JPH02264792A - オリゴヌクレオチド誘導体及びその合成原料 - Google Patents

オリゴヌクレオチド誘導体及びその合成原料

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JPH02264792A
JPH02264792A JP8545689A JP8545689A JPH02264792A JP H02264792 A JPH02264792 A JP H02264792A JP 8545689 A JP8545689 A JP 8545689A JP 8545689 A JP8545689 A JP 8545689A JP H02264792 A JPH02264792 A JP H02264792A
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acid
methyl
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JP8545689A
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Eiko Otsuka
栄子 大塚
Hideo Inoue
英夫 井上
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Ajinomoto Co Inc
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Ajinomoto Co Inc
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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 LL上立且ユ±1 本発明は、有用な遺伝子のクローニングに際し、通常行
なわれているmRNAの分離操作を効率化することに用
いることができるヌクレオチドの誘導体、その合成原料
であるヌクレオチドオリゴマー及び更にその合成原料で
あるヌクレオチドに関する。これらの物質は、いずれも
、新規化合物である。
監迷Jとl五 有用遺伝子をりl」−ニングする際、−殻内にはその遺
伝子が発現している生物材料より全mRNAを分離し、
そのmRNAよりcDNAを合成し、クローニングした
侵、目的遺伝fをスクリーニングすることが行われてい
る。mRNAを分離する操作においては、mRNAがポ
リ(A>テール(poly(A)−mRNA)を有すル
コとを利用し、ポリ(A)に相補的なオリボアオキシチ
ミジル酸をセルロース等に固定化したいわゆるオリゴ(
dT)−セルロースカラムを使用して、ハイブリダイゼ
ーシジン効果を利用してポリ(A)を持たないRNA 
(poly(A> −RNA)との分離を行っている。
しかし、この操作におけるpoly(A) −mRNA
の単離収率が必ずしも充分でなく、クローニングの効率
を向上させる為にはポリ(A)部分と更に安定なハイブ
リッドを作るオリゴマーの発見が強く望まれでいた。
発明が解決しようとする問 目的有用遺伝子をクローニングする上で、その効率に大
きくかかわるpoly(A)−mRNA単離操作におい
て、オリゴ(dT)−セルロースカラムに代り収率がよ
り向上できる技術、すなわちポリ(A)とより安定なハ
イブリッドを形成しうる性質を有する新規オリゴマーの
開発が¥1請されている。
の   よび 本発明者は、上記問題を解決するため鋭意研究を重ねた
結果、デオキシリボヌクレオチドに比べ、オリゴ(2°
−0−メチルリボヌクレオチド)が相補鎖オリゴリボヌ
クレオチドとより安定なハイブリッドを形成することを
見い出し、ハイブリダイゼーションプローブとして有用
であることを報告した(H,Inoueら、Nucle
ic Ac1ds Ites、j5(15)6131頁
、 198/年)。更に、ハイブリッドの安定性におけ
るオリゴマーの構造上の寄与を詳細に検討した結果、2
°−0−メチルウリジル酸の代りに2゜−〇−メブ・ル
ー5−メチルウリジル酸をオリゴマーの構成ユニットに
用いることにより、相補鎖中のアデニル酸ユニットと強
固に結合しオリゴリボヌクレオチドとの熱的安定性が増
大することを見い出した。この知見に基づいて、デカリ
ボアデニル酸とその相補鎖であるデオキシリボチミジル
酸。
2°−0−メチルウリジル酸及び2°−0−メチル−5
−メチルウリジル酸のそれぞれのデカマーを合成して熱
的安定性(Tm値)をそれぞれ測定したところ、デカ2
°−0−メチル−5−メヂルウリジル酸が著しくすぐれ
た性質を有することを見出し、本発明を完成するに至っ
