JP2000512494A - 細胞増殖調節遺伝子 - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】
転写調節される増殖応答遺伝子は、細胞の運命の決定において中心的な役割を果たす。p53は細胞増殖能の調節に重要な遺伝子を転写調節するとわかっている。温度感受性p53対立遺伝子を含むラット胚繊維芽細胞の、ディファレンシャルRT-PCR解析を用い、我々は野生型p53タンパク質を保有する細胞で特異的に正に調節される、いくつかの転写産物を単離することができた。これらの遺伝子のうちの2つ、SM20およびミクロソームエポキシド加水分解酵素(mEH)は、以前に記載された遺伝子である。以前に特徴づけられていない2つのcDNA、細胞増殖調節(CGR)遺伝子CGR11およびCGR19を単離した。これらの新規タンパク質の予想アミノ酸配列には既知のモチーフ、すなわちEFハンドドメイン(CGR11)およびリングフィンガードメイン(CGR19)が含まれ、これは機能を示唆するものである。CGR11およびCGR19は、野生型p53細胞において全mRNAの0.05%および0.01%で発現する、初期応答遺伝子であるとみられる。CGR11およびCGR19ともに、SM20およびmEHと同様に、いくつかの細胞株の増殖を阻害することができる。
Description
【発明の詳細な説明】
細胞増殖調節遺伝子発明の背景
細胞内の数々の潜在的増殖エフェクターの同定に対して重要な発展がなされた
。以前の分析は細胞環境、増殖因子及びストレスの表現型の効果を評価したが、
細胞増殖を混乱させる原因である根元的な分子イベントを明らかし始めたのはつ
い最近のことである。多くの場合で、特定の細胞増殖反応の原因は、転写減少に
帰することができる。実際、細胞周期調節に直接的に関連する最近の遺伝子の発
見は、かなりの程度までディファレンシャル遺伝子発現解析に基礎をおいていた
。
p53遺伝子は、細胞増殖の制御において、間違いなくこの遺伝子に対する重要
な調節機能を反映するヒト癌において、もっとも頻度の高い変異された遺伝子で
あり続けている。p53の機能は、ウイルスの、もしくは細胞のタンパク質と細胞
質隔離との相互作用によって弱めることができ、最終的には細胞増殖潜在力の変
化を導いている。p53はDNA損傷に反応して、そしてDNA複製を直接的に阻害し、
またはアポトーシスを誘導することにより増殖調節機能を発揮すると考えられて
いるが、データの大部分が示すところによると、p53の主たる機能は、下流のエ
フェクター遺伝子を転写的に調節することである。p53は強力な転写の活性ドメ
インをもち、配列特異的様式によってDNAと結合することができ、これにより、
標的遺伝子の転写の活性及び抑制の両方を見込んでいる。
細胞増殖及び/または生存の制御に直接的に影響を及ぼすと示唆されている産
物であり、p53転写反応性遺伝子であるp21WAFl/CIPl、MDM2、GADD45、HIC、サイ
クリンG、及びBAXの同定は、増殖反応遺伝子の発現レベルを調節する時にp53の
中心的な役割を強調する。最近までに、もっとも特徴づけられた、p53によって
転写的に調節される細胞増殖の直接のエフェクターのうちの二つはp21WAFl/CIPl
及びMDM2である。p21WAFl/CIPlは、細胞周期の進行中、サイクリン依存キナーゼ
(CDK)タンパク質と直接的に相互作用することにより、CDK阻害剤として機能す
る。形質導入によるp21WAFl/CIPlの過剰発現は、癌細胞株の広い範囲で、細胞増
殖を抑制する。一方、MDM2は、p53の活性をネガティブに調節することで機能し
、MDM2の過剰発
現により調節されない細胞増殖と腫瘍形成を導く。しかしながら、p53誘導転写
反応は、疾病保護(ill-conserved)である様であり、このことは、細胞型依存
性の、遺伝子依然性の、そして種依存性の因子がp53反応性に寄与する可能性が
あることを示唆する。例えば、p21WAFl/CIPlとMDM2の両方は、温度感受性p53対
立遺伝子を含んでいる齧歯類細胞において、p53依存の様式によって転写的に活
性化されるが、p21WAFl/CIPlだけは類似したヒトの系において誘導される。加え
て、p21WAFl/CIPlの活性化はp53依存的である場合、及び非依存である場合の両
方が示され、このことはp21WAFl/CIPlの制御に対する多くの経路を示唆する。さ
らにBCL2もしくはE1Bのようなアポトーシス調節遺伝子産物のレベルも、細胞がp
53依存増殖停止を受けるか、アポトーシスを受けるかを決定することを促進する
ことが明らかである。これらの結果は、多くのエフェクター遺伝子産物を使用す
る複雑な調節カスケードが、細胞増殖潜在力に関して細胞の運命を決定している
ことを示唆する。細胞増殖調節の複雑な性質は、細胞増殖調節に影響している分
子成分をさらに明らかにする必要性を強調している。発明の概要
哺乳類細胞増殖調節タンパク質をコードするDNA分子を提供することは本発明
の目的である。
哺乳類細胞増殖調節タンパク質を提供することは本発明の他の目的である。
哺乳類細胞増殖調節タンパク質に選択的に結合し、その分析に使用することが
できる抗体を提供することは本発明のさらなる他の目的である。
腫瘍細胞の増殖を抑制する方法を提供することは本発明のさらなる他の目的で
ある。
癌に対する診断及び診断方法を提供することは本発明の他の目的である。
細胞増殖を剌激するのに有用なアンチセンス構築物を提供することは本発明の
目的である。
細胞増殖調節遺伝子の発現を阻害するためのアンチセンスオリゴヌクレオチド
を提供することは本発明の目的である。
細胞の分裂増殖を誘導するための方法を提供することは本発明の他の目的であ
る。
癌への感受性を評価するための方法を提供することは本発明のさらなる他の目
的である。
本発明のこれらの、そして他の目的は、以下に記載の、一つもしくはそれ以上
の態様によって提供される。本発明の一態様において、哺類のCGR11くはCGR19タ
ンパク質をコードする、単離され、そして精製されたサブクロモゾームDNA分子
が提供される。
本発明の他の態様によれば、単離され、そして精製された哺乳類CGR11もしく
はCGR19タンパク質が提供される。
本発明の他の態様において、哺乳類CGR11もしくはCGR19タンパク質に特異的に
結合する抗体が提供される。
本発明の他の態様によれば、腫瘍細胞の増殖を抑制する方法が提供される。こ
の方法は、
腫瘍細胞に、哺乳類CGR11もしくはCGR19タンパク質を投与することの段
階を含む。
本発明の他の態様によれば、腫瘍細胞の増殖を抑制する方法が提供される。こ
の方法は、
CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択した哺乳類タンパク質
を発現させる原因となるDNA分子を、腫瘍細胞に投与すること
の段階を含む。
本発明のさらなる他の態様によれば、癌の診断のための方法が提供される。こ
の方法は、
組織を試験して、その組織が正常組織に比べて、CGR11、CGR19、mEH及
びSM20からなる群から選択した哺乳類タンパク質、または、哺乳類タンパク質を
コードしているmRNAを、より少なく発現しているかどうか決定すること
の段階を含む。
本発明のさらなる他の観点によれば、癌の診断のための方法が提供される。こ
の方法は、
組織を試験し、前記組織におけるDNAが、CGR11、CGR19、mEH及びSM20か
らなる群から選択した哺乳類遺伝子コーディング配列の変異形であって、遺伝子
コーディング配列の野生型とは異なる変異型を含むかどうかを決定するために調
べること、
の段階を含む。
本発明の他の態様において、アンチセンスCGR11、CGR19、mEH及びSM20構築物
が提供される。この構築物は:
a.転写プロモーター
b.転写ターミネーター
c.CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択した哺乳類タンパク
質の遺伝子コーディング配列の一つもしくはそれ以上の区分を含むDNA区分であ
って、前記遺伝子コーディング配列の区分が前記プロモーターと前記ターミネー
ターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーター及び前記ターミネーターに
関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によって作られるRNAが、哺
乳類細胞によって作られる対応するmRNAの区分と相補的である前記DNA区分、
を含む。
本発明の他の観点において、CGR11、mEH、SM20、もしくはCGR19のアンチセン
スオリゴヌクレオチドが提供される。このオリゴヌクレオチドは、哺乳類CGR11
もしくはCGR19のmRNAに相補的な、少なくとも10ヌクレオチドを含む。
本発明の一つの態様によれば、細胞の分裂増殖を促進するための方法が提供さ
れる。この方法は、
CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択した哺乳類遺伝子に対
するアンチセンスオリゴヌクレオチドであって、CGR11、CGR19、mEH及びSM20か
らなる群から選択した哺乳類遺伝子mRNAに相補的な、少なくとも10ヌクレオチド
を含むものを前記細胞に投与して、CGR11、CGR19、mEH及びSM20の発現を阻害す
ること、
の段階を含む。
本発明の他の観点によれば、細胞の増殖を促進するための方法が提供される。
この方法は、
CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択した哺乳類遺伝子に相
