JPH07322880A - 酵素をコードするdnaとそれを含む組換えdna並びに形質転換体 - Google Patents

酵素をコードするdnaとそれを含む組換えdna並びに形質転換体

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JPH07322880A
JPH07322880A JP7058244A JP5824495A JPH07322880A JP H07322880 A JPH07322880 A JP H07322880A JP 7058244 A JP7058244 A JP 7058244A JP 5824495 A JP5824495 A JP 5824495A JP H07322880 A JPH07322880 A JP H07322880A
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Abstract

(57)【要約】 【目的】 澱粉糖から末端にトレハロース構造を有する
非還元性糖質を生成する酵素をコードするDNAとそれ
を含む組換えDNA並びに形質転換体を提供する。 【構成】 特定の作用を有する酵素をコードするDNA
と、そのDNAと自律複製可能なベクターを含んでなる
複製可能な組換えDNAと、その組換えDNAを適宜宿
主に導入してなる形質転換体を構成とする。

Description

【発明の詳細な説明】
【0001】
【産業上の利用分野】この発明は、グルコース重合度3
以上の還元性澱粉糖から末端にトレハロース構造を有す
る非還元性糖質を生成する酵素をコードする新規なDN
Aと、そのDNAを含む組換えDNA並びに形質転換体
に関するものである。
【0002】
【従来の技術】トレハロースは、グルコース2分子が還
元性基同士結合した二糖類であり、天然には細菌、真
菌、藻類、昆虫などに微量存在する。トレハロースは分
子中に還元性基を持たないので、アミノ酸類の存在下で
加熱しても褐変反応を起こすことがなく、着色や変質の
懸念なく飲食物を甘味付けできる利点がある。しかしな
がら、従来の製造方法では所望量を入手するのが難し
く、実際に飲食物の甘味付けに使われることは殆ど無か
った。
【0003】これまでの製造方法は、微生物の菌体を利
用する方法と、糖質に複合酵素系を作用させる方法とに
大別される。前者の方法は、特開昭50−154485
号公報などにも見られるように、細菌、酵母などの微生
物を栄養培地で増殖させ、培養物中の菌体からトレハロ
ースを採取するものである。一方、後者の方法は、特開
昭58−216695号公報などにも見られるように、
基質にマルトースを使用し、これにマルトース・フォス
フォリラーゼとトレハロース・フォスフォリラーゼから
なる複合酵素系を作用させ、生成したトレハロースを系
外に取出すものである。前者の方法は、微生物そのもの
の増殖は比較的容易なものの、トレハロースを菌体から
採取するのに一連の繁雑な工程を要し、しかも、菌体に
含まれるトレハロースが15%(w/w)と僅少である
という問題があった。後者の方法は、トレハロースその
ものの分離は比較的容易なものの、反応自体が2種類の
酵素による平衡反応であり、しかも、その平衡が常時グ
ルコース燐酸側に傾いていることから、基質を高濃度に
して反応させ、トレハロースの収量を上げることが原理
的に難しかった。
【0004】斯かる状況に鑑み、本発明者が、澱粉糖か
らトレハロース構造を有する糖質を生成する酵素につき
鋭意検索したところ、リゾビウム・スピーシーズM−1
1やアルスロバクター・スピーシーズQ36などの微生
物が、グルコース重合度3以上の還元性澱粉糖から末端
にトレハロース構造を有する非還元性糖質を生成すると
いう、従来未知の全く新規な酵素を産生することが判明
した。この知見とあい前後して、この非還元性糖質は、
同じくリゾビウム・スピーシーズM−11やアルスロバ
クター・スピーシーズQ36が産生する別の酵素によ
り、ほぼ定量的にトレハロースとグルコース及び/又は
マルトオリゴ糖に加水分解されることが判明した。これ
ら酵素を併用することにより、澱粉を原料に所望量のト
レハロースが比較的容易に得られることとなり、トレハ
ロースに係わる前記課題は悉く解決されていくものと期
待される。しかしながら、リゾビウム・スピーシーズM
−11もアルスロバクター・スピーシーズQ36も当該
酵素の産生能が充分でなく、トレハロースや末端にトレ
ハロース構造を有する非還元性糖質を大規模に製造しよ
うとすると、微生物を大量に培養しなければならないと
いう問題がある。
【0005】一方、昨今の組換えDNA技術の進歩には
目覚しいものがある。今日では、全アミノ酸配列が解明
されていない酵素であっても、これをコードする遺伝子
を単離し、その塩基配列を解明できれば、その酵素をコ
ードするDNAを含む組換えDNAを作製し、これを微
生物や動植物の細胞に導入して得られる形質転換体を培
養することにより、比較的容易に所望量の酵素が取得で
きるようになった。斯かる状況に鑑み、両酵素をコード
する遺伝子を突き止め、その塩基配列を解明するのが急
務となっている。
【0006】
【発明が解決しようとする課題】この発明の目的は、グ
ルコース重合度3以上の還元性澱粉糖から末端にトレハ
ロース構造を有する非還元性糖質を生成する酵素をコー
ドするDNAを提供することにある。
【0007】この発明の別の目的は、そのDNAと自律
複製可能なベクターを含んでなる組換えDNAを提供す
ることにある。
【0008】この発明のさらに別の目的は、その組換え
DNAを適宜宿主に導入してなる形質転換体を提供する
ことにある。
【0009】
【課題を解決するための手段】この発明は、前記第一の
課題を、グルコース重合度3以上の還元性澱粉糖から末
端にトレハロース構造を有する非還元性糖質を生成する
酵素をコードするDNAにより解決するものである。
【0010】この発明は、前記第二の課題を、グルコー
ス重合度3以上の還元性澱粉糖から末端にトレハロース
構造を有する非還元性糖質を生成する酵素をコードする
DNAと自律複製可能なベクターを含んでなる複製可能
な組換えDNAにより解決するものである。
【0011】この発明は、前記第三の課題を、グルコー
ス重合度3以上の還元性澱粉糖から末端にトレハロース
構造を有する非還元性糖質を生成する酵素をコードする
DNAと自律複製可能なベクターを含んでなる複製可能
な組換えDNAを適宜宿主に導入してなる形質転換体に
より解決するものである。
【0012】
【作用】この発明のDNAは、自律複製可能な適宜ベク
ターに挿入して複製可能な組換えDNAとし、この組換
えDNAを、本来、当該酵素を産生しないけれども、比
較的容易に増殖させることのできる宿主に導入して形質
転換体とすることにより、コードされた当該酵素の産生
を発現する。
【0013】この発明の組換えDNAは、本来、当該酵
素を産生しないけれども、比較的容易に増殖させること
のできる宿主に導入して形質転換体とし、この形質転換
体を培養することにより、コードされた当該酵素の産生
を発現する。
【0014】この発明の形質転換体は、培養すると、当
該酵素を産生する。
【0015】以下、実験例、実施例等に基づきこの発明
を説明すると、この発明は、グルコース重合度3以上の
還元性澱粉糖から末端にトレハロース構造を有する非還
元性糖質を生成する、従来未知の全く新規な酵素をコー
ドするDNAに関するものである。斯かる酵素はリゾビ
ウム・スピーシーズM−11やアルスロバクター・スピ
ーシーズQ36の培養物から得ることができ(以下、そ
れぞれ「酵素M−11」又は「酵素Q36」と云
う。)、本発明者がカラムクロマトグラフィーを中心と
する種々の精製方法を組合せてこの酵素を単離し、その
性質・性状を調べたところ、その本質はポリペプチドで
あり、次のような理化学的性質を有することが判明し
た。 (1) 作用 グルコース重合度3以上の還元性澱粉糖から末端にトレ
ハロース構造を有する非還元性糖質を生成する。 (2) 分子量 約76,000乃至87,000ダルトン(SDS−ポ
リアクリルアミドゲル電気泳動) (3) 等電点 約3.6乃至4.6(等電点電気泳動) (4) 至適温度 pH7.0で60分間インキュベートすると、35乃至
40℃付近に至適温度を示す。 (5) 至適pH 40℃で60分間インキュベートすると、pH6.4乃
至7.2付近に至適pHを示す。 (6) 熱安定性 pH7.0で60分間インキュベートすると、35乃至
40℃付近まで安定である。 (7) pH安定性 25℃で16時間インキュベートすると、pH5.5乃
至11.0付近まで安定である。
【0016】斯かる理化学的性質を有する酵素は未だ知
られておらず、新規物質であると判断される。なお、リ
ゾビウム・スピーシーズM−11は岡山県岡山市の土壌
から分離され、平成4年12月24日以降、茨城県つく
ば市東1丁目1番3号にある通商産業省、工業技術院、
生命工学工業技術研究所、特許微生物寄託センターに寄
託番号『FERM BP−4130』で寄託されてい
る。一方、アルスロバクター・スピーシーズQ36は岡
山県総社市の土壌から分離されたものであり、平成5年
6月3日以降、同センターに寄託番号『FERM BP
−4316』で寄託されている。同じ出願人による特願
平5−349216号明細書には、当該酵素の性質・性
状とともに、両微生物の菌学的性質が詳細に開示されて
いる。
【0017】本発明者が、高度に精製した酵素M−11
の部分アミノ酸配列を調べ、その部分アミノ酸配列に基
づき化学合成したオリゴヌクレオチドをプローブにして
リゾビウム・スピーシーズM−11の染色体DNAを鋭
意検索した結果、配列表における配列番号3に示す塩基
配列を有する2,316塩基対からなるDNA断片が得
られた。そして、その塩基配列を解読したところ、酵素
M−11は、配列表における配列番号1に示すように、
772個のアミノ酸により構成されていることが判明し
た。
【0018】一方、酵素Q36の部分アミノ酸配列に基
づき化学合成したオリゴヌクレオチドをプローブにし、
アルスロバクター・スピーシーズQ36の染色体DNA
を同様に検索したところ、配列表における配列番号4に
示す塩基配列を有する2,325塩基対からなるDNA
断片が得られた。この塩基配列を解読したところ、酵素
Q36は775個のアミノ酸からなり、配列表における
配列番号2に示すアミノ酸配列を有していることが判明
した。
【0019】配列表における配列番号1乃至4に示す塩
基配列及びアミノ酸配列を解明するに到った一連の工程
を要約すると、次のようになる。 (1) 供与体微生物の培養物から当該酵素を分離し、
高度に精製した。精製酵素をプロテアーゼにより部分加
水分解後、加水分解物から2種類のペプチド断片を単離
し、そのアミノ酸配列を決定した。 (2) 別途、供与体微生物の菌体より染色体DNAを
分離し、精製後、制限酵素により部分的に切断して約
3,000乃至7,000塩基対からなるDNA断片を
採取した。DNAリガーゼにより、このDNA断片を予
め制限酵素で切断しておいたプラスミドベクターに連結
し、組換えDNAを作製した。 (3) 大腸菌に組換えDNAを導入して形質転換体を
作製し、前記部分アミノ酸配列に基づき化学合成したオ
リゴヌクレオチドをプローブとするコロニーハイブリダ
イゼーションにより当該酵素をコードするDNAを含む
形質転換体を選択した。 (4) 形質転換体から組換えDNAを採取し、プライ
マーとともにアニーリング後、DNAポリメラーゼを作
用させてプライマーを伸長し、得られた相補鎖DNAを
ジデオキシ・チェーン・ターミネータ法により分析して
塩基配列を決定した。そして、その塩基配列から推定さ
れるアミノ酸配列と前記部分アミノ酸配列とを比較し、
その塩基配列が当該酵素をコードしていることを確認し
た。
【0020】供与体微生物の遺伝子がコードするアミノ
酸配列は配列表における配列番号1又は2に示すとおり
であるが、この発明のDNAは、配列表における配列番
号1又は2に示すとおりのアミノ酸配列をコードするも
のは無論のこと、これと相同的なアミノ酸配列を有する
ものをも包含するものとする。すなわち、組換えDNA
技術の進歩により、斯界においては、酵素の作用を実質
的に変えることなく、比較的容易にその構成アミノ酸の
1個又は2個以上を他のアミノ酸で置換できるようにな
った。また、同じDNAであっても、それを導入する宿
主や、そのDNAを含む形質転換体の培養に使用する栄
養培地の成分・組成、培養温度・pHなどに依っては、
宿主内酵素によるDNA発現後の修飾などにより、所期
の酵素作用は保持しているものの、配列表における配列
番号1又は2のアミノ酸配列におけるN末端付近のアミ
ノ酸の1個又は2個以上以上が欠失したり、N末端に1
個又は2個以上のアミノ酸が新たに付加した変異体の産
生することがある。斯かる技術水準に鑑み、この発明で
いう酵素とは、配列表における配列番号1又は2に示す
アミノ酸配列をそのまま具備するものは言うに及ばず、
そのアミノ酸配列におけるアミノ酸の1個又は2個以上
が他のアミノ酸に置き換わるか、欠失若しくは付加した
変異体であっても、それがグルコース重合度3以上の還
元性澱粉糖から末端にトレハロース構造を有する非還元
性糖質を生成するかぎり包含するものとする。
【0021】さらに、斯界においては、遺伝子コードの
縮重により、コードするアミノ酸配列を変えることな
く、DNAにおける塩基の1個又は2個以上を他の塩基
で置換することができる。これにより、この発明のDN
Aは、配列表における配列番号3又は4に示す塩基配列
をそのまま有するもののみならず、それが配列表におけ
る配列番号1又は2に示すアミノ酸配列を有する酵素若
しくはその相同変異体をコードするものであるかぎり、
遺伝子コードの縮重に基づき、塩基の1個又は2個以上
が他の塩基に置き換わったものをも包含するものとす
る。
【0022】また、現在の組換えDNA技術に依るとき
には、一般に、5′末端からの塩基配列が決まれば、こ
れに相補的な塩基配列は一義的に定まる。したがって、
この発明のDNAは、上記いずれかの塩基配列に相補的
な塩基配列を有するものも包含するものとする。なお、
この発明のDNAが宿主中で実際に当該酵素の産生を発
現するために、当該酵素又はその相同変異体をコードす
る塩基配列における塩基の1個又は2個以上を他の塩基
で適宜置換し得ることはいうまでもない。
【0023】この発明のDNAは上記のごときものであ
るが、この発明のDNAは、それが前記のごとき配列を
有するかぎり、それが天然に由来するものか人為的に合
成されたものであるかは問わない。天然の給源として
は、例えば、リゾビウム・スピーシーズM−11(FE
RM BP−4130)、アルスロバクター・スピーシ
ーズQ36(FERM BP−4316)、ブレビバク
テリウム・ヘロボルム(ATCC11822)、フラボ
バクテリウム・アクアチレ(IFO3772)、ミクロ
コッカス・ルテウス(IFO3064)、ミクロコッカ
ス・ロゼウス(ATCC186)、クルトバクテリウム
・シトレウム(IFO15231)、マイコバクテリウ
ム・スメグマチス(ATCC19420)及びテラバク
ター・ツメスセンス(IFO12960)を含むリゾビ
ウム属、アルスロバクター属、ブレビバクテリウム属、
フラボバクテリウム属、ミクロコッカス属、クルトバク
テリウム属、マイコバクテリウム属、テラバクター属の
微生物が挙げられ、これら微生物の菌体からはこの発明
のDNAを含む遺伝子が得られる。すなわち、斯かる微
生物を栄養培地に植菌し、好気的条件下で約1乃至3日
間培養後、培養物から菌体を採取し、リゾチームやβ−
