JP5809707B2 - Afmにより癌進行を病期分類する方法 - Google Patents
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Description
本発明の意味では、剛性または弾性は、作用力による変形に対する組織試料または組織の抵抗性を意味する。剛性または弾性は、組織試料の弾性率としてパスカル(Pa)単位で測定される。軟質組織試料は、低い剛性値を特徴とし、剛性組織は、高い剛性値を特徴とする。
− 少なくとも100μm、好ましくは50μm、20μm、10μm、または1μmの空間分解能で上記試料の複数の地点を測定することにより、上記腫瘍生検試料の複数の剛性値を決定するステップ、および
− 上記試料に悪性の確率を割り当てるステップ。
− ある区域の地点について上記腫瘍生検試料の複数の剛性値を決定し、前記地点が、少なくとも100μm、好ましくは10μmまたは1μmの空間分解能で、n1×n2地点(n1およびn2は、独立して1より大きな整数)のグリッドを形成するステップ、および
− 上記試料に悪性の確率を割り当てるステップ。
− 少なくとも100μm、好ましくは10μmまたは1μmの空間分解能で、上記試料の複数の地点を測定することにより、前記試料の複数の剛性値を決定すること、および
− 上記試料に悪性の確率を割り当てることを含み、
− 単峰型剛性分布を示す試料には、非悪性である高い確率が割り当てられ、
− 第1のピークが第2のピークよりも少なくとも2倍高い剛性値を示す少なくとも2峰型の剛性分布を示す試料には、悪性である高い確率が割り当てられる、ことを特徴とする方法が提供される。
− 1.1kPaと1.85kPaとの間に特徴付けられる剛性分布を示す試料には、正常乳腺組織である高い確率が割り当てられ、
− 1.9kPaと3.7kPaとの間に特徴付けられる剛性分布を示す試料には、良性病変である高い確率が割り当てられ、
− 0.31kPaと0.75kPaとの間のピークおよび1.2kPaより大きな値のピークに特徴付けられる剛性分布を示す試料には、悪性腫瘍である高い確率が割り当てられる。
− 少なくとも1mm、好ましくは100μm、10μm、または1μmの空間分解能で剛性値を決定するためのデバイス、
プログラムされたマイクロプロセッサーを含み、
上記プログラムされたマイクロプロセッサーが、本発明の上記の態様または実施形態による方法を実行するように装備および設定されているシステムを提供する。
物質および方法
MMTV−PyMTマウスに由来する乳腺および肺組織試料
PyMT導入遺伝子がヘテロ接合性である雌マウスを得るために、C3H/B6×FVB−C3H/B6バックグラウンドの雄PyMTマウスを、PyMT導入遺伝子を欠如するC3H/B6雌と無作為に交配させた。マウスを週2回触診して、乳腺腫瘍発症を評価した。腫瘍容積は、カリパスで測定した後、幅×長さ×0.4として算出した。マウスを、CO2吸入により安楽死させた。
腫瘍保持マウスに、0.9%無菌生理食塩溶液中100mg/mlのピモニダゾール塩酸塩(120mg/kg、hypoxyprobe−1、HPI)を腹腔内注射した。90分後、マウスを犠牲にし、上述のようなナノ力学的試験用に生検を採取した。その後、ピモニダゾール取込みの免疫組織化学的分析により、低酸素を評価した。
ヒト生検は、切除後、バーゼル大学産婦人科病院乳癌治療センター(Breast Treatment Center of the Basel University Women’s Hospital)から直接取得した。患者募集および剛性分析は、倫理的要件に従い、臨床データの事前の知識なしで実施した。顕著な病変を超音波誘導でコア生検して、およそ2mm直径の放射状で円筒状の0.2〜1cmの長さの標本を切除し、それを、直接、グルコースおよびプロテアーゼ阻害剤カクテル(完全)で補完した氷冷無菌リンゲル液を含有するバイアルに移した。マウス組織に関しては、生検後1時間以内にAFM検査を開始した。標本の機械的性質は、この期間中に変化しなかった。標本は、組織分解を最小限に抑えるために、AFM測定まで4℃に維持した。標本のAFM分析は、自己分解効果(つまり、組織自己分解)を回避するために、切除後3日以内に実施した。