補
的な、少なくとも10ヌクレオチドを含む、三本鎖形成オリゴヌクレオチドを哺乳
類細胞に対して投与し、CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択した哺
乳類遺伝子の発現を阻害すること、
の段階を含む。
他の観点によれば、細胞の増殖を促進するための他の方法が提供される。この
方法は、
哺乳類細胞に、CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択したアン
チセンス遺伝子構築物であって、
a.転写プロモーター
b.転写ターミネーター
c.哺乳類遺伝子コーディング配列の一つもしくはそれ以上の区分を含む
DNA区分であって、前記遺伝子区分が前記プロモーターと前記ターミネーターの
間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーター及び前記ターミネーターに関して
逆になっており、それによってDNA区分の転写によって作られるRNAが、哺乳類細
胞によって作られる対応するmRNAの区分と相補的であるとする前記DNA区分、
を含む遺伝子構築物を投与して、哺乳類遺伝子の発現を阻害すること、
の段階を含む。
本発明の他の態様によれば、癌への感受性を評価するための方法が提供される
。この方法は、
血液、絨毛膜絨毛、羊水、着床前の胚の卵割球からなる群から選択した組織を
検査して、前記組織内のDNAが、CGR11、CGR19、mEH及びSM20からなる群から選択
した変異型遺伝子コーディング配列を含むかどうか決定すること、
の段階を含む。
本発明は従って、付加的な診察及び治療手段に関した分野を提供し、それによ
って癌リスク評価、初期癌、及び明らかな癌を扱う。
図面の簡単な説明
図1:REF-112 RNAの特性記述。図1a、WAF1誘導の速度論。示した時間(時)、3
2℃で維持したRFE12細胞からの全RNAを、ラットWAF1 cDNAにてプローブした。
図1b、サイクリンG RT-PCR。8時間、38℃、もしくは32℃で維持したREF-112細
胞から回収した全RNAを、固定オリゴ−dTプライマーにて逆転写した。PCRは、こ
のプライマー及びラットサイクリンGの3'末端に特異的なプライマーで行った。
矢印は約300塩基対の、ディファレンシャルに(differentially)発現したラッ
トサイクリンG RT-PCR産物を示す。図1c、REF-112細胞からの全RNAのノザン分
析。図1bに記載したサイクリンG RT-PCR cDNAを、38℃、もしくは32℃で維持
したREF-112細胞から単離したRNAに対するプローブとして用いた。
図2:野生型p53含有REF-112細胞からのディファレンシャルに発現した発現遺
伝子。38℃、及び32℃(8時間)維持した、CGR11(図2a)、CGR19(図2b)、SM20(図
2c)、及びmEH(図2d)を発現しているREF-112細胞からのRT-PCR及びノザン分析
。矢印は切り取り、再増幅し、付随したノザン分析のためのプローブとして使用
した、ディファレンシャルに発現したcDNAを示している。レーン1、レーン3;8
時間インキュベーション後回収した、32℃維持したREF-112 RNA。レーン2、レ
ーン4;38℃維持したREF-112 RNA。デュプリケーションのサンプルは全RNA調整
物から独立に単離した。
図3:CGR11及びCGR19についての発現図。図3a;CGR11、CGR19、及びβ−アク
チンに特異的な32P標識されたcDNA断片によりプローブした、ラットの複数の組
織のノザンブロット。図3b;CGR11及びCGR19の誘導速度論。REF-112細胞を示し
た時間(時)32℃で維持した。全RNAを単離し、電気泳動し、ブロットし、そし
てラットCGR11もしくはCGR19に対して特異的な32P標識されたcDNAにてプローブ
した。
図4:ラット及びヒトのCGR11とCGR19のアミノ酸配列。図4a;ヒト(上段)及
びラット(下段)CGR11の推定したアミノ酸配列。ダッシュはヒト及びラット配
列間での一致を示す。アスタリスクはラットCGR11配列内に存在する欠落を示す
。上線は、二つの推定のEF−ハンドドメインを示す。図4b、コンセンサスのEF−
ハンドメインと配列させたCGR11 EF−ハンドドメインI及びII。ヒトの配列と異
なっているラットアミノ酸を下線に示す。図4c、ヒト(上)及びラット(下)CG
R19の推定したアミノ酸配列。上線の配列は潜在的なジンク−バインディング、
リング−フィンガードメインをコードしている。ダッシュはヒト及びラット配列
間で一致を示す。図4d、CGR−9リン−ーフィンガードメインは、コンセンサスの
リング−フィンガー配列とともに配列させた。
好ましい態様の詳細な説明
本発明者は、以前にはp53によって調節されていると知られてはいない、4つ
の遺伝子がp53によって調節され、本明細書で増殖調節をすることが示されるこ
とを発見した。単離された遺伝子の二つ、ラットSM20とラット及びヒトmEHは、
すでに記述された遺伝子であるが、p53の状態とこれらの遺伝子の転写的誘導の
間の関係は以前には確立されてはいないものである。他の二つの遺伝子、CGR11
及びCGR19は以前には単離も記述もされていない。
ラットSM20は、血管平滑筋細胞のPDGF-A-誘導転写の解析により初めて単離さ
れたが、しかしながら、ラットSM20の機能はいまだに解明されていない。一方、
mEHは、代謝反応性エポキシドを含む生体異物の触媒反応解毒化に関係すること
が知られている。mEHと野生型p53の間には既知の関係は何も知られていないが、
エポキシドを介したp53活性の誘導は、毒素の存在下での遺伝子の安定性を保つ
ことを助ける可能性がある。
我々は、よく特徴づけられているネズミの温度感受性p53変異VAL135を利用し
て、野生型p53タンパク質の転写反応を同定した。活性化RAS及び、p53-VAL135を
形質導入したラット胚繊維芽細胞(REF-112)の増殖は温度感受性である。これ
らの細胞の38℃での増殖は、細胞質中でHSP70と複合体形成する変異構造にp53タ
ンパク質を維持する。REF-112細胞を32℃に移すと、p53タンパク質は、野生型構
造を採用し、核内に移動し、そして標的遺伝子の転写を調節する。これらの細胞
は、はじめに、特に細胞周期のG1期における増殖停止として記述された。我々は
、p53の機能に対して、温度感受性であるラット細胞からのディファレンシャル
転写解析を利用した。我々は、複製を許容する温度では存在し、しかしながら複
製を許容しない温度では存在しないこれらの転写を同定した。
本発明によるDNA分子は、他の遺伝子配列から単離され、そして精製される。
それらは、ゲノム配列またはcDNA配列のいずれかであり、すなわちそれらは介在
配列を含む可能性があるか、もしくはその可能性がない。ヒトCGR11、ヒトCGR19
、
ラットCGR11、及びラットCGR19のコーディング領域のヌクレオチド配列はそれぞ
れSEQ ID Nos:1、3、5、及び7に示される。他の哺乳類相同物は、開示されてい
る配列由来のヌクレオチドプローブ、またはプライマーを用いてcDNAライブラリ
ーをスクリーニングすることで、容易に得ることができる。ゲノムクローンも、
遺伝子コーディング領域由来のプローブを用いて、YACもしくはP1クローンのよ
うなゲノムDNAライブラリーをスクリーニングすることで入手できる。遺伝子の
対立遺伝子型も、本発明の範囲に含まれている。これらは、コード配列に影響し
ない無影響変異、またはアミノ酸の相違を導く多型のいずれかをもちうる。アミ
ノ酸の相違は、タンパク質の機能の変化を引き起こす可能性がある場合またはそ
の可能性が内場合とがある。
SEQ ID Nos: 2、4、6、及び8に示したタンパク質配列を用いることで、変性し
たオリゴヌクレオチドプローブを使用して、対応する遺伝子及び関連した哺乳類
CGR遺伝子を同定し、入手することもできる。一つもしくはそれ以上の変性した
プローブを使用して、cDNA、もしくはゲノムDNAライブラリーにハイブリット形
成することができる。CGR遺伝子は、変性したプローブとハイブリット形成する
ことによって同定できる。遺伝子の同定は、一つもしくはそれ以上の、以下の特
性に基づいて確かめることができる:すなわち、コードしているタンパク質のお
およその大きさ、SEQ ID Nos:2、4、6、もしくは8のタンパク質との類似性もし
くは同一性、そして野生型p53による遺伝子に対するmRNAの亢進調節である。変
性したプローブの使用のデザイン及び条件は、当該技術分野においてよく知られ
ている。全長遺伝子、もしくはcDNAの一部分は、全長遺伝子を単離することによ
り、もしくは全長遺伝子を単離することなく、同様に単離できる。あるいは、CG
Rタンパク質(群)に特異的に結合する抗体は、SEQ ID Nos:2、4、6、及び8に示
した、タンパク質もしくはそのタンパク質のポリペプチド部分に対して作り上げ
ることができる。これらの抗体を使用して、同様の、もしくは関連したエピトー
プを発現している発現cDNAライブラリー中のクローンを選択することができる。
同定されたCGR遺伝子の部分は、制限エンドヌクレアーゼにより、または一部の
配列の増幅による遺伝子の断片化により作ることができる。ハイブリット形成に
より、もしくは抗体結合により単離されたCGR遺伝子の部分は、全遺伝子を単離
することなしに、直接的に使用することもできる。
現在、4つの哺乳類細胞増殖調節遺伝子の配列が提供されているので、当業者
