JP6859314B2 - Hcv ns4a/改変されたns3ポリペプチド及びその使用 - Google Patents
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Description
本願は、2015年3月27日出願の米国特許仮出願第62/139,183号の利益を主張するものである。
(合衆国政府の助成による研究又は開発に関する陳述)
該当なし。
(c)標識ディテクターを工程(b)から得た第1の免疫複合体に追加することであって、この標識ディテクター免疫複合体に反応性であること;及び(d)生体サンプル内のHCV抗体の存在の指標として標識ディテクターと第1の免疫複合体との間に形成された第2の免疫複合体を検出すること(存在する場合)。好ましくは、標識ディテクターは、抗体又は抗原である。好ましくは、イムノアッセイ試薬は、固体担体に結合している。
本発明の記述において、以下の用語を利用し、それらは以下のように定義されることを意図している。
本発明を詳細に説明する前に、本発明が特定の処方又は処理パラメーターに限定されないこと、したがって当然ながら変化し得ることが理解されるべきである。本明細書で用いられる専門用語が、本発明の特定の実施形態を説明することのみを目的とし、限定することを意図するものではないことも理解されるべきである。
HCV株のゲノムは、約9,000〜12,000ヌクレオチドの単一のオープンリーディングフレームを含み、これは、ポリタンパク質に転写される。図1及び表1に示されるように、HCVポリタンパク質は、開裂時、次の順序で少なくとも10個の異なる生成物を産生する:NH2−コア−E1−E2−p7−NS2−NS3−NS4a−NS4b−NS5a−NS5b−COOH。コアポリペプチドは、HCV−1に対して番号が付された、配列番号1の1〜191位で生じる(HCV−1ゲノムについては、Choo et al.(1991)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 88:2451〜2455を参照されたい)。このポリペプチドは、更にプロセシングされて、ほぼ配列番号1のアミノ酸1〜173を有するHCVポリペプチドを産生する。エンベロープポリペプチド、E1及びE2は、大体、配列番号1の192〜383位及び配列番号1の384〜746位でそれぞれ発生する。P7ドメインは、大体、配列番号1の747〜809位で見出される。NS2は、タンパク質分解活性を有する内在性膜タンパク質であり、大体、ポリタンパク質の配列番号1の810〜1026位で見出される。NS2は、NS3(大体、配列番号1の1027〜1657位で見出される)との組み合わせで、NS2−NS3の切断しやすい結合を開裂し、次にNS3のN末端を生成し、セリンプロテアーゼ活性及びRNAヘリカーゼ活性の両方を含む大きなポリタンパク質を放出する。NS3プロテアーゼ(大体、配列番号1の1027〜1207位で見出される)は、残りのポリタンパク質をプロセシングするために役立つ。ヘリカーゼ活性は、大体、配列番号1の1193〜1657位で見出される。NS3は、NS3補因子(大体、配列番号1の1658〜1711位で見出されるNS4a)、2つのタンパク質(大体、配列番号1の1712〜1972位で見出されるNS4b、及び大体、配列番号1の1973〜2420位で見出されるNS5a)、及びRNA依存性RNAポリメラーゼ(大体、配列番号1の2421〜3011位で見出されるNS5b)を遊離させる。ポリタンパク質成熟の完了は、NS3セリンプロテアーゼによって触媒されたNS3−NS4a接合部での自己触媒的開裂によって開始される。
抗HCV抗体(同じ又は異なるHCVドメインエピトープに対して指向される)は、例えば、HCV抗コア抗体を含み得る。本発明において有用な特定の抗コア抗体の実施例は、抗体分子、例えば、配列番号1のアミノ酸10〜53、配列番号1のアミノ酸10〜45、配列番号1のアミノ酸67〜88、配列番号1のアミノ酸120〜130の間で見出されるコア領域内のエピトープに対して指向されるモノクローナル抗体、又は、例えば、米国特許第6,630,298号;米国特許第6,150,087号;米国特許第6,346,375号;Houghtonら、米国特許第5,350,671号;Chien et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1992)89:10011〜10015;Chien et al.,J.Gastroent.Hepatol.(1993)8:S33〜39;Chienら、国際公開第93/00365号;及びChien,D.Y.、国際公開第94/01778号(これらの開示は、本明細書に全体にわたり参照により組み込まれる)で同定されるコアエピトープのいずれかに対して指向される抗体などが挙げられるが、これらに限定されない。
