JPH10510992A - 安定化リボザイムアナログ - Google Patents

Abstract

(57)【要約】 ３'から５'へ連結したリボヌクレオチドの配列をエンドヌクレオチド分解により開裂する能力を有する安定化リボザイムアナログを開示する。該リボザイムアナログは、ループ、触媒コア、およびフランキング領域の特定のヌクレオチドが修飾されており、このことが該リボザイムアナログをヌクレアーゼに対して一層耐性にする。本発明のリボザイムアナログの製造方法および利用方法、並びに該リボザイムアナログを含有する医薬組成物およびキットをも開示する。

Description

【発明の詳細な説明】 安定化リボザイムアナログ 発明の背景 本発明は、部位特異的なＲＮＡ開裂に有用なエンドヌクレオチド分解活性およ び増大した半減期を有する分子に関する。本発明はまた、ｍＲＮＡの分解による 遺伝子発現の制御に関する。 リボザイムは、それが結合したＲＮＡ分子、たとえばｍＲＮＡ、ＲＮＡ含有基 質およびリボザイムそれ自体において特異的なホスホジエステル結合を開裂する 能力を含む触媒活性を有するＲＮＡ分子である。 リボザイムは幾つかの物理構造の一つをとり、その一つは「ハンマーヘッド（ hammerhead）」と呼ばれる（ハーゼロフ（Ｈaseloff）およびゲルラッハ（Ｇerl ach）（１９８８）Ｎature ３３４：５８５〜５９１）。ハンマーヘッドリボザ イムは、９つの保存された塩基を含有する触媒コア、二本鎖のステムおよびルー プ構造（ヘリックスII）、および該触媒コアの領域の両側にある（フランキング する）標的ＲＮＡに相補的な２つの領域からなる。フランキング領域は、二本鎖 のステムＩおよびIIIを形成することによってリボザイムが標的ＲＮＡに特異的 に結合することを可能にする。開裂は、３',５'−リン酸ジエステルから２',３' 一環状リン酸ジエステルへのエステル交換反応により特定のリボヌクレオチドト リプレットの隣でシス（すなわち、ハンマーヘッドモチーフを含有する同じＲＮ Ａ分子の開裂）かまたはトランス（該リボザイムを含有するものとは異なるＲＮ Ａ基質の開裂）で起こる。現在、この触媒活性にはリボザイムの触媒領域中の特 定の高度に保存された配列の存在が必要であると信じられている。 リボザイムのエンドヌクレオチド分解活性はインビトロでは示されているが、 リボザイムはＲＮアーゼに感受性であるためインビボでの使用は制限されている 。さらに、３０またはそれ以上のヌクレオチドを有するリボザイムなどの治療剤 は高価であり、大量に製造するのは困難である。それゆえ、インビトロおよびイ ンビボでＲＮＡを開裂したりインビボでの使用のために遺伝子発現を制御したり す るのに用いることのできるヌクレアーゼ耐性の増大した一層小さな分子に対する 必要性が存在する。 アンチセンスオリゴヌクレオチドをインビボでの分解作用から保護する努力が なされる中で、これら分子に対して種々の構造上の修飾が施されており、このよ うな修飾にはホスホジエステル結合の非ホスホジエステル結合による置換、種々 の糖基および塩基の置換、末端キャッピング基の付加、および存在する構造の自 己ハイブリダイズ末端による置換が含まれる（グッドチャイルド（Ｇoodchild） （１９９０）Ｂioconjugate Ｃhem.１：１６５〜１８７；アグラワル（Ａgrawal ）ら（１９９２）Ｔrends.Ｂiotechnol.１０：１５２〜１５８；ＷＯ９３／１５ １９４；ＷＯ９４／１０３０１；ＷＯ９４／１２６３３に概説されている）。 しかしながら、ＲＮＡ分子をエンドヌクレアーゼによる消化から保護する修飾 はまたリボザイムの触媒活性にも影響を及ぼす。たとえば、ペロール（Ｐerreau lt）ら（Ｎature（１９９０）３４４：５６５〜５６７）は、リボザイム配列内 の種々の保存された位置でのリボヌクレオチドの２'−デオキシヌクレオチドに よる置換が触媒効率の９６％の減少となることを報告している。ペロールら（Ｂ iochem.（１９９１）３０：４０２０〜４０２５）およびダーム（Ｄahm）ら（Ｂ iochem．（１９９０）７２：８１９〜２３）は、種々の２'−ヒドロキシル基の 水素原子による置換がハンマーヘッドリボザイムの触媒活性を減少させることを 開示している。オルセン（Ｏlsen）ら（Ｂiochem．（１９９１）３０：９７３５ 〜９７４１）は、すべてのアデノシン残基上の２'−ヒドロキシル基のフッ素か または水素による置換がリボザイムの触媒活性を減少させることを報告している 。オダイ（Ｏdai）ら（ＦＥＢＳ Ｌett．（１９９０）２６７：１５０〜１５２ ）は、コア領域中の保存されたグアノシン残基の環外アミノ基の水素による置換 が触媒活性を減少させることを報告している。ラッフナー（Ｒuffner）ら（Ｎuc leic Ａcids Ｒes.（１９９０）１８：６０２５〜６０２９）およびブザヤン（ Ｂuzayan）ら（Nucleic Ａcids Ｒes.（１９９０）１８：４４４７〜４４５１） は、種々のインターヌクレオチドリン酸残基上の酸素原子を硫黄で置換すると触 媒活性が減少することを開示している。ピーケン（Ｐieken）ら（Ｓcience（１ ９９１）２ ５３：３１４〜３１７）は、アデノシン残基上の種々の２'−ヒドロキシル基を フッ素で置換したとき、およびシチジン残基上の２'−ヒドロキシル基をアミン 基で置換したときに触媒活性が減少することを開示している。パオレラ（Ｐaole lla）ら（ＥＭＢＯ Ｊ．（１９９２）１１：１９１３〜１９１９）は、どの２' −ヒドロキシル基が触媒活性を喪失させることなくアルキル化可能か否かについ て調べている。 他の研究グループは、リボザイム内のヌクレオチドをヌクレオチドアナログで 置換している。たとえば、ウスマン（Ｕsman）ら（ＷＯ９３／１５１８７）は、 触媒活性において重要な部位にリボヌクレオチドまたは核酸アナログ（修飾され た糖、リン酸、または塩基を有する）を、触媒活性において重要でない部位に核 酸アナログまたはデオキシリボヌクレオチドを有する、リボザイム様の触媒活性 を有するキメラポリマーまたは「ヌクレオザイム」をデザインしている。 最近、触媒活性を減ずることなく一層安定な分子をデザインする努力の中で、 ハンマーヘッドリボザイムのヘリックスII構造の長さを短くするなどの修飾がな されている（たとえば、グッドチャイルドら（１９９１）Ａrch.Ｂiochem.Ｂiop hys.２８４：３８６〜３９１；ツシュル（Ｔuschl）ら（１９９３）Ｐroc.Ｎatl .Ａcad.Ｓci．（ＵＳＡ）９０：６９９１〜６９９４；マッコール（ＭcＣall） ら（１９９２）Ｐroc.Ｎatl.Ａcad.Ｓci.（ＵＳＡ）８９：５７１０〜５７１４ 参照）。 リボザイム構造の修飾にはまた、該分子の種々の非コア部分の非ヌクレオチド 性分子による置換が含まれる（たとえば、ベンセラー（Ｂenseler）ら（１９９ ３）Ｊ.Ａm.Ｃhem.Ｓoc.１１５：８４８３〜８４８４；マ（Ｍa）ら（１９９３ ）Ｂiochem.３２：１７５１〜１７５８；マら（１９９３）Ｎucleic Ａcids Ｒe s.