JP2913406B2 - 放線菌株におけるクローン化および発現ベクター,この株の形質転換方法,得られた放線菌株および蛋白質の製造方法 - Google Patents
放線菌株におけるクローン化および発現ベクター,この株の形質転換方法,得られた放線菌株および蛋白質の製造方法Info
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Description
のクローン化および発現ベクター並びにこれらベクター
により形質転換された株に関する。
ptomyces)に属する細菌は、微生物工業において特に重
要な地位を占めている。実際、ストレプトマイシンを生
成するストレプトミセスのWaksmanによる発見以来、最
近の40年間、多くの様々な抗生物質生成ストレプトミセ
スが単離され且つ工業的に利用されている。ストレプト
ミセスにより生成される二次代謝産物は、多量に且つ様
々な種類となって製造されており、このことはストレプ
トミセスが1978年までの天然抗生物質の55%を合成して
いるという事実から明らかである。現在、工業的に生成
されている抗生物質の約70%は、ストレプトミセスによ
り製造されている。微生物からの二次代謝産物は、特に
それらの抗菌性、防カビ性または抗腫瘍性のために用い
られている。これらの特性を有する物質は、1950〜1970
年におびただしい数が発見されている。現在、これら種
類の発見のペースは鈍ってきたが、微生物二次代謝産物
のすべてが利用されているわけではない。実際、それら
の用途については、多くの利用分野で現在検討されてい
る。例えば、これらの利用分野としては、寄生虫駆除
剤、殺虫剤、除草剤およびこれら生成物の薬理学的用途
の分野がある。これら分野においても、ストレプトミセ
スの生成物が多い。即ち、それらの例としては、胞子虫
病に対する物質、牛の寄生線虫に対して非常に活性で且
つまた殺虫作用を有するアベルメクチン(avermectin
s)、およびキチン質の合成を妨害し、殺虫作用を有す
るニコマイシン(nikkomycins)が挙げられる。ストレ
プトミセスはまた抗炎症剤および血管拡張剤のような薬
理学的活性を有する物質を生成する。
異型遺伝子を発現するホストとして使用できることであ
る。実際、この分野に係わる多くの企業では、ストレプ
トミセスを培養し且つ培養物を利用するのに必要なノウ
ハウおよび装置を保有している。定常期における培養物
は数週間代謝活性を維持し、且つ蛋白質および二次代謝
産物を合成し続ける。ストレプトミセスは多数の細胞外
酵素を生成し、そのうちの幾つかがプロテアーゼまたは
グルコース異性化酵素のように工業的に使用されている
ことを考えると、それらの代謝排出物は異種蛋白質の生
成に使用することができるはずである。ストレプトミセ
ス・リビダンス(lividans)は、Biogen Companyによ
ってウシの成長ホルモンの発現用ホストとしてすでに有
益に採用されている(Gray etcoll.、1985)。
s)株は、Rhone−Poulencによって特にスピラマイシ
ン、即ちマクロライド科の抗生物質の生成に利用されて
いる。さらに、この株は分子クローン化を容易にする異
種DNAに対して制限的特性を示さない(Coxet coll.、1
984)。マクロライド生成ストレプトミセスを研究し、
且つストレプトミセス・アンボファシエンスを使用して
いる主なグループは、日本のOmura教授のグループ、米
国のEli Lilly CompanyのR.H. Baltsのグループ、お
よびRhone Poulenc Sante CompanyのA Sabatier博
士のグループである。
法、新規なマクロライドの発見およびハイブリッドマク
ロライドの生成について研究している(Omura、198
4)。Baltzのグループは特にチロシンおよびエリスロマ
イシンをそれぞれ生成するストレプトミセス・フラジア
エ(S. fradiae)およびストレプトミセス・エリスラ
エウス(S. erythraeus)について研究をしているが、
多くの分子クローン化実験においてストレプトミセス・
アンボファシエンスをホストとして使用している(Kuhs
tossおよびRao、1983;MatsuhimaおよびBaltz,1985)。
ミセス・アンボファシエンスの幾つかの株の研究によっ
て、特別なプラスミドの存在が検出された。このプラス
ミドはpSAM2である(「Plasmids in different stra
