JPH01266858A - キュベット - Google Patents

キュベット

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JPH01266858A
JPH01266858A JP63297168A JP29716888A JPH01266858A JP H01266858 A JPH01266858 A JP H01266858A JP 63297168 A JP63297168 A JP 63297168A JP 29716888 A JP29716888 A JP 29716888A JP H01266858 A JPH01266858 A JP H01266858A
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cuvette
chamber
liquid
strand
strands
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Ruisu Koronbusu Richiyaado
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Jeffrey L Helfer
ジェフリー・ローレンス・ヘルファー
Johannes J Porte
ジョハンズ・ジャコブス・ポート
Jeffrey A Wellman
ジェフリー・アレン・ウェルマン
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    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813Hybridisation assays
    • C12Q1/6834Enzymatic or biochemical coupling of nucleic acids to a solid phase
    • BPERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01JCHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J19/00Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
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    • B01L7/52Heating or cooling apparatus; Heat insulating devices with provision for submitting samples to a predetermined sequence of different temperatures, e.g. for treating nucleic acid samples
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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    • C12Q1/686Polymerase chain reaction [PCR]
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 (産業上の利用分野j 本発明は、中に含まれる准体内で反応を行なう(特にこ
れらの反応は注意深い温度調督、限られた量の試料、お
よび急速な液体温度変化を必要とするノキュペットに関
する。
(従来の技術プ 本発明は核酸拡張に使用するキーペットに限られるもの
ではないが、これに関連させて説明する。
核酸拡張Iト通常以下θン工程を経て進む(第1図参照
): IJDNAを拡張する場合、適当な制限酵素を使っ℃完
全なりNA2重らせんを任意に化学的に切り取り℃関心
のある部分を単離する。
2)単離した核酸部分(ここで)ま、DNAJおよびヌ
クレオチドの溶液を92〜95℃に加熱しそして、例え
ば約10分以内の間、この温度に保つて2つの核酸スト
ランドを変性させる(すなわち、これらのらせんをとき
1分離し、そして原型を形成する)。
3ノ 次に溶液を50〜60℃の帯域に通して冷却して
プライマー核酸ストランドをアニールする、すなわち2
つの原型ストランドのそれぞれにこれを結合させる。こ
れが確実に起こるようにするために、溶液を適当な温度
、例えば約55℃、で約15秒間、「培養」帯域に保つ
4ノ次に溶液を約70℃に加熱し、この副産に保っ℃、
存在するヌクレオチドを使い、拡張酵素好ましカス、マ
セルマス・アクアティカス(thermuS ’ aq
uat i CuS Jから単離したポリメラーゼのよ
うな熱に安定な酵素、で原型ストランドに結合したプラ
イマーストランドを拡張させる。
5)完成した新しい対のストランドを再び92〜95℃
に約10〜15秒間加熱し1:2 この対を分離する。
6ノ 次に適当な数のストランドが得られるまで工程3
J〜5ノを何回か繰り返す。(詳細は米国特許第4,6
83.202号参照。) 繰り返すほど、多数の核酸(
ここでは、DNAJが生成される。
希望の濃度の核酸が最少の時間に得られるのが好ましい
キーペットは通常、溶液が前記の温度段階を通過する間
溶液を保持するのに使われろ。キュベツトを速やかに様
々な段階に進めることができるがどうか(まキュベツト
のデザインによる。これをコントロールする鍵となるも
のはキーペットの熱伝達効率である−一すなわち、キュ
ベツト内の溶液全体へまた1ま溶液全体から熱を瞬時に
伝達するキュベツトの能力である。熱源またはシンクか
ら比較的離れている浴液部分は望ましい温度に達するの
により時間がかかるので、配置および溶液自体の熱抵抗
