JPH01277490A - プライマーdna - Google Patents
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
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Description
【発明の詳細な説明】
(産業上の利用分野)
本発明は、遺伝子のクローニングに有効に使用できるプ
ライマーDNAに関するものである。
ライマーDNAに関するものである。
(従来の技術および発明が解決しようとする問題点)
現在、生物活性を有する蛋白質の遺伝子をクローニング
する方法が種々提案されている。
する方法が種々提案されている。
例えば、目的とする蛋白質が精製されている時は、その
蛋白質の一部のアミノ酸配列を決定し、そのアミノ酸配
列に相当するオリゴヌクレオチドを合成し、そのオリゴ
ヌクレオチドとハイブリダイズするクローンをcDNA
ライブラリーから選択する方法が知られている。
蛋白質の一部のアミノ酸配列を決定し、そのアミノ酸配
列に相当するオリゴヌクレオチドを合成し、そのオリゴ
ヌクレオチドとハイブリダイズするクローンをcDNA
ライブラリーから選択する方法が知られている。
一方、目的とする蛋白質が精製の困難なものである時は
、その蛋白質のmRNAを分離してcDNAライブラリ
ーを作製し、そのcDNAライブラリーを用いてmRN
Aをバイブリド形成法で選択し、さらに翻訳したものの
活性を測定することを繰返して単一のcDNAを分離す
る方法が知られている。
、その蛋白質のmRNAを分離してcDNAライブラリ
ーを作製し、そのcDNAライブラリーを用いてmRN
Aをバイブリド形成法で選択し、さらに翻訳したものの
活性を測定することを繰返して単一のcDNAを分離す
る方法が知られている。
しかしながら、後者の方法では、少なくとも数百μgの
mRNAを必要とするため、少量の、例えば数μgのm
RNAからでもcDNAをクローニングできる方法の開
発が望まれていた。
mRNAを必要とするため、少量の、例えば数μgのm
RNAからでもcDNAをクローニングできる方法の開
発が望まれていた。
かかる方法として、目的とする蛋白質のmRNAをポリ
リンカーの上流にdT鎖を有するpcDV1−PLプラ
イマーDNAにハイブリダイズして、cDNAを合成し
、それをSPプロモーターを有するヘククーに組込み、
宿主を形質転換して目的蛋白質のcDNAをクローニン
グする方法が提案されている(特開昭62’−7429
1号公報)。
リンカーの上流にdT鎖を有するpcDV1−PLプラ
イマーDNAにハイブリダイズして、cDNAを合成し
、それをSPプロモーターを有するヘククーに組込み、
宿主を形質転換して目的蛋白質のcDNAをクローニン
グする方法が提案されている(特開昭62’−7429
1号公報)。
しかし、」二連の様にプライマーDNAを使用して少量
のmRNAから目的とする蛋白質のc D N Aをク
ローニングする方法において使用し得るプライマーDN
Aの種類は未だ少ないのが現状であった。
のmRNAから目的とする蛋白質のc D N Aをク
ローニングする方法において使用し得るプライマーDN
Aの種類は未だ少ないのが現状であった。
(問題点を解決するための手段)
そこで本発明者は、かかる方法において有利に使用し得
る新規なプライマーDNAを提供すべく検討を重ねた結
果、特定のプラスミドpUC19に着目し、その特定の
断片を更に修飾したものが、プライマーDNAとして有
利に使用し得ることを知得し、本発明を完成するに至っ
た。
る新規なプライマーDNAを提供すべく検討を重ねた結
果、特定のプラスミドpUC19に着目し、その特定の
断片を更に修飾したものが、プライマーDNAとして有
利に使用し得ることを知得し、本発明を完成するに至っ
た。
即ち、本発明の要旨は、プラスミドpUC19由来の制
限酵素Saβ■切断部位を含む制限酵素PstI−Pv
ulI切断断片から得られるプライマーDNAであって
、該制限酵素、巴牡I切断部位の3′−末端にポリ (
dT)が付加され、且つ該制限酵素5anl切断部位に
下記塩基配列で示されるDNA断片が挿入されているこ
とを特徴とするプライマーDNAに存する。
限酵素Saβ■切断部位を含む制限酵素PstI−Pv
ulI切断断片から得られるプライマーDNAであって
、該制限酵素、巴牡I切断部位の3′−末端にポリ (
dT)が付加され、且つ該制限酵素5anl切断部位に
下記塩基配列で示されるDNA断片が挿入されているこ
とを特徴とするプライマーDNAに存する。
5 ’ −TCGAGCGGCCGCCATGGC
CTCGAG−3’3 ’ −CGCCGGCGGTA
CCGGAGCTCAGCT−5’以下本発明を説明す
るに、本発明で使用するプラスミドpUC19は容易に
入手し得る公知のプラスミド(例えば、Gene、33
,103−119 (1985)、rTOYOBo
1988/89遺伝子工学研究用試薬総合カタログ」東
洋紡績社製)である。
CTCGAG−3’3 ’ −CGCCGGCGGTA
CCGGAGCTCAGCT−5’以下本発明を説明す
るに、本発明で使用するプラスミドpUC19は容易に
入手し得る公知のプラスミド(例えば、Gene、33
,103−119 (1985)、rTOYOBo
1988/89遺伝子工学研究用試薬総合カタログ」東
洋紡績社製)である。
本発明のプライマーDNAは例えば、次の様な方法によ
り得ることができる。即ち、まず、プラスミドpUC1
9を制限酵素SaβIで切断し、該切断部位(1ケ所)
に別途化学合成した下記塩基配列のDNA断片を挿入し
、2重鎮の環状プラスミドに修復する。このDNA断片
は下記に示す通り制限酵素Notl、Sf il、Nc
oI及びXholの切断部位を右′tス 川I 次いで、上記DNA断片を導入された環状プラスミドを
制限酵素PstIで切断(切断個所1ケ所)し、Pst
I切断部位の3′−末端に常法に従いターミナルトラン
