JP7792115B2 - 感染症及び関連炎症プロセスの処置のための細菌結合ペプチド - Google Patents
感染症及び関連炎症プロセスの処置のための細菌結合ペプチドInfo
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Description
a)固相ペプチド合成工程と、
b)ポリマー支持体からペプチドを切断する工程と、
c)任意に、溶液中でペプチドをサイクリングする工程と、
d)保護基を除去する工程と、
を含むか、或いは、
i)固相ペプチド合成工程と、
ii)任意に、固相ペプチドのサイクリング工程と、
iii)ポリマー支持体からペプチドを切断し、同時に保護基を除去する工程と、
を含む。
前記少なくとも1つの成分を含有する可能性がある水溶液を準備することと、
前記装置に含まれる1つ以上の前記アミノ酸配列への前記少なくとも1つの成分の結合をもたらす条件下で、前記水溶液を本発明の装置に通して、前記水溶液から前記少なくとも1つの成分を除去することと、
を含む、方法を開示する。
第1の態様において、本発明は、
CD6.PD1:GTVEVRLEASW(配列番号1);
CD6.PD2:GRVEMLEHGEW(配列番号2);及び、
CD6.PD3:GQVEVHFRGVW(配列番号3);
の1つ以上の配列(「本発明のアミノ酸配列」)又はその誘導体を含む、或いはそれのみからなるアミノ酸配列を提供する。
CD6.PD1:GTVEVRLEASW(配列番号1);
CD6.PD2:GRVEMLEHGEW(配列番号2);及び、
CD6.PD3:GQVEVHFRGVW(配列番号3);
の1つ以上のペプチド(「本発明のペプチド」)又はその誘導体を提供する。
DQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANATLAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHGEWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFTPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDCPGLPGQHYCGHKEDAGVVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAKVLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLCSASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESR
gaccagctca acaccagcag tgcagagagt gagctctggg agccagggga gcggcttccg
gtccgtctga caaacgggag cagcagctgc agcgggacgg tggaggtgcg gctcgaggcg
tcctgggagc ccgcgtgcgg ggcgctctgg gacagccgcg ccgccgaggc cgtgtgccga
gcactgggct gcggcggggc ggaggccgcc tctcagctcg ccccgccgac ccctgagctg
ccgcccccgc ctgcagccgg gaacaccagc gtagcagcta atgccactct ggccggggcg
cccgccctcc tgtgcagcgg cgccgagtgg cggctctgcg aggtggtgga gcacgcgtgc
cgcagcgacg ggaggcgggc ccgtgtcacc tgtgcagaga accgcgcgct gcgcctggtg
gacggtggcg gcgcctgcgc cggccgcgtg gagatgctgg agcatggcga gtggggatca
gtgtgcgatg acacttggga cctggaggac gcccacgtgg tgtgcaggca actgggctgc
ggctgggcag tccaggccct gcccggcttg cacttcacgc ccggccgcgg gcctatccac
cgggaccagg tgaactgctc gggggccgaa gcttacctgt gggactgccc ggggctgcca
ggacagcact actgcggcca caaagaggac gcgggcgtgg tgtgctcaga gcaccagtcc
tggcgcctga cagggggcgc tgaccgctgc gaggggcagg tggaggtaca cttccgaggg
gtctggaaca cagtgtgtga cagtgagtgg tacccatcgg aggccaaggt gctctgccag
tccttgggct gtggaactgc ggttgagagg cccaaggggc tgccccactc cttgtccggc
aggatgtact actcatgcaa tggggaggag ctcaccctct ccaactgctc ctggcggttc
