JPH0286781A - 新規な一本鎖ファスミドベクターおよびストレプトマイセスおよび他のアクチノマイセス類を形質転換する方法 - Google Patents

新規な一本鎖ファスミドベクターおよびストレプトマイセスおよび他のアクチノマイセス類を形質転換する方法

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JPH0286781A
JPH0286781A JP1204557A JP20455789A JPH0286781A JP H0286781 A JPH0286781 A JP H0286781A JP 1204557 A JP1204557 A JP 1204557A JP 20455789 A JP20455789 A JP 20455789A JP H0286781 A JPH0286781 A JP H0286781A
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streptomyces
dna
plasmid
coli
phasmid
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JP1204557A
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English (en)
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Jeffrey T Fayerman
ジェフリー・トビン・フェイヤーマン
Richard K Stanzak
リチャード・カール・スタンザック
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Eli Lilly and Co
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Eli Lilly and Co
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/74Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
    • C12N15/76Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Actinomyces; for Streptomyces

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 [産業上の利用分野コ ストレプトマイセス(S Lreptomyces)お
よび近縁のアクチノマイセス(act inomyce
te)1mの菌のような産業上有用な微生物に組換えD
NA技術を適用するには有効な遺伝子クローニング法と
形質転換法か必要である。プラスミドによるプロトプラ
ストのポリエチレングリコール(PEG)誘導形質転換
により、幾つかのストレプトマイセス種および近縁属の
種の遺伝子クローニング法が発達した。
即ち、アセパルら(Acebal、  FEMS Mi
crobi。
1、Lett、35ニア9 82,1986)はラクタ
ム系抗生物質産生菌S、ワタヤメンシス(S、wada
yamens is)の形質転換法について記載し、ビ
ブら(Bibb)、ネイチャー(N ature)、2
74 : 398−400(1978)はストレプトマ
イセスをプラスミドD N Aで高頻度に形質転換する
ことについて記載し、ランペル(Lampel)および
ストロール(Strohl)ら、アプライド・アンド・
エンピロメンタル・マイクロハイオロ’; −(A p
pl、 E nviron、 M 1crobio1.
 )、51: 126−131(1986)はアントラ
サイクリン産生ストレプトマイセスの形質転換およびト
ランスフェクションについて記載し、マツ/マ(Mat
sushima)およびバルゾ(B altz)ら、ジ
ャーナル・オブ・バクテリオロジー(J、Bacter
iol、 )、+63 : 180−185(1985
)はSアンホフy’yエンス(amboracienc
e)およびS、フラディエ(fradiae)の効率的
なプラスミドによる形質転換について記載し、ヤマモト
ら(Y amam。
to)、J 、 A nt 1biot、、39 : 
1304−1313(1986)はS、エリスレアス(
erythraeus)の形質転換について記載し、ビ
ドコソクら(P 1dcock)、アプライド・アンド
・エンピロメンタル・マイクロバイオロジー(Δpp1
. E nviron、 M 1crobio1. )
、50 : 693−695(] 985)はサーモモ
ノスポーク0フスカ(T hermomonosupo
ra fusca)プロトプラストの形質転換について
記載し、マツシマら(Matsushima)、ジャー
ナル・オブ・ハクテリオロシー(J 、 B acte
riol、 )、169 : 22982300(19
87)はアミコラドブシス(ノカルデイア)・オリエン
タリス(Amycolatopsis(Nocardi
a)oriental is)の形質転換について記載
している。このように、ストレプトマイセスの様々な種
、および株、並びに他のアクチ/マイセス属の菌の形質
転換が達成されているか、多くの場合、形質転換頻度が
かなり低い。形質転換頻度の低さには、DNA取り込み
の効率の低さ、DNA取り込み後の制限酵素消化、また
はプロトプラスト調製および/またはその再生の困難さ
なと、様々な理由がある。
しかしながら、上記した、二本鎖DNAを用いるプロト
プラスト形質転換法に関連した幾つかの困難が、ストレ
プトマイセスおよび近縁の属の多数の種への組換えDN
A法の適用を妨げていた。
大多数のストレプトマイセスはプラスミド形質転換およ
びファージ感染を著しく減少させ得る制限酵素を複数個
産生ずる[コックス(Cox)およびバルン(Balt
z)ら、ジャーナル・オブ・バクテリオロジー(J 、
 B acteriol、 )、159:499−50
4(1984);ロモプスカヤ(L movskaya
)、マイクロバイオロジカル・レビューズ(M 1cr
obiol。
Rev、)、44:206 229(1980): マ
クヘ二一(McHenney)およびバルン(Balt
z)ら、ジャーナル・オブ・バタテリオロジ−(J、B
acteriot、 )、170 : 2276−22
82(1988);およびエンジェル(Engel)、
アプライド・アンド・エンピロメンタル・マイクロバイ
オロジー(Appl、 and E nviron、 
M 1crobio1. )、53 : l−3(19
87)]。マッンマ(Matsushima)およびバ
ルン(Baltz)ら、ジャーナル・オブ・バクテリオ
ロジー(JB acteriol、 )、163 : 
180−185(1985)、チャタ−(Chater
)およびワイルド(Wilde)ら、ジャーナル・オブ
・ジェネラル・マイクロジイオロジ−(J 、G en
、 M 1crobio1. )、116:323−3
34(1,980);チャタ−(Chater)および
ワイルド(Wilde)ら、ジャーナル・オブ・バクテ
リオロジ−(J 、 B acteriol、 )、1
28:644−688(1976);および、チャタ−
(Chater)およびチャタ−(Chater)ら、
ジャーナル・オブ・ジェネラル・マイクロジイオロ)−
(J、Gen。
M 1crobio1. )、109 : 181i8
5(1978)参照。制限酵素に起因する問題の解決に
は、しばしば、プラスミドDNAの効率的な取り込みお
よびプロトプラストの再生において厳格な工程が要求さ
れる。制限酵素の発現が最小となる細胞増殖の生理学的
条件下では、有効なりNAの取り込み、プラスミドの複
製およびプロトプラスとの再生が阻害されることが多い
これらの困難の解決に向けた幾つかの試みが報告されて
いる。1つの試みは欧州特許出願No、Q281356
(1988年9月7日公開)に記載のごとく、遺伝子ク
ローニングおよび伝達(トランスファー)にファージの
形質導入系を用いて制限を部分的に阻害することである
。形質導入系では、形質導入DNAを包み込んだファー
ジ粒子が細胞に付着してDNAを注入することにより、
プロトプラストを使用せずに無傷の細胞に形質を導入を
することができる。4!!(傷の細胞はプロトプラスト
よりも広範な培養条件、特にインキュベーション温度に
耐えることかできるであろう。多くの宿主の制限系は、
インキュベーション温度が増殖至適温度から変位するに
つれて低活性となるので、無傷の細胞を用いる形質導入
系を使用し、インキュベージコン温度を変化させること
により、宿主の制限酵素の影響を減少することができる
かもしれない。さらに、感染の多重度(m、 o、 i
、 )を高め、細胞への形質導入DNAの導入量を増大
することを、宿主制限系の制圧に利用することかできる
であろう。しかしながら、この系には、そのようなファ
ージ感染を受は易い宿主細胞のみを有効に形質導入し得
るという制限がある。欧州特許出願No、028135
6に記載の形質導入系では、バクテリオファージFP4
3  DNAの1セグメント(高頻度形質導入(hig
h frequency transduction)
から、hnと称する)をプラスミドplJ702にクロ
ーニングしている。得られたプラスミドpRHB101
は線状コンカテマーとして効率的にFP43ファージの
頭部に詰め込まれ、有効な形質導入粒子を形成する。
マツシマら(Matsushima)、モレキュラー・
アンド・ジェネラル・ジエネティクス(Mo1. G 
en。
G enet、 )、206 : 393−400(1
987)が用いたもう1つの制限問題の解決法は、形質
転換可能な幾つかの制限系を欠失したストレプトマイセ
ス・フラディエ突然変異体を開発する方法である。スト
レプトマイセス・フラディエは、マクロライド抗生物質
チロシンの生産に用いられる産業上重要な微生物である
。遺伝子クローニングの宿主としてS、フラディエを発
展させる過程で、コックス(Cox)およびバルン(B
altz)、ジャーナル・オブ・バタテリオロジー(J
 、 B acteriol、 )、159:499−
504(1984)および、マツシマ(Matsush
ima)およびバルン(Baltz)ら、ジャーナル・
オブ・バクテリオロシ−(J 、 B acterio
l、 )、163: 180−185(198,5)は
S フラディエが、バクテリオファージDNAおよびプ
ラスミドDNAの各々に対し、強力な制限系を発現する
ことを見いだした。他の産業上重要なストレプトマイセ
ス種についても同様に高度の制限性カ見イ出された。し
たかって、ヘテロローガスな供給源から得たDNAをS
、フラディエのように高い制限株に有効にクローニング
するために、マツシマ(Matsushima)および
バルン(B altz)ら、モレキュラー・アンド・ジ
ェネラル・ジェネティクス(M。
1、 G en、 G enet、 )、206 : 
313−400(1987)は1またはそれ以上の制限
酵素系を欠く突然変異体を開発した。この方法に関連す
る重要な問題は、そのような突然変異体を株/株に基づ
いて開発しなければならず、そのような突然変異体の開
発および選択は簡単ではなく、非常に長期間を要し、多
くの選択工程が要求されるという点である。例えば、マ
ツシマら(Matsushima)、モレキュラー・ア
ンド・ジェネラル・ジエネティクス(Mo1. G e
n、 G enet、 )、206 + 392−40
0(L987)は1つの修飾系の喪失に伴い、4つの別
々の形質転換効率を増大させる、突然変異の4つの初期
ラウンド、3つの修飾系(およびおそらくは制限系)の
喪失をも°たらす、突然変異の第5ラウンド、および形
質転換効率を大きく増大させる突然変異の最終ラウンド
について記載している。
これらは野生型S、フラディエ株が5つ以上の機能的な
制限系を発現していることを示唆するものである。
1つの実施態様として、本発明は宿主細胞の制限系を迂
回するよう作用し、ストレプトマイセスの様々な種間、
および大腸菌とストレプトマイセスの種間でのDNA伝
達を可能ならしめる新規な一重鎖DNAベクターを含む
ものである。これらのベクターはファージ粒子に詰め込
まれ(パッケージングされ)、細胞膜に融合し、DNA
を伝達させることもできる。これらのクローニングベク
ターは2機能性であり、ストレプトマイセスのtg製製
産点例えば、5CP2宜−oriまたはplJlol 
−ori)と大腸菌の複製起点の両者を含有している。
このように、本発明によればストレプトマイセスの多く
の種間、またはその他の幾つかのアクチノマイセス属、
および大腸菌の間での遺1云子伝達が行える。
多くの1本鎖DNAベクターが報告されている。
これらのベクターを表1に総括する。
表1 ベクター        文献または供給業者pEMB
Lシリーズ pB 1uescript pB 1uescribe rBBlol、  rBB103 pπ18.pπ19 pKIJN9.  pKUN19 pGBT518. pGBT519 pGBTT13 pYK331.  pYK332 pYK333. pYK335 YK336 デンテら(Dente)、ヌクレイ/り・ア/ノズ・リ
サーチ(Nucl、 Ac1ds、 Res、 )、1
1 : 1645−55(19ストラタジーン(Str
aLagene)、カリフォルニア92037、う・ジ
コラ、ノース・トレイ・パインズ・ロード11099番 バラニー(Barany)、マイクロバイオメジ−(M
icrobiology)、51 : 125−129
(1982)メッドら(Mead)、タンパク工学(P
rotein Engineering)、l : 6
7−74 ;ファルマシア(Pharmacia)、モ
レキュラー・バイオロジー・デイビジョン・ビス力タウ
ェイ、二ニー〇シャーシー08854からpTZ18R
およびpTZ19Rとしても入手可。
コニングズら(Konings)、Methods i
n Enzymology)、153 : 12−34
 ;欧州特許出願第86201252゜3号 ゴールド・バイオテクノロジー(Gold Biote
chnology)、ミズーリ63110、セント・ル
イス、オークランド・アベニュー5050! 欧州特許出願第84112724.4号表1に記載の1
本鎖ベクターは以下の使用のために構築された・クロー
ニングおよびジデオキシDNA配列決定Lサンガーら(
S anger)、ジャーナル・オブ・モレキュラー・
バイオロジー(J、Mo1B iol、 )、143 
: 161−178(1980)]、部位特異的突然変
異誘発[シラー(Zoller)およびスミス(Smi
th)ら、ヌクレイツク・アシッズ・リサーチ(N u
cl、 A cids、 Res、 )、10:648
7−6500(1982)]、S1マツピング[シリバ
ートら(C1liberto)、ジーン(Gene)、
22:95113(1983)]、mRNAクローニン
グ[)−イデソカ−(Heidecker)およびメッ
シング(Messing)ら、ヌクレイツク・アシッズ
・リサーチ(Nucl、 A cids、 Res、 
)、11 : 4891−4906(1983)]、ク
ローニングしたp N Aの大腸菌での発現[スロコン
ベら(S locombe)、7’ロシーデイングズ・
オブ・ナショナル・アカデミ−・オブ・サイエンシイー
ズUSA(Proc、Natl、Acad、Sci。
USA)、79・5455−5459(1982)]、
1本鎖重鎖プリタイゼーションブローブの生産[ヒユー
(Hu)およびメツ7ング(Messing)、ジーン
(Gene)、17 : 271−277(1982)
]、RNAのへテロ二重鎖分析およびインビトロでの転
写[メノド(Mead)ら、タンパク工学(Prote
in Engineer ing)、1 : 67−7
4(1986)]。表1の一本鎖ベクターのどれを用い
てもストレプトマイセス、他のアクチノマデユラ属およ
び/または大腸菌を形質転換し、または、し得ることは
示唆されていない。バラニー[B arany、マイク
ロバイオロジー(M icrobiology)、51
 : 125−129(1982)]によって記載され
たrBBlolおよびfBB102ベクターをストレプ
トコッカス・ニューモニエを用いる形質転換実験に用い
た。しかしながら、fBBlolまたはfBB103ベ
クターの一本鎖DNAおよび二本鎖DNAの形質転換効
率を比較すると一本鎖DNAを用いて得られるストレプ
トコッカス・ニューモニエ形質転換効率は、二本鎖DN
Aを用いて得られるそれより、50100倍低かった。
即ち、fBBlolおよびfBB103を用いてバラニ
ーが示した結果は、形質転換において、一本鎖DNAベ
クターは二本鎖DNAベクターよりも有用性が低いこと
を示唆するものである。
これら、従来の一本鎖ベクターおよびその用途と対照的
に本発明のベクターは、ストレプトマイセスのプラスミ
ドベクター、大腸菌のプラスミドベクター、および大腸
菌のバクテリオファージの新規なハイブリッドである。
これらのベクターはストレプトマイセスおよび大腸菌の
両方の複製起点を含有するので、ストレプトマイセスお
よび大腸菌について2機能性を有している。最後に、本
発明の一本鎖ベクターは、ストレプトマイセス宿主細胞
の制限システムを迂回し、他の方法では有用な形質転換
頻度で形質転換され得ないストレプトマイセスの高度の
制限株および池の生物に有効にDNAを伝達すると思わ
れる。これらの一本鎖ベクターはストレプトマイセスを
、二本鎖DNAを用いて得られる頻度よりも高頻度で、
