JPH06233690A - D−α−アミノ酸の製造法 - Google Patents

D−α−アミノ酸の製造法

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JPH06233690A
JPH06233690A JP5249167A JP24916793A JPH06233690A JP H06233690 A JPH06233690 A JP H06233690A JP 5249167 A JP5249167 A JP 5249167A JP 24916793 A JP24916793 A JP 24916793A JP H06233690 A JPH06233690 A JP H06233690A
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秀明 山田
Akira Shimizu
昌 清水
Yasuhiro Ikenaka
康裕 池中
Reika Yajima
麗嘉 矢島
Yukio Yamada
勇喜雄 山田
Hironori Nanba
弘憲 難波
昌行 ▲高▼野
Masayuki Takano
里美 ▲高▼橋
Satomi Takahashi
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Abstract

(57)【要約】 【構成】 一般式: 【化1】 [式中、Rはフエニル基、水酸基で置換されたフエニル
基、置換または未置換アルキル基、もしくはチエニル基
を示す。]で表わされるN−カルバミル−D−α−アミ
ノ酸に、水性媒体中で、微生物の産生する酵素を作用さ
せ、一般式: 【化2】 [式中、Rは前記と同意義である。]で表わされるD−
α−アミノ酸を製造する方法において、N−カルバミル
−D−α−アミノ酸をD−α−アミノ酸に変換する酵素
デカルバミラーゼとして、コマモナス属、ブラストバク
ター属、アルカリゲネス属、スポロサルシナ属、リゾビ
ウム属、ブラディリゾビウム属またはアルスロバクター
属に属する微生物が産生することのできる酵素を用い
る。 【効果】 中性ないしアルカリ性においてN−カルバミ
ル−D−α−アミノ酸からD−α−アミノ酸を製造する
ことができる。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】本発明は、一般式:
【化6】 [式中、Rはフエニル基、水酸基で置換されたフエニル
基、置換または未置換の、好ましくは炭素数1〜5のア
ルキル基またはチエニル基を示す。]で表わされるD−
N−カルバミル−α−アミノ酸に、カルバミル基を除去
する能力を有する酵素(以下、「デカルバミラーゼ」と
言う。)を作用させ、一般式:
【化7】 [式中、Rは前記と同意義である。]で表わされるD−
α−アミノ酸を製造する方法に関する。
【0002】このような光学活性なD−α−アミノ酸類
は、医薬中間体として重要な化合物であり、特に半合成
ペニシリン、半合成セファロスポリンの製造中間体とし
ての、D−フェニルグリシンやD−(4−ヒドロキシフ
ェニル)グリシン(以下、「D−HPG」と言う。)等が
工業的に有用な化合物として挙げられる。
【0003】
【従来の技術】D−α−アミノ酸類の製造法としては、
対応するD−N−カルバミル−α−アミノ酸類のカルバ
ミル基を除去して、これを得る方法が知られており、こ
の際のカルバミル基の除去は、化学的方法(特公昭58
−4707号公報参照)や微生物の酵素反応を利用する
方法(特公昭57−18793号公報、特公昭63−2
0520号公報および特公平1−48758号公報参
照)によって行われている。
【0004】しかし、これらの微生物の酵素は、中性付
近に至適pHをもつものが多い。D−α−アミノ酸に対
応するDL−5−置換ヒダントインを、酵素の作用によ
りD−体を選択的に加水分解してN−カルバミル−D−
α−アミノ酸を得、続いてデカルバミラーゼを作用させ
てD−α−アミノ酸を得る反応では、第1段階のヒダン
トイン水解酵素の至適pHがpH8〜9にあるため、第2
段階のデカルバミラーゼとは異なる反応系で行う必要が
あった。
【0005】
【発明が解決しようとする課題】本発明者らは、D−N
−カルバミル−α−アミノ酸類に作用して酵素的にカル
バミル基を除去してD−α−アミノ酸類に変換させる
(以下、「脱カルバミル」と言う。)能力を有する微生
物について、従来デカルバミラーゼの存在が知られてい
ない属を中心に種々検討した結果、コマモナス(Comam
onas)属、ブラストバクター(Blastobacter)属、ア
ルカリゲネス(Alcaligenes)属、スポロサルシナ(S
porosarcina)属、リゾビウム(Rhizobium)属、ブラ
ディリゾビウム(Bradyrhizobium)属またはアルスロ
バクター(Arthrobacter)属に属する細菌類に脱カル
バミル活性が存在することを見い出し、本発明を完成す
るに至った。
【0006】
【課題を解決するための手段】すなわち、本発明は、一
般式(I):
【化8】 [式中、Rはフエニル基、水酸基で置換されたフエニル
基、置換または未置換の、好ましくは炭素数1〜5のア
ルキル基、もしくはチエニル基を示す。]で表わされる
N−カルバミル−D−α−アミノ酸に、水性媒体中で、
微生物の産生する酵素を作用させ、一般式(II):
【化9】 [式中、Rは前記と同意義である。]で表わされるD−
α−アミノ酸を製造する方法において、N−カルバミル
−D−α−アミノ酸をD−α−アミノ酸に変換する酵素
デカルバミラーゼとして、コマモナス(Comamonas)
属、ブラストバクター(Blastobacter)属、アルカリ
ゲネス(Alcaligenes)属、スポロサルシナ(Sporosa
rcina)属、リゾビウム(Rhizobium)属、ブラディリ
ゾビウム(Bradyrhizobium)属またはアルスロバクタ
ー(Arthrobacter)属に属する微生物が産生すること
のできる酵素を用いることを特徴とするD−α−アミノ
酸の製造法を提供する。
【0007】本発明で使用するデカルバミラーゼは、D
−異性体に特異的に作用するものであっても、D−体、
L−体いずれに作用する酵素であっても、実際上差し支
えない。なお、D−N−カルバミル−α−アミノ酸に対
する立体選択性の厳しい酵素は、D−N−カルバミル−
α−アミノ酸アミドヒドロラーゼと呼ばれることがあ
る。
【0008】これらの微生物の中で脱カルバミル活性が
比較的高い菌株としては、コマモナスsp.E222C
(FERM BP第4411号)、コマモナスsp.E2
06a、コマモナスsp.E217a、ブラストバクターs
p.NA88−b、ブラストバクターsp.A17p−4
(FERM BP第4410号)、アルカリゲネスsp.
