JPH02291300A - 高感度特異的核酸の測定法 - Google Patents
高感度特異的核酸の測定法Info
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- JPH02291300A JPH02291300A JP11485389A JP11485389A JPH02291300A JP H02291300 A JPH02291300 A JP H02291300A JP 11485389 A JP11485389 A JP 11485389A JP 11485389 A JP11485389 A JP 11485389A JP H02291300 A JPH02291300 A JP H02291300A
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔産業上の利用分野〕
本発明は特異的核酸の高惑度測定法に
3.
2.
関する.
〔従来の技術〕
感染症、癌および遺伝子病の臨床検査の分野において、
核酸レベルの異常は蛋白質レベルの異常に先行するため
、核酸の測定は病態の把握に、病因の解析に重要な意義
を持っている. 従前、前述のごとき核酸の測定はDNA(RNA)プロ
ープを用いたハイプリダイゼーシテン法によって行われ
ている. まず、フィルター上に検体から抽出した核酸を固定し、
標識プロープをハイプリダイズさせる方法(サザンプロ
ット法、ドット法)がある(第一の技術). この例と
しては、リンパ芽球細胞中のEI3ウィルス(Epst
ein−Barr Virus)の 測定におけるプラ
ンズマ(J.Brandsma)らの報告〔プロシーデ
ィングス オプ ナショナル ア力デミイ オブ サイ
エンス(Proc.Natl. Acad.Sci.
USA)、第77@、第6851頁(1980) )が
ある. 細胞をニトロセルローズ膜に固定して、DNA
を変性させた後、放射性同位元素で標識したEBウィル
スのDNAプローブをハイブリダイズさせて定量したも
のである。
核酸レベルの異常は蛋白質レベルの異常に先行するため
、核酸の測定は病態の把握に、病因の解析に重要な意義
を持っている. 従前、前述のごとき核酸の測定はDNA(RNA)プロ
ープを用いたハイプリダイゼーシテン法によって行われ
ている. まず、フィルター上に検体から抽出した核酸を固定し、
標識プロープをハイプリダイズさせる方法(サザンプロ
ット法、ドット法)がある(第一の技術). この例と
しては、リンパ芽球細胞中のEI3ウィルス(Epst
ein−Barr Virus)の 測定におけるプラ
ンズマ(J.Brandsma)らの報告〔プロシーデ
ィングス オプ ナショナル ア力デミイ オブ サイ
エンス(Proc.Natl. Acad.Sci.
USA)、第77@、第6851頁(1980) )が
ある. 細胞をニトロセルローズ膜に固定して、DNA
を変性させた後、放射性同位元素で標識したEBウィル
スのDNAプローブをハイブリダイズさせて定量したも
のである。
また、第一のプローブを固定したフィルターに被検液中
の測定すべき特異的核酸をトラップし、これに標識した
第二のプローブをハイブリダイズさせる方法(サンドイ
ンチ法)がある(第二の技術)。 この例としては、鼻
咽喉分泌物中のアデノウィルスの測定におけるパルバ(
A.Palva)らの報告〔フェムス マイクロバイオ
ロジカルレター( FEMS Microbiol.L
ett.)第23巻、第83頁( 1984) )があ
る. メンプレンフィルター上に固定したアデノウィル
ス2型のDNAプロープと放射性同位元素で標識したD
NAプローブを用いて、アデノウィルスDNAを定量し
たものである。
の測定すべき特異的核酸をトラップし、これに標識した
第二のプローブをハイブリダイズさせる方法(サンドイ
ンチ法)がある(第二の技術)。 この例としては、鼻
咽喉分泌物中のアデノウィルスの測定におけるパルバ(
A.Palva)らの報告〔フェムス マイクロバイオ
ロジカルレター( FEMS Microbiol.L
ett.)第23巻、第83頁( 1984) )があ
る. メンプレンフィルター上に固定したアデノウィル
ス2型のDNAプロープと放射性同位元素で標識したD
NAプローブを用いて、アデノウィルスDNAを定量し
たものである。
第一の技術では!Il識DNAプローブが被検体中に多
量に存在するゲノムDNAと非特異的にハイプリダイズ
することにより、フィルターに吸着するため、測定の特
異性が低くなるとともに、バンクグラウンドが高くなり
、感度が悪くなるという欠点がある. 第二の技術では、2種のブローブを用いるため、DNA
を認識する特異性は高くなるが、フィルター上のDNA
プローブの検体DNA}ラップ能力に限界がある. も
し担体の能力を大きくすれば、その結果、標識ブローブ
のフィルターへの非特異的吸着によるバンクグラウンド
が大きくなり、いずれにしても高感度化は困難であった
.〔発明の解決しようとする!!l!題〕本発明の目的
は、このような状況下、 標識プローブの非特異的吸着による測定値のバックグラ
ウンドを減少させて高惑度のサンドインチ法による核酸
の測定法を提供することにある. 〔課題を解決するための手段〕 本発明は以下の(A)、(B)および (C)工程を包含することを特徴とする高感度特異的核
酸の測定法である。
量に存在するゲノムDNAと非特異的にハイプリダイズ
することにより、フィルターに吸着するため、測定の特
異性が低くなるとともに、バンクグラウンドが高くなり
、感度が悪くなるという欠点がある. 第二の技術では、2種のブローブを用いるため、DNA
を認識する特異性は高くなるが、フィルター上のDNA
プローブの検体DNA}ラップ能力に限界がある. も
し担体の能力を大きくすれば、その結果、標識ブローブ
のフィルターへの非特異的吸着によるバンクグラウンド
が大きくなり、いずれにしても高感度化は困難であった
.〔発明の解決しようとする!!l!題〕本発明の目的
は、このような状況下、 標識プローブの非特異的吸着による測定値のバックグラ
ウンドを減少させて高惑度のサンドインチ法による核酸
の測定法を提供することにある. 〔課題を解決するための手段〕 本発明は以下の(A)、(B)および (C)工程を包含することを特徴とする高感度特異的核
酸の測定法である。
工程(A): 被検液中の測定すべき特異的核酸と2種
以上のプローブを反応せしめ担体上にプローブと測定す
べき核酸からなる複合体を結合せしめる工程. 工程(B): 担体から前記複合体を含む成分を解離さ
せる工程. 工程(C)= Ig成分量を測定する工程.以下、本発
明について工程順に従い、説明する.工 (A)につい
て 本工程は被検液中の測定すべき特異的核酸とブローブと
を反応せしめ、担体上に核酸一ブロープ複合体を結合せ
しめる工程である。
以上のプローブを反応せしめ担体上にプローブと測定す
べき核酸からなる複合体を結合せしめる工程. 工程(B): 担体から前記複合体を含む成分を解離さ
せる工程. 工程(C)= Ig成分量を測定する工程.以下、本発
明について工程順に従い、説明する.工 (A)につい
て 本工程は被検液中の測定すべき特異的核酸とブローブと
を反応せしめ、担体上に核酸一ブロープ複合体を結合せ
しめる工程である。
被検液としては、たとえば、血清、血漿、髄液、裸等の
体液、測定すべき核酸を含む緩衝液が挙げられる.測定
すべき特異的核酸としては、実質上、従来の核酸ブロー
プ法で測定し得たすべての特異的DNA (RNA)が
挙げられる. 例を挙げれば、■血友病A型、血友病B型、フェニルケ
トン尿症、α.−アンチトリブシン欠損症、鎌型赤血球
症、家族性アミ口イドボリニューロパチー、およびハン
チントン病等の遺伝子疾患のDNA ■EBウィルス
、アデノウィルス、B型肝炎ウィルス、HIV、マイコ
プラズマ、レジオネラ、およびクラミジア等のウィルス
・微住物のDNA ■神経芽細胞腫のN−11VC%
パーキットリンパ腫のC−myc等の癌疾患のDNA
■心疾患におけるLDLレセプター、アボA−1,お
よびアボC−11等のリスクファクターのDNA等があ
る. ブローブとは、測定すべき特異的核酸と相補的な核酸の
断片である.一般に1〜2 0 kb(キロ塩基)のも
のが用いられているが、合成オリゴヌクレオチドブロー
ブ(約20〜50ヌクレオチド)を用いることもできる
〔高橋、DNAプローブー技術と応用−、(株)シーエ
ムシー、1988年発行〕。これらのブローブは通常(
A)以下の工程において、担体または標識との結合に関
与する官能基を1種または2種以上結合させて用いる。
