【発明の詳細な説明】
シアミルトランスフェラーゼのd とAのための と ゛
本出願は、1992年3月9日に出願された出願番号第07/850.357号
の一部継続出願である。
発 明 の 背 景
この発明は、シアリルトランスフェラーゼ遺伝子ファミリー、すなわち触媒領域
に相同性の保存された領域を含む糖タンパク質、糖脂質やオリゴ糖の炭水化物基
の末端シアリル化を担う一連のグリコジルトランスフェラーゼに関連している。
シアリルトランスフェラーゼ遺伝子ファミリーに属するものは、Galβ1,3
GalNACα−2,3−シアリルトランスフェラーゼとGa1l、3 (4)
GlcNAc α−2,3−シアリルトランスフェラーゼである。
この発明は、さらに新規な形と構成に、それから特に、充分な利用できる量で均
質であるような、シアリルトランスフェラーゼ遺伝子ファミリーのメンバーの同
定と産生を行うための手段と方法に関連している。本発明は、さらにシアリルト
ランスフェラーゼの産生を関連している。即ち、シアリルトランスフェラーゼを
コードしているDNA分子を得る方法や、そのようなりNAを利用するヒトや哺
乳類のシアリルトランスフェラーゼの発現に、さらにシアリルトランスフェラー
ゼやそのフラグメントをコードしている新規な核酸を含む新規化合物に関連して
いる。本発明は、またシアリルトランスフェラーゼ誘導体、特にタンパク質の細
胞質のまたは膜貫通の部分を欠いた誘導体、そして組換えDNA技術によるそれ
らの産生物にも向けられている。
シアリルトランスフェラーゼは、一般的な反応、つまりシチヂヂン 5−一燐酸
−シアル酸(CMP−8A) 十HO−受容体 → CMP+5A−0−受容体
(Beyer、 T、A、 et Adv、 Enzynol、 52.23−
175 [19811)において糖脂質やオリゴ糖の炭水化物基の末端部分への
シアル酸転移を触媒する酵素のファミリーである。
シアリルトランスフェラーゼは、翻訳後のグリコシレージョン経路を持っている
細胞のゴルジ装置で最初に見つけられた。(Fleischer、 BJ、 C
e1l Biol、 89.246−255 [1981コ)。 それらは、ま
た体液中、たとえば母翫初乳や血液中にも発見された。少なくとも10−12個
の異なったシアリルトランスフェラーゼが、知られている全てのシアリルオリゴ
糖配列を合成するのに必要である。それらの一つ一つは、受容体オリゴ糖の配列
と、シアル酸とそれが結合した糖の間に形成されるアノメリックリンケージとに
対する特異性によって酵素的に区別されるだろう。四つのシアリルトランスフェ
ラーゼが精製されている。(Beyer et al、 、 Ib1d; We
instein、 J、 et 旦↓ 、J、BioL、Chem、257.1
3835−13844 [1982コ; Miagi、T and Tsuik
i、 S、 Eur、 J、 Biochem、 125.253−261 [
1982]; and Joziasse、 DH,et al、、 J、 B
iol、 Chem、 260.4941−4951[1985])。 より詳
しくいえば、Galβ1.4G1cNAc a−2,6−シアリルトランスフェ
ラーゼとGalβ1,3 (4)GIcNAc a−2゜3−シアリルトランス
フェラーゼは、ラット肝臓膜から精製された(Weinstein et al
、 Ib1d)。
他のグリコジルトランスフェラーゼは、シアリル基の、フコシル基の、ガラクト
シル基の、N−アセチルグルコサミニル基のそしてN−アセチルガラクトサミニ
ル基の転移酵素を含んだ血清、母乳や初乳中に可溶性酵素として単離されている
。(Beyer et al、 Ib1d、)ウシやヒトのβ−N−アセチルゲ
ルコサミド β1,4−ガラクトシルトランスフェラーゼは、単離されている(
Narimatsu、 H,et al、Proc、Nat、Acad、Sci
、’U、S、A 83. 4720−4724 [1986コ; 5haper
、NL et al、、 Proc、Nat、 Acad、 Sci、 U、S
、A、 83.1573(577[1986]:Appert、 H,E、 e
t al、、 Biochem、 Biophys、 Res、 Common
139.163−168 [1986];and、 Humphreys−B
eyer、 M、G、 et al、、Proc、 Nat、 Acad、 S
ci、 U、S、A、 83.8918−8922 [1986コ、)。これら
の精製されたグリコジルトランスフェラーゼは、活性には本質的ではない、たと
えば膜貫通領域のタンパク質部分のおそらく除去によってサイズに違いがある。
ガラクトシルトランスフェラーゼ、シアリルトランスフェラーゼ、フコシルトラ
ンスフェラーゼやN−アセチルガラクトサミニルトランスフェラーゼを含むグリ
コジルトランスフェラーゼをコードしているcDNAクローンの決定されたアミ
ノ酸配列の比較を行うことによって、これら酵素が実質的には少しも配列の相同
性を持たないということが明らかにされた。グリコジルトランスフェラーゼのこ
のファミリーが、構造的にどの様に関連しているかに対するいくつかの洞察は、
クローン化されたシアリルトランスフェラーゼの一次構造のごく最近の解析から
生じている(Weinstein、 J、鮭m1. 、1bid、)。しかしな
がら、それらは全て短いNH2−末端の細胞質テール、即ち16−20アミノ酸
シグナル−アンカー領域や、大きなC00H−末端の触媒領域か続く拡張された
ステム領域をもっている(Weinstein、J、et al、、J、Bio
l、Chem、262. 17735−17743 [1987コ Pauls
on、 J、 C,et、 al、、 J、 Biol、 Chem、 264
.17615−17618 [1989コ)。シグナルアンカー領域は、開裂で
きないシグナルペプチドかつ膜貫通領域として作用し、ゴルジ装置の管腔内でこ
れらのグリコジルトランスフェラーゼの触媒領域に配向している。通常のアミノ
酸配列は、類似の受容体や供与体基質を持つグリコジルトランスフェラーゼのフ
ァミリーの範囲内で予想されるだろう。しかしながら、驚くべきことに、相同性
のある領域は、グリコジルトランスフェラーゼの触媒領域の中にはほとんど見つ
けられていない。そして、有意な配列相同性は、GenBankの他のどんなタ
ンパク質とも一切見つかっていない(Shaper、 N、L、 et al、
、 J、 Biol Chem216.10420−10428 [19811
1コ、D’Agostaso、G、et al、、Eur J、Biochet
n 1g3゜211−217 [19B9] and Weinstein、
J、 et al、、 J、 Biol、 Chem 263゜17735−1
7743 [1987])。これは、Galαl、3−GTとGIcNAc β
1. 4−GT、という二つのガラクトシルトランスフェラーゼに対して特に驚
きである。しかしながら、これらのガラクトシルトランスフェラーゼは、全体に
わたる相同性は見られない一方で、Ga I al、3−GT (ウシ、304
−309)に対する通常のへキサペプチド KDKKND やGlcNAc β
1,4−GT(ウシ、ヒト、ネズミのアミノ酸346−351)はある。(Jo
ziasse et al、、 J、 Biol、Chem 264. 142
90−14297 [1989コ)。
シアル酸は、糖タンパク質や糖脂質に存在する炭水化物基中の末端の糖であり、
動物組織に・広く分布している(Momol、 T、 et al、JBiol
、 Chem、 261.16270−16273 [1986コ)。シアル酸
は、炭水化物の末端部にあるため、その構造の生物学的機能に重要な役割を担っ
ている。例えば、シアル酸は、インフルエンザウィルスの宿主細胞への結合を担
うリガンドとして機能している(Paulson、 J、 C,、The」想狙
已旦翻、Vo1.2. Conn、 P、M、、ed、、 pp、131−21
9. Academic Press [1985])。シアル酸リンケージに
おける変化さえも、宿主特異性を変えるに充分である(Roger、 G、N、
et al、、 Nature 304.76−78 [1983])。神経
細胞接着分子(N CA M)は、神経系の発生においてNCAmに媒介された
細胞接着を修飾すると信じられている、発生学的に調節されているポリシアリル
化の対象物である(Rutishauser、 U、 et al、、 5ci
ence 240.53−37 [1988] and Rutishause
r、 U、。
Adv、 Exp、 Med、 Biol、 265.179−18 [199
0コ)。最近、炭水化物の構造である、シアリルルイスX(SLe・)は、好中
球の活性化内皮細胞に対する結合を媒介する内皮細胞白血球接着分子(“E−8
eIectin”)のリガンドとして機能することが解明されてきている(Lo
we et al、、 1990; Ph1llips et al、、 19
90; Goelz et al、。
1990; Walz et al、、 1990: Brandley et
al、、 1990)。 P−セレクチン(外側の膜タンパク質、すなわちC
D62である血小板活性化依存的顆粒)は、セレクチンファミリーのもう一つの
メンバーであり、また単球やPMNsに存在するSLe・を認識することが開示
されている(Larsen et al、、 Proc、 Natl、 Aca
d、 Sci、 USA 87.6674−6678 [1990]; Mom
ol et al、、 J、 Biol、 Chem、 261.16270−
16273[1986コ; Po1ley et al、、Proc、Natl
、Acad、Sci、USA 88. 6624−6628 [1991];
Chan、 K、F、J、、 J、 Biol、 Chem、 263.568
−574 [1988]; Beyer、T、A、et al、、Adv、En
zymol、、52. 23−175 [1981コ、)。 両方の例において
、シアル酸は、リガンドとして機能する炭水化物構造にとって鍵となる物である
。細胞接着における役割に加えて、炭水化物構造を含んだシアル酸は、分化にお
いて直接的な役割を担うことも示されつつある。造血細胞系HL−60は、糖脂
質Gj13の処理によって分化が誘発されうる。ガングリオシドもまた、細胞周
期の調節や成長因子−タンパク質キナーゼ活性の調節において役割を担っている
と考えられている。
一つのそのようなシアリルトランスフェラーゼは、米国特許明細書5,047,
335に記載されているように、精製されている。
”精製された”シアリルトランスフェラーゼのうちの大部分が利用されている一
方で、それ谷は、ゴルジ装置や小胞体の膜結合タンパク質であるため、きわめて
少量のみが利用されているにすぎない。
これらシアリルトランスフェラーゼを精製するための経済的もしくは労力の多大
なコストは、それらの不足を生じさせる。シアリルトランスフェラーゼをコード
するDNAを単離し、そして哺乳類、特にヒトのシアリルトランスフェラーゼの
実用的な量を組換えDNA技術を用いて生産することが本発明の目的である。他
の種や色々な組織からシアリルトランスフェラーゼ遺伝子ファミリーの他のメン
バーをコードするDNAを得る手段を提供することも更なる目的の一つである。
シアリルトランスフェラーゼの新規な形態を調整することも、本発明の一つの更
なる目的である。ある炭水化物基土でシアル酸の末端部位への転移を触媒する改
良方法を提供することは、ここになおもう一つの目的となる。これらのそして他
の本発明の目的は、全体として明細書から明かとなるだろう。
発 明 の 背 景
本発明の目的は、以下のことからなる方法によって達成される。
つまり、ブタGalβ1. 3GalNAc a2. 3−シアリルトランスフ
ェラーゼやラット Galβ1,3 (4)−Gl cNAcα2,3シアリル
トランスフエラーゼ(Galβ1,4G’1cNACα2,6シアリルトランス
フエラーゼとは異なる)のみならず哺乳類のシアリルトランスフェラーゼ(後に
この中で定義される)をコードする遺伝子のクローニングと同定をすること、組
換えDNAベクターにその遺伝子を組み入れること、その遺伝子を持ったベクタ
ーを適当な宿主にトランスフォーミングすること、そのような宿主で哺乳類のシ
アリルトランスフェラーゼ遺伝子を発現させること、そして産生された哺乳類の
シアリルトランスフェラーゼを回収することである。これに代えて、色々な他の
組換え技術を、シアリルトランスフェラーゼの発現を得るために使うことができ
るかもしれない。同様に、本発明は、そのようなシアリルトランスフェラーゼを
産生ずる方法を提供することに加えて、哺乳類のシアリルトランスフェラーゼや
その誘導体を組換え技術によって産生ずることを可能にする。シアリルトランス
フェラーゼは、豊富にないタンパク質であり精製するのが難しい。シアリルトラ
ンスフェラーゼ遺伝子の単離や同定は、極端に難しい。mRNAは稀であり、細
胞系やmRNAの大量の他のソースは、利用できない。本発明は、はじめて、酵
素の触媒領域の相同性の保存された領域によって定義されたシアリルトランスフ
ェラーゼ遺伝子ファミリーを構築した。本発明は、以下のことを含む組換えDN
A技術を介して哺乳類のシアリルトランスフェラーゼを産生ずる構成と方法を提
供している。すなわち、1)酵素の完全なりNA配列とそれの5°側の隣接した
領域の発見と同定; 2)@乳類のシアリルトランスフェラーゼタンパク質、そ
れにそのなかの融合体やシグナルN−末端コンジュゲートの発現を可能にするよ
うな、前記DNAからなる発現ベクターとクローニングの構築;そして3)遺伝
子的に哺乳類のシアリルトランスフェラーゼの産生を可能にし、かつそのような
ベクター含む効能によって変わるような、胎児細胞培養や他の発現系や他の発現
系である。本発明は、さらに哺乳類のシアリルトランスフェラーゼの細胞産生を
コードするDNAを産生ずる構成と方法を指向している。また、本発明のもう一
つの側面は、新しい化合物、すなわちシアリルトランスフェラーゼを発現させう
るクローンを得る際に利用されるデオキシリボヌクレオチドやりボヌクレオチド
である。さらに本発明のもう一つの側面は、シアリルトランスフェラーゼが血液
や組織に典型的に見いだされる時に共存するような、自然に出て来る全ての物質
が本質的に除去されたシアリルトランスフェラーゼそのものである。例えば、組
換え手法によって産生されたシアリルトランスフェラーゼは、in vivoの
生理学的環境中に典型的に見られる共雑物を全く含まないだろう。加えて、産生
の方法に依存して、このなかのシアリルトランスフェラーゼは、例えば血液や組
織のような土1vivoの生理学的環境から得られるものと多かれ少なかれ比較
されるような、一連のグリコシレージョンを含んでいるだろう。本発明は、更に
新規のシアリルトランスフェラーゼ誘導体、特にシアリルトランスフェラーゼア
ミノ末端残基を欠いた誘導体を指向している。例えば、シアリルトランスフェラ
ーゼ膜貫通領域やステム領域を構成する疎水的N−末端シグナル−アンカー配列
や短いN H2細胞質領域を欠く誘導体である。
本発明の哺乳類のシアリルトランスフェラーゼやその誘導体は、糖タンパク質や
糖脂質にある炭水化物基土へのシアル酸の付加に利用できる。加えて、シアリル
トランスフェラーゼやその誘導体は、生物学的認識において決定基として機能す
る炭水化物を作るために、シアル酸を糖鎖に付加することによって酵素的に利用
できる。そのようなシアリルトランスフェラーゼ酵素は、オリゴ糖や誘導体の合
成のための多重酵素系に使われるかもしれない(Ichikawa et al
、。
J、Am、Chew、Soc ↓13. 4698 [1991コ and I
chikawa et al、、J、Arn、 Chem、 Soc 旦3,6
300[1991コ)。最終的に、本発明のシアリルトランスフェラーゼ遺伝子
をコードしているD N A、特に触媒領域の相同性の保存された領域は、シア
リルトランスフェラーゼ遺伝子ファミリーの他のメンバーをコードしている遺伝
子をクローニングする方法を提供する際に利用される。シアリルトランスフェラ
ーゼをコードするDNAやシアリルトランスフェラーゼの他の利用は、これらの
当業者にとって明らかであろう。
図面の簡単な説明
第1図には、ブタのGalβ1,3GalNAc a2,3−シアリルトランス
フェラーゼ(”α2,3−0”)の核酸配列とアミノ酸配列が示されている。ブ
タα2,3−OmRNAの核酸配列は、λST1とλST2という二つのオーバ
ーラッピングしたクローンのDNA配列解析から決定されtも 示されたα2,
3−0 ポ、リベブチトのアミノ酸は、DNA配列の上に示されており、類似の
精製されたタンパク質のN−末端の残基最初のがら数えられている。
提案されるシグナル−アンカー配列は、差し示されている(枠)。
Asn−X−Thr配列を持つ強力なグリコシレージョン部位は、星印(*)に
よって示されている。その配列は、クローンλSTIとλST2をオーバーラッ
ピングすることによってコードした、α2.3−シアリルトランスフェラーゼの
長い形に一致している。
第2図には、ラットのGalβ1,3 (4)GIcNAc a2゜3−シアリ
ルトランスフェラーゼ(”α2,3−N”)の核酸配列とアミノ酸配列か示され
ている。ラットα2,3 mRNAの核酸配列は、DNA配列解析から決定され
た。シアリルトランスフェラーゼポリペプチドの差し示されたアミノ酸は、DN
