【発明の詳細な説明】[Detailed description of the invention]
遺伝子工学的に得られた融合タンパク質をコラゲナーゼによって特異的に分解す
ることjこよってペプチドを製造する方法
背景技術
遺伝子工学によって、特に比較的長いアミノ酸配列の場合には従来の化学的合成
法よりもはるかに優れている、ペプチド及びタンパク質の新規製造方法が開発さ
れた。これによって初めて、かつては入手し難かった物質、例えば成長ホルモン
、インターフェロン及び多数のペプチドホルモンが十分な量で利用されうる[E
、 A、 O,Marston、 Bioche+n、 J 、240. 1〜
12(1986)]。
ポリペプチドの遺伝子工学的製造方法は、製造すべきアミノ酸配列のコドンを有
する適当なデオキシリボ核酸(DNA)を、新しく導入される遺伝子情報の複製
及び発現を可能にする形で、適当な宿主細胞に移すことを基礎にしている。宿主
細胞としては、小乃至中の大きさのペプチド(約100個未満のアミノ酸)の場
合には、好ましくはEscherichia coliのような細菌を使用する
。
ところで、前記範囲の大きさのポリペプチドは、顕著な三次構造によって保護さ
れていないために、細胞内ノ細菌プロテアーゼによって極めて容易に攻撃される
ことが判明した。この事実は、発現が製造すべきポリペプチドが直接最終的な形
で又は場合によってハ付加的なN末端メチオニン基をもって形成される(所謂直
接発現)ように制御される場合には、著しい収量の減少又は−凍土合成生成物の
多大な損失をもたらす。
これに対して所望のアミノ酸配列は、先づはるかに大きい先駆物質分子、所謂融
合タンパク質として合成される場合Jこは一般Iこ良好な収量で製造することが
できる。
従って小さい及び中等大のペプチドを製造するためには、良好に発現可能であり
、またできるだけ調節可能でもある細菌遺伝子と製造すべきペプチドのDNA配
列七から試験管内の新しい結合によってプラスミドベクター上にハイブリッド遺
伝子を形成することより成る変法が有利になる。前記ハイブリッド遺伝子は、細
菌の原調節要素(プロモーター、リポソームの結合位置及びターミネータ−)な
らびに細菌の遺伝子生成物のN末端アミノ酸のコドンのできるだけ大きい部分を
有し、その後に新しいペプチドのコドン及び終結コドンが続く。プラスミドベク
ターを適当な細菌宿主細胞中に移した後形質転換によって、ハイブリッド遺伝子
は、相応の細菌タンパク質から誘導されるN−末端部分及び製造すべきペプチド
のアミノ酸配列から成るC−末端部分を有する融合タンパク質の生合成を制御す
るゎこの融合タンパク質は形質転換された細胞の発酵によって容易に多量に製造
され、単離されうる。ハイブリッド遺伝子を形成するためには種々の細菌遺伝子
が使用されt:、しかし好ましくは酵素、すなわちβ−ガラクトシダーゼ、β−
ラクタマーゼ、アントラニル酸シシテターゼ、アルカリ性ホスファターゼ及びク
ロルアンフェニコール−アセチルトランスフェラーゼの遺伝子が使用された。
前記方法によりペプチドを製造する場合の最終段階は、融合タンパク質の正確な
分解である。このような分解を可能にするためには、ハイブリッド遺伝子は、後
期の融合タンパク質の細菌部分と新しく製造すべきペプチド配列との間に、容易
にかつ選択的に分解できるペプチド結合が存在するよう+: @成されなければ
ならない、小さい及び中等大のペプチドを遺伝子工学的に製造する場合、融合タ
ンパク質を分解するための、できるだけ広範囲に適用できる特異的方法の開発は
、従来は、十分に満足のいくように解決されない大きな問題でありた。
本発明の対象は、N末端に不所望な余分のアミノ酸を残すことなく、所望なペプ
チドの正確なアミノ酸配列を供給する、融合タンパク質を分解するだめの一般に
適用できる特異的方法である。
遺伝子工学的Jこ製造された最初のペプチド、例えば1056〜1063.19
77)又はヒトインシュリンのA鎖及びB 鎖(D、 V、 Goeddal等
、 Proc、 Natl。
Acad、 Sci、 TJSA 76、 106−110. 1979)は、
β−ガラクトシダーゼから誘導される相応の融合タンパク質からブロムシアン分
解によって遊離された。ブロムシアンは、メチオニンと次のカルボキシル位のア
ミノll[Net−X、この際Xは遺伝コードによって固定され7220個の何
らかのアミノ酸であってよい]との間の結合を選択的に分解する。この方法は、
当然メチオニンすら有しないペプチドに関して適用できるにすぎない。これは前
記3種のペプチドに関しても該当する。
同様な制限は、個々のアミノ酸の認識を基礎とする、すべての融合タンパク質分
解方法について認められる。さて、N末端部分とC末端部分との間の結合として
リシン、アルギニン又はグルタミン酸を含有する融合タンパク質が製造される。
この分解のためには、酵素トリプシン(J、 5hine等、 Nature
285 、456−461.1980)及びクロストリパイン(A、 D。
Bennett等、EPA Cz31363)C両酵素ともLys−X と A
rg −Xとの間の結合を開く)、ならびにGlu−Xの結合を切断するエンド
プロテイナーゼGlu −C(A、 D、 Bennett等、EPAO131
363)を使用する。同様に、リジンの後を特異的に分解するエンドプロテイナ
ーゼ Lys −C(Chem、 Hoppe −Seyler3 6 7 .
5upp1. Aug、l 9 8 6 、S−162、Abstr。
+9.01.03)も使用された。
正確に定義さJ]た数個のアミノ酸の配列内部の特異的結合を切断する方法があ
るならば、はるかに特異的となり、ひいてはより広範囲に適用することができる
。そこでP、 R,5zoka等(DNA5.l 1−20.1986)は、ア
ントラニル酸シンテターゼ及びラン成長ホルモンからの部分配列がAsp −P
ro配列を介して相互に結合されている融合タンパク質を、 Asp−Pro結
合が極めて酸不安定であるから酸を作用させて前記同成分に分解することに成功
した。しかしこの方法は、酸の作用時にまたその他のペプチド結合の切断も副反
応として考慮しなければならないという事実の他に、特に、結合配列から該ペプ
チドのN末端にプロリンが残っていて、これが多くの場合不利であるという欠点
を有している。融合タンパク質の配列Pro−Phe−His−Leu−Leu
−Val−Tyr内で2個のロイシン張基の間の結合を選択的に切断するために
使用したレニンとの反応の場合にも同様な限界を設けざるを得ない(J、 S。
Boger等、FPAO163573)、この場合には、しばしば不所望の余分
の3個のアミノ酸が残る。
λcllタンパク質の31個のアミノ酸から成るN末端部分を有する融合タンパ
ク質からヒトβ−グロビンを遊離するために、K、 Nagai及びH,C,T
hgersenはXa因子、つまり通常、プロトロンビンからトロンビンへの変
換を作用する血漿グロテアーゼを使用した。
同様にしてT、 1mai等は、9個の付加的N末端アミノ酸を有する融合タン
パク質を介してヒトプロレニンを製造するために、Iv記酵素を使用した。両者
の場合ともN及びC末端部分の間の移行部として、Xa因子によって認識されか
つArg−X(Xはヒトタンパク質の一番目のN*端アミノ酸である)の結合に
おいて切断される配列+ 1e−G 1u−G ly−Arg−Xが存在した。
従ってXa因子は、融合タンパク質の分解のために使用スべき酵素に対する必須
の要件を満足させるようl;思われる。しかしまた、前記認識配列を有する融合
タンパク質の分解はXa因子によって不可能である2例も報告された(に、 A
11en等、 Biol、 Chem、 )Ioppe −5eyler367
、5uppl 、Aug、] 986 、5.162 、 Abstr。
19 、01−03 ; H,hlayer等、 Biol、 Chem、 H
oppe−5eyler 367 、5upp1. Aug、1986 、S
285、 Absir、 05. 01−50) 。従ってXa因子を用いる方
法を一般的に適用することは不可能である。
また、(Asp) a Lys −Xの配列においてLysとXとの間の結合を
分解する酵素エンテロキナーゼの場合にも同様な制限を設けざるを得ない。R,
M、 Belagaje等(DNAユ、120.1984)は、確かに、前記配
列がN末端部分から遠く離れて存在する融合タンパク質から、エンテロキナーゼ
の天然基質であるトリプシノーゲンの場合と同様にこのエンテロキナーゼを用い
てヒト成長ホルモンを遊離した。しかしアルカリ性ホスファターゼき副腎皮質刺
戟ホルモンとが前記配列を介して結合された融合タンパク質をエンテロキナーゼ
で分解する実験は成功しなかった。
EP20290には、相応の構造を有する融合タンパク質を分解するためにコラ
ゲナーゼの高い特異性を利用する方法が記載されている。コラゲナーゼは、Pr
o−YJ: 1y−Proの配列(Yは遺伝暗号の20種のアミノ酸の任意のも
のであってよい)を認識し、YとGayとの間の結合を分解する。前記配列を有
する融合タンパク質から、N末端部にざらにコラゲナーゼ配列から由来するアミ
ノ酸たるGly及びProを有するペプチドが遊離される。これらのアミノ酸は
、他の酵素、すなわちボストープロリンージペプチジルーアミノベプチダーゼ(
PPDA)を用いてジペプチドとして除去することができる。
ところで、Pro−Y−Gly−Pro配列を有するペプチド及びタンパク質を
、クロストリジウム・ヒストリチクム(C1os tridium histo
lytieum) (EC3,4,24,3)からのコラゲナーゼであるクロス
トリジオペプチターゼAで分解する実験によって、前記の反応順序を適用して融
合タンパク質を介してペプチドを製造することは極めて限定された程度でしか行
い得ないことが判明した。なるほど、N1丁oepert等(第14回FEBS
会議の報告、1981)は、比較的小さい、半合成的モデルペプチド、厳密言え
ば化合物:Cbo−Gly−Pro−Leu−Gly−Pro−インシュリンA
鎖(ウシ)が前記図式に従ってクロストリジオベプチターゼA及びPPDAと反
応し、期待された反応生成物が良好な収量で得られることを証明することができ
