JP2023123725A - 二重特異性抗体およびその使用 - Google Patents
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Abstract
Description
本出願は、2017年8月1日に出願された米国仮特許出願第62 / 539,970号および2018年4月6日に出願された米国仮特許出願第62/654,112号における利益を主張するものである。前述の内容全体は、参照により本明細書に組み込まれている。
本開示は、二重特異性抗体またはその抗原結合断片に関する。
二重特異性抗体とは、2種類の抗原または2種類のエピトープに同時に結合できる人工タンパク質である。この二重の特異性は、T細胞を腫瘍細胞にリダイレクトすること、2つの異なるシグナル伝達経路を同時にブロックすること、異なる疾患メディエーターの二重標的化、標的部位へのペイロードの送達を含む幅広い用途を切り開く。カツマソマブ(抗EpCAMおよび抗CD3)およびブリナツモマブ(抗CD19および抗CD3)の承認は、二重特異性抗体の開発における主要なマイルストーンになった。
本開示は、二重特異性抗体または抗原結合断片が異なる結合親和性で2つの異なる抗原に特異的に結合する、不均衡な二重特異性抗体または抗原結合断片に関するものである。
第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体または抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体または抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体または抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体または抗原結合断片が第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%より高いと判定する段階;
共通の軽鎖可変領域(VLc)を設計する段階であって、VLcが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する、前記段階;
VHaおよびVHb配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHb’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHb’を得る段階;ならびに
2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体または抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHb’を含む、前記段階
を含む。
第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体または抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体または抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体または抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体または抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
VHa、VLa、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3重鎖可変領域(VHc)を得る段階;
VHaおよびVHc配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa'を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc'を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体または抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa'およびVHc'を含む、前記段階
を含む。
第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体または抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体または抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体または抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、該第2の抗体または抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
第2の抗原に対してパニングする段階;
共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHa-VLcが、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;
VHaおよびVHc配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa'を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc'を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに、
2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体または抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa'およびVHc'を含む、前記段階
を含む。
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階。いくつかの実施形態おいて、該第1の抗体またはその抗原結合断片は、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ、該第2の抗体またはその抗原結合断片は、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階。いくつかの実施形態おいて、該軽鎖可変領域は、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である;
(e) 第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階。いくつかの実施形態おいて、VHc-VLcは、所望の親和性で第2の抗原に結合する;
(g) VLaとVLcとの間の相同性が80%より高いと判定する段階;
(h) 共通の軽鎖可変領域(VLd)を設計する段階。いくつかの実施形態において、VLdは、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持し、VHcと結合するとき、第2の抗原に対する所望の親和性を有する;
(i) 任意に、VHaおよびVHc配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa'を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLdを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc'を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLdを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに、
(j) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階。いくつかの実施形態おいて、該2つの軽可変領域の各々がVLdを含み、かつ該2つの重鎖可変領域はそれぞれVHa'およびVHc'を含む。
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階。いくつかの実施形態おいて、該第1の抗体またはその抗原結合断片は、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片は、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%より高いと判定する段階;
(d) 共通の軽鎖可変領域(VLc)を設計する段階。いくつかの実施形態おいて、VLcは、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する;ならびに、
(e) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階。いくつかの実施形態おいて、該2つの軽可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域はそれぞれVHaおよびVHbを含む。
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階。いくつかの実施形態おいて、該第1の抗体またはその抗原結合断片は、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片は、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む;
(b) VHa、VLa、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3重鎖可変領域(VHc)を得る段階;ならびに、
(e) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階。いくつかの実施形態おいて、該2つの軽可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域はそれぞれVHaおよびVHcを含む。
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階。いくつかの実施形態おいて、該第1の抗体またはその抗原結合断片は、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片は、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域で置き換える段階。いくつかの実施形態おいて、該軽鎖可変領域は、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である;
(e) 第1のおよび/または第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階。いくつかの実施形態おいて、VHa-VLcは、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcは、所望の親和性で第2の抗原に結合する;ならびに、
(g) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階。いくつかの実施形態おいて、該2つの軽可変領域の各々がVLcを含み、かつ2つの重鎖可変領域はそれぞれVHaおよびVHcを含む。
相補性決定領域(CDR)1、2、3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに、
CDR1、2、3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含み、ここで、選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列および選択されたVL CDR、1、2、3のアミノ酸配列は、次のうちの一つである:
選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:22~24にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:28~30にそれぞれ記載される。
相補性決定領域(CDR)1、2、3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに、
CDR1、2、3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含み、ここで、選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列および選択されたVL CDR、1、2、3のアミノ酸配列は次のうちの一つである:
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載される;
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載される。
相補性決定領域(CDR)1、2、3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに、
CDR1、2、3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含み、ここで、選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列および選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、次のうちの一つである:
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載される;
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列はSEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載される。
第1の重鎖可変領域、
第2の重鎖可変領域、
第1の軽鎖可変領域、および
第2の軽鎖可変領域
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1の重鎖可変領域と第1の軽鎖可変領域が互いに結合して、107 M-1、108 M-1、109 M-1、1010 M-1、1011 M-1、または1012 M-1よりも高い結合親和性で第1の抗原に特異的に結合する第1の抗原結合領域を形成し、かつ
第2の重鎖可変領域と第2の軽鎖可変領域が互いに結合して、109 M-1、108 M-1、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも低い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合領域を形成する、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1002]
前記第2の抗原結合領域が、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも高い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する、本発明1001の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1003]
第1の抗原と結合するときの第1の抗原結合領域の結合親和性が、第2の抗原と結合するときの第2の抗原結合領域の結合親和性よりも少なくとも100倍、1000倍、または10000倍高い、本発明1001の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1004]
第1の軽鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域が、少なくとも90%、95%、99%、または100%同一である、本発明1001の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1005]
第1の重鎖可変領域および第1の軽鎖可変領域を含む第1のアーム;ならびに
第2の重鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域を含む第2のアーム
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
該第1のアームが、107 M-1、108 M-1、109 M-1、1010 M-1、1011 M-1、1012 M-1よりも高い結合親和性で第1の抗原と特異的に結合し、かつ該第2のアームが、109 M-1、108 M-1、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも低い結合親和性で第2の抗原と特異的に結合する、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1006]
前記第2のアームが、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも高い結合親和性で第2の抗原と特異的に結合する、本発明1005の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1007]
第1の抗原と結合するときの前記第1のアームの結合親和性が、第2の抗原と結合するときの前記第2のアームの結合親和性よりも少なくとも100倍、1000倍、または10000倍高い、本発明1005の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1008]
第1の軽鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域が、少なくとも90%、95%、99%、または100%同一である、本発明1005の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1009]
第1の重鎖可変領域を含む第1の重鎖、
第2の重鎖可変領域を含む第2の重鎖、
第1の軽鎖可変領域を含む第1の軽鎖、および
第2の軽鎖可変領域を含む第2の軽鎖
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1の重鎖可変領域および第1の軽鎖可変領域が互いに結合して、107 M-1、108 M-1、109 M-1、1010 M-1、1011 M-1、1012 M-1よりも高い結合親和性で第1の抗原に特異的に結合する第1の抗原結合領域を形成し、かつ
第2の重鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域が互いに結合して、109 M-1、108 M-1、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも低い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合領域を形成する、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1010]
第2の抗原結合領域が、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも高い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する、本発明1009の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1011]
第1の抗原と結合するときの第1の抗原結合領域の結合親和性が、第2の抗原と結合するときの第2の抗原結合領域の結合親和性よりも少なくとも100倍、1000倍、または100000倍高い、本発明1009の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1012]
第1の軽鎖および第2の軽鎖が、少なくとも90%、95%、99%、または100%同一である、本発明1009の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1013]
第1の重鎖および第2の重鎖が、ノブ・イントゥ・ホール(knobs into holes)法によって互いに結合している、本発明1009の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1014]
第1の抗原が、がん特異抗原であり、かつ第2の抗原が、CD3である、本発明1001~1013のいずれかの二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1015]
