JP7628083B2 - 植物の形質および収量を改善するための新規な種子処理方法および組成物 - Google Patents

植物の形質および収量を改善するための新規な種子処理方法および組成物 Download PDF

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Description

相互参照
本出願は、２０１９年４月１７日に出願された、米国仮特許出願第６２／８３５，２８１号の利益を主張するものであり、これはその全体が引用により本明細書に組み込まれる。
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に提出され、参照により全体として本明細書に組み込まれる配列表を含んでいる。２０１９年４月１７日に作成された上記のＡＳＣＩＩコピーは、「５４４４９７０１１０１＿ＳＬ．ｔｘｔ」と命名され、８，５５５，４８０バイトの大きさである。
本発明は、植物に有益な微生物または２種類以上の微生物の合成的な組み合わせおよび／またはその浸出物および／またはその個別化された生体分子を種子内部に導入することからなる種子処理方法に関する。この方法は、特定の量の有益な微生物または２つ以上の微生物の合成的な組み合わせ、および／またはその浸出物、および／またはその個別化された生体分子で補足された、化学的に不活性であるが浸透的に活性な化合物の水溶液中での、種子の制御された迅速な吸水を含む。植物胚の初期の休眠後の段階での種子の水和と、植物に有益な微生物の組み込みは、種子処理から数ヶ月後であっても、迅速かつ均一な発芽を促進し、種子の活力を向上させ、植物の成長を促進し、および植物の形質を改善することができる。
２０５０年までに、世界の人口は９８億人に達すると予想されているが（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｕｎ．ｏｒｇ／ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ／ｄｅｓａ／ｅｎ／ｎｅｗｓ／ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ／ｗｏｒｌｄ－ｐｏｐｕｌａｔｉｏｎ－ｐｒｏｓｐｅｃｔｓ－２０１７．ｈｔｍｌ）、その一方で、５億ヘクタール以上の広大な原野が農地に変わると予想されている（ＩＲＰ，２０１７）。現在の状況では、農業生産は異常気象を伴う気候変動と新たな病原菌による厳しい課題に直面しなければならず、世界の農家は主に後者による収量の減少と低い営業利益率に対処しなければならない（ＧＡＰ ２０１７；Ｓｅｓｓｉｔｓｃｈ ｅｔ ａｌ．）。予想される世界的な人口増加と環境破壊の両方を考慮すると、今後１０年間で、持続可能で環境に優しいやり方で農業と食糧生産を大幅に増加させることが重要な課題になることは明らかである。
本明細書に記載される本発明の一態様は、植物の種子に細菌を組み込む方法であり、上記方法は、前記植物種子を、前記細菌を含む溶液と接触させる工程であって、ここで、前記溶液は、約０．１％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む、工程と、前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、少なくとも１コロニー形成単位（ＣＦＵ）の前記細菌を前記植物種子に組み込む、工程とを含む。いくつかの実施形態では、（ｂ）は、前記植物種子を前記溶液とインキュベートすることであって、それによって、少なくとも５００ＣＦＵの前記細菌を前記植物種子に組み込むことを含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、微生物浸出物を含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来しない。いくつかの実施形態では、前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、前記植物種子の種皮と胚の間に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本方法は、（ａ）の前に、前記植物種子を消毒する工程をさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約０．８５％の前記塩を含む。いくつかの実施形態では、前記塩は、ＮａＣｌを含む。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子を含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、ルリア・ベルターニ（ＬＢ）ブロスをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、カルシウム、マグネシウム、マンガン、カリウム、鉄、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約４℃～約４０℃、約２０℃～約４０℃、または約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約２３℃または約３０℃に維持される。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、約１分～約９６０分、約２０分～約２４０分、または約１分～約２０分、前記溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、約１分、約５分、約１０分、約２０分、約２４０分、または約９６０分、前記溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、上記方法は、前記内生胞子形成細菌の内生胞子形成（ｅｎｄｏｓｐｏｒｕｌａｔｉｏｎ）を誘導することをさらに含む。
本明細書に記載される本開示の別の態様は、改変された植物種子であって、改変された植物種子の種皮と胚との間に組み込まれた少なくとも１ＣＦＵの細菌を含む改変された植物種子である。いくつかの実施形態では、前記改変された植物種子は、少なくとも５００ＣＦＵまたは少なくとも１０００ＣＦＵの前記細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む。いくつかの実施形態では、前記改変された植物種子は、微生物浸出物を含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来しない。いくつかの実施形態では、前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記改変された植物種子は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子である。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、少なくとも１０００ＣＦＵの前記微生物を含む。
本明細書に記載される本開示の別の態様は、少なくとも１×１０３ＣＦＵ／ｍＬの１つ以上の細菌を含む製剤を含んでおり、ここで、前記製剤は、約０．１％～約２％の塩を含む。いくつかの実施形態では、前記製剤は、０．８５％の前記塩を含む。いくつかの実施形態では、前記塩は、ＮａＣｌを含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む。いくつかの実施形態では、前記製剤は、微生物浸出物を含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来しない。いくつかの実施形態では、前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記製剤はＬＢブロスをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記製剤は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記製剤は、カルシウム、マグネシウム、マンガン、カリウム、鉄、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記製剤は、約４℃～約４０℃、約２０℃～約４０℃、または約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される。いくつかの実施形態では、前記製剤は、約２３℃または約３０℃に維持される。いくつかの実施形態では、前記製剤は、少なくとも５×１０５ＣＦＵ／ｍＬの前記細菌を含む。
本明細書に記載される本開示の別の態様は、植物種子において植物成長効果を促進する方法であって、前記方法は、前記植物種子を、細菌を含む溶液と接触させる工程であって、ここで、前記溶液は、約０．１％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む、工程と、前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、少なくとも５００コロニー形成単位（ＣＦＵ）の前記細菌を前記植物種子に組み込む、工程とを含む。いくつかの実施形態では、本方法は、（ａ）の前に、前記植物種子を消毒する工程をさらに含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、微生物浸出物を含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記細菌に由来しない。いくつかの実施形態では、前記細菌は、前記改変された植物種子の種皮と胚の間に組み込まれる。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約０．８５％の前記塩を含む。いくつかの実施形態では、前記塩は、ＮａＣｌを含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子を含む。いくつかの実施形態では、前記溶液はＬＢブロスをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、カルシウム、マグネシウム、マンガン、カリウム、鉄、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約４℃～約４０℃、約２０℃～約４０℃、または約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約２３℃または約３０℃に維持される。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、約１分～約９６０分、約２０分～約２４０分、または約１分～約２０分、前記溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、約１分、約５分、約１０分、約２０分、約２４０分、または約９６０分、前記溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、上記方法は、前記内生胞子形成細菌の内生胞子形成を誘導することをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記植物成長効果は、収量増加、細胞の浸透圧制御、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、光合成能力の維持、窒素固定、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、前記細菌は、前記植物成長効果に関連して選択される。
本明細書に記載される本開示の別の態様は、植物種子において植物成長効果を促進する方法であって、前記方法は、前記植物種子を、微生物浸出物を含む溶液と接触させる工程であって、ここで、前記溶液は、約０．１％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む、工程と、前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、前記微生物浸出物を前記植物種子に組み込む、工程と、を含む。いくつかの実施形態では、本方法は、（ａ）の前に、前記植物種子を消毒する工程をさらに含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記非内生胞子形成細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記改変された植物種子の種皮と胚の間に組み込まれる。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約０．８５％の前記塩を含む。いくつかの実施形態では、前記塩は、ＮａＣｌを含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌に由来する。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐからの細菌を含む。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子を含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約４℃～約４０℃、約２０℃～約４０℃、または約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される。いくつかの実施形態では、前記溶液は、約２３℃または約３０℃に維持される。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、約１分～約９６０分、約２０分～約２４０分、または約１分～約２０分、前記溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、前記植物種子は、約１分、約５分、約１０分、約２０分、約２４０分、または約９６０分、前記溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、前記植物成長効果は、収量増加、細胞の浸透圧制御、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、光合成能力の維持、窒素固定、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、前記微生物浸出物は、前記植物成長効果に関連して選択される。
一態様では、（ｉ）間に間隙を有する、種子の果皮と種子のアリューロン細胞層、および、（ｉｉ）間隙に配置された１つ以上の微生物を含む、改変された種子が本明細書に記載されている。別の態様では、（ｉ）種子の果皮と種子のアリューロン細胞層、および、（ｉｉ）種子の果皮と種子のアリューロン細胞層の間に配置された１つ以上の微生物を含む、改変された種子が本明細書に記載されている。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物成長促進効果をもたらすように選択される。ある実施形態では、種子は単子葉植物の種子である。ある実施形態では、種子は、トウモロコシ、イネ、およびモロコシの種子から選択される。ある実施形態では、種子はトウモロコシの種子である。ある実施形態では、種子はトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｉｚｅ）の種子である。ある実施形態では、種子は双子葉植物の種子である。ある実施形態では、種子は、大豆、小麦、綿、アルファルファ、レタス、トマト、およびキャベツの種子から選択される。ある実施形態では、種子はレタス（ｌｅｔｔｕｃｅ）の種子である。ある実施形態では、種子はレタス（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）の種子である。ある実施形態では、種子はトマト（ｔｏｍａｔｏ）の種子である。ある実施形態では、種子はトマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）の種子である。ある実施形態では、種子はＧＭＯ種子である。ある実施形態では、種子は非ＧＭＯ種子である。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍの混合物を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍの混合物を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉの混合物を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓの混合物を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓの混合物を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、内生胞子形成細菌を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、種子内に配置された後に内生胞子を形成する。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、内生胞子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上の化合物をコードする遺伝子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上の化合物をコードする遺伝子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物の発育を引き起こす１つ以上の化合物をコードする遺伝子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、窒素固定に関連する遺伝子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、リン酸塩の可溶化に関連する遺伝子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物ホルモン合成に関連する遺伝子を含む。ある実施形態では、操作された種子は、微生物浸出物をさらに含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、植物の発育を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、非内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。
ある態様において、１つ以上の植物種子を処理する方法が本明細書に記載され、上記方法は、１つ以上の種子を培地に浸漬させる工程であって、上記培地が、塩と、植物の成長促進効果をもたらすように選択された１つ以上の微生物とを含む、工程と、１つ以上の微生物を種子に組み込ませるのに十分な期間、培地中で１つ以上の種子をインキュベートする工程とを含む。別の態様において、１つ以上の植物種子を処理する方法が本明細書に記載され、上記方法は、１つ以上の種子を培地に浸漬させる工程であって、培地が、塩と、植物の成長促進効果をもたらすように選択された１つ以上の微生物とを含む、工程と、細菌を果皮とアリューロン細胞層との間に組み込むために、１つ以上の種子を培地中とインキュベートする工程とを含む。ある実施形態では、１つ以上の植物の種子は、処理後に休眠段階のままである。ある実施形態では、１つ以上の植物の種子は、処理後に休眠段階のままである。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、種子の果皮の内部に組み込まれる。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、果皮とアリューロン細胞層との間に組み込まれる。ある実施形態では、方法は、１つ以上の種子を培地から除去する工程をさらに含む。ある実施形態では、方法は、１つ以上の種子を乾燥させる工程をさらに含む。ある実施形態では、１つ以上の種子は、全種子水分の約１０％まで乾燥される。ある実施形態では、方法は、発芽を防ぐために１つ以上の種子を乾燥させる工程をさらに含む。ある実施形態では、方法は、１つ以上の種子を培地に浸す前に、１つ以上の種子の表面を殺菌する工程をさらに含む。ある実施形態では、方法は、１つ以上の種子を培地に浸漬した後に、１つ以上の種子の表面を殺菌する工程をさらに含む。ある実施形態では、方法は、種子の表面に殺菌剤を添加する工程をさらに含む。ある実施形態では、１つ以上の種子は、単子葉植物の種子を含む。ある実施形態では、種子は、トウモロコシ、イネ、およびモロコシの種子から選択される。ある実施形態では、種子はトウモロコシの種子である。ある実施形態では、種子はトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｉｚｅ）の種子である。ある実施形態では、種子は双子葉植物の種子である。ある実施形態では、種子は、大豆、小麦、綿、アルファルファ、レタス、トマト、およびキャベツの種子から選択される。ある実施形態では、種子はレタス（ｌｅｔｔｕｃｅ）の種子である。ある実施形態では、種子はレタス（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）の種子である。ある実施形態では、種子はトマト（ｔｏｍａｔｏ）の種子である。ある実施形態では、種子はトマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）の種子である。ある実施形態では、種子はＧＭＯ種子である。ある実施形態では、種子は非ＧＭＯ種子である。ある実施形態では、培地は水性培地である。ある実施形態では、培地はポロキサマー１８８をさらに含む。ある実施形態では、培地は０．１％の濃度でポロキサマー１８８をさらに含む。ある実施形態では、培地はＴｗｅｅｎ ２０をさらに含む。ある実施形態では、培地は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、およびポロキサマー４０７の群から選択された１つ以上の薬剤をさらに含む。ある実施形態では、培地は、１つ以上の細菌の内生胞子形成（ｅｎｄｏｓｐｏｒｕｌａｔｉｏｎ）を促進する１つ以上の成分をさらに含む。ある実施形態では、培地は、カリウム、硫酸第一鉄、カルシウム、マグネシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせを含む。ある実施形態では、培地はマンガンをさらに含む。ある実施形態では、培地はカルシウム、マグネシウム、およびマンガンを含む。ある実施形態では、培地は１つ以上の微生物のための栄養素をさらに含む。ある実施形態では、培地は室温である。ある実施形態では、培地は、約４℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約１０℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約１５℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約４℃から約２０℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約３０℃から約４０℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約２０℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約３０℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約２０℃から約２４℃の温度である。ある実施形態では、培地は、約４０℃の温度である。ある実施形態では、塩は塩化ナトリウムを含む。ある実施形態では、塩は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の濃度である。ある実施形態では、塩は、約０．８５％の濃度である。ある実施形態では、塩は約１．２５％以下の濃度である。ある実施形態では、塩は約１．２５％の濃度である。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓおよびＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、内生胞子形成細菌を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、および、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、
１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、種子内に組み込まれた後に内生胞子を形成する。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、内生胞子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ内生胞子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、培地は微生物浸出物をさらに含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、植物の発育を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、非内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、培地中の１つ以上の微生物の濃度は、約１×１０６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの範囲内である。ある実施形態では、培地中の１つ以上の微生物の濃度は、１×１０６～１×１０７ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０７～１×１０８ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０８～１×１０９ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０９～１×１０１０ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１０～１×１０１１ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１１～１×１０１２ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１２～１×１０１３ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１３～１×１０１４ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１４～１×１０１５ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１５～１×１０１６ＣＦＵ／ｍＬ、または１×１０１６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬである。ある実施形態では、培地中に存在する１つ以上の微生物の量が１０１０ＣＦＵ／種子未満である。ある実施形態では、培地中に存在する１つ以上の微生物の量は、種子１グラムあたり約１０５～１０９の細胞である。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物成長促進効果をもたらすように選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物の植物成長促進効果は、細胞の浸透圧制御、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、および／または光合成能力の維持を含む群の１つ以上から選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、互換性のために選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、捕食作用または拮抗作用が進行しないように選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、保存中の安定性のためにも選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物の迅速なコロニー化および関連組織内での生存のためにも選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物において大規模かつ長期的な生理学的応答を刺激するためにも選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、１つ以上の種子への最適な組み込みのために選択される。ある実施形態では、微生物の少なくとも１つは植物生活環全体にわたって存在し続ける。ある実施形態では、インキュベーション時間は１分未満である。ある実施形態では、インキュベーション時間は約１分である。ある実施形態では、インキュベーション時間は２０分未満である。ある実施形態では、インキュベーション時間は４時間未満である。ある実施形態では、インキュベーション時間は１６時間未満である。ある実施形態では、インキュベーション時間は数日間未満である。ある実施形態では、インキュベーション時間は１２時間未満である。ある実施形態では、１×１０６よりも多くの細菌細胞が、１つ以上の種子のそれぞれに組み込まれる。ある実施形態では、１×１０５～１×１０８の細菌細胞が、１つ以上の種子のそれぞれに組み込まれる。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、１つ以上の種子に安定的に組み込まれる。ある実施形態では、組み込まれた１つ以上の微生物は、３０日を超えて安定している。ある実施形態では、組み込まれた１つ以上の微生物は、６ヶ月を超えて安定している。ある実施形態では、組み込まれた１つ以上の微生物は少なくとも１年間安定している。ある実施形態では、組み込まれた１つ以上の微生物は少なくとも２年間安定している。
別の態様では、塩と１つ以上の微生物とを含む植物種子処理培地が本明細書に記載される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、植物成長促進効果を与えるように選択される。ある実施形態では、培地は水性培地である。ある実施形態では、培地はポロキサマー１８８をさらに含む。ある実施形態では、培地は０．１％の濃度でポロキサマー１８８をさらに含む。ある実施形態では、培地はＴｗｅｅｎ ２０をさらに含む。ある実施形態では、培地は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、およびポロキサマー４０７を含む群からの１つ以上の薬剤をさらに含む。ある実施形態では、培地は、１つ以上の細菌の内生胞子形成（ｅｎｄｏｓｐｏｒｕｌａｔｉｏｎ）を促進する１つ以上の成分をさらに含む。ある実施形態では、培地は、カリウム、硫酸第一鉄、カルシウム、マグネシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせをさらに含む。ある実施形態では、培地はマンガンをさらに含む。ある実施形態では、培地はカルシウム、マグネシウム、およびマンガンをさらに含む。ある実施形態では、培地は選択された１つ以上の微生物のための栄養素をさらに含む。ある実施形態では、塩は塩化ナトリウムを含む。ある実施形態では、塩は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の濃度である。ある実施形態では、塩は、約０．８５％の濃度である。ある実施形態では、塩は約１．２５％以下の濃度である。ある実施形態では、塩は約１．２５％の濃度である。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓとＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、内生胞子形成細菌を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、種子内に組み込まれた後に内生胞子を形成する。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、内生胞子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ内生胞子を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む。ある実施形態では、培地は微生物浸出物をさらに含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、植物の発育を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、非内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、培地中の１つ以上の微生物の濃度は、約１×１０６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの範囲内である。ある実施形態では、培地中の１つ以上の微生物は、約１×１０６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの範囲内である。ある実施形態では、培地中の１つ以上の微生物の濃度は、１×１０６～１×１０７ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０７～１×１０８ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０８
～１×１０９ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０９～１×１０１０ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１０～１×１０１１ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１１～１×１０１２ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１２～１×１０１３ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１３～１×１０１４ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１４～１×１０１５ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１５～１×１０１６ＣＦＵ／ｍＬ、または１×１０１６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬである。
別の態様では、１つ以上の植物種子を処理する方法が本明細書に記載され、上記方法は、１つ以上の種子を培地に浸漬させる工程であって、培地が、塩と、植物の成長促進効果をもたらすように選択された１つ以上の微生物浸出物とを含む、工程と、１つ以上の微生物浸出物を種子に組み込ませるのに十分な期間、培地中で１つ以上の種子をインキュベートする工程とを含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、植物の発育を引き起こす１つ以上の化合物を含む。ある実施形態では、微生物浸出物は、内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、非内生胞子形成細菌からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のうちのいずれかの１６Ｓ核酸配列に少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである。ある実施形態では、塩は塩化ナトリウムを含む。ある実施形態では、塩は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の濃度である。ある実施形態では、塩は、約０．８５％の濃度である。ある実施形態では、塩は約１．２５％以下の濃度である。ある実施形態では、塩は約１．２５％の濃度である。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓに由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される微生物に由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、 Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、 Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、 Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、 Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、 Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、 Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、 Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、 Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、 Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、 Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、 Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、 Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、 Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、 Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、 Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、 Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、 Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、 Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、 Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、 Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、 Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、 Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、 Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、 Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、 Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、 Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、 Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、 Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．および、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される微生物に由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、ｐｈｙｌａ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される微生物に由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．に由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、ｐｈｙｌａ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される微生物に由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．に由来する。ある実施形態では、微生物浸出物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．に由来する。引用による組み込み
本明細書で言及されるすべての出版物、特許、および特許出願は、あたかも個々の出版物、特許、または特許出願が参照により組み込まれるように具体的かつ個々に指示される程度に、参照により本明細書に組み込まれる。参照により組み込まれる特許公開、特許、または特許出願が本明細書に含まれる開示に矛盾するという程度まで、本明細書は、そのような矛盾のある題材に取って代わるおよび／またはそれに優先することを意図している。
特許または出願のファイルは、色つきで作成された少なくとも１つの図面を含む。カラーの図面を有するこの特許または特許出願公開のコピーは、必要な料金の請求および支払い後に当該事務局によって提供される。
本明細書に記載される方法および組成物の新規な特徴は、添付の請求項で具体的に説明される。本明細書に記載される方法および組成物の原則が用いられている具体的な実施形態を説明する以下の詳細な記載、および、添付の図面を参照することで、本明細書に記載される方法と組成物の特徴と利点がより良く理解されるであろう。
