JPH022358A - 百日咳菌の新規な線毛性サブユニットをコード付ける遺伝子 - Google Patents
百日咳菌の新規な線毛性サブユニットをコード付ける遺伝子Info
- Publication number
- JPH022358A JPH022358A JP63324757A JP32475788A JPH022358A JP H022358 A JPH022358 A JP H022358A JP 63324757 A JP63324757 A JP 63324757A JP 32475788 A JP32475788 A JP 32475788A JP H022358 A JPH022358 A JP H022358A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- gene
- sequence
- bordetella pertussis
- dna
- subunit
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
- C07K14/235—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Bordetella (G)
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/04—Antibacterial agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Immunology (AREA)
- Public Health (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
線毛(pili)の新規なタンパク質性サブユニソトを
コード付ける遺伝子のクローニング及び配列決定(シー
フェンス)に係る。
コード付ける遺伝子のクローニング及び配列決定(シー
フェンス)に係る。
本発明は、遺伝子又はそのフラグメントを包含する組換
えプラスミド、及びこの組換えプラスミドによって形質
転換させた宿主微生物にも係る。
えプラスミド、及びこの組換えプラスミドによって形質
転換させた宿主微生物にも係る。
さらに、本発明は、上記タンパク質サブユニット又はそ
の領域と同じアミノ酸配列を有する免疫学的に活性な合
成ペプチドに係る。
の領域と同じアミノ酸配列を有する免疫学的に活性な合
成ペプチドに係る。
百日咳は、百日咳菌によって起る呼吸器系の病気であり
、カタル期又は発作期に、患者から罹患し易い健康者に
伝染する。
、カタル期又は発作期に、患者から罹患し易い健康者に
伝染する。
百日咳は痙宰、大脳障害を生ずることがあり、時には、
特に幼児及び母性の抗百日咳抗体が欠けた新生児では死
亡する場合がある。従って、このような病気に対して有
効なワクチンが望まれている。
特に幼児及び母性の抗百日咳抗体が欠けた新生児では死
亡する場合がある。従って、このような病気に対して有
効なワクチンが望まれている。
現在では、マーシオレートで殺菌し、56℃で処理した
ビルレント細菌でなる抗百日咳細胞性ワクチンが使用さ
れているが、この場合、たとえ永久防御を与えることが
できるとしても、望ましくない副作用がある。このため
、上述の欠点を持たない新規な抗百日咳無細胞ワクチン
の開発が要求されている。
ビルレント細菌でなる抗百日咳細胞性ワクチンが使用さ
れているが、この場合、たとえ永久防御を与えることが
できるとしても、望ましくない副作用がある。このため
、上述の欠点を持たない新規な抗百日咳無細胞ワクチン
の開発が要求されている。
百日咳の発病における必須の段階は、上部気道の上皮細
胞への細菌の付着であり、これにより、微生物が宿主の
防御系をくぐり抜けることが可能になる。
胞への細菌の付着であり、これにより、微生物が宿主の
防御系をくぐり抜けることが可能になる。
この過程において細菌の細胞表面のいかなる成分が関与
するかは完全には明白にされていないが、かかる付着は
、細菌の表面上に存在する重合化サブユニット[繊毛(
fimbriae)又は線毛として知られている]でな
る細胞外タンパク質によって起るものとみられる。
するかは完全には明白にされていないが、かかる付着は
、細菌の表面上に存在する重合化サブユニット[繊毛(
fimbriae)又は線毛として知られている]でな
る細胞外タンパク質によって起るものとみられる。
Ashworthらは、百日咳菌の繊毛が血清形−特異
的凝集原、すなわち細菌細胞を凝集させる抗体の生産を
促進する表在性抗原であることを示唆している[rln
fect、1m+++un、J 37.127g−12
81(I982)]。
的凝集原、すなわち細菌細胞を凝集させる抗体の生産を
促進する表在性抗原であることを示唆している[rln
fect、1m+++un、J 37.127g−12
81(I982)]。
Irons及び共同実験者らは、血清形2及び3凝集原
として分類される百日咳菌の繊毛を単離、精製している
[rDev、Bio、5Land、J 61.153−
163(I985)コ。この繊毛が分子量21,000
.22,000及び24.000ドルトンを有するサブ
ユニットでなることが明らかにされている。
として分類される百日咳菌の繊毛を単離、精製している
[rDev、Bio、5Land、J 61.153−
163(I985)コ。この繊毛が分子量21,000
.22,000及び24.000ドルトンを有するサブ
ユニットでなることが明らかにされている。
上記凝集原と共に、血清形1.4.5及び6の繊毛も単
離、精製されている。百日咳に対して防御的に働く無細
胞ワクチンの開発における繊毛又はそのサブユニットの
使用に鑑み、上皮細胞への付着の原理[Urisu T
、H,らrlnfect、Immun、J 52゜69
5−701 (I,986)]、その免疫原活性[Zh
ang J、M、らrDev、Boil、5tand、
J 61.173−185 (I985)]及びその構
造[Zhang J、M、 rlnfect、Immu
n、J 48.422427 (I985)]に関して
多数の研究が行われている。
離、精製されている。百日咳に対して防御的に働く無細
胞ワクチンの開発における繊毛又はそのサブユニットの
使用に鑑み、上皮細胞への付着の原理[Urisu T
、H,らrlnfect、Immun、J 52゜69
5−701 (I,986)]、その免疫原活性[Zh
ang J、M、らrDev、Boil、5tand、
J 61.173−185 (I985)]及びその構
造[Zhang J、M、 rlnfect、Immu
n、J 48.422427 (I985)]に関して
多数の研究が行われている。
純化した百日咳菌の線毛を接種したマウスが、その後に
おけるビルレント細菌による鼻腔内感染に対して防御さ
れることが観察された(、RobinsonらrDev
、Boil、5tand、J 6]、165−172
(I985)]が、精製した線毛又は線毛から単離され
たサブユニットをベースとする無細胞ワクチンの調製で
は、百日咳菌の異なる菌株において観察される抗原性の
変化を考慮しなければならない。
おけるビルレント細菌による鼻腔内感染に対して防御さ
れることが観察された(、RobinsonらrDev
、Boil、5tand、J 6]、165−172
(I985)]が、精製した線毛又は線毛から単離され
たサブユニットをベースとする無細胞ワクチンの調製で
は、百日咳菌の異なる菌株において観察される抗原性の
変化を考慮しなければならない。
実際、特殊な血清形の繊毛による免疫では、異なる血清
形の繊毛を含有する菌株による感染に対して常に防御免
疫を形成できるわけではない。
形の繊毛を含有する菌株による感染に対して常に防御免
疫を形成できるわけではない。
たとえば、抗血清形2抗体は、タイプ2の凝集原を含有
する百日咳菌細胞のみを凝集し、抗血清形6抗体につい
ても同様のことが言える[CowellJ、L、らrl
nf、and Immun、J Vol、55. No
、4 916−922(I987)]。
する百日咳菌細胞のみを凝集し、抗血清形6抗体につい
ても同様のことが言える[CowellJ、L、らrl
nf、and Immun、J Vol、55. No
、4 916−922(I987)]。
さらに、抗血清形2及び3モノクロナ一ル抗体がインビ
トロで、血清形に関して特異的に百日咳菌をVIRO細
胞に結合させることが観察されており[Gorring
eらrFEMS Microbiol、5ect、J
26. 5−9(I985)]、これにより、繊毛は抗
原的に相違するしのであることが示唆される。従って、
完全に満足できる多価の無細胞性ワクチンの開発のため
には、百日咳菌によって発現される多数の異なった抗原
タイプの繊毛に関する知識の獲得が基本的に重要である
と考えられる。
トロで、血清形に関して特異的に百日咳菌をVIRO細
胞に結合させることが観察されており[Gorring
eらrFEMS Microbiol、5ect、J
26. 5−9(I985)]、これにより、繊毛は抗
原的に相違するしのであることが示唆される。従って、
完全に満足できる多価の無細胞性ワクチンの開発のため
には、百日咳菌によって発現される多数の異なった抗原
タイプの繊毛に関する知識の獲得が基本的に重要である
と考えられる。
血清形2に相当する大きい線毛性サブユニットをコード
付ける遺伝子が近年クローン化され、配列決定されてい
る[Livey J、ら「モレキュラー・マイクロバイ
オロジー(Molecular Microbiol、
)J 1(2)、 203−209 (I987)]。
付ける遺伝子が近年クローン化され、配列決定されてい
る[Livey J、ら「モレキュラー・マイクロバイ
オロジー(Molecular Microbiol、
)J 1(2)、 203−209 (I987)]。
発明者らは、百日咳菌の新規な線毛性サブユニットをコ
ード付ける新規な遺伝子を単離し、配列決定した。サブ
ユニットの成熟部分のアミノ末端配列は、線毛2.3及
び6のものと同様ではあるが、同一ではない。
ード付ける新規な遺伝子を単離し、配列決定した。サブ
ユニットの成熟部分のアミノ末端配列は、線毛2.3及
び6のものと同様ではあるが、同一ではない。
従って、本発明の目的は、百日咳菌の新規な腺毛性サブ
ユニットをコード付ける遺伝子のクローニング及び配列
決定にある。
ユニットをコード付ける遺伝子のクローニング及び配列
決定にある。
本発明の他の目的は、上記サブユニット又はそのフラグ
メントをコード付ける遺伝子を包含することを特徴とす
る組換えプラスミド、及び該組換えプラスミドによって
形質転換させた宿主微生物にある。
メントをコード付ける遺伝子を包含することを特徴とす
る組換えプラスミド、及び該組換えプラスミドによって
形質転換させた宿主微生物にある。
本発明のさらに他の目的は、線毛性サブユニット又はそ
の領域のものと同じアミノ酸配列を有する免疫学的に活
性なペプチドにある。
の領域のものと同じアミノ酸配列を有する免疫学的に活
性なペプチドにある。
さらに本発明の他の目的は、抗百日咳無細胞ワクチンの