A配列の上に示されており、N−末端のタンパク質配列決定によって決められた
ように、成熟タンパク質の最初の残基がら数えられている。
第3図には、CDP−ヘキサノールアミン アガロース(KCIにより溶出)で
のα2,3−0 シアリルトランスフェラーゼの精製結果が示されている。2k
gのブタ肝臓がらのポモジエネートが、CDP−ヘキサノールアミン アガロー
ス カラムにロードさ札KCIを直線的勾配で変化させて溶出された(実験手順
を見よ)。
タンパク質濃度や受容体としてラクトースを用いたシアリルトランスフェラーゼ
活性は、個別のフラクションで決定された。酵素活性の二つのピークが、図示さ
れているようにブールAとブールBに分離され九
第4図には、CDP−ヘキサノールアミン アガロース でのα2.3−0 シ
アリルトランスフェラーゼの精製(カラムIII、基質アンチフリーズ 糖タン
パク質(A F G P)を用いて決定された。カラムから得られた酵素活性の
あるAとBのエリューションは、48 KD aと45KDaのタンパク質種と
それぞれ明らかに一致した(挿入1m 5DS−PAGEを見よ)。これら二つ
の種、すなわちα2,3−シアリルトランスフェラーゼのフオームAとフオーム
Bは、8−10un i t/mgタンパク質という特異的活性を持っていた。
その48 KD aや45KDa種は、PVDF膜にプロットさね、NH2−末
端の配列決定により解析された。
第5図には、48KDaと45KDaのa2.3−0シアリルトランスフエラー
セペプチドのN H2−末端アミノ酸配列が示されている。推定されるシグナル
−アンカー領域からなる、48KDaペプチドのN H2−末端部近くの16個
の疎水性アミノ酸に下線が施しである。
第6図には、二つのα2,3−0シアリルトランスフエラーゼCDNAクローン
の制限酵素地図と配列決定手段について示されている。
第7図には、二つのシアリルトランスフェラーゼのドメイン構造と相同領域の比
較について示されている。
A: α2,6−シアリルトランスフェラーゼとα2,3−0−シアリルトラン
スフェラーゼの一次構造の配列は、64%の配列アイデンティティ−と84%の
配列シミラリティーをもつ45個のアミノ酸領域を明らかにしている。
B:相同性のある領域が、α2,6−シアリルトランスフェラーゼのエクソン2
と3の間の結合部に広がっており、両酵素の触媒領域内にある。
第8図には、可溶性の触媒的に活性なα2,3−0−シアリルトランスフェラー
ゼの発現について示されている。
A: α−2,3−0−シアリルトランスフェラーゼの可溶性フオームの発現を
指向しているc D N A、すなわち5p−STは、野生型シアリルトランス
フェラーゼ細胞質領域とシグナル−アンカー領域をインスリンシグナルペプチド
で置き換えることによって構築された。つまり、5p−3Tは、宿主細胞にトラ
ンスフェクトされた時に、38KDaの分泌タンパク質種をコードすることを予
想された。
B:5p−3Tは、発現ヘクターpSVLに挿入さね、CO5−1細胞にトラン
スフェクトされる。つまり、トランスフェクション後48時間に、細胞は、Tr
an35S−ラベルを含んだ培地で2時間パルスラベルさね、さらにラベルのな
い培地で5時間チェイスされ總 この培地は、集められ15倍に濃縮さね、そし
て5DS−PAGE/フルオログラフィーで解析された。5p−3Tとmock
トランスフェクトされた細胞培地の二っののサンプルについて、解析が行われた
。
C: cos−i細胞は、7Bのように固有の方法でリポフエクチン(+5p−
3T)またはりポフェクチン単独(mock)によってトランスフェクトされた
。つまり、トランスフェクト後48時間たった時点で培地が集められて、15倍
に濃縮さね、そして特異的受容体基質AFGPを用いたシアリルトランスフェラ
ーゼ活性の定量が行われた(Asdler、 J、E、 et al、、J、
Biol、 Chem、 254.4434−4443 [1979コ)。
第9図には、Gal α2,3−N−シアリルトランスフェラーゼ酵素の最も長
い配列決定されたトリプシンで切断されたペプチドのCIDスペクトルが示され
ている。ペプチド配列は、Leu−Thr−P ro −A I a−Leu−
Asp−3e r−Leu−Hi s−Cy s’−A r g、MMCl 2
83. 6である。cys゛は、カルボキシメチル システィンを表している。
N−末端部におけるチャージリテンションをもつイオンは、a、b、cイオンと
してラベルさね、C−末端のイオンは、x、y、Zフラグメントとされる(Bi
emann、 K、 (1990) Meth、 Enz mol、出886−
887参照)。最初のイオン(a、X)は、α−炭素とカルボニル基の間の開裂
生成物である。
イオンyとbは、ペプチドが開裂した時に形成される。イオンCと2は、アミノ
基とα炭素との間での開裂に起因して生じる。これらのフラグメントのナンバー
リングは、たいてい各々の末端部がら始められる。側鎖の断片化は、いわゆるd
(N−末端)やw(C−末端)イオンを生成するように、アミノ酸のβとγ炭
素の間でおこる。
観測されるフラグメントイオンは、表に示されている。同じイオン系列を含むイ
オンは、横方向にリストされている。
第10図には、Galα2,3−N−シアリルトランスフェラーゼ酵素のカルバ
モイル化されたトリプシンで切断されたペプチドのCIDスペクトルが示されて
いる。ペプチド配列は、Leu−Asn−3e r−A I a−Pro−Va
I−Lys、MH” =771゜4である。断片化は、明らかにリジン残基の
εアミノ基での修飾ではなく、N−末端部での修飾をしめしている。m/z 6
69 (w7)での大量のイオンは、このペプチドにおけるN−末端ロイシンの
存在を確実にする。星印でラベルされたイオンは、マトリックス関連のバックグ
ラウンドイオンである(Falick et al、 (1990) 肋飢d
Co+no+un、 Mass S ectrom、 4:318)。観測され
るフラグメントイオンが、表に示されている。同じイオン系列に属すイオンは、
横方向にリストされている。
第11図には、先にクローンされたシアリルトランスフェラーゼによってGal
β1. 3 (4)GIcNAc β2,3−シアリルトランスフェラーゼ(S
73N)から誘導されたペプチド1や11の配列が示されている。Galβ1,
4GICNAC(IE−2,6−シアリルトランスフェラーゼ(ST6N)やG
alβ1,3GalNAcα−2,3−シアリルトランスフェラーゼ (ST3
0)は、白いバーで示されている。白いボックスは、シグナル−アンカー配列を
示している。ハツチングの施されたボックスは、二つのシアリルトランスフェラ
ーゼ間で同定された相同性のある領域を示している。
第12図には、三つのクローンされたシアリルトランスフェラーゼによって共有
される保存された領域が示されている。三つのクローンされたシアリルトランス
フェラーゼは、ラットのGalβ1゜3 (4)Gl cNAcα−2,3−シ
アリルトランスフェラーゼ(ST3N)、ブタのGalβ1,3GalNAc
a−2,3−シアリルトランスフェラーゼ(ST30)、それにラットのGal
β1.4GlcNAc α−2,6−シアリルトランスフェラーゼ(ST6N)
である。その領域は、Galβ1,3 (4)GlcNAca−2,3−シアリ
ルトランスフェラーゼ(S T 3 N)の156残基から210残基にわたる
55個のアミノ酸からなる。アミノ酸の相同性の保持された部分は、箱で囲んで
示されている。
第13図には、増幅されたフラグメントであるSMlの指し示されたアミノ酸配
列について、及び先に特徴づけされた相同性の保存された領域との比較について
示されている。相同性のコンセンサスな保存された領域は、増幅されたフラグメ
ントSM1とクローン化され特徴づけされたシアリルトランスフェラーゼの相同
性の保存された領域との比較から明らかされた。相同性の保存された領域の50
%以上のアミノ酸の存在性が、より下側のケースに見られると、その不変のアミ
ノ酸は、より上側のケースの文字で示されている。
rやqが見られる所は、bによって示されている。iまたは■の場所は、Xによ
って示されている。下線を引いたアミノ酸は、縮重したプライマーのデザインに
使われる領域を表している。増幅したフラグメントに見られる先に不変としたア
ミノ酸の変化は、星印によってしるされている。
第14図には、ヌクレオチドと5TXIの指し示されたアミノ酸配列が示されて
いる。最も長いオーブンリーディングフレームの示されたアミノ酸配夕IK つ
まり相同性SMI (アミノ酸154−208)の保存された領域は、影のつい
たボックスで区別されている、をコードしている。提案されたシグナル−アンカ
ー(アミノ酸8−23)配列は、ボックスで囲んであり、強力なN−結合したグ
リコシレージョン部位には下線を施しである。
詳 細 な 説 明
ここで扱われているシアリルトランスフェラーゼやその誘導体は、活性部位に相
同性を持ち、糖タンパク質や糖脂質、オリゴ糖類等の糖鎖末端にシアル酸を転移
する酵素活性を持つラットのGalβ1.4G l cNAc α−2,6−シ
アリルトランスフェラーゼ以外のシアリルトランスフェラーゼ酵素に関連してい
る。酵素学的に機能的なシアリルトランスフェラーゼの例を挙げると、CMP−
シアル酸から受容体であるオリゴ糖にシアル酸を転移する能力を持つ。そこで、
オリゴ糖受容体は特別なシアリルトランスフェラーゼに依存して変化する。
”相同性が保存された領域”とは、2つのシアリルトランスフェラーゼのアミノ
酸配列を比較した際に、一方の酵素のアミノ酸配列と他方の酵素の同じ位置のア
ミノ酸配列とが本質的に同一である領域のことである。この発明ではシアリルト
ランスフェラーゼ遺伝子ファミリー内で、相同性が保存された領域が活性部位に
あり、第2図で言えば156〜210残基、第1図で言えば142〜196残基
を持つタンパク質的の、少なくとも約7個の一連のアミノ酸、むしろ少なくとも
約20個の一連のアミノ酸、さらに贅沢を言えば少なくとも約55個のアミノ酸
を示す。相同性が保存された領域を同定することにより、保存領域のアミノ酸配
列の変異体は作られ、それらは置換、挿入、欠損のうちで1つまたは複数に当て
はまるだろう。これらの変異体は、シアリルトランスフェラーゼをコードするD
NA内で部位特異性の突然変異生成ヌクレオチドによって形成される。その方法
を用いて、相同性のある変異体の保存領域を持つシアリルトランスフェラーゼを
コードするDNAが作られる。
例えば、しばしば複雑なN−結合オリゴ糖を終結させるNeuNAc β2.
3Galβ1,3GIcNAcとN e u A c a 2. 3Galβ1
,4GIcNAc配列を形成するラットのGalβ1゜3 (4)Gl cNA
c a−2,3−シアリルトランスフェラーゼ(ここでは”α2,3−N”とい
うこととする)もまた、シアリルトランスフェラーゼ領域に含まれる。シアリル
トランスフェラーゼ領域に含まれる酵素のもう1つの例は、スレオニンやセリン
と同様に、あるガングリオシドの末端に〇−結合する糖鎖にみられるNeuAc
a2,3Galβ1.3GalNAcを形成するブタのGa1β1. 3Gal
NAc a−2,3−シアリルトランスフェラーゼである(ここでは”α2,3
−0”ということとする)。
ここで用いられるシアリルトランスフェラーゼの範囲内に含まれるものを、以下
にリストアツブした。グリコシレージョン機能とアミノ酸配列を持つシアリルト
ランスフェラーゼはもちろんのこと、第1図、第2図にあるラットとブタのシア
リルトランスフェラーゼや、ウシやヒト等の他の哺乳類由来の類似のシアリルト
ランスフェラーゼ、または他の組織由来のもの、さらにそのようなシアリルトラ
ンスフェラーゼの脱グリコシレージョンまたはグリコシレージョンされていない
誘導体、シアリルトランスフェラーゼのアミノ酸配列変異体、シアリルトランス
フェラーゼのin vitro 条件下での電子対を共有する誘導体、等である
。シアリルトランスフェラーゼのこれら全ての形態は、相同性が保存された領域
を含み、酵素とじての機能を持ち、活性のあるシアリルトランスフェラーゼとし
て共通の抗原決定基を少なくとも1つ共有している。
シアリルトランスフェラーゼのアミノ酸配列変異体は、置換、挿入、欠損のうち
の1つまたは複数に当てはまる。これら変異体は通常、シアリルトランスフェラ
ーゼをコードするDNA内でのヌクレオチドの部位特異的な突然変異生成によっ
て作られ、そのため、変異体をコードするDNAを作成し、その後組換えた培養
細胞内でDNAを発現させる。しかし、約100〜150の残基をもつシアリル
トランスフェラーゼフラグメントは、in vitro合成に便利である。アミ
ノ酸配列変異体は、その変異の予定された性質によって特徴づけられる。その特
徴とは、シアリルトランスフェラーゼアミノ酸配列の対立遺伝子、または種間変
異を生じさせないことである。
相同性が保存された領域内での変異体は、一般的には自然発生したアナログとし
て量的には同じ生物学的な活性を示す。
アミノ酸配列を誘導する部位が予想される一方で、突然変異それ自体が予想され
る必要のないものである。例えば、与えられた部位で効果的に突然変異を起こす
ために、ランダムな突然変異生成がターゲットとなるコドンや領域で計画さね、
発現されたシアリルトランスフェラーゼ変異体は必要な活性が最良な組合せで起
きているかどうか審査される。既知の配列を持つDNAの目的とする部位に置換
突然変異を起こす技術は広く知られており、例えばM13プライマー突然変異生
成やPCRに基づく突然変異生成がある。
アミノ酸置換は単一の塩基で起こすのが一般的である。挿入は通常1〜10個の
アミノ酸残基で行なわれる。欠損は1〜30残基の範囲で起きることが多い。欠
損や挿入は、近接したペアで起こすことが好ましい。すなオ〕ち、2残基の欠損
や2残基の挿入である。置換や欠iL 挿入、またはそれらのどんな組合せも、
最終的にはその構造に影響を及ぼす。明らかに、変異体シアリルトランスフェラ
ーゼをコードするDNA内で起きた突然変異は、その配列を翻訳できる領域外に
できないし、2次的なm RN A構造を作成可能な相補的領域を創造できない
(EP 75,444A)。
置換による変異体は、第1図や第2図の配列内で少なくとも1つの残基が除去さ
ね、同じ場所に異なる残基が挿入されたものである。
一般にその置換は、シアリルトランスフェラーゼの特徴を高度に調整することが
必要なとき、以下の第1表に従ってなされる。
第 1 表
Asn gin; his
Gin asn
cry pr。
His asn; gln
I Ie leu; val
Leu i Ie; val
Lys arg; gln; glu
Met Ieu;1le
Phe met; leu; tyr
Ser thr
Thr ser
機能面または免疫学的同一性に関して置換変化は、第1表に示しである変化より
保守的ではないような置換を選ぶこと、すなわち(a)置換により影響が及ぶポ
リペプチドの背骨の構造、例えばシート構造や螺旋構h (b)ターゲット部位
の電価や疎水性、 (C)側鎖の容積をがらりと変えるような残基を選ぶことに
よって行われる。一般的にシアリルトランスフェラーゼの性質を著しく変化する
ことを期待して行う置換は、 (a)親水性残基、すなわちセリンやスレオニン
を疎水性残基、つまりロイシス イソロイシン、フェニルアラニン、バリン、ア
ラニンに変えること(または逆の変化)、(b)システィンやプロリンを他の残
基に変えること(または逆の変化)、 (C)圧電価を帯びた側鎖を持っ残基、
すなわちリリジスアルギニン、ヒスチジンを負電価を帯びた残基、つまりグルタ
ミンやアスパラギンに変えること(または逆の変化)、 (d)かなりの空間を
占める残基であるフェニルアラニンをグリシンという側鎖のない残基に変えるこ
と(または逆の変化)である。
置換または欠損変異体の変化は、主にシアリルトランスフェラーゼの膜貫通また
は細胞質領域を含んでいる。シアリルトランスフェラーゼの細胞質領域は、第1
図と第2図で示されている開始コドン以下およそ11個の付加的な残基を含むア
ミノ酸配列である。ラットでは10〜28残基、ブタでは12〜27残基が、そ
れぞれ転移終結配列として機能すると信じられている。ラットとブタではphe
−Va l−Arg−AsnとP r o−Me t −A r g−Ly s
−Lys−Se r−Thr−Leu−Lysという配列によッテ導かれてい
る曲がった構造と、これらの残基の圧電価が協調して、後述する膜貫通領域でシ
アリルトランスフェラーゼが膜を通過するのではなく、ちょうど貫通して止まる
役割を果たす。
シアリルトランスフェラーゼの膜貫通領域は、ブタの配列では約12〜27残基
(第2図に示しであるようにアラニンは+1)に位置する。ラットでも類似の位
置にある。この領域は、細胞膜の脂質2重層に対して適当な大きさで、かなり疎
水性の領域である。ゴルジ体や小胞体内のシアリルトランスフェラーゼをアンカ
ーし、細胞質領域に機能すると信じられている。
細胞質と細胞膜領域の一方または両方の欠損や置換は、細胞内又は膜脂質親和性
を減少させたり、水への溶解度を変化させることによって、組換えシアリルトラ
ンスフェラーゼの回収を容易にする。
そのため、水溶液中のシアリルトランスフェラーゼ維持に可溶化剤は必要ない。
(参考:米国特許明細書第5,032,519号に記載の、可溶化β−ガアク
トシデースα2の生産、この中で特別に取り入れられたG−シアリルトランスフ