た。またE。
Wuensch等(Hoppa−Seyler’s Z、 Physiol、
Chem。
362.1285−1287.1981)も、他のモデルペプチドの反応の場合
に同様な結果を得た。しかるに、Pro−Y−Gly−Pro配列を宵する41
1の天然タンパク質に関しては、2種のみにューロフインン■及びランカタラー
ゼ)がクロストリジオペプチターゼAで特異的に分解され、この分解はまt;シ
スティン側鎖がS−スルホネートに変換した後のみであった。しかも酵素の比較
的大きい過剰でも、定量的反応は達成され得なかった( M、 Toepert
等、第14回FEBS会議報告、1981)。
西独国特許出願第P3731875.6号明細書には、E、 coliのアルカ
リ性ホスファターゼから得られる融合タンパク質を介して、副腎皮質刺戟ホルモ
ンを製造するための方法が記載されている。この場合にも、細菌タンパク質配列
と目標ペプチドとの間にテトラペプチド配列Pro−Y−Gly−Pro (Y
は遺伝暗号の20種のアミノ酸の任意のものを表わす)を有する融合タンパク質
が、なるほど所定の位置でクロストリジオペプチターゼAで特異的に分解されう
るけれども、反応速度が極めて低いことが判った。
J、 Germino及びり、 Ba5tia (Proc、 Natl、 A
cad。
Sci、USA 81.4692〜4696..1984)は、N及びC末端部
の間の結合部分としてProa −2−コラーゲンからの約60個のアミノ酸か
ら成る配列を有する融合タンパク質を製造した。このタンパク質は、コラゲナー
ゼによって相応のコラーゲン自体と同様j二良好に分解された。しかし、該融合
タンパク質は約60個のアミノ酸の配列内のどの位置で正確に分解されるのか判
らない。また、この配列の程度の差こそあれ大きい残分が、C末端分解生成物の
N末端部になお存在していることも判明した。従ってこの変法は、正確に規定さ
れf−N末端部を有するポリペプチドを製造するためには不適である。
発明の開示
本発明の本質は、式I:
H,N−Z、−χ−(Pro−Y−(、Iy)、−Pro−Z、−CooH(I
)[式中、n > 2であり、X及びYは遺伝暗号によって決定される20種
のアミノ酸の任意のものを表わし、2、は細菌のアミノ酸配列を表わし、2.は
遺伝暗号による任意のアミノ酸から成る目探ペプチドを表すすjで示される融合
タンパク質から、アミノ酸配列−X−(Pro−Y−Gly)s−Pro−(こ
こでX及びYは遺伝的にフード可能の7i)酸の任意のものを表わし、n〉2で
ある)の後に絖〈C末端タンパク質配列を、コラゲナーゼ及びポストプロリンジ
ベチジルアミノペグチダーゼ(PPDA)で酵素的に分離することを特徴とする
、目標ペプチドの製造方法にある。
まに本発明は、請求の範囲第1項から第6項までに記載の式■で示される融合タ
ンパク質及びその製造方法、式1で示される融合タンパク質をコードする遺伝子
構造、反復コラゲナーゼ切断位置のコドンを有し、従って式Iの融合タンパク質
の製造のために適当なプラスミド又は比較可能なベクター(例えばフフージベク
ター)に関する
細菌のアミノ酸配列2.としては、アルカリ性ホスファターゼ、アントラニル厳
シンテターゼ、β−ラクタマーゼ、β−ガラクトシダーゼ、クロラムフェニコー
ル−アセチルトランスフェラーゼ等が該当する。
次の反応図式は、コラゲナーゼ及びポストプロリンージペプチジルーアミノベブ
チダーゼ(PPDA)による融合タンパク質の加水分解を説明する:細菌 ペプ
チド
NHx−−−−−−−−−−−−−−X−(Pro−Y−Gly)、−Pro
−−−−C00HNH3−−−=−−−−−−−−−X−Pro−Y+(Gly
−Pro−Y)a−+タンパク質配列
ペプチド
+ に1y−Pro−−−−−−−−−−COOHX及びYは遺伝暗号で決定さ
れる20種のアミノ酸の任意のものを表わし、nは好ましくは2〜10である。
融合タンパク質の新規分解方法の利点は、ヨーロッパ特許第20290号記載の
方法と比べて、例えばクロストリジオペグチダーゼAによる反応速度が数オーダ
ーも増大されうる点にある。コラゲナーゼの認識配列を反復形で含有する融合タ
ンパク質は、コラゲナーゼの単一の分解位置を有する相応の融合タンパク質より
もはるかに良好に分解されうる。
本発明による方法を説明するために、例1〜3で、コラゲナーゼによって分解可
能の配列を有する3種のモデルタンパク質の製造及び酵素的分解を記載する。
これらのタンパク質のアミノ酸配列を表1に総括しである。これらのタンパク質
は、大腸菌に12株(E。
coli K ] 2)からのプレホスファターゼ、つまり471個のアミノ酸
から成るアルカリ性ホスファターゼの生合成の中間生成物から誘導される。この
プレホスファターゼは、アミノ1122個のN末端のシグナル配列の分離によっ
て活性酵素・に変えられる。これに対して修飾されたホスファターゼの場合には
アミノ酸22個のシグナル配列は注目すべき程度には分離されないアルカ5り性
ホスファターゼのアミノ酸配列(R,A。
Brashav 等、Proc、Natl、Acad、Sci、U S A 8
1 *4692−4696.1981)及びE、 Co11 K 12からの
相応の遺伝子(phoA)のヌクレオチド配列は公知である(M、 Simon
is、 Dissertation、 FreieUniversitaet
Berlin、 l 983 ; C,N、 Chaul等。
Gene 44.121〜125.1986)、まt: 7 ルカリ性ホフ7ア
ターゼをベースとする融合タンパク質の構成のために使用されうるベクターも記
載されている( W、 Boido1等+ Mo1. Gen、 にenet、
185 + 510−512. l 932; W、 Boidol、 Di
ssertation。
Technische Universitaet Berlin、1984
) a pSB94の名称を有する、これらのプラスミドの1種から出発して、
試験管内の新しい結合及びDNAクローニングの自体公知の方法(T、 Man
iatis等、 MolecularCloning、 Co1d Sprin
g Harbor Laboratory、 ColdSpring Harb
or、 N、 Y、 、 USA、1982)を用いて、E、 coli宿主細
胞への導入後表1に記載したタンパク質の生合成をもたらす修飾ベクターを製造
した。このたメニpSB 49上のpho A遺伝子の2つの位置に、つまりN
eo I−及びSph I配列に、條飾遺伝子でコラゲナーゼによって認識され
うるアミノ酸配列のコドンを形成するオリゴヌクレオチドを導入した。第1図乃
至第4図には、pSB94及び同プラスミドから誘導されたプラスミドpSA3
02、pSAs 06及びpH54133の制限酵素切断地図を図示しである。
3種のモデルタンパク質とクロストリジオペブチダーゼAとの反応の結果は、第
38頁及び第39頁ならびに表2に示しである。
第38頁は、所期の分子量を有する分解生成物の形成、従って所定の位置におけ
る特異的分解を裏付けるゲル電気泳動分離を示す。
第39頁には、生成物形成のインキュベーション時間及び使用酵素量に対する依
存関係を示しである。これらの曲線から得られた生成物形成速度(表2に総括さ
れている)は、二重切断位置(H54133/l)及び二重切断位置(S A
506 / 1 )がコラゲナーゼI:対する反応能力を単一の切断位置(SA
302/1)と比べてどの程度高めるかを明らかにしている。
副腎皮質刺戟ホルモン及びそれから誘導されたペプチドの製造方法を対象とする
西独国特許出願第P3731875.6号明細書には、ホルモン配列が単−及び
反復コラゲナーゼ切断位置を介してE、 coliからのアルカリ性ホス77タ
ーゼの部分配列に結合された融合タンパク質が記載されている。この融合タンパ
ク質とクロストリジオペブチダーゼAとを反応させる1;めの、同明細書に記載
された実験は、本発明で記載された結果を十分に保証している。表2には極めて
重要なACTH融合タンパク質の生成物形成速度も所載されている。単一コラゲ
ナーゼ切断位置をタンパク質(SA186/])からは、ペプチドホルモンは不
完全にして、しかも実際の裂取的適用には不適当な条件下でしか遊離され得なか
ったのに、二重切断位置を有する相応のタンパク質(SA343/])は、すで
に少な切断位置(SA341/1及び5A360/1)t−使用することによっ
て反応速度はさらに増大された。
AC丁H融合タンパク質5A341/lの配列は表1に示しである。第38頁の
ゲル電気泳動による分離は、5A34]/1とクロストリジオペブチダーゼAと
の反応の生成物3種をバンドで示しである。
上記図式に相応するPPDAによる反応は、反復クラゲナーゼ切断位置を使用す
る場合には、反復切断位置内で、該ペプチドのN末端に最も近いY−Gly結合
も切断される場合のみ、N末端に正確なアミノ酸配列を有する標準ペプチドを形
成しうる。ゲル電気泳動法及びHPLCによる分析テストによって、反復フラゲ
ナーゼ切断位置を有する融合タンパク質からの分解生成物の異質性は認識されな
い。これは、クロストリジオペブチダーゼAによる反応の際に反復配列のすべて
のy−c+y結合が切断されることを示す。これは、西独国特許出!lI第P3
731875.6号明細書に記載されているように、5A341/1からの相応
の分解生成物の例では、N末端の部分配列の決定によって証明された:エドマン
分解法はGly −Pro −ACTHの初めの7個のアミノ酸に関して予想さ
れI;配列を明らかにした。一つの反復配列内で初めの結合を切断することによ
って、他の切断位置が、露出及びより良好になる作用容易性によって、初めの切
断位置よりもはるかに迅速に反応するように活性化されることは明らかであり、
その結果不完全な切断による中間生成物は検出され得ない。
該方法の特異性は、反復コラゲナーゼ切断位置を使用することによって明らかに
高められ、偶然Pro −X−Gly−Pro配列を有するペプチドすら、この
配列の反応性が小さいためにここで使用される条件下で製造することができた。
従って該製造方法は、事際に任意のすべてのペプチドにとって適しており、ま!
