JP2000502342A - 固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカーアームおよびその製法 - Google Patents
固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカーアームおよびその製法Info
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Abstract
(57)【要約】
固体支持体オリゴヌクレオシド合成用のリンカー アームであって、該リンカー アームは、式(1)を備え、該式(1)において、X1は、−O−基、−S−基、−S(O)2−基および−N(R12)−基からなる群から選択され;R12は、水素基、置換または未置換C1〜C20アルキル基、置換または未置換C〜-C30アリール基、および置換または未置換C5〜C40アルカリール基からなる群から選択され;X3は、−O−基または−N(H)−基であり、R1、R2、R3R4およびR5は、同じかまたは異なり、水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換C1〜C20アルキル基、置換または未置換C5〜C30アリール基、および置換または未置換C5〜C40アルカリール基からなる群から選択され;nは、0、1または2であり、A’及びB’の一方は、水素基、ハロゲン化物基、置換又は未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基及び置換または未置換のC5〜C40アルキルアリール基からなる群から選択され、A’およびB’の他方は、式(2)を有し、該式(2)において、−O−基、−S−基、−S(O)2−基および−N(R13)−基からなる群から選択され、R13は、水素基、置換または未置換C1〜C20アルキル基、置換または未置換C5〜C30アリール基、および置換または未置換C5〜C40アルカリール基からなる群から選択され、R6およびR7は、同じかまたは異なり、水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換C1〜C20アルキル基、置換または未置換C5〜C30アリール基、および置換または未置換C5〜C40アルキルアリール基からなる群から選択され、pは0または1であり、mは、0、1または2である。リンカー アームを製造するための方法が開示されている。このリンカー アームは、固体支持体オリゴヌクレオチド合成に有用であり、また、自発的な加水分解に対する安定性と、リンカー アームから合成されたオリゴヌクレオチドの意図された分割の容易さとの望ましい組み合わせを特徴とする。
Description
【発明の詳細な説明】
固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカーアームおよびその製法
技術的分野
本発明は、固体支持体オリゴヌクレオチド合成(solid support oligonucleo-
tide synthesis)のためのリンカー アームに関し、またその製法に関するもの
である。
背景の技術
固体支持体上の有機化学の技術は一般に知られている。この話題に関する有用
な調査研究論文はフリュヒテル(Fruchtel)らの“固体支持体上の有機化学(Or
ganic Chemistry on Solid Supports)”、Angew.Chem.Int.Ed.Engl.,1996
、35巻、17−42ページに見いだされる;その内容は参考として本明細書に
組み入れられるものである。
フリュヒテルらが述べているように、この技術はポリペプチド、オリゴヌクレ
オチドおよびオリゴ糖の自動固相合成を発達させた。ここで特に興味深いのは、
オリゴヌクレオチドの固相合成である。下記はこの話題に関する有用な調査研究
論文/テキストブックである:
ビューケージ(Beaucage)ら、テトラヘドロン(Tetrahedron)、1992、4
8巻、2223ページ;
ビューケージら、テトラヘドロン、1993、49巻、6123−6194ペ
ージ;
デービス(Davis)ら、固相合成における技術革新および展望(Innovation an
d Perspectives in Solid Phase Synthesis)(編集.R.Epton)、Intercept、An
dover、1992、63ページ;
モントセラ(Montserra)ら、テトラヘドロン、1994、50巻、2617
ページ;
この各々の内容は参考として本明細書に組み入れられるものである。
オリゴヌクレオチドの固相合成において、スクシニル リンカー アームを担
持する無機固体支持体上でオリゴヌクレオチドを合成することは公知である;例
えば下記の文献を参照されたい:
カルサーズ(Caruthers)ら、遺伝子工学(Genetic Engineering)、Plenum P
ress、ニューヨーク(1982)、4巻、1−17ページ;
レッツィンガー(Letsinger)ら、遺伝子工学、Plenum Press、ニューヨーク
(1985)、5巻、191ページ;
フレーラー(Froehler)ら、核酸研究(Nucleic Acids Research)14巻、5
399−5407ページ(1986);および
マットィシ(Matteucci)ら、Journal of American ChemicalSociety、103
巻、3185−3186ページ(1981);
これらの内容は参考として本明細書に組み入れられるものである。
典型的にはスクシニル リンカー アームは下記の一般式を有する:
こうしてスクシニル基は、成長するオリゴヌクレオチドをその末端3’ヒドロキ
シル基からエステル結合によって、そして支持体上の第一アミンにアミド結合に
よって結合させる。その支持体は例えば従来のコントロールド・ポーラスガラス
(CPG)またはシリカである。所望オリゴヌクレオチドがひとたび合成される
と、エステルカルボニル基の加水分解によって、それをスクシニル リンカーア
ームから遊離させるか、または切断する。その加水分解剤は普通は濃水酸化アン
モニウムである。普通はこの反応は完了するまでに1〜4時間かかる。現在の固
相オリゴヌクレオチド合成器が改良されると、この切断段階は所望オリゴヌクレ
オチドの合成のために必要な総時間数の50%またはそれ以上に達する。
こうして固相オリゴヌクレオチド合成に用いるための改良リンカー アームを
開発するために当業者は種々の試みを行っている。
特に注目すべきはレッツィンガーら(レッツィンガー)の米国特許第5,11
2,962号である;この内容は参考として本明細書に組み入れられるものであ
る。レッツィンガーは、下記の構造式を有するオリゴヌクレオチドおよびオリゴ
ヌクレオチド誘導体の固相合成のためのリンカー アームを教示している:
こうしてレッツィンガーは、彼の主張によれば、合成されたオリゴヌクレオチド
またはオリゴヌクレオチド誘導体を1〜30分の間に、それらオリゴヌクレオチ
ドが完全に保護されたままになるようにして遊離することができる、オキサリル
リンカー アームを教示している。オキサリル リンカー アームは、彼の主張
によれば、メタノール中5%水酸化アンモニウム、水酸化アンモニウム、湿潤第
三アミン、トリエチルアミン/アルコール、トリエチルアミン/メタノール、ト
リエチルアミン/エタノール、水性トリメチルアミンおよびその他の塩基によっ
て速やかに切断される。残念ながら、レッツィンガーのオキサリル リンカーア
ームは彼が主張する利点によって被害を受ける。より詳細に述べるならば、本発
明者は、レッツィンガーのオキサリル リンカー アームが顕著な自発的加水分
解(例えば1カ月あたり約10〜40%の自発的加水分解)を受け、そのため市
場的規模におけるその使用が難しいことを発見した。このことの詳細は以下に示
す。オキサリル リンカー アームは作るのがむずかしい、なぜならばそれは、
非常に反応性に富みかつ有毒でしたがって危険である塩化オキサリルを使用しな
ければならないからである。
よって、当業者は、スクシニル リンカー アームの利点(製造/利用しやす
い)およびオキサリル リンカー アームの利点(短い切断時間)を有し、一方
両方のアームの欠点を軽減または未然に防ぐことができるリンカー アームをい
まだに必要としている。
発明の開示
先行技術の上記の欠点の少なくとも1つを防ぎまたは緩和する固体支持体オリ
ゴヌクレオチド合成のための新規のリンカー アームを提供することが本発明の
目的である。
固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカー アームの新規の製法を
提供することが本発明のもう一つの目的である。
よって、その一面において、本発明は固体支持体オリゴヌクレオチド合成のた
めのリンカー アームを提供する;このリンカー アームは下記の式を含む:
上記式中、X1は、−O−、−S−、−S(O)2-、−C(O)−および−N(R12)
−からなる群から選択され;R12は水素、置換または未置換のC1〜C20アルキ
ル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40
アルカリール基を含んでなる群から選択され;X3は−O−または−N(H)−
であり;R1、R2、R3、R4およびR5は同じかまたは異なり、水素、ハロゲン
化物、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30
アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルキルアリール基からなる
群から選択され;nは0、1または2であり;A’およびB’の1つは水素、ハ
ロゲン化物、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5
〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルキルアリール基からなる
群から選択され、A’およびB’の他の1つは下記の式であらわされ:
上記式中、X2は−O−、−S−、−S(O)2-、−N(R13)−からなる群から
選択され;R13は水素、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または
未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルカリール基を
含んでなる群から選択され;R6およびR7は同じかまたは異なり、水素、ハロゲ
ン化物、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30
アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルキルアリール基からな
る群から選択され;pは0または1;mは0、1または2である。
また別の一面において、本発明は固体支持体オリゴヌクレオチド合成のための
リンカー アームの製法を提供する;
その製法は:次の段階:
反応:(A)下記の式(I)のリンカー アーム、
ここで上記式(I)中、R1、R2およびR3は、同じかまたは異なり、水素、ハ
ロゲン化物、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5
〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルカリール基からなる群か
ら選択され;R4およびR5は、同じかまたは異なり、置換または未置換のC1〜
C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換
のC5
〜C40アルカリール基からなる群から選択され;X1は−O−、−S−、−S(
O)2-、および−N(R12)−からなる群から選択され;R12は、水素、置換また
は未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、お
よび置換または未置換のC5〜C40アルカリール基からなる群から選択され;n
は0、1または2であり;AおよびBの1つは、水素、ハロゲン化物、置換また
は未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、お
よび置換または未置換のC5〜C40アルカリール基からなる群から選択され、A
およびBの他の1つは下記の式であらわされ:上記式中pは0または1、X2は、−O−、−S−、−S(O)2-および−N(R13
)−からなる群から選択され、R13は、水素、置換または未置換のC1〜C20ア
ルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜
C40アルカリール基からなる群から選択され;R6およびR7は、同じかまたは異
なり、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30
アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルカリール基からなる群から選択
され;mは0、1または2であるリンカー化合物またはその誘導体;または下記
の式IIであらわされる化合物であって、
上記式中、Yは、−O−、−S−、−S(O)2−およびO−((CH2)l−O)
qからなる群から選択され、lは60以下の整数であり、qは1〜1000の
範囲の整数であり、R4、R5、R6、R7、mおよびnは前記と同じ意味であり、
YがOであるとき、nおよびmの少なくとも1つは0または2であるという条件
がつけられている前記化合物を;(B)所望ヌクレオシドのOHと反応させて、
エステル結合を有する誘導体化ヌクレオシドを作り;(C)固体支持体と反応さ
せてリンカー アームを作る段階を含んでなる。
もう一つの面では、本発明は固体支持体オリゴヌクレオシド合成のためのリン
カー アームの製法を提供する;そのリンカー アームは下記の式を含み:
上記式中X3は−O−または−N(H)−であり;
その製法は、下記の式III、IVおよびVであらわされ、上記式中X3は、前に定義したものである化合物類を、O−(7−アザベンゾト
リアゾール−1−イル)−1、1、3、3−テトラメチルウロニウム ヘキサフ
ルオロホスフェート(HATU)、2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル
)−1、1、3、3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート、
(HBTU)、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)およびそれらの
混合物からなる群から選択される少なくとも1つのメンバーを含んでなる活性化
剤の存在下で、一緒に反応させる段階を含む。
本発明のリンカー アームは、(i)製造および使用しやすい;(ii)無視で
きるほど少ない自発的加水分解(1年あたり、<5%);および(iii)合成さ
れ
たオリゴヌクレオチドが速やかに(室温で概ね5分以内)切断される、という所
望の組み合わせを提供する。
本明細書を通して使用する用語“オリゴヌクレオチド”とは、広い意味を有す
るものであり、一般的オリゴヌクレオチド、主鎖改変オリゴヌクレオチド(例え
ばオリゴ治療薬として有用なホスホロチオエート、ホスホロジチオエートおよび
メチル−ホスホネート同族体など)およびオリゴヌクレオチド誘導体、例えばオ
リゴヌクレオチド−ペプチド結合体などを包含する。
図面の簡単な説明
本発明の実施態様は添付の図面によって説明される:
図1は、本発明の製法の特異的好適実施態様を示す。
発明を実施するための最良の形態
こうして本発明は、支持体と出発ヌクレオシドとの間の特殊なリンキング化合
物の使用が、固体支持体オリゴヌクレオチド合成のための改良リンカー アーム
に導くことを発見した。
1実施態様において、リンキング化合物は、下記の式Iの化合物:
またはその誘導体である。上記式中:X1は、−O−、−S−、−S(O)2-、
−C(O)−および−N(R12)−からなる群から選択され;R12は、水素、置換
または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基
、置換または未置換のC5〜C40アルカリール基を含んでなる群から選択され;
R1、R2、R3、R4およびR5は、同じかまたは異なり、水素、ハロゲン化物、
置
換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール
基、および置換または未置換のC5〜C40アルキルアリール基からなる群から選
択され;nは0、1または2であり;AおよびBの1つは、水素、ハロゲン化物
、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリ
ール基、置換または未置換のC5〜C40アルキルアリール基からなる群から選択
され、AおよびBの他の1つは下記の式であらわされ:
上記式中、pは0または1、X2は、−O−、−S−、−S(O)2-、−C(O
)−および−N(R13)−からなる群から選択され;R13は、水素、置換または未
置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換ま
たは未置換のC5〜C40アルカリール基を含む群から選択され;R6およびR7は
同じかまたは異なり、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未
置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルカリール基から
なる群から選択され;mは0、1または2である。
本明細書を通じて、置換部分を参照する場合、その置換の性質は明細書によっ
て制限されるものでなく、C1〜C20アルキル基、C5〜C30アリール基、C5〜
C40アルカリール基からなる群から選択できる。
好適には式IのBは、水素、ハロゲン化物、置換または未置換のC1〜C20ア
ルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜
C40アルキルアリール基からなる群から選択され、それによって“パラ”の位置
に酸含有部分を与える。
式IのR4およびR5が、両方共に、水素であり、式IのR6およびR7が、両方
共に水素であるのが好ましい。式IのR4、R5、R6、R7、R12およびR13の各
々が水素であるのがより好ましい。
式Iのmおよびnの少なくとも1つ、より好適には両方共に1であり、式Iの
pが1であるのが好ましい。
式IのR1、R2およびR3の各々が水素で、式IのX1およびX2が両方共にO
であるのが好ましい。
式Iの好適リンキング化合物は、ヒドロキノン−O,O’−二酢酸である。当
業者には公知のように、その化合物は下記の構造を有する:
これは、固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカー アームを製造す
るためにこの酸を使用した最初であると考えられる。
他の実施態様において、リンキング化合物は下記の式IIを有する化合物であっ
て:
上記式中Yは、−O−、−S−、S(O)2-、および−O−((CH2)1-O)q
からなる群から選択され、lは60以下の整数であり、qは1〜1000の範囲
の整数であり、R4、R5、R6、R7、mおよびnは前と同様の意味をもち、Yが
Oであるとき、nおよびmの少なくとも1つは0か2であるという条件がつけら
れる。
好適には式Iのlは、1〜10の範囲の整数であり、式IIのqは、1〜100
0の範囲の整数である。
式 の最も好適な化合物はチオジグリコール酸(すなわちR4=R5=R6=R7
=H、n=m=1、およびY=S)である。
本発明のリンカー アームを定義づける上記の式において、NUCLEOSI
DE(ヌクレオシド)は、下記の式の1つから選択される部分である:
上記式中、R8およびR10は同じかまたは異なり、水素または保護基であり、R9
は水素(デオキシリボヌクレオシドまたはDNAの場合)または−OR11(リボ
ヌクレオシドまたはRNAの場合)であり、ここではR11は水素または保護基で
あり、B*は核酸塩基である。例えばRNAの場合、2個の水酸基があり、それ
らは保護されていてもよい。またリンカーは5’−、3’−、または(もしリボ
ースである場合)2’−ヒドロキシル位置のいずれかに付着できる。実際、RN
A配列の場合、ヌクレオシドとリンカー化合物との間に形成されるエステルリン
カーがヌクレオシドの2’−ヒドロキシル位置であっても、3’−ヒドロキシル
位置であってもほとんど差はない。こうして熟練せる当業者はヌクレオシドがそ
の種々のヒドロキシル部分において保護され、またはブロックされることを理解
するであろう。
有用な保護基の非制限的例はトリチル、メトキシトリチル、ジメトキシトリチ
ル(DMT)、ジアルキルホスファイト、ピバリル−イソブチルオキシカルボニ
ル、t−ブチルジメチルシリル、フェノキシアセタール、9−フェニルキサンテ
ン−9−イル(ピキシル)、テトラヒドロピラニル、メトキシテトラヒドロピラ
ニル、メトキシメチル、ベンジルオキシメチル、メトキシエトキシメチル、メチ
