JPH044879A - ヒモ状ウイルス遺伝子 - Google Patents
ヒモ状ウイルス遺伝子Info
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Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Agricultural Chemicals And Associated Chemicals (AREA)
Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
〔産業上の利用分野〕
本発明は、ニンニク葉にモザイク症状を惹起するヒモ状
ウィルスの外被蛋白質をコードする遺伝子に関する。
ウィルスの外被蛋白質をコードする遺伝子に関する。
〔従来の技術〕
ウィルスは植物病害の主要な病原の一つであり、その有
効な防除法が無いこともあってウィルス病害による経済
的損失は非常に大きい。植物ウィルスは棒状〜ひも状、
球状〜正多面体状、及び桿状の3群に大別される多様な
形態を持ち、その染色体遺伝子も一本鎖RNA、2本鎖
RNA、1本鎖DNA、2本鎖DNAと多様で、現在ま
でに600種以上のウィルスが記録されている。
効な防除法が無いこともあってウィルス病害による経済
的損失は非常に大きい。植物ウィルスは棒状〜ひも状、
球状〜正多面体状、及び桿状の3群に大別される多様な
形態を持ち、その染色体遺伝子も一本鎖RNA、2本鎖
RNA、1本鎖DNA、2本鎖DNAと多様で、現在ま
でに600種以上のウィルスが記録されている。
一方、分子生物学の進歩に伴い、これら植物ウィルスの
外被蛋白質(以下〔P〕遺伝子を植物に導入し、発現さ
せることにより、形質転換植物にウィルス抵抗性(干渉
作用)が獲得されることが明らかとなってきた。この様
な例はタバコモザイクウィルス(TMV)に端を発し、
形態や遺伝子構造の異なる他のウィルス〔例えば、アル
ファルファモザイクウィルス(八LMV)、ジャガイモ
ウィルスX(PVX) 、キュウリモザイクウィルス(
CMV) )についても同様な報告がされている。この
事実は、CP遺伝子の導入によるウィルス抵抗性植物の
育種が普遍的に可能であることを示唆している。
外被蛋白質(以下〔P〕遺伝子を植物に導入し、発現さ
せることにより、形質転換植物にウィルス抵抗性(干渉
作用)が獲得されることが明らかとなってきた。この様
な例はタバコモザイクウィルス(TMV)に端を発し、
形態や遺伝子構造の異なる他のウィルス〔例えば、アル
ファルファモザイクウィルス(八LMV)、ジャガイモ
ウィルスX(PVX) 、キュウリモザイクウィルス(
CMV) )についても同様な報告がされている。この
事実は、CP遺伝子の導入によるウィルス抵抗性植物の
育種が普遍的に可能であることを示唆している。
更に、アンチセンスRNAを用いたウィルス防除も微生
物を用いた実験系やPVXでは成功しており、末法も、
ウィルス抵抗性植物の育種に於て有力な手段となり得る
ことが期待されている。
物を用いた実験系やPVXでは成功しており、末法も、
ウィルス抵抗性植物の育種に於て有力な手段となり得る
ことが期待されている。
以上の様な分子生物学的な手法によるウィルス抵抗性植
物の育種を行うに際して、ウィルス遺伝子産物のアミノ
酸配列およびウィルス遺伝子の塩基配列の解明が必要不
可欠であることは言うまでもない。
物の育種を行うに際して、ウィルス遺伝子産物のアミノ
酸配列およびウィルス遺伝子の塩基配列の解明が必要不
可欠であることは言うまでもない。
ところで、ニンニクは有史以来、その独特の香や味から
香辛料や調味料として利用されるのみならず、種々の生
理活性物質を含んでいることから医薬品原料としても利
用されているユリ科の多年草である。ニンニクもウィル
スの感染を受け、緑葉にモザイク斑の発生、葉先の貧化
などの病徴が表われ、ウィルス感染によりその収量が低
下することが報告されている。ニンニクに感染するウィ
ルスとしては屈曲性のヒモ状ウィルスであるニンニクモ
ザイクウィルス(GMV)及びニンニク潜在ウィルス(
GLV) 、並びに棒状ウィルス(TMV)が知られて
おり、このうちGMVが病原ウィルスであり、GLVは
病徴には直接関与しないとされている。
香辛料や調味料として利用されるのみならず、種々の生
理活性物質を含んでいることから医薬品原料としても利
用されているユリ科の多年草である。ニンニクもウィル
スの感染を受け、緑葉にモザイク斑の発生、葉先の貧化
などの病徴が表われ、ウィルス感染によりその収量が低
下することが報告されている。ニンニクに感染するウィ
ルスとしては屈曲性のヒモ状ウィルスであるニンニクモ
ザイクウィルス(GMV)及びニンニク潜在ウィルス(
GLV) 、並びに棒状ウィルス(TMV)が知られて
おり、このうちGMVが病原ウィルスであり、GLVは
病徴には直接関与しないとされている。
しかしながら、最近GLVとGMVの重複感染による収
量の低下はGMV単独感染の場合の数倍にも達すること
が明らかになってきた。従って見かけ上病徴を示さない
GLVもニンニクの収量低下には重要な役割を担ってい
ることになる。
量の低下はGMV単独感染の場合の数倍にも達すること
が明らかになってきた。従って見かけ上病徴を示さない
GLVもニンニクの収量低下には重要な役割を担ってい
ることになる。
先に述べた様にGLV及び、GMVはともに屈曲性のヒ
モ状ウィルスであるが、その粒子長の違いや細胞質内封
入体の有無から、GLVはCarlavirusグルー
プのウィルスであり、そしてGMVはPotyviru
sグループのウィルスであることが知られており、各々
宿主特異性が異なるだけでなく血清学的にも区別される
ことが明らかとなっている。しかしながら、これらのウ
ィルスのCPの正確な分子量やアミノ酸配列などに関す
る生化学的知見、ウィルス遺伝子に関する情報などは全
く得られていないのが現状である。
モ状ウィルスであるが、その粒子長の違いや細胞質内封
入体の有無から、GLVはCarlavirusグルー
プのウィルスであり、そしてGMVはPotyviru
sグループのウィルスであることが知られており、各々
宿主特異性が異なるだけでなく血清学的にも区別される
ことが明らかとなっている。しかしながら、これらのウ
ィルスのCPの正確な分子量やアミノ酸配列などに関す
る生化学的知見、ウィルス遺伝子に関する情報などは全
く得られていないのが現状である。
従って本発明は、ニンニクに感染している複数のウィル
スのクローン化された遺伝子を提供し、ウィルスの遺伝
子診断や分子生物学的手法によるウィルス抵抗性ニンニ
クの作出等を可能にするのみならず、これらの遺伝子の
解析により、ニンニクに感染し病徴に影響を与えるウィ
ルスの全容解明に寄与し広くニンニクのウィルス防除に
貢献しようとするものである。
スのクローン化された遺伝子を提供し、ウィルスの遺伝
子診断や分子生物学的手法によるウィルス抵抗性ニンニ
クの作出等を可能にするのみならず、これらの遺伝子の
解析により、ニンニクに感染し病徴に影響を与えるウィ
ルスの全容解明に寄与し広くニンニクのウィルス防除に
貢献しようとするものである。
[課題を解決するための手段〕
上記の課題は、ニンニク葉にモザイク状病状を惹起する
ヒモ状ウィルスGMV及びGLVの外被蛋白質をコード
する遺伝子及びその種々の断片を提供することにより解
決される。
ヒモ状ウィルスGMV及びGLVの外被蛋白質をコード
する遺伝子及びその種々の断片を提供することにより解
決される。
囚双抜久盃五ス
本発明でいうひも状ウィルスとは、ニンニクモザイク病
を引き起す、ひも状のウィルスをいう。
を引き起す、ひも状のウィルスをいう。
具体的には、長さ約600〜700nmの屈曲の少いニ
ンニク潜在ウィルス(GLV)および長さ約700〜8
00nmの比較的屈曲の多いニンニクモザイクウィルス
(GMV) とに大別される。いずれのウィルスも各地
に広く分布している(日植病報、郵、 ?27 (19
79))。
ンニク潜在ウィルス(GLV)および長さ約700〜8
00nmの比較的屈曲の多いニンニクモザイクウィルス
(GMV) とに大別される。いずれのウィルスも各地
に広く分布している(日植病報、郵、 ?27 (19
79))。
ひ ウィルスの の
本発明は、前記のウィルスに由来する外被蛋白質のクロ
ーン化された遺伝子に関するものである。
ーン化された遺伝子に関するものである。
ウィルスの外被蛋白質、その一部又は外被蛋白質を含む
前駆体蛋白質をコードする本発明の遺伝子は、次に示す
アミノ酸配列A、B、E、F、I。
前駆体蛋白質をコードする本発明の遺伝子は、次に示す
アミノ酸配列A、B、E、F、I。
J、M、又はNをコードしている。
Asn Asn Pro Val Asp Pro S
er Thr 5erGln Gln Met Ser
Gly Thr Thr Gly Gln ValS
er Gin Pro Arg Pro Asn Va
l Asn Pro PheGly Gin Ser
Gln Thr Arg Pro Leu Gly A
snArg Asp Pro Gin Asn Asn
Ser Asn Ala 5erAsp Asp S
er Asp Ala Leu Met Pro Al
a ValThr Asp Phe Glu Thr
Leu Thr Lys AspνaIGlu Ser
Asn Ser Val Ala Ser Arg
Leu l1e11e Arg Asp Ile Le
u Asp Met Leu Gin AlaLys
Arg Gln Gly Ala Thr Pro L
ys Asp LeuPhe Ser Leu
Ala Trp Thr Cys Tyr
旧s AsnGly Ser Ser Arg Asp Ala Pro CysLeu Ly
s Asp l1eLeu Arg Gln
PheAha Cys Tyr Val Lys Pro Pro Ala Tyr Gln Glu Asp Asp Phe Phe Asn 5er Pro Ser Pr。
er Thr 5erGln Gln Met Ser
Gly Thr Thr Gly Gln ValS
er Gin Pro Arg Pro Asn Va
l Asn Pro PheGly Gin Ser
Gln Thr Arg Pro Leu Gly A
snArg Asp Pro Gin Asn Asn
Ser Asn Ala 5erAsp Asp S
er Asp Ala Leu Met Pro Al
a ValThr Asp Phe Glu Thr
Leu Thr Lys AspνaIGlu Ser
Asn Ser Val Ala Ser Arg
Leu l1e11e Arg Asp Ile Le
u Asp Met Leu Gin AlaLys
Arg Gln Gly Ala Thr Pro L
ys Asp LeuPhe Ser Leu
Ala Trp Thr Cys Tyr
旧s AsnGly Ser Ser Arg Asp Ala Pro CysLeu Ly
s Asp l1eLeu Arg Gln
PheAha Cys Tyr Val Lys Pro Pro Ala Tyr Gln Glu Asp Asp Phe Phe Asn 5er Pro Ser Pr。
Lys Pro Thr Asp
Ser Met Asn AlaSer Ar
g Arg AlaArg Ala Asp
LeuHis Glu Gin Pr。
g Arg AlaArg Ala Asp
LeuHis Glu Gin Pr。
Phe i
〔アミノ酸配列B〕
Gly Asp Arg
rle Gln Gly Leu
Asp Gly Ser 5er
Pro Asn Arg Asn
Phe Val Thr
Gly Met Ala
Val Glu Asn
Cys Gly Phe
Ala Gly Lys
/l5yl Trp 5er
Ser Lys Phe
Ala Val Leu
Pro Gly Gly
Ala Glu l1e
Lys Met 5er
Thr Asn Met
Leu Ala Gln
Lys Pro Pr。
Leu Thr Thr
His Ser Glu
Ser Cys Thr
Tyr Ala Lys
Gfn GIr+ Asn
Arg Lys Gly
Ala Ala Phe
Ser Asp Ser
Met Arg Phe
Leu Ala 旧5
lie Val Glu
Val Ser Thr
Gln Gln Ile
Met Ile Thr
Ser Glu
Asn Ala
Gly Gln
Pro Pr。
Gly Thr Asn Pr。
Gln Ala Gln Gly
Ser Gln Arg Asn
Pro Arg Pro Gln
Ala Asp Leu
Pro Ser Glu
Gly Glu Val
Lys Glu Thr
Leu Gln Ala
Lys Asp Leu
丁yr His Asn
Leu Thr Thr
旧s Ala Glu
Tyr Cys Thr
Tyr Ala Lys
Gln Gin Asn
Arg Lys Gly
Ser Ala Phe
Asn Asp Ser
Met Arg Phe
Leu Gly His
11e Ile Glu
Vat Ser Thr
Gln Gin l1e
Asn Ala Gln
Asn Asp Leu
Thr Ser Asn
Val Lys Glu
Arg Arg Thr
Phe Ser Leu
Gly Ser 5er
Asp Gly Pr。
Leu Lys Asp
Leu Arg Gin
Thr Cys Tyr
Lys Pro Pr。
Phe Gin Glu
Asp Phe Phe
Ser Pro Ala
Lys Pro Thr
Ser Met Asn
5er Arg Lys
八rg Ala Asp
Hls Glu Ala
Asp Asn 1ie
Ala Ala l1e
Ser Val Ala
11e Leu 5er
Asn Ala Thr
八la Trp Ala
Lys Phe Thr
Cys Gly l1e
Leu Val Glu
Phe Cys Gly
Val Met Gly
Ser Asn Trp
Glu Ser Lys
Asn Ala Val
Pro Pro Gly
Gln Asp Glu
Ala Lys Met
Ala Ser Asn
Leu Leu Aha
Pro Lys Pr。
Met
Aha
Thr
5p
Pr。
Cys
Thr
Pr。
Asp
Tyr
Cys
Ser
Phe
Leu
Gay
1e
Ser
Met
Gln
Leu
Met Leu Thr Phe〔アミノ酸配列
