JPH06506583A - ベクターとして修正された植物ウイルス - Google Patents

ベクターとして修正された植物ウイルス

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 ベクターとして修正された植物ウィルス本発明は外来ペプチドの産生又は供与用 のキャリア(ベクター)としてのウィルスの使用に関する。更に詳しくは、本発 明はウィルス粒子(ピリオン)においてペプチドとして発現される外来核酸配列 の組込みによるウィルス核酸の遺伝子操作に関する。この明細書において、ペプ チド又はそれについてコードする核酸に適用されるような“外来”という用語は ベクターとして用いられる植物ウィルスに固有でないペプチド又は核酸配列を意 味する。一方、このような配列は外因性又は異種配列として記載することもでき る。“ペプチド”という用語には小さなペプチド及びポリペプチドを含む。
外来ペプチドのキャリアとしてウィルスの使用は複合ウィルスワクチンの分野で 広範囲に探求されている。このようなワクチンは異なる動物ウィルス成分のハイ ブリッドであるキメラウィルスに基づいている。通常、このようなハイブリッド の主成分は無害であるか又は無害にされたウィルスに由来し、副成分は病原ウィ ルスの選択された抗原成分である。例えば、ワタシニア又は弱毒化ポリオウィル スのようなポックスウィルスはヒトウィルスを含めた他の動物ウィルスの免疫原 成分に関するベクターとして用いてもよい。
しかしながら、上記技術はい(っかの欠点を有する。
このようなワクチンはデザインしてランさせる上で高くつく細胞培養系で増殖さ れたウィルスから産生される。
複合ウィルスアプローチでは生きた動物感染ウィルスの遺伝子操作を行うが、変 異が感染力、抗原力及び/又は病原力の変化した新規形のウィルスを生じるとい うリスクを伴う。ベクターとして用いられる動物ウィルスは動物が既に接触して その動物がそのベクターに対する抗体を既に産生じているかもしれないウィルス であることがよくある。したがって、そのベクターは東二ウィルスの組込み抗原 部位が免疫応答を誘導する前に免疫系により破壊されるであろう。
本発明は外来配列を発現するキメラウィルスのデザインにおいて根本的に異なる タイプのウィルス成分の使用により上記欠点を回避している。更に、本発明はウ ィルスワクチンの産生に際して遭遇する問題の解決に特に関連性を有するが、そ れは下記のような適用の概念及び分野の双方に関してかなり広い。
本発明では外来ヌクレオチド配列、即ちNNareでみられるように植物ウィル ス中に存在せず、結果的にいかなる天然存在植物ウィルスにも正常ではみられな いペプチドについてコードするヌクレオチド配列(RNA又はDNA)の発現に 関するベクター系として植物ウィルスを利用している。
本発明は外来ペプチドを含む植物ウィルスの集合粒子に関する。したがって、本 発明の植物ウィルスは天然ウィルスの修正形であり、便宜上修正ウィルスと称さ れる。
本発明による植物ウィルス中に組込まれる外来ペプチドはかなり異なったタイプ であり得、外来ペプチドの性質及びサイズとそれがウィルス粒子中又は上におか れた位置がインビトロ又はインビボで培養された場合に集合する修正ウィルスの 能力を干渉しないという制限のみに付される。広義の概念において、修正ウィル スはいかなる生物学的に有用なペプチド(通常ポリペプチド)から形成してもよ いが、その機能はその活性のために特別な立体配座を要する。これは例えば具体 的な生物系でその安定性又は供与様式を改善するためにそのペプチドとそれより 大きな分子との結び付きにより実現される。このようなペプチドの例はペプチド ホルモン;酵素;増殖因子:原生動物、ウィルス、細菌又は真菌源の抗原;抗イ デイオタイプ抗体を含めた抗体;免疫調節剤及びサイトカイン、例えばインター フェロン及びインターロイキン;レセプター;アトへシン;あらゆる前記タイプ のペプチドの一部又は前駆体である。ペプチドは5以上のアミノ酸を含むことが 好ましい。
本発明による植物ウィルスベクターに結合される広範囲の生物活性ペプチド配列 の中で、特別な重要性はワクチン、特に動物(ヒトを含む)ウィルスワクチンの 基礎である抗原ペプチドにある。ワクチン適用に関して、本発明は特に魅力的な エピトープ供与系を提供する。このような適用で用いられる場合、抗原ペプチド 成分は免疫系により、例えばウィルスのコートタンパク質の露出部分上における 位置決めで容易に認識されるようにウィルス粒子上に適切におかれる。したがっ て、後者に適用されるように、本発明は植物ウィルスのコートタンパク質の露出 表面に組込まれた病原体、例えば動物ウィルスに由来する抗原を含む修正植物ウ ィルスの集合粒子に関する。本発明はワクチンの免疫原成分としてこのような集 合修正植物ウィルス粒子の使用にも関する。
米国特許第4.407.956号、欧州出願第067゜553号、第194.8 09号、第221.044号、PCT出願WOjl1871062611及びW O第90100611号明細書では、植物自体に新しい性質を付与するか又はあ る貴重な化合物(例えば、植物代謝産物)を回収するために植物中への外因性物 質の導入用ベクターとしである植物ウィルスのDNA及びRNAを用いることが 既に提案されている。このような従来の提案において、関心は植物ウィルスの修 正DNA又はRNAと植物の表現型変換におけるその使用にすっかり向いている 。
これら先行明細書のほとんどは理論的及び推論的な性格であり、いずれも修正コ ートタンパク質を有する植物つイルスの全粒子(ピリオン)の単離又は動物ウィ ルスワクチンの製造もしくはその他いずれかの目的に関するこのような粒子の使 用について開示していない。FebsLettes (199G) 269.7 3−76において、タカマツらはタバコモザイクウィルスのコートタンパク質の カルボキシ末端に融合された5アミノ酸の外来ペプチドを発現する試みについて 記載している。しかしながら、修正植物ウィルス粒子は記載された実験で産生さ れなかった。
本発明に従い修正植物ウィルス粒子を産生ずるため、植物ウィルス核酸は、外来 ペプチド、例えば動物ウィルス抗原についてコードするヌクレオチド配列をコー トタンパク質の露出部分についてコードする植物ウィルスゲノムのその部分に導 入し、植物又は植物細胞を修正ウィルス核酸で感染させ、修正ウィルスの集合粒 子を収集することにより修正される。この操作は、DNAウィルスのケースにお いてウィルスのDNAの直接操作、又はRNAウィルスのRNAに対応するcD NAの操作で最良に実施される。RNAウィルスのケースでは、修正DNAのR NA転写物は修正ウィルスの集合粒子の収集前に増殖段階を行うため植物細胞又 は好ましくは全植物の接種用に通常製造される。DNAウィルスのケースにおい ては、DNA自体が植物中に導入される。このやり方で、外来ペプチドはキャプ シドタンパク質の一部として最初に発現され、それにより全ウィルス粒子の一部 として産生される。こうして、ペプチドは使用そのものに向けられた接合体分子 として産生される。一方、ウィルスの遺伝的修正もウィルス粒子から開裂を行う 適切な物質の適用により望ましいペプチドを放出させるようにデザインしてよい 。
商業的規模で修正ウィルスを産生ずるためには、各バッチのウィルス産生用に感 染性接種原(DNA又はRNA転写物)を製造する必要はない。代わりに、初期 接種原は植物に感染させるために用いてよく、得られた修正ウィルスは後のバッ チ用の接種原として全ウィルス又はウィルスRNAを産生ずるために植物で継代 してもよい。
本発明の目的にとり、ベクターとしての使用上ウィルスの特に貴重な群は、キャ プシドについてコードする核酸が他の機能性分子についてコードするものとは別 の部分であって、そのコートタンパク質がβ−バレル構造を有するものである。
この構造を有するウィルスの使用の利点はβ−シートの個別鏡開におけるループ が外来ペプチドの挿入用に便利な部位を与えることである。1以上のループの修 正が本発明に従う外来ペプチドの発現にとり好ましい戦略である。この群にはカ ラピーモザイクウィルス及びボッド・モトル(pad moNlel豆ウィルス のようなコモウィルス(comoマ1tus) とトマトリングスポットウィル ス及びストロベリー潜伏リングスポットウィルスのようなネポウィルス(nep oviz+)がある。コモウィルスの利点はそれらのキャプシドが個別に操作で きる3つの異なるβ−バレルを各々60コピー含むことである。
