発明の開裂方法は、オリゴヌクレオチドを担う固体支持体を、 メチルアミンおよび/または水酸化アンモニウムを含む第1の化合物と第二アミ ンおよび/または第三アミンである第2の化合物との混合物とを含む本発明の開 裂試薬と接触させることを含む。開裂試薬は40wt%メチルアミン水:23〜 25wt%トリメチルアミン水、約1:9(v/v)から、40wt%メチルア ミン水:23〜25wt%トリメチルアミン水溶液、約9:1(v/v)の範囲 であるのが好ましい。 これらのおよびその他の利点は、当業者には下記に示す本発明のより完全な理 解によって十分明らかになる。発明の詳細な説明 本発明は固体支持体に基づくオリゴヌクレオチド合成の組成物および方法の改 良を提供する。より詳細に述べるならば、本発明は、環状部分がホスフォルアミ デート結合を介して固体支持体に結合しているオリゴヌクレオチド合成試薬を提 供する。環状部分はビシナル位置の官能基を有し、その一方はオリゴヌクレオチ ドの段階的合成のための部位であり、他方は、合成中はブロッキングされるが開 裂プロセス中は脱ブロックして活性になる。本発明のオリゴヌクレオチド合成試 薬はユニバーサルな固体支持体であり、この支持体においては単一のオリゴヌク レオチド試薬がいかなる最初のヌクレオシドを有するいかなるオリゴヌクレオチ ドの合成にも有用であり、そのため種々の異なる適切に誘導体化された固体支持 体を維持する必要がない。その上典型的開裂プロセス中、本発明のホスフォルア ミデート結合は安定のままであるから、本発明の合成試薬をその後のオリゴヌク レオチド合成に使用することができる。 このような系において、2つのヒドロキシル(または以下に定義するような、 これらの同等物)が好ましくはcis型配置で隣接する炭素原子に結合している 。オリゴヌクレオチド合成のためには2つのヒドロキシルまたはヒドロキシル同 等物の1つがブロッキングされ、好ましくはヒドロキシルがヒドロキシルまたは ヒドロキシル同等物のエステル誘導体の形でブロッキングされる。ヒドロキシル または同等物または両ヒドロキシルまたは同等物の混合物のいずれか1つを適切 に使用すればよい。残るブロッキングされていないビシナル位置を用いてオリゴ ヌクレオチド鎖を延長する。典型的には この部位は適した保護基、例えばDMT(ジメトキシトリチル)で保護され、そ の後その合成に最初のヌクレオシドを加える直前に脱保護する。 合成終了時にブロックされたビシナル部位を脱ブロックするか、加水分解して ヒドロキシルまたは同等物を遊離させる。ヒドロキシルなどはその後オリゴヌク レオチド鎖の第1のヌクレオチドの隣接ホスフェート基を分子内攻撃して、環状 ホスフェートを形成する。これは固体支持体からオリゴヌクレオチド分子を放出 させる。オリゴヌクレオチド合成中にどんなヌクレオシドが最初に固体支持体に 加えられても、そのヌクレオシドが合成分子の3’−末端ヌクレオシドになる( そのオリゴヌクレオチドが一般的な3’から5’への方向に合成される場合)。 本発明の第一の面により、一般式Iを有するオリゴヌクレオチド合成試薬が提 供される SS - R6 - O -R3 I スフェート保護基であり、R3はビシナル基−XR1および−YR2を有する環状 部分であり、ここでXおよびYはそれぞれO、S、およびNHからなる群から独 立に選択され、R1およびR2の一方はブロッキング部分であり、他方は水素、ま たは−OH、−SH、もしくはNH2の保護に適したヒドロキシ保護基である。 )R6が ホスフォルアミダイトまたはその酸化型、ホスフォルアミデートである場合、当 業者はR5が好ましくは水素であることを認める。これは、これらのオリゴヌク レオチド合成試薬が一般に第一アミンを用いて作られるからである。しかし当業 者は、ホスフォルアミデートは第二アミン類を用いて作られるから、R5はアル キルでもよいことを理解する。 ホスフェート保護基R4は、オリゴヌクレオチド合成中、ホスフォルアミデー トまたはホスフォルアミダイトのリンを切断または反応から保護することのでき るいかなる適した基でもよい。当業者は、シアノエチル部分が、オリゴヌクレオ チド合成条件下で安定であり、アンモニアまたはメチルアミンで除去しやすいた め、好ましいホスフェート保護基であることを認めている。しかし、本発明に利 用されるホスフォルアミデートまたはホスフォルアミダイト結合は脱保護の必要 がなく、したがってアルキル部分は一般的に、またはアリール含有部分も、適し たホスフェート保護基R4であることは理解される。 下記の理由により、ビシナル基−XR1および−YR2は、それらが相互にci s型に位置する場合に最も有効である。環部分に結合した隣接官能基はcis型 に存在し得るから、R3は好ましくは環部分であり、−XR1および−YR2は空 間で固定されたcis位置をとる。しかしR3は適切なビシナル構成成分を有す る直鎖部分、例えばグリセロールであることも可能である。多くの糖はビシナル 位ヒドロキシ官能基を有する環系であるから、R3は、−XR1および−YR2が 糖環の第2およ第3の炭素位置を占めている糖であることが好ましい。下記の理 由により、ヌクレオシド類、また は付加プリンまたピリミジン塩基を有する糖類が特に好ましい環部分である。最 も好ましいR3は下記の構造を有する (式中、Bはプリンまたはピリミジン塩基であり、XおよびYはそれぞれO、S 、およびNHからなる群から独立に選択され、R1およびR2の一方はアルキルカ ルボニルまたはアリールカルボニル基であり、R1およびR2の他方は水素、また は−O、−S、もしくは−NHを保護するために適した保護基である。)利用可 能性および使用しやすさの点から、Bがウリジンであるのが好ましい。 当業者は、糖類およびグリセロール型ジオール類に利用でき、それらの保護に 適した公知の保護基であることから、XおよびYは好ましくはO(酸素)である ことを認めている。しかし、当業者にとって、本発明の目的のためにこのような 位置にNHおよびSを利用することも本発明の範囲内であることは当然である。 ビシナル位置の1つをオリゴヌクレオチド合成参加からブロックするために、 R1またはR2は適切なブロッキング基である。下記のように、ブロックされない XまたはYは最終的オリゴヌクレオチド開裂工程において活性であるから、ブロ ッキング基は開裂反応条件下では容易に除去されなければならないとはいえ、オ リゴヌクレオチド合成に一般的に認められる条件下では安定でなければならない 。この理由により、R1またはR2の1つは好ましくはアルキルカルボニルまたは アリールカルボニルである。アルキルカルボニル 部分はC=Oに終わる脂肪族基であり、その脂肪族成分は1(すなわちアセチル )〜約10個の炭素原子を含む。アリールカルボニル基とは少なくとも1つのホ モ芳香族環またはヘテロ芳香族環を含み、C=Oに終わる残基を意味する(例え ばC6H5CO)。 ブロッキング基ではないR1またはR2と結合するヒドロキシル保護基は、容易 に除去される基であるのが適切であり、その結果保護された基はオリゴヌクレオ チド合成開始中に第1のヌクレオシド導入のための部位として使用できるように なる。本発明の目的のためには、4,4’−ジメトキシトリチル(DMT)基が 特に好ましい。その他の適した基としては下記のものが含まれるが、これらに制 限するものではない:4,4’,4”−トリス−(ベンジルオキシ)トリチル( TBTr)、4,4’,4”−トリス−(4,5−ジクロロフタルイミド)トリ チル(CPTr)、4,4’,4”−トリス−(レブリニルオキシ)トリチル( TLTr)、3−(イミダゾリルメチル)−4,4’−ジメトキシトリチル(I DTr)、ピキシル(9−フェニルキサンテン−9−イル)、9−(p−メトキ シフェニル)キサンテン−9−イル(Mox)、4−デシロキシトリチル(C10 Tr)、4−ヘキサデシロキシトリチル(C16Tr)、9−(4−オクタデシロ キシフェニル)キサンテン−9−イル(C18Px)、1,1−ビス−(4−メト キシフェニル)−1’−ピレニルメチル(BMPM)、p−フェニルアゾフェニ ロキシカルボニル(PAPoc)、9−フルオレニルメトキシカルボニル(Fm oc)、2,4−ジニトロフェニルエトキシカルボニル(DNPEoc)、4− (メチルチオメトキシ)ブチリル(MTMB)、2−(メチルチオメトキシメチ ル)−ベンゾイル(MTMT)、2− (イソプロピルチオメトキシメチル)ベンゾイル(PTMT)、2−(2,4− ジニトロベンゼンスルフェニルオキシメチル)ベンゾイル(DNBSB)、およ びレブリニル基。これらのおよびその他の適した保護基はビューケイジ(Beauca ge,S.L.)およびアイヤー(Iyer,R.P.)テトラヘドロン、48巻、2223− 2311ページ(1992)に詳細に記載されている。この全開示は参照されて ここに挿入される。 本発明の目的のために、Bはピリミジンまたはプリン塩基である。本発明によ り使用するためには、グアニン、アデニン、チミジンおよびシトシンを特徴づけ る塩基が好ましいが、ヌクレオチド類似体の合成に用いられるその他のプリンま たはピリミジン塩基も代わりに基Bとして用いてもよい。 ここに記載の例から明らかなように、本発明の好適オリゴヌクレオチド合成試 薬は下記の構造を有する この分野に従事する人々には容易に理解できるように、オリゴヌクレオチド合 成には従来用いられている非常に種々様々の固体支持体を用いることができる。 固体支持体は、適切なホスフォルアミダイトが結合するための官能基を含み、そ れに結合するホスフォルアミデート結合、置換ホスフォルアミダイト結合、また は日常的方法によってそれに結合するエステル結合を形成し、一般的官能基はヒ ドロキシル、スルフヒドリルおよびアミノを含む。下記の典型的支持体が用いら れる。CPG[ポン(Pon,R.T.)ら、バイオテクニックス、6巻、768ページ 、1988、アダムス(Adams,S.P.)ら、J.Amer.Chem.Soc.105巻、661ペ ージ(1983)]、フラクトゲル[メルク社(E.Merck)、ダルムシュタット 、ドイツ、から“フラクトゲル”の商品名で販売、およびトソハース社(TosoHa as)、フィラデルフィア、ペンシルバニア、から“トヨパール”の商品名で販売 、レディー(Reddy,M.P.)ら、テトラヘドロンレターズ 35巻、5771−5 774ページ(1994)]、およびテンタゲル[ラップポリマー社(Rapp Pol ymere)、チュービンゲン、ドイツ、アンドルス(Andrus)ら、テトラヘドロン レターズ、34巻、3373−3376ページ(1993)]。固体支持体は 、ビシナル反応基と結合を形成するための適した官能基を有するスペーサー結合 で誘導体化できることは、当業者によって理解される。このようなスペーサー結 合は若干の人々には好まれる、なぜならばそれらは固体支持体に距離を置く鎖と して作用するからである。 DNA合成に一般に用いられるその他の支持体[例えばガイト(Gait,M.J.) 著、オリゴヌクレオチド合成:実際的アプローチ、I RLプレス(1984)および米国特許第4,923,901号に記載されてい る]も本発明によって使用するのに適している。固体支持体は樹脂状または粒状 型で、その他のあらゆるサイズの予備成形された形、繊維、フィルムなどの形で 好適に用いられる。 