E〕 Ser Gly Asp Val Asn Ala AlaGll Gly
Leu Asn Gly Ser Arg Pr。
E〕 Ser Gly Asp Val Asn Ala AlaGll Gly
Leu Asn Gly Ser Arg Pr。
Gly Ser Gln Thr
Pro Ser Ser ThrThr As
n Glu LeuLeu Glu Ala
ValAsn Ser Val AlaGlu
Ile Leu Asp Pro Ser Ala ThrLeu Ala
Trp Ala Ser Arg Tyr Thr Pro Cys Gly Met Asp Leu Val Glu Gln Phe Cys Gly Tyr Vat Thr Gly Pro Ala Asn Trp Ser Leu Ser Met Thr Asp Glu Ala Thr Gly Leu Val Pro Ser Lys Gln Gly Gly Leu Pro Ser 八Ia Asn Asp Thr Gin 5er Leu Leu Arg Pro Lys Asp Cys Tyr His Asn Leu Ala Ser 1lis Ala Glu Phe Cys Phe Tyr Ala Arg Gin Gin Ala Arg Lys Asp Asp Leu Pro Ser Thr Ser Ala Gln 5er Gly Pr。
n Glu LeuLeu Glu Ala
ValAsn Ser Val AlaGlu
Ile Leu Asp Pro Ser Ala ThrLeu Ala
Trp Ala Ser Arg Tyr Thr Pro Cys Gly Met Asp Leu Val Glu Gln Phe Cys Gly Tyr Vat Thr Gly Pro Ala Asn Trp Ser Leu Ser Met Thr Asp Glu Ala Thr Gly Leu Val Pro Ser Lys Gln Gly Gly Leu Pro Ser 八Ia Asn Asp Thr Gin 5er Leu Leu Arg Pro Lys Asp Cys Tyr His Asn Leu Ala Ser 1lis Ala Glu Phe Cys Phe Tyr Ala Arg Gin Gin Ala Arg Lys Asp Asp Leu Pro Ser Thr Ser Ala Gln 5er Gly Pr。
Asn Pro Arg
Pro Thr Vat
Glu Ser Glu
Val Thr 5er
Thr Ile Arg
Ala Arg Lys
Leu Phe 5er
Asn Gly 5er
Thr Asp Ala
Glu Leu Lys
Thr Leu Arg
Lys Thr Cys
Asn Lys Leu
Gly Phe Gin
Asp Glu Ser Lys
Phe Asn Ala Val^sn Pro
Pro Gly Thr Gln Ala GluAsn Al
a Lys MetLys Ala Thr A
sn Asp Val Ile Ala Pro Pro Lys Pr。
Pro Gly Thr Gln Ala GluAsn Al
a Lys MetLys Ala Thr A
sn Asp Val Ile Ala Pro Pro Lys Pr。
八sn Glu Gln
5er Pro Arg Gay
Pro Pro Gin Pr。
Gin Gly Gln Thr
Asp Pro Pro Asn
Glu Gln Asp Glu
Glu Phe Glu Asn5er Asn
Ser Leu Arg Asp lie Leu Arg Gin Gly Ala Ser Leu Ala Trp Phe Ser 1y Ile Ser にet Gln Leu Ala Ala Phe Ser Asp Ser Met Arg Phe Leu Gly His 11e lie Glu Vat Ser Thr Gln Gln lie Met Leu Thr Gly Asn Thr 5erThr Va
l Asn Pr。
Ser Leu Arg Asp lie Leu Arg Gin Gly Ala Ser Leu Ala Trp Phe Ser 1y Ile Ser にet Gln Leu Ala Ala Phe Ser Asp Ser Met Arg Phe Leu Gly His 11e lie Glu Vat Ser Thr Gln Gln lie Met Leu Thr Gly Asn Thr 5erThr Va
l Asn Pr。
八sn Val Ser AlaArg Pr
o Ser Gly Ala Asn Pro l1eLeu Me
t Pro AlaLeu Ala Asn
AspAla Ser Arg Ala Asp Met Leu Glu Thr Pro Lys AspThr Cys
Tyr His Asp Aha Cys Ser Ser Arg Hls Phe Phe Pr。
o Ser Gly Ala Asn Pro l1eLeu Me
t Pro AlaLeu Ala Asn
AspAla Ser Arg Ala Asp Met Leu Glu Thr Pro Lys AspThr Cys
Tyr His Asp Aha Cys Ser Ser Arg Hls Phe Phe Pr。
Pr。
Leu
^rg
Aha
1u
Thr Gin
Pro Gly
Phe Gly
Ser Arg
Thr Asn
Val Thr
Val Glu
Thr l1e
Ala Thr
Leu Phe
八sn Gly
Ser Ser Arg Phe
Ala Pro Cys Gly
Lys Asp Leu Val
Arg Gin Phe Cys
Cys Tyr Val Thr
Pro Pro Ala 5erGln As
p Asp Ala Phe Phe Asn AlaPro Al
a Pro Pr。
p Asp Ala Phe Phe Asn AlaPro Al
a Pro Pr。
Pro Thr Asp Ala
Met Asn Ala Lys
Arg Arg Ser 5er
Ala Asp Leu Leu
Glu Gln Pro Lys
〔アミノ酸配列I〕
Ala Asn Glu
Met Gin Asn LeuThr Ile
Pro Glu Val Asn Asp Val Asn Phe Glu Ala Val Thr Met Pr。
Pro Glu Val Asn Asp Val Asn Phe Glu Ala Val Thr Met Pr。
Glu Asn
Gly Phe
Gay Lys
Trp 5er
Lys Phe
Val Leu
cty cty
Glu lie
Met 5er
Asn Met
Ala Gln
Pro Pr。
1u
Pr。
Glu
Gay
Val
Glu
Thr
1u
Val
Leu
Leu Ser Thr
Leu Ser Glu
Phe Cys Thr
Tyr Ala Lys
Gln Gln Lys
Arg Lys Gly
Ala Gly Phe
Ser Asp Phe
Met Arg Phe
Leu Ala His
11e Vat Glu
Val Ser Thr
Gln Gln Ile
Met Ile Thr
Cys
Leu
Leu
Aha
Cys
Tyr
^sp
Ser
Cys
Ser
Ser
Arg
1s
Phe ;
Glu Leu
Arg Asp
Arg Ser
Met Asp
Arg Arg
Ser Arg
Pro Gly
Lys Ala
八rg Glu
Ser Glu
Asp Arg Phe
Leu Ser Glu
Asn Cys Gly
Ala Gln Leu
Ala Ser Asn
Asp Ala Leu
Glu Ser Asn
Leu Ala Lys
Leu Gly Ala
Val Phe Trp
Thr Ala Gly
Lys Gly Thr
Val Thr Arg
Lys Glu Tyr
Arg Cys Tyr
Met Leu Leu
Trp ’Asp 5er
Lys Tyr Ala
Val Thr Asn
Glu Gly Leu
Asn Lys Leu
Leu Ser 5er
Trp Glu 5er
Ala Asp 5er
11e Phe Thr
Lea Val Arg
Asn Met Ala
11e Ser Ala
Pro Glu Glu
Asp Ile Cys
Ser Ser Pr。
11e Ser Vat
Asp Met Val
Ser Thr Leu
Ala Pro Val
Asn Glu Gin
Lys Gly Phe
Ala Phe Asp
Lys Ala Ala
Tle Arg Ala
Lys Glu Lys
Val Arc Val
Gly Arg Pr。
Leu Lys Gly
八rg Pro 5er
Asn Tyr Aha
Thr Ala Glu
Lys Ile Gin
Cys Leu Ala
Met Tyr Cys
Asn Val Asn
Gly Gly Lys
Vat Ala Val
Arg Gin Val
Val Trp Asn
Pro Pro Ala
Thr Glu Asn
Thr Phe Asp
lie Gin Pr。
Pro Thr Asp
Cys
Thr
Cys
Asp
Met
Pr。
Glu
Aha
Glu
Thr
Pr。
Val
1e
Cys
Tyr
Asn
Thr
Aha
Lea
Ser
Glu Arg Ile Ala Phe
Ala Thr HisLeu Ala Le
u Ala Lys Asn Ser Ar
gAsn Thr Ser Ala Glu Val
Thr GlyPhe Gly Cys Phe P
ro Lys His AsnGlu Asn A
rg Cys〔アミノ酸配列J〕 Gln Pro Pro Aha Asn
Trp AspGly Phe Thr Glu A
sn Thr Lys TyrPhe Asp T
hr Phe Asp Ala Val T
hrAla Ala Ile Gln Pro Leu
Glu GlyArg Ala Pro Thr A
sp Ala Glu ArgPhe Ala Thr
His Lys Lys Leu AlaLys
Asn Ala Gin Asn Ser
Arg TyrThr Ser Ala Glu V
al Thr Gly GlyGly Cys Ser
Pro Lys Asn Asn PheAsn A
rg Cys 。
Ala Thr HisLeu Ala Le
u Ala Lys Asn Ser Ar
gAsn Thr Ser Ala Glu Val
Thr GlyPhe Gly Cys Phe P
ro Lys His AsnGlu Asn A
rg Cys〔アミノ酸配列J〕 Gln Pro Pro Aha Asn
Trp AspGly Phe Thr Glu A
sn Thr Lys TyrPhe Asp T
hr Phe Asp Ala Val T
hrAla Ala Ile Gln Pro Leu
Glu GlyArg Ala Pro Thr A
sp Ala Glu ArgPhe Ala Thr
His Lys Lys Leu AlaLys
Asn Ala Gin Asn Ser
Arg TyrThr Ser Ala Glu V
al Thr Gly GlyGly Cys Ser
Pro Lys Asn Asn PheAsn A
rg Cys 。
[アミノ酸配列M]
Glu Leu Ser Thr Leu Gly L
ysPhe lie Ser Glu Ala
Ala Leu ArgTyr Thr
Asp Cys Glu Ala Thr
GluLys Lys Tyr 5er Gly Phe Phe Arg Ala Lys 八Ia Ala 八sn Lys Leu Tie 口eAIa Leu ^1a Ala Asn Phe Phe 八rg Glu Ala Pr。
ysPhe lie Ser Glu Ala
Ala Leu ArgTyr Thr
Asp Cys Glu Ala Thr
GluLys Lys Tyr 5er Gly Phe Phe Arg Ala Lys 八Ia Ala 八sn Lys Leu Tie 口eAIa Leu ^1a Ala Asn Phe Phe 八rg Glu Ala Pr。
Asn Leu
Ala Glu
Leu Ala Arg
Asp Ala Pr。
Gln Ala Asn
Gln Thr 5er
Asp Lys 5er
Ser Ser Gin
Asp Gly Glu
Asn Lys Asp
Thr Gly Thr
Gln Ile Pr。
Met Asp Gly
Asp His Leu
Leu Asn l1e
Ala Gin Phe
Gin Glu Asp
Met Gly 1ie
Trp Cys l1e
11e Asn Gly
Asp Glu Gln
11e Val Glu
Tyr Leu Glu
Val Glu Asp
Asp Glu Leu
Lys Lys Gln
11e Glu Gln
Vat Ser 5er
Gly Gly Ser
Arg Asp Val
Phe Ser Val
Gin Lys Gly
Gly Lys 5er
Leu Gln Tyr
Ser Asn Thr
Lys Thr Trp
Tyr Gly Val
11e Leu Asn
Glu Asn Gly
Thr Trp Thr
Val Ala Tyr
His Ala Lys
Leu Tyr Asp
Thr Phe Val
八sp Ala Gly
Lys Asp Gly
Arg Asp Pr。
Leu Gly Lys
Gly Met 5er
Asn Val Gly
Pro Arg 1ie
lie Ser l1e
11e Leu Asn
Lys Pro Asn
Arg Ala Thr
Met Glu Arg
Thr Lys Gly
Gly Leu Met
Thr Ser Pr。
Met Met Asp
Pro Leu Arg
Pro Thr Leu
Ser
Phe
Met
八sn
Aha
Cys
Arg
Thr
Cys
Pr。
Lea
Gln
Val
Val
Glu
Val
Asn
Gly
Pr。
Arg
Gin Ile Lys AlaGlu Al
a Tyr 1ieGln Ala Tyr Me
t Arg Asn Leu Thr Tyr Ala Phe Asp Arg Thr Pro VatAla Gln
Met Lys Ser Arg Pro Arg 八sn Val Thr ThrArg旧s T
hr Ala Met His His Leu (アミノ酸配列N〕 11e Leu Asn Tyr Lys Pro 5er Thr Arg Ala Thr Trp Lys Ala Arg Val Thr Ala 5er Asn Gly Leu Met Gly Thr Ser Pr。