が熱伝達に影響を及ぼす主な要素である。
従来使用されてきた最も素朴で初期のタイプのキュベツ
トは試験管であり、これは、aツガラスまたはプラスチ
ックのキュベツトの壁が熱エネルギーをよく伝達しない
、およびb)円筒状の液体では液体すみずみへの熱伝達
が比較的不十分であるため熱伝導効率が不十分である。
すなわち、液体の熱伝導が低いばかりでな(、円筒状の
成体1マ表面対容積比(すなわち、約100μlの注入
に対して約27+ncある〕が小さい。
DNA拡張におげろ別の問題は1反応の児了後キュベツ
トから液体を簡単に取り出せるようにすることである。
試験管の形はそれが簡単にできる。
しかしながら、キュベツトをよりよい熱伝導効率のもの
に変えると、o、体の移動性が悪(なる。
液体の反応用の最近のキュベツトまた1ま容器についC
は1984年1月17日発行の米国特許第、1,426
,451号および1972年9月12日発行の米国特許
第3.691.017号に記載されている。前者では、
熱が液体を通るとき、液体を、急速な加熱が行なえる薄
いフィルム状に散布している他は、熱伝導効率を高める
試み゛はほとんどなされ℃いない。金属また1工熱伝導
性の高い材料でできたキュベツトについ℃は何も記載さ
れ℃いない。さらに、上部と下部の壁との間の間隔は1
25ミクロン以下であり強力な毛管効果をもたらすので
、そのようなキュベツトから液体を取り出すのは難しい
もつとも良い状態であっても5強力な毛管吸引力のため
全ての液体は取り出せない。
米国特許第3.691,017号のキュベツトの場合は
、DNA拡張により適した特徴を有する。たとえば、主
要面23と24との間隔が約5 ffJであることによ
って、全ての液体の取り出しがより簡単にでき、そのよ
うな大きな間隔では毛管吸引力はほとんど残っ℃−・な
い。さらに、金属層38Aがキュベツトの外側にとりつ
け℃あって加熱装置に接触している。しかしながら、こ
のキュベットハいくつかの理由で熱時定数が小さくない
。理由の1つは、確実に透明にするために表面23およ
び24が金属でできておらずむしろ絶縁体でできている
からである。その結果、装置の端の周りとキュベツトの
容積部分35のみに金属38Aを伸ばすことによって、
熱伝達路を長くすることが必要となる。この熱路長さは
主要面23および24となる壁の厚さよりはるかに大き
いので、これは0.51をはるかに越す値となる。実際
は、キュベツトの容積部分だけが金属熱エネルギー伝達
部材と直接接触している。
第2の理由は、さらに電装なことであり、後で詳しく述
べるがこの米国特許第3,691,017号のキュベツ
トはキュベツトの形状から、液体表面/容積比が小さ(
・ので熱抵抗が高いからである。
本発明の目的は、たとえばDNAの部分の複製化に使用
できる選択された液体が入っ℃いる場合の熱時定数によ
っ℃判定されるような、急速な熱伝達特性を有するキュ
ベツトを提供することである。
(発明の構成] 本発明の1つの態様によれば1本発明の目的は、すくな
くとも約35℃(たとえば約55〜約90’C)の温度
範囲をサイクルさせる液体成分の制御反応用の以下の熱
サイクルキュベツトによっ℃達成される。このキュベツ
トは2つの間隔をおいて離れた向かいあった壁によって
定められた少なくとも1つの液体を入れ℃お(室を有し
、側壁は前記の2つの向かいあった壁に接続しているも
のであっ℃、そして前記の向かいあった壁および前記の
側壁は、注入容量100〜200/ltに対し有効温度
調整面対容量比が約65〜約130in−1の室をもた
らす大きさであること、および少なくとも1つの前記の
向かいあった壁の熱路長さが約0、3 IIJ以下およ
び耐熱度が約0.01℃/フット以下であることを特徴
とするものである。
本発明の別の態様によれば1本発明の目的は。
液体成分の制御反応用の以下のキュベツトによっ℃達成
される。このキュベツトは反応を行なうための第1およ
び第2の液体を入れておく室を有し。
それぞれの室は2つの間隔をおいて離れた向かいあった
壁によって定められ℃おり、そして側壁は前記の2つの
向かいあった壁のそれぞれに接続しており、前記の各室
は液体を入れておく主要面を提供するものであっ℃、前
記の2つの室は、前記室の一方の主要面が他方の室の主
要面上に配置されるようになっ℃いることを特徴とし、
そのため前記主要面が共通面となる前記キュベントの長
さおよび/または幅が、同等のキュベツトと比へ℃小さ
くなるものである。
本発明のさらに別の態様によれば1本発明の目的は、切
り離した1ストランドの核酸とモル過剰のオリゴヌクレ
オチドブライマーとの混合物をプライマーを前記ストラ
ンドに結合させるのに有効な温度で処理し、この結合し
たブライマーおよびストランドを延長酵素の存在下で加
熱してプライマーを延長して補足ストランドを形成し、
この結合補足ストランドおよび前記核酸のストランドを
、これらを2つの原型ストランドに分離する温度で加熱
し、その後前記の各工程をこれらの原型ストランドに繰
り返して多数の拡張ストランドを生成することよりなる
核酸配列を拡張する方法において、さらに以下の各工程
: 選択したオリゴヌクレオチド配列に結合したヌクレオチ
ドの補足配列よりなる検知および捕捉プローブを前記混
合物に加える(前記プローブはさらに、反応して検知信
号を出すことのできる信号部分またはプローブに結合し
たストランドを固定化する捕捉部分のいずれか、または
両方を含んでいる)工程; 前記プローブを前記拡張ストランドと反応させてプロー
ブを拡張ストランドに結合する工程;結合したプローブ
およびストランドを曾む混合物を分離手段に移丁工程; そして、この混合物を、そのような捕捉部分とは結合す
るがそのような捕捉部分の無いストランドは通過させる
物質を含有するフィルターに通すことによって、捕捉プ
