JPH0634724B2 - プラスミド - Google Patents
プラスミドInfo
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- JPH0634724B2 JPH0634724B2 JP57147035A JP14703582A JPH0634724B2 JP H0634724 B2 JPH0634724 B2 JP H0634724B2 JP 57147035 A JP57147035 A JP 57147035A JP 14703582 A JP14703582 A JP 14703582A JP H0634724 B2 JPH0634724 B2 JP H0634724B2
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Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
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Description
【発明の詳細な説明】 本発明はプラスミドに関する。詳しくは高度好塩菌ハロ
バクテリウムハロビウムから得られる新規なプラスミド
に関する。
バクテリウムハロビウムから得られる新規なプラスミド
に関する。
染色体外遺伝子であるプラスミドは、インビトロ(in vi
tro)遺伝子組換えにおけるベクター(vector)として、遺
伝子工学において広く用いられており、インビトロ遺伝
子組換え技術は、有用な微生物の育種をはじめとして用
途が広い。
tro)遺伝子組換えにおけるベクター(vector)として、遺
伝子工学において広く用いられており、インビトロ遺伝
子組換え技術は、有用な微生物の育種をはじめとして用
途が広い。
本発明者等は、高い塩濃度がデオキシリボ核酸(DN
A)の高次構造に及ぼす影響を検討するため、高度好塩
菌プラスミドを検索中のところ、ハロバクテリウムハロ
ビウムから新しいプラスミドを分離することに成功し、
本発明を達成した。すなわち、本発明の要旨は、高度好
塩菌ハロバクテリウムハロビウムR1は株(微工研菌寄
6677号)から得られ、制限酵素に対し下記の分解特性を
有する分子量27メガダルトン塩基組成GC(%)=6
1、融解温度(Tm)92.5℃の環状プラスミド BamHIで6個の断片に、Hind IIIで2個の断片に、Bal
Iで6個の断片に、Pvu IIで7個の断片に、KpnIで4
個の断片に、HpaIで2個の断片にPstIで8個の断片に
それぞれ分解される。
A)の高次構造に及ぼす影響を検討するため、高度好塩
菌プラスミドを検索中のところ、ハロバクテリウムハロ
ビウムから新しいプラスミドを分離することに成功し、
本発明を達成した。すなわち、本発明の要旨は、高度好
塩菌ハロバクテリウムハロビウムR1は株(微工研菌寄
6677号)から得られ、制限酵素に対し下記の分解特性を
有する分子量27メガダルトン塩基組成GC(%)=6
1、融解温度(Tm)92.5℃の環状プラスミド BamHIで6個の断片に、Hind IIIで2個の断片に、Bal
Iで6個の断片に、Pvu IIで7個の断片に、KpnIで4
個の断片に、HpaIで2個の断片にPstIで8個の断片に
それぞれ分解される。
に存する。
本発明を詳細に説明するに、本発明における供試菌は、
高度好塩菌ハロバクテリウムハロビウム(Halobacterium
halobium)R1由来の変異株である。ハロバクテリウムハ
ロビウムR1は株(微工研菌寄第6677号)である。
高度好塩菌ハロバクテリウムハロビウム(Halobacterium
halobium)R1由来の変異株である。ハロバクテリウムハ
ロビウムR1は株(微工研菌寄第6677号)である。
この菌は所謂古細菌(アルケバクテリア)に属し、唯一
のプラスミドを有し、通常約25%濃度の食塩の存在下
においてのみ、生育し、かつ細胞内は低濃度であるため
細胞膜を挾んでNa+イオンを積極的に排除する機構をも
つている。視紅素(ロドプシン)と類似するバクテリオ
ロドプシンを有し、光の刺激に対して電子を動かす仕組
みをもつている。さらにアルギニンを唯一のエネルギー
源として嫌気的にATPを生産することができ、またそ
の構成成分としてイソプレノイドの誘導体、カロチノイ
ドの誘導体などの有用成分が見出されている。
