JPH02128689A - カルバメート‐ヒドロラーゼを単離し引続き精製する方法、カルバメート‐ヒドロラーゼのBrCN‐分解ペプチド、合成オリゴヌクレオチドの製法、カルバメート‐ヒドロラーゼ‐遺伝子の単離法及びアルトロバクター・オキシダンスの新規菌株 - Google Patents
カルバメート‐ヒドロラーゼを単離し引続き精製する方法、カルバメート‐ヒドロラーゼのBrCN‐分解ペプチド、合成オリゴヌクレオチドの製法、カルバメート‐ヒドロラーゼ‐遺伝子の単離法及びアルトロバクター・オキシダンスの新規菌株Info
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- JPH02128689A JPH02128689A JP1124595A JP12459589A JPH02128689A JP H02128689 A JPH02128689 A JP H02128689A JP 1124595 A JP1124595 A JP 1124595A JP 12459589 A JP12459589 A JP 12459589A JP H02128689 A JPH02128689 A JP H02128689A
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Abstract
め要約のデータは記録されません。
Description
ルトロバクター・オキシダンスからのカルバメート−ヒ
ドロラーゼであり、これは、7エンメジ7アム(IUP
AC−命名では6−m−トリル力ルバモイルオキシフェ
ニルヵルバメート)の2つのフェニル核の間の一00C
−N−結合の分解に寄与する。
除草剤もL <は除草剤混合物金便用しなければならな
い。この問題は、遺伝子操作により変えられ、非選択性
除草剤に対する抵抗を有する植物により嘔けることがで
きる。
保脛の前面に出ている。
謝により失活させることのできる酵素の単離及び引続く
精製のための方法及び第2に、活性酵素のコード化のた
めに寄与するDNS−配列を有する遺伝子#素糸の特性
化の方法が必要である。
素系の単離及び引続く特性化のこのような方法は従来未
知でおる。
は、7エンメジフアムを失活化することのできる遺伝子
酵素系を即離し、引続き、特性化する方法?:開発する
ことである。
より失活化させる能力を有する微生物を同定するために
微生物のスクリーニングを行なう。
ダンスから、フェンメジファムの2つのフェニル核の間
の−000−N−結合の加水分解に関与するカルバメー
ト−ヒドロラーゼを単離できることを発見した。フエン
メジフアムの2つのフェニル核の間の−000−N−結
合の加水分解は、次の反応により、除草剤失活化合物例
えはメチル−6−ヒトロキシフエニルーカルバメート及
びm−)ルイゾンを生せしめるニ アエンメゾ7アム メチル−6−ヒド m−トルイ
ジンロキンーフェニル ーカル7寸メート 前記の反応によりフェンメゾ7アムを加水分解すること
のできる遺伝子−酵素系の単離及び引続く精製のために
、アルトロバクター・オキシダンスの微生物を栄養培地
中で培養する。7エンメジ7アムの分解に関与するカル
バメート−ヒドロラーゼを、超音波細胞崩解及び遠心分
離により単離し、アニオン交換体クロマトグラフィ、勾
配俗離、硫酸アンモニウム沈殿及びFPLC−分離によ
り、電気泳動的な均一性に達するまで*aする。この精
製されたカルバメートにより決定することのできる2個
のペプチドを単離することができる。このペプチドの配
列情報に準拠して、交雑ゾンデ(Hybridisie
rungssonden ) としてカルバメート−
ヒドロラーゼ−遺伝子の検出のために使用されるオリゴ
