JPH0568569A - エンドチアペプシン前駆体 - Google Patents

エンドチアペプシン前駆体

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JPH0568569A
JPH0568569A JP3232047A JP23204791A JPH0568569A JP H0568569 A JPH0568569 A JP H0568569A JP 3232047 A JP3232047 A JP 3232047A JP 23204791 A JP23204791 A JP 23204791A JP H0568569 A JPH0568569 A JP H0568569A
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JP
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endothiapepsin
sequence
strain
plasmid
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JP3232047A
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Inventor
Patrick Jara
パトリツク・ジヤラ
Richard Legoux
リシヤール・ルグー
Gerard Loison
ジエラール・ロワソン
Voahangy Razanamparany
ヴオアアンジ・ラザナンパラニ
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Societe National Elf Aquitaine
Sanofi SA
Original Assignee
Societe National Elf Aquitaine
Sanofi SA
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Publication date
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/80Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for fungi
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/48Hydrolases (3) acting on peptide bonds (3.4)
    • C12N9/50Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25)
    • C12N9/58Proteinases, e.g. Endopeptidases (3.4.21-3.4.25) derived from fungi

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Abstract

(57)【要約】 【目的】 本発明はクリホネクトリア・パラシチカ中の
エンドチアペプシンの発現カセット、このカセットで形
質転換された株、この株を使用するエンドチアペプシン
の製造法および優性選択マーカーを欠く株の製法を提供
するものである。 【構成】 配列(P1)を有するエンドチアペプシンの
前駆体をコード化する配列の上流に機能的プロモーター
を含むことを特徴とする、クリホネクトリア・パラシチ
カ中エンドチアペプシン前駆体の発現のためのカセッ
ト。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明はクリホネクトリア・パラ
シチカ(Cryphonectria parasitica)中のエンドチアペ
シン発現カセット、このカセットで形質転換された菌種
の株、この株を使用するエンドチアペプシンの製造法お
よび優性選択マーカー(dominant selection marker)
を持たないような株の製法に関する。
【0002】
【従来の技術および発明が解決しようとする課題】線状
真菌クリホネクトリア・パラシチカはエンドチア・パラ
シチカ(Endothiaparasitica)としても知られ、子のう
菌類群に属し、天然にアスパラギン酸プロテアーゼ、す
なわち、エンドチアペプシンを分泌し、これはカゼイン
のミセルを特異的に加水分解して牛乳を凝乳にし得るも
のであり、ある種のチーズ、特に、エメンタル型の調理
されたチーズの製造に有用である。この酵素はその配列
が330個のアミノ酸であると、バーコルト V.ら、
ユーロピアンジャーナル・オブ・バイオケミストリー
(Eur.J.Biochem)167巻327−328頁に記載
されており、キモシンに代替する。
【0003】この酵素は最近、エンドチアペプシンの高
濃度発現により選択されたクリホネクトリア・パラシチ
カ種の発酵法により工業規模で生産されている。これら
のプロセスは欠点があり、特に大容量反応器が必須であ
るという欠点を有し、従って、単位バイオマス当りのエ
ンドチアペプシン量およびバイオマスの所与量について
の単位反応容器当りのエンドチアペプシン量が低いとい
う欠点を有する。従来の突然変異体/選択技術では単位
バイオマス当り生産されるエンドチアペプシン量を約3
0%だけ増加させるにすぎない。
【0004】従って、過産生ファクターによりエンドチ
アペプシンを過産生するクリホネクトリア・パラシチカ
株を得る遺伝子工学技術が必要である。過産生ファクタ
ーはここでは、バイオマス同量当りの、非形質転換対照
株により生産されたエンドチアペプシンの量に対する過
産生性形質転換株により生産されたエンドチアペプシン
の量に対する比をいう。クリホネクトリア・パラシチカ
は線状真菌であり、子のう菌類中の他の線状真菌類、例
えばアスペルギルス菌、ノイロスポラ菌またはトリコデ
ルマ菌などの遺伝子とは対照的に、その遺伝子はほとん
ど知られていない。ごく最近、クリホネクトリアの最初
の形質転換体がチャーチルら、カレント・ジェネチクス
(Curr.Gen.)、17巻25−31頁(1990年)に記載
された。この著者らはヒグロマイシン、ベノミルまたは
G418に対し耐性マーカーを有するプラスミドを用い
てクリホネクトリアの実験室株を形質転換した。遺伝子
工学による組換クリホネクトリアを用いて商品化された
蛋白質はこれまでのところない。
【0005】最近、学会:アメリカ植物病理学会および
カナダ植物病理学会年会、1990年8月8日におい
て、G.H.チョワーらは−明らかに(その論文の刊行
要旨によれば)−エンドチアペプシンのコード化配列で
あり、88個のアミノ酸およびTATAボックスを含む
が、機能に必要な活性領域を含まないエンドチアペプシ
ンプロモーター部を含む推定プレプロ配列を提示してい
る。この遺伝子のDNAフラグメントは、但し89個の
アミノ酸のプレプロ配列を含むものが1989年に出願
人により配列化され、これはエンドチアペプシンの発現
が不可能であることが観察されている(下記セクション
1および6参照)。
【0006】
【発明の構成】本発明はクリホネクトリア・パラシチカ
中のエンドチアペプシン前駆体の発現のための新規なカ
セットであり、エンドチアペプシン前駆体のコード化配
列の上流に機能的プロモーターを含むことを特徴とする
ものであり、エンドチアペプシンは下記の配列(P1):
【化7】 を有する。
【0007】エンドチアペプシン前駆体発現用のカセッ
トはここでは、転写および翻訳されるべきクリホネクト
リア中のコード化配列を特徴づける符号によってフラン
クされたこの前駆体をコードする配列を含む。エンドチ
アペプシン前駆体は1または2個の成熟工程を経て培養
地中にエンドチアペプシンを分泌し、産生し得る蛋白質
を意味する。
【0008】エンドチアペプシンの天然前駆体はプレプ
ロエンドチアペプシンといい、下記の配列(P4)を有し
ているものを用いるのが好ましい。
【化8】
【0009】子牛キモシン(ホルトマン、メソッド・イ
ン・エンチモロジー(Methods inEnzymol.)、19巻
421−423頁(1970年)、ブタペプシノーゲン
(ジェームスおよびシーレキ、ネイチュア(Naturer)、
319巻33−38頁(1986年)およびサッカロミセ
ス・セレビシアエ(S.cerevisiae)プロテアーゼA(ウ
ールホルドら、モルキュラー・アンド・セルラー・バイ
オロジイ(Mol.Cell.Biol.)6巻2500−251
0頁(1986年)などの他の公知のアスパラギン酸プロ
テアーゼから類推して、エンドチアペプシンの天然の前
駆体は不活性分泌型でプロエンドチアペプシンといい、
これは自己消化によりエンドチアペプシンに成熟する。
【0010】遺伝子コードの縮重の結果、配列P4が上
記配列に対応している蛋白質をコードする多数のDNA
配列が存在する。これらのうち、適切な配列は下記の配
列(N4a)を含む。
【化9】
【0011】エンドチアペプシン前駆体をコード化する
配列は少くとも1個のイントロンにより遮断されている
のが好ましい。事実、遺伝子のコード化部分中のイント
ロンの存在はある種の場合に、遺伝子の発現を増大させ
る(例えば、J.カリスらの研究、ジーンズ・アンド・
デベロップメント(Genes and Development)、1巻1
183−1200頁参照)。
【0012】従って、エンドチアペプシンをコード化す
る有利な配列は少くとも1個のイントロンによって遮断
された配列(N4a)を含む。この型の特に価値の高い配
列は下記の配列(N4b)を含むものである。
【化10】
【0013】機能的なプロモーターはここでは、エンド
チアペプシン前駆体をコードする配列の転写をクリホネ
クトリア・パラシチカ中に生じさせうる、構造性または
調節可能なプロモーターを意味する。このプロモーター
は、ATに富む領域中に位置するTATA要素、この要
素の下流の転写開始領域、TA要素の上流に、上流活性
化配列 UAS、または調整蛋白の作用によってプロモ
ーターの長さを調節する上流抑制配列URSを含む。プ
ロモーターとしエンドチアペプシンのDNA配列の機能
性を測定するために、セクション11に記載された方法
を便宜的に用いた。これは、この蛋白質の構造遺伝子の
突然変異によりエンドチアペプシンの産生を欠いている
クリホネクトリア・パラシチカを、試験配列および選択
マーカーで形質転換し、形質転換体の中からエンドチア
ペプシンの生産するものを、セクション7に記載のカゼ
イン含有寒天培地上選択試験を用いて識別することから
なる。
【0014】価値あるプロモーターはエンドチアペプシ
ンをコードする遺伝子のプロモーターまたはこのプロモ
ーターの機能的部分である。当該部分は、例えば、下記
の配列(N5):
【化11】 を含むTATAボックスを有する部分であり、配列(N
5)の上流に、フラグメントAの5'−末端およびフラグ
メントCの5'−末端に接しているフラグメントCのセ
グメントXを含み、このセグメントXは活性化領域を含
むように選択されている。フラグメントCは1990年
8月31日にCNCMに寄託番号I−998のもとで寄
託されたエシェリヒア・コリ(E.Coli)株中に含まれ
るクリホネクトリア・パラシチカのゲノムDNAの一部
である。その制限地図およびフラグメントC中に含まれ
るフラグメントAの制限地図を第4図に示した。フラグ
メントAのヌクレオチド配列はプレプロエンドチアペプ
シンをコードしたクリホネクトリア・パラシチカのゲノ
ムDNAを含むものであり、第2図に示した。この活性
化領域のより詳細な位置は、一連のフラグメントCのセ
グメントを得る(例えば、エンドヌクレアーゼまたはエ
クソヌクレアーゼを用いて消化して調製される)ことに
行われ、フラグメントCは、フラグメントAの5'−末
端およびフラグメントCの5'−末端に接しているフラ
グメントCの種々の大きさの部分のセグメントによっ
て、5'−側でフランクされたフラグメントを含むもの
であり、上記の方法を用いて得られたプロモーターの機
能性を測定する。
【0015】活性化領域を含むフラグメントCのセグメ
ントXの例は下記の配列のフラグメントである。
【化12】
【0016】プレプロエンドチアペプシンをコードする
遺伝子のプロモーターの機能的部分の例はフラグメント
CのBgl II−ScaIおよびBamHI−ScaIセグメ
ントである(第4図参照)。クリホネクトリア・パラシチ
カまたは子のう菌類に属する他の線状真菌中に発現する
ことが知られている他の遺伝子に由来するプロモータ
ー、例えば、チュワら、ヌクレイック・アシッド・リサ
ーチ(Nucleic Acid Research)、18巻18頁(1
990年)、オックスフォード大学発行記載のクリホネ
クトリア・パラシチカのグリセルアルデヒド−3−ホス
ファートデヒドロゲナーゼをコードする遺伝子のプロモ
ーターまたはムラネーら、モルキュラー・アンド・ジェ
ネラル・ジェネティクス(Mol.Gen.Genet.)、19
9巻37−45頁(1985年)記載のアスペルギルス・
ニデュランス(Aspergillus nidulans)のグリセルアル
デヒド−3−ホスファートデヒドロゲナーゼをコードす
る遺伝子のプロモーターも有利に用い得る。
【0017】発現カセットは好ましくは選択遺伝子を有
するベクターとの同時形質転換によってクリホネクトリ
ア・パラシチカ中に導入される。発現カセットはそれ自
体、好ましくは線状フラグメントの形態でベクターを有
する。発現カセットは染色体中に結合状態で維持される
のが好ましい。選択遺伝子を有するベクターは染色体中
組込によるか、または末端小粒配列型の配列を用いて染
色体外直線形態でのいずれかで維持する。胞子形成後、
選択マーカーを喪失した形質転換体を選択する。
【0018】従って、本発明はまた、エンドチアペプシ
ン産生性クリホネクトリア・パラシチカ株に関するもの
であり、これは上記に定義されたカセットで形質転換さ
れており、非形質転換株と比較してエンドチアペプシン
を過産生、すなわち、非形質転換株より多量にエンドチ
アペプシンを分泌することを特徴とする。農産食品産業
でのこの株の利用については、この株が、例えば抗生物
質耐性遺伝子などの主要選マーカーを持たないことが有
利である。好ましくは宿主株は、通常の突然変異/選択
法の結果得られ、1990年8月31日にCNCMに寄
託番号I−997のもとに寄託された株SEBR103
である。ついで、この形質転換株はSEBR103と比
較して、エンドチアペプシンを、少くとも2倍の過産生
率で過産生することを認識すべきである。
【0019】本発明はまた、エンドチアペプシンの製造
方法に関するものであり、上記で定義した株の培養工
程、蛋白質の分離および精製を含むことを特徴とする。
この方法は現在のエンドチアペプシン製造方法を有利に
代替するものである。
【0020】本発明はまた、上記で定義したカセットで
形質転換され、優性選択マーカー(dominant selection
marker)を欠く、エンドチアペプシン過産生性クリホ
ネクトリア・パラシチカ株を得る方法であり、これは少
くとも1個の、請求項1−12のいずれか1項記載のカ
セットと優性選択マーカーでの同時形質転換の工程、つ
いで有力な選択マーカーの除去を可能にする胞子形成に
よる精製工程を伴うサイクルを含むことを特徴とする。
この方法は少くとも2個のサイクルを含むのが好まし
い。
【0021】本発明より理解するために下記に、実験結
果および結果の考察をセクションに分けて記載する。こ
れらのうち数セクションは、本発明を実施するために行
れた実験に関し、他は、本発明の具体的実施例に関する
ものであり、本発明の理解は詳細な説明により、自ら、
正確になされるであろう。下記の集合的技術の大部分
は、当業者には周知であり、サムブルックおよびマニア
チス、モルキュラー・クローニング(Molecular cloni
ng):実験操作、1989年コールドスプリングハーバー
プレス刊、ニューヨーク(第2版)による論文中に詳細に
記載されている。第1図から12を参照すれば以下の記
載はより理解できる。第1図はエンドチアペプシンのア
ミノ酸配列を示す。第2図はフラグメントAのヌクレオ
チド配列、縦の線で示したセクション10で用いたBat
EII部位および翻訳アミノ酸配列を示す。第3図はプ
レプロエンドチアペプシンのアミノ酸配列を示す。第4
図はB、H、P、Sp、C、GおよびSの文字で記号化
したフラグメントC、BamHI、HindIII、Pet
I、SphI、SacI、BglIIおよびScaI部位および
フラグメントC中に含まれるフラグメントA、D、Eお
よびFを示す。第5図は下線を引いた3個のイントロン
により遮断されたプレプロエンドチアペプシンをコード
したゲノムDNA配列を示す。
【表1】 第7図はプラスミドp160のPvuI−XhoI−BamH
I(1)およびPvuI−ORI−BamHI(2)フラグメン
トがそれぞれプラスミドp163.1およびpBR327
から由来し、プラスミドp160の小BamHI(2)−Ba
mHI(1)フラグメントが下記のフラグメント3であ
る、プラスミドp160の制限地図を示す。
【表2】 第11図はプレプロエンドチアペプシンをコードする相
補的DNA配列を示す。第12図はフラグメントFのS
phI−HindIIIの配列を示す。
【0022】セクション1:エンドチアペプシン前駆体
の暗号配列を含有するゲノムDNAの約2.1kbフラグ
メントであるフラグメントAの単離 1)ゲノムDNAの調製 SEBR103と呼ぶ菌株をセントラル・ビューロー・
ボーア・シュメルカルチュレス(Centraal Bureau Voor
Schimellcultures)により種クリホネクトリア・パラ
シチカ(Cryphonectria parasitica)に属するものと同
定し、コレクシオン・ナシオナル・ド・キュルチュル・
ド・ミクロルガニスム(Collection Nationale de Cult
ure de Microorganismes(National Collection of Micr
oorganism Cultures)C.N.C.M.にNo.I-997のもとで寄託
した。予めクリホネクトリア・パラシチカ(Cryphonect
ria parasitica)株の菌糸移植体または分生子柄の懸濁
液を接種し、次いで室温および明るい所で4週間インキ
ュベートしておいた、寒天培地(培地G:その組成は後
記の表3に明示する)を入れたペトリ皿の表面から集め
たクリホネクトリア・パラシチカ(Cryphonectria para
sitica)株SEBR103の分生子柄から、1滴の分生
子柄の懸濁液をプレーティングすることによって寒天培
地(培地A:その組成は後記の表1に示す)(25ml)を入
れたペトリ皿の接種を行う。30℃で3日間インキュベ
ートした後、得られた菌糸を液体培地(培地B:その組
成は後記の表2に示す)(100ml)を入れた1Lフラス
コに接種する。220rpmで撹拌しながら28℃で24
時間インキュベートした後、培養ブロス(25ml)を1L
フラスコ中の新鮮な培地B(250ml)の接種に用いる。
先に示した条件のもとでインキュベートした翌日に、全
培養ブロス(250ml)を5,000gで5分間遠心す
る。このペレットを、1mM EDTA含有の0.15M
酢酸ナトリウム溶液に懸濁させる。ホワットマン 3MM紙
で濾過して菌糸を回収し、液体窒素中で凍結させ、乳鉢
と乳棒によって粉末にする。
【0023】菌糸粉末(10g)を、4%ラウロイルサル
コシン ナトリウム塩を含有する0.15M酢酸ナトリウ
ム溶液(pH5)(40ml)に取る。室温で30分間穏やか
に撹拌した後、塩化ナトリウムを0.1Mの最終濃度に
なるまで加える。室温で30分間穏やかに撹拌した後、
イソアミルアルコール(2% v/v)およびクロロホルム
(49% v/v)を含むフェノール溶液(49% v/v)でタ
ンパク質を抽出する。この混合液で3回抽出した後、イ
ソアミルアルコールを含むクロロホルム溶液(96%ク
ロロホルム/4%イソアミルアルコール)で抽出を行
う。この溶液で2回抽出を行った後、水相に2容量のエ
タノールを加える。この2つの溶液を穏やかに反転混合
すると、沈澱したDNAの繊維が現れる。この繊維をパ
スツールピペットで取り、エッペンドルフ管に入れる。
この管を100gで5分間遠心する。このペレットを7
0%エタノール溶液で洗浄し、次いで真空下で乾燥す
る。このペレットを、組成が[10mMトリス-HCl(pH
8);1mM EDTA]である緩衝液(TE緩衝液と呼ぶ)
(1ml)に取る。
【0024】 第1表 培地Aの組成 グルコース(無水) 50 g/L 大豆粉(Societe Industrielle des OleagineuxのSoyoptim) 20 g/L 硝酸カルシウム 9 g/L 寒天(Difco Bacto-寒天) 15 g/L 塩溶液1(組成は以下に示す) 0.5 g/L pHを調べ、1N HClまたは1N NaOHを用いて6.