のプラスミドを有し、通常約25%濃度の食塩の存在下
においてのみ、生育し、かつ細胞内は低濃度であるため
細胞膜を挾んでNa+イオンを積極的に排除する機構をも
つている。視紅素(ロドプシン)と類似するバクテリオ
ロドプシンを有し、光の刺激に対して電子を動かす仕組
みをもつている。さらにアルギニンを唯一のエネルギー
源として嫌気的にATPを生産することができ、またそ
の構成成分としてイソプレノイドの誘導体、カロチノイ
ドの誘導体などの有用成分が見出されている。
本発明のプラスミドは、上述のハロバクテリウムハロビ
ウムR1は株の菌体を、後記実施例に具体的に記述する方
法に従つて、低張液で溶菌し、アルカリ処理して得られ
るプラスミド分画をフエノールで除蛋白し、精製するこ
とによつて分離することができる。
ウムR1は株の菌体を、後記実施例に具体的に記述する方
法に従つて、低張液で溶菌し、アルカリ処理して得られ
るプラスミド分画をフエノールで除蛋白し、精製するこ
とによつて分離することができる。
本発明のプラスミドの分子量は、アガロースゲル電気泳
動および透過型電子顕微鏡写真による測定の結果から、
27メガダルトン(38.5キロベース)である。また塩基
組成はGC(%)=61であり、融解温度(Tm)は92.5℃であ
る。
動および透過型電子顕微鏡写真による測定の結果から、
27メガダルトン(38.5キロベース)である。また塩基
組成はGC(%)=61であり、融解温度(Tm)は92.5℃であ
る。
さらに、本発明のプラスミドの制限酵素による分解断片
の分子量はつぎの通りである。
の分子量はつぎの通りである。
分子量(単位はメガダルトン) BamHI:7.3,5.9,5.3,2.95,2.9,2.7 Hind III:22.4,4.6 BalI:8.8(2本),3.1,2.7,2.4,1.3 Pvu II:11.2,3.9,3.0,2.7,2.4,2.2,1.4 KpnI:11.6,10.6,3.6,1.2 HpaI:13.9,13.0 PstI:9.8,6.2,2.8,2.5,1.7,1.5,1.3,0.8 以上に述べたように、本発明のプラスミドは、各種の制
限酵素による適当な切断部位を備え、またその分子量も
既知のものよりも遥かに小さい。さらに、前記の好塩菌
ハロバクテリウムハロビウムR1株の諸性状に徴し、本発
明のプラスミドは、例えば、イソプレノイド誘導体、カ
ロチノイド誘導体などの有用成分の産生用ベクターとし
ての用途が期待される。
限酵素による適当な切断部位を備え、またその分子量も
既知のものよりも遥かに小さい。さらに、前記の好塩菌
ハロバクテリウムハロビウムR1株の諸性状に徴し、本発
明のプラスミドは、例えば、イソプレノイド誘導体、カ
ロチノイド誘導体などの有用成分の産生用ベクターとし
ての用途が期待される。
以下本発明を実施例について説明する。
実施例 (1)菌の培養 ハロバクテリウムハロビウムR1は(株)を下記組成の寒
天培地上に接種し、37℃で約4日間静置培養する。
天培地上に接種し、37℃で約4日間静置培養する。
寒天培地1の組成(pH6.5) イーストエキス 5g バクトトリプトン 5g NaCl 250g MgSO4・7H2O 5g CaCl2 0.2g 寒 天 15g 得られたコロニーを下記組成の液体培地(本培養の1/10
倍量)中に植菌し、37℃で約3日間振とう培養し、前
培養を行う。
倍量)中に植菌し、37℃で約3日間振とう培養し、前
培養を行う。
これを、本培養の液体培地に植え継ぎ、37℃で約1日
間振とう培養を行う。
間振とう培養を行う。
液体培地1の組成(pH6.5) カザミノ酸 7.5g イーストエキス 10g NaCl 250g MgSO4・7H2O 20g クエン酸ナトリウム 3g KCl 2g 1mlの4.98%FeSO4・7H2O(W/V) (2)プラスミドの調製 (1)で得られた培養液から遠心で菌体を集める。これ
を、下記組成の洗菌用緩衝液にサスペンドし、7,000rp
m、10分間遠心して、上清をすてる。
を、下記組成の洗菌用緩衝液にサスペンドし、7,000rp
m、10分間遠心して、上清をすてる。
洗菌用緩衝液100mlの組成(pH6.5) NaCl 25g MgSO4・7H2O 2g クエン酸ナトリウム 0.3g KCl 0.2g このようにして得られた菌体を溶液I〔50mM グルコ
ース、10mM CyDTA(シクロヘキサンジアミン四酢
酸)、25mM トリス塩酸pH8.0〕1mlにサスペンド