ヌクレオチドを合成する。
施されている単離物中で、#I胞の分解及び核酸の抽出
の後に、プラスミドを検出することができる。
カルバメート−ヒドロラーゼはプラスミドでコードされ
ることが明らかにすることができる。
ェンメゾファムを加水分解する特性を失なう。カルバメ
ート−ヒドロラーゼは、砲株p52のプラスミド不含の
誘導体中では生化学的に検出するqとはできない。
/ドヌクレアーゼを書き入れる。電気泳動により生じる
制限フラグメントをメンブランフィルタ−上に移し、オ
リゴヌクレオチドと交雑嘔せる。プロットーハイブリダ
イセ゛−ジョン(Bloz−Hybridisieru
ng)のデータから、このカルバメート−加水分解−遺
伝子は3.3 kbの大きさのPszI−制限7ラグメ
ント上に局在することが明らかである。
位に導入する( Yanigh−Perron 、 C
,Vieira。
103ff参照)。連結バッチを用いるE、コリーDH
5αの形質転換の後に、2つの型の組換えE、コリーク
ローンが得られ(それぞれpp52Pa c及びpp
52 Pac )、これらは、ベクターのLac−プロ
モータに対する種々の配向でカルバメート−ヒドロラー
ゼ−遺伝子を含有する(第5図参照〕。
duccora )イソプロピル−β−D−チオがラク
トシトの存在で、E、コリーDH5d(pp 52Ps
z )型のクローンの培養により機能的に表現石れうる
。E、コリーD)l 5αC,pp 52inv )型
のクローンの蛋白質抽出物(これはLac−プロモータ
ーに対する逆の配向でカルバメート−ヒドロラーゼ−遺
伝子を含有する)中には、カルバメート−ヒドロラーゼ
−遺伝子の発現は検出できない。このことから、アルト
ロバクタープロモーターF′iE、コリーRNA−ポリ
メラーゼにより認識されないことが推考できる。
列はザンが−(Sanger ) 等による方法(S
anger、 F、 N1cklen、 S、 & C
oulson、 A(1977)、Proe、 Naz
l、 Acad、 Sci、 USA74.5466〜
5468)により蓚紹纒れる。
t、l−制限フラグメントから出発して、15サブクロ
ーンは、−1鎖DNS−バクテリオファージM 13
mp 18及びmp 19に分けられる( Mesqi
ng、 J。(1983) 、MechodsinEn
zymol、 101.20〜78 )。第6図に、
配列決定法を明らかにするコード化帯域の正確な制限地
図を示す。
ド〜二列金第7図に示す。双方のThkBrCN−分解
ベゾチドのアミノ酸配夕1 (例4奈照)Vi−同じ絖
み忰(La5eras cer ) 内でDNA−面
上で同定することができる。この読み枠は、TGA−翻
訳トポコドンで終結しく第7図、ヌクレオチド位置17
89〜1791)、pそらくGTG−出発コドンで開始
する(第7図、Nuk:teocia−位置640〜3
42)。合計で、14794基対の絖み枠が生じる。推
定上の()TG−スタートコドンの上流に、E、コリー
リポソーム結合位置に関するコンセンサス−配列に対し
て有意のホモロゾー金有する領域(Shine−Da1
garnoボックス)をamすることができる(第7図
8照、ヌクレオチド−位置298〜302)。
M ) (Goutingen 、西ドイツ在に、次の
微生物を寄託した(寄託番号): アルトロバクター・オキシダンスp 16/4/B (
DSM 4038 )、 アルトロバクター中オキ7ダンスp 67 (DSM4
039)、 アルトロバクターΦオキシダンスp 75 (DSM4
[)40)、 アルトロバクター・オキシダンスpH/1/−b (D
SM 4041 )、 アルトロバクター・オキシダンスp15/4/A (D
