JPH06508037A - 免疫不全ウイルス組換えポックスウイルスワクチン - Google Patents

免疫不全ウイルス組換えポックスウイルスワクチン

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Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるため要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 関連出願についての説明 この出願は、参照文献としてここに含む、1991年6月14日出願の同時系属 出願第07/715.921号の一部継続出願である。1992年3月6日出願 の同時系属出願第07/847.951号もまた参照文献としてここに含む。
産業上の利用分野 本発明は修飾ポックスウィルスおよびその製造方法並びに使用方法に関するもの である。さらに詳しくは、本発明は、免疫不全ウィルス遺伝子の遺伝子産生物を 発現する組換えポックスウィルス、および宿主に投与したときに免疫不全ウィル ス感染に対して免疫応答を誘発する免疫組成物に関するものである。
いくつかの出版物をこの出願において参照する。これらの参照文献の全引用を請 求の範囲の前で明細書の終りに示す。これらの参照文献は、本発明が属する従来 技術を記載するものである。
発明の背景 ワクシニアウィルスおよびより最近では他のポックスウィルスが、異種遺伝子の 挿入と発現に用いられている。異種遺伝子の生感染ポックスウィルスへの挿入の 基礎技術は、供与体プラスミド中の異種遺伝子要素をフランキング(flank ing)するボックスDNA配列と治療(rescuing)ポックスウィルス 中に存在する相同配列との間の組換えを含む(ピッチm=等、1987)。
つまり、組換えポックスウィルスは、従来技術で知られ、米国特許第5.110 .587号、第4.769.330号、第4.772.848号および第4.6 03.112号に記載されているワクシニアウィルスの合成組換え体の産生方法 に相同な2工程で構成される。それらの開示を参照文献としてここに含む。この 点に関して、1992年5月4日出願のものと1990年6月14日出願の第5 37.890号の同時系属出願も、参照文献としてここに含む。
第一に、ウィルス中に挿入されるDNA遺伝子配列、特に非ボックス源からの読 取り枠を、ポックスウィルスのDNAの切片に相同なりNAが挿入されるE、c oliプラスミド構成物中に配する。個々に、挿入されるDNA遺伝子配列をプ ロモーターに連結せしめる。プロモーター−遺伝子結合は、可欠座を含有するボ ックスDNAの領域をフランキングするDNA配列に相同なりNAにより両端に フランキングされるように、プラスミド構成物中に位置している。産生じたプラ スミド構成物は次いで、E、coli細菌内の成長により増幅せしめ(フレウェ ル、1972)、単離する(フレウェル等、1969;マニアチス等、1986 )。
第二に、挿入されるDNA遺伝子配列を含有する単離プラスミドを、ポックスウ ィルスとともに、細胞培地、例えば、ひな胚胎繊維芽細胞中にトランスフェクシ ョンせしめる。プラスミド中の相同ボックスDNAとウィルスゲノムとの間の組 換えはそれぞれ、そのゲノムの可欠領域における異種遺伝子DNA配列の存在に より修飾されたポックスウィルスを与える。「異種J DNAという用語は、外 因性DNAかその中に配されるゲノムにより通常は産生されない遺伝子産生物を コードする外因性DNA、特に非ボックス源からのDNAを示す。
遺伝子組換えは一般的に、DNAの2つの鏡開のDNAの相同切片の交換である 。あるウィルスにおいては、RNAがDNAを置換する。核酸の相同切片は、ヌ クレオチド塩基の同一配列を有する核酸切片(DNAまたはRNA)である。
遺伝子組換えは、感染宿主細胞内の新しいウィルスゲノムの複製または産生中に 自然に生じる。それゆえ、ウィルス遺伝子間の遺伝子組換えは、2つ以上の異な るウィルスまたは他の遺伝子構成物により共感染せしめられた宿主細胞中で生し るウィルス複製周期中に生じ得る。第一のゲノムからのDNA切片は、DNAが 第一のウィルスゲノムのDNAと相同である第二の共感染ウィルスのゲノム切片 を構成する際に交換可能に用いられる。
しかしながら、組換えはまた、完全には相同ではない異なったゲノム中のDNA 切片の間にも生じ得る。そのような切片の1つか、例えば、遺伝子マーカーまた は相同DNAの部分に挿入される抗原決定因子をコードする遺伝子の第一の切片 内の存在を除いて、別のゲノムの切片と相同な第一のゲノムからのものである場 合、組換えはまだ生じ得てその組換えの産生物は次いで組換えウィルスゲノム中 の遺伝子マーカーまたは遺伝子の存在により検出可能である。
修飾感染ウィルスによる挿入DNA遺伝子配列の発現がうまくいくには2つの条 件が必要である。第一に、挿入は、修飾ウィルスが生きたままでいるために、ウ ィルスの可欠領域に行なわなければならない。挿入DNAの発現の第二の条件は 、挿入DNAに対して適切な関係にあるプロモーターの存在である。プロモータ ーは、発現されるDNA配列から上流に位置するように配されなければならない 。
近年では、ウィルス医学の分野において、ヒト免疫不全ウィルス(HI V)に より生じた後天性免疫不全症候群(エイズ)の発生の上昇している点が注目を集 めている。
HIV−1は、ウィルス科、レトロウィルス科、より詳しくはレンチウィルス亜 科の一員である。HIV−2およびシミアン免疫不全ウィルス(SIV)のよう な他の関連ウィルスとともにこのウィルスシステムは、安全で有効であるワクチ ンおよび抗ウイルス療法を発達せしめる努力におけるその分子生物学、免疫学、 および病原論に関して、綿密に検査されている。しかしながら、2つの主な障害 により、HIVワクチンの候補者の設計が悩まされている。第−に、HIV単離 体の中に著しい配列異質性が存在し、第二に、防御免疫に属する情報が欠如する 。感染した個体は、HIVに対する抗体(スターシチ等、1986;ウェイス等 、1985)応答とCD8′−丁細胞(ウォーカー等、1987 ;ブラタ等、 1987)応答を発達せしめるが、個体は徐々にエイズを発達せしめるので、防 御されない。
多くのHIV遺伝子産生物を発現し、その生化学特性、機能特性および免疫学特 性、特に細胞媒介応答を研究するために、ワクシニアウィルスが広く用いられて きた。これらの特異的試薬を用いることにより、エンベロープ(リビエレ等、1 989 、ウォーカー等、1987 ;クープ等、1989)、コアタンパク質 (gag)(リビエレ等、1989;クープ等、1989 ;ニクソン等、19 88) p o l (ウォーカー等、1989 。
ウォーカー等1988) 、およびnef(リビエレ等、1989)遺伝子産生 物に対して血清陽性な個体に細胞媒介細胞障害活性が示されてきた。さらに、H IV遺伝子を含有する枠ウィルス組換え体は、小さな実験動物(チャクラパーテ ィ等、1986 、ツー等、1986 ;ロートマン等、1989 、ミツシェ ル等、1988)、マカク(ツアーリング等、1986) 、チンパンジー(ツ ー等、1987)およびかなりヒト(コアグリー等、1988 ;コツ等、19 89)における細胞媒介応答および液性免疫応答を誘発することが分かっている 。現在まで、霊長類における制限されたワクチン接種/防御研究が、HIVおよ び関連ウィルスからの遺伝子産生物を発現するワクシニアウィルス組換え体に関 して報告されている。
エイズが原因のレトロウィルスからのエンベロープ糖タンパク質を発現する組換 えワクシニアウィルスによる霊長類のワクチン接種は、液性および細胞媒介免疫 応答を誘発し、さらに著しくは、HIV感染に対して防御した(コアグリー等、 1988 ;ツー等、1989)。ツー等に記載された結果において、シミアン エイズレトロウィルス(SRV−2)からのエンベロープ糖タンパク質を発現す るワクシニアウィルス組換え体を用いてブタ尾(pig−tailed)マカク (マカカ ネメストリナ)をワクチン接種した。免疫化した全ての動物は、中和 抗体および5RV−2感染細胞に対してADCCを媒介する抗体を含む、5RV −特異細胞−媒介応答および液性免疫応答の両者を発達せしめた。動物に、5  x103T CI D、oノS RV −2/Wヲ静脈+:抗原投与り。
た。抗原投与した対照動物(非ワクチン接種)は、抗原投与から2週間後にウィ ルス血症となり、血清転換しなかった動物は抗原投与から7週間後に死亡した。
明らかに、以前にワクシニアウィルス−env組換え体を接種して抗原投与した 動物の全ては、健康で、ウィルスがなく、エンベロープ抗原に対してもっばら血 清陽性であった。
ヒトにおける試験的な実験において、HIV血清陰性の個体にワクシニアウイル ス/HIV−1エンベロープ組換え体をワクチン接種した。この初期の接種は、 弱い免疫応答となった(コアグリー等、1988)。これらの初期応答に続いて 様々なプロトコルを追加抗原投与した。しかしながら、ワクシニアウィルス−H IV組換え体にin vitro感染したパラホルムアルデヒド固定自己細胞の 静脈注射の使用により、最も著しい追加抗原投与の効果が得られた。この免疫化 プロトコルに関して、群特異中和抗体、細胞障害Tリンパ球および遅延型過敏性 からなるエンベロープ抗原に対して、既往免疫応答が行なわれた(コアグリー等 、1988)。)(IV enV遺伝子を発現する組換えワクシニアウィルス( HIVAV−1e ;ブリストルーメイヤース)を用いて米国で行なわれた臨床 試験において、組換え体を受けた個体は、HIVに対するT細胞増殖性応答を開 始した(コツ等、1989)。しかしながら、こらの応答の強度は、ワクシニア ウィルスへの以前の露出により影響された。結果として、ワクシニアウィルスに 対する個々の免疫は、弱く一過性のT細胞応答を開始したが、ワクシニアウィル スに対して免疫性ではない個体においては、HIVエンベロープ抗原に対して強 い応答が観察された(コツ等により調査された、1989)。これらの結果は励 みになり、免疫状態が、ポックスウィルスベースの免疫化ビヒクルを用いたHI V露出の前にヒトに得られるという証拠を提供した。
HIV−1ワクシノロジーに関するおもしろい可能性は、単体またはエンベロー プ糖タンパク質との組合せのいずれかのワクシニアウィルスによるHIV−tg agタンパク質の発現により提供される。いくつかの研究所が、ワクシニアウィ ルスによるgagまたはgag/pOf配列の発現か非感染粒子の産生となるこ とを示した(ツー等、1990 ;ンオダ等、1990;カラコスタス等、19 89)。これらのワクシニアウィルス組換え体感染細胞の電子顕微鏡による分析 は、形質膜から出芽したレトロウィルス状粒子およびHIV−1感染細胞に観察 された粒子からは見分けの付かない細胞外形状を示した。生化学的に、これらの 粒子はまた天然のHIV−1粒子に類似している。さらに、ワクシニアウィルス −HIV gag組換え体を接種したげっし動物とチンパンジーは、HIV−1 コア抗原に対する液性免疫応答と細胞媒介免疫応答の両方を示した(ツー等、1 990)。
ワクシニアウィルスによる哺乳綱細胞中のコアタンパク質とHIV−1エンベロ ープ糖タンパク質の共発現はまた、HIV−1粒子の組立てと放出となった(ヘ イファー等、1990)。これらの典型的な種類のC−レトロウィルス粒子は、 エンベロープ糖タンパク質(gp120およびgp41)およびgagタンパク 質(p24、p17、p55、およびp39)の両方を含んだ。これらのタンパ ク質はまた、HIV−1ウィルス粒子中に観察されたのと同一の比重小これらの 組換え体産生粒子中に存在するとして記載された。多価ワクシニアウィルス組換 え体の接種によりワクシニー(vaccinee)中に合成されたまたは精製形 状のいずれかのこれらの非感染HIV粒子の産生は、HI■に対する価値のある 「完全ウィルス」ワクチン接種剤を提供する。レンチウィルス、SIVに対する 防御が、完全不活性化ウィルス標品を用いて示されたので、このことは特に魅力 的である(マーフィーコープ等、1989;デロシアース等、1989)。
上述した調査実施例は、防御に必要である適切な免疫応答を誘発する、HIV抗 原を発現するワクシニアウィルス組換え体の潜在的な使用を示す。しかしながら 、生ウイルスワクチンの使用に関する主な関心は、安全性の問題である。ワクシ ニアウィルスによる免疫化による合併症は、特に免疫無防備状態にある個々にお いてはほとんど証拠書類はなく、ワクチン候補としての容認に異論が出されてい る(ベーベハニ、1983 ;レイン等、1969)。しかしながら最近では、 免疫化ビヒクルとしての使用のための修飾菌株の望みのあるウィルス毒性因子を 理解するにあたって、長足の進歩がなされている。(タータグリア等、1990 )。エイズの免疫予防と免疫療法のためのワクシニアウィルスペースのHI V ワクチン候補の産生に関して、ヒト細胞系におけるワクシニアウィルスの産生複 製の原因の遺伝子を同定した(ギラード等、1986 ;パーカス等、1990 )。これらの遺伝子が欠けているワクシニアウィルスベクターの潜在的な使用は 、防御免疫応答を誘発する様式で、適切なHIV抗原を提供する非複製ベクター ワクチン候補を提供する。
安全で効果的なボックスウイルスヘースのHIVワクチン候補の産生への別の手 法は、適切なHIV抗原を発現するアビポックスウィルスベクター(すなわち、 カナリア痘ウィルスおよび鶏痘ポックスウィルス)を使用する。これらのウィル スは自然に宿主制限されており、アビアン種においてのみ豊富に複製する。それ ゆえ、ヒト、特に免疫無防備状態の個体においての使用のための本来備わった安 全性因子が存在する。この点に関して、これらのウィルスは、狂犬病G糖タンパ ク質を発現するように操作され、生狂犬病抗原投与からの様々な非アビアン種を 防御するのが示された(ティラー等、1988a ; 1991)。
それゆえ、免疫不全ウィルス組換えポックスウィルス、および宿主に投与された ときに免疫不全ウィルス感染に対する免疫応答を誘発する免疫原性組成物、特に 安全性の高められた組成物を提供することが、現在の技術状態に関して非常に望 ましい進歩であることが分かる。
発明の目的 それゆえ、本発明の目的は、免疫不全ウィルスの遺伝子産生物を発現する組換え ポックスウィルスを提供すること、およびそのような組換えポックスウィルスを 製造する方法を提供することにある。
本発明のさらなる目的は、免疫不全ウィルス暗号配列、特にポックスウィルスベ クター中のヒト免疫不全ウィルス(HI V)およびシミアン免疫不全ウィルス (SIV)暗号配列のクローニングおよび発現に備えることにある。
本発明の別の目的は、安全性か高められ、宿主に投与されたときに免疫不全ウィ ルス感染に対して免疫応答を誘発することのできる免疫原性組成物を提供するこ とにある。
本発明のこれらと他の目的および利点は、以下を考慮することによりより容易に 明確となる。
発明の構成 一態様において、本発明は、ポックスウィルスゲノムの回天領域に、免疫不全ウ ィルス、特にHIVまたはSIVからのDNA配列を含有する組換えポックスウ ィルスに関するものである。ポックスウィルスは好ましくは、鶏痘ポックスウィ ルスまたはカナリア痘ウィルスのような、ワクシニアウィルスまたはアビポック スウィルスである。
本発明によると、組換えポックスウィルスは異種免疫不全ウィルス遺伝子、特に HIVまたはSIV遺伝子の遺伝子産生物を発現する。
別の態様によると、本発明は、ワクチンを接種した宿主動物中に免疫応答を誘発 するワクチンに関し1、該ワクチンはその回天領域中に免疫不全ウィルス、特に HIVまたはSIVからのDNAを含有する組換えポックスウィルスおよび担体 を含む。本発明によるワクチンに用いるポックスウィルスは好ましくは、鶏痘ウ ィルスまたはカナリア痘ウィルスのような、ワクシニアウィルスまたはアビポッ クスウィルスである。
添付した図面を参照することにより、本発明をよりよく理解する。
第1図は、チミジンキナーゼ遺伝子の欠失したプラスミドpsD460の構成方 法および組換えワクシニアウィルスvP410の産生方法を示す概略図である。
第2図は、出血性領域が欠失したプラスミドpSD486の構成方法および組換 えワクシニアウィルスvP553の産生方法を示す概略図である。
第3図は、ATI領域が欠失したプラスミドpMP 494Δの構成方法および 組換えワクシニアウィルスvP618の産生方法を示す概略図である。
第4図は、血球凝集素遺伝子の欠失したプラスミドpSD467の構成方法およ び組換えワクシニアウィルスvP723の産生方法を示す概略図である。
第5図は、遺伝子クラスター[C7L−KIL]の欠失したプラスミドpMPc sK1Δの構成方法および組換えワクシニアウィルスvP804の産生方法を示 す概略図である。
第6図は、巨大サブユニットの欠失したプラスミドpSD548の構成方法およ び組換えワクシニアウィルスvP866 (NYVAC)の産生方法を示す概略 図である。
第7図は、ワクシニアウィルスまたはカナリア痘ウィルスベクター(NYVAC SALvAC)で免疫化した、もしくはHIV I II B env (vP 911、vCP112)を発現するワクシニアウィルスまたはカナリア痘ウィル ス組換え体で免疫化した、マウスの肺臓の細胞障害応答を示すグラフである。
第8図は、gp120のHIV 11 B超可変v3ループのためであって、H IV MNまたはSF2のv3ループのためではない細胞障害Tリンパ球抗原受 容体の特異性を示すグラフである。
第9図は、ベクター(NYVAC,ALVAC)またはHIV−1envを発現 するカナリアボックス組換え体vcP112または真ワクシニアウィルス組換え 体vP911で免疫化したマウスのHIv III Bgp120に対する抗体 応答を示すグラフである。
第10図は、細胞障害Tリンパ球細胞表面抗原’rhy1゜2およびLyt2. 2に対する抗体に対するvcP112で免疫化したマウスの肺臓からの細胞障害 効果器細胞の感度を示すグラフである。
第11図は、PBMCのin vitro刺激に対する細胞障害のパーセントを 示すグラフである。
発明の詳細な説明 説明のための以下の実施例から、本発明とその利点がよく理解される。
実施例において、以下の方法と材料を用いる。
DNAクローニングおよび合成 プラスミドを標準方法により構成し、スクリーニングし、成長せしめた(マニア チス等、1982;パーカス等、1985;ピッチm;等、1.987)。制限 エンドグルカナーゼを、MD。
ケイサースフルク、GIBCO/BRL 、MA、ビバージー、ニューイングラ ンドバイオラボ;およびIN、インディアナポリス、ベーリンガーマンハイムバ イオケミカルスから得た。E、coliポリメラーゼのフレノウ断片をベーリン ガーマンハイムバイオケミカルスから得た。BAL−31エキソヌクレアーゼお よびファージT4 DNAリガーゼをニューイングランドバイオラボから得た。
試薬は様々な供給者により指定されたものを用いた。
前述したように、バイオサーチ8750またはアプライドバイオシステムス38 0B DNAシンセサイザーにより合成オリゴデオキシリボヌクレオチドを産生 じた(パーカス等、1989)。前述したように(グオ等、1988)シー乞ナ ーゼ(ティパー等、1987)を用いたジデオキシ−鎖終止方法(サンガー等、 1977)によりDNA塩基配列決定を行なった。配列確認(エンゲルケ等、1 988)のためのポリメラーゼ鎖反応(P CR)によるDNA増幅を、自動パ ーキンエルマーセタスDNAサーマルサイクラ−中で注文合成オリゴヌクレオチ ドプライマーおよびジエネアンプDNA増幅試薬キット(CT、ノルウオーク、 パーキンエルマー)を用いて行なった。制限エンドヌクレアーゼ切断と、続いて のBAL−31エキソヌクレアーゼによる制限切断と合成オリゴヌクレオチドを 用いた突然変異誘発(マンデツキ、1986)により、過剰のDNA配列をプラ スミドから欠失せワクシニアウィルスのコペンハーゲン菌株の培養の起源と条件 は以前に記載した(グオ等、1989)。組換え、ニトロセルロースフィルター のin 5itu雑種形成オよびB−ガラクトシダーゼ活性のイクリーニングに よる組換えウィルスの産生は以前に記載した(パニカリ等、1982;パーカス 等、1989)。
親カナリア痘ウィルス(レントシュラー菌株)はカナリアの接種菌株である。ワ クチン菌株は、野生型単離体から得て、ひな胚胎繊維芽細胞の200以上の系列 継代により弱毒化した。マスターウィルス種子に、寒天の元の4連続のプラーク 精製を施し、1つのプラーククローンを、1nvitro組換え試験における親 ウィルスとして株ウィルスを用いた後の追加の5回の継代により増幅した。プラ ーク精製したカナリア痘単離体をALVACと称する。
FP−1と称する鶏痘ウィルス(F P V)の菌株は前述した(ティラー等、 1988a )。この菌株は生後1日の鶏のワクチン接種に有用な弱毒化ワクチ ン菌株である。親つィルス菌株デュベッティは、鶏からの鶏痘スケールとしてフ ランスで得た。鶏の感染幼虫包蔵卵中の約50の連続継代と続いての鶏胚胎繊維 芽細胞の25の継代によりウィルスを弱1つのプラーク単離体をさらに主CEF 細胞中で増幅せしめ、TR0VACと称する株ウィルスを確立した。
前述したように、NYVAC,ALVACおよびTR0VACウイルスベクター およびその誘導体を増殖せしめた(ピッチー二等、1987 、ティラー等、1 988a Sb ) o P 815マウスの肥満細胞種細胞(H−d2)をA TCC(#TIB64)から得て、10%の胎仔ウシ血清CFBSおよび100  I U/m lのペニシリン並びに10(1μg/mlのストレプトマイシン を補足したイーグルスMEM中で保持した。
マウス 雌のBALB/c J (H−d2)マウスをジャクソン研究所(ME、バーハ ーバ−)から購入し、不断給餌に保持した。全てのマウスは生後6から15週間 の年齢のものを用いた。
培地 免疫アッセイのアッセイ培地は、10%のFBS、4mMのし一グルタミン、2 0mMのHEPES (N−2−ヒドロキシエチルピペラジン−N’ −2−二 タンスルホネート)、5X10−’Mの2−メルカプトエタノール、100IU /mlのペニシリン、および100μg/mlのストレプトマイシンを補足した RPM11640培地からなった。ステイム培地は、10%のFBS、4mMの し一グルタミン、101Mの2−メルカプトエタノール、1001 U/m l のペニシリン、および100μg / m lのストレプトマイシンを補足した イーグルス最小必須培地からなった。
ラジオイムノプレシピテーション分析 細胞単層を、修飾イーグルスメチオニン不含有培地(MEM met−)中でl 0PFU/細胞で感染せしめた。
感染から2時間後、20u Ci 7m lの[35S]−メチオニンを、2% の透析胎仔ウシ血清(フロー)を含有するMEM(−met)中に添加した。ジ ーシス緩衝液(150mMのNaC1,1mMのEDTA pH8,10m M のトリス−HC1(pH7,4) 、0.2 mg/m lのPMSF、1%( 7)NP40.0.01%のNa Azide)および50μmのアプロチニン 中に再懸濁せしめることにより、感染から15時間後に細胞を収穫し、エッペノ ドルフ管中に削り取り、溶解産物を、4℃で20分間回転することにより清澄化 せしめた。60mmの直径のペトリ皿の上澄液の三分の−を、1μlの正常ヒト 血清と100μlのタンパク質A−セファロースCL−48(SPA)(ファー マシア)により室温で2時間に亘り培養せしめた。1分間の回転後、上澄液をH IV−1、HIV−2、またはSIvタンパク質を特異的に認識する免疫血清お よび100μlのSPAにより4℃で90分間に亘り培養せしめた。
沈殿を、ジーンス緩衝液で4回、塩化リチウム/尿素緩衝液(0,2MのLiC 1,2Mの尿素、10m Mのトリス−HCl pH8)で2回洗浄し、沈殿タ ンパク質を60μlのラエムリ緩衝液(ラエムリ、1970)中で溶解せしめた 。
100℃での5分間の加熱と1分間の回転の後、タンパク質をS D S 10 %ポリアクリルアミドゲル上で再溶解せしめ、蛍光間接撮影せしめた。
接種 マウスに、外側尾静脈により0.1mlの食塩加リン酸緩衝液中の5X10”の プラーク形成単位(PFU)を静脈内に接種した。
膵臓細胞産生 頚部脱臼による安楽死後、マウスの肺臓を、ハンクス平衡塩類溶液を含有する殺 菌プラスチックバッグに無菌の状態に移した。1つの実験群からの個々の肺臓ま たはプール肺臓をストマツチャーブレンダ−中において1分間の周期により1つ の細胞懸濁液に処理した。膵臓細胞懸濁液を適切なアッセイ培地またはステイム 培地のいずれかにより数回洗浄した。コルターカウンターの使用により、または 血球計算盤と顕微鏡を用いたトリパンブルー色素排除により肺臓を数えた。
血清 マウスにエーテルで軽く麻酔をかけ、血液を眼か後方叢から集積した。実験群か らなるマウスからの血液をプールして、凝固せしめた。血清を集積し、使用まで 一70℃で貯蔵した。第2の細胞障害Tリンパ球(CT L)の産生のためのi n vitro刺激 様々な実験群(応答動物)からのプールした膵臓細胞をステイム培地中で5×1 0”/ m lに希釈した。同系で未経験のマウス(刺激要因)からの膵臓細胞 を、I XIO’ /mlに希釈し、2%のFBSを含有する組織培養培地中で 1時間に亘り25PFU/細胞のm、o、i、で適切なポックスウィルスにより 感染せしめた。感染後、刺激要因細胞をステイム培地中で数回洗浄し、ステイム 培地により1×10′′/m’lに希釈せしめた。5mlの刺激要因細胞と5m lの応答動物細胞を25cm’の細胞培養フラスコに加え、5%のCO□中で5 日間に亘り37℃で直立して培養した。アッセイの日に、肺臓を、アッセイ培地 で数回洗浄し、顕微鏡を用いてトリパンブルーの血球計算盤で数えた。
標的細胞の産生 ポックスウィルス特異的CTL活性に関して、組織培養細胞を、2%のFBSを 含有する組織培養培地中で37℃で1時間に亘り25PFU/細胞のm、0.  1.で1.X107細胞/mlての培養により一晩感染せしめた。培養後、細胞 を10%のFBSを含有する組織培養培地により1−2X105細胞/mlの間 に希釈し、使用するまで5%のCO3中、37℃でさらに培養した。HIV特異 的CTL活性に関して、組織培養細胞を、それぞれHIV−1単離体l11o、 SF2、およびMNのgp120の■3ループ領域に対応する、20ug/ml のペプチドHBX2 (MA、ケンブリッジ、アメリカンバイオテクノロジー)  、SF2 (MA、ケンブリッジ、アメリカンバイオテクノロジー)またはM N(MA、ケンブリッジ、アメリカンバイオテクノロジー)で−晩培養した。ア ッセイの日に、標的をアッセイ培地中の遠心分離により数回洗浄した。最終の洗 浄後、細胞を約100、czciのNa2”Cr04 (”Cr)中で再懸濁せ しめた。37℃での1時間の培養後、遠心分離によりアッセイ培地中で少なくと も3回洗浄し、血球計算盤で数え、アッセイ培地によりlXIO3/mlに希釈 した。
細胞障害アッセイ 第1のCTLアッセイに関して、新たに産生じた膵臓細胞をアッセイ培地で1  xio’ 7m lに希釈した。第2のCTLアッセイに関して(i n v  i vo接種または1nvitro刺激のいずれかの後)、膵臓細胞をアッセイ 培地で2 xlO6/m 1に希釈した。1/10m1の膵臓細胞懸濁液を、9 6ウエル、丸底マイクロタイタ板(E X P)のウェル中で51Cr標識標的 細胞に加えた。はとんどの場合、第1のCTL活性についてアッセイした膵臓細 胞を、標的細胞の添加前に、マイクロタイタ板のウェル中でさらに2倍に希釈し た。”Cr (SR)の自発的な放出の測定の際、標的細胞をアッセイ培地のみ で培養した。”Cr (MAX)の最大放出を測定するために、0.1mlの1 0%ドデシル硫酸ナトリウムを適切なウェルに加えることにより、アッセイの初 めに標的細胞を慎重に溶解せしめた。アッセイを開始するために、マイクロタイ タ板を200Xgで2分間に亘り遠心分離し、5%のCO2中、37℃で4また は5時間に亘り培養した。培養後、各ウェルの培養上澄液を、スカトロン上澄液 集積システムを用いて集積した。ベックマン5500Bガンマカウンターにより 放出された’IIc、を測定した。特異的細胞障害のパーセントは、以下の式に よる計算から決定した: 細胞障害%= (EXP −MAX ) / (MAX −3R) X100単 クローン性抗−CD4および単りローン性抗−CD8を用いたTヘルパー細胞と 細胞障害Tリンパ球の除去膵臓細胞懸濁液を、1:5の抗−CD4の希釈溶液( 単クローン性抗体172.4)または1:200の抗−CD8の希釈溶液(単り ローン性抗体抗−Lyt2.2)および1:16のセダーレインロウ−ドックス ウサギ補体の希釈溶液を含有する細胞障害培地(0,2%のBSAおよび5mM のHEPESを含有するRPMl 1640)で107/mlの濃度に希釈した 。単一成分(補体、抗−CD4、抗−CD8)のために適切な対照を含んだ。
抗−HIV−1gpL60 ELISAEL I SA板のウェル(イムロンI I)を、炭酸塩緩衝液、pH9,6中の100nHの精製HIV−1gp160 (イムノ)により4℃で一晩被覆した。次いで板を、0.05%のTween2 0を含有する食塩加リン酸緩衝液(PBST)で洗浄した。次いて板を、1%の ウシ血清アルブミン(BSA)を含有するPBSTにより37℃で2時間に亘り 遮断した。PBSTによる洗浄後、最初に血清を、0.1%のBSAを含有する PBST (希釈緩衝′pfL)でJ:20に希釈した。さらにELISA板の ウェル中で連続して血清を2倍に希釈した。この板を37℃で2時間に亘り培養 し、PBSTで洗浄した。ホースラディツシュペルオキシダーゼ接合ウサギ抗− マウスイムノグロブリン(ダコー)を希釈緩衝液で1 : 2000に希釈し、 EL I SA板のウェルに加え、1時間に亘り37℃で培養した。PBSTに よる洗浄後、基質緩衝液中のOPD (o−フェニレンジアミン ジヒドロクロ ライド)を加え、約20分間に亘り周囲温度で色を発達せしめた。反応は、2. 5MのH2SO4の添加により、停止せしめられた。バイオ−チックEL−30 9ELISA読取機により490nmでの吸収を測定した。血清の終点は、1. 0の吸収値を与える希釈の逆数として定義した。
リンパ球増殖アッセイ 個々のマウスの膵臓細胞の1つの細胞懸濁液をアッセイ培地で2 X 10’  7m lに希釈し、0.1mlを、アッセイ培地単体、1.5、または10μg のHIV−1ペプチドT1.1.5、また10μgのHIV−1ペプチドT2、 および1*たはIOμgの精製HIV−1gp160(イムノ)を含有する96 ウエルの平底マイクロタイタ板のウェルに加えた。細胞は、5%のCO2中、3 7℃で5日間に亘り培養した。最終の6時間の培養のために、■、0μCiの[ ″H]−チミジンを各ウェルに加え、ケンブリッジPHD細胞ハーベスタ−を用 いてベックマンレディーフィルターに収穫した。フィルターディスクを液体シン チレーションカウンターでドライカウントした。
刺激指数−CP M S +1、p / CP M S Mro+uM実施例1 −弱毒化ワクシニアワクチン菌株NYVAC中しいワクシニアワクチン菌株、N YVAC(vP866)を発生せしめるために、既知のまたは潜在的な毒性因子 をコートするゲノムの6つの回天領域の欠失によりワクシニアウィルスのコペン ハーゲン菌株を修飾した。配列の欠失は以下に詳細に示す。ワクシニア制限断片 、読取り枠、およびヌクレオチドの位置の全ての名称は、ゲーベル等に報告され た用語法(1990aSb)に基づく。
異種遺伝子の挿入のための受容圧として、欠失塵を操作した。
NYVAC中で連続して欠失した領域を以下に列記する。
また、欠失領域の省略形と読取り枠の名称(ゲーベル等、1990a、 b)並 びに特定された欠失の全ての欠失を含むワクシニア組換え体(v P)の名称を 以下に列記する:(1)チミジンキナーゼ遺伝子(TK ; J 2R)vP4 10; (2)出血性領域(u ; B13に+B14R)vP553: (3)型金有体領域(ATI ;A26L)vP618 ;(4)血球凝集素遺 伝子(HA ; A36R)vP723 ;(5)宿主範囲遺伝子領域(C7L −KIL)vP804;および (6)巨大ユニット、リボヌクレオチドレダクターゼ(I 4L)vP866  (NYVAC)。
以下の実施例に記載したように、これらの領域のいずれかまたはいずれの組合せ は、単体または組合せのいずれかて、免疫不全ウィルスからの外因性DNAおよ び他の外因性DNAを挿入して有用な組換え体を得るための部位であここで第1 図を参照する。プラスミドpsD406はpUC8にクローニングされたワクシ ニアHindIIIJ(位置83359−88377)を含有している。pSD 406をHindIIIとPvullで切断し、HindllI Jの左側から の1.7kb断片を、HindIII/SmaIで切断したpUC8にクローニ ングし、pSD447を形成した。p SD447はJ2R(位置83855− 84385)の全遺伝子を含有している。開始コドンはNlalll部位内に含 まれ、終止コドンは5sp1部位内に含まれる。転写の方向は第1図の矢印によ り示す。
左の側腹アームを得るために、0.8kbのHindlII/EcoR1断片を pSD447から単離して、次いでN1a111で切断し、0.5kbのHin dlll/N1alll断片を単離した。アニールした合成オリゴヌクレオチド MPSYN43/MPSYN44 C配列認m番号1/配列認識番号2) を0.5kbのHinsIII/N1aII I断片により、Hindl I  I/EcoRIで切断したpUc18ベクタープラスミドに連結し、プラスミド pSD449を産生じた。
ワクシニア右側腹アームとpUCベクター配列を含有する制限断片を得るために 、pSD447をワタシニア配列内の5spI (部分的)とpUC/ワクシニ ア接合部のHindIIIで切断し、2.9kbのベクター断片を単離した。こ のベクター断片を、アニールした合成オリゴヌクレオチドMPSYN45/MP SYN46 (配列認識番号37′配列認識番号4) と連結し、pSD459を産生じた。。
1つのプラスミド中に左と右の側腹アームを結合するために、0.5kbのHi  nd I I I/Sma I断片をpSD449から単離し、Hi nd  I I I/Sma Iで切断したpSD459ベクタープラスミドと連結し、 プラスミドpsD460を産生じた。psD460を、野生型親ワタシニアウイ ルスコペンハーゲン菌株VC−2による組換えのための供与体プラスミドとして 用いた。テンプレートとしてのMPSYN45 (配列認識番号3)およびプラ イマーとしての相補20merオリゴヌクレオチドMPNYN47(配列認識番 号5) (5’ TTAGTTAATTAGGCGGCCGC3’)を用いたプライマー 延長により32p標識プローブを合成した。組換えウィルスvP410はプラー ク雑種形成によりここで第2図を参照する。プラスミドp SD419は、pU C8にクローニングされたワクシニア5all G(位置160,744−17 3.351)を含有している。
pSD422は、右側に隣接する5ail断片である、pUC8にクローニング された5ail J(位置173゜351−182.746)を含有している。
出血性領域、uSB l 3R−B ]、 4R(位置172,549−173 ゜552)の欠失したプラスミドを構成するために、pSD419を左側腹アー ムの供給源として用い、pSD422を右側腹アームの供給源として用いた。U 領域の転写方向を第2図の矢印により示す。
psD419から望ましくない配列を除去するために、psD419のNcoI /Smalによる切断と、続いてE、coliポリメラーゼのフレノウ断片によ るプラントエンドと連結により、Nco1部位(位置172.253)の左まで の配列を除去し、プラスミドp S D 4.76を産生じた。B14Rの終止 コドンでのHpalによるpSD422の切断と0.3kb右のNru Iによ る切断により、ワクシニア右側腹アームを得た。この0.3kb断片を単離し、 pSD476から単離した3、4kbのHinclIベクター断片で連結し、プ ラスミドpSD477を産生じた。pSD477中のワクシニアU領域の部分的 欠失の位置を三角形により示す。pSD477中の残りのB13R暗号配列をC 1al/Hpalでの切断により除去し、生成したベクター断片を、アニールし た合成オリゴヌクレオチドSD22me r/SD20me r (配列認識番 号6/′配列認識番号7) と連結し、pSD479を産生じた。pSD479は、開始コドン(下線)と続 いてBamH1部位を含有している。