体液、測定すべき核酸を含む緩衝液が挙げられる.測定
すべき特異的核酸としては、実質上、従来の核酸ブロー
プ法で測定し得たすべての特異的DNA (RNA)が
挙げられる. 例を挙げれば、■血友病A型、血友病B型、フェニルケ
トン尿症、α.−アンチトリブシン欠損症、鎌型赤血球
症、家族性アミ口イドボリニューロパチー、およびハン
チントン病等の遺伝子疾患のDNA ■EBウィルス
、アデノウィルス、B型肝炎ウィルス、HIV、マイコ
プラズマ、レジオネラ、およびクラミジア等のウィルス
・微住物のDNA ■神経芽細胞腫のN−11VC%
パーキットリンパ腫のC−myc等の癌疾患のDNA
■心疾患におけるLDLレセプター、アボA−1,お
よびアボC−11等のリスクファクターのDNA等があ
る. ブローブとは、測定すべき特異的核酸と相補的な核酸の
断片である.一般に1〜2 0 kb(キロ塩基)のも
のが用いられているが、合成オリゴヌクレオチドブロー
ブ(約20〜50ヌクレオチド)を用いることもできる
〔高橋、DNAプローブー技術と応用−、(株)シーエ
ムシー、1988年発行〕。これらのブローブは通常(
A)以下の工程において、担体または標識との結合に関
与する官能基を1種または2種以上結合させて用いる。
ここでいう官能基とは、プロープに導入した特異的な結
合性を有する物質であり、抗原(ハプテンを含む)一抗
体、酵素一掃酵素等のアフィニティー結合物質対の一方
を用いる. 官能基としては、例えば、ジニトロフェニル基またはト
リニトロフェニル基等のハブテン、ビオチン、抗原、お
よび抗体等が挙げられる。特に分子量の小さい、ハブテ
ンやビオチン等が好ましい。これらは公知の方法により
、ブローブに導入できる. ビオチン基に関しては、ラ
ンガー(P.R.Langer) (プロシーディング
ス オブ ナシタナル アカデミイオブ サイエンス(
Proc.Natl.Aead.Sci.LISA)第
78巻、第6633頁(1981)) 、フォスター(
^.C.Fos ter)他〔ヌクレイックアシズ リ
サーチ(Nucletc Actda Res.)第1
3巻、第745頁(1985)〕等、ジニトロフェニル
基に関しては、シュロイヤー( K.R.Shroye
r ) (ジャーナルオブ セル バイオロジー(J
.C@ll. Biol.)第97@、第377a頁(
1983) )等、参照のこと.また、官能基を結合さ
せる際、官能基とブローブの間に核酸−プローブ複合体
に影響を与えずに切断することができる結合を導入して
もよい.このような例として、−S−S−結合、ビオチ
ンーアビジン結合、および抗原(ハブテンを含む)一抗
体結合等が挙げられる. また、これらのプロープの一つは、工程(C)の測定の
際に利用されるtuiを結合させて用いてもよい. 標
識としては免疫学的測定法において用いられるいずれの
物質でもよく、酵素、放射性物質、発光物質、蛍光物質
、および金属化合物等が挙げられる. 例えば、酵素で
は、ベルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、アルカ
リホスファターゼ、放射性物質としては、りん(”P)
、ヨウ素(tgsI)、水素( ”H) 、蛍光物質
としてはフルオレセインイソチオシアネート、発光物質
としては、アクリジウム塩、金属化合物としては、ユー
ロビウム(Eu’9等が好適である。 標識を結合させ
る方法としては、従来の核酸プロープ法における技術を
何れでも用いることができる. 酵素標識プローブに関
しては、レンツ(M.Renz)他〔ヌクレイックアン
ズ リサーチ(Nucleic Acids Res.
)第12巻、第3435頁(1984) ) ,ヤブロ
ンスキー(E.Jablonski)他〔ヌクレイック
アシズ リサーチ(Nucleic Acids Re
s.)第14巻、第6115頁(1986) ) :蛍
光物質標識プロープに関しては、ルース(J . Ru
th)他(ディーエヌエ−(DNA)第311,第1
22頁(1984) ) 、ブロバー(J. Prob
er)他〔サイエンス(Science)第238巻、
第336頁(19B?) )等、公知の方法にて作成で
きる. これらの官能基、標識は、(A)から(C)の工程に影
響を及ぼさないキャリアーを介在させてプロープに結合
させても良い. キャリアーとしては、蛋白質や鎖状の
有機化合物、ポリヌクレオチド等が挙げられる.例とし
て、アル・ハキムら〔ヌクレイックアシズ リサーチ(
Nucleic Acids Res.)第14@、第
9965頁(1986) )による、DNAプローブに
ヒストンH1、チトクロムCおよびボリエチレンイミン
(分子量60.000)を介して、ビオチン分子を結合
させている報告がある.また、検体DNAとハイプリダ
イズしていない、DNAブローブの一端と相補的な塩基
配列を有するポリヌクレオチドを介して、DNAプロー
ブとビオチンを結合させているアーディア他(特開昭6
2−188970)の技術がある.プロープは少なくと
も2種以上作成し、測定の対象や目的により、最適の組
み合わせを任意に選択するが、代表例として下記のよう
な組み合わせが挙げられる. ■ プローブA一官能基 プローブB一標識 ■ プロープ八一官能基1 ブローブB一官能基2 ■ プロープA一官能基1 プローブB一官能基2 プロープC一標識 ■ ブローブA一官能基1、官能基2 1ローブB一標識 ■のように+!識プロープをハイプリダイズさせる時に
用いない場合には、後に官能基の標識化を行う.その方
法については、工程(C)の項で述べる. 担休としては、従来サンドインチ法測定法において使用
されている物全てを使用しうる.例えば、ボリスチレン
、ポリアクリル、テフロン、紙、ガラス、アガロース等
の他、ニトロセルロース、ナイロンが挙げられる.また
、その形状はどのようなものであっても良い.担体は、
工程(A)で形成される複合体を結合させるため、また
は、担体上で複合体を形成させるために反応基を結合さ
せておく.反応基は、プローブに結合された官能基と特
異的に結合するものならば、どのようなものでも良く、
例えば、官能基がジニトロフェニル基、トリニトロフェ
ニル基等のハプテンのときは、抗ハブテン抗体、 官能
基がビオチンのときは、アビジンまたはストレプトアビ
ジン、 官能基が抗原または抗体のときは、対応する抗
体または抗原が挙げられる。
合性を有する物質であり、抗原(ハプテンを含む)一抗
体、酵素一掃酵素等のアフィニティー結合物質対の一方
を用いる. 官能基としては、例えば、ジニトロフェニル基またはト
リニトロフェニル基等のハブテン、ビオチン、抗原、お
よび抗体等が挙げられる。特に分子量の小さい、ハブテ
ンやビオチン等が好ましい。これらは公知の方法により
、ブローブに導入できる. ビオチン基に関しては、ラ
ンガー(P.R.Langer) (プロシーディング
ス オブ ナシタナル アカデミイオブ サイエンス(
Proc.Natl.Aead.Sci.LISA)第
78巻、第6633頁(1981)) 、フォスター(
^.C.Fos ter)他〔ヌクレイックアシズ リ
サーチ(Nucletc Actda Res.)第1
3巻、第745頁(1985)〕等、ジニトロフェニル
基に関しては、シュロイヤー( K.R.Shroye
r ) (ジャーナルオブ セル バイオロジー(J
.C@ll. Biol.)第97@、第377a頁(
1983) )等、参照のこと.また、官能基を結合さ
せる際、官能基とブローブの間に核酸−プローブ複合体
に影響を与えずに切断することができる結合を導入して
もよい.このような例として、−S−S−結合、ビオチ
ンーアビジン結合、および抗原(ハブテンを含む)一抗
体結合等が挙げられる. また、これらのプロープの一つは、工程(C)の測定の
際に利用されるtuiを結合させて用いてもよい. 標
識としては免疫学的測定法において用いられるいずれの
物質でもよく、酵素、放射性物質、発光物質、蛍光物質
、および金属化合物等が挙げられる. 例えば、酵素で
は、ベルオキシダーゼ、β−ガラクトシダーゼ、アルカ
リホスファターゼ、放射性物質としては、りん(”P)
、ヨウ素(tgsI)、水素( ”H) 、蛍光物質
としてはフルオレセインイソチオシアネート、発光物質
としては、アクリジウム塩、金属化合物としては、ユー
ロビウム(Eu’9等が好適である。 標識を結合させ
る方法としては、従来の核酸プロープ法における技術を
何れでも用いることができる. 酵素標識プローブに関
しては、レンツ(M.Renz)他〔ヌクレイックアン
ズ リサーチ(Nucleic Acids Res.