提唱された本発明の実施による２段階の植物強化戦略を描いている。（１０１）は、単子葉植物の種子を例示している。本明細書に記載される種子処理プロセスは、アリューロン層（１０３）と果皮（１０２）との間に細菌（またはその内生胞子）（１０６）を組み込む。アリューロン層（１０３）は、胚乳（１０４）を外層から分離している。本明細書に記載される植物成長効果の促進は、細菌（１０６）および／または細菌浸出物による植物胚（１０５）の遺伝子改変に起因する。 種子処理プロセス（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセス）を示すプロセス図である。 安定した微生物技術の種子処理（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）を得るための本発明の方法を描いている。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後に細菌が位置するトウモロコシ種子（Ｚｅａ ｍａｙｓ）内部の空間を示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後に細菌が位置するトウモロコシ種子（Ｚｅａ ｍａｙｓ）内部の空間の拡大画像を示す。 合成細菌コンソーシアム（Ｌａｓｃａｒ）のレタス種子（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）へのＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理によるローディング動態を示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理によって種子に事前にロードされた特定の菌株のトウモロコシ植物（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の根における分子検出を示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子からの細菌を研究および定量化するために使用される二重管増殖チャンバを示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）の種子処理によって種子にロードされた細菌による植物の根のコロニー化を定量化したものである。 レタスの種子（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）の内部に収容された細菌コンソーシアムの経時的安定性を示す。 トウモロコシの種子（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の内部に収容されたＢａｃｉｌｌｕｓの内生胞子の経時的安定性を示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後のトウモロコシ種子（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の経時的安定性を示す。 内部ではＬａｓｃａｒと呼ばれている細菌の独自の組成物を使用するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理のレタス種子（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）に対する効果を示す。 国内でＪＩＴと呼ばれている細菌の独自の組成物を使用するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理のレタス種子（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）に対する時間的な効果を示す。 塩分ストレス下で成長するレタスの種子（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 トマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）の成長および発育に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 シュート重量によって測定されるトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の成長および発育に対する、単一の細菌（Ｓ３Ｃ１）によるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 根重量によって測定されるトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の成長および発育に対する、単一の細菌（Ｓ３Ｃ１）によるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 シュート重量によって測定されるトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の成長および発育に対する、２つの細菌（Ｓ３Ｃ１０株およびＳ３Ｃ２３株）を含む合成コンソーシアムによるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 根重量によって測定されるトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の成長および発育に対する、２つの細菌（Ｓ３Ｃ１０株およびＳ３Ｃ２３株）を含む合成コンソーシアムによるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 シュート長さによって測定されるトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の成長および発育に対する、２つの細菌（Ｓ３Ｃ１０株およびＳ３Ｃ２３株）を含む合成コンソーシアムによるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 アセチレン還元アッセイにおける固定窒素細菌（Ｓ３Ｃ１４株）のパフォーマンスを示す。 窒素欠乏症下での窒素固定菌（Ｓ３Ｃ１４株）の内生胞子によるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理した種子からのトウモロコシ植物（Ｚｅａ ｍａｙｓ）のパフォーマンスを示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）による種子処理に対応したトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の遺伝子群の発現パターンを示す。 水ストレス条件下でのＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）のトウモロコシ植物（Ｚｅａ ｍａｙｓ）のパフォーマンスを示す。 シュート重量によって測定される、圃場（フィールド）条件下でのＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）トウモロコシ植物（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の栄養発育の効果を示す。 全植物重量によって測定される、圃場条件下でのＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）トウモロコシ植物（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の栄養発育の効果を示す。 様々な生殖成長期にある穂の割合を示すグラフとしての、圃場条件下でのトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）のライフサイクルに対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 トウモロコシの画像で示されるような、圃場条件下でのトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）のライフサイクルに対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 圃場条件下でのトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の収量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 圃場で成長しているＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）のトウモロコシ植物（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の穀物タンパク質含有量を示す。 窒素の存在下でのアセチレン還元アッセイにおける固定窒素細菌（Ｓ３Ｃ２３株）のパフォーマンスを示す。 圃場における窒素欠乏下でのトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の収量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。 Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理技術を用いて行われたトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の圃場試験データをまとめた成功率を示す。
本発明の実施形態が本明細書中で示され、記載されているが、このような実施形態はほんの一例として提供されるものであることは、当業者に明らかであろう。多くの変形、変更、および置き換えは、本発明から逸脱することなく、当業者によって想到され得る。本明細書に記載される本発明の実施形態の様々な代案が利用され得ることを理解されたい。
農業は、人間の健康に対する潜在的なリスクを伴う環境破壊に最も貢献している人間活動の一つである。農業活動は、土地の侵食、栄養素の枯渇、酸性化、塩化、圧密、化学的汚染を引き起こし、土壌を中程度から高度に劣化させる。特に、従来の農法では、作物の収量を向上させるために、合成肥料や農薬の使用に大きく依存している。これらの製品は主に農業分野で使用されるが、林業、家庭菜園、およびレクリエーションの分野でも使用されている。これらの化学汚染物質は、その生産と使用の両方において環境リスクを引き起こす可能性がある。過剰に使用されると、土壌中の必須栄養素のバランスが崩れ、土壌微生物叢や土壌動物相に悪影響を及ぼす可能性があり、最終的には農業に適さない土地になってしまうかもしれない。
私たちの社会は現在、より持続可能な生産システムを求めており、いくつかの国の規制の枠組みは、作物の形質を改善するための遺伝子組み換えの使用を受け入れていない。さらに、多くの化学物質が今後数年間で市場から撤去される予定である（Ｓｅｓｓｉｔｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，２０１８；Ｔｉｍｍｕｓｋ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。このような消費者の圧力は、多くの合成化合物の撤退や、規制環境により課される最大残留基準値の引き下げに有利に働いている。例えば、人や環境の健康に悪影響を及ぼすことが明らかになっているため（温室効果ガス、地球温暖化、水質汚染、土壌中の生物窒素固定の減少、土壌の生物多様性と遺伝資源の損失など）、窒素系肥料や農薬の使用を制限および削減するための規制が世界的に増加している。さらに、合成農薬の開発と登録にかかるコストが高騰しており、新しい化学物質の開発と発売が大幅に減少している。
この問題に対処する１つの可能な方法は、重要な栽培品種の生産性と収量をより効果的に改善するために、農業のための微生物技術を使用することである（Ｔｉｍｍｕｓｋ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。植物に付随する微生物叢は、ここ数十年で広範囲に調査されており（Ｓｅｓｓｉｔｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，２０１８）、コロニー化した微生物叢は、植物の成長の速度と程度を決定する上で基本的な役割を果たし、ある場合には、生存に必要な栄養素と条件を提供し、および／または、植物の発達と環境上の課題に対する応答を直接刺激することが示されている。植物圏における微生物のコロニー化は、発芽から始まり、植物のライフサイクル全体を通じて継続し、植物の表面全体に広がり、根の浸出物からの高い栄養素と水分の供給により微生物の成長に適した環境を作り出す根圏に集中することが示されている（Ｂａｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００６）。さらに、多様な芳香族化合物の根の浸出物は、特定の微生物の成長を阻害する一方で、他の微生物の増殖を刺激し、根圏を選択的な環境にすることが実証されている（Ｂａｄｒｉ ｅｔ ａｌ．，２０１３、Ｌｅｄｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１２、Ｓａｓｓｅ ｅｔ ａｌ．，２０１８）。さらに、微生物叢の関連するメンバーは、植物の発育を通じて起こる根の浸出物組成の変化に反応し、植物の成長に重要な異化機能を発現する（Ｃｈａｐａｒｒｏ ｅｔ ａｌ．２０１３）。逆に、微生物のコロニー化によって根の浸出物の流れやパターンが変化することもあり、宿主との間に継続的なコミュニケーションが成立していることが示唆される（Ｂａｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００６）。植物と、害または感染の兆候を引き起こすことなくその内部組織をコロニー化する微生物との間には、より親密な関係が構築されている（Ｓｔｕｒｚ ｅｔ ａｌ．，２０００）。これらの内部寄生菌微生物は、植物の根、茎、葉、種子、果実、塊茎、および根粒に見られる多数の多様な細菌を含む（Ｒｙａｎ ｅｔ ａｌ．，２００８）ことが示されている（Ｒｏｓｅｎｂｌｕｅｔｈ ａｎｄ Ｍａｒｔｉｎｅｚ－Ｒｏｍｅｒｏ，２００６）。通常、植物成長促進細菌（ＰＧＰＢ）として知られている有益なまたは相利共生の細菌は、植物の根圏および内部組織（Ｌｕｇｔｅｎｂｅｒｇ ａｎｄ Ｋａｍｉｌｏｖａ，２００９）だけでなく、通常、植物圏として知られている葉および茎の表面にも頻繁にコロニーを形成しており、ここでの微生物集団は着生微生物と呼ばれている。
植物の成長を増加させるＰＧＰＢの能力は十分に確立されており、それは異なる分子メカニズム：例えば、栄養供給の改善（窒素固定、リン酸塩可溶化など）、植物のホルモンバランスの調節（オーキシン、サイトカイニン、一酸化窒素（ＮＯ）などの産生、またはＡＣＣの脱アミノ化を介して）、真菌、細菌、ウイルス、草食動物、および線虫によって引き起こされた植物防御の強化（全身抵抗性経路の誘導、および／または、抗菌性二次代謝産物、細胞外溶解酵素、界面活性剤、または揮発性有機化合物の産生などによって）、ならびに、非生物的ストレスに対する耐性の向上（塩害、干ばつ、高温および低温、重金属など）によって、進行することができる（Ｄｉｍｋｐａ ｅｔ ａｌ．，２００９；Ｋｌｏｅｐｐｅｒ ｅｔ ａｌ．，２００４；ＬｕｇｔｅｎｂｅｒｇおよびＫａｍｉｌｏｖａ、２００９；Ｌｅｄｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１６；Ｔｉｍｍｅｒｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，２０１７；Ｖａｃｈｅｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，２０１３；Ｖａｎ Ｌｏｏｎ、２００７；Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ．，２００９）。この文脈で、ＰＧＰＢは微生物接種剤として人気を博しており、最近では多くの新製品が配合されている（ＰＣＴ／ＵＳ２０１６／０１７２０４；ＵＳ２０１６／０３３８３６０Ａ１；ＵＳ２０１６／０３３０９７６Ａ１；ＵＳ２０１７／０２２３９６７Ａ１；ＵＳ２０１８／００２０６７７Ａ１；Ｓｅｓｓｉｔｓｃｈ ｅｔ ａｌ，２０１８）。
植物関連細菌の効果による農業植物の形質の改善
過去２０年間、通常の農業実践においてＰＧＰＢの接種が広く採用されてきた。しかし、連想的な植物－細菌相互作用の生態学、生理学、および生化学に関する科学的知識が不足しているため、このバイオテクノロジーは産業的応用にはまだ不足している。この意味で、非マメ科作物へのＰＧＰＢの接種技術を強化するためには、接種した微生物の生理的状態、および／または、土壌中や貯蔵中の悪条件下での高い生存率などの、より幅広い理解を得る必要がある。同様に、細菌が農作物と共働する場合、植物の成長促進に関与する遺伝子の発現は有益な効果を得るための基本となる可能性がある。これらの遺伝子は、環境条件に応じてスイッチをオンまたはオフにして、農地での発現に影響を与える可能性があり、このことが、いくつかの細菌が、実験室で制御された環境下では植物の成長を改善するが、圃場（フィールド）条件では頻繁に失敗し、または他の事例で示されるように、変動的な結果を示す理由を説明することができる（Ｂａｅｚ－Ｒｏｇｅｌｉｏ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。
植物－ＰＧＰＢ相互作用の重要性にもかかわらず、これらの微生物のいくつかの能力のみが、植物の成長促進および保護と明確かつ直接的に関連している。例えば、植物の成長の律速となる無機栄養素の可溶化、大気中の窒素を固定する能力、植物の根による栄養素の供給と取り込みの刺激、およびオーキシンならびに／またはエチレン、ジベレリン、サイトカイニン、揮発性有機化合物（ＶＯＣ）、および他の代謝産物などのホルモンの産生を通じた植物の調節機構の調節などが、植物の育成と関連している。
通常、農業植物は複数のストレスに同時にさらされる。ストレス要因が農業システムの機能性／生産性に有害な影響を与えるため、根圏微生物の役割は、植物が不利な条件で繁栄するのを助ける上で重要である（Ｂａｒｅａ，２０１５）。生存または繁殖するための戦略として、ストレスを受けた植物は、植物の形態、生理機能、トランスポーター活性、根の浸出プロファイルに変化をもたらし、ストレス緩和能力を持つ微生物を補充することができる。しかしながら、ストレス状況下での植物と微生物の相互作用に関わるメカニズムはあまり理解されていない（Ｂａｒｅａ，２０１５）。この理解は、植物の適応メカニズムを最適化するためのバイオテクノロジー戦略を設計すること、および作物のストレス緩和のための土壌微生物の能力を向上させることに関連している（Ｐｏｚｏ ｅｔ ａｌ．，２０１０）。
とりわけ、塩害、干ばつ、栄養不足、高温および低温、病気および害虫などの多様な種類のストレスは、根圏における植物と微生物の相互作用を変化させ、農業の生産性に深刻な影響を与えかねない。例えば、世界の多くの陸地では、干ばつ、塩害問題、および高温などにより乾燥度が徐々に高まっている。とりわけ、干ばつは、世界の食糧生産を最も脅かす非生物的ストレスの一つであり、２０５０年までに地球上の耕作地の５０％超で作物に深刻な植物成長の問題を引き起こすと予想されている（Ｎｇｕｍｂｉ ａｎｄ Ｋｌｏｅｐｐｅｒ，２０１６）。一方、塩害は農業におけるもう一つの大きな制約であり、世界の灌漑地の約２０％、１００を超える国々で影響を与えている。この割合は、自然現象、慣行農法、および地球規模の気候変動により増加している。塩害を被った土壌は、塩分量、塩の種類、存在するナトリウムの量、および土壌のアルカリ度によって、塩、塩－ナトリウム土壌、ナトリウムに分けられる。塩害土壌の種類によって特徴が異なるため、管理の仕方も変わってくる。１９９５年には、灌漑地の塩化により、世界全体で約１２０億米ドルの年間収入の損失が発生したと推定されている。さらに、水の利用可能性の低下は、主に気候条件の変化、利用可能な真水源の誤用および過剰使用、および塩水源の使用（海洋由来または内陸の高導電率源の両方であり、および主に真水の利用可能性の制限によって誘発される）によって生じるものであり、このせいで、非生物的な塩ストレスは、現在の農学的手順に非常に関連する問題となっている。
浸透圧ストレッサー（塩害および干ばつ）に対処するために、植物は、主に水の取り込み能力と蒸散速度の微調整、およびストレスによって引き起こされる活性酸素種（ＲＯＳ）の過剰生産を克服するための抗酸化機構の活性化を含む、多くの適応メカニズムを開発しなければならない。水分とＲＯＳのバランスを維持することは、ＰＧＰＢによる接種で改善される可能性があり、これは多様な特定のメカニズム：ｉ）－細胞浸透圧制御（プロリン、グリシン、ベタイン、可溶性糖、ピニトール、およびマンニトールなどの適合性溶質の蓄積に関連する）、ｉｉ）－イオン恒常性（カリウム、ナトリウム、カルシウムの絶妙なバランスとその比率の維持に基づく）、ｉｉｉ）－抗酸化防御（有害な活性酸素種（ＲＯＳ）の生成を補う）、およびｉｖ）－光合成能力の維持を通じて作用することができる。根系構造の変化も、植物が干ばつに耐えるために持つ他の重要な適応形質の一つである。大豆、ヒヨコ豆、および小麦などのいくつかの作物では、ＰＧＰＢの接種と耐乾性との間に良好な相関関係があることが報告されている（Ｎｇｕｍｂｉ ａｎｄ Ｋｌｏｅｐｐｅｒ，２０１６）。そのため、水に関連する問題の解決策を見つけることに改めて関心が寄せられている。特に、干ばつと塩ストレスに対する植物の耐性を高め、水資源の利用が限られた中で食糧需要を満たす作物の成長強化に貢献する解決策を見つけることが求められている。ＰＧＰＢを用いた植物の塩ストレス耐性の向上は、この制限を克服するのに役立つ有望な戦略として浮上しているが、塩ストレス下での植物－ＰＧＰＢ相互作用に焦点を当てた報告はわずかしかない（Ｌｅｄｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１６；Ｐｉｎｅｄｏ ｅｔ ａｌ．，２０１５）。その結果、微生物を接種した植物は、植物の水分状態をより適切に制御することができ、水不足の条件下でも高い蒸散速度と光合成速度を得ることができる。トウモロコシの根に接種されたＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ株は、塩条件下で根の吸水能力を向上させた（Ｍａｒｕｌａｎｄａ ｅｔ ａｌ．，２０１０）。同様の習性は、Ｐａｎｔｏｅａ ａｇｇｌｏｍｅｒａｎｓをトウモロコシの根に接種した場合にも観察された（Ｇｏｎｄ ｅｔ ａｌ．，２０１５）。さらに、塩ストレス下では、Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ ｓｐ．を接種することで、レタスの品質と貯蔵寿命を向上させる（Ｆａｓｃｉｇｌｉｏｎｅ ｅｔ ａｌ．，２０１５）。
乾燥は、高温により植物に非生物的ストレスを与える。高温に対する植物の反応は複雑であり、生理学的、分子的、および生化学的なレベルでの変化と、一連の複雑なシグナル伝達、および植物の成長、生産性、ならびに穀物の品質と収量の制限につながる遺伝子発現の変化とを含む（Ｖｅｊａｎ ｅｔ ａｌ．，２０１６）。具体的には、熱ストレスは、タンパク質の変性および凝集、膜脂質の流動性、葉緑体やミトコンドリアの酵素の不活性化、タンパク質合成の阻害、および膜の完全性の喪失に影響を与える（Ｈｏｗａｒｔｈ，２００５）。これらの損傷は最終的に、飢餓、成長の阻害、イオンフラックスの減少、毒性化合物、および活性酸素種（ＲＯＳ）の生成につながる。高温による生産性および収量の低下を克服するために、ＰＧＰＢの接種戦略による熱耐性の向上は、費用対効果の高いバイオテクノロジー・ツールであり、世界中の農家が採用できる可能性がある。例えば、植物成長促進性のＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．株ＡＫＭ－Ｐ６と熱耐性のＰ．ｐｕｔｉｄａ株ｃの接種は、高分子量タンパク質の合成により、高温ストレスに対するモロコシと小麦の苗の耐性をそれぞれ向上させ、細胞内代謝物のレベルも向上させた（Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，２００９；Ｚｕｌｆｉｋａｒ Ａｌｉ ｅｔ ａｌ．，２０１１）。しかしながら、宿主特異性、有効期間の短さ、予測可能性の低さ、および／または環境条件下での接種剤の生存率の低さが問題となり、作物の熱およびその他の非生物的ストレスを軽減するための接種剤の適用に強い制限が生じるため、圃場条件下での微生物接種剤の有効性は依然として課題である（ｄｅ Ｆｒｅｉｔａｓ ａｎｄ Ｇｅｒｍｉｄａ，１９９２； Ｋａｕｒ ｅｔ ａｌ．）。様々な気温や気候の地域、作付けシステム、および農学的管理条件の下で、実地試験における作物収量増加効果に対するＰＧＰＢ接種の効果のいくつかの矛盾した結果が報告されている（Ｌｅｇｇｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，２０１５，２０１７）。このように、作物収量の統計は、達成可能な収量（例えば、理論的／潜在的な収量との関連で）を裁定する環境要因の根本的な複雑さに加えて、物流上の制約、サンプリングに伴うコストの両方のため、堅実に取り組む必要がある。
植物関連細菌の合成コンソーシアム
植物刺激性微生物接種剤の圃場でのパフォーマンスを向上させるための有望な戦略は、単離した微生物が示す有効性の限界を克服する可能性のある合成微生物コンソーシアムの設計である。いくつかの研究では、結果として生じる植物の成長促進と生物学的防除の観点から、種子または植物に複数の有益な細菌の組み合わせを接種するほうが、単一の細菌種を接種するよりも、大きな可能性があることが報告されている（Ｋｕｍａｒ，２０１６； Ｓｕｎｄａｒａｍｏｏｒｔｈｙ ｅｔ ａｌ．，２０１２）（Ｏｌｉｖｅｉｒａ ｅｔ ａｌ．，２００９）。異なる植物成長促進細菌が植物宿主と相乗的に相互作用して、栄養素を供給したり、阻害生成物を除去したり、または成長を刺激したりすることが証明されているため、接種剤としてこのようなコンソーシアムを使用することは利点をもたらす可能性がある（Ｂａｒｅａ ｅｔ ａｌ．，２００２；Ｚｏｐｐｅｌｌａｒｉ ｅｔ ａｌ．，２０１４）。さらに、それらは、代謝の相補性、捕食者の抑制、バイオフィルムの保護、および／またはクオラムセンシングを通じて、互いの生存を刺激することが分かっている。
栄養獲得に関して、合成コンソーシアムの優れたパフォーマンスの具体例としては、ヒヨコマメに対するＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ（ＳＦ３）、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｓｐｐ．（ＳＴ９）、およびＭｅｓｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ ｃｉｃｅｒｉの共接種が挙げられ、これは、単一の細菌株を接種した場合と比較して、灌漑および雨水条件下で、植物あたりの根粒数、根粒乾燥重量、植物あたりのさや数、穀物収量、タンパク質含量、および総クロロフィル含量が増加させた（Ｓｈａｈｚａｄ ｅｔ ａｌ，２０１４）。一方、５種類の窒素固定細菌（Ｇｌｕｃｏｎａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｄｉａｚｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ、Ｈｅｒｂａｓｐｉｒｉｌｌｕｍ ｓｅｒｏｐｅｄｉｃａｅ、Ｈｅｒｂａｓｐｉｒｉｌｌｕｍ ｒｕｂｒｉｓｕｂａｌｂｉｃａｎｓ、Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ ａｍａｚｏｎｅｎｓｅ、およびＰａｒａｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ ｔｒｏｐｉｃａ）のコンソーシアムをサトウキビに接種することによって、単菌接種した植物と比較して、低～中レベルの化学肥料を使用した２つの土壌において、高い茎の生産量も示した（Ｏｌｉｖｅｉｒａ ｅｔ ａｌ．２００９）。
Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉによって引き起こされるチリ萎凋病（ｃｈｉｌｉ ｗｉｌｔ ｄｉｓｅａｓｅ）に対する保護、および、植物宿主における全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）反応の誘導という観点から、互換性のある根粒菌株であるＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｓ Ｐｆ１と組み合わせる際の、保護的な内部寄生菌株であるＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ ＥＰＣＯ１６およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ ＥＰＣ５の場合に示されるように、共接種したコンソーシアムを個々の菌株の適用と比較した場合にも、生物学的制御および誘導された植物防御は増強される。植物の防御酵素やフィトアレキシンの合成に関わる代謝経路を誘導することで、３つの細菌の組み合わせが、それぞれ別の菌株を添加するよりも効果的であることが示された（Ｓｕｎｄａｒａｍｏｏｒｔｈｙ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。さらに、病原菌Ｓｃｌｅｒｏｔｉｕｍ ｒｏｌｆｓｉｉに曝露されたヒヨコ豆植物の植物成長促進と防御誘導を目的として、蛍光性のＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ａｅｒｕｇｉｎｏｓａ（ＰＨＵ０９４）、Ｔｒｉｃｈｏｄｅｒｍａ ｈａｒｚｉａｎｕｍ（ＴＨＵ０８１６）、およびＭｅｓｏｒｈｉｚｏｂｉｕｍ ｓｐ．（ＲＬ０９１）を別々に接種した場合と、組み合わせて接種した場合の比較を行った。その結果は、最も効果的な処理が、病原性の曝露の有無にかかわらず、ＰＨＵ０９４、ＴＨＵ０８１６、およびＲＬ０９１を組み合わせて適用することであることを実証した（Ｓｉｇｈ ｅｔ ａｌ．，２０１４）。
さらに、合成コンソーシアムの接種は、非生物的ストレスの条件下で、個々の菌株よりも効果的であることが証明されている。例えば、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｐｕｔｉｄａ（ＫＴ２４４０）、Ｓｐｈｉｎｇｏｍｏｎａｓ ｓｐ．（ＯＦ１７８）、Ａｚｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ ｂｒａｓｉｌｅｎｓｅ（Ｓｐ７）、およびＡｃｉｎｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．（ＥＭＭ０２）を含む４つの互換性と乾燥耐性を持つＰＧＰＢ株をトウモロコシ植物の成長促進剤として試験した。細菌コンソーシアムを接種した植物は、全般的に個々の細菌を接種した植物よりも優れており、この利点は、接種した種子が発芽前に乾燥ストレスを受けた場合にも観察され、乾燥地農業への応用における合成コンソーシアムの強い保護能力を示した（Ｍｏｌｉｎａ－Ｒｏｍｅｒｏ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。加えて、いくつかのＰＧＰＢ形質を有するＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｐｕｔｉｄａ（ＮＢＲＩＲＡ）とＢａｃｉｌｌｕｓ ａｍｙｌｏｌｉｑｕｅｆａｃｉｅｎｓ（ＮＢＲＩＳＮ１３）を、ヒヨコマメの干ばつストレスを改善するための相乗効果について評価し、これは、コンソーシアムを接種した植物では、個々のＰＧＰＢの効果と比較して、植物成長パラメータが有意に高いことが示された（Ｋｕｍａｒ，２０１６）。
一般に、単離された微生物は、トマト植物から単離されたＡｅｒｏｍｏｎａｓ、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ、およびＥｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ株について（Ｖａｉｋｕｎｔａｐｕ ｅｔ ａｌ．，２０１４）、および異なる稲の品種から得られたＡｚｏｓｐｉｒｉｌｌｕｍ株について（Ｃｈａｍａｍ ｅｔ ａｌ．，２０１３）示されているように、ａ）有益な効果に比して宿主範囲が制限されていること、ｂ）環境条件の変化に対する回復力が低いこと（（Ｍａｈｍｏｏｄ ｅｔ ａｌ．，２０１６）で検討されている）、ｃ）在来の微生物叢による拮抗または捕食に対する感受性が高いこと（Ｓａｖｋａ ｅｔ ａｌ．，２００２）、ｄ）Ｍｅｎｔｈａ ｐｉｐｅｒｉｔａの成長を向上させる在来のＰｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ 株と比較して実証されるように、在来の十分に適応した宿主微生物叢に関して競争力が低いこと（Ｓａｎｔｏｒｏ ｅｔ ａｌ．，２０１５）から、植物成長促進作用に限界があると考えられる。さらに、根圏環境は、多くの補完的な機能を発現する単一の細菌よりも、互いに補完して植物の成長を促進する少数または単一の機能を保有する異なる微生物との結びつきを好む傾向がある（Ｖａｃｈｅｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，２０１６）。
微生物接種剤の次世代
植物に有益な細菌を接種することは１００年前からある技術であるという事実にもかかわらず、農業用の微生物ベースの技術は現在、農業生態系の保全に対する経済的コストと経済的利益のバランスに基づいて、農業生産を増加させるための最も革命的で環境に優しいバイオテクノロジーとして提起されている（Ｂｅｒｎｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１８；Ｃａｓｓａｎ ａｎｄ Ｄｉａｚ－Ｚｏｒｉｔａ，２０１６；Ｄｕｎｈａｍ Ｔｒｉｍｍｅｒ，２０１７）。
一連の微生物接種剤が商業市場に登場しているが、作物へのＰＧＰＢの適用は、依然として実質的な技術的課題を暗に意味している。植物の成長を増強し、および／または環境ストレスに対する全身的な耐性を誘導するように設計された農業製品として、単離された微生物または合成コンソーシアムの有効性を制限するいくつかの要因が記載されている（土壌の種類、気候条件、作物の品種、細菌の遺伝子型、細菌単離体の有効性、接種剤の品質不良、または適切な接種技術または生産技術が制限されていることなどの不利な要因）。そのため、ＰＧＰＢを用いた細菌製剤は、通常、圃場での適用において望ましい効果を得ることができず、普通は標準的な農業慣行とは相容れない（Ｂａｓｈａｎ，１９９８；Ｂａｓｈａｎ ｅｔ ａｌ．，２０１４）。したがって、伝統的な農業および有機農業のための次世代の微生物技術は、これらの重大な現在の制限を克服しなければならない。本明細書に記載されている製剤と方法は、これらの限界を克服するものである。
改善された作物のパフォーマンスのための種子への微生物接種技術
持続可能で精密な農業のために、現在の課題は、より強固で効果的な生物学的接種剤（ｂｉｏｉｎｏｃｕｌａｎｔ）を開発するために、微生物をよりよく管理することである。有益な微生物が作物に適用される目的にかかわらず、それらはその機能性を最適化して確実なものにする方法で適用されなければならない。いくつかの報告では、液体（スプレー塗布、ドレンチング、または根の浸漬用）または乾燥製剤（（Ｂａｒｅａ，２０１５；Ｏ’Ｃａｌｌａｇｈａｎ，２０１６）（およびその中の参考文献）などのＰＧＰＢ微生物を送達するための様々な技術が示されている。しかし、これらのアプローチの多くは、必要とされる微生物接種物の量（特に大規模作物の場合）のため、および微生物の生存と機能を低下させる他の環境要因や運用上の要因（乾燥、高温、汚染、圃場の土壌微生物叢、微生物学的に適さない管理など）のため、大規模なシナリオでは経済的に効率的ではなく、実現可能ではない。生物学的接種剤の圃場での適用におけるよく知られている制限は以下の通りである：
農場での取扱品質：生産者にとっての大きな関心事は、接種剤の取り扱いを容易にすることと、可能であれば標準的な播種機を使って散布することに依存している。加えて、特殊な機械を使用した高品質の接種剤技術に対応するために、農場の慣習が変わることは珍しいことである（Ｄａｔｅ，２００１）。
長期保存品質：接種剤は十分な有効期限を持っていなくてはならない。微生物技術を現在の農業流通システムにうまく組み込むためには、室温で１～２年が必要な場合が多い（Ｄｅａｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１１）。
接種剤のパフォーマンス：微生物製剤は、生産、流通、保管、および農家への輸送中に安定していなければならず、とりわけ、農薬と比較して、主成分が生きていて変化しやすい場合には、安定していなければならない。微生物を、微生物学的に熟練していない農家が使用する手頃な製品に製剤化する場合、主に以下の理由で困難な作業となる：ｉ）－正確な実験室条件下では、微生物株が最適に機能する可能性があり、野外条件下でも同様の結果が期待されるが、農場の条件は理想的ではない可能性がある。ｉｉ）－生物学的接種剤は通常、液体または固体の製剤であり、誤って保存された場合（例えば、高温または室温で）、または誤って混合または希釈された場合、微生物の生存率が低下し、圃場での有益な効果が低下する可能性がある。また、他の微生物による二次汚染は、元の生物学的接種剤に悪影響を及ぼし（Ｂａｓｈａｎ ｅｔ ａｌ．，２０１４；Ｍａｈｍｏｏｄ ｅｔ ａｌ．，２０１６）、最終的には作物にも悪影響を及ぼす可能性がある。
接種の方法：生物学的接種剤を種子に直接適用することは、土壌中および植物上での細菌の生存および効率に寄与する。いくつかの実施態様では、植物における微生物の有益な効果の有効性は、特定の生物学的および非生物学的要因（土壌の温度および水分、栄養素の存在、ならびにｐＨを含む）、製品の保存条件、およびその有効期間によって制限される（Ｃａｌａｂｉ－Ｆｌｏｏｄｙ ｅｔ ａｌ．，２０１８；Ｍａｈｍｏｏｄ ｅｔ ａｌ．，２０１６；Ｔａｙｌｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８）。
有益な微生物を種子の上に直接適用することは、土壌および／または植物への微生物接種物のコロニー化を促進するため、これらの欠点のいくつかを克服するための効率的なメカニズムとして提案されている。このように、有益な微生物を用いて直接種子処理することは、発育の初期段階で、およびそのライフサイクル全体を通じて、微生物による植物のコロニー化を助ける。一般的に、これらの方法は、様々な有益な微生物を種子に適用するための最良の選択肢として報告されている。しかし、それらは主に研究目的で記述されたものである（Ｏ’Ｃａｌｌａｇｈａｎ，２０１６）（およびその中の参考文献）。微生物の種子接種に関するほとんどの研究は、農薬会社や種子会社によって開発されており、使用されている技術やプロセスはほとんど公開されておらず、「社内の知識」として保持されている（ＵＳ２０１０／０１５４２９９Ａ１；ＵＳ２０１５／０２８９５１５Ａ１；ＵＳ２０１８／００６４１１６Ａ１；ＵＳ２０１８／０９８４８３Ａ１；ＵＳ２０１８／００６４１１６Ａ１；ＵＳ２０１８／０１３２４８６Ａ１）。生物学的接種剤としてＰＧＰＢを使用する現在の種子処理は、以下のような手順を含む：
コーティング：正確な量の有効成分（細菌、農薬、殺菌剤など）を、液体媒体を使って種子表面に塗布し、種子の上に薄い層を作り、その形状を変えないようにする。大きく分けて２種類のコーティング：「膜コーティング」または「スラリーコーティング」がある。膜コーティングでは、ポリマーまたは接着材料（例えば、メチルセルロース、植物油またはパラフィン油、多糖類など）を用いて、接種物は水性の細胞懸濁液として塗布される。反対に、スラリーコーティングによる種子処理法では、接種剤は乾燥した粉末として配合されるか、特定の担体（一般的には、泥炭、木炭、褐炭、農家の堆肥など）に付着し、さまざまなシールを使って種子の外側に塗布される。膜コーティングは主に実験的に使用されていますが、スラリーコーティングは農場で広く使用されている。これらの方法は、圃場での再現性の不一致の問題を軽減することが証明されているが、市販の製剤では、種子の有効期間および細胞の生存率などの問題が依然として残っている（Ｃａｌａｂｉ－Ｆｌｏｏｄｙ ｅｔ ａｌ．，２０１８；Ｔａｙｌｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８；Ｔａｙｌｏｒ ａｎｄ Ｈａｒｍａｎ，１９９０）。
ペレット化：このプロセスは、種子を大きくし、標準サイズの球状ユニットを作ることを意図して、不活性物質の添加を含んでいる。この手順は、小さくて不規則な種子の形と大きさを変えることができ、精密な播種のための機械での取り扱いを容易にするため、精密農業の分野で人気を博している。種子のペレット化には、２つの主要な成分：バルキング（ｂｕｌｋｉｎｇ）コーティング材料と結合剤がある。バルキング材料は、複数の異なる鉱物および／または有機物の混合物、あるいは単一の成分でもよい。第２の成分である結合剤は、コーティング材料を一緒に保持する。様々なデンプン、糖類、アラビアガム、粘土、セルロース、ビニルポリマーを含む多くの異なる化合物が結合剤として使用されている（Ｏ’Ｃａｌｌａｇｈａｎ，２０１６；Ｔａｙｌｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８；Ｔａｙｌｏｒ ａｎｄ Ｈａｒｍａｎ，１９９０）（およびその中の参考文献）。
プライミング：この方法は、（液体ポリマーまたは接着剤を使用せずに）種子を水性懸濁液にあらかじめ決められた期間浸漬し、その後、発芽の開始を防ぐために種子を乾燥させることを含む。このプロセスにかかる労力を考えると、それは、野菜の種子などの低～中容量で高価値の作物に最も適している（Ｏ’Ｃａｌｌａｇｈａｎ，２０１６；Ｔａｙｌｏｒ ｅｔ ａｌ．，１９９８；Ｔａｙｌｏｒ ａｎｄ Ｈａｒｍａｎ，１９９０）。様々なプライミング技術のうち、任意の生物学的化合物を用いた水和は「バイオプライミング」と呼ばれる（Ａｓｈｒａｆ ａｎｄ Ｆｏｏｌａｄ，２００５；Ｂｅｎｎｅｔｔ ａｎｄ Ｗｈｉｐｐｓ，２００８ｂ，２００８ａ；Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．，２００３；Ｙａｄａｖ ｅｔ ａｌ．，２０１８）。
種子に対して微生物技術を実践する上での現在の限界
微生物技術、生物学的接種剤の製剤と実用的な視点についての包括的なレビューが発表されている（Ｂａｓｈａｎ ｅｔ ａｌ，２０１４）。著者は、送達システムの実施の改善、担体の詳細な評価、接種剤中の微生物の生存率の向上、接種剤製品の有効期間の増加、複数株の接種剤の使用、より低コストな技術の開発、移植作物のための苗床接種の実施などを考慮すれば、ＰＧＰＢ接種剤のための多くの最優先事項を注意深く分析して、克服しなければならないと報告した。近年では、最も一般的なバイオプライミング技術がレビューされた（Ｏ’Ｃａｌｌａｇｈａｎ，２０１６）。網羅的ではないが、引用された研究は、微生物種子接種剤の商業的開発を制限する主要な制約を特定することで合意している。
今日まで、微生物接種物に基づく商業的に実行可能な種子処理を達成する前に、重要な技術的課題に取り組まなければならず、とりわけ、１）播種後の圃場の植物に対する所望のＰＧＰＢ効果を最終的に得るために、種子処理、処理、および貯蔵のすべての段階を通じて、種子上の微生物接種物の有効な生存率、２）ハイドロプライミングおよびオスモプライミングなどの液体吸水に基づく技術で処理された種子は、発芽能力や活力として測定される貯蔵寿命が急速に低下することがよく知られているため、処理された後の種子の有効な生存率（Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ．，２０１８； Ｓｃｈｗｅｍｂｅｒ ａｎｄ Ｂｒａｄｆｏｒｄ，２０１１； Ｈｉｌｌ ａｎｄ Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍ，２００７； Ｔａｒｑｕｉｓ ａｎｄ Ｂｒａｄｆｏｒｄ，１９９２）、および３）異なる土壌タイプおよび環境条件でも成功裏に実現される、微生物接種剤と宿主植物との相互作用から得られる正の効果に取り組まなければならない。
バイオプライミングと種子処理の方法論：Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）