Uプロモーターの制御下でE、coliベータガラクトシダーゼを813−81 4 (u)欠失塵に配するために、ベータガラクトシダーゼ遺伝子を含有する3 、2kbBamHI断片(シャピラ等、1983)をpSD479のBamH1 部位に挿入し、pSD4.798Gを産生じた。psD4798Gを、ワクシニ アウィルスvP410による組換えのための供与体プラスミドとして用いた。組 換えワクシニアウィルスvP533を、色素基質X−galの存在下でブループ ラークとして単離した。vP533において、B13R−814R領域を欠失せ しめ、ベータガラクトシダーゼにより置換する。
vP533からベータガラクトシダーゼを除去するために、U欠失接合部には開 始コドンを含まないがポリリンカー領域を含むpSD477の誘導体である、プ ラスミドpSD486を用いた。最初に、上述のpSD477からのC1al/ HpaIベクタ一断片をアニールした合成オリゴヌクレオチドSD42me r /SD40me r (配列認識番号8/配列認識番号9) t と連結し、プラスミドpSD478を産生じた。次に、EcoRIによりpS0 478の切断と続いてのE、coliポリメラーゼのフレノウ断片によるプラン トエンドと連結により、pUC/ワクシニア接合部でのE c o R,I部位 を破壊し、プラスミドpSD478E−を産生じた。pSD478E−をBam HIとHpalで切断し、アニールした合成オリゴヌクレオチドHEM5/HE M6 (配列認識番号10/配列認識番号11) と連結し、プラスミドpSD486を産生じた。pSD486は、組換えワクシ ニアウィルスvP533による組換えのための供与体として用い、vP553を 産生じ、これをX−galの存在下で透明プラークとして単離した。
ここで第3図を参照する。psD414はpUC8にクローニングされた5ai l Bを含有している。A26L領域の左側までの望ましくないDNA配列を除 去するために、psD414をワクシニア配列(位置137.079)内のXb aIとpUC/ワクンニア接合部でのHi n d IIIで切断し、次いでE 、coliポリメラーゼのフレノウ断片でプラントエンドし、連結し、プラスミ ドpSD483を産生じた。A26L領域の右側までの望ましくないDNA配列 を除去するために、pSD483をEcoRI(位置140.665およびpu c、、’ワクシニア配列内)で切断し、連結し、プラスミドpSD484を産生 じた。
A26L暗号頌域を除去するために、pSD484をA26L ORFからやや 上流のNdel(部分的)(位置139.004)とA26L ORFからやや 下流のHpaI (位置137.889)で切断した。5.2kbベクタ一断片 を単離し、アニールした合成オリゴヌクレオチドAT13/ATI4(配列認識 番号12/配列認識番号13)ACTCATTGAATrGAGAAAACAA TTAATrTTCATATAAGTTTTTTATTCAと連結し、A26L から上流の領域を再構成し、A26LORFを、上述したような制限部位Bgl  I L Ec。
RIおよびHpalを含有する短いポリリンカー領域と置換した。産生じたプラ スミドをpSD485と称した。pSD485のポリリンカー領域におけるBg llIおよびEcoRI部位は特異的ではないので、BgllI(位置140. 136)とpUC/ワクシニア接合部でのEc。
R1での切断と、続いてのE、coliポリメラーゼのフレノウ断片によるプラ ントエンドと連結により、プラスミドpSD483 (上述)からBgllIお よびEcoRI部位を除去した。産生じたプラスミドをpsD489と称する。
A26L ORFを含有するpミD489からの1゜8kb C1aI (位置 137.198)/EcoRV(位置139,048)断片を、pSD485か らの、対応する0、7kbポリリン力−含有C1aI/EcoRV断片と置換し 、pSD492を産生じた。pSD492のポリリンカー領域のBglllおよ びEcoRI部位は特異的である。
ワクシニア11kDaプロモーター(バートレット等、1985 、パーカス等 、1990)の制御下でE、coliベータガラクトシダーゼを含有する3、3 kbのBgllIカセット(シャピラ等、1983)をpsD492のBgl  I I部位に挿入し、pSD493KBGを産生じた。プラスミドpSD493 KBGは治療ウィルスvP553による組換えに用いた。A26L欠矢部位にベ ータガラクトシダーゼを含有する組換えワクシニアウィルス、vP581を、X −galの存在下でブループラークとして単離した。
ワクシニア組換えウィルスvP581からベータガラクトシダーゼを除去するた めのプラスミドを産生ずるために、プラスミドpSD492のポリリンカー領域 を、合成オリゴヌクレオチドMPSYN177 (配列認識番号14)(5’  AAAATGGGCGTGGATrGTTAACffrATATAACTrAT T’lTT’rGAATATAC3′) を用いた突然変異誘発により欠失せしめた。産生じたプラスミドpMP 494 Δにおいて、全A26L ORFを含有する、ワクシニアDNA包含位置[13 7,889−138,937]が欠失せしめられる。pMP 494Δとワクシ ニア組換え体vP581を含有するベータガラクトシダーゼの間の組換えにより 、ワクシニア欠失変異体vP618か産生せしめられ、この変異体はX−gal の存在下透明プラークとして単離した。
ここで第4図を参照する。ワクシニア5alI G制限断片(位置160,74 4−173,351)はHindIII A/B接合部(位置162,539) と交差している。psD419はpUC8中にクローニングされたワクシニア5 alI Gまを含有している。血球凝集素(HA)遺伝子の転写方向を第4図の 矢印で示す。ワクシニア配列内とpUC/ワクシニア接合部のHindllIに よるpsD419の切断と続いての連結により、Hi n−d III Bから 誘導せしめられたワクシニア配列を除去した。
差産生したプラスミドpSD456は、右に0.4kbのワクシニア配列と左に 0.4kbのワクシニア配列を側腹に有するHA遺伝子、A36Rを含有してい る。A36R暗号配列から上流のRsal(部分的;位置161,090)およ びこの遺伝子の末端近くのEagl (位置162゜054)でpSD456を 切断することによりA36R暗号配列を除去した。pSD456からの3.6k bのRsa I / E a g Iベクター断片を単離し、アニールした合成 オリゴヌクレオチドMPSYN59(配列認識番号15)、MPSY62 (配 列認識番号16) 、MPSYN60 (配列認識番号17)、およびMPSY N61 (配列認識番号MPSYN59 −ACAAAATACATAATrT :l’TGTTTTATGTATTAAAACATTTrTATrTAGTGA AAAATATGATrCTAGA−と連結し、A、56RORFから上流のD NA配列を再構成し、上述したようにA36RORFをポリリンカー領域と置換 した。産生じたプラスミドはpSD466である。
pSD466中ノワクンニア欠失は位1ctst、185−162,053]を 包含している。pSD466中の欠失部位を第4図の三角形により示す。
ワクシニア11 kDaプロモーターの制御下で(バートレット等、1985  、グオ等、1989) E、c o l iベータガラクトシダーゼ遺伝子(シ ャピラ等、1983)を含有する3゜2kbのBg l I I/BamHI  (部分的)カセットをpSD466のBg l I I部位に挿入シ、pSD4 66KBGを産生じた。治療ウィルスvP618による組換えにプラスミドpS D0466KBGを用いた。A36R欠失部位にベータガラクトシダーゼを含有 する組換えワクシニアウィルスvP708を、X−galの存在下でブループラ ークとして単離した。
ベータガラクトシダーゼ配列を、供与体プラスミドpSD467を用いてvP7 08から欠失せしめた。EcoR1/Bam、HIによるpSD466の切断と 続いてのE。
coliポリメラーゼのフレノウ断片によるプラントエンドおよび連結により、 EcoRI、SmalおよびBamH1部位がp U C/ワクシニア接合部か ら除去されたことを除いては、pSD467はpSD466と同一である。
vP708とpSD467の間の組換えにより、組換えワクシニア欠失変異体v P723が産生した。この変異体をX−galの存在下で透明プラークとして単 離した。
ここで第5図を参照する。以下のワクシニアクローンはp M P CS K  lΔの構成に用いた。psD420はpuc8にクローニングされた5all  Hである。pSD435はpUc18にクローニングされたKpnl Fである 。
pSD435を5pblて切断し、再連結し、pSD451を産生した。psD 451において、HindIIIM中の5ph1部位(位置27,416)の左 までのDNA配列を除去した(パーカス等、1990)。psD409はpUC 8にクローニングされたHindIII Mである。
ワクシニアから[C7L−に、IL]遺伝子クラスターを欠失するための基質を 提供するために、E、coliベータガラクトシダーゼを以下のようにワクシニ アM2L欠失座に最初に挿入した(グオ等、1990)。psD409中のBg l11部位を除去するために、プラスミドをワクシニア配列中のBglll(位 置28,212)およびptrc/′ワクシニア接合部でのBamH,Iで切断 し、次いで連結し、プラスミドpMP 409 Bを産生じた。pMP409B を特異的Spn 1部位(位置27,416)で切断した。
合成オリゴヌクレオチドMPSYN82 (配列認識番号1比Uエエ を用いた突然変異誘発(グオ等、1990 ;マンデツキ、1986)により除 去した。産生じたプラスミドpMP409Dは、上述したようにM2L欠失座に 挿入された特異的BglIi部位を含有している。11kDaプロモーターの制 御下で(バートレット等、1985) E、c o l iベータガラクトシダ ーゼを含有する3、2kbのBamHI (部分的)/BgIIIカセットを、 BglIIで切断したpMP409Dに挿入した。産生じたプラスミドpMP4 09DBG(グオ等、1990)を、治療ワクシニアウィルスvP723による 組換えのための供与体プラスミドとして用いた。M2 L欠失塵に挿入されたベ ータガラクトシダーゼを含有する句か見えワクシニアウィルスvP784を、X −galの存在下でブループラークとして単離した。
ワクシニア遺伝子[C7L−KIL]の欠失したプラスミドを、Sma IとH indl I Iで切断し、E、coliポリメラーゼのフレノウ断片でプラン トエンドしたpUC8中に組み込んだ。psD420のXbaI(位置18゜6 28)の切断と続いてのE、coliポリメラーゼのりルノウ断片によるプラン トエンドとBgllI(位置1−9゜706)での切断により、ワクシニアHi ndllI C配列からなる左側腹アームを得た。BglII(位置29゜06 2)とEcoRV(位置29,778)でのpSD451の切断により、ワクシ ニアH1ndIII K配列からなる右側腹アームを得た。産生じたプラスミド pMP581CKは、Hindlll C中のBg111部位(位ill、9. 706)とHindlll、に中のBgl11部位(位ti129,062)の 間のワクシニア配列が欠失している。プラスミドpMP581cK中のワクシニ ア配列の欠失部位を第5図中の三角形で示す。
ワクシニア欠失接合部での過剰のDNAを除去するために、プラスミドpMP  581 CKをワクシニア配列内のNco1部位(位置18,811;19.6 55)で切断し、Ba1−31エキソヌクレアーゼで処理し、合成オリゴヌクレ オチドMPSYN233 (配列認識番号20)5’ TGTCATTTAAC ACTATACTCATATTAATAAAAATAATATTTATT 3’ を用いた突然変異誘発(マンデツキ、1986)を施した。産生じたプラスミド pMPcsK1Δは、12ワクシニア読取り枠[C7L−KIL]を包含する、 ワクシニア配列位置18.805−29,108が欠失している。ワクシニア組 換え体vP784を含有するベータガラクトシダーゼとpMPcsK1Δの間の 組換えにより、ワクシニア欠失接合部vP804が産生せしめられた。この変異 体を、X−galの存在下で透明プラークとして単離した。
ここで第6図を参照する。プラスミドpsD405はpUC8にクローニングさ れたワクシニアHindlllI (位置63.875−70.367)を含有 している。
psD405を、ワクシニア配列内のEcoRV(位置67.933)およびp UC/ワクシニア接合部でのSma■で切断して連結し、プラスミドpsD51 8を産生じた。
pSD548の構成に用いた全てのワクシニア制限断片の供給源としてpsD5 18を用いた。
真ワクシニア14L遺伝子は位置67.371−65゜059に亘り延びている 。I4Lの転写方向を第6図中の矢印により示す。14L暗号配列の部分が欠失 したベクタープラスミド断片を得るために、psD518をBamHI(位置6 5,318)およびHpaI(位置67.001)で切断し、E、coliポリ メラーゼのフレノウ断片を用いてプラントエンドした。この4.8kbのベクタ ー断片を、ワクシニア11kDaプロモーターの制御下で(バートレット等、1 985 、パーカス等、1990) E、c o 11ベータガラクトシダーゼ 遺伝子(シャピラ等、1983)を含有する3、2kbのSmalカセットと連 結し、プラスミドpSD524KBGを産生じた。ワクシニアウィルスvP80 4による組換えのための供与体プラスミドとしてpSD524KBGを用いた。
14L遺伝子が部分的に欠失したベータガラクトシダーゼを含有する組換えワク シニアウィルスvP855を、X−galの存在下でブループラークとして単離 した。
vP855から残りのI4L ORFとベータガラクトシダーゼを欠失するため に、欠失プラスミドpSD548を構成した。上述し、第6図に概略を示したよ うに、左右のワクシニア側腹アームをpUC8中で別々に組立てた。
左ワクシニア側腹アームを受容するベクタープラスミドを構成するために、pU C8をB a m HI / E c o RIで切断し、アニールした合成オ リゴヌクレオチド518A11518A2(配列認識番号21/配列認識番号2 2)GATCCTGAGTACTTTGTMTATAATGATATATATT TTCACTTTATCTCATGACTCATGAAACATI’ATATT ACTATATATAAAAGTGAAATAGAGTAと連結し、プラスミド psD531を産生じた。pSD531をRsaI(部分的)とBamHIで切 断し、2.7kbのベクター断片を単離した。psD518をBgll■ (位 置64.459)/Rs a I (位置64.994)で切断し、0.5kb の断片を単離した。2つの断片をともに連結し、pSD537を産生した。この pSD537は、I4L暗号配列の左に完全なワクシニア側腹アームを含有して いる。
右ワクシニア側腹アームを受容するベクタープラスミドを構成するために、pU C8をB a m HI / E c o RIで切断し、アニールした合成オ リゴヌクレオチド518B11518B2(配列認識番号23/配列認識番号2 4)GATCCAGATCTCCCGGGA〜υす講ATTATTTAACTT TTCATTAATAGGGATTT51BB2 ’31 GTCTAGAGGGCCCTTTTTTTAATAAATTGAAAAGTA ATTATCCCTAAAと連結し、プラスミドpSD532を産生じた。ps D532をRsaI(部分的)/EcoRIで切断し、2.7kbのベクター断 片を単離した。psD518をワクシニア配列内のRsaI(位置67.436 )およびワクシニア/ p U C接合部でのEcoRIで切断し、0.6kb の断片を単離した。2つの断片をともに連結し、pSD538を産生じた。この pSD538は、14L暗号配列の右゛に完全な側腹アームを含有している。
右ワクシニア側腹アームをpSD538からの0.6kbのEcoRI/Bgl II断片として単離し、EcoRI/BgllIで切断したpSD437ベクタ ー断片に連結した。産生じたプラスミドpSD539において、l4LORF( 位5165.047−67.386)は、ポリリンカー領域により置換されてい る。この領域は、全てpUC背景において、左には0.6kbのワクシニアDN Aと右には0.6kbのワクシニアDNAを側腹に有する。
ワタシニア配列内の欠失部位を第6図中の三角形で示す。
pSD539のpUC誘導部分におけるベータガラクトシダーゼ配列の組換えワ クシニアウィルスvP855中のベータガラクトシダーゼ配列により起こり得る 組換えを避けるために、ワクシニア14L欠失カセツトをpSD539からpR cll中に除去した。全てのベータガラクトシダーゼ配列はpUC誘導体から除 去し、ポリリンカー領域と置換した(コリナス等、1990) 。p SD53 9をEcoR1/Pstlで切断し、1.2kbの断片を単離した。この断片を EcoRI/PstIで切断したpRcll (2゜35kb)中に連結し、p SD548を産生じた。ワクシニア組換え体vP855を含有するベータガラク トシダーゼとpSD548との間の組換えにより、ワクシニア欠失変異体vP8 66が産生せしめられた。この変異体を、X−ga lの存在下で透明プラーク として単離した。
組換えワタシニアウイルスvP866からのDNAを、制限切断と続いてのアガ ロースゲル上での電気泳動により分析した。制限模様は予期したものであった。
テンプレートとしてのvP866と上述した6つの欠失塵を側腹に有するプライ マーを用いたポリメラーゼ連鎖反応(PCR)(エンゲルケ等、1988)によ り、予期したサイズのDNA断片を産生じた。欠失接合部の区域辺りのPCR産 生断片の配列分析により、接合部は予期されたものであることが確認された。上 述したような6つの操作欠失を含む組換え株rNYVAcJと称した。
この実施例は、HIV遺伝子産生物を発現する宿主制限ポックスウィルスの産生 を記載する。用いたベクターは、NYVAC,ALVACおよびTR0VACで ある。
HIV−1(I I I B)V3ループおよびエピトープ88を含有するAL VACおよびNYVAC組換え体HIV−1(I I IB)のv3ループ(ア ミノ酸299−344.ジャブヘリアン等、1989 、ラローザ等、1990 )を包含する150bp断片を、オリゴヌクレオチドHIV3BL5 (配列認 識番号25) (5’ −ATGGTAGAAATrMTTGTAC−3’ )およびHIV3 BL3 (配列認識番号26)(5’−ATCATCGMTTCMGCTrAT TAT’rTrGCTCTACTMTGTrAC−31)をテンプレートとして のpHXB、2D (I I I)(MD1ヘセスダ、NCI−NIH,Dr、 R,C,ガロにより提供された)とともに用いたPCRにより誘導せしめた。オ リゴヌクレオチドE(IV88A (配列認識番号27)およびHIV88B  (配列認識番号28)をともにアニールして、HIV−1エピトープ88を含有 する二本鎖断片(アミノ酸95−105、シャファーマン等、1989)を産生 じた。エピトープを含有する150bpのv3含有PCR断片および88工ピト ープ配列を含有する42bp断片を、相補配列に存在のためPCRにより、とも に融合せしめた。反応は、オリゴヌクレオチドHIV88C(配列認識番号29 ) (5’ −AGTAATGTGACAGAAAATTrTAAC−3’ )およ びHIV3BL3を用いて行なった。192bpのPCR誘導断片は、v3ルー プ配列の上流に融合されたエピトープ88配列を含有している。終止コドンはオ リゴヌクレオチドHIV3BL3P中に含まれ、読取り枠の翻訳を終止し、開始 コドンはオリゴヌクレオチドHIV88C中に含まれ、エピトープ88/V3ル ープ融合タンパク質を発現する翻訳の開始のときに作用した。さらに、オリゴヌ クレオチドHIV3BL3は、EcoRI部位が192pb PCR断片の3′ 末端に存在するように合成された。
エントモポックスウィルスプロモーター、42kDa(初期)は、テンプレート としてのプラスミドpAM12とともにオリゴヌクレオチドRG273 (配列 認識番号3(5’ −AGGCAAGCTTTC店店MTATAAATGATI TC−3’ )およびRG274 (配列認識番号31)(5’ −TTTAT A’1TGTAATTATATATI’TTC−3’ )を用いたPCRにより 産生じた。42kDaプロモーターを含有する108bp断片を、5′末端にH indIII部位を含有するように合成した。分節を含有する42kDaプロモ ーターを、EcoRIで切断したエピトープ88/V3断片およびHindII IとEcoRIで切断したp RW831に連結する前に、キナーゼし、Hin dIIIで切断した。産生じたプラスミドはpc5HIVL88と称した。この プラスミドを治療ウィルスとしてのCPppによるin vitro組換えに用 いてvCP95を産生した。ALVAC組換え体vCP95は、CPppのde −ORFedC5座にエピトープ88/V3を含有している。
プラスミドpc5HIVL88をHindI I IとEvoRIで切断し、上 述したエピトープ88/V3発現カセットを含有する300pb断片を遊離せし めた。この断片をLMP−アガロースゲルから切除して、フェノール抽出(2× )とエーテル抽出(IX)により単離した。単離断片を、2mMのdNTPの存 在下でE、coli DNAポリメラーゼのフレノウ断片を用いてプラントエン ドした。
プラントした断片をSma Iで切断したpsD550Vcに連結し、プラスミ ドpHIVL88Vcを産生した。このプラスミドを治療ウィルスとしてのvP 866とともに用いてvP878を産生じた。vP878は、vP866のde −ORFed I4L座にエピトープ88/V3ループカセツトを含有している 。
ワクシニアウィルスH6プロモーターに対して3′が並列したHIV−1(II  IB)env遺伝子からなる発現カセット(グオ等、1989 、ティラー等 、1988a、 b)を、A、 L V A CおよびNYVACベクターによ るHIV−1からのgp160の発現のために操作した。オリゴヌクレオチドH IV3Bl (配列認識番号32)(5’ −GTTTTAATTGTGGAG GGGAATrCTTCTACTGTAATTC−3’ )およびHIV3B5  (配列認識番号33)(5’ −ATCATCTCTAGAATAAAAAT TATAGCAAAATCCTTTC−3’ )を用いて、1,4kbの断片を pHXB、2D (I I I)(MD 、ベセスダ、NCI−NIHSDr、 R,C,ガロにより提供された)から増幅せしめた。この断片は、enV遺伝子 の3′部分を含有している。これらのプライマーによるPCR増幅により、暗号 配列の後にワクシニアウィルス初期転写終止T5NT配列モチーフを配し、アミ ノ酸配列を変更することなく位置6146から6152に位置したT5NTモチ ーフ(ラトナー等、1985)を除去した。
この変更(TからC)により、この位置にEcoRI部位(GAATTC)を産 生じた。この1.4kbの断片をEcoRI (5’ −末端)とXbaI(3 ’ −末端)で切断し、EcoRIとXbaIで切断したpBS−3Kに挿入し た(CA、ラジョラ、ストラタンエネ)。産生じたプラスミドをpBsHIVE NVl、5と称した。この断片のヌクレオチド配列の分析により、位置7048 でのTからCへの転移以外は、配列は完全に正確であったことが示された。この 転移は以下のように正された:テンプレートとしてのpHX8.2D (I I  I)とともにオリゴヌクレオチドHIV3B1 (配列認識番号32)(5’  −GTTTTAATTGTGGAGGGGAATTCTrCTACTGTAA TTC−3’ )およびHIV3B17 (配列認識番号34)(5’ −TG CTACTCCTAATGGTTC−3’ )を用いたPCRにより250bp の断片を誘導した。この断片をBgllIとEcoRlで切断した。この断片を Ba1llとEcoRIで切断したpBsHIV3B1.5に挿入し、そして不 正確なヌクレオチドを有する領域と置換してプラスミドpBSHIV3B3Pを 産生した。テンプレートとしてのpHXB、2D (I I I)とともにオリ ゴヌクレオチドHIV3B9 (配列認識番号35)(5’ −CATATGC TTTAGCATCTGATG−3’ )およびHIV3B10 (配列認識番 号36)(5’ −ATGAMGAGCAGAAGACAGTG−3’ )を用 いたPCRにより、env遺伝子の5′部分を含有する150bpの断片を誘導 した。オリゴヌクレオチドv■(5’−ATCATCGGTACCGATTCT TTATTCTATAC−コt)およびVVH63P (配列認識番号38)( 5’ −TACGATACAAACTTAACGG−3’ )を用いたPCRに より、pC3FGAGからワクシニアウィルスH6プロモーターを含有する12 8bp断片を産生じた。KpnIで切断したpBS−3Kにこれらの断片をとも に挿入する前に、両方の断片をKpnlで切断し、150bpの断片を、キナー ゼした。産生じたプラスミドをpBSH6HIV3B5Pと称シタ。
オリゴヌクレオチドHIV3B2 (配列認識番号39)(5’−GAATTA CAGTAGAAGAATTCCCCTCCACAATTAAAAC−3′)− およびHIV3B7 (配列認識番号40)(5’ −CMTAGATAATG ATACTAC−3’ )を用いたPCRにより、pHXB、2D (I I  I)から6oobpの断片を産生じた。この断片をEcoRIで切断し、キナー ゼした。同一のテンプレートであるが、オリゴヌクレオチドHIV3B6 (配 列認識番号41)(5’ −GTATTATATCAAGTrTATATAAT AATGCAT’ATTC−31)およびHIV3B8 (配列認識番号42) (5’−GTTGATGATCTGTAGTGC−31)を用いたPCRにより 、500bpの断片を誘導した。この断片をKpnIて切断した。これらの断片 はヌクレオチド5878から6368にともに対応している(ラトナー等、19 85)。これらのプライマーによるこれらの断片の操作により、アミノ酸配列を 変更することなく、ヌクレオチド6322から6328に位置するT5NT配列 を除去する。これらの2つの断片をKpnlとEcoRIで切断したpBsHI V3B3Pに挿入した。このプラスミドをpBSHIV3BP2768と称した 。
プラスミドpBsH6HIV3B5PをKpnlで切断し、HIV−1env遺 伝子の5′部分(150bp)と146プロモーターを含有する360bpの断 片を遊離せしめた。このKpnI断片をK p n Iて切断したpBSHI  V 383 P 276 s ニ連結し、プラスミドpBsHIV3BEIIを 産生した。Xbalての切断と部分的なKpnlての切断により、pBsHIV 3BEI [から2.8kbの断片を誘導した。この断片をプラントエンドし、 Smalで切断したpsD550に挿入した。プラスミドp14LH6HIV3 Bを産生じ、治療ウィルスとしてのVP866による組換え実験に用いた。これ により、NYVACゲノムのI4L座にHIV−1env遺伝子を含有するVP 911を産生じた。
HIV−1env遺伝子をALVACベクター中に挿入するために、pBsHI V3BEAI IをNru IとXbalて切断した。誘導した2、7kbの断 片を、2mMのdNTPの存在下でE、coli DNAポリメラーゼのフレノ ウ断片でプラントエンドした。この断片は、ワクシニアH6プロモーターの3′ −側21bpまで(N r u■部位まで)3′が並列する全HIV−1env 遺伝子を含有している。この断片を、Nru IとEcoRIでのp RW83 8の切断と続いてのフレノウによるプラントエンドにより誘導した3、lkbの 断片に連結した。pRW838誘導断片は、05座に対して異種遺伝子を向ける カナリアボックスから誘導した相同アームを含有している。
また、H6プロモーターの5′側の100bpも含有している。それゆえ、これ らの断片の連結により、HIV−1env遺伝子の発現カセットを含有する挿入 プラスミドが産生せしめられ、これをpc5HIV3BEと称した。
このプラスミドを、治療ウィルスとしてのALVACにょろりin vitro 組換え実験に用いて、vcP112を産生した。
HIV−1(l l IB)gp120を発現するNYVAC−ベースの組換え 体 プラスミドpBsHIV3BEAI IをEcoRIとXbalで切断し、4. 3kbの断片を遊離せしめた。この断片は、HIV−1env遺伝子からヌクレ オチド6946に結合したワクシニアウィルスH6プロモーターを含有している (ラトナー等、1985)。4.3kbの断片を、gp120暗号配列の3′部 分に対応する300bpのEcoRI/Xbal切断PCR誘導断片に連結した 。テンプレートとしてのpHXB、2D (I I I)とともにオリゴヌクレ オチドHIVI−120A (配列認識番号43)(5’−ATCATCTCT AGMTAAAAATTATGGTTCAATrTTTACTACTTTI’A TATTATATATrTC−3’) およびHIVI−120B (配列認識番号44)(5’ −CAATAATC TrTAAGCAAATCCTC−3’ )を用いて、300bpのPCR断片 を誘導した。4.3kbのXbaI/EcoRI断片と300bpのXbaI/ EcoR1断片の連結により、プラスミドpBsHIVB120が産生せしめら れた。
最初にプラスミドをXbalにより線状化し、続いて部分的なKpnl切断によ り1.6kbのKpnl/Xba1[T片をpBSHIVB120から誘導した 。l、5kbの断片を、2mMのdNTPの存在下でE、coliDNAポリメ ラーゼのフレノウ断片による処理によりプラントエンドした。この断片をSma  Iで切断したpSD541に挿入し、pATIHIVB120を産生した。こ のプラスミドをin vitro組換え実験に用いてvP921を産生じた。こ の組換え体は、NYVACOATI座中のgp120をコードするHIV−1e nv遺伝子の部分を含有している。
vP911、vP921およびvcP112により表されるHIV−1遺伝子産 生物の確実性を決定するために、イムノプレシビテーション分析を行なった。
感染細胞から誘導した溶解産物を、HIV−1血清陽性個体からプールした血清 (MD、ベセスダ、NCI −N IHSDr、ジェノベファ フランチ一二か ら得た)を用いてHIV−1env遺伝子発現に関して分析した。血清は、vP 866感染Vero細胞で予備吸着せしめた。予備吸着ヒト血清を4℃での一晩 の接種によりタン、<り質Aセファロースに結合せしめた。ある場合には、gp 120に特異的な単クローン性抗血清(デュポン)を第1血清として用い、ラッ ト抗マウスを第2抗体として用いた。この培養期間に続いて、材料をI×緩衝液 Aで4回洗浄した。
通常のヒト血清とタンパク質Aセファロースで予備浄化した溶解産物を、タンパ ク質Aセファロースに結合せしめられた血清陽性の個体からのヒト血清により4 ℃で一晩培養せしめた。−晩の培養期間に続いて、試料を、1×緩衝液Aで4回 、LiCl2/尿素緩衝液で2回洗浄した。2Xラエムリス緩衝液(125mM のトリス(pH6,8) 、4%のSDS、20%のグリセロール、10%の2 −メルカプトエタノール)の添加と、5分間の沸騰により、沈殿したタンパク質 を免疫複合体から分離した。タンパク質を10%ドリファスゲルシステム(ドリ ファス等、1984)上で分画し、固定化し、蛍光光度法のためにLM−Na− サリチル酸塩で処理した。
HIV−1血清陽性個体からプールした血清を用いたイムノプレシピテーション の結果は、vP911感染細胞溶解産物からのgp160エンベロープ糖タンパ ク質のgp120およびgp41成熟形状の特異的沈殿を示した。親ウィルス( NYVAC; v P 866)感染細胞溶解産物においては、そのような特異 的遺伝子産生物は検出されない。
gp120の特異的沈殿はまた、vP921感染細胞溶解産物中にも発見された 。
同一血清の免疫蛍光分析は、それぞれvP911およびv P 921.により 発現せしめられたgp160およびgp120種は、感染細胞の表面に存在した ことを説明した。
vcP112感染CEF細胞に関してもイムノプレシピテーションを行なった。
ALVAC親ウィルスに感染した細胞および未感染CEF細胞からのgp120 細胞外部分に対して群れられた単クローン性抗体により、HI V−特異的ポリ ペプチドはまったく沈殿しなかった。しかしながら、vcP112感染細胞から は、2つのHIV−特異的ポリペプチド種が沈殿した。これらの種は、それぞれ 前駆体env遺伝子産生物および成熟細胞外形状に対応する、160kDaおよ び120 k、 D aの明確な移動度により移動した。
HIV gp120を発現する組換えワクシニアウィルスは主要HIV−特異的 細胞障害Tリンパ球活性を誘発する5X10’PFUのワクシニアウィルス組換 え体vP878、vP911、またはvP921、もしくは、対照としてのベク ターNYVACのiv投与に続いて、ペプチドHBX2て一晩培養した合成P8 15細胞に対する、BALB/cマウスの肺臓CTL活性を評価した(表1)。
あまり多くないが、顕著な(P < 0.05)第1CTL活性がvP921を 投与したマウスの肺臓中に生成され、HIV gp120を発現した。他の組換 えワクシニアウィルスまたはベクターは、第1HIV−特異的CTL活性を誘発 できなかった。ワクシニアウィルスを投与したマウスの各群が第1ワクシニア− 特異的CTL活性に応答したので、これは不適切な感染のためではない。対照の 免疫化していないマウスも標的に応答しなかった。
HIV envペプチドを発現する組換えポックスウィルスはH[V−特異的記 憶細胞障害Tリンパ球を産生ずる1つの組換えワクシニアウィルスの1回の接種 から少なくとも1か列後、マウスの肺臓細胞を、NYVACまたは各HIV組換 えワクシニアウィルスを事前に感染せしめた同系で未経験の肺臓細胞によりin  vitroで刺激せしめた(表2)。同一のワクシニアウィルスHIV組換え 体(vP878、vP911、またはvP921)の1つに感染せしめた細胞に よりin vitroで再刺激せしめた、vP878、vP911、およびvP 921で免疫化したマウスの牌象細胞培養中のみで強いHIV特異的CTL活性 が検出サレタ。HIV gp120またはgp160を発現するワクシニアウィ ルス組換え体は、88エピトープに融合されたV3ループのみを発現するワクシ ニアウィルス組換え体よりも良好に記憶CTLを産生できた。
HIV特異的CTL活性は、未免疫化対照またはNYVAC免疫化牌象細胞から は誘発できなかった。ワクシニア特異的記憶CTL活性は、使用したワクシニア ウィルスのいずれかに感染せしめた肺臓細胞によるin vitro刺激後に明 確となったので、ベクター免疫化マウスにHIV特異的CTL活性のないことは 、乏しい免疫化に帰するものではなかった。
同様な研究において、HIV特異的記憶CTLを生成する、88エピトープに融 合されたv3ループ領域を発現するカナリアボックス組換え体(vCP95)の 能力を実験した(表3) 。to’ PFUのvCP95またはカナリアボック スベクター、CPppの1回の接種から3週間後、HtV特異的記憶CTL応答 を、組換えワクシニアウイル−ス類似体、vP878により誘発せしめられた応 答と比較した。ワクシニアおよびカナリアボックスCTL応答は、適切な免疫化 の対照として含まれた。vP878およびvCP95で免疫化したマウスからの 肺臓細胞のみが、vP878により刺激できたHIV特異的記憶CTL活性を生 成した。機能的細胞溶解CTLに対して存在する記憶CTLを刺激しないvCP 95の能力は、ワクシニアウィルス組換え体の使用に基づいて最大とされる、使 用したin vitro条件に関連したかもしれない。
