JPH02234698A - 細菌ルシフェラーゼ系によるdnaプローブの検出法 - Google Patents

細菌ルシフェラーゼ系によるdnaプローブの検出法

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JPH02234698A
JPH02234698A JP5390289A JP5390289A JPH02234698A JP H02234698 A JPH02234698 A JP H02234698A JP 5390289 A JP5390289 A JP 5390289A JP 5390289 A JP5390289 A JP 5390289A JP H02234698 A JPH02234698 A JP H02234698A
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enzyme
nad
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nadh
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Haruo Watanabe
治夫 渡辺
Hideji Shibata
柴田 秀司
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Toyobo Co Ltd
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    • G01N33/58Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances
    • G01N33/581Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving labelled substances with enzyme label (including co-enzymes, co-factors, enzyme inhibitors or substrates)
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 〔産業上の利用分野〕 本発明は核酸のハイプリダイゼーシジンを利用して、特
定の塩基配列を同定するDNAプローブ法におけるDN
Aプローブの検出方法に関する。
〔従来の技術および発明が解決しようとする課題〕酵素
を標識したDNAプローブを核酸の特定配列の同定のた
めに用いることは、ラジオアイソトープを標識する方法
に代るDNAプローブ検出法として近年広く検討されて
いる。とりわけ、酵素標識により対象物質を検出するこ
とは、免疫反応において酵素免疫測定法として広く実施
され、ラジオアイソトープと同等感度もしくはそれを上
まわる感度の検出系を実現している。酵素標識のうちで
もアルカリフォスファターゼを標識することは該酵素の
ターンオーバー数の大きさ(比活性の大きさが目安とな
る)により、高活性が期待され、事実標識に伴う酵素の
安定性も含めてアルカリフォスファターゼが、標識系に
選ばれることが多い。
また、その反応基質として、外部にリン酸基を有するも
のならアルカリフォスファターゼの基質になるため、吸
光法のみならず蛍光法による検出法にも適した酵素であ
る。しかし基質を選定する際、該酵素の至適反応条件に
近いpHで自然分解のない安定な基質を選定することが
、検出系のブランクを低下させ、検出を高感度化するた
めに必須な条件である。
更に検出系を高感度化するために発光法を用いることが
アルカリフォスファターゼ活性、ひいては該酵素標識物
の検出を高感度に行うため有利であることはいうまでも
ない。ここで、リン酸結合型発蛍光物質(例えばウンベ
リフェリルリン酸)から、リン酸が遊離され、生成する
蛍光物質をシュウ酸ジエステルと過酸化物(HzO2)
と酸化触媒(ベルオキシダーゼなど)により化学発光さ
せ高感度系を実現できることは、原理的に可能である。
しかし、自然氷解を受けない安定なリン酸化発蛍光物質
により実施されなければならず、化学発光での検出感度
の向上は蛍光法と同程度もしくは10倍程度の高感度化
が実現されるにすぎない。
〔発明が解決しようきする課題〕
そこで、本発明者らはアルカリフォスファターゼを標識
とするDNAプローブの検出系において、より高感度な
発光法による検出法を開発すべく鋭意研究を行った。
核酸のハイブリダイゼーションにおいては、非特異的な
吸着及びハイブリダイゼーションの正確性及び効率性の
ため、60゜C付近の高温にて、標識酵素をとり扱い、
また、洗浄に苛酷な界面活性剤(例えばSDS)が用い