調製における上記ペプチドの使用にある。
調製における上記ペプチドの使用にある。
本発明の他の目的は、該明細書の記載及び後述の実施例
より明白になるであろう。
より明白になるであろう。
本発明がさらに理解されるように、該明細書において使
用する用語に関して簡単に説明する。
用する用語に関して簡単に説明する。
この用語は、各々がドナー生物(バンクが形成される)
由来のDNAフラグメントを有する宿主微生物の一群の
クローンを意味する。
由来のDNAフラグメントを有する宿主微生物の一群の
クローンを意味する。
ゲノムバンクは、各クローンに含有される一群の各フラ
グメントを組み合わせてトナー生物の全染色体DNAを
再構成できる場合を代表例として定義される。
グメントを組み合わせてトナー生物の全染色体DNAを
再構成できる場合を代表例として定義される。
発現
これは、宿主微生物が与えられた遺伝子によってコード
付けられたタンパク質を合成する機構をいつ。
付けられたタンパク質を合成する機構をいつ。
該機構は転写[すなわち、DNAからメッセンンヤ−R
NA(mRNA)へ遺伝情報を映ずことコ及び翻訳[す
なわち、J、D、 WaLson rモレキュラー・バ
イオロジー・オブ・ザ・ジーン(hlolecular
Biology ofthe Gene)J W、A
、 Benjamin Inc、発行、第3版(I97
6)によって記載された遺伝暗号の原則(コドン、すな
わち特定のアミノ酸をコード付けするヌクレオチド塩基
のトリプレットに関する)に従ってmRNAからタンパ
ク質に情報を移すこと]の過程を包含する。各種のコド
ンが同じアミノ酸をコード付けできるが、各アミノ酸に
ついては、これらの特殊なコドンのみであり、他にはな
い。
NA(mRNA)へ遺伝情報を映ずことコ及び翻訳[す
なわち、J、D、 WaLson rモレキュラー・バ
イオロジー・オブ・ザ・ジーン(hlolecular
Biology ofthe Gene)J W、A
、 Benjamin Inc、発行、第3版(I97
6)によって記載された遺伝暗号の原則(コドン、すな
わち特定のアミノ酸をコード付けするヌクレオチド塩基
のトリプレットに関する)に従ってmRNAからタンパ
ク質に情報を移すこと]の過程を包含する。各種のコド
ンが同じアミノ酸をコード付けできるが、各アミノ酸に
ついては、これらの特殊なコドンのみであり、他にはな
い。
制限酵素
これは、特異な部位(制限酵素の認識部位)でDNA分
子を切断する加水分解酵素である。
子を切断する加水分解酵素である。
クローニングベクター
これは、宿主微生物に移される際、復製を可能にするす
べての遺伝情報を含有するDNA分子をいう。クローニ
ングベクターの例としては、プラスミド及びいくつかの
バクテリオファーノのDNA及びコスミッドがある。
べての遺伝情報を含有するDNA分子をいう。クローニ
ングベクターの例としては、プラスミド及びいくつかの
バクテリオファーノのDNA及びコスミッドがある。
プラスミドDNA (環状の形状を有する)を適当な手
段で切断し、異種DNAのフラグメントを挿入し、再度
環を閉じて、元よりら大きい分子を形成する(組換えD
NA分子又はハイブリッドプラスミド)。
段で切断し、異種DNAのフラグメントを挿入し、再度
環を閉じて、元よりら大きい分子を形成する(組換えD
NA分子又はハイブリッドプラスミド)。
異種DNAフラグメント(すなわち、ベクターによって
形質転換される生物によっては一般に生産されないタン
パク質をコード付けるDNAのフラグメント)を挿入す
るためにベクターを使用する。
形質転換される生物によっては一般に生産されないタン
パク質をコード付けるDNAのフラグメント)を挿入す
るためにベクターを使用する。
プライマー
これは、酵素法によって配列決定されるべきジングルス
トランドの領域に相捕的な15−50塩基のオリゴヌク
レオチドである。
トランドの領域に相捕的な15−50塩基のオリゴヌク
レオチドである。
次に、添付図面について簡単に説明する。
第1図は百日咳菌の菌株SAIから得られたSTX線毛
をコード付ける遺伝子のヌクレオチド配列及び対応する
アミノ酸配列を示す。
をコード付ける遺伝子のヌクレオチド配列及び対応する
アミノ酸配列を示す。
遺伝子を同定しかつ配列決定するために使用した合成オ
リゴヌクレオチドを矢印(−一)で示す。
リゴヌクレオチドを矢印(−一)で示す。
開始のメチオニン、成熟タンパク質の1番目のアミノ酸
及びストップコドンを二二二で示す。
及びストップコドンを二二二で示す。
STX線毛の成熟部分とシグナル配列との間の切断部位
を(↓)で示す。制限酵素Ban旧及びEcoRIの切
断部位を(−−−一)で示す。
を(↓)で示す。制限酵素Ban旧及びEcoRIの切
断部位を(−−−一)で示す。
第2図はSTX、 ST2、ST3及びST6線毛の成
熟部分のNl+、末端配列を比較する図である。
熟部分のNl+、末端配列を比較する図である。
同じアミノ酸残基を==コでグループ分けしている。
第3図はSTX線毛(上方の列)及びSTZ線毛(下方
の列)の類似性を示す。
の列)の類似性を示す。
百日咳菌のビルレンスに関連する遺伝子のクロニングに
おける最近の進歩によれば、これらの同定のための最適
な方法が、大腸菌における遺伝子の直接的な発現[Lo
chtら「ヌクレイツク・アシッド・リサーチ(Nuc
leic Ac1d Res、)j 14.32513
261 (I986); N1cosiaらrP、N
、A、S、 USAJ 83. 4631−4635
(I986)]に基く方法ではなく、遺伝子を含有す
るクローン化DNAフラグメントの特殊なプローブの使
用による同定に基く方法であることが明らかになってい
る。
おける最近の進歩によれば、これらの同定のための最適
な方法が、大腸菌における遺伝子の直接的な発現[Lo
chtら「ヌクレイツク・アシッド・リサーチ(Nuc
leic Ac1d Res、)j 14.32513
261 (I986); N1cosiaらrP、N
、A、S、 USAJ 83. 4631−4635
(I986)]に基く方法ではなく、遺伝子を含有す
るクローン化DNAフラグメントの特殊なプローブの使
用による同定に基く方法であることが明らかになってい
る。
従って、本発明では、百日咳菌の菌株165(血清形l
、2.3)のアミノ末端領域をエドマン法によって配列
決定し、Zhang J、M、によって開示された方法
[rDev、Biol、5tand、J 61.173
−185 (I985)]により精製した。
、2.3)のアミノ末端領域をエドマン法によって配列
決定し、Zhang J、M、によって開示された方法
[rDev、Biol、5tand、J 61.173
−185 (I985)]により精製した。
アミノ酸配列は、
NH−Asp−Asp Gly−Thr lie
Val Ile Thr Gly Thr lie
Thr〔該配列は血清形2の繊毛の主サブユニット(
Livey J、らll1olecular Micr
obiol、J 1 (2)、 203209 (I
987)]のものと同一であることが確認された〕であ
り、該アミノ酸配列を、遺伝暗号の相対的なデジエネラ
ンーを考慮して、オリゴヌクレオチドの合成に使用した
。
Val Ile Thr Gly Thr lie
Thr〔該配列は血清形2の繊毛の主サブユニット(
Livey J、らll1olecular Micr
obiol、J 1 (2)、 203209 (I
987)]のものと同一であることが確認された〕であ
り、該アミノ酸配列を、遺伝暗号の相対的なデジエネラ
ンーを考慮して、オリゴヌクレオチドの合成に使用した
。
この目的には、アミノ酸7−12に相当する領域が選ば
れ、自動システムにより、第3の塩基の変性を有する一
吐(ファミリー)のオリゴヌクレオチド(可能なトリブ
レットの組合せのすべて)を合成した。
れ、自動システムにより、第3の塩基の変性を有する一
吐(ファミリー)のオリゴヌクレオチド(可能なトリブ
レットの組合せのすべて)を合成した。
このファミリーをプローブAと称する。該ファミリーは
次の如く表される。
次の如く表される。
!le Thr Gly Thr Ile
ThrATCACCGGCACCATCAC TTTT GGGA ついで、プローブA (Arrand J、E、の方
法[ヌクレイツク・アンラド・ハイブリダイゼーション
ア・プラクティカル・アプローチ(Nucleic A
c1d11ybridisation: A Prac
tical Approach) B、D。
ThrATCACCGGCACCATCAC TTTT GGGA ついで、プローブA (Arrand J、E、の方
法[ヌクレイツク・アンラド・ハイブリダイゼーション
ア・プラクティカル・アプローチ(Nucleic A
c1d11ybridisation: A Prac
tical Approach) B、D。
Hames−S、 Higgins編、(I985)、
p34]によってマーク付けした〕を、百日咳菌遺伝子
ライブラリー内で、プローブとハイブリダイズする染色
体DNAフラグメントを有するクローンを確認するため
に使用した。
p34]によってマーク付けした〕を、百日咳菌遺伝子
ライブラリー内で、プローブとハイブリダイズする染色
体DNAフラグメントを有するクローンを確認するため
に使用した。
本発明によれば、百日咳菌のゲノムで代表される遺伝子
ライブラリーは細菌の染色体を好適な制限酵素によって
消化することにより作製される。
ライブラリーは細菌の染色体を好適な制限酵素によって
消化することにより作製される。
この目的に、百日咳菌の各種の菌株を使用できる。
詳しくは、市販の百日咳菌の菌株165(血清形1.2
.3) (SCLAVO)を使用した。
.3) (SCLAVO)を使用した。
この菌株の染色体を溶菌化した細胞から抽出し、制限酵
素5au3Aによって該酵素の供給者の推奨する方式で
消化し、エタノールによる沈殿及び遠心分離によって回
収する。このようにして得られた染色体DNAフラグメ
ントをクローニングベクターに導入し、プローブAとの
ハイブリダイゼーション後、Sanger F、らの方
法[rP、N、A、S、J 74.5463(I977
)]によって配列決定した。
素5au3Aによって該酵素の供給者の推奨する方式で
消化し、エタノールによる沈殿及び遠心分離によって回
収する。このようにして得られた染色体DNAフラグメ
ントをクローニングベクターに導入し、プローブAとの
ハイブリダイゼーション後、Sanger F、らの方
法[rP、N、A、S、J 74.5463(I977
)]によって配列決定した。
この方法は酵素的ンークエンシングシステムに基くもの
であり、長鎖及び短鎖の公知DNAフラグメントの配列
の決定に特に適している。
であり、長鎖及び短鎖の公知DNAフラグメントの配列
の決定に特に適している。
この方法では、ジングルストランド形で配列決定される
フラグメント及びジングルストランドの開始領域に相補
的である小さいプライマーオリゴヌクレオチド(塩基1
5−50個)を利用できることが必要である。該方法に