E215(FERM BP第4409号)、アルカリゲ
ネス・キシロソキシダンスsubsp.デニトリフィカンス
(Alcaligenes xylosoxidans subsp. denitrificans)
CL66−2a、スポロサルシナsp.NCA28−b
(FERM BP第4408号)、リゾビウムsp.KN
K1415(FERM BP第4419号)、ブラディ
リゾビウム・ジャポニカム(Bradyrhizobium japonicu
m)IFO14783、ブラディリゾビウムsp.IFO
15003、アルスロバクターsp.CA17−2(FE
RMBp.第4420号)などがある。
【0009】上記細菌の代表例として、コマモナスsp.
E222C、ブラストバクターsp.A17p−4、アル
カリゲネスsp.E215、スポロサルシナsp.NCA2
8−b、リゾビウムsp.KNK1415およびアルスロ
バクターsp.CA17−2の菌学的性質を次に示す。
【0010】コマモナスsp.E222C (a)形態的性質 ・桿菌(曲がっている) ・グラム染色性 バリアブル(Variable) ・胞子の有無 なし ・コロニー形態 淡黄色、やや半透明、丸い、規則
的な、真円の、輝きのある、低い凸面の、滑らかな、直
径1mm(48hr)
【0011】(b)生理学的性質 ・カタラーゼ + ・オキシダーゼ − ・グルコース発酵性 − ・NO3還元性 − ・インドール生成 − ・グルコースからの酸生成 − ・アルギニンデヒドロラーゼ − ・ウレアーゼ − ・エスクリン(Aesculin)加水分解 − ・ゼラチン加水分解 − ・β−ガラクトシダーゼ − ・チトクロムオキシダーゼ +(弱い)
【0012】(c)資化性 ・グルコース − ・アラビノース − ・マンノース − ・マンニトール − ・N−アセチル・グルコサミン − ・マルトース − ・グルコン酸 + ・カプロン酸 + ・アジピン酸 − ・リンゴ酸 + ・クエン酸 + ・フエニルアセテート +
【0013】ブラストバクターsp.A17p−4 (a)形態的性質 ・桿菌(卵型) ・グラム染色性 陰性 ・胞子の有無 なし ・コロニー形態 白、やや半透明、丸い、規則的
な、真円の、輝きのある、低い凸面の、平滑な、ムコイ
ド生成、直径1.0〜1.5mm(48hr)
【0014】(b)生理学的性質 ・カタラーゼ + ・オキシダーゼ +(弱い) ・グルコース発酵性 − ・NO3還元性 − ・インドール生成 − ・グルコースからの酸生成 − ・アルギニンデヒドロラーゼ − ・ウレアーゼ + ・エスクリン(Aesculin)加水分解 + ・ゼラチン加水分解 − ・β-ガラクトシダーゼ + ・チトクロムオキシダーゼ +
【0015】(c)資化性 ・グルコース + ・アラビノース + ・マンノース + ・マンニトール + ・N−アセチルグルコサミン + ・マルトース + ・グルコン酸 − ・カプロン酸 − ・アジピン酸 − ・リンゴ酸 − ・クエン酸 − ・フエニルアセテート −
【0016】アルカリゲネスsp.E215 (a)形態的性質 ・桿菌 ・グラム染色性 バリアブル(Variable) ・胞子の有無 なし ・運動性 あり ・コロニー形態 淡黄色、やや半透明、丸い、規則
的な、真円の、低い凸面の、輝きのある、滑らかな、直
径1mm(48hr)
【0017】(b)生理学的性質 ・カタラーゼ + ・オキシダーゼ − ・グルコース醗酵性 −
【0018】スポロサルシナsp.NCA28−b (a)形態的性質 ・球菌 ・グラム染色性 バリアブル(Variable) ・胞子の有無 あり ・運動性 なし ・コロニー形態 丸い、規則的な、真円の、クリー
ム色又は白色、やや半透明、直径0.5mm以下(48h
r) ・各温度での生育 37℃ − 45℃ −
【0019】(b)生理学的性質 ・カタラーゼ + ・オキシダーゼ + ・グルコース発酵性 −
【0020】リゾビウムsp.KNK−1415(FER
M BP−4419) (a)形態的性質 ・桿菌(やや棍棒状の短桿菌) ・グラム染色性 陰性 ・胞子の有無 なし ・ベン毛 極付近又は周生 ・コロニーの形態 やや黄色かかった白色、光沢のな
い、真円の、大きさのそろった滑らかな、やや凸面の、
直径5mm(5日)、ムコイド生成 ・各温度での成育 30℃ + 37℃ (±)
【0021】(b)生理学的性質 ・カタラーゼ + ・オキシダーゼ + ・グルコース発酵性 − ・NO3還元性 + ・インドール生成 − ・グルコースからの酸生成 − ・アルギニンデヒドロラーゼ − ・ウレアーゼ + ・エスクリン(Aesculin)加水分解 + ・ゼラチン加水分解 − ・β−ガラクトシダーゼ + ・チトクロムオキシダーゼ + ・3−ケトラクトース生成 − ・H2S生成 −
【0022】(c)資化性 ・グルコース + ・アラビノース + ・マンノース + ・マンニトール + ・N−アセチルグルコサミン + ・マルトース + ・グルコン酸 − ・カプロン酸 − ・アジピン酸 − ・リンゴ酸 + ・クエン酸 − ・フェニルアセテート − GC含量 63.4% キノン分析 Q−10 95.7% Q−9 3.3% Q−11 0.6% Q−8 0.4% 菌体脂肪酸分析 (全菌体脂肪酸)成分名 面積比(%) 3−OH C14:0 4.6 C16:1 5.9 C16:0 14.0 3−OH C16:0 0.1 C18:1 70.7 C18:0 3.3 不明 1.4 (3−OH脂肪酸)成分名 面積比(%) 3−OH C14:0 88.8 3−OH C16:0 6.6 3−OH C18:0 4.6 (2−OH脂肪酸) 検出されず
【0023】アルスロバクターsp.CA17−2(FE