a Tyr 1ieGln Ala Tyr Me
t Arg Asn Leu Thr Tyr Ala Phe Asp Arg Thr Pro VatAla Gln
Met Lys Ser Arg Pro Arg 八sn Val Thr ThrArg旧s T
hr Ala Met His His Leu (アミノ酸配列N〕 11e Leu Asn Tyr Lys Pro 5er Thr Arg Ala Thr Trp Lys Ala Arg Val Thr Ala 5er Asn Gly Leu Met Gly Thr Ser Pr。
Thr Met Met Asp
Hls Phe 5er
Glu Met Arg
Pro Arg Tyr
八sp Met Gly
Phe Tyr Glu
Arg Ala Arg
^1a Ala Aha
Leu Phe Gly
Thr Asp Glu
His Val Val
Asp Gly Ala
Leu Asp His
Gln Leu Cys
Arg Ser Gln
Leu Gln Gly
Glu Met 5er
Val Trp Cys
Asn rle Asn
Gly Glu Glu
八la Leu Ala
八sn Ser Glu
Gly Leu Gin
Leu Ala Arg
Val Thr 5er
Glu Aha His
Leu Arg Asn
Leu Asp Gly
八sp Thr Glu
Asn Ala Arg
His Met Gin
Leu Leu Gln
11e Ser Asn
Phe Met Leu
Glu Tyr Gay
11e lie Leu
lie Glu Asn
Gly Val Trp
Gln Val Gin
Phe Pro Leu Arg Pro
Val Val Glu His AlaGl
n Pro Thr Leu Arg Gl
n lie Met Thr HisPhe
Ser Ala Leu Ala Glu
Ala Tyr Ile GluMet A
rg Asn Ala Glu Gln A
la Tyr Met Pr。
Val Val Glu His AlaGl
n Pro Thr Leu Arg Gl
n lie Met Thr HisPhe
Ser Ala Leu Ala Glu
Ala Tyr Ile GluMet A
rg Asn Ala Glu Gln A
la Tyr Met Pr。
Arg Tyr Gly Leu Gln
Arg Asn Leu Thr AspMe
t Ser Leu Ala Arg Ty
r Ala Phe Asp PheTyr
Glu Val Thr Ser Arg
Thr Pro Val Arg八lへ A
rg Glu Ala His Ala G
ln Met Lys AlaAla Ala
Leu Arg Asn Ser Arg
Pro Arg LeuPhe Gly Le
u Asp Gly Asn Val Thr Thr
Met八sへ Glu Asp Thr G
lu Arg His Thr Ala H
isAsp Val Asn Ala Arg
Met His His Leu Asp
Gly Ala His Met Gln
。
Arg Asn Leu Thr AspMe
t Ser Leu Ala Arg Ty
r Ala Phe Asp PheTyr
Glu Val Thr Ser Arg
Thr Pro Val Arg八lへ A
rg Glu Ala His Ala G
ln Met Lys AlaAla Ala
Leu Arg Asn Ser Arg
Pro Arg LeuPhe Gly Le
u Asp Gly Asn Val Thr Thr
Met八sへ Glu Asp Thr G
lu Arg His Thr Ala H
isAsp Val Asn Ala Arg
Met His His Leu Asp
Gly Ala His Met Gln
。
さらに具体的には、例えばアミノ酸配列A、B。
E、F、I、J、MおよびNをコードする遺伝子の塩基
配列はそれぞれ下記C,D、G、H,K。
配列はそれぞれ下記C,D、G、H,K。
L、O及びPの通りである。
ATG AACAAT CCT GTT GA
T CCG AGCACG TCACAA C
AA ATG TCCGGT ACT ACG
GGT CAA GTTTCCCAG CC
T CGA CCCAACGTG AACCCC
TTTGGT CAG AGT CAG AC
CCGCCCCCTA GGCAATCGT GA
T CCG CAA AAT AAT AG
T AAT GCA AGYGACGACTCC
GACGCA CTCATG CCCGCT G
TGACCGACTTT GAG ACT CT
CACT AAA GAT GTCGAA T
CCAACTCA GTCGCT TCA AG
G TTA ATTATT CGCGACATA
CTT GACATG CTA CAA C
CC^八G へCGA CAA GGA GCC
ACCCCA AAA GACCTTTTCTCA
CTA GCT TGG ACCTGCTACCAC
AACGGT TCA TCG CGA TTT GT
T ACCCTG ACCACTGACGCG CC
T TGCGGCATG GCG CACTCG
GAACTCAAA GACATCGTT G
AA AAT TCCTGT ACGCTA
AGA CAG TTT TGCGGT TT
T TAT GCT AAAGCCTGCTAC
GTCGCA GGCAAA CAA CAA
AACAAG CCCCCT GCCAAT TGG
TCT AGG AAA GGTTAT CAG
GAA GACTCA AAA TTT G
CCGCT TTCGACTTCTTT AACGC
T GTA CTCAGCGACTCTTCT CCG
AGT CCT CCCGGA GGT ATG A
GA TTTAAA CCT ACA GACG
CCGAA ATCCTCGCG CATTCT
ATG AAT GCT AAG ATG
TCT ATT GTT GAATCT AG
G CGCGCCACCAACATGCGCGCG
GAT TTA CTCGCA CAACAT
GAG CAG CCT AAA CCT
CCへへTC (YはC又はTを示す); 〔塩基配列D〕 八TG GGA GACAGG TCA CA
A GGAATCCAA GGA CTCAAT G
CT CAAGACGGG TCA AGCGGT C
AG AGCCCA AACAGA AACCCA
CCG CCTGCT GACTTG AAT
GCT CAG GACCCCAGT GAA A
AT GACCTT GCCGGCGAA GT
A ACG TCCAAT TCTAAA G
AG ACG GTG AAA G^八 八T
TCTCCAA GCA AGG AGG ACT A
ACAAA GAT TTA TTT TCA CTT
GCTTACCACAAT GGA TCA TCA
AAATTG ACCACG GACGGCCCT
TGCCAT GCCGAA CTCAAA G
ACTTATAT TGT ACG CTA
AGA CAG TTTGTCTCCACT CAA CAA ATA・ ^TG ATCACG ACA AAT CCG GCG GAG GGA CAA CGCAAT AGA CCT CAA AACATCATG GCA ATCGCC GTT GCT ACC CTCAGCGAT GCT ACA CCT TGG GCT TGC TTCACG ACT GGCATA CCT GTCGAG GAT TGT GGA TAC TACGCCAAG CAG CAG AAT CGT AAA GGG TCT GCT TTT AACGACTCC ATG CGT TTC TTA GGT CAT ATA ATT GAA GTCTCCACT CAA CAG ATT ATG CTT ACA 〔塩基配列G〕 ATG AGT GG^ GTG AAT GCT CAG GGA TTG GGA TCA ACA GGT TCA CA八 CCA TCCTCT ACA AAT GAA CTG GAG GCG ACA TGCTAC AAG CCCCCT TTCCAG GAA GAT TTCTTC TCCCCCGCC 八AA CCA ACA TCCATG AAC TCCCGCAAG CGCGCA GAC CAT GAA GCG TTT 。
T CCG AGCACG TCACAA C
AA ATG TCCGGT ACT ACG
GGT CAA GTTTCCCAG CC
T CGA CCCAACGTG AACCCC
TTTGGT CAG AGT CAG AC
CCGCCCCCTA GGCAATCGT GA
T CCG CAA AAT AAT AG
T AAT GCA AGYGACGACTCC
GACGCA CTCATG CCCGCT G
TGACCGACTTT GAG ACT CT
CACT AAA GAT GTCGAA T
CCAACTCA GTCGCT TCA AG
G TTA ATTATT CGCGACATA
CTT GACATG CTA CAA C
CC^八G へCGA CAA GGA GCC
ACCCCA AAA GACCTTTTCTCA
CTA GCT TGG ACCTGCTACCAC
AACGGT TCA TCG CGA TTT GT
T ACCCTG ACCACTGACGCG CC
T TGCGGCATG GCG CACTCG
GAACTCAAA GACATCGTT G
AA AAT TCCTGT ACGCTA
AGA CAG TTT TGCGGT TT
T TAT GCT AAAGCCTGCTAC
GTCGCA GGCAAA CAA CAA
AACAAG CCCCCT GCCAAT TGG
TCT AGG AAA GGTTAT CAG
GAA GACTCA AAA TTT G
CCGCT TTCGACTTCTTT AACGC
T GTA CTCAGCGACTCTTCT CCG
AGT CCT CCCGGA GGT ATG A
GA TTTAAA CCT ACA GACG
CCGAA ATCCTCGCG CATTCT
ATG AAT GCT AAG ATG
TCT ATT GTT GAATCT AG
G CGCGCCACCAACATGCGCGCG
GAT TTA CTCGCA CAACAT
GAG CAG CCT AAA CCT
CCへへTC (YはC又はTを示す); 〔塩基配列D〕 八TG GGA GACAGG TCA CA
A GGAATCCAA GGA CTCAAT G
CT CAAGACGGG TCA AGCGGT C
AG AGCCCA AACAGA AACCCA
CCG CCTGCT GACTTG AAT
GCT CAG GACCCCAGT GAA A
AT GACCTT GCCGGCGAA GT
A ACG TCCAAT TCTAAA G
AG ACG GTG AAA G^八 八T
TCTCCAA GCA AGG AGG ACT A
ACAAA GAT TTA TTT TCA CTT
GCTTACCACAAT GGA TCA TCA
AAATTG ACCACG GACGGCCCT
TGCCAT GCCGAA CTCAAA G
ACTTATAT TGT ACG CTA
AGA CAG TTTGTCTCCACT CAA CAA ATA・ ^TG ATCACG ACA AAT CCG GCG GAG GGA CAA CGCAAT AGA CCT CAA AACATCATG GCA ATCGCC GTT GCT ACC CTCAGCGAT GCT ACA CCT TGG GCT TGC TTCACG ACT GGCATA CCT GTCGAG GAT TGT GGA TAC TACGCCAAG CAG CAG AAT CGT AAA GGG TCT GCT TTT AACGACTCC ATG CGT TTC TTA GGT CAT ATA ATT GAA GTCTCCACT CAA CAG ATT ATG CTT ACA 〔塩基配列G〕 ATG AGT GG^ GTG AAT GCT CAG GGA TTG GGA TCA ACA GGT TCA CA八 CCA TCCTCT ACA AAT GAA CTG GAG GCG ACA TGCTAC AAG CCCCCT TTCCAG GAA GAT TTCTTC TCCCCCGCC 八AA CCA ACA TCCATG AAC TCCCGCAAG CGCGCA GAC CAT GAA GCG TTT 。
GACAGCCT^
GCCATG ACT
AACCAG GCC
CCG GGA CTT
ACG CCT AGC
ACG CAA GGT
TTG TTG CCG
GTA GCG AAT
GTG ATG GGC
TCA AACTGG
GAA TCA AAA
AAT GCT GTG
CCG CCCGGT
CAA GAT GAG
GCCAAA ATG
GCA TCA AAC
TTG CTA GCT
CCCAAA CCA
AAA
TCC
ATT
ATT
CCC
ATT
TCC
ATC
CAA
CTC
TCT GACGAT
GACCCG TCA
ACG TCT GCC
GTA TCCGGA
AAG AAT CCC
GGA CCG ACT
AGT GAG TCT
GACGTCACA
CTC
ACT
CAC
CC八
ACA
CTC
CAC
CG
4八T TCCGTA
GAA ATCCTA
CCA AGCGCT
CTT GCA TGG
TCCAGG TAT
CCG TGT GGA
GACCTT GTT
CAA TTCTGC
TACGTA ACT
CCA GCA AAT
GAT GAG TCG
TTT AACGCA
AACCCT CCT
八CG CAA ACA
八ACGCG AAA
AAG GCT ACC
GAT GTCATA
CCT CCCAAG
〔塩基配列H〕
ATG AAT AAA
GCT ACA CAG
GACCTA CTT
八CG CCA AAA
GCT TGCTAC
ACCAACCTA
ATG TCT CAT
GAG GAA TTT
GGG TTT TAT
GGA CGA CAG
TGG GCA AGG
AAA TTT GCT
GTG TCG AGC
GGCGGCATG
GAA ATT CTT
ATG TCA ATC
AACATG GTT
GCG CAA CAA
CCT CTCATG
CAM GGA AAC
AGCACA ATT
CGCGCA CGC
GACCTCTTT
CACAAT GGT
GCCACG GAT
GCA GAG CTC
TGCACCTTA
GCG AAA ACT