られる。そして、この核酸のハイブリダイゼーションに
おけるDNAプローブの標識酵素としては、このような
ハイブリダイゼーション条件に耐える高活性なアルカリ
フォスファターゼが用いられる。本発明者らは、この高
活性のアルカリフォスファターゼの特性と、苛酷なハイ
ブリダイゼーション条件を考慮しつつ、該酵素の検出系
を高惑度な発光系と結合することにより高惑度な方法を
見出し、本発明を完成した。
〔課題を解決するための手段〕
本発明は、アルカリフォスファターゼを標識したDNA
ブローブにNADP”.を反応させ、生成するNAD”
にアルコールおよびアルコール脱水素酵素を反応させて
NADHに変換し、該NADHを細菌由来のフラビン還
元酵素およびルシフェラーゼを用いて、発光強度として
測定するこを特徴とする細菌ルシフェラーゼ系によるD
NAブローブの測定法である。
すなわち、本発明は、DNAブローブの検出法において
、高感度化を実現するため、生物発光法による高感度検
出を実現する方法である。まず、アルカリフォスファタ
ーゼの基質であってその生成物が生物発光法、とくには
、発光細菌の発光系酵素の基質に転換しうるものであり
、かつ基質ブランクが発光検出においてきわめて小さい
ことが、発光検出の精度を維持する上で必要なため、ア
ルカリフォスファターゼが該基質に小さいh値を示し、
かつ基質の反応条件における自然氷解(脱リン酸)が小
さいものが基質として選ばれなければならない。上記条
件をみたす基質としてNADP”(ニコチンアミドアデ
ニンジヌクレオチドリン酸)を用いることが良いことを
、探索の結果見出した。
NAI)P”がアルカリフォスファターゼの基質であり
、氷解反応によりNAI)”(ニコチンアミドアデニン
ジヌクレオチド)が生成することは文献(Leon A
.Heppelら:J.Biol.Cheli.Vol
. 237, p841846, 196i)により示
されているが、アルカリフォスファターゼのNADP+
に対するbが、吸光法に用いられる好適な基質p−ニト
ロフェニルリン酸より小さいことが検討した結果判明し
た。b値の小さい基質を用いることは、アルカリフォス
ファターゼ反応に対し、少ない基質量で最大活性をうる
ことができ、少ない基質量を用いることで非酵素的反応
によるNAD”の生成量を少なくし、発光反応における
、基質によるブランクアップを最小限にすることが可能
となる。次に生成したNAD”を細菌発光系の基質であ
るNADHに転換する時、NADP″過剰存在下に選択
的に生成したNAD+のみをNADHに還元することの
できる酵素として、イースト由来のアルコール脱水素酵
素(E.C.1.1.1.1) (例えばベーリンガー
・マンハイム社製の酵素)がNAD”に特異的に作用す
ることが知られている。しかもこのアルコール脱水素酵
素は基質であるエチルアルコールの存在下にアルカリ性
条件下で作用・し、エチルアルコールの必要濃度はアル
カリフォスファターゼ活性に何ら障害とならないため、
極めて有利な酵素であり、一一の反応系において、アル
カリフォスファタ−ゼにより生成するNAD”をアルコ
ール脱水素酵素との共役により逐次NADHに転換せし
めることが可能である。かつ、該アルコール脱水素酵素
は該酵素に含まれるフォスファターゼ及びNAD・分解
酵素(NADase)の混在量が極めて少ないため、非
特異反応の防止上有利である。かくして、生成し蓄積し
たNADH量をFMN (フラビンモノヌクレオチド)
、長鎖アルデヒド及び酸素の存在下、発光細菌より得ら
れるフラビンレダクターゼ及びルシフェラーゼにより、
反応させて、短時間で、例えば約7秒前後で迅速に発光
強度をピーク高さとして測定することにより、該アルカ
リフォスファターゼ存在量、酵素標識したDNAプロー
ブ量ひいては該DNAプローブとハイブリッドした核酸
配列量を測定することができる。上記したアルコール脱
水素酵素はイースト由来のものと同等の性質を有するも
のであれば、イースト由来のものに限定されない。例え
ばウマ肝臓由来のアルコール脱水素酵素を用いることも
できる。なお、上記した発光細菌としては、ビブリオ・
ハーベアイ(Vibrio harveyi)やビブリ
オ・フィッシャライ (Vibrio fischer
i) (ATCC 7744)が挙げられ、上 記発光
細菌の分類については、Current Microb
iology vol.4, p.127(1980)
に記載されている。
該発光細菌からフラビン還元酵素を得る方法は例えばJ
ournal of Biological Chem
istry vol.247, p.398−404(
1972)に記載されている。またフラビン還元酵素を
得る方法は例えばMolecular &Cellul
ar Biochemistry vo1.44,p.
