JPH0146111B2 - - Google Patents

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JPH0146111B2
JPH0146111B2 JP3446781A JP3446781A JPH0146111B2 JP H0146111 B2 JPH0146111 B2 JP H0146111B2 JP 3446781 A JP3446781 A JP 3446781A JP 3446781 A JP3446781 A JP 3446781A JP H0146111 B2 JPH0146111 B2 JP H0146111B2
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JP
Japan
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gene
protein
lactamase
sequence
plasmid
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JP3446781A
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Japanese (ja)
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JPS56137896A (en
Inventor
Chan Shin
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Novartis Vaccines and Diagnostics Inc
Original Assignee
Cetus Corp
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Publication date
Application filed by Cetus Corp filed Critical Cetus Corp
Publication of JPS56137896A publication Critical patent/JPS56137896A/en
Publication of JPH0146111B2 publication Critical patent/JPH0146111B2/ja
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  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Description

【発明の詳細な説明】 この発明は分子生物学、詳細にはいわゆる組み
換えDNAに関する。この発明は、枯草菌などの
グラム陽性菌にクローンされた外来遺伝子を導入
することにより該遺伝子産生物を制御された条件
下に産生させる遺伝子組み換え菌の製造方法に関
し、これによつて外来遺伝子生産物の回収が促進
される。 この発明は新規な遺伝子操作を加えたプラスミ
ドを開示する。これらの微生物の例はメリーラン
ド20852、ロツクビルのアメリカンタイプカルチ
ヤー(ATCC)にプダペスト条約下に寄託してあ
る。プラスミドpOG1196はATCCNo.31776;プラ
スミドpOG2165はATCCNo.31777;プラスミド
pOG2110はATCCNo.31778である。 周知の如く、特定の蛋白質のアミノ酸配列は該
蛋白質に対する遺伝子に担持されているコードに
より決定される。DNAからメツセンジヤーRNA
を経て蛋白質を形成するための翻訳の過程におい
ては、DNAの中の3つずつのヌクレオチドで構
成される群、いわゆるコドン1つに対して1つの
アミノ酸(20個の可能なアミノ酸のうち)が上記
蛋白質鎖の対応する位置に置かれる。 組み換えDNA技術の出現によつて、合成した
かあるいは1つの菌株または種から単離されたあ
らかじめ決められたヌクレオチド配列を他の菌株
または種の遺伝子に導入することによつて遺伝学
的変化が人為的に行なえるようになつた。既知ヌ
クレオチド配列を選択して、ヌクレオチド配列を
導入された菌株または種が翻訳の過程の一部分と
して該既知ヌクレオチド配列によつてコード化さ
れている蛋白質を生産するようにできる。このよ
うな操作を受けた菌株または種は通常の複製過程
において上記導入されたヌクレオチド配列をも複
製する。 組み換えDNA技術は適当なDNA鎖(クローニ
ングベクター)を単離し、該クローニングベクタ
ーのDNAの2本の鎖を外来DNAを挿入したい位
置で切断することからなる。これを行うために、
特定タイプの蛋白質、いわゆる制限酵素が典型的
に使用される。制限酵素はDNAを特定のヌクレ
オチド配列で切断するであろうが、いくつかの制
限酵素については上記切断は必ずしも上記2本の
からみ合つたDNA鎖の同一の位置で生じるとは
限らない。そのような場合、もし2つの異なつた
タイプのDNAが同じ様に切断されると、各開裂
末端は互いに相補的であり、適当な条件下に並行
している相補的末端とくつつくであろう。次いで
これらの末端は酵素(リガーゼ)により結合され
る。このことは、どんなものから得られた2つの
DNA断片でも単一のDNA分子に組み込むことを
可能にする。 DNAベクターを単離し外来の断片を挿入した
ら、この組み換えDNAを適当な宿主微生物に入
れる。宿主微生物が挿入されたDNAを複製する
ためには、組み換えDNAが宿主微生物の遺伝子
系の一部となるように宿主に挿入する必要があ
る。 いつたん外来DNAがうまく宿主微生物に組み
込まれ、その宿主微生物がクローニングされた遺
伝子の生産物を生産したら、その所望の生産物は
回収されねばならない。本発明以前は、この生産
物を回収するのに所望の生産物を生産する細胞を
殺す必要があつた。又、細胞は多くの異なる蛋白
質を含んでいるので、所望の生産物の単離方法が
困難あるいは複雑である。最終的には所望の生産
物は特に高いレベルで生産されている場合には宿
主細胞にとつて有害である。いくつかの場合、こ
のことより細胞が崩壊し、他の場合には細胞の防
御機構が活性化されて所望の生産物を分解してし
まう。 今日までの組み換えDNA研究のほとんどは大
腸菌(E.coli)によつて行なわれており、大腸菌
はペリプラズミツク間隙(periplasmic space)
を封じる2層の細胞膜を有する細菌のグラム陰性
菌の1つである。大腸菌において生産された生産
物の多くはこのペリプラズミツク間隙に分泌され
る。ほんのわずかの生産物が生きている細胞から
成育倍地へ分泌されるにすぎない。 一方、たとえば、単層の細胞膜のみを有するグ
ラム陽性菌群の一員である。枯草菌(B.subtilis)
は大量の蛋白質を生産し、これは生育倍地に直接
分泌される。大腸菌(E.coli)における遺伝子ク
ローニングの一般的研究手法は枯草菌(B.
subtilis)に適用できるが、枯草菌に組み込まれ
た外来遺伝子の有用な生産物を生産させて成育倍
地に分泌させる試みは成功しなかつた。枯草菌は
プラスミドを介した形質転換の効率が大きく病原
性がないのでいく分大腸菌よりも好ましい。 本発明の目的は添付図面を参照することにより
下記説明から明らかであろう。 第1図はバチルス・リケニフオルミス
(Bacillus licheniformis)から得られたβ−ラク
タマーゼのための遺伝子を有するDNA断片の部
分的構造地図を示す全体図であり; 第2図は第1図の断片中の多くのヌクレオチド
配列と該断片がコードする蛋白質中に存在するア
ミノ酸配列との対応関係を示す全体図であり; 第3図は組み換えプラスミドを有する枯草菌
(Bacillus subtilis)菌株が生育するプレートの
典型的外見を示す概略図であり、該プレートはβ
−ラクタマーゼ活性を試験するPVA検定を行な
つた後の状態を示している。 第4図は大腸菌(E.coli)プラスミドpOG2110
枯草菌(B.subtilis)プラスミドpOG1196および
二機能性プラスミドpOG2165の構造を説明する
全体図であり; 第5図は組み換えプラスミドを有する種々の細
菌の菌株が生育するプレートの典型的外観を示し
ている図面であつて、該プレートはβ−クラタマ
ーゼ活性を試験するPVA検定後の状態を示して
おり; 第6図はバチルス・リケニフオルミス(B.