In Vitro刺激細胞障害細胞の特徴付けHIVペプチド瞬間標識標的細胞 に対する細胞媒介細胞障害が、ナチュラルキラー細胞のような、CTLに関連し ない非特異的エフェクター細胞の個体群を示すことが考えられる。これを試験す るために、vP921で免疫化し、vP921感染牌臓細胞によりin vit roで再刺激′したマウスの肺臓細胞を、Tヘルパーリンパ球(CD、4)また は細胞障害リンパ球(CD8)に特有のTリンパ球結実表面抗原が枯渇していた (表4)。前述のように、vP921で免疫化したマウスのみが、vP921感 染同系牌臓細胞によりin vitroで刺激しえた記憶HIV特異的CTL活 性を生成した。補体産生(C′)および単クローン性の抗−CD4と抗−CD8 はある程度の毒性効果を生成したけれども、CD8結実細胞、(抗−CDa十C ”)もまた、HIV特異的細胞障害エフェクター細胞が枯渇していた。それゆえ 、HIVペプチド瞬間標識標的細胞に対する細胞媒介細胞障害活性は、MHIク ラスI制限CTLの特徴である、細胞膜上のCD8抗原を有した。
HIV gp120のV3ループ領域のCTL抗原受容体認識の特異性 Tリンパ球抗原受容体は、エピトープ断片の第1アミノ酸配列における小さな変 化に対して極めて感度が高い。HIV gp120のV3ループ領域は、超可変 性であり、HIV単離体の中で免疫学的に異なる。超可変性は、いくつかのアミ ノ酸の置換と添加にある。HIVワクシニアウィルス組換え体により産生された 細胞障害の特異性を実験するために、HIV単離体II1.3、SF2、および MNのV3ループ領域に対応するペプチドで標識したP815標的細胞の中で、 CTL活性に対する感受性を比較した。
vP911およびvP921による免疫化のみが、HIV特異的第1CTL活性 を誘発した(表5)。さらに、HI■特異的CTL活性は、HIV単離体■ll 11のV3ループに対応するペプチドで標識したP815標的細胞のみに限られ た。同様の結果か、ワクシニアウィルス組換え体VP878、v P 9 ]、  1、およびvP921による免疫化で誘発された、in vitro刺激の、 HIV特異的第2CTL活性に関して得られた(表6)。それゆえ、HIV単離 体i r t 、、のenv遺伝子の様々な部分を発現する組換えワクシニアウ ィルスにより誘発されたHIV特異的CTLは、同一の抗原単離体から誘導せし められた標的エピトープのみを認識する。
ワクシニアウィルスHIV組換え体にによる免疫化後のHIVエピトープに対す るリンパ球増殖 抗原に対するリンパ球の増殖は、細胞媒介免疫性の1nvitro相関関係であ る。適切な抗原の提示により、抗原のための受容体を発現する細胞の免疫個体群 における細胞増殖を誘発する。増殖の開始と継続には可溶性媒介物質によるTヘ ルパーリンパ球を含有することが必要である。
HIV抗原を発現する組換えワクシニアウィルスで免疫化したマウスにおけるH IV抗原に対する細胞媒介免疫性を評価するために、27日前に免疫化したマウ スからの膵臓細胞を、T1およびT2と称するTヘルパーリンパ球エピトープに 関連するペプチド、並びに精製HIV gp160で5日間に亘って培養した( 表7)。Tヘルパー細胞エピトープT1およびT2に対する増殖応答は、どの膵 臓細胞培養物にも観察されなかった。しかしながら、vP921で事前に免疫化 したマウスの膵臓細胞は、[3H]−チミジンを含有することにより測定された ように、HIV gp160に活発に応答した。2.0より大きな刺激指数(S l)は、免疫を示すものと考えられる。それゆえ、vP921によるマウスの接 種は、HIV gp160に対する細胞媒介免疫を誘発した。
HIVに対する液性応答を評価するために、ワクシニアウィルスHIV組換え体 の1つでマウスを免疫化した日を0日とし、5週目に第2の免疫化を行なった。
最初の免疫化後9週間に亘り、様々な間隔で、マウスから採血した。
各処理群からプールした血清を、抗原としての精製gp160を用いたELIS AによりHIVに対する抗体についてアッセイした(表8)。第1の抗体応答は 一般的にあまり大きくないが、vP911により誘発された最高水準に関しては 検出できた。第2の免疫化後、vP911およびvP921により免疫化したマ ウスの抗体価は増大し、9週目にやや衰える前に、それぞれ4.600および3 .200を超える力価で7週目にピークとなった。それゆえ、2つのワクシニア ウィルスHIV組換え体、vP911およびvP921は、著しい抗体応答を誘 発することができた。
表1.ワクシニアウィルス感染標的およびHIV−1gp120のv3ループ領 域に対応するペプチドで標識した標的に対するワクシニアウィルス組換え体で免 疫化したマウスからの膵臓細胞の第1CTL活性 E : Tm2O3: 1 * P<0.05対適切な対照、スチューデント、検定表2.ワクシニアウィル ス組換え体によるin疫化したマウスからのBALB/cJ牌臓細胞を、肺臓間 に亘り感染した同系膵臓細胞で培養し、20:1の標的細胞に対するエフェクタ ー細胞の比率で細胞障害についてア・ソ表3. HjVgp120のv3ループ を発現するカナリアボックスウ免疫化から23日後、5日間に亘り膵臓細胞をウ ィルス感染またはペプチド瞬間標識同系膵臓細胞によりin vitroで刺激 し、次いで20・1の標的細胞に対するエフェクター細胞の比率でウィルス感染 またはペプチド瞬間標識P815標的細胞に対する特異的細胞障害についてアッ セイした。
* P<0.05を適切な対照、スチューデント、検定と比較。
表4. CD8−補体に対する単クローン性抗体による細胞障害活性の涸渇 表5.HIV組換えワクシニアウィルスによる1回の接種後のHIV−1単離体 III。のv3ループに関する第1 CTL活性の特異体 マウスに1回のiv接種により表示したワクシニアウィルス組換え体を投与し、 7日後にP815標的およびHIV−1単離体III。、SF2 、およびMN のv3ループ領域に対する3つのペプチドのうち1つで瞬間標識したP815標 的に対するCTL活性についてアッセイした。100 : 1.50:1、およ び25:1の標的細胞に対するエフェクター細胞の比率でアッセイしたが、10 0:1のデータのみを示す。
* P<0.05対適切な対照、スチューデント、検定表6.1(IV組換えワ クシニアウィルスの1回の接種後におけるHIV単離体lll1lの■3ループ に関する第2 CTL活性の特異性 細胞障害パーセント NYVACO,40,5−0,6−0,3vP878 0.2 0.2 −0. 5 −1.0vP911 −1.5 0.3 −0.5 0.2vP921 − 0.6 1.4 0.1 −0.5NYVACな し −2,20,20,5− 1,0NYVAC3,22,23,92,5 vP878 4.4 5.9 5.0 6.1vP911 5.8 11.1  5.0 5.3vP921 5.0 6.5 2.9 2.9vP878 な  し 0.1 −0.2 −0.9 −1.0NYVAC3,04,84,44, 5 vP878 7.9 20.2 7.8 8.6vP911 4.8 7.8  4.5 4.7vP921 2.7 6.9 2.8 3.0VP911 な  し 0.9 1.8 1.4 0.5NYVAC8,88,38,16,6 vP878 6.6 57.2 6.8 8.2vP911 4.6 63.7  2.9 4.2vP921 7.2 63.6 4.1 4.9vP921  な し 0.5 0.8 1.2 0.6NYVAC4,47,97,56,0 vP878 8.1 59.0 7.1 7.5vP911 6.4 71.4  7.9 6.6vP921 9.3 63.4 9.0 8.L実施例3−A LVAC,TR0VACおよびNYVAcべ全HIV−1(ARV−2またはF S−2菌株)ゲノムを含有するラムダクローンをJ、レビーから得て、前に記載 している(サンチェズーペスカドール等、1985)。enV配列をpUc13 中にサブクローニングし、プラスミドpMP7MX373を産生した。プラスミ ドpMP7MX373は、env遺伝子産生物の開始コドン(ATG)に相対的 な−1からenv遺伝子の終止コドン(T A A)の715bp下流までの配 列を含有している。これらのenV配列は、EcoRIおよびHindlllの 切断によりpMP7MX373から切除し、プラスミドベクター、pIBI25 (CT、ニューハブン、インターナショナルバイオテクノロジー社)に挿入し、 プラスミドpIBI25envを産生した。
組換えプラスミドpIBI25envを用いてコンピテントE、coli CJ 236(dat−ung−)細胞を形質転換した。1本鎖DNAを、形質転換E 、coli CJ236細胞のへルバーファージ、MG408による感染により 誘導したファージから単離した。この1本鎖テンプレートを、オリゴヌクレオチ ドMUENVT12(配列認識番号45) (5/−AGAGGGGMTTCTTCTACTGCMTACA−:l’)によ るin vitro突然変異誘発反応(クンケル等、1985)に用いた。この オリゴヌクレオチドによる突然変異誘発により、TからCの転移が行なわれ、A RV−2ゲノムのヌクレオチド位置6929−6935でのT5CTモチーフを 分断する(サンチェズーペスカドール等、1985)。
この変異体はenv遺伝子のアミノ酸配列を変更せずにEcoR1部位を産生ず る。EcoR1部位を突然変異誘発プラスミドクローンのスクリーニングに用い た。ジデオキシヌクレオチド鎖終止法により配列確認を行なった(サンガー等、 1977)。産生じた突然変異誘発プラスミドをplBI25mutenvll と称した。
1.45kbのBglII断片をpIBI25mutenvllから誘導した。
この断片は変異体env配列を含有した。この断片は、plBI25env中の 対応する未変異断片を置換するのに用いた。産生じたプラスミドをpIBI25 mutenv8と称した。さらに、plBI25mu t env8に修飾を行 なった。In vitro突然変異誘発を行なって、遺伝子の3′末端からし・ ツクスタンバク質をコードする配列とLTR配列(LTR領域)を除去し、推定 の免疫抑制(Is)領域アミノ酸583から(配列認識番号45 : Leu− Gln−Ala−Arg−Val−Lau−Ala−Val−Glu−Arq− TYr−Leu−Arq−Asp−Gin−Gin−Lau)を削除した(クラ ッセ等、1−9138 )。これらの反応は、オリゴヌクレオチドLTRI ( 配列認識番号47)(5’ −TTGGAAAGGCTT’rTGGCATGC CACGCGTC−3’ )およびMUENSVI SR(配列認識番号48) (5’ −ACAGTCTGGGGCATCAAGCAGCTAGGGATIT GGGGTTGCTCT−3’ )によりpIBI25mutenv8から誘導 した1本鎖テンプレートに関して行なった。突然変異誘発したクローンは、雑種 形成および制限分析により同定した。ISおよびLTR領域の両方が削除される ように、そしてもう一方はLTRが削除されるように突然変異誘発されたクロー ンは、ヌクレオチド配列分析により確認し、それぞれpIBI25mut3en v40およびpIBI25mut2env22と称した。
全env遺伝子を含有する3、4kbのSmal/Hindlll断片をpIB I25mut3env40とpiBI25mut2env22とから誘導し、p cpcvtとpFPCV2に挿入し、Sma I/Hi nd I I Iで切 断した。プラスミドpcPcVlは1.03座に生じる挿入によりALVAC組 換え体の産生を可能にする挿入プラスミドである。プラスミド、pFPCV2は 、H7座に生じる挿入によりTR0VAC組換え体の産生を可能にする挿入プラ スミドである。プラスミドpcPcV1およびpFPCv2は、1989年4月 20日ニ発行されたPCT国際公報第89103429号に記載されている。
オリゴヌクレオチドPROVECNS (配列認識番号4(5’ −CCGTT AAGTTTGTATCGTAATGAAAGTGAAGGGGACCAGG− 3’ )をマンデツキ(1986)の方法によるin vitro突然変異誘発 反応に用いて、VVH6プロモーターおよびenV配列に関する正確なATG  : ATG構成を産生じた。潜在的な変異体をSma1部位の損失に関してスク リーニングした。Sma I部位が欠失しているプラスミドクローンを、ヌクレ オチド配列分析により同定し、確認した。正確に突然変異誘発したプラスミドク ローンを同定し、pCPenvls+またはpCPenv I S−およびpF Penvls+またはpFPenv I Sと称した◇Nru IとHindl lIでの切断により、HIV−1env遺伝子をpcPenvls−から切除し た。それぞれ2.5kb (envls+)と2.4kb (envIS−)の 2つのenv断片を単離し、2mMのdNTPの存在下でE、coli DNA ポリメラーゼのフレノウ断片の反応によりプラントエンドした。これらの断片を pSIVenvVVのNrulとPstIでの切断により誘導された3、5kb の断片と連結し、続いて2mMのdNTPの存在下でE、coli DNAポリ メラーゼのフレノウ断片でプラントエンドした。プラスミドpSIVenvv■ は、ATI挿入座においてワクシニアウィルスH6プロモーターにより調節され たSIV env遺伝子発現カセットを含有している。pSIVenvVVのN ruIとPstlでの切断によって、全SIV env遺伝子暗号配列およびプ ロモーター要素の3′側の20bpを切除する。env Is−およびenv  Is十断片への連結により、H6プロモーターの20bpを修復し、ATI挿入 プラスミド中にHIV−1env遺伝子を挿入する。産生じたプラスミドを、そ れぞれenv IS+およびenvls(7)7’l:めのpAR5VV+およ びpAR6VV−と前述したように、ALVACおよびTR0VAC組換え体の 両方のリン酸カルシウム沈殿により、プラスミドDNAを感染細胞に導入する組 換えを行なった(ピッチm=等、1987) 。プラスミドpCPenv I  S+およびpCPenvls−を用いて、それぞれ組換え体vCP61およびV CP60を産生じた。プラスミドpFPenvls+およびpFPenvls− により、それぞれ組換え体vFP53およびvFP62を産生した。プラスミド pAR5VV+およびpAR6VV−を治療ウィルスとしてのvP866による in vitro組換え実験に用いて、それぞれvP939およびvP940を 産生した。組換えプラークを、前述したように、32p標識env特異的プロー ブによる雑種形成後のオートラジオグラフィーにより選択し、連続3回の継代を 行なって純度を確認した(ピッチm=等、ARV−2または5F−2菌株のHI V env遺伝子がワクシニア早期晩期プロモーター、H6から下流に挿入され た場合に、6つの異なる組換えウィルスを産生じた。
単純化するために、2つのALVACベースの組換えウィルス、vCP61およ びvcP60を、CPIS+およびCPIS−と称し、2つのTR0VACベー スの組換え体、vFP63およびvFP62を、FPIS+およびFPIS−と 称し、2つのNYVACベースの組換え体、vP939およびvP940を、そ れぞれ■V−およびVv+と称する。
全ての構成概念は、HIV−4env遺伝子のATG開始フトンがワクシニアH 6プロモーターのATGに重ねられているという点て正確であった。さらに、全 ての異質の遺伝情報3′から終止コドンが除去された。CPIS−1FPIS− 1およびVV−は全て、gp41遺伝子産生物の5′部分の近くに位置するアミ ノ酸583−599に対応する、51gp領域の欠失により得られた。この領域 は、他のレトロウィルス糖タンパク質の膜内外ポリペプチド(シアンシオロ等、 1985 、ルーダ等、1989a、 b)に生じる推定の免疫抑制領域(クラ ッセ等、1988 ;ルーダ等、1988aSb)と相同性がある。
全ての6つの組換えウィルスに関する発現分析を、CEFSVero、およびM RC−5細胞単層において行なった。HIV血清陽性個体からプールした血清を 用いたラジオイムノプレシピテーション実験を前述したように行なった。6つの 組換え体の全てが、HIV−1gp160エンベロープ前駆体の合成を指向した 。しかしながら、gp120およびgp41に対するgp160の処理能率は、 細胞の種類により変化し、免疫抑制領域の欠失によっても影響を受ける。HIV 血清陽性個体からのプールした血清によるgp41の認識はまた、ウィルスのバ ックグラウンドと細胞の種類により変化する。
オリゴヌクレオチドHIV25PA (配列認識番号50)(5’−ATGAG TGGTAAAATTCAGCTGCTTGTTGCCTTTCTGCTAAC TAGTGCTTGCTTA−3′) およびHIV25PB (配列認識番号51)(5’ −TAAGCAAGCA CTAGTrAGCAGAAAGGCAACAAGCAGCrGAAゴACCA CTCAT−3’ ) をアニールしてHIV−21SSY菌株(フランチm;等、1989) e n  v暗号配列の最初の54bpを構成した。
この断片を、テンプレートとしてのpTP15 (グオ等、1989)を用いた オリゴヌクレオチドH65PH(配列認識番号52) (5’ −ATCATCAAGCTTGATrCTTTATTCTATAC−3 1)およびH63PHIV2 (配列認識番号53)(5’ −CAGCTGA ATTTTACCACrCATTACGATACAAACTrAACG−3’  )によるPCRによって誘導した129bpの断片に3′を融合せしめた。これ らの2つの断片の融合は、オリゴヌクレオチドHIV25PC(配列認識番号5 4)(5’−TAAGCAAGCACTAGTTAG−3’)およびH55PH (配列認識番号52)を用いたPCRにより行なった。L74bpのPCR誘導 断片をHindlIIと5aciで切断し、Hindl l Iと5aclで切 断したpBS−3k (CA、ラジョラ、ストラタジエネ)に挿入した。産生じ たプラスミドをpBSH6HIV2と称した。挿入は、ヌクレオチド配列分析に より確認した。
HIV−2env遺伝子の3′部分をまたPCRにより誘導した。この反応にお いて、テンプレートとしてpIS 5Y−KPN (MD、ベセスダ、NCI− NIH,Dr。
ジエノベファ フランチー二により提供された)を用いてオリゴヌクレオチドH IV2B1 (配列認識番号55)(51−CCGCCTCTrGACCAGA C−3’ )およびHIV2B2 (配列認識番号56)(5’ −ATCAT CTCTAGAATAAAAATTACAGGAGGGCAATrTCTG−3 ’ )により増幅した。この断片をBamHIとXbalで切断した。この切断 から誘導した150bp断片は5’ BamHlおよび3’Xbal粘着末端を 含有した。この断片は、終止コドン(T A A)の後に、ワクシニアウィルス 早期転写終止信号(ユエン等、1987)として認識されることが知られている T5NT配列モチーフを含有するように操作せしめられた。
HIV−2env遺伝子の大部分は、5aclとBam1の切断によりplss Y−KPNから得られた。この切断により産生された2、7kbの断片を、遺伝 子の3′末端に対応する150bpのBamHI/XbaI断片とともに、5a clとXbaIで切断したpBS−SKに共挿入した。産生じたプラスミドをp BSHIV2ENVと称した。
pBsH6HIV2からの174bpのS p e I /H1ndIII断片 およびpBSHI V2ENVからの2.5kbの5pel/Xbal断片を、 Hindl I Iとxbalで切断したpBS−8Kに連結し、pBsH6H IV2ENVを産生した。pBSH6HIV2ENVかラノ2゜7kbのHin dl I I/XbaI挿入体を単離し、2mMのdNTPの存在下でE、co li DNAポリメラーゼのフレノウ断片でプラントエンドした。プラントエン ドした断片をSma I切断psD541Vc挿入ベクター中に挿入した。産生 じたプラスミドをpATIHIV2EN■と称した。このプラスミドを治療ウィ ルスとしてのvP866 (NYVAC)によるin vitro組換え実験に 用いて、vP920を産生じた。
イムノプレシピテーション分析を行なって、vP920が真正HIV−2gpL 60を発現するか否かを決定した。
HIV−2血清陽性個体(MD、ベセスダ、NCI −NIH,Dr、ジエノベ ファ フランチm=から得た)からプールした血清を用いて、HIV−2env 遺伝子発現に関して、感染細胞からの溶解産物を分析した。血清をVP866感 染Vero細胞で予備吸着せしめた。予備吸着せしめたヒト血清を、4℃での一 晩の培養によりタンパク質A−セファ0−スに結合せしめた。この培養期間の後 、物質を1×の緩衝液Aで4回洗浄した。通常のヒト血清とタンパク質入−セフ ァロースで予備浄化した溶解産物を、タンパク質入−セファロースに結合した血 清陽性個体からのヒト血清により4℃で一晩培養せしめた。−晩の培養期間後、 試料を1×の緩衝液で4回、L I Cl 2 /尿素緩衝液で2回洗浄した。
2×のラエムリス緩衝液(125mMのトリス(p H6,8) 、4%のSD S、20%のグリセロール、10%の2−メルカプトエタノール)の添加と5分 間の沸騰により、沈殿タンパク質を免疫複合体から分離した。タンパク質を、1 0%のドリフアメゲルシステム上で分画しくドリファス等、1984) 、固定 化し、蛍光光度法のためにIMのサリチル酸塩で処理した。
HIV−2血清陽性個体からのヒト血清は、vP920感染細胞からのHIV− 2gp160エンベロープ糖タンパク質を特異的に沈殿せしめた。さらに、gp 160ポリタンパク質が成熟gp120およびgp41タンパク質種に処理され るので、発現したHIV−2env遺伝子産生物の真正が確認された。どのHI V特異的タンパク質種は、疑似感染細胞または親つィルスvP866感染した細 胞からは沈殿しなかった。また、遺伝子産生物がvP920感染細胞の表面上に 発現されるという蛍光抗体法アッセイによる観察で、vP920によるHIV− 2envの適切な発現が支持された。
gp120の発現 HIV−2env遺伝子の5′末端に融合されたワクシニアウィルスH6プロモ ーターを含有するプラスミドpBSH6HIV2を5pelとHindIIIで 切断し、これらの配列を含有するtsobpの断片を遊離せしめた。
この断片を、pBsHIV212OAの1.4kbの5peI/XbaI断片と ともに、HindI I IとXbalで切断したpSB−3K111m連結し 、pBsHIV2120Bを産生じた。
最初にPCHによりgp120暗号配列の3′部分を誘導することにより、プラ スミドpBsHIV212OAを誘導した。PCRは、テンプレートとしてのp ISSY−KPNとともにオリゴヌクレオチドHIV212OA (配列認識番 号57) (5’ −ATCATCTCTAGAATAAAAATTATCTCTrATG TCTCCCrGG−3’ )およびHIV2120B (配列認識番号58) (5’−MTTAACT’rTACAGCACC−3’)を用いて行なった。P CR誘導断片をEcoRlとXbaIて切断して、5’ −]:coRI粘着末 端と3’ −XbaI粘着末端を含有する300bp断片を産生じた。この断片 を、Xba1部位に対してちょうど5′のT5NT配列モチーフと翻訳終止配列 (TAA)に関して操作した。300bpのXbaI/EcoRI PCR断片 を、pISSY−KPNから誘導した1、4kbのS a c I / E c  。
R1断片とともに5acI/Xbal切断したpBS−3K1.:連結L、pB sHIV2120Aを産生じた。
プラスミドpBsHIV2120BをHindl I IとXbaIで切断し、 ワクシニアウィルスH6プロモーターに対して3′に並列したHIV−2gp1 20暗号配列を含有する1、8kb断片を産拒した。この断片を、2mMのdN TPの存在化でE、coli DNAポリメラーゼのフレノウ断片でプラントエ ンドした。プラントエンドした断片をSma I切断psD541Vcに連結し 、pATIHIV2120を産生じた。このプラスミドを1nvitro組換え 実験を用いてvP922を産生じた。
vP922感染細胞によるイムノプレシピテーション実験を、全HIV−2en v遺伝子の発現に関して上述したように行なった。疑似感染またはvP866感 染Ver0細胞からは、どのHIV特異的種も沈殿しなかった。しかしながら、 120kDaのタンパク質種が、vP922に感染した細胞から誘導した溶解産 物より沈殿した。
SIV (mac142)env遺伝子を含有するプラスミドps311EをD r、ジエノベファ フランチーノ(MD、ベセスダ、NCI−NIH)から得た 。このプラスミドをHindIIIとPstlで切断し、SIV env遺伝子 のヌクレオチド220から翻訳終止コドンから160bp下流の領域までを含有 する2、2kbpの断片を遊離した。この断片を含有する発現カセットはgp1 60種よりもむしろgp140タンパク質種の発現となることに注意すべきであ る。膜内外領域のこの40%の欠失は、ゲノムのヌクレオチド7.934での未 熟な終止から生じる(フランチー二等、1987)。そのようなenv遺伝子産 生物の未熟終止は、培養中のSIVの増殖後に認められる。
(コダマ等、1989)。
遺伝子のアミノ酸部分は、テンプレートとしてのpSSllEとオリゴヌクレオ チド5IVENVI (配列認識番号59) (5’ −C(:ATATCCGTTAAGTTTGTATCGTAATGGG ATGTCTTGGGAATC−31)およびS IVENV2 (配列認識番 号60)(5’ −CAAGGCTTTATTGAGGTCTC−3’ )を用 いたPCRにより誘導した。産生じた25obpの断片は、ワクシニアウィルス H6プロモーターの3′側の20bp(Nru1部位の3′末端)から下流に並 列したSIV env遺伝子の5′側230bpを含有している。
170bpの断片を、SIV env配列の5obpを除去する、250bpの 断片のHindI I Iでの切断により得た。
未熟終止信号の後のSIV env遺伝子の残りを含有する配列をpSS35E  (Dr、ジエノベファ フランチm=から得た)からのPCHにより誘導した 。このプラスミドは、env遺伝子から下流のLTR領域中に5IVenv遺伝 子のC末端部分を含有する配列を含有している。
360bpの断片を誘導するのに用いたオリゴヌクレオチドは、5IVENV3 (配列認識番号61)(5’ −CCTGGCCTTGGCAGATAG−3L  )およびS IVENV4A (配列認識番号62)(5’ −ATCATC GAATTCAAAAATATTACAAAGAGCGTGAGCTCAAGT CCTTGCCTMTCCTCC−3’ ) てあった。この断片をPstIとEqoRIで切断し、5’Pstl粘着末端と 3’ EcoR1粘着末端を有する260bl)の断片を産生じた。
ps311Eからの2.2kbのHindllI/Psti断片、遺伝子の5′ 末端を含有する170bpのNrul/HindlII断片、および遺伝子の3 ′末端を含有する260bpのPstI/EcoRIを、pRW838から誘導 した3、1kbのN r u I / E c o RI断片に連結した。p  RW838は、遺伝子の05座への挿入を可能にするカナリアポックスウィルス 配列を側腹に有する狂犬病G遺伝子に連結したワクシニアウィルスH6プロモー ターを含有している。Nru IとEcoRIでの切断により、狂犬病G遺伝子 を遊離し、H6プロモーターの3′側20bpを除去する。ワクシニアH6プロ モーターに連結したSIV env遺伝子を含有する、産生じたC5挿入プラス ミドをpc5sIVENVと称した。
プラスミド、pc5sIVENVをHindIIIとEcoRIで切断し、SI V env遺伝子のヌクレオチド150から全遺伝子の末端までを含有する2、 2kbの断片を遊離せしめた。PCRを用いて、オリゴヌクレオチドMPSYN 8286 (配列認識番号63)(5’ −CCCCCCMG!ATrCTAT ACTT−3’ )および5IVENV2(配列認識番号64)(5’ −CM GGCTTTATTGAGGTCTC−3’ )によりpc5sIVENVから ワクシニアH6プロモーター/SIV env連結を誘導した。320bpの断 片をHindlllで切断し、240bl)の断片を誘導した。
2.2kbのHindI I I/EcoRIおよび240bpのHindll I断片を、HindlllとEcoRIで切断したpc31に共連結した。SI V env暗号配列に関連して適切な配位にHindl I I断片を含有する 産生じたプラスミドをpc3sIVEMと称した。プラスミドpC3Iを以下の ように誘導した。2.5kbのBgIIIカナリアポックスウィルスゲノム断片 のヌクレオチド配列分析により、全C3読取り枠および5′ と3′の側腹領域 が明らかにされた。C3読取り枠を完全に切除したC3座への異種遺伝子のため の供与体プラスミドを構成するために、PCRプライマーを用いてC3に関連す る5′および3′配列を増幅した。5′配列のためのプライマーはRG277  (配列認識番号65) (5’ −CAGTTGGTACCACTGGTAT”ITrATrTCAG− 3’ )およびRG278 (配列認識番号66)(5’ −TATCTGAA TTCCTGCAGCCCGGGTTTTTATAGCTAATTAGTCAA ATGTGAGTTAATA TTAG−3’ )であった。
3′配列のためのプライマーは、RG289 (配列認識番号67) (5’ −TCGCTGAATTCGATATCAAGCTTATCGATI’ rTrATにACTAGTTAATCAAATM刃vG CATA CAAGC −3’ )およびRG280(配列認識番号68)(5’ −TrATCGAG CTC′rGTAACATCAGTATCTAAC−3’ )であった。このプ ライマーは、ワクシニア転写および翻訳終止信号を側腹に有する多重クローニン グ部位を含有するように設計された。また、左アームと右アームの5′末端と3 ′末端には、2つのアームをASI)718/5acl切断pBS−8Kプラス ミドベクターに連結可能にする適切な制限部位(左アームにはAsp178およ びEcoR11右アームにはEcoRIおよび5acl)を含む。生成したプラ スミドをpC3Iと称した。
プラスミドpC3S IVEMをEC0RIでの切断により線状とした。続いて の部分的なHindIIIでの切断により、2,7kbのHindI I I/ EcoRI断片を遊離せしめた。この断片を、2mMのdNTPの存在下でE、 coli DNAポリメラーゼのフレノウ断片の処理によりプラントエンドした 。この断片を、SmaIで切断したpsD550Vcに連結せしめた。産生じた プラスミドをpsIVEMVcと称した。このプラスミドを、治療ウィルスとし てのvP866によるin vitro組換え実験に用いて、vP873を産生 じた。vP873は、IJL座にSIV env遺伝子を含有している。
NYVAC/gag/po lおよびgag組換え体の産生gagおよびpol 遺伝子を包含するSIV cDNA配列を含有するプラスミド、psIVAGs sllGをDr、ジェノベファ フランチm=(MD、ベセスダ、NC1−NI H)から得た。このプラスミドからのgagおよびpol遺伝子は、ワクシニア tk側腹アームの間のワクシニアI3Lプロモーターに3′が並列していた。g agおよびI3Lプロモーターに対応するオリゴヌクレオチド5IVLI(配列 認識番号69) および5IVL2(配列認識番号70)(5’−CCCATGATTAAACC TAAATAATTGTACTTTGTAATATAATGCTATATATr TTCACTT TATCTCAC−3’ )を含有するpsIVGAGs31 1Gの4,800bpのCfol/Tagl断片を、psD460の誘導体であ る、pSD542の4.070bt)のXhol/Accl断片にクローニング することによりこのことを行なった(第1図)。この操作により産生じたプラス ミドを、psIVGlと称した。
pO1遺伝子を除去するために、215bpのPCR断片を、オリゴヌクレオチ ド5IVP5(配列認識番号71)(5’−AATCAGAGAGCAGGCT −3′)および5IVP6(配列認識番号72)(5’ −TTGGATCCC TATGCCACCTCTCT−3’ )を用いてpsIVGAG311Gから 誘導した。PCR誘導断片をBamHIと5tuIで切断し、5IVGIの5゜ 370bp部分的BamHI/5tuI断片に連結した。
これにより、psIVG2を産生じた。pSIVG2を、治療ウィルスとしての vP873によるin vitr。
組換え実験に用いてvP948を産生じた。
gagとpolの両者をNYVACベースのベクター中に挿入するプラスミドを 以下のように操作した。上述したpsIVGlは、lkbのPCR断片を用いて 除去された外因性3′非暗号配列を含有している。この断片を、オリゴヌクレオ チド5IVP5および5IVP6を有するプラスミドpsIVGAGss11G かう産生じり。pol遺伝子の3′末端を含有するこのPCR誘導断片をBam HIとHpalで切断した。lkbのBamHI/HpaI断片をpsIVGl の7,400bp部分的BamHI/Hpal断片に連結し、pSIVG4を産 生じた。
psIVG4の配列分析により、pol遺伝子内の1つの塩基対欠失が認められ た。この誤りを修正するために、psIVGlからの2.31)ObpのBgl ll/5tuI断片を、psIVG4の6.100bpの部分的BglII/5 tuI断片に挿入し、psIVG5を産生じた。
このプラスミド、pSIvG5を、治療ウィルスとしてのvP873によるin  vitro組換え実験に用いて、vP943を産生じた。
NYVAC/SIV pl6およびp28組換え体の産生p28、p2、p8、 pl、およびp6をコードするgag遺伝子部分とpol遺伝を、psIVGl から除去した。これは、オリゴヌクレオチド5IVLIO(配列認識番号73) および5IVLII (配列認識番号74)(5’ −GATCCTCTAGA ATAAAAATTAGTAATTTCC′rCCTCTGCCGCTAGAT GGTGCTGTTGGT−3’ )をpsIVGlの4,430bpのAcc l/BamHI断片にクローニングすることによりpsIVG3を産生ずること により行なった。このプラスミドは、ワクシニア13Lプロモーターにより発現 されたSIV p16遺伝子産生物の発現カセットを含有している。
エントモポックスウィルス42kDaプロモートしたSIV p28遺伝子(5 ′末端のみ)をI3Lプロモートしたp16遺伝子の下流に挿入した。これは、 p28遺伝子の5′末端を含有する、ps IVGI+7)360bp(7)B spMI/BamHI断片、エントモボックス42kDaプロモーターを含有す る、オリゴヌクレオチドpSIVL14(配列認識番号75) (5’−TAGACAAAATTGAAAATATATAATrACAATAT AAAATGCCAGTACAACAAATAGGTG GTAACTATGT CCACCTGCCATT−:l ’ )および5IVL15(配列認識番号7 6)(5’ −GCTTMTGGCAGGTGGACATAG’ITACCAC CTATTrGTTGTACTGGCATTTrATATTG TAATrAT ATAffrTCAA、I’rTTGT−3’ )を、psIVG3の、4.4 70bp部分的Xbal/BamHI断片にクローニングすることにより行なっ た。産生じたプラスミドをpsIVG6と称した。
次いてp28遺伝子の3′部分をpsIVG5に挿入した。SIV p28遺伝 子を含有する、290bp PCR断片を、オリゴヌクレオチド5IVP12( 配列認識番号77) (5’ −TGGATGTACAGACAAC−3’ )および5IVP13( 配列認識番号78)(5’−AAGGATCCGMTTCTTACATTAAT CTAGCCTTC−3’)を用いてpsIVGIから誘導した。この断片をB amHIで切断し、psIVG6の4.830bpのBamHI断片に連結した 。産生じたプラスミド、psIVG7を、治療ウィルスとしてのvP866およ びvP873によるin vitro組換え実験に用いて、それぞれvP942 およびvP952を産生した。