典型的な種子のプライミングプロトコルは、必要なプライミング剤（無機塩および有機塩、ナノ粒子、植物成長調整物質および／または植物成長促進細菌）を含む任意の溶液に種子を浸し、その後、種子を再乾燥させる工程を含む。これにより、幼根の出現以外の発芽プロセスが開始される（Ｈｅｙｄｅｃｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９７３；Ｍａｈａｋｈａｍ ｅｔ ａｌ．，２０１７；ＭｃＤｏｎａｌｄ，１９９９；Ｓｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，２０１７；Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．，２００３）。浸透圧溶液を用いた種子プライミング（オスモプライミング）は、何十年も前から行われており（Ｈｅｙｄｅｃｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９７３）、現在では選択された高価値の園芸用種子において一般的な商習慣となっている。この概念は、穀物やマメ科の作物におけるハイドロプライミングにも拡張され、「農場での」プライミング技術が復活した（Ｈａｒｒｉｓ ｅｔ ａｌ．，２００１）。近年では、いくつかの金属および炭素ベースのナノ粒子（例えば、ＡｇＮＰｓ１６、ＡｕＮＰｓ５、ＣｕＮＰｓ１７，１８、ＺｎＮＰｓ１７，１８、フラーレン２２（ｆｕｌｌｅｒｅｎｅ２２）および炭素２３のナノチューブなど）が、いくつかの作物における種子の発芽、苗の成長、およびストレス耐性を促進するための種子プライミング剤として適用されている（Ｍａｈａｋｈａｍ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。異なるプライミング技術（例えば、ハイドロプライミング、オスモプライミング、ナノプライミングなど）の中でも、この手順が微生物細胞を用いて行われる際に、種子内の内部空間は、細菌の接種およびコロニー化のための潜在的に理想的な条件を有している（ＭｃＱｕｉｌｋｅｎ ｅｔ ａｌ．，１９９８； Ａｓｈｒａｆ ａｎｄ Ｆｏｏｌａｄ，２００５； Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，２００９； Ｔａｂａｓｓｕｍ ｅｔ ａｌ．，２０１８； Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．，２００３）。
９０年代初頭から、バイオプライミング方法は広範囲の作物に広く使用されており、環境に優しい農業技術として間違いなく認められている（Ｏ’Ｃａｌｌａｇｈａｎ，２０１６；Ｔａｙｌｏｒ ａｎｄ Ｈａｒｍａｎ，１９９０）。時には、バイオプライミング技術は、種子の外側に、微生物全体、その浸出物、またはいくつかの生物学的に活性な化合物を適用するものと誤って定義されることがある（Ｅｌ－Ｍｏｕｇｙ ａｎｄ Ａｂｄｅｌ－Ｋａｄｅｒ，２００８；Ｍｕｌｌｅｒ ａｎｄ Ｂｅｒｇ，２００８；Ｓｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，２０１７；Ｓａｂｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。より正確には、バイオプライミングは、苗の出現率と均一性を促進し、および、植物の形質を改善することによって、生物学的要素（有益な微生物を種子に接種すること）と生理学的要素（種子の水和）を種子に組み込む。微生物を用いて処理された種子は、微生物を用いた種子処理を行っている間は細胞が生きている可能性があるため、添加した微生物のコロニー化と増殖が種子の内部で生じなければならない点で、他の生物学的種子処理とは根本的に異なる。しかしながら、これまでの文献では、その違いを詳細に説明しているものはほとんどない。具体的には、１）関連する時間枠（数ヶ月）を通じた種子内の生物学的薬剤（ＰＧＰＢ株またはコンソーシアム）の生存および／または増殖、２）処理後数ヶ月後の種子の有効期間と有効な発芽、３）種子を保存した関連時間後の有効な微生物の接種と植物との相互作用、４）経済的に実行可能な方法論（種子処理に必要な時間、投入物、エネルギーなどの関連要因を考慮したもの）で、拡張性があり、したがって従来の種子ビジネスモデルの中で実施可能なもの、についての結果や研究はまだ報告されていない。さらに、バイオオスモプライミングは、細菌コーティング手順と関連付けられる場合、発芽の均一性と植物の成長形質を大幅に向上させることが実証されている（Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，２００９；Ｒａｊ ｅｔ ａｌ．，２００４；Ｓｈａｒｉｆｉ，２０１１；Ｓｈａｒｉｆｉ ｅｔ ａｌ．，２０１１；Ｓｈａｒｉｆｆｉ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。複数の研究者が、２０分から数日までのインキュベーション時間を報告している（Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，２００９；Ｂｅｎｎｅｔｔ ａｎｄ Ｗｈｉｐｐｓ，２００８ｂ，２００８ａ；Ｍｕｒｕｎｄｅ ａｎｄ Ｗａｉｎｗｒｉｇｈｔ，２０１８）。同様に、細胞懸濁液は、種子１グラム当たり１０５から１０９細胞の範囲であり、生物学的薬剤のタイプ（すなわち、胞子、内生胞子、または栄養細胞）に依存していた（Ｗｒｉｇｈｔ ｅｔ ａｌ．，２００３； Ｓａｂｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１２； Ｒａｊ ｅｔ ａｌ．，２００４； Ｍｕｒｕｎｄｅ ａｎｄ Ｗａｉｎｗｒｉｇｈｔ，２０１８）。実際、バイオプライミングはさまざまな研究者によっていくつかの方法で実践され、説明されてきたが、いまだに曖昧なアプローチであり、探求と議論が必要である（Ｂｅｎｎｅｔｔ ｅｔ ａｌ．，２００９；Ｃａｌｌａｎ ｅｔ ａｌ．，１９９０，１９９１；Ｃｈａｋｒａｂｏｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，２０１１；Ｍｉｒｓｈｅｋａｒｉ ｅｔ ａｌ．，２０１２；Ｍｏｅｉｎｚａｄｅｈ ｅｔ ａｌ．，２０１０；Ｒａｊ ｅｔ ａｌ．，２００４；Ｒｅｄｄｙ，２０１３；Ｓｈａｒｉｆｉ，２０１１；Ｓｈａｒｉｆｉ ｅｔ ａｌ．，２０１１；Ｓｈａｒｉｆｉ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。
最新技術によれば、キュウリ植物で免疫性を引き起こすためのＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．浸出物が、Ｓｏｎｇらによって説明された（Ｓｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，２０１７）。このアプローチは、方法と範囲の両方において、いくつかの誤解を招く結果となっている。なぜなら、それは、１）細菌接種物またはそれ由来の植物成長促進剤を使用せず、代わりに、ペプチドをベースとした化合物によって、種子が生体刺激されている；２）種子発芽の初期の休眠後の段階で、微生物またはその浸出物を胚に接触させるために、生きた微生物を種子の中に組み込んでいない；３）生物学的薬剤（例えば、シクロジペプチド）が種子に入って、植物の胚の初期段階（果皮が破れる前）でＰＧＰ効果（遺伝子発現の変化）を引き起こしたかどうかを確認していない；４）経時的な植物免疫トリガーのエリシターの安定性について知らせていないからである。この最後の問題は、商業的に実現可能な農業用微生物技術が、現在の農業流通システムに適合するためには、比較的長い期間（例えば、６ヶ月超）にわたって安定していなければならないため、特に重要である。加えて、この参照された研究で使用された生物学的プライミング剤は、経時的に特に不安定であり、生物学的および非生物学的環境要因（例えば、温度、ｐＨ、他の微生物による生分解活性など）によって変化しやすい。
Ｓｅｒｒａｔｉａ ｐｌｙｍｕｔｈｉｃａ株ＨＲＯ－Ｃ４８は、種子への接種手順のための生物学的薬剤としても報告されている（Ｍｕｌｌｅｒ ａｎｄ Ｂｅｒｇ，２００８）。この研究では、ペレット化、膜コーティング、バイオオスモプライミングの３つの異なる技術を比較することを試みた。種子処理と保存の直後に種子あたりの細胞数を測定したにもかかわらず、著者らは、農業分野で商業的に実現可能な製品の有効期間を正確に定量化することができなかった。実際、ＨＲＯ－Ｃ４８株の生存率は、極めて短い保存期間（３０日）に測定されただけであった。著者らが報告したその他の曖昧なトピックは、１）種子浸漬のために高い初期細胞密度が調整されたこと、２）生物学的薬剤の存在下での種子の長いインキュベーション時間（１２時間と報告されている）が使用されたことから、バイオプライミングの最適化手順に依存する。確かに、このような態様はすべて、この方法を工業的および商業的に実施するための実行可能なパラメータではないことが多い（Ｍｕｌｌｅｒ ａｎｄ Ｂｅｒｇ，２００８）。
種子の内部に合成微生物製剤を組み込むことを指摘した他のいくつかの著作物も、最新技術で報告された。例えば、米国特許出願第２０１６／０３３８３６０Ａ１および米国特許出願第２０１６／０３３０９７６Ａ１は、有益な細菌を含む種子に言及している。これらの参照された著作物の両方に提示された方法は、最終的に所望の微生物を含む種子を得るために、花や植物の異なる部分を直接接種することに基づいている（Ｍｉｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ，２０１６ａ，２０１６ｂ）。
本発明は、先に記載された問題点に直接取り組む、従来のバイオプライミング技術に代わる新しい、効果的で、信頼性の高い方法を提案するものである。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）と命名された提案された種子処理方法は、改善された植物形質および収量パフォーマンスを有する商業的種子を得るための、十分に設計され、計算され、実行され、および制御されたプロセスである。正確には、本発明は安定した微生物による種子処理方法に関するものであり、工業的に拡張可能なプロセスを通じて、植物に有益な細菌、および／または、微生物の合成コンソーシアム、その浸出物、および／または、その個別化された生体分子を種子の内部に組み込むものであり、この方法は、プロセスのコスト、時間、およびエネルギー、経時的な技術の安定性（植物の胚と接種剤の両方）、複数の土壌への適合性、異なる環境条件下での安定性、さらには農業投入物の従来の流通チェーンとの適合性を考慮している。この方法は、種子内の浸透性を高める界面活性剤、および／または種子内の微生物のコロニー化を促進する栄養素の群、および／または細菌内生胞子形成を促進する補助試薬に加えて、特定量の有益な微生物または微生物の合成コンソーシアム、および／または、その浸出物、および／または、その個別化された生体分子を補充した浸透活性液体培地の水溶液中での、種子の制御された、経済的かつ迅速な吸水を含む。生物学的薬剤の生存、胚の遺伝子改変、処理済み種子の有効期間の延長は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子技術によって保証されている。最後に、今回報告された新しい方法論では、プロセス全体に一定のチェックポイントが設けられており、再現性と信頼性の高い最終製品を提供している。チェックポイントのいくつかは、種子に対する分子プライミングの確認、発育、非生物的ストレス耐性、および病原体に対する防御反応に関連する遺伝子の特定のセットの発現の測定を含む。
本発明は、植物の形質を可能にし、その収量を高めるための新しい戦略を提案する。この戦略は、以下に説明する特定の種子処理方法（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標））の実施によって達成される、植物の種子における２つの効果に基づいている：
１．種子機能細菌へのローディング：現在の種子処理方法の実施により、内生胞子形成細菌および／または内生胞子が種子にロードされる。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の結果、図１および図４に示すように、種子果皮とそのアリューロン細胞層との間に位置する間隙中に、内生胞子形成細菌および／または内生胞子が種子に割り当てられる。種子に組み込まれる内生胞子形成細菌および／または内生胞子は、植物の根圏を効果的にコロニー化する能力を持ち、および、窒素固定能力および／またはリン酸可溶化能力および／または植物ホルモン合成能力を持つ菌株に対応する。選択された細菌の内生胞子変換能力と種子内への割り当てにより、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後および全商業的保管期間中の安定性が保証される。このプロセスは、時間内の細菌細胞数によって確認される（例１－５）。
２．植物遺伝子発現の調節：これは、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）の種子処理プロセス中に選択された細菌および／または細菌浸出物の作用によって達成され、細菌および／または細菌浸出物は、種子の中に入り込み、胚に到達して、全身誘導耐性（ＩＳＴ）および／または全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）および／または植物発育プログラムを引き起こすことができる。これらの３つのプロセスにより、植物は非生物的ストレス（熱、干ばつ、塩分など）に耐え、生物学的ストレス（病原菌の攻撃）に抵抗し、および根系を強化して栄養素と水の獲得を増強し、植物のパフォーマンスを直接向上させることができる。この効果は、前述のプロセスに関与する主要な遺伝子のｑＲＴ－ＰＣＲによる転写分析で確認される（実施例１１）。
本発明が価値を持ち、実際に産業規模で適用可能であるためには、この方法がコスト効率が良く、拡張可能であることが必要である。本発明のような種子処理プロセスでは、時間、入力、およびエネルギーを必要とする複数の工程がある。提案されている方法と発明は、種子処理の処理コストと時間を可能な限り低くすることを最優先事項としている。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）法は、種子の吸水を２０分～１６時間未満で行いつつ、種子処理プロセスを室温（２０～２４℃）で行う際に効果的なものにすることを目指している。後者を実現するのは簡単なことではない。なぜなら、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後の種子内の細菌、内生胞子形成細菌、および／または内胞が望ましい最小数であることに加えて、細菌が時間の経過とともに安定して生存し続けることが必要であるため、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を行っていない従来の種子と同じように、種子（製品として）は保管、包装、物流、および播種のプロセスを経ても影響を受けることがないからである。
提案された方法論は、前もって消毒された種子を、栄養素、界面活性剤、および塩を含む種子処理培地（以下、マイクロプライミング溶液）に浸漬することからなる。図２は、種子処理プロセスを描いたプロセス図を示す。
細菌種子処理の安定性
種子内の細菌の経時的な安定性は、単純でもなく、対処すべき明らかな問題でもない。我々が提案する種子処理方法（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理）を用いて細菌を種子に組み込む際、トウモロコシ種子の場合、細菌が位置する種子内の場所を図４に示す。
図４Ａでは、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後に赤色蛍光タンパク質（ＲＦＰ）でマークされた細菌が留まっているトウモロコシ種子内の空間を理解することができる（ピンク色の線維）。この場所は、胚乳と胚を外層から隔てている、種子の果皮と種子のアリューロン細胞層との間の空間である。この場所は、ある種の微生物が限られた期間快適に過ごすことができる場所であり、その後、利用可能な栄養素の枯渇により必然的に細胞が死滅するか、または、ある種の特定の微生物の場合、内生胞子形成（ｅｎｄｏｓｐｏｒｕｌａｔｉｏｎ）のプロセスを開始する（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ，ＰｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａおよびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ Ｐｈｙｌｕｍからの細菌）。前述の場所に蓄積することの利点は、他の微生物または脱水などの微生物の即時的な完全性に影響を与える可能性のある外的要素から微生物が保護されることである。
栄養不足による長期間の生存率の問題に取り組むためには、それに対処する細菌の種類によって方法論が変わってくる。ある条件下で（主に実現可能性のリスクを感じるシナリオで）、増殖を停止し、内生胞子と呼ばれる物理的な状態に入る能力を持つ細菌がいる。内生胞子として、細菌は、長期間にわたって栄養素を摂取しない休眠状態のシナリオに入る。内生胞子を生成する能力を持つ、主にＦｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、ＰｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａおよびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ Ｐｈｙｌｕｍからの細菌について、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液は特定の塩で補充され、種子に組み込まれると、細菌がこの休眠状態に入るように仕向ける。後者を行うことで、種の中の細菌の生存率を長期的に確実なものにすることができる。水分と栄養素のある好条件の場所で内生胞子が再度見られるとき（例えば、種まき時）、それは、活性細菌状態（栄養細胞）に戻り、正常な機能と栄養生殖を開始する。
別の戦略は、種子処理プロセスを実行している間に細菌に転換を迫るのではなく、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液に内生胞子を直接補充することである。後者は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）の種子処理後に見られる種子あたりの内生胞子の観点で、より良い収量を示した。
次の表１は、内生胞子に転換する能力のために、この提案された新規の種子処理の特別な関心対象となっているいくつかの細菌属を示している。
Ｂａｃｉｌｌｕｓ属の細菌は、内生胞子形成能力を持つ最も豊富な細菌の一つであり、ＰＧＰＢ形質を持つ複数のＢａｃｉｌｌｕｓ株の広範な研究も存在する。種子内で細菌を十分に増殖させるためには、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液に、選択した細菌と特に相性の良い栄養素を補充するか、あるいは、種子に組み込むべき所望の細菌の内生胞子をＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液に直接添加することが必要である。種子胚の生物学的プライミング
本開示の方法は、先に説明したように設計された細菌組成物による植物種子の処理（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理）を企図している。このような処理は、細菌の組み込みを可能にするために種子の浸透圧を採用することができ、化学的プライミング剤を種子に導入するためにＳｍｉｔｈらによって最初に記載された処理は、現在オスモプライミングと呼ばれている。しかし、本開示の方法は、休眠中の種子への細菌集団の組み込みに適応されており、休眠が終了し、適切な環境または農学的条件が発芽の第１段階を誘発すると、胚の直接的な生物学的プライミングを通じて、出現する小植物の早期の条件付けを行うことを目的としている。この新規なアプローチは、生物学的プライミングを生成するように設計された従来の細菌製剤に対して、前例のない利点を提供する。なぜなら、組み込まれた細菌は休眠種子内で保護され、それ自体またはその浸出物の作用によって、可能な限り初期の発育段階から胚の永続的なプライミングを生成するように好都合に配置されるからである（実施例１１）。さらに、処理された種子は、操作、栄養添加剤、防腐剤、または灌漑に関する追加要件なく、かつ、害虫または植物病害の制御剤に関する不適合の制限もなく、標準的な農学的慣行に従って、通常の輸送、貯蔵、コーティングペレット化、および播種処理に晒される。したがって、本明細書に記載される方法（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理）は、種子のバイオプライミング（Ｍａｈｍｏｏｄ ｅｔ ａｌ．，２０１６）からの明確な利点も提供している。なぜなら、その方法は、種子の事前発芽、および、貯蔵生存率を低下させ、操作および処理の実現性を制限する休眠停止反応を含むからである（実施例５および６）。
加えて、本開示の方法は、微生物の成長のためのリアクターとして親植物を使用して、または植物の性器官を接種することによって、種子を接種すると以前に報告された方法とは異なる（Ｍｉｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１６ａ； Ｍｉｔｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，２０１６ｂ）。このような方法は、最終的に種子に組み込むことができる細菌の種類に本質的な偏りがあることを暗に意味している。なぜなら、成功する接種剤は、植物の標的器官または組織内で生存し、内在性微生物と競合し、自ら種子の内部空間にアクセスできなければならないからである。本明細書で提示されるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）戦略は、内部寄生能力または組織の生存に妨げられることはない。なぜなら、人工的に組み込まれた細菌は内部共生体である必要はなく、成熟した植物の防御反応に直面する必要もなく、または、内部寄生微生物群を凌駕する必要もないが、植物の分子プライミングを生成するために、十分に長く生存するか、その浸出物が植物の胚に到達できることが必要なだけであるからである。
我々は、上記の固有の利点および差別化される特徴により、本開示の方法は、細菌植物成長刺激に関与する技術の当業者にとって自明ではないと考えている。実際、この戦略を成功させるためには、ある重要な条件が処理組成物の候補となる細菌によって満たされなければならず、これは、植物成長促進微生物の標準的な配合では必ずしも考慮されていない。第一に、細菌組成物は、種子内での競争および／または拮抗作用を避けるために、上述の有効性と互換性の基準を用いて設計されなければならない。これらの効果がないことは、組成物を製剤化する前に実験的に評価されなければならない。種子内在化（Ｓｅｅｄ ｉｎｔｅｒｎａｌｉｚａｔｉｏｎ）は、設計された組成物に含まれる各細菌について評価されなければならず、飽和曲線を決定し、貯蔵時間および種子処理手順の間の細菌の生存を決定する（図５、実施例１～５）。さらに、種子内部組織の分析も、所望の細菌の存在と生存率、および他に対する各構成株の相対的な存在度を評価するために実施しなければならない（図４、実施例１～５）。
植物材料はさらに、特定の細菌組成物で処理する前に条件付けされなければならない。種子は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の有効性を決定する間、バックグラウンドノイズを排除するために、殺菌されてもよい。
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）が発生したら、処理された種子に対する有益な細菌の影響を確認するために、病原体間の防御、非生物的ストレス耐性、および発育に関連するマーカー遺伝子の転写分析を決定しなければならない（実施例１１）。この分析は、種子の休眠段階後、ならびに、種子の果皮および胚乳の破裂および幼根の出現の前に行われなければならない。休眠種子の以前の細菌処理に起因する発育中の胚における転写変化の評価は、方法論の検証において重要な工程でもある。なぜなら、これは、プライミング効果の迅速な確認を提供し、その結果は、種子外部から発育中の植物組織への他の微生物へのアクセス、および／または、周囲の土壌あるいは成長基質の化学組成を含む、種子破裂後に現れる外部要因によっても影響されないからである。
本発明で提案された方法および組成物は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理法にまとめることができ、この方法では、種子が、室温および短期間の種子浸漬で種子にロードされる細胞負荷を増加させるために、種子適合性細菌組成物、細菌適合性栄養素（非内生胞子形成細菌を使用する場合）、および界面活性剤を、ならびに内生胞子形成細菌の内生胞子への転換率を上昇させるために補充されたミネラルを含む生理食塩水に組み込まれる（図２）。
図３は、安定した微生物技術の種子処理を得るための本発明の方法論を示したものである。
改変された植物種子
一態様では、種子に組み込まれた微生物または微生物の浸出物を含む改変された植物種子が本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、植物に有益な特性を付与する。いくつかの実施形態では、有益な特性は、植物の成長を改善する。いくつかの実施形態では、有益な特性は、植物の成長を改善した。いくつかの好ましい実施形態では、微生物は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子である。
改変された植物種子に組み込まれた微生物または浸出物は、植物の成長を促進する様々な植物の特性を改善することができる。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、植物成長効果を付与する。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、細胞の浸透圧制御、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、光合成能力の維持、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、細胞の浸透圧制御を含む。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、イオン恒常性を含む。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、抗酸化防御を含む。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、熱ストレス耐性を含む。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、光合成能力の維持を含む。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、全身誘導抵抗性を引き起こすことである。いくつかの実施形態では、植物成長効果は、全身誘導耐性を引き起こすことである。
いくつかの実施形態では、種子に組み込まれた微生物または浸出物は、種子の発芽率を改善する。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約１％、少なくとも約２％、少なくとも約３％、少なくとも約４％、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、または少なくとも約５０％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約１％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約２％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約３％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約４％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約５％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約１０％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約２０％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、少なくとも約３０％改善される。いくつかの実施形態では、種子の発芽率は、微生物または浸出物が組み込まれていない種子と比較して、改善される。
いくつかの実施形態では、種子に組み込まれた微生物または浸出物は、ストレス条件における植物の成長を改善する。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれた微生物または浸出物は、干ばつ耐性を改善する。いくつかの実施形態では、改善された干ばつ耐性は、干ばつの時に成長する能力である。いくつかの実施形態では、植物の成長は、微生物または浸出物が組み込まれていない種子から成長した植物と比較して、干ばつの時に改善される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、干ばつの条件において、少なくとも約１％、少なくとも約２％、少なくとも約３％、少なくとも約４％、少なくとも約５％、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、または少なくとも約５０％改善される。
いくつかの実施形態では、植物の成長は、約１％～約５０％改善される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約１％～約２％、約１％～約３％、約１％～約４％、約１％～約５％、約１％～約１０％、約１％～約２０％、約１％～約３０％、約１％～約４０％、約１％～約５０％、約２％～約３％、約２％～約４％、約２％～約５％、約２％～約１０％、約２％～約２０％、約２％～約３０％、約２％～約４０％、約２％～約５０％、約３％～約４％、約３％～約５％、約３％～約１０％、約３％～約２０％、約３％～約３０％、約３％～約４０％、約３％～約５０％、約４％～約５％、約４％～約１０％、約４％～約２０％、約４％～約３０％、約４％～約４０％、約４％～約５０％、約５％～約１０％、約５％～約２０％、約５％～約３０％、約５％～約４０％、約５％～約５０％、約１０％～約２０％、約１０％～約３０％、約１０％～約４０％、約１０％～約５０％、約２０％～約３０％、約２０％～約４０％、約２０％～約５０％、約３０％～約４０％、約３０％～約５０％、または約４０％～約５０％改善される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約１％、約２％、約３％、約４％、約５％、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、または約５０％改善される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、少なくとも約１％、約２％、約３％、約４％、約５％、約１０％、約２０％、約３０％、または約４０％改善される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、最大で約２％、約３％、約４％、約５％、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、または約５０％改善される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、微生物または浸出物で処理されていない種子から育てられた植物と比較して測定される。
植物の成長は、植物の一部の大きさを測定することによって測定されてもよい。植物の一部は、植物の種類に依存してもよい。例えば、植物の種子はレタス植物種子（例えば、Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）である場合、ロゼットのサイズが測定されてもよい。いくつかの実施形態では、果実の大きさは、植物の成長を測定するために使用される。いくつかの実施形態では、植物のシュートの重量は、植物の成長を測定するために使用される。いくつかの実施形態では、植物の根の重量は、植物の成長を測定するために使用される。いくつかの実施形態では、植物または植物の一部は、測定前に乾燥される。
いくつかの実施形態では、植物の成長は、所望の期間の後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約１週間後～約３６週間後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約１週間後～約２週間後、約１週間後～約４週間後、約１週間後～約６週間後、約１週間後～約８週間後、約１週間後～約１２週間後、約１週間後～約１８週間後、約１週間後～約３６週間後、約２週間後～約４週間後、約２週間後～約６週間後、約２週間後～約８週間後、約２週間後～約１２週間後、約２週間後～約１８週間後、約２週間後～約３６週間後、約４週間後～約６週間後、約４週間後～約８週間後、約４週間後～約１２週間後、約４週間後～約１８週間後、約４週間後～約３６週間後、約６週間後～約８週間後、約６週間後～約１２週間後、約６週間後～約１８週間後、約６週間後～約３６週間後、約８週間後～約１２週間後、約８週間後～約１８週間後、約８週間後～約３６週間後、約１２週間後～約１８週間後、約１２週間後～約３６週間後、または約１８週間後～約３６週間後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約１週間後、約２週間後、約４週間後、約６週間後、約８週間後、約１２週間後、約１８週間後、または約３６週間後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、少なくとも約１週間後、約２週間後、約４週間後、約６週間後、約８週間後、約１２週間後、または約１８週間後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、最大で約２週間後、約４週間後、約６週間後、約８週間後、約１２週間後、約１８週間後、または約３６週間後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は約７日後～約４２日後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約７日後～約１４日後、約７日後～約２８日後、約７日後～約４２日後、約１４日後～約２８日後、約１４日後～約４２日後、または約２８日後～約４２日後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、約７日後、約１４日後、約２８日後、または約４２日後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、少なくとも約７日後、約１４日後、または約２８日後に測定される。いくつかの実施形態では、植物の成長は、最大で約１４日後、約２８日後、または約４２日後に測定される。
いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種子の内部に組み込まれる。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、果皮の下の種子に組み込まれる。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、果皮とアリューロン細胞層との間で種子に組み込まれる。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種子の胚に接触する。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種子の胚に接触しない。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種子の胚乳に接触する。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種子の胚乳に接触しない。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種皮と種子胚との間の間隙で種子に組み込まれる。いくつかの実施形態では、微生物または浸出物は、種子の果皮と種子のアリューロン細胞層との間の間隙に組み込まれる。
改変された植物種子は、任意の種類の植物種子であってもよい。いくつかの実施形態では、改変された種子は単子葉植物の種子である。いくつかの実施形態では、植物の種子は、トウモロコシ、小麦、イネ、大麦、ライ麦、サトウキビ、アワ、オート麦、またはモロコシの種子である。いくつかの実施形態では、植物の種子はトウモロコシの種子である。いくつかの実施形態では、植物の種子はトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｉｚｅ）の種子である。いくつかの実施形態では、改変された種子は双子葉植物の種子である。いくつかの実施形態では、種子は、大豆、綿、アルファルファ、豆、キノア、レンズ豆、ピーナッツ、レタス、トマト、またはキャベツの種子である。いくつかの実施形態では、種子はレタス（ｌｅｔｔｕｃｅ）の種子である。いくつかの実施形態では、種子はレタス（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ）の種子である。いくつかの実施形態では、種子はトマト（ｔｏｍａｔｏ）の種子である。いくつかの実施形態では、種子はトマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）の種子である。いくつかの実施形態では、種子は遺伝子組換え生物（ＧＭＯ）種子である。いくつかの実施形態では、種子は非ＧＭＯ種子である。
種子に組み込まれる微生物または浸出物の量は、植物成長効果を植物に付与するために十分なレベルでなければならない。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれる微生物の量は、約２５０コロニー形成単位（ＣＦＵ）～約５，０００ＣＦＵである。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれる微生物の量は、約２５０ＣＦＵ～約５００ＣＦＵ、約２５０ＣＦＵ～約７５０ＣＦＵ、約２５０ＣＦＵ～約１，０００ＣＦＵ、約２５０ＣＦＵ～約２，０００ＣＦＵ、約２５０ＣＦＵ～約３，０００ＣＦＵ、約２５０ＣＦＵ～約４，０００ＣＦＵ、約２５０ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ～約７５０ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ～約１，０００ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ～約２，０００ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ～約３，０００ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ～約４，０００ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ～約１，０００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ～約２，０００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ～約３，０００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ～約４，０００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ～約２，０００ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ～約３，０００ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ～約４，０００ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵ、約２，０００ＣＦＵ～約３，０００ＣＦＵ、約２，０００ＣＦＵ～約４，０００ＣＦＵ、約２，０００ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵ、約３，０００ＣＦＵ～約４，０００ＣＦＵ、約３，０００ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵ、または約４，０００ＣＦＵ～約５，０００ＣＦＵである。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれる微生物の量は、約２５０ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ、約２，０００ＣＦＵ、約３，０００ＣＦＵ、約４，０００ＣＦＵ、または約５，０００ＣＦＵである。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれる微生物の量は、少なくとも約２５０ＣＦＵ、約５００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ、約２，０００ＣＦＵ、約３，０００ＣＦＵ、または約４，０００ＣＦＵである。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれる微生物の量は、最大で約５００ＣＦＵ、約７５０ＣＦＵ、約１，０００ＣＦＵ、約２，０００ＣＦＵ、約３，０００ＣＦＵ、約４，０００ＣＦＵ、または約５，０００ＣＦＵである。いくつかの実施形態では、少なくとも約５００ＣＦＵが種子へ組み込まれる。いくつかの実施形態では、少なくとも約１０００ＣＦＵが種子へ組み込まれる。
いくつかの実施形態では、種子に組み込まれる微生物または浸出物は、長期間にわたって保存安定性を有する。いくつかの実施形態では、保存安定性は、組み込まれる微生物または浸出物の植物成長促進効果が、長時間にわたって持続することを示す。いくつかの実施形態では、改変された種子は、約３ヶ月間から約３６ヶ月間、保存安定性を有する。いくつかの実施形態では、改変された種子は、約３ヶ月～約６ヶ月、約３ヶ月～約９ヶ月、約３ヶ月～約１２ヶ月、約３ヶ月～約１５ヶ月、約３ヶ月～約１８ヶ月、約３ヶ月～約２１ヶ月、約３ヶ月～約２４ヶ月、約３ヶ月～約３０ヶ月、約３ヶ月～約３６ヶ月、約６ヶ月～約９ヶ月、約６ヶ月～約１２ヶ月、約６ヶ月～約１５ヶ月、約６ヶ月～約１８ヶ月、約６ヶ月～約２１ヶ月、約６ヶ月～約２４ヶ月、約６ヶ月～約３０ヶ月、約６ヶ月～約３６ヶ月、約９ヶ月～約１２ヶ月、約９ヶ月～約１５ヶ月、約９ヶ月～約１８ヶ月、約９ヶ月～約２１ヶ月、約９ヶ月～約２４ヶ月、約９ヶ月～約３０ヶ月、約９ヶ月～約３６ヶ月、約１２ヶ月～約１５ヶ月、約１２ヶ月～約１８ヶ月、約１２ヶ月～約２１ヶ月、約１２ヶ月～約２４ヶ月、約１２ヶ月～約３０ヶ月、約１２ヶ月～約３６ヶ月、約１５ヶ月～約１８ヶ月、約１５ヶ月～約２１ヶ月、約１５ヶ月～約２４ヶ月、約１５ヶ月～約３０ヶ月、約１５ヶ月～約３６ヶ月、約１８ヶ月～約２１ヶ月、約１８ヶ月～約２４ヶ月、約１８ヶ月～約３０ヶ月、約１８ヶ月～約３６ヶ月、約２１ヶ月～約２４ヶ月、約２１ヶ月～約３０ヶ月、約２１ヶ月～約３６ヶ月、約２４ヶ月～約３０ヶ月、約２４ヶ月～約３６ヶ月、または約３０ヶ月～約３６ヶ月にわたって保存安定性を有する。いくつかの実施形態では、改変された種子は、約３ヶ月、約６ヶ月、約９ヶ月、約１２ヶ月、約１５ヶ月、約１８ヶ月、約２１ヶ月、約２４ヶ月、約３０ヶ月、または約３６ヶ月にわたって保存安定性を有する。いくつかの実施形態では、改変された種子は、少なくとも約３ヶ月、約６ヶ月、約９ヶ月、約１２ヶ月、約１５ヶ月、約１８ヶ月、約２１ヶ月、約２４ヶ月、または約３０ヶ月にわたって保存安定性を有する。いくつかの実施形態では、改変された種子は、最大で約６ヶ月、約９ヶ月、約１２ヶ月、約１５ヶ月、約１８ヶ月、約２１ヶ月、約２４ヶ月、約３０ヶ月、または約３６ヶ月にわたって保存安定性を有する。
いくつかの実施形態では、種子に組み込まれた微生物は、組み込み後に安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、３０日より長い間、６ヶ月より長い間、１年より長い間、または２年より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、３０日より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、６ヶ月より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、１年より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、２年より長い間、安定している。