従って、DNAフラグメントをM13ファージベクター
内でクローン化した。使用される好適なファージベクタ
ーは、M13mp8[Messing JらrNucl
eic Ac1d Re5er、J 9.309(I9
81)コ及びM13mp9 [Messing J、ら
rGeneJ 19263 (I982)]であり、こ
れらでは、クローニング部位の位置は、挿入体の配列が
2つの対向末端から始じまって限定されることを可能に
するプライマーのアニーリング部位に対して逆の様式で
で配置される。実際には、ファージ(予め酵素Bam旧
で消化)を、公知の技術によって、T4 DNAリガー
ゼの存在下でリゲーションし、DNAフラグメントに接
合させた。
フラグメント及びジングルストランドの開始領域に相補
的である小さいプライマーオリゴヌクレオチド(塩基1
5−50個)を利用できることが必要である。該方法に
従って、DNAフラグメントをM13ファージベクター
内でクローン化した。使用される好適なファージベクタ
ーは、M13mp8[Messing JらrNucl
eic Ac1d Re5er、J 9.309(I9
81)コ及びM13mp9 [Messing J、ら
rGeneJ 19263 (I982)]であり、こ
れらでは、クローニング部位の位置は、挿入体の配列が
2つの対向末端から始じまって限定されることを可能に
するプライマーのアニーリング部位に対して逆の様式で
で配置される。実際には、ファージ(予め酵素Bam旧
で消化)を、公知の技術によって、T4 DNAリガー
ゼの存在下でリゲーションし、DNAフラグメントに接
合させた。
ついで、リゲーション混合物を、Mandel M、及
び旧gaによって開示された方法[「ジャーナル・才ブ
・モレキュラー・バイオロジー(J、Mo1.Biol
、) J53、154 (I970)]に従いCaCQ
tでコンピテントした大腸菌の形質転換に使用した。
び旧gaによって開示された方法[「ジャーナル・才ブ
・モレキュラー・バイオロジー(J、Mo1.Biol
、) J53、154 (I970)]に従いCaCQ
tでコンピテントした大腸菌の形質転換に使用した。
適切な培養基上、温度35ないし40’Cで1夜培養し
て形質転換体を選別した。
て形質転換体を選別した。
得られた陽性のプラーク(白色)をニトロセルロースフ
ィルターに移し、Arrand法に従ってマーク付けし
たプローブAとハイブリダイズさせた。
ィルターに移し、Arrand法に従ってマーク付けし
たプローブAとハイブリダイズさせた。
陽性のハイブリダイゼーションングナルを示したプラー
クのうち2つを使用し、サンガー法に従い、連続ブライ
マー戦略(successive primersst
rategy)を使用して(Strauss E、C,
ら[アナリティカル・バイオケミストリー(Anal、
BiocheIll、)J154、353 (I986
)]ジングルストランドDNAの配列決定を行った。
クのうち2つを使用し、サンガー法に従い、連続ブライ
マー戦略(successive primersst
rategy)を使用して(Strauss E、C,
ら[アナリティカル・バイオケミストリー(Anal、
BiocheIll、)J154、353 (I986
)]ジングルストランドDNAの配列決定を行った。
このようにして、1つのプラークのジングルストランド
の配列が、プローブの調製に使用されたN−末端アミノ
酸配列からのものと同一であって、ST2遺伝子がコー
ド付ける血清形2の線毛性サブユニットのN−末端領域
に相当するヌクレオチド領域を含有することが明らかに
なった。
の配列が、プローブの調製に使用されたN−末端アミノ
酸配列からのものと同一であって、ST2遺伝子がコー
ド付ける血清形2の線毛性サブユニットのN−末端領域
に相当するヌクレオチド領域を含有することが明らかに
なった。
しかしながら、他のプラークのジングルストランドはS
T2遺伝子のものと類似してはいるが、同一ではないヌ
クレオチド配列を有する領域を含有しており、この結果
、異なる遺伝子の存在が推測された。
T2遺伝子のものと類似してはいるが、同一ではないヌ
クレオチド配列を有する領域を含有しており、この結果
、異なる遺伝子の存在が推測された。
遺伝子を含有する全染色体DNAフラグメントを得ろた
めには、このクローンが遺伝子の一部分(STXと称す
る)のみの含有していればよいことから、百日咳菌の遺
伝子ライブラリーを、クローニングベクターとしてコス
ミッドを使用して作製した。
めには、このクローンが遺伝子の一部分(STXと称す
る)のみの含有していればよいことから、百日咳菌の遺
伝子ライブラリーを、クローニングベクターとしてコス
ミッドを使用して作製した。
コスミッドは、λファージのCO8末端が挿入されたあ
る種のプラスミドである。これらは、組換え分子がウィ
ルス性タンパク質を含有し、これによりウィルス粒子を
形成することを可能にする。
る種のプラスミドである。これらは、組換え分子がウィ
ルス性タンパク質を含有し、これによりウィルス粒子を
形成することを可能にする。
コスミッドのDNAを、ウィルス粒子により、λファー
ジであるかの如く細菌内に挿入する。
ジであるかの如く細菌内に挿入する。
λDNAは非常に大きいが、コスミッドは比較的小さい
ため、DNAの長いフラグメントをベクターに挿入でき
る。
ため、DNAの長いフラグメントをベクターに挿入でき
る。
詳しくは、コスミソドpcH79[Hohn B、らj
’−GeneJll、 291−298 (I980)
]及び百日咳閑の菌株SAI[Ar1co 3.及びR
appuolj R,rンヤーナル・才ブ・バクテリオ
ロジーJ (J、 Bacteriol、) 169.
28472853 (I9g?)]を使用した。
’−GeneJll、 291−298 (I980)
]及び百日咳閑の菌株SAI[Ar1co 3.及びR
appuolj R,rンヤーナル・才ブ・バクテリオ
ロジーJ (J、 Bacteriol、) 169.
28472853 (I9g?)]を使用した。
百日咳菌S^1の染色体DNAを溶菌細胞から分離し、
酵素5Au3Aによって部分的に消化(7た。
酵素5Au3Aによって部分的に消化(7た。
エタノールによる沈殿及び遠沈による分離の後、35−
45に塩基(Kb)の染色体DNAフラグメントを単離
し、T4 DNAリガーゼの存在下でリゲーションして
、予め酵素Bam旧で消化したコスミッドに接合させた
。ついで、このリゲーション混合物を大腸菌の形質転換
に使用し、アンピシリンを添加した選択培地で形質転換
体を選別した。
45に塩基(Kb)の染色体DNAフラグメントを単離
し、T4 DNAリガーゼの存在下でリゲーションして
、予め酵素Bam旧で消化したコスミッドに接合させた
。ついで、このリゲーション混合物を大腸菌の形質転換
に使用し、アンピシリンを添加した選択培地で形質転換
体を選別した。
陽性のコロニーについて、2対のプローブI−2及び3
−4(STX及びST2の予め配列決定されている領域
の異なる部位に対して相捕的である)を使用するハイブ
リダイゼーション法によって分析した。
−4(STX及びST2の予め配列決定されている領域
の異なる部位に対して相捕的である)を使用するハイブ
リダイゼーション法によって分析した。
詳しくは、プローブ(自動システムによって合成される
)は下記の配列を有する。
)は下記の配列を有する。
プローブI (STX) CCG CCCA T G
CCG A A G A Cプローブ2 (STX
) (i CCG G T A A T G A CA
A T G Cプローブ3 (ST2) CCT
T CA G CT T G A T G A Tプロ
ーブ4 (ST2) G T G A T G A
CG A T G G T Gコロニーをニトロセルロ
ースフィルターに移し、溶菌し、2対のプローブとハイ
ブリダイズさせた(二重にテストする)。
CCG A A G A Cプローブ2 (STX
) (i CCG G T A A T G A CA
A T G Cプローブ3 (ST2) CCT
T CA G CT T G A T G A Tプロ
ーブ4 (ST2) G T G A T G A
CG A T G G T Gコロニーをニトロセルロ
ースフィルターに移し、溶菌し、2対のプローブとハイ
ブリダイズさせた(二重にテストする)。
2対のプローブについて65℃、6時間でプレハイブリ
ダイゼーションを行い、一方、ハイブリダイゼーション
を4つのプローブについて各々異なる温度で実施した。
ダイゼーションを行い、一方、ハイブリダイゼーション
を4つのプローブについて各々異なる温度で実施した。
このようにして、対をなすプローブの両方とハイブリダ
イズしたいくつかの陽性のクローンを確認した。
イズしたいくつかの陽性のクローンを確認した。
染色体DNAフラグメント(STX遺伝子を含む)を含
有するコスミッドを同定するため、迅速抽出法[Man
iatisら[モレキュラー・クローニングニア・ラボ
ラトリ−・マニュアル(Molecular Clon
ing:A Laboratory Manual)J
(I982)、 Co1d SpringHarbo
r、ニューヨーク]によってコスミッドを陽性のコロニ
ーから抽出し、EcoRlでの消化によって分析した。
有するコスミッドを同定するため、迅速抽出法[Man
iatisら[モレキュラー・クローニングニア・ラボ
ラトリ−・マニュアル(Molecular Clon
ing:A Laboratory Manual)J
(I982)、 Co1d SpringHarbo
r、ニューヨーク]によってコスミッドを陽性のコロニ
ーから抽出し、EcoRlでの消化によって分析した。
これにより、これらのうちの1つ(以下、psM280
と表示する)がSTX遺伝子の予め同定されている部分
と同一の配列を含有することが明らかになった。
と表示する)がSTX遺伝子の予め同定されている部分
と同一の配列を含有することが明らかになった。
本発明に従い、遺伝子の配列決定を行うため、STXに
関して特異なプローブとハイブリダイズする百日咳菌S
AIの染色体DNAのフラグメントをコスミツドpsM
280がら抽出し、大腸菌ベクターにサブクローン化し
た。
関して特異なプローブとハイブリダイズする百日咳菌S
AIの染色体DNAのフラグメントをコスミツドpsM
280がら抽出し、大腸菌ベクターにサブクローン化し
た。
本発明の目的に適するベクターは、組換えDNA技術で
一般的に使用されるプラスミド、ウィルス及びバタテリ
オファージの中から選ばれる。
一般的に使用されるプラスミド、ウィルス及びバタテリ
オファージの中から選ばれる。
詳しくは、外来のDNAフラグメントが組込まれたクロ
ーンの迅速かつ容易な同定を可能にするプラスミドpU
c12 (2730bp) [Messing J、ら
によってrGeneJ 19.259 (I982)に
開示]を使用した。
ーンの迅速かつ容易な同定を可能にするプラスミドpU
c12 (2730bp) [Messing J、ら
によってrGeneJ 19.259 (I982)に
開示]を使用した。
事実、該プラスミドはβ−ラクタマーゼ及びβガラクト