aacaactcca acctctgcag ccagtcgctg gcagccaggg tcctctgctc agcttcccgg
agtttgcaca atctgtccac tcccgaagtc cctgcaagtg ttcagacagt cactatagaa
tcttctgtga cagtgaaaat agagaacaag gaatctcggt ag
a)固相ペプチド合成の工程と、
b)好ましくは酸処理によってポリマー支持体からペプチドを切断する工程と、
c)任意に、溶液中のペプチドをサイクリングする工程と、
d)必要に応じて、好ましくはトリフルオロ酢酸で保護基を除去する工程と、
を含むか、或いは
i)固相ペプチド合成の工程と、
ii)任意に、固相ペプチドサイクリングの工程と、
iii)ポリマー支持体からペプチドを切断し、必要に応じて、同時に好ましくはトリフルオロ酢酸で処理することにより保護基を除去する工程と、
を含む方法によって調製される。
第2の態様において、本発明は、本発明の1つ以上のアミノ酸配列若しくはペプチド、又はその誘導体と、少なくとも1つの抗生物質とを含む組合せを提供する。好ましくは、抗生物質はβ-ラクタム系抗生物質、より好ましくはイミペネムである。好ましい実施形態において、組合せはデヒドロペプチダーゼ阻害剤又はβ-ラクタマーゼ阻害剤等の酵素阻害剤、より好ましくはシラスタチンを更に含む。更に好ましくは、組合せはイミペネム及びシラスタチンを含む。
第3の態様では、本発明は、本発明の1つ以上のアミノ酸配列若しくはペプチド、又はその誘導体を含む組成物、好ましくは医薬組成物(「本発明の組成物」)を提供する。例えば、本発明の組成物、好ましくは、医薬組成物は、本発明の組合せを含み得る。
第3の態様では、本発明は、本発明の1つ以上のアミノ酸配列又はペプチド(又はその誘導体)と、少なくとも1つの抗生物質とを含む、或いはそれからなるパーツのキットを提供する。好ましくは、抗生物質はβ-ラクタム系抗生物質、より好ましくはイミペネムである(「本発明のパーツのキット」)。好ましい実施形態において、組合せはデヒドロペプチダーゼ阻害剤又はβ-ラクタマーゼ阻害剤等の酵素阻害剤、より好ましくはシラスタチンを更に含む。更により好ましくは、パーツのキットはイミペネム及びシラスタチンを含む。
a)本発明の1つ以上のアミノ酸配列若しくはペプチド、若しくはその誘導体、又は、及び薬学的に許容可能な担体、薬学的に許容可能な塩、アジュバント及び/又は適切な賦形剤を含む医薬組成物と、
b)上述するように、抗生物質、好ましくはイミペネムと、また上述するように、好ましくはデヒドロペプチダーゼ阻害剤又はβ-ラクタマーゼ阻害剤等の酵素阻害剤、好ましくはシラスタチンと、薬学的に許容可能な担体、薬学的に許容可能な塩、アジュバント及び/又は適切な賦形剤とを含む医薬組成物と、
を含んでもよく、或いはそれらからなってもよい。より好ましくは、医薬組成物はイミペネムを含み、更に好ましくはシラスタチンとともにイミペネムを含む。
イミペネムは、カルバペネムクラスの抗生物質に属するβ-ラクタム抗生物質である。カルバペネムは、多くの多剤耐性G-細菌によって産生されるβ-ラクタマーゼ酵素に対して非常に耐性である。イミペネムは、様々なG+細菌及びG-細菌の細胞壁合成を阻害すること、したがって溶菌中に放出されるPAMPの量を低減することにより、抗菌薬として作用する。イミペネムは、幾つかの細菌によって産生されるβ-ラクタマーゼ(ペニシリナーゼ及びセファロスポリナーゼの両方)の存在下で非常に安定なままであり、ほとんどのβ-ラクタム抗生物質に対して耐性である幾つかのG-細菌由来のβ-ラクタマーゼの強力な阻害剤である。イミペネムに関するIUPAC系統名は、(5R,6S)-6-[(1R)-1-ヒドロキシエチル]-3-({2-[(イミノメチル)アミノ]エチル}チオ)-7-オキソ-1-アザビシクロ[3.2.0]ヘプタ-2-エン-2-カルボン酸であり、そのCAS登録番号は、74431-23-5であり、その化学式は、以下で式1において記載している:
シラスタチンは、抗生物質イミペネムのin vivoでの分解に関与する酵素であるヒトデヒドロペプチダーゼを阻害する化合物である。したがって、シラスタチンは、イミペネムとともに投与されて、デヒドロペプチダーゼによるその分解を抑え、それにより、身体中の循環時間、したがってその抗菌効果を延ばし得る。シラスタチン自体は、抗生物質活性を持たない。当業者が承知しているように、イミペネム単独は、有効な抗生物質であり、シラスタチンを伴わずに投与することができる。しかしながら、好ましくは、イミペネムは、好ましくはイミペネム:シラスタチンの比1:1でシラスタチンとともに投与される。