0に調節する。 塩溶液1の組成 H3BO3 30ml MnCl2・4H2O 79ml ZnCl2 200ml Na2MoO4・2H2O 20ml FeCl3(無水) 50ml CuSO4・5H2O 200ml 蒸留水(qs) 500ml (この懸濁液は、1ヶ月以内は4℃で保存する)
【0025】 第2表 培地Bの組成 グルコース 10 g/L チアミン 2 mg/L 塩溶液2(組成は以下に示す) 62.5ml/L 酵母エキス(Difco) 2.5 g/L 麦芽エキス(Difco) 7.5 g/L pHを調べ、1N HClまたは1N NaOHを用いて6.
0に調節する。110℃で30分間滅菌する。 塩溶液2の組成 NH4NO3 24g/L KH2PO4 16g/L NaHSO4 4g/L KCl 8g/L MgSO4・7H2O 2g/L CaCl2 1g/L 塩溶液1(表1に示した組成) 8ml/L
【0026】第3表 培地Gの組成 パートA 麦芽エキス 20g 酵母エキス 2g 寒天 16g 水 1L pH5.5に調節。 120℃で20分間オートクレーブ処理。 パートB アスパラギン酸 1,000mg ビオチン 10mg 水 1L パートBを1/10に希釈し、これを1mlの分画中に
0.2Mの濃度で濾過しながら分配し、−20℃で保存
する。使用時には、45℃に過冷したパートA(1L)に
希釈したパートB(1ml)を加え、次いでこの混合物をペ
トリ皿に分配する。
【0027】2)プローブ1およびプローブ2の調製 これらプローブは合成オリゴヌクレオチドのプールであ
り、クリホネクトリア・パラシチカ(C.parasitica)
の培養培地中に放出される成熟エンドチアペプシンのア
ミノ酸配列内から選ばれた2つのペプチドの集合的な暗
号配列からなり、V.バクホルト[Eur.J.Biochem.,167,32
7-338 (1987)]が開示しており、第1図に示されてい
る。この配列内から選ばれたペプチド(ペプチド1およ
びペプチド2と呼び、それぞれがプローブ1およびプロ
ーブ2に対応する)は次の通りである: ペプチド1: Val-Asp-Gly-Gln-Thr ペプチド2: Gly-Phe-Trp-Glu-Trp-Thr 。 これらのペプチドにはこれらをコードするそれぞれ25
6(43×22)および64(42×22)のオリゴヌクレオチ
ドが対応しており、これを以下の式で示す:
【化13】
【0028】3)プローブ1およびプローブ2のラベル
化 ターミナル デオキシヌクレオチジル トランスフェラー
ゼ(TdT)(ストラタジーンから市販;照会:600 132)を
用いてプローブをラベルする。 「コバルト」反応緩衝液(IBI Inc.から10倍濃度で供
給):1.4Mカコジル酸カリウム(pH7.2)、300m
Mジチオトレイトール、1μlのターミナル デオキシヌ
クレオチジルトランスフェラーゼ酵素(ストラタジー
ン)、および50μCiの32Pラベルしたデオキシシチジ
ン三リン酸dCTPに溶解したオリゴヌクレオチド混合
物(100ng)を用いて反応を行う。反応は37℃で10
分間行い、次いで0.5M EDTA(1μl)の添加によ
って停止させる。生成物をフェノールで抽出し、混合物
をビオゲル P10ポリアクリルアミド カラム(Biorad:15
0-1050)で透析する。このようにして、放射ラベルした
プローブ1および放射ラベルしたプローブ2が得られ
る。
【0029】4)クリホネクトリア・パラシチカ(Cryp
honectria parasitica)のゲノムDNAの加水分解 上記(1)で得たゲノムDNAを別々に次の制限酵素のそ
れぞれによる消化にかけた:EcoRI、HindIIIおよびBamH
I。それぞれの場合において、消化産物(10μg)を0.
8%アガロースゲル上にスポットし、一連の放射ラベル
された大きさのマーカー(Amersham;照会:SJ5000)の存
在下で電気泳動にかけた。次いで、Maniatis(上記)に記
載されているサザーン・ブロッティングの名で当業者に
周知の方法に従って、DNAをニトロセルロースフィル
ター(Biorad;照会:162-0117)に移した。この操作を繰
返して2つのニトロセルロースフィルターを得、一方は
プローブ1との、他方はプローブ2とのハイブリダイゼ
ーション用とした。
【0030】5)ハイブリダイゼーション 常法(マニアチスら;上記)に従って処理したそれぞれの
ニトロセルロースフィルターを初めに6X SSC、1
0X デンハルトおよび100μg/mlの超音波処理して
変性したサケ精子DNA(SigmaD9156)を含むプレハイブ
リダイゼーション溶液において42℃で数時間洗浄し、
次いでラベルしたプローブ1および2の一方の存在下、
上記と同じ溶液中および同じ条件下でインキュベートし
た。このハイブリダイゼーションを一晩進行させた。6
X SSC溶液は20X SSC溶液の希釈によって得
た。20X SSC緩衝液の調製はマニアチス(上記)に
記載されている。簡単に説明すると、この緩衝液は17
5.3g/LのNaClと88.2g/Lのクエン酸ナトリウ
ムを含み、数滴の1NNaOHでpH7に調節されてい
る。10X デンハルト溶液は、最終容量500mlあた
りに1gのフィコール、1gのポリビニルピロリドンおよ
び1gのウシ血清アルブミンを含んでいる。ハイブリダ
イゼーションの後に、それぞれのフィルターを42℃で
0.5SSC含有の溶液中で個々に洗浄する。次いで、
このフィルターを写真フィルム(Kodak XAR5)に一晩暴露
する。現像したフィルムの分析により、酵素HindIIIを
用いて得た加水分解物の場合には、大きさが2.1kbよ
りもわずかに大きいフラグメントにほぼ対応する分子量
のバンドが放射ラベルプローブの両方とポジティブに反
応することがわかる。
【0031】6)放射ラベルされたプローブ1および2
とハイブリダイズする約2.1kbのHindIII-HindIII D
NAフラグメントのクローニング a)ゲノムDNAライブラリーの調製 クリホネクトリア・パラシチカ(Cryphonectria parasi
tica) DNA(100μg)を酵素HindIIIで加水分解
し、そのフラグメントを0.8%アガロースゲルの電気
泳動で分離する。大きさが2.1kbよりもわずかに大き
いフラグメントに対応する領域を切り出し、シリカミル
ク(Geneclean Tm, Biorad P.O.Box 2284, LaJolla, Cal
ifornia 92038-2284)に吸着させることによってDNA
を精製する。これらのフラグメントを、HindIIIで加水
分解して脱ホスホリル化しておいたpBR322(Biolab
s;照会:321)にファージT4 DNAリガーゼ(Gibco B
RL)を用いて連結する。コンピテントな細胞(即ち、形質
転換されうる細胞)(RRI細胞;Gibco BRL;照会:520
-8261 SA)を、供給元の指示の通り連結溶液で形質転換
し、以下の第4表に明示した組成の寒天培地[LB寒天
培地と呼ぶ;マニアチス(上記)]にプレーティングす
る。得られたコロニーを集めたものがゲノムDNAライ
ブラリーである。 第4表 LB寒天培地の組成 Bactoトリプトンカゼイン加水分解物(Difco) 10g/L Bacto酵母エキス(Difco) 5g/L NaCl 10g/L 5N NaOHを用いてpH7.0に調節 Bacto寒天(Difco) 15g/L 120℃で20分間オートクレーブ処理。
【0032】b)放射ラベルされたプローブ1および2
とハイブリダイズするHindIII-HindIIIフラグメント(フ
ラグメントAと呼ぶ)を担持するクローンの選択 形質転換の後に得られたコロニーをニトロセルロースフ
ィルター(Schleicherand Schull;照会:40117)上に吸
着させ、2つの他のニトロセルロースフィルター上に複
製する。第1系列のフィルターは放射ラベルしたプロー
ブ1とハイブリダイズさせ、第2系列のフィルターは放
射ラベルしたプローブ2とハイブリダイズさせる。プレ
ハイブリダイゼーション、ハイブリダイゼーションおよ
び洗浄の条件は、先に用いた条件と同じである(上記5
を参照)。両プローブとポジティブに反応したクローン
を精製する。これらクローンの1つのプラスミドDNA
を単離する。対応するプラスミドをp472と呼ぶ。こ
のプラスミドが2種類の放射ラベルしたプローブ1およ
び2のそれぞれとまさしくハイブリダイズすることをチ
ェックした後、このプラスミドに担持されている2.1k
bのHindIII-HindIIIフラグメントを単離し、M13mp1
9(Pharmacia)にサブクローニングした。このフラグメ
ントをフラグメントAと呼ぶ。このフラグメントをサイ
クロン法(IBI "Cyclone I Biosystem")で配列決定し
た。フラグメントAのヌクレオチド配列を第2図に示す
が、この図には、No.1をフラグメントAの5'末端の
ヌクレオチドに割り当てるために任意に選んだヌクレオ
チドの数、ならびに翻訳されるアミノ酸配列も示されて
いる。
【0033】7)フラグメントAの配列の説明(第2図
を参照) フラグメントAは、Barkoltが開示しているように(第1
図参照)、培養培地に放出される成熟エンドチアペプシ
ンのペプチド配列をコードしているヌクレオチド配列を
担持しており、これはヌクレオチド694で始まってヌ
クレオチド1861で終わり、ヌクレオチド850−9
38および1279−1367に位置する2つのイント
ロンで遮断されている。ヌクレオチド694の上流には
オープン読み取り枠がヌクレオチド566まで続き、こ
こにイントロン末端に特徴的なシグナル:AGが存在す
る。ヌクレオチド468−469には、イントロンの始
まりに特徴的なシグナル:GTが存在する。イントロン
の始まりとエクソンの終わりにまたがる配列、即ちAA
GGTGAGTが、Mount S.M.[Nucl.Ac.Res., 10,459-
472 (1982)]が開示しているスプライス部位の5'共通配
列と一致していることがわかるであろう。ヌクレオチド
468の上流には、少なくとも1個のATGを含む1個
のオープン読み取り枠(停止コドンによって遮断されて
いない)のみが存在する。この枠は365−367位に
ATG[そのヌクレオチド環境は、M.Kozak(Nucl.Ac.Re
s., 12, p.2 (1984))と適合する]を、そして329−3
31位にATG(この読み取り枠は305−307位の
停止コドンTAGで遮断されている)を含有している。
ウイスコンシン大学のソフトウエアU.W.G.C.G.:D
evereuxら[Nucl.Ac.Res., 12, 8711-8721-Option (198
4)]:G.vonHeijne[Nucl.Ac.Res., 14, 483-490 (1986)]
の方法によるシグナルペプチドの試験は、このオープン
読み取り枠において、プレヌクレオチド配列(ヌクレオ
チド329から始まる)と呼ぶ以下の配列を有する、シ
グナルペプチドをコードしている1個の配列を予想させ
た:
【化14】 この配列は、プレペプチド配列と呼ぶ以下の配列の20
アミノ酸シグナルペプチドをコードしている: Met Ser Ser Pro Leu Lys Asn Ala Leu Val Thr Ala Met Leu Ala Gly Gly Ala Leu Ser
【0034】シグナルペプチドは当業者によって予想さ
れるものであるが、これは、エンドチアペプシンが分泌
型タンパク質であり、シグナルペプチドの存在を必要と
するためである。上記シグナルペプチドをコードしてい
る配列と成熟タンパク質をコードしている配列の間に
は、プロヌクレオチド配列(ヌクレオチド389から始
まる)と呼ぶ次のヌクレオチド配列が存在し:
【化15】 この配列はプロペプチド配列と呼ぶ以下のペプチド配列
をコードしている:
【化16】
【0035】プロペプチド配列(389−693)も当業
者によって予想されるものであるが、これは、C.parasi
ticaに対して恐らくは毒性であるエンドチアペプシンを
それが外部培地に放出されるまで抑制する機能を有して
いるためである(放出の後にこの配列は切断される)。従
って、成熟エンドチアペプシンをコードしている配列の
上流には、以下のプレプロペプチド配列をコードしてい
る配列が存在する:
【化17】
【0036】3つのイントロンで遮断されたヌクレオチ
ド329(第2図)から始まってヌクレオチド1861
(第2図)で終わるヌクレオチド配列を第5図に示すが
(イントロンには下線を引いた)、上記のようにこれはプ
レプロエンドチアペプシンをコードしている(そのアミ
ノ酸配列は第3図に示す)。フラグメントAは、さら
に、開始ATGコドン(329−331)の5'側に32
8ヌクレオチドの配列およびTAA停止コドン(186
2−1864)の3'側に275ヌクレオチドの配列(こ
れはいくつかの可能性あるポリアデニル化部位を含む)
を含有する。フラグメントAの開始ATGの5'側の部
分は、一方でメッセンジャーRNAの非翻訳化5'末端
を、そして他方でこの末端の上流に真核生物のほとんど
のプロモーターに存在する共通配列である通常TATA
ボックスと呼ばれるTATAA配列(187−191)を
含有する[BallanceD.J.,Yeast,2,229-236 (1986)]。対
照的に、この部分は、例えばSaccharomyces[Guarente
L., all, 52, 303-305(1988)]およびNeurospora[Freder
ick G.D., Mol.Gen.Gent., 221, 148-154 (1990)]に存
在している通常は上流活性化配列(UAS)または上流調
節配列(URS)と呼ばれる型の配列を含有していない。
従って、フラグメントAのTATAボックスの上流には
プロモーター活性化領域は存在していない。従って、こ
のプロモーターは、セクション6に示すように機能的で
はない。
【0037】セクション2:エンドチアペプシン前駆体
の暗号配列を含むゲノムDNAの約32.6kbフラグメ
ントであるフラグメントBの単離 1)クリホネクトリア・パラシチカDNAの調製 クリホネクトリア・パラシチカSEBR103のゲノム
DNAを、下記に要約したB.タルコ(大学論文:専門
分野生命科学、ボルドーII大学1689年1月6日口
頭試問)記載のプロトコルと同じプロトコルにより調製
した。 プロトプラストの調製 クリホネクトリア・パラシチカ株SEBR103培養ブ
ロス250mlから生じた菌糸体をセクション1と同様
に調製し、ガーゼ上で濾過し、1MMgSO450ml
で濯いだ。37℃にて30分間インキュベートした後、
菌糸体を再びガーゼ上で濾過し、1MMgSO420m
lに添加する。ついで、チチナーゼ(chitinases)およ
びβ−1,3−、β−1,6−、α−1,3−、および
α−1,4グルカナーゼ、およびその他のポリサッカリ
ダーゼからなるCAYLASEC3(CAYLA社製)
からなる酵素混合物10mg/lを含む1MMgSO4
20mlを添加し、得られた混合物を、緩やかに撹拌し
つつ37℃にて1時間30分インキュベートする。混合
物を濾過した後、濾液を3000gにて10分間遠心分
離し、得られたプロトプラストペレットを、0.8Mソ
ルビトール、100mM トリス−HCl、pH7.5
の組成のST緩衝液と称する緩衝液20ml中に添加す
る。
【0038】プロトプラストからゲノDNAの抽出 さらに、3000gにて10分間遠心分離した後、プロ
トプラストペレットを融解緩衝液(100mMトリス−
HCl pH9、35mMEDTA pH8;4(重量
/容量)%SDS;プロテイナーゼK(シグマ社製)6
00μg/ml)14mlに添加し、ついで、混合物を
50℃にて1時間インキュベートする。12000gに
て10分間遠心分離した後、上清容量を、10mMトリ
ス−HClpH8、1mMEDTAおよび19.53g
のCsClの組成のTE緩衝液で15.5mlに調製し
た。超遠心分離(縦型ローター中で50000rpmに
て16時間)後、勾配ごとに各フラクションに集め、こ
れらを10mMトリス−HCl pH8、1mMEDT
Aの組成の緩衝液に対して透析し、0.8%アガロース
ゲル上で分析する。260nmにおける吸収と280n
mにおける吸収の分光比が1.8の範囲にあるものを維
持した。