グルカナーゼなどの細胞壁溶解酵素や超音波で処理する
ことにより、当該DNAを含む遺伝子を菌体外に溶出さ
せる。このとき、細胞壁溶解酵素にプロテアーゼなどの
蛋白質加水分解酵素を併用したり、菌体を超音波処理す
る際、SDSなどの界面活性剤を共存させたり凍結融解
してもよい。斯くして得られる処理物に、例えば、フェ
ノール抽出、アルコール沈澱、遠心分離、プロテアーゼ
処理、リボヌクレアーゼ処理などの斯界における通常一
般の方法を適用すれば目的のDNAが得られる。
【0024】一方、この発明のDNAを人為的に合成す
るには、例えば、配列表における配列番号3又は4に示
す塩基配列に基づいて化学合成するか、配列表における
配列番号1又は2に示すアミノ酸配列をコードするDN
Aを自律複製可能な適宜ベクターに挿入して組換えDN
Aとし、これを適宜宿主に導入して得られる形質転換体
を培養し、培養物から菌体を分離し、その菌体から当該
DNAを含むプラスミドを採取すればよい。
【0025】さて、この発明は、本来、当該酵素を産生
しないけれども、比較的容易に増殖させることのできる
微生物や動植物の細胞に導入すると当該酵素の産生を発
現する複製可能な組換えDNAに係わるものでもある。
斯かる組換えDNAは、通常、前述のごときDNAと自
律複製可能なベクターを含んでなり、DNAが入手でき
れば、通常一般の組換えDNA技術により比較的容易に
調製することができる。斯かるベクターの例としては、
pBR322、pUC18、Bluescript I
I SK(+)、pUB110、pTZ4、pC19
4、pHV14、TRp7、YEp7、pBS7などの
プラスミドベクターやλgt・λC、λgt・λB、ρ
11、φ1、φ105などのファージベクターが挙げら
れ、このうち、この発明のDNAを大腸菌で発現させる
にはpBR322、pUC18、Bluescript
II SK(+)、λgt・λC及びλgt・λBが
好適であり、一方、枯草菌で発現させるにはpUB11
0、pTZ4、pC194、ρ11、φ1及びφ105
が好適である。pHV14、TRp7、YEp7及びp
BS7は、組換えDNAを2種以上の宿主内で増殖させ
る場合に有用である。
【0026】斯かるベクターにこの発明のDNAを挿入
するには、斯界において通常一般の方法が採用される。
具体的には、先ず、この発明のDNAを含む遺伝子と自
律複製可能なベクターとを制限酵素及び/又は超音波に
より切断し、次に、生成したDNA断片とベクター断片
とを連結する。遺伝子及びベクターの切断にヌクレオチ
ドに特異的に作用する制限酵素、とりわけ、II型の制
限酵素、詳細には、Sau 3AI、Eco RI、H
ind III、Bam HI、Sal I、Xba
I、Sac I、Pst Iなどを使用すれば、DNA
断片とベクター断片を連結するのが容易となる。DNA
断片とベクター断片を連結するには、必要に応じて、両
者をアニーリングした後、生体内又は生体外でDNAリ
ガーゼを作用させればよい。斯くして得られる組換えD
NAは、適宜宿主に導入して形質転換体とし、これを培
養することにより無限に複製可能である。
【0027】この発明による組換えDNAは、大腸菌、
枯草菌、放線菌、酵母を始めとする適宜の宿主微生物に
導入することができる。宿主が大腸菌の場合には、宿主
を組換えDNAとカルシウムイオンの存在下で培養すれ
ばよく、一方、宿主が枯草菌の場合には、コンピテント
セル法やプロトプラスト法を適用すればよい。形質転換
体をクローニングするには、コロニーハイブリダイゼー
ション法を適用するか、グルコース重合度3以上の還元
性澱粉糖を含む栄養培地で培養し、該澱粉糖より末端に
トレハロース構造を有する非還元性糖質を生成するもの
を選択すればよい。
【0028】斯くして得られる形質転換体は、栄養培地
で培養すると、菌体内外に当該酵素を産生する。栄養培
地には、通常、炭素源、窒素源、ミネラル、さらには、
必要に応じて、アミノ酸やビタミンなどの微量栄養素を
補足した通常一般の液体培地が使用され、個々の炭素源
としては、例えば、澱粉、澱粉加水分解物、グルコー
ス、果糖、蔗糖などの糖質が、また、窒素源としては、
例えば、アンモニア若しくはアンモニウム塩、尿素、硝
酸塩、ペプトン、酵母エキス、脱脂大豆、コーンスティ
ープリカー、肉エキスなどの含窒素無機乃至有機物が挙
げられる。形質転換体を斯かる栄養培地に植菌し、栄養
培地を温度25乃至65℃、pH2乃至8に保ちつつ、
通気撹拌などによる好気的条件下で約1乃至6日間培養
すれば、当該酵素を含む培養物が得られる。この培養物
は酵素剤としてそのまま使用可能ではあるが、通常は使
用に先立ち、必要に応じて、超音波や細胞壁溶解酵素に
より菌体を破砕した後、濾過、遠心分離などにより酵素
を菌体又は菌体破砕物から分離し、精製する。精製には
酵素を精製するための通常一般の方法が採用でき、例え
ば、菌体又は菌体破砕物を除去した培養物に濃縮、塩
析、透析、分別沈澱、ゲル濾過クロマトグラフィー、イ
オン交換クロマトグラフィー、疎水クロマトグラフィ
ー、アフィニティークロマトグラフィー、ゲル電気泳
動、等電点電気泳動などの1種若しくは2種以上を適宜
組合せて適用すればよい。
【0029】前述のとおり、当該酵素は、グルコース重
合度3以上の還元性澱粉糖から末端にトレハロース構造
を有する非還元性糖質を生成するという、従来の酵素に
見られない顕著な作用を有する。したがって、この発明
の形質転換体が産生する酵素は、澱粉又はアミロペクチ
ン、アミロースなどの澱粉質を酸及び/又はアミラーゼ
で処理して得られるマルトトリオース、マルトテトラオ
ース、マルトペンタオース、マルトヘキサオースを始め
とする、グルコース重合度3以上の一連のマルトオリゴ
糖を含む澱粉加水分解物に作用させることにより、末端
にトレハロース構造を有するα−グルコシルトレハロー
ス、α−マルトシルトレハロース、α−マルトトリオシ
ルトレハロース、α−マルトテトラオシルトレハロース
などの対応する非還元性糖質を収量良く、効率的に生成
する。そして、これら非還元性糖質は、特願平5−34
0343号に開示されているトレハロース遊離酵素を作
用させると、ほぼ定量的にトレハロースを生成する。
【0030】次に、グルコース重合度3以上の還元性澱
粉糖から末端にトレハロース構造を有する非還元性糖質
を生成する酵素の理化学的性質を解明すべく行なった一
連の実験について説明する。
【0031】
【実験例1 精製酵素の調製】
【0032】
【実験例1−1 酵素M−11の精製】500ml容三
角フラスコにマルトース2.0%(w/v)、ペプトン
0.5%(w/v)、酵母エキス0.1%(w/v)、
燐酸水素二ナトリウム0.1%(w/v)及び燐酸二水
素カリウム0.1%(w/v)を含む液体培地(pH
7.0)を100mlずつとり、120℃で20分間オ
ートクレーブして滅菌した。冷却後、三角フラスコ内の
液体培地にリゾビウム・スピーシーズM−11を植菌
し、回転振盪下、27℃で24時間種培養した。別途、
30l容ジャーファーメンタに上記と同組成の液体培地
を20lとり、滅菌後、上記で得た種培養液を1%(v
/v)接種し、液体培地をpH6乃至8に保ちつつ、3
0℃で24時間通気撹拌培養した。
【0033】次に、上記で得た培養物約18lを超高圧
菌体破砕装置にとり、菌体を破砕後、遠心分離により採
取した上清約16lに硫酸アンモニウムを20%飽和に
なるように加え、4℃で1時間静置後、遠心分離により
沈澱部を除去した。得られた上清に60%飽和になるよ
うに硫酸アンモニウムを加え、4℃で24時間静置後、
沈澱部を遠心分離により採取し、最少量の10mM燐酸
緩衝液(pH7.0)に溶解し、10mM燐酸緩衝液
(pH7.0)に対して24時間透析後、遠心分離によ
り不溶物を除去した。得られた上清を予め10mM燐酸
緩衝液(pH7.0)により平衡化させておいた東ソー
製イオン交換クロマトグラフィー用カラム『DEAE−
トヨパール』に負荷し、0Mから0.5Mに上昇する塩
化ナトリウムの濃度勾配下、カラムに10mM燐酸緩衝
液(pH7.0)を通液した。溶出液より酵素を含む画
分を採取し、2M硫酸アンモニウムを含む50mM燐酸
緩衝液(pH7.0)に対して10時間透析後、遠心分
離により不溶物を除去した。その後、上清を予め2M硫
酸アンモニウムを含む50mM燐酸緩衝液(pH7.
0)により平衡化させておいた東ソー製疎水クロマトグ
ラフィー用カラム『ブチルトヨパール』に負荷し、2M
から0Mに低下する硫酸アンモニウムの濃度勾配下、カ
ラムに50mM燐酸緩衝液(pH7.0)を通液した。
溶出液から酵素を含む画分を採取し、予め50mM燐酸
緩衝液(pH7.0)により平衡化させておいた東ソー
製ゲル濾過カラムクロマトグラフィー用カラム『トヨパ
ールHW−55』に負荷し、カラムに50mM燐酸緩衝
液(pH7.0)を通液し、溶出液から酵素を含む画分
を採取した。このようにして精製した酵素M−11の比
活性は約195単位/mg蛋白質であり、収量は培養物
1l当たり約220単位であった。
【0034】なお、この発明を通じて、酵素の活性は次
の方法により測定した活性値(単位)で表示する。すな
わち、マルトペンタオースを1.25%(w/v)含む
50mM燐酸緩衝液(pH7.0)を4mlとり、これ
に酵素液を1ml加え、40℃で60分間インキュベー
トして反応させた後、反応液を100℃で10分間加熱
して反応を停止させる。反応液を蒸留水で10倍希釈し
た後、ソモギ・ネルソン法により還元力を測定する。当
該酵素の1単位とは、上記条件下において、1分間にマ
ルトペンタオース1μmolに相当する還元力を低下さ
せる酵素の量と定義する。
【0035】
【実験例1−2 酵素Q36の精製】実験例1−1と同
様にアルスロバクター・スピーシーズQ36を培養し、
培養物を処理したところ、比活性約200単位/mg蛋
白質の精製酵素Q36が、培養物1l当たり、約295
単位の収量で得られた。
【0036】
【実験例2 酵素の理化学的性質】本実験例では、実験
例1で得た精製酵素を試料に使い、当該酵素の理化学的
性質を調べる。
【0037】
【実験例2−1 作用】基質としてグルコース、マルト
ース、マルトトリオース、マルトテトラオース、マルト
ペンタオース、マルトヘキサオース又はマルトヘプタオ
ースを20%(w/v)含む50mM燐酸緩衝液(pH
7.0)に実験例1で得た精製酵素M−11又は精製酵
素Q36を基質1g当たり2単位加え、40℃で48時
間反応させた。常法により反応物を脱塩した後、和光純
薬製高速液体クロマトグラフィー用カラム『WB−T−
330』に負荷し、溶出液の糖濃度を東ソー製示差屈折
計『RI−8012型』でモニターしながら、室温下に
てカラムに蒸留水を0.5ml/分の流速で通液するこ
とにより、反応物に含まれる糖質を分離した。表1及び
表2に、それぞれ、酵素M−11及び酵素Q36を加え
た場合の糖組成を示す。なお、表中の糖質P1乃至P5
は、反応により生成した糖質をグルコース重合度の小さ
い順に命名したものである。
【0038】
【表1】
【0039】
【表2】
【0040】表1及び表2の結果から明らかなように、
酵素M−11及び酵素Q36は、マルトトリオース、マ
ルトテトラオース、マルトペンタオース、マルトヘキサ
オース及びマルトヘプタオースなどのグルコース重合度
が3以上の還元性澱粉糖からは新たな糖質を生成するけ
れども、グルコース重合度が3を下回るグルコースやマ
ルトースからは新たな糖質を生成しない。また、反応に
より生成した糖質はそれぞれ糖質P1乃至P5のみであ
り、糖質P2乃至P5の含量は固形分当たり85%以上
と著しく高かった。
【0041】次に、糖質P1乃至P5を分離すべく、東
京有機化学工業製強酸性カチオン交換樹脂『XT−10
16(Na+型)』を内径2.0cm、長さ1mのジャ
ケット付きステンレス製カラム3本に充填し、これらカ
ラムを直列に連結した。そして、カラム内の温度を55
℃に保ちつつ、カラムに糖質P1乃至P5のいずれかを
含む前記反応物を別々に負荷した後、カラムに55℃の
蒸留水をSV0.13の流速で通液した。溶出液の糖組
成を調べ、糖質P1乃至P5のいずれかを固形分で97
%以上含む画分を採取し、真空乾燥により粉末化した。
このようにして精製した糖質P1乃至P5の還元力をソ
モギ・ネルソン法により調べたところ、いずれの糖質に
も実質的な還元力は認められなかった。
【0042】さらに、糖質P1乃至P5を同定すべく、
これら糖質のいずれかを50mgとり、50mM酢酸緩
衝液(pH4.5)1mlに溶解後、グルコアミラーゼ
を1単位加え、40℃で6時間インキュベートした。表
1及び表2に示す反応物の糖組成を高速液体クロマトグ
ラフィーにより分析したところ、それぞれ表3及び表4
に示すように、全ての反応物からグルコースとトレハロ
ースが検出された。同様にして、糖質P1乃至P5にβ
−アミラーゼを作用させたところ、糖質P1及びP2が
β−アミラーゼの作用を受けなかったのに対して、糖質
P3は1分子のマルトースと糖質P1を、糖質P4は1
分子のマルトースと糖質P2を、また、糖質P5は2分
子のマルトースと糖質P1を与えた。
【0043】
【表3】
【0044】
【表4】
【0045】表3及び表4の結果は、糖質P1乃至P5
が1分子のトレハロースと1乃至5分子のグルコースに
より構成されることを強く示唆している。また、グルコ
アミラーゼがマルトオリゴ糖におけるα−1,4結合及
びα−1,6結合に特異的に切断することと、β−アミ
ラーゼがマルトオリゴ糖におけるα−1,4結合をその
末端よりマルトース単位で切断することから、糖質P1
乃至P5は、グルコース又はグルコース重合度が2乃至
5のマルトオリゴ糖の末端にトレハロース残基が1個結
合した構造を有していると推定される。
【0046】以上の結果を総合的に判断すると、糖質P
1乃至P5は、それぞれ、α−グルコシルトレハロー
ス、α−マルトシルトレハロース、α−マルトトリオシ
ルトレハロース、α−マルトテトラオシルトレハロース
又はα−マルトペンタオシルトレハロースと同定され、
このことは、当該酵素にグルコース重合度3以上の還元
性澱粉糖から末端にトレハロース構造を有する非還元性
糖質を生成する作用のあることを裏付けている。
【0047】
【実験例2−2 分子量】ユー・ケー・レムリが『ネー
チャー』、第227巻、第680〜685頁(1970
年)に報告している方法に準じて精製酵素をSDS−ポ
リアクリルアミドゲル電気泳動したところ、酵素M−1
1、酵素Q36とも、分子量約76,000乃至87,
000ダルトンに相当する位置に単一バンドが観察され
た。なお、このときの分子量マーカは、ミオシン(20
0,000ダルトン)、β−ガラクトシダーゼ(11
6,250ダルトン)、フォスフォリラーゼB(97,
400ダルトン)、血清アルブミン(66,200ダル
トン)及びオボアルブミン(45,000ダルトン)で
あった。
【0048】
【実験例2−3 等電点】等電点電気泳動法により測定
したところ、酵素M−11、酵素Q36とも、約3.6
乃至4.6に等電点を示した。
【0049】
【実験例2−4 至適温度】常法により、50mM燐酸
緩衝液(pH7.0)中で60分間インキュベートする
条件で試験したところ、図1又は図2に示すように、酵
素M−11、酵素Q36とも、35乃至40℃付近に至
適温度を示した。
【0050】
【実験例2−5 至適pH】常法により、pHの相違す
る50mM酢酸緩衝液、燐酸緩衝液又は炭酸ナトリウム
−炭酸水素ナトリウム緩衝液中、40℃で60分間イン
キュベートする条件で試験したところ、図3又は図4に
示すように、酵素M−11、酵素Q36とも、pH6.
