JP6432962B2 - 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 - Google Patents
腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 Download PDFInfo
- Publication number
- JP6432962B2 JP6432962B2 JP2018508107A JP2018508107A JP6432962B2 JP 6432962 B2 JP6432962 B2 JP 6432962B2 JP 2018508107 A JP2018508107 A JP 2018508107A JP 2018508107 A JP2018508107 A JP 2018508107A JP 6432962 B2 JP6432962 B2 JP 6432962B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- renal function
- group
- test substance
- disease
- test
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 208000020832 chronic kidney disease Diseases 0.000 title claims description 505
- 230000003907 kidney function Effects 0.000 title claims description 451
- 239000000126 substance Substances 0.000 title claims description 392
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 title claims description 367
- 201000010099 disease Diseases 0.000 title claims description 366
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 282
- 208000022831 chronic renal failure syndrome Diseases 0.000 title claims description 228
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 title claims description 190
- 238000012216 screening Methods 0.000 title claims description 168
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 title claims description 103
- 238000012360 testing method Methods 0.000 claims description 484
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims description 364
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims description 255
- 239000003550 marker Substances 0.000 claims description 213
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 claims description 197
- 238000005259 measurement Methods 0.000 claims description 166
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 claims description 163
- 230000006870 function Effects 0.000 claims description 147
- 238000011156 evaluation Methods 0.000 claims description 144
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 118
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 claims description 116
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 80
- 241000282414 Homo sapiens Species 0.000 claims description 68
- 101100188850 Mus musculus Oscar gene Proteins 0.000 claims description 68
- 238000012545 processing Methods 0.000 claims description 67
- 241000501754 Astronotus ocellatus Species 0.000 claims description 43
- 101001051973 Homo sapiens Fibroblast growth factor 23 Proteins 0.000 claims description 43
- 102100024802 Fibroblast growth factor 23 Human genes 0.000 claims description 34
- 101150063735 DNASE1 gene Proteins 0.000 claims description 31
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 claims description 30
- 210000003625 skull Anatomy 0.000 claims description 26
- 101150063837 Aplnr gene Proteins 0.000 claims description 23
- 102100037084 C4b-binding protein alpha chain Human genes 0.000 claims description 23
- 108010002069 Defensins Proteins 0.000 claims description 23
- 102000000541 Defensins Human genes 0.000 claims description 23
- 101150095230 SLC7A8 gene Proteins 0.000 claims description 23
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 claims description 23
- 239000008280 blood Substances 0.000 claims description 23
- 230000008520 organization Effects 0.000 claims description 23
- XJOTXKZIRSHZQV-RXHOOSIZSA-N (3S)-3-amino-4-[[(2S,3R)-1-[[(2S)-1-[[(2S)-1-[(2S)-2-[[(2S,3S)-1-[[(1R,6R,12R,17R,20S,23S,26R,31R,34R,39R,42S,45S,48S,51S,59S)-51-(4-aminobutyl)-31-[[(2S)-6-amino-1-[[(1S,2R)-1-carboxy-2-hydroxypropyl]amino]-1-oxohexan-2-yl]carbamoyl]-20-benzyl-23-[(2S)-butan-2-yl]-45-(3-carbamimidamidopropyl)-48-(hydroxymethyl)-42-(1H-imidazol-4-ylmethyl)-59-(2-methylsulfanylethyl)-7,10,19,22,25,33,40,43,46,49,52,54,57,60,63,64-hexadecaoxo-3,4,14,15,28,29,36,37-octathia-8,11,18,21,24,32,41,44,47,50,53,55,58,61,62,65-hexadecazatetracyclo[32.19.8.26,17.212,39]pentahexacontan-26-yl]amino]-3-methyl-1-oxopentan-2-yl]carbamoyl]pyrrolidin-1-yl]-1-oxo-3-phenylpropan-2-yl]amino]-3-(1H-imidazol-4-yl)-1-oxopropan-2-yl]amino]-3-hydroxy-1-oxobutan-2-yl]amino]-4-oxobutanoic acid Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](Cc1ccccc1)NC(=O)[C@H](Cc1cnc[nH]1)NC(=O)[C@@H](NC(=O)[C@@H](N)CC(O)=O)[C@@H](C)O)C(=O)N[C@H]1CSSC[C@H](NC(=O)[C@@H]2CSSC[C@@H]3NC(=O)[C@@H]4CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](Cc5ccccc5)NC(=O)[C@@H](NC1=O)[C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CSSC[C@H](NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@H](CO)NC(=O)[C@H](CCCNC(N)=N)NC(=O)[C@H](Cc1cnc[nH]1)NC3=O)C(=O)NCC(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N2)C(=O)NCC(=O)N4)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XJOTXKZIRSHZQV-RXHOOSIZSA-N 0.000 claims description 22
- 101150058497 ANPEP gene Proteins 0.000 claims description 22
- 101100338765 Danio rerio hamp2 gene Proteins 0.000 claims description 22
- 101150043052 Hamp gene Proteins 0.000 claims description 22
- 101710136733 Proline-rich protein Proteins 0.000 claims description 22
- 101150110435 Slco1a1 gene Proteins 0.000 claims description 22
- 101710168942 Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 Proteins 0.000 claims description 22
- 102100030684 Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1 Human genes 0.000 claims description 22
- 102000018511 hepcidin Human genes 0.000 claims description 22
- 108060003558 hepcidin Proteins 0.000 claims description 22
- 229940066919 hepcidin Drugs 0.000 claims description 22
- 241000282412 Homo Species 0.000 claims description 20
- -1 Oskar Proteins 0.000 claims description 10
- 210000003405 ileum Anatomy 0.000 claims description 8
- 210000001630 jejunum Anatomy 0.000 claims description 8
- 210000001913 submandibular gland Anatomy 0.000 claims description 7
- 210000000056 organ Anatomy 0.000 description 555
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 149
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 113
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 description 87
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 87
- OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N Phosphorus Chemical compound [P] OAICVXFJPJFONN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 84
- 230000037213 diet Effects 0.000 description 61
- 235000005911 diet Nutrition 0.000 description 60
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 53
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 50
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 description 48
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 46
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 38
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 description 37
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 37
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 33
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 31
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 30
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 28
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 28
- 238000003559 RNA-seq method Methods 0.000 description 24
- 108020001507 fusion proteins Proteins 0.000 description 24
- 102000037865 fusion proteins Human genes 0.000 description 24
- 208000001647 Renal Insufficiency Diseases 0.000 description 20
- 201000006370 kidney failure Diseases 0.000 description 20
- 210000002381 plasma Anatomy 0.000 description 19
- FBPFZTCFMRRESA-ZXXMMSQZSA-N D-iditol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-ZXXMMSQZSA-N 0.000 description 18
- 102000008946 Fibrinogen Human genes 0.000 description 18
- 108010049003 Fibrinogen Proteins 0.000 description 18
- DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N creatinine Chemical compound CN1CC(=O)NC1=N DDRJAANPRJIHGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 18
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 18
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 18
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 18
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 17
- 210000000577 adipose tissue Anatomy 0.000 description 16
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 16
- 210000003491 skin Anatomy 0.000 description 15
- IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N Atomic nitrogen Chemical compound N#N IJGRMHOSHXDMSA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 14
- 238000011529 RT qPCR Methods 0.000 description 14
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 14
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 13
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 description 12
- 235000021590 normal diet Nutrition 0.000 description 12
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 11
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 11
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 description 11
- 208000017169 kidney disease Diseases 0.000 description 11
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 11
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 11
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 10
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 10
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 10
- 210000000988 bone and bone Anatomy 0.000 description 10
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 10
- 238000001262 western blot Methods 0.000 description 10
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 9
- 210000001124 body fluid Anatomy 0.000 description 9
- 229940109239 creatinine Drugs 0.000 description 9
- 238000002493 microarray Methods 0.000 description 9
- 210000003681 parotid gland Anatomy 0.000 description 9
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 9
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 8
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 8
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 8
- 239000010839 body fluid Substances 0.000 description 8
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 8
- 230000008859 change Effects 0.000 description 8
- 238000001914 filtration Methods 0.000 description 8
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 8
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 description 8
- 238000003753 real-time PCR Methods 0.000 description 8
- 238000010839 reverse transcription Methods 0.000 description 8
- 238000003757 reverse transcription PCR Methods 0.000 description 8
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 8
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 8
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 7
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 7
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 7
- 210000002216 heart Anatomy 0.000 description 7
- 210000004185 liver Anatomy 0.000 description 7
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 7
- 238000010172 mouse model Methods 0.000 description 7
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 description 7
- 210000002027 skeletal muscle Anatomy 0.000 description 7
- 210000000952 spleen Anatomy 0.000 description 7
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 description 7
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 7
- 238000005406 washing Methods 0.000 description 7
- 108091033409 CRISPR Proteins 0.000 description 6
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 6
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 6
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 6
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 6
- 238000002123 RNA extraction Methods 0.000 description 6
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 6
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 6
- 239000002299 complementary DNA Substances 0.000 description 6
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 6
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 6
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 6
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 6
- 210000003296 saliva Anatomy 0.000 description 6
- 210000001550 testis Anatomy 0.000 description 6
- 210000001685 thyroid gland Anatomy 0.000 description 6
- 238000001890 transfection Methods 0.000 description 6
- 206010062767 Hypophysitis Diseases 0.000 description 5
- 230000005856 abnormality Effects 0.000 description 5
- 210000004100 adrenal gland Anatomy 0.000 description 5
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 5
- 239000000090 biomarker Substances 0.000 description 5
- 238000010804 cDNA synthesis Methods 0.000 description 5
- 230000006866 deterioration Effects 0.000 description 5
- 239000007850 fluorescent dye Substances 0.000 description 5
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 5
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 5
- 239000002504 physiological saline solution Substances 0.000 description 5
- 210000003635 pituitary gland Anatomy 0.000 description 5
- 238000011002 quantification Methods 0.000 description 5
- 210000002784 stomach Anatomy 0.000 description 5
- 210000001541 thymus gland Anatomy 0.000 description 5
- 210000000626 ureter Anatomy 0.000 description 5
- 108700039887 Essential Genes Proteins 0.000 description 4
- 108020005004 Guide RNA Proteins 0.000 description 4
- 101000907912 Homo sapiens Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 Proteins 0.000 description 4
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 4
- 101100521367 Mus musculus Prp2 gene Proteins 0.000 description 4
- 102100023390 Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16 Human genes 0.000 description 4