licheniformis)Pen P遺伝子の一部を構成する
ヌクレオチドの図式である。 本発明の一態様として、枯草菌(B.subtilis)
にとつて生来のものでないあらかじめ決められた
蛋白質が枯草菌の形質発現によつて生産される。
プラスミドが導入されている枯草菌(B.subtilis)
の菌株を生育させるに適した生育倍地および条件
が与えられる。上記プラスミドは上記菌株におい
て複製でき、あらかじめ決められた蛋白質のため
の遺伝子を有している。この遺伝子はオペレータ
ー、プロモーターおよびリボゾーム結合位塩基配
列の制御下におかれるようにプラスミド中に位置
付けられ、方向付けられている。この蛋白質は宿
主菌株によつて分泌される輸送機構の制御下にも
おかれる。分泌の際、この蛋白質は生育倍地から
回収される。 この発明の方法は転写及び翻訳過程を開始せし
めることが出来るヌクレオチド配列を有するクロ
ーニングベクター微生物を必要とする。オペレー
タ、プロモーターおよびリボゾーム結合位塩基配
列を提供するヌクレオチドは上記ベクター中に本
来存在するか、DNA組み換え技術を使用して独
立したDNA断片として挿入されるか、あるいは
重要な遺伝子を有する外来DNAの一部である。
少なくとも所望の蛋白生産物のための構造遺伝子
を有するであろう外来DNAをオペレーター、プ
ロモーターおよびリボゾーム結合位塩基配列の制
御下に転写し翻訳出来るようにクローニングベク
ター中に組み込む。挿入された外来DNAが正し
い翻訳を行えるように、挿入されたDNA中のヌ
クレオチドが正しい読み取り枠の中になければな
らない。さらに、クローニングベクターが、上記
オペレーター、プロモーターおよびリボゾーム結
合位塩基配列から正しい読み取り枠にある挿入さ
れた外来DNAへ読み取りと翻訳が確実に行なわ
れるに充分な数の、宿主細胞にとつて生来のヌク
レオチドを含有するのが望ましいかあるいは必要
である。 この発明によれば、利用されるクローニングベ
クターは機能性輸送シグナルペプチド配列のため
のコドンからなるヌクレオチド配列からなる。輸
送シグナルペプチド配列は新しくつくられた蛋白
質上のアミノ酸の短いリーダー配列であるのがふ
つうである。輸送シグナルペプチド配列が作動す
るメカニズムはまだ完全には理解されていない
が、輸送蛋白質は細胞によつて排泄され、蛋白質
がつくられるにつれて細胞質から該つくられた蛋
白質をくつつけて引き出すものと考えられてい
る。輸送機能が輸送シグナルペプチド配列によつ
て遂行されると、該輸送配列は自然の過程によつ
て除去される。 この発明によれば、外来DNAはこのDNAによ
つてコードされている蛋白質がシグナルコドンに
よつてコードされた輸送シグナルペプチド配列に
従つて輸送されるようにクローニングベクターに
挿入することができる。このようにクローン化し
た遺伝子生産物は望ましい場所に都合よく輸送さ
れ、そこから回収される。これはいくつかの有利
な点を有する。該場所は細胞の外なので、宿主細
胞を該遺伝子生産物の回収のために破壊する必要
はないので、遺伝子生産物を連続的に中断するこ
となく生産できる。又、細胞は非常に多くの蛋白
質を含有するのでクローン化した遺伝子の生産物
を排出する能力があると該生産物の単離および精
製が非常に簡単になる。結局、クローニングした
遺伝子の生産物は特に高いレベルで生産される場
合宿主細胞にとつて有害であるので、クローン化
した遺伝子の生産物を細胞膜の外から回収する能
力とはしばしば細胞を害さないという意義を有
し、もし回収能力がないと、細胞は防衛的酵素を
生産して遺伝子生産物を分解するであろう。 外来DNAがクローニングベクターに挿入され
るべき正確な位置は輸送シグナルペプチド配列機
能が働くかにかかつている。いくつかの場合、輸
送シグナルペプチド配列は細胞の遺伝子自体の一
部として外来DNAのすぐ前に位置するかプラス
ミドにすでに存在するであろう。上記シグナル配
列自体は外来DNAの読み取り翻訳のために必要
なヌクレオチドの配列からなる。一方、輸送シグ
ナルペプチド配列が外来DNAのすぐ前に位置し
てはならない場合もある。そのような場合は開始
部位(外来のコドンによりコードされている)に
さらにいくつかのアミノ酸を有する所望のペプチ
ド配列を生成して必要な読み取り機能を提供する
必要がある。 下記例はこの発明が使用できる他の特定例を説
明するものであつてこの発明の範囲を限定しよう
とするものではない。 例 1 宿主微生物にとつて生来のものでない導入され
たあらかじめ決められた蛋白質を生産するため
のプラスミドの形成 宿主微生物にとつて生来のものでないあらかじ
め決められた蛋白質を生産するためのプラスミド
を提供するために、バチルス・リケニフオルミス
(B.licheniformis)β−ラクタマーゼ遺伝子を有
するプラスミドベクターをつくり、枯草菌(B.
subtilis)および大腸菌(E.coli)の両方において
複製された。上記プラスミドはβ−ラクタマーゼ
遺伝子を有する3.5Kb(キロベース(Kirobase))
EcoR−Sst断片を精製し、これを大腸菌(E.
coli)プラスミドpOP1Δ6(Gelfand et al.、proc.
the Nat.Acad.Sci.USA(1978)75、5869−5873)
の複製機能を有する2.1Kb EcoR−Sst断片
と結合させることによつて形成された。適当な大
腸菌(E.coli)CS412菌体(C600rkmkPr誘
導菌体)をこれで形質転換させ、形質発現のため
に適当な生育時間(90分)後に、Ap−耐性形質
転換株が得られた。3つのクローンからのプラス
ミドが得られた。pOG2110と断定されたプラス
ミドについてさらに特性をしらべた。第4図は
pOG2110において予期されかつ観察される限定
部位の位置を詳述するものである。枯草菌におい
てpOG2110を複製させるために、二機能レプリ
コンはpOG2110および枯草菌プラスミド
pOG1196を使用して形成された。pOG1196の形
成は第4図に総括されている。 プラスミドpC194(CmR)およびpUB110(KmR
の全配列を有するキメラ性プラスミド(pCS832)
は、最初pC194の2つのMbo断片をBam
切断pUB110と結合させることによつてつくら
れた。得られたプラスミドはpC194からのCm遺
伝子およびpUB110からKm(Nm)遺伝子を有し
ている。このプラスミドの大きさは7.5Kbであ
る。自然欠失突然変異体(プラスミドpCS1006)
はサブクローンのうちの1つから得られた。これ
はpC194において生じたHpa部位を失つてお
り、pC194複製域(Chang and Cohen、Molec.
Gen.Genet.、(1979)168、111〜115)に位置し
ていることが知られている。これはまだpUB110
の複製機能および2つのレジスタンスマーカーを
保持している。pCS1006の最大のHpa断片
(3.6Kb)を再循環させることによりプラスミド
pOG1196が得られた。このプラスミドはCm−耐
性のみを提供し、プラスミドpUB110からの複製
機能を有している。pOG1196の地図は第4図に
示されている。 大腸菌プラスミドpOG2110および枯草菌プラ
スミドpOG1196は各々2つおよび3つのPvu
位を有していた。等量のPvu切断pOG2110およ
びpOG1196プラスミドDNAを結合させ大腸菌
(E.coli)菌株CS412を形質転換させるのに使用し
た。Cm−耐性クローンを選択した。選択された
クローンはすべてAp−耐性でもあつた。Cm−耐
性Ap−耐性形質転換株の1つから単離された複
合プラスミドpOG2165をさらに研究した。この
7.5Kbプラスミドの地図は第4図に示されてい
る。プラスミドpOG2165は大腸菌と枯草菌の両
方において複製し、そのいずれの宿主にもCm−
およびAp−耐性を与える。 プラスミドpOG2165を有する枯草菌および大
腸菌はバチルス・リケニフオルミス(B.
licheniformis)β−ラクタマーゼ酵素の生産の
結果としてアンピシリンに耐性なのである。これ
はシエラツト(Sherratt)およびコーリング
(Colling)によつて開発されたPVAプレート検
定によつて示すことができる(参考文献9参照)。
そのような検定から得られた陽性の結果は第5図
に示されている。 pOG2165が枯草菌BD224中で増殖する場合、
結合した膜および分泌型の外来β−ラクタマーゼ
が合成される。この菌株により生産される量は使
用された生育条件に依存して変化する。
pOG2165は又枯草菌の菌株QB127(Kunst et al、
Bio.Chemie.(1974)56 1481−1490)中でも増殖
できる。QB127はレバンスクラーゼ
(levansucrase)、α−アミラーゼおよび細胞外蛋
白分解酵素のようないくつかのエキソエンチーム
を過剰生産せしめるsacUh変異した菌株である
QB127(pOG2165)の培養物中に検出されるβ−
ラクタマーゼのレベルは同一条件下にBD224
(pOG2165)において検出されるβ−ラクタマー
ゼのレベルと同じ程度である。 二機能プラスミドpOG2165自体は制限酵素Sst
HindstおよびBglに対して特異的部
位を有する。DNAをBglおよびPst部位に挿
入するとバチルス・リケニフオルミス(B.
licheniformis)β−ラクタマーゼ遺伝子を失活
させ、挿入物を担持しているクローンを同定する
ための確認容易な表現型を提供する。 挿入されるべきDNA配列の正確の読み取り枠
が既知の場合はBgl部位にクローンすることに
よりβ−ラクタマーゼエキソエンチームの最初の
71個のアミノ酸残基およびリーダー配列を有する
融合蛋白質をつくり出すことができる。この方法
でつくられた融合蛋白質はアミノ末端にあるリー
ダー配列の存在によりバチルス・リケニフオルミ
ス(Bacillus licheniformis)菌体から分泌され
る。これらの点からpOG2165は外来遺伝子のク
ローニングおよび有効な形質発現ならびにそれに
続く枯草菌および大腸菌中の遺伝子生産物の分泌
のために有用なベクターである。 一方、挿入されるべきDNA配列の正確な読み
取り枠が既知であつて、挿入がPst部位で行な
われる場合は、融合蛋白質は宿主微生物中に蓄積
するようにつくられる。Pst確認部位はシグナ
ルペプチドをコードしているヌクレオチド配列の
開始部分に位置しているので、外来遺伝子配列に
接する以前に該ヌクレオチド配列の一部分のみが
転写される。上記融合蛋白質が形質発現されて
も、上記シグナルペプチドのこの部分は通常のシ
グナルペプチドの分泌機能を提供するのには不充
分である。その結果としてPst部位に挿入され
た遺伝子の生産物は宿主微生物中に蓄積する。 バチルス・リケニフオルミス(Bacillus
licheniformis) Pen P遺伝子からなるヌクレ
オチド配列の一部が第6図に図式化されている。
β−ラクタマーゼプロモーター域はヌクレオチド
1および221oneとの間に位置するが、正確な
位置は未知である。シグナルペプチドを構成する
アミノ酸をコードするヌクレオチドはヌクレオチ
ド222で開始し、ヌクレオチド323で終了す
る。その結果、シグナルペプチドは34個のアミノ
酸からなる。Pst確認部位はヌクレオチド25
9と264の間、すなわちシグナルペプチド鎖の
アミノ酸13ないし15にある。外来DNAをこ
Pst部位に挿入すると外来DNA生産物および
上記シグナルペプチド鎖の最初の14個のアミノ酸
から構成される融合蛋白質が形成されよう。その
ような融合蛋白質は形質発現されても細胞膜を通
過して輸送されないであろう。うまく分泌させる
にはシグナルペプチド全体あるいはシグナルペプ
チド鎖の少なくとも最初の26個のアミノ酸残基と
融合させる必要がある。 例 2 バチルス・リケニフオルミス(B.