ins of Streptomyces ambofaciens: free and in
tegrated form of plasmid pSAM2」、Mol. Gen.Ge
net.、198、35〜41頁、1984年および「Excision and
integration of a self−transmissible replicon
of Streptomyces ambofaciens」、et Gene,59、13
7〜144頁、1987年)。
よび/または組込み状態で存在し、且つ1つの株から他
の株に転移することができると説明されている。受容体
株の染色体へのプラスミドpSAM2の組込み現象もまた実
証可能であると思われるが、この現象は現在のところ明
らかにされていない。
コードするDNA配列のクローン化および発現用ベクター
において、 att付加配列と、 上記株における機能性int配列をコードするDNA配列
と、 上記特定蛋白質をコードし、且つ上記株における上記
配列の発現を確実にする要素をコードするDNA配列とか
ら成るベクターに関する。
をコードし、または特に抗菌剤、防カビ剤、抗潰瘍剤お
よび酵素等の蛋白質のような上記二次代謝産物の生成を
促進する発現ベクターである。なお、上記二次代謝産物
は、放線菌株から既に得られており、または他の生物体
により生成することもできる。
特に挙げることができる。
する配列。
込み機構は、この種のヌクレオチド配列により特徴付け
られる付加配列を含むことが実証された。
されている。付加配列は第3図に呈示されている。この
配列は+24の位置から開始し、−24の位置で終わってい
る。0の位置におけるヌクレオチドは付加位置の中央に
対応する。
t配列をコードする配列を含む。この配列はインテグラ
ーゼをコードする配列であり、通常付加配列の上流に位
置するか、または付加配列の付近に位置する(第2図参
照)。int配列は組込み現象において重要な役割を演じ
る。
決定されており、この配列は第3図に示されている。in
t配列は+1261部位〜+97部位のDNA配列に対応する。こ
のint配列は、殆どの場合、切除部分をコードする遺伝
子であるxis配列の下流に位置するか、またはxis配列に
部分的に挟まれる。この遺伝子配列もまた第3図に示さ
れている。
って染色体に組込まれる。
は組込まれていまいと、自己複製可能なプラスミドの形
で1つのゲノムにつく多数のベクターコピーを得るため
には、pSAM2のEcoR I部位のNo.33の各側から600bpのフ
ラグメントを切除したベクター、即ちEcoR I部位のNo.3
3の各側に位置する2つの反復配列間のフラグメントか
ら600bpのフラグメントを本質的に切除したベクターに
再配列することが有益である(第1図参照)。さらに、
これらのベクターはintおよびxis遺伝子を有するフラグ
メントを含むことができる。
質を有している。
うに、細菌特に大腸菌からの要素を挿入することが好ま
しく、これによりベクターをこれら細菌に組込むことが
できる。しかしながら、放線菌株に利用する場合、大腸
菌に対応するこれらフラグメントは排除することができ
るはずである。菌体において使用可能な要素は公知であ
る。殆どの場合、これら要素はプラスミドを増殖し、機
能抵抗性を有する複製起源から成り、また必要に応じ
て、大腸菌への組込みを容易にする他の要素を含むこと
もできる。
列の発現を確実にする要素をコードするDNA配列は、ベ
クター内のさまざまな位置に挿入することができる。
る放線菌株を製造する場合、上記のようなベクターを使
用することが好ましく、且つ上記DNA配列はattおよびin
t配列以外の場所に組込まれる。この場合、染色体への
組込みは促進される。
まれる場合、上記DNA配列はint遺伝子に挿入される。
ことができないように構成する場合、特定の蛋白質をコ
ードするDNA配列は、形質転換した株の機能性転移要素
をコードする配列部分に挿入することができる。
物質に対する抵抗性をコードする配列が挙げられ、特に
チオストレプトンに対する抵抗性をコードする配列が挙
げられる。
識化遺伝子として使用することができる。この場合、他
の蛋白質を発現することが望まれるならば、他のクロー
ン化部位を設けることが必要である。このとは、例え
ば、多価ベクターによって、即ち上記ベクターの1つに
「ポリリンカー」配列を挿入することにより達成するこ
とができる。