【0039】コスミッドライブラリーの構築 上記のフラクションのゲノムDNAの約10μgを制限
酵素で部分消化を行い、T4リガーゼを用いて、コスミ
ッドpHC79−ura5、市販のコスミッドpHC7
9(BRL社製、ホーン B.ら構築、ジーン(Gene)
11巻291−298頁(1980年))のEcoRI
部位にura5遺伝子を含むEcoRI−EcoRIフ
ラグメント(ベケレットら、ジーン(Gene)32巻48
7−492頁(1980年))を挿入して構築したおよ
そ8−kbのコスミッドベクター、このコスミッドpH
C79−ura5はエンドヌクレアーゼBamHIであ
らかじめ直線化されており、アルカリホスファターゼで
脱燐酸されている(プロメガ参照CIP−M204)、
に連結した。連結混合物はストラタジーン「ギガパック
プラス」キットを用いてファージ粒子中にパッケージン
グし、形質転換のためにエシェリキア・コリ(E.coli)
リセプター株LE392(ムレら、モルキュラー・アン
ド・ジェネラル・ジェネティクス(Mol.gen.Gene)15
0巻53頁(1977年))を用い、これは市場で入手
可能であり、ゲノフィトから販売されている。アンピシ
リン100mg/lを補足したLB寒天培地(第4表参
照)上にプレーティングした後、こうして得られた45
00個のアンピシリン耐性クローンを、寒天を含まない
第4表記載の組成であるLB液体培地を含むマイクロタ
イタープレート上で個々に継代培養し、−80℃にて貯
蔵した。ライブラリー中の挿入物の大きさ平均は約37
kbであることを、任意に採取したおよそ12個のクロ
ーンから抽出したコスミッドの消化によって示した。
【0040】2)フラグメントAとのハイブリッド形成
によるライブラリーのスクリーニング エンドチアペプシン構造遺伝子を含むフラグメントAは
ハイブリッド形成のためのプローブとして使用した。最
初に、マイクロタイタープレート中に含まれるクローン
を、アンピシリンを添加したLB寒天培地(第4表参
照)を含むペトリ皿中で継代培養し、ついで、ナイロン
膜(ハイボンドN+、アメルシャム)上に移した。つい
で、細菌を1.5MNaClおよび0.5MNaOHを
含む溶液を用いて溶菌した。プロテイナーゼK(シグ
マ)の溶液で、37℃にて30分間処理し、フィルター
を2×SSC(17.5g/lのNaCl、くえん酸ナ
トリウム8.82g/l、pH7)で洗浄し、42℃に
て20分間プレハイブリッド形成させた。フィルター
を、実施例1で分離しフラグメントAと1夜、42℃に
てハイブリッド形成させ、西洋ワサビペルオキシダーゼ
(アメルシャム)で標識し、「Gene detection system」
ECL chemiluminescent probe kit(RPN2101、Ame
rsham)に暴露させる。得られたハイブリダイゼーショ
ンシグナルを適当なフィルム上で可視化する。ライブラ
リーの4500個のクローンのうち、2個のシグナルは
陽性シグナルであった。これらの2個のクローンは、以
下8H12および41H7と定義し、それぞれ、p8H
12およびp41H7と称されるコスミッドを含んでお
り、アンピシリン100mg/lを含むLB液体培地上
で継代培養した。1夜37℃にて培養後、コスミッドを
アルカリ性培地中溶菌法により抽出し、マニアチス、上
掲に記載の技法により、塩化セシウムおよび臭化エチジ
ウムとともに超遠心分離して精製した。かくして精製し
たコスミッドをHindIII酵素にて消化し、得られ
たフラグメントを0.8%アガロースゲル上で電気泳動
にかけた。ナイロン膜上でサザンブロッティングを行
い、フィルターを、上記の技法を用いて、フラグメント
Aとハイブリッド形成させた。コスミッドp8H12お
よびp41H7の各々におけるこのフラグメントの存在
をこれによって確認した。
【0041】3)陽性コスミッドp8H12各々p41
H7の物理的分析 酵素、NotI、SmaI、SfiI、XbaI、Ba
mHIおよびPvuIを用いて得られたコスミッドp8
H12およびp41H7の制限プロフィールは一致し、
それによってクリホネクトリア・パラシチカのエンドチ
アペプシンをコードした遺伝子を含むゲノムDNAの領
域はこれらの二つのクローンについて配列換えなしにク
ローンされている。コスミッドp8H12の制限プロフ
ィール(このコスミッドは次ぎの検討で取り上げられて
いる)を第5表に示す。 第5表 コスミッドp8H12の制限プロフィール 制限酵素 開裂部位数 kbの寸法 合計(kb) NotI 1 測定せず − SmaI 2 測定せず − SfiI 3 20;16;4.1 40.1 XbaI 4 23;14;2.9;1.2 41.1 BamHI 5 15;9;7;7;2.6 40.6 PvuI 5 23;7.4;6.4;2.1;1.5 40.4 平均 40.6 この表はコスミッドp8H12の平均寸法が約40.6
kbであり、従って、ゲノム挿入物の寸法は、40.6
−8.0=32.6であると計算することを可能にするも
のである。このゲノム挿入物をフラグメントBという。
【0042】さらに、ナイロン膜上のサザンブロッティ
ングにより、約9kbのBamHI−BamHIフラグ
メント(第5表参照、以下、フラグメントCという)
は、プローブとして用いたフラグメントAとハイブリッ
ド形成する唯一のBamHI−BamHIフラグメント
であることが示された。従って、このフラグメントCは
フラグメントAを含む。
【0043】セクション3:エンドチアペプシン前駆体
のコード配列を含むゲノムDNAの約9−kbのフラグメ
ントである、フラグメントCのクローニング 10μgのコスミドp8H12をエンドヌクレアーゼBam
HIで消化し、種々のフラグメントを0.8%アガロー
スゲル上で分離した。フラグメントCを含む酵素BamH
I消化産物を、T4DNAリガーゼ(ギブゴBRL)を用
いて、BamHI部位で開き脱リン酸化したプラスミドp
BR322に連結した(バイオラブズより市販−参照番
号320)。連結産物はエシェリキア・コリ(E.coli)
K12RR1株(ギブゴBRL、参照番号520−82
61A)のコンピテント細胞に形質転換するのに用い
た。形質転換混合物を、アンピシリン(100μg/ml)
添加LB寒天培地を含むペトリ皿に置いた後、その皿を
37℃で24時間インキュベートし、コロニーをナイロ
ン膜上に写す;細菌は溶菌し、膜はその後セクション
2.2)記載のとおりフラグメントAでハイブリダイズ
する。フラグメントAとハイブリダイズするDNAを含
むコロニーが、それにより18個検出された。これらの
DNA含有プラスミドを抽出し、エンドヌクレアーゼB
amHIで消化した後0.8%アガロースゲルで分析し
た。従って、これらの全てのコロニーがpBR322に
由来する、BamHI部位に挿入された約9−kbのフラグ
メントを有するプラスミドを含有することが立証され
た。SEBR3104と称するクローンは、pEp1と称
するプラスミドを含有し、次の研究のために選択され
た。クローンSEBR3104は、No.I−998の
もとでCNCMに寄託した。
【0044】プラスミドpEp1は、酵素BamHI、Hin
dIII、PstI、SacI、SphI、BglIIおよびSc
aIを用いた単一および/または多重消化に供した。得
られた制限地図を第4図に示すが、記号B、H、P、S
p、C、GおよびSは各々BamHI、HindIII、Pst
I、SphI、SacI、BglIIおよびScaIを示し、
C.パラスチカ(C.parasitica)のエンドチアペプシン
遺伝子の開始コドンはiにより示し、矢印は、エンドチ
アペプシン遺伝子の転写の方向を指す。セクション2に
記載されたフラグメントA、並びにセクション4および
5に記載されたフラグメントD、EおよびFもこの図に
示す。フラグメントCの5'末端を形成するBamHI部
位(B)は、開始コドンから約4kbの所に位置し、5'側
のBglII部位(G)は開始コドンから約3kbの所に位置
することは明白である。故に、フラグメントDと称す
る、フラグメントA全部を含む約5.1−kbのBglII
−BglIIフラグメントを単離し、クローニングするの
に優れているようである。これをフラグメントDとい
い、おそらくエンドチアペプシン前駆体の発現に必要な
情報を含んでいる。
【0045】セクション4:エンドチアペプシン前駆体
のコード配列を含有するゲノムDNAの約5.2−kbの
フラグメントである、フラグメントDのクローニング 20μgのプラスミドpEp1を酵素BglII(第4図参
照)で消化し、消化産物を0.8%低融点アガロース(シ
グマ−参照番号A9414)ゲル上で分離した。臭化エ
チジウムでアガロースゲルを染色した後、約5.2−kb
のフラグメントDを含有するアガロースバンドを、31
0nmの紫外光の下で、外科用メスを用いて切除する。次
いでDNAをNACS、52PREPACキットに指示
されるとおりに抽出する。およびその後10mMトリス
−塩酸pH8、1mM EDTAから成るTE緩衝液10
μl中に希釈する;得られた懸濁液1μlは、T4DNA
リガーゼ(ギブゴBRL)を用いて、pUC12のポリリ
ンカーのSmaI部位でBglIIリンカーの挿入すること
により、プラスミドpBT3から得られるプラスミドpB
T6に連結した。オルバッハM.J.ら、Mol.Cel
l.Biol、6巻2452−2461頁(1986年)によ
り報告されているプラスミドpBT3は、ベノミル抵抗
性(優性選択標識)を有するニューロスポロ・クラサ(Ne
urospora crassa)(線状子嚢菌類)のβ−チューブリン
の変異遺伝子を持っている。連結する前に、プラスミド
pBT6をエンドヌクレアーゼBglIIで直線状にし、
アルカリ性ホォスファターゼ(プロメガ、参照番号CI
P−M204)で脱リン酸化した。
【0046】連結産物はエシェリキア・コリ(E.coli)
K12RR1株(ギブゴBRL、参照番号530−82
61SA)のコンピテント細胞に形質転換するために用
いた。形質転換混合物を、アンピシリン(100μg/m
l)添加LB寒天培地を含むペトリ皿に置いた後、その皿
を37℃で24時間インキュベートし、コロニーをナイ
ロン膜上に写した。細菌を溶菌し、その後膜をセクショ
ン2.2)記載のとおり、フラグメントAでハイブリダ
イズする。それにより、フラグメントAでハイブリダイ
ズするDNAを含有するコロニーが2個検出された。そ
れらのプラスミドDNA内容物を抽出し、エンドヌクレ
アーゼBglIIで消化した後、0.8%アガロースゲル
上で分析した。従って、これらの2個のコロニーが、B
glII部位で、両方に可能な方向性をもって挿入された
約5.2−kbのフラグメントDを有するpBT6に由来
するプラスミドを含有することが立証された。このプラ
スミドを含有するクローンは、プラスミドpEp2と称
し、次の研究のために選択された。
【0047】セクション5:エンドチアペプシン前駆体
のコード配列を含有するゲノムDNAの約3.5−kbの
フラグメントである、フラグメントFのクローニング クローニングは二段階で行った。最初に段階F全部を含
有する約3.7−kbのフラグメントEを、ポリリンカー
のSphI部位でプラスミドpUC18にクローン化し
た。それにより得られたプラスミドpEp3はフラグメン
トFを精製することができ、そのフラグメントは、今度
はポリリンカーのBamHII部位でプラスミドpUC1
8にサブクローン化した。それによりプラスミドpEp4
が得られた。
【0048】1) プラスミドpEp3の構築 1μgのプラスミドpEp1を酵素SphI(第4図参照)で
消化し、次にDNAを0.1容の3M酢酸ナトリウムお
よび2容のエタノールで精製した。それにより約3.7
−kbのSphIフラグメントが得られ、これをフラグメン
トEと称した。次にDNAを組成:10mMトリス塩酸p
H8、1mM EDTAであるTE緩衝液40μlに溶解
し、その後P10カラム(ファルマシア)で透析した。上
記で得られた混合物1μlは、T4DNAリガーゼ(ギブ
ゴBRL)を用いて、前もってエンドヌクレアーゼSph
Iで直線状にし、アルカリ性フォスファターゼ(プロメ
ガ、参照番号CIP−M204)で脱リン酸化したプラ
スミドpUC18約25ngと連結した。連結産物は、エ
シェリキア・コリ(E.coli)DH5α株(ギブゴBR
L、参照番号530−8263SA)のコンピテント細
胞に形質転換するために用いた。形質転換混合物をアン
ピシリン(100μg/ml)、X−ガル(40μ/ml)およ
びIPTG(2μg/ml)添加LB寒天培地を含むペトリ
皿に置いた後、その皿を37℃で24時間インキュベー
トし、350個の白色コロニーを同じ培地で:継代培養
した。次にコロニーをナイロン膜上に写し、その後細菌
を溶菌し、最終的に上述のセクション2.2)に記載し
たとおり膜をフラグメントAでハイブリダイズした。そ
れによりフラグメントAでハイブリダイズするDNAを
含有するコロニーが37個検出された。30クローンの
プラスミドDNAを抽出し、エンドヌクレアーゼSphI
で消化した後0.8%アガロースゲルで分析した。Sph
I部位で(両方に可能な方向性をもって)挿入された3.
7−kbのフラグメントEを有するpUC18に由来する
プラスミドを含有するコロニー2個が維持された。これ
らのプラスミドはpEp3(a)およびpEp3(b)と称した。
プラスミドpEp3(b)では、フラグメントEのBglII
部位は、pUC18のポリリンカー上に位置するBamH
I部位から約3.5−kb離れたところにある。
【0049】2) プラスミドpEp4の構築 10μgのプラスミドpEp3(b)を、エンドヌクレアーゼ
BglII、BamHIおよびPvuIによる3連続消化に供
し、消化産物を0.8%アガロースゲル上で分離した。
ゲルを臭化エチジウムで染色した後、pUC18のポリ
リンカーのSphI−BamHIフラグメントを混入した、
フラグメントEと称する約3.5−kbのSphIフラグメ
ントを含有するアガロースバンドを、310nmの紫外光
の下で外科用メスを用いて切除した。次にDNAを抽出
し、その後組成:10mMトリス塩酸pH8、1mM E
DTAであるTE緩衝液20μlに溶解した。得られた
懸濁液5μlを、前もってエンドヌクレアーゼBamHI
で直線状にし、アルカリ性ホォスファターゼで脱リン酸
化したプラスミドpUC18約750ngに連結した。連
結産物は、上述の手順に従って、エシェリキア・コリ
(E.coli)DH5α株のコンピテント細胞に形質転換す
るのに用いた。30個の白色コロニーのプラスミドDN
Aを抽出し、エンドヌクレアーゼBamHI、BglIIま
たはSmaIで消化した後、0.8%アガロースゲルで分
析した。約3.5−kbのフラグメントFを有するpUC
18に由来し、pUC18のポリリンカーのSphI−Ba
mHIフラグメントを混入し、BamHI部位で挿入され
たプラスミドを含有するコロニーを採用した。このプラ
スミドをpEp4と称した。
【0050】3) フラグメントFのSphI−HindII
Iセグメントの配列の決定 この配列は上述と同様に決定し(セクション1参照)第1
2図に示す。これにはプレプロエンドチアペプシンをコ
ード化する遺伝子のプロモーターを活性化する信号が含
まれ、セクション10を示す。
【0051】セクション6:C.パラスチカ(C.parasi
tica)の、フラグメントA、BおよびCの1つを含有す
るベクターの各々による形質転換 プロトプラストの調製 セクション1記載のとおり調製したC.パラスチカ
(C.parasitica)SEBR103株の培養液250mlか
ら得られた菌糸体を、1M MgSO450mlですすぐ。
37℃で30分インキュベートした後、菌糸体をガーゼ
で濾過し1M MgSO420mlに採る。次に、シチナー
ゼおよびβ−1,3、β−1,6−、α−1,3−および
α−1,4−グルカナーゼ並びにその他のポリサッカリ
ダーゼから成る酵素混合物ケイラーゼC3(カンパニー
・ケイラ)10mg/lを含有する1MMgSO420mlを加
え、その結果得られた混合物を37℃で1時間30分お
だやかに攪拌しながらインキュベートする。混合物を濾
過した後、濾液を3000gで10分間遠心にかけ、得
られたプロトプラストのペレットを、ST緩衝液と称す
る0.8Mソルビトール、100mMトリス塩酸pH7.