ルチオメチル、ジアルキルホスフェート、レブリニル、ジメチルフェニルシリル
、トリメチルシリル、イソプロピルジメチルシリル、ジイソプロピルメチルシリ
ル、ジエチルイソプロピルシリル、トリイソプロピルシリル、アセチル、ベンゾ
イル、ピバロイル、トリフルオロアセチル、アリル、ベンジル、o−ニトロベン
ジル、o−ヒドロキシスチリルジメチルシリル、2−オキソ−1,2−ジフェニ
ルエチル、アリルオキシカルボニル、モノメトキシメチル、ニトロベラトリルオ
キシカルボニル、ジメトキシベンゾイン、ジメトキシベンゾイン カルボネート
、メチルニトロピペロニル カルボネート、フルオレニルメトキシカルボニル、
2−フェニルスルホニルエトキシカルボニル、フルオロフェニルメトキシピペリ
ジニルなどからなる群から選択される。
当業者には公知のように、5’−ヒドロキシル位置に用いられる保護基の主な
必要条件は、リンカー アームの切断をおこすことなくそれが選択的に除去され
ることである。例えば5’−ヒドロキシル位置(1つまたは複数)のための好適
保護基は酸に不安定なジメトキシトリチル基である。その他のヒドロキシル位置
の保護基の主な必要条件は上記保護基の除去のために用いられる条件に対して安
定なことである。これらの後者の保護基はリンカーを切断するために用いる同じ
条件(以下で論ずる)または分離条件によって除去される。これらの位置の好適
保護基はトリアルキルシリル(すなわちt−ブチルジメチルシリル)またはアセ
チルである。その他の情報は以下の文献から得られる:
1.グリーン(T.W.Greene)&ナッツ(P.G.M.Nuts)、“有機合成における保
護基(Protecting Groups in Organic Synthesis)”、第2版(1991)、Jo
hnWiley and Sons,Inc.,NY;
2.シェルハース(M.Schelhaas)&ワルドマン(H.Waldman)、“有機合成に
おける保護基戦略(Protecting Group Strategies in Organic Synthesis)”、
Angew.ChemieInt.Ed.Engl.35巻、2056−2083ページ(1996);
3.ゲイト(M.J.Gait)編“オリゴヌクレオチド合成、実際的アプローチ(Ol
igo nucleotide Synthesis A Practical Approach)”IRL Press、オックスフォ
ード(1984);
4.ナラング(S.A.Narang)編、“DNAおよびRNAの合成および使用(Sy
nthesis and Appilcations of DNA and RNA)”、Academic Press,Inc.,オーラ
ンド(1987);
5.アグラワル(S.Agrawal)編、“分子生物学における方法、20巻:オリ
ゴヌクレオチドおよび同族体のためのプロトコル(Methods in Molecular Biolo
gy,Vol.20:Protocols for Oligonucleotides and Analogs)”Humana Press、To
towa、NJ(1993);
これらの各々の内容は、その他の考えられるヒドロキシル保護基について論ずる
ために、参考として本明細書に組み入れられるものである。
所望ヌクレオシドを保護する方法は一般的なものであり、熟練せる当業者の権
限の範囲内である。例えばメルビー(Melby)の米国特許第3,400,190
号、カルサース(Caruthers)らの米国特許第4,458,066号を参照され
たい;その各々の内容は参考として本明細書に組み入れられるものである。
本発明の範囲のデオキシリボヌクレオシドの好適製法は、5’−ジメトキシト
リチル保護基および適した環外アミノ保護基を有するヌクレオシド、例えば、N6
−ベンゾイル−5’−ジメトキシトリチル−2’−デオキシアデノシン、N4-
ベンゾイル−5’−ジメトキシトリチル−2’−デオキシシチジン、5’−ジメ
トキシトリチル−N2-イソブチリル−2’−デオキシグアノシン、または5’
−ジメトキシトリチルチミジンを用いることである。
本発明の範囲のリボヌクレオシドの好適製法は、適した環外アミノ保護基を有
し、2’−または3’−ヒドロキシル位置のどちらかに保護基がない5’−ジメ
トキシトリチル保護ヌクレオシドを用いることである。リンカーはその後2つの
隣接ヒドロキシル基のどちらか1つ(どちらでもかまわない)と反応することが
でき、その結果2’−および3’−結合の混合物を与える。その後未反応のヒド
ロキシル基を、無水酢酸による固定ヌクレオシド処理によってアセチル化するこ
とができる。別法として、5’−ジメトキシトリチル基、適切な環外アミノ基保
護、3’−ヒドロキシル保護基かまたは2’−および3’−保護基の混合物のど
ちらかを有するリボヌクレオシドを用いることができる。3’−保護化合物は、
2’−ヒドロキシル位置を保護するときに同時に生成し、ほとんど他の用途をも
たない、概ね好ましくない異性体である。
本発明のリンカー アームを定義づける上記式において、SUPPORT(支
持体)は、従来の固体支持体である。その固体支持体の性質は特に制限されてお
らず、熟練せる当業者の権限の範囲内である。例えば、固体支持体は無機物質で
もよい。適した無機物質の非制限的な例は、シリカ、ポーラスガラス、アルミノ
シリケート、ボロシリケート、金属酸化物(例えば酸化アルミニウム、酸化鉄、
酸化ニッケルなど)およびこれらの1つ以上を含む粘土からなる群から選択でき
る。或いは、固体支持体は架橋ポリマーのような有機物質でもよい。適した架橋
ポリマーの非制限的例はポリアミド、ポリエーテル、ポリスチレンおよびそれら
の混合物からなる群から選択できる。ここに用いるために好適な固体支持体は一
般的なものであり、ポーラスガラスビーズまたはポリスチレンビーズから選択で
きる。
本発明のリンカー アームを作成するこの製法において、活性化剤の存在下で
リンカー化合物と所望ヌクレオシドと固体支持体とを反応させるのが好ましい。
本明細書を通して用いられる用語“活性化基(activating group)”とは広義の
ものであり、カルボキシル部分のアシル炭素に離脱基を結合させることによって
、カルボキシル部分(例えば、式Vのリンキング化合物上の)を活性化すること
のできる親電子試薬類を包含する一例えばボダンスキー(M.Bodanszky)著“ペ
プチド合成の原理(Principles of Peptide Synthesis)”、第2版、Springer-
Verlag)ベルリン(1993)を参照されたい;この内容は参考として本明細書
に組み入れられるものである。こうして活性化剤は下記の少なくとも1つを開始
できなければならない:(a)分離した段階または諸段階においてカルボキシル
部分から反応性アシル化剤を形成し(これは誘導体の1例である)、その後直ち
にアミノ成分(この場合はアミノ末端支持体)で処理してアミド結合を形成する
か、またはヒドロキシ成分(この場合はヒドロキシ末端支持体または所望ヌクレ
オシド上のヒドロキシル基)で処理してエステル結合を形成する;(b)段階(
a)に述べたアミノまたはヒドロキシ成分で処理する前に、別個に任意的精製を
伴う、分離可能のアシル化剤の形成;(c)アミノ/ヒドロキシ成分の存在下で
、2成分の混合物に活性化剤を添加することによって、アシル化中間体を形成す
る。こうして(a)、(b)および(c)の各々はカルボン酸エステルおよび−
アミド両方を形成するために適用でき、3経路すべてはヌクレオシドを支持体に
結合させるために使用できる。
例えば、先ず最初に塩化オキサリルをトリアゾールと反応させ、それから生成
したオキサリル トリアゾリドにヌクレオシドを付加するというレッツィンガー
の方法は経路(a)の例である。p−ニトロフェノール、またはジ−、トリ−、
テトラ−、またはペンタ−塩素化またはフッ素化フェノール、またはN−ヒドロ
スクシンイミドを用いてカルボン酸基を“活性”エステルに変換するのは経路(
b)の一般的例である。経路(c)は近年最も一般的に用いられる方法であり、
カルボジイミド試薬(ジシクロヘキシルカルボジイミド、1−(3−ジメチルア
ミノプロピル)エチルカルボジイミド、およびジイソプロピルカルボジイミド)
もウロニウム試薬(O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1、1、
3、3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HATU)、
2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチル
ウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HBTU))も両方共このアプロー
チに用いられる。実際、本発明の一面は、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(
HOBt)、HATUまたはHBTU(HBTUの方が好ましい)の1つまたは
両方を、4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)と組み合わせて使用すると驚
くべきことに、そして予想に反して、従来の活性化剤(例えばDMAPと1−(
3−ジメチルアミノプロピル)−エチルカルボジイミド(DEC))を使用した
場合と比べて、固体支持体への誘導体化ヌクレオシドの比較的速い、高レベルの
担持がおこることを発見したことに関係する。
好適実施態様において、リンカー化合物、所望ヌクレオシドおよび固体支持体
の反応は、活性化剤に加えて、反応をスピードアップするための求核触媒または
添加剤(典型的には4−ジメチルアミノ ピリジン(DMAP)、1−ヒドロキ
シベンゾトリアゾール(HOBt)、または1−ヒドロキシ−7−アザベンゾト
リアゾール(HOAt))、およびカルボン酸基をイオン化するための第三アミ
ン塩基(典型的にはトリエチルアミン、ピリジン、またはジイソプロプルエチル
アミン)の存在下で行われる。
こうして熟練せる当業者は、活性化されたカルボン酸基がエステルまたはアミ
ド結合の生成を適切に開始することができ、活性化試薬が所望ヌクレオシドに悪
影響を与えないという条件のもとでは、活性化剤の精密な性質は特に制限されな
いことを当然理解する。
こうしてカルボン酸の、酸塩化物;活性エステル(すなわちニトロフェニル、
ニトロフェニルチオ、トリクロロフェニル、トリフルオロフェニル、ペンタクロ
ロフェニル、ペンタフルオロフェニル、または3−ヒドロキシ−2,3−ジヒド
ロ−4−オキソ−ベンゾトリアジンエステル);活性ヒドロキシルアミンエステ
ル(すなわちN−ヒドロキシフタールイミドまたはN−ヒドロキシスクシンイミ