は、コードされているタンパク質を容易に入手できる。これらは、細菌、酵母、
もしくは他の便利な細胞に発現させることができる。発現ベクターは、当該技術
分野で既知のベクターに、コーディング領域をライゲーションすることによって
構築することができる。一般的には、ベクターはプロモーター、エンハンサー、
転写シグナルのターミネーションなどの発現調節配列を含みうる。従って、コー
ディング配列を、発現調節配列に関して、正しい場所にそして正しい方向に配置
することによって、希望する宿主細胞内に選択された哺乳類タンパク質の発現を
指向することのできる、発現ベクターを入手する。適当なベクターは当該技術分
野で知られており、プラスミドもしくはウイルスゲノムに基くことができる。ベ
クターに対する適当な宿主細胞も知られており、そしてそれら宿主細胞が示す希
望する性質について選択できる
選択されたタンパク質の部分を、合成し、実験動物の免疫のための担体タンパ
ク質に結合して、これらの特異的に免疫反応性である抗体を産生することができ
る。この抗体を使用して、天然の、もしくは組換え源からのタンパク質を精製す
ることができる。このような抗体は、特定の用途に便利なように、ポリクローナ
ルもしくはモノクローナルであってもよい。開示されたCGRタンパク質に特異的
に結合する抗体は、当該技術分野にてよく知られているように、日常的なスクリ
ーニングを用いて容易に単離することができる。
本明細書で記載のように、細胞増殖調節タンパク質は、腫瘍細胞に対して増殖
抑制効果をもっている。従って、細胞増殖調節タンパク質の腫瘍細胞への投与、
もしくは結果としてタンパク質の発現を生ずるであろう構築物を用いたそれらに
対応する遺伝子の投与は、そのような増殖抑制をもたらすために好ましい可能性
がある。本発明のタンパク質は、ヒトに投与するために、薬剤組成物として製剤
化されうる。一般的には、これらは発熱性成分を含まない、希釈剤もしくは賦形
剤中での無菌剤形でありうる。この剤形は、鼻腔内及び非経口投与いずれにも適
合する。増殖性疾患に関連する他の細胞も、細胞増殖調節遺伝子媒介性増殖抑制
の標的でありうる。このような増殖性疾患は、乾鮮、ポリープ、再狭窄、いぼ、
炎症性疾患を含むが、これらにの限定されない。細胞増殖調節タンパク質は、腫
瘍細胞に、適切な剤形で投与されうる。それらは、腫瘍細胞への微量注入、もし
くは単純に外部から供給することができる。それらは、例えばリポソーム内に被
包されるうる。哺乳類に投与する場合には、循環系内で腫瘍抑制量に達すること
が望ましい。腫瘍抑制効果は、細胞増殖調節タンパク質が10-10から10-6Mの濃
度の時に目的を達することができる。細胞増殖調節タンパク質をコードしている
DNAを、腫瘍細胞に投与すると、細胞は増殖抑制のための、それ自身の細胞増殖
調節タンパク質を発現することができる。そのようなDNAは、上述したように、
ゲノムDNA、もしくはcDNAであり得る。増殖性疾患に関連する他の細胞は、同様
にして処理されるうる。
本発明の細胞増殖調節遺伝子は、ここで、野生型p53によって調節されること
が示される。従って、いずれかの細胞増殖調節遺伝子の発現を、野生型p53の発
現のマーカーとして使用できる。ちようど野生型p53の発現の減少、もしくは変
異したp53の発現の存在が癌を示すように、正常組織と比較して増殖調節遺伝子
の発現の減少は、癌を指し示すことができる。細胞増殖調節遺伝子の発現の分析
は、直接的な野生型p53の分析に加えて、もしくはそれに代えて使用することが
できる。正常コントロールを提供するための比較目的に適合する組織は、一般的
には近接した、形態学的に正常な組織である。細胞増殖調節遺伝子の発現の存在
もしくはその量の試験は、細胞増殖調節タンパク質に特異的な抗体、核酸プロー
ブ、もしくはSEQ ID Nos:1、3、5、もしくは7の配列の全部、または一部に相補
的な、少なくとも約10ヌクレオチドのプライマー、もしくは当該分野で知られて
いる他の試験の、いずれかによって行うことができる。
同様に、腫瘍組織のDNAを試験して、それが変異を含んでいるかどうか決定す
ることができる。細胞増殖調節遺伝子の変異は、p53変異がそうであるように、
細胞に腫瘍形成表現型を与える。変異は、試験をする組織内の遺伝子の配列を決
定し、その配列をSEQ ID Nos:1、3、5、もしくは7にて開示している配列と比較
することにより決定することができる。このような変異は、生殖系列もしくは体
組織で起こりうる。体組織で変異が起こった場合、同じ個体において他の組織で
は変異は発見されないであろう。変異が生殖系列で起こった場合、体のすべての
組織で変異が発見され、生殖系列のp53変異のように癌への感受性を示すであろ
う。生殖系列変異について試験をするのに適した組織は、血液、粘膜スメア、子
宮頸部スメア、皮膚、絨毛膜絨毛、羊水、及び着床前の卵割球を含む。
アンチセンス細胞増殖調節遺伝子構築物は転写プロモーターと転写ターミネー
ター(ポリアデニル化シグナル)を含み、それらの間にDNA区分を持つ。DNA区分
は、一つもしくはそれ以上の細胞増殖調節遺伝子区分を含むが、その区分は構築
物中で、哺乳類ゲノムの方向に比べて逆になっている。この構築物の転写プロモ
ーターからの転写は、正常哺乳類細胞における細胞増殖調節プロモーターから作
られる、細胞増殖調節遺伝子RNAに相補的な(アンチセンス)RNA分子を産生する
。アンチセンスRNA分予を作るのに使用したプロモーターは、ある処方された刺
激物質によって調節されうる誘導可能なプロモーターであり得る。例えば、メタ
ロチオネインプロモーターもしくはホルモン応答性プロモーターは、都合よく使
用できる。他のプロモーター及びターミネーターは、特定の用途に都合よく使用
できる。加えて、当該技術分野で知られているエンハンサーを使用して、希望す
るタンパク質の発現を高めることができる。
本発明のアンチセンス細胞増殖調節遺伝子構築物は、細胞の一つのタイプにお
いて使用してアンチセンスRNAを産生し、当該技術分野で知られている技術によ
って他の細胞に適用することができる。あるいは、細胞増殖調節遺伝子構築物を
、細胞増殖調節遺伝子の調節が望まれる、最終的な標的細胞に投与できる。細胞
へのDNA構築物の導入の適切な方法は、当該技術分野で知られている。アンチセ
ンス構築物の投与は、当該技術分野で知られているような、トランスフェクショ
ン、形質転換、エレクトロポレーション、融合、その他によって行われうる。細
胞増殖調節遺伝子発現の阻害は、細胞を増殖分裂させ、細胞死を防ぐ。これは、
移植のための表皮細胞を培養する場合のように、培養中で多数のある細胞が増殖
することが好ましいような状態で特に有用でありうる。あるいは、体のある細胞
への投与は、老化を防ぐために老齢化(aging)あるいは老化(senescent)しつ
つある細胞に、もしくは免疫性の細胞または胃腸管の細胞などに関して望ましい
ものでありうる。
細胞増殖調節遺伝子アンチセンスオリゴヌクレオチドはまた、以上で議論した
ような、アンチセンス構築物と同様な目的のためにも提供される。オリゴヌクレ
オチドは、長さとして、少なくとも10ヌクレオチドであり、20から30ヌクレオチ
ドであり得る。それらは、通常のヌクレオチド、またはヌクレオチド類似体、ま
たは二つの混合物から成り立ちうる。類似体はメチルホスホン酸塩、アミノアル
キルホスホン酸塩、ホスホロチオン酸塩、ホスホロジチオン酸塩、置換または非
置換ホスホルアミデイトを含む。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、環状分子
も利用されうるが、一般的には、哺乳類細胞から作られた天然細胞増殖調節遺伝
子mRNAと相補的である、直鎖で一本鎖の分子である。これらは、受動、もしくは
レセプター媒介性の輸送によって細胞により取り込まれるように、リポソーム中
、もしくはむきだしで細胞に投与することができる。アンチセンスオリゴヌクレ
オチドが、mRNAの5'末端、特に転写開始部位に特異的に相補的にデザインされて
いることがたいてい好ましい。しかしながら、mRNA分子の他の部分が、アンチセ
ンス阻害に影響を受けやすいことが明らかになっており、本発明の実施において
使用できうる。同一分子の他の部分との水素結合が関連する二次構造をもつ、ア
ンチセンスヌクレオチドに対する標的としてのmRNAの部分をさけることも好まし
い。例えば、ステム−ループ構造のステムの形態に関連していることが明らかな
部位をさけることは好ましい。
細胞増殖調節遺伝子の発現はまた、転写に対する干渉によって、オリゴヌクレ
オチド、または細胞増殖調節遺伝子の区分と複合体化することで三重鎖構造(三
本鎖、triplexes)を形成できる修飾オリゴヌクレオチドを加えることによって
、抑制しうる。
以下の実施例は、例示の目的のためのみに提供され、そして、以上の広い用語
にて記載した本発明の範囲に限定するものではない。
実施例 実施例1
予備研究により、温度感受性p53システムの有用性を明らかにする。
38℃および32℃の両方で培養した細胞から調製した全RNAを、まずp53に調節さ
れる既知の遺伝子に関して特徴づけることにより、REF-112細胞を用いたデ
ィファレンシャルディスプレイ解析の実行可能性を評価した。p21WAFl/CIPlのノ
ーザン解析では急速な転写誘導が示され、p21WAFl/CIPlRNA量が32℃に移してか
ら8-10時間後に頂点に達した(図1a)。さらに我々は、32℃に移してから8-10時間
以内のアポトーシス誘導の、同様の速度論を明らかにした。
本明細書中で述べるディファレンシャル転写解析に関して、我々は8時間の誘
導時間を選んだ。この時点では、ラットp21WAFl/CIPlおよびラットサイクリンG