licheniformis)は分泌型(エキソエンチーム)
として大量のβ−ラクタマーゼを生産する。この
蛋白質の分泌は細胞膜と単層の細胞膜を通過して
蛋白質を輸送するのを促進するアミノ酸リーダー
配列との間の相互作用の結果であると信じられて
いる。β−ラクタマーゼ遺伝子をクローン化し、
枯草菌中で複製できるプラスミドに挿入された。
これらのプラスミドを次いで枯草菌(B.subtilis)
宿主に入れて形質転換し、β−ラクタマーゼと分
泌させた。該分泌はまず枯草菌にとつての外来遺
伝子に形質発現させ枯草菌菌体から培地または生
育培地へ遺伝子生産物を輸送させることからな
る。 バチルス・リケニフオルミス(B.
licheniformis)菌株からのβ−ラクタマーゼ遺
伝子をクローンするために、バチルス・リケニフ
オルミス(B.licheniformis)菌株749/Cから全
染色体DNAを単離しEcoR制限エンドヌクレア
ーゼにより切断した。Marmurの方法(J.of
Molec.Biol.(1961)、208−18)によつてバチ
ルス・リケニフオルミス(B.licheniformis)
749/Cから染色体DNAを調製した。大腸菌(E.
coli)プラスミドpSC101をKupersztochおよび
Helinski(Biochem.Biophys.Res.Commun.
(1973)54、1451−59)の菌体溶解澄明液をつく
る工程(cleared lysate procedure)により菌体
から単離した。3μgの染色体DNAおよび2μgの
pSC101DNAをエンドヌクレアーゼEcoRで切
断し、Hershfield、et al.proc.Natl.Acad.Sci.
USA(1974)71、3455−59に記載されている方法
でT4DNAリガーゼで結合し、大腸菌(E.coli)
菌株CS412(C600のrkmkPro誘導体)の適当
な細胞にCohen、et al.Proc.Natl.Acad.Sci.、
USA(1972)69、2110−14の方法によつて組み込
まれた。 10μg/mlのアンピシリンに耐性の形質転換体
を選択し、組み換えプラスミドpTB2を有する上
記形質転換体の1つをさらに研究した。プラスミ
ドpTB2はpSC101ベクター上に4.2Kb(キロベー
ス対)EcoR断片を有している。このプラスミ
ドは宿主にテトラサイクリン(pSC101上のマー
カー)およびアンピシリン耐性を与え、培地中の
アンピシリンを分解する機能的酵素としてのβ−
ラクタマーゼ遺伝子生産物をつくることが示され
る。 β−ラクタマーゼ遺伝子は上記4.2キロベース
対のEcoR断片上にある。種々の制限酵素およ
び遺伝子クローニングを使用してこの断片を分析
すると、第1図において部分的に地図として示さ
れているようなβ−ラクタマーゼのための遺伝子
の構造が導かれてくる。バチラス・リケニフオル
ミス(B.licheniformis)菌株749/Cから得られ
るβ−ラクタマーゼの主たる配列はすでに決定さ
れている(R.J.Meadway、Ph.D.、エジンバラ大
学論文)。既知アミノ酸配列から、Gly−Pro(116
−117の位置)配列がヌクレオチド配列GGN−
CCNに対応し、これはエンドヌクレアーゼSau96
(GGNCC)のための確認配列である。同様
に、Trp−Pro(222−223の位置)配列はヌクレオ
チドコドンTGG−CCNによつてコードされ、該
コドン内に中央のテトラヌクレオチド配列GGCC
が認められ、エンドヌクレアーゼHae
(Roberts,DNA Insertion Elements、Plasm
ds、and Episomes、1977、Bukhari、Shapiro
and Adhya、Cold Spring Harbor Lad、p757)
によつて開裂される。 供給者(マサチユーセツツ州01915、ビバーリ
イのニユーイングランド・バイオラブズ・インコ
ーポレーテツド(New England Biolads、Inc.)
1978カタログ)によつて特定されている条件を使
用して第2図に示されているよな数々のエンドヌ
クレアーゼによつて上記4.2Kbクローン化断片が
分析された。切断されたDNAをSharp、et al.
Biochemistry(1973)12、3055−63によつて記載
されているようにアガロースゲル上で分析し、ア
クリルアミドゲル(Maxam and Gillert、Natl.
Acad.Sci.、USA(1973)73、3942−46)の上で
分析した。地図化するためのデータは第2図にま
とめてある。Sau96部位およびHae部位は完
全なβ−ラクタマーゼ遺伝子配列を含有する
2.3Kb Pvu断片に局在していた。これら2つ
の部位はヌクレオチド320個離れており、これは
上記蛋白質配列データにおいてアミノ酸106個離
れているのと一致する。 β−ラクタマーゼ遺伝子を含むヌクレオチド配
列を固定後、該遺伝子を種々のバチルス
(Bacillus)プラスミドおよび枯草菌(B.
subtilis)−大腸菌(E.coli)融合プラスミドを使
用して枯草菌に導入した。プラスミドはpUB110
およびpC221誘導プラスミドであつた。この組み
換えプラスミドを有する上記枯草菌株は、アンピ
シリンに耐性となるばかりでなくPVAプレート
上でのβ−ラクタマーゼ反応が陽性である。(第
3図参照)さらに、β−ラクタマーゼ活性は菌体
をとり除いた後も培養物中に検出された。この活
性は、枯草菌の外来遺伝子がうまく形質発現した
ばかりでなく細胞膜を通して蛋白質が培養物すな
わち成育培地中にうまく輸送されたことを示して
いる。 β−ラクタマーゼ遺伝子を含むEco R断片
を大腸菌(E.coli)について上述した方法を使用
して枯草菌プラスミドベクターpUB110
(Gryczan and Dubnau、Proc.Natl.Acad.Sci.、
U.S.A.、(1978)75、1428−1432)およびpC221
(Ehrlich、Proc.Natl.Acad.Sci.、USA(1977)
74、1680−82)の各EcoR部位にクローンした。
同様に、β−ラクタマーゼ遺伝子を含む2.3Kb
Pva断片はPva部位およびTac部位におい
pUB110にクローンされた。 結合DNA調製物(ligated DNA
preparations)を使用してChangおよびCohen、
Molec.Gen.Genet.、(1979)168、111−115の方
法(参考文献7参照)によつて枯草菌菌株
BD224(recE4、trpC2、thr5)を形質転換した。
継代プレート上でアンピシリンに耐性の形質転換
株を選択し試験した。β−ラクタマーゼの生産は
2つの方法によつて検出される。1つはSherratt
およびCollins(J.Gen.Microbiol.(1973)76、217
−230)によつて開発された感受性プレート検定
であり、他はRossおよびO Callaghan(Meth.in
Enzymology、(1975)43 6.9〜85)によつて記
載されているヨードメトリツク検定である。アン
ピシリンに耐性の枯草菌クローンは上記2つの方
法に陽性の結果を与えた。さらに、ヌクレオチド
−ラクタマーゼ活性も菌体を除去した後の培地に
検出された。このことは、β−ラクタマーゼが生
産されただけでなく枯草菌から排出されたことを
示す。 外来遺伝子を枯草菌内にクローニングし、該遺
伝子に細胞内蛋白質として機能的形質発現をさせ
ることはKeggins Proc.Natl.Acad.Sci.USA
(1978)75、1423−1427にすでに示されている。
しかし、この研究において、クローンされた遺伝
子は通常野性型枯草菌(Wild type B.subtilis)
の細胞内に存在する酵素のためのコードを有する
遺伝子であつて、枯草菌にとつて生来のものでな
い遺伝子をうまく形質発現させ、これらの遺伝子
の生産物をうまく分泌させることについては示さ
れていない。 この例によつて示されたβ−ラクタマーゼ遺伝
子についての研究は新しい機能、つまりβ−ラク
タマーゼ生産機能が遺伝子クローニング技術によ
つて枯草菌に導入できることを初めて示したもの
である。さらに、この例は外来遺伝子生産物を枯
草菌細胞膜の障壁を通して外来蛋白質(エキソプ
ロテイン)として分泌させることができることを
初めて示したものである。市販されている有用な
生産物であるβ−ラクタマーゼはこの酵素を他の
手段では生産できない菌株によつて生産される。 例 3 例2に記載されているバチルス・リケニフオル
ミス(B.licheniformis)β−ラクタマーゼ遺伝
子は、大腸菌(E.coli)において複製され得るプ
ラスミドにも挿入した。これらのプラスミドを例
2において枯草菌について記載したと同一の方法
を使用して大腸菌宿主に入れて形質転換した。こ
れらのプラスミドを有する大腸菌菌体は、バチル
ス・リケニフオルミス(B.licheniformis)β−
ラクタマーゼ酵素生産の結果としてアンピシリン
に対して耐性である。これはSherrattおよび
Collinsによつて開発されたPVAプレート検定
(参考文献9参照)によつて示される。 バチルス・リケニフオルミスβ−ラクタマーゼ
遺伝子を有するプラスミドが大腸菌内で増殖する
場合、該β−ラクタマーゼの分泌型は枯草菌にお
けるように倍地に輸送されない。大腸菌は細菌細
胞膜を囲む細胞壁を有するので外来蛋白生産物は
細胞膜と細胞壁を隔離しているペリプラズミツク
間隙(periplasmic space)に輸送される。β−
ラクタマーゼエキソエンザイムは原形質の周囲の
間隙に蓄積され、次いで適当な方法により回収さ
れる。 例 4 バチルス・リケニフオルミス(B.
