JPS6219088A - 新規ベクタ−プラスミド - Google Patents
新規ベクタ−プラスミドInfo
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- JPS6219088A JPS6219088A JP61168975A JP16897586A JPS6219088A JP S6219088 A JPS6219088 A JP S6219088A JP 61168975 A JP61168975 A JP 61168975A JP 16897586 A JP16897586 A JP 16897586A JP S6219088 A JPS6219088 A JP S6219088A
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- Japan
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- plasmid
- dna
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- vector plasmid
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- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/10—Processes for the isolation, preparation or purification of DNA or RNA
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
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Abstract
(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。
め要約のデータは記録されません。
Description
【発明の詳細な説明】
本発明は、組み換えDNA技術に用いる新規ベクープラ
スミド、及びこのプラスミドの構築法と使用、イしてこ
れが取込まれる微生物(特に大腸菌)に関する。
スミド、及びこのプラスミドの構築法と使用、イしてこ
れが取込まれる微生物(特に大腸菌)に関する。
最近数年間に多くの組み換えDNA分子が作成され、そ
の中にはユニークな生物学的機能が一緒になってDNA
クローニングやDNA操作の重要な手段となっているも
のもいくつかある(Old &Primrose、 1
982年)。これらのベクターは、挿入不活性化により
表現型を変化させることができる遺伝的決定因子が存在
することが特徴である。
の中にはユニークな生物学的機能が一緒になってDNA
クローニングやDNA操作の重要な手段となっているも
のもいくつかある(Old &Primrose、 1
982年)。これらのベクターは、挿入不活性化により
表現型を変化させることができる遺伝的決定因子が存在
することが特徴である。
さらにこれらのベクターは複数の制限酵素の単一切断部
位を有し、多くの制限断片を直接クローニングできる。
位を有し、多くの制限断片を直接クローニングできる。
最近、レプリカ平板法を用いることなく組み換えクロー
ンの直接的同定を可能にするクローニングベークルが作
成された。これらのベクターのうち最も多機能のものは
、適当な宿主株のl ac7突然変異の相補性を利用す
る繊維状ファージベクターとptJcプラスミドである
(Vieira &Messing、1982年; (
Hessino 、1983年)。(1lenteら、
1983年)は、1)LJCプラスミドとM131Il
pファージの性質が組合わさった一連のクローニングベ
クターの構築を報告している。Ffファージf1の機能
性複製開始点と形態形成シグナルを含む断片をpUCプ
ラスミドにクローニングして、新規プラスミドベクター