発現分析 SIV gp140 env遺伝子産生物は、感染細胞の形質膜に関連する典型 的な糖タンパク質である。この産生物は、112kDaの細胞外種および28k Daの膜内外領域にタンパク質分解的に開裂した140kDaのポリタンパク質 として発現される(フランチm=等、1987)。
フルオレセイン接合ウサギ抗サルIgGの後でSIVに血清陽性なアカゲサルマ カクからの血清を用いた免疫蛍光抗体分析は、組換え体感染Vero細胞の表面 上にenv遺伝子産生物の発現を示した。表面発現は、疑似感染細胞またはNY VAC(vP866)親ウィルスに感染した細胞の表面には検出されなかった。
さらに、gag遺伝子のみを含む組換え体に感染した細胞は、表面にいかなるS IV成分も発現しなかった。vP873、vP943、vP948およびvP9 52に感染した細胞中の表面発現はすべて表面発現を示し、意味ありげに、全て SIV env遺伝子を含有している。
全ての試料が、1mlの3×緩衝液への添加による感染から17時間後に収穫し たことを除いては、NYVAC/HIV組換え体に感染したVero細胞中の発 現SIV遺伝子産生物(envおよびgag)の真正は、前述したようにイムノ プレシピテーションにより分析した。感染細胞からの溶解産物を、SIV血清陽 性アカゲサルマカクからのプール血清またはgag p24遺伝子産生物に特異 的な単クローン性抗体(両者とも、MD、ベセスダ、NCI−NIH,Dr、ジ エノベファ フランチm=から得た)により分析した。
SIV血清陽性マカク血清によりイムノプレシピテーションを以下のような方法 で行なった。マカク血清を4℃で16時間に亘りタンパク質Aセファロースで培 養した。緩衝tAによる洗浄後、タンパク質Aセファロースに結合した血清を、 通常のサルの血清とタンパク質Aセファロースで予備浄化した溶解産物に加えた 。4℃での一晩の培養後、沈殿物を緩衝液Aで4回、LiC1:]/尿素緩衝液 で2回洗浄した。沈殿したタンパク質を抗体から分離するために、試料を80μ lの2×ラエムリ緩衝液中で5分間に亘り沸騰せしめた。ドリファスゲルシステ ム(ドリファス等、1984)を用いて、試料を12.5%のゲル上で分画した 。ゲルを固定化し、フルオログラフィーのためにIMのNa−サリチル酸塩で処 理した。SIV遺伝子を含有する全ての組換え体は、関連する遺伝子産生物を発 現した。SIV env遺伝子を含有するNYVAC組換え体vP871、vP 943、vP948およびvP952は全て、真正gp140を発現した。しか しながら、112kDaおよび28kDaの熟成形状に対するgp140タンパ ク質の加工を評価することは困難である。140kDaのみかけの分子量を有す る種はどの種も、疑似感染Vero細胞、vP866感染Vero細胞およびS IV env遺伝子を含有しないNYVAC組S IM組換え体に感染したVe ro細胞からのマカク抗SIv血清によっては沈殿しなかった。SIVに感染し たマカクからのプール血清およびp28 gag成分に特異的な単クローン性抗 体を用いて、vP942、vP943、vP948、およびVP952によるS IVgagコード遺伝子産生物の発現が示された。プロテアーゼ機能を含む、p al領域のない全p55 gagタンパク質の、Vero細胞中のNYVAC( vP948)による発現は明確である。これらの結果は、SIvプロテアーゼ発 現の欠如がp55の成熟形状への完全なタンパク質分解を拒むことを示す。この ことは、p28に特異的な単クローン性抗体を、vP948感染Vero細胞か らのgag特異的遺伝子産生物を沈殿せしめるのに用いたときに、より明確に示 される。この結果に反して、pol遺伝子によるSIV gagの発現(vP9 48感染Vero細胞中のプロテアーゼを含む)は、発現されたp55 gag 前駆体ポリペプチドがタンパク質分解的に開裂せしめられて成熟形状となること を可能にする。
vP942およびVP952感染Vero細胞中のp16およびp28 SIV 遺伝子タンパク質の両方の発現は、SIVに感染したマカクからのプール血清を 用いて示された。p24に特異的な単クローン性抗体を使用することは、p28 発現成分のみを明確に認識した。
生後6週間の雌のB A L B / cマウスに、5X10’pfUのワクシ ニアウィルス(NYVAC) 、HIV−1(111B)envを発現する組換 えワクシニアウィルス(VP911)、カナリアボックスウイ/l、ス(ALV AC)、またはHIV−1(I I I B)envを発現する組換えカナリア ポックスウィルス(vcP112)を静脈に接種した。7日後、HIV−1(I  IIB)gp120(7)超可変V3ループ領域に対応するペプチドで一晩培 養(7た未修飾P815細胞またはP815細胞に対する第1 CT L活性に ついて、膵臓細胞をアツーセイした。最初の免疫化から22日後、実験マウスの 膵臓をワクシニア感染刺激要因膵臓細胞で培養し、前述したようにペプチド瞬間 標識標的に対する記憶CTL活性についてアッセイした。第2CTL活性を測定 するために、第1の免疫化から29日後、最初と同一の投与量と内容物の第2の 接種をマウスに投与した。
5日後、膵臓細胞を、ペプチド瞬間標識標的に対する細胞溶解性活性についてア ッセイした。細胞障害アッセイのために、H−2’ P815マウス肥満細胞種 細胞を、20μg/ml V3ペプチド(CNTRKRIRIQRGPGRAF VTGK、アメリカンバイオテクノロジー社)(配列認識番号79)とともにま たはこれを含まず、培地(イーグルス塩を含有し、10%の給仕ウシ血清、2m Mのし一グルタミン、100U/mlのペニシリン、および100μg/m1の ストレプトマイシンを補給した最少必要培地)中で一晩培養した。翌朝、遠心分 離によりP815細胞を洗浄し、2X106細胞当り100μCiのN a 1  ” Cr O4中、37℃で1時間に亘り標識した。無傷膵臓を、安楽死せし めたマウスから無菌状態で除去し、水冷したハンクス平衡塩溶液中に浸し、スト マツチャーブレンダ−を用いてタンパク質の細胞懸濁液に粉砕せしめた。膵臓細 胞懸濁液を低速遠心分離により数回洗浄し、アッセイ培地(10%の給仕ウシ血 清、20mMのHEPES、2mMのし一グルタミン、5X]、O−5の2−メ ルカプトエタノール、100U/mlのペニシリン、および100μg / m  lのストレプトマイシンを含有するRPM11640)中に再懸濁せしめた。
記憶CTL活性に関して、免疫化マウスからの膵臓細胞を、刺激培地(10%の 給仕ウシ血清、2mMのし一グルタミン、10−4の2−メルカプトエタノール 、100 U/m lのペニシリン、および100μg / m lのストレプ トマイシンを含有し、イーグルス塩を有する最少必要培地)中で再懸濁せしめ、 ポックスウィルスまたはポックスウィルス組換え体の1つに感染せしめられた同 系刺激器膵臓細胞を有する直立した25cm2の組織培養フラスコ中においてi n vitr。
刺激せしめた。37℃での5日後、細胞を洗浄し、数え、アッセイ培地中で再懸 濁せしめた。″クロム標識標的細胞を、96ウエルマイクロタイタ板中の滴定エ フェクター細胞に加え、4時間の51 Cr放出アッセイを行なった。3つのア ッセイに関して標的細胞に対するエフェクターの比率(E:T)は100 :  1 (第1)、20:1(記憶)、および50:1(第2)であった。細胞障害 パーセントは前述のようにして計算した。すなわち、(実験9 + (r放出− 自発5ICr放出)/(最大51 Cr放出−自発’l I Cr放出)X10 0.最大放出は、5%のドデシル硫酸ナトリウムを標的細胞に添加することによ り測定し、一方自発放出は、エフェクター細胞が不在の状態で標的細胞を培養す ることにより測定した。
どの実験においても、標的細胞からのνCrの自発放出は、最大”Cr放出の2 0%を超えることはなかった。第7図における誤差のバーは、平均からの1標準 偏差を示す。Pく0.05、適切なワタシニアまたはカナリアポックスウィルス 免疫化マウスに比較したスチューデントを検体。
細胞障害エフェクター細胞の細胞表面表現型マウスの牌象細胞を、ワタシニアま たはカナリヤポックスウィルスベクター(NYVACSALVAC) 、もしく はHIV I I IB env (vP911、vcP112)を発現するワ クシニアウィルスまたはカナリアワクシニア組換え体で免疫化せしめた。2回目 の接種は、最初の接種から30日後に投与した。V3ペプチド瞬間標識標的に添 加する前に、膵臓を、2段階プロトコルにおけるマウスTリンパ球表面抗原に対 する単クローン性抗体または同種異系抗血清で処理した。手短に言うと、膵臓細 胞を、同種異系抗”rhy−i、2 (セダーレイン)、単りローン性抗−CD 4(デューク大学医学センター、K、J、ワインホールド、172.4)、また は単りローン性抗Lyt2.2(セダーレイン)が加えられた細胞障害培地(0 ,2%のBSAおよび5mMのHEPESを含有するRPM11640)の1m l当り107の生菌数で再懸濁せしめた。5℃に保持して30分後、細胞を洗浄 し、細胞障害培地の元の量に再懸濁せしめた。補体(ウサギLo−ToxM、セ ダーレイン)を有するものと有さないものと2つの等量に分け、45分間に亘り 37℃で培養した。次いで細胞をアッセイ培地で洗浄し、予備処理細胞密度に基 づいて、’i l Cr放出アッセイに添加する前に、100 : 1 (第1 )、10:1(記憶)、および80:1(第2)の標的細胞に対するエフェクタ ーの比率のアッセイ培地の容量中で再懸濁せしめた。第10図における誤差のバ ーは平均からの1の標準偏差を示す。
前述したようにマウスにvcP112を接種せしめることにより、細胞障害19 28球および細胞1928球の記憶前駆体を産生じた。P815標的細胞をHI V−111B (CNiRKRより工QJ3GPGRAFVTj;1K)(配列認識番号79) 、MN (CNliRKRIliIGPGRAFITxKN)(配列認識番号80)、ま たは5FI (CNIRKfi工IIGPGRAFllTxGR)(配列認識番号81)から のv3ペプチドで一晩瞬間標識せしめたことを除いては、前述したように細胞障 害1928球のアッセイを行なった。標的細胞に対するエフェクターの比率は、 100 : 1. (第1)、20+1(記憶)、および50:1(第2)であ った。
HIV−1(IIIB) p120に対する抗体応答EL I SA板のウェル (イムロンII)を、炭酸塩緩衝液、pH9,6中の0.5ug(D部分的精製 HIV−1(I IIB)gp120 (MD、ベセスダ、NCI−NIHSF Dr、G、フランチm=)により4℃で一晩培養せしめた。
次いで板を0.05%のTween20 (PBST)を含有する食塩加リン酸 緩衝液で洗浄した。次いで板を1%のウシ血清アルブミン(BSA)を含有する PBSTにより37℃で2時間に亘り阻止した。PBSTによる洗浄後、血清を 最初に、0.1%のBSAを含有するPBST (希釈緩衝液)で1:20に希 釈せしめた。血清をELISA板のウェルでさらに2倍に連続希釈した。板を2 時間に亘り37℃で培養し、PBSTで洗浄した。ホースラディツシュペルオキ シダーゼ接合ウサギ抗マウスイムノグロブリン(ダコー)を希釈緩衝液で1 :  2000に希釈し、EL I SA板のウェルに加え、1時間に亘り37℃で 培養した。PBSTによる洗浄後、基質緩衝液中の0PS(o−フェニレンジア ミンジヒドロクロライド)を加え、約20分間に亘り周囲温度で色を呈させた。
2.5MのH2SO4の添加により反応を停止させた。490nmの吸収を、バ イオチックEL−309ELISAリーダーにより測定した。血清終点を、0, 4の吸収値を与える希釈の逆数として定義した。
クスウイルスはHIV特異的細胞障害TリンパHIVカナリアポックスウィルス 組換え体(vcP112:実施例2で定義した)の最初の接種から7日後、HI V V2ペプチド瞬間標識標的細胞に対する肺臓細胞の細胞障害応答は、5X1 07pfuの、同一のHIV env遺伝子を発現するNYVAC組換え体、v P911(実施例2)の同一投与量により誘発せしめられた細胞障害応答と等し かった(第7図)。適切なin vitro刺激または第2の接種後、カナリア ポックスウィルス組換え体を投与したマウスの肺臓細胞の細胞障害の水準は増大 し、同様にNYVAC組換え体を投与したマウスからの肺臓細胞と匹敵した。そ のような細胞障害応答は、非組換えNYVACまたはALVACベクターを接種 したマウスからは検出されず、HIV env遺伝子を発現するポックスウィル ス組換え体による免疫化の必要を確認した。さらに、細胞障害反応性は、接種養 生にかかわらず、いかなるマウスの肺臓細胞からも未修飾P815細胞に対して 検出されなかった。それゆえ、組換えNYVAC,またはより著しくは、HIV −1からのenv暗号配列を発現する組換えALVACを接種したマウスのみが 、v3特異的細胞障害応答を示した。
実施例7−細胞障害エフェクター細胞の特徴付けHIV−I V3ペプチド瞬間 標識標的細胞の溶解に関連する肺臓細胞の同一性を決定するために、マウスをv CP112で免疫化した。各免疫化後、または最初の接種から21日後のin  vitro刺激において、2段階欠失方法を行なって、肺臓細胞を、v3ペプチ ド瞬間標識P815細胞に対する細胞障害性について評価した。カナリアボック スベクターALVACを接種したマウスは、ペプチド瞬間標識標的を殺すことの できない肺臓細胞を産生じなかった。1回の免疫化後、vcP112誘導牌臓細 胞は、V3ペプチド瞬間標識標的を殺すことができる。溶解エフェクター細胞は 、補体を加えた抗マウス’rhyt、2またはL7t2.2による処理に対して 感受性があり、抗−CD4に対して抵抗があった。第10図は、細胞障害Tリン パ球細胞表面抗原’rhyt、2およびLyt2.2に対する抗体に対しての、 vCP112で免疫化したマウスの肺臓細胞からの細胞毒性エフェクター細胞の 感受性を示す。補体または単クローン性抗体もしくは同種異系抗血清のいずれも 1つでは、これらの細胞の細胞障害反応に影響しなかった。300回目投与した 2回目の免疫化から5日後に、同様の結果が得られた。vcP112感染同種牌 臓細胞による1回の接種、in vitro刺激から21日後、抗−LYt2. 2に対して完全に感受性であり、抗−CD4に対する抵抗を有する溶解エフェク ター細胞が生じた。これらのThyl、2−1CD4−1Lyt2.2+エフエ クター細胞は、vCPIL接種マウスからの牌象細胞のvP911によるin  vitro刺激後には見られない。言うまでもなく、HIV V3ループ特異的 細胞障害性は、CD4ではなく、’rhyi、2およびLby2.2を発現せし める1928球の個体群により介在せしめられたことが明確である。この細胞表 面表現型は、古典的細胞障害T IJンパ球の特徴である。
HIVカナリアポックスウィルス(ALVAC)組換え体により産生せしめられ た細胞障害細胞の特異性を実験するために、CTL活性に対するvcP112の 感受性を、HIV単離体I I I B、、MN、またはSF2のgp120の v3ループ領域に対応するペプチドで瞬間標識したP815標的細胞のなかで比 較した。第8図に示すように、HIV特異的第1CTL活性は、HIV単離体M NまたはSF2のgp120のV3ループ領域に対応するペプチドで瞬間標識し た標的細胞ではなく、HIV単離体IIIBのV3ループに対応するペプチドで 瞬間標識したP815標的細胞のみに限定した。この第8図は、HIV MNま たハS F 2 ノV 3 /I、−プノテハなく、gp120+7)HIV1 11B超可変V3ループの細胞障害Tリンパ球抗原受容体の特異性を説明してい る。in vitro刺激した、HIV特異的規約CTL活性およびALVAC 組換え体VCP112による免疫化によって誘発せしめられた第2のCTL活性 に関して、同様の結果が得られた。それゆえ、HIV単離体111Bのenv遺 伝子を発現する組換えカナリアポックスウィルスにより誘発せしめられたHIV 特異的CTLが、同一の抗原単離体から誘導せしめられた標的エピトープのみを 認識する。これらの結果は明確に、HIVカナリアポックスウィルス組換え体の 免疫化により産生されたリンパ球エフェクター細胞の鋭敏な特異性を示し、ナチ ュラルキラー(N K)細胞活性のような非特異的エフェクター機構を除外する 。
HIVに対する体液性応答を評価するために、0回目にマウスにNYVACHI V組換え体またはカナリアポックスウィルス(ALVAC)組換え体を接種し、 4週目に2回目の免疫化を行なった。最初の免疫化から20週間に亘り、様々な 間隔でマウスから採血した。各処理群からのプール血清を、抗原としての精製g p120を用いたELISAによりHIVに対する抗体についてアッセイした; 結果を第9図に示すが、この図は、ベクター(NYVAC。
ALVAC)またはHIV−1envを発現するALVAC組換え体(vcP1 12)もしくはNYVAc組換え体vP911で免疫化したマウスのHIV I IIB gp120に対する抗体応答を提供するものである。ここで逆三角形は 、2回目の接種の投与の時間を示している。第1の抗体応答は一般的に僅かであ るが、検出可能であった。
2回目の免疫化後、vP911およびvcP112の両方で免疫化したマウスの 抗体価は増大し、10.000を超える価で6週目にピークに達した。これらの 抗体価は、研究の期間中ずっと、はぼ同一水準で保持された。それゆえ、ALV ACHIV組換え体、vcP112は、著しい抗体応答を誘発できた。
HIV−1のenv遺伝子を発現するALVACのマウスへの接種は、細胞障害 T IJンパ球の特徴:免疫化、細胞表面表現型、記憶、およびエピトープ特異 性の必要条件を有する肺臓細胞反応性を誘発する。さらに、このALVAC組換 え体の接種により、HIV−1gp120に対する抗体応答が誘発せしめられる 。
実施例1O−NYVAC−およびALVAC−ベースノHIV−1組換え体の誘 導およびALVACとHIV−1(MN) env配列は、それぞれ、HIV− 1(MN)のゲノムcDNAクローンからの1774bpおよび1803bpサ ブ断片を含有するプラスミドpMN1.8−9およびpMNl、8−10から誘 導せしめられた。これらのプラスミドは、Dr、R,C,ガロ(NC1−NIH )の研究所により提供された。オリゴヌクレオチドNIVMN6(配列認識番号 82)(5t −GGGTTATTAATGATCTGTAG−3〆)およびH IV3B2 (配列認識番号39)を用いたPCRによりpMNl、8−9から のこれらの配列を増幅し、続いてK p n I / E c o RIでの切 断により、1.028bpのK p n I / E c o RI断片を誘導 した。この断片を、KpnlとEcoRIで切断したpBS−8Kに挿入し、p BsMIDMNを産生じた。
オリゴヌクレオチドHIVMN5(配列認識番号83)(5’ −ATCATC GAGCTCTGTTCCTI’GGGTTCTrAG−3’ )およびHIV MN3P(配列認識番号84)(5’ −ATCATCTCTAGAATAAA AATrATAGCAAAGCCCTTTCCAAGCC−3’ )を用いたP CRと続いての5acIとXbaIでの切断により、pMNl、8−10から1 ,028bpの5alI/XbaI断片を誘導した。この断片を、404bpの EcoRI/5acI断片と共にEcoRIとXbalで切断したpBS−3K に共挿入した。404bpの断片は、テンプレートとしてのpMNl、8−9お よびオリゴヌクレオチドHIV3B1 (配列認識番号32)とHIVMN4( 配列認識番号85) (5’ −ATCATCGAGCTCCTATCGCTGCTC−3’ )を用 いたPCRにより誘導した。産生じたプラスミドをpBS3MNと称した。
pBsMIDMNからの1,026bpのEcoRI/KpnI断片をEcoR I/KpnIで切断した4、315bpのpBS3MNに挿入し、pBSMID 3MNを産生じた。このプラスミドは、5′側領域を除いてほとんどのenv遺 伝子を含有している。psH6HIV3B5Pから(実施例2で定義した)31 8bpのKpnl断片を単離することにより、ワクシニアウィルスH6プロモー ター(ゲーベル等、1990aSb)およびenv遺伝子の5′側領域を得た。
この断片を、pBsMID3MNからの2゜9bpのKpnI/Xbal断片と ともにK p n I / X bal切断したpBS−3Kに連結せしめた。
産生じたプラスミドをpH6HMNEと称した。
H6プロモーターの3′側26bpに3′が並列した全HIV−1(MN) e nv遺伝子を含有する、pH68MNEからの2.7kbのNrul/Xbal 断片をプラントエンドし、Nrul/SmaI切断したp S PHAH6に挿 入した。これによりプラスミドpHAHIVMNEを産生じた。プラスミドpS PHAH6は以下のようにして誘導した。プラスミドpMP2VCL (KIL 宿主範囲遺伝子の上流のワクシニア配列ないのポリリンカー領域を含有する)を ポリリンカー領域内のHindlllとxhOIて切断し、アニールしたオリゴ ヌクレオチド5PHPRHA AからDに連結し、 (SPHPRHAΔ(配列認識番号86) 5’−5PHPR)LA旦(配列認 識番号87) (5’−TGTGTTAAATTGAAAGCGAGAAATA ATCATAAATTATTTCATTATCGCGATATCCGTTMGT TTGTATCGTAC−3’ )SPHPR)LA Q (配列認識番号88 ) (3’−TTATTAGTATTTAATAAAGTAATAGCGCTA TAGGCM’I’rCMACATAGCATGAGCT−5′) SPHPR)LA Q (配列認識番号89) (3’−AGAAATAAGA TATGAA’ITrTTCACTrTrATTrATGTrTCCj五GAA CTCCCAACACAATTTMCTTTCGCTCT−5’ )HindI 11部位、H6プロモーター−124から−1(パーカス等、1989) 、X ho I、Kpn I、Sma I。
5aclおよびEcoR1部位を含有するpsP126を産生じた。
プラスミドpSD544 (6つの読取り枠内のポリリンカー領域と翻訳終止コ ドンにより置換されたHA遺伝子の部位を囲うワクシニア配列を含有する)をポ リリンカー内のXholで切断し、DNAポリメラーゼIのフレノウ断片で満た し、アルカリホスファターゼで処理した。5PI26をHindlllで切断し 、フレノウで処理し、Smalでの切断によりH6プロモーターを単離した。H 6プロモーター断片のpSD544への連結により、ポリリンカー領域中にH6 プロモーターを含有する(HA転写の方向)pSPHAH6を産生した。この挿 入プラスミドにより、異種遺伝子材料によりワクシニアHA遺伝子(A56;ケ ーベル等、1990aSb)の置換を可能にする。
C5L挿入プラスミドを以下のように誘導した。コスミドベクターpVK102 を用いて(ノーテおよびネスター、1982) 、vCP65のゲノミックライ ブラリー(C5座に狂犬病を有するALVAC−ベースの狂犬病G組換え体)を 構成した。このライブラリーを、pRW764.5内に(C5座)含まれる0、 9kbのPvu I Iカナリアポックスウィルスゲノム断片でプローブした。
これらのカナリアボックスDNA配列は、超厚挿入座を含有している。29kb の挿入物を含有するクローンを成長せしめ、pHC081と称した。C5配列を 含有するこのコスミッドがら、3.3kb C1a断片をサブクローンした。こ のC1a■断片からの配列分析を用いて、1−1372の05座の地図を拡張し た。
C5挿入ベクター、pC5Lを2段階で構成した。1535bpの左アームを、 オリゴヌクレオチドC5A (配列認識番号90) (5’ −ATCATCGAATTCTGAATGTTAAATGTTATAC TTTG−3’ )およびC5B (配列認識番号91) (5/−GGGGGTACCTrTGAGAGTACCACTTCAG−3’  )を用いてPCR増幅により産生じた。テンプレートDNAはカナリアポックス ウィルスゲノムDNAであった。この断片をEcoRI/Smalで切断したp UC8にクローニングした。標準配列プロトコルにより配列を確認した。
オリゴヌクレオチドC5C(配列認識番号92)(5’ −ATCATCCTG CAGGTATTCTAAACTAGGAATAGATG−3’ )およびC3 DA (配列認識番号93)(5r −ATCATCCTGCAGGTATTC TAAACTAGGMTAGATG−3)を用いたPCR増幅により404bp の右アームを産生じた。次いでこの断片を、Smal/PstIで切断した左ア ームを含有する、前に産生じたベクター中にクローニングした。標準配列分析に より全構成物を確認し、pC5Lと称した。この挿入プラスミドにより、異種遺 伝子のC5座への挿入を可能にする。
pH68MNEからの2.8kbのXbaI/部分的Kpnl断片を単離し、X balとKpnIで切断したpC5L中に挿入した。産生じたプラスミドをI) C5HIVMNEと称した。
プラスミドpHAHIVMNEおよびpC5HIVMNEを、治療ウィルスとし て、それぞれNYVAC(vP866)およびALVAC(CPpp)によりi n vitro組換え実験に用いた。これらは、標準方法(ピッチー二等、19 87)により行なった。組換えウィルスから誘導したプラークは、放射線標識e nv特異的DNAプローブを用いたプラークハイブリダイゼーションにより同定 した(ピッチm=等、1987)。3回のプラーク精製後、組換えウィルスを増 幅せしめた。NYVAC−ベースのHIV−1(MN) env組換え体をvP 1008と称し、ALVAC−ベースの組換え体をvcP125と称した。
前述した方法を用いた蛍光抗体法およびイムノプレシピテーションにより、HI V−1(MN) env遺伝子の発現に関して、組換えウィルス、vcP125 およびvP1008を分析した(ティラー等、1990)。HIV−血清陽性個 体からのプールヒト血清(CA、エメリービル、チロン社、Dr、に、ステイマ ーから得た)をこれらのアッセイに用いた。蛍光抗体法の結果により、vcP1 25またはvP1008のいずれかに感染した細胞は、その表面にHIV−1( MN)遺伝子産生物を発現することが示された。vP1008およびvcP12 5感染細胞から調製した溶解産物からのイムノプレシピテーションにより、それ ぞれ、160kDa、120kDa、および41kDaのみかけの分子量を有す る3つの主要なHIV−1特異的タンパク質の存在が示された。これらのことは 、前駆体エンベロープ糖タンパク質(L60kDa)およびタンパク質分解誘導 成熟形状(120kDaおよび41kDa)の発現と一致する。
実m例11−NYVACおよびALVACにょるHIV−i (MN) gp1 20(7)発現 オリゴヌクレオチドT7(配列認識番号94)(5’−AATACGACTCA CTATAG−3’)およびHIVMN120(配列認識番号95)(5’ − ATCATCTCTAGAATAAAAATTATCTT!TTrCTCTCT GCACCACTC−3’ )を用い、続いてのEcoRIとXbalでの切断 により、pB33MNから391bpのEcoRI/Xbal断片を増幅せしめ た。この断片を、pH6HMNE (実施例10で定義した)から誘導した4、 2kbのEcoRI/XbaI断片に連結せしめた。産生じたプラスミドは、p BS−8K中+:HIV−i (MN) gp120のポックスウィルス発現カ セットを含有しており、pBSHIVMN120と称した。
1.7kbのXbal/部分的Kpnl断片を単離し、Kpnl/Xbalで切 断したpC5Lに挿入した。産生じたプラスミドをpc5HIVMN120と称 した。HIV−1(MN) gp120遺伝子をNYVAC中に組み込む挿入プ ラスミドは、最初に1.6kbのN r u I / Smal断片をpBsH IVMN120がら単離することにより得た。この断片を、NrulとSba  Iで切断したpSPHAH6に挿入し、pHAHIVMN120を産生した。
挿入プラスミド、pc5HIVMN120およびpHAHIVMN120を、治 療ウィルスとしてのALVAC(CP p p)およびNYVAC(vP866 )とともに組換え実験に用いた。これらのアッセイおよびプラーク同定と精製を 、標準方法により行なった(ピッチm=等、1987)0ハイブリダイゼ一シヨ ン分析を、放射線標識HIV−1(MN) gp120特異的プローブにより行 なった。精製した組換え体を増幅せしめた。A I、 V A C−ベースのH IV−1(MN) gp120組換え体をvcP124と称し、NYVAC−ベ ースのHIV−1(MN) gp120組換え体をvP1004と称した。
vcP124とvP1004に感染した細胞を、蛍光抗体法およびイムノプレシ ビテーションにより、HIV−1(MN) g p 120を発現する組換え体 の存在について分析した。これらのアッセイは、HIV血清陽性個体からのプー ルヒト血清(CA、エメリービル、チロン社、K。
ステイマーから得た)を用いて、前述したように行なった(ティラー等、199 0)。これらの研究による結果は明確に、vcP124およびvP1004のい ずれかに感染した細胞1tHIV−1(MN) gp120を含有するが、gp l 20 ハ、親ウィルス、ALVACおよびNYvACに感染した細胞および 未感染細胞には観察されなかったことをHIV−1(I I IB) gp16 0の非開裂可能形状を発現するために、スレオニンに対するアルギニンの突然変 異を、グオ等(1990)により示されたように、アミノ酸511で操作した( ラトナー等、1985)。これらの修飾は、感染細胞の表面からのgp120の 放出を減少せしめるために行なった。これらの操作は以下のように行なった。最 初にオリゴヌクレオチドHIV3B2A (配列認識番号9(5’ −GAAA TAATAAAACAATAATC−3’ )オヨびHIVECB (配列認識 番号97)(5’ −GCTCc’rATTCCCACTGCAG’rrTTT TcTc’rCTGCAC−3t )を用いてpBsHIV3BEII (実施 例2に記載した)からの配列を増幅し、続いてPstIとXbaIでの切断によ り376bpのPstI/XbaI断片を得た。この断片を、1,061bpの Pstl/Xbal断片およびpBSHIV3BEI Iから(7)4.5kb (7)EcoRI/Xbal断片と連結した。
ハシターンウィルスSセグメントの中央領域を、オリゴヌクレオチドT5HT3 PPS (配列認識番号98)(5’GTCCTGCAGGATGGAAAAG AATGCCCCAAGC−3’)およびHTS55PN (配列認識番号99 )(5’ −GGGGGAGGCAAACTACCAAGG−3’ )並びにテ ンプレートとしてのS−特異的cDNAクローンを用いたPCRにより産生じた 。581bpの断片は、その3′末端にPst1部位を含み、5′末端は、Sセ グメントの位置499にNci1部位を含む(シュマルジョン等、1986)。
さらに、オリゴヌクレオチドT5HT3PPS(配列認識番号98)を使用する ことにより、アミノ酸配列を変更することなく、位置1029から1035での T、NT要素を除去する。次いでこの断片をNcilとPstlで切断した。H 6プロモーターに融合した暗号配列の5′末端を含有するPCR断片(上述した ようにHindlll/NciIで切断)を、Sセグメントの中央領域を含有す る581bpのNcil/Pstl断片とともに、H4ndllIとPStlで 切断したpBS−SKに連結した。産生じたプラスミドをpBsHTsH65P と称した。
オリゴヌクレオチドHTS3PXBA (配列認識番号1+5 ’ −ATCA TCTCTAGAATAAAAATTAGAGTTrCAAAGGC−3’ ) およびT5HT5PSP (配列認識番号1o1)(5’ −CGCCAGCA TGCAGAAGCAGC−3’ )並びにテンプレートとしてのS特異的cD NAクローンを用いたPCTにより、Sセグメントの3′側438bl)を誘導 した。この断片の5′末端は、Sセグメントの位置1039に位置するPst1 部位(シュマルジョン等、1986)を含有し、3′末端は、PstI/Xba l切断pBS−SKへの挿入前に特有なXbalおよびTsNT配列モチーフを 含有し、pBSHTS3Pを産生ずる。
全Sセグメント発現カセットを産生ずるために、1122bp Pstl/部分 的HindI I I断片をpBSHTS)(56Pから誘導した。コノ断片を 、pBsHTs3Pからの290bpのPstl/XbaI断片とともにHin d I I I/Xba I切断したpBS−3Kに共挿入した。Xbalでの 線状化と続いての部分的なHindl I■切断し、産生じたプラスミドをpB sHVsと称した。
gp160カセットに連結せしめられたH6プロモーターの3′側26bpを含 有する、pBSHIV3BEECからの2.6kbのNrul/Xbal断片を 単離し、pBSHVSの3.0kbのNrul/Xbal断片に連結し、pBs HIV3BEEcMを産生した。NrulとXbalでの切断により、H6プロ モーターの3′側26bpおよびハンターンウィルスS配列を切除する。3.0 kbのNrul/Xbal断片は、pBS−3Kプラスミド中にH6プロモータ ーの5′側100bpを含有している。
pBsHIV3BEEcMからの2.8kbのXbal/′部分的Kpnl断片 をXbal/Kpnl切断したpC5Lに連結し、pC5HIV3BEECを産 生した。pBSHIV3BEECMからの2.7kbのNruI/XbaI断片 をE、coliDNAポリメラーゼのフレノウ断片でプラントエンドし、Nru l/Smal切断したpSPHAH6に挿入し、pHAHIV3BEECを産生 した。
挿入プラスミド、pc5HIV3BEEcおよびpHAHIV3BEECを用い て、それぞれALVAC(CPpp)とNYVAC(vP866)を用いた標準 方法(ピッチm=等、1987)によりin vitro組換え実験を行なった 。HIV−1env遺伝子に特異的な放射線標識プローブを用いた標準プラーク ハイブリダイゼーション分析(ピッチm=等、1987)により、組換えプラー クを同定した。3回の精製による組換えウィルスを増幅した。組換えALVAC −ベースのHIV−1(I I IB) gp160(非開裂可能)をvcP1 26と称し、NYVAC−ベースのものをvP1020と称した。
HIV血清陽性個体からのプールしたヒト血清(CA。
エメリービル、チロン社、K、スティマーから得た)を用いてvP1020およ びvCP126に感染した細胞について、前述した方法により蛍光抗体法および イムノプレシビテーション分析を行なった。蛍光抗0体法の結果は明確に、vc P126またはvP1020のいずれかに感染した細胞cy:を表i上i、:、 HIV−1(IIIB) gp160(非開裂可能形状)の表面発現を示した。
さらに、イムノプレシピテーションの結果は、成熟gl)120およびgp14 0枠にタンパク質分解的に開裂されなかったこれらの感染細胞中+、:HIV− 1(I I rB) gp160の存在を示した。
HIV−1(MN) gp160の非開裂可能形状もまた追跡し、組換えウィル スを以下のように得た。
オリゴヌクレオチドHIVMN3P(配列認識番号10(5’ −ATCATC TCTAGAATAAJiAATrATAGGAAAGCCCTTrCCAAG CC−3’ )およびHIVECA(配列認識番号103)(5’−GTGCA GAGAAAAAACTGCAGTGGGAATAGGAGC−コl)を用いた p H6HMN EからのPCR増幅と続いてのPstlおよびXbalでの切 断により、Pstl/Xbar断片を得た。この1061bpの断片をpBsH IVMNT(実施例13に記載)からの391bpのEcoRI/Pstlおよ びpH6HMNE (実施例10に定義)からの4.2kbのEcoRI/Xb alと連結した。産生じたプラスミドをpBsHIVMNEEc’ と称した。
HIV env挿入物の配列分析により1.1つのヌクレオチドが失われた(S acIおよびXba1部位の間)ことが示された。これを修正するために、以下 の操作を行なった。
p H6HMN Eからの1.028kbのS a c I / X b aI を、pBsHIVMNEEcからの対応断片を置換するのに用いて、pBsHI VMNEEcを形成せしめた。