本発明の教示によれば、本発明の1つ以上のアミノ酸配列、ペプチド、若しくはその誘導体、組合せ、組成物、医薬組成物及び/又はパーツのキットの構成成分を、哺乳類、好ましくはヒトに投与することができる。或いは、本発明の1つ以上のアミノ酸配列、ペプチド、若しくはその誘導体、組合せ、組成物、医薬組成物及び/又はパーツのキットの構成成分を、非哺乳類、好ましくはニワトリ、アヒル、ガチョウ、ダチョウ、ハト及び/又はシチメンチョウに投与することができる。本発明の1つ以上のアミノ酸配列、ペプチド(又はその誘導体)、組合せ、組成物、医薬組成物及び/又はパーツのキットの構成成分の投与の目的は、予防的(これらの疾患の発症を回避するため)及び/又は治療的(これらの疾患が発症/導入された後に、これらの疾患を処置するため)であり得る。
更なる態様では、本発明の1つ以上のアミノ酸配列、ペプチド(又はその誘導体)、組合せ、組成物、医薬組成物及び/又はパーツのキットを、その変形形態のいずれかにおいて、薬剤として、好ましくはヒトを含む哺乳類及び/又はニワトリ、アヒル、ガチョウ、ダチョウ、ハト及び/又はシチメンチョウを含む非哺乳類における、感染症、又は感染症に関連した炎症状態、又は感染病原体に由来する産物の存在に関連した炎症性疾患の処置の治療法及び/又は予防法において使用することができる。したがって、本発明は、哺乳類及び/又は非哺乳類への、本発明の1つ以上のアミノ酸配列、ペプチド(又はその誘導体)、組合せ、組成物、医薬組成物及び/又はパーツのキットを投与することを含む、感染症、又は感染症と関連する炎症状態、又は感染病原体に由来する産物の存在に関連した炎症性疾患の処置の治療法及び/又は予防法を提供する。例えば、哺乳類は齧歯類(ネズミ又はラット等)、霊長類(類人猿、サル又はキツネザル等)、イヌ、ネコ、ウサギ、及びウシ、ウマ又はブタ等の有蹄類であってもよい。好ましい実施形態において、哺乳類はヒトである。例えば、非哺乳類は、ニワトリ、アヒル、ガチョウ、ダチョウ、ハト、シチメンチョウ等であってもよい。
更なる実施形態において、本出願は、本発明の1つ以上のアミノ酸配列及び/又はペプチドを含むコンジュゲートを開示する。コンジュゲートは、好ましくは、本発明の1つ以上のアミノ酸配列及び/又はペプチドが、担体、好ましくはポリマー、例えば可溶性ポリマー又は好ましくは不溶性ポリマーに複合化されている(好ましくは共有結合されている)コンジュゲートである。
本発明の更なる態様は、本発明の1つ以上のアミノ酸配列又はペプチドを含む「吸着剤」とも呼ぶことができる装置、好ましくは医療装置(「本発明の装置」)に関するものである。
CD6.PD1:GTVEVRLEASW(配列番号1);
CD6.PD2:GRVEMLEHGEW(配列番号2);及び/又は、
CD6.PD3:GQVEVHFRGVW(配列番号3);
の配列を含む、或いはそれのみからなる1つ以上のアミノ酸配列、又はその誘導体を含む。
細胞壁ペプチドグリカン(PGN):G+細菌及びG-細菌はいずれも、特徴的な細胞形状を与え、細胞に機械的保護を提供する細胞壁ペプチドグリカンを持つ。ペプチドグリカンは、原核生物に特有であり、ムラミン酸及びグルコサミン(共にN-アセチル化されている)のグリカン骨格と、G+細菌(例えば黄色ブドウ球菌)では橋と高度に架橋されている、又はG-細菌(例えば大腸菌)では部分的に架橋されているペプチド鎖とからなる。架橋トランスペプチダーゼ酵素は、β-ラクタム系抗生物質の標的の一部である。
テイコ酸(TA):テイコ酸は、強い負電荷を持つポリオールリン酸ポリマーである。テイコ酸は、幾つかのG+細菌においてペプチドグリカンに共有結合されている。テイコ酸は抗原性が強いが、一般的にはG-細菌には存在しない。
リポテイコ酸(LTA):膜テイコ酸としてのリポテイコ酸は、両親媒性グリコリン酸(glycophosphates)と親油性糖脂質とのポリマーであり、細胞質膜に固定されている。リポテイコ酸は、抗原性で細胞傷害性であり、アドヘシン(例えば、化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes))である。
リポ多糖(LPS):G-細菌の外膜の主要な構成成分の1つは、リピドAアンカー、多糖コア及び炭水化物の鎖からなる複合体分子であるリポ多糖類(エンドトキシン)である。多糖鎖の糖は、血清学的特異性を付与する。
壁喪失型(Wall-Less Forms):細胞壁ペプチドグリカンのない2つの群の細菌は、表面膜構造を持つマイコプラズマ(Mycoplasma)種、及びペプチドグリカン構造を産生する能力を失ったG+細菌の細胞又はG-細菌の細胞のいずれかから生じるL型である。
上記少なくとも1つの成分を含む可能性がある、水溶液、好ましくは哺乳類及び/又は非哺乳類等の動物、好ましくはヒトを含む哺乳類に由来する、血液、血漿、血清又は他の適切な血液画分等の体液を準備することと、
上記少なくとも1つの成分、好ましくはLPS、LTA及び/又はPGN等のエンドトキシン等のG-細菌及び/又はG+細菌の表面構造の1つ以上の化学成分を、医療装置の固体支持体に固定された1つ以上のアミノ酸配列若しくはペプチド、又はその誘導体に結合させて、水溶液から少なくとも1つの成分を除去する条件下で、水溶液、好ましくは哺乳類及び/又は非哺乳類等の動物、好ましくはヒトを含む哺乳類に由来する、血液、血漿、血清又は他の適切な血液画分等の体液を、本発明の医療装置に通すことと、