または少なくとも同等の頻度で形質転換することができ
る。
[課題を解決するための手段] 本発明はストレプトマイセスのみならずアクチノマイセ
ス科全体の様々な微生物並びに大腸菌に用いられる、一
本鎖DNAによる形質転換または形質導入を介する遺伝
子伝達系のための新規なベクターおよび方法を提供する
ものである。アクチノマデユラ科の微生物は、例えばス
トレプトスボランギウム(S treptospora
ngium)、アクチップラン(Actinoplan
es)、ノカルデイア(Nocardia)、アミコラ
ドブシス(A mycolatopsis)、サツカロ
ポリスポラ(S accharopolyspora)
、アルスロバクタ−(A rthrobacter)、
チャイニア(Chainia)、ストレプトバーチシリ
ウム(S treptoverticillium)、
マイクロビスボラ(M 1crobispora)、マ
イクロコツカス(M 1crococcus)、マイク
ロテトラスポラ(Microtetraspora)、
コリネバクテリウム(Corynebacterium
)、アクチノマデユラ(A at inomadura
)およびマイクロモノスポラ(M icromonos
pora)を包含するがそれらに限定されない。この一
本鎖DNAで仲介される遺伝子伝達系は宿主細胞の制限
系を迂回し、遺伝子伝達に有効であると思われる。
本発明はストレプトマイセスおよび曲の宿主1111胞
内で使用するクローニングベクターを提供するものであ
る。ストレプトマイセスおよび他のアクチ/マイセスを
も含む他の抗生物質産生性生物における組換えDNA法
の開発および利用は適当なりローニングベクターが手に
入るか否かにかかつている。この開発は、現在、利用可
能なストレプトマイセスおよび他の抗生物質産生性生物
の制限系を迂回し、有用な頻度で生物を形質転換し得る
ベクターの数か非常に少ないという理由からかなり遅れ
ている。本発明は、−本漬ブラスミドまたはファスミド
ベクターか宿主細胞の複数の制限系を回避することがで
き、ストレプトマイセスの高度の制限株をも含む、高度
に制限性の宿主細胞系への遺伝子伝達効率を増大し得る
ということを初めて証明した点で有用であり、とりわけ
重要である。本発明はそのような遺伝子の伝達に適した
ベクターおよび宿主の数を大幅に拡張した。
本発明のベクターは、小さく、多方面に利用可能であっ
て、多くのストレプトマイセス種およびこれまで形質転
換し得なかった多くの他の微生物を形質転換し、〕y択
することができるので、特に有用である。ストレプトマ
イセスは、臨床上重要な抗生物質の半数以上を産生じて
おり、商業上重要な菌類である。本発明はこの工業上重
要なグループのための、新規で有用なりローニングシス
テムおよびベクターを提供し、既知の抗生物質の収率を
増大すると共に、新規な抗生物質、抗生物質誘導体、あ
るいは神々の哺乳類タンパク質産物など、その池の有用
な遺伝子産物を製造するための遺伝子クローニングを可
能にするものである。
本明細書で開示した本発明の目的に従い、以下のごとく
語句を定義する。
抗生物質:微生物によって産生され、天然のままで、あ
るいは制限された1疹飾の下で、他の微生物または真核
細胞の成長を阻害するか死滅させる物質。
抗生物質生合成遺伝子ニー次代謝産物を抗生物質に変換
する工程に必要な酵素活性または池の活性をコードして
いるD N Aセグメンj・。
抗生物質生合成経路ニー次代謝産物を抗生物質に変換す
る工程に必要な抗生物質生合成遺伝子の完全な1組。
抗生物質耐性付与遺伝子゛ある抗生物質に対する耐性を
付与する酵素活性または他の活性をコードしているDN
Aセグメント。
AmR・アブラマインン耐性表現型またはそれを付与す
る遺伝子。
ApR:アンビシリン耐性付与表現型またはそれを付与
する遺伝子。
COS :ファージDNAの詰め込み(パッケージング
)中に切断される特殊なファージの粘着末端。
コスミド:ファージλCOS部位が挿入されており、イ
ンビトロでプラスミドDNAをファージカプシドに詰め
込むことができるプラスミド。
コ轟1云子ライフ゛ラリ−またはゲノムライフ゛ラリー
特定の生物またはファージの実質上、全てのDNAを含
むDNAセグメントがクローニングされている1組の組
換えDNAクローニングベクターhn:高頻度形質導入
、ベクターに高頻度形質導入性を付与するファー/DN
Aセグメントをも敬味する。
感染(インフェクンヨン)・ファー/の複製工程であっ
て、ファージか宿主細胞に付善し、そのDNAを注入す
る、宿主細物はファージの復製および成熟を助け、つい
には溶解してファージ粒子を放出する工程。
oriニブラスミドの?QiJ起点。
ファージ・細菌のウィルス、バクテリオファージともい
う。
ファスミド:ファージ、またはプラスミドとして作用す
る組換えDNAベクター プラスミド・自律的に自己′fSf製可能な細胞外環状
DNA0 組換えDNAクローニングベクター:1またはそれ以上
の付加的なりNAセグメントを付加し得る、または既に
付加されているDNA分子からなる自律的に複製可能ま
たは組み込み可能な物質であって、プラスミドを含むか
それに限定されない。
レプリコン DNAか復製されるケ/ム弔位であって、
複製開始の起点を含有する。
制限断片=1またはそれ以上の制限酵素の作用によって
生成される線状DNA分子。
選択マーカー:自由に複製可能または組み込み可能な組
換えDNΔベクターに挿入され、該ベクターを含有する
宿主細胞を同定するのに役立つDNAセグメント。選択
マーカーには、抗生物質耐性付与遺伝子のほか、β−ガ
ラクトシダーゼ遺伝子などが含まれる。
感受性宿主細胞:特定の抗生物質に対する耐性を付与す
るDNAセグメントの存在なしには該抗生物質の存在下
に増殖し得ない宿主細胞。
シャトルヘクター・2fl類の宿主(例えば、大腸菌と
ストレプトマイセス)のための′fq製開始部位を3有
するように構築されており、いずれの宿主内でも外来の
配列を担持することができるブラスミ ド。
形質導入:ファージを介して受容宿主細胞にDNAを導
入し、遺伝型を変化させ、受容細胞に変化をもたらすこ
と。
(形質)導入完了体:形質導入された受容宿主細胞。
トランスフェクタント・ファージDNAによって形質転
換された受容宿主細胞。
形質転換体ニブラスミドまたはファスミドDNAによっ
て形質転換された受容宿主細胞。
形質転換: DNAを受容宿主細胞に導入して遺伝子型
を変化させ、その結果受容宿主細胞に変化をもたらすこ
と。
tsrR:チオストレプトン耐性表現型またはそれを付
与する遺伝子。
第1図はプラスミドpOJ160の制限部位および機能
地図である。
第2図はファスミドpo J 401の制限部位および
機能地図である。
第3図はコスミドpKC462aの制限部位および機能
地図である。
第4図はプラスミドplJ702の制限部位および機能
地図である。
第5図はプラスミドpOJ326の制限部位および機能
地図である。
第6図はプラスミドpo J 348の制限部位および
機能地図である。
第7図はプラスミドplJ352の制限部位および機能
地図である。
第8図はプラスミドpOJ355の制限部位および機能
地図である。
第9図はプラスミドpOJ361の制限部位および機能
地図である。
第10図はファスミドpOJ402の制限部位および機
能地図である。
第11図はプラスミドpOJ192の制限部位および機
能地図である。
第12図はファスミドpo J 405の制限部位およ
び機能地図である。
本発明は、 a)大腸菌内で機能的なレプリコン、 b)ストレプトマイセス内て機能的なレプリコン、 c) Fビリを有する大腸菌のフィラメント状バクテリ
オファージの複製起点および形態形成シグナルを含有す
るD N Aセグメント、およびd)感受性宿主細胞に
導入されたとき、少なくとも1個の抗生物質に対する耐
性を伝達するlまたはそれ以上のDNAセグメントを含
有する組換えDNAファスミドシャトルベクターに関す
るものである。
また、本発明は、上記ベクターによる形質転換体に関す
るものである。
本発明のベクターはストレプトマイセスベクター、大腸
菌ベクターおよび大腸菌バクテリオファージの新規なバ
イブリドである。例えば、ファスミドベクターpo J
 401またはpOJ402はストレプトマイセスおよ
び大腸菌の両者に由来するレプリコンを含有しているの
で、ストレプトマイセスおよび大腸菌内で自律的に複製
可能である。
その上、両微生物のための2機能性マーカーが存在して
いる(例えば、大腸菌およびストレプトマイセスの両方
に対するAmR)ので、便利な選択手段が得られる。さ
らに、バクテリオファージflの複製起点および形態形
成シグナルの存在により、この新規ベクターは一本鎖D
NAとしてインビトロで詰め込まれ得る。次いで、組換
えファスミドを用いてストレプトマイセス宿主細胞を形
質転換またはトランスフェクトすることができる。
ファスミドシャトルベクターpOJ401は約7kbで
あって、プラスミドpB Iuescript(ストラ
タジーンから、カタログNo、212201の下で入手
可能)から導かれ、とりわけ分子クローニングに好都合
な複数個の制限部位を有するポリリンカーを含有してい
る。ファスミドpOJ401の構築出発物質は以下のよ
うにして得ることができる。
プラスミドpOJ160は構築された株であって、ノー
ザン・リージョナル・リサーチ・ラボラトリーズ、イリ
ノイ61604、ペオリアに寄託され、そのストック・
カルチュアー・コレクションの一部となっているE、c
oli K 12  J M 109/pOJ160か
ら常法通り単離することができる。この株は受託番号N
RRL  B−18088(受託日:1986年7月2
9日)の下、該プラスミドの供給源および保存体として
、何人も入手可能である。プラスミドpOJ160の制
限部位および機能地図を添付の第1図に示す。本発明の
目的により、第1図および他の図面はすべて等尺で描か
れていない。rlFu製起点および形態形成シグナルは
、1acZ遺伝子およびポリリンカーと一緒にバクテリ
オファージM13mp19[インターナショナル・バイ
オチクノロシーズ・インコーポレイテノド(I B I
 )([nternational  B iotec
hnologies。
I nc、 )、コ不チカット06535、−’−、:
L−・ヘイブン、ウィンチエスタ−・アベニュー2フ5
番、P、O,Box9558からカタログNo、336
30として入手可能コ、またはファゲミド(phage
mids)pTZ18およびpTZ19[メッドら(M
ead)、タンパク工学(P rotein E ng
ineering)、1.6774(1986)]また
はファゲミドpB 1uescript(ストラタジー
ン)から導くことができる。
構築の便宜および容易さから、pB 1uescrip
tSK”由来の〜2.25kb AhaIII断片をプ
ラスミドpOJ160の〜4.5kb Xmn[/5a
lI(フレノウ)断片と結合(ライゲート)させた。E
、coliK12  XL−I  BlueSE、co
lj K12  JMI09および、ヤニッシュ・ペロ
ンらの表1(前掲)に記載されている他のE、coli
 K l 2誘導体をファスミドpOJ401DNAで
形質転換した。
ファスミドpOJ401は、直接的にはストレプトマイ
セス、他のアクチクマイセスおよび大腸菌のクローニン
グベクターとして有用であるが、本発明の範囲に含まれ
る誘導体ベクターの構築にも用いることができる。レプ
リコン、選択マーカーおよびその他の必要なプラスミド
機能を破壊しないことを条件として、pOJ160ポリ
リンカー内の部位をも含めて様々なファスミドpOJ4
01の制限部位をDNAセグメントの挿入に用いること
ができる。当業者ならば、特定のDNAの結合(ライゲ
ーション)および挿入にはどのような部位か有利である
かを理解し、容易に決定することができる。ファスミド
pOJ401を制限処理し、1またはそれ以上の抗生物
質耐性付与DNA断片(実施例16参照、ピクロマイシ
ン耐性をコードするDNA断片をpOJ401に結合さ
せる)、または既知の抗生物質の遺1云子、新規な抗生
物質または抗生物質誘導体の遺伝子、あるいは哺乳類タ
ンパク質などのなんらかの有用な他の物質の遺伝子と結
合させることかできる。
本発明のベクターは特定の選択マーカーの使用に限定さ
れない。使用可能な選択マーカーとして、アミカ/ン、
アブラマインン、クロラムフェニコール、コリスチン、
ジペカシン、エリスロマインン、ゲンタマイシン、ハイ
グロマイノン、カナマイシン、ネオマイシン、パロモマ
イシン、ポリミキシンB1リボメタマイフン、リファン
ピシン、スペクチノマイシン、テトラサイクリン、チオ
ストレプトン(サルフォマインン)、ツベラクチノマイ
シンおよびビオマイシン(カブレオマイシン)を挙げる
ことができる。
本発明のベクターはまた、大腸菌やストレプトマイセス
のプラスミドから得られる特定のレプリコンの使用に限
定されない。本発明のファスミドベクターで例示した大
腸菌の機能的レプリコンはプラスミドpBR322から
導かれたが、その他、%M1な三機能性ファスミドの生
産のための大腸菌レプリコン含有断片は、例えば、プラ
スミドpBR324[ポリバーら(Bolivar)、
ジーン(G ene)、4:121(1978)コ、P
BR325[ソベロンら(S oberon)、ジーン
(Gene)、9 : 287(1980)]等からも
得られる。
さらに、上記のベクターは、プラスミド5CP2宜から
導かれたストレプトマイセスのレプリコン5CP2束[
ビブ(Bibb)およびホップウッド(HopwoOd
)う、ジャーナル・オフ゛・ジェネラル・マイクロバイ
オロジー(J 、 G en、 M 1crobio1
. )、126・/127−442(1981)]また
はプラスミドp+J702から導かれたストレプトマイ
セスレプリコンpz702[キーサーら(K 1ese
r)、モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジエ不テイ
クス(Mo1. G en、 G enet、 )、+
 85 : 223−238(1982)]を含有する
が種々の既知のストレプトマイセスレプリコンを用いて
同様のベクターを構築することができる。表2には、包
括的ではないか、その他の機能的なストレプトマイセス
レプリコンを得ることかできるストレプトマイセスプラ
スミドの例を示す[ホップウッドら(Hopw。
od)、Meth、in Enzyme、、  153
 : l l 6−166(1987)]。当業者なら
ば、レプリコンの機能が破壊されない限り、全プラスミ
ドまたは一部を用いて本発明の例示ベクターを構築する
ことができるということを認めるであろう。表2には、
親レプリコンの供給株も示されている。
(以下余白) 表 2 ストレプトマイセスプラスミドプラスミド  
    1ノ(給源の株(親−レプリコン)SeF6 
    ストレプトマイセス・コエリカラーA3(2)
(S treptomyces coel 1colo
r)1)VEI JVI pUc1? ストしブトマイセス・へ不ス゛エラエATCC1458
5(S treptomyces venezucla
e)ストレプトマイセス・フエエクロモゲ不スNRRL
−3559(S trcptomyccs phaeo
chromogenes)ストレプトマイセス・ビオオ
ラセウスルーハー(S Lreptomyces vi
olaceusruber)SLPl ストレプトマイセス噛りビタンス (Streptomyces 1ividans)SL
Pl、 2 BT1 5VIII FJ103 ストレプトマイセス・リビダンス66’″1(S tr
eptomyces l 1vidans)ストレプト
マイセス・グリセオブル不ウス1Ps55066(S 
treptomyccs griseobrunneu
s)ストレプトマイセス・ベネス゛エラより5M407
55(S treptomyces venczuel
ae)ストレプトマイセス・グラニュロルーパーA39
912.13(S trepjomyces  gra
nuloruber)pT八へ001 ストレプトマイセス・ラヘンデュラエ1080(S t
reptomyces 1avendulae)表2(
続き) ストレプトマイセスプラスミドプラスミド  
    供給源の株(親−レプリコン)psRc+ −
6ストレプトマイセス・ロセオクロモケ竿ス5264(
S jreptomyces  roseohromo
)Henes)psLl     ストレプトマイセス
・ラベンテユラエKCC5O985(S trepto
myces 1avendulae)pAIG200 ストレプトマイセス・クリツマラスZ1NIET 43
686(S treptomyces chrysom
al 1us)ps+2765 ストレプトマイセス・フラディアエ5F765(S t
reptomyces rradiae)SK2 SG2 SG5 NMlo0 不トレプトマイセス・カス力エンシス〜lB273(S
treptomyces kasugaensis)ス
トレプトマイセス・ガンゲンシスDSM 2932(S
 treptomyces ghangensis)ス
トレプトマイセス・ガンゲンシスDSM 2932(S
 Lreptomyces ghangensis)ス
トレプトマイセス・バージニアエ (S treptomyccs virginiac)
本発明の組換えDNAファスミドシャトルベクターの使
用は、ストレプトマイセスまたは他のアクナノマイセス
類の単一の種または株に制限されるものではなく、アミ
ノサイクリトール、アンサマイシン、アントラサイクリ
ンおよびキノン、マクロライド、リンコサミドおよびス
トレプトグラミン、β−ラクタム、ポリエーテル等の抗