植物の種子に組み込まれる微生物またはその浸出物は、本明細書で提供される微生物のいずれか、または他の微生物であってもよい。いくつかの実施形態では、微生物（ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍ）は、微生物（ｍｉｃｒｏｂｅ）である。いくつかの実施形態では、微生物は、内生芽胞形成微生物である。いくつかの実施形態では、微生物は、内生芽胞形成微生物またはその内生胞子である。いくつかの実施形態では、微生物は、本明細書で提供される微生物の内生胞子である。いくつかの実施形態では、微生物は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子である。
細菌を組み込む方法
一態様では、１つ以上の微生物またはその浸出物を１つ以上の植物種子に組み込む方法が本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、上記方法は、植物の種子を消毒する工程を含む。いくつかの実施形態では、上記方法は、１つ以上の微生物またはその浸出物を含む溶液と種子を接触させる工程を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、塩をさらに含む。いくつかの実施形態では、上記方法は、一定期間、種子を溶液とインキュベートする工程を含む。いくつかの実施形態では、一定期間は、所望の量の微生物またはその浸出物を植物の種子に入れるのに十分なものである。いくつかの実施形態では、上記方法は、所望の量の微生物またはその浸出物を種子に組み込む。
いくつかの実施形態では、上記方法は、塩を含む溶液に種子を接触させる工程を含む。任意の塩が使用されてもよい。いくつかの好ましい実施形態では、塩はＮａＣｌである。いくつかの実施形態では、塩は、ＮａＣｌ、ＬｉＣｌ、ＫＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＣａＣｌ２、ＮａＢｒ、ＬｉＢｒ、ＫＢｒ、ＭｇＢｒ２、ＣａＢｒ２、ＮａＩ、ＬｉＩ、ＫＩ、ＭｇＩ２、またはＣａＩ２である。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム、リチウム、またはカリウムのイオンを含む。いくつかの実施形態では、塩はアルカリ金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、塩はアルカリ土類金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、塩は、ハロゲン化物イオンを含む。いくつかの実施形態では、塩は、アルカリまたはアルカリ土類のハロゲン化物塩である。いくつかの実施形態では、塩は、塩化物、臭化物、またはヨウ化物のイオンを含む。いくつかの実施形態では、塩は、硫酸塩、リン酸塩、炭酸塩、または硝酸塩である。
塩は、任意の適切な濃度で溶液中に存在してもよい。いくつかの実施形態では、溶液は約０．８５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．１％～約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．１％～約２．０％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．１％～約０．２５％、約０．１％～約０．５％、約０．１％～約０．６％、約０．１％～約０．７％、約０．１％～約０．７５％、約０．１％～約０．８％、約０．１％～約０．８５％、約０．１％～約０．９％、約０．１％～約０．９５％、約０．１％～約１％、約０．１％～約１．２５％、約０．２５％～約０．５％、約０．２５％～約０．６％、約０．２５％～約０．７％、約０．２５％～約０．７５％、約０．２５％～約０．８％、約０．２５％～約０．８５％、約０．２５％～約０．９％、約０．２５％～約０．９５％、約０．２５％～約１％、約０．２５％～約１．２５％、約０．５％～約０．６％、約０．５％～約０．７％、約０．５％～約０．７５％、約０．５％～約０．８％、約０．５％～約０．８５％、約０．５％～約０．９％、約０．５％～約０．９５％、約０．５％～約１％、約０．５％～約１．２５％、約０．６％～約０．７％、約０．６％～約０．７５％、約０．６％～約０．８％、約０．６％～約０．８５％、約０．６％～約０．９％、約０．６％～約０．９５％、約０．６％～約１％、約０．６％～約１．２５％、約０．７％～約０．７５％、約０．７％～約０．８％、約０．７％～約０．８５％、約０．７％～約０．９％、約０．７％～約０．９５％、約０．７％～約１％、約０．７％～約１．２５％、約０．７５％～約０．８％、約０．７５％～約０．８５％、約０．７５％～約０．９％、約０．７５％～約０．９５％、約０．７５％～約１％、約０．７５％～約１．２５％、約０．８％～約０．８５％、約０．８％～約０．９％、約０．８％～約０．９５％、約０．８％～約１％、約０．８％～約１．２５％、約０．８５％～約０．９％、約０．８５％～約０．９５％、約０．８５％～約１％、約０．８５％～約１．２５％、約０．９％～約０．９５％、約０．９％～約１％、約０．９％～約１．２５％、約０．９５％～約１％、約０．９５％～約１．２５％、または約１％～約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．１％、約０．２５％、約０．５％、約０．６％、約０．７％、約０．７５％、約０．８％、約０．８５％、約０．９％、約０．９５％、約１％、または約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも約０．１％、約０．２５％、約０．５％、約０．６％、約０．７％、約０．７５％、約０．８％、約０．８５％、約０．９％、約０．９５％、または約１％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、最大で約０．２５％、約０．５％、約０．６％、約０．７％、約０．７５％、約０．８％、約０．８５％、約０．９％、約０．９５％、約１％、または約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は約０．８５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．８％～約０．９％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．７５％～約０．９５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．７％～約１％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．５％～約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約０．５％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。
いくつかの実施形態では、溶液は追加の添加剤を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（例えば、Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の固化脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、ポリエチレングリコールモノラウレート（例えば、Ｔｗｅｅｎ ２０）、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、溶液はポロキサマーを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、ポリエチレングリコールモノラウレート（例えば、Ｔｗｅｅｎ ２０）を含む。追加の添加剤は、任意の濃度で存在してもよい。いくつかの実施形態では、追加の添加剤は、最大で、溶液の約０．０１％、０．０５％、０．１％、０．１２５％、０．１５％、０．２％、０．５％、または１％（ｖ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、追加の添加剤は、溶液の約０．０１％～約１％（ｖ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、追加の添加剤は、溶液の約０．１％（ｖ／ｖ）を含む。
いくつかの実施形態では、溶液は追加の金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、マグネシウム、カルシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、溶液はマグネシウムを含む。いくつかの実施形態では、溶液はカルシウムを含む。いくつかの実施形態では、溶液はマンガンを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、マグネシウムとカルシウムとを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、マグネシウムとマンガンとを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、カルシウムとマンガンとを含む。いくつかの実施形態では、溶液は、マグネシウムと、カルシウムと、マンガンとを含む。
いくつかの実施形態では、溶液は、微生物の１つ以上の栄養素を含む。いくつかの実施形態では、溶液は細菌の増殖培地を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、溶原培地（ＬＢ）、栄養ブロス、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、溶液は溶原培地を含む。いくつかの実施形態では、溶液は栄養ブロスを含む。
いくつかの実施形態では、溶液は微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０１７のコロニー形成単位（ＣＦＵ）／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０４、約１０３～約１０５、約１０３～約１０６、約１０３～約１０７、約１０３～約１０８、約１０３～約１０９、約１０３～約１０１０、約１０３～約１０１２、約１０３～約１０１５、約１０３～約１０１７、約１０４～約１０５、約１０４～約１０６、約１０４～約１０７、約１０４～約１０８、約１０４～約１０９、約１０４～約１０１０、約１０４～約１０１２、約１０４～約１０１５、約１０４～約１０１７、約１０５～約１０６、約１０５～約１０７、約１０５～約１０８、約１０５～約１０９、約１０５～約１０１０、約１０５～約１０１２、約１０５～約１０１５、約１０５～約１０１７、約１０６～約１０７、約１０６～約１０８、約１０６～約１０９、約１０６～約１０１０、約１０６～約１０１２、約１０６～約１０１５、約１０６～約１０１７、約１０７～約１０８、約１０７～約１０９、約１０７～約１０１０、約１０７～約１０１２、約１０７～約１０１５、約１０７～約１０１７、約１０８～約１０９、約１０８～約１０１０、約１０８～約１０１２、約１０８～約１０１５、約１０８～約１０１７、約１０９～約１０１０、約１０９～約１０１２、約１０９～約１０１５、約１０９～約１０１７、約１０１０～約１０１２、約１０１０～約１０１５、約１０１０～約１０１７、約１０１２～約１０１５、約１０１２～約１０１７、または約１０１５～約１０１７のコロニー形成単位（ＣＦＵ）／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、または約１０１５ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、最大で約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも１０６～１０７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、１×１０３～１×１０４ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０４～１×１０５ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０５～１×１０６ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０６～１×１０７ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０７～１×１０８ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０８～１×１０９ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０９～１×１０１０ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１０～１×１０１１ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１１～１×１０１２ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１２～１×１０１３ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１３～１×１０１４ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１４～１×１０１５ＣＦＵ／ｍＬ、１×１０１５～１×１０１６ＣＦＵ／ｍＬ、または、１×１０１６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。
いくつかの実施形態では、溶液は、種子質量あたり所望の量の微生物を含んでいる。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０１７のコロニー形成単位（ＣＦＵ）／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０４、約１０３～約１０５、約１０３～約１０６、約１０３～約１０７、約１０３～約１０８、約１０３～約１０９、約１０３～約１０１０、約１０３～約１０１２、約１０３～約１０１５、約１０３～約１０１７、約１０４～約１０５、約１０４～約１０６、約１０４～約１０７、約１０４～約１０８、約１０４～約１０９、約１０４～約１０１０、約１０４～約１０１２、約１０４～約１０１５、約１０４～約１０１７、約１０５～約１０６、約１０５～約１０７、約１０５～約１０８、約１０５～約１０９、約１０５～約１０１０、約１０５～約１０１２、約１０５～約１０１５、約１０５～約１０１７、約１０６～約１０７、約１０６～約１０８、約１０６～約１０９、約１０６～約１０１０、約１０６～約１０１２、約１０６～約１０１５、約１０６～約１０１７、約１０７～約１０８、約１０７～約１０９、約１０７～約１０１０、約１０７～約１０１２、約１０７～約１０１５、約１０７～約１０１７、約１０８～約１０９、約１０８～約１０１０、約１０８～約１０１２、約１０８～約１０１５、約１０８～約１０１７、約１０９～約１０１０、約１０９～約１０１２、約１０９～約１０１５、約１０９～約１０１７、約１０１０～約１０１２、約１０１０～約１０１５、約１０１０～約１０１７、約１０１２～約１０１５、約１０１２～約１０１７、または約１０１５～約１０１７ＣＦＵ／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、または約１０１５ＣＦＵ／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、最大で約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１０ＣＦＵ／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０９ＣＦＵ／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０８ＣＦＵ／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１１ＣＦＵ／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は約１０５～約１０９ＣＦＵ／グラムの種子を含む。
いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０１７コロニー細胞／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０４、約１０３～約１０５、約１０３～約１０６、約１０３～約１０７、約１０３～約１０８、約１０３～約１０９、約１０３～約１０１０、約１０３～約１０１２、約１０３～約１０１５、約１０３～約１０１７、約１０４～約１０５、約１０４～約１０６、約１０４～約１０７、約１０４～約１０８、約１０４～約１０９、約１０４～約１０１０、約１０４～約１０１２、約１０４～約１０１５、約１０４～約１０１７、約１０５～約１０６、約１０５～約１０７、約１０５～約１０８、約１０５～約１０９、約１０５～約１０１０、約１０５～約１０１２、約１０５～約１０１５、約１０５～約１０１７、約１０６～約１０７、約１０６～約１０８、約１０６～約１０９、約１０６～約１０１０、約１０６～約１０１２、約１０６～約１０１５、約１０６～約１０１７、約１０７～約１０８、約１０７～約１０９、約１０７～約１０１０、約１０７～約１０１２、約１０７～約１０１５、約１０７～約１０１７、約１０８～約１０９、約１０８～約１０１０、約１０８～約１０１２、約１０８～約１０１５、約１０８～約１０１７、約１０９～約１０１０、約１０９～約１０１２、約１０９～約１０１５、約１０９～約１０１７、約１０１０～約１０１２、約１０１０～約１０１５、約１０１０～約１０１７、約１０１２～約１０１５、約１０１２～約１０１７、または約１０１５～約１０１７細胞／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７細胞／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、または約１０１５細胞／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、最大で約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７細胞／グラムの種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１０細胞／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０９細胞／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０８細胞／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１１細胞／グラム未満の種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は約１０５～約１０９細胞／グラムの種子を含む。
いくつかの実施形態では、種子は、種子あたり所望の量の微生物を含んでいる。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０１７のコロニー形成単位（ＣＦＵ）／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０４、約１０３～約１０５、約１０３～約１０６、約１０３～約１０７、約１０３～約１０８、約１０３～約１０９、約１０３～約１０１０、約１０３～約１０１２、約１０３～約１０１５、約１０３～約１０１７、約１０４～約１０５、約１０４～約１０６、約１０４～約１０７、約１０４～約１０８、約１０４～約１０９、約１０４～約１０１０、約１０４～約１０１２、約１０４～約１０１５、約１０４～約１０１７、約１０５～約１０６、約１０５～約１０７、約１０５～約１０８、約１０５～約１０９、約１０５～約１０１０、約１０５～約１０１２、約１０５～約１０１５、約１０５～約１０１７、約１０６～約１０７、約１０６～約１０８、約１０６～約１０９、約１０６～約１０１０、約１０６～約１０１２、約１０６～約１０１５、約１０６～約１０１７、約１０７～約１０８、約１０７～約１０９、約１０７～約１０１０、約１０７～約１０１２、約１０７～約１０１５、約１０７～約１０１７、約１０８～約１０９、約１０８～約１０１０、約１０８～約１０１２、約１０８～約１０１５、約１０８～約１０１７、約１０９～約１０１０、約１０９～約１０１２、約１０９～約１０１５、約１０９～約１０１７、約１０１０～約１０１２、約１０１０～約１０１５、約１０１０～約１０１７、約１０１２～約１０１５、約１０１２～約１０１７、または、約１０１５～約１０１７ＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、または約１０１５ＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、最大で約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１０未満のＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０９未満のＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０８未満のＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１１未満のＣＦＵ／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は約１０５～約１０９未満のＣＦＵ／種子を含む。
いくつかの実施形態では、種子は、種子あたりの所望の量の微生物を含んでいる。いくつかの実施形態では、溶液は約１０３～約１０１７細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３～約１０４、約１０３～約１０５、約１０３～約１０６、約１０３～約１０７、約１０３～約１０８、約１０３～約１０９、約１０３～約１０１０、約１０３～約１０１２、約１０３～約１０１５、約１０３～約１０１７、約１０４～約１０５、約１０４～約１０６、約１０４～約１０７、約１０４～約１０８、約１０４～約１０９、約１０４～約１０１０、約１０４～約１０１２、約１０４～約１０１５、約１０４～約１０１７、約１０５～約１０６、約１０５～約１０７、約１０５～約１０８、約１０５～約１０９、約１０５～約１０１０、約１０５～約１０１２、約１０５～約１０１５、約１０５～約１０１７、約１０６～約１０７、約１０６～約１０８、約１０６～約１０９、約１０６～約１０１０、約１０６～約１０１２、約１０６～約１０１５、約１０６～約１０１７、約１０７～約１０８、約１０７～約１０９、約１０７～約１０１０、約１０７～約１０１２、約１０７～約１０１５、約１０７～約１０１７、約１０８～約１０９、約１０８～約１０１０、約１０８～約１０１２、約１０８～約１０１５、約１０８～約１０１７、約１０９～約１０１０、約１０９～約１０１２、約１０９～約１０１５、約１０９～約１０１７、約１０１０～約１０１２、約１０１０～約１０１５、約１０１０～約１０１７、約１０１２～約１０１５、約１０１２～約１０１７、または約１０１５～約１０１７細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、少なくとも約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、または約１０１５細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、最大で約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１０未満の細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０９未満の細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０８未満の細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は１０１１未満の細胞／種子を含む。いくつかの実施形態では、溶液は約１０５～約１０９未満の細胞／種子を含む。
いくつかの実施形態では、微生物は細菌である。いくつかの実施形態では、細菌は内生胞子形成細菌である。いくつかの実施形態では、上記方法は、内生胞子形成細菌の内生胞子形成を誘導する工程を含む。いくつかの実施形態では、種子に組み込まれた細菌は、内生胞子である。いくつかの実施形態では、溶液は、内生胞子形成を引き起こすために１つ以上の成分を含む。いくつかの実施形態では、溶液は、カリウム、硫酸第一鉄、カルシウム、マグネシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせを含む。
いくつかの実施形態では、方法は、種子を殺菌する工程を含む。いくつかの実施形態では、方法は、種子の表面を殺菌する工程を含む。殺菌された表面を有する種子を生成する任意の方法が採用されてもよい。いくつかの実施形態では、種子はブリーチ溶液で殺菌される。いくつかの実施形態では、種子は、１つ以上の微生物を含有する溶液中に種子を浸す前に殺菌される。いくつかの実施形態では、種子は殺菌された種子である。いくつかの実施形態では、種子は殺菌された表面を有する。本明細書で使用されるように、「殺菌すること」、「殺菌された」、および関連する用語（例えば、「消毒すること」など）は、殺菌されたものの上に生存している微生物が実質的にないことを示す。いくつかの実施形態では、種子は、微生物を含む溶液中で種子をインキュベートする前に、殺菌される。いくつかの実施形態では、種子は、微生物を含む溶液中で種子をインキュベートした後に、殺菌される。いくつかの実施形態では、殺菌剤が種子の表面に添加される。
いくつかの実施形態では、殺菌または消毒された種子は、種子（例えば、種子の表面）上に生きている微生物を実質的に含まない。いくつかの実施形態では、無菌のまたは殺菌された種子は、種子上に１ＣＦＵ未満、５ＣＦＵ未満、１０ＣＦＵ未満、２０ＣＦＵ未満、３０ＣＦＵ未満、４０ＣＦＵ未満、または５０ＣＦＵ未満の微生物を含んでいる。
いくつかの実施形態では、植物の種子は、微生物を種子に組み込むのに十分な時間、微生物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１分間～約９６０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物は、約１分間～約５分間、約１分間～約１０分間、約１分間～約２０分間、約１分間～約６０分間、約１分間～約２４０分間、約１分間～約９６０分間、約５分間～約１０分間、約５分間～約２０分間、約５分間～約６０分間、約５分間～約２４０分間、約５分間～約９６０分間、約１０分間～約２０分間、約１０分間～約６０分間、約１０分間～約２４０分間、約１０分間～約９６０分間、約２０分間～約６０分間、約２０分間～約２４０分間、約２０分間～約９６０分間、約６０分間～約２４０分間、約６０分間～約９６０分間、または約２４０分間～約９６０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１分間、約５分間、約１０分間、約２０分間、約６０分間、約２４０分間、または約９６０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、少なくとも約１分間、約５分間、約１０分間、約２０分間、約６０分間、または約２４０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、最大で約５分間、約１０分間、約２０分間、約６０分間、約２４０分間、または約９６０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約５分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約２０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約６０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約２４０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約９６０分間、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む溶液とインキュベートされる。
いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１分間～約９６０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物は、約１分間～約５分間、約１分間～約１０分間、約１分間～約２０分間、約１分間～約６０分間、約１分間～約２４０分間、約１分間～約９６０分間、約５分間～約１０分間、約５分間～約２０分間、約５分間～約６０分間、約５分間～約２４０分間、約５分間～約９６０分間、約１０分間～約２０分間、約１０分間～約６０分間、約１０分間～約２４０分間、約１０分間～約９６０分間、約２０分間～約６０分間、約２０分間～約２４０分間、約２０分間～約９６０分間、約６０分間～約２４０分間、約６０分間～約９６０分間、または約２４０分間～約９６０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１分間、約５分間、約１０分間、約２０分間、約６０分間、約２４０分間、または約９６０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、少なくとも約１分間、約５分間、約１０分間、約２０分間、約６０分間、または約２４０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、最大で約５分間、約１０分間、約２０分間、約６０分間、約２４０分間、または約９６０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約５分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約１０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約２０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約６０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約２４０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、植物の種子は、約９６０分間、微生物またはその浸出物を含む溶液とインキュベートされる。
いくつかの実施形態では、種子は所望の温度で、溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、種子は、約２～約４０℃の温度で、溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、種子は、約２～約４℃、約２～約８℃、約２～約１２℃、約２～約１６℃、約２～約２５℃、約２～約３０℃、約２～約３５℃、約２～約４０℃、約４～約８℃、約４～約１２℃、約４～約１６℃、約４～約２５℃、約４～約３０℃、約４～約３５℃、約４～約４０℃、約８～約１２℃、約８～約１６℃、約８～約２５℃、約８～約３０℃、約８～約３５℃、約８～約４０℃、約１２～約１６℃、約１２～約２５℃、約１２～約３０℃、約１２～約３５℃、約１２～約４０℃、約１６～約２５℃、約１６～約３０℃、約１６～約３５℃、約１６～約４０℃、約２５～約３０℃、約２５～約３５℃、約２５～約４０℃、約３０～約３５℃、約３０～約４０℃、または約３５～約４０℃の温度で、溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、種子は、約２℃、約４℃、約８℃、約１２℃、約１６℃、約２５℃、約３０℃、約３５℃、または約４０℃の温度で、溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、種子は、少なくとも約２℃、約４℃、約８℃、約１２℃、約１６℃、約２５℃、約３０℃、または約３５℃の温度で、溶液とインキュベートされる。いくつかの実施形態では、種子は、最大で約４℃、約８℃、約１２℃、約１６℃、約２５℃、約３０℃、約３５℃、または約４０℃の温度で、溶液とインキュベートされる。
いくつかの実施形態では、方法は、種子を乾燥させる工程を含む。いくつかの実施形態では、種子は、全種子水分の約１０％まで乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は、全種子水分の約５％～約２５％まで乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は、全種子水分の約５％～約８％、約５％～約１０％、約５％～約１２％、約５％～約１５％、約５％～約２０％、約５％～約２５％、約８％～約１０％、約８％～約１２％、約８％～約１５％、約８％～約２０％、約８％～約２５％、約１０％～約１２％、約１０％～約１５％、約１０％～約２０％、約１０％～約２５％、約１２％～約１５％、約１２％～約２０％、約１２％～約２５％、約１５％～約２０％、約１５％～約２５％、または約２０％～約２５％まで乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は、全種子水分の約５％、約８％、約１０％、約１２％、約１５％、約２０％、または約２５％まで乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は、全種子水分の少なくとも約５％、約８％、約１０％、約１２％、約１５％、または約２０％まで乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は、全種子水分の最大約８％、約１０％、約１２％、約１５％、約２０％、または約２５％まで乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は種子の発芽を防ぐために乾燥される。いくつかの実施形態では、種子は種子を植える前に発芽を防ぐために乾燥される。
微生物を組み込むための製剤
一態様では、微生物、内生胞子、またはその浸出物を種子内に組み込むための製剤が本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、上記製剤は、１つ以上の微生物またはその内生胞子および塩を含む。１つ以上の微生物は、本明細書で提供される微生物またはその内生胞子のいずれかであり得る。いくつかの実施形態では、１つ以上の微生物は、１つ以上の内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む。いくつかの実施形態では、上記製剤は微生物浸出物を含む。浸出物は、本明細書で提供される微生物のいずれかからのものであってもよい。
いくつかの実施形態では、製剤は溶液である。いくつかの実施形態では、製剤は水溶液である。
いくつかの実施形態では、製剤は塩を含む。塩は、任意の適切な濃度で製剤中に存在してもよい。いくつかの実施形態では、製剤は約０．８５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．１％～約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．１％～約２．０％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．１％～約０．２５％、約０．１％～約０．５％、約０．１％～約０．６％、約０．１％～約０．７％、約０．１％～約０．７５％、約０．１％～約０．８％、約０．１％～約０．８５％、約０．１％～約０．９％、約０．１％～約０．９５％、約０．１％～約１％、約０．１％～約１．２５％、約０．２５％～約０．５％、約０．２５％～約０．６％、約０．２５％～約０．７％、約０．２５％～約０．７５％、約０．２５％～約０．８％、約０．２５％～約０．８５％、約０．２５％～約０．９％、約０．２５％～約０．９５％、約０．２５％～約１％約０．２５％～約１．２５％約０．５％～約０．６％、約０．５％～約０．７％、約０．５％～約０．７５％、約０．５％～約０．８％、約０．５％～約０．８５％、約０．５％～約０．９％、約０．５％～約０．９５％、約０．５％～約１％、約０．５％～約１．２５％、約０．６％～約０．７％、約０．６％～約０．７５％、約０．６％～約０．８％、約０．６％～約０．８５％、約０．６％～約０．９％約０．６％～約０．９５％約０．６％～約１％、約０．６％～約１．２５％、約０．７％～約０．７５％、約０．７％～約０．８％、約０．７％～約０．８５％、約０．７％～約０．９％、約０．７％～約０．９５％、約０．７％～約１％、約０．７％～約１．２５％、約０．７５％～約０．８％、約０．７５％～約０．８５％、約０．７５％～約０．９％、約０．７５％～約０．９５％、約０．７５％～約１％、約０．７５％～約１．２５％、約０．８％～約０．８５％、約０．８％～約０．９％、約０．８％～約０．９５％、約０．８％～約１％、約０．８％～約１．２５％、約０．８５％～約０．９％、約０．８５％～約０．９５％、約０．８５％～約１％、約０．８５％～約１．２５％、約０．９％～約０．９５％、約０．９％～約１％、約０．９％～約１．２５％、約０．９５％～約１％、約０．９５％～約１．２５％、または約１％～約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．１％、約０．２５％、約０．５％、約０．６％、約０．７％、約０．７５％、約０．８％、約０．８５％、約０．９％、約０．９５％、約１％、または約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、少なくとも約０．１％、約０．２５％、約０．５％、約０．６％、約０．７％、約０．７５％、約０．８％、約０．８５％、約０．９％、約０．９５％、または約１％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、最大で約０．２５％、約０．５％、約０．６％、約０．７％、約０．７５％、約０．８％、約０．８５％、約０．９％、約０．９５％、約１％、または約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は約０．８５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．８％～約０．９％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．７５％～約０．９５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．７％～約１％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．５％～約１．２５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約０．５％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の塩（ｗ／ｖ）を含む。
任意の塩が使用されてもよい。いくつかの好ましい実施形態では、塩はＮａＣｌである。いくつかの実施形態では、塩は、ＮａＣｌ、ＬｉＣｌ、ＫＣｌ、ＭｇＣｌ２、ＣａＣｌ２、ＮａＢｒ、ＬｉＢｒ、ＫＢｒ、ＭｇＢｒ２、ＣａＢｒ２、ＮａＩ、ＬｉＩ、ＫＩ、ＭｇＩ２、またはＣａＩ２である。いくつかの実施形態では、塩は、ナトリウム、リチウム、またはカリウムのイオンを含む。いくつかの実施形態では、塩はアルカリ金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、塩はアルカリ土類金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、塩は、ハロゲン化物イオンを含む。いくつかの実施形態では、塩は、アルカリまたはアルカリ土類のハロゲン化物塩である。いくつかの実施形態では、塩は、塩化物、臭化物、またはヨウ化物のイオンを含む。いくつかの実施形態では、塩は、硫酸塩、リン酸塩、炭酸塩、または硝酸塩である。
いくつかの実施形態では、製剤は追加の添加剤を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム（ｌａｕｒｏｃａｐｒａｍ）、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（例えば、Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン性）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、ポリエチレングリコールモノラウレート（例えば、Ｔｗｅｅｎ ２０）、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、製剤はポロキサマーを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、ポリエチレングリコールモノラウレート（例えば、Ｔｗｅｅｎ ２０）を含む。追加の添加剤は、任意の濃度で存在してもよい。いくつかの実施形態では、追加の添加剤は、最大で、製剤の約０．０１％、０．０５％、０．１％、０．１２５％、０．１５％、０．２％、０．５％、または１％（ｖ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、追加の添加剤は、製剤の約０．０１％～約１％（ｖ／ｖ）を含む。いくつかの実施形態では、追加の添加剤は、製剤の約０．１％（ｖ／ｖ）を含む。
いくつかの実施形態では、製剤は追加の金属イオンを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、マグネシウム、カルシウム、マンガン（ｍａｎａｇａｎｅｓｅ）、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、製剤はマグネシウムを含む。いくつかの実施形態では、製剤はカルシウムを含む。いくつかの実施形態では、製剤はマンガンを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、マグネシウムとカルシウムとを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、マグネシウムとマンガンとを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、カルシウムとマンガンとを含む。いくつかの実施形態では、製剤は、マグネシウムと、カルシウムと、マンガンとを含む。
いくつかの実施形態では、製剤は、微生物のための１つ以上の栄養素を含む。いくつかの実施形態では、製剤は細菌増殖培地を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、溶原培地（ＬＢ）、栄養ブロス、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、製剤は溶原培地を含む。いくつかの実施形態では、製剤は栄養ブロスを含む。