5から成る緩衝液15mlに採る。さらに3000gで1
0分間遠心にかけた後、ペレットをSTC10緩衝液と
称する0.8Mソルビトール、100mMトリス塩酸pH
7.5、10mMCaCl2から成る緩衝液10mlに採る。
3000gで10分間遠心にかけ、ペレットをSTC5
0緩衝液と称する0.8Mソルビトール、100mMト
リス塩酸pH7.5、50mMCaCl2から成る緩衝液に
採った後、プロトプラストをマラセッツセルを用いて数
え、濃度が108/mlになるよう調整する。
【0052】コスミドp8H12およびプラスミドpBT
3を用いたプロトプラストの同時形質転換 フラグメントB(セクション2参照)を含有するコスミド
p8H12は、優性選択標識を持たない(直接選択に使用
可能)。プラスミドpBT3は、オルバッハM.J.ら、
モル.セル.ビオール(Mol.Cell.Biol)6巻245
2−2461頁に報告されているように、ベノミル抵抗
性(優性選択標識)を有するニューロスポラ・クラサ(線
状子嚢菌類)のβ−チューブリンの変異遺伝子を運び、
そのためコスミドp8H12と組み合わせて使われた(同
時形質転換法:ウェルナーズK.ら、モレキュラー・ア
ンド・ジェネラル・ジェネティクス(Molecular and
General Genetics)209巻71−77頁(1987
年)のアルペルギルス・ニガー(Aspergillus niger)の
同時形質転換に関する研究を参照)。
【0053】上述のサンブロークに報告された技法に従
って、塩化カルシウムおよび臭化エチジウムを含有する
緩衝液中超遠心にかけて前もって精製したプラスミドp
BT3 1μg、並びに同じ方法で組成:10mMトリス
塩酸pH8、1mMEDTAであるTE緩衝液10ml中で
精製したコスミドp8H12 4μgから成る混合物を、
上述のとおり調製されたプロトプラスト調製物100ml
(107プロトプラストに相当)と一緒に0℃で20分間
インキュベートする。60%(重量/容量)PEG400
0(分子量4000のポリエチレングリコール)および組
成が20mMトリス塩酸pH7.5、100mMCaCl2
ある緩衝液から成る溶液1mlを加えた後、混合物を室温
で10分間インキュベートし、STC10緩衝液(上記
で定義)1mlを混合物に混合する。このように処理した
プロトプラストは、培地Dと称し、その組成は以下の第
6表に明記するベンレート(デュポント・ネモアーズよ
り市販されている抗菌剤)1mg/l含有寒天培地60mlに
加え、45℃で過冷した混合物はベンレート(デュポン
ト・ネモアズにより市販される、50%ベノミルを含有
する抗菌剤)1mg/lを添加した寒天培地を含むペトリ皿
に置く。その培地は培地Cと称し、その組成は以下の第
7表に明記する。ペトリ皿を28℃でベノミル抵抗性を
生じたプロトプラストを発現するのに必要な時間インキ
ュベートする。それにより得られた再繁殖した形質転換
体は29Pnと称し、nは検討中のクローンの番号を意味
する。クローンのベノミル抵抗性は、1mg/lベンレー
トを補足した寒天20g/lを加えた寒天培地にした培地
B上の各クローンの菌糸状埋没物(mycelial implants)
を継代培養することにより確認される。
【0054】この培地で成長するクローンのみが、セク
ション1.1)に記載された方法に準じて胞子形成され
る。得られた分生子胞子(conidiospores)は、少なくと
も15%のグリセロールを含有する緩衝液中に大量に採
取し、−80℃で保存した。 第6表 培地Dの組成
ショ糖 250 g/l グルコース 20 g/l チアミン 2 g/l アスパラギン 100 mg/l 麦芽抽出物 0.2 g/l 寒天 20 g/l 生理食塩水1(組成は第2表に明記) 62.5 ml 1NHClまたはNaOHを用いてpH調整110℃で3
0分間高圧滅菌次いで60℃に冷却した培地に1mg/l
のベンレート添加 第7表 培地Cの組成 培地D 750 ml/l STC10緩衝液 250 ml/l (0.8Mソルビトール、100mMトリス塩酸pH7.5、10mM CaCl2 から成る) pH6.0に調整 60℃で高圧滅菌した培地に1mg/lのベンレート添加
【0055】一方でプラスミドp472およびプラスミ
ドpBT3と、並びに他方でプラスミドpEp1およびプ
ラスミドpBT3を用いた、プロトプラストとの同時形
質転換 フラグメントA(セクション1参照)を含有するプラスミ
ドp472も、フラグメントC(セクション3参照)を含
有するプラスミドpEp1も、優性選択標識は持たない。
C.パラシチカ(C.parasitica)SEBR103株は、
上述のサブセクションに記載されたのと同じ手順に従っ
て以下のプラスミド混合物と同時形質転換した。4μg
のpEp1および1μgのpBT3、4μgのp472および
1μgのpBT3。それにより得られた形質転換体は、プ
ラスミドpEp1およびpBT3で同時形質転換したもの
は30Pn、並びにプラスミドp472およびpBT3で
同時形質転換したものは31Pnと称し、nは検討中のク
ローンの番号を表示する。
【0056】セクション7:エンドチアペプシンを過産
生する形質転換株の選択 1) 一般法 a) カゼイン含有寒天培地上の選択 約100のベノミル抵抗性コロニーの菌糸状埋没物(myc
elial implants)は、カゼイン含有寒天培地上で継代培
養する。この培地は培地Eと称し、その組成は以下の第
8表に明示する。この培地では、プロテアーゼを産生す
るクリフォネクトリア・パラシチカ(Cryphonectria p
arasitica)コロニーは塩沈殿を増加させ、その面積はエ
ンドチアペプシン分泌量に比例する。過産生株は塩沈殿
の直径の、コロニーの直径に対する比率に基づいて選択
され、その比率は形質転換していない対照株の比率より
も有意に高い。これらの過産生株の分生子胞子(conidio
spores)の調製は、セクション1.1)で用いた方法に準
じて行う。さらに、アスパラギン酸プロテアーゼを特異
的な阻害する物質であるペプスタチン5μg/mlを培地
Eに添加することにより、過産生株で観察される塩の増
加が減少することが立証された。この結果は、観察され
た効果が全くアスパラギン酸プロテアーゼの過産生に寄
与するものであることを示している。
【0057】b) 液体培地での選択 α) フラスコでの検討 この結果を確認するために、以下の方法:組成は以下に
明記する培地F40mlを含む250mlフラスコに接種す
ることにより、フラスコ中の産生試験を実施した。フラ
スコは220ppm48時間に調整した偏心回転攪拌器中
28℃でインキュベートする。各々の株について、3個
の別個のフラスコで培養を行い、3個のフラスコの凝集
活性の検定結果の平均を算出した。形質転換していない
クリフォネクトリア・パラシチカ(Cryphonectria par
asitica)SEBR103株を対照とする。凝集活性の検
定は、ジャーナル・オフィシェル・デ・ラ・レパブリー
ク・フランセーズ(オフィシャル・ジャーナル・オブ・
ザ・フレンチ・リパブリック)Journal Official de
la Republiqne Fransaise(Official Journal
of the French Republic)1981年3月20日
(セクションC)で公けにされている凝固溶液の酵素含量
の公的な検定方法に準じて行い、それを以下に要約す
る: −凝固時間が5−10分になるように水で希釈した培養
上清1mlに標準化ミルク(INRAより入手−エクスペ
リメンタル・デイリー・ステーション−3980 0ポ
リグニー)10mlを加え、適当なビンに入れる; −30℃の水浴中で回転した時、ビンの壁にミルクの凝
固が認められることによって確認される凝固時間を測定
する; −凝固活性はCAと表示し、mg/lで表し、以下の式に
より得られる: CA=(K/T−a)×α Kおよびa因子はミルクおよび検討中の酵素により変化
する(各々mgs/lおよびsで表す) T:凝固時間(秒で表す) α:希釈因子
【0058】β) 発酵器条件下での検討 エンドチアペプシンの産生は、120℃で45分間高圧
滅菌により無菌化した、培地Fを濃縮して得られる培養
培地1.2lを含有する2−1発酵器(ビオラファイト)
中で検定した。培養条件は以下のとおりである:800r
pmで振とう;通気:2vvm(vvm:分あたりの培地容量あたり
の空気容量)。発酵器は5%(容量/容量)の比率で上述
(α)のフラスコ前培養で接種する。温度は28℃を維持
する。凝固活性の測定は、上述の検定方法に従って約9
0時間発酵させた後に行う。
【0059】培養物の乾燥重量を決定することにより、
形質転換体の過産生により産生する生物量は、対照株が
産生したものとは有意には異ならないことが立証され
る。 第8表 培地Eの組成 KH2PO4 0.36 g/l Na2HPO4・2H2O 0.71 g/l MgSO4・7H2O 0.50 g/l NaCl 0.10 g/l カゼイン加水分解物 0.05 g/l (ディフコ、カスアミノ酸) カゼイン(ハンマーステン) 6.0 g/l CaCl2 0.06 g/l 生理食塩水2 10 ml/l (組成は実施例2の第2表に明記) 泡を形成しないように15分間攪拌。寒天15g(ディフ
コ、バクト寒天)を添加。1NHClまたは1N NaO
Hを用いてpH6.1に調整。120℃で20分間高圧
滅菌。
【0060】 コットンシードミール 10 g/l グルコース 35 g/l Ca(OH3)2 3.5 g/l CaCO3 0.75 g/l リンシード油 2.5 ml/l オレイン酸ナトリウム 1.5 g/l 1N HClまたは1N NaOHを用いてpH6.20
に調整。120℃で45分間高圧滅菌。
【0061】形質転換体により分泌される酵素の分析 発酵は、(フラスコまたは発酵器中)培養した過産生形
質転換体および形質転換していないC.パラシチカ
(C.parasitica)の対照株SEBR103を遠心に供
し、菌糸体ペレットを除去した後に得られる。SDSの
存在下100℃で5分間上清中のタンパクを変性した
後、SDSの存在下ポリアクリルアミドゲルで電気泳動
した。コマシー・ブルーで染色した後、36kDaの分子
質量の部分に主なバンドが観察され、これは、その配列
(第1図参照)から導き出される成熟エンドチアペプシン
の分子質量に相当し、過産生形質転換体の場合は、対照
株の場合よりも強く染色され、過産生形質転換体および
対照株で一致するバンドはあまり重要でない。さらに、
過産生形質転換体と形質転換していない対照株の培養上
清における抗原−抗体反応(レネテストキット、フラン
ス・バイオケム)により、ジャーナル・オフィシェル・
デ・ラ・レプリーク・フランセーズ(オフィシャル・ジ
ャーナル・オブ・ザ・フランス・リパブリック(Journa
l Official de la Republiqne Fransaise(Off
icial Journal of the French Republic)19
81年3月20日で報告された同定法に準じ、分泌酵素
はクリフォネクトリア・パラシチカ(Cryphonectria p
arasitica)の酵素と同一であることが立証された。
【0062】さらに、分泌酵素のタンパク分解活性に対
する凝固活性の比率を検定した。凝固活性はg/lで表
し、上述のサブセクションb)α)に記載された方法に準
じて測定する;タンパク分解活性はリットルあたりのグ
リシンのミリ当量として表現し、R.フィールズ、ザ・
バイオケミカル・ジャーナル(the Biochemical Jou
rnal)124巻518−590頁(1971年)で報告さ
れたTNBS試薬を用い、ジメチルカゼインのタンパク
分解後に現れるアミノ基を検定することにより測定す
る。この比率は過産生形質転換体では0.045と0.
050の間であり、形質転換していない対照株の値と非
常に近接している。これらの3研究よりエンドチアペプ
シン産生は、過産生形質転換体で特異的に増加するとい
う特徴があると結論づけることができる。
【0063】c) サザンブロッティングによる、フラグ
メントA、BまたはCの組み込みの立証 選択された形質転換体のゲノムDNAは、リーダーおよ
びブロダ、レターズ・イン・アプライド・ミクロバイオ
ロジー(Letters in Applied Microbiology)1巻
17−20頁(1965年)に報告されたのと同じ手順に
従って調製し、この手順は以下に要約する:セクション
1.1)に記載されたとおりに実施したフラスコ培養に
由来する菌糸体を凍結乾燥し、カーゼで濾過する。20
mM EDTA溶液pH8ですすいだ後、菌糸体を再び濾
過し、−80℃で凍結し凍結乾燥する。得られた凍結乾
燥物50mgをすり砕き、その後以下の抽出緩衝液:20
0mMトリス塩酸pH8.5、250mM NaCl、25m
M EDTA、0.5%SDS、200μg/mlプロテ
ィナーゼK(シグマ)、500μlに再懸濁する。混合物
は45℃で45分間インキュベートし、DNAをフェノ
ール/クロロホルムで抽出し、次いでイソプロパノール
で沈殿させる。ペレットをTE(10mM トリス塩酸p
H8、1mM EDTA)100μlに採る。DNAを適
当なエンドヌクレアーゼで消化し、得られたフラグメン
トを0.8%アガロースゲル上で電気泳動して分離す
る。フラグメントは、製造業者により推挙される方法従
って、毛細管でナイロン膜(ハイボンN+−アメルシャ
ム)上に移す。濾過膜は、フラグメントAおよびプラス
ミドpBT3のニューロスポラ(Neurospora)のβ−チュ
ーブリンの変異遺伝子を含むフラグメントAおよびHin
dIII−HindIIIフラグメントを用いて42℃で一
晩連続的にバイブリダイズする。これらのフラグメント
は、西洋ワサビペルオキシダーゼ(アメルシャム)で標識
し、“遺伝子検出システム“ECL化学蛍光プローブキ
ット(RPN2101、アメルシャム)で暴露される。得
られたハイブリダイズした信号は、適当なフィルム上で
可視化する。
【0064】2) 29Pn形質転換体(フラグメントB
を持つコスミドp8H12を含む−セクション4参照)の
中からの過産生体の選択 コスミドp8H12およびプラスミドpBT3とで同時形
質転換している間に、ベノミル抵抗性クローン164個
得られた。その中から無作為に127個のクローンを選
び、カゼイン含有寒天培地で選択試験を行い、14のク
ローンを採用することができた。その中から無作為に選
んだ7個を、液体培地中の選択試験に供した。それによ
り3個のクローンが採用された;これらのクローン29
P1、29P2および29P3は、フラスコ培養後、各
々0.9、1.07および0.94g/lの凝固活性を有
し、一方、形質転換していない対照株は、0.62g/l
の活性を有する(過産生ファクター、すなわち過産生株
の凝固活性の、対照株の凝固活性に対する比率は、従っ
て、各々1.45、1.73、および1.54であ
る)。クローン29P2および29P3は、次に2−1
発酵器中で試験を行い、凝固活性は各々1.76および
2.19g/lであり、対照株では1.20g/lであった
(過産生ファクターは従って+1.47および+1.8
3である)。
【0065】クローン29P3およびC.パラシチカ
(C.parasitica)の対照株SEBR103を、実験条件
とりわけ振とう、通気およびバルク移動に関してをあま
り限定しないで、工業的な方法で用いられる条件に近づ
けて20−1培養器中で培養した。この試験により、対
照株により産生される量の約2倍の量に等しいエンドチ
アペプシンを得ることができた。上記無作為に選ばれた
7個のクローンをサザンブロッティングにより分析し
た。これらのゲノムDNAと、非形質転換C.パラシチ
カ(C.parasitica)の対照株SEBR103のゲノムD
NAを酵素SmaIで消化し、これによりコスミドp8H
12中の2か所でのみ開裂し、フラグメントAでは開裂
しない。フラグメントAとハイブリダイズすると、クロ
ーン29P1、29P2および29P3について、2本
のハイブリダイゼーションでできたバンドが観察され、
対照株および液体培地中での選択試験の後で採用されな
かったその他のクローンについて観察された1本のハイ
ブリダイズでできたバンドは、上述の2本のバンドの1
つに大きさが同じである。3個の過産生クローン29P
1、29P2および29P3はコスミドp8H12の複
製をそのゲノムと異なる遺伝子座で組み込み、それ故、
観察される余分なバンドは大きさが異なる。最終的に、
上記で得られたサザンブロットはベノミル抵抗性を有す
るプラスミドpBT3のHidnIIIフラグメントでハイ
ブリダイズした。これにより以下のことを確立すること
ができた;7個のベノミル抵抗性クローンは全て、少な
くとも1個のプラスミドpBT3の複製を受けとること
ができる。というのはこれらは対照株と比べてさらに数
本のハイブリダイズによるバンドを示し、対照株は内因
性β−チューブリン遺伝子(βチューブリンは線状菌、
とりわけニューロスポラ・クラサ(Neurospora crass
a)およびC.パラシチカ(C.parasitica)に存在する構
造タンパクである)対応する1本のバンドしか示さな
い。
【0066】これらの結果は、フラグメントBがエンド
チアペプシンの発現(および分泌)に必要な信号を含んで
いることを示す。従ってこれがエンドチアペプシンの機
能的遺伝子、すなわちエンドチアペプシン前駆体をコー
ドし、機能的プロモーターおよび機能的ターミネーター
によってフランクされた配列を含む。この機能的プロモ
ーターは、フラグメントA(セクション1参照)に局在す
るTATAボックスの上流に位置する活性化部位から成
る。このフラグメントをさらに複製したものをC.パラ
シチカ(C.parasitica)SEBR103株のゲノム、形
質転換により加えると、2の部分のファクターを持った
エンドチアペプシンを過産生する形質転換株を得ること
ができるようになる。
【0067】3) 30Pn形質転換体(フラグメントC
を運ぶプラスミドpEp1を含有する:セクション6参照)
の中からの過産生体の選択 プラスミドpEp1およびプラスミドpBT3で同時形質
転換している間に、663個のベノミル抵抗性コロニー
が得られた。その中から、カゼイン含有寒天培地中で行
う選択試験のために108個のクローンが無作為に選ば
れ、32個のクローンが採用された。この試験により、
29Pn形質転換体から得られるよりも(14/127)
32Pn形質転換体からの方が著しく高値の過産生体(3
2/108)を採用することができることは注目される
であろう。このことは、約13.4−kbのプラスミドp
Ep1で得られる同時形質転換の頻度が、約40.6−k
bのコスミドp8H12で得られるものよりも高いことを
示している。これらの32個のクローンの中から、12
個のクローンを無作為に選び、液体培地中での選択試験
に供した。それにより7個のクローンが採用された:ク
ローン30P1、30P2、30P3、30P4、30
P5、30P6および30P7であり、これらはフラス
コ培養の後、凝固活性が各々1.12、1.06、0.
