JPH09501832A - 高等植物の色素体においてポリヒドロキシブチレートおよび関係するポリヒドロキシアルカノエートを生産する方法 - Google Patents

高等植物の色素体においてポリヒドロキシブチレートおよび関係するポリヒドロキシアルカノエートを生産する方法

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、ポリ−D−(−)−3−ヒドロキシ酪酸(PHB)および関係するポリヒドロキシアルカノエート(PHA)を植物の色素体において生産する方法に関する。PHBの生産は、微生物からの修飾された遺伝子で植物を遺伝的に形質転換することによって達成される。これらの遺伝子は、アセチル−CoAまたは関係する代謝物からPHBを合成するために要求される酵素をコードし、そして色素体に酵素を標的化するために追加の植物の配列と融合される。

Description

【発明の詳細な説明】 高等植物の色素体においてポリヒドロキシブチレートおよび 関係するポリヒドロキシアルカノエートを生産する方法発明の背景 (1)発明の分野 この特許は、高等植物におけるポリヒドロキシアルカノエート(PHA)と呼 ぶあるクラスの物質の生産を改良する発明に関する。PHAはヒドロキシ酸の線 状ポリエステルから構成された細菌のポリマー物質の1グループであり、そして 熱可塑性を有する。PHAの低いレベルの生産は、1991年7月19日提出の 米国特許出願第07/732,243号に記載されているように、PHA合成に 関係する細菌の遺伝子で形質転換されたアラビドプシス・タリアナ(Arabi dopsis thaliana)において証明された。高等植物において大量 のPHAを生産するために、PHAの生産のための酵素は、PHA合成のための 前駆体を高いレベルで有する細胞下区画、すなわち色素体、の中に位置しなくて はならない。アセチル−CoAからのPHAの合成に関係するアルカリゲネス・ エウトロフス(Alcaligenes eutrophus)の3つの遺伝子 を修飾して、本発明の具体例として対応する酵素をアラビドプシス(Arabi dopsis)植物の細胞の色素体に標的化した。 (2)関係技術の説明 多種の細菌による炭素貯蔵物として、ポリヒドロキシアルカノエート(PHA )、即ち、3−ヒドロキシ酸のポリエステルが生産される(Anderson、A.j.および Dawes、E.A.、Microbiol.Rev.54:450-472、1990) 。ポリ−D−(−)−3−ヒドロ キシブチレート(PHB)、即ち、最も最も広くかつ完全に特性決定されたPH Aは、生物分解性でありかつ生物適合性の熱可塑性物質である。 PHAの生産についての研究は、短鎖PHA(C3−C5単位)を生産するアル カリゲネス・エウトロフス(Alcaligenes eutrophus)に 主として集中してきた。アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophu s)において、PHBはアセチル−CoAから3つの酵素の順次の作用により合 成される(第1図)(Steinbu chel、A.およびSchlegel、H.G.、Mol.Microbiol.5: 535-542、1991)。この経路の第1酵素である3−ケトチオラーゼ(E.C.2. 3.1.9)は、アセトアセチル−CoAを形成する2つのアセチル−CoA部 分の可逆的縮合を触媒する。アセトアセチル−CoAレダクターゼ(E.C.1 .1.1.36)は引き続いてアセトアセチル−CoAをD−(−)−3−ヒド ロキシブチリル−CoAに還元し、次いでこれはPHBシンターゼの作用により 重合してPHBを形成する。PHBは105〜106モノマー単位のポリマーとし て生産され、このポリマーは直径0.2〜0.5μmの顆粒で蓄積され、各顆粒 はほぼ1000のポリマー鎖を含有する(Anderson、A.J.および Dawe s、E.A.、Mic robiol.Rev.54:450-47 2、1990)。グルコースを含有する培地の中で増殖させると き、アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)は典型的にはP HBを80%の乾燥重量まで蓄積する。前述の3つのphb生合成酵素をコード する遺伝子は、アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)から クローニングされてきた(Peoples、O.P.およびSinskey、A.J.、J.Biol.Chem.264: 15293-15297、1989 およびJ.Biol.Chem.264:15298-15303、1989;Slater、S.C.、Vo ige W.H.およびDennis、D.E.、J.Bacteriol.170:4431-4436 、1988、Schubert、P.、 Steinbuchel 、A.およびSchlegel、H.G.、J.Bacteriol.170:5837-5847、1988)。 PHBホモポリマーに加えて、アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutr ophus)および他の細菌種はある数の異なるC3−C5モノマーを種々の比で 含有するポリマーを生産することができる。これらのモノマー の特質および性質は増殖培地の中に供給される炭素源により影響を受ける。例え ば、プロピオン酸またはペンタン酸を発酵の供給原料に供給するとき、3−ヒド ロキシブチレート(3HB)および3−ヒドロキシバレレート(3HV)の両方 のモノマーを含有するランダムコポリマーは、それぞれ、40モル%〜90モル %の3HV単位の最大で生産される(Anderson、A.j.およびDawes、E.A.、Microbiol .Rev.54:450-472、1990)。これらのPHAコポリマーは、C3−C5有機酸の補酵 素Aチオエステル誘導体を使用して、同一PHBシンターゼにより合成される。 PHBおよびPHBを含有するコポリマーに加えて、C6〜C12の領域のモノ マー単位を含有するPHAの他の一般的クラスが存在する。シュードモナス・オ レバランス(Pseudomonas olevorans)は、n−アルカン またはn−アルカン酸を増殖培地の中に供給するとき、中鎖(D)−ヒドロキシ 酸を含有するPHAを合成するプロトタイプの細菌である。これらのPHAのう ちで研究された最良のものはポリオキシオクタノエートであり、これはオクタノ エートを含有する培地の中でシュードモナス・オレバランス(P.olevor ans)を増殖させるとき蓄積される(Huisman、G.W.、de Leeuw 、O.、Eggink、G.、 およびWitholt、B.、Appl.Environ.Microbiol.54:2924、1988)。さらに、発酵の供 給原料の操作により、不飽和または分枝鎖状のモノマーを有し、ならびに塩化物 またはフッ化物の側面の基を有するユニークなポリマーを得ることができる(Doi、 Y.(編)、Micorbial polyesters、Chpt.3、VCH Publisher、New York(1990)。 PHBは、堅く、比較的脆い熱可塑性物質である(Doi、Y.(編)、Micorbial Poly esters、Chpt.6、VCH Publisher、New York、1990;Holmes、P.A.、Developments in cr ystalline polymers-2 、Basset、D.C.(編)、1-65、1988)。ポリマーの中への3HV モノマーの組み込みはPHBに比較して結晶化度および融点の減少に導き、 ポリマーの堅さを減少させそして靭性を増加し、多数の商業的応用のためにいっ そう適当なP(3HB−co−3HV)および他の関係するコポリマーを作る。 また、種々のポリマーおよび可塑剤をPHBにブレンドしてその物理的特性を改 良することが可能である(Holmes、P.A.、Developments in crystalline plymer-2、 Basset、D.C.(編)、1-65、1988)。PHBはすぐれた紫外線耐性を有するが、酸およ び塩基ならびに有機溶媒に対する耐性が一般に劣る。PHBはすぐれた酸素不透 過性を有し、そして湿った空気の中の加水分解的分解に対して耐性である。これ らの性質により、PHBは広い範囲の商品、例えば、家庭用容器、バッグおよび 包装フィルム、のためのプラスチック源として魅力的である。PHBと対照的に 、長鎖PHAは40〜60℃の融点範囲をもつエラストマーである(Gross、R.A.、 De Mello、C.、Lenz、R.W.、Brandl、H.およびFuller、R.C.、Macromolecules 22:1106、 1989)。これらのPHAの物理的性質を、なお、完全に特徴づけなくてはならな い。 PHBおよび関係するコポリマーは、土壌、スラッジおよび海水の中で容易に 分解される。例えば、30℃の土壌の中で、P(3HB−co−4HB)コポリ マーおよびPHBのホモポリマーは、それぞれ、2週および10週で分解する(D oi、Y.(編)、Micorbial Polyesters、Chpt.1、VCH Publishers、New York、1990)。多 くの細菌および真菌は、これらのポリマーを活性的に分解できることが示された (Dawes、E.A.およびSenior、P.J.、Adv.Microb.Physiol.10:135-266(1973)。細胞 外PHBデポリメラーゼおよびヒドロラーゼが、アルカリゲネス・フェカーリス (Alcaligenes fecalis)を包含する、いくつかの細菌から 単離された。従って、PHBはモノマーの3HB単位に分解され、これらの単位 は細菌および真菌の増殖のための炭素源として使用されうる。さらに、PHBは 非常に生体適合性であり、これにより縫合糸のフィラメントおよび薬物担体のよ うな医学的応用のために潜在的に魅力的である(Koosha、F.、Muller、R.H.および Davis、S.S.、Critical reviews in therapeutic drug carrier system、6:117-129 、1989)。PHBが分解すると、D−3−ヒドロキシ酪酸、即ち、血液の中に通 常存在する代謝物、が生成する。PHBの生物分解性は、商品の使い捨て製品の ためプラスチックとして、ならびに例えば農芸の根覆いまたは医学的移植片のよ うな特殊化された用途のためのプラスチックとしてのPHBの有用性の重要な面 である。 アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)により合成された P(3HB−co−3HV)コポリマーは、インペリアル・ケミカル・インダス トリーズ(Imperial Chemical Industries)によ り工業的に製造され、そしてBIOPOLの商標で市販されている。50000 0kg/年のポリマーの生産に基づく推定原価は、石油誘導商品のプラスチック 、例えば、ポリプロピレンについてのほぼ1$/kgと対照的に、ほぼ15$/ kgである(Poole、R、Science 245:1187-1189、1989)。製造費に対する2つの主要 な寄与因子は供給原料に添加される炭素源(例えば、スクロース、グルコース、 プロピオネート)および細菌からのポリマーの収獲である。多くの戦略が製造費 を減少するために探索されている(Poirier、Y.、Dennis、D.E.、Nawrath、C.およびSo merville、C,、Adv.Mater.5:30-36、1993)。例えば、ある細菌は、安価な未精製の 糖源、例えば、糖蜜およびコーンシロップ上で増殖させるとき、PHBを生産す ることができる。シュードモナス(Pseudomonas)およびロドコッカ ス(Rhodococcus)のいくつかの株は、グルコース上で増殖させると き、ある数のPHAコポリマーを生産することができ、このようにして通常コポ リマーの生産に要求される高価な基質、例えば、プロピオネートの添加は回避さ れる。PHBを合成する大腸菌(E.coli)の使用を包含する、細菌の遺伝 子操作は、また、PHBの製造費に対するインパクトを有することが期待される 。しかしながら、これらの潜在的改良にかかわらず、細菌の発酵および下流の プロセスに関連する固有の原価のために、細菌により生産されるPHAの原価は 多分ほぼ3〜5$/kgより低くないであろうことが一般に認められている。高 等植物からバイオマスを生産する原価に匹敵する原価で細菌のバイオマスを生産 することが可能であるようには思われない。例えば、ジャガイモはほぼ2000 0kg/ヘクタールの澱粉を生ずることができ、ジャガイモの塊茎はその乾燥重 量の80%まで澱粉を蓄積する(Martin、J.H.、Leonard、W.H.およびStamp、D.L.( 編)、Chapter36、Principles of Field Crop Production、898-932、Macmillan、New York、1976)。澱粉は最低の価格(ほぼ0.2$/kg)の1つであり、そして最 も豊富な世界的な商品である。同様に、油生産作物、例えば、菜種は1000k g/ヘクタールの油を生産し、種油含量は乾燥重量の44%までである(Downey、 R.K.およびRobbelen、G.、Oil crops of the world、Robbelen 、G.、Downey、R.K.お よびAshri、A.(編)、Chpt.16、McGraw-Hill、New York、1989)。植物は高度に生産的 であることに加えて、ある数の生物学的に活性な外来タンパク質、例えば、抗体 の生産において非常に有効であることが示された(Hiatt、A,、Cafferkey、R.および Bowdish、K.、Nature 342:76-78、1989)。植物の高い生産性および柔軟性を使用し て、タンパク質および種々の他のポリマーを包含する、種々の有機物質を生産す ることにおいて関心が増加しつつある(Moffat、A.S.、Science 256:770-771、1992) 。 PHAのファミリーにおける1つの構成員であるポリD−(−)−3−ヒドロ キシブチレートの生産は、高等植物のアラビドプシス・タリアナ(Arabid opsis thaliana)において以前に証明された(Poirier、Y.、Dennis 、E.、Klomparens、K.およびSomerville、C.、Science 256:520-523、1992および米 国特許出願第07/732,243号)。アセチル−CoAからPHBを作るために要求さ れる3つの酵素のうちで、3−ケトチオラーゼは植物の中に内因的に存在する。 初期の実験において、3−ケトチオラーゼ(phbA)、アセトアセチル−Co A レダクターゼ(phbB)およびPHBシンターゼ(phbC)をコードする細 菌アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)からの遺伝子をア ラビドープシス(Arabidopsis)の中に転移させ、そしてその中で構 築CaMV35Sプロモーターの転写のコントロール下に発現させた(第1図) 。遺伝子産物上にオルガネラの標的化シグナルが存在しないので、これらの実験 において、酵素を細胞質に対して標的化した。適当な遺伝的交雑を通して、PH B合成に要求される酵素のすべてを含有するハイブリッド植物を得た。ハイブリ ッド植物の中に存在するクロロホルム可溶性化合物をガスクロマトグラフィーお よび質量分析(GC−MS)により分析すると、PHBの存在が明らかにされた 。20〜100μgのPHB/gの植物材料の新鮮重を検出できた。PHBを生 産する植物組織の薄い切片を電子顕微鏡検査すると、電子透明の顆粒の集合体の 存在が明らかとなった。これらの顆粒は、アルカリゲネス・エウトロフス(A. eutrophus)およびPHBを蓄積する他の細菌において見出される顆粒 に、大きさおよび外観が非常に類似した。驚くべきことには、PHB顆粒は種々 の区画、即ち、核、空胞および細胞質、の中に見出された。PHBはミトコンド リアまたは葉緑体の中に検出することができなかった。顆粒のこの分布の根拠は 未知である。 遺伝子操作されたアラビドープシス(Arabidopsis)植物における PHBの生産の証明は、いくつかの問題を明らかにした。問題の1つはPHBの 低い収率である。第2の問題は植物の成長へのphb遺伝子の発現の悪影響であ る。トランスジェニック植物におけるアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性 の大量の発現は、野生型植物に関して、成長および種子生産の有意な減少を引き 起こした。例えば、ほぼ9単位のアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性/m gタンパク質(1単位は1μmoleのアセトアセチル−CoAレダクターゼ/ 分として定義される)を発現するトランスジェニック系統において、22日齢 のシュートの新鮮重(fresh weight)は野生型の19%に減少した(Poirier、Y.、 Dennis、D.E.、Klomparens、K.、Nawrath、C.およびSomerville C.、FEMS Microbiol. Lett.、103:237-246、1992)。種子の生産はほぼ同一の比率に減少した。この表現 型は、植物ホルモン、カロテノイド、ステロール、キノン、フロボノイド、およ び脂質のような化合物の生産の減少に導く本質的な生化学的経路から離れる方向 に、アセチル−CoAおよび/またはアセトアセチル−CoAの有意な量が変更 する結果であろう(第2図)。また、β−ヒドロキシブチリル−CoA、または それから誘導される生産物の蓄積は、植物細胞にとって有害であろう。トランス ジェニック植物において生産されたD−β−ヒドロキシブチリル−CoAの運命 は未知である。PHBシンターゼの発現は、それ自体、トランスジェニック植物 の成長または成長力への見掛けの作用をもたなかった。しかしながら、両方の遺 伝子を含有するハイブリッド植物は、アセトアセチル−CoAレダクターゼ活性 のみを含有する植物より成長がいっそう厳しく阻害された。これはメバロネート 経路からの基質のいっそう厳しい消耗のためであるか、あるいはPHB顆粒、特 に核の中に蓄積する顆粒、の有害性の作用のためであろう。好ましい態様の説明 本発明は、色素体を有するトランスジェニック植物材料(material)に関し、 前記植物材料は、植物の中の色素体においてポリヒドロキシアルカノエートの生 産を導く3−ケトチオラーゼ、アセトアセチル−CoAレダクターゼおよびポリ ヒドロキシアルカノエート(PHA)シンターゼおよびそれらの混合物から成る 群より選択される細菌のポリペプチドをコードする外来DNAを含有する。 本発明は、また、植物の中の色素体において3−ケトチオラーゼ活性を示すペ プチドをコードする外来DNAを含有する、色素体を有するトランスジェニック 植物材料に関する。 本発明は、また、植物の色素体においてアセトアセチル−CoAレダクターゼ 活性をコードする外来DNAを含有する、色素体を有するトランスジェニック植 物材料に関する。 本発明は、また、植物の色素体においてPHAシンターゼ活性を示すポリペプ チドをコードする外来DNAを含有する、色素体を有するトランスジェニック植 物材料に関する。 本発明は、また、植物の色素体においてヒドロキシアシル−CoAからのポリ ヒドロキシアルカノエート(PHA)の合成を導く1種または2種以上の酵素を コードする外来DNAを含有する、色素体を有するトランスジェニック植物材料 に関する。 本発明は、さらに、植物の中の色素体においてヒドロキシアシル−CoAの合 成を触媒する1種または2種以上の酵素をコードする外来DNAを含有する、色 素体を有するトランスジェニック植物材料に関する。 本発明は、また、植物の中の色素体における、外来DNAによりコードされる 生産物由来のヒドロキシアシル−CoAの生産を導く1種または2種以上の酵素 をコードする外来DNAを含有する、色素体を有するトランスジェニック植物材 料に関する。 本発明は、また、植物の中の色素体における外来DNAによりコードされる生 産物由来の3−ヒドロキシブチリル−CoAの生産を導く1種または2種以上の 酵素をコードする外来DNAを含有する、色素体を有するトランスジェニック植 物材料に関する。 本発明は、また、ポリヒドロキシアルカノエート(PHA)を生産しない2つ の植物を性的受精により交配することを含んでなり、各植物は植物の中の色素体 においてPHAを合成する植物を生産するためにPHAシンターゼによるヒドロ キシアシル−CoAの重合を導く経路において1または2以上の異なる酵素をコ ードする細菌由来の外来DNAを含有する、植物の中の色素体におけるPHAの 合成を導くポリペプチドをコードする外来DNAを導入する方法に関する。目的 従って、本発明の目的は、色素体におけるPHA、特にPHB、の蓄積を導く 1種または2種以上の酵素を提供することである。さらに、本発明の目的は、す ぐれた成長および種子の形成を示す植物を提供することである。これらおよび他 の目的は、以下の説明および図面を参照することによって徐々に明らかになるで あろう。図面の簡単な説明 第1図は、アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)におけ るPHB合成の経路を示すフローダイヤグラムである。3つの酵素をコードする 遺伝子は括弧内に示されている。 第2図は、PHBを生産するトランスジェニック植物においてアセチル−Co Aおよびアセトアセチル−CoAを利用する代謝経路を示すフローダイヤグラム である。前駆体としてアセチル−CoAおよびアセトアセチル−CoAを利用す る内因性植物の代謝経路の主要な最終生産物は、このダイヤグラムの上部に示さ れている。アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)からのp hbBおよびphbC遺伝子の発現によるトランスジェニック植物においてつく られた追加の経路は、ボックスの中に示されている。 第3図は、TPSS−phb遺伝子融合の略図である。a)TPSS−3−ケ トチオラーゼの遺伝子融合、b)TPSS−アセトアセチル−CoAレダクター ゼの遺伝子融合およびc)TPSS−PHBシンターゼの遺伝子融合。これらの 構築物のすべては、ボックスの中に示す4つの明確な領域、即ち、55アミノ酸 のトランシット(transit)ペプチドおよびエンドウのルビスコ(Rubisc o)の小さいサブユニットの遺伝子3.6によりコードされる成熟タンパク質の 最初の23アミノ酸、短いリンカー配列および、初期のメチオニンを除外したア ルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)からのphbA(A) 、phbB(B)およびphbC(C)遺伝子の完全なコーディング領域、から 構成されている。ボールドフェースのアミノ酸配列(1文字のコード)および各 領域の結合部に存在するDNA配列が示されている。ハイフンで示す、結合部の 間のアミノ酸の伸長部は以前に発表された(Cashmore、A.R.、Genetic Engineering of planls(編者、Kosuge、T.、Meredith、C.P.およびHollaender、A.)29-38、Plenum Press N Y、1983;Janes、B.、Hollar、JおよびDennis、D.、E.A.Dawes(編)、Novel Biod egradable Microbial Polymers 175-190(1990))。星印は終止コドンを示す。サ ブクローニング法の間にPCRにより導入されたエンドヌクレアーゼ制限部位が 示されている。 第4図は、CaMV35SプロモーターおよびTPSS−phbの遺伝子融合 を収容するTi−プラスミドの略図である。pBI−TPSS−Thio(A) 、pBI−TPSS−Red(B)およびpBI−TPSS−Syn(C)が示 されている。各構築物の物理的成分は、左から右に、次の通りである:LB、左 の境界配列;Kan、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼII遺伝子;Ca MV−35S、カリフラワーモザイクウイルスの35Sプロモーター;TPSS 、エンドウのルビスコ(Rubisco)の小さいサブユニット(3.6遺伝子 )のトランシットペプチド;陰影のボックス、合成リンカー;3−ケトチオラー ゼ遺伝子(A)、アセトアセチル−CoAレダクターゼ遺伝子(B)、またはP HBシンターゼ遺伝子(C);ポリA、ポリアデニル化部位;RB、右の境界配 列。重要なエンドヌクレアーゼ制限部位の位置が示されている。 第5図は、種子特異的プロモーターおよびTPSS−phb遺伝子融合を収容 するTi−プラスミドの略図である。pBIB−CCN−Thio(A)、pB IB−KCN−Red(B)、およびpBIB−HCN−Syn(C)の地図が 示されている。構築体において、アラビドプシス・タリアナ(A. thaliana)の12Sa種子貯蔵タンパク質のCRB遺伝子の種子特異的 プロモーターはTPSS−phb遺伝子融合の上流に配置された。下記の選択可 能なマーカーを使用した:アセトアセテートシンターゼをコードするALS(A )、ネオマイシンホスホトランスフェラーゼIIをコードするKan;Hyg、 ハイクロマイシンホスホトランスフェラーゼ。第4図はより詳細な記載を示す。 第6図は、プラスミドpBI−TPSS−Thioを発現するトランスジェニ ックアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)植物および対照植物の ウェスタンブロット分析のオートラジオグラフである。1.2μgのタンパク質 を含有する粗製の葉タンパク質抽出物のアリコートを10%SDS−PAGE上 で分離した。ニトロセルロース上でエレクトロブロットしたタンパク質を抗3− ケトチオラーゼ抗体とインキュベートした。分析したタンパク質抽出物は、T4 −3A(レーンC;Somerville、C.R.、Poirier、Y.、およびDennis、D.E.、米国特許 出願第07/732,243号)、TPSS−Thio GHI1(レーン1)、TPSS −Thio L(レーン2)、TPSS−Thio STU4(レーン3)、お よびTPSS−Red STU(レーンU)であった。 第7図は、プラスミドpBI−TPSS−Redを発現するトランスジェニッ クアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)植物および対照植物のウ ェスタンブロット分析のオートラジオグラフである。1.2μgのタンパク質を 含有する粗製の葉タンパク質抽出物のアリコートを12%SDS−PAGE上で 分離した。ニトロセルロース上でエレクトロブロットしたタンパク質を抗アセト アセチル−CoAレダクターゼ抗体とインキュベートした。分析したタンパク質 抽出物は、RedB−2B(レーンC;Somerville、C.R.、Poirier、Y.、およびDe nnis、D.E.、米国特許出願第07/732,243号)、TPSS−Red DEF(レーン 1)、TPSS−Red GHI1(レーン2)、TPSS−Red GHI2 (レーン3)、TPSS−Red MNO1(レーン4)、TPSS−Red MNO2(レーン5)、TPSS−Red STU(レーン6)、TPSS− Red VXY(レーン7)、およびTPSS−Syn VXY(レーンU)で あった。 第8図は、プラスミドpBI−TPSS−Synを発現するトランスジェニッ クアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)植物および対照植物のウ ェスタンブロット分析のオートラジオグラフである。50μgのタンパク質を含 有する粗製の葉タンパク質抽出物のアリコートを8%SDS−PAGE上で分離 した。ニトロセルロース上でエレクトロブロットしたタンパク質を抗PHBシン ターゼ抗体とインキュベートした。分析したタンパク質抽出物は、S8−1−2 C(レーンC;Somerville、C.R.、Poirier、Y.、およびDennis、D.E.、米国特許出願 第07/732,243号)、TPSS−Red STU(レーンU)、TPSS−Syn GHI1(レーン1)、TPSS−Syn GHI2(レーン2)、TPSS −Syn JKL(レーン3)、およびTPSS−Syn VXY(レーン4) であった。 第9図は、プラスミドpBIB−CCN−Thioを発現するトランスジェニ ックアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)植物および対照植物の ウェスタンブロット分析のオートラジオグラフである。50μgのタンパク質を 含有する粗製の葉タンパク質抽出物のアリコートを12%SDS−PAGE上で 分離した。ニトロセルロース上でエレクトロブロットしたタンパク質を抗3−ケ トチオラーゼ抗体とインキュベートした。分析したタンパク質抽出物は、CN− Red 17−1(レーンC)、CN−Thio 13−3(レーン1)および CN−Thio 14−1(レーン2)であった。 第10図は、プラスミドpBIB−KCN−Redを発現するトランスジェニ ックアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)植物および対照植物の ウェスタンブロット分析のオートラジオグラフである。50μgのタンパク質を 含有する粗製の葉タンパク質抽出物のアリコートを12%SDS−PAGE上で 分離した。ニトロセルロース上でエレクトロブロットしたタンパク質を抗アセト アセチル−CoAレダクターゼ抗体とインキュベートした。分析したタンパク質 抽出物は、RedB−2B(レーンLR;Somerville、C.R.、Poirier、Y.、および Dennis、D.E.、米国特許出願第07/732,243号)であり、種子タンパク質抽出物(レ ーンU)、CN−Red 17−3K(レーン1)およびCN−Red 17− 1(レーン2)であった。 第11図は、プラスミドpBIB−HCN Synを発現するトランスジェニ ックアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)植物および対照植物の ウェスタンブロット分析のオートラジオグラフである。50μgのタンパク質を 含有する粗製の葉タンパク質抽出物のアリコートを12%SDS−PAGE上で 分離した。ニトロセルロース上でエレクトロブロットしたタンパク質を抗PHB シンターゼ抗体とインキュベートした。分析したタンパク質抽出物は、S8−1 −2C(レーンLS;Somerville、C.R.、Poirier、Y.、およびDennis、D.E.、米国特 許出願第07/732,243号)、RedB−2B(レーンLR;Somerville、C.R.、Poir ier、Y.、およびDennis、D.E.、米国特許出願第07/732,243号)、CN−Red 1 7−1(レーンC)、CN−Syn 35−1(レーン1)、CN−Syn 3 5−1aA(レーン2)、CN−Syn 35−G1(レーン3)、CN−Sy n 34−1 Hb(レーン4)、CN−Syn 34−1 Hc(レーン5) 、CN−Syn 34−1bA(レーン6)、CN−Syn 34−1bA2( レーン7)、CN−Syn 34−1bB(レーン8)、CN−Syn 34− 1B(レーン9)、およびCN−Syn 34−1G(レーン10)であった。 第12図は、非形質転換対照およびプラスミドpBI−TPSS−phb構築 体で形質転換したトランスジェニックアラビドプシス・タリアナ (A.thaliana)植物のサザンブロット分析のオートラジオグラフであ る。非形質転換アラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)品種Rsc hewおよびトランスジェニック植物からのゲノムDNAの1μgを制限酵素H indIIIで消化し、形質転換体をアガロースゲル電気泳動により分離し、そ してナイロン膜に移した。フィルターを遺伝子(A)phbA、(B)phbB および(C)phbCからの32P標識化DNA断片にハイブリダイゼーションさ せた。分析したゲノムDNAは次の通りであった:TPSS−Thio GHI 1(レーンThio1)、TPSS−Thio L(レーンThio2)、TP SS−Thio STU4(レーンThio3)、TPSS−Red DEF( レーンRed1)、TPSS−Red GHI1(レーンRed2)、TPSS −Red GHI2(レーンRed3)、TPSS−Red MNO1(レーン Red4)、TPSS−Red MNO2(レーンRed5)、TPSS−Re d STU(レーンRed6)、TPSS−Red VWX(レーンRed7) 、TPSS−Syn GHI1(レーンSyn1)、TPSS−Syn GHI 2(レーンSyn2)、TPSS−Syn JKL(レーンSyn3)、TPS S−Syn VWX(レーンSyn4)および非形質転換野生型(レーンC)。 第13図は、非形質転換対照およびプラスミドpBIB−CN−phb構築体 で形質転換したトランスジェニックアラビドプシス・タリアナ(A.thali ana)植物のサザンブロット分析のオートラジオグラフである。分析したゲノ ムDNAは次の通りであった:CN−Thio 13−3(レーンThio1) 、CN−Thio 14−1(レーンThio2)、CN−Red 17−2( レーンRed1)、CN−Red 17−3(レーンRed2)、CN−Red 17−1dA(レーンRed3)、CN−Red 17−1dB(レーンRe d4)、CN−Red 17−3K(レーンRed5)、CN−Red 17− 2 K(レーンRed6)、CN−Syn 34−1bA(レーンSyn1)、CN −Syn 34−1bB(レーンSyn2)、CN−Syn 34−1Hb(レ ーンSyn3)、CN−Syn 34−1G1(レーンSyn4)、CN−Sy n 35−1(レーンSyn5)、CN−Syn 35−1A(レーンSyn6 、および非形質転換野生型(レーンC)。いっそう詳細な説明については、図面 の凡例12を参照のこと。 第14図は、精製したPHBおよび植物抽出物のガスクロマトグラフィー(G C)分析を示す。(A)シグマ・ケミカル・カンパニー(Sigma Chem ical Company)から購入したエステル交換PHBのガスクロマトグ ラム;(B)非形質転換野生型アラビドプシス・タリアナ(A.thalian a)品種Rschewからの葉のクロロホルム抽出物のガスクロマトグラム。矢 印は、エチル−ヒドロキシブチレートがクロマトグラムから溶出する位置を示す ;(C)ハイブリッドTPSS−Thio L/TPSS−Red DEF/T PSS−Syn GHI1からの葉のクロロホルム抽出物のガスクロマトグラム 。矢印はエチル−ヒドロキシブチレートのピークの位置を示す。 第15図は、PHB標準および植物抽出物から調製したPHBのガスクロマト グラフィー−質量分析の分析を示す。(A)エステル交換された商用PHBの質 量スペクトラム;(B)エチル−ヒドロキシブチレートと同一の保持時間を有す るTPSS−Thio L/TPSS−Red DEF/TPSS−Syn G HI1ハイブリッドの葉のクロロホルム抽出物からのGCピークの質量スペクト ラム(第14C図)。 第16図は、異なるハイブリッドTPSS−Thio/TPSS−Red/T PSS−Syn植物の葉におけるPHBの蓄積を図解する棒グラフを示す。 (A)伸び広がる葉についての測定(20〜30日齢);(B)成熟した葉につ いての測定(50〜60日齢)。 第17図は、色素体(A)および細胞質(B)の中でPHB生合成酵素を発現 する野生型(WT)およびトランスジェニックアラビドープシス(Arabid opsis)植物の完全に発育したロゼットの写真を示す。色素体の中でPHB を生産するハイブリッドTPSS−Thio L/TPSS−Red DEF/ TPSS−Syn GHI1の葉は、1.2mgのPHB/gの新鮮重を含有し た(A、PHB+)。細胞質の中でPHB酵素を発現するRed/Synハイブ リッドは、ほぼ100μgのPHB/gの新鮮重を含有した(B/PHB+)。 野生型およびトランスジェニック植物は同一条件下に成長させた。 第18図は、葉の色素沈着への色素体におけるPHBの高いレベルの蓄積の効 果を図解する写真を示す。(A)50日齢の野生型植物の葉;(B)伸び広がる 葉の色素体において700μgのPHB/gの新鮮重を生産する50日齢のトラ ンスジェニックアラビドープシス(Arabidopsis)ハイブリッドの葉 。 第19図は、色素体においてPHB酵素を発現するPHB生産性トリ−ハイブ リッドからの薄い切片の透過型電子顕微鏡写真(TEM)を示す(TPSS−T hio L/TPSS−Red DEF/TPSS−Syn GHI1)。 (A)葉肉細胞の葉緑体の中における電子透過性顆粒の凝集を矢印で示す。EM 分析のためのサンプリングの前に、植物を48時間の間暗所に配置して澱粉を除 去する。バーは1μmを表す。(B)12時間の光周期において4時間の照明後 に集めた、野生型の葉の薄い切片の透過型電子顕微鏡写真。胚珠の特異な顆粒の 形態の色素体の中の澱粉の蓄積を、野生型において大きい矢印で示す;(C)1 2時間の光周期において4時間の照明後に集めた、PHB陽性のTPSS−Th io L/TPSS−Red DEF/TPSS−Syn GHI1ハイブリッ ドの葉の薄い切片の透過型電子顕微鏡写真。胚珠の特異な顆粒の形態の色素 体の中の澱粉の蓄積を、野生型において大きい矢印で示す。トリハイブリッドの 色素体における電子透過性PHB顆粒の凝集を小さい矢印で示す。バーは1μm を表す。 第20図は、抗PHBシンターゼ抗体とインキュベートしたトランスジェニッ クTPSS−Thio L/TPSS−Red DEF/TPSS−Syn G HI1植物の植物抽出物のウェスタンブロット分析を示す。2つの異なるTPS S−Thio L/TPSS−Red DEF/TPSS−Syn GHI1植 物の可溶性タンパク質(レーン1、2)および膜および粒状画分の可溶化タンパ ク質(レーン3、4)の抽出物。レーンCはTPSS−Syn GHI1植物の 可溶性タンパク質の抽出物を示す。 以後使用すべきある種の用語の定義を記載することは助けとなるであろう。 形質転換は、どんな手段によってもDNAの安定な導入により受容生物の遺伝 子型を変化する方法を意味する。 トランスジェニック植物は、種の中に通常存在するが、形質転換により導入さ れたDNA配列を含有する植物である。 転写は、DNAの中に含有される遺伝情報に従うRNA鎖の形成を意味する。 翻訳は、mRNA分子の中の遺伝情報がタンパク質合成の間の特定のアミノ酸 の順序を方向づける方法を意味する。 プロモーターは、遺伝物質の転写を引き起こすDNA断片である。本明細書に 記載する目的のために、プロモーターは植物細胞の中で転写を可能とするDNA 断片を示すために使用する。 ポリ−A付加部位は、ある種の酵素がmRNAを特定の部位で切断し、そして アデニル酸残基をmRNAの3’末端に付加するようにさせるヌクレオチド配列 である。 phbC、phbA、phbBは、それぞれ、PHBポリメラーゼ、3−ケト チオラーゼおよびアセトアセチル−CoAレダクターゼについてアルカリゲネス ・エウトロフス(A.eutrophus)遺伝子に与えられた遺伝子記号であ る(Peoples、O.P.およびSinskey、A.J.、J.Biol.Chem.264:15298-15303、1989)。 色素体は、異なる種類の植物細胞の細胞質の中に多数のコピーで位置する、自 己複製性オルガネラである。このオルガネラは二重層の膜により取り囲まれてお り、そしてそれ自身のDNAを含有する。色素体の中に位置するタンパク質は、 それ自身のDNAによりコードされそして色素体の中で合成されるか、または植 物細胞の核によりコードされ、細胞質の中で合成されそして色素体の中に輸送さ れる。 トランスジェニック植物の子孫を記載するとき、DNAの導入から、どれだけ の数の自家受粉の世代が経過したかを表示するコンベンションを採用することは 有用である。ここにおいて、われわれはもとの形質転換体をT0世代と表示する 。この世代の自家受粉から生ずる子孫をT1世代などと表示する。 2つの明確な親の植物の間の異花受粉の場合において、最初の異花受粉事象か ら生ずる子孫をF1世代と表示する。 この開示の中に記載する本発明は、PHB生合成酵素の細胞の局在化を変化さ せそして組織の特異性および発現のタイミングを調節することによって、PHB 生産植物の第1世代に関連する成長の崩壊および低いPHB生産を軽減すること に関する。 PHBの生産を増加しかつアセチル−CoAおよび/またはアセトアセチル− CoAから誘導された必須生産物の潜在的消耗を回避するために、アセチル−C oAおよび/またはアセトアセチル−CoAを通る高い代謝の流れを有する細胞 下区画、即ち、色素体、に細菌のPHB生合成酵素を標的化した(Harwood、J.L.、 Ann.Rev.Plant Physiol.Plant Mol.Biol.39:101-138、1988)。貯蔵組織において 、脂肪酸の生合成からPHBの生産に向かうこの色素体の多少の転換は植物の 成長に有害であってはならない。植物の中で自然に合成される高分子量のバイオ ポリマーである澱粉は、多数の貯蔵組織(アミロプラスト)の色素体の中に大量 に蓄積される(Preiss、J.、Ann.Rev.Plant Physiol.33:431-454、1982)。光合成葉 緑体において、澱粉は、また、CO2固定の日周期の間に一時的に蓄積される。 従って、色素体はその寸法を変化させることができそして大きい貯蔵容量を有す る区画である。従って、色素体の中のPHBの蓄積が色素体の機能を妨害しない か、または多少の機械的崩壊を引き起こすことは期待されない。さらに、細胞質 におけるPHBの生合成経路の発現は、色素体の中でなく、細胞質、核および空 胞の中のPHB顆粒の蓄積を生じた(Poirier、Y.、Dennis、E.、Klomoparens、K.およ びSomerville、C.、Science 256:520-523、1992)。これは色素体のエンベロープが PHB顆粒による浸透に対して不透過性である可能性を発生させる。従って、色 素体のPHBの生産の付加された利点は、PHB顆粒がもっぱら色素体の中に蓄 積されかつその中に止まることができ、顆粒による他のオルガネラの潜在的機械 的崩壊を回避するということである。 本明細書に記載する本発明において、コードされた酵素の色素体の標的化のた めに修飾されたアルカリゲネス・エウトロフス(Alcaligenes eu trophus)からの遺伝子phbA、phbBおよびphbCは植物細胞の 中に導入された。それらの遺伝子はCaMV35Sプロモーターの転写のコント ロール下に発現され、このプロモーターはPHB生産植物を構築するために従来 使用されてきているプロモーターと同一であった。このアプローチは、酵素の色 素体および細胞質の発現とPHB生産レベルとの直接の比較を可能とする。 本明細書に記載する本発明の第2面において、植物の全体の成長への有害作用 の可能性を減少するために、PHB生産は特定の組織および植物の生活環の特定 の段階に限定された。色素体におけるアセチル−CoAの流れは大量の油脂を通 常蓄積する組織、例えば、油脂植物の種子、において特に高いので、発育する種 子はPHB生産のために適当な組織である。貯蔵脂質に使用される脂肪酸合成か らPHB合成に向かうこのアセチル−CoAの多少の転換は、植物の成長に有害 であってはならない。従って、色素体標的化phb酵素は、アラビドプシス・タ リアナ(Arabidopsis thaliana)の種子貯蔵タンパク質遺 伝子のプロモーターを使用して、発育する種子において特別に発現された。 農芸規模のPHA生産は、PHA生産植物が正常の成長力を有することと、生 産されたPHAのレベルがトランスジェニック植物の前の世代においてまだ到達 されていないある最小レベルを超えることとを必要とする。従って、本発明はP HB生産植物の有望な発育のために高い重要性を有する。アラビドープシス(A rabidopsis)とブラシカ・ナプス(Brassica napus) との密接な関係のために、下記の節に記載する構築体をブラシカ(Brassi ca)におけるPHB生産のために直接使用した。さらに、高等植物の異なる種 における遺伝子発現および一次炭素代謝のメカニズムが類似するために、本発明 の本質、即ち、本発明におけるPHAの生産、は他の植物種に適用可能であるこ とがまた明らかである。他の油脂生産植物、例えば、菜種およびヒマワリの種子 、またはアボカドまたはギネアアブラヤシの中果皮におけるPHBの生産は、こ れらの植物器官が脂肪酸の生合成のための前駆体アセチル−CoAを提供するた めに特殊化されているので、特に魅力的である。 後述する実験は植物種アラビドプシス・タリアナ(Arabidopsis thaliana)(L.)Heynholdに関するが、記載する方法は形質 転換法が利用可能である任意の高等植物に一般に適用可能である。同様に、本明 細書に記載する方法はアルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus )からの遺伝子の使用に関するが、記載する方法はPHBを合成できる任意の生 物からの遺伝子の使用に一般に適用可能である。また、記載する方法はPHBの 生産に関するが、PHAシンターゼ(PHBシンターゼを包含する)活性により 微 生物の中で通常生産され、そしてそのために適当なヒドロキシアセチル−CoA 基質が特定の植物の中で生産される、任意のポリヒドロキシアルカノエートの生 産に、この手法は一般に適用可能であることが明らかである。 トランスジェニック植物の中の色素体におけるPHBの生産は、次のような順 序のステップの完結を必要とする: 1.)大腸菌(E.coli)において植物プロモーターのコントロール下に発 現された色素体標的化配列と、PHB合成のための細菌遺伝子との融合体を含有 する1または2以上のプラスミドの構築、2.)アグロバクテリウム・ツメファ シエンス(Agrobacterium tumefaciens)の中へのこ れらのプラスミドの導入、3.)修飾された遺伝子で植物細胞を形質転換するた めの、形質転換されたアグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobac terium tumefaciens)による植物の感染(即ち、この例にお いてアラビドプシス・タリアナ(A.thaliana))4.)修飾された遺 伝子で形質転換された植物の選択、5.)異所性(ectopic)遺伝子についてホ モ接合である植物の選択、6.)形質転換された植物をプラスミドの組み込みお よび異所性遺伝子の発現に関して分析して、それらが活性でありかつ遺伝子産物 が色素体に標的化されることを保証すること、7.)性的交雑による2またはそ れ以上の異なる異所性遺伝子を含有するハイブリッド植物の生産、8.)ハイブ リッド物質のPHBの存在についての分析。 1. 大腸菌(E.coli)の中で植物プロモーターのコントロール下に色 素体標的化配列−phb遺伝子融合を含有するプラスミドの構築。 1.1. phb遺伝子のコーディング領域へのシグナル配列の融合。 植物細胞の中の色素体のストロマにタンパク質を標的化させるために、タンパ ク質はN−末端にトランシット(transit)ペプチドを含有しなくてはならない (Keegstra、K.およびOlsen、L.J.、Ann.Rev.Plant Physiol.Plant Mol.Biol.40:471 -501、1989;Archer、E.K.およびKeegstra、K.、J.Bioenerg.Biomem.22:789-810、199 0)。従って、トランシットペプチドをコードするシグナル配列を、正しいリーデ ィングフレームにおいてタンパク質のコーディング配列の5’末端に融合させな くてはならない。リブロース1−5ビスホスフェートカルボキシラーゼ(ルビス コ)の小さいサブユニットのトランシットペプチド(ransit ept ide of the mall ubunit)(TPSS)はよく特性 決定され(Robinson、C.およびEllis、R.J.、Eur.J.Biochem.142:343-346、1984、Wasm ann、C.C.、Reiss、B.、Barlett、S.G.、およびBohnert、H.J.、Mol.Gen.Genet.205:446 -453、1986;Friemann、A.L.およびKeegstra、K.、Plant Physiol.89:993-999、1988; Lubben、T.H.、Gatenby、A.A.、Ahlquist、P.、およびKeegstra、K.、Plant Mol.Biol.1 2:13-18、1989;Schnell、D.J.、Blobel、G.、およびPain、D.、J.Biol.Chem.266:3335-3 342,1991)そして従来ある数の標的化実験において首尾よく使用された(van de B roeck、G.、Timko、M.P.、Kausch、A.P.、Cashmore、A.R.、Van Montagu、M.およびHerrer a-Estrella、L.、Nature 313:358-363、1985;Schreier、P.H.、Seftor、E.A.、Schell、J .、およびBohnert、H.J.、EMBO J.4:25-23、1985;Boutry、M.、Nagy、F.、Poulsen、C.、Ao yagi、K.、およびChua N.-H.、Nature 328:340-342、1987;Lubben、T.H.、およびKeeg stra、K.、Proc.Natl.Acad.Sci.83:5502-5506、1986;Lamppa、G.K.、J.Biol.Chem.263 :14996-14999、1988;Gatenby、A.A.、Lubben、T.H.、Aphlquist、P.、およびKeegstra、 K.、EMBO J.7:1307-1314、1988;Cheung、A.Y.、Bogorad、L.、Van Montagu 、M.、およ びSchell、J.、Proc.Natl.Acad.Sci.85:391-395、1988;Lubben、T.H.、Theg、S.M.およ びKeegstra、K.、Photosyn.Res.17:173-194、1988)。従って、エンドウのTPSS を下記の実験において使用した。しかしながら、色素体の標的化に関係した多く の異なるトランシットペプチドを類似の方法で使用できるであろう。 トランシットペプチドは色素体の中に輸入されるの間に通常切断されるので、 トランシットペプチドとタンパク質との間の結合部における3次元構造は輸送の 効率のために重要であることがある(Wasmann、C.C.、Reiss、B.、Barlett、S.G.、およ びBohnert、H.J.、Mol.Gen.Genet.205:446-453、1986;Lubben、T.H.、Gatenby、A.A.、 A hlquist 、P.、およびKeegstra、K.、Plant Mol.Biol.12:13-18、1989)。従って 、ルビスコの成熟した小さいサブユニットの最初の23アミノ酸をコードする遺 伝子の配列はトランシットペプチドの中に含め、このペプチドをPHB生産に関 係するアルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)の細菌の遺伝 子、即ち、phbA、phbBおよびphbC遺伝子に融合させた。 シグナル配列と細菌の遺伝子との間の正確な断片を得るために、TPSSをコ ードする配列ならびにphb遺伝子をポリメラーゼ連鎖反応(PCR)によりオ リゴヌクレオチドのプライマーを使用して増幅し、そしてオリゴヌクレオチドの プライマーは配列のいずれかの末端に新しい合成制限部位をつくった。増幅のた めに設計したプライマーを表1に表す。 表1は、また、断片の増幅に使用したDNA源および増幅された断片の大きさ を含む。PCR断片を増幅し、導入された制限部位を認識する酵素で切断し、そ してアガロースゲル電気泳動により分離した。 シグナル配列のDNA断片を含有する精製された0.27kbpのXbaI− SmaI断片を、同一の制限酵素で切断したベクターpUC18に結合して、プ ラスミドpUC−TPSSを生成した。 phbA遺伝子の精製された1.3kbpのSmaI−SacI断片およびp hbB遺伝子の0.8kbpの断片をSmaIおよびSacIで切断したpUC −TPSSプラスミドの中に結合して、プラスミドpUC−TPSS−Thio およびpUC−TPSS−Redをつくった。phbC遺伝子の1.9kbpの SmaI断片をSmaI切断pUC−TPSSに結合した。シンターゼがシグナ ル配列の背後に正しい向きにクローニングされたしたクローンを選択し、そして pUC−TPSS−Synと表示した。 要約すると、つくられたプラスミド、即ち、pUC−TPSS−Thio、p UC−TPSS−RedおよびpUC−TPSS−Synの各々は、1つの合成 ポリペプチドをコードするような方法で一緒に融合された植物遺伝子および細菌 遺伝子のコーディング領域の一部分を含有する。植物の配列と細菌の配列との間 の結合部において、3アミノ酸のセリン−アルギニン−バリン(S−R−V)を コードする合成配列が形成された。シグナル配列と細菌遺伝子との間の結合部に 存在するアミノ酸およびDNA配列は、表3に示されている。植物細胞の中で発 現されるとき、これらのポリペプチドは色素体のタンパク質輸入機構により認識 され、そして色素体のストロマに輸送されることが期待される。 1.2. 修飾されたphb遺伝子の上流の植物プロモーターの付加。 高等植物において合成コーディング領域を転写するために、コーディング領域 はその5’末端付近に位置する植物プロモーターのコントロール下になくてはな らない。さらに、ポリアデニル化部位をコーディング領域の3’末端に付加して 、高等植物における遺伝子の発現を保証することは普通に実施されている。さら に、形質転換された植物を選択するために、形質転換された植物のみが選択条件 下に生き残るようにさせる遺伝子が存在しなくてはならない。このような遺伝子 は選択可能なマーカーと呼ばれる。2つの異なるプロモーターを使用して、修飾 されたphb遺伝子を発現した:CaMV35SプロモーターおよびCRBプロ モーター。 CaMV35Sプロモーター(カリフラワーモザイクウイルスから)は、高等 植物の多数の種における広範な種類の組織において比較的高いレベルの転写を生 ずる構成的プロモーターと見なされる(Benfey、P.N.およびChua、N.-H.、Science 2 50:959-966、1990)。対照的に、アラビドプシス・タリアナ(Arabidops is thaliana)の12S種子貯蔵タンパク質のCRB遺伝子から単離 されたCRBプロモーターは、ほとんどもっぱら発育する種子の胚における高い レベルの転写を促進する(Pang、P.P.、Pruitt、R.E.、およびMeyerowitz、E.M.、Plan t Mol.Biol.11:805-820、1988)。 1.2.1. 修飾されたphb遺伝子の上流のCaMV35Sプロモーターの 付加。 修飾されたphbA、phbBおよびphbC遺伝子の上流にCaMV35S プロモーターを配置し、そして高等植物におけるコーディング領域の発現のため の他の要求を満足させるために、プラスミドベクターpBI121(Clone tech、カリフォルニア州)を使用した。このベクターは選択可能なマーカー としてネオマイシンIIホスホトランスフェラーゼ遺伝子を含有する。 CaMV35S−TPSS−phbAおよびCaMV35S−TPSS−ph bBの遺伝子融合体を構築するために、プラスミドpUC−TPSS−Thio およびpUC−TPSS−Redを制限酵素XbaIおよびSacIで消化した 。pUC−TPSS−Thioからの1.6kbpの断片およびpUC−TPS S−Redからの1.1kbpの断片を、アガロースゲル電気泳動により他の断 片から分離した。精製されたDNA断片を同一酵素で切断したpBI121に結 合し、そして大腸菌(E.coli)の中にクローニングした。新しくつくられ たプラスミドpBI−TPSS−ThioおよびpBI−TPSS−Redは、 色素体の標的化のために修飾されそして植物プロモーターの下流に位置する、そ れぞれ、phbA遺伝子およびphbB遺伝子を含有する(第4図)。 CaMV35S−TPSS−phbC遺伝子融合体を構築するために、プラス ミドpUC−TPSS−SynをEcoRIで消化し、そして付着末端をT4D NAポリメラーゼにより充填した。引き続いて、プラスミドをXbaIで消化し た。2.2kbpのDNA断片をアガロースゲル電気泳動により他の断片から分 離した。精製されたDNA断片を制限酵素SmaI/XbaI消化pBI121 の中にクローニングした。生ずるプラスミドをpBI−TPSS−Synと表示 し(第4図)、これはアルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus )からのphbC遺伝子を有し、この遺伝子は色素体の標的化のために修飾され 、CaMVプロモーターおよびpBI121のポリアデニル化部位に関して、右 向きにクローニングされているので、それは高等植物において発現されることが 期待される。 これらの構築体は、遺伝子の高い発現および対応するタンパク質、即ち、修飾 された3−ケトチオラーゼ、修飾されたアセトアセチル−CoAレダクターゼお よび修飾されたphbシンターゼ、の色素体のストロマへの標的化のためのすべ ての要件を満足する。 1.2.2. 修飾されたphb遺伝子の上流の種子特異的プロモーターの付加 。 CRBプロモーターの下流の修飾されたphbコーディング領域をクローニン グするために、pBIBベクター(Becker、D.、Nucleic Acids Res.18:203,1990) を使用した。これらのベクターは、植物の形質転換のために必要なすべての機能 を含有する。ベクターの2つのバージョンが存在する:pBIB−Kanは選択 可能なマーカーとしてネオマイシンIIホスホトランスフェラーゼ、pBIB− Hyg、即ち、ハイグロマイシンホスホトランスフェラーゼ遺伝子を有する。 引き続くクローニング手法を簡素化するために、CRBプロモーターは位置− 993におけるXbaI制限部位を除去することによってわずかに修飾しなくて はならなかった。従って、プラスミドnAt4011(Pang P.P.、Pruitt、R.E.、 およびMeyerowits、E.M.、Plant Mol.Biol.11:805-820、1988)をBamHIおよび EcoRIで消化しそして精製後、3.5kbpの断片をpBR322(Bolivar、 F.、Rodriguez、R.L.、Greene、P.J.、Betlach、M.C.、Heyneker、H.L.およびBoyer、H. W.、Gene 2:95-113、1977)の中にクローニングしてpBR322−CRBを生産し た。pBR322−CRBの単一のXbaI部位を切断した後、付着末端をT4 DNAポリメラーゼとのインキュベーションによりデオキシリボヌクレオチドで フィルインし、そしてプラスミドを再結合した。生ずるプラスミドはCRBプロ モーター領域の中にXbaIを含有しなかった。 配列のいずれかの末端に適当な制限部位をもつCRBプロモーターを得るため に、表1に示すオリゴヌクレオチドのプライマーを使用してポリメラーゼ連鎖反 応を実施した。1.1kbpのXbaI断片をpK19(Pridmore、R.D.、Gene 56 :309-312、1987)の中にクローニングしてpK−CRBをつくった。 CRBプロモーターの背後のTPSS−phbAコーディング領域をクローニ ングするために、プラスミドpUC−TPSS−Thioを制限酵素XbaIお よびSacIで消化し、そして1.6kbpのDNA断片をアガロースゲル電気 泳動により精製した。この断片をXbaIおよびSacI切断ベクターpBIB −Hygに結合した。3つのphb遺伝子の各々と組み合わせた異なる選択可能 なマーカーを有することは非常に有用であるので、pBIB−Hygベクターの ハイクロマイシンIIホスホトランスフェラーゼ遺伝子を、引き続いて、形質転 換された植物にクロルスルフォロン耐性を付与するアセトラクテートシンターゼ 遺伝子と置換した(Haughn、G.W.、Smith、J.、Mazur、B.およびSomerville C.R.、Mol. Gen.Genet.211:266-271、1988)。これを行うために、生ずるプラスミドをおよび HindIIIおよびBamHIで切断して、ハイクロマイシンIIホスホトラ ンスフェラーゼ遺伝子を除去した。プラスミドの付着末端をT4DNAポリメラ ーゼによりデオキシリボヌクレオチドで充填した。プラスミドpGH1(Haughn、 G.W.、Smith、J.、Mazur、B.およびSomerville C.R.、Mol.Gen.Genet.211:266-271、19 88)から精製された5.8kbpのXbaI断片を、引き続いて調製されたプラ スミドの中に挿入した。生ずる構築体をpBIB−C−TPSS−Thioと表 示した。次いで、pK−CRBの1.1kbpの長いXbaI断片をユニークX baI部位の中にクローニングすることによって、CRBプロモーターを構築体 に付加した。修飾されたphbAの適切な発現のために右向きにプロモーターを 含有するクローンを、pBIB−CCN−Thioと表示した(第5図)。 CRBプロモーターの背後のTPSS−phbBコーディング領域をクローニ ングするために、プラスミドpUC−TPSS−RedをXbaIで消化し、そ してプラスミドpK−CRBの1.1kbpのXbaI断片を挿入した。右向き のプロモーターをもつクローンを選択し、そしてpK−CN−Redと表示した 。プラスミドpK−CN−RedをEcoRIおよびPstIで消化してプロモ ーター/遺伝子断片を形成し、そして末端をT4DNAポリメラーゼによりデオ キ シリボヌクレオチドで満した。2.2kbpの断片をアガロースゲル電気泳動に より精製し、そしてSmaIで消化したベクターpBIB−Kanの中に結合し た。植物における適切な遺伝子の発現のための右向きの断片を有するクローンを 、pBIB−KCN−Redと命名した(第5図)。 pBIB−HygベクターにおいてCRBプロモーターの背後のTPSS−p hbCコーディング領域をクローニングするために、プラスミドpUC−TPS S−SynをEcoRIで消化し、付着末端をT4DNAポリメラーゼにより充 填し、そして線状化プラスミドを引き続いてXbaIで切断した。2.2kbp のDNA断片を他の断片からアガロースゲル電気泳動により分離した。精製され たDNA断片を制限酵素XbaIおよびSmaIで消化したpBIB−Hygの 中にクローニングした。XbaIで消化したこの生ずるプラスミドにおいて、プ ラスミドpk−CRBの切断により得られたCRBプロモーターを含有する1. 1kbpの断片をクローニングした。修飾されたphbC遺伝子の適切な発現の ための右向きのプロモーターを有するクローンを、pBIB−HCN Synと 表示した(第5図)。 要約すると、植物の中に形質転換したとき、修飾された遺伝子が発育する種子 の中で特異的に発現され、タンパク質が種子の中の色素体のストロマに標的化さ れるように、プラスミドpBIB−CCN−Thio、pBIB−KCN−Re d、pBIB−HCN−Synは構築される。 2. アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)の中への構築体の導入。 アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tu mefaciens)により伝達される植物形質転換法の使用を可能とするため に、両方の系列の構築体のプラスミドをアグロバクテリウム・ツメファシエ ンス(Agrobacterium tumefaciens)pGV3101 株の中にエレクトロポレーションにより転移させた(Koncz、C.およびSchell、J.、 Mol.Gen.Genet.204:383-396、1986;Sambrook、J.、Fritsch、E.F.およびManiatis、 T.、Molecular cloning:a Laboratory manual、Cold Spring Harbor Laboratory Press、1989)。種々のプラスミドで形質転換された細菌のコロニーを、プラスミ ドpBI121およびpBIB上に存在するカナマイシン耐性遺伝子の細菌の発 現について選択することによって回収した。 3. アグロバクテリウム・ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)による植物細胞の形質転換。 開示する実験において、アラビドプシス・タリアナ(Arabidopsis thaliana)を色素体におけるPHB生産のモデル植物として使用した 。アラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)をアグロバクテリウム・ ツメファシエンス(Agrobacterium tumefaciens)伝 達分裂組織形質転換法により形質転換することができる(Chag、S.S.、Perk、S.K.お よびNam、h.-G.、Abstract in:Fourth International Conference on Arabidopsis Research、Vienna、1990)。 アラビドプシス・タリアナ(Arabidopsis thaliana)R schew品種の植物を、植物が抽薹を開始するまで(ほぼ3週)、連続的光の 下で成長させた。薹(ほぼ2cm)を副芽(auxiliary buds)と 一緒にそれらの基部から除去した。創傷部位を所望のプラスミドを有するアグロ バクテリウム(Agrobacterium)で感染させた。新しい薹が発生す るまで(ほぼ1週)植物を成長させた。再び、薹を除去し、そして創傷部位をア グロバクテリウム(Agrobacterium)で感染させた。植物を完全な 成熟に成長させ、そして種子を収穫した。 4. 形質転換された植物の選択。 種々のアグロバクテリウム(Agrobacterium)株で感染させた植 物から得られた種子を、適当な選択化合物を含有する寒天固化植物培地上に分散 させることによって、形質転換されたT0植物を選択した。pBI−TPSS− Thio、−Redおよび−SynおよびpBIB−KCN−RedのT−DN Aを有する形質転換された植物を選択するために、50μg/mlのカナマイシ ンを培地に添加した。pBIB−CCN−ThioのT−DNAを有する形質転 換された植物を選択するために、30ng/mlのクロルスルフォロンを培地に 添加し、そしてpBIB−HCN Synを有する植物の選択するために30μ g/mlのハイクロマイシンを添加した。上の濃度の選択化合物は非形質転換ア ラビドプシス・タリアナ(A.thaliana)の成長を妨害するが、形質転 換された植物の正常の成長を可能とする。平均すると、ほぼ40のアグロバクテ リウム(Agrobacterium)感染植物の種子から1つの推定上の形質 転換体を単離できた。カナマイシン耐性植物を文字/番号の組み合わせで表示し た。 プラスミドpBI−TPSS−Thioを有するアグロバクテリウム・ツメフ ァシエンス(A.tumefaciens)で感染した植物の種子から、合計1 4のカナマイシン耐性植物が回収された。これらをTPSS−Thio GHI 1、−GHI2、−GHI3、−GHI4、−L、−STU1、−STU2、− STU3、−STU4、−STU5、−STU6、−YZAA1、−YZAA2 および-YZAA3と表示した。 プラスミドpBI−TPSS−Redを有するアグロバクテリウム・ツメファ シエンス(A.tumefaciens)で感染した植物の種子から、合計10 のカナマイシン耐性植物系が回収された。これらをTPSS−Red DEF、 −GHI1、−GHI2、−MNO 1、−MNO 2、−P1、−P2、 −QR、−STU、−VWXと表示した。 プラスミドpBI−TPSS−Sy nを有するアグロバクテリウム・ツメファシエンス(A.tumefacien s)で感染した植物の種子から、合計6のカナマイシン耐性植物系が回収された 。これらをTPSS−Syn−ABC、−GHI1、−GHI2、−JKL、− PQR、−VWXと表示した。 プラスミドpBI−CCN−Thioを有するアグロバクテリウム・ツメファ シエンス(A.tumefaciens)で感染した植物の種子から、合計2つ のクロルスルフオロン耐性植物が回収された。これらをCN−Thio 13− 3および−14−1と表示した。 プラスミドpBIB−KCN−Redを有するアグロバクテリウム・ツメファ シエンス(A.tumefaciens)で感染した植物の種子から、合計6の カナマイシン耐性植物が回収された。これらをCN−Red 17−1、−17 −3、−17−1dA、−17−1dB、−17−2K、−17−3Kと表示し た。 プラスミドpBIB−HCN−Synを有するアグロバクテリウム・ツメファ シエンス(A.tumefaciens)で感染した植物の種子から、合計17 のカナマイシン耐性植物が回収された。これらをCN−Syn 34−1bA、 −34−1bB、−34−2A、−34−2B、−34−1 Ha、−34−1 Hb、−34−1 Hc、−34−1G1、−34−1G2、−35−1、− 351aA、−35−1aB、−35−2A、−35−2B、−35−2C、− 35−3、−35−1G1と表示した。 5. 推定上のホモ接合トランスジェニック系統の単離。 ホモ接合植物を生産するために使用した最小の基準は、ホモ接合植物からのす べての子孫が選択マーカーに対して耐性であることが期待されるということであ る。ゲノムの中の異なる位置に挿入されたT−DNAの多数の異所性コピーの存 在は同様な表現型を生じさせるので、一次形質転換事象がただ1つの染色体位置 の中へのT−DNAの挿入を含むとき、この基準は最も有用である。 推定上のホモ接合系統を同定するために、耐性T0植物を生殖的隔離で成熟ま で成長させた。引き続いて、選択培地に対して耐性であることが示されたいくつ かのT1植物を再び成熟まで成長させた。次いで、各系統からのほぼ100個の T2種子の試料において、選択可能なマーカーに対する耐性頻度を決定した。特 定の植物からのT2種子のすべてが選択可能なマーカーに対して耐性である場合 、その系統は仮にホモ接合であると考えた。 6. 得られたトランスジェニック植物の分析。 6.1. phb酵素の発現および色素体標的化およびそれらの酵素の色素体へ の標的化の分析。 6.1.1. pBI−TPSS−Thio、pBI−TPSS−Redおよび pBI−TPSS−Synで形質転換後に得られた推定上の植物の分析。 pBI−TPSS−Thio、pBI−TPSS−RedおよびpBI−TP SS−Synで形質転換されたトランスジェニック植物が葉緑体の中に位置する 機能的酵素を生産したかどうかを決定するために、カナマイシン耐性トランスジ ェニック植物のタンパク質をウェスタンブロット分析により分析した。 pBI−TPSS−Thioで形質転換したトランスジェニック植物のタンパク 質のウェスタンブロットをアルカリゲネス・エウトロフス(A.eutroph us)の3−ケトチオラーゼに対して生じさせた抗体とインキュベートした。p BI−TPSS−Redで形質転換したトランスジェニック植物のタンパク質の ウェスタンブロットをアセトアセチル−CoAレダクターゼに対して生じさせた 抗体とインキュベートし、そしてpBI−TPSS−Synで形 質転換したトランスジェニック植物のタンパク質をPHBシンターゼに対して生 じさせた抗体とインキュベートした。陰性対照として、推定的に生産された酵素 を含有しないトランスジェニック植物の植物抽出物の分析を分析に含めた。陽性 対照として、細胞質において酵素を生産するトランスジェニック植物の抽出物を 含めた. pBI−TPSS−Thioで形質転換された14の推定上のトランスジェニ ック植物のうちで、3つの植物、即ち、TPSS−Thio GHI1、−Lお よび−STU4、の植物抽出物は3−ケトチオラーゼの生産について強いシグナ ルを示した(第6図)。この酵素はウェスタンブロット上に45、46.5およ び48kDのバンドのトリプレットとして現れた。これらのバンドは正しくプロ セシングされたタンパク質および不正確にプロセシングされた生産物を表す。細 胞質の中に位置する非修飾の3−ケトチオラーゼは44kDaに現れる。従って 、葉緑体に標的化した、正しくプロセシングされたTPSS−3−ケトチオラー ゼは、ルビスコの小さいサブユニットから付加された23アミノ酸のために、約 47kDaの分子量を有することが期待される。非プロセシングタンパク質は、 なお全体のトランシットペプチドを収容し、約53kDaの分子量を有するであ ろう。 pBI−TPSS−Redで形質転換された10の推定上のトランスジェニッ ク植物のうちで、P1およびP2を除外したすべてはアセトアセチル−CoAレ ダクターゼの生産のシグナルを示した。これらのシグナルの強度は変化し、そし てTPSS−Red−DEFおよび−STUにおいて最強であった(第7図)。 シグナルは、タンパク質の正しくプロセシングされた形態および不正確にプロセ シングされた形態を表す28.5、29.0および30.5kDaのバンドとし て常に現れた。非修飾のタンパク質は26.5kDaで移動した。従って、非プ ロセシングTPSS−アセトアセチル−CoAレダクターゼは35kDaの分子 量を有することが期待され、そしてタンパク質の正しくプロセシングされた形態 は約29kDaの分子量を有するであろう。 TPSS−Syn−ABCおよび−PQRを除外した、pBI−TPSS−S ynで形質転換された6つの推定上のトランスジェニック植物のすべてはシグナ ルを示した。これらのシグナルの強度は変化し、そして植物TPSS−Syn− VWXにおいて最強であった(第8図)。シグナルは正しくプロセシングされた TPSS−Synタンパク質の大きさでトリプレットのバンドとして示され(6 3kDa)、そしてプロセシングされたバージョンは期待したものよりわずかに 短かった(60および61kDa)。非修飾のPHBシンターゼは60kDaで 移動する。 実施したすべてのウェスタンブロット分析において、非形質転換植物のタンパ ク質はシグナルを示さなかった。細胞質においてphb酵素を発現する植物は、 期待した大きさで強いシグナルを示した。色素体への標的化のためのトランシッ トペプチドで修飾されたPHB酵素は期待した大きさにプロセシングされ、従っ て、色素体の中にほとんど挿入された。さらに、わずかに高いか、または低い移 動度におけるバンドがまた発生した。期待するよりわずかに高い移動度をもつタ ンパク質は、細菌の酵素に付加されたルビスコの小さいサブユニットの成熟タン パク質の23アミノ酸上のプロテアーゼ活性により発生させることができる。人 工的につくられたエクステンションはプロテアーゼに対して特に感受性であるこ とがある。 CaMVプロモーターを含有する各構築体について、高いレベルで期待した酵 素を生産する形質転換された植物を得ることができることを、これらの結果は示 す。ウェスタンブロット分析において期待した大きさのダブレットまたはトリプ レットとしてこれらの酵素の各々が出現することは、酵素が色素体へ輸送されそ して期待した方法でプロセシングされることを示す。 pBI−TPSS−Thioで形質転換して得られたトランスジェニック植物 を、下記の文献に記載されているアッセイの小さい修飾により3−ケトチオラー ゼ活性についてアッセイした:Senior、P.J.およびDawes、E.A.、Biochem.J.134:2 25-238、1973。カナマイシン耐性ヘテロ接合T1植物からの凍結した葉の組織を Tris緩衝液の中で均質化し、そして清澄化粗抽出物を3−ケトチオラーゼ活 性について試験した。これらの実験の結果を表2に表す。 ウェスタンブロット分析により検出したところ遺伝子を発現していなかった、非 形質転換植物、pBI−TPSS−Redで形質転換されたトランスジェニック 植物およびpBI−TPSS−Thioで形質転換されたトランスジェニック植 物の抽出物は、アッセイの条件下に非常に低いレベルの3−ケトチオラーゼ活性 を有した。対照的に、ウェスタンブロット分析において高い3−ケトチオラーゼ の生産を有することが発見されたトランスジェニック植物の各々は、また、増加 したレベルの3−ケトチオラーゼ活性を有した。これは修飾された細菌3−ケト チオラーゼが植物の中で機能であることを示す。修飾された3−ケトチオラーゼ の比活性は、アラビドープシス(Arabidopsis)植物の細胞質の中で 発現された、非修飾の細菌3−ケトチオラーゼとして活性であった。 pBI−TPSS−Redで形質転換して得られたトランスジェニック植物を 、下記の文献に記載されているアッセイの小さい修飾によりアセトアセチル−C oAレダクターゼ活性についてアッセイした:Senior、P.J.およびDawes、E.A.、B iochem.J.134:225-238、1973。カナマイシン耐性ヘテロ接合T1植物からの葉を リン酸塩緩衝液の中で均質化し、そして清澄化抽出物をアセトアセチル−CoA レダクターゼ活性についてアッセイした。これらの実験の結果を表3に表す。 ウェスタンブロット分析により検出したところ遺伝子を発現していなかった、非 形質転、pBI−TPSS−Thioで形質転換された植物または形質転換され た植物からの抽出物は、検出不可能なレベルのアセトアセチル−CoAレダクタ ーゼを有した。対照的に、ウェスタンブロット分析においてアセトアセチル−C oAレダクターゼを生産することが発見されたトランスジェニック植物の各々は 、アセトアセチル−CoAレダクターゼ活性を示した。活性レベルはウェスタン ブロットにおいて見られる生産レベルと相関した。これは修飾された細菌アセト アセチル−CoAレダクターゼが植物において機能的であることを示す。 構築体pBI−TPSS−Synで形質転換して得られたトランスジェニック 植物は、PHBシンターゼ活性の存在についてアッセイしなかった。なぜなら、 チオラーゼ活性およびレダクターゼ活性の不存在においてこの酵素の活性を測定 するのが困難であったからである(Peoples、O.P.およびSinsky、A.J.、J.Biol.Che m.264:15298-1530 3、1989)。 要約すると、色素体の標的化のために修飾されたPHBシンターゼに関係する すべての3つの酵素は植物の中で有意なレベルに生産され、色素体への輸送につ いて期待した方法でプロセシングされ、そして酵素的に活性であったことを、こ れらの実験の結果は示す。 6.1.2. pBIB−CCN−Thio、pBIB−KCN−Redおよび pBIB−HCN−Synによる形質転換後に得られた推定トランスジェニック 植物の分析。 pBIB−CCN−Thio、pBIB−KCN−RedおよびpBIB−H CN−Synで形質転換された推定トランスジェニック植物が適当な酵素を生産 するかどうかを決定するために、未熟種子の中のタンパク質を分析した。Pan g et al.は、これらの実験において使用した種子特異的プロモーターは 花の受精後第6日〜第14日の間に高い遺伝子の発現を指令するので、種子をこ の期間に集めた(Pang、P.P.、Pruitt、R.E.およびMeyerowitz、E.M.、Plant Mol.Biol .11:805-820、988)。凍結未熟種子を緩衝液の中で均質化し、そして水性相の中に 存在するタンパク質をSDSポリアクリルアミドゲル電気泳動により分離した。 タンパク質をニトロセルロースに移し、そして前述したように抗体とインキュベ ートした。 pBIB−CCN−Thioで形質転換後に得られた両方の植物は、ウェスタ ンブロットにおいて酵素の高いレベルの発現を示した。酵素は43〜47KDa の間の大きさで四重バンドとして現れた。47KDaにおけるバンドは修飾され た酵素の正しくプロセシングされた形態について期待した大きさを表す(第9図 )。 6つのカナマイシン耐性植物のウェスタンブロット分析において、植物17− 3Kのタンパク質抽出物のみがアセトアセチル−CoAレダクターゼに対して生 じさせた抗体と反応した。シグナルはタンパク質の正しくプロセシングされた大 きさ(29KDa)における二重バンドおよびわずかに大きいタンパク質(31 KDa)として現れた(第10図)。 pBIB−HCN−Synで形質転換後に得られた17植物のうちの13を分 析した。これらのうちで、11植物は修飾された細菌シンターゼの低いレベルの 発現を示した。トランスジェニック植物TPSS−Syn 34−1G1は、他 のトランスジェニック植物よりほぼ5倍高いレベルの発現を有する。シグナルは プロセシングされた酵素の大きさの単一バンドとして現れる(63KDa)(第 11図)。 種子特異的プロモーターのコントロール下に発現された修飾PHB酵素の予備 的結果は、それらが種子の中で合成されておりそして色素体に対する標的化につ いて期待した方法でプロセシングされることを示す。 適当なphb酵素を高いレベルに発現する形質転換植物のホモ接合系統が得ら れた後、酵素が色素体の中に位置することをさらに示すために、免疫局在化研究 が実施されるであろう。 6.2. トランスジェニック植物におけるphb遺伝子の組み込みの分析 生産された種々のトランスジェニック植物系統におけるphb遺伝子の適切な 組み込みを評価するために、トランスジェニック植物のゲノムDNAを分析した 。非形質転換植物およびプラスミドpBI−TPSS−Thio、pBI− TPSS−RedおよびpBI−TPSS−SynまたはpBIB−CCN−T hio、pBIB−KCN−RedおよびpBIB−HCN Synで形質転換 されたT2トランスジェニック植物から、高分子量のDNAを単離した。DNA を制限酵素HindIIIで消化し、断片をアガロースゲル電気泳動により分離 し、そしてナイロンフィルター上に移した。構築体pBI−TPSS−Thio 、pBI−TPSS−RedおよびpBI−TPSS−Synにおいて、制限酵 素HindIIIはCaMV35Sプロモ一ターの5’末端において1回だけ切 断する(第4図)。pBIB−CCN−Thio、pBIB−KCN−Redお よびpBIB−HCN Synにおいて、制限酵素HindIIIはphb遺伝 子のコーディング領域の5’のみを数回切断する。従って、phb遺伝子特異的 プローブを使用して検出された断片は、Tiベクターと植物ゲノムDNAとの接 合断片、またはコンカタマー化Tiベクターの内部断片を表すであろう。プラス ミドpUC−THIO、pUC−REDおよびpUC−SYNの中のインサート をEcoRIおよびHindIIIで処理して切取り、電気泳動により精製し、 そしてランダムプライミングにより32p−デオキシリボヌクレオチドで標識化し た。次いで、標識化phb遺伝子断片を使用してナイロンフィルターをプロービ ングした。フィルターをハイブリダイゼーションし、そして引き続いて高いスト リンジェント条件下に洗浄した。これらのフィルターのハイブリダイゼーション の結果をpBI−TPSS−phb構築体について第12図に、そしてpBIB −CN−phb構築体について第13図に示す。3つのphb遺伝子のいずれも 非形質転換対照植物において検出できない(第12図a、b、cおよび第13図 a、b、c、レーンC)。 プラスミドpBI−TPSS−Thioで形質転換して生産された3つのトラ ンスジェニック系統(第12図a、レーンThio1〜3)およびプラスミドp BIB−CCN−Thioで形質転換して生産された2つのトランスジェニッ ク系統(第13図a、レーンThio1〜2)において、phbA遺伝子が検出 された。 プラスミドpBI−TPSS−Redで形質転換して生産されたトランスジェ ニック植物(第12図b、レーンRed1〜7)およびプラスミドpBIB−K CN−Redで形質転換して生産された6つのトランスジェニック系統のうちの 2つ(第13図b、レーンRed1〜5)において、phbB遺伝子が検出され た。植物系統CN−Red17−3、−17−1dA、17−1dBおよび−1 7−2Kは50μg/mlのカナマイシンに対して耐性であり、NPTII遺伝 子の組み込みを示唆したが、phbB遺伝子は検出されなかった。NPTII遺 伝子を収容し、phbB遺伝子を収容しないTiベクターの断片のみがこれらの 系統のゲノムDNAの中に組み込まれたようである(第13図b)レーンRed 2、3、4、6)。 プラスミドpBI−TPSS−Synで形質転換して生産された4つのトラン スジェニック植物系統(第12図c、レーンSyn1〜4)およびプラスミドp BIB−HCN−TPSS−Synで形質転換して生産された6つのトランスジ ェニック植物系統(分析した、第13図c、レーンSyn1〜6)において、p hbC遺伝子が検出された。トランスジェニック植物系統CN−Syn 34− 1bAおよびCN−Syn 34−1bBは、サザンブロット上でバンドの同一 パターンを有するので、同一である(第13図c、レーンSyn1および2)。 植物CN−Syn 34−1HbおよびCN−Syn 34−1G1(第13図 c、レーンSyn3および4)および植物CN−Syn 35−1およびCN− Syn 35−1a(第13図c、レーンSyn5および6)について同一の現 象を見ることができ、そしてこの現象は形質転換法に関係づけられる。 一連の性的交雑を使用して、すべての組織の色素体の中にすべての3つのph b酵素を含有する植物系統を構築した。色素体の中で大量のアセトアセチル −CoAレダクターゼを発現する3つのトランスジェニック系統(系統TPSS −Red DEF、MNO1およびSTU)を、色素体の中で大量のPHBシン ターゼを生産するトランスジェニック植物(系統TPSS−Syn GHI1、 GHI2およびVWX)と異花受粉させた。色素体の中でアセトアセチル−Co AレダクターゼおよびPHBシンターゼを発現する、生ずるハイブリッドTPS S−Red/TPSS−Syn植物は、ガスクロマトグラフィーにより分析して 、伸び広がる葉の中で測定可能な量のPHBを生産しなかった(<20μg/g 新鮮重のPHB)。比較により、細胞質の中でアセトアセチル−CoAレダクタ ーゼおよびPHBシンターゼを同様なレベルに生産するトランスジェニック植物 はPHBを生産した(Poirier、Y.、Dennis、D.E.、Klomparens、K.、およびSomerville、 C.R.、Science 256、520-523、1992および米国特許出願第07/732,243号)。この差 について考えられる理由は、PHB生産を支持するために十分な3−ケトチオラ ーゼを色素体が有することができないということである。これはアセチル−Co Aからイソペンテニル−ピロホスフェートへ導かれるメバロネートの経路の初期 の段階が分化した色素体の中に存在しないという証拠と一致する(Krenz、K.およ びKleinig、H.、Eur.J.Biochem.141、531-535、1984、Schultz、G.およびSchulze-Sieb ert、D.、Biological Role of Plant Lipids、編、Biacs P.A.、Gruiz、K.、およびKre mmer、T.(Plenum Publishing Corporation、New York、NY)pp.313-319、989)。 すべての組織の色素体における完全な生合成経路を確立するために、大量のチ オラーゼを有するトランスジェニックアラビドプシス・タリアナ(A.thal iana)(系統TPSS−Thio L)をTPSS−Red/TPSS−S ynハイブリッドで異花受粉した。交雑の5つの組み合わせから、PHBを生産 しそして従ってPHB生産のために必要なすべての3つの酵素を有するある数の ハイブリッドを形成した(TPSS−Thio L/TPSS− Red DEF/TPSS−Syn GHI1、TPSS−Thio L/TP SS−Red STU/TPSS−Syn GHI1、TPSS−Thio L /TPSS−Red STU/TPSS−Syn−GHI2、TPSS−Thi o L/TPSS−Red STU/TPSS−Syn VWX、TPSS−T hio L/TPSS−Red MNO1/TPSS−Syn VWX)。まず 、ナイル・ブルー(Nile Blue)Aで染色した組織のエピフルオレンス 顕微鏡により、PHBを生産するハイブリッドを同定した。高いレベルの蛍光を もつ植物は、比較的低いレベルの蛍光をもつ植物より高いレベルのPHBを有し た。次いで、これらのハイブリッドにおいて生産されたPHBをガスクロマトグ ラフィーにより定量し、そしてGC−MSにより同定した(第14図、第15図 )。日齢20〜30の植物の伸び広がる葉の中のPHBの量は、20μgのPH B/g新鮮重〜700μgのPHB/g新鮮重の範囲であった(第16A図)。 3系ハイブリッドは植物の生存を通じてPHBを蓄積し続けたので、老衰する植 物の葉において、PHBのレベルは伸び広がる葉における量より8〜13倍高か った(即ち、7mgまでのPHB/g新鮮重)(第16B図)。経時的PHB蓄 積のこの増加は、初期PHB含量が低い植物(伸び広がる葉における100μg /g新鮮重は老衰前の葉における1.1mg/gに到達する)ならびに初期PH B含量が高い植物(伸び広がる葉における700μg/g新鮮重は老衰前の葉に おける7mg/gに到達する)において観察された。TPSS−Thio L/ TPSS−Red DEF/TPSS−Syn GHI1ハイブリッドにおいて 、老衰する葉において測定したPHBの最大量はそれらの乾燥重量のほぼ14% であった(10mg/g新鮮重)。 色素体の中でPHBを生産する植物は、最高レベルのPHB蓄積においてさえ 野生型の成長および受精能力を示した(第17図)。高いレベルのPHBを生産 するハイブリッドの種子の発芽速度において、野生型と差は観察されなかった。 しかしながら、伸び広がる葉において300〜400μgPHB/g新鮮重を生 産する植物は、成長の後の段階の間に視的検査により野生型と区別することがで きた。これらの植物において、葉はほぼ50〜60日の成長後にわずかの白化を 示し、非常に高いレベルのPHB蓄積(>3mgPHB/g新鮮重)において、 葉緑体の代謝のある面は影響を受けることがある(第18図)。 PHB生産ハイブリッドの葉の試料の透過型電子顕微鏡検査は、PHBが電子 密な物質の薄層で取り囲まれた、ほぼ0.2〜0.7μmの電子透過性顆粒の集 合体として蓄積することを明らかにした(第19A図)。同様な外観の顆粒は細 菌のPHBについて(Lundgren、D.G.、Pfister、R.M.、およびMerrick、j.M,、J.Gen. Microbiol.3 4、441-446、964)または植物細胞の細胞質、核および空胞におけるP HBについて(Poirier、Y.、Dennis、D.E.、Klomparens、K.、およびSomerville、C.R.、 Science 256、520-523、992および米国特許出願第07/732,243号)記載されてきてい る。色素体ターゲテッドphb酵素を発現する植物において、これらの顆粒の集 合体はもっぱら色素体の中に位置した。これは細胞質においてPHB生合成経路 を発現するトランスジェニック植物と対照的であり、この細胞質は色素体の中で はなく、核、空胞および細胞質の中でPHBを蓄積した(Poirier、Y.、Dennis、D.E .、Klomparens、K.、およびSomerville、C.R.、Science 256、520-523、1992および米国 特許出願第07/732,243号)。PHB顆粒は、慣用の電子顕微鏡検査の固定のプロ トコールにより可視化したとき、顆粒の形態、外観および体制において、澱粉顆 粒と明瞭に区別された。PHB顆粒は小さく、丸い電子透過性顆粒を形成する密 な集合体である(第17a図)。比較において、澱粉は、拡散区域により取り囲 まれた、胚珠の形態の、変わった、電子が密な顆粒として現れる(第19B図) 。伸び広がる葉において少量のみのPHBを生産するトリ−ハイブリッドにおい て、電子顕微鏡検査の分析により、すべてではない葉緑体がPHBを蓄積したよ うに思われた。この理由は知られていない。異なる組織における導入遺伝子 の異なる発現についての徴候が存在した。多分、それは電子顕微鏡検査の分析が 全体の色素体の体積の小さい区域のみの検査を可能とするという事実を単に反映 しているのであろう。また、それはペチュニアにおいて観察されるような、示差 的発現のモザイクに導くことがある共抑制の作用を反映していることがある(Jor gensen、R,、Trends in Biotechno1ogy 8、340-344、990)。高いレベルのPHBを蓄 積するトリ−ハイブリッドの古い葉において、ほとんどすべての葉緑体はPHB を含有した。 種々のハイブリッドにおいて生産されたPHBの異なる量の原因となるメカニ ズムを洞察するために、PHB生産植物の中に存在する3−ケトチオラーゼ活性 およびアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性のレベルを清澄化粗葉タンパク 質抽出物において測定した。PHBシンターゼはウェスタンブロット分析により 分析した。TPSS−Thio L/TPSS−Red/TPSS−Synハイ ブリッド植物における3−ケトチオラーゼ活性は、0.001〜0.8u/mg タンパク質の範囲であった。対照的に、親TPSS−Thio L植物における 3−ケトチオラーゼ活性は0.84+/−0.15u/mgタンパク質であった 。TPSS−Thio L系統のサザンブロット分析は、多分構築体のいくつか の独立の組み込みに相当する、phbA遺伝子にハイブリダイゼーションした4 つのバンドを明らかにした(第12A図、TPSS−Thioレーン2)。従っ て、異なるpBI−TPSS−Thio構築の分離は、F1世代における3−ケ トチオラーゼ活性の範囲を発生させることができる。このような変動は、問題の 種々の導入遺伝子についてホモ接合である真の育種系統を発生させる標準の植物 育種法を使用することによって、容易に排除することができる。TPSS−Th io L/TPSS−Red DEF/TPSS−Syn GHI1ハイブリッ ド植物におけるアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性は、0.007〜0. 78u/mgタンパク質であった。TPSS−Thio Lとの交雑における親 とし て働いたTPSS−Red DEF/TPSS−Syn GHI1ハイブリッド におけるアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性は、2.09+/−0.23 u/mgタンパク質であった。F1世代におけるサザンブロット分析および選択 可能なマーカーの分離比の分析は、TPSS−Red DEF植物が構築体pB I−TPSS−Redを単一の組み込み部位に収容することを示した(第12b 図、TPSS−Redレーン1)。ウェスタンブロット分析において、活性の減 少はPHB生産植物の清澄化抽出物の中のタンパク質量のほぼ10倍の減少と相 関することが示された。同様に、PHB生産ハイブリッド植物TPSS−Thi o L/TPSS−Red STU/TPSS−Syn GHI1、TPSS− Thio L/TPSS−Red STU/TPSS−Syn GHI2、TP SS−ThioL/TPSS−Red STU/TPSS−Syn VWX、お よびTPSS−Thio L/TPSS−Red MNO1/TPSS−Syn VWXは、また、それらの親植物に比較して、広く変化する、予期せざるほど に低いレダクターゼ活性を有し、これはウェスタンブロット分析におけるタンパ ク質の少ない物質と相関した。トリ−ハイブリッドにおいてレダクターゼ活性が 変動し、異常に低い理由は、pBI−TPSS−Red構築体のコピー数の変化 により説明することができない。この変動性は修飾されたphb遺伝子のすべて の転写体が243bpの共通の配列、即ち、トランシットペプチド(TPSS) のコーディング領域、を含有するという事実のためである(第3図)。TPSS のコーディング領域で修飾された1または2以上のチオラーゼ遺伝子を獲得する と、共抑制のメカニズムにより、他のTPSS含有遺伝子、例えば、TPSS− Red、を下方に調節することができる(Jorgensen、R.、Trends in Biotechnolog y 8、340-344、1990、Seymour、G.B.、Fray、G.R.、Hill、P.およびTucker、G.A.、Plant Mol.Biol.23、1-9、1993)。共抑制は、また、透過型電子顕微鏡検査により検査し たとき、ある細胞はPHBで充満されているが、隣接す る細胞はPHBを示さないという理由を説明することができる。従って、共抑制 を回避しかつPHB生産植物におけるphb遺伝子の変動する低い発現を軽減す るために、導入されたphb遺伝子の各々のために異なるトランシットペプチド を付加することによって、色素体の標的化のためにすべてのphb遺伝子を修飾 すべきである。トランシットペプチドの配列を包含する多数の異なる葉緑体局在 化タンパク質のために配列は、現在、入手可能である。従って、この例において 使用するアミノ末端のトランシットペプチドの一部分またはすべてを、通常葉緑 体局在化のタンパク質のそれと置換することによる本発明の改良方法は、当業者 にとって明らかであろう。 PHB生産植物の葉タンパク質抽出物のウェスタンブロット分析により、PH Bシンターゼの存在を研究した。TPSS−Thio/TPSS−Red/TP SS−Synハイブリッド植物において、PHBシンターゼは可溶性タンパク質 の画分の中に決して検出することができなかった。しかしながら、PHBシンタ ーゼは可溶化膜のウェスタンブロットおよび植物抽出物の粒状画分上で容易に検 出可能であった。対照的に、pBI−TPSS−Synのみで形質転換した植物 において、PHBシンターゼは可溶性画分の中で検出できた(第20図)。この 発見は、細菌の中のPHBシンターゼについて示したように、PHBシンターゼ は植物の中で形成されたPHB顆粒と密接に関連することを示唆する(Fukui、T.、 Yoshimoto、A.、Matsumoto、M.、Hosokawa、S.Saito、T.、Nishikawa、H.、およびTomita、 K.、Arch.Microbiol.110、149-156、1976、Haywood、G.W.、Anderson、A.J.およびDawe s、E.A.、FEMS Microbiol.Lett.57、1-6、1989)。 一般に、最高のレベルの3−ケトチオラーゼ活性およびアセトアセチル−Co Aレダクターゼ活性の両方をもつトランスジェニック植物は最高のレベルのPH Bを有し、そして低いレベルの両方の活性をもつ植物は最低のレベルのPHBを 有した。最高のレベルの測定可能な酵素活性において、PHB生産の明 らかなプラトーは存在しなかった。従って、PHB蓄積はアセチル−CoAの利 用可能性よりむしろ酵素活性の量により制限されるように思われる。従って、植 物において生産される種々のphb酵素の量を増加することによって、トランス ジェニック植物において生産されるPHBの量を本明細書に記載する量を越えて 増加させることができるであろう。これを達成する1つの方法は、植物の中に導 入されるphb遺伝子の各々について異なる色素体標的化配列を使用することに よって、同一トランシットペプチド(色素体に対する標的化のための)を有する 修飾されたphb遺伝子の共抑制現象を回避することである。また、これらの実 験において使用するCaMVまたはCRBプロモーターを使用して可能であるよ り高い発現レベルに導く強いプロモーターを使用することによって、トランスジ ェニック植物におけるphb酵素の生産量を増加することが可能である。phb 遺伝子の細菌のコーディング領域のコドンの使用は高等植物について典型的では ないので、また、その中で遺伝子を発現すべき高等植物が最も普通に利用するコ ドンによりアミノ酸配列がコードされるように、細菌遺伝子のコーディング配列 を変更することによって、酵素の発現を増加することが可能であろう。 要約すると、PHB生合成経路をそれらの色素体の中で発現するように操作さ れた植物は、PHBを大量に蓄積する。アセチル−CoAを通る低い流れをもつ 細胞区画(細胞質)からアセチル−CoAを通る高い流れをもっ区画(色素体) にPHB生産の位置を変化させることによって、PHB生産の最大レベルは10 0倍まで増加された(Poirier、Y.、Dennis、D.E.、Klomparens、K.、およびSomervil le、C.R.、Science 256、520-523、992および米国特許出願第07/732,243号に記載さ れているように、細胞質の発現についてほぼ100 μg/g新鮮重から、本明細書に 記載されているように、色素体の発現についてほぼ10mg/g新鮮重まで)。色素体 において高いレベルのPHBを生産する植物は、通常の成長および成長力を示し た。これは、PHBが植物に対して毒性でないこと、そして色素体におけ るPHB生産に対する生物学的障害は存在しないように思われることを示す。細 胞質の必須の代謝経路からの代謝物の消耗は、細胞質においてPHB酵素を発現 する植物におけるPHB生産の有害作用のための理由であったように思われる( Poirier、Y.、Dennis、D.E.、Klomparens、K.、およびSomerville、C.R.、Science 256、 520-523、1992および米国特許出願第07/732,243号)。しかしながら、PHB顆粒 は、また、核の中に位置したので、PHB顆粒と核の構成成分との相互作用は、 また、これらの植物におけるPHB生産の有害作用の原因であった可能性がある 。 種子特異的プロモーターCRBのコントロール下に修飾されたphb遺伝子を 発現するトランスジェニック植物を使用して、同様な分析を実施した。pBIB −KCN−Redで形質転換され、発育する種子の色素体において実質的な量の アセトアセチル−CoAレダクターゼを生産する植物を、pBIB−HCN−S ynで形質転換され、発育する種子の色素体において実質的な量のPHBシンタ ーゼを生産する植物と異花受粉させた。GC−MS分析および電子顕微鏡検査に より、生ずるハイブリッドを種子におけるPHB生産について分析する。発育す る種子の色素体の中の内因性アセチル−CoAの量はPHB生産を可能とするた めに十分であるので、発育する種子の色素体における色素体の標的化のために修 飾された3−ケトチオラーゼを導入してトリ−ハイブリッドをつくる。すべての 3つの酵素を生産するトリ−ハイブリッドをつくるために、レダクターゼ/シン ターゼの二重ハイブリッドを、発育する種子の色素体において3−ケトチオラー ゼを発現するトランスジェニック植物と異花受粉させる。生ずるチオラーゼ/レ ダクターゼ/シンターゼのトリ−ハイブリッドの種子の中で生産される大量のP HBを、GC−MSおよび電子顕微鏡検査により分析する。 色素体の中でPHBを生産するこの方法は、種々のトランスジェニック系統を 交雑して生産されたハイブリッド植物の使用に制限されない。この方法の好まし い別の実行は、宿主植物の中への同時の導入のために共直線状DNA分子上にす べての3つの遺伝子を配置することを包含する。また、本明細書に記載するPH Bを高いレベルで生産させる一般的方法はすべての高等植物に一般に適用可能で あり、そして遺伝子を導入しそして発現させ、そして高等植物の他の種における 色素体の中にタンパク質を輸送することは当業者にとって明らかであると考えら れる。材料および方法 DNA組み換え体の構築 プラスミドを収容する大腸菌(E.coli)DH5α株を、カナマイシン( 50μg/ml)またはアンピシリン(50μg/ml)を補充したLBブロス の中で増殖させた。プラスミドDNAの調製は、Sambrook、J.、Fr itsch、E.F.およびManiatis、T.、Molecular c loning:a laboratory manual、Cold Spri ng Harbor Laboratory Press(1989)に記載さ れているようなアルカリ溶解法により実施し、そして必要に応じてマジックミニ DNAアフィニティーカラム(Pormega Corp.、ウイスコンシン州 )による精製を実施した。プラスミドDNAを製造業者(New Englan d Biolabs、マサチュセッツ州;Pormega Corp.、ウイス コンシン州;Boehringer Mannheim Biochemica ls、インジアナ州;Stratagene、カリフォルニア州)の勧めに従い 制限エンドヌクレアーゼで切断し、アガロースゲル電気泳動により分離し、そし てSambrook、J.、Fritsch、E.F.およびManiatis 、T.、Molecular cloning:a laboratory m anual、Cold Spring Harbor Laboratory Press(1989)に記載されているように臭化 エチジウムにより可視化した。DNA断片を凍結融解法(freeze thr ow method)およびフェノール抽出によりアガロースゲルから回収した 。簡単に述べると、アガロース断片をレーザーブレードで非常に小さい片にスラ イスし、同一体積のフェノール(Sambrook、J.、Fritsch、E .F.およびManiatis、T.、Molecular cloning: a laboratory manual、、Cold Spring Har bor Laboratory Press(1989)に記載されているよう に調製した)を添加し、そして激しく攪拌した。懸濁液を2回凍結し、融解し、 そして引き続いて遠心した。断片を含有する上澄みをフェノール−クロロホルム 抽出およびエタノール沈澱によりさらに精製した。いくつかの実験において、D NA断片のくぼんだ(recessed)3’末端を、Sambrook、J. 、Fritsch、E.F.およびManiatis、T.、Molecula r cloning:a laboratory manual、Cold S pring Harbor Laboratory Press(1989)に 記載されているプロトコールを使用して、T4DNAポリメラーゼで平滑末端に 変換した。DNA断片と粘着末端または平滑末端との結合は、Sambrook 、J.、Fritsch、E.F.およびManiatis、T.、Molec ular cloning:a laboratory manual、、Co ld Spring Harbor Laboratory Press(19 89)に記載されているように、50mMのトリス−HCl(pH7.6)、5 mMのMgCl2、5%(w/v)のポリエチレングリコール8000、0.5 mMのATPおよび5mMのジチオスレイトールを含有する緩衝液の中で14℃ において16時間実施した。結合反応の画分を、Hanahan、D.、J.M ol.Biol.166:557−580(1983)に記載されているような 塩化ルビジウム法 により大腸菌(E.coli)の中に移した。形質転換された細菌をLBブロス および50μg/mlのカナマイシンまたは50μg/mlのアンピシリンを含 有する寒天プレート上にプレートした。放射線標識化DNAプローブの調製およ びハイブリダイゼーションは、下記の節に記載されている。 オリゴヌクレオチドはミシガン州立大学の生化学設備により合成された。 ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は、パーキン−エルマー・セツス(Perk in−Elmer Cetus)サーマルサイクラー(Perkin Elme r、コネチカット州)を使用して実施した。反応混合物は200 pmolの2 オリゴヌクレオチドPCRプライマー(表1)、200ngのプラスミド(表1 )、および2.5単位のVentポリメラーゼを供給業者(New Engla nd Biolabs Inc.、マサチュセッツ州)により推奨される緩衝条 件において含有した。細菌のPHB酵素の増幅のためのDNAサーマルサイクラ ーのプログラムは次の通りであった:95℃において4分、続いて97℃におい て1.5分−65℃において2分−72℃において3分を30回繰り返すおよび 最後に72℃において7分。TPSS断片について:95℃において4分、続い て95℃において1.5分−60℃において2分−72℃において2分を30回 繰り返す、および最後に72℃において7分。CRBプロモーターについて:9 5℃において4分、続いて95℃において1.5分−58℃において2分−72 ℃において2分を30回繰り返す、および最後に72℃において7分。PCR生 成物をアガロースゲル電気泳動により単離し、そして前述したように精製した。 ゲノムDNAの抽出および制限エンドヌクレアーゼ切断 野生型植物およびトランスジェニック植物を土壌の中で2〜3週間成長させ、 そして葉材料のほぼ5gを集め、そして液体窒素の中で凍結させた。高分子量の DNAを、Rogers、S.C.およびBendich、A.J.、 Plant Molecular Biology Manual A6:1− 10(1988)に記載されているように、凍結植物組織から抽出した。1μg のDNAについて酵素HindIIIによる制限エンドヌクレアーゼ切断を、製 造業者(New England Biolabs Inc.、マサチュセッツ 州)により推奨される条件下に実施した。 アガロースゲル電気泳動およびハイブリダイゼーション法 アガロースゲル電気泳動によるDNA分析およびナイロン膜(Hybond− N、Amersham、イリノイ州)への転移は、Southern et a l.(1975)およびSambrook、J.、Fritsch、E.F.お よびManiatis、T.、Molecular cloning:a la boratory manual、Cold Spring Harbor L aboratory Press(1989)に記載されている確立された方法 により実施した。プローブとして使用すべき特定のクローニングしたDNA断片 を適当な制限エンドヌクレアーゼでベクターから切取り、インサートをアガロー スゲル電気泳動および電気溶離によりベクターから精製した。 Feinberg、A.P.およびVolgelstein、B.、Anal. Biochem.132、6−13(1983)に記載するように、ヘキサマー を使用するランダムプライマー抽出法により、断片を32P−デオキシリボヌクレ オチドで標識化した。ナイロンフィルターを標識化プローブとハイブリダイゼー ションさせ、そしてPoirier、Y.およびJolicoeur、P.J. 、J.Virol.63、2088−2098(1989)に記載されているよ うに、フィルム上に露出した。 融合タンパク質の構築および抗体の発生 アルカリゲネス・エウトロフス(A.eutrophus)の3−ケトチオラ ーゼ、アセトアセチル−CoAレダクターゼおよびPHBシンターゼに対する抗 体を発生させるために、pIH821(New England Biolab s Inc.、マサチュセッツ州)を使用することによって、大腸菌(E.co li)のマルトース結合タンパク質malEとの融合タンパク質を構築した。p UC−Thioプラスミド(Somerville、C.R.、Poirier、Y.、およびDennis、D.E.、米 国特許出願第07/732,243号)の1.2kbpのXhoII−EcoRI断片を精 製し、T4−DNAポリメラーゼにより末端を満たし、そしてそれをpIH82 1の中にクローニングすることによって、MALE−Thiolase融合タン パク質を構築した。XbaIで消化しそしてT4−DNAポリメラーゼにより末 端を満たすことによって、ベクターを調製した。所望の向きでインサートを有す るクローンは、リーディングフレームがMALE−Thiolase融合を得る ために正しい方法で、遺伝子融合を含有する。このプラスミドをpmalE−T hioと表示した。 MALE−Reductase融合タンパク質を得るために、pUC−Red プラスミド(Somerville、C.R.、Poirier、Y.、およびDennis、D.E.、米国特許出願第07 /732,243号)をDdeIおよびSacIで消化した。0.7kbpの断片の精製 後、末端をT4−DNAポリメラーゼで満した。平滑末端のpIH821ベクタ ーを、前述したように、XbaI消化した平滑末端のpIH821ベクターの中 にクローニングした。MALE−Reductaseの発現のために正確な向き で断片を含有するクローンを、pmalE−Redと表示した。 MALE−Synthase融合タンパク質の構築のために、pUC−Syn をNcoIで消化し、そして末端をT4−DNAポリメラーゼで充填した。引き 続いて、プラスミドをHindIIIで消化し、そして1.6kbpの断片をp IH821の中にクローニングした。XbaIで消化し、そしてT4DNAポリ メラーゼで末端を満し、引き続いてHindIIIで消化することによって、ベ クターを調製した。このクローンをpmalE−Synと表示した。 pma lE−Thio、−Redおよび−SynプラスミドをDH5αの中に形質転換 しそして、製造業者(New England Biolabs Inc.、マ サチュセッツ州)が記載するように、融合タンパク質を発現させそして精製した 。免疫刺激剤としてフロインドアジュバントを使用することによって、融合タン パク質をウサギに注射してポリクローナル抗体を発生させた。 3−ケトチオラーゼ活性についてのアッセイ 100mMのトリス−HCl(pH8.0)、40mMのMgCl2および5 mMのβ−メルカプトエタノールを含有する200μlの氷冷チオラーゼ緩衝液 の中で、凍結した葉の試料(0.1g)を均質化した。ホモジネートを1000 0×gで5分間遠心することによって清澄化し、そして上澄みを新しい管に移し た。ブラッドフォード(Bradford)アッセイによりBio Radタン パク質アッセイキット(Bio Rad Laboratories、カリフォ ルニア州)を使用して、抽出物のタンパク質含量を測定した。3〜30μg/ア ッセイの植物タンパク質を使用した。異なる抽出物の中の3−ケトチオラーゼ酵 素の活性を、Senior、P.J.およびDawes、E.A.、Bioch em.J.134:225−238、1973、の方法従いアッセイした。 アセトアセチル−CoAレダクターゼ活性のアッセイ 100mMのKH2PO4(pH5.5)、0.02mMのMgCl2および4 .0mMのβ−メルカプトエタノールを含有する200μlの氷冷レダクターゼ 緩衝液の中で、凍結した葉の試料(0.1g)を均質化した。ホモジネートを1 0000×gで5分間遠心することによって清澄化し、そして上澄みを新しい管 に移した。ブラッドフォード・アッセイによりBio Radタンパク質アッセ イキットを使用して、抽出物のタンパク質含量を測定した。0.8〜10μg/ アッセイの植物タンパク質を使用した。アセトアセチル−CoAレダクターゼ 酵素の活性を、Senior、P.J.およびDawes、E.A.、Bioc hem.J.134:225−238、1973、の方法従いアッセイした。 ウェスタンブロット分析 ウェスタンブロット分析のために、酵素活性のアッセイのために前述したよう に調製した粗植物抽出物を使用した。PHBシンターゼの発現の分析のために、 100mMのトリス−HCl(pH8.0)、5mMのEDTAおよび4mMの β−メルカプトエタノールを含有する200μlの氷冷チオラーゼ緩衝液の中で 、凍結した葉の試料(0.1g)を均質化した。ホモジネートを10000×g で5分間遠心することによって清澄化し、そして上澄みを新しい管に移した。い くつかの実験において、膜および粒子の画分を1%のSDSを含有する抽出緩衝 液の中で部分的に可溶化し、そして再び遠心により清澄化した。変更されたLo wry法(Markwell、M.A.K.、Haas、M.、Bieber、L.L.およびTolbert、N.E.、Anal.Bioc hemistry 87、206-210(1978)により、この試料のタンパク質含量を測定した。 Laemmli、Nature 227:680−685、1970に従い、 ドデシル硫酸ナトリウムのポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS PAGE )により、上澄みのアリコートを分離した。タンパク質を電気泳動によりニトロ セルロースフィルターに移した。ECLウェスタンブロッティングプロトコール (Amersham International pIc、Amersham UK)において推奨されているように、ウェスタンブロット分析を実施した。 フィルターをブロッキングするために、5%の脂肪不含乳粉/0.12%のツイ ーン20を含むTBS(20mMのトリス−HCl、pH7.6、137mMの NaCl)を選択した。フィルターのインキュベーション前に、第1抗体をブロ ッキング溶液の中で1:1000に希釈した。ECLウェスタンブロッティン検 出システム(Amersham International plc、 Amersham UK)により、抗体反応を検出した。 ポリヒドロキシブチレートの分析 ガスクロマトグラフィーの分析のために、20〜100mgの葉材料を50% のエタノールで3〜4回抽出し、次いで100%のメタノールで45分〜1時間 の間55℃において抽出した。乾燥残留物を55℃において0.5mlのクロロ ホルムで少なくとも12時間抽出し、そしてエタノール中の0.8MのHClの 中で100℃において4〜6時間エステル交換した。0.9MのNaClで抽出 後、クロロホルム相をヒューレット−パッカード(Hewlett−Packe rd)5890系列IIガスクロマトグラフで分析した。細菌のPHB(Sig ma)を標準として使用した。エピフルオレセンス顕微鏡検査によりPHB顆粒 を可視化するために、葉の試料を10mMのリン酸塩緩衝液中の2%のグルタル アルデヒドの中で2時間固定した。組織を水の中ですすぎ、そして1%のナイル ・ブルーAの中で5分間染色した。組織を水の中で数回すすぎ、そして8%の酢 酸の中で1分間ソーキングし、次いで最後に水の中ですすいだ。546または5 65nmの励起波長下のエピフルオレセンス顕微鏡検査により、PHB顆粒を可 視化した(Ostle、A.G.およびHolt、J.G.、Appl.Environ.Microbiol.44、238-241、19 82)。 透過型電子顕微鏡検査 組織の試料を0.01Mのリン酸塩緩衝液(pH7.2)中の0.8%のグル タルアルデヒド/2%のパラホルムアルデヒドの中でわずかの真空下に2時間固 定した。リン酸塩緩衝液で4回洗浄した後、試料を1%の四酸化オスミウムで4 0〜60分間処理した。試料をエタノール勾配の系列で脱水し、そしてスプール (Spurr)樹脂(Ted Pella Inc.)の中に埋め込んだ。80 〜90nmの切片を切断し、銅グリッド上に配置し、そして5%の酢酸ウラニル で30〜45分間染色し、次いでレイノルズ(Reynolds)クエン酸 鉛で3〜4分間染色した。80kVで作動するJEOL100CX II透過型 電子顕微鏡で、切片を見た。 本明細書に記載する本発明の特定の実施例は、アラビドプシス・タリアナ(A rabidopsis thaliana)植物、アルカリゲネス・エウトロフ ス(Alcaligenes eutrophus)からの遺伝子およびエンド ウのトランシットペプチドを含んだが、本発明は一般的実用性を有する。植物の 中のプラスチドにおけるポリD−(−)−3−ヒドロキシブチレートおよび/ま たはポリヒドロキシアルカノエートの生産に関する請求の範囲は、アラビドプシ ス・タリアナ(Arabidopsis thaliana)に限定されず、ま たは色素体の標的化のためのアルカリゲネス・エウトロフス(Alcalige nes eutrophus)からの遺伝子または記載したトランシットペプチ ドの使用に特別に関連しない。後述する請求の範囲は、植物細胞の中に外来DN A物質を導入することによって、植物の中のプラスチドにおいてポリヒドロキシ アルカノエートを生産する一般的方法について記載する。 本発明の改良は次の通りである: 1 − 3−ケトチオラーゼ活性を有する酵素の色素体の中における生産を導く 情報をコードする外来DNA物質による植物細胞の形質転換。用語「外来DNA 物質」は、生物の中に通常存在しないが、細胞の中に導入されそして染色体の中 に組み込まれて存在するか、または染色体外の形態で存在するDNA物質を意味 する。植物細胞の色素体の中の3−ケトチオラーゼ活性の増加は、植物細胞の中 への外来DNA物質の導入から生ずる。 2 − アセトアセチル−CoAレダクターゼ活性を有する酵素の色素体の中に おける生産を導く情報をコードする外来DNA物質による植物細胞の形質転換。 植物細胞の色素体の中のアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性の増加は、植 物細胞の中への外来DNA物質の導入から生ずる。 3 − 色素体の中におけるヒドロキシアシル−CoAの生産を導く情報をコー ドする、植物細胞に対して外来である外来DNA物質による植物細胞の形質転換 。外来DNA物質による植物細胞の形質転換は、植物細胞の色素体の中のヒドロ キシアシル−CoAのレベルの増加を導く。 4 − 植物細胞のヒドロキシアシル−CoAを重合する能力を有する酵素の色 素体の中における生産を導く情報をコードする外来DNA物質による植物細胞の 形質転換。植物細胞の色素体におけるヒドロキシアシル−CoAの重合を導く酵 素活性の増加は、植物細胞の中への外来DNA物質の導入から生ずる。 5 − 植物細胞の中に外来DNA物質を導入することによる、植物細胞の色素 体における、D−(−)−3−ヒドロキシブチレートを包含する、ポリヒドロキ シアルカノエートの生産。 6 − 植物細胞の色素体におけるポリヒドロキシアルカノエートの生産は、好 ましくは2μgポリヒドロキシアルカノエート/g新鮮植物材料より高いレベル である。 7 − 色素体におけるポリヒドロキシアルカノエートの生産は、好ましくは、 外来DNA物質を導入できる任意の植物細胞において、2μgポリヒドロキシア ルカノエート/g新鮮植物材料より高いレベルである。 8 − ハイブリッド植物の色素体におけるポリヒドロキシアルカノエートの生 産は、好ましくは2μgポリヒドロキシアルカノエート/g新鮮植物材料より高 いレベルであり、これは外来DNA物質で形質転換されているが、それら自体色 素体の中でポリヒドロキシアルカノエートを生産しないか、またはハイブリッド 植物において生産されるより低いレベルでポリヒドロキシアルカノエート生産す る、2つの親植物系統から生ずる。 9 − 植物細胞の色素体の内部で顆粒の形態のポリヒドロキシアルカノエート の生産。 第3図および第4図の遺伝子を含有する種子は、ミシガン州立大学(ミシガン 州イーストランジング)において維持されている。 以上の記載は本発明の例示のみであり、そして本発明は下記の請求の範囲によ ってのみ限定されることを意図する。
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.6 識別記号 庁内整理番号 FI C12N 9/04 9359−4B C12N 9/10 9/10 9359−4B C12P 7/62 C12P 7/62 9281−4B C12N 5/00 C (C12N 15/09 ZNA C12R 1:05) (81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE, DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M C,NL,PT,SE),OA(BF,BJ,CF,CG ,CI,CM,GA,GN,ML,MR,NE,SN, TD,TG),AP(KE,MW,SD),AM,AU, BB,BG,BR,BY,CA,CN,CZ,FI,G E,HU,JP,KG,KP,KR,KZ,LK,LT ,LV,MD,MG,MN,NL,NO,NZ,PL, RO,RU,SI,SK,TJ,TT,UA,UZ,V N (72)発明者 ポワリエ,イブ アメリカ合衆国ミシガン州、イー.ランシ ング、チェリー、レイン、704、アパート メント、203

Claims (1)

  1. 【特許請求の範囲】 1. 植物の中の色素体においてポリヒドロキシアルカノエートの生産を導く 3ケトチオラーゼ、アセトアセチル−CoAレダクターゼおよびポリヒドロキシ アルカノエート(PHA)シンターゼおよびそれらの混合物から成る群より選択 される細菌のポリペプチドをコードする外来DNAを含有することを特徴とする 、トランスジェニック植物材料。 2. ポリヒドロキシアルカノエート(PHA)がポリヒドロキシブチレート (PHB)であり、そしてポリヒドロキシブチレート(PHB)合成を導く酵素 の生産のためのDNAおよびRNAのコーディング配列が配列番号:1、配列番 号:2および配列番号:3に示されるものである、請求項1に記載の植物材料。 3. 植物の中の色素体において3−ケトチオラーゼ活性を示すペプチドをコ ードする外来DNAを含有することを特徴とする、色素体を有するトランスジェ ニック植物材料。 4. オープンリーディングフレームを含有するDNAが配列番号:1に示す ものである、請求項3に記載の植物材料。 5. 植物の色素体においてアセトアセチル−CoAレダクターゼ活性をコー ドする外来DNAを含有することを特徴とする、色素体を有するトランスジェニ ック植物材料。 6. オープンリーディングフレームを含有するDNAが配列番号:2に示す ものである、請求項5に記載の植物材料。 7. 植物の色素体においてPHAシンターゼ活性を示すポリペプチドをコー ドする外来DNAを含有することを特徴とする、色素体を有するトランスジェニ ック植物材料。 8. DNAが配列番号:3に示すものである、請求項7に記載の植物材料。 9. 胚、種子または種子の零余子 (propagule)である、請求項1〜8のいず れか一つに記載の植物材料。 10. ポリヒドロキシアルカノエート(PHA)を生産しない2つの植物を 性的受精により交配することを含んでなり、各植物は植物の中の色素体において PHAを合成する植物を生産するためにPHAシンターゼによるヒドロキシアシ ル−CoAの重合を導く経路において1または2以上の異なる酵素をコードする 細菌由来の外来DNAを含有する、植物の中の色素体におけるPHAの合成を導 くポリペプチドをコードする外来DNAを導入する方法。 11. PHAがポリヒドロキシブチレート(PHB)である、請求項10に 記載の方法。 12. 植物の色素体に標的化するための修飾された3−ケトチオラーゼ遺伝 子をコードするプラスミドpBI−TPSS−ThioまたはpBIB−CCN −Thioの中に含有された遺伝子セグメント。 13. 植物の色素体に標的化するための修飾されたアセトアセチル−CoA レダクターゼ遺伝子をコードするアルカリゲネス・エウトロフス(Alcali genes eutrophus)由来のプラスミドpBI−TPSS−Red の中に含有された遺伝子セグメント。 14. 植物の色素体に標的化するための修飾されたポリヒドロキシブチレー ト(PHB)シンターゼ遺伝子をコードするアルカリゲネス・エウトロフス(A lcaligenes eutrophus)由来のプラスミドpBI−TPS S−SynまたはpBIB−HCN Synの中に含有された遺伝子セグメント 。 15. 請求項12〜14のいずれか一つに記載の遺伝子セグメントを含有す る植物。 16. 請求項1〜9のいずれか一つに記載の植物材料により生産されたポリ ヒドロキシアルカノエート。
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