ローブを有するストランドをそのようなプローブの無い
ストランドから分離する工程 よりなる上記の方法によって達成される。
本発明は以後、好ましくは、DNAストランドの複製化
に特に有用な少なくとも35℃の範囲に渡る温度サイク
ルについて述べる。さらに、これは、その中で反応が行
なわれろキュベツトの加熱および冷却を繰り返し行なう
必要のある液体成分および試薬のどのような種類の反応
にも有用である。
「上」および「下」のような配置方向は、七のように使
用するのが好ましいキュベツトに関して用いる。
まず第2〜4図につい℃述べる。本発明によって作った
キエベヅト30は距離t1の間隔で離れた2つの向かい
あった壁34および36により℃定められた液体を入れ
る室32(第4図〕よりなる。そのような間隔は室32
の向かいありた端42および44で接合する側壁38お
よび40によっ℃得られる(第3図)。最も好ましいの
は。
側壁38および40の形が徐々にへこんでいく形のもの
であり、そのためこれらの壁は端42で約90°の角度
アルファにて分かれ、端42および44の中途の地点か
ら再び約90°の角度で1点に集まるように近づき始め
る。距離は(第4図月ま。
側壁38および40の形のありかたを考えた場合、液体
を取り除いたときキュベツトに留まる液体の量が最少と
なるような距離を選ぶ。すなわち1毛管状の間隔が液体
の除去を妨げることはよく知られていることである。従
って1間隔が接近している壁34および360間の液体
の厚さは毛管状の間隔ではないのが、すなわち間隔≧0
.5藷、最も好ましくは0.5〜2.5であるのが好ま
しい。さらに正確に?工、i体容器が特定の形に定めら
れている場合、容器が毛管吸引力のような悪影響を及ぼ
すファクターに対抗して容器を空にする能力)エキャピ
ラリーーナンバーCで表すことができる。その式1工C
=μ・V/rである。式中、μは粘度であり、水溶液の
場合これは約0.01ポアズである。
rは表面張力であり、水溶液の場合これ(1約70ダイ
ン/cmである。v1工速度(cm /秒〕であり。
空にする全容積を出口の通過面積で割りそして空にする
のに許容される時間で割ることによっ℃決定される。従
って、速度ファクターについ工熟考する必要がある。空
にする容積は200〜100μlである。許容時間は1
〜10秒である。従って、■は最高の200/A・1か
ら最低の100/A・10である。本発明の目的の場合
、Aは約5.2X10  cm 、出口の通過面積は6
0と仮定する。従って、■は約3.85〜38.5α/
秒である。
つまり、このキュペントのキャピラリー・ナンバ−は約
o、ooos〜約0006である。しかしながら、非毛
管状間隔だけかそのような速度で空にすることができる
ので、これに非毛管状間隔を組み込まなければならない
壁34および36は液体と接触する主要面となる。その
ため、厚さを間隔t1と考えた場合、それらの表面積を
、呈32の表面対容積比が高速度の熱エネルギー伝達に
最も適するように選択する。
非常に好ましい例は、6壁34および36の露出表面積
が2.4m (0,371n2)であり、0.36 c
m2の接触面積で側壁の面と接触している場合である。
したかって、表面対容積比が、注入容積200〜100
μjに対し、それぞれ約65−130in−1であるの
が最も好ましい。
液体表面積対容稍比がそのように大きいと、急速な熱エ
ネルギー伝達とは別の利点がもたらされる。これはまた
、一定の容積に対して、より広い表面積が塗布試薬に提
供されることを意味する。
このこと(ま、早すぎる混合、すなわち、液体を呈に圧
入する前の混合、を防ぐために表面上の離れた位置に塗
布しなげればならない試薬の場合、特に軍装なことであ
る。また、液体を入れると、これらの試薬はより効果的
に溶解される。
従って、任意に、1つ以上の試薬rV150を、1層以
上が、室32に挿入する液体試料との反応に加わるよう
にする形で壁36(第4図)の内面に塗布することがで
きる。従っ℃「試薬」とは、液体試料と物理的かつ化学
的に互いに作用し合う物質である。そのような試薬層は
噴霧乾燥によるような従来法で塗布することができる。
そのような試薬にはポリメラーゼ酵素、塩、緩衝剤およ
び安定剤がある。塗布層にはまた複製化に必要なプライ
マー・ベアーおよびジヌクレオチドも含まれる。
液体出入口60は端42に隣接する壁36に形成される
。この出入口は上部62および下部64を有し、上部を
室32に接続している。好ましくは、少なくとも上部6
2は円錐形であり、その傾斜は種々の円錐ピペットP(
第2図)が合うようになっ℃いる。
反対の端44には、米国特許第4.426.451号に
記載のように空気抜き70が設けろt′1.”Cいる。
最も好ましくは、空気抜き70は通路72vC延び(第
3図り、端42の隣接点に戻り、出入口6゜に隣接する
開ロア4で終わる。
単一の密封機構で出入口60および空気抜き開ロア4を
共にシールするには、高(した円筒状ボス80でこれら
を囲む。どのような密封機構(たとえば栓82.第10
図]もボス80に対して有用である。そり)ような栓に
は、ボスの雌ねじ(図示さね℃いない)に合う雄ねじ8
4があっ℃もよく、あるいはボス80内への押し込み式
にしてもよい。
最も好ましいのは、壁34以外の装置の壁を例えばポリ
カーボネートプラスチックのようなあまり湿潤性でない
材料から作ることである。
本発明の1つの態様では、壁36の反対側σ)壁34は
、熱エネルギー伝達が高速となる予め決めらねた熱路長
さおよび熱抵抗を有するように作る最も好ましいのは、
そのような路の長さ(第5図のt2Jが約0.3 am
以下であり、熱抵抗が約0.01℃/ワツト以下である
。このような性質は、厚さ約0.15mのアルミニウム
のような金属から壁34を作ることによって簡単に得ら
れる。そのようなアルミニウムは、厚さX・1/(熱伝