)第12巻、第3435頁(1984) ) ,ヤブロ
ンスキー(E.Jablonski)他〔ヌクレイック
アシズ リサーチ(Nucleic Acids Re
s.)第14巻、第6115頁(1986) ) :蛍
光物質標識プロープに関しては、ルース(J . Ru
th)他(ディーエヌエ−(DNA)第311,第1
22頁(1984) ) 、ブロバー(J. Prob
er)他〔サイエンス(Science)第238巻、
第336頁(19B?) )等、公知の方法にて作成で
きる. これらの官能基、標識は、(A)から(C)の工程に影
響を及ぼさないキャリアーを介在させてプロープに結合
させても良い. キャリアーとしては、蛋白質や鎖状の
有機化合物、ポリヌクレオチド等が挙げられる.例とし
て、アル・ハキムら〔ヌクレイックアシズ リサーチ(
Nucleic Acids Res.)第14@、第
9965頁(1986) )による、DNAプローブに
ヒストンH1、チトクロムCおよびボリエチレンイミン
(分子量60.000)を介して、ビオチン分子を結合
させている報告がある.また、検体DNAとハイプリダ
イズしていない、DNAブローブの一端と相補的な塩基
配列を有するポリヌクレオチドを介して、DNAプロー
ブとビオチンを結合させているアーディア他(特開昭6
2−188970)の技術がある.プロープは少なくと
も2種以上作成し、測定の対象や目的により、最適の組
み合わせを任意に選択するが、代表例として下記のよう
な組み合わせが挙げられる. ■ プローブA一官能基 プローブB一標識 ■ プロープ八一官能基1 ブローブB一官能基2 ■ プロープA一官能基1 プローブB一官能基2 プロープC一標識 ■ ブローブA一官能基1、官能基2 1ローブB一標識 ■のように+!識プロープをハイプリダイズさせる時に
用いない場合には、後に官能基の標識化を行う.その方
法については、工程(C)の項で述べる. 担休としては、従来サンドインチ法測定法において使用
されている物全てを使用しうる.例えば、ボリスチレン
、ポリアクリル、テフロン、紙、ガラス、アガロース等
の他、ニトロセルロース、ナイロンが挙げられる.また
、その形状はどのようなものであっても良い.担体は、
工程(A)で形成される複合体を結合させるため、また
は、担体上で複合体を形成させるために反応基を結合さ
せておく.反応基は、プローブに結合された官能基と特
異的に結合するものならば、どのようなものでも良く、
例えば、官能基がジニトロフェニル基、トリニトロフェ
ニル基等のハプテンのときは、抗ハブテン抗体、 官能
基がビオチンのときは、アビジンまたはストレプトアビ
ジン、 官能基が抗原または抗体のときは、対応する抗
体または抗原が挙げられる。
反応基の担体への結合は、免疫学的測定における担体作
成の公知の方法で行われる。
成の公知の方法で行われる。
また、反応基と担体の間に、核酸一プローブ複合体に影
響を与えずに切断することができる結合を導入してもよ
い. このような例として、−S−S−結合、ビオチン
ーアビジン結合、および抗原(ハブテンを含む)一抗体
結合等が挙げられる。
響を与えずに切断することができる結合を導入してもよ
い. このような例として、−S−S−結合、ビオチン
ーアビジン結合、および抗原(ハブテンを含む)一抗体
結合等が挙げられる。
工程(A)は次の手順で行う.
まず、被検液に2種以上のプロープを加えて、通常のD
NAプローブ法で用いられる条件下、測定すべき核酸と
ブロープから構成される複合体を形成させる。反応は一
般には20〜75 ’C,数時間〜数十時間、好ましく
は65〜72’C,10〜20時間行う。このようにし
て形成された核酸一プローブ複合体は免疫学的測定に通
常用いられる条件で、担体に結合させる.プローブと測
定すべき核酸を反応させ、核酸−プローブ複合体形成後
、担体と結合させる方法、または、プローブと測定すべ
き核酸と担体とを同時に加えて、核酸一プロープ複合体
形成を担体上で行わせる方法等がある. 後者は工程を
簡略にできるので望ましい. 担体上に複合体を結合させた後、一般には担体の洗浄を
行う.洗浄は免疫学的測定法で用いる公知の方法で行わ
れる. 工 (B)について 本工程はバックグラウンドの原因となる、担体に非特異
的に結合した標識ブローブ及び非特異的核酸から、核酸
−プロープ複合体を含む成分を選択的に分離する工程で
ある。
NAプローブ法で用いられる条件下、測定すべき核酸と
ブロープから構成される複合体を形成させる。反応は一
般には20〜75 ’C,数時間〜数十時間、好ましく
は65〜72’C,10〜20時間行う。このようにし
て形成された核酸一プローブ複合体は免疫学的測定に通
常用いられる条件で、担体に結合させる.プローブと測
定すべき核酸を反応させ、核酸−プローブ複合体形成後
、担体と結合させる方法、または、プローブと測定すべ
き核酸と担体とを同時に加えて、核酸一プロープ複合体
形成を担体上で行わせる方法等がある. 後者は工程を
簡略にできるので望ましい. 担体上に複合体を結合させた後、一般には担体の洗浄を
行う.洗浄は免疫学的測定法で用いる公知の方法で行わ
れる. 工 (B)について 本工程はバックグラウンドの原因となる、担体に非特異
的に結合した標識ブローブ及び非特異的核酸から、核酸
−プロープ複合体を含む成分を選択的に分離する工程で
ある。
複合体の解離は下記のいずれかの結合を切断して行う.
?)官能基と反応基の結合
2)官能基とプロープの結合
3}反応基と担体の結合
核酸−ブローブ複合体に影響を与えずに解離させる好ま
しい方法は、 ■上記の結合に関与する結合物質対にお
いて、一方の物質と置換しうる反応部位を有する物質を
加えること、■還元剤または酸化剤を加えること、等で
ある. 具体的には、結合がジニトロフエニル基または
トリニトロフエニル基等のハブテンー抗ハブテン抗体の
ときには、ジニトロフェニルアミノ酸(例:ジニトロフ
エニルリジン)、ビオチン■アビジンまたはストレプト
アビジンのときには、ビオチンを添加する. 結合が−
S−S一である場合、一S−S−を切断する試薬、例え
ば2−メルカプトエタノール等を用いる。
しい方法は、 ■上記の結合に関与する結合物質対にお
いて、一方の物質と置換しうる反応部位を有する物質を
加えること、■還元剤または酸化剤を加えること、等で
ある. 具体的には、結合がジニトロフエニル基または
トリニトロフエニル基等のハブテンー抗ハブテン抗体の
ときには、ジニトロフェニルアミノ酸(例:ジニトロフ
エニルリジン)、ビオチン■アビジンまたはストレプト
アビジンのときには、ビオチンを添加する. 結合が−
S−S一である場合、一S−S−を切断する試薬、例え
ば2−メルカプトエタノール等を用いる。
工王(C)について
工程(B)で解離された核酸一ブロープ複合体を含む成
分を定量する工程である。
分を定量する工程である。
解離された該成分はそのまま溶液状態で定量しても良く
、また他の担体に結合させ、洗浄後定量しても良い。こ
の他の担体への結合は公知の材料、方法にて行うことが
できる。
、また他の担体に結合させ、洗浄後定量しても良い。こ
の他の担体への結合は公知の材料、方法にて行うことが
できる。
そして、免疫学的測定に通常用いられる方法で定量する
。測定法の例として、放射性同位元素、酵素、蛍光物質
等を用いた方法が、臨床病理((The Japane
se Journal of CIinicalPat
hology)、臨時増刊特集第53号、昭和58年2
月28日発行〕に総括されている。
。測定法の例として、放射性同位元素、酵素、蛍光物質
等を用いた方法が、臨床病理((The Japane
se Journal of CIinicalPat
hology)、臨時増刊特集第53号、昭和58年2
月28日発行〕に総括されている。
解離された核酸−プローブ複合体を含む成分を測定する
には、該成分中の標識を用いる.従って、工程(A)の
項で記載したように、標識プローブを工程(A)のハイ
ブリダイゼーションに用いない場合は、後の工程で反応
基を結合させた標識を加え、核酸−プローブ複合体上の
官能基に結合させて標識化を行う。
には、該成分中の標識を用いる.従って、工程(A)の
項で記載したように、標識プローブを工程(A)のハイ
ブリダイゼーションに用いない場合は、後の工程で反応
基を結合させた標識を加え、核酸−プローブ複合体上の
官能基に結合させて標識化を行う。
ここで用いる反応基と官能基は、工程(A)で担体と核
酸−プローブ複合体との結合に用いる様なアフィニティ
結合物質対であり、強い結合性を有するものが好ましい
。例としてアビジンービオチンが挙げられる。反応基と
結合させた標識は当分野で公知の方法により作成される
。標識と官能基及び反応基の選択は任意であるが、標識
化に用いる反応基一官能基は、担体と核酸−プロープ複
合体の結合に関与している反応基一官能基とは異なるも
のを選ぶ.また、担体との結合に関与しているプロープ
には標識を導入しない。
酸−プローブ複合体との結合に用いる様なアフィニティ