部位の下流に位置することが好ましい。
遺伝子の下流に位置することが好ましく、この場合、得
られたベクターは組込みベクターとなる。特に好ましい
例は、下記実施例1に述べられるベクターpTS55であ
る。
は、「ポリリンカー」配列の部位を変更して、得られた
ベクターが1つの株から多の株に転移できないようにす
ることができる。
有益な蛋白質をコードする異種遺伝子の場合に特に有用
である。
ついては次の実施例で説明される。
int遺伝子内に配置させることもでき、この場合、得ら
れたベクターは受容体株の染色体に組込むことができな
い。その1つの例はベクターpTS13であり、この構造は
次の実施例で詳述される。
定性が高く且つ多くのホストに組込みが可能であるから
である。
保持するための所定の圧力は不必要である。
安定である。場合によって、組込まれたコピーは、遊離
のプラスミドを再生することのできるマトリックスを形
成することができる。
即ち第3図に示された部位+24〜−24のヌクレオチド配
列のすべて、または一部から成る配列を有する部位、こ
の部位を含むすべての株に組込むことができる。この部
位は、S. antibioticus (DSM 40868)、S. bikini
ensis (ATCC 11062)、S. parvulus (ATCC 1243
4)、S. glaucescens (ETH 22794)、S. actuosus
(ATCC 25421)、S. coelicolor (A3(2))、
S. ambofaciens.S. lividans TK64(66)およびS.
griseofuscus(DSM 40191)における+21〜−18の位置
のプローブでハイブリッド形成することによりすでに検
出されている。
即ち+21の位置におけるヌクレオチドはチミジン(T)
ではなくてアデニン(A)であることに注意すべきであ
る。
用性に対して影響を及ぼすことはない。
クレオチドの少なくとも50%は置換すべきではない。
蛋白質を生成する放線菌株の製造方法において、上記DN
A配列がattおよびint配列以外の部位に挿入され、好ま
しくはこのDNA配列が転移要素をコードする配列に挿入
される放線菌株の製造方法に関する。
スミドに組込まれたDNA配列の特定蛋白質を生成する放
線菌株の製造方法において、上記DNA配列がint遺伝子に
組込まれる放線菌株の製造方法に関する。
菌株、特にストレプトミセスに関する。本発明はまたこ
れら形質転換した株の工業的用途に係わり、また特に、
所望の培地で本発明の形質転換した株を発酵させ、特定
の蛋白質を回収することから成る特定蛋白質を製造する
方法に関する。
ることができる。
蛋白質に対して特別に適用することができる。特に、こ
の例としては、染色体に単一遺伝子の組込みを可能にす
るベクターpTS55がある。従って、形質転換した細胞1
個につきプラスミドの単一コピーが存在する。そのよう
なベクターは、蛋白質または工業的に有益な代謝産物の
生成に作用する調節遺伝子またはアミラーゼのような酵
素蛋白の発現に望ましいものである。
質の発現に大変望ましいものである。例えば、pSAM2のE
coR I−No.33の部位の各側を切除することにより得られ
るpTS13およびpTS12は、ストレプトミセスおよび特にス
トレプトミセス・リビダンスTK64に導入される時、多量
のコピーを生成する。コピーの数はゲノム1個当たり10
0以上である。
Laboratory Manual 1985)においてHopwoodにより
述べられたアルカリ化法に従って、プラスミドpSAM2
(第1図)をストレプトミセス・アンボファシエンス
(JI3212)から抽出し且つ精製した。
(kb:キロ塩基対)のフラグメントを単離し、プラスミ
ドpBR329のBamH I部位でクローン化し、プラスミドpOS2
10(第4図)を得た。
部位からEcoR I−No.33部位までのpSAM2のフラグメント
を含む7.25kbのフラグメントおよびプラスミドpBR329の
3.55kbのフラグメントBamH I−EcoR Iを単離し、それ自
身で閉環して、プラスミドpOS210A(第4図)を得た。
(azureus)の1.8kbのBamH Iフラグメントによってチオ
ストレプトンに対する抵抗性を与える遺伝子を含むプラ
スミドpBR322に対応する(Thompson C.J.;Ward J.M.;
Hopwood D.A.、Nature 286、525〜527頁、1980年)。