類似した三次元構造だが但し単一タイプのβ−バレルを有する他のウィルス群と してはトンブスウイルス()ombusvirus)及びソベモウイルス(so bemowitas)がある。構造類似性を有するが但しコートタンパク質がβ −バレル構造を有しない他の群の植物及び動物ウィルス、例えば植物及び動物ラ ブドウィルスも本発明に従い修正してよい。
外来RNA又はDNAは様々な立体配置で植物ウィルスゲノム中に挿入してよい 。例えば、それは現存核酸への付加として又は現存配列の一部の置換として挿入 され、その選択はキャプシドタンパク質の構造と、付加又は置換が植物で集合し うる遺伝的修正ウィルスの能力の干渉なしに行えるという容易性により大部分決 定される。本発明の且的にとり許容できる最も適切なサイズの付加又は欠失の決 定は本開示からみて実験により各具体的ケースで行ってよい。付加インサートの 使用は一部の場合において置換インサートよりも大きな柔軟性を与えるようであ る。
本発明によれば、植物宿主における修正ウィルスの増殖及びその重要な産出物の 産生はワクチン用の抗原と他のタイプのペプチドを宵利なやり方で産生ずる本発 明の新規戦略の重要部分である。前記のように、挿入される異種ヌクレオチド配 列としては容易に開裂されるアミノ酸についてコードするものがあり、そのため 増殖段階後に望ましい物質がウィルス粒子から分離される。ペプチドの全開裂の 代替法として、一部のケースにおいてはキャプシドの主要部分内でそのままだが ウィルス核酸から分離された形でペプチドを放出することが可能でかつ望ましい 。
CPMVキャプシドの表面上で発現できる多数のエピトープの中には口蹄疫ウィ ルス(FMDV) 、ポリオウィルス、ヒトライノウィルス(HRV)及びA全 肝炎ウィルス(HAV)のようなピコルナウィルスからのもの、ヒト免疫不全ウ ィルス(HI V)のgp41又はgp120いずれかと関連したエピトープと ヒトパピローマウィルス(HP V)の主コートタンパク質に由来するエピトー プが含まれる。
ワクチンの製造に適用されるように、本発明は従来のワクチン、動物ウィルスに 基づ(組換えワクチン及びペプチドワクチンよりも多くの利点を有する1例えば 1、非常に高収率の純粋なウィルスが感染植物から入手でき、組織培養産生ステ ップが不要であることによる低い産生コスト 2、従来の組換え動物ウィルスワクチンのケースのように、植物ウィルスが動物 で感染及び複製できず、このためビルレフト形に変異できないことから改善され た安全性 3、一部の植物ウィルス、特にコモウィルスは例外的に安定であり、精製された 調製物は感染力を失うことなく乾燥させて室温で長年にわたり貯蔵できる。この 性質によれば徐放出ワクチンを開発でき、免疫力を維持する上で要求される注射 回数を減少させることができる。
4、動物は植物ウィルスと接触したことがないようであり、したがってベクター に対する抗体をまだ有さず、このため複合ワクチンの有効性を増加させる。
5、植物ウィルスはベクターとして以前に用いられたほとんどの動物ウィルス、 例えばワクシニアよりも小さく、インビボにおける相同的組換え(トランスフェ クション)と対比されるようにインビトロ操作によりキメラ遺伝子を導入できる 。
この系を実証するため、植物ウィルスのカラビーモザイクコモウィルス(CPM v)が選択された。CP M Vの三次元構造は粒子構造の破壊なしに修正に適 した部位の確認を可能にした原子分解で解析された。
本発明の広い適用性を実証するため、3種の異なる動物ウィルスの抗原部位が用 いられた。2種はピコルナウィルス群の動物ウィルスに属するウィルスーロ蹄疫 ウィルス(FMDV)及びヒトライノウィルス(HRV)であった。この群には いくつかの重要な病原体、具体的にはFMDV、灰白髄炎(ポリオ)及びA型肝 炎がある。
選択された東三のウィルスはいかなる既知の植物ウィルスとも類似性を有さず、 成功したワクチンが現在入手できないヒト免疫不全ウィルス(HI V)であっ た。
本発明は下記添付図面を参考にして更にここに記載される: 図1は単純なT=3ウィルス、ピコルナウィルス及びコモウィルスキャプシドの 構造の比較について示す。各ケースにおいて、1つの台形は1つのβ−バレルを 表す。
このため、コモウィルスの大きな(L又はVF37)キャプシドタンパク質はT =3ウィルスのC及びBタイプサブユニット又はピコルナウィルスのVF2及び VF6に相当する2つの共有結合β−バレルからなる。コモウィルスの小さな( S又はVF23)キャプシドタンパク質はT=3ウィルスのAタイプサブユニッ ト又はビコル+ウィルスのVPlに相当する単一のβ−バレルを含む。
図2は標準β−バレルの二次構造及び接合性について示す。β−シートの個別鎖 はB−Gで標識され、タンパク質のアミノ(NH2)及びカルボキシ(COOH )末端が示されている。
図3はプラスミド(A)p PMM2902及び(B)pB77−123につい て示す。点模様領域はプラスミドのCPMV特異性領域を表すが、そのコード領 域は更に広い部分により示され、その上では様々なウィルスコードタンパク質が マークされている。関連制限酵素部位も示される。プラスミドの組立ての詳細は Ho1nes+ ら(1989+とDe+sen+及びLomonos+oll  (1991)でみられる。
図4はVF23のアミノ末端40アミノ酸についてコードするCPMV M R NAの領域を示す。ヌクレオチド配列下の数値はM RNA配列に関するもので 、唯一のNhe I部位の位置が示されている。VF23のβB及びβC!1を 形成する上で関与するアミノ酸は標準1文字コードを用いて示されたタンパク質 のアミノ酸配列上で示される。
図5は(A)トップ(ポジティブ)鎖によりコードされたアミノ酸配列と一緒に pFMDVの組立てに用いられたオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列と(B ) FMDV特異性オリゴヌクレオチドの挿入後におけるVF23の構造につい て示す。矢印領域は挿入されたFMDVエピトープの大きさについて示す。クロ ーニング時に復元されないNhe1部位はxNheIで示される。挿入配列中に 存在する特徴的B g I 11部位も示されている。
図6はプラスミドpFMDVの組立て方について示す。
様々なCPMV特異性領域の表示は図3のとおりである。
VF23に挿入されたFMDV特異性領域はCPMV特異性コード領域中で黒色 セグメントとして示される。
図7はプラスミドpMT7−601について示す。様々なCPMV特異性領域の 表示は図3のとおりである。
関連制限部位も示されている。
図8は部位特定変異誘発による“置換”ベクターの組立て方について示す。アス テリスクは部位特定変異誘発でCに変えられて新しいAat11部位を形成する T残基について示す。
図9は(A)トップ(ポジティブ)鎖によりコードされたアミノ酸配列と一緒に pMT7−HIVの組立てに用いられたオリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列 と(B)HIV特異性オリゴヌクレオチドの挿入後におけるVF23の構造につ いて示す。矢印領域は挿入されたHIVエピトープの大きさについて示す。挿入 配列中に存在する特徴的Pvu I部位も示されている。
図10は(A)トップ(ポジティブ)鎖によりコードされたアミノ酸配列と一緒 にI)MT7−HRVの組立てに用いられたオリゴヌクレオチドのヌクレオチド 配列と(B)HRV特異性オリゴヌクレオチドの挿入後におけるVF23の構造 について示す。矢印領域は挿入されたHRVエピトープの大きさについて示す。
挿入配列中に存在する特徴的C1aI部位も示されている。
図11はブラスミFl)MT7− Hr V及びpMT7−HRVの組立て方に ついて示す。様々なCPMV特異性領域の表示は図3のとおりである。VF23 に挿入されたHIV及びHRV特異性領域はCPMV特異性コード領域中で黒色 セグメントとして示される。