RM BP−4420) (a)形態的性質 ・桿菌又は球菌 ・グラム染色性 陽性 ・胞子の有無 なし ・運動性 有り ・コロニー形態 やや黄色かかった白色、光沢のな
い、丸い、大きさのそろった、凸面の、滑らかな、直径
約0.5mm(2日) ・各温度での生育 30℃ + 37℃ (+) 45℃ −
【0024】(b)生理学的性質 ・カタラーゼ + ・オキシダーゼ − ・グルコース発酵性 − (c)化学分類学的分析 ・ペプチドグリカンのアミノ酸 L−Lysine ・ミコール酸 − ・脂肪酸組成 anteiso C15:0(12-メチルテトラデカ
ン酸) 58% iso C15:0(13-メチルテトラデカン酸)5.5% iso C16:0(14-メチルペンタデカン酸)8% anteiso C17:0(14-メチルヘキサデカン酸)25%
【0025】これらの脱カルバミル活性を示す酵素系
は、微生物を通常の方法で培養することにより調製する
ことができる。培養は、通常液体栄養培地で行われる
が、固体表面培養によっても行うことができる。培地に
は、通常資化し得る炭素源、窒素源、各微生物の生育に
必須の無機塩栄養素を含有させる。更にD−p−ヒドロ
キシフェニルグリシン、D−フェニルグリシン等のD−
アミノ酸;N−カルバミル−DL−メチオニン、N−カ
ルバミル−D−フエニルアラニン等のN−カルバミル−
α−アミノ酸類;DL−5−p−ヒドロキシフェニルヒ
ダントイン、DL−5−フエニルヒダントイン等の5置
換ヒダントイン類;ウラシル、ジヒドロウラシル、β−
ウレイドプロピオン酸等のピリミジン代謝物;Fe2+
Fe3+、Be2+、Co2+、Al3+、Li+、Mn2+、Mg2+、C
s+等の金属イオン類;尿素などを少量添加してデカルバ
ミラーゼを増強蓄積させることが好ましい。これらデカ
ルバミラーゼ生産増強物質の培地中濃度は、金属イオン
類で0.1〜10mM、その他の基質で0.01〜1重
量%の範囲から選ばれる。
【0026】培養時の温度としては20〜85℃の範
囲、pHとしては4〜11の範囲が用いられ、通気撹拌
によって微生物の生育を促進することもできる。
【0027】D−N−カルバミル−α−アミノ酸の脱カ
ルバミル反応においては、前記のようにして得ることの
できる微生物の培養液、菌体または菌体処理物を酵素源
として使用する。菌体は、生菌体のままで用い得ること
は勿論であるが、凍結乾燥菌体のような乾燥菌体、ま
た、菌体破砕物や菌体抽出物や、界面活性剤や超音波で
処理した菌体処理物を微生物酵素源として本発明の反応
に利用することができる。さらに、これら菌体の破砕
物、抽出物や処理物より酵素を精製または部分精製した
酵素または粗酵素の状態で使用することができる。ま
た、これら酵素または粗酵素を固定化し、固定化酵素と
して使用できる。固定化方法としては、例えば、国際特
許出願PCT/JP91/01696の固定法が使用で
きる。
【0028】さらに、これらの微生物から遺伝子操作に
より産生させた酵素も、基本的には該微生物の産生する
ことの出来る酵素と等価である。
【0029】脱カルバミル反応は、水性媒体中で行わ
れ、そのpHとしては6〜11の範囲が用いられるが、
特に好ましくは、pH7〜9.5である。さらに、pH8
〜9に至適pHを持つ酵素もある。脱カルバミル反応の
温度としては、通常20〜85℃の範囲が用いられる
が、使用する菌株の酵素系に適した温度が採用される。
【0030】本発明において、デカルバミラーゼの基質
となるN−カルバミル−D−α−アミノ酸化合物の例と
しては、D−N−カルバミルアラニン、D−N−カルバ
ミルメチオニン、D−N−カルバミルバリン、D−N−
カルバミルロイシン、D−N−カルバミルフェニルグリ
シン、D−N−カルバミル−(4−ヒドロキシフェニル)
グリシン、D−N−カルバミル−(2−チエニル)グリシ
ン、D−N−カルバミルフェニルアラニンなどが挙げら
れる。一般式中のRとしては、置換アルキル基の場合の
置換基としてはフェニル基、インドリル基、アルキルチ
オ基、ヒドロキシル基、アミノ基、カルボキシル基など
がある。
【0031】前述したような微生物酵素による脱カルバ
ミル反応によって生成したD−α−アミノ酸類の単離
は、濃縮、中和、イオン交換樹脂処理などの公知の方法
により行うことができる。すなわち、D−フェニルグリ
シン、D−(4−ヒドロキシフェニル)グリシン、D−ロ
イシンやD−フエニルアラニンなどの比較的疎水性のD
−α−アミノ酸類の場合は、酸性またはアルカリ性での
不溶物を除去後、濃縮、中和等により目的のD−α−ア
ミノ酸を沈澱として得ることができる。また、D−チエ
ニルグリシン、D−セリンやD−アラニンなどのように
比較的親水性である場合には、イオン交換樹脂により目
的物を吸着させ、これをアンモニア水等で溶出し、つい
で中和し濃縮することにより目的物を取得することがで
きる。
【0032】ところで、これらデカルバミラーゼの基質
となるN−カルバミル−D−アミノ酸化合物は、多種の
種属の微生物の培養液、菌体、菌体処理物または菌体か
ら抽出した酵素を5−置換ヒダントイン類に作用させ
て、製造することができる。このような製造方法は、特
開昭53−44690号公報、特開昭53−69884
号公報、特開昭53−91189号公報、特開昭53−
133688号公報、特開昭54−84086号公報お
よび特開昭55−7001号公報等に記述されている。
これらのD−カルバミル−α−アミノ酸類を、本発明の
方法によって対応する光学活性のD−α−アミノ酸類に
変換する。
【0033】
【実施例】以下、実施例を示し、本発明を具体的に説明
する。実施例1 土壌試料(採取地名:日本各地より採取)を、2mlの培
地A(1g/l KH2PO4、1g/l K2HPO4、0.