;宿主系/ベクター系の選択に関しても及びは様な特異性を有する他のコラゲナ
ーゼ及びアミノペプチジル−ジペプチダーゼを使用する場合にも制限は存在しな
い。
本発明による方法はもちろんまた1段階でも、つまりコラゲナーゼ及びPPDA
との同時反応の場合にも実施することができる。
プラスミドpBR322: USAの Rockeville、 Md。
在 American 丁ype Cu1ture Co11ection (
ATCC)で1979年7月16日に寄託(ATCC40015)。
大腸WSB44:ゲッチンゲン在DsM、r1979年7月16日に寄託15M
1.606)。
大腸菌に12野生型・DSMで1973年11月26日以来寄託(DSM498
.)。
発明を実施するために最良の形態
例:
1、 ホス7アターゼタンパク質SA、302/1.SA506/I及びH54
133/1の遺伝子を有する新組換えプラスミドの製造
前記3種のタンパク質の生合成を、適宜形質転換された細菌細胞において新組換
えプラスミドpSA 302、 psA 506及びpH34133によって決
定する。これらのプラスミドはベクタープラスミドpSB 94から形成された
。pSB 94はプラスミドpSB 53 (寄託番号ATCC40020で1
979年7月16日に寄託)から公知方法(L Boidol、 Disser
tation。
Technische Universitaet Berlin、1984
;また米国特許第4.375.514号明細書)により誘導したプラスミドpS
B 94の製造[W、 Boidol、 Disser−tation、 TU
−Berlin D83/、F B I 3. Nr、158(1984)]ニ
グラスミドpSB53[ヨーロッパ特許第23882号、ATCC40020(
1979年7月16日)]から出発して、プラスミドpSB94を次のように製
造したpSB53 (205,c+9/mM)60μff、反応緩衝液60ii
Q CトリスHCI 20 mN、 MgC1* 20 mW、 NaC+15
0mM、 メルカプト玉タノール20mM、 pH7−5)、ウシ血清アルブミ
ン(l tag/lnQ’) 18 it Q 、 5aI5μg%Xho15
μg及び)1,012μ0かも成る反応混合物中でpSB53−DNAを37℃
で3時間インキュベートとした。制限エンドヌクレアーゼ5alI 及[xhO
IはBiolabs社(U S A)から取得しt;。
pSB53 (ゲル電気泳動により分子量を測定)を2255bp及び6454
bp(配列分析により分子量を測定)の断片に定量的に分解する反応条件を予備
試験で確定した・
両断片の分離は寒天ゲル電気泳動によって行なった6 454 bp断片は、0
.7%寒天ゲルから電気溶離1:ヨッて単離し[丁、Maniatis、 E、
Fr1tseh、 j。
S!+obrock; Mo1ecular Cloning、1 64 1
65 +Co1d Spring )larbor Lab−New Work
(1982)] 、リガーゼ溶液中で一本鎖の相補的5′−突出端を介して結
合して環状分子を形成した。T、リガーゼ(LTSA Biolpbs製)との
りガーゼ反応は、トリスHC150mM、 lLgcI210 mM、ジチオト
レイトール2C1mL ウシ血清アルブミン50μg/rnQ%ATP 1+n
A (pH7,8)を含有する緩衝反応液中で行なった。リガーゼ溶液(容量1
00μQ)を13℃で16時間インキュベートしt二。
反応をフェノール抽出によって停止し、エタノ−1ヲ用いる3回のエーテル抽出
によりDNAを水相から沈殿させた。遠心分離後にDNAam殿物をDNA緩衝
液 [ト リ ス )IC+ 4 5+oM% EDTA O−1wM % p
H7−9]50μg中に溶かし、大腸WSB44株の適格細胞の形質転換のため
に使用した(適格細胞200μg+リガーゼ溶液からのDNA25μQ)。
適格細胞の製造及び形質転換条件はヨーロッパ特許第23882号に記載された
方法及び条件と同様である。
得られた形質転換細胞(アンピシリン耐性細胞)からプラスミドDNAを単離し
、側照分析によってプラスミドの構造を確認しt;。
第1図にはグラスミドpsB94の制限酵素切断地図を図示しである(個々の制
限酵素配列の間の間隔には塩基対(Bp)が記載してあり、全塩基対は6454
個である)。該プラスミドはpBR322からのβ−ラクタマーゼの遺伝子(ア
ンピシリン耐性)及びE、 coliK12からのアルカリ性ホスファターゼの
遺伝子を有する。 pSA302及びpS^506の製造のためには、相応のオ
リゴヌクレオチドを、phoA遺伝子内に存在するfll限エンドヌクレアーゼ
Neo 1及びSplの認識配列中に導入した。次にpsA506から27塩基
対のPsLI断片を除去することによってpH54133を製造した、第2図乃
至第4図には3種の新組換えプラスミドの制限酵素切断地図を図示しである:
第2図について二アミノ酸部分配列上の297及び298アミノ酸はプレホスフ
ァターゼのアミノ酸の特性を示しており、タンパク質5A302/lにおいては
これら2個のアミノ酸の間にさらに6個のアミノ酸が導入されている。
第3図について二アミノ酸部分配列上の447及び448アミノ酸はプレホスフ
ァターゼのアミノ酸の特性を示しており、タンパク質5A506/lにおいては
、これらの2個のアミノ酸の間にさらに15個のアミノ酸が導入されている。
第4図について二アミノ酸部分配列上の447及び448アミノ酸はプレホスフ
ァターゼのアミノ酸の特性を示しており、タンパク質)!54133/1ではこ
れら21′i!1のアミノ酸の間にさらに6個のアミノ−が導入されている。
新組換えプラスミドの製造の場合には、DNAクローニングの文献公知の方法を
適用しj;。これらの方法は、T、 Maniatis等によって(Mo1ec
ular Cloning。
Co1d Spring Harbor Laborarory、 Co1d
SpringHarbor、 N、 Y、 、 USA [1982] )詳細
かつ総括的に記載された。宿主細胞としてはE、coli 5B44株を使用す
る( W、 Boidol、 Dissertation。
Techniscbe 1Jniyersitaet Berlin f 19
84 ] ; G−5ieWert等、米国特許第4,375.514号[19
83])。これは、広く普及されたクローリング株E。
coli HBIOI (DSM1607の番号で1979年7月165に寄託
)のホスファターゼ員突然変異体(phoA)である。
オリゴヌクレオチドは、自動DNA合成装置 Specifically degrades genetically engineered fusion proteins using collagenase.
Background Art Genetic engineering has developed new methods for producing peptides and proteins that are far superior to traditional chemical synthesis methods, especially for relatively long amino acid sequences.
It was. For the first time, substances that were previously difficult to obtain, such as growth hormone, interferon and a number of peptide hormones, can be made available in sufficient quantities [E, A, O, Marston, Bioche+n, J, 240.1-12 (1986 )]. Genetic engineering methods for producing polypeptides include codons with the amino acid sequence to be produced.
It is based on the transfer of suitable deoxyribonucleic acid (DNA) into suitable host cells in a form that allows the replication and expression of the newly introduced genetic information. As host cells, small to medium sized peptides (less than about 100 amino acids) are
In this case, preferably bacteria such as Escherichia coli are used. By the way, polypeptides with sizes in the above range are protected by significant tertiary structure.
It has been found that the cells are extremely easily attacked by intracellular bacterial proteases. This fact makes it clear that the polypeptide to be produced is directly formed in the final form or optionally with an additional N-terminal methionine group (the so-called direct methionine group).
If controlled in such a way that it can lead to significant yield reductions or large losses of frozen soil synthesis products. In contrast, the desired amino acid sequence is first obtained from a much larger precursor molecule, the so-called fusion
When synthesized as a synthetic protein, it can be produced in good yields. Therefore, in order to produce small and medium-sized peptides, it is necessary to use bacterial genes that can be expressed well and are also as regulatable as possible and the DNA sequence of the peptides to be produced.
Hybrid genes are transferred from column 7 onto the plasmid vector by new ligation in vitro.
A variant consisting of forming genes becomes advantageous. The hybrid gene is
Bacterial regulatory elements (promoter, liposome binding site and terminator)
and the largest possible portion of the N-terminal amino acid codon of the bacterial gene product, followed by the new peptide codon and the termination codon. plasmid vector
After transfer of the protein into a suitable bacterial host cell, the hybrid gene is transformed into a fusion protein having an N-terminal part derived from the corresponding bacterial protein and a C-terminal part consisting of the amino acid sequence of the peptide to be produced. control the biosynthesis of
This fusion protein can be easily produced in large amounts and isolated by fermentation of transformed cells. A variety of bacterial genes may be used to form the hybrid gene, but preferably the enzymes are β-galactosidase, β-lactamase, anthranilate cycythetase, alkaline phosphatase, and enzymes.
The gene for loramphenicol-acetyltransferase was used. The final step in producing peptides by the method described above is the precise degradation of the fusion protein. To enable such degradation, the hybrid gene must be
The small and medium-sized peptides that need to be made such that there is an easily and selectively cleavable peptide bond between the bacterial portion of the initial fusion protein and the new peptide sequence to be produced. For engineering manufacturing, fusion
The development of specific methods for degrading proteins that are as widely applicable as possible has hitherto been a major problem that has not been solved satisfactorily. The object of the present invention is to obtain the desired peptide without leaving undesired extra amino acids at the N-terminus.
It is a universally applicable and specific method for degrading fusion proteins that provides the exact amino acid sequence of the compound. The first peptides produced by genetic engineering, e.g. 110.1979), the bromocyanine component was extracted from the corresponding fusion protein derived from β-galactosidase.
liberated by solution. Bromcyan consists of methionine and the atom at the next carboxyl position.
Minol [Net-X, in this case, X is fixed by the genetic code and consists of 7220 numbers.
selectively breaks down bonds between amino acids]. This method is of course only applicable to peptides that do not even have methionine. This is before
This also applies to the three types of peptides listed above. Similar limitations apply to all fusion protein components based on recognition of individual amino acids.
The solution method is recognized. Now, a fusion protein containing lysine, arginine or glutamic acid as the linkage between the N-terminal and C-terminal parts is produced. For this degradation, the enzymes trypsin (J, 5hine et al., Nature 285, 456-461.1980) and clostripain (A, D. Bennett et al., EPA Cz31363), both of which contain Lys-X and Arg- The endoproteinase Glu-C (A, D, Bennett et al., EPAO 131 363), which opens the bond between Glu- Similarly, endoproteins that specifically degrade after lysine
Lys-C (Chem, Hoppe-Seyler367.5upp1.Aug, l986, S-162, Abstr. +9.01.03) was also used. There is a way to cleave specific bonds within a precisely defined sequence of several amino acids.
If it were, it would be much more specific and therefore more broadly applicable. Therefore, P, R, 5zoka et al. (DNA5.l 1-20.1986)
A fusion protein in which subsequences from trannylate synthetase and orchid growth hormone are linked to each other via the Asp-Pro sequence is produced by Asp-Pro conjugation.
Since this compound is extremely acid-labile, we were able to successfully decompose it into the same components by applying acid. However, this method also prevents cleavage of other peptide bonds during the action of the acid as a side reaction.
In addition to the fact that the peptide must be taken into account as a
It has the disadvantage that it retains a proline at the N-terminus, which is often a disadvantage. A similar limit was found in the case of the reaction with renin, which was used to selectively cleave the bond between two leucine tethers within the sequence Pro-Phe-His-Leu-Leu -Val-Tyr of the fusion protein. (J, S. Boger et al., FPAO 163573), in which case an undesired extra three amino acids often remain. A fusion protein having an N-terminal portion consisting of 31 amino acids of the λcll protein.
To release human β-globin from protein, K, Nagai and H, C, Thgersen used factor
A plasma grotease that acts as a catalytic converter was used. Similarly, T, 1mai, etc. are fusion proteins with 9 additional N-terminal amino acids.
Enzyme IV was used to produce human prorenin via protein. In both cases, the transition between the N- and C-terminal portions is recognized by factor Xa.
For the bond of Arg-X (X is the first N*-terminal amino acid of the human protein)
There was a sequence + 1e-G 1u-G ly-Arg-X that was cleaved at. Factor Xa therefore appears to fulfill the essential requirements for an enzyme to be used for the degradation of the fusion protein. However, two cases have also been reported in which fusion proteins having the above recognition sequence cannot be degraded by factor .162, Abstr. 19, 01-03; H, Hlayer et al., Biol, Chem, H oppe-5eyler 367, 5upp1. Aug, 1986, S 285, Absir, 05.01-50). Therefore, it is better to use factor Xa.
It is impossible to apply the law generally. Furthermore, similar restrictions must be placed in the case of enterokinase, an enzyme that breaks down the bond between Lys and X in the (Asp)aLys-X sequence. R. M. Belagaje et al. (DNA U, 120.1984) certainly
Enterokinase was used to release human growth hormone from a fusion protein in which the sequence was located far from the N-terminal portion, as well as trypsinogen, the natural substrate of enterokinase. However, alkaline phosphatase
Experiments using enterokinase to degrade a fusion protein in which the terrestrial hormone was bound via the above sequence were not successful. EP 20290 includes a framework for disassembling fusion proteins with corresponding structures.
Methods have been described that take advantage of the high specificity of genease. Collagenase has the sequence Pro-YJ: 1y-Pro (Y can be any of the 20 amino acids in the genetic code).
) and decomposes the bond between Y and Gay. having the above array
The fusion protein contains an amino acid derived from the collagenase sequence at the N-terminus.