licheniformis)のβ−ラクタマーゼは、枯草菌
または大腸菌において機能することができるシグ
ナルペプチド配列の唯一の源ではない。上述の如
く、多くの蛋白質(特に成熟核において)は細胞
膜を通して輸送される。“シグナル領域
(region)”の正確なアミノ酸配列は実際には輸送
された種々の蛋白質によつて異なるが、これらの
シグナル域の折り重ねられた構造(Chou and
Fasman Ann.Rev.Biochem.(1978)47、251〜
276の法則によつて予測できる)は非常に類似し
ている。このように輸送シグナルペプチド配列に
対する要件は非バチルス(Bacillus)シグナルペ
プチド類によつて満たされ得るが、シグナル配列
をコードしているDNA断片はバチルスプロモー
ターおよびリボゾーム結合位塩基配列から下流の
方へ正しく位置している。 所望の遺伝子生産物のために使用できる上記の
ような成熟核輸送シグナル配列の1つはインシユ
リンB鎖に先立つシグナルすなわち先駆体配列
(presequence)である。(種々のインシユリン鎖
A、BおよびCは単一のポリペフチドとしてつく
られ、組立てられ、内質網状組織で処理され、細
胞によつて排出される。)しかしながら、インシ
ユリン先駆体配列には、外来DNAのクローン化
した遺伝子と結合させるのに使用できるシグナル
ペプチド配列のすぐ後の便利な制限部位がない。
しかしながら、インシユリンのシグナル配列の最
後の5つのヌクレオチドはAGGCTであつてイン
シユリンB鎖自体の最初のヌクレオチドはTであ
る。これらの6つのヌクオチドはいつしよになる
とAGGCTTであつて制限酵素Hindのため確認
配列であるAAGCTTとは1つのヌクレオチドが
異なる。この酵素は2つのAsの間を切断する。
外来DNAが同じ酵素Hindを使用あるいは半
Hind部位二機能性リンカー(half Hind
site bifunctional linlcer)を使用してクローン
化され、あるいは分離される場合、上記外来
DNAが挿入されると上記配列はもとにもどる。 単一のヌクレオチドGxをAに変換して米国特
許出願第133150号(Bahlによる)に記載された
方法によつてHind部位を提供することができ
る。この工程では変換すべきヌクレオチドを露出
し、変え、配列を再構成する。この変換によりシ
グナル配列の次のアミノ酸ないし最後のアミノ酸
が変化することはない。 DNA結合はHershfield et al.Proc.Natl.Acad.
Sci.USA(1974)71、3455−3459に記載されてい
るようにして達成できる。逆転写酵素はBahl et
al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA(1977)74、966−
970によつて記載されるようなDNAポリメラーゼ
として使用できる。形質転換はCohen et
alProc.Natl.Acad.Sci.USA(1973)70、3240−
3244によつて記載されるように進行する。 例 5 上記例4に記載された方法は技術的に便利であ
るが、成熟核リーダー配列に関するものであつ
て、一般的開発にのみ有用であり得る。商業的立
場からのもつとも有用な研究が原核(細菌)宿主
についてなされているのがふつうである。ほんの
少しの上記の如きシグナル配列のみが原核系につ
いて知られているだけであるが、よく特性がしら
べられている1つの配列はTEMβ−ラクタマー
ゼからの配列である。(SutcliffeProc.Nath.
Acad.Sci USA(1976)75、3747−3741)この配
列は先駆体の配列プロセシングのための位置に何
ら便利な制限部位がない以外はクローニングされ
た遺伝子に付加するには理想的である。シグナル
配列にもつとも近い制限部位はMbo部位であ
つて16個の外来アミノ酸をクローン化遺伝子生産
物に結合させる。 しかしながら、TTTGCTであるシグナル配列
の末端部分は上述の技術の1つによつて
TTTGATに変換できる。この後者の配列が
TEMβ−ラクタマーゼ遺伝子の最初のいくつか
の下記ヌクレオチドに沿つて読まれる場合、Bcl
(TGATCA)のための制限部位が存在する。
これにより最後のアミノ酸がAla(アラニン)か
らAsp(アスパラギン酸)に変わり、外来DNAの
最初の付加されたヌクレオチドが何であるかに依
つて1つの外来アミノ酸、すなわち、Glu(グル
タミン酸)またはHis(ヒスタミン酸)のどちら
かを上記遺伝子生産物に付加させる。 ヌクレオチド鎖を上記の如く変化させるために
は、上記方法を使用して短い断片を合成する。上
記シグナル配列より上流に制限部位(Tha)が
あり、下流に制限部位Mboがある。さらに下
流にはtaq部位が存在する。Thaの制限条件は
Mc Connell et al.、Nucleic AcidRes(1978)
5、1729−1939に記載された条件に従い、Mbo
の制限条件はGelinas et al.、J.Mol.Biol
(1977)114:169〜179に記載された条件に従い、
Taqの制限条件はSato et al.、Proc.Natl.
Acad.Sci.USA(1977)74;542〜546に記載され
た条件に従う。ただし、Mboに関しては、
DNAはデオキシアデノシンメチラーゼを欠く宿
主細胞GM119において調製されて各部位
(regions)のメチル化を避け、Mbo切断を防止
する。この後者の関係でMarinus and Morris、
Mutat.Res.(1975)28、15〜26を参照されたい。
別法としては、制限エンドヌクレアーゼSAU
3A、すなわちMboのイソチゾーム
(isoschizome)を使用してDNAを宿主から単離
することができる。 したがつて、この発明は外来のクローニングさ
れた遺伝子生産物の制御された蓄積のための方法
およびベクターを提供することが理解されよう。
これらの生産物を宿主細胞の外に移動すなわち輸
送すれば生産物を最小の制限を伴なうに止めて回
収でき、宿主細胞または遺伝子生産物自体のいず
れかの分解あるいは破壊のおそれをなくす。 本明細書の記載から、該明細書に記載した発明
の外に種々の変形が可能であることは当業者には
明らかであろう。そのような変形も本発明の範囲
内にあるものとみなされる。 本発明に関する参考文献は次のとおりである。 1 Bahl、C.P.、Wu、R.、Stawinsky、J.and
Narang、S.A.、Proc.Nat.Acad.Sci.、USA
(1977)74、966−970. 2 Chang、A.and Cohen、S.、Molec Gen.
Genet.、(1979)168、111−115. 3 Chou、P.Y.and Fasman、G.D.、Ann.Rev.
Biochem.、(1978)、47、251−276. 4 Cohen、S.N.and Chang、A.C.Y.、Proc.
Nat.Acad.Sci.、USA、(1972)、69、2110−
2114. 5 Cohen、S.N.、Chang、A.C.Y.、Boyer、H.
W.and Helling、R.B.、Proc.Nat.Acad.Sci.、
USA、(1973)70、3240:3244. 6 Ehrlich、S.D.、Proc.Nat.Acad.Sci.、USA
(1977)74、1680−1682. 7 Gelinas、R.E.、Myers、P.A.and Roberts、
R.J.、J.Molec.Biol.、(1977)114、169−179. 8 Gelfand、D.、Shepard、H.、O′Farrell、P.
and Polisky、B.、Proc.Nat.Acad.Sci.、
USA、(1978)75、5869−5873. 9 Grycazn、T.J.、and Dubnau、D.、Proc.
Nat.Acad.Sci.、USA、(1978)75、1428−
1432. 10 Hershfield、V.、Boyer、H.W.、
Yanofsky、C.、Lovett、M.A.and Helsinki、
D.R.、Proc.Nat.Acad.Sci.、USA、(1974)
71、3455−3459. 11 Keggins、K.M.、Lovett、P.S.and Duvall、
E.J.、Proc.Nat.Acad.Sci.、USA、(1978)75
1423−1427. 12 Kunst、F.、Pascal、M.、Lepesant−
Kejzlarova、J.、Lepesant、J.、Billault、A.
and Dedonder、R.、Bio.Chemie.、(1974)
56、1481−1490. 13 Kupersztoch、Y.and Helinski、D.、
Biochem.Biophys.Res.Commun.、(1973)54
1451−1459. 14 Marinus、M.G.and Morris、N.R.、Mutat.