96、1.12、1.05、0.88および0.90g
/lであり、一方、形質転換していない対照株では活性
は0.62g/lであった(従って、過産生ファクターは
+1.42と+1.81の間である)。次にクローン3
0P1、30P2および30P5を2−1発酵器中で試
験し、各々3.05、3.0および3.04g/lの凝固
活性が得られ、対照株では1.20g/lにしかならなか
った(従って過産生ファクターは各々+2.54、+
2.50および+2.53である)。恐らく(上記2参
照)20−1発酵器の試験を実験条件を制限しないで行
うと、過産生ファクターを約3に達することができるで
あろう。
【0068】上記で無作為に選択した7個のクローンを
サザンブロッティングで分析した。これらのゲノムDN
Aおよび形質転換していないC.パラシチカ(C.paras
itica)対照株SEBR103のゲノムDNAを酵素Sac
Iで消化した。この酵素はプラスミドpEp1で1か所で
しか開裂しないので選ばれた。この開裂部位はフラグメ
ントAの外側でフラグメントC(第4図参照)に局在す
る。フラグメントAで7個のクローンの各々をハイブリ
ダイズした後、少なくとも2本のハイブリダイズによる
バンド(クローンに依り2−4本)が観察されたが、対照
株にも存在する内因性エンドチアペプシンのバンドも含
み、プロフィールは各クローンにより異なっている。3
0P1、30P2および30P5のクローンでは直線状
プラスミドpEp1のバンドと大きさが同じであるハイブ
リダイズによるバンドがバンド間に観察され、このこと
はプラスミドのさらに少なくとも2個の複製が直列に組
み込まれている可能性を示唆している。
【0069】線状菌では形質転換の後、プラスミドのい
くつかの複製が直列に組み込まれることが通常的におこ
り(フィンチャムJ.R.S.、マイクロバイオロジカ
ル・レビューズ(Microbiological Reviews)148−
170頁(1989年3月))、プラスミドがそれより組
み込まれるゲノムDNAを、このプラスミドを1箇所で
しか開裂しないエンドヌクレアーゼで消化すると、この
プラスミドを遊離することが、実際には当業者間では周
知である。これらの結果により、フラグメントCがエン
ドチアペプシンの発現(および分泌)に必要な全ての信号
を含むことが示唆される。従ってこれはエンドチアペプ
シンの機能的遺伝子および完全な機能的プロモーターを
含む。プロモーター活性化部位は、故にフラグメントC
に位置する。このフラグメントの複製を少なくともさら
に2個、C.ポアラシチカ(C.poarasitica)SEBR
103株のゲノムに加えると、3の領域中にファクター
を有するエンドチアペプシンを過産生する形質転換株を
得ることができる。
【0070】4) 31Pn形質転換体(フラグメントA
を持つプラスミドp472を含む:セクション6参照)の
中からの過産生体の選択 プラスミドp472およびプラスミドpBT3で同時形質
転換している間に、ベノミル抵抗性コロニーが840個
得られた。カゼイン含有寒天培地での選択試験のため
に、108のクローンを無作為に選んだ。上述の29P
nおよび30Pnの同時形質転換で得られた結果と対照的
に、過産生体は検出されなかった。それにもかかわら
ず、形質転換していない対照株よりも有意ではないが多
い加水分解塩ができるものの中から選んだ5個のクロー
ン30P1、30P2、30P3、30P4および30
P5を液体培地中で選択試験に供した。上述のクローン
はフラスコ培養後、凝固活性が各々0.38、0.6
6、0.66、0.56および0.65g/lであり、一
方対照株の活性は0.62g/lである(従ってディフェ
レンス・ファウンド(difference found)は−38、+
6、+6、−22および+4%である)。液体培地中で
のこの試験では、有意な過産生は検出されず、カゼイン
寒天培地中の選択試験で陰性の結果が確認された。
【0071】サザンブロッティングにより分析すると、
5個のクローンはプラスミドpBT3の複製を少なくと
も1個組み入れたことが示されたが、5個のうち3個の
クローンはプラスミドpBT3およびプラスミドp472
により真正に同時形質転換される。プラスミドp472
に含まれるフラグメントAをさらに複製したものを加え
ても、エンドチアペプシンの過産生は引きおこさない。
このことは、エンドチアペプシンの発現に不可欠なDN
A配列がこのフラグメントでは欠如していることを示唆
している。従ってフラグメントAはエンドチアペプシン
の機能的遺伝子を含まず、フラグメントAでは、それを
機能的にするのに必要なプロモーターの上流にある活性
化部位が欠如していることが確認されるセクション1−
7参照)。プロモーターの上流にある活性化部位は、フ
ラグメントCの、5'末端(BamHI部位)およびフラグ
メントCに含まれるフラグメントAの5'末端(HindI
II部位)の間に位置する。
【0072】この活性化部位の厳密な位置は、フラグメ
ントAの5'末端並びにフラグメントAの5'末端および
フラグメントCの5'末端の間に位置するヌクレオチド
に接しているフラグメントCの一部分の大きさの異なる
セグメントを、5'末端でフランクしたフラグメントA
から成るフラグメントCの一連のセグメントを得(たと
えばエンドヌクレアーゼまたはエクソヌクレアーゼを用
いて消化して調製する)、これらの切片でクリフォネク
トリア・パラシチカ(Cryphonectria parasitica)SE
BR103を形質転換し、組み換えプロテアーゼを発現
する形質転換体を選択することにより、さらに正確に決
定することができる。このようなフラグメントCの切片
の例は、フラグメントDおよびFであり、これの調製に
ついてはセクション4および5に記載する。
【0073】セクション8:エンドチアペプシンを過産
生する形質転換体の精製方法(選択標識の除去)および連
続形質転換によるエンドチアペプシンの遺伝子コードの
増幅方法 1) 背景 菌細胞は、一般的に同じ遺伝物質を含有するいくつかの
核を包含することが知られている(とりわけ、フィンシ
ャムJ.R.S.、マイクロバイオロジカル・レビュー
ズ(Microbiological Reviews148−170頁(19
89年3月)参照)。細胞壁を酵素で消化した後得られる
プロトプラストは無核(再生不可)、単核または多核にな
る。後者を形質転換すると、形質転換された核を含むヘ
テロカオリン型の形質転換細胞を得ることができ、その
細胞では異なる種類の核(組み込み方法および組み込む
物質に依存し、変化し得る)および形質転換していない
核が充当される。C.パラシチカ(C.parasitica)の場
合、分生子胞子(cinidiospores)は単核である(プハラ
J.E.ら、フィトパソロジー(Phytopathology)61
巻169−173頁(1971年))。以下に記載された
研究は、興味のある組み換えDNAのみを含有し、選択
標識は含有しない鎖を構築するために、菌類細胞のこれ
らの特徴を用いたものである。
【0074】2) ベノミル感受性過産生体を試験する
目的のための形質転換体29P3の精製(選択標識の除
去); 最初のエンドチアペプシン29P3の過産生転換体の分
生子胞子の調製物[セクション1.1)およびセクション
7.2)参照]は、単離コロニーを得るために十分希釈
し、寒天培地に寒天20g/lを加えて作られる培地B
(上記の第2表参照)を含有するペトリ皿に接種するため
に用いた。30℃で5日間インキュベートした後、50
コロニーの菌糸埋没物を同じ寒天培地Bおよびそれにベ
ンレート(50%ベノミル含有)1μg/mlを添加した培
地とで平行して前培養した。30℃で5日間インキュベ
ートした後、寒天培地Bでは6個のクローンが正常な成
長を示し、ベンレートを添加した寒天培地では全く成長
が認められない。これらの6個のベノミル感受性クロー
ンは、各々1個の胞子の発芽に由来するものであり、ホ
モカオリン型であるので純粋である。6個のクローンお
よび最初の形質転換体29P3は、カゼイン含有寒天培
地でエンドチアペプシンの過産生の選択試験に供した
[セクション7.1)a)参照].これにより、29P3ben
Sと称するベノミル感受性クローンが選択でき、そのク
ローンが過産生を示すが、最初の形質転換体と有意差は
ない。クローン29P3benS、クローン29P3および
C.パラシチカ(C.parasitica)対象株SEBR103
を胞子形成後、液体培地での選択試験に供した。クロー
ン29P3および29P3benSは同等の凝固活性を有す
る(実験誤差の範囲を考慮に入れる)が、対照株の活性よ
りは著しく大きい。さらに、これらの2個のクローンお
よび対照株でサザンブロッティング行なったが、これら
のゲノムDNAをエンドヌクレアーゼSmaIで消化した
後、2個のクローンの各々はプローブとしてのフラグメ
ントAとのハイブリダイゼーションプロフィールを有
し、このプロフィールは対照と比較すると余分なバンド
を有する(セクション7.2)参照)。これは、両者のク
ローンで、エンドチアペプシンの機能的遺伝子の組み込
みが同じであり、ベノミル抵抗性を有するプラスミドp
BT3のHindIII−HindIIIフラグメントによる
ハイブリダイズのプロフィールは異なり(セクション6
参照)、最初の形質転換体29P3をこのフラグメント
でハイブリダイズすると数本のバンドが示され、クロー
ン29P3benSおよび対照株もハイブリダイズすると同
じ大きさのバンドが認められる(β−チューブリンの内
因性遺伝子に相当)。これらの結果は、精製方法により
(遺伝子型に関して)純粋で、選択標識(ベノミル抵抗性
を有する遺伝子)を欠いた形質転換体を得ることがで
き、エンドチアペプシン過産生という特徴は、クローン
29P3benSに安定して組み込まれており、それは単核
分生子胞子(conidiospore)の発芽に由来し全ての菌糸細
胞はDNAにコスミドp8H12を組み込んだ核を保有
するためである。
【0075】3) 増幅: クローン29P3benSより調製したプロトプラストは、
セクション6に記載された手順に従ってプラスミドpB
T3で形質転換した。400のベノミル−抵抗性クロー
ンが、プラスミドDNA1μgにつき得られた。従っ
て、エンドチアペプシンの機能的遺伝子を含有するコス
ミドおよび選択標識を含むプラスミドで同時形質転換す
ると、エンドチアペプシンを過産生し、選択標識を欠
き、再び形質転換する能力のある形質転換体を得ること
が可能である。故に、上記の2個のベクターを用いた同
時形質転換の段階、次に選択標識を除去できる精製段階
から成るいくつかの連続したサイクルを行うことによ
り、C.パラシチカ(C.parasitica)のエンドチアペプ
シン前駆体をコードする遺伝子を選択的に増幅すること
が可能である。
【0076】セクション9:C.パラシチカ(C.parasi
tica)SEBR103形質転換後のエンドチアペプシン
産生欠失株の試験 C.パラシチカ(C.parasitica)SEBR103株をコ
スミドp8H12およびプラスミドpBT3で同時形質転
換(セクション6参照)した後に得られたベノミル抵抗性
クローンを完全分析すると、カゼイン含有寒天倍地E上
で加水分解の塩を産生しないクローンを得ることができ
た。このクローンはセクション8記載の方法により精製
し、加水分解の塩を産生しないベノミル感受性クローン
を多く得た。29P(end−)と称する1個のクローン
を、これらのベノミル感受性クローンの中から無作為に
選んだ。フラスコ培養の後、クローン29P(end−)の
凝固活性は0.01g/l以下であり、一方形質転換して
いないクリホォネクトリア・パラシチカ(Cryphonectri
a parasitica)対照株SEBR103の凝固活性は0.
62g/l(産生において観察される差は従って98%以
上である)であった。さらに、このクローンの形態学的
および生理学的特徴は、C.パラシチカ(C.parasitic
a)SEBR103株の特徴に相応して変えられる。
【0077】クローン29P(end−)のゲノムDNAお
よび対照株SEBR103のサザンブロット分析を、一
方ではフラグメントAと、もう一方ではプラスミドpB
T3のベノミル抵抗性遺伝子を含有するフラグメントで
ハイブリダイズした後に行ったが、差異は認められなか
った。これらの結果は、C.パラシチカ(C.parasitic
a)株をコスミドp8H12およびプラスミドpBT3で同
時形質転換すると、選択され精製されたクローン29P
(end−)はエンドチアペプシン産生を欠失することを示
唆する。当業者では、エンドチアペプシン産生を欠失す
る形質転換体は、C.パラシチカ(C.parasitica)SE
BR103を、選択標識たとえばプラスミドpBT3、
およびたとえばコード配列の一部を欠失することにより
非機能的にしたプレプロエンドチアペプシン遺伝子を含
有するDNAで同時形質転換し、次いでカゼインの加水
分解塩を産生しないベノミル抵抗性形質転換体を選択し
て得られるということは明白であると解されている。こ
のような非機能的遺伝子を運ぶDNAは、pEp1プラス
ミドのDNAを直線状にし、たとえばScaIおよびSfi
Iで二重消化し、次いで大きなフラグメントを0.8%
アガロースゲルで電気泳動して精製し、最後にこのフラ
グメントの末端を4つのデオキシリボヌクレオチドトリ
フォスファターゼdNTPの存在下クレノウポリメラー
ゼで処理してベクターを再連結させ、それによりエンド
チアペプシンの非機能的遺伝子を運ぶプラスミドを得る
ようにして容易に得ることができる。
【0078】セクション10:エンドチアペプシンの生
産せず、優性選択マーカーを欠く、SEBR3700株
の構築。 1)エンドチアペプシンをコードする配列が2個の翻訳
停止コドンにより中断されているフラグメント(フラグ
メントEMと称す)の構築。 エンドチアペプシン前駆体をコードする配列の始めに、
翻訳の停止を引き起こす突然変異を導入した。その結
果、エンドチアペプシンはこれらの突然変異が加えられ
たメッセンジャーRNAからはもはや生産されなくな
る。エンドチアペプシンのフラグメントAは約360bp
(塩基対)HindIII−BstEIIフラグメント(第2図参照)
を含み、BstEII部位は暗号化配列の始まりから25bp
下流に位置している。問題の天然配列は次の通りであ
る。
【化18】 下線部のATGトリプレットは、暗号化フレームを開く
コドンを表す。BstEII部位は垂線により示されてい
る。
【0079】所望の突然変異配列は次の通りである。
【化19】 この配列は、一方は第5および第6コドン間、他方は第
6コドン内(第2および第3塩基間)である、2Tの導入
の点で天然配列とは相異する。これらの導入の結果、エ
ンドチアペプシン遺伝子の解読枠を停める2つの停止コ
ドンが作成される。これら2つの修飾のみが野生型配列
とは異なるHindIII−BstEIIフラグメントは、プライ
マーの一方について所望の突然変異を有するオリゴヌク
レオチドを用いて、セクション15記載のPCR増幅技
術により得られた。オリゴヌクレオチド1は下記配列を
有する。
【化20】 この配列は、HindIII−BstEIIフラグメントのHindI
II末端に見出される。HindIII部位は垂線により示され
ている。オリゴヌクレオチド2は下記配列を有する。
【化21】 このオリゴヌクレオチドは、所望の突然変異配列に相補
的である。天然BstEII部位に近接するBamHI部位は
それに結合されている。下線部のヌクレオチドは、相補
鎖上に停止コドンを作成する付加配列に対応する。
【0080】鋳型として使用されるDNAは、セクショ
ン1記載のプラスミドp472のDNAである。増幅混
合物は、300ng(3μlに等しい)のp472 DNA、
100ng(1μlに等しい)の各オリゴヌクレオチド、5
μlの10倍濃縮緩衝液bipv2、40μlの水、2単位
(0.5μlに等しい)の酵素Taqポリメラーゼを含む。1
0倍濃縮緩衝液bipv2は次の組成を有する:670ミリ
モルのトリス−HCl(pH8.8)、165ミリモルの硫
酸アンモニウム、10ミリモルの2−メルカプトエタノ
ール、ゼラチン2mg/ml、トリトンX−100(1.5
%)、67マイクロモルのEDTA、20ミリモルのMg
Cl2、2ミリモルのdATP、2ミリモルのdCTP、2
ミリモルのdGTP、2ミリモルのdTTP。
【0081】3つの増幅試験は平行して行なわれる。1
5の増幅サイクルが遂行され、各サイクルは92℃で1
分の変性、55℃で1分のハイブリダイゼーションおよ
び72℃で1分の伸長に分けられる。PCR増幅後、2
本の管を1本のエッペンドルフ管で合わせ、0.3モル
酢酸アンモニウムを含む2倍容量の無水エタノールによ
り沈澱させ(0℃で20分間)、次いで、10000gで
遠心分離(20分間)する。沈澱物を70%エタノールで
洗浄し、次いで10分間真空乾燥する。DNAを60μ
lのTE溶液(10ミリモルのトリス−HCl、pH7.