好都合なことに、本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬は保護されていない、 または保護された−OH、−SH、−NH2を使用することができるいかなるオ リゴヌクレオチド合成法―オリゴヌクレオチド合成のために最も広く用いられる カップリング化学であるホスフォルアミダイトを用いる方法も含める―にも用い ることができる。しかし、その他のカップリング化学、例えばH−ホスフォネー ト化学[米国特許第4,959,463号、フレーラー(Froehler,B.C.)ら、 核酸研究14巻、5399ページ(1986)]およびトリエステル化学[ステ ック(Stec,W.J.)ら、テトラヘドロンレターズ、26巻、2191ページ(1 985)、ガロ(Gallo,K.O.)ら、核酸研究14巻、7406ページ(1986 )、ガイト、オリゴヌクレオチド合成:実際的アプローチ、IRLプレス(19 84)]も同様に使用に適する。こうして種々の種類の核酸がオリゴヌクレオチ ド合成に用いられる。DNA、RNA、オリゴヌクレオシドメチルホスフォネー ト類[アガルワル(Agarwal.S)&グッドチャイルド(Goodchild,J)、テトラヘ ドロンレターズ28巻、3539ページ(1987)]、オリゴヌクレオシドホ スフォロチオエート類[ビューケイジら、J.Am.Chem.Soc.112巻、1253ペ ージ(1990)]、オリゴヌクレオシド ホスフォロジチオエート類[ダール (Dahr,O)&ジャーゲイド(Bjergade.K.)核酸研究19巻、5843ページ( 1991)]、環状オリゴヌクレオチ ド類[クール(Koool,E.T.)およびワング(Wang S.)、核酸研究22巻、23 26ページ(1994)、クールら、J.Amer.Chem.Soc.115巻、360ページ 、(1993)]、2’−OMeRNA[スプロート(Sproat,B.S.)ら、核酸 研究18巻、41ページ(1989)]、およびペプチド核酸含有生成物[ニー ルセン(Nielsen,P.E.)ら、Bioconjugate Chem.5巻、3ページ(1994) ]またはモルフォリン型バックボーン改質核酸[スターチャク(Stirchak)ら、 核酸研究17巻 6129ページ(1989)、米国特許第5,034,506 号]。 ここに記載の方法による固体支持体上の合成は、固体支持体につながれたオリ ゴヌクレオチドを生成する選択を提供する。支持体につながれたオリゴヌクレオ チドは種々の用途、例えばDNA親和性抽出および逆ブロットハイブリッド形成 などに使用できる。一アプローチにおいてオリゴヌクレオチド合成の終了時に固 体支持体を室温でメチルアミンで約1時間処理して、ヌクレオシドに含まれるプ リンおよびピリミジンの複素環アミノ基から保護基を除去する。この処理はごく 少量のオリゴヌクレオチドを固体支持体から解放し、大部分のオリゴヌクレオチ ドはそのままに固体支持体上に残る。これはまだ固体支持体に付着結合している 生物学的活性オリゴヌクレオチドを提供する。 もう一つのアプローチにおいて、隣接ヒドロキシルをシリルなどの基によって 保護する。このような系においては、オリゴヌクレオチドは例えばCH3NH2な どで処理した後も支持体に結合したまま留まる。しかしシリル基は例えばテトラ ブチルアンモニウムフルオライドによっては除去され、ヒドロキシルを遊離する ことができ る。塩基性条件下では離脱したヒドロキシルは隣接したホスフェートを攻撃し、 こうしてDNAを固体支持体から放出する。 本発明のその他の面により、固体支持体からオリゴヌクレオチドを切り離す方 法およびオリゴヌクレオチドの合成に用いられた固体支持体からそのオリゴヌク レオチドを離脱させるために有用な試薬が提供される。好ましくは本発明の開裂 試薬および開裂方法は、ビシナルジオール対またはその官能基同等物の1つのヒ ドロキシル又はその同等物などからヌクレオシドの段階的付加によってオリゴヌ クレオチドを合成する、オリゴヌクレオチド合成系に応用できる。最も好ましい のは、そのオリゴヌクレオチド試薬が、本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬を 用いて合成したオリゴヌクレオチドの開裂に利用できることである。しかしなが ら、本発明の方法および開裂試薬は、エステル結合およびホスフェート結合によ って固体支持体に付着したオリゴヌクレオチド類の開裂にも同様に有用である。 特に、本発明の開裂方法は、オリゴヌクレオチドを担う固体支持体と、 第三アミン類と第二アミン類とからなる群から選択されるアミンと、水酸化アン モニウムと第一アミンとからなる群から選択される塩基との混合物を含む本発明 の開裂試薬、 とを接触させることを含んでなる。最も好ましい開裂試薬はトリメチルアミンと メチルアミンとの溶液である。本発明の実施に適したその他の第二および第三ア ミン類は種々のアミン(高いpKaをもつ塩基)、例えばトリエチルアミン、n −プロピルアミン、ジイソプロピルアミン、ジイソプロピルエチルアミン、ジメ チルアミン、ジエチルアミン、ピペリジン、N−メチルピペリジンおよびN−メ チルピロリジンなどを含める。好ましい第三アミン類はトリメチルアミン、トリ エチルアミン、N−メチルピロリジン、およびジイソプロピルエチルアミンを含 める。下に示すように、開裂試薬中の水酸化アンモニウムまたは第一アミンの量 、および第二アミンまた第三アミンの量はかなり変動し得る。例えば、好ましい 開裂試薬において、第二アミンまたは第三アミンに対するメチルアミンまたは水 酸化アンモニウムの比は約1:100〜約100:1の範囲内である。好ましい 濃度比および構成成分は、メチルアミン水を少なくとも9部 対 アンモニアよ り大きい塩基性をもつ有機塩基1部、である。最も好ましい開裂試薬は、40w t%メチルアミン水1部対 3〜25wt%トリメチルアミン1部、である。( 当業者は、メチルアミンおよびトリメチルアミンが標準温度および圧力では気体 であり、それらの典型的利用可能性は水溶液の形であることを認めている。典型 的メチルアミン水は40wt%メチルアミンで、トリメチルアミンの典型的濃度 は23〜25wt%の範囲である。本発明の範囲で用いられる、メチルアミンお よびトリメチルアミンの1:1v/v溶液という言い方は、40wt%メチルア ミンと約24wt%トリメチルアミン溶液の1:1v/v溶液を指す。) さらに開裂反応混合物中に無機塩を含み、開裂速度を高めることも本発明の範 囲内と考えられる。そのような塩は典型的にはLiまたはNaの塩であるが、そ の他のMnおよびMgなどのカチオン類も適する。0.5M LiClを1:1 メチルアミン:トリメチルアミンの開裂試薬に用いるとき、65℃、15分後に 開裂されるオリゴヌクレオチド量は、約45%(LiClの存在しないとき)か ら約65分に増加することが認められている。 本発明によると、固体支持体からのオリゴヌクレオチドの開裂速度は固体支持 体とオリゴヌクレオチド合成部位との結合の性質によって影響を受ける。より詳 細に述べるならば、固体支持体にエステル結合によって結合したビシナル部位で 合成されたオリゴヌクレオチドに関係する開裂反応は、先ず最初のエステル結合 の加水分解と、その後のビシナル部位からのオリゴヌクレオチドの開裂を含む。 ビシナル−ジオール基を含む結合基を固体支持体に付着させる脂肪族エステル結 合の使用に対して、ホスフォルアミデート結合の使用は開裂速度を容易により速 くする。 エステル結合の場合(デベアらが記載したように)、エステルは最初に約5分 間で加水分解される。この結果オリゴヌクレオチドを結合基を含んで固体支持体 から離脱する。結合基をオリゴヌクレオチドから分離するには、その後65℃、 約4時間のインキュベーションを必要とする。 本発明によるホスフォルアミデート結合を有するオリゴヌクレオチド合成試薬 を利用する場合、オリゴヌクレオチドはビシナル反応部位から離脱され、ホスフ ォルアミデート結合はその支持体にまだ付着しそのままである。この開裂反応は 1:1v/vメチルアミン/トリメチルアミン開裂試薬を用いて(上記のように )65℃約90分間で完了する。かなりの量のオリゴヌクレオチドが実質的に短 時間内にその結合から離脱する。すなわち、約60%のオリゴヌクレオチドが1 5分間の反応時間後離脱する。これは、結合基のホスフォルアミデート基が核酸 からのビシナル−ジオール系の開裂を促進することを示唆する。 エステル結合を介して固体支持体に付着結合したビシナル−ジオ ール系からのオリゴヌクレオチドの開裂を調べると、濃アンモニアを65℃で用 いると、24時間ものインキュベーション時間が必要であることが認められ、こ れは商業上は好ましくない長い時間である。メチルアミン/アンモニアを用いた とき、開裂時間は12時間に短縮された。しかしその時間短縮は、メチルアミン の反応性に基づいて期待した程には大きくない。メチルアミンはその求核性のた めにエステルを加水分解させるにはアンモニアより約10倍も反応性であること が報告されている[レディー(Reddy,M.P.)ら、テトラヘドロン レターズ 3 5巻 、4311(1994);米国特許第5,348,868号]。メチルアミ ンは速度の約2倍の加速を示したに過ぎないから、メチルアミンは強い求核剤と してでなく、単にアンモニアより強い塩基として作用しているらしいと考えられ る。これは、ビシナル−ジオール系の1つのヒドロキシルを活性化して隣接ヒド ロキシルを攻撃するためには、より強い塩基が必要であることを示唆する。 よって、種々の比較的強い有機塩基(高いpKaを有する塩基類)、例えばト リメチルアミン、トリエチルアミン、n−プロピルアミン、ジイソプロピルアミ ン、ジイソプロピルエチルアミン、ジメチルアミン、ジエチルアミン、ピペリジ ン、N−メチルピペリジンおよびN−メチルピロリジンを、メチルアミンと1: 1混合物として用いた。メチルアミンを用いてオリゴヌクレオチドの複素環アミ ノ基から保護基を除去し、合成されるオリゴヌクレオチドのヌクレオシドのホス フェート保護基を除去した。これらの典型的組成物を用いて、開裂時間をどうに か3時間〜7時間の間に減らすことができた。 本発明の方法はオリゴヌクレオチド合成に用いられるほとんどすべての種類の ビシナル−ジオールまたは同等の系からオリゴヌクレオチドを開裂するために適 する。このような系は下記の一般式によって、表わされる (式中、Sは固体支持体であり、Aは結合基、XおよびYは−OH、−SH、お よび−NH2からなる群から独立に選択され、R9、R10およびR11はオリゴヌク レオチド合成反応を妨害しない置換基である。当業者は、ある条件下のアミノま たはチオール基が、より大きい安定性を提供しおよび/または固体支持体から核 酸をより速く遊離させる観点から好都合であることを認識している。好適系にお いてR9、R10およびR11の2つが一緒になって、(XおよびY置換基を担う炭 素と組合って)環系を形成する単一部分を構成する。例えば開裂速度はグリセロ ール系よりウリジン系の方が速い、それは多分グリセロールC−C結合周囲の自 由回転(それは環状ホスフェートを形成しにくくする)によるものである。好適 系(例えばウリジンを含むもの)の場合には、ヒドロキシルはcis配置に固定 されていて、それは環状ホスフェートに導きやすい。非常に種々様々のその他の ビシナル−ジオール系(例えばジヒドロキシシクロペンタン、ジヒドロキシシク ロヘキサンおよびアンヒドロエリトリトール)も適する。 