上述のように、本発明の分子は、一般に、組み換え的に産生される。したがって、本発明で使用するHCV抗原をコードするポリヌクレオチドは、分子生物学の標準技術を使用して作製され得る。例えば、上述の分子をコードするポリヌクレオチド配列は、例えば、その遺伝子を発現する細胞からcDNAライブラリー及びゲノムライブラリーをスクリーニングすることによって、又はその遺伝子を含むことが知られているベクターからその遺伝子を誘導することによってなど、組み換え法を使用して得ることができる。更に、所望の遺伝子は、Houghtonら、米国特許第5,350,671号などで、当該技術分野において記載される技術を使用してウイルス核酸分子から直接単離することができる。目的の遺伝子はまた、クローン化されるのではなく合成的にも産生され得る。この分子を、特定の配列用に適切なコドンで設計することができる。次に完全な配列は、標準手法によって調製された重複オリゴヌクレオチドからアセンブリされ、完全なコード配列にアセンブリされる。例えば、Edge(1981)Nature 292:756;Nambair et al.(1984)Science 223:1299;及びJay et al.(1984)J.Biol.Chem.259:6311を参照されたい。
ひとたび産生されると、そのHCV抗原を、周知の抗原を使用する実質的に任意のアッセイ形式で使用して、抗体を検出することができる。これらのアッセイ全ての共通の特徴は、サンプル中に存在する任意のそのような抗体に、抗原が結合することを可能にする条件下で、抗原を、HCV抗体を含むと疑われる生体サンプルと接触させることである。そのような条件は、典型的には、過剰の抗原を使用した、生理的な温度、pH、及びイオン強度であろう。抗原の検体によるインキュベーションの後に、抗原からなる免疫複合体の検出が続く。
以下は、本発明を実施するための特定の実施形態の実施例である。実施例は、例示の目的のみで提供され、いかなるようにも本発明の範囲を限定することを意図しない。
3つの突然変異(Ile1043Lys、Ile1044Lys、Ser1165Ala)を有するNS4a−ターン−NS3をコードするプラスミドpd.4a.t.ns3.1165.KKを以下のように4工程の手順で生成した。
配列番号6:CTAGGGTGCAAGAAGACCAGCCTAAC
配列番号7:AGGCTGGTCTTCTTGCACC
配列番号8:TGTCGGCCGACCTGGAGGTCGTCACGTGATAAG
配列番号9:TCGACTTATCACGTGACGACCTCCAGGTCGGCCGACATGCA
S.cerevisiae株AD3(MATa,leu2,ura3−52,prb1−1122,pep4−3,prc1−407,gal2,[cir0],:pDM15(pGAP/ADR1:G418R),:Yip5ΔleuAD)を、S.c.EasyComp Transformation Kit(Invitrogen,(Carlsbad,CA)より入手される)を使用して、pd.4a.t.ns3.1165.KK #7によって形質転換した。ウラシルを含まない寒天プレートで増殖された形質転換体(8%グルコースを用いたUra−寒天プレート)を、単一のコロニーについて画線し、Leu−8%グルコース寒天プレート上にパッチして、プラスミドコピー数を増加させた。7.1%グルコースを含有するLeu−液体スターター培養物を30℃で24時間にわたり増殖させ、次に、YEPD(1%酵母抽出物、2%バクトペプトン、2%グルコース)培地に1:20に希釈した。細胞を30℃で48時間及び25℃で増殖させた。発現をテストするために、細胞のアリコートを、溶解緩衝液中でガラスビーズを用いて溶解した。組み換えタンパク質は、クマシーブルー染色によって検出され、モノクローナル抗体の抗C33C 4D−1を使用した免疫ブロット解析によって確認されたように酵母において高レベルで発現した。(この抗体は、Sansan Lin et.al,Journal of Clinical Microbiology,Aug.2005,p.3917〜3924に記載されている。)