ド);酸無水物;または混合無水物への変換による活性化は、所望結合を形成す
る誘導体を生成し、したがってこれらの戦略は本発明に含まれる。
活性化剤の非制限的例は、アリールスルホニルクロリド(例えばベンゼンスル
ホニルクロリド(BS−Cl)、メシチレンスルホニルクロリド(MS−Cl)
、トリイソプロピルスルホニルクロリド(TPS−Cl));活性アリールスル
ホニルエステル(すなわちBS−Cl、MS−ClまたはTPS−Clのイミダ
ゾール、トリアゾール、ニトロトリアゾール、またはテトラゾールエステル);
2−エトキシ−1−(エトキシカルボニル)−1,2−ジヒドロキノリン(EE
DQ);アシルカルボネート:1,1’−(カルボニルジオキシ)ジベンゾトリ
アゾール;クロロトリメチルシラン;カルボジイミド(すなわちジシクロヘキシ
ルカルボジイミド(DCC)、1−(3−ジメチルアミノプロピル)−エチルカ
ルボジイミド(DEC)、ジイソプロピルカルボジイミド(DIC))の単独化
合物、または補助的求核剤(すなわち1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HO
Bt)、1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(HOAt)、N−ヒド
ロキシスクシンイミド(HOSu)、または3−ヒドロキシ−3、4−ジヒドロ
−1,2,3−ベンゾトリアジン−4−オン(HOObt)および/または触媒
(すなわち4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)またはN−メチルイミダゾ
ール(NMI))との組み合わせからなる群から選択される;またはウロニウム
塩(すなわちテトラメチルウロニウム クロリド(TMU−Cl)、2−(1H
−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム
ヘキサフルオロホスフェート(HBTU)、2−(1H−ベンゾトリアゾール−
1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テトラフルオロボレー
ト(TBTU)、2−スクシンイミド−1,1,3,3−テトラメチルウロニ
ウム テトラフルオロボレート(TSTU)、2−(3,4−ジヒドロ−4−オ
キソ−1,2,3−ベンゾトリアジン−3−イル)−1,1,3,3−テトラメ
チルウロニウム テトラフルオロボレート(TDBTU)、2−(2−オキソ−
1(2H)−ピリジル−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テトラフル
オロボレート(TPTU)、2−(5−ノルボルネン−2,3−ジカルボキシミ
ド)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テトラフルオロボレート(T
NTU)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,3−ジメチル
−1,3−トリメチレンウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HAMTU
)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−ビス(
ペンタメチレン)ウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HAPipU)、
O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−ビス(テト
ラメチレン)ウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HAPyU)、O−(
7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロ
ニウム ヘキサフルオロホスフェート(HATU))の単独化合物、または補助
的求核剤(すなわち1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)、1−ヒド
ロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(HOAt)、N−ヒドロキシスクシンイ
ミド(HOSu)、または3−ヒドロキシ−3,4−ジヒドロ−1,2,3−ベ
ンゾトリアジン−4−オン(HOObt))および/または触媒(例えば4−ジ
メチルアミノピリジン(DMAP)またはN−メチルイミダゾール(NMI))
との組み合わせも所望結合を生成する。
適した活性化剤のその他の例は下記の文献のいずれかに見いだされる:
エム.ボダンスキー(M.Bodanszky)“ペプチド合成の原理”、第2版、スプ
リンガ フェアラーク(Springer-Verlag)、ベルリン(1993);
ジョーンズ(J.Jones)“アミノ酸およびペプチドの合成(Amino Acid and Pe
ptide Synthesis)”、オックスフォード大学出版(Oxford University Press)
、オックスフォード(1992);
ジー.グラント(G.Grant)“合成ペプチド:ユーザーのための指針(Synthet
ic Peptides:A Users Guide)”、ダブリュー.エイチ.フリーマン アンドコ
ウ(W.H.Freeman & Co.)NY(1992);
イー.ハスラム(E.Haslam)、テトラヘドロン、36巻、2409ページ(1
980);
エム、オグリアルソ(M.A.Ogliaruso)およびウォルフェ(J.F.Wolfe)“カル
ボン酸、エステル、それらの誘導体の合成(Synthesis of Carboxylic Acids,Es
ters and Their Derivatives)”、ジョン ウイリ アンド サンズ チセスタ
(John Wiley & Sons、Chicester)(1991);
これら各々の内容は、文献により本明細書に組み入れられるものである。
本発明の製法の好適実施態様を図1を参照して説明する。図1において、DM
Tはジメトキシトリチルを指す;Bは核酸塩基であり、AはH(デオキシリボヌ
クレオシドの場合)またはOR(リボヌクレオシドの場合)であり、ここでRは
Hまたはブロッキング/保護基、例えば先行パラグラフに記載したようなものを
指す。図1は説明のためにのみ与えられた好適実施態様に過ぎないことは明らか
である。下記の議論において、括弧内の参照番号は図1の参照番号と対応する。
本発明の製法の1実施態様において、リンカー化合物(2)を先ず最初に所望
ヌクレオシド(1)と反応させて誘導体化ヌクレオシド(3)を作る。誘導体化
ヌクレオシド(3)をその後固体支持体と反応させてリンカー アーム(5)を
作る−−図1の段階1aおよび2aを参照されたい。
この製法のもう一つの実施態様において、リンカー化合物(2)を先ず最初に
固体支持体と反応させて誘導体化支持体(4)を作り、その後誘導体化支持体(
4)を所望ヌクレオシド(1)と反応させてリンカー アーム(5)を作る。
図1に示すように、リンカー アーム(5)において、エステル結合がヌクレ
オシドとリンカー化合物との間に形成され、アミド結合がリンカー化合物と固体
支持体との間に形成される。もちろん熟練せる当業者たちは、もし支持体が末端
ヒドロキシル基を含む場合は、リンカー化合物と固体支持体との間にエステルリ
ンカーが形成されることを理解する。
図1の段階3に説明されるように、ひとたびリンカー アーム(5)が作られ
たならば、それを従来の方法で用いてそのリンカー アーム(6)に付着したオ
リゴヌクレオチドを合成する−−例えば米国特許第5,112,962号(レッ
ツィンガー)を参照されたい;これは参考として本明細書に組み込まれるもので
図1の段階3に説明されるように、ひとたびリンカー アーム(5)が作られ
たならば、それを従来の方法で用いてそのリンカー アーム(6)に付着したオ
リゴヌクレオチドを合成する−−例えば米国特許第5,112,962号(レッ
ツィンガー)を参照されたい;これは参考として本明細書に組み込まれるもので
ある。
この時点において、オリゴヌクレオチドは固体支持体から切断され、遊離オリ
ゴヌクレオチド(7)と使用ずみ支持体を与える(8)−−図1の段階6参照。
切断段階は通常、最初のヌクレオシドがリンキング化合物(すなわち式 および
の化合物)に付着した点の加水分解を含む。
切断をおこすために用いる試薬は特に制限されず、熟練せる当業者の権限の範
囲内である。好適には試薬は弱塩基である。この目的に適した試薬の非制限的例
は、水酸化アンモニウム、水酸化アンモニウム/メタノール、トリエチルアミン
/アルコール(例えばエタノール、メタノール、など)、メチラミン、ジメチル
アミン、トリメチルアミン/水、メチラミン/水酸化アンモニウム、アンモニア
/メタノール、炭酸カリウム/メタノール、t−ブチラミン、エチレンジアミン
などからなる群から選択される。
切断はDMF中20%ピペリジン溶液を用いて室温でも行うことができる。し
かし重要なことに切断速度は遅く(t1/2〜200分(min))、そのためま
だピペリジン溶液を用いて、より敏感な保護基(例えばフルオレニルメトキシカ
ルボニル(Fmoc)基など)を除去したり、非誘導体化カルボン酸基を反応性
のないアミドに変換したりすることができる。リンカーアームを中性条件下で室
温でフッ化物イオン(例えば1Mテトラブチルフッ化アンモニウム/THFまた
はトリエチルアミン トリヒドロフルオリド)で処理することによって切断する
こともできる。
好適切断法は室温で濃水酸化アンモニウム水溶液で3分間処理することである
。 本発明の実施態様は、本発明の範囲を制限するものではない下記の実施例で
説明される。実施例においては、種々の材料および図1が参照される。実施例に
は下記の材料を用いた;
1.CPG、長鎖アルキルアミン コントロールド・ポーラスガラス、120
〜200メッシュ、500Å、90〜120μmol/gのNH2基);CPG
社(Lincoln Park、NJ)から市販される;
2.HQPD、ヒドロキノン−O,O’−二酢酸、ランカスタ シンセシス(
Lancaster Synthesis)社(ランカシャー(Lancashire)、英国)から市販され
る;
3.水酸化アンモニウム溶液(28−30%)および溶媒はVWR Canlab社
(Edmonton,Alberta,カナダ)から入手した;
4.キャップA:無水酢酸、2,6−ルチジンおよびテトラヒドロフラン(T
HF)1:1:8の容量比からなる溶液;
5.キャップB:N−メチルイミダゾールおよびTHF、16:84の容量比