A peptide with the amino acids Gly and Pro is released. These amino acids can be removed as dipeptides using another enzyme, namely Vostoproline dipeptidyl aminobeptidase (PPDA). By the way, an experiment was conducted in which peptides and proteins having the Pro-Y-Gly-Pro sequence were degraded with clostridiopeptidase A, a collagenase from Clostridium histolytium (EC3, 4, 24, 3). By applying the reaction sequence described above, the melting
The production of peptides via conjugation is only possible to a very limited extent.
It turned out to be impossible. Indeed, N1choepert et al. (Report of the 14th FEBS Conference, 1981) proposed a relatively small, semi-synthetic model peptide, strictly speaking, a compound: Cbo-Gly-Pro-Leu-Gly-Pro-Insulin A chain ( bovine) reacts with clostridiobeptidase A and PPDA according to the above scheme.
Accordingly, we were able to prove that the expected reaction product could be obtained in good yield. E again. Wuensch et al. (Hoppa-Seyler's Z, Physiol, Chem. 362.1285-1287.1981) also obtained similar results in the case of reactions with other model peptides. However, regarding the 411 natural proteins that contain the Pro-Y-Gly-Pro sequence, only two species include eurofine and lankathalar.
is specifically degraded by clostridiopeptidase A, and this degradation is also
Only after the Stain side chain was converted to S-sulfonate. Moreover, even with relatively large excesses of enzyme, quantitative reactions could not be achieved (M. Toepert et al., 14th FEBS Conference Report, 1981). West German Patent Application No. P3731875.6 discloses that E. coli alkaline
adrenocortical stimulant hormone via a fusion protein derived from phosphatase
A method is described for producing a ton. In this case as well, a fusion protein having the tetrapeptide sequence Pro-Y-Gly-Pro (Y represents any one of the 20 amino acids of the genetic code) between the bacterial protein sequence and the target peptide is clearly a predetermined protein. Can be specifically degraded by clostridiopeptidase A at the position
However, the reaction rate was found to be extremely low. J. Germino et al., Ba5tia (Proc, Natl., Acad. Sci, USA 81.4692-4696..1984) uses approximately 60 molecules from Proa-2-collagen as the linking moiety between the N- and C-termini. Amino acids of
A fusion protein having a sequence consisting of the following was produced. This protein is collagener
Like the corresponding collagen itself, it was successfully degraded by the enzymes. However, it is unclear exactly where within the approximately 60 amino acid sequence this fusion protein is degraded.
No. It was also found that more or less large residues of this sequence still exist at the N-terminus of the C-terminal degradation product. This variant is therefore precisely defined.
It is unsuitable for producing polypeptides having an f-N terminus. DISCLOSURE OF THE INVENTION The essence of the invention resides in the formula I: , X and Y represent any of the 20 amino acids determined by the genetic code, 2 represents the bacterial amino acid sequence, and 2. The amino acid sequence -X-(Pro-Y-Gly)s-Pro-(this
where X and Y represent any of the genetically foodable 7i) acids, n>2) followed by the C-terminal protein sequence, collagenase and post-proline di-vetidylaminopegtidase ( A method for producing a target peptide, characterized by enzymatic separation using PPDA). The present invention also provides a fusion tag represented by the formulas recited in claims 1 to 6.
Proteins and methods for their production, the gene structure encoding the fusion protein of formula 1, a plasmid or a comparable vector ( For example, Huhuzibek
2. Bacterial amino acid sequences related to These include alkaline phosphatase, anthranyl synthetase, β-lactamase, β-galactosidase, and chloramphenicol.
This includes acetyltransferase and the like. The following reaction scheme shows collagenase and post-proline di-peptidyl-aminobeb.
Describe the hydrolysis of fusion proteins by titase (PPDA): Bacterial PEP
Tido NHx------------X-(Pro-Y-Gly), -Pro----C00HNH3---=----- Y+ (Gly -Pro-Y)a-+ Protein sequence Peptide + to 1y-Pro--COOHX and Y are determined by genetic code.
represents any one of the 20 types of amino acids, and n is preferably 2 to 10. The advantage of the new method for degrading fusion proteins is that, compared to the method described in European Patent No. 20290, the reaction rate with clostridiopegtidase A is several orders of magnitude faster.
- is also at the point where it can be increased. A fusion tag containing the recognition sequence of collagenase in repeated form.
Proteins can be degraded much better than corresponding fusion proteins with a single degradation site of collagenase. In order to illustrate the method according to the invention, in Examples 1 to 3,
The production and enzymatic degradation of three model proteins with functional sequences are described. The amino acid sequences of these proteins are summarized in Table 1. These proteins are derived from the biosynthetic intermediate of prephosphatase, an alkaline phosphatase consisting of 471 amino acids, from E. coli K]2. This prephosphatase is produced by the separation of an N-terminal signal sequence of 1122 amino acids.
can be converted into active enzymes. In contrast, in the case of modified phosphatases, the 22-amino acid signal sequence is not separated to a remarkable degree. , USA 81 *4692-4696.1981) and the nucleotide sequence of the corresponding gene (phoA) from E. Co11 K12 is known (M. Simonis, Dissertation, Freie Universitat Berlin, 1981). 3; C, N., Chaul et al. Gene 44.121-125.1986), 7.
Vectors that can be used for the construction of fusion proteins based on
(W, Boido1 et al. These plasmids, bearing the name SB94, Starting from one species, new conjugations in vitro and methods known per se for DNA cloning (T. Maniatis et al., Molecular Cloning, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, N. Y., US A, 1982) and E. coli host cells.
Modified vectors were produced that, after introduction into cells, led to the biosynthesis of the proteins listed in Table 1. In addition, oligonucleotides forming codons for amino acid sequences that can be recognized by collagenase in the conditioning genes were introduced into two positions of the pho A gene on pSB49, ie, at the Neo I- and Sph I sequences. Figure 1
FIG. 4 shows restriction enzyme cleavage maps of pSB94 and plasmids pSA302, pSAs06 and pH54133 derived from the same plasmid. The results of the reaction between three model proteins and clostridiopebutidase A are shown on pages 38 and 39 and in Table 2. Page 38 describes the formation of a decomposition product with a desired molecular weight and thus in a given position.
Figure 2 shows gel electrophoretic separation confirming specific degradation. Page 39 describes the dependence of product formation on incubation time and amount of enzyme used.
It shows the existing relationship. The product formation rates obtained from these curves (summarized in Table 2)
compared to the single cleavage position (SA 302/1), It is clear whether the level will be increased. West German Patent Application No. P3731875.6, which is directed to a process for the production of adrenocorticotropic hormone and peptides derived therefrom, discloses that the hormone sequence is an alkaline compound from E. coli via single and repeated collagenase cleavage sites. Hoss 77ta
Fusion proteins linked to subsequences of the enzyme have been described. This fusion Tampa
The experiments described in the same specification for reacting clostridiopebutidase A with clostridiopebutidase A fully guarantee the results described in the present invention. Table 2 also lists the critical ACTH fusion protein product formation rates. single collage
If the enzyme cleavage site is from the protein (SA186/), the peptide hormone will be incomplete and can only be released under conditions unsuitable for actual cleaving applications.
However, the corresponding protein with a double cleavage site (SA343/) has already been
By using fewer cutting positions (SA341/1 and 5A360/1)
The reaction rate was further increased. The sequence of AC Ding H fusion protein 5A341/l is shown in Table 1. The separation by gel electrophoresis on page 38 shows three bands of products of the reaction between 5A34]/1 and clostridiopebutidase A. A reaction with PPDA corresponding to the above scheme uses repeated clagenase cleavage sites.
If the Y-Gly bond closest to the N-terminus of the peptide is also cleaved within the repeated cleavage position, a standard peptide with the correct amino acid sequence at the N-terminus is formed.
It can be done. Repeated flagging was performed by gel electrophoresis and HPLC analytical testing.
The heterogeneity of degradation products from fusion proteins with enzyme cleavage sites is not recognized.
stomach. This indicates that upon reaction with clostridiopebutidase A, all y-c+y bonds of the repeat sequence are cleaved. This is a West German patent! In the example of the corresponding degradation products from 5A341/1, as described in II No. P3 731875.6, the Edman degradation method was demonstrated by determination of the N-terminal partial sequence. - predicted for the first 7 amino acids of ACTH
I: The sequence was revealed. by breaking the first bond within a repeat sequence.
Therefore, the other cutting positions can be compared to the first one with better exposure and ease of operation.
It is clear that the cleavage position is activated to react much more rapidly than the cleavage position, so that intermediate products due to incomplete cleavage cannot be detected. The specificity of the method is clearly enhanced by the use of repeated collagenase cleavage sites, and even peptides that happen to have a Pro-X-Gly-Pro sequence can be easily detected under the conditions used here due to the low reactivity of this sequence. could be manufactured below. The production method is therefore suitable for virtually any peptide, and! ; other collagens with different specificities also regarding the choice of host system/vector system.
There are also no restrictions when using aminopeptidyl-dipeptidases and aminopeptidyl-dipeptidases.
stomach. The method according to the invention can of course also be carried out in one step, ie in the case of simultaneous reaction with collagenase and PPDA. Plasmid pBR322: Rockeville, Md. USA. Deposited with the American Culture Collection (ATCC) on July 16, 1979 (ATCC 40015). Colon WSB44: DsM, Göttingen, r15M 1.606, deposited on July 16, 1979). Deposited since November 26, 1973 in E. coli with 12 wild type DSM (DSM498.). BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION Examples: 1. Phos-7 atase protein SA, 302/1. Production of a new recombinant plasmid carrying the genes of SA506/I and H54 133/1 The biosynthesis of the above three proteins was carried out by the new recombinant plasmid in appropriately transformed bacterial cells.
plasmids pSA 302, psA 506 and pH34133.
Set. These plasmids were formed from vector plasmid pSB94. pSB 94 is plasmid pSB 53 (deposit number ATCC 40020).
Production of plasmid pS B 94 [W, deposited on July 16, 1979] by known methods (L Boidol, Dissertation. Technische Universitaet Berlin, 1984; also U.S. Pat. No. 4,375,514). Boidol, Disser-tation, TU-Berlin D83/, F B I 3. Nr, 158 (1984)]
Starting from Grasmid pSB53 [European Patent No. 23882, ATCC 40020 (July 16, 1979)], plasmid pSB94 was constructed as follows.
pSB53 (205, c+9/mM) 60μff, reaction buffer 60ii QC Tris HCI 20 mN, MgCl* 20 mW, NaC+15 0mM, mercaptotanol 20mM, pH 7-5), bovine serum albumin.
pSB53-DNA was incubated at 37°C for 3 hours in a reaction mixture consisting of 18 it Q, 5aI 5μg% Restriction endonucleases 5alI and [xhOI were obtained from Biolabs (USA); The reaction conditions for quantitatively decomposing pSB53 (molecular weight measured by gel electrophoresis) into fragments of 2255 bp and 6454 bp (molecular weight measured by sequence analysis) were established through preliminary tests.・Separation of both fragments was performed by agar gel electrophoresis. The 6454 bp fragment obtained was 0. Electroelution 1: Isolation from 7% agar gel [Ding, Maniatis, E, Frltseh, J. S! +obrock; Molecular Cloning, 164 165 +Colid Spring) Labor Lab-New Work (1982)], ligation via the complementary 5'-overhang of the single strand in ligase solution.
together to form a cyclic molecule. T, with ligase (manufactured by LTSA Biolpbs)
The ligase reaction was carried out using 150 mM Tris HC, 210 mM HLgcI, and dithiotide.