導率K・表面積AJとして計算して、約0.003℃/
ワットの熱抵抗を有する。(これらの(ILは、約0,
24℃の熱抵抗を有する同じ厚さの普通のガラスと対照
的である。ノ 壁34は側壁38および40にどのような適当な手段で
固定してもよい。そのような1つの手段は、例えば一般
的な高温硬化接着剤よりなるプライマーの層90(k5
図ノ、それに続(一般的なポリエステル接着剤の層92
である。場合によっては1層90および92は壁34の
表面領域−面に延ばす必要はない。というのは、このよ
うに−面に延ばすと壁34の熱抵抗が高まり、室内での
前述の反応が妨げられる場合があるからである。
他方、反応によっては存在する金属イオンが同じように
悪影響を及ぼすことがあり、このような反応の場合、接
着剤を壁340表面積全体に塗布する。
第2〜4図の上記のようなキュベツトでは、そこに含ま
れる液体の熱時定数タウ(τ)が約10秒以下となるこ
とがわかった。最も好ましいのは、τが3〜8秒のもの
である。すなわち、水を入れたそのようなキュベツトを
壁34の外側にそって加熱し、その温度をY点(第4図
)で測定すること、熱応答曲線が28℃〜最終温度10
3℃に生じる(第6図)。中の液体が76℃〔初期温度
280C,プラス差(103,9−28〕の63%〕と
なるのにかかる時間がタウのおおよその値である。
(おおよその)この値はよく知られた以下の熱応答式か
ら得られる: fi+  温度T(t)=最終温度子(初期温度−最終
温度)・e−t/T 従っ℃、式中の時間間隔tがタウに等しい場合、e’−
” = e−1::0.37となる。このような場合。
T(tJ’(t=タウでのハエ初期温度に(最終温度−
初期温度]の63%を加えたものに等しい温度である。
(第6図のデータの階段の形は記録計によるものである
。) 従って、上記キュベツトの液体のタウは約3.5秒であ
る(第6図の応答曲線が上の式fi+に従い、近似値に
十分に近ずけたと仮定する)。
層90および92の接着剤を壁34の表面全体に広げる
と、タウは7〜8秒にも増加する。
タウが約3.5秒の値では、同じキュベツトの熱応答曲
線が第1図の説明に従っ又加えられる条件下で予想され
る。第7図は大体におい′CX印の付いた第1図の最終
部分のみに対するそのような応答曲線であり、階段部分
「AJjXタウ3秒の場合のオープンまたは培養器温度
であり、曲線rBJは同様の場合の液体内容物の温度で
ある。(しかしながら、この実施例では、培養温度は5
5℃の代わりに37℃を選んだ。
比較実施例としての米国特許第3.691,017号に
記載のキュベツトは以下の性質を有する。その全体の厚
さは5/16”すなわち0.31”である(第8欄、4
2〜44行〕。液体が占めろスペースは51の厚さであ
る(第8欄、44行)。窓はlhn×μ″(45行)で
ある。そのため1平方インチの単位面積の液体の容積は
約0.197in3であると推測され、そしてキュベツ
トが接触しているその表[10積は約2.79 in2
であると推測される。このことから、精々僅か約14.
21n−1の表面/容積比となる。同じ容積の球は8.
3のS/V比であり、このキュベツトは最も悪そうな形
(球〕よりもS/■比が僅かに良いだけである。さらに
、発熱体は外部からキュベツトの中に延びたアルミニウ
ムのフォイルであり、従って熱路長さはIUをがなり超
える。これらのことから、そのようなキュベヴト内の水
の熱時定数タウは明らかに10秒よりかなり犬であるこ
とが分かる。キュベツトを接着剤を使って取り付ける必
要はない。接着剤を使わない具体例を第8図に示す。こ
こでは、前記具体例で使用されたものと類似の部品に(
ま文字「a」を添えた参照番号を付けている。従って、
キュペラ)30aは側壁(,40aのみを図示)と共に
室32aを定める2つの向かい合った壁34aおよび3
5aよりなる。液体出入口60aおよび空気抜き70a
も前記具体例と同様に設けられており、壁34aは前記
と同じ性質を持つ。しかしなから、この具体例では壁3
4aと側壁40aとの間のどこにも接着剤を使用し′″
C(・ない。そのかわりに、室32aの周りの端金部に
エラストマーのガスケットシール100または他の適当
な7jスケツト材が壁34aと側壁との間にある。さら
に、プラスチックは0のバンプが側壁から側壁34a(
7)適当な開口を通って延びている。そこでバンプは0
を熱または圧力によってアプセットして壁34aを適所
にびょう締めする。任意に、ガスケットシール100を
そのようなバンプの周りに延ばしてもよい。出入口およ
び空気抜きを封じ、キュベツトを加熱すると、室32お
よび32a内で圧力が高まる。従って、反応容器壁34
と培養器との間の緊密な接触を保つために、熱伝導性を
以外のキュベツトの1部が変形して圧力の増加に適応す
るのが好ましい。さらに、別の壁が変形すると熱伝導性
壁を適所に保持するシール上の歪みが減少する。
そのような具体例は、 He1f’er等の「非屈曲回
熱伝導性壁を有するキーベット」と題する1987年は
月23日付けの共有所有の出願番号第123.752号
に記載のような第9図のものである。
前記のものと類似の部品には文字+1)Jを添えた参照
番号が付いている。
従って、キュベツト3obtz側壁40b(1つのみ図
示)と共に1間隔t1を有する室32bを定める向かい
合った壁34bおよび36bからなる。これらおよび出
入口60bおよび空気抜き70bは前記具体例における
と同様に作られている。しかしながら、ga4bが加圧
下で確実に変形しないようにするために、壁36tI壁
34bより小さい曲げ強さを有するように作られ℃いる
詳しくは、以下のようにするのか好ましい:壁34bが
厚さ約0.15ffJのアルミニウムからなる場合、曲
げ中心でのその曲げ強さKは以下のようにして判定され
る: 撓みXはよ(知らjた以下の式で判定される:(2) 