ノーザン解析により、32℃という増殖阻害温度においては各転写産物の量が多く
、38℃において対数的に増殖した細胞では転写産物はほとんどあるいは全くない
、ということが示された(図1)。サイクリンGおよびp21WAFl/CIPlともに、同様
の量まで誘導されるようであった。
両方の増殖条件から単離した全RNAについて、ラットサイクリンGの3'末端に
特異的なプライマーを用いてRT-PCR反応を行い、RNA調製物について特徴を調べ
た後、p53に調節される新規遺伝子を同定した。予想した通り、ディファレンシ
ャルに発現する300bpのバンドを、32℃で誘導したRNA中に検出したが、誘導して
いない細胞由来のRNA中にはなかった(図1b)。サイクリンG RT-PCRバンドを切り
出し、続いてクローニングおよびノーザン解析(図1c)を行ったところ、このバ
ンドがラットサイクリンGと同一であることが確認された(データは示さず)。
細胞培養:ラット胚の繊維芽細胞REF-112(p53-VAL135)およびREF-132(p53-
PHE132)(B.VogelsteinおよびM.Orenのご好意によりご供与いただいた)を、10
%ウシ胎児血清を含むDMEM中、5%CO2、38℃あるいは32℃のいずれかにおいて培
養した。いずれかの温度移動の48時間前に、細胞を分配し、まいた。温度移動は
、あらかじめ平衡化したインキュベーターにサブコンフルエントなフラスコを、
培地を交換せずに単に移動させて行った。トランスフェクション用に、4x105
個の細胞(T98GおよびSW480細胞)、または0.8x105個の細胞(SKOV3-IP1)を6穴
培養皿にまいた。製造者が説明する通りに、リポフェクチン(Gibco/BRL)を用
いてトランスフェクションを行った。簡単にいうと、40μlの血清低減培地(OP
TIMEMTM、Giboco/BRL)を2μgのDNAに加えた。10μlのリポフェクチンを含む
50μlの混合液および、40μlのOPTIMEMTMを、DNA混
合液に加えた。15分間、室温でインキュベートしたあと、1mlのOPTIMEMTMを加え
、optimemで洗った細胞の上に混合液を重層した。細胞を5時間、37℃/5%CO2イ
ンキュベーター中でインキュベートし、そのあと、トランスフェクション混合液
を通常の増殖培地と置き換えた。44時間後、ハイグロマイシン(0.25mg/ml)を
含む選択培地に細胞を分配した。12-14日後、50%エタノール中の2%メチレンブル
ーにてコロニーを染め、計数した。50個以上の細胞を含むコロニーのみを取った
。
RNA単離:製造者が説明する通りに、RNAzol B(Tel-Test,Inc.)中で直接可
溶化することにより全RNAを単離した。製造者が説明する通りにMessageMakerkit
(Gibco/BRL)を用い、全RNA調製物からpoly A+RNAを単離した。
RT-PCR反応:5mM MgCl2/10mM Tris、pH8.3/10mM KCl/20μM dNTP's/20units
Rnase阻害剤(Perkin Elmer)/50μM T12NN中の200ngの全RNAおよび50units M
MLV逆転写酵素(Perkin Elmer)を用い、試料(逆転写酵素なし)を65℃に5分
間温めて逆転写反応を行い、次いで反応液を37℃に5分間置いた。逆転写を37℃
で55分間かけて行った。5分間、95℃でインキュベートすることにより、RT反応
を不活性化させた。1.5mM MgCl2/10mM Tris pH8.3/10mM KCl/4μM dNTP's/2.5u
nits Taqポリメラーゼ(Perkin Elmer)/10μCi35S-α-dATP(12.5μCi/μl、N
EN)/50μM T12MN中の2μlの逆転写反応液および0.2μMランダム10-merを用
い、PCR反応を行った。サーモサイクラー中で、94℃を3秒/40℃を2分/72℃を3
0秒というサイクルを40サイクル、PCR反応を行った。38%ホルムアミド/8mMEDTA
/0.02%ブロモフェノールブルーおよびキシレンシラノールを加えることにより、
反応を終了させた。試料を2分間、70℃で温め、6%変性ポリアクリルアミドゲル
上で泳動した。ゲルをWhatmann 3MM紙上に乾燥させフィルムに露光した後、PCR
産物を精製した。切り出したバンドを120μl H2Oに10分間、室温で再懸濁させ
、続いて15分間煮沸した。遠心して残渣をペレットにし、10μlの3M酢酸ナトリ
ウム、5μlの10mg/mlグリコーゲン、400μlエタノールを、溶出した100μl
のDNAに加えた。DNAを一晩、-20℃で沈殿させた。DNAをペレットにし、もとのRT
-PCRに用いたプライマーと同じものを用いて増幅し、ゲルを精製し、pCRII (InV
itrogen)にクローン化した。
オリゴヌクレオチド:サイクリンG RT-PCR反応に関して、dT12GCおよび5'-TCT
TCACTGC-3'プライマー対を用いて約300bpの断片を増幅した。
ノーザン解析:1.2%ホルムアルデヒドゲル上で電気泳動した10-20μgの全RNA
を用い、ノーザン解析を行った。ブロッティングおよびプローブによる探索(pr
obing)は、根本的には記載されている通りであった。プローブは、ランダムプ
ライム(BMB)によりα-32Pラベルしたゲル精製cDNA断片とした。ラット組織ブ
ロットをClontechから得て、製造者が勧めるように、プローブによる探索をし、
除去し(stripped)、再びプローブによる探索をした。ラットWAF1 cDNAは、B.Vog
elsteinの好意によりご供与いただいた。実施例2
本実施例では、p53が調節する遺伝子の同定に、温度感受性p53システムを使用
することを明らかにする。
増殖により調節される他の遺伝子を同定するために、我々は12の“固定された
”オリゴdTプライマーを25の“ランダムな”10-merと組み合わせて利用し、RT-P
CR反応を行った。RT-PCR反応は、38℃または32℃に維持したREF-112細胞由来の
、独立に単離した全RNAについてデュプリケートで行った。ラットp21WAFl/CIPl
またはMDM2のいずれかを増幅するであろうプライマー対を除外した。
異なって発現した総計35のRT-PCR産物を、32℃という誘導温度単独での産物の
誘導に基づいて、さらなる解析のために選んだ。RT-PCR反応を二重のRNAサンプ
ルについて行ったが、可能性として目的の転写産物を含むすべての反応を省略せ
ずに繰返して、ディファレンシャルディスプレイ解析における共通の問題である
、生じ得る人工物をさらに避けた。続くノーザン解析では、これらのRT-PCR産物
のうちすべてだが4つを、異なって発現した遺伝子として出した。これら4つの
遺伝子のいずれも、32℃で培養した非温度感受性p53変異を持つ対照細胞(REF-1
32細胞[PHE132])由来のRNAではいかなる転写誘導も示さず、観察された転写誘
導は温度の移動のためのみでなく、変異のためでもあることを示唆する。誘導さ
れた遺伝子のうちの2つは、以前にSM20およびミクロソームエポキシド水酸化酵
素(mEH)を含めて記載されたものである。相関的な遺伝子発現解析では、これ
らの遺伝子を増殖条件に依存して異なって発現するとして説明した
が、これらの遺伝子の転写は、以前にp53発現とは結び付けられていなかった。
11および19と名付けられた、2つの新規cDNAに由来するディファレンシャルRT
-PCR産物を、SM20およびmEHと同様に図2に示す。これらの部分cDNAのそれぞれ
に関するノーザン解析により、これらの転写産物が38℃または32℃で培養した細
胞において異なって発現していたということが確かめられた。
オリゴヌクレオチド:12の固定されたオリゴ-dTプライマー(dT12[A,C,G][
A,C,G,T]の組み合わせ)および25のランダムな10merをRT-PCR反応に用いた。サ
イクリンG RT-PCR反応に関しては、dT12GCおよび5'-TCTTCACTGC-3'プライマー対
を用いて□300bpの断片を増幅した。特異的なクローンのRT-PCR増幅を、以下の
プライマー対を用いて達成した。すなわち、CGR11:dT12AT/TACAACGAGG;SM20:d
T12GG/GATCATAGCG;CGR19:dT12CG/GATCATAGCC;mEH:dT12CA/GATCATGGTCである
。実施例3
本実施例では、新規に同定した遺伝子、CGR11およびCGR19の組織特異的発現を
明らかにする。
部分cDNA断片11および19を、様々なラット組織由来の発現解析のプローブとし
て用いた(図3a)。部分11cDNAプローブを用いて、1.3kbの転写産物が、脳全体お
よび腎に広く存在し、心臓、肺、肝および骨格筋では限られた発現を示し、牌お
よび精巣には検出できるような発現は示さない、といった限定された発現パター
ンが観察された。部分cDNA19をプローブとして用いると、1.4kbの転写産物がラ
ット精巣で最も高い発現量を示し、よりユビキタスな発現パターンを見せた。こ
れらの遺伝子のいずれも以前に記載されていないため、我々はこれらを選び、細
胞増殖調節(Cell Growth Regulatory)遺伝子CGR11およびCGR19と名付けた。実施例4
本実施例では、温度移動の際の細胞増殖調節遺伝子の発現の速度論も、遺伝子
の発現量の定量も明らかにする。
38℃から32℃への温度の移動後のREF-112細胞における、CGR11およびCGR19転
写産物誘導の速度論を、これらの遺伝子の転写誘導が増殖阻害に至るカスケー