The reaction was carried out in a buffer reaction solution containing 1 mL of Reitol 2C and 50 μg of bovine serum albumin/rnQ% ATP 1+n A (pH 7, 8). The ligase solution (volume 100 μQ) was incubated at 13°C for 16 hours. The reaction was stopped by phenol extraction and the DNA was precipitated from the aqueous phase by three ether extractions using ethanol-1. After centrifugation, the DNAam precipitate was dissolved in 50 μg of DNA buffer [Tris) IC+45+oM% EDTA O-1wM% pH7-9] and used for transformation of competent cells of colon WSB44 strain ( 200 μg cells + 25 μQ DNA from ligase solution). The production of qualified cells and transformation conditions are similar to the methods and conditions described in European Patent No. 23882. Plasmid DNA was isolated from the obtained transformed cells (ampicillin-resistant cells), and the structure of the plasmid was confirmed by side-light analysis. Figure 1 shows the restriction enzyme cleavage map of Grasmid psB94 (individual restriction
Base pairs (Bp) are written in the spaces between the restriction enzyme sequences, and the total base pairs are 6454). The plasmid contains the β-lactamase gene (A) from pBR322.
ampicillin resistance) and the gene for alkaline phosphatase from E. coli K12. For the production of pSA302 and pS^506, corresponding optics are required.
Ligonucleotides were introduced into the recognition sequences of the fll restriction endonucleases Neo 1 and Spl, which are present within the phoA gene. pH54133 was then produced by removing the 27 base pair PsLI fragment from psA506, Figure 2.
Figure 4 shows the restriction enzyme cleavage maps of the three new recombinant plasmids: Regarding Figure 2, amino acids 297 and 298 on the two amino acid partial sequences are prephosph.
In protein 5A302/l, six additional amino acids are introduced between these two amino acids. Regarding Figure 3, amino acids 447 and 448 on the two amino acid partial sequences are prephosph
In protein 5A506/1, 15 additional amino acids are introduced between these two amino acids. Regarding Figure 4, amino acids 447 and 448 on the two amino acid partial sequences are prephosph
Shows the amino acid properties of atase, protein )! In 54133/1 this
21'i! Six additional amino acids have been introduced between one amino acid. For the production of new recombinant plasmids, methods known in the literature for DNA cloning are applied. These methods have been described in detail and comprehensively by T. Maniatis et al. (Molecular Cloning. Colorado Spring Harbor Laboratory, Colorado Spring Harbor, N.Y., USA [1982]). E. coli strain 5B44 was used as the host cell.
(W, Boidol, Dissertation. Techniscbe 1Jniyersitaet Berlin f 1984]; G-5ieWert et al., U.S. Pat. No. 4,375.514 [1983]). This is the widely popular crawling strain E. The phosphatase member mutant (phoA) of E. coli HBIOI (deposited July 165, 1979 under number DSM 1607). Oligonucleotides are an automatic DNA synthesizer
【Applied Biosyst
em社(850LincoIn CenterDrive、 Foster C
1ty、 Ca1if、 94404 、 U S A )製381A型]によ
って装置メーカーの指示に従って合成し、ゲル電気泳動によって精製した。
DNAの配列決定は、−木調ファージベクターM13+++p18及びM 13
mpl 9 (C,Yaniseh −Perron等、Gene33.10
3−119 N985])を使用してジデソキシ法(F、 Sanger等、
Proc、 Natl。
Aead、Sci、tJsA 74.5463−5467 [1977])によ
り行なった。前記ファージベクターは、Boehringer (Mannhe
im )、 Pharmacia −L K B Gmb)l及び他の多くの提
供者から入手できる。
放射性標識のためには、デソキシアデノンン−5−[a −3& s ] チオ
トリホスフェートを使用した( lil、D。
BigHin等、 Proc、 Natl、 Aca4. Sci、 U S
A −80+3963−3965 [983] )。
制限エンドヌクレアーゼEcoRI 、 PstI 、 5phl及びHae
mならびにDNAリガーゼ(74)i:t、Boehringer (Mann
heim)社から入手した。NcoIはNevi England Biola
bs Gmb)l (62315chvalbach )から、ポリヌクレオチ
ド−キナーゼ(T4)はPharmacia/P−L (7800Freibu
rg i、 Br、)から入手した。
1.1 pSA302の製造
プラスミドpSB94を制限エンドヌクレアーゼNeo Tで線状化した。その
ために、プラスミドDNA14μ9及び反応緩衝液(トリスHCI 50 mM
、 MgCl210 mM、 NaCl2100 mM、ジチオトレイトール1
mM、 pH7,5) 50 p (l中のNcol 17単位を含有する反応
混合物を37℃で7時間インキュベートした。反応混合物を)二ノールで抽出し
た後エタノールでDNAを沈殿し、乾燥し、TE緩衝液(トリスHCl45 m
&i、 EDTAI iM、 pH7,5)中で溶かした。
5’ −OH基で加リン酸分解さねなかった2種の18ffler合成オリゴヌ
クレオチド:5 ’ −CAT GGCCCT にCA GにA CCC−3’
5 ’ −CATG GGG 丁CCTGCAGG にC−3’各1μgを水性
溶液中で混合し、37℃で15分前保温した。次に両オリゴヌクレオチドを、線
状化されたpSB94 3−5μ9及びリガーゼ反応緩衝液(トリスHCI 2
0 +nM、 MgCL 10 m1lI、ジチオユリトリット10+nlJ、
ATP’0.6mM、pH7,6) 50pO中(’)DNAリガーゼ4単位と
20℃で2.5時間反応させた。DNAを前記のようにフェノール抽出及びエタ
ノール沈殿t:よって後処理し、E、 coli SB44株の形質転換のため
に使用した。適格細胞の製造及び形質転換を賢。
Dagert及びS、 D、 Ehrlichの方法(Gene 6.23−2
8N979])により行なった。
形質転換細胞を塗布して単一コロニーを形成させた。前記オリゴヌクレオチド配
列を有するプラスミドDNAを含むコロニーをコロニーハイブリッド形成によっ
て同定した。コロニーハイブリッド形成は、T。
Mania【is等(Mo1ecular Cloning、 Co1d Sp
ringl(arbor Laboratory、 Co1d Spring
Harbor’、 N 、Y 、 。
USA [982] )によって記載された基礎記録に従ってJ、 P、 ’G
ergen等(Nucleic Ac1dsResearch ヱ 2115’
−2136[1979])によって記載された変法で実施した。放射性ハイブリ
ッド形成試薬としては、γP ”−A T P及びポリヌクレオチドキナーゼ(
T、)との反応によって予め5′=p$2−ホスフェートで標識された前記オリ
ゴヌクレオチドを使用した。
正のクローンの新組換えプラスミドにおいて、18塩基対の合成Ncol断片の
定位を制限分析によって確認した。このためにプラスミドDNAを標準方法によ
り単離し、制限エンドヌクレアーゼHaeDTと反応させた。生成された断片混
合物をゲル電気泳動によって分析した(8%ポリアクリルアミドゲル中のHae
m切断PBR322との比較によって分子量を測定)。
18塩基対の合成断片の組込みのために使用したNco I切断位置は、pSB
94の385塩基対のHae m断片上に局在している。この断片は新組換えプ
ラスミドにおいては欠けていて、2側の新しい断片と交換されていなければなら
ない。それというのも18塩基対断片はHae m配列さえ有しているからであ
る。2個の新しい断片の大きさは、18塩基対の断片の定位に依存している:第
2図に図示した所望の定位の場合I:は342塩基対及び61塩基対の断片が期
待されるし、他方逆の定位は330塩基対及び73塩基対の断片を与える。両定
位を有する数個のプラスミドが見出された。第2図に図示したpSA302は所
望の定位を有するプラスミドの1つである。
クロニーングによって導入された合成りNAを含む、’ pSA302からの塩
基対349のEcoRI断片を、配列決定ベクターM13mp19にクローニン
グシ、前記のように配列決定しI;。第2図に図示した、両EcoR1切断位置
の間のpSA302の部分配列は完全に立証された。
1.2 pSA506の製造
この製造もpSA302の製造と同様に行なった。 pSB94を’#I@エン
ドヌクレアーゼsph Iで線状化した。
反応条件及び後処理はpSA302に関して記載したとおりである。
2個の45marオリゴヌオリゴヌクレオチド配列TCCTGCAG(、CCC
GGCGGGTCCAGCAGGCCC丁GCAGGTCCGCATG−3′
及び
5 ’ −CGGACCTGCAGGGCCTGCTGGA CCCGCCGG
GCCT GCAGGACCATG−3′
を、pSA302の場合に記載したのと同一の条件下でSph I線状化pSB
94及びDNAリガーゼと反応させて後処理したa E、 coli SB44
の形質変転後に正のコロニーを、P3″末端標識45merオリゴヌクレオチド
によるコロニーハイブリッド形成によって同定しt;。
このようにして得られた新組換えプラスミドは、2個の45merオリゴヌクレ
オチドから形成されf;D Nへ部分の片側にのみ完全なSph I配列を有す
る。これは請求められたプラスミドにおいて次に位置するEcoRI配列(第3
図参照)から257塩基対の距離を有し、他方この距離は逆定位のプラスミドに
おいてはpSB94の場合と全く同じように僅かに212塩基を有する。
新組換えプラスミドと制限配列EcoRI及びsph Iとの反応によって得ら
れたDNA断片の、ゲル電気泳動による大きさ決定によって、psAs 06が
合成りNA断片の所望の定位を有するプラスミドの1つであることが判った。第
3図で示した配列を立証するために、257塩基対のEcoRI / Sph
I断片を配列決定ベクターにクローリングし、配拘決定した。
1.3 pH54133の製造
プラスミドpSA506のDNA3μ9と反応緩衝液(1,1と同様)50μa
中の制@酵素Pstlの5単位とから成る反応混合物を、37℃で2時間インキ
ュベートし、例1.1で記載したように後処理した。これによって1%寒天ゲル
における電気泳動によって相互に分離された3個のDNA断片(27塩基対、2