- MCMNRKCIXSYSNV-UHFFFAOYSA-N Zirconium dioxide Chemical compound O=[Zr]=O MCMNRKCIXSYSNV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 210000001015 abdomen Anatomy 0.000 description 4
- 210000000709 aorta Anatomy 0.000 description 4
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 4
- 238000004140 cleaning Methods 0.000 description 4
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 4
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 4
- 210000004209 hair Anatomy 0.000 description 4
- 238000007912 intraperitoneal administration Methods 0.000 description 4
- 239000004973 liquid crystal related substance Substances 0.000 description 4
- 101150052159 maeA gene Proteins 0.000 description 4
- 238000000691 measurement method Methods 0.000 description 4
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 4
- 239000013641 positive control Substances 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 210000002254 renal artery Anatomy 0.000 description 4
- 210000002796 renal vein Anatomy 0.000 description 4
- 210000003079 salivary gland Anatomy 0.000 description 4
- 230000028327 secretion Effects 0.000 description 4
- 210000004243 sweat Anatomy 0.000 description 4
- YFDSDPIBEUFTMI-UHFFFAOYSA-N tribromoethanol Chemical compound OCC(Br)(Br)Br YFDSDPIBEUFTMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 229950004616 tribromoethanol Drugs 0.000 description 4
- 230000002485 urinary effect Effects 0.000 description 4
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 3
- 102000002260 Alkaline Phosphatase Human genes 0.000 description 3
- 108020004774 Alkaline Phosphatase Proteins 0.000 description 3
- 206010002091 Anaesthesia Diseases 0.000 description 3
- 241000283690 Bos taurus Species 0.000 description 3
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 3
- 101150070116 FGG gene Proteins 0.000 description 3
- 206010016654 Fibrosis Diseases 0.000 description 3
- 108010043121 Green Fluorescent Proteins Proteins 0.000 description 3
- 102000004144 Green Fluorescent Proteins Human genes 0.000 description 3
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 3
- 108700011259 MicroRNAs Proteins 0.000 description 3
- 101150057301 PRP gene Proteins 0.000 description 3
- 102000003992 Peroxidases Human genes 0.000 description 3
- 108091034057 RNA (poly(A)) Proteins 0.000 description 3
- 238000011530 RNeasy Mini Kit Methods 0.000 description 3
- 238000000692 Student's t-test Methods 0.000 description 3
- 241000282887 Suidae Species 0.000 description 3
- 108020004417 Untranslated RNA Proteins 0.000 description 3
- 102000039634 Untranslated RNA Human genes 0.000 description 3
- 230000037005 anaesthesia Effects 0.000 description 3
- 102000015736 beta 2-Microglobulin Human genes 0.000 description 3
- 108010081355 beta 2-Microglobulin Proteins 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 210000001185 bone marrow Anatomy 0.000 description 3
- 210000004720 cerebrum Anatomy 0.000 description 3
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 3
- 206010012601 diabetes mellitus Diseases 0.000 description 3
- 238000002405 diagnostic procedure Methods 0.000 description 3
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 3
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 3
- 238000010195 expression analysis Methods 0.000 description 3
- 230000004761 fibrosis Effects 0.000 description 3
- 239000005090 green fluorescent protein Substances 0.000 description 3
- 230000036541 health Effects 0.000 description 3
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 3
- 238000007689 inspection Methods 0.000 description 3
- 210000002429 large intestine Anatomy 0.000 description 3
- 239000002679 microRNA Substances 0.000 description 3
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 3
- 238000013059 nephrectomy Methods 0.000 description 3
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 3
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 3
- 108040007629 peroxidase activity proteins Proteins 0.000 description 3
- 239000000047 product Substances 0.000 description 3
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 3
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 3
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 3
- QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-L (5-bromo-4-chloro-1h-indol-3-yl) phosphate Chemical compound C1=C(Br)C(Cl)=C2C(OP([O-])(=O)[O-])=CNC2=C1 QRXMUCSWCMTJGU-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 2
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 206010003445 Ascites Diseases 0.000 description 2
- 238000010354 CRISPR gene editing Methods 0.000 description 2
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091026890 Coding region Proteins 0.000 description 2
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108090000569 Fibroblast Growth Factor-23 Proteins 0.000 description 2
- 102100031181 Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Human genes 0.000 description 2
- 229930186217 Glycolipid Natural products 0.000 description 2
- 102000003886 Glycoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108090000288 Glycoproteins Proteins 0.000 description 2
- 101000740685 Homo sapiens C4b-binding protein alpha chain Proteins 0.000 description 2
- 101001090065 Homo sapiens Peroxiredoxin-2 Proteins 0.000 description 2
- 101100387152 Mus musculus Defb19 gene Proteins 0.000 description 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 239000012807 PCR reagent Substances 0.000 description 2
- 241001494479 Pecora Species 0.000 description 2
- 208000002151 Pleural effusion Diseases 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- 239000004793 Polystyrene Substances 0.000 description 2
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 2
- CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N SYBR Green I Chemical compound CN(C)CCCN(CCC)C1=CC(C=C2N(C3=CC=CC=C3S2)C)=C2C=CC=CC2=[N+]1C1=CC=CC=C1 CGNLCCVKSWNSDG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000007984 Tris EDTA buffer Substances 0.000 description 2
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 2
- 239000003463 adsorbent Substances 0.000 description 2
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 2
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 2
- 230000036772 blood pressure Effects 0.000 description 2
- 230000004097 bone metabolism Effects 0.000 description 2
- 210000005252 bulbus oculi Anatomy 0.000 description 2
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 2
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 2
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 2
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 description 2
- 238000005119 centrifugation Methods 0.000 description 2
- 239000012228 culture supernatant Substances 0.000 description 2
- DIOQZVSQGTUSAI-UHFFFAOYSA-N decane Chemical compound CCCCCCCCCC DIOQZVSQGTUSAI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000013461 design Methods 0.000 description 2
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 2
- 235000013601 eggs Nutrition 0.000 description 2
- 230000002124 endocrine Effects 0.000 description 2
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 2
- 239000013604 expression vector Substances 0.000 description 2
- 210000003754 fetus Anatomy 0.000 description 2
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 2
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 2
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 2
- 108020004445 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Proteins 0.000 description 2
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 2
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 2
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 2
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 2
- 230000008595 infiltration Effects 0.000 description 2
- 238000001764 infiltration Methods 0.000 description 2
- 230000010365 information processing Effects 0.000 description 2
- 230000009545 invasion Effects 0.000 description 2
- 238000011862 kidney biopsy Methods 0.000 description 2
- 150000002632 lipids Chemical class 0.000 description 2
- 238000011068 loading method Methods 0.000 description 2
- 238000004020 luminiscence type Methods 0.000 description 2
- 239000000463 material Substances 0.000 description 2
- 239000002207 metabolite Substances 0.000 description 2
- 238000010208 microarray analysis Methods 0.000 description 2
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 2
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 2
- 210000003205 muscle Anatomy 0.000 description 2
- 238000001543 one-way ANOVA Methods 0.000 description 2
- 210000003101 oviduct Anatomy 0.000 description 2
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 2
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 2
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 229920002223 polystyrene Polymers 0.000 description 2
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 description 2
- 238000002331 protein detection Methods 0.000 description 2
- 230000000384 rearing effect Effects 0.000 description 2
- 238000011084 recovery Methods 0.000 description 2
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 2
- 230000008439 repair process Effects 0.000 description 2
- 230000001850 reproductive effect Effects 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 2
- 239000012089 stop solution Substances 0.000 description 2
- 238000013513 substance screening Methods 0.000 description 2
- CCEKAJIANROZEO-UHFFFAOYSA-N sulfluramid Chemical group CCNS(=O)(=O)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)C(F)(F)F CCEKAJIANROZEO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 2
- 210000001138 tear Anatomy 0.000 description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 description 2
- 239000012096 transfection reagent Substances 0.000 description 2
- 238000002562 urinalysis Methods 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- INAPMGSXUVUWAF-PTQMNWPWSA-N 1D-myo-inositol 3-phosphate Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@H](O)[C@H](OP(O)(O)=O)[C@@H](O)[C@@H]1O INAPMGSXUVUWAF-PTQMNWPWSA-N 0.000 description 1
- ZOOGRGPOEVQQDX-UUOKFMHZSA-N 3',5'-cyclic GMP Chemical compound C([C@H]1O2)OP(O)(=O)O[C@H]1[C@@H](O)[C@@H]2N1C(N=C(NC2=O)N)=C2N=C1 ZOOGRGPOEVQQDX-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 4-Nitrophenyl Phosphate Chemical compound OP(O)(=O)OC1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 XZKIHKMTEMTJQX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YRNWIFYIFSBPAU-UHFFFAOYSA-N 4-[4-(dimethylamino)phenyl]-n,n-dimethylaniline Chemical compound C1=CC(N(C)C)=CC=C1C1=CC=C(N(C)C)C=C1 YRNWIFYIFSBPAU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000007469 Actins Human genes 0.000 description 1
- 108010085238 Actins Proteins 0.000 description 1
- 229920000936 Agarose Polymers 0.000 description 1
- 206010001580 Albuminuria Diseases 0.000 description 1
- 239000012099 Alexa Fluor family Substances 0.000 description 1
- 241000271566 Aves Species 0.000 description 1
- 208000003174 Brain Neoplasms Diseases 0.000 description 1
- 208000014644 Brain disease Diseases 0.000 description 1
- 102100021943 C-C motif chemokine 2 Human genes 0.000 description 1
- 101710155857 C-C motif chemokine 2 Proteins 0.000 description 1
- 241000282693 Cercopithecidae Species 0.000 description 1
- 102000019034 Chemokines Human genes 0.000 description 1
- 108010012236 Chemokines Proteins 0.000 description 1
- 241000725101 Clea Species 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- 102000012192 Cystatin C Human genes 0.000 description 1
- 108010061642 Cystatin C Proteins 0.000 description 1
- 208000026292 Cystic Kidney disease Diseases 0.000 description 1
- 101150114387 DEFB1 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150003873 DEFB10 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150002560 Defb12 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150052772 Defb14 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150114952 Defb15 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150041732 Defb18 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150043957 Defb20 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150028559 Defb25 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150017959 Defb29 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150078094 Defb30 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150048530 Defb39 gene Proteins 0.000 description 1
- 101150044438 Defb43 gene Proteins 0.000 description 1
- 238000008157 ELISA kit Methods 0.000 description 1
- 206010015548 Euthanasia Diseases 0.000 description 1
- 108090000331 Firefly luciferases Proteins 0.000 description 1
- 239000012739 FreeStyle 293 Expression medium Substances 0.000 description 1
- 241000287828 Gallus gallus Species 0.000 description 1
- 206010018364 Glomerulonephritis Diseases 0.000 description 1
- 206010020772 Hypertension Diseases 0.000 description 1
- 208000019025 Hypokalemia Diseases 0.000 description 1
- 206010061218 Inflammation Diseases 0.000 description 1
- 108010002352 Interleukin-1 Proteins 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N L-leucine Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N Leucine Natural products CC(C)CC(N)C(O)=O ROHFNLRQFUQHCH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090001030 Lipoproteins Proteins 0.000 description 1
- 102000004895 Lipoproteins Human genes 0.000 description 1
- 206010067125 Liver injury Diseases 0.000 description 1
- 206010027476 Metastases Diseases 0.000 description 1
