JPH0662855A - プロテアーゼおよび関連dna化合物 - Google Patents

プロテアーゼおよび関連dna化合物

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JPH0662855A
JPH0662855A JP5125760A JP12576093A JPH0662855A JP H0662855 A JPH0662855 A JP H0662855A JP 5125760 A JP5125760 A JP 5125760A JP 12576093 A JP12576093 A JP 12576093A JP H0662855 A JPH0662855 A JP H0662855A
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 アミロイド前駆体タンパク質を切断する新規
プロテアーゼ、およびそれに関連する核酸化合物を提供
する。 【構成】 アミロイド前駆体タンパク質を切断するプロ
テアーゼタンパク質および関連核酸化合物を提供する。
このプロテアーゼはアミロイド前駆タンパク質のMet
596−Asp597の位置でこのタンパク質を切断する。こ
れらの化合物の生産方法、物質、および検定方法を提供
する。本発明の化合物はアルツハイマー病およびダウン
症候群のような神経疾患の特徴を明らかにするのに有用
である。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【従来の技術】β−アミロイドペプチド(β/A4)と
して知られている42〜43残基のペプチドがアルツハ
イマー病およびダウン症候群に関与している。研究者ら
は、この4キロダルトン(kd)のタンパク質の脳内異常
蓄積がアミロイド前駆体タンパク質(APP)と呼ばれ
る一層大きい前駆体タンパク質の切断に起因していると
仮定した。正常なAPPの切断はA4領域内で起こるの
で、これと異なった切断事件は正常な完全鎖長が生じた
ときに起こることが判る。β/A4のアミノ末端残基は
アスパラギン酸(ASP)であることが最も多く、従っ
てこれらの事実は、APPの596位のメチオニン(M
et)[Met596、J.カン(Kang)らのアミノ酸番号表
示方法(ネーチャー(Nature)、325巻、733頁(1
987年))を用いる]とAsp597の間で切断するプロ
テアーゼがアミロイドを生成することを示している。従
ってAPPを切断してβ/A4を生成するプロテアーゼ
はアルツハイマー病およびダウン症候群の特徴を明らか
にする重要な手段である。
【0002】従来、研究者らは古典的なタンパク質精製
技術を利用することによって、異常な切断事件の特徴を
明らかにしようと企ててきた。これらの研究の結果、合
成ペプチドのMet−Asp結合を切断する部分的に精
製された68キロダルトンのプロテアーゼが報告された
[C.アブラハム(Abraham)ら、ニューロバイオロジー・
オブ・エージング(Neurobiology of Aging)、11A
巻、303頁(1990年)]。1991年にアブラハ
ムおよびその共同研究者らは68kdプロテアーゼの切断
パターンを既知のセリンプロテアーゼ類と比較した[C.
アブラハムら、バイオケミカル・アンド・バイオフィジ
カル・リサーチ・コンミュニムケーションズ(Biochemic
al and Biophysical Research Communications)、17
4巻、790頁(1991年)]。その後、以前の研究
で観察した活性が、実際は2つの独立したプロテアーゼ
の作用であることが同じ研究者らによって報告された。
その1つはカルシウム依存性セリンプロテアーゼであ
り、もう1つはシステイン・メタロプロテアーゼである
ことが確認された[C.アブラハムら、ジャーナル・オブ
・セルラー・バイオケミストリー(Journal of Cellular
Biochemistry)、15巻、115頁(1991年)、
C.アブラハムら、ジャーナル・オブ・ニューロケミス
トリー(Journal of Neurochemistry)、57巻、510
9頁(1991年)]。これらのプロテアーゼの構造ま
たは特性については報告されなかった。
【0003】
【発明が解決しようとする課題】本発明は、以前に報告
された酵素類とは構造的に異なり、APPの切断によっ
て、Met596−Asp597切断が期待される大きさのア
ミロイド原性断片を生じる新規酵素を提供する。従って
新規酵素はアルツハイマー病およびダウン症候群の特徴
をさらに明らかにするのに極めて有用である。そのうえ
本発明を利用することによって、これらの疾患およびそ
の他の関連疾患の処置をもたらし得る。
【0004】現在までのところ痴呆そのものが完全に証
明されるまで、ヒトでアルツハイマー病を診断する満足
すべき手段はなかった。アルツハイマー病によって痴呆
が起こったと確認するには、患者の脳の死後剖検が必要
である。本発明では、患者がまだ生存している間に、ア
ルツハイマー病の患者またはアルツハイマー病の発病傾
向をもつ患者を決定する手段を提供する。
【0005】