自動レベル調整は、組織の天然凸凹を補正するためのデータを収集している間、特注のアルゴリズムセットにより制御した。各試料は、考え得る不均質性を把握するために、一方の端部からもう一方の端部まで系統的な様式で検査した。スキャン領域間では、およそ500μmの規則的距離を維持し、その際、2つのカンチレバー間の距離が基準の役目を果たした(図1)。これにより、生検全長に応じて1標本当たりおよそ10〜15枚のFV地図がもたらされた。マウス乳腺および肺から得られた標本が、ヒト生検のように円筒状でなかったことを考慮して、標本が全体的にカバーされることを保証するように、スキャン区域を選択した。
力圧入曲線は、以前に記載されている方法を使用して分析した(Oparicら、Biophysical Journal、98巻(11):2731〜40頁、2010年、Plodinecら、Journal of Structural Biology、174巻(3):476〜484頁、2011年)。手短に言えば、FVデータ自動分析法用のソフトウェアをLABVIEWで開発した。接触ポイントは、公開されているアルゴリズム(Linら、Journal of Biomechanical Engineering−Transactions of the Asme、129巻(6):904〜912頁、2007年)に基づいて、未処理の力曲線に多項式フィッティングを適用することにより決定した。圧電変位とカンチレバー反りとの差に相当する圧入hにより、およびカンチレバー反りdとばね定数kを積算して負荷Fを得ることにより、力曲線を得た。最大負荷F=1.8nNと0.9nNの最小負荷との間の剛性を規定する力曲線の上部50%に線形フィッティングを実施することにより、負荷除去力曲線を分析した。この手順により、粘着等の、力曲線に対する外部からの影響を回避できる。ポアソン比は、0.5に設定した。ヤング率は、OliverおよびPharr法(Oliverら、Journal of Materials Research、7巻(6)、1564〜1583頁、1992年)により決定した。傾き値を、Igor Pro 6.22を用いて空間的にプロットして、色分けされた剛性地図を得た。2Dの二次スプライン補間を2D剛性地図に実施して、データの視覚的表示を滑らかにした。
AFM後、試料を全て回収し、ホルマリン固着し、標準的な組織学的手順によりパラフィン包埋した。およそ5μm厚の切片を切断し、スライドガラスに移した。連続する切片の最初のスライドおよび最後のスライドを、ヘマトキシリン&エオシン(H&E)で通常通りに染色した。その後の病理組織検査は、病変のタイプ(浸潤性腺管癌、DCIS、線維腺腫等)および幾つかの標準組織病理学的マーカー(腫瘍浸潤、線維症、ネクローシス、およびリンパ球浸潤の程度)の評価を含んでいた。ヒト乳腺組織の残りのスライドの免疫組織化学的分析(IHC)には、以下の抗体を使用した:抗コラーゲンI(1:80;Biologo CO2111、USA)、抗ラミニン(1:25;Thermo RB−082−A、Thermo Scientific社、USA)、抗ビメンチン(希釈済み、Ventana 790−2917、Roche Diagnostics社、CH)、抗デスミン(希釈済み、Ventana 760−2513、Roche Diagnostics社、CH)。ラミニン、デスミン、およびビメンチンに関するマウス組織切片のIHC分析は、ヒト切片の場合と同じ様式で実施した。加えて、マウス切片を、抗β1インテグリン(1:50、Abcam社、ab52971、USA)および抗マウスコラーゲンI(1:800、Abcam社、ab34710、USA)で染色した。