キシダーゼ用遺伝子のキャリヤーであり、宿主の大腸菌
菌株がアンピノリン含有培地で生育することを可能にす
る。外来のフラグメントがβ−ガラクトキシダーゼ用遺
伝子内に存在する制限部位(特にクローニングに好適で
ある)間に挿入されている場合には、遺伝子が中断され
酵素を生産できなくなる。
キシダーゼ用遺伝子のキャリヤーであり、宿主の大腸菌
菌株がアンピノリン含有培地で生育することを可能にす
る。外来のフラグメントがβ−ガラクトキシダーゼ用遺
伝子内に存在する制限部位(特にクローニングに好適で
ある)間に挿入されている場合には、遺伝子が中断され
酵素を生産できなくなる。
このようにして、ガラクトースと類似の物質(減成され
る場合であっても、色素産生性の分子を生成する)を使
用することにより、プラスミドを含有するものから組換
えコロニー(着色されない)を区別できる。
る場合であっても、色素産生性の分子を生成する)を使
用することにより、プラスミドを含有するものから組換
えコロニー(着色されない)を区別できる。
本発明に従い、コスミッドpsM280を制限酵素Ec
oRIによって消化し、消化混合物をアーガロースゲル
上に負荷した(二重にテストする)。
oRIによって消化し、消化混合物をアーガロースゲル
上に負荷した(二重にテストする)。
電気泳動後、DNAバンドをニトロセルロースフィルタ
ーに移し、プローブl及び2(適当にマーク付けした)
とハイブリダイズさせた。
ーに移し、プローブl及び2(適当にマーク付けした)
とハイブリダイズさせた。
プレハイブリダイゼーション及びハイブリダイゼーショ
ンを各プローブについて異なる操作条件下で実施した。
ンを各プローブについて異なる操作条件下で実施した。
フィルターを適当に洗浄し、ラジオグラフィーに供した
。
。
得られた結果は、両プローブに関して陽性の1.2Kb
のバンドが唯1つ存在することを示した。
のバンドが唯1つ存在することを示した。
該バンドに相当する染色体DNAフラグメントを電気溶
出し、ついでリゲーションを行って、予め1’:coR
Iで消化したプラスミドpUc12に接合させた。
出し、ついでリゲーションを行って、予め1’:coR
Iで消化したプラスミドpUc12に接合させた。
このリゲーションを、緩衝混合物中、T4 DNAリガ
ーゼの存在下、DNAフラグメントが過剰のプラスミド
/ DNAフラグメント比(好ましくは1/3)で実施
した。
ーゼの存在下、DNAフラグメントが過剰のプラスミド
/ DNAフラグメント比(好ましくは1/3)で実施
した。
リゲーション終了後、混合物を使用してコンピテント大
腸菌を形質転換させ、アンピンリンを添加した培養基上
で形質転換体を選別した。
腸菌を形質転換させ、アンピンリンを添加した培養基上
で形質転換体を選別した。
このようにして得られた陽性のクローンから、所望の組
換えプラスミドを含有するいくつかのものを単離した。
換えプラスミドを含有するいくつかのものを単離した。
これらのうちの1つ(psM281と表示する)を使用
して、1.2Kb染色体DIIAフラグメントを単離し
、配列決定に供した。
して、1.2Kb染色体DIIAフラグメントを単離し
、配列決定に供した。
配列決定を、連続プライマー戦略を使用するサンガー法
に従って実施した。
に従って実施した。
rpUCンークエンノング」キットを使用し、かっα[
P”] トレーサーとしてATPを使用して、正常なり
oehringerプロトコールに従い、変性プラスミ
ドについてシーフェンシング反応を行った。
P”] トレーサーとしてATPを使用して、正常なり
oehringerプロトコールに従い、変性プラスミ
ドについてシーフェンシング反応を行った。
上記操作によって、1 、2Kbフラグメントがコスミ
ソドpHc79の375塩基領域及びSTX遺伝子の8
44塩基領域(これらのヌクレオチド配列及びアミノ酸
配列を第1図に示す)で構成されることが明らかになっ
た。
ソドpHc79の375塩基領域及びSTX遺伝子の8
44塩基領域(これらのヌクレオチド配列及びアミノ酸
配列を第1図に示す)で構成されることが明らかになっ
た。
844塩基領域の5′末端から塩基628個下流に位置
するストップコドンまで伸長する配列内で開放読み取り
フレームが確認された。さらに、5Txa伝子がコード
付ける成熟タンパク質のヌクレオチド配列及びアミノ酸
配列が、ST2サブユニットのアミノ末端配列の場合と
同様にして確認された。
するストップコドンまで伸長する配列内で開放読み取り
フレームが確認された。さらに、5Txa伝子がコード
付ける成熟タンパク質のヌクレオチド配列及びアミノ酸
配列が、ST2サブユニットのアミノ末端配列の場合と
同様にして確認された。
この配列(N−末端アミノ酸: NH−Glu−Asp
−GlyThr−11e4al−11e−Thr−Gl
yで表される)は、線毛性ST2サブユニットの成熟タ
ンパク質とその分泌シグナル(リーダー配列)との間に
存在するものと同一のテトラペプチドAla−Ala−
His−Alaによって先導される。このテトラペプチ
ド(膜リーダーーペプチダーゼに関する特異な切断部位
を表わす)は、中央の疎水性ドメイン(アミノ酸−6な
いし−16)(リーダー配列の特徴である)及び−21
位のメチオニンを含有するアミノ酸29個のアミ、ノ酸
配列によって先導される。
−GlyThr−11e4al−11e−Thr−Gl
yで表される)は、線毛性ST2サブユニットの成熟タ
ンパク質とその分泌シグナル(リーダー配列)との間に
存在するものと同一のテトラペプチドAla−Ala−
His−Alaによって先導される。このテトラペプチ
ド(膜リーダーーペプチダーゼに関する特異な切断部位
を表わす)は、中央の疎水性ドメイン(アミノ酸−6な
いし−16)(リーダー配列の特徴である)及び−21
位のメチオニンを含有するアミノ酸29個のアミ、ノ酸
配列によって先導される。
21位メチオニンをコード付けるATGは、おそらく、
翻訳コドンであろう。実際、該コドンの下流から成熟タ
ンパク質の開始点(GAA)までの配列は、シグナル配
列の代表的な長さ及び特性[Perlman D、らr
J、 Mo1. Bioll 167、391−409
(I983)]を有するポリペプチドをコード付ける。
翻訳コドンであろう。実際、該コドンの下流から成熟タ
ンパク質の開始点(GAA)までの配列は、シグナル配
列の代表的な長さ及び特性[Perlman D、らr
J、 Mo1. Bioll 167、391−409
(I983)]を有するポリペプチドをコード付ける。
STX遺伝子生産物のアミノ酸配列(そのヌクレオチド
配列から推測される)は、ST2遺伝子生産物とかなり
類似している。2つのタンパク質の大きい類似性が、ア
ミノ末端領域及び他の線毛性タンパク質について見られ
る如く、最高の保存塵を有するものであるアミノ酸12
個のアルボキシ末端領域で観察された[Liveyらr
Molecular Microbiol、J(2)、
203−209 (I987)]。
配列から推測される)は、ST2遺伝子生産物とかなり
類似している。2つのタンパク質の大きい類似性が、ア
ミノ末端領域及び他の線毛性タンパク質について見られ
る如く、最高の保存塵を有するものであるアミノ酸12
個のアルボキシ末端領域で観察された[Liveyらr
Molecular Microbiol、J(2)、
203−209 (I987)]。
成熟タンパク質の類似性の全体の度合は、アミノ酸レベ
ルで66%及びヌクレオチドレベルで61%と評価され
る。
ルで66%及びヌクレオチドレベルで61%と評価され
る。
STXの予測されるシグナル配列は、タンパク質の残部
よりもST2サブユニットに対してわずかに低い類似性
(52%)を有する。さらに、Sr1及びSTXの配列
によって予測される疎水塵(hydrophobici
ty)/IJt水度(hydrophilicity)
モデルは非常に類似している。
よりもST2サブユニットに対してわずかに低い類似性
(52%)を有する。さらに、Sr1及びSTXの配列
によって予測される疎水塵(hydrophobici
ty)/IJt水度(hydrophilicity)
モデルは非常に類似している。
結局のところ、百日咳菌のSTX遺伝子は分子量的20
Kdを有する線毛タイプの成熟タンパク質をコード付け
、血清形の異なる線毛2.3又は6に又は新規な線毛に
相当すると考えられる。
Kdを有する線毛タイプの成熟タンパク質をコード付け
、血清形の異なる線毛2.3又は6に又は新規な線毛に
相当すると考えられる。
本発明に従い、百日咳菌の染色体遺伝子において存在す
る2種類の遺伝子ST2及びSTXの間の関連性を確認
するため、ゲノム分析を行った。
る2種類の遺伝子ST2及びSTXの間の関連性を確認
するため、ゲノム分析を行った。
詳述すれば、百日咳菌165の染色体DNAを各種の制
限酵素で消化し、消化混合物をSTX及びST2遺伝子
に関して特異なプローブとハイブリダイズさせた。
限酵素で消化し、消化混合物をSTX及びST2遺伝子
に関して特異なプローブとハイブリダイズさせた。
いずれの場合にも、両プローブとハイブリダイズできた
バンドは確認されなかった。
バンドは確認されなかった。
これは、2つの遺伝子が単一のオペロン内に又は相互に
近接して位置していないが、最小距離数Kbで位置しな
ければならないことを示している。
近接して位置していないが、最小距離数Kbで位置しな
ければならないことを示している。
このような事実は、百日咳菌SAIの遺伝子ライブラリ
ーから両遺伝子を含有するコスミッドが存在しないこと
によっても確認された。
ーから両遺伝子を含有するコスミッドが存在しないこと
によっても確認された。
本発明によれば、STX遺伝子がコード付ける成熟タン
パク質のもの又はその免疫学的に活性な領域のものと同
一のアミノ酸配列を有するペプチドは、無細胞性の多価
抗百日咳ワクチンの調製に特に有用である。本発明に係
るプラスミドpsM281をE、coli JM103
(psM281)として、アメリカン・カルチャー・
センターに1987年12月7日付けで寄託している(
寄託番号: ATCC67572)。
パク質のもの又はその免疫学的に活性な領域のものと同
一のアミノ酸配列を有するペプチドは、無細胞性の多価
抗百日咳ワクチンの調製に特に有用である。本発明に係
るプラスミドpsM281をE、coli JM103
(psM281)として、アメリカン・カルチャー・
センターに1987年12月7日付けで寄託している(
寄託番号: ATCC67572)。
以下の実施例は本発明を説明するためのものであって、
本発明を限定するものではない。
本発明を限定するものではない。
実施例1
百日咳菌165から染色体DNAの抽出電文
β−カザミノ酸
(casamino acid) (DIFCO)CQ
MgCQt・6H,O
K、PO。
ニコチン酸
グルタチオン
0.2 g
o、19
0.5 g
O,029
0,019
デンプン 1.009HtOlρ
吋 6.8予め12
0°Cにおいて15分間殺菌した上記組成の発酵培養基
100R12に百日咳菌の菌株165(血清形l、2.