3g/l MgSO4・7H2O、0.1g/l酵母エキス、
1g/l NH4Cl、1.5g/l 炭素源として用い以下
に記載の化合物(pH7.0))、または培地B(1g/
l KH2PO4、1g/l K2HPO4、0.3g/l Mg
SO4・7H2O、0.5g/lグルコース、0.1g/l酵
母エキス、1.5g/l窒素源として用いる以下に記載の
化合物(pH7.0))に接種し、28℃で好気的に振
盪培養し、同様の培地に継植して微生物の増殖が認めら
れるまで培養した。その後、平板培地(2%寒天を含む
同様の培地)に広げ、28℃で2〜6日培養して微生物
を分離した。
【0034】炭素源または窒素源として用いる化合物 N−カルバミル−D−p−ヒドロキシフェニルグリシン
(C−D−HPG) N−カルバミル−D−フェニルグリシン(C−D−PG) N−カルバミル−D−アラニン(C−D−Ala) DL−5−メチルヒダントイン(DL−Ala−hyd) DL−5−フェニルヒダントイン(DL−PG−hyd) DL−5−p−ヒドロキシフェニルヒダントイン(DL−
HPG−hyd) シトルリン フェニルウレア カルバミン酸−n−ブチルエステル
【0035】それぞれの平板培地上の株を100μlの
反応液(35mM C−D−HPG、200mMリン酸カ
リウム緩衝液(pH7.0)に懸濁し、28℃で1〜3
日間反応させた後、薄層クロマトグラフィーによりカル
バミルD−HPG及びD−HPGの分析を行なった。薄
層クロマトグラフィーは、メルク社製60F254プレー
トを使用し、ブタノール:酢酸:水,3:3:1(v/v/v)で
展開し、紫外線ランプ(254nm)またはp−(ジメチルア
ミノ)シナムアルデヒドとニンヒドリンのスプレーによ
って検出した。その結果、1868株が上記の炭素源ま
たは窒素源化合物を資化する微生物として分離でき、そ
の内37株がD−HPGを生産しており、その16株が
良好なD−HPG生産性(2mM以上のD−HPGを生
産)を示した。
【0036】実施例2 実施例1で得られた16株のデカルバミラーゼ生産株に
ついては、2次スクリーニングの為に、1mlの培地C
(1.5g/l C−D−HPG、1g/l KH2PO4
1g/l K2HPO4、0.3g/l MgSO4・7H
2O、3g/l酵母エキス、3g/l肉エキス、10g/lグ
リセロール、2g/lポリペプトン(pH7.0))によ
り、28℃で3日間培養した。培養液1mlを遠心分離
し、菌体を実施例で使用したのと同じ反応液100μl
に懸濁し、30℃または50℃で24時間反応させて、
生成したD−HPGの定量を行なった。
【0037】D−HPGの定量は、コスモシル(Cosmo
sil)5C18カラム(φ4.6×250mm、ナカライ
テスク社製)を用い、水:アセトニトリル:リン酸(9
5:5:0.01(v/v/v))を溶離液として、高速液体
クロマトグラフィー(HPLC)によって分離し、25
4nmの吸光度を測定することにより行なった。その結果
を図1に示す。
【0038】16株のうちの3株、E206a、E22
2CおよびE215は、C−D−Alaを単一炭素源とし
て生育し、30℃で高い活性を示した。E222Cで
は、30℃で30.8mMのD−HPGが生成していた
が、50℃では3.5mMのD−HPGしか生成してい
なかった。また他の3株、A17p−1、A17p−3お
よびA17p−4は、C−D−HPGを単一炭素源とし
て生育し、50℃で高い活性を示した。A17p−4で
は、50℃で28.8mMのD−HPGが生成していた
が、30℃では2.5mMのD−HPGしか生成してい
なかった。
【0039】実施例3 得られたデカルバミラーゼの基質特異性 コマモナスsp.E222Cおよびブラストバクターsp.