ェラーゼ) 膜貫通領域を保存したままで細胞質領域のみを欠損すると、可溶化
剤に可溶なシアリルトランスフェラーゼを生産する。細胞質領域欠損シアリルト
ランスフェラーゼは、膜に進入し易くなり、その酵素活性をターゲツトにするこ
とが可能になる。細胞質領域や膜貫通領域は、 (例えば、ラットα−2,3−
シアリルトランスフェラーゼでは可溶なシアリルトランスフェラーゼを生成する
目的で転移終結配列であるアミノ酸1から33を)置換するよりはむしろ、除去
されていることか好ましい。
細胞質または膜貫通(C−T)欠損及び置換シアリルトランスフェラーゼは、シ
グナル配夕+l それも宿主類似シグナルの融合として、組換え培養細胞用いて
直接的に合成された。例えば、原核細胞発現ベクターを構築して、そのC−T領
域がバクテリア由来アルカリフォスファターゼやI pp、耐熱性エンタートキ
シン■リーダーのために除去さね、酵母ではその領域は酵母の転化酵素やα因子
、燐酸化酵素リーダーによって置換された。哺乳類由来細胞での発現を見ると、
C−T領域は哺乳類細胞に感染するウィルス性分泌リーダー、例えばヘルペス単
−gDシグナルによって置換される。分泌リーダーが宿主によって認識されると
き、宿主のシグナルペプチダーゼは、C−T欠損シアリルトランスフェラーゼと
C末端で融合したリーダーポリペプチドの融合を分割できる。C−T欠損シアリ
ルトランスフェラーゼの利点は、培地内に分泌されることができることである。
この変異体は水に可溶で、細胞膜脂質に感知できるほど親和性がなく、組換え培
養細胞から容易に回収できる。
可溶化剤を添加することは、例えば非イオン性だとしても、膜結合配列を持つタ
ンパク質の可溶(L 安定イヒ 生物学的活性を増加させることに役立つ。例え
ば、デオキシコール酸は最適な可溶化剤であるし、ツイーン、NP−40、トラ
イトンX−100や他の可溶化剤も用いることができる。可溶化剤の選択は、特
別な周囲の状態と関係するポリペプチドの性質に基づく現場の判断に従って決定
される。
置換や欠損の突然変異生成は、N−または〇−結結合グリコリレーション部位除
去する役割も果たす。グリコシレージョンされていないシアリルトランスフェラ
ーゼは、組換え原核細胞で産生される。
システィンや他の不安定な残基の欠損もまた望ましいもので、例えばシアリルト
ランスフェラーゼの酸化安定性を増加させる。タンパク質分解部位、すなわちA
rg−Argのような2塩基性残基での欠損や置換は、塩基性残基の1つを欠損
したり、1つをグルタミンかヒスチジン残基に置換することで完了する。
挿入によって作られたシアリルトランスフェラーゼのアミノ酸配列変異体は、タ
ーゲットとなるシアリルトランスフェラーゼに、1つかそれ以上のアミノ酸残基
を予め決められた部位に挿入することで得られる。一般的には、挿入により作ら
れた変異体は、異種のタンパク質を融合したもの力\ あるいはシアリルトラン
スフェラーゼのアミノ末端またはカルボキシル末端にポリペプチドを融合したも
のである。
シアリルトランスフェラーゼをコードするDNAは、ラットとブタ以外の材料か
ら、a)ある特定の動物の肝臓や顎下腺などの様々な組織由来のCDNAライブ
ラリー、b)相同な配列を含むCDNAライブラリー内のクローンの検出を目的
に、シアリルトランスフェラーゼやそのフラグメント(通常30bp以上)の相
同性保存領域をコードする、ラベルしたDNAによるハイブリダイゼーション解
析、C)そのクローンを完全な長さのクローン同定に酵素断片解析や核酸配列に
よって解析する。もし、完全な長さのクローンがCDNAライブラリーに存在し
なかった場合、適切なフラグメントを様々なりローンから回収し、それらクロー
ンに共通な制限酵素部位でつなぎあわせて、完全な長さのクローンを構築する。
例えばシアリルトランスフェラーゼが抽出や精製によって血液や組織から得られ
る時に、この発明によって産生されたシアリルトランスフェラーゼの状況を記述
する際に”本質的に・・・・・・から自由”または”本質的に純粋”という表現
は、in vivoでそれが生ずる生理的環境においてタンパク質またはシアリ
ルトランスフェラーゼに関係する他の物質が全く無いということである。現在こ
の発明の方法で産生じたシアリルトランスフェラーゼか、全タンパク質量の95
%力\ それ以上を含み、ポリアクリルアミドゲル電気泳動上に(クマシーブル
ー染色で)単一のバンドを形成し、少なくとも500nmole/mg pro
tein/minの活性を持つ。
この文章内で用いられる”実質的類似性”や”実質的同一性”という用語は、ポ
リペプチド配列や核酸配列の特徴を示している。つまり、ポリペプチド配列が、
参照となる配列と比較して少なくとも70%以上の相同性を持ち、核酸配列が、
参照となる配列と少なくとも80%以上の相同性を持つことである。配列同一性
の割合は、参照となる配列全体の35%以下の欠損や付加を含めて計算される。
参照となる配列が、第1図及び第2図で示されているように、より大きな配列の
一部分であるケースもある。しかし、参照となるその配列は、ポリヌクレオチド
の場合では少なくとも18ヌクレオチド、ポリペプチドの場合では少なくとも6
アミノ酸残基がなくてはならない。
一般に、原核生物は、この発明で用いられるベクターを構築するDNA配列のク
ローニングに用いられる。例えif、E、 coliK12株294 (ATC
CNo、 31446)はかなり使いやすい。他の細菌株では、E、coliB
やE、co l i X1776 (ATCCNo、 31537)がある。こ
れらのいくつかは、制限なく使わわ、実証されている。
原核生物は遺伝子発現にも用いられている。前述の細菌株の(LE coli
W3110(F−λ\原核細胞、ATTCNo、 27325)、バチルスサブ
チルス、サルモネラチフィムリウムやセラチアマルセカンスなどの他の腸内細菌
、様々なシュードモナス等が用いられる。
一般に、宿主細胞と両立できる種由来のプロモーターと制御配列を含むプラスミ
ドベクターは、これらの宿主と同時に用いられる。
そのベクターは、通常、形質転換した細胞中で表現形によって選択することがで
きるマーカー配列や複製部位を持っている。例えば、旦−coliは、p B
R,322を用いて、即ち旦−coli由来のプラスミドを用いて一般的には形
質転換される(Bolivar etユリ、、 Gene 2.、95 [19
77])。pBR322はアンピシリン耐性とテトラサイクリン耐性遺伝子を持
ち、形質転換された細胞を容易に検出できる。pBR322プラスミドや他の細
菌用プラスミドは、組換えDNA構築に用いられるプロモーターや他の制御要素
を含むよう調整されてなければならない。
原核細胞形質転換に適するプロモーターは、β−ガラクタマーゼとラクトースの
プロモーター系(Chang et al、、 Nature、 275.61
5[1976コ; and Goeddel et al、、Nature、2
81. 544 [1979コ)、アルカリフォスファターゼ、トリプトファン
プロモーター系(Goeddel 。
D、、 Nucleic Ac1ds Res、4.4057 [1980コ)
、tacプロモーター(de Boer、 H,、PNAS (USA) 80
.21−2509831)のようなハイブリッドプロモーターが実証されている
。しかし、他にも機能的なバクテリア用プロモーターがある。それらのヌクレオ
チド配列は広く知られており、有能な技術者が必要などんな制限酵素部位でもシ
アリルトランスフェラーゼをコードするDNA (Siebenlist et
al、、 Ce1l ?[1980])をそれらとつなぐことは可能である。
バクテリアに用いられるプロモーターは、シアリルトランスフェラーゼをコード
するDNAにつなかれたShine−Dalgarno (S、D、)配列を持
っている。
原核細胞の加えて、酵母のような真核細胞も用いられる。サツカロマイシスセレ
ビシェや一般的なパン酵母は、もつとも頻繁に用いられる真核生物である。一方
、別な株も利用することができる。サツカロマイシスを用いた遺伝子発現には、
例えばプロモーターYRb 7 (Stinchomb et aユ、、Nat
ure 282. 39 [1979コ; Kingsman et al、、
Gene 7. 141 [1979コ; Tschemper at a↓=
、Gene 10. 157 [1980])が一般的である。このプロモータ
ーは、トリプトファンを含む培地内での増殖能を欠く酵母変異株を選択的に検出
するマーカーであるtrpl遺伝子、例えばATCCNo、44076やPEP
4−1 (Jones、 Genetics 85.12 [1977])を既
に備えている。宿主である酵母細胞ゲノムの特色として、trpl欠損株が、ト
リプトファン欠乏下での増殖によって形質転換体を検出する際に効果的である。
宿主である酵母用の好適なプロモーター配列は、3−フオスフオグルコネートキ
ナーゼ(Hitzeman et al、、 J、 Biol、 Chem、
255.2073 [1980])や糖分解酵素(Hess et al、、
J、 Adv、 Enzyme Reg、 7.149 [1968コ; an
d Ho1land、 Biochemistry 17.4900 [197
8])である、例えばエノラーゼ、グリセルアルデヒド−3−燐酸脱水素酵素、
ヘキソキナーゼ、ピルベートデカルボキシレース、フオスホフルクトキナーゼ、
グルコース−6=燐酸イソメラーゼ、トリオセフオスフェートイソメラーゼ、フ
オスフオグルコースイソメラーゼ、グルコキナーゼなどを含む。
他の酵母プロモーターは、増殖環境によって転写制御されるという付加的な利点
を持つ誘導性プロモーターであるが、アルコール脱水素酵素2やイソシトクロー
ムC1アシッドフォスフェート、窒素代謝に関係する分解酵素、メタロチオニス
グリセルアルデヒド−3−フォスフェートデヒドロゲナーゼ、マルトースとガ
ラクトース利用の関する酵素のプロモーター領域である。酵母での遺伝子発現に
好適なベクターとプロモーターは、R,Hitzmann et al、 、
European Patent Publication No、 73.6
57Aに詳細に記載されている。
酵母のエンハンサ−もまた、酵母プロモーターと同時に好意的に利用される。
”制御領域”は、転写や翻訳のいずれかの制御に関する真核生物由来の遺伝子の
5′末端または3°末端に存在する特異的な配列に関係している。全ての真核生
物の遺伝子は、転写開始位置より25〜30ベース上流にATリッチな領域を持
つ。多くの遺伝子は転写開始位置から70〜80ベース上流域にもう1つ別の配
列が観察される。それは、CXCAAT (Xにはどんなヌクレオチドが入って
もよい)である。はとんどの真核生物の遺伝子の3°末端には、転写されたmR
NAにポリAを付加するシグナルと考えられているAATAAA配列が存在する
。
哺乳類宿主細胞内でベクターからの転写を制御する好適なプロモーターは、さま
ざまな源から得られた。例えば、ポリオマ、シミアンウィルス40 (SV40
)、アデノウィルス、レトロウィルス、ヘバティティスーβウィルス、サイトメ
ガロウィルスのようなウィルスゲノム、または異種の哺乳類プロモーター、すな
わちベータアクチンプロモーターから得られた。SV40ウィルスの初期および
後期のプロモーターは、SV40ウィルス起源の複製開始点をも含むSV40の
制限酵素フラグメントとして容易に得られた(Fierset al、、 Na
ture、 273.113 [1978コ)。ヒトのサイトメガロウィルス得
られた(Greenaway、 P、J、 et al、、Gene 1835
5−360 [1982])。
もちろん、宿主細胞や近縁種からのプロモーターもまた、ここで用いられる。
高等真核生物によるエンケファキネースをコードするDNAの転写は、ベクター
にエンハンサ−を挿入することで増加する。エンハンサ−は、DNAのシス要素
で、通常10〜300bpで、プロモーターに作用し転写を増加させる。エンハ
ンサ−は、相対的な方向性があり、転写単位に対する5° (Laimins、
L、 et al、、 PNAS 78゜993 [1981])と3’ (
Lusky、 M、L、 et al、、 Mo1. Ce11. Bio、
3.、1108 [1983])に位置し、それ自身をコードする配列中でイン
トロン内にある(Osborne、 T、F、 et al、、 Mo1. C
e1l Bio、 4.1293 [1984コ)。多くのエンハンサ−配列は
、哺乳類由来遺伝子(グロビス エラスターゼ、アルブミス α−フエトプロテ
イス インシュリン)から知られている。しかし、一般にエンハンサ−には真核
細胞ウィルス由来のものが用いられている。例えば、複製開始点の下流域あるS
V40エンハンサ−や、サイトメガロウィルス初期プロモーターエンハンサ−1
複製開始点の下流にあるポリオマエンハンサー、アデノウィルスエンハンサ−で
ある。
宿主である真核細胞(酵母、菌、昆虫、植物、動物、ヒト、他の多細胞生物との
凝集細胞)に使用する遺伝子発現ベクターは、mRNA発現に影響を与える転写
終結に必要な配列を持っている。これらの領域は、シアリルトランスフェラーゼ
をコードするmRNAの非翻訳領域内のポリA化された部分のように転写された
。哺乳類細胞に対する適切な選択的マーカーとして、例えばジハイドロフオレー
トリダクテース(DHFR)、オルニチンデカルボキシレース、多様な薬剤に耐
性生物化学的マーカー、アデノシンデアミネース、アスパラギンシンセテース、
グルタミンシンセテース、チミジンキナーゼ、ネオマイシンなどがある。そのよ
うな選択的マーカーが宿主である哺乳類由来細胞に転移が成功すると、形質転換
された細胞は選ばれた条件下でも生き残ることができる。計画的な選別に対して
、広く用いられる二つの異なったカテゴリーがある。最初のカテゴリーは、細胞
の代謝や、抗生物質を付加した培地での増殖能力を欠く突然変異細胞系に基づく
ものである。中国産ハムスター卵巣由来D HF R−細胞とマウス由来LTK
−細胞がその例である。これらの細胞は、チミジンやハイポキサンチンのような
栄養素の存在なくしては増殖できない。それらの細胞はヌクレオチド合成系に必
要なある遺伝子を欠いており、失われているヌクレオチド合成系の回復なくして
は生存できない。培地に追加する物質は、生来のDHFR遺伝子やTK遺伝子を
それぞれの遺伝子を欠く細胞導入に必要なもので、これは増殖に必須である。D
HFR遺伝子やTK遺伝子で形質転換されていないここの細胞は、添加されてい
ない培地では生き残ることができない。
第2のカテゴリーは、優勢選択、つまりどんな細胞系を用いても計画的に選択す
ることである。また、この方法は突然変異細胞系を必要としない。これらの計画
は一般的に宿主細胞の増殖を停止する薬物を用いる。珍奇な遺伝子を持つ細胞は
、薬物耐性の役割を果たすタンパク質を発現し、その選択条件下で生き残る。そ
のような優勢選択の例は、ネオマイシン(Southern、 P、 and
Berg、 P、、 J、 M。
lrc、 Appl、 Genet、 !、 327 [1982コ)マイコフ
ェノリック酸(Mulligan、 R,C,and Berg、 P、、 5
cience 209.1422 [1980])、ハイグロマイシン(Sug
den、 B、 et al、、Mo1. Ce1l Biol、互、 410
−413 [1985])がある。上に挙げた3例は、それぞれ適切な薬剤であ
るG418やネオマイシン(ゲンチシンL xgpt (マイコフェノリック酸
ん)、ハイグロマイシンに耐性を持っ真核細胞制御下で細菌遺伝子を実行する。
“増幅”は、細胞の染色体DNA内の単離された領域の増加や複製に関係してい
る。増幅は選択用薬剤にすなわちDHPRを不活化するメトトレキセート(MT
X)を用いて達成される。DHFR遺伝子のたくさんのコピーの増幅や蓄積は、
多量なMTXにもかかわらず産生される大量のDHFRに通じる。増幅圧は、培
地にMTXを多量に付加することによって、内生的なりHFRの存在にもかかわ
らず作用される。必要な遺伝子の増幅は、必要なタンパク質をコードするDNA
を持つプラスミドを宿主である哺乳類由来細胞に相互感染させることによって達
成される。また、相互導入によってDHFRや増幅した遺伝子が相互増幅に関係
する。この過程は、その細胞がより多くのDHFRを必要とし、その必要性が選
択した遺伝子の複製に一致し、更に多くのMTX濃度下で増殖可能な細胞のみを
選び出すことによって確実となる。目的とする異種のタンパク質をコードする遺
伝子が選択する遺伝子と相互に調節し合う限り、この遺伝子の複製はしばしば目
的とするタンパク質をコードする遺伝子の複製を生じさせる。その結果、異種タ
ンパク質のコピーが増え、目的とする異種タンパク質をより多く産生ずる。
この発明において、高等真核生物においてシアリルトランスフェラーゼをコード
するベクターの発現に関して好適な宿主細胞としては以下のものがある。SV4
0により形質転換されたサル腎臓Cv1細胞系(COS−7,ATCCCRL
1651)、ヒト胚腎臓細胞系(293) (Graham、 F、L、 gl
lL、 J、 Gen。VLroL、 3G、 59 [1977コ)、稚ハム
スター腎臓細胞(BHK、 ATCCCCL 10)、中国産ハムスター卵巣細
胞DI(F R(CHO,Urlaub and Chasin、 PNAS
(USA) 77、4216 [1980])、マウスセルトリ細胞(7M4.