X=乙P己2 / E t3 〔式中、P−今加荷重、Eニブレートの弾性率、t=ニ
ブレート厚さ、そし′Caは実験係数(通常約0.01
5である〕〕 整理し直すと、 (31P / X = Et3/αa2P/XはKに等
しいF/Xに類似しているので。
(41K=Et3/α7!L2 このことがらKHz約6.はX106ダイン/ myx
と計算できる。これよりも曲げ強さが小さい壁36bの
場合は、同様に計算して約8.3XlOダイン/Uの曲
げ強さを持つ約0.3 yの厚さ(アルミニウムのga
4bの2倍の厚さt3Jのポリエチレンまた’+Sポリ
プロピレンの層よりもっばらなる必要がある。そのよう
な構造では、室32b内に圧が生じるにつれて、壁36
1)は上にドーム状にふ(らみ、壁34bを発熱体に対
して平らな状態にしておく(rEJとして疑似模型で示
す〕。使用の際、上記のキュベツトを44(第3図Jの
ところあたりまで満たす。これ警工反応のための好まし
い試料を含む液体1例えば拡張を行な5DNA配列の溶
液、で約90%満たてことになる。次にこの装置を適当
な培養器に入れ1反応に必要な段階をサイクルさせる。
本発明の別の態様では、可動バルブを配置してキュベン
ト内の室への入り口を選択的に開閉する。
前に記載したものと類似の部品には、識別文字FC」を
添えた同じ参照査号を付けた。
従って、第は〜14図において、室32Cの端42C,
は高くしたボス80C内に互いに隣接しC@り付けられ
た液体出入口600および空気抜き通路72Cを有する
(第は図〕。上部620は前の具体例と同様に円錐形で
あり、ピベウトPと合わせられる(第12図)。
しかしながら、この具体例では、円錐形のかみ合い開口
122内に取り付けた回転可能部120よりなるバルブ
が設けられ℃いる(第12図)。
回転可能m 120は円錐形の外表面123を有する。
バルブは、好ましくは一ロ60C内に同中心的に配置さ
れた1回転軸を有する。ハンドル126によってバルブ
を手動または自動回転させる。出入口60Cならびに空
気抜きロア40’t’L可動バルブ部120内に取り付
ける(第はおよび13図)。
開口60Gおよび開ロア4Cを室320に選択的に接続
するには、回転部120に2つの路を作る。路130は
開口60Cから外表面123に延び(第12図)、そこ
でその表面の角度シータに開く(第は図)。路132は
開ロア4Cから面123上の出口134に延びる(第1
4図」。第320および通路72Cにそれぞれ関連する
路130および132の高さは、回転部120が第13
図に示す位置に回転すると、路か室または通路に通じる
ようになっている。さらに必要ならば、路130に生じ
た出入口の角度シータにより、部分120を出入口60
Cのみが室32Gに通じる位置(図示せず)に回転させ
ることもできる。
テール部分140は回転可能部120を適所に垂直に保
持し、溝144に掛かる(第12図)。
出入口および空気抜きバルブは回転するようにする必要
はない。移動可能なバルブも有用である。
前に記載したものと類似の部品には、識別のために「d
」を添えた同じ参照番号を付けた。従って、第15図で
は、出入口60dおよび空気抜きロア4dの両方を組み
込むようにパルプ部120dが端42d配置されている
。しかしながら、前の具体例とは異なり1部分120d
は垂直に移動可能なように取り付けられ℃おり、テール
部分140dは回転しない溝144dに垂直に掛かっ℃
いる。
通常、スプリング150は、高くして路130(1およ
び134dが室32dおよび空気抜き通路72dに対し
てそれぞれ一直線にならないように5部分120dにか
たよらせる。こうすることによって、至32dj’工外
の環境から遮断される。室に入れるには、使用者は、例
えば出入口60dにピペットPを合わせ、スプリングを
押すことによつ℃、部分120dを下に押し下げるだけ
でよい。
この具体例では、空気抜きロア4dは外表面123dに
形成した溝であり、これによつは部分120dを、室3
2dが出入口60dとも通じるのに十分な距離押し下げ
ると、通路72dのガス抜きができるようになっている
ある反応では、第1室での適当な滞留時間の後液体を第
2室に移動するのが好ましい。例えば、DNAプローブ
試験では、DNAプローブを拡張する目標配列に結合す
る単一の新しい熱サイクルを加える必要がある。上記の
DNA拡張温度サイクルに絖い−C,DNAを有する液
体培地を拡張する目標配列に特定なりNAプローブと接
触させる。
そのようなプローブは反応容器の壁土に、さらに詳しく
は、第16〜17図に示すような第2のDNAプローブ
の入った室の壁に塗布してもよい。
前に記載したものと類似の部品には、識別のために「e
」を添えた同じ参照番号を付けた。
従って、キュベツト30eは2つの向かい合った壁34
eおよび36eの間に配置された室32eよりなり(第
17図〕、主要面および側壁38eおよび40eを有し
く第16図ノ、これら(ま全℃前記具体例と大体類似し
ており、そして出入口60e、空気抜き70eおよび空
気抜きロア4eがある。しかしながら、前記具体例と異
なり、金属壁34eが室326の下ではなく上にあり(
第17図〕、そのため熱はキュベツト30eの上から下
方へ供給される。(図示されていないフィルター膜を7
01Bに任意においてもよい。) 壁34eおよび36
8のこの配置は、室32eの下に配置された第2室16
0が設けられているためである。すなわち、各2室は、
液体を収納する主要面を有し、そして主要表面部の背中
合わせの壁が一般に平らでありかつそれぞれに共通面で
あるため、好ましくは一般に平らな形状をしている。従
っ℃。
室328の主要収納面1工室160の主要収納面の上に
配置され℃いる。
第17図で明らかなように、m160は実際1ま壁36
eである背中合わせの主要表面壁を有する。