ンに対する抵抗性を有する1.8kbのフラグメントを単離
し、BamH Iで消化したpOS21OAと混合した(BamH IはpOS
21OAにおける特有な部位である)。
つ9.08kbの大きさを有する。このプラスミドをBamH Iで
部分的に消化し、9.08kbの線状プラスミドを単離した。
このプラスミドをポリメラーゼのクレノウ・フラグメン
トで処理し、次にそれ自身で閉環して、2つのBamH Iの
一方を除去した。
部位を有するプラスミドpTS54を得た(第5図)。
リゴヌクレオチドを、「応用バイオシステム」装置で合
成した。
オリゴヌクレオチドと混合し、ファージT4からのリガー
ゼにより結合した。
このプラスミドはクローン化に有用な次の独特な制限部
位を有している。即ち、Xba I、XhoI、Hind III、Kpn
I、Sac I、BamH IおよびSph I。
することにより大腸菌内に保持することができる。
R329を除去した。なぜならばこのプラスミドはストレプ
トミセスの染色体への組込みに対して必須のものではな
いからである。このようにして、ストレプトミセスのDN
Aのみを含むストレプトミセスの組込み形質転換物質を
得た。
ストレプトンまたはノシヘプチド(Nosiheptide)に対
する抵抗性を付与するものである。
R Iを有している。つぎに、Tth111−No.2の部位からBg
IIIおよびBamH Iの間に位置するプラスミドの組込み部
位までのヌクレオチド配列を得た(第2図参照)。この
配列は第3図に示されている。
は、染色体へのプラスミドの組込みに必要なインテグラ
ーゼに対応する。+1448部位から開始し+1247部位で終
わるコード化相は、xis遺伝子に対応する。
ラスミド(att)の組込み部位に対応する。ヌクレオチ
ド位置0は付加部位の中央に対応する。このヌクレオチ
ド位置は、「実験の手引き」に述べられた技術に従っ
て、形質転換によりストレプトミセスに導入することが
できる。上記ヌクレオチド位置は特に次の株に組込まれ
る: ストレプトミセス・アンボファシエンス ストレプトミセス・リビダンスTK64および ストレプトミセス・グリセオフカス(griseofuscu
s)。
位を有するあらゆる株に組込むことができる。この部位
は、第3図に述べられている+24〜−24の位置までのヌ
クレオチド配列と同様な配列を有するもの、またはこの
ヌクレオチド配列をすべて、または部分的に含むものと
定義することができる。この部位は、S. antibioticu
s、 S. bikiniensis、S. parvulus、S. actuosus、
S. coelicolor、S. gluacescensにおける+21の位置
から−18の位置までのプローブでのハイブリッド形成に
より検出された。
を組込むことができる。従って、1つの細胞に1つのコ
ピーのみが存在し、組込みが非常に安定で、このため組
込まれた遺伝子を保持するために所定の圧力を加える必
要がない。
プラスミドpSAM2をEcoR Iで部分的に消化し、11kbの直
線状プラスミドを単離し、プラスミドpIJ39(上記に説
明されている)のEcoR I部位においてクローン化した。
得られたプラスミドpTS39は、プラスミドpSAM2からEcoR
I−No.22の部位にクローン化したプラスミドpIJ39を含
む(制限地図pSAM2、第1図)。
異なる株に導入することができ、この場合、上記プラス
ミドは遊離の状態に保持され、且つチオストレプトンお
よびノシヘプチドに対する抵抗性を付与することにより
組込まれる。上記プラスミドは多くのホストに組込むこ
とができるベクターである。コピーの数は1つのゲノム
につき5〜20コピーである。
987年、137〜144頁に述べられている。pSAM2(第1図)
の0.88kb(BamH I−No.15〜21)および1.01kb(BamH I
−No.21〜27)の2つのフラグメントBamH Iを切除し、
且つチオストレプトンおよびノシヘプチドに対する抵抗
性を付与するストレプトミセス・アズレウスの1.79kbの
BamH Iフラグメントと置換した。
消化し、混合し、結合した。この結果プラスミドpOS11
を得た。このプラスミドはpSAM2のEcoR I−No.33の部位
にクローン化したpBR322を含んでいる。
ラスミドをストレプトミセス・リビダンスに導入し、こ
の場合、上記プラスミドはチオストレプトンおよびノシ
ヘプチドに対する抵抗性を付与する。