Mather、 J、P、、 Biol、 Reprod、 23.243−
251 [1980])、サル腎臓細胞(CVI ATCCCCI 70)、7
7+J7’7グリーンモンキー腎臓細胞(VERO−76、ATCCCRL 1
587)、ヒト子宮腫瘍細胞(HELA、 ATCCCCI 2)、イヌ腎臓細
胞(MDCK、 ATCCCCL34)、バフアローラット肝臓細胞(BRL3
A、 ATCCCRL 1442)、ヒト肺細胞(1138,ATCCCCI
75)、ヒト肝臓細胞(Hep G2. )IB 8065)、マウス乳腺腫瘍
(MMT 060562.’ATCCCCL51)、TRI細胞(Mather
、 J、F’、 et al、、 Annals N、Y、 Acad、 Sc
i、 383.44−46 [19821)、ノくクロウィルス細胞。
1形質転換”とは生物にDNAを導入して、DNAが複製し、染色体外に存在す
る力\ または染色体に組み入れられることである。
他で示されていないが、この発明で用いられている宿主細胞を形質転換する方法
は、Graham、 F、 and Van der Eb、 A、 、 Vi
rology 52゜456−457 [1973]の方法である。しかし、核
注射や原形質融合のような方法によって細胞にDNAを導入する他の方法もまた
用いられてきた。原核細胞や細胞壁構造を持つ細胞を用いるとき、トランスフェ
クション即ち感染の最適な方法はCohen、 F、N、 et al、、 P
roc、 Natl、 Acad、 Sci、 USA 69.’2110 [
1972コによって示された塩化カルシウムを用いたカルシウム処理である。
構築されたプラスミド内で正しい配列を確認する解析として、ライゲーション混
合物が旦−coli K12株294 (ATCC31446)を形質転換する
ために用いられ、アンピシリン耐性やテトラサイクリン耐性によりうまくゆく形
質転換体が選ばれた。形質転換体のプラスミドを調整し、制限酵素を用いたフラ
グメント化により解析したり、Messing et al、、 Nuclei
c Ac1ds Res、 g、 309 [1981]やMaxam et
al、、 Methods in Enzymology 65.449 [1
980]の方法で配列を決定することで解析する。
宿主細胞は、この発明で発現ベクターにより形質転換さね、プロモーター活性を
誘導し、形質転換体を選び出し、遺伝子増幅(こ適切な従来の栄養組成の培地で
培養される。温度やpHのような培養条件は、発現のために選ばれて宿主細胞に
用いる既存の条件でよく、通常の技術で充分である。
”感染(トランスフェクション)”は、コドン配列力(実際の発現されているか
どう力\宿主細胞で遺伝子発現ベクター力(進入することである。トランスフェ
クションについては多くの方法力(既1こ知られている。例えば、CaPO4や
エレクトロポレーション法である。
宿主細胞内でこのベクターが活動している証拠力(ある時、トランスフェクショ
ンが成功したといえる。
以下の用例を理解するために、頻出の方法や用語力<言己述されて0る。
“プラスミド“は、pに先行または後行する大文字と数字で84寸けられている
。この発明で用いられている開始プラスミド′(マ、市販されているものか、ま
たは制限酵素フラグメント以外でiJ用できるもの、出版された方法に従って利
用可能なブラスミド力・ら構築されたものである。付は加えて言うと、記載され
たものと同価値のプラスミドも実際に知られており、通常の技術で使用できる。
DNAの“切断”は、DNAのある特定の配列を認識する制限酵素によるDNA
の酵素による切断である。ここで用(為られた様々な制限酵素は、市販されてお
り、その反応条件、補酵素、イ也の必要な物質は既知の条件下で充分である。解
析過程として(ま、1μgのフ゛ラスミドやDNAフラグメントは、通常的20
μmルソトルの緩!j:夜中で約2ユニツトの酵素によって処理される。プラス
ミドから目的のDNAフラグメントを単離に、前述より大きな容積中でおよそ5
〜50μgのDNAが20〜250ユニツトの酵素で処理される。
特定の制限酵素に対し適切な緩衝液と基質力(先人たちによって決定づけされて
いる。37℃で約1時間のインキュベートが普通用いられている。しかし、提供
者の指導により変わる。切断後、反応液を直接ポリアクリルアミドゲル上で電気
泳動し、目的のフラグメントを単離する。
Goeddel、 D、 et al、、 Nucleic Ac1ds Re
s、、 8.4057 [1980コに記載されている8%ポリアクリルアミド
ゲル電気泳動により分離されたフラグメントはその大きさにより分離される。
”脱燐酸化“はバクテリアのアルカリフォスファターゼ(BAP)を用いて5′
末端の燐酸を除去することである。この過程は、DNAフラグメントに2つある
制限酵素切断面が接合し、制限酵素部位に他のフラグメントが挿入するのを邪魔
するかのよ引へ 輪を作るのを妨げるためである。脱燐酸化の過程と試薬には、
既知のものが用いられる(Maniatis、 T、 et al、、 Mo1
ecular C1onin pp、 133−134 [1982コ)。BA
Pを用いた反応は、68°C,50mM)リス存在下で、酵素抽出液中に含まれ
るエキソヌクレアーゼの活性を抑制しながら行われる。反応時間は1時間。反応
後、DNAフラグメントはゲル分離される。
”オリゴヌクレオチド”は、1水路ポリデオキシヌクレオチドカ\化学的に合成
された相補的な2重鎖ヌクレオチドのいずれかである。
そのような合成オリゴヌクレオチドは、5′末端に燐酸がついていない。キナー
ゼの存在下でATPから燐酸を付加した後ではないと他のオリゴヌクレオチドに
つなげることができない。合成されたオリボヌクレオチドは脱燐酸化していない
フラグメントにつなげることはできる。
”ライゲーション”とは、2本の2重鎖核酸フラグメントの間で燐酸エステル結
合を形成する過程のことを示す(Maniatis、 T、 etl工、 Id
、、 p、 146)。特に注意すべき点がなければ、通常、ライゲーションは
0.5μgのおよそ等モルのDNAフラグメントに対して10ユニツトのT4D
NAリガーゼという既知の緩衝液と条件下で行われる。目的のコードと制御配列
を含む適切なベクターを構築することが、標準的なライゲーション技術である。
単離したプラスミドやDNAフラグメントは、目的のプラスミド形成に分離・調
整・再結合される。
”フィリングイン”や”プラントエンディグとは、制限酵素により切断された核
酸フラグメントの付着末端部分の1本鎖を2重鎖にすることである。これは、付
着末端を除去する力\平滑末端を形成することである。この過程は、1つまたは
2.3の他の制限酵素により作られた切断面に結合能のある制限酵素切断面を、
エンドヌクレアーゼによる平滑末端や他の満たされた付着末端と両立できるよう
に変換する融通のきく道具である。一般には、平滑末端化は以下の条件でなされ
る。8ユニツトのDNAポリメラーゼ■のKlenowフラグメントと250μ
Mの4種類のデオシヌクレオシド3燐酸存在下で、ターゲットDNA2〜15μ
gに対し、10mMMgCL、1mMジチオスレイトール、50mM NaCl
、10mMトリス(pH7,5)緩衝液の条件で37℃でインキュベート。
インキュベートは通常30分で終了し、フェノール・クロロホルム混液で抽出し
、エタノール沈澱する。
明らかにされた配列の一部に一致する相補的なポリペプチドは、それぞれの生殖
系遺伝子を同定したり、単離するために、ハイブリダイゼーションプローブとし
て用いられる。そのようなポリヌクレオチドもまた、cDNAをスクリーニング
のためのハイブリダイゼーションプローブとして、また、cDNA単離のゲノム
ライブラリーとして、この発明の構造的および進化的に興味のあるシアリルトラ
ンスフェラーゼ配列をコードする遺伝子として用いられる。そのようなポリヌク
レオチドは、ポリメラーゼチェイン反応(PCR)により生殖細胞系の遺伝子配
列や近縁の配列を増幅する際プライマーとして有用である。
シアリルトランスフェラーゼcDNAを同定または単離を目的とするハイブリダ
イゼーションプローブは、ヌクレオチドに基づき設計さね、第1図と第2図に示
されたアミノ酸配列を導き出す。ハイブリダイゼーションプローブは、放射性核
種によってラベルされているが、ブタのα−2,3−0シアリルトランスフェラ
ーゼ(第1図)でアミノ酸残基134〜189のうち55残基が一致する保存領
域の一部または全部をコードする縮重したオリゴヌクレオチドの1つまたはそれ
以上からなりたっている。ヘプタペプチドモチーフである −Asp−Val−
Gly−8er−Lys−Thr−Thr−という配列がかなり保存されており
、このモチーフをコードする縮重したオリゴヌクレオチドを含むハイブリダイゼ
ーションプローブや、ヘプタペプチドの少なくとも4.5アミノ酸が保存さね、
1つか2つが修正されているようなものが、このモチーフの変異体といえるだろ
う。第1図と第2図に紹介しである、ヘプタペプチドモチーフの1つか2つのア
ミノ酸残基置換変異体をコードする縮重したオリゴヌクレオチドプローブは、プ
ローブとして働く。
そのようなプローブはへブタペプチドモチーフに作用し、前述したように55ア
ミノ酸残基が保存されている。
シアリルトランスフェラーゼをコードするゲノムまたはcDNAクローンは、第
1図と第2図に示しであるようなシアリルトランスフェラーゼヌクレオチド配列
を基に設計されたハイブリダイゼーションプローブを用いて、単離された。cD
NAクローンが必要であるとき、シアリルトランスフェラーゼを発現する細胞由
来のcDNAを含むクローンライブライ−が必要である。第1図と第2図に示し
であるような配列の一部または全てに一致するような合成ポリヌクレオチド配列
が化学合成したオリゴヌクレオチドよって構築された。付は加えると、第1図と
第2図に示されている配列データに基づきプライマーを用いてポリメラーゼチェ
イン反応(PCR)は、ゲノムD N A、m RN Aプール、cDNAクロ
ーンライブラリー由来のDNAフラグメントを増幅に用いられる。PCR法は、
u、s、 patents 4,683,195 and 4,683,202
に記載されている。さらに、第1法と、その配列データを利用しない第2のプラ
イマーを用いるPCR法か使用される。例えば、第2のプライマーにはポリA化
された領域に類似もしくは相補的なものが用いられた。
ヌクレオチドの置換、欠損、付加は、この発明のポリヌクレオチドに関係する技
術の1つである。しかし、そのような置換、欠損、付加は、特別なハイブリダイ
ゼーションの結果、充分説得力のあるバイブ°リダイゼーション条件下で第1図
と第2図に示されているポリヌクレオチド配列の1つにハイブリダイゼーション
するポリヌクレオチドの能力を実質的には破壊しない。
第1図と第2図にあるヌクレオチドとアミノ酸配列は、コードされているポリペ
プチド配列の一部またはすべてに一致するポリペプチドを作成可能にする。その
ポリペプチドは、完全な長さを持つシアリルトランスフェラーゼ、またはそのフ
ラグメント、そのアナログをコードするポリヌクレオチドの発現によって真核、
原核どちらの宿主細胞でも産生される。そして、そのポリペプチドは化学合成ま
たは翻訳をコントロールする鋳型となるポリヌクレオチドを用いてin vit
ro翻訳系によって製造されt為 組換え宿主内での異種タンパク質発現の方法
、ポリペプチドの化学合成法、in vitro翻訳系は既に広く知られていて
、以下の文献を参照されたし。Maniatis etal、、 Mo1ecu
lar C1onin : A Laborator Manual (198
9)、 2nd Ed、。
Co1d Spring Harbor、 N、Y、 and Berger
and Kimmel、 Methods n Enz molo Volum
e 152 Guide to Mo1ecular C1onin Tech
ni ues(1987)、 Academic Pres、 Inc、、 S
an Diego、 CA。
シアリルトランスフェラーゼのフラグメントを抽出するのもそんなに困難なこと
ではない。フラグメントまたはアナログの好適なアミノ末端とカルボキシル末端
は、例えば酵素活性中心のような、構造的または機能的領域の境界付近にある。
実際1つまたはそれ以上の機能的領域からなるフラグメントは、異種のポリペプ
チド配列を融合した形態をなすことが多い。その結果、融合したタンパク質は、
そのフラグメントから与えられる酵素活性のような機能的な性質を示す。そして
、その内部の機能的領域を一部除去した欠損ポリペプチドは、失われたフラグメ
ントによって通常その性質を若干減少させる。
ハタロウイルス真核生物遺伝子発現は、複製した遺伝子から機能的に活性のある
大量のタンパク質をコントロールするもっとも有効な手段の1つである(Sum
mers、 M、 and Luckow、 V、 (19′88) 肛奴す仙
■状勉y6: 47)。この発明のシアリルトランスフエラーゼポリベブチドは
バクロウィルス発現系での発現によってクローンされたポリヌクレオチドから産
生された(Invitrogen Corporation、 san Die
go、 CA)。
一般のシアリルトランスフェラーゼとその組換え発現産物は以下のプロトコルに
従って得られt島
1、ブタ肝臓シアリルトランスフェラーゼを明らかに均質になるまで純度を高め
る。
2、ブタのシアリルトランスフェラーゼのN端アミノ酸配列を決定する。
3、NH2末端配列付近の18アミノ酸に一致するオリゴヌクレオチドプローブ
を化学的に合成する。
4、a)ブタ顎下腺からランダムプライマーで標識したポリAに富んだmRNA
を用いて、または
b)ラット肝臓からオリゴdTで標識しポリAに富んだmRNAを用いて、また
は
C)ラット脳からオリゴdTで標識しポリAに富んだmRNAを用いて、
cDNAライブライ−をλgtlOで構築する。
5、 シアリルトランスフェラーゼのアミノ酸配列に対してコドンで相補的な放
射能ラベルした合成デオキシオリゴヌクレオチドブールを用いる。例えば、以下
のようなa) 5’ ACCCTG AAG CTG CGCACCCTG C
TG GTCCTG TTCATCTTCCTG ACCTCCTTCTT 3
’
b) 5° GACGTCGGG AGCAAGACCA、CC3゜
6、ランダムにプライマーしたブタ顎下腺由来のポリヌクレオチドキナーゼと3
2P−ATPを用いてラベルした長短の化学合成されたオリゴヌクレオチドプロ
ーブを用いてスクリーニングする。2重のポジティブプラークが精製さね、挿入
されたフラグメントの配列を決定する。
7゜32pラベルされた挿入フラグメントを、オリゴdTデオキシヌクレオチド
標識したブタ顎下腺ライブラリーを再スクリーニングに用いる。
8、ブタのシアリルトランスフェラーゼの完全なリーディングフレームは、2つ
の重複クローンを得る。ラット肝臓と脳由来のcDNAは、クローンのDNA配
列解析によって決定されるような相同性が保存された領域を含む。
9、ブタのシアリルトランスフェラーゼをコードする完全な長さを持つcDNA
をプローブの2つのオーバーラツプするクローンから構築し、配列決定する。第
1図と第2図にDNA配列が明らかになって、シアリルトランスフェラーゼcD
NAの相同性が保存された領域のデータからプローブが作成可能になった。
水種や他種由来または他の組織由来のcDNAやゲノムライブラリーのプローブ
づけの効率が単純かつ増加することでシアリルトランスフェラーゼの精製、配列
決定、プローブブールの作成を不要にした。
10、ブタとラットのシアリルトランスフェラーゼをコードする完全な長さを持
っcDNAが、適当な宿主細胞を形質転換に用いられる発現ベクターを調整した
。そして、それを目的とするのシアリルトランスフェラーゼを産生ずることを目
的として培養する。
11、これまでの過程で生成された生物学的に活性のある成熟したシアリルトラ
ンスフェラーゼは、第4図と第5図にあるように2つの相互的な形態を持ち、そ
の2つの形態はそれぞれ45kDaと48kDaの分子量を持つ。
この発明のポリヌクレオチド、組換えにより産生じたシアリルトランスフェラー
ゼポリペプチドとフラグメントやアミノ酸置換による変異体は、第1.2.3.
5.7.8図に示される配列データや、この発明の方法で単離されたシアリルト
ランスフェラーゼcDNAから得られた配列データに基づき作成された。ポリヌ
クレオチドと組換えにより産生じたシアリルトランスフェラーゼポリペプチドの
生産は、以下の文献にある手法でなされた。Maniatis et al、、
Mol四見lLk知1n4−A Laborator Manual、 2n
d Ed、 、 (1989) 、 Co1d Spring Harbor、
N、Y、 and Berger and Kimmel、 Methods
in Enz molBy−、Volume 152 Guide to M
o1ecular C1onin Techni ues (1987)、 A
cademic Press、 Inc、、 San Diego、 CA 参
照のこと。ポリヌクレオチド配列は宿主で発現された。それに先立ち、その配列
は発現制御配列と(すなわち、その機能を確実にするために位置つけられるよう
に)有機的に結合していることが分かつ總 そのため、ポリヌクレオチド配列の
転写は転写に好適な環境で起きる。
”特異的なハイブリダイゼーション”とは、ここでは、プローブとなるポリヌク
レオチド(すなわち、置換、欠焦付加というこの発明で生産されたポリヌクレオ
チド)と特定のターゲットとなるポリヌクレオチド(つまり、相補的な配列を持
つポリヌクレオチド)の間でハイブリッドを形感することと定義される。つまり
、プローブは、その特定のターゲットに優先的にハイブリダイゼーシヨンする。
例えば、ターゲットRNAを含む真核細胞から調整したRNAのノーサンプロッ
ト上に単一のバンドが検出されるときや、プローブポリヌクレオチドがPCRプ
ライマーとして用いられたとき、単一のPCR産物が得られることなど。ある場
合には、タープ・ソトとなる配列は1つのターゲットのポリヌクレオチド以上存
在するときがある(すなわち、特定のターゲット配列が、シアリルトランスフェ
ラーゼ遺伝子ファミリーの多様なメンバー内、もしくは同じ遺伝子から転写され
たスプラシングが異なるRNAに由来するものである場合)。最良のハイブリダ
イゼーション条件というものは、配列構成や長さ、プローブ、ターゲット、使用
者の選んだ方法によりころころ変わることは明らかである。様々な案内は、適切
なハイブリダイゼーション条件を選ぶために用いられた (参考: Mania
tis et al、、 Mo1ecular C1onin : A Lab
orator Manual (1989)、 2nd Ed、 、 Co1d
Spring Harbor、 N、Y、 and Berger and
Kimmel、 Methods in Enz molo Volume 1
52 Guide to Mo1ecular C1onin j匹抽知ues
(1987)、 Academic Press、 Inc、、 San D
iego、 CA、)”アンチセンスポリヌクレオチド”とは、 (1)第1図
と第2図に示されているような配夕+J、またはこの発明の方法で単離されたシ
アリルトランスフェラーゼcDNAから得られた配列の一部または全てに相補的
で、 (2)相補的なタープ・ノド配列に特異的にハイブリダイゼーシヨンする
ポリヌクレオチドのことである。その相補的なアンチセンスポリヌクレオチドは
、関連したタープ・ノド配列(すなわち、第1図と第2図に一致する)に対して
特異的な/’%イブリダイゼーションがポリヌクレオチドの機能的な特徴として
維持されている限り、ヌクレオチドの置換、付加、欠損や転移を含む。相補的な
アンチセンスポリヌクレオチドは、個々のシアリルトランスフェラーゼmRNA
やシアリルトランスフェラーゼmRNAファミリーの多様なメンバーに対して特
異的にハイブリダイゼーション可能で、また、mRNAの転写やコードされたポ
リペプチドの翻訳を阻害する、可溶なアンチセンスRNAやDNAオリゴヌクレ
オチドである(Ching et al、、 Proc、 Natl、 Aca
d、 Sci、 U、S、A、 86: 10006−10010 (1989
); Brpder et al、、 Ann、 Int、 Med、 113
: 604−618 (1990):Loreau et al、、 FEBS
Letters 274: 53−56 (1990); Holcenbe
rg et al、、 WO91/11535; U、S、SN、 07153
0,165 (”New human CRIPTOgene”; WO911
09865; WO91104753; WO90/13641; and E
P 386563.)。それゆえ、アンチセンスポリヌクレオチドはコードされ
ているポリペプチドの生産を阻害する。この結果、1つまたはそれ以上のシアリ
ルトランスフェラーゼの転写または翻訳を阻害するようなアンチセンスポリヌク
レオチドは、ポリペプチドをグリコシレージョンする細胞の特異性や能力を変化
させる。
アンチセンスポリヌクレオチドは、感染を受けた細胞やトランスジェニックな細
胞、例えば個体の造血幹細胞群の一部または全ての再構成に用いられるトランス
ジェニック多能性造血幹細胞の異種発現から産生される。アンチセンスポリヌク
レオチドは、in vitroっまり培地中またはin vivoっまり循環器
系や間隙流内といった外部環境に順応した可溶性のオリゴヌクレオチドがら成り
立っている。外部環境下での可溶なアンチセンスポリヌクレオチドは、細胞質に
接触し、また特別なmRNAの翻訳を阻害することを示す。ある実施例では、ア
ンチセンスポリヌクレオチドは一部がメチルフォスフォネートであり、フォスフ
ォロチオネートかオルト−メチルリボヌクレオチドも用いられ、キメラのオリゴ
ヌクレオチドもまた用いられた(Dagle et al、 (1990) N
ucleic Ac1ds Res、 18: 4751)。ある適応では、ア
ンチセンスオリゴヌクレオチドはポリアミド核酸からなっていた(Nielse
n et al、 (1991) 5cience 254: 1497)。ア
ンチセンスポリヌクレオチドに関係する一般的な方法については以下の文献を参
照して下さい。Antisense RNA and DNA、 (1988)
、 D、A、 Melton、 Ed、、 Co1d Spring Harb
or Laboratory、Co1d Spring Harbor。
Y
1つまたはそれ以上の配列に相補的なアンチセンスポリヌクレオチドは同族のm
RNAの翻訳を阻害したり、それぞれコードされているポリペプチドの量を減少
させる。そのアンチセンスポリヌクレオチドは、in vivoで1つまたそれ
以上のシアリルトランスフェラーゼ形成を阻害することから治療効果を与える。
1つまたはそれ以上のシアリルトランスフェラーゼトランス遺伝子の調節されて
いるコピーを持つように、トランスジェニック動物は設計されている。シアリル
トランスフェラーゼトランス遺伝子は、シアリルトランスフェラーゼタンパク質
をコードし、機能的プロモーターに有意義に結合しているフラグメントをコード
し、例えばG−418耐性遺伝子のような選別用マーカー配列をつないでいるフ
ラグメントをコードするポリヌクレオチド配列からなるポリヌクレオチドである
。
遺伝子操作を用いて、使用可能なシアリルトランスフェラーゼトラス遺伝子を持
つトランスジェニックモデル系や細胞系を、薬剤スクリーニングや薬効果を評価
するモデルとして発展させることは可能である。加えて言うと、そのようなモデ
ルは、シアリルトランスフェラーゼ代謝系の潜在的な生化学的な内容を決定する
道具とし役立ち、合理的な薬理設計とテストとしての実験にその基礎となる情報
を与えるだろう。
トランスジェニック動物を生み出すアプローチの1つは、1nvit匹で調整し
た胚幹(ES)細胞系を宿主胚盤胞にマイクロインジェクションし、その後養母
内でインキュベートするというES細胞系相同な組換えによって目的とする遺伝
子に突然変異をおこすことである(参考: Frohman and Mart
in (1989) Ce1l 56: 145)。別法としては突然変異を起
こした遺伝子やその一部を1細胞期胚にマイクロインジェクションし、その後、
養母内でインキュベートする技術が用いられる。トランスジェニック動物は、形
質転換せずともシアリルトランスフェラーゼタンパク質を発現しているが、様々
の用途に用いられるだろう。酵素活性を持つかどうか分からない(すなわち突然
変異が起きた)シアリルトランスフェラーゼタンパク質をコードしているトラン
ス遺伝子を持つトランスジェニック動物を目的通りに設計できる。トランスジェ
ニック動物を作り出す方法は既に知られている。
部位特異的突然変異と遺伝子転移は、内生的またはトランスフェクション(感染
)によって、in vivoでシアリルトランスフェラーゼ対立遺伝子に突然変
異を起こすために用いられる。例えば、突然変異を受けた対立遺伝子はシアリル
トランスフェラーゼ変異体をコードする。
また、相同組換えは宿主ゲノムの特異的部位、例えば宿主シアリルトランスフェ
ラーゼ遺伝子座にシアリルトランスフェラーセ配列の挿入に用いられる。相同組
換えの1つの形態は、1つまたはそれ以上の宿主の配列を置き換えることである
。例えば、宿主シアリルトランスフェラーゼ対立遺伝子(またはその一部)が突
然変異を受けたシアリルトランスフェラーゼ配列(またはその一部)に置き換え
られる。そのような遺伝子置換法について付は加えると、相同組換えは、シアリ
ルトランスフェラーゼ(またはそのフラグメント)をコードするポリヌクレオチ
ドを宿主のシアリルトランスフェラーゼ遺伝子座以外の部位に組み入れるのに用
いられる。相同組換えは、突然変異を受けたシアリルトランスフェラーゼ対立遺
伝子を持つヒト以外のトランスジェニック動物や細胞を作成する目的でに用いら
れる。遺伝子ターゲツト法は、1つまたはそれ以上の内生的シアリルトランスフ
ェラーゼ遺伝子を破壊し不活性化するために用いられる。これらはいわゆる”ノ
ックアウビ トランスジェニックといわれて次の文献に記載されている。WO9
1/10741; Kuhn et al、 (1991)Science 7
08: 707
以下に挙げる例は、単に発明を実行するために既知の最良の方式を図解、説明し
であるだけで、発明を制限しているわけではない。
実 験 例 1
ブタシアリルトランスフェラーゼの 12タイ のα−23−0シア嘗ルトラン
スフエラーゼα−2,3−0シアリルトランスフエラーゼは以前に報告された2
種類の方法を組み合わせて精製された(Salder、 J、E、 et al
、、 J、Biol、Chem、 254.4434−4443 (1979)
及びConradt、 H,S、 et al、。
in 5ialic Ac1ds 1988 Proceedings of
the Japanese−german Symposium on 5ia
lic Ac1ds (Schauer and Yamakawa、 eds
、) pp、 104−105゜Verlag Wissenschaft a
nd Bildung、 Kiel (1988))。 酵素はブタ肝臓のトラ
イトンX−100抽出液を連続する3つのCDP−ヘキサノールアミンアガロー
スカラムに通しアフィニティクロマトグラフィにより精製した。1回目と3回目
の精製でカラムを通過したフラクション(エリューション)のプロファイルを第
3図、第4図にそれぞれ示した。1回目のアフィニティヵラムのエリューション
ブロファイル中にシアリルトランスフェラーゼ活性の2つのピークが観察される
ことか第3図で示されている。これら2つのピークは示されたフラクションを1
.α−2,3−0シアリルトランスフエラーゼの分子量の異なる2つの形態が濃
縮されたものであることがあとで分かった2つのプール、プールAとプールBに
分離したものである。
2回目のアフィニティ精製を行うことにより、ブタ肝臓に同様に混在しているα
−2,6−シアリルトランスフェラーゼ(Sadler、 JE、 et al
、、 J、 Biol、 Chem、 254.4434−4443 (197
9))の殆どを各プールから除去した。3回目のアフィニティクロマトグラフィ
後カラムのフラクションを分析し、個々のフラクションに48KDa (第4A
図、4−6フラクシヨン)または45KDa (第4B図、2−6フラクシヨン
)の分子量を持っα−2,3−シアリルトランスフェラーゼが濃縮されているこ
とを確認した。これら2つのタンパク質種はそれぞれフオームA1 フオームB
と命名した。両力ラムのピークのフラクションの比活性は8−10ユニット/m
gタンパク質である。第4図の第6フラクシヨンに見られる強いバンド(約44
KDa)は、先行するカラムを終え最後のアフィニティクロマトグラフィで酵素
活性のなくなったプールAとプールBの両プール中に主要な混在物として現れて
いるので、α−2,3−シアリルトランスフェラーゼではない。
シアリルトランスフェラーゼの活性はラクトースや低分子量不凍糖タンパク質質
を基質としてアッセイした(Sadler、 J、E、 et al、。
J、 Biol、 Chem、 254.4434−4443 (1979))
。酵素はブタ肝臓から、記述された方法(5adler、 J、E、 et a
l、、 J、 Biol、 Chew、 254.4434−4443 (19
79) and Conradt、 H,S、 et al、、 in 5ia
lic Ac1ds 1988Proceeding of the Japa
nese−German Symposium on 5ialic Ac1d
s(Schauer and Yamakawa、 eds、) pp、 10
4−105. Verlag Wissenschaft and Bildu
ng、 Kiel (1988))に多少修正を加えた方法で精製した。
2kgの肝臓をすばやくホモジエネートし、膜フラクションを記述されたように
調製した(Sadler、 J、E、 et al、。J、 Biol、 Ch
em、 254、4434−4443 (1979))。膜フラクション分は緩
衝液中で3回抽出しくConradt、 H,S、 et al、、 in 5
ialic Ac1ds 1988 Proceeding of theJa
panese−German Symposium on 5ialic Ac
1ds (Schauer and Yamakawa、 eds、) pp、
104−105. Verlag Wissenschaft and Bi
ldung、 Kiel (1988))、抽出物は1.51 CDP−ヘキサ
ノールアミンアガロースカラム(カラム1)(16μmol/ml)に通した。
カラムは3リツトルのB緩衝液で洗浄した後、B緩衝液中に0.05Mから1.