２１：２５８５〜２５８９）；およびトムソン（Ｔhomson）ら（１９９３）Ｎ ucleic Ａcids Ｒes.２１：５６００〜５６０３参照）。 それゆえ、エンドヌクレオチド消化に対する耐性が改善されたリボザイムが望 ましく、かかる触媒分子に対する必要性が依然として存在する。発明の要約 本発明は、一本鎖ＲＮＡをエンドヌクレオチド分解により開裂することができ 、特定の位置にヌクレオチドアナログが存在するためにヌクレアーゼ耐性の増大 した触媒性オリゴヌクレオチドまたは安定化リボザイムアナログを提供する。 ヒト血清およびＣＥＭ細胞の抽出物において、リボザイムの分解には、まず、 フランキング配列、触媒コア、またはヘリックスIIのループ内の塩基対を形成し ていないピリミジンにおけるエンドヌクレアーゼ攻撃が最初に関与することがわ かった。これらのうち、塩基Ｃ３およびＵ４のみが必要であり、他の塩基で置換 できない。これらの知見を本発明を開発するのに用いた。すなわち、本発明は一 つの側面において、「安定化リボザイムアナログ」、すなわちエンドヌクレオチ ド分解活性およびハンマーヘッドリボザイムと類似の構造を有するが、対照的に 種々の位置にヌクレオチドアナログが置換されたことによってヌクレアーゼ耐性 を増大させたリボザイム様のＲＮＡ−含有分子を包含する。 本発明の安定化リボザイムアナログは、３'末端を有し、ステム領域およびル ープ領域からなるヘリックスIIを含む。本明細書において「ヘリックスII」とは 、ハーゼロフらによって記載されているように（Ｎature（１９８８）３３４： ５８５〜５９１）、一方の端に一本鎖ループを有する、ハンマーヘッドリボザイ ム中の二本鎖でコイル状のらせん構造をいう。ステム領域もまた３'末端および ５'末端を有し、複数の３'から５'へ共有結合により連結した自己ハイブリダイ ズヌクレオチドを含む。 本明細書において「自己ハイブリダイズ」とは、ヘリックスIIのステム領域中 に存在し、互いに相補的で通常のワトソン−クリック型の塩基対を形成するヌク レオチドをいう。このステム領域は２本の相補的なヌクレオチド鎖を有し、これ ら鎖には一方の鎖上の少なくとも一つのヌクレオチドと他方の鎖上の一つのヌク レオチドが含まれ、これらが一緒になって塩基対を形成する。一つの制限されな い例において、ヘリックスIIのステムは２〜８の塩基対を有する。 他の好ましい態様において、ヘリックスIIのステム中のいずれかまたはすべて のピリミジンは２'−Ｏ−アルキル化されている。それゆえ、幾つかの態様にお いて、ステム領域は少なくとも一つの２'−Ｏ−アルキル化ヌクレオチドを有す るかまたはすべてが２'−Ｏ−アルキル化されている。「２'−Ｏ−アルキル化」 とは、ヌクレオシドまたはヌクレオチドのリボース糖上の２'ヒドロキシル基が 、アルキル基、たとえばメチル、エチル、プロピルまたはブチル基で置換されて いるものをいう。一つの特定の態様において、ハンマーヘッドリボザイム位１０ .３、１０.４、１１.１および１１.２のヌクレオチドが２'−Ｏ−アルキル化さ れている（命名については、上記ハーゼロフらの文献を参照）。 ヘリックスIIのループ領域は、その３'末端および５'末端においてステム領域 に共有結合により連結しており、位置Ｌ２.２およびＬ２.３（命名については、 上記ハーゼロフらの文献を参照）において少なくとも２つの修飾ヌクレオチド（ ２'−Ｏ−アルキル化、プリン、またはその組み合わせである）を含む複数の３' から５'へ共有結合により連結したヌクレオチドを含む。 本明細書において「修飾ヌクレオチド」とは、２'−Ｏ−アルキル化した、す なわち、そのリボース糖上の２'ヒドロキシル基がアルキル基で置換されたヌク レオチド、またはピリミジンに対して置換されたプリンをいう。 幾つかの態様において、ループ領域のすべてのヌクレオチドが修飾される。他 の態様において、位置Ｌ２.２およびＬ２.３のヌクレオチドがメチルホスホネー ト、ホスホルアミデートまたはホスホルアミデートアナログである。さらに他の 態様において、ループ領域中のヌクレオチドは、ホスホジエステル結合、アルキ ルホスホネート結合、ホスホロチオエート結合、ホスホロジチオエート結合、ア ルキルホスホノチオエート結合、ホスホルアミデート結合、リン酸エステル結合 、カルバメート結合、カーボネート結合、アセトアミデート結合、またはカルボ キシメチルエステル結合により、またはそれら結合の組み合わせにより共有結合 で連結している。 リボザイムアナログはさらに第一および第二の触媒コア領域を含み、これら領 域はそれぞれ、複数の３'から５'へ共有結合により連結したヌクレオチドを含み 、それぞれ３'末端および５'末端を有する。第一の触媒コア領域の３'末端はス テム領域の５'末端に共有結合により連結しており、第二の触媒コア領域の５'末 端はステム領域の３'末端に共有結合により連結している。第一の触媒コア領域 は さらに、位置７（命名については、上記ハーゼロフらの文献を参照）において少 なくとも一つの２'−Ｏ−アルキル化またはプリンヌクレオチドを含む。さらに 、第一の触媒コア領域の位置３および４のヌクレオチドが２'−Ｏ−アルキル化 されている。他の態様において、ヌクレオチド６と７との間の結合はメチルホス ホネートまたはホスホルアミデートである。 第一のヌクレオチド性コア領域の５'末端に第一のフランキング領域の３'末端 が共有結合により連結しており、第二のヌクレオチド性コア領域の３'末端に第 二のフランキング領域の５'末端が共有結合により連結している。これら第一お よび第二のフランキング領域は、それぞれ複数の３'から５'へ共有結合により連 結したヌクレオチドを含み、それぞれ３'末端および５'末端を有する。第一のフ ランキング領域の少なくとも一部が基質ＲＮＡ分子の第一の標的領域に相補的で あり、第二のフランキング領域の少なくとも一部が基質ＲＮＡ分子の第二の標的 領域に相補的である。 好ましい態様において、第一および／または第二のフランキング領域は少なく とも一つの２'−Ｏ−アルキル化ヌクレオチドを含む。他の態様において、第一 および第二のフランキング領域の少なくとも４つのヌクレオチドが２'−Ｏ−ア ルキル化されている。他の態様において、第一および第二のフランキング領域中 のすべてのピリミジンが２'−Ｏ−アルキル化されている。さらに他の態様にお いて、第一および／または第二のフランキング領域中のすべてのヌクレオチドが ２'−Ｏ−アルキル化されているが、位置１５.１（命名については、上記ハーゼ ロフらの文献を参照）のヌクレオチドだけが例外である。他の態様において、第 一および第二のフランキング領域中のヌクレオチドは、ホスホジエステル、アル キルホスホネート、ホスホロチオエート、リン酸エステル、ホスホロジチオエー ト、アルキルホスホノチオエート、ホスホルアミデート、カルバメート、カーボ ネート、アセトアミデート、またはカルボキシメチルエステルインターヌクレオ チド結合により、またはそれら結合の組み合わせにより共有結合で連結している 。好ましい態様において、これらフランキング領域は、それぞれ、少なくとも４ つのヌクレオチドを含む。