JPH01503197A - Dnaの生物学的活性の不活性化法 - Google Patents

Dnaの生物学的活性の不活性化法

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 組換DNAの不活性化法 本発明はDNA、%に組換えDNAの生物学的活性の不活性化法に関する。
学術及び科学技術庁長官(Bundesminister furForsch ung und Technology )によシ発布され九、試験管中で新友 に組換えられた核酸による危険を保護するための指導要綱によれば、核酸、すな わちDNA t−含有する廃棄物は滅菌もしくは変性されなければならない。従 って、組換えDNA含有微生物での作業の際に、有機体を不活性化することだけ ではなく、場合によシ 。
有機体中〆の組換えDNA t−破壊することも必要である。
微生物の死滅は一般に比較的簡単に行なうことができる。しかしながら、この適 用される処置により微生物中のDNAは一般に破壊されない。この滅菌もしくは 変性は行なわれなければならないので、活性汚泥法による生物学的浄化装置が供 給される場合(これは有利な方法である)、例えば活性汚泥の微生物を損なった り、殺したりするバイオマスtVする物質が後続の浄化装置に達しないような処 置も、バイオマスを浄化装置に導入する前に行なわなければならない。すなわち 、毒性でない物質?使用するとか、又は浄化装置に達する前に分解して、これが 損害を与えないようにするというような配慮も行なわなければならない。
例えば、西ドイツ国の公衆衛生局(BC)A ;Bundesgesundhe itamt )によシ、及び西ドイツ国の生物学的安全に関する中央委員会(Z kBS ;Zentralkommission fffir Biologi sche 5icherheit )によシ承認された、公知の、牧菌及び不活 性化法(例えば、121°Cで20分を越える蒸気滅菌)は非常に費用がかかる 。特に工業上通常である10〜s o m3の発酵処理においては、この方法は 装置においても高いエネルギー消費においても著しく費用が高い。
従って、本発明の課題はDNA 、特に組換えDNAの生物学的活性t−確冥に 不活性化することができ、不所望な、特に毒性の物質が廃水中に達しない方法を 提供することである。更に、この方法は安価に実施可能であ・ るべきである。
この課題はDNA%%に組換えDNAの生物学的活性を不活性化するための方法 において、DNAt含有するバイオマスに炭素原子数1〜3のベルカルボン酸、 アルカリペルオキシド又はアルカリベルオキソモノスルフェートを添加し、この 混合物を60〜100°Cに加熱すること’t−w徴とする方法によシ解決する 。
前記化合物を使用し、かつこの配合物を加熱することにより、なお生・きている 微生物を殺すことができるだけでなく、七の中に含有されるDNA ’t” 、 複製可能な断片がもはや含有されていない程十分に分解するということが意外に も確認された。
本発明による方法で、500 bpより小さいか/同じ断片へのDNAの分解が 達せられ、このことはZkBSにより承認された安全法(オートクレーブ法)に よっても越えられない。この種の断片はもはや生物学的に活性ではなく、従って 、廃水中に導入しても危険ではない。
不発明による方法は動物又は人間の細胞の、並びに微生物の内側又は外側での組 換DNAの培養及び段進において生じるようなバイオマスに有利に使用すること ができる。従って、本発明による前処置を本来の浄化装置中への導入の前に、微 生物、プラスミド及び同様なりNA含有材料全含有する廃水に行なうことができ 、このことはDNAが複製可能な形でもはや全(存在していることができないこ とを確実にする。
例えば、微生物を含有する培養溶液のようなバイオマスを炭素原子数1〜3を有 するベルカルボン酸、アルカリペルオキシド又はアルカリペルオキソモノスルフ ェートと混合する。この際、過酢酸は1方では比較的安定でちり、他方では安価 であるので、これを使用するのが有利である。過蟻酸及び過プロピオン酸も同様 に好適である。アルカリとしては、本発明においてはNa、K及びLlが有利で ある。アンモニウム塩もここではアルカリ塩とする。0.05〜5重量係の濃度 でベル化合物?使用するのが有利である。この際、濃度は使用し几化合物並びに 処理すべきバイオマスに依存する。
ベル化合物の添加後、この混合物を加熱する。不活性化は60〜100℃の温度 に加熱することにより達せられる。70〜90℃の温度に加熱するのが有利であ る。特に過酢酸の使用においては、混合物を少なくとも70℃に加熱するのが有 利である、それというのもこの温度において過酢酸は迅速に完全に分解するから である。
混合物の加熱全1塩基対500に越える鎖長のDNAがもはやクロマトグラフィ ーによシ検出されなくなるまで行なう。一般に20〜60分後である。すべての DNAが分解されたかどうか検査するために、部分量をこの混合物から取り出し 、こうしてアガロースデル−電気泳動にかげる。分子量によるクロマトグラフィ ー分離は溶液中にどのような断片が存在するかを示す。