当業者は、本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬またはその他の有効な固体支 持体系のビシナル位置のブロッキング部分は、本発明 の試薬を用いる全体的開裂時間に影響しないことを認識している。すなわち、開 裂時間はその基が例えばアセチル基で保護されるかまたはベンゾイル基で保護さ れるかには関係しない。これはさらに、エステル加水分解(すなわち保護基のヒ ドロキシルからの除去)が速度非制限的な速い段階であり、一方離脱したヒドロ キシの、合成オリゴヌクレオチドの隣接リンへの攻撃は速度制限的なより緩徐な 段階である。 本発明は添付の例を参照してより良く理解される。これらの例は説明の目的で 提供されるものであり、ここに添付のクレームにおいて定義される本発明の範囲 を決して制限するものではない。 例 例1 2’(3’)−O−アセチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリ チル)−ウリジン−5’−O−(N,N−ジイソプロピル)−β−シアノエチル −ホスフォルアミダイトの合成 下記の例は本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬を製造するために適したホス フォルアミダイト試薬の合成を説明する。 2’(3’)−O−アセチル−2’(3’)−O−(4、4’− ジメトキシトリチル)−ウリジン(0.65g、1.1mmol)をピリジン、 トルエンおよびTHFと共に次々と同時蒸発することによって乾燥した。乾燥残 渣を乾燥THF(5ml)に溶解し、N、N−ジイソプロピルエチルアミン(0 .85ml、4mmol)を加え、その後β−シアノ−エチルモノクロロ−N、 N−ジイソプロピルホスフォルアミダイト(0.5ml、2mmol)を、室温 でアルゴン下で一定に撹拌し、注射器を用いて5分間にわたって滴下して加える 。さらに60分撹拌後、反応混合物を蒸発乾固し、残渣を酢酸エチル(50ml )に溶解し、10%NaHCO3溶液で洗い(2×50ml)、Na2SO4で乾 燥した。酢酸エチルを減圧下で除去した後、残渣をシリカゲル(あらかじめ10 0〜120℃に加熱した)カラムクロマトグラフィーを用いて精製した。カラム に酢酸エチル/ジイソプロピルアミン(95/5v/v)中予備加熱したシリカ ゲルを詰め、酢酸エチルで溶出した。生成物を含むフラクションを集め、減圧下 で蒸発し、高真空を用いて乾燥すると標題の化合物が白色固体として得られた( 0.6g、69%収率)。 1H−NMR、CDCl3中、次のようである:δ1.19(m、12H、2C H(CH 3)2)、1.97(d、3H、COCH 3)、2.46(m、4H、C H2CH 2CN)、3.63(m、4H、C5、CH 2および2×CH(CH 3)2) 、3.77(d、6H、2×OCH 3)、4.13(m、1H、C4・H)、4. 29(m、1H、C3・H)、5.0(m、1H、C2・H)、5.69(m、1 H、C1・H)、6.50(m、1H、C5・H)および6.75−7.72(m 、14H、C6 HおよびDMTの 芳香族プロトン)。 CDCl3中の31p−NMRデータは次のようであった:δ147.98およ び148.56ppm。例2 2’−トリフルオロアセトアミド−3’−O−(4,4’−ジメキシトリチル) −2’−デオキシウリジン−5’−スクシネーヒドロキシル/アミノ類似体)の 合成 下記は、本発明の開裂試薬を用いて開裂することのできるオリゴヌクレオチド の作成のために利用できる固体支持体の製造に適したスクシネートの合成を説明 する。文献の方法[モファット(J.Moffat)ら、J.Org.Chem.36巻、250ペ ージ(1971);エクスタイン(F.Eckstein)ら、J.Org.Chem.42巻、71 4ページ(1977)]により合成した2’−アミノ−2’−デオキシウリジン (3.1g、12.76mmol)を乾燥メタノール(260ml)中に懸濁し 、S−エチルトリフルオロアセテート(2.5ml、19.67mmol)を加 えた。混合物を室温で2時間撹拌し、それから室温で24時間放置し、均質な透 明溶液を得た。この溶液に 窒素を1時間あわだてて通した。溶媒を減圧で除去すると2’−トリフルオロア セトアミド−2’−デオキシウリジン中間体が4g得られ、それを精製せずに用 いた。この中間体(1.5g、4.62mmol)を乾燥ピリジンと共蒸発し( 2×50ml)、イミダゾール(0.35g、5mmol)を含む乾燥ピリジン (50ml)に溶解した。tert- ブチルジメチルシリルクロライド(0.75g 、5mmol)を撹拌しながら加えた。反応混合物を室温で16時間撹拌した。 溶媒を減圧下で除去し、残渣をCH2Cl2(100ml)に溶解し、5%炭酸水 素ナトリウム溶液(2×50ml)で洗い、無水硫酸ナトリウム上で乾燥した。 溶媒を除去すると粗生成物が得られ、それをシリカゲル(60g)で精製した。 CH2Cl2−MeOH(98/2、v/v)で溶出すると5’−O−(tert- ブ チルジメチルシリル)−2’−トリフルオロアセトアミド−2’−デオキシウリ ジンが得られた(1.63g、78%収率)。 5’−O−(tert- ブチルジメチルシリル)−2’−トリフルオロアセトアミ ド−2’−デオキシウリジン(1.5g、3.3mmol)を乾燥ピリジンとの 共蒸発によって(2×50ml)乾燥し、乾燥ピリジン(50ml)に溶解した 。ジメトキシトリチルクロライド(1.725g、5.1mmol)を撹拌下で 加えた。生成した反応混合物を一晩撹拌した(16時間)。反応混合物をメタノ ール(10ml)で希釈し、溶媒を減圧下で除去した。残留物をCH2Cl2(1 00ml)に溶解し、5%炭酸水素ナトリウム(1×100ml)、ブライン( 1×100ml)で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を除去すると粗 生成物が得られ、それをシリカゲルで、溶出溶媒としてCH2Cl2−MeOH( 99:1 、v/v)を用いて精製した。その生成物を含むフラクションを集め、蒸発する と2’−トリフルオロアセトアミド−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチ ル)−5’−O−(tert- ブチルジメチルシリル)−2’−デオキシウリジンが 得られた(1.8g、72.29%)。 2’−トリフルオロアセトアミド−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチ ル−5’−O−(tert- ブチルジメチルシリル)−2’−デオキシウリジン(1 .5g、1.98mmol)をTHF中1.0Mテトラブチルアンモニウムフル オライド(20ml)で室温で15時間処理した。溶媒を除去し、残留物をCH2 Cl2に溶解し、シリカゲルカラムに注入し、それをCH2Cl2中0〜3%メタ ノールの400ml部分で溶出した。所望フラクションを集め、蒸発乾固し、真 空下で乾燥すると2’−トリフルオロアセトアミド−3’−O−(4,4’−ジ メトキシトリチル)−2’−デオキシウリジン(0.9g、71%収率)が得ら れた。 2’−トリフルオロアセトアミド−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチ ル)−2’−デオキシウリジン(0.64g、1mmol)、無水コハク酸(0 .32g、2.55mmol)およびDMAP(0.7g、2.5mmol)を 無水ピリジン(15ml)に溶解し、室温で24時間撹拌した。ピリジンを減圧 下で蒸発し、残留物を乾燥トルエンと共蒸発した(2×10ml)。残留物をC H2Cl2(10ml)に溶解し、室温で、速く撹拌しているヘキサン(100m l)に入れて沈殿させた。生成物を濾取し、真空乾燥すると2’−トリフルオロ アセトアミド−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−デオキシ ウリジン−5’−スクシネートが得られた。例3 2’−トリフルオロアセタミド−3’−O−(4、4’−ジメトキシトリチル) −2’−デオキシウリジン−5’−O−(N,N−ジイソプロピル)−β−シア ノエチル−ホスフォルアミダイトの合成 下記は本発明のオリゴヌクレオチド試薬の製造に有用なホスフォルアミダイト 試薬の合成を説明する。2’−トリフルオロアセトアミド−3’−O−(4,4 ’−ジメトキシトリチル)−2’−デオ キシウリジン(0.64g、1mmol)を、ピリジン、トルエンで次々に共蒸 発して乾燥し、N、N−ジイソプロピルエチルアミン(0.85ml、4mmo l)を含む乾燥THF(5ml)に溶解した。この溶液に、β−シアノ−エチル モノクロロ−N,N−ジイソプロピルホスフォルアミダイト(0.5ml、2m mol)を、アルゴン下で常に撹拌しながら注射器を用いて、室温で5分間にわ たって滴下した。90分間撹拌後、反応混合物を蒸発乾固し、残留物を酢酸エチ ル(50ml)に溶解し、10%NaHCO3で洗い、Na2SO4で乾燥した。 減圧下で酢酸エチルを蒸発し、残留物をシリカゲル(100〜120℃に予備加 熱したもの)カラムクロマトグラフィーを用いて精製すると、2’−トリフルオ ロアセトアミド−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−デオキ シウリジン−5’−O−(N,N−ジイソプロピル)−β−シアノエチル−ホス フォルアミダイトが得られた。例4 2’−(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’−ジメトキシリチル)−2’ −デオキシウリジン−5’−スクシネート(ヒドロキシル/チオール類似体)の 合成 下記は、本発明の開裂試薬および方法を用いてその後開裂できるオリゴヌクレ オチドを合成するために用いる適したスクシネート試薬の合成を説明する。乾燥 ピリジン(50ml)中の、文献記載の方法[リース(B.Reese)ら、J.Chem.So c.、Perkin Trans 1、969(1990)]によって製造した2’−デオキシ −2’−メルカプトウリジン(2.6g、10mmol)を無水条件下で1,3 −ジクロロ−1,1,3,3−テトライソプロピルジシロキサン(3.13ml 、10mmol)で室温で処理した。TLCは4時間後には反応が完了すること を示した。溶媒を真空除去し、残留シロップを酢酸エチル(50ml)に溶解し た。溶液を5%炭酸水素ナトリウム水で洗い(2×50ml)、Na2SO4で乾 燥し、濾過した。溶媒を真空中で除去した。粗3’,5’−O−(テトライソプ ロピルジシロキサン−1,3−ジイル)−2’−デオキシ−2’−メルカプトウ リジンを、シリカゲルカラムで、CH2Cl2を溶出溶媒として用いて精製した。 3’,5’−O−(テトライソプロピルジシロキサン−1,3−ジイル)−2 ’−デオキシ−2’−メルカプト−ウリジン(5mmol)をDMAP(250 g、2mmol)を含む乾燥ピリジン(20ml)に溶解した。塩化ベンゾイル (10mmol)を加え、生成した混合物を室温で5時間撹拌した。