スフェラーゼでポリ (dT)を付加する。ボ’J(d
T)は、通常60〜80塩基程度とする。
り得ることができる。即ち、まず、プラスミドpUC1
9を制限酵素SaβIで切断し、該切断部位(1ケ所)
に別途化学合成した下記塩基配列のDNA断片を挿入し
、2重鎮の環状プラスミドに修復する。このDNA断片
は下記に示す通り制限酵素Notl、Sf il、Nc
oI及びXholの切断部位を右′tス 川I 次いで、上記DNA断片を導入された環状プラスミドを
制限酵素PstIで切断(切断個所1ケ所)し、Pst
I切断部位の3′−末端に常法に従いターミナルトラン
スフェラーゼでポリ (dT)を付加する。ボ’J(d
T)は、通常60〜80塩基程度とする。
次いで、制限酵素PvuIIで切断し、約135bp(
ポリ (dT)を除いたDNA断片の大きさ)のDNA
断片を得ることによって、本発明のプライマーDNAを
得ることができる。
ポリ (dT)を除いたDNA断片の大きさ)のDNA
断片を得ることによって、本発明のプライマーDNAを
得ることができる。
本発明のプライマーDNAは、第1図にその概略を示す
ようにプラスミドpUC19のAacZ遺伝子に由来す
るDNA配列を有し、その上流に、前記合成りNA断片
による制限酵素Notl、5fiI、NC0I及びXh
olの切断部位の外に、プラスミドpUC19に由来す
る制限酵素■旦■、SaflXXbalXBamHI。
ようにプラスミドpUC19のAacZ遺伝子に由来す
るDNA配列を有し、その上流に、前記合成りNA断片
による制限酵素Notl、5fiI、NC0I及びXh
olの切断部位の外に、プラスミドpUC19に由来す
る制限酵素■旦■、SaflXXbalXBamHI。
S m a I 、 x1且1 、、S a c I及
びEcoRIの切断部位を含むポリリンカーを有する。
びEcoRIの切断部位を含むポリリンカーを有する。
そしてPstI切断部位の3′−末端にポリ (dT)
を有する。
を有する。
以下に、本発明のプライマーDNAを使用して遺伝子を
クローニングする方法の1例を説明する。
クローニングする方法の1例を説明する。
(第1段階)本発明のプライマーDNAと、目的物質を
産生ずる細胞から常法にてポリA″RNAを分離し、蔗
糖密度勾配法等により得られる目的物質のmRNAを含
むmRNA群とをハイブリダイズさせ、逆転写酵素及び
DNAポリメラーゼ■ ゛を用い、常法に従
って二本鎖cDNAを合成する。
産生ずる細胞から常法にてポリA″RNAを分離し、蔗
糖密度勾配法等により得られる目的物質のmRNAを含
むmRNA群とをハイブリダイズさせ、逆転写酵素及び
DNAポリメラーゼ■ ゛を用い、常法に従
って二本鎖cDNAを合成する。
(第2段階)次いで、EcoRIメチラーゼ処理してこ
のcDNA鎖をEcoRIによる切断から保護した後、
cDNA鎖の両末端にEcoRIリンカ−を付加する。
のcDNA鎖をEcoRIによる切断から保護した後、
cDNA鎖の両末端にEcoRIリンカ−を付加する。
(第3段階)上記のcDNAをSP6プロモーターを有
するλgtlo等のλファージベクターのSP6プロモ
ーターの下流にあるEcoRI切断部位に挿入して組換
えファージDNA群を得る。
するλgtlo等のλファージベクターのSP6プロモ
ーターの下流にあるEcoRI切断部位に挿入して組換
えファージDNA群を得る。
SP6プロモーターを有するλgtloは次の様にして
得ることができる。即ち、例えばプラスミドpGEM2
(プロメガ・バイオチック社製)のようなSP6プ
ロモーターを有する公知のプラスミドから、常法により
適当な制限酵素、例えば13amHIを用いてSP6プ
ロモーターを含むDNA断片を分離する。一方、公知の
λフアージベクター、例えばλgtlODNA中に5つ
ある制限酵素B a m HI認識切断部位を公知のB
amHIメチラーセにより制限酵素BamHIによる切
断から保護し、同DNA中に唯一ある制限酵素EcoR
I認識切断部位をT4DNAポリメラーゼ、DNAリガ
ーゼおよびBamHIリンカ−を用いてBamHI部位
に変換する。その後、この新たに作成したB a m
HI部位にSP6プロモーターを含むDNA断片を挿入
することによって得ることができる。
得ることができる。即ち、例えばプラスミドpGEM2
(プロメガ・バイオチック社製)のようなSP6プ
ロモーターを有する公知のプラスミドから、常法により
適当な制限酵素、例えば13amHIを用いてSP6プ
ロモーターを含むDNA断片を分離する。一方、公知の
λフアージベクター、例えばλgtlODNA中に5つ
ある制限酵素B a m HI認識切断部位を公知のB
amHIメチラーセにより制限酵素BamHIによる切
断から保護し、同DNA中に唯一ある制限酵素EcoR
I認識切断部位をT4DNAポリメラーゼ、DNAリガ
ーゼおよびBamHIリンカ−を用いてBamHI部位
に変換する。その後、この新たに作成したB a m
HI部位にSP6プロモーターを含むDNA断片を挿入
することによって得ることができる。
(第4段階)得られた組換えファージDNA群を常法に
より組換えλフアージ粒子群を形成させる。次いで、こ
のλフアージ粒子群を宿主、例えば大腸菌等に感染、増
殖させた後、各クローンから得られる組換えλフアージ
DNAを鋳型として、常法に従い、m7G (5’)p
pp (5’)G等の存在下、S P 6 RNAポリ
メラーゼを用い試験管内転写を行い、真核細胞のmRN
Aに特有なキャップ構造をもったmRNAを得(Nuc
leicAcids Re5earch、12,70
57゜1984)、これをアフリカッメガエルの卵母細
胞内で翻訳して、得られる蛋白質について活性試験等を
行ない、目的物を選択する。
より組換えλフアージ粒子群を形成させる。次いで、こ
のλフアージ粒子群を宿主、例えば大腸菌等に感染、増
殖させた後、各クローンから得られる組換えλフアージ
DNAを鋳型として、常法に従い、m7G (5’)p
pp (5’)G等の存在下、S P 6 RNAポリ