3)を接種し、37℃で3日間撹拌下(200rpm)
に維持した。
0°Cにおいて15分間殺菌した上記組成の発酵培養基
100R12に百日咳菌の菌株165(血清形l、2.
3)を接種し、37℃で3日間撹拌下(200rpm)
に維持した。
この時間の経過後、ローター5orvall RC5B
モデル5S34において4°Cで遠心処理して(I0分
間、5000rpm)、上澄み液から細胞を分離し、l
oomMNaCQ、 50mM Tris−i(CQ(
pH7,5)を含有する溶液で洗浄した(2 X 12
0iflり。
モデル5S34において4°Cで遠心処理して(I0分
間、5000rpm)、上澄み液から細胞を分離し、l
oomMNaCQ、 50mM Tris−i(CQ(
pH7,5)を含有する溶液で洗浄した(2 X 12
0iflり。
このようにして得られた懸濁液を上述の如くして再度遠
心分離し、細胞を回収し、リゾチーム(SIGMA)
1 tttgh(lを含有する緩衝溶液(I00mM
EDTA。
心分離し、細胞を回収し、リゾチーム(SIGMA)
1 tttgh(lを含有する緩衝溶液(I00mM
EDTA。
50mM NaCQ、 2.5%ショ糖; pH6,9
) 10m(!中に再度壁間化した。@濁液を撹拌し、
37℃に30分間維持し、ドデシルスルホン酸ナトリウ
ム(SDS)を最終濃度1%まで添加し、60°Cに3
0分間推持した。
) 10m(!中に再度壁間化した。@濁液を撹拌し、
37℃に30分間維持し、ドデシルスルホン酸ナトリウ
ム(SDS)を最終濃度1%まで添加し、60°Cに3
0分間推持した。
予めI xssc (I xSSC=0.15M Na
C(!、 15mMクエン酸ナトリウム)中37℃で3
0分間インキュベートしたプロテアーゼ l uhQを
該溶液に添加し、得られた溶液を37℃で2時間反応さ
せた。NaCaを最終濃度IMで添加した後、混合物を
水中に30分間維持し、ついで遠沈した。上澄み液中に
含有されるDNAを冷エタノール(−20’C)2−3
容で沈殿させ、ガラス棒で集め、0,1xSSC10π
Q中に再度懸濁化させた。懸濁液をゆるやかに撹拌しな
がら室温(20−25℃)に1夜推持し、RNA5e
(I07/mQ)を添加した後、37℃に30分間維持
した。
C(!、 15mMクエン酸ナトリウム)中37℃で3
0分間インキュベートしたプロテアーゼ l uhQを
該溶液に添加し、得られた溶液を37℃で2時間反応さ
せた。NaCaを最終濃度IMで添加した後、混合物を
水中に30分間維持し、ついで遠沈した。上澄み液中に
含有されるDNAを冷エタノール(−20’C)2−3
容で沈殿させ、ガラス棒で集め、0,1xSSC10π
Q中に再度懸濁化させた。懸濁液をゆるやかに撹拌しな
がら室温(20−25℃)に1夜推持し、RNA5e
(I07/mQ)を添加した後、37℃に30分間維持
した。
溶液の塩濃度をtxsscとし、フェノール(l容)で
抽出し、ゆっくりと撹拌しながら室温に推持した溶液に
イソプロパツールを添加することによってDNAを沈殿
させた。
抽出し、ゆっくりと撹拌しながら室温に推持した溶液に
イソプロパツールを添加することによってDNAを沈殿
させた。
ついで、遠心分離によってDNAを回収し、0.1×5
SCII(2中に再度懸濁化させた。
SCII(2中に再度懸濁化させた。
染色体DNAの量(分光光度計Perkin−E1me
rモデル515を使用し、OD 260での分光測光の
読みにより評価)l;t 0.845mg/icであっ
た。
rモデル515を使用し、OD 260での分光測光の
読みにより評価)l;t 0.845mg/icであっ
た。
実施例2
線毛性サブユニットをコード付ける遺伝子の実施例1で
得られた染色体DNA 10μ9を、反応緩衝溶液[6
mM Tris−HCQ(pH7,5)、50mM N
aCQ15 mM MgCl2t] 200μQ中、制
限酵素5auaA 100単位(II)により37℃に
おいて1.5時間消化した。
得られた染色体DNA 10μ9を、反応緩衝溶液[6
mM Tris−HCQ(pH7,5)、50mM N
aCQ15 mM MgCl2t] 200μQ中、制
限酵素5auaA 100単位(II)により37℃に
おいて1.5時間消化した。
このようにして消化したDNAを混合物に3M酢酸ナト
リウム及びエタノールを添加することによって沈殿させ
、Eppendorf遠心分離機において4℃、120
00rpmで15分間遠沈して分離し、ついでTEm衝
溶液[10mM Tris−H(4(pH8,0)、1
mM EDTA] to。
リウム及びエタノールを添加することによって沈殿させ
、Eppendorf遠心分離機において4℃、120
00rpmで15分間遠沈して分離し、ついでTEm衝
溶液[10mM Tris−H(4(pH8,0)、1
mM EDTA] to。
μQ中に再度懸濁化させた。同時にファージM13mp
8(5μ9)及びM13mp9 (5u9)を、別個に
、反応緩衝溶液[10mM Tris−HCl2 (p
H7,8)、10mM MgC12t、50mM Na
CQ) 50uQ中、酵素BamH[(Boherin
ger)20Uにより37℃で1.5時間消化した。
8(5μ9)及びM13mp9 (5u9)を、別個に
、反応緩衝溶液[10mM Tris−HCl2 (p
H7,8)、10mM MgC12t、50mM Na
CQ) 50uQ中、酵素BamH[(Boherin
ger)20Uにより37℃で1.5時間消化した。
ついで消化混合物からファージDNAを沈殿させ、遠沈
によって分離し、上述のTE緩衝液に再度@濁化させた
。
によって分離し、上述のTE緩衝液に再度@濁化させた
。
染色体DNAフラグメント(I,5μ9)を含有する溶
液15μcを、リゲーンヨン緩衝溶液[66mM Tr
is −HCQ (pH7,6)、1 mM ATP、
10mM MgCl2t、 10mMジチオトレイト
ール) 1.25村中、T4 DNAリガーゼ10の存
在下、ファージDNA溶液12.5μff (I,25
μ9)と共に14℃で18時間リガーゼ処理した。
液15μcを、リゲーンヨン緩衝溶液[66mM Tr
is −HCQ (pH7,6)、1 mM ATP、
10mM MgCl2t、 10mMジチオトレイト
ール) 1.25村中、T4 DNAリガーゼ10の存
在下、ファージDNA溶液12.5μff (I,25
μ9)と共に14℃で18時間リガーゼ処理した。
ついで、リゲーション混合物125μQずつを使用して
、50a+M CaCa、での処理によりコンピテント
とした[Mandel M、及び旧ga rJ、Mo1
.Biol、 J 53゜154 (I970)]大腸
菌71/1g [Miller J、H,rエクスペリ
メンツ・イン・モレキュラー・ジエネティックス(Ex
periments in Mo1ecular Ge
netics)J(I972)、Co1d Sprin
g Harbor Lab、、ニューヨーク]を形質転
換させた。アンピシリン50μ97村、0.03mVI
PTG(イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシ
ド)及び0.05%X−ゲル(5−ブロモ−4−クロロ
−3−インドリル−〇−ガラクトピラノシド)を添加し
て選択的としたIXYT培地プレートし89/ρBac
to Triptone (DIFCO)、59/(l
Bacto−yeastextract (DIFC
O)及び59/(l NaC(2]上に細胞を置き、恒
温室において37℃で12時間インキュベートすること
によって、形質転換体の選別を行った。
、50a+M CaCa、での処理によりコンピテント
とした[Mandel M、及び旧ga rJ、Mo1
.Biol、 J 53゜154 (I970)]大腸
菌71/1g [Miller J、H,rエクスペリ
メンツ・イン・モレキュラー・ジエネティックス(Ex
periments in Mo1ecular Ge
netics)J(I972)、Co1d Sprin
g Harbor Lab、、ニューヨーク]を形質転
換させた。アンピシリン50μ97村、0.03mVI
PTG(イソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシ
ド)及び0.05%X−ゲル(5−ブロモ−4−クロロ
−3−インドリル−〇−ガラクトピラノシド)を添加し
て選択的としたIXYT培地プレートし89/ρBac
to Triptone (DIFCO)、59/(l
Bacto−yeastextract (DIFC
O)及び59/(l NaC(2]上に細胞を置き、恒
温室において37℃で12時間インキュベートすること
によって、形質転換体の選別を行った。
このようにして、陽性のプラーク(白色) 14000
個を得た。
個を得た。
B)特異性プローブの作製
百日咳菌165の線毛の大きいタンパク質サブユニット
(2)のN−末端部をエドマン法によって分析したとこ
ろ、下記配列を有することを示した。
(2)のN−末端部をエドマン法によって分析したとこ
ろ、下記配列を有することを示した。
+111−Asp−Asp Gly−Thr lle
Val lle Thr Gly Thr Il
e Thrアミノ酸配列配列推測されるヌクレオチドを
、遺伝暗号の相対的なデジェネラシーを考慮して、オリ
ゴヌクレオチド(プローブとして使用される)の合成に
使用した。詳しくは、下記配列を有する一群(ファミリ
ー)のオリゴヌクレオチドの合成にあたり、自動システ
ム I Plus DNA合成装置(Beckman
)を使用した。
Val lle Thr Gly Thr Il
e Thrアミノ酸配列配列推測されるヌクレオチドを
、遺伝暗号の相対的なデジェネラシーを考慮して、オリ
ゴヌクレオチド(プローブとして使用される)の合成に
使用した。詳しくは、下記配列を有する一群(ファミリ
ー)のオリゴヌクレオチドの合成にあたり、自動システ
ム I Plus DNA合成装置(Beckman
)を使用した。
11e Thr Gly Thr lie T
hrATCACCGGCACCATCAC TTTT GGGA ^rrandの方法[rNucleic Ac1d H
ybridjsat4on:A Practical
ApproachJ B、D、Hanes−S、旧gg
insg、Press Washington DC(
I985)、p34]に従って、オリゴヌクレオチド0
.9μ9を、5′OH末端部でα[P”] ATP 5
00μCi (3000Ci/ミリモル)でマーク付け
した。算定された固有活性度[シンチレータ−LS 7
500 (Backman)]は8.3xlO’ cp
m/μ9(DNA)であった。
hrATCACCGGCACCATCAC TTTT GGGA ^rrandの方法[rNucleic Ac1d H
ybridjsat4on:A Practical
ApproachJ B、D、Hanes−S、旧gg
insg、Press Washington DC(
I985)、p34]に従って、オリゴヌクレオチド0
.9μ9を、5′OH末端部でα[P”] ATP 5
00μCi (3000Ci/ミリモル)でマーク付け
した。算定された固有活性度[シンチレータ−LS 7
500 (Backman)]は8.3xlO’ cp
m/μ9(DNA)であった。
MI3における遺伝子ライブラリーのプラークをニトロ
セルロースフィルター(Schleicher &5c
hnell O,45μ!l)に移し、このフィルター
について、P、J、Mason及びJ、買i11iam
sの方法(rNucleicAcid Hybridi
sation: A Practical Appro
achJp123)に従って、上記特異性プローブによ
るハイブリダイゼーションを行った。プレハイブリダイ
ゼーションを39℃、6時間で行い、ハイブリダイゼー
ションを39℃、18時間で行った。最後に、25°C