た。
以下、本発明の詳細な説明する。
本発明は、次の一般式(I)で表されるオリゴヌクレオ
チド誘導体に関する。
式中、Rは、水素原子、0Mセルロース、ラテックス粒
子などのカルボニル残基等のアシル基、ホスホリル基、
又は置換基を有していてもよいホスホリル基例えばセル
ローズなどの水酸基を有する化合物とIF5酸とのエス
テル結合を有するホスホリル基を表し、■は、チミン−
1−イル基を表し、Yl、Y2及びY3は、相互に同一
であってもよく文具なっていてもよくて、水素原子、ヒ
ドロキシル基、メトキシ基、エトキシ基等の低級アルキ
ルオキシ基又は低級アルキルシリル基を表し、Bは、チ
ミン−1−イル基、アデニン−9−イル基。
グアニン−9−イル基、シトシン−9−イル基。
ウシシル−1−イル基又はヒボキサンチン−9−イル基
を表し、nは1〜100の整数を表すが、実用的には平
均鎖長がn−10〜40のものを用いることができる。
因みに、一般式CI)の誘導体において、Rが上記のよ
うなアシル基(これは担体と称されることもある)又は
置換U<これも担体と称されることがある)を有するホ
スホリル基であるものは、mRNAの分離操作に直接使
用される化合物であり、Rが水素原子又は置換基を有し
ないホスホリル基である化合物(オリゴヌクレオチド)
は、前者の化合物の合成原料となりうるばかりでなく、
前者の化合物をどのような方法で合成したにしろ、11
者の化合物は前者の化合物の構成部分としてその中心的
機能を果たすのである。
本発明は、又、次の一般式(I)で表されるヌクレオチ
ド誘導体にも関する。
式中、Xは、モノメトキシトリプル基、ジメトキシトリ
チル基又は例えば0−クロルフェニル基等の置換基を有
していでもよいホスホリル基を表し、Yは、水素原子、
0−クロルフェニル燐酸、−1〕(OCI−13)  
 −N−<CF+   (CH3)  2  )  2
  。
−P (OC82CI−12ON)−N−(CH(CH
3)2 ’)2 又Gt−GO−(CH,)。
C0NH−(CH2’)、−(CPGII体)(コこに
、m及びnは、それぞれ、1〜1oの整数である)を表
わす、ただし、Xが置換基を有していてもよいホスホリ
ル基のときは、Yは水素原子である。一般式(I[)の
化合物は、一般式(1)の化合物の合成原料として使用
することができる。
次に、これらの化合物の合成法の例を説明する。
本発明のオリゴ(2°−O−メチル−5−メチルウリジ
ル酸)部分を一合成する為には、先ずその構成ヌクレオ
シドである2°−0−メチル−5−メヂルウリジン(化
合物3)を後述する様に合成し(第1図)、次に常法に
より(例えば、H,Yoshikawa et al、
、 Tetrahedron 1ett、、 5065
(1967))、5’位水酸基に直接リンL2基を導入
し2゛−〇−メチルー 5−・メチル−5゛−ウリジル
酸を得、それをジシク「」ヘキシルカルボジイミド(D
CC)等の縮合剤を用いて重合する方法を採用すること
ができる。または、化合物3を後述する様に3°−フォ
スホロアミデート誘導体(化合物5)とし、公知の方法
に従い(S、5hibaraha et al、、 H
ucleicAcids Rcs、、 15(11)、
 4403 (1987))、DNA自動合成りi(ア
プライドバイオシステム社製、モデル38OA )を用
いて容易に合成することができる。
一方、オリゴ(2°−0−メチル−5−メチルウリジル
酸)誘導体を製造する為には、先に述べた2°−〇−メ
チルー5−メチルー5°−ウリジル酸のDCCによる重
合反応において、公知の方法(P、 T、 Gi Ih
am、 JAC5,88,4982(1964))に従
い、セルロース等を同時に反応させ、セルロース誘導体
等とすることが簡便である。また一方、先に述べた自動
合成機により合成した5°末端水Rj4を有するオリゴ
(2°−0−メチル−5−メチルウリジル酸)の5′末
端水wi基に燐wIWを導入した後に、同様にセルロー
ス等と反応させることもできる。
また一方、5゛末端水Milkを有したオリゴ(2゛−
〇−メチルー5−メチルウリジル酸)とCM−セルロー
スまたはラテックス粒子等とを縮合剤(DCC等)を用
いて結合させ、セルロースあるいはラテックス誘導体(
に、にuribayashi et al、。
NuCleiCAc1ds 5VllpO3iul 5
eries、に19.61(1988)参照)等とする
ことも可能である。
化合物3の製造は、リボチミジンを出発原料として例え
ば先ず化合物1を得た後合成できる(第1図及び実施例
1〜3参照)。因みに、化合物1の合成は、リボチミジ
ンの3’、5’水酸基を公知の方法(tl、Inouc