CAG AAT AAA
AAA GGA TTT
GCT TTT GAT
GACTCA GCC
CGCTTT AAA
GGG CACTCC
ATCGAG TCA
TCCACA CGA
CAG ATT CAC
TTA ACG TTT
CCC
4八G
ACC
ACC
CCC
AAA
ACA
TCT
TTA
CAC
TTC
ACA
CCT
CTC
CCC
CCT
AAA
ACG AGCACCCAA
TCA CCA
CCA CCC
CAA GGT
GACCCG
GAA CAG
GAA TTC
TCA AAC
八GA GAT
AGG CAA
TCCTTA
TCCTCA
GCA CCT
八AA GAC
AGA CAA
TGT TAC
CCA CCA
CAA GAT
TTCTTT
CCT GCC
CCCACT
CGA GGT ACA
CAG CCT AAC
CAA ACT AGG
CCA AAT GCT
GAT GAA CTA
GAA AAT CTG
TCA CTA GCT
ATCCTG GAT
GGA GCT ACA
GCT TGG ACG
CGCTTCGTT
TGCGGA ATG
TTG GTCGAG
TTCTGCGGG
GTCACG GGC
GCCAGT TGG
GACGCA AAA
八AT GCG GTG
CCA CCT GGA
GACGCCGAA
GTT AACCCG
GTA TCA GCT
CCCTCT GGC
AACACA 八TT
ATG CCCGCC
GCT AACGAC
TCA AGA GCG
ATG CTA AAA
CCG AAG GAC
TGCTACCAC
ACA CTA 八GC
CCT CTCTCG
AAT TTCTGC
TTT TAT GCC
AAG CAA CAG
TCCAGA AAA
TTT GCCCGA
CTT AGCGAC
GGA ATG ACA
ATT CTT GCT
CCT GGA
TTCGGC
AGCCGT
ACCAAT
GTA ACC
GTCGAG
ACT ATA
GCA ACC
CTCTTT
AAT GGC
ACG AAA
GAA CTC
^CA TTG
AAA GCC
AAG AAA
GGCTAC
TTT GAC
TTT TCC
TTCAAA
CACTCC
ATG AACGCT
CGCCGG TCC
GCT GACCTC
GAG CAG CCT
〔塩基配列K〕
ATG GCT AAC
ATG CAA AAC
ACT ATCCCC
GTT AAT GAT
AAT TTT GAA
GAT AGA TTC
CTG TCG GAA
Aへ↑ TGCGGG
GCA CAA TTA
GCA TCCAAC
GAT GCCTTG
GAG AGCAAC
TTA GCG AAA
CTCGGCGCT
GTT TTCTGG
AAG ATG TCA ATT GTG
GAA TCCAGCAACATG GTT T
CT ACCCGCCTT GCA CAA
CAA CAG ATA CATAAG CC
T CCA ATG ATCACA TTC。
GAA TCCAGCAACATG GTT T
CT ACCCGCCTT GCA CAA
CAA CAG ATA CATAAG CC
T CCA ATG ATCACA TTC。
GAA GAA GAA
CTG CCT ACC
GAG CAA GAA
GTT GGCGTG
GCT GTG TTG
AAT AAG CTT
CTA TCT AGC
TGG GAG TCA
GCCGAT AGT
ATT TTCACA
CTA GTG AGG
AAT ATG GCT
ATT TCT GCT
CCT GAA AAA
GAT ATCTGT
GAA CTCAGT
CGCGAT CCC
CGT AGCAAG
ATG GAT CGT
CGG AGA AGT
4八G GAG AAA
GTG AGA GTG
GGG AGA CCC
CTT AAG GGG
CGCCCCTCA
AACTACGCG
ACCGCCG八八
八AA ATA CAG
T(;CTTG GCC
ATG TAT TGT
ACA
ACA
ACA
CAC
GAA
CCC
ACC
AAA
CAT
八TG
CCT
CAC
CCT
AAA
ACC
八CT GCA GGC
AC4GGT ACT
GTG ACT CG八
AAG GAG TAT
CGT TGCTAC
八TG CTA TTA
TGG GAT TCC
八AA TACGCG
GTCACG AAC
GAG GGCCTT
GAA CGCATC
TTA GCT CTG
4八CACT TCT
TTCGGA TGT
GAG AAT CG八
〔塩基配列し〕
CAA CCA CCT
TTCACCGAG
GACACT TTT
GCA ATCCAA
AGT TCG CCA
ATCTCA GTC
GAT ATG GTT
TCCACA TTA
GCA CCA GTG
八AT GAA CAA
A^八 GGA TTT
GCT TTCGAT
AAG GCT GCA
ATT AGA GCC
GCT TTT GCG
GCG AAG AAT
GCT GAA GTT
TTT CCA AAA
TCT
CCT
AAC
AT
CCT
AAT TGG
ACT AAA
GCCGTG
CTCGAG
AAA GTG
GGG GGT
GTCGCT
CGT CAA
GTCTGG
CCA CCA
CAT GAG
ACT TTT
ATCCルミ
CCG ACT
ACG CAC
TCA CGT
ACCGGT
CAC4八T
GACGCG
TAT GCC
ACG AAT
GGT CTG
AAT CCC
へへへ GTC
GTG ATC
GTCTGT
AAT TAC
GCT AAT
八八ルミ ACT
GAT GCT
CCA CTC
GACTCG
AAG 八^A
TAT TCC
GGCTTC
TTCAGA
AACGGT
GCT TTC
AAG GCT
ATT AGG
GCCCCT ACT
GCG ACG CAC
AACGCT CAA
TCT GCT GAG
TGT TCA CC八
CGA TGT ;
〔塩基配列0〕
GAG TTG AGT
ATCTCT GAA
ACT GAT TGT
GCA CGA TAC
GCA CCCGTA
GCT AAT GAT
ACA AGT AAG
4八A TCT ATT
TCA CAA GTT
GGT G八八 GGC
AAA GACAGG
GGG ACT TTT
ATA CCA CAG
GACGCT CAA
AAA AAA TTG
AAT TCCCGC
GTT ACT CGA
AAA AACAAT
ACT TTA GGT
GCA GCCCTG
GAG GCA ACG
CTCGAA CTT
GAA GACACA
GAA TTA GAT
AAA CAG AAG
GAA C八八 CGC
AGT TCA TTA
GGT TCA CGA
GAT GTG AAC
AGT GTT CCA
^4八 GGCATC
CGG ATCGCT
GCT CTG GCT
TACGCCAAC
GGCTTCTTT
TTT AGA GAG
ATC
4八A
^CT
ACA
八AT
AAA GCG CCA
CGG AAT TTA
GAA GCG GAG
TACGACAGC
TTT GTG TTC
GCA GGCATG
GAT GGT AAT
GAT CCA GC八
GGCAAG 八^A
八TG AGT AGA
GTT GGCACA
CG八 八TCAAA
TCG ATA CCA
TTT
AAC
CTA
AAT
CAA
CAA
AAT
ACA
AAC
八AC
ACA
CAC
八TG
GACGGA GGA
CACTTA CTA
AAT ATA TCG
CAA TTT 4八A
GAG GAT TAC
GGCATA ATT
TGCATCCAA
AAT GGG ACT
GAG CAA GTC
GTT GAA CAT
ATA AAG GCG
GCG TACATT
GCT TAT ATG
AAT CTT ACA
GCA TTT GAT
ACA CCA GTT
CAA ATG AA八
AGG CCA AGG
GTCACA ACC
CACACA GCA
4八G TCA ATA
CAG TAT AAA
AACACA ACA
ACCTGG ATG
GGT GTCACT
CTG AAT GGT
AAT GGA ACC
TGG ACT ATG
GCG TACCCT
GCA AAA CCA
CAT TTT TCA
GAA ATG AGA
CCA AGA TAT
GACATG GGC
TTT TAT GAA
AGA GCG CGC
GCA GCG GCC
CTG TTT GGA
ACG GAT GAG
CAT GTCGTG
CTCAACTTA
CCA AAT CAA
GCCACG GTG
GAG AGA GTG
八AA GGT GAA
TTG ATG GTG
TCA CCA AAT
八TG GAT GGC
TTA CGG CCG
ACCTTA CGG
GCA CTCGCG
^^T TCA GAG
GGA CTA CAA
CTCGCA CGG
GTCACA ACA
GAG GCT CAC
CTA CGT AAT
CTA GACGGT
GACACG GAG
AAT GCA CGG
AAT
ATC
GC八
CAA
ATC
TCG
八TA
AAT
ATC
CAA
CAC
CAC
八GA
AAT
^G^
ACA
ACA
AAC
八GG
ATC
CACCAT CTT
〔塩基配列P〕
TCG ATA CTT
TAT 4八G CCT
ACA AGG GCA
TGG AAA GCA
GTCACCGCG
AAT GGT TT八
GGCACG TCA
AC八 八TG ATG
TTT CCT TTG
CAG CCCACC
TTCTCA GCA
ATG ACA 4八T
AGG TAT GGG
ATG AGT CTC
TAT GAA GTC
GCG CGCGAG
GCG GCT TTG
TTT GGA TTG
GAT GGT GCG
AAT TTG GAT
AGT CAG TTA
ACT AGA TCG
AGG TTG CAA
AGT GAA ATG
ATG GTG TGG
CCA AACATA
GAT GGT GAG
CGA CCG GTC
TTA AGG CAA
CTCGCA GAA
GCA GAA CAA
CTA CAA AGG
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ACG TCA AGA
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GACGGT AAC
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TGCATT ACA
CAG TTCATG
GGT GAA TAT
AGT ATA ATT
TGCATCGAG
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GAG CAG GTC
GTG GAA CAT
ATA ATG ACT
GCT TACATT
GCA TACATG
AAT CTT ACA
GCA TTT GAC
ACA CCA GTT
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AGG CCCAGG
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CAA
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AAT
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CCC
AAC
TTT
ACA
ACA
ATC
ATC
GAT GAG GACACG GAG AG
G CACACA GCA CATGACGTG
AAT GCA CGG ATG CACCAT C
TT GATGGT GCG CAT ATG CAG
。
G CACACA GCA CATGACGTG
AAT GCA CGG ATG CACCAT C
TT GATGGT GCG CAT ATG CAG
。
這11L片
本発明は、クローン化された遺伝子を提供することによ
りGMV及びGLVに対して耐性な植物、例えばニンニ
ク、を育成すること及びニンニクのウィルス防除に貢献
することを目的とするのみならず、植物ウィルス病の迅
速な診断のためのプローブをも提供するものであり、こ
のようなプローブのためには前記C又はDで示される遺
伝子の全長を必要せず、これらの部分から成る断片であ
ってもよい。これらの断片は前記C又はDで示されるD
NAを1種類又は複数種類の制限酵素により完全消化又
は部分消化することによって得ることができる。この様
な制限酵素としては、例えば第4図及び第5図に示すよ
うな制限酵素、例えば、Xbal + HpaI 、
HindI[I 、 Ncol + NaeI 、
5phl +Nhel 、 Aatll 、EcoR
V 、 MluI 、BamHI 、Xmn1 。
りGMV及びGLVに対して耐性な植物、例えばニンニ
ク、を育成すること及びニンニクのウィルス防除に貢献
することを目的とするのみならず、植物ウィルス病の迅
速な診断のためのプローブをも提供するものであり、こ
のようなプローブのためには前記C又はDで示される遺
伝子の全長を必要せず、これらの部分から成る断片であ
ってもよい。これらの断片は前記C又はDで示されるD
NAを1種類又は複数種類の制限酵素により完全消化又
は部分消化することによって得ることができる。この様
な制限酵素としては、例えば第4図及び第5図に示すよ
うな制限酵素、例えば、Xbal + HpaI 、
HindI[I 、 Ncol + NaeI 、
5phl +Nhel 、 Aatll 、EcoR
V 、 MluI 、BamHI 、Xmn1 。
5alI + BglII 、 Nrul 、Pm
a〔I 、HincIr 、Accl *Accm 、
Bcl I 、 Dral 、 EcoRI 、
EcoR47m 。
a〔I 、HincIr 、Accl *Accm 、
Bcl I 、 Dral 、 EcoRI 、
EcoR47m 。
EcoT22 T 、 N5p(7524)V 、
Sac I 、 5naB I等が挙げられる。また
、これらのDNA断片は、本発明に従ってDNAライブ
ラリーから直接選択することもできる。例えば後に記載
するpSGV52. pSGV27゜psGV30.
pSGV39. pSGV42. pSGシフ1等のベ
クター中に挿入されている遺伝子断片も、本発明の遺伝
子断片に属する。
Sac I 、 5naB I等が挙げられる。また
、これらのDNA断片は、本発明に従ってDNAライブ
ラリーから直接選択することもできる。例えば後に記載
するpSGV52. pSGV27゜psGV30.