において、フィルターを0.1%ドデシル硫酸ナトリウ
ム(SDS)、6 X5SC(0,P、M NaCl2
.0.09Mクエン酸Na)で1時間洗浄し、ラジオグ
ラフィックプレート Kodak X−Omat AR
と接触させた。
セルロースフィルター(Schleicher &5c
hnell O,45μ!l)に移し、このフィルター
について、P、J、Mason及びJ、買i11iam
sの方法(rNucleicAcid Hybridi
sation: A Practical Appro
achJp123)に従って、上記特異性プローブによ
るハイブリダイゼーションを行った。プレハイブリダイ
ゼーションを39℃、6時間で行い、ハイブリダイゼー
ションを39℃、18時間で行った。最後に、25°C
において、フィルターを0.1%ドデシル硫酸ナトリウ
ム(SDS)、6 X5SC(0,P、M NaCl2
.0.09Mクエン酸Na)で1時間洗浄し、ラジオグ
ラフィックプレート Kodak X−Omat AR
と接触させた。
このようにして、陽性のシグナルを示したプラーク5個
が確認された。これらのうちの2つについて同定した。
が確認された。これらのうちの2つについて同定した。
陽性のプラーク2個のジングルストランドをMessi
ng J、の方法[[メソッズ・オブ・エンザイモロジ
ー(Methods of Enzymol、)j V
、101 (I983)]によって抽出し、5trau
ss E、 C,らによってrAnalytical
Biochem、J 154.353 (I986)に
開示された連続プライマー戦略によって配列決定した。
ng J、の方法[[メソッズ・オブ・エンザイモロジ
ー(Methods of Enzymol、)j V
、101 (I983)]によって抽出し、5trau
ss E、 C,らによってrAnalytical
Biochem、J 154.353 (I986)に
開示された連続プライマー戦略によって配列決定した。
ジングルストランドの1つの配列は、ST2遺伝子のも
のと同じ領域を含有し、他方は、類似してはいるが、同
一ではない配列を含有していた(異なる遺伝子の存在を
示唆する)(STXと称する)。
のと同じ領域を含有し、他方は、類似してはいるが、同
一ではない配列を含有していた(異なる遺伝子の存在を
示唆する)(STXと称する)。
実施例3
A)百日咳菌SAIのゲノムバンクの作製遺伝子STX
の完全暗号配列を得るため、コスミッドpHc79を使
用して百日咳菌SAIのゲノムバンクを作製した。
の完全暗号配列を得るため、コスミッドpHc79を使
用して百日咳菌SAIのゲノムバンクを作製した。
実施例1に記載の如くして抽出した百日咳菌SAIの染
色体DNA 500μ9を、制限酵素5au3A 51
Jによって37℃、15分間で部分的に消化した。
色体DNA 500μ9を、制限酵素5au3A 51
Jによって37℃、15分間で部分的に消化した。
このようにして消化したDNAを、溶液にエタノールを
添加することによって沈殿させ、分離後、LOmM T
ris、 1 mM EDTA緩衝溶液0.5n(l
に懸濁化させた。
添加することによって沈殿させ、分離後、LOmM T
ris、 1 mM EDTA緩衝溶液0.5n(l
に懸濁化させた。
溶液を、1 mM NaCQ、 10mM Tris、
1 mM EDTA緩衝溶液(pH7,5) 35
xσ中に溶解したショ糖濃度勾配(gradient)
(I0%から40%)に負荷した。
1 mM EDTA緩衝溶液(pH7,5) 35
xσ中に溶解したショ糖濃度勾配(gradient)
(I0%から40%)に負荷した。
ライで、ローターBeckman SW 2Bにおいて
、濃度勾配を2600Orpmで16時間遠心分離した
。
、濃度勾配を2600Orpmで16時間遠心分離した
。
フラクション(各111Qずつ)を集め、各フラクショ
ンに含有されたDNAの分子量をアーガロースでの電気
泳動[Maniatis T、らrMolecular
Cloning ALaboratory Manu
alJ (I982) Co1d Spring )I
arbor。
ンに含有されたDNAの分子量をアーガロースでの電気
泳動[Maniatis T、らrMolecular
Cloning ALaboratory Manu
alJ (I982) Co1d Spring )I
arbor。
ニューヨーク]によって測定した。
35−45KbのDNAフラグメントを含有するフラク
ションを透析し、上述の如くしてエタノールでDNAを
沈殿させた。
ションを透析し、上述の如くしてエタノールでDNAを
沈殿させた。
ついで、遠沈によってDNAを分離し、10mM Tr
isll mM EDTA緩衝溶液(pH7,5)にD
NAa度1μg/μ&で懸濁化させた。
isll mM EDTA緩衝溶液(pH7,5)にD
NAa度1μg/μ&で懸濁化させた。
染色体DNAフラグメントをクローン化した。
コスミッドp)lc7920μ9を、消化混合物200
μC中、酵素BamHI 40Uにより37℃、1時間
で消化した。
μC中、酵素BamHI 40Uにより37℃、1時間
で消化した。
リゲーション混合物10μQ中、T4 D!JAリガー
ゼIUの存在下で、染色体DNA 2μ9をコスミソド
DNA 0.5μ9と共に14℃において18時間リガ
ーゼ処理した。
ゼIUの存在下で、染色体DNA 2μ9をコスミソド
DNA 0.5μ9と共に14℃において18時間リガ
ーゼ処理した。
この時間の経過後、リゲーション混合物2.5μaをS
tratagene Packageneキットと共に
インビトロで使用した。
tratagene Packageneキットと共に
インビトロで使用した。
このようにして得られた組換えコスミッドを大腸菌の菌
株JM109に接種し、形質転換体をLB培地(Bac
to Triptone 109、Bacto Y、E
、 5g、NaCC10り、l1yOI Q: pH
7,5)上で選別した。
株JM109に接種し、形質転換体をLB培地(Bac
to Triptone 109、Bacto Y、E
、 5g、NaCC10り、l1yOI Q: pH
7,5)上で選別した。
陽性のコロニー約15000個が生産された。
ついて、コロニー1500個を、下記の配列を有する2
対のプローブを使用してスクリーニングした。
対のプローブを使用してスクリーニングした。
プローブI (STX) CCG CCCA T G
CCG A A G A Cプローブ2 (STX
) G CCG G T A A T G A CA
A T G Cプローブ3 (ST2) CCT T
CA G CT T G A T G A Tプロー
ブ4 (ST2) G T G A T G A C
G A T G G T GHeckmanオートシス
テムによってオリゴヌクレオチドを合成し、下記の方法
によって5’OH末端においてα[P”] ATP 1
05μCiでマーク付けした。
CCG A A G A Cプローブ2 (STX
) G CCG G T A A T G A CA
A T G Cプローブ3 (ST2) CCT T
CA G CT T G A T G A Tプロー
ブ4 (ST2) G T G A T G A C
G A T G G T GHeckmanオートシス
テムによってオリゴヌクレオチドを合成し、下記の方法
によって5’OH末端においてα[P”] ATP 1
05μCiでマーク付けした。
ヌクレオチド200n7を、Kinase緩衝液3uQ
。
。
ATP 21μQ、 T4ポリヌクレオチドキナーゼt
oux(Iμm2)でなる水溶液30μQに懸濁化させ
た。
oux(Iμm2)でなる水溶液30μQに懸濁化させ
た。
混合物を37℃に45分間推持し、酵素を65℃、】0
分間で脱活性化した。
分間で脱活性化した。
ついで、マーク付けしたプローブを、TE緩衝溶液(p
H8)中、5ephadex G−50で精製して、組
込まれなかったマーカーを除去した。
H8)中、5ephadex G−50で精製して、組
込まれなかったマーカーを除去した。
フラクション13個(各150μρずつ)を集めた。
各フラクション2μQをンンチレーンション液dmQ中
に入れ、シンチレータ−で測定した。
に入れ、シンチレータ−で測定した。
バンク(コスミッド)のコロニーをニトロセルロースフ
ィルター(Schleicher & 5chuell
O,45μm)に移し、NaOHで溶菌した後、サザ
ン法(Maniatis1982)によって不動化させ
た。フィルターを、上述の如くしてマーク付けした2対
のプローブでハイブリダイズさせた(2重にテストした
)。
ィルター(Schleicher & 5chuell
O,45μm)に移し、NaOHで溶菌した後、サザ
ン法(Maniatis1982)によって不動化させ
た。フィルターを、上述の如くしてマーク付けした2対
のプローブでハイブリダイズさせた(2重にテストした
)。
プレハイブリダイゼーション処理を65℃、6時間で行
い、ハイブリダイゼーションを下記の温度において18
時間で行った。
い、ハイブリダイゼーションを下記の温度において18
時間で行った。
プローブlに関して 53℃
プローブ2に関して 47°C
プローブ3に関して 41℃
プローブ4に関して 45℃
ついで、フィルターを洗浄し、前記実施例のC)に記載
した如く、ラジオグラフィックプレートと接触させた。
した如く、ラジオグラフィックプレートと接触させた。
4種類のプローブとハイブリダイズしたクローン5個を
上述の方法によって単離した。
上述の方法によって単離した。
クローンから抽出したコスミッドをEcoRIでの消化
によって分析した。これらのうち3種類がプローブ3及
び4と類似するが、同一ではない配列を含有しており、
1種類が予め単離されたSTX遺伝子の領域と同一の配
列を含有しており、残りのらの(プローブl及び3とハ
イブリダイズしたもの)はSTX遺伝子のものと同一で
ない配列を含有していることが明らかになった。
によって分析した。これらのうち3種類がプローブ3及
び4と類似するが、同一ではない配列を含有しており、
1種類が予め単離されたSTX遺伝子の領域と同一の配
列を含有しており、残りのらの(プローブl及び3とハ
イブリダイズしたもの)はSTX遺伝子のものと同一で
ない配列を含有していることが明らかになった。
STX遺伝子を有するコスミッドを含有するコロニーを
psM280と名付けた。
psM280と名付けた。
コスミッドpsM280を迅速抽出法によって抽出し、
その250n9をl00n+M Tris−HCf2
(pH7,5)、50mMNaCQ110mM MgC
Qtの消化混合物10μc中、EcoRI(Boher
inger) 5 tlにより37℃、1時間で消化し
た。
その250n9をl00n+M Tris−HCf2
(pH7,5)、50mMNaCQ110mM MgC
Qtの消化混合物10μc中、EcoRI(Boher
inger) 5 tlにより37℃、1時間で消化し
た。
ついで、65℃で10分間処理して酵素反応を停止させ
、混合物を2つの0.8%アーガロースゲルに平行して
負荷し、80v、3時間で電気泳動した後、DNAのバ
ンドをニトロセルロースフィルター(Micro Fi
ltrationシステム; Q、45μm)2個に移
し、上記C)で記載した方法に従ってプローブ1及び2
とハイブリダイズさせた。
、混合物を2つの0.8%アーガロースゲルに平行して
負荷し、80v、3時間で電気泳動した後、DNAのバ
ンドをニトロセルロースフィルター(Micro Fi
ltrationシステム; Q、45μm)2個に移
し、上記C)で記載した方法に従ってプローブ1及び2
とハイブリダイズさせた。
プレハイブリダイゼーション処理を、6XSSC(I
X 5SC1= 150mM NaCl2.25+++
Mクエン酸Na)、1OXDenhardt (I X
Denhardt= 1%Ficoll、 1%PvP