SM 4045 )、 アルトロバクター・オキシダンスp21/2CDSM
4046 )、 ブ′ラスミドpHP 52を含有するアルトロバクタ・
オキシダンスp52(Dsu4044 )。
Po1yn−ukleoZid Liquid Ch
romat、ography:蛋白質、ペゾチド及びポ
リヌクレオ チドに関する高速液体クロマトグラ フィ) 一水累イオン濃度の負の常用対数 一ヤロ塩基 SDS −ラウリル5I1.酸ナトリウムDTT
−ジチオヌレイトール 1xSSC−NaCJ O,15M、クエン酸三ナトリ
ウム0.015 M (絹7.0) 1XDen特徴rat−牛血清アルブミン0.02%(
w/v) (シグマ、7ラクンヨンV) フィニル(Ficoll) 4000.02%(WAF
)ポリビニルピロリドン0.02% MC8−マルチグルクローニンク部位 (Mult;1ple Cloning sice)B
m = BamHl 、 Bs = Bs1EIl
、 C1= C1al 。
p = Kpnl 。
Nh==Nhel 。
、 Pvu = Pvul 、5c=Sacl %
8p=Sphl 、 5c=Scul 。
ンメゾフアム分解性カルバメートヒドロラーゼの単離及
び引続く精製法(例2)會示す系統図である。
れ、プールされた蛋白質7ラクシヨンの8DS−ポリア
クリルアミドデル上での電気泳動分離状態を示す図であ
り、ここで分子量に関するマーカーとして標準蛋白*C
S )t−共に泳動させている。
の遠心分離上澄みからの粗製エキス、 B : DEAE−セファセル−カラムでの勾配耐難の
後にプールてれた蛋白質クラクション、CABからのフ
ラクションの硫酸アンモニウム沈殿 D:硫酸アンモニウム沈殿のデル痺過及び引続〈セファ
クリルS−300カラム上での分離の後の蛋白質クラク
ション ENDからのプールされ次クラクションを匠」(アニオ
ン交換体−クロマトグラフィ)の分離後の蛋白質フラク
ション Fニア°−ルでれたクラクションEのサブロース6−カ
ラムでの分離(例2)の後の蛋白質フラクション。
H,!5.8)を得るための曲線図である。この至適P
HFi、酵素活性(%)を−僅に対してプロットするこ
とにより確定することができる(例2)。第4図は、ア
ルトロバクター・オキシダンス(菌株p52)からのグ
ラスミドpHP52の制限地図である。第5図は、カル
バメート−ヒドロラーゼ−遺伝子のクロー二ンダ法を示
す図である。概要を示すため、5′−及び6′−側面領
域を包含するオリゴヌクレオチVと交雑性の遺伝子範囲
を壌土のプラスミv地図の下に拡大して示している。
inv、が線状で示ちれている。このLac Z’−遺
伝子の転写方向は矢印(−)で示括れている。
な位置を示す(開始:GTG=開始コ図である。
れている。矢印の長さから、それぞれの配列決定された
範囲の長さを読み取ることができる〇 例4に記載のオリゴヌクレオチドに対してホモロジー範
囲七有する制限フラグメントは、この地図から明らかで
ある(()。
メート−ヒドロラーゼ−遺伝子のヌクレオチド配列を示
す図である。
結合位1llit(Bhine−/ Dalgarno
Box ; S / D )、6、例4に記載のオリ
ゴヌクレオチドに対するホモロゾー領域(oligo
I & l / oligo量)を明示している。
に翻訳した。この絖み枠は、明らかに蛋白5i!面匈定
アミノ醜部分配列により決定されている。
物の単離 フェンメゾ7アムを代謝により失活嘔せる能力を有する
微生物の同定のために、微生物のスクリーニング會実施
する。この微生物源として搾々の土地(フェンメゾファ
ムで数回処fJ!キれた実験地)の土壌試料及び泄明ス
ライムをも使用する。カルバメート分解を実施すること
のできる微生物の同定のための遣択尺度として、次の特