 et al、、Nuclcic AcidsSymp
osiun 5eries、  N(116,165(
1985)、獣■。
Harkiewicz、J、Chem、Ite、;(S
) 24−25  (1979))に準じて、テトライ
ソプロピルジシロキサン−1,3−ジイル基で保護した
後、公知の方法(H,rnouc etal、の前出の
電文(1987) )に準じて、適当な溶媒中トリエチ
ルアミンの存在下塩化ベンゾイルで処理することにより
3N位を選択的に保護することにより得ることができる
また、2°−〇−メチルー5−メチルウリジンー3°−
フォスフォロアミダイト誘導体(化合物5)及び2°−
〇−メヂルー 5−メチルウリジン−3゛−CPG誘導
体(化合物6)の製造は、公知の方法(S、5hiba
hara et at、の前出の電文、L、J、HcB
rid13 et at、、 Tetrahedron
 Iett、、24,245(1983)参照)に従い
合成できる(第2図並びに実施例4及び5参照)。また
、ここで合成したフォスフォロアミダイト誘導体(化合
物5)の他に、亜g4r11の保護基としてシアノエチ
ル基を有する化合物も、同様の方法(S、5hibah
ara et at、の前出の電文、N、D、5hin
ha et al、、Nucleic Ac1ds R
QS、、  12゜4539(1984)6照)に従い
合成することができる。
本発明に関して肝要な点は、従来より一般に使用されて
いるオリゴ(dT)−セル[]−スのオリゴ(dT)に
比べて、オリゴ(2°−〇−メチルー5−メチルウリジ
ルM)−がオリゴリボアデニル酸(オリゴ(rA))と
著しく安定なハイブリッドを形成する性質を有すること
を発見したことにある。
以下、この点について詳述する。すなわち、それらのハ
イブリッドの熱的安定性(Tm値)を実際に測定する為
に、デカリボアデニル酸を公知の方法(p、に1erz
ek et al、、Biochemistry、 2
5.7840(198B)参照)に従い合成しく実施例
6)、またデカ(2°−0−メチル−5−メチルウリジ
ル酸)は、実施例4及び5により製還した化合物5及び
6を用いてDNA自動合成機により常法通り(S、5h
ibahara et al、の前出の電文参照)合成
した(実施例7)、一方、比較実験用のオリゴマーであ
るデカデオキチミジル酸は常法により市販試薬を用いて
、デカ(2°−0−メチルウリジル酸)は公知の方法(
S、5hibahara et al、の前出の電文参
照)に従い、それぞれ、DNA自動合成機を用いて合成
した。
それぞれのオリゴヌクレオチドは常法により定ゴした後
に、熱的安定性測定用試料とした。それぞれのハイブリ
ッドのTm値の測定は常法に従い、ベックマンDU−8
B型分光光度計を用いて測定した(第3図及び実施例8
参照)。この結果、それぞれのハイブリッドのTm値は
、18.9℃、 21.0”C,31,1℃となり、デ
カ(2°−0−メチフレー5−メチルウリジル酸)とデ
カリボアデニル酸とのハイブリッドが他のハイブリッド
と比べて、Tm値が約10℃も高く、著しく安定である
ことを発見した。
以上のことより、オリゴ(2°−0−メチル−5−メチ
ルウリジル酸)は、そのセルロース結合体として、現在
市販されているオリゴ((fT)−セルロースに代わる
新規poly(A) −mRNA単離用担体として使用
できることが充分期待される。
以下、実施例により本発明を具体例的に説明する。
1塵旦 以下、実施例により本発明を更に説明する。
実施例1 (N3−Benzoyl−5−sethyl−3’ 、
  5’ −0−(tQtraisol)rot)yl
−disilOXane −1,3−dll/I)ur
idine(化合物1)の合成) 5−14ethyl−1,3−O−(tetraisO
I)I’0DVldiSi 1OXane−1,3−d
iyl) uridine(IG、67 g 、33.
3mmol)を塩化メチレン250dに溶解し、トリエ
チルアミン(6,3d、 45.2ma+of)を加え
、水冷撹拌ド、塩化ベンゾイル(4,4d、 37.9
n+mol)を滴下した。室温で一晩世拌1ノ、原料の
消失を確認後、0.01 NHCl、水、NaHCO3
水溶液、水の順で反応溶液を洗浄した。有tIII@N
a SO4で乾燥後、溶媒を減圧トで留去し、残漬をシ
リカゲルクロマトグラフィー(C−200、4009、
CHCl3>で精製し、化合物1を泡状物質として13
.699(67、9%)得た。
IJV (MeOH) :λwax 256rv、λs
in 225ne。
1H−川(coct3>δE)l)lニア、99−7.