1%BSA PentaxフラクションV)及び変性し
た鮭の精子50μ971の混合物10g!σ中、フィル
ターNo、 1については53℃、4時間、フィルター
N002については47℃、4時間で実施した。
X 5SC1= 150mM NaCl2.25+++
Mクエン酸Na)、1OXDenhardt (I X
Denhardt= 1%Ficoll、 1%PvP
1%BSA PentaxフラクションV)及び変性し
た鮭の精子50μ971の混合物10g!σ中、フィル
ターNo、 1については53℃、4時間、フィルター
N002については47℃、4時間で実施した。
ハイブリダイゼーションを、フィルターNo、 1につ
いてはプローブ1 600μ(!(6XlO’cpm/
yDNA)を、フィルターN022についてはプローブ
2600μQ (8,4X10″cpm/γDIIA)
を添加した上記混合物l0yO中で実施した。
いてはプローブ1 600μ(!(6XlO’cpm/
yDNA)を、フィルターN022についてはプローブ
2600μQ (8,4X10″cpm/γDIIA)
を添加した上記混合物l0yO中で実施した。
ついで、フィルターNo、I及びNO42をそれぞれ5
3℃及び47℃で1夜インキユベートした。最後に、フ
ィルターを、0,1%ドデンル硫酸ナトリウムを含有す
る6 X5SC1oOInf!ずつで4回(I5分間)
洗浄し、ラジオグラフィックプレートKodak X−
OmatARと一80℃で1夜接触させた。
3℃及び47℃で1夜インキユベートした。最後に、フ
ィルターを、0,1%ドデンル硫酸ナトリウムを含有す
る6 X5SC1oOInf!ずつで4回(I5分間)
洗浄し、ラジオグラフィックプレートKodak X−
OmatARと一80℃で1夜接触させた。
その結果、両プローブとハイブリダイズする陽性のバン
ド(I,2Kb) 1つのみが存在することを示した。
ド(I,2Kb) 1つのみが存在することを示した。
ベクターpUc121μ9を消化混合物10μρ中、E
coRI 5 Uによって37℃、1時間で消化した
。
coRI 5 Uによって37℃、1時間で消化した
。
65°Cに10分間維持して酵素反応を脱活性化し、D
NAをエタノールで沈殿させ、遠沈によって分離した。
NAをエタノールで沈殿させ、遠沈によって分離した。
ついで、消化プラスミドDNA 50nfJを、リゲー
ソヨン混合物25μe中、T4 DNAリガーゼIUの
存在下、12℃で1夜処理して、DNAの1.2Kb
EcoRIフラグメン)・66n9を接合させた。
ソヨン混合物25μe中、T4 DNAリガーゼIUの
存在下、12℃で1夜処理して、DNAの1.2Kb
EcoRIフラグメン)・66n9を接合させた。
リゲーンヨン混合物20μCを使用して、コンピテント
大腸菌JM103 (Maniatis; 1982)
200.4z12を形質転換させた。ついで、アンピ
シリン50γ/WQ。
大腸菌JM103 (Maniatis; 1982)
200.4z12を形質転換させた。ついで、アンピ
シリン50γ/WQ。
Xゲル40γ/m(l及びIPTG 125γ/+Cを
添加したLB寒天培地プレート上、37℃、18時間で
形質転換体の選別を行った。
添加したLB寒天培地プレート上、37℃、18時間で
形質転換体の選別を行った。
陽性のクローン24個を得た。このうち17個は所望の
組換えプラスミドを含有していた。
組換えプラスミドを含有していた。
これらの1つ(psM281)を、迅速抽出によって陽
性のクローンから抽出した。
性のクローンから抽出した。
D) psM281の配列決定
3angerらの方法[rP、N、A、S、J 74.
5463 (I977)]に従い、連続プライマー戦略
[5traussらrAnal。
5463 (I977)]に従い、連続プライマー戦略
[5traussらrAnal。
Biochem、J 154.553 (I986)]
によって組換えプラスミドpsM281の配列決定を行
った。プライマーとして使用するオリゴヌクレオチドを
、自動システムl Plus DN人合成装置(Be
ckman)によって合成した。
によって組換えプラスミドpsM281の配列決定を行
った。プライマーとして使用するオリゴヌクレオチドを
、自動システムl Plus DN人合成装置(Be
ckman)によって合成した。
rpUcシークエンンング」キット及びトレーサーとし
てα[P”] dATPを使用し、変性プラスミド上、
正常Boehringerプロトコールに従ってシーフ
ェンシング反応を行った。
てα[P”] dATPを使用し、変性プラスミド上、
正常Boehringerプロトコールに従ってシーフ
ェンシング反応を行った。
電気泳動分離に使用した装置はMacrophorシー
クエンシングシステム(LKB)である。
クエンシングシステム(LKB)である。
このようにして配列決定された完全1.2Kbフラグメ
ントは、コスミッドpHC79の塩基375個及びST
X遺伝子の塩基844個で構成されていた(第1図)。
ントは、コスミッドpHC79の塩基375個及びST
X遺伝子の塩基844個で構成されていた(第1図)。
第3図に示すように、STX遺伝子産生物のアミノ酸配
列は、ST2遺伝子の産生物との類似性を有している。
列は、ST2遺伝子の産生物との類似性を有している。
ゲノム分析
百日咳菌165の染色体を実施例1の如くして抽出し、
DNAの一部を各種の酵素によって別個に消化した。
DNAの一部を各種の酵素によって別個に消化した。
詳しくは、染色体DNA 1.571を、酵素3tul
。
。
5phl、 Smal、 PvuIr、Pstl、 E
coRl及びBamHI (各々1511 )により、
消化混合物201Q中、37℃、3時間で消化した。
coRl及びBamHI (各々1511 )により、
消化混合物201Q中、37℃、3時間で消化した。
ついで、混合物を0.8%アーガロースゲル上に負荷し
、100■において3−4時間泳動させた。
、100■において3−4時間泳動させた。
染色体DNAのバンドをニトロセルロースに移し、実施
例2に記載の如くして、プローブI及び4と別々にハイ
ブリダイズさせた。
例2に記載の如くして、プローブI及び4と別々にハイ
ブリダイズさせた。
いずれの場合にも、2つのプローブとハイブリダイズす
るバンドは全く確認されなかった。
るバンドは全く確認されなかった。
これは、これら2つの遺伝子が単一オペロン内に又は相
互に隣接して位置しないが、最小距離数Kbで存在しな
ければならないことを示している。
互に隣接して位置しないが、最小距離数Kbで存在しな
ければならないことを示している。
該i1Z実は百日咳菌の遺伝子ライブラリーから両遺伝
子を含有するコスミッドが欠けていることによっても確
認される。
子を含有するコスミッドが欠けていることによっても確
認される。
4図面の簡単な説明
第1図は百日咳菌の菌株SAIから得られたSTX線毛
をコード付ける遺伝子のヌクレオチド配列及び対応する
アミノ酸配列を示す図、第2図はSTX。
をコード付ける遺伝子のヌクレオチド配列及び対応する
アミノ酸配列を示す図、第2図はSTX。
ST2、ST3及びST6線毛の成熟部分のNl+、末
端配列を示す図、及び第3図はSTX線毛及びS72線
毛の類似性を示す図である。
端配列を示す図、及び第3図はSTX線毛及びS72線
毛の類似性を示す図である。
(ほか1名)
図面の浄書(内容に変更なし)
ロQコロυ■OCコロυω口00口Q−ロQΦロ+ψQ
Oφ口Q−ロ←0の ← 0・ c+J ← −−リ
← い ザ ← 二重 ロ 0−・ の ← 句嘩
へ ← −奢 ■ く −一・! く ・−健01j
ユe+ Φ υ −Q−一く一−+Q−へ←工のQ−
凶Cシ寸く一!Q−のυ工Φ(←ψQ顛cpfi (
jI+uX (Jh6 C:lコ(J+−(51:
c5e Qコ 〇−υ閲0− Qぶ く・−CI
+<−<><−<− ←ω Q≦ 〇−〇〈 く← (
J : IJ < C:l (:l ←← (J
C:l (j(j ←−く← Qく6 L+ e
J I+ ロ閃 Q++I+1IIQぶ (j C:l C:3 :> <←くψ CJ >
(j OCJ > (JCくψ C−1j−J(
jに ロコ くdく> ロー CJ &+ lj −
+ < v+ <諷 ヒー ←■ (−<− υ−
←印 く1−
Oφ口Q−ロ←0の ← 0・ c+J ← −−リ
← い ザ ← 二重 ロ 0−・ の ← 句嘩
へ ← −奢 ■ く −一・! く ・−健01j
ユe+ Φ υ −Q−一く一−+Q−へ←工のQ−
凶Cシ寸く一!Q−のυ工Φ(←ψQ顛cpfi (
jI+uX (Jh6 C:lコ(J+−(51:
c5e Qコ 〇−υ閲0− Qぶ く・−CI
+<−<><−<− ←ω Q≦ 〇−〇〈 く← (
J : IJ < C:l (:l ←← (J
C:l (j(j ←−く← Qく6 L+ e
J I+ ロ閃 Q++I+1IIQぶ (j C:l C:3 :> <←くψ CJ >
(j OCJ > (JCくψ C−1j−J(
jに ロコ くdく> ロー CJ &+ lj −
+ < v+ <諷 ヒー ←■ (−<− υ−
←印 く1−
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1 新規な線毛性サブユニットをコード付ける百日咳菌
に属する菌株の染色体DNAから単離された遺伝子であ
って、下記ヌクレオチド配列( I )を有することを特
徴とする、遺伝子。 【遺伝子配列があります】 2 請求項1記載のものにおいて、線毛性サブユニット
が下記アミノ酸配列(II)で表される、遺伝子。 【遺伝子配列があります】 3 請求項1記載の遺伝子に含有される成熟線毛性サブ
ユニットをコード付ける構造遺伝子であって、下記ヌク
レオチド配列(III)を有することを特徴とする、構造
遺伝子。 【遺伝子配列があります】 4 請求項3記載のものにおいて、前記成熟線毛性サブ
ユニットが下記アミノ酸配列(IV)で表される構造遺伝
子。 【遺伝子配列があります】 5 請求項1記載の遺伝子を含有することを特徴とする
、百日咳菌に属する菌株から単離された染色体DNAフ
ラグメント。 6 請求項5記載のものにおいて、第1図に示されたヌ
クレオチド配列を有する、染色体DNAフラグメント。 7 請求項1又は2記載の遺伝子にクローニングベクタ
ーを結合させることによって得られた組換えDNA分子
。 8 請求項3又は4記載の遺伝子にクローニングベクタ
ーを結合させることによって得られた組換えDNA分子
。 9 請求項5又は6記載の染色体DNAフラグメントに
クローニングベクターを結合させることによって得られ
た組換えDNA分子。 10 請求項7−9のいずれか1項に記載のものにおい
て、前記ベクターが細菌又は酵母における発現用のプラ
スミドである、組換えDNA分子。 11 請求項10記載のものにおいて、プラスミドがp
UC12である、組換えDNA分子。 12 プラスミドを請求項5記載の染色体DNAフラグ
メントに結合させたことを特徴とする、請求項11記載
のpSM281組換えDNA分子。 13 請求項7−12のいずれか1項に記載の組換えD
NA分子によって形質転換させた微生物であって、該微
生物が大腸菌、桿菌類及び酵母の中から選ばれるもので
あることを特徴とする、微生物。 14 大腸菌JM103(pSM281)ATCC67
572である、請求項13記載の微生物。 15 単独で又は高分子支持体に結合された状態で、百
日咳菌による感染に対して防御的な特異な抗体応答をヒ
トにおいて誘発する免疫学的に活性な合成ペプチドであ
って、該ペプチドがアミノ酸配列(II)により、又はそ
の領域で表されることを特徴とする、免疫活性合成ペプ
チド。 16 請求項15記載のペプチドを治療上有効な量で含
有してなる、百日咳菌による感染に対して防御免疫をヒ
トにおいて誘発する医薬組成物。 17 請求項15記載のペプチド又は請求項16記載の
組成物を免疫学的に有効な量で投与することを特徴とす