定を採用する: a)特有の炭素源もしくは窒素源としての2エンメゾフ
アムを有する栄鵞培地上での生長b)次の反応による7
エンメゾ7アムの木酢性化合物への分解: フェンメゾ7アム メチル−6−ヒド m−トルイ
ゾンロキンーフェニル ーカル/ぐメート 土壌試料中に存在する、フェンメジファムを分解するこ
とのできる多くの微生物から、特に明白な分解を示す7
徳の代表ケ色択する。すべての代表がアルトロバクター
に輌し、この風向のオキシダンス株に属するこれら土壌
細at次の合成培地(M9−培地)′f::有する培養
液中で培宜する: NH,C11,01/ 1 Mg5O4x 7H200,25、!il / l!肚
2P0. 3.09 / 1Na2HO4X
2H207,011/ lグルコース
2.0 & / l及びNa(J O,5
& / l)このM9−培地は、付加的にチアミン(ビ
タミンB1.>111k?/l並ひに微少量元素を含有
しこれらは基幹浴液の形で(1y / M 9−培地l
)添加される。この微少員元素−基幹浴欣は、次のもの
金含有するニ ホウ酸 0.5 g/ 1CuSO4x5
H7o O,04jl / lFeC43X6H2
00,2jl / lMn5O4x 7H200,4g
/ 1ZnC420,411/ l CNH4)6MO7024X4H200,2、!i’
/ lこの液体培地中での振動培養のために、この合成
培地はカサミノアンド(Casaminoaeids
;Difco■)0.1%を補充する。
下に対数生長期の終りまでインキュベートする。酵素精
製のために、培地101に定常予備培養液18100を
接種する。
オキシダンスの培養物中で、フェンメゾファムを分解し
て、除草活性のない生成物にすることが明らかにできた
。
ヒドロラーゼの*馳及びN製カルバメート−ヒドロラー
ゼをjl1し、引続ぎ電気泳動的に均一になる筐で精製
することは6エ程のa教法により実施する。アルトロバ
クター・オキシダンス(pHP 52 ) (DSM遅
4044)の鰹P対数培製物61から、カルバメート−
ヒドロラーゼ0.5〜1履9を再現可能に単離すること
ができる。カルバメート−ヒドロラーゼの単離のために
、細胞を遠心(7000x1りにより叡得し、俗解緩衝
液(10mM燐酸ナトリクムP)46.8 / 1 m
M DTT ) 約40ILl中に再懸濁させる。細
胞懸濁液を超音波により崩壊石せ、同時にホモrナイズ
する。
Cの温度で45分間遠心する。沈殿を捨て、上澄みをD
EAE−セファセルカラム(10QmMトリスーHC2
、p)17.2 / 100 mM Na已/ 1 m
MDTTで平衡化)上に装入する(カラム直径2.6n
1デル床の高さ20.5crIL、カラム容積約100
叡)。
Mトリス/100mMNa(J/imMDTT )で約
1:10に稀釈する。引続き、結合していない物at除
去するために、カラムを出発緩衝液で洗浄する。仄いで
、カルバメート−ヒドロラーゼを、NaC2100mM
−NaCj 500凸の縁状勾配濃度(5×カラム容
積)で溶離させる。#素活性フラクションをプールしく
集める)、固体硫酸アンモニワム(NH4)2SO4を
加えて、飽和溶液の63%の最終濃度にする。この際に
生じる蛋白質沈殿を遠心により沈殿させ(20000X
9750分)捨てる。上澄みに(NH4)a80z (
固体)を加えて、飽和f#液の60俤の最終酸度にし、
0℃で約12時間攪拌する。
60分)。この沈殿を出発緩衝液約i ILt中に解か
し、10 w/v%サッカロースを加え、セファクリル
S−300カラム上に装入する。ゲル濾辿を2.5cI
t/hの流速で実施する(浴l@緩衝液→出発緩@ff
!L)。このカラムは、矢の寸法を有する:直径=2.