pSGV39. pSGV42. pSGシフ1等のベ
クター中に挿入されている遺伝子断片も、本発明の遺伝
子断片に属する。
゛ 云 のクローニング
次に本発明の遺伝子のクローニング方法の概略を説明す
る。
る。
(ウィルスの純化)
GLVまたはGMV感染ニンニク葉を、任意の方法で破
砕後、搾汁する。一般にGLVまたはGMV感染ニンニ
ク葉は、モザイク症状あるいは葉先の貧化症状を呈する
ニンニク葉を用いればよく、破砕は適当な緩衝液中で行
うのがよい。
砕後、搾汁する。一般にGLVまたはGMV感染ニンニ
ク葉は、モザイク症状あるいは葉先の貧化症状を呈する
ニンニク葉を用いればよく、破砕は適当な緩衝液中で行
うのがよい。
得られた汁液は、クロロホルム、エーテル、四塩化炭素
等を加えることにより清澄化処理を行い、不純物を除去
する。処理後必要に応じて、遠心分離を行い残存する有
機溶媒を除去することもできる。
等を加えることにより清澄化処理を行い、不純物を除去
する。処理後必要に応じて、遠心分離を行い残存する有
機溶媒を除去することもできる。
その後、水層に塩およびポリエチレングリコールを添加
し、遠心分離を行うことにより目的とするウィルスを沈
殿画分として得ることができる。
し、遠心分離を行うことにより目的とするウィルスを沈
殿画分として得ることができる。
このウィルス画分は、任意の緩衝液に再懸濁し遠心分離
を行うこと、およびこの操作をくり返すことにより、濃
縮純化することができる。このようにして得られたウィ
ルス画分は、任意の緩衝液に懸濁した後、塩化セシウム
又はショ糖を用いた密度勾配遠心に付すことにより、該
ウィルスを純化することができる。
を行うこと、およびこの操作をくり返すことにより、濃
縮純化することができる。このようにして得られたウィ
ルス画分は、任意の緩衝液に懸濁した後、塩化セシウム
又はショ糖を用いた密度勾配遠心に付すことにより、該
ウィルスを純化することができる。
(ウィルスcDNAの調製)
上記方法により得られた純化ウィルスからSDS法、熱
フェノール・SDS法またはプロテアーゼ処理法等の任
意の方法によりRNAを抽出する。
フェノール・SDS法またはプロテアーゼ処理法等の任
意の方法によりRNAを抽出する。
得られたRNA画分は、エタノール沈殿および塩化リチ
ウム処理等を行うことにより、さらに精製することがで
きる。
ウム処理等を行うことにより、さらに精製することがで
きる。
このようにして得られたウィルスRNAを鋳型として必
要に応じてポリAポリメラーゼ処理を行ってポリAを付
加することにより、oligo(dT)をプライマーと
してcDNAを合成することができる。
要に応じてポリAポリメラーゼ処理を行ってポリAを付
加することにより、oligo(dT)をプライマーと
してcDNAを合成することができる。
合成されたcDNAは、任意のファージまたはプラスミ
ド等のベクターに導入し、インビトロパッケージング法
や常法の形質転換法により、大腸菌を形質転換すること
により、ウィルスcDNAをクローン化することもでき
る(この様にして得られたcDNAをプローブとして、
ウィルス画分から抽出したRNAとのノーザンハイブリ
ダイゼーションを行うことにより、ウィルスRNAに対
するcDNAクローンを選択する)。
ド等のベクターに導入し、インビトロパッケージング法
や常法の形質転換法により、大腸菌を形質転換すること
により、ウィルスcDNAをクローン化することもでき
る(この様にして得られたcDNAをプローブとして、
ウィルス画分から抽出したRNAとのノーザンハイブリ
ダイゼーションを行うことにより、ウィルスRNAに対
するcDNAクローンを選択する)。
以上の様にして、ウィルス遺伝子RNAに対するcDN
^クローンを得ることができる。得られたcDNAの塩
基配列を常法のグイデオキシ法により決定すれば、容易
にウィルス遺伝子の塩基配列を明らかにすることができ
る。
^クローンを得ることができる。得られたcDNAの塩
基配列を常法のグイデオキシ法により決定すれば、容易
にウィルス遺伝子の塩基配列を明らかにすることができ
る。
(ウィルスDNAの合成)
以上cDNAのクローニングについて説明したが、前記
の配列を有するDNAは常法に従って容易に化学合成す
ることもできる。
の配列を有するDNAは常法に従って容易に化学合成す
ることもできる。
(ウィルスの植物への導入)
前記のようにして得られた本発明の遺伝子は、常法に従
って植物に導入することができる。ウィルス遺伝子の植
物体への導入方法の一興体例としては、1)、Tiプラ
スミドによる形質転換法(Methods in En
zymology、 118.627(1986)及び
Methods in Enzymology、 15
3.253(1987)) 2 )、ウィルスベクター
による形質転換法(EMBO,J、、 6゜307(1
987)、 Nature、 310.51N1984
)、 Nature。
って植物に導入することができる。ウィルス遺伝子の植
物体への導入方法の一興体例としては、1)、Tiプラ
スミドによる形質転換法(Methods in En
zymology、 118.627(1986)及び
Methods in Enzymology、 15
3.253(1987)) 2 )、ウィルスベクター
による形質転換法(EMBO,J、、 6゜307(1
987)、 Nature、 310.51N1984
)、 Nature。
344、179(198B)、 EMBO,J、、 7
.1583(1988)) 3 )、直接導入法(M
ethods in Enzymology+ 153
+ 313(1987)、 Proc、Natl、八
cad、sci、UsA、 82. 5824(19
85)。
.1583(1988)) 3 )、直接導入法(M
ethods in Enzymology+ 153
+ 313(1987)、 Proc、Natl、八
cad、sci、UsA、 82. 5824(19
85)。
Nature、 296.72(1982)、 EMB
O,J、、 3.2717(1984)Mo1.Gen
、Genet、、 202.179(1986)、 N
ature、 325゜192 (1987)及びNa
ture、 327.70(1987))等がある。
O,J、、 3.2717(1984)Mo1.Gen
、Genet、、 202.179(1986)、 N
ature、 325゜192 (1987)及びNa
ture、 327.70(1987))等がある。
また、本発明遺伝子をプローブとして用いる場合、B、
D、HamesおよびS、J、Higgins : N
ucleicacid hybridization、
a practical approach、 IR
LPress、 1985. DNA、 4.
327−33H1985)、 MolecularC
1oning+ p382. Co1d Spri
ng Harbor(19B2)。
D、HamesおよびS、J、Higgins : N
ucleicacid hybridization、
a practical approach、 IR
LPress、 1985. DNA、 4.
327−33H1985)、 MolecularC
1oning+ p382. Co1d Spri
ng Harbor(19B2)。
Nucleic Ac1ds Res、15. 537
3−5390(1987) ) 。
3−5390(1987) ) 。
Nucleic Ac1ds Res、14.5037
−5048(1986) 、特開昭62−229068
.62−281及び特開平1−63398号公報に基づ
き、ウィルス診断薬とすることもできる。
−5048(1986) 、特開昭62−229068
.62−281及び特開平1−63398号公報に基づ
き、ウィルス診断薬とすることもできる。
(効 果)
本発明遺伝子を任意の方法により、植物体に導入するこ
とにより、GMVおよびGLVに対して耐性な植物を育
成することができる。
とにより、GMVおよびGLVに対して耐性な植物を育
成することができる。
また、該遺伝子をプローブとして用いれば、植物ウィル
ス病の迅速な診断も可能となる。
ス病の迅速な診断も可能となる。
更には、本発明遺伝子を適当な宿主、例えば大腸菌を用
いて発現させた後、遺伝子産物の抽出・精製を行い、こ
れを抗原として用いることにより、ウィルスの同定や診
断に供する抗体の作成を行うこともできる。
いて発現させた後、遺伝子産物の抽出・精製を行い、こ
れを抗原として用いることにより、ウィルスの同定や診
断に供する抗体の作成を行うこともできる。
以上のことより、本発明遺伝子は、該ウィルスによる植
物病害の診断および防除に多大な貢献をなすのは言うま
でもなく、ニンニクに感染し病徴に影響を及ぼすウィル
スの全容解明に寄与し、広くニンニクのウィルス防除に
貢献すると思われる。
物病害の診断および防除に多大な貢献をなすのは言うま
でもなく、ニンニクに感染し病徴に影響を及ぼすウィル
スの全容解明に寄与し、広くニンニクのウィルス防除に
貢献すると思われる。
モザイク症状あるいは葉先の貧化症状を呈するニンニク
葉450gを18001n1の0.2%チオグリコール
酸を含むpH8,1の0.5 Mホウ酸緩衝液中で、ワ
ーリングプレンダーを用い最高速度で2分間摩砕した。
葉450gを18001n1の0.2%チオグリコール
酸を含むpH8,1の0.5 Mホウ酸緩衝液中で、ワ
ーリングプレンダーを用い最高速度で2分間摩砕した。
摩砕液を2重のガーゼを用いて搾汁し、得られた汁液に
1/4容量の四塩化炭素/クロロホルム1:1混液を加
え、4°Cで30分間撹拌した後、5.0OOXgで1
0分間遠心して水層を得た。得られた水層に最終濃度が
1%となる様にトリトンX−100を加え30分間撹拌
し、続いて終濃度が各々0.1Mと5%(W/V)とな
る様に食塩とポリエチレングリ:I−ル6000 (P
EG)を溶解し、4°cテ2〜3時間撹拌した。次いで
10,000x gで1o分間遠心することによりウィ
ルスを含む沈殿画分を得た。
1/4容量の四塩化炭素/クロロホルム1:1混液を加
え、4°Cで30分間撹拌した後、5.0OOXgで1
0分間遠心して水層を得た。得られた水層に最終濃度が
1%となる様にトリトンX−100を加え30分間撹拌
し、続いて終濃度が各々0.1Mと5%(W/V)とな
る様に食塩とポリエチレングリ:I−ル6000 (P
EG)を溶解し、4°cテ2〜3時間撹拌した。次いで
10,000x gで1o分間遠心することによりウィ
ルスを含む沈殿画分を得た。
沈殿物を100#!i!の再懸濁緩衝液(0,5M尿素
を含む50mMホウ酸緩衝液pH8,0)に懸濁し、4
°Cで一夜撹拌した。この懸濁液を5.OOOXgで1
0分間遠心し不溶物を除去した後103.000 X
gで90分間遠心することによりウィルスを沈殿させた
。得られた沈殿物を15dの再懸濁緩衝液にガラスホモ
ジナイザーを用いて混濁させた後、5.OOOXgで1
0分間遠心して不溶物を除き、20dの20%(w/v
)ショ糖を含む再懸濁緩衝液の上部に上層して103
.0OOX gで2時間遠心した。
を含む50mMホウ酸緩衝液pH8,0)に懸濁し、4
°Cで一夜撹拌した。この懸濁液を5.OOOXgで1
0分間遠心し不溶物を除去した後103.000 X
gで90分間遠心することによりウィルスを沈殿させた
。得られた沈殿物を15dの再懸濁緩衝液にガラスホモ
ジナイザーを用いて混濁させた後、5.OOOXgで1
0分間遠心して不溶物を除き、20dの20%(w/v
)ショ糖を含む再懸濁緩衝液の上部に上層して103
.0OOX gで2時間遠心した。
ウィルスを含む沈殿画分を1011!i!の再懸濁緩衝
液にガラスホモジナイザーを用いて懸濁した後5,00
0×gで10分間遠心して不溶物を除いた。次いで浮遊
密度(ρ)が1.32となる様に塩化セシウムを加えて
溶解させ、ρ=1.482とρ−1,157となる様に
調製した塩化セシウムを含む等量の再懸濁緩衝液層の間
に重層(すなわち遠心チューブの底からρ= 1.48
2 、ρ=1.32、ρ=1.157の塩化セシウム再
懸濁緩衝液が重層される)し、103,0OOX gで
20〜25時間遠心した。この浮遊密度勾配遠心により
遠心チューブのほぼ中央(ρ=1.34付近)に形成さ
れる乳白色のウィルス層を分取し、20〜30倍量の1
0mMIJン酸緩衝液pH7,5で希釈した後103.
0OOX gで90分間遠心することにより塩化セシウ
ムを除くとともにウィルスを濃縮した。
液にガラスホモジナイザーを用いて懸濁した後5,00
0×gで10分間遠心して不溶物を除いた。次いで浮遊
密度(ρ)が1.32となる様に塩化セシウムを加えて
溶解させ、ρ=1.482とρ−1,157となる様に
調製した塩化セシウムを含む等量の再懸濁緩衝液層の間
に重層(すなわち遠心チューブの底からρ= 1.48
2 、ρ=1.32、ρ=1.157の塩化セシウム再
懸濁緩衝液が重層される)し、103,0OOX gで
20〜25時間遠心した。この浮遊密度勾配遠心により
遠心チューブのほぼ中央(ρ=1.34付近)に形成さ
れる乳白色のウィルス層を分取し、20〜30倍量の1
0mMIJン酸緩衝液pH7,5で希釈した後103.