一つの態様において、第一のフランキング領域の該４ つ のヌクレオチドが標的ＲＮＡの第一セットのヌクレオチドに相補的であり、第二 のフランキング領域の該４つのヌクレオチドが標的ＲＮＡの第二セットのヌクレ オチドに相補的であり、これら第一および第二セットは互いに排他的である。他 の態様において、第一および第二のフランキング領域は、ともに少なくとも６つ のヌクレオチドを含む。 本明細書において「標的ＲＮＡ」および「基質ＲＮＡ」とは、リボザイムアナ ログのフランキング領域がハイブリダイズし、リボザイムアナログが認識および 開裂する、３'から５'へ共有結合により連結したリボヌクレオチドからなるオリ ゴリボヌクレオチドをいう。 幾つかの態様において、リボザイムアナログの少なくとも２つのヌクレオチド が、ホスホジエステル、アルキルホスホネートおよび／またはホスホルアミデー トインターヌクレオシド結合により共有結合で連結している。一つの特定の態様 において、リボザイムアナログ中の少なくとも２つのヌクレオシドがメチルホス ホネート結合により連結している。 本発明の他の側面は、基質ＲＮＡ分子の発現を制御する方法である。この方法 において、本発明の安定化リボザイムアナログを用意し、これを用いて該ＲＮＡ と接触させる。「用意」とは、市販もしくは他の仕方で供給し、利用可能または 調製することをいう。リボザイムアナログの第一のフランキング領域が該基質Ｒ ＮＡの第一の標的領域にハイブリダイズし、第二のフランキング領域が該基質Ｒ ＮＡの第二の標的領域にハイブリダイズし、かくして該安定化リボザイムアナロ グが該基質ＲＮＡを開裂することを可能にする。このようにして、基質ＲＮＡの 発現、たとえばタンパク質に翻訳される能力が制御される。 該方法の幾つかの態様において、開裂しようとする基質ＲＮＡはまた、リボザ イムアナログに接触させると同時にファシリテーターオリゴヌクレオチドにも接 触させる。本明細書において「ファシリテーターオリゴヌクレオチド」とは、該 リボザイムアナログのいずれかのフランキング領域によってターゲティングされ る第一または第二の標的領域に近接するＲＮＡ基質上のリボヌクレオチド配列に 相補的で該配列にハイブリダイズしうるオリゴデオキシリボヌクレオチド、オリ ゴリボヌクレオチドまたはキメラをいう（ＷＯ ９３／１５１９４を参照）。 本発明の他の態様において、一本鎖のＲＮＡ含有基質を部位特異的に開裂する 方法が提供される。本明細書において「部位特異的開裂」とは、リボヌクレオチ ドの特定の配列の前または後で基質ＲＮＡ分子のリン酸骨格を酵素的に切断する ことをいう。該方法は、本発明の安定化リボザイムアナログを用意し、ついで該 リボザイムアナログの第一のフランキング領域が該基質ＲＮＡの第一の標的領域 にハイブリダイズし、該リボザイムアナログの第二のフランキング領域が該基質 ＲＮＡの第二の標的領域にハイブリダイズし、かくして該リボザイムアナログが 該ＲＮＡ基質を部位特異的に開裂することを可能にするように、該ＲＮＡ含有基 質分子を該リボザイムアナログと接触させることを含む。幾つかの態様において 、該方法はさらに、該基質ＲＮＡ分子を該リボザイムアナログに接触させるのと 同時にファシリテーターオリゴヌクレオチドと接触させることを含む。 本発明はまた、本発明の少なくとも一つの安定化リボザイムアナログを含むキ ットを提供する。幾つかの態様において、該キットはさらにファシリテーターオ リゴヌクレオチドおよび／またはＲＮＡリガーゼを含む。他のキットはまた生理 学的に許容しうる担体を含む。 本発明のさらに他の態様は、生理学的に許容しうる担体中に本発明の安定化リ ボザイムアナログを少なくとも一つ含む治療組成物である。幾つかの態様におい て、該組成物はさらにファシリテーターオリゴヌクレオチドを含む。図面の簡単な説明 本発明の上記および他の目的、その種々の特徴、並びに本発明そのものは、添 付の図面とともに以下の記載を読んだときに一層完全に理解される。該図面にお いて： 図１は、基質ＲＮＡにハイブリダイズした共通ハンマーヘッドリボザイムの模 式図であり、保存されたリボヌクレオチド（Ｃ、Ｕ、Ｇ、Ａ、Ｇ、Ａ、Ｇ、Ａ、 Ａ）および非保存性ヌクレオチド（Ｎ）が該リボザイムの触媒コア中に存在し、 該基質ＲＮＡ中のヌクレオチド（Ｙ）の３'側で開裂が起こることを示す； 図２は、基質にハイブリダイズしたハンマーヘッドリボザイムおよび該複合体 のヌクレオチドの標準位置番号の模式図である； 図３Ａは、基質ＲＮＡにハイブリダイズした本発明の安定化リボザイムアナロ グであるＲ４８の模式図であり、２'−Ｏ−アルキル化されたヌクレオチドは囲 んである； 図３Ｂは、基質ＲＮＡにハイブリダイズした本発明の安定化リボザイムアナロ グであるＲ５２の模式図であり、２'−Ｏ−アルキル化されたヌクレオチドは囲 んである； 図３Ｃは、基質ＲＮＡにハイブリダイズした本発明の安定化リボザイムアナロ グであるＲ５６の模式図であり、２'−Ｏ−アルキル化されたヌクレオチドは囲 んである； 図３Ｄは、基質ＲＮＡにハイブリダイズした本発明の安定化リボザイムアナロ グであるＲ５３の模式図であり、２'−Ｏ−アルキル化されたヌクレオチドは囲 んである； 図３Ｅは、基質ＲＮＡにハイブリダイズした本発明の安定化リボザイムアナロ グであるＲ４４の模式図であり、星印を付したヌクレオチドはプリン置換されて いる； 図４は、本発明の代表的な安定化リボザイムアナログのヒト血清中での安定性 を示すグラフである； 図５は、基質ＲＮＡにハイブリダイズした本発明の安定化リボザイムアナログ およびファシリテーターオリゴヌクレオチドの模式図である； 図６Ａは、ファシリテーターオリゴヌクレオチドの存在下（−●−）および不 在下（−○−）でのリボザイムコントロールであるＲ２２の開裂活性を示すグラ フである； 図６Ｂは、ファシリテーターオリゴヌクレオチドの存在下（−●−）および不 在下（−○−）での本発明の安定化リボザイムアナログであるＲ５２の開裂活性 を示すグラフである； 図６Ｃは、ファシリテーターオリゴヌクレオチドの存在下（−●−）および不 在下（−○−）での本発明の他の安定化リボザイムアナログであるＲ５３の開裂 活性を示すグラフである； 図６Ｄは、ファシリテーターオリゴヌクレオチドの存在下（−●−）および不 在下（−○−）での本発明のさらに他の安定化リボザイムアナログであるＲ５６ の開裂活性を示すグラフである； 図６Ｅは、ファシリテーターオリゴヌクレオチドの存在下（−●−）および不 在下（−○−）での本発明のさらに他の安定化リボザイムアナログであるＲ４４ の開裂活性を示すグラフである。好ましい態様の詳細な説明 本明細書中に引用する特許および科学文献は当業者に利用可能な知識を確立す るものである。発行された米国特許、許された特許出願、およびそれらに引用さ れた文献は参照のため本明細書中に引用する。 ハンマーヘッドリボザイムはハーゼロフおよびゲルラッハによって作成された ものであり（Ｎature（１９８８）３３４：５８５〜５９１）、図１に示してあ る。ハンマーヘッドリボザイムは、９つの保存されたリボヌクレオチドを有する 触媒コア領域の２つの部分を連結し、標的ＲＮＡに相補的な２つの領域によって フランキングされた、一本鎖のループ領域と二本鎖のステム領域とからなるラセ ン構造（ヘリックスII）からなる。