生物質、およびペプチド抗生物質または他の商業上重要
な生産物を産生ずる経済上重要な、制限性の、または非
制限性の多くのアクチクマイセス株宿主細胞の形質転換
にも用いることかできる。
アミンサイクリトール抗生物質を産生じ、本発明方法か
特に有用であって、本発明ベクターを導入することかで
きる好ましいストレプトマイセス煩宿主1111胞には
、例えば、ストレプトマイセス・カナマイセチカス(S
 treptomyces kanamyceticu
s)(カナマイシンm)、S、クレストマイセチカス(
Schrestomyceticus)(アミノンジン
)、S、グリセオフラパス(Sogriseoflav
us)(抗生物質MA1267)、S、ミクロスボレウ
ス(S 、 m1crosporeus)(抗生物質5
F−767)、S、リホンフィカス(S、ribosi
dificus)(抗生物質5F733)、S フラホ
ペルンカス(S 、 Navoperisicus)(
スペクチクマイシン)、S、スペクタビリス(S 、 
5pectabil 1s)(スペクチクマインン)、
S リモサス・ホルマ・パロモマインナス(S、rim
osus forma paromomycinus)
(パロモマインン類、カテヌリン)、S、フラティエ・
バー、イタリカス(S 、 fradiae var、
 1talicus)(アミノンジン)、S フルエン
シス・バー・フルエンシス(S 、 bluensis
 var、 bluensis)(プルエンソマインン
)、S、カテニューレ(S 、 catenulae)
(ノノテヌリン)、S、オリポレティキュリ・バー・セ
ルロフイラス(S、olivoreticuli va
r、cellulophilusXデストマインンA)
、S、ラベンテ゛ユーレ(Savendulae) (
不オマインン)、S アルホグリセオラス(S 、 a
lbogriseolus)(ネオマイシン頌)、Sア
ルプス・バー・メタマイシンス(S、albus va
rmetamycinus)(メタマイシン)、3  
ハイグロスコビノノス・バー・サガミエンシス(S 、
 hygroscopicus var、sagami
ensis)(スペクチクマイシン)、Sビキニエンシ
ス(S、bikiniensis)(ストレプトマイシ
ン)、S、グリセウス(S、griseus)(ストレ
プトマイシン)、S、エリスロクロモゲナス・バー・ナ
ルトエンシス(S 、 eryehrochromog
enes var、 narutoens 1s)(ス
トレプトマイシン)、S、フルエンシス(S 、 po
olensis)(ストレプトマイシン)、Sガルブス
(S 、 galbus)(ストレプトマイシン)、S
ラメウス(S 、 rameus) (ストレプトマイ
シン)、Sオリバセウス(S 、 ol 1vaceu
s)(ストレプトマイシン)、S、7 ンユxンシス(
S、mashuensis)(ストレプトマイシン)、
S バイグロスコピカス・バー・ノモ不ウス(S 、 
l+ygroscopicus var、 Iimon
eus)()\リタマインンm)、S、リモファシエン
ス(S、rim。
faciens)(テストマイシンA)、S、バイグロ
スコピカス・ホルマ・グレポサス(S 、 hygro
scopicusforma glebosus)(グ
レポマイシン)、S フラディエ(S、 fradia
e)(ハイフ゛リマインン類、ネオマイノン類)、S 
ニーロンジカス(S 、 eurocidicus)(
抗生物質A16316−C)、S、アクアカナス(Sa
quacanus)(N−メチルハイグClフインンB
)、Sクリスタリヌス(S 、 crystal l 
1nus)(ハへグロマイノン八)、S ノホリトエン
/ス(S 、 nobor i Loens 1s)(
ハイグロマイシン)、S バイグロスコピカス(S 、
 hygroscopicus)()λイブ0フイ/ン
頌、ロイカニ/ノン、ハイグロリンン)、S アトロフ
ァンエンス(S 、 atrofaciens)(ハイ
グロマイノン)、Sカスカスビナス(S 、 kasu
gaspinus)(カスツノマイノン)、S、カスガ
エンンス(S 、 kasugaensis)(カナマ
イシン類)、S ネトロブシス(S 、 netrop
sis)(抗生物質LL−AM31)、S リビタス(
S、1ividus) (リビドマインン類)、S、ホ
フエン/ス(Shofuensis)(セルドマイノン
複合体)、およびSカナス(S 、 canus) (
リホシルパロマミン)の細胞か含まれる。これらの抗生
物質を産生じ、本発明に有用なアクナノマイセス類(ス
トレプトマイセス以外)および他の生物には、例えば、
バシラス(Bacillus)の様々な種(種々のアミ
ノグリコ7ド類)、ミクロモノスポーラ(M icro
monospora)の様々な腫(ケンタマイソン類)
、サツカロポリスポーラ(Saccharopolys
pora)のL・l々な種(種々のアミングリコシド)
およびストレプトパーティシリウム・フラボベルンカス
(スペクチクマイシン)(S treptoverti
cillium flavopersicus(S p
ectinomycin))の細胞が含まれる。
アンサマイシン抗生物質を産生じ、本発明方法が特に有
用であって、本発明ベクターを導入するごとができる好
ましいストレプトマイセス類宿主細胞には、例えば、S
、コリンズ(S、collinus)(アンサトリエン
T頁、ナブトマイ/ンl)、S  シアストクロモケン
(S 、diastochromogenes)(アン
サトリエン類、ナプトマイ/ン類)、S ガルブス・亜
種・S グリセオスポラス(S 、 galbus 5
ubsp、 S 、 griseosporeus)(
ナブトマインンB)、S、ノ飄イグロスコピカス(S 
、 hygroscopicus) (ヘルビマイシン
)、S バイグロスコピカス・バー・ゲルタヌス・バー
9ノーハ(S、hygroscopicus var、
geldanus  var、 nova) (ケルダ
マインン類)、S、=ゲラス(S、nigel 1us
)(21−ハイドロキシ−25−デメチル25−メチル
チオプロトストレブトバリンン)、S リ7リエン/ス
(S 、 rishiriensis)(マイコトリエ
ン類)、ストレプトマイセスsp、E/784(Str
eptomyccs sp、 E / 784 )(ア
クタマイシン、マイコトリエン類)、ストレプトマイセ
スsp、 E 88 (S treptomyces 
sp、 E 88 )(マイコトリエン類)、S、スペ
タビリス(S 、 5pectabi 1is) (ス
トレプトバリシン類)、s、トリポフォラス(S 、t
olyp。
phorous) (トリポリマイシン)の細胞か含ま
れる。
これらの抗生物質を産生じ、本発明に有用なアクナノマ
イセス類(ストレプトマイセス以外)および他の生物に
は、例えば、ミクロモノスポーラの様々な種(アンサマ
イシン類)およびノカルデイア・メディトリアネ(リフ
ァマイシン)(Nocardia mediterra
nei(rifamycin))の細胞か含まれる。
アントラサイクリンおよびキノン抗生物質を産生じ、本
発明方法か特に有用であって、本発明ベクターを導入す
ることができる好ましいストレプトマイセス類宿主細胞
には、例えば、S カスビトサス(S、caspito
sus)(ミドマイシンA、 B、およびC)、S コ
エリカラー(S 、 coelicolor)(アクチ
ノロディン)、S、コエルレオルビデイカス(S。
coerulcorubidicus)(タウノマイ/
ン)、S ンアヌス(S 、 cyaneus)(’;
 l−リサルビンン)、S フラホグリセウス(S 、
 f lavogriseus)(ンアノサイクリンl
\)、S ノノリラウス(S 、 galilaeus
)(アクラシノアイシンΔ、オーラマイ/ン、およびス
ルフルマイジン)、S ランタヌス(S 、 1usi
Lanus)(ナプチリ/ノマイ/ン)、S、プセチカ
ス(S 、 peucet 1cUS)(クウ/マイン
ンおよびアトリアマイジン)、およびS バイオロクロ
モケン(S 、 violochromogenes)
(アルコマイジン)の細胞か含まれる。
マクロライド、リンコサミドおよびストレプトグラミン
抗生物質を産生じ、本発明方法が特に有用であって、本
発明ベクターを導入することができる好ましいストレプ
トマイセス類宿主細胞には、例えば、ストレプトマイセ
ス・ケレステイス(Streptomyces cae
lesjis)(抗生物質M188、セレスチセチン)
、S プラテンンス(S 、 platensis)(
プラテノマインン)、S ロノチェイ・バー・ホルビリ
ス(S、rochci var、volubilis)
(抗生物質′F263G)、8 へ不ズエラx (S 
、 venezuelae)(メチマイノン類)、S 
グリセオスポス(S 、griseofuscus)(
ハントリン)、S ブールホ不ンシス(S 、 nar
bonens is) (ジョサマイシン、ナルホマイ
シン)、Sフンシンジカス(S 、 fungicid
icus)(抗生物質NA181)、S グリセオファ
フェンス(S、grise。
raciens)(抗生物質PA133A、B)、S、
ロゼオシトレウス(S 、 roseocHreus)
(アルボサイクリン)、S プルネオグリセウス(S 
、 bruneogriseus)(アルボサイクリン
)、S、ロセオクロモゲネス(Sroseochrom
ogenes)(アルボサイクリン)、S、シ不ロクロ
モゲネス(S 、 c inerochromogen
es) (シネロマイシンB)、S アルプス(S 、
 albus)(アルボマイセチン)、S、コエルウス
(S 、 rel 1eus)(アルコマイ・シン、ピ
クロマイシン)、S、ロッチェイ(Srochei)(
ランカシジン、ポレリジン)、S、ビオラセオニケル(
S、violaceoniger)(ランカシジン、ホ
レリジン)、S、グリセウス(S 、 griseus
Xホレリジン)、S メゼウス(S 、 maizeu
s)(インゲラマイシン)、S、アルプス・バー・コイ
ルマイセチカス(S、albus  var、coil
myceticus)(コレイマイシン)、S、ミカロ
ファシエンス(S 、 mycarofaciens)
(アセチルロイコマイジン、エスピノマイジン)、S 
バイグロスコピカス(S、hygroscopicus
)(タイロシン)、S、グリセオスビラリス(S 、 
griseospiralis)(レロマイシン)、S
、ラベンジュレ(S、1avendulae)(アルト
ガマイシン)、S リモサス(S 、 rimosus
)(タイロシン、ニュートラマイシン)、Sデルタエ(
S 、 deltae) (デルタマイシン類)、S、
ファンジンジカス・バー・エスピノマイセチカス(S。
fungicidicus  var、espinom
yceticus)(ニスピノマイシン類)、S、フル
ジンジカス(S 、 furdicidicus)(ミ
デカマイシン)、S、アンホファ/エンス(Samob
ol’aciens)(スピラマイジン、)7C7マン
ジンD)、S エーロ/デイカス(S 、 euroc
 id 1cus)(メチマイシン)、S グリセオラ
ス(S 、 griseolus)(グリセオフラプス
)、S、フラポクロモゲ不ス(S 、 [1avoch
romogenes)(アマロマイシン、シンコマイレ
ン類)、S フィムブリアタス(S、fimbriat
usXアマロマイシン)、S、ファシキュラス(S 、
 fasciculus)(ア?CIフィシン)、S、
xリスレウス(S 、 erythreus)(エリス
ロマイシンff1U、S  アンチビオチカス(S :
antibioticus)(オレアンドマイシン)、
S、オリホクロモゲ不ス(S 、 of ivochr
omogenes)(オレアンドマイシン)、S スピ
ニクロモゲネス・バー°スラガエンシス(S 、 sp
inidhromogenes var、 surag
aoens is) (クジマイシン類)、S、キタサ
トエンシス(S 、 kitasatoensis)(
ロイコマイシンA3およびジョサマイシン)、S、ナル
ボ不ジンス・バー・ジョサマイセチカス(S 、 na
rbonens is var、 josamycet
icus)(ロイコマイノンA3、ジョサマイシン)、
S アルケンチオラス(S 、 albogriseo
lus)(ミコノマイシン)、S ビキニエン7ス(S
、bikiniensis)(チャルコマイシン)、S
 サーラタス(S 、 cirratus)(メチマイ
シン)、S シャカルテンシス(S、djakarte
nsis)にタマイジン)、S、ユーリーサーマス(S
 、 eurythermus) (アンコラマイシン
)、Sフラディエ(S 、 f radiae) (タ
イロシン、ラクテノシン、マイクロジン)、S ゴシキ
エンシス(S 、 g。
5hikiensis)(パンダマイジン)、S グリ
セオフラプス(S 、 griseof 1avus)
(アキュマイシン)、S ハルステシイC5、hals
tedii)(カルボマイシン)、Sテンダニ(S 、
 tendae) (カルボマイシン)、S、?クロス
ポレウス(S 、 macrosporeus)(カル
ボマイシン)、S サーモトレランス(S 、 the
rmotolerans)(カルボマイシン)、および
S、アルピレチキュリ(Salbireticuli)
(カルボマイ/ノンの細胞が含まれる。これらの抗生物
質を産生し、本発明に有用なアクナノマイセス類(スト
レプトマイセス以外)および他の生物には、例えば、ミ
クロモノスボーラ・Oザリア(ロイコマイシン)(M 
icromonosporarosaria(rosa
ramycin))の細胞か含まれる。
β−ラクタム抗生物質を産生じ、本発明方法が特に有用
であって、本発明ベクターを導入することができる好ま
しいストレプトマイセス類宿主細胞には、例えば、S、
リソブマニ(S 、 lipmanii)(ペニシリン
N17−メドキシセフアロスポリンC3A16884、
MM455 C)、およびMM l 3902)、S、
クラブリゲラス(S 、 clavuligerus)
(PA−32413−1、セファマイシンC,Al68
86B、クラプラン酸および他のグラバム類)、S、グ
リセウス(S 、 griseus)(セファマイシン
A1B)、S バイグロスコピカス(S 、 hygr
oscopicus)(テアセトキンセファロスポリン
C)、S、ワタヤメン/ス(S、wadayamens
is) (WS  3442D)、S、チャートレウシ
ス(S 、 chartreusis)(SF1623
セファマイシンAおよびB)、S、ヘテロモルファス(
S 、 heteromorphus)、およびS パ
ナX 7 シス(S、panayensis)(C20
81XセファマイシンAおよびB);S  シナモ不ン
シス(S、cinnamonens is)、S、フィ
ンブリアタス(S 、 fimbriatus)、S、
ハルステジ(S 、 halstedii)、S ロノ
チェイ(S 、 rochei)およびS、ピリドクロ
モゲネス(Sviridochromogenes)(
セファマイシンAXB);Sカトレヤ(S 、 cat
 t 1eya) (チェナマイ77);S、7ラボビ
レンス(S 、 Navovirens)、S、コラハ
ス(Sflavus)、S、フルホビリジス(S、 f
ulvoviridis)、およびS、ンオヤエンシス
(S 、 sioyaensis)(MM4550およ
び!v1M 13902)、S、アルケンチオラス(S
 、 argentcolus)(アスパレノマイジン
A、MM4550お、上ひMM1390);およびS、
オリバセウス(S 、olivaceus)(エピチェ
ナマイシンF、MM1780、MM4450、およびM
MI3902)の細胞が含まれる。これらの抗生物質を
産生じ、本発明に有用なアクナノマイセス類(ストレプ
トマイセス以外)および他の生物には、例えば、セファ
0スポリウム(Cephalospol ium)の様
々な種(種々のβ−ラクタム類)、ノカルデイア・ラク
タマジュランス(Nocardia lactamad
urans)、セファマインC(cephamycin
 C)およびペニシリウム(Penicillium)
の様々な種(種々のβ−ラクタム類)の細胞が含まれる
ヌクレオチド抗生物質を産生じ、本発明方法が特に有用
であって、本発明ベクターを導入することかできる好ま
しいストレプトマイセス類または池のアクチクマイセス
宿主細胞には、例えば、コリネバクテリウム・ミシガネ
ーゼpv、ラサイ(Corynebacterium 
michiganese pv、  rathai)(
ツニカマイシン同族体)、ノカルデイア・カシジダス(
Nocardia candidus)(ビラシフリン
)、S、アンチバイオティカス(S 、 antibi
oticus)(アラ−A)、S。
チャートレウシス(S 、 chartreusis)
(ツニカマイシン)、S、グリセオフラバス・バー・ス
リンゲエジンス(S 、 qriseoflavus 
var、 thuringiensis)(ストレプト
ビリダンス)、S、グリセオラス(S 、 grise
olusXシネフンギン)、およびS、リンスペリマイ
カス(S 、 1ysosuperiricus(ツニ
カマイシン)の細胞が含まれる。
ポリエーテル抗生物質を産生じ、本発明方法かを特に有
用であり、本発明ベクターを導入することができる好ま
しいストレプトマイセス類の好ましい宿主細胞には、例
えば、S、アルプス(S 、 albus)(A 20
4、A28695AおよびB1サリノマイシン)、S 