溶媒を真空 中で除去し、残留物をCH2Cl2(50ml)に溶解し、5%炭酸水素ナトリウ ム水およびブラインで洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を除去し、粗 生成物3’,5’−O−(テトライソプロピルジシロキサン−1,3−ジイル) −2’−デオキシ−2’−(ベンゾイルチオ)ウリジンをシリカゲルカラムクロ マトグラフィーで精製し た。 3’,5’−O−(テトライソプロピルジシロキサン−1,3−ジイル)−2 ’−デオキシ−2’−(ベンゾイルチオ)ウリジン(3.25mmol)をテト ラヒドロフラン中1.0Mテトラブチルアンモニウムフルオライド25mlに溶 解した。溶媒を減圧下で除去し、残留物をCH2Cl2(10ml)に取り、シリ カゲルカラムクロマトグラフィーで精製し、2’−デオキシ−2’−(ベンゾイ ルチオ)ウリジンを得た。 2’−デオキシ−2’−(ベンゾイルチオ)ウリジン(2.75mmol)を 乾燥ピリジンとの共蒸発によって(2×20ml)乾燥し、イミダゾール(5m mol)を含む乾燥ピリジン(50ml)に溶解した。tert−ブチルジメチルシ リルクロライド(5mmol)を撹拌しながら加えた。反応混合物を室温で16 時間撹拌した。溶媒を真空下で除去し、残留物をCH2Cl2(100ml)に溶 解し、5%炭酸水素ナトリウム溶液で洗い(2×50ml)、無水硫酸ナトリウ ムで乾燥した。溶媒を除去すると粗生成物5’−O−(tert−ブチルジメチルシ リル)−2’−デオキシ−2’−(ベンゾイルチオ)ウリジンが得られ、それを シリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製した。 5’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)−2’−デオキシ−2’−(ベン ゾイルチオ)ウリジン(2.09mmol)を乾燥ピリジンとの共蒸発によって (2×20ml)乾燥し、乾燥ピリジン(25ml)に溶解した。ジメトキシト リチルクロライド(3mmol)を撹拌下で加えた。反応混合物を室温で一晩( 16時間)撹拌し、それからメタノール(10ml)で希釈した。溶媒を真空下 で除去した。残留物をCH2Cl2(100ml)に溶解し、5%炭酸水素ナトリ ウム(2×50ml)およびブライン(50ml)で洗い、無水硫酸ナトリウム 上で乾燥した。溶媒を除去すると粗生成物5’−O−(tert−ブチルジメチルシ リル)−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’−デオキシ−2’ −(ベンゾイルチオ)ウリジンが得られ、それをシリカゲルカラムクロマトグラ フィーで精製した。 5’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)−3’−O−(4,4’−ジメト キシトリチル)−2’−デオキシ−2’−(ベンゾイルチオ)ウリジン(1.4 mmol)をTHF中1.0Mテトラブチルアンモニウムフルオライド20ml で室温で16時間処理した。溶媒を除去し、残留物をシリカゲルカラムクロマト グラフィーで精製すると、2’−(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’− ジメトキシトリチル)−2’−デオキシウリジンが得られた。 2’−(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)− 2’−デオキシウリジン(1mmol)、無水コハク酸(2.55mmol)お よびDMAP(2.5mmol)を無水ピリジン(20ml)に溶解し、室温で 24時間撹拌した。ピリジンを減圧下で蒸発し、残留物を乾燥トルエンで共蒸発 した(2×100ml)。残留物をCH2Cl2(15ml)に溶解し、室温で速 やかに撹拌しているヘキサン(100ml)中に入れて沈殿させた。生成物を濾 取し、真空下で乾燥すると2’−(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’− ジメトキシトリチル)−2’−デオキシウリジン−5’−スクシネートが得られ た。例5 2’−(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’−ジメトキシリチル)−2’ −デオキシウリジン−5’−O−(N,N’−ジイソプロピル)−β−シアノエ チル ホスフォルアミダイトの合成 下記は本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬の製造に有用なホスフォルアミダ イト試薬の合成を説明する。2’−(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’ −ジメトキシトリチル)−2’−デオキシウリジン(1mmol)をピリジンお よびトルエンとの連続共蒸発によって乾燥し、N,N’−ジイソプロピルエチル アミン(4mmol)を含む乾燥THF(5ml)に溶解した。この溶液にβ− シアノ−エチルモノクロロ−ジイソプロピルホスフォルアミダイト(2mmol )を注射器を用いて、アルゴン下、室温で常に撹拌しながら5分間にわたって滴 下した。60分間撹拌後、反応混合物を蒸発乾固し、残留物を酢酸エチル(50 ml)に溶解し10%炭酸水素ナトリウム溶液で洗い(2×50ml)、有機層 をNa2SO4で乾燥した。酢酸エチルを減圧下で蒸発後、残留物をシリカゲル( 100〜120℃で予備加熱)カラムクロマトグラフィーによって精製し、2’ −(ベンゾイルチオ)−3’−O−(4,4’−ジ メトキシトリチル)−2’−デオキシウリジン−5’−O−(N,N’−ジイソ プロピル)−β−シアノエチル−ホスフォルアミダイトを得た。例6 2’(3’)−O−(4、4’−ジメトキシトリチル)−2’(3’)−O−ア セチルウリジン−5’−スクシネートの合成 ウリジン(10g、41mmol)、トルエン−p−スルフォン酸1水和物( 2g、0.5mmol)およびトリメチルオルトアセテートを一緒に20℃で2 0時間撹拌した。TLCは4:1の割合で2生成物を表わした。ウリジンは見い だされなかった。反応混合物をメタノール性MeONaでわずかに塩基性にし、 濃縮して油状にし、CH2Cl2に溶解し、アルミナカラムクロマトグラフィーに よって精製した。生成物を(CH2Cl2:MeOH、96:4、v/v)で溶出 し、所望フラクションを集め、減圧下で蒸発すると、2’,3’−O−メトキシ エチリデンウリジン(8.8g、71.8%収率)が無色ガラスとして得られた 。 IR(KBr):u1670cm-1(s,環状アミドのC=O)、2900− 3600cm-1(NH,OH)。 1H−NMR(CDCl3):δ1.51および1.58(2s、3H、−CH 3 )、3.14および3.29(2s、3H、OCH 3)、3.58(m、2H 、C5・−CH 2)、4.06(m、1H、C4・−H)、4.89−5.10( m、2H、C2・−HおよびC3・−H)、5.63(d、1H、C5−H)、5 .80および5.95(2d、1H、C1・−H)、7.77(d、1H、C6−H )および11.42(s、1H、−NH)。 THF(100ml)中2’,3’−O−メトキシエチリデンウリジン5.2 g(18mmol)にイミダゾール(4.9g、4eq)を加え、その後ter t−ブチルジメチルシリルクロライド(5.4g、2eq)を加えた。生成した 反応混合物を室温で一晩(16時間)撹拌した。溶媒を除去した後、残留物をC H2Cl2(200ml)に取り、NaCl飽和溶液(200ml)、水で洗い、 Na2SO4で乾燥した。溶媒を減圧下で除去するとほぼ純粋な2’,3’−O− メトキシエチリデン−5’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)ウリジン (7.2g、99%収率)が半固体として得られ、それをそれ以上精製せずに次 の工程に用いた。 IR(Neat):1650cm-1(環状アミドのC=O)、3400−3600 cm-1(NH,OH)。 1H−NMR(CDCl3):δ−0.005(s、6H−Si(CH 3)2)、 0.82(s、9H、Si−(CH 3)3)、1.55および1.6(2s、3H 、CH 3)、2.79および2.87(2s,3H、−OCH 3)、3.82(m 、2H、C5・−CH 2)、4.22(m、1H、C4・H)、4.65(m、2 H、C2・H)、5.64(d、1H、C5−H)、6.0(2d、 1H、C1・−H)、7.50(d、1H、C6−H)および9.35(br、1 H、NH)。 2’,3’−O−メトキシエチリデン−5’−O−(tert−ブチルジメチ ルシリル)ウリジン8.0g(27.58mmol)に80%酢酸水(20ml )を加え、生成した混合物を室温で30分間撹拌した。溶媒を蒸発後、粗残留物 をシリカゲルカラムクロマトグラフィーにより、CH2Cl2/MeOH(97/ 3、v/v)を溶出溶媒として精製した。所望化合物を含むフラクションを集め 、蒸発し、真空下で乾燥すると、2’,(3’)−O−アセチル−5’−O−( tert−ブチルジメチルシリル)−ウリジンが半固体として得られた(7.6 g、68%収率)。 IR(Neat):u1701cm-1(s,br,アセチル基および環状アミドの C=O)。 1H−NMR(CDCl3):δ0.07(s、br、6H、−Si(CH 3)2 )、0.87(s、9H、−Si(CH 3)3)、2.03および2.10(2s 、3H、COCH 3)、3.87(m、2H、C5・−CH 2)、4.33(2m 、2H、C3・HおよびC4・H)、4.7(m、1H、C2、H)、5.65( d、1H、C5 H)、6.06(2d、1H、C1・−H)、7.85(d、1H 、C6 H)および10.18(br、s 1H、NH)。 2’,(3’)−O−アセチル−5’−O−(tert−ブチルジメチルシリ ル)−ウリジン(4g、10mmol)を乾燥CH2Cl2(50ml)に溶解し た。コリジン(4ml)を加え、その後テトラブチルアンモニウム過塩素酸(5 .13g、15eq)お よびジメトキシトリチルクロライド(5.07g、1.5eq)を加えた。反応 混合物を一晩撹拌し(16時間)、5%NaHCO3水2×50mlおよび水2 ×50mlで逐次洗った。有機層を無水Na2SO4で乾燥し、蒸発した。残留物 をシリカゲルクロマトグラフィーで精製した。カラムに1%TEA/CH2Cl2 を詰め、生成物をCH2Cl2で溶出した。所望フラクションを集め、蒸発すると 2’(3’)−O−アセチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリ チル)−5’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)−ウリジン(4.8g 、68%収率)が得られた。 1H−NMR(CDCl3):δ0.6(m、6H、−Si(CH 3)2)、0. 88(2s、9H、Si(CH 3)3)、2.22(2s、3H、COCH 3)、 3.52(m、2H、C5・−CH 2)、3.85(2s、6H、2×OCH 3) 、4.07(m、1H、C4・H)、4.26(m、1H、C3・H)、5.08 (m、1H、C2・H)、5.71(2d、1H、C1・−H)、6.59(2d 、1H、C5 H)、6.80−7.83(m、13H、芳香族H)および8.7 4(d、1H、C6 H)。 