0Mまで直線的に増加したKCI (2,51x2.51)を含む溶液で溶出し
た。α−2,3−シアリルトランスフェラーゼを含むフラクションを、2つのプ
ール、プールAとプールBに分番九それぞれピークの主部とトレーリングエンド
を表した(第3図参照)。各プールはB緩衝液で透析し、CDP−ヘキサノール
アミンアガロースカラム(カラムII−A及びカラムIIB)のアフィニティク
ロマトグラフィに再度通した。プール八には150m1カラム、プールBには3
0m1カラムを用い、カラムIから調整した2つのフラクション(全体で4kg
の肝臓)は第2段階で同一のカラムに通した。α−2,3−シアリルトランスフ
ェラーゼはB緩衝液中にOmMから2.0mMまでの勾配をつけたCTPを含む
溶液(プールAには750m1.プールBには150m1)で溶出した。α−2
゜3−シアリルトランスフェラーゼ活性を持つフラクションはG50セフアデツ
クス(G505ephadex)で脱塩し、緩衝液で平衡化してから、活性のあ
るフラクションを1.0m1CDP−ヘキサノールアミンアガロースカラム(バ
ー1−111)にか広 B緩衝液中に0゜1mMから1.OmMまでのCTPの
ステップ勾配(20ステツプ、1、Omlずつ)をもつ溶液で溶出した(第2図
参照)。活性のあるフラクションはプールし、両力ラムを合わせて8−10ユニ
ット/mgタンパク質の比活性で2.5ユニツトを産生じた。48KDa及び4
5 KD aのシアリルトランスフェラーゼペプチド(第4図参照)を5DS−
ポリアクリルアミドゲルで泳動しくLeammli、 U、K。
Nature 227,680−685 (1970))、PVDF膜(Imm
obilon Transfer、 Millipore)へ電気的に移し、ク
マシーブリリアントブルー(Sigma)で染色し?= シアリルトランスフェ
ラーゼのバンドは切り出した後、そこに結合しているペプチドをエドマン(Ed
man)分解法によりアブライドハイオシステムズ(Applied Bios
ystems 475A)タンパク質シーケンサ−を用いてN82末端のアミノ
酸配列解析し九48KDa (フオームA)及び45KDa (フオームB)の
シアリルトランスフェラーゼが濃縮されたフラクションはポリアクリルアミドゲ
ル電気泳動(PAGE)L、PVDF膜にプロ・ントし、N1]2末アミノ酸配
列解析をおこなって各ペプチドのアミノ酸配列を22残基決定した(第5図)。
フオームAのNH2末アミノ酸配列は疎水的アミノ酸から成る領域を含んでおり
、低分子量型のタンパク質は高分子量型のものがハイドロフォーシスなペプチド
(hydrophosis peptide)のタンパク質開裂によって生じた
ものであるという5adler et al、、 (J、 Biol、 Che
m、 254.4434−4443 (1979))とWescott et
al、、 (J、 Biol、 Chem、 260.13109−13121
)の予想と矛盾しない。
この領域はフオームAに特有な変性剤特性及び膜結合特性を説明するものと考え
られている。
実 験 例 2
19ンア1ルトランスフエラーゼc DNAInvitogenから販売されて
いるキットを用い、ポリA+RNAを鋳型として一本鎖cDNAを合成した。c
DNAはPerkin Elmer CetUSから販売されている試薬とプロ
トコールを用いたポリメラーゼ連鎖反応(PCR)の鋳型として使用した。用い
た条件は、92℃で1分間変性、50℃で2分間再生、72℃で2分間相補鎖形
成である。PCR反応はST1の3′側末端にある120bpの欠損領域に隣接
した配列に対応する30bpのオリゴヌクレオチドをプライマーとして行った。
PCR増幅反応の生成物は2%アガロースゲルで分離し、ST1とST2に相当
する互いに120bp異なる2本のバンドをエチジウムブロマイド染色により確
認した。明確に同定するためにこれらのバンドはゲルから抽出しくQiaex
kit、Qiagen)、TAベクター(Invitrogen)にサブクロー
ニングして塩基配列を決定した。
RNAの びcDNAライブラ1−の
新鮮なブタ顎下腺(死後30分以内)を凍結し、ドライアイス−エタノール溶液
中に移した。トータルRNAはChomczynskiとSacchiの方法(
Anal、 Biochem、 162.156−159 (1987))に従
って分離した。ポリA十RNAはオリゴdT−セルロースクロマトグラフィ(P
harmacia)を用いて生成した。2重鎖cDNAはPharmaciaの
cDNA合成キットおよび推薦されている方法を用い、ランダムヘキサマーをプ
ライマーとしてポリA+RNAを逆転写することにより合成し1.:o Eco
RIで消化したλgtloにはEcoRIアダプターをin vitroでパッ
ケージングした(ProMega)。 cDNAライブラリーをスクリーニング
する目的で、パッケージした混合液は[co I 1c600にトランスフェク
ション(感染)させてブレーティングした。
cDNAクローンの び 1′1
特に記述していない場合は、すべての方法はManiatis et al、
(in Mo1ecular Cloning: A Laboratory
Manual、 Co1d Spring Harb。
r Laboratory、 Co1d Spring Harbor、 N、
Y、 (1982))に従って行ッt、:O精製した48KDaのシアリルトラ
ンスフェラーゼペプチド(第5図参照)のN H2末端に近い18アミノ酸に相
当する53bpのオリゴヌクレオチドプローブ(5’ ACCCTGAAGCT
GCGCACCCTGCTGGTGCTGTTCATCTTCCTGACCTC
CTTCTT3°)は、12pを用いて107cpm/pmo l eの比活性
でエンドラベルした。50000個のプラークは核酸ハイブリダイゼーションに
より、以下の条件のプレハイブリダイゼーション/ハイブリダイゼーション混合
液中でスクリーニングした。即ちその条件は、5xSSC,50mM リン酸2
水素ナトリウム pH6,7,20%ホルムアミド、5Xデンハルト液、0.
1%5Dide to Mo1ecular Cloning Techniq
ueslMethods in Enzymology。
pp、 443)である。ニトロセルロースフィルター(Schleiher
and 5chuell O,45m pore)は、0,2xSSC,0,1
%SDS中で420α 40分間洗浄した。強くハイブリダイズしたクローン、
λST1クローンが得られ、これは48KDaと45KDaの精製したシアリル
トランスフェラーゼペプチドに対応したアミノ酸をコードしたオーブンリーディ
ングフレームを持っている。2っめのクローンであるλST2は、λSTIの3
°側末端がら得た制限酵素フラグメントをプローブとして核酸ハイブリダイゼー
ションを行うことにより単離した。このプローブは0.5kbのPvu I I
−EcoR■制限フラグメントであり、ランダムブライミングキットと[α−3
2Pコd CT P (Amersham)を用いてラベルした。
ファージDNA内のcDNAインサートに対応するEcoRI制限フラグメント
は、pUCベクター(Pharmacia)にサブクローニングした。サブクロ
ーニングしたクローンはファルマシアのT7キツトを用いて塩基配列を決定した
。配列データについては、ナスター(DNASTARInc、、 WI、 US
A)を用いてコンピューター解析をおこなった。
α2,3シアリルトランスフエラーゼのcDNAをクローニングするため、第5
図に示したアミノ酸配列情報に基づいていくつかのクローニング手段を試みf、
まず第1の手段として、48及び45KDaのタンパク質種のNH2末端部分が
酵素本体に隣接しているという予想をたて、この末端部分に対応したプローブを
産生ずる目的でポリメラーゼ連鎖反応プライマーを調製しt島 結論をいうと、
この試みは45KDaのタンパク質種(第5図および第6図参照)のアミノ酸配
列が不正確であったために失敗した。失敗した他の例はブタ下顎腺cDNAをス
クリーニングするためのプローブとして短かい(16−20bp)縮重プローブ
を使用したものである。最終的に成功した手段はAフオームのタンパク質のNH
2末端の17アミノ酸配列から設計した53bpの縮重していないプローブを用
いたものであった。この53bpプローブを用いて500000プラークのλg
tloブタ顎下腺cDNAライブラリーをスクリーニングした。単一の1.6k
bのクローン、コンセンサスなATG開始コドン(KozaklM、、 Ce1
l 49.283−292 (1986) and Kozak、 M、、 N
ucAcids Res、 12.857−872 (1984))とa−2,
3−シアリルトランスフェラーゼのフオームAとフオームB両方のN H2末端
側アミノ酸配列をコートするオーブンリーディングフレームを持ちインフレーム
停止コドンを持たないλST1クローンが得られた。λST1のオーブンリーデ
ィングフレームを翻訳するとα−2,3−シアリルトランスフェラーゼの両フオ
ームのNH2末端アミノ酸配列か見られることから、λSTIクローンはα−2
,3−シアリルトランスフェラーゼの一部をコードしていることが分かる。
λSTIの3゛側制限フラグメントを用いて2つめのオーバーラツプしたクロー
ンであるλST2ST2クローン一のライブラリーから得た(第6図参照)。λ
ST2てはλSTIから開始したオーブンリーディングフレームが終了している
。これら2つのcDNAは合わせて11−のオーブンリーディングフレーム(9
09−1029、以下に参照)、5°側600bpの非翻訳領域、および3′側
1000bpの非翻訳領域ををコードしている。1029bpのオーブンリーデ
ィングフレームの核酸配列および決定したアミノ酸配列を第7図に示し總 λS
TIのオーブンリーディングフレームを翻訳して決定したアミノ酸配列と、精製
したタンパク質を直接解析して得たアミノ酸配列はよく一致している。
λST1とλST2の重複した領域は、λSTIに見られる120bpのギャッ
プを除くと完全に一致している。単一のオーブンリーディングフレームはλST
Iのこのギャップの両側に広がっている(第6図参照)。実際のmRNAを表し
ているのがこの2種類のcDNAの形態のうちの一方かそれとも両方かを決定す
るため、ブタ下顎腺のポリA+RNAを逆転写して調製したcDNAを鋳型とし
てギャップ両側に位置するプライマーを用いたPCR解析を行った。λSTIと
λST2に相応する増幅したPCRフラグメントはこの方法で検出した(データ
は示していない)。PCR産物は同一性確認のためサブクローニングして塩基配
列を決定し、両方ともλST1とλST2の対応する領域に一致していることを
確かめた。
このような直接的なcDNAクローニングとPCR増幅の結果から、ブタ下顎腺
のα−2,3−シアリルトランスフェラーゼmRNAはオーブンリーディングフ
レーム内に120bpの挿入配列をもつかとうかの違いで2種類存在することが
示唆された。
シアリルトランスフェラーゼ(1029bpオーブンリーデイングフレーム)の
タンパク質の予想される分子量は39kDaで、4つの潜在的なN−グリコシレ
ージョン部位を持つ(第7図参照) (Bouse、 E、Biochem、
J、 209.331−336 (1983))。このうちの3つの部位がグリ
コシレージョンされることにより、予想されるタンパク質の分子量は精製したシ
アリルトランスフェラーゼのフオームAで観察されたものと同じ約45kDaと
なる。アミノ末端配列には2つのATGコドンが非常に近接して存在しているに
も関わらず、最初のATGのみが高いコンセンサスを持つ翻訳開始部位のなかに
あids Res、12.857−872 (1984))。カイトート−リッ
トル(Kyte−Do。
1ittle)疎水性解析(J、 Mo1. Biol、 157.105−1
32 (1982))によりアミノ末端から11残基はなれたところに16個の
疎水性残基がら成る潜在的な膜貫通領域があることが分がった(第7図参照)。
この構造的な特徴から、α−2,3−シアリルトランスフェラーゼはこれまでに
研究されてきた他のグリコジルトランスフェラーゼと同様にタイプIIの膜方向
性を持ち、この単一の疎水性領域は非開裂型のアミノ末端シグナル/アンカー領
域(Paulson、 J、 C,and Co11ey、 K、J、、J、
Biol、 Chem、 264.17615−17618 (1989))と
しての役割を持つと考えられる。
λSTIとλST2にコードされたオーブンリーディングフレームは、α−2,
3−0シアリルトランスフエラーゼのフオームAとフオームBから決定したアミ
ノ末端側の完全なアミノ酸配列を含んでいる。第6図に示されたように、フオー
ムAのNH2アミノ酸配列配列想されるオーブンリーディングフレームの翻訳開
始部位がら8アミノ酸離れており、対応するフオームBのNH2末端配列はタン
パク質のカルボキシル末端側へ27アミノ酸残基分離れている。
α−2,3−シアリルトランスフェラーゼのフオームBは完全な酵素活性を持つ
ため(Rearick、 J、1. et al、、 J、 Biol、 Ch
em、 254.4444−4451 (1979))、予想される全長酵素の
開始メチオニンとフオームBのアミノ末端の間の配列は恐らく酵素活性には必要
ない。このように、以前に研究されたグリコジルトランスフェラーゼ(Wein
stein、 J、 et al、、 Biol、 Chem、 262.17
735−17743 (1987) and Paulson、 J、 C,a
nd Co11ey、 K、J、、 J、 Biol、 Chem、 264.