る、百日咳菌による感染に対してヒトにおいて免疫を誘
発する方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| IT23150/87A IT1223579B (it) | 1987-12-22 | 1987-12-22 | Clonaggio e sequenziamento del gene codificante per una nuova subunita' pilinica di bordetella pertussis |
| IT23150A/87 | 1987-12-22 |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH022358A true JPH022358A (ja) | 1990-01-08 |
Family
ID=11204314
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP63324757A Pending JPH022358A (ja) | 1987-12-22 | 1988-12-22 | 百日咳菌の新規な線毛性サブユニットをコード付ける遺伝子 |
Country Status (9)
| Country | Link |
|---|---|
| US (2) | US5059537A (ja) |
| EP (1) | EP0324124B1 (ja) |
| JP (1) | JPH022358A (ja) |
| AT (1) | ATE85811T1 (ja) |
| CA (1) | CA1338632C (ja) |
| DE (1) | DE3878553T2 (ja) |
| ES (1) | ES2053694T3 (ja) |
| HK (1) | HK192695A (ja) |
| IT (1) | IT1223579B (ja) |
Families Citing this family (7)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| IT1231961B (it) * | 1989-09-22 | 1992-01-16 | Eniricerche Spa | Clonaggio del gene codificante la subunita' pilinica fim3 di bordetella pertussis. |
| IT1236971B (it) * | 1989-11-03 | 1993-05-07 | Eniricerche Spa | Regione promotore dei geni codificanti le subunita' piliniche fim2, fm3 e fimx di bordetella pertussis e loro impiego per l'espressione di geni che codificano una proteina di interesse. |
| DE69333467T2 (de) * | 1992-08-18 | 2005-01-20 | Dimminaco Ag | Bordetella bronchiseptica impfstoff |
| US7632803B2 (en) * | 1999-10-01 | 2009-12-15 | Dmi Life Sciences, Inc. | Metal-binding compounds and uses therefor |
| US7592304B2 (en) | 1999-10-01 | 2009-09-22 | Dmi Life Sciences, Inc. | Metal-binding compounds and uses therefor |
| US20130203057A1 (en) * | 2012-01-20 | 2013-08-08 | Biohelix Corporation | Step-wise detection of multiple target sequences in isothermal nucleic acid amplification reactions |
| TWI733719B (zh) * | 2015-12-07 | 2021-07-21 | 美商河谷控股Ip有限責任公司 | 改善的組合物及用於新表位之病毒遞送的方法及其應用 |
-
1987
- 1987-12-22 IT IT23150/87A patent/IT1223579B/it active
-
1988
- 1988-12-15 AT AT88120994T patent/ATE85811T1/de not_active IP Right Cessation
- 1988-12-15 ES ES88120994T patent/ES2053694T3/es not_active Expired - Lifetime
- 1988-12-15 EP EP88120994A patent/EP0324124B1/en not_active Expired - Lifetime
- 1988-12-15 DE DE8888120994T patent/DE3878553T2/de not_active Expired - Fee Related
- 1988-12-21 CA CA000586579A patent/CA1338632C/en not_active Expired - Fee Related
- 1988-12-22 JP JP63324757A patent/JPH022358A/ja active Pending
- 1988-12-22 US US07/288,169 patent/US5059537A/en not_active Expired - Fee Related
-
1994
- 1994-11-04 US US08/334,425 patent/US5622706A/en not_active Expired - Fee Related
-
1995
- 1995-12-21 HK HK192695A patent/HK192695A/en not_active IP Right Cessation
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| ES2053694T3 (es) | 1994-08-01 |
| US5622706A (en) | 1997-04-22 |
| IT1223579B (it) | 1990-09-19 |
| DE3878553T2 (de) | 1993-09-02 |
| DE3878553D1 (de) | 1993-03-25 |
| CA1338632C (en) | 1996-10-08 |
| EP0324124A1 (en) | 1989-07-19 |
| IT8723150A0 (it) | 1987-12-22 |
| US5059537A (en) | 1991-10-22 |
| ATE85811T1 (de) | 1993-03-15 |
| HK192695A (en) | 1995-12-29 |
| EP0324124B1 (en) | 1993-02-17 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| JP2685442B2 (ja) | ボルデテラ・パータツシス染色体DNAのEcoRIフラグメント | |
| EP1066375B1 (en) | $i(LACTOBACILLI) HARBORING AGGREGATION AND MUCIN BINDING GENES AS VACCINE DELIVERY VEHICLES | |
| JP3253327B2 (ja) | 髄膜炎菌外層膜蛋白質をコードするヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドおよびワクチン組成物 | |
| EP0170584B1 (fr) | Sonde d'ADN et procédé pour la détection de "Shigelles" et des souches entéro-invasives de Escherichia coli | |
| JP3878207B2 (ja) | osmB プロモータで制御される発現プラスミド | |
| JP3955317B2 (ja) | ヘリコバクター感染に対する免疫性組成物、該組成物に用いられるポリペプチドおよび該ポリペプチドをコードする核酸配列 | |
| JPH09500538A (ja) | ナイセリア・メニンギチジス外膜グループbポーリンタンパク質の高レベル発現、精製および再生 | |
| JPH06504446A (ja) | 肺炎球菌タンパクの構造遺伝子 | |
| JP2007289194A (ja) | 空胞形成毒素欠損H.pyloriおよび関連する方法 | |
| JPH07501210A (ja) | Moraxella catarrhalisの有用な抗原に関する方法と組成 | |
| JP2002315589A (ja) | ウレアーゼの調節及び成熟のために必要なHelicobacterpyloriの遺伝子及びその用途 | |
| JP3388171B2 (ja) | 淋菌piタンパク質およびワクチンの製造 | |
| JP5966018B2 (ja) | 改変ボルデテラ・パータシス株 | |
| EP0500736B1 (en) | Recombinant vaccine for porcine pleuropneumonia | |
| US6268171B1 (en) | Recombinant PilC proteins, methods for producing them and their use | |
| JPH022358A (ja) | 百日咳菌の新規な線毛性サブユニットをコード付ける遺伝子 | |
| JPH11500630A (ja) | ナイセリア・メニンジティディス・サブユニットtbp2 | |
| KR100425884B1 (ko) | 살모넬라 타이피의 특정 항원성 외부막 단백질을 코딩하는 디엔에이 서열 | |
| US5525489A (en) | Cloning of the gene which codes for the pilinic subunit fim3 of Bordetella pertussis | |
| EP0264150B1 (fr) | Microorganismes comportant des pili comme protéines porteuses, pili isolés à partir de ces microorganismes, procédé d'excrétion de peptides ou de protéines à l'aide de ces pili et utilisation de ceux-ci | |
| WO1992001703A1 (en) | Production of and compositions for the major cs1 pilin antigen including vaccines and diagnostic probes | |
| JP2002539763A (ja) | ヘリコバクター・ピロリ抗原 | |
| JPH11501203A (ja) | 大腸菌およびサルモネラ菌中における淋菌piタンパクおよびワクチンの製造 | |
| MXPA97009194A (en) | Antigens of helicobacter pylori and compositions of vac | |
| JPH11509401A (ja) | プロテアーゼ活性低下型のHaemophilus Hin47の類似体 |