2’(3’)−O−アセチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシト リチル)−5’−O−(tert−ブチルジメチルシリル)−ウリジン(1.5 g、2.14mmol)をTHF中1.0Mテトラブチルアンモニウムフルオラ イド(15ml)に溶解し、反応混合物を室温で15時間撹拌した。溶媒を蒸発 し、残留物をCH2Cl2(10ml)に取り、シリカゲルカラムに注入し、それ をCH2Cl2中0〜3%メタノール400ml部分で溶出した。所望フラクショ ンを集め、蒸発乾固し、真空下で乾燥すると、2 ’(3’)−O−アセチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリチ ル)−ウリジン(1g、79.4%収率)が得られた。 1H−NMR(CDCl3):d 2.07(d、3H、−COCH 3)、3. 61(m、2H、C5・−CH 2)、3.83(d、6H、2×OCH 3)、3. 89(m、1H、C4・H)、4.44(m、1H、C3・H)、4.91(m、 1H、C2・H)、5.66(m、C1・H)、6.03(m、1H、C5 H)、 6.75−7.43(m、13H、芳香族H)および7.49(m、1H、C6 H )。 2’(3’)−O−アセチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシト リチル)−ウリジン(0.59g、1mmol)、無水コハク酸(0.32g、 2.55mmol)およびDMAP(0.7g、2.5mmol)を無水ピリジ ン(10ml)に溶解し、室温で24時間撹拌した。ピリジンを減圧下で蒸発し 、残留物を乾燥トルエン(2×10ml)で共蒸発した。ゴム状残留物をCH2 Cl2(50ml)に溶解し、飽和NaCl溶液(2×40ml)、および水( 40ml)で洗った。有機層を無水Na2SO4上で乾燥し、その後蒸発した。残 留物をCH2Cl2(10ml)に溶解し、室温で、速やかな撹拌下のヘキサン( 100ml)に入れて沈殿させた。生成物を濾過し、真空下で乾燥すると2’( 3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’(3’)−O−アセチル ウリジン−5’−スクシネート(0.4g、60%収率)が得られた。 融点:100−115℃(分解)。1H−NMR(CDCl3):δ 2.10(d、3H、COCH 3)、2.5 0(m、4H、COCH 2CH 2CO)、2.96(m、2H、C5・CH 2)、3 .75(d、6H、2×OCH 3)、4.10(m、2H、C4・HおよびC3・H )、4.23(m、1H、C2・H)、5.66(d、1H、C1・H)、6. 32(d、1H、C5 H)、6.74−7.41(m、14H、DMT基および C6 H)および9.50(s、1H、COOH)。例7 ヒドロキシ誘導体化固体支持体の作成 下記は、オリゴヌクレオチド合成試薬の生成に適した試薬とその後反応するため の固体支持体の製法を説明する。トヨパールAF−アミノ樹脂(1g、アミノ= 300μmoles/g、トーソーハース(TosoHaas)、フィラデルフィア、P A)の乾燥DMF4ml懸濁液に文献記載の方法[ハラランビディス(J.Harala mbidis)ら、核酸研究18巻、493ページ(1989)]によって製造したp −ニトロフェノール−4−[ジ−(p−メトキシフェニル)フェニルメチロキシ ]−ブチレート(2.0g、0.4M)の4mlジオキサン溶液を加え、その後 TEA(2ml)を加えた。反応混合物を室温で一晩(16時間)振とうした。 固体支持体を濾過し、DMF(5ml)、CH3CN(2×5ml)、CH2Cl2 (2×5ml)およびジエチルエーテル(2×5ml)で洗い、真空下で3時 間乾燥した。その樹脂を乾燥ピリジン10mlに懸濁した。DMAP(250m g、0.2M)を加え、その後Ac2O(2.5ml、2.5M)を加えて未反 応アミノ基をキャップし、反応混合物を室温で5時間振とうした。樹脂を濾過し 、乾燥ピリジン(10ml)、CH3CN(10ml)およびジエチルエーテル (10ml)で洗い、真空中で2時間乾燥した。固体支持体のヒドロキシ基担持 は、測定(A500nm)し、放出されたジメトキシトリチルカチオン量を計算す ることによって、200〜250μmoles/gの範囲であることがわかった 。 同様な方法を用いてCPG−LCAAおよびアミノプロピル−CPG[セリガ ー(H.Seliger)およびグロガー(Groger)、ヌクレオシドおよびヌクレオチド7巻 、773ページ(1988)]樹脂をヒドロキシル基で官能性にした。例8 CPG−固体支持体のホスフェート結合を介するウリジン部分による誘導体化 下記は本発明によって固体支持体から開裂されるオリゴヌクレオチドの合成に 用いることができるCPG−固体支持体の製法を説明する。例7からのCPG− OH固体支持体(500mg、遊離OH=27mmoles/g)を乾燥アセト ニトリル(3ml)に懸濁した。2’(3’)−O−アセチル−2’(3’)− O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−ウリジン−5’−O−(β−シアノエ チル−N,N−ジイソプロピル)−ホスフォルアミダイト(39.4mg、0. 05mmole)を加え、それからCH3CN中0.5Mテトラゾール溶液2m lを加えた。反応混合物を室温で30分間振とうした。固体支持体を濾過し、乾 燥CH3CN(2×3ml)で洗い、I2溶液(THF/ピリジン/水−93:5 :2中0.3%I2)3mlに懸濁し、反応混合物を室温で30分間撹拌した。 固体支持体を濾過し、THF(2×5ml)およびCH3CN(2×5ml)で 洗い、1〜2時間真空乾燥した。その固体支持体にTHF中17%N−メチルイ ミダゾール3mlを加え、それから10%Ac2O、10%ルチジン、80%T HFv/vを加えた。反 応混合物を室温で30分間撹拌した。固体支持体を濾過し、CH3CN(2×5 ml)およびジエチルエーテル(2×5ml)で洗い、真空乾燥した。ウリジン 部分の担持は、遊離するジメトキシトリチルカチオン量の測定(A500nm)に よって、20.2μmoles/gであることがわかった。例9 トーヨーパール(フラクトゲル65M)樹脂のホスフェート結合を介するウリジ ン部分による誘導体化 例7からのトーヨーパール(フラクトゲル65M)樹脂(1g、遊離OH=2 00mmoles/g)を乾燥CH3CN(6ml)に懸濁し、2’(3’)− O−アセチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−ウリジ ン−5’−O−(β−シアノエチル−N、N−ジイソプロピル)−ホスフォルア ミダイト(39.4mg、0.05mmole)を加え、その後CH3CN中0 .5Mテトラゾール溶液2mlを加え、反応混合物を室温で30分間撹拌した。 固体支持体を濾過し、乾燥CH3CN(2×6ml)で洗い、それからI2溶液( THF/ピリジン/水−93:5:2中0.3%I2)6mlに懸濁し、反応混 合物を室温で30分間振とうした。固体支持体を濾過し、THF(2×6ml) およびCH3CN(2×5ml)で洗い、2時間真空乾燥した。その固体支持体 に(THF中17%N−メチルイミダゾール)5mlを加え、それから(10% Ac2O、10%ルチジン、80%THF、v/v)5mlを加え、反応混合物 を室温で30分間振とうした。固体支持体を濾過し、CH3CN(2×10ml )およびジエチルエーテ ル(2×5ml)で洗い、真空乾燥した。ウリジン部分の担持は、遊離したジメ トキシトリチルカチオン量の測定(A500nm)によって、45〜55μmol es/gであることがわかった。例10 テンタゲル樹脂の、ホスフェート結合を介するウリジン部分による誘導体化 テンタゲル−ヒドロキシ樹脂(500mg、遊離OH=200mmoles/ g)を例8および9に記載の方法により、ウリジン部分で誘導体化した。ウリジ ン部分の担持は遊離したジメトキシトリチルカチオン量の測定(A500nm)に よって17.6μmoles/gであることがわかった。例11 トーヨーパール(フラクトゲルAF−アミノ65M)樹脂の、ホスホルアミデー トリンカーを介するるウリジンによる誘導体化 トーヨーパール−AF−アミノ−65−樹脂(1g、300mmoles/g アミノ基、トーソーハース、フィラデルフィア、PA)を乾燥CH3CN(6m l)に懸濁した。2’(3’)−O−ア セチル−2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−ウリジン−5 ’−O−(β−シアノエチル−N,N−ジイソプロピル)−ホスフォルアミダイ ト(39.4mg、0.05mmole)を加え、その後CH3CN中0.5M テトラゾール溶液2mlを加え、反応混合物を室温で30分間振とうした。固体 支持体を濾過し、乾燥CH3CN(2×6ml)で洗い、I2溶液(THF/ピリ ジン/水−93:5:2中0.3%I2)6mlに懸濁し、反応混合物を室温で 30分間振とうした。固体支持体を濾過し、THF(2×6ml)およびCH3 CN(2×5ml)で洗い、2時間真空乾燥した。その固体支持体にTHF中1 7%N−メチルイミダゾール5mlを加え、それから10%Ac2O、10%ル チジン、80%THF、v/v、を加え、反応混合物を室温で30分間振とうし た。固体支持体を濾過し、CH3CN(2×10ml)およびジエチルエーテル (2×5ml)で洗い、真空乾燥した。樹脂のウリジン部分担持を、ジクロロメ タン中2.5%ジクロロ酢酸溶液の少部分におけるトリチル放出を分光光度法で 500nmで測定することによって算出した。この例では担持は45μmole s/gであった。 例12CPG−LCAA樹脂のホスフォルアミダイトリンカーを介するウリジン部分に よる誘導体化 CPG−LCAA樹脂(シグマ、500mg、〜60μmoles/gアミノ 基)を乾燥CH3CN(3ml)に懸濁した。2’(3’)−O−アセチル−2 ’(3’)−O−(4,4’−ジメトキ シトリチル)−ウリジン−5’−O−(β−シアノエチル−N,N−ジイソプロ ピル)−ホスフォルアミダイト(39.4mg、0.05mmole)を加え、 その後CH3CN中0.5Mテトラゾール溶液2mlを加え、反応混合物を室温 で30分間振とうした。固体支持体を濾過し、乾燥CH3CN(2×3ml)で 洗い、I2溶液(THF/ピリジン/水−93:5:2中0.3%I2)5mlに 懸濁し、その反応混合物を室温で30分間振とうした。固体支持体を濾過し、T HF(2×5ml)およびCH3CN(2×5ml)で洗い、2時間真空乾燥し た。その固体支持体に、THF中17%N−メチルイミダゾール3mlを加え、 それから10%Ac2O、10%ルチジン、80%THF、v/v、の溶液3m lを加え、反応混合物を室温で30分間振とうした。固体支持体を濾過し、CH3 CN(2×10ml)およびジエチルエーテル(2×5ml)で洗い、真空乾 燥した。樹脂のウリジン部分の担持は、離脱したジメトキシトリチルカチオンの A500nmによって測定して8.1μmoles/gであった。