17615−17618(1989))で定義されたように、シグナル/アンカ
ー領域と酵素活性領域の間にあるα−2,3−0シアリルトランスフエラーゼの
タンパク質分解感受性領域はステム領域である。
ブタまたはラット組織から調製した20mgのトータルRNAは2.2Mのホル
ムアミド(26)を含む1.0%アガロースゲルで電気泳動し、記述したように
ニトロセルロースフィルター(schleicher and 5chuell
)に移した。ニトロセルロースフィルターは32pでラベルしたcDNAプロー
ブとハイブリダイゼーションさせ前述したように洗浄した。
実 験 例 3
0° ブタシア1ルトランスフエラーゼのλST2クローンのC末端側890b
pをpGIR−199(Hsueh et al、、 J、 Biol、Che
m、 261.4940−4947 (1986))ベクターのN末端部位へ両
方のベクターのリーディングフレームに含まれる5ac1部位を用いて組み込む
ことで、α−2,3−シアリルトランスフェラーゼの酵素活性領域とインシュリ
ンシグナル配列を融合した分泌型のキメラタンパク質を作成した。このキメラタ
ンパク質、5p−8Tは、制限酵素NheIとSmaIで消化して1.0kbの
フラグメントを分離し、XbalとSmaIでポリリンカ一部位を開裂したp
S V L (Pharmacia)にサブクローニングした。作成したものは
pSVL−s pSTと名付け、可溶型のa−2,3−0シアリルトランスフエ
ラーゼをC’ OS−1細胞で一時的に発現させるために用いた。スーパーコイ
ル型のpsVL−spSTはリポフェクチンを用い販売元から推薦されている方
法でトランスフェクトした。
(50%コンフルエントの細胞を培養した60mmカルチャーディツシュに5μ
gDNA、20m1リポフェクチン試薬をトランスフェクトした)。α−2,3
−0シアリルトランスフエラーゼの活性測定のため、トランスフェクション後4
5時間経過後にCO5−1細胞の培養上清を回収し、セントリコン30フイルタ
ー(Amicon)を用いて15回遠心した。α−2,3−0シアリルトランス
フエラーゼは不凍性糖タンパク質受容体をもちい、以前の記述(Sadler
etal、、 J、 Biol、 Chem、 254.4434−4443
(1979))にしたがって活性測定した。
pSVL−spSTをトランスフェクションしてから45時間経過後、COS細
胞(60mmカルチャーディツシュ)はmet−free培地(DMEM、5%
ウシ胎児血清) (Gibco)で洗浄し、同し培地を用いて1時間培養した。
細胞は1.5mlのmet−free培地中で150mC1/150pmole
の3SS−発現ラベル(NEN)で2時間パルスラベルした。これらの細胞はP
BSで洗浄し、”S−metラベルを除いた培地で5時間チェイスした。分泌さ
れたタンパク質を含むこの培地は集めて15回遠心し、5DS−PAGEで泳動
後フルオログラフィで解析した。
以前に述べたように、α−2,3−0シアリルトランスフエラーゼのフオームB
は酵素活性を持ち、全長型のタンパク質が開裂して出来た膜結合型酵素である。
それゆえ、もし可溶性のキメラタンパク質がBフオームの完全な配列を含んでい
るなら、このタンパク質はα−2,3−〇シアリルトランスフェラーゼの活性を
保持していると考えられる。このような可溶性タンパク質を作成するため、B−
ペプチド配列のN H2末端の上流の制限部位を、λ5T2cDNAとインシュ
リンシグナル配列をコードしたpGIR−199ベクターとの融合のために用い
た。第9A図に示されているように、作成されたものは我々かシグナル配列−S
T (sp−ST)と名付けた、インシュリンシグナル配列とそれに続<pGI
Rリンカ−でコードされた9アミノ酸およびα−2,3−0シアリルトランスフ
エラーゼの予想される全酵素活性領域から成る融合タンパク質をコードしている
。5p−STを宿主哺乳細胞にトランスフェクトした場合、38kDaの分泌タ
ンパク質の合成をうながすと期待される。可溶性のグリコジルトランスフェラー
ゼを合成する同様の手段はこれまでにも成功している(Paulson、 J、
C,and Co11ey、 K、J、、 J、 BiolChem、 264
.17615−17618 (1989): Co11ey、 K、J、 et
al、、 J、 Biol。
Chem、 264.17619−17622 (1989); Larsen
、 R,D、 et al、、 Proc、 Natl、 Acad、 Sci
、 USA 87.6674−6678 (1990))。
5p−STはpSVL発現ベクターに移し、CO3−1細胞中へ一時的にトラン
スフェクションをした。48時間後、トランスフェクションを行った細胞はトラ
ンス36Sラベルを含む培地で2時間培養し、ラベルを含まない培地でさらに5
時間チェイス培養した。培地を回収して15倍に濃縮し、5DS−PAGE/フ
ルオログラフィで解析した。この培地は予想される5p−STタンパク質の分子
量である38kDaのタンパク質を多量に含んでいることが第9図に示されてい
る。同時にトランスフェクトした培養では、培地はトランスフェクション後48
時間経過後に回収して濃縮し、α−2゜3−〇シアリルトランスフェラーゼ活性
を解析した。第9C図に示しているように、ミリユニット/mlのシアリルトラ
ンスフェラーゼを含む5p−STをトランスフェクションした細胞およびモック
のトランスフェクションをした細胞から調製した培地は大きな活性を持たなかっ
た。
実 験 例 4
ラット シアリルトランスフェラーゼの 1およ゛ 1゛小胞体およびゴルジ装
置の内在性膜タンパク質である他のグリコリルトランスフエラーゼと同様に、シ
アリルトランスフェラーゼは少数タンパク質で精製が困難であり、このファミリ
ーのタンパク質が2つしかクローニングされていないことを説明している。Ga
lβ1.3 (4)GlcNAc a−2,3−シアリルトランスフェラーゼ(
” a2. 3−N” )は最初、1982年にWeinstein等によって
800000倍に濃縮さね、10μg/ng組織を産生じた(Weinstei
n、 J、 et al、、 J、 Biol、 Chern、 ’4¥2.1
3835−13844 (1982) and Weinstein、 J、
et al、、 J、 Biol、 Chem、 13845−13853 (
1982))。簡便な方法を用いてアミノ酸配列の情報を得るためにあるいは酵
素にたいする抗体を作成するためにいくつかの手段を試みたが、得られる希釈さ
れたタンパク質の量がわずかであったためにこれらの試みは失敗した。これに代
わる方法として、マススペクトロメトリーは生物学的に重要な巨大分子の構造を
明らかにするための方法としてその需要が高まってきた。新しいイオン化法とそ
のための装置の開発は解析可能な分子量の範囲と検出精度を広げてきた。高速タ
ンデムマススペクトロメトリーは翻訳後修飾及び化学修飾の決定(Dever、
T、E、 et al、、 J、 Biol、 Chem、 264.205
18−20525 (19899; 5ettineri、 C,A、 et
al、、 Biomed、 Environ、 Mass Spectrom、
19、665−676 (1990); and DeWolf Jr、、
W、 E、 et al、、 Biochem、 27゜9093−9101
(1988))と同様にタンパク質配列決定(Mathews、 W、R。
et al、、 J、 Biol、 Chem、 262.7537−7545
(1987))のための強力な技術として現在確立されている。それ故、シア
リルトランスフェラーゼのアミノ酸配列を調ぺるためにマススペクトロメトリー
を採用した。
゛ −およびカルボキシメチレーション約13μgのGalβ1.3(4)GI
cNAc a−2,3−シアリルトランスフェラーゼ(α2.3N)を、350
m1の30mM力コディレートナトリウム(pH=6. 5)、100mM塩化
カルシウム、0.1%トライトンCF−54,50%グリセロール中に保存した
。トリス塩酸(pH=8.0)、グアニジン塩酸、ジチオスレイトールをそれぞ
れ最終濃度が0. 21vi、6μ 7mMになるように加えた。還元は60ス
アルゴン下で1.5時間行った。
2.5mlの0.2M)リス塩酸緩衝液に溶解したヨウ化酢酸ナトリウム(1,
32mg)を混合液に加えた。アルキル化は室温、アルゴン下、暗所で1.5時
間行った。
透析
還元しカルボキシメチレーションを行ったα2.3Nは、ベセスダリサーチ ラ
ボラトリーズ(Bethesda Re5earch Labs: ” B R
L”)のマイクロダイアリンスシステム(Microdialysis Sys
tem)を使用し12−14kDaで分子量をカットオフする BRL製のダイ
アリシスメンプラン(Dialysis Membrane)を用いて4リツト
ルの50mM N−エチル−モルフォリン酢酸緩衝液(pH=8. 1) 中で
透析した。透析完了後、10%SDSを透析ウェルに加えてSDSの最終濃度を
約0.1%とした。ウェル中の内容物はプールし、5peedvac Conc
entrator(Savant)を用いて乾燥した。SDSを除去するために
、Kon 1g5be rg沈澱を行った( Konigsberg、 W、H
,、Henderson、 L、 、 Methods in Enzymol
ogy 91,254−259 (1993))。
1ニブ之之逍孔
沈澱したα2.3Nは消化緩衝液(100mM)リス塩酸、2Mウレア、1mM
塩下カルシウム、pH=8.0)に溶解されて、約2mg/mlのタンパク質濃
度の溶液を得た。α2.3Nは10%トリプシン(W/W)(ベーリンガーマン
ノ1イム、シーケンスグレード(Boehlinger−Mannheim、
sequencing gradq)、1mM HClに溶解)で37℃で消化
した。7時間消化した後、さらにトリプシンを加えて最終トリプシン濃度を約1
3%とした。18時間後に消化を停止しt島トリプシン消化物は、ABI 14
0A ソルベントデリバリ−システム(solvent delivery s
ystem)を用いて逆相HPLC(ABI C18カラム、1.OxlOOm
m)を用いて分離した。溶剤Aは0. 1%TFA水溶液である。また溶剤Bは
70%アセトニトリル/30%水にTFAを0.08%で加えたものである。装
置は50m1/分の流速で用いた。注入後10分経過してから、溶剤Bの割合を
90分かけて0%から50%まで増加させ、次に30分かけて100%まで上昇
させた。ペプチドはABl 783A吸収検出装置を215nmで用いて検出し
た。いくつかのフラクションは塩酸/n−ヘキサノール混合物を用いてエステル
化しtム
マススベクトロメト1−
液体第2イオンマススペクトロメトリー(LS IMS)はLSIMS源と高磁
磁石を備え付けたクラトス(Kratos) M S 50 S二重焦点マスス
ペクトロメーターを用いて行った。回収した各両分のおよそ5分の1をLSIM
S解析に使用し九 1マイクロリ・ノトルの1%TFAで酸性化したグリセロー
ル−チオグリセロール 1:1混合液を液体マトリックスとして使用した。サン
プルはプローブチップから再回収した。衝突誘導型分離(CI D)解析のため
に、最も豊富に存在する分子イオンを選択した。実験は、質量範囲の連続した4
%セグメントを同時に記録できる電子光学的多チヤンネルアレイ検出器を装備し
たクラトスコンセプトIIHH4セクターマススペクトロメーターを使用してお
こなった。衝突エネルギーは4keV、衝突ガスはヘリウムでその圧力は選択し
た前駆体イオンを初期値の30%に減弱するように調整した。各サンプルの残り
をロードし、前述したマトリックスを1ml加えた。高エネルギーCIDのデー
タはコンピューター解析を用いずに解釈した。
タンデムマススペクトロメトリーは簡便なエドマン技術を有利に行え、タンパク
質配列決定の強力な道具である。この方法では等モルの混合液からの配列決定も
可能である。マススペクトロメトリー解析をおこなうためHPLCから得た最初
の少量のタンパク質画分は疎水性を増すためにエステル化し、スパッタリング効
率を向上した(Falick、 A、M、 and Maltby、 D、A、
、 Anal、Biochem、 182.165−169(1989))。各
画分のLSIMS解析により複数の分子イオンが明らかになり、各両分に2つ以
上のペプチドが存在することが示された。
CID解析には最も多く見られる30種の分子イオンを選択した。
これらの実験では、最初のマススペクトロメーターには注目するイオンの12C
アイソトープピークを選んだ。2つのマススペクトロメーターの間に据えた衝突
室でヘリウム下で起こした衝突により引き起こされた分離の結果、この種のフラ
グメントのみが2度目のマススペクトロメーターの終了時に検出された。高エネ
ルギー衝突誘導分離(CI D)解析では、主にペプチドの主鎖に沿って断片化
が起こる。複数の開裂、すなわちアミノ酸側鎖の断片化も同様に観測される。ペ
プチド鎖に沿った断片化はアミノ酸残基の重さの異なるイオン種を生み出し、相
応するアミノ酸配列が決定される。高エネルギーモードての断片化によってアミ
ノ酸決定に関しての付加的な情報かもたらさね、得られた配列を確かなものにし
イソバリンロイシン/イソロイシンアミノ酸対の区別が可能になる(Johns
on、 R,Set al、、 Anal、 Chem、 59.2621−2
625 (1987))。側鎖の断片化は、塩基性アミノ酸、すなわちアルギニ
ン、リジン、ヒスチジンが配列中に存在する場合に最もよく見られる(John
son、 R,S、 et al、、 Int、 J、 Mass Spect
rom、 Ion Proc、 86.137−154 (198g))。 大
抵の場合、塩基性アミノ酸のプロトン化はN末端であるいはその近傍で起こり易
く、その結果分子のこの末端が電荷を保持しゃすい。塩基性アミノ酸をC末端に
あるいはその近傍に持つペプチドは大抵C末端側での開裂を示す。このように、
トリプシンは最初の消化を行うのに有利である。高エネルギーCIDのデータを
解析することにより、最終的に14アミノ酸配列を決定した(第2表および第9
図参照)。
CIDスペクトルを解析することにより、トリプシン消化中に起こる副反応が明
らかになうた。トリプシンの自己消化による2つの生成物がm/z659.3と
1153.6で同定された(第9図)。
長時間のインキュベートおよび適切な捕捉剤の欠如により、いくつかのトリプシ
ンペプチドはN末端でカルバモイル化された。このような副反応はエドマン分解
を妨げる一方、N末端の修飾はマススペクトロメトリーでの配列決定に有利であ
る。実際、これらの修飾ペプチドのCID解析は上述したいくつかの配列を確証
するのに有効であり、−例としてN末端のロイシンをインロイシンを区別する方
法を得るのに有効な場合もある(第10図参照)。
実 験 例 5
ラット シア1ルトランスフエラーゼ
持異ficDNA”o−ブのPCR−5α2.3Nに由来する14ペプチドのう
ちの11についてのアミノ酸配列に基づき、センス鎖とアンチセンス鎖両方から
なる22個の縮重オリゴヌクレオチドブールを合成した(Genosys)。第
11ペプチドと第1ペプチドは以前にクローニングしたシアリルトランスフェラ
ーゼであるGalβ1.4GIcNAc a−2,6−シアリルトランスフェラ
ーゼ(Weinstein、 J、 et al、、 Biol、Chem、銀
、 13835−13844 (1982))および前述したα−2,3−0の
中央部近くの領域に相同であるという観察結果に基づいて最初のPCR実験を組
み立てた(第11図参照)。第11ペプチドに対するセンスプライマーまたは第
1ペプチドに対するアンチセンスプライマーを、他のペプチドに対するオリゴヌ
クレオチドブライマーやラット肝臓トータルRNAを鋳型として合成したcDN
A第1鎖と組み合わせることで、2組のPCR実験をおこなった。鋳型を変性(
94℃で5分間)する段階から初めて、AmpliTaqTM DNAポリメラ
ーゼ(Perkin Elmer Cetus)を用いたGeneAmpTMD
N4増幅試薬キットを使用して、35回のサイクル、94℃で1分、37℃で1
分、72℃で2分、及び最終的な伸長段階(72℃で15分)を加えて増幅をお
こなっμ これらのPCR実験によっていくつかのcDNAフラグメントを産生
した。第11ペプチドと第1ペプチドは連続したアミノ酸配列を表していること
を考え、特異的cDNAフラグメントを同定するためネステッドプライマー法(
nested primer法) (Mullis、 K、B、 and Fa
loona、 F、、 MethodsEnzymol、 155.335−3
50 (1987)参照)を用いた別のPCR実験をおこなった。この方法で、
特異的なcDNAフラグメントである11セ:zス−14アンチセンス(lls
−14as)cDNAフラグメントを同定し總 11s−14as cDNAフ
ラグメントはブルースクリプトプラスミド(Stratagene)にサブクロ
ーニングし、ユニバーサルブライマー(Stratagene)とシーケナーゼ
バージョン2.0キツト(U S B)を用いて塩基配列を決定した。
シアリルトランスフェラーゼのクローニンファルマシア(Pharmacia)
のcDNA合成キットを用いてラット肝臓ポリΔ+RNAからcDNAライブ
ラリーを作成した(Gubler、 U、 and Hoffman、 B、J
、 Gene 25.263−269 (1983))。オリゴdTから始まる
cDNAは合成後EcoRI−Notlリンカ−を結合した。cDNAは次にE
coRIで開裂したλgtlODNA(Promega)に結合した。DNAパ
ッケージングキット(Stratagene)を用いてin vitroでパッ
ケージングをした後、ファージは宿主株のE、coli C600hC600h
fl−(Proにブレーティングした。およそ100万のプラークを、1ls−
14ascDNAプローブを用いてスクリーニングした(GuMer、 U、
andHoffman、 B、J、 Gene 25.263−269 (19
83))。2つの陽性ファージ(18−1と9−1)をプラーク精製し、塩基配
列決定のためにブルースクリプトベクター(S t ra t agene)に
サブクローニングした。
cDNAクローンのt
ダイホッフタンパク質データベース(The Dayhoff Protein
database)を用い、既知のタンパク質に参照してペプチド配列のスク
リーニングを行った。この解析でまず、α2. 3−Nと他の単離されたシアリ
ルトランスフェラーゼとの相同性が示された。この解析により、第11ペプチド
(第2表)はラットおよびヒトβガラクトシドα−2,6−シアリルトランスフ
ェラーゼの両方に見られる配列との相同性があることが示された(2つの酵素は
88%が保存的、Gu、 T、J、 et al、、 FEBS 275.83
−86 (1990) and Lance、 P、 et al。
、 Biochem、 Biophys、 Res、 Common、 164
.225−232 (1989))。この解析をブタα2. 3−0.付加的な
ペプチドである第1ペプチドの配列まで広げて行った(第2表)結果、クローニ
ングしたシアリルトランスフェラーゼ両方の配列と相同性があることを確認した
。これらのペプチド配列のアライメントは以前の単離されたシアリルトランスフ
ェラーゼに存在し、これら2つのペプチドはトリプシン消化中にアルギニン残基
で開裂した連続したアミノ酸配列を表していることか示唆される。
呻
第11ペプチドと第1ペプチドが、単離された別の2つのシアリルトランスフェ
ラーゼの中央部にある以前に保存領域として同定された配列に相同性を示すこと
から、クローニングの戦略の基礎が示唆された(第11図参照)。第11ペプチ
ドと第1ペプチドはタンパク質の中央部に位置していると思わわ、PCR実験は
長いcDNAプローブを産生ずるように設計された。14個のシアリルトランス
フェラーゼペプチドのアミノ酸配列に基づき、センスおよびアンチセンス両方の
縮重オリゴヌクレオチドブライマーをPCR実験で用いるために合成した。これ
らの実験では、α2.3−Nの長いCDNAフラグメントを増幅するために第1
1プライマーのセンス鎖と第1プライマーのアンチセンス鎖を、他のプライマー
と共に用いた。これらの実験の結果、いくつかのCDNAフラグメントが増幅さ
れた。第11ペプチドと第1ペプチドはアミノ酸の連続した配列を表していると
考え、特異的CDNAフラグメントを同定するために第11プライマーと第1プ
ライマーを用いてネステッドプライマー法(nested primer法)を
行った(Mullis、 K、B、 and Faloona、 F、 Met
hods Enzymol、 155.335−350 (1987))。 第
11プライマーのセンス鎖と第14プライマーのアンチセンス鎖を用いて増幅し
たフラグメントは第1プライマーのセンス鎖と第14プライマーのアンチセンス
鎖を用いて増幅したフラグメントとほぼ同サイズであり、産生じたフラグメント
はアーティファクトではなくプライマーの特異的な結合によるものであることが
示唆されている。
第11プライマーセンス鎖−第14プライマーアンチセンス鎖フラグメントのク
ローニングおよび特徴付けによって、第11ペプチドと第1ペプチドは連続して
いることが明らかになった。CDNAフラグメントの配列と単離した2つのシア