4乃至7.2付近に至適pHを示した。
【0051】
【実験例2−6 熱安定性】常法により、50mM燐酸
緩衝液(pH7.0)中で60分間インキュベートする
条件で試験したところ、図5又は図6に示すように、酵
素M−11、酵素Q36とも、35乃至40℃付近まで
安定であった。
【0052】
【実験例2−7 pH安定性】常法により、pHの相違
する50mM酢酸緩衝液、燐酸緩衝液又は炭酸ナトリウ
ム−炭酸水素ナトリウム緩衝液中、25℃で16時間イ
ンキュベートする条件で試験したところ、図7又は図8
に示すように、酵素M−11、酵素Q36とも、pH
5.5乃至11.0付近まで安定であった。
【0053】
【実験例2−8 N末端アミノ酸配列】常法により、ア
プライッド・バイオシステム製気相プロテイン・シーケ
ンサ『470A型』を使用して分析したところ、酵素M
−11は、N末端に配列表における配列番号7に示すア
ミノ酸配列を有していることが判明した。
【0054】同様に分析したところ、酵素Q36は、N
末端に配列表における配列番号8に示すアミノ酸配列を
有していることが判明した。
【0055】
【実験例2−9 部分アミノ酸配列】実験例1−1で得
た精製酵素M−11を適量とり、10mMトリス−塩酸
緩衝液(pH9.0)に対して4℃で18時間透析後、
10mMトリス−塩酸緩衝液(pH9.0)を加えて酵
素濃度を約1mg/mlとした。この溶液を約1mlと
り、リジルエンドペプチダーゼを10μg加え、30℃
で22時間インキュベートして酵素を部分加水分解し
た。加水分解物を、予め16%(v/v)水性アセトニ
トリルを含む0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸によ
り平衡化させておいた資生堂製逆相高速液体クロマトグ
ラフィー用カラム『カプセルパックC18』に負荷し、
次いで、16%(v/v)から64%(v/v)に上昇
するアセトニトリルの濃度勾配下、カラムに0.1%
(v/v)トリフルオロ酢酸を0.9ml/分の流速で
通液した。そして、通液開始から約28分後又は約40
分後に溶出したペプチド断片(以下、それぞれ「ペプチ
ド断片A」又は「ペプチド断片B」と云う。)を含む画
分を別々に採取し、真空乾燥後、50%(v/v)水性
アセトニトリルを含む0.1%(v/v)トリフルオロ
酢酸に溶解した。以後、実験例2−8と同様に分析した
ところ、ペプチド断片A及びBは、配列表における配列
番号9及び10に示すアミノ酸配列を有していることが
判明した。
【0056】別途、実験例1−2で得た精製酵素Q36
を上記と同様にして部分加水分解し、予め24%(v/
v)水性アセトニトリルを含む0.1%(v/v)トリ
フルオロ酢酸により平衡化させておいた日本ミリポア・
リミテッド製逆相高速液体クロマトグラフィー用カラム
『マイクロボンダパックC18』に負荷し、24%(v
/v)から44%(v/v)に上昇する水性アセトニト
リルの濃度勾配下、カラムに0.1%(v/v)トリフ
ルオロ酢酸を0.9ml/分の流速で通液した。そし
て、通液開始から約22分後又は約40分後に溶出した
ペプチド断片(以下、それぞれ「ペプチド断片C」又は
「ペプチド断片D」と云う。)を含む画分を採取し、真
空乾燥後、50%(v/v)水性アセトニトリルを含む
0.1%(v/v)トリフルオロ酢酸に溶解した。以
後、上記と同様に分析したところ、ペプチド断片C及び
Dは、配列表における配列番号11及び12に示すアミ
ノ酸配列を有していることが判明した。
【0057】酵素M−11と酵素Q36の理化学的性質
は以上のとおりであるが、以下の実施例では、これら理
化学的性質に基づき、この発明による複製可能な組換え
DNAと形質転換体を調製するとともに、そこに含まれ
ている当該酵素をコードするDNAを採取し、その塩基
配列とアミノ酸配列を決定する。なお、これら実施例で
用いる手法自体は斯界において公知のものであり、例え
ば、ジェー・サムブルック等『モレキュラー・クローニ
ング・ア・ラボラトリー・マニュアル』、第2版、19
89年、コールド・スプリング・ハーバー・ラボラトリ
ー・プレス発行などにも詳述されている。
【0058】
【実施例1 リゾビウム・スピーシーズM−11に由来
するDNAを含む組換えDNAと形質転換体の調製】
【0059】
【実施例1−1 染色体DNAの調製】リゾビウム・ス
ピーシーズM−11をバクト・ニュートリエント・ブロ
ス培地(pH7.0)に植菌し、27℃で24時間回転
振盪培養した。遠心分離により培養物から菌体を分離
し、TES緩衝液(pH8.0)に浮遊させ、リゾチー
ムを0.05%(w/v)加えた後、37℃で30分間
インキュベートした。処理物を−80℃で1時間凍結
後、TSS緩衝液(pH9.0)を加えて60℃に加温
し、TES緩衝液/フェノール混液を加え、氷冷後、遠
心分離により上清を採取した。この上清に2倍容の冷エ
タノールを加え、沈澱した粗染色体DNAを採取し、S
SC緩衝液(pH7.1)に溶解後、リボヌクレアーゼ
とプロテアーゼをそれぞれ7.5μg又は125μg加
え、37℃で1時間インキュベートして反応させた。そ
の後、反応物にクロロフォルム/イソアミルアルコール
混液を加えて染色体DNAを抽出し、冷エタノールを加
え、生成した染色体DNAを含む沈澱を採取した。この
ようにして得た精製染色体DNAを濃度約1mg/ml
になるようにSSC緩衝液(pH7.1)に溶解し、溶
液を−80℃で凍結した。
【0060】
【実施例1−2 組換えDNA pBMT7と形質転換
体BMT7の調製】実施例1−1で得た精製染色体DN
A溶液を約1mlとり、これに制限酵素Sau 3AI
を約35単位加え、37℃で約20分間反応させて染色
体DNAを部分切断した後、蔗糖密度勾配超遠心法によ
り約3,000乃至7,000塩基対からなるDNA断
片を採取した。別途、プラスミドベクターBluesc
ript II SK(+)を1μgとり、常法により
制限酵素Bam HIを作用させて完全に切断した後、
上記で得たDNA断片10μgとT4 DNAリガーゼ
を2単位加え、4℃で一夜静置することによりDNA断
片をベクター断片に連結した。そして、得られた組換え
DNAに東洋紡績製コンピテントセル『Epicuri
an Coli XLI−Blue』を30μl加え、
氷冷下に30分間静置後、42℃に加温し、SOCブロ
スを加えて37℃で1時間インキュベートすることによ
り、組換えDNAを大腸菌に導入した。
【0061】次に、上記で得た形質転換体を5−ブロモ
−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクトシド50
μg/mlを含む寒天平板培地(pH7.0)に植菌
し、37℃で18時間培養後、培地上にナイロン膜を載
置し、培地上に形成された約4,400個のコロニーを
ナイロン膜に固定した。別途、常法により、配列表にお
ける配列番号9に示すアミノ酸配列における第17乃至
21番目のPro−Glu−Trp−Glu−Lysで
表される配列に基づき5′−CCNGARTGGGAR
AA−3′で表される塩基配列のプローブ1を化学合成
し、同位体32Pで標識後、前記ナイロン膜上に固定した
形質転換体のコロニーにハイブリダイズさせ、顕著な会
合が認められた9種類の形質転換体を選択した。
【0062】常法により、これら9種類の形質転換体か
ら組換えDNAを採取し、配列表における配列番号10
に示すアミノ酸配列における第16乃至20番目のTh
r−Glu−Phe−Trp−Aspで表される配列に
基づき化学合成した5′−ACNGARTTYTGGG
A−3′で表される塩基配列のプローブ2をイー・エム
・サザーン『ジャーナル・オブ・モレキュラー・バイオ
ロジー』、第98巻、第503〜517頁(1975
年)に記載されている方法に準じてハイブリダイズさ
せ、プローブ2と顕著な会合を示した組換えDNAを選
択した。以上のようにして選択した組換えDNAと形質
転換体を、それぞれ、『pBMT7』又は『BMT7』
と命名した。
【0063】上記で得た形質転換体BMT7をアンピシ
リン100μg/mlを含むL−ブロス培地(pH7.
0)に植菌し、37℃で24時間回転振盪培養した。培
養終了後、遠心分離により培養物から菌体を採取し、通
常一般のアルカリ法により組換えDNAを菌体外に溶出
させた。処理物を常法により精製し、分析したところ、
組換えDNA pBMT7は約9,300塩基対からな
り、図9に示す制限酵素地図で表される構造を有してい
た。図9に示すように、酵素M−11をコードする2,
316塩基対からなるDNAは、制限酵素Pst Iに
よる切断部位付近の下流に位置していることが判明し
た。
【0064】
【実施例1−3 形質転換体BMT7による酵素の産
生】マルトース2.0%(w/v)、ペプトン0.5%
(w/v)、酵母エキス0.1%(w/v)、燐酸水素
二ナトリウム0.1%(w/v)、燐酸二水素カリウム
0.1%(w/v)を含む液体培地をpH7.0に調整
し、アンピシリンを50μg/ml加え、120℃で2
0分間加熱滅菌し、冷却後、実施例1−2で得た形質転
換体BMT7を植菌し、37℃で24時間回転振盪培養
した。培養物を超音波処理して菌体を破砕し、遠心分離
により不溶物を除去後、上清中の酵素活性を測定したと
ころ、培養物1l当たりに換算して、約3,000単位
の酵素が産生していた。
【0065】別途、対照として、大腸菌XLI−Blu
e株及びリゾビウム・スピーシーズM−11をアンピシ
リン無含有の同じ液体培地に植菌し、リゾビウム・スピ
ーシーズM−11の場合、培養温度を30℃に設定した
以外は上記と同様に培養・処理した。処理物の活性を測
定したところ、リゾビウム・スピーシーズM−11によ
る酵素の産生は培養物1l当たり約1,500単位と、
形質転換体BMT7と比較して有意に低いものであっ
た。なお、宿主に使用した大腸菌XLI−Blue株
は、当該酵素を全く産生しなかった。
【0066】その後、形質転換体BMT7が産生した酵
素を実験例1−1と同様に精製し、その性質・性状を調
べたところ、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動
で分子量値約76,000乃至87,000ダルトン
を、また、等電点電気泳動で約3.6乃至4.6に等電
点を示すなど、実験例2で得られた酵素M−11のもの
と同様の理化学的性質を有することが判明した。このこ
とは、組換えDNA技術によっても当該酵素を製造で
き、且つ、酵素の生産性も有意に向上することを示唆し
ている。
【0067】
【実施例2 リゾビウム・スピーシーズM
−11に由来する相補鎖DNAの調製とその塩基配列、
アミノ酸配列の決定】実施例1−2で得た組換えDNA
pBMT7を、常法に従って、各種制限酵素で分解
し、Bluescript II SK(+)にサブク
ローニングして、塩基配列決定用DNAとした。これら
塩基配列決定用DNAを2μgとり、これに2M水酸化
ナトリウム水溶液を加えて変性させた後、適量の冷エタ
ノールを加え、生成したテンプレートDNAを含む沈澱
を採取し、真空乾燥した。このテンプレートDNAに化
学合成した5′−GTAAAACGACGGCCAGT
−3′で表される塩基配列のプライマー1を50pmo
l/mlと、20mM塩化マグネシウムと50mM塩化
ナトリウムを含む40mMトリス−塩酸緩衝液(pH
7.5)を10μl加え、65℃で2分間インキュベー
トしてアニーリングした後、dATP、dGTP及びd
TTPをそれぞれ7.5μM含む水溶液を2μlと、
[α−32P]dCTP(2mCi/ml)を0.5μl
と、0.1Mジチオスレイトールを1μlと、1.5単
位/mlのT7 DNAポリメラーゼを2μl加え、2
5℃で5分間インキュベートすることによりプライマー
1を5′末端から3′末端に向かって伸長させ、相補鎖
DNAを生成させた。
【0068】次に、上記で得た相補鎖DNAを含む反応
物を四等分し、それぞれにddATP、ddCTP、d
dGTP及びddTTPのいずれかを8μMと80μM
dNTPを含む50mM塩化ナトリウム水溶液を2.