を含む。
組換えタンパク質及びペプチドの産生及び精製
rshCD6タンパク質及びrshCD5タンパク質を、報告された方法(Sarrias MR, et al., 2004, Biochemical characterization of recombinant and circulating human Sp alpha. Tissue Antigens 63:335-44、非特許文献14)に従い、SURE CHO-M細胞株(商標)クローン(スイス国ジュネーブのSelexis SUREtechnology Platform(商標))及びPX'Therapeutics(フランス国グルノーブル)で開発されたサイズ排除クロマトグラフィープロトコルを用いて精製した。ヒト及びウシの血清アルブミン(それぞれHAS及びBSA)をSigma-Aldrich(ミズーリ州セントルイス)から購入した。
TTCバッファー(50mM Tris(pH7.5)+150mM NaCl、0.1%Tween 20及び1mM Ca2+)で希釈した5×108コロニー形成単位(CFU)/mLを、96U底ウェルマイクロタイタープレート(Biofil)において異なるペプチド濃度(0μg/mL~200μg/mL)で混合した(1:1)(Bikker FJ, et al., 2002, Identification of the bacteria-binding peptide domain on salivary agglutinin (gp-340/DMBT1), a member of the scavenger receptor cysteine-rich superfamily, J Biol Chem 277:32109-15)。37℃で一晩インキュベーションした後、細菌凝集を光学顕微鏡法で検査し、2名の独立した観察者によって-(なし)から+++(最大)までスコアを付けた。
多剤耐性アシネトバクター・バウマンニ臨床分離株、エンテロバクター・クロアカエATCC 23355、大腸菌ATCC 25922、クレブシエラ・ニューモニエATCC 13883、リステリア・モノサイトゲネスATCC 19111、シュードモナス・エルギノーサATCC 27853、黄色ブドウ球菌ATCC 25923及びメチシリン耐性黄色ブドウ球菌(MRSA)臨床分離株は、ジョルディ・ビラ博士(バルセロナ病院クリニック微生物学部門)によって提供され、ブレインハートインフュージョン培地(Pronadisa)で培養されたリステリア・モノサイトゲネスを除き、Luria Bertoni又は5%ヒツジ血液(Becton Dikinson)を含む寒天において37℃で増殖させた。
内部蛍光実験
異なるペプチド/タンパク質がLTA(Mr=14000、黄色ブドウ球菌由来)及び粗い(rough)LPS(Re-LPS、Mr=2500、サルモネラ・ミネソタ(Salmonella minnesota)血清型Re595由来)を結合する能力を調べるため、記載されるとおり(Coya JM, et al., 2015, Natural Anti-Infective Pulmonary Proteins: In Vivo Cooperative Action of Surfactant Protein SP-A and the Lung Antimicrobial Peptide SP-BN, J Immunol 195:1628-36)、5mm×5mmパス長の石英キュベットを使用して、サーモスタットキュベットホルダー(±0.1℃)を備えるAB2分光蛍光光度計で結合研究を行った。2-ケト-3-デオキシオクトウロン酸の定量によりRe-LPS濃度を評定した(Garcia-Verdugo I, et al., 2003, Effect of hydroxylation and N187-linked glycosylation on molecular and functional properties of recombinant human surfactant protein A, Biochemistry 42:9532-42)。ペプチド/タンパク質サンプル(10μg/mL)をリン酸バッファー生理食塩水(PBS)(pH7.2)中のLTA又はRe-LPSのいずれかの異なる量の原液で滴定し、295nmの励起でTrp蛍光発光スペクトルを記録した。蛍光強度の読み取り値を、ペプチド/タンパク質の添加により生じる希釈に対して補正した。LTA又はRe-PSに起因するペプチド/タンパク質を含まないサンプルのバックグラウンド強度を各記録から差し引いた。ペプチド/タンパク質-リガンド複合体の見かけ上の解離定数(Kd)は、LTA又はRe-LPSの添加量による353nmのペプチド蛍光変化のヒルの式に非線形最小二乗法を当てはめることによって得られた(Garcia-Verdugo I, et al., 2003, Effect of hydroxylation and N187-linked glycosylation on molecular and functional properties of recombinant human surfactant protein A, Biochemistry 42:9532-42):