第1の抗原がCD20であり、かつ第2の抗原がCD3である、本発明1001~1013のいずれかの二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1016]
第1の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:1と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、第2の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:2と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、かつ第1のおよび第2の軽鎖可変領域が、SEQ ID NO:3と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含む、本発明1015の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1017]
第1の抗原が、がん特異抗原であり、かつ第2の抗原が、がん関連抗原である、本発明1001~1013のいずれかの二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1018]
第1の抗原がPD-L1であり、かつ第2の抗原がCD55である、本発明1001~1013のいずれかの二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1019]
第1の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:4と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、第2の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:5と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、かつ第1のおよび第2の軽鎖可変領域が、SEQ ID NO:6またはSEQ ID NO:7と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含む、本発明1018の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1020]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%より高いと判定する段階;
(d) 共通の軽鎖可変領域(VLc)を設計する段階であって、VLcが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する、前記段階;
(e) VHaおよびVHbの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHb’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHb’を得る段階;ならびに
(f) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHb’を含む、前記段階。
[本発明1021]
段階(d)において、第2の抗原に対するVLc-VHbの結合親和性が低下し得る、本発明1020の方法。
[本発明1022]
さらに以下を含む、本発明1020の方法:
(g) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。
[本発明1023]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3の重鎖可変領域(VHc)を得る段階;
(e) VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(f) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHc’を含む、前記段階。
[本発明1024]
さらに以下を含む、本発明1023の方法:
(g) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。
[本発明1025]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHbおよびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 該第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHa-VLcが、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;
(g) VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(h) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHc’を含む、前記段階。
[本発明1026]
段階(d)において、複数の軽鎖可変領域が、エラープローンPCRによって作製される、本発明1025の方法。
[本発明1027]
さらに以下を含む、本発明1025の方法:
(i) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。
[本発明1028]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 該第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;
(g) VLaとVLcとの間の相同性が80%より高いと判定する段階;
(h) 共通の軽鎖可変領域(VLd)を設計する段階であって、VLdが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持し、VHcと結合するとき、第2の抗原に対する所望の親和性を有する、前記段階;
(i) 任意に、VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLdを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLdを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(j) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLdを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHc’を含む、前記段階。
[本発明1029]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%より高いと判定する段階;
(d) 共通の軽鎖可変領域(VLc)を設計する段階であって、VLcが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する、前記段階;ならびに
(e) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHaおよびVHbを含む、前記段階。
[本発明1030]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3の重鎖可変領域(VHc)を得る段階;ならびに
(e) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHaおよびVHcを含む、前記段階。
[本発明1031]
二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、および/またはVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 第1のおよび/または第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHa-VLcが、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;ならびに
(g) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHaおよびVHcを含む、前記段階。
[本発明1032]
相補性決定領域(CDR)1、2、および3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含む、CD3に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:22~24にそれぞれ記載され、かつ該選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:28~30にそれぞれ記載される、
前記抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1033]
VHが、SEQ ID NO:22、23、24にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含み、VLが、SEQ ID NO:28、29、30にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含む、本発明1032の抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1034]
ヒトCD3に特異的に結合する、本発明1032~1033のいずれかの抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1035]
二重特異性抗体である、本発明1032~1034のいずれかの抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1036]
相補性決定領域(CDR)1、2、および3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含む、PD-L1に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、および3のアミノ酸配列および該選択されたVL CDR1、2、および3のアミノ酸配列が、
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載される;
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載される
のうちの一つである、
前記抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1037]
VHが、SEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含み、かつVLが、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含む、本発明1036の抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1038]
ヒトCD3に特異的に結合する、本発明1036~1037のいずれかの抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1039]
二重特異性抗体である、本発明1036~1038のいずれかの抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1040]
相補性決定領域(CDR)1、2、および3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含む、CD55に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、および3のアミノ酸配列および該選択されたVL CDR1、2、および3のアミノ酸配列が、
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載される;
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載される
のうちの一つである、
前記抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1041]
VHが、SEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含み、かつVLが、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含む、本発明1040の抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1042]
ヒトCD3に特異的に結合する、本発明1040~1041のいずれかの抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1043]
二重特異性抗体である、本発明1040~1042のいずれかの抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1044]
SEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を含むCDR1、2、および3を含むVLを含む免疫グロブリン軽鎖またはその断片
を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む核酸であって、
該VLが、SEQ ID NO:4に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はPD-L1と結合し、かつ/またはSEQ ID NO:5に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はCD55に結合する、
前記核酸。
[本発明1045]
SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を含むCDR1、2、および3を含むVLを含む免疫グロブリン軽鎖またはその断片
を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む核酸であって、
該VLが、SEQ ID NO:4に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はPD-L1と結合し、かつ/またはSEQ ID NO:5に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はCD55に結合する、
前記核酸。
[本発明1046]
二重特異性抗体をコードする、本発明1044~1045のいずれかの核酸。
[本発明1047]
cDNAである、本発明1044~1045のいずれかの核酸。
[本発明1048]
本発明1044~1047のいずれかの核酸のうちの一つまたはそれ以上を含むベクター。
[本発明1049]
本発明1048のベクターを含む細胞。
[本発明1050]
CHO細胞である、本発明1049の細胞。
[本発明1051]
本発明1044~1047のいずれかの核酸のうちの一つまたはそれ以上を含む細胞。
[本発明1052]
SEQ ID NO:1と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の重鎖可変領域(VH)を含む第1のポリペプチド;
SEQ ID NO:2と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の重鎖可変領域(VH)を含む第2のポリペプチド;
SEQ ID NO:3と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の軽鎖可変領域(VL)を含む第3のポリペプチド;
SEQ ID NO:3と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の軽鎖可変領域(VL)を含む第4のポリペプチド
を含む、CD20およびCD3に結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1053]
第1の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:1を含み;
第2の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:2を含み;
第1の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:3を含み;かつ
第2の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:3を含む、
本発明1052の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1054]
第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:34、35、または36と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:37、38、または39と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO:40と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;かつ
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO:40と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む、
本発明1052の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1055]
第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:35に記載されるアミノ酸配列を含み;かつ
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:38に記載されるアミノ酸配列を含む、
本発明1052の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1056]
SEQ ID NO:4と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の重鎖可変領域(VH)を含む第1のポリペプチド;
SEQ ID NO:5と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の重鎖可変領域(VH)を含む第2のポリペプチド;
SEQ ID NO:6または7と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の軽鎖可変領域(VL)を含む第3のポリペプチド;
SEQ ID NO:6または7と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の軽鎖可変領域(VL)を含む第4のポリペプチド
を含む、PD-L1およびCD55と結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1057]
第1の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:4を含み;
第2の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:5を含み;
第1の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:7を含み;かつ
第2の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:7を含む、
本発明1056の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1058]
第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:65と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:66と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO:67または68と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;ならびに