【課題を解決するための手段】本明細書の記載内容を明
白にし、本発明の理解を助ける目的のため、下記の事項
について定義する。
【0006】「293細胞」とは、グラハムらが報告し
た広く入手可能な形質転換したヒト初代胎児性腎細胞系
[F.L.グラハム(Graham)ら、ジャーナル・オブ・ジェ
ネラル・バイロロジー(Journal of General Virolog
y)、36巻、59〜72頁(1977年)]をいう。こ
の細胞系は、例えばジ・アメリカン・タイプ・カルチャ
ー・コレクション(the American Type Culture Collect
ion)、12301、パークローン・ドライブ(Parklawn
Drive)、ロックビル(Rockville)、マリーランド(Maryla
nd)、10852−1776(ATCC)から、受入番
号ATCC CRL1573のもとに入手し得る。
【0007】「AV12細胞」とは、受入番号ATCC
CRL9595のもとにATCCから入手し得る別の
広く入手可能な細胞系をいう。
【0008】「アミロイド原性断片」とは、β/A4ペ
プチドを含有しているAPP断片をいう。
【0009】「配列番号1の機能的な化合物」とは、A
PPを切断できる配列番号1を含んでいる化合物をい
う。
【0010】「クニッツ様ドメイン」とは、大豆トリプ
シンインヒビターと類似のプロテアーゼインヒビター、
または大豆トリプシンインヒビターと類似のプロテアー
ゼインヒビターを暗号化している核酸配列をいう。例え
ばP.ポンテ(Ponte)ら[ネーチャー、331巻、525
頁(1988年)]、またはR.E.タンジ(Tanzi)ら[ネ
ーチャー、331巻、528頁(1988年)]、また
はN.キタグチら[ネーチャー、331巻、530頁(1
988年)]が報告したAPPのクニッツ・プロテアー
ゼインヒビター(KPI)領域はクニッツ様ドメインで
ある。
【0011】「pRc/ザイム(Zyme)」とは、修飾した
pRc/CMV真核性発現ベクターをいい、pRc/C
MVベクターは商業的に入手可能である[インビトロジ
ェン・コーポレーション(Invitrogen Corporation)、3
985、ソレント(Sorrent)、バレイ(Valley)Blv
d.、シュート(Suite)B、サンジエゴ(San Diego)、カ
リフォルニア(California)、92121]。プラスミド
pRc/ザイムはヒト・シトメガロウイルスプロモータ
ーおよびエンハンサー、ウシ成長ホルモン・ポリアデニ
ル化シグナル、ネオマイシン耐性遺伝子、エシェリキア
・コリ(E. coli)におけるアンピシリン耐性マーカーと
して有用なβ−ラクタマーゼ遺伝子、およびその他の多
数の特徴(1991年、インビトロジェン社カタログ、
29頁)および全ザイムのコード領域を含んだ1451
塩基対のNotI/SalI挿入体を含んでいる。
【0012】「pSザイム(pSZyme)」とは、修飾したエ
シェリキア・コリ・クローニングベクターpSPORT
−1(商標)[E.Y.チェン(Chen)ら、DNA、4巻、
165頁(1985年)]をいい、プラスミドpSPO
RT−1(商標)は商業的に入手可能である[ギブコ(Gi
bco)−BRL社、8400、ヘルガーマン・コート(Her
german Court)、ガイザースバーグ(Gaithersburg)、マ
リーランド、20877]。このプラスミドはpUCベ
クターからの複製開始点を含んでいる。このプラスミド
はC.ヤニッシュ・ペロン(Yanisch-Perron)ら[ジーン(G
ene)、33巻、103〜119頁(1985年)]に報
告されており、アンピシリン耐性を付与するβ−ラクタ
マーゼ遺伝子、ザイムの全コード領域を含んだ1451
塩基対のNotI/SalI挿入体、およびその他の特
徴を含んでいる。
【0013】「配列番号1の一部」とは、配列番号1の
少なくとも6個の連続したアミノ酸残基をいう。
【0014】「mRNA」とは、イン・ビトロまたはイ
ン・ビボの何れかで転写されたリボ核酸(RNA)をい
い、例えばRNAポリメラーゼによるDNA暗号配列の
転写によってイン・ビトロで調製されたRNA転写物を
含む。
【0015】「配列番号1または機能的なその等価物」
とは、配列番号1、または配列番号1のアミノ酸配列の
保存的な変化物をいい、ここでその保存的変化とは、配
列番号1と実質的に同一な生物学的、生化学的、化学
的、物理学的、および構造的品質を示す化合物を生じ
る。
【0016】「配列番号3」とは、以下に示すDNA配
列をいう。
【化3】ATG GCT GGC GGC ATC ATA GTC AGG G
【0017】「配列番号4」とは、以下に示すDNA配
列をいう。
【化4】AAC CGA ATC TTC AGG TCT TCC TGG GG
【0018】「配列番号5」とは、以下に示すDNA配
列をいう。
【化5】TCG CTC TCT CCT GGG GAC ACA GA
【0019】「配列番号6」とは、以下に示すDNA配
列をいう。
【化6】CCA GGT GCT ATT CCA TGT ATG TCA TAG