例13 トーヨーパール(フラクトゲル)AF−アミノ−65M樹脂のコハク酸エステル 結合を介するウリジン部分による誘導体化 トーヨーパール(フラクトゲル)AF−アミノ−650M(アミノ基=300 μmmoles/g)を、無水コハク酸(1g、1M)およびN−メチルイミダ ゾール(1ml)を含む乾燥ピリジン10mlに懸濁した。混合物を室温で16 時間放置した。濾過後、支持体を水性ピリジン、乾燥ピリジン(10ml)、ジ エチルエーテル(10ml)で洗い、真空乾燥した。ニンヒドリン試験で遊離ア ミノ基は陰性であった。 スクシニル化支持体(1g)を、2’,3’−O−メトキシエチリジンウリジ ン(0.9g、3.12mmole)、DMAP(0.3g、2.46mmol e)およびDCC(2.14g、10.37mmole)を含む乾燥ピリジン( 10ml)に懸濁し、その反応混合物を室温で48時間振とうした。この溶液に p−ニトロフェノール(1.8g、12.186mmole)を加え、さらに2 0時間振とうを続けた。モルフォリン(1ml)の添加によって反応を停止し、 さらに2時間振とうを続けた。この工程は未反応カルボン酸のキャッピングに必 要である。固体支持体を濾過し、ピリジン(10ml)で洗い、MeOH(2× 10ml)およびジエチルエーテル(10ml)で洗い、真空乾燥した。80% 酢酸水(10ml)で室温で4時間処理することによって、2’,3’−オルト エステル中間体を加水分解して2’,3’−アセテート類の混合物を得た。濾過 後、固体支持体をMeOH(2×10ml)およびジエチルエーテル(10ml )で洗い、3時間真空乾燥した。 固体支持体(1g)を乾燥CH2Cl2(10ml)、コリジン(0.66ml 、0.5M)を加え、その後テトラブチルアンモニ ウム過塩素酸塩(0.17g、0.05M)およびジメトキシトリチルクロライ ド(0.169g、0.05M)を加えた。反応混合物を室温で1時間撹拌した 。固体支持体を濾過し、CH2Cl2(2×10ml)、MeOH(2×10ml )、ジエチルエーテル(2×10ml)で洗い、真空下で3時間乾燥した。固体 支持体のウリジン部分担持は、遊離したジメトキシトリチルカチオンのA500n mにおける測定により、22.35μmoles/gであることがわかった。例14 テンタゲル−アミノ樹脂のコハク酸エステルリンカーを介するウリジン部分によ る誘導体化 例6からの2’(3’)−O−(4,4’−ジメトキシトリチル)−2’(3 ’)−O−アセチル ウリジン−5’−スクシネート(68.8mg、0.1m mole)を、乾燥ピリジン(0.4ml)およびp−ニトロフェノール(14 mg、0.1mmole)を含む乾燥ジオキサン(4ml)に溶解した。1、3 −ジシクロヘキシルカルボジイミド(DCC)(52mg、0.25mmole )を加え、その反応混合物を室温で3時間振とうした。ジシクロヘキシル尿素を 濾去し、上澄液をテンタゲル−アミノ樹脂(1g、N H2基=220mmoles/g、RAPPポリマーカンパニー、ドイツ)に加 え、乾燥DMF(4ml)に懸濁し、トリエチルアミン(2ml)を加えた。反 応混合物を室温で6時間振とうした。固体支持体を濾過して取り、DMF(2× 10ml)およびジエチルエーテル(2×5ml)でよく洗い、1時間真空乾燥 した。固体支持体を乾燥ピリジン(10ml)に再懸濁し、DMAP(250m g、0.2M)を加え、その後無水酢酸(2.5ml、2.5M)を加えた。反 応混合物を室温で16時間振とうした。樹脂を濾取し、CH3CN(2×10m l)およびジエチルエーテル(2×10ml)で洗い、2時間真空乾燥した。樹 脂のウリジン部分担持は、遊離したジメトキシトリチルカチオンのA500nmに よる測定から、48.8μmoles/gであることがわかった。例15 CPG−LCAAのコハク酸エーテルリンカーを介するウリジン部分による誘導 体化 CPG(1g、LCAA、シグマ、アミノ基=60mmoles/g)を例1 3および14に記載の方法によってコハク酸エステルリンカーを介してウリジン 部分で誘導体化した。固体支持体のウリジン担持は遊離したジメトキシトリチル カチオンのA500nmによる測定から、20.23μmoles/gであること がわかった。例16 トーヨーパール(フラクトゲル)65F−樹脂の、コハク酸エステルリンカーを 介するウリジン部分による誘導体化 フラクトゲル 65F−樹脂(5g乾燥重量、トーソーハース、フィラデルフ ィア、PA)を乾燥CH3CN(50ml)に懸濁した。1’,1’−カルボニ ルジイミダゾール(8.1g、1M溶液を作るため)を加え、反応混合物を室温 で4時間振とうした。固体支持体を焼結ガラス漏斗で濾過し、乾燥CH3CN( 2×50ml)で洗い、それから乾燥CH2Cl2(50ml)に再懸濁した。1 ,12−ジアミノドデカン(10g、1M溶液を作るため)を加え、生成した混 合物を室温で一晩(16〜20時間)振とうした。n−プロピルアミン(4.1 ml、1M溶液を作るため)をその混合物に加え、溶液をさらに1時間振とうし た。樹脂を濾過し、乾燥CH2Cl2(5×50ml)、アセトン(5×50ml )およびCH3CN(5×20ml)で逐次洗浄し、最後の洗浄濾液は陰性のニ ンヒドリン試験を示した。樹脂をその後ジエチルエーテルで洗い(2×20ml )、約3時間真空乾燥した。固体支持体のアミノ基含量は、ピクリン酸分析試験 による測定によって300〜400μmoles/gの範囲であることがわかっ た。[スチュワート(J.M.Stewart)& ヤング(J.D.Young)、固相ペプチド合成 、ピアース・ケミカル・カンパニー、107(1984)]。その後固体支持体 (1g)を例13に記載の方法によって無水コハク酸と反応させた。その後スク シニル化樹脂(1g)を例13の方法によりウリジンで官能基にした。その固体 支持体を例13の方法によりジメトキシトリチルクロライドと反応させた。固体 支持体のウリジン部分担持は、遊離したジメトキシトリチルカチオンのA500n mによって測定して20〜25mmoles/gであることがわかった。例17 トーヨーパール(フラクトゲル)65F−樹脂の、カルバメート(ウレタン)リ ンカーを介するウリジン部分による誘導体化 例16の方法により、フラクトゲル65F樹脂(5g、乾燥重量)を1,12 −ジアミノドデカンで官能基にした。その固体支持体のアミノ基含量はピクリン 酸分析試験によって測定して330μmoles/gであることがわかった。 固体支持体(1g)を乾燥CH2Cl2(20ml)に懸濁した。p−ニトロフ ェニルクロロホルメート(4.02g、1M溶液を作るため)を加え、その後コ リジン(3.95ml、1.5M溶液を作るため)を加えた。反応混合物を室温 で一晩(16〜20時間)振とうした。固体支持体を濾過し、乾燥CH2Cl2( 5×20ml)で洗い、真空下で2時間乾燥した。 固体支持体(1g)をその後乾燥CH2Cl2(10ml)に懸濁した。2’, 3’−O−メトキシエチリデンウリジン(3g、1M溶液を作るため)を加え、 その後TEA(1.52ml、1M溶液を作るため)を加えた。反応混合物を室 温で24時間撹拌した。反応混合物をn−プロピルアミン(0.82ml、1M 溶液を作るため)の添加によって停止し、さらに1時間撹拌を続けた。固体支持 体を濾過し、CH2Cl2(2×10ml)、CH3OH(2×10ml)および ジエチルエーテル(2×10ml)で洗い、真空下で2時間乾燥した。固体支持 体を室温で4時間80%酢酸水(10ml)で処理することによって2’,3’ −オルトエステル中間体を加水分解すると2’,3’−アセテート類の混合物が 得られた 。固体支持体を濾過し、CH3OH(2×10ml)およびジエチルエーテル( 10ml)で洗い、3時間真空乾燥した。 固体支持体(1g)をその後乾燥CH2Cl2(10ml)に懸濁し、コリジン (0.66ml、0.05M)を加え、それからテトラブチルアンモニウム過塩 素酸塩(0.17g、0.05M)およびジメトキシトリチル塩化物(0.16 9g、0.5M)を添加した。反応混合物は室温で1時間振とうした。固体支持 体は濾過し、CH2Cl2(2×10ml)、CH3OH(2×10ml)および ジエチルエーテル(2×10ml)で洗い、真空下で3時間乾燥した。固体支持 体のウリジン部分担持は遊離したジメトキシトリチルカチオンのA500nmによ って測定して20〜30mmoles/gの範囲であることがわかった。例18 51merの合成 下記はオリゴヌクレオチドの合成および本発明の開裂試薬を用いるその後のオ リゴヌクレオチド開裂を説明する。 配列: (配列番号:1)のオリゴヌクレオチドを、オリゴ−1000DNA合成機(ベ ックマン・インスツルメント、ブレア、CA)および標準合成プロトコルを用い て、例15の固体支持体上に組み立てた。最後のトリチル基を除去した後、固体 支持体をCH3NH2/Me3Nの溶液と室温で5分間接触させることによって、 3’末端ウ リジン部分を有するオリゴマーを固体支持体から開裂した。その溶液は1:1、 v/v、の40%メチルアミン水および24wt%トリメチルアミン水であった 。その開裂オリゴヌクレオチドを固体支持体から除去した後の、その開裂オリゴ ヌクレオチドを含むメチルアミン/トリメチルアミン溶液を65℃で3時間加熱 した。スピード真空濃縮器を用いて試薬を蒸発乾固した。残留物を二回蒸留水( 200ml)に溶解し、生成物を毛細管ゲル電気泳動法によって分析した。P/ ACE電気泳動図は高品質の生成物を表わした。それはその溶出時間を従来のC PG−A支持体上で独立に合成した同一配列のそれと比較することによって同定 された。例19 101merおよび35merの合成 下記は本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬および本発明の開裂試薬を用いる オリゴヌクレオチドの合成を説明する。 配列(配列番号:2)のオリゴヌクレオチドを、オリゴ1000DNA合成機および 標準合成プロトコルを用いて、例11の固体支持体上に組み立てた。最後のトリ チル基を除去した後、固体支持体を乾燥し、〜300mlのMeNH2/Me3N (例18に記載したように1:1、v/v)を含むスクリューキャップバイアル に入れ、65℃(湯浴)で90分間加熱した。試薬(MeNH2/Me3N)を他 のバイアルに注意深くデカントし、スピード真空濃縮器を用いて蒸発乾固した。 残留物を2回蒸留水(500ml)に溶解し、総A260nmを計算した。生成物 を毛細管ゲル電気泳動法によって分析した。P/ACE電気泳動図は良質の生成 物を表わした。この生成物は、その溶出時間を、通常のCPG−T支持体上で独 立に合成した同一配列のそれと比較することによって同定された。 配列 (配列番号:3)を有する35merを例11の固体支持体上で合成し、毛細管 電気泳動法および逆相HPLCによって、5’−DMTオリゴヌクレオチドとし て分析した。例20 10merオリゴリボヌクレオチド(RNA)の合成 例15に記載のように誘導体化したCPG支持体0.2μmole(20μm ols/gを担持)をカラムに入れ、10merの配列 (配列番号:4)をオリゴ−1000自動合成機でスカーリング(Scaringe)ら の方法(核酸研究、18巻、5433−5411ページ、1990)を用いて合 成した。RNA合成のカップリング時間は12分であった。