結合物質対であり、強い結合性を有するものが好ましい
。例としてアビジンービオチンが挙げられる。反応基と
結合させた標識は当分野で公知の方法により作成される
。標識と官能基及び反応基の選択は任意であるが、標識
化に用いる反応基一官能基は、担体と核酸−プロープ複
合体の結合に関与している反応基一官能基とは異なるも
のを選ぶ.また、担体との結合に関与しているプロープ
には標識を導入しない。
標識化する時点は任意であるが、溶液状態で定量する場
合は、担体から核酸−プローブ複合体を最終的に解離す
る前に行う。また、他の担体上で定量する場合は最終的
な担体洗浄の前の適切な時点を選んで行う. 例を挙げれば、■工程(A>の核酸一プローブ複合体形
成後■工程(B)の複合体解離前■工程(C)の他の担
体への複合体結合後、等である。
合は、担体から核酸−プローブ複合体を最終的に解離す
る前に行う。また、他の担体上で定量する場合は最終的
な担体洗浄の前の適切な時点を選んで行う. 例を挙げれば、■工程(A>の核酸一プローブ複合体形
成後■工程(B)の複合体解離前■工程(C)の他の担
体への複合体結合後、等である。
このハイプリダイゼーション終了後に標識を導入する方
法は、特に酵素で標識する場合に好ましい。一般に酵素
の分子量は大きいため、酵素標識ブロープを用いた場合
、各プロープと、測定すべき核酸とのハイプリダゼーシ
ョンが阻害されるかも知れないからである.以上説明し
たように、本発明は従来の核酸サンドイッチ法における
バックグラウンドの原因であった、担体に非特異的に結
合する標識プローブおよび非特異的核酸を除くことによ
り、より高感度に特異的核酸を定量しうる測定法を提供
するものである。
法は、特に酵素で標識する場合に好ましい。一般に酵素
の分子量は大きいため、酵素標識ブロープを用いた場合
、各プロープと、測定すべき核酸とのハイプリダゼーシ
ョンが阻害されるかも知れないからである.以上説明し
たように、本発明は従来の核酸サンドイッチ法における
バックグラウンドの原因であった、担体に非特異的に結
合する標識プローブおよび非特異的核酸を除くことによ
り、より高感度に特異的核酸を定量しうる測定法を提供
するものである。
以下、本発明を実施例に即して説明するがもとより、こ
れに限られるものではない.実施例 I DNA びプローブ DNAの 測定の検体モデル用DNA及びそれの一部分と相補的な
配列をもつ二種のブロープ用DNAは、全自動DNA合
成機MOD[!L 381A (アブライド・バイオシ
ステム、カルフォルニア州)を用い、同社の操作手引書
に従い、公知の方法(M.0.マツーシ(M.D.Ma
tteucci)ら、ジャーナルオブ アメリカン ケ
ミカル ソサイエティ(J.^m.chem.soc.
)第103巻.第3185頁(1981) )で合成し
た. 合成後、150シリーズセパレーシッンシステム
(アプライド・バイオシステム)を用い、逆相の高速液
体クロマトグラフィーにより精製を行った。
れに限られるものではない.実施例 I DNA びプローブ DNAの 測定の検体モデル用DNA及びそれの一部分と相補的な
配列をもつ二種のブロープ用DNAは、全自動DNA合
成機MOD[!L 381A (アブライド・バイオシ
ステム、カルフォルニア州)を用い、同社の操作手引書
に従い、公知の方法(M.0.マツーシ(M.D.Ma
tteucci)ら、ジャーナルオブ アメリカン ケ
ミカル ソサイエティ(J.^m.chem.soc.
)第103巻.第3185頁(1981) )で合成し
た. 合成後、150シリーズセパレーシッンシステム
(アプライド・バイオシステム)を用い、逆相の高速液
体クロマトグラフィーにより精製を行った。
上記の方法で調製した各DNAの塩基配列を以下に示す
. 検体DNA(51塩基) 3′9。−ACGTTGCCGC CCCGCCGC
CG CCTGTCGCTG^GCTCGGACC T
GCTCGGCAC G一。%JブローブDNA−2
10#g(1.5nmole)に対してCr−”P)
アデノシン3リン酸(アマシャム・ジャパン、東京)
20nmole ( 5μCi/nmole)及びT4
ポリヌクレオチド・キナーゼ(東洋紡.大阪)80単位
を用い、公知方法(C.C.リチャードソン(C.C.
Richardson) 、プロシーディングス オ
ブ ナショナル ア力デミイオプ サイエンス(Pro
c.Nat1.Acad.Sci.υ,S6A.)第5
4巻.第158頁(1965) )で、5′末端を32
p標識した。次いでPD−10カラム(ファルマシア、
ウプサラ、スウェーデン)を用いて0.15M塩化ナト
リウムおよびI n+M EDTAを含む0. 1 M
リン酸ナトリウム緩衝液でゲルろ過を行った後、70%
エタノールで沈澱させて、プローブを精製した。
. 検体DNA(51塩基) 3′9。−ACGTTGCCGC CCCGCCGC
CG CCTGTCGCTG^GCTCGGACC T
GCTCGGCAC G一。%JブローブDNA−2
10#g(1.5nmole)に対してCr−”P)
アデノシン3リン酸(アマシャム・ジャパン、東京)
20nmole ( 5μCi/nmole)及びT4
ポリヌクレオチド・キナーゼ(東洋紡.大阪)80単位
を用い、公知方法(C.C.リチャードソン(C.C.
Richardson) 、プロシーディングス オ
ブ ナショナル ア力デミイオプ サイエンス(Pro
c.Nat1.Acad.Sci.υ,S6A.)第5
4巻.第158頁(1965) )で、5′末端を32
p標識した。次いでPD−10カラム(ファルマシア、
ウプサラ、スウェーデン)を用いて0.15M塩化ナト
リウムおよびI n+M EDTAを含む0. 1 M
リン酸ナトリウム緩衝液でゲルろ過を行った後、70%
エタノールで沈澱させて、プローブを精製した。
ビオチニルーDNAプロープの
プロープDNA−1 104g (1.5nmole
)に対して、アデノシン3リン酸(ファルマシア、ウプ
サラ、スウェーデン) 80ru++ole及びT4ボ
リヌクレオチドキナーゼ80単位を用い、公知の方法(
C.C.リチャードソン(C.C. Richards
on)、プロシーデインダス オプ ナショナル ア力
デミイ オブ サイエンス(前出)〕で5′末端にリン
酸基を導入した. 次いでリン酸基の先にアミノ基を導
入し、N−ヒドロキシサクシニミジルビオチンを結合さ
せる公知の方法[C.F.バーバラ(C.F.Barb
ara) ら、ディーエヌエ−(DNA) 、第4巻、
第327頁(1985) )に従ってブローブDNAの
5′末端にビオチン分子を導入した.反応後、前述同様
PD−10カラムによるゲルろ過及びエタノール沈澱に
よりプローブの精製を行った。
)に対して、アデノシン3リン酸(ファルマシア、ウプ
サラ、スウェーデン) 80ru++ole及びT4ボ
リヌクレオチドキナーゼ80単位を用い、公知の方法(
C.C.リチャードソン(C.C. Richards
on)、プロシーデインダス オプ ナショナル ア力
デミイ オブ サイエンス(前出)〕で5′末端にリン
酸基を導入した. 次いでリン酸基の先にアミノ基を導
入し、N−ヒドロキシサクシニミジルビオチンを結合さ
せる公知の方法[C.F.バーバラ(C.F.Barb
ara) ら、ディーエヌエ−(DNA) 、第4巻、
第327頁(1985) )に従ってブローブDNAの
5′末端にビオチン分子を導入した.反応後、前述同様
PD−10カラムによるゲルろ過及びエタノール沈澱に
よりプローブの精製を行った。
szpの ・活 の測
各ポリスチレンボールに結合した32P放射活性の測定
は、ポリスチレンボールをキシレン系液体シンチレータ
ACSn (アマシャム・ジャパン、東京)5lllを
含むミニバイアル中で激しく撹拌した後、液体シンチレ
ーションカウンター(バッカード、旧NAXI TRI
〜CARB 4000)を用いて5分間計測で行った。
は、ポリスチレンボールをキシレン系液体シンチレータ
ACSn (アマシャム・ジャパン、東京)5lllを
含むミニバイアル中で激しく撹拌した後、液体シンチレ
ーションカウンター(バッカード、旧NAXI TRI
〜CARB 4000)を用いて5分間計測で行った。
(11 ウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血清アル
プミン) IgG不溶化固相の調製 ウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血清アルブミン)
IgG(生化学工業、東京) 4.23gを溶解した0
.0175 M リン酸ナトリウム緩衝液(all6
.3)に 0.747 gの硫酸ナトリウムを少しずつ
加え、O℃ 30分間撹拌した1!t 10,000
x gで15分間遠心した.沈澱を4.0mlの0.0
175Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH6.3)に溶解
し、同緩衝液で透析した後、DE−52セルロース(ワ
ソトマン、ケント州、イギリス)カラム(1.6X8.