29(1,6H,blZOVI QrOIjl)、 C
6−H)。
5.76(d、 IH,J−111Z。
C1°−H)、 1.97(d、311.J=1.2H
2゜C5−CH3)。
1.12−1.06 (m、28H,TIPDS  a
roup)。
実施例2 (N3−Benzoyl−5−nethyl−2’−0
−methyl−3’5’ −0−(tetraiso
propyldisiloxane−1,3−diyl
)uridine (化合物2)の合成〉実施例1で得
た化合物1 (13,697,22,6mmo l )
をベンゼン80mに溶解し、酸化銀(14,7g、63
.3uo l )を加え、5OniCatOrに約10
分かけた。ヨウ化メチル(65,Od、1045mmo
l )を加え、45℃で3日間撹拌した1反応混合物を
P退し、溶媒を減圧下留去後、CHC13=H20’t
’分液し、有amをNa2SO4で乾燥後、シリカゲル
カラムクロマトグラフィー(C−200,300g、C
HCl3)で精製し、化合物2を泡状物質として6.7
59(48,2%)得た。さらに、分離できなかったフ
ラクションを染め、シリカゲル力ラムク口マトグラフィ
ー(C−200,2G03、ヘキサン:酢酸エチル−4
:1)でf6賀し、泡状物質(化合物2)を3.96 
!? (28,4%)得た。
UV(HeOH): λmax 252tv、λwin
 225nt実施例3 (5−Nethyl−2’−0−sethylurid
ine(化合物3)の合成) 化合物2 (6,99rJ、 11.3mmol)をジ
オキサン100d ニ溶解し、cNH40H(12,2
mlり e加え、空温で5時間撹拌した。原料の消失を
確認し、反応溶液を濃縮し、CHCl3−820で分液
した。
有機層を、水、NaHCO3水溶液、水の順に洗浄した
後、Na  SO4で乾燥し、溶媒を減圧下留去後、ヘ
キナンから結晶し、5.469 (93,9%)の結晶
性化合物を得た。
m、p、:116.5〜118.0℃ mass m/e: 471 (14+−1sopro
pylラジカル)元素分析:  C23++4282 
07 S12としての、計算値: C,53,70;H
,8,17;N、5.4b実験値: C,54,53,
H,8,13;N、5.68この化合物(4,00す、
7.811101)をテトラヒドロ7ラン50−1に溶
解し、T 0trabutVIalllOniulfl
uoride(3,2m、  3.1w5ol)加え、
空温で4.5時間撹拌した。ピリジン:水: M e 
01−I J3:1:1(v/V)の溶液を100m!
入れて反応溶液を希釈し、これにOowcx 50  
(ピリジニウム型)を30ae加え、中和した。樹脂を
濾過後、反応溶液を濃縮し、CHCl3−1−120で
分液した。水層を濃縮乾固した後、エタノールから結晶
化を行い、化合物3を1.859 (87,2%)を得
た。
UV (He’ll ) : λwax 266nm、
λsin 233nm。
1、p、     :197.O〜198.0  ℃m
ass  m/e:   2γ2(14”  )元素分
析”  C11’16 ’2 0Gとしての、計算値:
 C,48,53;H,5,88;H,10,29実験
値: C,48,36;H,5,96;N、10.37
’II−NHR(DH3O−d6)δpp17.78(
d、111.J−1,2Hz、CB  −H)。
5、86(d、 111. J−5,4Hz、 CI’
−It)。
3.33 (s、311.02’−CH3)。
1.78(S、3N、C5−CH3)。
因みに、化合物3は、・尿から単離されたとの報告があ
るが(C,A、 、 Vol、1G1,68654a(
1984)、尿からの単離では単離できる量に自ら制限
があり、上記の実施例1〜3によって製造するのが極め
て有利である。
実施例4 (メトキシ−5′−ジメトキシトリチル−2′−〇−メ
チルー5−メチルーウリジン−310−(N、N−ジイ
ソプロピルアミノ)フォスフイン(化合物5)の合成) 化合物3 (0,544tJ、  2.0mmolピリ