リルトランスフェラーゼの配列(Weinstein、 J、 et al、、
J、 Biol、 Chem、 262.17735−17743 (198
7))を比較した結果、相同性は第1ペプチドから18アミノ酸連続しているこ
とが明らかになつt= この相同性によって、11s−14as CDNAフラ
グメントはシアリルトランスフェラーゼmRNAから増幅されたものであること
が確認された。またこの配列により、CDNAフラグメントはラット肝臓に豊富
に見られるGa1bl、4GIcNAc a−2,6−シアリルトランスフェラ
ーゼ(Weinstein、 J、 et al、、 J、 Biol、 Ch
em、 257.13835−13844 (1982))のフラグメントでは
ないことが示された。 11センス−14アンチセンスフラグメントはオリゴd
Tから始まるcDNAラット肝臓cDNAライブラリーをステップクリーニング
するのに用いられ、100万個のプラークから2つの陽性のクローンを単離し總
陽性のクローンの特徴付けを行った結果、5T3N−1クローンは2.1kb
の挿入フラグメントを含み、一方5T3N−2クローンはそれよりも短い1.5
kbの挿入フラグメントを含んでいることか分かつt= ノーザンプロット解析
を行うことにより、GaI a−2,3−3T mRNAの長さは2.5kbで
あり(以下を参照)、5T3N−1クローンはGal a2.3−STの完全な
コーディング配列を含んでいるらしいことが示された。
α−23−Nシア1ルトランスフエラーゼの1°1配列解析により、573N−
1クローンはシアリルトランスフェラーゼの完全なオープンリーディングフレー
ム〔第2図参照)を含んでいることか分かった。このクローンは82bpの5°
−非翻訳領域、1122bpのオーブンリーディングフレーム、lkbの3の
オープンリーディングフレームは374アミノ酸をコードしており、推定される
分子量は42033である。1個のアミノ酸の違いを除くと、オーブンリーディ
ングフレームは精製したシアリルトランスフェラーゼのマススペクトロメトリー
解析により得られた14個のペプチド配列をすべて含んでいる。このことから、
5T3N−1cDNAクローンは正しくシアリルトランスフェラーゼであること
が確認された。他の単離されたグリコジルトランスフェラーゼで観察されたよう
に(Paulson、 J、C,and Co11ey、 K、J、、 J、
Biol、 Chem、 264.17615−17618 (1989))、
α2.3−NはN末端に短い細胞質側鎖、約20残基から成るシグナルアンカー
配夕11.およびC末端に酵素活性領域を含む領域をもつと予測されている。
実 験 例 6
0・ ラットシア1ルトランスフェー−ゼの酵素の特徴付けのためにシアリルト
ランスフェラーゼの可溶性形態を生成する目的で、酵素の触媒領域とインスリン
開裂性のシグナル配列とを含む融合タンパク質を哺乳動物の発現ベクターpSV
L(Pharmasia)において構築した。特定すると、シアリルトランスフ
ェラーゼの触媒領域を、膜貫通領域の下流側の+182(第11図参照)の位置
で5′プライマーを用い、そしてポリアゾニレ−ジョン部位の3’ UTR上流
側に位置する3′プライマーを用いてPCR法を行うことによって増幅した。P
CR法を、アニール化温度である55℃にて上記に記載したのと同様に行った。
得られたPCR生成物を、p G I R−199(K、 Drickamer
より譲り受けた。)のBamHI−EcoRI部位にサブクローニングし、結果
としてpGIRヘクター(Huseh、E、 C,et al、、 J、 Bi
ol、 Chem、 261,4940−4947 [1986])に存在する
インスリンシグナル配列に、シアリルトランスフェラーゼをインフレームで融合
した。結果的に得られた融合タンパク質を、発現ベクターpsvt、のXba
I −3ma I部位に挿入して、発現プラスミドpBD122を得た。
CO5−1細胞にてトランジェントな発現を行わせるために、発現プラスミドp
BD122 (20mg)をマニュファクチュラー(BRL)によって示唆され
ているように、リポフエチンを用いて100mmのプレート上に載せたCO5−
1細胞にトランスフェクションし總 48時間後にその細胞培養培地を集めて、
セントリコン1゜マイクロコンセントレータ−を用いて濃縮した。そして濃縮さ
れた培地を、アクセプターとなる基質としてオリゴ糖を用いることで、シアリル
トランスフェラーゼの活性のアッセイを行った。オリゴ糖へのシアル酸の転移を
、イオン交換クロマトグラフィーを用いてモニターした(Sadler、 J、
E、 et al、、 J、 Biol、 Chem、254.5934−5
941 [1979]及びPaulson、 J、 C,et al、、 J、
Biol、 Chem、 264.10931−10934 [1989コ参
照のこと)。
5T3N−1がα−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼをコードすること
を証明する目的で、発明者らはCO5−1細胞においてクローンを発現させる手
法をとった。クローン5T3N−1のアミノ酸配列は、そのタンパク質がNH2
−末端のシグナルアンカー配列を含有していることを表しており、そのシグナル
アンカー配列によってその細胞中にあるゴルジ装置に酵素かアンカーされること
が示されている(Paulson、 J、 C,and Co11ey、 K、
J、、 J、 BiolChem、 264.17615−17618 [1
989]参照のこと)。酵素の機能分析を容易に行うために発明者らは、発現に
際して細胞から分泌されるように、酵素の形態を可溶性にすることを目的とした
。融合タンパク質を開裂性のインスリンシグナル配列を用いて構築することによ
って、シアリルトランスフェラーゼのNH2末端にあるシグナル−アンカー配列
を置き換えることができた。発現プラスミドpBD122がCO5−1細胞中に
て発現した場合、酵素はその細胞から分泌されて、シアリルトランスフェラーゼ
活性が示された。
α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼの酵素の性質は、精製されたタン
パク質を用いることで第1の特徴づけをおこなうことができる(Weinste
in、J、 et al、、 J、 Biol、 Chem、 257.138
45−13853 [1982]参照)。シアリルトランスフェラーゼは、Ne
uAcα2.3Ga In2.3GIcNAcを形成するGalβ1,3GI
c N A C,あるいはGalβ1,4GIcNAc配列のいずれかを含有す
るβ−ガラクトシドアクセプターを触媒できることが分かっており、NeuAc
a2.3Ga In2.3GIcNAc配列はよく、末端複合タイプのN−結合
されたオリゴ糖の複合体タイプを終止させることがわかっている。発現プラスミ
ドpBD122を用いてトランスフェクションさせた細胞から分泌された酵素は
、Ga1β1. 3G1cNAcあるいはGalβ1,4GIcNAc配列のい
ずれかを含むβ−ガラクトシドアクセプターを用いることができる(第2表参照
)。元のベクターを用いてトランスフェクションを行った細胞では、そのような
シアリルトランスフェラーゼ活性は見られない。分泌された酵素もまた、アシア
ロ−α1酸−糖タンパク質をシアル化する能力を有している。このデータは、精
製されたα−2,3−N体の酵素の性質と一致している。
実 験 例 7
バキュロウィルスにお番るα−23−N−21」ルトランスフエラーゼの
末端のテトラサツカライドシアリルルイス× (Sle’ : SAα2、3G
a I β1、4G I cNAc [al、 3Fuc]) は、 P−セレ
クチン及びE−セレクチンのためのリガンドとして同定されており、SLe’構
造を含有する合成オリゴサツカライドはセレクチンーリガントインターラクショ
ンをブロックできる可能性のあるものである。SLe’を完全に化学合成するこ
とは技術が難しく、かつ経済的にも困難性を有している。しかし、化学的に合成
されたコアのサツカライドに末端のシアル酸とフコース残基を付加させるための
特殊なグリコジルトランスフェラーゼを使用することで、フリーのSLe’の合
成を可能にすることができる。α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼを
コードする遺伝子がラットの肝のCDNAライブラリーからクローニングさね、
そしてトランスフェクトさせたCO3−1細胞にて発現させた場合に、特殊なα
2,3(Galβ1.3/4GIcNAc)シアリルトランスフェラーゼ活性を
持つことが示された(Wen et al、、プレバレージョンの操作法)。ポ
リペプチドの酵素部位をコードしていて疎水性のシグナル/膜アンカー領域を欠
如しているcDNAクローンの一部分を、プレインスリン シグナル配列に融合
することによって、可溶性で分泌性のα2. 3NSTタンパク質をコードする
cDNAを形成した。このcDNAをバキュロウィルストランスファーベクター
でクローニングして、野生型のバキュロウィルスDNAの存在下で5f−9昆虫
細胞をトランスフェクションするのに用いた。α−2,3−N−シアリルトラン
スフェラーゼのcDNAを含有する組換えウィルスを単離して精製し、昆虫の5
f−9細胞に用いt:o このトランスフェクションされた感染細胞は、培地に
大用量のα2,3 NSTを分泌し、この分泌されたタンパク質をイオン交換ク
ロマトグラフィーによって精製した。
5f−9細胞はATCCから購入した。DNAベクターpcIR199及びpB
lueBacはJ、 C,PaulsonとInvitrogen (SanD
iego、 CA)よりそれぞれ入手した。5f−9細胞を、Gibco(Gr
andIsland、 NY)から人手されたグレーセスインセクトメディア(
0゜33%のラクタルブミン ハイドロライセード及び0.33%のイーストレ
ートで捕捉されている)に10%の熱により不活性化された胎児のウシ血清(J
RHBioscience、 Lenexa、 KS)を加えた培地、1ミリリ
ツトルあたり0. 3及び1.5ミリオン細胞個の範囲内の細胞密度に保たれた
スピカー培養で生育させた。この培地は、GCMS+10%FC3と名付けられ
ている。
α2. 3−Nシアリルトランスフェラーゼの可溶性形態を次の方法によって作
成した。完全な形のα2,3−N−シアリルトランスフェラーゼmRNAを表す
cDNAを、二つのオリゴヌクレオチドをアンプライマーとして用いているPC
R法を行うための鋳型として用いt島 これらの二つのオリゴヌクレオチドは、
その酵素のシグナル/アンカー領域を結合するちょうどC−末端の位置(5゛)
と3° −非翻訳領域にあるポリ(A)付加部位の上流(3°)でハイブリダイ
ゼーションされている。5′末端でBamHI部位をコートする二個のオリゴヌ
クレオチドは、PCR生産物をpGIR199のBamH1部位でクローニング
するのを可能にするオリゴヌクレオチドであって、プレーインスリンシグナル配
列を持つフレーム内に融合された。隣接するNhe1部位は、遺伝子融合体を遊
離させるために用いられ、このcDNAフラグメントは、バキュロウィルス ト
ランスファーベクター pBluebacで、そのバキュロウイルスのポリへド
リンプロモーターのコントロール下、クローニングした。全ての組換えDNAの
操作は、酵素マニュファクチャー操作書によって推奨されている条件の下で行っ
た。pBluebacベクターは、異なるバキュロウィルスプロモーターのコン
トロールの支配下でE、coli β−ガラクトシダーゼ遺伝子を含んでおり、
組換えが行われかつDNAベクターが取り込まれているウィルスは、染色体X−
galを青色の生成物に変換することができる。
組換えバキュロウィルスの創製は、続く操作手引書に推奨されているプロトコー
ルに正確に従い、MaxBac発現システム(Invitrogen)を用いて
行った。簡単に説明すると、プラスミド及び野生型のウィルスDNAを混合して
から、燐酸カルシウム法によって5f−9細胞をトランスフェクションするため
に用いた。ウィルスはトランスフェクトされた細胞によって産生さね、培養培地
中に入り込んでいた。組換えウィルスは、150μg/mlの濃度でプラーク培
地中に含まれるX−gal上にあるβ−ガラクトシダーゼの作用によって生成さ
れた青色によりプラークアッセイを行うことで同定し、反復しなからの希釈/プ
ラーク形成によって野生型のウィルスから精製した。精製されたウィルスは、フ
レッシュな5f−9細胞を感染することによって500m1に広げられた。数個
のクローンについて、ラジオアクティブなシアリルトランスフェラーゼアッセイ
で直接的に培地のアリコートをテストすることによって、感染された細胞培地中
にα−2,3−Nシアリルトランスフェラーゼを分泌させる能力を分析すべく下
記に説明するようにアッセイを行っt島
ウィルスを大量に増殖させる目的で、250m2の細胞培養フラスコ内において
5mlのGCMS+10%FCS中、3×106個の5f−9細胞を、野生型ウ
ィルスの含まれない単一の青色プラークを用いて感染させ、27℃で5−7日間
、増殖させた。得られたウィルスストックから5mlを採取し、遠心分離を行っ
て精製し、更に増殖させた。対数曲線(1mlあたり0. 5−1. 5×10
6個の細胞)を描いて増殖途中にある5f−9細胞を、1感染効率(moi)の
多重度で、1mlあたり1×107個の細胞濃度で感染させた。
この1感染効率は、1mlあたり1×108プラーク形成ユニツト(pfu)の
5mlストック中でのウィルス力価を想定している。
細胞をGCMS+10%FC8中で10倍に希釈し、27℃で5−7日間、増殖
させた。結果として得られるウィルスの精製を行い、ウィルス力価をプラークア
ッセイによって決定したところ、だいたい109pfu/m1以上の大きさであ
った。α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼを発現させるために、対数
生育曲線で2゜5×109個の5f−9細胞を、5F−10と言われるテントレ
ーセルフアクタ−(Nunc、 Naperville、 IL)のそれぞれの
層の表面に植え付けた。それぞれのCF−10は、6000cm2の全生育範囲
を持ち、細胞を容積300m1中に5mo i含まれる組換えノくキュロウイル
スを用いてi染させた。1時間インキュベートした後で、1リツトルのエクセル
−400(J RHBiosciences)よりなる血清フリーの培地が加え
られ、さらにその細胞を27℃で72時間インキュベートした。その培地を集め
てから精製し、0.2μmフィルターユニットを通過させて濾過した。フレッシ
ュな培地(2%の胎児のウシ血清を補充したエクセル400)が加えられてから
、その細胞を更に48時間、27℃でインキュベートした。それからその培地を
収穫し、精製を行ってから濾過した。
α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼ活性は、公開されている分析法(
Sadler et al、、1979)の変形法を行うことでアッセイした。
容積30μm中において14μmのサンプルは、3.5μlのラクト−N−テト
ラオース(Galβ1.3G l cNAcβ1.3Galβ1.4Glc)と
、下記に説明するような12.5μmのアッセイミックスチャ−と混合した。そ
のサンプルは簡単に混合されてから反応チューブの底面に引き延ばさね、続いて
10分間、37℃でインキュベートした。その後その反応物を直ちに1mlの5
mM燐酸緩衝液、pH6を用いて希釈してから、0.5mlのイオン交換カラム
にかけた。そのカラムを流して、1mlで洗浄したものを、シンチレーションチ
ューブ内に集めて計数した。1ユニツトは、1分間に1マイクロモルのシアル酸
をアクセプターにトランスファーするのに必要な酵素量として規定されている。
反応のキネティックスが線形の範囲、即ち約110000cpに保たれているそ
のままの上澄あるいは希釈された上澄のいずれかからなるサンプルが、カラムか
ら取り出された。そのアッセイ混合物は、0.65m1 (50μCi)の[1
4Cコ−CMP−シアル酸(NEN、 Boston、 MA)をドライしてか
ら、2.3mgのCMP−シアル酸を含有する0、65m1の水中に再懸濁する
ことによって調製し總 二二に、LM、pH6のソジウム力コディエート緩衝液
を0゜96.20%のトライトン CF−54を0.48m1. ウシ血清アル
ブミンの1mlあたり50mgを溶液を0.29m1 (これらは全て、Sig
ma、 St、 Louis、 MOから入手した。)を加え、さらに全体の用
量が8mlになるように水を加えた。このアッセイ混合物の特殊活性を決定し、
それをアリコートしてから一20℃で貯蔵した。
用いたイオン交換樹脂は、AGI−X8.200−400メツシユ、燐酸型であ
る(Biorad、 Richmond、CA)。
α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼの濃縮及び精製。
α−2,3NSTを含有する培地(1−3す・ントル)は濾過し、5IYIOカ
ートリツジを備えたアミコンCHPR3らせん状カートリッジシステム中で、は
ぼ250m1になるまで濃縮した。その後そのユニットは、濾過モードを10m
Mのカフダイ1ルツクアシ・ノドと、25mMのNaCl、25%のグリセロー
ル、pH5,3の溶液を二倍容量を用いて濾過モードを行うことによって先の濃
縮した上澄の脱塩をおこなった。続いてそのサンプルをS−セファロースファー
ストフo −(Pharmacia)型のカラム(2,5×17cm)にかけて
、緩衝液Aを用いて2ml/分の流量速度で平衡した。その全てのサンプルはカ
ラム上に載せてから、そのカラムを緩衝液Aを用いて、カラム溶出物の0D2e
sがベースライン(1,6カラム容量)に戻るまで洗浄した。それからα−2,
3NSTを50mMのカコダイリックアシツドとIMのNaCl、25%のグリ
セロールからなり、pH6,5の溶液を用いてカラムから溶出させr= α−2
,3NSTを含有するフラクションを集め、50mMのカコダイリックアシッド
と0.5MのNaC1,50%のグリセロール、pH6,0の溶液ILを用いて
一昼夜透析を行ったあとで、−8000で貯蔵し九
実 験 例 8
1ニドじ−23二凡二とり」佳旦之入乙gヒ」℃l」
クローン化されたラットのα−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼの組織
への分配の特徴を調べるために、全RNAを種々のラットの組織から単離し、シ
アリルトランスフェラーゼの32pでラベルしたcDNAを用いて探索した。〜
2,5KbのmRNAに対するハイブリダイゼーションが全てのテストした組織
から観察された。二個のクローン化したシアリルトランスフェラーゼついて観察
すると、α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼはラットの組織中で異な
った発現を示していた。α−2,3−N−シアリルトランスフェラーゼのm R
N Aの最高レベルは、脳内で検出された。
肝臓や腎臓、大腸、心臓、°卵巣、及び肺では中間レベルのメツセージを発現し
、これに対して顎下腺、膵臓、腸内ではmRNAが低レベルであった。反対に、
Galβ1.4GIcNAc a−2,6−シアリルトランスフェラーゼのmR
NA (4,7及び4. 3Kb。
41.46)の最高レベルはラットの肝臓や顎下腺内で検出さね、一方、mRN
Aが低レベルであるのは心臓、卵巣、及び脳内であった。
実 験 例 9
にて d ・の された
シアリルトランスフェラーゼファミリーの保存された領域。
三つのクローン化されたシアリルトランスフェラーゼの第1構造の比較を行うこ
とで、広範囲の相同性の領域が明らかになった(第12図参照)。この領域は、
同定されたアミノ酸の42%と、三つ全ての酵素の間に保存されているアミノ酸
の58%とを伴うα−2゜3−N−シアリルトランスフェラーゼの156番目の
残基から210番目の残基までの55個のアミノ酸からなっている。三つ全ての
シアリルトランスフェラーゼの配列は、この領域の他には重要な相同性を有して
いない。この領域の相同性が酵素の触媒領域の中心近くに局在しているため、こ
の領域は、これらのシアリルトランスフェラーゼの酵素活性に対して必要な保存
された構造に相当するのであろう。
グリコジルトランスフェラーゼのうちのシアリルトランスフェラーゼファミリー
の三つのメンバーは、これまでにクローン化されている。三つ全てのクローン化
されたシグナルの配列の85%は、重要な相同性を有してはいないが、それぞれ
の分子の中心にある55個のアミノ酸領域は、シアリルトランスフェラーゼファ
ミリー内のタンパク質モチーフを示唆しており、高度に保存されている。タンパ
ク質モチーフは、特定の領域内にある充分に保存されたアミノ酸配列である。こ
の領域以外の他のアミノ酸残基は、通常はほとんど保存されてはおらず、そのた
め同じモチーフを含むタンパク質的であっても全体の相同性は低い。このような
定義づけによれば、三つのクローン化されたシアリルトランスフェラーゼの第1
構造によって決定されている保存された領域力ζ シアリルトランスフェラーゼ
ファミリー内のモチーフである。
タンパク質モチーフは触媒内、またリガンド結合内によく見られる(Hodgm
an、 T、 C,、Comput、 Applic、 Biosci、 5.