- 206010027525 Microalbuminuria Diseases 0.000 description 1
- 101000869869 Mus musculus Beta-defensin 22 Proteins 0.000 description 1
- 101100063264 Mus musculus Defb35 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100063266 Mus musculus Defb37 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100063272 Mus musculus Defb41 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100063273 Mus musculus Defb42 gene Proteins 0.000 description 1
- 101100063280 Mus musculus Defb50 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 208000032366 Oversensing Diseases 0.000 description 1
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 1
- 239000004698 Polyethylene Substances 0.000 description 1
- 239000004743 Polypropylene Substances 0.000 description 1
- 208000004880 Polyuria Diseases 0.000 description 1
- 239000013614 RNA sample Substances 0.000 description 1
- 101100386928 Rattus norvegicus Defb4 gene Proteins 0.000 description 1
- 206010061481 Renal injury Diseases 0.000 description 1
- 208000027032 Renal vascular disease Diseases 0.000 description 1
- 108010052090 Renilla Luciferases Proteins 0.000 description 1
- 108700008625 Reporter Genes Proteins 0.000 description 1
- MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N Serine Natural products OCC(N)C(O)=O MTCFGRXMJLQNBG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 208000000223 Solitary Kidney Diseases 0.000 description 1
- 206010000196 Urinary abnormalities Diseases 0.000 description 1
- 208000012931 Urologic disease Diseases 0.000 description 1
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- HVQBXHLQJMXLLY-UHFFFAOYSA-L [Na+].[Na+].P(=O)(OC=1NC2=CC(=CC=C2C1Br)Cl)([O-])[O-] Chemical compound [Na+].[Na+].P(=O)(OC=1NC2=CC(=CC=C2C1Br)Cl)([O-])[O-] HVQBXHLQJMXLLY-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 230000007495 abnormal renal function Effects 0.000 description 1
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003213 activating effect Effects 0.000 description 1
- 239000000654 additive Substances 0.000 description 1
- 229940035676 analgesics Drugs 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 1
- 239000000730 antalgic agent Substances 0.000 description 1
- 210000000436 anus Anatomy 0.000 description 1
- 229940064452 artec Drugs 0.000 description 1
- 210000001367 artery Anatomy 0.000 description 1
- 238000013528 artificial neural network Methods 0.000 description 1
- 210000001815 ascending colon Anatomy 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- 210000000467 autonomic pathway Anatomy 0.000 description 1
- LFYJSSARVMHQJB-QIXNEVBVSA-N bakuchiol Chemical compound CC(C)=CCC[C@@](C)(C=C)\C=C\C1=CC=C(O)C=C1 LFYJSSARVMHQJB-QIXNEVBVSA-N 0.000 description 1
- 102000005936 beta-Galactosidase Human genes 0.000 description 1
- 108010005774 beta-Galactosidase Proteins 0.000 description 1
- 210000000941 bile Anatomy 0.000 description 1
- 210000000013 bile duct Anatomy 0.000 description 1
- 210000003445 biliary tract Anatomy 0.000 description 1
- 238000010876 biochemical test Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- 230000005540 biological transmission Effects 0.000 description 1
- 238000001574 biopsy Methods 0.000 description 1
- 230000017531 blood circulation Effects 0.000 description 1
- 239000012503 blood component Substances 0.000 description 1
- 238000009534 blood test Methods 0.000 description 1
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 1
- 210000002798 bone marrow cell Anatomy 0.000 description 1
- 210000000133 brain stem Anatomy 0.000 description 1
- 210000000481 breast Anatomy 0.000 description 1
- 210000000621 bronchi Anatomy 0.000 description 1
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 1
- 230000002308 calcification Effects 0.000 description 1
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 210000000845 cartilage Anatomy 0.000 description 1
- 210000004534 cecum Anatomy 0.000 description 1
- 210000001638 cerebellum Anatomy 0.000 description 1
- 235000013330 chicken meat Nutrition 0.000 description 1
- 239000003593 chromogenic compound Substances 0.000 description 1
- 230000002759 chromosomal effect Effects 0.000 description 1
- 239000007979 citrate buffer Substances 0.000 description 1
- 238000009535 clinical urine test Methods 0.000 description 1
- 210000003477 cochlea Anatomy 0.000 description 1
- 238000004040 coloring Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 238000012790 confirmation Methods 0.000 description 1
- 210000002808 connective tissue Anatomy 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000030609 dephosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006209 dephosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000188 diaphragm Anatomy 0.000 description 1
- 235000020805 dietary restrictions Nutrition 0.000 description 1
- 210000002249 digestive system Anatomy 0.000 description 1
- 239000012470 diluted sample Substances 0.000 description 1
- UKWLRLAKGMZXJC-QIECWBMSSA-L disodium;[4-chloro-3-[(3r,5s)-1-chloro-3'-methoxyspiro[adamantane-4,4'-dioxetane]-3'-yl]phenyl] phosphate Chemical group [Na+].[Na+].O1OC2([C@@H]3CC4C[C@H]2CC(Cl)(C4)C3)C1(OC)C1=CC(OP([O-])([O-])=O)=CC=C1Cl UKWLRLAKGMZXJC-QIECWBMSSA-L 0.000 description 1
- TYJOJLOWRIQYQM-UHFFFAOYSA-L disodium;phenyl phosphate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]P([O-])(=O)OC1=CC=CC=C1 TYJOJLOWRIQYQM-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 1
- 238000002224 dissection Methods 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 210000001198 duodenum Anatomy 0.000 description 1
- 210000000883 ear external Anatomy 0.000 description 1
- 210000003027 ear inner Anatomy 0.000 description 1
- 210000000959 ear middle Anatomy 0.000 description 1
- 239000003792 electrolyte Substances 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 208000028208 end stage renal disease Diseases 0.000 description 1
- 201000000523 end stage renal failure Diseases 0.000 description 1
- 238000010201 enrichment analysis Methods 0.000 description 1
- 238000006911 enzymatic reaction Methods 0.000 description 1
- 210000000918 epididymis Anatomy 0.000 description 1
- 201000010063 epididymitis Diseases 0.000 description 1
- 210000003238 esophagus Anatomy 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 239000013613 expression plasmid Substances 0.000 description 1
- 210000001508 eye Anatomy 0.000 description 1
- 210000000744 eyelid Anatomy 0.000 description 1
- 208000000283 familial pityriasis rubra pilaris Diseases 0.000 description 1
- 108091006047 fluorescent proteins Proteins 0.000 description 1
- 102000034287 fluorescent proteins Human genes 0.000 description 1
- 238000013277 forecasting method Methods 0.000 description 1
- 230000008014 freezing Effects 0.000 description 1
- 238000007710 freezing Methods 0.000 description 1
- 230000008717 functional decline Effects 0.000 description 1
- 210000000232 gallbladder Anatomy 0.000 description 1
- 230000002496 gastric effect Effects 0.000 description 1
- 210000004051 gastric juice Anatomy 0.000 description 1
- 238000010353 genetic engineering Methods 0.000 description 1
- 210000004907 gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000024924 glomerular filtration Effects 0.000 description 1
- 230000005484 gravity Effects 0.000 description 1
- 230000003394 haemopoietic effect Effects 0.000 description 1
- 230000012447 hatching Effects 0.000 description 1
- 208000019622 heart disease Diseases 0.000 description 1
- 210000005003 heart tissue Anatomy 0.000 description 1
- 208000006750 hematuria Diseases 0.000 description 1
- 231100000753 hepatic injury Toxicity 0.000 description 1
- 230000036732 histological change Effects 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 210000003016 hypothalamus Anatomy 0.000 description 1
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 1
- 230000003100 immobilizing effect Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 210000004969 inflammatory cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000004054 inflammatory process Effects 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 238000003780 insertion Methods 0.000 description 1
- 230000037431 insertion Effects 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 208000037806 kidney injury Diseases 0.000 description 1
- 210000004561 lacrimal apparatus Anatomy 0.000 description 1
- 210000000867 larynx Anatomy 0.000 description 1
- 210000003041 ligament Anatomy 0.000 description 1
- 238000011542 limb amputation Methods 0.000 description 1
- 210000003141 lower extremity Anatomy 0.000 description 1
- 210000001165 lymph node Anatomy 0.000 description 1
- 210000001365 lymphatic vessel Anatomy 0.000 description 1
- 206010025482 malaise Diseases 0.000 description 1
- 238000002844 melting Methods 0.000 description 1
- 230000008018 melting Effects 0.000 description 1
- 210000004379 membrane Anatomy 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 210000001259 mesencephalon Anatomy 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002739 metals Chemical class 0.000 description 1
- 230000009401 metastasis Effects 0.000 description 1
- 239000004005 microsphere Substances 0.000 description 1
- 235000013336 milk Nutrition 0.000 description 1
- 210000004080 milk Anatomy 0.000 description 1
- 239000008267 milk Substances 0.000 description 1
- 239000004570 mortar (masonry) Substances 0.000 description 1
- 208000010125 myocardial infarction Diseases 0.000 description 1
- 210000003928 nasal cavity Anatomy 0.000 description 1
- 210000000653 nervous system Anatomy 0.000 description 1
- 210000001672 ovary Anatomy 0.000 description 1
- 210000003254 palate Anatomy 0.000 description 1
- 210000002741 palatine tonsil Anatomy 0.000 description 1
- 210000000277 pancreatic duct Anatomy 0.000 description 1
- 210000001819 pancreatic juice Anatomy 0.000 description 1
- 210000003695 paranasal sinus Anatomy 0.000 description 1
- 210000002990 parathyroid gland Anatomy 0.000 description 1
- 210000003899 penis Anatomy 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 210000000578 peripheral nerve Anatomy 0.000 description 1
- 210000004303 peritoneum Anatomy 0.000 description 1
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 1
- 238000001050 pharmacotherapy Methods 0.000 description 1
- 210000003800 pharynx Anatomy 0.000 description 1
- 210000004560 pineal gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000036470 plasma concentration Effects 0.000 description 1
- 210000004224 pleura Anatomy 0.000 description 1
- 150000008442 polyphenolic compounds Chemical class 0.000 description 1
- 235000013824 polyphenols Nutrition 0.000 description 1
- 229920001155 polypropylene Polymers 0.000 description 1
- 208000024896 potassium deficiency disease Diseases 0.000 description 1
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 1
- 208000037920 primary disease Diseases 0.000 description 1
- 238000000513 principal component analysis Methods 0.000 description 1
- AURWGUVCKQSRJX-UYCJUBBXSA-N prorenal Chemical group CCCC[C@H](C)C[C@H](O)\C=C\[C@H]1[C@H](O)CC(=O)[C@@H]1CCC\C=C/C(O)=O.OC[C@H]([C@H]([C@@H]([C@H]1O)O)O[C@H]2O[C@@H]([C@@H](O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O[C@H]3O[C@H](CO)[C@H]([C@@H]([C@H]3O)O)O3)[C@H](O)[C@H]2O)CO)O[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]3O[C@@H]1CO AURWGUVCKQSRJX-UYCJUBBXSA-N 0.000 description 1
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 1
- 125000006239 protecting group Chemical group 0.000 description 1
- 230000004853 protein function Effects 0.000 description 1
- 230000009822 protein phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000001742 protein purification Methods 0.000 description 1
- 201000001474 proteinuria Diseases 0.000 description 1
- 238000003908 quality control method Methods 0.000 description 1
- 238000004445 quantitative analysis Methods 0.000 description 1
- 230000005855 radiation Effects 0.000 description 1
- 239000002994 raw material Substances 0.000 description 1
- 210000000664 rectum Anatomy 0.000 description 1
- 208000015670 renal artery disease Diseases 0.000 description 1
- 201000002793 renal fibrosis Diseases 0.000 description 1
- 210000005084 renal tissue Anatomy 0.000 description 1
- 239000011347 resin Substances 0.000 description 1
- 229920005989 resin Polymers 0.000 description 1
- 230000000241 respiratory effect Effects 0.000 description 1
- PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N rhodamine B Chemical compound [Cl-].C=12C=CC(=[N+](CC)CC)C=C2OC2=CC(N(CC)CC)=CC=C2C=1C1=CC=CC=C1C(O)=O PYWVYCXTNDRMGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000005070 sampling Methods 0.000 description 1
- 239000013049 sediment Substances 0.000 description 1
- 210000000697 sensory organ Anatomy 0.000 description 1
- 208000015891 sexual disease Diseases 0.000 description 1
- 210000001599 sigmoid colon Anatomy 0.000 description 1
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 1
- 241000894007 species Species 0.000 description 1
- 210000000278 spinal cord Anatomy 0.000 description 1
- 239000012086 standard solution Substances 0.000 description 1
- 210000003670 sublingual gland Anatomy 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 239000004094 surface-active agent Substances 0.000 description 1
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 1
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 1
- 210000002435 tendon Anatomy 0.000 description 1
- 238000010998 test method Methods 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- 230000035922 thirst Effects 0.000 description 1