からなる溶液;
6.I2/H2O酸化、容量比7:2:1のTHF中0.05M I2、H2Oおよ
びピリジンからなる溶液;
7.無水ピリジンおよびアセトニトリル(CaH2から蒸留したもの);
8.無水メタノール、Mgターニング(Mg turnings)から蒸留したもの;
9.DMAP、4−ジメチルアミノピリジン、試薬級;
10.DIEA、CaH2から蒸留した無水ジイソプロピルエチルアミン;
11.DEC、1−(3−ジメチルアミノプロピル)−エチルカルボジイミド
、試薬級;
12.HBTU、2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3
,3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロ−ホスフェート、試薬級;
13.HOBT)1−ヒドロキシベンゾトリアゾール、試薬級;
14.TEA、トリエチルアミン、試薬級;
15.N6-ベンゾイル−5’−ジメトキシトリチル−2’−デオキシアデノシ
ン−3’−O−ヘミスクシネート、N4-ベンゾイル−5’−ジメトキシトリチル
−2’−デオキシシチジン−3’−O−ヘミスクシネート、N2-イソブチリル−
5’−ジ−メトキシトリチル−2’−デオキシグアノシン−3’−O−ヘミスク
シネートおよび5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’−O−ヘミスクシネー
トはシグマケミカル社から入手した;
16.硫酸マグネシウム、試薬級;
17.塩化オキサリル、試薬級;
18.クロロホルム、試薬級;
19.ジクロロメタン、試薬級;そして
20.スクシニル−CPG、89μmol/g担持、は無水琥珀酸とLCAA
−CPGからダムハ(Damha)らの方法(Nucl.Acids Res.18巻、3813ペー
ジ、1990)を用いて作った。
下記の実施例において不溶性支持体上(に担持されている)ヌクレオシドの量
は分光光度法トリチル分析によって測定した。この方法では支持体試料(4−5
mg)を直接10mL容量フラスコに正確に秤取した。それから1,2−ジクロ
ロエタン中ジクロロ酢酸溶液(ジクロロ酢酸:1、2−ジクロロエタンの容量比
、5:95)を加えてフラスコを満たす。その内容物をその後徹底的に混合し、
オレンジ色の溶液の吸光度をフィリップスUV/Vis分光光度計で波長503
nmで測定した。それからヌクレオシド担持量(μmol/gのCPG)を次の
ように計算した:
担持量=(A503×Vol×1000)/(Wt×76)
上記式中、A503=503nmにおける吸光度、Vol=溶液の容量(mL)、
Wt=試験したCPGの量(mg)。トリチル測定の精度は約±2〜3%であっ
た。
実施例1:5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’−O−ヘミヒドロキノン−
O、O’−ジアセテートの合成(図1、段階1a)。
HQPA(10mmol、2.26g)、5’−ジメトキシトリチルチミジン
(10mmol、5.45g)、DMAP(1mmol、122mg)、DEC(
10mmol、1.92g)、トリエチルアミン(0.2ml)およびジクロロ
メタン(50ml)を100ml丸底フラスコ中で合一し、室温で一晩撹拌した
。溶液を分液漏斗に移し、付加的CH2Cl2(50ml)で希釈し、酸性H2O(
10%HCl水溶液を含む150mlH2O)で1回洗い、NaHCO3で1回、
H2Oで2回洗った。CH2Cl2溶液を無水MgSO4上で乾燥し、濾過し、それ
から蒸発することにより、明灰色フォームが得られた(95%収率)。粗材料
をシリカゲルTLCによってチェックすると(Rf=0.02、5%メタノール
/CHCl3;またはRf=0.08、10%メタノール/CHCl3)、大部分所
望産物(図1の化合物3)を含むことが判明した。残る不純物は、未反応のヌク
レオシド(Rf=0.39、5%メタノール/CHCl3)、および、ジエステル
と予想されるより速く移動する不純物(Rf=0.54、5%メタノール/CH
Cl3)を含んでいた。この粗材料はそれ以上精製しなくとも支持体に結合させる
のに適していた。しかし所望ならば、シリカゲルカラムクロマトグラフィーによ
り0−30%メタノール/CHCl3勾配を用いて精製することができる。
実施例2:HOPA誘導体化CPGの合成(図1、段階1b)
101μmol/gアミノ担持CPG(1g)、HQPA(1mmol、22
6mg)、DMAP(1mmol、122mg)、HBTU(1mmol、37
9mg)および無水ピリジン(5mL)を20mlねじ蓋つきガラスバイアル中
で合一し、室温で撹拌した(5分間)。H2O(1mL)を加え、振とうを続け
た(10分間)。CPGを濾別し、メタノール(〜50ml)で洗い、その後C
H2Cl2(〜50ml)で洗い、真空中で乾燥した。CPG試料(〜1−2mg)
を0.28Mニンヒドリン/エタノール(100μL)と共に加熱すると陰性結
果が出た(無色ビーズ)。
実施例3:DECを用いる5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’−O−ヘミ
ヒドロキノン−O,O’−ジアセテートとCPGとの結合(図1、段
階2a)
実施例1からの精製していないヌクレオシド−3’−O−カルボン酸生成物(
2.0mmol、1.5g)、DMAP(0.5mmol、61mg)、DEC
(5mmol、0.96g)、CPG(5g)、トリエチルアミン(0.5ml
)および無水ピリジン(25ml)を100mL丸底フラスコ中で合一し、室温
で振とうした(4.5時間)。CPGを濾別し、メタノールで、その後CH2C
l2で洗った。未反応アミノ基は、CPGを1:1容量比のCapAおよびCa
pB溶液混合物で処理し(2時間)、その後CH2Cl2で洗い、乾燥すること
によってキャッピングした。ヌクレオシド担持量はトリチル分析によって測定し
た。典型的担持量は30−40μmol/gであった。
実施例4:HBTU/HOBTを用いる5’−ジメトキシトリチルチミジン−3
’−O−ヘミヒドロ−キノン−O,O’−ジアセテートとCPGとの
結合(図1、段階2a)
実施例1からの精製していないヌクレオシド−3’−O−カルボン酸生成物(
0.05mmol、38mg)、HBTU(0.05mmol、19mg)、H
OBT(0.05mmol、7mg)、CPG(500mg)、DIEA(0.
1mmol、17μl)、および無水DMF、ジクロロメタン、アセトニトリル
、またはピリジン(5ml)をネジ蓋付きガラス壜中で混ぜ合わせ、室温で振と
うした。CPG試料を時々取り、トリチル分析を行った。最大担持に達した後(
1時間)、CPGを濾別し、CH2Cl2で洗い、乾燥し、実施例3に記載したよ
うにキャッピングした。各溶媒で種々の時間間隔で得られたヌクレオシド担持量
を表1に示す。
実施例5:高度に担持した5’−ジメトキシトリチルチミジンCPG(図1、段
階2a)の製法
実施例1からの精製していないヌクレオシド−3’−O−カルボン酸生成物(
0.1mmol)76mg)、HBTU(0.1mmol、38mg)、HOB
T(0.1mmol、14mg)、CPG(500mg)、DIEA(0.2m
mol、34μl)および無水アセトニトリル(3ml)を密栓フラスコ中で合
一し、室温で振とうした。CPG試料を時々取ってトリチル分析を行った。最大
の担持に達したとき(1時間)、CPGを濾別し、CH2Cl2で洗い、乾燥した
。10、20、30および60分のカップリング時間後に得られたヌクレオシド
担持量はそれぞれ60.9、64.8、65.9および66.2μmol/gで
あった。
表1:HBTU/HOBTを用いた場合の5’−ジメトキシトリチルチミジン担
実施例6:5’−ジメトキシトリチルチミジンとHOPA誘導体化CPGとの結
合(図1、段階2b)
5’−ジメトキシトリチルチミジン(0.1mmol、54mg)、HBTU
(0.1mmol、38mg)、DMAP(0.1mmol、12mg)、実施
例2で作られたHQPA−CPG(250mg)および無水アセトニトリル(1
ml)をねじ蓋つきガラスバイアル中で合一し、室温で振とうした(2時間)。
CPGを濾別し、CH2Cl2で洗い、乾燥した。トリチル分析は42.9μmo
l/gの担持量を示した。
実施例7:自動オリゴヌクレオチド合成にヌクレオシド−HOPA−CPG支持
体の使用
ヌクレオシド誘導体化CPG(図1の化合物4)を一般の誘導体化CPGと同
じように用いた、すなわちCPGをプラスチック製合成カラム(〜12mg/カ
ラム)に充填し、従来の合成試薬を有するパーキン−エルマーアプライド−ビオ
システムズ394自動DNA合成器に取り付けた。オリゴヌクレオチド合成は改
変しない0.2μmolスケール合成サイクルを用いて行われた。しかし従来の
自動的最終方法の待ち段階(表2)は変更され、総切断時間は60分から3分間
に短縮された。合成オリゴヌクレオチドを含む水酸化アンモニウム溶液をその後
加熱し(50℃、16時間)、一般的方法でオリゴヌクレオチドの脱保護を完了
した。
表2::PE/ABD394DNA合成器の自動末端操作プログラム 注:試薬10および18はそれぞれ水酸化アンモニウムおよびアセトニト
リルである。
実施例8:オキサリル リンカーアーム
塩化オキサリル(2.5mmol、218μl)を、セプタム(隔膜)で封止
した50mlバイアル中で、無水ピリジン(25mmol、2.0ml)および
無水アセトニトリル(17.5ml)中トリアゾール(12.5mmol、86
3mg)の撹拌、室温溶液に加えた。無水ピリジン(2.5ml)およびアセト
ニトリル(17.5ml)中5’−ジメトキシトリチルチミジン(2.5mmo
l、1044mg)溶液を第2のセプタム封止バイアル中で作った。それからヌ
クレオシド溶液を注射器で定常的撹拌下の第1の溶液に加えた。30−45分間
撹拌後、溶液を100mlフラスコ中のCPG(10g)に加えた。そのフラス
コの内容物を30分間撹拌し、その後無水メタノール(50ml)を加えた。5
分後、CPGを濾別し、クロロホルムで洗い、乾燥した。その後CPGをCap
AおよびCapB溶液の1:1容量比の混合物で30分間キャッピングし、洗い
、乾燥した。トリチル分析により、ヌクレオシド担持は30−40μmol/g
の範囲であることが確認された。
実施例9:スクシニル リンカーアーム
方法A(ポン(Pon)ら、1988、Biotechniques 6巻、768−775ペ
ージによる)
5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’−O−ヘミスクシネート(0.2m
mol、123mg)、CPG(1g)、DEC(2mmol、382mg)、