OCIml)を用いて、塩化ナトリウムの直線濃度勾配
による陰イオン交換クロマトグラフィーを行った. I
gGを含む分画を集め、061hリン酸ナトリウム緩衝
液(pH 7. 0 )で透析した後1gG濃度を2
80nmにおける吸光係数1.5g − 1 , l
, CI1− 1から求め、0.1g/j!になるよう
に同緩衝液で希釈した。
プミン) IgG不溶化固相の調製 ウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血清アルブミン)
IgG(生化学工業、東京) 4.23gを溶解した0
.0175 M リン酸ナトリウム緩衝液(all6
.3)に 0.747 gの硫酸ナトリウムを少しずつ
加え、O℃ 30分間撹拌した1!t 10,000
x gで15分間遠心した.沈澱を4.0mlの0.0
175Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH6.3)に溶解
し、同緩衝液で透析した後、DE−52セルロース(ワ
ソトマン、ケント州、イギリス)カラム(1.6X8.
OCIml)を用いて、塩化ナトリウムの直線濃度勾配
による陰イオン交換クロマトグラフィーを行った. I
gGを含む分画を集め、061hリン酸ナトリウム緩衝
液(pH 7. 0 )で透析した後1gG濃度を2
80nmにおける吸光係数1.5g − 1 , l
, CI1− 1から求め、0.1g/j!になるよう
に同緩衝液で希釈した。
次いで、この溶液を用いてポリスチレンボール〔直径3
.2m(プレシジョン・プラスチックポール、シカゴ)
〕表面上に公知の方法〔石川ら、スカンジナビアン ジ
ャーナル オブ イムノロジー(Scand.J. I
mmunol.)第8巻(補7)第43頁(1978)
)で、物理的吸着により不溶化した. (2) ジニトロフェニルーアビジンの調製(1)メ
ルカプトサクシニルーアビジンのj屑製0.1Mリン酸
ナトリウム緩衝液(p}17.5)に溶解したアビジン
D(ベクター社)1■にS−アセチルメルカブトーサク
シニックーアンハイドライド(ナカライテスク、京都)
を用いて、公知の方法〔石川ら、ジャーナル オブ イ
ムノアソセイ (J.Immunoassay)第4巻
、第209頁(1983) )に従ってチオール基を導
入した.導入されたチオール基の数はアビジン1分子当
たり13個であった. ( ii )マレイミドージニトロフェニルーL−リジ
ンの調製 5.5nll 2. 4−ジニトロフェニルーし−
リジン塩酸塩(東京化成,東京)を含む0.1MIJン
酸ナトリウム緩衝液(pH7.0) 1.7mlと、
5.5mMN−サクシニミジル−6−マレイミドヘキサ
ノエート(同仁化学,熊本)を溶解したN.N−ジメチ
ルホルムアミド0.17mlとを30℃で30分反応さ
せた。
.2m(プレシジョン・プラスチックポール、シカゴ)
〕表面上に公知の方法〔石川ら、スカンジナビアン ジ
ャーナル オブ イムノロジー(Scand.J. I
mmunol.)第8巻(補7)第43頁(1978)
)で、物理的吸着により不溶化した. (2) ジニトロフェニルーアビジンの調製(1)メ
ルカプトサクシニルーアビジンのj屑製0.1Mリン酸
ナトリウム緩衝液(p}17.5)に溶解したアビジン
D(ベクター社)1■にS−アセチルメルカブトーサク
シニックーアンハイドライド(ナカライテスク、京都)
を用いて、公知の方法〔石川ら、ジャーナル オブ イ
ムノアソセイ (J.Immunoassay)第4巻
、第209頁(1983) )に従ってチオール基を導
入した.導入されたチオール基の数はアビジン1分子当
たり13個であった. ( ii )マレイミドージニトロフェニルーL−リジ
ンの調製 5.5nll 2. 4−ジニトロフェニルーし−
リジン塩酸塩(東京化成,東京)を含む0.1MIJン
酸ナトリウム緩衝液(pH7.0) 1.7mlと、
5.5mMN−サクシニミジル−6−マレイミドヘキサ
ノエート(同仁化学,熊本)を溶解したN.N−ジメチ
ルホルムアミド0.17mlとを30℃で30分反応さ
せた。
( iii )ジニトロフェニノレーアビジンの8周製
(i)で調製したメルカプトサクシニルーアビジン0.
54■を溶解した、5mMEDT^ (エチレンジアミ
ン四酢酸)を含む、0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液(
pH6. 0 > 1.0mlと( ii )で調製
したマレイミドージニト口フエニルーL−リジン溶液0
.43mlとを30℃で30分反応させた後、同緩衝液
に溶解した0.1MN−エチルマレイミド(ナカライテ
スク,京都)5μlを加え30℃で15分保温した.反
応液をセファデフクスG一25 (ファルマシア、スウ
ェーデン)カラム(1.OX30ai)を用い、0.1
M リン酸ナトリウム緩衝液でゲルろ過を行った。アビ
ジン1分子当り導入されたジニトロフェニル基の数は7
個であった. (3)ジニトロフェニルーアビジン結合ウサギ(抗ジニ
トロフェニルーウシ血清アルブミン)■gG不溶化固相
の調製 (1)で調製したウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血
清アルプミン) IgG不溶化ポリスチレンボールを、
(2)で調製したジニトロフェニルアビジンを溶解した
(0.1 g/j!) 、0.1M塩化ナトリウムおよ
び0. 1%ウシ血清アルプミンを含む0.OIMリン
酸ナトリウム緩衝液(pH 7.0)中で、30℃10
時間保温して反応させた。
(i)で調製したメルカプトサクシニルーアビジン0.
54■を溶解した、5mMEDT^ (エチレンジアミ
ン四酢酸)を含む、0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液(
pH6. 0 > 1.0mlと( ii )で調製
したマレイミドージニト口フエニルーL−リジン溶液0
.43mlとを30℃で30分反応させた後、同緩衝液
に溶解した0.1MN−エチルマレイミド(ナカライテ
スク,京都)5μlを加え30℃で15分保温した.反
応液をセファデフクスG一25 (ファルマシア、スウ
ェーデン)カラム(1.OX30ai)を用い、0.1
M リン酸ナトリウム緩衝液でゲルろ過を行った。アビ
ジン1分子当り導入されたジニトロフェニル基の数は7
個であった. (3)ジニトロフェニルーアビジン結合ウサギ(抗ジニ
トロフェニルーウシ血清アルブミン)■gG不溶化固相
の調製 (1)で調製したウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血
清アルプミン) IgG不溶化ポリスチレンボールを、
(2)で調製したジニトロフェニルアビジンを溶解した
(0.1 g/j!) 、0.1M塩化ナトリウムおよ
び0. 1%ウシ血清アルプミンを含む0.OIMリン
酸ナトリウム緩衝液(pH 7.0)中で、30℃10
時間保温して反応させた。
ポリスチレンボールは、0.1M塩化ナトリウム、0.