これらフランキング領域は、二本鎖のステム ＩおよびIIIを形成することによりリボザイムが標的ＲＮＡに特異的に結合する のを可能にする。現在信じられているところでは、リボザイムが一本鎖ＲＮＡを 開裂する能力を維持するためにはリボザイムの触媒コア領域のヌクレオチド配列 の大部分が保存されていなければならない（コイズミ（Ｋoizumi）ら（１９９１ ）Ｂiochem.３０：５１４５〜５１５０；トムソンら（１９９３）Ｎucleic Ａci ds Ｒes.２１：５６００〜５６０３）。しかしながら、今や該開裂は、ヘリック スIIのステムおよび／またはループ、触媒コアおよびフランキング領域内の特定 のヌクレオチドが置換されたリボザイムアナログを含む分子によって達成しうる こと、およびこれらリボザイムアナログが改善されたヌクレアーゼ耐性を有する （すなわち、安定化されている）ことがわかった。 これら知見に基づいて本発明を開発したものであり、本発明は、かかるヌクレ オチドアナログを含有するハンマーヘッドリボザイムの安定化アナログを提供す るものであり、該アナログは一本鎖ＲＮＡおよびＲＮＡ含有基質をエンドヌクレ オチド分解により開裂する能力を有する。それゆえ、本発明による安定化リボザ イムアナログはＲＮＡ特異的な制限エンドヌクレアーゼとして有用であり、その ようなものとしてＲＮＡリガーゼと組み合わせたときに組換えＲＮＡ分子の調製 を可能にする。 本発明の安定化リボザイムアナログのヘリックスIIステム領域は、自己ハイブ リダイズする少なくとも４つ、好ましくは６〜１２のヌクレオチドからなる。こ の領域は図２において１０.１〜１０.４および１１.１〜１１.４の番号が付され ているが、これは当該技術分野で記載されたハンマーヘッドリボザイムにおける ヌクレオチドの標準位置番号を示すものである（たとえば、プレイ（Ｐley）ら （１９９４）Ｎature ３７２：６８；ハーテル（Ｈertel）ら（１９９２）Ｎucl eic Ａcids Ｒes.２０：３２５２を参照）。ヘリックスIIのループ領域は少なく とも２つ、好ましくは４またはそれ以上のハイブリダイズしていないヌクレオチ ドを有し、図２ではＬ２.１〜Ｌ２.４の位置にある。 本発明のリボザイムアナログの触媒コアは、図２において位置３〜９および１ ２〜１４にあるヌクレオチドからなる第一および第二の触媒コア領域からなる。 この領域は、保存されたヌクレオチドまたは触媒活性のために存在すると思われ るヌクレオチドを有する。 触媒コア領域は第一および第二のフランキング領域によりフランキングされて おり、これら第一および第二のフランキング領域は、それぞれ、開裂すべきＲＮ Ａ基質上の標的領域に相補的でハイブリダイズしうるヌクレオチド配列を含む。 これらフランキング領域に相補的な標的領域は一つのヌクレオチドによって隔て られている。フランキング領域を構成しているヌクレオチドは、デオキシリボヌ クレオチド、デオキシリボヌクレオチドのアナログ、リボヌクレオチド、リボヌ クレオチドのアナログ、またはそれらの組み合わせであり、一つのヌクレオチド またはヌクレオチドアナログの５'末端と他のヌクレオチドまたはヌクレオチド アナログの３'末端とが共有結合により連結している。これらフランキング領域 は、長さが少なくとも４のヌクレオチドであるが、長さが６〜５０のヌクレオチ ドであるのが好ましく、６〜１５ヌクレオチドのフランキング領域が最も一般的 である。図２において、これらヌクレオチドは１.１〜１.６および２.１〜２.６ にある。 本発明のリボザイムアナログは、ヘリックスIIのループ内のいずれかのピリミ ジン、並びに位置３、４および７のピリミジンが２'−Ｏ−アルキル化されるこ とによってリボヌクレアーゼ耐性とされている点で非修飾のハンマーヘッドリボ ザイムと構造的に異なるものである（たとえば、図３Ａ〜図３Ｄを参照）。ヘリ ックスIIのループ内のピリミジンおよび位置７のピリミジンはプリンヌクレオチ ドで置換されていてもよい（たとえば、図３Ｅを参照）。さらに、フランキング 配列中の少なくともすべてのピリミジンヌクレオチドを２'−Ｏ−アルキル化す ることにより、またはインターヌクレオシドリン酸をチオリン酸もしくはメチル ホスホネートなどに修飾することにより、ヌクレアーゼに対して耐性とする。好 ましくは、フランキング配列中のプリンヌクレオチドも同様にして修飾する。さ らに、ヘリックスIIのステム中のピリミジンヌクレオチドか、ピリミジンヌクレ オチドおよびプリンヌクレオチドの両者を２'−Ｏ−アルキル化することにより リボヌクレアーゼに対して耐性とすることができる。 リボザイムアナログはさらに、触媒コア領域の位置３および４、第一のフラン キング領域の位置２.１〜２.６、および／または第二のフランキング領域の位置 １５.２〜１５.６、および／またはヘリックスII内のすべての位置において、ヌ クレオチドを置換することができる。図３Ａ〜図３Ｅは、「囲んだ」位置におい てヌクレオチド置換を有する幾つかの非限定的な態様を示す。かかる置換はヌク レアーゼの存在下での安定性を増大させるものであり、ファシリテーターオリゴ ヌクレオチドの存在下でいかなる程度にも活性に影響を及ぼさない。 図３Ａ〜図３Ｅに模式的に示した本発明の幾つかの代表的なリボザイムアナロ グの構造特性を下記表１にまとめて示す。 これら修飾位置の組み合わせはパオレラらによって記載されたもの（（１９９ ２）ＥＭＢＯ Ｊ.１１：１９１３〜１９１９）とは異なるものであり、パオレラ らは、どの２'−ヒドロキシル基がヒト血清でリボヌクレアーゼによる速やかな 消化に導くかということではなく、どの２”−ヒドロキシル基が触媒活性に必要 かを決定した。 上記種々のヌクレオチド位置での有用な置換としては、プリンヌクレオチド、 デオキシヌクレオチド、２'−Ｏ−アルキル化ヌクレオチド、ヌクレオチドメチ ルホスホネート、およびヌクレオチドホスホルアミデートが挙げられる。好まし い置換は、２'−Ｏ−アルキル化ヌクレオチドであり、たとえば２'−Ｏ−メチル 、２'−Ｏ−プロピルおよび２'−Ｏ−ブチルなどである。最も好ましいヌクレオ チドアナログは２'−Ｏ−メチルである。 リボザイムアナログはホスホルアミデートやＨ−ホスホネート化学などの当該 技術分野で認識された方法により調製でき、該方法は米国特許第５,１４９,７８ ９号に記載されている標準Ｈ−ホスホネート化学を用い、または標準ホスホルア ミダイト化学（たとえば、ボーケージ（Ｂeaucage）（Ｍeth.Ｍol.Ｂiol．（１ ９９３）２０：３３〜６１）；ダマー（Ｄamha）ら（Ｐrotocols for Ｏligonuc leotides and Ａnalogs;Ｓynthesis and Ｐroperties（アグラワル編）（１９９ ３）ヒューマナ・プレス、トトワ、ニュージャージー、８１〜１１４頁中；また はウールマン（Ｕhlmann）ら（Ｃhem.Ｒev．（１９９０）９０：５３４〜５８３ ））を用い、手動または自動合成機により行うことができる。 