A17p−4が生産するデカルバミラーゼの基質特異性
を調べるため、実施例2に記載の培地Cを用い、28℃
で、コマモナスsp.E222Cを1日間、またはブラス
トバクターsp.A17P−4を7日間振とう培養した。
培養液3mlを遠心分離し、この菌体を300μlの反応
液(200mMリン酸カリウム緩衝液、1%(w/v)の種
々の反応基質)に懸濁し、コマモナスsp.E222Cで
は30℃で、ブラストバクターsp.A17P−4では5
0℃でそれぞれ24時間反応させた。
【0040】表1に示すように、両菌体とも、脂肪族お
よび芳香族D−アミノ酸のN−カルバミル体に対する強
い加水分解活性を示したが、極性基を持つアミノ酸のN
−カルバミル体に対する活性は低かった。またコマモナ
スsp.E222Cではβ−ウレイドプロピオン酸を加水
分解でき、ブラストバクターsp.A17P−4ではヒダ
ントイナーゼ活性も有することがわかった。
【0041】
【表1】
【0042】実施例4 コマモナスsp.E222C株デカルバミラーゼの生産増
強物質 コマモナスsp.E222C株を培養する際に、デカルバ
ミラーゼ生産を増加させる酵素生産増加物質の探索を行
なった。栄養培地である培地D(1g/l KH2PO4
1g/l K2HPO4、0.3g/l MgSO4・7H
2O、3g/l酵母エキス、3g/l肉エキス、10g/lグ
リセロール、2g/lポリペプトン(pH7.0))に、
図2に示す化合物を0.15%(w/v)の濃度で添加し、
菌を植えて28℃で2日間振盪培養した。
【0043】この培養液1mlを遠心分離し、菌体を10
0μlの反応液(200mMリン酸カリウム緩衝液(pH
7.0)、35mM C−D−HPG)に懸濁し、30
℃で24時間反応させ、生成したD−HPGを、実施例
2に示す方法に従い、HPLCにより定量した。その結
果、図2に示す様に、尿素、β−ウレイドプロピオン
酸、D−フェニルグリシン、N−カルバミル−DL−メ
チオニンにより活性が増強されることがわかった。
【0044】実施例5 コマモナスsp.E222Cが生産するデカルバミラーゼ
の精製 コマモナスsp.E222Cを28℃にて、β−ウレイド
プロピオン酸(0.15%(w/v)を添加した実施例4に
記載の培地Dで3日間振盪培養し、合計3.6lの培地
を遠心分離して菌体を分離した。この菌体を10mMリ
ン酸カリウム緩衝液(pH7.0)100mlに懸濁し、
超音波によって破砕し、遠心分離によって残渣を除い
た。この粗酵素液に硫安を添加しつつ、飽和濃度の20
%から40%までの濃度での硫安沈澱画分を遠心分離に
よって分離し、上記緩衝液に溶解させた。
【0045】この酵素液177mlを上記緩衝液10lに
対して12時間透析し、DEAE−セファセル(Sepha
cel)カラム(φ5×15cm)に吸着させ、0〜1Mの
NaCl直線型濃度勾配で溶出させ、活性画分を集めた。
この溶出液のNaCl濃度を4Mに合わせ、フェニル−セ
ファロース(Phenyl−Sepharose)CL−4Bカラム
(φ1.5×15cm)に吸着させ、4〜0MのNaCl直
線型濃度勾配で溶出させ、活性画分を集めてYM−10
膜(アミコン社)を用いて限外濾過により濃縮した。
【0046】この濃縮液(5ml)を0.2M NaClを
含む上記緩衝液中、セファクリル(Sephacryl)S−2
00HRカラム(φ1.8×80cm)を用いてゲル濾過
し、活性画分を透析により脱塩した後、ヒドロキシアパ
タイトカラム(φ1.2×10cm)に吸着させ、0〜1
Mのリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)の直線型濃度
勾配で溶出し、活性画分(8.5ml)を10mMリン酸
カリウム緩衝液(pH7.0)500mlに対し、12時
間透析した。これをモノ(Mono)Q HR5/5カラ
ムに吸着させ、0〜1.0M NaClの直線型濃度勾配
で溶出させて、この活性画分(1.2ml)を精製酵素液
として分析に用いた。
【0047】以上の精製操作により、表2に示す様に、
細胞破砕上清と比較して、比活性が108倍向上し、そ
の際の酵素活性回収率は約2%であった。またこの精製
酵素10mgをキングとレムリーの方法[King,J.,L
aemmli,U.K.,ジャーナル・オブ・モレキュラー・バ
イオロジー(Journal of Molecular Biology)62
巻、465−477(1971)]により10%ポリアク
リルアミドゲルを用いたSDS−ポリアクリルアミドゲ
ル電気泳動に付したところ、図3に示す様に、分子量3
8,000付近に単一バンドが得られた。
【表2】
【0048】また、セファデックス(Sephadex)G−
150カラム(φ1.5×85cm)を用い、0.2M
NaClと0.1mMジチオスレイトール(DTT)を含
む10mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)でゲル濾
過を行なったところ、図4に示す様に、分子量111,
000付近に溶出された。
【0049】実施例6 コマモナスsp.E222Cデカルバミラーゼの性質 実施例5で得た酵素液を用い、コマモナスsp.E222
Cが産生するデカルバミラーゼの反応至適pHおよび反
応至適温度を調べた。反応至適pHは、以下の方法によ
って測定した。反応液(500μl)の緩衝液(濃度2
00mM)として、pH4.2〜5.9では酢酸−塩酸緩
衝液、pH5.0〜8.8ではリン酸カリウム緩衝液、p
H7.6〜9.9ではトリス−塩酸緩衝液及びpH8.