0OOX gで90分間遠心することにより塩化セシウ
ムを除くとともにウィルスを濃縮した。
以上の様にして得られた純化ウィルスを適当量の10m
Mリン酸緩衝液pH7,5に溶解して以後の実験に用い
た。尚、最終的に得られたウィルス量は260nmにお
ける吸光係数Ef=A%=2.5の値(N、^。
Mリン酸緩衝液pH7,5に溶解して以後の実験に用い
た。尚、最終的に得られたウィルス量は260nmにお
ける吸光係数Ef=A%=2.5の値(N、^。
Mohamed et al Ann、Appl、Bi
ol、97+ 67+ 1981)に基づいて1.5■
と見積もられた。また純化ウィルス画分中には700n
m前後の屈曲性のヒモ状ウィルスの存在が確認された(
第1図参照)、尚、以上の操作は全て4°Cで行った。
ol、97+ 67+ 1981)に基づいて1.5■
と見積もられた。また純化ウィルス画分中には700n
m前後の屈曲性のヒモ状ウィルスの存在が確認された(
第1図参照)、尚、以上の操作は全て4°Cで行った。
2、 ウィルスRNAの
約1.5■の純化ウィルスを1%のドデシル硫酸ナトリ
ウム(SO5) と30mMのエチレンジアミン四酢酸
(EDTA)を含む0.2M pH9,o(7))リ
ス塩酸緩衝液に溶解し、80°Cに保温した水飽和フェ
ノールを等量刑え15分間振とうした。次いで80”C
に5分間保温し更に10分間振とうした後12.000
X gで1o分間遠心し水層を得た。フェノール層に1
151tの1%SDSを含む0.1 M pH9,0
のトリス塩酸緩衝液を加えてウィルスRNAを再抽出し
、得られた水層を先に得られた水層に加え、更に等量の
水飽和フェノールによる抽出を3回繰り返した。最後に
等量のクロロホルムによる抽出を行い、得られたウィル
スRNA水溶液に0.3 Mとなる様酢酸緩衝液pH4
,8を加えた後2倍量のイソプロピルアルコールを加え
一20°Cで30分以上放置した後15.OOOXgで
10分間遠心してRNAを沈殿させた。
ウム(SO5) と30mMのエチレンジアミン四酢酸
(EDTA)を含む0.2M pH9,o(7))リ
ス塩酸緩衝液に溶解し、80°Cに保温した水飽和フェ
ノールを等量刑え15分間振とうした。次いで80”C
に5分間保温し更に10分間振とうした後12.000
X gで1o分間遠心し水層を得た。フェノール層に1
151tの1%SDSを含む0.1 M pH9,0
のトリス塩酸緩衝液を加えてウィルスRNAを再抽出し
、得られた水層を先に得られた水層に加え、更に等量の
水飽和フェノールによる抽出を3回繰り返した。最後に
等量のクロロホルムによる抽出を行い、得られたウィル
スRNA水溶液に0.3 Mとなる様酢酸緩衝液pH4
,8を加えた後2倍量のイソプロピルアルコールを加え
一20°Cで30分以上放置した後15.OOOXgで
10分間遠心してRNAを沈殿させた。
得られた沈殿画分を70%のエタノールで洗って風乾し
た後150IのTE緩衝液(1mM EDTAを含む1
0mM )リス塩酸緩衝液pH7,5)に溶解し、50
μlの8M塩化リチウム溶液を加え4°Cで一夜放置し
てRNAを沈殿させた。70%のエタノールで沈殿を洗
浄し、風乾させた後50IllのTEに溶解した。
た後150IのTE緩衝液(1mM EDTAを含む1
0mM )リス塩酸緩衝液pH7,5)に溶解し、50
μlの8M塩化リチウム溶液を加え4°Cで一夜放置し
てRNAを沈殿させた。70%のエタノールで沈殿を洗
浄し、風乾させた後50IllのTEに溶解した。
以上の様にして抽出したRNAは260nmにおける吸
光度1.0が40n RNAに相当するとして、32μ
gと見積もられた。
光度1.0が40n RNAに相当するとして、32μ
gと見積もられた。
3、 ウィルスRNAの
抽出したウィルスRNAの3′末端をシチジン3’
、5’ −(5’ 、”P)バイフォスフエイト(p
Cp)存在下にRNAリガーゼを作用させることにより
放射標識し、変性アガロースゲル電気泳動による分析を
行うとともに、ポリUを共有結合させた濾紙mAPペー
パー(宝酒造)への結合能を調べ、ポリAテイルの有無
を調べた。
、5’ −(5’ 、”P)バイフォスフエイト(p
Cp)存在下にRNAリガーゼを作用させることにより
放射標識し、変性アガロースゲル電気泳動による分析を
行うとともに、ポリUを共有結合させた濾紙mAPペー
パー(宝酒造)への結合能を調べ、ポリAテイルの有無
を調べた。
RNAのpcp標識は以下の様にして行った。
すなわち、抽出したRNA3xを30jIIの反応液(
20mMの塩化マグネシウム、3.3mMのジチオスレ
イトール(DTT) 、6岸のATP、o、ooi%牛
血漿アルフ゛ミン(BS八)、10%のジメチルスルフ
オキシド2、590KBq ( 7−ole)のpcp
を含むpH7.5の50jIIMヘペス緩衝液)中で5
0UのRNAリガーゼ(宝酒造)を5°Cで16時間作
用させることにより放射標識した。フェノール抽出を2
回行った後エーテル抽出を行い、続いてセファデックス
G−50クロマトグラフイーにより標識RNAを精製し
、エタノール沈殿により標識RNAを回収した。
20mMの塩化マグネシウム、3.3mMのジチオスレ
イトール(DTT) 、6岸のATP、o、ooi%牛
血漿アルフ゛ミン(BS八)、10%のジメチルスルフ
オキシド2、590KBq ( 7−ole)のpcp
を含むpH7.5の50jIIMヘペス緩衝液)中で5
0UのRNAリガーゼ(宝酒造)を5°Cで16時間作
用させることにより放射標識した。フェノール抽出を2
回行った後エーテル抽出を行い、続いてセファデックス
G−50クロマトグラフイーにより標識RNAを精製し
、エタノール沈殿により標識RNAを回収した。
この様にして放射標識したRNAを2.2Mのホルムア
ルデヒド存在下での変性アガロースゲル電気泳動により
分析したところ、約10kbの分子量を持つ1本のRN
Aバンドが観察された。この結果を第2図レーン4に示
す。なお、レーン1は分子量マーカーを示し、レーン2
はNKI細胞より抽出したmRNAを示し、そしてレー
ン3は対照としてのタバコモザイクウィルスRNAを示
す。このバンドはDNaseに対して抵抗性を示しRN
aseAに対しては感受性であることがらRNAである
ことが確認された。次にこのゲルをmAPペーパーにブ
ロッティングしたところ、10kbのRNAが特異的に
mAPペーパーにトラップされることが示された(第3
図)。また、放射標識したウィルスRNAを1mM E
DTA 、 I M食塩を含むlOIIIMトリス塩
酸緩衝液pI(7.5中でmAPペーパーに結合させ、
その結合能を調べたところ、第1表に示すように添加し
た放射活性の28.9%がmAPペーパーに結合した。
ルデヒド存在下での変性アガロースゲル電気泳動により
分析したところ、約10kbの分子量を持つ1本のRN
Aバンドが観察された。この結果を第2図レーン4に示
す。なお、レーン1は分子量マーカーを示し、レーン2
はNKI細胞より抽出したmRNAを示し、そしてレー
ン3は対照としてのタバコモザイクウィルスRNAを示
す。このバンドはDNaseに対して抵抗性を示しRN
aseAに対しては感受性であることがらRNAである
ことが確認された。次にこのゲルをmAPペーパーにブ
ロッティングしたところ、10kbのRNAが特異的に
mAPペーパーにトラップされることが示された(第3
図)。また、放射標識したウィルスRNAを1mM E
DTA 、 I M食塩を含むlOIIIMトリス塩
酸緩衝液pI(7.5中でmAPペーパーに結合させ、
その結合能を調べたところ、第1表に示すように添加し
た放射活性の28.9%がmAPペーパーに結合した。
ポジティブコントロールとして用いたヒト胃癌細胞株N
KI細胞から得られたmRNA (ポリAテイルを持つ
)は21.1%が結合するのに対し、ネガティブコント
ロールとして用いたポリAテイルを持たないタバコモザ
イクウィルス(TMV)RNAは3.6%がmAPペー
パーに結合するにすぎなかった。以上の結果から、ウィ
ルスRNAはその3′末端にポリAテイルを持つ10k
bのRNAであることが確認された。
KI細胞から得られたmRNA (ポリAテイルを持つ
)は21.1%が結合するのに対し、ネガティブコント
ロールとして用いたポリAテイルを持たないタバコモザ
イクウィルス(TMV)RNAは3.6%がmAPペー
パーに結合するにすぎなかった。以上の結果から、ウィ
ルスRNAはその3′末端にポリAテイルを持つ10k
bのRNAであることが確認された。
第1表
mRNA (NKI細胞)
6、210 1.310
ニンニクウイ
ルスのRNA
4、740 1.370
cDN^合成はGublerとHoffwanの方法(
Gene, 25+263、 1983)に基づいたア
マジャム社のcDNA合成キットを用い、ウィルスRN
A5Jrgを鋳型としてアマジャム社のプロトコールに
従って行った。合成した2重鎖cDNAのクローニング
はラムダファージ由来のファージベクターλgtllを
用いるアマジャム社のcDNAクローニングシステムを
用いて行った。
Gene, 25+263、 1983)に基づいたア
マジャム社のcDNA合成キットを用い、ウィルスRN
A5Jrgを鋳型としてアマジャム社のプロトコールに
従って行った。合成した2重鎖cDNAのクローニング
はラムダファージ由来のファージベクターλgtllを
用いるアマジャム社のcDNAクローニングシステムを
用いて行った。
21、1
28、9
出現したファージプラークのうち、cDNAの挿入を持
つと考えられる白いファージプラークをピックアップし
、大腸菌Y 1090を宿主としてファージを増殖させ
、Ben5onとTaylarの方法(Biotech
niques。
つと考えられる白いファージプラークをピックアップし
、大腸菌Y 1090を宿主としてファージを増殖させ
、Ben5onとTaylarの方法(Biotech
niques。
2、126.1982)とZagurskyらの方法(
Gene Anal。
Gene Anal。
Tech、、 2.89.1985)に基づいてファー
ジDNAを精製した。精製したファージDNAをEco
RIで消化した後アガロース電気泳動を行うことにより
cDN八イフィンサート在を確認した。次いでcDN八
断へをアガロースゲルから切り出し、電気的抽出あるい
はGENECLEAN”(Bio 101 Inc、)
による抽出を行ってcDNA断片を回収した。回収した
cDNA断片を常法によりpUc119ベクター(Vj
eira J、and Messing+J、Meth
ods in Enzymology+ 153+ 3
+ 1987)のEcoRrの認識部位に挿入した。こ
の様にして得られた組換えDNAを用いてHanaha
nの方法(J、Mo1.Biol、。
ジDNAを精製した。精製したファージDNAをEco
RIで消化した後アガロース電気泳動を行うことにより
cDN八イフィンサート在を確認した。次いでcDN八
断へをアガロースゲルから切り出し、電気的抽出あるい
はGENECLEAN”(Bio 101 Inc、)
による抽出を行ってcDNA断片を回収した。回収した
cDNA断片を常法によりpUc119ベクター(Vj
eira J、and Messing+J、Meth
ods in Enzymology+ 153+ 3
+ 1987)のEcoRrの認識部位に挿入した。こ
の様にして得られた組換えDNAを用いてHanaha
nの方法(J、Mo1.Biol、。
166、577、1983)ニヨリ調製シタ大腸菌JM
109株を形質転換することによりcDNAをサブクロ
ーン化した。
109株を形質転換することによりcDNAをサブクロ
ーン化した。
5、 ウィルスcDNAのスクリーニング得られたcD
NAのうちから、ウィルスRNAに対するcDNAをス
クリーニングするため、サブクローン化したcDN八を
二・ンクトランスレーションにより放射標識し、これを
プローブとしたノーザンハイプリダイゼーションを行っ
た。ノーザンハイブリダイゼーションノ結果、psGV
20. pSGV27. psGV30゜psGB50
及びpSGV52と命名したcDNAサブクローンがウ
ィルスRNAとハイブリダイズすることが明らかとなっ
た。更にこれらのサブクローンの制限酵素分析、サザン
ハイプリダイゼーションの結果pSGV27. psG
V30. psGV50及びpSGV52は同一クロー
ンでありpscvsoが最長のcDNAを持つことが明
らかとなった(第4図参照)。
NAのうちから、ウィルスRNAに対するcDNAをス
クリーニングするため、サブクローン化したcDN八を
二・ンクトランスレーションにより放射標識し、これを
プローブとしたノーザンハイプリダイゼーションを行っ
た。ノーザンハイブリダイゼーションノ結果、psGV
20. pSGV27. psGV30゜psGB50
及びpSGV52と命名したcDNAサブクローンがウ
ィルスRNAとハイブリダイズすることが明らかとなっ
た。更にこれらのサブクローンの制限酵素分析、サザン
ハイプリダイゼーションの結果pSGV27. psG
V30. psGV50及びpSGV52は同一クロー
ンでありpscvsoが最長のcDNAを持つことが明
らかとなった(第4図参照)。
従って以後の解析は、psGV20とpsGV50(7
) 2種のcDNAクローンについて行った。
) 2種のcDNAクローンについて行った。
6、塩基y死公汰足
第4図に示すpsGV20及びpsGV50の制限酵素
地図に基づいてcDNAを種々の制限酵素で切断するこ
とにより得られたDNA断片をpUc118又はp[I
c119のポリリンカ一部位に挿入した。次いで先に示
した様にして大腸菌JM109を形質転換し、得られた
形質転換体から常法により一本鎖DNAを調製し、これ
を鋳型としてダイデオキシ法により塩基配列を決定した
。塩基配列の決定は第4図中の各制限酵素認識部位から
両方向(矢印)にお互い重複する様に行い正確を期した
。この様にして決定した塩基配列のうち蛋白質をコード
し得るオープンリーディングフレーム(ORF)を検索
した。次いで一般的遺伝コードを用いて翻訳したORF
のアミノ酸配列と他のヒモ状ウィルスの外被蛋白質のア
ミノ酸配列とのホモロジー等から判断して、ウィルス外
被蛋白質をコードしていることが示された遺伝子配列部
分を同定した。
地図に基づいてcDNAを種々の制限酵素で切断するこ
とにより得られたDNA断片をpUc118又はp[I
c119のポリリンカ一部位に挿入した。次いで先に示
した様にして大腸菌JM109を形質転換し、得られた
形質転換体から常法により一本鎖DNAを調製し、これ
を鋳型としてダイデオキシ法により塩基配列を決定した
。塩基配列の決定は第4図中の各制限酵素認識部位から
両方向(矢印)にお互い重複する様に行い正確を期した
。この様にして決定した塩基配列のうち蛋白質をコード
し得るオープンリーディングフレーム(ORF)を検索
した。次いで一般的遺伝コードを用いて翻訳したORF
のアミノ酸配列と他のヒモ状ウィルスの外被蛋白質のア
ミノ酸配列とのホモロジー等から判断して、ウィルス外
被蛋白質をコードしていることが示された遺伝子配列部