反対側の壁164は、壁346と実質的に同じように作
られ℃おり、熱エネルギー伝達する壁である。側壁16
6および168(第16図)は、室160が室32ei
に対して約45°回転している他は、室32e)の場合
と同様に室160を形づくり。
そのため下記のその空気抜きは出入口60eの下部64
8とぶつからない。
空気抜きおよび通路170を室160に取り付げる(第
16図)。前記具体例の空気抜きの空気抜き通路と同様
に作る。あるいは、図示していな  −いが、第16図
に示すようにu32eを通して回収することなく、室1
60から液体を直接取り出せるように空気抜きロア4e
を作っ℃もよい。
使用の際、空気圧を出入口を通して室32eに注入する
かまたは例えば任意にキュベヴト内の後続の反応用の試
薬を含む溶液を注入することによっ℃、あるいは室16
0を真空にすることによって、室326内の液体を第1
7図の矢印のように室160へ流す。
あるいは、2つの室を、45°食い違わせないで、正確
にならべて側壁を互いに重ねてもよい。この具体例は第
18図に示してある。前に記載のものと類似の部品は識
別文字rfJを添えた同じ参照番号を付けた。
従って、キュペyト30fは、熱伝達壁ではない共通壁
36fを共有する上および下の室32f゛および160
fからなる。空気抜き70fは液体を室32fから16
ofへ供給し、壁34fおよび164fk−1必要とさ
れる急速な熱エネルギー伝達を行なう。しかしながら、
前記具体例とは異な’)、 fll[tCCa22 f
)4 Of、N’i室160 fノ側壁(壁166fJ
と並列している。これは、液体を室32fに納める主要
面内に出入口60fがすっかり入るように、ボス80f
を90°回転させることによっ℃可能である。そのよう
なキュベツトでは、空気抜き170fおよびその開ロア
4fは液体を室160f内に納める主要面内に取り付け
る。
第16〜18図の2つの各具体例では、液体を納める2
つの主要面が共通面であるならば、キュベツトの長さま
たは幅は第2図のキュベツトのそれ以上にはならないと
いう利点が得られる。2つの室を垂直に積み重ねて3次
元の流れにすることかできるため、垂直の厚さが少し増
えるだけである。
さらに別の有用な形は第20および21図に示すもので
あり、ここでは液体を納める第3の室が前記の第2の室
に通じ℃おり、液体透過性膜が第3室を第2室から隔離
および分離している。前に記載したものと類似の部品に
は、識別のために「g」を添えた同じ参照番号を付けた
従って、キュベツト30g1!、、向かい合った壁34
gおよび36g(この壁34gは金属性であろJ1側壁
38gおよび40g(第21図]そして出入口60gを
有する第1室32gよりなる。
室32gは5第16図の具体例におけるように、通路ま
たは空気抜き70gを経℃、室32gが占める構造の主
要面に並行な栴造主要面に配置された第2室160gに
つながる。しかしながら、この具体例では、室160g
は室32gの下ではなく上にある。室160gは向かい
合った壁162gおよび136によっ℃一部定められ℃
おり、壁136は第9図の具体例の壁36bの場合のよ
うに好ましくはびょう締めさねた、好ましくは透明な壁
である。壁136も引掻きかう壁136の外面を保護す
るために表面137の下σ)凹所にはめ込むのが好まし
い。室160gも、室160gに面している上面302
を有する液体透過性膜300によって定められている。
膜の下の面304は室160gとは反対向きになっ℃い
る。この膜に有用な材料にはキャストした、織った。ま
たは電子光学的に機械加工した微細濾過膜がある。側壁
166gおよび168g(第21図)により室が完成す
る。
第3呈310は膜300を経℃室160gにつながっ℃
おり、そのため室31旧工膜によっ℃他の2つの室と隔
離および分離されている。好ましくは、室310は壁3
6gと162gとの間に取り付けられたブロック内に形
成さt1℃おり(第20図)、そのため室160g、3
10および32gの3室は垂直に下方へ順に積み重なっ
℃いる。空気抜き通路170gは、前記具体例のように
、室310からボス80g内に取り付けられた空気抜き
ロア4gへつながる。さらに、一般に通路170gの上
の位置に、空気透過性ではあるが液体不透過性の栓を持
つ空気抜き(図示せず)が室160gからボスsogへ
延び℃いる。
最も好ましいのは、室を満たし、好ましくは膜300の
下面304に接するように液体吸収性材料320を室3
10内に配置ものである。
キュペラ)30gは、キュベツト内で拡張した特定の核
酸配列1例えばDNAのそれ、を捕捉し、識別するのに
使用するのが好ましい。このためには1面302にDN
Aストランドに結合しうろ蛋白質物質を捕らえる手段が
あるのが好ましい。そのような捕捉蛋白負は一般的なも
0)であり、選択したDNA配列に結合するヌクレオチ
ドの補足配列よりなるものであり、配列は膜に結合する
適轟な手段で付く。例えば、一般的に行なわれ℃いろよ
うに、そのような結合手段は一対のアビジンおよびビオ
チンのうちの1つでよい。一対の他方は面302に結合
させる。
キュペラ)30gの使用法は以上のことから明らかであ
ろう。概して以下の通りである:室32gは、予めつ(
ら4た、DNA拡張に8装な試薬のほとんどまたは全部
を含む。DNA含有液体はビペヅ)Pによって注入して
室32gを部分的にのみ満た丁。蓋Cは回して締めるか
あろい警工他の方法で取り付ける。変性、培養および複
製化は他の具体例と同様に進める。その後、ピペットを
再び使って室32gへ上記の捕捉プローブおよび検知プ
ローブも注入する。そのような検知プローブも従来のも
のであり、蛋白質および補足ヌクレオチドからなり、こ
れは捕捉プローブが付く端と(速成対の端の選択された
DNAストランドに付く。検知プローブにはまた。ロイ