図12+!pMT7− FMDV−1及びpBT7−123転写物の混合物で接 種されたカラピー植物5例(列A−E)の葉のタンパク質抽出物の“ウェスタン プロット”について示す。そのプロットはFMDVエピトープに特異的な血清で プローブ探査された。列“偽”及び“wt”は各々偽接種又は野生型CPMV  RNAで接種された葉の抽出物を含む。“ウィルス”とマークされた列は精製さ れた野生型CPMVを含む。マーカータンパク質のサイズはプロットの右側で示 されている。
コモウィルス コモウィルスは主にマメ科植物に感染する少(とも14種の植物ウィルスの群で ある。それらのゲノムは約2811I11径の異性粒子で別々に包膜された異な るサイズの一本鎖ポジティブセンスRNAの2分子からなる。2タイプの核タン パク質粒子は塩化セシウム密度勾配におけるそれらの挙動性からミドル(M)及 びボトム(B)成分と称され、粒子内のRNAは各々M及びB RNAとして知 られる。双方のタイプの粒子は同一のタンパク質組成を有し、大(VF37)及 び小(VF23):+−トタンバク質各々の60コピーからなる。核タンパク質 粒子に加えて、コモウィルス調製物はトップ(T)成分として知られる空の(タ ンパク質のみ)キャプシドを様々な量で含有する。
コモウィルス群のタイプメンバー、カラピーモザイクウィルス(CPMV)のケ ースにおいて、M及びB双方のRNAはポリアデニル化され、小さなタンパク質 (VPg)をそれらの5′末端に共有結合させていることが知られている。他の コモウィルスに関して更に限定された研究ではこれらの特徴がその群のすべての メンバーのRNAにより共有されることを示唆している。CPMYからの双方の RNAが配列決定され、ポIJ(A)尾部を除いて3481(M)及び5889 (B)ヌクレオチドからなることが示された(yan Wexenbeekら、 19113;Lomonossofl及び5hxnks、 1983)。双方の RNAは単一の長いオープン読取り枠を含み、ウィルス遺伝子産物の発現は大き な前駆ポリペプチドの合成とその後で開裂から生じる。双方のRNAは全植物の 感染に要求されるが、大きな方のB RNAは原形質体で独立して複製でき、ウ ィルス粒子はこのケースで産生されない(Goldbxchら。
1980)。この観察は、初期の遺伝子研究と合わせれば、コートタンパク質が M RNAによりコードされることを立証した。
CPMVの3.5入電子育度地図ではCPMVとトンブスウイルス、特にトマト ブッシースタント(T B S V)及びソベモウイルス、特にサザンビーンモ ザイク(SBM V )のようなT−3植物ウイ/lスとの間で明確な関係があ ることを示す。これら後者のウィルスのキャプシドは180の同一コートタンパ ク質サブユニットから構成され、各々が単一のβ−バレルドメインからなる。こ れらはピリオン内で3つの異なる位置A、B及びCを占めることができる(図1 )。CPMVの2つのコートタンパク質は3つの別個のβ−バレルドメインから なることが示されたが、2つはVF37に由来し、1つはVF23に由来する。
このため、T;3ウイルスと共通して、各CPMV粒子は180のβ−バレル構 造から構成される。VF23からの単一ドメインはTBSV及びSBMVのAタ イプサブユニットの場合に類似した位置を占め、一方VP37のN及びC末端ド メインは各々C及びBタイプサブユニットの位置を占める(図1)。
CPMVとその群のもう1つのメンバー、ボッド・モトル豆ウィルス(BPMV )の結晶のX線回折分析ではBPMV及びCPMVの3−D構造が非常に類似し ており、一般にコモウィルス群に典型的であることを示している。
CPMV及びBPMVの構造において、各β−バレルは様々な長さのループによ り接合された逆平行β−シートの8つの鎖から主になる。その鎖の接合性及び名 称は図2で示される。平坦なβ−シートはB、C5DSE。
F、G、H及びIシートと呼ばれ、接合ループはβローβC1βD−βE1βF −βG及びβH−βIループと称される。
コモウィルスは動物ピコルナウィルスとも構造的に関連している。ピコルナウィ ルスのキャプシドは3種の異なるコートタンパク質VPI、VF6及びVP3P 2O60コピーからなり、各々は単一のβ−バレルドメインからなる。コモウィ ルスのケースのように、これらのコートタンパク質は前駆ポリタンパク質の開裂 により放出され、VF6−VF6−VPIの順序で合成される。
CPMVの三次元構造とピコルナウィルスの場合との比較ではVF37のN及び C末端ドメインがVF2及びVF3に各々相当し、VF23がvPlに相当する ことを示した(図1)。構造的位置と遺伝子順序との間における相同性はVF3 7が2種のピコルナウィルスキャプシドタンパク質VP2及びVF6の未開裂形 に相当することを示唆している。
コモウィルスとピコルナウィルスとの主要な差異の1つは、粒子の基本的構造が 非常に類似しているにもかかわらず、コモウィルスのタンパク質サブユニットが ピコルナウィルスでみられるβ−バレルの鑓の間で大きな挿入を欠くことである 。β−シート間における4つのループ(βローβC1βD−βE1βF−βG及 びβH−β■−図2参照)はピリオンの構造一体性を維持する上で重要でないが 、但し本発明によれば動物ウィルスからの抗原部位のような外来ペプチド配列の 発現部位として用いられる。
CPMVウィルスの修正 CPMVのコートタンパク質中に挿入を行うためには、ウィルスのゲノムを操作 する手段を有することが必要である。転写ベクターpPMIにおけるCPMV  MRNAの全鎖長cDNAクローン(p PMM2902)は入手可能であった (図3A参照) (Ahlquist及びIanda。
19114、 t(alnes+ら(1989)とHo1ness (1989 ))。我々はpPMM2902からの転写物が高度精製ピリオンB RNAの存 在下でカラビー葉肉原形質体で電気穿孔された場合に増殖でき、したがってウィ ルスの増殖及び集合に影響を与えることなくウィルスコートタンパク質に修正を 施せることを示した。
pPMM2902でのウィルス複製に要求されるタンパク質を提供する上でピリ オンから精製されたBRNAが野生型M RNAで交差汚染されているという生 じつる危険性からみて、我々はB RNAの全鎖長cDNAクローン、pBT7 423を組み立てた(図3B参照)。B RNAの全鎖長コピーは修正T7プロ モーターのすぐ下流である。制限酵素M l u Iでの直鎖化後に、天然B  RNAとサイズが同一の転写物がT7RNAポリメラーゼにより合成できる。p PMM2902及びpBT7−123からの転写物の混合物はカラピー原形質体 中に電気穿孔された場合に全ウィルス感染を生じ、したがって天然B RNAの 使用に置き換わる。
我々は外来ペプチドの挿入用にVF23でβB−βCループを選択した。このル ープはウィルス粒子の表面上で明らかに露出しており、コンピューターモデリン グではこの部位で挿入された大きなループさえもキャプシド構造及び安定性に関 与する隣接サブユニット間の相互作用に干渉しそうにないことを示した。このル ープは外来配列が挿入されるM RNA特異性配列の2708位で唯一のNhe 1部位を有する(図4参照)。
ピコルナウィルスの口蹄疫(FMDV)及びヒトライノウィルス(HRV)とレ ンチレトロウィルスのヒト免疫不全ウィルス(HI V)の主要抗原部位は動物 ウィルスに対するワクチンの産生において本発明の用法を実証するために用いた 。
FMDVループタンパク質のセグメントについてコードCPMVのVF63(D 13B−13cループ中に″FMD■ループ”を挿入するため、双方とも長さ8 1残基の2つの相補的オリゴヌクレオチドを化学的に合成した。それらの配列は 図5Aで示される。ポジティブセンスオリゴヌクレオチドはFMDv血清型01 株BFS1860のVPIからのアミノ酸残基136−160についてコードす る配列を含む。オリゴヌクレオチドのヌクレオチド配列はCPMvでみられるコ ドン使用優先性について考慮するためにデザインしたが、スクリーニングを容易 にするため配列の中間にB g l 11部位を含む。アニーリングした場合、 オリゴヌクレオチドはN h e I適合末端のある二本鎖DNA配列を与える 。このため、そのオリゴヌクレオチドはpPMM2902の唯一のNhe1部位 中に挿入できる。VF23の配列におけるこのような挿入の効果は図5Bで示さ れている。FMDVループの挿入を容易にするため、FMDV特異性オリゴヌク レオチドはVF23についてコードする配列を含むppMM2902のM13サ ブクローン中に最初に結合させた。