5μl加え、37℃で5分間インキュベートして反応さ
せた後、20mM EDTA、0.05%(w/v)ブ
ロムフェノールブルー及び0.05%(w/v)キシレ
ンシアノールを含む95%(v/v)水性ホルムアミド
溶液を4μl加えて反応を停止させた。反応物を沸騰水
浴中で3分間加熱後、6%(w/v)ポリアクリルアミ
ドゲル上にとり、約2,000Vの定電圧を印加しなが
ら電気泳動してDNA断片を分離し、次いで、常法によ
りゲルを固定し、乾燥させた後、オートラジオグラフィ
ーした。
【0069】ラジオグラム上に分離したDNA断片を解
析した結果、相補鎖DNAは配列表における配列番号5
に示す2,936塩基対からなる塩基配列を含んでいる
ことが判明した。この塩基配列から推定されるアミノ酸
配列は配列表における配列番号5に併記したとおりであ
り、このアミノ酸配列と配列表における配列番号7、9
又は10に示す酵素M−11のN末端アミノ酸配列、部
分アミノ酸配列を比較したところ、配列番号7のN末端
アミノ酸配列は配列表における配列番号5における第1
乃至20番目の配列に、また、配列番号9又は10の部
分アミノ酸配列は配列表における配列番号5における第
486乃至506番目又は第606乃至626番目の配
列に一致した。これは、酵素M−11が配列表における
配列番号1に示すアミノ酸配列を有するものであり、リ
ゾビウム・スピーシーズM−11においては、酵素M−
11が配列表における配列番号3に示す塩基配列のDN
Aによりコードされていることを示している。
【0070】
【実施例3 アルスロバクター・スピーシ
ーズQ36に由来するDNAを含む組換えDNAと形質
転換体の調製】
【0071】
【実施例3−1 染色体DNAの調製】実施例1−1と
同様にしてアルスロバクター・スピーシーズQ36から
染色体DNAを分離・精製し、濃度約1mg/mlにな
るようにSSC緩衝液(pH7.1)に溶解し、−80
℃で凍結した。
【0072】
【実施例3−2 組換えDNA pBQT13と形質転
換体BQT13の調製】実施例3−1で得た精製染色体
DNA溶液を実施例1−2と同様に部分切断した後、蔗
糖密度勾配超遠心法により約3,000乃至6,000
塩基対からなるDNA断片を採取した。その後、T4
DNAリガーゼを使用し、このDNA断片を実施例1−
2と同様に制限酵素Bam HIによるベクターBlu
escript II SK(+)の消化物に連結し、
得られた組換えDNAを大腸菌XLI−Blue株に導
入した。得られた形質転換体を実施例1−2と同様に5
−ブロモ−4−クロロ−3−インドリル−β−ガラクト
シドを含む寒天平板培地で培養し、生成した約4,50
0個のコロニーをナイロン膜上に固定する一方、配列表
における配列番号12に示すアミノ酸配列における第1
1乃至16番目のPhe−Asp−Val−Asp−T
rp−Aspで表される配列に基づき5′−TTYGA
YGTNGAYTGGGA−3′で表される塩基配列の
プローブ3を化学合成し、同位体32Pで標識後、前記ナ
イロン膜上に固定した形質転換体のコロニーにハイブリ
ダイズさせ、顕著な会合が認められた8種類の形質転換
体を選択した。
【0073】実施例1−2と同様にして、これら8種類
の形質転換体から組換えDNAを採取し、配列表におけ
る配列番号11に示すアミノ酸配列における第16乃至
20番目のThr−Glu−Phe−Trp−Aspで
表される配列に基づき化学合成した5′−ACNGAR
TTYTGGGA−3′で表される塩基配列のプローブ
4をハイブリダイズさせ、顕著な会合を示した組換えD
NAを選択した。以上のようにして選択した組換えDN
Aと形質転換体を、それぞれ、『pBQT13』又は
『BQT13』と命名した。
【0074】その後、この形質転換体BQT13をアン
ピシリンを含むL−ブロス培地で実施例1−2と同様に
培養し、培養物より採取した菌体から組換えDNAを溶
出させ、精製し、分析したところ、組換えDNA pB
QT13は約7,200残基対からなり、図10に示す
制限酵素地図で表される構造を有していた。図10に示
すように、酵素Q36をコードする2,325塩基対か
らなるDNAは、制限酵素Xmn Iによる切断部位付
近の下流に位置していることが判明した。
【0075】
【実施例3−3 形質転換体BQT13による酵素の産
生】マルトース2.0%(w/v)、ペプトン0.5%
(w/v)、酵母エキス0.1%(w/v)、燐酸水素
二ナトリウム0.1%(w/v)、燐酸二水素カリウム
0.1%(w/v)を含む液体培地をpH7.0に調整
し、アンピシリンを50μg/ml加え、120℃で2
0分間加熱滅菌し、冷却後、実施例3−2で得た形質転
換体BQT13を植菌し、37℃で24時間回転振盪培
養した。培養物を超音波処理して菌体を破砕し、遠心分
離により不溶物を除去後、上清中の酵素活性を測定した
ところ、培養物1l当たりに換算して、約2,450単
位の酵素が産生していた。
【0076】別途、対照として、大腸菌XLI−Blu
e株及びアルスロバクター・スピーシーズQ36をアン
ピシリン無含有の同じ組成の液体培地に植菌し、アルス
ロバクター・スピーシーズQ36の場合、培養温度を3
0℃に設定した以外は上記と同様に培養・処理した。処
理物の活性を測定したところ、アルスロバクター・スピ
ーシーズQ36による酵素の産生は培養物1l当たり約
1,200単位と、形質転換体BQT13と比較して有
意に低いものであった。なお、宿主に使用した大腸菌X
LI−Blue株は、当該酵素を産生しなかった。
【0077】その後、形質転換体BQT13が産生した
酵素を実験例1−1と同様に精製し、その性質・性状を
調べたところ、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳
動で分子量約76,000乃至87,000ダルトン
を、また、等電点電気泳動で約3.6乃至4.6に等電
点を示すなど、実験例2で得られた酵素Q36のものと
同様の理化学的性質を有することが判明した。このこと
は、組換えDNA技術によっても当該酵素を製造でき、
且つ、酵素の生産性も有意に向上することを示唆してい
る。
【0078】
【実施例4 アルスロバクター・スピーシ
ーズQ36に由来する相補鎖DNAの調製とその塩基配
列、アミノ酸配列の決定】実施例3−2で得た組換えD
NA pBQT13を実施例2と同様に処理してテンプ
レートDNAとし、これをプライマー1とともにアニー
リング後、T7DNAポリメラーゼを作用させてプライ
マー1を5′末端から3′末端に向かって伸長させ、相
補鎖DNAを生成させた。実施例2と同様に、この相補
鎖DNAにジデオキシ・チェーン・ターミネータ法を適
用し、ラジオグラム上に分離したDNA断片を解析した
結果、相補鎖DNAは配列表における配列番号6に示す
3,073塩基対からなる塩基配列を含んでいることが
判明した。この塩基配列から推定されるアミノ酸配列は
配列表における配列番号6に併記したとおりであり、こ
のアミノ酸配列と配列表における配列番号8、11又は
12に示すN末端アミノ酸配列、部分アミノ酸配列を比
較したところ、配列番号8に示すN末端アミノ酸配列は
配列表における配列番号6における第1乃至20番目の
配列に、また、配列番号11又は12の部分アミノ酸配
列は配列表における配列番号6における第606乃至6
25番目又は第110乃至129番目の配列に一致し
た。これは、酵素Q36が配列表における配列番号2に
示すアミノ酸配列を有するものであり、アルスロバクタ
ー・スピーシーズQ36においては、酵素Q36が配列
表における配列番号4に示す塩基配列のDNAによりコ
ードされていることを示している。
【0079】
【発明の効果】以上説明したように、この発明は、グル
コース重合度3以上の還元性澱粉糖から末端にトレハロ
ース構造を有する非還元性糖質を生成する、従来未知の
全く新規な酵素の発見に基づくものである。この発明
は、組換えDNA技術により斯かる酵素を大規模且つ効
率的に生産する道を拓くものである。しかも、この発明
による形質転換体が産生する酵素は、全アミノ酸配列ま
でが明らかにされた酵素であり、食品等への配合使用を
前提とするトレハロースや末端にトレハロース構造を有
する非還元性糖質の製造に安心して使用し得るものであ
る。
【0080】この発明は斯くも顕著な作用効果を奏する
意義のある発明であり、斯界に貢献すること誠に多大な
発明であると言える。
【0081】
【配列表】
配列番号:1 配列の長さ:772 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ポリペプチド 配列 Met Arg Thr Pro Ala Ser Thr Tyr Arg Leu Gln Ile Arg Arg Gly Phe Thr 1 5 10 15 Leu Phe Asp Ala Ala Glu Thr Val Pro Tyr Leu Lys Ser Leu Gly Val Asp 20 25 30 Trp Ile Tyr Leu Ser Pro Ile Leu Lys Ala Glu Ser Gly Ser Asp His Gly 35 40 45 50 Tyr Asp Val Thr Asp Pro Ala Val Val Asp Pro Glu Arg Gly Gly Pro Glu 55 60 65 Gly Leu Ala Ala Val Ser Lys Ala Ala Arg Gly Ala Gly Met Gly Val Leu 70 75 80 85 Ile Asp Ile Val Pro Asn His Val Gly Val Ala Ser Pro Pro Gln Asn Pro 90 95 100 Trp Trp Trp Ser Leu Leu Lys Glu Gly Arg Gly Ser Pro Tyr Ala Val Ala 105 110 115 Phe Asp Val Asp Trp Asp Leu Ala Gly Gly Arg Ile Arg Ile Pro Val Leu 120 125 130 135 Gly Ser Asp Asp Asp Leu Asp Gln Leu Glu Ile Lys Asp Gly Glu Leu Arg 140 145 150 Tyr Tyr Asp His Arg Phe Pro Leu Ala Glu Gly Ser Tyr Arg Asp Gly Asp 155 160 165 170 Ser Pro Gln Asp Val His Gly Arg Gln His Tyr Glu Leu Ile Gly Trp Arg 175 180 185 Arg Ala Asp Asn Glu Leu Asn Tyr Arg Arg Phe Phe Ala Val Asn Thr Leu 190 195 200 Ala Gly Ile Arg Val Glu Val Pro Pro Val Phe Asp Glu Ala His Gln Glu 205 210 215 220 Val Val Arg Trp Phe Arg Ala Gly Leu Ala Asp Gly Leu Arg Ile Asp His 225 230 235 Pro Asp Gly Leu Ala Asp Pro Glu Gly Tyr Leu Lys Arg Leu Arg Glu Val 240 245 250 255 Thr Gly Gly Ala Tyr Leu Leu Ile Glu Lys Ile Leu Glu Pro Gly Glu Gln 260 265 270 Leu Pro Ala Ser Phe Glu Cys Glu Gly Thr Thr Gly Tyr Asp Ala Leu Ala 275 280 285 Asp Val Asp Arg Val Phe Val Asp Pro Arg Gly Gln Val Pro Leu Asp Arg 290 295 300 305 Leu Asp Ala Arg Leu Arg Gly Gly Ala Pro Ala Asp Tyr Glu Asp Met Ile 310 315 320 Arg Gly Thr Lys Arg Arg Ile Thr Asp Gly Ile Leu His Ser Glu Ile Leu 325 330 335 340 Arg Leu Ala Arg Leu Val Pro Glu Gln Thr Gly Ile Pro Gly Glu Ala Ala 345 350 355 Ala Asp Ala Ile Ala Glu Ile Ile Ala Ala Phe Pro Val Tyr Arg Ser Tyr 360 365 370 Leu Pro Glu Gly Ala Glu Ile Leu Lys Glu Ala Cys Asp Leu Ala Ala Arg 375 380 385 390 Arg Arg Pro Glu Leu Gly Gln Thr Val Gln Leu Leu Gln Pro Leu Leu Leu 395 400 405 Asp Thr Asp Leu Glu Ile Ser Arg Arg Phe Gln Gln Thr Ser Gly Met Val 410 415 420 425 Met Ala Lys Gly Val Glu Asp Thr Ala Phe Phe Arg Tyr Asn Arg Leu Gly 430 435 440 Thr Leu Thr Glu Val Gly Ala Asp Pro Thr Glu Phe Ser Leu Glu Pro Glu 445 450 455 Glu Phe His Val Arg Met Ala Arg Arg Gln Ala Glu Leu Pro Leu Ser Met 460 465 470 475 Thr Thr Leu Ser Thr His Asp Thr Lys Arg Ser Glu Asp Thr Arg Ala Arg 480 485 490 Ile Ser Val Ile Ala Glu Val Ala Pro Glu Trp Glu Lys Ala Leu Asp Arg 495 500 505 510 Leu Asn Thr Leu Ala Pro Leu Pro Asp Gly Pro Leu Ser Thr Leu Leu Trp 515 520 525 Gln Ala Ile Ala Gly Ala Trp Pro Ala Ser Arg Glu Arg Leu Gln Ser Tyr 530 535 540 Ala Leu Lys Ala Ala Arg Glu Ala Gly Asn Ser Thr Ser Trp Thr Asp Pro 545 550 555 560 Asp Pro Ala Phe Glu Glu Ala Leu Ser Ala Val Val Asp Ser Ala Phe Asp 565 570 575 Asn Pro Glu Val Arg Ala Glu Leu Glu Ala Leu Val Gly Leu Leu Ala Pro 580 585 590 595 His Gly Ala Ser Asn Ser Leu Ala Ala Lys Leu Val Gln Leu Thr Met Pro 600 605 610 Gly Val Pro Asp Val Tyr Gln Gly Thr Glu Phe Trp Asp Arg Ser Leu Thr 615 620 625 Asp Pro Asp Asn Arg Arg Pro Phe Ser Phe Ala Glu Arg Ile Arg Ala Leu 630 635 640 645 Asp Gln Leu Asp Ala Gly His Arg Pro Asp Ser Phe Gln Asp Glu Ala Val 650 655 660 Lys Leu Leu Val Thr Ser Arg Ala Leu Arg Leu Arg Arg Asn Arg Pro Glu 665 670 675 680 Leu Phe Thr Gly Tyr Arg Pro Val His Ala Arg Gly Pro Ala Ala Gly His 685 690 695 Leu Val Ala Phe Asp Arg Gly Ala Gly Gly Val Leu Ala Leu Ala Thr Arg 700 705 710 Leu Pro Tyr Gly Leu Glu Gln Ser Gly Gly Trp Arg Asp Thr Ala Val Glu 715 720 725 730 Leu Glu Ala Ala Met Thr Asp Glu Leu Thr Gly Ser Thr Phe Gly Pro Gly 735 740 745 Pro Ala Ala Leu Ser Glu Val Phe Arg Ala Tyr Pro Val Ala Leu Leu Val 750 755 760 765 Pro Ala Thr Gly Gly Lys Ser 770