5、1ミリモルのEDTA)に吸収させ、アガロース・
ゲルで分析する。360bpフラグメントに対応する帯を
ゲルから溶離し、精製し、これらの酵素の作用後、Hin
dIIIおよびBamHI部位間におけるファージM13の複
製形態(M13mp19)へクローン化する。
【0082】こうしてクローン化されたフラグメントを
1本鎖フラグメントから配列決定し、この配列が、予想
された点に突然変異が存在するフラグメントには事実上
対応しないことが証明された。セクション1記載の約
2.1kbフラグメントAは2つのHindIII部位により結
合され、一端から360塩基対の場所に位置する単一B
stEII部位を有する。この故、単一BstEII部位はフラ
グメントAの2つのセグメントを結合する。短い方は、
PCR増幅に付された配列に対応する。フラグメントA
の大きなBstEII−HindIIIセグメントおよび小さい突
然変異HindIII−BstEIIセグメントを製造し、HindI
IIによるpBR322切断で全体をライゲーションする
ことにより、2つの突然変異を有するフラグメントA
(フラグメントA−Mと称す)が再形成される。フラグメ
ントA−Mは、このフラグメントに特有なPstI部位を
有する。この故、このPstI部位は、二重突然変異を有
する約1.67kbのHindIII−PstIセグメントを含
む、フラグメントA−Mの2つのセグメントを結合す
る。
【0083】セクション5記載のプラスミドpEp3は、
約3.7kbのSphIフラグメント(フラグメントEと称
す)がクローン化されたpUCプラスミドから誘導され
る。この3.7kbフラグメントは、サブフラグメントと
してフラグメントAを含む。このフラグメントAは、次
の方法でフラグメントA−Mと置き換えられた。プラス
ミドpEp3bを、一方は酵素ScaIおよびPstIおよび
他方は酵素ScaIおよびHindIIIにより両方とも消化し
た。第1消化により、約2.250kbのScaI−PstI
フラグメントが単離された。第2消化により、約2.4
2kbのScaI−HindIIIフラグメントが単離された。二
重突然変異をもつ1.67kbのHindIII−PstIセグメ
ントによりこれら2つのフラグメントをライゲーション
すると、二重突然変異のみがpEP3bとは異なるpEpM
3bと称する新しいプラスミドが得られる。二重突然変
異を有するSphIフラグメント(フラグメントE−Mと
称す)は、pEpM3bのSphI消化、次いで0.8%アガ
ロース・ゲルでの2つのDNAフラグメントの分離およ
び20μlのTE溶液中における突然変異3.7kbフラグ
メントの抽出により製造された。
【0084】2)フラグメントEMおよびテロマー配列
によりフランクされたベノミル耐性遺伝子をもつSfiI
フラグメントによるクリホネクトリア・パラシティカ
(Cryphonectria parasitica)の同時形質転換。 精製フラグメントEMは、SfiIにより消化されたプラ
スミドp578.12のDNAによる同時形質転換で使用
された。プラスミドp578.12は、既に記載したプラ
スミドpBT3の誘導体である。pBT3のDNAをエン
ドヌクレアーゼXhaIにより線形化し、両端をクレノウ
DNAポリメラーゼによりブラント化した。それに、ポ
リメラーゼにより修復し、BamHI部位をSfiIと置き
換えるべく修飾された、ペロ、バリューおよびベゲレ、
Mol.Cel.Biol.、1987(7)、1725−17
30頁に記載されたプラスミドpPATuraに由来するテ
トラヒメナ(Tetrahymena)のテロマー配列を含むXhaI
フラグメントを組み込んだ。SfiIによるp578.12
の消化により、ベノミル耐性遺伝子をもち、その両端の
各々でテロマー配列により終結する線形フラグメントが
解離される。ペロ等(上記参考文献)は、かかるフラグメ
ントが、糸状菌ポドスポラ・アンセリナ(Podospora an
serina)において線形プラスミドの状態(染色体に組み込
まれていない)で維持され得ることを示した。さらに、
ポーウェルおよびキツラー(「ジャーナル・オブ・バクテ
リオロジー」(J.Bacteriology)、1990、172
巻、3163−3171頁)は、テロマー型の反復配列
が、クリホネクトリア・パラシティカ(C.parasitica)
において線形プラスミドの自律複製を可能にすることを
示した。この特性を利用して、線形フラグメントとの同
時形質転換により適当な株を構築した。染色体にベノミ
ル耐性マーカーが組み込まれていない場合、ベノミル感
受性株は、形質転換体の胞子形成後に得られた分生子か
ら非常に高い頻度で回収され得るべきである。
【0085】クリホネクトリア・パラシティカ(Crypho
nectria parasitica)株SEBR103において、各々
プラスミドp578.12のフラグメントE−M約0.5
μg(3μl)およびSfiIフラグメント0.5μg(4μl)
により2つの同時形質転換実験を行った。397のベノ
ミル耐性コロニーが得られた。これらのコロニーのうち
395を、培地E(セクション7参照)で継代培養するこ
とにより、セクション7記載のハローの存在について試
験した。カゼイン凝結のハローをもはや形成しない一コ
ロニーが見出された。コロニーAJ7.72と称するこ
のコロニーを、1セクション記載の方法に従い胞子形成
(分生子形成)培地へ移した。分生子を塊で採取し、発
芽培地で希釈した。分生子形成から誘導された152の
コロニーをカゼイン培地で試験した。それらのうち、凝
結のハローを示したものは無かった。これらのコロニー
のベノミル耐性についても試験した。152のうち58
は、この形質転換特性を喪失していた。58のうちの5
つを取り出した。それらをコロニーAJ7272/A、
コロニーAJ7272/B、コロニーAJ7272/
J、コロニーAJ7272/LおよびコロニーAJ72
72/Mと称した。ゲノムDNAを各コロニーから抽出
し、ハイブリダイゼーション・プロフィールおよびSE
BR103株の場合を、様々な制限酵素を用いたサザー
ン・ブロッティング技術により比較した。フラグメント
A(エンドチアペプシン遺伝子)、pUC18(細菌性配
列)またはネウロスポラ(Neurospora)のベータ-ツブリ
ンにおける遺伝子によりプローブした、SEBR103
株および5つの突然変異体間に差異は見出されなかっ
た。フラグメントAの場合、エンドチアペプシン遺伝子
の配列が現れた。ハイブリダイゼーション・プロフィー
ルは全株とも同じであるため、突然変異体に突然変異フ
ラグメントの「変位的」組換え(すなわち、非相同的組換
え)は存在しないという結論に達し得る。pUC18の場
合、株とは関係無くハイブリダイゼーションは達成され
ず、細菌由来の配列が突然変異体に一切組み込まれてい
ないことを示している。β−ツブリン遺伝子の場合、配
列は全ての株に現れる。これは、非常に高い確率でクリ
ホネクトリア・パラシティカ(C.parasitica)のβ−ツ
ブリンにおける「内在性」遺伝子に対応する。
【0086】コロニーAJ7272から誘導された株が
実際にエンドチアペプシン構造遺伝子で突然変異してい
ることをチェックするため、それらの欠如が形質転換に
より補われ得ることを証明した。上記コロニーの各々
を、プラスミドpBT3およびプラスミドpEP2のDN
Aを伴う同時形質転換用のレセプターとして使用した。
下表は、この方法で得られたベノミル耐性形質転換体の
大多数もまたエンドチアペプシンを生産することを示
す。 株 ベノミル耐性コロニー プロテアーゼ生産性コロニー (カゼインに関する試験) AJ7272/A 2 2 AJ7272/B 8 7 AJ7272/J 13 11 AJ7272/L 17 16 AJ7272/M 10 10 対照: プラスミドpBT3単独による分離体の形質転換
によって、プロテアーゼを生じる形質転換体は得られな
い。アクリルアミド・ゲル電気泳動による培養上清の分
析の結果、突然変異株は、形質転換前には検出可能量の
エンドチアペプシンを生産しないことが確認された。こ
うして、胞子形成後、エンドチアペプシン構造遺伝子に
作用する1つまたはそれ以上の突然変異のみがSEBR
103株とは異なる5つのコロニーを生じるAJ727
2/株を構築した。これらのコロニーの一つを採用し
た。それをSEBR3700と称す。それは、エンドチ
アペプシンの生産に不完全であり、優性選択マーカーを
欠く。
【0087】セクション11:エンドチアペプシンの生
産に不完全なSEBR3700株の補足によるフラグメ
ントDおよびFの機能性の証明。 プラスミドpEp1に含まれるフラグメントCは、エンド
チアペプシンの発現に必要なシグナルを全てもつこと
が、セクション7のサブセクション3において立証され
た。セクション10で得られた、エンドチアペプシンの
生産に不完全なSEBR3700株を用いて、プラスミ
ドpEp2およびpEp4に含まれるフラグメントDおよび
Fの機能性が証明された。 1)プラスミドpEp2およびpBT3によるSEBR37
00株のプロトプラストの形質転換。 プラスミドpEp2は、ベノミル耐性遺伝子およびフラグ
メントDの両方をもつため、形質転換に直接使用され得
る。エンドチアペプシンをコードする遺伝子をもたない
プラスミドpBT3を陰性対照として使用する。約1μg
のプラスミドpEp2および1μgのプラスミドpBT3に
よるSEBR103株(セクション6参照)に関する記載
と同一のプロトコールに従い、SEBR3700株を形
質転換した。
【0088】2)プラスミドpEp1およびpBT3および
プラスミドpEp4およびpBT3によるSEBR370
0株のプロトプラストの同時形質転換。 プラスミドpEp1およびpEp4は、優性選択マーカーを
もたない。プラスミドpEp1を、SEBR3700株の
補足の陽性対照として使用する。SEBR3700株
を、プラスミド混合物:4μgのpEp1および1μgのpB
T3、4μgのpEp4および1μgのpBT3により同時
形質転換した。
【0089】3)エンドチアペプシンを生産する形質転
換体の検出。 上記形質転換および同時形質転換の各々について選択さ
れた幾つかの形質転換体の菌糸体移植物を、培地E、す
なわちカゼインを含む寒天培地において継代培養した。
インキュベーション後、エンドチアペプシンの分泌の沈
澱特性であるハローを示すコロニーが同定された。得ら
れた結果は次の通りである。 −プラスミドpBT3により得られた形質転換体: 沈澱
のハローを与えるクローンは無かった。 −プラスミドpEp1およびpBT3またはプラスミドpE
p4およびpBT3により得られた形質転換体: 約30%
の比率のクローンは沈澱のハローを与えた。 −プラスミドpEp2により得られた形質転換体: 試験さ
れたクローンの92%は沈澱のハローを与えた。 これらの結果は、プラスミドpEp1、pEp2およびpEp
4がエンドチアペプシンの生産に不完全なSEBR37
00株を補足すること、このため、これらのプラスミド
に含まれるフラグメントC、DおよびFは全てエンドチ
アペプシンの機能的プロモーターをもつことを示す。し
かしながら、フラグメントの各々に存在するプロモータ
ーの相対強度は、この定性試験からは誘導され得ない。
これらの結果から、配列がセクション5で決定されたフ
ラグメントFのSphI−HindIIIセグメントは、プレプ
ロエンドチアペプシンをコードする遺伝子のプロモータ
ーの活性化に関与するシグナルを有することが誘導され
得る。
【0090】セクション12:エンドチアペプシンを過
産生し、優性選択マーカーを欠く形質転換体の選択。 1)選択プロトコール プロトコールの相異なる段階を下表に示す。その原理は
次の通りである。セクション6記載のプロトコールと同
一のプロトコールに従って、プラスミドpEp1またはp
Ep2の消化後アガロース・ゲルで予め精製し、バイオ
ラド・ジーン-クリーン・キットの使用説明書に従い抽
出した0.5〜2μgのフラグメントC、DまたはF、お
よび環状または線状形態の選択プラスミドpBT3また
はpBT6、0.5μgから成る混合物を用いて、クリホ
ネクトリア・パラシティカ(C.parasitica)SEBR1
03プロトプラストを同時形質転換する。
【0091】培地Cにおいてプロトプラストの再生後、
得られた形質転換体(「初代形質転換体」と命名する)を、
20g/lの寒天(非選択的培地)を加えることにより寒天
培地に調製された培地Bおよびカゼイン含有寒天培地で
ある培地Eにおいて、適当ならば5μg/mlのペプスタ
チンを補充し、同時に継代培養する。沈澱のハローの直
径対コロニー直径が非形質転換対照株の場合よりも顕著
に高いクローンを、「過産生性初代形質転換体」と命名
し、胞子形成用に調整する。これらの株の分生子標本を
セクション1.1で使用した方法に従い製造し、各分生
子懸濁液の希釈液を培地Gで培養することにより、分離
コロニーが得られる。約50コロニーから生じる菌糸体
移植物を、20g/lの寒天を加えることにより寒天培地
に調製された培地B(適当な場合0.5mg/lのベンレー
トを補充する(ベノミル感受性試験))および培地E(カゼ
イン培地に関する試験)において同時に、各過産生性初
代形質転換体に関して継代培養する。この段階で、ベノ
ミル感受性であり、エンドチアペプシン過産生性である
クローンを、過産生性ベノミル(複数もあり得る)分離体
と命名し、胞子形成用に調整する。次いで、分生子標本
を作成することにより、フラスコ培養後のエンドチアペ
プシンの過産生を証明し、フラグメントAから成るプロ
ーブによるゲノムDNAのハイブリダイゼーションによ
るフラグメントC、DまたはFの1つまたはそれ以上の
コピーの組み込みを証明し、選択プラスミドの全部また
は一部から成るプローブを用いて異種DNAが存在しな
いことをチェックする。これら3つの基準を積極的に満
たす株を過産生性適性株と命名する。次いで、同時形質
転換/選択のさらに別のサイクルをこの過産生性適性株
から遂行することにより、フラグメントC、DまたはF
を再増幅することができる。
【0092】この方法の利点は、興味の対象であるフラ
グメントの増幅により得られるものに加えて、法定規則
の見地からさらに許容性の高い、選択マーカーを欠く形
質転換体を構築することである。
【表3】
【0093】2) フラグメントC、DまたはFおよび
プラスミドpBT3でSEBR103の同時形質転換後
主要選択マーカーを欠く過産生性形質転換体の選択。 下記の表は得られた結果を要約したものである。 同時形質転換 フラグメントF フラグメントC フラグメントD 量 0.5μg 2μg 0.5μg 選択プラスミド 環状 環状 直線状 初代形質転換体 4 137 106 過産生性初代 1 26 33 形質転換体 ベノミル分離体 1 4* 8** 過産生性ベノミル 0 2 7 被分離体 過産生性適性株 0 1 4 フラグメントCでは過産生性該当株は得られなかった。
このことは初代被形質転換体数が低いことを考慮すると
驚くべきことではない。 *12個の過産生性初代被形質転換体の子孫に対して行
った選択 **21個の過産生性初代被形質転換体の子孫に対して
行った選択
【0094】フラグメントDにより得られた過産生性適
性株を2リットル発酵槽中で試験すると、1.9g/lの
凝結活性を生じたが、対照株は1.2g/lの凝結活性し
か生じなかった(この故、過産生性係数は+1.58であ
る)。SEBR3574株のサザーン・ブロッティング
によるゲノムDNAの分析は、それが直列での2コピー
を含め、フラグメントDの少なくとも3つの追加コピー
を組み入れていることを示した。フラグメントFにより
得られた4つの過産生性適性株の中で、SEBR391
2株を2リットル発酵槽中で試験すると、2.4g/lの
凝結活性が生じた(この故、対照株に対する過産生性係
数は+2である)。サザーン・ブロッティングによるゲ
ノムDNAの分析は、それが頭−尾配向に従い直列でフ
ラグメントFの少なくとも5つの追加コピーを組み入れ
ていることを示した。
【0095】得られた過産生性株からは、選択プラスミ
ドの組み込みは全く検出されなかった。従って、これら
の株は、同時形質転換/選択のさらに別のサイクルに付
され得る。さらに、これらの株について観察された過産
生性係数を組み込まれたコピーの推定数と比較すると、
得られた割合は0.2の範囲であり、フラグメントCを
含むプラスミドpEp1の2つの追加コピーが組み込まれ
た30Pn形質転換体の場合約1であることが見出され
た。従って、これは、フラグメントDの5'末端に位置
するBglII部位の上流からBamHI部位までに、エンド
チアペプシン遺伝子の強力な発現に重要な調節配列が存
在することを示唆している。
【0096】セクション13:プラスミドpEMR71
3、すなわち、アスペルギルス・ニデュランス(Asperg
illus nidulans)のグリセルアルデヒド−3−燐酸デヒ
ドロゲナーゼをコードする遺伝子のプロモーター領域を
含むクリホネクトリア・パラシティカ(C.parasitica)
におけるプレプロエンドチアペプシン発現用ベクターの
構築。 プラスミドpAN52(プント等、1987、「ジーン」
(Gene)、56、117−124)は、アンピシリン耐性
をコードする遺伝子およびpUC18の複製開始点に加
えて、アスペルギルス・ニデュランス(Aspergillus ni
dulans)のグリセルアルデヒド−3−燐酸デヒドロゲナ
ーゼ(gpd)をコードする遺伝子のプロモーター領域[プン
ト等、「ジーン」(Gene)、93、(1990)101−1
09]およびtrpC遺伝子のターミネーター領域[ムラニ
ー等、「モレキュラー・アンド・ジェネラル・ジェネテ
ィクス」(Mol.Gen.Genet.)(1985)189、37
−45]を有する。プロモーター領域およびターミネー
ター領域は、制限酵素NcoIおよびMluIにより認識さ
れるヌクレオチド配列を含むDNA配列により分離され
る。これらの配列はプラスミドpAN52に特有のもの
である。NcoI部位の配列、すなわちCCATGGは、
それが大多数の蛋白質における開始コドンであるメチオ
ニンをコードするATGコドンを含むため、特に有用で
ある。この実験の目的は、上記発現シグナルを用いてエ
ンドチアペプシンをコードする遺伝子を発現させること
である。エンドチアペプシンをコードする遺伝子の組み
込みは、下記セクション15で詳述されている、PCR
(ポリメラーゼ連鎖反応)技術により行なわれる。
【0097】1−PCRに使用されるプライマーの記
載。 PCRによる遺伝子増幅により、増幅される配列に修飾
が加えられる。この特性を用いることにより、エンドチ
アペプシンをコードする遺伝子のプレプロ配列の5'末
端にNcoI部位が導入され、エンドチアペプシンをコー
ドする遺伝子の非暗号化3'末端にMluI部位が導入さ
れる。従って、2種のプライマーの配列は次の通りであ
る: −NcoI部位をもつ5'プライマー
【化22】 このプライマーは、主として a)制限酵素NcoIにより認識される配列:CCATGG b)エンドチアペプシンのシグナルペプチドの5'末端の
修飾配列 により構成される。
【0098】この修飾は、メチオニンの後の第1コドン
の変更により構成される。事実、セリンをコードするT
CTコドンは、アラニンをコードするGCTコドンと置
き換えられている。この修飾は、シグナルペプチドの効
力に影響を及ぼさない。−MluI部位をもつ3'プライ
マー
【化23】 このプライマーは、主として a)制限酵素MluIにより認識される配列:ACGCGT b)第2図のヌクレオチド1921および1940間に位
置する配列に相補的な配列である、エンドチアペプシン
の非暗号化3'末端の配列 により構成される。
【0099】2−修飾エンドチアペプシンをコードする
遺伝子を含む増幅フラグメントの製造。 セクション1に記載されている生成物のプラスミドp4
72を鋳型として用いる。 a)PCR反応 予めP10カラムで精製しておいた100ngのプラスミ
ドp472を、100ngの5'プライマー、100ngの
3'プライマー、2ミリモルのMgCl2、0.2ミリモル
のdNTPおよび5μlの10倍濃縮した反応混合物(最
終量:67ミリモルのトリス−HCl(pH8.8)、16.