【0020】「配列番号7」とは、以下に示すDNA配
列をいう。
【化7】TCT GTG TCC CCA GGA GAG AGC GA
【0021】「配列番号8」とは、以下に示すDNA配
列をいう。
【化8】ATA GTG AAG CTG TCT TCT CAA T
【0022】「トランスフェクション」とは、宿主細胞
ゲノムへの核酸の組込みを伴ない、または伴なわない宿
主細胞への核酸の任意の伝達をいう。
【0023】「ザイム」とは、配列番号1のアミノ酸配
列、またはその機能的な等価物をいう。
【0024】「ザイム関連バンドの立体配置」とは、本
明細書に記載した制限断片多型の2種のバンド立体配置
から選ばれた2種のバンド配置のうちの1つをいう。一
方のパターンは2400塩基対バンドを示すが、250
0塩基対バンドを示さない。他方のパターンは2500
塩基対バンドを示すが、2400塩基対バンドを示さな
い。
【0025】本発明は、下記の配列:
【化9】 [以下、配列番号1という]で示されるアミノ酸配列、ま
たは機能的なその等価物を含むアミノ酸化合物を提供す
る。特に配列番号1であるアミノ酸化合物は好ましい。
【0026】当業者であれば、配列番号1の若干の変更
がアミノ酸化合物の働きを変え得ないことを認めるであ
ろう。例えばある疎水性アミノ酸は他の疎水性アミノ酸
と交換し得、類似の側鎖をもつアミノ酸は互いに交換し
得、塩基性アミノ酸は他の塩基性アミノ酸と交換し得、
酸性アミノ酸は他の酸性アミノ酸と交換し得、小型アミ
ノ酸は他の小型アミノ酸と交換し得、そのほか種々の保
存的な入れ替えを実施し得る。例示したアミノ酸化合物
と実質的に同一の態様で、実質的に同一の働きを付与す
るこれらの変化したアミノ酸化合物も、本発明の範囲に
包含される。
【0027】当業者であれば、このタンパク質が多数の
異なった方法によって合成できることは理解し得よう。
本発明のすべてのアミノ酸化合物は、固相ペプチド合成
法または組換え法等を含む当業界で既知の化学的な方法
によって製造できる。上記の方法はともに米国特許第4
617149号に記載されている。高収量を望むのな
ら、組換え法が好ましい。任意の所望のDNA配列を組
み立てる一般的な方法はブラウンら[ブラウン(Brown)
ら、メソッズ・イン・エンジモロジー(Methods inEnzym
ology)、68巻、109頁(1979年)]によって報
告されている。
【0028】他の生産経路も周知である。真核細胞での
発現は配列番号2を経由して達成できる(後記)。例え
ば配列番号1を暗号化しているDNAを含んでおり、シ
ミアンウイルス40、シトメガロウイルス、またはマウ
ス乳がんウイルスで誘導された発現ベクターを使用し
て、真核細胞でアミノ酸化合物を生産することができ
る。また当業界で周知のように、ある種のウイルスも好
適なベクターである。例えばアデノウイルス、ワクシニ
アウイルス、ヘルペスウイルス、バキュロウイルスおよ
びラウス肉腫ウイルスは有用である。そのような方法は
米国特許第4775624号に報告されている。発現に
関する数種の別法が、サンブルックら[J.サンブルック
(Sambrook)ら、モレキュラー・クローニング(Molecular
Cloning)、ア・ラボラトリー・マニュアル(A Laborato
ry Manual)、第16および17章(1989年)]によ
って報告されている。
【0029】本発明の別の実施態様では、配列番号1を
暗号化している核酸配列を含んだ核酸化合物を包含す
る。当業者であれば理解し得るように、本発明のアミノ
酸化合物は大部分のアミノ酸が1組以上の核酸トリプレ
ットによって暗号化されている遺伝コードの同義性のた
め、多数の異なった核酸配列によって暗号化できる。そ
れらの入れ替わった核酸配列は同一のアミノ酸配列を暗
号化しているから、本発明はさらにこれらの入れ替わっ
た核酸配列を包含する。好ましくは核酸化合物は、DN
A、センスまたはアンチセンスmRNAである。ザイム
を暗号化しているDNA化合物の最も好ましい具体例
は、下記の配列:
【化10】 [以下、配列番号2という]を有するものである。ただし
センスおよびアンチセンスmRNAである核酸化合物も
好ましい。
【0030】本発明はまた、配列番号1または機能的な
その等価物を暗号化した核酸を含んでいる核酸ベクター
を提供する。好ましい核酸ベクターはDNAである核酸
ベクターである。最も好ましいものは、配列番号2であ
るDNA配列を含んでいるDNAベクターである。特に
好ましいDNAベクターはプラスミドpSザイムであ
る。
【0031】エシェリキア・コリ/pSザイムは配列番
号2を含んだクローニングベクターを含んでいるが、こ
の株をザ・ノーザン・レジオナル・リサーチ・ラボラト
リーズ(The Northern Regional Research Laboratorie
s)(NRRL)、アグリカルチュラル・リサーチ・サー
ビス(Agricultural Research Service)、U.S.デパー
トメント・オブ・アグリカルチャー(U.S. Department o
f Agriculture)、ペオリア(Peoria)、イリノイズ(Illin
