JPH09505470A - 植物アシルacpチオエステラーゼ配列 - Google Patents
植物アシルacpチオエステラーゼ配列Info
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Abstract
(57)【要約】
本発明は、植物チオエステラーゼ、特にパルミトイル−ACP基質に対して実質的な活性を有する植物アシル−ACPチオエステラーゼに関する。植物種子細胞において植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼの発現のために有用なDNA構造体を記載する。そのような構造体は、その構造体がトランスジェニック植物において発現される場合、他の植物組織と比較して、種子組織における植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼの発現を選択的に指令できる調節要素の制御下で対象の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードするDNA配列を含むであろう。本発明は、植物種子細胞に生成される遊離脂肪酸の割合の修飾のために植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードするDNA配列を用いる方法にも関する。本明細書で例示される植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼ配列は、クフェア、ニラ、マンゴ及びニレを包含する。それらのパルミトイル−ACPチオエステラーゼ配列の発現の結果としてそれらの種子における高められたレベルのC16:0脂肪酸を有するトランスジェニック植物をも提供する。
Description
【発明の詳細な説明】
植物アシルACPチオエステラーゼ配列
発明の分野
本発明は、植物への遺伝子工学技法の適用に関する。より特に、本発明は植物
アシル−ACPチオエステラーゼ配列及びそのような配列の使用方法に関する。
背景
脂肪酸は約4〜24個の炭素の炭化水素鎖を有する有機酸である。鎖長において
、及び二重結合の存在、数及び位置においてお互い異なる多くの異なった種類の
脂肪酸が知られている。細胞内では、脂肪酸は典型的には、共有結合形で存在し
、そのカルボキシル部分は脂肪アシル基といわれる。それらの分子の鎖長及び飽
和の程度がしばしば、式CX:Y(式中、“X”は炭素の数を示し、そして“Y”
は二重結合の数を示す)により示される。
脂肪アシル基は多くの脂質の主要成分であり、そしてそれらの長い非極性炭化
水素鎖はそれらの脂質分子の水不溶性性質の原因となる。脂肪アシル基の他の因
子への共有結合のタイプは変化することができる。たとえば、生合成反応におい
て、それらは特定の酵素反応に依存して、チオエステル結合を通してアシルキャ
リヤータンパク質(ACP)又は補酵素A(CoA)に共有結合されることができる。ワッ
クスにおいて、脂肪アシル基はエステル結合を通して脂肪アルコールに結合され
、そしてトリアシルグリセロールはエステル結合を通してグリセロール分子に結
合される3個の脂肪アシル基を有する。
油の脂肪酸組成はその物性及び化学的性質、及び従ってその用途を決定する。
植物、特に植物種子において多量の油を合成する植物種は食用及び産業使用の両
者のために重要な油源である。
パルミテート含有率により列挙された、主要油種子の脂肪酸組成が下記表Iに
示される。ココヤシの実の胚乳及びヤシの仁のラウレート(C12:0)源を除い
て、通常の食用油のすべては、基本的に16:0,18:0,18:1(オレエート)
、18:2(リノレエート)及び18:3(リノレネート)から成る。
植物栽培家は、植物交雑及び所望する特性を担持する子孫の選択により所望す
る特性を未来に導びくプログラムを通して種々の植物種子油の収量及び脂肪酸組
成を都合良く修正してきた。従って、本技法の適用は、同じ植物種内に見出され
る特性に限定される。他方、突然誘発剤への暴露は、植物種子油の組成に変化を
もたらすことができる特性をも導びく。しかしながら、脂肪酸合成(FAS)が葉(
クロロプラスト)及び種子組織(プロプラスチド)において生じる
ことを注目することが重要である。従って、突然変異誘発アプローチは時々、植
物種子油の組成の所望する変性をもたらすけれども、植物の他の組織におけるFA
Sを変えないであろう変化をもたらすことは困難である。
広範囲の新規植物油組成、及び/又は生合成又は天然植物源から脂肪酸組成を
得又は操作するための改良された手段は、種々の意図された使用のために必要と
される。突然変異誘発による植物栽培は、この必要性を満たすことはできず、そ
して標的の植物遺伝子プール外であるいづれかの油性質の導入を提供する。
高等植物は、FAS複合体の一部として、植物プラスチドオルガネラ(すなわち
クロロプラスト、プロプラスチド又は他の関連するオルガネラ)における通常の
代謝経路を通して脂肪酸を合成すると思われる。(脂肪酸とは遊離脂肪酸及びア
シル−脂肪酸基を意見する)。プラスチドオルガネラを除いて、脂肪酸はトリア
シルグリセロール(トリグリセリド)中に組込まれ、そして植物膜及び中性脂質
において使用される。油が生成され、そして未来での使用のためにエネルギー源
として貯蔵される種子を開発する場合、FASがプロプラスチドに存在する。
脂肪酸の生成は、酵素、β−ケトアシル−ACPシンターゼIIIにより触媒される
ブチリル−ACPを生成するためにアセチル−CoAとマロニル−ACPとの間での反応
によりプラスチドにおいて始まる。16−及び18−炭素の脂肪酸へのアセチル−AC
Pの拡張は、次の反応の順の環化作用を包含する:β−ケトアシル−ACPを形成す
るためのマロニル−ACPからの2炭素ユニットとの縮合(β−ケトアシル−ACPシ
ンターゼ)、アルコールへのケト−機能の還元(β−ケトアシル−ACPレダクタ
ーゼ)、エノイル−ACPを形成するための脱水(β−ヒドロキシアシル−ACPデヒ
ドラーゼ)及び最後に、拡張さ
れた飽和アシル−ACPを形成するためのエノイル−ACPの還元(エノイル−ACPレ
ダクターゼ)。β−ケトアシル−ACPシンターゼIはパルミトイル−ACP(C16:
0)までの拡張を触媒し、そしてβ−ケトアシル−ACPシンターゼIIはステアロイ
ル−ACP(C18:0)への最終拡張を触媒する。FASにより生成される最長鎖の脂肪
酸は典型的には18個の炭素の長さである。一飽和脂肪酸はまた、デサチュラーゼ
酵素の作用を通してプラスチドにおいて生成される。
プラスチドに存在する追加の脂肪酸生化学段階は、ステアレート、すなわち、
18炭素アシル−ACPに対するその高い活性のために、しばしば、“ステアロイル
−ACPデサチュラーゼ”ともいわれるΔ−9デサチュラーゼによりしばしば触媒
される反応においてオレオイル−ACP(C18:1)を形成するためのステアロイル
−ACP(C18:0)の不飽和化である。デサチュラーゼ酵素は、下記反応(I)に
従って9番目の炭素で二重結合を付加するように働く:
ステアロイル−ACP+フェレドキシン(II)+O2+2H+→
オレオイル−ACP+フェレドキシン(III)+2H2O.
プラスチドにおける炭素−炭素伸張は、グリセロール3−ホスフェートへのア
シル基の移行により停止され、そして得られるグリセロ脂質がプラスチドの“原
核性”脂質生合成経路に保持される。他方、特定のチオエステラーゼは、遊離脂
肪酸及びACPへのその新しく生成されるアシル−ACPの加水分解により原核性経路
を阻止することができる。続いて、遊離脂肪酸はプラスチドを出、そしてリン脂
質、トリグリセリド及び他の中性脂質の形成を担当する小胞体において“真核性
”脂質生合成経路中に導入される。
これまでは、18:1−ACPチオエステラーゼに対して特異的な植物アシル−ACP
チオエステラーゼは知られており、そして“長鎖”−又は“オレオイル”−ACP
チオエステラーゼと称せられる。核遺
伝子によりコードされる18:1−ACPチオエステラーゼは、細胞質においてプレ
タンパク質として合成され、そして続いて、プラスチド中に導入される。配列は
いくつかの被子植物から得られており、そして遷移性ペプチドにおける高い変動
性は別として、それらはお互いひじょうに類似する。最近、Pollard,et al.,
(Arch.of Biochem.and Biophys.(1991)284:1−7)は、California Bay
のウンベリュラリアカリホルニア(Umbellularia california)の発育する油種子
において中間鎖のアシル−ACPチオエステラーゼ活性を同定した。この活性は、
発育する子葉がラウロイル(12:0)及びカプロイル(10:0)脂肪酸とのトリ
グリセリドのほぼ独占的な生成を開始する場合にのみ現れる。この研究は植物に
おける中間鎖脂肪酸合成のための機構についての第1の証拠を表わした。続いて
月桂樹のチオエステラーゼがDavies et al.,(Arch.Biochem.Biophys.(199
1)290:37−45)により精製されており、これは関連するクローンを得、そして
植物のトリグリセド組成を変性するために使用されて来た対応するcDNAのクロー
ニングを可能にした(Voelker et al.(1992)Science 257:72−74;WO91/164
21及びWO92/20236)。
小胞体への遊離脂肪酸の輸送に続いて、トリグリセリドのための続く連続的な
段階が生じ得る。たとえば、多不飽和脂肪アシル基、たとえばリノレオイル及び
α−リノレノイルが、膜結合性酵素の作用によりオレオイルアシル基の連続的な
不飽和化の結果として生成される。そのような膜結合性酵素の可溶化の困難性が
、それらの酵素を特徴づけるため努力を妨げて来た。追加の二重結合が12位の炭
素で付加され、そしてその後、付加された場合、それぞれΔ−12デサチュラーゼ
及びΔ−15デサチュラーゼの作用を通して15位の炭素で付加される。従って、そ
れらの“デサチュラーゼ”は、それぞれ
一又は多不飽和脂肪酸を創造する。
次に、トリグリセリドが1−,2−及び3−アシル−ACPトランスフェラーゼ
酵素、グリセロール−3−ホスフェートアシルトランスフェラーゼ、リゾホスフ
ァチジン酸アシルトランスフェラーゼ及びジアシルグリセロールアシルトランス
フェラーゼの作用により形成される。植物細胞の脂肪酸組成は、アシルトランス
フェラーゼ活性の結果としてトリグリセリド中に組込まれる遊離脂肪酸プール及
び脂肪酸(脂肪アシル基)の反映である。従って、トリグリセリド分子において
は、下記式(I):
〔式中、X,Y及びZは、お互い同じであっても良く又はお互い異なっていても
良い脂肪アシル基をそれぞれ表わす〕として表わされる。トリグリセリドにおけ
る異なった位置での脂肪アシル基の種々の組合せが、トリグリセリドの性質を変
えるであろう。たとえば、脂肪アシル基がほとんど飽和された脂肪酸である場合
、トリグリセリドは室温で固体であろう。しかしながら、一般的に植物油は異な
ったトリグリセリドの混合物であろう。従って、トリグリセリド油の性質は、そ
れらのそれぞれの脂肪アシル組成により影響される、油を製造するトリグリセリ
ドの組合せの結果である。
たとえば、ココアバターは、そのトリグリセリド組成の機能である一定の所望
する性質(マウスフィール、鋭い融点、等)を有する。ココアバターは、およそ
24.4%のパルミテート(16:0)、34.5%のステアレート(18:0)、39.1%の
オレエート(18:1)及び2%のリノレエート(18:2)を含む。従って、ココ
アバターにおいては、パルミトイル−オレオイル−ステアロイル(POS)(すなわ
ち
、X,Y及びZはそれぞれ式Iにおける通りである)は、トリグリセリド組成物
のほとんど50%を包含し、そしてステアレート−オレエート−ステアレート(SOS
)及びパルミトイル−オレオイル−パルミトイル(POP)は、トリグリセリド組成物
のそれぞれ39%及び16%のバランスでの主要部分を包含する。対象の他の新規油
組成物は、トリグリセリド分子の個々の位置で中間鎖の脂肪酸を有するトリエル
シン(3個のエルカ酸)又はトリグリセリドを包含する。
パルミトイルが式IのX及びZ位置でエステル化されており、そしてC18脂肪