Res.、(1975)28、15−26. 15 Marmur、J.、J.Molec.Biol.、(1961)
208−218. 16 Maxam.A.and Gilbert、W.、Proc.Nat.
Acad.Sci.、USA、(1973)73、3942−3946 17 McConnell、D.J.、Searcy、D.G.and
Sutcliffe、J.G.、Nucleic Acids Res.、(1978)
5、1729−1739. 18 Meadway、R.J.Ph.D.Thesis、University
of Edinburgh、(1969). 19 Roberts、R.J.、in DNA Insertion
Elements、Plasmi ds and Episomes、
(1977)、Editors、Bukhari、A.I.,Shapiro、
J.A.、and Adhya、S.L.、Cold Spring
Harbor Laboratory、Pages757−468. 20 Ross、G.W.and O:Callaghan、C.H.、
Meth.Enzymol.、(1975)43、69−85. 21 Sato、S.、Hutchison、D.A.III and
Harris、J.I.、Proc.Nat.Acad.Sci.USA
(1977)、74、542−546. 22 Sharp、P.A.、Sugden、B.and Sambrook、
J.、Biochem.、(1973)12、3055−3063 23 Sherratt、D.J.and Collins、J.F.、J.Gen.
Microbiol.、(1973)、76、217−230. 24 Sutcliffe、J.G.、Proc.Nat.Acad.Sci.、
USA、(1978)75、3737−3741.
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The present invention relates to molecular biology and in particular to so-called recombinant DNA. This invention relates to a method for producing a genetically modified bacterium in which a cloned foreign gene is introduced into a Gram-positive bacterium such as Bacillus subtilis to produce the gene product under controlled conditions. Collection of items will be promoted. This invention discloses a novel genetically engineered plasmid. Examples of these microorganisms have been deposited under the Treaty of Budapest at the American Type Culture Center (ATCC), Rockville, Maryland 20852. Plasmid pOG1196 is ATCC No. 31776; Plasmid pOG2165 is ATCC No. 31777; Plasmid
pOG2110 is ATCC No. 31778. As is well known, the amino acid sequence of a particular protein is determined by the code carried in the gene for that protein. Methsenjar RNA from DNA
During the process of translation to form proteins through It is placed at the corresponding position of the above protein chain. With the advent of recombinant DNA technology, genetic changes can be made artificially by introducing predetermined nucleotide sequences synthesized or isolated from one strain or species into the genes of another strain or species. I am now able to do it properly. A known nucleotide sequence can be selected such that a strain or species into which the nucleotide sequence is introduced will produce the protein encoded by the known nucleotide sequence as part of the process of translation. A strain or species that has undergone such manipulation also replicates the introduced nucleotide sequence in the normal course of replication. Recombinant DNA technology consists of isolating the appropriate DNA strand (cloning vector) and cutting the two strands of DNA of the cloning vector at the location where you want to insert the foreign DNA. To do this,
Certain types of proteins, so-called restriction enzymes, are typically used. Restriction enzymes will cut DNA at specific nucleotide sequences, but for some restriction enzymes, the cuts will not necessarily occur at the same position of the two intertwined DNA strands. In such cases, if two different types of DNA are cut in the same way, each cleaved end will be complementary to each other and, under appropriate conditions, will interlock with a parallel complementary end. These ends are then joined together by an enzyme (ligase). This means that the two
It allows even DNA fragments to be incorporated into a single DNA molecule. Once the DNA vector has been isolated and the foreign fragment inserted, the recombinant DNA is placed into a suitable host microorganism. In order for the host microorganism to replicate the inserted DNA, it is necessary to insert the recombinant DNA into the host microorganism so that it becomes part of the host microorganism's genetic system. Once the foreign DNA has been successfully integrated into the host microorganism and the host microorganism produces the product of the cloned gene, the desired product must be recovered. Prior to the present invention, recovering this product required killing the cells producing the desired product. Also, cells contain many different proteins, making methods of isolating the desired product difficult or complicated. Ultimately, the desired product is harmful to the host cell, especially if it is produced at high levels. In some cases this causes the cell to disintegrate, and in other cases the cell's defense mechanisms are activated to degrade the desired product. Most of the recombinant DNA research to date has been carried out in E. coli, which lives in the periplasmic space.
It is a type of Gram-negative bacterium that has a two-layered cell membrane that encloses the cells. Many of the products produced in E. coli are secreted into this periplasmic space. Only a small amount of product is secreted from living cells into the growth medium. On the other hand, for example, it is a member of the Gram-positive bacteria group that has only a single cell membrane. Bacillus subtilis
produces large amounts of protein, which is secreted directly into the growth medium. A common research method for gene cloning in E. coli is Bacillus subtilis (B.
However, attempts to induce B. subtilis to produce useful products from foreign genes and secrete them into the growth medium have not been successful. Bacillus subtilis is somewhat preferred over E. coli because of its high efficiency of plasmid-mediated transformation and lack of pathogenicity. BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS The objects of the invention will become apparent from the following description, taken in conjunction with the accompanying drawings. Figure 1 is an overall diagram showing a partial structural map of a DNA fragment containing the gene for β-lactamase obtained from Bacillus licheniformis; Figure 2 shows many of the fragments in Figure 1. Fig. 3 is an overall diagram showing the correspondence between the nucleotide sequence of the fragment and the amino acid sequence present in the protein encoded by the fragment; Fig. 3 is a typical appearance of a plate on which a Bacillus subtilis strain containing a recombinant plasmid is grown; FIG. 2 is a schematic diagram showing the plate β
- Shows the situation after performing the PVA assay to test lactamase activity. Figure 4 shows E. coli plasmid pOG2110.
Figure 5 is a general diagram illustrating the structure of B. subtilis plasmid pOG1196 and bifunctional plasmid pOG2165; Figure 5 shows a typical appearance of a plate on which various bacterial strains carrying recombinant plasmids are grown; Figure 6 shows the plate after PVA assay for testing β-clatamase activity; Figure 6 shows Bacillus licheniformis (B.
This is a diagram of the nucleotides that make up part of the Pen P gene. In one embodiment of the present invention, B. subtilis
A predetermined protein that is not native to B. subtilis is produced by expression in Bacillus subtilis.
B. subtilis with plasmid introduced
A suitable growth medium and conditions are provided for growing this strain. The plasmid is capable of replicating in the strain and contains the gene for the predetermined protein. The gene is located and oriented in the plasmid so that it is under the control of an operator, a promoter, and a ribosome binding site sequence. This protein is also placed under the control of transport machinery secreted by the host strain. Upon secretion, this protein is recovered from the growth medium. The method of the invention requires a cloning vector microorganism having a nucleotide sequence capable of initiating the transcription and translation process. The nucleotides providing the operator, promoter, and ribosomal binding site sequences may be present naturally in the vector, inserted as independent DNA fragments using recombinant DNA techniques, or inserted as part of the foreign DNA carrying the important gene. Department.
Foreign DNA, which will contain at least the structural gene for the desired protein product, is incorporated into a cloning vector so that it can be transcribed and translated under the control of an operator, a promoter, and a ribosome binding site sequence. For the inserted foreign DNA to be translated correctly, the nucleotides in the inserted DNA must be in the correct reading frame. Additionally, the cloning vector contains a sufficient number of nucleotides native to the host cell to ensure that the operator, promoter, and ribosomal binding site sequences are read and translated into the inserted foreign DNA in the correct reading frame. It is desirable or necessary to contain. According to the invention, the cloning vector utilized consists of a nucleotide sequence consisting of codons for a functional transport signal peptide sequence. Transport signal peptide sequences are usually short leader sequences of amino acids on newly created proteins. Although the mechanism by which transport signal peptide sequences operate is not yet fully understood, it is thought that transport proteins are excreted by cells, and as proteins are produced, they latch onto and pull the produced proteins out of the cytoplasm. ing. Once the transport function is performed by the transport signal peptide sequence, the transport sequence is removed by natural processes. According to the invention, foreign DNA can be inserted into a cloning vector such that the protein encoded by this DNA is transported according to the transport signal peptide sequence encoded by the signal codon. The thus cloned gene product is conveniently transported to a desired location and recovered therefrom. This has several advantages. Since the location is outside the cell, the host cell does not need to be destroyed for recovery of the gene product, so the gene product can be produced continuously without interruption. Also, since cells contain so many proteins, the ability to excrete the products of cloned genes greatly simplifies the isolation and purification of the products. After all, the product of a cloned gene can be harmful to the host cell, especially when produced at high levels, so the ability to retrieve the product of a cloned gene from outside the cell membrane often means that it does not harm the cell. Significantly, if there is no salvage capability, cells will produce defensive enzymes to degrade the gene product. The exact location at which the foreign DNA should be inserted into the cloning vector depends on the functioning of the transport signal peptide sequence. In some cases, the transport signal peptide sequence will immediately precede the foreign DNA, as part of the cell's gene itself, or will already be present on a plasmid. The signal sequence itself consists of a nucleotide sequence necessary for reading and translating foreign DNA. On the other hand, there are cases in which the transport signal peptide sequence should not be located immediately in front of the foreign DNA. In such cases it is necessary to generate the desired peptide sequence with a few more amino acids at the start site (encoded by the foreign codon) to provide the necessary reading function. The following examples are intended to illustrate other specific examples in which the invention may be used and are not intended to limit the scope of the invention. Example 1 Formation of a plasmid for producing an introduced predetermined protein that is not native to the host microorganism Providing a plasmid for producing a predetermined protein that is not native to the host microorganism For this purpose, we created a plasmid vector containing the B. licheniformis β-lactamase gene and used it to infect Bacillus subtilis (B.
subtilis) and E. coli. The above plasmid is 3.5Kb (Kirobase) containing the β-lactamase gene.