し、さらに同溶液9mlを加え均一にとかす。次に、溶液
II〔0.2M MaOH、1%(W/V)SDS(ドデシル硫酸ナトリウ
ム)〕20mlを加え、0℃で10分間静かに攪拌する。
さらに溶液III〔3M CH3COOK、2M CH2COOH〕15mlを加
え、0℃で20分間放置し、変性タンパク、SDS変性
DNA等を沈殿させる。これを12000rpmで15分間遠心
し、上清をとり、0.6倍量のイソプロパノールを加え
て、攪拌してのち、−20℃で一晩放置する。
ース、10mM CyDTA(シクロヘキサンジアミン四酢
酸)、25mM トリス塩酸pH8.0〕1mlにサスペンド
し、さらに同溶液9mlを加え均一にとかす。次に、溶液
II〔0.2M MaOH、1%(W/V)SDS(ドデシル硫酸ナトリウ
ム)〕20mlを加え、0℃で10分間静かに攪拌する。
さらに溶液III〔3M CH3COOK、2M CH2COOH〕15mlを加
え、0℃で20分間放置し、変性タンパク、SDS変性
DNA等を沈殿させる。これを12000rpmで15分間遠心
し、上清をとり、0.6倍量のイソプロパノールを加え
て、攪拌してのち、−20℃で一晩放置する。
次いで、5000rpm、10分間遠心し、上清を捨て沈殿物
を50mM トリス塩酸(pH8.0)−0.1M CH3COONa緩衝液に
とかし、等量の水飽和フエノールを加え、手で振とうし
て遠心により、水層を集める。
を50mM トリス塩酸(pH8.0)−0.1M CH3COONa緩衝液に
とかし、等量の水飽和フエノールを加え、手で振とうし
て遠心により、水層を集める。
さらに、クロロホルム−イソアミルアルコール(24:
1v/v)を等量加え、振とうし、これを遠心して水層を集
め、再度クロロホルム−イソアミルアルコールを加えて
除蛋白を行う。
1v/v)を等量加え、振とうし、これを遠心して水層を集
め、再度クロロホルム−イソアミルアルコールを加えて
除蛋白を行う。
このようにして得られた水層に、2倍量のエタノールを
加えて攪拌して−20℃で2〜3時間放置する。次い
で、5000rpm10分間の遠心でDNAを沈殿させ、50m
M トリス塩酸−25mM Na3EDTA緩衝液(pH8.0)に溶解し
て、再び2倍量のエタノールで沈殿させてCH3COONaを除
去し、アルコールをできるだけ除いてから、10mlの5
0mMトリス塩酸−25mM Na3EDTA緩衝液に溶解し、さら
に同緩衝液で、溶液12gに調整する。次に、13.2gの
セシウムクロライドを加え、5mg/ml H2Oエチジウムブ
ロマイド2.4mlを加えて静かに混合する。これを、ポリ
アロマーチユーブにいれ、アルミキヤツプをつけた後、
上部の穴から、流動パラフインを重層し、35,000rpmで
40〜48時間、15℃で遠心を行う。
加えて攪拌して−20℃で2〜3時間放置する。次い
で、5000rpm10分間の遠心でDNAを沈殿させ、50m
M トリス塩酸−25mM Na3EDTA緩衝液(pH8.0)に溶解し
て、再び2倍量のエタノールで沈殿させてCH3COONaを除
去し、アルコールをできるだけ除いてから、10mlの5
0mMトリス塩酸−25mM Na3EDTA緩衝液に溶解し、さら
に同緩衝液で、溶液12gに調整する。次に、13.2gの
セシウムクロライドを加え、5mg/ml H2Oエチジウムブ
ロマイド2.4mlを加えて静かに混合する。これを、ポリ
アロマーチユーブにいれ、アルミキヤツプをつけた後、
上部の穴から、流動パラフインを重層し、35,000rpmで
40〜48時間、15℃で遠心を行う。
U.Vランプをあてると、2本のシヤープなバンドが見え
るので下の方のバンドを集め、セシウムクロライド−エ
チジウムブロマイドの溶液〔50mM トリス塩酸(pH8.
0)−25mM Na3EDTA 8.0g、セシウムクロライド8.8
g、1.25mg/ml H2Oエチジウムブロマイド1.6ml〕を加え
て、再度35,000rpm40〜48時間、15℃で遠心す
る。UVランプをあてると、バンドが1本観察されるの
で、これを取り出し、n−ブタノールで4〜5回抽出し
てエチジウムブロマイドを除き、透析チユーブにいれて
10mM トリス塩酸(pH8.0)−1mM Na3EDTA緩衝液に対
し、数時間以上4℃で透析する。得られたプラスミド
は、4℃で保存する。
るので下の方のバンドを集め、セシウムクロライド−エ
チジウムブロマイドの溶液〔50mM トリス塩酸(pH8.