1−13 [1989]; Ba1roch、 A、 Prosite: タン
パク質部位及びパターンのディクショナリー、5th edn、、 Unive
rsity of Geneva [1990]; and Sternber
g、 M、 J、 E、、 Nature 349.111 [1991コ参照
のこと)。三つの全てのクローン化されたシアリルトランスフェラーゼは、末端
のガラクトースのα−2,3リンケージあるいはα−2,6リンケージにあるC
MP−NeuAcからシアル酸のトランスファーを触媒して、次の配列を形成す
る。即ち、
NeuAca−2,3Galβ1,3 (4)GIcNAc−(S73N)
NeuAca−2,3Galβ1. 3GIcNAc−三つ全ての酵素は、共通
の機能を有している。保存された領域内にある残基のうちの50%以上は、チャ
ージされているアミノ酸あるいは極性のあるアミノ酸のいずれか一方であり、酵
素の表面にあるものと一致している。この領域にある6個のチャージされた残基
は、3個のシアリルトランスフェラーゼ全てで同一である。3個全てのクローン
化されたシアリルトランスフェラーゼ−Asp、Val、Gly、Ser、Ly
s、Thr、Thr (第12図参照)の中に、同一の保存された領域で、同一
の範囲の7個のアミノ酸残基が存在することは非常に目につくことである。
実 験 例 10
6 の された いる な
シアリルトランスフェラーゼのクローニン相同性の保存された領域は、シアリル
トランスフェラーゼ遺伝子ファミリーのもう一つのメンバーであるシアリルトラ
ンスフェラーゼ遺伝子をクローニングする目的で用いられる。
したオ!ゴヌクレ チド いたPCRクローニン相同性の保たれた領域の5゛及
び3′末端に対応する二つの縮重したオリゴヌクレオチド(第13図参照)が合
成された(Genosys)。
5′及び3′のプライマー配列は、それぞれ5’ GGAAGCTTCCGGT
RGTYTTNSNSCCACRTC(N=A+G+T+CS S=G+C,R
=A十G、M=A+C,Y=C+T)であった。PCR操作はそれぞれ1001
00pのプライマーと、鋳型としての新生ラットの脳から合成された第1番目の
cDNA配列とを用いて行った。増幅を、94℃で1分間、37℃で1分間、そ
して72℃で2分間というサイクルを30回繰り返して行った。PCRによる生
成物を、Bam HI及びHind IIIを用いて切断してから、ブルースク
リプト K S (Stratagene、 11099 North Tor
rey Pines Road、 La Jolla、 CA 92037)の
これらの部位にサブクローニングした。得られたサブクローンは、T3プライマ
ーを用いて配列決定することによって特徴を決定した。これらのサブクローンの
一つから増幅したフラグメントであるSMIは、シアリルトランスフェラーゼを
コードするSMI含有遺伝子をスクリーニングするために以下のように用いた。
SMIA ′ −のクローニン
ランダムプライマーを用いて作成した新生ラットの脳のcDNAを、EcoRI
−NotIリンカ−を用いて接合し、続いてEc。
RIで切断したλgtloに接合した。結果的に得られたライブラリーは、抽出
物をパッケージするStratagene Gigapack IIを用いてパ
ッケージされて、E、coli C600hfl上に植えつけられた。約106
個のプラークがクローン化したSMI PCRフラグメントを用いてスクリーニ
ングされた。4個のクローン、5TX1−4が精製されてからブルースクリプト
(Stratagene)のNot1部位にサブクローニングさね、次の分析が
行われた。
ムニf之公所
ラットの組織から得られた全RNAは前述した酸フェノール法を用いて調製され
た(Chomoznsyi、 P、、 et al、、 Anal、 Bioc
hem、 162.136−159 [1987コ参照)。新生のRNAサンプ
ルは、生後4日以内の子ラットから単離された。RNAは、ホルムアルデヒドを
含む1%のアガロースゲル内で電気泳動が行わわ、ニトロセルロースに転写され
たのち、続く標準的な手法を用いてハイブリダイゼーションが行われた(Kri
egler、 M、 Gene transfer and ezpressi
on、 5tockton Press、N、 Y、、 N、 Y、 [199
0コ参照)。精製されたゲルと、放射ラベルさね、5TXIから単離された90
0bpのEcoRIフラグメントをプローブとして用いてノーザンプロット分析
が行なわれへ
足工入■ユ蓋社IΩ」蓬
切り取られた形のSTX、 即ちペンリーディングフレームの31個のアミノ酸
を欠如したSTXは、インフレームのBam H1部位を含む5゛プライマーと
、stpコドンの50bp下流側に位置づけられている3゛プライマーとを用い
たPCR増幅によって調製された。増幅は、94℃で1分間、45℃で1分間そ
して72℃で2分間を30回サイクル処理して行われた。組み入れられたベクタ
−pGIR201protAには、pGIR201(コロンビア大学のDr、
K、 Drickamerより譲り受けた。)のBam H1部位に、p RI
T 5 (Pharmacia LKB Biotech、 Inc、、 1
025 At1antic Avenue、 5uite 101. Alam
eda、 CA 94501)から単離されたBclI/Bam Hlフラグメ
ントが挿入さね、タンパク質AIgG結合領域をコードさせることによって構築
されt:6 その増幅されたフラグメントは、pGIR201protAのBa
m HI部位にサブクローニングさね、結果としてインスリンシグナル配列及び
ベクターにあるタンパク質AにSTXの融合がなされた。この融合タンパク質を
含有するNheフラグメントは、プラスミドpSVLにサブクローニングされて
、その結果、発現型プラスミドAX78が得られた。
STXの口゛ 型の
発現型プラスミドAX78 (10μg)は10cmのプレートに載せたCO5
−1細胞にトランスフェクションされた。トランスフェクションした後の2日目
に、この培養培地を回収し、それをIgGセファロース(Pharmacia)
を用いて1時間、室温下でインキュベートした。ビーズを、アクセプターの基
質としてオリゴ糖、アンチフリーズ糖タンパク質、混合ガングリオシド、あるい
はノイラミニダーゼで処理された新生ラットの脳の膜を用いてシアリルトランス
フェラーゼ活性についてアッセイした。これらのアクセプターへのシアリル酸の
トランスファーは、イオン交換法を用いて測定された(Weinstein、
J、、 et al、、 J、 Biol、 Chem、 25713835−
13844 [1982]、 5ize exclusion (Id、)、a
nddescending paper chromatographY (M
cCoy、 R,D、、 et al、、 J、 Biol Chem、 26
012695−12699 [1985])参照)。
相同性のトランスフェクションは、パルス−チェイスラベリング装置で行われた
。36時間の発現期間に引続き、そのプレートを37℃で2.5mlのDMEM
−メ千オンとともにインキュベートした。1時間経過後、250uCI35S−
トランスラベル(Amersham、 2636 S、 C1airebroo
k、 ArliArlln Heigbts、 IL 60005)をその培地
中に加えてから、そのプレートを更に3時間インキュベートした。
このあと、そのプレートを洗浄し、完全なりMEMを用いて一晩インキユベート
した。ラベルされた融合タンパク質は、IgGセファロース(Pharmacf
a)を用いたインキュベートによって単離された。
続いてそのビーズを結合した後、洗浄し、ラエマリーサンプル緩衝液中でボイル
し、分泌されたタンパク質を5DS−PAGE/フルオログラフィーによって分
析した。
が日゛かにされたシアミルトランスフェラーゼに る6 ゛の た のPCR−
一
特徴が明らかにされたシアリルトランスフェラーゼの相同性の保存された領域に
存在するアミノ酸は、そのうち約70%が保存されている。保存性のある最大の
連続領域は、相同性の保存された領域の末端部分のアミノ酸配列に存在している
(第13図参照)。相同性の保存された領域のC−末端近くのアミノ酸配列には
、7個の不変な残基の連続配列か含まれていることが分かっている。このアミノ
酸配列のしっかりとした保存性があることが、コドンの利用において観察された
全てのバリエーションを含んだ256倍の縮重性をもつ相対的に複雑性の低いオ
リゴヌクレオチドのデザインを可能にした。相同性の保存された領域のN−末端
に対応するオリゴヌクレオチドをデザインすることは、更に困難である。この領
域に存在するアミノ酸は、相同性の保存された領域の反対側の末端に存在してい
るアミノ酸配列よりもかなり変化に富んでいることを示している。
オリゴヌクレオチドのデザインは、アミノ酸のコドンの重複度が高いためにより
複雑となる。相同性の保たれた領域の5゛末端からのオリゴヌクレオチドは、こ
れらの要因を補償するために、1026倍の縮重度で合成されt= 複雑性のこ
の程度は、PCRE実験で許される縮重性の限界付近であるが、結果として得ら
れたプライマーは、相同性の保存された領域のこの領域をコードすることが見い
だされた全ての核酸配列を明らかにした。
神経の発生は、細胞表面の炭水化物発現物に見いだされる劇的な変化から明かと
なるように、グリコジルトランスフェラーゼがダイナミックな調節の主因として
働く複雑な過程である。この理由により生まれたばかりのラット脳は、新しいシ
アリルトランスフェラーゼを単離するためのソースとして選ばれている。鋳型と
して生まれたばかりのラット脳cDNAを用いることによって、縮重プライマー
を用いたPCR実験は、150bpバンド、すなわち相同性の保存された領域の
既知のサイズに一致したものの増幅をもたらす。サブクローニングや配列決定は
、そのバンドが、二つのDNAフラグメントの混合物であることを明らかにした
。特徴づけされた30個の単離物のうち、56%がαの相同性の保存された領域
をコードしていた。さらに、残りのクローンはSMlという相同性の独特の保存
された領域をコードしていた。やや驚くべきことに、SMlは、三つの既にクロ
ーン化されたシアリルトランスフェラーゼで不変であることが見いだされたアミ
ノ酸において、五つの変化を含んでいる。これらの変化は、不変残基のトータル
数を減らすが、SMIの特徴づけによってもたらされた新しい配列情報は、コン
センサス配列の全体的な保存性を高める。
SMIの差し示されたアミノ酸配列は、相同性の保存された個別のいかなる領域
にたいする予想にも反する。いくつかの場所(アミノ酸 1.2.53.54)
で、SMIは、相同性のα2,6の保存された領域に似ている。他の場所(アミ
ノ酸 8.9.54.55)では、SMlは、相同性のα2,3の保存された領
域に見いだされる配列を反映している。相同性の保存された領域は、85%保存
されているが、この類似性のバランスは、シアリルトランスフェラーゼ遺伝子フ
ァミリーの他のメンバーにおよそ45%の相同性のあるSMIとなるように導く
。
遣]−一 むSMIの1゛1
1.5Kbクローンの5TXIの配列解析は、先のPCR実験で特徴づけされた
相同性の保存されたSMIの領域をコードする、−続きの375個のアミノ酸の
オーブンリーディングフレームを同定した(図14)。STIの決定されたアミ
ノ酸配列は、他のクローンされたそれぞれのグリコジルトランスフェラーゼに見
られるように、このタンパク質は、タイプIIの膜貫通タンパク質である。ST
1の指し示されたアミノ酸配列は、シグナル−アンカー領域として役立つであろ
う、タンパク質のアミノ末端から8個の残基からなる疎水性領域の存在を示して
いる。相同性の保存された領域は、タンパク質の中心付近に位置している。ST
Xタンパク質の全サイズと疎水性領域と相同性の保存された領域の両方の相対的
な位置関係は、クローン化されたシアリルトランスフェラーゼの一次配列の特徴
に類似している。STXは、相同性の保存された領域を除いてクローン化された
シアリルトランスフェラーゼに対する相同性を少しも示さないけれども、これら
遺伝子の前述した構造類似性があることで、STXが、この遺伝子ファミリーの
最も新しい一員であることが明らになっている。
Σニス!」II清劃側
シアリルトランスフェラーゼの自然になる可溶性の形態は、様々em、 498
29−837 [1971])。これらの可溶性の形態は、シアリルトランスフ
ェラーゼのステム領域を切断して、膜貫通のアンカーから触媒領域を切り離すと
いうタンパク質分解から生じる。可溶性シアリルトランスフェラーゼは、内在性
のシグナル−アンカーを切断可能なシグナル配列で置き換えることによる組換え
技術を用いて作ることができる(Colley、 K、 J:、et al、、
J、 Biol、 Chem、、 26417619−17622 [1989
])。STXの機能的解析を行うため(ミそのタンパク質の可溶性形態は、最初
の31個のアミノ酸を切断できるインシュリンシグナル配列やプロティンA I
gG結合領域で置き換えることによって作られた。IgG結合領域は、可溶性の
STXタンパク質の検出に係わるところに含まれていた。5T3Nとの同様な融
合体は、IgGセファロースに結合されることで、発現細胞から積極的に分泌さ
ね、酵素的に活性である。プロティンAやSTX融合体を含む発現プラスミドが
、CO5−1細胞で発現さね、85Kdタンパク質が単離された。融合体タンパ
ク質のサイズは、多くのSTXの強力なN結合グリコシレージョン部位が使われ
るべきだと提案されたポリペプチドの示された分子量より大きくて、およそ15
Kdである。
結合した融合タンパク質については、様々な基質受容体を用いてシアリルトラン
スフェラーゼ活性が試験された。活性は、Galβ1.3 (4)G I cN
Ac配列を含むβ−ガラクトシド受容体を用いると検出されなかった。同様に、
シアル酸をアンチフリーズ糖タンパク質の〇−結合したオリゴサツカライドに転
移する活性も検出されなかった。脳組織内でSTXの発現から、その遺伝子が糖
脂質生合成に関係していることが示唆された。しかし、成熟したウシ脳由来の雑
多なガングリオシドは、基質受容体として役立たなかっt島ニューロアミダーゼ
処理された新生児脳膜は、たった1つの基質に対してのみ受容体としての能力の
片鱗を見せた。STX融合タンパク質で処理された細胞膜をインキュベートする
ことで、バックグラウンドに対して50%の活性増加が示された。
STXの、生゛ と、、 ・
STX遺伝子の発現パターンとその強度を決定する目的で、5TX1から単離さ
れた900bpのEcoRIフラグメントをプローブとしてノーザンプロット分
析を行った。試験された様々な組織の5.5kbpを目的とするハイブリダイゼ
ーションは、新生児ラット脳RNAでのみ観察されtミ 相同性が保存された領
域近辺に対するクロスーハイプリダイセーションは観察されなかった。STXの
制限された発現は、特徴のあるシアリルトランスフェラーゼに観察される組織特
異的な発現から出発する。これらの遺伝子がそれぞれ独立にコントロールさね、
その結果、組織特異的発現の異なるパターンを生み出す一方で、一般にどのシア
リルトランスフェラーゼも多様多彩な組織でさまざまに発現している(Paul
son、 J、 C,、et al、、 J、 Biol、 Chem、 26
410931−10934 [1989コ)。これとは対照的に、STXは新生
児脳でのみ発現さね、その発現は、新生児腎臓では検出されないように、法則化
された初期発生の段階では現れない。
ロQOロロロロロロロロロロロロロロロのnのψトかψ〜いい寸■の一〜寸−ト
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(”1sr−5占十′l!(ラクトースン
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第5図
目
↓雨量
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了ンカー々胸仁灸゛θσ12−27)図1−rl騒” (aa 2a−5ty)
口hgQd、 (0056−J4J)
sp−5T (シフ′切しヘ・)3テドーシ7・)ルートラ〉スフェラーゼノシ
ブナ・レベフ・子ドめmダしt>イ立ロ インシシ1)ンシブルへo7°すV、
q−yミノ饋口触嫌値威(aa46−3437
第8図
区 ミづミミ冶ジe弓&ミ)
Φ 相ブす強戊
法
o 5 o も o cb cb cb cb b 5()OHζ へ 癲 喝
聾 1 N N1対強爪
区
Ll”>6 L、I−ロー
′″ ′″−2″′ 壕
、、、、、、、、=NllPCT/US93102002. 、、 PCT/U
S 93102002フロントページの続き
(81)指定国 EP(AT、BE、CH,DE。
DK、ES、FR,GB、GR,IE、IT、LU、MC,NL、PT、SE)
、0A(BF、BJ、CF、CG、 CI、 CM、 GA、 GN、 ML、
MR,SN、 TD。
TG)、 AT、 AU、 BB、 BG、 BR,CA、 CH。
CZ、DE、DK、ES、FI、GB、HU、JP、KP、 KR,LK、 L
U、 MG、 MN、 MW、 NL、 N。
、 NZ、 PL、 PT、 RO,RU、 SD、 SE、 SK。
A
(72)発明者 ボールソン ジェームス イー。
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
90214 デルマー トーレイパインズテラス209
(72)発明者 ウエン シャオホン
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
92122 サンディエゴ カララブレイスフ260−エイ
(72)発明者 リビングストン プライアン デュアンアメリカ合衆国 カリ
フォルニア州
92126 サンディエゴ コピナストリートロ15
(72)発明者 ジレスピー ウィリアムアメリカ合衆国 カリフォルニア州
90230 カルバ−シティ ガルビンストリート10761
(72)発明者 ケルム ソージ
ドイツ ディー−2300キエル 14 ドルフシュトラーセ 14
(72)発明者 バーリンゲイム アルマ エル。
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
94965 サウサリート アレクサンダーアベニュー 26
(72)発明者 メドツィラドスキー カラリンアメリカ合衆国 カリフォルニ
ア州
94122 サンフランシスコ エイスアベニュー 1867