DMAP(0.1mmol、12mg)、トリエチルアミン(80μl)および
無水ピリジン(10ml)を100ml丸底フラスコ中で合一し、室温で振とう
した(30−60分間)。CPGを濾別し、ピリジンで、その後CH2Cl2で洗
い、乾燥した。トリチル分析により、ヌクレオシド担持は30−40μmol/
gの範囲であることが確認された。
方法B(米国特許第5,554,744号(ボーングル(Bhongle)ら)によ
る)
HOBT(0.015mmol、2mg)、CPG(0.5g)、無水アセト
ニトリル(2ml)、無水ピリジン(0.1ml)およびジイソプロピルカルボ
ジイミド(0.15mmol)24μl、をねじ蓋つきガラスバイアル中で合一
し、室温で振とうした(20分間)。5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’
−O−ヘミスクシネート(0.05mmol、32mg)をバイアルに加え、室
温で一晩振とうを続けた。CPGを濾別し、CH2Cl2で洗い、乾燥した。トリ
チル分析でヌクレオシド担持量68.4μmol/gが確認された。
方法C(ダムハら、1990、Nucl.Acids Res.18巻、3813−3821ペ
ージ)
CPG(25g)、無水琥珀酸(50mmol、5g)、DMAP(5mmo
l、610mg)および無水ピリジン(110ml)を250ml丸底フラスコ
中で合一し、室温で振とうした(24時間)。その後CPGを濾別し、メタノー
ルおよびクロロホルムで洗い、乾燥した。
上記のようにして作ったスクシニル化CPG(1g)、5’−ジメトキシトリ
チルチミジン(0.1mmol、54mg)、DEC(1mmol、192mg
)、DMAP(0.1mmol、12mg)、トリエチルアミン(80μl)お
よび無水ピリジンを100ml丸底フラスコ中で合一し、室温で一晩振とうした
。ペンタクロロフェノール(0.5mmol、135mg)をフラスコに加え、
もう1日振とうを続けた。最後にピペリジン(5ml)を加え、5分間振とう後
、CPGを濾別し、CH2Cl2で洗い、乾燥し、実施例3のようにキャッピング
した。トリチル分析により、ヌクレオシド担持量は30−40μmol/gの範
囲であることが確認された。
実施例10:リンカーアームの安定性の評価
5’−ジメトキシトリチル化ヌクレオシド、オキサリル(実施例8)またはH
QPA(実施例3−6)リンカーアームで誘導体化した後、長鎖アルキルアミン
コントロールド・ポーラスガラス(LCAA−CPG)支持体をクロロホルムま
たはジクロロメタンでよく洗い、残留試薬を除去した。支持体を乾燥させ、その
後ヌクレオシド担持をトリチル分析によって測定した。CPGは使用するまで密
栓ガラスバイアル中に室温で貯蔵した。
CPG試料(〜50mg)をブフナー漏斗上でジクロロメタンでよく洗い、支
持体に共有結合していないヌクレオシドをすべて除去することによってCPG試
料のヌクレオシド含量を再測定した。この洗浄段階は重要であった;この洗浄が
なければ、その後のトリチル分析は支持体表面上の共有結合した(すなわち完全
無傷リンカー)と共有結合していない(すなわち分離しているリンカー)ヌクレ
オシドとを区別することはできなかったであろう。乾燥後、洗ったばかりのCP
Gでトリチル分析を行った。新たに測定したヌクレオシド担持量を最初の担持量
と比較し、切断程度を決定した。
オキサリル リンカーの場合、最初のヌクレオシド担持量が〜40μmol/
gである6ロットを調べた。その結果を表3に示す。表3では、“経過時間”は
リンカーアームの合成後に経過した期間である。
表3:オキサリル リンカーアームの安定性
これらの結果は切断量の大きな変動を示した(〜10−40%切断/月)。こ
れはオキサリル リンカーが不満足であることを我々に納得させるデータであり
、このリンカー化学のその後の評価は止めた。
同様な安定性試験をHQPDリンカーを含む支持体で行った結果は、表4に示
す。
表4:HQPDリンカーアームの安定性
これらの結果はdA、dCおよびTヌクレオシドで非常によい安定性を示し、
dGでは1カ月あたり〜0.7%切断を示した。これはオキサリル リンカーア
ームで得られた結果より遥かにすぐれている。
実施例11:HBTU/DMAPを用いる5’−ジメトキシトリチルチミジン−
3’−O−ヘミスクシネートとLCAA−CPGとのカップリング
5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’−O−ヘミスクシネート(0.05
mmol、32mg)、HBTU(0.05mmol、19mg)、DMAP(
0.05mmol、6mg)、CPG、101μmol/g、(0.5g)、無
水アセトニトリル(2mL)、および無水ピリジン(0.1mL)をセプタムで
封止したバイアル中で合一し、室温で5分間振とうする。CPGを濾別し、クロ
ロホルムで洗い、乾燥した。トリチル分析は65.3μmol/gの担持量を示
した。比べてみると、これは、上記ボーングルらのDIC/HOBT法および同
一のCPGおよびヌクレオシドを用いて一晩行った反応から得られた担持量の9
5%であった。
実施例12:HBTU/DMAPを用いる5’−ジメトキシトリチルチミジンと
スクシニルCPGとのカップリング
5’−ジメトキシトリチルチミジン(0.1mmol、54mg)、HBTU
(0.1mmol、38mg)、DMAP(0.1mmol、12mg)、スク
シニル−CPG(250mg)および無水アセトニトリル(1ml)を1本のね
じ蓋ガラスバイアル中で混ぜ合わせた。5’−ジメトキシトリチルチミジン(0
.05mmol、37mg)、HBTU(0.05mmol、19mg)、DM
AP(0.05mmol、6mg)、スクシニル化CPG、89μmol/g(
250mg)および無水アセトニトリル(1mL)を含む第2のバイアルも作っ
た。各バイアルからCPGの1部(〜10mg)を時々取り出し、CH2Cl2で
洗い、担持量をトリチル分析によって測定した結果を、表5に示す。最後の試料
分析後、残るCPGを濾別し、CH2Cl2で洗い、乾燥した。
実施例13:ヌクレオシド−3’−O−ヘミスクシネートとLCAA−CPGと
の自動的カップリング
N6-ベンゾイル−5’−ジメトキシトリチル−2’−デオキシアデノシン−
3’−O−ヘミスクシネート(0.05mmol、38mg)、N4-ベンゾイ
ル−5’−ジメトキシトリチル−2’−デオキシシチジン−3’−O−ヘミスク
シネート(0.05mmol、37mg)、またはN2-イソブチリル−5’−
ジメトキシトリチル−2’−デオキシグアノシン−3’−O−ヘミスクシネート
(0.05mmol、37mg)のいずれかと、DIEA(0.05mmol、
9μL)をセプタムで封止したバイアルに入れ、無水アセトニトリル(1mL)
に溶解した。セプタムで封止したバイアル中の5’−ジメトキシトリチルチミジ
ン−3’−O−ヘミスクシネート(0.05mmol、32mg)およびDIE
A(0.05mmol、9μL)を無水CH2Cl2/アセトニトリル、容量比1
:1(1mL)に溶解した。各溶液をその後0.45μm注射器フィルターを通
して濾過し、PE/ABD394自動DNA合成器の#5、6または7のボトル
位置のいずれかに据え付けた。同様に調製したHBTU(0.1mmol、38
mg)およびDMAP(0.1mmol、12mg)−無水アセトニトリル(2
mL)溶液をDNA合成器の#8のボトル位置に据え付けた。LCAA−CPG
(12mg)をプラスチック合成カラムに正確に秤取し、DNA合成器のカラム
位置#1に据え付けた。
表5:5’−ジメトキシトリチルチミジンとスクシニル−CPGとのHBTU/
DMAPカップリング
注:1.HBTU/DMAPの代わりにHATU/DMAPの使用は同様な結果
をもたらした。すなわちより強力なHATU試薬を使用するメリットはなかった
。
2.上記のカップリング反応をHBTU/HOBTおよび0.2mmol/
gのDMT−Tを用いても行った。しかし、その反応は速度が半分に過ぎず、3
0、60および120分後に担持量はそれぞれ6.5、13.0および25.6
μmol/gであった。
ボトル#5、6または7のいずれかの1つの内容と、ボトル#8の内容とを同時
に合成カラムに供給するための一般的ユーザー操作は、PE/ABD394ユー
ザーマニュアルのように決めた。一般的開始操作は次のように決められた:1、
アセトニトリル充填およびアルゴンのフラッシング(4×)により合成カラムを
洗う;2、上記の一般的ユーザー操作法を用いて、カラムにヌクレオシド−3’
−O−ヘミスクシネートおよびHBTU/DMAP溶液を満たす;3、アセトニ
トリル充填およびアルゴンのフラッシング(4×)によって合成カラムを洗う。
ボトル#7および#8を同時に合成カラム#1に供給するための決められたユー
ザー操作#200を含む開始操作のためのサンプルリストを表6に示す。開始操
作の完了後、未変更の0.2μmol規模の合成サイクルが自動的に開始され、
一般的方法でオリゴヌクレオチド合成が行われる。CPG上の担持量は次のよう
に決められる;1.取り付けられたフラクションコレクターを用いて最初のトリ
チル色を集める;2.その色を、25.0mlのジクロロ酢酸−1、2−ジクロ
ロエタン溶液(5:95、容量)で希釈する;3.吸光度(503nm)を測定
する;そして下記の式を用いて担持量を測定する:
担持量(μmol/g)=(A503×vol×1000)/(76×Wt)上
記式中、vol=容量(mL)、Wt=CPG量(mg)である。
試薬を合成カラムに充填するために必要な短かい時間(4秒)内に、45−5
3μmol/gのヌクレオシド担持量が得られた(すなわち表6、段階#13)
。待ち時間(すなわち表6、段階#14)は必要なかった。
実施例14:5’−ジメトキシトリチルチミジン−3’−O−ヘミヒドロキノン
−O、O’−ジアセテートとLCAA−CPGとの自動カップリン
グ
0.01、0.025および0.05M5’−ジメトキシトリチルチミジン−
3’−O−ヘミヒドロキノン−O、O’−ジアセテートおよびDIEAの無水ア
セトニトリル溶液を作り、0.45μmシリンジ フィルターを通して濾過し、
PE/ABD394DNA合成器のボトル#7として据え付けた。自動誘導体化
を実施例13に記載のようにして、0.01M、0.025Mおよび0.05M
HBTUおよびDMAP溶液を用いて行った。0.01、0.025および0
.05M試薬を用いて4第二反応から得た5’−ジメトキシトリチルチミジン担
持量は13.4、28.8および46.0μmol/gであった。
表3.1 LCAA−CPGを自動的に誘導体化するためのPE/ABD394