アシル基がYで存在するトリグリセリド分子が特に興味の対象である。そのよう
なPXP(パルミトイル−C18−パルミトイル)分子に富んでいる植物油はショート
ニング用途に一定の所望する性質を有し、そして消費者又は産業食品製造者のた
めに機能的な効果を高めるために固体ショートニングへの添加剤として使用され
るであろう。たとえば、ジパルミテートは、ケーキベーキング用途のために全体
の脂肪の適切な結晶化を付与するためにベーキング及びフライ用途のためのショ
ートニングに添加され得る。さらに、ジパルミテートは他の可能な脂肪添加剤、
たとえばジステアレートよりも溶融性質に対して低い効果を有し、そしてベーキ
ング物内で高い“広がり能力”を有するショートニングを製造するために使用さ
れ得る。ジパルミテート含有ショートニングのこの性質は、ショートニングがた
とえばパイ皮又は甘味物において積層成分として使用される場合、特に興味の対
象である。
さらに、パルミテート及び/又はステアレート脂肪酸からの、飽和脂肪酸含有
に富む植物油は室温で固体でありがちである。そのような植物脂肪は、化学的な
水素化の必要性を伴わないで、ショートニング、マーガリン及び他の“広がる”
食品に直接的に使用され得る。水素化は、液体油における不飽和脂肪酸を飽和形
に転換する工
程であり、この工程は油をマーガリン及びショートニング用途に有用な固体脂肪
に転換する。化学的な水素化に関連する費用及び他のいづれかの要因は、植物油
が植物種子において富んでいるパルミテート及び/又はステアレートであるよう
に構築される場合に回避され得る。パルミテート及びステアレートがトリグリセ
リドのsn−2位から除外されている植物油がこれに関して特に興味の対象である
。
さらに、パルミトイル及びステアロイル脂肪アシル基の有意な割合(すなわち
40%)を含む植物油に由来する脂肪酸は、そのような植物油から得られるパルミ
テートに富む画分の所望する軟化性質のために食品乳化用途に使用される。
従って、種々の植物油変性、たとえば一定の油製品のための代用の収穫物源及
び/又は植物種子のための新規脂肪酸組成物を付与するための手段が所望される
。
図面の説明
図1.マンゴ・クラスIアシル−ACPチオエステラーゼcDNAクローンの核酸配
列及び翻訳されたアミノ酸配列を提供する。
図2.マンゴ・クラスIIアシル−ACPチオエステラーゼcDNAクローン(MANI−
2)の核酸配列及び翻訳されたアミノ酸配列を提供する。
図3.ニラからの部分的なクラスIIアシル−ACPチオエステラーゼcDNAクロー
ン8−2のDNA配列を提供する。
図4.ニラからの完全な長さのクラスIIアシル−ACPチオエステラーゼcDNAク
ローン9−1のDNA配列を提供する。
図5.月桂樹のクラスIIC12好適アシル−ACPチオエステラーゼcDNAクローン
の核酸配列及び翻訳されたアミノ酸配列を提供する。
図6.完全な長さのクラスIIクフェアホーケリアナ(Cuphea hookeriana)チオ
エステラーゼ(CUPH−2)cDNAクローン、CMT7の核酸配列及び翻訳されたアミ
ノ酸配列を提供する。
図7.完全な長さのクラスIIクフェアホーケリアナチオエステラーゼ(CUPH−
1)cDNAクローン、CMT9の核酸配列及び翻訳されたアミノ酸配列を提供する。
図8.ニレC10:0−ACPチオエステラーゼ(クラスII)部分的cDNAクローン
の核酸配列及び翻訳されたアミノ酸配列7を提供する。
図9.樟脳PCR−生成チオエステラーゼをコードする配列7の核酸配列及び翻
訳されたアミノ酸配列を提示する。
図10.月桂樹のチオエステラーゼ遺伝子のクラスIIを表わす、月桂樹のチオエ
ステラーゼクローン、月桂樹のDの核酸配列及び翻訳されたアミノ酸配列を提示
する。
図11.ブラシカカンペストリス(Brassica campestris)の長鎖アシルACPチオエ
ステラーゼクローンの核酸配列及び翻訳されたアミノ酸配列を示す。
図12.第2のマンゴクラスIIクローン(M4−23)の核酸配列及び翻訳された
アミノ酸配列を提供する。
図13.C16:0−ACPチオエステラーゼCUPH-1(Ch FatB1)構造体pCGN4800に
より形質転換された植物からのブラシカナプス(Brassica napus)212/86プール
の種子サンプルの脂肪酸分析。
図14.ニレのクラスIIアシル−ACPチオエステラーゼ構造体PCGN4803により形
質転換された植物からのブラシカナプス212/86プールの種子サンプルの脂肪酸
分析。
発明の要約
本発明は、植物チオエステラーゼ、特異的にはトランスジェニック植物種子に
おいてC16:0(パルミテート)脂肪酸を生成できる植物アシル−ACPチオエス
テラーゼに関する。そのようなアシル−ACPチオエステラーゼはパルミトイル−A
CPチオエステラーゼとして本発明においては言及されるが、しかしまた、種々の
鎖長の他のアシル−ACPに対する活性をも示す。
本発明によれば、植物種子細胞において植物パルミトイル−ACPチオエステラ
ーゼの発現のために有用なDNA構造体が記載される。そのような構造体は、その
ような構造体がトランスフェニック植物において発現される場合、他の植物組織
と比較して、種子組織において選択的に発現を指図できる調節要素の制御下でパ
ルミトイル−ACP加水分解活性を有する植物チオエステラーゼをコードするDNA配
列を含むであろう。DNA構造体の少なくとも1種の要素は少なくとも1種の他の
要素に対して異種であり、又は植物細胞に見出される場合、少なくとも1種の要
素が植物細胞に対して異種であろう。
異なった態様において、植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼを発現でき
る第1のDNA構造体、及びアンチセンスステアロイル−アシルACPデサチュラーゼ
配列を発現できる第2のDNA構造体を含む宿主植物細胞が所望される。そのよう
な第1のDNA構造体は、そのような構造体がトランスゲニック植物において発現
される場合、他の植物組織に比較して、種子組織において植物チオエステラーゼ
の発現を選択的に指図できる調節要素の制御下で対象の植物パルミトイル−ACP
チオエステラーゼをコードするDNA配列を含むであろう。第2のDNA構造体は、植
物宿主の種子細胞において植物ステアロイル−アシルACPデサチュラーゼアンチ
センス配列の転写を指図できる調節要素の制御下でアンチセンス配向に位置する
植物ステアロイル−アシルACPデサチュラーゼ要素をコードするDNA配列を
含むであろう。
さらに異なった態様において、本発明は、植物種子細胞に生成される遊離脂肪
酸の割合の変性のために植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードするD
NA配列を用いる方法に関する。同様のやり方で、本発明は、トリグリセリドの組
成、すなわち高められたレベルのC16脂肪アシル基を含むように植物種子により
生成される植物油を変性するためにそのような植物パルミトイル−ACPチオエス
テラーゼをコードする配列を用いる方法に関する。植物及び植物部分、特に種子
及びそのような変性された脂肪酸組成を有する、そのような種子から抽出された
油が本明細書において企図される。
本明細書において例示される植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼ配列は
、ニラ類、マンゴ、クフェアホーケリアナ及びニレから得られる配列を包含する
。
発明の詳細な記載
本発明により、植物においてパルミテート(C16:0)の高められた蓄積のた
めの機構が立証される。すなわち、C16:0−ACP基質に対する活性を有する植
物アシル−ACPチオエステラーゼを、提供し、そしてトランスゲニック植物の種
子に発現される場合、高められたレベルのパルミテートの生成を導びくことを立
証する。
多くの植物アシル−ACPチオエステラーゼのコード配列及び翻訳されたアミノ
酸配列の分析は、“クラスI”又は“Fat A”(脂肪アシルトランスフェラーゼ
タイプA)及び“クラスII”(又は“Fat B”)として命名した、植物アシル−
ACPチオエステラーゼの2種の進化クラスの存在を示した。それらのクラスは、
チオエステラーゼをコードする配列が得られた種々の植物の系統分類関係の単純
な考えではない。たとえば、クフェアホーケリアナFat Aクローン
(WO94/10288の図10におけるクローンCLT7)は、ベニバナFatAクローン(WO9
2/20236の図4に提供される配列)に密接して関連する。対照的に、クフェアホ
ーケリアナFat Bクローン(図7のCUPH−1クローン)は、クフェアホーケリア
ナFat Aクローン及びベニバナFat Aクローンとは進化関係において同程度に異
なっている。
クラスIチオエステラーゼは、マンゴ(図1)、ベニバナ、ブラシカカンペス
トリス及びクフエアホーケリアナに見出されており、これらの配列は現在継続中
である1992年9月21日に出願されたUSSN07/949,102及びWO92/20236及びWO94
/10288に提供される。クラスIIチオエステラーゼはカリフォルニアの月桂樹(
図5及び10)、ニレ(図8)、クフェアホーケリアナ(図6及び7)、及び樟
脳(図9)に発見されている。現在、すべての既知植物の中間鎖を好むアシル−
ACPチオエステラーゼはクラスIIタイプのものであり、そしてすべての既知の18
:1−ACPチオエステラーゼはクラスIタイプのものである。
驚くべきことには、図7に示されるクフェアホーケリアナクラスIIクローンは
、パルミトイル−ACP脂肪酸に対して選択的な活性を有し、そしてトランスゲニ
ック植物の種子において発現される場合、トリグリセリド中に組込まれるC16:
0脂肪アシル基の含有率を高めるように脂質合成経路を変えることができること
が発見された。この発見は、このクフェア種がその種子貯蔵脂質においてC8及
びC10脂肪アシル基を主に蓄積するので予想できなかった。クフェアC16:0−
ACPチオエステラーゼは、種々の植物組織、たとえば葉、茎及び根に発現される
ことが示されており、ところがC8:0及びC10:0基質に対して選択的に活性
である異なったクフェアクラスIIチオエステラーゼ(CUPH−2;図6)は種子組
織に選択的に
発現された。
クラスIIアシル−ACPチオエステラーゼクローンは、月桂樹のC12:0−ACPチ
オエステラーゼクローンに対するランダムにクローン化されたcDNAフラグメント
の相同性に基づいてアラビドプシスシリク(Arabidopsis silique)cDNAライブラ
リーにも発見された。アラビドプシスのチオエステラーゼをコードする完全な長
さのcDNAクローンがまた得られ、そして広範囲のアシル−ACP基質、たとえば16
:0−ACPに対する活性を有するチオエステラーゼをコードすることが示された
。従って、クラスIIタイプの脂肪アシル−ACPチオエステラーゼ配列は中間鎖の
長さの脂肪酸を蓄積することが知られていない植物種に見出され得ることが現在
わかっている。そのようなアシル−ACPチオエステラーゼ配列がたとえば、C16
:0−ACP基質に対する有意な又は好ましい活性を有するそれらのクローンを同
定するために、E.コリ(E.coli)又は植物細胞における発現により試験され得
る。
本出願においては、クフェアホーケリアナのパルミトイル−ACPチオエステラ
ーゼのcDNA配列(図7)、並びにマンゴ(図2及び12)及びニラ類(図3及び4
)からの追加のC16:0−ACPチオエステラーゼ配列が提供される。さらに、ニ
レアシル−ACPチオエステラーゼクローンのDNA配列が提供される(図8)。トラ
ンスジェニック植物種子におけるニレクローンの発現は、トリグリセリドにおけ
る高められた割合のC16:0脂肪アシル基、並びにC16:0脂肪アシル基の割合
のより低い上昇率をもたらす。トランスジェニク植物種子油のパルミトイル含有
率を高めるために使用され得る、それらのすべてのアシル−ACPチオエステラー
ゼ配列は、他のクラスII植物チオエステラーゼタンパク質との有意な配列の同一
性を示す。
C16:0脂肪酸の有意な存在性を有する植物はまた、天然由来の