【0082】配列番号:2 配列の長さ:775 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ポリペプチド 配列 Met Arg Thr Pro Val Ser Thr Tyr Arg Leu Gln Ile Arg Lys Gly Phe Thr 1 5 10 15 Leu Phe Asp Ala Ala Lys Thr Val Pro Tyr Leu His Ser Leu Gly Val Asp 20 25 30 Trp Val Tyr Leu Ser Pro Val Leu Thr Ala Glu Gln Gly Ser Asp His Gly 35 40 45 50 Tyr Asp Val Thr Asp Pro Ser Ala Val Asp Pro Glu Arg Gly Gly Pro Glu 55 60 65 Gly Leu Ala Ala Val Ser Lys Ala Ala Arg Ala Ala Gly Met Gly Val Leu 70 75 80 85 Ile Asp Ile Val Pro Asn His Val Gly Val Ala Thr Pro Ala Gln Asn Pro 90 95 100 Trp Trp Trp Ser Leu Leu Lys Glu Gly Arg Gln Ser Arg Tyr Ala Glu Ala 105 110 115 Phe Asp Val Asp Trp Asp Leu Ala Gly Gly Arg Ile Arg Leu Pro Val Leu 120 125 130 135 Gly Ser Asp Asp Asp Leu Asp Gln Leu Glu Ile Arg Asp Gly Glu Leu Arg 140 145 150 Tyr Tyr Asp His Arg Phe Pro Leu Ala Glu Gly Thr Tyr Ala Glu Gly Asp 155 160 165 170 Ala Pro Arg Asp Val His Ala Arg Gln His Tyr Glu Leu Ile Gly Trp Arg 175 180 185 Arg Ala Asp Asn Glu Leu Asn Tyr Arg Arg Phe Phe Ala Val Asn Thr Leu 190 195 200 Ala Gly Val Arg Val Glu Ile Pro Ala Val Phe Asp Glu Ala His Gln Glu 205 210 215 220 Val Val Arg Trp Phe Arg Glu Asp Leu Ala Asp Gly Leu Arg Ile Asp His 225 230 235 Pro Asp Gly Leu Ala Asp Pro Glu Gly Tyr Leu Lys Arg Leu Arg Glu Val 240 245 250 255 Thr Gly Gly Ala Tyr Leu Leu Ile Glu Lys Ile Leu Glu Pro Gly Glu Gln 260 265 270 Leu Pro Ala Ser Phe Glu Cys Glu Gly Thr Thr Gly Tyr Asp Ala Leu Ala 275 280 285 Asp Val Asp Arg Val Leu Val Asp Pro Arg Gly Gln Glu Pro Leu Asp Arg 290 295 300 305 Leu Asp Ala Ser Leu Arg Gly Gly Glu Pro Ala Asp Tyr Gln Asp Met Ile 310 315 320 Arg Gly Thr Lys Arg Arg Ile Thr Asp Gly Ile Leu His Ser Glu Ile Leu 325 330 335 340 Arg Leu Ala Arg Leu Val Pro Gly Asp Ala Asn Val Ser Ile Asp Ala Gly 345 350 355 Ala Asp Ala Leu Ala Glu Ile Ile Ala Ala Phe Pro Val Tyr Arg Thr Tyr 360 365 370 Leu Pro Glu Gly Ala Glu Val Leu Lys Glu Ala Cys Glu Leu Ala Ala Arg 375 380 385 390 Arg Arg Pro Glu Leu Asp Gln Ala Ile Gln Ala Leu Gln Pro Leu Leu Leu 395 400 405 Asp Thr Asp Leu Glu Leu Ala Arg Arg Phe Gln Gln Thr Ser Gly Met Val 410 415 420 425 Met Ala Lys Gly Val Glu Asp Thr Ala Phe Phe Arg Tyr Asn Arg Leu Gly 430 435 440 Thr Leu Thr Glu Val Gly Ala Asp Pro Thr Glu Phe Ala Val Glu Pro Asp 445 450 455 Glu Phe His Ala Arg Leu Ala Arg Arg Gln Ala Glu Leu Pro Leu Ser Met 460 465 470 475 Thr Thr Leu Ser Thr His Asp Thr Lys Arg Ser Glu Asp Thr Arg Ala Arg 480 485 490 Ile Ser Val Ile Ser Glu Val Ala Gly Asp Trp Glu Lys Ala Leu Asn Arg 495 500 505 510 Leu Arg Asp Leu Ala Pro Leu Pro Asp Gly Pro Leu Ser Ala Leu Leu Trp 515 520 525 Gln Ala Ile Ala Gly Ala Trp Pro Ala Ser Arg Glu Arg Leu Gln Tyr Tyr 530 535 540 Ala Leu Lys Ala Ala Arg Glu Ala Gly Asn Ser Thr Asn Trp Thr Asp Pro 545 550 555 560 Ala Pro Ala Phe Glu Glu Lys Leu Lys Ala Ala Val Asp Ala Val Phe Asp 565 570 575 Asn Pro Ala Val Gln Ala Glu Val Glu Ala Leu Val Glu Leu Leu Glu Pro 580 585 590 595 Tyr Gly Ala Ser Asn Ser Leu Ala Ala Lys Leu Val Gln Leu Thr Met Pro 600 605 610 Gly Val Pro Asp Val Tyr Gln Gly Thr Glu Phe Trp Asp Arg Ser Leu Thr 615 620 625 Asp Pro Asp Asn Arg Arg Pro Phe Ser Phe Asp Asp Arg Arg Ala Ala Leu 630 635 640 645 Glu Gln Leu Asp Ala Gly Asp Leu Pro Ala Ser Phe Thr Asp Glu Arg Thr 650 655 660 Lys Leu Leu Val Thr Ser Arg Ala Leu Arg Leu Arg Arg Asp Arg Pro Glu 665 670 675 680 Leu Phe Thr Gly Tyr Arg Pro Val Leu Ala Ser Gly Pro Ala Ala Gly His 685 690 695 Leu Leu Ala Phe Asp Arg Gly Thr Ala Ala Ala Pro Gly Ala Leu Thr Leu 700 705 710 Ala Thr Arg Leu Pro Tyr Gly Leu Glu Gln Ser Gly Gly Trp Arg Asp Thr 715 720 725 730 Ala Val Glu Leu Asn Thr Ala Met Lys Asp Glu Leu Thr Gly Ala Gly Phe 735 740 745 Gly Pro Gly Ala Val Lys Ile Ala Asp Ile Phe Arg Ser Phe Pro Val Ala 750 755 760 765 Leu Leu Val Pro Gln Thr Gly Gly Glu Ser 770 775
【0083】配列番号:3 配列の長さ:2316 配列の型:核酸 トポロジー:直鎖状 配列 ATGAGGACAC CCGCCTCGAC CTACCGGCTG CAGATCAGGC GGGGTTTCAC GCTGTTTGAT 60 GCCGCCGAGA CCGTGCCCTA CCTGAAGTCA CTCGGGGTGG ACTGGATCTA CCTGTCGCCC 120 ATCCTGAAGG CAGAGAGCGG CTCCGACCAC GGCTATGACG TCACCGATCC CGCCGTAGTG 180 GACCCGGAGC GCGGCGGCCC TGAAGGGCTG GCCGCGGTGT CCAAGGCGGC CCGCGGTGCC 240 GGCATGGGCG TGCTGATCGA CATCGTGCCG AACCACGTGG GCGTGGCGTC GCCGCCGCAG 300 AACCCGTGGT GGTGGTCGCT GCTCAAGGAA GGGCGCGGGT CGCCCTACGC CGTGGCGTTC 360 GACGTCGACT GGGACCTGGC GGGGGGCCGC ATCCGGATCC CCGTCCTGGG CAGCGACGAC 420 GATCTGGACC AGCTCGAAAT CAAGGACGGC GAGCTGCGGT ACTACGACCA CCGCTTCCCG 480 CTGGCCGAGG GCAGCTACCG GGACGGCGAC TCCCCGCAGG ACGTCCACGG CCGGCAGCAC 540 TACGAACTCA TCGGCTGGCG GCGCGCCGAC AATGAACTGA ACTACCGCCG GTTCTTCGCG 600 GTGAACACGC TCGCCGGCAT CCGGGTGGAG GTGCCGCCGG TCTTCGATGA AGCGCACCAG 660 GAGGTGGTGC GCTGGTTCCG TGCGGGGCTC GCCGACGGGC TGCGGATCGA CCACCCGGAC 720 GGCCTGGCCG ATCCCGAGGG GTATTTGAAG CGGCTCCGTG AGGTCACCGG GGGCGCGTAC 780 CTGCTCATCG AAAAGATCCT CGAGCCGGGC GAACAGTTGC CGGCCAGCTT CGAGTGCGAA 840 GGCACCACCG GCTACGACGC CCTCGCGGAT GTCGACAGGG TCTTCGTGGA CCCGCGGGGA 900 CAGGTGCCGC TGGACCGTCT GGACGCACGG CTGCGCGGCG GTGCGCCGGC CGACTACGAG 960 GACATGATCC GCGGGACCAA GCGCCGGATC ACCGACGGCA TCCTGCACTC CGAGATCCTG 1020 CGCCTTGCCA GGCTGGTGCC CGAGCAGACC GGAATTCCCG GGGAGGCGGC CGCGGATGCG 1080 ATCGCGGAGA TCATCGCGGC CTTCCCGGTC TACCGGTCCT ATCTTCCCGA GGGCGCGGAG 1140 ATCCTGAAGG AGGCCTGCGA CCTCGCCGCG CGGAGGCGTC CGGAACTGGG CCAGACCGTC 1200 CAGCTGCTGC AGCCGCTGCT GCTGGATACC GACCTCGAGA TTTCCCGCAG GTTCCAGCAG 1260 ACCTCGGGAA TGGTCATGGC CAAAGGCGTG GAGGACACCG CGTTCTTCCG CTACAACCGG 1320 CTGGGAACGC TCACCGAGGT GGGCGCCGAC CCCACCGAGT TCTCGCTGGA ACCGGAGGAG 1380 TTTCACGTCC GGATGGCCCG CCGGCAGGCC GAACTCCCGC TCTCCATGAC CACCCTGAGC 1440 ACGCACGACA CCAAGCGCAG CGAGGACACC CGGGCCCGGA TCTCGGTGAT CGCCGAGGTC 1500 GCGCCTGAAT GGGAAAAGGC CCTGGACAGG CTGAACACCC TCGCTCCGCT GCCGGACGGC 1560 CCGCTCTCCA CGCTGCTCTG GCAGGCGATT GCGGGGGCAT GGCCGGCCAG CCGGGAACGC 1620 CTTCAGTCCT ACGCCCTGAA AGCGGCGCGC GAAGCCGGGA ACTCGACCAG CTGGACCGAT 1680 CCGGACCCGG CATTCGAGGA GGCACTTTCC GCCGTCGTCG ACTCCGCCTT CGACAATCCG 1740 GAGGTGCGTG CGGAACTTGA GGCCCTGGTG GGCCTCCTTG CGCCGCACGG TGCGTCCAAC 1800 TCGCTCGCGG CAAAGCTTGT CCAGCTGACC ATGCCGGGCG TTCCGGACGT GTACCAGGGC 1860 ACCGAGTTCT GGGACAGGTC GCTGACCGAT CCGGACAACC GGCGCCCCTT CAGCTTCGCC 1920 GAACGGATTA GGGCCTTGGA CCAGTTGGAC GCCGGCCACC GTCCGGACTC CTTCCAGGAC 1980 GAGGCGGTCA AGCTGCTGGT CACCTCGAGG GCGCTGCGGC TGCGGCGGAA CCGGCCCGAG 2040 CTCTTCACCG GCTACCGCCC CGTGCATGCC AGGGGCCCCG CCGCCGGGCA CCTGGTGGCG 2100 TTCGACCGCG GCGCCGGGGG AGTGCTGGCG CTTGCCACCC GGCTCCCCTA CGGGCTGGAA 2160 CAGTCGGGCG GCTGGCGGGA CACCGCCGTC GAGCTTGAAG CCGCCATGAC GGACGAACTG 2220 ACCGGCTCCA CTTTCGGGCC GGGACCGGCG GCGCTGTCAG AAGTCTTCCG GGCCTACCCG 2280 GTGGCCTTGT TGGTCCCCGC GACAGGAGGC AAGTCA 2316
【0084】配列番号:4 配列の長さ:2325 配列の型:核酸 トポロジー:直鎖状 配列 ATGAGAACGC CAGTCTCCAC GTACAGGCTG CAGATCAGGA AGGGATTCAC ACTCTTCGAC 60 GCGGCCAAAA CCGTTCCGTA CCTGCACTCG CTCGGCGTCG ACTGGGTCTA CCTTTCTCCG 120 GTCCTGACTG CCGAGCAGGG CTCCGACCAC GGGTACGACG TCACCGATCC CTCCGCCGTC 180 GACCCCGAAC GCGGCGGGCC GGAGGGCCTC GCGGCGGTTT CCAAGGCGGC CCGCGCCGCG 240 GGCATGGGCG TGCTGATCGA CATCGTGCCC AACCACGTGG GCGTCGCGAC GCCGGCGCAG 300 AACCCCTGGT GGTGGTCGCT GCTCAAGGAG GGACGCCAGT CCCGTTACGC GGAGGCGTTC 360 GACGTCGATT GGGACCTCGC CGGGGGACGC ATCCGGCTGC CGGTGCTCGG CAGCGACGAT 420 GACCTCGACC AGCTCGAAAT CAGGGACGGG GAGCTGCGGT ACTACGACCA CCGATTCCCG 480 CTCGCCGAGG GAACCTACGC CGAAGGCGAC GCCCCGCGGG ATGTCCACGC CCGGCAGCAC 540 TACGAGCTCA TCGGCTGGCG CCGCGCGGAC AACGAGCTGA ACTACCGCCG CTTTTTCGCG 600 GTGAACACGC TCGCCGGCGT CCGCGTGGAA ATCCCCGCCG TCTTCGACGA GGCACACCAG 660 GAGGTGGTGC GCTGGTTCCG CGAGGACCTT GCGGACGGCC TGCGGATCGA CCACCCGGAC 720 GGCCTCGCTG ACCCCGAGGG GTACCTGAAG CGACTCCGGG AAGTCACCGG CGGCGCTTAC 780 CTGCTGATCG AAAAGATCCT GGAGCCGGGG GAGCAGCTGC CCGCCAGCTT CGAGTGTGAA 840 GGCACCACAG GCTACGACGC CCTCGCCGAC GTCGACCGGG TTCTCGTGGA CCCGCGCGGC 900 CAGGAACCGC TGGACCGGCT TGACGCGTCC CTGCGTGGCG GCGAGCCCGC