プラスミドpTS11(第8図)を抽出した。
らず、且つこのプラスミドからpSAM2のNo.33の部位に位
置する塩基の600対を切除した。Pvu II−No.1部位およ
びApal−No.1ビス部位は消失した(pSAM2の制限地図、
第1図参照)。
し、10.3kbの大きさを有するプラスミドを線状にした。
プラスミドの大きさを有するこの線状分子を単離した。
リゴヌクレオチドを合成した。
結合した。Bgl II−No.14に挿入したオリゴヌクレオチ
ドを有する形成プラスミドをpTS12と呼び(第11図)、
且つBg1 II−No.28部位に挿入したオリゴヌクレオチド
を有する形成プラスミドをpTS13と呼ぶ(第12図)。
する1.79kbのフラグメントBamH Iに接するBamH I部位
に、ポリリンカーを挿入することが可能である。
れたこれらベクターは、多量のコピーを形成する。なぜ
ならばこれらベクターはストレプトミセス、特にストレ
プト・リビダンスTK64に導入されているからである。コ
ピーの数は1つのゲノムにつき100以上である。
付与し、クローン化部位Hind III、Pst I、Sph I、Xba
I、Xho IおよびEcoR Iを有する。
唯一の複製開始部位を有する。
はや接合不可能である。
は、約10コピーから100コピー以上を形成する。
トレプトミセス・リモサス(limosus)のアルファ−ア
ミラーゼ遺伝子の発現形成法 抗生物質スペクチノマイシン(PrentkiおよびKirsh、
Gene29、303〜312頁、1984年)に対する抵抗性を付与す
るオメガ・インターポソン(Omega interposon)を、
第4図のプラスミドpOS210のEcoR I部位に挿入した。ス
トレプトミセス・リモサスのアルファ−アミラーゼの構
造遺伝子を有するフラグメント並びにプロモーター配列
(Long等、Jounal of bacteriology、169、5745〜575
4頁、1987年)(この遺伝子はCetus Companyの特許で
ある)を、得られたプラスミドのBamH I部位に挿入し
た。次に、組換えプラスミドを形成転換によりストレプ
トミセス・リビダンスに導入した。抗生物質スペクチノ
マイシンに対する抵抗性を与えるために選ばれた上記形
成形質変換物質は、非常に安定で、且つ組換えプラスミ
ドを組込み状態に保持するための所定圧力を必要とする
ことなしに、アルファーアミラーゼを生成する。
よびWild G.M.共著、「Biosynthesis of the macro
lide antibiotic tylosin a preferred pathway
from tylactone to tylosin」、J. of Antibiot
ics、36巻、2号、131〜141頁、1983年。
of Bacteriophage plaque formation in Strept
omyces ssp.」、J.Bact.、159巻、1984年。
P.、Escanes S.、Hofer S.、Voegeli P.およびThomp
son C.J.、「Synthesis of bovine growth by St
reptomyces lividans]、Gene、1124巻、21〜30頁、19
84年。
「Expression in Streptomyces ambofaciens of a
n Escherichia coli K−12 gene which confers
resistance to hygromycin」、B. Gene、26巻、29
5〜299頁、1983年。
icientplasmid transformation of Streptomyces a
mbofaciens and Streptomycesfradiae protoplast
s」、J. Bact、163巻、180〜185頁、1985年。
try,Biology and Practice」、Academic Press、198
4年。
nstruction and characterization of new clonin
g vehicles. VI. Plasmid pBR329、a new deriv
ative of pBR328 lacking the 482 base−pair
inverted dupication」、Gene17、79〜89頁、1982年。
限部位は1〜33の番号で表示され、最初がPvu II(No.