分を同定した。
こうして決定された塩基配列を、塩基配列(C)及び(
D)として示し、これらによりコードされるアミノ酸を
それぞれアミノ酸配列(Al及び(B)として示す。
D)として示し、これらによりコードされるアミノ酸を
それぞれアミノ酸配列(Al及び(B)として示す。
実JJLη
実施例1の1.〜5.に記載した方法によりウィルスc
DNAライブラリーを作製し、そのスクリーニングを行
った。但し、このスクリーニングのプローブとして、実
施例1において得られたpsGV20及びpsGV50
を用いた。尚、プローブの標識は5′〔α−” P )
dCTP存在下でのニックトランスレーションにより
行った。このサザンハイプリダイゼーションの結果、p
sGV20及びpsGV50とハイブリダイズしない(
すなわち、両者との相同性が低い)cDN八クコクロー
フ5種なわち各々λGV91λcv16 。
DNAライブラリーを作製し、そのスクリーニングを行
った。但し、このスクリーニングのプローブとして、実
施例1において得られたpsGV20及びpsGV50
を用いた。尚、プローブの標識は5′〔α−” P )
dCTP存在下でのニックトランスレーションにより
行った。このサザンハイプリダイゼーションの結果、p
sGV20及びpsGV50とハイブリダイズしない(
すなわち、両者との相同性が低い)cDN八クコクロー
フ5種なわち各々λGV91λcv16 。
J cv39 、 A cv42及びλ6v71が見い
出された。これらの組換ファージクローンのDNAから
ウィルスcDNA部分を切り出し、常法によりptlc
119ベクター(Vieira J、 and Mes
sing+ J、Methods in Enzymo
logy。
出された。これらの組換ファージクローンのDNAから
ウィルスcDNA部分を切り出し、常法によりptlc
119ベクター(Vieira J、 and Mes
sing+ J、Methods in Enzymo
logy。
153、3.1987)のEcoRI認識部位に挿入し
た。この様にして得られた組換えDNAを用いて)la
nahanの方法(J、Mo1.Biol、、 166
、577、1983)により調製した大腸菌JM109
株を形質転換することによりcDNAをサブクローン化
した。この様にして得られた組換プラスミドは各k p
SGV 9 、 psGV16. I)SGV39゜p
SGV42. psGV71と命名し、以下の実験に供
した。
た。この様にして得られた組換えDNAを用いて)la
nahanの方法(J、Mo1.Biol、、 166
、577、1983)により調製した大腸菌JM109
株を形質転換することによりcDNAをサブクローン化
した。この様にして得られた組換プラスミドは各k p
SGV 9 、 psGV16. I)SGV39゜p
SGV42. psGV71と命名し、以下の実験に供
した。
2、 ウィルスcDNAサブクローンの 所以上の様に
して新に得られた5種のウィルスcDNAについて、制
限酵素分析、サザンハイプリダイゼーションなどによる
分析を行ったところ、psGV16 、 pSGV39
、 pSGV42は同一クローンであり、このうちp
sGV16が最長(7)cDNAを持ツコと、pSGV
9とpsGV71も同一クローンテありpSGV 9
(7)cDNAの方が長いことが明らかとなった。従
って以下の解析は、psGV16及びpSGV 9 (
7) 2種(7)cDNAりl:l−7ニツいて行った
。尚、ウィルス遺伝子RNAを用いたノーザンハイブリ
ダイゼーションにより、psGV16 。
して新に得られた5種のウィルスcDNAについて、制
限酵素分析、サザンハイプリダイゼーションなどによる
分析を行ったところ、psGV16 、 pSGV39
、 pSGV42は同一クローンであり、このうちp
sGV16が最長(7)cDNAを持ツコと、pSGV
9とpsGV71も同一クローンテありpSGV 9
(7)cDNAの方が長いことが明らかとなった。従
って以下の解析は、psGV16及びpSGV 9 (
7) 2種(7)cDNAりl:l−7ニツいて行った
。尚、ウィルス遺伝子RNAを用いたノーザンハイブリ
ダイゼーションにより、psGV16 。
pscv 9共にウィルスRNAに由来するcDNAで
あることを確かめた。
あることを確かめた。
3、塩基酊A傅夾定
第5図に示すpscv 9及びpsGV16の制限酵素
地図に基づいてcDNAを種々の制限酵素で切断するこ
とにより得られたDNA断片をpUcllB又はpUc
119のポリリンカ一部位に挿入した。次いで先に示し
た様にして大腸菌JM109を形質転換し、得られた形
質転換体から常法により一本fAD N Aを調製し、
これを鋳型としてダイデオキシ法により塩基配列を決定
した。塩基配列の決定は図中の各制限酵素認識部位から
両方向(矢印)にお互い重複する様に行い正確を期した
。この様にして決定した塩基配列のうち蛋白質をコード
し得るオープンリーディングフレーム(ORF)を検索
した。次いで一般的遺伝コードを用いて翻訳したORF
のアミノ酸配列と他のヒモ状ウィルスの外被蛋白質のア
ミノ酸配列とホモロジー等から判断して、ウィルス外被
蛋白質をコードしていることが示された遺伝子配列部分
を同定した。こうして決定された塩基配列を塩基配列〔
G〕及び(H)として示し、そしてこれらによりコード
されるアミノ酸配列をそれぞれアミノ酸配列〔E〕及び
〔F〕として示す。この様にして同定されたウィルス外
被蛋白質のアミノ酸配列はお互に約60%の相同性を示
し、実施例1において決定された2種のウィルス外被蛋
白質のアミノ酸配列とは61〜77%の相同性を示すこ
とが明らかとなった。
地図に基づいてcDNAを種々の制限酵素で切断するこ
とにより得られたDNA断片をpUcllB又はpUc
119のポリリンカ一部位に挿入した。次いで先に示し
た様にして大腸菌JM109を形質転換し、得られた形
質転換体から常法により一本fAD N Aを調製し、
これを鋳型としてダイデオキシ法により塩基配列を決定
した。塩基配列の決定は図中の各制限酵素認識部位から
両方向(矢印)にお互い重複する様に行い正確を期した
。この様にして決定した塩基配列のうち蛋白質をコード
し得るオープンリーディングフレーム(ORF)を検索
した。次いで一般的遺伝コードを用いて翻訳したORF
のアミノ酸配列と他のヒモ状ウィルスの外被蛋白質のア
ミノ酸配列とホモロジー等から判断して、ウィルス外被
蛋白質をコードしていることが示された遺伝子配列部分
を同定した。こうして決定された塩基配列を塩基配列〔
G〕及び(H)として示し、そしてこれらによりコード
されるアミノ酸配列をそれぞれアミノ酸配列〔E〕及び
〔F〕として示す。この様にして同定されたウィルス外
被蛋白質のアミノ酸配列はお互に約60%の相同性を示
し、実施例1において決定された2種のウィルス外被蛋
白質のアミノ酸配列とは61〜77%の相同性を示すこ
とが明らかとなった。
Potyvirusグループに於ては、血清学的あるい
は植物病理学的に区別し得る個々の独立したウィルスの
外被蛋白質のアミノ酸配列の相同性は38〜71%(平
均54%)であり、各々のウィルスのストレインとして
存在するウィルスの相同性は90〜99%(平均95%
)であることが報告されている(Advances i
n Virus Re5each、 36+ 273−
314)。従って、これら4種のウィルスは各々独立し
たウィルスである可能性が高いと考えられる。
は植物病理学的に区別し得る個々の独立したウィルスの
外被蛋白質のアミノ酸配列の相同性は38〜71%(平
均54%)であり、各々のウィルスのストレインとして
存在するウィルスの相同性は90〜99%(平均95%
)であることが報告されている(Advances i
n Virus Re5each、 36+ 273−
314)。従って、これら4種のウィルスは各々独立し
たウィルスである可能性が高いと考えられる。
ニンニク病葉の超薄組織切片の電子顕微鏡観察により、
いわゆる風車状の細胞質内封入体の存在が確認されたニ
ンニク葉を材料として、実施例1に記載した方法により
純化したウィルス画分を用い、実施例2及び4に記載し
た方法によりウィルスcDNAライブラリーを作成した
。尚、ここで観察された風車状の細胞質内封入体の形成
はPotyvirusグループのウィルスの持つ特徴の
1つである。
いわゆる風車状の細胞質内封入体の存在が確認されたニ
ンニク葉を材料として、実施例1に記載した方法により
純化したウィルス画分を用い、実施例2及び4に記載し
た方法によりウィルスcDNAライブラリーを作成した
。尚、ここで観察された風車状の細胞質内封入体の形成
はPotyvirusグループのウィルスの持つ特徴の
1つである。
次いで、実施例1及び2で得られた各々独立した4種の
ウィルスcDNA psGV20. pSGV−50,
pSGV−9及びpSGV−16をプローブとして用い
、これらのプローブ゛とハイフ゛リダイズしないcDN
八クコクローンクリーニングした。このスクリーニング
により7種のcDNAクローンλcvH2s 、λG
VH44、λ、v7゜λcvH2L 、λcvH36、
λcvl(38、及びλcvH39が見い出された。こ
れらの組換ファージクローンからDNAを抽出し、実施
例1の1.及び2.に記載した方法により各々のcDN
Aをサブクローン化した後(各k pSGV−H2S、
pSGV−H44,pSGV−7,pSGV−H2L
pSGV−836,pSGV−838、及びpSGV−
H39と命名)、各サブクローンの分析を行った。その
結果、pSGV−1+2S。
ウィルスcDNA psGV20. pSGV−50,
pSGV−9及びpSGV−16をプローブとして用い
、これらのプローブ゛とハイフ゛リダイズしないcDN
八クコクローンクリーニングした。このスクリーニング
により7種のcDNAクローンλcvH2s 、λG
VH44、λ、v7゜λcvH2L 、λcvH36、
λcvl(38、及びλcvH39が見い出された。こ
れらの組換ファージクローンからDNAを抽出し、実施
例1の1.及び2.に記載した方法により各々のcDN
Aをサブクローン化した後(各k pSGV−H2S、
pSGV−H44,pSGV−7,pSGV−H2L
pSGV−836,pSGV−838、及びpSGV−
H39と命名)、各サブクローンの分析を行った。その
結果、pSGV−1+2S。
pSGV−H44及びpSGV−7は、同一あるいは非
常に相同性の高イcDNAクローンテあり、pSGV−
H2L、 pSGV−1(36゜pSGV−838及び
pSGV−H39も同一あるいは非常に相同性の高いク
ローンであることが明らかとなった。
常に相同性の高イcDNAクローンテあり、pSGV−
H2L、 pSGV−1(36゜pSGV−838及び
pSGV−H39も同一あるいは非常に相同性の高いク
ローンであることが明らかとなった。
従って以下の解析は、これら2種のクローン群のうち代
表的なpSGV−H2LとpSGV−836、及びpS
GV−7とpSGシーH2Sについて行うこととした。
表的なpSGV−H2LとpSGV−836、及びpS
GV−7とpSGシーH2Sについて行うこととした。
2.塩基酊刀■吠定
第6図及び第7図に示すpSGシー7、 pscシーH
2SpSGV−H2L、及びpSGV−H36の制限酵
素地図に基づいてcDNAを種々の制限酵素で切断し、
得られた各DNA断片をp[Ic118又はpUc11
9のポリリンカーン部位に挿入した。次に先に示した方
法により大腸菌JM109を形質転換し、得られた形質
転換体から常法により一本鎖DNAを調製し、これを鋳
型としてグイデオキシ法により塩基配列を決定した。
2SpSGV−H2L、及びpSGV−H36の制限酵
素地図に基づいてcDNAを種々の制限酵素で切断し、
得られた各DNA断片をp[Ic118又はpUc11
9のポリリンカーン部位に挿入した。次に先に示した方
法により大腸菌JM109を形質転換し、得られた形質
転換体から常法により一本鎖DNAを調製し、これを鋳
型としてグイデオキシ法により塩基配列を決定した。
この様にして決定した塩基配列のうち、蛋白質をコード
し得るオーブンリーディングフレーム(ORF)を検索
した。
し得るオーブンリーディングフレーム(ORF)を検索
した。
その結果、pSGV−112LとpSGV−1(36の
塩基配列は非常に類似しており、pSGV−H36cD
NA 674bp(poly Atail付加部位から
上流側)のうち14.4%がpSGV−+12Lと異っ
ているにすぎなかった。更にORFに於ける塩基の変異
によるアミノ酸の置換は10.6%で、置換が認められ
たアミノ酸もその性質が類似しているものが多かった。
塩基配列は非常に類似しており、pSGV−H36cD
NA 674bp(poly Atail付加部位から
上流側)のうち14.4%がpSGV−+12Lと異っ
ているにすぎなかった。更にORFに於ける塩基の変異
によるアミノ酸の置換は10.6%で、置換が認められ
たアミノ酸もその性質が類似しているものが多かった。
またこれらのクローンの遺伝子構造は、実施例1及び2
に示した各クローンの遺伝子構造と同一であり、外被蛋
白質遺伝子と推定される遺伝子にコードされる蛋白質の
アミノ酸配列も各々20%程度の相同性を示すこと、更
にはCarlaν1rusに分類されるポテトウィルス
M (PVM)の外被蛋白質のアミノ酸配列(ジャーナ
ル・オブ・ジェネラル・ヴイロロジーJ、Gen、Vi
rol、、 70186L1869.1989)と43
.8%の相同性を示すことも明らかとなった。以上の結
果から、実施例1及び2に記載したウィルスcDNAク
ローンとここに示したpSGV−H2L及びpSGV−
H36は、同一あるいは近縁のウィルス群の染色体RN
Aに由来するcDNAクローンであり、ニンニク潜在ウ
ィルス(GLV) と称されているCarlavir
usグループに分類されるウィルスのcDNAクローン
である可能性が高いと考えられた。
に示した各クローンの遺伝子構造と同一であり、外被蛋
白質遺伝子と推定される遺伝子にコードされる蛋白質の
アミノ酸配列も各々20%程度の相同性を示すこと、更
にはCarlaν1rusに分類されるポテトウィルス
M (PVM)の外被蛋白質のアミノ酸配列(ジャーナ
ル・オブ・ジェネラル・ヴイロロジーJ、Gen、Vi
rol、、 70186L1869.1989)と43
.8%の相同性を示すことも明らかとなった。以上の結
果から、実施例1及び2に記載したウィルスcDNAク
ローンとここに示したpSGV−H2L及びpSGV−
H36は、同一あるいは近縁のウィルス群の染色体RN
Aに由来するcDNAクローンであり、ニンニク潜在ウ
ィルス(GLV) と称されているCarlavir
usグループに分類されるウィルスのcDNAクローン
である可能性が高いと考えられた。
この様にして明らかとなった外被蛋白質遺伝子の塩基配
列を(K)及び(L)として示し、コードされるアミノ
酸配列を(1)及び(J)として示す。
列を(K)及び(L)として示し、コードされるアミノ
酸配列を(1)及び(J)として示す。