181−187(1982)に記載されている。ここで
発光検出に用いるフラビンレダクターゼ及びルシフェラ
ーゼには、フォスファターゼ及びアルコール脱水素酵素
、更にはNADH分解反応を惹起する成分が含まれない
ため、NADH量を発光量として正しく検出できたこと
はいうまでもない。更には共役反応に用いたアルコール
脱水素酵素、フラビンレダクターゼ、゛ルシフェラーゼ
試薬が残存する界面活性剤に影響されないことも本発明
の大きな利点である。
上記の反応は、以下の反応式にまとめることができる。
?MNII■+C−RCHO+Oz         
   FMN+C−RCOO旧ozo+h νここでh
νは光量を示す。(上記の式中、RCHOは長鎖アルデ
ヒドを示し、例えばデカナールである。
RCOOHは長鎖カルボン酸を示し、例えばデカン酸で
ある。
本発明の検出法ではナイロン膜上に標的DNAを変性さ
せ一本鎖として固定した上、アルカリフォスファターゼ
標識のDNAプローブをハイブリダイズさせたものを試
料として用いる。そして、既知量の標的DNAをあらか
じめ固定しハイブリダイズさせることにより検量線を作
成し、未知試料中の標的DNA量を知ることができる。
〔実施例〕
以下に実施例により本発明を詳しく説明する。
但し、本発明はこれら実施例に限定されるものでない。
〔実施例1〕 HSV−genericの特異配列を組込んだプラスミ
ドをコントロール・プラスミドとして用意し、蒸留水に
て希釈系列を作った。これらに等量の0.6NNaOH
を加え15分間室温に放置した後、75u1をドット・
プロットした。ドット・プロットされたナイロン膜は2
0XSSC (175g Nacl, 88gクエン酸
ナトリウム/1)を4倍希釈した(5 X SSC)バ
ッファーにて軽く洗浄し、80゜C30分間乾燥した。
これをドットに従い、3III[I1径に切り抜き、ハ
イブリダイゼーション・バy 7 7  (20XSS
Cに5gBSA,5gポリビニルピロリドン、Log 
SOSを加える)を加え、60゜C,15分間加温し、
1 mllハイブリダイゼーション・バッファーに対し
、5μ2のアルカリフォスファターゼ標識DNAプロー
ブ5μl  (50ngDNA/mff)を加えて、更
に60゜c,15分間加温した。
次に洗浄は室温にて1 x ssC(1/20希釈)に
l%SDSを加え、5分間2回振騰しておこなった。次
に1%トリトンX−100をIXSSCに加えた洗浄液
l0 で60″C,  5分間洗浄し、室温に戻して更に上記
バッファーで2回洗浄し、最後に1xsscにし室温5
分間2回洗浄した。試料量は12.3ng (1.4 
X 109コピー)を希釈して用いた。
このようにして、試料DNAの希釈系列に従って作製し
た標識DNAプローブをパイプリダイズさせたd is
cを円筒形の容器に納めた。次いで25μlの2u/m
アルコール脱水素酵素、21mMエチルアルコール及び
iooμM NADP“を加えた0.5mM MgCl
2を含む20mMトリスー塩酸バッフ7−pH8.5を
加え、25”CI時間反応させた。反応後、20μlを
サンプルとして発光反応に供した。発光反応用試薬は0
.006%デカナール、10μM FMN、0.6%B
SA,50mν/Fdフラビンレダクターゼ、2 X 
10−2m u / 1dルシフェラーゼを0.1Mリ
ン酸バッファ一pH7.0に溶解した。20μ2の試料
に対し、200μlの上記発光試薬を注射器で注入し、
そのピーク高さを測定する。発光測定はラボサイエンス
社製TD4000ルミフォトメーターを用いた。
測定の結果は表1に示すように、2. 13 X 10
’コピーが最少感度であり、0.188 pgブラスミ
ドに相当した。なお、S/N比は、ブランクに対し1.