ジン共沸後、5−のピリジンに溶解しジメトキシトリチ
ルク1]ライド(0,829,2,4mmo l )加
え、空温で4時間撹拌した。原料の消失を確認し、メタ
ノール1111を加え、反応を停止させた。溶媒を減圧
];留去し、CHC13−H,20で分液し、有t1層
をNa  SO4乾燥俊、シリカゲルカラムクロマトク
ラ)イー (C−200、407、〜4%MeOH/C
HCl3)で精製した後、n・−ヘキサンから粉末化し
、化合物4を0.92g(80%)得た。
この化合物4 (2811910,49霞■01)をピ
リジン共S侵、蒸留メチレンクロライドに溶解し、ジイ
ソプロピルエチルアミン(0,35ad!、2.0mm
ol)を加えた。密栓した侵、雰囲気をアルゴン置換し
、そこへchloro−N 、 N −diisopr
opylaiinoiethoxyphosphine
 (0,12ad、0.61101)を約1分かけて滴
下した。室温で約60分放置し、原料の消失を確認し、
(シリカゲルTLC法:移FIJ Fn、酢酸エチル、
原料R(Wi O,43、II!i部R,値0.7)、
酢酸エチル約15mを加え、反応溶液を希釈した。
飽和NaHCO3水溶液、飽和食塩水ぐ洗浄した後、無
水硫酸ナトリウムで乾燥後、濃縮し、残渣を得た。更に
、シリカゲルカラムクロマトグラフィー(C−300,
2,5g、酢酸エチル)でm製し、泡状物質として化合
物5を0.349 (94%)を得た。
実施例5 (ヌクレオシド樹脂の合成) 化合物4 (0,179,3,01101)をピリジン
共沸した侵、塩化メチレン3mに溶解し、無水コハク酸
(47,8■、4.5uol)とジメチルアミノピリジ
ン(55,5q、  0.46imoりを加え、変温で
2時間撹拌した。TLCで原料の消失を確認した後、反
応液を0.5M  KHPO4水で洗浄した。溶媒を減
圧上留去し、残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィ
ー(C−300、109)で精製し、ノルマルへ4−サ
ンで粉末化し、0.18 g (0,17m1ol、8
8.9%)の3’ −(2’−0−Hethl/+−5
’ −0−dimcthoxytrityl −5−1
cthyluridinyl) −monosucct
nateを得た。
全量をDMF3aeに溶解し、ペンタクロロフェノール
(87,111I!F、約1.2当量)、ジシクロへキ
シルカルボジイミド(66,0■、約1.2当量)を加
え、室温で一晩撹拌した。TLCで原料の消失を確認し
、生じた沈澱をP別した後、溶媒を減圧ド留去した。さ
らに、残渣にベンゼンを加え、析出した不溶物をP別し
、P液を濃縮した後、n−ヘキサンから粉末化し、pe
ntach+oropheny+ −3’(2’  −
0−methyl−5’  −0−dimethoxy
trityl= 5−18thyILIridiny1
)−3uCCinateを得た。収gL0.23 g、
0.249mg+o I、収率92.3%。
コノ化合物(75,3I!rg、82μmol)をCP
G樹脂(100μ1iol  NH2/g、0.24I
J)のトリエチルアミン(15J11)−DMF (3
m)の懸濁液中へ加え、室温で一晩振とうした。反応液
を一過し、樹脂をDMF、ピリジン、塩化メチレンで順
次洗浄した後、減圧乾燥した。
常法により定量し、ローディング量1μm01/29.
4■であることを確認した。
0.1Mジメチルアミノピリジン/ピリジン4.5−と
無水酢酸0.5mを加えて10分!ffi振とうした。
反応液を濾過し、樹脂をピリジン、塩化メチレンで順次
洗浄した後減圧下乾燥し、化合物6を得た。
実施例6 (デカリボアデニル酸(γA  10wer)の合成)
公知方法(E 、 Ohtsuka et al、。
Tetrahedron、 40.47(1984)参
照)に従い合成したN6−ペンゾイルー5′−〇−ジメ
トキシトリチルー2’−0−テトラヒドロピラニルアデ
ノシンを公知方法(L 、 J 、 M c B ri
de ctal、。
Tetrahedron  Letters、 24.