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO:67または68と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む、
本発明1056の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1059]
第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:65に記載されるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:66に記載されるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO:68に記載されるアミノ酸配列を含み;かつ
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO:68に記載されるアミノ酸配列を含む、
本発明1056の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
[本発明1060]
治療薬に共有結合した、本発明1001~1019、1032~1043、および1052~1059のいずれかの抗体またはその抗原結合断片を含む、抗体-薬物複合体。
[本発明1061]
前記治療薬が細胞傷害剤または細胞増殖抑制剤である、本発明1060の抗体-薬物複合体。
[本発明1062]
がんを患っている対象を治療する方法であって、本発明1001~1019、1032~1043、および1052~1059のいずれかの抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明1060もしくは1061の抗体-薬物複合体を含む組成物の治療的に有効な量を該対象へ投与することを含む、前記方法。
[本発明1063]
前記対象が固形腫瘍を有する、本発明1062の方法。
[本発明1064]
前記がんが、黒色腫、膵臓癌、または血液悪性腫瘍である、本発明1062の方法。
[本発明1065]
前記がんが、非ホジキンリンパ腫、リンパ腫、または慢性リンパ性白血病である、本発明1062の方法。
[本発明1066]
腫瘍成長の速度を低下させる方法であって、対象に対して、本発明1001~1019、1032~1043、および1052~1059のいずれかの抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明1060もしくは1061の抗体-薬物複合体を含む組成物の有効量に、腫瘍細胞を接触させることを含む、前記方法。
[本発明1067]
腫瘍細胞を殺滅する方法であって、対象に対して、本発明1001~1019、1032~1043、および1052~1059のいずれかの抗体もしくはその抗原結合断片、または本発明1060もしくは1061の抗体-薬物複合体を含む組成物の有効量に、腫瘍細胞を接触させることを含む、前記方法。
[本発明1068]
本発明1001~1019、1032~1043、および1052~1059のいずれかの抗体またはその抗原結合断片と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
[本発明1069]
本発明1060または1061の抗体-薬物複合体と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
本発明の他の特徴および利点は、以下の詳細な説明および図面、ならびに特許請求の範囲から明確なものとなる。
二重特異性抗体またはその抗原結合断片は、異なる2種類の抗原に同時に結合できる人工タンパク質である。いくつかの実施形態で、二重特異性抗体またはその抗原結合断片は2つのアーム(アームAおよびB)を持つことができる。各アームは1つの重鎖可変領域および1つの軽鎖可変領域を持っている。
Ka = [抗体-抗原] / [抗体] [抗原]
Kd = [抗体] [抗原] / [抗体-抗原]
T細胞を動員および活性化することのできるT細胞特異的抗原(例:CD3、CD4またはCD8)結合アームを持つ二重特異性抗体(BsAbまたはBsMab)は、がん治療のために広く研究されてきた。しかし、このような二重特異性抗体の多くのエフェクター機能は、安全の懸念という理由で排除されている。ADCCおよびCDC等の抗体のエフェクター機能はがん細胞の殺滅において重要な役割を果たすことが示されているため、抗体のエフェクター機能を「安全に」維持することで抗体のがん殺滅の機能が改善するとともに、治療用抗体の作用メカニズムが拡大する。エフェクター機能を「安全に」維持し、このような二重特異性抗体の応用を拡大するために、コンピューターによる抗体設計に基づき、不均衡な二重特異性抗体技術のプラットフォームが開発されてきている。
本明細書では、がん特異抗原を標的とする第1の抗原結合領域、およびがん関連抗原を標的とする第2の抗原結合領域を持つ不均衡な二重特異性抗体も開示している。
二重特異性抗体もしくは抗原、またはその抗原結合断片は、以下の方法で作製することができる:
(1) 2つの標的抗原を選択し、かつ第1の抗原に結合する抗体(抗体A)の重鎖可変領域の配列(VHa)および軽鎖可変領域の配列(VLa)を決定し、かつ第2の抗原に結合する抗体(抗体B)の重鎖可変領域の配列(VHb)および軽鎖可変領域の配列(VLb)を決定する。
(2) VLaおよびVLbを整列させ、配列相同性が80%を超える場合はコンピューターのモデリングツール(マサチューセッツ州CambridgeにあるSchordingerm社のBioLuminate(バイオルミネート)等)を利用して共通 VLを設計する。設計プロセス中はVLaの親和性を維持するように努めるが、ある程度VLbの親和性を犠牲にする可能性がある。共通VLはVLaまたはVLbそのものであることができ、またはその配列がVLaおよびVLbに対して高い相同性を共有する新しいVLcであることができる。VLaおよびVLbの3次元構造は、例えば構造モデル化または結晶構造といったものから決定することができる。このプロセスはVLaの配列で開始することができる。3次元構造に基づいている場合、軽鎖内のアミノ酸は第2の抗原との結合に重要であると識別され(例えばVHbと組み合わせる場合)、第1の抗原との結合には関与せず(例えばVHaと組み合わせる場合)、VLa内のアミノ酸はVLb内の対応するアミノ酸に変更することができる。このプロセスを数回くり返した後、共通VLcを得ることができる。
(3) VLaおよびVLbの相同性が80%に満たない場合は、既存のヒトナイーブScFVライブラリのVLを抗体AのVLと置き換えることによって、ヒトScFVまたはFabファージライブラリを作製し、次いでエラープローンPCRを用いて20%未満のヌクレオチド変異をVL内に誘発し、抗体Bの抗原に対してパニングして、そのVLとしてVLaまたはその相同体(80%を超える相同性)を有する新しい抗体B’を得る。VLがVLaでなく、VLa相同体(例:80%を超える相同性を有する)である場合、手順(2)をくり返し、共通VLを設計する。
(4) AとBの生化学的および生物物理学的特性(3次元等電点(PI)等)の差異を増加させるために、コンピューターのモデリングツールを用いてVHaおよびVHbの配列をそれぞれ再設計する。このプロセスの間、Aの親和性は減少することができず、Bの親和性はある程度まで減少することができる。
(5) 緩衝系を作り、不均衡な二重特異性抗体を精製する。
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLaおよびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリ内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3の重鎖可変領域(VHc)を得る段階;
(e) VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(f) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa'およびVHc'を含む、前記段階。
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHbおよびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリ内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 第1および/または第2の抗原(例:第2の抗原)に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHa-VLcが、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;
(g) VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(h) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa'およびVHc'を含む、前記段階。
本開示は、本開示において記載される相補性決定領域(CDR)、重鎖可変領域、軽鎖可変領域、重鎖、または軽鎖を含む抗体およびその抗原結合断片を提供する。いくつかの実施形態では、この抗体およびその抗原結合断片は、不均衡な二重特異性抗体およびその抗原結合断片である。
相補性決定領域(CDR)1、2、3を含む重鎖可変領域(VH)であって、CDR1領域が、選択されたVHCDR1のアミノ酸配列と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一であるアミノ酸配列を含むかまたは該アミノ酸配列からなり、CDR2領域が、選択されたVHCDR2のアミノ酸配列と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一であるアミノ酸配列を含むかまたは該アミノ酸配列からなり、かつCDR3領域が、選択されたVHCDR3のアミノ酸配列と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一であるアミノ酸配列を含むかまたは該アミノ酸配列からなる、前記重鎖可変領域(VH)、ならびに
CDR1、2、3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、CDR1領域が、選択されたVLCDR1アミノ酸配列と、少なくとも80%、85%、90%、または95%同一であるアミノ酸配列を含むかまたは該アミノ酸配列からなり、CDR2領域が、選択されたVLCDR2アミノ酸配列と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一であるアミノ酸配列を含むかまたは該アミノ酸配列からなり、かつCDR3領域が、選択されたVLCDR3のアミノ酸配列と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一であるアミノ酸配列を含むかまたは該アミノ酸配列からなる、前記軽鎖可変領域(VL)
を有することができる。前記選択されたVHCDR1、2、3のアミノ酸配列は、表1、表2、表11および表12に示されており、かつ前記選択されたVLCDR、1、2、3のアミノ酸配列は、表3、表13および表14に示されている。
本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片(例えば、二重特異性抗体)は、免疫反応を増大できる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体またはその抗原結合断片は、免疫反応、T細胞(例えば、CD3+細胞、CD8+および/またはCD4+細胞)の活性または数を、少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、2倍、3倍、5倍、10倍、または20倍に増やすことができる。
TGI(%)=[1-(Ti-T0)/(Vi-V0)]×100
本開示は、本明細書において開示される単離されたポリヌクレオチド(例えば、本明細書において開示されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチド)を含む組み換えベクター(例えば、発現ベクター)、この組み換えベクターが(すなわち、宿主細胞がポリヌクレオチド、および/またはこのポリヌクレオチドを含むベクターを含むように)導入された宿主細胞、および組み換え技法による、組み換え抗体ポリペプチドまたはその断片の生成も提供する。
ヒトタンパク質の単離された断片(例えば、CD55、CD3、がん特異抗原またはがん関連抗原)は、ポリクローナルおよびモノクローナル抗体調製のための標準技法を用いる、抗体を生成するための免疫原として用いられ得る。ポリクローナル抗体は、抗原性ペプチドまたはタンパク質の複数回の注射(例えば、皮下または腹腔内注射)により、動物内で生じさせることができる。いくつかの実施形態では、前記抗原性ペプチドまたはタンパク質は、少なくとも1つのアジュバントと共に注射される。いくつかの実施形態では、前記抗原性ペプチドまたはタンパク質は、免疫化される種において免疫原性である作用物質と結合される。動物には、抗原性ペプチドまたはタンパク質を2回以上(例えば、2回、3回、または4回)注射できる。
本明細書に記載された方法は、がんに関連する疾患の治療のための方法を含む。一般的に、この方法は、本明細書に記載される操作された二重特異性抗体(例えば、不均衡な二重特異性抗体)またはその抗原結合断片の治療的な有効量を、それを必要とする対象、またはそのような治療を必要とすると決定された対象に投与することを含む。
本明細書により更に提供されるものは、本明細書に記載される抗体、抗原結合断片、または抗体-薬物複合体のうちの少なくとも1つ(例えば、1つ、2つ、3つ、または4つ)を含む薬学的組成物である。本明細書に記載された抗体、抗原結合断片、または抗体-薬物複合体のうちの任意のものの2つ以上(例えば、2つ、3つ、または4つ)が、薬学的組成物中に任意の組み合わせで存在できる。前記薬学的組成物は、当技術分野で周知の任意の方法で製剤化され得る。
以下のアッセイが実施例において用いられる。
(a) 50μLの培地中の5x105細胞を96ウエルプレートの各ウエルに分注する。
(b) 100μLの抗体を、異なる希釈でウエル中に加える。
(c) プレートを室温(RT)で60分間インキュベートする。
(d) 遠心分離で細胞を沈下させ、および0.1ウシ血清アルブミン(BSA)を含むリン酸緩衝生理食塩水(PBS)で3回洗浄する。
(e) 細胞ペレットを、1:500 Cy3複合体化ヤギ抗ヒトIgG抗体を含む100μLのPBSと0.1%BSA中に再懸濁する。
(f) 暗所で室温で30分間インキュベートする。
(g) 細胞を3回洗浄し、および蛍光標識細胞分取(FACS)緩衝液中で再懸濁する。
(h) 細胞をフローサイトメーターで分析する。
(a) カルセインAM標識の前に標的細胞をPBSで1回洗浄する。
(b) 1:333の2.5mMカルセインAM保存液を標的細胞の標識のために用いる。
(c) 遮光して、細胞を37℃で30分間インキュベートする。
(d) 細胞をPBSで3回洗浄する。
(e) 1x104カルセインAM標識標的細胞の50μLを各ウエルに分注する。
(f) 100μLの希釈抗体をウエルに加える。
(g) プレートを室温で60分間インキュベートする。
(h) 5x104のPBMS(細胞に効果を与える)を各ウエル中の50μL培地中に加える(E/T比は5)。
(i) このプレートを37℃で4時間インキュベートする。
(j) 細胞を遠心分離で沈下させ、180μLの上澄み液を底が半透明で壁が黒い別の96ウエルプレートに移す。
(k) 485励起および520発光の波長でプレートを読む。
(a) 標的細胞を収集し、およびADCC(カルセイン放出だけのアッセイ)として、カルセインAMで染色する。
(b) 50μLの標的細胞(1x105細胞)を96ウエルプレートの各ウエルに播種する。
(c) 異なる濃度で100μL抗体をウエル中に加える。
(d) プレートを室温で15分間インキュベートする。
(e) 50μLの10%補体濃縮ヒト血清を各ウエルに加える(最終濃度5%)。
(f) プレートを室温で45分間インキュベートする。
(g) 180μLの上澄み液を底が半透明で壁が黒い別の96ウエルプレートに移す(カルセイン放出アッセイに対してのみ)。
(h) 細胞を0.1%BSAを含むPBSで3回洗浄する。
(i) 細胞を、ウエルごとに2μLの7-アミノアクチノマイシンD(7AAD)を用いて、室温で15分間暗所で染色する。
(j) 細胞を3回洗浄し、および細胞をフローサイトメーターで分析する。
事前に活性化した末梢血単核球細胞(PBMC)をいくつかのADCC実験に用いた。
(a) Dynabeads(ヒトT細胞賦活化剤CD3/CD28)をPBMCの活性化に用いる。
(b) 緩衝液で洗浄後、DynabeadsをPBMCに1:1の比で30U/mLのインターロイキン-2(IL2)と共に加える。
(c) 細胞混合物を十分な期間インキュベートする。
(d) インキュベーションの最後に、磁石でビーズを除去し、賦活化されたPBMCを、次いでADCCアッセイに用いる。
(a) MDA231細胞を培地中で、1x106細胞/mLの濃度で調製する。
(b) 抗体サンプルを適切な濃度に希釈する。
(c) 50μLの細胞を96ウエルV底プレートの各ウエルに移す。
(d) 50μLの抗体を、96ウエルV底プレートの各ウエルに移す。
(e) 細胞混合物を60分間室温でインキュベートする。
(f) 細胞を遠心分離で沈下させ、およびFACS緩衝液で2回洗浄する。
(g) 各ウエル中のCy3複合体化ヤギ抗ヒト(GAH)IgG抗体を含む100μLのFACS緩衝液中で細胞を再懸濁(1:500)する。
(h) 室温で30分間インキュベートし、およびFACS緩衝液で2回洗浄する。
(i) FACS分析。
(a) 50μLの細胞懸濁物(MDA231またはSIHA細胞)を1x106/mで96ウエルプレートの各ウエルに加える。
(b) 50μLのAbを対応するウエルに加える。
(c) 37℃で30分間インキュベートする。
(d) 100μLのpHrodo Red標識GAHIgGを各ウエルに加え、および37℃で24時間インキュベートする。
(d) トリプシン消化しおよび細胞を収集し、2回洗浄し、FACSを行う。
(a) 標的細胞:MDA231細胞をPBSで2回洗浄し、および次いでPBS中で0.5x106/mLの濃度に調整する。
(b) 平底24ウエルプレートに、300μL/ウエルで細胞を播種する。
(c) 20μg/mL抗体の300μLを対応するウエルに加えて、10μg/mLの最終濃度にする。
(d) プレートを37℃で48時間インキュベートする。
(e) インキュベーションの最後に、細胞をトリプシン消化し単純培地で2回洗浄する。
(f) 細胞ペレットを100μL単純培地に再懸濁し、および細胞を96ウエルプレートに移す。
(g) 100μLの10%補体濃縮血清を各ウエルに加える。
(h) 細胞を4時間、37℃でインキュベートする。
(i) 細胞を2回FACS緩衝液で洗浄する。
(j) 100μLトリプシンを加えて3分間細胞を分離する。
(k) 細胞ペレットを7AADを含む(1:50希釈)FACS緩衝液中で再懸濁する。
(l) 室温で15分間インキュベーション後に細胞を2回洗浄する。
(m) FACS分析を行う。
二重特異性抗体が、CD20およびCD3に結合するために設計された。この二重特異性抗体は、2つの共通軽鎖(同一の配列を持つ)および2つの異なる重鎖を有する。2つの重鎖の可変領域および共通軽鎖の配列が以下に示される。
CD20重鎖バージョン2の全長(Y407T(ホール)突然変異を伴うIgG1Fc):
CD20重鎖バージョン3の全長(T366Y(ノブ)突然変異を伴うIgG1Fc):
CD3重鎖バージョン1の全長(野生型IgG1Fc):
CD3重鎖バージョン2の全長(T366Y(ノブ)突然変異を伴うIgG1Fc):
CD3重鎖バージョン3の全長(Y407T(ホール)突然変異を伴うIgG1Fc):
共通軽鎖の全長:
コンピュータによる設計の後に、設計されたVH配列(SEQ ID NO:1)および共通VL配列(SEQ ID NO:3)を含むCD20ホモ二量体IgGは、親の抗CD20IgG(親CD20)と比較して、同様のCD20に対する結合能力を示した。細胞結合親和性アッセイがRaji細胞(CD20を発現する)を用いて行われた。その結合結果は図2Aに示されている。