6ミリモルの(NH4)2SO4、1ミリモルのβ−メルカ
プトエタノール、6.7ミリモルのEDTA、0.15%
のトリトンX−100、200g/mlのゼラチン)と混合
する。次いで、水を加えることにより混合物の容量を5
0μlにする。こうして得られた反応混合物を94℃で
4分間インキュベーションし、次いで50℃の温度に
し、4分間維持する。次いで、2.5単位に等しい0.5
μlのTaqポリメラーゼ(ベーリンガー・マンハイム参照
番号1146−165)を加える。次に、反応混合物を
パラフィンで覆うことにより、水溶液の蒸発を防ぐ。増
幅は18反応サイクル間で行なわれ、その段階は次の通
りである。 92℃で2分間 → 変性 50℃で2分間 → ハイブリダイゼーション 72℃で2分間 → ポリマー化。 18サイクル後、20ミリモルのEDTA溶液を加える
ことにより酵素反応を止める。次いで、約1620bpの
予測されたサイズを有する、こうして増幅されたDNA
フラグメントを単離し、1%アガロース・ゲルで精製
し、P10カラム(ファルマシア)において透析し、次い
で、酵素NcoIおよびMluIにより同時に加水分解す
る。加水分解後、フラグメントをP10カラムで精製す
る。
【0100】b)プラスミドpEMR713の製造。 プラスミドpAN52のDNAを、制限酵素NcoIおよ
びMluIにより加水分解する。gpd遺伝子のプロモータ
ー領域、エシェリヒア・コリの複製開始点、アンピシリ
ン耐性をコードする遺伝子およびtrpCターミネーター
をもつフラグメントを精製する。このフラグメント10
0ngを、DNAリガーゼの存在下、エンドチアペプシン
遺伝子をもつ増幅フラグメント100ngへライゲーショ
ンする(上記サブセクション2参照)。次いで、ライゲー
ション混合物を用いて、RRI株を形質転換する。生成
したプラスミドは、修飾エンドチアペプシンをコードす
る遺伝子がgpdのプロモーター領域およびtrpCのターミ
ネーター領域の制御下に置かれているpEMR713で
ある。
【0101】プロトプラストの製造。 セクション6参照。 プラスミドpEMR713およびプラスミドpBT3によ
るSEBR3700株のプロトプラストの同時形質転
換。 セクション6参照。 得られた約2000の形質転換体は、0.5mg/lのベン
レートを含む寒天培地Bにおいて生育し得る。これは、
これらのコロニーが全て少なくとも1つのプラスミドp
BT3をもつことを示している。
【0102】エンドチアペプシン生産性形質転換株の選
択。 A)一般的方法 a)カゼイン含有寒天培地における選択。 2000ベノミル耐性コロニーの菌糸体移植物を、カゼ
イン含有寒天培地(培地Eと称す)において継代培養す
る。前記培地の組成は、上記表8に詳記されている。こ
の培地において、プロテアーゼを生産するクリホネクト
リア・パラシティカ(Cryphonectria parasitica)コロ
ニーは、面積が分泌されたエンドチアペプシンの量に比
例する沈澱のハロー(halo)を生じる。生産性株は、沈
澱のハローの存在に基づいて採用される。これらの生産
性株の分生子の標本を、セクション1.1)で使用された
方法に従い作成する。さらに、5μg/mlのペプスタス
チンという、アスパラギン酸プロテアーゼを特異的に阻
害する物質を培地Eへ加えることにより、過産生性株で
観察されたハローの増大は縮小されることが証明され
た。この結果は、観察された作用が事実上アスパラギン
酸プロテアーゼの過産生によるものであることを示す。
凝結のハローを生成し得る3つの形質転換体を単離し
た。対照実験は、プラスミドpBT3およびpEMR71
3により形質転換された組換えクローン(クローン1、
クローン2およびクローン3と称す)のハローのサイズ
が、SEBR103株の場合に得られるものと同等であ
ることを示す。
【0103】b)フラスコでの試験による液体培地におけ
る選択。 この結果を確認するため、フラスコでの生産性試験を、
40mlの培地F(7セクション参照)を含む250mlフラ
スコの接種により行った。次いで、フラスコを、48時
間220rpmに調節した偏心回転振動器上28℃でイン
キュベーションする。各株について、3つの異なるフラ
スコで培養を行い、3フラスコに関する凝結活性の検定
結果の平均を計算した。対照は、非形質転換クリホネク
トリア・パラシティカ(Cryphonectriaparasitica)株S
EBR103により構成される。凝結活性の検定は、1
981年3月20日のジュルナル・オフィシエル・ド・
ラ・レプブリク・フランセーズ(Journal Officiel de
la Republique Francaise)(フランス共和国の公式刊行
物)(セクションC)で発表された、凝固溶液の酵素含有
量の公式測定方法(セクション7で要約している)に従い
行なわれる。
【0104】c)クローン1、2および3により分泌され
る酵素の分析。 発酵物は生産性形質転換体の培養後に得られなければな
らず、非形質転換クリホネクトリア・パラシティカ(Cr
yphonectria parasitica)対照株SEBR3700の発
酵物を遠心分離に付すことにより、菌糸体の塊を除去し
た。100℃で5分間SDSの存在下での上清における
蛋白質の変性後、SDSの存在下ポリアクリルアミド・
ゲル電気泳動を行った。クーマシー・ブルーで染色後、
配列から誘導された(第1図参照)、成熟エンドチアペプ
シンの分子質量に対応し、生産性形質転換体の場合にも
対照株の場合と同じ強度を有する、36kDa領域におけ
る分子質量の優勢な帯、および過産生性形質転換体およ
び対照株において同一である重要性の劣る帯が観察され
る。
【0105】さらに、過産生性形質転換体および非形質
転換対照株の培養上清における抗原−抗体反応(レンネ
ッテスト・キット、フランス・バイオケム)によって、
分泌された酵素は、1981年3月20日のジュルナル
・オフィシエル・ド・ラ・レプブリク・フランセーズ
(Journal Officiel de la Republique Francaise)(フ
ランス共和国の公式刊行物)で報告された同定方法に従
い、クリホネクトリア・パラシティカ(Cryphonectria
parasitica)の場合と同一であることが証明された。さ
らに、分泌された酵素の凝結活性対蛋白質分解活性の割
合を評価した。g/lで表される凝結活性は、フィールズ
による「バイオケミカル・ジャーナル」(Biochem.J.)
(1971)124:581−590に記載されたTNB
S試薬を用いて、ジメチルカゼインの蛋白質分解後に現
れたアミノ基を検定することにより測定される。この割
合は、過産生性形質転換体の場合0.040ないし0.0
45であり、非形質転換対照株により得られた値に非常
に近い。これら3つの試験から、エンドチアペプシンは
事実上クローン1、2および3により特異的に生産され
たという結論に達し得る。この実験は、プロモーター領
域および異種ターミネーター領域(クリホネクトリア・
パラシティカに属していない)を用いると、クリホネク
トリア・パラシティカ(C.parasitica)におけるエンド
チアペプシンをコードする遺伝子の発現が可能であるこ
とを示す。
【0106】セクション15.エンドチアペプシン前駆
体をコード化している相補的DNAのPCR法による増
幅 1)クリホネクトリア・パラシティカのメッセンジャー
RNA類の分離 クリホネクトリア・パラシティカSEBR103株をエ
ンドチアペプシン産生条件下に培養した。ガーゼ濾過に
より菌糸体を採取し、水洗し、液体窒素中で凍結した。
凍結菌糸体15g(湿潤重量)を溶解緩衝液45mlにけん
だくし、同容のビーズ(直径0.45μm)中にとる。溶
解緩衝液は4Mグアニジン・チオシアン酸塩、10mM
トリスHCl(pH7.6)、10mMEDTAおよび50mg
/lβ−メルカプトエタノールからなるものである。菌糸
体けんだく液を5分間磨砕する。磨砕物を回収しビーズ
を沈澱後除去する。約45mlの上清をとり、塩化リチウ
ムを最終濃度3Mになるように加え、0℃で保存する。
2日後、上記溶液を10000rpmで60分間遠心する。上清
を除き、ペレットを3MLiCl40mlに入れる。得られ
たけんだく液を10000rpmで1時間30分遠心する。プロ
ティナーゼK(シグマ社)40μg/ml、SDS(0.1%w/
v)および20mMEDTAを加える。混合物を37℃で
3時間インキュベートする。エタノール2容で沈澱を生
起させ、沈澱物を70%エタノールで洗浄する。ついで
ペレットをTE緩衝液(10mMトリスHCl、1mMED
TA、pH7.5)に入れ、混合物をクロロホルムで2回
抽出し、生成物をエタノールで沈澱させる。RNAをエ
タノール中−80℃で保存する。
【0107】2)RNAポリ(A)+フラクションの精製 RNA約1mgを4℃(15000rpm)で20分間沈澱さ
せ、70%エタノールで洗い、乾燥する。ペレットをT
E緩衝液1mlに入れ、旋回させてけんだくする。タイプ
3オリゴ(dT)セルロース(コラボラティブ・リサーチ・
インコーポレイテッド、バイオメディカル製品部)を業
者の指示書に従って製造する。RNAをオリゴ(dT)に
加え、ゆるやかに撹拌してビーズを再けんだくし、65
℃で1時間加温する。けんだく液を0.5MNaClに調
整し、10分間ゆるく撹拌する。ついで、けんだく液を
1000rpmで1分間遠心し、上清を除き、ペレットを
0.5MNaCl含有TE緩衝液で2回洗浄する。上清を
除く。ビーズをTE緩衝液1mlにけんだくし、このけん
だく液を60℃で1分間加温し、ついでロックステージ
ミキサーで10分間撹拌して、ポリアデニル化RNAフ
ラクション(メッセンジャーRNA)の溶離を行なう。混
合物を1000rpmで1分間遠心し、溶液中遊離mRNA
を含む上清と、セルロースビーズのペレットを得る。上
記全操作(溶離から)を反復する。得られた上清を合わ
せ、過剰のビーズを遠心で除き、上清を常法(マニアテ
ィス、前掲)にしたがってNaCl含有エタノールで沈澱
させる。
【0108】3)ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法の記
載 ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法は、あらかじめ変性し
たDNAの両鎖をプライマーとして2種のオリゴヌクレ
オチドを用い同時にコピーし得る、当業者に周知の技術
である[特に、エールリッヒ等、「PCRテクノロジー:
プリンシプルズ・アンド・アプリケーションズ・フォー
・DNAアンプリフィケーション(PCR Technolog
y:Principles and Applications for DNA ampli
fication)」マクミラン・パブリッシャーズ・リミテッド
(英国)1989年刊、および、イニス等、「PCRプロ
トコールズは(PCR Protocols)」アカデミック・プ
レス・インコーポレイテッド(米国カルフォルニア州サ
ンジエゴ)1990年刊の研究参照]。この方法の原理
を以下に要約して示す。それぞれが3段階からなる多数
のサイクルが関心のあるDNA鎖の増幅をもたらす。そ
の3段階とは、次の通りである。 a)鋳型の変性 b)鋳型に対するプライマーのハイブリダイゼーション c)プライマーの延長 数時間のサイクル後、一般にTaqポリメラーゼと称され
るテルムス・アクアティクス(Thermus aquaticus)の熱
安定性DNAポリメラーゼを用いて、原鋳型の数百・数
千のコピーが生ずる。
【0109】このPCR法は下記3段階を反復すること
に基づく。 a)鋳型の変性 2本鎖DNAを高温(92℃−96℃)で約2分間インキ
ュベートすることにより1本鎖DNAに変性する。 b)プライマーのハイブリダイゼーション プライマーは増幅すべき領域の端にハイブリダイズする
一対の合成オリゴヌクレオチドである。2種のプライマ
ーは反対側の鎖にハイブリダイズする。プライマーは、
プライマー鋳型複合体の生成に好都合なように、過剰に
加える。 c)プライマーの延長 5’から3’へのプライマー鋳型複合体の延長をTaqポ
リメラーゼが行なう段階は72℃で実施する。PCR法
では、関心がある生成物は第3サイクルで出現し、その
後著しく増幅する。サイクルが進むにつれて、増幅生成
物は急速に主要鋳型となり、そこにプライマーがハイブ
リダイズする。
【0110】4)使用するプライマーの記載 2種の合成オリゴヌクレオチドはフラグメントAの配列
から製造した(第2図)。第1のオリゴヌクレオチド(プ
ライマー1と称する)は下記配列
【化24】 をもち、2つの異なる領域を有する。エンドヌクレアー
ゼHindIIIの認識部位に対応するクローニング部位AA
GCTTを有する領域1と、フラグメントAのコード鎖
の非コード化領域にハイブリダイズさせる配列でプレプ
ロエンドチアペプシンをコード化する配列の3’側に位
置する領域2である(第2図、1870−1881位)。
【0111】第2のオリゴヌクレオチド(プライマー2
と称する)は下記配列
【化25】 をもち、同様に2つの異なる領域を有する。エンドヌク
レアーゼNdeIの認識部位に対応するクローニング部位
CATATGを有し開始コドンATGの配列を含む領域
1と、最初のメチオニンに続くプレプロエンドチアペプ
シンの最初の5個のアミノ酸をコード化するものに等し
いヌクレオチド配列を有する領域2である。この領域は
フラグメントAの非コード化鎖とハイブリダイズするも
のである。
【0112】5)エンドチアペプシンの相補的DNAを
示す増幅フラグメントの産生 エンドチアペプシンをコード化するメッセンジャーRN
Aを含むことが知られるメッセンジャーRNAプールを
鋳型として用いる。逆転写酵素を用いる酵素反応を増幅
前にメッセンジャーRNAについて実施する。 a)総RNA製品中におけるエンドチアペプシンコード化
メッセンジャーRNAの存在の実証 イ)ノーザンブロッティング ノーザン法を用いる(マニアティス)。この方法は、基本
的に、変性条件(20mM MOPS、pH7、5mM酢酸
ナトリウム、1mMEDTA、6.6%ホルムアルデヒ
ド)下1.0%アガロースゲル上で電気泳動することによ
り約10μg総RNAを分離することからなる。分離し
たRNAはニトロセルロースシートに移す(マニアティ
ス、前掲)。これにより2種の異なるニトロセルロース
シートを製造し、その一方を放射能標識プローブ1とハ
イブリダイズし、他方を放射能標識2とハイブリダイズ
させる(プローブの製造に関するセクション1(2)、1
(3)および32P標識参照)。
【0113】ロ)放射能標識プローブ1および放射能標
識プローブ2とのハイブリダイゼーション ハイブリダイゼーション条件はセクション1(5)に記載
したのと同一である。ハイブリダイゼーション後、各フ
イルターを個々に0.5XSSC含有溶液中42℃で洗
う。ついでフイルターを写真フイルム(コダックXAR
5)に一夜露出する。フイルムを分析すると、RNA集
団が特異的に両プローブに対応し、エンドチアペプシン
をコード化するメッセンジャーRNAが製品中に存在す
ることを示す。
【0114】b)逆転写酵素を用いる反応 逆転写酵素とメッセンジャーRNA1μgの反応は、1
0mMジチオスレイソールDTT、RNasin(RNエース
インヒビター、ゼノフィット)0.0040U/μl、10
mM濃度の4種のデオキシリボヌクレオチドトリホスフ
ェートdNTPの混合物、組成:50mMトリスHCl(p
H8.3)、20mMKClおよび10mMMgCl2の緩衝
液、逆転写酵素(ストラタジーン)0.7単位および0.1
ngのプライマー1と0.1mgのプライマー2(最終容量1
0μl)の存在下に行なう。46℃で2分の1時間インキ
ュベーション後、20mMEDTAを加えて反応を停止
させ、ついで65℃で5分間混合物をインキュベートす
る。
【0115】c)PCR反応 上記混合物を、小分子(ヌクレオチド、EDTA等)を除
くためP10ポリアクリルアミドゲルカラムでクロマト
グラフィーにかける。得られた溶液を92℃で2分間イ
ンキュベートして相補的DNA鎖とメッセンジャーRN
A鎖からなる鋳型を変性する。100ngのプライマー
1、100ngのプライマー2、2mM MgCl2、0.2m
MdNTPおよび10倍濃縮反応混合物5μl(最終量、
67mMトリスHCl(pH8.8)、16.6mM(NH4)2
4、1mMβ−メルカプトエタノール、6.7mMEDT
A、0.15%トリトンX−100、200g/mlゼラチ
ン)を試験管に入れる。混合物の容量を水で50μlにす
る。得られた反応混合物を94℃で4分間インキュベー
トし、41℃にし、4分間維持する。41℃の温度は、
当業者に周知の実験式で計算したオリゴヌクレオチドの
半変性温度より5度低い。2.5単位に対応する0.5μ
lのTaqポリメラーゼ(ベーリンガーマンハイム、No.1
146−165)を加える。ついで、反応混合物をパラ
フィンで覆って水の蒸発を防ぐ。
【0116】増幅は30反応サイクルで行ったが、1サ
イクルが含む段階は次の通りである。 92℃2分→変性 41℃2分→ハイブリダイゼーション 72℃2分→ポリメリゼーション 30サイクル後、20mMEDTAを加えて酵素反応を
停止させる。増幅したDNAフラクションは、約130
0bpの寸法をもつと予測されるものであるが、これを分
離し、1%アガロースゲル上で精製し、P10カラムで
透析し、当業者に周知の方法により酵素NdeIおよびH
indIIIで同時加水分解(マニアティス、前掲)して、Nde
IおよびHindIII付着末端を形成する。加水分解後、フ
ラグメントをP10カラムで精製する。
【0117】セクション16.エンドチアペプシン前駆
体をコード化するエシエリヒア・コリ(E.Coli)相補的
DNAのクローニング・発現用ベクターであるプラスミ
ドp572の構築。この相補的DNAの配列決定と後者
の発現。 1)プラスミドp572の構築 プラスミドp572は、特許出願PCT/FR90/0
0532号に記載されたエシエリヒア・コリ(E.coli)
中でアスペルギルス・フラブス(Aspergillus flavus)
ウレートオキシダーゼの相補的DNAをクローン化、発
現するベクターであるp466から構築されたが、上記
ベクターは複製開始点とアンピリシン耐性遺伝子を含む
プラスミドpBR327のフラグメント、エシエリヒア
・コリ(E.coli)の合成プロモーター(ロドリゲおよびシ
ャンブルラン、「プロモータース−ストラクチュア・ア
ンド・ファンクション(Promoters−Structure and fu
nction)」1982年、プリーガー社)、シャイン−ダル
ガルノ配列を有し、その後に単一NdeIおよびHindIII
部位を有するポリリンカー、転写ターミネーター(ファ
ージfd由来)およびlacで遺伝子をもつ。
【0118】a)プラスミドp466の構築 エシエリヒア・コリ(E.coli)中での発現用ベクターで