1%ウシ血清アルブミンおよび0.1%アジ化ナトリウ
ムを含む0.OIMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7.
0)中で保存した。
1%ウシ血清アルブミンおよび0.1%アジ化ナトリウ
ムを含む0.OIMリン酸ナトリウム緩衝液(pH7.
0)中で保存した。
ビオチニルーウシ血 アルブミン の且盟
(1)N−ビオチニル−2−メルカプトエチルアミンの
調製 N−ヒドロキシサクシニミジルービオチン(ピアスケミ
カル.イリノイ州)に2−メルカプトエチルアミンを用
いて公知の方法〔石川ら、バイオケミカル アンド バ
イオフィジカルリサーチ コミュニケーション(Bio
chem. Biophys.Res. Commun
.)、第147巻、第644頁(1987)〕でチオー
ル基を導入した。
調製 N−ヒドロキシサクシニミジルービオチン(ピアスケミ
カル.イリノイ州)に2−メルカプトエチルアミンを用
いて公知の方法〔石川ら、バイオケミカル アンド バ
イオフィジカルリサーチ コミュニケーション(Bio
chem. Biophys.Res. Commun
.)、第147巻、第644頁(1987)〕でチオー
ル基を導入した。
(2) マレイミドーウシ血清アルブミンの調製ウシ
血清アルブミン(ナカライテスク、京都)にN−サクシ
ニミジル−6−マイレミドヘキサノエートを用い、公知
の方法〔橋田ら、ジャーナルオプ アプライド バイオ
ケミストリ− (J.Appl. Biochem.)
第6巻、第56頁(1984)〕に従って マレイミド
基を導入した.導入されたマレイミド基の数は、ウシ血
清アルブミン1分子当り11個 であった。
血清アルブミン(ナカライテスク、京都)にN−サクシ
ニミジル−6−マイレミドヘキサノエートを用い、公知
の方法〔橋田ら、ジャーナルオプ アプライド バイオ
ケミストリ− (J.Appl. Biochem.)
第6巻、第56頁(1984)〕に従って マレイミド
基を導入した.導入されたマレイミド基の数は、ウシ血
清アルブミン1分子当り11個 であった。
《3) ビオチニルーウシ血清アルプミンの調製(2
)で調製したマレイミドーウシ血清アルプミン10■を
溶解した5 mM EDTAを含む0. 1 M IJ
ン酸ナトリウム緩衝液(pH 6. 0) 2. 0
a+lに{1}で調製したN−ビオチニル−2−メルカ
ブトエチルアミン溶液0.22mlを加え30℃、30
分反応させた。 反応後、O.l?I2−メルカプトエ
チルアミンを熔解した5mM !!DTAを含む0.1
M リン酸ナトリウム緩衝液(pl+ 6。O ) 0
.05mlを加え、セファデソクスG−25(ファルマ
シア、スウェーデン)カラム( 1. 0 X30CI
I1)を用い、0.INリン酸ナトリウム緩衝液(pl
+ 7. 5 ”)でゲルろ過を行った。ウシ血清アル
プミン1分子当りに導入されたビオチン分子は7個であ
った.(4) ビオチニルーウシ血清アルプミン不溶
化固相の調製 (3)で調製したビオチニルーウシ血清アルブミン溶液
(0.1g/l)を用いて、ポリスチレンボール〔直径
3.2■■(プレシジョン社、シカゴ)〕表面上に公知
の方法〔石川ら、スカンジナビアンジャーナル オプ
イムノロジー(前出)〕で、物理的吸着により不溶化し
た。
)で調製したマレイミドーウシ血清アルプミン10■を
溶解した5 mM EDTAを含む0. 1 M IJ
ン酸ナトリウム緩衝液(pH 6. 0) 2. 0
a+lに{1}で調製したN−ビオチニル−2−メルカ
ブトエチルアミン溶液0.22mlを加え30℃、30
分反応させた。 反応後、O.l?I2−メルカプトエ
チルアミンを熔解した5mM !!DTAを含む0.1
M リン酸ナトリウム緩衝液(pl+ 6。O ) 0
.05mlを加え、セファデソクスG−25(ファルマ
シア、スウェーデン)カラム( 1. 0 X30CI
I1)を用い、0.INリン酸ナトリウム緩衝液(pl
+ 7. 5 ”)でゲルろ過を行った。ウシ血清アル
プミン1分子当りに導入されたビオチン分子は7個であ
った.(4) ビオチニルーウシ血清アルプミン不溶
化固相の調製 (3)で調製したビオチニルーウシ血清アルブミン溶液
(0.1g/l)を用いて、ポリスチレンボール〔直径
3.2■■(プレシジョン社、シカゴ)〕表面上に公知
の方法〔石川ら、スカンジナビアンジャーナル オプ
イムノロジー(前出)〕で、物理的吸着により不溶化し
た。
挟生旦凡人立皿足
種々の濃度に希釈した検体D N A (n=6) 、
5ngの3茸P標識DNAプローブ、5ngのビオチニ
ルーDNAブロープ、loOngのサケ精子の単鎖DN
A、 0.15M塩化ナトリウム、1mM EDTAお
よび0.1%ウシ血清アルプミンを含む、0.1阿リン
酸ナトリウム緩衝液(pH 7. 0 ) 0. 15
mlを65℃、16時間保温した。 室温に戻した後、
ジニトロフェニルーアビジン結合ウサギ(抗ジニトロフ
ェニルーウシ血清アルブミン) IgG不溶化ポリスチ
レンポールを1個添加し、30℃5時間反応させた。
ボールを0.15M塩化ナトリウム、I a+M ED
TA及び0. 1%ウシ血清アルブミンを含む0.1M
リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.0) 2mlで
2回洗浄した後、1 5 0nmoleのジニトロフヱ
ノールーし−リジン(東京化成工業、東京)を溶解した
、0.15M塩化ナトリウム、1 mM EDTA及び
0.1%ウシ血清アルブミンを含む0.16リン酸ナト
リウム緩衝液(pH 7.0) 0.15ml中でビオ
チニルーウシ血清アルプミン不溶化ポリスチレンボール
1個とともに30℃、2時間反応させた。 ジニトロフ
ェニルーアビジン結合ウサギ(抗ジニトロフェニル〜ウ
シ血清アルプミン) IgG不溶化ポリスチレンボール
を除去した後、さらに30℃、3時間反応させた.ポリ
スチレンボールを上述と同様に洗浄した後、ポリスチレ
ンボールに結合した3!Pの放射活性を測定した。 結
果を第1図に示す。
5ngの3茸P標識DNAプローブ、5ngのビオチニ
ルーDNAブロープ、loOngのサケ精子の単鎖DN
A、 0.15M塩化ナトリウム、1mM EDTAお
よび0.1%ウシ血清アルプミンを含む、0.1阿リン
酸ナトリウム緩衝液(pH 7. 0 ) 0. 15
mlを65℃、16時間保温した。 室温に戻した後、
ジニトロフェニルーアビジン結合ウサギ(抗ジニトロフ
ェニルーウシ血清アルブミン) IgG不溶化ポリスチ
レンポールを1個添加し、30℃5時間反応させた。
ボールを0.15M塩化ナトリウム、I a+M ED
TA及び0. 1%ウシ血清アルブミンを含む0.1M
リン酸ナトリウム緩衝液(pH7.0) 2mlで
2回洗浄した後、1 5 0nmoleのジニトロフヱ
ノールーし−リジン(東京化成工業、東京)を溶解した
、0.15M塩化ナトリウム、1 mM EDTA及び
0.1%ウシ血清アルブミンを含む0.16リン酸ナト
リウム緩衝液(pH 7.0) 0.15ml中でビオ
チニルーウシ血清アルプミン不溶化ポリスチレンボール
1個とともに30℃、2時間反応させた。 ジニトロフ
ェニルーアビジン結合ウサギ(抗ジニトロフェニル〜ウ
シ血清アルプミン) IgG不溶化ポリスチレンボール
を除去した後、さらに30℃、3時間反応させた.ポリ
スチレンボールを上述と同様に洗浄した後、ポリスチレ
ンボールに結合した3!Pの放射活性を測定した。 結
果を第1図に示す。
比較例 1
検体用およびプローブ用DNAの調製、固相の調製、お
よび放射活性の測定は実施例1の方法に従った。
よび放射活性の測定は実施例1の方法に従った。
穂淋』」シ眞(社)燵定
種々の濃度に希釈した検体D N A (n・6)、5