ドにおける初期の出来事であるのか決定することを目的として行った(図3b)。
誘導速度論は、CGR19に関してはp21WAFl/CIPlと密接に対応していた(図3b)。C
GR11に関してはわずかに遅い誘導速度が観察された。これは、これらの遺伝子の
誘導が増殖阻害に至るカスケードにおける比較的初期の出来事であることを示唆
している。誘導された転写産物の発現量は有意に異なり、CGR11は32℃で誘導し
たREF-112細胞においてより高く発現していた(図3b)。しかし、CGR11よりもCGR1
9について、基底状態の(誘導しない)転写産物量がより高く存在していた(図2
)。CGR11およびCGR19の発現量は、このREF-112システムにおいてp21WAFl/CIPlお
よびサイクリンGと比較して間接的に評価することもできた。誘導されたREF-112
cDNAライブラリーに対するプローブハイブリッド形成では、p21WAFl/CIPlより
も2倍高いサイクリンG量をもたらし、p21WAFl/CIPlは細胞内の全mRNAの□0.1%
で発現し、サイクリンGは0.2%で発現した。実施例5
本実施例では、単離された細胞増殖調節遺伝子の配列解析を提供する。
CGR11およびCGR19に対応する全長であろうcDNAを、REF-112 RNAから5'RACE(5
'末端の急速な増幅)およびヒト、胎児脳cDNAライブラリーへのハイブリッド形
成により得た。得られたラットおよびヒトCGR11 cDNAは、長さが1,209および1,1
13bpである。5’RACE解析では、ヒトクローンに関してはより長い5'伸長を持っ
たcDNAは得られなかった。CGR11に対するラットおよびヒトcDNAは、それぞれ272
および301アミノ酸のタンパク質産物をコードするオープンリーディングフレー
ムを有する(図4a)。どちらのcDNAの予想される開始コドンの上流にも、読み枠に
あう終止コドンは一つも見られなかった。ラットおよびヒトCGR11タンパク質の
間の最適な5'整列(allgnment)は、最初のラットCGR11 ATGから7アミノ酸(MS
RWLMQ)を欠いており、従ってラットATG開始コドンを最終的に指定することがで
ぎない。ラットおよびヒトCGR11タンパク質は65%同一である。加えて、非常に保
存された2つの予想Ca2+結合EFハンドモチーフ(ヒトタンパク質におけるアミノ
酸82-94およびアミノ酸127-139;図4bに上線を引いた)は、ほとんど100%同一で
ある。クラスター状の17アミノ酸の繰返し4つが、ヒトCGR11タンパク質のみの
カルボキシ末端部分内に存在しており(コンセ
ンサス:PGPRGEAEGQAEA[K/R]GDA)、全く異なるターンによって中断される4つ
のαヘリカルドメインに似た構造を示唆している。
CGR11およびCGR19タンパク質のIn vitro産生により、それぞれ□37Kdおよび34
Kdの産物を得た。CGR11タンパク質は非常に酸性で、計算された正味の負電荷が-
29でpIは4.21と予想される。
ラットおよびヒトCGR19タンパク質は、アミノ酸レベルで85%同一であり、332
アミノ酸タンパク質の完全長を通して一貫して相同である(図4c)。読み枠にあ
う終止コドンは、予想される開始コドンより上流には一つも見つからないが、ラ
ットおよびヒトのタンパク質相同体は開始コドンのすぐ上流で分かれており、指
定したATGが本当にCGR19の開始コドンであることをさらに示唆している。CGR19
の予想タンパク質配列は、タンパク質のアミノ末端の予想される亜鉛結合C3HC4
リングフィンガードメインの領域においてのみ、既知のタンパク質と重要な相同
性を示す(図4d)。リングフィンガーを含むいくつかのタンパク質で見られてい
た通り、付随するB-boxドメインはCGR19内には一つも見られなかった。
我々はREF-112細胞から、cDNAの中央部内に130bpのインサートを含む全長CGR1
9 cDNAも単離した。このインサートはエキソン−イントロン境界に一致する5'GT
および3'AG末端を含む。これは、細胞内のいくつかのCGR19転写産物が不完全に
加工されているか、または保持されたイントロンを含む代替の転写産物が産生さ
れていることを示唆する。この第二のCGR19は、CGR19の最初の140アミノ酸を保
持するタンパク質キメラを作り出す、読み枠にあう終止コドンを予想されるイン
トロン内に作り出すだろう。さらに、32℃で誘導したREF-112細胞に由来するRT-
PCR解析では、2つのCGR19転写産物の安定な生成と一致する、同等の強さの2つ
のバンドが現れる。これらの2つの転写産物から作られる、あり得る異なるタン
パク質産物のさらなる解析が、この異なって加工される転写産物が重要であるか
どうかを決定するのに必要である。
5'RACE:cDNA末端の急速な増幅を、32℃処理した細胞から回収したREF-112 RN
Aを使い、製造者が説明する通りにmarathon kit(Clonetech)を用いて行った。
ラットCGR11およびCGR19の3’末端に特異的なオリゴヌクレオチドを手順の中で
用いた。
DNA配列決定:すべてのcDNAクローンの配列決定を、完全長cDNAに沿って両方
の鎖の配列決定ができるプライマーを利用した、手動のSangerダイデオキシ配列
決定(USB)により行った。複数のクローンを、ラットおよびヒトCGR11およびCG
R19 cDNAについて配列決定した。
データベース検索:すべての相同性検索(FASTA)、整列(BESTFIT)および構造
上の特徴(MOTIFS)を、The Genetics Computer Group(GCG)ソフトウエアプロ
グラム(Madison、WI)を用いて行った。最終的な検索は、GenBank version 91
を利用して行った。実施例6
本実施例では、細胞増殖調節遺伝子の増殖抑制特性を明らかにする。
本研究で単離した、異なって発現する遺伝子のあり得る増殖抑制特性を評価す
るために、我々はコロニー阻害アッセイにおける、安定トランスフェクションに
よる増殖阻害を分析した。調べたすべての遺伝子は、染色体外に維持されるプラ
スミド(pCEP)上の唾液腺ウイルス(CMV)プロモーターから発現させ、コロニ
ー形成はトランスフェクションの2から3週間後に計上した。対照として、p21W AFl/CIPl
、p53、およびp53アンチセンス構築物もトランスフェクとした。増殖抑
制機能の解析のために、我々は異なるp53対立遺伝子をすべてが持つ、3つの細
胞株を選んだ。すなわち、2つの点突然変異HIS273およびSER309を含むSW480大
腸カルシノーマ細胞株;卵巣カルシノーマ株、SKOV3 IP1、これはp53-nu11であ
る;およびp53内に一つの点突然変異MET237を含むグリオブラストーマ細胞株、T
98Gである。
ラットmEH、SM20、CGR11、およびCGR19は、すべていくらかの増殖抑制効果を
示したが、解析した細胞に依存した様々な程度であった(表1に要約した)。こ
の相違は、増殖抑制効果に対して臓器特異性という局面があることを示唆する。
p53は一貫して最も強力な増殖阻害効果を示した。以前の結果と一致して、p21WA Fl/CIPl
は65-80%の間の阻害を示した。CGR11およびSM20のみがSW480細胞におい
て有意な増殖阻害を示したが(それぞれ80%および85%)、調べたすべてのクローン
がSKOVIPlおよびT98G細胞において増殖阻害を示し(70-90%阻害)、ヒトの細胞間
でCGR11およびCGR19の機能が保存されている可能性を明らかにしてい
る。
上記の結果は、調べたcDNAの増殖阻害機能を示唆するものであるが、これらの
タンパク質の過剰発現が非特異的な毒性のために、観察された阻害効果をもたら
したという可能性が残っている。この可能性に焦点をあてるために、我々はヒト
CGR11cDNA内のEFハンド欠失変異体を構築し、このタンパク質を増殖阻害能につ
いて評価した。EFハンドを含むタンパク質を用いた以前の結果は、2つのEFハン
ドモチーフのうちの一つを欠失させた結果、Ca2+結合能に関しては機能的なタン
パク質が得られたということを示唆する。従って、我々はこの解析のために、ヒ
トCGR11内の両方のEFハンドドメインを欠失させた(CGR11ΔEF、アミノ酸82-139)
。EFハンドを欠失したCGR11 cDNAトランスフェクタントは、SKOV3 IP1細胞にお
いてコロニー形成を阻害できなかった(表1)。ヒト野生型CGR11 cDNAは細胞増殖
を、調べた変異体と比較して8%まで(SKOV3 IP1)および58%まで(T98G)抑制した。
従って、少なくともCGR11に関しては、観察された増殖抑制効果は構造-機能相関
を増殖阻害に反映しものであるかもしれない。同様の解析は、CGR19内のリング
フィンガードメインに関して進行中である。
本発明の原理、好ましい態様および実施方法は、先行する明細書に記載されて
いる。しかし、本明細書中で保護しようと意図する発明は、限定というよりはむ
しろ説明として考えられるので、開示した特定の形態に限定されるとはみなされ
ない。変化および変更は、本発明の精神から離れることなく、当業者によってな
され得る。
Tab1e1 細胞増殖調節遺伝子によるコロニー形成阻害 a実験はデュプリケートで行った。b
pCEP4ベクターのみ
N.D.,測定せず
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考)
C07K 14/47 C07K 16/18
16/18 C12P 21/08
C12N 5/06 C12Q 1/68 Z
C12P 21/08 A
C12Q 1/68 G01N 33/53 D