CGACTACCAG 960 GACATGATCC GCGGAACCAA GCGCCGGATC ACCGACGGTA TCCTGCACTC GGAGATCCTG 1020 CGGCTGGCCC GGCTGGTTCC GGGCGACGCC AACGTTTCAA TCGACGCCGG AGCCGACGCT 1080 CTCGCCGAAA TCATCGCCGC CTTCCCGGTC TACCGCACCT ACCTGCCGGA GGGCGCCGAG 1140 GTCCTGAAGG AGGCGTGCGA GCTTGCCGCG CGTAGGCGGC CGGAACTCGA CCAGGCCATC 1200 CAGGCTCTGC AGCCGCTGCT GCTGGACACG GACCTCGAGC TTGCCCGGCG CTTCCAGCAG 1260 ACCTCGGGCA TGGTCATGGC CAAGGGCGTG GAGGACACCG CGTTCTTCCG CTACAACCGC 1320 CTGGGCACCC TCACGGAAGT GGGCGCCGAC CCCACCGAGT TCGCCGTGGA GCCGGACGAG 1380 TTCCACGCCC GGCTGGCACG CCGGCAGGCC GAGCTTCCGC TGTCCATGAC GACGCTGAGC 1440 ACGCACGACA CCAAGCGCAG CGAGGACACC CGAGCAAGGA TTTCGGTCAT TTCCGAGGTT 1500 GCGGGTGACT GGGAAAAGGC CTTGAACCGG CTGCGCGACC TGGCCCCGCT GCCGGACGGC 1560 CCGCTGTCCG CGCTGCTCTG GCAGGCCATT GCCGGCGCCT GGCCCGCCAG CCGGGAACGC 1620 CTGCAGTACT ACGCGCTGAA GGCCGCGCGT GAAGCGGGGA ACTCGACCAA CTGGACCGAT 1680 CCGGCCCCCG CGTTCGAGGA GAAGCTGAAG GCCGCGGTCG ACGCCGTGTT CGACAATCCC 1740 GCCGTGCAGG CCGAGGTGGA AGCCCTCGTC GAGCTCCTGG AGCCGTACGG AGCTTCGAAC 1800 TCCCTCGCCG CCAAGCTCGT GCAGCTGACC ATGCCCGGCG TCCCGGACGT CTACCAGGGC 1860 ACGGAGTTCT GGGACCGGTC GCTGACGGAC CCGGACAACC GGCGGCCGTT CAGCTTCGAC 1920 GACCGCCGCG CCGCGCTGGA GCAGCTGGAT GCCGGCGACC TTCCCGCGTC ATTTACCGAT 1980 GAGCGGACGA AGCTGCTAGT GACGTCGCGC GCGCTGCGGC TGCGCCGGGA CCGTCCGGAG 2040 CTGTTCACGG GGTACCGGCC GGTCCTGGCC AGCGGGCCCG CCGCCGGGCA CCTGCTCGCG 2100 TTCGACCGCG GCACCGCGGC GGCGCCGGGT GCATTGACCC TCGCCACGCG GCTTCCCTAC 2160 GGGCTGGAAC AGTCGGGTGG ATGGCGGGAC ACCGCCGTCG AACTTAACAC CGCCATGAAA 2220 GACGAACTGA CCGGTGCCGG CTTCGGACCG GGGGCAGTGA AGATCGCCGA CATCTTCCGG 2280 TCGTTCCCCG TTGCGCTGCT GGTGCCGCAG ACAGGAGGAG AGTCA 2325
【0085】配列番号:5 配列の長さ:2936 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 起源 生物名:リゾビウム・スピーシーズ(Rhizobium sp.) 株名:M-11(FERM BP-4130) 配列の特徴 特徴を表わす記号:5´UTR 存在位置:1..564 特徴を決定した方法:E 特徴を表わす記号:mat peptide 存在位置:565..2880 特徴を決定した方法:S 特徴を表わす記号:3´UTR 存在位置:2881..2936 特徴を決定した方法:E 配列 CGTGCTCTAC TTCAACGCGC ACGACGGCGA CGTCGTGTTC AAGCTCCCGT CGGATGAATA 60 CGCCCCGGCC TGGGACGTCA TCATCGACAC CGCCGGCGCG GGTGCCGATT CCGAACCCGT 120 GCAGGCTGGC GGCAAACTCA CCGTGGCAGC GAAATCGCTC GTGGTGCTCC GTGCCCACAG 180 CGCCCCGGAG GAGGAACCGG ACCACTCGGT GGCCGCCTCC CTCGCAGCGC TGACGCAGAC 240 TGCGACCGCC GAAACCGCGG CGCTCACCGC CCCCACCGTT CCGGAGCCGA GGAAGACCAA 300 GAAGGCAGCG CCGAAGCCGG AAGAGGAGGC TCCCGACGAG GCGGCGCCGA AGCCGGAAGA 360 GAAGGCTCCC GACGAGGCGG CGGCGAAGCC GGAAGAGGCT GCTTCCGACG AGGCGGCGGC 420 GAAGCCGGAA GAGAAGGCTC CCGACGAGGC GGCGGCGAAG CCGGAAGAGG CTGCTTCCGA 480 CGAGGCGGCG GCGAAGCCCG CGGGGAAGGC AGCGGCCAAA ACGGCCGGCA GGCGAGCGCC 540 AGGCAAGCAG GGCGGGACGG GCTC 564 ATG AGG ACA CCC GCC TCG ACC TAC CGG CTG CAG ATC AGG CGG GGT TTC 612 Met Arg Thr Pro Ala Ser Thr Tyr Arg Leu Gln Ile Arg Arg Gly Phe 1 5 10 15 ACG CTG TTT GAT GCC GCC GAG ACC GTG CCC TAC CTG AAG TCA CTC GGG 660 Thr Leu Phe Asp Ala Ala Glu Thr Val Pro Tyr Leu Lys Ser Leu Gly 20 25 30 GTG GAC TGG ATC TAC CTG TCG CCC ATC CTG AAG GCA GAG AGC GGC TCC 708 Val Asp Trp Ile Tyr Leu Ser Pro Ile Leu Lys Ala Glu Ser Gly Ser 35 40 45 GAC CAC GGC TAT GAC GTC ACC GAT CCC GCC GTA GTG GAC CCG GAG CGC 756 Asp His Gly Tyr Asp Val Thr Asp Pro Ala Val Val Asp Pro Glu Arg 50 55 60 GGC GGC CCT GAA GGG CTG GCC GCG GTG TCC AAG GCG GCC CGC GGT GCC 804 Gly Gly Pro Glu Gly Leu Ala Ala Val Ser Lys Ala Ala Arg Gly Ala 65 70 75 80 GGC ATG GGC GTG CTG ATC GAC ATC GTG CCG AAC CAC GTG GGC GTG GCG 852 Gly Met Gly Val Leu Ile Asp Ile Val Pro Asn His Val Gly Val Ala 85 90 95 TCG CCG CCG CAG AAC CCG TGG TGG TGG TCG CTG CTC AAG GAA GGG CGC 900 Ser Pro Pro Gln Asn Pro Trp Trp Trp Ser Leu Leu Lys Glu Gly Arg 100 105 110 GGG TCG CCC TAC GCC GTG GCG TTC GAC GTC GAC TGG GAC CTG GCG GGG 948 Gly Ser Pro Tyr Ala Val Ala Phe Asp Val Asp Trp Asp Leu Ala Gly 115 120 125 GGC CGC ATC CGG ATC CCC GTC CTG GGC AGC GAC GAC GAT CTG GAC CAG 996 Gly Arg Ile Arg Ile Pro Val Leu Gly Ser Asp Asp Asp Leu Asp Gln 130 135 140 CTC GAA ATC AAG GAC GGC GAG CTG CGG TAC TAC GAC CAC CGC TTC CCG 1044 Leu Glu Ile Lys Asp Gly Glu Leu Arg Tyr Tyr Asp His Arg Phe Pro 145 150 155 160 CTG GCC GAG GGC AGC TAC CGG GAC GGC GAC TCC CCG CAG GAC GTC CAC 1092 Leu Ala Glu Gly Ser Tyr Arg Asp Gly Asp Ser Pro Gln Asp Val His 165 170 175 GGC CGG CAG CAC TAC GAA CTC ATC GGC TGG CGG CGC GCC GAC AAT GAA 1140 Gly Arg Gln His Tyr Glu Leu Ile Gly Trp Arg Arg Ala Asp Asn Glu 180 185 190 CTG AAC TAC CGC CGG TTC TTC GCG GTG AAC ACG CTC GCC GGC ATC CGG 1188 Leu Asn Tyr Arg Arg Phe Phe Ala Val Asn Thr Leu Ala Gly Ile Arg 195 200 205 GTG GAG GTG CCG CCG GTC TTC GAT GAA GCG CAC CAG GAG GTG GTG CGC 1236 Val Glu Val Pro Pro Val Phe Asp Glu Ala His Gln Glu Val Val Arg 210 215 220 TGG TTC CGT GCG GGG CTC GCC GAC GGG CTG CGG ATC GAC CAC CCG GAC 1284 Trp Phe Arg Ala Gly Leu Ala Asp Gly Leu Arg Ile Asp His Pro Asp 225 230 235 240 GGC CTG GCC GAT CCC GAG GGG TAT TTG AAG CGG CTC CGT GAG GTC ACC 1332 Gly Leu Ala Asp Pro Glu Gly Tyr Leu Lys Arg Leu Arg Glu Val Thr 245 250 255 GGG GGC GCG TAC CTG CTC ATC GAA AAG ATC CTC GAG CCG GGC GAA CAG 1380 Gly Gly Ala Tyr Leu Leu Ile Glu Lys Ile Leu Glu Pro Gly Glu Gln 260 265 270 TTG CCG GCC AGC TTC GAG TGC GAA GGC ACC ACC GGC TAC GAC GCC CTC 1428 Leu Pro Ala Ser Phe Glu Cys Glu Gly Thr Thr Gly Tyr Asp Ala Leu 275 280 285 GCG GAT GTC GAC AGG GTC TTC GTG GAC CCG CGG GGA CAG GTG CCG CTG 1476 Ala Asp Val Asp Arg Val Phe Val Asp Pro Arg Gly Gln Val Pro Leu 290 295 300 GAC CGT CTG GAC GCA CGG CTG CGC GGC GGT GCG CCG GCC GAC TAC GAG 1524 Asp Arg Leu Asp Ala Arg Leu Arg Gly Gly Ala Pro Ala Asp Tyr Glu 305 310 315 320 GAC ATG ATC CGC GGG ACC AAG CGC CGG ATC ACC GAC GGC ATC CTG CAC 1572 Asp Met Ile Arg Gly Thr Lys Arg Arg Ile Thr Asp Gly Ile Leu His 325 330 335 TCC GAG ATC CTG CGC CTT GCC AGG CTG GTG CCC GAG CAG ACC GGA ATT 1620 Ser Glu Ile Leu Arg Leu Ala Arg Leu Val Pro Glu Gln Thr Gly Ile 340 345 350 CCC GGG GAG GCG GCC GCG GAT GCG ATC GCG GAG ATC ATC GCG GCC TTC 1668 Pro Gly Glu Ala Ala Ala Asp Ala Ile Ala Glu Ile Ile Ala Ala Phe 355 360 365 CCG GTC TAC CGG TCC TAT CTT CCC GAG GGC GCG GAG ATC CTG AAG GAG 1716 Pro Val Tyr Arg Ser Tyr Leu Pro Glu Gly Ala Glu Ile Leu Lys Glu 370 375 380 GCC TGC GAC CTC GCC GCG CGG AGG CGT CCG GAA CTG GGC CAG ACC GTC 1764 Ala Cys Asp Leu Ala Ala Arg Arg Arg Pro Glu Leu Gly Gln Thr Val 385 390 395 400 CAG CTG CTG CAG CCG CTG CTG CTG GAT ACC GAC CTC GAG ATT TCC CGC 1812 Gln Leu Leu Gln Pro Leu Leu Leu Asp Thr Asp Leu Glu Ile Ser Arg 405 410 415 AGG TTC CAG CAG ACC TCG GGA ATG GTC ATG GCC AAA GGC GTG GAG GAC 1860 Arg Phe Gln Gln Thr Ser Gly Met Val Met Ala Lys Gly Val Glu Asp 420 425 430 ACC GCG TTC TTC CGC TAC AAC CGG CTG GGA ACG CTC ACC GAG GTG GGC 1908 Thr Ala Phe Phe Arg Tyr Asn Arg Leu Gly Thr Leu Thr Glu Val Gly 435 440 445 GCC GAC CCC ACC GAG TTC TCG CTG GAA CCG GAG GAG TTT CAC GTC CGG 1956 Ala Asp Pro Thr Glu Phe Ser Leu Glu Pro Glu Glu Phe His Val Arg 450 455 460 ATG GCC CGC CGG CAG GCC GAA CTC CCG CTC TCC ATG ACC ACC CTG AGC 2004 Met Ala Arg Arg Gln Ala Glu Leu Pro Leu Ser Met Thr Thr Leu Ser 465 470 475 480 ACG CAC GAC ACC AAG CGC AGC GAG GAC ACC CGG GCC CGG ATC TCG GTG 2052 Thr His Asp Thr Lys Arg Ser Glu Asp Thr Arg Ala Arg Ile Ser Val 485 490 495 ATC GCC GAG GTC GCG CCT GAA TGG GAA AAG GCC CTG GAC AGG CTG AAC 2100 Ile Ala Glu Val Ala Pro Glu Trp Glu Lys Ala Leu Asp Arg Leu Asn 500 505 510 ACC CTC GCT CCG CTG CCG GAC GGC CCG CTC TCC ACG CTG CTC TGG CAG 2148 Thr Leu Ala Pro Leu Pro Asp Gly Pro Leu Ser Thr Leu Leu Trp Gln 515 520 525 GCG ATT GCG GGG GCA TGG CCG GCC AGC CGG GAA CGC CTT CAG TCC TAC 2196 Ala Ile Ala Gly Ala Trp Pro Ala Ser Arg Glu Arg Leu Gln Ser Tyr 530 535 540 GCC CTG AAA GCG GCG CGC GAA GCC GGG AAC TCG ACC AGC TGG ACC GAT 2244 Ala Leu Lys Ala Ala Arg Glu Ala