(pEMBI−プラスミド)が得られた。ヘルパーファ
ージの存在しないところではこれらのプラスミドの複製
はGOI Fl複製開始点に依存する。
ンの直接的同定を可能にするクローニングベークルが作
成された。これらのベクターのうち最も多機能のものは
、適当な宿主株のl ac7突然変異の相補性を利用す
る繊維状ファージベクターとptJcプラスミドである
(Vieira &Messing、1982年; (
Hessino 、1983年)。(1lenteら、
1983年)は、1)LJCプラスミドとM131Il
pファージの性質が組合わさった一連のクローニングベ
クターの構築を報告している。Ffファージf1の機能
性複製開始点と形態形成シグナルを含む断片をpUCプ
ラスミドにクローニングして、新規プラスミドベクター
(pEMBI−プラスミド)が得られた。ヘルパーファ
ージの存在しないところではこれらのプラスミドの複製
はGOI Fl複製開始点に依存する。
このプラスミドを有する細胞をファージIR1(flの
誘導体)で感染させると、プラスミドはFf型の複製を
開始し、1つの鎖(F鎖)がファージ様粒子中に選択的
にパッケージされる。
誘導体)で感染させると、プラスミドはFf型の複製を
開始し、1つの鎖(F鎖)がファージ様粒子中に選択的
にパッケージされる。
M13mpファージと1) E M B Lプラスミド
は、大量の1本鎖DNA (これは例えばF)NA配列
解析に利用できる)の調製に特に適1ノでいるが、1つ
大きな欠点を有する。このベクターを用いた場合r’)
NA鎖の1つのみ(すなわちウィル、ス鎖複製開始点が
存在する鎖)がパッケージされる。普通DNA断片の両
鏡のヌクレオチド配列を求める必要があるため、目的の
断片は同じベクター内で2つの配向でクローン化しなけ
ればならない。比較的釜石のDNA分子の配列は、ラン
ダムに作成した断片のショットガンクローニング法で求
められることが多い(5anoerら、1980年);
(Hessinoら、1981年) ; (peete
rsら、1985年)。この場合両鏡の配列決定には、
配向が逆になった重複断片を含むりO−ンのDNAライ
ブラリーが存在する必要がある。もしこの条件が満たさ
れない場合、特定の組み換えプラスミドから目的の断片
を回収して反対の方向に再クローニングする必要がある
。あるいは2本鎖DNAを用いて直接又はエキソヌクレ
アーぜ■で処理後、配列解析によりヌクレオチド配列を
決めなければならなイ(WaNaceら、1981年)
; (Guo &旧1.1982年)。このいずれの
方法も細胞内プラスミドDNAの単離と精製が必要であ
り、これは特に大量のクローンが関与する場合特に時間
がかかる。さらに2本鎖DNAを用いて行う配列前析は
、1本鎖DNA鋳型を用いて行う方法に比べ結果が劣る
(rleininger 、1983年)。
は、大量の1本鎖DNA (これは例えばF)NA配列
解析に利用できる)の調製に特に適1ノでいるが、1つ
大きな欠点を有する。このベクターを用いた場合r’)
NA鎖の1つのみ(すなわちウィル、ス鎖複製開始点が
存在する鎖)がパッケージされる。普通DNA断片の両
鏡のヌクレオチド配列を求める必要があるため、目的の
断片は同じベクター内で2つの配向でクローン化しなけ
ればならない。比較的釜石のDNA分子の配列は、ラン
ダムに作成した断片のショットガンクローニング法で求
められることが多い(5anoerら、1980年);
(Hessinoら、1981年) ; (peete
rsら、1985年)。この場合両鏡の配列決定には、
配向が逆になった重複断片を含むりO−ンのDNAライ
ブラリーが存在する必要がある。もしこの条件が満たさ
れない場合、特定の組み換えプラスミドから目的の断片
を回収して反対の方向に再クローニングする必要がある
。あるいは2本鎖DNAを用いて直接又はエキソヌクレ
アーぜ■で処理後、配列解析によりヌクレオチド配列を
決めなければならなイ(WaNaceら、1981年)
; (Guo &旧1.1982年)。このいずれの
方法も細胞内プラスミドDNAの単離と精製が必要であ
り、これは特に大量のクローンが関与する場合特に時間
がかかる。さらに2本鎖DNAを用いて行う配列前析は
、1本鎖DNA鋳型を用いて行う方法に比べ結果が劣る
(rleininger 、1983年)。
本発明は以下の点でこれらの欠点を克服した新規ベクタ
ープラスミドを与える:すなわちこのベクタープラスミ
ドは、 a)F1毛を有する大腸菌のm絹状バクテリオファージ
の複製開始点+形態形成シグナル、又はそれらの活性突
然変異体;及び b) N11i毛を有する大腸菌のl1ff状バクテ
リオフアージの複製開始点+形態形成シグナル、又はそ
れらの活性突然変異体を、互いに反対の配向で組み込ん
でいる出発ベクターから作成される。
ープラスミドを与える:すなわちこのベクタープラスミ
ドは、 a)F1毛を有する大腸菌のm絹状バクテリオファージ
の複製開始点+形態形成シグナル、又はそれらの活性突
然変異体;及び b) N11i毛を有する大腸菌のl1ff状バクテ
リオフアージの複製開始点+形態形成シグナル、又はそ
れらの活性突然変異体を、互いに反対の配向で組み込ん
でいる出発ベクターから作成される。
さらに詳しくは、本発明は、
a)繊維状バクテリオファージFf(M13、fd及び
f1)又はその突然変位体の複製開始点+形態形成シグ
ナル、又はそれらの活性突然変異体;及び b)繊繍状バクテリオファージIKe又はその突然変異
体の複製開始点+形態形成シグナル、又はその活性突然
変異体を含有するベクタープラスミドに関する。
f1)又はその突然変位体の複製開始点+形態形成シグ
ナル、又はそれらの活性突然変異体;及び b)繊繍状バクテリオファージIKe又はその突然変異
体の複製開始点+形態形成シグナル、又はその活性突然
変異体を含有するベクタープラスミドに関する。
好ましくは新規ベクタープラスミドは、pUCプラスミ
ド(ざらに好ましくはp LJ C9)を出発ベクター
とする。
ド(ざらに好ましくはp LJ C9)を出発ベクター
とする。
このような新規のベクタープラスミドの1つの態様はp
tJ C9に基づいており、ここでは(2)は制限酵
素NarIの甲−の認識配列に挿入され、0は制限酵素
NdeIの単一の認識配列に挿入されているか、又はこ
の逆になっている。
tJ C9に基づいており、ここでは(2)は制限酵
素NarIの甲−の認識配列に挿入され、0は制限酵素
NdeIの単一の認識配列に挿入されているか、又はこ
の逆になっている。
本明細書ではその様なプラスミドの例、すなわち第1図
に示す構造を有JるプラスミドpKLIN9を与える。
に示す構造を有JるプラスミドpKLIN9を与える。
もう1つの例は、第2図に示す構造を有するI’)KU
N9由来プラスミドpKUN19である。
N9由来プラスミドpKUN19である。
本発明は又、1つの2本鎖DNAが適当な位置に挿入さ
れた上記のベクタープラスミドを包含する。
れた上記のベクタープラスミドを包含する。
本発明は又、本発明のベクタープラスミドを含有する微
生物、特に大腸菌に関する。このベクターは、Ftra
及び/又はNtra3m1仏子が存在するために、F−
特異的及び/又はN−特異的繊維状バクテリオファージ
の感染に対し感受性のある大引りすなわちF繊毛及び/
又はN繊毛を有する大腸菌に導入されることが好ましい
。
生物、特に大腸菌に関する。このベクターは、Ftra
及び/又はNtra3m1仏子が存在するために、F−
特異的及び/又はN−特異的繊維状バクテリオファージ
の感染に対し感受性のある大引りすなわちF繊毛及び/
又はN繊毛を有する大腸菌に導入されることが好ましい
。
本発明はさらに、本発明の新規プラスミドの使用と、本
発明の新規ベクタープラスミドの構築法に関する。
発明の新規ベクタープラスミドの構築法に関する。
従って本発明は、F−特異的繊維状バクテリオファージ
による感染に対して感受性がある本発明のベクタープラ
スミドを含有する大腸菌を、F−特異的繊維状バクテリ
オファージで感染させインキュベートした後、ファージ
様形質導入粒子を単離するか、及び/又はN−特異的繊
維状バクテリオファージによる感染に対して感受性があ
る本発明のベクタープラスミドを含有する大腸菌を、N
−特異的繊維状バクテリオファージで感染させインキュ
ベートした後、ファージ様形質導入粒子をl11111
1するか、又はF−特異的かつN−特異的繊維状バクテ
リオファージに対して感受性がある本発明のベクタープ
ラスミドを含有する大腸菌集団の一部をF−特異的繊維
状バクテリオファージで感染させ、この集団の別の一部
をN−特異的1維状バクテリオフアージで感染さVイン
キュベートした後、生成したファージ様形質導入粒子を
単離することより成る、1つの2本鎖DNAの鎖の1本
又は2本を、ファージ様粒子を含有する1本鎖DNAに
選択的にパッケージする方法を与える。
による感染に対して感受性がある本発明のベクタープラ
スミドを含有する大腸菌を、F−特異的繊維状バクテリ
オファージで感染させインキュベートした後、ファージ
様形質導入粒子を単離するか、及び/又はN−特異的繊
維状バクテリオファージによる感染に対して感受性があ
る本発明のベクタープラスミドを含有する大腸菌を、N
−特異的繊維状バクテリオファージで感染させインキュ
ベートした後、ファージ様形質導入粒子をl11111
1するか、又はF−特異的かつN−特異的繊維状バクテ
リオファージに対して感受性がある本発明のベクタープ
ラスミドを含有する大腸菌集団の一部をF−特異的繊維
状バクテリオファージで感染させ、この集団の別の一部
をN−特異的1維状バクテリオフアージで感染さVイン
キュベートした後、生成したファージ様形質導入粒子を
単離することより成る、1つの2本鎖DNAの鎖の1本
又は2本を、ファージ様粒子を含有する1本鎖DNAに
選択的にパッケージする方法を与える。
本発明は、こうして得られたDNAの合鏡の配列決定方
法と、さらに一般的にはDNA又はメツセンジャーRN
Aのクローニング、DNA配列決定、部位特巽的突然変
異誘発、S1マツピング、クローン化D N Aの発現
、及び1重鎖ハイブリダイゼーションブ日−ブのI!f
Jのために2本鎖DNAが挿入された、本発明のベクタ
ープラスミドの使用に関する。
法と、さらに一般的にはDNA又はメツセンジャーRN
Aのクローニング、DNA配列決定、部位特巽的突然変
異誘発、S1マツピング、クローン化D N Aの発現
、及び1重鎖ハイブリダイゼーションブ日−ブのI!f
Jのために2本鎖DNAが挿入された、本発明のベクタ
ープラスミドの使用に関する。
広くいうと、本発明のプラスミドは、親ベクターの制限
酵素認識配列で(a)又は(b)をクローン化し、形質
転換体を選択し、親ベクターの別の制限酵素認識配列で
0又は(a)をクローン化し、形質転換体を選択するこ
とにより構築される。
酵素認識配列で(a)又は(b)をクローン化し、形質
転換体を選択し、親ベクターの別の制限酵素認識配列で
0又は(a)をクローン化し、形質転換体を選択するこ
とにより構築される。
さらに訝しくはこの方法は、pUC9の制限酵素Nar
I又は制限酵素NdeIの単一の認識配列で(2)又は
(b)をクローン化し、[−特異的又はN−特異的繊維
状バクテリオファージで感染さけた大腸菌のpolA突
然変異体の方法により形質転換体を選択し、次に未使用
の単一の認識配列で、得られた組み換えプラスミドの1
つで(b)をり0−ン化し、N−特異的又はF−特異的
繊維状バクテリオファージで感染させた大腸菌のpol
A突然変異体の方法により形質転換体を選択することよ
り成る。
I又は制限酵素NdeIの単一の認識配列で(2)又は
(b)をクローン化し、[−特異的又はN−特異的繊維
状バクテリオファージで感染さけた大腸菌のpolA突
然変異体の方法により形質転換体を選択し、次に未使用
の単一の認識配列で、得られた組み換えプラスミドの1