バイグロスコピカス(S 、 hygrosc。
picus)(A 218、エメリシト、DE3936
、AL20AXA29695A およびB、エテロマイ
シン、ジア不マイシン)、S、グリセウス(Sgris
eus)(ギルソリキシン)、S、コングロバタス(S
conglobatus)(イオノマイシン)、S、ユ
ーロシンジカス・バー・アステロシジカス(S 、 e
urocidicus var、asterocidi
cusXライドロマイシン)、Sラサリエンシス(S 
、 1asaliensis)(ラサロシド)、S、リ
ボシジフイカス(S 、 r 1bos id 1cu
s) (C’ノマイシン)、S、カカオ・バー・アラエ
ンシス(S 、 cacaoi var、asoens
isXリソセリン)、S、シナモネンシス(S、cin
amonensis)(モネンシン)、S オーレオフ
ァンエンス(S 、 aureof ac 1ens)
 (ナラジン)、S、ガリナリウス(S、gallin
arius)(RP 30504)、S、ロングウソデ
ン/ス(S 、 longwoodens 1s)(リ
ソセリン)、S フラベオラス(S 、 flaveo
lus)(CP38936)、S、ムタビリス(S、m
utabilis)(S11743a)、およびS ビ
オラセオニゲル(Sviolaceoniger)にゲ
リシン)の細胞が含まれる。
これらの抗生物質を産生じ、本発明に有用なアクナノマ
イセス類(ストレプトマイセスを除<)オ・よひ池の微
生物には、種々のポリエーテルを産生ずるアクチ/マジ
ュラ(A at inomadura)、タクチクスボ
ランギウム(Dactinosporangium)、
ノカルデイアおよびストレプトベルチシリウム(S t
reptoverticillium)の細胞が含まれ
る。
ペプチド抗生物質を産生じ、本発明方法が特に有用であ
り、本発明ベクターを導入することかできる好ましいス
トレプトマイセス類、または近縁の属、例えば、バ/ル
ス、ノカルデイア、アミコラドブシスおよびアクチップ
ランの宿主細胞には、例えば以下のような微生物の細胞
が含まれる;アミコラドブシス、・オリエンタリフ、 
(Amycolatopsis orientalis
)およびS、ハラノシエンシス(S 、 harano
mochiensis)(バンコマイシン)、ノカルデ
イア・カンジダス(Nocardia candidu
s)(A−35512、アボパルジン)、ノカルデイア
・ルリタ(Nocardia 1urida)(リスト
セチン)、S、アンチバイオティカス(S 、 ant
 1biot 1cus)(アクチクマイシン)、S、
アクレウス(S 、 aureus) (チオストレプ
トン)、S、カヌス(S 、 canus)(アンフォ
マイシン)、S、プリスチナエスピラリス(S 、 p
ristinaespiralls)(プリスタマイシ
ン)、S、ロゼオスポラス(S。
rosesporusXA 21978 Cの様なりボ
ペプチド)および3.エブロスボレウス(S 、 eb
urosporeus)(LL−AM374)、S、バ
ージニアx (S 、 virginiae)(A41
030)およびS トヨ力エンシス(S、toyoca
ensis)(A 47934 )、アクチップラン・
ミソリエンシス(Actinoplanes m1ss
ouriensis)(A4696、アクチプラン)、
およびアクチップラン・ティコマイセチカス(Acti
noplanes teichomycet 1cus
)(ティコマイシンあるいはティコプラニン)。
他のタイプの抗生物質を産生じ、本発明方法が特に有用
であって、本発明ベクターを導入することかできるスト
レプトマイセス類の株の好ましい宿主細胞には、以下の
微生物の細胞が含まれる。
様々な種のストレプトマイセス(S treptomy
ces)(アミノ酸同族体、例えばサイクロセリン)、
S、コエリカラ−(S 、 coel 1color)
 (シクロペンクン環を含有、例えばメチレノマイシン
A)、S、エリスロクロモケン(S 、 erythr
ochromogenes)(シクロペンクン環を含有
、例えばサイコマイクン)、S、バイオラセオルーバ−
(S 、 violaceoruber)(シクロペン
タン環を含有、例えばメチレノマイシンA)、Sべ不ズ
エラx (S 、 venezuelae) にトロ含
有、例えばクロラムフェニコール)、S、グリセウス(
S、griseus)(ポリエン類、例えばカンクンジ
ン)、Sノドサス(S 、 nodosus)(ポリエ
ン類、例えばアンファテリシンB)、S ヌルセイ(S
 、 norsei) (ポリエンL例えばニスタチン
)、S、オーレオファシエン(S 、 aureofa
diens)(テトラサイクリン類、例えばテトラサイ
クリン、クロルテトラサイタリン、デメチルテトラサイ
クリン、およびデメチルクロルテトラサイクリン)およ
びS、リモサス(S 、 rim。
5US(テトラサイクリン、例えばオキンテトラサイク
リン)。
本発明に係るベクターを特に有用に使用でき、形質転換
できる、その他の好ましいストレプトマイセスの好まし
い宿主細胞には、例えば以下のような微生物の細胞が含
まれる 、S、グラニュロルーバ−(S 、 gran
u 1oruber)、S、リビタンス(S、1ivi
dans)、S、アクリマイシンス(S 、 acri
mycis)、S、グラウセッセンス(S 、 gla
ucescens)、S、パルビリン(S 、 par
vilin)、S、ビンセウス(S 、 vinace
us)、S、ニスピノサス(S 、 espinosu
s)およびSアズレウス(S 、 azureus)。
上記の代表的なストレプトマイセス宿主細胞に加えて、
本発明に係るベクターは、上記の他の類の株の細胞を形
質転換するのにも有用である。そのような菌株は例えば
、ハシルス(Bacillus)、スタフィロコッカス
(5taphylococcus)、並びにストレプト
スボランキウム(S trepto  sporang
ium)、アクチノプラネス(A ctinoplan
es)、メカルティア(N ocard ia)アミコ
ラドブシス(A mycolat。
psis)、サツカロポリスポラ(saccharop
olyspola)およびミクロモノスポーラ(M i
cromonospola)などのアクナノマイセス類
(Actimycetes)近縁株である。この様に、
本発明のベクターは広範囲に適用でき、有用であって、
様々な微生物の宿主細胞を形質転換することができる。
本発明のあらゆる態様が利用できるが、本発明の組換え
DNAクローニングベクターおよび形質転換体の内、幾
つかのものが好ましい。即ち、好適なベクターは、ファ
スミドpo J 401、pOJ402およびpOJ4
05であり、好ましい形質転換体は、ストレプトマイセ
ス・フラディエ/pOJ401.S  コラディI/p
OJ402、Sフラディエ/pOJ405、S、グリセ
オフスカス/po J 401/S  グリセオフスカ
ス/pOJ402、S、グリセオフスカス/pOJ40
5、S。
トヨカエジンス/po J 40 ]、S トヨ力エン
シス/pOJ402、S、トヨ力エンシス/pOJ40
5、大腸菌に12 XLI−Blue/pOJ401、
大腸菌K 12 XL 1−Blue/pOJ 402
および大腸菌に12  XLI−Blue/pOJ40
5である。これらの好ましい群の内、ファスミドpo 
J 402並びに形質転換体S、グリセオフスカス(A
TCC23916)/pOJ402が最も好ましい。
本発明に係る組換えDNAクローニングベクターおよび
形質転換体は、広範囲な用途を有し、ストレプトマイセ
スおよび近縁微生物とりわけ、これまでは複数の制限酵
素系によって有効な形質転換か妨げられていた生物に使
用するための好適なりローニングビヒクルの必要性を満
たすものである。その上、非形質転換宿主細胞にとって
は宵毒な抗生物質に対する耐性を付与する本発明に係る
ベクターの能力は、形質転換体を選択する機能的手段を
提供することにもなる。このことは、ベクターDNAを
獲得した特定の細胞を決定し選択することが実際上必要
であるが故に重要である。その存在を確認するための機
能的な試験法のない他のDNAセグメントもまた、本発
明に係るベクター上に挿入することができ、この非選択
性DNAを含有する形質転換体を、適当な抗生物質選択
によって分離できる。そのような非選択性のD N A
セグメントは、プラスミドの機能、維持、並ヒに複製に
必要な領域の内部以外ならどの部位へも挿入することが
できる。これには、抗生物質修飾酵素、抗生物質耐性、
抗生物質合成を特定する遺伝子およびあらゆる型の調節
または構造遺伝子か含まれるが、これらに限定される訳
ではない。
また、本発明は、■またはそれ以上の制限系を迂回する
ためにプラスミドまたはファスミドベクターを用いる新
規な方法に関するものであって、該方法は、 (a)ベクターの1本鎖DNAを大腸菌または他の適当
な生物内で調製し、 (b) (a)で得たDNAでアクチノミセス宿主細胞
を形質転換することからなる。
形質転換に用いられるベクターの1本鎖DNAは常法通
り2本鎖DNAから調製するか、あるいは、ある種のベ
クターについては1本鎖DNAとして直接、合成しても
よい。アクチノミセスの大部分の株は形質転換に際して
アクチノミセス宿主細胞か取り込んだ外来性の2本鎖D
NAを破壊することができる制限酵素を複数個、有する
ので、この方法は、ストレプトマイセスをも含むアクチ
ノミセスの制限性株にDNAを導入する上で、特に重要
である。
また、本発明は、組換えDNA含有含有アンチノミセス
宿主細胞択する方法であって、該方法は、l)抗生物質
感受性のアクチノミセス宿主細胞を、ある抗生物質に対
する耐性を付与するDNA配列を含有する組換えDNA
ファスミドシャトルヘクターで形質転換し、 2)形質転換宿主細胞を、抗生物質耐性形質転換体の選
択に適した条件下で培養することからなる。
本発明は上記の方法を実施するために用いられるベクタ
ーおよび形質転換体を包含する。
アクチノミセス形質転換体を、それらによる抗生物質耐
性の発現に基ついて選択する本発明方法の最適例は、形
質転換するアクチノミセス宿主細胞に調和させてベクタ
ーを構築することである。
そのようなベクターの一例はファスミドpOJ402で
ある。ファスミドpo J 402の構築出発物質は市
販品から入手するか、ノーザン・リージョナル・リサー
チ・ラボラトリ−、アグリカルチュラル・リサーチ・サ
ービス、1815ノース・ユニハーンイティー・ストリ
ート、米国農業省、ペオリア、1L61604またはア
メリカン・タイプ・カルチュアー・コレクション、12
30+バークローン・ドライブ、ロックビレ、MD20
852に寄託され、その永久(♀存株の一部となってい
る。ファスミドpOJ402の構築に用いた出発物質を
含有する株の受託番号は、1)ATCC39155−S
treptomyces l1vidans/pI J
 702(寄託日、1982年7月6日)および2)N
RRL  B−15973E、coli K12  S
F8/pKC462a(寄託日、1985年6月3日)
である。プラスミドpUc19およびpB 1uesc
ript SK゛はストラタジーン(S tratag
ene)から入手可能である。ファスミドpo J 4
02の構築方法は実施例13に記載されている。構築さ
れたファスミドpo J 402はアクチノミセス(ス
トレプトマイセスを含む)および大腸菌内で選択するた
めのアブラマイジン耐性遺伝子とストレプトマイセス内
で複製するためのplJ702?ff製起点から導かれ
たpIJlo]を含有する。これらの要素はプラスミド
pOJ361から〜4.5kb Xmn1 / Eco
RI(フレノウ)断片として得ることかできる。
これらの要素は、これら要素の内lまたはそれ以上を含
有する種々のプラスミドから様々な断片として得てもよ
い。特に、他のストレプトマイセスレプリコンを用いて
もよい。さらにファスミドpOJ402は1個のM13
複製起点、1個ノft形態発生シグナル、1個の1aC
2遺伝子、1個のポリリンカー、および大腸菌内で複製
するための複製起点をも含有している。これらの付加的
要素はプラスミドpB 1lescriptから、〜2
.2kb Aha■断片として得るか、■またはそれ以
上のこれらの要素を含有する様々なプラスミドまたはフ
ァスミドベクターから、別々に得ることができる。
本発明の新規なベクターはストレプトマイセスのレプリ
コン、大腸菌のレプリコン、およびアブラマイジン耐性
付与制限断片を含有している。プラスミドの増幅および
操作はストレプトマイセスよりも大腸菌においてより迅
速かつ効率的に行われるのでベクターか大腸菌内でも複
製可能なように大腸レプリコンをコードしているDNA
配列を加えることが好ましい。従って、pBR322、
pACYC184、pBR325、およびpB R32
8などの大腸菌プラスミドから得た機能的なレプリコン
を含有する制限断片を付加することは極めて好都合であ
り、本発明の例示ベクターに一般的な有用性を与えるも
のである。
本発明方法に用いられるベクターは、大腸菌と同様、感
受性を有するストレプトマイセスや近縁のアクチノミセ
ス宿主細胞にアブラマイジン耐性を付与する。本発明の
アブラマイジン耐性付与ヘクターは結合した環状DNA
セグメントが宿主細胞内で数世代に渡って安定に保持さ
れることを確実なものとする上で有用である。アプラマ
イジン耐性付与断片と共有結合し、ストレプトマイセス
内で増殖したこれらの遺伝子またはDNA断片は、非形
質転換体にとっては有毒な濃度のアブラマイシンに形質
転換体を暴露することにより維持される。従ってベクタ
ーを失い、結果的に共有結合したDNAを失った形質転
換体は増殖することができず、培地から消滅してしまう
。このように、本発明ベクターによれば所望のDNA配
列を安定化し、維持することができる。
本発明の方法、クローニングベクター、および形質転換
体は現在ストレプトマイセスおよび近縁の細胞で産生さ
れている種々の産物の収率を改善するための遺伝子クロ
ーニングを与えるものである。そのような産物の例とし
て、ストレプトマイシン、タイロシン、セファロスポリ
ン、アクタプラニン、ナラジン、モネンシン、トフ゛ラ
マイジン、エリスロマイシン等が含まれるが、これらに
限定されない。本発明はまた、ヒトインシュリン、ヒト
プロインシュリン、グルカゴン、インターフェロン等の
商業上重要なタンパク質類、商業上重要な工程および化
合物に至る代謝経路における酵素機能、あるいは遺伝子
発現を改良する調節要素なとをコードするDNA配列の
クローニング、特性化および再t+W築に有用である。
これらの望ましいDNA配列には、例えば、ストレプト
マイシン、タイロシン、セファトスボリン、アクタブラ
ニン、ナラジン、モネンシンおよびエリスロマイシン誘
導体のような抗生物質誘導体の合成を触媒する酵素、抗
生物質または他の産物の生合成を仲介し、増大する酵素
をコートしているDNAが含まれるがそれらに限定され
ない。これらのDNAセグメントを挿入し、安定化する
能力により、ストレフトマイセスおよび近縁の株によっ
て産生されている抗生物質の収率と利用可能性を増大す
ることかできる。
ストレプトマイセスをも含むアクナノマイセス類は、幾
つかの異なる培地のどれかを用いて種々の方法で培養で
きる。培地中の好ましい炭水化物源としては、例えば、
糖みつ、グルコースデキストリンおよびグリセリンが含
まれる。窒素源としては例えば大豆粉、アミノ酸混合物
およびペプトン類か含まれる。栄養無機塩類もまた添加
され、これには、ナトリウム、カリウム、アンモニウム
、カルシウム、リン酸、塩素および硫酸イオンなどを放
出し得る通常の塩類が含まれる。曲の微生物の発育と増
殖に必要であるように、必要微量元素もまた添加する。
こうした微量元素は、通常、曲の培地成分の添加に付随
する不純物の形で供給される。
ストレプトマイセスをも含むアクナノマイセス類は、約
5〜9という比較的広いpH領域に渡って約15°C〜
40°Cの温度範囲において好気的培養条件下に発育さ
せることができる。しかしながら、ファスミドまたはプ
ラスミドの安定性および維持のためには、培地のpHを
約72として培養を開始し、約30°Cの温度に維持す
るのが望ましい。
以下に実施例を挙げ、本発明をさらに詳しく説明する。
本発明の構築に関する説明および実際の方法を適宜、記
載した。
実施例1 大腸菌に12  JM109/pOJ 16
0の培養、プラスミドpOJ160の単離A 大腸菌に
12  JM109/pOJ 160の培養 大腸菌に12  JM109/pOJ 160(NRR
L B−18088、寄託臼、1986年7月29日)
の培養物5mffを、TY培地(1%トリプトン、0.
5%NaCC,0,5%酵母エキス、pH7゜4)中、
アブラマイシン200μ9/ m(lの存在下、細胞が
定常相に到達するまで培養した。
次いで培養物5mQを200μ9/叶アプラマイシン含
有の250z(!TY培地の入ったフラスコに接種し、
細胞が定常相に到達するまで培養した。
B プラスミドpOJ160の単離 培養物を遠心し、細胞ペレットをショ糖溶液(25w/
v%シヨ糖、50 mM T ris−HCf2(pH
80)、1mM EDTA)7mQに再懸濁した。次1
.Vテ、再懸濁した細胞ペレットに0.5M EDTA
  04RQおよび0.25M Tris−HCQ、(
pH8,0)中、5 yrq/ mρリゾチーム溶液1
xf2を加え、得られた混合物を水上(4°C)で15
分間インキユヘートした。15分間のインキュベーショ
ンの後、リソチーム処理細胞に50 mM T ris
−HCC(pH80)、6mM EDTA、および0.