ΔF/ΔFmax=[L]n/([L]n+Kd)
(式中、ΔFは遊離ペプチドの強度に対する353nmでの蛍光強度の変化であり、Fmaxは飽和しているLTA又はRe-LPS濃度での蛍光強度の変化であり、[L]は遊離しているリガンドのモル濃度であり、nはヒル係数である)。
96ウェルマイクロタイタープレート(デンマーク国ロスキレのNunc)をPBS中5μg/mLの精製されたLPS(大腸菌O111:B4、Sigma L2630)又はLTA(黄色ブドウ球菌、Sigma L2515)を用いて4℃で一晩コーティングした後、ブロッキング溶液(20mM Tris-HCl(pH7.4)+0.05%Tween20及び1%BSA)中で室温にて2時間インキュベートした。ビオチン標識ペプチド/タンパク質(2.5μg/mL~20μg/mL)を加え、ブロッキング溶液中で4℃にて一晩インキュベートした。徹底的に洗浄した後、結合したペプチド/タンパク質を、室温で1時間セイヨウワサビペルオキシダーゼ(HRP)標識ストレプトアビジン(1:5000希釈;DAKO)の添加によって検出した。3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)液体基質(Sigma)を加えることにより発色させ、光学密度を405nm~620nmで読み取った。
ペプチドの流体力学的径(PBS中10μg/mL)を、記載されるとおりに(Saenz A, et al., 2010, Fluidizing effects of C-reactive protein on lung surfactant membranes: protective role of surfactant protein A, FASEB J 24:3662-73)、633nmのHeNeレーザーを搭載したMalvern Instruments(英国ウスターシャー)製のZetasizer Nano Sにおいて25℃で測定した。サンプルごとに4回のスキャンを記録し、サンプルを3回分析した。
6週齢~8週齢のC57BL/6マウス(Charles River)の脾臓を、細胞ストレーナーを通して濾過することによって脱凝集させ、赤血球溶解後、L-グルタミン(Lonza)+10%ウシ胎児血清(BioWest)、100U/mLペニシリン、100μg/mLストレプトマイシン及び50μM 2-βメルカプトエタノール(Merck)を含むRPMI1640中に細胞を再懸濁した。ペプチドを漸増させて(0.5μg/mL~20μg/mL)又はペプチドの不在下で、LPS(0.5μg/mL;大腸菌O111:B4)を含むU底96ウェルプレート(Biofil)において48時間(5%CO2の加湿雰囲気中37℃)に亘り細胞(2×105)を刺激した。培養上清を採取し、製造業者の指示(BD Biosciences OptEIAセット)に従い、ELISAによってマウスサイトカインを測定した。
動物の処理は、バルセロナ大学の動物実験倫理委員会によって承認された。死亡率の高い(最初の48時間~72時間以内の死亡率が90%以上)CLP誘導性敗血症性ショックを以前に報告されているとおりに(非特許文献25)8週齢~10週齢のC57BL/6J雄性マウス(20g~25g;Charles River)において誘導した。
タンパク質又はペプチド(各2.5mg)を、先に記載されるプロトコル(Zimmermann M, et al., 1999, Endotoxin adsorbent based on immobilized human serum albumin. Clin Chem Lab Med 37:373-379)に従って、マクロ多孔性アクリルEUPERGIT(商標)ビーズ(0.2g、Roehm-Pharma GmbH、ドイツ)上にNH2基を介して固定化した。室温でポリマービーズを撹拌しながら、リン酸ナトリウムバッファー100mM(pH8)中、本発明のペプチドの溶液とともに24時間インキュベーションすることによって、ペプチド又はタンパク質でコーティングしたEupergit(商標)ビーズを得る。インキュベーション後、ビーズを3M塩化ナトリウム(pH7.0)、30mMリン酸ナトリウムバッファー(pH4.0)、及び30mMリン酸ナトリウムバッファー(pH8.0)で3回洗浄した。最後に、ペプチド又はタンパク質でコーティングしたビーズに154mM塩化ナトリウム溶液(pH7.0)を加えた。
製造業者の指示に従い、カイネティック比濁(turbidimetric-kinetic)Limulus Amebocyte Lysate(LAL)キット-QCL(50U~650U、Lonza)を用いてLPS検出を行った。タンパク質/ペプチドでコーティングされたEUPERGIT(商標)ビーズを、製造業者の指示に従って、室温で異なる期間(0分~150分)、準備したエンドトキシン溶液(50UI/mL)と1:1(体積:体積)でインキュベートした。