いくつかの実施形態では、製剤は、１つ以上の微生物の内生胞子形成（ｅｎｄｏｓｐｏｒｕｌａｔｉｏｎ）を促進するための追加の成分を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、カリウム、硫酸第一鉄、カルシウム、マグネシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、製剤はカリウムを含む。いくつかの実施形態では、製剤は硫化鉄を含む。いくつかの実施形態では、製剤はカルシウムを含む。いくつかの実施形態では、製剤はマグネシウムを含む。いくつかの実施形態では、製剤はマンガンを含む。
いくつかの実施形態では、製剤は微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約１０３～約１０１７のコロニー形成単位（ＣＦＵ）／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、少なくとも１×１０６ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約１０３～約１０４、約１０３～約１０５、約１０３～約１０６、約１０３～約１０７、約１０３～約１０８、約１０３～約１０９、約１０３～約１０１０、約１０３～約１０１２、約１０３～約１０１５、約１０３～約１０１７、約１０４～約１０５、約１０４～約１０６、約１０４～約１０７、約１０４～約１０８、約１０４～約１０９、約１０４～約１０１０、約１０４～約１０１２、約１０４～約１０１５、約１０４～約１０１７、約１０５～約１０６、約１０５～約１０７、約１０５～約１０８、約１０５～約１０９、約１０５～約１０１０、約１０５～約１０１２、約１０５～約１０１５、約１０５～約１０１７、約１０６～約１０７、約１０６～約１０８、約１０６～約１０９、約１０６～約１０１０、約１０６～約１０１２、約１０６～約１０１５、約１０６～約１０１７、約１０７～約１０８、約１０７～約１０９、約１０７～約１０１０、約１０７～約１０１２、約１０７～約１０１５、約１０７～約１０１７、約１０８～約１０９、約１０８～約１０１０、約１０８～約１０１２、約１０８～約１０１５、約１０８～約１０１７、約１０９～約１０１０、約１０９～約１０１２、約１０９～約１０１５、約１０９～約１０１７、約１０１０～約１０１２、約１０１０～約１０１５、約１０１０～約１０１７、約１０１２～約１０１５、約１０１２～約１０１７、または約１０１５～約１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、少なくとも約１０３、約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、または約１０１５ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、最大で約１０４、約１０５、約１０６、約１０７、約１０８、約１０９、約１０１０、約１０１２、約１０１５、または約１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、少なくとも１０６～１０７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。いくつかの実施形態では、製剤は、１×１０３～１×１０４ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０４～１×１０５ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０５～１×１０６ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０６～１×１０７ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０７～１×１０８ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０８～１×１０９ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０９～１×１０１０ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１０～１×１０１１ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１１～１×１０１２ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１２～１×１０１３ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１３～１×１０１４ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１４～１×１０１５ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１５～１×１０１６ＣＦＵ／ｍＬ；または、１×１０１６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの微生物を含む。微生物は、本明細書で提供される微生物のいずれか、または本明細書で提供される微生物のいずれかの内生胞子であってもよい。
いくつかの実施形態では、製剤は所望の温度で維持される。いくつかの実施形態では、製剤は、約２～約４０℃の温度で維持される。いくつかの実施形態では、製剤は、約２～約４、約２～約８、約２～約１２、約２～約１６、約２～約２５、約２～約３０、約２～約３５、約２～約４０、約４～約８、約４～約１２、約４～約１６、約４～約２５、約４～約３０、約４～約３５、約４～約４０、約８～約１２、約８～約１６、約８～約２５、約８～約３０、約８～約３５、約８～約４０、約１２～約１６、約１２～約２５、約１２～約３０、約１２～約３５、約１２～約４０、約１６～約２５、約１６～約３０、約１６～約３５、約１６～約４０、約２５～約３０、約２５～約３５、約２５～約４０、約３０～約３５、約３０～約４０、または約３５～約４０℃の温度で維持される。いくつかの実施形態では、製剤は、約２、約４、約８、約１２、約１６、約２５、約３０、約３５、または約４０℃の温度で維持される。いくつかの実施形態では、製剤は、少なくとも約２、約４、約８、約１２、約１６、約２５、約３０、または約３５℃の温度で維持される。いくつかの実施形態では、製剤は、最大で約４、約８、約１２、約１６、約２５、約３０、約３５、または約４０℃の温度で維持される。
微生物および浸出物
本明細書で提供される微生物またはその浸出物は、植物種子に取り込まれた時に、植物成長促進効果をもたらすことができる。いくつかの実施形態では、微生物は細菌である。いくつかの実施形態では、微生物は内生胞子形成細菌である。いくつかの実施形態では、微生物は細菌の内生胞子である。本明細書で言及される微生物（例えば、細菌）が内生胞子を形成することができる場合は常に、その微生物の任意の内生胞子も包含されることが意図される。例えば、植物種子の処理製剤がＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む場合、その製剤は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．の内生胞子を含む場合がある。
いくつかの実施形態では、微生物は、Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａの門からの微生物である。いくつかの実施形態では、微生物は、ｐｈｙｌｕｍ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓの微生物である。いくつかの実施形態では、微生物は、ｐｈｙｌｕｍ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａの微生物である。いくつかの実施形態では、微生物は、ｐｈｙｌｕｍ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａの微生物である。いくつかの実施形態では、微生物は、微生物のいずれかの内生胞子である。
いくつかの実施形態では、微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される微生物である。いくつかの実施形態では、微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｅｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、およびＳｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．から選択される微生物である。いくつかの実施形態では、微生物はＡｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＡｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＣｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＣｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＥｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＰａｎｔｏｅａ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物はＳｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、微生物は、微生物のいずれかの内生胞子である。
いくつかの実施形態では、微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、またはＳｅｒｒａｔｉａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａを含む。いくつかの実施形態では、微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、またはＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＡｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＣｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＥｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＰａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉを含む。いくつかの実施形態では、微生物はＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む。いくつかの実施形態では、微生物は、微生物のいずれかの内生胞子である。
いくつかの実施形態では、微生物は内生胞子形成細菌である。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌はｇｅｎｕｓ Ｂａｃｉｌｌｕｓからのものである。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からのものである。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子形成細菌は枯草菌を含む。いくつかの実施形態では、微生物は、微生物のいずれかの内生胞子である。
いくつかの実施形態では、微生物は内生胞子である。いくつかの実施形態では、内生胞子はｇｅｎｕｓ Ｂａｃｉｌｌｕｓからのものである。いくつかの実施形態では、内生胞子はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．である。いくつかの実施形態では、内生胞子は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子はＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子はＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子はＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉを含む。いくつかの実施形態では、内生胞子はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。
いくつかの実施形態では、微生物のコンソーシアムは種子へ組み込まれるる。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される２つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｅｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、またはＳｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．から選択される２つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、またはそれ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは２つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは３つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは４つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは５つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは６つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、微生物のいずれかの内生胞子を含む。
いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、ｐｈｙｌｕｍ Ｂａｃｉｌｌｕｓからの細菌および１つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、ｐｈｙｌｕｍ Ｂａｃｉｌｌｕｓからの細菌、および、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、 Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｅｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、およびＳｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．から選択される２つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、微生物のいずれかの内生胞子を含む。
いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、およびＳｅｒｒａｔｉａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａから選択される２つ以上の細菌の混合物を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、およびＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓから選択される２つ以上の細菌の混合物を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０の細菌の混合物を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは２つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは３つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは４つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは５つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは６つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、微生物のいずれかの内生胞子を含む。
いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、およびＥｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓから選択される２つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは２つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは３つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは４つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは５つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは６つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは７つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、微生物のいずれかの内生胞子を含む。
いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍから選択される２つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ．から選択される２つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍから選択される２つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ．から選択される３つの細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍの混合物を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍの混合物を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、微生物のいずれかの内生胞子を含む。
いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、およびＥｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓから選択される２つ以上の細菌を含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓおよびＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓまたはＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓおよびＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓおよびＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む。いくつかの実施形態では、上記コンソーシアムは、微生物のいずれかの内生胞子を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される微生物のいずれかの浸出物は細胞に組み込まれる。いくつかの実施形態では、浸出物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．またはＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からのものである。いくつかの実施形態では、浸出物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｅｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、およびＳｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．からのものである。いくつかの実施形態では、浸出物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓ、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍ、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ、またはＳｅｒｒａｔｉａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａからのものである。いくつかの実施形態では、浸出物は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓからのものである。いくつかの実施形態では、浸出物は、微生物のいずれかの内生胞子からのものである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される微生物は、植物の成長を引き起こす１つ以上の化合物をコードする遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、化合物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす。いくつかの実施形態では、化合物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす。いくつかの実施形態では、微生物は、窒素固定、ホスフェート可溶化、または植物ホルモン合成、あるいはそれらの任意の組み合わせに関連する遺伝子を含む。いくつかの実施形態では、微生物は、遺伝子は窒素固定に関連する。いくつかの実施形態では、微生物は、遺伝子はホスフェート可溶化に関連する。いくつかの実施形態では、微生物は、遺伝子は植物ホルモン合成に関連する。
いくつかの実施形態では、微生物は、植物と相互作用する微生物の能力に関連する１つ以上の特性のために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は適合性のために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は、補食作用または拮抗作用が生じないことを確実にするために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は、保存中の安定性のために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は、迅速な植物のコロニー形成および関連する組織内での生存のために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は、植物における大規模かつ長期的な生理学的反応の刺激のために選択されている。いくつかの実施形態では、微生物は、植物の生活環の促進するために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は、１つ以上の種子への最適な取り込みのために選択される。いくつかの実施形態では、微生物は、植物の生活環全体にわたって存在し続ける。
いくつかの実施形態では、種子に取り込まれた微生物は、取り込み後に安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、３０日より長い間、６ヶ月より長い間、１年より長い間、または２年より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、３０日より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、６ヶ月より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、１年より長い間、安定している。いくつかの実施形態では、微生物は、２年より長い間、安定している。
「少なくとも」、「～より大きい」、または「～以上」との用語が一連の２つ以上の数値における最初の数値の前に付けられる場合は常に、「少なくとも」、「～より大きい」、または「～以上」のと用語は、一連の数値における数値の各々に適用される。例えば、１、２、または３以上は、１以上、２以上、または３以上と同等の意味である。
「～以下（ｎｏ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ）」、「～未満」、または「～以下（ｌｅｓｓ ｔｈａｎ ｏｒ ｅｑｕａｌ ｔｏ）」との用語が一連の２つ以上の数値における最初の数値の前に付けられる場合は常に、「～以下（ｎｏ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ）」、「～未満」、または「～以下（ｌｅｓｓ ｔｈａｎ ｏｒ ｅｑｕａｌ ｔｏ）」との用語は、一連の数値における数値の各々に適用される。例えば、３、２、または１以下は、３以下、２以下、または１以下と同等の意味である。
番号付けされた実施形態
１．操作された種子であって、上記操作された種子は：（ｉ）間に間隙を有する、種皮および胚と；（ｉｉ）上記間隙に配置された１つ以上の微生物とを含む、操作された種子。２．操作された種子であって、上記操作された種子は：（ｉ）間に間隙を有する、種子果皮および種子アリューロン細胞層と；（ｉｉ）上記間隙に配置された１つ以上の微生物とを含む、操作された種子。３．操作された種子であって、上記操作された種子は：（ｉ）種子果皮および種子アリューロン細胞層と；（ｉｉ）上記種子果皮と上記種子アリューロン細胞層との間に配置される１つ以上の微生物と、を含む、操作された種子。４．上記１つ以上の微生物は植物成長促進効果を生成するために選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５．上記種子は単子葉植物の種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。６．上記種子は、トウモロコシ、イネ、コムギ、モロコシの種子から選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。７．上記種子はトウモロコシの種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。８．上記種子はトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｉｚｅ）の種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。９．上記種子は双子葉植物の種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１０．上記種子は、大豆、ワタ、アルファルファ、豆、キノア、レンズ豆、ピーナッツ、レタス、トマト、およびキャベツの種子から選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１１．上記種子はレタスの種子またはトマトの種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１２．上記種子は、レタスの種子またはトマトの種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１３．上記種子はＧＭＯ種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１４．上記種子は非ＧＭＯ種子である、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１５．上記１つ以上の微生物は、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ，およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍの混合物を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１６．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ，Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍの混合物を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１７．上記１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ ａｎｄ Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓの混合物を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１８．上記１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉまたはＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。１９．上記１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａまたはＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２０．上記１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓまたはＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２１．上記１つ以上微の生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ，Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２２．上記１つ以上の微生物は、内生胞子形成微生物を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２３．上記１つ以上の微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２４．上記１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２５．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓから選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２６．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、および Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２７．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、前述の実施形態のいずれかに記載の操作された種子。２８．上記１つ以上の微生物はＡｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。２９．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３０．上記１つ以上の微生物はＣｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３１．１つ以上の微生物は、上記種子内に配置された後に内生胞子を形成する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３２．上記１つ以上の微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３３．上記１つ以上の微生物は内生胞子を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３４．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３５．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％、９８％、９７％、９６％、９５％、９４％、９３％、９２％、９１％、または９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３６．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３７．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３８．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。３９．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４０．上記１つ以上の微生物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上化合物をコードする遺伝子を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４１．上記１つ以上の微生物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上化合物をコードする遺伝子を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４２．上記１つ以上の微生物は植物の成長を引き起こす１つ以上化合物をコードする遺伝子を含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４３．上記１つ以上の微生物は、遺伝子は窒素固定に関連する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４４．上記１つ以上の微生物は、遺伝子はホスフェート可溶化に関連する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４５．上記１つ以上の微生物は、遺伝子は植物ホルモン合成に関連する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４６．微生物浸出物をさらに含む、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４７．上記微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４８．上記微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。４９．上記微生物浸出物は、植物の成長を引き起こす１つ以上の化合物を
含有する、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５０．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５１．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％、９８％、９７％、９６％、９５％、９４％、９３％、９２％、９１％、または９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５２．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５３．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５４．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。５５．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、前述の実施形態のいずれか１つに記載の操作された種子。
５６．１つ以上の植物種子を処理する方法であって、上記方法は：上記１つ以上の種子を製剤に浸す工程であって、上記製剤は、塩と、植物成長促進効果を生成するために選択される１つ以上の微生物とを含む、工程と；１つ以上の微生物を上記種子に組み込むのに十分な期間にわたって、１つ以上の種子を製剤中でインキュベートする工程と、を含む、方法。
５７．１つ以上の植物種子を処理する方法であって、上記方法は：（ｉ）１つ以上の種子を製剤に浸す工程であって、上記製剤は、塩と、植物成長促進効果を生成するために選択される１つ以上の微生物とを含む、工程と；（ｉｉ）種子果皮と種子アリューロン細胞層との間に細菌を組み込むために、上記１つ以上の種子をインキュベートする工程と、を含む、方法。５８．上記１つ以上の植物は処理後に休眠期のままである、実施形態５７に記載の方法。５９．上記１つ以上の植物は処理後に休眠期のままである、実施形態５７または実施形態５８に記載の方法。６０．上記１つ以上の微生物は種子果皮の内部に組み込まれる、実施形態５７－５９のいずれか１つに記載の方法。６１．上記１つ以上の微生物は種子果皮とアリューロン細胞層との間に組み込まれる、実施形態５７－６０のいずれか１つに記載の方法。６２．上記１つ以上の種子を上記製剤から取り出す工程をさらに含む、実施形態５７－６１のいずれか１つに記載の方法。６３．上記１つ以上の種子を上記製剤に浸す前に、上記１つ以上の種子を完全に殺菌する工程をさらに含む、実施形態５７－６２のいずれか１つに記載の方法。６４．上記１つ以上の種子を乾燥させる工程をさらに含む、実施形態５７－６３のいずれか１つに記載の方法。６５．上記１つ以上の種子は種子の全水分の約１０％まで乾燥させる、実施形態５７－６４のいずれか１つに記載の方法。６６．発芽を防ぐために、上記１つ以上の種子を乾燥させる工程をさらに含む、実施形態５７－６５のいずれか１つに記載の方法。６７．１つ以上の種子を上記製剤に浸す前に、上記１つ以上の種子の表面を殺菌する工程をさらに含む、実施形態５７－６６のいずれか１つに記載の方法。６８．上記１つ以上の種子を上記製剤に浸した後、１つ以上の種子の表面を殺菌する工程をさらに含む、実施形態５７－６７のいずれか１つに記載の方法。６９．殺真菌剤を上記種子の表面に添加する工程をさらに含む、実施形態５７－６８のいずれかつに記載の方法。７０．上記１つ以上の種子は、単子葉植物の種子である、実施形態５７－６９のいずれか１つに記載の方法。７１．上記種子は、トウモロコシ、コムギ、イネ、オオムギ、ライムギ、サトウキビ、アワ、オート麦、モロコシから選択される、実施形態５７－７０のいずれか１つに記載の方法。７２．上記種子はトウモロコシ（ｍａｉｚｅ）の種子である、実施形態５７－７１のいずれか１つに記載の方法。７３．上記種子はトウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ）の種子である、実施形態５７－７２のいずれか１つに記載の方法。７４．上記種子は双子葉植物の種子である、実施形態５７－７３のいずれか１つに記載の方法。７５．上記種子は、大豆、ワタ、アルファルファ、マメ、キノア、レンズ豆、ピーナッツ、レタス、トマト、およびキャベツの種子から選択される、実施形態５７－７４のいずれか１つに記載の方法。７６．上記種子はレタスの種子またはトマトの種子である、実施形態５７－７５のいずれか１つに記載の方法。７７．上記種子は、レタスの種子またはトマトの種子である、実施形態５７－７６のいずれか１つに記載の方法。７８．上記種子はＧＭＯ種子である、実施形態５７－７７のいずれか１つに記載の方法。７９．上記種子は非ＧＭＯ種子である、実施形態５７－７８のいずれか１つに記載の方法。８０．上記製剤は水性製剤である、実施形態５７－７９のいずれか１つに記載の方法。８１．上記製剤はポロキサマー１８８をさらに含む、実施形態５７－８０のいずれか１つに記載の方法。８２．上記製剤は、０．１％の濃度のポロキサマー１８８をさらに含む、実施形態５７－８１のいずれか１つに記載の方法。８３．上記製剤はＴｗｅｅｎ ２０をさらに含む、実施形態５７－８２のいずれか１つに記載の方法。８４．上記製剤は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８とポロキサマー４０７の群から選択される１つ異常の薬剤をさらに含む、実施形態５７－８３のいずれか１つに記載の方法。８５．上記製剤は、１つ以上の細菌の内生胞子形成を促進する１つ以上の成分をさらに含む、実施形態５７－８４のいずれか１つに記載の方法。８６．上記製剤は、カリウム、硫酸第一鉄、カルシウム、マグネシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせを含む、実施形態５７－８５のいずれか１つに記載の方法。８７．上記製剤はマンガンをさらに含む、実施形態５７－８６のいずれか１つに記載の方法。８８．上記製剤は、カルシウム、マグネシウム、およびマンガンを含む、実施形態５７－８７のいずれか１つに記載の方法。８９．上記製剤は１つ以上の微生物のための栄養素を含む、実施形態５７－８８のいずれか１つに記載の方法。９０．上記製剤は室温である、実施形態５７－８９のいずれか１つに記載の方法。９１．上記製剤は、約４℃、１０℃、１５℃、２０℃、または３０℃の温度である、実施形態５７－９０のいずれか１つに記載の方法。９２．上記製剤は、約４℃～２０℃の間、または約３０℃～４０℃の間の温度である、実施形態５７－９１のいずれか１つに記載の方法。９３．上記製剤温度は、約２０℃～２４℃の間である、実施形態５７－９２のいずれか１つに記載の方法。９４．上記製剤は約４０℃の温度である、実施形態５７－９３のいずれか１つに記載の方法。９５．上記塩は塩化ナトリウムを含む、実施形態５７－９４のいずれか１つに記載の方法。９６．上記塩は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の濃度である、実施形態５７－９５のいずれか１つに記載の方法。９７．上記塩は約０．８５の濃度である、実施形態５７－９６のいずれか１つに記載の方法。９８．上記塩は約１．２５％以下の濃度である、実施形態５７－９７のいずれか１つに記載の方法。９９．上記塩は約１．２５％の濃度である、実施形態５７－６８のいずれか１つに記載の方法。１００．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍから選択される、実施形態５７－９９のいずれか１つに記載の方法。１０１．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む、実施形態５７－１００のいずれか１つに記載の方法。１０２．上記１つ以上の微生物は、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む、実施形態５７－１０１のいずれか１つに記載の方法。１０３．上記１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓおよびＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む、実施形態５７－１０２のいずれか１つに記載の方法。１０４．上記１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉまたはＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む、実施形態５７－１０３のいずれか１つに記載の方法。１０５．上記１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａまたはＳｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む、実施形態５７－１０４のいずれか１つに記載の方法。１０６．上記１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓまたはＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含む、実施形態５７－１０５のいずれか１つに記載の方法。１０７．上記１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓを含む、実施形態５７－１０６のいずれか１つに記載の方法。１０８．上記１つ以上の微生物は、内生胞子形成微生物を含む、実施形態５７－１０７のいずれか１つに記載の方法。１０９．上記１つ以上の微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む、実施形態５７－１０８のいずれか１つに記載の方法。１１０．上記１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、実施形態５７－１０９のいずれか１つに記載の方法。１１１．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓから選択される、実施形態５７－１１０のいずれか１つに記載の方法。１１２．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃ
ｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される、実施形態５７－１１１のいずれか１つに記載の方法。１１３．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ．から選択される、実施形態５７－１１２のいずれかつに記載の方法。１１４．上記１つ以上の微生物はＡｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．を含む、実施形態５７－１１３のいずれか１つに記載の方法。１１５．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、実施形態５７－１１４のいずれか１つに記載の方法。１１６．上記１つ以上の微生物はＣｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．を含む、実施形態５７－１１５のいずれか１つに記載の方法。１１７．上記１つ以上の微生物は、上記種子に取り込まれた後、内生胞子を形成する、実施形態５７－１１６のいずれか１つに記載の方法。１１８．上記１つ以上の微生物は内生胞子を含む、実施形態５７－１１７のいずれか１つに記載の方法。１１９．上記１つ以上の微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｓｐｏｒｅｓを含む、実施形態５７－１１８のいずれか１つに記載の方法。１２０．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態５７－１１９のいずれか１つに記載の方法。１２１．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態５７－１２０のいずれか１つに記載の方法。１２２．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態５７－１２１のいずれか１つに記載の方法。１２３．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態５７－１２２のいずれか１つに記載の方法。１２４．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態５７－１２３のいずれか１つに記載の方法。１２５．上記製剤は微生物浸出物をさらに含む、実施形態５７－１２４のいずれか１つに記載の方法。１２６．上記微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、実施形態５７－１２５のいずれか１つに記載の方法。１２７．上記微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、実施形態５７－１２６のいずれか１つに記載の方法。１２８．上記微生物浸出物は、植物の成長を引き起こす１つ以上の化合物を含有する、実施形態５７－１２７のいずれか１つに記載の方法。１２９．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態５７－１２８のいずれか１つに記載の方法。１３０．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態５７－１２９のいずれか１つに記載の方法。１３１．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態５７－１３０のいずれか１つに記載の方法。１３２．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態５７－１３１のいずれか１つに記載の方法。１３３．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態５７－１３２のいずれか１つに記載の方法。１３４．上記製剤中の上記１つ以上の微生物の濃度は、約１×１０６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの範囲である、実施形態５７－１３３のいずれか１つに記載の方法。１３５．上記製剤中の上記１つ以上の微生物の濃度は：１×１０３～１×１０４ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０４～１×１０５ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０５～１×１０６ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０６～１×１０７ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０７～１×１０８ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０８～１×１０９ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０９～１×１０１０ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１０～１×１０１１ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１１～１×１０１２ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１２～１×１０１３ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１３～１×１０１４ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１４～１×１０１５ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１５～１×１０１６ＣＦＵ／ｍＬ；または、１×１０１６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬである、実施形態５７－１３４のいずれか１つに記載の方法。１３６．上記製剤中の上記１つ以上の微生物の量は、１グラムの種子当たり１０１０ＣＦＵ未満である、実施形態５７－１３５のいずれか１つに記載の方法。１３７．上記製剤中の上記１つ以上の微生物の量は、１グラムの種子当たり約１０５～１０９の細胞である、実施形態５７－１３６のいずれか１つに記載の方法。１３８．上記１つ以上の微生物は、植物成長促進効果を生成するために選択される、実施形態５７－１３７のいずれか１つに記載の方法。１３９．上記１つ以上の微生物の植物成長促進効果は、細胞の浸透圧調節、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、および／または光合成能力の維持からなる群から選択される、実施形態５７－１３８のいずれか１つに記載の方法。１４０．上記１つ以上の微生物は適合性のための選択される、実施形態５７－１３９のいずれか１つに記載の方法。１４１．上記１つ以上の微生物は、補食作用または拮抗作用が発生しないことを確実にするために選択される、実施形態５７－１４０のいずれか１つに記載の方法。１４２．上記１つ以上の微生物は、保存中の安定性のために選択される、実施形態５７－１４１のいずれか１つに記載の方法。１４３．上記１つ以上の微生物は、迅速な植物コロニー形成および関連する組織内での生存のために選択される、実施形態５７－１４２のいずれか１つに記載の方法。１４４．上記１つ以上の微生物は、植物における大規模かつ長期的な生理学的応答の刺激のために選択される、実施形態５７－１４３のいずれか１つに記載の方法。１４５．上記１つ以上の微生物は、植物の生活環を促進するために選択される、実施形態５７－１４４のいずれか１つに記載の方法。１４６．上記１つ以上の微生物は、１つ以上の種子への最適な取り込みのために選択される、実施形態５７－１４５のいずれか１つに記載の方法。１４７．上記微生物の少なくとも１つは、植物の生活環全体にわたって存在し続ける、実施形態５７－１４６のいずれか１つに記載の方法。１４８．インキュベーション時間は１分未満である、実施形態５７－１４７のいずれか１つに記載の方法。１４９．インキュベーション時間は約１分である、実施形態５７－１４８のいずれか１つに記載の方法。１５０．インキュベーション時間は１０分未満である、実施形態５７－１４９のいずれか１つに記載の方法。１５１．インキュベーション時間は５分未満である、実施形態５７－１５０のいずれか１つに記載の方法。１５２．インキュベーション時間は２０分未満である、実施形態５７－１５１のいずれか１つに記載の方法。１５３．インキュベーション時間は４時間未満または１６時間未満である、実施形態５７－１５２のいずれか１つに記載の方法。１５４．インキュベーション時間は数日未満である、実施形態５７－１５３のいずれか１つに記載の方法。１５５．インキュベーション時間は１２時間未満である、実施形態５７－１５４のいずれか１つに記載の方法。１５６．１×１０６よりも大きい細菌細胞は、上記１つ以上の種子の各々に組み込まれる、実施形態５７－１５５のいずれか１つに記載の方法。１５７．１×１０５～１×１０８の間の細菌細胞は、上記１つ以上の種子の各々に組み込まれる、実施形態５７－１５６のいずれか１つに記載の方法。１５８．上記１つ以上の微生物は、１つ以上の種子に安定して組み込まれる、実施形態５７－１５７のいずれか１つに記載の方法。１５９．取り込まれた上記１つ以上の微生物は、３０日を超えて安定している、実施形態５７－１５８のいずれか１つに記載の方法。１６０．取り込まれた上記１つ以上の微生物は、６ヶ月を超えて安定している、実施形態５７－１５９のいずれか１つに記載の方法。１６１．取り込まれた上記１つ以上の微生物は、少なくとも１年間安定している、実施形態５７－１６０のいずれか１つに記載の方法。１６２．取り込まれた上記１つ以上の微生物は、少なくとも２年間安定している、実施形態５７－１６１のいずれか１つに記載の方法。
１６３．塩と１つ以上の微生物とを含む、植物種子処理製剤。１６４．上記１つ以上の微生物は植物成長促進効果をもたらすために選択される、実施形態１６３に記載の製剤。１６５．上記製剤は水性製剤である、実施形態１６３または１６４に記載の製剤。１６６．上記製剤はポロキサマー１８８をさらに含む、実施形態１６３－１６５のいずれか１つに記載の製剤。１６７．０．１％の濃度のポロキサマー１８８をさらに含む、実施形態１６３－１６６のいずれか１つに記載の製剤。１６８．Ｔｗｅｅｎ ２０をさらに含む、実施形態１６３－１６７のいずれか１つに記載の製剤。１６９．ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、およびポロキサマー４０７からなる群からの１つ以上の薬剤をさらに含む、実施形態１６３－１６８のいずれか１つに記載の製剤。１７０．１つ以上の細菌の内生胞子形成を促進する１つ以上の成分をさらに含む、実施形態１６３－１６９のいずれか１つに記載の製剤。１７１．カリウム、硫酸第一鉄、カルシウム、マグネシウム、マンガン、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態１６３－１７０のいずれか１つに記載の製剤。１７２．マンガンをさらに含む、実施形態１６３－１７１のいずれか１つに記載の製剤。１７３．カルシウム、マグネシウム、およびマンガンをさらに含む、実施形態１６３－１７２のいずれか１つに記載の製剤。１７４．選択された１つ以上の微生物のための栄養素をさらに含む、実施形態１６３－１７３のいずれか１つに記載の製剤。１７５．上記塩は塩化ナトリウムを含む、実施形態１６３－１７４のいずれか１つに記載の培地。１７６．上記塩は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の濃度である、実施形態１６３－１７５のいずれか１つに記載の製剤。１７７．上記塩は約０．８５の濃度である、実施形態１６３－１７６のいずれか１つに記載の製剤。１７８．上記塩は約１．２５％以下の濃度である、実施形態１６３－１７７のいずれか１つに記載の製剤。１７９．上記塩は約１．２５％の濃度である、実施形態１６３－１７８のいずれか１つに記載の製剤。１８０．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍから選択される、実施形態１６３－１７９のいずれか１つに記載の製剤。１８１．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む、実施形態１６３－１８０のいずれか１つに記載の製剤。１８２．上記１つ以上の微生物は、Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ、およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍを含む、実施形態１６３－１８１のいずれか１つに記載の製剤。１８３．上記１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓおよびＢａｃｉｌｌｕｓ ｎａｋａｍｕｒａｉ またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む、実施形態１６３－１８２のいずれか１つに記載の方法。１８４．上記１つ以上の微生物は、Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉまたはＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含む、実施形態１６３－１８３のいずれか１つに記載の製剤。１８５．上記１つ以上の微生物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａまたはＳｅｒｒａｔｉｏａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓを含む、実施形態１６３－１８４のいずれか１つに記載の製剤。１８６．上記１つ以上の微生物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓまたはＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓを含む、実施形態１６３－１８５のいずれか１つに記載の製剤。１８７．上記１つ以上の微生物は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含む、実施形態１６３－１８６のいずれか１つに記載の製剤。１８８．上記１つ以上の微生物は、内生胞子形成微生物を含む、実施形態１６３－１８７のいずれか１つに記載の製剤。１８９．上記１つ以上の微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．を含む、実施形態１６３－１８８のいずれか１つに記載の製剤。１９０．上記１つ以上の微生物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、実施形態１６３－１８９のいずれか１つに記載の製剤。１９１．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓから選択される、実施形態１６３－１９０のいずれか１つに記載の製剤。１９２．上記１つ以上の微生物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される、実施形態１６３－１９１のいずれか１つに記載の製剤。１９３．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ．から選択される、実施形態１６３－１９２のいずれかに記載の製剤。１９４．上記１つ以上の微生物はＡｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．を含む、実施形態１６３－１９３のいずれか１つに記載の製剤。１９５．上記１つ以上の微生物はｐｈｙｌｕｍ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される、実施形態１６３－１９４のいずれか１つに記載の製剤。１９６．上記１つ以上の微生物はＣｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．を含む、実施形態１６３－１９５のいずれか１つに記載の製剤。１９７．上記１つ以上の微生物は、上記種子に取り込まれた後、内生胞子を形成する、実施形態１６３－１９６のいずれか１つに記載の製剤。１９８．上記１つ以上の微生物は内生胞子を含む、実施形態１６３－１９７のいずれか１つに記載の製剤。１９９．上記１つ以上の微生物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｓｐｏｒｅｓを含む、実施形態１６３－１９８のいずれか１つに記載の製剤。２００．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態１６３－１９９のいずれか１つに記載の製剤。２０１．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態１６３－２００のいずれか１つに記載の製剤。２０２．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態１６３－２０１のいずれか１つに記載の製剤。２０３．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態１６３－２０２のいずれか１つに記載の製剤。２０４．上記１つ以上の微生物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む、実施形態１６３－２０３のいずれか１つに記載の製剤。２０５．微生物浸出物をさらに含む、実施形態１６３－２０４のいずれか１つに記載の製剤。２０６．上記微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、実施形態１６３－２０５のいずれか１つに記載の製剤。２０７．上記微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、実施形態１６３－２０６のいずれか１つに記載の製剤。２０８．上記微生物浸出物は、植物の成長を引き起こす１つ以上の化合物を含有する、実施形態１６３－２０７のいずれか１つに記載の製剤。２０９．上記微生物浸出
物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態１６３－２０８のいずれか１つに記載の製剤。２１０．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態１６３－２０９のいずれか１つに記載の製剤。２１１．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態１６３－２１０のいずれか１つに記載の製剤。２１２．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態１６３－２１１のいずれか１つに記載の製剤。２１３．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態１６３－２１２のいずれか１つに記載の製剤。２１４．上記製剤中の上記１つ以上の微生物の濃度は、約１×１０３～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬの範囲である、実施形態１６３－２１３のいずれか１つに記載の製剤。２１５．上記製剤中の上記１つ以上の微生物の濃度は：１×１０３～１×１０４ＣＦＵ／ｍＬ；１ｘ１０４～１×１０５ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０５～１×１０６ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０６～１×１０７ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０７～１×１０８ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０８～１×１０９ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０９～１×１０１０ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１０～１×１０１１ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１１～１×１０１２ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１２～１×１０１３ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１３～１×１０１４ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１４～１×１０１５ＣＦＵ／ｍＬ；１×１０１５～１×１０１６ＣＦＵ／ｍＬ；または１×１０１６～１×１０１７ＣＦＵ／ｍＬである、実施形態１６３－２１４のいずれか１つに記載の製剤。
２１６．１つ以上の植物種子を処理する方法であって、上記方法は：（ｉ）上記１つ以上の種子を製剤に浸す工程であって、上記製剤は、塩と、植物成長促進効果を生成するために選択される１つ以上の微生物浸出物とを含む、工程と；（ｉｉ）上記１つ以上の微生物浸出物を上記種子に組み込むのに十分な期間にわたって、上記１つ以上の種子を上記製剤中でインキュベートする工程と、を含む、方法。２１７．上記微生物浸出物は、全身誘導耐性（ＩＳＴ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、実施形態２１６に記載の方法。２１８．上記微生物浸出物は、全身誘導抵抗性（ＩＳＲ）を引き起こす１つ以上化合物を含有する、実施形態２１６または２１７に記載の方法。２１９．上記微生物浸出物は、植物の成長を引き起こす１つ以上の化合物を含有する、実施形態２１６－２１８のいずれか１つに記載の方法。２２０．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態２１６－２１９のいずれか１つに記載の方法。２２１．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９９％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態２１６－２２０のいずれか１つに記載の方法。２２２．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９８％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態２１６－２２１のいずれか１つに記載の方法。２２３．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９５％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態２１６－２２２のいずれか１つに記載の方法。２２４．上記微生物浸出物は、配列番号：１－１０２２１のいずれかの配列と少なくとも９０％同一の１６Ｓ核酸配列を含む微生物からのものである、実施形態２１６－２２３のいずれか１つに記載の方法。２２５．上記塩は塩化ナトリウムを含む、実施形態２１６－２２４のいずれか１つに記載の方法。２２６．上記塩は、０．１～０．２％、０．２～０．３％、０．３～０．４％、０．４～０．５％、０．５～０．６％、０．６～０．７％、０．７～０．８％、０．８～０．９％、０．９～１．０％、１．０～１．１％、１．１～１．２％、１．２～１．３％、１．３～１．４％、または１．４～１．５％の濃度である、実施形態２１６－２２５のいずれか１つに記載の方法。２２７．上記塩は約０．８５の濃度である、実施形態２１６－２２６のいずれか１つに記載の方法。２２８．上記塩は約１．２５％以下の濃度である、実施形態２１６－２２７のいずれか１つに記載の方法。２２９．上記塩は約１．２５％の濃度である、実施形態２１６－２２８のいずれか１つに記載の方法。２３０．微生物の浸出物はＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｙａｎｎｉｃｉｉまたは Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍに由来する、実施形態２１６－２２９のいずれか１つに記載の方法。２３１．上記微生物浸出物は、Ｓｅｒｒａｔｉｏａ ｕｒｅｉｌｙｔｉｃａまたはＳｅｒｒａｔｉｏａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓに由来する、実施形態２１６－２３０のいずれか１つに記載の方法。２３２．上記微生物浸出物は、Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ａｒｉｌａｉｔｅｎｓｉｓまたはＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａに由来する、実施形態２１６－２３１のいずれか１つに記載の方法。２３３．上記微生物浸出物はＥｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓに由来する、実施形態２１６－２３２のいずれか１つに記載の方法。２３４．上記微生物浸出物はＣｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓに由来する、実施形態２１６－２３３のいずれか１つに記載の方法。２３５．上記微生物浸出物は、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ、Ｐａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ、またはＢａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓに由来する、実施形態２１６－２３４のいずれか１つに記載の方法。２３６．上記微生物浸出物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、および Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ選択される微生物に由来する、実施形態２１６－２３５のいずれか１つに記載の方法。２３７．上記微生物浸出物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、およびＶｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．から選択される微生物に由来する、実施形態２１６－２３６のいずれか１つに記載の方法。２３８．上記微生物浸出物はｐｈｙｌｕｍ Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａから選択される微生物に由来する、実施形態２１６－２３７のいずれか１つに記載の方法。２３９．上記微生物浸出物はＡｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐに由来する、実施形態２１６－２３８のいずれか１つに記載の方法。２４０．上記微生物浸出物はｐｈｙｌｕｍ Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａに由来する、実施形態２１６－２３９のいずれか１つに記載の方法。２４１．上記微生物浸出物はＣｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．に由来する、実施形態２１６－２４０のいずれか１つに記載の方法。２４２．上記微生物浸出物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐに由来する、実施形態２１６－２４１のいずれか１つに記載の方法。
２４２．植物種子に細菌を組み込む方法であって、上記方法は：ａ．前記植物種子を、前記細菌を含む溶液と接触させる工程であって、ここで前記溶液は約０．１％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む、工程と；ｂ．前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、前記植物種子に少なくとも１のコロニー形成単位（ＣＦＵ）の前記細菌を組み込む工程と、を含む、方法。２４３．（ｂ）は、前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、前記植物種子に少なくとも５００のＣＦＵの前記細菌を組み込むことを含む、実施形態２４２に記載の方法。２４４．前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む、実施形態２４２または２４３に記載の方法。２４５．前記溶液は微生物浸出物を含む、実施形態２４２－２４４のいずれか１つに記載の方法。２４６．前記微生物浸出物は前記細菌に由来する、実施形態２４５に記載の方法。２４７．前記微生物浸出物は前記細菌に由来しない、実施形態２４５に記載の方法。２４８．前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２４２－２４７のいずれか１つに記載の方法。２４９．前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２４２－２４８のいずれか１つに記載の方法。２５０．前記細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む、実施形態２４２－２４９のいずれか１つに記載の方法。２５１．前記細菌は、前記植物種子の種皮と胚との間に組み込まれる、実施形態２４２－２５０のいずれか１つに記載の方法。２５２．（ａ）の前に、前記植物種子を消毒する工程をさらに含む、実施形態２４２－２５１のいずれか１つに記載の方法。２５３．前記溶液は約０．８５％の前記塩を含む、実施形態２４２－２５２のいずれか１つに記載の方法。２５４．前記塩はＮａＣｌを含む、実施形態２４２－２５３のいずれか１つに記載の方法。２５５．前記植物は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子を含む、実施形態２４２－２５４のいずれか１つに記載の方法。２５６．前記溶液はルリア・ベルターニ（ＬＢ）ブロスをさらに含む、実施形態２４２－２５５のいずれか１つに記載の方法。２５７．前記溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）６０、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態２４２－２５６のいずれか１つに記載の方法。２５８．前記溶液は、カルシウム、マグネシウム、マンガン、カリウム、鉄、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態２４２－２５７のいずれか１つに記載の方法。２５９．前記溶液は、約４℃～約４０℃；約２０℃～約４０℃；または、約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される、実施形態２４２－２５８のいずれか１つに記載の方法。２６０．前記溶液は約２３℃または約３０℃で維持される、実施形態２４２－２５９のいずれか１つに記載の方法。２６１．前記植物種子は、約１分～約９６０分、約２０分～約２４０分、または約１分～約２０分の間、前記溶液とインキュベートされる、実施形態２４２－２６０のいずれか１つに記載の方法。２６２．前記植物種子は、約１分、約５分、約１０分、約２０分、約２４０分、または約９６０分間、前記溶液とインキュベートされる、実施形態２４２－２６１のいずれか１つに記載の方法。２６３．前記内生胞子形成細菌の内生胞子形成を誘発することをさらに含む、実施形態２４５－２６２のいずれか１つに記載の方法。
２６４．改変された植物種子であって、前記改変された植物種子の種皮と胚と間に取り込まれた少なくとも１のＣＦＵの細菌を含む、改変された植物種子。 ２６５．前記改変された植物種子は、少なくとも５００ＣＦＵまたは少なくとも１０００ＣＦＵの前記細菌を含む、実施形態２６４に記載の改変された植物種子。２６６．前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む、実施形態２６４または２６５に記載の改変された植物種子。２６７．前記改変された植物種子は微生物浸出物を含む、実施形態２６４－２６６のいずれか１つに記載の改変された植物種子。２６８．前記微生物浸出物は前記細菌に由来する、実施形態２６７に記載の改変された植物種子。２６９．前記微生物浸出物は前記細菌に由来しない、実施形態２６７に記載の改変された植物種子。２７０．前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２６４－２６９のいずれか１つに記載の改変された植物種子。２７１．前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２６４－２７０のいずれか１つに記載の改変された植物種子。２７２．前記細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む、実施形態２６４－２７１のいずれか１つに記載の改変された植物種子。２７３．前記改変された種子は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子である、実施形態２６４－２７２のいずれか１つに記載の改変された植物種子。２７４．前記植物種子は、少なくとも１０００ＣＦＵの前記微生物を含む、実施形態２６４－２７３のいずれか１つに記載の改変された植物種子。
２７５．１×１０３ＣＦＵ／ｍＬの少なくとも１つ以上の細菌を含有する製剤であって、ここで、前記製剤は約０．１％～約２％の塩を含む、製剤。２７６．０．８５％の塩を含む、実施形態２７５に記載の製剤。２７７．前記塩はＮａＣｌを含む、実施形態２７５または２７６に記載の製剤。２７８．前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む、実施形態２７５－２７７のいずれか１つに記載の製剤。２７９．前記製剤は微生物浸出物を含む、実施形態２７５－２７８のいずれか１つに記載の製剤。２８０．前記微生物浸出物は前記細菌に由来する、実施形態２７９に記載の方法。２８１．前記微生物浸出物は前記細菌に由来しない、実施形態２７９に記載の方法。２８２．前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａからの細菌を含む、実施形態２７５－２８１のいずれか１つに記載の製剤。２８３．前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２７５－２８２のいずれか１つに記載の製剤。２８４．前記細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む、実施形態２７５－２８３のいずれか１つに記載の製剤。２８５．前記製剤はＬＢブロスをさらに含む、実施形態２７５－２８４のいずれか１つに記載の製剤。２８６．前記製剤は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）６０、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態２７５－２８５のいずれか１つに記載の製剤。２８７．前記製剤は、カルシウム、マグネシウム、マンガン、カリウム、鉄、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態２７５－２８６のいずれか１つに記載の製剤。２８８．前記製剤は、約４℃～約４０℃；約２０℃～約４０℃；または、約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される、実施形態２７５－２８７のいずれか１つに記載の製剤。２８９．前記製剤は、２３℃または３０℃で維持される、実施形態２７５～２８８のいずれか１つに記載の製剤。２９０．前記製剤は少なくとも５×１０５ＣＦＵ／ｍＬの前記細菌を含有する、実施形態２７５～２８９のいずれか１つに記載の製剤。
２９１．植物種子において植物成長効果を促進する方法であって、上記方法は：ａ．前記植物種子を、細菌を含む溶液と接触させる工程であって、ここで、前記溶液は、約０．１％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む、工程と；ｂ．前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、前記植物種子に少なくとも５００のコロニー形成単位（ＣＦＵ）の前記細菌を組み込む工程と、を含む、方法。２９２．（ａ）の前に、前記植物種子を消毒する工程をさらに含む、実施形態２９１に記載の方法。２９３．前記細菌は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む、実施形態２９１または２９２に記載の方法。２９４．前記溶液は微生物浸出物を含む、実施形態２９１－２９３のいずれか１つに記載の方法。２９５．前記微生物浸出物は前記細菌に由来する、実施形態２９４に記載の方法。２９６．前記微生物浸出物は前記細菌に由来しない、実施形態２９４に記載の方法。２９７．前記細菌は、前記改変された植物種子の種皮と胚との間に組み込まれる、実施形態２９１－２９６のいずれか１つに記載の方法。２９８．前記溶液は約０．８５％の前記塩を含む、実施形態２９１－２９７のいずれか１つに記載の方法。２９９．前記塩はＮａＣｌを含む、実施形態２９１－２９８のいずれか１つに記載の方法。３００．前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２９１－２９９のいずれか１つに記載の方法。３０１．前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、実施形態２９１－３００のいずれか１つに記載の方法。３０２．前記細菌はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む、実施形態２９１－３０１のいずれか１つに記載の方法。３０３．前記植物は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子を含む、実施形態２９１－３０２のいずれか１つに記載の方法。３０４．前記溶液はＬＢブロスをさらに含む、実施形態２９１－３０３のいずれか１つに記載の方法。３０５．前記溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）６０、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態２９１－３０４のいずれか１つに記載の方法。３０６．前記溶液は、カルシウム、マグネシウム、マンガン、カリウム、鉄、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態２９１－３０５のいずれか１つに記載の方法。３０７．前記溶液は、約４℃～約４０℃；約２０℃～約４０℃；または、約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される、実施形態２９１－３０６のいずれか１つに記載の方法。３０８．前記溶液は約２３℃または約３０℃で維持される、実施形態２９１－３０７のいずれか１つに記載の方法。３０９．前記植物種子は、約１分～約９６０分、約２０分～約２４０分、または約１分～約２０分の間、前記溶液とインキュベートされる、実施形態２９１－３０８のいずれか１つに記載の方法。３１０．前記植物種子は、約１分、約５分、約１０分、約２０分、約２４０分、または約９６０分間、前記溶液とインキュベートされる、実施形態２９１－３０９のいずれか１つに記載の方法。３１１．前記内生胞子形成細菌の内生胞子形成を誘発することをさらに含む、実施形態２９１－３１０のいずれか１つに記載の方法。３１２．前記植物成長効果は、収量増加、細胞の浸透圧制御、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、光合成能力の維持、窒素固定、またはそれらの組み合わせを含む、実施形態２９１－３１１のいずれか１つに記載の方法。３１３．前記細菌は、前記植物成長効果に関連して選択される、実施形態３１２に記載の方法。
３１４．植物種子において植物成長効果を促進する方法であって、上記方法は：ａ．前記植物種子を、微生物浸出物を含む溶液と接触させる工程であって、前記溶液は約０．１％～約２％の塩（ｗ／ｖ）を含む、工程と；ｂ．前記植物種子を前記溶液とインキュベートする工程であって、それによって、前記植物種子に前記微生物浸出物を組み込む工程と、を含む、方法。３１５．（ａ）の前に、前記植物種子を消毒する工程をさらに含む、実施形態３１４に記載の方法。３１６．前記微生物浸出物は、内生胞子形成細菌またはその内生胞子に由来する、実施形態３１４または３１５に記載の方法。３１７．前記微生物浸出物は、非内生胞子形成細菌に由来する、実施形態３１４または３１５に記載の方法。３１８．前記微生物浸出物は、前記改変された植物種子の種皮と胚との間に組み込まれる、実施形態３１４－３１７のいずれか１つに記載の方法。３１９．前記溶液は約０．８５％の前記塩を含む、実施形態３１４－３１８のいずれか１つに記載の方法。３２０．前記塩はＮａＣｌを含む、実施形態３１４－３１９のいずれか１つに記載の方法。３２１．前記微生物浸出物は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせに由来する、実施形態３１４－３２０のいずれか１つに記載の方法。３２２．前記微生物浸出物は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．，Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせに由来する、実施形態３１４－３２１のいずれか１つに記載の方法。３２３．前記微生物浸出物はＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌に由来する、実施形態３１４－３２２のいずれか１つに記載の方法。３２４．前記植物は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子を含む、実施形態３１４－３２３のいずれか１つに記載の方法。３２５．前記溶液は、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）６０、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、ポロキサマー１８８、ポロキサマー２３７、ポロキサマー３３８、ポロキサマー４０７、またはそれらの組み合わせをさらに含む、実施形態３１４－３２４のいずれか１つに記載の方法。３２６．前記溶液は、約４℃～約４０℃；約２０℃～約４０℃；または、約１０℃～約２０℃の間の温度で維持される、実施形態３１４－３２５のいずれか１つに記載の方法。３２７．前記溶液は約２３℃でまたは約３０℃で維持される、実施形態３１４－３２６のいずれか１つに記載の方法。３２８．前記植物種子は、約１分～約９６０分、約２０分～約２４０分、または約１分～約２０分の間、前記溶液とインキュベートされる、実施形態３１４－３２７のいずれか１つに記載の方法。３２９．前記植物種子は、約１分、約５分、約１０分、約２０分、約２４０分、または約９６０分間、前記溶液とインキュベートされる、実施形態３１４－３２８のいずれか１つに記載の方法。３３０．前記植物成長効果は、植物の収量増加、細胞の浸透圧制御、イオン恒常性、抗酸化防御、熱ストレス耐性、光合成能力の維持、窒素固定、またはそれらの組み合わせを含む、実施形態３１４－３２９のいずれか１つに記載の方法。３３１．前記微生物浸出物は、前記植物成長効果に関して選択される、実施形態３１４－３３０のいずれか１つに記載の方法。３３２．前記植物成長効果は窒素固定を含む、実施形態３１４－３３１のいずれか１つに記載の方法。３３３．前記植物成長効果は植物の収量の増加を含む、実施形態３１４－３３１のいずれか１つに記載の方法。