6cm、h=95cm、容積=475都。#素活注フラ
クションを引続ぎFPLC−カラム(Mono QHR
5/ 5 :アニオン父換体)を通し史に後処理する(
勾配容@ : NaCJl 00 mM −NaCj
300 mM ; n速:0.51U/i;装入鎗:2
Rt)。
ンクラティック溶離(1sokratisc特徴Elu
zion )により除去する(勾配溶離ニドリス100
mM / HCI t p’ 7−2 / DTT
1mM中20β以内でのNa(J 100 mM −N
aCj 300 mM )。
n1iによる5DS−ポリアクリルアミド−デル電気法
!に!])の後に、限外濾過により濃縮さ(′R) せ(Am1con Cenzricon 10 K
onzenzracor)、FPLC−デル認過カラム
(8uperollIe 6、HFI 10/ 30
、P特徴rmacia )上に装入する(流速:Q、
2tttt / min 、 k入量: 100 pi
、展開剤:100mMトリス/ HCj、p)17.2
/10mMNaC,L )。
に単一である。
1衝漱、例えば燐酸塩緩衝液、トリス緩衝液等、pi(
6,8)中で活性である。コファクター又は全極イオン
は、この反応のために不必要であり、SH−収集に対す
る敏感性も同様に存在しない。この酵素の至適PH1−
cμm6.8である。
自然の条件(デル濾過)下でも、このカルバメート−ヒ
ドロラーゼの分子量は50〜60kd有利に56〜57
kdの範囲内にある。このことから、このカルバメー
ト−ヒドロラーゼは、モノマーの蛋白質であると結論す
べきである。
である。
のない検出のために、拭験管内#累テストを開発する。
俗性の加水分解生成物に変えるこの#木の特性に基づく
。このために、固体7エンメジフアムを水中に懸濁させ
、超音波でマイクロ懸濁液させる。引続き、このマイク
ロ懸濁液を引続ぎ50°Cで撹拌下にアがロース浴液中
に注ぎ、硬化の前にペトリシャーレ中に入れる。濁った
ゲルマトリックスが生じる。引続き、この酵素#液を、
固体マトリックス中に導入されている押し抜き大中に入
れる。
の後に、#素活性は、7エンメジフアムによる乳濁マト
リックス中の澄明帯域の現われにより示される。
的検出のための2種のBrCN−分解ペプチドのアミノ
酸配列の同定及びオリゴヌクレオチドの合成 精製されたカルバメート−ヒドロラーゼから出発して、
BrCN−分解により、その配列がエドマン−分解(E
dman−Abbau )により部分的に確定すること
のできる2槙のベグチド七単離する。
sn−Leu−Asp−−Ar g−Trp−Thr−
Gly−Lys −Pro −Phe−Val−Asp
(Val)− −Gly(Hlg)−Leu−Asp−Glu−Val
−Ala−Val−CooHBrCNペゾチド■: N2H−Glu−)JiB−Thr−Lys−Phe(
Val)−Asn(Gly)−Glu−Arg(Cys
)− −Pro−Leu−Ala−Phs−Tyr−Pro−
Val−Phe−Asn−Glu−COOH このペプチドの配列情報の割合に従って、交雑ゾンデと
してカルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子の検出のため
に使用されるオリゴヌクレオチドを合成する: オリゴヌクレオチド! (17+ner混合試料)は、
−X鎖DN8−フラグメントとしてBrCN−ペプチド
エアミノ酸 pos、 10〜15(相補重連@)から
の配列情報を有する: オリゴヌクレオチドn (42mar )は−重鎖DN
S−7ラグメントとしてBrCNペプチドI アミノ酸
pos、8〜21からの配列情報(相補的連鎖)を有す
る。コドン選択は、グアニン(G)及ヒシトシンCC)
−の多いDNS −配列(トリプレットの第6の位置で
アデニン(A)−及びチミン(T)−ヌクレオチドの前
のグアニン(G)4ひシトシン(C)−ヌクレオチドを
考慮する)の想定のもとに行なう。
ペプチド川からの配列情報(相補重連*J )を有する
: これらヌクレオチドの使用下に、ヘルビチダーゼー遺伝
子を交雑によりプラスミドpHP 52内に局在化させ
ることができる。このためにこのプラスミド−DNSを
制限エンドヌクレアーゼを用いて切断させ、この際に生
じるフラグメントをアガロースデル電気泳動により分離
させ、引続き、E、 M、プずンの方法(J、 Mo1
. Biol。
形でメンブランフィルタ−上に移す(Gen 5cre
en PlusTMHybridisierungsm