DNA合成器の一般的開始操作法 表3.1 LCAA−CPGを自動的に誘導体化するためのPE/ABD394
DNA合成器の一般的開始操作法
(1)段階のナンバー (2)ファンクション# (3)ファンクションネーム(4
)段階の時間
1ボトル#18は無水アセトニトリルを含む。
2一般的ユーザー機能
3この段階は、より緩徐なカップリング反応の場合、増加させることができ
る。
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【要約の続き】2
−基および−N(R13)−基からなる群から選択さ
れ、R13は、水素基、置換または未置換C1〜C20アル
キル基、置換または未置換C5〜C30アリール基、およ
び置換または未置換C5〜C40アルカリール基からなる
群から選択され、R6およびR7は、同じかまたは異な
り、水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換C1〜
C20アルキル基、置換または未置換C5〜C30アリール
基、および置換または未置換C5〜C40アルキルアリー
ル基からなる群から選択され、pは0または1であり、
mは、0、1または2である。リンカー アームを製造
するための方法が開示されている。このリンカー アー
ムは、固体支持体オリゴヌクレオチド合成に有用であ
り、また、自発的な加水分解に対する安定性と、リンカ
ー アームから合成されたオリゴヌクレオチドの意図さ
れた分割の容易さとの望ましい組み合わせを特徴とす
る。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカーアームの製法であって 、(A)下記の式(I)であらわされるリンカー化合物: またはその誘導体であって、上記式中、R1、R2、およびR3は同じかまたは異 なり、水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置 換または未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40ア ルカリール基からなる群から選択され;R4およびR5は同じかまたは異なり、置 換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール 基、および置換または未置換のC5〜C40アルカリール基からなる群から選択さ れ;X1は−O−、−S−、−S(O)2−および−N(R12)−からなる群から 選択され;R12は水素基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換また は未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルカリ ール基からなる群から選択され;nは0、1または2であり;AおよびBの1つ は水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換ま たは未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルカ リール基からなる群から選択され;AおよびBの他の1つは下記の式を有し: 上記式中、pは0または1であり、X2は−O−、−S−、−S(O)2−、−C (O)−および−N(R13)−からなる群から選択され、R13は水素基、置換ま たは未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、 および置換または未置換のC5-C40アルカリール基からなる群から選択され ;R6およびR7は同じかまたは異なり、置換または未置換のC1〜C20アルキル 基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜 C40アルカリール基からなる群から選択され、mは0、1または2である上記化 合物;または下記の式IIで表され: 上記式中Yは−O−、−S−、−S(O)2-およびO−((CH2)1-O)qから なる群から選択され、1は60以下の整数であり、qは1〜1000の範囲の整 数であり、R4、R5、R6、R7、mおよびnは上と同じ意味を有し、YがOであ るとき、nおよびmの少なくとも1つは0または2であるという条件である化合 物を、(B)所望ヌクレオシドのOHと反応させて、エステル結合を有する誘導 体化ヌクレオシドを作り;(C)固体支持体と反応させてリンカーアームを作る 諸段階を含むことを特徴とする固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリン カーアームの製法。 2.リンカー化合物を先ず最初に所望ヌクレオシドと反応させて誘導体化ヌクレ オシドを作り、その誘導体化ヌクレオシドをその後固体支持体と反応させてリン カーアームを作ることを特徴とする請求項1に記載の製法。 3.リンカー化合物を最初に固体支持体と反応させて誘導体化支持体を作り、そ の後前記誘導体化支持体を所望ヌクレオシドと反応させてリンカーアームを作る ことを特徴とする請求項1に記載の製法。 4.リンカー化合物が式Iから選択されることを特徴とする請求項1に記載の製 法。 5.Bが水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、 置換または未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40 アルキルアリール基からなる群から選択されることを特徴とする請求項4に記載 の製法。 6.R4およびR5が両方共水素基であることを特徴とする請求項1に記載の製法 。7.R6およびR7が両方共水素基であることを特徴とする請求項1に記載の製 法。8.R4、R5、R6およびR7の各々が水素基であることを特徴とする請求項 4に記載の製法。 9.mおよびnが両方共1であることを特徴とする請求項4に記載の製法。 10.pが0であることを特徴とする請求項4に記載の製法。 11.1が1〜10の範囲の整数であることを特徴とする請求項1に記載の製法 。 12.R12およびR13が両方共水素基であることを特徴とする請求項1に記載の 製法。 13.R1、R2およびR3の各々が水素基であることを特徴とする請求項1に記 載の製法。 14.X1およびX2が両方共Oである請求項1に記載の製法。 15.固体支持体が無機物質であることを特徴とする請求項1に記載の製法。 16.無機物質がシリカ、ガラスビーズ、ポーラスガラス、アルミノシリケート 、ボロシリケート、酸化金属、粘土およびこれらの混合物からなる群から選択さ れることを特徴とする請求項15に記載の製法。 17.固体支持体が有機物質であることを特徴とする請求項1に記載の製法。 18.有機物質が架橋ポリマーであることを特徴とする請求項17に記載の製法 。 19.架橋ポリマーがポリアミド、ポリスチレンおよびこれらの混合物からなる 群から選択されることを特徴とする請求項18に記載の製法。 20.所望ヌクレオシドをリンカー化合物との反応の前に保護基と反応させるこ とを特徴とする請求項1に記載の製法。 21.リンカー化合物と所望ヌクレオシドが、エステル結合を形成できる活性化 剤の存在下で反応することを特徴とする請求項1に記載の製法。 22.活性化剤が、アリールスルホニル クロリド(例えばベンゼンスルホニル クロリド(BS−Cl)、メシチレンスルホニル クロリド(MS−Cl)、ト リイソプロピルスルホニル クロリド(TPS−Cl));活性アリールスルホ ニル エステル(例えばBS−Cl、MS−ClまたはTPS−Clのイミダゾ ール−、トリアゾール−、ニトロトリアゾール−、またはテトラゾールエステル );2−エトキシ−1−(エトキシカルボニル)−1,2−ジヒドロキノリン( EEDQ);アシルカルボネート;1,1’−(カルボニルジオキシ)ジベンゾ トリアゾール;クロロトリメチルシラン;カルボジイミド(例えばジシクロヘキ シルカルボジイミド(DCC)、1−(3−ジメチルアミノプロピル)−エチル カルボジイミド(DEC)、ジイソプロピルカルボジイミド(DIC))の単独、 または補助的求核剤(すなわち1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt) 、1−ヒドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(HOAt)、N−ヒドロキシ スクシンイミド(HOSu)、または3−ヒドロキシ−3,4−ジヒドロ−1, 2,3−ベンゾトリアジン−4−オン(HOObt)、4−ジメチルアミノピリ ジン(DMAP)、N−メチルイミダゾール(NMI))との組み合わせ;およ びこれらの混合物からなる群から選択されることを特徴とする請求項1に記載の 製法。 23.活性化剤がウロニウム塩であることを特徴とする請求項1に記載の製法。 24.ウロニウム塩が、テトラメチルウロニウム クロリド(TMU−Cl)、 2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチル ウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HBTU)、2−(1H−ベンゾト リアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テトラフ ルオロボレート(TBTU)、2−スクシンイミド−1,1,3,3−テトラメ チルウロニウム テトラフルオロボレート(TSTU)、2−(3、4−ジヒド ロ−4−オキソ−1,2,3−ベンゾトリアジン−3−イル)−1,1,3,3 −テトラメチルウロニウム テトラフルオロボレート(TDBTU)、2−(2 −オキソ−1(2H)−ピリジル−1,1,3,3−テトラメチルウロニウムテ トラフルオロボレート(TPTU)、2−(5−ノルボルネン−2,3−ジカル ボキシミド)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム テトラフルオロボ レート(TNTU)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,3 −ジメチル−1,3−トリメチレンウロニウム ヘキサフルオロホスフェート( HAMTU)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3, 3−ビス(ペンタメチレン)ウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HAP ipU)、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3− ビス(テトラメチレン)ウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HAPyU )、O−(7−アザベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラ メチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HATU))からなる群から 選択されることを特徴とする請求項1に記載の製法。 