メラーゼを用い試験管内転写を行い、真核細胞のmRN
Aに特有なキャップ構造をもったmRNAを得(Nuc
leicAcids Re5earch、12,70
57゜1984)、これをアフリカッメガエルの卵母細
胞内で翻訳して、得られる蛋白質について活性試験等を
行ない、目的物を選択する。
かくして、目的蛋白質の遺伝子をクローニングすること
ができる。
ができる。
(発明の効果)
本発明のプライマーDNAは、構造遺伝子に含まれる確
率が比較的低い制限酵素NotIおよび5fil切断部
位を有するので、λフアージベクターに挿入されたcD
NAを切断することなく試験管内転写における転写終結
を行うことがおおむね可能であり、またλファージをベ
クターとすることによって、より長い外来遺伝子を高い
効率でクローニングすることができ、しかもクローン化
DNAとして得られることなどから、十分な数のcDN
Aライブラリー作製が容易であること、更にまた、サル
モネラ・チフイムリムファージphage)SF3が有
するRNAポリメラーゼがSP6フアージプロモーター
下流のいかなるDNAをも特異的に転写するという性質
を応用して、目的蛋白質をコードするmRNAを試験管
内で十分量得られるので、少量のmRNAからでも有利
に目的蛋白質の遺伝子をクローニングすることができる
。
率が比較的低い制限酵素NotIおよび5fil切断部
位を有するので、λフアージベクターに挿入されたcD
NAを切断することなく試験管内転写における転写終結
を行うことがおおむね可能であり、またλファージをベ
クターとすることによって、より長い外来遺伝子を高い
効率でクローニングすることができ、しかもクローン化
DNAとして得られることなどから、十分な数のcDN
Aライブラリー作製が容易であること、更にまた、サル
モネラ・チフイムリムファージphage)SF3が有
するRNAポリメラーゼがSP6フアージプロモーター
下流のいかなるDNAをも特異的に転写するという性質
を応用して、目的蛋白質をコードするmRNAを試験管
内で十分量得られるので、少量のmRNAからでも有利
に目的蛋白質の遺伝子をクローニングすることができる
。
(実施例)
以下に実施例を挙げて本発明をより具体的に説明するが
、その要旨を超えない限り、以下の実施例に限定される
ものではない。
、その要旨を超えない限り、以下の実施例に限定される
ものではない。
実施例1 (I〕 CDAライブラリーの作製(i
)cDNAプライマーDNAの作製プラスミドDNAp
UC19(東洋紡績社製〕のポリリンカーDNA中の制
限酵素5anI切断部位に、NotIおよび5fiI切
断部位を含んだ合成二重鎖DNA、即ち、 5 ’ −TCGAGCGGCCGCCATGGCCT
CGAG−3’3 ’ −CGCCGGCGGTA
CCGGAGCTCAGCT−5’を挿入、T、DNA
リガーゼを用いて結合し、pUC19Nsを得る。これ
により大腸菌HB101を常法(Gene、10,63
.1980)で形質転換し、形質転換株のうちpUC1
9Nsを持つ株を選択し、該プラスミドDNAを常法に
より分離した。
)cDNAプライマーDNAの作製プラスミドDNAp
UC19(東洋紡績社製〕のポリリンカーDNA中の制
限酵素5anI切断部位に、NotIおよび5fiI切
断部位を含んだ合成二重鎖DNA、即ち、 5 ’ −TCGAGCGGCCGCCATGGCCT
CGAG−3’3 ’ −CGCCGGCGGTA
CCGGAGCTCAGCT−5’を挿入、T、DNA
リガーゼを用いて結合し、pUC19Nsを得る。これ
により大腸菌HB101を常法(Gene、10,63
.1980)で形質転換し、形質転換株のうちpUC1
9Nsを持つ株を選択し、該プラスミドDNAを常法に
より分離した。
pUC19N3200μgに350ユニツトの制限酵素
江Iを反応液400μj2(10mMl−リス−塩酸(
pH7,5) 、10mM塩化マグネシウム、50mM
塩化ナトリウムおよび1mMジチオスレイトーノaで作
用させて、37℃で5時間反応させた。反応液をフェノ
ール・クロロホルムで抽出後、エタノール沈澱及び70
%エタノール洗浄を行ってDNAを回収した。
江Iを反応液400μj2(10mMl−リス−塩酸(
pH7,5) 、10mM塩化マグネシウム、50mM
塩化ナトリウムおよび1mMジチオスレイトーノaで作
用させて、37℃で5時間反応させた。反応液をフェノ
ール・クロロホルムで抽出後、エタノール沈澱及び70
%エタノール洗浄を行ってDNAを回収した。
このDNAのPstI断端に末端デオキシヌクレオチシ
ルトランスフェラーゼ(TdTase)を反応液200
μn(140mMカコジル酸す1ヘリウム、30mM1
−リス−塩酸(pH6,8) 、1mM塩化コバルト、
0.1mMジチオスレイトール、0、2 m M d
T (3H−d T T P 4 μCi含有)および
TdTa s e 108ユニツト〕中で作用させて、
10分おきに3 I−I −d T T Pのとりこみ
を測定して、dT鎖伸長をモニターしながら、平均長7
0塩基のdT鎖を付加した。0.2MEDTA20μl
と10%5DSIOμβを加えて反応を止め、フェノー
ル/クロロホルムで抽出、エタノール沈澱および70%
エタノール洗浄してDNAを回収した。次にこのDNA
を200ユニツトの制限酵素兄vu’llで37°C1
5時間反応液〔50mM塩化ナトリウム、10mM)リ
ス−塩酸(pH7,5) 、10mM塩化マグネシウム
および1mMジチオスレイトール〕中で消化した後1%
アガロースゲル上で電気泳動し、小さい方のフラグメン
トをDEAE−ペーパー法(DretzenG、ら、A
nal、Biochem、、112゜295.1981
)で分取した。得られたDNA断片を400μlのNT
E溶液(1M塩化すI−IJウム〜10mM)リス−塩
酸(pH7,4) −1mMEDTA)に溶かし、0℃
に冷却した。このDNAをNTE溶液で平衡化した0、
5 mlのオリゴdAカラムに吸着させ、固液30m
7!で洗浄した後室温に戻した。65“Cの蒸留水で吸