ngの”pi!liDNAプロープ、5ngのビオチニ
ルーDNAプローブ、100ngのサケ精子の単ill
D N A , 0.15M塩化ナトリウム1 mM
EDTAおよび0. 1%ウシ血清アルブミンを含む
、0。I台リン酸ナトリウム緩衝液(pH 7. 0
) 0. 15mlを65℃、16時間保温した. 室
温に戻した後、ジニトロフェニルーアビジン結合ウサギ
(抗ジニトロフェニルーウシ血清アルブミン) IgG
不溶化ポリスチレンボールを1個添加し、30℃で5時
間反応させた。 ポリスチレンボールを0.15M塩化
ナトリウム、1 mM EDTA及び0.1%ウシ血
清アルブミンを含む0. 1 M リン酸ナトリウム緩
衝液(all 7.0) 2mlで2回洗浄した後、
ポリスチレンボールに結合した3tpの放射活性を測定
した. 結果を第1図に示す。
ngの”pi!liDNAプロープ、5ngのビオチニ
ルーDNAプローブ、100ngのサケ精子の単ill
D N A , 0.15M塩化ナトリウム1 mM
EDTAおよび0. 1%ウシ血清アルブミンを含む
、0。I台リン酸ナトリウム緩衝液(pH 7. 0
) 0. 15mlを65℃、16時間保温した. 室
温に戻した後、ジニトロフェニルーアビジン結合ウサギ
(抗ジニトロフェニルーウシ血清アルブミン) IgG
不溶化ポリスチレンボールを1個添加し、30℃で5時
間反応させた。 ポリスチレンボールを0.15M塩化
ナトリウム、1 mM EDTA及び0.1%ウシ血
清アルブミンを含む0. 1 M リン酸ナトリウム緩
衝液(all 7.0) 2mlで2回洗浄した後、
ポリスチレンボールに結合した3tpの放射活性を測定
した. 結果を第1図に示す。
本発明による実施例の測定限界は1 0pg (0.5
fmole)であった. 従来法である比較例に比し
て、バックグラウンドが約1/8に減少し、3倍の感度
向上が認められた. 実施例 2 検体用DNA及びプローブ用DNAの調製、alp標識
DNAプローブの調製、及び ウサギ(抗ジニトロフェ
ニルーウシ血清アルプミン)IgG不溶化固相の調製は
実施例1の方法に従った. ジニトロフエニルーD N A 7”ロープの(l)5
゜−アミノヘキシルホスヰールアミデート−DNAの調
製 ブローブDNA−1 104g (1.5r+mol
e)に対して、アデノシン3リン酸(ファルマシア、ウ
プサラ、スウェーデン) 80nmole及びT4ポリ
ヌクレオチドキナーゼ80単位を用い、公知の方法(C
.C.リチャードソン(C.C. Richardso
n) 、プロシーデインダス オプ ナショナル アカ
デミイ オブ サイエンス(前出))で5′末端にリン
酸基を導入した。 次いで、0.1M イミダゾール
ー塩酸緩衝液(pH 6.0)中で、1−エチル−3.
3−ジメチルアミノブロピルカルボジイミド(ナカライ
テスク、京都)により導入したリン酸基に イミド基を
結合させた後、1.6−ジアミノヘキサン(ナカライテ
スク)を反応させる公知の方法(A, コレソト (A
.Chollet)ら、ヌクレインクアシズ リサーチ
(Nucleic Acids Res.)、第13巻
、第1529頁(1985)]に従って、5末端にアミ
ノ基を導入した。
fmole)であった. 従来法である比較例に比し
て、バックグラウンドが約1/8に減少し、3倍の感度
向上が認められた. 実施例 2 検体用DNA及びプローブ用DNAの調製、alp標識
DNAプローブの調製、及び ウサギ(抗ジニトロフェ
ニルーウシ血清アルプミン)IgG不溶化固相の調製は
実施例1の方法に従った. ジニトロフエニルーD N A 7”ロープの(l)5
゜−アミノヘキシルホスヰールアミデート−DNAの調
製 ブローブDNA−1 104g (1.5r+mol
e)に対して、アデノシン3リン酸(ファルマシア、ウ
プサラ、スウェーデン) 80nmole及びT4ポリ
ヌクレオチドキナーゼ80単位を用い、公知の方法(C
.C.リチャードソン(C.C. Richardso
n) 、プロシーデインダス オプ ナショナル アカ
デミイ オブ サイエンス(前出))で5′末端にリン
酸基を導入した。 次いで、0.1M イミダゾール
ー塩酸緩衝液(pH 6.0)中で、1−エチル−3.
3−ジメチルアミノブロピルカルボジイミド(ナカライ
テスク、京都)により導入したリン酸基に イミド基を
結合させた後、1.6−ジアミノヘキサン(ナカライテ
スク)を反応させる公知の方法(A, コレソト (A
.Chollet)ら、ヌクレインクアシズ リサーチ
(Nucleic Acids Res.)、第13巻
、第1529頁(1985)]に従って、5末端にアミ
ノ基を導入した。
(2) サクシニミジル−2.4−ジニトロフエニル
−ξ一カプロン酸の合成 2.4−ジニトロフェニルーξ一カプロン酸(シグマ社
、ミズーリ州)と、N−ヒドロキシサクシニミド(和光
純薬工業、大阪)をジクロ口力ルポジイミド(和光純薬
工業)により縮合される公知の方法(F.レビ・シエー
ファ−(F.levi−schaffer)ら、アメリ
カン ジャーナルオプ トロピカル メディスン アン
ド ハイジーン(八m. J. Trop.Med.H
yg.、第32巻、第343頁(1983) )により
サクシニミジル−24−ジニトロフエニルーξ一カプロ
ン酸ヲ合成した。次いで、シリカゲル(40g)カラム
を用い、クロロホルム/メタノール(40/1(V/V
) )の系で精製を行った後、NMR (核磁気共鳴法
)および質量スペクトル法により構造を確認した。
−ξ一カプロン酸の合成 2.4−ジニトロフェニルーξ一カプロン酸(シグマ社
、ミズーリ州)と、N−ヒドロキシサクシニミド(和光
純薬工業、大阪)をジクロ口力ルポジイミド(和光純薬
工業)により縮合される公知の方法(F.レビ・シエー
ファ−(F.levi−schaffer)ら、アメリ
カン ジャーナルオプ トロピカル メディスン アン
ド ハイジーン(八m. J. Trop.Med.H
yg.、第32巻、第343頁(1983) )により
サクシニミジル−24−ジニトロフエニルーξ一カプロ
ン酸ヲ合成した。次いで、シリカゲル(40g)カラム
を用い、クロロホルム/メタノール(40/1(V/V
) )の系で精製を行った後、NMR (核磁気共鳴法
)および質量スペクトル法により構造を確認した。
(3) ジニトロフエニルーDNAプローブの調製(
1)で調製した5′−アミノへキシルホスホールアミデ
ートーD N A 150pmoleを熔解した0.
01M リン酸カリウム緩衝液(pH7.5)50μl
に、(2)で調製したサクシニミジル−2,4−ジニト
ロフェニルーξ一カプロン酸50nmole ヲ含むN
,N−ジメチルホルムアミド50μlを加え、20℃、
20時間反応させた。反応後RPC−5カラム(アプラ
イド・バイオシステム )を用いる公知の方法(R.L
.ピアソン(R.L.Peason)ら、パイオケミカ
ル エト バイオフィジカ アクタ(Biochem.
Biophys. Acta) 、第228巻、第7
70頁(1971) )で高速液体クロマトグラフィー
を行って未反応DNAを除き、さらにエタノール沈澱に
よりブロープを精製した。
1)で調製した5′−アミノへキシルホスホールアミデ
ートーD N A 150pmoleを熔解した0.
01M リン酸カリウム緩衝液(pH7.5)50μl
に、(2)で調製したサクシニミジル−2,4−ジニト
ロフェニルーξ一カプロン酸50nmole ヲ含むN
,N−ジメチルホルムアミド50μlを加え、20℃、
20時間反応させた。反応後RPC−5カラム(アプラ
イド・バイオシステム )を用いる公知の方法(R.L
.ピアソン(R.L.Peason)ら、パイオケミカ
ル エト バイオフィジカ アクタ(Biochem.