ois)、61604に寄託し(1992年4月29日)、
NRRL B−18971の受入番号のもとにその保存
培養株の一つとして貯蔵された。配列番号2は、例えば
1451塩基対のNotI/SalI制限断片としてプ
ラスミドから単離できる。その他の断片も配列番号2を
得るのに有用である。
【0032】またDNA配列は、ABS[アプライド・
バイオシステムズ(Applied Biosystems)、850、リン
カーン・センタードライブ(Lincoln Centre Drive)、フ
ォスターシティー(Foster City)、CA、94404]3
80B DNAシンセサイザーのような商業的に入手可
能な自動DNAシンセサイザーを使用して合成すること
ができる。またDNA配列は、米国特許第488981
8号に報告されたポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によ
って生産することができる。
【0033】またこれらのベクターの制限断片も提供さ
れる。好ましい断片は、pSザイムの1451塩基対の
NotI/SalI制限断片、803塩基対のBsrB
I/Esp3I制限断片、および815塩基対のEco
NI/BfaI制限断片である。
【0034】さらに本発明のDNAベクターは好ましく
は配列番号2、または機能的なその対応物の発現を推進
させる位置にプロモーターを含む。プロモーターがヒト
胎児性腎細胞(293細胞)、AV12細胞、酵母細
胞、またはエシェリキア・コリ(Escherichia coli)細胞
で機能するようなベクターが好ましい。最も好ましいD
NA発現ベクターはプラスミドpRc/ザイムである。
【0035】標準的な手技を用いてエシェリキア・コリ
から単離できるプラスミドpSザイムを容易に修飾し
て、例えばエシェリキア・コリ、サッカロマイセテス(S
accharomycetes)科に属する酵母、スポドプテラ(Spodop
tera)属のフォール・アーミーウオーム(fall armyworm)
の卵巣に由来するSf9細胞(バキュロウイルス発現系
の宿主として普通に使用される)等を含むさまざまな生
物で、ザイムを生産する発現ベクターを組み立てる[こ
れらの手技については、例えばサンブルックら(前掲)
参照]。
【0036】現在の文献はAV12発現ベクターを組み
立て、AV12宿主細胞をトランスフェクトする技術を
含んでいる(例えば米国特許第4992373号参
照)。また現在の文献は293発現ベクターを組み立
て、293宿主細胞をトランスフェクトする多数の技術
を含んでいる。
【0037】必要であれば周知の技術を用い、単に好適
な調節要素を置き換えることによって、293細胞を利
用する組立てのプロトコールをその他の細胞系の類似の
ベクター組立てに応用することができる。使用し得るプ
ロモーターは、例えばチミジンキナーゼプロモーター、
メタロチオニンプロモーター、熱ショックプロモータ
ー、免疫グロブリンプロモーター、またはマウス乳がん
ウイルスプロモーター、SV40プロモーター、ヘルペ
スウイルスプロモーター、BKウイルスプロモーターの
ような種々のウイルスプロモーター等が挙げられる。さ
らに「共通」配列から誘導し、または他のプロモーター
のハイブリッドとして作り出して人工的に組み立てたプ
ロモーターも本発明を実施する過程で使用し得る。
【0038】また本発明のDNA化合物はプライマーお
よびプローブを含む。配列番号1、またはその一部を暗
号化している少なくとも18個連続した塩基対からなる
核酸化合物は本発明に包含される。DNAであるプロー
ブまたはプライマーは好ましい。最も好ましいプローブ
またはプライマーは配列番号3および配列番号4であ
る。当業者にとって、プローブおよびプライマーに関連
する技術が周知であることは明白であろう。
【0039】例えば配列番号3または配列番号4の全部
または一部を、暗号配列へハイブリッド形成するのに使
用し得る。ついで周知の技術を用いるポリメラーゼ連鎖
反応(PCR)増幅を用いて、完全鎖長の配列を生産で
きる。ついで完全鎖長の配列を任意の最も適したベクタ
ーへサブクローンすることができる。
【0040】別法として、通常の手段によってcDNA
ライブラリーをスクリーニングするため、配列番号3ま
たは配列番号4を5'末端で放射能で標識し得る。また
結合したmRNA転写物を逆転写するため、フィルター
へ結合したザイム暗号化DNAの任意の一片を全mRN
A転写物で飽和し得る。
【0041】プライマーおよびプローブは当業界周知の
手段によって入手し得る。例えばpSザイムを単離した
ら、制限酵素およびそれに続くゲル分離を用いて、最も
適した断片を単離し得る。
【0042】本発明のもう1つの態様は、ザイムのゲノ
ムクローンである。好ましいゲノムクローンは、配列番
号1を暗号化しているDNA断片とハイブリッド形成す
るヒト染色体19ライブラリーからの4.0キロベース
のHindIII断片である。これは、配列番号2または
その一部とのハイブリダイゼーションによって得ること
ができる。例えば配列番号3および配列番号4を放射能
標識し、ついで対応するゲノムDNAを同定し、単離す