パルミトイル−ACPを好む植物チオエステラーゼを得るための候補体でもある。
しかしながら、パルミテートの有意な存在性を有さない他の植物源はまた、他の
酵素源としてスクリーンされ得ることもまた認識される。上記で論ぜられたよう
に、パルミトイル−ACPチオエステラーゼ活性を示すタンパク質は、“クラスII
”チオエステラーゼとして本明細書において知られている特定クラスのアシル−
ACPチオエステラーゼに関して、DNA及びアミノ酸レベルで高い程度の相同性を示
すであろうと思われる。従って、いづれかの対象の植物において追加の植物のパ
ルミトイル−ACPチオエステラーゼについて容易にスクリーンすることが可能で
ある。
次の例により詳細に記載されているように、C16:0脂肪酸に対する活性を有
するアシル−ACPチオエステラーゼは、種子トリグリセリドにおけるC16:0脂
肪酸の百分率の上昇を伴って、標的のトランスジェニック植物の種子に発現され
得る。たとえば、トランスジェニック性ブラシカナプス(Brassica napus)植物の
種子においてのクフェア・ホーケリアナ(Cuphea hookeriana)クローン、CUPH
−1(Ch Fat B1)としても知られている)の発現は、プールされた種子サン
プルにおいて7〜26モル%の範囲のC16:0種子脂肪酸含有率を有する形質転換
体をもたらす。選択された形質転換体からの個々の種子の分析は、34モル%まで
のC16:0脂肪酸含有率を示した。同様に、マンゴクラスIIクローン(図2に示
されるMANT−2配列)の発現は、プールされた種子サンプルにおいて7〜16モル
%の範囲のC16:0種子脂肪酸含有率を有する形質転換体をもたらす。ニレから
のクラスIIアシル−ACPチオエステラーゼの発現(図8)は、15〜32モル%の範
囲のC16:0のプールされた種子脂肪酸含有率を有するトランスジェニックブラ
シカナプスを生成する。さらに、C14:0脂肪酸含有率は、2〜12モル%の範囲
のレベルにそ
れらの種子において高められ、そしてC10:0(4モル%まで)及びC12:0(
15モル%まで)における上昇がまた観察される。形質転換された種類の非トラン
スジェニック種子におけるC12:0,C14:0及びC16:0脂肪酸のバックグラ
ウンド・レベルはそれぞれ、約0.02,0.14及び6モル%である。非トランスジェ
ニック種子におけるC10:0脂肪酸は典型的には、1%以下で存在するものとし
て決定される。(対照におけるC10:0バックグラウンド値は、そのレベルが非
トランスジェニックブラシカナプス植物種子の分析において0〜1%に変化する
場合、非C10:0ピークの機械読み取りの結果であり得る。)記載されたトラン
スジェニック植物のTAG位置分析は、その種子トリグリセリドのsn−2位置から
のC16:0脂肪アシル基の除外を示すことが予測される。ブラシカ(Brassica)
植物における種子ミクロソーム2−アシルトランスフェラーゼは、C18:1−Co
A以外の基質に対して効果的な活性を示さない。さらに、月桂樹C12:0−ACPチ
オエステラーゼにより形質転換された植物における種子脂質は50モル%までのC
12:0脂肪酸を含むが、しかしC12:0アシル基はトリグリセリドのsn−1及び
sn−3位置にほとんど独占的に位置した(WO92/20236)。
本発明の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼDNA配列はタンパク質、ポリ
ペプチド又はペプチドフラグメントの形でアミノ酸をコードし、このアミノ酸は
植物酵素反応条件下でパルミトイル−ACP基質からC16:0遊離脂肪酸(すなわ
ちパルミテート)の生成を触媒する能力を示す。“酵素反応条件”とは、いづれ
かの必要な条件が酵素の機能を可能にするであろう環境(すなわち、温度、pH、
阻害物質の欠乏のような因子)に利用できることを意味する。
抗体調製物、核酸プローブ(DNA及びRNA)及び同様のものが調製され得、そして
種々の植物源から“相同”又は“関連する”パルミト
イル−ACPチオエステラーゼをスクリーンし、そして回収するために使用され得
ることを当業者は容易に認識することができるであろう。典型的には、核酸プロ
ーブは、酵素又は他の方法もまた使用され得るが、好ましくは放射能によりラベ
ルされ、検出を可能にされる。免疫学的なスクリーニング方法に関しては、抗体
調製物、たとえばモノクローナル又はポリクローナル抗体が利用される。ポリク
ローナル抗体は、ほとんど特異的ではないが、典型的には、遺伝子単離において
より有用である。検出に関しては、抗体は放射能を用いて、又は市販の種々の第
2抗体/酵素結合体システムのいづれか1つを用いてラベルされる。前記利用で
きる抗体検出システムのいくつかの例がOberfilder(Focus(1989)BRL Life Te
chnol.,Inc.,11:1〜5)により記載されている。
相同の配列が、配列の同一性が存在する場合、見出され、そして配列の情報、
核酸又はアミノ酸の比較、又は既知のチオエステラーゼと候補体源との間のハイ
ブリダイゼーション反応を通して決定され得る。保存性変化、たとえばGlu/Asp
,Val/Ile,Ser/Thr,Arg/Lys、及びGln/Asnはまた、配列の相同性を決定す
ることにおいても考慮され得る。典型的には、長い核酸配列は、50〜60%の配列
同一性及びより好ましくは少なくとも約70%の配列同一性を、標的の配列と存在
し、そしてさらに関連していると思われるいづれかの欠失を除外する対象の一定
の植物チオエステラーゼとの間に示すことができる。アミノ酸配列は、2種の完
全な成熟タンパク質間に25%ほどの配列同一性により相同であると思われる。(
一般的に、Doolittle,R.F.,OF URFS and ORFS(University Science Books,CA
,1986)を参照のこと)
すべての植物チオエステラーゼは核酸レベルで約50%の配列同一性を示すが、
クラスIIのメンバー間における配列同一性の百分率は
少なくとも60%に高まる。アミノ酸レベルで、カリフォルニア月桂樹におけるア
ミノ酸60〜アミノ酸150に相当する領域は、クラスIIチオエステラーゼのメンバ
ー間にひじょうに高い程度の保存性を示すであろう。
追加のパルミトイル−ACPチオエステラーゼを得るためには、対象の候補体植
物源から調製されたゲノム又は他の適切なライブラリーは、相同的に関連する配
列を同定するために1又は複数のクラスII植物チオエステラーゼからの保存され
た配列によりプローブされる。次に、陽性クローンが、制限酵素消化及び/又は
配列決定により分析される。ゲノムライブラリーが使用される場合、コード領域
並びそのような植物源からのチオエステラーゼ遺伝子の転写調節要素の両者を供
給する1又は複数の配列が同定され得る。プローブはまた、完全な配列よりも相
当に短い。オリゴヌクレオチドが使用され得るが、しかし少なくとも約10、好ま
しくは少なくとも約15、より好ましくは少なくとも20個の長さのヌクレオチドで
あるべきである。より短い長さの領域が比較のために使用される場合、より高い
程度の配列同一性がより長い配列のためによりも必要とされる。より短いプロー
ブは、ポリメラーゼ鎖反応(PCR)のために、特に高く保存された配列が同定され
得る場合、特に有用である。(Gould,et al.,PNAS USA(1989)86:1934−1938
を参照のこと)
より長い核酸フラグメントがプローブとして使用される場合(100bp以上)、特
に完全な又は大きなcDNA配列を用いる場合、20〜50%の偏差を伴っての標的サン
プルからのシグナル、すなわち相同配列を得るためには、中適度に高い緊縮性(s
tringencies)(たとえば最少の洗浄を伴って37℃で50%のホルムアミドを用いる
)を伴ってさらにスクリーンすることができる。(スクリーニング技法に関する
追加の情報のためには、Beltz,et al.,Meth.Enzymology(1983)
100:266〜285を参照のこと)
再び、図2〜10に示されるような配列が相同の植物パルミトイル−ACPチオエ
ステラーゼを同定するために使用され得るのみならず、また、それから得られる
配列は他の植物源から植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼを得るための追
加の方法を提供できる。特に、PCRは、本明細書は提供される配列データから関
連する植物チオエステラーゼを得るために有用な技法であり得る。当業者は、配
列の比較又は典型的には高く保存された配列の領域に基づいてオリゴヌクレオチ
ドプローブを企画することができるであろう。
核酸配列が得られた後すぐに、宿主細胞における植物パルミトイル−ACPチオ
エステラーゼの転写、又は転写及び翻訳(発現)が、酵素の容易な源を生成し、
そして/又は脂肪酸及び/又は本明細書において見出されるトリグリセリドの組
織を変性するために所望される。他の有用な用途は、宿主細胞が植物宿主細胞で
ある場合、インビトロ及びインビボで見出される。
たとえば、植物FAS複合体に利用できるパルミトイル−ACPを好むチオエステラ
ーゼの量を高めることによって、パルミテートの高められた百分率が提供され得
る。同様の態様において、いくつかの用途に関して、利用できるパルミトイル−
ACPチオエステラーゼの量の上昇と同時に植物FAS複合体に利用できるステアロイ
ル−ACPデサチュラーゼの量を低めることによって、飽和脂肪酸及びパルミテー
トの実質的な上昇が得られる。
植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードする核酸配列が種々の構造
体において、たとえば追加の配列を得るためのプローブとして使用され得る。他
方、それらの配列は、ヒンビトロ又はインビボでの酵素の回収又は研究のために
宿主細胞における対象のそれぞれのチオエステラーゼのレベルを高めるために、
又は宿主細胞
が植物実在物、たとえば植物細胞、植物部分(種子、切り枝又は組織に限定され
ない)及び植物である場合、いくつかの用途のために対象のそれぞれのチオエス
テラーゼのレベルを低めるために適切な調節配列と一緒に使用され得る。
本発明の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードする核酸配列は、
ゲノム、cDNA又はmRNA配列を包含することができる。“コードする(encoding)”
とは、配列が特定のアミノ酸配列にセンス又はアンチセンス方向において一致す
ることを意味する。“染色体外”とは、その配列が天然において関連する植物ゲ
ノムの外部に存在することを意味する。“組換え体”とは、その配列が変異誘発
による操作、制限酵素及び同様のものを通して、遺伝的に構築された変性を含む
ことを意味する。cDNA配列は、プレプロセッシング配列、たとえば輸送(transit
)ペプチド配列を含んでも又は含まなくても良い。輸送ペプチド配列は、一定の
オルガネラへのタンパク質の輸送を促進せしめ、そしてオルガネラ中への侵入に
基づいてアミノ酸成分から切断され、“成熟”配列が放される。前駆体植物パル
ミトイル−ACPチオエステラーゼDNA配列の使用は、植物細胞発現カセットにおい
て好ましい。他のプラスチド輸送ペプチド配列、たとえば種子ACPの輸送ペプチ
ドは、対象の種々のオルガネラに本発明の植物パルミトイル−ACPチオエステラ
ーゼをトランスロケートするために使用され得る。11/15/89に出願されたU.S.
07/437,764号及びヨーロッパ特許出願公開第189,707号を参照のこと。同様の態
様において、一定の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼ輸送ペプチドが得
られた後すぐに、それは、その天然のコード領域以外の配列をトランスロケート
するために使用され得る。種々のクラスIIチオエステラーゼクローンに対する配
列の比較は、それらのチオエステラーゼクローンのための輸送ペプチド領域につ
いての情
報を提供する。精製された月桂樹C12:0−ACPチオエステラーゼの成熟N−末
端は、残基84としてのアミノ酸配列決定により本来決定された(Voelker et al.