一方、pSGV−7とpSGV−H2Sの塩基配列の決
定によって明らかとなったこれらのcDNAの塩基配列
とORFのアミノ酸配列は、実施例1及び2に記載され
たウィルスcDNへや先に示した2種のcDNA(pS
GV−112L、 pSGシーH36)とは大きく異っ
ており、遺伝子構造も大きく異っていた。すなわち、p
SGV−7cDNA (全長3.4 kbp)中には、
蛋白質をコードし得るORFは唯一つしか存在せず、従
って本ウィルスの遺伝子産物は1つの巨大な前駆体蛋白
質として発現された後、プロセシングにより特異的な機
能を持った個々の蛋白質分子が生じている可能性が強く
示唆された。
定によって明らかとなったこれらのcDNAの塩基配列
とORFのアミノ酸配列は、実施例1及び2に記載され
たウィルスcDNへや先に示した2種のcDNA(pS
GV−112L、 pSGシーH36)とは大きく異っ
ており、遺伝子構造も大きく異っていた。すなわち、p
SGV−7cDNA (全長3.4 kbp)中には、
蛋白質をコードし得るORFは唯一つしか存在せず、従
って本ウィルスの遺伝子産物は1つの巨大な前駆体蛋白
質として発現された後、プロセシングにより特異的な機
能を持った個々の蛋白質分子が生じている可能性が強く
示唆された。
この様な遺伝子構造及びウィルス蛋白質分子のプロセシ
ング機構は、球状RNAウィルスのComoν1rus
グループ及びPotyvirusグループのウィルスに
特徴的なものであり(アドヴアンシイズ・イン・ウィル
ス・リサーチ、共、 273−314.1989)、従
ってここに記載したpSGシー7とpSGV−H2Sが
Potyvirusグループに属するとされるニンニク
モザイクウィルス(GMV) cDNΔである可能性が
高いと考えられた。
ング機構は、球状RNAウィルスのComoν1rus
グループ及びPotyvirusグループのウィルスに
特徴的なものであり(アドヴアンシイズ・イン・ウィル
ス・リサーチ、共、 273−314.1989)、従
ってここに記載したpSGシー7とpSGV−H2Sが
Potyvirusグループに属するとされるニンニク
モザイクウィルス(GMV) cDNΔである可能性が
高いと考えられた。
更に、pSGV−7の唯一のORFがコードするアミノ
酸配列とタバコエッチウィルス(TEV) 、タバコヴ
エインモトルウイルス(TVMV)などのPotyvi
rusグループに属するウィルスのORFがコードする
アミノ酸配列間には高い相同性があること、前駆体蛋白
質のプロセシング部位が共通性(グルタミングリシン、
アラニンあるいはセリン配列のグルタミンのC末端側が
切断される)を持っている可能性が高いこと、コート蛋
白質のアミノ酸配列が60%程度の高い相同性を示すこ
となども明らかとなった。以上の結果から、pSGV−
7及びpSGV−H2Sニ代表されるcDNAクローン
はGMVに対するcDNAクローンであると結論された
。この様にして決定された外被蛋白質遺伝子を含むGM
V cDNAの塩基配列を〔O〕及びCP〕として示し
、この塩基配列から推定されるアミノ酸配列を〔M〕及
び〔N〕として示す。
酸配列とタバコエッチウィルス(TEV) 、タバコヴ
エインモトルウイルス(TVMV)などのPotyvi
rusグループに属するウィルスのORFがコードする
アミノ酸配列間には高い相同性があること、前駆体蛋白
質のプロセシング部位が共通性(グルタミングリシン、
アラニンあるいはセリン配列のグルタミンのC末端側が
切断される)を持っている可能性が高いこと、コート蛋
白質のアミノ酸配列が60%程度の高い相同性を示すこ
となども明らかとなった。以上の結果から、pSGV−
7及びpSGV−H2Sニ代表されるcDNAクローン
はGMVに対するcDNAクローンであると結論された
。この様にして決定された外被蛋白質遺伝子を含むGM
V cDNAの塩基配列を〔O〕及びCP〕として示し
、この塩基配列から推定されるアミノ酸配列を〔M〕及
び〔N〕として示す。
以上の結果及び実施例1及び2で得られた結果を総合す
ると、我が国で栽培されているニンニクには少なくとも
、Carlavirusグループあるいはその近縁ウィ
ルスグループに属すると考えられるつイルスが5種、P
otyν1rusグループに属するウィルス1種が感染
し、ウィルス病害を発現していると考えられる。先に記
載した様に、クローン化したウィルスcDNAを用いる
ことにより個々のウィルスの同定を行うことが可能であ
り、従って感染ウィルスと病徴・病害との関係、あるい
は各ウィルス間の相互作用、ひいては病徴発現機構など
の解明を行うことが可能となり、ニンニク(あるいはネ
ギ、ラッキョウなどの他のアリウム属植物)のウィルス
防御を行うにあたって多大の貢献が期待される。
ると、我が国で栽培されているニンニクには少なくとも
、Carlavirusグループあるいはその近縁ウィ
ルスグループに属すると考えられるつイルスが5種、P
otyν1rusグループに属するウィルス1種が感染
し、ウィルス病害を発現していると考えられる。先に記
載した様に、クローン化したウィルスcDNAを用いる
ことにより個々のウィルスの同定を行うことが可能であ
り、従って感染ウィルスと病徴・病害との関係、あるい
は各ウィルス間の相互作用、ひいては病徴発現機構など
の解明を行うことが可能となり、ニンニク(あるいはネ
ギ、ラッキョウなどの他のアリウム属植物)のウィルス
防御を行うにあたって多大の貢献が期待される。
第1図は純化ウィルス画分の電子顕微鏡写真を示したも
のであり、生物の形態を表す図面に代る写真である。 第2図はウィルスRNAの変性アガロースゲル電気泳動
の結果を示したものである。 第3図はウィルスRNAのmAPペーパーへのプロッテ
ィングを示したものである。 第4図はpsGV20及びpsGV50の制限酵素地図
を示したものである。 第5図はpscv 9及びpsGV16の制限酵素地図
を示したものである。 第6図はpSGV−7及びpSGV−H2S(7)制限
酵素地図を示したものである。 第7図はpSGV−H2L及びpSGV−1(36(7
)制限酵素地図を示したものである。
のであり、生物の形態を表す図面に代る写真である。 第2図はウィルスRNAの変性アガロースゲル電気泳動
の結果を示したものである。 第3図はウィルスRNAのmAPペーパーへのプロッテ
ィングを示したものである。 第4図はpsGV20及びpsGV50の制限酵素地図
を示したものである。 第5図はpscv 9及びpsGV16の制限酵素地図
を示したものである。 第6図はpSGV−7及びpSGV−H2S(7)制限
酵素地図を示したものである。 第7図はpSGV−H2L及びpSGV−1(36(7
)制限酵素地図を示したものである。
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1、下記のアミノ酸配列〔A〕または〔B〕で示される
ヒモ状ウィルスの外被蛋白質をコードする遺伝子: 〔A〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 〔B〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 2、下記の塩基配列〔C〕または〔D〕で示されるヒモ
状ウィルスの外被蛋白質をコードする遺伝子: 〔C〕 【遺伝子配列があります】 (式中、YはC又はTを示す); 〔D〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 3、請求項1又は2に記載の遺伝子の部分から成る遺伝
子断片。 4、請求項1又は2に記載の遺伝子を1又は複数の制限
酵素により切断することにより得られる遺伝子断片。 5、下記のアミノ酸配列〔E〕または〔F〕で示される
ヒモ状ウィルスの外被蛋白質をコードする遺伝子; 〔E〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 〔F〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 6、下記の塩基配列〔G〕または〔H〕で示されるヒモ
状ウィルスの外被蛋白質をコードする遺伝子: 〔G〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 〔H〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 7、請求項5又は6に記載の遺伝子の部分から成る遺伝
子断片。 8、請求項5又は6に記載の遺伝子を1又は複数の制限
酵素により切断することにより得られる遺伝子断片。 9、下記のアミノ酸配列〔 I 〕で示されるヒモ状ウィ
ルスの外被蛋白質をコードする遺伝子:〔 I 〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 10、下記の塩基配列〔K〕で示されるヒモ状ウィルス
の外被蛋白質をコードする遺伝子: 〔K〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 11、下記のアミノ酸配列〔J〕で示されるアミノ酸配
列をカルボキシ末端領域に有するヒモ状ウィルスの外被
蛋白質をコードする遺伝子: 〔J〕 【遺伝子配列があります】 12、下記の塩基配列〔L〕で示される塩基配列を3′
末端領域に有するヒモ状ウィルスの外被蛋白質をコード
する遺伝子: 〔L〕 【遺伝子配列があります】 13、請求項9〜12のいずれか1項に記載の遺伝子の
部分から成る遺伝子断片。 14、請求項9〜12のいずれか1項に記載の遺伝子を
1又は複数の制限酵素により切断することにより得られ
る遺伝子断片。 15、下記のアミノ酸配列〔M〕で示される外被蛋白質
を含むウィルス前駆体蛋白質をコードするヒモ状ウィル
ス遺伝子: 〔M〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 16、下記の塩基配列〔O〕で示される外被蛋白質を含
むウィルス前駆体蛋白質をコードするヒモ状ウィルス遺
伝子: 〔O〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 17、下記のアミノ酸配列〔N〕で示されるアミノ酸配
列をカルボキシ末端領域に有するヒモ状ウィルスの外被
蛋白質をコードする遺伝子: 〔N〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 18、下記の塩基配列〔P〕で示される塩基配列を3′
末端領域に有するヒモ状ウィルスの外被蛋白質をコード
する遺伝子: 〔P〕 【遺伝子配列があります】 【遺伝子配列があります】 19、請求項15〜18のいずれか1項に記載の遺伝子
の部分から成る遺伝子断片。 20、請求項15〜18のいずれか1項に記載の遺伝子
を1又は複数の制限酵素により切断することにより得ら
れる遺伝子断片。
Applications Claiming Priority (4)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP26911889 | 1989-10-18 | ||
| JP5177990 | 1990-03-05 | ||
| JP1-269118 | 1990-03-05 | ||
| JP2-51779 | 1990-03-05 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPH044879A true JPH044879A (ja) | 1992-01-09 |
| JP3090680B2 JP3090680B2 (ja) | 2000-09-25 |
Family
ID=26392344
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP02277686A Expired - Fee Related JP3090680B2 (ja) | 1989-10-18 | 1990-10-18 | ヒモ状ウイルス遺伝子 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JP3090680B2 (ja) |
Cited By (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2000044919A1 (en) * | 1999-01-29 | 2000-08-03 | New Zealand Institute For Crop & Food Research Limited | Transformation and regeneration of allium plants |
| US7067719B1 (en) | 1999-05-05 | 2006-06-27 | Seminis Vegetable Seeds, Inc. | Transformation of Allium sp. with Agrobacterium using embryogenic callus cultures |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JPH0595685U (ja) * | 1992-05-28 | 1993-12-27 | 株式会社亀山製作所 | 洗浄装置 |
-
1990
- 1990-10-18 JP JP02277686A patent/JP3090680B2/ja not_active Expired - Fee Related
Cited By (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2000044919A1 (en) * | 1999-01-29 | 2000-08-03 | New Zealand Institute For Crop & Food Research Limited | Transformation and regeneration of allium plants |
| US7112720B1 (en) | 1999-01-29 | 2006-09-26 | New Zealand Institute For Crop & Food Research Limited | Transformation and regeneration of Allium plants |
| US7067719B1 (en) | 1999-05-05 | 2006-06-27 | Seminis Vegetable Seeds, Inc. | Transformation of Allium sp. with Agrobacterium using embryogenic callus cultures |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JP3090680B2 (ja) | 2000-09-25 |
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