JPH08509461A - ポリペプチドを固定化するための支持体及び方法 - Google Patents
ポリペプチドを固定化するための支持体及び方法Info
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Abstract
(57)【要約】
ポリペプチドの固定化と配列分析のための固体支持休と方法。ひとつの局面では、本発明はポリペプチドを固体支持体に固定化する方法にある。本方法では、表面結合カルボン酸基を有する固体支持体がイソオキサゾリウム塩と反応し活性化支持体を形成する。活性化支持体を洗浄して残りのイソオキサゾリウム塩と塩基を除いた後、支持体を乾燥させる。乾燥した支持体を次に支持体にポリペプチドを共有結合するために有効な条件下にポリペプチドと接触させる。固定化したポリペプチドはN−およびC−末端配列決定法により都合良く配列決定することができる。
Description
【発明の詳細な説明】
ポリペプチドを固定化するための支持体及び方法発明の技術分野
本発明はポリペプチドを固定化するための固体支持体および方法、そして特に
、ポリペプチド配列決定に使用するための固体支持体および方法に関するもので
ある。参照文献
アエバーソルド アール エイチら(1988)Biochem.27(18):6860-6867。
アレン ジイ(1981)Sequencing of Proteins and Peptides:Elsevier Scie
nce Publishers、オランダ アムステルダム。
ブリジェン ジェイ(1975)FEBS Lett.35:97-102。
コウル ジェイ エムら(1991)Anal Biochem.194:110-120。
ディアス エイ ジェイら(1987)Macromolecules 20:2074-2075。
フィンドレイ ジェイ ビイ シイとゲイソウ エム ジェイ著(1989)Prot ein Sequencing:A Practical Approach
IRL Press、イギリス オツクスフオー
ド。
ラウルセン アール エイとマッハレイト ダブリュ(1980)In:Methods of
Biochemical Analysis 26:201-284。
リー ケイ ダブリュら(1987)Macromolecules 20:1437-1439。
マツダイラ ピイ(1987)J.Biol.Chem.262:10035。
ウッドワード アール ビイとオロフソン アール エイ J.Am.Chem.Soc.83
:1007(1961)83:1007-1009;Tetrahedron Suppl.No.7(1966)pp.415-440
。発明の背景
固相ペプチド配列決定において、ポリペプチドは固体支持体上に固定化し、ポ
リペプチドのC−またはN−末端からのアミノ酸残基を放出しそして同定するた
めに一連の化学反応が連続的に行われる(コウル)。
N−末端配列決定のための最も広く使用される方法は、エドマン分解として知
られている工程で、ポリペプチドのN−末端アミノ基にフェニルイソチオシアネ
ート(PITC)を反応させることを含む(エドマン)。PITCと末端アミノ
基の反応はフェニルチオウレア基を付加し、環化し、分裂し、N−末端アミノ酸
の遊離アニリノチオゾラノン(ATZ)と短鎖ペプチドを生成する。N−末端ア
ミノ酸のATZ誘導体は分離され、対応するフェニルチオヒダントイン(PTH
)に転化し、そして高性能液体クロマトグラフィー(HPLC)で同定される。
次に配列決定は次の位のN−末端残基を遊離アミノ酸PTHに連続的に転化し、
そして各連続的に分離されたアミノ酸を同定して行われる。この方法は一般的に
約20〜40までのアミノ酸残基の配列決定に信頼性があり、容易に自動化装置
で行われる。
現時点で、大抵のC−末端配列決定はC−末端チオヒダントイン(TH)また
はチオヒダントイン類似誘導体の生成を含む。一つのアプローチとして、ポリペ
プチドのC−末端カルボキシル基はイソチオシアネート(ITC)塩または酸の
存在下に無水酢酸を用いて活性化され、C−末端ITC中間体を経由してC−末
端チオヒダントインを生成する(スターク)。このC−末端チオヒダントインは
ポリペプチドから分裂することができ、短鎖のペプチドとC−末端アミノ酸残基
のチオヒダントイン誘導体を生成する。この誘導体は分離して、例えばHPLC
で同定することができる。
2つの一般的なアプローチが配列決定のための固体支持体上にポリペプチドを
固定化するために用いられた。1つのアプローチでは、ポリペプチドは支持体上
の反応性基を経て支持体に共有付加によって固定化される。N−末端配列決定の
ため、C−末端カルボン酸基は、カルボニルジイミダゾールまたはカルボニルジ
イミドのような活性化試薬と反応させ、続いて支持体結合アミノ基と結合させる
ことができる(ラウルセン)。内部残基の側鎖基を経ての共有付加もまた可能で
ある(フィンドレイおよびゲイソウ、1989)。
N−末端配列決定のために、DITC−活性化ガラスが一般に使用され、そこ
では支持体結合イソチオシアネート基はポリペプチドアミノ基(すなわち、リシ
ルε−アミノ基)と反応しポリペプチドと安定なチオウレア結合を形成する(ブ
リドゲン)。またポリペプチドのα−アミノ基は支持体と反応できるが、そのよ
うな結合(α−アミノ基との)はトリフルオロ酢酸(TFA)を用いて解裂でき
る(アレン、1981)。
活性化支持体を用いた共有付加は支持体上の本質的に耐久性のポリペプチドの
固定化の利点を与え、これにより試料の流失を最小にする。しかし活性化支持体
は水によって不活性化されやすい傾向がある。従って、ポリペプチド試料は支持
体上に固定化する前に特別の無水溶媒(例えばアセトニトリル)に溶解しなけれ
ばならない。更に、活性基が経時的に劣化するで、しばしば固定化の効率は一定
しない。
第2のアプローチでは、ポリペブチドは非共有結合的に固定化される。気体一
液体固相配列決定法では、例えば、試料は一般的にはポリペプチドとのイオン的
および水素結合的相互作用によってメンブラン型の支持体の中に引っ張り込まれ
る。他のタイプの支持体も使用できるが、ガラス繊維支持体はこの応用では実用
的であることを立証された。例えば、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動
によって分離された蛋白質はポリビニルデンジフロライド(PVDF)メンブラ
ン上に直接に電気ブロットでき、目的の蛋白質を含むメンブランの一部を自動配
列決定装置に直接充填できる(マツダイラ、1987)。
非共有結合のための支持体は活性基の安定性の問題を回避するが、このような
支持体は一般に小さなポリペプチドの保持に失敗する。固定化の効率と耐久性は
しばしば、ポリペプチドの保持を高めるために支持体の表面にマトリックスを形
成するポリブレン(POLYBRENE)のようなポリカチオン型キャリヤを支
持体に加えて改良することができる。しかしながら、1つの欠点は、このような
マトリックスは一般に、試料を充填する前にマトリックスを被覆した支持体を複
数の配列決定サイクルで処理し、配列分析中のアミノ酸の同定を妨げるような汚
染物質をマトリックスから除くための予備循環が必要なことである。従って、こ
のようなマトリックスの使用は配列決定のプロトコルを遅くさせる。
理想的には、ポリペプチドの共有結合固定化のための活性化支持体はポリペプ
チドと容易に反応する必要がある。支持体はポリペプチド試料水溶液と適合性が
あり、長期間にわたり結合効果を失うことなく貯蔵ができなければならない。発明の概要