- 210000002105 tongue Anatomy 0.000 description 1
- 210000003437 trachea Anatomy 0.000 description 1
- 238000002054 transplantation Methods 0.000 description 1
- 230000032258 transport Effects 0.000 description 1
- 210000003384 transverse colon Anatomy 0.000 description 1
- 210000005239 tubule Anatomy 0.000 description 1
- 210000000689 upper leg Anatomy 0.000 description 1
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 1
- 210000003708 urethra Anatomy 0.000 description 1
- 210000003932 urinary bladder Anatomy 0.000 description 1
- 208000014001 urinary system disease Diseases 0.000 description 1
- 208000019206 urinary tract infection Diseases 0.000 description 1
- 201000002327 urinary tract obstruction Diseases 0.000 description 1
- 210000004291 uterus Anatomy 0.000 description 1
- 210000001215 vagina Anatomy 0.000 description 1
- 210000001177 vas deferen Anatomy 0.000 description 1
- 230000002792 vascular Effects 0.000 description 1
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000012795 verification Methods 0.000 description 1
- 230000000007 visual effect Effects 0.000 description 1
- 230000001755 vocal effect Effects 0.000 description 1
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
- C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/02—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms
- C12Q1/025—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving viable microorganisms for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/5005—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells
- G01N33/5008—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving human or animal cells for testing or evaluating the effect of chemical or biological compounds, e.g. drugs, cosmetics
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
- G01N33/6845—Methods of identifying protein-protein interactions in protein mixtures
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2503/00—Use of cells in diagnostics
- C12N2503/02—Drug screening
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/136—Screening for pharmacological compounds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
- C12Q2600/158—Expression markers
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2500/00—Screening for compounds of potential therapeutic value
- G01N2500/04—Screening involving studying the effect of compounds C directly on molecule A (e.g. C are potential ligands for a receptor A, or potential substrates for an enzyme A)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2500/00—Screening for compounds of potential therapeutic value
- G01N2500/10—Screening for compounds of potential therapeutic value involving cells
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/34—Genitourinary disorders
- G01N2800/347—Renal failures; Glomerular diseases; Tubulointerstitial diseases, e.g. nephritic syndrome, glomerulonephritis; Renovascular diseases, e.g. renal artery occlusion, nephropathy
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/56—Staging of a disease; Further complications associated with the disease
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/60—Complex ways of combining multiple protein biomarkers for diagnosis
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/70—Mechanisms involved in disease identification
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B20/00—ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Urology & Nephrology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Pathology (AREA)
- Food Science & Technology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Toxicology (AREA)
- Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Description
下記の演算手段を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置:
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得手段、及び
前記第1の測定値取得手段が取得した測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定手段。
被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第2の測定値取得手段、及び
被験物質処理検体の前記測定値及び未処理検体の前記測定値を比較する測定値比較手段、をさらに有し、
前記決定手段は、前記測定値比較手段の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、項1に記載のスクリーニング装置。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項1又は2に記載のスクリーニング装置。
コンピュータに実行させたときに、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするための下記の処理を当該コンピュータに実施させるスクリーニングプログラム:
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得処理、及び
前記第1の測定値取得処理で取得された測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定処理。
さらに、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第2の測定値取得処理、及び
被験物質処理検体の前記測定値及び未処理検体の前記測定値を比較する測定値比較処理、
を前記コンピュータに実施させ、
前記決定処理では、前記測定値比較処理の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、項4に記載のスクリーニングプログラム。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項4又は5に記載のスクリーニングプログラム。
以下の工程を含む、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法:
(I)被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する工程、及び
(II)前記工程(I)で得られた測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程。
前記工程(I)と(II)の間に、前記工程(I)で取得された被験物質処理検体の測定値と、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)の対応する腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値とを比較する工程
をさらに含む、項7に記載のスクリーニング方法。
前記工程(I)の前に、
(i)被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞を、被験物質で処理する工程、
(ii)前記工程(i)において被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から検体を採取する工程、及び
(iii)前記工程(ii)で得られた検体からタンパク質及び/又はmRNAを回収する工程
を含む、項7又は8に記載の方法。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項7から9のいずれか一項に記載の方法。
以下の工程を含む、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法:
(A)被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質及び/又は前記タンパク質のmRNAを検出する工程、及び
(B)前記工程(A)で得られた結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程。
前記工程(A)と工程(B)の間に、前記工程(A)で取得された被験物質処理検体の前記検出結果と、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)の対応する腎機能予測マーカータンパク質及び/又は前記タンパク質のmRNAの検出結果とを比較する比較工程、
をさらに含む、項11に記載のスクリーニング方法。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項11又は12に記載のスクリーニング方法。
下記の演算手段を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置:
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得手段、及び
前記第1の評価結果取得手段が取得した評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定手段。
被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第2の評価結果取得手段、及び
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較手段、
をさらに有し、
前記決定手段は、前記評価結果比較手段の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、項14に記載のスクリーニング装置。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項14又は15に記載のスクリーニング装置。
コンピュータに実行させたときに、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするための下記の処理を当該コンピュータに実施させるスクリーニングプログラム:
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得処理、及び
前記第1の評価結果取得処理で取得された評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定処理。
さらに、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第2の評価結果取得処理、及び
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較処理、
を前記コンピュータに実施させ、
前記決定処理では、前記評価結果比較処理の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、項17に記載のスクリーニングプログラム。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項17又は18に記載のスクリーニングプログラム。
以下の工程を含む、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法:
(I)被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能を評価する工程、及び
(II)前記工程(I)で得られた評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程。
前記工程(I)と(II)の間に、前記工程(I)で取得された被験物質処理検体の前記評価結果と、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞から採取された検体(未処理検体)の対応する腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果とを比較する工程
をさらに含む、項20に記載のスクリーニング方法。
前記工程(I)の前に、
(i)被験体(ヒトを除く)、被験組織又は被験細胞を、被験物質で処理する工程、及び(ii)前記工程(i)において被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から検体を採取する工程
を含む、項20又は21に記載のスクリーニング方法。
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項20から22のいずれか一項に記載のスクリーニング方法。
下記の演算手段を有する、被験体の腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測装置:
前記被験体の腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する被験データ取得手段、
前記被験データ取得手段が取得した被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得され、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1とを比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出するパターン類似度算出手段、及び
前記パターン類似度算出手段で得られた器官連関指標因子のパターンの類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測手段;
ここで、
前記被験データは、「前記被験体の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎臓に疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係を表している、器官連関指標因子のパターンであり、
前記標準データ1は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項24に記載の予測装置。
コンピュータに実行させたときに、被験体の腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測するための下記の処理を当該コンピュータに実施させる予測プログラム:
前記被験体の腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する被験データ取得処理、
前記被験データ取得処理で取得された被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得され、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1とを比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出するパターン類似度算出処理、及び
前記パターン類似度算出処理で得られた器官連関指標因子のパターンの類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測処理;
ここで、
前記被験データは、「前記被験体の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係を表している、器官連関指標因子のパターンであり、
前記標準データ1は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎臓に疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項25に記載の予測プログラム。
下記の工程を有する、被験体の腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測方法:
(1)前記被験体の腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する工程、
(2)前記工程(1)で取得された被験データを、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得され、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1と比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出する工程、及び
(3)前記工程(2)において算出された器官連関指標因子のパターンの類似度が「類似している」と決定された場合に、前記被験体が前記標準データ1に対応する疾患を有する、及び/又は前記被験体が前記標準データ1に対応する病期であると決定する工程;
ここで、
前記被験データは、「前記被験体の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係を表している、器官連関指標因子のパターンであり、
前記標準データ1は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項26に記載の予測方法。
下記の工程を有する、被験体の腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測するために器官連関指標因子のパターンの類似度の情報を取得する取得方法:
(1)前記被験体の腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する工程、及び
(2)前記工程(1)で取得された被験データを、あらかじめ決定された対応する器官連関指標因子の標準データ1と比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出し、その情報を取得する工程;
ここで、
前記被験データは、「前記被験体の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係を表している、器官連関指標因子のパターンであり、
前記標準データ1は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項27に記載の取得方法。
下記の演算手段を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測装置:
前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する病期情報取得手段、
前記病期情報取得手段が取得した病期の情報と、標準データ2とを照合する病期情報照合手段、
前記病期情報照合手段で得られた結果から、前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを抽出するパターン抽出手段、及び
前記パターン抽出手段で得られた器官連関指標因子のパターンを指標にして、腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測手段;
ここで、
前記標準データ2は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項28に記載の予測装置。
コンピュータに実行させたときに、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測するための下記の処理を当該コンピュータに実施させる予測プログラム:
前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する病期情報取得処理、
前記病期情報取得処理で取得された病期と、標準データ2とを照合する病期情報比較処理、
前記病期情報比較処理で得られた結果から、前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを抽出するパターン抽出処理、及び
前記パターン抽出処理で得られた器官連関指標因子のパターンを指標にして、腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測処理;
ここで、
前記標準データは、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項29に記載の予測プログラム。
下記の工程を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における当該腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測方法:
(i)前記被験体の診断結果から、前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する工程、
(ii)前記工程(i)で取得された前記病期の情報と、標準データ2を照合する工程、(iii)前記工程(ii)で取得された照合結果に基づいて、標準データ2の中から前記病期の情報と対応する腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の標準データαを決定し、前記被験体の病期に対応する前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを標準データαの中から抽出する工程、
(iv)前記工程(iii)で抽出された器官連関指標因子のパターンを公知の疾患、及び/又は前記疾患の病期における器官連関指標因子のと情報と照合して、前記被験体の腎臓以外の器官の器官連関指標因子のパターンに対応する前記腎臓以外の器官の疾患の存在及び/又は当該疾患の病期を決定する工程、及び
(v)前記工程(iv)において決定された前記腎臓以外の器官の疾患及び/又は当該疾患の病期を、前記被験者が罹患している可能性のある疾患であると、及び/又は当該疾患の病期であるとさらに決定する工程;
ここで、
前記標準データ2は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎臓に疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項30に記載の予測方法。
下記の工程を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測するための情報の取得方法:
(i)前記被験体の診断結果から、前記被験体における前腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する工程、
(ii)前記工程(i)で取得された前記病期の情報と、標準データ2を照合する工程、(iii)前記工程(ii)の取得された照合結果に基づいて、標準データ2の中から前記病期の情報と対応する腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の標準データαを決定し、前記被験体の病期に対応する前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを標準データαの中から抽出する工程、及び
(iv’)前記工程(iii)で抽出された器官連関指標因子のパターンを公知の疾患、及び/又は前記疾患の病期における器官連関指標因子の情報と照合して、前記被験体の腎臓以外の器官の器官連関指標因子のパターンに対応する前記腎臓以外の器官の疾患の存在及び/又は当該疾患の病期の情報を取得する工程;
ここで、
前記標準データ2は、「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎臓に疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、あらかじめ決定された器官連関指標因子のパターンである。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項31に記載の取得方法。
下記の工程を有する、被験体において腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測するために用いる、器官連関指標因子のパターンの標準データの作成方法:
ゴールデンスタンダードの陽性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に応じて器官連関指標因子を抽出する工程;
ゴールデンスタンダードの陰性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から器官連関指標因子を抽出する工程;
前記器官連関指標因子を同定及び定量する工程;
「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、器官連関指標因子のパターンを決定する工程;及び
前記器官連関指標因子のパターンを、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に対応付ける工程。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項32に記載の作成方法。
下記の工程を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体において腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測するために用いる、器官連関指標因子のパターンの標準データの作成方法:
ゴールデンスタンダードの陽性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に応じて器官連関指標因子を抽出する工程;
ゴールデンスタンダードの陰性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から器官連関指標因子を抽出する工程;
前記器官連関指標因子を同定及び定量する工程;及び
「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、器官連関指標因子のパターンを決定する工程。