The EcoR-Sst fragment was purified and transferred to Escherichia coli (E.
coli) plasmid pOP1Δ6 (Gelfand et al., proc.
the Nat.Acad.Sci.USA (1978) 75 , 5869−5873)
2.1 Kb EcoR -Sst fragment with replication function. Appropriate E. coli CS412 cells (C600rk - mk + Pr-induced cells) were transformed with this, and after an appropriate growth time (90 minutes) for gene expression, Ap-resistant transformants were obtained. Obtained. Plasmids from three clones were obtained. The plasmid identified as pOG2110 was further characterized. Figure 4 is
Figure 2 details the locations of expected and observed restriction sites in pOG2110. To replicate pOG2110 in B. subtilis, the bifunctional replicon combines pOG2110 and the B. subtilis plasmid.
Formed using pOG1196. The formation of pOG1196 is summarized in Figure 4. Plasmids pC194 ( CmR ) and pUB110 ( KmR )
Chimeric plasmid (pCS832) containing the entire sequence of
first converted the two Mbo fragments of pC194 into BamH
generated by ligation with truncated pUB110. The resulting plasmid contains the Cm gene from pC194 and the Km (Nm) gene from pUB110. The size of this plasmid is 7.5Kb. Natural deletion mutant (plasmid pCS1006)
was obtained from one of the subclones. It has lost the Hpa site that occurred in pC194, and the pC194 replication region (Chang and Cohen, Molec.
Gen. Genet., (1979) 168 , 111-115). This is still pUB110
It retains a replication function and two resistance markers. Plasmid by recycling the largest Hpa fragment (3.6Kb) of pCS1006
pOG1196 was obtained. This plasmid provides only Cm-resistance and has the replication function from plasmid pUB110. A map of pOG1196 is shown in Figure 4. E. coli plasmid pOG2110 and Bacillus subtilis plasmid pOG1196 had two and three Pvu sites, respectively. Equal amounts of Pvu -cut pOG2110 and pOG1196 plasmid DNA were ligated and used to transform E. coli strain CS412. Cm-resistant clones were selected. All selected clones were also Ap-resistant. The composite plasmid pOG2165, isolated from one of the Cm-resistant Ap-resistant transformants, was further studied. this
A map of the 7.5Kb plasmid is shown in Figure 4. Plasmid pOG2165 replicates in both E. coli and Bacillus subtilis, and Cm-
and Ap − confers resistance. Bacillus subtilis and E. coli carrying plasmid pOG2165 are Bacillus licheniformis (B.
licheniformis) is resistant to ampicillin as a result of the production of the β-lactamase enzyme. This can be demonstrated by the PVA plate assay developed by Sherratt and Colling (see reference 9).
A positive result from such an assay is shown in FIG. When pOG2165 is grown in B. subtilis BD224,
A membrane bound and secreted exogenous β-lactamase is synthesized. The amount produced by this strain varies depending on the growth conditions used.
pOG2165 is also a Bacillus subtilis strain QB127 (Kunst et al.
Bio. Chemie. (1974) 56 1481-1490). QB127 is a sacU h mutated strain that overproduces several exoenzymes such as levansucrase, alpha-amylase, and extracellular proteolytic enzymes.
β- detected in cultures of QB127 (pOG2165)
Lactamase levels are BD224 under the same conditions
(pOG2165). The bifunctional plasmid pOG2165 itself contains the restriction enzyme Sst
, Hind , st and Bgl . Inserting DNA into the Bgl and Pst sites produces Bacillus licheniformis (B.
licheniformis) inactivates the β-lactamase gene and provides an easily confirmed phenotype to identify clones carrying the insert. If the exact open reading frame of the DNA sequence to be inserted is known, the first part of the β-lactamase exoenzyme can be prepared by cloning into the Bgl site.
Fusion proteins with 71 amino acid residues and a leader sequence can be created. The fusion protein produced by this method is secreted from Bacillus licheniformis cells due to the presence of a leader sequence at the amino terminus. In these respects, pOG2165 is a useful vector for cloning and efficient expression of foreign genes and subsequent secretion of the gene products in Bacillus subtilis and E. coli. On the other hand, if the exact reading frame of the DNA sequence to be inserted is known and the insertion is made at the Pst site, the fusion protein is made to accumulate in the host microorganism. Since the Pst confirmation site is located at the beginning of the nucleotide sequence encoding the signal peptide, only a portion of the nucleotide sequence is transcribed before encountering the foreign gene sequence. Even if the fusion protein is expressed, this portion of the signal peptide is insufficient to provide normal signal peptide secretion function. As a result, the product of the gene inserted into the Pst site accumulates in the host microorganism. Bacillus licheniformis
A portion of the nucleotide sequence consisting of the Pen P gene (B. licheniformis) is diagrammatically shown in FIG.
The β-lactamase promoter region is located between nucleotides 1 and 221, but the exact location is unknown. The nucleotides encoding the amino acids that make up the signal peptide begin at nucleotide 222 and end at nucleotide 323. As a result, the signal peptide consists of 34 amino acids. Pst confirmation site is nucleotide 25
9 and 264, ie, amino acids 13 to 15 of the signal peptide chain. Insertion of foreign DNA into this Pst site will form a fusion protein consisting of the foreign DNA product and the first 14 amino acids of the signal peptide chain. Although such a fusion protein is expressed, it will not be transported across the cell membrane. Successful secretion requires fusion with the entire signal peptide or at least the first 26 amino acid residues of the signal peptide chain. Example 2 Bacillus licheniformis (B.
licheniformis) is a secreted type (exoenzyme)
It produces large amounts of β-lactamase. Secretion of this protein is believed to be the result of interactions between the cell membrane and an amino acid leader sequence that facilitates transport of the protein across the monolayer cell membrane. Cloning the β-lactamase gene,
inserted into a plasmid that can replicate in Bacillus subtilis.
These plasmids were then transformed into B. subtilis
The cells were transformed into a host and secreted β-lactamase. The secretion consists of first expressing a gene foreign to Bacillus subtilis and transporting the gene product from the Bacillus subtilis cells to the medium or growth medium. Bacillus licheniformis (B.
To clone the β-lactamase gene from a B. licheniformis strain, total chromosomal DNA was isolated from B. licheniformis strain 749/C and cut with EcoR restriction endonuclease. Marmur's method (J.of
B. licheniformis by Molec.Biol. (1961) 3 , 208-18)
Chromosomal DNA was prepared from 749/C. Escherichia coli (E.
coli) plasmid pSC101 with Kupersztoch and
Helinski (Biochem.Biophys.Res.Commun.
(1973) 54, 1451-59). 3μg chromosomal DNA and 2μg
pSC101DNA was cut with the endonuclease EcoR and purified by Hershfield, et al.proc.Natl.Acad.Sci.
USA (1974) 71, 3455-59 by ligating with T4 DNA ligase and
Cohen, et al . Proc . Natl. Acad . Sci.;
USA (1972) 69, 2110-14. Transformants resistant to 10 μg/ml ampicillin were selected and one of the above transformants carrying recombinant plasmid pTB2 was further studied. Plasmid pTB2 carries a 4.2 Kb (kilobase pair) EcoR fragment on the pSC101 vector. This plasmid confers tetracycline (marker on pSC101) and ampicillin resistance to the host, and β-
It has been shown to produce lactamase gene products. The β-lactamase gene is located on the 4.2 kilobase pair EcoR fragment. Analysis of this fragment using various restriction enzymes and gene cloning leads to the structure of the gene for β-lactamase as partially mapped in FIG. The main sequence of β-lactamase obtained from B. licheniformis strain 749/C has been determined (RJ Meadway, Ph.D., University of Edinburgh dissertation). From the known amino acid sequence, Gly-Pro (116
−117 position) sequence is the nucleotide sequence GGN −
Corresponding to CCN, this is the endonuclease Sau 96
This is the confirmation sequence for (GGNCC). Similarly, the Trp-Pro (positions 222-223) sequence is encoded by the nucleotide codon TGG-CCN, with a central tetranucleotide sequence GGCC
was recognized, endonuclease Hae
(Roberts, DNA Insertion Elements, Plasm
ds, and Episomes, 1977, Bukhari, Shapiro.
and Adhya, Cold Spring Harbor Lad, p757)
cleaved by Supplier (New England Biolads, Inc., Beverly, Mass. 01915)
The 4.2 Kb cloned fragment was analyzed with a number of endonucleases as shown in FIG. 2 using conditions specified by (1978 catalog). The cut DNA was prepared by Sharp, et al.
Biochemistry (1973) 12, 3055-63 and analyzed on agarose gels and acrylamide gels (Maxam and Gillert, Natl.