1つの局面で、本発明は固体支持体上にポリペプチドを固定化するための方法
に向けられる。本方法において、表面に結合したカルボン酸基をもつ固体支持体
がイソオキサゾリウム塩と反応し活性化支持体を形成する。活性化支持体を洗浄
し、残りのイソオキサゾリウム塩および塩基を取り除いた後、支持体は空気乾燥
する。次に乾燥した支持体は、支持体にポリペプチドを共有結合により結合する
に効果的な状態でポリペプチドに接触させる。
1つの具体例では、固体支持体は、ポリペプチド中のカチオンチャージ基と非
共有結合により結合するため、表面に結合したスルホネート基を含む。
また、本発明は、ポリペプチド中の1あるいはそれ以上のアミノ基と反応する
表面結合エノールエステル基を持つ、上記の方法で使用されるための固体支持体
を含む。この支持体は水性ポリペプチド試料と適合性があり、固体化効率の減少
なく、乾燥形態(すなわち、空気乾燥後)で長期間、例えば数ヶ月間貯蔵ができ
る。1つの好ましい具体例では、支持体はポリビニリデンジフルオリドメンブラ
ンからなる。更に、支持体は、上述のようにポリペプチド中のカチオンチャージ
基と非共有結合により結合するために、表面結合スルホネート基を含むことがで
きる。
他の局面では、本発明は、今記述したタイプの固体支持体をメンブランにポリ
ペプチドを結合するのに有効な条件下でポリペプチドと接触させる、ポリペプチ
ドを固定化するための方法を含む。
他の局面では、本発明は、ポリペプチド中のN−末端およびC−末端残基の配
列位置を同定するための方法を含む。この方法では、C−末端カルボン酸基をも
つポリペプチドを、メンブランに共有結合または非共有結合によりポリペプチド
を固定化するのに有効な条件下に、表面結合エノールエステル基をもつポリビニ
リデンジフルオリドメンブランと接触させる。ポリペプチド固定化後、メンブラ
ンは1サイクルまたはそれ以上のエドマン分解を行い、結合したポリペプチド中
の1個またはそれ以上のN−末端残基の配列を決定する。次に、同じメンブラン
を1サイクルまたはそれ以上のC−末端配列決定を行い、ポリペプチド中の1個
またはそれ以上のC−末端残基の配列を決定する。
本発明のこれらおよび他の目的および特徴は、本発明の次の詳細な説明を図面
との関連で読むと一層明らかになるであろう。
図面の簡単な説明
図1は、アミノプロピル−(トリエトキシラン)との反応によるガラス固体支
持体の改良を示す;
図2は、無水コハク酸との反応による支持体結合アミノ基のカルボン酸基への
転化を示す;
図3は、ウッドワード試薬K(WRK)を用いる支持体結合カルボン酸基の活
性化カルボキシレート基(エノールエステル基)への転化を示す;
図4は、本発明の反応性支持体へのポリペプチドカップリングを示す;
図5A−5Eは、本発明の反応性支持体(PVDF−メンブラン)上に固定化
されたアポミオグロビンを用いる第1から第5までのC−末端配列決定サイクル
におけるHPLCクロマトグラムを示す;
図6A−6Dは、本発明の反応性支持体(活性化PVDF−メンブラン)上に
固定化されたリゾチームを用いる第1から第4までのC−末端配列決定サイクル
におけるHPLCクロマトグラムを示す;
図7A−7Dは、本発明の反応性支持体(PVDF−メンブラン)上に固定化
された15残基ペプチド(SEQ ID NO:1)を用いる第1から第4まで
のC−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示す;
図8A−8Dは、本発明の反応性支持体(ポリスチレン樹脂)上に固定化され
た12残基ペプチド(SEQ ID NO:2)を用いる第1から第4までのC
−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示す;
図9A−9Dは、本発明の反応性支持体(CPGビーズ)上に固定化された1
2残基ペプチド(SEQ ID NO:2)を用いる第1から第4までのC−末
端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示す;
図10A−10Dは、本発明の反応性支持体(CPGビーズ)上に固定化され
た11残基ペプチド(SEQ ID NO:3)を用いる第1から第4までのC
−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示し、ここでの固定
化は有機溶液中で行った;
図11A−11Dは、反応性支持体(DSS誘導化CPGビーズ)上に固定化
された図10A−10Dからの同じペプチドを用いる第1から第4までのC−末
端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示す。ここでの固定化は
有機溶液中で行った;
図12A−12Dは、図10A−10Dでのペプチドおよび反応性支持体を用
いる第1から第4までのC−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグ
ラムを示し、ここでの固定化はpH6の水溶液中で行った;
図13A−13Cは、図11A−11Dでのペプチドおよび反応性支持体(D
SS−誘導化CPGビーズ)を用いる第1から第3までのC−末端配列決定サイ
クルにおけるHPLCクロマトグラムを示し、ここでの固定化はpH6の水溶液
中で行った;
図14A−14Dは、使用前に乾燥形態で3ヶ月間貯蔵されていた反応性支持
体(ポリスチレン)上に固定化した12残基ペプチド(SEQ ID NO:2
)を用いる第1から第4までのC−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロ
マトグラムを示す;
図15A−15Dは、使用前に乾燥形態で6ヶ月間貯蔵されていた反応性支持
体(CPGビーズ)上に固定化した12残基ペプチド(SEQ ID NO:2
)を用いる第1から第4までのC−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロ
マトグラムを示す;
図16A−16Eは、使用前に乾燥形態で3ヶ月間貯蔵されていた反応性支持
体(PVDFメンブラン)上に固定化したアポミオグロビンを用いる第1から第
5までのC−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示す;
図17は、本発明の反応性支持体(白棒)および、非カルボキシル化、非活性
PVDFメンブラン(黒棒)に固定化された12残基ペプチド(SEQ IDN
O:4)のN−末端配列決定のための配列決定サイクルに対する反応収率のプロ
ットを示す。
図18Aは、本発明の反応性支持体(PVDFメンブラン)上に固定化したア
ポミオグロビンを用いる第1から第4までのN−末端配列決定サイクルにおける
HPLCクロマトグラムを示し;図18Bは、図18Aに示されるN−末端配列
決定の後、同じメンブランおよび同じ試料を用いて得られた第1から第4までの
C−末端配列決定サイクルにおけるHPLCクロマトグラムを示す;
図19は、WRK−誘導エノールエステルの分子内転位を示す;
図20は、本発明の説明に用いられたペプチド配列を示す;
発明の詳細な説明
I.定義
特に言及しない限り、下記の用語は次の意味をもつ:
“活性化支持体”または“活性化固体支持体”とは、ポリペプチドと反応しポ
リペプチドと支持体間に共有結合を形成できる表面結合化学基をもつ固体支持体
をいう。
“ポリペプチド”とは、ペプチド(アミド)結合により結合した多重アミノ酸
残基をいう。ここで用いられるように、“ポリペプチド”は、例えばアポミオグ