9〜11.1ではグリシン−NaOH緩衝液をそれぞれ
用い、10mMのN−カルバミル−D−フエニルアラニ
ンと酵素液を添加したものを反応液として用い30℃で
20分間反応させ、500μlエタノールを添加して反
応を停止させた。
【0050】生成したD−フエニルアラニンの定量は、
200mMリン酸カリウム緩衝液(pH7.0)、1.5
mM4−アミノアンチピリン、2.1mMフェノール、
2.25uパーオキシダーゼ(西洋わさび由来、カルザ
イム・ラボラトリー(CALZYME Lab.)社製)
及び0.375単位のD−アミノ酸オキシダーゼ(シグ
マ社製)を含む反応液に、上記酵素反応液の1部を添加
し(最終容量500μl)、37℃で60分間反応させ
て500nmの吸光度の増加を測定することによって行っ
た。
【0051】また、反応至適温度は、リン酸カリウム緩
衝液(pH7.0)を用いて上記と同様の反応液組成
で、10℃〜80℃で20分間反応させ、生成したアン
モニアを、インドフェノール法[ボルター(Bollter,
W.T.)ら、アナリティカル・ケミストリー(Analy
tical Chimistry)33巻、592−594(196
1))によって測定した。
【0052】以上の結果を図5および図6に示す。コマ
モナスsp.E222Cのデカルバミラーゼでは反応至適
pHがpH8〜9で、反応至適温度が40℃であることが
わかる。
【0053】実施例7 コマモナスsp.E222C株デカルバミラーゼのアミノ
酸配列 実施例5で得た酵素液を用い、デカルバミラーゼ蛋白の
アミノ末端のアミノ配列の決定を行なった。酵素液をセ
ントリコン−10マイクロセントレーター(アミコン社
製)を用いて脱塩し、パルス式液相プロテインシーケン
サーにチャージし、解析を行なったところ、デカルバミ
ラーゼ蛋白のアミノ末端の配列は
【0054】
【化10】 (20番目及び26番目のArgはピークが不明瞭で確定
できなかった。)であることがわかった。
【0055】実施例8 ブラストバクターsp.A17p−4株デカルバミラーゼ
の生産増強物質 ブラストバクターsp.A17p−4株を培養する際に、
デカルバミラーゼ生産を増加させる酵素生産増強物質の
探索を行なった。実施例4で用いたのと同じ培地Dに図
7に示す化合物を0.15%(w/v)添加し、これに植菌
し、28℃で3日間振盪培養した。実施例4に示した方
法で、反応温度のみを40℃として生成したD−HPG
をHPLCで定量したところ、図7に示す様に、ウラシ
ル、ジヒドロウラシルまたはβ−ウレイドプロピオン酸
を添加した場合、デカルバミラーゼの生産量が増加する
ことがわかった。
【0056】さらに、金属イオンの添加効果を調べるた
め、培地Dに0.15%(w/v)のウラシルを添加し、さ
らに図8に示す金属イオンを2mMの濃度で添加し、こ
の培地に植菌し、28℃で4日間振盪培養した。そして
生成したD−HPGを定量したところ、図8に示す様
に、Fe2+、Fe3+、Li+、Cs+、Be2+、Mg2+、M
n2+、Co2+、Al3+等のイオンを添加することにより、
デカルバミラーゼの生産量が増加することがわかった。
【0057】実施例9 ブラストバクターsp.A17p−4が生産するデカルバ
ミラーゼの精製 ブラストバクターsp.A17p−4を実施例4で用いた
のと同じ培地Dに、0.15%(w/v)のウラシルと2m
MのFeSO4・7H2Oを添加し、この培地に植菌し、
28℃で7日間振盪培養した。合計4.8lの培養液を
遠心分離し、菌体を10mMリン酸カリウム緩衝液12
0mlに懸濁し、直径0.25mmのガラスビーズ[ダイノ
−ミル・ケイ・ディ・エル(Dyno−Mill KDL)
(スイス)]を用いて、5℃で20分間破砕し、遠心分
離によって残渣を除いた。この粗酵素液に硫安を添加し
つつ、飽和濃度の20%から40%までの濃度での硫安
沈澱画分を遠心分離によって分離し、上記緩衝液に溶解
させた。
【0058】この酵素液41mlを5lの上記緩衝液に対
して12時間透析し、実施例5に示す方法によってDE
AE−セファセルカラムおよびフェニル−セファロース
CL−6Bカラムによって精製を行ない、限外濾過によ
って濃縮した。この濃縮液(3ml)を0.2M NaCl
を含む上記緩衝液中、セファデックスG−150カラム
(φ1.5×80cm)を用いてゲル濾過し、活性画分を透
析により脱塩した後、実施例5に示す方法によってモノ
QHR5/5カラムを用いて精製し、活性画分(2ml)
を精製酵素液として分析に用いた。以上の精製操作によ
り、表3に示す様に、細胞破砕上清と比較して、比活性
が37倍向上し、その際の酵素活性回収率は2.3%で
あった。
【表3】
【0059】またこの精製酵素をSDS−ポリアクリル
アミド電気泳動に付したところ、図9に示す様に、分子
量39,000付近に単一バンドが得られた。また、実
施例5に示す方法によってセファデックスG−150カ
ラムによるゲル濾過を行なったところ、図10に示す様
に、分子量120,000付近に溶出された。
【0060】実施例10 ブラストバクターsp.A17p−4デカルバミラーゼの
性質 実施例9で得た酵素液を用い、ブラストバクターsp.A
17p−4デカルバミラーゼの反応至適pH及び反応至適
温度を調べた。いずれの場合も、反応は実施例6に示す
方法に従って行った。これらの結果を図11及び図12
に示す。ブラストバクターsp.A17p−4デカルバミ
ラーゼの反応至適pHは9であり、反応至適温度は50
℃であることがわかった。
【0061】実施例11 ブラストバクターsp.A17p−4デカルバミラーゼの
アミノ酸配列 実施例9で得た酵素液を用い、デカルバミラーゼ蛋白の
アミノ末端アミノ酸配列の決定を実施例7と同様の方法
により行なったところ、デカルバミラーゼ蛋白のアミノ
末端のアミノ酸配列は、
【0062】
【化11】 (38番目のArgはピークが不明瞭で確定できなかっ
た。)であることがわかった。
【0063】実施例12 表4のリゾビウム属及びブラディリゾビウム属の株7株
について、1mlの805液体培地(イーストエキス 1g
/l、マンニトール 5g/l、K2HPO4 0.7g/l、KH2
PO4 0.1g/l、MgSO4・7H2O 1g/l、C−D−
HPG 1g/l(pH7.0))に終濃度1g/lのC−D−