３３４．上記１つ以上の微生物は植物の収量を改善するために選択される、実施形態１－５５のいずれか１つに記載の操作された種子。
３３５．植物成長効果は収量の増加を含む、実施形態５７－１６１のいずれか１つに記載の方法。
３３６．前記植物成長効果は収量の増加を含む、実施形態２９１－３１２のいずれか１つに記載の方法。
本開示の方法および組成物は、休眠期中に、植物有益微生物（ｐｌａｎｔ ｂｅｎｅｆｉｃｉａｌ ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ）、および／またはその浸出物、および／またはその個別化された生体分子で種子を処理することによって、種子に由来する農業植物または農業草木の成長、栄養状態、および環境的と生物的なストレスに対する耐性を増強するように設計される。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理により、種子の胚の生物学的プライミング（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｉｍｉｎｇ）が可能になる。この段階では、種子内に以前に取り込まれた細菌および／または内生胞子ならびに浸出物は、植物胚にアクセスし、持続する植物発育を刺激し、および／または植物宿主における耐性応答を誘発するように好都合に配置され、同時に、細菌を使用する場合は、根が土壌微生物相に露出される前に、根ニッチ（ｒｏｏｔ ｎｉｃｈｅ）をうまくコロニー形成（定着？）するという利点がある。例えば、窒素固定細菌によって効果的な根ニッチコロニー形成を達成することで、植物にアンモニウムを効率的に送達することができる。
微生物製剤の定義：初期のコンディショニングを達成するために、本開示は、懸濁培地中の合成コンソーシアムまたは単一の単離された菌種あるいは内生胞子を含む、種子処理組成物を使用する。典型的には、植物栽培の組成物および方法は、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ ｐｈｙｌｕｍ（α－、β－、γおよびδ－プロテオバクテリアクラス）、ならびに、Ｐｈｙｌｕｍ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ、およびＡｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ内の異なる分類群中に分布する、種々様々な細菌属に属する多様で環境的に適応可能な植物に関連する細菌を含む。本発明者らは、これらの大きな分類群内の、通常、植物に関連する微生物を含む、様々な属に属する植物成長を促進する細菌を単離および特徴づけて、これを、植物成長および健康を改善するために、本開示の方法を使用して、種子に適用することができる。組成物は、個別に培養された１つ、２つ、３つ、またはいくつかの様々な細菌属を含み、それをＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理のために混合した。
実施例１．内生胞子を成形しない細菌、内生胞子を成形する細菌、および／または細菌内生胞子を形成する細菌のローディングを増加させるための種子処理：Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）技術。
種子の内部の細菌および細菌内生胞子にロードするという概念は、図１に例示される。室温で、短期間で行なうことができるプロセスは、より少ない資源およびエネルギーを使用するため産業上拡張可能でより経済的であることから、常に望ましいものである。室温で微生物を種子に組み込むプロセスを合理化するために、いくつかの界面活性剤または薬剤を探した。界面活性剤のうち、種子浸透性、およびそれ自体でまたは組み合わせて種子の中に所望の要素を入れることを改善する可能性があるものは、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、１－ドデシルアザシクロヘプタン－２－オン、ラウロカプラム、１－メチル－２－ピロリドン（ＮＭＰ）、オレイン酸、エタノール、メタノール、ポリエチレングリコール（Ｂｒｉｊ ３５、５８、９８）、ポリエチレングリコールモノラウレート（Ｔｗｅｅｎ ２０）、Ｔｗｅｅｎ ４０（ポリオキシエチレン酸ソルビトールエステル）、Ｔｗｅｅｎ ６０、Ｔｗｅｅｎ ８０（非イオン物質）、臭化セチルメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ）、尿素、レシチン（大豆由来の凝固脂肪酸）、キトサン、および様々なポロキサマー（１８８、２３７、３３８、４０７）である。下記の表は、２つの選択された界面活性剤または薬剤（Ｔｗｅｅｎ ２０およびポロキサマー１８８）で補足された培地中で、０．８５％ｗ／ｖのＮａＣｌ塩を用いて実施した試験の要約表（表２）である。その処理は、市販のトウモロコシ種子（Ｄｅｋａｌｂ ＤＫ６３０）においてＳｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．の株を用いて２３℃で５分間実行した。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液中の細胞の濃度は、６．４×１０９ＣＦＵ／ｍｌであった。
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液にポロキサマー１８８（０．１％ｗ／ｖ）を添加すると、種子内部の細菌のローディングが５２％増加した。（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセス中、周囲温度および短い吸水時間のパラメータを維持する間）種子内の細菌細胞を大幅に増加させるこの効果は、その工業規模の実施のために非常に望ましい。
同じ前の試験の結果を下記の表３に示すが、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液中のＮａＣｌをより高い濃度（１．２５％ｗ／ｖ）にし、細胞濃度を２．９×１０１２ＣＦＵ／ｍｌにした。
両方の結果を比較する場合、Ｔｗｅｅｎ ２０とポロキサマー１８８の両方の効果は、これらの界面活性剤を含まない同じ吸水液培地と比較すると、種子内により多くの細菌細胞を組み込むのを助け続けることは明白である。１．２５％（ｗ／ｖ）のＮａＣｌを使用すると、種子に細菌細胞を組み込む効率が劇的に減少する。
処理された種子内に存在する細菌細胞の数の標準偏差および標準誤差を減らすために、栄養素を添加した（以下の実施例では、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液に細菌を組み込む前に、細菌を成長させるために同じルリア・ベルターニ（ＬＢ）培地を使用した）。表４では、細菌のための栄養源を添加すると、標準偏差および標準誤差の減少が達成され、したがって、種子内で細菌細胞の数がより均質になり得ることが示される。
細菌を種子の内部に配置すると、種子は、栄養素が枯渇するまで、または細菌のための生存可能な成長条件が止められる（例えば、種子が乾燥するとき）まで、これらの栄養素にアクセスすることによって増殖し続けることができるため、吸収培地を細菌のための栄養源で補足する場合に標準偏差と標準誤差がより低くなることが説明され得る。
栄養補助剤のうち、内生胞子を形成する細菌のその栄養成長期から内生胞子までの転換を改善することができるものは、単独でまたは組み合わせで、カルシウム、マグネシウム、カリウム、マンガン、および硫酸第一鉄である。表５では、ミネラルを含有する様々な培地および単離されたＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．の様々なインキュベーション時間の下で得られた、１ミリリットル当たりの内生胞子の数が報告される。
種子にロードした細菌を適切に増殖するためには、選択した細菌と特に適合性がある栄養素でＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液を補足すること、あるいは、種子に組み込まれることが望まれる細菌の内生胞子をＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液に直接添加することが必要となる。
所望の細菌、内生胞子、または細菌コンソーシアムを双子葉植物あるいは単子葉植物の種子内にロードすることは、複雑で非線形のプロセスである。表６に示すように、および単子葉植物の種子（トウモロコシ（ｍａｉｚｅ）、トウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ））の場合には、植物内での効果を有するＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．分離菌の所望量の内生胞子のローディングの成功には、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液中の内生胞子の初期最小濃度の観点での変曲点があり、この変曲点の後、種子に細胞を効果的にロードすることができる。
図５は、４つの細菌分離菌で構成される、内部ではＬａｓｃａｒと呼ばれる合成細菌コンソーシアムの双子葉植物の種子（レタス（ｌｅｔｔｕｃｅ）、レタス（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ））内へのローディング動態（ｌｏａｄｉｎｇ ｋｉｎｅｔｉｃｓ）を示す。この結果により、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理による細菌のローディングプロセスが線形挙動に従わないこと、および、種子内への細菌の効率的なロードを実現するために満たさなければならない、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液中で１ミリリットル当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）の初期最小濃度があることが確認される。さらに、これらの動態の曲線は飽和点が存在することを示し、その飽和点は、１つの種子当たり約１．００Ｅ＋５ＣＦＵである。今度は、ローディング動態および初期最小濃度が一般化できるものではなく、細菌の種類に依存することが観察され得る。
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセスの期間は、工業スケーリングへの鍵となる。表７に示すように、栄養細胞および２つの異なる細菌の内生胞子を使用して共培養の時間を評価した。種子は外部的に殺菌し、２４時間乾燥させ、粉にした後、種子内の平均コロニー形成単位（ＣＦＵ）を定量化した。ＣＦＵ／種子の定量化のために、３つの種子それぞれのプールからなる３つの生物学的反復（ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｐｌｉｃａｔｅｓ）を使用した。すべての場合で、少なくとも５分の曝露は、株Ｓ３Ｃ２３の栄養細胞を例外として、何千もの細菌細胞をロードするのに十分である。最大のロードは、すべての細胞型において２０分かけて達成される。
実施例２．蛍光細菌によるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の視覚化。
種子内にロードした細菌の空間分布を評価するために、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ蛍光レポーター株を使用した。赤色蛍光タンパク質を恒常的に発現するＥ．ｃｏｌｉを使用して、トウモロコシ種子（Ｄｅｋａｌｂ ＤＫ６３０）をＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）で処理した。１つの種子当たりのコロニー形成単位は１．９９Ｅ＋５であり、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理条件は３７℃で２４０分（４時間）であった。種子を固定し、０．５ｃｍ長の切片に切断した。その後、サンプルを５５８ｎｍの波長で共焦点顕微鏡下で分析した。細菌のローディングおよび局在化を視覚的に確認した（ピンク色の繊維、図４Ａ）。より詳しい観察により、種子果皮と種子アリューロン細胞層との間の間隙に細菌を特異的に配置することで、胚乳と胚が外層から分離されることが示される（図４Ｂ）。
これらの結果により、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理は、細菌を種子内に、単子葉植物の場合には、種子果皮と種子アリューロン細胞層との間の間隙に、効果的にローディングできることを示す。
実施例３．Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセスによる特定の細菌の種子ローディング効率
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセスは、種子内への細菌のローディングを可能にするのに十分な期間にわたって、特定の細菌を含有する明確に定義された液体溶液中での種子の給水を含む。このプロセスの効率を知ることが必要である、つまり、細菌をロードすることができる種子のパーセンテージを知る必要がある。この値を特定するために、図６に示すＰＣＲ技術を使用することによって、分子レベルで細菌を検出することができる特定のＤＮＡプライマーを設計する。内部では株Ｓ３Ｃ１０と呼ばれる細菌分離菌Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓを使用してＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を施したトウモロコシ種子（Ｄｅｋａｌｂ ＤＫ６３０）を、３ｍｌのムラシゲスクーグ液体培地を含む培養管を使用してインビトロで発芽させた。植物根が種子から出た後（播種後３～５日）、迅速なＤＮＡ抽出手順を液体培地から実施し、図６に示すように特定のプライマーを使用して、ＰＣＲ反応を実行した。プライミング種子（同じ条件および製剤の下で処理されたが、細菌は除外した種子）を対照として使用した。１つの種子当たりのコロニー形成単位は６．５３Ｅ＋４であり、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は２３℃で２０分であった。
表８は、ロードされた細菌がＰＣＲによって検出可能である種子のパーセンテージを示す。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理による種子のローディング効率は、約９８％である。
実施例４．Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理によって種子にロードされた細菌による、植物根のコロニー形成
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）および細菌分離菌Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ（Ｓ３Ｃ１０）で処理したトウモロコシ種子（Ｄｅｋａｌｂ ＤＫ６３０）を、Ｎｉｕ ｅｔ ａｌ．，２０１８に記載される方法に従って、図７に示すような、基質として寒天を使用する二重管の成長チャンバ中で成長させた。このプロトコルは、根に関連する単純化された群生によってコロニー形成されたトウモロコシ実生を栽培するためのノトバイオート系を設定するために開発された。未処理の種子（処理も接種もしていない種子）、プライミング種子（処理し、接種していない種子）と、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子（処理し、接種した）とを、以下の条件で二重管のチャンバ内で直接発芽させた：１６時間の明期（日）と８時間の暗期（夜）、２５℃および５４％の相対湿度。トウモロコシ実生を上記の条件下で１５日間保存した。この時間の後、無菌の外科用メスの刃で一次根を切断することによって、発芽した種子から、トウモロコシ穀粒未満の１ｃｍ長の一次根の断片を収集した。その後、根の断片を天秤で重さを測り、無菌の１ｘＰＢＳ緩衝液中ですすぎ、無菌の雌しべ（ｐｉｓｔｉｌｓ）でつぶした。混合した細菌懸濁液を、連続的に希釈し、ＬＢ寒天中でプレーティングした。各処理での１グラムの根当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）の定量化を、図８に示す（ｎ＝１５）。これらの実験条件下で、未処理のプライミング実生ではＣＦＵを検出することができない。代わりに、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子の実生では、根の７．００Ｅ＋７ＣＦＵ／グラムの平均値を検出し、このことは、種子にロードされたその細菌が、発芽後に、植物根構造を効果的にコロニー形成することができることを示す。
実施例５．Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理によって種子にロードされた細菌の経時的安定性
細菌種子処理技術が従来の種子産業の物流に適合し、農家にとって価値のあるものとなるためには、種子内の細菌の生存率として理解される細菌安定性を数か月にわたって保証できる必要がある（典型的な種子産業の物流は、農家によって種まき／植え付けされるまで、種子を数か月、さらには数年間保存すること含む）。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後の細菌安定性を評価するために、内部ではＬａｓｃａｒと名付けられた細菌コンソーシアムと、内部では株Ｓ３Ｃ２３と呼ばれる細菌分離菌Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓの内生胞子とをそれぞれ用いて、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセス下で、レタスとトウモロコシの種子を処理した。特定の細菌コロニー形成単位（ＣＦＵ）を、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）で処理した種物の保存時間により評価した。両方の場合で、種子の三つ組みのプールを、処理後に異なる時間で粉にし、１つの種子当たりのＣＦＵを記録した。ＭＰ－Ｓ３Ｃ２３種子における１つの種子当たりのコロニー形成単位は、７．１０Ｅ＋３であり、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理条件は２３℃で２０分であった。図９は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）レタス種子における、短時間（５０日未満）および長時間（１００日を超える）の細菌コンソーシアムの生存を示す。
加えて、図１０は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後の１～１２ヶ月間の期間に、トウモロコシ種子内の株Ｓ３Ｃ２３の内生胞子の生存を示す。
両方の結果により、従来の種子産業および慣行農法の要件と適合する種菌の保存期間が示される。
実施例６．Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理した種子における植物胚の経時的安定性
浸透圧または水ベースの種子処理は、経時的に胚の生存率と双生とにかなりの影響を及ぼし、植物の迅速かつ均一の出芽の可能性を決定する種子活力を経時的に減少させる。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理が、発芽率および種子活力に悪影響を与えないことを示すために、様々な時間でトマト、レタス、およびトウモロコシの種子を分析した。表９は、トマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）胚（Ｔｏｍａｔｏ Ｆｅｒｒｙ－Ｍｏｒｓｅ ｃｖ．Ｒｏｍａ ＶＦ）に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理および従来の種子プライミング処理（オスモプライミング（ｏｓｍｏｐｒｉｍｉｎｇ）としても知られている）の活力における影響を示す。１処理当たり３６の植物の出芽のパーセンテージを、泥炭：真珠岩（土壌基質として使用）に種をまいた７日後に測定した。成長条件は、２５℃、５４％の湿度、および１６時間／８時間（明／暗の時間）であった。細菌分離菌（内部では株Ｐ９Ｃ１と呼ばれるＰａｎｔｏｅａ ａｌｌｉｉ）および２つの異なる吸水培地溶液（ｓｏｌ．１およびｓｏｌ．２）を使用して、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を実施した。ｓｏｌ．１は細菌しか有しておらず、ｓｏｌ．２は細菌とその浸出物を有した。ＭＰ－Ｐ９Ｃ１＿ｓｏｌ．１の種子中の１つの種子当たりのコロニー形成単位は、２．００Ｅ＋５であり、ＭＰ－Ｐ９Ｃ１＿ｓｏｌ．２の種子中の１つの種子当たりのコロニー形成単位は５．００Ｅ＋５であった。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は、３０℃で２４０分（４時間）であった。対照種子は処理しなかった。プライミング種子を、同じ２つの吸水培地ｓｏｌ．１およびｓｏｌ．２を用いて、しかし細菌は用いずに処理した（基本的にオスモプライミング種子処理）。
よく知られているように、種子を（浸透圧的にまたは非浸透圧的に）液体溶液に浸漬するプライミングプロセスの後に、植物胚の活力は経時的に悪影響受ける。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を用いると、以下の表（表９）に示すように、植物胚の活力は未処理の種子と同様に維持される。
図１１は、内部ではＳ８Ｃ６およびＳ８Ｃ７と呼ばれる２つの細菌分離菌、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｍａｒｃｅｓｃｅｎｓ およびＧｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを使用した、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子）を用いた、トウモロコシ（ｍａｉｚｅ）（トウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ））の発芽率をそれぞれ示す。２１のトウモロコシ種子（ＤｅｋａｌｂのＧＭＯ ＤＫ６３０ｄ）の発芽率を、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理後０、３３、５１、および９８日を含むいくらかの保存時間を通じて測定した。対照種子は処理しなかった。プライミング種子を、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子と同じ吸水培地を用いて、しかし細菌を用いずに処理した（基本的にオスモプライミング種子処理）。結果により、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）で処理した種子は、対照／未処理の種子と同じ発芽率を示し、その両方がプライミングされた種子よりも有意に高かったことが示される（図１１）。
加えて、内部ではＪＩＴと呼ばれる細菌の合成コンソーシアムを含むＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を用いて、レタス（ｌｅｔｔｕｃｅ）（レタス（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ））種子の発芽率を評価した。ＪＩＴコンソーシアムは、細菌４（Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ）、細菌５（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、および細菌６（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）からなる。
種子処理から２４０日後のレタス種子の発芽率を以下の表（表１０）に示す。
これらの結果により、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理は、トマト、レタス、トウモロコシが正常に成長する間、発芽率および種子活力に影響を及ぼさず、市販の商品と適合することが示される。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理が長期保存時間で種子活力に影響を及ぼすかどうかを検証するために、加速老化（ＡＡ）試験を、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）（ＭＰ）トウモロコシ種子（Ｄｅｋａｌｂ ＤＫ６３０）において実施した。ＡＡ試験は、保存およびの苗畑出芽の可能性についての価値のある情報を提供する。各ロットまたは処理の２０のトウモロコシ種子を、４３℃で７２時間、および約９５％の相対湿度にさらした。ＡＡ処理後、泥炭：真珠岩土に種子を蒔き、２５℃の温度、５４％の湿度、１６時間の明期と８時間の暗期の光周期で、温室でインキュベートした。播種の７日後に、胚軸の出芽、および、正常な実生と異常な実生と死んでいる実生の数を測定した。対照種子は処理しなかった。プライミング種子をＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液を用いて、しかし細菌を用いずに処理し（基本的にオスモプライミング処理）、ＭＰ－Ｓ３Ｃ１０＋Ｓ３Ｃ２３種子を、２つの細菌分離菌Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ（Ｓ３Ｃ１０）およびＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ（Ｓ３Ｃ２３）を含む合成コンソーシアムを含有するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液で処理し、ＭＰ－Ｓ８Ｃ７を、内部では株Ｓ８Ｃ７と呼ばれる細菌分離菌Ｇｌｕｔａｍｉｃｉｂａｃｔｅｒ ｈａｌｏｐｈｙｔｏｃｏｌａを含むＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）溶液で処理した。株Ｓ３Ｃ１０の１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、２．２０Ｅ＋３であり、株Ｓ３Ｃ２３の１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は５．００Ｅ＋１であり、株Ｓ８Ｃ７の１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は１．９８Ｅ＋４であった。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は３０℃で１０分であった。
ＡＡ試験の結果を以下の表（表１１）に示す。
図１１に例示される結果は、表９、表１０、および表１１とともに、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理が、経時的に発芽率、胚生存率、および種子活力に影響を及ぼさず、これにより、市販の商品（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子）と非常に適合することを示す。
実施例７．レタスの成長および発育におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果。
種子内に微生物を入れることの主な目標の１つは、成長の増強および圃場性能などの所望の農業の形質を改善する、効率的な細菌の送達方法を実現することである。植物における効果を評価するために、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子から成長するレタス植物の成長および発育を試験した。図１２では、レタス（ｌｅｔｔｕｃｅ）種子（レタス（Ｌａｃｔｕｃａ ｓａｔｉｖａ））における、内部ではＬａｓｃａｒと呼ばれる独自に開発した（ｐｒｏｐｒｉｅｔａｒｙ）細菌の組成物の効果が示される。Ｌａｓｃａｒコンソーシアムは、細菌１（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｃｅｒｅｖｉｓｅａｅ）、細菌４（Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ）、細菌５（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、および細菌６（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）からなる。播種後６７日目に、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子から成長する植物（ＭＰ－Ｌａｓｃａｒ）、液体の形態としてのＬａｓｃａｒを用いて接種した種子から成長する植物（Ｌａｓｃａｒ）、細菌を含まない吸水溶液を用いて処理した種子から成長する植物（プライミング）、および処理なしの種子から成長する植物（未処理）において、レタス（Ｓｅｍｉｎｉｓ ｂｒａｎｄ ｃｖ．Ｍｏｈａｗｋ）のロゼット新鮮重を測定した。Ｌａｓｃａｒと名付けられた処理は、合成コンソーシアムに対応する陽性対照であり、この処理は、典型的な微生物技術の用途で実施されるように、播種前に種子に外部的に適用される。プライミングと名付けられた処理は、細菌コンソーシアムを含まない吸水溶液からなる陰性対照の処理である。バーは、１処理当たり少なくとも１５の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは統計的有意差を表す（一元配置分散分析、ｐ値＜０．０５；Ｄｕｎｎｅｔｔの多重比較検定、ｐ値＜０．０５）。アッセイを、温室で、基質としての泥炭：真珠岩土、６７日の成長期で実施した。成長温度は１９℃、湿度は５４％、光周期は１６時間の明期と８時間の暗期であった。
この結果により、Ｌａｓｃａｒコンソーシアムを用いるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理は、液体の形態での従来の接種と同じくらいレタスの栄養生長を増加させることが示された（図１２）。しかし、この新規な送達システム（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子）の利点は、商業的な問題（スケーラビリティ、長期保存）から操作上の問題（農家が簡単に使用できる製品、汚染の可能性を減少）までいくつかあり、したがって、圃場において有益な微生物を使用する技術的なリスクを低下させる。
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）を用いて処理したレタス種子に対する保存効果を、内部ではＪＩＴと呼ばれる独自に開発した細菌の組成物を使用して評価した。ＪＩＴコンソーシアムは、細菌４（Ｃｈｒｙｓｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌａｃｔｉｓ）、細菌５（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃｕｓ）、および細菌６（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｍｅｇａｔｅｒｉｕｍ）からなる。図１３は、以下の処理を行い６０日間保存した種子を蒔いた２８日目のレタスＨａｒｒｉｓ Ｍｏｒａｎ ｃｖ．Ｄｅｓｅｒｔ Ｓｔｏｒｍの新鮮重を示す：ＭＰ－ＪＩＴ（処理し、接種した）、プライミング（処理し、接種しなかった）、および未処理。プライミングと名付けられた処理は、細菌コンソーシアムを含まない溶液に同じものを浸漬することをからなる処理を行った、陰性対照の種子である。バーは、１処理当たり少なくとも１５の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは、統計的有意差を表す（Ｋｒｕｓｋａｌ Ｗａｌｌｉｓ、ｐ値＜０．０５；Ｄｕｎｎｅｔｔの多重比較検定、ｐ値＜０．０５）。アッセイを、２８日の成長期、基質としての泥炭：真珠岩土、温室で実施した。成長温度は１９℃、湿度は５４％、光周期は１６時間の明期と８時間の暗期であった。
植物に対する有益な細菌の処理により、非生物的ストレス耐性が引き起こされる場合がある。ＪＩＴコンソーシアムを使用するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理が非生物的ストレスに対する耐性を引き起こすかどうかを評価するために、レタス植物（Ｈａｒｒｉｓ Ｍｏｒａｎ ｃｖ．Ｄｅｓｅｒｔ Ｓｔｏｒｍ）を塩ストレス条件で１４日間成長させ、その後、植物全体の新鮮重を測定した（図１４）。１２０／１２ｍＭのＮａＣｌ／ＣａＣｌ２（塩ストレス）で補足したムラシゲスクーグ培地を含む正方形プレートと、塩を含まない対照プレート（０／０ｍＭのＮａＣｌ／ＣａＣｌ２）とを使用して、インビトロのアッセイを実施した。植物を、１９℃、５４％の湿度で、１６時間／８時間（明／暗時間）の光周期を用いて成長させた。バーは、１処理当たり少なくとも１０の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは統計的有意差を表す（一元配置分散分析、ｐ値＜０．０５；Ｄｕｎｎｅｔｔの多重比較検定、ｐ値＜０．０５）。
これらの結果により、ＪＩＴコンソーシアムを用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理がレタス植物において耐塩性を引き起こすことが示された。
実施例８．トマト植物の成長に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果
トマト植物の成長および発育に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を評価するために、トマト（Ｆｅｒｒｙ－Ｍｏｒｓｅ ｃｖ．Ｒｏｍａ ＶＦ）の種子を、内部では株Ｓ３Ｃ２３と呼ばれる細菌分離菌Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを含むＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を用いて処理した。図１５に示すように、播種後４２日目に、対照（未処理）、プライミング、およびＭＰ－Ｓ３Ｃ２３トマト実生の完全な植物新鮮重を測定した。プライミングと名付けられた処理は、細菌を含まない溶液中に種子を浸すことからなる陰性対照である。バーは、１処理当たり少なくとも１５の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは、統計的有意差を表す（一元配置分散分析、ｐ値＜０．０５；Ｄｕｎｎｅｔｔの多重比較検定、ｐ値＜０．０５）。吸収培地中の株Ｓ３Ｃ２３の１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、１．２０Ｅ＋９ＣＦＵ／ｍｌであった。種子を乾燥させた後のＣＦＵ／種子は４．００Ｅ＋３であった。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は、３０℃で２４０分（４時間）であった。アッセイを、温室、基質としての泥炭：真珠岩土、４２日の成長期で実施した。成長温度は２５℃、湿度は５４％、光周期は１６時間の明期と８時間の暗期であった。
これらの結果により、株Ｓ３Ｃ２３を使用するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理がトマト植物の新鮮重を有意に増加させることが示される。
実施例９．トウモロコシの成長および発育におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）効果。
トウモロコシ植物の成長および発育におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を評価するために、トウモロコシの種子（Ｄｅｋａｌｂブランド、ＤＫ６３０の非ＧＭＯ種子）を、内部では株Ｓ３Ｃ１と呼ばれる細菌分離菌Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍを含むＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を用いて処理した。図１６は、半固体の基質への播種後１４日目に測定された、植物のシュートと根の新鮮重を示す。処理には、液体を接種した種子（Ｓ３Ｃ１）およびＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理した種子（ＭＰ－Ｓ３Ｃ１）、プライミング処理した種子（プライミング）、および処理も接種もしない種子（対照）が含まれる。従来の微生物技術の用途で実施されているように、Ｓ３Ｃ１と名付けられた処理は、株Ｓ３Ｃ１を用いた種子の外部接種に対応する陽性対照である（液体製剤、種子の外側）。プライミングと名付けられた処理は、細菌コンソーシアムを含まない溶液中に種子を浸漬することからなる陰性対照である。ＭＰ－Ｓ３Ｃ１種子の１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、１．９０Ｅ＋５であり、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は３０℃で９６０分（１６時間）であった。バーは、１処理当たり少なくとも１５の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは、統計的有意差（Ｋｒｕｓｋａｌ Ｗａｌｌｉｓ、ｐ値＜０．０５；Ｄｕｎｎｅｔｔの多重比較検定、ｐ値＜０．０５）を表す。種子処理を３０℃で５分間実施し、その後、１１．２％の含水量を達成するまで種子を乾燥させた。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理における１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、７．７９Ｅ＋１５であった。種子を乾燥させた後の１つの種子当たりのＣＦＵは１．９Ｅ＋５であった。アッセイを温室で、および半固体の基質で実施した。播種後１４日目（１４ＤＡＳ）にデータを得た。成長温度は２５℃、湿度は５４％、光周期は１６時間の明期と８時間の暗期であった。トウモロコシ植物のシュートの新鮮重は、種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ１の効果によって３７．２％増加し（図１６Ａ）、トウモロコシ植物の根の新鮮重は、種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ１の効果によって４５．９％増加した（図１６Ｂ）。
複数の細菌の効果を評価するために、２つの細菌分離菌、Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ（Ｓ３Ｃ１０）とＢａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓ（Ｓ３Ｃ２３）とを含む合成コンソーシアムを試験した（図１７）。Ｄｅｋａｌｂの非ＧＭＯ種子（ＤＫ６３０）を使用した。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理溶液中の１ｍｌ当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、株Ｓ３Ｃ１０で４．５２Ｅ＋１０であり、および株Ｓ３Ｃ２３で３．７６Ｅ＋０８であった。種子処理を３０℃の温度で１０分間実施し、その後、１１．４％の含水量を達成するまで、種子を乾燥させた。これらの２つの株を同時にロードした後の１つの種子当たりのＣＦＵは、株Ｓ３Ｃ１０で２．２０Ｅ＋０３ＣＦＵ／種子であり、株Ｓ３Ｃ２３で５．００Ｅ＋０１ＣＦＵ／種子であった。播種後１４日（１４ＤＡＳ）の成長期中、温室、半固体の基質で、植物成長アッセイを実施した。成長温度は２５℃、湿度は５４％、光周期は１６時間の明期と８時間の暗期であった。バーは、１処理当たり少なくとも３０の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは統計的有意差（マン・ホイットニーの検定、ｐ値＜０．０５）を表す。種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ１０＋Ｓ３Ｃ２３の効果によって、シュートの重量は２１．０％増加し（図１７Ａ）、根の重量は２９．３％増加した（図１７Ｂ）。加えて、シュート長さは、同じコンソーシアムの効果によって１３．６増加し（図１７Ｃ）、このことは、液体の形態として適用したものと比較してより低い細菌濃度を用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理が、トウモロコシ実生の成長を増強するのに有効であることを示す。
実施例１０：窒素飢餓下でのトウモロコシ成長におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）の効果。