ロビンあるいはリゾチームのような蛋白質である非常に長鎖のポリペプチドと同
様に、短いペプチド(すなわち、ペプチド 2から20個のアミノ酸残基)も含
む。
“ペプチド”は2から約50個のアミノ酸残基を含むポリペプチドをいう。
アミノ酸残基の省略形は当該分野で用いられる標準の3文字および/または1
文字コードである。
II.本発明の一般的な特徴
本発明は固体支持体上にポリペプチドを固定化するための方法を含む。1つの
具体例として、この方法はN−エチル−5’−フェニルイソオキサゾリウムスル
フォネート(ウッドワード試薬K;WRK)のようなN−置換イソオキサゾリウ
ム化合物を用いて、代表的には塩基の存在下に有機溶媒中で、適当な支持体上に
カルボン酸基を誘導化することを含む。この誘導化反応は求核分子による攻撃に
対して“活性化される”エノールエステル基に支持体結合カルボン酸基を転化す
る。活性化反応後、残りのイソオキサゾリウム塩および塩基は除かれて、そして
支持体は長期間の貯蔵のため空気乾燥させる。本発明の重要な局面によると、本
発明者は、乾燥し活性化した支持体は、支持体の固定化効率を減少させることな
く長期間(例えば、数ヶ月間)貯蔵ができることを見出した。本発明の特に有利
な具体例では、固体支持体はポリビニリデンジフルオリド(PVDF)メンブラ
ンからなる。
ポリペプチドの固定化は、ポリペプチドアミノ基と支持体結合のエノールエス
テル基との反応を促進するに有効な状態で、ポリペプチドと乾燥支持体を接触さ
せることにより行われ、支持体にポリペプチドを共有結合することができる。こ
のような共有結合は有機熔媒(例えば、アセトニトリル、メタノール、または、
N−メチルピロリドン)の存在下、あるいは代わりに、pHが約1ないし8の間
の水溶液中で行われてもよい。一般に、反応時間は約3から24時間であり、通
常は3から6時間の範囲である。また、さらに一層短い反応時間も効率の良い固
定化のために有効であり、例えば特に支持体がPVDFメンブランからなる場合
には、分の単位になる。配列分析に先だって、非結合のポリペプチドを溶媒でメ
ンブランを洗浄して除くこともできる。
支持体上のポリペプチドの固定化は、例えば、その全体が参照文献としてここ
に組み込まれるボイドおよびゾンの米国特許第5,185,266号で明らかにされてい
る方法によって、C−末端配列決定のためのペプチドフリーのC−末端終端を残
す。
III.活性化固体支持体
この章では、本発明の活性化(反応性)固体支持体を生成するために適当な固
体支持体、活性化試薬および反応を記述する。
A.カルボキシル化固体支持体
種々の固体支持体物質および形態を本発明に従ってペプチド固定化に用いるこ
とができる。適当な形態は、例えばビーズ、樹脂およびメンブランを含む。適当
な支持体物質はガラス(例えば、CPGビーズ);およびナイロン、ポリスチレ
ン、改質ポリエチレン、テフロン(登録商標)およびテフロン中に埋め込まれた
ポリスチレン樹脂のようなポリマー物質を含む。
本発明の活性化支持体を形成するための支持体は、支持体結合カルボン酸基、
あるいは既知の反応系によりカルボン酸基に転換できる他の化学基を含む。この
目的のための具体例としての支持体はバイオ−レックス70(バイオ−ラド社、
リッチモンド、カリフォルニア)、カルボン酸基濃度10meq/gのカチオン交換
樹脂;活性化に先だってカルボキシル基に転化できる、アミノプロピル制御ポア
グラス(CPG)およびアミノメチルポリスチレンビーズ(アプライドバイオシ
ステムズインコーポレイテッド、フォスターシティ、カリフォルニア);および
アンバーライトIRP64(ロームアンドハース)、他のカルボキシレート含有
カチオン交換樹脂を含む。好ましい固体支持体はカルボン酸基によって誘導され
たポリビニリデンジフルオリドメンブランである(PVDF−COOH)。この
ようなメンブランのひとつははポールコーポレーション(ロングアイランド、ニ
ューヨーク)から市販されている。代わりになるものとして、カルボキシル化P
VDFメンブランは当該分野で知られている方法で調製できる。
図1は、ワットマンGF/Fガラスファイバーメンブランのようなガラス支持
体を支持体結合のアミノ基を与えるために誘導する方法を説明する。ガラスファ
イバーメンブランは酸でエッチングし、次にアミノプロピル−トリエトキシシラ
ン(APTES)で処理する(アエバーソルド)。アミノ基結合の程度は容易に
ニンヒドリン分析で定量できる。具体的なガラス支持体の誘導化のプロトコルは
実施例1に挙げた。
上記した支持体上、あるいは他の適当な支持体上のアミノ基は図2、実施例2
および実施例3で説明されているように、無水コハク酸で一晩インキュベートし
てカルボン酸基に転化できる。無水コハク酸との反応の経時過程は残存アミノ基
についてのニンヒドリン分析により監視できる。
支持体上のカルボン酸基の数は無水コハク酸処理後の支持体上のアミノ基の数
(ニンヒドリン分析)を処理前の数から引算して判断できる。このような分析は
使用者の特別なニーズに合わせた支持体上のカルボキシル基の水準に達するよう
に反応条件を変えるために有効である。
多くの他の方法を固体支持体上にカルボン酸基を結合させるために用いること
ができる。例えば、ポリ(クロロトリフルオロエチレン)含有支持体は水酸基を
含有するように改質でき(リー)、このものは無水コハク酸との反応によりカル
ボン酸基に転化できる。代わりになるものとして、上記の支持体は2−(リチオ
メチル)−4,4−ジメチルオキサゾリンで改質でき、次にトリフルオロ酢酸/
水/アセトン混合物と還流し支持体上に直接カルボン酸基を導入できる(ジアス
)。
B.活性化試薬
本発明によれば、支持体結合のカルボン酸基は、2−エチル−5’−フェニル
イソオキサゾリウムスルフォネート(WRK)のようなN−置換イソオキサゾリ
ウム化合物(ウッドワード等)と反応し、活性化カルボン酸基(エノールエステ
ル基)を生成する。この活性基はエノールエステル部分を持ったベーターアシル
オキシ−N−エチル−桂皮酸アミドの誘導体であり(参照、図3下部)、アミノ
基と反応性がある。他の特別な具体例では、N−置換イソオキサゾリウム化合物
はウッドワード試薬Lである。
図3で説明したカルボン酸基の活性化は、アセトニトリルまたはN−メチルピ
ロリドンのような適当な有機溶媒中で、実施例4で記述したように、ジイソプロ
ピルエチルアミン(DIEA)のような適当な塩基の存在下に行われる。エノー
ルエステル基はアミンによる求核攻撃を受けやすいので、エノールエステルの触
媒による生成に用いられる塩基は比較的に非求核的でなければならないことは評
価できる。従って第3級アミン、特に立体障害の第3級アミンが塩基として好ま
しい。
図3に説明したように、カルボン酸含有支持体は塩基(好ましくは、上記のよ
うに非求核)の存在下にWRKを用いて活性化することができ、その位置で反応
性ケテンイミン中間体を生成する(ウッドワード)。反応性ケテンイミンは支持
体結合カルボン酸基と容易に反応して、図4に示すように、エノールエステル基
を生成する。この反応は、実施例4に詳述したように、WRKおよび塩基を含有
する溶液中にカルボキシル化支持体を浸漬して行うことができる。
例として、支持体結合カルボン酸基を含有するガラスファイバーメンブランは
新たに調製したケテンイミン溶液を入れた浅い皿の中で緩やかに約4〜6時間渦
巻き攪拌することができる。次にこのメンブランをアセトニトリルで洗浄し、未
反応ケテンイミンを除き、そして活性化支持体を空気乾燥させる。この方法で調