pBsHIVMNEEcからの2.6kbのNruI/Xbal断片を単離し、 フレノウでプラントエンドし、Nrul/Smal切断したpsPHAH6(実 施例10で定義)に挿入した。産生じたプラスミドをpHAHIVMNEECと 称した。pBsHIVMNEEcからの2.6kbのNruI/XbaI断片も またNrul/XbaI切断したpVQH6C5LSP6 (下記)に挿入し、 pC5HIVMNEECを産生した。
挿入プラスミド、pHAHIVMNEECおよびpC5HIVMNEECを、治 療ウィルスとして、それぞれNYVAC(v P 866)およびALVAC( CPpp)による標準組換え実験(ピッチm=等、1987)に用いた。放射線 標識HIV env特異的DNAプローブを用いた標準プラークハイブリダイゼ ーション(ピッチm=等、1987)により、組換えウィルスを同定し、プラー ク精製した。精製した組換えウィルスを増幅せしめた。HIV−1(MN)非開 裂可能gp160を含有するNYVACベースの組換え体をvP1078と称し 、ALVACベースのものをVCP i−44と称した。
vCP144およびvP1o78の発現分析を上述したように行なった。これら の結果は、発現は質的に、HIV−1(IIIB)封部、vP1020およびv cP126と等しいことを示した。
1 envの非開裂可能、分泌形状の発現タンパク質分解的に開裂されず、遺伝 子産生物のカルボキシ末端の近くの膜内外配列の削除により分泌されるHIV− 1(MN) envを発現するALVACおよびNYVACベースの組換えウィ ルスを産生じた。オリゴヌクレオチドHIVECA(配列認識番号1o3)およ びHIvMNTI(配列認識番号104) (5’ −ATCATCTCTAGAATAAAAATTACAAACTTGC CCATTTATCCAATTCC−3’ )を用いてpH6HMNE (実施 例1oで定義)がらのこれらの配列を最初に増幅し、続いてPstl(5’末端 )とXbaI(3’末端)での切断により、502bpのPstI/Xbai断 片を得た。この断片はヌクレオチド7219から7808に対応する(ラトナー 等、1985)。この断片は、env発現カセットの3′末端として機能する。
それ自体、env遺伝子産生物は、膜内外領域を欠き、オリゴヌクレオチドHI VMNTI (配列認識番号1o4)により提供された終止コドンにより終止さ れ、オリゴヌクレオチドHIVECA(配列認識番号103)を用いて提供され た511でのアミノ変化(実施例12で定義)により開裂されない。この502 bp断片を、オリゴヌクレオチドHIV3B1 (配列認識番号32)およびH IvECB(配列認識番号97)を用いたp H6HMN EからのPCRによ る391bpのEcoRI/Pstl断片に連結せしめ、4.2kbのEcoR I/XbaI断片をpH6MNEに連結せしめた。産生じたプラスミドをpBs HIVMNTと称した。
pBSHIVMNTからの2.2kbのXbaI/部分的Kpnl断片を単離し 、XbalとKpnIで切断したpC5Lに挿入した。産生じたプラスミドをp C5HIVMNTと称した。pBsHIVMNTから2.1kb(7)NruI /Xbal断片を単離することにより、NYVAC挿入プラスミドを誘導した。
この断片を2mMのdNTPの存在下でE、coli DNAポリメラーゼのフ レノウ断片によりプラントエンドし、NrulとSma Iで切断したpSPH AH6に挿入し、pHAHIVMNTを産生した。
挿入プラスミド、pc5HIVMNTおよびpHAHIVMNTを、治療ウィル スとして、それぞれALVAC(CPpp)およびNYVAC(vP866)に よる標準組換え実験(ピッチm=等、1987)に用いた。放射線標識HIV  env特異的プローブを用いた標準プラークハイブリダイゼーションアッセイ( ピッチm=等、1987)により組換えウィルスを同定した。増幅の前に、組換 えウィルスに3回の精製を行なった。ALVACベースのHIV−1(MN)  env (非開裂可能;分泌)をvcP120と称し、NYVACベースのもの をvP994と称した。
HIV血清陽性個体からのプールしたヒト血清を用いて、vcP120およびv P994感染細胞について、前述したようにイムノプレシピテーション分析を行 なった。vCP120およびvP994の両者が、非開裂可能、トランケート遺 伝子産生物と一致する分子量を有するHIV−1(MN) env特異的遺伝子 産生物を発現した。さらに、vcP120およびVP994感染細胞培養物から の無細胞培地のイムノプレシピテーションは、このenv遺伝子産生物の分泌を 示した。
HIV−1(I I IB) envについて同様の構成を操作した。このこと を達成するために、以下の操作を行なった。オリゴヌクレオチドHIVECA  (配列認識番号103)およびHIv3BT(配列認識番号105)(5’ − ATCATCTCTAGAATAAAAATTACAAACTrGCCCATT TATCTAATrCC−3’ )を用いてこれらの配列をpBsH6HIV3 B5P (実施例2で定義)から最初に増幅し、続いてPstlとXbalでの 切断により、487bpのP!5tl/Xbal断片を得た。397bpのEc oRI/Pstl断片をpBSHIV3BEECから単離し、4.2kbのEc oRI/Xbal断片をpH68I I I BEMから単離した。これらの3 つの断片をともに連結し、pBsHIV3BT1を産生した。プラスミドpH6 HIIIBEMまを、KpnIでの切断によりpBSHIV3BEI I (実 施例2で定義)から誘導し、HIV−1(IIIB) env遺伝子の5′部分 に連結したH6プロモーターの2番目のコピーを遊離せしめた。次いで5.4k bのKpnlを再連結し、pBsHIV3BEI Iを形成した。
pBSHIV3BEECMのHindl I I/XbaI切断により誘導した 2、1kbおよび2.9kbの断片をpBSHIV3BT1からの105bpの HindlII/Xbal断片に連結し、pBsHIV3BTを産生じた。
このプラスミドをNru IとXbalで切断し、2.1kbの断片を切除した 。この断片をプラントエンドし、NrulとSmalで切断したpsPHAH6 に挿入し、pHAHIV3BTを産生じた。
プラスミドpHAHIV3BTを、治療ウィルスとしてのNYVAC(vP86 6)により上述したような組換え実験に用いた。組換えウィルスを上述したよう に同定し精製し、産生じたプラスミドをvP1036と称した。この組換え体は 、vcP120およびvP994について上述した発現特徴の全てを有した。
列により固定されたHIV−1(MN) gp120の発現 gp120をコードするenv領域を親水性膜内外配列をコードする領域に融合 するために、以下の操作を行なった。gp120暗号配列の3′側領域に対応す る200bpの断片を、オリゴヌクレオチドHIV3B1 (配列認識番号32 )およびHIVMN18(配列認識番号l 06)(5’−GCCTCCTAC TATCATTATGAATAATCTTTTTCTCTCTG−3′)を用い たPCRによりpH6HMNE (実施例1oで定義)から誘導した。オリゴヌ クレオチドHIV3B1 (配列認識番号32)およびHIVTM3(配列認識 番号1o9)(5’ −ATCATCTCTAGAATAAAAAT’rATC CCTGCCTAACTCTATTCAC−3’ )を用いたPCRにより、ア ニールしたオリゴヌクレオチドHIVTMI(配列認識番号107) (5′− TTATTCATAATGATAGTAGGAGGCTTGGTAGGTTTM GMTAGTTrTTGCTGTACTCTCTにTAGTGMTAGAGTT AGGCAGGGATAA−3’ )およびHIVTM2(配列認識番号108 )(5’−TTATCCCTGCCTAACTCTATTCACTACAGAG AGTACAGCλAAAACTATTCTTAAACCTACCAAGCCT CCTACTATCATTATGMTM−3’)にこの断片を融合せしめた。オ リゴヌクレオチドHIVTM1.(配列認識番号107)およびHIVTM2  (配列認識番号108)はヌクレオチド7850から7934に対応しくラトナ ー等、1985) 、HIV env親水性アンカー配列をコードする領域を示 す。HIVTM3 (配列認識番号109)による融合により、終止コドンと3 ’Xba1部位を有する、結果として生じたカセットの3′末端を操作する。誘 導断片をEcoRI/XbaIで切断し、EcoRIとXbalで切断したp  H6HMN Eに連結し、pBsHIVMN120Tを産生した。
H6プロモーターの3′側26bpおよび全HIV−1カセットを含有する、p BsHIVMN120Tからの1゜7kbのNrul/XbaI断片を単離し、 pVQH6C5LSP6からの5.lkbのNruI/Xbal断片に挿入し、 pc5HIVMN120Tを誘導した。プラスミドpVQH6C5LSP6を以 下のように誘導した。
pC5L (実施例10で定義)をポリリンカー内のAsp718とNotlで 切断し、アルカリ性ホスファターゼで処理し、キナーゼしてアニールしたオリゴ ヌクレオチドCP26 (配列認識番号110) (5’−GTACGTGACTAATTAGCTATAJlIAMGGATCC GGTACCαCGAGTCTAGAATCGATCCCにGGTrTTTAT GACTAGTTAATCAC−3’ )およびCP27 (配列認識番号11 1)(5I− GGCCGTGATTAACTAGTCATAAAAACCCGGGATCGA TTCTAGACTCGAGGGTACCGGATCCTrTrTATAGCT AATTAGTCAC−3’ )(不能Asp718部位、6つの読取り枠中の 翻訳停止コドン、ワクシニア初期転写終止信号(ユエンおよびモス、1987)  、BamHISKpnl、XhoI、XbalSClaI、およびSma I 制限部位、ワクシニア初期転写終止信号、6つの読取りワクシニア中の翻訳停止 コドン、および不能Not1部位を含有する)に連結し、プラスミドpC5LS Pを産生じた。
pC5LSPをBamHIで切断し、アニールしたオリゴヌクレオチドCP32  (配列認識番号112)(5r− GATCTTAJkTrAATTAGTCATCAGGCAGGGCGAGAA CGAGACTATCTGCTCGTrAATTMTTAGGTCGACG−3 ’ ) およびCP33 (配列認識番号113)(5′− GATCCGTCGACCTAATTAATTAACにAGCACATAGTC TCGTTCTCGCCCTGCCTGATGACTAATTMTTM−:l  I )に連結し、pVQc5LsP6を産生した。
pBsHIVMN120Tからの1.7kbのNrul/Xbal断片もまたプ ラントエンドし、Nru IとSmalで切断したpsPHAH6に挿入した。
産生じたプラスミドをpHAHIVMN120Tと称した。
挿入プラスミド、pc5HIVMN120TおよびpHAHIVMN120Tを 、治療ウィルスとしての、それぞれALVACおよびNYVACによる標準組換 え実験(ピッチ一二等、1987)に用いた。放射線標識したHIV−1gp1 20特異的DNAプローブを用いた標準プラークハイブリダイゼーション(ピッ チ一二等、1987)により組換えウィルスを同定し、精製した。純粋個体群を 増幅し、ALvACベースの固定HIV−1(MN) gp120組換え体をv cP138と称した。NYVACベースのものをvP1035と称した。
標準方法(上記)により蛍光抗体法およびイムノプレシピテーション分析を行な って、vP138およびvP1035感染細胞中のHIV−1(MN)個体gp 120の発現を評価した。このアッセイは、HIV血清陽性個体からのプールし たヒト血清(CA、エメリービル、チロン社、Dr、に、 ステイマーから得た )を用いて行なった。表面蛍光抗体の調査により、vcP138およびVP10 35感染細胞は、形質膜中にHIV−1(MN) gp120を含有することが 示された。特に、vcP138およびVP1035感染細胞の表面染色は、gp 160または非固定gp120を発現する組換えウィルス(すなわち、vCP1 25、vcP124、vP1004、およびvP1008)に感染した細胞と比 較して増大した。イムノプレシピテーション分析の結果により、vcP138お よびvP1035感染細胞中のgp120の発現を確認し、発現された産生物は 予期した分子量であった。
実施例7に記載したように、ベクタープラスミドpSD513を形成することに より、プラスミドpSD542(NYVACTK座供与体プラスミド;実施例5 参照)をプラスミドpsD460から誘導した。psD513中のポリリンカー 領域を、PstI/BamHIで切断し、アニールしたオリゴヌクレオチドMP SYN288 (配列認識番号114) (5’GGTCGACGGATCCT :l’)およびMPSYN289 (配 列認識番号115)(5’ GATCAGGATCCGTCGACCTGCA  3’)と連結して修飾し、プラスミドpSD542を産生じた。
1型ヒト免疫不全ウイルス(HIV−1)cDNA配列を含有する、プラスミド 、pHXB2Dを、Dr、 R,C。
ガロ(NCI−NIH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコードする配列を ワタシニアウイルスtk側原アームの間にクローニングした。これは、gag遺 伝子の5′末端ヲ含有スル、pHXB2Dの1,625bp(7)BglII断 片を、pSD542の4.075bpのBglll断片にクローニングすること により行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG2と称する。
gag遺伝子の3′末端をgag遺伝子の残りからの下流にクローニングした。
これは、gag遺伝子の3′末端を含有する、280bpのApal−BamH I PCR断片を、pHIVG2の5,620bpのApaI−BamHI断片 にクローニングすることにより行なった。このPCR断片を、プラスミド、pH XB2Dから、オリゴヌクレオチドHIVP5 (配列認識番号116)(5’  −TGTGGCAAAGAAGGGC−3’ )およびHIVP6 (配列認 識番号117)(5’ −TTGGATCcTTATrGTGACGAGGGG TC−3t )により産生じた。この操作により産生じたプラスミドをpHIV G3と称する。
13Lプロモーターをgag遺伝子の上流にクローニングした。これは、ワクシ ニアウィルス13Lプロモーターおよびgag遺伝子の5′末端をコードするオ リゴヌクレオチドHIVL17 (配列認識番号118)GATCTTGAGA TAAAGTGAAAATATATATCATTATATTACAAAGTAC AATTATTTAGGTrTAATCATGGGTGCGAGAGCGTCA GTATTAAGCGGGGGAGAATTAGAT−3”1およびHIVL1 8 (配列認識番号119)(5I− CGATCTAATTCTCCCCCGCTTAATACTGACGCTCTC GCACCCATGATTAAACCTAAATAATTGTACTTTGTA ATATAATGATATATAlrTTTcAC11′rTATσC晶−3′ )を、pHIVG3の5,540bpの部分的Bglll−C1aI断片に挿入 することにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG4と 称する。
pHIVG4を、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)による組換え 実験に用いてvP969を産生じた。
イムノプレシピテーション分析を行なって、vP969が真正HIV−1gag 前駆体タンパク質を発現するか否かを決定した。
HIV−1血清陽性個体からのプールした血清(CA。
エメリービル、チロンから得た)を用いて、感染細胞からの溶解産物をHIV− 1gag前駆体発現に関して行なった。血清をvP866感染Vero細胞によ り予備吸着せしめた。予備吸着した血清を4℃で一晩培養せしめてタンパク質A セファロースに連結せしめた。この培養期間後、材料をI×の緩衝液Aで洗浄し た。通常ヒト血清およびタンパク質Aセファロースにより予備浄化した溶解産物 を、タンパク質Aセファロースに結合したHIV−1血清陽性ヒト血清により4 ℃で一晩培養した。−晩の培養期間後、試料を1×緩衝液Aで4回、LiC1, /尿素緩衝液により2×洗浄した。沈殿したタンパク質を、2Xのラエムリ緩衝 液(125mMのトリス(pH6,8) 、4%のSDS。
20%のグリセロール、10%の2−メルカプトエタノール)を添加し、5分間 の沸騰により免疫複合体から分離した。
タンパク質を10%のドリファスゲルシステム(ドリファス等1984)上に分 画し、固定し、フルオログラフィーのためにIMのNaサリチル酸塩で処理した 。
HIV−1血清陽性個体からのヒト血清は、vP969感染細胞からのHIV− 1gag前駆体タンパク質を特異的に沈殿せしめたが、疑似感染またはNYVA C感染細胞からのHIV−1特異的タンパク質を沈殿せしめなかった。
gag遺伝子の5′末端をコードする配列をワクシニアウィルスtk側腹アーム の間にクローニングした。これは、gag遺伝子の5′末端を含有する、pHX B2Dの1゜625bpのBglII断片を、pSD542 (、実施例15で 定義)の4.075bpのBglII断片に挿入することにより行なった。この 操作により産生じたプラスミドをpHIVG2と称する。
次いでgag遺伝子の3′末端をpHIVG2にクローニングした。これは、g ag遺伝子の3′末端を含有する、280bpのApal−BamHI PCR 断片をpHIVG2の5.620bpのApal−BamHI断片にクローニン グすることにより行なった。このPCR断片を、オリゴヌクレオチドHIVP5  (配列認識番号116)およびHIVP6 (配列認識番号117)により、 プラスミドpHXB2Dから産生じた。この操作により産生じたプラスミドをp HIVG3と称する。
I3Lプロモーターをgag遺伝子の上流にクローニングした。これは、ワクシ ニアウィルス13Lプロモーターおよびgag遺伝子の5′末端をコードする、 オリゴヌクレオチド、HIVL17 (配列認識番号118)およびHIVL1 8(配列認識番号119)を、pHIVG3の5゜540bpの部分的Bgll I−C1al断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生 じたプラスミドをpHIVG4と称する。
次いでp24、p2、p7およびp6をコードするgag遺伝子の部分を除去し た。これは、オリゴヌクレオチド、HIVL19 (配列認識番号120)(5 ′− CTGACACAGGACACAGCAATCAGGTCAGCCAAAATT ACTAATTTTrATCTCGAGGTCGACAGGACCCG−コr) およびHIVL20 (配列認識番号121)(5′− GATCCGGGTCCTGTCGACCTCGAGATAAAAATTAGT AAT”ITrGGCTGACCTGATrGCTGTGTCCTGTGTCA G−3’)を、pHIVG4の4,450bp部分的PvulI−BamHI断 片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミド をpHIVG5と称する。
次いで、gag遺伝子の残り、並びにpot遺伝子をp17「遺伝子」の下流に クローニングした。これ番よ、大分のgag遺伝子および全てのpol遺伝子を 含有する、pHXB2Dの4.955bpのC1al−8ail断片を、pHI VG5の4.150bpのC1al−3all断片にクローニングすることによ り行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG6と称する。
次いで外来性3′非暗号配列を除去した。これGi、pO1遺伝子の3′末端を 含有する、360bpのAflll−BamHI PCR断片を、pHIVG6 の8.030bpのAf l I I−BamHI断片に断片−ニングすること により行なった。このPCR断片は、第1ノゴヌクレオチド、HIVP7 (配 列認識番号122)(5’ −AAGMAATTATAGGAC−3’ )およ びHIVP8 (配列認識番号123)(5’ −TTGGATCCCTMTC CTCATCCTGT−31)により、プラスミド、pHXB2Dから産生じた 。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG7と称する。
pHIVG7は、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)による組換え 実験に用いて、vP989を産生じた。
vP989感染細胞によるイムノプレシピテーション実験を、HIV−1gag 前駆体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。HIV−1特異的 種は、疑似感染またはNYVAC感染Vero細胞からは全く沈殿しなかった。
しかしながら、gag前駆体タンパク質に対応するタンパク質種、並びに様々な 中間体および成熟gag開裂産生物は、vP989感染細胞の溶解産物から沈殿 した。
gag遺伝子の5′末端をコードする配列をワクシニアウィルスtk側腹アーム の間にクローニングした。これは、前述したように(実施例16参照)、最初に プラスミドpHIVG7を産生することにより行なった。
pHIVG7を、治療ウィルスとしてのvP921による組換え実験に用いてv P991を産生じた。
vP991感染細胞のイムノプレシピテーション分析を、HIV gag前駆体 タンパク質の発現に関して、前述したように行なった。HIV特異的種は、疑似 感染Ver。
細胞からは全く沈殿しなかった。しかしながら、enVおよびgag前駆体タン パク質に対応するタンパク質種、並びに様々な中間体および成熟gag開裂産生 物は、vP991感染細胞の溶解産物から沈殿した。
実施例18−NYVAC/HIV−1ga /polおよびenv (gp16 0)組換え体の産生gag遺伝子の5′末端をコードする配列を、ワクシニアウ ィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、前述したように(実施 例16参照)最初にプラスミドpHIVG7を産生ずることにより行なった。
pHI VG7を、治療ウィルスとしてのvP911 (上記)による組換え実 験に用いてvP990を産生じた。
vP990感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。HIV−1特異的種は 、疑似感染Vero細胞からは全く沈殿しなかった。しかしながら、envおよ びgag前駆体タンパク質に対応するタンパク質種、並びに様々な中間体および 成熟gag開裂産生物は、vP990感染細胞の溶解産物から沈殿した。
HIV−1cDNA配列を含有する、プラスミドpHXB2Dは、Dr、R,C ,ガ0(NCI−NIH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコードする配列 を、ワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。
これは、前述したように(実施例16参照)、最初にpHIVG5を産生するこ とにより行なった。
次いでp24「遺伝子」の3′末端をpHIVG5i、’70−二レグした。こ れは、p24「遺伝子」の3′末端を含有する、660bpのSail−Bam HI PCR断片をpHIVG5の4,450bpのSalI−BamH■断片 にクローニングすることにより行なった。このPCR断片は、オリゴヌクレオチ ド、HIVP25 (配列認識番号124) (51−AAAGTCGACCCATATCAαゴAGAAC−3’ )および HIVP26 (配列認識番号125)(5’ −TTTGGATCCTTAC AAAACTCTTGCCTTAT−3’ )によりプラスミドpHXB2Dか ら産生じた。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG8と称する。
次いで昆虫ボックス42kdプロモーターをp24「遺伝子」の上流にクローニ ングした。これは、昆虫42kdプロモーターおよびp24「遺伝子」の5′末 端をコードする、オリゴヌクレオチド、HIVL21 (配列認識番号(5t− 丁CGAGCAAAATTGAAAATATATAATTACAATATAAA ATGCCTATAGTGCAGAACATCCAGGGGCAAATGGTA CATCAGGCCATATCACCTAGAACTTTAAATGCA−3’ )およびHIVL22 (配列認識番号127)〔5′− TTTAAAGTTCTAGGTGATATGGCCTGATGTACCATT TGCCCCTGGATGTTCTGCACTATAGGCATTTTATAT TGTAATTATATATT’rTCAATrTTGC−3I )を、pHI VG8の5.070bp(7)Xhol−NsiI断片にクローニングすること により行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG9と称する。
pHIVG9を、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)にによる組換 え実験に用いてvP970を産生じた。
vP970感染細胞のイムノプレシピテーション分析を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。HIV−1特異的種は 、疑似感染またはNYVAC感染Vero細胞からは全く沈殿しなかった。しか しながら、I)24に対応するタンパク質種は、vP970感染細胞の溶解産物 からは沈殿した。
実施例2O−NYVAC/HIV−1,p178、p24およびenv (gp 120)組換え体の産生HIV−1cDNA配列を含有する、プラスミドpHX B2Dは、Dr、R,C,ガロ(NCI−NIH)から得た。gag遺伝子の5 ′末端をコードする配列を、ワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニ ングした。
これは、前述したように(実施例19参照)最初にpHIVG9を産生ずること により行なった。
pHIVG9は、治療ウィルスとしてのVP921による組換え実験に用いてv P973を産生じた。
vP973感染細胞のイムノブレシピテーション実験を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して、前述したように行なった。疑似感染Vero細胞 からはHIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。しかしながら、envおよび p24に対応するタンパク質種は、vP973感染細胞の溶解産物から沈殿した 。
実施例2l−NYVAC/HIV−1p17、p24およびenv (gp16 0)組換え体の産生HIV−1cDNA配列を含有する、プラスミドpHXB2 Dを、Dr、 RlC,ガo(NCI−NIH)から得た。gag遺伝子の5′ 末端をコードする配列を、ワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニン グした。
これは、前述したように(実施例19参照)、最初にプラスミドpHIVG19 を産生することにより行なった。
pH’IVG9を、治療ウィルスとしてのvP911による組換え実験に用いて vP971を産生じた。
vP971感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して、前述したように行なった。疑似感染Vero細胞 からHIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。しかしながら、enVおよびp 24に対応するタンパク貫挿は、vP971感染細胞の溶解産物からは沈殿した 。
HI V’ −1c D N A配列を含有する、プラスミドpHXB2Dは、 Dr、R,C,ガロ(NCI −N IH)から得た。gag遺伝子の5′末端 をコードする配列を、ワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングし た。
これは、前述したように(実施例19参照)、最初にプラスミドpHIVG9を 産生することにより行なった。
次いでH6プロモートしたトランケートHIV−1エンベロープ遺伝子をp H I V G 4に挿入した。これは、H6プロモートしたトランケートHIV− 1エンベロープ遺伝子を含有する、pHIVEloのE、coli DNAポリ メラーゼ■ (フレノウ断片)充填1,600bp Xho l−No t I 断片を、pHIVG4の充填BamH1部位に挿入した。この操作により産生じ たプラスミドは、pHIVGEIIと称する。
pBsHIV3BcDT1からの5acl/部分的Kpnl断片をpIBI24 (CT1ニューハブン、IBI)の多重クローニング領域に挿入することにより プラスミドpHIVELOを誘導した。プラスミドpBsHIV3BCDTIは 、HIV−1(I I IB)エンベロープの顕著なトランスケート形状を発現 するH6プロモートしたカセットを含有している(アミノ酸1から447;ラト ナー等、1985)。このカセットの発現を評価して、V3ループ領域およびT Iエピトープを保持しつつCD4結合を除去した。
pBsHIV3BcDT1を構成するために、以下の操作を行なった。オリゴヌ クレオチドHIV3B2A (配列認識番号96)およびHIVCD4A (配 列認識番号12(5’ −GCCTCCTACTATCATTATGMTAAA CTGATGGGAGGGGCATAC−:l ’ )を用いて、pBsH6H IV3B5P (実施例2に定義)から200bpのPCR誘導断片を増幅せし めた。オリゴヌクレオチドHIV3B2A (配列認識番号96)およびHI  VTM3 (配列認識番号109)を用いたPCRにより、この断片を、アニー ルしたオリゴヌクレオチドHIVTMI (配列認識番号107)およびHIV TM2(配列認識番号108)に融合せしめた。HIV−1env膜内膜内シア ンカーミノ酸691から718;ラトナー等、1985) 、翻訳終止コドン( TAA) 、および3’Xba1部位をコードする配列を配することにより、こ の操作でトランスケートenvカセットの3′末端を産生ずる。このPCR融合 産生物をEcoRIとXbalで切断し、243bpの断片を産生じた。この断 片をpH6HI I IBEの4.5kbのE c oRI/Xb a 1.断 片に連結し、pBSHIV3BCDT1を産生した。
pHIVGEllを、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)による組 換え実験に用いて、vP979を産生じた。
vP979感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。疑似感染またはNYV AC感染Vero細胞からは、HIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。しか しながら、envおよびgag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿は、v P979感染細胞の溶解産物から沈殿した。
gag遺伝子の5′末端をコードする配列を、ワタシニアウイルスtk側腹アー ムの間にクローニングした。これは前述したように(実施例16参照)最初にプ ラスミドpHIVG7を調製することにより行なった。
次いでH6プロモートしたトランケートHIV−1エンベロープ遺伝子をpHI VG7に挿入した。これは、H6プロモートしたトランケートHIV−1エンベ ロープ遺伝子を含有する、pHIVEloのE、coli DNAポリメラーゼ I (フレノウ断片)充填1,600bp Xho l−No t I断片を、 pHIVG7の充填BamH1部位に挿入した。この操作により産生じたプラス ミドをp、HIVGE12と称する。
pHIVGE12を、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)による組 換え実験に用いてvP978を産生じた。
vP978感染細胞のイムノプレシビテーション実験を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して前述したように行なった。疑似感染またはNYVA C感染Vero細胞からはHIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。
しかしながら、envおよびgag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、 並びに様々な中間体および成熟gag開裂産生物は、vP978感染細胞の溶解 産物から沈殿した。
gag遺伝子をコードする配列をワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクロ ーニングした。これは、前述したように(実施例16参照)、最初にプラスミド pHIVG7を産生することにより行なった。
次いで13Lプロモートしたgagおよびpol遺伝子をカナリアボックス挿入 ベクター中に挿入した。これは、13Lプロモートしたgagおよびpo!遺伝 子を含有する、pHIVG7の4,360bpの部分的Bglll−BamHI 断片をpVQH6CP3L、のBamHI部位にクローニングすることにより行 なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVGE14と称する。
次いでH6プロモートしたHIV−1(MN)エンベロープ(gp120)遺伝 子をpHIVGE141J!i入した。
これは、オリゴヌクレオチド、HIVL29 (配列認識番とHIVL30 ( 配列認識番号130)(5’ −TCGAGTTGC−3’ )並びにH6プロ モートしたgp120遺伝子を含有する、pBsHIVMN120の1,600 bpのNrul−Notl断片を、pHIVGE14の11.500bpのNr u I−Xho I断片に挿入することにより行なった。この操作により産生じ たプラスミドをpHIVGE15と称する。
次いでH6プロモートしたエンベロープ(g p 120)遺伝子およびI3L プロモートしたgagとpol遺伝子をワクシニアウィルス挿入ベクター中に挿 入した。これは、H6プロモートしたgp120遺伝子およびI3Lプロモート したgagとpol遺伝子を含有する、pHIVGT15の6.400bpのN o t l−BamHI断片をpSD542VCVQの4,000bpのNot l−Bgll■断片に挿入することにより行なった。この操作により産生じたプ ラスミドをpHIVGE16と称する。
pHIVGE16を、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)による組 換え実験に用いて、vP988を産生じた。
vP988感染細胞野イムノプレシビテーション実験を、HIV−1gag前駆 体タンパク質の発現に関して、前述したように行なった。疑似感染またはNYV AC感染■ero細胞からはHIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。しかし ながら、envおよびgag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに 様々な中間体および成熟gag開裂タンパク質は、vP988感染細胞の溶解産 物から沈殿した。
gag遺伝子の5′末端をコードする配列をワクシニアウィルスtk側腹アーム の間にクローニングした。これは、前述したように(実施例24参照)最初にプ ラスミドpHIVGE16を産生することにより行なった。
次いでgp120遺伝子をgp160遺伝子により置換した。これは、全HI  V−1(MN)エンベロープ(gp160)遺伝子を含有する、p H68MN  Eの2.600bpのNrul−Notl断片を、pHIVGE16の8゜o oobpの部分的Nrul−Notl断片にクローニングすることにより行なっ た。この操作により産生されたプラスミドをpHIVGR19と称する。