これはFMDV特異性配列を保有するクローンを配列分析で容易に確認できるよ うに行った。すべての標準DNA操作はMxniatisら(1982)に従い 実施した。p F M D Vの組立ての詳細は以下で示され、図6で図示され ている。
ステップ1.プラスミドpPMM2902はCPMVM RNA特異性配列内に おいて2296及び3423位で2回切るが、但しプラスミドp P M lの 配列内では切らない制限酵素5stiで切断した。アガロースゲル電気泳動後に 、大(6、0kb)及び小(1,1kb)双方の断片をゲルから電気溶出により 精製した。1.1kbSstI断片をバクテリオファージMl 3mp 18か らの5stI切断ホスフアターゼ処理複製形DNA中に結合させた。結合混合物 は塩化カルシウム操作を用いて大腸菌株JM101を形質転換するために用いた 。MRNAからの1. 1kbS s t I断片を含むプラークはLac相補 性アッセイ及びDNA配列分析により確認し、1つのM13−JRIを次の研究 用に選択した。
ステップ2.M13−JRIの二本鎖復製形DNAをBirnboim及びDe 17 (+979)の方法により感染大腸菌株JM101細胞から単離した。精 製DNAを制限酵素NheIでの切断により直鎖化し、直鎖化プラスミドを子牛 腸ホスファターゼで処理した。FMDVからのVPIのアミノ酸残基136−1 60についてコードするNhel適合末端のある2つのオリゴヌクレオチドはポ リヌクレオチドキナーゼを用いてATPでリン酸化し、煮沸及び徐冷却で互いに アニーリングさせた。アニーリングされたオリゴヌクレオチドをNheI切断M 13−JRI中に結合させ、結合混合物を用いて大腸菌株JMIOIを形質転換 させ、形質転換混合物をJMIOI地に塗った。
多数のプラークをプレート上で見出したが、そのうちの20は配列分析用に選択 した。バクテリオファージをJ M 101で増殖させ、一本鎖DNAを正確に 5xBctら(198i1)で記載されたように単離した。NheI部位周囲に おけるバクテリオファージDNAの領域のヌクレオチド配列はプライマーとして M RNA配列のヌクレオチド2735−2752に相補的な18マーのS’  AGT−TAC−TGC−TG丁−AAC−G丁C3’ を用いてBiggIら (1983)lこより修正されたようなジデオキシ法で決定した。分析されたプ ラークの中で、1つの名称M13−ushalは正確な向きで望ましい配列の単 一コピーを有していた。
ステップ3.M13−ushaIを大腸菌株JMIQ1で増殖させ、複製形DN AをBirnbaim及びDelr (19791の方法により感染細胞から単 離した。そのDNAを5stIで切断し、1.1kb断片をアガロースゲル電気 泳動で精製した。この断片を子牛腸ホスファターゼで処理されたpPMM290 2(前記参照)からの大きな(6,0kb) S s t I断片に結合させた 。結合混合物は塩化カルシウム法を用いて大腸菌株JM83を形質転換させるた めに用いた。形質転換混合物を100μs/mlカルベニシリン含有し寒天プレ ート上に塗り、そのプレートを37℃で一夜インキユベートした。12のカルベ ニシリン耐性コロニーを次の研究用に選択した。クローンをLブロス中で11培 養物として増殖させ、プラスミド“ミニプレツブ“(miniprep)を調製 し、制限酵素切断により分析した。酵素ss t ISBglll及びEC0R vでの切断により得られたパターンから、4コロニーが正確な向きでFMDV特 異性オリゴヌクレオチドの配列を含むCPMVの全鎖長クローンからなることを 導き出すことができた。次いで、これらのうちの1つpFMDVを大規模に増殖 させ、プラスミドDNAをBirnbaim及びDo17 (1979)の方法 により単離し、塩化セシウム/臭化エチジウム勾配(Mxnizt目ら、 19 g2)を用いて遠心により更に精製した。
pFMDV転写物の性質 1、精製pFMDV DNAをEcoRI切断により直鎖化し、正確にHotn essら(19N+によりpPMM2902に関して記載されたように大腸菌R NAポリメラーゼを用いて転写した。ホルムアルデヒド含有アガロースゲルの産 物の電気泳動(L!h「xchら、 1977)では標準ウィルスM RNAと 同時移動する転写物の存在について現した。
2、鋳型DNAを除去するためDNA5elでの処理と塩化リチウム沈降の後に 、転写物を358−メチオニンの存在下においてメツセージ依存性ウサギ網状赤 血球系(Pelhxm及びIxck+on、 1976)でインビトロ翻訳した 。その産物をSDS含有ポリアクリルアミドゲル上で電気泳動により試験しくl aeamli、 1970)、乾燥ゲルのオートラジオグラフィーにより視覚化 した。オートラジオグラフでは天然M RNAの翻訳産物と同時移動する105 及び95 kDzの2つのタンパク質の存在について現した。
3、植物細胞で複製されるp FMDVの転写物の能力を下記のように試験した :カラピー葉肉原形質体をdeVxtennesら(1985)により記載され たように調製した。pFMDvからの転写物をpBT7−123 C全鎖長コピ ーB RNAを含むプラスミド)からの転写物とミックスし、Halnu+ら( 1989)により記載されたように原形質体中に電気穿孔した。コントロールと して、原形質体の同調製物のサンプルをp BT7−123及びpPMM290 2からの転写物の混合物で電気穿孔した。電気穿孔後72時間目に原形質体を収 集し、核酸をde Varennesら(1985)により記載されたように抽 出した。RNAのサンプルをホルムアルデヒド含有アガロースゲル上で電気泳動 しくLehtachら、1977)、核酸をハイボンド(Hybond)N膜〔 アマ−ジャム・インターナショナル(入mershamInte!nation al))上にプロットした。核酸をUV光照射で膜に架橋させた。その膜はFe 1nbeB及びVogelsjeia(1983)により記載されたように32 Pで標識されたMRNAのヌクレオチド482−2211に相当するH i n  d III断片形p P M M 2902を用いてMRNA配列についてプ ローブ探査した。pBT7−123とpPMM2902又1tpFMDV −1 のいずれかで電気穿孔された原形質体からのサンプルはMRNA特異性配列の存 在について現し、FMDVループについてコードする配列の存在が転写物の複製 を妨げないことを確かめた。p FMDV復製の子孫がFMDVループについて コードする配列を保有していることを確認するため、複製膜を“オリゴ標識”さ れたポジティブセンスFMDVオリゴヌクレオチドでプローブ探査しくFe1n beBg及びvagel++ein、 1983)、(+)センス特異性プロー ブを得た。pBT7−123及びpFMDV転写物の混合物で電気穿孔された原 形質体からのサンプルはM RNAに関して予想される位置で明らかなシグナル を示したが、そのシグナルはpPMM2902コントロールに存在しなかった。
4、FMDVループを含むタンパク質サブユニットがピリオンに集合することを 立証するため、感染原形質体からの抽出物を免疫吸着電子顕微鏡観察によりウィ ルス粒子の存在に関して試験した。pBT7−123及びpFMDVからの転写 物の混合物で電気穿孔された原形質体のサンプルを23ゲージ針で反復通過によ り溶解させた。抽出物をエッベンドルフ小遠心管で遠心し、上澄を試験用に保留 した。10μlサンプルの上澄を抗CPMY抗血清でコートされた全電子顕微鏡 (em)グリッドと共にインキュベートした。洗浄と酢酸ウラニル染色の後に、 そのグリッドをJ EOL 1200電子顕微鏡を用いて試験した。CPMVピ リオンの特徴的外観を有する28nm径の粒子がみられた。これはVP23にお けるFMDVループの存在がウィルス集合を妨げないことを証明している。
前記は本発明に従い修正された植物ウィルスが植物原形質体中に電気穿孔された 場合に増殖してウィルス粒子に集合することを立証している。修正された植物ウ ィルスを大規模に産生ずるためには、全植物に直接接種できて前記原形質体系の ように複製してウィルス粒子に集合する組立て物を製造することが必要である。