つで(b)をり0−ン化し、N−特異的又はF−特異的
繊維状バクテリオファージで感染させた大腸菌のpol
A突然変異体の方法により形質転換体を選択することよ
り成る。
実験の項で詳述Jる本発明の好適な態様は、ベクタープ
ラスミドDKUN9の構築法であり、これはプラスミド
ptJ C9を制限酵素N[)e Iとクレノウ[IN
Aポリメラーゼlで処理して平滑末端線状2本鎖DNA
を形成させ、この線状DNAを平滑末端線状2本鎖DN
A (これはプラスミドpIKori 2b(1)を
制限酵素FCOR1とBam1−11で処理し、I k
e (7) (+ ) 複製fitlQfi点+形態
形成シグナルを有する断片を単離し、これをクレノウD
NAポリメラーぜ1で処即して作成する)と結合させ、
Ike又はその突然変異体で感染させた大腸菌のr)O
IA突然変異株の形質転換とアンピシリン耐性]ロニー
の選択により、pLJ C9のNdeI部位にIkeの
複製開始点十形前形成シグナルが挿入された形質転換体
を選択し、p LJ C9のl ac7遺伝子と同じ配
向でIkeの(+)複III開始点を含有する組み換え
プラスミドを単離し、このプラスミドを制限酵素Nar
IとクレノウI)NAポリメラーゼIで処即して平滑末
端線状2本鎖DNAを形成され、この線状DNAを平滑
末端線状2本鎖DNA (これはプラスミドp E M
Bl−8を制限酵素R6a■で処即し、flの(+)
複製開始点+形態形成シグナルを含有する断片を単離し
、これをクレノウDNAポリメラーゼIで処理して作成
Jる)と結合させ、Ff又はその突然変異体で感染させ
た大腸菌のr)OIA突然変異株の形成転換とアンピシ
リン耐性]ロニーの選択により、pUC9のNar1部
位にflの複製開始点+形態形成ジグナルが挿入された
形質転換体を選択することにより成る。
ラスミドDKUN9の構築法であり、これはプラスミド
ptJ C9を制限酵素N[)e Iとクレノウ[IN
Aポリメラーゼlで処理して平滑末端線状2本鎖DNA
を形成させ、この線状DNAを平滑末端線状2本鎖DN
A (これはプラスミドpIKori 2b(1)を
制限酵素FCOR1とBam1−11で処理し、I k
e (7) (+ ) 複製fitlQfi点+形態
形成シグナルを有する断片を単離し、これをクレノウD
NAポリメラーぜ1で処即して作成する)と結合させ、
Ike又はその突然変異体で感染させた大腸菌のr)O
IA突然変異株の形質転換とアンピシリン耐性]ロニー
の選択により、pLJ C9のNdeI部位にIkeの
複製開始点十形前形成シグナルが挿入された形質転換体
を選択し、p LJ C9のl ac7遺伝子と同じ配
向でIkeの(+)複III開始点を含有する組み換え
プラスミドを単離し、このプラスミドを制限酵素Nar
IとクレノウI)NAポリメラーゼIで処即して平滑末
端線状2本鎖DNAを形成され、この線状DNAを平滑
末端線状2本鎖DNA (これはプラスミドp E M
Bl−8を制限酵素R6a■で処即し、flの(+)
複製開始点+形態形成シグナルを含有する断片を単離し
、これをクレノウDNAポリメラーゼIで処理して作成
Jる)と結合させ、Ff又はその突然変異体で感染させ
た大腸菌のr)OIA突然変異株の形成転換とアンピシ
リン耐性]ロニーの選択により、pUC9のNar1部
位にflの複製開始点+形態形成ジグナルが挿入された
形質転換体を選択することにより成る。
り成る。
本発明のさらに好適な態様(これも実験の項で詳述する
)は、puc9から得られるベクタープラスミドpKU
N19の構築方法であり、これはプラスミドp LJ
C19を制限酵素EcoRI。
)は、puc9から得られるベクタープラスミドpKU
N19の構築方法であり、これはプラスミドp LJ
C19を制限酵素EcoRI。
Hi ndI[lで処理し次に制限酵素1−18 e
Iで処理して、この消化生成物を単離し、ここにプラス
ミドpKUN9をN111限酵素FcoRI、 1」i
ndTIl及びPstIで消化して得られる断片を添