るために、染色体19ライブラリーをプローブするのに
使用し得る。
【0043】本発明はまた、ドナーのヒトDNAを
(1)制限酵素TaqIで消化し、(2)標識したザイ
ムDNAとハイブリッド形成して、ザイム関連バンドの
形態(立体配置)を明らかにし、(3)アルツハイマー
病の症状を示し、またはかって症状を示したことがある
ドナー家族の構成員の、同様に消化しハイブリッド形成
したバンドの形態と比較することからなるアルツハイマ
ー病の診断検定を提供する。好ましくはアルツハイマー
病の診断検定では、ドナーのヒトDNA供給源として血
液試料を利用する。
【0044】ゲノムDNAが本発明で提供され、ザイム
関連制限断片鎖長の多型が本発明の開示によって確認さ
れるから、この操作の残りの部分は当業界既知の方法に
よって達成し得る。例えば米国特許第4666828号
には、これらの操作が記載されている[例えばB.リュー
イン(Lewin)、ジーンズ(Genes)、78頁(1987
年)、レビュー・レストリクション・フラグメント・レ
ングス・ポリモルフィズム・テクニクス・アンド・セオ
リー(review restriction fragment length polymorphi
sm techniques and theory)のような多数の参考文献が
ある]。
【0045】本発明によって提供された核酸を内蔵して
いる宿主細胞は、本発明の範囲に包含される。好ましい
宿主細胞は卵母細胞である。好ましい卵母細胞は、本発
明のセンスmRNAまたはDNA化合物を注入したもの
である。一層好ましい卵母細胞は、本発明のセンスmR
NAまたはDNA化合物を、APPを暗号化しているD
NAまたはmRNAとともに注入したものである。最も
好ましい本発明の卵母細胞はセンスmRNAを注入した
ものである。
【0046】それ以外の好ましい宿主細胞は、配列番号
2を含んだベクターでトランスフェクトしたものであ
る。配列番号2をトランスフェクトした好ましい宿主細
胞としては、293細胞、AV12細胞、酵母細胞、お
よびエシェリキア・コリ細胞等が挙げられる。最も好ま
しい293およびエシェリキア・コリの宿主細胞は、2
93/pRc/ザイム、エシェリキア・コリ/pSザイ
ムである。
【0047】同様に好ましい宿主細胞は、配列番号2を
含んでいるDNAベクターとAPPの暗号配列を含んで
いるDNAで同時トランスフェクトしたものである。2
93細胞、AV12細胞、酵母細胞、およびエシェリキ
ア・コリ細胞は特に有用な同時トランスフェクトの宿主
細胞である。
【0048】卵母宿主細胞はリューベルトらが報告した
方法に従って組み立てることができる[リューベルト(Lu
ebbert)ら、プロシーディングズ・オブ・ザ・ナショナ
ル・アカデミー・オブ・サイエンシズ(USA)(Proce
edings of the National Academy of Sciences (US
A))、84巻、4332頁(1987年)]。APPを暗
号化しているDNAまたはRNA(ともに695および
751アミノ酸の形)はセルコエらの報告に従って入手
し得る[セルコエ(Selkoe)ら、プロシーディングズ・オ
ブ・ザ・ナショナル・アカデミー・オブ・サイエンシズ
(USA)、85巻、7341頁(1988年)]。そ
の他の宿主細胞のトランスフェクションは当業界周知の
ものである。細胞の同時トランスフェクションは標準的
な手技を用いて達成し得る[例えばゴーマン(Gorman)
ら、モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジー(M
olecular and Cellular Biology)、2巻、1044頁
(1982年)参照]。
【0049】従って本発明はまた、配列番号1を発現で
きる宿主細胞を組み立てる方法を提供する。その方法
は、配列番号1を暗号化したDNA配列を含んでいるD
NAベクターで宿主細胞をトランスフェクトすることか
らなる。好ましい方法では293細胞を宿主細胞として
使用する。この293細胞は受入番号ATCC CRL
1573のもとにATCCから入手し得る。別の好まし
い方法としては、AV12細胞を宿主細胞として使用す
る。AV12細胞は受入番号ATCC CRL9595
のもとにATCCから入手し得る。別の好ましい方法で
は、サッカロマイセテス科に属する酵母細胞、または細
菌エシェリキア・コリを宿主細胞として使用する。
【0050】好ましい方法では293細胞で配列番号2
を含んでいる発現ベクターを利用する。この目的のため
特に好ましいものはpRc/ザイムである。
【0051】別の好ましい方法は、(a)配列番号2を
含んでいるDNAベクター、および(b)APP暗号配
列を暗号化しているDNA発現ベクターからなる。最も
好ましい方法では、DNAベクターpRc/ザイムを利
用する。トランスフェクトした宿主細胞を、配列番号1
が発現されるような当業者周知の条件下で培養し、この
ようにしてトランスフェクトした宿主細胞内でザイムを
生産し得る。
【0052】また本発明は、本発明のプローブと相同な
DNAを同定する方法を提供する。この方法は、ハイブ