420塩基対及び4007塩基対)が生じた。2(1の大きい方の断片を電気溶
離によってゲルから単離し、精製し、例1.1と同様の反応条件下でDNAリガ
ーゼ(T4)と反応させ、後処理し、E、coliSB44の形質転換のため1
:使用した。若干のアンピシリン耐性クローンからプラスミドDNAを単離した
。その中の1つがpH54133であって、その制限酵素切断地図は第4図に示
しである。pH54133は、pSA506から、257塩基対のEcoRI
/ Sph I断片の230塩基対への太きさの低減をもたらす欠失によって誘
導される。この断片を例1.2と同様にM13mp1gにクローニンクシ、配列
決定した。これによって第4図で示したヌクレオチド配列が立証された。
2、 タンパク質5A302/1.5A506/l及びH34133/lの製造
前記3種のタンパク質は例1で記載した株:E、 coli S B 44 (
pSA302)、E、 coli SB44 (pSA506) 及びE、 c
o目 SB44 (pHS4133)の発酵によって得られた。それらの生合成
は、アルカリ性ホスファターゼの生合成と同様にして調節する。
該生合成は無機ホスフェートによって再開始され、逆にホス7工−ト不足の培地
では誘導される( A。
Torriani、 Biochem Biophys、 Acta 38 e
460− ’469 [1960] )。
ホス77ターゼ誘導体の同定のためlこは、就中H8Towbin等による抗原
プロット検出法(Proc、 Natl。
Acad、 Sci、 USA 76、4350 4354 [1979])を
適用した。このために必要な抗血清は、標準条件(D、 L Weir、 Ha
ndbook of ExperimentalImmunology、 Vo
l、 ni 、 Blackwell 5cientific Publ。
0xford 1978 )下で精製されたE、 coli K 12度アルカ
リ性ホスフェートでウサギを免疫することによって製造しt:。免疫のために使
用したホスフェートは1公知法(A、丁orriani : ’ Method
s inEnzymolog7’ 、Vol、nlB、2 1 2 2 1 8
. L。
Grossman、K、Mo1dave (Eds、)Academic Pr
ess、NewYork [1968] )により単離した。第二抗体としては
、指標酵素としてアルカリ性ホスファターゼが結合されたウサギIgGに対する
ヤギの抗血清を用いた(Cooper Biomedieal Inc、、 M
alvern、 U S A ) e呈色試薬としては5−ブロム−4−クロル
−3−1ン)’!Jルホスフェートを使用した。
3種のタンパク質及びこれらのタンパク質が生産される前記3種の菌株は、すべ
での同じ発酵法及び単離法に関して適用されうるように相互を二類似している。
2.1 発酵
付加的にインピシリン100μg/+aQを含有するし一培地(、E、 S、
Lenaox 、 Viroiogy上、190−206 El 955] )
2omu:、単一””二−ヲ接種L、37℃で24時間振盪し、次1:同−培
地800+mQ中に移し、これをさらに37℃で16時間振盪した。この予備培
地を、低ホスフエート培地(K、Kreuzer等によるLP培地: Gene
tics 13ユ、、459−468[1975] )9.2Qがその中に存在
する2012ガラス発酵檀に移した。発酵槽を37℃で、10ff/winの通
気(220+n1n)下で6時間撹拌した。次に流動遠心分離機で細胞を得た。
約30gの湿潤細胞物質が得られた。
2.2 増量されたタンパク質抽出物の単離2.1からの湿潤細胞30gを分解
緩衝液(トリスHCl50mM、 NaC1l 60mM、 pH8−0) 4
00yaQ中で懸濁した。フェニルメチルスルホニルフルオリド(最終濃度10
mM)及びDNA5e(ウシ膵臓からのD N A sel 、 Boehri
nger/ Mannheim社、純度1:10py/9湿潤細胞)を加えた後
、該懸濁液を低温室(4℃)において細胞ホモジナイザー(Manton −G
aulin)で圧力650〜700ky/ctn”(10000Psi)で分解
した。分解を2回反復し、各通過後に懸濁液を水中で冷却した。不溶細胞成分を
遠心分離によって分離しく110000x及び4℃で20分)、分解緩衝液で2
回洗浄し、トリスHC150mM(pH8,0) /尿素8M(60wQ)中に
溶かした。この溶液から遠心分離によって不溶成分を除去し、勾配クロマトグラ
フィーによるさらなる精製まで水中に保管した。
2.3 ホスファターゼ誘導体の同定
2.2で得られt:タンパク質抽出物の尿素緩衝液中の主要タンパク質成分(約
50〜70%)がその都度ホスファターゼ誘導体である。タンパク質混合物を、
標準条件(Ll、 K、 Laan+mli 、 Nature 227 、6
80−685 [970] )下?5DS−ポリアクリルアミドゲルで電気泳動
することによって分離した後、相応のタンパク質バンドを次の基準により同定し
た:a)タンパク質混合物の最も太いバンドは表1で記載したアミノ酸配列に相
応する分子量を有する。
b) このタンパク質はホスフェートによって再開始可能である、つまり細胞を
2.1で記載したように、しかし10倍のホスフェート濃度で発酵した場合には
該バンドは現われない。
C)該バンドはプラスミド特異的であって、2.1と同じ条件下で製造されI;
、プラスミドを含まないE。
colis844株の細胞では現われない。
d)該バンドは、抗原プロット検出法では特異的にE、 coli K 12産
精製アルカリ性ホスフアターゼに対する抗血清と反応する。
探準タンパク質混合物(Pharmacia社製低分子量タンパク質)を用いる
ゲル電気泳動分子量測定から、ホスファターゼ誘導体が所謂前駆形で存在する、
つまりさらにアルカリ性ホスファターゼのシグナル配列も有することが認められ
る。該タンパク質は希薄緩衝液中では比較的難溶である。従って細胞分解及び遠
心分離後に得られる上澄みでは僅少量しか検出することができない。
2.4 ホスファターゼ誘導体の精製
2.2で得られたタンパク質抽出物を分離して、中圧クロマトグラフィー装置(
FPLC) (スウェーデン国つプサラ在Pharmacia社)を用いる勾配
クロマトグラフィーによって修飾ホスファターゼをさらに精製する。
前記メイ力−のアニオン交換カラム(Mono Q −HR515型)を、緩衝
液A(1−リスHCI 50 +nM、尿素8M、I))18.0)で平衡化し
、2.1からのタンパク(質溶液を負荷し、最後に緩衝液Aと緩衝液B()リス
MCl50 mM、 NaC1l M 、尿素8M、pH8,0)から形成され
る、NaCl O−200m1Jの勾配を用いて、l−0,fl/minの流量
で溶出を行なった。全勾配容量は20rnQであり、1rnQのフラクションづ
つ集めt;。
溶出液の280nlllでの吸光を流量プロットメーターで記録した。@々のフ
ラクションのタンパク質組成は5DS−ポリアクリルアミドーゲ・ルミ気泳動に
よって分析した。ホスファターゼ誘導体は50〜70mMのNaClで溶出され
た。相応のフラクションを精製し、400倍の容積の緩衝液(トリスHC150
mM、 NaC1150mM、 pH8,0)に対して透析した。この条件下で
該タンパク質は溶解しており、この形で次のコラゲナーゼ分解のt:めに使用し
た。ホスファターゼ製剤の純度を5DS−ポリアクリルアミド−ゲル電気泳動に
よってコントロールした(第38頁、バンド4,6及8参照)。同純度は90%
よりも高かった。タンパク質分はW、 Schaffmer等(Ar+a1.
Biochem、 56 、502−514 [1973])によりアミドシュ
ワルツ10Bを用いて測定し、濃度は0.6〜0.7πg/1l112であった
。1012の発酵から約160m5のタンパク質が得られた。
3、修飾ホスファターゼタンパク質のコラゲナーゼL:よる特異的分解
3.1. コラゲナーゼの精製
クロストリジウム・ヒストリチクム(Clostridiumhistolyt
icum) (EC3,4−24,3)産クロストリジオペブチダーゼAを、S
igma Chemie GmbH社(D −8024Deisenhofen
、 Gruenwaldar Weg 30 )から入手した( Typ■、
Be5t、−Nr、 CO773)。
この酵素を、FPLC装置及び例2.4.記載のものと同じアニオン交換カラム
の使用下に勾配クロマトグラフィーによってさらに精製した。コラゲナーゼ2t
agを使用し、緩衝液A(トリスHCI I OmM、 CaC1z 5mM、
pH8。
0)と緩衝液B()リスHCI ] O0+nM、 CaC1= 5 mM。
NaC1l mM、 pH8−0)とから成る、NaC10−200mMの勾配
を用いて流出速度0 、5 m12/minで流出させた。勾配の全容量は20
凋Ωであっt;。フラゲナーゼ活性はE+Wuensch等(Floppe−5
eyler’s Z、 Physiol。
Chem、333,149 151 [1963])によって記載されたテスト
によって測定した。極めて活性のある7ラクシ謬ンは0.811g/rnQのタ
ンパク質分及び2500単位/vnyの特異活性を有していた。次に記載する分
解実験は、−20℃で保管し!:前記フラクシnンを用いて実施した。
12 HS4133/1の分解
一木調タンパク質は477個のアミノ酸(分子量49919)の長さを有してい
る。該タンパク質は、コラゲナーゼによって切断可能の配列ニ
ー〇ly −(Pro −Y −Gly )! −Pro −[前記配列中Yは
1回は旧s、1回はAhaを表わす(表1参照)]を有している。2つのY −
Gly結合を切断することによって、447アミノ酸(分子量46880)及び
27アミノ酸(分子量2832)を有する2種のタンパク質ならびにトリペプチ
ドGly−Pro−Alaが形成される。種々のホスファターゼ誘導体のコラゲ
ナーゼに対する反応性を相互に比較するために、最大分解生成物の形成を反応時
間及び酵素量に依存して測定し1;。
反応緩衝液(トリスHCI 90 mM、 CaCl25 mM、 NaC11
20!IIM、 pl(8,0)中にH34133/1 53 μ9及びクロス
トリジオペブチダーゼA0.1単位を含有する反応混合物を、37℃で2.5時
間インキュベートした。15〜30分の時間間隔で各10μQの試料を取り出し
、試料緩衝液(10%サッカロース、10%ナトリウムドデシルスルフェート、
ジチオトレイトール1mM、 EDTA 2mM) 3μQを加え、95℃に5
分加熱することによって直ちに停止しt:。
試料を5DS−ポリアクリルアミド−勾配ゲル(定数0.33%ビスアクリルア
ミドを有する12.5〜25%アクリルアミドの勾配)で電気泳動することによ
って分離した。同ゲルをクーマシーブリリアントブルーGで染色しl:後、タン
パク質バンドに従って細片状1:切断し一ゲルスキャナー(ISCO社製、光学
装置6型、吸収モニターU A −、5)を用いて280nmで定量的に評価し
た。精製されたホスファターゼタンパク質を用いて得られた相応の校正曲線によ
ってピークの高さから、最大分解生成物のバンドのタンパク質含分を確定した。
この結果は第38頁に総括しである。これらのデータからH54133/lの生
成物形成速度21 、0 pMol/功in/酵素単位が得られる。
第38頁の分離は、バンド7でクロストリジオペブチダーゼAとの完全な反応後
のHA4133/1の試料からの最大分解生成物の電気泳動分離を示す。
3.3 5A506/1の分解
該−木調タンパク質は、486個のアミノM(分子量50596)の長さを有し
、;ラゲナーゼによって切断可能の配列ニ
ー Gly −(Pro−Y−Gly)s −Pr。
]前記配列中Yは1回は旧s、 4回はAlaを表わす(表1参照)〕を含む。
すべてのY −cry結合を切断すると、H54133/1から生じるタンパク
質(,3,2゜参照)と同じタンパク質及び基質1M01当り4MO】のGly
−Pro−Alaが形成される。クロストリジオペブチダーゼAに対する5A5
06/1の反応性の測定は、H54133/lの場合と同様に行なった。
反応溶液はIQQ、uff中53μyの5A506/1を含有しており、H54
133/1の反応溶液と同じ酵素濃度及び緩衝液濃度を有してぃt;。37℃で
80分間インキニペートした。10〜15分の間隔で10μQの試料を取出し、
3.2.で記載したように停止し、ゲル電気泳動後にゲルスキャナーで分析した
。結果は第38頁に区示しである。生成物形成速度は60pMol/m111/
#素単位であった。
第38頁の分離は、クロストリジオペブチダーゼAとの定量的反応後の5A50
6/1からの最大反応生成物をバンド5で示す。
3.4. 5A302/lの分解
該−木調タンパク質は477個のアミノ酸の長さを有し、コラゲナーゼによって
切断できる配列ニー Gay −Pro −Ala −Gly −Pro −(
表1参照)を含む。301アミノ酸(分子量31269)及び176アミノ酸(
分子量18668)の長さを有する2種の分解生成物が形成される。5A302
/1の反応性は小さいためt:、生成物形成速度のおおよその値しか得られなか
った。
反応緩衝液15μQ (3,2の場合と同様)中に5A302/1μり及びクロ
ストリジオペブチダーゼA1.0単位を含有する反応混合物を37℃で15時間
インキュベートとし、次に3.2で記載したように試料緩衝液を加えかつ加熱し
て停止し、ゲル電気泳動及びゲルスキャナーでの評価によって分析した。大きい
反応生成物約0 、02 pMol/ min/酵素単位が形成された。第38
頁にはバンド9で相、応のゲル電気泳動分離を示しである。
表 2: 修飾プレホスファターゼ(表1)及びプレホスファターゼ/ATCH
融合タンパク質(西独国特許出願第P・3731875.6号)とクロストリジ
オペブチダーゼAとの反応の性成物形成速度
us4t33/’l 2 21.0
sA506A 5 59.8
SA186/1 1 < D−01
SA343/1 2 40
SA341/1 5 350
SA360ダ 8540
応生成物のグル電気泳動分離
5A34T/1 5A506/I H54T33/I 5A302/1第3.