C12N 5/00 E
G01N 33/53 A61K 37/02
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,IT,L
U,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF
,CG,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,
SN,TD,TG),AP(GH,KE,LS,MW,S
D,SZ,UG),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ
,MD,RU,TJ,TM),AL,AM,AT,AU
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B,GE,GH,HU,IL,IS,JP,KE,KG
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LU,LV,MD,MG,MK,MN,MW,MX,N
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,SI,SK,TJ,TM,TR,TT,UA,UG,
UZ,VN
(72)発明者 ガレラ,エリザベス・エイ
アメリカ合衆国ニュージャージー州07645,
ワシントン・タウンシップ,マウンテン・
アベニュー 572
(72)発明者 マッデン,スティーヴン・アイ
アメリカ合衆国ニュージャージー州08512,
クランベリー,ステイション・ロード 12
―シー
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1. 哺乳類CGR11タンパク質をコードする、単離され、そして精製されたサブ クロモゾームDNA分子。 2. ヒトCGR11タンパク質をコードする、請求項1の単離され、そして精製さ れたサブクロモゾームDNA分子。 3. 介在配列を含まない、請求項2のDNA分子。 4. SEQ ID NO:1に示す配列を含む、請求項2のDNA分子。 5. ラットCGR11タンパク質をコードする、請求項1の単離され、そして精製 されたサブクロモゾームDNA分子。 6. 介在配列を含まない、請求項5のDNA分子。 7. SEQ ID NO:5に示す配列を含む、請求項2のDNA分子。 8. 単離され、そして精製された哺乳類CGR11タンパク質。 9. SEQ ID NO:2に示すようなヒトCGR11の配列からなる、請求項8の単離され 、そして精製された哺乳類CGR11タンパク質。 10. SEQ ID NO:6に示すようなラットCGR11の配列からなる、請求項8の単離 され、そして精製された哺乳類CGR11タンパク質。 11. 哺乳類CGR11タンパク質に特異的に結合する抗体。 12. CGR11がヒトのものであってSEQ ID NO:2に示す配列からなる、請求項11 の哺乳類CGR11タンパク質に特異的に結合する抗体。 13. CGR11がラットのものであってSEQ ID NO:6に示す配列からなる、請求項1 1の哺乳類CGR11タンパク質に特異的に結合する抗体。 14. 腫瘍細胞に哺乳順CGR11タンパク質を投与すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を抑制する方法。 15. タンパク質がヒトのものであってSEQ ID NO:2に示す配列からなる、請求 項14の方法。 16. タンパク質がラットのものであってSEQ ID NO:6に示す配列からなる、請 求項14の方法。 17. 腫瘍細胞に哺乳類CGR11タンパク質を発現させるようなDNA分子を、前 記細胞に投与すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を抑制する方法。 18. DNA分子がSEQ ID NO:1に示す配列を含む、請求項17の方法。 19. DNA分子がSEQ ID NO:5に示す配列を含む、請求項17の方法。 20.組織サンプルを分析して組織における哺乳類CGR11タンパク質またはmRNAの 発現量を測定すること、 その量を正常組織に見出される発現量と比較することであって、組織サン プルにおいて正常組織サンプルよりも発現量が低いことが癌であることの指標と すること、 の段階を含む、癌を診断する方法。 21.哺乳類CGR11タンパク質と特異的に反応する抗体を分析段階で利用する、 請求項20の方法。 22.哺乳類CGR11タンパク質がSEQ ID NO:2に示すようなヒトCGR11である、請 求項21の方法。 23. 哺乳類CGR11タンパク質がSEQ ID NO:6に示すようなラットCGR11である、 請求項21の方法。 24. 哺乳類CGR11 mRNAに相補的な少なくとも15ヌクレオチドを含む核酸プロ ーブを分析段階で利用する、請求項20の方法。 25. プローブがSEQ ID NO:1から選択される配列を有する、請求項24の方法。 26. プローブがSEQ ID NO:5から選択される配列を有する、請求項24の方法。 27. 組織を分析して、哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列の変異型あって 、その遺伝子のコーディング配列の野生型とは異なるものを前記組織のDNAが含 むかどうか決定すること、 の段階を含む、癌を診断する方法。 28. 組織のDNAを正常組織のDNAと比較して、CGR11遺伝子のコーディング配列 が変異型であるかどうか決定する、請求項27の方法。 29. 野生型遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:1に示される、請求項27の 方法。 30. 野生型遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:5に示される、請求項27 の方法。 31. a. 転写プロモーター、 b. 転写ターミネーター、 c. 哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列の一つまたはそれ以上の区分 を含むDNA区分であって、前記遺伝子のコーディング配列の区分が前記プロモー ターと前記ターミネーターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーターと前 記ターミネーターに関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によっ て作り出されるRNAが、哺乳類細胞によって作り出される対応するCGR11 RNAの区 分と相補的である、前記DNA区分、 を含むアンチセンスCGR11構築物。 32. 前記転写プロモーターが誘導性である、請求項31のアンチセンスCGR11構 築物。 33. 哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:5に示すラット遺伝 子配列である、請求項31のアンチセンスCGR11構築物。 34. 哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:1に示すヒト遺伝子 コーディング配列である、請求項31のアンチセンスCGR11構築物。 35.哺乳類CGR11 mRNAに相補的な、少なくとも10ヌクレオチドを含む、CGR11 アンチセンスオリゴヌクレオチド。 36. CGR11 mRNAに相補的な少なくとも約20ヌクレオチドを含む、請求項35のC GR11アンチセンスオリゴヌクレオチド。 37. 修飾を加えたヌクレオチド類似体を一つまたはそれ以上含む、請求項35 のCGR11アンチセンスオリゴヌクレオチド。 38. 環状分子である、請求項35のCGR11アンチセンスオリゴヌクレオチド。 39. SEQ ID NO:1の配列に相補的である、請求項35のCGR11アンチセンスオリ ゴヌクレオチド。 40. SEQ ID NO:5の配列に相補的である、請求項35のCGR11アンチセンスオリ ゴヌクレオチド。 41. 哺乳類CGR11 mRNAに相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含むCGR11アン チセンスオリゴヌクレオチドを、細胞に投与してCGR11の発現を阻害するこ と、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 42. CGR11アンチセンスオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO:5に示すようなラ ットCGR11に相補的である、請求項41の方法。 43. CGR11アンチセンスオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO:1に示すようなヒ トCGR11に相補的である、請求項41の方法。 44.哺乳類CGR11遺伝子に相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含む、CGR11三 本鎖形成オリゴヌクレオチドを、細胞に投与して哺乳類CGR11遺伝子の発現を阻 害すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 45. オリゴヌクレオチドがSEQ ID NO:5に示すようなラットCGR11に相補的で ある、請求項44の方法。 46. オリゴヌクレオチドがSEQ ID NO:1に示すようなヒトCGR11に相補的であ る、請求項44の方法。 