HPG又はC−D−Alaを添加した培地に植菌し、30
℃で24時間振とう培養した。菌を遠心分離によって集
め、0.5mlの1%C−D−HPG又はC−D−Ala、
0.1MK−リン酸緩衝液(pH7.0)、0.1%トリ
トン X−100に懸濁した。37℃で振とうしながら
24時間反応後、実施例1に示す方法によって薄層クロ
マトグラフィーによって分析した。表4に示すようにブ
ラディリゾビウム属の株に脱カルバミル活性が存在する
ことがわかった。
【0064】
【表4】 菌株名 デカルバミラーゼ活性 リゾビウム・ロティ ++ (Rhizobium loti) IFO 14779 リゾビウム・メリロティ ++ (Rhizobium meliloti) IFO 14782 リゾビウム・フレディイ ++ (Rhizobium fredii) IFO 14780 リゾビウム・カレガエ ++ (Rhizobium galegae) IFO 14965 リゾビウム・フアクィイ + (Rhizobium huakuii) IFO 15243 ブラディリゾビウム・ジャポニカム + (Bradyrhizobium japonicum) IFO 14783 ブラディリゾビウム sp. + (Bradyrhizobium sp.) IFO 15003
【0065】実施例13 実施例1に示す方法によって、土壌よりさらにスクリー
ニングを行った。スクリーニングを、N−カルバミル−
D−ロイシン(C−D−Leu)、N−カルバミル−D−
アラニン(C−D−Ala)、N−カルバミル−D−フェ
ニルグリシン(C−D−PG)又はDL−5−メチルヒ
ダントイン(DL−Ala−hyd)を炭素源又は窒素源と
して用いて行った。生育した菌のうち、9株につきC−
D−AlaとC−D−HPGを用い、実施例12と同様に
脱カルバミル活性を調べた。結果は、表5に示すよう
に、C−D−HPGに対しより活性の高い菌株とC−D
−Alaに対しより活性の高い菌株とがあった。
【0066】
【表5】 菌株名 生育基質 活性 リゾビウムsp.KNK1415 C−D−PG +++(C−D−HPG) アルカリゲネス・キシロ ソキシダンス・subsp. デニトリフィカンス CL66-2a C−D−Leu ++ (C−D−HPG) CL67-1 C−D−Leu ++ (C−D−HPG) CL85-1 C−D−Leu + (C−D−HPG) CA17-1 C−D−Ala + (C−D−Ala) アルスロバクター sp. CA17-2 C−D−Ala ++ (C−D−Ala) CA77-2 C−D−Ala ++ (C−D−Ala) AH71-1 DL−Ala−hyd + (C−D−Ala) AH57-1 DL−Ala−hyd ++ (C−D−Ala)
【0067】実施例14 実施例3で得られたリゾビウムsp.KNK1415を1
0lのSE培地(ショ糖 23g/l、酵母エキス 4
g/l、尿素 2g/l、KH2PO4 2g/l、Na
2HPO4 2g/l、MgSO4・7H2O 1g/l、
MnCl2・4H2O 0.01g/l(pH6.5))に植
菌し、30℃で40時間振とう培養した。遠心分離によ
って集菌し、0.9%食塩水で菌体を洗浄後、超音波に
より菌体を破砕し、残渣を遠心で除いた後、プロタミン
硫酸処理(0.1mg/mg蛋白)により除核酸した。
そして遠心した上清を50℃、30分間熱処理し、変性
した蛋白を遠心で除き、30%飽和となる様に硫安を添
加した。沈でんを遠心分離によって集め、500mlの
20mM Tris・HCl(pH7.5)、2mM DTTに
溶解し、同緩衝液に透析後、DEAEセルロースカラム
に吸着させ、10mM Na−リン酸緩衝液(pH7.
2)、0.15M NaCl、1mM DTTで溶出し
た。この溶出液をYM−10膜(アミコン社)を用いて
限外濾過による濃縮を行った。この酵素液をSDS−ポ
リアクリルアミドゲル電気泳動によって分析したとこ
ろ、約35,000付近にこのデカルバミラーゼは泳動
された。
【0068】実施例15 実施例14で得られたデカルバミラーゼを分析したSD
S−ポリアクリルアミドゲルよりデカルバミラーゼのバ
ンド部分のゲルを切り出し、溶出バッファー(50mM
Tris・HCl(pH7.5)、0.1%SDS、0.1m
M EDTA、150mM NaCl、5mM DTT)
中でホモジナイズし、室温で溶出させた。この抽出液を
限外濾過によって濃縮し、逆相HPLCカラム(AP−
303;YMC社製)にチャージし、アセトニトリルの
濃度勾配により溶出させた。このデカルバミラーゼを含
む画分を気相プロテイン・シーケンサー(アプライド・
バイオシステム社製)にチャージし、解析したところ、
デカルバミラーゼのアミノ末端の配列は
【化12】 であることがわかった。
【0069】
【発明の効果】抗生物質の中間原料等として重要なD−
α−アミノ酸類を製造する新規な脱カルバミル酵素を発
見したことにより、従来とは違った条件、例えばpH8
〜9での反応や50℃での反応が行える様になり、効率
的にD−アミノ酸を製造することが可能となった。
【図面の簡単な説明】
【図1】 新規スクリーニングによって取得した株の5
0℃と30℃での脱カルバミル反応の結果を示す。
【図2】 コマモナスsp.E222Cの培養時に添加し
た化合物のデカルバミラーゼの生産に及ぼす影響を示
す。
【図3】 コマモナスsp.E222Cの精製デカルバミ
ラーゼをSDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によ
り分析した結果を示す。
【図4】 コマモナスsp.E222Cの精製デカルバミ
ラーゼを、セファデックスG−150カラムによって、
ゲル濾過した結果を示す。
【図5】 コマモナスsp.E222Cの精製デカルバミ
ラーゼを用いて反応時のpHの影響を調べた結果を示
す。
【図6】 コマモナスsp.E222Cの精製デカルバミ
ラーゼを用いて、反応時の温度の影響を調べた結果を示
す。
【図7】 ブラストバクターsp.A17p−4の培養時
に添加した化合物のデカルバミラーゼ生産に及ぼす影響
を示す。
【図8】 ブラストバクターsp.A17p−4の培養時
に添加した金属イオンのデカルバミラーゼ生産に及ぼす
影響を示す。
【図9】 ブラストバクターsp.A17p−4の精製デ