245(1983)参照)従い3’ −0−(N、N−
ジイソプロピルアミノ)−メトキシホスホアミダイト誘
導体に導いた。
即ち、N6−ペンゾイルー5′−〇−ジメトキシトリチ
ルー 2’−0−テトラヒドロピラニルアデノシン(5
76,3q、  766.5μmol)をピリジン共沸
により無水にした後、ジクロルメタン1ai!に溶解し
た。この溶液に窒素ガス気流「fジイソプロピルエチル
アミン(0,49rd>を加えた後、水冷下クロロ・−
メトキシ−N、N−ジイソプロピルアミノホスフィン(
0,17d)を徐々に加えた。1時間放置後、薄層りO
マドグラフィーにより原料の消失を確認した後、酢酸エ
チル10dを加え希釈した。この希釈液を飽和炭酸水素
ナトリウム水溶液、次いで飽和食塩水で洗浄し、酢酸エ
チル層を減圧下濃縮乾固した。得られた残渣を酢酸エチ
ルに溶解し、10gのシリカゲル(C−300)を充填
したカラムクロマトグラフィー(移動相:酢酸エチル)
により精製した。溶出されたNG−ペンゾイルー5′−
〇−ジメトキシトリエチルー2′−〇−テトラヒドロピ
ラニルアデノシン−3’−0−(N。
N−ジイソプロピルアミノ)メトキシホスホアミダイト
(化合物7)の純粋画分を集め濃縮乾固し、0.67 
g(733,9μmol )の化合物7を95.7%の
収率で得た。
次に、NG−ベンゾイル−2′−〇−テトラヒドロピラ
ニルアデノシン(1μ101)を結合した固相担体(R
、K 1erzek etal、、 B iochem
istry。
25、7840〜7846 (1986)を出発原料に
用い、20μmol / 140IIiの濃度になるよ
うに溶解した化合物7のアセトニトリル溶液とともにD
NA自動合成m<7プライドバイオシステムズ社製、モ
デル380A >にて鎖長延長反応を行なった。各縮合
サイクルに先立つ脱ジメトキシトリチル化反応は、1%
ジクL1ル酸/メチレンクロライド溶液を用いた。反応
後の固相担体より切り出された部分的に保1m3を有す
るデカアデニル酸のアンモニア水溶液は、60℃で5時
間加温した。次いで、この溶液を濃縮し、逆相シリカゲ
ル(Prel) F’AK−500/C−18、ウォー
タース社製)を詰めたカラムク0マドグラフイーを行な
うことにより精製した。
即ち、移動相として5%から35%のアセトニトリルの
直線濃度勾配をかけた501M t’リエチルアミンー
炭酸緩衝液(1)H7,5、以ドTEABと略す。)を
用いて溶出し、5′末端にジメトキシトリチル基及び2
′位水w1基にテトラヒドロピラニル基を有するデカア
デニル酸の純粋画分を集め、濃縮乾固した0次に、この
、残渣を0.01 Nの塩酸水溶液10dに溶かしてp
i−12,0に調整し、室温に24時間放置した。反応
液は希釈したアンモニア水で中和後、酢酸エチルにて洗
浄したのち濃縮し、セファデックスG−25を詰めたゲ
ルー過カラムクロマトグラフィー(移動相:  0.I
M  TEAB)を行なうことにより脱塩した。
完全に脱保護されたデカアデニル酸は、最後に逆相シリ
カゲル(YMCPack ODS、C−18(山村科学
社製))を用いた高速液体クロマトグラフィーにより精
製し、6.5700ユニツト、約50nIO+のデカア
デニル酸を5%の通算収率で単離した。
得られたデカアデニル酸は、陰イオン交換カラム(DE
AE−28W)を用いた高速液体クロマトグラフィーで
分析を行い、はぼ単一なピークを与えることを確認した
実施例7 (デカ(2’−0−メチル−5−メチルウリジル酸)す
なわちm5[Jm 10mar (D合成>実施例5で
得た2’−0−メチル−5−メヂルウリジン(1μ5o
l)を結合した固相担体を出発原料にして、実施例4・
で得た化合物5のアセトニトリル溶液(20μmof/
140 l11)を用いて、常法に従い実施例6と同様
に(この場合は説ジメチルトリチル化は、3%トリクロ
ル酢酸ジクロメタン溶液を用いた)鎖長延長反応を行っ
た。反応後の固相担体より切り出された5′末端にジメ
トキシトリチル基を有するデカ(2’−0−メチル−5
−メチルウリジル酸)を実施例6と同様に逆相シリカゲ
ルカラムを用いて分mm製した。
次に、この一部をとり溶媒を減圧留去した後、80%酢
酸水溶液1dを加え、室温で10分間放直置た6反応液
を減圧留去した後、更に水と減圧共沸することにより酢