幾つか場合、抗原を回収するため、熱により、または10mM Tris緩衝液、1mM EDTA、pH9.0、およびクエン酸緩衝液pH6.0を用いて、切片を処理した。ヒト生検をコラーゲン染色するために、切片を、室温にて30分間ペプシンで前治療した。アビジン/ビオチンを使用して、一次抗体の非特異的結合をブロッキングした。免疫標識するために、切片を、10mM PBS、pH7.6、および0.1%アジ化ナトリウムで相応に希釈した100μlの抗体と共にインキュベートした。染色は、西洋ワサビペルオキシダーゼ(HRP)結合二次抗体(DakoCytomation社、デンマーク)で視覚化した。切片は、表示倍率にて正立光学顕微鏡(Carl Zeiss社、ドイツ)を用いて検査した。
本発明では、20人の異なる患者に由来する21個のヒト生検を分析した(表1を参照)。加えて、16匹のMMTV−PyMTマウスから得た32個の乳腺および6個の肺を分析した。6個の肺のうち3個は健康であり、3個は転移性病変を示していた。個々の剛性値は全て、OriginPro 8.5に集約し、各標本の剛性分布を得た(以降、全体ヒストグラムと規定する)。ビン幅は、乳腺標本の場合は全て200Pa、ネズミ肺の場合は500Paに設定した。計数を、1標本当たりのデータポイントの合計量に従って正規化した。データフィッティングは、最初にOrigin Proピーク分析アプリケーションソフトを使用して分布ピークを特定し、その後剛性分布に多重ピークフィッティングを適用することにより実施した。
MMTV−PyMTトランスジェニックマウスおよびヒト患者に由来する軟質乳房組織生検のナノ力学的特性を、生理学的緩衝液条件下でAFMにより評価した。AFM検査に使用される試料は、放射状で円筒状の生検の形状で乳腺から切除した(図1a)。典型的な円筒状の組織試料は、コアから末梢へと明確な配向性を示す。新鮮な組織試料を、図1dに示されているように配向された様式で、生体適合性接着剤を用いて固体テフロン支持体に安定的に付着させた。これらの試料では、3D組織完全性および不均質性は保存されており、標本全体にわたる対応する構造的およびナノ力学的情報は、AFMプローブに対しての2D平面に示されている(図2)。これにより、配向された様式でのナノ力学的反応の測定が可能になった。試料は、常にリンゲル液中で維持した。
ヒト乳癌のナノ力学的組織特性の診断および予後の可能性を解明するために、新鮮なヒト乳房生検のAFM剛性測定を実施した(図3)。
MMTV−PyMTトランスジェニックマウスの乳腺に由来する組織試料を、様々な腫瘍病期で切除して、腫瘍進行に関連するナノ力学的変化を評価した。AFM測定に由来する剛性値の頻度分布を示すヒストグラムは、図6aに示されている。正常マウス乳腺(n=3)のAFM測定は、弾性率E=1.28±0.12kPaを有する均質な(均一なガウシアン)剛性分布を明らかにした(図6a、最上段パネル)。標本の関連性組織学的検査は、低剛性値に寄与する可能性が最も高い多量の脂肪組織を有する正常健常乳腺組織の外観を確認した(図6b、最上段パネル)。前悪性病変(n=3)では、剛性分布は、より幅が広がっているものの、依然として単峰型ガウシアンであるが(図6a、中央パネル)、剛性は、E=4.38±0.55kPaに増加する。組織学的検査は、組織剛性の増加とよく関連する高密度に密集した過剰増殖する乳房上皮を明らかにした(図6b、中央パネル)。しかしながら、均一な剛性分布は、癌病変(n=8)では失われ、その代わり、上皮内癌腫は、2つの明確な機械的表現型を示す2峰型剛性分布を示す(図6a、最下段パネル)。腫瘍発生のこれら初期段階では、コア領域のE=0.54±0.13kPaは、良性病変より8倍低く、正常組織剛性より3倍低い。軟質コアは、E=16.97±6.89kPaの著しくより剛性の区域に囲まれている。上皮内癌の2峰型剛性分布は、腫瘍に2つの明確な細胞集団があることを示唆するが、組織切片の組織学的外観は、2峰型剛性分布に寄与する場合がある、癌細胞中の著しい形態学的差異を一切明らかにしない(図6b、最下部パネル)。上皮内癌では、個々の導管内の組織構造の喪失および癌細胞の存在を、はっきりと視認できる。しかしながら、癌細胞は、細胞学的に類似しているように見える。特筆すべきは、上皮内癌では、周囲間質は、筋上皮と比較して変化していないように見えることである。