前記器官連関指標因子が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins、Fibrinogens及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、項33に記載の作成方法。
1.用語の説明
はじめに、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法及び装置、及び腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニングするための機能をコンピュータに実施させるためのプログラムの発明に関し、本明細書、請求の範囲、要約で使用される用語について説明する。後述する「II.iOrgans」において、本項「I.スクリーニング」と同じ文言が使用される場合があるが、特に記載がない限り、「I.スクリーニング」に記載の発明に係る明細書、請求の範囲、要約で使用されている用語は、本項の規定に従う。本項「I.スクリーニング」と後述する「II.iOrgans」で使用される用語の定義は、それぞれの項を引用する記載がないかぎり、それぞれ独立した別の定義である。
[式1]
eGFR(%)=(0.3×身長(m)/被験体の血清Cr値)×100
また、ネコ、イヌ等のヒト以外の哺乳動物の場合、1日平均引水量、又は尿比重等から慢性腎疾患であることを予測することができる。
本明細書における腎機能予測マーカーからなる群から選択される少なくとも一種のタンパク質の測定値、及び腎機能予測マーカーからなる群から選択される少なくとも一種のmRNAの測定値の取得方法は、それぞれの測定値が取得できる限り制限されない。例えば、以下に述べる方法に従って取得することができる。
腎機能予測マーカーからなる群から選択される少なくとも一種のタンパク質の測定値(以下、本明細書において「腎機能予測マーカータンパク質の測定値」と略記することもある)を測定する場合、本工程では、当該測定値を取得するために、上記「1.用語の説明」で述べた抗腎機能予測マーカー抗体を用いた測定方法を使用することができる。腎機能予測マーカータンパク質の測定値を取得する測定方法としては、公知のELISA法等を使用して行うことができる。
腎機能予測マーカータンパク質からなる群から選択される少なくとも一種のmRNAの測定値(以下、本明細書において「腎機能予測マーカーmRNAの測定値」と略記することもある)を取得するために、マイクロアレイ法、RNA−seq解析法、定量的RT−PCR法等公知の測定方法を使用することができる。マイクロアレイ法に使用するプローブは、自ら選択したプローブ又は公知のプローブを合成して使用してもよく、また市販のマイクロアレイチップを使用してもよい。
本発明において、腎機能予測マーカータンパク質の機能を評価する方法としては、腎機能予測マーカータンパク質の機能を評価できる限り特に制限されない。ここで「腎機能予測マーカータンパク質の機能」とは、それぞれの腎機能予測マーカータンパク質が有している本来の機能である。例えば、腎機能予測マーカータンパク質が受容体である場合には、そのリガンドが腎機能予測マーカータンパク質に結合した際に活性化し、当該タンパク質が属する情報伝達経路の下流に存在するタンパク質やケミカルメディエーターにその活性化の情報を伝達し、その受容体の支配下にある情報伝達経路を通じて細胞等に働きかける機能である。また、腎機能予測マーカータンパク質がリガンドである場合には、例えば当該リガンドが結合する受容体を活性化する機能である。
本発明においては、上記「I.2.各測定値の取得方法」において取得された測定値を用いて、後述する「I.5.スクリーニング1」を行う。また、本発明においては、上記「I.3.腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価」において取得された評価結果を用いて、後述する「I.6.スクリーニング2」を行う。まず、これらの処理を行うためのシステム構成について説明する。
5−1.概要
本態様においては、上記「I.2.各測定値の取得方法」を実施することによって取得される、被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を用いて、当該被験物質が腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質であると決定する。より具体的には、本態様は、工程(I):被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する工程、及び工程(II):前記工程(I)で得られた測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程を含む。この場合、被験物質処理検体中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値が、健常個体の対応する腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値に近づいていれば、当該被験物質が有効成分の候補物質であると決定することができる。
本発明は、第1の態様として、下記の演算手段を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置を含む:
被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得手段、及び
前記第1の測定値取得手段が取得した測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定手段。
被験物質処理検体の前記測定値及び未処理検体の前記測定値を比較する測定値比較手段、
をさらに有し、
前記決定手段は、前記測定値比較手段の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する。決定方法は、後述する「I.5−4.スクリーニング方法」の記載に準ずる。
被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得機能、及び
前記第1の測定値取得機能が取得した測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定機能。
被験物質処理検体の前記測定値及び未処理検体の前記測定値を比較する測定値比較機能、
をCPU101により実行し、
前記決定機能は、前記測定値比較機能の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する。
本発明の第1の態様に係るスクリーニング装置1は、以下の図4で説明するステップS11〜S17の処理を行うために、本態様に係るスクリーニングプログラムを、例えば実行形式(例えばプログラミング言語からコンパイラにより変換されて生成される)で記録部103に予め記録しており、スクリーニング装置1は、記録部103に記録したスクリーニングプログラムを使用して処理を行う。
被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得処理、及び
前記第1の測定値取得処理で取得された測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定処理。
を前記コンピュータに実施させ、
前記決定処理では、第1の測定値取得処理で取得された測定値を前記第2の測定値取得処理で取得された測定値と比較することにより前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する。決定方法は、後述する「I.5−4.スクリーニング方法」の記載に準ずる。
本発明の第1の態様に係るスクリーニング装置1は、本発明の第1の態様に係るスクリーニング方法を実行する。本発明の第1の態様に係るスクリーニング方法は、以下の工程を含む、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法を含む:
(I)被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する工程、及び
(II)前記工程(I)で得られた測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程。
をさらに含む。
6−1.概要
本態様においては、上記「I.3.腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価」の方法を実施することによって取得される、被験物質処理検体中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を用いて、当該被験物質が腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質であると決定する。より具体的には、本態様は、工程(I):被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能を評価する工程、及び工程(II):前記工程(I)で得られた評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると工程を含む。この場合、被験物質処理検体中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果が、健常個体の対応する腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果に近づいていれば、当該被験物質が有効成分の候補物質であると決定することができる。
本発明は、第2の態様として、下記の演算手段を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置を含む:
被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得手段、及び
前記第1の評価結果取得手段が取得した評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定手段。
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較手段、
をさらに有し、
前記決定機能は、前記評価結果比較手段の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する。決定方法は、後述する「I.6−4.スクリーニング方法」の記載に準ずる。
被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得機能、及び
前記第1の評価結果取得機能が取得した評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定機能。
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較機能、
をCPU101により実行し、
前記決定機能は、前記評価結果比較機能の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する。決定方法は、後述する「I.6−4.スクリーニング方法」の記載に準ずる。
本発明の第2の態様に係るスクリーニング装置2は、以下の図8で説明するステップS21〜S27の処理を行うために、本態様に係るスクリーニングプログラムを、例えば実行形式(例えばプログラミング言語からコンパイラにより変換されて生成される)で記録部103に予め記録しており、スクリーニング装置2は、記録部103に記録したスクリーニングプログラムを使用して処理を行う。
被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得処理、及び
前記第1の評価結果取得処理で取得された評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定処理。
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較処理、
を前記コンピュータに実施させ、
前記決定処理では、前記評価結果比較処理の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する。決定方法は、後述する「I.6−4.スクリーニング方法」の記載に準ずる。
本発明の第2の態様に係るスクリーニング装置2は、本発明の第2の態様に係るスクリーニング方法を実行する。本発明の第2の態様に係るスクリーニング方法は、以下の工程を含む、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法を含む:
(I)被験物質で処理された被験体、被験組織又は被験細胞から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能を評価する工程、及び
(II)前記工程(I)で得られた評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程。
さらに本発明は、第3のスクリーニング方法を含む。本態様は、被験物質処理検体中の腎機能予測マーカータンパク質及び/又は前記タンパク質のmRNAを検出する検出工程(A)を含む腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法である。腎機能予測マーカータンパク質の検出は、例えば上記「I.1.用語の説明」に記載の「抗腎機能予測マーカー抗体」を用いて、ウエスタンブロッティング法、ELISA法、等のタンパク質の公知の検出方法によって行うことができる。腎機能予測マーカータンパク質の検出は、例えば上記「I.1.用語の説明」に記載の「腎機能予測マーカー mRNA検出核酸」を用いて、マイクロアレイ法、RT−PCR等の公知の方法によって行うことができる。
腎機能予測マーカータンパク質の1つであるOscarの機能発現を抑制すると高リン食摂取下でのFGF23の発現誘導が抑制される。したがって、前記スクリーニング1からスクリーニング3において、腎機能予測マーカータンパク質がOscarである場合には、「腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング」は、「FGF23の機能発現を抑制することができる候補物質のスクリーニング」と読み替えることができる。
本発明は、腎機能予測マーカータンパク質及び/又は、腎機能予測マーカータンパク質のmRNAを、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするためのバイオマーカーとして使用する方法に関する。ここで、「腎機能予測マーカー」の定義は、上記「1.用語の説明」の記載にしたがう。
本態様は、「iOrgans(Inter−Organ Cross−Talks)(アイ・オーガンズ)テクノロジー」という新しい方法論に基づき、被験体において特定の器官の機能および組織学的変化に付随する該特定器官以外の器官の遺伝子発現、代謝物質等の量の変動の網羅的データベースの構築を行い、「Reverse iOrgans(リバース・アイ・オーガンズ)」と「Forward iOrgans(フォワード・アイ・オーガンズ)」という二つの新規の疾患判定方法に関する。「iOrgans」とは、あるひとつの器官の状態とその他の器官の関連性を指標に疾患の診断、予防、治療を行うテクノロジーである。
はじめに、iOrgansに係る発明に関し、本明細書、請求の範囲、要約で使用される用語について説明する。特に記載がない限り、本明細書、請求の範囲、要約で使用されている用語は、本項の規定に従う。本稿「II.iOrgans」において、前述した「I.スクリーニング」と同じ文言が使用される場合があるが、特に記載がない限り、「II.iOrgans」に記載の発明に係る明細書、請求の範囲、要約で使用されている用語は、本項の規定に従う。前述した「I.スクリーニング」と本稿「II.iOrgans」で使用される用語の定義は、それぞれの項を引用する記載がないかぎり、それぞれ独立した別の定義である。
、胆嚢、胆管、胆道、膵臓、膵管等)、泌尿器系器官(尿道、膀胱、尿管、腎臓)、神経系器官(大脳、小脳、中脳、脳幹、脊髄、末梢神経、自律神経等)、女性生殖器系器官(卵巣、卵管、子宮、膣等)、乳房、男性生殖器系器官(陰茎、前立腺、精巣、精巣上体、精管)、内分泌系器官(視床下部、下垂体、松果体、甲状腺、副甲状腺、副腎等)、外皮系器官(皮膚、毛、爪等)、造血器系器官(末梢血、骨髄、脾臓等)、免疫系器官(リンパ節、扁桃、胸腺等)、骨軟部器官(骨、軟骨、骨格筋、結合組織、靱帯、腱、横隔膜、腹膜、胸膜、脂肪組織等)、感覚器系器官(眼球、眼瞼、涙腺、外耳、中耳、内耳、蝸牛等)が挙げられる。本発明において、対象とする組織としては、好ましくは心臓、大脳、肺、腎臓、脂肪組織、肝臓、骨格筋、精巣、脾臓、胸腺、骨髄、膵臓等であり、より好ましくは心臓、大脳、肺、腎臓、脂肪組織、肝臓、骨格筋、脾臓、骨髄、膵臓等である。
本発明において使用される器官連関指標因子を抽出するための細胞又は組織の採取方法及びそれらの保存方法は、特に制限されず、器官連関指標因子の種類に応じた公知の方法にしたがって行うことができる。また、本発明において使用される器官連関指標因子の抽出方法も、特に制限されず、器官連関指標因子の種類に応じた公知の方法に従って行うことができる。本発明における、器官連関指標因子の測定方法も、器官連関指標因子の量を測定できる限り特に制限されない。
3−1.概要
本態様においては、被験体の腎臓以外の器官から取得された器官連関指標因子のパターンから、被験体の腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する。具体的には、上記II.2.に記載の測定方法を実施することによって取得される、腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患毎又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得され、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1とを比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出し、当該類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する。具体的には、工程(1):前記被験体の腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する工程、工程(2):前記工程(1)で取得された被験データを、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患毎又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得され、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1と比較して、より具体的には、前記工程(1)で取得された被験データの器官名と、あらかじめ決定された標準データ1に記録された器官名とを照合し、被験データの器官名と同じ器官名を有する標準データ1の中の器官連関指標因子のパターンと比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出する工程、及び工程(3):前記工程(2)において算出された前記器官連関指標因子のパターンの類似度が「類似している」と決定された場合に、前記被験体が前記標準データ1に対応する疾患を有する、及び/又は前記被験体が前記標準データ1に対応する病期であると決定する工程を含む。
図13は、本発明の第3の態様に係るシステム120の概観図であり、図14は、システム120のハードウェア構成を示すブロック図である。システム120は入力部3と、表示部4と、装置5bと、予測装置6とを備える。
本発明は、第3の態様として、下記の演算手段を有する、被験体の腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測装置を含む:
前記被験体の腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する被験データ取得手段、
前記被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得される、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データとを比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出するパターン類似度算出手段、及び
前記比較手段で得られた器官連関指標因子のパターンの類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測手段。
前記腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する被験データ取得機能、
前記被験データ取得機能が取得した被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得される、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1とを、比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出するパターン類似度算出機能、及び
前記パターン類似度算出機能で得られた器官連関指標因子のパターンの類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測機能。
また、予測装置6は、以下の図16で説明するステップS31〜S36の処理を行うために、本発明に係る予測プログラムを、例えば実行形式(例えばプログラミング言語からコンパイラにより変換されて生成される)で記録部103に予め記録しており、予測装置6は、記録部103に記録した予測プログラムを使用して処理を行う。
前記腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データを取得する被験データ取得処理、
前記被験データ取得処理で取得された被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から取得される、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1とを比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出するパターン類似度演算処理、及び
前記パターン比較処理で得られた器官連関指標因子のパターンの類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測処理。
本発明の第3の態様に係る予測装置6は、本発明の第3の態様に係る予測方法を実行する。本発明の第3の態様に係る予測方法は、下記の工程を有する、被験体において腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する方法である:
前記腎臓以外の1種以上の器官から採取された細胞又は組織から得られた各器官における器官連関指標因子の被験データと、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患又は病期毎にあらかじめ決定された標準データ1の群から、被験データが由来する器官に対応する器官の標準データ1とを比較して、器官連関指標因子のパターンの類似度を算出する類似度算出工程、及び
前記類似度算出工程で得られた器官連関指標因子のパターンの類似度を指標にして、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測工程。
4−1.概要
本態様においては、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における当該腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する。具体的には、被験体の診断結果から得られる、前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報に基づいて、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における当該腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する。工程(i):前期被験体の診断結果から、前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する工程、工程(ii):前記工程(i)で取得された前記病期の情報と、標準データ2を照合する工程(iii):前記工程(ii)で取得された照合結果に基づいて、標準データ2の中から前記病期の情報と対応する腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の標準データαを決定し、前記被験体の病期に対応する前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを標準データαの中から抽出する工程、工程(iv):前記工程(iii)で抽出された器官連関指標因子のパターンを公知の疾患、及び/又は前記疾患の病期における器官連関指標因子の情報と照合して、前記被験体の腎臓以外の器官の器官連関指標因子のパターンに対応する前記腎臓以外の器官の疾患及び/又は当該疾患の病期を決定する工程、及び工程(v):前記工程(iv)において決定された前記腎臓以外の器官の疾患の存在及び/又は当該疾患の病期を、前記被験者が保有している可能性のある疾患であると、及び/又は当該疾患の病期であるとさらに決定する工程を含む。
図17は、本発明の第4の態様に係るシステム130の概観図であり、図18は、システム130のハードウェア構成を示すブロック図である。システム130は入力部3と、表示部4と、予測装置7とを備える。
本発明は、第4の態様として、下記の演算手段を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における当該腎臓器官以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測装置を含む:
前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する病期情報取得手段、
前記病期情報取得手段が取得した病期の情報と、標準データ2とを照合する病期情報照合手段、
前記病期情報照合手段で得られた結果から、前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを抽出するパターン抽出手段、及び
前記パターン抽出手段で得られた器官連関指標因子のパターンを指標にして、腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測手段。
前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する病期情報取得機能、
前記病期情報取得機能が取得した病期と、標準データ2とを照合する病期情報照合機能、
前記病期情報照合機能で得られた結果から、前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを抽出するパターン抽出機能、及び
前記パターン抽出機能で得られた器官連関指標因子のパターンを指標にして、腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測機能。
また、予測装置7は、以下の図20で説明するステップS41〜S49の処理を行うために、本発明に係る予測プログラムを、例えば実行形式で記録部103に予め記録しており、予測装置7は、記録部103に記録した予測プログラムを使用して処理を行う。
前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する病期情報取得処理、
前記病期情報取得処理で取得された病期と、標準データ2とを照合する病期情報照合処理、
前記病期情報照合処理で得られた結果から、前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを抽出するパターン抽出処理、及び
前記パターン抽出処理で得られた器官連関指標因子のパターンを指標にして、腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測処理。
4−1.概要」で述べた市販のデータベースソフトとリンクさせ、当該データベースソフトを利用して病期情報照合処理及びパターン抽出処理を実施してもよい。
本発明の第4の態様に係る予測装置7は、本発明の第4の態様に係る予測方法を実行する。本発明の第4の態様に係る予測方法は、下記の工程を有する、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する被験体における当該腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する方法である:
前記被験体における前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期の情報を取得する病期情報取得工程、
前記病期情報取得処理で取得された病期と、標準データ2とを照合する病期情報照合工程、
前記病期情報照合工程で得られた照合結果から、前記被験体における腎臓以外の1種以上の器官の器官連関指標因子のパターンを抽出するパターン抽出工程、及び
前記パターン抽出処理で得られた器官連関指標因子のパターンを指標にして、腎臓以外の1種以上の器官の疾患の存在、及び/又は病期を予測する予測工程。
5−1.標準データの作成
本発明は、上記「3.Reverse iOrgans」において使用する標準データ1、及び「4.Forward iOrgans」において使用する標準データ2の作成方法に関する。
ゴールデンスタンダードの陽性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に応じて器官連関指標因子を抽出する工程;
ゴールデンスタンダードの陰性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から器官連関指標因子を抽出する工程;
当該器官連関指標因子を同定及び定量する工程;