したがって、我々は得られる転写物がそれらの5′末端で“キャップ”構造をと り、RNA合成がより効率的なプロモーターにより駆動されるようにp P M  M 2902を修正した。
pMT7−601 (図7)を産生ずる上でpPMM2902の修正に関するス テップは以下で詳細に記載されて1、精製CPMV M RNAに対する1番鎖 cDNAはプライマーとしてpdT を用いて正確に+2−18 2−18Lo++ol! ら(19B2)により記載されたように合成した。
2番鎖合成は下記オリゴヌクレオチドを用いてプライミングした。
P+tl T7 プロモーター ↓5′ 末 l M RNA5’ CCCTG CAGTAATACGACTCACTATAGTATTAAAATCTTAAT AG合成条件はLomonostoffら(1982)及び5hanksら(1 986)で記載されたとおりであった。
2、二本鎖cDNAを制限酵素PstI及びBamHI (1504位でM R NA配列を開裂する)で切断し、1、 5kbP s t I/B amHI断 片をPstI/BamH1切断Ml 3mp 18に結合させた。結合ミックス を用いて大腸菌株JMIOIを形質転換させた。インサート保有組換えファージ をlac相補性アッセイにより確認し、l11gg1nら(191131により 修正されたように“T−トラック”分析(S!Be+ら、1980)で正確なイ ンサートの存在に関して調べた。1つのクローンM13−MT7−6を次の分析 用に選択し、M RNA特異性配列の5−末端200ヌクレオチドの配列をBi gginら(1983)により記載されたように決定したところ、pPMM29 02における相当配列と同一であることを示した。
3、二本鎖複製DNAをBi+nboim及びDoly (19791の方法に よりM13−MT7−6で感染された大腸菌JMI01細胞から単離した。二本 鎖DNAをPstl及びBglll(189位でM RNA配列を切断する)で 切断し、放出された200bp断片をアガロースゲル上での電気泳動とそれから の電気溶出により精製した(Maniatisら、1982)。
4、プラスミドp P M M 2902 (Holnes+ら、 1989) をPstI及びBglllで切断して1,1及び6.Okbの2つのDNA断片 を産生じた。小さい方(1,1kb)の断片はCPMV M RNAの配列の最 初の189ヌクレオチドに結合された大腸菌プロモーターの配列を含み、一方大 きい方(6、Okb)の断片はpUC9に結合されたM RNAの配列の残りを 含む。切断物を子牛腸ホスファターゼで処理し、2つの断片をアガロースゲル電 気泳動で分離し、6.Okb断片を電気溶出により回収した。
5、M13−MT7−6からの200bpP s t I/Bg1]1とp P  M M 2902からの6.0kb断片を一緒に結合させ(MBiati+ら 、 1982)、混合物を用いて大腸菌株JM83を形質転換させた。カルベニ シリン耐性コロニーの数を確認したところ、1つのpMT7−601は望ましい 構造を有することが示された。したがって、大規模量のプラスミドpMT7−6 01はpFMDVに関して記載されたように製造した。
6、EcoRIで直鎖化後、プラスミドp M T 7−601はT7RNAポ リメラーゼを用いて転写してRNAを得たが、これはホルムアルデヒド含有アガ ロースゲル上で分析した場合に天然ピリオンM RNAとサイズが同一であった (Lehtachら、1977)。転写物の収率は直鎖化鋳型DNAのμg当た り約1μgの全鎖長M転写物であった。
7、pMT7−601及びpBT7−123からのT7転写物の混合物をカラピ ー葉肉原形質体中に電気穿孔した場合、子孫RNAのノザンプロット分析ではp MT7−601からの転写物が生物学的に活性であることを示した。原形質体単 離及び核酸分析のために用いられた方法はp F M D Vの生物学的性質を 分析するために用いられた場合と同一であった。
カラビー植物におけるキャップ化pB77−123及びpBT7−123及びp M77−601のサンプルを各々Mlul及びEcoRIで直鎖化した。直鎖化 された鋳型の一部は本質的にX1Ble+−Gtxafら(19811)により 記載されたようにGpppGの存在下で77RNAポリメラーゼを用いて転写し た。転写反応液は0 、 1 mg/ml直鎖化DNA鋳型、pH8,0の40 mMhリスHC1゜25mMNaCL、8mMMgC12mM塩酸塩酸スペルク ジ2 ″−各0.5mMのUTP、ATF’及びCTP。
0.025mMGTP、0.5mMGpppG、0.05mg/ml B S  A、 10mMDTT、 200単位/m1RNAガードを含有していたが、転 写を1400単位/mlの最終濃度までT7RNAポリメラーゼの添加により開 始させた。
インキュベートは37℃で2時間であった。30.60及び90分間目にGTP の5mM溶液の一部(転写反応液1ml当たり5μりを加えた。転写後、EDT Aを151nM最終濃度まで加え、転写物の一体性をホルムアルデヒド含有アガ ロースゲル上で電気泳動により調べた。転写混合物を2倍容量のフェノール/ク ロロホルム(1,1マ/y)で抽出し、核酸をエタノールで2回沈降させた。核 酸を遠心により収集し、エタノールで洗浄し、真空下で乾燥させた。核酸を植物 への接種のためpH8,0の50mMトリスリン酸に溶解させた口 10日齢カウピー〔ビグナ・ウンギクラタ変種カリフ中ルニアササゲ(Vign i unguiculut マar、 Cx1iforniablxcke7e ) 〕の−次葉をカーボランダムでダスト化し、pMT7−601及びpBT7 −123に由来する転写物の1 + 1 (W/v)混合物を穏やかにこすり合 わせながら葉に適用した。様々な転写物濃度を用いたが、但しすべてのケースに おいて最終接種原容量は50μ!であった。
得られた結果は、全量5μgの各転写物を一次葉当たりで適用した場合に、接種 された植物の100%がCPMV感染に特徴的な症状を日常的に現すことを示し た。このような植物の接種及び上部双方の葉におけるCPMV特異性配列の存在 は“ドツトプロット”分析により確認した。接種葉及び三葉のサンプルは10号 コルク穿孔器を用いて採取し、1101IIリン酸ナトリウム0.4mlに漫°  して抽出した。そのサンプルを遠心し、上澄5μ!を20XSSCで前湿潤さ れたニトロセルロースフィルターに適用した。核酸をUV光照射で膜に架橋させ 、MRNA配列のヌクレオチド482−2211からなる32P “オリゴ標識 ” (FeinbeB及びVogel+tein、 1983)プローブを用い てM RNA特異性配列についてプローブ探査した。ハイブリッド形成及びフィ ルター洗浄に関する条件は1lxniat目ら(1982)により記載されたと おりであった。乾燥後、フィルターをオートラジオグラフィーに付した。強いハ イブリッド形成シグナルはCP M V特異性配列の存在を示した。
pMT7−FMDV−I、pMT7−HIV及びpMT7−HRVの組立て pMT7− FMDV−Iを組立テルタメ、pMT7−601及びpFMDVを 双方とも制限酵素5stIで切断し、しかる後pMT7−601からの切断物を 子牛腸ホスファターゼで処理した。5stIはM RNA特異性領域の2296 及び3423位で各プラスミドを2回切断して1.1kb断片を放出する。既に 記載されたように、この5stI断片はFMDVループ挿入が行われたβB−β Cループを有するVP23の領域を含んでいる。
アガロースゲル上で電気泳動後、pFMDvからの1゜lkb断片とベクター配 列及びM RNA特異性配列の残り全部を含むp M T 7−601からの5 .1kb断片を電気溶出により回収した。2つの5stI断片を一緒に結合させ 、その混合物で大腸菌株JM83を形質転換させた。いくつかのカルベニシリン 耐性コロニーを選定し、“ミニプレツブ”を造り、プラスミドDNAを制限酵素 切断により試験して、FMDVループを含む組換え体を確認した。1つのこのよ うなりローンを確認してpMT7−FMDV−Iと命名し、大規模で増殖させた 。すべてのDNA操作はpFMDV及びpMT7−601の組立てに関して記載 されたとおりであった。