Gly Asn Ser Thr Ser Trp Thr Asp 545 550 555 560 CCG GAC CCG GCA TTC GAG GAG GCA CTT TCC GCC GTC GTC GAC TCC GCC 2292 Pro Asp Pro Ala Phe Glu Glu Ala Leu Ser Ala Val Val Asp Ser Ala 565 570 575 TTC GAC AAT CCG GAG GTG CGT GCG GAA CTT GAG GCC CTG GTG GGC CTC 2340 Phe Asp Asn Pro Glu Val Arg Ala Glu Leu Glu Ala Leu Val Gly Leu 580 585 590 CTT GCG CCG CAC GGT GCG TCC AAC TCG CTC GCG GCA AAG CTT GTC CAG 2388 Leu Ala Pro His Gly Ala Ser Asn Ser Leu Ala Ala Lys Leu Val Gln 595 600 605 CTG ACC ATG CCG GGC GTT CCG GAC GTG TAC CAG GGC ACC GAG TTC TGG 2436 Leu Thr Met Pro Gly Val Pro Asp Val Tyr Gln Gly Thr Glu Phe Trp 610 615 620 GAC AGG TCG CTG ACC GAT CCG GAC AAC CGG CGC CCC TTC AGC TTC GCC 2484 Asp Arg Ser Leu Thr Asp Pro Asp Asn Arg Arg Pro Phe Ser Phe Ala 625 630 635 640 GAA CGG ATT AGG GCC TTG GAC CAG TTG GAC GCC GGC CAC CGT CCG GAC 2532 Glu Arg Ile Arg Ala Leu Asp Gln Leu Asp Ala Gly His Arg Pro Asp 645 650 655 TCC TTC CAG GAC GAG GCG GTC AAG CTG CTG GTC ACC TCG AGG GCG CTG 2580 Ser Phe Gln Asp Glu Ala Val Lys Leu Leu Val Thr Ser Arg Ala Leu 660 665 670 CGG CTG CGG CGG AAC CGG CCC GAG CTC TTC ACC GGC TAC CGC CCC GTG 2628 Arg Leu Arg Arg Asn Arg Pro Glu Leu Phe Thr Gly Tyr Arg Pro Val 675 680 685 CAT GCC AGG GGC CCC GCC GCC GGG CAC CTG GTG GCG TTC GAC CGC GGC 2676 His Ala Arg Gly Pro Ala Ala Gly His Leu Val Ala Phe Asp Arg Gly 690 695 700 GCC GGG GGA GTG CTG GCG CTT GCC ACC CGG CTC CCC TAC GGG CTG GAA 2724 Ala Gly Gly Val Leu Ala Leu Ala Thr Arg Leu Pro Tyr Gly Leu Glu 705 710 715 720 CAG TCG GGC GGC TGG CGG GAC ACC GCC GTC GAG CTT GAA GCC GCC ATG 2772 Gln Ser Gly Gly Trp Arg Asp Thr Ala Val Glu Leu Glu Ala Ala Met 725 730 735 ACG GAC GAA CTG ACC GGC TCC ACT TTC GGG CCG GGA CCG GCG GCG CTG 2820 Thr Asp Glu Leu Thr Gly Ser Thr Phe Gly Pro Gly Pro Ala Ala Leu 740 745 750 TCA GAA GTC TTC CGG GCC TAC CCG GTG GCC TTG TTG GTC CCC GCG ACA 2868 Ser Glu Val Phe Arg Ala Tyr Pro Val Ala Leu Leu Val Pro Ala Thr 755 760 765 GGA GGC AAG TCA 2880 Gly Gly Lys Ser 770 TGACGCAGCC CAACGATGCG GCCAAGCCGG TGCAGGGAGC GGGGCGCTTC GATATC 2936
【0086】配列番号:6 配列の長さ:3084 配列の型:核酸 鎖の数:二本鎖 トポロジー:直鎖状 配列の種類:Genomic DNA 配列の特徴 起源 生物名:アルスロバクター・スピーシーズ(Arthrobacte
r sp.) 株名:Q36(FERM BP-4316) 配列の特徴 特徴を表わす記号:5´UTR 存在位置:1..677 特徴を決定した方法:E 特徴を表わす記号:mat peptide 存在位置:678..3002 特徴を決定した方法:S 特徴を表わす記号:3´UTR 存在位置:3003..3073 特徴を決定した方法:E 配列 GATCCGGACG GCAACCTCAT GTCCCCGGAG GACTGGGACA GCGGCTTCGG CCGTTCGGTG 60 GGCATGTTCC TCAACGGCGA CGGCATCCAG GGCCACGATG ACCGCGGCCG CCGCATCACG 120 GACGTGAACT TCCTGCTGTA CTTCAACGCC CACGACGGCG ACGTCGAGTT CACGCTGCCG 180 CCGGACGAAT ACGCCCCGGC CTGGGACGTC ATCATCGACA CCGCCGGTGA AGGGGCCGAC 240 TCCAAGCCCG CGGACGCCGG AACCATCCTG TCCGTTGCGG CCAAGTCGCT GGTTGTGCTT 300 CGCGCCCACA GCGCACCGGA GGAGGAGCCT GACCATTCCG TGGCTGCTTC CCTGGCTGCA 360 CTGACGCAGA CCGCCACCGC CGAGACGGCG GCGCTCACAG CTCCTGCCGT TCCCGAGCCG 420 GCCAAGACGA AGAAGCCGGC CGCTGACCCG GTTGCTGAAC CGGCCGACCC GCCGGTTGCT 480 GACCCGGCCG ACCCGGTTGC TGACCCGGTT GCTGACCCGG CGCCGGAACC GGCTGCGGAG 540 CCTGCGAAAT CCGCAGCGGA ACCTGGTGCG GAGCCTGCGA AGGACCCGGA GGAGCAGCCG 600 GCGGAAAAGC CGGCGCGCAA GCCTGCGGCA AAGCGCGGCG GCCACCTGAG GGCGGTCAAG 660 CCCGCTGGGG AGGACGC 677 ATG AGA ACG CCA GTC TCC ACG TAC AGG CTG CAG ATC AGG AAG GGA TTC 725 Met Arg Thr Pro Val Ser Thr Tyr Arg Leu Gln Ile Arg Lys Gly Phe 1 5 10 15 ACA CTC TTC GAC GCG GCC AAA ACC GTT CCG TAC CTG CAC TCG CTC GGC 773 Thr Leu Phe Asp Ala Ala Lys Thr Val Pro Tyr Leu His Ser Leu Gly 20 25 30 GTC GAC TGG GTC TAC CTT TCT CCG GTC CTG ACT GCC GAG CAG GGC TCC 821 Val Asp Trp Val Tyr Leu Ser Pro Val Leu Thr Ala Glu Gln Gly Ser 35 40 45 GAC CAC GGG TAC GAC GTC ACC GAT CCC TCC GCC GTC GAC CCC GAA CGC 869 Asp His Gly Tyr Asp Val Thr Asp Pro Ser Ala Val Asp Pro Glu Arg 50 55 60 GGC GGG CCG GAG GGC CTC GCG GCG GTT TCC AAG GCG GCC CGC GCC GCG 917 Gly Gly Pro Glu Gly Leu Ala Ala Val Ser Lys Ala Ala Arg Ala Ala 65 70 75 80 GGC ATG GGC GTG CTG ATC GAC ATC GTG CCC AAC CAC GTG GGC GTC GCG 965 Gly Met Gly Val Leu Ile Asp Ile Val Pro Asn His Val Gly Val Ala 85 90 95 ACG CCG GCG CAG AAC CCC TGG TGG TGG TCG CTG CTC AAG GAG GGA CGC 1013 Thr Pro Ala Gln Asn Pro Trp Trp Trp Ser Leu Leu Lys Glu Gly Arg 100 105 110 CAG TCC CGT TAC GCG GAG GCG TTC GAC GTC GAT TGG GAC CTC GCC GGG 1061 Gln Ser Arg Tyr Ala Glu Ala Phe Asp Val Asp Trp Asp Leu Ala Gly 115 120 125 GGA CGC ATC CGG CTG CCG GTG CTC GGC AGC GAC GAT GAC CTC GAC CAG 1109 Gly Arg Ile Arg Leu Pro Val Leu Gly Ser Asp Asp Asp Leu Asp Gln 130 135 140 CTC GAA ATC AGG GAC GGG GAG CTG CGG TAC TAC GAC CAC CGA TTC CCG 1157 Leu Glu Ile Arg Asp Gly Glu Leu Arg Tyr Tyr Asp His Arg Phe Pro 145 150 155 160 CTC GCC GAG GGA ACC TAC GCC GAA GGC GAC GCC CCG CGG GAT GTC CAC 1205 Leu Ala Glu Gly Thr Tyr Ala Glu Gly Asp Ala Pro Arg Asp Val His 165 170 175 GCC CGG CAG CAC TAC GAG CTC ATC GGC TGG CGC CGC GCG GAC AAC GAG 1253 Ala Arg Gln His Tyr Glu Leu Ile Gly Trp Arg Arg Ala Asp Asn Glu 180 185 190 CTG AAC TAC CGC CGC TTT TTC GCG GTG AAC ACG CTC GCC GGC GTC CGC 1301 Leu Asn Tyr Arg Arg Phe Phe Ala Val Asn Thr Leu Ala Gly Val Arg 195 200 205 GTG GAA ATC CCC GCC GTC TTC GAC GAG GCA CAC CAG GAG GTG GTG CGC 1349 Val Glu Ile Pro Ala Val Phe Asp Glu Ala His Gln Glu Val Val Arg 210 215 220 TGG TTC CGC GAG GAC CTT GCG GAC GGC CTG CGG ATC GAC CAC CCG GAC 1397 Trp Phe Arg Glu Asp Leu Ala Asp Gly Leu Arg Ile Asp His Pro Asp 225 230 235 240 GGC CTC GCT GAC CCC GAG GGG TAC CTG AAG CGA CTC CGG GAA GTC ACC 1445 Gly Leu Ala Asp Pro Glu Gly Tyr Leu Lys Arg Leu Arg Glu Val Thr 245 250 255 GGC GGC GCT TAC CTG CTG ATC GAA AAG ATC CTG GAG CCG GGG GAG CAG 1493 Gly Gly Ala Tyr Leu Leu Ile Glu Lys Ile Leu Glu Pro Gly Glu Gln 260 265 270 CTG CCC GCC AGC TTC GAG TGT GAA GGC ACC ACA GGC TAC GAC GCC CTC 1541 Leu Pro Ala Ser Phe Glu Cys Glu Gly Thr Thr Gly Tyr Asp Ala Leu 275 280 285 GCC GAC GTC GAC CGG GTT CTC GTG GAC CCG CGC GGC CAG GAA CCG CTG 1589 Ala Asp Val Asp Arg Val Leu Val Asp Pro Arg Gly Gln Glu Pro Leu 290 295 300 GAC CGG CTT GAC GCG TCC CTG CGT GGC GGC GAG CCC GCC GAC TAC CAG 1637 Asp Arg Leu Asp Ala Ser Leu Arg Gly Gly Glu Pro Ala Asp Tyr Gln 305 310 315 320 GAC ATG ATC CGC GGA ACC AAG CGC CGG ATC ACC GAC GGT ATC CTG CAC 1685 Asp Met Ile Arg Gly Thr Lys Arg Arg Ile Thr Asp Gly Ile Leu His 325 330 335 TCG GAG ATC CTG CGG CTG GCC CGG CTG GTT CCG GGC GAC GCC AAC GTT 1733 Ser Glu Ile Leu Arg Leu Ala Arg Leu Val Pro Gly Asp Ala Asn Val 340 345 350 TCA ATC GAC GCC GGA GCC GAC GCT CTC GCC GAA ATC ATC GCC GCC TTC 1781 Ser Ile Asp Ala Gly Ala Asp Ala Leu Ala Glu Ile Ile Ala Ala Phe 355 360 365 CCG GTC TAC CGC ACC TAC CTG CCG GAG GGC GCC GAG GTC CTG AAG GAG 1829 Pro Val Tyr Arg Thr Tyr Leu Pro Glu Gly Ala Glu Val Leu Lys Glu 370 375 380 GCG TGC GAG CTT GCC GCG CGT AGG CGG CCG GAA CTC GAC CAG GCC ATC 1877 Ala Cys Glu Leu Ala Ala Arg Arg Arg Pro Glu Leu Asp Gln Ala Ile 385 390 395 400 CAG GCT CTG CAG CCG CTG CTG CTG GAC ACG GAC CTC GAG CTT GCC CGG 1925 Gln Ala Leu Gln Pro Leu Leu Leu Asp Thr Asp Leu Glu Leu Ala Arg 405 410 415 CGC TTC CAG CAG ACC TCG GGC ATG GTC ATG GCC AAG GGC GTG GAG GAC 1973 Arg Phe Gln Gln Thr Ser Gly Met Val Met Ala Lys Gly Val Glu Asp 420 425 430 ACC GCG TTC TTC CGC TAC AAC CGC CTG GGC ACC CTC ACG GAA GTG GGC 2021 Thr Ala Phe Phe Arg Tyr Asn Arg Leu Gly Thr Leu Thr Glu Val Gly 435 440 445 GCC GAC CCC ACC GAG TTC GCC GTG GAG CCG GAC GAG TTC CAC GCC CGG 2069 Ala Asp Pro Thr Glu Phe Ala Val Glu Pro Asp Glu Phe His Ala Arg 450 455 460 CTG GCA CGC CGG CAG GCC GAG CTT CCG CTG TCC ATG ACG ACG CTG AGC 2117 Leu Ala Arg Arg Gln Ala Glu Leu Pro Leu Ser Met Thr Thr Leu Ser 465 470 475 480 ACG CAC GAC ACC AAG CGC AGC GAG GAC ACC CGA GCA AGG ATT TCG GTC 2165 Thr His Asp Thr Lys Arg Ser Glu Asp Thr Arg Ala Arg Ile