製された活性支持体の多くは発明者らにより、長期間にわたり安定性があり、そ
してペプチド固定化のために用いるのに先立つ数ヶ月間を室温で貯蔵できること
が見出された。
C.ペプチド固定化
本発明の活性化支持体への共有結合のため、ポリペプチドを緩衝水溶液または
有機溶媒中に溶解し、支持体上にポリペプチドが固定化するに充分な時間、活性
化支持体と接触させる。
本発明の重要な局面によれば、本発明者等は乾燥した活性化支持体は広いpH
域にわたり水性条件下で充填した試料と適合性があることを見出した;すなわち
、支持体へのポリペプチドの共有結合は、支持体結合エノールエステル基が水に
よりあまり加水分解(すなわち、非活性)することなく、水性条件下に行うこと
ができる。
本発明の支持体で行われた研究において、いくつかのカルボキシル基を含有す
るかまたはカルボキシル基を含有するように誘導された固体支持体をWRKを用
いて活性化させ、そして活性化された支持体のタンパク質を固定化する能力につ
いて試験した。更に、WRK−活性化支持体を用いたペプチド固定化は、下記の
他のペプチド固定化方法と比較した。
C.1 ポリペプチド固定化
本発明の活性固体支持体上のポリペプチド(タンパク質およびペプチド)の固
定化のために、ポリペプチドはもし必要ならイオン−ぺア試薬(例えばトリフル
オロ酢酸)と共に有機溶媒中に溶解してもよい。あるいは、これに代えてポリぺ
プチドをpH約1〜8の緩衝水溶液に溶解してもよい。
支持体上のポリペプチド固体化の高割合を達成するのに、活性化支持体をポリ
ペプチド溶液に浸漬し、室温で数時間インキュベートしてもよい。速い固定化の
ために、ポリペプチド溶液を支持体上にスポットし、次に乾燥させてもよい(例
えば、実施例15A)。
支持体が回転濾過装置中でメンブランの形態をとる場合、固定化は遠心分離に
より効果が表れ、そこでは溶液が支持体から遠心分離により引き出されるので、
ポリペプチドが支持体の側に保持される。例えば、メンブランを遠心分離管の口
から吊り下げることができる挿入物として形成できる(実施例15B)。試料ポ
リペプチド溶液は挿入物中にあり、そして遠心分離管/挿入物集合体はメンブラ
ンを通してすべての溶液を通過させるに充分な時間遠心分離機にかけられ、メン
ブラン上にポリペプチドを固定化させる。
ポリペプチドが活性化支持体上に固定化された後、支持体は普通には配列分析
に先だって結合しなかったポリペプチドを除くため数回洗浄する。注意すること
は、高温または強い塩基条件は支持体の不活性化を最小にするために避けるべき
である。
図5A−5Eおよび6A−6DはアポミオグロビンおよびリゾチームのC−末
端配列分析からのHPLCクロマトグラムを示す。これらのタンパク質は実施例
5および6に記載した手順によりWRK−活性化PVDFメンブラン上にpH7
で固定化された。図5A−5Eを参照すると、アポミオグロビン試料は第5残基
まで容易に配列決定される。同様に、図6A−6Dはリゾチームの最初の4個の
C−末端残基が容易に配列決定されることを示している。注意することはリゾチ
ームに関して、第3配列決定サイクルにおいてピークが観察されない(図6C)
のはおそらく、第3残基のシステインがリゾチームポリペプチド鎖中に他のシス
テイン残基とのジスルフィド結合を残し、従って遊離チオヒダントイン誘導体と
して放出できないためであろう。
図7A−7Dおよび9A−9Dは小さいペプチドのC−末端配列決定(実施例
14)からのHPLCクロマトグラムを示す。水に殆ど溶解しないペプチドに対
して、固定化はジメチルホルムアミド(DMF)、N−メチルピロリドン(NM
P)またはアセトニトリルのような有機溶媒中で行われる。しかしながら、水溶
性ペプチドに関して、高い固定化収率を同様に水性溶媒中で得ることができる。
一般に、ペプチドの濃度はポリペプチド固定化を促進するのに1ないし6mg/
mlがよいが、さらに低い濃度を使用してもよい。例えば、図17は12残基ペ
プチドのちょうど10pmol(メンブラン上にスボット)のN−末端配列決定
分析を示す。
図7A−7DはWRK−活性化PVDF−メンブラン上に固定化された15残
基ペプチド(SEQ ID NO:1)のC−末端配列分析を示す(実施例7)
。図から見ることができるように、アルキル化チオヒダントインのピークの強い
シグナルが4つの全ての配列決定サイクルに観察された。
図8A−8Dは、実施例3および4に記述した一般的な手順で生成したWRK
−活性化ポリスチレン樹脂上に固定化された12残基ペプチド(SEQ IDN
O:2)のC−末端配列分析を示す。この例では、無水コハク酸改質に先だって
存在する支持体結合アミノ基の量が、ニンヒドリン分析によって決められ、樹脂
1g当たり約26μmolと測定された。無水コハク酸で誘導化後、遊離アミ
ノ酸基は検出されず、アミノ基が量的にカルボン酸基に転化されたことを示唆し
ている。図8A−8Dから分かるように、強いアルキル化チオヒダントインのピ
ークが4つの全ての配列決定サイクルに観察された。
図9A−9Dは図8A−8Dで使用した同じ12残基ペブチドのC−末端配列
分析を示すが、WRK−活性化CPGビーズ(実施例3および4で記したように
調製した)上に固定化したものである。再度、強い配列決定ピークが、図に示さ
れる最初の4配列決定サイクルを通じて観察された。
C.2 DSS−活性化支持体との比較
本発明の支持体で行った実験で、WRK−活性化支持体を用いた固定化収率を
他のペプチド固定化方法により得られた収率と比較した。
1つの研究では、実施例3および4で記述したように調製したWRK−活性化
CPGビーズの固定化収率をジスクシンイミジルスベレート(DSS)で活性化
したCPGビーズによって与えられた収率と比較した。DSSは、ポリペプチド
アミノ基をアミン誘導化支持体によってカップリングするのに用いられた2官能
性架橋試薬(ピアーズ、ロックフォード、ILから入手可能)である。この研究
で用いられたDSS−誘導化ビーズの調製は実施例8に記述した。
2つの活性化支持体は先に記した手順により各々の支持体上に合成11残基ペ
プチド(SEQ ID NO:3,“11−mer”)を固定化して調べた。実
験の一つの組では、ポリペプチド固定化は有機溶媒、N−メチルピロリドン(N
MP)中で行った。実験の第2組では、固定化を0.1M燐酸塩緩衝液、pH6
で行った。比較の固定化収率は各配列決定サイクルの終端で解離するアミノ酸ア
ルキル化チオヒダントイン誘導体に対するHPLCピークの振幅を調べて決定し
た。
図10A−10Dおよび11A−11Dは、WRK−活性化CPGビーズに結
合したペプチド(図10A−10D)およびDSS−活性化CPG−ビーズに結
合したペプチド(図11A−11D)についての最初の4回のC−末端配列決定
サイクルからのHPLCクロマトグラムを示し、ここでの11量体の固定化はN
MP中で行った。図から見られるように、WRK−活性化ビーズはDSS−活性
化ビーズよりも大きなチオヒダントインピークを与えた。これはWRK−活性化
CPGビーズがDSS−活性化ビーズよりも11量体をより多量に結合している
(すなわち、より大きい固定化収率)を示している。
図12A−12Dおよび13A−13Cは、WRK−活性化CPGビーズ(図
12A−12D)およびDSS−活性化CPG−ビーズ(図13A−13C)に
関するC−末端配列決定結果を示し、ここでの11量体の固定化はpH6での燐
酸塩緩衝溶液中で行った。図から見られるように、WRK−活性化ビーズは11
量体を有機溶媒中で固定化した時に観察(図10A−10D)されるものとほぼ