47. a. 転写プロモーター、 b. 転写ターミネーター、 c. 哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列の一つまたはそれ以上の区 分を含むDNA区分であって、前記遺伝子配列の区分が前記プロモーターと前記タ ーミネーターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーターと前記ターミネー ターに関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によって作り出され るRNAが、哺乳類細胞によって作り出される対応するCGR11 RNAの区分と相補的で ある、前記DNA区分、 を含むアンチセンスCGR11構築物を、細胞に投与して哺乳類CGR11の発現を阻害す ること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 48. 前記転写プロモーターが誘導性である、請求項47の方法。 49. 哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:5に示すラット遺伝 子配列である、請求項47の方法。 50. 哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:1に示すヒト遺伝 子コーディング配列である、請求項47の方法。 51. 血液、粘膜塗布標本(スメア)、皮膚、頚管塗布標本(スメア)、絨毛 膜絨毛、羊水、および着床前の胚の卵割球からなる群から選択される組織を分析 して、変異体である哺乳類CGR11遺伝子のコーディング配列を前記組織のDNAが含 むかどうか決定すること、 の段階を含む、癌に対する感受性を分析する方法。 52. DNAをヒトCGR11遺伝子のコーディング配列の野生型配列と比較する、請 求項51の方法。 53.ヒト遺伝子のコーディング配列の野生型配列がSEQ ID NO:1に示される、 請求項52の方法。 54. 哺乳類CGR19タンパク質をコードする、単離され、そして精製されたサブ クロモゾームDNA分子。 55. SEQ ID NO:4に示すようなヒトCGR19タンパク質をコードする、請求項54 の単離され、そして精製されたサブクロモゾームDNA分子。 56. 介在配列を含まない、請求項55のDNA分子。 57. SEQ ID NO:3に示す配列を含む、請求項55のDNA分子。 58. SEQ ID NO:8に示すようなラットCGR19タンパク質をコードする、請求項5 4の単離され、そして精製されたサブクロモゾームDNA分子。 59. 介在配列を含まない、請求項58のDNA分子。 60. SEQ ID NO:7に示す配列を含む、請求項58のDNA分子。 61. 単離され、そして精製された哺乳類CGR19タンパク質。 62. SEQ ID NO:4に示すようなヒトCGR19の配列からなる、請求項61の単離さ れ、そして精製された哺乳類CGR19タンパク質。 63. SEQ ID NO:8に示すようなラットCGR19の配列からなる、請求項61の単離 され、そして精製された哺乳類CGR19タンパク質。 64. 哺乳類CGR19タンパク質に特異的に結合する抗体。 65.CGR19がヒトのものであってSEQ ID NO:4に示す配列からなる、哺乳類CGR1 9タンパク質に特異的に結合する請求項64の抗体。 66. CGR19がラットのものであってSEQ ID NO:8に示す配列からなる、哺乳 類CG19タンパク質に特異的に結合する請求項64の抗体。 67. 腫瘍細胞に哺乳煩CGR19タンパク質を投与すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を抑制する方法。 68. タンパク質がヒトのものであってSEQ ID NO:4に示す配列からなる、請求 項67の方法。 69. タンパク質がラットのものであってSEQ ID NO:8に示す配列からなる、請 求項67の方法。 70. 腫瘍細胞に咄乳類CGR19タンパク質を発現させるようなDNA分子を、前記 細胞に投与すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を抑制する方法。 71. DNA分子がSEQ ID NO:3に示す配列を含む、請求項70の方法。 72. DNA分子がSEQ ID NO:7に示す配列を含む、請求項70の方法。 73. 組織の試験サンプルを分析して哺乳類CGR19タンパク質またはmRNAの発現 量を測定すること、 試験サンプルにおいて正常組織よりも発現量が低いことが癌であることの 指標である、試験サンプルの発現量を正常組織の発現量と比較すること、 の段階を含む、癌を診断する方法。 74.哺乳類CGR19タンパク質と特異的に反応する抗体を分析段階で利用する、 請求項73の方法。 75. 哺乳類CGR11(19?)タンパク質がヒトCGR19である、請求項74の方法。 76. ヒトCGR11(19?)タンパク質がSEQ ID NO:4に示す通りである、請求項75の 方法。 77. 哺乳類CGR19 mRNAに相補的な少なくとも15ヌクレオチドを含む核酸プロ ーブを分析段階で利用する、請求項73の方法。 78. プローブがSEQ ID NO:3に隣接するヌクレオチドから選択される配列を有 する、請求項77の方法。 79. プローブがSEQ ID NO:7に隣接するヌクレオチドから選択される配列を有 する、請求項77の方法。 80. 試験組織を分析して、哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列の変異型 を前記組織のDNAが含むかどうか決定すること、 の段階を含む、癌を診断する方法。 81. 組織のDNAを正常組織のDNAと比較して、CGR19遺伝子のコーディング配列 が変異型であるかどうか決定する、請求項80の方法。 82. 野生型遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:3に示される、請求項80の 方法。 83. 野生型遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:7に示される、請求項80の 方法。 84. a. 転写プロモーター、 b. 転写ターミネーター、 c. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列の一つまたはそれ以上の区分 を含むDNA区分であって、前記遺伝子のコーディング配列の区分が前記プロモー ターと前記ターミネーターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーターと前 記ターミネーターに関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によっ て作り出されるRNAが、哺乳類細胞によって作り出される対応するCGR19 RNAの区 分と相補的である、前記DNA区分、 を含むアンチセンスCGR19構築物。 85. 前記転写プロモーターが誘導性である、請求項84のアンチセンスCGR19構 築物。 86. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:7に示すラット遺伝 子配列である、請求項84のアンチセンスCGR19構築物。 87. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:3に示すヒト遺伝子 配列である、請求項84のアンチセンスCGR19構築物。 88.哺乳類CGR19 mRNAに相補的な、少なくとも10ヌクレオチドを含む、CGR19 アンチセンスオリゴヌクレオチド。 89. CGR19 mRNAに相補的な少なくとも約20ヌクレオチドを含む、請求項88のC GR19アンチセンスオリゴヌクレオチド。 90. 修飾を加えたヌクレオチド類似体を一つまたはそれ以上含む、請求項88 のCGR19アンチセンスオリゴヌクレオチド。 91. 環状分子である、請求項88のCGR19アンチセンスオリゴヌクレオチド。 92. SEQ ID NO:3の配列に相補的である、請求項88のCGR19アンチセンスオリ ゴヌクレオチド。 93. SEQ ID NO:7の配列に相補的である、請求項88のCGR19アンテセンスオリ ゴヌクレオチド。 94. 哺乳類CGR19 mRNAに相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含むCGR19アン チセンスオリゴヌクレオチドを、細胞に投与してCGR19の発現を阻害すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 95. CGR19アンチセンスオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO:7に示すようなラ ットCGR19に相補的である、請求項94の方法。 96. CGR19アンチセンスオリゴヌクレオチドが、SEQ ID NO:3に示すようなヒ トCGR19に相補的である、請求項94の方法。 97.哺乳類CGR19遺伝子に相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含む、CGR19三 本鎖形成オリゴヌクレオチドを、細胞に投与して哺乳類CGR19遺伝子の発現を阻 害すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 98. オリゴヌクレオチドがSEQ ID NO:7に示すようなラットCGR19に相補的で ある、請求項97の方法。 