本発明による方法は明域6〜11、特に7〜10で実施するのが有利である。
本発明による方法の著しい利点は、使用したベル化合物が完全に分解されるとい うことである。使用した化合物からは生物学的に無害で毒性kWさない化合物が 生じ、これを直接排水網に導び(ことができ、かつこの際に活性汚泥中に含有さ れる微生物が殺されるという危険は全くない。
次に笑施例並びに電気泳動に関する図面につき、本発明の詳細な説明する。
第1図は種々のベル化合Wt使用した種々の試料の電気泳動の結果を示す(第1 表)。
第2図は種々のベル化合物を使用した種々の試料の電気泳動の結果を示す(第2 表)。
第6図は種々のベル化合物をより高い濃度と変化した恒温保持時間で使用した試 料の電気泳動の結果を示す(第3茨)。
第4図は種々の過酢酸濃度を使用した試料の電気泳動の結果を示す(第4表)。
第5図は種々の濃度のベルオキシモノスルフエートを使用した試料の電気泳動の 結果を示す(第5表)。
算6図は異なる温度で過酢酸を使用した試料の電気泳動の結果金子す(第6表) 。
第7図は種々の濃度の過酢酸を使用した試料の電気泳動の結果を示す(第7表) 。
第8図は過酢酸で処理し几真核細胞系のDNAの試料の電気泳動の結果を示す( 第8及び9表)。
例 1 プラスミドDNAの分解?ベル化合物により試験した。
このためにはプラスミド1)BR522(PNAS 、 USA第75巻、19 78年、第673頁)t−使用し友。プラスミドDNA 50μg/mlを含有 する溶液をこのプラスミドに関しては使用した。この試料をベル化合物との種々 の配合において処理した。相応する配合@100μl−を次の表中でそれぞれ挙 げた条件下に恒温保持した。引@続き配合物の各20μlを取り出し、試料緩衝 液5μlと混合し、アガロースデル電気泳動プレート(アガロース0.8重量係 ; TRl5 /酢酸塩緩衝液、pH80,O4Mo1/J ; EDTA O ,001Mol/l)上に載せ、T、マニアテイス(Maniatis )、E 、 S、 7リツテ(Fr1tsch )及びJ、サムプルツク(Sambro ok )(Mo1ecular Cloning 、 Co14 Spring  HarborLaboratory SNew York 、 第11724 巻、1982年、第454頁)によると同様にして分離する。比較溶液としては TE−緩衝液20μ!及び試料緩i液5μ!中のpBR3220,6μg全使用 した。鎖長標準としては、Hindl[で切断したファージ・ラムダ(J。
Mo1. Biol、第162巻、1982年、第729−773頁) (DN A−鎖長標準■、注文番号236250としてBoehringer Mann heim GmbHより入手可能)1−使用した。フラグメントの分子量は15 .27. 6.21゜4.41 、 2.88. 1.55. 1.34. 0 .37メガドルトンであり、これは塩基対23130,9416゜6682.4 361,2322,2027.564に相応する。使用したベル化合物、濃度及 び恒温保持条件を次の第1〜5表に挙げる: 索 承 尊 * 寧 **** 迄 巨 0 部 則 の 咽 側 事 事 ζ 寧 事 * エ 綜 爛 巨 セ * 寧 * 尊 啄 寧 S 1 ひ 1 4n セ 掴K セ 税 哨 澁 −へ蛸寸(イ)つトωさ 馳 煽 第4表 痕 跡 過酢酸濃度(重量幅) 1 0 qb(室温) ・第5表 痕 跡 ベルフオーム(ベルオキソモノスルフェート)の濃度(重量%)1 0  チ(室温) 7 λ−鎖長標準 結果は第1〜5図から明らかになる。この際、第1図及び第2図からは、ベル化 合物0.14の濃度において、30分の恒温保持時間において、かつ80°Cの 温度において、ベル化合物として過酢酸及びナトリウムペルオキシドを使用する 場合のみ、塩基対(bp )500を越える長さのDNA −7ラグメントを検 出しない。舅6図は0.5 %の濃度のベルオキソモノスルフェートの使用がプ ラスミド−DNAの十分なフラグメント化を与えることを示す。第4図からは8 0℃の温度で、恒温保持時間50分で、濃度0.1%の過酢酸の使用がプラスミ ド−DNAの十分な分解に導びき、ゲル画像中に塩基対500に越える長さのフ ラグメントが全く認められないということが明らかになる。第5図は温度80’ Cで、かり恒温保持時間60分で濃度0.54のベルオキソモノスルフェートに 使用する際、同様に十分なプラスミド−DNAフラグメント化が達せられるとい うことを示します。
例 2 プラスミド1)BR322の溶液を、例1に記載されているように0.051過 酢酸で60分間、異なる温度で恒温保持した。しかしながら、プラスミド−DN A 30μ97m1のかわりにプラスミドDNA 5 [1μ9/ml@:使用 し友。それぞれ使用した温度を次の第6表に示す。
第6表 痕跡 温度 I RT、過酢酸なし 2 80°C9過酢酸なし この溶it例1に記載したように、アガロースデル−電気泳動プレート上で分離 する。比較溶液としてはTE−緩衝液20μl及び試料緩衝液5μl中のpBR 5221μgを使用した。鎖長標憔の濃度は例1と同様であった。結果を第6図 に示す。この際、609cで60分間の恒温保持時間においてプラスミド−DN Aの十分なフラグメント化が達せられ、かつ70℃においてはデル画像中にはs  o o bpより大きいフラグメントは全(検出されなかった。