同じ大きさのヒダントインピークを与えた。反対に、11量体を燐酸塩緩衝溶液
中で固定化したDSS−活性化ビーズを使用したのものでは殆ど配列決定物質が
観察されなかった。この最後の結果は支持体上のスクシンイミド基のかなりの部
分が11量体と反応できる前に水によって不活性になったことを示唆している。
より一般には、これらの結果は試料の固定化が達せられる広い範囲の条件から
みると本発明の活性化(エノールエステル)支持体の順応性を証明している。D
SS活性化支持体は有機溶媒の存在で試料の固定化を可能にするが、水性条件下
では不完全に行われる。反対に、エノールエステル支持体では有機溶媒条件およ
び水性条件下で試料充填が可能である。この順応性によりほとんどのポリペプチ
ド試料は特別な溶媒に移しかえる必要なく固定化される。例えば、ポリペプチド
を緩衝水溶液中に供給すると、溶液は支持体と直接接触し固定化を行うことがで
きる。更に、エノールエステル支持体は試料の溶解度の問題を回避する。すなわ
ち、支持体は各種の溶解特性を持つポリペプチドを適応させ、必要な広い範囲の
溶媒条件に適合性がある。
短いペプチドのN−末端配列決定についての本発明の活性化支持体の有用性は
実施例13Aの研究により証明される。この研究では、12残基ペプチド(SE
Q ID NO:4)をWRK−活性化PVDFメンブラン上にスポットし、そ
してカルボキシル化も他の誘導化もしない標準のPVDFメンブラン上にもスポ
ットした。乾燥後、両メンブランは自動配列決定装置に配置し、N−末端エドマ
ン分解にかけた(実施例17)。
図17から見られるように、WRK−活性化メンブランはペプチドに終りから
2番目の残基を配列決定するようにする(中空棒)。対照的に、非活性メンブラ
ンは最初の6または7残基のみに見出せる不十分なピークを与えた。
C.3 結合モード
本発明の他の重要な局面によると、特に活性化がWRKを用いて行われた場合
に、活性化支持体への共有結合が失敗したポリペプチドはなお非共有相互作用に
より、支持体上に固定化され得ることが見出された。このような非共有固定化は
WRK試薬から誘導された支持体結合スルホネート基と、ポリペプチド中の正電
荷基(アンモニウム、グアニジニュウムおよび/またはイミダゾリウム基からの
)との間の好ましい電荷−電荷相互作用に基づくと仮定される。
図3から分かるように、WRKにより生成されたエノールエステルはフェニル
リングに結合したスルホネート基を含む。従って、エノールエステルがそのまま
で残っている間(すなわち、ポリペプチド、塩基または水と反応しない)に、ス
ルホネート基が支持体のエノールエステル部位に結合する。更に、もし、図19
に図式的に示したように、図3に示したエノールエステルが分子内アシル転位を
行うとすると、永久的に結合したスルホネート基が支持体上に形成できる。
実施例11で詳述した、一研究では、アポミオグロビンを酸性(0.1%TF
A、pH2)あるいは僅かに塩基性(0.1MNaHCO3、pH8)の条件下にWR
K−活性化PVDFメンブラン上に固定化し、次に25%TFA水溶液(“酸性
溶液”)または50%ジイソプロピルエチルアミンのメタノール溶液(“強塩基
溶液”)のいずれかですすいだ。引続き追加の洗浄工程を行い、メンブランはメ
ンブラン上になお固定化されているポリペプチドの水準を決定するためにアミノ
酸分析を行った(回収%)。
表2Aに関して(実施例11)、固定化をpH8で行い、すすぎ溶液を用いた
のに拘らず、回収%(固定化収率)は両者共に50%であった。対照的に、pH
2で行った固定化はすすぎ工程のpHにより顕著に異なる回収値を与えた。メン
ブランを酸性溶液ですすいだ時、収率は非常に高かった(70%)。しかしなが
ら、すすぎを強塩基DIEA溶液で行うと、回収%は約5%に落ちた。
同様な回収形態が、ポリペプチドとしてスーパーオキシドジスムターゼ(SO
D)を用いたときに観察された(表2B)。試料充填をpH2で行い、そしてす
すぎ工程をpH8(回収5.5%)で行った場合を除いた全ての場合、試料回収
は約50%であった。
これらの結果は、アポミオグロビンをpH8(0.1MNaHCO3)で充填する場
合、回収%がすすぎ溶液にかかわらず同じであるので、ポリペプチドの固定化は
最初は共有結合によることを示している。試料がpH2(0.1%TFA中)で
充填された時、ポリペプチドの固定化は、ポリペプチドが支持体からDIEAす
すぎ溶液を用いて洗浄できるという事実により証明されるように、最初にメンブ
ランに非共有結合する。おそらく、この強い塩基性のすすぎ溶液は、支持体上の
スルホネート基と相互作用するポリペプチド上の正チャージ基の脱プロトン化に
より好ましい電荷−電荷相互作用(塩ブリッジ)を中断することができるからで
あろう。
実施例12に記述した研究では、支持体と結合したままの非共有的結合の試料
の能力を異なる変性の条件下に試験した。変性の条件は2%トリトンX−100
(登録商標)、1M尿素、1ドデシルスルホン酸ナトリウム(SDS)、および
10%Brij−35(登録商標)を含む。水は対照として含まれる。
表3(実施例12)に示すように、結合したアポミオグロビンの回収%は、1
%SDSを除き全てのすすぎ条件で約80%であった。尿素、トリトンX−10
0(登録商標)、およびBrij−35(登録商標)が荷電しないのに反し、S
DSは、SDSがアニオン洗剤である他の変性剤とは異なっている。この結果は
実施例11の結果と矛盾がなく、負に荷電した洗剤は、何とか塩ブリッジを中断
することで、非共有固定化を中断することができるが、中性の変性剤ではできな
い。
より重要なのは、実施例12からの結果が、活性化支持体が試料を溶解するた
めに加えた変性剤の存在にもかかわらずポリペプチドに非共有結合できることを
証明していることである。
C.4.結合したN−末端およびC−末端配列決定
他の局面では、本発明の活性化支持体は同じポリペプチド試料中のN−および
C−末端アミノ酸基の両方の配列決定に用いることができる。この能力はポリペ
プチド試料の同定および/または特性化を以前よりもずっと容易にし、その理由
は容易に認められるように、ペプチドの両方の末端からの配列決定情報を持ち、
配列決定情報がポリペプチドの1端だけからのみ得られる場合よりも、他のポリ
ペプチド類からずっと容易に該ポリペプチド試料を識別できることである。さら
に、ポリペプチドが既にその配列決定がされたものである場合、ポリペプチドの
両末端での僅かの残基の配列決定分析により試料の同一性を迅速に確認すること
ができる。
本方法の応用を実施例13Bに示す。実施例に詳述したように、アポミオグロ
ビンは0.1%TFA水溶液中でWRK−活性化PVDFメンブラン上に固定化
した。空気乾燥後、メンブランは自動配列決定装置中に入れ、5サイクルのN−
末端エドマン分解を行ったた。最初の4個のN−末端残基のHPLCクロマトグ
ラムを図18Aに示す。
第5番目の配列決定サイクルの後、次に同じメンブランを4サイクルのC−末
端配列分析にかけた。図18Bに示すように、アボミオグロビン試料の最初の4
個のC−末端残基が容易に確認された。
C.5 WRK−活性化支持体の長期安定性
他の実験では、各種のWRK−活性化支持体の長期安定性を3ないし6ヶ月間
乾燥形態で貯蔵した後に決定した。下記の研究では、支持体はアミノメチルポリ
スチレン樹脂(実施例3および4を参照;WRK−活性化CPGビーズ(実施例
3および4);およびWRK−活性化PVDFメンブラン(実施例4))から調
製されたWRK−活性化ポリスチレン樹脂からなる。各支持体をWRK−活性化