(1992)Science 257:72−74)。しかしながら、これは、すべてのFat B代表物
(月桂樹チオエステラーゼのためには残基60−82;図5)間に保存されるほとん
どのN−末端領域を輸送ペプチド中に配置する。この配列は、高い程度の配列保
存のためのみならず、また、それが疎水性ドメインに類似するチラコイド遷移性
ペプチドを含むので、ストロマ輸送ペプチドのためには異例であろう。この保存
された領域は輸送配列の一部ではなく、そしてそれはプロセスされた成熟タンパ
ク質のN−末端部分に含まれると思われる。トランスゲニックカノラ種子におけ
る月桂樹チオエステラーゼの発現は40KD、すなわち34KDの精製された種子タンパ
ク質よりも長いMrを有する月桂樹チオエステラーゼを生成するこの仮説と調和す
る。この40KD形は月桂樹チオエステラーゼのインビボ状態を表わし、そして34KD
形は精製の間の限定されたN−末端のタンパク質加水分解に起因する。
さらに、上記で論ぜられたように、植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼ
の完全なゲノム配列が、プローブ、たとえばcDNAプローブによりゲノムライブラ
リーをスクリーニングし、そして種子組織における発現を調節するそれらの配列
を単離することによって得られる。この態様においては、植物パルミトイル−AC
Pチオエステラーゼの転写及び翻訳開始領域、イントロン及び/又は転写終結領
域が、チオエステラーゼ構造遺伝子を伴って又はそれを伴わないで、種々のDNA
構造体への使用のために得られる。従って、本発明の植物パルミトイル−ACPチ
オエステラーゼに対応する核酸配列はまた、プラスチド中への輸送を指図するの
に有用なシグナル配列、有用な組織及びタイミングプロフィールを有する5′上
流の非コード
調節領域(プロモーター)、転写及び翻訳調節領域として有用な3′下流の非コ
ード調節領域も提供することができ、そして遺伝子の他の特徴に対する洞察力を
寄与する。
所望する植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼ核酸配列が得られた後すぐ
に、それは種々の手順で操作され得る。その配列が非コード領域を包含する場合
、フランキング領域は再切断、変異誘発、等にゆだねられ得る。従って、トラン
ジッション、トランスバージョン(変異)欠失及び挿入が、天然に存在する配列
に対して実施され得る。さらに、その配列のすべて又は一部が合成され得る。構
造遺伝子においては、1又は複数のコドンが、変性されたアミノ酸配列を提供す
るために変性され得、又は1又は複数のコドン変異が構成又は発現に関与する便
利な制限部位又は他の目的を提供するために導入され得る。構造遺伝子は、合成
アダプター、1又は複数の便利な制限部位を導入するためのリンカー又は同様の
ものを用いることによってさらに変性され得る。
本発明の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードする核酸又はアミ
ノ酸配列は種々の手段で他の非天然の又は“異種(heterologous)”配列と組合さ
れ得る。
“異種”配列とは、植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼに連結されるこ
とが天然において見出されていないいづれかの配列を意味し、そしてたとえば、
天然において一緒に連結することが見出されていない同じ植物からの核酸配列の
組合せを意味する。
本発明の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードするDNA配列は、そ
のチオエステラーゼに通常関連する遺伝子配列のすべて又は一部に関して使用さ
れ得る。その成分部分においては、DNAチオエステラーゼコード配列が、転写の
5′から3′方向に、宿主細胞において転写及び翻訳を促進できる転写開始制御
領域、植物
パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードするDNA配列及び転写及び翻訳終結
領域を有するDNA構造体において組合される。
可能性ある宿主細胞は原核及び真核細胞の両者を包含する。宿主細胞は単細胞
であり得、又はその意図された使用に依存して多細胞分化又は未分化有物に見出
され得る。本発明の細胞は、本明細書に存在する野生型細胞に関係しない植物パ
ルミトイル−ACPチオエステラーゼを有することにより、たとえば植物パルミト
イル−ACPチオエステラーゼをコードする組換え核酸構造体を有することにより
区別され得る。
宿主に依存して、調節領域、たとえばウィルス、プラスミド又は染色体遺伝子
からの領域、又は同様のものは変化するであろう。原核又は真核微生物、特に単
細胞宿主における発現のためには、広範囲の種類の構成又は調節可能なプロモー
ターが使用され得る。微生物における発現は、植物酵素の整った源を提供するこ
とができる。これまで記載されて来た転写開始領域間には、細菌及び酵母宿主、
たとえばE.コリ(E.coli),B.サブチリス(B.subtilis)、サッカロミセス
セレビシアエ(Sacchromyces cerevisiae)からの領域、たとえばβ−ガラクトシ
ダーゼ、T7ポリメラーゼ、トリプトファンE及び同様のものが存在する。
ほとんどの場合、構造体は植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼの変性さ
れた生成及びたぶん、脂肪酸組成の変性を提供する植物において機能的な調節領
域を包含するであろう。植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼ又はその機械
的なフラグメントをコードする読み取り枠が、その5′端で、転写開始調節領域
、たとえばチオエステラーゼ構造遺伝子に向かって上流の5′に天然において見
出される野生型配列に連結されるであろう。広範囲の種類の構成上の又は調節可
能な、たとえば誘発できる、構造遺伝子機能の転写を
提供する多くの他の転写開始領域が利用できる。植物のために使用される転写開
始領域間には、例えばナパリン及びマンノピン・シンターゼのための構造遺伝子
、又はナピン、ACPプロモーター及び同様のものに関連するそのような領域が存
在する。そのような構造遺伝子に対応する転写/翻訳開始領域がそれぞれの開始
コドンに対してすぐの5′上流で見出される。チオエステラーゼタンパク質の発
現が植物宿主において所望される態様においては、完全な植物パルミトイル−AC
Pチオエステラーゼ遺伝子のすべて又は一部の使用が所望され;すなわち構造遺
伝子配列及び3′下流の非コード領域と一緒に、5′上流の非コード領域(プロ
モーター)のすべて又は一部が使用され得る。異なったプロモーター、たとえば
対象の植物宿主に生来のプロモーター、又は変性されたプロモーター、すなわち
1つの遺伝子源に由来する転写開始領域及び異なった遺伝子源に由来する翻訳開
始領域(ここで対象の植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードする配
列を包含する)を有するプロモーター、又は増強されたプロモーター、たとえば
二重35S CaMVプロモーターが所望される場合、その配列は標準の技法を用いて
一緒に連結され得る。
5′上流の非コード領域が種子の成熟の間に調節される他の遺伝子から得られ
るそのような出願には、植物胚組織において選択的に発現されるもの、たとえは
ACP及びナピン由来の転写開始制御領域が記載されている。そのような“種子特
異的プロモーター”が得られ、そして1/25/88出願のアメリカ特許出願第07/
147,781号(現在、7/9/90出願のアメリカ特許出願第07/550,804号)及び表
題“Novel Sequences Preferentially Expressed In Early Seed Development a
nd Methods Related Thereto”を有する、1990年3月16日に出願されたアメリカ
特許出願第07/494,722号の教授に従
って使用され得る。種子組織において選択的に発現される、すなわち他の植物部
分において検出できない転写開始領域が、遺伝子生成物のいづれかの分裂性又は
逆効果を最少にするために脂肪酸変性のために所望されると思われる。
調節転写終結領域は、同様に本発明のDNA構造体に供給され得る。転写終結領
域は、植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼをコードするDNA配列又は異なっ
た遺伝子源に由来する便利な転写終結領域、たとえば転写開始領域に天然におい
て関与する転写終結領域により提供され得る。転写終結領域が異なった遺伝子源
からである場合、それは少なくとも約0.5kb、好ましくは約1〜3kbの配列を含
み、ここで前記配列は終結領域が由来する構造遺伝子の3′側に存在する。
高められた又は低められた発現のための対象のDNA配列として植物パルミトイ
ル−ACPチオエステラーゼを有する植物発現又は転写構造体が、広範囲の種類の
植物生命体、特に食用及び産業使用のために植物油の生成に関与する植物生命体
を伴って使用され得る。適切な油性種子収穫物が最とも好ましい。対象の植物は
、ナタネの種子(カノラ及び高エルカ酸品種)、ヒマワリ、ベニバナ、綿花、ク
フェア(Cuphea)、ダイズ、ナンキンマメ、ココヤシの実及びヤシ油及びトウモ
ロコシを包含するが、但しこれだけには限定されない。宿主細胞中に組換え構造
体を導入するための方法に依存して、他のDNA配列が必要とされ得る。重要なこ
とには、本発明は双子葉類及び単子葉類種に適用でき、そして新規及び/又は改
良された形質転換及び調節技法に容易に適用できるであろう。
形質転換の方法は本発明に臨界ではなく;植物形質転換の種々の方法が現在利
用できる。より新しい方法が収穫物を形質転換するために利用できるので、それ
らはここで直接的に適用され得る。たと
えば、アグロバクテリウムの感染に対して天然において敏感な多くの植物種は、
アグロバクテリウム介在形質転換の三元又は二元ベクター法を通して都合良く形
質転換され得る。さらに、種々の単子葉及び双子葉植物種の形質転換を可能にす
る、マイクロインジェクション、DNA粒子衝撃、エレクトロポレーションの技法
が開発されて来た。
DNA構造体を開発する場合、その構造体又はそのためのフラグメントの種々の
成分が、細菌宿主、たとえばE.コリにおいて複製できる便利なクローニングベ
クター中に通常挿入されるであろう。文献に記載されて来た種々のベクターが存
在する。個々のクローニングの後、プラスミドが単離され、そして所望する配列
の成分を適合せしめるために追加の操作、たとえば制限、新規フラグメントの挿
入、連結、欠失、挿入、再切断、等にゆだねられ得る。構造体が完結された後す
ぐに、次にそれは宿主細胞の形質転換の方法に従って追加の操作のために適切な
ベクターにトランスファーされ得る。
通常、DNA構造体に包含されるものは、宿主における発現のための必要な調節