リッド形成条件下で試験核酸をプローブと組み合わせ、
ハイブリッド形成する試験核酸を同定することからな
る。この方法で使用する好ましいプローブは、配列番号
3および配列番号4である。ハイブリダイゼーション技
術は当業界周知のものである[例えばサンブルックら
(前掲)参照]。
【0053】また本発明によって提供された化合物を利
用する検定も本発明の範囲に包含される。提供された検
定は、物質がザイムのリガンドであるかどうかを決定す
るものであって、その方法は、ザイムを物質と接触さ
せ、物理的に検出可能な手段によってザイム活性をモニ
ターし、ザイムと相互作用し、またはザイムに影響を与
える物質を同定する方法からなる。
【0054】本発明の好ましい検定は、細胞培養検定、
高速液体クロマトグラフィー(HPLC)検定、または
合成競合検定である。
【0055】好ましい細胞培養検定は、ザイムおよびA
PPを暗号化している核酸を同時発現する卵母細胞、A
V12細胞、エシェリキア・コリ細胞、酵母細胞、また
は293細胞を使用する。好ましい同時発現細胞培養検
定は293/pRc/ザイムを利用するものである。好
ましい検定は酵母細胞とAPPのアミノ酸587〜60
6を暗号化しているDNA化合物を利用する。ザイム暗
号化DNAおよびMet596/Asp597切断部位コドン
を含んだAPP暗号化DNAを使用した酵母検定を実施
する1方法が報告されている[スミス(Smith)およびコホ
ーン(Kohorn)、プロシーディングズ・オブ・ザ・ナショ
ナル・アカデミー・オブ・サイエンシズ、USA、88
巻、5159頁(1991年)]。
【0056】最も好ましい卵母細胞検定はmRNAを同
時発現する。最も好ましい細胞培養検定はウエスタンブ
ロット分析、または物理学的に検定可能な手段として放
射能標識したAPPを使用する。好ましいHPLC検定
では、基質として完全鎖長の真核細胞で誘導したAPP
を利用する。
【0057】最も好ましい合成競合検定は、物質がクニ
ッツ様ドメイン遺伝子生産物とザイムへの結合を競合す
るものである。最も好ましいザイム/クニッツドメイン
競合検定は、APPを放射性同位元素で標識したもので
ある。
【0058】細胞培養検定はアウスベルらによって詳細
に報告された方法に従って達成され得る[F.アウスベル
(Ausubel)ら、カレント・プロトコールズ・イン・モレ
キュラー・バイオロジー(Current Protocols in Molecu
lar Biology)、1989年、9.1〜9.5頁]。HPL
C検定は主としてヒルズおよびチマシェフが報告した方
法により実施し得る[ヒルズ(Hirs)およびチマシェフ(Ti
masheff)編、メソッズ・イン・エンジモロジー(Methods
in Enzymology)、91巻、第VおよびVI節(1983
年)]。ザイム/クニッツ様ドメイン結合または競合検
定は、ベンネットおよびヤマムラの報告に従って実施し
得る[J.ベンネット(Bennet)およびH.ヤマムラ(Yamamu
ra)、ニューロトランスミッター・レセプター・バイン
ディング(Neurotransmitter Receptor Binding)、19
85年、第3章]。
【0059】本発明はまた、ザイムを同定し、または精
製する方法を提供する。この方法は試験タンパク質を抗
ザイム抗体で飽和し、結合できなかった抗ザイム抗体を
除去し、結合したまま残っている抗ザイム抗体を検出す
ることからなる。抗体イメージング技術は当業界既知の
方法である。
【0060】
【実施例】以下に実施例を挙げて本発明を説明する。実
施例は単に発明を説明するためのものであって、これに
よって本発明の範囲を限定する目的をもつものではな
い。
【0061】実施例1293細胞内におけるザイムの
生産 エシェリキア・コリ・pSザイムの凍結乾燥品のアリコ
ートをザ・ノーザン・レジオナル・リサーチ・ラボラト
リーズ、ペオリア、イリノイズ、USA、61604か
ら受入番号NRRL B−18971のもとに入手し、
下記の方法で、培養として直接使用できた。この培養は
NRRLに寄託された。
【0062】エシェリキア・コリ/pSザイムの培養か
ら塩化セシウム精製によってプラスミドpSザイムを単
離した。ついでプラスミドpSザイムをSalIおよび
NotIで消化した。生じた断片は直線状であった。D
NAリガーゼを使用して、あらかじめ直線化したpRc
プラスミド(商標)(インビトロジェン、カタログ#V
750−20)へこのSalI−NotI断片およびS
alI−HindIIIリンカーをライゲーションした。
【0063】ついで新たに作成した配列番号2を含んで
いるpRc/ザイム・ベクターでコンピテント・エシェ
リキア・コリ細胞をトランスフェクトし、これをアンピ
シリン含有培地で増殖することにより、アンピシリン耐
性遺伝子を含んでいる細胞を選び出した。
【0064】エシェリキア・コリへpRc/ザイム・ベ
クターをトランスフェクトしたのち、pRc/ザイムベ
クターを単離するため、引き続きプラスミド調製品を作
成した。293細胞をpRc/ザイム・ベクターでトラ
ンスフェクトするため、チェンおよびオカヤマが開発し