pHIVGE19を、治療ウィルスとしてのvP866(NYVAC)による組 換え実験に用いて、vP1009を産生した。
vP1009感染細胞のイムノプレシピテーション実験は、HIV−1gag前 駆体タンパク質の発現に関して前述したように行なった。疑似感染またはNYV AC感染Vero細胞からはHIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。しかし ながら、envおよびgag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに 様々な中間体と成熟gag開裂産生物は、vP1009感染細胞の溶解産物から 沈殿した。
実施例26−ALVAC/HIV−1gag/po lおよびenv (gp1 20)組換え体の産生gag遺伝子の5′末端をコードする配列をワクシニアウ ィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、前述したように(実施 例24参照)最初にプラスミドpHIVGE15を産生することにより行なった 。
pHIVGE15を、治療ウィルスとしてのALvAC(CP p p)による 組換え実験に用いて、vcP117を産生した。
CEF細胞単層についてイムノプレシピテーション分析を行なって、vcP11 7が真正HIV−1gagおよびenv遺伝子産生物を発現するか否かを決定し た。
HIV−1血清陽性個体にューヨーク州、保健省から得た)を用いて、HIV  gagおよびenv遺伝子発現に関して感染細胞からの溶解産物を分析した。血 清をALVAC感染CEF細胞に予備吸着せしめた。予備吸着せしめた血清を、 4℃での一晩の培養によりタンパク質Aセファロースに結合せしめた。この培養 期間後、物質を1×緩衝液Aで4回洗浄した。正常ヒト血清とタンパク質Aセフ ァロースで予備浄化した溶解産物を、タンパク質Aセファロースに結合したHI M−1血清陽性ヒト血清により4℃で一晩培養した。−晩の培養期間後、試料を 、1×緩衝液Aで4回、LiCl□/尿素緩衝液で2回洗浄した。2×のラエム リ緩衝液(125mMのトリス(pH6,8) 、4%のSDS、20%のグリ セロール、10%の2−メルカプトエタノール)を添加し、5分間に亘り沸騰せ しめることにより、沈殿したタンパク質を免疫複合体から分離した。タンパク質 を10%のドリファスゲルシステム(ドリファス等、1984)上で分画し、固 定し、フルオログラフィーのためにIMのNaサリチル酸塩で処理した。
HIV−1血清陽性個体からのヒト血清は、vcP117感染細胞からHIV− 1gagおよびenvタンパク質を特異的に沈殿せしめたが、疑似感染またはA LVAC感染細胞からはHIV−1特異的タンパク質を沈殿せしめなかった。
gag遺伝子の5′末端をコードする配列をワクシニアウィルスtk側腹アーム の間にクローニングした。これは、前述したように(実施例24参照)最初にプ ラスミドpHIVGE15を産生することにより行なった。
次いでgp120遺伝子をgp160遺伝子と置換した。
これは、全HIV−1(MN)エンベロープ(gp160)遺伝子を含有する、 p H6HMN Eの2,600bpのNrul−Notl断片を、pHIVG E15の9.800bpのNruI−Notl断片にクローニングすることによ り行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVGE18と称する。
前の段階において欠失したカナリアボックス側腹アームをpHIVGE18にク ローニングした。これは、C3側腹アームヲ含有スル、pHIVGE15の1. 500bpのNotI断片を、pHIVGE18の12.400bpのNotI 断片にクローニングすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpHIVGE20と称する。
pHIVGE20を、治療ウィルスとしてのALvAC(CP p p)による 組換え実験に用いて、vcP130を産生した。
CEF細胞単層に関してイムノプレシピテーション分析を前述したように行なっ て、v CP 1.30が真正HIV−1gagおよびenv遺伝子産生物を発 現するか否かを決定した。
HIV−1血清陽性個体からのプールした血清(CA。
エメリービル、チロンから得た)を用いて、感染細胞からの溶解産物を、HIV −1gagおよびenv遺伝子発現について分析した。血清をALVAC感染C EF細胞で予備吸着した。予備吸着した血清を、4℃の一晩の培養により、タン パク質Aセファロースに結合せしめた。この培養期間後、物質を1×緩衝液Aで 4回洗浄した。次いで正常ヒト血清とタンパク質Aセファロースで予備浄化した 溶解産物を、タンパク質Aセファロースに結合したHIV−1血清陽性ヒト血清 により4℃で一晩培養せしめた。−晩の培養後、試料を、I×の緩衝液Aで4回 、LiCl2/尿素緩衝液で2回洗浄した。2×のラエムリ緩衝液(125mM のトリス(pH6,8)、4%のS D S、 20%+7)グIJ −+?ク ロール10%の2−メルカプトエタノール)を添加し、5分間に亘り沸騰せしめ ることにより、沈殿したタンパク質を免疫複合体から分離した。タンパク質を1 0%のドリファスゲルシステム(ドリファス等、1984)上で分画し、固定し 、フルオログラフィーのためにIMのNaサリチル酸塩で処理した。HIV−1 血清陽性個体からのヒト血清は、vcP130感染細胞からHIV−1gagお よびen■タンパク質を特異的に沈殿せしめたが、疑似感染またはALVAC感 染細胞からはHIV−1特異的タンパク質を沈殿せしめなかった。
HIV−1cDNA配列を含有する、プラスミドpHXB2DをDr、 R,C ,ガo (NCI −N IH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコードす る配列をワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、 前述したように(実施例16参照)最初にプラスミドpHIVG7を産生するこ とにより行なった。
次いでgagおよびpal遺伝子をカナリアボックス側腹アームの間にクローニ ングした。これは、I3Lプロモートしたgagおよびpol遺伝子を含有する 、pHIVG7の4.400bpのSma I −No t I断片、およびオ リゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)(5’−GGCCA AAC−:]’) およびHIV2L7 (配列認識番号132)(5’ −TCGAGTTT−3 ’ )を、pSPCP3LのSma I−Xho I部位にクローニングするこ とにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG24と称す る。
pHIVG24を、治療ウィルスとして(7)ALVAC(CP p p)によ る組換え実験に用いて、VCP152を産生した。
vcP152感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV−1envお よびgagタンパク質の発現に関して上述したように行なった。疑似感染または ALVAC感染細胞からは、HIV=1特異的種は全く沈殿しなかった。しかし ながら、gag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様々な中間体 と成熟gag開裂産生物は、vcP152感染細胞の溶解産物から沈殿した。
HIV−1cDNA配列を含有する、プラスミドpHXB2Dを、Dr、 R, C,ガロ(NCI−NIH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコードする配 列をワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、前述 したように(実施例28参照)最初にプラスミドpHIVG24を産生ずること により行なった。
pHIVG24を、治療ウィルスとしてのvcP120による組換え実験に用い て、vcP155を産生した。
vcP155感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV−1envお よびgagタンパク質の発現に関して上述したように行なった。疑似感染細胞か らは、HtV−を特異的種は全く沈殿しなかった。しかしながら、envおよび gag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様々な中間体と成熟g ag開裂産生物は、VCP155感染細胞の溶解産物から沈殿した。
実施例3O−ALVAC/HIV−1ag/polおよびenv(膜内外アンカ ーを有するgp120)組換え体の産生 HIV−1cDNA配列を含有する、プラスミドpHXB2Dを、Dr、 R, C,ガロ(NCI −N IH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコードす る配列をワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、 前述したように(実施例28参照)最初にプラスミドpHIVG24を産生ずる ことにより行なった。
pHIVG24を、治療ウィルスとしてのvcP138による組換え実験に用い て、vcP156を産生した。
vcP156感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV−1envお よびgagタンパク質(CEF細胞単層)の発現に関して上述したように行なっ た。疑似感染細胞からは、HIV−1特異的種は全く沈殿しなかった。しかしな がら、envおよびgag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様 々な中間体と成熟開裂産生物は、vcP156感染細胞の溶解産物から沈殿した 。
ワクシニアウィルスによるenvとの組合せまたは単体のいずれかのHIV−1 gag特異的遺伝子産生物の発現は、非感染ウィルス状粒子の産生となることが 示された(ハフナー等、1990 、ツー等、1990)。この背景に関して、 HIV−1gag−polおよびenv遺伝子を発現するALVACベースの組 換え体に感染した細胞もそのような粒子を産生ずるか否かを調査した。さらに、 これらのALVACベースの組換え体が非アビアン細胞(すなわち、Vero、 MRC−5、等)を感染せしめるのに用いられた場合、HIV−1ウィルス状粒 子がいかなるポックスウィルス粒子不純物なく精製された。
vcP156に感染したVero細胞を用いて粒子形成を評価するために、以下 の実験を行なった。約5pfu/細胞のm、o、i、でVero細胞を感染せし めた。感染期間から24時間後、上澄み液を収穫し、2000rpmで10分間 の遠心分離により浄化した。次いで上澄み液を30.000 kDaの分子量カ ットオフを有するフィルター(PA、ワリントン、ポリサイエンス社、セントリ セル60)を通じて遠心回転せしめた。それゆえ、小さな分子はこれらのフィル ターを通過する。HIV血清陽性個体からのプールしたヒト血清にューヨーク州 、保健省、Dr、J、 コンロイから得た)を用いた標準ウェスタンプロット分 析(マニアチス等、1990)により、フィルターで保持した物質を分析した。
ウェスタンプロット分析からの結果により、フィルターで保持された物質中の、 主要コアタンパク質p24およびHIV−1(MN)固定gp120の存在が示 された。
上述したサイズ除去に関して、p24は、高い構造配置(すなわち、ウィルス状 粒子)にあるのでなければ、フィルターを通過する。それゆえ、これらの結果は 、gp120エンベロープ成分を含有するHIV−1ウィルス状粒子はvcP1 56感染細胞中で産生されることを強く示唆する。
実施例3l−ALVACおよびNYVAC中のHIV−1env遺伝子のT1、 T2、およびTH4゜1エピトープの発現 個々のペプチドとしてのHIV−1envのT1、T2、およびTH4,1エピ トープを発現する組換えポックスウィルスvP1062およびvcP146を産 生した(ホスマリン等、1991)。
プラスミドp731T1の構成 プラスミドpMP I 3Hは、pUC8バックグラウンド中にワクシニアI3 L早期/中間プロモーター要素(シュミットおよびスタネンベルグ、1988  ;ホスおよびスタネンベルグ、1988)を含有している。テンプレートとして の、ワクシニアHindllI Iのサブクローン、pMPVClおよびプライ マーとしての、合成オリゴヌクレオチドMPSYN283 (配列認識番号13 3)(5’−CCCCCCMGCTTACATCATGCAGTGGTTAAA C−3’)およびMPSYN287 (配列認識番号134)(5’ −GAT TAAACCTAAATAAT’rGT −3’ )を用いたポリメラーゼ連鎖 反応(PCR)によりプロモーター要素を合成した。この反応からのDNAをH indlIIとRsaIで切断し、プロモーター要素を過含有する0、1kbの 断片を精製した。補体合成オリゴヌクレオチドMPSYN398 (配列認識番 号135)(5’ −ACAATTATTTAGGTTAACTGCA −3’  )およびMPSYN399 (配列認識番号136)(5’ −GTTAAC CTAAATAATTGT −3’ )をアニールすることによりリンカ−領域 を組み立てた。PCR誘導プロモーター要素およびポリリンカー領域を、Hin dlIIとPstlで切断したベクタープラスミドpUC8と連結せしめた。産 生じたプラスミドpMP I 3Hは、Hpa I、Ps t IS Sa l  I、BamHI、SmaIおよびEcoR1部位を含有するポリリンカー領域 の後に、開始コドンに対して位置−100から−6の13Lプロモーター領域を 含有している。HpaIによる開裂により、プロモーター中の位置−6で線状化 した、プラントエシトしたDNAを産生じた。
相補オリゴヌクレオチドTic (配列認識番号137)(5’ −TAATC ATGAAACAAATrATTAATATGTGGCAAGAAGAGGAA AAGCTATGTACGCTTGACTAGTI’AATCACTCGAG  −3’ )およびTIN (配列認識番号138)(5’−GATCCTCGA GTGATTAACTAGTCMGCGTACATAGCTrTTCCTACT TCTTGCCACATATTMTAATrTGTITCATGATTA −3 71を、HpaIとBamHIで切断したプラスミドpMP I3Hに連結し、 ワクシニア13Lプロモーターにより誘導したT1ペプチドを含有するカセット を産生じた。この連結により、プロモーターの最後の5塩基対を再構成し、T1 ペプチドの完全な暗号配列を提供し、停止コドンとBamH1部位の間にXho 1部位を産生じた。これがプラスミドp731T1である。断片の配列を、ヌク レオチド配列分析により確認した。
プラスミドpH6T2の構成 ワクシニアH6プロモーターにより誘導されたT2ペプチドを含有するカセット を2段階で産生じた:PCRとプライマーH6PCR1(配列認識番号157) およびH6PCR2(配列認識番号205) (5f −TTAACGGATATCGCGATAATG−3’ 1を用いて、 5’HindllI部位を産生ずることにより、合成H6プロモーターを含有す るプラスミド(パーカス等、1989)から、EcoRV部位に通じるH6プロ モーターを誘導した。この122bpのPCR誘導断片’f−HindI2とE coRVで切断し、続いて同様に切断したpBS−8K+ (CA、ラジョラ、 ストラタジエネ)に連結し、プラスミドpBSH5を産生じた。EcoRV部位 がらH6プロモーターの3′末端を完成し、T2ペプチドをコードし、遺伝子の 3′末端にBamHI部位を産生ずる相補オリゴヌクレオチド72C(配列認識 番号139)(5’ −ATCCGTTAAG?fTGTATCGTAATGC ACGAAGATATTAT’rTCTTI’GTGGGATCAjdCTTT AAAATGACTAG−CAG −3’ )およびT2N (配列認識番号1 4o)をアニールし、次いでEcoRVとBamHIで切断したpBSH6と連 結した。このプラスミドをpH6T2と称し、ヌクレオチド配列分析により断片 を確認した。
プラスミドpVQ42KTH4,1の構成AmEPV 42にプロモーターによ り誘導されたTH4,1ペプチドを含有するカセットを、連続したPCR反応に より産生じたニプライマー42KVQ1 (配列認識番号141) および42KVQ2 (配列認識番号142)を用いたPCRにより、42にプ ロモーターの制御下で狂犬病糖タンパク質の遺伝子を含有するプラスミドである 、プラスミドp42KRAB Iがら、5’ P s t I オ、J:ヒsm a1部位を有する107bpの42にプロモーターを誘導した。このPCR誘導 断片の107bpのプロモーター領域の配列は(配列認識番号143) である。この断片と、テンプレートとしてのTH4,lペプチドTH41C(配 列認識番号144)およびTH41N(配列認識番号145)(5’ −GGA TCCTCGAGTGATTAACTAGTCATCTAATAGCTCTAT AAGCTCCTrGTACTACTTCMTTACTCTATCCAT −3 t )並びにプライマー42KTH41(配列認識番号146)(5’ −AT CATCGGATCCTCGAGTGATTAAACTAGTCATCTAAT AGCTC−3’ )および42KVQ1 (配列認識番号141)をコードす る合成オリゴヌクレオチドとを用いた第2のPCHにより、159bpのPCR 誘導断片をTH4,1の暗号配列に融合した。プライマー42KTH41(配列 認識番号146)およびBAMVQ (配列認識番号149)(5’ −TTA ATCAGGATCCTTAATrAA?rAGTrATrAGAC−3’ ) を用いた第3のPCRのために、テンプレートとして合成オリゴヌクレオチドV QC(配列認識番号147)およびVQN (配列認識番号148)並びにこの 断片を用いて、5′末端にBamH1部位を含むように、この210bpのPC R誘導断片を5′の方向に延長せしめた。続いてのヌクレオチド配列分析により 、余分な塩基(A)が42KTH41の上述した配列の下線により示される位置 24の後に挿入されるという、オリゴヌクレオチド42KTH41(配列認識番 号146)の配列に誤りを示した。これは、テンプレートとして第3のPCRに より誘導した272bpの断片と、プライマーBAMVQ (配列認識番号14 9)および42KTH41A(配列認識番号150) (5/ −ATCATCにGATCCTCGAGTGATTMCTAGTCAT CTMTAGCTC−3’ )を用いた最終PCRにより修正した。最終PCR 後、このカセットは、XholおよびBamHI部位3′を有する42に−TH 4,1に対してBamHISPs t I、およびSma 1部位5′を含有し た。この271bp(7)PCR誘導断片をBamHIで切断し、pBs−3K + (CA。
ラジョラ、ストラタジエネ)のBamHI部位にクローニングして、プラスミド pVQ42KTH4,1を産生じた。
このプラスミドのヌクレオチド配列分析により、プロモーターの配列と暗号領域 が正確であることを確認した。しかしながら、3bpの欠失は、3’ BamH I部位の損失となったことが分かった。
プラスミドpTIT2TH4,1の構成これらの3つのカセットを、13L−T lが以下のようにして他の2つの遺伝子に対して反対方向となるように、1つの プラスミドpTIT2TH4,,1に結合せしめた=170bpのHi nd  I I I/Xho I断片をp731T1から単離し、同様に切断したpH6 72に連結し、pTIT2を産生じた。pVQ42KTH4,1からの290b pのBamHI/5acl断片を同様に切断したpTIT2に連結し、pTIT 2TH4,1を産生じた。挿入物の配列は、ヌクレオチド配列分析により確認し た。
pc5LsP (実施例14で定義)をEcoRIで切断し、アルカリホスファ ターゼで処理し、Notlで切断し自己連結後に線状精製した自己アニールオリ ゴヌクレオチドCP29 (配列認識番号151) (5’ −AATTGCGGCCGC−:] ’ )に連結した。この方法によ りNot1部位をpc5LsPに導入し、pNC5LSP5を産生した。
プラスミドpsD550を、以下のようにしてpSD548から誘導した。プラ スミドpSD548 (タータグリア等、1992)は、14L、0RF(ゲー ベル等、1990 a 。
b)が、BglIIとSma1部位からなるクローニング領域により置換された ワクシニアベクタープラスミドである。多重クローニング領域を拡大するために 、pSD548をBglllとSma Iで切断し、アニールした相補合成オリ ゴヌクレオチド539A (配列認識番号152)(5I− AGAAAAATCAGTTAGCTAAGATCTCCCGGGCTCGAG GGTACCGGATCCTGATrAG’I’rAATTrTTGT−3’) および539B (配列認識番号153)(5t− に連結した。産生じたプラスミドpsD550において、多重クローニング領域 は、Ba 11 I、Sma I、Xho、KpnlおよびBamHI制限部位 を含有している。
それぞれのプロモーターにより誘導させたエピトープのための遺伝子を含有する pTIT2TH4,1からの602bpのXhol断片を、それぞれのXhoI 部位で、供与体プラスミドpNC5LSP5およびpsD550にクローニング した。ヌクレオチド配列分析を用いて、挿入物の配列と方向を確認した。産生じ たプラスミドpc5TIT2TH4,1およびp14TIT2TH4,1を、A LVACおよびNYVACによるin vitro組換え実験に用いて、それぞ れ組換えウィルスvcP146およびvP1062を産生した。これらの組換え ウィルスは、ウィルスプラークに対して特異的なりNAプローブのハイブリダイ ゼーシヨンにより所望の遺伝子を含有することが示された。
実施例32−HIV−1,envからの膜内外アンカード組換えポックスウィル スvP1060、vP1061、vcP154およびvcP148を産生し、開 裂可能リンカ−領域により、HIV−1envのT1、T2、TH4,1エピト ープに対応する配列に結合したHIV−1envからの信号配列からなる融合ペ プチドを発現した。
vP1060およびvcP154は、HIV−1envの膜内外領域に対応する 配列とともに融合ペプチドを発現するという点で、vP1061およびvcP1 48とは異なる。
両方の融合ペプチドは、HIV−4(I I IB)envの51アミノ酸N末 端部分を含み、残基1−50 (開始metも加える)はラトナー等(1985 )に基づく。この信号領域のアミノ酸配列(配列認識番号154)はM)(EQ KTVAMRVKE)CYQHLWRWGWRWGTKLLGMLMXCSAT EKLWVTVYYGVPである。
これに続いて、長さで5つのアミノ酸までの開裂可能リンカ−領域により、T1 、T2、TH4,1エピトープ(ホスマリン等、1991)を、互いに信号配列 から、そして存在する場合にはアンカー配列から分離する。ペプチドのこの領域 のアミノ酸配列(配列認識番号155)は、[13号 ]−]PFR−KQエエ !10ト嘔1−IQ四GKAjシ啜YAPPF■−HEDエエ5LWDQSLK −PPFR)C−DRVIEVVQGAYPLAIR−[PPFRK−7ンh− 3である。アンカードメインは、HIV−1(I I IB)envの28のア ミノ酸膜内外領域、残基691−718である。この領域のアミノ酸配列(配列 認識番号1.56)は、 LFIMIVGGLVGLRIVFAVLSWNRVRQG−[停止]である。
融合ペプチドの両方のバージョンに関して、プライマーH6PCR1(配列認識 番号157) (5’ ACTACTAAGCTTCTTTATTCTATACTTAAAAA GTG−3’ )およびPCR3IGTI (配列認識番号158)(5’−C ATATTAATTTGTTTrCTAAAAGGAGGTACCCCATAA TAGACTGTG −3’)を用いたPCRにより、プラスミドpBsH6H IV3B5P(実施例2で定義)からH6プロモーターとHIV−1env信号 配列を誘導した。この314bpのPCR誘導断片は、H6プロモーターと、信 号、リンカ−1およびT1ペプチドの最初の6つのアミノ酸の暗号配列との後の 5’Hindl11部位からなる。
膜内外領域のない構成物のための暗号領域の残りを、プライマーPCRTIT2  (配列認識番号161)CTTTTAGAMACACGAAG −3〆)およ びPCRT4END (配列認識番号162)を用いた、オリゴヌクレオチドT 2T4A (配列認識番号およびT2T4B (配列認識番号160)(5’− GTACTACTTCAATTACTCTATCTTTTCTMAAGGAGG TrTrAMGATTGATCCCACAJIAGAAATAATATCTTC GTGTT’rTCTAAAAGGAGGAGC−3’ )のPCR増幅により 産生じた。この177bpのPCR誘導断片は、3’Xba1部位の後の、リン カ−領域、T2ペプチド、別のリンカ−領域、T2ペプチド、およびTH4,1 ペプチドをコードする。この断片を、プライマーH3PCR1(配列認識番号1 57)およびPCRT4END(配列認識番号162)を用いたPCRにより、 プロモーターと信号配列を含有する314bpのPCR誘導断片と融合した。こ の473bpのPCR誘導断片のHindIIIとXbalでの切断後、455 bpの断片をアガロースゲルから単離し、同様に切断したpBS−8Kに連結し 、挿入物の配列をヌクレオチド配列分析により確認した。
産生じたプラスミドをpBsTIT2TH4,1と称した。
膜内外アンカーのバージョンの暗号領域の残りを、プライマーPCRTIT2  (配列認識番号161)およびPCRT4TM (配列認識番号163) (5’ −TACTATCATTATGAATAATTTrCTAAAAGGA GGTCTAATAGCrCTATAAGCTCCTTGTACTACTTCA A’rTACTC−3’ )を用いた、オリゴヌクレオチド、T2T4A (配 列認識番号159)およびT2T4B (配列認識番号160)のPCR増幅に より産生じ、膜内外領域を収容する3′末端を変更した。この195bpのPC R誘導断片を、プライマーPCRTIT2 (配列認識番号161)およびPC RT4END(配列認識番号162)を用いたPCRにより、アンカー、HIV TMI (配列認識番号107)およびHIVTM2(配列認識番号108)か らなるオリゴヌクレオチドに融合した。この276bpのPCR誘導断片を、プ ライマーH6PCR1(配列認識番号157)およびPCRT4END (配列 認識番号162)を用いたPCRにより、プロモーターと信号配列を含有する3 14bpのPCR誘導断片に融合した。この572bpのPCR誘導断片のHi ndlIIとXbaIでの切断後、554bpの断片をアガロースゲルから単離 し、同様に切断したpBSに連結し、挿入物の配列をヌクレオチド配列分析によ り確認した。産生じたプラスミドをpBsTIT2TH4,IAと称した。
pc5LsP (実施例14で定義)をB amHI テ切断し、アニールした オリゴヌクレオチドCP32 (配列認識番号112)とCP33 (配列認識 番号113)に連結し、pVQC5LSP6を産生した。pVQC5LSP6を EcoRIで切断し、アルカリホスファターゼで処理し、Notlで切断して自 己連結後に線状精製した、自己アニールしたオリゴヌクレオチドCP29 (配 列認識番号151)に連結した。この方法によりNotI部位をpBQC5LS  P 61:導入し、pNVQc5LsP7を産生シタ。
両方のカセットを、挿入プラスミドpNcQc5LsP7のXholとXbaI 部位との間に個々に配した。これらのプラスミドpc5sTITITH4,1お よびpC5STIT2TH4,IAを用いて、それぞれカリナアボックスウイル ス組換え体、vcP148およびvcP154を産生した。BamHI−8ma I断片をpc5sTITITH4,1およびpc5sTIT2TH4,IAから 切除して、同様に切断したpsD550 (実施例31で定義)に連結し、それ ぞれプラスミドp l4STIT2TH4゜1およびpI4sTIT2TH4, LAを産生じた。これらのプラスミドを、治療ウィルスとしてのNYVACによ る組換え実験に用いて、それぞれ組換え体VP1061およびvP1060を産 生した。これらの組換えウィルスは、ウィルスプラークに対する特異的DNAプ ローブのハイブリダイゼーションにより所望の遺伝子を含有することが示C中の HIV−1net遺伝子の発現 HIV−1ne f (MN)を発現する組換えポックスウィルスvP1084 、vFP1084、およびvcP168を以下のように産生じたニ ブライ7−13PCR1(配列認識番号164)(5′−ATCATCGGAT CCAAGCTTACATCATGCAGTGG −3’)およびPI 3NE F2 (配列認識番号165)(5’−CGTTrTGACCATTTGCCA CCCATGATTAAACCTAAATAATTGTAσ[”rTG−3′) を用いたPCRにより、プラスミドpMP13HがらI3Lプロモーターを誘導 した。nefの暗号領域を、プライマーPI3NEF1 (配列認識番号166 )(5’ −AGTACMTTATrTAGGTTTMTCATGGGTGGC AAATGGTCAAMCG −3’ )およびPNEFBAM (配列認識番 号167)(5’−ATCATCGGATCCTMCACTTCTCTCTCC GG −31)を用いたpMNl、8−10 (7792と9595での5st 1部位の間のMNゲノムの部分のクローン)のPCR増幅により産生じた。暗号 領域とプロモーターとの融合は、プライマー13PCR1(配列認識番号164 )およびPNEFBAM(配列認識番号167)を用いた前述のpcR産生物の 増幅により行なった。この産生物のBamHIでの切断後、0.7kbの断片を アガロースゲルから単離し、同様に切断したpBS−3K+ (CA、ラジョラ 、ストラタジエネ)に連結し、プラスミドp 13NEFを産生じた。配列異常 か最初に観察されたのはこの時点であった。
プラスミドpMN1.8−10 (NCI−NIH,Dr。
R,C,ガロにより提供された)中の異常のために、カセットの配列は、公表さ れた配列(ガーゴ等、1988、ジエンバンクアセッション番号M17449) とは異なると決定された。これらの違いは、公表された配列に対して以下のよう に要約されている。
塩基番号 ガーゴ等 pMNl、 8−10結果 カセット8834 T T  サイレント C(aa=Arg)8863 G A Lys−>Arg A(a a=Jys)8890 T CPro−>Leu C(aa=Pro)9028  A G Arg−>Lys G(aa=Arg)9127 A A サイレン ト G(aa=G1n)9330−9331 GG GGG フレーム GGシ フト カセット中の2つのサイレント突然変異(位置8834と9127)はPCRに おける明白な誤りであった。コードしたタンパク質には影響がないので、そのま まにしておいた。9930でのフレームシフトは、他のHIV−1単離体に非常 に似ている読取り枠を長くすることになった。MN単離体からのnefを公表さ れたサイズに保持するには、このカセットは、暗号領域のトランスケート3′末 端を産生ずる第4のPCRを必要とした。
9930での余分な塩基の除去は、プライマーl3PCR1(配列認識番号16 4)およびPNEFFIXI (配列認識番号168) を用いた、p I 3NEF中の挿入物のPCR増幅により行なった。この67 8bpのPCR誘導断片のBamHIでの切断後、660bpの断片をアガロー スゲルから単離し、同様に切断したpBSに連結し、プラスミドpBS I 3 NEFを産生した。この挿入物をヌクレオチド配列分析により確認した。
nef遺伝子を含有するpBS I 3NEFからの660bpのBamHI断 片を挿入プラスミドpNVQC5LSP7(実施例32に定義)のBamHI部 位に配した。産生じたプラスミドpC5■3NEFをALVAC(7)C5座へ の組換えに用いて、組換え体CP168を産生じた。同一の660bpのBam HI断片もまた挿入プラスミドpSD550 (実施例31で定義)のBamH 1部位に配し、プラスミドp1413NEFを産生した。このプラスミドのNY VACによる組換えによって、組換え体vP1084を産生した。
TR0VACのF16座のための挿入プラスミドを以下の方法により誘導した。
7.3kbのNaeI/Ndel断片を、タータグリア等(1990)により記 載された鶏痘ウィルスの10.5kbのHindlII断片から単離して、同様 に切断したpUC9に連結し、プラスミドpRW866を産生じた。
pUC9をPvu I Iで切断し、EcoRIリンカ−をPvu11部位の間 に連結し、プラスミドp RW715を産生じた。鶏痘配列を側腹に有するクロ ーニング部位を、プライマーRW264(配列認識番号169)TMTCGTT MCTTATTAG −3’)およびRW267(配列認識番号170)(5’  −GCTAGAAATCTCTTAGTTTTTATAGTTG −3’ ) を用いた、10.5kbの断片の一部のPCR増殖により産生じた。隣接する領 域もまた、プライマーRW266(配列認識番号171) (5’−GTTACATATGTACAGMTCTGATCATAG −3’) およびRW265(配列認識番号172)を用いたPCRにより増幅した。これ らのPCR誘導断片を、プライマーRW266(配列認識番号171)およびR W267(配列認識番号170)を用いた第3のPCRにより融合した。産生し たPCR誘導断片は、5’Ec。
RI部位と3’NdeI部位を側腹に有する鶏痘配列からなる。この断片の中央 は、Notlと6つの読取り枠中の翻訳停止コドンを側腹に有する、Sma I SBamHI。
およびHindl I 1部位を含有するポリクローニング領域である。早期転 写終止信号(ユエンおよびモス、1987)は、3’NotI部位に隣接してい る。EcoRIとNdelで切断した、PCR誘導断片を、同様に切断したpR W715に連結し、プラスミドp RW864を産生じた。
LIKプロモートしたlac Z遺伝子を、部分的BamH1,全体のPstl の切断により、pAMlから切除した。この断片をフレノウポリメラーゼ、でプ ラントエンドし、Sma Iで切断したp RW864に連結し、p RW86 7Aを産生した。I)RW867AからのNotl断片を、Not1部位がFs p1部位に連結される場合に再産生されるように、dNTPの存在下でフレノウ ポリメラーゼによりプラントエンドし、タータグリア等(1990)により記載 された位11955に対応する挿入が行なわれるように部分的にFsplで切断 したpRW866に連結した。次いで産生じたプラスミドp RW868をNo tIで切断し、lac Zカセットを除去し、NotI切断により切除したp  RW864からの66bpのポリリンカー領域に連結した。産生じたプラスミド をp RW673と称した。81bpのSma I断片をpVQ42KTH4, 1(実施例31で定義)から誘導し、Sma Iで切断したp RW873に挿 入し、プラスミドpVQ873を産生じた。
TR0VACのF16座ヘノ組換え後のpvQ873への挿入のために、684 MのHindl I I断片として、pBsI3NEFからnefカセットを切 除し、vFP174を産生した。