リボザイムアナログはまた、該リボザイムアナログが基質ＲＮＡにハイブリダ イズする能力を損なうことなく、ヌクレアーゼ消化に対して保護するために多く の仕方で修飾できる。たとえば、リボザイムアナログのフランキング領域および 他のヌクレオチド性部分のヌクレオシドを、一つのヌクレオシドの５'末端と他 のヌクレオシドの３'末端との間でホスホジエステルインターヌクレオシド結合 以外の結合（３'リン酸基がいずれかの化学基で置換されている）で共有結合に より連結できる。そのような知られた化学基の例としては、アルキルホスホネー ト、ホスホルアミデート、カルバメート、アセトアミデート、カルボキシメチル エステル、カーボネート、およびリン酸エステルが挙げられる。 他の修飾としては、ヌクレオチド性コア領域またはフランキング領域の内部ま たは末端におけるものが挙げられ、インターヌクレオシドリン酸結合へのコレス テリル化合物またはジアミン化合物（アミノ基と末端リボース、デオキシリボー スとの間に種々の炭素数の残基を有する）の付加、およびリン酸修飾が挙げられ る。そのような修飾フランキング領域の例としては、修飾した塩基および／また は糖（リボースの代わりのアラビノースなど）を有するヌクレオチド配列、また はその３'位および５'位の両方において酸素またはリン酸以外の化学基に結合し た糖を有する３',５'−置換ヌクレオシドを含む。他の修飾ヌクレオチド配列は 、その３'および／または５'末端においてヌクレアーゼ耐性を付与する嵩ばった 置換基または自己ハイブリダイズ領域でキャッピングされているか、またはヌク レオチド当たり一つの非架橋性の酸素に置換を有する。そのような修飾は、イン ターヌクレオシド結合の幾つかまたはすべてにおいて、並びにオリゴヌクレオチ ドのいずれかの末端または両末端において、および／または該分子の内部にあっ てよい。 これら修飾オリゴヌクレオチドの調製は、当該技術分野でよく知られている（ アグラワルら（１９９２）Ｔrends.Ｂiotechnol.１０；１５２〜１５８；グッド チャイルド（１９９０）Ｂioconjugate Ｃhem.２：１６５〜１８７；ゾン（Ｚon ）、Ｐrotocols for Ｏligonucleotides and Ａnalogs（アグラワル編）ヒュー マナ・プレス、トトワ、ニュージャージー（１９９４）２０巻、１６５〜１８９ 頁中に概説されている）。たとえば、ヌクレオチドは当該技術分野で認められた 技術、たとえば、ホスホルアミダイト、Ｈ−ホスホネートまたはメチルホスホノ アミダイト化学などを用いて共有結合できる。 本明細書に記載した方法を用い、代表的なリボザイムアナログとしてＲ５２（ 図３Ｂ）、Ｒ５３（図３Ｄ）、およびＲ５６（図３Ｃ）を合成し、ヌクレアーゼ を含有するヒト血清中での安定性を試験した。図４に示した結果は、ほとんど即 時に分解された非修飾リボザイムコントロールであるＲ２２（配列番号１）に比 べ、これらリボザイムアナログが血清中に存在するヌクレアーゼに対して極めて 耐性であることを示している。 本発明のリボザイムアナログの開裂能は、リボザイムアナログに隣接してハイ ブリダイズするファシリテーターオリゴヌクレオチド（ＷＯ ９３／１５１９４ を参照）を系中に導入することにより促進することができる。そのようなファシ リテーターオリゴヌクレオチドは、フランキング領域がリボザイムアナログの５ '側または３'側にて結合するＲＮＡ基質配列に隣接する基質ＲＮＡ上の標的配列 に結合するように選択する。基質ＲＮＡ、リボザイムアナログおよびファシリテ ーターオリゴヌクレオチドによって形成された触媒複合体を図５に示す。 幾つかの状況においては２つのファシリテーターオリゴヌクレオチドの組み合 わせが用いられ、その場合、一方のファシリテーターはリボザイムアナログの第 一の（５'）フランキング配列にハイブリダイズするヌクレオチド配列に直接近 接した基質ＲＮＡ部分にハイブリダイズし、他方のファシリテーターはリボザイ ムアナログの第二の（３'）フランキング配列にハイブリダイズするヌクレオチ ド配列に直接近接した基質ＲＮＡ部分にハイブリダイズする。別の態様として、 複数のファシリテーターを用いてリボザイムアナログ活性を促進することができ る。たとえば、３つのファシリテーターを用いた系では、２つのファシリテータ ーは第一の（５'）フランキング配列に相補的なＲＮＡ基質配列に隣接して結合 することができ、一方、単一の別のファシリテーターは第二の（３'）フランキ ング領域に相補的なＲＮＡ基質配列に隣接して結合することができる。当業者で あれば、他の種々の組み合わせも可能であることを認識するであろう。 さらに、ファシリテーターオリゴヌクレオチドは、リボザイムアナログのフラ ンキング配列に相補的な基質配列に直ちには隣接しないＲＮＡ基質の領域に相補 的なヌクレオチド配列を有していてよい。たとえば、リボザイムアナログとファ シリテーターオリゴヌクレオチドとが基質ＲＮＡに結合したときにリボザイムア ナログとファシリテーターオリゴヌクレオチドとの間に１〜約５オリゴヌクレオ チドの小さなギャップが存在するように、ファシリテーターを合成することがで きる。通常、ファシリテーターとリボザイムアナログとの間のギャップは０〜２ ヌクレオチドの範囲であろう。最も頻繁には、ファシリテーターとリボザイムア ナログとの間にはヌクレオチドギャップは存在しないであろう。 本発明のファシリテーターオリゴヌクレオチドは、一般に約５〜５０ヌクレオ チドを有する。より好ましいファシリテーターオリゴヌクレオチドは約５〜１５ デオキシリボヌクレオチドを含む。本発明による特に好ましいファシリテーター は約１３のヌクレオチドを含む。特定の長さのファシリテーターを選択すること は、リボザイムアナログのフランキング配列の長さと関係する。さらに、幾つか のファシリテーターデオキシヌクレオチドは、その一部がＲＮＡ基質配列に相補 的であり、別の一部は基質ＲＮＡ配列に相補的ではないヌクレオチドの配列を有 する。 ファシリテーターオリゴヌクレオチドは自動ＤＮＡ合成機により、またはＤＮ Ａ鋳型から手動により合成できる。ファシリテーターオリゴヌクレオチドは、合 成し、その後、リボザイムアナログによる基質開裂速度に影響を及ぼしたり、細 胞による取り込みを増大させたり、または分解に対する耐性を高めたりするよう な残基を含むように修飾することができる。たとえば、開裂部位近傍に結合した 基質ＲＮＡの塩基数を増加させることにより、ファシリテーターは一層短いフラ ンキング配列で一層速やかに作用するリボザイムアナログの使用を可能にする。 ウイルスにおける適用においては、ファシリテーターは内在性のリボヌクレアー ゼＨによるウイルスＲＮＡの開裂をも行わせる点で二重の利点を有する。 本発明の安定化リボザイムアナログの触媒能およびファシリテーターオリゴヌ クレオチドが該触媒能を促進する能力をさらに示すため、以下の研究を行った。 リボザイムコントロールＲ２２および安定化リボザイムアナログＲ５２、Ｒ５３ 、Ｒ５６、Ｒ４４およびＲ５０を、ファシリテーターオリゴヌクレオチド（Ｆ１ ）の不在下および存在下で基質ＲＮＡとともにインキュベートした。