非効率的な血管新生により引き起こされる腫瘍低酸素は、広範囲の固形腫瘍で記述されている。これは、放射線、化学療法、および手術後の予後不良と関連する。腫瘍の低酸素状態に対する関心は、低酸素が、細胞挙動を変更し、より悪性の腫瘍表現型をもたらす多数の遺伝子を制御するという発見と共に、更に大きくなっている。低酸素性コアは、侵襲性癌進行の重大な特徴として知られているため、原発性癌病変の末梢からコアに観察される2峰型剛性分布が、酸素供給低減と関連するか否かを検討した。病期分類された腫瘍試料にて低酸素と組織剛性とを直接的に関連させるため、MMTVPyMTマウスに、酸素欠乏細胞と選択的に結合するピモニダゾール剤を腫瘍切除に先立って注射した。その後、組織試料のナノ力学的特性をAFMにより検査し、後に、組織を低酸素評価のために処理した。免疫組織化学的染色は、正常腺および良性病変は低酸素に陰性であるが、原発性腫瘍は、剛性の著しい減少とよく関連する明白なコアの低酸素を示すことを明らかにした。
AFMを使用して、乳房組織をex vivoで生理学的緩衝液条件下にて検査した(図8)。特に、病態組織学的知見に対応するナノ力学的プロファイルを、正常生検、良性生検、および悪性生検で明らかにし、関連付けた(図8)。図8aは、正常乳腺組織の代表的なFV地図を示す。標本全体の全体ヒストグラムをプロットすると、1.13±0.78kPaの単峰型剛性分布が明らかになる(図8a、中央)。マッピングした標本のH&E染色切片の組織学的外観は、それらの円形核およびわずかに染色された細胞質により識別可能である2層の上皮細胞により区切られた健常導管(図8a、右)により規定される。良性線維腺腫病変は、3.68±1.92kPaの剛性増加を示す(図8b、中央)。剛性地図内のより軟質特徴(2kPa未満)は、線維性間質に埋め込まれている個々の線維芽細胞を画定すると考えられる(図8b、左)。これは、組織学的検査により検証され、そこでは、線維芽細胞が、良性病変内の多くを占める細胞タイプである(図8b、右)。それに比べて、癌生検は、典型的には、0.61±0.21kPa(「原発性」)および1.54±0.30kPa(「続発性」)の2つの顕著なピークを有する2峰型剛性分布を示す(図8c、中央)。2kPaより剛性の値では、分布は幅広くなり、それは、試料全体内の著しい不均質性を反映する。代表的なFV地図(図8c、左)は、多くを占める軟質ピークが、より剛性の間質に囲まれている癌細胞に典型的であることを明らかにする。H&E染色は、索状パターンで間質に浸潤する腫瘍細胞が多くを占めることを確認する(図8c、右)。
ヒト患者は遺伝的および疫学的に多様性であるため、MMTV−PyMTマウスモデルを、腫瘍進行および転移のナノ力学的足跡を系統的に解明するために選択した。病態組織学的分類によると、MMTV−PyMTの初期過形成は、正常ヒト乳腺であり、基底膜内に限定されている広範な上皮増殖は、ヒトの前悪性新生物に類似する。初期癌のその後の段階は、形態学的にヒト腺管上皮内癌と類似する。
次に、最も軟質な癌表現型と、遠位部位、特に肺に転移する能力との関連性を検討した。健常マウス肺は、多量のコラーゲンIVおよびラミニンを含有しており、したがって、乳腺と比較して、より剛性の表現型を示す。AFMは、拡張した肺胞および気管支構造ならびに血管で構成される健常肺組織(図15a、左、中央の代表的なAFM剛性地図、表3)の平均剛性値が、11.01±5.19kPaであることを明らかにした(図15a、右)。腫瘍進行の後期では、MMTV−PyMTマウスは、肺転移を発症する。それと一致して、後期癌病期のマウスに由来する肺の剛性測定は、健常肺には存在しない、0.61±0.41kPaの極めて軟質のピークを示す(P<0.0001)(図15b、左、灰色バー、中央の代表的なAFM剛性地図、表3)。AFM後の組織学的染色は、複数の転移性病変の存在を確認した。興味深いことには、健常肺と比較して、転移を囲む肺組織は、8.19±4.94kPaの平均剛性を有するより平坦な剛性分布を示した。進行腫瘍病期における広範な低酸素は、肺のコラーゲン架橋を変更する。おそらくは、転移肺のECMにおける変化が、転移に隣接する肺組織の剛性の局所的変動の原因である。