1%トリトンX100の溶液0.75i12を加えた。
次いで、溶解した細胞混合物をS orvall(デュ
ボジンプロダクツ、B iomedical D 1v
ision、  N ewton、CT 06470)
SS340−ターを用い、20、OOOrpmで40分
間、細胞デブリス(片)が緩いペレットを形成するまで
遠心した。細胞デブリスのペレットを捨て、上清をTE
バッファー(50mM Tris−HCρ(pH8,0
)、1mMEDTA)で30RQに調節した。次いで、
塩化セシウム286gを加えると、密度1.559/*
Qとなった。
ベックマン(Beckman、  5cientifi
c I nstrument D 1vision、 
 Campus Drive at J ambore
e Blvd、、  I rvine、  CA 92
713)Vti50ローターを用い、臭化エチジウムに
よる塩化セシウム勾配遠心を行い(45,OOOrpm
、  16時間、20’C)、プラスミドDNAを精製
した。遠心の後、所望のプラスミドpOJ160DNA
を収集し、20X S S C(0,15M NaCl
2、O,015Mクエン酸ナトリウム)で飽和したイソ
プロパツールで4回抽出することにより、臭化エチジウ
ムと塩化セシウムを除去した。抽出液をl OOOt@
容のTEバッファーに対して室温で一夜透析した後、エ
タノールで沈澱させた。この工程で得たプラスミドpO
J 160  DNA約300μ9をTEバッファー3
00μaに溶解し、−20°Cで保存した。
プラスミドpOJ160の制限部位および機能地図を添
付の第1図に示す。
実施例2 大腸菌K 12  J M 109/pB 
1uescript S K ”の培養、プラスミドp
B 1uescript SK゛の単離 A、大腸菌K 12  J M I O9/ pB 1
uescriptSK”の培養 選択マーカーとしてアブラマイシン200μ9/靜では
なくアンピシリン100μg/ II(lを用いるほか
は実質上、実施例1記載の方法と同様にして大腸菌に1
2  JM109/pBIuescript SK゛を
培養した。まず、プラスミドpB 1uescript
SK”をストラタジーン(11099North To
rrey Pines Road、  La J ol
la、  CA92037)から得、実質上、実施例4
記載の形質転換法に従い、これを用いて大腸菌K12 
 JM109細胞(これもストラタジーンまたはベセス
ダ・リサーチ・ラボラトリーズ(BRL)、P、 O,
Box6009、ガイザースバーグ、MD20877か
ら入手可能である)を形質転換した。
B、プラスミドpB 1uescript S K ’
の単離実買上、実施例IB記載の方法に従い、プラスミ
ドp B Iuescript S K ’ D N 
Aを単離した。このようにして得たプラスミドpB 1
uescript S K ”をTEバッファーに溶解
し、濃度〜lμ9/μQで=20°Cで1呆存した。
実施例3 ファスミドpo J 401の構築A、プラ
スミドpBluescript SK’  DNAのA
haII[消化 実施例2で単離したプラスミドpB Iuescrip
t SK゛約3μ9(3μのを10XAhalllバツ
フアー(15M NaC(L 60mM Tris−H
Cρ(pH7,5)、5 Q mM MgC12,およ
び10mMジチオスレイトール(DTT))2.cl、
制限酵素AhaIII  lμQ(約40単位、本明細
書中、すべての酵素単位は、特に明記しない限り、酵素
の供給源が異なっていても、N ew E nglan
d B 1olabs(N E B )、32Toze
rRoad、 B everly、 M A Ol 9
15の単位に関する定義に従うものとする)および水1
4μQに加え、静かに撹拌した後、37°Cで2時間反
応させた。
反応後、消化物をpH8,0に緩衝化したフェノールで
1回、クロロホルム(CHCσ3)で1回抽出した。次
いで、酢酸ナトリウム濃度を0.3M、pH8,0に調
節し、2倍容のエタノールを加えた。
混合後、溶液を一70°Cに冷却し、遠心した核酸をペ
レット化した。上清を捨て、DNAペレットを70%エ
タノールで1回洗浄した後、乾燥した。
次いで、Ahanl消化プラスミドpB 1uescr
ipt SKoをTEバ、ファー20μQに再懸濁した
B、プラスミドpOJ160の〜4.5kbレプリコン
含有Xmnl−3all(フレノウ)断片の単離実施例
1で単離したプラスミドpOJ160DNA約IOμg
(lOμ12)を10XXmnlバッファー(500m
M NaCl2.60mM Tris−H(J!(pH
7,5)、6QmM MgCQ2および10mMDTT
)10μc、制限酵素Xmnr  20μI2(約20
単位)および水78μQに加え、37°Cで2時間イン
キュベートした。次いで、10×5alIバツフア(1
,5M NaCl2.60 mM T ris−HCl
!(pH7,5)、60mMMgCQ、2.2mM E
DTA)11μQ、制限酵素5all  2μρ(約2
0単位)を加え、37°Cで2時間インキュベートした
次いで、フレノウ酵素1μσ(約5単位)を溶液に加え
、4種類のdNTP類(10mMづつ)を含有する溶液
1μQを加え、反応混合物を37°Cで1時間インキュ
ベートした。次いて、フレノウ処理した消(ヒ物を1%
アガロースケル電気泳動にかけた。次いで、DEAEペ
ーパー[ワットマン・ラボラトリ−・ブロタクツ・イン
コーボレイテノド(Whatman Laborato
ry Products  I nc、)、二ニー・シ
ャーシー07014、クリフトン、ブリッジウェル・ブ
レイス9番]を用いる通常の電気泳動ゲルにより、所望
のプラスミドpOJ160の〜4.5kb Xmnl−
3alr(フレノウ)断片を単離した。次いで、高鳴バ
ッファー(1,OM NaCρ含有TEバッファー)中
、60°Cで5分間インキュベートすることにより、D
EAEペーパーから該断片を溶離し、遠心してペーパー
断片をペレット化した。上清を取り、エタノールにより
上清からDNAを沈澱させた。精製断片をTEハソファ
−20μQに懸濁した。
C,AhalII切断プラスミドpB 1uescri
pt S K ”のプラスミドpOJ160の〜4.5
kbXmnlSal+(フレノウ)制限断片への結合本
実施例のAで単離したAhaII[消化プラスミドpB
 1uescript S K ’ 511Qを上記B
、で単離したプラスミドpOJ160の〜4.5kb 
Xmn1−3aII(フレノウ)制限断片5μgに加え
、このDNAに10xT4DNAリガーゼバッフ−r−
(500mM Tris−HCl2(pH7,4)、l
 Q Q mM MgC122,100mMDTTおよ
び10mM AT P)411Q。
T4DNAリガーゼ1μQ(約500単位)および水2
5μCを加えた。静かに撹拌した後、反応混合物を16
°Cで16時間インキュベートした。この反応でファス
ミドpo J 401が生成した。
D、ファスミドpOJ401の単離 実質上、実施例IBiEl’載の方法に従い、ファスミ
ドpOJ401DNAを単離した。このようにして得た
ファスミドpOJ401をTEバッファ−に溶解し、濃
度〜1μ9/μQて一20°Cで保存した。ファスミド
pOJ401の制限部位および機能地図を添イ」の第2
図に示す。
実施例4 ファスミドpo J 401による大腸菌K
 12 XL 1−Blue細胞の形質転換A 形質転
換用の細胞の調製のための培養物の培養 大腸菌K12 XLI−Blue細胞(Bullock
ら、1987、B 1oTechniques5 : 
376−378、ストラタシーンから入手可能)を、T
Y−寒天プレート上、TYジブロス中培養した。テトラ
サイクリン20μg/ 11+12を含有するTY−寒
天プレートから大腸菌K 12 XL 1−B−1ue
細胞の単一のコロニーを選択し、テトラサイクリン10
0μ9/、l?f2含有TYブロス10肩σに接種した
。この10mQ培養物を37°Cで一夜(16時間)振
盪培養した。
この−夜培養物を500m12のフラスコ中のテトラサ
イタリフ10μ9/ に接種した。37°Cで激しく撹拌しながらO,D。
550か0.5になるまでインキュベートした。次いで
、細胞培養物を水上で15分間インキュベートし、この
インキュベーションの後、5orvall 53340
ーターを用い、10.00Orpmにおいて4°Cで1
0分間遠心した。上清を捨て、細胞ペレットを4°Cの
10mMモルホリノプロパンスルホン酸(MOPS)、
pH7.0およびlQmM塩化ルビジウム(RbC12
)滅菌溶液50m(に静かに再懸濁した。上記のごとく
遠心して細胞をペッレト化した。上清を捨て、細胞ペレ
ットをQ.1MM0PS,pH6.5、50mM Ca
CQl、10mMRbCρの滅菌溶液50x(lに静か
に再懸濁した。細胞懸濁液を水上に15分間置き、上記
のごとく遠心した。上清を除き、細胞ペレットをO.1
MM0PSSpH6.5、5 0 mM C aC h
、10mMRbCQおよび20%グリセリンの滅菌溶液
20m(!に静かに再懸濁した。細胞懸濁液を200μ
ρつつに分け、−70’Cで急速凍結した。細胞はいっ
でも形質転換でき、これを凍結保存して本実施例の下記
Bにおける形質転換工程の為に解凍した。
B.形質転換工程 上記A.で調製した大腸菌に12 XLI−Btue細
抱の一部200μQを解凍し、実施例3Dで調製した7
yスミt’pOJ4QIDNA11Z12(約1μg)
を加えた。混合物を氷上で30分間インキュベートした
。次いで、混合物を42°Cで2分間インキュベートし
た後、水上で5分間インキュベートすることにより熱衝
撃を与えた。次いで、細胞懸r8液を30分間マクロフ
ュージョン処理し、上清を捨てた。細胞ペツレトをTY
ブロス5MQに再懸濁し、ローラードラム上、37°C
で2時間インキュベートした。約100μσづつ、アブ
ラマインン200μg/mQ含有TY−寒天により平板
培養した。TY−寒天プレートを37℃で一夜インキユ
ベートし、形質転換体を増殖させた。所望の形質転換体
は大腸菌K 1 2 XL 1 −Blue/p。
J401である。アブラマイジン耐性形質転換体を制限
酵素分析に付し、大腸菌に12 XLI−B lue/
po J 4 0 1形質転換体を同定した。分析のた
めに実施例12記載の方法でプラスミドDNAを調製し
た。
実施例5 大腸菌K l 2 XL 1 −Blue/
p。
J401からの形質転換用1本鎖DNAの調製実質.上
、実施例4記載の方法で調製し、200μ9/mQアプ
ラマイシン含有TYブロス中で37°Cにおいて増殖さ
せた大腸菌に12 XLIBIue/ po J 4 
0 1の一夜培養物lRρを500zρのフラスコ内の
TYブロス100xCに加えた。次いで、VC8−M1
3ヘルパーファージ(ストラタジー7)5 0 μQ(
 〜2. O X 1 0 7P F U)ヲ加エタ。
これにより感染の多重度(MO+)〜0、■を得た。
この培養物100R夕を37°Cで一夜、激しく撹拌し
ながらインキュベートした。−夜培養した後、細胞培養
物100m(を遠心して細胞をベソレj・化した。)7
−ジ滲出液を含有する上清を得、04μフイルターでろ
過した。
上清ろ液にl Oxg/xQ DNA5el 5 0 
μ(!(約5 0 0 O 1位)(ヘセスタ・リサー
チ・ラボラトリーズI nc. (B R L)、82
17グローブモント・サークル、ガイザースバーグ、M
D20877)および2 m9/ mQ R N A 
seA (ヘーリンガー・マンハイム・バイオケミカル
ス、7941キヤツスルウエイ・ドライヴ、インデイア
ナポリス、lN46250)50μQ(約5単位)を加
え、37°Cで2時間インキュベートした。インキュベ
ーションの後、20%PEG−8000(シグマ、私書
箱14508、セントルイス、MO63178)および
14.6%NaC+2溶液75J112をDNA5eお
よびRNA5e処理した上清に加え、得られた溶液を充
分混合し、−80°Cで約1時間インキュベートした。
冷却後、S orvall G S Aローターで4°
Cにおいて15分間、10.OOOrpmにおいて遠心
し、溶液からファージを沈澱させた。上演を捨て、ファ
−ンペ、レトをTEバッファー800μρに再懸濁した
。次いで、1M Tris−HCff(pH8,0)2
00μσ、0.5M ED′FA  200μQおよび
20%ドデシル硫酸ナトリウム(SDS)10μQをこ
のファージ懸濁液に加えた。混合物を70°Cで15分
間加熱し、室温まで冷却した後、室温で、3M酢酸ナト
リウム140μQを等容量のイソプロパツールと一緒に
加えた。この溶液を室温で15分間マイクロフュージョ
ン処理することによって1本鎖DNAを沈澱させた。1
本鎖DNAのベルトをTEバッファー100μQに再懸
濁した。
1本鎖DNA溶液の○、D、2110を測定したところ
、1本鎖DNA−18μgが得られていた。
実施例6 大腸菌K l 2 XL 1−Blue/p
J401からの形質転換用2本鎖DNAの調製実質上、
実施例IA記載の方法で大腸菌K12XL 1−Blu
e/pOJ 401を培養した。実質上、実施例IB記
載の方法に従い、ファスミドpOJ401DNAを単離
した。このようにして得られた2本漬ファスミドDNA
をTEバッファーに溶解し、濃度〜1μ9/μQで保存
した。
実施例7 ファスミドpo J 401およびpOJ4
02の1本鎖DNAおよび2本鎖DNAによる大腸菌に
12  JM109の形質転換大腸菌に12  JM1
09細胞(Y anisch −P erronら、1
985、Gene33:103  119、ストラタジ
ーンから入手可能)を、テトラサイクリンを加えないこ
とを除いて、実質上、実施例4A記載の方法に従い、培
養した。実質上、実施例4A記載の方法に従い、形質転
換にコンピテントな細胞とし、実質上、実施例4Bの方
法と同様にして1本鎖または2本鎖のフ1スミドpo 
J 401あるいはpOJ402DNAによって形質転
換した。形質転換体を以下のようにして平板培養した 
TYジブロス中培養物5+(jの内、100μQをTA
XI(TYブロス、200μ9/肩Qアブラマイ/ン、
40 u 9/ dX−G al、および1mMIPT
G)−寒天にプレートする。TAXI−寒天プレートを
37°Cで一夜培養し、翌日、コロニーを計数した。
代表的な実験結果を表3に示す。結果は、形質転換効率
(DNAμりあたりの、形質転換されたコロニーの数)
で表3に示されている。表3の結果は、1本鎖DNAが
、2本鎖DNAと同様、大腸菌に12JM109細胞の
形質転換に有効であることを示唆するものである。
表3 JM109/pOJ 401 ds JM109/pOJ402 ds 1.2X105/μ9 2.3x103/μy” 1、lX105/μ9 1.1X10’/μ9 ”ds :二本鎖DNA 5Sニ一本鎖DNA 末X 形質転換に用いた一本鎖pOJ401DNAは〜
50−80%のへルバーファージDNA不純物を含んで
いた。
実施例8 ファスミドpOJ401およびpOJ402
の1本鎖および2本鎖DNAによるストレプトマイセス
・グリセオフスカスの形質転換ストレプトマイセス・グ
リセオフスカス(ATCC23916)の凍結培養物(
菌糸フラグメント)をトリブチカーゼ・ソイブロス(T
 S B)(D ifc。
Laboratories I nc、私書箱1058
A、テトロイト、M148232)中で〜70’Cにお
いて保存した。菌糸フラグメントの凍結培養物を解凍し
TSBIQx(に接種した。10m(lの初期培養物を
30°Cで一夜、培養した。この−夜培養物をホモジナ
イズして菌糸フラグメントを分解し、得られたホモジネ
ート0.5111&を0,4%グリシン含有TSBIC
)+12に接種した。得られたl0JI72の第2培養
物を30’Cで一夜培養した。この培養物をホモジナイ
ズし、その0.5tIQを用いて0.4%グリシン含有
TSBIQzQに接種し、この第3培養物を30°Cで
一夜培養した。この培養物を同様にホモジナイズし、細
胞を2.00Orpmで10分間テーブル・トップ遠心
機により、遠心してペレット化した。得られたベレット
をP(プロトプラスト)培地10ff(!に再懸濁した
。P培地(〜1001のは以下のようにして調製された
國−分            量 シヨ糖          10.309に、So、 
             0.259MgC(h ・
6 H202、029 微量元素溶液IQに対して 40rng ZnC(1゜ 200119FeCQ3・6H2゜ 10TR9CuCQ2・2H20 10Mg MnCQt ’ 4 H201ong Na
tB、Ov・l 0HtO10mg(NHa)aMo7
02*” 4H200,2ffQ蒸留水を加えて80.
0ffiaとする。
オートクレーブした後、以下を加える K)12PO,(0,5%)            
1.ox&CaC(22・2H,0(3,68%)  
 10.OmC[N−トリス(ヒドロキシメチル)  
10.0iQ。
−メチル−2−アミノエタン スルホン酸]“TBS”バッファー 0、25M、 pH7,2 細胞懸濁液を上記のようにして遠心し、上清を捨て、細
胞ペレットをリゾチーム5a9/mσを含有するP培地
10m9/mQ、に再懸濁した。リゾチーム処理した細
胞懸濁液を15分おきに静かに振盪しながら、30°C
で1時間インキュベートしてプロトプラストを形成させ
た。このようにして形成されたプロトプラストを上記の
ごとくにして遠心してペレット化し、P培地10ff1
2に再懸濁した。この工程を繰り返し、洗浄したプロト
プラストをP培地3酎に懸濁して形質転換に備えた。
形質転換に際しては、P培地1000+C中のプロトプ
ラスト150μQおよび55%PEGIO00(100
μ12)に、1本鎖(実施例5)または2本鎖(実施例
6)のファスミドpOJ401またはpOJ402DN
Aいずれか3μσを加えた。このDNA−プロトプラス
ト−PEG懸濁液を室諷で30秒間維持してから、該懸
濁液をR2重層(オーバーレイ、0.41%寒天を含有
するR2培地)に加え、これをR2寒天プレートに流し
た。改良R2(再生)培地(〜lのは下記のごとくにし
て調製された。
成分 ショ糖 に2S○4 微■元素溶液 量 103、 OO1? 0.25g 2、OOao2 MgCL・6 R2010,1217 グルコース          10.0(hL−7ス
ハラキンー R202,O0gカザミノ酸(Dirco
)        O,l O9寒天        
    22. O0g蒸留水を加えて、700 m(
lとする。
オートクレーブした後、以下を加える KH,Po、          100ff12(0
,05g/100次の CaC12t(2,229/ 100ff12)  1
00!I(Q“T E S ”バッファー     1
00肩Q(5,739/100mQ、pH7,2)Na
OH(5N)           lx(!形質転換
されたプロトプラストを含有するR2重層を有するR2
寒天プレートを30°Cで一夜インキユベートした。翌
日、アブラマイシンを含有する第2のR2重層4mQを
プレートに注ぎ、プレートのアブラマイシン終濃度を2
5μg/mQとした。再度、プレートを30°Cで5日
間インキュベートした。5日j用のインキュベートの後
、形質転換コロニーの数を計数した。形質転換効率を算
出して表4に示した。制限酵素分析のために、実施例1