カルバミラーゼをSDS−ポリアクリルアミドゲル電気
泳動により分析した結果を示す。
【図10】 ブラストバクターsp.A17p−4精製デ
カルバミラーゼを、セファデックスG−150カラムに
よってゲル濾過した結果を示す。
【図11】 ブラストバクターsp.A17p−4精製デ
カルバミラーゼを用いて、反応時のpHの影響を調べた
結果を示す。
【図12】 ブラストバクターsp.A17p−4精製デ
カルバミラーゼを用いて、反応時の温度の影響を調べた
結果を示す。
フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12R 1:01) (72)発明者 山田 勇喜雄 兵庫県加古川市加古川町美乃利34−6 (72)発明者 難波 弘憲 兵庫県高砂市高砂町沖浜町2−63 光雲寮 (72)発明者 ▲高▼野 昌行 兵庫県明石市二見町東二見299−3−106 (72)発明者 ▲高▼橋 里美 兵庫県神戸市垂水区神和台1−13−13

Claims (16)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 一般式: 【化1】 [式中、Rはフエニル基、水酸基で置換されたフエニル
    基、置換または未置換アルキル基、もしくはチエニル基
    を示す。]で表わされるN−カルバミル−D−α−アミ
    ノ酸に、水性媒体中で、微生物の産生する酵素を作用さ
    せ、 一般式: 【化2】 [式中、Rは前記と同意義である。]で表わされるD−
    α−アミノ酸を製造する方法において、 N−カルバミル−D−α−アミノ酸をD−α−アミノ酸
    に変換する酵素デカルバミラーゼとして、コマモナス
    (Comamonas)属、ブラストバクター(Blastobacte
    r)属、アルカリゲネス(Alcaligenes)属、スポロサ
    ルシナ(Sporosarcina)属、リゾビウム(Rhizobiu
    m)属、ブラディリゾビウム(Bradyrhizobium)属また
    はアルスロバクター(Arthrobacter)属に属する微生
    物が産生することのできる酵素を用いることを特徴とす
    るD−α−アミノ酸の製造法。
  2. 【請求項2】 該微生物が産生することのできるデカル
    バミラーゼを、培養液、菌体、菌体破砕物、菌体抽出
    物、菌体処理物、粗酵素、精製酵素固定化菌体または固
    定化酵素として作用させる請求項1記載の製造法。
  3. 【請求項3】 該微生物が、コマモナスsp.E222C
    (FERM BP第4411号)、ブラストバクターs
    p.A17p−4(FERM BP第4410号)、アル
    カリゲネスsp.E215(FERM BP第4409
    号)、スポロサルシナsp.NCA28−b(FERM B
    P第4408号)、リゾビウムsp.KNK1415(F
    ERM BP第4419号)、ブラディリゾビウム・ジ
    ャポニカム(Bradyrhizobium japonicum)IFO 14
    783、ブラディリゾビウムsp.IFO 15003ま
    たはアルスロバクターsp.CA17−2(FERM B
    P第4420号)である請求項1または2記載の製造
    法。
  4. 【請求項4】 デカルバミラーゼの産生増強物質を添加
    した培地で、該微生物を培養し、産生したデカルバミラ
    ーゼを作用させる請求項1または2記載の製造法。
  5. 【請求項5】 デカルバミラーゼ産生増強物質が、D−
    アミノ酸、N−カルバミル−α−アミノ酸、5−置換ヒ
    ダントイン類、ピリミジン代謝物または金属イオンであ
    る請求項4記載の製造法。
  6. 【請求項6】 該微生物がコマモナス属の微生物であ
    り、産生増強物質が尿素、β−ウレイドプロピオン酸、
    D−フェニルグリシンまたはN−カルバミル−DL−メ
    チオニンである請求項4記載の製造法。
  7. 【請求項7】 該微生物がブラストバクター属に属する
    微生物であり、産生増強物質が、ウラシル、ジヒドロウ
    ラシル、β−ウレイドプロピオン酸、Li+、Cs+、B
    e+、Mg2+、Mn2+、Fe2+、Fe3+、Co2+またはAl3+
    ある請求項4記載の製造法。
  8. 【請求項8】 水性媒体のpHを6〜11に保持する請
    求項1記載の製造法。
  9. 【請求項9】 水性媒体のpHを7.5〜9.5に保持
    する請求項1記載の製造法。
  10. 【請求項10】 40℃〜50℃でデカルバミラーゼを
    作用させる請求項1記載の製造法。
  11. 【請求項11】 至適pHが8〜9にあるデカルバミラ
    ーゼ。
  12. 【請求項12】 至適温度が40℃〜50℃にあるデカ
    ルバミラーゼ。
  13. 【請求項13】 コマモナスsp.E222C、ブラスト
    バクターsp.A17p−4またはリゾビウムsp.KNK
    1415が産生する請求項11または12記載のデカル
    バミラーゼ。
  14. 【請求項14】 該酵素のアミノ末端側のアミノ酸配列
    が 【化3】 である、コマモナスsp.E222Cが産生する請求項1
    3記載のデカルバミラーゼ。
  15. 【請求項15】 該酵素のアミノ末端側のアミノ酸配列
    が 【化4】 である、ブラストバクターsp.A17p−4が産生する
    請求項13記載のデカルバミラーゼ。
  16. 【請求項16】 該酵素のアミノ末端側のアミノ酸配列
    が、 【化5】 であるリゾビウムsp.KNK1415が産生する請求項
    13記載のデカルバミラーゼ。
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WO2006080409A1 (ja) 2005-01-31 2006-08-03 Kaneka Corporation 5-置換ヒダントインラセマーゼ、これをコードするdna、組換えdna、形質転換された細胞、および、光学活性n-カルバミルアミノ酸または光学活性アミノ酸の製造方法

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