embra−nin 、 Du Ponz de Ne
mours / NEN−ResearchProdn
cza )。
ーゼ(Boehringer Mannheim )及
び[r 32−p〕−アデノシン−5′−トリホスフェ
ート(>5000ci/mモル、Du Pan5 de
Nemours / NEN −Reasarch −
Produczs )の使用下に末端標識しく R,B
、 Wallace and C,G。
ology 152.432〜442 (1987))
、更に精製せずに交雑のために使用する。
法(P、 J 、 Mason & J、 G、 Wi
lliamssのNucleicacid hybri
diaazion 、 133〜160負(1985)
、B、 D、 Hameg & S、 J、 Hlgg
ingHrsg、 IRL Press 0xford
、 Washingzon D、 C,)の使用下に行
なうo 6 x Sac e、 10 x Dsn特徴
−rdz ’、 0.5%(w/v) SDS及び5−
RNA 1004/ tsA (Bickerhefe
、 Boehringer Mannheim )並
びに標識オリゴヌクレオチドI/II/110n9/I
Ltの条件下で41°C(≧6h)で、特異的な交雑が
達成できる。雑種細胞(Hybrids )の検出は、
オートラジオグラフィ(T、 ManiaziaE、
P、 Fr1csch & J、 Sambrook、
MolecularCloning、 Co1d S
pring Harbor Laboratory(1
982))により行なう。
P 52の単離及び特性化 アルトロバクターからプラスミドpH52を単離するた
め、Bicoboim及びDolyによるアルカリ抽出
法(Birnboim H,C,& Doly 、 J
。
、1513〜1523)で、Br ands ch及
びDe c ke rの変法(Brangch、 R,
Decker、 K、 (1984)Arch、 Mi
crobiol、 138 + 15〜17)を用いる
。調製のために、バクテリアを次の成分:バクトートリ
ゾトン (Baczo−Trypzon ; Difcoo)
1011 / lバクトーヘーフエーエキス (Dirco ) 5 M
/ INa(J 101
1 / 1よりなるLB−培地61中で、細胞密度0D
550=1.4になるまで培養し、引続ぎ、遠心分離に
より収穫する。
0 mM EDTA 、 25 mM トリス/ H
Cj pi”18.0、リンチーA 1 q/ag )
合計210Ilt中忙再懸濁させ、室温で1時間インキ
ュベートする。
0auの添加により分解を行なう。注意深い混合及び弓
続く室温での5分間のインヤユペーション及ヒ引続く5
分間の水冷の後に、混合物を浴液■(2M トlJス/
HCJpH7,0/ 0.5MK(J) 180紅の添
加により中和する。氷上で1時間インキュベーションの
後に、不溶の沈殿を遠心により除去する。プラスミド−
DNSはインゾロパノール0.6容量係の添加により沈
殿させ澄明上澄みを得、室温で15分間のインヤユベー
ションの後に遠心(15000X1!/30分)Kjリ
ペレット化する。プラスミド含有沈殿を真空中で乾燥さ
せ、引続き10 XTE lit衝fK (100mM
トリス/ HCJ−p)18.0 ; 10mM E
DTA ) 24 tea中Kmかす。このプラスミド
含有#!rat−引続き等@匿(iaopyknigc
he ) 塩化セシウム−密度勾配遠心により、臭化
エチジウムの存在下に、精製する( Maniazig
T、 Fr1zsch 、 E、 F、 & 8dm
brookJ、によるMo1ecular Cloni
ng (1982)Cold Spring Harb
or 、N、Y、)。
クレアーゼを用い、単一又は多重切断により、かつ引続
< 0.8 (w/v)%アがロースジつル中での制限
フラグメントのゲル寛気泳動分合;ユにより分析する。
nd鳳並びにHind j s”ECoRIで処理した
バクテリオファージλのDNSt−標準として用いる。
限地図が得られる(第4図参照)。この:・″′プラス
ミド大きさは、41 kbの制限フラグメント長さの合
計として確認できる。
Maniazia T、 Fr1zach E、 F
、 &SambrOOk J、によるMo1ecula
r Coloning 。
(1982)癖f4tA’i。
ロラーゼー遺伝子のコード化領域の:・4r p、−1
i気泳動により現われ、メンブランフィルタ−上に移さ