2記載のミニブレブ(miniprep)法で形質転換
体のプラスミドDNAを調製した。あるいは、制限酵素
分析のために、プラスミドDNAを大腸MK12  J
M109に戻しくシャトルバック)でもよい(実施例9
)。
代表的な形質転換実験の結果を表4に示す。表の結果か
ら1重鎖ファスミドpo J 401またはpOJ40
2DNAがS、グリセオフスカスを高頻度に形質転換し
、その頻度は2本鎖DNAにおけるそれと同等であるこ
とが分かる。
表4 細胞/DNA       鎖 形質転換効率 S グリセオフスカス/pOJ401   ds(S 
、 griseofuscus)        ss
S、グリセオフスカス/pOJ402   ds(S 
、 griseofuscus)       ss〉
105 〜2XIO’ 4.6X105 1.8Xlo’ 実施例9 ストレプトマイセス・グリセオフスカスと大
腸菌に12の株間でのファスミドpOJ401またはp
OJ402のシャトル作用(ンヤトリング) 実質上、実施例8記載の方法と同様にストレプトマイセ
ス・グリセオフスカスに導入したファスミ)’pOJ4
01およびpOJ402DNAはストレプトマイセス・
グリセオフスカスと、大腸[]K12の様々な株、例え
ばJM109やRRI株との間でシャトル作用を示した
。実施例8に従って調製した形質転換プレートから単一
のコロニーフラグ(plug)を得、これをアブラマイ
シン25μ9/吋を含有するTSB5ff(に接種した
。この5mg培養物をホモジナイズし、30°Cにおい
てローラー・ドラム上で一夜インキユベートした。−夜
インキユベートした後、培養物を再度ホモジナイズした
。実質上、実施例12記載の方法に従ってこの培養物〜
1.5n(!からDNAを調製し、DNAをTEバッフ
1−20μρに再懸濁した。この試料20μgの内5μ
σを用い、実質上、実施例4記載のごとくにして大腸M
K12  JM109を形質転換した。TAX I上で
37°Cにおいて一夜培養することにより、形質転換体
を選択した。形質転換に用いたファスミドpOJ401
やpOJ402DNAか形質転換後も無傷であることを
確かめるために、実質上、実施例12記載の方法により
ファスミドDNAを調製し、制限酵素分析によって分析
した。
ファスミドD N Aをストレプトマイセスでなく大腸
菌内で分析することの利点は幾つかある。まず第1に、
分析すべきDNAかより多く存在する(大腸菌内の方が
コピー数が多い)、第2にミニフレプ法(minipr
eps)によってより純粋で高純度のDNAを得ること
ができる。
実施例IOファスミドpOJ401およびp。
J402の1本鎖および2本鎖DNAによるストレプト
マイセス・フラグィエの形質転換ストレプトマイセス・
フラグィエPM77[バルブ(B altz)およびセ
ノ(Seno)、Δnn、 Rev、 M 1crob
io1.42 : 547−574(1988)]を、
実質上、実施例8記載のストレプトマイセス・グリセオ
フスカスの形質転換法に従って形質転換した。形質転換
体のコロニーを計数した。形質転換効率を算出し、表5
に示した。形質転換体のファスミドDNAを実施例8記
載のごとくにして分析した。
表5は代表的な形質転換実験の結果を示すものである。
この表の結果から1本箱ファスミドp○J401または
pOJ402DNAか高51度に、2本鎖DNAにおけ
る頻度と同等、またはむしろそれ以上でS、フラグィエ
PM77を形質転換することが示唆される。より制限性
の株であるスi・レプトマイセス・フラグィエ(GS6
2)を用いた他の実験の結果、1重鎖po J 40ま
たはpo J 402DNAの形質転換効率は、2本鎖
DNAによるそれの約1000倍高いことが分かった。
表−互 細胞/DNA       鎖 S、フラディエ/PM77 pOJ401   ds(
S 、 fradiae)          ssS
、フラディエ/PM77 pOJ402   ds(S
 、 fradiae)          ss形質
転換効率 5.4X10’ 1.0X107 1.5XIO5 1,8Xlo6 実施例11 ファスミドpo J 401およびpOJ
402の1本鎖および2本鎖DNAによるストレプトマ
イセス・トヨカエンシスの形質転換ストレプトマイセス
・トヨ力エンシス80934(NRRL  18112
)またはM、Ji6[80934の非制限性変異体であ
って、(マツシマらのMo1.Gen、Genet、、
206:393 499に従って調製された)細胞を以
下の点を除いて実質上、実施例8記載の形質転換法に従
い、形質転換した。形質転換に際しては、プロトプラス
ト10mQをペレット化し、上清をデカントし、55%
PEG100O含有P培地0.5mQ中のヘレット化プ
ロトプラストにファスミドpOJ401またはpOJ4
02DNA(1本鎖(実施例5)または2本鎖(実施例
6))〜5−10μgを加えた。
次いで、DNA−プロトプラスト−P E G %% 
7F5液をR2重層と一緒にTSB/R2(R2培地1
f2あたりTSB120m12)寒天プレートにのせ、
300Cで一夜インキユベートし、翌日、アブラマイシ
ン5μ9/m(lを含有する第2のR2重層を重層した
。次いでプレートを30℃で7日間インキュベートした
。7日間のインキュベーションの終了時に、形質転換コ
ロニーの数を計数し、形質転換効率を算出して表6に示
した。実施例8と同様にして形質転換体のプラスミドD
NAを分析した。
表6の結果は代表的な形質転換実験の結果を示すもので
ある。表6は非制限変異株であるS、トヨ力エンシスM
J16および制限活性を有するSトヨ力エンシス809
34に関する結果を示す。
表6 イ田胞/DNA 5 トヨ力エンシス (S 、 toyocaensis) S トヨ力エジンス (S  toyocaensis) 鎖 形質転換効率 MJ16/ pOJ401   ds MJ16/ pOJ402   ds S トヨ力エジンス80934/ pOJ401  d
s(S 、 toyocaens is)      
     ssS トヨカエンシス80934/ pO
J402  ds(S 、 toyocaensis)
          ssS、0XIO3 1,8X103 9.0X10’ (2,7XIO3) 1.5X103 (9,3XIOり 1.2X10’ 6.3X10” 2.9X10’ 1.4X103 S トヨカエンシス80934に関する上記の結果は1
本漬ファスミドpo J 401またはpOJ402D
NAが2本鎖DNAの1−2ケタ(log)高い効率で
形質転換することを示している。これは、1本漬ファス
ミドpOJ401またはpOJ402DNAか、s、ト
ヨカエンシス80934のような高度の制限株において
、いくつかの制限系を迂回するのに有効であることを暗
示するものである。
実施例12 ストレプトマイセスまたは大腸菌ミニプレ
ブ工程によるプラスミドDNAの調製プラスミドDNA
を、キーサー[(K 1eser)、1984、Pla
smid、  12 : 19 36]の方法を下記の
ごとくに1龜飾した方法で調製する。ストレプトマイセ
スまたは大腸菌の一夜培養物約1.5+Qを遠心し、細
胞をリゾチーム溶液(ストレプトマイセス用の溶液は、
リゾチーム(シグマ)2πy/ wQ、0.3Mショ糖
、25mM Tris−HCl2 (pH80)、およ
び25mM EDTASp)(8,0を含有し、大腸菌
用の溶液は、リゾチーム以外の上記全成分を含有する)
500 u(lに再#&、濁し静かに撹拌しながら、ス
トレプトマイセスは37°Cで、大腸菌は0°C(また
はインキュベーションせずに)で培養する。インキュベ
ーション後、アルカリ/SDS溶を夜(0,3M  N
aOH;  2%5DS)250 μcを加え、得られ
た1誤濁液をポルテックス・ミキサーで混合し、即座に
、完全な混合を確実に行う。
次いで、懸濁液を70°Cで10分間インキュベートし
て室tISに冷却する。次に、ポルテックス・ミキサ−
上で撹拌しなから、フェノール−クロロホルム80μQ
を加え、相が完全に混合するまで(〜10秒間)混合し
た後、エッペンドルフ遠心機で2分間遠心する。上清を
とり、3M非緩衝化酢酸ナトリウム70μgを含有する
別のエッベンドルフ遠心管に入れる。ここに撹拌下、イ
ンプロパツール700μQを加え、溶液を室温で5分間
インキ二ベートスる。インキュベーンコン後、溶液ヲ5
分間遠心し、上清をデカントし、2秒間、第2の遠心処
理をし、全液体成分を除く。DNAペレットをTEバッ
ファー500μQに溶解し、100mMスペルミン−H
CQ(25μのを加える。混合後、DNA溶液を室温で
5分間インキュベートし、上記のごとく遠心し、完全に
上清を除く。DNAペレットを0.3M酢酸ナトリウム
とl OmM MgCC3300μQに再溶解する。次
いで、混合しながら冷エタノール700μQを加え、室
温で5分間インキュベートする。DNA溶液を再度遠心
し、上記のごとく上清を完全に除去する。DNAペレッ
トをTEバッファー20μQに再溶解する。このように
して得られたDNAは制限酵素分析または形質転換に用
いることができる。
(以下余白) 実施例13 ファスミドpOJ402の構築A、中間体
プラスミドpOJ107の構築1、プラスミドpUc1
9のB amHI/ P st I消化 実質上、実施例2記載の方法に従って単離したプラスミ
ドpUc19DNA約lμg(3μのを10X10XB
aバツフア  (500mM NaC(,500mM 
Tris−HCl2(pH8,0)、lQQmMMgC
ILおよび10mM DTT)1μC1制限酵素Pst
+  1li(2(約20単位)および水4μQに加え
、静かに撹拌した後、37°Cて1時間反応させた。反
応後、BamHI / Pst I消化pUc19DN
Aをエタノールで沈澱させ、TEバッファーに懸濁した
2 コスミドpKC462aDNAのBamHI/Ps
tl消化 大腸菌に12  SF8/pKC462a(NRRLB
−15973M寄託日、1985年6月3日)の培養お
よび以後のコスミドpKC462aDNAの単離は実質
上、実施例1の教示に従って行われた。コスミド1)K
C462aの制限部位および機能地図を添付の第3図に
示す。この工程で得られたコスミドpKC462aDN
A約10μ9(10μQ)を1OXPstlバツフy 
 (500mM NaCQ。
500mM Tris−HC(!(pH8,0)、10
0mMM g CQ xおよび10mM DTT)50
μQ、制限酵素Pst■ 5μ12(約100単位)お
よび水420μQに加え、静かに撹拌した後、37°C
で3時間反応させた。反応後、消化物をエタノール沈澱
に付し、TEバッファー100μgおよびゲル−ローデ
ィング・バッファー(水中、0.25%プロムファノー
ルブルー、0.25%キシレンシアツール、15%フィ
コールくタイプ400))20μQに再懸訓した。次い
で、Pstl消化DNAを1%アカロースゲル電気泳動
にかけた。コスミドpKC462aの所望の〜2.Ok
b Pstl断片を実質上、実施例3B記載の方法と同
様にして単離した。精製断片をTEバッファー50μρ
に懸濁した。次いで、10X10XBaバツフアー10
μC1制限酵素BamHT 5 μc(約100単位)
および水35μ(!を加えた。37°Cで2時間のイン
キュベーションの後、エタノール沈澱に付した。Bam
HI消化DNA断片をTEバッファー20μgに再懸濁
し、コスミドpKC462aの〜1.7kb BamH
1/Pst1断片を得た。
3、BamHI/Pstl消化プラスミドpUc19と
コスミドpKC462aの〜1.7 kb BamHl
/Pstl断片との結合 上で調製したBamHr / Pst I消化プラスミ
ドpUc19約0.1μg(2μQ)を上記のようにし
て単離したコスミドpKC4,62aの〜1.7kbB
amH1/Pstl断片1μg(約lOμのに加え、こ
のDNAに10XT4DNAリガ一ゼバツフアー2μL
T4DNAリガーゼ1μm2(約500単位)および水
5μQを加えた。静かに撹拌した後、ライゲーション混
合物を16°Cで一夜(〜16時間)インキュベートし
た。このライゲーションによって中間体プラスミドpO
J107が生成した。このライゲーション反応混合物約
5μσを用い、実質上、実施例4記載の方法と同様にし
て大腸菌K12  JM109を形質転換し、実質上、
実施例IB記載の方法に従い、プラスミドDNAを調製
した。
B 中間体プラスミドpOJ326の構築1、pOJ1
07のBamHI / Pst I ?肖化本実施例の
Aに記載のごとくにして単離したプラスミドpOJ10
7約5 R9(5ttのをlOX10XBaバッファー
2μC1制限酵素BamHI  1μc(約20単位)
、制限酵素Pst[l1l(約20単位)および水11
μCに加え、37°Cで1時間反応させた。DNAをエ
タノール沈澱させ、TEバ。
ファー20μQに再懸濁した。
2、 pl J 702のPst I / Bcl I
 (部分)消化実質上、実施例IB記載の方法に従って
ストレプトマイセス・リビダンス/pi J 702(
ATCC39]、55)を培養し、プラスミドpIJ7
02D N Aを単離した。チオストレプトン(25μ
9/ffc)を用いてストレプトマイセス・リビタンス
/plJ702細胞内でのプラスミドp[J702の選
択を確実にした。プラスミドplJ702の制限部位お
よび機能地図を添付の第4図に示す。
このようにして得られたプラスミドplJ702DNA
約5μg(5μのをIOX制限酵素Pst■バッフy−
10u(1、制限酵素PstI  1μ12(約20単
位)および水84μQに加え、37°Cて1時間反応さ
せた。反応後、制限酵素BclI  1μa、(約10
単位)を50°Cにおいて2分間で加えた。等容退のフ
ェノールおよびS evag(クロロホルム:イソアミ
ルアルコール、24:1混合物)で抽出して部分消化を
停止した後、エタノール沈澱に付した。DNAをTEバ
ッファー20μQに再懸濁した。
3、BamHI/Pstl消化プラスミドpOJ107
とplJ702のPsLI/Be1l(部分)消化物と
の結合 BamHr / Pst T消化プラスミドpOJ10
7杓1 μy(4ttのをプラスミドplJ702のP
stI/BclI(部分)消化物1μg(4μg)に加
え、このDNAに1QxT4DNAリガーゼバツフアー
、1μQ、T4DNAリガーゼ1μρ(約500単位)
および水27μρを加えた。16°Cで一夜インキュベ
ートシた。このライゲージ3フ反応によって中間体プラ
スミドpOJ326か生成した。プラスミドpOJ32
6の制限部位および機能地図を添付の第5図に示す。こ
のライゲーション1昆合物約10μQを用い、実質上、
実施例8記載の形質転換法に準じてストレプトマイセス
・グリセオフスカスを形質転換した。R2−寒天プレー
トを終濃度か25μy/m(lとなるようにアブラマイ
ジンまたはチオストレプトンと一緒に重層した。アブラ
マイジンプレート上では増殖するがチオストレプトンプ
レート上では増殖しないことに基づいて形質転換体を選
択した。形質転換コロニーを選択し、アブラマイジン2
5μ9/ m(l含有TSB培地で培養し、実施例12
記載のm1niprep法によってアブラマイシン25
μh/*Q含有TSB培地25!QからプラスミドDN
Aを調製した。m1niprepD NΔをTEバッフ
ァー100μQに再懸濁し、DI’JAをDEAEセル
ロースカラム(Elutip D、  5chleic
her & S chuell、 I nc、、543
ワンントン・ストリート、ケーン、N、H,03431
)に通してさらに精製し、エタノール沈澱させ、TEバ
ッファー100μQに再懸濁した。
C9中間体プラスミドpOJ328の構築上記Bで得た
プラスミドpOJ326DNA約5μg(40μのを1
0XEcoRTバツフアー(500mMNaC12、I
M Tris−HC?!(P)17.5)、100mM
 MgC(hおよび10mM DTT)l 0ttQ、
制限酵素EcoRI  1 μ((約32単位)および
水51μQに加え、静かに撹拌した後、37°Cで1時
間反応させた。次いて、フレノウ1μQ(約5単位)と
4種のdNTP含有溶液1μQ(各10mM)を加え、
37°Cで30分間インキュベートした。
EcoRI?FI化し、フレノウ処理したDNAをフェ
ノール:Sevag抽出し、エタノール沈澱してTEバ
ッファー50μgに再腎濁した。
このようにして得られたEcoRI消化し、フレノウ処
理したDNA約40μρをl0XT4DNAリガーゼバ
ツフアー5μf7.T4DNAリガーゼ1μg(約50
0単位)および水4μQにより、16°Cで一夜結合さ
せた。このライゲーション反応によってプラスミドに第
2のXmnT部位が創製され、中間体プラスミドpOJ
328が生成した。
ライゲートしたDNA溶液約40μρを上記のごと<E
coRIと反応させた後、エタノール沈澱に付し、TE
バッファー20μQに再懸濁した。フラスミドpOJ3
28DNA約10μQを用い、実質上、実施例8記載の
方法に従いストレプトマイセス・グリセオフスカスを形
質転換し、アブラマイジン25μ9/m(l含有TSB
プレート上で選択した。実施例12記載のm1nipr
ep法に従い、分析用にプラスミドpOJ328DNA
を調製した。
D、中間体プラスミドpo J 347の構築1、プラ
スミドpOJ160DNAのP vu II /Xmn
[消化および〜925bp断片の単離実質上、実施例1
記載の方法に従い、大腸菌に12  JM109/pO
J 160(NRRL  B−18088)から単離し
たプラスミドpOJI60DNA約lOμg(lOμの
を10XPvuIIバフ77−(500mM NaCQ
、60mM Tris−HC(!(pH7,5)、60
 mM M g CQ tおよびlomMDTT) 1
0 tt(1、制限酵素Pvull  II(!(約1
0単位)、制限酵素Xmn1 1μg(約10単位)お
よび水78μQに加え、37°Cで1時間反応させた。
反応後、実質上、実施例3B記載の方法に従って消化物
を1%アガロースゲル電気泳動にかけ、〜900および
〜925bp断片をDEAEペーパー上で単離した。断
片を溶離し、エタノール沈澱に付し、TEバッファー2
0μQに再懸、蜀した。
2 プラスミドpOJ328のXmn1消化上記Cて得
たプラスミドpOJ328DNA約1μg(lμQ)を
10XXmnlバッフy−(PvuI[バッファーと同
じ)1μ夕、制限酵素Xmn1  lμQ(約10単位
)および水7μQに加え、37°Cで1時間反応させた
。反応後、DNAをエタノール沈澱に付し、TEバッフ
ァー10m&に再懸濁した。
3、プラスミドpOJ160のPvu[I/Xmn1消
化断片とXmn1消化プラスミドpo J 328との
結合 上で1したXmn[消化プラスミドpo J 328D
NA約lμy(10μρ)を上で調製したプラスミドp
lJ160の〜900および〜925bpPνull/
Xmn1断片に加え、このDNAに10X′F4 DN
Aリガーセハノファ−4μ(l、T4.DNAリガーゼ
1μQ(約500単位)および水20μQを加えた。静
かに撹拌した後、このライヶーノヨン混合物を16°C
で一夜(〜16時間)インキュベートした。このライゲ
ーションによって中間体プラスミドpOJ347か生成
した。ライゲーンヨン混合物約10μQを用い、実質上
、実施例4記4戊の方法に従い、大腸菌に12JM1.