着したDNAを溶出させ、溶出液をフェノール/クロロ
ホルムで抽出して、エタノール沈澱を2回くり返し70
%エタノールで洗浄してcDNAブライマーDNAを得
た。
ルトランスフェラーゼ(TdTase)を反応液200
μn(140mMカコジル酸す1ヘリウム、30mM1
−リス−塩酸(pH6,8) 、1mM塩化コバルト、
0.1mMジチオスレイトール、0、2 m M d
T (3H−d T T P 4 μCi含有)および
TdTa s e 108ユニツト〕中で作用させて、
10分おきに3 I−I −d T T Pのとりこみ
を測定して、dT鎖伸長をモニターしながら、平均長7
0塩基のdT鎖を付加した。0.2MEDTA20μl
と10%5DSIOμβを加えて反応を止め、フェノー
ル/クロロホルムで抽出、エタノール沈澱および70%
エタノール洗浄してDNAを回収した。次にこのDNA
を200ユニツトの制限酵素兄vu’llで37°C1
5時間反応液〔50mM塩化ナトリウム、10mM)リ
ス−塩酸(pH7,5) 、10mM塩化マグネシウム
および1mMジチオスレイトール〕中で消化した後1%
アガロースゲル上で電気泳動し、小さい方のフラグメン
トをDEAE−ペーパー法(DretzenG、ら、A
nal、Biochem、、112゜295.1981
)で分取した。得られたDNA断片を400μlのNT
E溶液(1M塩化すI−IJウム〜10mM)リス−塩
酸(pH7,4) −1mMEDTA)に溶かし、0℃
に冷却した。このDNAをNTE溶液で平衡化した0、
5 mlのオリゴdAカラムに吸着させ、固液30m
7!で洗浄した後室温に戻した。65“Cの蒸留水で吸
着したDNAを溶出させ、溶出液をフェノール/クロロ
ホルムで抽出して、エタノール沈澱を2回くり返し70
%エタノールで洗浄してcDNAブライマーDNAを得
た。
(ii)ベクターDNAの作製
SP6プロモーターを含むプラスミドpGEM2 〔プ
ロメガバイオチク(PromegaBiotech)社
製、lDNA100μgを制限酵素NaellOOユニ
ットにより反応液(20mM塩化ナトリウム、10mM
トリス−塩酸(pH8,0) 、10mM塩化マグネシ
ウム、5mM2−MEおよび100.ljg/mj!B
SA)中で37℃5時間消化し、フェノール/クロロホ
ルムにてDNAを抽出、エタノール沈澱乾燥を行う。
ロメガバイオチク(PromegaBiotech)社
製、lDNA100μgを制限酵素NaellOOユニ
ットにより反応液(20mM塩化ナトリウム、10mM
トリス−塩酸(pH8,0) 、10mM塩化マグネシ
ウム、5mM2−MEおよび100.ljg/mj!B
SA)中で37℃5時間消化し、フェノール/クロロホ
ルムにてDNAを抽出、エタノール沈澱乾燥を行う。
回収したDNAと、1500pmoleのリン酸化した
BamHIリンカ−(東洋紡績社製)とを、宝酒造製ラ
イゲーションキットを用いて、説明書の指示に従い結合
した。B a m HIリンカ−を有するプラスミドD
NAを1%アガロースゲルより回収し、制限酵素Bam
1(1100ユニツトにて反応液(50mM塩化ナトリ
ウム、10mM)リス−塩酸(pH7,5) 、10m
M塩化マグネシウムおよび1mMジチオスレイトール〕
中にて反応させる。このものを5%アクリルアミド上で
電気泳動し、SP6プロモーターを含む小さい方のフラ
グメントを切り出した。ゲルより抽出後、フェノール/
クロロボルム抽出、エタノール沈澱、乾燥を行った。
BamHIリンカ−(東洋紡績社製)とを、宝酒造製ラ
イゲーションキットを用いて、説明書の指示に従い結合
した。B a m HIリンカ−を有するプラスミドD
NAを1%アガロースゲルより回収し、制限酵素Bam
1(1100ユニツトにて反応液(50mM塩化ナトリ
ウム、10mM)リス−塩酸(pH7,5) 、10m
M塩化マグネシウムおよび1mMジチオスレイトール〕
中にて反応させる。このものを5%アクリルアミド上で
電気泳動し、SP6プロモーターを含む小さい方のフラ
グメントを切り出した。ゲルより抽出後、フェノール/
クロロボルム抽出、エタノール沈澱、乾燥を行った。
λファージλgtlo (プロメガバイオチク社)DN
A5μgを20μβの反応液〔8μMアデノシルメチオ
ニン、100mMトリス−塩酸(pH7,5) 、1m
MEDTAおよび0.4 mg/m I! B SA〕
中で37℃で20分間BamHIメチラーゼにより処理
して、λgtlODNAが制限酵素BamHIで切断で
きぬようにした。このものをフェノール/クロロホルム
抽出、エタノール沈澱、洗浄した後、制限酵素EcoR
I5ユニットにより反応液(100mM塩化ナトリウム
、50mMトリス−塩酸(1)H7,5) 、10mM
塩化マグネシウムおよび1mMジチオスレイトール〕中
でDNAを切断し、フェノール/クロロホルム抽出、エ
タノール沈澱・洗浄した。このEcoRIフラグメント
を反応液(50mMトリス−塩酸(pH7、5) 、1
m M E D T A、5mMジチオスレイトール
、10mM塩化マグネシウムおよび20mMdNTP
(dATP、、dTTP、dGTP、、dCTP))中
で10ユニツトのDNAポリメラーゼIを作用させ断端
を平滑末端とした後、100p100pのBamHIリ
ンカ−(東洋紡績社製)と宝酒造製ライゲーションキッ
トを用いてDNAを結合させ、フェノール・クロロホル
ム抽出およびエタノール沈澱、洗浄を行った。このもの
を反応液(10mMI−リス−塩酸(pH7,5) 、
50mM塩化ナトリウム、10mM塩化マグネシウムお
よび1mMジチオスレイトール〕中で5ユニツトの制限
酵素BamHIと37°Cで5時間反応させ、再びフェ
ノール/クロロホルム抽出、エタノール沈澱、洗浄を施
した後、さらにこのDNAを50μlの反応液C50m
M)リス−塩酸(pH9,0)、1mM塩化マグネシウ
ム、1mM塩化亜鉛および1mMスペルミジン〕中で1
ユニツトのアルカリホスファターゼと37°Cで60分
間反応させることによってBamHI断片の5′末端を