た方法を用いた[C.チェン(Chen)およびH.オカヤマ(Ok
ayama)、モレキュラー・アンド・セルラー・バイオロジ
ー、7巻、2745頁(1987年)]。これらの細胞
を実施例2で報告する細胞培養検定に使用した。
【0065】293細胞内で安定な形質転換体を生産す
るため、抗生物質G418(ゲネチシン)による選択を
この段階に加えた。ついでG418の存在で生育したコ
ロニーをザイムの供給源として使用した。
【0066】実施例2細胞培養検定 ヒト胎児性腎細胞(293細胞)をpRcザイムとAP
P暗号化ベクターで同時トランスフェクトした。一方の
場合は、695アミノ酸のAPPを暗号化しているベク
ター(クニッツ様ドメインを欠いている)をpRcザイ
ムとともに同時トランスフェクトした。また他方の場合
は、751アミノ酸のAPPを暗号化しているベクター
(クニッツ様ドメインを含む)をpRcザイムともに同
時トランスフェクトした。
【0067】トランスフェクションは標準的なリン酸カ
ルシウム・トランスフェクションを用いて達成した。サ
ンブルックら(前掲)が報告したようなそれ以外のトラ
ンスフェクション・プロトコールでも有効であった。6
95アミノ酸(KPIを含まず)のAPP暗号配列を使
用すると、サンブルックら(前掲)が報告したようなA
PPタンパク質のカルボキシ末端アミノ酸に対する抗血
清を使用するウエスタン・ブロット分析により、アミロ
イド原性断片が検出された。この方法では、オルタース
ドルフら[T.オルタースドルフ(Oltersdorf)ら、ジャー
ナル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー(Journal o
f Biological Chemistry)、265巻、4492〜44
97頁(1991年)]が報告した抗BX6を使用し
た。751アミノ酸(KPIを含む)のAPPを使用す
ると、アミロイド原性断片は検出されなかった。
【0068】実施例3HPLC検定 APPを暗号化しているバキュロウイルスで感染させた
細胞で、完全鎖長のAPPを生産する。この方法は、ク
ノップスらの方法[J.クノップス(Knops)ら、ジャーナ
ル・オブ・バイオロジカル・ケミストリー、266巻、
7285頁(1991年)]によって達成される。つい
で活性ザイムおよび試験化合物の存在でAPPをインキ
ュベートする。そのあとAPP断片を高速液体クロマト
グラフィーによって分離する。それぞれプールした断片
をヒルズおよびチマシェフの方法[ヒルズおよびチマシ
ェフ編、メソッズ・イン・エンジモロジー、91巻、第
VおよびVI節(1983年)]のような標準的な方法を
用いて微量配列決定する。生成したアミロイド原性断片
(Met596またはAsp597の何れかで終わる)の量
を、試験化合物が存在しない場合に生じる量と比較し
て、試験化合物のザイムに与える影響の強さを決定す
る。
【0069】実施例4ザイム/クニッツ様ドメインの
競合検定 APPのKPIドメインのペプチドを合成し、これを同
位元素ヨウ素−125(125I)で標識する。ついでJ.
P.ベンネットおよびH.ヤマムラの方法[ニュウーロト
ランスミッター・レセプター・バインディング、61
巻、(1985年)]に従って、競合結合検定を実施す
る。ついで従来のELISA検定の場合と同様に、ザイ
ムをプラスチック微量滴定板ウエルへ結合させる。この
段階の代表的なプロトコールの1つはF.アウスベルが
報告している[カレント・プロトコールズ・イン・モレ
キュラー・バイオロジー、2巻、11.1〜11.3(1
989年)]。引き続き、放射能標識したKPIドメイ
ンおよび未標識競合化合物を96穴の微量滴定板ウエル
へ添加する。ついでウエルを洗浄する。ザイムに対する
未標識競合化合物の比親和性を計算するため、残留する
同位元素を記録する。
【0070】実施例5ゲノムクローンの単離 カロン21Aバクテリオファージ内のヒト染色体19ゲ
ノムライブラリーに特異的なゲノムライブラリーをアメ
リカン・タイプ・カルチャー・コレクション、1230
1、パークローン・ドライブ、ロックビル、マリーラン
ド、USA20852(ATCC)(カタログ番号57
711)から購入した。これらのファージをエシェリキ
ア・コリK802 recA-宿主株(カタログ番号47
026)へトランスフェクトした。ファージの力価は、
1マイクロリットル当たり6.5〜7.0×104プラー
ク形成単位であった。ザイムを暗号化している遺伝子の
ゲノムクローンを、ファージライブラリーの通常のスク
リーニング[例えばサンブルックら、モレキュラー・ク
ローニング、ア・ラボラトリー・マニュアル、2.6〜
2.114(1989年)参照]によって単離した。
【0071】ポリメラーゼ連鎖反応[例えばショワルタ
ー(Schowalter)およびゾンマー(Sommer)、アナリティカ
ル・バイオケミストリー(Analytical Biochemistry)、
177巻、90〜94頁(1989年)が報告したよう
な]を利用して、EcoRI/NotI精製した[バイオ
・ラド・ラボラトリーズ(Bio-Rad Laboratories)、P.