09を形質転換した。TAX r−フツート上、37°
Cで一夜平板培養することにより形質転換体を選択した
実質上、実施例IB記載の方法に従い、プラスミドpO
J347DNAを調製した。
E、中間体プラスミ)”po J 348 (D構築上
記りて調製したプラスミドpOJ347DNA約5μg
(5μのを10XNdelハノ7ア (1゜5MNaC
f2.16mM Tris−1((J(pI(7,5)
、60mM MgCLおよびl OmM DTT)2 
μQ、制限酵素Ndel  1μ12(約5単位)、制
限酵素Nru1(NEBカタログによると、Nru+は
エキソヌクレアーセ不純物を含有するので、Ndel粘
着末端がエキソヌクレアーゼ除去される)1μρ(約5
単位)および水11μQに加え、37°Cで2時間反応
させた。反応後、消化物をエタノール沈澱に付し、TE
バッファー20μQに再懸濁した。
NdeI/Nrul消化プラスミドpo J 347 
DNA20μQを1OXT4DNAリガーゼノイ、ファ
ー4μIJ、T4DNAリガーゼ1μQ(約500単位
)、l QmM AT P 411Qおよび水11μQ
に加えた。このライゲーション反応混合物を16°Cで
−夜インキユヘートすると、中間体プラスミドpOJ3
48か生成した。プラスミドpOJ348の制限部位お
よび機能地図を添付の第6図に示す。
この工程は、上記工程りでプラスミドpOJ160由来
の所望の〜925断片と一緒に結合した、不要のチオス
トレプトン耐性遺伝子含有〜900bpPvuII断片
から〜700bpを除去するのに必要であった。
ライゲーション反応混合物約10μQを用い、実質上、
実施例4記載の方法に従い、大腸菌に12  JM10
9を形質転換した。形質転換体をアブラマイシン200
μg/m(l含有TY−寒天プレート上、37°Cで一
夜培養し、選択した。実質上、実施例IBまたは実施例
12記載の方法に従い、分析および使用用のプラスミド
DNAをlした。
F 中間体プラスミドpo J 352の構築1、プラ
スミドpOJ348DNAのKpnl消化 上記Eで得たプラスミドpOJ348DNA約5μy(
5μQ)を1OXKpnlバツフアー(60mMNaC
(!、60mM Tris−HCC(pH7,5)、6
0mM MgCl22およびl OmM DTT)I 
OμQ、制限酵素Kpnl  lμρ(約15単位)お
よび水8・1μQに加え、37°Cで1時間反応させた
。反応後、エタノール沈澱に付し、TEバッファー20
ttI2に再懸濁した。
2、 Mung Beanヌクレアーゼ処理Kpnl消
化プラスミドpOJ348DNA約1μy(5μ&)を
l Q X Mung B eanヌクレアーセバノフ
7−(300mM酢酸ナトリウム、pH4,6,500
mMNaC(および10mM ZnCQ2) 1011
0.、Mung Beanヌクレアーゼ1μ(2(約1
00単位、l×バッファーにより、l:10に希釈した
ばかりのもの)および水84μρに加え、37°Cて1
0分間反応させた。反応後、TE飽和フェノールで2回
抽出し、エタノール沈澱に付し、TEバッファー20μ
Qに再懸濁した。
3、Kpnli肖化し、Mung Beanヌクレアー
ゼ処理したプラスミドpOJ348DNAの結合Kpn
l消化し、Mung Beanヌクレアーゼ処理したプ
ラスミドpOJ348DNA約0.3μg(10μσ)
を1OXT4DNAリガーセパ、ファーlOμLT4D
NAリガーゼ1μσく約500単位)および水79μQ
に加え、37°Cで一夜インキュへ一トシて平滑床☆:
1jを結合させた。このライゲーションによって中間体
プラスミドpo J 352が生成した。プラスミドp
o J 352の制限部位および機能地図を添付の第7
図に示す。このライゲーション反応混合物約20μQを
用い、実質上、実施例4記4戊の方法に従い、大腸菌に
12  JM109を形質転換した。アブラマイシン2
00μ9/7ρ含有TY−寒天プレート上で形質転換体
を選択した。実質上、実施例IBまたは実施例12記・
抵の方法に従い、制限酵素分析および以後の使用のため
にプラスミドpOJ352DNAを調製した。
G、中間体プラスミドpo J 354の構築1、プラ
スミドpOJ352DNAのEcoRI消化 上記F記載のごと(にして調製されたプラスミドpOJ
352DNA約5μ9(5μのを1QxEcoRIバッ
ファー10μQ、制限酵素EcoRIlμg(約20単
位)および水84μρに加え、37°Cて2時間反応さ
せた。反応後、DNAをエタノール沈、殿させ、TEバ
ッファー20μρに再懸濁した。
2、 Mung Beanヌクレアーゼ処理EcoR1
消化プラスミドpOJ 352DNA約1Mg(5μの
をインキュベーションを10分間でなく2時間行う外は
実質上、上記F記載の方法に従い、Mung Bean
ヌクレアーゼ処理した。
3、EcoRI消化し、Mung Beanヌクレアー
ゼ処理したプラスミドpOJ352DNAの結合Eco
RI消化し、Mung Beanヌクレアーゼ処理した
プラスミドpOJ352DNA約0.1μ9(10μの
を実質上、上記F記載の方法で結合させた。
ライゲーションにより中間体プラスミドpOJ354が
生成した。このライゲーション反応混合物40ff12
の内、約101112を用い、実質上、実施例4記載の
方法に従い、大腸菌に12  JM109を形質転換し
た。アブラマイシン200μg/11(l含有TY−寒
天プレート上で形質転換体を選択した。
実質上、実施例IBまたは実施例12記載の方法に従い
、制限酵素分析および以後の使用のためにプラスミドp
OJ354DNAを調製した。
H1中間体プラスミドpOJ355の構築1、プラスミ
ドpOJ354DNAのPstl消化 上記G記載のごとくにして調製されたプラスミドpOJ
354DNA約5μg(5μのをl0XPstlバツフ
アー10Xf2、制限酵素PstflμI2(約30単
位)および水84μQに加え、37°Cで2時間反応さ
せた。反応後、DNAをエタノール沈澱させ、TEバッ
ファー20μQに再懸濁した。
2.7二−ルしたポリリンカーの調製 ポリリンカーの調製に用いた1本鎖DNA断片は5ys
tec1450A DNA合成装置(S ystec。
T nc、、  3815 Chandler Dri
ve、 Minneapolis、MN 55401)
またはABS  380.A DNA合成装置(App
lied B iosystems、 T nc、、 
 850  Lincoln Centre Driv
e、  Foster C1tyCA  94404)
のいずれかを用いて化学合成された。当業者には多くの
DNA合成装置が知られており、該断片の製造に用いる
ことができる。さらに、この断片は、実質上、イタクラ
ら[(r takura)、サイエフ ス(S cie
nce)、198 : 1056]およびフレアら[(
Crea)、プロシイーディングズ・オブ・ナショナル
・アカデミ−・オブ・サイエンシイ−ズUS A(Pr
oc、Natl、Acad、 Sci、US A)、7
5:5765]の方法に従い、常法通り合成することが
できる。
1本鎖を合成した後、以下のようにして鎖1(#806
.28.58μM/μのと鎖2(#807.18.39
μM/μのとをアニーリングした。エッペンドルフ管内
で鎖1(18μQ、〜500pM)と鎖2(28μQ、
〜500pM)とを混合し、10×TMバッフy  (
0,5M Tris−HCQ(pH7,6)および0 
、1 M MgC122) 3μQを加えた。管を沸騰
している水浴にいれ、沸騰水浴から取り出し、室温で徐
々に冷却させ、4°Cて一夜放置した。この工程で1本
鎖がアニーリングし、2本鎖ポリリンカーが形成された
。このようにして構築されたポリリンカーは式。
で示される構造を有し、以下の制限酵素切断部位を含有
する Pstl、 HindlI[、S ph I、X
baI、Bgl、■、S ca I SK pn I、
EcoRI、N5il。
3、  Pstl消化プラスミドpOJ354DNAと
ポリリンカーとの結合 Pst[/ljl化プラスミドpOJ354DNA約1
μ9(5μQ)を上で調製した、アニーリングしたポリ
リンカー4μL  l0XT4DNA’、Iガ−セ’4
μQおよび水2・6μQに加え、16°Cで一夜インキ
ーヘートした。このライゲーションによってポリリンカ
ーの方向性に関してのみ異なるプラスミドpOJ355
およびpo J 356が生成した。プラスミドpo 
J 355の制限部位および機能地図を添付の第8図に
示す。ライゲーション反応混合物約10μQを用い、実
質上、実施例4記載の方法に従い、大腸菌に12  J
M109を形質転換した。アブラマイシン200μ9/
 y(l含有TY−寒天プレート上で形質転換体を選択
した。実質上、実施例IBまたは実施例12記載の方法
に従い、制限酵素分析のおよび以後の使用のためにプラ
スミドpOJ355およびプラスミドpOJ356DN
Aを1凋製した。
■ 中間体プラスミドpOJ361の構築プラスミドp
o J 355のD ra I 〆肖化上記日記載のご
とくにして調製されたプラスミドpOJ355DNA約
5μg(5μのを10XDralバツフア (60mM
  NaCQ!、60mMTris1(C&(p)I 
7 、5 )、60mM MgCLおよび10mM D
TT)10μ(、制限酵素Dral(Ahamのアイソ
ンゾマー)lμQ(約20単位)および水84aQに加
え、37°Cて1時間反応さけた。反応後、DNAをエ
タノール沈澱させ、TEバッファー20μQ(こ再懸・
ン蜀した。
2 プラスミドplJ702+)NAのBc目l肖化お
よびフレノウ処理、および〜lkb断片の’111’M
プラスミドpl J 702 DNA(本実施例のB)
1′:J5μy(5μのを1OXBcllバッフy−(
500mM NaCQ、、500 mM T ris 
−1(CQ、(pH80)、100 mM MgC(1
,およびlomMDTT)10uQ、制限酵素Bc11
 111(約10i1位)および水84μQに加え、5
0’Cて1時間反応させた。70’Cて1時間インキュ
ベートし熱的に反応を停止した。
実質上、実施例3B記載の方法に従い、Be1l消化プ
ラスミドpI J 702DNAをフレノウ酵素で処理
した。次いて、Bcl■消化し、フレノウ処理したプラ
スミドpl J 702DNAを1%アガロースゲル電
気泳動にかけた。実質上、実施例3B記11i1iの方
法に従い、〜1kbBcll(フレノウ)断片を単離し
た。この断片をTEバッファー20μQに再懸濁した。
3、Dralメ肖化プラスミドpo J 355とBc
lI(フレノウ)消化ブラスミl’p[J 702 D
NAとの結合 D ra H消化プラスミドpo J 355約1μg
(5μのをDell(フレノウ)消化プラスミドplJ
702DNA2μe(約0.Iμg)、l0XT4DN
Aリガーセ4μLT4DNAリガーセlμQ(約500
単位)および水32μQに加え、37°Cて一夜インキ
ユベートして平滑末端を結合させた。このライゲーショ
ンによって中間体プラスミドpOJ361か生成した。
プラスミドpOJ361の制限部位および機能地図を添
付の第9図に示す。
このライゲー/ヨン反応混合物約10μQを用い、実質
上、実施例8記載の方法に従い、S グリセオフスカス
を形質転換した。チオストレプトン25μg/*0含有
改良R2寒天プレート上で形質転換体を選択した。プレ
ートからコロニーを選択腰チオストレプトン25 u 
g/ηQ含?T ′「S B培地で−(夕培養した。実
質上、実施例I2記載の方法に従い、制限酵素分析のお
よび以後の使用のためにプラスミl”pOJ 361 
DNAを調製した。
このようにして得たプラスミドpOJ361DNAをT
Eバッファー20μQに再懸濁した。このDNA約5μ
Qを用い、実質上、実施例4記載のごとくにして大腸菌
K12JM109を形質転換した。アブラマイシン20
0μg7yρ含有TY寒天プレート上で形質転換体を選
択した。生成したコロニーを選択し、実質上、実施例1
2記械の方法に従い、プラスミドDNAを稠fflした
J ファスミドpOJ、102の1.′l築1 プラス
ミドpB 1uescript  S K ’の、へh
allI消プラスミドpBluescript SK”
 DNA(実施例1)約3μ9(3μ+りをIO×Ah
a■バッファー10μQ1制限酵素l\ham(Dra
lのアイソシゾマー)1uQ(約20 tjx位)およ
び水86μ(1m加え、37°Cで2時間反応させた。
反応後、D N Aをエタノール沈澱させ、TEバッフ
ァー20μQに再懸濁した。
2 プラスミドpOJ361DNAのXmn1/Eco
RI消化およびフレノウ処理、および〜45kb断片の
単離 プラスミドpOJ361DNA(上記I)約10μg(
10μQ)をlOXXmnlバッファーlOμQ、制限
酵素Xmn!  1μ0.(約10単位)および水79
μQに加え、37°Cて1時間反応させた。次いで、こ
のXm口I消化物にEcoR1バッファー11μQおよ
び制限酵素EcoR11μQ(約20単位)を加え、3
7°Cで2時間インキュベートさせたXmn I / 
EcoRl i白化プラスミドpOJ36]D N A
を実質上、実施例3B記載の方法に従い、フレノウ酵素
で処理し、次いて、フレノウ処理した消化物を1%アガ
ロースケル電気泳動にかけた。
実質上、実施例3A記載の方法に従い、〜4.5kbX
mnl / EcoRI (フレノウ)断片を単離し、
TEバッファー20ttρに再懸濁シタ。
3、プラスミドpOJ361DNAの〜4.5kbXm
nI/EcoRI (フレノウ)断片とAhaIII消
化プラスミドpB 1uescript S K ” 
D N Aとの結合プラスミドpOJ361DNAの〜
4.5kbXmnI/EcoRI(フレノウ)断片約0
.5μ9(5μのをAhaII!消化プラスミドpB 
1uescript S K ’ DNA5μQ(約0
.15μy)、IQxT4DNAリカーセ4aci、T
4DNAlガーセlμ(!(約500単位)および水2
5μQに加え、37°Cて一丙イノキユヘートして平滑
末端を結合させた。このライゲーションによって所望の
ファスミトpOJ402か生成した。ファスミドpOJ
402の制限部位および機能地図を添付の第10図に示
す。
このライケーンフン反応混合物約10μQを用い、実質
上、実施例・1記載のごとくにして大腸菌に12  R
RIを形質転換した。TAXIプレート上で形質転換体
を選択した。実質」二、実施例12記載の方法に従い、
制限酵素分析および以後の大腸菌に12JM109の形
質転換のためにファスミトpOJ402DNAを;’J
、!]装した。
実施例14 プラスミドpOJ192の構築A、中間体
プラスミドpOJ189の構築l プラスミドpOJ1
60DNAのXmn1/1−1 i nd III 消
化および〜59kb断片の単離プラスミドpOJ160
DNA(実施例1)約20μ9(20μのを10XXm
nlバッフy −10tiQ、制限酵素Xmn+  3
μQ(約18単位)および水64μQに加え、37°C
て2時間反応させた。1肖化物を実質上、実施例3B記
載の方法に従って1%アカ狛−スゲル電気泳動にかけ、
〜5 、9 kblJ−r片を単離した。この〜5.9
kb断片をTEバッファー20μQに再懸濁した。
2  コスミ ドpKC462aDNAのEcoR+/
1−1 i nd ’H消化およびフレノウ処理コスミ
ドpKC462a(実施例13A)約30μy(15μ
のを10XEcoRIバツフアー10uQ、制限酵素E
coR13μQ(約15単位)および水7211Qに加
え、37°Cて3時間反応させた。次いで、このEco
RI消化物を実質上、実施例3B記、誠の方法に従い、
フレノウ酵素で処理した。フレノウ処理の後、DNAを
エタノール沈澱に付し、1XHindlTIバツフアー
100μQに再1面濁し、制限酵素1(i nd II
I 37112(約60単位)を加えた。反応混合物を
37°Cで2時間インキユヘートし、1%アガロースケ
ル電気泳動にかけた。実質上、実施例3B記載の方法に
従い、〜5.7 kb EcoRI (フレノウ)/H
ind[II断片をケルから単離し、T E ”” 。
ファー20μQに再懸濁した。
3 プラスミドpOJ160の〜5.9 kb Xmn
I/ト(indlll断片とコスミドpKC462aの
〜57kb EcoR[(フレノウ)/Hindlll
断片との結合プラスミドpOJ160の〜5.9kbX
mnl/1(indI11断片約2μy(4μQ)とコ
スミドpKC462aの〜5.7kbEcoRl (フ
レノウ)、/ II 1ndlII断片杓2μ9(4μ
Q)を1QXTlIDNAリガーセノザノフアー4μQ
、T=IDNAリカーセ1/10.(約500単位)お
よび水27μρに加えた。このライケーンフン反応混合
物を16°Cで一夜イノキュへ−!・した。このライゲ
ーションによって中間体プラスミl=’po J l 
89か生成した。
このライケーンフン反応混合物約10μρを用い、実質
上、実施例4記載のごとくにして大腸菌K12  JM
109を形質転換した。TAX Iフレート上、30’
Cで形質転換体を選択した。実質上、実施例IBまたは
実施例12記載の方法に従い、制限酵素分析および以後
の使用のためにプラスミドpOJ189DNAを調製し
た。
B プラスミドpOJ192の構築 上記A記載のごとくにして調製されたプラスミドpOJ
189DNA約20μg(20μのを10XAhalI
Iバツフアー10μ&、制限酵素A ha III 2
μQ(約6巾位)および水68μQに加え、37°Cて
8分間反応させた。Aha1部分消化の後、D N A
をエタノール沈1殿さl゛、′I’ IEノ\7フアー
20μQ(こ再%% iにUシtこ。
プラスミドpOJ189DNΔのAhalII(部分)
消化物約2μg(2μg)を1OT4DNAリガーセバ
ッファ−4μN!、T4DNAリガーゼ1μQ(約50
0単位)および水33μgに加え、16°Cで一夜イン
キユベートした。インキュベー7−3ン後、反応混合物
を70°Cて20分間熱処理して反応を不活化した。次
いで、このライゲーション反応混合物40μ(lを1O
Xscal)’ノフy−(500mM Na(jl、 
60mM T ris−1(Cl2(pH7,5)、6
0mM〜1gCLおよびl OmM DTT) l O
ttQ、制限酵素5cal  311Q<約30単位)
および水50μQに加え、37°Cで2時間反応させた
。この5cal処理したライケーションC昆合物は所望
のプラスミl’po J l 92を含有していた。S
 ca l処理したi(、DNAをエタノール沈、毀さ
せ、′I″Eバッファー・toInに再lび濁1−だ。
Ahal旧1電化しライケーノヨンしたS ca l処
理プラスミドpOJ189DNA約10μgを用い、実
質上、実施例・1記載の方法に従い、大腸菌KI2J 
M 109を形質転換した。アブラマイジン200μ9
/1Q含有′FY−寒天プレート上、30°Cにおいて
大腸菌K 12  JM109/pOJ 189形質転
換体を選択した。アブラマイノン耐性大腸菌K 12 
 JM109/pOJ 189形質転換体をアンピノリ
ン100μq/yQ含有TY−寒天プレート上で平板培
養し、所望のプラスミドpOJ192の構築および選択
に際するプラスミドpOJ189からのアンピシリン耐
性遺伝子の欠失によるアンピシリン感受性を確認した。
プラスミドpOJ 192の制限部位および機能地図を