図16は、圧電素子1が、カンチレバー2に直接接続されている、本発明の実施形態を示す。圧電素子1が、第1の方向Rに沿って最大限に伸長し、カンチレバーのチップ21と試料4表面との間の接触が緩んだ場合、コントローラー31は、外部モーター3(アクチュエーター)を始動して、圧電素子1の所望の伸長が達成されるまで、カンチレバーのチップ21を第1の方向Rに沿って表面へと下降させる。圧電素子1が、最大限に収縮し、カンチレバーのチップ21が、望ましくない力で試料表面4に圧入される場合、コントローラー31は、外部モーター3を始動して、カンチレバー2を第1の方向Rに沿って上昇させ、圧電素子1の所望の伸長を回復させる。
図17は、圧電素子が、試料ホルダー41に直接接続されており、カンチレバー2が、カンチレバーホルダー25に直接接続されている、本発明の別の実施形態を示す。
図18は、第1の方向Rに沿った垂直圧電運動の模式図を示す。圧電素子は、最大伸長12および最大収縮11を特徴とする。これら2状態間に、至適動作範囲13および非至適動作範囲に分割できる圧電素子の動作範囲が存在する。第1の閾値15は、至適動作範囲13と非至適動作範囲14との間の、最大収縮11側の境界に位置している。第2の閾値16は、至適動作範囲13と非至適動作範囲14との間の、最大伸長12側の境界に位置している。
癌の複雑性は、疾患を検出および分析するためのバイオマーカーの向上を要求する。本発明は、ナノ力学的特性を、臨床設定に翻訳できる天然腫瘍組織の変化を感知および評価するための新規バイオマーカーとして使用するための重要な示唆を示す。
本発明のデータは、軟質表現型が、癌進行に重要な役割を果たすという証明を提供する。ヒト組織試料のナノ力学的特徴を、対応する病理組織学的診断と比較することにより、剛性領域に対する軟質領域の比率が高いことが、より侵襲性の表現型の指標であることが証明される。
1 圧電素子
11 最大収縮
12 最大伸長
13 至適動作範囲
14 非至適動作範囲
15 カンチレバーを上昇させるための閾値
16 カンチレバーを降下させるための閾値
2 カンチレバー
21 カンチレバーのチップ
22 レーザー
23 ミラー
24 フォトダイオード
25 カンチレバーホルダー
3 モーター
31 コントローラー
4 試料
41 試料ホルダー
R 第1の方向
Claims (14)
- 隣接する細胞と細胞外マトリックスとを有するとともに腫瘍から得られる組織生検試料を分類する方法であって、
少なくとも100μmの空間分解能で前記試料の複数の地点の剛性値を決定して剛性分布を取得する工程と、
前記試料に対し、悪性の確率を特定する工程と、
を備え、
第1のピークが第2のピークの2倍剛性値を有することにより特徴付けられた少なくとも2峰型剛性分布を示す試料に対し、悪性が高確率と特定し、
前記複数の地点はn1×n2地点(n1およびn2は2以上の独立した整数)の区域を規定するグリッドとして配置され、
前記組織生検試料は、前記腫瘍の少なくとも2分の1の断面を示し、前記腫瘍のコアから末梢への明確な配向性を示す円筒状またはプリズム状をなし、当該組織生検試料の長軸方向に沿って1mm、2mm、3mm、4mm、5mm、6mm、7mm、8mm、9mm、10mm、15mm、または20mmの距離にわたって当該組織生検試料の表面に前記n1×n2地点の区域が位置決めされる
ことを特徴とする方法。 - 当該方法によって、
同一の前記試料における、幾何学的中心間の距離が前記空間分解能の少なくとも10の倍数である少なくとも2つの異なる区域について、前記剛性値が決定される