れたシラスミドpHP 52の制限7ラグメントと例4
に記載の311 p−標識オリゴヌクレオチドとの交雑
により、プラスミドpHP52の制限地図上のカルバメ
ート−ヒドロラーゼ−遺伝子のコード化領域の位rIL
は明白に薙定することができる。第5図には、交雑範囲
が拡大して示されている。すべての3fBAのオリゴヌ
クレオチドは、3.3kbの大きさのPszI−制限フ
ラグメントの中心部と交雑する。第6図には7ラグメン
ト内の又雑範囲の正確な位置を明らかにするフラグメン
トの訃細な制限地図が示されている。
クローニング及びLac−プロモーター制限下における
遺伝子発現の検出 E、コリー中のカルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子の
クローニングのために、ベクターpUC19(Yani
sh−perron 、 C,Vieira、J+&
Measing、J、(1985)Gene33 .1
033ff)を使用する。CのTITJC19DNSを
制限ヌクレアーゼPszlを用いる切断により線状化し
アルカリ性ホスファターゼで処理する。プラスミドpH
P 52の3,31cbの長さのPszfi−制限フラ
グメントのDNS ’z 、Psc I−を用いる野性
型シラスミド−DNSの切断の後に調製用アがロースデ
ル電気泳動により単離する。この線状化され、脱ホスホ
リル化されたベクターDNS及び6゜3 kbの長さの
Pscl−7ラグメントt1引絖ぎT 4 DNA +
7が一ゼで連結6せる。この連結混合物で、E、コIj
−DH5αは形質転換される。
れぞれベクターpUC19のLac Z’−因子の転写
方向に対するそれぞれ異なる方向で7ラグメ/トヲ含有
する。これは、クローンpp52及び1)T) 52
Psc inv、でbる。双方のクローンの匍」限地図
が第5図に水式れている。E。
イソプロピル−β−〇−チオがラクトシトを培地に添加
の後に、カルバメート−ヒドロラーゼを発現する。クロ
ーンpp 52Pscの対数培養物へのインダクター添
加なしに(1ae−プロモータの未表現状態)、かつク
ローンpp 52PaC1nV、の未表現の(repr
imierZ )及び誘導でれた対数培養物においては
、#素工ヤス中で例6に記載の検を法により酵素活性は
立鉦できない。
メート−ヒドロラーゼ−遺伝子がベクターのLac Z
’内因子おけると同じ転写方向(5′−6′−配向)で
存在すること全意味する。アルトロバクタープロモータ
は明らかに、11コリー中にV:L、認められない(か
つ又は不光分にのみ認められる)。
カルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子のヌクレオチド虻
タリ及びこれから111!!帰された酵素の蛋白質配列 カルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子のヌクレオチド配
列をサンが−の方法で確認する( Sanger、 F
、 N1eklenIlS、 & Coulson、
A。
Sci、 USA74.5463〜5468 )。
NSから出発し、−1鎮DNS−バクテリオファージM
13 ml) 18及びM 13 mp 19内で1
5クローンを構成する( Messing、 J。
ol。10120〜78)。E、コリーDH5αyへの
トランスフェクションの後に−l鎖組声えデソキシリボ
ヌクレイン酸の配列が確認される。
列決定法が水式れている。合計して1864塩基対の配
列が確認δれる(ストランド及び対向ストランド 第6
図参照)。
ドロラーゼの蛋白員配列を有する確認ヌクレオチド配列
が水式れている。この読み枠は明らかに、例4に記載の
2個のBrCN−切断ペプチドのアミノ酸部分配列によ
り定義される。この読み枠は、T()A−停止コドンで
終結している(第7図のヌクレオチド−位1i1178
9〜1791)。翻訳開始コドンとしては、GTC(ヌ
クレオチド位am340〜642)がこれに該当する。
アミノ酸)を生じる。慣用のATG開始コドンで開始す
るすべての開放読み枠は、蛋白質通過寸法(蛋白質の分
子1測定と比較)を生じない。
災に、推定GTG−開始コrンの7 bp上流の間隔で
、リボソマールE、コリー結合位置に関するコンセンサ
ス−配列に対して明らかなホモロゾー領域の存在により
支持される。
niacis l ’r、 Fr1Z8Ch、 E、
F、 & SambrookJ、(1982)によるM
o1ecular Cloning。
) 。この配列化反応は、[セクエナーゼ@ DNA
セクエンシングキッ ト (Bequenase RD
NA Sequencing Kits :Un
ized 8iaces Biochemical C
orporazion )の使用下に、製造者の指示に
従って実施される。
6 (w/v)%/尿木デル中で行なった( Mara
m、 A、 M、 & G11berc、 W、 (1
980)Method Enzymol、 65 +
497〜557 )。
シフアム分解性カルバメート−ヒドロラーゼを単離し、
引続き精製する方法を示す系統図であり、第2図は、粗
製エキス及び精製工程の後の単離嘔れ、プールされた蛋
白質フラクションの5D8−ポリアクリルアミドデル上
での電気泳動分離状態を示す(2)であり、第6図はカ
ルバメート−ヒドロラーゼの活性と一佃の間係を示す図
であり、第4図は、アルトロバクター・オキシダンス1
1株p52)からのプラスミドpHP 520制@地図
であり、第5図は、カルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝
子の10−ユング法を示す図であり、第6図は、カルバ
メニトーヒドロラーゼー遺伝子の正確な位置(開始:(
)TG=開始コドン、停止:TAG=停止コドン)を示
すクローン化された3、3 kb Psz I−制限フ
ラグメントの制限地図であり、第7図は、カルバメート
−ヒドロラーゼ−遺伝子のヌクレオチド配列を示す図で
ある。 図面の浄書(内容に変更なし) 第1図 活性 第3図 第5図
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、フエンメジフアムの2つのフェニル核の間の−OO
C−N−結合の分解に寄与するアルトロバクター・オキ
シダンスからのカルバメートヒドロラーゼを単離し、引
続き精製する方法において、アルトロバクター・オキシ
ダンスの微生物を栄養培地中で培養し、引続き、カルバ
メート−ヒドロラーゼを超音波−細胞崩壊及び遠心分離
により単離し、アニオン交換体−クロマトグラフィ、勾
配溶離、硫酸アンモニウム沈殿、ゲル濾過及びFPLC
−分離により電気泳動的な均一性に達するまで精製し、
この際、カルバメート−ヒドロラーゼは、至適pH6.
8、50〜60kdの範囲の分子量及び等電点pI=6
.2を有することを特徴とする、除草剤フエンメジフア
ムの失活化のための遺伝子−酵素系を単離し、引続き精
製する方法。 2、アミノ酸配列 ペプチド I : 【遺伝子配列があります】 ペプチドII: 【遺伝子配列があります】 を有することを特徴とする、カルバメート−ヒドロラー
ゼのBrCN−分解ペプチド。 3、配列 オリゴヌクレオチド I : 【遺伝子配列があります】 オリゴヌクレオチドII: 【遺伝子配列があります】 オリゴヌクレオチドIII: 【遺伝子配列があります】 の合成ヌクレオチドを製造するため、請求項2に記載の
ペプチド I 及びIIを使用することを特徴とする、合成
オリゴヌクレオチドの製法。 4、カルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子の単離のため
に、請求項3に記載の合成オリゴヌクレオチドを使用す
ることを特徴とする、カルバメート−ヒドロラーゼ−遺
伝子の単離法。 5、41kbの長さのプラスミドpHP52を3.3k
bの長さのPst−制限フラグメントと共に含有し、そ
の上にカルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子が局在して
いる、アルトロバクター・オキシダンスp52(pHP
52)(DSM4044)。 6、カルバメート−ヒドロラーゼ−遺伝子は、1479
塩基対のヌクレオチド配列を有するレーゼラスターより
なる、請求項5記載のアルトロバクターオキシダンス。 7、アルトロバクター・オキシダンスp16/4/B(
DSM4038)。 8、アルトロバクター・オキシダンスp67(DSM4
039)。 9、アルトロバクター・オキシダンスp75(DSM4
040)。 10、アルトロバクター・オキシダンスp11/1/−
b(DSM4041)。 11、アルトロバクター・オキシダンスp15/4/A
(DSM4045)。 12、アルトロバクター・オキシダンスp21/2(D
SM4046)。
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