領域を有し、そして形質転換細胞の選択を提供する構造遺伝子である。その遺伝
子は、細胞毒性物質、たとえば抗生物質、重金属、毒素、等に対する耐性、栄養
要求宿主に原栄養性を提供する相補性、ウィルス免疫性又は同様のものを提供す
ることができる。異なった宿主種の数に依存して、発現構造体又はその成分が導
入され、1又は複数のマーカーが使用され得、この際、選択のための異なった条
件がその異なった宿主のために使用される。
DNAコードの縮重は、アミノ酸配列のいづれかの対応する変性を伴わないでDNA
配列のいくつかのコドンの置換が許容されることを提供することが注目される。
上記のように、DNA構造体が植物宿主中に導入される方法は本発
明に臨界的ではない。効果的な形質転換を提供するいづれかの方法が使用され得
る。植物細胞の形質転換のための種々の方法は、Ti−又はRi−プラスミド、マイ
クロインジェクション、エレクトロポレーション、DNA粒子衝撃、リポソーム融
合、DNA衝撃又は同様のものを包含する。多くの場合、特に左及び右のボーダー
、より特定には左のボーダーを有する、T−DNAにより1つの又は両側に隣接し
ている構造体を有することが所望されるであろう。これは、T−DNA ボーダーは
形質転換の他の態様を使用するけれども、構造体が形質転換のための態様として
A.ツメファシエンス(A.tumefaciens)又はA.リゾゲネス(A.rhizogenes)を
用いる場合、特に有用である。
アグロバクテリウムが植物細胞形質転換のために使用される場合、アグロバク
テリウム宿主に存在するT−DNA又はTi−又はRi−プラスミドによる相同組換え
のためにアグロバクテリウム宿主中に導入され得るベクターが使用され得る。組
換えのためにT−DNAを含むTi又はRi−プラスミドは武装され(嬰瘤(gall)形
成を引き起こすことができる)、又は非武装され(嬰瘤形成を引き起こすことが
できない)、後者は、vir遺伝子が形質転換されたアグロバクテリウム宿主に存
在する限り許容される。武装されたプラスミドは正常な植物細胞及び嬰瘤の混合
物を付与することができる。
アグロバクテリウムが植物細胞を形質転換するためのビークルとして使用され
る場合、T−DNAボーダーにより隣接される発現構造体は、広い宿主範囲のベク
ター中に挿入され、文献に記載される広い宿主範囲のベクターが存在する。pRK
2又はその誘導体が通常使用される。たとえば、Ditta et al.,PNAS USA(1980
)77:7347−7351及びEPA0120515を参照のこと。発現構造体及びT−DNAは1又
は複数のマーカーを含み、これは形質転換されたアグロバクテリウ
ム及び形質転換された植物細胞の選択を可能にする、多くのマーカー、たとえば
クロラムフェニコールに対する耐性、アミノグリコシドG418、ヒグロマイシン
又は同様のものが、植物細胞との使用のために開発されて来た。使用される特定
のマーカーは本発明には不可決ではなく、1又は複数のマーカーが特定の宿主及
び構成の態様に依存して、好ましい。
アグロバクテリウムを用いての植物細胞の形質転換のためには、外植片が組合
され、そして形質転換のために十分な時間、形質転換されたアグロバクテリウム
と共にインキュベートされ、細菌が殺害され、そして植物細胞が適切な選択培地
において培養される。カルスが形成した後すぐに、菌条の形成が既知の方法に従
って、適切な植物ホルモンを用いることによって促進され、そして菌条は植物の
再生のために根づかせのための培地に移される。次に、植物は種子に成長せしめ
られ、そしてその種子がくり返しての再生を確立するために及び植物油の単離の
ために使用される。
一旦、修飾された脂肪酸組成を有する種子を生成できるトランスジェニック植
物が得られると、変異誘発法を包含する従来の植物育成技法がその脂肪酸組成を
さらに操作するために使用され得る。他方、追加の外来性脂肪酸変性DNA配列が
、その脂肪酸組成をさらに操作するために遺伝子技法により導入され得る。形質
転換の方法は本発明においては臨界的ではないことが注目される。しかしながら
、遺伝子構築性植物形質転換法、すなわち1つの所望するDNA配列を挿入する力
の使用は臨界的である。これまでは、植物油の脂肪酸組成を変性する能力は植物
交雑の間、性的に移行される特性又は変異誘発により生成される効果的に機能す
る特性の導入に限定された。種間遺伝子情報の導入を可能にする遺伝子工学技法
の使用及び内因性遺伝子の組織特異性発現を調節する手段を通して、変性された
脂肪酸組成を有する植物種子油の生成のための新規方法が利用できる。さらに、
本明細書に記載される手段の適用に基づいて新規植物種子油の開発のための可能
性が存在する。
植物宿主細胞における植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼの発現と協調
して対象の1又は複数の他の配列の転写、又は転写及び翻訳を提供するために選
択できる。特に、植物パルミトイル−ACPチオエステラーゼの発現と組合しての
ステアロイル−ACPデサチュラーゼの減じられた発現がいくつかの用途において
好ましい。
対象の1つ以上の核酸配列の組合された効果のために形質転換された植物を供
給することを所望する場合、典型的には、別々の核酸構造体が個々のために供給
されるであろう。上記のような構造体は転写、又は転写及び翻訳調節制御P領域
を含む。当業者はそれぞれの発現又はアンチセンス構造体に関して示される上記
原理に従って最終生成物に適切な所望するタイミング及び組織特異性を提供する
ために調節配列を決定できるであろう。複数の構造体が使用される予定である場
合、それらが同じ脂肪酸変性配列又は異なった脂肪酸変性配列に両者とも関連し
ているかどうかについては、異なった調節配列が配列間の自発的な相同組換えを
減じるために個々のカセットに使用されることが所望される。その構造体は、得
られる生成物がそのゲノム中に組込まれる両特性を有する植物である限り、同じ
か又は異なった方法、たとえば従来の植物育成法を通してトランスゲニック植物
を交雑することによってのそのような特性の導入により宿主細胞中に導入され得
る。
本発明の植物ステアロイル−ACPデサチュラーゼは、植物宿主細胞、すなわち
インビボにおいて、又は植物細胞様環境、すなわちインビトロにおいて脂肪アシ
ル−ACP成分中への第1の二重結合の挿入を触媒できる植物源から得られる、ア
ミノ酸、たとえばタンパク
質、ポリペプチド、又はペプチドフラグメントのいづれかの配列を含む。“植物
細胞様環境”とは、いづれかの必要な条件が、酵素の機能を可能にする環境(す
なわち温度、pH、阻害物質の欠乏のような要因)において利用できることを意味
する。特に、本発明は脂肪アシル−ACP鎖の9番目の炭素位置でそのような第1
の二重結合を付加する酵素に関する。異なった特異性を有する本発明の類似する
植物デサチュラーゼ酵素、たとえばニンジンのΔ−12デサチュラーゼが存在する
。
デサチュラーゼの量を減じることによって、飽和脂肪酸の高められた百分率が
提供される。アンチセンス、トランスイッチ、リボザイム又はいくつかの他のス
テアロイル−ACPデサチュラーゼ低下技法を用いて、植物細胞に利用できるデサ
チュラーゼの量の低下が生成され、高い百分率の飽和物、たとえば1又は複数の
ラウレート(C12:0)、ミリステート(C14:0)、パルミテート(C16:0
)、ステアレート(C18:0)、アラキデート(C20:0)、ベヘメート(C22
:0)及びリグノセレート(C24:0)がもたらされる。ナタネ種子においては
、減じられたデサチュラーゼは高められたステアレートレベル及び合計の飽和物
をもたらす。高められたレベルのパルミテート又はパルミテート及びステアレー
トを有するトリグリセリドの生成が特に興味の対象である。さらに、種々の範囲
のそのような飽和物の生成が所望される。従って、低い及び高いレベルのパルミ
テート又はパルミテート及びステアレート脂肪酸を有する植物細胞が企画されて
いる。たとえば、10%レベルのパルミテート及びステアレートを有する、油を含
む脂肪酸組成物及び約60%レベルまでのパルミテート及びステアレートを有する
ように企画された組成物、又は他のそのような変性脂肪酸組成物が企画されてい
る。
高められた百分率のパルミテート又はパルミテート及びステアレートを有する
油が所望される。天然源から25倍までの範囲での高められたステアレート百分率
(重量による)が記載されている。DNA構造体(たとえばプロモーターの選択、
コピーの数、等)及び従来の育成法の種々の観点の操作により、当業者はステア
レートのさらに高いレベルを達成できる。種子組織における植物パルミトイル−
ACPチオエステラーゼの発現と組合しての植物デサチュラーゼ配列の組合せによ
り、高められた百分率のパルミテート及びステアレートがナタネ種子及び他の植
物種において達成され得る。
C.チンクトリウム(C.tinctorius)のデサチュラーゼ遺伝子のDNA配列、並
びにリシナス(Ricinus)、ブラシカ(Brassica)及びシモンドシア(Simmondsi a
)植物からのデサチュラーゼ遺伝子のDNA配列が、1992年9月21日に出願された
継続中のUSSN07/949,102に見出される。
本発明は現在一般的に記載されており、例示目的であり、本発明を限定するも
のではない次の例により一層容易に理解されるであろう。
実施例
実施例1 チオエステラーゼ遺伝子配列
A.マンゴ(Mango)
マンゴのcDNAバンクを、Stratagene Zap cDNA Synthesis キット(Stratagene
:La Jolla,CA)に記載されるような方法を用いて用意する。マンゴの胚を、食
料雑貨屋から購入されたグリーン(成熟しているが、柔らかくはない)マンゴか
ら集める。合計のRNAを、Webb and Knapp(Plan+Mol.Biol。Reporter(1990)8
:180−195)のDNA単離法を変性することによって前記胚から単離する。緩衝
液は次のものである:
REC:50mMのトリスcl pH9,0.7MのNacl,10mMのETDA pH 8,
0.5%のCTAB。
REC+:使用のすぐ前でβ−メルカプトエタノールを加えて1
%にしている。
RECP:50mMのトリスcl pH9,10mMのEDTA pH8,及び0.5%
CTAB。
RECP+:使用のすぐ前でβ−メルカプトエタノールを加えて1
%にしている。
組織1gの抽出のために、10mlのREC+及びPVPP 0.5gを、液体窒素において
砕かれ、そして均質化されている組織に添加する。その均質化された材料を1200
rpmで10分間、遠心分離する。その上清液を3mlの冷クロロホルム上にミラクロ
スを通して注ぎ、そして再び均質化する。12,000RPMで10分間の遠心分離の後、
上部相を取り、そしてその体積を決定する。等体積のRECP+を添加し、そしてそ
の混合物を室温で20分間静置する。その材料を10,000rpmで20分間、2度遠心分
離し、そして上清液を個々の回転の後、捨てる。ペレットを1μのNacl(DEPC)0.
4mlに溶解し、そして等体積のフェノール/クロロホルムにより抽出する。エタ
ノール沈殿に続いて、ペレットをDEPC水1mlに溶解する。
手短に言えば、cDNA合成のためのクローニング方法は次の通りである。第1の
鎖cDNA合成は、Robinson,et al.(Methods in Molecalar and Cellular Biolog
y(1992)3:118−127)によるいくらかの修正を伴ってのStatagene Instruction
Manualに従ってである。特に、30μgのLicl沈殿化された合計RNAが、5μgの
ポリ(A)+RNAの代わりに使用され、そしてその反応は37℃よりもむしろ45℃
で1時間インキュベートされる。
スクリーニングのため約300,000個のプラークを供給するために、0.9%のNZY
上部アガロースにおいて150mmのNZYプレート当たりLE392 E.コリ細胞上に約15
000pfuでプレートすることによって、前記ライブラリーをスクリーンする。プラ
ークをColony/Plague Screen(NEN)上に持ち上げ、そして変、中和及びベーキン
グをStratagoneに記載されているようにして行なった。
フィルターを、フィルター間にテフロンスクリーンを有するプラスチック製箱
において、50%のホルムアミド、5×のSSC、10×のDenharts、0.1%(w/v)
SDS、5mMのNa2EDTA、0.1mg/mlの変性されたサケ精子DNA(2時間〜一晩)にお
いて室温で再ハイブリダイズする。ハイブリダイゼーションは、添加される10%
(w/v)のデキストランスルフェート及びプローブを伴って上記と同じ緩衝液
において室温で行なわれる。使用されるプローブは、図11に示される配列のヌク
レオチド27-1191を含むブラシカ クラスエチオエステラーゼのフラグメントで
ある。フィルターを1×SSC/0.1%SDSにより2分間、そして0.1×SSC/0.1%SD
Sによりそれぞれ20分間2度洗浄する。フィルターをX−線フィルムに一晩暴露
する。26個のハイブリダイズするプラークを同定する。プラーク精製及びファー
ゲミド(phagemid)切断を、Stratagene Zap cDNA Synthesis Kitの指示に記載さ
れているようにして行なう。
分析された25個の精製されたファーゲミドのうち、2種のクラスからのチオエ
ステラーゼクローンを、DNA配列分析により同定した。9個のクローンがクラス
Iチオエステラーゼをコードし、そして16個がクラスIIチオエステラーゼをコー
ドする。個々のクラスの最長メンバーの配列は、図1(クラスI)及び図2(ク
ラスII)に示される。
マンゴのライブラリーを追加のチオエステラーゼクローンのため
に再スクリーンした。ファージ(147200pfu)を、上記のようにして16個のNZYプ
レート(9200pfu/プレート)上にプレートする。個々のプレートのために、約9
200個ファージを600μlのLE392細胞(1 0.D.,10mMのMgSO4における)と共に
混合し、そして37℃で20分間インキュベートする。次に細胞を、0.9%のNZY上部
アガロース(55℃)6mlを添加することによってプレートし、そして37℃に暖め
られたNZYプレート上に直接的に注ぐ。プレートを37℃で一晩インキュベートす
る。プラークをColony/Plague Screen(NEN)上に持ち上げ、そして変性及び中和
を上記のようにして(Stratagene)行なう。フィルターを一晩、空気乾燥せしめ
、プレハイブリダイズし、そして上記のようにしてハイブリダイズせしめる。マ
ンゴクラスIIチオエステラーゼのPCRフラグメント(図2)をプローブとして使
用する。プローブを、次のプライマーを用いてPCR鋳型としてpCGN5214プラスミ
ドから調製する:
次のPCR条件が使用される:Perkin−Elmer GeneAmp PCR System 9600サーモサ
イクラーにおいて30サイクルの間、94℃で15秒、50℃で30秒、72℃で30秒。約12
00個の得られる塩基対のPCRフラグメントを、Stratagene“Prime-itII Random P
rime Labeling Kit”を用いて放射性ラベルする。ラベルされたDNAフラグメント
をSephadex−G50回転カラムに達し、組込まれていないdHTPを分離する。ラベル
されたプローブをハイブリダイゼーション溶液に添加する。この溶液において室
温で一晩のインキュベーションの後、膜を1×SSC+0.1%のSDSにより室温で15
分間1度洗浄し、続いて同じ条件下で0.1×SSC+0.1%のSDSにより2度洗浄する
。膜をX線フィルムに3日間、露光する。合計28個の陽性シグナルがX線フィ
ルム上に見出され、そしてその対応するクローンを追加のスクリーニングのため
に取る。DNA配列分析により、17個のクローンを、アシル−ACPチオエステラーゼ
をコードするものとして同定した。28個の陽性シグナルを除くすべてが、図2に
提供されるマンゴのクラスIIクローンと同一であった。他のクローン、すなわち
前のマンゴのクラスIIチオエステラーゼクローンに密接に関連するM4−23が図
12に示されている。
B.ニラ(Leek)
マンゴのチオエステラーゼ配列の単離についての上記方法と同じようにして、
λZAP(Stratagene)におけるニラcDNAライブラリーをチオエステラーゼクローン
のためにスクリーンする。ファージ(2×105pfu)を、上記のようにして10個のNZ
Yプレート上にプレートする(20,000pfu/プレート)。個々のプレートのために
は、約20,000個のファージを600μlのLE392細胞と共に混合し(10mMのMgSO4にお
いて10.D)、そして37℃で15分間インキュベートする。次に細胞を、7mlの0.9%
NZY上部アガロース(55℃)を添加することによってプレートし、そしてNZYプレ
ート上に直接的に注ぐ(上記を参照のこと)。プレートを37℃で一晩インキュベ
ートする。4℃で2時間のインキュベートに続いて、ファージを上記のようにし
てクローン/プラークスクリーン膜(New England Nuclear)上に持ち上げる。誤
った陽性のシグナルを防ぐために二回の持ち上げを行なう。持ち上げた後、膜を
上記のように、変性し、中和し、そしてすすぐ。ファージDNAをUV Stratalinker
2400(Stratagene)を用いて膜へ架橋する。次に膜を、50%ホルムアミド及び5
×SSCを含むプレハイブリダイゼーション溶液に沈め、そして室温で2時間イン
キュベートする(振盪を伴う)。
3種のチオエステラーゼDNAフラグメントを、ハイブリダイゼー
ション反応への使用のために選択する。混合されたプローブは、
(1)月桂樹12:0チオエステラーゼフラグメント(図5に示される月桂樹cDNA
のゲル精製された400bpのPstIフラグメント);
(2)マンゴのクラスIIチオエステラーゼ(図2)及び(3)バラシカのクラス
Iチオエステラーゼ(図11)を含んだ。約100ngの個々の精製されたDNAフラグメ
ントを、Pharmacia“Ready-To-Go”DNAラベリング キットを用いて放射性ラベ
ルする。製造業者の指示に従って、50μCiの32P-dCTPを個々の反応のために使用
する。ラベルされたDNAフラグメントをSephadex−G25回転カラムに通し、組込
まれていないdNTPを分離する。3種のラベルされたプローブを混合し、そして75
mlのハイブリダイゼーション溶液(10%のデキストランスルフェートを含むプレ
ハイブリダイゼーション溶液)に添加する。室温でこの溶液における一晩のイン
キュベーションの後、膜を室温で15分間2度、1×SSC+0.1% SDSにより洗浄し
、続いて0.1×SSC+0.1% SDSにより同じ条件下で2度洗浄する。膜をX−線フ
ィルムに一晩露光する。
合計28個の陽性シグナルがX−線フィルム上に見出された。5個のクローン(
LTE 6−1,8−2,8−3,9−1,9−4として称される)を追加のスク
リーニングのために取った。ファージを、200μlのSM緩衝液にアガロースのコ
アーをソークすることによって陽性シグナルの部分におけるプレートから溶出す
る。個々のファージを約100pfu/プレートの力価で上記のようにしてプレートす
る。ファージDNAを膜に移し、変性し、中和し、そして架橋する。膜を初期スク
リーニングに使用される同じプローブによりハイブリダイズせしめ、そして同一
の条件下で洗浄する。プラークの大部分がまた、二次スクリーニングにおいても
陽性である。十分に単離された陽性プラークを取り、そしてStratageneからのEx
assist/SO
LRシステムを用いて切断にゆだねる。現在、pBluescriptの二本鎖ファゲミドに
おけるクローン化されたDNA挿入体を精製し、そしてABS自動配列決定機を用いて
配列決定する。
5個の選択されたクローンのDNA配列は、クローン8−2,8−3及び9−4
が同一であり、そして9−1及び6−1が同一であるように見え、そして他の3
種のクローンと同一でない場合、ひじょうに密接して関連していることを示した
。それらのcDNAクローンによりコードされるニラのチオエステラーゼは、クラス
IIチオエステラーゼに対して高い相同性を示す。8−2及び9−1の予備の核酸
配列及び翻訳されたアミノ酸配列が図3及び4に提供される。
C.クフェア(Cuphea)
アシル−ACPチオエステラーゼクローンをクフェア・ホーケリアナ(Cuphea ho okeriana
)からWO94/10288に記載されているようにして単離する。クラスIIC
.ホーケリアナクローンの配列は図6及び7に提供される。
D.ニレ(Elm)
クラスIIアシル−ACPチオエステラーゼクローンを、WO94/10288に記載されて
いるようにしてニレから単離する。このクローンのDNA配列は図8に与えられる
。
実施例2 E.コリにおけるアシル−ACPチオエステラーゼの発現
単離された配列によりコードされるチオエステラーゼの基質選択性を決定する
ために、E.コリにおける発現のための組換えDNA構造体を調製する。
A.マンゴ
pET3a発現ベクター中にマンゴクラスIIチオエステラーゼをコードする配列を
挿入するために、マンゴクラスIIチオエステラーゼcD
NA,MANI−2をE coRIにより消化する。線状化されたプラスミドを次のプライ
マーを用いてPCR鋳型として使用する:
次のPCR条件が使用される:Perkin-Elmer GeneAmp PCR System9600サーモサイ
クラーにおける30サイクルの間、94℃ 1分、60℃30秒、72℃ 2分。約1100個
の塩基対をもたらすPCRフラグメントは、推定される成熟タンパク質開始コドン
(ロイミン112)のすぐ上流にNdeI部位を含む。そのフラグメントをTA1000ベク
ター(Invitrogen)中にクローン化し、pCGN5217を生成する。pCGN5217をNdeI
及びEcoRIにより消化し、成熟マンゴチオエステラーゼ コード配列の大部分を
含むフラグメントを生成する。NdeI/EcoRIフラグメントを、NdeI/EcoRIに
より消化されたプラスミド発現ベクターpET3a(Novagen;Madison,WI)中に挿入
し、pCGN5218をもたらす。発現の分析のために、pCGN5218を用い、T7ポリメラ
ーゼ(Novagen)を含むE.コリ株BL21(DE3)を形質転換する。
異なった成熟タンパク質のN−末端候補体(ロイシン88)を含む追加の構造
体を調製する。PCRを、次のPCR条件によりプライマー4466及び4464を用いて行な
う:30サイクルのために94℃ 1分、60℃ 30秒、72℃ 2分。PCRフラグメン
トをCloneAmp System(GIBCO BRL)中にクローン化し、そして得られるプラスミ
ドをNdeI及びEcoRIにより消化し、成熟マンゴチオエステラーゼ コード配列
の大部分を含む約1200塩基対フラグメントを生成する。そのNdeI/EcoRIフラ
グメントを、NdeI/EcoRIにより消化されたプラスミド発現ベクターpET3a(No
vagen)中に挿入する。発現の分析のために、その得られるプラスミドを用いて
、T7ポリメラーゼ(Novagen)を含むE.コリ株BL21(DE3)を形質転換する。
lacZ融合タンパク質としての発現のために、PCRをプライマー4463及び4464に
より行ない、ロイシン112コドンに向かって5′で挿入されたXbaI部位で開始し
、そしてヌクレオチド1561で挿入されたEcoRI部位で終結する約1100塩基対のXb
aI/EcoRIフラグメントを製造する。他方、プライマー4465及び4464を用いて
、プロリン81コドンに向かって5′で挿入されたXbaI部位で開始し、そしてヌ
クレオチド1561で挿入されたEcoRI部位で終結する約1200塩基対のフラグメント
を製造する。PCR条件は次の通りである:30のサイクルのために94℃ 1分、60
℃ 30秒、72℃ 2分。
PCRフラグメントをCloneAmp System(GIBCO BRL)中にクローン化する。そのプ
ラスミドをXbaI及びEcoRIにより消化し、2つの推定される成熟タンパク質N
−末端の1つからの成熟マンゴ チオエステラーゼ コード配列の大部分を含む
約1100又は1200塩基対フラグメントを生成する。XbaI/EcoRIフラグメントを
、XbaI/EcoRIにより消化されたプラスミド発現ベクター、たとえばpBCSK(St
ratagene)中に挿入する。発現分析のために、そのベクターを用いて、E.コリ
fadD+細胞(市販の細胞、たとえばBRLからのSURE細胞がまた使用され得る)、
又はE.コリ変異体、すなわち中間鎖特異的アシル−CoAシンターゼを欠くfadD(
Onerath et al.,Eur.J.Biochem(1969)7:559-574)中に挿入する。
lacZ融合タンパク質としてマンゴM4−23(pCGN5234)クラスIIチオエステ
ラーゼコード配列を発現するために、クローンをSphI及びHindIIIにより切断す
る。得られたフラグメントを、Gene CleanIIキット(Bio 101)を用いて0.7%アガ
ロースTBEゲルから単離する。フラグメントを、SphI及びHindIIIによりまた消
化されたpUC18(Novagen;Madison,WI)中に連結し、pCGN5235を生成する。pCGN5
235をSmaI及びHindIIIにより消化し、そしてSmaI及びHind
IIIによりまた消化されたpBC SK(Stratagene)中にサブクローン化し、pCGN5236
を生成する。
PCRプライマー
チオエステラーゼ活性アッセイのために、マンゴのチオエステラーゼ構造体を
含むE.コリ細胞の培養物20ml及び対照の細胞の類似する培養物を25〜37℃で増
殖し、約0.5のOD600にする。チオエステラーゼ発現の誘発を、IPTGを添加し、0.