25.ウロニウム塩が補助的求核剤の存在下で用いられることを特徴とする請求 項24に記載の製法。 26.補助的求核剤が1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)、1−ヒ ドロキシ−7−アザベンゾトリアゾール(HOPAt)、N−ヒドロキシスクシ ンイミド(HOSu)、または3−ヒドロキシ−3,4−ジヒドロ−1,2,3 −ベンゾトリアジン−4−オン(HOObt)、4−ジメチルアミノピリジン( DMAP)、N−メチルイミダゾール(NMI)およびこれらの混合物からなる 群から選択されることを特徴とする請求項1に記載の製法。 27.固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカーアームであって、下 記の式を含み; 上記式中:X1は−O−、−S−、−S(O)2−、−C(O)−および−N(R1 2 )−からなる群から選択され;R12は水素基、置換または未置換のC1〜C20ア ルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5 〜C40アルキルアリール基を含んでなる群から選択され;X3は−O−または− N(H)−であり;R1、R2、R3、R4およびR5は同じかまたは異なり、水素 基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未 置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルカリール 基からなる群から選択され;nは0、1または2であり;A’およびB’の1つ は水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1-C20アルキル基、置換 または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルキルア リール基からなる群から選択され、A’およびB’の他の1つは下記の式であら わされ: 上記式中、X2は−O−、−S−、−S(O)2-、−N(R13)−からなる群から 選択され;R13は水素基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換また は未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40アルカリール基 を含んでなる群から選択され;R6およびR7は同じかまたは異なり、水素基、ハ ロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換の C5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C30アルキルアリール基 からなる群から選択され;pは0または1;mは0、1または2であることを特 徴とするリンカーアーム。 28.B’が水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル 基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、置換または未置換のC5〜C40ア ルキルアリール基を含んでなる群から選択されることを特徴とする請求項27に 記載のリンカーアーム。 29.R4が水素基である請求項27に記載のリンカーアーム。 30.mおよびnが両方共1であることを特徴とする請求項27に記載のリンカ ーアーム。 31.R1、R2、R3、R12およびR13の各々が水素基であることを特徴とする 請求項27に記載のリンカーアーム。 32.X1およびX2が両方共Oであることを特徴とする請求項27に記載のリン カーアーム。 33.SUPPORT(支持体)が無機物質であることを特徴とする請求項27 に記載のリンカーアーム。 34.無機物質が、シリカ、ガラスビーズ、ポーラスガラス、アルミノシリケー ト、ボロシリケート、酸化金属、粘土およびこれらの混合物からなる群から選択 されることを特徴とする請求項33に記載のリンカーアーム。 35.SUPPORT(支持体)が有機物質であることを特徴とする請求項27 に記載のリンカーアーム。 36.有機物質が架橋ポリマーであることを特徴とする請求項35に記載のリン カーアーム。 37.固体支持体オリゴヌクレオチド合成のためのリンカーアームの製法であっ て、リンカーアームは下記の式であらわされ; 上記式中、X3が−O−または−N(H)−であり; 前記製法は、 下記の式III、IVおよびVであらわされ: 上記式中、X3は上に定義したものである化合物を一緒に、O−(7−アザベン ゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム ヘキ サフルオロホスフェート(HATU)、2−(1H−ベンゾトリアゾール−1− イル)−1,1,3,3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェー ト(HBTU)、1−ヒドロキシベンゾトリアゾール(HOBt)およびこれら の混合物からなる群から選択される少なくとも1つのメンバーを含んでなる活性 化剤の存在下で反応させる段階を含むことを特徴とする固体支持体オリゴヌクレ オチド合成のためのリンカーアームの製法。 38.活性化剤と4−ジメチルアミノピリジン(DMAP)の存在下で行われる ことを特徴とする請求項37に記載の製法。 39.活性化剤が2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1,1,3, 3−テトラメチルウロニウム ヘキサフルオロホスフェート(HBTU)である ことを特徴とする請求項37に記載の製法。 40.Zが下記の式を有することを特徴とする請求項37に記載の製法: 41.Zが下記の式を有することを特徴とする請求項37に記載の製法: 42.Zが下記の式を有することを特徴とする請求項37に記載の製法: 43.Zが下記の式を有し: 上記式中、X1が、−O−、−S−、−S(O)2−、−C(O)−および−N( R12)−からなる群から選択され;R12は水素基、置換または未置換のC1〜C20 アルキル基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置 換のC5〜C40アルカリール基からなる群から選択され;X3は−O−または−N (H)−;R1、R2、R3、R4およびR5は、同じかまたは異なり、水素基、ハ ロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未置換の C5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルカリール基から なる群から選択され;nは0、1または2であり;A’およびB’の1つが水素 基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換または未 置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルキルアリ ール基からなる群から選択され;A’およびB’の他の1つが下記の式であらわ され: 上記式中、X2は−O−、−S−、−S(O)2−、および−N(R13)−からな る群から選択され;R13は水素基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、 置換または未置換のC5-C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C4 0 アルカリール基からなる群から選択され、R6およびR7は同じかまたは異なり 、水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル基、置換ま たは未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜C40アルキ ルアリール基からなる群から選択され;pは0または1;mは0、1または2で あることを特徴とする請求項37に記載の製法。 44.B1が、水素基、ハロゲン化物基、置換または未置換のC1〜C20アルキル 基、置換または未置換のC5〜C30アリール基、および置換または未置換のC5〜 C40アルカリール基からなる群から選択されることを特徴とする請求項37に記 載の製法。 45.R4が水素基であることを特徴とする請求項37に記載の製法。 46.nおよびmが両方共1であることを特徴とする請求項37に記載の製法。 47.R1、R2、R3、R12およびR13の各々が水素基であることを特徴とする 請求項37に記載の製法。 48.X1およびX2が、両方共に、−O−である請求項37に記載の製法。 49.Zが下記の式を有し: 上記式中、Yが−O−、−S−、−S(O)2−およびO−((CH2)1-O)qか らなる群から選択され、1が60以下の整数であり、qは1−1000の範囲の 整数であり、R4、R5、R6、R7、mおよびnは上と同じ意味を有し、Yが0で あるとき、nおよびmの少なくとも1つが0または2であるという条件がつけら れることを特徴とする請求項37に記載の製法。 50.SUPPORT(支持体)が無機物質であることを特徴とする請求項37 に記載の製法。 51.無機物質がシリカ、ガラスビーズ、ポーラスガラス、アルミノシリケート 、ボロシリケート、酸化金属、粘土およびこれらの混合物からなる群から選択さ れることを特徴とする請求項37に記載の製法。 52.SUPPORT(支持体)が有機物質であることを特徴とする請求項37 に記載の製法。 53.有機物質が架橋ポリマーであることを特徴とする請求項37に記載の製法 。 54.NUCLEOSIDE(ヌクレオシド)が下記の式の1つから選択される 部分であり: 上記式中、R8およびR10は、同じかまたは異なり、水素基または保護基であり 、R9は水素基またはOR11であり、ここでR11は、水素基または保護基であり 、B*は、核酸塩基であることを特徴とする請求項37に記載の製法。
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