脱リン酸化し、セルフ−ライゲーション(Self−1
igation)がおこらぬようにした。
A5μgを20μβの反応液〔8μMアデノシルメチオ
ニン、100mMトリス−塩酸(pH7,5) 、1m
MEDTAおよび0.4 mg/m I! B SA〕
中で37℃で20分間BamHIメチラーゼにより処理
して、λgtlODNAが制限酵素BamHIで切断で
きぬようにした。このものをフェノール/クロロホルム
抽出、エタノール沈澱、洗浄した後、制限酵素EcoR
I5ユニットにより反応液(100mM塩化ナトリウム
、50mMトリス−塩酸(1)H7,5) 、10mM
塩化マグネシウムおよび1mMジチオスレイトール〕中
でDNAを切断し、フェノール/クロロホルム抽出、エ
タノール沈澱・洗浄した。このEcoRIフラグメント
を反応液(50mMトリス−塩酸(pH7、5) 、1
m M E D T A、5mMジチオスレイトール
、10mM塩化マグネシウムおよび20mMdNTP
(dATP、、dTTP、dGTP、、dCTP))中
で10ユニツトのDNAポリメラーゼIを作用させ断端
を平滑末端とした後、100p100pのBamHIリ
ンカ−(東洋紡績社製)と宝酒造製ライゲーションキッ
トを用いてDNAを結合させ、フェノール・クロロホル
ム抽出およびエタノール沈澱、洗浄を行った。このもの
を反応液(10mMI−リス−塩酸(pH7,5) 、
50mM塩化ナトリウム、10mM塩化マグネシウムお
よび1mMジチオスレイトール〕中で5ユニツトの制限
酵素BamHIと37°Cで5時間反応させ、再びフェ
ノール/クロロホルム抽出、エタノール沈澱、洗浄を施
した後、さらにこのDNAを50μlの反応液C50m
M)リス−塩酸(pH9,0)、1mM塩化マグネシウ
ム、1mM塩化亜鉛および1mMスペルミジン〕中で1
ユニツトのアルカリホスファターゼと37°Cで60分
間反応させることによってBamHI断片の5′末端を
脱リン酸化し、セルフ−ライゲーション(Self−1
igation)がおこらぬようにした。
55μpの反応停止液Cl0mM1−’Jスス−酸(p
H8,0) 、100mM塩化ナトリウム、1mME
DTAおよび1%5DS)を加え 、68°Cで10分
間加熱しアルカリホスファターゼを失活させた後、フェ
ノールクロロホルム抽出、エタノール沈澱、乾燥を行っ
た。
H8,0) 、100mM塩化ナトリウム、1mME
DTAおよび1%5DS)を加え 、68°Cで10分
間加熱しアルカリホスファターゼを失活させた後、フェ
ノールクロロホルム抽出、エタノール沈澱、乾燥を行っ
た。
次のこのものと前述のようにして得られたSP6プロモ
ーターを含むBamHI断片DNAと宝酒造製ライゲー
ションキットを用いて結合させた。
ーターを含むBamHI断片DNAと宝酒造製ライゲー
ションキットを用いて結合させた。
次にこのDNAをイン・ビトロ・パンケージング・キッ
ト(プロメガ社製)を用いλフアージ粒子に再構成し、
宿主大腸菌NM641に感染、プレート上で増殖させた
後、SP6プロモーターDNA断片を有するλgtlo
の感染によって生じた透明な単一プラークのうちいくつ
かより各々λファージDNAを抽出し制限酵素地図を作
製した結果、SP6プロモーター断片の挿入を確認した
ものをλgtlO3P6とした。
ト(プロメガ社製)を用いλフアージ粒子に再構成し、
宿主大腸菌NM641に感染、プレート上で増殖させた
後、SP6プロモーターDNA断片を有するλgtlo
の感染によって生じた透明な単一プラークのうちいくつ
かより各々λファージDNAを抽出し制限酵素地図を作
製した結果、SP6プロモーター断片の挿入を確認した
ものをλgtlO3P6とした。
(iii)cDNAの合成
ウシ胃組織より分離したp o 1 yA” RNAを
蔗糖密度勾配法により分画し2.6キロベース(ki
1obase Hkb)の大きさの画分のRNAl0μ
gに対し、(i)で得たプライマー2.1pmoleを
用いて100μlの反応液(50mM)リス−塩酸(p
H8,3) 、50mM塩化カリウム、8mM塩化マグ
ネシウム、1mMdNTP (dATPX dGTP
、dCTP。
蔗糖密度勾配法により分画し2.6キロベース(ki
1obase Hkb)の大きさの画分のRNAl0μ
gに対し、(i)で得たプライマー2.1pmoleを
用いて100μlの反応液(50mM)リス−塩酸(p
H8,3) 、50mM塩化カリウム、8mM塩化マグ
ネシウム、1mMdNTP (dATPX dGTP
、dCTP。
およびdTTP) 、10mMジチオスレイトール、6
0ニーS17 l・RNa s i nおよび10,1
jC4α−:+zp−dGTP)中で100ユニツトの
逆転写酵素を加えて32P−dGTPのとりこみをモニ
ターしながら42℃で反応させた結果、2時間の反応で
724ngの鋳型RNAとcDNAの第−鎖とのハイブ
リッドが合成された。さらにこのものをフェノール/ク
ロロホルム抽出、エタノール沈澱させた後100μlの
反応液(50mMHEPES (pH7,6) 、68
mM塩化カリウム、4mM塩化マグネシウム、0.15
mMβ−NADおよび0.6mMdNTP)中で30ユ
ニツトのE、c。
0ニーS17 l・RNa s i nおよび10,1
jC4α−:+zp−dGTP)中で100ユニツトの
逆転写酵素を加えて32P−dGTPのとりこみをモニ
ターしながら42℃で反応させた結果、2時間の反応で
724ngの鋳型RNAとcDNAの第−鎖とのハイブ
リッドが合成された。さらにこのものをフェノール/ク
ロロホルム抽出、エタノール沈澱させた後100μlの
反応液(50mMHEPES (pH7,6) 、68
mM塩化カリウム、4mM塩化マグネシウム、0.15
mMβ−NADおよび0.6mMdNTP)中で30ユ
ニツトのE、c。
上上pDNAポリメラーゼ■および1ユニツトのRNa
s eHによりcDNAの第−鎖を鋳型として14℃
で1時間、さらに23°Cで1時間反応させ、第二鎖を
合成し、フェノール/クロロホルム抽出、エタノール沈