4mMにし、続いて1〜18時間の追加の増殖により達成することができる。
個々の培養物の10mlのアリコートを、次のようにしてC10:0−ACP,C12:
0−ACP,C14:0−ACP,C16:0−ACP,C18:0−ACP及びC18:1−ACP基
質に対する比活性についてアッセイする。細胞を、遠心分離により収穫し、0.4m
lのアッセイ緩衝液に再懸濁し、そして高波処理により溶解する。細胞残骸を追
加の遠心分離により除去する。上清液を、C10:0−ACP,C12:0−ACP,C14
:0−ACP,C16:0−ACP,C18:0−ACP及びC18:1−ACP基質を用いて、Da
vies et al.,Arch.Biochem & Biophys.(1991)290:37-45によるチオエステラ
ーゼ活性をアッセイに使用する。
脂肪酸組成物の分析のために、上記のようにして増殖され、そして誘発された
E.コリ細胞のサンプル4.5mlを、テフロンで裏打ちされたキャップを有する15m
lのガラス製バイアル中に移す。C11:
0遊離脂肪酸、C15:0遊離脂肪酸及び1:1のクロロホルム:メタノール溶液
中、C17:0−TAGをそれぞれml当たり1mg含む1mg/mlの標準溶液100μlをサ
ンプルに添加し、続いて氷酢酸200μl及び1:1のクロロホルム:メタノール
溶液10mlを添加する。サンプルを十分に混合し、そして完全な相分離のために10
00rpmで5分間、遠心分離する。低部の相(クロロホルム)を注意して除去し、
そして回転蒸発器(Rotovap)への使用のために適切なきれいなフラスコに移す。
サンプルを乾燥近くまで蒸発する。中間鎖脂肪酸が、溶媒が除去された後、選択
的に蒸発するように見えるので、室温でバイアルを維持するためには十分な加熱
を用いることが重要である。乾燥されたサンプルを、メタノール中、5%硫酸溶
液1mlを添加し、そのサンプルを5mlのバイアルに移し、90℃の水浴においてサ
ンプルを2時間インキュベートすることによってメタノリシスする。サンプルを
冷却し、その後、0.9%Nacl1ml及びヘキサン300μlを添加する。サンプルを十
分に混合し、そして1000rpmで5分間、遠心分離する。上部(ヘキサン)層を注
意して除き、そしてガラスコーン挿入物を有するプラスチック製オートサンプラ
ーバイアルに配置し、続いて、クリップシールによりそのバイアルをキャップす
る。
サンプルを、10又はそれよりも少ない炭素を有する成分の分離を高めるための
温度プログラムを用いてガス−液体クロマトグラフィー(GC)により分析する。
使用される温度プログラムは、3分間、140℃の温度、続いて230℃に達するまで
、5℃/分での温度上昇を提供し、そして230℃が11分間維持される。サンプル
をHewlett-Packard 5890(Palo Alto,CA)ガスクロマトグラフィー上で分析す
る。脂肪酸含有率の計算は、内部標準に基づかれている。
マンゴM4−23クローンを発現するE.コリ細胞のチオエステラ
ーゼ活性及び脂肪酸組成分析の結果が下記表IIに示されている。
上記結果は、M4−23マンゴ クラスIIチオエステラーゼが16:0−ACP基質
に対して特異性を有し、そしてC18:1−ACP及びC18:0−ACP基質に対してい
くらかの活性を有することを示す。
B.ニラ
PCR反応を、チオエステラーゼcDNAの成熟コード領域の5′中への便利な制限
部位の挿入のために使用する。PCRプライマーは、ユニーク制限部位の導入のた
めに企画されている(5′端でSacI−NdeI及び停止コドンの後の右の3′端で
KpnI)。末端で前記の記載された制限部位を有するニラのチオエステラーゼの
完全な成熟タンパク質コード領域(図4のアミノ酸位置118でのロイシンで始ま
る)を、PCRにより生成する。得られるDNAフラグメントをpBluescriptクローニ
ングベクター中に挿入し、lacZ融合構造体を創造し、又は他方、pETプラスミド
ベクター中に連結し、非融合構造体を製造する。
ニラのチオエステラーゼlacZ融合構造体により形質転換されたE.コリ細胞
を増殖し、そして上記のようにIPTGにより誘発する。細胞溶解物を、上記のよう
にしてチオエステラーゼ活性についてア
ッセイする。
9−1及び8−2ニラクローンに関するチオエステラーゼ活性アッセイの結果
は、ニラクラスIIチオエステラーゼが16:0−ACP基質に対して高い特異性を有
し、そして14:0,18:0及び18:1−ACP基質に対してのいくらかの低い活性
が観察されるこを示す。
C.クフェア及びニレ
E.コリにおけるクフェア ホーケリアナ(CUPH−1及びCUPH−2)及びニラ
クラスIIアシル−ACPチオエステラーゼクローンの発現がWO94/10288に記載され
ている。クフェアCUPH−2クローンは、C8及びC10基質に対して高められた活
性を示した。このクローンは、天然のクフェア ホーケリアナ種子におけるC8
及びC10脂肪酸の生成を担当するチオエステラーゼ活性を表わすことが決定され
た。しかしながら、CUPH−1クローンの発現は、C16:0及びC14:0−ACP基
質に対して高められた加水分解活性を示した。C.ホーケリアナ種子はC14:0
及びC16:0−脂肪酸の有意なレベルを含まないので、それらの脂肪酸の生成が
CUPH-1発現の直接的な結果であるか又はE.コリ細胞自体におけるいくらかの
活性の結果であるかどうかは明確ではなかった。
CUPH-1形質転換記載K27(fad D)の液体培養物の合計脂肪酸分析が下記表III
に示される。
14:0,16:0,16:1及び18:1のレベルは、対照に比較して高められる。
トランスゲニック植物細胞におけるCUPH−1クローンの発現により本明細書に示
されるように、E.コリ表現型は16:0−ACP基質に対して卓越した活性を有す
るCUPH−1アシル−ACPチオエステラーゼの結果であり、そして14:0−ACPに対
してはいくらかの低い活性を有するものの結果である。
ニレアシル−ACPチオエステラーゼの発現はC10:0-ACP基質に対して高めら
れた加水分解活性をもたらし、この活性はニレ種子におけるC10:0−脂肪酸の
有意なレベルを占める。しかしながら、C16:0基質に対しての高められた活性
がまた観察され、そしてニレ種子はC16:0脂肪酸の有意なレベルを含まないの
で予測できな
い結果が観察される。WO94/10288に提供されるデータは、C16:0−ACP加水分
解活性がニレのチオエステラーゼよりもむしろE.コリ細胞に由来したことを示
唆した。しかしながら、トランスゲニック植物の種子におけるニレアシル−ACP
チオエステラーゼの発現により本明細書に示されるように、E.コリにおける観
察されたC16:0活性はC16:0−ACPニレチオエステラーゼの実際の加水分解
活性によるものでる。
実施例3 植物におけるパルミトイル−ACPチオエステラーゼの発現
A.マンゴ
植物種子組織に選択的に発現される遺伝子からの転写開始領域の調節制御下で
植物におけるマンゴクラスIIチオエステラーゼ クローンの発現のための構造体
を次のようにして調製する。Sal±制限部位を、ポリメラーゼ鎖反応(PCR)におけ
る鋳型として図2に示されるマンゴチオエステラーゼcDNA配列を用いてマンゴ
チオエステラーゼ読み取り枠の開始コドンの上流に導入する。センスPCRプライ
マー(5′−GCTTGTCGACAAGATGGCTTCTACTG-3′)は、マンゴチオエステラーゼ
開始コドン及びSalI制限部位を含む。アンチセンスプライマー(5′−GCGTAAG
CTTGCATGCTGGTCA−3′)はヌクレオチド421でユニークSphI部位を取り囲む配
列を含み、そしてSphI部位の下流にHindIII制限部位の挿入を提供する。PCR反
応の生成物(約300のbp)を、SalI及びHindIIIにより消化されたクロラムフェ
ニコール耐性ベクターpBCSK(Stratagene)中にSalI及びHindIIIによる消化に
よりサブクローン化する。マンゴ チオエステラーゼ遺伝子を、マンゴクラスII
チオエステラーゼコード配列からのSphI−EcoRIフラグメント(ヌクレオチド1
561−1566で翻訳停止コドンの方の3′に位置するEcoRI部位を通してのヌクレ
オチド42
1 SphI部位からの約1140bpフラグメント)と約300bpのN−末端コード配列と
をN−末端フラグメント/pBCSK構造体におけるユニークSphI及びEcoRI部位を
用いて組合すことによって再集成する。得られるプラスミドは完全なコード配列
、及びSalI及びNcoI(ヌクレオチド1425-1430)制限部位を両端に有するマンゴ
チオエステラーゼ遺伝子のいくらかの3′−未翻訳配列を含む。マンゴチオエ
ステラーゼ配列を含むフラグメントを、NcoIによる消化及びDNAポリメラーゼの
クレノウフラグメントによるブラント末端化、続いてのSalIによる消化により
得る。ブラント末端/Sal Iマンゴ チオエステラーゼフラグメントを、ナピ
ン発現カセット、すなわちXhoIにより消化され、ブラント末端化され、そしてS
alIにより消化されているpCGN3223(WO92/20236に記載されている)中に連結
する。得られる発現カセットは、ナピン5′−配列及びナピン3′−配列を両端
に有するマンゴ チオエステラーゼを含む。この発現カセットを、Asp718による
消化及びAsp718により消化されたpCGN1557(McBride et al.(1990)Plant Mol.Bi
ol.14:269-276)への連結により植物形質転換のための二元ベクター中にクロー
ン化し、pCGN5228をもたらす。たとえば株EHA101(Hood et al.,J.Bacteriol(19
86)168:1291-1301)の構造体により、Holsters et al.(Mol.Gen.Genet.(1978)
163:181-187)の方法に従ってアグロバクテリウム細胞を形質転換する。
B.ニラ
クローン9−1は、ニラのクラスIIチオエステラーゼの完全な特性ペプチド及
び成熟配列を含む。便利な制限消化部位をPCRにより付加し、そして5′端でSal
I部位及び3′端でXhoI部位を両端に有し、そして完全なコード領域を含むフ
ラグメントを単離する。このフラグメントを、pCGN3223のSalI/XhoI部位中に
連結する
(上記のナピン発現カセット)。次に、ナピン5′/ニラチオエステラーゼ/ナ
ピン3′構造体を、pCGN1558、すなわちアグロバクテリウム/植物形質転換二元
プラスミド(McBride et al.前記)中に挿入する。得られる構造体、すなわちpC
GN5230を用いて、アグロバクテリウム菌株を形質転換し、そして形質転換された
植物を生成する。
C.クフェア
クフェア ホーケリアナ逆転写cDNA(WO94/10288の図5)のPCR分析は、TAA3
42 CUPH-1クローンの5′領域がWO94/10288の図5に示される配列のヌクレオ
チド144に続くグアニンヌクレオチド(G)を欠いていることを示した。〔CMT9
CUPH−1クローン(本明細書における図7)のDNA配列分析は、5′領域におけ
る読み取り枠の追加の操作のための必要性を伴わないで、CUPH−1発現構造体の
調製のためにも使用され得る。〕従って、Gヌクレオチドを、WO94/10288の図
5に示される配列の143-145でのATGで開始するコード領域をもたらすPCR指図の
変異誘発によりTAA342におけるヌクレオチド144の後に挿入した。修正されたコ
ード配列をSalI及びXhoI部位を用いて便利なベクター中にクローン化し(PCR反
応においても挿入される)、KA2をもたらした。WO94/10288の図5に示される配
列のヌクレオチド137-1464(及び上記の挿入されたGヌクレオチド)を含んで成
る、その得られるクローンのSalIフラグメントを、ナピン発現カセットpCGN322
3中にクローン化した。次に、ナピン/クフェア チオエステラーゼ/ナピン構
造体を、HindIIIフラグメントとして切断し、そして二元ベクターpCGN1557(McBr