した後、支持体をアセトンですすぎ、そして空気乾燥する。次に、各乾燥した活
性化支持体はシンチレーション瓶またはエッペンドルフチューブ中に密封し、室
温で貯蔵した。
ポリペプチド結合能力を評価するために、各支持体を、貯蔵後に残っている支
持体結合エノールエステルとポリペプチドとの反応を最小にするため、高濃度の
ポリペプチドとインキュベートした。次に支持体を実施例14で記述した手順に
したがって、C−末端配列決定分析に委ねた。
WRK−活性化ポリスチレン樹脂上に固定化した12残基ペプチド(SEQI
D NO:2)の配列決定分析は図14A−14Dに示した。ここでの固定化は
、乾燥し活性化した支持体を3ヶ月間貯蔵した後に行われた。図15A−15
Dは同じ12量体のC−末端配列決定分析を示す。ここでの固定化は乾燥し活性
化した支持体を3ヶ月間貯蔵の後に、活性化CPGビーズ上に行った。図16A
−16Eは乾燥形態で6ヶ月間前もって貯蔵されたWRK−活性化PVDFメン
ブラン上に固定化されたアポミオグロビンのC−末端配列分析を示す。
図14A−14D、15A−15D、および16A−16Dに関して、各活性
化支持体は、乾燥した活性化支持体を数ヶ月間貯蔵後に、少なくとも4回のC−
末端配列決定サイクルによって強いアルキルチオヒダントインシグナルを与える
ことが分かる。さらに加えて、チオヒダントインピークの大きさは、固定化を僅
か数日間貯蔵して置いた乾燥した活性化支持体を用いて行ったときに観察される
のに匹敵していた。
従って、本発明は通常の状態ではポリペプチドを共有結合させるその能力を著
しく減らすことなく数ヶ月間貯蔵ができ、容易に使用できる活性化固体支持体を
提供する。
本発明の支持体の有用性を、アミノ酸配列決定に特に焦点をあてて討論すると
き、本発明の支持体はまた免疫アッセイに用いられる固体支持体にポリペプチド
をカップリングさせるのに用いることができることは評価できる;例えば、この
免疫アッセイでは、抗原、抗体あるいはFabフラグメントを試料中の選択された
抗体あるいは抗原を結合し、同定するために支持体にカップリングさせる。
前記からいかに本発明の各種の目的および特徴が兼ね備えているかは評価され
るであろう。本発明は乾燥した活性化支持体とポリペプチドを固定化するための
有用な方法を提供する。支持体は乾燥形態で貯蔵するとき長期間の安定性を示し
何も特別な貯蔵条件を必要としない。さらに、支持体は試料装填の間、水性状態
に適合し、広い範囲のpH域でポリペプチドの固定化を行う。特に、支持体がP
VDFメンブランからなる場合、本発明は1つのメンブランを用いてポリペプチ
ドのN−およびC−末端の両方の配列決定ができる。
下記の実施例は本発明を説明するのに提示するものであり、いかなる場合も、
この範囲に限定されるものではない。
材料
DITCガラスビーズはシグマケミカル社(セントルイス、MO)から入手し
、
DITC−PVDFメンブラン(セクエロン 登録商標)はミリポア(バーリン
グトン、MA)から購入した。表面に結合したカルボン酸基をもつポリビニリデ
ンジフルオリドメンブラン(“カルボキシル化PVDF”はまたは“PVDF−
COOH”)はポールコーポレイション(ロングアイランド、NY)から入手し
た。アミノプロピル制御ポアガラス(CPG)ビーズおよびアミノメチルポリス
チレンビーズはパーキン・エルマーのアプライド・バイオシステムズ・デイビイ
ジョン(“ABI”、ファスターシティー、CA)から入手した。
ABIモデル476AシーケンサーでN−末端配列決定分析を行った。C−末
端配列決定分析はABIモデル477Aシーケンサーで行った(ボイドら、Anal
Biochem.,206,344-352,1992)。アミノ酸組成分析はABIモデル421ア
ミノ酸アナライザーで行った。
実施例1
アミノプロピルガラスファイバーフィルターペーパーの調製
ワットマンGF/Fの円盤(直径11cm)を穏やかに揺り動かすガラス皿中
で室温で1時間、純粋のトリフルオロ酢酸(TFA)中で最初に酸エッチングす
る。次に、エッチングされたペーパーはワットマン#3濾紙上に置き、一晩空気
乾燥した。
エッチングしたガラスファイバー濾紙はプラスチック袋の中で室温で3〜5時
間(アミノプロピル)トリエトキシシラン(2%水溶液)で処理した。アセトン
で数回洗浄後に、まだ湿気のあるアミノプロピル−GF/Fをオーブン中で10
0℃で45分間硬化させた。このフィルターペーパーはニンヒドリン検査で定量
できる第一アミン基をもつ。アミン含有量は普通には16nモル/直径9mmデ
ィスクである。
実施例2
アミノプロピルガラスフィルターペーパー上のアミノ基を
無水コハク酸を用いてカルボキシル基に転化
無水コハク酸1gおよびジメチルアミノピリジン(DMAP)0.25gをア
セトニトリル20ml中に溶解した。この溶液をガラス皿中でアミノプロピルガ
ラスファイバーフィルターペーパー(実施例1)の半円上に注ぎ、そして室温で
一晩反応させた。アセトニトリルで数回洗浄し、アセトンで最後のすすぎをした
後、フィルターペーパーを空気乾燥させた。小片でニンヒドリン検査で試験し、
アミノ基は陰性であった。
実施例3
アミノプロピルCPGビーズのアミノ基を
無水コハク酸を用いてカルボキシル基に転化
アミノプロピルCPGビーズ(45μモルNH2/gビーズ)100mgを蓋付
エッフェンドルフチューブに入れ、約1mlのDMAP/無水コハク酸溶液(実
施例2)中で室温で一晩振り動かした。このビーズをアセトニトリル、アセトン
で数回洗浄し、次に乾燥させた。得られたものは、ニンヒドリン検査で試験し、
アミノ基は陰性であった。
実施例4
活性化支持体の調製
反応性ケテンイミン溶液をWRK0.063g(0.063モル)およびジイ
ソプロピルエチルアミン0.5ml(DIEA、0.025モル)をCH3CN
2ml中で混合して、N−エチル−5−フェニルイソオキサゾリウムスルホネー
ト(ウッドワード試薬K.WRK)からアセトニトリル(CH3CN)中に生成
させた。この溶液は固体WRKが完全に溶解すると直ぐに使用した。カルボキシ
ル化支持体(例えば、実施例2または3からのカルボキシル化合物PVDFメン
ブランまたはカルボキシル化支持体)をこの溶液に4〜6時間浸漬し、ここでの
溶液量は支持体を完全に浸漬するように調整した。次に、得られたエノールエス
テル支持体はCH3CNで数回洗浄し、最後にアセトンで洗浄し、短く空気乾燥
させた。次に、この活性化支持体を蓋付きエッペンドルフチューブまたは密閉プ
ラスチック袋に保管した。
実施例5
アポミオグロビンの活性化PVDFメンブランへの共有結合
アポミオグロビン120nモルをpH7の100mM燐酸塩緩衝溶液の3ml
に不完全に溶かした。この溶液を活性化カルボキシルPVDFメンブラン(実施
例4、2日前に調製)のシート(286mg)上に3時間揺れ動かした。アミノ
酸分析では150pモルのタンパク質/mgメンブランが結合し、35.8%の
結合効率(アポミオグロビンとの反応前のメンブランの概算アミノ基含量に基づ
く)を示した。C−末端配列分析の第1サイクルの収率(実施例14)は35%
(メンブランに結合した150pモルのタンパク質から50pモルの“配列決定
用”物質)であった。
実施例6
リゾチームの活性化PVDFメンブランへの共有結合
pH7の燐酸塩緩衝溶液中の鶏卵白リゾチーム(1mg/mL)溶液を実施例
5に記したように活性化カルボキシルPVDFメンブランのシート上(283m
g)に揺れ動かした。アミノ酸分析は50%の結合効率を示した。C−末端配列
分析の結果(実施例14)は図6A−6Dに示した。
実施例7