pFMDvとその誘導体pMT7− FMDV−1では双方ともVP23のβB −βCルーβCループ中に挿入している。外来配列の挿入に際してループのサイ ズ増加を制限するために置換ベクターをデザインしたが、その場合に外来配列は 天然βB−βCループに加えられるよりもむしろVP23においてそれと置き換 わる。VP23についてコードするCF’MVゲノムの領域のヌクレオチド配列 において、2740位における単一のサイレント塩基変化(UからCへ)はアミ ノ酸バリン27において唯一のAat11部位を形成する。M RNAの配列に おける変化は図8で示されている。Aat11部位の形成によればCPMVにお いて天然βB−βCループからの6アミノ酸についてコードするヌクレオチド配 列をNheI及びAatll切断で除去することができる。その後に、その配列 はNheI及びAatll適合末端で何らかの配列により置き換えることができ る。
2つの異なる配列を変異M RNA配列のNheI及びA a t If!位間 の配列に置き換わるようにデザインした。VP23中に置換される第一の配列は ヒト免疫不全ウィルス(HIV−1)の経膜糖タンパク質gp41からの残基7 35−752についてコードするオリゴヌクレオチドからなっていた。この配列 はこの領域に関する合成ペプチドが血清陽性エイズ患者の抗血清による酵素結合 免疫吸着アッセイ(ELISA)で認識され、ある範囲のHIV−1単離物を中 和する抗体を誘導できることから選択された(にenned7ら、 1986; Chanhら、 1986;Dxglei+hら、1988]。第二の配列はヒ トライノウィルス14 (HRV14) のVP 1からの残基85−99+= ついてコードするヌクレオチド配列からなる。双方のケースにおいて、オリゴヌ クレオチドはスクリーニングを容易にするため制限酵素部位を含むようにデザイ ンした。
オリゴヌクレオチドの配列とVP23のアミノ酸配列における置換の効果は図9 及び10で示されている。pMT7−HIV及びpMT7− HRV(7)組立 テニ関すルステップは以下で示され、図11で図示されている。
ステップ1.M13−JR−1(図6参照)を大腸菌株CJ236で増殖させ、 dU金含有本鎖DNAをKunkel (19115)により記載されたように 単離した。MRNA配列の2740位におけるTからCへの変異はKunkel  (1985)により記載されたようにプライv −CTG−CTG−TGA− CGT−CTG−AAA−人を用いてdU金含有本11M13−JRIDNAの オリゴヌクレオチド特定変異誘発により行った。これによりクローンM13−J RAatllを組み立てた。変異は一本鎖DNAのジデオキシ配列分析(Big ginら、1983)と二本鎖複製形DNAの制限酵素切断により確認した。
ステップ2.M13− JRAa tllの復製形DNAを単離し、NheI及 びAatllで切断し、子牛腸ホスファターゼで処理した。図9及び10で示さ れたオリゴヌクレオチドの対をポリヌクレオチドキナーゼを用いでATPでリン 酸化し、蕉沸及び徐冷却で一緒にアニーリングさせ、NheI/Aat[I切断 Ml 3− JRAa tll中に結合させた。挿入配列を保有する組換えM1 3クローンは正確にpFMDVに関して前記されたように一本鎖バクテリオファ ージDNAの配列分析により確認した。
2つのクローン、必要配列を含むM13−HIV及びM13−HRVを確認し、 二本鎖複製形DNAを単離したところ、これは制限酵素切断で予想されるパター ンの断片を与えることを示した。
ステップ3.M13−HIV及びM13−HRVからの複製形DNAを5stI で切断し、1.2kbMRNA特異性断片をアガロースゲル上で切断物の電気泳 動後に電気溶出により回収した。1.2kb断片をpMT7−FMDV−1の産 主に関して前記されたようにpMT7−601からの大きな5stI断片中に結 合させた。
結合混合物を用いて大腸菌株JM83を形質転換させ、カルベニシリン耐性コロ ニーを選択した。2つのクローン、名称pMT7−HIV及びpMT7−HRV +!制限酵素地図作製及びヌクレオチド配列分析により望ましい構造を含むこと が示された。
転写のために、pMT7−HIV及びpMT7−HRVをEcoRI切断により 直鎖化した。T7RNAポリメラーゼを用いた転写はpMT7−601及びpM T7−123に関して記載されたように正確に実施した。得られた転写物は天然 ピリオンRNAとサイズが同一であった。
カラビー原形質体で複製しうるpMT7− FMDV−I及びpMT7−HIV 転写物の能力の証明pMT7−601、pMT7−FMDV−I又はpMT7− HIVいずれかのインビトロ転写物の10μgサンプルをpBT7−123から の転写物の15μgサンプルとミックスし、その混合物を用いて106カウピー 葉肉原形質体を電気穿孔した。サンプルを直ちに(0時間)又は25℃光下で7 2時間にわたる原形質体のインキュベート後に採取した。核酸を各サンプルの1 74から抽出し、前記のように1%ホルムアミド含有アガロースゲル上で電気泳 動した。核酸をハイボンドN上にプロットし、UV照射で膜に架橋させ、前記の ようにCPMV M RNA特異性配列に関してプローブ探査した。各ケースに おいて、位置がM RNAに相当する強いハイブリッド形成シグナルは0時間で はなく72時間のインキュベートサンプルで検出できたが、これは4種すべての 組立て物からの転写物がカラピー原形質体で増殖できることを証明している。
各原形質体サンプルの残り3/4を前記のように溶解させ、抗CPMV血清でコ ートされた電子顕微鏡グリッドに塗布した。次いでそのグリッドはJEOL12 00電子顕微鏡を用いて試験した。多数の粒子がpMT7−601、pMT7− FMDV−1及びpMT7−HIV転写物で電気穿孔された原形質体の72時間 サンプルでみられた。これらの結果はpMT7− FMDV−I及びpMT7− HIVでコードされた修正コートタンパク質がピリオンに集合できることを示し ている。
全カラピー植物で複製しうるpMT7−FMDV−I及びpMT7−HIV転写 物の能力 pB77423に由来する転写物の存在下において全カラビー植物で複製しうる pMT7− FMDV −I及びpMT7−HIVからの転写物の能力を証明す るため、GpppGでキャップされた転写物を前記のように製造した。各々5. 10日齢からなる6群のカラピーを前記方法により転写物で接種した。各ケース において、転写物の量は個々の葉に適用された量に関する。
群1:pH8,0の50mM)リスリン酸で偽接種群2:1.5μgの天然CP MvピリオンRNAで接種群3:各5μgのpMT7−601+ pB77−1 23転写物で接種群4:各5 tt g ノpMT7−FMDY−1+ pB7 7−123転写物で接種群5:各511 g (7) pMT7−HIV+ p BT7−123転写物で接種症状を日ベースで評価し、各植物からの葉組織のサ ンプルを“ドツトプロット”分析のため接種後11日目に採取し、前記のように 実施した。群4及び5において全植物から葉組織の残りを収集し、将来の使用の ために凍結した。
結果 群1(偽接種)の植物はいずれも感染後(P、 1.) 11日以内でどんな症 状も呈さず、CPMV特異性核酸は“ドツトプロット”分析による葉組織で検出 できなかった。
これはCPMVによるカラピー植物の偶発的感染が実験中に生じなかったことを 示している。群2及び3(ピリオンRNA又はpMT7−601及びpMT7− 123転写物の混合物のいずれかで接種)におけるすべての植物は7日[’、  1.までに接種及び全身双方の葉で強い症状を現した。葉組織の“ドツトプロッ ト”分析では全植物の接種及び全身双方の葉で多量のウィルス特異性RNAの存 在を示した。これは実験で用いられた植物がピリオンRNA又は野生型転写物の 混合物いずれかを用いたCPMV感染に十分に感受性であったことを認めている 。
11日P、 1.までに群4 (pMT7−FMDV−I転写物で接種)におい て全植物の接種葉は野生型ウィルス感染に通常伴う場合とは異なる斑点外観を呈 した。この結果はpMT7−FMDV−Iからの転写物が全カラビー植物で増殖 して細胞対細胞により伝搬できることを示す。