5. 7及び9列:クロスト1,1ジオペプチダーゼAで分解した後の生成物第
2及び3列で使用した融合タンパク質は勾配クロマトグラフィーによって精製さ
れなかった。
第3列の最低分子量を有するバンドはaly−pro−hcTHc 1−39)
である。
第5及び7列には高分子分解生成物のみが認められ、低分子生成物はデルを完全
に通過する。
タンパク質5A302/1、n54133/1及び5A506/1 とクロスト
リジオペブチダーゼAとの反応の時間従属関係単試料半シ
の生成物
反応条件は例3.2〜3.4に記載されている。
5A506/1及びH94133/1の値はそれぞれクロスト1.1ジオペプチ
ダーゼA O,01単位を用いて得られ、5A302/1の値はクロストリジオ
ペプチダ−Ao、1単位で得られた。
Abb、i: プ7 スミ) psB94 (6454塩基対)ノ制限p素a断
地図15す
Abb・ 2 : r5ヌミドpsA3,02の制限酵素切断地図Abb、3
: プラスミドpSA 50.6の制限酵素切断地図15!3
Abb、4 : プラスミドpps4133の制限酵素切断地図国際調査報告
−1−−1−m−1龜 PCT/DE 8ε100535国際調査報告 [Model 381A manufactured by Applied Biosystems (850 LincoIn CenterDrive, Foster C1ty, Calif, 94404, USA)]
It was synthesized according to the equipment manufacturer's instructions and purified by gel electrophoresis. DNA sequencing was performed using the didesoxy method (F, Sanger et al., Proc, Natl. Aead, Sci, tJsA 74.5463-5467 [1977]).
I did it. The phage vectors are commercially available from Boehringer (Mannheim), Pharmacia-LKB Gmb) and many others.
Available from the donor. For radiolabeling, desoxyadenon-5-[a-3&s]thio triphosphate was used (Lil, D. BigHin et al., Proc, Natl. Aca4. Sci, USA-80+3963-3965 [ 983] ). Restriction endonucleases EcoRI, PstI, 5phl and Haem and DNA ligase (74)i:t were obtained from Boehringer (Mannheim). NcoI was a polynucleotide obtained from Nevi England Biola bs Gmb)l (62315chvalbach).
Kinase (T4) was obtained from Pharmacia/P-L (7800 Freiburg, Br.). 1.1 Production of pSA302 Plasmid pSB94 was linearized with restriction endonuclease Neo T. the
The reaction mixture containing 14 μ9 of plasmid DNA and reaction buffer (Tris-HCI 50 mM, MgCl2 10 mM, NaCl2 100 mM, dithiothreitol 1 mM, pH 7,5) containing 50 p (Ncol 17 units in l) was incubated at 37 °C for 7 hours. The reaction mixture was extracted with dinol (incubated for an hour).
The DNA was then precipitated with ethanol, dried and dissolved in TE buffer (Tris HCl45 m&i, EDTAI iM, pH 7,5). Two 18ffler synthetic oligonucleotides that did not undergo phosphorolysis at the 5'-OH group.
Creotides: 1 μg each of 5'-CAT GGCCCT, CAG, ACCC-3', 5'-CATG GGG, and C-3' were mixed in an aqueous solution and incubated at 37°C for 15 minutes. Both oligonucleotides were then incubated with linearized pSB94 3-5μ9 and ligase reaction buffer (Tris HCI 20 +nM, MgCL 10mlI, dithioeurytrit 10+nlJ, ATP'0.6mM, pH 7,6) at 50pO ( ') Reacted with 4 units of DNA ligase at 20°C for 2.5 hours. The DNA was phenol extracted and evaporated as described above.
Nord precipitation: thus post-treated and used for transformation of E. coli strain SB44. For the production and transformation of qualified cells. It was performed according to the method of Dagert and S. D. Ehrlich (Gene 6.23-2 8N979). Transformed cells were plated to form single colonies. The oligonucleotide sequence
Colonies containing plasmid DNA with sequences are isolated by colony hybridization.
Identified it. Colony hybridization was performed by T. J. P. 'Gergen' according to the basic record described by Mania [is et al. etc. (Nucleic Ac1dsResearch 2115 '-2136 [1979]).
As a compound-forming reagent, the oligonucleotide previously labeled with 5'=p$2-phosphate by reaction with γP''-ATP and polynucleotide kinase (T, ) is used.
nucleotides were used. The localization of the 18 base pair synthetic Ncol fragment in the new recombinant plasmid of the positive clone was confirmed by restriction analysis. For this purpose, plasmid DNA was prepared using standard methods.
and reacted with the restriction endonuclease HaeDT. The generated fragments
Compounds were analyzed by gel electrophoresis (molecular weight determined by comparison with Haem cleaved PBR322 in an 8% polyacrylamide gel). The Nco I cleavage site used for incorporation of the 18 base pair synthetic fragment is located on the 385 base pair Haem fragment of pSB94. This fragment is a new recombinant protein.
In the rasmid it is missing and must be replaced with a new fragment on the 2nd side.
do not have. This is because the 18 base pair fragment even has the Haem sequence.
Ru. The sizes of the two new fragments depend on the orientation of the 18 base pair fragment: In the desired orientation case I, illustrated in Figure 2, the 342 base pair and 61 base pair fragments are expected.
while the reverse orientation gives fragments of 330 base pairs and 73 base pairs. Ryoden
Several plasmids were found that had the same position. The pSA302 shown in Figure 2 is
This is one of the plasmids with the desired orientation. 'salt from pSA302, containing synthetic NA introduced by cloning.
The EcoRI fragment of base pair 349 was cloned into the sequencing vector M13mp19.
Gusi, sequenced as described above. The partial sequence of pSA302 between both EcoR1 cleavage sites, illustrated in FIG. 2, has been completely verified. 1.2 Production of pSA506 This production was carried out in the same manner as the production of pSA302. pSB94’#I@en
Linearized with donuclease sph I. Reaction conditions and work-up were as described for pSA302. Two 45mar oligonucleotide sequences TCCTGCAG (, CCC GGCGGGTCCAGCAGGCCC-3' and 5'-CGGACCTGCAGGGCCTGCTGGA CCCGCCGG GCCT GCAGGACCATG-3' was Sph I linearized under the same conditions as described for pSA302. After transformation of E. coli SB44 post-treated by reaction with pSB94 and DNA ligase, positive colonies were identified by colony hybridization with P3'' end-labeled 45mer oligonucleotides obtained in this way. The new recombinant plasmid contains two 45mer oligonucleotides.
Formed from the otid f;DN with a complete Sph I sequence on only one side of the part
Ru. This has a distance of 257 base pairs from the next located EcoRI sequence in the claimed plasmid (see Figure 3), whereas this distance
It has only 212 bases, just like pSB94. obtained by reaction of the new recombinant plasmid with the restriction sequences EcoRI and sphI.
Size determination of the synthesized DNA fragments by gel electrophoresis revealed that psAs06 was one of the plasmids with the desired orientation of the synthesized DNA fragments. To verify the sequence shown in Figure 3, a 257 base pair EcoRI/Sph I fragment was crawled into a sequencing vector and bound. 1.3 Production of pH54133 A reaction mixture consisting of 3μ9 DNA of plasmid pSA506 and 5 units of the inhibitor enzyme Pstl in 50μa of reaction buffer (same as in 1, 1) was incubated at 37°C for 2 hours.
The mixture was incubated and worked up as described in Example 1.1. This resulted in three DNA fragments (27 base pairs, 2
420 base pairs and 4007 base pairs). 2 (electrolyze the larger piece of 1)
The DNA ligature was isolated from the gel by separation and purified under reaction conditions similar to Example 1.1.
(T4), post-treated, and used for transformation of E. coli SB44. Plasmid DNA was isolated from some ampicillin resistant clones. One of them is pH54133, and its restriction enzyme cleavage map is shown in Figure 4.
It is. pH54133 was induced from pSA506 by a deletion resulting in a reduction in the size of the 257 base pair EcoRI/Sph I fragment to 230 base pairs.
be guided. This fragment was cloned into M13mp1g and sequenced as in Example 1.2. This verified the nucleotide sequence shown in FIG. 2. Production of proteins 5A302/1.5A506/l and H34133/l The three proteins were obtained from the strains described in Example 1: E. coli SB 44 (pSA302), E. coli SB44 (pSA506) and E. c. Obtained by fermentation of order o SB44 (pHS4133). Their biosynthesis is regulated in a manner similar to that of alkaline phosphatase. The biosynthesis is reinitiated by inorganic phosphate and conversely induced in phosphate-deficient media (A. Torriani, Biochem Biophys, Acta 38 e 460-'469 [1960]). For the identification of phos-77tase derivatives, the antigen plot detection method by H8Towbin et al. (Proc, Natl. Acad, Sci, USA 76, 4350 4354 [1979]) was applied, among others. The antiserum required for this was obtained from E. coli purified under standard conditions (D. L. Weir, Handbook of Experimental Immunology, Vol. 2, Blackwell 5 Scientific Publ. Oxford 1978). K 12 degree Arca
produced by immunizing rabbits with phosphoric phosphate. used for immunity
The phosphates used were prepared according to a known method (A., D., 'Methods in Enzymolog 7', Vol. nlB, 2122218.L. Grossman, K., Moldave (Eds,) Academic Press, New York). [1968]) isolated by. As the second antibody, a goat antiserum against rabbit IgG conjugated with alkaline phosphatase was used as the indicator enzyme (Cooper Biomedial Inc., Malvern, USA).As the color reagent, 5-bromo-4- Kroll -3-1n)'! J ruphosphate was used. The three proteins and the three strains from which these proteins are produced are similar to each other so that the same fermentation and isolation methods can be applied in all cases. 2.1 Fermentation 2 omu: single inoculum L, 37 °C Shake for 24 hours, then incubate the same medium.