短鎖ペプチドの活性化PVDFメンブランへの結合
15残基のペプチド(2mg、SEQ ID NO:1)を3mlのN−メチ
ルピロリドン(NMP)に溶解した。このペプチド溶液を活性化カルボキシルP
VDFメンブラン(予め活性化し、2日間乾燥したもの)のシート286mg上
に3時間揺れ動かした。結合していないペプチドは、アセトニトリル、アセトン
を用いてこの順に流去し、次にこのシートにC−末端配列分析を行った(実施例
14、図7A−7D)。
実施例8
固体支持体にペプチドを結合させるための
ジスクシンイミジルスベレートの使用
ジスクシンイミジルスベレート(DSS、15mg)をN−メチルピロリドン
(NMP、720μL)、ジイソプロピルエチルアミン(DIEA、40μL)
およびピロリジン(40μL)の混合物に溶解した。この混合物が完全に溶解す
ると直ぐに100mgのアミノメチルポリスチレンビーズ(ABIから入手、2
6μモルNH2基/gビーズ)に加え、反応混合物は1〜2時間、室温で振とう
させた。
得られた活性化ビーズはNMPで2回洗浄した。結合されるペプチド(通常は
約10μM)をNMP360μLおよびピリジン40μLの混合物に溶解した。
完全に溶解後、ペプチドをまだ湿った活性化ビーズに加え、室温で一晩振とうさ
せた。次の日ビーズをNMP、水、次にアセトニトリルで数回洗浄し、真空遠心
分離で乾燥させた。この手順は一般的に約2nモルペプチド/mgシートのペプ
チドの充填を与える。また、同じ手順はアミノプロピルCPGビーズに首尾よく
応用された。
実施例9
エノールエステル支持体の安定性
3種の異なったWRK−活性化支持体を乾燥形態で長期間貯蔵後、ポリペプチ
ド結合能力の保持力について試験した。研究に用いた乾燥支持体は実施例4で記
した一般的な手順により生成され、空気乾燥した後、シンチレーションガラス瓶
またはエッペンドルフチューブに貯蔵した。特別な貯蔵条件は用いなかった;換
言すれば、活性化支持体を完全に乾燥したり、または不活性雰囲気下に、または
冷凍庫中に貯蔵する作業は不用である。
活性化支持体は数日間貯蔵後、および数ヶ月間貯蔵後にポリペプチド結合能力
についてC−末端配列分析により試験した。
WRK−活性化ポリスチレン樹脂(実施例4)はジメチルホルムアミド(DM
F)0.5ml中で12残基ペプチド(SWQ ID NO:2)3mgと3時
間インキュベートし次に実施例14に記した手順によりC−末端配列決定した。
3ヶ月間乾燥形態で貯蔵後のポリスチレン樹脂の結果は図14A−14Dに示し
た。
WRK−活性化CPGビーズをDMF中、12残基ペプチドと同様な仕方でイ
ンキュベートし、上記のように配列決定した。3ヶ月間乾燥形態で貯蔵後の活性
化ポリスチレン樹脂についての結果を図15A−15Dに示す。
WRK−活性化PVDF(実施例4)は実施例5で記したようにアポミオグロ
ビン120nモルとインキュベートし、そして上記のように配列決定した。6ヶ
月間乾燥形態で貯蔵後の活性化メンブランについての結果を図16A−16Eに
示す。
実施例10
試料を活性化メンブランに結合させる際のpH効果
実施例4と同様に調製した6個の各々直径4mmの活性化PVDFメンブラン
上に、下記に記す1つに、3mg/mLアポミオグロビン(500pモル、馬の
骨格筋肉からのもの)を含む溶液4μLをスポットする:水、0.1%TFA水
溶液、pH2、または0.1MNaHCO3、pH5、7、8、または9。ディスクは
室温で30分間空気乾燥させた。次に各ディスクを水0.5mLで2回、5%T
FA水溶液0.5mLで2凹、アセトニトリル、またはメタノール0.5mLで
1回洗浄した。結合した試料はアミノ酸分析で定量し(材料と方法)、異なるバ
ッファー条件の各々についてディスクの結合効果を充填した量に対する結合した
試料の割合として計算した(表1)。
実施例11
活性化PVDFメンブランへの共有結合対非共有結合の試料
実施例4で調製した4個の直径4mmの各活性化PVDFメンブランディスク
上に、0.1%TFA水溶液、pH2(最初のペアのディスク)中または0.1
M NaHCO3、pH8(第2のペアのディスク)中に2.5mg/mLアポミオグ
ロビン(750pモル)を含む溶液の5μLをスポットした。ディスクは室温で
約30分間空気乾燥させた。次に、各ペアからの1個のディスクを25%TFA
水溶液(酸性溶液)の500μLで2回洗浄し、引続き5%アセトニトリル水溶
液500μLと純粋アセトニトリル500μLで洗浄した。各ペアからのもう一
個のディスクを50%DIEAメタノール溶液(塩基性溶液)500μLで洗浄
し、引続き5%アセトニトリル水溶液500μLと、純粋アセトニトリル500
μLで洗浄した。充填した試料のパーセンテージとして、各ディスクに結合した
試料の水準を表2Aに示す。
また、この手順はアポミオグロビンの代わりにスーパーオキシドジスムターゼ
(200pモル;牛赤血球からのもの)を用いて行った。メンブラン上に保持さ
れている試料の水準は表2Bに示す。
実施例12
活性化メンブランの試料結合強度における洗浄効果
実施例4で調製された5個の直径4mmの活性化PVDFメンブランディスク
の各々に、0.1%TFA水溶液、pH2のアポミオグロビンの1mg/mL溶
液の2.5μLをスポットした。次に各ディスクを500μlの下記の溶液の1
つで2回洗浄した:水、2%トリトンX−100、1M尿素、1%SDS、また
は10%Brij−35。第2番目の洗浄後、支持体は500μLの水で2回洗
浄した。充填量のパーセンテージとして各ディスクに結合した残りの試料を表3
に示す。
実施例13
活性化PVDFメンブランを用いる配列分析
A.ペプチドのN−末端配列分析: 活性化PVDFメンブラン対非活性化、非カルボキシル化PVDFメンブラン
(i)直径4mmのPVDFメンブラン(アプライド・バイオシステムズ・イ
ンコーポレイテッドからのプロブロットメンブラン;非活性化、非カルボキシル
化)および(ii)実施例4で調製された直径4mmの活性化PVDFメンブラン
ディスクの各々の上に、0.1%TFA水溶液中に溶解した2μlの12残基ペ
プチド(SEQ ID NO:4;7μg/mL、全10pモル)を充填した。
ディスクを空気乾燥した後、ディスクを5%TFA水溶液(500μL)で、続
いてアセトニトリル(500μL)で洗浄した。次にディスクをABIモデル4
76Aシーケンサーに置き、12サイクルのエドマン分解を行った。各サイクル
での残基の同定と収率を図17に示す。
B.単一試料ディスクを用いる二元的N−およびC−末端配列分析
実施例4と同様に調製された直径4mmの活性化PVDFメンブラン上に、0
.1%TFA水溶液中に溶解したアポミオグロビン(1mg/mL、全120p
モル)2μLを充填した。ディスクを空気乾燥した後、ディスクをABIモデル
476Aシーケンサーに装填し、5サイクルのエドマン分解を行った。最初の4
サイクルの分析からのHPLCを図18Aに示した。最後のサイクルが完了した
後、ディスクをシーケンサーから取り出し、そしてABIモデル477Aシーケ
ンサーに移した。次に、C−末端配列分析を実施例14に記したように行った。
結果を図18Bに示す。
実施例14
固定化ペプチドの配列分析
上記のように固体支持体に結合したタンパク質およびペプチドを、下記のよう
にC−末端チオヒダントインに転化し、次にアプライド・バイオシステムズ・モ
デル477Aタンパク質シーケンサーを用いてC−末端から配列決定した。10
%DIEA(ジイソプロピルアミン)のアセトニトリル溶液をモデル477Aの
S1位置に充填し、8%ジフェニルクロロホスフェートのアセトニトリル溶液を