18であり、有意差が認められた。また各測定点におけ
るS/N比は吸光法により検出可能な濃度域においても
極めて高く本法が優れた検出系であることが示された。
〔比較例1〕 同一のHSV− gener icの特異配列を組込ん
だプラスミドをサンプルとし、同一の希釈系列を用意し
、MBI社SNAPキットを用いて測定した結果、本法
のフォルマザン発色法では、5.46X10’コピーが
検出された(表1)。S/N比は発光法に比べて小さか
った。なお、検出系の原理は5−ブロモー4−クロロー
3−インドリルフォスフェートを基質としてアルカリフ
ォスファターゼにより脱リン酸した生成物が非酵素的に
ニトロブルーテトラゾリウムを還元発色させ、このフォ
ルマザン色素が膜に沈着するので、その発色の色調を計
測する方法によった。
〔比較例2〕 NADP”を基質として、アルカリフォスファターゼ活
性を検出する別法としてC,H,SelfはJourn
al of Immuno1ogical Metho
t3s, 76巻389393ページ(1985)にお
いて、生成するNAD”をアルコール脱水素酵素とジア
ホラーゼのサイクリング反応により、フォルマザン色素
を蓄積する方法でアルカリフォスファターゼを高感度に
検出する方法を報告している。発明者らは上記方法に従
い、25μlの100μM NADP“を加えて、di
sc上のアルカリフォスファターゼと反応させ、1時間
後に、10μ℃をサンプリングし0.9Mのサイクリン
グ用試薬を添加して15分反応させ、0.3N HCI
IIdを加えて反応を停止する。このときサイクリング
用試薬の組成は0.01■/ mlアルコール脱水素酵
素、5%エタノール、0.5%トリトンX〜100、ジ
アホラーゼ0. 1 tng / mll、ニトロブル
ーテトラゾリウム0. 1 mg / mlを5On+
Mリン酸バッツ7 −  pH7.5に溶解して用いた
サイクリング条件については至適組成濃度を検討して用
いたがブランク吸光度が高く、高感度に生成したNAD
+を測定できなかった(表1に測定結果を示す)。
(本頁以下余白) 〔発明の効果〕 本発明のDNAプローブ検出法は、アルカリフォスファ
ターゼで標識したDNAプローブを発光系と結合するこ
とにより、吸光法よりも高感度でかつ安定性の高い優れ
たものである。
そして、アルカリフォスファターゼの基質としてNAD
P”を用いることにより、少ない基質量で最大の活性を
得ることができ、しかも発光検出の精度が高くなり、ま
たNAD+をNADHに還元する手段として、アルコー
ル脱水素酵素を用いることにより、アルカリフォスファ
ターゼ活性に悪影響を及ぼすことなく、さらに発光検出
手段として、フラビン還元酵素及びルシフェラーゼを用
いることにより、迅速にまた他の酵素・反応に影響する
ことがないので正確にNADH量を発光量として検出す
ることができる。
そして、核酸のハイブリダイゼーションにおいて使用す
る界面活性剤にもこの反応系は影響をうけることがない
という優れた効果をも奏する。

Claims (1)

    【特許請求の範囲】
  1. アルカリフォスファターゼを標識したDNAプローブに
    NADP^+を反応させ、生成するNAD^+にアルコ
    ールおよびアルコール脱水素酵素を反応させてNADH
    に変換し、該NADHを細菌由来のフラビン還元酵素お
    よびルシフェラーゼを用いて、発光強度として測定する
    ことを特徴とする細菌ルシフェラーゼ系によるDNAプ
    ローブの測定法。
JP5390289A 1989-03-08 1989-03-08 細菌ルシフェラーゼ系によるdnaプローブの検出法 Pending JPH02234698A (ja)

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