実施例34−NYVAC中ノHI V−2遺伝子ノ発現NYVAC/HIV2  gag/pot組換え体の産生2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2)gagお よびpol遺伝子を含有するプラスミドp I S 5YEGPを、Dr、 G 、 7ランチー二(NCI−NIH)から得た。このプラスミドからのgagお よびpoL遺伝子を、13Lプロモーターの下流と、ワクシニアウィルスtk側 腹アームの間にクローニングした。これは、HIV2 gagおよびpol遺伝 子を含有する、p I 5SYEGPの4,400bpのBs tUI−Bg  l I I断片、および13Lプロモーターを含有するオリゴヌクレオチド、5 IVLI (配列認識番号69)およびHIV2L1 (配列認識番号17(5 I− CGCCCATGATTAAACCTAAATAATrGTACTTrGTAA TATAATGATATATATTTrCACTTTATCTCAC−3’ ) を、pSD542 (実施例15で定義)の4.070bpのXhol−Bgl II断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラ スミドをpHIV21と称する。
次いで外因性の3′非暗号配列を除去した。これは、po1遺伝子の3′を含有 する、280bpのBclI−8mal PCR断片を、pHIV21の8,1 00bpのBe I I−Sma I断片にクローニングすることにより行なっ た。このPCR断片は、オリゴヌクレオチド、HIv2P2(配列認識番号17 4) (5F −ATGGCAGTTCA’!TGCAT−3’ )およびHIV2P 3 (配列認識番号↓75)(51−TTCCCGGGAGATCTCTATG CCATI’rCTCCAT−3# )により、プラスミドp I 5SYEG Pから産生じた。この操作により産生じたプラスミドをpHIV22と称する。
pHIV22を、治療ウィルスとして(7)NYVAC(vP 866)による 組換え実験に用いて、vP1045を産生した。
イムノプレシビテーション分析を行なって、vP1045が真正HIV2 ga g遺伝子産生物を発現するか否かを決定した。
感染細胞からの溶解産物を、HIV2血清陽性個体からのプールした血清(Dr 、G、フランチm=(NCI−NIH)から得た)を用いて、HIV2 gag 発現に関して、分析した。血清を、vP866感染Vero細胞で予備吸着せし めた。予備吸着した血清を、4℃の一晩の培養によりタンパク質Aセファロース に結合せしめた。この培養期間後、物質を1×の緩衝液Aで4回洗浄した。正常 ヒト血清およびタンパク質Aセファロースで予備浄化した溶解産物を、タンパク 質Aセファロースに結合したHIV2血清陽性ヒト血清により4℃で一晩、培養 した。−晩の培養期間後、試料を、■×の緩衝液Aで4回、LiC1:+/尿素 緩衝液で2回洗浄した。沈殿したタンパク質を、2Xのラエムリ緩衝液(125 mMのトリス(pH6,8) 、4%のSDS、20%のグリセロール、10% の2−メルカプトエタノール)を添加し、5分間の沸騰により免疫複合体から分 離した。タンパク質を10%のドリファスゲルシステム(ドリファス等、198 4)上で分画し、固定し、フルオログラフィーのためにIMのNaサリチル酸塩 で処理した。
HIV2血清陽性個体からのヒト血清は、vP1045感染細胞から、HIV2  gag前駆体タンパク質、並びに様々な中間体および成熟gag開裂開裂タン パク生産生物異的に沈殿せしめたが、疑似感染またはNYVAC感染細胞からは 、HIV2特異的タンパク質を沈殿せしめなかった。
HIV2 gagおよびpol遺伝子を含有する、プラスミドpISSYEGP をDr、G、フランチー:(NC1−NIH)から得た。このプラスミドからの gagおよびpol遺伝子を13Lプロモーターの下流およびワタシニアウイル スtk側腹アームの間にクローニングした。これは、前述したように(実施例3 4参照)、最初にプラスミドpHIV22を産生ずることにより行なった。
pHIV22を、治療ウィルスとしてのvP920による組換え実験に用いて、 vP1047を産生した。
vP1047感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、HIV2 gagタ ンパク質の発現に関して、上述したように行なった。疑似感染細胞からはHIV 2特異的特異全種沈殿しなかった。しかしながら、HIV2 envおよびga g前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様々な中間体および成熟g ag開裂可能産生物は、vP1047感染細胞の溶解産物から沈殿した。
HIV2 gagおよびpol遺伝子を含有する、プラスミドp I 5SYE GPをDr、G、 7ランチー=(NC1−N I H)から得た。このプラス ミドからのgagおよびpol遺伝子を13Lプロモーターの下流およびワクシ ニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、前述したように (実施例34参照)、最初にプラスミドpHIV22を産生ずることにより行な った。
pHIV22を、治療ウィルスとしてのvP922による組換え実験に用いて、 vP1044を産生した。
vP1044感染細胞のイムノプレシビテーション実験を、HIV2 gagタ ンパク質の発現に関して、上述したように行なった。疑似感染細胞からはHIV 2特異的特異全種沈殿しなかった。しかしながら、HIV2 envおよびga g前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様々な中間体および成熟g ag開裂可能産生物は、vP1044感染細胞の溶解産物から沈殿した。
実施例37−ALVAC中のHIv2遺伝子の発現ALVAC/HIV2 ga g/pol遺伝子およびenv (gp160)組換え体の産生 プラスミド、pBsH6HIV2ENV (実施例4で定義)は、H6プロモー トしたHIV2 env (gp160)遺伝子を含有している。このプラスミ ドからのH6プロモートしたenv遺伝子をカナリアボックス側腹アームの間に クローニングした。これは、H6プロモートしたenv遺伝子を含有する、pB SH6HIV2ENVの2゜700bpのXho l−8ac I I断片、お よびオリゴヌクレオチドHIV2L4 (配列認識番号176)(5# −GG TTG−3’ ) およびHIV2L5 (配列認識番号177)(5’ −n=CJACCGC− 3’ )を、pC6L (実施例50で定義)のXhoI−EcoR1部位にク ローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpH I V23と称する。
次いでHIV2 gagおよびpol遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、■3LプロモートしたHIV2 gagおよびpol遺伝子を含有す る、pHIV22の4.450bpのXma l−No t I断片、およびオ リゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号13■)およびHIV2L7  (配列認識番号132)を、pHIV23の7,0OObpのXmal−Xh oI断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラ スミドをpHIV25と称する。
p HI V 25を、治療ウィルスとして(7)ALVACCCPpp)によ る組換え実験に用いて、vCPL53を産生した。CEF細胞単層に関してであ るが、前述したようにイムノプレシピテーション分析を行なって、vcP153 が真正HIV2 gagおよびenv遺伝子産生物を発現るか否かを決定した。
感染細胞からの溶解産物を、HIV2血清陽性個体からのプールした血清(Dr 、G、フランチm=(NCI−NIH)から得た)を用いてHIV2 gagお よびenv遺伝子発現に関して分析した。血清をALVAC感染CEF細胞で予 備吸着した。予備吸着した血清を、4℃で一晩の培養により、タンパク質Aセフ ァロースに結合せしめた。
この培養期間後、物質を1×緩衝液Aで4回洗浄した。正常ヒト血清およびタン パク質Aセファロースで予備浄化した溶解産物を、タンパク質Aセファロースに 結合したHI■2IM陽性ヒト血清により4℃で一晩、培養した。−晩の培養期 間後、試料を、I×の緩衝液Aで4回、LiCl2/尿素緩衝液で2回洗浄した 。沈殿したタンパク質を、2×のラエムリ緩衝液(125mMのトリス(pH6 ,8)、4%のSDS、20%のグリセロール、10%の2−メルカプトエタノ ール)を添加し、5分間の沸騰により免疫複合体から分離した。タンパク質を1 0%のドリファスゲルシステム(ドリファス等、1984)上で分画し、固定し 、フルオログラフィーのためにIMのNaサリチル酸塩で処理した。
HIV2血清陽性個体からのヒト血清は、vcP153感染細胞から、HIV2  envおよびgag前駆体タンパク質、並びに様々な中間体および成熟gag 開裂開裂タンパク生産生物異的に沈殿せしめたが、疑似感染またはALVAC感 染細胞からは、HIV2特異的タンパク質を沈殿せしめなかった。
実施例38−NYVACにおけるSIV遺伝子の発現NYVAC/SIV en v (gp120−gp28)およびgag (プロテアーゼ−)組換え体の産 生 イムノプレシピテーション分析を行なって、vP948(実施例5で定義)が真 正SIV envおよびgag前駆体タンパク質を発現するか否かを決定した。
感染細胞からの溶解産物を、SIv血清陽性マカクからのプールした血清(Dr 、G、フランチm=(MCI−NIH)から得た)を用いてSIV gagおよ びenv遺伝子発現に関して分析した。血清をNLVAC(vP866)感染V ero細胞で予備吸着した。予備吸着した血清を、4℃で一晩の培養により、タ ンパク質Aセファロースに結合せしめた。この培養期間後、物質をI×緩衝液A で4回洗浄した。正常マカク血清およびタンパク質Aセファロースで予備浄化し た溶解産物を、タンパク質Aセファロースに結合したSIV血清陽性マカク−血 清により4℃で一晩、培養した。−晩の培養期間後、試料を、1×の緩衝液Aで 4回、1ic1./尿素緩衝液で2回洗浄した。沈殿したタンパク質を、2×の ラエムリ緩衝液(125mMのトリス(pH6,8) 、4%のSDS、20% のグリセロール、10%の2−メルカプトエタノール)を添加し、5分間の沸騰 により免疫複合体から分離した。タンパク質を10%のドリファスゲルシステム (ドリファス等、1984)上で分画し、固定し、フルオログラフィーのために IMのNaサリチル酸塩で処理した。
SIV血清陽性個体からのマカク血清は、VP948感染細胞から、SIVga g前駆体タン前駆体タンパクンベロープ糖タンパク質を特異的に沈殿せしめたが 、疑似感染細胞からは、SIV特異特異的タンパ音質殿せしめなかった。
S I VMACI42を含有する、プラスミドpsIVGAGsS11GをD r、G、フランチ−=(NCI−NIH)から得た。このプラスミドからのga gおよびpal遺伝子を13Lプロモーターの下流およびワクシニアウィルスt k側腹アームの間にクローニングした。これは、前述したように(実施例5参照 )、最初にプラスミドpsIV5を産生ずることにより行なった。
pSIV5を、治療ウィルスとして(7)NYVAC(vP866)による組換 え実験に用いて、vP1042を産生した。
VP1042感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、SIV envおよ びgag前駆体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。疑似感染 またはNYVAC感染Vero細胞からはSIV特異的種は全く沈殿しなかった 。しかしながら、gag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様々 な中間体および成熟gag開裂可能産生物は、vP1042感染細胞の溶解産物 がら沈殿した。
実施例4O−NYVAC/SIV gag/potおよびenv (gp120  gp41)組換え体の産生 psIVG5(実施例5)を、治療ウィルスとしてのVP1050による組換え 実験に用いて、vP1071を産生した。
vP1071感染細胞のイムノプレシピテーション実験は、SIV遺伝子の発現 を示す。
実施例4l−NYVAC/SIV gag/polおよびenv (gp120 −gp28)組換え体のpsIVG5(実施例5)を、治療ウィルスとしてのV P874による組換え実験に用いて、vP943を産生じた。
vP943感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、SIV envおよび gag前駆体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。疑似感染V ero細胞からはSIV特異的種は全く沈殿しなかった。しかしながら、env およびgag前駆体タンパク質に対応するタンパク貫挿、並びに様々な中間体お よび成熟gag開裂可能産生物は、vP943感染細胞の溶解産物から沈殿した 。
vP942 (実施例5)感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、SIV  envおよびgag前駆体タンパク質の発現に関して、上述したように行なっ た。疑似感染Vero細胞からはSIV特異的種は全く沈殿しなかった。
しかしながら、p16およびp28に対応するタンパク貫挿は、vP942感染 細胞の溶解産物から沈殿した。
実施例43−NYVAC/SIV p16、p28およびenv (gp120  gp28)組換え体の産生 vP952 (実施例5)感染細胞のイムノプレシピテーンヨン実験を、SIV  envおよびgag前駆体タンパク質の発現に関して、上述したように行なっ た。疑似感染Vero細胞からはSIV特異的種は全く沈殿しなかった。
しかしながら、p16およびp28に対応するタンパク貫挿は、vP952感染 細胞の溶解産物から沈殿した。
プラスミド、pS I VEMVCは、H6プロモートしたS I V、Aht :x=エンベロープ遺伝子(in vitro選択トランスケートバージョン) を含有している。未熟終止コドンを含有するエンベロープ遺伝子の領域をpBS K十にクローニンクシタ。コレハ、psIVEMVcの1,120bpのC1a l−BamHI断片をp B S K十のC1a1−BamHI部位にクローニ ングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpsIVl oと称する。
次いで上流の終止コドン、TAGを元のCAGコドンに変更した。これは、オリ ゴヌクレオチド5IVL20 (配列認識番号178) (5を− CTAGCTAAGTTAAGGCAGGGGTATAGGCCAGTGTrC TCT’l’CCCCACCCTCTTATTTCCAGCAGACTCATA CCCMCAG−31)および5IVL21 (配列認識番号179)(5′− GTCCTGTTGCGTATCAGTCTGCTGGAAkTkkGkGGG TGGG CAAGACkkCACTGGCCTATACCCCTGCCTTM CTTAG−:l/)をpsIVIQの4.ooobpのNh−el−PpuM I断片にクローニングすることにより行なった。この操作ににより産生じたプラ スミドをpsIVllと称する。
次いで修飾コドンを含有する領域をpsIVEMVcにクローニングして戻した 。これは、修飾コドンを含有する、pslVllの380bpのBgllI−N hel断片を、psIVEMVcの5,600bpの部分的BglII−Nhe l断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラス ミドをpSIV12と称する。
pSIV12を、治療ウィルスとしてのNYVAC(vP866)l=よるin  vitro組換え実験に用いて、vP1050を産生した。
vP1050感染細胞のイムノプレシピテーション実験を、SIV envおよ びgag前駆体タンパク質の発現に関して、上述したように行なった。疑似感染 またはNYVAC感染Vero細胞からはSIV特異的種は全く沈殿しなかった 。しかしながら、envに対応するタンパク貫挿は、vP1050感染細胞の溶 解産物から沈殿した。
実施例45−ALVAC中のSIV遺伝子の発現ALVAC/SIV gag/ pot組換え体の産生S I VMACl、l:! CD N A配列を含有す る、プラスミドpSIVGAGSSIIGをDr、G、フランチ−=(NGI− NIH)から得た。このプラスミドからのgagおよびpol遺伝子を、I3L プロモーターの下流とワクシニアウィルス側腹アームの間にクローニングした。
これは、前述したように(実施例5参照)、最初にプラスミドpSIVG5を産 生ずることにより行なった。
次いてgag/pal遺伝子をカナリアボックス側腹アームの間にクローニング した。これは、I3Lプロモートしたgag/pol遺伝子を含有する、psI VG5の4゜500bpのSma l−No t I断片を、pC5L (実施 例10で定義)のSma I −No t 1部位にクローニングすることによ り行なった。この操作により産生じたプラスミドをpsIVGc13と称する。
psIVGc13を、治療ウィルスとして(7)ALVAC(CP p p)に よる組換え実験に用いて、vcP172を産生した。
vcP172感染細胞のイムノプレシビテーション実験は、SIV遺伝子の発現 を示した。
シミアン免疫不全ウィルス(S I VMAC+4□)cDNA配列を含有する 、プラスミドpsIVGAGs311Gはジエノベファ フランチm=(NCI  −N I H)から得た。
このプラスミドからのgag/pal遺伝子を、I3Lプロモーターの下流とワ クシニアウィルス側腹アームの間にクローニングした。これは、gag/pal 遺伝子を含有するpsIVGAGSSIIGの4,800bpのCf。
1−Tagl断片、およびワクシニアウィルス13Lプロモーターをコードする 、オリゴヌクレオチド、5IvL1(配列認識番号69)および5IVL2(配 列認識番号70)を、pSD542VCVQの4,070bpのXh。
I−AccI断片にクローニングすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpsIVGlと称する。
次いで外因性の3′非暗号配列を除去した。これは、po1遺伝子の3′末端を 含有する、1.ooobpのBamHI−Hpal PCR断片を、psIVG lの7,400bpの部分的BamHI−Hpal断片にクローニングすること により行なった。(このPCR断片は、オリゴヌクレオチド、5IvP5(配列 認識番号71)および5IVP6 (配列認識番号72)により、プラスミドp S■VGAGSSIIGから産生じた。)この操作により産生じたプラスミドを pSIVG4と称する。
配列分析により、psIVG4にはpol遺伝子内に1つの塩基対の欠失がある ことが分かった。このエラーを修正するために、pS IVGlの2.320b p(7)Bg l ll−3tuI断片を、psIVG4の6.100bpの部 分的Bglll−8tul断片にクローニングした。この操作によにり産生した プラスミドをp、5IVG5と称する。
次いでgag/pol遺伝子をカナリアボックス側腹アームの間にクローニング した。これは、■3Lプロモートしたgag/pol遺伝子を含有する、p S  I VG5の4゜5oobpのSmaI−Notl断片を、pC5LのSma  l−No t 1部位にクローニングすることにより行なった。この操作によ り産生じたプラスミドをpsIVGc13と称する。
次いてSIV env遺伝子をpsIVGc13にクローニングした。これは、 H6プロモートしたSIV enV遺伝子を含有する、psIV12のE、co li DNAポリメラーゼI (フレノウ断片)充填2,750bpの部分的B g l I I−Xho I断片を、psIVGc13のSma I部位にクロ ーニングした。この操作により産生じたプラスミドをpsIVGc14と称する 。
psIVGc14を、治療ウィルスとしてのALvACによるin vitro 組換え実験に用いる。
プラスミドp S I VENVCは、H6プロモートしたシミアン免疫不全ウ ィルスエンベロープ遺伝子(in vitro選択トランスケートバージョン) を含有している。
未熟終止コドンを含有するエンベロープ遺伝子の領域をpBSK十にクローニン グした。これは、p S I VEMVCの1,120bpのCl a I−B arnHI断片をpBSK+のC1al−BamH1部位にクローニングするこ とにより行なった。この操作により産生したプラスミドをpSIVIOと称する 。
次いで上流の終止コドン、TAGを、元のCAGコドンに変更した。これは、オ リゴヌクレオチド、5IVL20(配列認識番号178)および5IVL21( 配列認識番号179)をpsIVloの4.ooobpのNheI−P p u  M I断片にクローニングすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpsIVllと称する。
次いで修飾コドンを含有する領域を、p S I VEMVCにクローニングし て戻した。これは、psIVllの380bp(7)Bg 11 I−Nhe  I断片をpS IVEMVC(7)5.600bpの部分的Bg l I I− Nhe I断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じ たプラスミドをpsIV12と称する。
env遺伝子をカナリアボックス側腹アームの間にクローニングした。これは、 H6プロモートしたenv遺伝子を含有する、2,700bpのNruI−As p718断片を、pNVQH6c5sLP18の7,400bpのNrul−A sp718断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じ たプラスミドをpSIVGC15と称する。
psIVGc15を、治療ウィルスとしてのALvACによるin vitro 組換え実験に用いる。
実施例47−ALVAC中のHIVI遺伝子の産生ALVAC/HIVI ga g(+pro)(IIIB)およびgp120 (+膜内外)(MN)組換え体 の産生1型ヒト免疫不全ウイルス(HIVI)cDNA配列(IIIB)を含有 する、プラスミドpHXB2CをDr。
R,C,ガo(NCI−NIH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコードす る配列をワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。これは、 gag遺伝子の5′末端を含有する、pHXB2Dの1,625bpのBgll I断片をpsD542VcVQの4.075bpのBgllI断片にクローニン グすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpHIVG2と称する。
gag遺伝子の3′末端をpHIVG2にクローニングした。これは、gag遺 伝子の3′末端を含有する、280bp(DApnl−BamHI PCR断片 を、pHIVG2の5,620MのApal−BamHI断片にクローニングす ることにより行なった。(このPCR断片は、オリゴヌクレオチド、HIVP5  (配列認識番号116)およびHIVP6 (配列認識番号117)により、 プラスミドpHXB2Dから産生じた。)この操作により産生じたプラスミドを pHIVG3と称する。
次いで13Lプロモーターをgag遺伝子の上流にクローニングした。これは、 ワクシニアウィルス13Lプロモーターおよびgag遺伝子の5′末端をコード する、オリゴヌクレオチド、HIVL17(配列認識番号118)およびHIV L18 (配列認識番号119)を、pHIVG3の5,540bpの部分的B glII−C1al断片にクローニングすることにより行なった。この操作によ り産生じたプラスミドをpHIVG4と称する。
次いでp24、p2、p7およびp6をコードするgag遺伝子の部分を除去す る。これは、オリゴヌクレオチド、HIVL19 (配列認識番号120)およ びHIVL20(配列認識番号121)を、pHIVG4の4,450bpの部 分的Pvul I−BamHI断片にクローニングすることより行なった。この 操作により産生されたプラスミドをpHIVG5と称する。
次いでgag遺伝子の残り、並びにpot遺伝子をp17「遺伝子」の下流にク ローニングした。これは、はとんどのgag遺伝子と全てのpol遺伝子を含有 する、pHXB2Dの4.995bpのC1aI−3alI断片を、pHIVG 5の4,150bpのC1al−3all断片にクローニングすることにより行 なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG6と称する。
次いで外因性3′非暗号配列を除去した。これは、p。
1遺伝子の3′末端を含有する、360bpのAflll−BamHI PCR 断片をpHIVG6の8.030bpのAg l I I−BamHI断片にク ローニングすることにより行なった。(このPCR断片は、オリゴヌクレオチド 、HIVP7 (配列認識番号122)およびHIVP8(配列認識番号123 )により、プラスミドpHXB2Dから産生じた。)この操作により産生じたプ ラスミドをpHIVG7と称する。
次いで13Lプロモートしたgagおよびpol遺伝子をカナリアボックス挿入 ベクター中に挿入した。これは、13Lプロモートしたgagおよびpol遺伝 子を含有する、pHIVG7の4.360bpの部分的Bglll−BamHI 断片を、pVQH6CP3LのBamH1部位にクローニングすることにより行 なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVGE14と称する。
次いでH6プロモートしたHIVI gp120 (生膜内外)遺伝子をpH1 VGE14にクローニングした。これは、gp120 (+膜内外)遺伝子を含 有する、pC5HIVMNi20Tの1.700bpのNruI−8ma■断片 を、pHIVGE14の11.400bpのNrul−8ma I断片にクロー ニングすることにより行なった。
産生じたプラスミドをpHIVGE14Tと称する。
次いでほとんどのpol遺伝子を除去した。これは、HI V 1プロテアーゼ 「遺伝子」の3′末端を含有する、540bpのApal−BamHI PCR 断片を、pHIVGE14Tの10.0OObpのApaI−BamHr断片に クローニングすることにより行なった。(このPCR断片は、オリゴヌクレオチ ド、Hl、VF6(配列認識番号116)およびHIVP37 (配列JJaffi号180)(5’−人AAGGATCCCCCGGGTTA AAAATI’rAAAGTGCAACC−3′)により、プラスミドpHIV G7から産生じた。)この操作によりほとんどのpol遺伝子は除去するが、プ ロテアーゼ「遺伝子」は無傷のままにする。この操作により産生じたプラスミド をpHIV32と称する。
pHIV32を、治療ウィルスとしてのALVACによるin vitro組換 え実験に用いる。
実施例48−NYVAC中のHIV1遺伝子ノ産生NYVAC/HIVI ga g (+pro)1形ヒト免疫不全ウイルス(HIVl)cDNA配列(III B)を含有するプラスミドpHXB2Dを、Dr。
R,C,ガo (NCI −N IH)から得た。gag遺伝子の5′末端をコ ードする配列をワクシニアウィルスtk側腹アームの間にクローニングした。こ れは、gag遺伝子ノ5′末端ヲ含有する、pHXB2Dの1,625bpのB glll断片を、psD542VcVQの4.075bpのBgl(I断片にク ローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpH IVG2と称する。
次いでgag遺伝子の3′末端をpHIVG2にクローニングした。これは、g ag遺伝子の3′末端を含有する、280bpのApaI−BamHI PCR 断片を、pHIVG2の5.260bpのApal−BamHI断片にクローニ ングすることにより行なった。(このPCR断片は、オリゴヌクレオチド、HI VP5 (配列認識番号116)およびHIVP6 (配列認識番号117)に より、プラスミドpHXB2Dから産生じた。)この操作により産生じたプラス ミドをpHIVG3と称する。
次いで13Lプロモーターを、gag遺伝子の上流にクローニングした。これは 、ワクシニアウィルス13Lプロモーターおよびgag遺伝子の5′末端をコー ドする、オリゴヌクレオチド、HIVL17 (配列認識番号118)およびH IVL18 (配列認識番号119)を、pHIVG3の5,540bpの部分 的Bgl I l−C1aI断片にクローニングすることにより行なった。この 操作により産生じたプラスミドをpHIVG4と称する。
次いでp24、p2、p7およびp6をコードするgag遺伝子の部分を除去し た。これは、オリゴヌクレオチド、HIVL19 (配列認識番号120)およ びHIvL20(配列認識番号121)を、pHIVG4の4.450bpの部 分的Pvu I I−BamHI断片にクローニングすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpHI VG5と称する。
次いでgag遺伝子の残り、並びにpol遺伝子を、p17「遺伝子」の下流に クローニングした。これは、gag遺伝子のほとんどおよびpol遺伝子の全て を含有する、pHXB2Dの4.955bpのCa1l−SalI断片を、pH IVG5の4.150bpのC1aI−8alI断片にクローニングすることに より行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVG6と称する。
次いで外因性3′非暗号配列を除去した。これは、p。
1遺伝子の3′末端を含有する、360bpのAfllI−BamHI PCR 断片を、pHIVG6の8.030bpのAf l I I−BamHI断片に クローニングすることにより行なった。(このPCR断片は、オリゴヌクレオチ ド、HIVP7 (配列認識番号122)およびHIVP8(配列認識番号12 3)によりプラスミドpHXB2Dから産生じた。)この操作により産生じたプ ラスミドをpHIVG7と称する。
次いで13Lプロモートしたgagおよびpol遺伝子をカナリアボックス挿入 ベクターに挿入した。これは、I3Lプロモートしたgagおよびpol遺伝子 を含有する、pHIVG7の4.360bpの部分的Bglll−BamHI断 片を、pVQ86CP3LのBamH1部位にクローニングすることにより行な った。この操作により産生じたプラスミドをpHIVGE14と称する。
次いでH6プロモートしたHIVIエンベロープ「gp120」遺伝子(MN) をpHIVGE14に挿入した。
これは、H6プロモートしたエンベロープrgp120J遺伝子を含有する、p BsHIVMN120(7)1.600bpのNruI−NotI断片、および オリゴヌクレオチド、HIVL29 (配列認識番号129)およびHIVL3 0(配列認識番号130)を、pHI VGE 14(7)11゜500bpの NruI−Xhol断片にクローニングすることにより行なった。この操作によ り産生じたプラスミドをpHIVGE15と称する。
次いでH6プロモートしたHIVIエンベロープ「gp120」遺伝子(MN) および13Lプロモートしたgagおよびpot遺伝子(IIIB)を、ワクシ ニアウィルス挿入ベクターに挿入した。これは、H6プロモートしたHIv1エ ンベロー’ニア” r g I) 120J 遺伝子(MN) オにび13Lプ ロモートしたgagおよびpol遺伝子(IIIB)を含有する、pHIVGE 15の6,400bp(7)No t I−B amHI断片を、pSD542  (実施例15で定義)の4.000bpのN′o t I−Bg l I I 断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミ ドをpHIVGE16と称する。
次いでrg I) L 20J遺伝子をrgp160J遺伝子により置換した。
これは、全HIVIエンベロープ遺伝子(MN)を含有する、pH6HMNE  (実施例10で定義)の2,600bpのNrul−Not−I断片を、pHI VGE16の8,000bpの部分的Nrul−Notl断片にクローニングす ることにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIVGE19 と称する。
次いでgp41をコードするenv遺伝子の部分を、env膜内外領域により置 換した。これは、H6プロモートしたgp120 (+膜内外)遺伝子を含有す る、pBsHIVMN120Tの1,700bl)のNrul−Notl断片を 、pHIVGE19の8,500bpの部分的NruI−Notl断片にクロー ニングすることにより行なった。産生じたプラスミドをpHIVGE19Tと称 する。
次いでほとんどのpol遺伝子を除去した。これは、HIVIプロテアーゼ「遺 伝子」の3′末端を含有する、540bpのApaI−3mal PCR断片を 、pHIVGE19Tの7,000bpのApal−8mal断片にクローニン グすることにより行なった。(このPCR断片を、オリゴヌクレオチド、H[’ P5(配列認識番号116)およびHIVP37 (配列認識番号180)によ り、プラスミドpHIVG7から産生じた。)この操作によりほとんどのpol 遺伝子を除去するが、プロテアーゼ「遺伝子」を無傷のままにする。この操作に より産生じたプラスミドをpHI V33と称する。
pHI V33を、治療ウィルスとしてのNYVACによるin vitro組 換え実験に用いる。
プラスミドpBSH6HIV2ENV (実施例4で定義)は、H6プロモート した2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2)env遺伝子を含有している。この プラスミドからのH6プロモートしたenv遺伝子をカナリアボックス側腹アー ムの間にクローニングした。これは、pBSH6HIV2ENVの2.700b pのXhoI−5acII断片およびオリゴヌクレオチド、HIV2L4 (配 列認識番号176)およびHIV2L5 (配列認識番号177)を、pC6L  (実施例50で定義)のXhoI−EcoR1部位にクローニングすることに より行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHI V23と称スル。
次いでHIV2 gagおよびpol遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、■3LプロモートしたHl、V2 gagおよびpol遺伝子を含有 する、pHIV22の4.450bpのXma l−No t I断片、および オリゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)およびH1V2L 7 (配列認識番号132)を、pHIV23の7.000bpのXmal−X hol断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプ ラスミドをpHIV25と称する。
次いでenv遺伝子を除去した。これは、オリゴヌクレオチド、HIV2L8  (配列認識番号181)(5’ −CGATAAACCGC−3’ )およびH IV2L9 (配列認識番号182)(5I−GGTTTAT−3!> を、pHIV25の8.800bpの部分的C1al−8stlII断片にクロ ーニングすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpHIV27と称する。
pHI V27を、治療ウィルスとしてのALVACによるin vitro組 換え実験に用いてvcP190を産プラスミドpBsH6HIV2ENV (実 施例4で定義)は、H6プロモートした2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2) env遺伝子を含有している。このプラスミドからのH6プロモートしたenv 遺伝子をカナリアボックス側腹アームの間にクローニングした。これは、pBA H6HIV2ENVの2.700bpのXhoI−5acII断片およびオリゴ ヌクレオチド、HIV2L4 (配列認識番号176)およびHIV2L5 ( 配列認識番号177)を、pC6L (実施例50で定義)のXi>of−Ec oR1部位にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプ ラスミドをpHIV23と称する。