ことを特徴とする請求項1に記載の方法。 - 単峰型剛性分布を示す試料に対し、非悪性が高確率と特定することを特徴とする請求項1または2に記載の方法。
- 前記組織生検試料は、7μm以下の直径を有する円筒状またはプリズム状の生検であることを特徴とする請求項1〜3のいずれか一項に記載の方法。
- 前記腫瘍は、ヒト乳癌、または、リンパ節転移、肺転移、硬骨転移、肝臓転移、もしくは脳転移であることを特徴とする請求項1〜4のいずれか一項に記載の方法。
- 前記剛性値は、生理学的条件下で決定されることを特徴とする請求項1〜5のいずれか一項に記載の方法。
- 乳腺組織生検試料の剛性を決定し、
1.1kPaと1.5kPaとの間のピークで特徴付けられる剛性分布を示す試料に対し、正常乳腺組織が高確率と特定し、
1.9kPaと3.7kPaとの間のピークで特徴付けられる剛性分布を示す試料に対し、良性病変が高確率と特定し、
0.31kPaと0.75kPaとの間のピークおよび1.2kPaより大きな値のピークで特徴付けられる剛性分布を示す試料に対し、悪性腫瘍が高確率と特定する
ことを特徴とする請求項1〜6のいずれか一項に記載の方法。 - 0.31kPaと0.75kPaとの間のピークおよび1.2kPaと2.0kPaとの間のピークで特徴付けられる剛性分布を示す試料に対し、悪性腫瘍が高確率と特定することを特徴とする請求項7に記載の方法。
- 前記試料(4)と相互作用するチップ(21)を有するプローブ(2)と、
前記試料(4)または前記プローブ(2)を保持するナノスキャナー(1)と、を備えて、
前記チップ(21)が前記試料(4)に向かって移動する第1の方向(R)に沿った前記ナノスキャナー(1)の伸長をモニターして、
前記ナノスキャナー(1)が閾値より小さいまたは閾値より大きい伸長を示すとき、前記第1の方向(R)に沿った前記プローブ(2)のレベルを追加アクチュエーター(3)により調整する
走査型プローブ顕微鏡によって、前記剛性値が決定されることを特徴とする請求項1〜8のいずれか一項に記載の方法。 - 前記調整は、前記プローブ(2)の下降もしくは上昇、または、前記試料(4)の下降もしくは上昇により実施されることを特徴とする請求項9に記載の方法。
- 前記レベルの調整は、前記ナノスキャナー(1)が最大伸長の20%より小さいまたは80%より大きい伸長を示すとき、実施されることを特徴とする請求項10に記載の方法。
- 前記レベルは、前記プローブ(2)または前記試料(4)を、前記ナノスキャナー(1)の最大伸長の10%〜30%だけ下降または上昇させることにより調整されることを特徴とする請求項10または11に記載の方法。
- 腫瘍組織生検試料を分類するシステムであって、
少なくとも1μmの分解能で剛性値を決定する原子間力顕微鏡たるデバイス(100)と、
プログラムされたマイクロプロセッサーと、を備え、
前記プログラムされたマイクロプロセッサーは、請求項1〜11のいずれか一項に記載の方法を実行するべく設けられ構成されている
ことを特徴とするシステム。 - 原子間力顕微鏡たる前記デバイス(100)は、
試料(4)と相互作用するチップ(21)を有し、前記チップ(21)を第1の方向(R)に沿って前記試料(4)に向けて移動させるプローブ(2)と、
前記試料(4)または前記プローブ(2)を保持するナノスキャナー(1)と、
前記第1の方向(R)に沿った前記ナノスキャナー(1)の伸長をモニターするための手段と、
前記プローブ(2)のレベルを前記第1の方向(R)に沿って調整するアクチュエーター(3)と、
前記アクチュエーター(3)を制御するコントローラー(31)と、
を備え、
前記コントローラー(31)は、前記ナノスキャナー(1)が閾値より小さいまたは大きい伸長を示すとき、前記プローブ(2)の前記レベルを調整するべく前記アクチュエーター(3)を制御する
ことを特徴とする請求項13に記載のシステム。
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