あるプラスミドp466を製造した。これは、複製開始
点とアンピシリン耐性遺伝子を含めたpBR327フラ
グメントを有する。また、エシエリヒア・コリ(E.col
i)の合成プロモーター(ロドリゲおよびシャンブルラ
ン、「プロモータース−ストラクチュア・アンド・ファ
ンクション(Promoters−Structure and function)」1
982年、プリーガー社)、シャイン−ダルガルノ配列
と、続く単一NdeIおよびKpnI部位含有ポリリンカ
ー、転写ターミネーター(ファージfd由来)およびlacで
遺伝子を有する。このプラスミドは、hGH遺伝子を有
するフラグメントをウレートオキシダーゼcDNAで置
換することによりエシエリヒア・コリ(E.coli)中でhG
Hを発現するためのプラスミドから構築した。プラスミ
ドp466の構築を第6図、第7図、第8図、第9図お
よび第10図を参照しつつ以下に詳述する。
【0119】1)プラスミドp373.2の構築 使用したストラテジーンによると、公衆が入手可能な既
存プラスミドから得られるフラグメントと、現在一般に
用いられる技術による合成フラグメントを使用する。用
いたクローニング技術は、マニアティス、フリッツおよ
びザンブルツク、コールド・スプリンクグ・ハーバー・
ラボラトリー(1982年)の記載したものである。オラ
ゴヌクレオチド合成は、バイオサーチ4600DNA合
成機を用いて行なう。特許出願EP−A−024513
8に記載されCNCMに1986年2月17日付I−5
30として寄託されたプラスミドp163.1(第6図)
を、酵素PvnIおよびBamhI消化に付した。このプラ
スミドはhGHコード化遺伝子を含む。PvuI−BamhI
フラグメント(以下、フラグメント1と称する)は第6図
に示すように制限酵素XhoIの作用部位を含むが、これ
を精製した。同様に、当業者に周知(ソベロン等、ジー
ン(Gene)9巻(1980年)287−305頁)のプラス
ミドpBR327を、酵素PvuIおよびBamHI消化に
付した。PvuI−BamHIフラグメント(以下、フラグ
メント2と称する)は複製開始点を含むが、これを精製
した。
【0120】ついで、laci遺伝子およびそのプロモータ
ーを含み、第7および8図に示すプラスミド中のフラグ
メントの配向を明示するため鎖の両端に数字1と2を付
した配列をもつ合成BamHI(1)−BamHI(2)フラグ
メントであるフラグメント3を製造した。その配列を下
記に示す。
【化26】 ついで、フラグメント1、2及び3を次いで第7図に示
すようにプラスミドp160を得るように連結した。
【0121】このプラスミドは制限酵素HincII及びPs
tIにより部分分解に付した。複製起源を含み第7図に
示される大きなHincII−PstIフラグメントは、次い
で以下に示す、hGHの天然前駆体の最初の44アミノ
酸をコード化する配列及びこの配列の上流調節シグナル
を持つ合成DNAフラグメントであるフラグメント4に
連結した。 フラグメント4
【化27】
【0122】このフラグメントにおいて、アミノ酸は以
下のコード化に従った文字により示す。 A=アラニン M=メチオニン C=システィン N=アスパラギン D=アスパラギン酸 P=プロリン E=グルタミン酸 Q=グルタミン F=フェニルアラニン R=アルギニン G=グリシン S=セリン H=ヒスチジン T=スレオニン I=イソロイシン V=バリン K=リジン W=トリプトファン L=ロイシン Y=チロジン このフラグメントにおいて、プロモーター配列及びこの
分野の当業者によく知られたシャイン−ダルガルニ配列
の配列−35(TTGCTT)及び−10(TATAAT)
は連続してアンダーラインをする。これによりプラスミ
ドp380.1を得た。
【0123】次いでプラスミドp380.1は、上記フラ
グメント4の小さいClaI−NdeIフラグメントが除去
し、それに代って下のClaI−NdeIフラグメントが置
き換るよう制限酵素ClaI及びNdeIによる消化に付し
た。
【化28】 得られるプラスミドはプラスミドp373.2(第8図)で
ある。
【0124】2)プラスミドp466の構築 プラスミドp373.2を酵素BglII及びHindIIIによる
二重消化に付した。この消化から導かれた大きなフラグ
メントを精製し、その配列が下に示され、hGH遺伝子
末端および、その後3’末端でのKpnI及びSnaBIク
ローニング部位の再形成を意図するDNAフラグメント
と結合した。
【化29】 このフラグメントはBglII及びHindIII付着末端を含
む。形成される新しいプラスミドp462(第9図参照)
は即ち、発現ベクター中に尿酸オキシダーゼのcDNA
をを有するフラグメントをクローニングするためにKpn
I部位及びNdeI部位を含む。
【0125】尿酸オキシダーゼのほぼ1.2−KbcDN
AC(クローン9C)を持つpTZ19Rから誘導される
ハイブリッドプラスミドは単一KpnI部位を含む。この
部位は、cDNAのクローニング部位の少しの塩基対下
流に局在する。さらに、尿酸オキシダーゼのDNAは、
5’末端に近接して位置するAccI部位を含む。つい
で、このcDNAの大きな部分を含むAccI−KpnIフ
ラグメントを分離し精製した。さらにその配列が下に与
えられ、
【化30】 cDNAの5’末端を再形成するよう意図される2つの
相補オリゴヌクレオチドを合成した。得られたこの合成
フラグメントは、NdeI末端及びAccII末端を有する。
フラグメント及び合成配列は、KpnIで及びNdeIでカ
ットした発現ベクターと連結した。この3フラグメント
連結反応は、p466と名づける、得られるべきエセリ
シア・コリ(E.coli)に対する尿酸オキシダーゼの発現
用ベクターを得ることを可能にする(第10図参照)。こ
のプラスミドは、制限酵素によって一連の加水分解に付
し、このことは予想される制限部位、特に尿酸オキシダ
ーゼをコード化する遺伝子により運ばれる制限部位の存
在の照明を可能にした。
【0126】従って、プラスミドp466は、構築によ
って、下記配列の尿酸オキシダーゼをコード化する遺伝
子を含む。
【化31】 (エイ.フラブス(A.flavus)から分離したcDNAのヌク
レオチドと異なるヌクレオチドは、上記配列においてア
ンダーラインを引いている。これらの差は、ATGの下
流に、ヌクレオチド配列が原核遺伝子に通常出存在する
ものにより密接に順応するヌクレオチド配列を持つよう
に、合成AccII−KpnIフラグメントに導入され
た。)
【0127】プラスミドp466を酵素NdeI及びHind
IIIで加水分解し、laci遺伝子を運ぶフラグメント、複
製の起源及びアンピシリン耐性をコード化する遺伝子を
この分野の当業者に知られた技術に従って精製した(マ
ニアティス、前掲)。このフラグメントはエンドヌクレ
アーゼNdeI及びHindIIIで予め加水分解した増幅相補
DNAフラグメントに連結した。この連結の生成物はエ
シエリシア・コリ(E.coli)株K12RRI(ジブコBR
L−ref.:520−8261SA)に形質転換に用い
た。クローン512と名づけられ、p572として引用
されるプラスミドを含む形質転換体を採用した。
【0128】2)相補DNAの配列の測定 プラスミドp572を1方でエンドヌクレアーゼClaI
及びKpnIで、他方で酵素KpnI及びHindIIIで加水分
解した。(エンドヌクレアーゼKpnIはフラグメントA
のコード配列をカットする)。蛋白をコード化するDN
Aの5末端を運ぶClaI−KpnIフラグメント及び蛋白
をコード化するDNAの3’末端を運ぶKpnI−HindI
IIフラグメントを、ファージM13mp19(ファルマシ
ア)にコード化し、サイクロン技術(IBIの「ラククロ
ンIバイオシステム」)により配列した。得られた相補D
NAのヌクレオチド配列を第11図に示す。相補DNA
のコード配列がゲノムDNAのそれと正に同一であり、
わずかの差は、後者が正しく局在する3つのイントロン
により中断されていることが観られる(セクション1、
7参照)。
【0129】3)プレプロエンドチアペプシン(preproen
dothiapepsin)の相補DNAの発現 エセリシア・コリ(E.coli)株K12RRI(ジブコBR
LRef:520−8261A)を、その配列を2)で決定
したプレプロエンエンドチアペプチンの相補DNAを運
ぶプラスミド572と共に、及び陰性対照プラスミドp
BR322と共にアンピシリン耐性に形質転換した。ア
ンピシリン耐性コロニーを再場合において得た。各タイ
プの1コロニーを100μg/mlのアンピシリンを補充し
た(表4に特定したが寒天のない組成の)LB液体培地に
培養した。一夜37℃で撹拌後、両培養物を100μg/
mlのアンピシリンを補充した液体LB培地に100倍に
希釈した。1時間の培養後、IPTG(イソプロピル−
β−D−チオガラクトシド)を3時間で1mMの濃度まで
加えた。
【0130】ウエスタンブロッティングによるプレプロ
エンドチアペプシンの免疫測定 a)方法 OD=1を有する0.2mlに対応するアリコットフラク
ションを、IPTGによる誘発の3時間後得た培養培地
から取る。アリコットを遠心し上清を除く。次いでペレ
ットを、以下の段階を含むこの分野の当業者によく知ら
れた技術のウエスタンブロッティングに付す。 −0.125Mトリス−HClpH6.8、4%SDS、
0.002%ブロモフェノールブルー、20%グリセロ
ール及びβ−メルカプトエタノールから成る充填緩衝液
(loading buffer)と呼ばれる緩衝液中10分間煮沸する
ことによるペレットの可溶化(コー.ケイ.ラームリ.ネイ
チャー(Nature)、227(1970)、680−68
5))。 −ラームリ(ユー.ケイ.ラームリ.ネイチャー(Natur
e)、227、(1970)、680−685)により記載
されたプロトコールによる溶解物中に含まれる異なる蛋
白の電気泳動分離。 −ニトロセルロースフイルター上のゲルに含まれる該蛋
白の継代(エイチ.トウビン等、プロシーディングス・オ
ブ・ナショナル・アカデミィ・オブ・サイエンス・ユー
エスエイ(Proc.Natl.Acad.Sci.USA)76、(19
79)4350−4354)の技術による)。 −免疫検出、バーネッテ(ダブリュ・ダブリュ・バーネ
ッテ、アナリティカル・バイオケミストリィ(Ana.Bio
chem.)112(1981)195−203)により実施、
これは次を含む。組成、10mMトリスーHCl、170
mMNaCl、1mMKClの緩衝液により10分間ニトロ
セルロースフイルターをすすぐこと。 ・100ml当り3gの割合でウシ血清アルブミンを補足
した緩衝液Aで30分間37℃でニトロセルロースフイ
ルターを接触させること。 ・1981年3月20日のジャーナル・オフィシャル・
ド・ラ・レパブリーク・フランセーズ(オフィシャル・
ジャーナル・オブ・ザ・フレンチ・リパブリック)に記
載されたエンドチアペプシンの同空方法に従ってレネテ
スト・バイオケム・キットのポリクローナル抗体で1時
間37℃でニトロセルロースフイルターを接触させるこ
と。 ・3g/100mlのウシ血清アルブミンを補足した緩衝
液Aでニトロセルロースフイルターをすすぐこと。 ・0.1ミクロキューリー/mlの活性を有するヨード−
125−標識化蛋白Gの溶液で1時間37℃でニトロセ
ルロースを接触させること。 ・フイルターを緩衝液Aですすぐこと。 ・フイルターを2枚の吸収性シートの間で乾燥するこ
と。 ・フイルターを放射線写真フイルムと接触させること。 ・フイルムを現像すること。
【0131】b)結果 プラスミドp572で形質転換した株は、プレプロエン
ドチアベプシンの予想される分子の大きさに相応する明
らかな分子量約43KDaの蛋白を生成し、これはエン
ドチアペプシンに直接対する抗体により認識され又、対
照株には存在しないことが見られる。
【図面の簡単な説明】
【図1】 エンドチアペプシンのアミノ酸配列を示す第
1図である。
【図2】 フラグメントAのヌクレオチド配列、縦の線
で示したセクション10で用いたBatEII部位および
翻訳アミノ酸配列を示す第2図の前半部である。
【図3】 第2図の後半部である。
【図4】 プレプロエンドチアペプシンのアミノ酸配列
を示す第3図である。
【図5】 B、H、P、Sp、C、GおよびSの文字で
記号化したフラグメントC、BamHI、HindIII、
PetI、SphI、SacI、BglIIおよびScaI部位お
よびフラグメントC中に含まれるフラグメントA、D、
EおよびFを示す第4図である。
【図6】 下線を引いた3個のイントロンにより遮断さ
れたプレプロエンドチアペプシンをコードしたゲノムD
NA配列を示す第5図である。
【図7】 プラスミドp163.1の制限地図を示す第
6図である。
【図8】 プラスミドp160の制限地図を示す第7図
である。
【図9】 プラスミドp973.2の制限地図を示す第
8図である。
【図10】 プラスミドp462の制限地図を示す第9
図である。
【図11】 プラスミドp466の制限地図を示す第1
0図である。
【図12】 プレプロエンドチアペプシンをコードする
粗補正DNA配列を示す第11図である。
【図13】 フラグメントFのSphI−HindIIIの
配列を示す第12図である。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 //(C12N 15/57 C12R 1:645) (C12N 1/15 C12R 1:645) (71)出願人 591067727 ソシエテ・ナシヨナル・エルフ・アキテー ヌ SOCIETE NATIONALE E LFAQUITAINE フランス92400−6クールブヴオワ、ラ・ デフアンス、プラース・ド・ラ・クポル2 番 トウール・エルフ (72)発明者 パトリツク・ジヤラ フランス31320カスタネ−トローザン、リ ユ・デ・イリス・ジヨーン27番 (72)発明者 リシヤール・ルグー フランス31460カラマン、アン・マナール −ル・フアジエ(番地の表示なし) (72)発明者 ジエラール・ロワソン フランス31300トウールーズ、リユ・エ フ・リカルデイ15番 (72)発明者 ヴオアアンジ・ラザナンパラニ フランス31400トウールーズ、リユ・バン ジヤマン・コンスタン51番

Claims (18)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 下記の配列(P1)を有するエンドチア
    ペプシン: 【化1】 の前駆体をコードする配列の上流に機能的プロモーター
    を含むことを特徴とする、クリホネクトリア・パラシチ
    カ中エンドチアペプシン前駆体の発現のためのカセッ
    ト。
  2. 【請求項2】 エンドチアペプシン前駆体が下記の配列
    (P4): 【化2】 を有するプレプロエンドチアペプシンである、請求項1
    記載の発現カセット。
  3. 【請求項3】 プレプロエンドチアペプシンをコードす
    る配列が下記の配列(N4a): 【化3】 を含むものである、請求項2記載のカセット。
  4. 【請求項4】 プレプロエンドチアペプシンをコードす
    る配列が少なくとも1個のイントロンによって遮断され
    た配列(N4a)を含むものである、請求項2記載のカ
    セット。
  5. 【請求項5】 プレプロエンドチアペプシンをコードす
    る配列が下記の配列(N4b): 【化4】 である、請求項4記載のカセット。
  6. 【請求項6】 プロモーターが、プレプロエンドチアペ
    プシンをコードする遺伝子のプロモーターまたはこのプ
    ロモーターの機能的部分である、請求項1−5のいずれ
    か1項記載のカセット。
  7. 【請求項7】 プレプロエンドチアペプシンをコードす
    る遺伝子のプロモーターの機能的部分が、フラグメント
    CのBglII−ScaIセグメントである、請求項6記
    載のカセット。
  8. 【請求項8】 プレプロエンドチアペプシンをコードす
    る遺伝子のプロモーターの機能的部分が、フラグメント
    CのBamHI−ScaIセグメントである、請求項6
    記載のカセット。
  9. 【請求項9】 プロモーターが下記の配列(N5): 【化5】 を有するTATAボックスを担持している部分を含み、
    配列(N5)の上流に、フラグメントAの5'−末端およ
    びフラグメントCの5'−末端と接しているフラグメン
    トCのセグメントXを含み、このセグメントXは活性化
    領域を含むように選択されているものである、請求項6
    記載のカセット。
  10. 【請求項10】 フラグメントCのセグメントXが、下
    記の配列: 【化6】 を有するフラグメントである、請求項9記載のカセッ
    ト。
  11. 【請求項11】 プロモーターが、クリホネクトリア・
    パラシチカ中または他の子のう菌類の線状真菌中に発現
    する遺伝子に由来するものである、請求項1−5のいず
    れか1項記載のカセット。
  12. 【請求項12】 プロモーターが、アスペルギルス・ニ
    ドランスのグリセルアルデヒド−3−ホスファートデヒ
    ドロゲナーゼをコードする遺伝子に由来するものであ
    る、請求項11記載のカセット。
  13. 【請求項13】 請求項1−12のいずれか1項記載の
    カセットにより形質転換され、非形質転換株と比較して
    エンドチアペプシンを過産生することを特徴とする、エ
    ンドチアペプシン産生クリホネクトリア・パラシチカ
    株。
  14. 【請求項14】 優性選択マーカーを欠くものである、
    請求項13記載の株。
  15. 【請求項15】 宿主株がCNCMに1990年8月3
    1日付番号I−997で寄託されたSEBR103株で
    ある、請求項13または14記載の株。
  16. 【請求項16】 SEBR103株と比較して、エンド
    チアペプシンを少なくとも2に等しい過産生ファクター
    を有するものである、請求項15記載の株。
  17. 【請求項17】 請求項13−16のいずれか1項記載
    の株の培養段階、その後の分離および精製段階を含むこ
    とを特徴とする、エンドチアペプシンの製造法。
  18. 【請求項18】 請求項1−11のいずれか1項記載の
    カセット、および優性選択マーカーによる形質転換段
    階、優性選択マーカーの除去を可能にする胞子形成によ
    る精製段階を伴う、少なくとも1個のサイクルを含むも
    のである、請求項14記載の株の採取法。
JP3232047A 1990-09-11 1991-09-11 エンドチアペプシン前駆体 Pending JPH0568569A (ja)

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