最後のDMT基はオ リゴヌクレオチドに残った。合成後、RNAの保護基を除去し、CH3NH2/( CH3)3Nの1:1、v/v、溶液65℃で4時間を用いて支持体から開裂した 。1:1溶液は、40%w/vメチルアミン水と23〜25wt%トリメチルア ミン水とを用いて作った。2’−保護基の除去は、THF中1.0Mテトラブチ ルアンモニウムフルオライドを用いて室温で15時間行った。オリゴリボヌクレ オチドをNap−10カラム(ファルマシアLKBビオテクノロジー、ピスカタ ウェイ(Piscataway)、NJ)を用いて脱塩した。HPLC精製後、まだDMT 基が付いている生成物は、市販のCPG支持体を用いて合成した10merとは 化学的にも物理的にも区別できなかった。 HPLC:保持時間21.40分。条件:C18ミクロソーブMV(Rainin) 5m粒子、4.6mm×25cm。瓶A:0.1M酢酸アンモニウム(pH6. 9)、瓶B:アセトニトリル。流速:1 ml/min、50%Bまでは0〜25分勾配、50%Bでは25〜27分。0 %Bまでは27030分勾配、0%Bでは30〜32分。例21 21merRNAの合成 下記は、本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬および本発明の開裂試薬を用い るオリゴヌクレオチドRNAの合成を説明する。 例12に記載したように誘導体化したCPG支持体0.2mmoles(8. 09mmoles/g担持)をカラムに入れ、配列 (配列番号:5)の21merをオリゴ−1000上で合成した。カップリング 時間は12分であった。開裂および脱保護は例20に記載したMeNH2/Me3 N(1:1、v/v)を用いて室温で2時間行った。2’−保護基の除去は、T HF中1.0Mテトラブチルアンモニウムフルオライドを用いて室温で15時間 行った。オリゴリボヌクレオチドをSep−Pak(ミリポア社のC18カート リッジ)を用いて脱塩した。サンプルを凍結乾燥し、ベックマンP/ACE20 00で毛細管電気泳動によって分析した。毛細管ゲルカラムは、全長37cmを 有するベックマン・インスツルメントU100Pウレアゲルカラムであった。ベ ックマントリス−ボレート、7Mウレア緩衝ゲル緩衝液キットをメーカーの使用 説明書にしたがって使用した。オリゴリボヌクレオチドの吸光度は、オリゴリボ ヌクレオチドの質および長さに応じて1.0〜2OD260nm/mlの範囲内 であった。注入は10kVで5秒、分離は長さに応 じて11kVで30〜60分であった。例22 ホスフォロチオエート類の合成 下記は本発明によるホスフォロチオエートの合成およびそれらのその後の開裂 を説明する。 配列 (配列番号:6)の25merホスフォロチオエートを例15で作成した固体支 持体上で合成した。合成はオリゴ−1000上で0.2μmolスケール(20 μmoles/g担持)を用いて行われた。合成後、オリゴを開裂し、脱保護を 例20で調製したMeNH2/Me3N(1:1)溶液を用いて65℃で4時間行 った。サンプルをHPLCおよびCEで分析した。最後のDMTを有するホスフ ォロチオエートのHPLC保留時間は例20に記載した条件下では17.23分 であった。CE保持時間は最終的DMTを除去したホスフォロチオエートでは2 7.40分であった。条件は例21と同じであった。生成物は市販のCPG支持 体上で合成した25merとは化学的および物理的に区別できなかった。例23 ホスフォロチオエートの合成 下記は本発明のオリゴヌクレオチド合成試薬および本発明の開裂試薬を用いる ホスフォロチオエートの合成を説明する。 例22に記載の方法にしたがい、配列(配列番号:6)のオリゴホスフォロチオエートを例12で作成した固体支持体 上で合成した。開裂および脱保護は例20のMeNH2/Me3N(1:1v/v )試薬で室温で2時間行った。最終的DMTを有する開裂されたホスフォロチオ エートのHPLC保持時間は17.22分であった。最終的DMTを除去したホ スフォロチオエートのCE保持時間は26.64時間であった。条件はHPLC では例20と同じで、CEでは例21と同じであった。例24 CPG−ユニバーサルな固体支持体上で合成した粗ヘテロ15merの酵素消化 配列 (配列番号:7)の15merを例15からのCPG固体支持体上およびスクシ ニルリンカーを有する通常のCPG−A支持体上で組み立てた。最後のDMT保 護基を除去後、例15の固体支持体上で合成したオリゴマーを、例20で作った CH3NH2/Me3N(1:1、v/v)溶液で65℃で4時間、開裂し脱保護 を行った。通常のCPG−A支持体上で合成したオリゴマーは、65℃3時間ア ンモニアで、開裂し脱保護を行った。 粗オリゴマー類を酵素消化にかけた。それには5mlの40mMトリス、10 mMMgCl2、pH7.5、で再構成したホスフォジエステラーゼI(シグマ )(1回の試験ごとに0.01Uを用いる)および大腸菌(E.coli)からのアル カリホスファターゼ(シグ マ)200u/1.8ml(1回の試験に0.2uを用いる)を用いた。1〜2 OD260nmのオリゴヌクレオチドにホスフォジエステラーゼ25mlとアルカ リホスファターゼ2mlを加え、混合物を室温で30分〜2時間インキュベート した。サンプルをそのまま逆相HPLC C−18カラムに注入した。 HPLCカラム:C−18ウルトラスフェア(ベックマン)5m粒子、4.6 mm×25cm。 緩衝液A:0.1M酢酸アンモニウム 緩衝液B:アセトニトリル プログラム:流速1ml/分 15%Bまで0〜20分勾配 25%Bまで20〜25分勾配 50%Bまで25〜27分勾配 50%Bで27〜30分 0%Bで30〜35分 表Iは、例15の固体支持体(ユニバーサルなCPG)上および通常のCPG− A−支持体上で合成したオリゴヌクレオチドの理論値および分析値がよく一致す ることを示す。 例25 35merのヌクレオシド組成分析 配列 (配列番号:3)の35merを0.2μmole(20μmoles/g担持 )CPG−T上で、例15に記載の方法で合成した。オリゴ−1000DNA合 成機を用いた。合成後、開裂および脱保護を例20に記載のようにMeNH2/ Me3N(1:1、v/v)を用いて65℃、4時間行った。サンプルの1OD2 60 nmを取り、蛇毒ホスホジエステラーゼ25mlおよびアルカリホスファター ゼ2mlと混合した。混合物を30分間室温に保ち、例24に記載の条件を用い てHPLCカラムに注入した。結果を表 II に報告する。 例26 オリゴデオキシリボヌクレオチド/オリゴリボヌクレオチド合成のための再利用 可能支持体 例11に記載の方法によって合成した固体支持体上にオリゴヌクレオチドを組 み立てた後、例20に記載のように調製したMeNH2/Me3N(1:1、v/ v)を用いて、そのオリゴヌクレオチドを65℃で2時間かけて固体支持体から 離脱させた。固体支持体を蒸留水(1ml)で洗い、マツモトらが報告したよう に(Chemistry Letters 427(1990))[Co)トリエチレンテトラミン )(OH)H2O]+2で処理した。文献記載の方法[チン(J.Chin)およびゾー (X.Zou)、Can.J.Chem.65巻、1882ページ(1987)、チンおよびゾー 、J.Amer.Chem.Soc.110巻、223ページ(1988)]により調製した0. 05M[Co(トリエチレンテトラミン)Cl2]Cl溶液(15.57mg/ 1ml水)に、1.5等量のNaOH(0.075M、3mg/ml水)を加え た。10分後、1NHCl の添加により溶液のpHをpH7.0に調整した。こ の溶液を上記の固体支持体に加え、室温で30分間振とうした。この工程が環状 ホスフェートを加水分解してcis−ジオールにする。固体支持体を濾過し、蒸 留水(2ml)、CH3CN(2×2ml)およびジエチルエーテル(1ml) で洗い、真空乾燥した。 固体支持体をその後乾燥CH2Cl21mlに懸濁した。コリジン(1.3ml 、0.001M)を加え、その後テトラブチルアンモニウム過塩素酸塩(0.3 4mg、0.001M)およびジメトキシトリチルクロライド(0.338mg 、0.001M)を加えた。反応混合物を室温で15分間振とうした。固体支持 体を濾過し、CH2Cl2(1ml)、CH3OH(1ml)、ジエチルエーテル (1ml)で洗い、真空下で1時間乾燥した。 それから固体支持体を乾燥ピリジン(1ml)に懸濁した。DMAP(1.2 5mg、0.001M)を加え、それから無水酢酸(12.5ml、0.012 5M)を加えた。反応混合物を室温で15分間振とうした。固体支持体を濾過し CH2Cl2(1ml)およびジエチルエーテル(1ml)で洗い、真空下で30 分間乾燥した。例27 2’,3’−O−メトキシエチリデン−ウリジン−5’−O−(N,N−ジイソ プロピル)−β−シアノエチル−ホスフォルアミダイトの合成 下記は試薬の合成、およびその試薬とアミノ官能基固体支持体とを反応させて本 発明のオリゴヌクレオチド合成試薬を作ることを述べる。 2’,3’−O−メトキシエチリデン−ウリジン(0.58g、2mmole )を無水THF(10ml)に溶解した。ジイソプロピルアミン(1.4ml、 8mmol)を室温で加え、その後β−シアノエチルモノクロロ−N,N−ジイ ソプロピルホスフォルアミダイト(0.9ml、4mmole)を磁気式撹拌下 で加えた。1時間撹拌後、溶媒を30℃で真空蒸発した。粗生成物を酢酸エチル (50ml)に再溶解し、水で洗い、無水硫酸ナトリウムで乾燥した。溶媒を減 圧下で除去した後、残留物を酢酸エチル(10ml)に取り、酢酸エチル/ジイ ソプロピルアミン(95/5、v/v)とともに充填したシリカゲル(100〜 120℃で予備的加熱)のカラムを通過させ、酢酸エチルで溶出した。所望フラ クションを集め、蒸発し、高真空下で乾燥すると、2’,3’−O−メトキシエ チリデン−ウリジン−5’−O−(N、N−ジイソプロピル)−β−シアノエチ ル−ホスフォルアミダイトが得られた(0.55g、56%収率)。 IR(Kbrペレット):u1700cm-1(環状アミドのC=O)、225 0cm-1(C=N)、および2900cm-1(s,NH)。 1H NMR(CDCl3):δ1.10−1.28(m、12H、2×CH( CH 3)2)、1.62および1.68(2s、3H、COCH 3)、2.66お よび2.76(2t、4H、CH 2CH 2)、3.27およ3.40(2s、3H 、OCH 3)3.55(m、2H、2×N−CH(CH3)2)、3.88(m、 2H、C5・−CH 2)、4.15(m、1H、C4・−H)、4.97(m、2 H、C2・H、C3・H)、5.76(m、1H、C5−H)、6.03(d、1 H、C1・−H)および7.54(d、1H、C6−H)。 2’,3’−イソプロピリデンウリジン−5’−O−(N、N−ジイソプロピ ル)−β−シアノエチル−ホスフォルアミダイトも同様な方法によって作った。 上で合成したホスフォルアミダイト化合物を用い、これらホスフ ォルアミダイトを種々の固体支持体に付着結合させてオリゴヌクレオチド合成部 位と固体支持体間にホスフォルアミダイト結合を形成することによって、本発明 のオリゴヌクレオチド試薬を作った。これを実現するために、表面アミノ基を有 するCPGおよびフラクトゲルをホスフォルアミダイトと反応させた。