Biophys. Acta) 、第228巻、第7
70頁(1971) )で高速液体クロマトグラフィー
を行って未反応DNAを除き、さらにエタノール沈澱に
よりブロープを精製した。
3tpの ・ゞ性の測
反応溶液中に含まれるsip放射活性の測定は、反応溶
液全量(150μ1)をキシレン系液体シンチレークA
CSH (アマシャム・ジャパン、東京)5mlを含む
ミニバイアル中で激しく攪拌した後、液体シンチレーシ
ョンカウンター(バンカード、旧NAXI TRI−C
ARB 4000)を用いて5分間計測で行った。
液全量(150μ1)をキシレン系液体シンチレークA
CSH (アマシャム・ジャパン、東京)5mlを含む
ミニバイアル中で激しく攪拌した後、液体シンチレーシ
ョンカウンター(バンカード、旧NAXI TRI−C
ARB 4000)を用いて5分間計測で行った。
枚婆旦凡人二遠足
種々の濃度に希釈した検体D N A (n=6) 、
2ngの′32P標識DNAプローブ、2ngのジニト
ロフェニルーDNAプローブ、IQOngのサケ糟子の
単鎖DNA, 0.15M塩化ナトリウム、1mM
ED丁Aおよび0.1%ウシ血清アルブミンを含む、0
.1Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH 7. 0) ,
0.15m1を65℃、16時間保温した。 室温に戻
した後、ウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血清アルプ
ミン) IgG不溶化ポリスチレンボールを1個添加し
、30℃、5時間反応させた。 ボールを0. 15M
塩化ナトリウム、1 mM EDTA及び0.1%ウシ
血清アルブミンを含む0.1iリン酸ナトリウム緩衝液
(pH 7.0) 2mlで2回洗浄した後、1 5
0r+moleのジニトロフエノールーしリジン(東
京化成工業、東京)を溶解した、0. 15M塩化ナト
リウム、1 mM EDT八及び0.1%ウシ血清アル
プミンを含む0. 1 M リン酸ナトリウム緩衝液(
pH 7. 0 ) 0.15ml中で30℃、2時間
反応させた。
2ngの′32P標識DNAプローブ、2ngのジニト
ロフェニルーDNAプローブ、IQOngのサケ糟子の
単鎖DNA, 0.15M塩化ナトリウム、1mM
ED丁Aおよび0.1%ウシ血清アルブミンを含む、0
.1Mリン酸ナトリウム緩衝液(pH 7. 0) ,
0.15m1を65℃、16時間保温した。 室温に戻
した後、ウサギ(抗ジニトロフェニルーウシ血清アルプ
ミン) IgG不溶化ポリスチレンボールを1個添加し
、30℃、5時間反応させた。 ボールを0. 15M
塩化ナトリウム、1 mM EDTA及び0.1%ウシ
血清アルブミンを含む0.1iリン酸ナトリウム緩衝液
(pH 7.0) 2mlで2回洗浄した後、1 5
0r+moleのジニトロフエノールーしリジン(東
京化成工業、東京)を溶解した、0. 15M塩化ナト
リウム、1 mM EDT八及び0.1%ウシ血清アル
プミンを含む0. 1 M リン酸ナトリウム緩衝液(
pH 7. 0 ) 0.15ml中で30℃、2時間
反応させた。
反応後溶液150μl全量をとり、標識DNAプロープ
の3zP放射活性を測定した。 結果を第2図に示す。
の3zP放射活性を測定した。 結果を第2図に示す。
比較例 2
検体用DNA,ジニトロフエニルDNAプロープ、ツ2
P標11DNAプローブおよびウサギ(抗ジニトロフェ
ニルーウシ血清アルブミン)■gG不溶化固相の調製は
実施例1の方法に従った.3tp ・活 の測 各ポリエスチレンボールに結合した32P標識DNAプ
ロープの放射活性の測定は、ポリスチレンボールを液体
シンチレータを含むミニバイアルに入れ、実施例と同様
の条件で計測を行った。
P標11DNAプローブおよびウサギ(抗ジニトロフェ
ニルーウシ血清アルブミン)■gG不溶化固相の調製は
実施例1の方法に従った.3tp ・活 の測 各ポリエスチレンボールに結合した32P標識DNAプ
ロープの放射活性の測定は、ポリスチレンボールを液体
シンチレータを含むミニバイアルに入れ、実施例と同様
の条件で計測を行った。
艙淋』ひレ口填乳定
種々の濃度に希釈した検体D N A (n=6) 、
2ngの0P標識DNAブローブ、2ngのジニトロフ
ェニルーDNAプローブ、100ngのサケ精子の単鎖
DNA,0.15M塩化ナトリウム−1mMEDTAお
よび0.1%ウシ血清アルプミンを含む、0.1阿リン
酸ナトリウム緩衝液(pH 7.0) 0.15mlを
65℃、16時間保温した. 室温に戻した後、ウサギ
(抗ジニトロフエニルーウシ血清アルブミン) IgG
不溶化ポリスチレンボールを1個添加し、30℃で5時
間反応させた. ポリスチレンボールを0.15M塩化
ナトリウム、1mM EDTA及び0.1%ウシ血清
アルプミンを含む0.1M リン酸ナトリウム緩衝液(
pH 7.0) 2mlで2回洗浄した後、ポリスチ
レンボールに結合した2Zpの放射活性を測定した。
結果を第2図に示す。
2ngの0P標識DNAブローブ、2ngのジニトロフ
ェニルーDNAプローブ、100ngのサケ精子の単鎖
DNA,0.15M塩化ナトリウム−1mMEDTAお
よび0.1%ウシ血清アルプミンを含む、0.1阿リン
酸ナトリウム緩衝液(pH 7.0) 0.15mlを
65℃、16時間保温した. 室温に戻した後、ウサギ
(抗ジニトロフエニルーウシ血清アルブミン) IgG
不溶化ポリスチレンボールを1個添加し、30℃で5時
間反応させた. ポリスチレンボールを0.15M塩化
ナトリウム、1mM EDTA及び0.1%ウシ血清
アルプミンを含む0.1M リン酸ナトリウム緩衝液(
pH 7.0) 2mlで2回洗浄した後、ポリスチ
レンボールに結合した2Zpの放射活性を測定した。
結果を第2図に示す。
本発明による実施例の測定限界は0.9pg (50a
mole =5 x 10−17a+ole)であった
。従来法である比較例に比して、バックグラウンドが約
1/3に減少し、3倍の感度向上が認められた。
mole =5 x 10−17a+ole)であった
。従来法である比較例に比して、バックグラウンドが約
1/3に減少し、3倍の感度向上が認められた。
以上、説明したように、本発明は従来サンドインチ法で
測定しえた核酸を、より高感度に測定しうる方法を提供
するものである.
測定しえた核酸を、より高感度に測定しうる方法を提供
するものである.
第1図及び第2図は、本発明の実施例、及び比較例のD
NA測定における検量線である。横軸は、測定対象のD
NA量、縦軸に測定値C2P放射活性)を示した。 特許出願人 石川 栄治(ほか1名)
NA測定における検量線である。横軸は、測定対象のD
NA量、縦軸に測定値C2P放射活性)を示した。 特許出願人 石川 栄治(ほか1名)
Claims (1)
- (1)下記の(A)、(B)および(C)工程を包含す
ることを特徴とする特異的核酸の の測定法。 工程(A):被検液中の測定すべき特異的 核酸と2種以上のプローブを反応せしめ 担体上にプローブと測定すべき核酸から なる複合体を結合せしめる工程。 工程(B):担体から前記複合体を含む成 分を解離させる工程。 工程(C):該成分量を測定する工程。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP4957589 | 1989-02-28 | ||
| JP1-49575 | 1989-02-28 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH02291300A true JPH02291300A (ja) | 1990-12-03 |
| JP2837429B2 JP2837429B2 (ja) | 1998-12-16 |
Family
ID=12835011
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP11485389A Expired - Fee Related JP2837429B2 (ja) | 1989-02-28 | 1989-05-08 | 高感度特異的核酸の測定法 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP2837429B2 (ja) |
-
1989
- 1989-05-08 JP JP11485389A patent/JP2837429B2/ja not_active Expired - Fee Related
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP2837429B2 (ja) | 1998-12-16 |
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Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |