JPH08510120A - ヘリコバクター感染に対する免疫性組成物、該組成物に用いられるポリペプチドおよび該ポリペプチドをコードする核酸配列 - Google Patents

ヘリコバクター感染に対する免疫性組成物、該組成物に用いられるポリペプチドおよび該ポリペプチドをコードする核酸配列

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Abstract

(57)【要約】 この発明は、ヘリコバクター感染に対する防御抗体を誘発することが可能な免疫組成物であって、i)ヘリコバ クター・ピロリ由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの少なくとも1つのサブユニット、もしくはヘリコバクター ・フェリスウレアーゼと反応する抗体によって認識されるそれらの断片、および/またはヘリコバクター・フェ リス由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの少なくとも1つのサブユニット、もしくはヘリコバクター・ピロリウレアーゼと反応する抗体によって認識されるそれらの断片、ii)および/またはヘリコバクター由来の熱ショック蛋白質(HSP)、すなわちシャペロニン、もしくは該蛋白質の断片を包含することを特徴とする免疫組成物に関する。この発明はまた、この免疫組成物の組換え手段による調製にも関する。

Description

【発明の詳細な説明】ヘリコバクター感染に対する免疫性組成物、該組成物に用いられるポリペプチド および該ポリペプチドをコードする核酸配列 この発明は、ヘリコバクター種Helicobacler spp.]感染に対する防御抗体 を誘導する免疫性組成物に関する。また、ヘリコバクター由来の蛋白性物質、お よびそれらをコードする核酸配列にも関する。これらの蛋白性物質に対する抗体 もまた、この発明に含まれる。 H.ピロリH.pylori]はヒト胃粘膜に感染する微生物であり、進行性慢性 胃炎に関連付けられている。それはまた、胃十二指腸潰瘍の病因であることが示 されており(Peterson,1991)、最近の2つの研究では、H.ピロリに感染した 人間は胃ガン発生の危険性が高いことが報告されている(Nomura et al,1991; Parsonnet et al,1991)。 この菌のイン・ビボにおける研究、並びに、その結果として適当な予防または 治療剤の開発についての研究は、ヘリコバクター・ピロリが非常に小数の動物宿 主に由来する胃タイプの上皮とのみ関連し、それらの中で研究所でのモデルとし て適したものがないという事実によって妨げられてきた。 ネコの胃粘膜から単離され(Lee et al,1988,1990)、ヘリコバクター属の 一員であると同定された螺旋菌を用いて、胃コロニー形成のマウスモデルが開発 されている。この菌は、H.フェリスH.felis]と命名されている(Paster e t al,1990)。 現時点では、H.フェリスに関する限られた情報とそのH.ピロリとの類似お よび相違の程度しか入手できない。したがって、H.ピロリ感染の治療を開発す るためのマウスモデルの信頼性は不明である。近年、H.ピロリウレアーゼが .フェリス /マウスモデルにおける保護抗原であることが示された(Davin et a l,1993;Corthesy-Theulaz et al)。 したがって、この発明の目的は、ヘリコバクター感染において用いられ、さら に実験動物において試験することが可能な、治療および予防組成物を提供するこ とにある。 H.ピロリがウレアーゼ活性を発現すること、並びにウレアーゼが細菌性コロ ニー形成および特定の病原性プロセスの介在に重要な役割を果たすことは周知で ある(Ferrero and Lee,1991;Hazel et al,1991)。 H.ピロリのウレアーゼ構造ポリペプチドをコードする遺伝子(URE AURE B )は、H.ピロリにおけるウレアーゼ活性に必要な“アクセサリー” ポリペプチドをコードする遺伝子を含む(国際特許出願WO 93/07273)ものとし て、クローン化および配列決定がなされている(Labigne et al,1991;および フランス特許出願FR 8813135)。 H.ピロリウレアーゼ遺伝子クラスター由来の核酸配列を、プローブとして、H.フェリス 中のウレアーゼ配列の同定に用いる試みがなされている。しかしな がら、これらの試みは1つも成功していない。さらに、イン・ビトロにおける .フェリス クラスターの確立および維持は非常に困難であり、細菌中に存在する 大量のヌクレアーゼがDNAの抽出を繁雑 にしている。 しかしながら、本発明者らは、H.フェリスのウレアーゼ構造ポリペプチド並 びにアクセサリーポリペプチドの遺伝子のクローン化および配列決定に成功した 。これにより、この発明において、H.フェリスヘリコバクター・ピロリとのure 遺伝子産生物のアミノ酸配列データの比較が可能となり、ウレアーゼサブ ユニット間の高度の保存性が見出された。この2つのウレアーゼの間には免疫学 的な関係が存在し、ウレアーゼサブユニットまたはそれらの断片を免疫原として 用いてヘリコバクター感染に対する防御抗体を誘導することができる。 実際、個々のウレアーゼサブユニットが粘膜免疫原[mucosal immunogens]と して作用する能力を解明するために、ヘリコバクター・ピロリおよびヘリコバク ター・フェリス のそれぞれのウレアーゼサブユニット(UreAおよびUreB )をコードする遺伝子が発現ベクター(pMAL)にクローンされ、大腸菌[Es cherichia coli]中で翻訳融合蛋白質[translational fusion proteins]とし て発現されている。組換えUreAおよびUreB蛋白質は、アフィニティおよ び陽イオン交換クロマトグラフィー技術により精製され、それぞれ分子量約68お よび103kDaであると予想された。ウェスタン・ブロットでの研究により、こ の融合蛋白質のウレアーゼ成分が強度に免疫原性であり、ポリクローナルウサギ 抗‐ヘリコバクター血清により特異的に認識されることが示された。マウスを、 粘膜アジュバント[mucosal ajuvant](コレラ毒)と組合せて、50μgの組換えH.フェリスUreBでオ ロガストリック免疫[orogastric immunization]することにより、60%のマウ ス(n=7;p<0.005)が4ヶ月にわたってH.フェリス菌による胃コロニー 形成から保護された。これを異種H.ピロリUreB抗原に対する25%(n=8 ;p>0.05)という値と比較した。組換えサブユニット抗原が胃のヘリコバクタ 感染に対して免疫防御応答を誘発することが初めて示された。 本発明者らはまた、この発明において、ヘリコバクター中に、ウレアーゼ活性 に対する増強効果を有する新規熱ショック蛋白質、すなわちシャペロニンを同定 した。したがって、免疫性組成物中でシャペロニンを用いることにより、防御の 増強を誘発することができる。 実際、ヘリコバクター・ピロリのHspAおよびHspBポリペプチドの各々 をコードする遺伝子がクローニングされ、マルトース結合蛋白質(MBP)に対 する融合蛋白質として別々に発現させ、大規模に精製されている。これらの蛋白 質は組換え抗原としてウサギの免疫に、並びに、ELISAの他にウェスタン免 疫ブロット検定法において、HPに感染した患者(HP+)におけるそれらの免 疫活性を決定するために用いられている。MBP−HspAおよびMBP−Hs pB融合蛋白質は、それらの抗原特性を保持することが示されている。(HP+ )患者血清におけるHspAおよび/またはHspBに対する体液性免疫応答を 比較することにより、HspBだけではなくHspAも(HP+)患者血清によ り 認識されることが示された(それぞれ、29/38および15/38)。非感染患者14人の 中には、Hspと反応する抗体を有する者はいなかった。 この発明は、ヘリコバクター感染に対する抗体を誘発することが可能な免疫性 組成物であって、 i)ヘリコバクター・ピロリ由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの少なくとも 1つのサブユニット、もしくはヘリコバクター・フェリスウレアーゼと反応する 抗体によって認識されるそれらの断片、および/またはヘリコバクター・フェリ 由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの少なくとも1つのサブユニット、もしく はヘリコバクター・ピロリウレアーゼと反応する抗体によって認識されるそれら の断片; ii)および/またはヘリコバクター由来の熱ショック蛋白質(HSP)、すな わちシャペロニン、もしくはこの蛋白質の断片、 を含有することを特徴とする免疫性組成物に関する。 好ましくは、この免疫性組成物は防御抗体を誘発することが可能である。 好ましい態様によると、この発明の免疫性組成物は、ヘリコバクター・ピロリ および/またはヘリコバクター・フェリス由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの 少なくとも1つのサブユニットを主要活性成分として含有する。この発明におい て、“ウレアーゼ構造ポリペプチド”という表現は、ヘリコバクター・ピロリま たはヘリコバクター・フェリスの酵素を示す。これは、恐らく、2つの繰り返し モノマー性サブユニ ット、メジャーサブュニット(ure B遺伝子の産生物)およびマイナーサブ ユニット(ure A遺伝子の産生物)、からなる主要表面抗原であり、ウレア ーゼ遺伝子クラスターのアクセサリー遺伝子の産生物の存在によって補われてい る場合には、2つのヘリコバクター種における加水ウレアーゼ活性、すなわち遊 離NH4+への尿素の加水分解、の原因である。アクセサリー遺伝子産物の非存在 下においては、ウレアーゼ構造ポリペプチドは酵素活性を表わさないものの、 .フェリス またはH.ピロリウレアーゼと反応する抗体によって認識されること は理解されるであろう。 この発明において、“免疫性組成物”という用語は、上に定義される主要活性 成分を、免疫応答を確実にするか、もしくは最適化するために必要なあらゆる成 分、例えば粘膜アジュバントのようなアジュバント、と共に含有する組成物を表 わす。 ヘリコバクター・ピロリウレアーゼ構造ポリペプチドは、Labigne et al,199 1に記述され、配列決定されている。この論文に記載されるポリペプチドは、こ の発明の組成物における使用に特に適している。しかしながら、抗ヘリコバクタ ー・フェリス ウレアーゼ抗体との交叉反応性が関与する範囲内でその免疫学的特 徴が維持されるのであれば、核酸置換、欠失または挿入を含む、この公開された 配列と機能的な相同性を示す変異体を用いることもできる。一般的に述べると、 このポリペプチド変異体は、包含される配列と少なくとも75%、好ましくは約90 %の相同性を示す。 ヘリコバクター・ピロリウレアーゼ構造ポリペプチドの断片もまた、その断片 がヘリコバクター・フェリスウレアーゼと反応する抗体によって認識されるので あれば、使用することができる。そのような断片には、一般に、少なくとも6個 のアミノ酸からなる断片、例えば6ないし100個、好ましくは約20-25個のアミノ 酸からなる断片が含まれる。この断片がヘリコバクターに独特のエピトープを担 持していると好都合である。 この発明において、核酸およびアミノ酸配列は、遺伝子暗号およびアミノ酸略 語をそれぞれ示す図11および12を参照することにより説明される。 この発明に用いるに適切なヘリコバクター・フェリスウレアーゼ構造ポリペプ チドは、(CNCM I−1355という番号で1993年8月25日にCNCMに寄託さ れた)プラスミドpILL205の一部によってコードされ、図3(サブユニット AおよびB)にそのアミノ酸配列が示されるものが好ましい。さらに、図3の配 列についてアミノ酸置換、欠失または挿入を含む、この配列の変異体も、ヘリコ バクター・ピロリ ウレアーゼとの免疫学的交叉関係[cross-relationship]を維 持する限りにおいて用いることもできる。このような変異体は、図3の配列との 少なくとも90%の相同性、もしくは同一性を示す。H.フェリスウレアーゼAお よびBサブユニットと、それぞれ80%および92%の同一性を有することが示され ているヘリコバクター.ヘイルマンニーHelicobacter heilmannnii](Solnic k et al,1994)由来のウレアーゼ AおよびBサブユニットはそのような変異体の一例である。 このウレアーゼまたは変異体の断片も、この断片がヘリコバクター・ピロリウ レアーゼと反応する抗体によって認識される限りにおいて、免疫性組成物に用い ることができる。さらに、この断片の長さは通常少なくともアミノ酸6個、例え ば6ないし100であり、好ましくは約20ないし25である。好ましくは、この断片 は、ヘリコバクターに独特のエピトープを担持している。 この発明の免疫性組成物に天然ウレアーゼ配列の変異体または断片が用いられ る場合には、この断片または変異体を抗体、好ましくは天然もしくは組換えウレ アーゼのいずれか、あるいは全ヘリコバクターに対して生じたポリクローナル抗 体と接触させることにより、他のヘリコバクター種由来のウレアーゼと反応する 抗体との交叉反応性を試験することができる。好ましくは、これらの変異体およ び断片は、H.ヘイルマンニーウレアーゼとも反応し得る抗体を生じる。したが って、この発明の免疫性組成物によって、H.ヘイルマンニーによる感染に対す る交叉防御[cross protection]も得ることができる。 毒性の危険性を最少にしつつ全ポリペプチドの免疫学的特性を保全することが できるので、ウレアーゼ構造遺伝子の断片を用いることが特に好ましい。 この発明の免疫性組成物の活性成分は、それぞれure Aおよびure B 遺伝子のサブユニットAまたはサブユニットB産生物のいずれかである、ウレア ーゼ構造ポリペプチ ドのただ1つのサブユニットからなるものでもよい。H.ピロリもしくはH.フ ェリス のいずれかのウレアーゼサブユニットUre B、または上述の変異体お よび断片のみを含む組成物が特に好都合である。それに対する防御が求められて いる微生物からウレアーゼサブユニット、特にサブユニットB、例えば、H.フ ェリス 感染に対するH.フェリスサブユニットBが誘導される相同系が最も好ま しい。しかしながら、この組成物は、通常別のポリペプチドとして存在するサブ ユニットAおよびBの両者を含んでいてもよい。しかしながら、ポリペプチドが 組換え手段によって生成される場合には、隣接する2つのコーディング配列を分 け隔てる停止コドンを抑制することによってAおよびB遺伝子の全配列を含む融 合蛋白質を用いることもできる。 免疫性組成物のウレアーゼ成分は、それがサブユニットAであろうとサブユニ ットBであろうと、例えばマルトース結合蛋白質(MBP)との翻訳融合蛋白質 [translational fusion proteins]の形で用いることができる。他の適切な融 合は、国際特許出願WO 90/11360に例示されている。蛋白コーディング配列の 5´または3´末端で6×His tag配列を置換することが可能な、QIAGEN ,USAより市販されている“QIAexpress”が、他の適切な融合蛋白質の例である 。しかしながら、活性成分を融合蛋白質の形で用いることは完全に任意である。 さらに好ましい態様によると、この発明の免疫性組成物は、上述のウレアーゼ 構造ポリペプチドに加えて、あるいはそれ に替えて、“シャペロニン”としても知られるヘリコバクター由来の熱ショック 蛋白質を含んでいてもよい。これらのチァペロニンは、本願明細書において発明 者らにより明らかにされている。好ましくは、シャペロニンはヘリコバクター・ ピロリ に由来する。このHSPは、図6に示されるアミノ酸配列を有する、ウレ アーゼ関連HSP AまたはHSP Bまたはこの2つの混合物であってもよい 。これらのポリペプチドは、(1993年8月25日にCNCM I−1356という番号 でCNCMに寄託されている)プラスミドpILL689によってコードされる。 単独もしくはHsp−Bとの組合せでのH.ピロリHSP−A蛋白質が特に好ま しい。 この発明によると、HSP成分として、図6に示される配列のアミノ酸が置換 され、挿入され、もしくは欠失し、天然HSPと通常少なくとも75%、好ましく は少なくとも85%の相同性を示すポリペプチド変異体を用いることもできる。こ の変異体は、好ましくは、天然Hspと少なくとも75%、例えば少なくとも85% の同一性を示す。 この変異体は、さらに、天然ポリペプチドとの機能的相同性を示してもよい。 HSP成分の場合、“機能的相同性”は、活性ウレアーゼを発現することができ る微生物においてウレアーゼ活性を増強する能力、および/またはヘリコバクタ 、特にH.フェリスおよびH.ピロリによる感染を妨げる能力を意味する。ウ レアーゼ活性を増強する性質は、下記実施例に記載される定量ウレアーゼ活性ア ッセイを用いて試験することができる。好ましくは、少なくとも6個のアミノ酸 を有 する、HSP AおよびHSP Bポリペプチドのいずれかもしくは両者の断片 を組成物に用いることができる。この発明の免疫性組成物に用いられるHSP成 分の断片もしくは変異体は、好ましくは、HSPによって通常示されるウレアー ゼ増強効果を妨げる抗体を産生することが可能である。この性質も、実施例に記 述される定量アッセイによって試験することができる。組成物中にシャペロニン 類が存在することにより、ヘリコバクター・ピロリおよびフェリスに対する防御 が増強される。 免疫性組成物のHsp成分は、HspAであろうとHspBであろうと、例え ばマルトース結合蛋白質(MBP)との翻訳融合蛋白質の形で用いることができ る。ウレアーゼ成分については、他の適切な融合相手が国際特許出願WO 90/11 360に記載されている。QIAGEN,USAの“QIAexpress”システムを用いることもで きる。さらに、蛋白質を融合蛋白質の形態で用いることは完全に任意である。 したがって、この発明によると、免疫性組成物は上述のウレアーゼ構造ポリペ プチド、またはヘリコバクターHsp、特にHspA、あるいはこれらの免疫源 の組合せのいずれかを含めばよい。 好ましい態様によると、この免疫性組成物には、ヘリコバクター・フェリスの AおよびBサブユニットの両者が(すなわち、H.ピロリウレアーゼなしで)、 ウレアーゼ成分として、ヘリコバクター・ピロリのHSP AおよびHSP B と共に含まれる。あるいは、ヘリコバクター・フェリスウ レアーゼのAおよびBサブユニットを、H.ピロリのAおよびBサブユニットと 共に、ただしシャペロニン成分は含めずに用いることができる。 2種の異なるヘリコバクター種のウレアーゼ間の免疫学的交叉反応性が、組成 物中でのただ1種のウレアーゼ、好ましくはヘリコバクター・フェリスのウレア ーゼの使用を可能にする。しかしながら、共通のエピトープによって誘発される 防御抗体は、ヘリコバクター・ピロリおよびヘリコバクター・フェリスの両者に 対して活性である。この組成物は、ウレアーゼポリペプチドまたは断片が他の種 にも生じるエピトープを担持する場合には、他の種のヘリコバクターに対する防 御抗体をも誘発することが可能である。 この発明の組成物は、生理学的に許容し得る賦形剤および担体、並びに、任意 のアジュバント、ハプテン、担体、安定化剤等と共に、免疫性組成物またはワク チンとして有益に用いられる。適切なアジュバントには、ムラミルジペプチド[ muranmyl dipeptide](MDP)、完全もしくは不完全フロインドアジュバント およびミョウバンが含まれる。ワクチン組成物は、通常、経口投与用に処方され る。 このワクチンは好ましくはヒトに用いられるものであるが、非ヒト動物に投与 することもでき、例えば、家畜治療用、またはマウス、ネコおよびイヌのような 実験動物に用いることができる。 動物体内に注入された免疫性組成物は、治療の目的、例えば受動免疫において 用いることができる特異性抗体のイン・ ビボにおける合成を惹起する。 この発明はまた、免疫性組成物に用いられる蛋白様物質およびAおよびBウレ アーゼ構造サブユニット以外のウレアーゼ遺伝子クラスターによってコードされ る蛋白様物質にも関する。“蛋白様物質”は、精製され、もしくは他の蛋白様も しくは非蛋白様物質との混合物のいずれかの形態の、他のアミノ酸鎖、例えばペ プチド、ポリペプチドまたは蛋白質、融合もしくは混合蛋白質(すなわち、2種 以上の蛋白様物質の関連であり、それらの全てもしくは幾らかは免疫原性または 免疫調節特性を有していてもよい)を意味する。“ポリペプチド”は、その長さ にかかわらず、アミノ酸の鎖を表わし、“ペプチド”という用語を包含[englob es]する。“断片”という用語は、親の配列よりも少なくともアミノ酸1個だけ 短く、親の配列において連続している、例えば少なくとも6残基の長さのアミノ 酸を含む、いかなるアミノ酸配列をも意味する。 この発明のペプチド配列は、例えば、メリーフィールド[Merrifield]法のよ うな技術およびアプライド・バイオシステム社[Applied Biosystems]より市販 されているタイプのシンセサイザーを用いて、化学合成により得ることができる 。 特には、この発明は、プラスミドpILL205(CNCM I−1355)のウレ アーゼ遺伝子クラスターによってコードされるヘリコバクター・フェリスポリペ プチドの少なくとも1つを含むことを特徴とする蛋白質様物質であって、構造お よびアクセサリーウレアーゼポリペプチド、または前記ポリペプチドと少なくと も90%の相同性を有するポリペプチド、またはそれらの断片を含む蛋白質様物質 に関する。特に興味深いのは、図3に示されるure Aおよびure B遺伝 子の遺伝子産生物、または少なくとも90%の相同性を有するそれらの変異体もし くは少なくともアミノ酸6個を有する断片である。この断片および変異体は、 リコバクター・ピロリ ウレアーゼと反応する抗体によって認識される。 ウレアーゼ遺伝子クラスターのアクセサリー遺伝子によってコードされるポリ ペプチドの中でも、図9に示されるure Iの遺伝子産物もこの発明の一部を 形成する。少なくとも75%、好ましくは少なくとも85%の相同性を有するure 産生物の変異体、または少なくともアミノ酸6個を有する、この遺伝子産物 もしくは変異体の断片もまた含まれる。この変異体は、好ましくはure Aお よびure B遺伝子産物を、残りのウレアーゼアクセサリ-遺伝子産生物の存 在下において活性化する能力を有する。この機能的相同性は、以下の試験を用い て検出することができる;ure I遺伝子産生物変異体を有する細菌109個を 尿素−インドール培地1mlに懸濁させ、37℃でインキュベートした。尿素が加 水分解することによりアンモニウムが放出され、これがpHを増加させてオレン ジ色から暗赤色への色の変化を誘発する。そのような色変化が観察されることは 、試験中のure I遺伝子産生物の変異体がure Aおよび遺伝子産生物 を活性化し得ることを示している。 ure I遺伝子産生物の断片もまた、それが、例えば少なくともアミノ酸70 ないし100個の長さを有しているならば、この全ポリペプチドとの機能的相同性 を表わすことが可能である。 ure Iポリペプチドまたは変異体の断片は、ウレアーゼ熟成プロセスを妨 げる抗体の形成を誘発することが可能である。換言すると、この断片は、ure ure Aure B遺伝子産生物との間の相互作用において決定的な 役割を果たすエピトープを担持する。 この発明はまた、熱ショック蛋白質またはヘリコバクター・ピロリのシャペロ ニン類またはそれらの断片の少なくとも1種を含む蛋白質様物質にも関する。図 6に示されるHSP AおよびHSP Bポリペプチド、またはこのポリペプチ ドと少なくとも75%、好ましくは80もしくは90%の相同性または同一性を有する ポリペプチドが特に好ましい。ヘリコバクター・ピロリHSP Aポリペプチド の特に好ましい断片は、C−末端配列: または、少なくとも6個の連続したアミノ酸を有するこの配列のサブ断片である 。このC−末端配列は、例えばニッケルの結合を可能にする、金属結合ドメイン として作用することが教示されている。 この発明の蛋白質様物質はまた、H.ピロリおよび/またはH.フェリスのウ レアーゼ構造ポリペプチド、または上に定義されるそれらの断片もしくは変異体 の少なくとも1種を 含む融合もしくは混合蛋白質からなり、あるいはそれらを包含することもできる 。特に好ましい融合蛋白質は、上に定義されるMal−E融合蛋白質およびQIAe xpressシステム融合蛋白質(QIAGEN,USA)である。融合または混合蛋白質には 、ウレアーゼサブユニットに代えて、あるいは加えて、上に定義される熱ショッ ク蛋白質またはそれらの断片もしくは変異体が含まれる。 この発明はまた、上述の蛋白質様物質に対するモノクローナルもしくはポリク ローナル抗体にも関する。より詳細には、この発明は、構造およびアクセサリー ウレアーゼポリペプチド、すなわち、構造遺伝子ure Aおよびure B、 並びにure Cure Dure Eure Fure Gure およびure Iとして知られるアクセサリー遺伝子を有するプラスミドp ILL205(CNCM I−1355)のウレアーゼ遺伝子クラスターによってコー ドされるヘリコバクター・フェリスポリペプチドの1種に対する抗体またはそれ らの断片に関する。これらの抗体は、前記ウレアーゼポリペプチドとの少なくと も90%の相同性を有するポリペプチド、または、好ましくは少なくとも6個のア ミノ酸を有するそれらの断片にも向けられる。この発明の抗体は、ウレアーゼ遺 伝子クラスターによって発現されるヘリコバクター・フェリスポリペプチドを特 異的に認識することができる。この場合には、この抗体によって認識されるエピ トープはヘリコバクター・フェリスに独特のものである。あるいは、この抗体は 、ヘリコバクター・フェリスウレアーゼポ リペプチドおよびヘリコバクター・ピロリウレアーゼポリペプチドに共通のエピ トープに対する抗体からなり、またはそれを含んでいてもよい。この抗体がアク セサリー遺伝子産生物を認識する場合には、それらがヘリコバクター・ピロリア クセサリー遺伝子産生物と交叉反応することが特に都合がよい。このようにして 、ウレアーゼ熟成プロセスを阻害することにより、ヒトにおけるヘリコバクター ・ピロリ 感染の治療処置にこの抗体を用いることができる。 この発明の特に好ましい抗体は、ヘリコバクター・フェリス ureAおよび /またはureB遺伝子産生物、すなわちAおよびBウレアーゼサブユニットを 認識する。好ましくは、これらの抗体はまた、ヘリコバクター・ピロリAおよび Bウレアーゼサブユニットと交叉反応するが、他の尿素分解バクテリア[ureoly tic bacleria]とは交叉反応しない。このような抗体は、ヘリコバクターに独特 のエピトープ(図4参照)に対して調製し、あるいは全ポリペプチドに対して調 製した後に他の尿素分解バクテリアと反応するあらゆる抗体をスクリーニングで 除外すればよい。 この発明はまた、HSP類またはそれらの断片、特に、図6に示されるHSP Aおよび/またはHPS B蛋白質に対するモノクローナルもしくはポリクロ ーナル抗体にも関する。HSP類と少なくとも75%、好ましくは80%、または90 %の相同性を有するポリペプチドもまた、抗体形成の誘発に用いることができる 。これらの抗体は、認識されるエピトープにより、ヘリコバクター・ピロリシャ ペロニン類に特異的 であっても、あるいはヘリコバクター以外のバクテリアに由来するGroEL様 蛋白質もしくはGroES様蛋白質と交叉反応してもよい。図7は、それぞれ種 々のバクテリアに由来するGroES様蛋白質およびGroEL様蛋白質とのH SP AおよびHSP Bの相同領域を示す。特に好ましい抗体は、HSP A またはHSP Bシャペロニンのいずれかについて特異的な抗体、または金属結 合機能を有するHSP AのC末端配列を特異的に認識する抗体である。さらに 、抗体誘発に特異的な配列を使用することにより、ヘリコバクター特異的抗体の 産生が確実となる。 この発明の抗体は、古典的な技法を用いて調製することができる。例えば、モ ノクローナル抗体は、ハイブリドーマ法により、もしくはヒト抗体を調製するた めの周知技術により、あるいはMarks et al(Journal of Molecular Biology,1 991,222,p581-597)に記述される方法により生成させることができる。 この発明はまた、動物、例えば哺乳動物を、この発明の免疫組成物、蛋白様物 質もしくは断片、または融合もしくは混合蛋白質で免疫し、次いで抗体もしくは 血清を精製することにより得られる、精製された抗体もしくは血清にも関する。 また、H.ピロリ感染のイン・ビトロ検出のための試薬であって、少なくともこ れらの抗体または血清を包含し、さらにこれらの抗体を標識するための試薬、例 えば抗−抗体等を任意に伴う試薬にも関る。 この発明は、さらに、ペプチドを包含する上記のあらゆる 蛋白質様物質をコードする核酸配列に関する。特には、この発明は、 i)ヘリコバクター・フェリスウレアーゼおよび上記アクセサリーポリペプチ ドをコードする配列、および上述のH.ピロリのHSPをコードする配列; またはii)配列(i)に相補的な配列; またはiii)過酷な条件下において、配列(i)もしくは(ii)とハイブリダイ ズし得る配列; またはiv)少なくとも10個のヌクレオチドを含む配列(i)、(ii)もしくは( iii)の断片、 を包含することを特徴とする核酸配列に関する。 好ましい核酸配列は、プラスミドpILL205(CNCM I−1355)の配列 の全部または一部、例えば図3の配列、特にure Aの遺伝子産生物および re B をコードする配列、または図9(ure I)の配列、または過酷な条 件下でこれらの配列とハイブリダイズし得る配列、またはこれらの配列に相補的 な配列、またはこれらの配列の少なくとも10個の保全ヌクレオチドを含む断片を 包含する配列である。 他の好ましい配列は、プラスミドpILL689(CNCM I−1356)の配列 の全部もしくは一部、例えば図6の配列、特にはHSP Aおよび/またはHS P Bをコードする配列、またはこの配列に相補的な配列、または過酷な条件下 でこの配列とハイブリダイズし得る配列、またはそれらの断片を包含する配列で ある。 この発明における、非常に過酷なハイブリダイゼーション 条件とは以下の通りである: −5×SSC; −50%ホルムアミド、37℃; または: −6×SSC; −デンハード[Denhard]培地、68℃。 この発明の配列には、非過酷条件下、すなわち: −5×SSC; −0.1%SDS; −30もしくは40%、好ましくは30%ホルムアミド、42℃、において上述の配列 (i)、(ii)および(iii)と反応する配列が含まれる。 この発明において、“相補的配列”という用語は、“相補的”および“逆[re verse]”および“逆[inverse]”配列を意味する。 核酸配列はDNAであっても、あるいはRNAであってもよい。 この発明の配列は、適切な標識手段と関連付けて、核酸プローブとして用いる ことができる。そのような手段には、放射活性同位体、酵素、化学的もしくは化 学発光マーカー、蛍光色素、ハプテン、または抗体が含まれる。このマーカーは 、任意に固体支持体、例えば膜もしくは粒子、に固定することができる。 このプローブ配列の5´末端に、好ましいマーカーとして、放射活性リン(32 P)が組み込まれる。この発明のプローブ には、記載された核酸配列のあらゆる断片が含まれ、例えば少なくとも45個のヌ クレオチド、例えば60、80または100個以上のヌクレオチドの長さを有し得る。 好ましいプローブは、ure Aure Bure I、HSP Aおよび HSP B遺伝子に由来するものである。 この発明のプローブは、任意の遺伝子増幅反応後の、生物学的試料における リコバクター 感染のイン・ビトロ検出に用いることができる。最も好ましくは、 これらのプローブは、ヘリコバクター・フェリスもしくはヘリコバクター・ピロ 、またはその両者の検出に用いられる。いずれに用いられるかは、プローブと して選択される配列が一方もしくは他方のいずれに特異的であるか、あるいは両 者にハイブリダイズすることができるのかによる。一般に、そのような検出を行 なうにあたっては、ハイブリダイゼーション条件は過酷である。 この発明はまた、ヘリコバクター感染のイン・ビトロ検出のためのキットであ って: −上に定義される、この発明によるヌクレオチドプローブ; −ヘリコバクターの核酸とプローブとのハイブリダイゼーション反応を行なう ための適切な培地; を包含することを特徴とするキットにも関する。 この発明のヌクレオチド配列は、核酸増幅反応において、プライマーとしても 機能し得る。このプライマーは、通常、上述の配列の少なくとも10個、好ましく は少なくとも18個の保全ヌクレオチドを含む。典型的な長さは、保全ヌクレオチ ド25ないし30個であり、100個以上もの長さであることもあ る。このようなプライマーは一対で用いられ、増幅される断片の5’および3’ 末端とハイブリダイズするように選択される。この増幅反応は、例えばPCR法 を用いて行なうことができる(欧州特許出願EP 200363,201184および229701) 。Q−β−複製法(Biothechnology,vol.6,Oct.1988)もまた、増幅反応にお いて用いることができる。 この発明はまた、この発明の核酸配列のいずれかを含むことを特徴とする発現 ベクターにも関する。特に好ましい発現ベクターは、プラスミドpILL689お よびpILL205(それぞれ、CNCM I−1356およびCNCM I−1355) である。この発現ベクターは、通常、適切なプロモーター、ターミネーターおよ びマーカー遺伝子、並びに十分な発現に必要な他の調節信号を含む。 この発明はさらに、この発明の核酸配列によって安定に形質転換されている原 核もしくは真核宿主細胞に関する。宿主の例として、CHO細胞および細胞系の ような高度な真核生物;酵母、大腸菌、例えば大腸菌HB101のようなバクテリ アを含む原核生物;結核菌[Mycobacterium tuberculosum];バキュロウイルス およびワクチニアを含むウイルスに言及することができる。通常、宿主細胞はベ クターによって形質転換される。しかしながら、この発明においては、常法を用 いて、相同組換えにより核酸配列を挿入することもできる。 この発明の安定に形質転換された宿主を培養することにより、ヘリコバクター ウレアーゼポリペプチドおよび、適用可能である場合には、HSP物質を、組換 え手段により生成さ せることができる。次いで、この蛋白質様物質を収集し、精製する。この組換え 物質を適切な賦形剤、アジュバントおよび、任意に、安定化剤のような他の添加 剤と組合せることにより、医薬組成物が調製される。 この発明はまた、下記実施例に記載される通りに構築された(1993年7月20日 に、I−1337の受付番号でCNCMに寄託されている)プラスミドpILL920 およびpILL927(CNCM I−1340、1993年7月20日に寄託)にも関する 。この発明の異なる側面が図中に示される : 図1: pILL205のトランスポゾン変異誘発および配列決定。組換えコスミドpI LL199および組換えプラスミドpILL205の線形制限地図(並びに相対スケー ルマーカー)が示される。括弧内の数字は、クローニングベクターの1つ(それ ぞれ、pILL575およびpILL570)に挿入されたH.フェリスDNA断片の サイズを示す。円内の“プラス”および“マイナス”記号は、pILL205にお けるミニTn3-Km[MiniTn3-Km]トランスポゾンの挿入部位に相当する。 “ プラス”記号は、トランスポゾンがウレアーゼの発現を不活性化しなかったこと を示す。これに対して、マイナス記号はウレアーゼ発現が無効となったことを示 す。文字は、定量的なウレアーゼ活性およびウレアーゼ遺伝子産生物の合成につ いてさらに特徴付けられた変異体クローンを示す。pILL205上の構造ウレア ーゼ遺伝子(ure Aおよびure B)の位置がボックスで示されており、 その長さは各々の オープンリーディングフレームのサイズに比例している。矢印は転写の方向を示 す。図の底部のスケールはHindIIIおよびPstI制限断片の(キロ塩基で の)サイズを示している。制限部位は以下のように表わされている:B、Bam HI;Pv、PvuII;Bg、BglII;E、EcoRI;H、HindIII; C、ClaI;Ps、PstI。括弧内の文字は、クローニングベクター起源の 部位を示す。 図2: H.フェリスバクテリアに対して生成したウサギポリクローナル抗血清(1: 1に希釈、1000)と反応した、組換えプラスミドを有する大腸菌HB101細胞の 全細胞抽出物のウェスタンブロット解析。A)抽出物は:プラスミドベクターp ILL570(レーン1);組換えプラスミドpILL205(レーン2);および遺 伝子座“a”、“b”、“c”、“d”および“e”(レーン3−7)で分断さ れたpILL205誘導プラスミドを有する大腸菌細胞の抽出物。B)抽出物は: H.ピロリure Aおよびure B遺伝子を含む組換えプラスミドpILL 753(Labigne et al,,1991)(レーン1);および遺伝子座“f”、“g”、 “h”および“i”(レーン2−5)で分断されたpILL205誘導プラスミド を有する大腸菌細胞の抽出物。小さな矢の頭は、H.フェリスの推定ure A およびure B遺伝子産生物を表わす約30および66キロダルトンのポリペプチ ドを示す。パネルBにおける大きな矢の頭は、抗−H.フェリス血清と交叉反応 するH.ピロリの対応遺伝子産生物を示す。数字は、 蛋白標準の分子量(1000を単位として)を示す。 図3: H.フェリス構造ウレアーゼ遺伝子のヌクレオチド配列。配列の上の数字は、 2つのUre AおよびUre Bポリペプチドの各々において、アミノ酸位置 の他にヌクレオチド位置を示す。Ure A(bp43ないし753)およびUre (766ないし2616)の予想されるアミノ酸配列が配列の下に示される。推定 リボソーム結合部位(シャイン−ダルガーノ配列、SD)には下線が付されてい る。 図4: H.フェリスの構造ウレアーゼ遺伝子の配列と:a)H.ピロリウレアーゼの 2つのサブユニット配列(Labigne et al.,1991);b)プロテウス・ミラビリ Proteus mirabilis]の3つのサブユニットの配列(Jones and Mobley,198 9);c)タチナタマメウレアーゼの単一サブユニットの配列との比較。最良の 配列(アラインメント)を確実にするために(ダッシュで示される)ギャップが 導入されている。★、H.フェリス配列のアミノ酸と同一のアミノ酸;=、種々 のウレアーゼによって共有されるアミノ酸;・、ヘリコバクターウレアーゼに独 特のアミノ酸。パーセンテージは、H.フェリスウレアーゼサブユニットのアミ ノ酸と同一のアミノ酸の数に関連する。H.f.、ヘリコバクター・フェリスH.p.、ヘリコバクター・ピロリP.m.、プロテウスミラビリス;J. b. 、タチナタマメ。 図5: 組換えプラスミドpILL689、pILL685、およびpILL691の制限地図 。これらのプラスミドの構築は、表1に詳細に記載されている。三角内のKmは 、プラスミドpILL687、pILL688およびpILL696の構築につながるカ ナマイシンカセットの挿入部位を表わす(表2)。地図の下のボックスは、核酸 配列から推測された3つの遺伝要素、すなわちIS5、HSP AおよびHSP の位置を示す。 図6: ヘリコバクター・ピロリ熱ショック蛋白質遺伝子クラスターのヌクレオチド配 列。配列の上の最初の数字はヌクレオチド位置を示し、二番目の数字は、HSP およびHSP B蛋白質の各々について、アミノ酸残基位置に数字を振った ものである。推定リボソーム結合配列(シャイン−ダルガーノ[SD]部位)に は下線が付されている。 図7: ヘリコバクター.ピロリ Hsp A(A)またはHsp B(B)の推定ア ミノ酸配列と他のGroEL様(A)またはGroES様(B)蛋白質の推定ア ミノ酸配列との比較。アスタリスク印がついたアミノ酸は、ヘリコバクター・ピ ロリ Hsp AまたはHsp B配列のアミノ酸と同一である。 図8: 大腸菌ミニ細胞におけるヘリコバクター・ピロリ Hsp A熱ショック蛋白 質の発現。ヘリコバクター・ピロリ Hsp AおよびHsp B熱ショック蛋 白質に相当する、58 および13kDAの明らかな分子塊を伴う蛋白質バンドが、プラスミドpILL68 9およびpILL692に相当するレーンに明瞭に視認され、対照ベクター(各々、 pILL570およびpACYC177)には見られない。 図9: ヘリコバクター・フェリス ure I遺伝子のヌクレオチド配列および推定 アミノ酸配列。 図10: ヘリコバクター・フェリスおよびヘリコバクター・ピロリの、ure I遺伝 子のヌクレオチド配列から推定されるure I蛋白質のアミノ酸配列の比較。 図11: 遺伝暗号。鎖終結、もしくは“ノンセンス”コドン。イニシエーター・ホルミ ル−Met−tRNAMet Fの特定にも用いられる。このように、Valのトリプ レットであるGUGは“多義的”であり、バリンおよびメチオニンの両者をコー ドする。 図12: 一文字および三文字アミノ酸略語の意味。 図13: pMAL発現ベクター系を用いる、H.ピロリ UreA−MBP組換え蛋白 質の精製。蛋白精製の種々の段階からの抽出物を、10%解像SDS−ポリアクリ ルアミドゲル[10%resolving SDS-polyacrylamide gel]上で移動させた。電気 泳動に続いて、ゲルをクーマシーブルーで染色した。抽出 物は:1)非誘導細胞;2)IPTG誘導細胞;誘導細胞抽出物のフレンチプレ ス[French press]溶解物;5)アミロース樹脂カラムからの溶出物;6)陽イ オン交換カラムからの溶出物(第1溶出[first passage]);7)陽イオン交 換カラムからの溶出物(第2溶出);8)SDS−PAGE標準マーカー蛋白質 、であった。 図14: ポリクローナルウサギ抗−ヘリコバクター血清によるUreA組換え融合蛋白 質の認識。マルトース結合蛋白質(MBP、レーン1)、H.フェリスUreA −MBP(レーン2)、およびH.ピロリUreA−MBP(レーン3)の蛋白 抽出物を、H.ピロリおよびH.フェリスの全細胞抽出物に対して生じたウサギ ポリクローナル抗血清(1:5000に希釈)を用いて、ウェスタンブロッティング を行なった。精製された融合蛋白質は、矢印によって示されている。この蛋白質 の椎定分解生成物が、アスタリスクで示されている。 図15: 相同および非相同UreB蛋白質に対して生じたウサギ抗血清によるUreB 組換え融合蛋白質の認識。以下の抽出物をニトロセルロースメンブランにブロッ ティングした:1)標準蛋白質マーカー;2)H.フェリスUreA−MBP; 3)MBP;4)H.ピロリUreA−MBP。これらのメンブランを、それぞ れMBP−融合H.ピロリおよびH.フェリスUre Bサブユニットに対して 生じたポリクローナルウサギ抗血清(1:5000に希釈)と反応させた。標準蛋 白質の分子量をブロットの左手側に示す。 図16: 精製されたUreB MBP融合組換え蛋白質に対して生じた抗血清を用いる 、H.ピロリおよびH.フェリス全細胞抽出物のウェスタンブロット解析。H. フェリス (レーン1)およびH.ピロリ(レーン2)細胞のSDS−PAGE全 抽出物を、精製されたH.ピロリUreBおよびH.フェリスUreB MBP 融合蛋白質に対して生じたポリクローナルウサギ抗血清(1:5000に希釈された 血清)と反応させた。H.フェリスおよびH.ピロリの各非組換えUreBサブ ユニットのゲル移動度に相違を見出すことができる。左側の数字は標準マーカー 蛋白質の分子量を表わす。 図17: アミロースカラム(レーン2および3)から溶出された物質、または緩衝液E (pH4.5)、レーン4および5;もしくは緩衝液C(pH6.3)、レーン6およ び7、でNi−NTAカラムから溶出された物質のSDS−PAGE解析。MC 1061(PILL933)の溶解物から溶出された物質(レーン2、3、5および7 )並びにMC1061(PMAL−c2)の溶解物から溶出された物質(レーン4お よび6)。レーン3には、それが緩衝液Eに懸濁されていたことを除いて、レー ン2と同じ物質が含まれている。したがって、レーン3および5に見られるよう に、緩衝液EはMBP−HspAサブユニットのダイマー形成に応答し得ること が示されている。 図18: 血清IgGは、28名のH.ピロリ感染患者(四角、左)および12名の非感染患 者(円、右)のMBP(底部)、MBP−HspA(頂部)およびMBP−Hs pB(中間部)に応答する。実験手順に記載されるELISAアッセイにおける 各血清の光学密度は、30分間のインキュベーションの後に492nmで読取った。 表象の大きさは、同じ光学密度値を示す血清の数に比例している。 実施例 I−H.フェリス ウレアーゼ遺伝子のクローニング、発現および配列決定: パートIの実験手順:細菌株および培養条件H.フェリス(ATCC49179)を、5%溶血ウマ血液(バイオメリュークス )並びに10ng ml-1のバンコマイシン(レダリー研究室)、2.5μg ml- 1 のポリミキシンB(ファイザー)、5μg ml-1のトリメトプリン(シグマ 化学株式会社)および2.5μg ml-1のアンホテリシンB(E.R スキーブ アンド サンズ株式会社)からなる抗生補足物質で補足された血液寒天培地no .2(オキソイド)で成育させた。バクテリアを要時調製した寒天プレートで培 養し、一番上に蓋を置いて、好気状態下、37℃で2−3日間インキュベートした 。クローニング実験において用いられる大腸菌株HB101(ボイヤーおよびルー ランドーダソイックス)およびMC1061(マニアティスら、1983)は、グルコー ス無添加ルリアブロス[Luria broth]中あるいはルリア 寒天培地上において、37℃で、所定の通りに成育した。窒素−制限条件下で成育 したバクテリアを、0.4%(w/v)D−グルコースおよび10mM L−アルギ ニンを補足したアンモニア無添加M9最小培地(pH7.4)からなる窒素−制限 固形培地上で継代した(キュサックら、1992)。DNA操作 : 全ての標準DNAおよび分析は、他に記載された以外は、マニアティスらによ って記述された方法に従って行われた(1983)。H.フェリスDNAの単離 : 全てのゲノムDNAはザルコシループロテイナーゼK溶解法(ラビニュー−ラ ッセルら、1988)によって抽出した。H.フェリスを接種した12枚の血液寒天プ レートを、触媒無添加の嫌気性ガスパック(BBL70304)を用いた嫌気ジャー (BBL)中で、37℃にて1−2日保温した。ペレットを15%(V/V)グリ セロール−9%(W/V)ショ糖溶液50mlに集め、(ソルバール[Sorvall] 遠心機で)5,000rpm、4℃にて30分間遠心した。ペレットを5mg ml-1 リゾチームを含む25mMトリス−10mM EDTA(pH8.0)中に50mM D −グルコースを含む溶液0.2mlに再懸濁し、VTi65ポリアロマークイックシ ールチューブに移した。この懸濁液に、20mg ml-1プロテイナーゼKの溶液 0.2ml及び5M過塩素酸ナトリウム0.02mlを添加した。0.5M EDTA−10 %(W/V)ザルコシル0.65mlを添加することによって細胞を溶解し、懸濁液 が透 明になるまで65℃にてインキュベートした(約5分間)。チューブの容量は126 g塩化セシウム、1mlアプロチニン、99mlTESバッファー(30mMトリス 、5mM EDTA、50mM 塩化ナトリウム(pH7.5)からなる(100ml当 り)塩化セシウム溶液で満たした。溶解液を18℃で15−18時間、45000rpmで 遠心した。全DNAを収集し、TEバッファー(10mMトリス、1mM EDT A)に対して4℃で透析した。コスミド クローニングH.フェリスに由来する染色体DNAを、既に記述されているように(ラビニ ら、1991)、コスミドベクターpILL575にクローニングした。Sau3Aで の部分的切断により生じたDNA断片を、(10から40%)ショ糖密度勾配で分画 し、BamHIで切断して、脱リン酸化されたpILL575DNA調製物に連結 させた。コスミドをファージラムダ粒子(アマシャム、イン・ビトロ・パッケー ジングキット)に組込み、大腸菌 HB101に感染させるために用いた。ウレア ーゼ発現をスクリーニングするために、カナマイシン−耐性形質導入株を、マイ クロタイタープレート(ベクトン・ディキンソン)の個々のウェルに分配されて いる、(20μg ml-1)カナマイシンを含む窒素−制限[mimiting]固体培地 (上記参照)上にレプリカプレートした[replica-plated]。各々のウェルにウ レアーゼ試薬(ハゼールら、1987)0.1mlを添加する前に、マイクロタイター プレートを2日間37℃で有酸素的にインキュベートした。尿素分解は、試薬の色 調変化によって37℃で5−6時間以内に検出された。幾つかのウレアーゼ陽性反 応コスミドクローンの制限地図が作成され、そのうちの一つがサブクローニング のために選択された。H.フェリスDNAのサブクローニング : コスミドDNAの大規模な塩化セシウムプラスミド調製物を、部分的にSau 3Aで切断した。DNA断片(7−11kb)をアガロースゲルから電気溶出し、 フェノール−クロロホルム抽出を用いて精製した。冷却エタノールで沈殿させた 後、この断片をBg/III−切断プラスミドpILL570に連結し(ラビーニら、 1991)、その組換えプラスミドを十分な資格を有する大腸菌MC1061細胞の形質 転換に用いた。スペクチノマイシン−耐性形質転換体を、窒素−過多(ルリア寒 天)および窒素−制限条件下でウレアーゼ発現について選択し、かつスクリーニ ングした。定量性ウレアーゼ活性 : 37℃で2.5日間好気的に成育した培養体を集め、0.85%(W/V)塩化ナトリ ウムで2回洗浄した。ペレットをPEBバッファー(0.0IM EDTA含有0.1 Mリン酸ナトリウムバッファー(pH7.4))に再懸濁し、次いで30W、50%サ イクルにセットしたブランソン ソニファイヤー モデル450[Brnaon Sonifier model]を用いて30秒間の破砕を4回行なうことにより超音波処理した。細胞片 は遠心によって破砕物から除いた。破砕物のウレアーゼ活性を、バースロット反 応の変法(クーザックら、1992)により、PEBで調製された0.05Mウレアーゼ 溶液中において測定した。ウレアー ゼ活性は、μmol 尿素 min-1mg-1バクテリア蛋白として表現した。蛋白質測定 : 蛋白質濃度は、ブラッドフォードアッセイの市販品(シグマ化学)で推定した 。トランスポゾン突然変異 : MiniTn3−Kmデリバリー系(ラビーニら、1992)によってクローン化 されたH.フェリス中に、無作為挿入突然変異が生じた。簡単に説明すると、ト ランスポザーゼをコードするプラスミドpTCAを含む大腸菌HB101細胞を、 クローン化H.フェリスDNAを含むプラスミドpILL570形質転換した。p ILL570誘導体プラスミドへのMiniTn3−Kmエレメントの移動は接合 によって行なわれた。その後、得られた共組込み体[cointefrates]を、高濃度 のカナマイシン(500mgl-1)およびスペクチノマイシン(300mgl-1)の存 在下で、解析された構造に対して選択した。SDS−PAGEおよびウェスタンブロッティング : 可溶化された細胞抽出物を、4.5%アクリルアミドスタッキングゲルおよび12. 5%解析ゲルを含むスラブゲルで、レムリーの方法(レムリー、1970)に従って 分析した。電気泳動は、ミニ−スラブゲル装置(バイオ−ラド)で200Vにて行 なった。 ミニ・トランス−ブロット・トランスファー・セル[Mini Trans-Blot transf er cell](バイオ−ラド)セッ トにおいて、100Vで1時間(冷却しながら)、蛋白質をニトロセルロース紙に 転写した(トービンら、1979)。ニトロセルロースメンブランをリン酸バッファ ー生理食塩水(PBS、pH7.4)に溶解した5%(W/V)精製カゼイン(B DH)で、室温にて2時間ブロックした(フェレロら、1992)。メンブランを、 PBSで調製された1%(W/V)カゼインで希釈された抗血清で、4℃にて一 晩反応させた。その後、免疫反応体を、アビジン−ペルオキシダーゼ(KPL) と組み合わされたビオチニル化2次抗体(キルケガードおよびペリー研究室)を 用いて検出した。反応生成物を可視化するために、0.3%(W/V)4-クロロ-1- ナフトール(バイオ−ラド)からなる基質溶液を用いた。DNA配列決定 : 配列決定しようとするDNA断片を、M13mp18およびM13mp19バクテリオ ファージベクター(ファルマシア)中にクローニングした(メイシングおよびビ ーラ、1982)。組換えファージDNAを十分な資格を有する大腸菌JM101細胞 に感染させ、X−ガル[X-gal](5-ブロモ-4-クロロ-3-インドリル−β−D− ガラクトピラノシド)およびイソプロピル−β−D−チオガラクトピラノシドを 含む培地上にプレートした。組換えファージDNAで感染されたバクテリアから 生じたプラークを、ポリエチレングリコール処理による一本鎖DNAテンプレー トの調製(ザンガーら、1977)のために選択した。シークエナーゼキット[Sequ enase kit](ユナイテッド・ステイト・バイオケミカル社)を用いたジデオ キシヌクレオチド・チェイン・ターミネイション法に従って、一本鎖DNAの配 列を決定した。ヌクレオチド配列受託番号 : ヌクレオチド受託番号[accession number]は、X69080(EMBデータライ ブラリー)である。 パートI実験の結果:H.フェリス.コスミド・クローンによるウレアーゼ活性の発現 : コスミドベクターpILL575中にH.フェリス染色体DNAの部分的に切断 された断片(大きさが30から45kb)をクローニングした結果、約700のコスミ ドクローンが単離された。ウレアーゼ発現を誘発させるために、窒素−制限培地 でクローンをサブカルチャーした(クザックら、1992)。これらのうちの6株に ついては、5−6時間のインキュベーションの後(実験手順の項に記載したよう に)ウレアーゼ−陽性になることが同定された。さらに一晩インキュベーション を行なったものの、他にウレアーゼ−陽性コスミドクローンは同定されなかった 。ウレアーゼをコードするコスミドを持つ3つのクローンの制限酵素の分析によ り、共通の28kdDNA断片が示された。両末端に共通の断片のDNA領域を有 するコスミド(消化されたpILL199)を、サブクローニングのために選択し た。大腸菌細胞中へのクローニングの際に、ウレアーゼ発現に必要とされるH.フェ リス遺伝子の同定 : 大腸菌細胞において、ウレアーゼ発現に対して必要な最小 DNA領域を明らかにするために、ウレアーゼをコードするコスミドpILL19 9をSau3Aで部分的に切断し、その断片をプラスミドpILL570にサブクロ ーニングした。この形質転換株を窒素−過多および窒素−制限培地でサブカルチ ャーし、ウレアーゼ陽性表現型についてスクリーニングを行なった。窒素−制限 状態下で成育した場合には、5つの形質転換導入株がウレアーゼ活性を発現した 。一方、窒素−過多培地での成育の後には活性は検出されなかった。制限マッピ ング分析により、ウレアーゼをコードするプラスミドは7および11kb間にイン サートを含んでいることが示された。pILL205と呼ばれるプラスミドが、さ らなる実験のために選ばれた。 大腸菌におけるウレアーゼ発現に対して必須である推定領域を調べるるために 、かつウレアーゼ構造遺伝子を含むクローン化DNA領域を局在化するために、 クローン化H.フェリスDNAの無作為突然変異を行なった。このため、Min iTn3−Kmエレメント(ラビニら、1992)を用いて、プロトタイププラスミ ドpILL205の無作為挿入突然変異を発生させた。pILL205の各々の突然変 異コピーについて挿入の部位をマップし、これらのプラスミドを持つ細胞をウレ アーゼ活性に対して定性的に分析した(図1)。(“a”ないし“i”と呼ばれ る)pILL205の突然変異誘導体を持つ大腸菌HB101細胞の選択は、ウエスタ ンブロッティングによる推定ウレアーゼサブユニットの検出の他に、定量的なウ レアーゼ活性の決定にも用いられた。 pILL205を有する大腸菌HB101細胞のウレアーゼ活性は、1.2±0.5μmo l尿素min-1mg-1バクテリア蛋白であった(表1)。これはクローニングに 用いられた親H.フェリス株の活性の約5分の1である。“a”、“c”、“d ”、“f”および“g”の位置へのトランスポゾンの挿入は陰性の表現型となり 、一方“b”、“e”、“h”および“i”の位置での突然変異は、これらの突 然変異したpILL205のコピーを有するクローンのウレアーゼ活性には重大な 影響は与えなかった。このように、MiniTn3−KmエレメントによるpI LL205の突然変異により、大腸菌細胞におけるH.フェリスウレアーゼ遺伝子 発現に必要な3つのドメインが同定された。H.フェリスウレアーゼ構造遺伝子の局在 : pILL205を有する大腸菌細胞の抽出物のウエスタンブロット分析により、 ポリクローナルH.フェリスウサギ抗体と交叉反応する約30および66kDaの2 つのポリペプチドの存在が示された(図2A)。これらの蛋白質は、ベクター( pILL570)を有する細菌によっては生産されなかった。本来のH.フェリス ウレアーゼは、算出分子量30および69kDaの繰り返しモノマーサブユニットか らなることが報告されている(ターベットら、1992)。このため、30および66k Da蛋白は、各々ureAおよびureB遺伝子産生物に対応するものと思われ た。興味深いことに、ヘリコバクター・ピロリ ureAおよびureB遺伝子 を含む組換えプラスミドpILL763を有する大腸菌細胞の抽出物(クザックら 、 1992)は、抗−H.フェリス抗体と交叉反応する約30および62kDaの分子サイ ズを有する2つのポリペプチドを発現した(図2B)。 pILL205の突然変異誘導株を持つクローンは、1株の例外を除いて全てが 、ureAおよびureB遺伝子産生物を発現した(図2A,B)。幾つかの変 異株(すなわち“c”、“d”、“f”および“g”変異株)ではウレアーゼサ ブユニットは合成されるものの、活性酵素は産生されなかったことから、ウレア ーゼ活性発現に必須の補助機能がトランスポゾン挿入により破壊されていた可能 性が推測できる。対照的に、pILL205::aと呼ばれる変異体は、ureB産 生物を産生せず、ウレアーゼ陰性であった。したがって、トランスポゾン挿入部 位はureB遺伝子に局在しているものと推定された。H.フェリスウレアーゼ の構造ポリペプチドをコードする潜在的なオープンリーディングフレームを明ら かにするために、挿入部位“a”に対応するDNA領域の配列決定分析を行なっ た。H.フェリス構造ウレアーゼ遺伝子の配列決定分析 : トランスポゾン挿入部位“a”に隣接したH.フェリスDNAの2.4kb領域 の配列決定分析により、同じ方向に転写されるureAおよびureBと呼ばれ る2つのオープンリーディングフレーム(ORF)が同定された(図3)。トラ ンスポゾンはureBの末端から240bp上流に局在していることが確かめられ た。両方のORFはATG開始コドンで始まり、大腸菌コンセンサス・リボゾー ム結合配列に類似する部位が先行する(シャインおよびダルガーノ、1974)。こ れらのH.フェリス構造遺伝子間に介在する遺伝子[intergenic space]は3つ のコドンからなっており、それ らは隣接するオープンリーディングフレームと同位相である。すでにヘリコバク ター・ピロリ に対するcas(ラビニーら、1991)において観察されているよう に、これはureA遺伝子の停止コドンにおける単一突然変異により、理論的に は融合した単一ポリペプチドが生じるであろうということを示唆している。 H.フェリス ureAおよびureB遺伝子は各々26074kAおよび61663D aの算出分子量を有するポリペプチドをコードしており、H.ピロリureA およびureB遺伝子産生物とアミノ酸配列レベルで高い類似性を示している。 2つのヘリコバクターspp.の対応するureAおよびureB遺伝子産物間 の同一性の程度は、各々73.5%および88.2%であると計算された。アミノ酸配列 情報によると、H.フェリスおよびH.ピロリureAおよびureBポリペ プチド(ラビニーら、1991)の推定分子量は、非常に類似している。それにもか かわらず、SDS−ポリアクリルアミドゲル電気泳動を行なった場合には、H. フェリスureB産生物はヘリコバクター・ピロリの対応する遺伝子産生物よ りも移動度が低かった(図2B)。 II−H.ピロリとH.フェリスの組換えウレアーゼサブユニット蛋白質の発現: これらの蛋白質のマウスモデルでの粘膜免疫原としての可能性の評価: この研究の目的はH.ピロリH.フェリスのウレアーゼサブユニットに由来 する組換え抗原の開発と、H.フェリス/マウスモデルでのこれらの抗原の免疫 防御効果の評価であ る。H.ピロリH.フェリスのウレアーゼサブユニットをコードしているそれ ぞれの構造遺伝子を、Escherichia coli(大腸菌)に別個にクローニングし、過 剰発現[over-expressed]させた。その結果得られた組換えウレアーゼ抗原(大 腸菌の42kDaマルトース結合蛋白質と融合している)を大腸菌培養物から大量 に精製した。これらは免疫原性ではあったが酵素的には不活性だった。この発見 はH.ピロリの感染に対する組換えワクチンを開発することが可能であることを 示した。 パートIIの実験手順バクテリア株、プラスミドと成育条件H.フェリス(ATCC49179)を、10%の分解したウマ血液(BioMerieux) を加えた血液寒天ベースno.2(Oxood)を含み、バンコマイシン(10μg/mL )、ポリミキシンB(25ng/ml)、トリメトプリム(5μg/mL)と、ア ンホテリシンB(2.5μg/mL)の抗生物質を補足した血液寒天培地で培養し た。バクテリアを微好気条件で37℃で2日、前述したように培養した。大腸菌株 MC1061とJM101は、クローニングと発現の実験で使ったが、37℃で寒天を加 え、または加えないルリア培地で機械的に培養した。抗生物質のカルベニシリン (100μg/mL)とスペクチノマイシン(100μg/mL)を必要量加えた 。DNA操作と分析 : 全てのDNA操作と分析は、他の方法に言及しない限り標準的な方法で行った 。制限酵素と修飾酵素はアマシャム(フ ランス)から購入した。クローニングするDNA断片は、アガロースゲルから電 気抽出し、エルチップ[Elutip]ミニカラム(Schleicher and Schull、ドイツ )で精製した。単鎖DNAの配列決定は、M13mp18とM13mp19バクテリオフ ァージベクター(ファルマシア、フランス)を使って行なった。単鎖DNAのテ ンプレートは、組換えファージDNAをポリエチレングリコール処理して調製し た。テンプレートの配列決定は、ジデオキシ鎖終結法によってシークエンスキッ ト(米国バイオケミカル社、U.S.A.)を使って行なった。ポリメラーゼ・チェーン・リアクション(PCR)を用いたクローニングのため の挿入断片の調製 H.ピロリH.フェリスureA遺伝子をクローニングするために、変性 した36マー[36-mer]のプライマーを、公表されたウレアーゼ配列(Labigne et al.,1991:Ferrero and Lablgne,1993)から推測した。(プライマーセット #1;表2参照)。プラスミドpILL763とpILL203(表3)を有する大腸 菌クローンから得た精製DNAは、H.ピロリH.フェリスのウレアーゼの構 造遺伝子をコードしており、PCR反応のテンプレートとして使用した。反応試 料に含まれていたのは、10-50ngの変性DNA、PCR緩衝液(10mmol/ L トリス−HCl[pH8.3]中に50mmol/L KCl)、dATP、d GTP、dCTP、dTTP(それぞれ最終濃度が1.25mmol/L)、2.5m mol/L MgCl2、それぞれのプライマーが25pmol、および0.5μL Taqポリメラーゼである。試 料は次のプログラムを30回行なった。94℃で2分間、40℃で1分間。 増幅生産物は、pAMPベクター(図1)の接着末端に、製造者(“CloneAmp System”、ギブコ BRL;Cergy Pontoise、フランス)の記述したプロトコ ルに従ってクローニングした。簡単に説明すると、60ngの増幅生成物を直接、 緩衝液(50mmol/L KCl、1.5mmol/L MgCl2、0.1%(wt /vol)ゼラチンを含む10mmol/L トリス−HCl、pH8.3)に、50 ngのpAMPと1つのベクターDNAと1ユニットのウラシルDNAグリコシ ラーゼと共に混入した。結合は37℃で30分間行なった。受容細胞(200μL)で ある大腸菌MC1061を、20μLの結合混合物で形質転換した。続いてpAMPベ クターのポリリンカーからBamH1PstIを用いて挿入断片を二重に加水 分解して切り出し、配列決定のためのM13mpバクテリオファージと同様に、組 換え抗原の生産のために選ばれた発現ベクターpMAL(New England Biolabs. ,Beverly,USA)に、サブクローニングした。 H.ピロリureB遺伝子を含む生成物の増幅は、PCR反応で35マーのプ ライマー(セット#2、表2)を幾つか用いて行った。PCR反応混合物は、初 めに94℃で3分間変性してから、次のプログラムを30回行なった。94℃で1分間 、55℃で1分間、72℃で2分間。精製した増幅生成物(1850塩基対)をEcoR IとPstIで分解し、pMALにクローニングした(pILL927、図2)。 大腸菌MC1061の受容 細胞は結合反応で形質転換した。 H.フェリス ureBは2段階の方法でクローニングしたが、これは完全なureB サブユニットと不完全なものの両者を生成した。プラスミドpILL21 3(表3)をureBサブユニットのアミノ酸残基の219番に相当するDraI酵 素とHindIIIで分解した。その結果得られた1350塩基対の断片を精製して、XmnIHindIIIで分解したpMALにクローニングした(pILL219、 図2)。完全なureB蛋白質を合成できるクローンを生産するために、ure 遺伝子のN末端部分から685塩基対の断片(ATGコドンを除く)を増幅する PCRプライマーを開発したが、これはプラスミドpILL219内の挿入断片の 始めの部分とも重なり合っている。PCRの増幅材料を精製し、BamHI indIII で分解し、pMAL(pILL221、図14)にクローニングした。ur eB 遺伝子生産物の残りの部分をコードしている1350塩基対のPstI−Pst 断片をpILL219から切り出して、線状にしたpILL221調製物(pILL 222、図14)にクローニングした。ベクターpMALにおける組換えウレアーゼポリペプチドの発現 : 発現ベクターpMALは、誘導性プロモーター(Plac)の制御下にあり、M alE(マルトース結合蛋白質)の生産をコードするオープン・リーディング・ フレーム(ORF)を含んでいる。後者のORFとクローニングした配列によっ て、MBP融合蛋白質が合成された。これはアミロースレジ ンで容易に精製された。商業的に有用なpMALの2つのバージョンのうち、シ グナル配列(すなわちpMAL−c2)をコードしていないバージョンが組換え 蛋白質をより多く合成したので終始使用した。 大規模な精製実験に先立って、組換えプラスミドを持つ大腸菌クローンを融合 蛋白質の産生についてスクリーニングした。組換えウレアーゼペプチドの精製 : カルベニシリン[carbenicillin](100μg/mL)と2%(wt/vol) グルコースを含む新鮮な500mLのルリアブロスに、一晩培養した大腸菌クロー ンの培養物(5mL)を接種した。A600=0.5になるまで、培地を37℃ででイン キュベートし250rpmで振盪した。1mmol/L(最終濃度)イソプロピル −β−D−チオガラクトピラノシド(IPTG)を培養液に加える前に、1.0m Lのサンプルをとった(非誘導細胞)。培養株は、さらに4時間インキュベート し、別に1.0mLのサンプル(誘導細胞)をとった。この非誘導細胞と誘導細胞 を、後でSDS−PAGEで分析した。 IPTGで誘導した培養菌は7000rpmで20分間、4℃で遠心分離して上清を 除去した。沈殿物を、次にあげるプロテアーゼ阻害剤(ベーリンガー、マンハイ ム、ドイツより供給)を含む50mLのカラム緩衝液(200mmol/L NaC l、1mmol/L EDTAを含む10mmol/L トリスHCl、pH7.4 )に懸濁した。それらは、2μmol/L ロイペプシン、2μmol/L ペプスタチンと1mmol/L フェニルメ チルスルホニルフルオリド(PMSF)である。そのままの細胞を、フレンチ・ プレッシャー・セル[French Pressure Cell](16 000 1b/in2)を通し て溶解した。アミロースレジン(ニューイングランド、バイオラブス)の2.6c m×2O0mカラムのクロマトグラフィーにかける前に、細胞破片を遠心分離で除 去し、その溶解物をカラム緩衝液で希釈して最終濃度2.5mg蛋白/mLにした 、レジンは、A280がレベルに戻るまで、カラム緩衝液で0.5mL/分で洗浄した 。MBP融合組換え蛋白質は、カラムから10mmol/L 1-マルトースを含む カラム緩衝液で洗浄することによって溶出した。 組換え蛋白質を含む画分を集めて、数回4℃で低塩緩衝液(20mmol/L トリスHCl、pH8.0中、25mmol/L NaClを含む)で透析した。そ の後、集めた画分を、0.5mL/分の流量で、高負荷クロマトグラフィーシステ ム(ファルマシア)に接続した1.6×10cmの陰イオン交換カラム(HP−セフ ァロース、ファルマシア、スウェーデン)にのせた。蛋白質は塩勾配(25mmo l/Lから500mmol/L NaCl)でカラムから溶出した。A280で高い吸 光度を示した画分を蒸留水で4℃にて徹底的に透析し、SDS−PAGEで分析 した。ウサギ抗血清H.ピロリ85P株(Labigne et al.,1991)とH.フェリス(ATCC49179 )の全細胞抽出物に対するポリクローナ ルなウサギ抗血清を調製した。H.ピロリH.フェリスのウレアーゼサブユニ ットの組換え蛋白調製物に対するポリクローナルウサギ抗血清は、フロイント完 全アジュバント(シグマ)中の100μgの精製組換え蛋白質でウサギに免疫する ことによって生産した。4週間後、ウサギをフロイント不完全アジュバント中、 100μgの蛋白質で追加免疫した。6週間目に、最終的にこの動物から血を取り 、血清を-20℃で保存した。SDS−PAGEとウェスタンブロッティングによる蛋白質分析 : Laemmliの方法に従って、可溶化した細胞抽出物を4,5%アクリルアミド・スタ ッキング・ゲルと10%の解像ゲル[resolving gel]からなるスラブゲルで分析 した。ミニスラブゲル装置(バイオラッド、USA)で200Vで電気泳動を行った。 蛋白質を、ミニ・トランス−ブロット・トランスファー・セル(バイオラッド )セットのニトロセルロース紙にI00Vで1時間、冷やしながら転写した。ニト ロセルロースメンブランをリン酸緩衝液(PBS、pH7.4)中、5%(wt/ vol)のカゼイン(BDH、英国)で、室温で2時間静かに振盪してブロック した。メンブランを、4℃で一晩、PBSで調製した1%カゼインで希釈した抗 血清と反応させた。免疫反応は、特異的なビオチン結合二次抗体とストレプトア ビジン−ペルオキシダーゼ複合体(Kirkegaard and Parry Lab.,Gaithersburg ,USA)を用いて検出した。反応生成物 はオートラジオグラフフィルム(ハイパーフィルム、アマシャム、フランス)で 、化学発光法(ECLシステム、アマシャム)を用いて視覚化した。 蛋白質濃度はブラッドフォード分析(シグマ化学社、セントルイス、USA)で 測定した。動物実験 : 6週令のメスのスイス特定病原体フリー(SPF)マウスを得て(Centre d'E levage R.Janvier,Le-Genest-St-Isle,フランス)、市販の固形飼料と水で任 意に飼育した。この動物の腸でヘリコバクター・ムリダルムHelicobacter mur idarum ]がいないものを選んだ。全ての胃への投薬は、1.0mLのポリエチレン カテーテル(Biotrol、パリ、フランス)のついた使い捨ての注射器を使って100 μLをマウスに与えた。H.フェリス培養物からの音波処理した抽出物および接種物の調製H.フェリスバクテリアをPBSに回収し、5000rpmで10分間、4℃でソー バルRC-5遠心分離機(Sorvall、USA)で遠心分離した。沈殿物を2回洗浄し、 PBSに再懸濁した。バクテリア懸濁液を前述したように音波処理し、少なくと も一回凍結融解した。蛋白質の同定を音波処理物について行った。 防御の研究のためのH.フェリスの有毒株を確保するために、H.フェリスバ クテリアをイン・ビボで、必要になるまで培養した。簡単にいえば、マウスに3 回(1010バクテリア /mLを)、5日間にわたって接種した。バクテリアは、胃の生体組織検査から 血液寒天培地に再び単離した(37℃で4-7日間、微好気中で培養した)。血液 寒天プレートで2日間培養したバクテリアをペプトン水(ディフコ、USA)に直 接回収した。バクテリアの生存度と運動性を、動物に投与する前に、位相差顕微 鏡で評価した。マウス防御研究 : 50μgの組換え抗原と10μgのコレラ全毒素(シグマ化学社)をHCO3に再 懸濁し、0、1、2、3週にマウスの胃に投与した。音波処理したH.フェリス 抽出物(全蛋白質を400-800μg含む)で免疫したマウスに10μgのコレラ毒も 投与した。5週目に、それぞれのグループの半分のマウスに、有毒なH.フェリ の接種物を抗原投与した。残りのマウスには15週にさらなる“追加”免疫をし た。17週に、後者にH.フェリスの培養株を抗原投与した。マウスでのH.フェリスコロニー形成の評価 : 免疫用量を受けてから2週間後(つまり、それぞれ7週目と19週目)、脊椎脱 臼で死亡させた。胃を殺菌した0.8%NaClで洗浄し、それぞれの胃から胃腔 の一部を、尿素指示培地(2%尿素、120mgNa2HPO4、80mgKH2PO4、 1.2mgフェノールレッド、1.5g寒天を1000mLに調製)を含む12cm×12cm の寒天プレートの表面に置いた。それぞれの胃の残りはホルマリン−生理食塩水 に入れ、組織学用に処理するまで保存した。胃の縦の切片(4μm)を切り取り 、ギムザ法で機械的に染色した。必要 なときは、切片を更に、ヘマトキシリン−エオシンおよびウォーシン−スターリ ー銀染色法で染色した。 マウスの胃の粘膜でのH.フェリスバクテリアの存在は、観察者の先入観を排 除するために、コード化したギムザ染色した胃の切片のスクリーニングと同様に 、指示培地でのウレアーゼ活性(24時間まで)の検出で評価した。胃の切片のバ クテリアの数は半定量的に、次の方法に従って記録した:0、切片全体にバクテ リアが見られない:1、全体にわずかな(<20)バクテリアが見られる;2、少 数(<20)のバクテリアが存在する幾つかの高勢力[high power](H.P.) 域がある;3、少数から普通の数(<50)のバクテリアが存在する幾つかのH. P.域がある;および4、多数のバクテリア(>50)が存在する多くの(>5) H.P.域がある。単核細胞の浸潤は次のように記録した:0、明らかな浸潤が ない;1、粘膜下組織と粘膜筋板に限って少数の単核細胞の浸潤が見られる;2 、粘膜下組織と粘膜筋板に並みの数の単核細胞の浸潤が見られ、時には緩やかな 凝集が見られる;および3、多数の単核細胞の浸潤があり、細胞の結節性の凝集 を特徴とする パートII実験の結果:大腸菌におけるヘリコバクターウレアーゼポリペプチドの発現H.フェリスH.ピロリのそれぞれのureA遺伝子生産物をコードしてい る配列を含む断片をPCRで増幅し、発現ベクターpMAL上に存在する、42k DaのMBPをコー ドしているORFとクローニングした。PCR生成物の配列決定により、わずか なヌクレオチドの変化が明らかになったが、それぞれの遺伝子生成物の推定アミ ノ酸配列を変えるものではなかった。これらの組換えプラスミド(それぞれpI LL919とpILL920)で形質転換した大腸菌MC1061細胞は、およそ69kDa の予想分子量の融合蛋白質を発現した。続くアフィニティクロマトグラフィー( アミロースレジン)と陰イオン交換ゲルメディア(Q−セファロース)のクロマ トグラフィーにより、これらの蛋白質は高純度に精製された(図1)。組換え大 腸菌細胞の2-L培養物からの収量は精製抗原がおよそ40mgだった。 同様に、H.ピロリH.フェリスウレアーゼの大きなureBサブユニット は大腸菌(それぞれ、プラスミドpILL927とpILL222)で発現し、予想分 子量103kDaの融合蛋白質を生成した。これらの場合の収量は、ureA調製 物の場合より幾分少なかった(バクテリア培養物2-Lからおよそ20mgが回収さ れた)。さらに、融合蛋白質のMBP部分からのureBポリペプチドの開裂に 関連する問題が生じた。これらの難題は、組換えureBポリペプチドが大きい ことが原因である。組換えウレアーゼポリペプチドの分析H.ピロリおよびH.フェリスの全抽出物に対して生じたウサギポリクローナ ル抗血清を用いた抗原調製物のウェスタンブロット分析は、抗原が、非相同な抗 血清と同様に相同な抗血清に対しても免疫原性を保持していることを示した(図 14および15)。抗血清はMBP成分だけを認識したのではなかった。H.ピロリH.フェリスのウレアーゼポリペプチド間の交叉反応性は、これらの蛋白質の アミノ酸配列の同一性が高いことと一致している。 H.ピロリH.フェリスから調製された精製組換えureAおよびureB 蛋白質に対して生じたウサギポリクローナル抗血清は、バクテリアの全細胞抽出 物に存在するウレアーゼポリペプチドに強く反応した(図16)。我々が既に観察 しているように、H.フェリスウレアーゼのureBサブユニットはH.ピロリ のそれよりSDS−PAGEゲル上でわずかに移動度が高い(図16)。免疫防御研究に用いられるH.フェリス接種物の調製H.フェリスバクテリアの接種物の有毒性を確かめるために、H.フェリスに 感染したマウスの胃からバクテリアを再び単離した(材料と方法参照)。バクテ リアはイン・ビトロで、最小の回数継代した。これらのバクテリアから調製して -80℃で保存した手持ちの培養株を、他のマウスの防御研究のための新鮮な接種 物を調製するために用いた。この方法によって、連続した実験で使った接種物は 再生産できることが確かめられた。H.フェリスの胃への感染に対するマウスの免疫化 : 所定の抗原調製物で3週間免疫したマウスを2つのロットに分け、2週間の後 、これらの一方に107バクテリア/mLを含むH.フェリスの接種物を抗原投与 した。組換えH.フェリスureAで免疫した動物の一つのグループにも、接種 物を抗原投与したが、他の動物とは異なり、19週まで殺さなかった。 a)5週目の防御 音波処理したH.フェリス調製物で免疫化したマウスのコントロールグループ から取った胃の生体組織検査試料の85%はウレアーゼ陰性であり、したがって .フェリス 感染を防御したようだった(表4)。これは、MBPだけ投与した動 物の他のコントロールグループからのそれが20%であることと比較された。組換 えウレアーゼサブユニットが投与されたマウスのグループのウレアーゼ陰性の胃 の割合は、70%(H.ピロリureB)から20%(H.ピロリureA)まで変 化した。H.フェリスによる細菌性コロニー形成のレベルも、胃の組織から作っ た組織切片から評価した。H.フェリスバクテリアは、目立つらせん状の形態を しているので、胃の窪み部分と腺部分の両方の粘膜表面にあるこの生物体を簡単 に見ることができた。組織学的な証拠からマウスでの防御のレベルは生体組織検 査のウレアーゼテストで観察されたものより低いことがわかった。すなわち、 .フェリス の音波処理した調製物とH.ピロリureBで免疫したマウスのそれ ぞれ25%および20%の胃の組織が、H.フェリスバクテリアに感染していなかっ た。 これらのマウスのグループの中で、細菌性コロニー形成の組織学的スコアが低 いこと(未公開データ)の他に、生態組織検査でウレアーゼ陰性が多いことは、 この動物で免疫防御的な応答が誘起されていることを示している。しかし、この 応答は、抗原投与法で投与された接種物を防御するには不十分であったかもしれ ない。 b)17週目での防御: それぞれの動物グループの残りのマウスに、15週目に追加免疫した。これらの マウスに、17週目に、以前使ったもののおよそ100分の1以下のバクテリアを含 むH.フェリス接種物を抗原投与した。2週間後、MBPで免疫した全てのマウ スの胃の生態組織検査の結果はウレアーゼ陰性であった(表4)。対照的に、組 換えウレアーゼサブユニットで免疫したマウスの胃の生態組織検査のウレアーゼ 活性は、H.ピロリureAの50%からH.フェリスureBの100%と様々で あった。後者はH.フェリスの音波処理した抽出物で免疫した動物グループで観 察された防御に匹敵した。組織学的な証拠から、H.フェリスH.ピロリのu reBサブユニットは、それぞれ免疫した動物の60%と20%を防御した。これを 、H.フェリスの音波処理した抽出物で免疫したマウスの防御のレベルが85%で あったことと比較した。組換えH.ピロリureAによるマウスの免疫は、この 動物を防御しなかった。同様に、全てのH.フェリスureAで免疫したマウス の胃には、5週目に抗原投与したものの、19週目にはH.フェリスバクテリアが かなりコロニーを形成していた(表4)。 ウレアーゼの胃の生体組織検査では、胃の組織切片の組織学的な分析に比べて 、感受性と特異性の値はそれぞれ63%および95%であった。したがって、組織学 で、マウスでのH.フェリス感染をより正確に予測できることが分かった。免疫した胃の細胞性免疫応答H.フェリスのコロニー形成の組織学的な評価に加えて、マウスの胃組織を単 核細胞応答の存在についても評価した(0から3)。MBPだけで免疫したマウ スでは、穏やかな慢性の胃炎が、筋粘膜と胃上皮粘膜下組織だけに少数の単核細 胞と共に見られた。対照的に、組換えウレアーゼポリペプチドや、H.フェリス の音波処理した調製物で免疫した動物の胃の粘膜には、多くの単核細胞が存在し た。炎症性の細胞は合体して、組織の粘膜下組織でゆるい凝集体を作るか、結節 性の構造を作り胃上皮の粘膜領域に広がった。H.フェリスureAで免疫した マウスの胃粘膜は、H.フェリスバクテリアがかなりコロニーを形成していたが 、単核細胞を僅かか、もしくは全く含まなかったので、単核細胞の応答はバクテ リアの存在とは関係がないようだった。 III−ヘリコバクター・ピロリhspA−B熱ショック遺伝子クラスター:ヌク レオチド配列、発現及び機能: ヘリコバクター・ピロリのウレアーゼ(ニッケル金属酵素)と密接な関連があ ると報告されたGroELクラスの熱ショック蛋白質(HSP)の相同体が、最 近になってDunnらとEvansらによりH.ピロリの細胞から精製された(それぞれI nfect.Immun.,60:1946,1992,1946及び2125参照)。この免疫学的に優勢な[ immunodominant]蛋白質の報告されたN末端のアミノ酸配列に基づき、H.ピロ リ85P株の染色体中のGroEL様蛋白質をコードする遺伝子(hspB)を標 的とするために、変性オリゴヌクレオチドが合成された。遺伝子増幅の後、Hs pB蛋白質の初めの36アミノ酸をコードする108塩基対断片が精製され、H.ピ ロリ.ゲノミックバンク[genomic bank]中でHspBをコードしている全遺伝 子をもつ組換えコスミドを同定するためのプローブとして用いられた。hspB 遺伝子はpILL684コスミドのBglII制限酵素切断断片の3.15キロベース(K b)に存在した。pILL570プラスミドベクターにサブクローニングされたその 断片(pILL689)の塩基配列により、hspA及びhspBと命名された2 つのオープンリーディングフレーム(OFR)の存在が明らかにされ、その構成 は他の細菌種におけるgroESLバイシストロン性オペロン[bicistroic ope rons]と非常に類似したものであった。hspA及びhspBはそれぞれ118及 び545アミノ酸のポリペプチドをコードしており、それぞれ13.0キロダルトン (kDa)及び58.2kDaの分子量に相当する。アミノ酸配列の比較研究により 以下のことが明らかとなった。i)H.ピロリのHspA及びHspB蛋白質は それらの細菌の相同物に非常に類似していた;ii)H.ピロリのHspA蛋白質 は他の細菌のGroEs相同物にはないカルボキシル基末端での顕著なモチーフ を特徴とする;この独特なモチーフは、ニッケル結合のような金属結合ドメイン に似た、一連の8個のヒスチジン残基からなる。驚くべきことに、遺伝子クラス ターのすぐ上流にIS5挿入エレメントが見いだされた。それはH.ピロリのゲ ノムには存在せず、コスミドクローニングの過程で積極的に選択されたものであ った。そのIS5はpILL689内でhspA及びhspB遺伝子の発現に関連 していることが見いだされた。pILL689プラスミドでのHspA及びHsp B蛋白質の発現は、ミニ細胞生産株にて分析された。2つのポリペプチドは大腸 菌細胞内で構成的に発現されることが示された。pILL689組換え体プラスミ ドがH.ピロリウレアーゼ遺伝子クラスターとともに大腸菌宿主株に導入される と、ウレアーゼ活性の増加が観察された。そのことは熱ショック蛋白質とウレア ーゼ酵素との間の密な相互作用を示唆する。HspAシャペロンに関する特異的 な機能の概念を支えているのは、hspBのコピーがH.ピロリゲノム内では1 つだけ見いだされる一方で、hspAのコピーはゲノム内に2つ見いだされ、そ の内の1つはhspB遺伝子にリンクし、もう1つはhspB遺伝子にリンクし ていないという事実である。H.ピロリと同遺伝子型のhsp A及びhspB遺伝子における変異株を構築する試みは不成功に終わり、このこ とはこれらの遺伝子が細菌の生存に関して必須であることを示唆する。 パートIIIの実験手順:細菌の株、プラスミド、及び培養条件 : クローニング実験はH.ピロリ85P株から調製されたゲノムDNAにより行わ れた。H.ピロリN6株は、それらが好都合な形質転換能をもつという理由から エレクトロポーレーション実験の受容株として用いられた。大腸菌HB101株も しくは大腸菌MC1061株はそれぞれコスミドクローニング及びサブクローニング の実験用宿主として用いられた。大腸菌P678-54株はミニ細胞の調製用に用いら れた。本研究に用いられたベクター及び組換えプラスミドを表1に示した。H. ピロリ株は、バンコマイシン(10mg/l)、ポリミキシンB(2,500U/I) 、トリメトプリム(5mg/l)、及びアンファテリシンB(4mg/l)を添 加したウマ血液寒天培地上で生育された。プレートはCO2発生器[carbon diox ide generator envelope](BBL70304)を備えた嫌気性ジャー内で微好気性 条件下、37℃にて培養された。大腸菌株はグルコース無添加のL−ブロース中( 1L中に10gのトリプトン、5gの酵母抽出物及び5gの塩化ナトリウム;pH 7.0)、もしくはL−寒天培地(1.5%寒天)上で37℃にて生育された。ウレアー ゼ活性測定のために用いられた窒素制限培地は、炭素源として0.4%D−グルコ ースを含み、新しく調製された濾過滅菌したL−アルギニンが最終濃度10 mMになるように加えられた、アンモニウムフリーのM9最小寒天培地(pH7. 4)よりなる。組換え体クローンの選択のための抗生物質の濃度は以下のとおり である(1L中のミリグラム):カナマイシン、20;スペクチノマイシン、100 ;カーベニシリン、100。DNAの調製 : H.ピロリ由来のゲノムDNAは、従来記述されているようにして調製した。 コスミドDNAとプラスミドDNAは、アルカリ溶菌法により調製し、引き続い て従来記述されているセシウムクロライド‐臭化エチジウム勾配により精製した 。コスミドクローニング : H.ピロリhspA−B遺伝子クラスターのクローニングに用いられた、大腸 菌HB101内でのH.ピロリ85Pのコスミド遺伝子バンクの構築は以前に示され た通りである。DNA分析及びクローニング手法 : 制限エンドヌクレアーゼ、T4DNAライゲース、DNAポリメラーゼI 大 (クレノウ)フラグメント及びTaqポリメラーゼはアマシャム[Amersham]社 から購入し、T4DNAポリメラーゼはバイオラブ[Biolabs]から、及びコウ シ腸ホスフアターゼ[calf intestinal phosphatase]はファルマシア[pharmac ia]から購入した。全ての酵素は製品の使用説明書に従って用いた。DNA断片 はトリス酢酸緩衝液の存在下で泳動させるアガロースゲル上で単離した。ベテス ダ研究所[Bethesda Research Laboratories]からの1kbのラダーを断片サイ ズ標準として用いた。必要な場合 には、DNA断片は、従来記載されるようにアガロースゲル上から電気溶出によ り単離し、イルティップデー・ミニカラム[Elutip-d minicolum](Schleicher and Schuell,Dassel,ドイツ)により移動緩衝液[migration buffer]から回 収した。基本的なDNA操作はSambrookらにより示された実験手順に従い行なわ れた。ハイブリダイゼーション : H.ピロリ・コスミド・バンクのスクリーニング及びサブクローン同定用のコ ロニーブロットは、Sambrookら(43)の実験手順に従い、ニトロセルロースメン ブラン(Schlecher and Schuell,Dassel,ドイツ)上で調製した。PCR産物 の放射活性標識は、ファルマシア社のランダムヘキサマーをプライマーとして用 い、ランダムプライミング[random priming]により行なった。コロニーハイブ リダイゼーションは非常に厳しい条件下で行なった(5×SSC、0.1%SDS 、50%ホルムアミド、42℃)(1×SSC;150mM塩化ナトリウム、15mMク エン酸ナトリウム、pH7.0)。サザンブロットハイブリダイゼーションのため に、DNA断片をアガロースゲルからニトロセルロースシートへ転写し(0.45μ mポアサイズ;Schleicher & Schuell,Inc.)、そしてあまり厳しくない条件下 (5×SSC、0.1%SDS、30%もしくは40%ホルムアミド、42℃で32P標識 されたデオキシリボヌクレオチドプローブ添加)でハイブリダイズした。ハイブ リダイゼーションはアマシャム・ハイパーフィルム−MP(Amersham Hyperfilm -MP)を用い、オートラジオグラ ィーにより示された。DNA配列決定 : プラスミドDNAの適当な断片をM13mp18/19ベクターにサブクローニング した。1本鎖のDNAを大腸菌JM101株のファージ感染により調製した。配列 決定は、アメリカ合衆国バイオケミカルシークエナーゼキット[United States Biochemicals Sequenase kit]を用い、ジデオキシヌクレオチド鎖終結法により 行なった。M13ユニヴァーサルプライマー[M13 universal primer]と補助的な 特異的プライマーの両方(図1)を、コーディングおよびノンコーディングDN A鎖の双方の配列決定に用いた。2本鎖DNAの配列決定は従来記述される通り に行なった。PCR産物の直接配列決定[direct sequencing]を、増幅し、電 気溶出したPCR産物をイルティップデー・ミニカラム(Schleicher and Schue ll)に通して精製した後に行なった:シークエナーゼ・キットを用いた配列決定 に関する標準的な手順は以下の改良を加えてから用いられた:PCR産物は、プ ライマーとして200ピコモルのオリゴヌクレオチドを含み、最終濃度を1%とす るDMSOを含むアニーリング混合物を3分間煮沸することにより変性した;そ の混合物はすぐに氷上で冷却した;標識段階はマンガンイオン(mM)の存在下 で行なった。H.ピロリのエレクトロポーレーション : H.ピロリ変異株構築のための試みにおいて、カナマイシン耐性遺伝子(ap h3′-III)を含むカセットで分断された標的遺伝子を持つ適当なプラスミド構 造物で、従来記載され ているエレクトロポーレーション手法により、H.ピロリN6株を形質転換した 。カナマイシンで分断されたflaA遺伝子をもつプラスミドpSUS10をエレ クトロポーレーションのポジテイブコントロールとして用いた。エレクトロポー レーションの後、抗生物質耐性を発現させるためバクテリアを非選択培地にて48 時間生育し、その後カナマイシン含有培地へ移した。選択培地では6日目まで培 養した。ポリメラーゼ・チェイン・リアクション(PCR) : PCRは、パーキンエルマー・シータス・サーマルサイクラー[Perkin-Elmer Cetus ihermal cycler]を使用したジーンアンプキツト[GeneAmp kit](Perk in-Elmer celus)を用いて行なった。標準的な増幅反応は、50ピコモルの各プラ イマーと少なくとも5ピコモルの標的DNAを必要とする。標的DNAは増幅反 応に加えられる前に熱変性させた。反応は以下に示す3つの段階の25サイクルか ら構成された:変性(94℃、1分間)、アニーリング(算出されたプライマーの 融解温度[melting temperatures]により、42℃から55℃の範囲の温度で、2分 間)、伸長(72℃、2分間)。変性されたオリゴヌクレオチドを厳しくない条件 下で用いた場合には、それぞれのオリゴヌクレオチドは1000ピコモルまで加え、 50サイクル実行し、アニーリングは42℃で行なった。 ミニ細胞)内で発現した蛋白質の分析: 適当なハイブリッドプラスミドを有するミニ細胞を単離し、[35S]メチオニ ン(50μCi/ml)で標識した。アセトン沈殿性物質約100,000cpmを12.5 %のゲルでドデシル硫 酸ナトリウム(SDS)−ポリアクリルアミドゲル電気泳動にかけた。94,000か ら14,000までの範囲の分子量をもつ標準蛋白質(Bio-Rad Laboratories社の低〈 分子量キット[low<molecular-weights kit])を並行に流した。ゲルを染色し 、En3 Hance(New England Nuclear)を用いて蛍光間接撮影法により検査した。ウレアーゼ活性 : ウレアーゼ活性は従来記載されている手法に修正を加え、ベルテロット[Bert helot]反応により定量した。ウレアーゼ活性は細菌の蛋白質のミリグラム当り 、1分間に加水分解される尿素のマイクロモルとして示した。 パートIII実験の結果:ヘリコバクター・ピロリのGroEL様熱ショック蛋白質をコードする遺伝子を 持つ組換え体コスミドの同定 : H.ピロリの精製熱ショック蛋白質の公表されたN末端のアミノ酸配列を基に 、2つの変性されたオリゴヌクレオチドを、H.ピロリ85P株の染色体中の目的 の遺伝子を標的とするために合成した。初めの1つは5′-GCNAARGARATHAA RTTYT CNG-3′である。ここでNは4つのヌクレオチドを表し、RはAとGを、YはT とCを、HはT、C及びAを表す。このオリゴヌクレオチドは蛋白質(AKEIKFSD )の初めの8アミノ酸に由来する;2番目は5′-CRTTNCKNCCNCKNGGNCCCAT-3′で ある。ここでKはGとTを表し、それは29番目から36番目のアミノ酸を指定する 相補的なコドン(MGPRGRNV,参照)に相当する。PCR産物について期待される 大きさは108塩基対(bp) であった。増幅反応は、“材料と方法”の項で示された、あまり厳しくない条件 下で行なわれ、400bpから100bpまでの範囲の大きさを持つ6つの断片が合成 された。3つの最も小さな断片をアクリルアミドゲルから電気溶出し、精製した 。PCR産物の直接配列決定により、公知の配列に相当するアミノ酸をコードす るDNA断片の同定が可能となった。そこで、この断片を標識し、H.ピロリの GroEL様蛋白質をコードする遺伝子の5´部分と相同性を示す組換え体コス ミドを同定するために、コロニーハイブリダイゼーションにおけるプローブとし て用いた;さらにこの遺伝子はhspBと名付けられた。遺伝子バンクは、組換 え体コスミドを持つ400個の独立したカナマイシン耐性大腸菌形質導入体からな る。それらのうち、1つの単一コロニーがプローブとハイブリダイズした。それ はpILL684と命名された組換えプラスミドを持ち、その大きさは46kbであ った。hspB遺伝子を検出する際に見られた低い頻度(400分の1)は、幾つ かのクローン化された遺伝子が5から7個の組換え体コスミドで確実に検出され るのと比較すると異常なものであった。hspB遺伝子を同定するために、3k bから4kbまでの大きさを持つ断片をエンドヌクレアーゼSau3Aによるp ILL684コスミドDNAの部分制限により生成させ、精製し、プラスミドベク ターpILL570のBglII部位に連結した。100個のサブクローンのうち、xが ポジティブクローンであった。このうち1つをさらに研究した(pILL689) ;それは2つのBglII制限酵素サイトにより広げられた3. 15kbのインサートを持ち、その部分は詳細にマップされた(図5参照)。PC R32P標識されたプローブを用いることにより、hspB遺伝子の5´末端がp ILL689の632bpのHindIII−SphI中央の制限酵素断片に存在するこ とが見い出された。これは、pILL689組換え体プラスミド中にhspBの全 遺伝子が存在することを期待できることを示している。H.ピロリのhspA−B遺伝子群のDNA配列及びそれにより推定されたアミ ノ酸配列 : 図5で示された3200bpのpILL689は、非対称的な制限酵素断片であるB glII−SphI、SphI−HindIII、HindIII−BglIIをM13mp 18及びM13mp19にクローニングすることにより配列決定した:それぞれのクロ ーン化された断片は二本鎖のそれぞれで別々に配列決定した。16個のオリゴヌク レオチドプライマー(図1)を、解読の確認をするため、及び/または別々に配 列決定された断片をオーバーラップする配列を作製するために合成した;これら は2本鎖DNAの配列決定分析におけるプライマーとして用いた。 配列の分析により、2つの明確な遺伝子的な因子が明らかにされた。第1は、 図5で示された同じ方向に転写される2つのオープンリーディングフレーム(O RF)の存在である。それらはhspA及びhspBと命名された;この2つの ORFのヌクレオチド配列とそれにより予測されるアミノ酸配列を図6に示した 。hspAの第一番目のコドンはpILL 689のHindIIIの左方向323bp上流で始まる(図5)。そしてそれはシャイ ン−ダルガーノ・リボゾーム結合部位(RBS)(GGAGAA)により先導されてい る。hspAORFは118アミノ酸のポリペプチドをコードしている。hspB ORFの初めのコドンはhspA終始コドンの25塩基下流で始まる;それはR BS部位(AAGGA)により先導されている。hspB ORFは545アミノ酸のポ リペプチドをコードしており、rho−独立[rho-independent]転写ターミネ ーター(自由エネルギー、△G=−19.8Kcal/mol)に類似したパリン ドローム配列に引き続くTAAコドンにより終了する(図6)。予測されるHs pB蛋白質のN末端のアミノ酸配列は、既に公知である精製されたH.ピロリの 熱ショック蛋白質のN末端配列と、N末端のメチオニンを除いては同一であった 。そのメチオニンは精製された蛋白質には欠けており、転写後に除去されるのか もしれず、その結果成熟蛋白質は544個のアミノ酸よりなるかもしれない。 H.ピロリHspA及びHspBの推定されるアミノ酸配列をGroESやG roELクラスのHspの幾つかのアミノ酸配列と比較した(図7)。HspB はアミノ酸レベルでレジオネラ.ニュウモフィラ[Legionella pneumophila]H tpB蛋白質(82.9%の類似性)、大腸菌GroEL蛋白質(81.0%の類似性) 、クラミジア・プシタッキ[Chlamydia psittaci]もしくはクラミジア・トラコ マティス[C.trachomatis]のHypB蛋白質(79.4%の類似性)、及びクロス トリジウム・パーフリンゲンス[Clostridium perfringens]のHsp60蛋白質(80.7%の類似性)との間で高い相同性を示し 、マイコバクテリウムのGroEL様蛋白質に対しては低い類似性を示した。し かしながら、ほとんど全てのGroEL相同体と同様に、H.ピロリHspBは 、最近になって大腸菌GroELシャペロニン内で必須ではないことが示された 、カルボキシル基末端のグリシン−メチオニンモチーフ(MGGMGGMGGMGGMM)を保 存していることが証明された。H.ピロリHspA蛋白質と他のGroES様蛋 白質との間の、アミノ酸レベルでの相同性の程度を図7に示した。示された配列 は、H.ピロリHspA蛋白質のカルボキシルキ末端では他の細菌のGroES 相同体には欠如している顕著なモチーフが特徴的であることを示している。この 独自に高度に保存されたモチーフは、2つのシステイン残基間の2箇所でループ を形成することができる、27個の付加的なアミノ酸より構成される;27個のアミ ノ酸のうち、8個はヒスチジン残基であり、それらは金属結合ドメインを強く示 唆する。 配列決定分析により明らかにされた第2の遺伝子的な因子は、hspA遺伝子 の84bp上流での挿入配列(IS5)の存在であった。このエレメントの塩基配 列は、IS5のそばに位置する2つの逆方向反復配列のうちの1つに相当する16 個の塩基配列(CTTGTTCGCACCTTCC)が存在する点において、大腸菌内のIS5に 関して従来記載されているものと完全に一致していた。DNAレベルで完全に一 致したことから、我々はこのIS5はH.ピロリ染色体に初めから存在していた ものでなく、むしろクローニング過程でhspA−HspB遺伝子クラスターの 上流に挿入されたという仮説を推測した。ただし、この仮説はさらなる分析によ り確かめられる必要がある。H.ピロリ染色体中のhspA−B遺伝子クラスターの上流配列の同定 : i)H.ピロリ85P株の染色体中、ii)初めのコスミドpILL684中、及びi ii)PILL684組換え体コスミドのSau3A部分的制限酵素分解の結果生じ た100個のサブクローン中の推定配列を標的とするために、2つのオリゴヌクレ オチドを用いた遺伝子増幅によりIS5の存在を検査した。その2つのオリゴヌ クレオチドの1つはIS5エレメントの内部に存在するもので、もう1つはIS 5エレメントの下流に存在するものである(オリゴ#1及び#2、図6)。IS 5はH.ピロリの染色体には存在せず、コスミドpILL684を有する大腸菌株 のごく初期のサブカルチャー中に存在していた。IS5配列の全部もしくは一部 を含んでいると推定される100個のpILL684サブクローン誘導体において、我 々はIS5の左末端に加えて、元来のhspA−hspB遺伝子クラスターの上 流配列を見つけた。このスクリーニングは、異なったSau3Aで部分的に生成 されたサブクローンの制限酵素分析をすることにより行なった。これらの基準を 満たしているプラスミドの1つ(pILL694)の制限酵素地図を図5に示す。 IS5の左末端側のヌクレオチド配列が決定された;IS5エレメントの16bp の逆方向反復配列 の両端における4bpの重複CTAAの存在(図6)により、我々は、IS5エレメ ントは転移により最近取り込まれたことを確信することができた。その後、IS 5エレメントのすぐ上流に位置する245個のヌクレオチド配列を決定した(図6 に示す)。この配列は非コード領域からなり、その中には推定される共通の熱シ ョックプロモーター配列[heat shock promoter sequence]の存在が検出された ;そこには完全に保存された-35領域(TAACTCGCTTGAA)と、一致の程度が低い-1 0領域(CTCAATTA)が存在した。組換え体コスミド中に存在するIS5エレメン トの両端に位置する配列に対応する2つのオリゴヌクレオチド(図2に示される #3と#4)を合成した;これらの2つのオリゴヌクレオチドはIS5配列が存 在する場合にはXXXXbpの断片を増幅させるはずであり、IS5が存在しない場 合にはある断片を増幅させるはずである。標的DNAとしてpILL684コスミ ド、pILL694プラスミド、及びH.ピロリ85P株染色体を用いたPCR反応 の結果は予測に適合した(結果は記載せず)。さらにH.ピロリ染色体から得ら れたPCR産物の直接配列決定を行ない、図6(B)に示される再構築されたh spA−hspB上流配列が確認された。配列決定された全ての領域の遺伝子構 成をさらに確認にするために、オリゴヌクレオチドの#5及び#6、並びに#7 及び#8(図6)を用い、プラスミドpILL689の遺伝子を増幅することによ り2つのプローブを調製した;それらを、H.ピロリ85P株染色体のHindII I制限酵素消化物に対するあまり厳しくない条件下でのサ ザンハイブリダイゼーション実験において、プローブとして用いた。その結果、 クローニング過程において検出可能な転位は他には存在しないことが明らかとな った(データは記載せず)。これらの実験により、H.ピロリ85P株の染色体中 にhspB遺伝子は1つしか存在しないのに対して、サザンハイブリダゼーショ ンによりhspA遺伝子の2つのコピーが検出されることを我々は示し得た。ミニ細胞中で発現するポリペプチドの分析 : pILL689組換えプラスミドとpILL692組換えプラスミド及びそれぞれの クローニングベクターpILL570とpACYC177が、ミニ細胞生産株である大 腸菌p678-54への形質転換により導入された。pILL689とpILL692プラス ミド(図5)は、2つのベクターにクローン化された、同じ3.15kbのインサー トを有する。pILL570はポリクローニングサイトの上流に転写及び翻訳の終 結点をもつ;pILL689内でのインサートの向きは、転写の終結点がIS5断 片の上流に位置し、従ってhspA及びhspB遺伝子の上流に位置するような 方法で作製された。見かけ上の分子量が60kDaと14kDaであるポリペプチド と同様に泳動した2つのポリペプチドがミニ細胞実験においてpILL689及び pILL692から明らかに検出されたが(結果は示さず)、一方それらは当該の ベクターからは検出されなかった;これらの結果により、hspA及びhspB 遺伝子はIS5エレメント内に位置するプロモーターから構造的に発現している ことが示された。さらに、SDSゲル上で視認されたポリ ペプチドの量はそれぞれのベクターのコピー数に十分に一致していたが、一方で 、2つのポリペプチドのバンドの強度は2つの遺伝子のポリシストロン性転写[ polycistronic transcription]を示唆していた。HspA及びHspB蛋白質の役割を理解するための試み : 大腸菌内のプラスミドpILL686及びプラスミドpILL691のhspA遺伝 子もしくはhspB遺伝子内に、従来記述されているKmカセットを挿入するこ とにより、遺伝子を2箇所で分断した。これは、エレクトロポーレーションによ りH.ピロリ内で分断された遺伝子を元に戻すため、そして対立遺伝子の置換に 関して選択するために行なった。結果として生じたpILL696プラスミドは、 C末端のアミノ酸配列の欠失に相当する、一部が欠けた形態のHspA蛋白質を コードしていた;そのプラスミドにおいて、Kmカセットは、Km遺伝子のプロ モーターがhspBの下流遺伝子のプロモーターとして働くような方法で挿入さ れた。pILL687プラスミドとpILL688プラスミドは、hspB遺伝子内で Kmカセットをいずれかの向きで挿入することにより生じた。精製されたpIL L687プラスミド、pILL688プラスミド及びpILL696プラスミド(表2、 図5)をエレクトロポーレーション実験に用いた際には、これらのどの構築物か らも、H.ピロリN6株のカナマイシン形質転換株を単離することはできなかっ た。一方ポジティブコントロールとして用いられたpSUS10プラスミドでは常 に単離することができた。これらの結果により、H.ピロリのHspA 及びHspB蛋白質はH.ピロリの生存に必須な蛋白質であることが示唆された 。 i)文献におけるHspB蛋白質とウレアーゼサブユニットとの密接な関連性 についての一定の記述;ii)ニッケル結合ドメインを連想させるC末端配列を有 するHspA蛋白質の独特な構造;及びiii)H.ピロリの生育可能なhspA 及びhspB変異株が存在しないことのため、我々は大腸菌内で機能相補実験に より、H.ピロリのウレアーゼとの関係におけるH.ピロリのHsp蛋白質の役 割を示すことを試みた。ウレアーゼ遺伝子クラスターをコードしているプラスミ ドpILL763もしくはプラスミドpILL753(両方ともpILL570の誘導体 、表5)を、ミニ細胞内で視認されるように構造的にHspA及びHspBポリ ペプチドを発現する共存可能なpILL692プラスミド(pACYC177誘導体) と共に導入した。どちらの相補実験においても、同じ大腸菌内でHspA及びH spB蛋白質が発現することにより、制限された窒素源として10mM L-アルギ ニンが添加された最小培地で、ウレアーゼ遺伝子の誘導に引き続いてウレアーゼ 活性が3倍以上増加することが観察された。 IV−H.ピロリHSPA及びHSPBの発現、精製及び免疫原性 パートIVの実験手順:組換え融合蛋白質の発現と精製 : “結果”の項で示したようにpMAL−c2ベクター内への2つの遺伝子のク ローニングに引き続いて、以下に示すプライマーを用いてMalE−HspA及 びMalE−HspB融合蛋白質を発現させた。 グルコース(30%)とアンプシリン(100μg/ml)を含む2Lのルリア培 地に、融合プラスミドを含む一晩培養したMC1061株20mlを接種し、37℃で震 盪培養した。培養液のOD600が0.5に達した時、IPTG(最終濃度で10mM) を添加し、細胞をさらに4時間インキュベートした。細胞を遠心分離(5000rp m、30分間、4℃)により集め、プロテアーゼ阻害剤[ロイペプチン(2μM) −ペプスタチン(2μm)−PMSF(1mM)−アプロチニン(1:1000希釈 )]が添加された、10mMトリス−HCl、200mMNaCl、1mM EDT Aから成る100mlのカラム緩衝液に再懸濁し、フレンチプレスに通した。遠心 分離(10,000rmp、20分間、4℃)後、上澄み液を回収し、カラム緩衝液で希 釈した(2倍)。予め平衡に達したアミロース樹脂 (22×2.5cm)にのせる前に、溶解物を0.2μmのニトロセルロースフィルター に通した。カラム緩衝液にて調製された10mMマルトースを用いて融合蛋白質を 溶出して、融合蛋白質を含む画分を貯留し、蒸留水で透析し、凍結乾燥した。融 合蛋白質をml当り凍結乾燥物2mgの最終濃度で蒸留水に再懸濁させ、−20℃ で保存した。調製物の濃度と純度は、ブラッドフォルド蛋白質分析[Bradford p rotein assay](sigma Chemicals)とSDS−PAGE分析により制御した。組換え蛋白質のニッケル結合の特性 : pMAL−c2ベクターもしくは誘導組換えプラスミドのいずれかを含んでい る大腸菌MC1061細胞を、カーベニシリン存在下(100μg/ml)、100mlの ルリアブロス中で生育した。遺伝子の発現はIPTGを用いて4時間誘導した。 細胞を遠心分離し、そのペレットを2mlの緩衝液A(6M塩酸グアニジン、0. 1M NaH2PO4、0.01トリス、pH8.0)に再懸濁した。室温で1時間穏やか に撹拌した後、この懸濁液を10,000g、15分間、4℃で遠心分離した。予め緩衝 液Aで平衡に達しているニッケル-ニトリロ三酢酸樹脂(Nickel-NTA,QIA expre ss)のアリコート1.6mlを上清に加え、この混合物をカラムにのせる前に室温 で1時間撹拌した。カラムは20mlの緩衝液A、次いで30mlの緩衝液B(8M 尿素、0.1Mリン酸ナトリウム、0.01Mトリス−HCl、pH8.0)で洗浄した。 蛋白質は、pH6.3(緩衝液C)、pH5.9(緩衝液D)及びpH4.5(緩衝液E )に 調整された緩衝液Bと同等の緩衝液、並びに緩衝液F(6M塩酸グアニジン、0. 2M酢酸)で連続的に溶出した。それぞれの画分の15μlを50μlのSDS緩衝 液と混合し、SDSゲル上にのせた。ヒト血清 : 血清サンプルは40個体から得られた。そのうち28サンプルは、H.ピロリの培 養で陽性であることと生検の組織学的な考察によりH.ピロリ感染患者であるこ とが確認され、12サンプルは未感染患者であった。この血清は、R.J.Adamek( Bochum大学、ドイツ)の好意により提供を受けた。イムノブロッティング : ミニ・プロテインII・エレクトロフォレシス・セル[Mini PROTEAN II electr ophoresis cell]中でのSDS−PAGEが終了した時点で、1時間、I00Vに 調節されたミニ・トランスブロット・トランスファー・セル[Mini Trans-Blot transfer cell](Bio-Rad)で蛋白質をニトロセルロース紙に(冷却しながら) 転写した。免疫学的染色[immunostaining]を、反応産生物を視認するためにE CLウェスタン・ブロッティング検出システム(Amersham)を用いたことを除い て、従来記述されているように(Ferreroら,1992)行なった。H.ピロリ85P 株の全細胞抽出液に対して生じたヒト血清とウサギ抗血清を、リン酸緩衝溶液( PBS、pH7.4)中に調製された1%(w/v)カゼインで1:1000及び1:5 000にそれぞれ希釈した。血清学的方法[固相酵素免疫測定法(ELISA)] : 以下の量の抗原を96穴プレート(Falcon 3072)に吸収させた:2.5μgの蛋白 質MalE、5μgのMalE−HspA、もしくは2.5μgのMalE−Hs pB。プレートを一晩、4℃にて放置し、その後ELISA洗浄溶液(EWS) [0.05%(v/v)のトゥィーン20[Tween 20]を含む1%のPBS]で3回洗 浄した。プレートを、1%の粉末ミルクを添加されたEWS中において、37℃で 、90分間インキュベーションすることにより飽和させた。ウェルを再びEWSで 3回洗浄し、その後振とう条件下において、ヒト血清(0.5%粉末ミルクを含む EWSで1:500希釈)の存在下で37℃、90分間穏やかに撹拌した。結合した免 疫グロブリンは、ストレプトアビジン−ペルオキシダーゼ(1:500)(Kirkega ard and Perry Lab.)と組み合わせたビオチニル化2次抗体(0.5%の粉末ミル クを添加したEWS中に希釈(1:1000)されたヤギの抗ヒトIgG、IgAも しくはIgM)と共に37℃で、90分間インキュベートすることにより検出した。 結合したペルオキシダーゼは、基質であるクエン酸塩と過酸化水素との反応によ り検出した。プレートを暗条件下で室温にてインキュベートし、ELISAプレ ートレーダーで5分、15分、30分間隔で492nmでの吸光度を読み取った。30分 後、最終濃度0.5Mになるまで塩酸を添加することにより反応を停止させた。 パートIV実験の結果:誘導しうるMalE−HspA及びHspB融合蛋白質を生産する組換えプラス ミドの構築 : hspA及びhspBの全遺伝子をPCRにより増幅するために、オリゴヌク レオチド#1と#2(hspA)及び#3と#4(hspB)をそれぞれ用いた 。PCR産物を電気溶出し、精製し、EcoRIとPstIで切断した。切断に より生じた断片(それぞれ大きさとして360bp及び1600bp)を、次にそれぞ れpILL933とpILL934と命名されたプラスミドを生じさせるために、Ec oRI−PstIにより切断されたpMAL−c2ベクターに連結させた。IP TGによる誘導とアミロースカラム上での可溶性蛋白質の精製の後、予測された 大きさの融合蛋白質(pILL933に関しては55kDa[図17]、及びpILL9 34に関しては100kDa)がSDS−PAGE上で視覚化された。これらの各々 は、MalE蛋白質とHspポリペプチドのそれぞれの2番目のアミノ酸との融 合に相当する。融合蛋白質の発現収量は、2リットルのブロス培養液から調製さ れた場合、MalE−HspAについては100mgであり、MalE−HspB については20mgであった。HspA及びHspB融合蛋白質の抗原性、並びにH.ピロリに感染した患者に おけるHspA及びHspBの免疫原性の研究 : この融合蛋白質が依然として抗原性を有するか否かを決定するために、Mal E蛋白質とH.ピロリ85P株の全細胞の抽出液に対して生じたウサギ抗血清を用 いたウェスタンブロットによりそれぞれを分析した。どちらの融合蛋白質も、M alEに対する抗体(結果は示さず)、及び抗−H.ピロリ 抗血清に対して免疫反応があった。抗−H.ピロリ抗血清は精製されたMalE 蛋白質を認識しなかった(図18)。これらの結果により、融合蛋白質はそれらの 抗原性を維持していることが示された;さらに、HspB蛋白質が免疫原性であ ることは知られているものの、HspAそれ自体がウサギにおいて免疫原性であ るというこの事実はここで初めて示された。 同様の方法で、HspA及びHspBポリペプチドがヒトにおいて免疫原性で あるか否かを決定するために、ウェスタン・イムノブロッティング・アッセイと 固相酵素免疫測定法(ELISA)によりH.ピロリに感染した患者におけるH spA及び/またはHspBに対する体液性免疫応答を分析し、感染していない 患者のそれと比較した。H.ピロリ−陰性のヒトの12の血清のうち、MalE、 MalE−HspA、もしくはMalE−HspB蛋白質で陽性免疫ブロットシ グナルを示したものはなかった。対照的に、H.ピロリ−陽性患者の28の血清の うち、12(42.8%)がHspA蛋白質と反応し、20(71.4%)がHspB蛋白質 を認識した。HspAを認識した血清の全てがHspBとも反応した。免疫応答 とH.ピロリ感染についての臨床上の兆候との間には何の関連性も示されなかっ た。但し、分析された株の数が少ないので、このような結論は時期尚早であるか もしれない。融合MalE−HspA蛋白質のニッケル結合特性 : IPTGでの誘導に引き続いて発現したMBP−HspA組換え蛋白質を、ニ ッケル親和性カラムでの一段階精製によ り細胞全体の抽出液から精製した。これに対して、MBP単独及びMBP−Hs pBはこの特性を示さなかった。図18は、pH6.3でモノマーとして、またpH4 .5でモノマーとして溶出されたMBP−HspA蛋白質の一段階精製を示す。パ ネル7で見られる独特のバンドとパネル5で見られる2つのバンドは、ともに抗 HspAウサギ血清により特異的に認識された。これは、融合MBP−HspA 蛋白質のニッケル結合特性が、ヒスチジンとシステイン残基が豊富であるHsp AのC末端の配列に起因するかもしれないことを示唆した。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C12P 21/02 9452−4B C12P 21/02 C 21/08 9358−4B 21/08 C12Q 1/68 9453−4B C12Q 1/68 A G01N 33/569 8310−2J G01N 33/569 F 33/574 8310−2J 33/574 Z (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),AU,CA,JP,KR,U S (72)発明者 シュールボーム、セバスチャン フランス国、75116 パリ、リュ・スポン ティーニ 40 (72)発明者 フェレーロ、リシャール フランス国、75013 パリ、アブニュ・ デ・ゴブラン 60 (72)発明者 ティベルジュ、ジャン − ミッシェル フランス国、78270 プレシール、リュ・ デゥ・ラ・フェロヌリー 15、アパルトマ ン 532

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. ヘリコバクター感染に対する抗体を誘発し得る免疫組成物であって、 i)ヘリコバクター・ピロリ由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの少なくとも 1つのサブユニット、もしくはヘリコバクター・フェリスウレアーゼと反応する 抗体によって認識されるそれらの断片、および/またはヘリコバクター・フェリ 由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの少なくとも1つのサブユニット、もしく はヘリコバクター・ピロリウレアーゼと反応する抗体によって認識されるそれら の断片; ii)および/またはヘリコバクター由来の熱ショック蛋白質(HSP)、すな わちシャペロニン、もしくは該蛋白質の断片、 を含有することを特徴とする免疫組成物。 2. 防御抗体を誘発し得る請求の範囲第1項記載の免疫組成物。 3. プラスミドpILL205(CNCM I−1355)ureAおよび/またはureB 遺伝子によってコードされるヘリコバクター・フェリスウレアーゼ構造 ポリペプチド、該ポリペプチドと少なくとも90%の相同性を示すポリペプチド、 または少なくとも6個のアミノ酸を有し、ヘリコバクター・ピロリウレアーゼと 反応する抗体によって認識されるそれらの断片を含み、あるいはそれらからなる 成分(i)を包含する請求の範囲第1項記載の免疫組成物。 4. ヘリコバクター・ピロリ由来のHSP、またはそれら の断片である成分(ii)を包含することを特徴とする請求の範囲第1項記載の免 疫組成物。 5. HSPが、プラスミドpILL689(CNCM I−1356)のhspAお よび/またはhspBによって各々コードされるHSP Aおよび/またはHS P B、または該HSPと少なくとも75%の相同性を示すポリペプチド、または 少なくとも6個のアミノ酸を有する、これらの蛋白質のいずれかもしくは両方の 断片であることを特徴とする請求の範囲第1項ないし第4項のいずれか1項に記 載の免疫組成物。 6. ヘリコバクター感染、特にヘリコバクター・ピロリおよびヘリコバクター ・フェリス に対する防御においてワクチンとして用いられる医薬組成物であって 、生理学的に許容し得る賦形剤および、可能であればアジュバントとの組合せで 、請求の範囲第1項ないし第5項のいずれか1項に記載の免疫組成物を包含する ことを特徴とする医薬組成物。 7. プラスミドpILL205(CNCM I−1355)のウレアーゼ遺伝子クラ スターによってコードされるヘリコバクター・フェリスポリペプチドの少なくと も1つを含むことを特徴とする蛋白質様物質であって、構造およびアクセサリー ウレアーゼポリペプチド、または該ポリペプチドと少なくとも90%の相同性を有 するポリペプチド、またはそれらの断片を含む蛋白質様物質。 8. 図3に示されるureAおよび/またはureBの遺伝子産生物、または 少なくとも6個のアミノ酸を有する断片、もしくは少なくとも90%の相同性を有 する該遺伝子産生物の 変異体からなり、またはこれらを包含することを特徴とする請求の範囲第7項記 載の蛋白質様物質であって、該断片および該変異体が、ヘリコバクター・ピロリ ウレアーゼと反応する抗体によって認識される蛋白質様物質。 9. 図9に示されるureIの遺伝子産生物、または少なくとも6個のアミノ 酸を有するそれらの断片、または少なくとも75%の相同性を有する該遺伝子産生 物の変異体からなり、あるいはそれらを包含する請求の範囲第7項記載の蛋白質 様物質であって、該断片および該変異体が、残余のウレアーゼ“アクセサリー” 遺伝子産生物の存在下において、ureAおよびureB遺伝子産生物を活性化 する能力を有する蛋白質様物質。 10. (i)請求の範囲第6項ないし第9項のいずれか1項に記載される蛋白質 様物質をコードする少なくとも1つの配列; または(ii)配列(i)に相補的な配列; または(iii)過酷な条件下において、配列(i)もしくは(ii)とハイブリダ イズし得る配列; または(iv)少なくとも10個の保全ヌクレオチドを含む配列(i)、(ii)もし くは(iii)のいずれかの断片、を包含することを特徴とする核酸配列。 11. プラスミドpILL205(CNCM I−1355)の配列、例えば図3の配 列、特にureAの遺伝子産生物およびureBをコードする配列、または図9 (ureI)の配列、または過酷な条件下でこれらの配列とハイブリダイズし得 る配列、またはこれらの配列に相補的な配列、またはこれらの 配列の少なくとも10個の保全ヌクレオチドを含む断片を包含することを特徴とす る請求の範囲第9項記載の核酸配列。 12. 請求の範囲第10項または第11項に記載の核酸配列を包含することを特徴と する発現ベクター。 13. プラスミドpILL205(CNCM I−1355)。 14. 核酸増幅反応におけるプライマーとしての利用に適しているオリゴヌクレ オチドであって、請求の範囲第10項または第11項に記載の配列の10ないし100個 の保全ヌクレオチドを包含することを特徴とするオリゴヌクレオチド。 15. 適切な標識手段を有する、請求の範囲第9項または第10項のいずれか1項 に記載の配列を包含することを特徴とするヌクレオチドプローブ。 16. 請求の範囲第12項または第13項に記載の発現ベクターによって安定に形質 転換された原核もしくは真核宿主細胞。 17. ヘリコバクター・ピロリの熱ショック蛋白質(HSP)、すなわちシャペ ロニンの少なくとも1つ、またはそれらの断片を包含することを特徴とする蛋白 質様物質。 18. 図6に示されるアミノ酸配列を有するHSP Aおよび/またはHSP B、または該ポリペプチドと少なくとも75%、好ましくは少なくとも80%の相同 性を有するポリペプチド、または少なくとも6個のアミノ酸を有するそれらの断 片を包含し、あるいはそれらからなることを特徴とする請求の範囲第17項記載の 蛋白質様物質。 19. HSP A C−末端配列: または少なくとも6個の保全アミノ酸を有するこの配列の断片を包含し、あるい はそれらからなることを特徴とする請求の範囲第18項記載の蛋白質様物質。 20. (i)請求の範囲第17項ないし第19項のいずれか1項に記載される蛋白質 様物質、または請求の範囲第7項ないし第9項に記載の蛋白質様物質をコードす る配列; または(ii)配列(i)に相補的な配列; または(iii)過酷な条件下において、配列(i)もしくは(ii)とハイブリダ イズし得る配列; または(iv)少なくとも10個のヌクレオチドを含む配列(i)、(ii)もしく は(iii)のいずれかの断片、 を包含することを特徴とする核酸配列。 21. プラスミドpILL689(CNCM I−1356)の配列の全部もしくは一 部、例えば図6の配列、特にはHSP Aおよび/またはHSP Bをコードす る配列、または該配列に相補的な配列、または過酷な条件下で該配列とハイブリ ダイズし得る配列、またはそれらの断片を包含することを特徴とする請求の範囲 第20項記載の核酸配列。 22. 請求の範囲第20項または第21項に記載の核酸配列を包含することを特徴と する発現ベクター。 23. プラスミドpILL689(CNCM I−1356)。 24. 核酸増幅反応におけるプライマーとしての利用に適したオリゴヌクレオチ ドであって、請求の範囲第20項または第21項に記載の配列の10ないし100個の保 全ヌクレオチドを包含することを特徴とするオリゴヌクレオチド。 25. 適切な標識手段を有する、請求の範囲第20項または第21項のいずれか1項 に記載の配列を包含することを特徴とするヌクレオチドプローブ。 26. 請求の範囲第22項または第23項に記載の発現ベクターによって安定に形質 転換されている微生物。 27. 請求の範囲第8項ないし第10項のいずれか1項に記載の蛋白質様物質にた いするモノクローナルもしくはポリクローナル抗体、またはそれらの断片であっ て、ヘリコバクター・フェリス物質に対して特異的であるか、あるいはヘリコバ クター・ピロリ のウレアーゼ遺伝子クラスターの遺伝子産生物と交叉反応するか のいずれかであることを特徴とする抗体またはそれらの断片。 28. ヘリコバクター・フェリス ureAおよび/またはureB遺伝子産生 物、並びにヘリコバクター・ピロリ ureAおよび/またはureB遺伝子産 生物の両者を認識することを特徴とする請求の範囲第27項に記載のモノクローナ ルまたはポリクローナル抗体。 29. 請求の範囲第17項または第18項に記載の蛋白質様物質に対するモノクロー ナルもしくはポリクローナル抗体またはそれらの断片であって、ヘリコバクター ・ピロリ 物質に特異的であるか、あるいはヘリコバクター以外のバクテリアに由 来するGroEL様蛋白質もしくはGroES様蛋白質と交叉反応するかのいず れかであることを特徴とする抗体またはそれらの断片。 30. HSP A C−末端配列を特異的に認識することを 特徴とする請求の範囲第29項に記載のモノクローナルもしくはポリクローナル抗 体。 31. ヒトおよび動物における使用に適した、ヘリコバクター感染、特にヘリコ バクター・ピロリ およびヘリコバクター・フェリスに対するワクチンの調製への 、請求の範囲第1項に記載の免疫組成物の使用。 32. ヒトまたは動物での、ヘリコバクター、特にヘリコバクター・ピロリ リコバクター・ヘイルマンニー およびヘリコバクター・フェリスによる感染を治 療するための治療組成物における、請求の範囲第27項ないし第30項に記載の抗体 の使用。 33. 請求の範囲第6項に記載の医薬組成物の製造方法であって、請求の範囲第 16項記載の形質転換された微生物、および任意に請求の範囲第26項記載の微生物 、を培養し、ヘリコバクターウレアーゼポリペプチド物質、および適用可能であ る場合にはHSP物質をも収集して精製し、かつこれらの物質を適切な賦形剤、 アジュバントおよび、任意に、他の添加剤と組合わせることを特徴とする製造方 法。 34. 任意に遺伝子増幅反応を行なった後の、生物学的試料におけるヘリコバク ター による感染のイン・ビトロ検出への、請求の範囲第15項ないし第25項のいず れか1項に記載のヌクレオチド配列の使用。 35. ヘリコバクター感染のイン・ビトロ検出のためのキットであって: −請求の範囲第15項または第25項に記載のヌクレオチドプ ローブ; −ヘリコバクターの核酸と該プローブとのハイブリダイゼーション反応を行な うための適切な培地; −形成されるあらゆるハイブリッドを検出するための試薬、を包含することを 特徴とするキット。 36. ヘリコバクター・ピロリ由来のウレアーゼ構造ポリペプチドのサブユニッ トまたはそれらの断片、請求の範囲第1項ないし第3項、第5項、第7項ないし 第9項に記載のヘリコバクター・フェリス由来のウレアーゼ構造ポリペプチドの サブユニットまたはそれらの断片、および/または請求の範囲第17項ないし第20 項に記載のヘリコバクター由来の熱ショック蛋白質(HSP)またはそれらの断 片の少なくとも1つを含む融合もしくは混合蛋白質を包含することを特徴とする 蛋白質様物質。 37. 動物を、請求の範囲第1項ないし第5項に記載の免疫組成物、または請求 の範囲第7項ないし第9項に記載の蛋白質様物質もしくは断片、または請求の範 囲第36項に記載の融合もしくは混合蛋白質で免疫することにより得られる、精製 された抗体もしくは血清。 38. 少なくとも請求の範囲第37項に記載の精製された抗体もしくは血清を含有 し、かつ該抗体を投与するための適切な媒体もしくは賦形剤、または該抗体の標 識もしくは検出手段を任意に包含するキット。
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