コ染料と反応して検知信号(例えば色の変化〕を生じる
ことができる適当な信号発生部分、例えば西洋わさびペ
ルオキシダーゼ、が含まれる。2つの異なるプローブを
反対の3′および5′末端に付ける方法は公知である。
例えば、「核酸仙究」の第15巻、p5305(198
7)の1チオールの特定プローブを合成オリゴデオキシ
リボヌクレオチドの3′末端に付ける効果的な方法」で
は、3′末端に付けろ有用な方法が論じられ℃いる。5
′末端へ付けることを論じ℃いる文献は多数あり、以下
はその代表にすぎな(:「分析生化学」の第164巻、
p336(1987〕の「5末端官能基の導入」。3′
または5′末端のいずれかが2つのプローブのうちの1
つを付けるのに使われ、他の末端が2つのプローブのう
ちの他方をつげるのに使われることは明らかであろう。
あるいは、検知プローブおよび固定化プローブが前記「
分析生化学」の教示する方法を使つ℃正に5′末端に付
は得るものである。
両方のプローブ並びに拡張DNAを入れたキコペットを
撹拌して混合を促す。
その後、2つのプローブをDNAの別のストランドに付
けろために第1図に示すサイクル部分「x」を繰り返す
この工程の後、まだ室32 gKある液体を通路79g
を経て室160gに押し上げろ。この押し出しはピペッ
トによりさらに液体または空気を注入することによっで
あるいtエガス抜きロア4gで真空にすることによって
達成される。液体な使う場合、中性溶液(活性成分を含
まない)な使用する。液体は、好ましくはガス抜きロア
4gを蓋Cで閉じることにより、室160g内で培養す
る。
その後、液体全部を膜300を通って吸収H320中に
引く。これを工、さらに注入されろ空気のパルスにより
、あるいは74gから部分真空にすることによっ″CC
a2O3通る液体の自然な流れを促すことにより、ある
いは吸収剤H料320の毛管吸引力により行なわれる。
この時点で、捕捉および検知プローブ2ユ、サイクルの
X$の反仮部の結果とし一’CDNAストランドに結合
し、捕捉プローブは膜の而302によって捕らえられろ
捕捉プローブのないDNAストランド1お膜300を通
り材料320によっ℃吸収されろ。
最終段階は室32gおよび160gに注入することであ
り、液体は1面302上に捕捉されたDN Aストラン
ドから突き出℃いる検知プローブと反応しうるロイコ染
料また1工他の物負を含有している。有用なロイコ染料
には米国特許第4.089.747号に示されているも
のがあり、好ましくはポリ(ビニルピロリドンノのよ5
なザ定化ポリマーと組合せる。この染料の好ましい例は
2−(4−ヒドロキシ−3,5−ジメトキシフェニルJ
−4,5−ビス(4−メトキシフェニルノイミダゾール
である。と(・うの1工、この化合物は西洋わさびベル
オキシダー91モル当たり約1000の染料分子を提供
するからである。
これとは別に、やはり従来から使われて(・る、ビーズ
に結合した捕捉プローブを使用してもよい。
ビーズは膜300の細孔を通過しない程の大きさの直径
を持つビーズを選ぶ。
本発明のキュベツトを望ましい加熱および冷却段階にサ
イクルさせるどのような適当な培養器も有用である。培
養器が第1図に示″f温度をサイクルする段階を提供す
ることが最も好ましい。これを行なう従来の培養器20
 (Njk 19図に示すステーションを有するもので
ある。予備培養ステーション202は温度を約95℃に
定める加熱手段を有する。ここから、キュベツトを従来
の押し出し手段で一定温度のステーションのリング21
0上に押し出す。その最初のステーション212は55
℃に保たれ℃いる。このステーションからキュベツトを
ステーション214に動かし、ここで70’Cに加熱す
イ)1.この温度にある時間保つ。従っ”Cbステーシ
ョン216もその温度である。次に、95℃に保たれ℃
いる短時間変性ステーシコン218で新しく複製化した
D N Aを変性する。
ステーション220〜234はステーション212〜2
18でfでに行なわねたサイクルをさらに2回嫁り返″
f′j、うけである。
ステーション234の後、拡張かすべて終了したら、従
来の移動装置(囚示せず)でキュペットをリング210
から次の工程に移−f。(If、体のキュベツトへの注
入および液体のそこからの取り出しYまラインから離t
1′v:、すなわち、培養器200の外1則、で行なわ
才1ろ。)さらに拡張が必要なら。
特定のキュペクトを培養器内でさらにサイクルさせる。
(発明の効果) 本発明のη°益な技術的効果は、キーベットおよびそσ
:+p2i、体内容物へσ〕また(工それらからの熱エ
ネルギーの伝達を急速に行なって、希望する反応に必要
な多数の温度変化を液体に加える、二とができることで
ある。その結果、サイクルを必要な回数繰り返すことか
これまでよりも短時間で可能である。
本発明に関する有益な技術的効果1工、加熱と冷却を何
回も繰り返す必要のある多段階サイクルによるDNAス
トランドの急速熱処理を行なうことのできるキュベツト
を提供することである。
本発明に関する別の有益な技術的効果は、そのようなキ
ュベツトおよびその液体の熱時定数か小さ(、液体を加
熱または冷却−fる遅れか全くなし・ことである。
本発明の別の有益な技術的効果は、そのようなキュベツ
トではまた1反応か終われば、全部の液体内容物を比較
的容易にとりだすことができることである。
本発明のさらに別の有益な技術的効果は、そのようなキ
ュベツトが最小の長さと幅を持つ2つの室を有すること
である。
【図面の簡単な説明】
第1図は、DNAの複製化を行なうキュベツトの一般的
な温度変化をプロットしたグラフである。 第2図は、本発明も・二より製造したキュベツトの等角
投影図である。 第3図は、第2図のキュベツトの平面図である。 第4図は、第3図のラインIV −IV K添った断面
図である。 第5図は、第4図のIVJとあるキ、ベットの囲んだ部
分の拡大断面図である。 第6図は5そのようなキュベツトθ〕熱時定数を得るだ
めのキュベツトの実際の時間−温度応答のプロットであ
る。 第7図は、第6図に照らして、そのようなキュベツトが
有するでりろ5加熱応答曲線のプロントである。 第8および9図(ま、第4図と同様な断面図であるが、
2つの異なる具体例を示Tものである。 第10図)土、第4図と同様な断片的な断面図であり、
ピペットおよびシールのキュベツトとの相互関係を示す
ものである。 第は図は、特にバルブ機構の、別の具体例の断片的な平
面図である。 第12図(′i、第1第はコσイン■−Xllに添った
断面図である。 第13図は、第は図と同様な断片的な平面図であるが、
バルブか約45℃回転しているものである。 第14図は、第12図と同様な断面図であるが。 パルプが第13図のように回転したものであり。 第13図σ)ラインXIV−匁■ に添っ1得たもθ〕
である。 第15図は、第12図と同様な断面図であるか、また別
の具体例である。 第16図は1本発明の部分的に取り壊した別の具体例の
平面図である。 第17図は、第16図のラインXVII−XνIIに添
った断面図である。 第18図は、第17図と同様な断面図であるが、また別
の具体例を説明するものである。 第19図は、キュベツトをDNA処理温度にサイクルさ
せるのに有用な培養装置の略図である。 第20図1耘 また別の具体例の第17図と+=J I
な断面図である。 第21図は、第20図のラインXXI −XX1 K添
った断面図である。 図中、数字は次の意味を持つ: 30.30a 、30b 、308.3Of、30g−
# :Lベヴト、  32.32a、32b、320.
32(1,32e、32f、32g−・・室。 34.34a、34b、348またj’j−164゜3
4fまたは164f、34g・・・間隔をおいて離れた
2つの向かい合った壁のうちの1つ、および熱伝導性の
壁、   36.36a、36b、36e!。 36f、36g・・°間隔をおい℃離れた向かい合った
もう一方の壁、   160.16Of、160g・・
・32e1.32f、および32gと共に一対の室を形
成する第2の室、  200・・・本発明のキュベツト
と共に使う培養器、  300・・・核酸配列を拡(外
4名〕 図面の浄書(内容に変更なし) FIG、I FIG、 2 .40 rf”cl 藺 闇 (祢ン FfG、7 FIG、 18 FIG、 13 FIG、 17 FIG、 19

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、少なくとも約35℃の温度範囲をサイクルさせる液
    体成分の制御反応用の熱サイクルキュベットにおいて、
    前記キュベットは2つの間隔をおいて離れた向かいあっ
    た壁によって定められた少なくとも1つの液体を入れる
    室を有し、側壁は前記の2つの向かいあった壁に接続し
    ているものであり、 前記の向かいあった壁および前記の側壁は、注入容量1
    00〜200μlに対し有効温度調整面対容量比が約6
    5〜約130in^−^1の室をもたらす大きさである
    こと、 および前記の向かいあった壁の少なくとも1つの熱路長
    さが約0.3mm以下および熱抵抗が約0.01℃/ワ
    ット以下であること を特徴とする上記のキュベット。 2、液体成分の制御反応用キュベットにおいて、前記キ
    ュベットは反応を行なうための第1および第2の液体を
    入れる室を有し、それぞれの室は2つの間隔をおいて離
    れた向かいあった壁によって定められており、そして側
    壁は前記の2つの向かいあった壁のそれぞれに接続して
    おり、前記の各室は液体を入れておく主要面を提供する
    ものであって、 前記の2つ室は、前記室の一方の主要面が他方の室の主
    要面上に配置されるようになつていることを特徴とし、 そのため前記主要面が共通面となる前記キュベットの長
    さおよび/または幅が、同等のキュベットと比べて小さ
    くなる、前記のキュベット。 3、1ストランドの核酸とモル過剰のオリゴヌクレオチ
    ドプライマーとの混合物をプライマーを前記ストランド
    に結合させるのに有効な温度で処理し、この結合したプ
    ライマーおよびストランドを延長酵素の存在下で加熱し
    てプライマーを延長して補足ストランドを形成し、この
    結合補足ストランドおよび前記核酸のストランドを、こ
    れらを2つの原型ストランドに分離する温度で加熱し、
    その波前記の各工程をこれらの原型ストランドに繰り返
    して多数の拡張ストランドを生成することよりなる核酸
    配列を拡張する方法において、さらに以下の各工程; 選択したオリゴヌクレオチド配列に結合したヌクレオチ
    ドの補足配列よりなる検知および捕捉プローブを前記混
    合物に加える(これらのプローブはさらに、反応して検
    知信号を出すことのできる信号部分またはプローブに結
    合したストランドを固定化する捕捉部分のいずれか、ま
    たは両方を含んでいる)工程; 前記プローブを前記拡張ストランドと反応させてプロー
    ブを拡張ストランドに結合させる工程;結合したプロー
    ブおよびストランドを含む混合物を分離手段に移す工程
    ; そして、この混合物を、そのような捕捉部分とは結合す
    るがそのような捕捉部分の無いストランドは通過させる
    物質を含有するフィルターに通すことによって、捕捉プ
    ローブを有するストランドをそのようなプローブの無い
    ストランドから分離する工程 よりなる上記の方法。
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