この反応 生成物を80%酢酸水で処理した後、2’,3’−O−環状オルトエステル官能 基が開いて例11のオリゴヌクレオチド合成試薬が提供された。例28 1,2−O−メトキシベンジリデングリセロールの合成 下記は、合成後、本発明の開裂試薬で固体支持体から離脱されるオリゴヌクレ オチドの合成に適したオリゴヌクレオチド試薬を製造するために用いるグリセロ ール型化合物の合成を説明する。 グリセロール(5.61g、61mmole)を、トリメチルオルトベンゾエ ート(22.8g、125mmole)および無水ベンゼンスルフォン酸(0. 6g)を含むTHF(200ml)に懸濁した。湿気を排除しながら25℃で1 時間撹拌すると、溶液は透明になった。TLCは出発材料がより高いRf値をも つ新しい化合物に完全に変換したことを示した。反応混合物の反応をメタノール 性NaOCH3(1M、5ml)の添加によって停止し、溶媒を減圧下で除去し た。油状残留物をCH2Cl2に溶解し、アルミナカ ラムクロマトグラフィーによって精製した。生成物をCH2Cl2/MeOH(9 9/1、v/v)で溶出し、所望フラクションを集め、減圧下で蒸発すると、標 題化合物が無色油状物質として得られた(9.6g、74.9%収率)。 1H NMR(CDCl3):δ3.69(m、4H、2−CH 2)、4.0( t、1H、CH)、4.3(d、3H、−OCH 3)、7.37〜8.0(m、 5H、芳香族)。 上で作った化合物を用いて、それを標準的スクリニル化CPGおよびフラクト ゲル固体支持体と反応させることによってオリゴヌクレオチド合成試薬を作った 。その後反応した固体支持体と80%酢酸水とを室温で接触させると、エステル 結合によって支持体に結合したグリセロール部分を有する試薬が得られた。例29 下記は本発明の種々の開裂試薬に関連する予想外の開裂特性を証明する。 例25に記載された固体支持体を用いて作成された35−merを用いて、種 々の開裂試薬の有効性を研究した。合成した35−merを含む固体支持体を各 開裂試薬と65℃で30分間接触させた。固体支持体から実際に離脱したオリゴ ヌクレオチドの%を測定した。 開裂反応の結果を表III に示す。 NH4OH、CH3NH2、(CH3)3N、(CH3)2NH、を含む溶液は、そ れぞれ約29wt%、40wt%、約24wt%、および40wt%水溶液から 作った。 本発明によると、例えばトリメチルアミンおよびトリエチラミンなどの比較的 強い塩基は少量でも開裂速度を促進する。これは、40%メチルアミン水99部 と24wt%トリメチルアミン水1部とから作られた溶液(39.6%メチルア ミンと0.24%トリメチルアミン)で得られた開裂データと、40wt%メチ ルアミンで得られたデータとの比較から証明される(30分後に44%開裂 対 30分後に41%開裂)。CH3NH2/(CH3)3N(99:1)はCH3N H2/(CH3)3N(1:9)よりはるかに速い速度を与えるという事実は、メ チルアミンも開裂反応に顕著な役割を演ずることを説明するものである。上記の エチルアルコールは、溶液を混和可能にするために開裂試薬に用いられる。 上記のように、アンモニア、メチルアミンおよびトリメチルアミンは標準温度 および圧力では気体である。それらは容易に水溶液になり、この形を上記の溶液 の調製に用いた。使用溶液は40wt%メチルアミン水および23〜25wt% トリメチルアミンであった。すなわち1:1メチルアミン:トリメチルアミンは 、約20wt%メチルアミンおよび約12wt%トリメチルアミンである。同様 に、水酸化アンモニウムNH4OHは濃水酸化ナトリウムまたは約28wt%〜 30wt%を用いて作った。メチルアミンおよびトリメチルアミンを含む上記の 開裂試薬は濃度が約0.4wt%〜39.6wt%メチルアミンおよび約0.2 4wt%〜22.5wt%トリメチルアミンの間に変動する。 本発明をその特別の実施態様と関連づけて説明したが、その他の変更が可能で あることは当然であり、この出願は、概ね本発明の原理にしたがうあらゆる変形 、使用または応用を網羅するものとし、また、本発明が関係する技術領域の公知 のまたは慣習的実用の範囲に入り、これまでに示した本質的特徴にあてはまり、 そして添付の請求の範囲内に入るような本発明を含めるものとする。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 マイケル、メイジド エイ アメリカ合衆国 92870 カリフォルニア 州 プラセンティア ラヴェンダー レイ ン 348 (72)発明者 ファルーキ、ファーダス アメリカ合衆国 92821 カリフォルニア 州 ブリー アレグザンダー コート 1520

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1.下記の式 SS - R6 - O -R3 I アルキルであり、R4はリン保護基であり、R3はビシナル基−XR1および−Y R2をもつ環状部分であり、ここで、XおよびYはそれぞれ、O、SおよびNH からなる群から独立に選択され、R1およびR2の一方は、水酸化アンモニウムお よびメチルアミンからなる群から選択される試薬によって除去できるブロッキン グ部分であり、他方は水素、または−OH、−SHもしくは−NH2を保護する ために適したヒドロキシ保護基である。) を有する組成物を含んでなるオリゴヌクレオチド合成試薬。 2.前記環状部分が下記の構造 (式中、Bはプリンまたはピリミジン塩基である。) を有する請求項1記載のオリゴヌクレオチド試薬。 3.Bがウリジルである請求項2記載のオリゴヌクレオチド試薬。 4.R1およびR2の一方がアセチル、ベンゾイルおよびFMOCからなる群から 選択される請求項1記載のオリゴヌクレオチド合成試薬。 5.R1およびR2の一方がジメトキシトリチルである請求項1記載のオリゴヌク レオチド合成試薬。 6.固体支持体が、コントロールポアガラス、エチレンとアクリレートとのコポ リマー類、エチレンとメタクリレートとのコポリマー類、ポリスチレン、および ナイロンからなる群から選択される請求項1記載のオリゴヌクレオチド合成試薬 。 7.下記の式 (式中、SSは固体支持体、XおよびYはそれぞれO、S、およびNHからなる 群から独立に選択され、R1およびR2の一方はアルキルカルボニルまたはアリー ルカルボニル基であり、他方は水素、またはヒドロキシ保護基である。) を有する化合物を含んでなるオリゴヌクレオチド合成試薬。 8.XおよびYがそれぞれOであり、R1およびR2の一方がアセチルであり、他 方がジメトキシトリチルである請求項7記載のオリゴヌクレオチド合成試薬。 9.固体支持体がコントロールポアガラス、エチレンとアクリレートとのコポリ マー類、エチレンとメタクリレートとのコポリマー類 、ポリスチレン、ポリプロピレンおよびナイロンからなる群から選択される請求 項7記載のオリゴヌクレオチド合成試薬。 10.下記の式 (式中、SSは固体支持体であり、XおよびYはそれぞれOであり、R1および R2の一方はアルキルカルボニルまたはアリールカルボニル基であり、他方はジ メトキシトリチルである。) を含んでなるオリゴヌクレオチド合成試薬。 11.メチルアミンおよび水酸化アンモニウムからなる群から選択される第1の 化合物と、第二アミン類および第三アミン類からなる群から選択される第2の化 合物とを含んでなるオリゴヌクレオチド開裂試薬。 12.前記第1の化合物がメチルアミンである請求項11記載のオリゴヌクレオ チド開裂試薬。 13.前記第二アミンがジメチルアミン、ジイソプロピルアミンおよびジエチル アミンからなる群から選択される請求項11記載のオリゴヌクレオチド開裂試薬 。 14.前記第三アミンがトリメチルアミン水、N−メチルピロリジン水、トリエ チルアミン水およびジイソプロピルエチルアミン水からなる群から選択される請 求項11記載のオリゴヌクレオチド開裂試薬。 15.メチルアミンと、トリメチルアミン、トリエチルアミンおよ びN−メチルピロリジンからなる群から選択される第三アミンとを含んでなる水 性オリゴヌクレオチド開裂試薬。 16.低級アルキルアルコールをさらに含んでなる請求項15記載の水性オリゴ ヌクレオチド開裂試薬。 17.前記メチルアミンが約4wt%〜約39.6wt%の濃度で存在し、かつ 前記第三アミンが約0.24wt%〜約22wt%の濃度で存在する請求項15 記載の水性オリゴヌクレオチド開裂試薬。 18.前記第三アミンがトリメチルアミンである請求項17記載のオリゴヌクレ オチド開裂試薬。 19.前記メチルアミンが約8wt%〜約39.6wt%で存在し、かつ前記ト リメチルアミンが約0.24wt%〜約19.2wt%で存在する請求項18記 載のオリゴヌクレオチド開裂試薬。 20.固体支持体からオリゴヌクレオチドを開裂するための方法であって、 環状部分を介して固体支持体に付着結合したオリゴヌクレオチドを用意し、そ して 前記オリゴヌクレオチドを、メチルアミン並びに第二アミン類および第三アミ ン類からなる群から選択される化合物を含む試薬と接触させる 各工程を含んでなる方法。 21.前記オリゴヌクレオチドが、アルキルカルボニルおよびアリールカルボニ ルからなる群から選択されるブロックされた反応性基に隣接する前記環状部分に 付着結合し、かつ前記接触工程が前記反応性基の脱ブロックを含む請求項20記 載の方法。 22.前記環状部分が、エステル部分、ホスフェート部分、ホスフォルアミデー ト部分およびカルバメート部分からなる群から選択される結合部を介して前記固 体支持体に付着結合している請求項21記載の方法。 23.前記試薬が約4wt%〜約36wt%のメチルアミンを含み、かつ前記化 合物が約2.4wt%〜約22.5wt%の濃度で存在するトリメチルアミンで ある請求項20記載の方法。 24.前記結合部がエステル、ホスフォルアミダイトおよびホスフォルアミデー ト部分からなる群から選択される請求項22記載の方法。 25.オリゴヌクレオチドを合成する方法であって、 SS - R6 - O -R3 I アルキルであり、R4はホスフェート保護基であり、R3はビシナル基−XR1お よび−YR2をもつ環状部分であり、ここで、XおよびYはそれぞれ、O、Sお よびNHからなる群から独立に選択され、R1およびR2の一方は、水酸化アンモ ニウムおよびメチルアミンからなる群から選択される試薬によって除去できるブ ロッキング部分であり、かつ他方は水素、または−OH、−SHもしくは−NH2 を保護するために適したヒドロキシ保護基である。) のオリゴヌクレオチド合成試薬を用意し、 保護されたヌクレオチドモノマー単位を次々にカップリングしてオリゴヌクレ オチドを提供する 各工程を含んでなる方法。 26.前記合成試薬が (式中、SSは固体支持体であり、XおよびYはそれぞれOであり、R1および R2の一方はアルキルカルボニルまたはアリールカルボニル基であり、他方はヒ ドロキシ保護基である。) である請求項25記載のオリゴヌクレオチドを合成する方法。 27.前記合成試薬が (式中、SSは固体支持体であり、XおよびYはそれぞれOであり、R1および R2の一方はアルキルカルボニルまたはアリールカルボニル基であり、他方はジ メトキシトリチルである。) である請求項25記載の方法。 28.LiClをさらに含む請求項17記載の試薬。
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