The mixture was transferred to 800+ mQ soil and further shaken at 37° C. for 16 hours. This preliminary culture
The culture was transferred to a 2012 glass fermentation vessel in which low phosphate medium (LP medium by K. Kreuzer et al.: Genetics 13, 459-468 [1975]) 9.2Q was present. The fermenter was heated to 37°C with a flow rate of 10ff/win.
The mixture was stirred for 6 hours under air (220+n1n). Cells were then obtained using a flow centrifuge. Approximately 30 g of wet cellular material was obtained. 2.2 Isolation of expanded protein extract 30 g of wet cells from 2.1 were suspended in 400 yaQ of lysis buffer (Tris HCl 50 mM, NaCl 60 mM, pH 8-0). After adding phenylmethylsulfonyl fluoride (final concentration 10 mM) and DNA5e (DNA sel from bovine pancreas, Boehringer/Mannheim, purity 1:10 py/9 wet cells), the suspension was kept in a cold room. Cells were digested with a cell homogenizer (Manton-Gaulin) at a pressure of 650-700 ky/ctn" (10,000 Psi) at (4°C). Digestion was repeated twice, and the suspension was cooled in water after each pass. was separated by centrifugation (20 min at 110,000x and 4°C), washed twice with digestion buffer, and dissolved in Tris HC 150mM (pH 8,0)/Urea 8M (60wQ).Insoluble components were removed from this solution by centrifugation. and gradient chromatograph
It was kept in water until further purification by filtration. 2.3 Identification of phosphatase derivatives The major protein component (approximately 50-70%) in the urea buffer of the protein extract obtained in 2.2 is in each case a phosphatase derivative. The protein mixture was prepared under standard conditions (Ll, K, Laan+mli, Nature 227, 680-685 [970]). After separation by electrophoresis on a 5DS-polyacrylamide gel, the corresponding protein bands were identified according to the following criteria:
a) The thickest band of the protein mixture corresponds to the amino acid sequence listed in Table 1.
has a corresponding molecular weight. b) This protein can be reinitiated by phosphate, ie the band does not appear when the cells are fermented as described in 2.1 but at 10 times the phosphate concentration. C) The band is plasmid specific and was produced under the same conditions as in 2.1.I; plasmid-free E. It does not appear in cells of the coli 844 strain. d) The band specifically reacts with antiserum against purified alkaline phosphatase produced by E. coli K12 in the antigen plot detection method. Gel electrophoresis molecular weight measurements using a probe protein mixture (low molecular weight proteins manufactured by Pharmacia) revealed that the phosphatase derivative exists in a so-called precursor form, that is, it also has the signal sequence of alkaline phosphatase.
Ru. The protein is relatively poorly soluble in dilute buffers. Therefore, cell degradation and
Only a small amount can be detected in the supernatant obtained after heart separation. 2.4 Purification of phosphatase derivatives The protein extract obtained in 2.2 was separated and the modified phosphatase was further purified by gradient chromatography using a medium pressure chromatography device (FPLC) (Pharmacia, Psala, Sweden). do. The aforementioned Mayriki anion exchange column (Mono Q-HR515 type) was equilibrated with buffer A (1-lith HCI 50 + nM, urea 8 M, I)), and the protein from 2.1 The solution was loaded and finally 1-0, fl using a gradient of 200 ml of NaCl O, formed from buffer A and buffer B (50 mM NaCl, 11 M NaCl, 8 M urea, pH 8,0). Elution was performed at a flow rate of /min. The total gradient capacity is 20rnQ, and each fraction of 1rnQ
Collect them. The absorbance of the eluate at 280 nllll was recorded with a flow plot meter. @のふ
The protein composition of the lactation was determined by 5DS-polyacrylamide Ge-Lumi pneumophoresis.
Therefore, I analyzed it. Phosphatase derivatives were eluted at 50-70mM NaCl. The corresponding fractions were purified and dialyzed against 400 volumes of buffer (Tris HC 150 mM, NaCl 1150 mM, pH 8.0). Under these conditions, the protein is dissolved and used in this form for the next step of collagenase digestion.
Ta. Purity of phosphatase preparations determined by 5DS-polyacrylamide gel electrophoresis
Therefore, it was controlled (see page 38, bands 4, 6 and 8). The purity was higher than 90%. The protein content was analyzed by W. Schaffmer et al.
The concentration was measured using Waltz 10B and was 0.6 to 0.7 πg/1l112. Approximately 160 m5 of protein was obtained from 1012 fermentations. 3. Specific degradation of modified phosphatase proteins by collagenase L 3.1. Purification of Collagenase Clostridiopebutidase A from Clostridium histolyticum (EC3,4-24,3) was purchased from Sigma Chemie GmbH (D-8024 Deisenhofen, Gruenwaldar We). (Typ, Be5t, obtained from g30) -Nr, CO773). This enzyme was analyzed using an FPLC apparatus and Example 2.4. Further purification was performed by gradient chromatography using the same anion exchange column as described. Using collagenase 2t ag, buffer A (Tris HCI I OmM, CaC1z 5 mM, pH 8.0) and buffer B (Tris HCI] O0 + nM, CaC1 = 5 mM. A gradient of 10-200mM NaCl (11mM NaCl, pH 8-0) was used at a flow rate of 0 and 5 ml/min. The total capacitance of the gradient is 20Ω. Flagenase activity was determined by the test described by E+ Wuensch et al. (Floppe-5 eyler's Z, Physiol. Chem, 333, 149 151 [1963]). The highly active 7 lacs has a tar of 0.811g/rnQ.
It had a protein content and a specific activity of 2500 units/vny. The amount described next
Store the solution experiment at -20℃! : It was carried out using the above-mentioned fraxin. 12 Degradation of HS4133/1 Ichikicho protein has a length of 477 amino acids (molecular weight 49919).
Ru. The protein contains a sequence sequence cleavable by collagenase.
-〇ly-(Pro-Y-Gly)! -Pro-[Y in the above sequence represents old s once and once represents Aha (see Table 1)]. By cleaving two Y-Gly bonds, two proteins with 447 amino acids (molecular weight 46,880) and 27 amino acids (molecular weight 2832) and tripeptidyl
Gly-Pro-Ala is formed. Collagen of various phosphatase derivatives
In order to compare the reactivity towards enzymes with each other, the formation of maximum degradation products was determined during the reaction.
1; depending on the time and enzyme amount. The reaction mixture containing 53 μ9 of H34133/1 and 0.1 unit of cross-tridiopebutidase A in reaction buffer (90 mM Tris-HCI, 25 mM CaCl, 20!IIM, pl(8,0)) was incubated at 37°C. 2.5 o'clock
Incubated for a while. Remove 10 μQ of each sample at time intervals of 15 to 30 minutes, add 3 μQ of sample buffer (10% sucrose, 10% sodium dodecyl sulfate, 1 mM dithiothreitol, 2 mM EDTA), and heat to 95°C for 5 minutes. Stop immediately by t:. Samples were run on a 5DS-polyacrylamide gradient gel (constant 0.33% bis-acrylamide).
by electrophoresis in a gradient of 12.5-25% acrylamide with
It was separated. The same gel was stained with Coomassie brilliant blue G, and then stained.
Cut into strips according to protein bands and quantitatively evaluated at 280 nm using a gel scanner (manufactured by ISCO, optical device type 6, absorption monitor UA-5).
Ta. A corresponding calibration curve obtained using purified phosphatase protein
The protein content of the maximum degradation product band was determined from the height of the peak. The results are summarized on page 38. From these data, the production of H54133/l
Product formation rate 21, 0 pMol/in/enzyme unit is obtained. The separation on page 38 shows the electrophoretic separation of the largest degradation products from a sample of HA4133/1 after complete reaction with clostridiopebutidase A in band 7. 3.3 Degradation of 5A506/1 The wood-like protein has a length of 486 amino acids M (molecular weight 50,596);
-Gly-(Pro-Y-Gly)s-Pr. ] In the above arrangement, Y represents old s once and represents Ala four times (see Table 1)]. When all Y-cry bonds are cleaved, the protein generated from H54133/1
4 MO] of Gly-Pro-Ala is formed per 1 MO of the same protein and substrate as the protein and substrate (see , 3, 2). The reactivity of 5A506/1 with clostridiopebutidase A was measured in the same manner as for H54133/1. The reaction solution contained 53 μy of 5A506/1 in IQQ, uff, and had the same enzyme and buffer concentrations as the reaction solution for H54 133/1. Incubate for 80 minutes at 37°C. Remove 10 μQ samples at 10-15 minute intervals. 3.2. were stopped and analyzed on a gel scanner after gel electrophoresis as described in . The results are shown on page 38. The product formation rate was 60 pMol/ml/# unit. The separation on page 38 shows the maximum reaction product from 5A50 6/1 in band 5 after quantitative reaction with clostridiopebutidase A. 3.4. Degradation of 5A302/l The woody protein has a length of 477 amino acids and contains the sequence Gay-Pro-Ala-Gly-Pro- (see Table 1) which can be cleaved by collagenase. Two degradation products are formed with lengths of 301 amino acids (molecular weight 31,269) and 176 amino acids (molecular weight 18,668). Since the reactivity of 5A302/1 is small, only an approximate value of the product formation rate can be obtained.
It was. 5A302/1μ in 15μQ of reaction buffer (same as in 3 and 2) and chlorine.
The reaction mixture containing 1.0 units of stridiopeptidase A was incubated for 15 hours at 37°C, then stopped by adding sample buffer and heating as described in 3.2, and subjected to gel electrophoresis and gel analysis. Analyzed by scanner evaluation. A large reaction product of approximately 0.02 pMol/min/enzyme unit was formed. On page 38, band 9 shows the gel electrophoretic separation of the phase. Table 2: Rate of product formation for the reaction of the modified prephosphatase (Table 1) and the prephosphatase/ATCH fusion protein (West German Patent Application No. P. 3731875.6) with clostridiopebutidase A us4t33/'l 2 21. 0 sA506A 5 59.8 SA186/1 1 < D-01 SA343/1 2 40 SA341/1 5 350 SA360 da 8540 Glue electrophoretic separation of reaction product 5A34T/1 5A506/I H54T33/I 5A302/1 3rd. 5.7 and 9 rows: Products after digestion with clost 1,1 diopeptidase A. The fusion proteins used in rows 2 and 3 were purified by gradient chromatography.
I couldn't. The band with the lowest molecular weight in the third column is aly-pro-hcTHc 1-39). Only high-molecular decomposition products are observed in columns 5 and 7, and low-molecular products completely pass through the del. Clost with proteins 5A302/1, n54133/1 and 5A506/1
Time Dependency of the Reaction with Lysiopeptidase A Single Sample Product Reaction conditions are described in Examples 3.2 to 3.4. The values for 5A506/1 and H94133/1 are Clost 1.1 diopepti, respectively.
The value of 5A302/1 was obtained using Clostrigiopeptida-Ao, 1 unit. Abb, i: psB94 (6454 base pairs) restriction p fragment map 15 Abb.2: Restriction enzyme cleavage map of r5 numid psA3,02 Abb, 3: Restriction enzyme cleavage map of plasmid pSA 50.6 Map 15!3 Abb, 4: International research report on restriction enzyme cleavage map of plasmid pps4133 -1--1-m-1 龜 PCT/DE 8ε100535 International research report