1)で、最後がEcoR I(No.33)である。 第2図は組込みに必要なpSAM2のフラグメントBamH I−E
coR Iの制限地図を示しており、このフラグメントはBam
H I−EcoR I部位で、BamH I−No.27部位からEcoR I−N
o.33部位に渡っている。 第3図(A)はpSAM2のTth111−No.2および組込み部位a
ttの間の領域の配列を示す。なお、pSAM2の制限部位は
第2図に示されている。従って、第3図(B)はプラス
ミドpSAM2のヌクレオチド配列を示しており、この配列
はTth111−No.2の下流から組込み部位(att)までの70
ヌクレオチドより決定され、ヌクレオチド0はatt媒質
に対応する。 第4図はpTS53の形成工程を図示する。 第5図はベクターpTS53の制限地図を示す。 第6図は組込みベクターpTS55の制限地図を示す。 第7図はpTS55を形成するためにpTS54に導入するオリゴ
ヌクレオチドの配列を示す。 第8図はpTS11の形成工程を図示する。 第9図はpTS12およびpTS13を形成するためにpTS11に導
入するオリゴヌクレオチドの配列を示す。 第10図はpTS11の制限地図を示す。 第11図は多数コピー形成プラスミドpTS12の制限地図を
示す。 第12図はプラスミドpTS13の制限地図を示す。
Claims (11)
- 【請求項1】クローン化及び発現用ベクターとして必要
なフラグメントをpSAMより単離し、前記フラグメントを
他のプラスミドに挿入して製造されたクローン化および
発現用ベクターであり、且つ放線菌株における特定の蛋
白質のDNA配列のクローン化および発現用ベクターであ
って、基本的に TTCTCTGTCGGGGTGGCGGGATTTGAACCCACGACCTCTTCGTCCCGAA
の配列を有するatt付加配列と、 上記株における機能性int配列をコードするDNA配列と、 上記特定蛋白質をコードし、且つ上記株における上記配
列の発現を確実にする要素をコードするDNA配列とから
なり、 前記attおよびintフラグメントがpSAM2フラグメントか
ら誘導されるものであることを特徴とするベクター。 - 【請求項2】attおよびintフラグメントが、EcoR I−N
o.33の部位の各側の約600bpから切除したpSAM2フラグメ
ントから誘導される請求項1に記載のベクター。 - 【請求項3】上記切除部分が、2つの繰り返し配列間の
フラグメントを保有する請求項2に記載のベクター。 - 【請求項4】上記株における機能性転移要素をさらに含
む請求項1〜3のいずれかに記載のベクター。 - 【請求項5】染色体に組込まれているDNA配列の特定の
蛋白質を生成する放線菌株の製造方法において、上記DN
A配列がattおよびint以外の部位に挿入されている請求
項1〜4のいずれかのベクターにより上記株を形質転換
することから成る放線菌株の製造方法。 - 【請求項6】上記ベクターが非転移性であり、上記蛋白
質をコードする上記DNA配列が、上記転移要素をコード
する配列に挿入される請求項5記載の方法。 - 【請求項7】染色体に部分的に組込み可能なプラスミド
である請求項1〜4のいずれかのベクターに組込まれて
いるDNA配列の特定の蛋白質を生成する放線菌株の製造
方法において、上記DNA配列がint遺伝子に組込まれる放
線菌株の製造方法。 - 【請求項8】特定の蛋白質をコードする配列が、チオス
トレプトンに対する抵抗性をコードする配列である請求
項5〜7のいずれかに記載の方法。 - 【請求項9】請求項5〜8のいずれかに記載の方法を使
用することにより得られる放線菌株。 - 【請求項10】ストレプトミセスの株である請求項9記
載の株。 - 【請求項11】特定の蛋白質を製造する方法において、
請求項9および10の一方の株を適切な培地で発酵させ、
特定の蛋白質を回収することから成る方法。
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