Ser Val 485 490 495 ATT TCC GAG GTT GCG GGT GAC TGG GAA AAG GCC TTG AAC CGG CTG CGC 2213 Ile Ser Glu Val Ala Gly Asp Trp Glu Lys Ala Leu Asn Arg Leu Arg 500 505 510 GAC CTG GCC CCG CTG CCG GAC GGC CCG CTG TCC GCG CTG CTC TGG CAG 2261 Asp Leu Ala Pro Leu Pro Asp Gly Pro Leu Ser Ala Leu Leu Trp Gln 515 520 525 GCC ATT GCC GGC GCC TGG CCC GCC AGC CGG GAA CGC CTG CAG TAC TAC 2309 Ala Ile Ala Gly Ala Trp Pro Ala Ser Arg Glu Arg Leu Gln Tyr Tyr 530 535 540 GCG CTG AAG GCC GCG CGT GAA GCG GGG AAC TCG ACC AAC TGG ACC GAT 2357 Ala Leu Lys Ala Ala Arg Glu Ala Gly Asn Ser Thr Asn Trp Thr Asp 545 550 555 560 CCG GCC CCC GCG TTC GAG GAG AAG CTG AAG GCC GCG GTC GAC GCC GTG 2405 Pro Ala Pro Ala Phe Glu Glu Lys Leu Lys Ala Ala Val Asp Ala Val 565 570 575 TTC GAC AAT CCC GCC GTG CAG GCC GAG GTG GAA GCC CTC GTC GAG CTC 2453 Phe Asp Asn Pro Ala Val Gln Ala Glu Val Glu Ala Leu Val Glu Leu 580 585 590 CTG GAG CCG TAC GGA GCT TCG AAC TCC CTC GCC GCC AAG CTC GTG CAG 2501 Leu Glu Pro Tyr Gly Ala Ser Asn Ser Leu Ala Ala Lys Leu Val Gln 595 600 605 CTG ACC ATG CCC GGC GTC CCG GAC GTC TAC CAG GGC ACG GAG TTC TGG 2549 Leu Thr Met Pro Gly Val Pro Asp Val Tyr Gln Gly Thr Glu Phe Trp 610 615 620 GAC CGG TCG CTG ACG GAC CCG GAC AAC CGG CGG CCG TTC AGC TTC GAC 2597 Asp Arg Ser Leu Thr Asp Pro Asp Asn Arg Arg Pro Phe Ser Phe Asp 625 630 635 640 GAC CGC CGC GCC GCG CTG GAG CAG CTG GAT GCC GGC GAC CTT CCC GCG 2645 Asp Arg Arg Ala Ala Leu Glu Gln Leu Asp Ala Gly Asp Leu Pro Ala 645 650 655 TCA TTT ACC GAT GAG CGG ACG AAG CTG CTA GTG ACG TCG CGC GCG CTG 2693 Ser Phe Thr Asp Glu Arg Thr Lys Leu Leu Val Thr Ser Arg Ala Leu 660 665 670 CGG CTG CGC CGG GAC CGT CCG GAG CTG TTC ACG GGG TAC CGG CCG GTC 2741 Arg Leu Arg Arg Asp Arg Pro Glu Leu Phe Thr Gly Tyr Arg Pro Val 675 680 685 CTG GCC AGC GGG CCC GCC GCC GGG CAC CTG CTC GCG TTC GAC CGC GGC 2789 Leu Ala Ser Gly Pro Ala Ala Gly His Leu Leu Ala Phe Asp Arg Gly 690 695 700 ACC GCG GCG GCG CCG GGT GCA TTG ACC CTC GCC ACG CGG CTT CCC TAC 2837 Thr Ala Ala Ala Pro Gly Ala Leu Thr Leu Ala Thr Arg Leu Pro Tyr 705 710 715 720 GGG CTG GAA CAG TCG GGT GGA TGG CGG GAC ACC GCC GTC GAA CTT AAC 2885 Gly Leu Glu Gln Ser Gly Gly Trp Arg Asp Thr Ala Val Glu Leu Asn 725 730 735 ACC GCC ATG AAA GAC GAA CTG ACC GGT GCC GGC TTC GGA CCG GGG GCA 2933 Thr Ala Met Lys Asp Glu Leu Thr Gly Ala Gly Phe Gly Pro Gly Ala 740 745 750 GTG AAG ATC GCC GAC ATC TTC CGG TCG TTC CCC GTT GCG CTG CTG GTG 2981 Val Lys Ile Ala Asp Ile Phe Arg Ser Phe Pro Val Ala Leu Leu Val 755 760 765 CCG CAG ACA GGA GGA GAG TCA 3002 Pro Gln Thr Gly Gly Glu Ser 770 775 TGACGCACAC CTACCCGCGG GAAGCCGCGA AACCCGTCCT GGGCCCCGCA CGCTACGACG 3062 TCTGGGCGCC C 3073
【0087】配列番号:7 配列の長さ:20 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:N末端フラグメント 配列 Met Arg Thr Pro Ala Ser Thr Tyr Arg Leu Gln Ile Arg Arg Gly Phe Thr 1 5 10 15 Leu Phe Asp 20
【0088】配列番号:8 配列の長さ:20 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:N末端フラグメント 配列 Met Arg Thr Pro Val Ser Thr Tyr Arg Leu Gln Ile Arg Lys Gly Phe Thr 1 5 10 15 Leu Phe Asp 20
【0089】配列番号:9 配列の長さ:21 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部フラグメント 配列 Arg Ser Glu Asp Thr Arg Ala Arg Ile Ser Val Ile Ala Glu Val Ala Pro 1 5 10 15 Glu Trp Glu Lys 20
【0090】配列番号:10 配列の長さ:21 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部フラグメント 配列 Leu Val Gln Leu Thr Met Pro Gly Val Pro Asp Val Tyr Gln Gly Thr Glu 1 5 10 15 Phe Trp Asp Arg 20
【0091】配列番号:11 配列の長さ:20 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部フラグメント 配列 Leu Val Gln Leu Thr Met Pro Gly Val Pro Asp Val Tyr Gln Gly Thr Glu 1 5 10 15 Phe Trp Asp 20
【0092】配列番号:12 配列の長さ:20 配列の型:アミノ酸 トポロジー:直鎖状 配列の種類:ペプチド フラグメント型:中間部フラグメント 配列 Glu Gly Arg Gln Ser Arg Tyr Ala Glu Ala Phe Asp Val Asp Trp Asp Leu 1 5 10 15 Ala Gly Gly 20
【図面の簡単な説明】
【図1】酵素M−11の至適温度を示す図である。
【図2】酵素Q36の至適温度を示す図である。
【図3】酵素M−11の至適pHを示す図である。
【図4】酵素Q36の至適pHを示す図である。
【図5】酵素M−11の熱安定性を示す図である。
【図6】酵素Q36の熱安定性を示す図である。
【図7】酵素M−11のpH安定性を示す図である。
【図8】酵素Q36のpH安定性を示す図である。
【図9】この発明による組換えDNAであるpBMT7
の制限酵素地図である。なお、図中、太線表示部は、酵
素M−11をコードするDNAを示す。
【図10】この発明による組換えDNAであるpBQT
13の制限酵素地図である。なお、図中、太線表示部
は、酵素Q36をコードするDNAを示す。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI 技術表示箇所 C12R 1:41) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:06) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:13) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:20) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:265) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:32) (C12N 15/09 ZNA C12R 1:01) C12R 1:41) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:06) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:13) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:20) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:265) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:32) (C12N 15/00 ZNA A C12R 1:01)

Claims (24)

    【特許請求の範囲】
  1. 【請求項1】 グルコース重合度3以上の還元性澱粉糖
    から末端にトレハロース構造を有する非還元性糖質を生
    成する酵素をコードするDNA。
  2. 【請求項2】 酵素が下記の理化学的性質を有する請求
    項1に記載のDNA。 (1) 分子量 約76,000乃至87,000ダルトン(SDS−ポ
    リアクリルアミドゲル電気泳動) (2) 等電点 約3.6乃至4.6(等電点電気泳動)
  3. 【請求項3】 酵素が配列表における配列番号1又は2
    に示すアミノ酸配列かそれに相同的なアミノ酸配列を有
    する請求項1又は2に記載のDNA。
  4. 【請求項4】 DNAが配列表における配列番号3又は
    4に示す塩基配列かそれに相同的な塩基配列又はそれら
    に相補的な塩基配列を有する請求項1、2又は3に記載
    のDNA。
  5. 【請求項5】 遺伝子コードの縮重に基づき、配列表に
    おける配列番号1又は2に示すアミノ酸配列を変えるこ
    となく、配列表における配列番号3又は4に示す塩基配
    列における塩基の1個又は2個以上を他の塩基で置換し
    た請求項1、2、3又は4に記載のDNA。
  6. 【請求項6】 配列表における配列番号5又は6に示す
    塩基配列を有する請求項1、2、3、4又は5に記載の
    DNA。
  7. 【請求項7】 リゾビウム属、アルスロバクター属、ブ
    レビバクテリウム属、フラボバクテリウム属、ミクロコ
    ッカス属、クルトバクテリウム属、マイコバクテリウム
    属又はテラバクター属の微生物に由来する請求項1、
    2、3、4、5又は6に記載のDNA。
  8. 【請求項8】 請求項1に記載のDNAと自律複製可能
    なベクターを含んでなる複製可能な組換えDNA。
  9. 【請求項9】 DNAのコードする酵素が下記の理化学
    的性質を有する請求項8に記載の複製可能な組換えDN
    A。 (1) 分子量 約76,000乃至87,000ダルトン(SDS−ポ
    リアクリルアミドゲル電気泳動) (2) 等電点 約3.6乃至4.6(等電点電気泳動)
  10. 【請求項10】 DNAが配列表における配列番号1又
    は2に示すアミノ酸配列かそれに相同的なアミノ酸配列
    を有する酵素をコードする請求項8又は9に記載の複製
    可能な組換えDNA。
  11. 【請求項11】 DNAが配列表における配列番号3又
    は4に示す塩基配列かそれに相同的な塩基配列又はそれ
    らに相補的な塩基配列を有する請求項8、9又は10に
    記載の複製可能な組換えDNA。
  12. 【請求項12】 DNAが、遺伝子コードの縮重に基づ
    き、配列表における配列番号1又は2に示すアミノ酸配
    列を変えることなく、配列表における配列番号3又は4
    に示す塩基配列における塩基の1個又は2個以上を他の
    塩基で置換した請求項8、9、10又は11に記載の複
    製可能な組換えDNA。
  13. 【請求項13】 DNAが配列表における配列番号5又
    は6に示す塩基配列を有する請求項8、9、10、11
    又は12に記載の複製可能な組換えDNA。
  14. 【請求項14】 DNAがリゾビウム属、アルスロバク
    ター属、ブレビバクテリウム属、フラボバクテリウム
    属、ミクロコッカス属、クルトバクテリウム属、マイコ
    バクテリウム属又はテラバクター属の微生物に由来する
    請求項8、9、10、11、12又は13に記載の複製
    可能な組換えDNA。
  15. 【請求項15】 自律複製可能なベクターがプラスミド
    ベクターBluescript II SK(+)であ
    る請求項8、9、10、11、12、13又は14に記
    載の複製可能な組換えDNA。
  16. 【請求項16】 請求項1に記載のDNAと自律複製可
    能なベクターを含んでなる組換えDNAを適宜宿主に導
    入してなる形質転換体。
  17. 【請求項17】 DNAのコードする酵素が下記の理化
    学的性質を有する請求項16に記載の形質転換体。 (1) 分子量 約76,000乃至87,000ダルトン(SDS−ポ
    リアクリルアミドゲル電気泳動) (2) 等電点 約3.6乃至4.6(等電点電気泳動)
  18. 【請求項18】 DNAが配列表における配列番号1又
    は2に示すアミノ酸配列かそれに相同的なアミノ酸配列
    の酵素をコードする請求項16又は17に記載の形質転
    換体。
  19. 【請求項19】 DNAが配列表における配列番号3又
    は4に示す塩基配列かそれに相同的な塩基配列又はそれ
    らに相補的な塩基配列を有する請求項16、17又は1
    8に記載の形質転換体。
  20. 【請求項20】 DNAが、遺伝子コードの縮重に基づ
    き、配列表における配列番号1又は2に示すアミノ酸配
    列を変えることなく、配列表における配列番号3又は4
    に示す塩基配列における塩基の1個又は2個以上を他の
    塩基で置換した請求項16、17、18又は19に記載
    の形質転換体。
  21. 【請求項21】 DNAが配列表における配列番号5又
    は6に示す塩基配列を有する請求項16、17、18、
    19又は20に記載の形質転換体。
  22. 【請求項22】 DNAがリゾビウム属、アルスロバク
    ター属、ブレビバクテリウム属、フラボバクテリウム
    属、ミクロコッカス属、クルトバクテリウム属、マイコ
    バクテリウム属又はテラバクター属の微生物に由来する
    請求項16、17、18、19、20又は21に記載の
    形質転換体。
  23. 【請求項23】 自律複製可能なベクターがプラスミド
    ベクターBluescript II SK(+)であ
    る請求項16、17、18、19、20、21又は22
    に記載の形質転換体。
  24. 【請求項24】 宿主が大腸菌である請求項16、1
    7、18、19、20、21、22又は23に記載の形
    質転換体。
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