X1位置に配置した。
次の反応工程を55℃で行った。タンパク質またはペプチド誘導化支持体をシ
ーケンサーに充填した後、DIEAとジフェニルクロロホスフェート溶液の等容
積量を、メンブランを完全に湿めらせるに充分な量でメンブランに供給した。5
分間の休止の後、DIEAとジフェニルクロロホスフェート溶液の供給をもう一
度繰り返す。次に、メンブランをアセトニトリルで洗浄し、残りのクロロホスフ
ェート化合物を除く。さらに、5分間の休止の後、1%アンモニウムチオシアネ
ートのアセトニトリル溶液の等分量をメンブランに供給し、次に60秒間トリフ
ルオロ酢酸(TFA)蒸気にメンブランをさらした。5分間休止後、1%アンモ
ニウムチオシアネートとTFA蒸気の供給を5分間の休止をはさんで1〜5回繰
り返し行った。次に残存する試薬はアセトニトリルを用いてメンブランから洗浄
した。
アスパルテートおよびグルタメートの側鎖のカルボキシレート基のエステル化
が望ましい場合ば、エステル化工程はペプチジル−チオヒダントインの生成およ
び上記のようなアセトニトリルでのメンブランの洗浄の後に含まれる。エステル
化工程では、メンブランはメタノールで短時間(例えば、1分間)洗浄し、次に
TFA蒸気で60秒間処理される。5分間の休止後、メンブランをアセトニトリ
ルで洗浄した。
配列決定は基本的には米国特許第5,185,266号に記述されるように行
った。この手順で、C−末端チオヒダントインはアルカリ化剤と反応させ、チオ
ヒダントインを更によい脱離基にした。次にTMS−ITCまたはアンモニウム
チオシアネートおよびTFA蒸気を用いて残存のペプチドからチオヒダントイン
付加物を分裂させ、次のアミノ酸残基のチオヒダントインを生成する。分裂した
チオヒダントイン付加物を米国特許第5,185,266号に示された方法で分
離し同定した。
実施例15
A.メンブラン支持体上への試料のスポット
WRK−活性化カルボキシル化PVDFメンブランの直径4mmディスク上に
2つの2.5μLの等分量で、pH7の燐酸塩緩衝液中のリソチーム(1mg/
ml)を5μLスポットした。ディスクは空気乾燥し、次にN−またはC−末端
配列分析のため自動化シーケンサーに配置した。
B.回転濾過
遠心分離(回転濾過)によるポリペプチドの固定化のため、遠心分離管挿入装
置をプロスピン(登録商標)挿入装置(ABI、パーツ番号:401,256)
を改良し、直径4mmのWRK−活性化PVDF(分画分子量8,000)を含
めるように組み立てた。次に、挿入物は1.5mLエッペンドルフチューブに装
填し、一般にはタンパク質500pモルを含むポリペプチド試料溶液(50〜1
00μL)を加えた。次に、管/挿入物組立物をマイクロフュージに装填し、約
1時間8000rpmで遠心分離した。空気乾燥の後、支持体は配列分析に使用
できる。一般的に、50〜60%のタンパク質試料が、アミノ酸分析での測定に
よりメンブラン上に固定化されていた。
本発明は、特定の支持体およびポリペプチドに関して記述され説明されている
が、各種の改良および変更が、本発明から逸脱することなく行えることは高く評
価されるであろう。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M
C,NL,PT,SE),AU,CA,JP,US
(72)発明者 ユアン,パウ−ミアゥ
アメリカ合衆国 カリフォルニア州
95129 サン ジョーズ,ジョンソン ア
ベニュ 1249
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.表面結合カルボン酸基を有する固体支持体を、塩基の存在で有機溶媒中の イソオキサゾリウム塩と反応させ、反応性支持体を形成し、 反応性支持体を洗浄して残りのイソオキサゾリウム塩と塩基を除去し、 洗浄した支持体を乾燥させ、そして 前記乾燥後に、ポリペプチドを支持体に結合するために有効な条件下に、支持 体をポリペプチドと接触させる 各工程から成る、固体支持体上にポリペプチドを固定化する方法。 2.前記ポリペプチドが第1級アミノ基を含み、前記条件が活性化支持体にポ リペプチドを共有結合するために有効である、請求項1記載の方法。 3.さらに前記支持体が表面結合スルフォネート基を含み、前記条件が活性化 支持体にポリペプチドを非共有結合するために有効である、請求項1記載の方法 。 4.前記乾燥後、活性化支持体を少なくとも約3ヶ月間乾燥形態で貯蔵し、前 記反応によって、前記乾燥なしで達成されるであろう収率と実質的に同じペプチ ド固定化収率を達成する、請求項1記載の方法。 5.支持体がガラスファイバーメンブランから成る、請求項1記載の方法。 6.支持体がポリビニリデンジフルオリドメンブランから成る、請求項1記載 の方法。 7.イソオキサゾリウム塩が2−エチル−5’−フェニルイソオキサゾリウム スルフォネートである、請求項1記載の方法。 8.前記接触させるために、前記ポリペプチドを水溶液に溶解する、請求項1 記載の方法。 9.前記接触させるために、前記ポリペプチドを有機溶媒に溶 解する、請求項1記載の方法。 10.表面結合エノールエステル基と表面結合スルフォネート基を有するポリ ビニリデンジフルオリドメンブランを、ポリペプチドをメンブランに結合するた めに有効な条件下にポリペプチドと接触させて成る、 ポリペプチドを固定化する方法。 11.前記ポリペプチドが第1級アミノ基を含み、前記条件が活性化支持体に ポリペプチドを共有結合するために有効である、請求項10記載の方法。 12.前記条件が活性化支持体にポリペプチドを非共有結合するために有効で ある、請求項10記載の方法。 13.イソオキサゾリウム塩が2−エチル−5’−フェニルイソオキサゾリウ ムスルフォネートである、請求項10記載の方法。 14.前記接触させるために、前記ポリペプチドを有機溶媒に溶解する、請求 項10記載の方法。 15.前記接触が約1ないし8のpHで水性媒体の存在で行われる、請求項1 0記載の方法。 16.前記pHが約2である、請求項15記載の方法。 17.前記pHが約7である、請求項15記載の方法。 18.表面結合エノールエステル基を有する乾燥固体支持体から成り、前記支 持体がペプチド固定化効率を減少することなく少なくとも約3ヶ月間乾燥形態で 貯蔵できる活性化固体支持体。 19.さらに表面結合スルフォネート基を含む、請求項18記載の支持体。 20.支持体がポリビニリデンジフルオリドメンブランから成る、請求項18 記載の支持体。 21.活性化エノールエステル基が3−ヒドロキシ−N−エチル−シンナムア ミドのエステルである、請求項18記載の支持体。 22.C末端カルボン酸基を有するポリペプチドを、表面結合 エノールエステル基を有するポリビニリデンジフルオリドメンブランと、ポリペ プチドをメンブランに共有結合または非共有結合するために有効な条件下に接触 させ、 メンブランを1またはそれ以上のサイクルのエドマン分解にかけ、結合したポ リペプチド中の1またはそれ以上のN末端残基の配列を決定し、 最初の前記エドマン分解の工程の後、メンブランを1またはそれ以上のサイク ルのC末端配列決定に委ねる 各工程から成るポリペプチド中のN末端とC末端の残基の配列位置を同定する方 法。 23.前記接触が約1ないし8のpHで水性媒体の存在で行われる、請求項2 2記載の方法。 24.前記pHが約2である、請求項23記載の方法。 25.前記pHが約7である、請求項23記載の方法。
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