群5 (pMT7−HIV転写物で接種)において5例中4例の植物は11日P 、I、までにそれらの全青葉で症状を呈した。“ドツトプロット”分析では症状 を示す植物が接種及び全身双方の葉で実質量のウィルス特異性配列を有すること を示した。この結果はpMT7−HIVからの転写物が全カラピー植物内で増殖 して伝搬できることを示す。
pMT7− FMDV−I及びpMT7−HIVで得うレバク質が群4植物の接 種葉で合成されたことを証明するため、凍結葉組織のサンプルを微粉砕し、l× レムリ(Laemmli)サンプル緩衝液で抽出した。抽出物を15%ポリアク リルアミド−5DSゲルで電気泳動し、タンパク質をバイオラッド(B i a  r a d)セミトライトランスファー細胞を用いてニトロセルロース膜に移 した。その膜を全CPMVウィルス粒子に対する血清又はFMDVaOlのVP Iの残基141−160に相当する合成オリゴペプチドVPNL[1GDLQV LAQKVARTLP (CG) l:対する血清のいずれかでプローブ探査し た。この配列はpMT7−FMDVにおいてVP23中に挿入されたエピトープ に相当する。
双方の抗血清ともウサギで得た。ウェスタンプロット分析は二次抗体としてアル カリホスファターゼ複合化ヤギ抗ウサギIgGを用いて実施した。5例すべての 群4植物のタンパク質抽出物は抗CPMV血清と反応することがわかったが、こ れはウィルスコートタンパク質が群4植物の接種葉で合成されたことを示す。類 似のプロットを抗FMDVオリゴペプチド血清でプローブ探査した場合、単一バ ンドが群4植物の各々からの抽出物で現れた(図11)。このバンドは見掛は分 子量24 kDxで移動したが、これはFMDVループを有するVP23に関し て予想されたサイズそのものである。類似サイズの産物は偽接種又は野生型CP MV接種葉からの抽出物を分析した場合にみられなかった(図11)。同様に、 精製された野生型CPMVコートタンパク質もFMDV特異性抗血清と反応した 。更に、抗CPMV血清を得るために用いられたペプチドによるその血清の前処 理は群4植物からの抽出物との反応を消失させたが、これは免疫反応の特異性を 証明している。これらの結果は群4植物の接種葉がFMDVループ保有CPMV コートタンパク質を含有していたことを証明している。
pMT7−HIV:前記のように、群5植物からの接種及び全身双方の葉の“ド ツトプロット”分析ではpMT7−HIVからの転写物が全植物で増殖して伝搬 できることを示した。得られたシグナルのレベルと感染が全身に及ぶという事実 は子孫RNAが包膜されることを示す。
HIV特異性インサートが子孫RNAで保留されたことを立証するため、群5植 物からの抽出物の“ドツトプロット“をHIVインサート特異性プローブでプロ ーブ探査した。これはI)MT7−HIVの組立てで用いられたポジティブセン スオリゴヌクレオチドを“オリゴ標識する”ことにより行った(図9参照)。得 られた結果は症状を示す4植物の接種葉の抽出物でHi V配列の存在を示した 。
FMDVエピトープ保有CPMVによる結果の拡張pMT7− FMDV −I に由来する転写物で得られた既発見を拡張するため、5カウビー植物の5群を前 記のように製造されたキャップ化転写物で下記のように接種した・ 群1:pH8,0の50m1Ilトリスリン酸で偽接種群2: 05μgの天然 CP1MVピリオンRNAで接種群3・GpppGキャップ化pMT7−601 + pBT7−123転写物5μgで接種 群4 : GpppG −* ヤyyブ化pMT7−FMDLI + pBT7 −123転写物5μgで接種 症状を日ベースで評価した。接種後13日目に三葉ディスクサンプルを各植物の 1枚の接種葉及び1枚の三葉から採取した。サンプルを下記のように処理した: サンプル1(粗製ホモゲネート):pH7,0の101リン酸ナトリウム緩衝! 0.4ml中でホモゲナイズし、遠心し、上澄を回収した。
サンプル2 (RNA抽出物):液体窒素で凍結し、微粉砕し、核酸をフェノー ル/クロロホルムで抽出した。
エタノール沈降後、核酸を最終的に水0.1011に再懸濁した。
サンプル3(タンパク質抽出物):液体窒素で凍結し、微粉砕し、粉末を1×レ ムリサンプル緩衝液0.1mlに溶解した。
“ドツトプロット“を5μ!ずつのサンプル1及び2から調製し、前記のように 製造されたCPMV M RNAのヌクレオチド482−2211に特異的なプ ローブ(CPMV特異性プローブ)又はFMDV特異性インサートに特異的なプ ローブのいずれかでプローブ探査した。後者は図5で示されたポジティブセンス オリゴヌクレオチドを1オリゴ標議する”ことにより製造した。ウェスタンプロ ットをサンプル3の一部から調製し、前記のようにFMDV特異性エピトープに 関してプローブ探査した。ISEMはサンプル1の一部で実施した。
結果 症状は群1(偽接種)植物のいずれでも現れなかった。
粗製ホモゲネート又はRNA抽出物のドツトプロットではCP M V特異性又 はFMDV特異性配列が接種葉又は三葉いずれの抽出物にも存在しないことを示 した。抗CPMV血清でコートされた電子顕微鏡グリッドを用いた粗製ホモゲネ ートのISEMではウィルス粒子が存在しないことを示した。FMDV特異性血 清を用いたタンパク質抽出物のウェスタンプロット分析ではあらゆるFMDVエ ピトープの不存在を示した。これらの結果は残りの実験に関するネガティブコン トロールを与える。
症状は群2(ピリオンRNA接種)及び群3 (pMT7−601+pBT7− 123)接種植物すべての接種葉及び三葉双方で7日P、 1.までに現れた。
11日P、1.までに一次葉における病変部が2〜3■の径に広がった。
粗製ホモゲネート及びRNA抽出物双方のドツトプロットではFMDv特異性配 列ではなくCPMV特異性配列の存在について現した。抗CPMV血清でコート されたグリッドを用いたISEMでは接種葉及び三葉双方からの粗製ホモゲネー トで多数のCPMV粒子の存在を示した。タンパク質抽出物のウェスタンプロッ ト分析ではあらゆるFMDVエピトープの不存在を示した。
小さな病変部(径約1 ma+)が11日P、 1.までに群4(pMT7−  FMDV−I+pBT7−123)接種植物の接種葉で現れた。葉(サンプル2 )から抽出されたRNAのドツトプロットでは群4植物5例中3例の接種葉でC PMV及びFMDV双方の特異性配列の存在を示した。抗CPMV血清でコート されたグリッドを用いたISEMでは群4植物5例中4例の接種葉からの粗製ホ モゲネートでCPMV様ウィルス粒子の存在を示した。
タンパク質抽出物(サンプル3)のウェスタンブロッティングでは群4植物すべ てからの抽出物において小さなコートタンパク質上でF M D Vエピトープ の存在を示した。これらの結果はpMT7− FMDV −Iからの転写物が全 カラピー植物で増殖できることを確認し、ウィルス粒子がこのような植物で産生 されることを示す。
転写物接種植物からウィルスの製造 pMT7− FMDV −I感染葉組織からウィルス粒子を単離するため、下記 方法を開発した:各5μgのpBT7−123及びpMT7−FMDv転写物で 接種された一次カウビー葉22gを接種後16日目に収集した。葉を2倍容量( 約501)の0.1Mリン酸ナトリウム、pH7,0中4℃でホモゲナイズした 。液汁を2層のモスリンで濾過し、1’5.000gで15分間遠心し、上澄を 保留した。ペレットを数mlの0.1Mリン酸ナトリウム緩衝液、pH7,0で 再抽出し、再遠心した。上澄を合わせ、ベックマンタイプ30ローター中27. 000+pm、4℃で4時間遠心した。
得られたペレットをpH7,0の0.1Mリン酸ナトリウム3.51に4℃で一 夜再懸濁し、しかる後エッペンドルフ遠心管で10分間遠心した。上澄を採取し 、pH7,0の0.1Mリン酸ナトリウムで4.Oa+lに調製し、LM Na C1,20%PEG6000含有溶液1mlを加え、混合液を室温で2時間イン キュベートした。得られた沈降物をエッペンドルフ遠心管で10分間の遠心によ り集め、pH7,0の10mMリン酸ナトリウム0.25m1に再懸濁し、溶液 をエツペンドルフ遠心管で10分間の再遠心により清澄化させた。次いでウィル ス粒子を含む上澄を除去し、4℃で貯蔵した。最終懸濁液中におけるウィルス濃 度は約1. 5 mg/lであることが分光測定で評価された。F M D V 特異性抗血清を用いたウィルスのウェスタンプロット分析ではキメラウィルス粒 子の小コートタンパク質サブユニットと結び付いたFMDV抗原の存在について 現した。