不均衡なCD20/CD3二重特異性モノクローナル抗体(BsMab)は、標的腫瘍細胞の存在下で、T細胞のみを活性化した。Raji細胞をCD20+標的腫瘍細胞として、293細胞をCD20対照細胞として、およびJurkat細胞をT細胞モデルとして使用することにより、以下の実験が、T細胞および標的腫瘍細胞の両方に結合する複数のBsMabsから形成されたクラスターのためにCD20/CD3 BsMabが標的腫瘍細胞の存在下でT細胞を活性化できるかどうかを試験するために行われた。対照的に、CD20対照細胞の存在下では、T細胞上のCD3への1つのアームによる弱い結合に起因して、CD20/CD3 BsMabはT細胞を活性化しなかった。
(1) Raji&Jurkat、Jurkat&293の1x105を別々にU底の96ウエルプレートに播種する。
(2) 試験抗体を加えて、一晩(19時間)インキュベートする。
(3) 細胞をPBS+0.1%BSAで1回洗浄する。
(4) 抗ヒトCD69抗体(PEにより標識)(1.5μL/ウエル)を加え、および室温で30分間インキュベートする。
(5) 細胞を1回洗浄する。
(6) 読み取る。
不均衡なCD20/CD3 BsMabは、T細胞活性化の前と後で、リツマキシブおよびCD20ホモ二量体抗体よりも良好なPBMC媒介細胞殺滅を示した。
事前に活性化されたT細胞が、不均衡なCD20/CD3 BsMabにより枯渇し得るかを試験するための実験も行われた。
CD20/CD3 BsMabが、高い親和性でCD20と結合するアームを持つことから、CD20-アーム結合が、補体依存性細胞傷害の誘導に十分かどうかを試験するために実験を行った。この抗体を、ヒト補体濃縮血清およびCD20+Raji細胞とインキュベートした。不均衡なCD20/CD3 BsMabは、CDC有効性をリツマキシブおよびCD20ホモ二量体抗体に比べて減少させた。FACS(7AAD)による検出結果を図13に示す。カルセイン放出による検出結果を図14に示す。
CD3+Jurkat細胞および正常T細胞が、不均衡なCD20/CD3 BsMabにより殺滅されるかどうかも試験した。図15は、高い用量の不均衡なCD20/CD3 BsMabがJurkat細胞に対してCDCを誘導しなかったことを示す。
不均衡なCD20/CD3 BsMabが、リツマキシブ抵抗性Raji細胞(RRCL)を殺滅するかどうかを試験するために、図に示される抗体の存在下で、3人の異なるドナーからの7日間活性化されたPBMCと共にRRCLをインキュベートした。不均衡なCD20/CD3 BsMabの存在下での顕著なRRCLの殺滅が観察された(図17~19)。
CD20/CD3 BsMabの動物での効果を評価するために実験を行った。
精製されたCD20/CD3二重特異性抗体サンプルを特性付ける実験を行った。
2つのバージョンの二重特異性抗体が、PD-L1およびCD55に結合するために設計された(PD-L1/CD55 BsMab v1およびPD-L1/CD55 BsMab v2)。これらの二重特異性抗体は2つの共通軽鎖および2つの異なる重鎖を有する。
新たに設計されたPD-L1およびCD55抗体の結合親和性を決定するための実験を行った。
PD-L1/CD55二重特異性抗体についての補体依存性細胞傷害を試験する実験を行った。これらの親抗体が、比較の目的で含まれた。アッセイは、本明細書に記載されるプロトコルに基づいてMDA231細胞で行われ、および各抗体の濃度は10μg/mLであった。結果が図26A~26Bに示されている。
PD-L1/CD55二重特異性抗体により誘導されるインターナリゼーションを評価するために実験を行った。
本発明は、その詳細な説明と合わせて説明されたが、前述の説明は添付の特許請求の範囲によって定義される発明の範囲を例示するものであり、限定するものではないことを理解されたい。その他の態様、利点および修正は、添付の特許請求の範囲内である。
SEQUENCE LISTING
<110> AB STUDIO INC.
<120> BISPECIFIC ANTIBODIES AND USES THEREOF
<150> US 62/654,112
<151> 2018-04-06
<150> US 62/539,970
<151> 2017-08-01
<160> 68
<170> PatentIn version 3.5
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<212> PRT
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
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Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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Thr Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Glu Gly Leu Glu Trp Ile
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Gly Tyr Ile Asn Pro Ser Ser Gly Tyr Thr Lys Tyr Asn Gln Lys Phe
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ile Val Leu Ser Gln Ser Pro Ala Ile Leu Ser Ala Ser Pro Gly
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Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Ile
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His Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Glu Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
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Ile Met Met Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser Ser Ile Tyr Pro Ser Gly Gly Ile Thr Phe Tyr Ala Asp Thr Val
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr
20 25 30
Gly Met Ser Trp Ile Arg Gln Thr Pro Gly Lys Arg Leu Glu Trp Val
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Ala Thr Ile Asn Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Val Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Ser Ser Leu Lys Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Arg Asn Gly Thr Leu Tyr Tyr Tyr Leu Met Asp Tyr Trp Gly
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Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
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Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
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Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
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Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
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Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
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Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ala
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Ser Thr Arg Ile Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Arg
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
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Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
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Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
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Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
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Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
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Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
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Ser Thr Arg Ile Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Arg
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
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Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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Asn Met His Trp Val Lys Gln Thr Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Ile
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Gly Ala Ile Tyr Pro Gly Asn Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
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Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
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Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ile Val Leu Ser Gln Ser Pro Ala Ile Leu Ser Ala Ser Pro Gly
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Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Ile
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His Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu
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Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Thr Ser Asn Pro Pro Thr
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Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg
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<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Val Gln Leu Gln Gln Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
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Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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Thr Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Ile
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Gly Tyr Ile Asn Pro Ser Ser Gly Tyr Thr Lys Tyr Asn Gln Lys Phe
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Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
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Met Gln Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Trp Gln Asp Tyr Asp Val Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Gln Gly
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Thr Thr Leu Thr Val Ser Ser
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<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ile Val Leu Ser Gln Ser Pro Ala Ile Leu Ser Ala Ser Pro Gly
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Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Met
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His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr
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Ala Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu
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Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Pro Thr
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Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Thr Lys Arg
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<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
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Ile Met Met Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
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Ser Ser Ile Tyr Pro Ser Gly Gly Ile Thr Phe Tyr Ala Asp Thr Val
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Ile Lys Leu Gly Thr Val Thr Thr Val Asp Tyr Trp Gly Gln
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Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
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Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
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Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
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Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
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Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
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Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
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Ser Thr Arg Val Phe Gly Thr Gly Thr Lys Val Thr Val Leu
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
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Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr
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Gly Met Ser Trp Ile Arg Gln Thr Pro Asp Lys Arg Leu Glu Trp Val
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Ala Thr Ile Asn Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val
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Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Val Lys Asn Thr Leu Tyr