澱後、1.6μgのウシ胃組織mRNA由来の二本鎖c
DNA群を得た。このcDNAを30pnの反応液(3
3mM)リス−酢酸(pH7,9) 、66mM酢酸カ
リウム、10mM酢酸マグネシウム、5μgヌクレアー
ゼ・フリーBSAおよび0.8 m M d N T
P )中で9ユニツトのT4ポリメラーゼを37℃で3
0分間反応させ、フェノール/クロロホルム抽出、エタ
ノール沈澱および洗浄を行った。この操作で両端が平滑
末端となったcDNAを1oμlの反応液〔8μMS−
アデノシルーし一メチオニン、100mM1−リス−塩
酸(pH7,5)1mMEDTAおよび0.4■/mI
!BSA)中で5ユニツトのEcoRIメチラーゼによ
り制限酵素EcoRI認識部位のアデニンをメチル化す
ることにより、制限酵素EcoRIにより切断されぬよ
う修飾した。さらにこの修飾したcDNA群を10,1
7j!の反応液(5mM)リス−塩酸(pH7,5)
、5mM塩化マグネシウム、5mMジチオスレイトール
、2.7mMATPおよび0.111g/Illリン酸
化EcoRIリンカ−(東洋紡績製)〕中で200ユニ
ツトのT4DNAリガーゼにより14℃で一晩反応させ
ることにより、その両端にEc oR1リンカ−を付加
した。さらにこのものをセファロースCLdBカラム(
ファルマシア社製)を通すことにより、余分なリンカ−
を除き、結局590ngのBc oRIリンカ−付加さ
れたEc oR1メチラ一ゼ処理二本鎖cDNAを得た
。
s eHによりcDNAの第−鎖を鋳型として14℃
で1時間、さらに23°Cで1時間反応させ、第二鎖を
合成し、フェノール/クロロホルム抽出、エタノール沈
澱後、1.6μgのウシ胃組織mRNA由来の二本鎖c
DNA群を得た。このcDNAを30pnの反応液(3
3mM)リス−酢酸(pH7,9) 、66mM酢酸カ
リウム、10mM酢酸マグネシウム、5μgヌクレアー
ゼ・フリーBSAおよび0.8 m M d N T
P )中で9ユニツトのT4ポリメラーゼを37℃で3
0分間反応させ、フェノール/クロロホルム抽出、エタ
ノール沈澱および洗浄を行った。この操作で両端が平滑
末端となったcDNAを1oμlの反応液〔8μMS−
アデノシルーし一メチオニン、100mM1−リス−塩
酸(pH7,5)1mMEDTAおよび0.4■/mI
!BSA)中で5ユニツトのEcoRIメチラーゼによ
り制限酵素EcoRI認識部位のアデニンをメチル化す
ることにより、制限酵素EcoRIにより切断されぬよ
う修飾した。さらにこの修飾したcDNA群を10,1
7j!の反応液(5mM)リス−塩酸(pH7,5)
、5mM塩化マグネシウム、5mMジチオスレイトール
、2.7mMATPおよび0.111g/Illリン酸
化EcoRIリンカ−(東洋紡績製)〕中で200ユニ
ツトのT4DNAリガーゼにより14℃で一晩反応させ
ることにより、その両端にEc oR1リンカ−を付加
した。さらにこのものをセファロースCLdBカラム(
ファルマシア社製)を通すことにより、余分なリンカ−
を除き、結局590ngのBc oRIリンカ−付加さ
れたEc oR1メチラ一ゼ処理二本鎖cDNAを得た
。
次に(ii )で得られたベクターλg t 10SP
6 10pgを反応液200μj2 (50mM)リス
−塩酸(pH7,5) 、100mM塩化ナトリウム、
10mM塩化マグネシウムおよび1mMジチオスレイト
ール〕中で30ユニツトの制限酵素Ec oRIと37
℃で60分間反応させ、λgt10SP6DNA中唯−
のEcoRI認中部−を切断した後、フェノール/クロ
ロホルム抽出、エタノール沈澱、洗浄した。さらにこの
DNAの5′末端を(11)で述べたような方法で脱リ
ン酸化しこのうち4μgのベクターDNAと、上記の操
作で得られたcDNAL20ng (モル比−2:1)
とを5μlの反応液(60mM)リス−塩酸(pH7,
5)、10mM塩化マグネシウム、10mM2−メルカ
プトエタノール、1mMEDTAおよび2 m M A
T P )中ニテ、20 Qユニット(DT 4DN
Aリガーゼと14℃で一晩反応させることにより結合さ
せた。50μlの10mMトリス−塩酸(pH8,0)
−1mMEDTA溶液を加え65°Cで5分間加熱した
後、前述のイン・ビトロ・パッケージング・キットを用
い、説明書の指示に従ってイン・ビトロ・バソヶージン
グヲ行いcDNAを有するλフアージ粒子をDNA1μ
gあたり約30万クローン得た。
6 10pgを反応液200μj2 (50mM)リス
−塩酸(pH7,5) 、100mM塩化ナトリウム、
10mM塩化マグネシウムおよび1mMジチオスレイト
ール〕中で30ユニツトの制限酵素Ec oRIと37
℃で60分間反応させ、λgt10SP6DNA中唯−
のEcoRI認中部−を切断した後、フェノール/クロ
ロホルム抽出、エタノール沈澱、洗浄した。さらにこの
DNAの5′末端を(11)で述べたような方法で脱リ
ン酸化しこのうち4μgのベクターDNAと、上記の操
作で得られたcDNAL20ng (モル比−2:1)
とを5μlの反応液(60mM)リス−塩酸(pH7,
5)、10mM塩化マグネシウム、10mM2−メルカ
プトエタノール、1mMEDTAおよび2 m M A
T P )中ニテ、20 Qユニット(DT 4DN
Aリガーゼと14℃で一晩反応させることにより結合さ
せた。50μlの10mMトリス−塩酸(pH8,0)
−1mMEDTA溶液を加え65°Cで5分間加熱した
後、前述のイン・ビトロ・パッケージング・キットを用
い、説明書の指示に従ってイン・ビトロ・バソヶージン
グヲ行いcDNAを有するλフアージ粒子をDNA1μ
gあたり約30万クローン得た。
〔■〕試験管内転写
(i)鋳型DNAの調製
(1)で得たλファージcDNAライブラリーよりλフ
アージDNAを常法により抽出し、約30万クローンの
ファージ粒子より約1■のファージDNAを得た。この
うち30pgを100μ’ ノ反応液(150m M塩
化ナトリウム、10mM)リス−塩酸(pH7,9)
、10mM塩化マグネシウム、100μg/mfBsA
および0.01%トリトンX−100)中で30ユニツ
トの制限酵素Notlを用いて37℃で5時間消化した
後、フェノール/クロロホルム抽出、エタノール沈澱お
よび乾燥を行って得られたDNAを試験管内転写の鋳型
DNAとした。このDNAを用いて後述の試験管内転写
およびサブスタンスにレセプターの発現試験を行ったと
ころ、サブスタンスにレセプターの発現が認められ(サ
ブスタンスKによる100μAの外向き電流の惹起)、
確かにNotIが適当な制限酵素であることがわかった
。従って、Notlを用いて消化して得られるDNAを
試験管内転写の鋳型DNAとして以後用いた。
アージDNAを常法により抽出し、約30万クローンの
ファージ粒子より約1■のファージDNAを得た。この
うち30pgを100μ’ ノ反応液(150m M塩
化ナトリウム、10mM)リス−塩酸(pH7,9)
、10mM塩化マグネシウム、100μg/mfBsA
および0.01%トリトンX−100)中で30ユニツ
トの制限酵素Notlを用いて37℃で5時間消化した
後、フェノール/クロロホルム抽出、エタノール沈澱お
よび乾燥を行って得られたDNAを試験管内転写の鋳型
DNAとした。このDNAを用いて後述の試験管内転写
およびサブスタンスにレセプターの発現試験を行ったと
ころ、サブスタンスにレセプターの発現が認められ(サ
ブスタンスKによる100μAの外向き電流の惹起)、
確かにNotIが適当な制限酵素であることがわかった
。従って、Notlを用いて消化して得られるDNAを
試験管内転写の鋳型DNAとして以後用いた。
(ii)試験管内転写
〔■〕で得られた30万クローンのファージcDNAラ
イブラリーを5万クローンずつのグループに分け、各グ
ループのファージ粒子よりDNAを抽出し、制限酵素N
otIで消化した。
イブラリーを5万クローンずつのグループに分け、各グ
ループのファージ粒子よりDNAを抽出し、制限酵素N
otIで消化した。
このうち3μgの鋳型DNAを用い、50μlの反応液
〔20mMトリス−塩酸(pH7,5)、6mM塩化マ
グネシウム、2mMスペルミジン、10mMジチオスレ
イトール、1ユニツト/μ1RNAs in、0.2m
MrNTP (ATP。
〔20mMトリス−塩酸(pH7,5)、6mM塩化マ
グネシウム、2mMスペルミジン、10mMジチオスレ
イトール、1ユニツト/μ1RNAs in、0.2m
MrNTP (ATP。
CTP、GTP及びUTP) 、1mMm7G (5’
)ppp (5’) G (2個のGが5′同志で結合
しさらに一方のグアニンの7位がメチル化されたもの;
P L バイオケミカルズ(Biochemica
ls)製) 、0.1μw/mnBsAおよびα−”P
7GTP 20000 Cpm)中で3ユニット−のS
P 6 RNAポリメラーゼを用い、40 ’Cで1
時間試験管内転写を行った。反応後5oユニットのRN
A5inと1μgのRNA5eフリーDNA5eを加え
鋳型DNAを分解した後、転写されたRNAをフェノー
ル・クロロホルムで抽出後、以下のようにしてゲルろ過
性により基質のrNTPがら分離した。すなわち、1m
lの使い捨てシリンジに10mM)’Jスス−酸(pH
7,0)および0.1%SDSで平衡化したセファデク
スG−100(ファルマシア社製〕を充填する。このカ
ラムに上記反応液を供して、1300r、p、m、で4
分間遠心して、溶出液中に合成mRNAを回収した。
)ppp (5’) G (2個のGが5′同志で結合
しさらに一方のグアニンの7位がメチル化されたもの;
P L バイオケミカルズ(Biochemica
ls)製) 、0.1μw/mnBsAおよびα−”P
7GTP 20000 Cpm)中で3ユニット−のS
P 6 RNAポリメラーゼを用い、40 ’Cで1
時間試験管内転写を行った。反応後5oユニットのRN
A5inと1μgのRNA5eフリーDNA5eを加え
鋳型DNAを分解した後、転写されたRNAをフェノー
ル・クロロホルムで抽出後、以下のようにしてゲルろ過
性により基質のrNTPがら分離した。すなわち、1m
lの使い捨てシリンジに10mM)’Jスス−酸(pH
7,0)および0.1%SDSで平衡化したセファデク
スG−100(ファルマシア社製〕を充填する。このカ
ラムに上記反応液を供して、1300r、p、m、で4
分間遠心して、溶出液中に合成mRNAを回収した。
溶出液中の32pのカウントを測定し、合成mRNA量
を見積もった。上記条件で6.5μgの合成mRNAが
回収された。このmRNAをフェノール/クロロホルム
抽出、エタノール沈澱および乾燥後、蒸留水に溶かした
(1■/mβ)。
を見積もった。上記条件で6.5μgの合成mRNAが
回収された。このmRNAをフェノール/クロロホルム
抽出、エタノール沈澱および乾燥後、蒸留水に溶かした
(1■/mβ)。
(III)サブスタンスにレセプターc DNAのスク
リーニング (1)で得られたcDNAライブラリーを5万クローン
ずつのグループに分け、(II)に従イmRNAを合成
し、各々のグループ由来のmRNA)容液(1■/ m
12 )を8用型した。
リーニング (1)で得られたcDNAライブラリーを5万クローン
ずつのグループに分け、(II)に従イmRNAを合成
し、各々のグループ由来のmRNA)容液(1■/ m
12 )を8用型した。
成熟メスのアフリカッメガエル(X e n o p
uslaevis)を20分間氷水につけて麻酔し、解
剖して卵母細胞を取り出し、修正ハース(Barth’
s)培養?& (Co l eman、A、。
uslaevis)を20分間氷水につけて麻酔し、解
剖して卵母細胞を取り出し、修正ハース(Barth’
s)培養?& (Co l eman、A、。
Transcription and Trans
tation−a practical appr
oach、編者Hanes、B、D、、及びHiggi
ns、S、J、、pp271 IRLPress19
84)中で白金線を使用して卵母細胞を1個ずつに分離