農業では大量の化学肥料を使用することから、作物中の生物窒素固定を促進することが常に望まれている。種子の内部に窒素固定菌を取り込み、かつ窒素飢餓状態で植物を成長させるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を使用する能力を評価した。最初に、アセチレン還元アッセイ（ＡＲＡ）を使用して、細菌分離菌の純粋培養のニトロゲナーゼ活性を測定した。様々な分離菌を密閉フラスコ中で成長させ、セチレンからエチレンへの還元を測定した。このスクリーニングでは、内部ではＳ３Ｃ１４と名付けられた分離菌（Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｃｕｃｕｍｉｓ）を、窒素固定菌であると同定した（図１８）。株Ｓ３Ｃ１４（ＭＰ－Ｓ３Ｃ１４ｅ）の内生胞子を用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理のために、Ｄｅｋａｌｂ（ＤＫ６３０）の非ＧＭＯ種子を使用した。１つの種子当たりのコロニー形成単位は１．６２Ｅ＋３であり、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は２３℃で２０分であった。１１．６％の水分を達成するまで、種子を乾燥させた。対照の未処理の種子（未処理）およびＭＰ－Ｓ３Ｃ１４ｅの群は、１００％および６０％の合成窒素の管理体制下で成長した。６０日後、図１９に示すように、植物のシュート、根、および総新鮮重を測定した。バーは、１処理当たり少なくとも１２の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは統計的有意差（マン・ホイットニーの検定、ｐ値＜０．０５）を表す。基質として泥炭：真珠岩土を用いて、温室でアッセイを実施した。成長温度は２５℃、湿度は５４％、１６時間の明期と８時間の暗期の光周期であった。結果により、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）で処理した種子の植物は、窒素飢餓下で成長した場合、植物全体の新鮮重が有意に増加し、シュートと根の両方の重量も増加した（図１９）。
実施例１１．乾燥ストレス下でのトウモロコシの成長に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果。
干ばつは、植物の非生物的ストレスの最も有害な形態の１つであり、農業の作物の生産性を著しく制限する。トウモロコシは乾燥ストレスに敏感な植物と考えられている。選択した細菌を用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理が、植物遺伝子発現を調節し、かつ非生物的ストレス耐性を誘導することができるかどうかを評価するために、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子／植物を用いて、遺伝子発現プロファイルとインビボのアッセイを実施した。単離した株Ｓ３Ｃ１（Ｍｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍ）およびＳ３Ｃ１０（Ｅｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓ）を独立して用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理の４ヶ月後、マーカー遺伝子ｂＺＩＰ６０、ｂＺＩＰ４、ＡＲＦ３、およびＡＰＸ１の相対的発現を、ＤＫ６３０種子（Ｄｅｋａｌｂ）においてｑＲＴ－ＰＣＲによって定量化した（図２０）。ＭＰ－Ｓ３Ｃ１０種子における１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、５．００Ｅ＋４であり、ＭＰ－Ｓ３Ｃ１種子における１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は１．９０Ｅ＋５であった。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は、３０℃で９６０分（１６時間）であった。未処理の種子を対照として使用した。ユビキチン結合酵素とユビキチン輸送タンパク質（ｕｂｉｑｕｉｔｉｎ ｃａｒｒｉｅｒ ｐｒｏｔｅｉｎ）にそれぞれ対応する、内在性対照であるＵＢＣＥとＵＢＣＰのハウスキーピング遺伝子を使用した（Ｍａｎｏｌｉ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。これらの遺伝子は、ｑＲＴ－ＰＣＲ増幅のサイクル閾値（Ｃｔ）のデータ正規化のために使用した。バーは、１処理当たり３～５つの生物学的反復の平均値±標準誤差であり、それぞれの生物学的反復は、３つのトウモロコシ種子と２つの技術的反復（ｔｅｃｈｎｉｃａｌ ｒｅｐｌｉｃａｔｅｓ）のプールで構成された。転写因子ｂＺＩＰ６０は、熱ストレスに対する反応を調節するのに重要である。転写因子ｂＺＩＰ４は、植物の非生物的ストレス反応の正の調節因子であり、トウモロコシにおける根の発育に関与する。その発現は、高塩分、乾燥、熱、および寒さによって誘発され、その過剰発現は、側根の数の増加、より長い一次根、および根系の改善を結果としてもたらす。ＡＲＦ３はオーキシン関連遺伝子であり、オーキシン関連遺伝子はｂＺＩＰ４との組み合わせで根の発育を増強する。ＡＰＸ１遺伝子（アスコルビン酸塩ペルオキシダーゼ１）は、熱ストレス条件によって主に誘導可能な酸化ストレス遺伝子である。その生成物は、Ｈ２Ｏ２除去酵素である。
全体的に、これらの結果により、植物の胚の初期段階で分子プライミングを行うことで、非生物的ストレスの最終的なシナリオに対してより強力に、より速く反応する植物の能力が向上し、他方では、根の発育が増強し、結果として、圃場条件でのそのパフォーマンス全体が改善することが示される。
この仮定を評価するために、同じバッチのトウモロコシ種子を用いて非生物的ストレスアッセイ（干ばつ）を実施した。ＭＰ－Ｓ３Ｃ１、ＭＰ－Ｓ３Ｃ１０、および対照の種子を、基質としての泥炭：真珠岩土に蒔き、２５℃、湿度５４％、１６時間の明期と８時間の暗期の光周期、および温室で、６０日間成長させた。播種の７日後に、水制限に指定した植物の群に、最適な灌漑の管理体制の５０％で３週間灌漑した。この期間後、３０日間灌漑を中止することによって、植物に高い水ストレス処理を受けさせた。６０日間の試験が終わると、干ばつ条件下で成長するＭＰ－Ｓ３Ｃ１植物は、同じストレス条件の対照植物と比較して、根の新鮮重の増加とシュートの長さの増加を示し、このことは、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理技術によって媒介された胚レベルで実施された分子プライミング（おそらく全身誘導耐性、またはＩＳＴ）が、植物に効果的に翻訳された（ｔｒａｎｓｌａｔｅｄ）ことを示す（図２１）。
実施例１２：圃場でのトウモロコシ成長におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果。
トウモロコシ（ｍａｉｚｅ）（トウモロコシ（Ｚｅａ ｍａｙｓ））の成長および収量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の有効性を評価するために、圃場試験を実施した。２つの細菌分離菌である、内部ではＳ３Ｃ１と名付けられたＭｉｃｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｈｏｃｏｌａｔｕｍとＳ３Ｃ１０と名付けられたＥｎｓｉｆｅｒ ａｄｈａｅｒｅｎｓを使用して、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を実施した。Ｄｅｋａｌｂの非ＧＭＯ ＤＫ６３０種子をこの実験で使用し、対照植物は、処理も接種もしていない種子に相当する。ＭＰ－Ｓ３Ｃ１０種子における１つの種子当たりのコロニー形成単位は、５．００Ｅ＋４ＣＦＵ／種子であり、ＭＰ－Ｓ３Ｃ１における１つの種子当たりのコロニー形成単位は １．９０Ｅ＋５ＣＦＵ／種子であった。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は、３０℃で９６０分（１６時間）であった。
圃場条件下で成長させたＶ１２発育段階のトウモロコシ植物の植物全体の新鮮重およびシュート乾燥重量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を記録し、図２２Ａおよび図２２Ｂに示す。トウモロコシ植物の植物全体の新鮮重は、株Ｓ３Ｃ１０を用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果によって３５．９％増加し（図２２Ｂ）、シュート乾燥重量は、同じＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果によって３４．９％増加した（図２２Ａ）。バーは、１処理当たり少なくとも１５の植物の平均値±１標準誤差である。アスタリスクは、統計的有意差を表す（一元配置分散分析、ｐ値＜０．０５；Ｄｕｎｎｅｔｔの多重比較検定、ｐ値＜０．０５）。
図２３Ａおよび図２３Ｂは、圃場条件下のトウモロコシの生活環に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理は、トウモロコシ植物の成長速度を加速させ、より進行した栄養成長期（表１２）、したがって、対照植物と比較してより進行した生殖成長期を証拠づける。図２３Ｂは、対照植物の穂がＲ５生殖成長期にあり、一方、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子植物（ＭＰ－Ｓ３Ｃ１およびＭＰ－Ｓ３Ｃ１０）の穂が、Ｒ６生殖成長期（トウモロコシ植物における最終発育段階）にあることを示す。
図２４は、圃場条件下のトウモロコシの収量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。収量は、乾燥穀粒の１エーカー当たりブッシェル（１５．５％の含水量を有する）に相当する。トウモロコシの収量は、種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ１の効果によって２７．６％（４６．５ｂｕ／エーカー）増加し、種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ１０の効果によって５．９％（９．９ｂｕ／エーカー）増加した。
さらに、穀物の総タンパク質含有量は、株Ｓ３Ｃ１０を用いたＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果によって増加した（２０％）（図２５）。
この重要な結果により、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理プロセスによって種子内への特定の有益な細菌の単一かつ固有の接種を行うことで、植物の形質と、圃場条件下での収量パフォーマンスとを改善することができることが示される。
実施例１３：圃場における窒素飢餓下でのトウモロコシの成長におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果。
窒素飢餓下でのトウモロコシの成長および収量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の有効性を評価するために、圃場試験を実施した。最初に、アセチレン還元アッセイ（ＡＲＡ）を使用して、細菌分離菌の純粋培養のニトロゲナーゼ活性を測定した。この新しいスクリーニングでは、内部では株Ｓ３Ｃ２３と呼ばれる細菌分離菌Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを、ｄｉａｚｏｔｒｏｐｈｉｃ ｂａｃｔｅｒｉｕｍであると同定した。この知見により、株Ｓ３Ｃ２３が、外部窒素源（例えば、グルタミン）の存在下で窒素を固定する能力を有するかどうかを判定するために、新しいＡＲＡアッセイを実施した。このアッセイでは、グルタミン５ｍＭで補足された培地または補足させていない培地を用いて、５日間、株Ｓ３Ｃ２３を密閉フラスコ中で成長させた。その後、アセチレンを注入し、２日後に、アセチレンからエチレンへの還元を測定した。図２６に示すように、株Ｓ３Ｃ２３は、グルタミンの存在下でも窒素を固定し続ける。この結果により、窒素制限を用いるトウモロコシの圃場試験に株Ｓ３Ｃ２３を選択した。図２７は、窒素制限下でのトウモロコシ収量に対するＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の効果を示す。Ｄｅｋａｌｂ（商標）のＧＭＯ種子ＤＫＣ４７－２７ＲＩＢを使用した。１００％の窒素（１００％のＮ）は合成窒素の１５０ｌｂｓ／エーカーに相当し、６０％の窒素（６０％のＮ）は合成窒素の９０ｌｂｓ／エーカーに相当する。収量は、乾燥穀粒の１エーカー当たりのブッシェル（１５．５％の含水量）に相当する。内部では株Ｓ３Ｃ２３と呼ばれる細菌分離菌Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｕｂｔｉｌｉｓを使用して、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理を実施した。対照植物は、処理も接種もしていない種子に相当する。ＭＰ－Ｓ３Ｃ２３種子における１つの種子当たりのコロニー形成単位（ＣＦＵ）は、４．９８Ｅ＋３ＣＦＵ／種子であり、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理の条件は３０℃で２０分であった。
４０％の窒素制限下では、トウモロコシの収量は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ２３の効果によって、１００％の窒素において成長した植物と比較して１０．３％（１８．８ｂｕ／エーカー）増加した。他方では、１００％の窒素を用いる正常な成長条件下では、トウモロコシの収量は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理ＭＰ－Ｓ３Ｃ２３の効果によって、６．９％（１２．５ｂｕ／エーカー）増加した。
実施したトウモロコシの圃場試験の成功率（ｗｉｎ ｒａｔｅ）は７５％であった（図２８）。
Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子処理は、安定した微生物の胚の種子処理方法であり、これによって、産業上拡張可能なプロセスを介して、植物に有益な細菌、および／または微生物の合成コンソーシアム、および／またはその浸出物、および／またはその個別化された生体分子が種子内に組み込まれる。この種子処理プロセスは、農業投入物（ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ｉｎｐｕｔｓ）の従来の流通網と適合する。
圃場試験におけるＭｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子で得られた結果を考慮して、アイオワ州立大学の経済モデルに基づいて、Ａｎｄｅｓ Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）トウモロコシ種子の経済モデルを作成し、このモデルには、大豆成長期後のトウモロコシ生産に関するすべてのコストを含まれている（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｅｘｔｅｎｓｉｏｎ．ｉａｓｔａｔｅ．ｅｄｕ／ａｇｄｍ／ｃｒｏｐｓ／ｈｔｍｌ／ａ１－２０．ｈｔｍｌ）。我々の経済モデルを構築するための仮定は下記の通りであった：
１．Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）トウモロコシ種子は、農家にとって、通常のトウモロコシ種子（Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）処理なし）と同じ価格を有する。
２．液体製剤は、Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）種子に使用されるものと同じ細菌または細菌コンソーシアムに対応する。
３．液体製剤は、農家にとって、１エーカー当たり２０．００ドルの追加費用がかかる。
Ａｎｄｅｓ Ｍｉｃｒｏｐｒｉｍｅ（商標）トウモロコシ種子の経済モデルを、以下の表に要約する（表１３）。
本発明の好ましい実施形態が本明細書で示され、記載されてきたが、こうした実施形態がほんの一例として提供されているに過ぎないということは当業者にとって明白である。本発明が明細書内で提供される特定の例によって限定されることは意図していない。本発明は前述の明細書に関して記載されているが、本明細書中の実施形態の記載および例示は、限定的な意味で解釈されることを目的としていない。当業者であれば、多くの変更、変化、および置換が、本発明から逸脱することなく思いつくだろう。さらに、本発明のすべての態様は、様々な条件および変数に依存する、本明細書で説明された特定の描写、構成、または相対的な比率に限定されないことが理解されよう。本明細書に記載される本発明の実施形態の様々な代替案が、本発明の実施に際して利用され得ることを理解されたい。それゆえ、本発明は、任意のそのような代替物、修正物、変形物、または同等物にも及ぶものと企図される。以下の請求項は本発明の範囲を定義するものであり、この請求項とその均等物の範囲内の方法、および構造体がそれによって包含されるものであるということが意図されている。
参考文献
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Ｌｅｇｇｅｔｔ，Ｍ．，Ｎｅｗｌａｎｄｓ，Ｎ．Ｋ．，Ｇｒｅｅｎｓｈｉｅｌｄｓ，Ｄ．，Ｗｅｓｔ，Ｌ．，Ｉｎｍａｎ，Ｓ．，ａｎｄ Ｋｏｉｖｕｎｅｎ，Ｍ．Ｅ．（２０１５）．Ｍａｉｚｅ ｙｉｅｌｄ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ａ ｐｈｏｓｐｈｏｒｕｓ－ｓｏｌｕｂｉｌｉｚｉｎｇ ｍｉｃｒｏｂｉａｌ ｉｎｏｃｕｌａｎｔ ｉｎ ｆｉｅｌｄ ｔｒｉａｌｓ．Ｊ．Ａｇｒｉｃ．Ｓｃｉ．１５３，１４６４－１４７８．ｄｏｉ：１０．１０１７／Ｓ００２１８５９６１４００１１６６．
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Ｓａｓｓｅ，Ｊ．，Ｍａｒｔｉｎｏｉａ，Ｅ．，＆ Ｎｏｒｔｈｅｎ，Ｔ．（２０１８）．Ｆｅｅｄ ｙｏｕｒ ｆｒｉｅｎｄｓ： ｄｏ ｐｌａｎｔ ｅｘｕｄａｔｅｓ ｓｈａｐｅ ｔｈｅ ｒｏｏｔ ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅ？．Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ ｐｌａｎｔ ｓｃｉｅｎｃｅ．ｄｏｉ：１０．１０１６／ｊ．ｔｐｌａｎｔｓ．２０１７．０９．００３．
Ｓｅｓｓｉｔｓｃｈ，Ａ．，Ｂｒａｄｅｒ，Ｇ．，Ｐｆａｆｆｅｎｂｉｃｈｌｅｒ，Ｎ．，Ｇｕｓｅｎｂａｕｅｒ，Ｄ．，ａｎｄ Ｍｉｔｔｅｒ，Ｂ．（２０１８）．Ｔｈｅ ｃｏｎｔｒｉｂｕｔｉｏｎ ｏｆ ｐｌａｎｔ ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ ｔｏ ｅｃｏｎｏｍｙ ｇｒｏｗｔｈ．Ｍｉｃｒｏｂ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．ｄｏｉ：１０．１１１１／１７５１－７９１５．１３２９０．
Ｓｈａｈｚａｄ，Ｓ．Ｍ．，Ｋｈａｌｉｄ，Ａ．，Ａｒｉｆ，Ｍ．Ｓ．，Ｒｉａｚ，Ｍ．，Ａｓｈｒａｆ，Ｍ．，Ｉｑｂａｌ，Ｚ．，ｅｔ ａｌ．（２０１４）．Ｃｏ－ｉｎｏｃｕｌａｔｉｏｎ ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ ｗｉｔｈ Ｐ－ｅｎｒｉｃｈｅｄ ｃｏｍｐｏｓｔ ｉｍｐｒｏｖｅｄ ｎｏｄｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｇｒｏｗｔｈ ｏｆ Ｃｈｉｃｋｐｅａ（Ｃｉｃｅｒ ａｒｉｅｔｉｎｕｍ Ｌ．）ｕｎｄｅｒ ｉｒｒｉｇａｔｅｄ ａｎｄ ｒａｉｎｆｅｄ ｆａｒｍｉｎｇ ｓｙｓｔｅｍｓ．Ｂｉｏｌ．Ｆｅｒｔｉｌ．Ｓｏｉｌｓ．ｄｏｉ：１０．１００７／ｓ００３７４－０１３－０８２６－２．
Ｓｈａｒｉｆｉ，Ｒ．Ｓ．（２０１１）．Ｇｒａｉｎ ｙｉｅｌｄ ａｎｄ ｐｈｙｓｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｇｒｏｗｔｈ ｉｎｄｉｃｅｓ ｉｎ ｍａｉｚｅ（Ｚｅａ ｍａｙｓ Ｌ．）ｈｙｂｒｉｄｓ ｕｎｄｅｒ ｓｅｅｄ ｂｉｏｐｒｉｍｉｎｇ ｗｉｔｈ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ（ＰＧＰＲ）．Ｊ．Ｆｏｏｄ，Ａｇｒｉｃ．Ｅｎｖｉｒｏｎ．ｄｏｉ：１０．１００２／ｏｂｙ．２０９３７．
Ｓｈａｒｉｆｉ，Ｒ．Ｓ．，Ｋｈａｖａｚｉ，Ｋ．，ａｎｄ Ｇｈｏｌｉｐｏｕｒｉ，Ａ．（２０１１）．Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｓｅｅｄ ｐｒｉｍｉｎｇ ｗｉｔｈ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ Ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ（ ＰＧＰＲ ）ｏｎ ｄｒｙ ｍａｔｔｅｒ ａｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎ ａｎｄ ｙｉｅｌｄ ｏｆ ｍａｉｚｅ（ Ｚｅａ ｍａｙｓ Ｌ．）ｈｙｂｒｉｄｓ．Ｉｎｔ．Ｒｅｓ．Ｊ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍ．ｄｏｉ：ｈｔｔｐ：／／ｄｘ．ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１０１６／ｊ．ｌｉｔｈｏｓ．２０１２．１１．００８．
Ｓｏｎｇ，Ｇ．Ｃ．，Ｃｈｏｉ，Ｈ．Ｋ．，Ｋｉｍ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｈｏｉ，Ｊ．Ｓ．，ａｎｄ Ｒｙｕ，Ｃ．Ｍ．（２０１７）．Ｓｅｅｄ ｄｅｆｅｎｓｅ ｂｉｏｐｒｉｍｉｎｇ ｗｉｔｈ ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｃｙｃｌｏｄｉｐｅｐｔｉｄｅｓ ｔｒｉｇｇｅｒｓ ｉｍｍｕｎｉｔｙ ｉｎ ｃｕｃｕｍｂｅｒ ａｎｄ ｐｅｐｐｅｒ．Ｓｃｉ．Ｒｅｐ．７，１－１５．ｄｏｉ：１０．１０３８／ｓ４１５９８－０１７－１４１５５－９．
Ｓｔｕｒｚ，Ａ．Ｖ．，Ｃｈｒｉｓｔｉｅ，Ｂ．Ｒ．，ａｎｄ Ｎｏｗａｋ，Ｊ．（２０００）．Ｂａｃｔｅｒｉａｌ ｅｎｄｏｐｈｙｔｅｓ： Ｐｏｔｅｎｔｉａｌ ｒｏｌｅ ｉｎ ｄｅｖｅｌｏｐｉｎｇ ｓｕｓｔａｉｎａｂｌｅ ｓｙｓｔｅｍｓ ｏｆ ｃｒｏｐ ｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎ．ＣＲＣ．Ｃｒｉｔ．Ｒｅｖ．Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉ．ｄｏｉ：１０．１０８０／０７３５２６８００９１１３９１６９．
Ｓｕｎｄａｒａｍｏｏｒｔｈｙ，Ｓ．，Ｒａｇｕｃｈａｎｄｅｒ，Ｔ．，Ｒａｇｕｐａｔｈｉ，Ｎ．，ａｎｄ Ｓａｍｉｙａｐｐａｎ，Ｒ．（２０１２）．Ｃｏｍｂｉｎａｔｏｒｉａｌ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｅｎｄｏｐｈｙｔｉｃ ａｎｄ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ ａｇａｉｎｓｔ ｗｉｌｔ ｄｉｓｅａｓｅ ｏｆ Ｃａｐｓｉｃｕｍ ａｎｎｕｍ Ｌ．ｃａｕｓｅｄ ｂｙ Ｆｕｓａｒｉｕｍ ｓｏｌａｎｉ．Ｂｉｏｌ．Ｃｏｎｔｒｏｌ．ｄｏｉ：１０．１０１６／ｊ．ｂｉｏｃｏｎｔｒｏｌ．２０１１．１０．００２．
Ｓｃｈｗｅｍｂｅｒ，Ａ．Ｒ．，＆ Ｂｒａｄｆｏｒｄ，Ｋ．Ｊ．（２０１１）．Ｏｘｙｇｅｎ ｉｎｔｅｒａｃｔｓ ｗｉｔｈ ｐｒｉｍｉｎｇ，ｍｏｉｓｔｕｒｅ ｃｏｎｔｅｎｔ ａｎｄ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ ｔｏ ａｆｆｅｃｔ ｔｈｅ ｌｏｎｇｅｖｉｔｙ ｏｆ ｌｅｔｔｕｃｅ ａｎｄ ｏｎｉｏｎ ｓｅｅｄｓ．Ｓｅｅｄ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２１（３），１７５－１８５．ｄｏｉ：１０．１０１７／Ｓ０９６０２５８５１１００００８０．
Ｔａｂａｓｓｕｍ，Ｔ．，Ａｈｍａｄ，Ｒ．，Ｆａｒｏｏｑ，Ｍ．，ａｎｄ Ａｈｍｅｄ Ｂａｓｒａ，Ｓ．Ｍ．（２０１８）．Ｉｍｐｒｏｖｉｎｇ ｓａｌｔ ｔｏｌｅｒａｎｃｅ ｉｎ ｂａｒｌｅｙ ｂｙ ｏｓｍｏｐｒｉｍｉｎｇ ａｎｄ ｂｉｏｐｒｉｍｉｎｇ．Ｉｎｔ．Ｊ．Ａｇｒｉｃ．Ｂｉｏｌ．ｄｏｉ：１０．１７９５７／ＩＪＡＢ／１５．０７８８．
Ｔａｒｑｕｉｓ，Ａ．Ｍ．，＆ Ｂｒａｄｆｏｒｄ，Ｋ．Ｊ．（１９９２）．Ｐｒｅｈｙｄｒａｔｉｏｎ ａｎｄ ｐｒｉｍｉｎｇ ｔｒｅａｔｍｅｎｔｓ ｔｈａｔ ａｄｖａｎｃｅ ｇｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ａｌｓｏ ｉｎｃｒｅａｓｅ ｔｈｅ ｒａｔｅ ｏｆ ｄｅｔｅｒｉｏｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｌｅｔｔｕｃｅ ｓｅｅｄｓ．Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｂｏｔａｎｙ，４３（３），３０７－３１７．ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１０９３／ｊｘｂ／４３．３．３０７．
Ｔａｙｌｏｒ，Ａ．Ｇ．，Ａｌｌｅｎ，Ｐ．Ｓ．，Ｂｅｎｎｅｔｔ，Ｍ．Ａ．，Ｂｒａｄｆｏｒｄ，Ｋ．Ｊ．，Ｂｕｒｒｉｓ，Ｊ．Ｓ．，ａｎｄ Ｍｉｓｒａ，Ｍ．Ｋ．（１９９８）．Ｓｅｅｄ ｅｎｈａｎｃｅｍｅｎｔｓ．Ａｃｔａ Ｈｏｒｔｉｃ．６０７，５３－５９．ｄｏｉ：１０．１７６６０／ＡｃｔａＨｏｒｔｉｃ．２００３．６０７．８．
Ｔａｙｌｏｒ，Ａ．，ａｎｄ Ｈａｒｍａｎ，Ｇ．（１９９０）．Ｃｏｎｃｅｐｔｓ ａｎｄ ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ ｏｆ ｓｅｌｅｃｔｅｄ ｓｅｅｄ ｔｒｅａｔｍｅｎｔｓ．
Ｔｉｍｍｅｒｍａｎｎ，Ｔ．，Ａｒｍｉｊｏ，Ｇ．，Ｄｏｎｏｓｏ，Ｒ．，Ｓｅｇｕｅｌ，Ａ．，Ｈｏｌｕｉｇｕｅ，Ｌ．，＆ Ｇｏｎｚａｌｅｚ，Ｂ．（２０１７）．Ｐａｒａｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ ｐｈｙｔｏｆｉｒｍａｎｓ ＰｓＪＮ ｐｒｏｔｅｃｔｓ Ａｒａｂｉｄｏｐｓｉｓ ｔｈａｌｉａｎａ ａｇａｉｎｓｔ ａ ｖｉｒｕｌｅｎｔ ｓｔｒａｉｎ ｏｆ Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｙｒｉｎｇａｅ ｔｈｒｏｕｇｈ ｔｈｅ ａｃｔｉｖａｔｉｏｎ ｏｆ ｉｎｄｕｃｅｄ ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ．Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｌａｎｔ－Ｍｉｃｒｏｂｅ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ．ｄｏｉ： １０．１０９４／ＭＰＭＩ－０９－１６－０１９２－Ｒ
Ｔｉｍｍｕｓｋ，Ｓ．，Ｂｅｈｅｒｓ，Ｌ．，Ｍｕｔｈｏｎｉ，Ｊ．，Ｍｕｒａｙａ，Ａ．，ａｎｄ Ａｒｏｎｓｓｏｎ，Ａ．－Ｃ．（２０１７）．Ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓ ａｎｄ Ｃｈａｌｌｅｎｇｅｓ ｏｆ Ｍｉｃｒｏｂｉａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｃｒｏｐ Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ．Ｆｒｏｎｔ．Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉ．８，１－１０．ｄｏｉ：１０．３３８９／ｆｐｌｓ．２０１７．０００４９．
Ｖａｃｈｅｒｏｎ，Ｊ．，Ｄｅｓｂｒｏｓｓｅｓ，Ｇ．，Ｂｏｕｆｆａｕｄ，Ｍ．－Ｌ．，Ｔｏｕｒａｉｎｅ，Ｂ．，Ｍｏｅｎｎｅ－Ｌｏｃｃｏｚ，Ｙ．，Ｍｕｌｌｅｒ，Ｄ．，ｅｔ ａｌ．（２０１３）．Ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ－ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ ａｎｄ ｒｏｏｔ ｓｙｓｔｅｍ ｆｕｎｃｔｉｏｎｉｎｇ．Ｆｒｏｎｔ．Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉ．ｄｏｉ：１０．３３８９／ｆｐｌｓ．２０１３．００３５６．
Ｖａｃｈｅｒｏｎ，Ｊ．，Ｍｏｅｎｎｅ－Ｌｏｃｃｏｚ，Ｙ．，Ｄｕｂｏｓｔ，Ａ．，Ｇｏｎｃａｌｖｅｓ－Ｍａｒｔｉｎｓ，Ｍ．，Ｍｕｌｌｅｒ，Ｄ．，ａｎｄ Ｐｒｉｇｅｎｔ－Ｃｏｍｂａｒｅｔ，Ｃ．（２０１６）．Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ Ｓｔｒａｉｎｓ ｗｉｔｈ ｏｎｌｙ Ｆｅｗ Ｐｌａｎｔ－Ｂｅｎｅｆｉｃｉａｌ Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ Ａｒｅ Ｆａｖｏｒｅｄ ｉｎ ｔｈｅ Ｍａｉｚｅ Ｒｈｉｚｏｓｐｈｅｒｅ．Ｆｒｏｎｔ．Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉ．ｄｏｉ：１０．３３８９／ｆｐｌｓ．２０１６．０１２１２．
Ｖａｉｋｕｎｔａｐｕ，Ｐ．Ｒ．，Ｄｕｔｔａ，Ｓ．，Ｓａｍｕｄｒａｌａ，Ｒ．Ｂ．，Ｒａｏ，Ｖ．Ｒ．Ｖ．Ｎ．，Ｋａｌａｍ，Ｓ．，ａｎｄ Ｐｏｄｉｌｅ，Ａ．Ｒ．（２０１４）．Ｐｒｅｆｅｒｅｎｔｉａｌ Ｐｒｏｍｏｔｉｏｎ ｏｆ Ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｏｎ ｅｓｃｕｌｅｎｔｕｍ（Ｔｏｍａｔｏ）Ｇｒｏｗｔｈ ｂｙ Ｐｌａｎｔ Ｇｒｏｗｔｈ Ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ Ｂａｃｔｅｒｉａ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ Ｔｏｍａｔｏ．Ｉｎｄｉａｎ Ｊ．Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．ｄｏｉ：１０．１００７／ｓ１２０８８－０１４－０４７０－ｚ．
Ｖａｎ Ｌｏｏｎ，Ｌ．Ｃ．（２００７）．“Ｐｌａｎｔ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ ｔｏ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ－ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ，” ｉｎ Ｎｅｗ Ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓ ａｎｄ Ａｐｐｒｏａｃｈｅｓ ｉｎ Ｐｌａｎｔ Ｇｒｏｗｔｈ－Ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ Ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ｄｏｉ：１０．１００７／９７８－１－４０２０－６７７６－１＿２．
Ｖｅｊａｎ，Ｐ．，Ａｂｄｕｌｌａｈ，Ｒ．，Ｋｈａｄｉｒａｎ，Ｔ．，Ｉｓｍａｉｌ，Ｓ．，ａｎｄ Ｎａｓｒｕｌｈａｑ Ｂｏｙｃｅ，Ａ．（２０１６）．Ｒｏｌｅ ｏｆ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ ｐｒｏｍｏｔｉｎｇ ｒｈｉｚｏｂａｃｔｅｒｉａ ｉｎ ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ ｓｕｓｔａｉｎａｂｉｌｉｔｙ－Ａ ｒｅｖｉｅｗ．Ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ ２１．ｄｏｉ：１０．３３９０／ｍｏｌｅｃｕｌｅｓ２１０５０５７３．
Ｗａｎｇ，Ｗ．，Ｈｅ，Ａ．，Ｐｅｎｇ，Ｓ．，Ｈｕａｎｇ，Ｊ．，Ｃｕｉ，Ｋ．，＆ Ｎｉｅ，Ｌ．（２０１８）．Ｔｈｅ ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ｓｔｏｒａｇｅ ｃｏｎｄｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｄｕｒａｔｉｏｎ ｏｎ ｔｈｅ ｄｅｔｅｒｉｏｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｐｒｉｍｅｄ ｒｉｃｅ ｓｅｅｄｓ．Ｆｒｏｎｔｉｅｒｓ ｉｎ Ｐｌａｎｔ Ｓｃｉｅｎｃｅ，９，１７２．ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．３３８９／ｆｐｌｓ．２０１８．００１７２．
Ｗｒｉｇｈｔ，Ｂ．，Ｒｏｗｓｅ，Ｈ．Ｒ．，ａｎｄ Ｗｈｉｐｐｓ，Ｊ．Ｍ．（２００３）．Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｅｎｅｆｉｃｉａｌ ｍｉｃｒｏｏｒｇａｎｉｓｍｓ ｔｏ ｓｅｅｄｓ ｄｕｒｉｎｇ ｄｒｕｍ ｐｒｉｍｉｎｇ．Ｂｉｏｃｏｎｔｒｏｌ Ｓｃｉ．Ｔｅｃｈｎｏｌ．ｄｏｉ：１０．１０８０／０９５８３１５０３１０００１５１７９９２．
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ＵＳ２０１６／０３３８３６０Ａ１
ＵＳ２０１６／０３３０９７６Ａ１
ＵＳ２０１７／０２２３９６７Ａ１
ＵＳ２０１８／００２０６７７Ａ１
ＵＳ２０１０／０１５４２９９Ａ１
ＵＳ２０１５／０２８９５１５ Ａ１
ＵＳ２０１８／００６４１１６Ａ１
ＵＳ２０１８／０９８４８３Ａ１
ＵＳ２０１８／００６４１１６Ａ１
ＵＳ２０１８／０１３２４８６Ａ１

Claims (14)

  1. 改変された植物種子であって、前記改変された植物種子の種皮とアリューロン細胞層との間に組み込まれた少なくとも１００００ＣＦＵの細菌を含む、改変された植物種子。
  2. 前記細菌は内生胞子形成細菌またはその内生胞子を含む、請求項１に記載の改変された植物種子。
  3. 前記改変された植物種子は微生物浸出物を含む、請求項１に記載の改変された植物種子。
  4. 前記微生物浸出物は前記細菌に由来する、請求項３に記載の改変された植物種子。
  5. 前記微生物浸出物は前記細菌に由来しない、請求項３に記載の改変された植物種子。
  6. 前記細菌は、ｐｈｙｌａ Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ、Ｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ、Ａｃｔｉｎｏｂａｃｔｅｒｉａ、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、請求項１に記載の改変された植物種子。
  7. 前記細菌は、Ａｃｅｔｏｎｅｍａ ｓｐ．、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｍｏｎｉｐｈｉｌｕｓ ｓｐ．、Ａｍｐｈｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ａｎａｅｒｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ａｎｅｕｒｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ａｎｏｘｙｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｂｒｅｖｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃａｌｄａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃａｌｏｒａｍａｔｏｒ ｓｐ．、Ｃａｍｉｎｉｃｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｅｒａｓｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐ．、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｓａｌｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｃｏｈｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｄｅｎｄｒｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｓｐｏｒｏｓｉｎｕｓ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｒｇｕｌａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｄｅｓｕｌｆｕｒｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｆｉｌｉｆａｃｔｏｒ ｓｐ．、Ｆｉｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｌｒｉａ ｓｐ．、Ｇｅｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｇｅｏｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｇｒａｃｉｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｈａｌｏｎａｔｒｏｎｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｈｅｌｉｏｐｈｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｌａｃｅｙｅｌｌａ ｓｐ．、Ｌｅｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｌｙｓｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｍａｈｅｌａ ｓｐ．、Ｍｅｔａｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｍｏｏｒｅｌｌａ ｓｐ．、Ｎａｔｒｏｎｉｅｌｌａ ｓｐ．、Ｏｃｅａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｒｅｎｉａ ｓｐ．、Ｏｒｎｉｔｈｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｏｘａｌｏｐｈａｇｕｓ ｓｐ．、Ｏｘｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｌｉｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｐｅｌｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｉｓｃｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｌａｎｉｆｉｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｏｎｔｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｐｒｏｐｉｏｎｉｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｓａｌｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓａｌｓｕｇｉｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｅｉｎｏｎｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｈｉｍａｚｕｅｌｌａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒａｃｅｔｉｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｈａｌｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｍｕｓａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｓａｒｃｉｎａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔａｌｅａ ｓｐ．、Ｓｐｏｒｏｔｏｍａｃｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｓｙｎｔｒｏｐｈｏｓｐｏｒａ ｓｐ．、Ｔｅｎｕｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｅｐｉｄｉｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｅｒｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈａｌａｓｓｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｅｔｏｇｅｎｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｌｋａｌｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏａｎａｅｒｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｆｌａｖｉｍｉｃｒｏｂｉｕｍ ｓｐ．、Ｔｈｅｒｍｏｖｅｎａｂｕｌｕｍ ｓｐ．、Ｔｕｂｅｒｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｉｒｇｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、Ｖｕｌｃａｎｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．、またはそれらの組み合わせからの細菌を含む、請求項６に記載の改変された植物種子。
  8. 前記細菌は、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む、請求項７に記載の改変された植物種子。
  9. 前記細菌は、Ｐａｅｎｉｂａｃｉｌｌｕｓ ｓｐ．からの細菌を含む、請求項７に記載の改変された植物種子。
  10. 前記細菌は、Ａｃｔｉｎｏｍｙｃｅｓ ｓｐ．、Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、Ｈｅｒｂａｓｐｉｒｉｌｌｕｍ ｓｐ．、Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐ．、Ｐａｒａｂｕｒｋｈｏｌｄｅｒｉａ ｓｐ．、Ｓｅｒｒａｔｉａ ｓｐ．、Ｐａｎｔｏｅａ ｓｐ．、Ｅｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．、Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒ ｓｐ．、またはそれらの任意の組み合わせからの細菌を含む、請求項６に記載の改変された植物種子。
  11. 前記細菌は、Ｅｎｓｉｆｅｒ ｓｐ．からの細菌を含む、請求項１０に記載の改変された植物種子。
  12. 前記細菌は、Ｃｏｘｉｅｌｌａ ｓｐ．からの細菌を含む、請求項７に記載の改変された植物種子。
  13. 前記改変された植物種子は、トウモロコシ種子、小麦種子、イネ種子、モロコシ種子、大麦種子、ライ麦種子、サトウキビ種子、アワ種子、オート麦種子、大豆種子、綿種子、アルファルファ種子、豆種子、キノア種子、レンズ豆種子、ピーナッツ種子、レタス種子、トマト種子、エンドウ種子、またはキャベツ種子である、請求項１に記載の改変された植物種子。
  14. 前記種皮は種子の果皮である、請求項１に記載の改変された植物種子。
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