99. オリゴヌクレオチドがSEQ ID NO:3に示すようなヒトCGR19に相補的であ る、請求項97の方法。 100. a. 転写プロモーター、 b. 転写ターミネーター、 c. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列の一つまたはそれ以上の区 分を含むDNA区分であって、前記遺伝子の区分が前記プロモーターと前記ターミ ネーターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーターと前記ターミネーター に関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によって作り出されるRNA が、哺乳類細胞によって作り出される対応するCGR19RNAの区分と相補的である、 前記DNA区分、 を含むアンチセンスCGR19構築物を、細胞に投与して哺乳類CGR19の発現を阻害す ること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 101. 前記転写プロモーターが誘導性である、請求項100の方法。 102. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:7に示すラット遺伝 子配列である、請求項100の方法。 103. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列がSEQ ID NO:3に示すヒト遺伝子 コーディング配列である、請求項100の方法。 104. 血液、絨毛膜絨毛、羊水、および着床前の胚の卵割球からなる群から選 択される組織を分析して、変異体である哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列 を前記組織のDNAが含むかどうか決定すること、 の段階を含む、癌に対する感受性を評価する方法。 105. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列の野生型配列がSEQ ID NO:3に示 される、請求項104の方法。 106. 哺乳類CGR19遺伝子のコーディング配列の野生型配列がSEQ ID NO:7に示 される、請求項104の方法。 107. 哺乳類SM20またはmEHタンパク質を腫瘍細胞に投与すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を抑制する方法。 108. 腫瘍細胞に哺乳類SM20またはmEHタンパク質を発現させるようなDNA分子 を、前記細胞に投与すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を抑制する方法。 109.組織を分析して、組織が哺乳類SM20またはmEHタンパク質あるいはmRNAを 正常組織よりも少なく発現しているかどうか決定すること、 の段階を含む、癌を診断する方法。 110. 組織を分析して、哺乳類SM20またはmEH遺伝子のコーディング配列の変 異型であって、遺伝子のコーディング配列の野生型とは異なるものを前記組織の DNAが含むかどうか決定すること、 の段階を含む、癌を診断する方法。 111. 哺乳類SM20またはmEH mRNAに相補的な少なくとも10オリゴヌクレオ チドを含むSM20またはmEHアンチセンスオリゴヌクレオチドを、細胞に投与してS M20またはああEHの発現を阻害すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 112. 哺乳類SM20またはmEH遺伝子に相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含 む、SM20またはmEH三本鎖形成オリゴヌクレオチドを、細胞に投与して哺乳類SM2 0またはmEH遺伝子の発現を阻害すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 113. a. 転写プロモーター、 b. 転写ターミネーター、 c. 哺乳類SM20またはmEH遺伝子のコーディング配列の一つまたはそれ 以上の区分を含むDNA区分であって、前記遺伝子の区分が前記プロモーターと前 記ターミネーターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーターと前記ターミ ネーターに関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によって作り出 されるRNAが、哺乳類細胞によって作り出される対応するSM20またはmEH RNAの区 分と相補的である、前記DNA区分、 を含むアンチセンスSM20またはmEH構築物を、細胞に投与して哺乳類SM20またはm EHの発現を阻害すること、 の段階を含む、前記細胞の増殖を促進する方法。 114. 血液、絨毛膜絨毛、羊水、および着床前の胚の卵割球からなる群から選 択される組織を分析して、変異体である哺乳類SM20またはmEH遺伝子のコーディ ング配列を前記組織のDNAが含むかどうか決定すること、 の段階を含む、癌に対する感受性を分析する方法。 115. SM20、mEH、CGR11、およびCGR19からなる群から選択される哺乳類タン パク質を有効量含む薬剤組成物であって、鼻腔内または非経口投与するのに適し ている薬剤組成物。 116. SM20、mEH、CGR11、およびCGR19からなる群から選択される哺乳類タン パク質を作り出すことができる発現ベクターを調製する方法であって、宿主細胞 内でそのタンパク質を発現するDNAを発現することができるように、そのタンパ ク質をコードするDNAを、機能可能な位置および方向でベクターにつなぐこと、 を含む方法。 117. SM20、mEH、CGR11、およびCGR19からなる群から選択される哺乳類タン パク質を、宿主細胞内で作り出すことができる発現ベクターであって、 選択されたタンパク質をコードするDNA区分、および、 宿主細胞内でそのタンパク質をコードするDNAを発現することができるよ うに、作用可能な位置および方向でDNA区分がつながっている、ベクター、を含 むベクター。 118. SM20、mEH、CGR11、およびCGR19からなる群から選択される哺乳類タン パク質の発現を指向することができる発現ベクターを含む、宿主細胞。 119. 細胞が哺乳類の体内にあり、そして腫瘍を抑制する量のタンパク質を投 与する、請求項14、67、または107の方法。 120. 哺乳類SM20またはmEH mRNAに相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含む 、SM20またはmEHアンチセンスオリゴヌクレオチド。 121. 細胞が哺乳類SM20またはmEH遺伝子の発現を阻害するのを助ける、哺乳 類SM20またはmEH遺伝子に相補的な少なくとも10ヌクレオチドを含む、SM20また はmEH三本鎖形成オリゴヌクレオチド。 122. a. 転写プロモーター、 b. 転写ターミネーター、 c. 哺乳類SM20またはmEH遺伝子のコーディング配列の一つまたはそれ 以上の区分を含むDNA区分であって、前記遺伝子の区分が前記プロモーターと前 記ターミネーターの間に位置し、前記DNA区分が前記プロモーターと前記ターミ ネーターに関して逆になっており、それによってDNA区分の転写によって作り出 されるRNAが、哺乳類細胞によって作り出される対応するSM20またはmEH RNAの区 分と相補的である、前記DNA区分、 を含むアンチセンスSM20またはmEH構築物。 123. 少なくとも一組の混合オリゴヌクレオチドであって、混合オリゴヌクレ オチドの前記組の各要素が、SEQ ID NO:2、4、6、または8に示すアミノ酸配列 のうち少なくとも6つの隣接したアミノ酸の配列をコードするを哺乳類cDNAライ ブラリーとアニールさせること、 (1)混合オリゴヌクレオチドの組の少なくとも1つの要素にアニールし、 (2)約275から約335コドンの完全なオープンリーディングフレームを含み、そし て、(3)哺乳類CGRタンパク質をコードする、哺乳類cDNAを単離すること(その際 、CGR RNAが野生型p53の存在下で亢進調節される)、 の段階を含む方法によって得られる、哺乳類CGRタンパク質をコードするDNA配列 を単離する方法。 124. 少なくとも2組の混合オリゴヌクレオチドがアニールされる、請求項1 の哺乳類CGR DNA配列。
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| JP2008063244A (ja) * | 2006-09-05 | 2008-03-21 | Saitama Univ | 糖代謝異常の治療又は予防 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| AU3228197A (en) | 1998-01-05 |
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| EP0914338A2 (en) | 1999-05-12 |
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| WO1997045542A2 (en) | 1997-12-04 |
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