した。合成mRNA溶液(lfff/mn)40 n
Eずつを、1個の卵母細胞にキャピラリーとマイクロマ
ニュピレータ−を用いて実体顕微鏡下にて注入した。1
種類の合成mRNA溶液につき50個を使用し、mRN
A注入後修正ハース培養液に卵母細胞を戻し、18℃に
て2日間保温した。
tation−a practical appr
oach、編者Hanes、B、D、、及びHiggi
ns、S、J、、pp271 IRLPress19
84)中で白金線を使用して卵母細胞を1個ずつに分離
した。合成mRNA溶液(lfff/mn)40 n
Eずつを、1個の卵母細胞にキャピラリーとマイクロマ
ニュピレータ−を用いて実体顕微鏡下にて注入した。1
種類の合成mRNA溶液につき50個を使用し、mRN
A注入後修正ハース培養液に卵母細胞を戻し、18℃に
て2日間保温した。
培養した卵母細胞の外層をデュモン鉗子にて除いた後、
1個ずつ容量約0.4 m Aの膜電位記録槽に入れ、
リンゲル溶液(115mM塩化ナトリうム、2.5mM
塩化カリウム、1.8mM塩化カルシウムおよび5mM
HEPES (pH7,4))で毎分4mj2の流速で
潅流した。4M酢酸カリウム溶液を満たした2木のガラ
ス微小電極を卵母細胞に刺入し、膜電位をOmVに固定
した後、槽内の濃度が40秒間1μMになるようにサブ
スタンスKを加え、細胞全体の電流を測定した。もしサ
ブスタンスにレセプターが発現していれば塩素イオンの
透過性促進により外向きの電流が検出されるので、これ
を指標に各cDNAクローンのグループについてサブス
タンスにレセプターm RN A由来cDNAのスクリ
ーニングを行った。
1個ずつ容量約0.4 m Aの膜電位記録槽に入れ、
リンゲル溶液(115mM塩化ナトリうム、2.5mM
塩化カリウム、1.8mM塩化カルシウムおよび5mM
HEPES (pH7,4))で毎分4mj2の流速で
潅流した。4M酢酸カリウム溶液を満たした2木のガラ
ス微小電極を卵母細胞に刺入し、膜電位をOmVに固定
した後、槽内の濃度が40秒間1μMになるようにサブ
スタンスKを加え、細胞全体の電流を測定した。もしサ
ブスタンスにレセプターが発現していれば塩素イオンの
透過性促進により外向きの電流が検出されるので、これ
を指標に各cDNAクローンのグループについてサブス
タンスにレセプターm RN A由来cDNAのスクリ
ーニングを行った。
表1に示す通り、30万クローンのcDNAライブラリ
ー中に(i)で述べたようにサブスタンスにレセプター
cDNAが存在したので、それを5万個ずつ6グループ
に分は同様のスクリーニングを行い、陽性のグループを
1つ見出し、順次グループ分けとスクリーニングをくり
かえし最終的にサブスタンスにレセプターのcDNAク
ローンλ5KR56を得た。
ー中に(i)で述べたようにサブスタンスにレセプター
cDNAが存在したので、それを5万個ずつ6グループ
に分は同様のスクリーニングを行い、陽性のグループを
1つ見出し、順次グループ分けとスクリーニングをくり
かえし最終的にサブスタンスにレセプターのcDNAク
ローンλ5KR56を得た。
第1図は、本発明のプライマーDNAの概略図を示す図
面である。
面である。
Claims (1)
- (1)プラスミドpUC19由来の制限酵素¥Sal¥
I 切断部位を含む制限酵素¥Pst¥ I −¥Pvu¥
II切断断片から得られるプライマーDNAであって、該
制限酵素¥Pst¥ I 切断部位の3′−末端側にポリ
(dT)が付加され、且つ該制限酵素¥Sal¥ I 切
断部位に下記塩基配列で示されるDNA断片が挿入され
ていることを特徴とするプライマーDNA。 【遺伝子配列があります。】 【遺伝子配列があります。】
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP10615588A JPH01277490A (ja) | 1988-04-28 | 1988-04-28 | プライマーdna |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP10615588A JPH01277490A (ja) | 1988-04-28 | 1988-04-28 | プライマーdna |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH01277490A true JPH01277490A (ja) | 1989-11-07 |
Family
ID=14426421
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP10615588A Pending JPH01277490A (ja) | 1988-04-28 | 1988-04-28 | プライマーdna |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH01277490A (ja) |
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2001027633A (ja) * | 1999-05-07 | 2001-01-30 | Inst Of Physical & Chemical Res | 相互作用するタンパク質の検出方法 |
-
1988
- 1988-04-28 JP JP10615588A patent/JPH01277490A/ja active Pending
Cited By (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2001027633A (ja) * | 1999-05-07 | 2001-01-30 | Inst Of Physical & Chemical Res | 相互作用するタンパク質の検出方法 |
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