生存アッセイを、GraphPad Prismソフトウェアを用いてログランクχ2検定によって分析した。実験群間の差の有意性を、95%の信頼区間(CI)で対応のある両側T検定によって決定した。P<0.05の場合、P値を有意とみなした。統計学的分析(平均±SEM)を、95%のCIで両側マンホイットニー検定を用いて行った。
実施例1.CD6由来ペプチドの広範囲の細菌結合特性を裏付けるin vitro及びin vivoの証拠
CD6由来ペプチドによる細菌凝集の誘導
この研究で使用した、SRCRドメイン1~SRCRドメイン3にマッピングされている研究したCD6由来ペプチド(それぞれCD6.PD1、CD6.PD2及びCD6.PD3)、及び他のペプチド(CD6.cons、DMBT1.pbs1、CD5.PD1、及びCD5.PD2)、及びタンパク質(rshCD6(DQLNTSSAESELWEPGERLPVRLTNGSSSCSGTVEVRLEASWEPACGALWDSRAAEAVCRALGCGGAEAASQLAPPTPELPPPPAAGNTSVAANATLAGAPALLCSGAEWRLCEVVEHACRSDGRRARVTCAENRALRLVDGGGACAGRVEMLEHGEWGSVCDDTWDLEDAHVVCRQLGCGWAVQALPGLHFTPGRGPIHRDQVNCSGAEAYLWDCPGLPGQHYCGHKEDAGAVCSEHQSWRLTGGADRCEGQVEVHFRGVWNTVCDSEWYPSEAKVLCQSLGCGTAVERPKGLPHSLSGRMYYSCNGEELTLSNCSWRFNNSNLCSQSLAARVLCSASRSLHNLSTPEVPASVQTVTIESSVTVKIENKESR、配列番号10)及びrshCD5(RLTRSNSKCQGQLEVYLKDGWHMVCSQSWGRSSKQWEDPSQASKVCQRLNCGVPLSLGPFLVTYTPQSSIICYGQLGSFSNCSHSRNDMCHSLGLTCLEPQKTTPPTTRPPPTTTPEPTAPPRLQLVAQSGGQHCAGVVEFYSGSLGGTISYEAQDKTQDLENFLCNNLQCGSFLKHLPETEAGRAQDPGEPREHQPLPIQWKIQNSSCTSLEHCFRKIKPQKSGRVLALLCSGFQPKVQSRLVGGSSICEGTVEVRQGAQWAALCDSSSARSSLRWEEVCREQQCGSVNSYRVLDAGDPTSRGLFCPHQKLSQCHELWERNSYCKKVFVTCQD、配列番号11))の配列及び生理化学的特性を図1Aに収集する。図1Bに示されるin silico構造解析は、全てのCD6ペプチドがCD6の表面でアクセス可能であり、CD6.PD1(及びCD6.PD3)はCD6.PD2の反対側に露出していることを示した。図1Cに示すように、異なる動物種間のCD6由来ペプチドのアミノ酸保存は、CD6.PD2及びCD6.PD3では比較的高く、CD6.PD1では低い。
LPS又はLTAによって吸着された固相へのビオチン標識CD6由来ペプチドの結合を、ELISAによって試験した。図3A及び図3Bによって示すように、全てのCD6由来のペプチドが、陽性対照として用いたDMBT1.pbs1及びCD6.consのペプチドと同様に、LPS及びLTAへの用量依存性の結合を示した。しかしながら、CD6.PD3ペプチドは、他の試験したペプチドと比較して、固定化されたLPS及びLTAの両方を結合する能力に優れていた。予想通り、CD5.PD1ペプチド及びrshCD5タンパク質では、有意な結合は認められなかった。これらの結果より、CD6由来ペプチドがLPS及びLTAへの結合特性を保持することが確認される。
CD6由来ペプチドのin vivoの効果を、CLP誘導性敗血症性ショックを受けたマウスで試験した(Rittirsch D, et al., 2009, Immunodesign of experimental sepsis by cecal ligation and puncture, Nat Protoc 4:31-6)。この目的のため、CLP誘導の1時間後にC57BL/6マウスに単回静脈内(i.v.)用量(6mg/kg)の異なるペプチドを注入し、その後生存をモニタリングした。図7Aに示すように、CD6.PD2(12.5%、P<0.0005)及びCD6.PD3(36.36%、P<0.0001)を注入したマウス間で、生理食塩水処置群と比較して有意な生存の上昇が認められ、この事実は、DMBT-1.pbs1(23.07%、P<0.0025)及びCD6.cons(25%、P<0.0101)のペプチドを注入したマウスでも認められた(図7B)。CD6.PD1ペプチドでは、マウスの生存に対する有意な効果は認められなかった。
本実施例は、短い(長さ11-mer)CD6由来ドメイン内ペプチドが、天然CD6タンパク質のin vitro及びin vivoで細菌認識特性を保持していることを示している。かかる配列(CD6.PD1、CD6.PD2及びCD6.PD3)は、CD6の3つのSRCRドメインの表面アクセス可能部位にマッピングされ、DMBT-1/SAGタンパク質において同定された11-merコンセンサスペプチド(pbs1)に相同である(非特許文献9)。