酸を除去した。残渣を水に溶解し酢酸エチルで洗浄侵減
圧留去し、実施例6で用いた逆相シリカゲルによる高速
液体クロマトグラフィーによりIIIJL/、7.28
00ユニツトのデカ(2’−0−メチル−5−メチルウ
リジル酸)を得た。
得られたオリゴマーは陰イオン交換カラム(DEAE−
28W)を用いた高速液体クロマトグラフィーで分析を
行い単一なピークを与え、純粋であることを確認した。
また、同様の方法により、デカデオキシチミジル1l(
dT 10mer)ヲ20.8400−Lニット、7 
カ(2’−〇−メチルウリジル酸)  (Us 10m
ar )を15.4700ユニツト得た。
実施例8 (Ti測定実験) 実施例6及び7により得たそれぞれのデカオリゴヌクレ
オチド量は、次のε値(計算値)により定値した。
m−」ニー順− γA 10111Or   (相補鎖) :  123
400d丁10mer   (対 照) :  816
00m  Un 10mer  (本発明) :   
96800UmlOmer   (対 照”) :  
968007A 10a+er(0,20TOD、 1
.6nmol)とdTlomer、15U11101m
+3r 、LJI 1011er (7)ソれぞれ1.
6tvol相当幻をエッペンドルフヂュープにとり、減
圧乾固した。それぞれバッファー(0,01Mカコジル
酸ナトリウム塩、0.IM  NaC1゜11M  E
DTA、  E)H7,0)  300p1に溶解し、
ベックマン社IJDLI−88分光光度計を用いて、温
度上昇速度を2℃/winとし、吸光度変化を3回測定
し、それらの平均値を求め、これら3種のハイブリッド
それぞれのT+e値とした。
結果は次の第1表の通りであった(第3図)。
第1表 化合物5の合成の概要を図示したものである。第3図は
、3種のハイブリッドの温度変化に対する吸光度変化を
示す(実施例8)。
因みに、各ハイブリッドの構造式は次の通りである。
式中、Nは5− M etMIuracilを意味する
へイア1ノッ1:(1) :  5’ r (AAAA
AAAAAA)、  3’3’  (TTTTTTTT
TT)d 5’ハイブリッド■、  5’ r(AAA
AAAAAAA)  3’3’  (UtlUUUUU
ULtU)i 5’ハイフリット■:5’  r(AA
AAAAAAAA)  3’3’  (NHNNNHN
NNN)m 5’
【図面の簡単な説明】
第1図及び第2図は、それぞれ、実施例1〜31(埋入
弁理士 霜 越 正 夫

Claims (1)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)下記一般式( I )で表されるオリゴヌクレオチ
    ド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼( I ) 式中、Rは、水素原子、アシル基、又は置換基を有して
    いてもよいホスホリル基を表し、Tは、チミン・1−イ
    ル基を表し、Y_1、Y_2及びY_3は、相互に同一
    であってもよく又異なつていてもよくて、水素原子、ヒ
    ドロキシル基、低級アルキルオキシ基又は低級アルキル
    シリル基を表し、Bは、チミン−1−イル基、アデニン
    −9−イル基、グアニン−9−イル基、シトシン−9−
    イル基、ウラシル−1−イル基又はヒボキサンチン−9
    −イル基を表し、nは1〜100の整数を表す。 の下記一般式(II)で表されるヌクレオチド誘導体。 ▲数式、化学式、表等があります▼(II) 式中、Xは、モノメトキシトリチル基、ジメトキシトリ
    チル基又は置換基を有していてもよいホスホリル基を表
    し、Yは、水素原子、o−クロルフエニル燐酸、−P(
    OCH_3)−N−(CH(CH_3)_2)_2、−
    P(OCH_2CH_2CN)−N−(CH(CH_3
    )_2)_2又は−CO−(CH_2)_m−CONH
    −(CH_2)_n−(CPG誘導体)(ここに、m及
    びnは、それぞれ、1〜10の整数である)を表わす。 ただし、Xが置換基を有していてもよいホスホリル基の
    ときは、Yは水素原子である。
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