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Leu Gln Met Ser Ser Leu Lys Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Arg Asn Gly Thr Leu Tyr Tyr Tyr Leu Met Asp Tyr Trp Gly
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Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Ser Pro Gly Gln
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Ser Val Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
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Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Phe
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Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Val
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Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ala
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Ser Thr Val Ile Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Thr Val Leu
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Ser Tyr Asn Met His
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<211> 17
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Ala Ile Tyr Pro Gly Asn Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe Lys
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Gly
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<212> PRT
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Ser Thr Tyr Tyr Gly Gly Asp Trp Tyr Phe Asn Val
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<212> PRT
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 19
Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
1 5
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<212> PRT
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Tyr Pro Gly Asn Gly Asp
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Ser Thr Tyr Tyr Gly Gly Asp Trp Tyr Phe Asn Val
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 22
Ser Tyr Thr Met His
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Tyr Ile Asn Pro Ser Ser Gly Tyr Thr Lys Tyr Asn Gln Lys Phe Lys
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Asp
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Trp Gln Asp Tyr Asp Val Tyr Phe Asp Tyr
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Asn Pro Ser Ser Gly Tyr
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<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 27
Trp Gln Asp Tyr Asp Val Tyr Phe Asp Tyr
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<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 28
Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Ile His
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
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Ala Thr Ser Asn Leu Ala Ser
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 30
Gln Gln Trp Thr Ser Asn Pro Pro Thr
1 5
<210> 31
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 31
Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Ile His
1 5 10
<210> 32
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 32
Ala Thr Ser Asn Leu Ala Ser
1 5
<210> 33
<211> 9
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 33
Gln Gln Trp Thr Ser Asn Pro Pro Thr
1 5
<210> 34
<211> 451
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 34
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Asn Met His Trp Val Lys Gln Thr Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ala Ile Tyr Pro Gly Asn Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Thr Tyr Tyr Gly Gly Asp Trp Tyr Phe Asn Val Trp Gly
100 105 110
Ala Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
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210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
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370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
435 440 445
Pro Gly Lys
450
<210> 35
<211> 451
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 35
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Asn Met His Trp Val Lys Gln Thr Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ala Ile Tyr Pro Gly Asn Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Thr Tyr Tyr Gly Gly Asp Trp Tyr Phe Asn Val Trp Gly
100 105 110
Ala Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Thr Ser Lys Leu Thr Val
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Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
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Pro Gly Lys
450
<210> 36
<211> 451
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 36
Gln Val Gln Leu Gln Gln Pro Gly Ala Glu Leu Val Lys Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Asn Met His Trp Val Lys Gln Thr Pro Gly Arg Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Ala Ile Tyr Pro Gly Asn Gly Asp Thr Ser Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Gly Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Gln Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ser Thr Tyr Tyr Gly Gly Asp Trp Tyr Phe Asn Val Trp Gly
100 105 110
Ala Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ala Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
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Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
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Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
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Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
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Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
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Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
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Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Tyr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
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Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
435 440 445
Pro Gly Lys
450
<210> 37
<211> 449
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 37
Glu Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Thr Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Glu Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn Pro Ser Ser Gly Tyr Thr Lys Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Trp Gln Asp Tyr Asp Val Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Glu Gly
100 105 110
Thr Thr Leu Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
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Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
145 150 155 160
Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
165 170 175
Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
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Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
195 200 205
Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys
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Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro
225 230 235 240
Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser
245 250 255
Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp
260 265 270
Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn
275 280 285
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Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu
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Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys
325 330 335
Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr
340 345 350
Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr
355 360 365
Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu
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Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu
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Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys
405 410 415
Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu
420 425 430
Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
Lys
<210> 38
<211> 449
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 38
Glu Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
20 25 30
Thr Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Glu Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn Pro Ser Ser Gly Tyr Thr Lys Tyr Asn Gln Lys Phe
50 55 60
Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
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Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Trp Gln Asp Tyr Asp Val Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Glu Gly
100 105 110
Thr Thr Leu Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
115 120 125
Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
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Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
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Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
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Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
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Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
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Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys
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Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro
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Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser
245 250 255
Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp
260 265 270
Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn
275 280 285
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290 295 300
Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu
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Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys
325 330 335
Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr
340 345 350
Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Tyr
355 360 365
Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu
370 375 380
Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu
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Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys
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Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu
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Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
Lys
<210> 39
<211> 449
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 39
Glu Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Ala Glu Leu Ala Arg Pro Gly Ala
1 5 10 15
Ser Val Lys Met Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr Ser Tyr
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Thr Met His Trp Val Lys Gln Arg Pro Gly Glu Gly Leu Glu Trp Ile
35 40 45
Gly Tyr Ile Asn Pro Ser Ser Gly Tyr Thr Lys Tyr Asn Gln Lys Phe
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Lys Asp Lys Ala Thr Leu Thr Ala Asp Lys Ser Ser Ser Thr Ala Tyr
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Met Glu Leu Ser Ser Leu Thr Ser Glu Asp Ser Ala Val Tyr Tyr Cys
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Ala Arg Trp Gln Asp Tyr Asp Val Tyr Phe Asp Tyr Trp Gly Glu Gly
100 105 110
Thr Thr Leu Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe
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Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu
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Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp
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Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu
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Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser
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Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro
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Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys
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Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro
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Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser
245 250 255
Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp
260 265 270
Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn
275 280 285
Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val
290 295 300
Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu
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Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys
325 330 335
Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr
340 345 350
Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr
355 360 365
Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu
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Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu
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Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Thr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys
405 410 415
Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu
420 425 430
Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly
435 440 445
Lys
<210> 40
<211> 213
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 40
Gln Ile Val Leu Ser Gln Ser Pro Ala Ile Leu Ser Ala Ser Pro Gly
1 5 10 15
Glu Lys Val Thr Met Thr Cys Arg Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Ile
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His Trp Phe Gln Gln Lys Pro Gly Ser Ser Pro Lys Pro Trp Ile Tyr
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Ala Thr Ser Asn Leu Ala Ser Gly Val Pro Val Arg Phe Ser Gly Ser
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Gly Ser Gly Thr Ser Tyr Ser Leu Thr Ile Ser Arg Val Glu Ala Glu
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Asp Ala Ala Thr Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Thr Ser Asn Pro Pro Thr
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Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro
100 105 110
Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr
115 120 125
Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys
130 135 140
Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu
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Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser
165 170 175
Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala
180 185 190
Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe
195 200 205
Asn Arg Gly Glu Cys
210
<210> 41
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 41
Ser Tyr Ile Met Met
1 5
<210> 42
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 42
Ser Ile Tyr Pro Ser Gly Gly Ile Thr Phe Tyr Ala Asp Thr Val Lys
1 5 10 15
Gly
<210> 43
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 43
Ile Lys Leu Gly Thr Val Thr Thr Val Asp Tyr
1 5 10
<210> 44
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 44
Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
1 5
<210> 45
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 45
Tyr Pro Ser Gly Gly Ile
1 5
<210> 46
<211> 11
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 46
Ile Lys Leu Gly Thr Val Thr Thr Val Asp Tyr
1 5 10
<210> 47
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 47
Gly Tyr Gly Met Ser
1 5
<210> 48
<211> 17
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 48
Thr Ile Asn Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val Lys
1 5 10 15
Gly
<210> 49
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 49
Arg Asn Gly Thr Leu Tyr Tyr Tyr Leu Met Asp Tyr
1 5 10
<210> 50
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 50
Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr
1 5
<210> 51
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 51
Asn Ser Gly Gly Ser Tyr
1 5
<210> 52
<211> 12
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 52
Arg Asn Gly Thr Leu Tyr Tyr Tyr Leu Met Asp Tyr
1 5 10
<210> 53
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 53
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
1 5 10
<210> 54
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 54
Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser
1 5
<210> 55
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 55
Ser Ser Tyr Thr Ser Ala Ser Thr Arg Ile
1 5 10
<210> 56
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 56
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
1 5 10
<210> 57
<211> 7
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 57
Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser
1 5
<210> 58
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 58
Ser Ser Tyr Thr Ser Ala Ser Thr Arg Ile
1 5 10
<210> 59
<211> 14
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 59
Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
1 5 10
<210> 60
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 60
Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser
1 5
<210> 61
<211> 10
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Arg Ile
1 5 10
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<211> 14
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<213> Artificial Sequence
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Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr Asn Tyr Val Ser
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Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser
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Ser Ser Tyr Thr Ser Ser Ser Thr Arg Ile
1 5 10
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<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
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<400> 65
Glu Val Gln Leu Leu Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Glu Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ile Met Met Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ser Ser Ile Tyr Pro Ser Gly Gly Ile Thr Phe Tyr Ala Asp Thr Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Ile Lys Leu Gly Thr Val Thr Thr Val Asp Tyr Trp Gly Glu
100 105 110
Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val
115 120 125
Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala
130 135 140
Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser
145 150 155 160
Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val
165 170 175
Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro
180 185 190
Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys
195 200 205
Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp
210 215 220
Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly
225 230 235 240
Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile
245 250 255
Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His Glu
260 265 270
Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His
275 280 285
Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg
290 295 300
Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys
305 310 315 320
Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu
325 330 335
Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr
340 345 350
Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu
355 360 365
Tyr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp
370 375 380
Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val
385 390 395 400
Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp
405 410 415
Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His
420 425 430
Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro
435 440 445
Gly Lys
450
<210> 66
<211> 451
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 66
Gln Val Lys Leu Gln Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Lys Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Gly Tyr
20 25 30
Gly Met Ser Trp Ile Arg Gln Thr Pro Gly Lys Arg Leu Glu Trp Val
35 40 45
Ala Thr Ile Asn Ser Gly Gly Ser Tyr Thr Tyr Tyr Ser Asp Ser Val
50 55 60
Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Val Lys Asn Thr Leu Tyr
65 70 75 80
Leu Gln Met Ser Ser Leu Lys Ser Glu Asp Thr Ala Met Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Arg Asn Gly Thr Leu Tyr Tyr Tyr Leu Met Asp Tyr Trp Gly
100 105 110
Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser
115 120 125
Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala
130 135 140
Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val
145 150 155 160
Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala
165 170 175
Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val
180 185 190
Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His
195 200 205
Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys
210 215 220
Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly
225 230 235 240
Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met
245 250 255
Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Asp Val Ser His
260 265 270
Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val
275 280 285
His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr
290 295 300
Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly
305 310 315 320
Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile
325 330 335
Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val
340 345 350
Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser
355 360 365
Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu
370 375 380
Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro
385 390 395 400
Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Thr Ser Lys Leu Thr Val
405 410 415
Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met
420 425 430
His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser
435 440 445
Pro Gly Lys
450
<210> 67
<211> 217
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 67
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Lys Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ala
85 90 95
Ser Thr Arg Ile Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Arg Thr
100 105 110
Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu
115 120 125
Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro
130 135 140
Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly
145 150 155 160
Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His
180 185 190
Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val
195 200 205
Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
<210> 68
<211> 217
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 68
Gln Ser Ala Leu Thr Gln Pro Ala Ser Val Ser Gly Ser Pro Gly Gln
1 5 10 15
Ser Ile Thr Ile Ser Cys Thr Gly Thr Ser Ser Asp Val Gly Gly Tyr
20 25 30
Asn Tyr Val Ser Trp Tyr Gln Gln His Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu
35 40 45
Met Ile Tyr Asp Val Ser Asn Arg Pro Ser Gly Val Ser Asn Arg Phe
50 55 60
Ser Gly Ser Lys Ser Gly Asn Thr Ala Ser Leu Thr Ile Ser Gly Leu
65 70 75 80
Gln Ala Glu Asp Glu Ala Asp Tyr Tyr Cys Ser Ser Tyr Thr Ser Ser
85 90 95
Ser Thr Arg Ile Phe Gly Gly Gly Thr Lys Val Thr Val Leu Arg Thr
100 105 110
Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu
115 120 125
Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro
130 135 140
Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly
145 150 155 160
Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr
165 170 175
Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His
180 185 190
Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val
195 200 205
Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys
210 215
Claims (69)
- 第1の重鎖可変領域、
第2の重鎖可変領域、
第1の軽鎖可変領域、および
第2の軽鎖可変領域
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1の重鎖可変領域と第1の軽鎖可変領域が互いに結合して、107 M-1、108 M-1、109 M-1、1010 M-1、1011 M-1、または1012 M-1よりも高い結合親和性で第1の抗原に特異的に結合する第1の抗原結合領域を形成し、かつ
第2の重鎖可変領域と第2の軽鎖可変領域が互いに結合して、109 M-1、108 M-1、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも低い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合領域を形成する、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 前記第2の抗原結合領域が、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも高い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原と結合するときの第1の抗原結合領域の結合親和性が、第2の抗原と結合するときの第2の抗原結合領域の結合親和性よりも少なくとも100倍、1000倍、または10000倍高い、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の軽鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域が、少なくとも90%、95%、99%、または100%同一である、請求項1に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の重鎖可変領域および第1の軽鎖可変領域を含む第1のアーム;ならびに
第2の重鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域を含む第2のアーム
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
該第1のアームが、107 M-1、108 M-1、109 M-1、1010 M-1、1011 M-1、1012 M-1よりも高い結合親和性で第1の抗原と特異的に結合し、かつ該第2のアームが、109 M-1、108 M-1、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも低い結合親和性で第2の抗原と特異的に結合する、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 前記第2のアームが、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも高い結合親和性で第2の抗原と特異的に結合する、請求項5に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原と結合するときの前記第1のアームの結合親和性が、第2の抗原と結合するときの前記第2のアームの結合親和性よりも少なくとも100倍、1000倍、または10000倍高い、請求項5に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の軽鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域が、少なくとも90%、95%、99%、または100%同一である、請求項5に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の重鎖可変領域を含む第1の重鎖、
第2の重鎖可変領域を含む第2の重鎖、
第1の軽鎖可変領域を含む第1の軽鎖、および
第2の軽鎖可変領域を含む第2の軽鎖
を含む、二重特異性抗体またはその抗原結合断片であって、
第1の重鎖可変領域および第1の軽鎖可変領域が互いに結合して、107 M-1、108 M-1、109 M-1、1010 M-1、1011 M-1、1012 M-1よりも高い結合親和性で第1の抗原に特異的に結合する第1の抗原結合領域を形成し、かつ
第2の重鎖可変領域および第2の軽鎖可変領域が互いに結合して、109 M-1、108 M-1、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも低い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する第2の抗原結合領域を形成する、
前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第2の抗原結合領域が、107 M-1、106 M-1、105 M-1、または104 M-1よりも高い結合親和性で第2の抗原に特異的に結合する、請求項9に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原と結合するときの第1の抗原結合領域の結合親和性が、第2の抗原と結合するときの第2の抗原結合領域の結合親和性よりも少なくとも100倍、1000倍、または100000倍高い、請求項9に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の軽鎖および第2の軽鎖が、少なくとも90%、95%、99%、または100%同一である、請求項9に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の重鎖および第2の重鎖が、ノブ・イントゥ・ホール(knobs into holes)法によって互いに結合している、請求項9に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原が、がん特異抗原であり、かつ第2の抗原が、CD3である、請求項1~13のいずれか1項に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原がCD20であり、かつ第2の抗原がCD3である、請求項1~13のいずれか1項に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:1と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、第2の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:2と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、かつ第1のおよび第2の軽鎖可変領域が、SEQ ID NO:3と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含む、請求項15に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原が、がん特異抗原であり、かつ第2の抗原が、がん関連抗原である、請求項1~13のいずれか1項に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の抗原がPD-L1であり、かつ第2の抗原がCD55である、請求項1~13のいずれか1項に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 第1の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:4と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、第2の重鎖可変領域が、SEQ ID NO:5と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含み、かつ第1のおよび第2の軽鎖可変領域が、SEQ ID NO:6またはSEQ ID NO:7と少なくとも80%、85%、90%、または95%同一である配列を含む、請求項18に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。
- 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%より高いと判定する段階;
(d) 共通の軽鎖可変領域(VLc)を設計する段階であって、VLcが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する、前記段階;
(e) VHaおよびVHbの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHb’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHb’を得る段階;ならびに
(f) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHb’を含む、前記段階。 - 段階(d)において、第2の抗原に対するVLc-VHbの結合親和性が低下し得る、請求項20に記載の方法。
- さらに以下を含む、請求項20に記載の方法:
(g) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。 - 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3の重鎖可変領域(VHc)を得る段階;
(e) VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLaを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(f) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHc’を含む、前記段階。 - さらに以下を含む、請求項23に記載の方法:
(g) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。 - 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHbおよびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 該第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHa-VLcが、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;
(g) VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLcを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(h) 2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHc’を含む、前記段階。 - 段階(d)において、複数の軽鎖可変領域が、エラープローンPCRによって作製される、請求項25に記載の方法。
- さらに以下を含む、請求項25に記載の方法:
(i) 前記二重特異性抗体またはその抗原結合断片を精製するための緩衝系を作る段階。 - 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 該第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;
(g) VLaとVLcとの間の相同性が80%より高いと判定する段階;
(h) 共通の軽鎖可変領域(VLd)を設計する段階であって、VLdが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持し、VHcと結合するとき、第2の抗原に対する所望の親和性を有する、前記段階;
(i) 任意に、VHaおよびVHcの配列を再設計し、それによって、それぞれがVHa’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLdを含む2つのポリペプチドを含む第1のタンパク質と、それぞれがVHc’を含む2つのポリペプチドおよびそれぞれがVLdを含む2つのポリペプチドを含む第2のタンパク質との間の生化学的または生物物理学的特性の差異を増加させるVHa’およびVHc’を得る段階;ならびに
(j) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLdを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHa’およびVHc’を含む、前記段階。 - 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%より高いと判定する段階;
(d) 共通の軽鎖可変領域(VLc)を設計する段階であって、VLcが、VHaと結合するとき第1の抗原に対する親和性を維持する、前記段階;ならびに
(e) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHaおよびVHbを含む、前記段階。 - 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、およびVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域をVLaと置き換え、第2の抗原に対してパニングして、第3の重鎖可変領域(VHc)を得る段階;ならびに
(e) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLaを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHaおよびVHcを含む、前記段階。 - 二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する方法であって、以下を含む方法:
(a) 第1の抗原および第2の抗原を選択し、かつ該第1の抗原に結合する第1の抗体またはその抗原結合断片および該第2の抗原に結合する第2の抗体またはその抗原結合断片を特定する段階であって、該第1の抗体またはその抗原結合断片が、第1の重鎖可変領域(VHa)および第1の軽鎖可変領域(VLa)を含み、かつ該第2の抗体またはその抗原結合断片が、第2の重鎖可変領域(VHb)および第2の軽鎖可変領域(VLb)を含む、前記段階;
(b) VHa、VLa、VHb、および/またはVLbのアミノ酸配列を決定する段階;
(c) VLaおよびVLbのアミノ酸配列を整列させ、VLaとVLbとの間の配列相同性が80%未満であると判定する段階;
(d) ファージディスプレイ抗体ライブラリー内の全ての軽鎖可変領域を複数の軽鎖可変領域と置き換える段階であって、該軽鎖可変領域が、VLaまたはVLbと少なくとも80%、85%、90%、95%、または99%同一である、前記段階;
(e) 第1のおよび/または第2の抗原に対してパニングする段階;
(f) 共通の軽鎖可変領域(VLc)、および第3の重鎖可変領域(VHc)を選択する段階であって、VHa-VLcが、所望の親和性で第1の抗原に結合し、かつVHc-VLcが、所望の親和性で第2の抗原に結合する、前記段階;ならびに
(g) 任意に、2つの軽鎖可変領域および2つの重鎖可変領域を有する二重特異性抗体またはその抗原結合断片を作製する段階であって、該2つの軽鎖可変領域の各々がVLcを含み、かつ該2つの重鎖可変領域がそれぞれVHaおよびVHcを含む、前記段階。 - 相補性決定領域(CDR)1、2、および3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含む、CD3に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:22~24にそれぞれ記載され、かつ該選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列が、SEQ ID NO:28~30にそれぞれ記載される、
前記抗体またはその抗原結合断片。 - VHが、SEQ ID NO:22、23、24にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含み、VLが、SEQ ID NO:28、29、30にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含む、請求項32に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- ヒトCD3に特異的に結合する、請求項32~33のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- 二重特異性抗体である、請求項32~34のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- 相補性決定領域(CDR)1、2、および3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含む、PD-L1に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、および3のアミノ酸配列および該選択されたVL CDR1、2、および3のアミノ酸配列が、
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載される;
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載される
のうちの一つである、
前記抗体またはその抗原結合断片。 - VHが、SEQ ID NO:41~43にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含み、かつVLが、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含む、請求項36に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- ヒトCD3に特異的に結合する、請求項36~37のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- 二重特異性抗体である、請求項36~38のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- 相補性決定領域(CDR)1、2、および3を含む重鎖可変領域(VH)であって、VH CDR1領域が、選択されたVH CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VH CDR2領域が、選択されたVH CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVH CDR3領域が、選択されたVH CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記重鎖可変領域(VH);ならびに
CDR1、2、および3を含む軽鎖可変領域(VL)であって、VL CDR1領域が、選択されたVL CDR1アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、VL CDR2領域が、選択されたVL CDR2アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含み、かつVL CDR3領域が、選択されたVL CDR3アミノ酸配列と少なくとも80%同一であるアミノ酸配列を含む、前記軽鎖可変領域(VL)
を含む、CD55に結合する抗体またはその抗原結合断片であって、
該選択されたVH CDR1、2、および3のアミノ酸配列および該選択されたVL CDR1、2、および3のアミノ酸配列が、
(1) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載される;
(2) 選択されたVH CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載され、かつ選択されたVL CDR1、2、3のアミノ酸配列は、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載される
のうちの一つである、
前記抗体またはその抗原結合断片。 - VHが、SEQ ID NO:47~49にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含み、かつVLが、SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を有するCDR1、2、3を含む、請求項40に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- ヒトCD3に特異的に結合する、請求項40~41のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- 二重特異性抗体である、請求項40~42のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片。
- SEQ ID NO:53~55にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を含むCDR1、2、および3を含むVLを含む免疫グロブリン軽鎖またはその断片
を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む核酸であって、
該VLが、SEQ ID NO:4に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はPD-L1と結合し、かつ/またはSEQ ID NO:5に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はCD55に結合する、
前記核酸。 - SEQ ID NO:59~61にそれぞれ記載されるアミノ酸配列を含むCDR1、2、および3を含むVLを含む免疫グロブリン軽鎖またはその断片
を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む核酸であって、
該VLが、SEQ ID NO:4に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はPD-L1と結合し、かつ/またはSEQ ID NO:5に記載されるアミノ酸配列を含むVHと対にされる場合はCD55に結合する、
前記核酸。 - 二重特異性抗体をコードする、請求項44~45のいずれか1項に記載の核酸。
- cDNAである、請求項44~45のいずれか1項に記載の核酸。
- 請求項44~47のいずれか1項に記載の核酸のうちの一つまたはそれ以上を含むベクター。
- 請求項48に記載のベクターを含む細胞。
- CHO細胞である、請求項49に記載の細胞。
- 請求項44~47のいずれか1項に記載の核酸のうちの一つまたはそれ以上を含む細胞。
- SEQ ID NO:1と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の重鎖可変領域(VH)を含む第1のポリペプチド;
SEQ ID NO:2と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の重鎖可変領域(VH)を含む第2のポリペプチド;
SEQ ID NO:3と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の軽鎖可変領域(VL)を含む第3のポリペプチド;
SEQ ID NO:3と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の軽鎖可変領域(VL)を含む第4のポリペプチド
を含む、CD20およびCD3に結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第1の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:1を含み;
第2の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:2を含み;
第1の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:3を含み;かつ
第2の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:3を含む、
請求項52に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:34、35、または36と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:37、38、または39と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO:40と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;かつ
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO:40と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む、
請求項52に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:35に記載されるアミノ酸配列を含み;かつ
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:38に記載されるアミノ酸配列を含む、
請求項52に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - SEQ ID NO:4と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の重鎖可変領域(VH)を含む第1のポリペプチド;
SEQ ID NO:5と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の重鎖可変領域(VH)を含む第2のポリペプチド;
SEQ ID NO:6または7と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第1の軽鎖可変領域(VL)を含む第3のポリペプチド;
SEQ ID NO:6または7と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む第2の軽鎖可変領域(VL)を含む第4のポリペプチド
を含む、PD-L1およびCD55と結合する二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第1の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:4を含み;
第2の重鎖可変領域(VH)が、SEQ ID NO:5を含み;
第1の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:7を含み;かつ
第2の軽鎖可変領域(VL)が、SEQ ID NO:7を含む、
請求項56に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:65と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:66と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO:67または68と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含み;ならびに
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO:67または68と少なくとも90%、95%、96%、97%、98%、または99%同一であるアミノ酸配列を含む、
請求項56に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 第1のポリペプチドが、SEQ ID NO:65に記載されるアミノ酸配列を含み;
第2のポリペプチドが、SEQ ID NO:66に記載されるアミノ酸配列を含み;
第3のポリペプチドが、SEQ ID NO:68に記載されるアミノ酸配列を含み;かつ
第4のポリペプチドが、SEQ ID NO:68に記載されるアミノ酸配列を含む、
請求項56に記載の二重特異性抗体またはその抗原結合断片。 - 治療薬に共有結合した、請求項1~19、32~43、および52~59のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片を含む、抗体-薬物複合体。
- 前記治療薬が細胞傷害剤または細胞増殖抑制剤である、請求項60に記載の抗体-薬物複合体。
- がんを患っている対象を治療する方法であって、請求項1~19、32~43、および52~59のいずれか1項に記載の抗体もしくはその抗原結合断片、または請求項60もしくは61に記載の抗体-薬物複合体を含む組成物の治療的に有効な量を該対象へ投与することを含む、前記方法。
- 前記対象が固形腫瘍を有する、請求項62に記載の方法。
- 前記がんが、黒色腫、膵臓癌、または血液悪性腫瘍である、請求項62に記載の方法。
- 前記がんが、非ホジキンリンパ腫、リンパ腫、または慢性リンパ性白血病である、請求項62に記載の方法。
- 腫瘍成長の速度を低下させる方法であって、対象に対して、請求項1~19、32~43、および52~59のいずれか1項に記載の抗体もしくはその抗原結合断片、または請求項60もしくは61に記載の抗体-薬物複合体を含む組成物の有効量に、腫瘍細胞を接触させることを含む、前記方法。
- 腫瘍細胞を殺滅する方法であって、対象に対して、請求項1~19、32~43、および52~59のいずれか1項に記載の抗体もしくはその抗原結合断片、または請求項60もしくは61に記載の抗体-薬物複合体を含む組成物の有効量に、腫瘍細胞を接触させることを含む、前記方法。
- 請求項1~19、32~43、および52~59のいずれか1項に記載の抗体またはその抗原結合断片と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
- 請求項60または61に記載の抗体-薬物複合体と、薬学的に許容される担体とを含む、医薬組成物。
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