添付の第11図に示す。
実IA例15記載のストレプトマイセス・コエレウスの
ライブラリー構築に使用するために、実質上、実施例I
B記載の方法に従いプラスミドpOJ192DNAを調
製した。
実施例15 ストレプトマイセス・コエレウスのケノム
ライブラリーの構築 A、ヘクターpOJ192DNAの調製プラスミドpo
 J 192 DNA約30μg(30tt(1’)を
l0XHpalバツフy  (100mMTrisII
 CC(pi(7,5)、 l Q □ mM MgC
Q2、 JonMK(1!および1mM DT′T’)
I OμQ、制限酵素Hpal l OuQ(約50中
位)および水50/l(2中で37°Cにおいて3時間
消化した。BAP(i11閑性アルカリホスファターセ
)約2 、5 jlifi(25μQ)[インターナシ
ョナル・バイオチクノロシーズ・インコーボレイテノド
(l nLcrnational  B iot〔!c
hnol。
gies、 I nc、 )、P、0.130X l 
565、New Haven、CT  06506]を
加え、60°Cて2時間インキュベートした。DNAを
フェノール(2回)およびS evag(2回)抽出し
た後、エタノール化、+8させた。次いで、DNAをT
Eバッファー100μgに再1市濁した。再!冒濁した
DNA5Qμρを10X10XBaバツフアー中、制限
酵素B amHl 5 tt (Ic約50 ’ii位
)および水3511Qにより、37°Cで3時間消化し
た。再度、DNAを上記のごとくフェノールおよびS 
evagで抽出し、エタノール沈1毀させ、最後にTE
バッファー50μQに再U濁した。
B 挿入体D N Aの171制4 ストレフ!・マイセス・コエレウス(N1マF<L22
51)をスピラマイ/ン(/グマ)100μ9を袖先し
たT S +31’7+也250 rq(l中で30°
Cにおいて16時間培養した。遠心(8,000で10
分間)して細胞を収[Φし、ライメス(溶解)ミックス
(30QmM’/ ヨ糖、25mM Tris−HCl
2(1)H8,O)および25mM EDTA)l O
zGに再1ツ濁し、リソチームを終濃度1m9/、wQ
となるように加え、37°Cで10分間インキュベート
した。次いて、フロテイナーゼKを終濃度200μg/
yttQ、 S D S (j+デンル硫酸ナトリウム
)を終濃度2%となるように加えた。得られた混合物を
70’Cで10分間インキュベートした後、水上で冷却
した。混合物を1M酢酸カリウムに調節し、水上に30
分間放置した。この物質をフェノール飽和T Eて抽出
して液層を分離させ、水層を静かにS evag抽出し
た。
再び液層か分離し、水層の核酸をエタノール沈澱させた
。沈澱を70%エタノールで洗浄し、TEバッファー5
11IQに溶かした。このDNA溶液にRNaseAを
終濃度50μti/m(lとなるように加えた。
次いて、この溶液を37°Cで30分間インキュヘ−ト
し、フェノール(2回)およびS evag(2回)抽
出したiLエタノール沈澱させた。次いで、DNAをT
Eバッファー1z((545μy/mのに再溶解し、λ
DNADNA3μQズ)標準と一緒に0゜3%アガロー
スケル電気泳動にかけて分子量を決めたところ、平均分
子量は70kb以上であることが分かった。
次いで、ストレプトマイセス・コエレウスの染色体DN
A約50μg(l OOμρ)をl X M bo I
バッファ  (l 00mM NaC2,10mM T
 ris −HCl2(pH7、4)、10mM Mg
CQ2およびl mM D ′PT)500μρ中、制
限酵素Mbol約30単位)とfMに37°Cで15分
間インキュベートシた。この特定の条件によれば染色体
D N Aの所望の部分断片(ヒを行い得ることか経験
的に見いたされた。
D N Aをフェノール、S evag抽出し、′FE
バッファー100μQに溶解した。
次いで、ストレプトマイセス・コエレウスMb。
1部分約25μ9を1xBAPハソファ−500μσ中
、BAP処理(25単位、70’Cて30分間)した。
DNAをフェノールおよびS evagで抽出し、TE
バッファー1.00μQに1容解した。このDNAの分
子量を0.3%アカロースケル上で見積ちり、30 4
0kbであることが分かった。
CベクターDNへと挿入体DNAの結合pOJ192(
本実施例の八で調製)約1.25 ng(4μのをスト
レプトマイセス・コエレウスM 1301部分(本実施
例のBで調’!2) 500 B(4μのと混合し、1
mMATPとしたl Q X T 、4 D N I〜
リカーセパソファ−4μQ中てT 4:l D N t
〜す7リーセ、杓、100単位により結合させた。ライ
ケーン3フ反応は16°Cで16時間行った。
D インビトロでのパッケージング(詰め込み)バノケ
ー/ングはライケー/ヨンl昆合物(ハイブリッドベク
ターD N 、A〜62.5ny)約−1μeをGIG
Δr)ACKバノケー/ノグキノト(ストラタジーン)
に入れて行われた。このビ昆合物にファージバッファー
(室温で2時間、l OmM ′T’ risl−I 
CC(pH7、4)、lomMMgs○4および0,0
1%セラチン)を加えた。
E、大腸菌K12  SF3の形質導入パッケージング
したコスミド約200μQ、CヘクターD N A 2
5 ng)を02%マルトースおよび10mM硫酸マグ
ネシウムを補充したトリプトン酵母エキス中で培養した
大腸菌KI2 5F8(500μのに吸着させた。10
mM Tris(pH8,0)およびl OmM Mg
C122中、37°Cて10分間、吸着させた。細胞を
TYブロス5ησ中、30°Cて2時間培養し、形質導
入完了体をアプラマイジン200 tt g/ 、w(
lを補充したTYプレート上、30°Cで選択した。形
質導入された細胞0.lxσの平板培養で約6,000
コロニーが得られ、形質導入効率は約2×10°形質導
入完了体/μりであった。
F ストレプトマイセス・グリセオフスカスの形質転換 所望の形質転換は、上記Eで得た全ての分取したDNA
3μQ(約15μ9)を用い、実質上、実施例8記載の
方法に従い、行われた。S グリセオフスカス形質転換
体をアプラマイジン25μ9/xQ含4TR2寒天プレ
ート」−で、ザ択した。約60ooot囚の形質・1伝
換(本か得られた。l(固のブレートから得た約7.0
00個の形質転換体コロニをホモジナイズし、アブラマ
インノ25μgy’ytQおよびスピラマイ/ン0.1
μ9/7ρ倉有’FSB培1巾1.0!liQ中、30
°Cて一皮培存した。翌日、この−V培養物〜0 、5
 、w(lをアブラマイノン25μgZpQ&有1’ 
S B寒天プレートて平(反培篠した。プレーI・を3
0℃で7日1川インキユヘートした。アフ。
ラマイシン1h)1性かつスピラマイノン:fjJ 性
の形質転換体を得た。
上記で得た形質転換体の抗生物質耐性スペクトルを以下
のように、ティスフ分析法で1〕、1へた。スピラマイ
シン1耐性形質転換体クローンをアブラマイジン25μ
y/ m(l含有TSB5aj中て培養した。
−(り培養物をホモジナイズし、ホモジナイズした培谷
物0.2ffCを、栄篠寒天重層4.iCを用い、アブ
ラマイノン25μ9/1Q含有]’ S 13寒天プレ
ートに!n層した。マクロライドティスクバノト(ディ
スクパッドあたリマクロライト抗生物質20μ9)を固
化した重層に置き、30°Cで3日間インキュベートし
た。得られたコロニーはS、コエレウスのようにピクロ
マイシンおよび他のマクロライド抗生物質、例えばエリ
スロマイシン、リンコマイシン、スピロマイシンおよび
ロサマイシンなどに対して耐性であったが、タイロジン
には感受性であった。実質上、実施例12記載の方法に
従い、そのようなピクロマイジン耐性コロニー培養物4
111Qを培養してプラスミドを調製し、TEバ、ファ
ー20μQに再懸濁した。このプラスミドDNA101
1Qを用い、実質上、実施例4の方法に従い、大腸菌K
I2  JM109を形質転換した。形質転換体をアプ
ラマイシン200μg/:rrQを補充したTYプレー
ト上、37°Cで選択した。プラスミドpOJ208を
含有する所望の形質転換体を得た。プラスミドpOJ2
08はS、コエレウスの〜35kbを含有していた。
実施例16 ファスミドpo J 405の構築A、中
間体プラスミドpo J 303の構築実施例15で調
製したプラスミドpOJ208D N A約5μ!?(
5μのを1OXXholバツフアー(500mM  N
aCQ、500 mM  T ris−f(CQ(pH
8、0)、] 000mMMgCQ2および10mMD
TT)10μQ、制限酵素Xhol  lμQ(約10
単位)および水84μρに加え、37°Cで2分間反応
させて部分消化した。70’Cて15分間インキュベー
トして熱不活化し、反応を止めた。DNAをエタノール
沈澱に付し、TEバッファー20μaに再懸濁した。
pOJ208DNAのXhoI(部分)消化物約1μy
(4μρ)を10XT4DNAリガーゼバツフアー4μ
(、T4DNAリガーゼlμQ(約500単・・位)お
よび水31μQと一緒に16°Cで一夜インキユヘート
することにより結合させた。ライゲーションにより所望
の中間体プラスミドpOJ303か生成した。ライゲー
ション反応混合物40μQの内10μQを用い、実質上
、実施例4記載の方法に従い、大腸菌K12  JM1
09を形質転換した。形質転換体をアブラマイジン20
0μg/ w(1含有TY−寒天プレート上、37°C
で一夜培養し、選択した。
実質上、実施例12記載の方法に従い、プラスミドpO
J303DNAを調製し、実施例15記載のごとく、こ
れを用いてマクロライド耐性を試験するためにS グリ
セオフスカスの形質転換を行った。
B 中間体プラスミドpo J 321の溝築プラスミ
ドpOJ303DNA約5μg(5μのを10XNco
Tバツフア(1,5M NaCQ、60+nM Tri
s−HCQ(pH7,5)、60 mM MgCQ、お
よび10mM DT T)l Ou(1、制限酵素Nc
11μσ(約5単位)および水84μρに加え、37°
Cで1時間反応させた。反応後、エタノール沈澱に付し
、TEパンファー20μQに再懸濁した。
Ncoll肖化プラスミドpo J 303(4μ0を
1QxT4DNAリガーゼバツフアー4μρ、T4DN
AリガーセlμQ、(約500単位)および水31μ夕
中で16°Cで一夜インキユベートすることにより結合
させた。このライゲーションによって中間体プラスミド
pOJ321が生成した。
このライゲーション反応混合物約10μQを用い、実質
上、実施例4記載の方法に従い、犬陽閑に12  JM
109を形質転換した。アブラマイジン200μ9/m
(l含有TY−寒天プレート上、37°Cで形質転換体
を選択した。大腸菌KI2JM109/pOJ321の
培養物はナショナル・J−ジョナル・リサーチ・ラボラ
トリ−ペオリア、イリノイに、受託爵号NRRL  B
−18389(受託日、1988年7月22日)の下で
寄託されている。
実質上、実施例12記載の方法に従ってプラス’E、 
ドpOJ 321DNAを調製し、実施例15記載の方
法に従ってマクロライド耐性を試験するためにR’A 
D N Aを用いてS、グリセオフスカスを形質転換し
た。
G、ファスミドpo J 40のhW築プラスミドpO
J321DNA約20μg(20uQ)をLOXPvu
HバッファーXOμσ、制限酵素Pvull  3μR
(約60単位)および水67μ+E加え、37°Cで2
時間反応させた。反応後、消化物を1%アガロースゲル
電気泳動にかけ、実質上、実施例3B記載の方法に従っ
て〜2.8kb PvuII断片を単離した。この断片
をTEバ、ファー20μQに再懸濁した。
実施例3記載のごとくにして調製されたファスミ ドp
OJ401DNA約5μg(5μり)をIO×Smal
バッフy −(60mM Tris−HCf2(pH7
゜5)、60 mM MgC(l、、200mMKC(
および10mM DTT)loμc、制限酵素Smal
  2uQ(20単位)および水83μgに加え、37
°Cテ2時間反応させた。反応後、DNAをエタノール
沈澱させ、TEバッファー20μQに再懸濁した。
プラスミドpOJ321の〜2.8kbPvull断片
”約1μg(5μC)とS ma I iM化プラスミ
ドpOJ401 DNA 1 μg(5ttのとを10
 X ′r4 D N A IJガーゼバッファー4μ
Q、T4DNAリガーセlμQ(約500単位)および
水25μρと一緒に37°Cて一夜インキユベートする
ことにより結合させた。このライゲー/ヨンによって所
望のファスミドpo J 405が生成した。ファスミ
ドpo J 405の制限部位および機能地図を添付の
第12図に示す。
このライゲーション反応混合物約10μρを用い、実質
上、実施例4記載の方法に従い、大腸菌K12JM10
9を形質転換した。形質転換体をTAX Iフレート上
で選択し、実質上、実施例IBまたは実施例12記載の
方法に従い、制限酵素分析および形質転換のためにプラ
スミドDNAを調製した。このようにして得られたファ
スミドpOJ405DNAを用いてS グリセオフスカ
ス形質転換体し、アブラマイシン25μ9/vrQ、含
有R2寒天プレート上で選択した。ファスミドpOJ4
05のS、グリセオフスカスへの導入(トランスファー
)により、ディスク・アッセイにおいてS フェレシス
が示したと同様のマクロライド抗生物質耐性表現型か付
与された。このことは、pOJ401が、外来性DNA
、この場合には、広範囲におよぶマクロライド抗生物質
に対する耐性を付与するS8フエレウス由来のピクロマ
イジン耐性遺伝子をクローニングする二とかでき、スト
レプトマイセス内で発現させるのに適切なベクターであ
ることを証明するものである。制限酵素分析の結果は、
形質転換されたS、グリセオフスカスが無傷のファスミ
ドpo J 405を含有していることを示していた。
【図面の簡単な説明】
第1図はプラスミドpOJ160の制限部位および機能
地図、第2図はファスミドpOJ401の制限部位およ
び機能地図、第3図はコスミドpKC462aの制限部
位および機能地図、第4図はプラスミドplJ702の
制限部位および機能地図、第5図はプラスミドpo J
 326の制限部位および機能地図、第6図はプラスミ
ドpOJ348の制限部位および機能地図、第7図はプ
ラスミドp[J352の制限部位および機能地図、第8
図はプラスミドpOJ355の制限部位および機能地図
、第9図はプラスミドpOJ361の制限部位および機
能地図、第10図はファスミトpOJ402の制限部位
および機能地図、第11図はプラスミドpOJI92の
制限部位および機能地図、第12図はファスミl−’p
o J 405の制限部位および機能地図の模式図であ
る。 特許出願人 イーライ・リリー・アンド・カンパニ代 
理 人 弁理士 青 山  葆(外2名)FIG、1 FIG、3 FIG、2 F I G、 4 ビVu 11 FIG、5 FIG、7 FIG、6 FIG、8 FIG、9 FIGII FIG、lo FIG、+2

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1、a)大腸菌内で機能的なレプリコン、 b)ストレプトマイセス内で機能的なレプリコン、 c)Fピリを有する大腸菌のフィラメント状バクテリオ
    ファージの複製起点および形態形成シグナルを含有する
    DNAセグメント、および d)感受性宿主細胞に導入されたとき、少なくとも1個
    の抗生物質に対する耐性を伝達する1またはそれ以上の
    DNAセグメントを含有する組換えDNAファスミドシ
    ャトルベクター。 2、pOJ401、pOJ402またはpOJ405か
    らなる群から選択される請求項1記載の組換えDNAフ
    ァスミドシャトルベクター。 3、一本鎖DNAまたは二本鎖DNAである請求項1記
    載の組換えDNAファスミドシャトルベクター。 4、大腸菌のレプリコンが、プラスミドpBR322、
    pBR325またはpBR328のレプリコン含有断片
    からなる群から選択されるものである請求項1記載の組
    換えDNAファスミドシャトルベクター。 5、ストレプトマイセスのレプリコンがプラスミドpI
    J101、SCP2^*、SCP2、pVE1、pJV
    1、pUC17、SLP1、SLP1.2、pBT1、
    pSVH1、pFJ103、pTA4001、pSRC
    1−6、pSL1、pMG200、pSF765、pS
    K2、pSG2、pSG5、またはpNM100のレプ
    リコン含有断片からなる群から選択されるものである請
    求項1記載の組換えDNAファスミドシャトルベクター
    。 6、アクチノマイセスおよび大腸菌からなる群から選択
    される、請求項1記載の組換えDNAファスミドシャト
    ルベクターを含有する形質転換宿主細胞。 7、ストレプトマイセス・アンボファシエンス、ストレ
    プトマイセス・アンチビオチカス、ストレプトマイセス
    ・アベルミチリス、ストレプトマイセス・クリセウス、
    ストレプトマイセス・シラタス、ストレプトマイセス・
    エウリサーマス、ストレプトマイセス・フェレウス、ス
    トレプトマイセス・フラディエ、ストレプトマイセス・
    フンジシジカス、ストレプトマイセス・グリセオフスカ
    ス、ストレプトマイセス・ハルステジ、ストレプトマイ
    セス・ハイグロスコピカス、ストレプトマイセス・マク
    ロスポレウス、ストレプトマイセス・ミカロファシエン
    ス、ストレプトマイセス・ナルボネンシス、ストレプト
    マイセス・プラテンシス、ストレプトマイセス・サーモ
    トレランス、ストレプトマイセス・トヨカエンシスまた
    はストレプトマイセス・ベネズエラエからなる群から選
    択される請求項6記載の形質転換宿主細胞。 8、ストレプトマイセス・フラディエ/pOJ401、
    ストレプトマイセス・フラディエ/pOJ4O2、スト
    レプトマイセス・フラディエ/pOJ405、ストレプ
    トマイセス・グリセオフスカス/pOJ401、ストレ
    プトマイセス・グリセオフスカス/pOJ402、スト
    レプトマイセス・グリセオフスカス/pOJ405、ス
    トレプトマイセス・トヨカエンシス/pOJ402、ま
    たはストレプトマイセス・トヨカエンシス/pOJ40
    5である請求項7記載の形質転換宿主細胞。 9、大腸菌である請求項6記載の形質転換宿主細胞。 10、大腸菌に12XL1−Blue/pOJ401、
    大腸菌に12XL1−Blue/pOJ402、または
    大腸菌K12XL1−Blue/pOJ405である請
    求項9記載の形質転換宿主細胞。 11、1またはそれ以上の宿主細胞制限系を迂回するた
    めにベクターを用いる方法であって、a)該ベクターの
    一本鎖DNAを調製し、 b)工程a)で調製したDNAでアクチノマイセス宿主
    細胞を形質転換することからなる方法。 12、該ベクターがpOJ401、pOJ402または
    pOJ405からなる群から選択されるファスミドシャ
    トルベクターである請求項11記載の方法。
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