「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、器官連関指標因子のパターンを決定する工程;及び
前記器官連関指標因子のパターンを、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される一種の各病期に対応付ける工程。
ゴールデンスタンダードの陽性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に応じて器官連関指標因子を抽出する工程;
ゴールデンスタンダードの陰性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から器官連関指標因子を抽出する工程;
当該器官連関指標因子を同定及び定量する工程;及び
「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、器官連関指標因子のパターンを決定する工程;
具体的には、標準データ2を作成する手順は、後述する実施例に沿った手順である。
本発明は、上述の作成方法により作成される標準データ1又は標準データ1の群を含む。
ゴールデンスタンダードの陽性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に応じて器官連関指標因子を抽出する工程;
ゴールデンスタンダードの陰性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から器官連関指標因子を抽出する工程;
当該器官連関指標因子を同定及び定量する工程;
「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、器官連関指標因子のパターンを決定する工程;及び
前記器官連関指標因子のパターンを、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に対応付ける工程。
ゴールデンスタンダードの陽性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の各病期に応じて器官連関指標因子を抽出する工程;
ゴールデンスタンダードの陰性対象の腎臓以外の器官から採取された細胞又は組織から器官連関指標因子を抽出する工程;
当該器官連関指標因子を同定及び定量する工程;及び
「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有する陽性対象の前記腎臓以外の器官における器官連関指標因子の量」と「前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を有さない陰性対象の前記腎臓以外の器官と同一の器官における器官連関指標因子の量」との関係から、前記腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の病期毎に、器官連関指標因子のパターンを決定する工程。
R−iOrgans及びF−iOrgansは、さらに腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患の疾患を治療するための治療工程を含んでいてもよい。当該疾患の治療方法は公知の方法に従って行うことができる。被験体の腎機能が低下していると決定された場合には、その進行を遅らせるために、はじめに腎機能低下の原因となっている病態を治療してもよい。前記病態としては、糖尿病及び高血圧症等の生活習慣病、尿路感染、尿路閉塞糸球体腎炎、腎血管疾患(血流障害)、鎮痛剤による薬剤性腎症等の泌尿器系疾患等を挙げることができる。また、慢性腎疾患の進行を遅らせるため、血圧のコントロールや、食事制限等の処置を行ってもよい。さらに、慢性腎疾患が進行した場合には、リン吸着薬等の慢性腎臓病骨代謝異常に対する薬物治療等を行ってもよい。さらに、必要に応じて透析等を行ってもよい。
慢性腎疾患モデルマウスは、片腎摘出後に高リン食で飼育して作成した。対照として、偽手術後に普通食で飼育したマウスを作成した。
1.片腎摘出
マウス(C57BL/6、8週齢オス)を、Avertin (250 mg/kg)の腹腔内投与で麻酔後、背部より皮膚を切開、右腎動静脈と尿管を結紮した。結紮部より遠位側で切断し、右腎を摘出した後閉腹した。対照については、偽手術を施した。偽手術においては、右腎動静脈と尿管を露出した後、結紮せずにそのまま閉腹した。手術侵襲から完全に回復するのを待つ意味で、普通食(0.35%無機リン含有)で4週間飼育した。
手術終了4週間後(12週齢)から、片腎摘出したマウスには高リン食(2.0%無機リン含有)を与えた(以下、腎疾患群ともいう)。偽手術したマウスには普通食(0.35%無機リン含有)を与えた(以下、Sham群ともいう)。
1.高リン食開始後4週間(16週齢)
腎臓の組織学的観察では、Hematoxylin-Eosin(HE)染色で、近位尿細管細胞の好酸性色素(Eosin)に対する染色性の低下が認められ、ミトコンドリアに何らかの変化が起きていることが示唆された。腎間質に明らかな線維化の所見はないが、炎症細胞の浸潤が軽度認められた。
腎臓の組織学的観察では、腎間質に線維化と細胞浸潤、すなわち腎線維症を認めた。
生理学的観察では、尿蛋白の増加、血中クレアチニン、リン、FGF23の上昇が認められた。しかし、クレアチニン・クリアランスはむしろ上昇しており、いわゆるHyperfiltrationの状態と考えられた。
高リン食開始後12週間では、高リン食開始後8週間で認められた上記所見がさらに進行した。腎臓の皮髄境界を中心に石灰化を認める場合もあった。しかし、死亡する例はなかった。
1.各器官の摘出
高リン食開始後(Sham群においては普通食)、1週間後(初期)、4週間後(中期)に器官若しくは組織(膵臓、頭蓋骨、脳、下垂体、腎臓、副腎、肝臓、脾臓、胸腺、心臓、肺、顎下腺甲状腺、大動脈、骨格筋、皮膚、精巣、脂肪、眼、胃、空腸、回腸、大腸)を摘出した。
(1)各組織からのRNA抽出
凍結保存された各組織をTRIzol Reagent (Life technologies)中で、Cell Destroyer PS1000 (Pro Sense inc) あるいは、 PT 10-35 6T Polytron homogenizer (KINEATICA) にて組織をホモジナイズした。その後タンパク質を分離するため室温にて5分インキュベート後、1 ml のTRIzolに対して0.2mlのクロロホルムを加え、チューブの蓋をした後に15秒間激しくボルテックスした。撹拌後3分間室温でインキュベートし、4℃で15分間12,000 gで遠心し、RNAを含む水相を新しいチューブに回収した。回収した水相に等量の70%エタノールを加え撹拌後、RNeasy mini column (Qiagen)に700μlずつアプライしRNeasy minikit(Qiagen) 標準プロトコルに従って精製RNAを回収した。回収したRNAは1%アガロース電気泳動及びNanodrop にて品質及び濃度の確認を行った。
マクロジェン・ジャパン株式会社で上記試料を使用してRNA-seqのデータを以下の手順で取得した。
下記項目にて、受入サンプルの品質検定を行った。
・Agilent 2200 TapeStationSytemによる濃度測定・品質の確認
品質検定に合格したTotal RNAについて、500~1000ng のTotal RNAをテンプレートとしてイルミナ社TruSeq RNA Sample Prep Kit を用いて標準プロトコルに従い下記の要領でシーケンス用ライブラリ調製を行った。
(a)Oligo-dT ビーズを用いたpoly(A)-RNAの精製
(b)poly(A)-RNA断片化
(c) 逆転写/2nd鎖cDNA合成
(d) 末端修復・3'A付加
(e) アダプターライゲーション
※アダプターには、各検体識別用のインデックスタグを含む。
(f) PCR増幅
(g) AMPure XP ビーズによる精製・低分子除去(<200bp)
次世代シーケンサ「Illumina HiSeq 4000」を使用し、Paired-End法 100塩基読み取りにより塩基配列データを取得した。
上記出力データについて、下記に挙げる情報処理を実施した。
i.ベースコール:出力された解析生データ(画像データ)より、塩基配列のテキストデータを取得した。
ii.フィルタリング:所定のフィルタリングによるリードデータの選別を行った。
iii.Index配列による振り分け:Index情報による各サンプルデータの振り分けを行った。
Illumina Hiseqにて得られたデータファイル(Fastq形式)をローカルサーバーにダウ
ンロードしたGalaxy (https://usegalaxy.org/) 上にアップロードした。その後マウスゲノムマップ情報mm10に各配列をマッピングするためにBowtie2(http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml) を用いて解析した。Bowtie2で得られたBAMファイル
をCufflinks (http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/) にて解析することで遺伝子毎にFPKM(RPKM)を算出した。
それぞれの遺伝子のRNAの発現量(FPKM値)を対応するsham群マウスのRNAの発現量(FPKM値)で除した値(以下、[CKD/sham]ともいう)が1より大きいか1より小さい遺伝
子を2群、1.5より大きいか0.67より小さい遺伝子を3群、2より大きいか0.5より小さい遺伝子を4群、5より大きいか0.2より小さい遺伝子を5群に分類した(図22)。なお、FPKMが1未満のものは全て「1」として扱った。また、Sham>1であってCKD/Sham >5の遺伝子、Sham<1であってCKD>10の遺伝子、Sham>10であってCKD/Sham <0.3の遺伝子を図23に示した。特に図23の遺伝子は、腎機能の状態を最もよく反映すると考えられた。
実施例2:各疾患における器官連関指標因子のパターンの類似度の比較
R-iOrgansの理論にしたがって、慢性腎疾患モデルマウス各病期において採取された各器官の細胞又は組織から得られた器官連関指標因子のパターンから、慢性腎疾患の有無、及び病期が予測できることを実証するため、図22に示す5群のRNAに関し、心筋梗塞、病期毎に各器官でのRNAの発現パターンの相関係数を求めた。相関係数は、スピアマンの順位相関法と、Zスコア法を改変して求めた。
解析ソフトRの関数cor (method=”spearman”)を使用して、計算した。結果を表4−1〜表4−8に示す。
被験データの遺伝子発現量を標準データの遺伝子発現量で遺伝子毎に割り、その値をlog2 でスケーリングした。スケーリングした値を xi とした(i=1,…,遺伝子数)。値 x_i について、遺伝子全体での平均μ、分散 σ を求めた。
実験例I.Oscar遺伝子変異マウスの作製
1.gRNAおよびCas9発現ベクターの構築
Optimized CRISPR design tool [Massachusetts Institute of Technology, ZhangLabのHP (http://crispr.mit.edu/) において公開] を用いて、gRNA配列 (Oscar-gRNA1, Oscar-gRNA2)を設計し、gRNA配列をコードするオリゴDNAを合成した。これらの配列に含まれるOscar遺伝子標的配列は、Oscar-gRNA1がACAGCTGGAGTATCAGCGAC(配列番号5)およびOscar-gRNA2がGCTCACAGAGAGTCGACAGC(配列番号6)に示される配列であり、Oscar遺伝子のエクソン1に存在する配列である。これらを、Cas9発現ベクターであるpX330-U6-Chimeric_BB-CBh-hSpCas9に挿入した(pX330-Oscar-gRNA1, pX330-Oscar-gRNA2) 。得られたベクターについて、gRNA挿入部位の塩基配列を決定し、設計通りにgRNAが挿入されたことを確認した。また、それぞれのOscar遺伝子標的配列をはさむようにsingle-stranded oligodeoxynuleotides (ssODNs) を合成した。ドナーオリゴDNAは、Oscar-gRNA1切断予定部位のSerineコード配列直下およびOscar-gRNA2切断予定部位のLeucineコード配列直下に終止コドンを置くデザインとした(図24A、B)。
ssODNs for Oscar-gRNA1:GCCAAGGATCCACACACAGGGGAGGGACAGCTCACAGAGAGTCGACAGCTGGAGTATCAGcctcagaagaactcgtcaagaagtcaCGACAGGACCATGGTGGGCACTCTCCGTGGAGCTGAGGAAAAGGTTGACCCTGCCTTTTT(配列番号7)
ssODNs for Oscar-gRNA2:ATAGCCCTCAGCCCAGCCAAGGATCCACACACAGGGGAGGGACAGCTCACAGAGAGTCGAcctcagaagaactcgtcaagaagtcaCAGCTGGAGTATCAGCGACAGGACCATGGTGGGCACTCTCCGTGGAGCTGAGGAAAAGGT(配列番号8)
pX330-Oscar-gRNA1とpX330-Oscar-gRNA2を対応するssODNsと共にC57BL/6N Slc受精卵にそれぞれインジェクションした。インジェクションした受精卵は、偽妊娠ICRメスマウスの卵管に注入した。F0マウスをPCR(プライマーは表5参照)とダイレクトシークェンスでジェノタイプを確認した。F1マウスはF0マウス同士を交配させて作製した。
1.UNx/HPiモデルマウスの作成
UNx/HPiマウス(片腎切除-高リン食マウス)は、片腎摘出後に高リン食で飼育して作製した。対照として、偽手術後に低リン食で飼育したマウスを作成した。
マウス(C57BL/6J、8週齢オス)を、Avertin (250 mg/kg)の腹腔内投与で麻酔後、背部より皮膚を切開、右腎動静脈と尿管を結紮した。結紮部より遠位側で切断し、右腎を摘出した後閉腹した。対照については、偽手術を施した。偽手術においては、右腎動静脈と尿管を露出した後、結紮せずにそのまま閉腹した。手術侵襲から完全に回復するのを待つ意味で、0.54%無機リン含有普通食 (CE-2, 日本クレア)で4週間飼育した。
手術終了4週間後(12週齢)から、片腎摘出したマウスには2%無機リン含有高リン食 (TD.10662, オリエンタルバイオサービス)高リン食(2.0%無機リン含有)を与えた(以下、腎疾患群ともいう)。偽手術したマウスには0.35%無機リン含有低リン食 (TD.10662変型, オリエンタルバイオサービス)を与えた(以下、Sham群ともいう)。
高リン食開始後(Sham群においては低リン食)、1週間後(E)、4週間後(M)および8週間後(L)に組織を摘出した。
2−1.リン負荷
WTマウス (C57BL/6N、7週齢オス)、又は、Oscar遺伝子変異マウス(7−16週齢、オス・メス) を0.54%無機リン含有普通食 (CE-2, 日本クレア) で1週間飼育した後、特別リン含有食として2%無機リン含有高リン食 (TD.10662, オリエンタルバイオサービス) 又は、0.35%無機リン含有低リン食 (TD.10662変型, オリエンタルバイオサービス) を与えた。
WTマウスへの特別リン含有食の開始時(8週齢)、開始後1日、3日、1週間 (9週齢)、4週間 (12週齢) に頭蓋骨を摘出した。Oscar遺伝子変異マウスは特別リン含有食の開始後、1週間に頭蓋骨を摘出した。組織を摘出する動物は、Avertin (250 mg/kg) の腹腔内投与で麻酔後頸椎脱臼による安楽死の後に、組織を摘出した。摘出した組織は重量を測定した後、液体窒素で速やかに凍結後-80℃にて保存した。
1.各組織からのRNA抽出
凍結保存された各組織をTRIzol Reagent (LThermo Fisher Scientific, MA, USA)中で、PT10-35 GT Polytron homogenizer (KINEMATICA, Luzern, Switzerland) で15,000 r.p.m. で10分間ホモジナイズするか、乳鉢と乳棒を使い液体窒素中で粉砕、乾燥させた後、TRIzol Reagent (LThermo Fisher Scientific, MA, USA)中で、PT10-35 GT Polytron homogenizer (KINEMATICA, Luzern, Switzerland) で15,000 r.p.m. で10分間ホモジナイズするか、Cell Destroyer PS1000またはPS2000(Bio Medical Science Inc., Tokyo, Japan) で異なるサイズのジルコニアビーズ(1.5 mm diameter × 50, 3 mm diameter × 5, 5 mm diameter× 2)を用いて4,260 rpmで45秒間、4℃でホモジナイズした。その後タンパク質を分離するため室温にて5分インキュベート後、1 ml のTRIzolに対して0.2mlのクロロホルムを加え、チューブの蓋をした後に15秒間激しくボルテックスした。撹拌後3分室温でインキュベートし、4℃で15分間12,000 gで遠心し、RNAを含む水相を新しいチューブに回収した。回収した水相に等量の70%エタノールを加え撹拌後、RNeasy mini column (Qiagen)に700μlずつアプライしRNeasy mini kit(Qiagen) 標準プロトコルに従って精製RNAを回収した。回収したRNAはNanodrop (Thermo Fisher Scientific, MA, USA) にて品質および濃度の確認を行った。
(1)RNAseqデータの取得
上記試料を使用してRNAseqのデータを以下の手順で取得した。
下記項目にて、受入サンプルの品質検定を行った。
・Nanodrop(分光光度計)を用いた濃度測定
・Agilent 2100 Bioanalyzerによる濃度測定・品質の確認
SureSelect Strand-Specific RNA ライブラリ調製キットを用いて次世代シークエンサーHiSeq 用ライブラリを以下の工程に従い調製した。
i. Total RNA から、オリゴ(dT)磁性ビーズを用いて、poly (A)+RNA (mRNA) を回収
ii. RNA の断片化
iii. cDNA 合成
iv. 2 本鎖 cDNA 合成
v. 末端修復、リン酸化、A テイル付加
vi. インデックス付アダプターのライゲーション
vii. 13 サイクルPCR
viii. 磁性ビーズによる精製
次世代シーケンサHiSeq 2500または4000 (illumina 社)を使用し、以下の工程に従いシーケンスを行った。
i. シーケンス試薬の添加
試薬:TruSeq PE Cluster Kit v3 - cBot - HS (1 flowcell) <PE-401-3001> (illumina 社)
試薬:TruSeq SBS Kit v3 - HS (200 cycle) <FC-401-3001> (illumina 社)
ii. 1塩基伸長反応
iii. 未反応塩基の除去
iv. 蛍光シグナルの取り込み
v. 保護基と蛍光の除去
2Cycle…3Cycle…とサイクルを繰り返し、100 cycle まで実施。
vi. 逆鎖(Read2)について、i~viを100 cycle まで実施
(2)−1.次世代シーケンサ出力データの解析
上記出力データについて、下記に挙げる情報処理を実施した。
i.ベースコール:出力された解析生データ(画像データ)より、塩基配列のテキストデータを取得した。
ii.フィルタリング:所定のフィルタリングによるリードデータの選別を行った。
iii.Index配列による振り分け:Index情報による各サンプルデータの振り分けを行った。
Illumina Hiseq2500または4000にて得られたデータファイル(Fastq形式)をローカルサーバーにダウンロードしたGalaxy (https://usegalaxy.org/) 上にアップロードした。その後マウスゲノムマップ情報mm10に各配列をマッピングするためにBowtie2(http://bowtie-bio.sourceforge.net/bowtie2/index.shtml) を用いて解析した。Bowtie2で得られたBAMファイルをCufflinks (http://cole-trapnell-lab.github.io/cufflinks/) にて解析することで遺伝子のFPKM(RPKM)を算出した。すなわちこの解析では、各組織に発現している全てのRNAを解析対象とした。
各組織から得られたTotal RNA 1 μgをcDNA合成のテンプレートとしOligo dT20プライマーを用いてSuperscrtipt III First-Strand Synthesis Supermix (Life technologies) の標準プロトコルに従いcDNAを合成した。合成されたcDNAをTEバッファー(10mM Tris-HCl pH8.0、0.1 mM EDTA)にて20倍希釈した後 、LightCycler 480 SYBR Green I Master(Roche, Basel, Switzerland) の標準プロトコルに従い、LightCycler480II (Roche) にてリアルタイムPCRを行いCp値を測定した。各遺伝子で得られたCp値はreference geneとしてβ2−ミクログロブリン(B2m)のCp値と比較することでreference geneに対する各遺伝子の相対的発現量を定量した。リアルタイムPCRで使用したプライマーペアは表6の通りである。全てのプライマーはPrimer-BLAST(NCBI)で設計した。
発現差のある遺伝子を抽出するため、Bowtie2によってマッピングされた配列データについてHTSeq-count(パラメーターは -rがpos、および -sがno)を使用してそれぞれの転写物のアノテーションリードナンバーをカウントした。得られた結果は、DESeq2(Love, M. I., Huber, W. & Anders, S.; Genome biology 15, 550, doi:10.1186/s13059-014-0550-8 (2014))解析により、デフォルト設定で行った。発現差は、E-UNx/HPi vs. E-/M-/L-Sham (n=3)、M-UNx/HPi vs. E-/M-/L-Sham (n=3)、L-UNx/HPi vs. E-/M-/L-Sham (n=3)で比較した。遺伝子オントロジー解析(Gene ontology (GO) enrichment analysis)は、R package “topGO”を使用して行った。遺伝子オントロジー解析において、DESeq2解析の結果が1以上のものであり、かつP値が0.05より小さいものを「log2 (fold-change)」として定義した。
統計解析は、ステューデントのt検定を行うか、または一元配置分散分析を行った後Tukey-Kramer検定で有意差を求めた。そしてp値が0.05より小さい場合に有意差有りと定義した(* p < 0.05、 ** p < 0.01、 and *** p < 0.001)。散布図において平均値は横線で表す。
図25に高リン食開始後1週間後(E-UNx/HPi)、4週間後(M-UNx/HPi)、8週間後(L-UNx/HPi)の頭蓋骨のボルカノプロットを示す。各mRNAのDESeq解析後のプロットを小さな点で示し、Oscarを大きな点で示した。E-UNx/HPi、M-UNx/HPi、L-UNx/HPiとも、Oscar遺伝子は、shamマウス(LPi)よりもUNx/HPiモデルマウス(HPi)において発現が上昇していた。また、図26Aに各組織におけるOscar遺伝子の発現のDESeq解析結果を示す。Oscar遺伝子は-UNx/HPiモデルの頭蓋骨でE-、M-、L-に渡って高い発現を示した。また、この結果については、qRT-PCRで確認を行った(n=8~9)。その結果、頭蓋骨において、E-UNx/HPi、M-UNx/HPi、L-UNx/HPiとも、Oscar遺伝子は、shamマウス(LPi)よりもUNx/HPiモデルマウス(HPi)において発現が上昇していた(図26B)。DESeq解析では、腎臓でのOscar遺伝子の発現は、わずかに発現上昇を示したが、qRT-PCRで確認を行ったところ有意差は認められなかった(図26C)。
参考実施例2:可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクの調製
可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクをコードする塩基配列を有する含む発現プラスミドを動物細胞で発現させ、配列番号2に示す可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクを調製した。該タンパク質の調製は、株式会社プロテイン・エクスプレス(千葉、日本)に依頼した。
MALVLILQLLTLWPLCHTDITPSVAIIVPPASYHPKPWLGAQPATVVTPGVNVTLRCRAPQPAWRFGLFKPGEIAPLLFRDVSSELAEFFLEEVTPAQGGSYRCCYRRPDWGPGVWSQPSDVLELLVTEELPRPSLVALPGPVVGPGANVSLRCAGRLRNMSFVLYREGVAAPLQYRHSAQPWADFTLLGARAPGTYSCYYHTPSAPYVLSQRSEVLVISWEGEGPEARPASDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK*(配列番号2)
(下線―hinge regionを示す。hinge regionより上流がヒトOscarの配列であり、hinge regionより下流が、ヒトIgG1配列である。)
FreeStyle293-F細胞を、FreeStyle293 Expression Medium (Invitrogen)で継代培養を行った。継代培養は500mlフラスコを用い、振とう速度120rpm、二酸化炭素濃度8%、温度37℃にて培養を行った(170mL培地)。トランスフェクション前日に細胞を6 x 105 cells/mLに希釈し全量1Lとし、24時間培養した。培養後、1 x 106 cells/mLの細胞数に調整し、トランスフェクションに用いた。
37℃に温めておいたOptiProSFM (Invitrogen) 30 mLにトランスフェクション試薬薬293fection T ransfection Reagent( Invitrogen ) 2.1 mL を添加し、試薬溶液とした。同様にOptiPro SFM 30mL に下記配列を有するkozak-hOscar-hIgG1-intronXbaIを含むpcDNA3(インビトロジェン) 1 mgを添加し、DNA溶液とした。作製した試薬溶液とDNA溶液を室温で5分間インキュベートした。5分後の試薬溶液とDNA溶液を混合し、トランスフェクション溶液とした。トランスフェクション溶液を室温で20分間インキュベートし、トランスフェクション用に調整された培養液に添加した。トランスフェクション開始から1日目、2日目、3日目にサンプリングを行い、4日目に培養を終了した。得られたサンプルを遠心操作で上清と沈殿に分け、SDS-PAGE及びウエスタンブロッティングでタンパク質の発現を確認した。
aagcttgccaccATGGCCCTCGTGCTTATCCTCCAACTTCTCACGCTTTGGCCTCTGTGCCACACCGACATTACTCCGTCTGTTGCGATAATTGTCCCTCCCGCCTCTTATCACCCTAAACCTTGGCTGGGCGCACAGCCAGCTACTGTGGTTACTCCTGGGGTGAACGTAACACTGCGCTGCCGTGCTCCTCAGCCCGCCTGGAGATTTGGGTTGTTTAAGCCCGGAGAGATAGCACCACTGCTGTTTCGGGATGTGTCCTCAGAGCTGGCTGAGTTCTTCCTGGAAGAGGTCACTCCTGCCCAAGGAGGCAGCTATCGGTGCTGTTATAGGCGGCCGGATTGGGGACCCGGCGTTTGGTCCCAACCATCTGATGTGCTCGAACTGCTTGTGACAGAAGAGCTGCCCAGACCTAGCTTGGTAGCCTTGCCCGGTCCTGTCGTCGGACCTGGTGCCAATGTTTCTCTTCGATGTGCCGGAAGGCTGCGCAATATGTCCTTTGTACTGTATAGGGAGGGAGTAGCCGCACCTCTGCAGTATAGGCATAGCGCTCAGCCCTGGGCGGATTTTACTCTGCTTGGTGCCAGAGCACCCGGGACCTATTCCTGCTACTACCACACTCCTTCCGCACCCTACGTCCTGTCACAGAGATCAGAAGTGCTCGTGATCTCCTGGGAGGGAGAAGGCCCAGAAGCCGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGgtaagccagcccaggcctcgccctccagctcaaggcgggacaggtgccctagagtagcctgcatccagggacaggccccagccgggtgctgacacgtccacctccatctcttcctcagCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGgtgggacccgtggggtgcgagggccacatggacagaggccggctcggcccaccctctgccctgagagtgactgctgtaccaacctctgtccctacagGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTAAATGAtctaga(配列番号20)
培養上清(1L)をBipoResin Protein A (10mL)にロードし、目的タンパク質の精製を行った。PBSで洗浄後、100mMクエン酸バッファー pH2.5にて目的タンパク質の溶出を行った(5mL×5)。溶出液は1M Tris-HCI pH9.0で中和した。精製後、各フラクションについて、SDS-PAGE及びウエスタンブロッティングでタンパク質の精製を確認した。その結果溶出画分に目的タンパク質のバンドを確認した。目的タンパク質を含むフラクションを回収し、PBSにバッファー交換した(全量50mL)。かくしてl mg/mLの可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクを得た。