ide and Summerfelt(1990)Plant Mol.Biot.14:269-276)中にクローン化した
。得られた構造体pCGN4800を用いてアグロバクテリウムツメファシエンスを形質
転換し、そして形質転換された植物を調製
した。
C.ニレのアシル−ACPチオエステラーゼ発現構造体
ナピン発現カセットを用いての植物種子細胞におけるニレC10及びC8アシル
−ACPチオエステラーゼの発現のための構造体を次のようにして調製する。ニレU
LM−1中間鎖アシル−ACPチオエステラーゼcDNAは、完全なチオエステラーゼ遷
移性ペプチドをコードするようには見えない。従って、ニレのチオエステラーゼ
コード領域を次のようにしてクフェアCUPH−1クローンからの遷移性ペプチドコ
ード領域に融合した。pCGN4800(ナピンカセットにおけるCUPH−1)をXbaIに
より消化し、ブラント化し、そしてStaIにより消化し、CUPH−1構造体の成熟
タンパク質コード領域を除去した。StuI部位は、WO94/10288の図5に示される
CUPH−1配列のヌクレオチド496-501に位置する。XbaI部位は、クフェアのチオ
エステラーゼcDNA配列の末端とナピン3′調節領域との間に位置する。ULM−1
成熟タンパク質コード領域を、次のようにしてクフェア成熟タンパク質コード領
域の除去に起因するナピン/クフェア遷移性ペプチド主鎖中に挿入する。ULM−
1クローンをXbaIにより消化し、ブラント化し、そしてStaIにより消化し、ニ
レのチオエステラーゼ成熟タンパク質コード領域を得る。StuI部位は、図8に
示される配列のヌクレオチド250-255に位置し、そしてXbaI部位部位はヌクレオ
チド1251-1256、すなわち停止コドンの方の3′側に位置する。ナピン/クフェ
ア遷移性ペプチド主鎖中へのニレStuI/XbaIフラグメントの連結は、ナピン5
′/クフェア遷移性:ニレ成熟/ナピン3′発現構造体を有するpCGN4802をもた
らす。pCGN4803を、pCGN4803、すなわち植物形質転換をもたらすHindIIIフラグ
メントとしてpCGN1557にトランスファーする。
実施例4 植物形質転換及び分析
A.形質転換法
1.アグロバクテリウム−介在の形質転換
ブラシカのアグロバクテリウム介在の形質転換のために使用され得る方法は
、Radke et al.(Theor.Appl.Genet.(1988)75:685-694;Plant Cell Reports
(1992)11:499-505)により記載されている。
トランスゲニック アラビドプシス タリアナ(Arabidopsis thaliana)植物
を、Valverkens et al.,(Proc.Nat.Acad.Sci.(1988)85:5536-5540)により
記載されているようにしてアグロバクテリウム介在の形質転換により得ることが
できる。
2.粒子衝撃
対象のDNA配列を、少なくともプロモーター領域、対象の遺伝子及び終結領
域を含んで成る発現カセットとして、たとえばヨーロッパ特許出願第332,855号
及び継続出願USSN07/225,332号(1988年7月27日に出願されている)に記載さ
れているようにして、粒子衝撃により植物ゲノム中に導入する。
手短に言えば、0.5mM〜3mMの範囲のサイズのタングステン又は金粒子を、発
現カセットのDNAにより被覆する。このDNAは水性混合物又は乾燥DNA/粒子沈殿
物の形で存在する。衝撃のための目的として使用される組織は、子葉外植体、苗
条分裂組織、未熟小葉又は葯からであり得る。
DNA被覆の粒子による組織の衝撃は、Biolisticsの粒子ガン(Dupont;Wilming
ton,DE)を用いて行なわれる。粒子も、銃身口から1〜14cmの範囲の種々の距
離でその銃身に配置される。衝撃を与えられるべき組織は、停止プレートの下部
に配置され;試験は20cmまでの距離で組織に対して行なわれる。放出の瞬間で、
組織はナイロンネット又はナイロンネットと10mM〜300mMの範囲のメッシュとの
組合せにより保護される。
衝撃に続いて、植物はAtreya,et al.,(Plant Scienco Letters(1984)34;37
9-383)の方法に従って再生され得る。手短に言えば、胚の軸組織又は子葉断片を
、MS培地(Murashige and Skoog,Physio.Plant.(1962)15:473)(子葉断片の
ためにはMS及び2.0mg/l 6−ベンジルアデニン(BA))上に配置し、そして暗室
において25±2℃で1週間インキュベートし、そして続いて、連続した冷白色蛍
光(6.8w/m2)に移す。培養の10日目、苗を、殺菌した土壌を含むポットに移し
、3〜5日間、日陰に維持し、そして最終的に温室に移す。
推定上のトランスゲニック苗条が根づく。植物ゲノム中への外来性DNAの組込
みは当業者に知られている種々の方法により確認され得る。
B.植物の分析
上記のようにしてC16:0アシル−ACPチオエステラーゼにより形質転換され
た植物を分析し、種子における種々の脂肪酸の百分率を決定する。高レベルのC
16:0脂肪酸を含む植物を、TAG分子に対する脂肪酸の位置分析を包含する追加
の分析のために選択する。
pCGN4800及びpCGN4803構造体(それぞれCUPH−1及びニレアシル−ACPチオエ
ステラーゼを発現する)を含むトランスゲニック植物からの発育性(成熟に近い
)種子(10〜20個の種子/サンプル)を、E.コリ細胞培養物の分析について記
載されるようなパラメーターを用いてGCにより分析する。C16脂肪酸レベルにお
ける最大上昇を示すpCGN4800及びpCGN4803形質転換出来事からの個々の形質転換
体からのそれらの分析の結果が表IVに提供される。
CUPH−1、ニレ及びマンゴ(MANI−2)チオエステラーゼクローンを発現する
トランスゲニック ブラシカ ナプス植物(212/86)
を分析し、脂肪酸組成を決定する。pCGN4800,pCGN4803及びpCGN5288を含むトラ
ンスゲニック植物からの成熟種子(約20個の種子/サンプル)を、E.コリ細胞
培養物の分析について記載されているようなパラメーターを用いてGCにより分析
する。
pCGN4800(CUPH−1)により形質転換された植物からの種子においては、高め
られたレベルのC16:0脂肪酸が検出される。pCGN4803(ニレ)形質転換体から
の種子においては、有意なレベルのC16:0脂肪酸が、C14:0及びC10:0含
有率の上昇を伴って検出される。pCGN5288(マンゴMANI−2)により形質転換さ
れた植物からの種子においては、高められたレベルのC16:0脂肪酸が検出され
る。
本明細書に言及されるすべての出版物及び特許出願は、本発明が関与する当業
者の熟練のレベルの表彰である。すべての出版物及び特許出願は、引用により本
明細書に組込まれる。
これまで、発明を本発明をより明確に理解するために例示的且つ例的に詳細に
記載してきたが、一定の変更及び修飾を本発明の範囲内で実施できることは自明
である。
─────────────────────────────────────────────────────
フロントページの続き
(81)指定国 EP(AT,BE,CH,DE,
DK,ES,FR,GB,GR,IE,IT,LU,M
C,NL,PT,SE),CA,JP,US
(72)発明者 クリードル,ジーン
アメリカ合衆国,カリフォルニア 95616,
デイビス,リード ドライブ 538
(72)発明者 ホーキンス,デボラ
アメリカ合衆国,カリフォルニア 95616,
デイビス,グランド アベニュ 230
(72)発明者 ジョーンズ,オーブレイ
アメリカ合衆国,カリフォルニア 95695,
ウッドランド,マッキンレー アベニュ
647
Claims (1)
- 【特許請求の範囲】 1.作用可能な状態で連結された成分として転写の5′から3′方向に、種子 特異的プロモーター調節要素、C16:0−ACP基質に対して活性な植物アシル−A CPチオエステラーゼをコードするDNA配列及び植物細胞内で機能的な転写終結領 域調節要素を含んで成るDNA構造体であって、そのチオエステラーゼ配列要素が 上記調節要素の中の少なくとも1異種であるようなDNA構造体。 2.ニラのパルミトイル−ACPチオエステラーゼコード配列を含んで成る、請 求項1に記載の構造体。 3.マンゴのパルミトイル−ACPチオエステラーゼコード配列を含んで成る、 請求項1に記載の構造体。 4.前記種子特異的プロモーター要素がナピン・プロモーターである、請求項 1に記載の構造体。 5.T−DNAボーダー要素をさらに含んで成る、請求項1に記載の構造体。 6.DNA構造体を含んで成る植物細胞であって、そのDNA構造体が作用可能な状 態で連結された成分として転写の5′から3′方向に、種子特異的プロモーター 調節要素、C16:0−ACP基質に対して活性な植物アシル−ACPチオエステラーゼ をコードするDNA配列及び植物細胞内で機能的な転写終結領域調節要素を含んで 成り、ここでその要素の中の少なくとも1がその植物又はその構造体の他の要素 に対して異種であるような植物細胞。 7.ニラのパルミトイル−ACPチオエステラーゼコード配列を含んで成る、請 求項6に記載の植物細胞。 8.マンゴのパルミトイル−ACPチオエステラーゼコード配列を含んで成る、 請求項6に記載の植物細胞。 9.前記細胞がブラシカ細胞である、請求項8に記載の植物細胞。 10.前記細胞がブラシカ ナプス(Brassica napus)細胞である請求項8に 記載の植物細胞。 11.第1のDNA構造体及び第2のDNA構造体を含んで成る植物細胞であって、 その第1のDNA構造体が作用可能な状態で連結された成分として転写の5′か ら3′方向に、種子特異的プロモーター調節要素、植物パルミトイル−ACPチオ エステラーゼをコードするDNA配列及び植物細胞において機能的な転写終結領域 調節要素を含んで成り、そして その第2のDNA構造体が作用可能な状態で連結された成分として転写の5′か ら3′の方向に、種子特異的プロモーター調節要素、アンチセンス配向に位置す る植物ステアロイル−アシルACPデサチュラーゼ要素をコードするDNA配列、及び 植物細胞において機能的な転写終結領域調節要素を含んで成り、ここでその植物 ステアロイル−アシルACPデサチュラーゼが前記植物細胞の生来のステアロイル −アシルACPデサチュラーゼに対して相補的であることを特徴とする植物細胞。 12.C16:0−ACP基質に対しての加水分解性質を有する植物アシル−ACPチオ エステラーゼをコードするcDNA。 13.前記cDNA配列が図2に示されるマンゴのチオエステラーゼ配列である請求 の範囲第12項記載のcDNA。 14.前記cDNA配列が図4に示されるニラのチオエステラーゼ配列である請求の 範囲第12項記載のcDNA。 15.C16:0脂肪アシル基の高められた割合を有する植物種子トリグリセリド の製造方法であって、 トランスジェニック植物が種子を生成するように成長せしめることを含んで成 り、ここで前記植物が請求の範囲第1項記載の構造体を含んで成ることを特徴と する方法。 16.前記植物がブラシカ植物である、請求項15に記載の方法。 17.前記ブラシカ植物がブラシカ ナプス植物である請求項16に記載の方法。 18.C16:0−ACP基質に対して活性的な前記植物アシル−ACPチオエステラー ゼがニラ、マンゴ、クフェア ホーケリアナ又はニレからである請求項15に記載 の方法。 19.貯蔵トリグリセリドに最小8モル%のパルミテートを含んで成るトランス ジェニック・ブラシカ・ナプス植物種子。 20.貯蔵トリグリセリドに最小10モル%のパルミテートを含んで成る請求項19 に記載の種子。 21.貯蔵トリグリセリドに最小20モル%のパルミテートを含んで成る、請求項 19に記載の種子。 22.請求の範囲第19項記載の種子に由来する油。
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