結果
異なる期間に亘って、異なるCD6由来ペプチド(CD6.PD2、CD6.PD3及びCD6.cons)又はタンパク質(HSA(UniProtKB-P02768、MKWVTFISLLFLFSSAYSRGVFRRDAHKSEVAHRFKDLGEENFKALVLIAFAQYLQQCPFEDHVKLVNEVTEFAKTCVADESAENCDKSLHTLFGDKLCTVATLRETYGEMADCCAKQEPERNECFLQHKDDNPNLPRLVRPEVDVMCTAFHDNEETFLKKYLYEIARRHPYFYAPELLFFAKRYKAAFTECCQAADKAACLLPKLDELRDEGKASSAKQRLKCASLQKFGERAFKAWAVARLSQRFPKAEFAEVSKLVTDLTKVHTECCHGDLLECADDRADLAKYICENQDSISSKLKECCEKPLLEKSHCIAEVENDEMPADLPSLAADFVESKDVCKNYAEAKDVFLGMFLYEYARRHPDYSVVLLLRLAKTYETTLEKCCAAADPHECYAKVFDEFKPLVEEPQNLIKQNCELFEQLGEYKFQNALLVRYTKKVPQVSTPTLVEVSRNLGKVGSKCCKHPEAKRMPCAEDYLSVVLNQLCVLHEKTPVSDRVTKCCTESLVNRRPCFSALEVDETYVPKEFNAETFTFHADICTLSEKERQIKKQTALVELVKHKPKATKEQLKAVMDDFAAFVEKCCKADDKETCFAEEGKKLVAASQAALGL、配列番号12)、rshCD5、及びrshCD6)でコーティングしたEupergit(商標)ビーズとともに、エンドトキシン溶液(50UI/mL LPS)をインキュベートすることによって得られた結果を図11に示す。CD6.PD2、CD6.PD3及びrshCD6でコーティングされたビーズは、HSA及びrshCD5でコーティングされた対照と比較して、(LALアッセイで検出される)エンドトキシンレベルを低下させた。体外血液灌流のためのCD6由来ペプチドの使用は、ポリミキシンB固定化繊維血液浄化カラム等の既存の装置よりも利点があり(Esteban E, et al., 2013, Immunomodulation in sepsis: the role of endotoxin removal by polymyxin B-immobilized cartridge, Mediators Inflamm 2013:507539)、すなわち、i)報告されたLPS/ポリミキシンB相互作用の親和性(使用されるG-株に応じて、Kd100nM~900nM)(McInerney MP, et al., 2016, Quantitation of Polymyxin-Lipopolysaccharide Interactions Using an Image-Based Fluorescent Probe, J Pharm Sci; 105:1006-10)は、CD6.PD1及びCD6.PD2よりも低く(それぞれKd3.5±0.3nM、及び35±2nM)、またii)ポリミキシンBは、主にLPSに結合するが、CD6.PD1及びCD6.PD2もそれぞれKd0.39±0.06nM及び0.31±0.04nMの親和性でLTAを結合する。したがって、CD6由来のペプチドは、敗血症の50%超に関わるG+感染の場合にも使用することができる(Martin GS, 2012, Sepsis, severe sepsis and septic shock: changes in incidence, pathogens and outcomes, Expert Rev Anti Infect Ther 10:701-6)。
Claims (15)
- 配列番号3、配列番号1及び配列番号2からなる群より選択される少なくとも一つの単離アミノ酸配列からそれぞれなる1つ以上のペプチド、又はその誘導体を含む医薬組成物であって、
前記単離アミノ酸配列からなるペプチドの前記誘導体は、N-アシル化及び/又はC-アミド化若しくはC-エステル化、N-アルキル化、1つ以上のL-アミノ酸のD-アミノ酸への置換、1つ以上の高分子(例えば、ポリエチレングリコール(PEG)又はアルブミン)との複合化、及びCys残基でキャップされたN末端又はC末端からなる群より選択される少なくとも一種の修飾の点のみにおいて、前記単離アミノ酸配列と相違する、医薬組成物。 - 前記医薬組成物が、固体組成物、好ましくは錠剤、丸剤、カプセル剤若しくは顆粒の形態であるか、又は液体組成物、好ましくは溶液、懸濁液若しくはエマルションの形態である、請求項1に記載の医薬組成物。
- 前記医薬組成物が、薬学的に許容可能な担体、薬学的に許容可能な塩、アジュバント及び/又は適切な賦形剤を更に含む、請求項1又は2に記載の医薬組成物。