継代修正RNA 多量のキメラウィルスをできるだけ効率的に産生ずるため、転写物接種葉から抽 出されたRNAを植物で継代した。pMT7−FMDV−I接種葉からのRNA 抽出物のサンプル5μlをpH8,0のトリスリン酸で50μ!に希釈し、一群 5例のカラピー植物の一次葉に接種した。すべての植物はCP M V感染に典 型的な症状を呈し、23日P、1.で一次葉を植物から収集した。その葉を0. 1Mリン酸ナトリウム緩衝液中でホモゲナイズし、ウィルスを前記のように抽出 したが、但し初期の高速ペレット化ステップを省略した。pH7,0の10mM リン酸ナトジナトリウム中 5 mg/mlの最終濃度で全量3.Oa+Hのウ ィルスをこうして単離した。この調製物をセントリプレツブ(C!n++1pr ep)濃縮機〔アミコン(Amicon))で1 、 4 mg/mlの最終濃 度まで最終的に遠心し、Plと命名した。
PlのサンプルはSDSゲル電気泳動及びクマシーブルー染色により試験したと ころ、予想されたパターンのコートタンパク質を含むことを示した。抗FMDV 血清を用いたウェスタンプロット分析では小コートタンdり質がFMDVループ を含むことを示した。ウィルス粒子から抽出されたRNAはCPMVのM及びB  RNAに関して予想されたサイズであった。これはキメラウィルスが転写物接 種葉に由来するRNAを継代することで産生できることを証明している。
実験ワクチンを1mg/mlの最終濃度で無菌リン酸緩衝液(P B S)への 分散によりウィルス調製物P1から製造した。モルモットを0及び28日目にP 1ワクチン40μgで注射した。予備結果ではその動物がFMDVループに対す る抗体を産生ずることを示すが、これは野生型ウィルスが注射されたときにみら れない応答である。
T−3 FIGtlRE 1 H2 旦qJ延】 旦σJ正1 国際調査報告 国際調査報告 フロントページの続き (51)Int、C1,5識別記号 庁内整理番号Cl2N 15/40 ZN A (81)指定国 EP(AT、BE、CH,DE。
DK、ES、FR,GB、GR,IT、LU、MC,NL、SE)、0A(BF 、BJ、CF、CG、CI、CM、GA、GN、ML、MR,SN、TD、TG )、AT、 AU、 BB、 BG、 BR,CA、 CH,C3,DE。
DK、 ES、 FI、 GB、 HU、JP、 KP、 KR,LK、LU、 MG、MN、MW、NL、No、PL、RO、RU、SD、 SE、 US I C12N 5100 C (72)発明者 ラモノソフ、ジョージ ピータ−イギリス国ノーウィッチ、コ ルニー、レイン(番地なし)、ヨーシ、インズ、センター、フォー、プラント、 サイエンス、リサーチ内 (72)発明者 ジョンソン、ジョン イーミルアメリカ合衆国インディアナ用 、ウェスト、ラフアイエツト(番地なし)、パーデユー、ユニバージティー、デ パートメント、オブ、バイオロジカル、サイエンシス内

Claims (31)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.ウイルスのコートタンパク質の一部として既定外来ペプチドを含む植物ウイ ルスの集合粒子。
  2. 2.外来ペプチドが生物学的機能性ペプチドであり、その生物学的適用がそれよ り大きな分子もしくは粒子と組合されたそのペプチドの供与を要求するか又はそ れにより高められる、請求項1に記載のウイルス粒子。
  3. 3.ペプチドが抗原である、請求項1又は2に記載のウイルス粒子。
  4. 4.抗原がウイルス抗原である、請求項3に記載のウイルス粒子。
  5. 5.抗原が動物(ヒトを含む)ウイルス抗原である、請求項4に記載のウイルス 粒子。
  6. 6.外来ペプチドが植物ウイルスのコートタンパク質の露出表面に組み込まれた 、請求項1〜5のいずれか一項に記載のウイルス粒子。
  7. 7.植物ウイルスがRNAウイルスである、請求項1〜6のいずれか一項に記載 のウイルス粒子。
  8. 8.ウイルスコートタンパク質がβ−バレル構造を有する、請求項1〜7のいず れか一項に記載のウイルス粒子。
  9. 9.外来ペプチドが植物ウイルスのループ接合βシートに挿入された、請求項8 に記載のウイルス粒子。
  10. 10.植物ウイルスがコモウイルスである、請求項1〜9のいずれか一項に記載 のウイルス粒子。
  11. 11.コモウイルスがカウピーモザイクウイルス(CPMV)である、請求項1 0に記載のウイルス粒子。
  12. 12.外来ペプチドが植物ウイルスのβB−βCループに挿入された、請求項9 、10又は11に記載のウイルス粒子。
  13. 13.挿入された外来ペプチドが現存ループヘの付加である、請求項9〜12の いずれか一項に記載のウイルス粒子。
  14. 14.挿入された外来ペプチドが現存ループの一部の置換である、請求項9〜1 2のいずれか一項に記載のウイルス粒子。
  15. 15.外来ペプチドが口蹄疫ウイルス(FMDV)に由来する動物ウイルス抗原 である、請求項1〜14のいずれか一項に記載のウイルス粒子。
  16. 16.外来ペプチドがヒト免疫不全ウイルス(HIV)に由来する動物ウイルス 抗原である、請求項1〜14のいずれか一項に記載のウイルス粒子。
  17. 17.外来ペプチドがヒトライノウイルス(HRV)に由来する動物ウイルス抗 原である、請求項1〜14のいずれか一項に記載のウイルス粒子。
  18. 18.免疫原成分として請求項3〜17のいずれか一項に記載された集合植物ウ イルス粒子を含むヒト又は動物病原体に対する保護用ワクチン。
  19. 19.免疫原成分として請求項5に記載されたウイルス粒子を含む動物ウイルス ワクチン。
  20. 20.コートタンパク質についてコードする植物ウイルス核酸を修正するために 外来ペプチドについてコードするヌクレオチド配列を導入し、植物、植物組織、 植物細胞又は原形質体を修正ウイルス核酸で感染させ、修正ウイルスの集合粒子 を収集することからなる、請求項1〜17のいずれか一項に記載された植物ウイ ルス粒子の産生方法。
  21. 21.導入されるヌクレオチド配列がコートタンパク質の露出部分についてコー ドする植物ウイルス核酸のその部分で押入される、請求項20に記載の方法。
  22. 22.外来ペプチドについてコードするDNA配列をコートタンパク質の露出部 分についてコードする植物ウイルスのRNAに相当するcDNA中に導入し、こ うして修正されたcDNAからそのRNA転写物を産生させ、必要であれば植物 体で全ウイルス粒子の増殖及び集合に要求されるいずれか他のRNAと一緒に植 物、植物組織、植物細胞又は原形質体を転写物で接種し、修正ウイルスの集合粒 子を収集することからなる、RNA植物ウイルスに適用される、請求項20に記 載の方法。
  23. 23.外来ペプチドについてコードするDNAを植物ウイルスcDNAから切出 されたDNA断片中に導入し、修正形で植物ウイルスcDNAを再構成するよう に修正断片を組換える、請求項22に記載の方法。
  24. 24.塵生された修正ウイルス又はそれから抽出されたRNAが追加収量の修正 ウイルスを産生するために植物で継代される、請求項22又は23に記載の方法 。
  25. 25.コートタンパク質の露出表面に相当する部位で外来ペプチドについてコー ドするDNA配列を含むCPMVコートタンパク質cDNAの断片。
  26. 26.SstI断片である、請求項25に記載の断片。
  27. 27.請求項25又は26に記載された断片を含むベクター。
  28. 28.コートタンパク質の露出表面に相当する部位で外来ペプチドについてコー ドするDNAインサートを有するCPMV M RNAの全鎖長cDNAを含む ベクター。
  29. 29.請求項25〜28のいずれか一項に記載された断片又はベクターのRNA 転写物。
  30. 30.請求項29に記載されたキャップ化RNA転写物。
  31. 31.請求項18又は19に記載されたワクチンを投与することからなる病原体 に対する動物(ヒトを含む)の保護方法。
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