実施例2:HPモデルマウスへの可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパク投与実験
HPマウス(高リン食負荷マウス)は、高リン食で飼育して作製した。このモデルにおいて、可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクを毎週投与した。
高リン食マウス(HP)は、マウス (C57BL/6N、8週齢オス)に、特別リン含有食として2%無機リン含有高リン食 (TD.10662, オリエンタルバイオサービス)を与え作製した。低リン食マウス(LP)は、0.35%無機リン含有低リン食 (TD.10662変型, オリエンタルバイオサービス)を与えた。
高リン食開始日(第0週)から1週間毎に可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパク(10 mg/kg)を第4週までの計5回を腹腔内投与した。本実験においてのコントロール群には、生理食塩水を投与した。
第4週の5回目の腹腔内投与が終了した翌日に、組織を摘出した。組織を摘出する動物は、トリブロモエタノール麻酔(250 mg/kg)下で眼窩よりEDTA添加チューブへの採血後、頸椎脱臼して安楽死させ、器官、および組織(頭蓋骨、脳、下垂体、耳下腺、甲状腺、心臓、肺、膵臓、腎臓、副腎、肝臓、脾臓、胸腺、大動脈、大腿筋、皮膚、精巣、脂肪組織、胃、空腸、回腸、大腸、骨髄細胞)を摘出した。摘出した器官、および組織は湿重量を測定した後、液体窒素で速やかに凍結後-80℃にて保存した。採取した血液は、室温にて10分間1200gで遠心した。遠心後に上清の血漿を回収し、-80℃にて保存した。
3−1.各組織からのRNA抽出
凍結保存された各組織をTRIzol Reagent (LThermo Fisher Scientific, MA, USA)中で、PT10-35 GT Polytron homogenizer (KINEMATICA, Luzern, Switzerland) で15,000 r.p.m. で10分間ホモジナイズするか、Cell Destroyer PS1000またはPS2000(Bio Medical Science Inc., Tokyo, Japan) で異なるサイズのジルコニアビーズ(1.5 mm diameter × 50, 3 mm diameter × 5, 5 mm diameter× 2)を用いて4,260 rpmで45秒間、4℃でホモジナイズした。その後タンパク質を分離するため室温にて5分インキュベート後、1 ml のTRIzolに対して0.2mlのクロロホルムを加え、チューブの蓋をした後に15秒間激しくボルテックスした。撹拌後3分室温でインキュベートし、4℃で15分間12,000 gで遠心し、RNAを含む水相を新しいチューブに回収した。回収した水相に等量の70%エタノールを加え撹拌後、RNeasy mini column (Qiagen)に700μlずつアプライしRNeasy mini kit(Qiagen)標準プロトコルに従って精製RNAを回収した。回収したRNAはNanodrop (Thermo Fisher Scientific, MA, USA)にて品質および濃度の確認を行った。
各組織から得られたTotal RNA 0.5−1 μgをcDNA合成のテンプレートとしOligo dT20プライマーを用いてSuperscrtipt III First-Strand Synthesis Supermix (Life technologies) の標準プロトコルに従いcDNAを合成した。合成されたcDNAをTEバッファー(10mM Tris-HCl pH8.0、0.1 mM EDTA)にて20倍希釈した後、LightCycler 480 SYBR Green I Master (Roche, Basel, Switzerland)の標準プロトコルに従い、LightCycler480II (Roche)にてリアルタイムPCRを行いCp値を測定した。各遺伝子で得られたCp値はreference geneとしてMaeaのCp値と比較することでreference geneに対する各遺伝子の相対的発現量を定量した。リアルタイムPCRで使用したプライマーペアは表7の通りである。全てのプライマーはPrimer-BLAST(NCBI)で設計した。
FGF23の血漿中濃度は、カイノス社より販売されているELISAキット(TCY4000) を用いて測定した。冷凍庫にて凍結保存されていた血漿サンプルを氷上で融解し、無希釈サンプル又は、キット付属の標準溶液1(FGF-23 0 pg/ml)を用いて5倍希釈したサンプルを測定に用いた。
統計解析は、ステューデントのt検定を行うか、または一元配置分散分析を行った後Tukey-Kramer検定で有意差を求めた。そしてp値が0.05より小さい場合に有意差有りと定義した。
以下、図において、HP4Wは高リン食開始後4週間のマウス、LP4Wは低リン食開始後4週間のマウス(対照群)を示す。sOscarは、可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクを投与したマウスであり、NSは可溶性ヒトOscar-Fc融合タンパクに代えて、生理食塩水を投与したマウスである。WT(12W)は、普通食で飼育した12週齢のオスの野生型マウスを示す。
マウス (C57BL/6N、8週齢オス)に特別リン含有食として2%無機リン含有高リン食(TD.10662, オリエンタルバイオサービス) 又は0.35%無機リン含有低リン食(TD.10662変型, オリエンタルバイオサービス)を4週間与えた後に採取し凍結保存していた血漿サンプル(LP4W, HP4W)、12週齢オスマウス(C57BL/6N)から採取し凍結保存していた血漿サンプル(WT (12W))及び、8週齢オスマウス (C57BL/6N)に対して片腎摘出を行い、4週間の適応期間を経た後に高リン食で4週間飼育してその後に採取し凍結保存していた血漿サンプル(UNx/HP4W)、各々100μlずつを用いて血漿中クレアチニン値を、酵素法により測定した。
腎機能に対する可溶性Oscar-Fc融合タンパクの効果を評価するため、参考実施例2のHP4W_NS、HP4W_sOscar、LP4Wの腎臓における腎機能マーカーの発現を確認した。
腎臓では、高リン食により発現誘導されるフィブリノーゲン遺伝子の一つであるFgg遺伝子の発現が、可溶性Oscar-Fc融合タンパクの投与により有意に抑制されていた(図34)(p=0.00071;n=5〜6)。フィブリノーゲン遺伝子は腎機能マーカー及び、治療標的としての報告がありる。このことから、可溶性Oscar-Fc融合タンパク投与によって、高リン状態に伴う腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療できる可能性があることが示唆された。
3 入力部
4 表示部
5a 装置
5b 装置
5c 装置
6,7 予測装置
11 第1の測定値取得部
12 第2の測定値取得部
13 測定値比較部
14 候補物質決定部
21 第1の評価結果取得部
22 第2の評価結果取得部
23 評価結果比較部
24 候補物質決定部
52 反応/泳動部
53 検出部
61 被験データ取得部
62 パターン類似度算出部
63 予測部
71 病期情報取得部
72 病期情報照合部
73 パターン抽出部
74 予測部
100,110,120,130 システム
101 CPU
102 メモリ
103 記録部
104 バス
105 インタフェース部
109 記録媒体
Claims (19)
- 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置であって、
前記スクリーニング装置は、
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得手段であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、図23に記載するFGF23以外の遺伝子であって、前記遺伝子の発現が図23において示す組織において、1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す遺伝子より選択される少なくとも一種に由来し、
前記検体が、前記遺伝子の発現が1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す被験組織に由来する前記第1の測定値取得手段(但し、被験組織には腎臓は含まれない)、及び
前記第1の測定値取得手段が取得した測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定手段
を有する、
前記スクリーニング装置。 - 被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(未処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第2の測定値取得手段であって、
前記未処理検体は前記被験物質処理検体が採取された被験組織に対応する被験組織より採取されたものであり、
未処理検体について測定される腎機能予測マーカータンパク質は、前記被験物質処理検体について測定される腎機能予測マーカータンパク質に対応する
前記第2の測定値取得手段、及び
被験物質処理検体の前記測定値及び未処理検体の前記測定値を比較する測定値比較手段、
をさらに有し、
前記決定手段は、前記測定値比較手段の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、請求項1に記載のスクリーニング装置。 - 前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、請求項1又は2に記載のスクリーニング装置。
- コンピュータに実行させたときに、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするための処理を当該コンピュータに実施させるスクリーニングプログラムであって、
前記処理が、
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第1の測定値取得処理であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、図23に記載するFGF23以外の遺伝子であって、前記遺伝子の発現が図23において示す組織において、1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す遺伝子より選択される少なくとも一種に由来し、
前記検体が、前記遺伝子の発現が1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す被験組織に由来する前記第1の測定値取得処理(但し、被験組織には腎臓は含まれない)、及び
前記第1の測定値取得処理で取得された測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定処理、
を含む、
スクリーニングプログラム。 - さらに、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(未処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する第2の測定値取得処理であって、
前記未処理検体は前記被験物質処理検体が採取された被験組織に対応する被験組織より採取されたものであり、
未処理検体について測定される腎機能予測マーカータンパク質は、前記被験物質処理検体について測定される腎機能予測マーカータンパク質に対応する
前記第2の測定値取得処理、及び
被験物質処理検体の前記測定値及び未処理検体の前記測定値を比較する測定値比較処理、
を前記コンピュータに実施させ、
前記決定処理では、前記測定値比較処理の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、請求項4に記載のスクリーニングプログラム。 - 前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、請求項4又は5に記載のスクリーニングプログラム。
- 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法であって、
(I)被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値を取得する工程であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、図23に記載するFGF23以外の遺伝子であって、前記遺伝子の発現が図23において示す組織において、1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す遺伝子より選択される少なくとも一種に由来し、
前記検体が、前記遺伝子の発現が1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す被験組織に由来する前記工程(但し、被験組織には腎臓は含まれない)、及び
(II)前記工程(I)で得られた測定値に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程
を含む、
前記スクリーニング方法。 - 前記工程(I)と(II)の間に、前記工程(I)で取得された被験物質処理検体の測定値と、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(未処理検体)の対応する腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値とを比較する工程であって、
前記未処理検体は前記被験物質処理検体が採取された被験組織に対応する被験組織より採取されたものであり、
未処理検体について測定される腎機能予測マーカータンパク質は、前記被験物質処理検体について測定される腎機能予測マーカータンパク質に対応する
工程、
をさらに含む、請求項7に記載のスクリーニング方法。 - 前記工程(I)の前に、
(i)被験体(ヒトを除く)を、被験物質で処理する工程、
(ii)前記工程(i)において被験物質で処理された被験体に由来する被験組織から検体を採取する工程、及び
(iii)前記工程(ii)で得られた検体からタンパク質及び/又はmRNAを回収する工程
を含む、請求項7又は8に記載の方法。 - 前記腎機能予測マーカータンパク質が、Aplnr、Spp1、Dnase1、Slco1a1、Anpep、Slc7a8、Oscar、Proline−rich proteins、Defensins及びHamp/Hepcidinからなる群から選択される少なくとも一種である、請求項7から9のいずれか一項に記載の方法。
- 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置であって、
前記スクリーニング装置は、
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得手段であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1及びOscarよりなる群から選択される少なくとも一種であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1であるとき、検体は顎下腺、空腸及び回腸よりなる群から選択される少なくとも一種に由来し、前記腎機能予測マーカータンパク質が、Oscarであるとき、検体は頭蓋骨及び血液試料よりなる群から選択される少なくとも一種に由来する前記第1の測定値取得手段、及び
前記第1の評価結果取得手段が取得した評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定手段
を有する、
前記スクリーニング装置。 - 被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(未処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第2の評価結果取得手段であって、
前記未処理検体は前記被験物質処理検体が採取された被験組織に対応する被験組織より採取されたものであり、
未処理検体について機能が評価される腎機能予測マーカータンパク質は、前記被験物質処理検体について機能が評価される腎機能予測マーカータンパク質に対応する
前記第2の測定値取得手段、及び
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較手段、
をさらに有し、
前記決定手段は、前記評価結果比較手段の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、請求項11に記載のスクリーニング装置。 - コンピュータに実行させたときに、腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするための処理を当該コンピュータに実施させるスクリーニングプログラムであって、
前記処理が、
被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第1の評価結果取得処理であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1及びOscarよりなる群から選択される少なくとも一種であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1であるとき、検体は顎下腺、空腸及び回腸よりなる群から選択される少なくとも一種に由来し、前記腎機能予測マーカータンパク質が、Oscarであるとき、検体は頭蓋骨及び血液試料よりなる群から選択される少なくとも一種に由来する前記第1の測定値取得処理、及び
前記第1の評価結果取得処理で取得された評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する決定処理、
を含む、
スクリーニングプログラム。 - さらに、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(未処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果を取得する第2の評価結果取得処理であって、
前記未処理検体は前記被験物質処理検体が採取された被験組織に対応する被験組織より採取されたものであり、
未処理検体について機能が評価される腎機能予測マーカータンパク質は、前記被験物質処理検体について機能が評価される腎機能予測マーカータンパク質に対応する
前記第2の測定値取得処理、及び
被験物質処理検体の前記評価結果及び未処理検体の前記評価結果を比較する評価結果比較処理、
を前記コンピュータに実施させ、
前記決定処理では、前記評価結果比較処理の比較結果に基づいて前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する、請求項13に記載のスクリーニングプログラム。 - 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法であって、
(I)被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)、又は被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)の腎機能予測マーカータンパク質の機能を評価する工程であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1及びOscarよりなる群から選択される少なくとも一種であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1であるとき、検体は顎下腺、空腸及び回腸よりなる群から選択される少なくとも一種に由来し、前記腎機能予測マーカータンパク質が、Oscarであるとき、検体は頭蓋骨及び血液試料よりなる群から選択される少なくとも一種に由来する前記工程、及び
(II)前記工程(I)で得られた評価結果に基づいて、前記被験物質が有効成分の候補物質であると決定する工程
を含む、
前記スクリーニング方法。 - 前記工程(I)と(II)の間に、前記工程(I)で取得された被験物質処理検体の前記評価結果と、被験物質で処理されていない被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(未処理検体)の対応する腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果とを比較する工程
であって、
前記未処理検体は前記被験物質処理検体が採取された被験組織に対応する被験組織より採取されたものであり、
未処理検体について機能が評価される腎機能予測マーカータンパク質は、前記被験物質処理検体について機能が評価される腎機能予測マーカータンパク質に対応する
工程
をさらに含む、請求項15に記載のスクリーニング方法。 - 前記工程(I)の前に、
(i)被験体(ヒトを除く)を、被験物質で処理する工程、及び(ii)前記工程(i)において被験物質で処理された被験体に由来する被験組織から検体を採取する工程
を含む、請求項15又は16に記載のスクリーニング方法。 - 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするための、被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の測定値及び/又は前記タンパク質のmRNAの測定値の使用であって、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、図23に記載するFGF23以外の遺伝子であって、前記遺伝子の発現が図23において示す組織において、1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す遺伝子より選択される少なくとも一種に由来し、
前記検体が、前記遺伝子の発現が1.5より大きい値を示すか、0.8より小さい値を示す被験組織に由来する(但し、被験組織には腎臓は含まれない)、
前記使用。 - 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質をスクリーニングするための、被験物質で処理された被験体(ヒトを除く)に由来する被験組織から採取された検体(被験物質処理検体)中の腎機能予測マーカータンパク質の機能の評価結果の使用であって、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1又はOscarよりなる群から選択される少なくとも一種であり、
前記腎機能予測マーカータンパク質が、Dnase1であるとき、検体は顎下腺、空腸及び回腸よりなる群から選択される少なくとも一種に由来し、前記腎機能予測マーカータンパク質が、Oscarであるとき、検体は頭蓋骨及び血液試料よりなる群から選択される少なくとも一種に由来する、前記使用。
Applications Claiming Priority (5)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP2016066696 | 2016-03-29 | ||
| JP2016066696 | 2016-03-29 | ||
| JP2017015821 | 2017-01-31 | ||
| JP2017015821 | 2017-01-31 | ||
| PCT/JP2017/012761 WO2017170610A1 (ja) | 2016-03-29 | 2017-03-28 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
Related Child Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2018195341A Division JP2019047791A (ja) | 2016-03-29 | 2018-10-16 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPWO2017170610A1 JPWO2017170610A1 (ja) | 2018-09-27 |
| JP6432962B2 true JP6432962B2 (ja) | 2018-12-05 |
Family
ID=59964726
Family Applications (2)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2018508107A Active JP6432962B2 (ja) | 2016-03-29 | 2017-03-28 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
| JP2018195341A Pending JP2019047791A (ja) | 2016-03-29 | 2018-10-16 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
Family Applications After (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP2018195341A Pending JP2019047791A (ja) | 2016-03-29 | 2018-10-16 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
Country Status (5)
| Country | Link |
|---|---|
| US (1) | US12091701B2 (ja) |
| EP (2) | EP4005598A1 (ja) |
| JP (2) | JP6432962B2 (ja) |
| CN (3) | CN114686584A (ja) |
| WO (1) | WO2017170610A1 (ja) |
Families Citing this family (28)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2016208776A1 (ja) * | 2015-06-25 | 2016-12-29 | 株式会社国際電気通信基礎技術研究所 | 多器官連関システムを基盤とした予測装置、及び予測プログラム |
| EP3466446B1 (en) | 2016-03-29 | 2023-12-27 | Karydo Therapeutix, Inc. | Pharmaceutical composition or food composition, and method for assessing effect of active ingredient in vivo |
| JP6432962B2 (ja) | 2016-03-29 | 2018-12-05 | 株式会社国際電気通信基礎技術研究所 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
| WO2019026918A1 (ja) * | 2017-08-01 | 2019-02-07 | 株式会社国際電気通信基礎技術研究所 | 皮膚のバイオマーカー |
| JP2020146317A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146309A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146301A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146316A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146313A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146315A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146307A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146303A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146314A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146300A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146311A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146310A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146298A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146302A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146305A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146312A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146299A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146318A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146304A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146308A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| JP2020146306A (ja) * | 2019-03-14 | 2020-09-17 | 株式会社三洋物産 | 遊技機 |
| CN110890132A (zh) * | 2019-11-19 | 2020-03-17 | 湖南大学 | 基于自适应高斯混合模型的癌症突变簇识别方法 |