O.ボックス708、ロックビル・センター(Rockville C
entre)、ニューヨーク(New York)、USA、1157
1、カタログ番号732−6010)pRc−ザイムD
NA断片へ配列番号5および配列番号6のプライマーを
特異的にアニーリングすることにより、放射能標識した
cDNAプローブを合成した。
【0072】ゼータ・プローブ(Zeta-Probe)(商標)・
ブロッティング・メンブランの使用説明書(バイオ・ラ
ド、カタログ番号164−0153)の記載に従い、ハ
イブリダイゼーションおよび洗浄を65℃で実施した。
推定初代ザイム・バクテリオファージをクロロホルム2
〜3滴を含有するSM緩衝液中に貯蔵した。ついで単一
で均質なプラーク(711−4)を3次スクリーンから
単離した。ザイムへのイン・シトウ・ハイブリダイゼー
ションによって陽性であったλ−バクテリオファージD
NAの単離を標準的な手技を用いて達成した。
【0073】精製したλ−ファージ・ザイムDNAをH
indIIIで消化し、1%アガロース/TBE[0.1M
トリス−HCl(pH8.3)、0.1Mホウ酸、1mMエ
チレンジアミン四酢酸]ゲルで電気泳動した。ついで分
離したDNAを、ゼータ・プローブ(商標)使用説明書
の2.5節に記載された非変性条件[0.5×TBE泳動
緩衝液、80ボルト(一定)、1時間]、ついでゼータ
・プローブ(商標)使用説明書の2.8節に記載された
変性条件[0.4M NaOH、10分間]を用いて、ゼー
タ・プローブ(商標)・ブロッティング・メンブラン上
へ移動させた。
【0074】pRc/ザイムのBamHI/XbaI断
片を含んでいる放射能標識したプローブを、ランダム・
プライミングしたDNA標識キット(例えばベーリンガ
ー・マンハイム・コーポレーション(Boehringer Manhei
m Corporation)、9115、へーグ・ロード(Hague Roa
d)、P.O. ボックス 50414、インジアナポリス(I
ndianapolis)、インジアナ(Indiana)、USA、462
50−0414、カタログ番号1004760により商
業的に入手可能である)とともに使用し、本発明のクロ
ーン中に3'暗号配列が見つかるかどうかを測定した。
上記のゼータ・プローブ(商標)・メンブランへ前述の
ようにハイブリダイゼーションおよび洗浄を実施し、オ
ートラジオグラフィーによりザイムの3'領域との相同
性を明らかにした。
【0075】5'ザイムのコード領域を含んでいるファ
ージ711−4を確かめるため、配列番号7および配列
番号8を使用するポリメラーゼ連鎖反応をもう一度利用
してカインツらの方法[カインツ(Kainz)ら、アナリティ
カル・バイオケミストリー、202巻、46頁(199
2年)]に従い、3次プラーク精製した染色体19ザイ
ム・ファージDNAから470塩基対のバンドを増幅し
た。このDNA断片を精製し、ついでpUc19発現プ
ラスミドへ前述のようにサブクローンした。5'ザイム
cDNAコード領域の1〜33配列、および5'ザイム
コード領域の上流の追加的な272ヌクレオチドに対応
するDNA配列の同一性を標準的な手技を用いるDNA
配列分析によって確認した。
【0076】プラスミドの寄託:ブダペスト条約[ザ・
ブダペスト・トリーティー・オン・ジ・インターナショ
ナル・レコグニション・オブ・ザ・デポジット・オブ・
マイクロオーガニズムス・フォア・パーパシズ・オブ・
パテント・プロシデュアズ(the Budapest Treatyon the
International Recognition of the Deposit of Micro
organisms for Purposes of Patent Procedures)]の規
定に従い、下記の培養を、ザ・ノーザン・レジオナル・
リサーチ・センター(NRRL)、アグリカルチュラル
・リサーチ・サービス、U.S.デパートメント・オブ・
アグリカルチャー、1815N. ユニバーシティー・ス
トリート、ペオリア、イリノイズ、61604へその永
久保存株として寄託した。
【0077】 寄託物質 受入番号 エシェリキア・コリK12/pSザイム NRRL B−18971
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.5 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12R 1:91) (72)発明者 エドワード・マリオン・ジョンストン アメリカ合衆国46220インディアナ州イン ディアナポリス、イースト・シックスティ ナインス・ストリート5129番 (72)発明者 シーラ・パークス・リトル アメリカ合衆国46208インディアナ州イン ディアナポリス、ノース・メリディアン・ ストリート4480番 (72)発明者 フランクリン・ハーポルド・ノリス アメリカ合衆国46237インディアナ州イン ディアナポリス、サウス・アーリントン・ アベニュー5518番

Claims (5)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 下記の配列: 【化1】 [以下、配列番号1という]で示されるアミノ酸配列を含
    むアミノ酸化合物または機能的なその等価物。
  2. 【請求項2】 請求項1に記載のアミノ酸化合物を暗号
    化している下記の配列: 【化2】 [以下、配列番号2という]を含んでいる核酸、または機
    能的なその等価物、またはその一部。
  3. 【請求項3】 選択的ハイブリダイゼーションに好適な
    条件下に請求項2の化合物のDNA断片とハイブリッド
    形成する、ヒト染色体19ライブラリー由来の4.0キ
    ロベースのHindIII断片を含んでいる、配列番号1
    のアミノ酸化合物を暗号化しているゲノムクローン。
  4. 【請求項4】 (a)患者からDNAを取り出し、
    (b)そのDNAを制限酵素で消化し、(c)消化した
    DNAを配列番号2の化合物に対応する標識したヌクレ
    オチド配列、またはその一部とハイブリッド形成させ、
    (d)アルツハイマー病の症状を現わし、またはかって
    症状を現わしたことがあるドナー家族構成員の、同様に
    消化しハイブリッド形成させたバンドの形態とハイブリ
    ダイゼーションパターンを比較することからなる患者の
    アルツハイマー病の診断、またはアルツハイマー病の発
    病傾向の診断方法。
  5. 【請求項5】 (a)タンパク質を試験物質と接触さ
    せ、(b)物理的に検出可能な手段によってタンパク質
    活性をモニターし、(c)試験物質を投与されていない
    対照と比較して、タンパク質活性と相互作用する物質、
    またはタンパク質活性に影響を与える物質を同定する方
    法からなる、試験物質が配列番号1のタンパク質の機能
    的なリガンドであるかどうかを測定する検定。
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