精製水に、リン酸水素二ナトリウムを1.627g/L、リン酸二水素二ナトリウムを1.162g/L、塩化ナトリウムを29.22g/L、エデト酸二ナトリウムを0.336g/L、カゼインナトリウムを1.0g/L、及びProClinを0.5mL/L添加して、pHを約7.3に調節することによって、ベース緩衝液を調製した。好適な量の上記ベース緩衝液に、TWEEN20(商標)を5mL/L、SDS溶液(1%)を20mL/L、酵母抽出物を0.5g/L、及びBSA溶液(30%)を10g/L添加して、pHを6.4に調節し、結果として得られた溶液を、0.22μmのメンブランフィルタを通過させることによって、サンプル希釈剤を調製した。
HCV TMKK組み換え抗原を含む抗原の固相化のためのコーティング緩衝液を200μL/ウェルの量で分注し、一晩4℃で静置した。ウェル内の液体を除去した後、リン酸緩衝液で1回ウェルを洗浄した。次に、ブロッキング緩衝液を300μL/ウェルの量で分注し、4時間超室温で静置した。ウェル内の液体を除去した後、洗浄緩衝液で1回ウェルを洗浄して、その後固相プレートを作製するために乾燥させた。
抗原の固相化のためのコーティング緩衝液としてHCV TMKK組み換え抗原を使用する代わりにc200組み換え抗原を含む液体を用いることを除き、実施例1と同じ手順で光度計測を実行する。測定された値を表2に示す。
指示書に従い、上記サンプルから抗体を検出するためにRIBA3(Ortho Diagnostic Systems)を使用した。結果を表2に示す。表中、丸かっこ内のサンプル番号は、ProMedDxによって割り当てられたサンプル番号である。「NHS」は、正常なヒト血清であり、陰性対照として使用された。
C型肝炎ウイルス感染が遺伝子スクリーニングによって確認されているセロコンバージョンパネル(ZeptoMetrix)のパネル「6212」、「6215」、及び「9058」内のサンプルを使用することを除き、実施例1と同じ手順で光度計測を実行した。測定された値を表3〜5に示す。サンプルの枝番(例えば、「−1」、「−2」)が増加するにつれて、サンプルの血液採取日の遅いことを意味する、すなわちC型肝炎ウイルス感染がより進行したことを示す。各サンプルに対するRIBA3測定値の周知の結果もまた、表3〜5に示す。
セロコンバージョンパネル(ZeptoMetrix)のパネル「6212」、「6215」、及び「9058」内のサンプルを使用することを除き、比較実施例1と同じ手順で光度計測を実行した。測定された値を表3〜5に示す。
上述した「試薬の調製(1)」で調製された試薬を、後述の試薬を除き、使用する。
抗原の固相化のための上記コーティング緩衝液を200μL/ウェルの量で、96ウェルマイクロプレート(Corning high−bind type)に分注し、6時間室温で静置した。ウェル内の液体を除去した後、リン酸緩衝液で3回ウェルを洗浄した。次に、抗原の固相化のための上記コーティング緩衝液を200μL/ウェルの量で分注し、一晩4℃で置いた。ウェル内の液体を除去した後、リン酸緩衝液で1回ウェルを洗浄した。次に、ブロッキング緩衝液を300μL/ウェルの量で分注し、4時間超室温で静置した。ウェル内の液体を除去した後、洗浄緩衝液で1回ウェルを洗浄して、その後固相プレートを作製するために乾燥させた。
Claims (23)
- ポリペプチドを含むイムノアッセイ試薬であって、
配列番号3を有するC型肝炎ウイルスNS4aドメインと、
改変されたC型肝炎ウイルスNS3ドメインと、
前記改変されたNS3ドメインのアミノ末端に前記NS4aドメインのカルボキシ末端を接続する介在領域と、
を含む、ポリペプチド、を含み、
前記改変されたC型肝炎ウイルスNS3ドメインは、前記改変のない配列番号4を有するC型肝炎ウイルスNS3ドメインのプロテアーゼ活性と比較して、C型肝炎ウイルスNS3ドメインのプロテアーゼ活性を阻害するように、配列番号4の1つ又は2つ以上のアミノ酸残基が改変されており、
前記改変が、配列番号4のアミノ酸残基55、79、及び137のうち1つ又は2つ以上の置換を含む、
イムノアッセイ試薬。 - 前記置換が、アラニン又はグリシンの置換を含む、請求項1に記載のイムノアッセイ試薬。
- 前記置換が、アラニンによるアミノ酸残基137の置換を含む、請求項2に記載のイムノアッセイ試薬。
- 前記ポリペプチドの前記介在領域が、アミノ酸配列SGSを有する、請求項1に記載のイムノアッセイ試薬。