0)−25mM Na3EDTA 8.0g、セシウムクロライド8.8
g、1.25mg/ml H2Oエチジウムブロマイド1.6ml〕を加え
て、再度35,000rpm40〜48時間、15℃で遠心す
る。UVランプをあてると、バンドが1本観察されるの
で、これを取り出し、n−ブタノールで4〜5回抽出し
てエチジウムブロマイドを除き、透析チユーブにいれて
10mM トリス塩酸(pH8.0)−1mM Na3EDTA緩衝液に対
し、数時間以上4℃で透析する。得られたプラスミド
は、4℃で保存する。
(3)分子量の測定 (2)で得られたプラスミドをアガロースゲル電気泳動及
び電子顕微鏡写真により、分子量を測定した結果、分子
量は、27メガダルトンであることが判明した。使用し
たアガロースゲル電気泳動及びDNAの検出条件は、下
記の通りである。
び電子顕微鏡写真により、分子量を測定した結果、分子
量は、27メガダルトンであることが判明した。使用し
たアガロースゲル電気泳動及びDNAの検出条件は、下
記の通りである。
電気泳動装置:サブマリン型電気泳動装置(17×13
cm)を使用した。
cm)を使用した。
電気泳動:0.09Mトリス、0.09Mホウ酸、2.5mM Na2EDTA
を含む緩衝液に1%(w/v)のアガロースを溶解させて、
その上にDNAサンプルを置いて、100V、3〜4時
間泳動を行う。
を含む緩衝液に1%(w/v)のアガロースを溶解させて、
その上にDNAサンプルを置いて、100V、3〜4時
間泳動を行う。
泳動後、ゲルを0.2μg/mlのエチジウムブロマイド溶
液にひたして染色し、UV254nm照射下で、ポラロイ
ドフイルムで撮影する。
液にひたして染色し、UV254nm照射下で、ポラロイ
ドフイルムで撮影する。
(4)制限酵素による分解 (2)で得られたプラスミドを表1の各種制限酵素と共に
表1の緩衝液中で37℃、1時間反応させる。反応溶液
に50mM Na2EDTA、5%SDS、25%グリセリン、0.
05%(w/v)ブロムフエノールブルーの混合溶液を1/5倍量
加え反応を停止させ、アガロースゲル電気泳動法によ
り、DNA断片の分子量を測定した。インターナルマー
カーとしては、λDNAをHind IIIおよびBamHIで分解
したDNA断片を、またColE1/(プラスミド)をHae
IIで分解したものを使用した。
表1の緩衝液中で37℃、1時間反応させる。反応溶液
に50mM Na2EDTA、5%SDS、25%グリセリン、0.
05%(w/v)ブロムフエノールブルーの混合溶液を1/5倍量
加え反応を停止させ、アガロースゲル電気泳動法によ
り、DNA断片の分子量を測定した。インターナルマー
カーとしては、λDNAをHind IIIおよびBamHIで分解
したDNA断片を、またColE1/(プラスミド)をHae
IIで分解したものを使用した。
各種制限酵素で分解して得られた断片の分子量を表2に
示す。
示す。
Claims (1)
- 【請求項1】高度好塩菌ハロバクテリウムハロビウムR
1は株(微工研菌寄6677号)から得られ、制限酵素に対
し下記の分解特性を有する、分子量27メガダルトン、塩
基組成GC(%)=61、融解温度(Tm)92.5℃の環状プラ
スミド。 BamH Iで6個の断片に、HindIIIで2個の断
片に、Bal Iで6個の断片に、PvuIIで7個の断
片に、Kpn Iで4個の断片に、Hpa Iで2個の
断片にPst Iで8個の断片にそれぞれ分解される。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP57147035A JPH0634724B2 (ja) | 1982-08-25 | 1982-08-25 | プラスミド |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| JP57147035A JPH0634724B2 (ja) | 1982-08-25 | 1982-08-25 | プラスミド |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS5936700A JPS5936700A (ja) | 1984-02-28 |
| JPH0634724B2 true JPH0634724B2 (ja) | 1994-05-11 |
Family
ID=15421048
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP57147035A Expired - Lifetime JPH0634724B2 (ja) | 1982-08-25 | 1982-08-25 | プラスミド |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| JP (1) | JPH0634724B2 (ja) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| PL176653B1 (pl) * | 1993-03-25 | 1999-07-30 | Univ California | Wektor ekspresyjny i sposób otrzymywania polipeptydów heterologicznych w komórkach Halobacteria |
-
1982
- 1982-08-25 JP JP57147035A patent/JPH0634724B2/ja not_active Expired - Lifetime
Non-Patent Citations (1)
| Title |
|---|
| BioorganicheskayaKhimiya8(2)(1982)P.266−268 |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| JPS5936700A (ja) | 1984-02-28 |
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