次いでHIV2 gagおよびpal遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、13LプロモートしたHIV2 gagおよびpol遺伝子を含有す る、pHIV22の4,450bpのXm、a l−No t I断片、および オリゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)およびHIV2L 7 (配列認識番号132)を、pHIV23の7,000bpのXma I− Xho I断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じ たプラスミドをpHIV25と称する。
次いでgagおよびpol遺伝子を除去した。これは、オリゴヌクレオチド、H IV2L10 (配列認識番号18(5’−GGGAAAG−3’) およびHIV2L11 (配列認識番号184)(5’ −GATCCTTrC CC−3’ )を、pHIV25の7,000bpの部分的BamHI−3ma  I断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラ スミドをpHIV28と称する。
pHIV28を、治療ウィルスとしてのin vitro組換え実験に用いてv cP188e産生した。
ALVAC/HIV2 gp120組換え体の産生プラスミドpBsH6HIV 2ENVは、H6プロモートした2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2)env 遺伝子を含有している。このプラスミドからのH6プロモートしたenv遺伝子 をカナリアボックス側腹アームの間にクロー = :/ りり、 タ。コレハ、 pBsH6HIV2ENV (実施例4て定義)の2,700bpのXho l −3ac I 1断片およびオリゴヌクレオチド、HIV2L4 (配列認識番 号176)およびHIV2L5 C配列認識番号177)を、pC6LのXho  I−EcoRI部位にクローニングすることにより行なった。この操作により 産生じたプラスミドをpHI V23と称する。
次いでHIV2 gagおよびpol遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、13LプロモートしたHIV2 gagおよびpol遺伝子を含有す る、pHIV22の4,450bpのXma l−No t I断片、およびオ リゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)およびHIV2L7  (配列認識番号132)を、pHIV23の7,000bpのXma I−X ho I断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じた プラスミドをpHIV25と称する。
次いでgagおよびpol遺伝子を除去した。これは、オリゴヌクレオチド、H IV2L10 (配列認識番号183)およびHIV2L11 (配列認識番号 184)を、pHIV25の7.000bpの部分的BamHI−8ma■断片 にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミドを pHIV28と称する。
次いでgp41をコードするenv遺伝子の部分を除去した。これは、gp12 0遺伝子の3′末端を含有する、pBsHIV212QBの360bpのPst l−XbaI断片、およびオリゴヌクレオチドHIV2L12 (配列認識番号 185) (5′−CTAGAAAACCGC−3 ′)およびHIV2L13 (配列認 識番号186)(s t−aaTTTT−3t ) を、pHIV28の5,600bpのPstl−3stII断片にクローニング することにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIV29と 称する。
p−HIV29を、治療ウィルスとしてのALVACによるin vitro組 換え実験に用いる。
プラスミ)’pBsH6HIV2ENV (実施例4で定義)は、H6プロモー トした2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2)env遺伝子を含有している。こ のプラスミドからのH6プロモートしたenv遺伝子をカナリアボックス側腹ア ームの間にクローニングした。これは、pBSH6HIV2ENVの2,700 bpのXhoI−3ac I I断片およびオリゴヌクレオチド、HIV2L4  (配列認識番号176)およびHIV2L5 (配列認識番号177)を、p C6L (実施例5で定義)のXhoI−EcoR1部位にクローニングするこ とにより行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIV23と称する 。
次いでHIV2 gagおよびpol遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、I3LプロモートしたHIV2 gagおよびpot遺伝子を含有す る、pHIV22の4.450bpのXma l−No t I断片、およびオ リゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)およびHIv2L7 (配列認識番号132)を、pHIV23の7,000bpのXma I−Xh o I断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプ ラスミドをpHIV25と称する。
次いでgagおよびpol遺伝子を除去した。これは、オリゴヌクレオチド、H IV2L10 (、配列認識番号183)およびHIV2L11 (配列認識番 号184)を、pHIV25の7.ooobpの部分的B amHI−8maI 断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミ ドをpHIV28と称する。
次いでgp41をコードするenv遺伝子の部分を除去した。これは、gp12 0遺伝子の3′末端を含有する、pBsHIV212OBの360bpのPst I−XbaI断片、およびオリゴヌクレオチドHIV2L12 (配列認識番号 185)およびHIV2L13 (配列認識番号186)を、pHIV28の5 .600bpのPstl−8stll断片にクローニングすることにより行なっ た。この操作により産生じたプラスミドをpHIV29と称する。
次いでgl)120遺伝子をpHI V25にクローニングした。これは、H6 プロモートしたgp120遺伝子を含有する、pHIV29の1.550bpの Nrul−3aclI断片を、pHI V25の9,000bpのNruI−8 acII断片にクローニングすることにより行なった。
この操作により産生じたプラスミドをpHIV30と称する。
pHIV30を、治療ウィルスとしてのALVACによるin vitro組換 え実験に用いる。
ALVAC/HIV2 p120(+膜内外)組換え体の産生 プラスミドpBsH6HIV2ENV (実施例4で定義)は、H6プロモート した2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2)env遺伝子を含有している。この プラスミドからのH6プロモートしたenv遺伝子をカナリアボックス側腹アー ムの間にクローニングした。これは、pBSH6HIV2ENVの2.700b pのXho l−3acI I断片およびオリゴヌクレオチド、HIv2L4( 配列認識番号176)およびHIV2L5 (配列認識番号177)を、pC6 L C実施例5で定義)のXhoI−EcoR1部位にクローニングすることに より行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHI V23と称する。
次いでHIV2 gagおよびpol遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、■3LプロモートしたHIV2 gagおよびpol遺伝子を含有す る、pHIV22の4.450bpのXma l−No t I断片、およびオ リゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)およびHIV2L7  (配列認識番号132)を、pHIV23の7.000bpのXmaI−Xh oI断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラ スミドをpHI V25と称する。
次いでgagおよびpot遺伝子を除去した。これは、オリゴヌクレオチド、H IV2L10 (配列認識番号183)およびHIv2L11(配列認識番号1 84)を、pHIV25の7.ooobpの部分的B amHI−Smal断片 にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミドを pHI V28と称する。
次いでgp41をコードするenv遺伝子の部分を除去した。これは、gp12 0遺伝子の3′末端を含有する、pBsHIV212OBの360bpのPst l−Xba■断片、およびオリゴヌクレオチドHIV2L12 (配列認識番号 185)およびHIV2L13 (配列認識番号186)を、pHIV28の5 ,600bpのPstl−3stI I断片にクローニングすることにより行な った。この操作により産生じたプラスミドをpHi v2 gと称する。
次いでHIVI env膜内外領域をgp120遺伝子の末端にクローニングし た。これは、gp120遺伝子の3′末端およびenv膜内外領域を含有する、 pHIV31の500bpのEcoRI断片を、pHIV29の5゜600bp のEcoRI断片にクローニングすることにより行ナツタ。(pHIV31は、 gp120遺伝子の3′末端およびenv膜内外領域を含有する、500bpの Pstl−XbaI PCR断片をpIBI25のPstI−Xbal断片にク ローニングすることにより誘導した。)このPCR断片は、オリゴヌクレオチド 、HIV2P14(配列認識番号187) (s ′−CAGAAGTAGCATATATGT−3′)およびHIVTM3 (配列認識番号109)により、pcR断片、PCRTMI、およびオリゴヌク レオチドHIVTMI (配列認識番号107)とHIVTM2(配列認識番号 108)から産生じた。P CRTM 1は、オリゴヌクレオチド、HIV2P 14 (配列認識番号187)およびHIV2P15 (配列認識番号188) (5’ −GCCTCCTACTATCATTATGAATAATCTCTrA TGTCTCCCTGGAGC−3z )により、プラスミドpHIV28から 産生した。この操作により産生じたプラスミドをpHIV34と称する。
pHIV34を、治療ウィルスとしてのALVACによるin vitro組換 え実験に用いる。
ALVAC/HIV2 gag/polおよびgp120(生膜内外)組換え体 の産生 プラスミドpBsH6HIV2ENV (実施例4で定義)は、H6プロモート した2型ヒト免疫不全ウイルス(HIV2)env遺伝子を含有している。この プラスミドからのH6プロモートしたenv遺伝子をカナリアボックス側腹アー ムの間にクローニングした。これは、pBSH6HIV2ENVの2,700b pのXhoI−8aclI断片およびオリゴヌクレオチド、HIV2L4 (配 列認識番号176)およびHIV2L5 (配列認識番号177)を、pC6L  (実施例5で定義)のXhol−EcoRI部位にクローニングすることによ り行なった。この操作により産生じたプラスミドをpHIV23と称する。
次いでHIV2 gagおよびpol遺伝子をpHIV23にクローニングした 。これは、I3LプロモートしたHIV2 gagおよびpol遺伝子を含有す る、pHIV22の4.450bpのXma l−No t I断片、およびオ リゴヌクレオチド、HIV2L6 (配列認識番号131)およびHIV2L7  (配列認識番号132)を、pHIV23の7.000bpのXmal、−X hol断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプ ラスミドをpHIV25と称する。
次いでgagおよびpol遺伝子を除去した。これは、オリゴヌクレオチド、H IV2L10 (配列認識番号183)およびHIV2L11 (配列認識番号 184)を、pHIV25の7,000bpの部分的B amHI −3maI 断片にクローニングすることにより行なった。この操作により産生じたプラスミ ドをpHIV28と称する。
次いでgp41をコードするenv遺伝子の部分を除去した。これは、gp12 0遺伝子の3′末端を含有する、pBsHIV2120Bの360bpのPst I−XbaI断片、およびオリゴヌクレオチドHIV2L12 (配列認識番号 185)およびHIV2L13 (配列認識番号186)を、pHIV28の5 .600bpのPstI−3stl I断片にクローニングすることにより行な った。この操作により産生じたプラスミドをpHIV29と称する。
次いでHIVI env膜内外領域をgp120遺伝子の末端にクローニングし た。これは、gp120遺伝子の3′末端およびenv膜内外領域を含有する、 pi−i I V31の5oobpのEcoRI断片を、pHIV29の5゜6 00bpのEcoRI断片にクローニングすることにより行なった。(pHIV 31は、gp120遺伝子の3′末端およびenv膜内外領域を含有する、50 0bpのPstl−Xbal PCR断片をplBI25のPstI−Xbal 断片にクローニングすることにより誘導した。)このPCR断片は、オリゴヌク レオチド、HIV2P14(配列認識番号187)およびHIVTM3(配列認 識番号109)により、PCR断片、PCRTMI、およびオリゴヌクレオチド HIVTMI (配列認識番号1o7)とHIVTM2 (配列認識番号108 )から産生じた。PCRTMlは、7i IJゴヌクレオチド、HIV2P14  (配列認識番号187)およびHIV2P15 (配列認識番号188)によ り、プラスミドpHI V28から産生じた。この操作により産生じたプラスミ ドをpHI V34と称する。
次いでgp120 (+膜内外)遺伝子を、HIV2 gag/po+遺伝子を 含有するプラスミドにクローニングした。これは、H6プロモートしたgp12 0 (+膜内外)遺伝子を含有する、pHI V34の2,700bpのC1a l断片を、pHIV30の6,800bp(7)C1al断片にクローニングす ることにより行なった。(pHIV30は、H6プロモートしたgp120遺伝 子を含有する、pHI V29の1.550bpのNrul−3acll断片を 、pHIV25の9,000bpのNruI−8acII断片にクローニングす ることにより誘導した。)この操作により産生じたプラスミドをpHIV35と 称する。
pHI V35を、治療ウィルスとしてのALVACによるin vitro組 換え実験に用いる。
する場合と有さない場合のHIV−fenニュ1上旦主璽ヱ且酉二ヱ五互上二1 S勇童されたHIV−1gagのp24xピトープを含有する2つの融合ペプチ ドの発現2つの発現カセットを、以下に記載する一連のポリメラーゼ連鎖反応に より産生じた。これらのカセットは、一方のバージョンがエピトープに融合され たHIV−1enVの信号配列をコードするが、もう一方はしないという点で異 なる。
信号を有する融合ペプチドのバージョンは、開裂可能リンカ−領域の後に、ラト ナー等(1985)に基づ<HIV−1(I I IB) envの51アミノ 酸N末端部分、残基1−50 (開始Metを加えた)に先行する。この領域の アミノ酸配列は(配列認識番号189)MKEQKTVAMRWEKYQHLW RWGWRWGTMLLGMLMXC5ATEKLWVTVYYGVP−PFR Kである。融合ペプチドの両方のバージョンは、HIV−1(MN)envのp 24、v3ループ(MN) 、およびT1の定義されたT細胞エピトープに基づ くアミノ酸配列を含有している。ペプチドは、エピトープが互いと、存在する場 合には配列(配列認識番号189)PPFRKによる信号から離れるように設計 される。ペプチドのこの領域の配列は(配列認識番号190) [f、7号 −PFRK]− である。信号配列を欠如したバージョンにおいては、[信号−PFRK]にによ り示される領域は、開始メチオニンのみにより置換される。
信号を有するカセットに関して、プライマーH6PCR1(配列認識番号157 ) (5’ −ACTACTAAGCTTC?rTATTCTATACTTAAAA AGTG −3’)および5IGPCR24(配列認識番号191)を用いたP CRにより、プラスミドpBsTIT2TH4゜1(前記)からH6プロモータ ーと信号を誘導した。プライマーH6PCR1およびP24PCR(配列認識番 号1(5′−”ACAATTAATTTGTACTT’rTCTAAAAGGT GG’r’l”rATAAAATC−3’ )ヲ用いて、この307bpのPC R誘導断片およびオリゴヌクレオチドP24A (配列認識番号192)(5′ − CCATTCAGGAAGGGACCTAAAGAACCTTrTAGAGAT TATGTAGATAGATrTTATAAACCACCTTI’rAGAAA A−:l ’ )とP24B (配列認識番号193) (5を− TTTTCTAAAAGGTGGTTTATAAAATCTATCTACATA ATCTCTAAAAGGTrCTTrAGGTCCCTTCCTGkATGG −31)のPCR増幅によりp24エピトープを信号配列に融合した。この37 7bpのPCR誘導断片は、信号、p24エピトープおよびV3ループの最初の 6つのアミノ酸の暗号配列に結合せしめられたH6プロモーターからなる。
信号を有さないカセットに関して、プライマー86PCR1(配列認識番号15 7)およびH6P24 (配列認識番号195) (5・− GGTGGTTTATAAAATCTATCTACATAATCTCTAAAA GGTrCTrTAGGTCCCATTACGATACAAACTTMCGG− 3’)を用いたPCRにより、プラスミドpH6T2 (上記)からH6プロモ ーターを誘導した。p24エピトープは、プライマーH6PCR1(配列認識番 号157)およびP24PCR(配列認識番号194)を用いて、この187b pのPCR誘導断片およびオリゴヌクレオチドP24A(配列認識番号192) とP24B (配列認識番号193)のPCR増幅によりプロモーターに融合せ しめた。この214bpのPCR誘導断片は、p24エピトープおよびV3ルー プの最初の6つのアミノ酸の暗号配列に結合せしめられたH6プロモーターから なる。
v3ループ領域の暗号配列は、プライマーV3PCR1(配列認識番号196) (s ′−AAACCACCTTTTAGAAAAGTACMATTAATTG TAC−] # )オヨびV3PCR2C配列認識番号197)(5’ −CT GCTTACGGAACGGTGGTrTTGCTCTACTMTGTTACA ATG−] ’ )を用いたプラスミドpHIVGE16EV (前記)がらの Sma I断片のPCR増幅により誘導した。T1エピトープを、プライマーV 3PCR1(配列認識番号196)およびTIMNPCR(配列認識番号200 )(”−TCATCAAAGCTTCTCGAGAAAAATTAAGCATA CATAGごゴ買C−3・)を用いた、テンプレートとしてのオリゴヌクレオチ ドMNTIA (配列認識番号198) (5を− GCTTAA−3’ ) とMNTIB(配列認識番号199) (5・− TTAAGCATACATAGCTTTTTCTACTTCTTGCCACAT GTTTATTATCTGCTTACGGAACGGTGG−3’ ) およびこの171bpのPCR誘導断片のPC,R増幅によりv3ループの暗号 領域に結合せしめた。この239bpのPCR誘導断片は、早期転写終止信!  (TTTTTNT)およびXholとHindI11部位の後の3′に、p24 エピトープ、v3ループ、およびT1エピトープの最後のコドンからなる。
信号を有するカセットに関して、プロモーター、信号およびp24エピトープ暗 号配列を、プライマーH6PCR1(配列認識番号157)およびTIMNPC R(配列認識番号200)を用いた377bpと239bpのPCR誘導断片の PCR増幅により、v3ループ/Tlエピトープの暗号領域に結合せしめた。こ の581bpのPCR誘導断片のHindlIIての切断後、563bpの断片 をアガロースゲルから単離し、同様に切断したpBs(CA。
ラジョラ、ストラタジェネ)に連結し、プラスミドpMNTIP24を産生した 。挿入物は、ヌクレオチド配列分析により確認した。
信号を有さないカセットに関して、プロモーターおよびp24暗号配列を、プラ イマーH6PCR1(配列認識番号157)およびTIMNPCR(配列認識番 号200)を用いた、17 ]、 b pと239bpのPCR誘導断片のPC R増幅により、■3ループ/Tlエピトープの暗号領域に結合せしめた。この4 18M1のPCR誘導断片のHindlllでの切断後、400bpの断片をア ガロースゲルから単離は、同様に切断したpBS(CA、ラジョラ、ストラタジ エネ)に連結し、プラスミドpMN24EV3TINSAを産生じた。挿入物を ヌ・クレオチド配列分析により確認した。
C6の上流の370bpと、Sma I、PstlSXhoI、およびEcoR 1部位を含有するポリリンカーと、1156bpの下流配列とを含有するC6挿 入ベクターを以下のように誘導した。オリゴヌクレオチドC6Al SG(配列 認識番号201) (5’ −ATCATCGAGCTCGCGGCCGCCTATCAAAAGT CTTAATGAG’l’l’ −3’ )およびC6BISG (配列認識番 号202)を用いた、精製ゲノムカナリアボックスDNAから誘導したコスミド クローンのPCR増幅により、0.4kbの上流配列を誘導した。オリゴヌクレ オチドC6C1,3G(配列認識番号203) 15 ’ −CCCGGGCTGCAGCTCGAGGAATTCTTTTrA TTGATTAACTAGTCAMTGAGTATATATAATTGAAAA AGTAA −3’ )およびC6DISC(配列認識番号2o4)(s′−G ATGATGGTACCTTCATMATACAAGTTTGATTAAACT TAAGTTG −3〆)を用いた、同一のテンプレートのPCR増幅により、 1゜2kbの下流アームを産生じた。これらの断片を、プライ7− C6A I  S G (配列認識番号2o1)およびC6DISC(配列認識番号204) のためのテンプレートとしてのゲル精製0.4および0.2kbの断片を用いた 第3のPCRにより融合した。産生じた1、6kbの断片をアガロースゲルから 単離し、5acIとKpnIで切断し、同様に切断したpBS (CA、ラジョ ラ、ストラタジェネ)に連結し、C6挿入プラスミドpC6Lを産生じた。
両方の発現カセットを、pMNTIP24およびpMN24EV3TINSAの Pstl/XhoI切断により切除し、アガロースゲルから単離し、同様に切断 したpC6Lに連結して、ALVACのC6座への組換えのために、それぞれプ ラスミドpC6P24FSおよびpC6P24FNSを産生じた。産生じた組換 え体をそれぞれvcP189およびvcP195と称した。
pMNTIP24およびpMN24EV3TINsAからのBarnHI/Xh oI断片を、同様に切断したpSD550VC(実施例33で定義)に連結し、 それぞれvP1117およびvPllloを産生するNYVACのH4座への組 換えのために、p14P24Fsおよびp14P24FNSを産生じた。
同種タンパク質(グツト等、1987)および異種タンパク質(フランシス等、 1987)からの様々なThエピトープの添加により、合成ペプチドワクチンに 対する特異的B細胞応答のためにT細胞の援助を回復できるかもしれないことが 提案されている。HIV−1抗原に対して増大した免疫応答を誘発する努力にお いて、HIV−1から誘導した様々なT細胞エピトープを組換えポックスウィル スに含有せしめた。さらにこの戦略を追及するために、他の既知のヒトTヘルパ ー細胞エピトープ(ホ等、1990)を含有する破傷風毒素断片CもALVAC 組換え体中のHIV−1抗原とともに共発現せしめる。破傷風毒素からのこれら のエピトープの存在は、非特異的T細胞の援助を提供することによりHIV−1 に対する免疫応答を増大するかもしれない。
Pstl/SmaI切断pC6P24FS (上記)を、プラスミドpVQ42 KTH4,1(上記)からのPstI/Smal断片と連結することにより修飾 し、pC6P24FSVQを産生した。このプラスミドを、H6プロモーター内 のNru Iおよび3′末端でのXhoIで切断し、同様に切断したpH6TE TC(上記)から単離した1゜4kb断片に連結した。産生じたプラスミドpC 6VQTETCを、クローニング部位を囲む領域の制限切断およびヌクレオチド 配列分析により確認した。確認の後に、pC6VQTETCを、vcP112、 vcP125およびVCP156による組換え実験に用いた。
ヒトにおけるNYVAc/HIV−1およびALVAC/HIV−1構成物の免 疫原性に関する広域の問題が臨床試験の状況内で最も扱われているが、多くの適 切な洞察がin vitro細胞応答アッセイによりすでに収集されている。ヒ トにおけるこれらのワクチン構成物の使用に関する主な問題は、細胞抗HIV− 1反応性、特に細胞障害性Tリンパ球(CTL)応答に強い影響を与える能力で ある。防止的なまたは治療上のワクチン方法の成分のいずれかとして、ヒトにお ける多くのウィルス感染のCTLのための有益な役割を示唆する十分な先例があ る(マツクマイケル等、1983 、モス等、1987 、ポリシーウィッツ等 、1988)。ウィルス感染の防止または制御における抗HIV−ICTLの正 確な貢献は説明されたままであるが、SIV/マカク動物モデルを用いたレトビ ンと協力者による研究は、抗5IV−I CTL、特にgag特異的CTLは、 病気の経過を制御する主要な決定要因であることを示唆している(レトビンおよ びキング、1990)。このことは、抗H1v−i CTl−活性が、比較的高 率の無症候性患者の新鮮な末梢血単核細胞(PBMC)から直接測定できる(ウ ォーカーおよびブラタ、1990;オートラン等、1991において調査)とい う、多くの発明者の観察と結び付き、抗HIV−OI CTL反応性の誘発は、 予防および治療ワクチンの両者の主要目的として含むべきであると言う論点を支 持している。
適切なCTL反応性に強い影響を与える、NYVAC/HIV−1およびALV AC/HIV−1構成物の能力を試験するために、検出可能な直接の抗HIV− 1gI)i60 CTL反応性のないHIV−1感染患者の同齢集団に関連する 一連の実験を行なった。これらの患者からPBMCを得て、PBMCの一部を、 完全複製応答ワクシニア/ g p 160構成物vPE16 (ウォーカー等 、1987)、または複製弱毒化NYVAC/gp160もL<l;!ALVA C/gp160構成物のいずれかで感染せしめた。激しく感染したPBMCを洗 浄し、10日in vitro刺激プロトコルにおける残りのPBMCの刺激器 として用いた。対照は、未刺激培養物および対照ベクター(すなわち、HIV− 1遺伝子のない親ポックスウィルス)刺激培養物の両方を含んだ。外因性I L −2の不在の10日培養後、細胞を洗浄し、対照ワクシニアウィルス、vSC8 、またはワクシニア/gp160 vPE16構成物のいずれかに感染した自己 由来の8928球細胞系統(B L CL)に対するCTL活性について評価し たらさらに、マイクロスフイア選別を用いたCDS+細胞の表現型欠失を平行し て行なった。第11図に示したこれらの研究の結果は、未刺激培養物または対照 ベクター刺激培養物は、HI V−1gp160標的BLCLに対して検出可能 なCTL活性を有さず、HIV−1gp160構成物のいずれかで刺激した培養 物は、高水準の抗gp160細胞障害活性を有し、その全てはCDS+細胞の除 去後になくなり、それゆえ、CTL活性の出現と一致した。おそらく、これらの 研究に見られた最も著しい観察は、NYVAC/gp160およびALVAC/ gp160刺激培養物におけるCTL応答の大きさが、全複製応答vPE16感 染PBMCにより刺激された培養物におけるよりも大きいという矛盾のない発見 であツタ。NYVAC/gp 160およびALVAC/gl)160によるC TL刺激におけるこの明らかな増大は、vPE16また1tNYVACおよびA LVACベクターc7)弱毒特性と比較した組換え体による発現の差異によるも のであるか否かは知られていない。
より完全に、誘発されたエフェクター細胞表現型を同定するために、様々な刺激 培養物の延長流動血球計算分析を行なった。未刺激培養物または対照ベクター刺 激培養物のいずれかと比較した場合、抗gp160細胞障害反応性の発生は一般 的に、CD3+/CD4+サブ個体における減少およびCD3”/CD8+細胞 における代償上昇となる。
CD3“ /CD25’ S CD3+ /HLA−DR” 、CD8′/56 F1“、CD8+/CD38+、およびCD3+/CD69’細胞における著し い増大もまた注意されたい。各培養物の細胞障害活性を特定の細胞サブ個体にお ける増大に対してプロットした場合、細胞抗gpiso反応性とCD8°/36 F1“個体における増大との間に線形関係が見られた。この細胞表現型は大まか にCTLを定義する(モリモト等、1987)。
HIV−1感染患者からの細胞に関するこれらの初期の予備臨床研究は明確に、 患者のPBMCプール内に含まれる前駆体個体群からの能力のあるCTL活性を 誘発するNYVACおヨヒA L VA C/HI V−1ベクターノ能力ヲ説 明している。さらに、これらの研究は、治療ワクチン方法の状況におけるこれら ベクターの潜在的な臨床使用を強く例示している。これは、これらベクターによ る1つの免疫化の形態を取るか、または細胞標的および再注入のexvivo成 分もしくは大規模の養子免疫伝達後のexvi−voCTL産生を含みえた。い ずれの場合においても、非複製ベクターの共同安全性およびその固有の強い細胞 免疫原性が、ヒトにおける免疫ベースの治療の理想の候補とする。
本発明の好ましい実施態様を詳細に記載したが、添付した請求の範囲に定義した 本発明は、上記記載に述べた特定の詳細に限定されず、本発明の精神と範囲から 逸脱せずに多くの変更が可能であることが理解されよう。
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DK、ES、FR,GB、GR,IT、LU、MC,NL、 SE)、 AU、  CA、JP、 KR(72)発明者 タータグリア、ジェームズアメリカ合衆 国 ニューヨーク州 12303シエネクタデイ クリスティーナ ドライヴ  7 (72)発明者 コックス、ウィリアム アイアメリカ合衆国 ニューヨーク州  12180トロイ ワシントン プレース 1

Claims (21)

    【特許請求の範囲】
  1. 1.修飾組換えウイルスであって、該修飾組換えウイルスが、該ウイルスが弱毒 化された毒性を有するように不活化された可欠ウイルスコード遺伝機能を有し、 前記組換えウイルスゲノムの可欠領域中の免疫不全ウイルスからのDNAよりな ることを特徴とする修飾組換えウイルス。
  2. 2.前記ウイルスがポックスウイルスであることを特徴とする請求の範囲第1項 記載のウイルス。
  3. 3.前記ポックスウイルスがワクシニアウイルスであることを特徴とする請求の 範囲第2項記載のウイルス。
  4. 4.前記遺伝機能が、毒性因子をコードする読取り枠を欠失することにより不活 化されることを特徴とする請求の範囲第3項記載のウイルス。
  5. 5.前記遺伝機能が、毒性因子をコードする読取り枠の挿入不活化により不活化 されることを特徴とする請求の範囲第3項記載のウイルス。
  6. 6.前記読取り枠が、J2R、B13R+B14R、A26L、A56R、C7 L−KlL、14しおよびそれらの組合せからなる群から選択されることを特徴 とする請求の範囲第4項記載のウイルス。
  7. 7.前記読取り枠が、J2R、B13R+B14R、A26L、A56R、C7 L−KlL、14しおよびそれらの組合せからなる群から選択されることを特徴 とする請求の範囲第5項記載のウイルス。
  8. 8.前記免疫不全ウイルスからのDNAが位置する組換えウイルスゲノムの可欠 領域が、J2R、B13R+B14R、A26L、A56R、C7L−KlL、 14しおよびそれらの組合せからなる群から選択されることを特徴とする請求の 範囲第4項記載のウイルス。
  9. 9.前記免疫不全ウイルスからのDNAが位置する組換えポックスウイルスゲノ ムの可欠領域が、J2R、B13R+B14R、A26L、A56R、C7L− K1L、I4Lおよびそれらの組合せからなる群から選択されることを特徴とす る請求の範囲第5項記載のウイルス。
  10. 10.前記免疫不全ウイルスがヒト免疫不全ウイルスであることを特徴とする請 求の範囲第3項記載のウイルス。
  11. 11.vP911、vP921、vP878、vP939、vP940、vP9 20、vP922、vP1008、vP1004、vP1020、vP1078 、vP994、vP1035、vP969、vP989、vP991、vP99 0、vP970、vP973、vP971、vP979、vP978、vP98 8、vP1009、vP1062、vP1060、vP1061、vP1084 、vP1045、vP1047、またはvP1044であることを特徴とする請 求の範囲第10項記載のウイルス。
  12. 12.前記免疫不全ウイルスがシミアン免疫不全ウイルスであることを特徴とす る請求の範囲第3項記載のウイルス。
  13. 13.vP873、vP948、vP943、vP942、vP952、vP1 042、vP1071またはvP1050であることを特徴とする請求の範囲第 12項記載のウイルス。
  14. 14.弱毒化された毒性を有し、アビポックスウイルスゲノムの可欠領域中に免 疫不全ウイルスからのDNAを含有するすることを特徴とする組換えアビポック スウイルス。
  15. 15.前記免疫不全ウイルスがヒト免疫不全ウイルスであることを特徴とする請 求の範囲第14項記載の組換えアビポックスウイルス。
  16. 16.前記アビポックスウイルスがカナリアポックスであることを特徴とする請 求の範囲第15項記載の組換えアビポックスウイルス。
  17. 17.前記アビポックスウイルスが鶏痘であることを特徴とする請求の範囲第1 5項記載の組換えアビポックスウイルス。
  18. 18.vCP95、vCP112、vCP60、vCP61、vCP125、v CP124、vCP126、vCP144、vCP120、vCP138、vC P117、vCP130、vCP152、vCP155、vCP156、vCP 146、vCP148、vCP154、vCP168、vCP153またはvC P172であることを特徴とする請求の範囲第14項記載のヒト免疫不全ウイル ス組換えカナリアポックスウイルス。
  19. 19.vFP62、vFP63、またはvFP174であることを特徴とする請 求の範囲第17項記載のヒト免疫不全ウイルス組換え鶏痘ウイルス。
  20. 20.ワクチン接種した宿主動物中で免疫応答を誘発するワクチンであって、該 ワクチンが担体と請求の範囲第3項記載の組換えウイルスとからなることを特徴 とするワクチン。
  21. 21.ワクチン接種した宿主動物中で免疫応答を誘発するワクチンであって、該 ワクチンが担体と請求の範囲第14項記載の組換えウイルスとからなることを特 徴とするワクチン。
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