| IL322733A (en) | 2023-03-03 | 2025-10-01 | Karydo Therapeutix Inc | Antibody or antigen-binding fragment thereof |
| CN116843666B (zh) * | 2023-07-19 | 2025-07-08 | 福建省立医院 | 基于肾精细解剖的肾影像计算残肾肾功能的方法 |
Family Cites Families (59)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE4400745A1 (de) | 1994-01-13 | 1995-07-20 | Basf Ag | Testverfahren zur Identifizierung von beta-Fibrinogen-Senkern |
| AUPP362898A0 (en) | 1998-05-21 | 1998-06-11 | University Of Sydney, The | Xenobiotic induction of gene expression |
| JP3589113B2 (ja) * | 1998-09-24 | 2004-11-17 | 田辺製薬株式会社 | 腎疾患治療薬およびそのスクリーニング方法 |
| JP2002527489A (ja) | 1998-10-22 | 2002-08-27 | キュラゲン コーポレイション | 腎疾患および関連疾患に対する予想および治療的遺伝子およびタンパク質 |
| US20050079514A1 (en) | 1999-01-06 | 2005-04-14 | Chondrogene Limited | Method for the detection of Alzheimer's disease related gene transcripts in blood |
| US6647341B1 (en) | 1999-04-09 | 2003-11-11 | Whitehead Institute For Biomedical Research | Methods for classifying samples and ascertaining previously unknown classes |
| EP1180686B1 (en) * | 1999-05-27 | 2009-10-14 | CMIC Co., Ltd. | Remedies for kidney diseases and method for screening the same |
| WO2002020718A2 (en) | 2000-09-05 | 2002-03-14 | The Rockefeller University | Osteoclast-associated receptor |
| US6964850B2 (en) | 2001-11-09 | 2005-11-15 | Source Precision Medicine, Inc. | Identification, monitoring and treatment of disease and characterization of biological condition using gene expression profiles |
| US20050118586A1 (en) | 2001-11-28 | 2005-06-02 | Stephane Bejanin | Human cdnas and proteins and uses thereof |
| JP4527982B2 (ja) | 2001-12-28 | 2010-08-18 | 協和発酵キリン株式会社 | 線維芽細胞増殖因子−23に対する抗体 |
| WO2003057874A1 (fr) * | 2001-12-28 | 2003-07-17 | Sumitomo Pharmaceuticals Company, Limited | Marqueurs de maladies pour maladies renales et leur utilisation |
| GB0205455D0 (en) | 2002-03-07 | 2002-04-24 | Molecular Sensing Plc | Nucleic acid probes, their synthesis and use |
| KR20040111456A (ko) | 2002-04-04 | 2004-12-31 | 이시하라 산교 가부시끼가이샤 | 데이터 해석 장치 및 방법 |
| CA2487895A1 (en) * | 2002-05-31 | 2003-12-11 | Ciphergen Biosystems, Inc. | Defensins: use as antiviral agents |
| WO2004005934A2 (en) * | 2002-07-04 | 2004-01-15 | Oxford Glycosciences (Uk) Ltd | Toxicity markers |
| GB0215509D0 (en) * | 2002-07-04 | 2002-08-14 | Novartis Ag | Marker genes |
| JP2004187620A (ja) | 2002-12-13 | 2004-07-08 | Sumitomo Pharmaceut Co Ltd | 腎疾患の疾患マーカーおよびその利用 |
| US8068990B2 (en) | 2003-03-25 | 2011-11-29 | Hologic, Inc. | Diagnosis of intra-uterine infection by proteomic analysis of cervical-vaginal fluids |
| US20050112701A1 (en) | 2003-09-11 | 2005-05-26 | Aventis Pharma Deutschland Gmbh | Test system for the identification of APJ receptor ligands |
| DE602004032457D1 (de) | 2003-11-07 | 2011-06-09 | Novartis Ag | Nten |
| JP2005229834A (ja) | 2004-02-17 | 2005-09-02 | Shionogi & Co Ltd | 糸球体を用いたスクリーニング方法 |
| WO2005106493A1 (en) | 2004-04-30 | 2005-11-10 | Bayer Healthcare Ag | Diagnostics and therapeutics for diseases associated with g protein-coupled apelin receptor (apj) |
| WO2005114207A2 (en) | 2004-05-13 | 2005-12-01 | Bayer Healthcare Ag | Diagnostics and therapeutics for diseases associated with aminopeptidase n (anpep) |
| JP2005323573A (ja) * | 2004-05-17 | 2005-11-24 | Sumitomo Pharmaceut Co Ltd | 遺伝子発現データ解析方法および、疾患マーカー遺伝子の選抜法とその利用 |
| US7820382B2 (en) | 2004-08-03 | 2010-10-26 | Bauer A Robert | Method for the early detection of breast cancer, lung cancer, pancreatic cancer and colon polyps, growths and cancers as well as other gastrointestinal disease conditions and the preoperative and postoperative monitoring of transplanted organs from the donor and in the recipient and their associated conditions related and unrelated to the organ transplantation |
| EP1634948A1 (en) | 2004-09-10 | 2006-03-15 | Basf Aktiengesellschaft | Means and methods for preventing and/or treating caries |
| CN101218355A (zh) | 2004-11-05 | 2008-07-09 | 海军秘书处代表的美国政府 | 利用宿主血液生物基因表达标记诊断和预后判断感染性疾病的临床表型及其它生理状态 |
| US9002652B1 (en) | 2005-01-27 | 2015-04-07 | Institute For Systems Biology | Methods for identifying and using organ-specific proteins in blood |
| NZ593226A (en) | 2006-01-11 | 2012-10-26 | Genomic Health Inc | Gene expression markers (efnb2) for colorectal cancer prognosis |
| WO2007103541A2 (en) | 2006-03-09 | 2007-09-13 | The Trustees Of Boston University | Diagnostic and prognostic methods for lung disorders using gene expression profiles from nose epithelial cells |
| EP2041317A4 (en) | 2006-07-13 | 2009-10-14 | Univ Ohio State Res Found | METHODS AND COMPOSITIONS BASED ON MICRO-RNA FOR THE DIAGNOSIS AND TREATMENT OF COLON CANCER RELATED DISEASES |
| TW201307390A (zh) * | 2007-02-02 | 2013-02-16 | Amgen Inc | 海帕西啶(hepcidin)、海帕西啶拮抗劑及使用方法 |
| CN103399155A (zh) | 2007-03-26 | 2013-11-20 | 诺瓦提斯公司 | 用于监测肾功能的预测性的肾安全性生物标志物和生物标志物标签 |
| WO2010100633A1 (en) | 2009-03-01 | 2010-09-10 | Compugen Ltd. | Biomarkers for the prediction of renal injury |
| WO2009101181A2 (en) * | 2008-02-14 | 2009-08-20 | Universite Libre De Bruxelles | New plasma membrane biomarkers preferentially expressed in pancreatic beta cells useful in imaging or targeting beta cells |
| WO2010006414A1 (en) | 2008-06-30 | 2010-01-21 | Genenews Inc. | Methods, kits and compositions for determining severity and survival of heart failure in a subject |
| JP5444363B2 (ja) | 2008-10-31 | 2014-03-19 | セントビンセンツ ホスピタル シドニー リミテッド | 慢性腎疾患における予後判定の方法 |
| JP5481619B2 (ja) | 2009-08-31 | 2014-04-23 | 国立大学法人名古屋大学 | デノボ癌を自然発症するモデル動物及びその用途 |
| EA201290106A1 (ru) | 2009-09-18 | 2012-12-28 | Астьют Медикал, Инк. | Способы и композиции для диагностики и прогнозирования повреждения почек и почечной недостаточности |
| WO2011063470A1 (en) | 2009-11-27 | 2011-06-03 | Baker Idi Heart And Diabetes Institute Holdings Limited | Lipid biomarkers for stable and unstable heart disease |
| EP2531622B1 (en) | 2010-02-05 | 2016-04-06 | Astute Medical, Inc. | Methods and compositions for diagnosis and prognosis of renal injury and renal failure |
| EP2561091B1 (en) | 2010-04-20 | 2014-08-06 | Comprehensive Biomarker Center GmbH | Complex mirna sets as novel biomarkers for an acute coronary syndrome |
| CA2806296A1 (en) * | 2010-07-23 | 2012-01-26 | President And Fellows Of Harvard College | Methods of detecting kidney-associated diseases or conditions |
| EP2596132A4 (en) | 2010-07-23 | 2013-12-18 | Harvard College | METHOD FOR DETECTING SIGNS FOR ILLNESS OR SUFFERING IN BODY FLUIDS |
| TW201209171A (en) | 2010-07-23 | 2012-03-01 | Harvard College | Methods of detecting diseases or conditions using phagocytic cells |
| WO2012113413A1 (en) | 2011-02-21 | 2012-08-30 | Curevac Gmbh | Vaccine composition comprising complexed immunostimulatory nucleic acids and antigens packaged with disulfide-linked polyethyleneglycol/peptide conjugates |
| WO2013011063A1 (en) | 2011-07-18 | 2013-01-24 | Novo Nordisk A/S | Antagonistic antibodies against oscar |
| WO2013011059A1 (en) | 2011-07-18 | 2013-01-24 | Novo Nordisk A/S | Antagonist antibodies against oscar |
| AR087363A1 (es) | 2011-07-29 | 2014-03-19 | Pf Medicament | Uso del anticuerpo i-3859 para la deteccion y diagnostico de los canceres |
| AU2012350654C1 (en) | 2011-12-12 | 2018-05-10 | Pieris Ag | Methods for preventing or treating disorders by increasing bioavailability of iron and related pharmaceutical formulation |
| CN102558336B (zh) | 2012-01-13 | 2017-07-21 | 重庆医科大学 | Prr11基因及其编码的蛋白和应用 |
| WO2015069900A1 (en) | 2013-11-06 | 2015-05-14 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | Methods for profiliing and quantitating cell-free rna |
| US20140038203A1 (en) | 2012-07-09 | 2014-02-06 | Musc Foundation For Research Development | Methods for detecting or predicting kidney disease |
| EP3031921B1 (en) | 2012-12-12 | 2025-03-12 | The Broad Institute, Inc. | Delivery, engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation and therapeutic applications |
| JP6196034B2 (ja) | 2012-12-20 | 2017-09-13 | ライオン株式会社 | 高血糖リスク判定用マーカーペプチドおよびその用途 |
| US10570128B2 (en) * | 2014-05-28 | 2020-02-25 | Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute | Agonists of the apelin receptor and methods of use thereof |
| WO2016208776A1 (ja) | 2015-06-25 | 2016-12-29 | 株式会社国際電気通信基礎技術研究所 | 多器官連関システムを基盤とした予測装置、及び予測プログラム |
| JP6432962B2 (ja) | 2016-03-29 | 2018-12-05 | 株式会社国際電気通信基礎技術研究所 | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 |
-
2017
- 2017-03-28 JP JP2018508107A patent/JP6432962B2/ja active Active
- 2017-03-28 EP EP21203319.5A patent/EP4005598A1/en active Pending
- 2017-03-28 WO PCT/JP2017/012761 patent/WO2017170610A1/ja not_active Ceased
- 2017-03-28 CN CN202210266914.7A patent/CN114686584A/zh active Pending
- 2017-03-28 US US16/089,593 patent/US12091701B2/en active Active
- 2017-03-28 EP EP17775147.6A patent/EP3438282A4/en active Pending
- 2017-03-28 CN CN201780033224.4A patent/CN109196119A/zh active Pending
- 2017-03-28 CN CN202210267284.5A patent/CN114594268A/zh active Pending
-
2018
- 2018-10-16 JP JP2018195341A patent/JP2019047791A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| WO2017170610A1 (ja) | 2017-10-05 |
| US20190218587A1 (en) | 2019-07-18 |
| EP3438282A1 (en) | 2019-02-06 |
| CN109196119A (zh) | 2019-01-11 |
| US12091701B2 (en) | 2024-09-17 |
| JPWO2017170610A1 (ja) | 2018-09-27 |
| EP4005598A1 (en) | 2022-06-01 |
| CN114594268A (zh) | 2022-06-07 |
| JP2019047791A (ja) | 2019-03-28 |
| EP3438282A4 (en) | 2020-05-06 |
| CN114686584A (zh) | 2022-07-01 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP6432962B2 (ja) | 腎機能低下、慢性腎疾患及び腎不全からなる群から選択される少なくとも一種の疾患を予防、又は治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング方法 | |
| Pool et al. | The cellular basis of distinct thirst modalities | |
| Schütt et al. | Dogs with cognitive dysfunction as a spontaneous model for early Alzheimer’s disease: a translational study of neuropathological and inflammatory markers | |
| Perez et al. | Absence of the proapoptotic Bax protein extends fertility and alleviates age-related health complications in female mice | |
| US20220076832A1 (en) | Prediction device based on inter-organ cross talk system | |
| JP6414869B2 (ja) | 腎機能の評価装置、腎疾患の合併症の発症の予測装置、およびリン摂取量推定装置 | |
| JP2009521211A (ja) | 情動障害の治療に有用な薬剤の同定のためのバイオマーカー及び方法 | |
| Gerritsen et al. | Elevated urinary connective tissue growth factor in diabetic nephropathy is caused by local production and tubular dysfunction | |
| Stern et al. | Hypertrophic cardiomyopathy in purpose-bred cats with the A31P mutation in cardiac myosin binding protein-C | |
| Rock et al. | Developmental transcriptomic patterns can be altered by transgenic overexpression of Uty | |
| Vejandla et al. | Deficiency in nebulin repeats of sarcomeric nebulette is detrimental for cardiomyocyte tolerance to exercise and biomechanical stress | |
| Huang et al. | A novel de novo mutation in COL1A1 leading to osteogenesis imperfecta confirmed by zebrafish model | |
| Kumar et al. | Generation and standardized, systemic phenotypic analysis of Pou3f3L423P mutant mice | |
| JP6332780B2 (ja) | 医薬組成物又は食品組成物、及び有効成分の体内での効果の評価方法 | |
| JP2018105726A (ja) | 心筋梗塞、認知症、および腫瘍からなる群から選択される一種を予防、または治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置、スクリーニングプログラム、およびスクリーニング方法 | |
| JP7445288B2 (ja) | 皮膚のバイオマーカー | |
| Batan et al. | System Biology Research to Advance the Understanding of Canine Cancer | |
| JP2021051085A (ja) | 心筋梗塞、認知症、および腫瘍からなる群から選択される一種を予防、または治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置、スクリーニングプログラム、およびスクリーニング方法 | |
| JP2021047198A (ja) | 心筋梗塞、認知症、および腫瘍からなる群から選択される一種を予防、または治療するための有効成分の候補物質のスクリーニング装置、スクリーニングプログラム、およびスクリーニング方法 | |
| Chen | Applying Forward Genetic Approaches to Rare Mendelian Disorders and Complex Traits | |
| Tsuji | provide explanation to the cell-type specific vulnerability observed in neurodegenerative diseases. In addition, targeting spliceosome and/or Gem stability in notor neurons may represent a new class of candidate therapeutics for notor | |
| Blankenhorn et al. | Identification of the Gene for Scleroderma in the Tsk/2 Mouse Strain: Implications for Human Scleroderma Pathogenesis and Subset Distinctions | |
| Gerritsen et al. | Research Article Elevated Urinary Connective Tissue Growth Factor in Diabetic Nephropathy Is Caused by Local Production and Tubular Dysfunction | |
| Williams | A Systems Approach to Identify Genetic and Environmental Regulators of Metabolism |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180418 |
|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20180418 |
|
| A871 | Explanation of circumstances concerning accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A871 Effective date: 20180418 |
|
| A975 | Report on accelerated examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A971005 Effective date: 20180508 |
|
| A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20180612 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20180802 |
|
| TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
| A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20181002 |
|
| A521 | Request for written amendment filed |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20181016 |
|
| A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20181031 |
|
| A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20180418 |
|
| R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6432962 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
| S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313113 |
|
| R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
| R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