Acad.Sci., USA (1973) 73 , 3942-46). The data for mapping are summarized in Figure 2. Sau 96 and Hae sites contain the complete β-lactamase gene sequence
It was localized to a 2.3Kb Pvu fragment. These two sites are separated by 320 nucleotides, which is consistent with the separation of 106 amino acids in the protein sequence data above. After fixing the nucleotide sequence containing the β-lactamase gene, the gene was transferred to various Bacillus plasmids and Bacillus subtilis.
subtilis)-E. coli fusion plasmid was used to introduce it into Bacillus subtilis. The plasmid is pUB110
and pC221 derived plasmid. The Bacillus subtilis strain containing this recombinant plasmid is not only resistant to ampicillin but also positive in the β-lactamase reaction on PVA plates. (See Figure 3) Furthermore, β-lactamase activity was detected in the culture even after the bacterial cells were removed. This activity indicates that not only was the foreign gene of Bacillus subtilis successfully expressed, but also that the protein was successfully transported through the cell membrane into the culture or growth medium. The Eco R fragment containing the β-lactamase gene was inserted into the Bacillus subtilis plasmid vector pUB110 using the method described above for E. coli.
(Gryczan and Dubnau, Proc. Natl. Acad. Sci.,
USA, (1978) 75 , 1428−1432) and pC221
(Ehrlich, Proc. Natl. Acad. Sci., USA (1977)
74, 1680-82) into each EcoR site.
Similarly, the 2.3Kb containing the β-lactamase gene
The Pva fragment was cloned into pUB 110 at the Pva and Tac sites. ligated DNA preparation
Chang and Cohen,
B. subtilis strains by the method of Molec. Gen. Genet., (1979) 168, 111-115 (see reference 7).
BD224 (recE4, trpC2, thr5) was transformed.
Transformants resistant to ampicillin were selected and tested on passage plates. β-lactamase production is detected by two methods. One is Sherratt
and Collins (J.Gen.Microbiol. (1973) 76 , 217
-230) and the other is the susceptibility plate assay developed by Ross and O Callaghan (Meth.in
Enzymology, (1975) 43 6.9-85). Bacillus subtilis clones resistant to ampicillin gave positive results to the above two methods. Furthermore, nucleotide-lactamase activity was also detected in the medium after bacterial cells were removed. This indicates that β-lactamase was not only produced but also excreted from B. subtilis. Keggins Proc.Natl.Acad.Sci.USA describes the method of cloning a foreign gene into Bacillus subtilis and allowing the gene to express functionally as an intracellular protein.
(1978) 75 , 1423-1427.
However, in this study, the cloned genes were usually derived from wild type B. subtilis.
It has not been demonstrated that Bacillus subtilis can successfully express genes that code for enzymes present in B. subtilis cells and secrete the products of these genes. do not have. The study of the β-lactamase gene demonstrated by this example shows for the first time that a new function, the β-lactamase production function, can be introduced into Bacillus subtilis by gene cloning techniques. Furthermore, this example is the first to demonstrate that a foreign gene product can be secreted as a foreign protein (exoprotein) through the barrier of the Bacillus subtilis cell membrane. Beta-lactamase, a commercially available and useful product, is produced by strains that cannot otherwise produce this enzyme. Example 3 The B. licheniformis β-lactamase gene described in Example 2 was also inserted into a plasmid capable of replication in E. coli. These plasmids were transformed into an E. coli host using the same method described for B. subtilis in Example 2. E. coli cells containing these plasmids are B. licheniformis β-
Resistant to ampicillin as a result of lactamase enzyme production. This is Sherratt and
as demonstrated by the PVA plate assay developed by Collins (see reference 9). When a plasmid carrying the Bacillus licheniformis β-lactamase gene is grown in E. coli, the secreted form of the β-lactamase is not transported into the medium as in Bacillus subtilis. Since E. coli has a cell wall surrounding the bacterial cell membrane, foreign protein products are transported into the periplasmic space that separates the cell membrane and cell wall. β-
The lactamase exoenzyme accumulates in the interstitial space around the protoplasm and is then recovered by a suitable method. Example 4 Bacillus licheniformis (B.
β-lactamases of B. licheniformis are not the only source of signal peptide sequences that can function in B. subtilis or E. coli. As mentioned above, many proteins (particularly in the mature nucleus) are transported across the cell membrane. The exact amino acid sequence of the “signal region” actually differs depending on the various proteins transported, but the folded structure of these signal regions (Chou and
Fasman Ann.Rev.Biochem.(1978) 47 , 251~
276 laws) are very similar. Although the requirement for a transport signal peptide sequence can thus be met by non-Bacillus signal peptides, the DNA fragment encoding the signal sequence must be correctly positioned downstream from the Bacillus promoter and ribosome binding site sequence. positioned. One such mature nuclear export signal sequence that can be used for the desired gene product is the signal or presequence that precedes the insulin B chain. (The various insulin chains A, B, and C are made as a single polypeptide, assembled, processed in the endoplasmic reticulum, and excreted by the cell.) However, the insulin precursor sequences contain foreign DNA. There are no convenient restriction sites immediately following the signal peptide sequence that can be used to join the cloned gene.
However, the last five nucleotides of the insulin signal sequence are AGGCT and the first nucleotide of the insulin B chain itself is a T. These six nucleotides are actually AGGCTT, which differs by one nucleotide from the confirmed sequence AAGCTT because of the restriction enzyme Hind. This enzyme cleaves between two As.
Foreign DNA uses the same enzyme Hind or
Hind site bifunctional linker (half Hind
When cloned or isolated using a site bifunctional linlcer), the foreign
When DNA is inserted, the above sequence returns to its original state. A single nucleotide Gx can be converted to A to provide a Hind site by the method described in US Patent Application No. 133,150 (to Bahl). This step exposes and alters the nucleotides to be converted and rearranges the sequence. This conversion does not change the next or last amino acid of the signal sequence. DNA binding is described by Hershfield et al.Proc.Natl.Acad.
Sci. USA (1974) 71, 3455-3459. Reverse transcriptase was developed by Bahl et al.
al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA (1977) 74, 966−
970, as a DNA polymerase. Transformation was performed by Cohen et al.
alProc.Natl.Acad.Sci.USA (1973) 70, 3240−
Proceed as described by 3244. Example 5 Although the method described in Example 4 above is technically convenient, it concerns mature nuclear leader sequences and may only be useful for general development. The most useful research from a commercial standpoint is usually conducted on prokaryotic (bacterial) hosts. Although only a few such signal sequences are known for prokaryotic systems, one well-characterized sequence is that from TEM β-lactamases. (SutcliffeProc.Nath.
Acad. Sci USA (1976) 75, 3747-3741) This sequence is ideal for addition to a cloned gene except that there are no convenient restriction sites in place for precursor sequence processing. The closest restriction site to the signal sequence is the Mbo site, which attaches 16 foreign amino acids to the cloned gene product. However, the terminal part of the signal sequence, which is TTTGCT, can be removed by one of the techniques mentioned above.
Can be converted to TTTGAT. This latter array is
When read along the first few nucleotides of the TEM β-lactamase gene, Bcl
A restriction site exists for (TGATCA).
This changes the last amino acid from Ala (alanine) to Asp (aspartic acid), resulting in one foreign amino acid, Glu (glutamic acid) or His (histamine), depending on what the first added nucleotide of the foreign DNA is. acid) to the above gene product. To alter the nucleotide chain as described above, short fragments are synthesized using the methods described above. There is a restriction site (Tha) upstream of the above signal sequence, and a restriction site Mbo downstream. Further downstream there is a taq site. The limiting conditions for Tha are
Mc Connell et al., Nucleic AcidRes (1978)
5, 1729-1939, Mbo
The limiting conditions of Gelinas et al., J. Mol. Biol
(1977) 114:169–179,
The limiting conditions for Taq are as described by Sato et al., Proc. Natl.
The conditions described in Acad. Sci. USA (1977) 74; 542-546 are followed. However, regarding Mbo,
DNA is prepared in host cell GM119 lacking deoxyadenosine methylase to avoid methylation of regions and prevent Mbo cleavage. In this latter relationship, Marinus and Morris
See Mutat.Res. (1975) 28, 15-26.
Alternatively, the restriction endonuclease SAU
The isoschizome of 3A, Mbo , can be used to isolate DNA from the host. It will therefore be appreciated that this invention provides methods and vectors for the controlled accumulation of foreign cloned gene products.
Movement or transport of these products out of the host cell allows the products to be arrested and recovered with minimal restriction, eliminating the risk of degradation or destruction of either the host cell or the gene product itself. From the description of this specification, it will be apparent to those skilled in the art that various modifications can be made in addition to the invention described in this specification. Such variations are also considered to be within the scope of this invention. References related to the present invention are as follows. 1 Bahl, C.P., Wu, R., Stawinsky, J.and
Narang, SA, Proc.Nat.Acad.Sci., USA ,
(1977) 74 , 966-970. 2 Chang, A. and Cohen, S., Molec Gen.
Genet. , (1979) 168 , 111-115. 3 Chou, PYand Fasman, GD, Ann.Rev.
Biochem., (1978), 47 , 251-276. 4 Cohen, SNand Chang, ACY, Proc.
Nat.Acad.Sci., USA, (1972), 69 , 2110−
2114. 5 Cohen, SN, Chang, ACY, Boyer, H.
W.and Helling, R.B., Proc.Nat.Acad.Sci.,
USA, (1973) 70 , 3240:3244. 6 Ehrlich, SD, Proc.Nat.Acad.Sci., USA ,
(1977) 74 , 1680−1682. 7 Gelinas, RE, Myers, PA and Roberts,
RJ, J. Molec. Biol. , (1977) 114 , 169−179. 8 Gelfand, D., Shepard, H., O'Farrell, P.
and Polisky, B., Proc.Nat.Acad.Sci.,
USA, (1978) 75 , 5869−5873. 9 Grycazn, T.J., and Dubnau, D., Proc.
Nat.Acad.Sci., USA, (1978) 75 , 1428−
1432. 10 Hershfield, V., Boyer, H.W.
Yanofsky, C., Lovett, M.A. and Helsinki,
DR, Proc.Nat.Acad.Sci., USA , (1974)
71, 3455−3459. 11 Keggins, K.M., Lovett, PSand Duvall,
EJ, Proc.Nat.Acad.Sci., USA , (1978) 75 ,
1423−1427. 12 Kunst, F., Pascal, M., Lepesant−
Kejzlarova, J., Lepesant, J., Billault, A.
and Dedonder, R., Bio.Chemie. , (1974)
56, 1481−1490. 13 Kupersztoch, Y. and Helinski, D.,
Biochem.Biophys.Res.Commun., (1973) 54 ,
1451−1459. 14 Marinus, MGand Morris, NR, Mutat.
Res., (1975) 28 , 15-26. 15 Marmur, J., J. Molec. Biol. , (1961) 3 ,
208−218. 16 Maxam. A. and Gilbert, W., Proc. Nat.
Acad.Sci., USA, (1973) 73 , 3942−3946 17 McConnell, DJ, Searcy, DGand
Sutcliffe, J.G., Nucleic Acids Res. (1978)
5, 1729−1739. 18 Meadway, RJPh.D.Thesis, University
of Edinburgh, (1969). 19 Roberts, R.J., in DNA Insertion
Elements, Plasmi ds and Episomes,
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J.A., and Adhya, S.L., Cold Spring.
Harbor Laboratory, Pages 757−468. 20 Ross, GWand O: Callaghan, C.H.
Meth.Enzymol., (1975) 43 , 69−85. 21 Sato, S., Hutchison, DAIII and
Harris, J.I., Proc.Nat.Acad.Sci.USA ,
(1977), 74 , 542−546. 22 Sharp, P. A., Sugden, B. and Sambrook,
J., Biochem. , (1973) 12 , 3055−3063 23 Sherratt, DJand Collins, JF, J.Gen.
Microbiol., (1973), 76 , 217−230. 24 Sutcliffe, JG, Proc.Nat.Acad.Sci.,
USA, (1978) 75 , 3737−3741.

【図面の簡単な説明】[Brief explanation of drawings]

添付図面は下記説明から明らかであろう。 第1図はバチルス・リケニフオルミス
(Bacillus licheniformis)から得られたβ−ラク
タマーゼのための遺伝子を有するDNA断片の部
分的構造地図を示す全体図であり;第2図は第1
図の断片中の多くのヌクレオチド配列と該断片が
コードする蛋白質中に存在するアミノ酸配列との
対応関係を示す全体図であり;第3図は組み換え
プラスミドを有する枯草菌(Bacillus subtilis)
菌株が生育するプレートの典型的外見を示す概略
図であり、該プレートはβ−ラクタマーゼ活性を
試験するPVA検定を行なつた後の状態を示して
いる。図中Bなる符号は枯草菌を示す。第4図は
大腸菌(E.coli)プラスミドPOG2110、枯草菌
(B.subtilis)プラスミドpOG1196および二機能性
プラスミドpOG2165の構造を説明する全体図で
あり;第5図は組み換えプラスミドを有する種々
の細菌の菌株が生育するプレートの典型的外観を
示している図面であつて、該プレートはβ−ラク
タマーゼ活性を試験するPVA検定後の状態を示
しており;第6図はバチルス・リケニフオルミス
(B.licheniformis)Pen P遺伝子の一部を構成す
るヌクレオチドの図式である。
The accompanying drawings will be clear from the description below. FIG. 1 is an overall diagram showing a partial structural map of a DNA fragment containing the gene for β-lactamase obtained from Bacillus licheniformis; FIG.
FIG. 3 is an overall diagram showing the correspondence between many nucleotide sequences in the fragment shown in the figure and amino acid sequences present in the protein encoded by the fragment; FIG.
Figure 2 is a schematic diagram showing the typical appearance of a plate on which a strain is grown, after it has been subjected to a PVA assay to test β-lactamase activity. The symbol B in the figure indicates Bacillus subtilis. Figure 4 is an overall diagram illustrating the structures of E. coli plasmid POG2110, B. subtilis plasmid pOG1196 and bifunctional plasmid pOG2165; Figure 6 shows a typical appearance of a plate on which the bacterial strain grows after a PVA assay to test β-lactamase activity; Figure 6 shows B. licheniformis; This is a diagram of the nucleotides that constitute part of the Pen P gene.

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1 グラム陽性宿主菌において自律的複製を行う
ことができるクローニングベクターを作成し、該
ベクターはあらかじめ決められた蛋白質のための
遺伝子を有し、該あらかじめ決められた蛋白質は
上記宿主菌にとつて生来のものではなく、該遺伝
子は上記ベクターにおいてオペレーター、プロモ
ーターおよびリボゾーム結合位塩基配列によつて
制御されるように位置付けられかつ方向付けられ
ており、上記あらかじめ決められた蛋白質はバチ
ルス分泌リーダー配列の1部分からなる外来輸送
機構により制御されており、該輸送機構によつて
上記蛋白質が上記宿主菌から分泌され、そして該
ベクターを上記宿主菌に導入することからなる、
あらかじめ決められた蛋白質を形質発現により生
産することができるグラム陽性菌を製造する方
法。 2 自律的複製ができるベクターをつくる部分で
あつて、クローニングベクターがpC221、
pUB110、pC194、pUB112、pT127、pOG2165、
pOG2110、pCS1006、pOG1196、pCS832および
それらから誘導されたプラスミドからなる群から
選択されたプラスミドから得られる部分からなる
特許請求の範囲第1項記載の方法。 3 上記遺伝子または上記あらかじめ決められた
蛋白質がβ−ラクタマ−ゼオペレーター、プロモ
ーターおよびリボゾーム結合部位塩基配列によつ
て制御される特許請求の範囲第1項記載の方法。 4 あらかじめ決められた蛋白質が哺乳類の蛋白
質である特許請求の範囲第1項記載の方法。 5 あらかじめ決められた蛋白質が哺乳類のホル
モンである特許請求の範囲第1項記載の方法。 6 あらかじめ決められた蛋白質がβ−ラクタマ
ーゼである特許請求の範囲第1項記載の方法。 7 輸送機能がβ−ラクタマーゼ遺伝子の一部に
よつて提供される特許請求の範囲第1項記載の方
法。 8 輸送機能が真核生物のインシユリンシグナル
ペプチドの一部によつて提供される特許請求の範
囲第1項記載の方法。 9 上記クローニングベクターが制限酵素SStI、
Hind、PstIおよびBglに対して各々1つの特
異的部位を有する特許請求の範囲第1項記載の方
法。
[Scope of Claims] 1. A cloning vector capable of autonomous replication in a Gram-positive host bacterium is created, the vector has a gene for a predetermined protein, and the predetermined protein is Rather than being native to the host bacterium, the gene is positioned and oriented in the vector to be controlled by an operator, promoter and ribosome binding site sequence, and the predetermined protein is controlled by an exogenous transport mechanism consisting of a portion of a Bacillus secretory leader sequence, by which the protein is secreted from the host bacterium, and the vector is introduced into the host bacterium.
A method for producing Gram-positive bacteria that can produce predetermined proteins by expression. 2 This is the part that creates a vector capable of autonomous replication, and the cloning vector is pC221,
pUB110, pC194, pUB112, pT127, pOG2165,
The method according to claim 1, comprising a portion obtained from a plasmid selected from the group consisting of pOG2110, pCS1006, pOG1196, pCS832 and plasmids derived therefrom. 3. The method according to claim 1, wherein said gene or said predetermined protein is controlled by a β-lactamase operator, a promoter, and a ribosome binding site base sequence. 4. The method according to claim 1, wherein the predetermined protein is a mammalian protein. 5. The method according to claim 1, wherein the predetermined protein is a mammalian hormone. 6. The method according to claim 1, wherein the predetermined protein is β-lactamase. 7. The method of claim 1, wherein the transport function is provided by a portion of the β-lactamase gene. 8. The method of claim 1, wherein the transport function is provided by a portion of a eukaryotic insulin signal peptide. 9 The above cloning vector contains restriction enzymes SStI,
2. The method of claim 1, having one specific site each for Hind, PstI and Bgl.
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