例 6 形質転換した微生物太陽菌ED/pBT25L−I(DSM 3145 ) t −ヨーロッパ特許第187138号明細書中に記載されているように培養した。
培養液Q、1m!!i取り出し、本発明によジ80°Cで60分間種種の濃度の 過酢酸と恒温保持し、引@続きプロテイナーゼに10ダ/ ml f含有する溶 液10μlと混合し、膜結合DNA i分離させるために37°C″′c30分 間恒温保持する。遠心分離(Eppendorf遠心分離機 1400rpm1 5分間)の後、このように処理した培養液各20μlk電気泳動にかげる。過酢 酸の濃度並びにそのつと使用した恒温保持条件全第7表に示す:迩 淳 安 目 額 駆 ト 論 −へ (イ) 寸 Lr> つ ト 0m 爛 結果を第7図中に示しfcp30分間の恒温保持時間及び80 ’Cの温度で0 .2チ過酢酸で処理した後、培養液中にも500 bp ’r:こえるDNA− 7ラグメントは検出されないということが示された。
例 4 a)真核細胞の過酢酸での不活性化 ハイプリドーム細胞ECACC84122005をヨーロッパ特許第15030 9号明細書中に記載されているように培養した。種々の配合において、このハイ プリドーム細胞を過酢酸と恒温保持した。条件上次の第8表に記載する: 第8表 痕跡 過酢酸の濃度 温度/恒温保持時間1 0 チ 室 温 2 0 係 80’C/30分 6 0.2係 80°C/30分 試料1〜3として細胞107/100μlの葱濁液各20μlfアガロースどル ー電気泳動プレート上に担持させ、かつ分離した。結果t−第8図に示す。0. 2 %の濃度の過酢酸を用いて恒温保持温度80℃、恒温保持時間30分におい てDNAは500 bp k越える長さのDNA−フラグメントyk検出するこ とができない程度に破壊される。
pBR322の形質転換能力の検査 試料溶液としては、付加的にI)BR3225μg70.11?At−含有する 、a)により得られたハイプリドーム細胞を0.1mlあfcシ107含有する 懇濁液を使用し友。この溶液を過酢酸で処理した。恒温保持条件を次の第9表に 記載する: 第9表 痕跡 過酢酸濃度 温度/恒温保持時間4 0係 室温 5 0 チ 80’C/30分 60.2壬 l この混合初冬20μ/にアガロースデル電気泳動法により分離した。結果は第8 図かられかる。0.2係の濃度の過酢酸は恒温保持時間30分間及び恒温保持温 度80℃でDNA ’(i−十分に分解し、500 bpを越えるDNA−7ラ グメントはもはや含有されない。
b)により製造した試料4〜7t−過酢酸で恒温保持した後、それぞれ1部’I  T E−緩衝液、p!(7,5に対して透析した。この際得られた溶液から大 腸菌HB101(D!EM 1607 )の形質転換のために、それぞれ20μ l f ? ニアテイスによるMo1ecular Cloning″第250 〜251頁に記載されている塩化カルシウム法により形質転換した。
使用した条件並びに得られた生写菌数(LKZ )は次の第10表かられかる。
眩 掌 @ 水 * 噌 0 F a)TE−緩衝液、pH7,520μl中の純粋なプラスミド溶液1μs b)細胞培養液中のプラスミド(ヌクレアーゼによる部分消化:透析;このうち 20μlを大腸菌中に形質転換) LKZの測定のために細菌を含有する溶液’t10−1〜10−6−倍の希釈で 、LB−培地を有するアンピシリン含有(50μg)又は不含寒天プレート上に ひろげ、37℃で1夜培養し、生長したコロニーの数を視覚的に調べる。
8000の恒温保持温度及び30分間の恒温保持時間において0.2%過酢酸と の恒温保持は細胞の完全な死滅に導ひいたということを示す。
Fig、 1 09.2 09.3 Fig、 4 Fig、 5 Fig、 6 Fig、 7 Fig、 8 手続補正書(自船 平成1年6月6日

Claims (5)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.DNAを含有するバイオマスに炭素原子数1〜3のべルカルボン酸、その塩 、アルカリベルオキシド又はアルカリベルオキソモノスルフエートを添加し、引 き続き該混合物を60〜100℃に加熱することを特徴とするDNA、特に組換 えDNAの生物学的活性の不活性化法
  2. 2.ベル化合物を0.05〜5%の量で使用する請宗項1記載の方法。
  3. 3.クロマトクラフイーにおいて塩基対500を越える鎖長を有するDNAがも はや検出されなくなるまで加熱を行たう請求項1又は2記載の方法。
  4. 4.pH値が6〜11の範囲である請求項1から3までのいずれか1項記載の方 法。
  5. 5.pH値が7〜10の範囲である請求項4記載の方法。
JP63505715A 1987-10-07 1988-07-04 Dnaの生物学的活性の不活性化法 Expired - Lifetime JPH0642831B2 (ja)

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