図６Ｂ〜図 ６Ｅに示す結果は、本発明の安定化リボザイムアナログがファシリテーターオリ ゴヌクレオチドとの組み合わせでリボザイムコントロールに匹敵する触媒活性を 有することを示している（図６Ａ）。 本発明の安定化リボザイムアナログは、本発明の安定化リボザイムアナログを 入れた容器、種々の安定化リボザイムアナログの混合物を入れた容器、安定化リ ボザイムアナログとファシリテーターオリゴヌクレオチドとを入れた容器、安定 化リボザイムアナログとＲＮＡリガーゼとを入れた容器、および／または安定化 リボザイムアナログとファシリテーターオリゴヌクレオチドとを入れた容器を含 む、キットの形態でのあらゆる使用方法のために提供できる。各容器中の安定化 リボザイムアナログの量またはリボザイムアナログとファシリテーターオリゴヌ クレオチドとの量は、一つの治療投与量またはアッセイに充分なものであってよ い。別のやり方として、キットの構成成分の量は、たとえばＲＮＡ分子をインビ トロで開裂するのに使用する場合に、容器から少量のアリコートのみを一度にサ ンプリングすればよいように濃縮することができる。キットはリボザイムアナロ グ、ファシリテーターオリゴヌクレオチドおよびＲＮＡリガーゼを活性な形態で 保存しなければならない。５'リン酸末端および３'リン酸末端を有する一本鎖Ｒ ＮＡ分子を共有結合により連結しうるものであれば、いかなるＲＮＡリガーゼも 有用である。そのような一つのリガーゼは、バクテリオファージＴ４のＲＮＡリ ガーゼである。 本発明はまた、治療に有用な安定化リボザイムアナログ、または安定化リボザ イムアナログとファシリテーターオリゴヌクレオチドとを含む、治療用組成物を も提供する。これら治療用組成物は、リボザイムアナログおよび／またはリボザ イムアナログとファシリテーターオリゴヌクレオチドとを最初に生体内に、その 後、標的細胞中に送達しうる仕方で個体に投与しなければならない。 一つの投与方法は、生理学的に許容しうる担体とともに少なくとも一つの上記 安定化リボザイムアナログを含有する治療用組成物によるものである。幾つかの 治療用組成物は２以上のタイプの本発明のリボザイムアナログを含み、さらに幾 つかの組成物はファシリテーターオリゴヌクレオチドを含む。 本明細書において「生理学的に許容しうる担体」とは、いずれかおよびすべて の溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌および抗真菌剤、等張および吸収遅延剤 、およびオリゴヌクレオチドの取り込み改善剤などを含む。薬理学的に活性な物 質のためのそのような媒体および剤の使用は、当該技術分野でよく知られている 。通常の媒体または剤が活性成分と適合しない場合を除く他、通常の媒体または 剤を治療用組成物に使用することができる。補助的な活性成分を組成物中に配合 す ることもできる。 注射に使用するのに適した剤型としては、滅菌水溶液または分散液および滅菌 注射液または分散液を即座に調製するための滅菌粉末が挙げられる。いずれの場 合も剤型を滅菌しなければならない。それは製造および貯蔵の条件下で安定でな ければならず、細菌や真菌などの微生物の汚染作用に対して保存しなければなら ない。担体は溶媒または分散媒体であってよい。微生物の作用からの保護は、種 々の抗菌および抗真菌剤によりもたらすことができる。注射可能な治療剤の吸収 の遅延は、吸収遅延剤の組成物の使用によりもたらすことができる。 本発明の治療用組成物は、通常の非毒性の薬理学的に許容しうる担体、アジュ バントおよびビヒクルを含む単位投与量組成物にて、非経口、経口、スプレイの 吸入、または経直腸により投与できる。本明細書において「非経口」とは、皮下 注射、静脈内注射、筋肉内注射、胸骨内注射または注入法を含む。 １回投与剤型を形成する担体物質を配合した活性リボザイムアナログの量は、 治療しようとするホストおよび特定の投与経路により異なるであろう。ある特定 の患者についての特定の投与レベルは、種々の因子、たとえば、使用した特定の 組成物の活性、年齢、体重、一般的な健康状態、性別、食事、投与時間、投与経 路、および治療を受けている特定の疾患の重篤度に依存するであろう。 本発明の安定化リボザイムアナログそれ自体または治療用組成物中の安定化リ ボザイムアナログは、リボザイムまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドを用い る技術分野の当業者によく知られた目的のために投与および利用することができ る。たとえば、ウイルスに感染した細胞は、ウイルス遺伝子の発現を阻止するた めに該ウイルス遺伝子に対応する特定のｍＲＮＡのヌクレオチド配列に相補的な フランキング配列を有するリボザイムアナログで処理することができる。同様に 、リボザイムアナログは、癌関連遺伝子またはインビトロもしくはインビボで過 剰発現される遺伝子の発現を停止させるために投与することができる。リボザイ ムアナログはまた、たとえば、特定の遺伝子の機能をノックアウトさせてその結 果を観察することにより、特定の遺伝子のインビトロまたはインビボでの機能を 探索するのにも有用である。 本発明による安定化リボザイムアナログはＲＮＡ特異的な制限エンドヌクレア ーゼとして有用であり、そのようなものとして、ＲＮＡリガーゼと組み合わせる ことにより組換えＲＮＡ分子を調製することを可能にする。 下記実施例は本発明を製造および実施するために好ましい態様を示すものであ るが、本発明がこれらに限定されることを意図するものではない。なぜなら、別 の方法を利用して同様の結果を得ることができるからである。 実施例 １．オリゴヌクレオチドの合成 ［α−³²Ｐ］ＡＴＰを用いて内部を放射性標識した基質ＲＮＡの調製は、Ｔ７ ＲＮＡポリメラーゼおよび二本鎖プロモーターを有する化学的に合成した一本鎖 鋳型を用い（ミリガン（Ｍilligan）ら（１９８７）Ｎucleic Ａcids Ｒes.１５ ：８７８３〜８７９８）、グッドチャイルド（Ｇoodchild）およびコーリ（Ｋoh li）による記載（Ａrch.Ｂiochem.Ｂiophys．（１９９１）２８４：３８６〜３ ９１）に従って行った。オリゴデオキシヌクレオチドの合成を標準自動ホスホル アミダイト法（アトキンソン（Ａtkinson）ら、Ｏligonucleotide Ｓynthesis. Ａ Ｐractical Ａpproach（ゲイト編）ＩＲＬプレス、ワシントン、Ｄ.Ｃ．（１ ９８５）３５〜８１頁）を用いて行い、ついでポリアクリルアミドゲル電気泳動 により精製した。 放射性標識基質の濃度は、標識に使用した［α−³²Ｐ］ＡＴＰの比活性から決 定した。非標識ＲＮＡの濃度は、２６０ｎｍにおける吸光度から分光学的に決定 した。この波長における吸光係数は、ヘビ毒ホスホジエステラーゼおよび細菌ア ルカリホスファターゼを用いて試料を完全に消化したときに観察されるＲＮＡの 淡色性（hypochromicity）を可能とする成分ヌクレオチドの係数の合計から決定 した。 ２．リボザイムアナログの化学合成 リボザイムの合成を、市販の２'−Ｏ−シリルヌクレオシドホスホルアミダイ トを用いた自動固相支持体ホスホルアミダイト法（ウスマン（Ｕsman）ら（１９ ８７）Ｊ.Ａm.Ｃhem.Ｓoc.