- 配列番号3、配列番号1及び配列番号2からなる群より選択される少なくとも一つの単離アミノ酸配列からそれぞれなる1つ以上のペプチド、又はその誘導体を含むコンジュゲートであって、
前記単離アミノ酸配列からなるペプチドの前記誘導体は、N-アシル化及び/又はC-アミド化若しくはC-エステル化、N-アルキル化、1つ以上のL-アミノ酸のD-アミノ酸への置換、1つ以上の高分子(例えば、ポリエチレングリコール(PEG)又はアルブミン)との複合化、及びCys残基でキャップされたN末端又はC末端からなる群より選択される少なくとも一種の修飾の点のみにおいて、前記単離アミノ酸配列と相違する、コンジュゲート。 - 前記ペプチド、又はその誘導体が、可溶性ポリマー等のポリマー、又は好ましくは不溶性ポリマーに複合化されている、請求項4に記載のコンジュゲート。
- 配列番号3、配列番号1及び配列番号2からなる群より選択される少なくとも一つの単離アミノ酸配列からそれぞれなる1つ以上のペプチド、又はその誘導体と、抗生物質とを含み、好ましくはデヒドロペプチダーゼ阻害剤又はβ-ラクタマーゼ阻害剤を更に含むパーツのキットであって、
前記単離アミノ酸配列からなるペプチドの前記誘導体は、N-アシル化及び/又はC-アミド化若しくはC-エステル化、N-アルキル化、1つ以上のL-アミノ酸のD-アミノ酸への置換、1つ以上の高分子(例えば、ポリエチレングリコール(PEG)又はアルブミン)との複合化、及びCys残基でキャップされたN末端又はC末端からなる群より選択される少なくとも一種の修飾の点のみにおいて、前記単離アミノ酸配列と相違する、キット。 - 前記抗生物質がイミペネムであり、及び/又は前記デヒドロペプチダーゼ阻害剤若しくはβ-ラクタマーゼ阻害剤がシラスタチンである、請求項6に記載のパーツのキット。
- 薬剤として使用される、請求項1~3のいずれか一項に記載の医薬組成物、請求項4若しくは5に記載のコンジュゲート、又は請求項6若しくは7に記載のパーツのキット。
- 感染症、又は感染症によって引き起こされる炎症状態、又は感染病原体の構成成分によって引き起こされる炎症性疾患のヒトを含む哺乳類及び/又は非哺乳類における処置を治療及び/又は予防するための、請求項1~3のいずれか一項に記載の医薬組成物、請求項4若しくは5に記載のコンジュゲート、又は請求項6若しくは7に記載のパーツのキット。
- 前記感染症が、微生物感染、好ましくは菌血症であり、及び/又は前記炎症状態が、全身性炎症反応症候群又は敗血症であり、及び/又は前記感染病原体が、細菌、真菌、ウイルス、寄生虫、及びそれらの組合せからなる群より選択される、請求項9に記載の使用のための医薬組成物、コンジュゲート、又はパーツのキット。
- 水溶液から少なくとも1つの成分を選択的に結合及び分離するための装置であって、該装置が、配列番号3、配列番号1及び配列番号2からなる群より選択される少なくとも一つの単離アミノ酸配列からそれぞれなる1つ以上のペプチド、又はその誘導体を含み、好ましくは前記装置が配列番号3、配列番号1及び配列番号2のアミノ酸配列からそれぞれなるペプチドを含む、装置であって、
前記単離アミノ酸配列からなるペプチドの前記誘導体は、N-アシル化及び/又はC-アミド化若しくはC-エステル化、N-アルキル化、1つ以上のL-アミノ酸のD-アミノ酸への置換、1つ以上の高分子(例えば、ポリエチレングリコール(PEG)又はアルブミン)との複合化、及びCys残基でキャップされたN末端又はC末端からなる群より選択される少なくとも一種の修飾の点のみにおいて、前記単離アミノ酸配列と相違する、装置。 - 前記少なくとも1つの成分が、好ましくはLPS、LTA及びPGNからなる群より選択される、グラム-細菌及び/又はグラム+細菌の表面構造の化学成分である、請求項11に記載の装置。
- 水溶液から少なくとも1つの成分を除去する方法であって、
前記少なくとも1つの成分を含有する可能性がある水溶液を準備することと、
請求項11又は12に記載の装置に含まれる1つ以上の前記アミノ酸配列への前記少なくとも1つの成分の結合をもたらす条件下で、前記水溶液を前記装置に通して、前記水溶液から前記少なくとも1つの成分を除去することと、
を含む、方法。 - 前記少なくとも1つの成分が、好ましくはLPS、LTA及びPGNからなる群より選択される、グラム-細菌及び/又はグラム+細菌の表面構造の化学成分である、及び/又は前記水溶液が、哺乳類、好ましくはヒト、及び/又は非哺乳類等の動物に由来する体液、好ましくは血液、血漿、血清若しくは他の適切な血液画分である、請求項13に記載の方法。
- 前記方法が、哺乳類、好ましくはヒト、及び/又は非哺乳類等の動物に由来する体液、好ましくは血液、血漿、血清又は他の適切な血液画分から、LPS、LTA及び/又はPGN等のグラム-細菌及び/又はグラム+細菌の表面構造の少なくとも1つの化学成分の体外除去のためである、請求項13又は14に記載の方法。
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