- 前記ポリペプチドが、配列番号2に示されるようなアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のイムノアッセイ試薬。
- 固体担体に結合される、請求項1に記載のイムノアッセイ試薬。
- 生体サンプル内のC型肝炎ウイルスに対する抗体を検出する方法であって、
(a)請求項1に記載のイムノアッセイ試薬を提供する工程と、
(b)HCV抗体が前記生体サンプル内に存在する場合にHCV抗体を前記ポリペプチドに結合させて第1の免疫複合体を形成することを可能にする条件下で生体サンプルを前記イムノアッセイ試薬と混合する工程と、
(c)標識ディテクターを工程(b)から得た前記第1の免疫複合体に追加する工程であって、前記標識ディテクターが前記第1の免疫複合体に反応性である工程と、
(d)前記生体サンプル内のC型肝炎ウイルスに対する前記抗体の存在の指標として、前記標識ディテクターと前記第1の免疫複合体との間に形成された第2の免疫複合体を、存在する場合に検出する工程と、を含む方法。 - 前記標識ディテクターが、標識抗体又は標識抗原である、請求項7に記載の方法。
- 前記イムノアッセイ試薬が、固体担体に結合している、請求項7に記載の方法。
- 生体サンプル内のC型肝炎ウイルスに対する抗体及び/又はC型肝炎ウイルス抗原を検出する方法であって、
(a)請求項1に記載のイムノアッセイ試薬を提供する工程と、
(b)生体サンプルと、前記イムノアッセイ試薬及び1つ又は2つ以上の抗HCV抗体とを、HCV抗体が前記生体サンプル内に存在する場合にHCV抗体を前記ポリペプチドに結合させて第1の免疫複合体を形成することを可能にする条件下、及びHCV抗原が前記生体サンプル内に存在する場合にHCV抗原を前記抗HCV抗体に更に結合させて第2の免疫複合体を形成することを可能にする条件下で混合する工程と、
(c)第1の標識ディテクターを工程(b)から得た前記第1の免疫複合体に追加する工程であって、前記第1の標識ディテクターが前記第1の免疫複合体に反応性である工程と、第2の標識ディテクターを工程(b)から得た前記第2の免疫複合体に追加する工程であって、前記第2の標識ディテクターが前記第2の免疫複合体に反応性である工程と、
(d)前記生体サンプル内のHCVに対する抗体及び/又はHCV抗原の存在の指標として、前記第1の標識ディテクターと前記第1の免疫複合体との間に形成された第3の免疫複合体を、存在する場合に検出する工程と、前記第2の標識ディテクターと前記第2の免疫複合体との間に形成された第4の免疫複合体を、存在する場合に検出する工程と、を含む方法。 - 前記第1の標識ディテクター及び前記第2の標識ディテクターが、それぞれ標識抗体又は標識抗原である、請求項10に記載の方法。
- 前記イムノアッセイ試薬の1つ又は2つ以上及び1つ又は2つ以上の抗HCV抗体が、同じ又は異なる固体担体に結合している、請求項10に記載の方法。
- 請求項1に記載のイムノアッセイ試薬と、免疫診断テストを実施するための指示書と、を含む、免疫診断テストキット。
- 1つ又は2つ以上の抗HCV抗体を更に含む、請求項13に記載の免疫診断テストキット。
- 前記1つ又は2つ以上の抗HCV抗体が、抗HCVコア抗体である、請求項14に記載の免疫診断テストキット。
- 配列番号2のアミノ酸配列を含む、単離ポリペプチド。
- 配列番号2のアミノ酸配列からなる、単離ポリペプチド。
- ヒト生体サンプルの供給から、請求項1に記載のイムノアッセイ試薬を用いて抗原抗体複合体を形成する抗体を含むサンプルを選択することを含む、ヒト生体サンプルの供給から生体サンプルを選択する方法。
- 前記選択することが、前記供給から除去するためのHCV陽性サンプルを同定することである、請求項18に記載の方法。
- 前記生体サンプルが血液である、請求項18に記載の方法。
- 血液関連製品の調製に選択されない生体サンプルを使用することを更に含む、請求項18に記載の方法。
- ヒト生体サンプルの供給から、請求項1に記載の前記イムノアッセイ試薬を用いて抗原抗体複合体を形成する抗体を含まないサンプルを選択することを含む、ヒト生体サンプルの供給から生体サンプルを選択する方法。
- 前記選択することが、血液関連製品の調製に有用な生体サンプルを同定することである、請求項22に記載の方法。
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