１０９：７８４５〜７８５４）を用いて１μモルのス ケールで行った。支持体からの生成物の開裂および脱保護は、濃水酸化アンモニ ウム：エタノール（３：１、ｖ／ｖ）を用いて５５℃にて１６時間で行った。上 澄み液を半分に分割し、それぞれを別々に処理した。溶媒を蒸発させた後、各半 分の生成物を１Ｍテトラヒドロフラン（ＴＨＦ）（０．４ｍｌ）中のテトラブチ ルアンモニウムフルオライド（ＴＢＡＦ）の溶液中に溶解し、暗室、室温にて１ ６〜２４時間保持してシリル基を除去した。この溶液を氷中で冷却し、氷冷５０ ｎＭトリス−ＨＣｌ、ｐＨ７.４（０．４ｍｌ）で処理した。負荷染料（０.０５ 重量％のオレンジＧを含有する水中の９５％ホルムアミドを０.８ｍｌ）を加え た後、溶液を９５℃に加熱し、冷却し、基質ＲＮＡについて記載されたように（ グッドチャイルドら（１９９１）Ａrch.Ｂiochem.Ｂiophys.２８４：３８６〜３ ９１）電気泳動による精製のためにポリアクリルアミドゲルに直接適用した。 ４．ファシリテーターオリゴヌクレオチドの調製 非修飾（ホスホジエステル結合した）デオキシリボヌクレオチドを含むファシ リテーターオリゴヌクレオチドを、米国特許第５，１４９，７８９号に記載され ている標準Ｈ−ホスホネート化学を用い、またはボーケージ（Ｂeaucage）（Ｍe th.Ｍol.Ｂiol．（１９９３）２０：３３〜６１）またはウールマン（Ｕhlman） ら（Ｃhem.Ｒev．（１９９０）９０：５３４〜５８３）により記載された標準ホ スホルアミダイト化学を用い、自動ＤＮＡ合成機（アプライド・バイオシステム ズ（Ａpplied ＢioＳystems）、フォスターシティー、カリフォルニア）にて１. ０μモルスケールで合成した。 ５．開裂活性のアッセイ ５０ｎＭトリス−ＨＣｌ（ｐＨ７.４）中に置換されたリボザイムアナログま たはリボザイムコントロールＲ２２（最終濃度０.０２５μＭ）、基質ＲＮＡ（ たとえば、Ｓ１２；最終濃度０.５μＭ）および適当な場合にはファシリテータ ー（最終濃度１.０μＭ）を含有する溶液（４５μｌ）を、１０分間、反応温度 とした。反応は２００ｍＭ ＭｇＣｌ₂（５μｌ；最終濃度２０ｍＭ）を加えるこ とにより開始した。所定時間の後、反応液の５μｌアリコートを１０μｌの負荷 染料（０.０５重量％のオレンジＧを含有する水中の９５％ホルムアミド）に加 え、 氷上に置いた。試料を９５℃にて２分間加熱して変性させ、８Ｍ尿素を含有する １５％ポリアクリルアミドゲル上の電気泳動により分析した。放射能バンドの定 量をリン造影剤（phosphorimager）（モレキュラー・ダイナミックス（Ｍolecul ar Ｄynamics）、サニーベイル、カリフォルニア）を用いて行った。代表的な結 果を図６Ａ〜図６Ｄに示す。 ６．安定性アッセイ 下記手順を用いてヒト血清中でのリボザイムの半減期を調べた。Ｈ₂Ｏ中に５' ［³²Ｐ］末端標識リボザイム（４０,０００〜１５０,０００ｃｐｍ）およびｔＲ ＮＡ（最終濃度３００μＭ）を含有する溶液（５０μｌ）を調製した。この溶液 を５μｌ取り、負荷染料（０.０５重量％のオレンジＧを含有するＨ₂Ｏ中の９Ｍ 尿素、１００ｍＭ ＥＤＴＡ；２０μｌ）に加え、ドライアイス上に置いた。残 りの４５μｌを蒸発乾固した。得られたペレットを４５μｌのヒト血清（シグマ ・ケミカル、セントルイス、ミズーリ）中に溶解し、３７℃でインキュベートし た。所定時間に反応液の５μｌのアリコートを負荷染料（２０μｌ）に加え、ド ライアイス上に置いた。試料を９５℃で２分間加熱することにより変性し、８Ｍ 尿素を含有する１５％ポリアクリルアミドゲル上の電気泳動により分析した。代 表的な結果を図４に示す。

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＤＥ， ＤＫ，ＥＳ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，ＩＴ，ＬＵ，Ｍ Ｃ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ，ＣＦ，ＣＧ ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＭＬ，ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ， ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＫＥ，ＬＳ，ＭＷ，ＳＤ，ＳＺ，Ｕ Ｇ)，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ，ＡＵ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，Ｂ Ｙ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＥ，ＦＩ ，ＧＢ，ＧＥ，ＨＵ，ＩＳ，ＪＰ，ＫＥ，ＫＧ，ＫＰ， ＫＲ，ＫＺ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，Ｍ Ｄ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ ，ＰＴ，ＲＯ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ， ＴＪ，ＴＭ，ＴＴ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＺ，ＶＮ

Claims (1)

1. 【特許請求の範囲】 １．下記からなる安定化リボザイムアナログ： （ａ）３'末端および５'末端を有し、ステム領域およびループ領域を含むヘリッ クスIIであって、 該ステム領域は、３'末端および５'末端を有し、３'から５'へ共有結合により 連結した複数の自己ハイブリダイズヌクレオチドを含み、 該ループ領域は、その３'末端および５'末端にて該ステム領域に共有結合によ り連結しており、ハーゼロフ位置のＬ２.２およびＬ２.３に、プリン、２'−Ｏ −アルキル化またはそれらの組み合わせである少なくとも２つの修飾ヌクレオチ ドを含む３'から５'へ共有結合により連結した複数のヌクレオチドを含み、； （ｂ）第一および第二の触媒コア領域であって、これら領域はそれぞれ３'から ５'へ共有結合により連結した複数のヌクレオチドを含み、それぞれ３'末端およ び５'末端を有し、 該第一の触媒コア領域はさらに少なくとも２つの修飾ヌクレオチドを含み、該 修飾ヌクレオチドは、ハーゼロフ位置の少なくとも３および４において２'−Ｏ −アルキル化されたもの、およびハーゼロフ位置の７におけるプリンまたは２' −Ｏ−アルキル化である少なくとも一つの修飾ヌクレオチドであり、 該第一の触媒コア領域の３'末端は該ステム領域の５'末端に共有結合により連 結しており、該第二の触媒コア領域の５'末端は該ステム領域の３'末端に共有結 合により連結しており、 （ｃ）第一および第二のフランキング領域であって、これら領域はそれぞれ３' から５'へ共有結合により連結した複数のプリンおよびピリミジンヌクレオチド を含み、それらヌクレオチドの少なくとも一つが２'−Ｏ−アルキル化されてお り、それぞれ３'末端および５'末端を有し、該第一のフランキング領域の少なく とも一部は基質ＲＮＡ分子の第一の標的領域に相補的であり、該第二のフランキ ング領域の少なくとも一部は該基質ＲＮＡ分子の第二の標的領域に相補的であり 、該第一のフランキング領域の３'末端は該第一のヌクレオチド性コア領域の５' 末端に共有結合により連結しており、該第二のフランキング領域の５'末端は該 第 二のヌクレオチド性コア領域の３'末端に共有結合により連結しているもの。 ２．該ステム領域中の自己ハイブリダイズヌクレオチドの少なくとも一つが修飾 されており、該修飾ヌクレオチドがプリンまたは２'−Ｏ−アルキル化されたも のである、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 ３．該ステム領域のハーゼロフ位置の１０.３、１０.４、１１.１および１１.２ の自己ハイブリダイズヌクレオチドが修飾されている、請求項２に記載のリボザ イムアナログ。 ４．該ステム領域中のピリミジンが２'−Ｏ−アルキル化されている、請求項２ に記載のリボザイムアナログ。 ５．該ステム領域中のすべての自己ハイブリダイズヌクレオチドが修飾されてい る、請求項２に記載のリボザイムアナログ。 ６．該ループ領域中のすべてのヌクレオチドが修飾されている、請求項１に記載 のリボザイムアナログ。 ７．該ループ領域中のすべてのヌクレオチドが修飾されている、請求項５に記載 のリボザイムアナログ。 ８．該第一のフランキング領域中のすべてのヌクレオチドが２'−Ｏ−アルキル 化されている、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 ９．位置１５.１のヌクレオチド以外は該第二のフランキング領域中のすべての ヌクレオチドが２'−Ｏ−アルキル化されている、請求項１に記載のリボザイム アナログ。 １０．ハーゼロフ位置１５.１のヌクレオチド以外は該第二のフランキング領域 中のすべてのヌクレオチドが２'−Ｏ−アルキル化されている、請求項８に記載 のリボザイムアナログ。 １１．該ステム領域中に少なくとも一つの修飾ヌクレオチドをさらに含む、請求 項１０に記載のリボザイムアナログ。 １２．該ステム領域中のすべてのヌクレオチドが修飾されている、請求項１１に 記載のリボザイムアナログ。 １３．該ループ領域中のすべてのヌクレオチドが修飾されている、請求項１２に 記載のリボザイムアナログ。 １４．少なくとも２つのヌクレオシドがアルキルホスホネートインターヌクレオ シド結合により連結されている、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 １５．少なくとも２つのヌクレオシドがホスホルアミデートインターヌクレオシ ド結合により連結されている、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 １６．該第一および第二のフランキング領域が、それぞれ少なくとも４つのヌク レオシドを含む、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 １７．該第一および第二のフランキング領域が、それぞれ少なくとも６つのヌク レオチドを含む、請求項１６に記載のリボザイムアナログ。 １８．該第一のフランキング領域中の少なくとも４つのヌクレオチドが標的ＲＮ Ａの少なくとも４つのヌクレオチドの第一セットに相補的であり、該第二のフラ ンキング領域中の少なくとも４つのヌクレオチドが標的ＲＮＡの少なくとも４つ のヌクレオチドの第二セットに相補的であり、該第一セットおよび第二セットが 互いに排他的である、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 １９．２'−Ｏ−アルキル化ヌクレオチドが、２'−Ｏ−メチル化、２'−Ｏ−エ チル化、２'−Ｏ−プロピル化、および２'−Ｏ−ブチル化ヌクレオチドよりなる 群から選ばれる、請求項１に記載のリボザイムアナログ。 ２０．該２'−Ｏ−アルキル化ヌクレオチドが２'−Ｏ−メチル化ヌクレオチドで ある、請求項１９に記載のリボザイムアナログ。 ２１．該ループ領域および該第一および第二のフランキング領域中のヌクレオシ ドが、ホスホジエステル、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、ホスホ ロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホルアミデート、リン酸エ ステル、カルバメート、カーボネート、アセトアミデート、カルボキシメチルエ ステル、およびそれらの組み合わせよりなる群から選ばれたインターヌクレオシ ド結合により共有結合で連結されている、請求項１に記載のリボザイムアナログ 。 ２２．ＲＮＡ分子の発現を制御する方法であって、 （ａ）請求項１に記載の安定化リボザイムアナログを用意し、ついで （ｂ）該ＲＮＡ分子を該リボザイムアナログと、該第一のフランキング領域が該 ＲＮＡ分子の該第一の標的領域とハイブリダイズし、該第二のフランキング領域 が該ＲＮＡ分子の該第二の標的領域とハイブリダイズするように接触させる ことを含み、 該リボザイムアナログは該ＲＮＡ分子を開裂し、それによって該ＲＮＡの発現を 制御することを特徴とする方法。 ２３．該接触工程が、該ＲＮＡ分子を該リボザイムアナログに接触させるのと同 時に該ＲＮＡ分子をファシリテーターオリゴヌクレオチドと接触させることをさ らに含む、請求項２２に記載の方法。 ２４．一本鎖ＲＮＡ含有基質分子を部位特異的に開裂する方法であって、 （ａ）請求項１に記載の安定化リボザイムアナログを用意し、ついで （ｂ）該ＲＮＡ含有基質分子を該リボザイムアナログと、該リボザイムの該第一 のフランキング領域が該基質分子の該第一の標的領域とハイブリダイズし、該リ ボザイムアナログの該第二のフランキング領域が該基質分子の該第二の標的領域 とハイブリダイズするように接触させ、 該リボザイムアナログは該分子中の該ＲＮＡを開裂する ことを特徴とする方法。 ２５．該ＲＮＡ含有基質分子を該リボザイムアナログに接触させるのと同時に該 ＲＮＡ含有基質分子をさらにファシリテーターオリゴヌクレオチドと接触させる 、請求項２４に記載の方法。 ２６．請求項１に記載の安定化リボザイムアナログを含むキット。 ２７．ファシリテーターオリゴヌクレオチドをさらに含む請求項２６に記載のキ ット。 ２８．ＲＮＡリガーゼをさらに含む請求項２６に記載のキット。 ２９．請求項９に記載のリボザイムアナログを含むキット。 ３０．ファシリテーターオリゴヌクレオチドをさらに含む請求項２９に記載のキ ット。 ３１．ＲＮＡリガーゼをさらに含む請求項２９に記載のキット。 ３２．生理学的に許容しうる媒体中に請求項１に記載のリボザイムアナログを含 む治療用組成物。 ３３．生理学的に許容しうる媒体中に請求項９に記載のリボザイムアナログを含 む治療用組成物。 ３４．該ステム領域中のピリミジンが２'−Ｏ−アルキル化されている、請求項 ４に記載のリボザイムアナログ。