加し、この混合液にリガーゼを加え、生成した[)NA
分子を大腸菌JM83に形質転換し、これをアンピシリ
ンとx−galを含有する寒天平板上で選択することよ
り成る。
Iで処理して、この消化生成物を単離し、ここにプラス
ミドpKUN9をN111限酵素FcoRI、 1」i
ndTIl及びPstIで消化して得られる断片を添
加し、この混合液にリガーゼを加え、生成した[)NA
分子を大腸菌JM83に形質転換し、これをアンピシリ
ンとx−galを含有する寒天平板上で選択することよ
り成る。
pKUN9由来のプラスミドp K LJ N 19は
、r)LJC19プラスミドのポリリンカー配列を有す
るため、DKUN19に対して4個余分の甲−の制限酵
素切断部位を、従ってl ac7遺伝子中にクローニン
グ位置を有する。
、r)LJC19プラスミドのポリリンカー配列を有す
るため、DKUN19に対して4個余分の甲−の制限酵
素切断部位を、従ってl ac7遺伝子中にクローニン
グ位置を有する。
公知の様に、N−特異的(Ike)及びF−特異的(M
13、fd及びfl、ここではまとめてFfとする)繊
維状バクデリオファージの1本鎖(SS)DNAゲノム
は、複製型(RF)と呼ばれる2本鎖中間体を介して複
製される。l’)NA複製サイクルは、3段階に区別さ
れる( Denhardtら、1978年)の総説を参
照)。第1段階ではウィルス5SDNAはRFに変換さ
れる。これは、宿主に]−ドされる機能と、1本鎖ファ
ージゲノム中に存在する(相補的鎖)複製開始点((−
)−複製開始点)に完全に依存する。第2段階ではRF
が何回も複製され、大量の子孫RF分子が産生される。
13、fd及びfl、ここではまとめてFfとする)繊
維状バクデリオファージの1本鎖(SS)DNAゲノム
は、複製型(RF)と呼ばれる2本鎖中間体を介して複
製される。l’)NA複製サイクルは、3段階に区別さ
れる( Denhardtら、1978年)の総説を参
照)。第1段階ではウィルス5SDNAはRFに変換さ
れる。これは、宿主に]−ドされる機能と、1本鎖ファ
ージゲノム中に存在する(相補的鎖)複製開始点((−
)−複製開始点)に完全に依存する。第2段階ではRF
が何回も複製され、大量の子孫RF分子が産生される。
この工程はファージの]−ドする遺伝子■蛋白の作用で
開始され、ウィルス鎖の特異的な位置くウィルス鎖複製
開始点又は(+)−複製開始点)にニックが導入され(
Neverら、1979年)、その結果ローリングリ−
クル(roNingcircle) 1!構に従いDN
Aポリメラーゼによる複製のためのプライマーとして作
用する3′−〇[]末端ができる。複製が1回終了した
後、遺伝子■蛋白は再び、別れたウィルス鎖を全く同じ
位置で切断して、親(+)鎖を新に合成された(+)鎖
から分離する。同時に、得られたRFと5sDNA分子
は、共有結合で閉じられて円形分子が産生される(Ne
ver & Ge1der11982年)。
開始され、ウィルス鎖の特異的な位置くウィルス鎖複製
開始点又は(+)−複製開始点)にニックが導入され(
Neverら、1979年)、その結果ローリングリ−
クル(roNingcircle) 1!構に従いDN
Aポリメラーゼによる複製のためのプライマーとして作
用する3′−〇[]末端ができる。複製が1回終了した
後、遺伝子■蛋白は再び、別れたウィルス鎖を全く同じ
位置で切断して、親(+)鎖を新に合成された(+)鎖
から分離する。同時に、得られたRFと5sDNA分子
は、共有結合で閉じられて円形分子が産生される(Ne
ver & Ge1der11982年)。
感染の初期では新に合成された5sDNAは、複製の第
1段階と同様にRFに変換される。しかし感染の後1f
l(第3段階)では、5sDNAはファージのコードす
る5sDNA結合蛋白(遺伝子V蛋白)にカバーされR
Fへの変換が妨げられるため、子孫5sDNAが合成さ
れる。5sDNAと遺伝子■蛋白の核蛋白複合体は、宿
主細胞膜へ輸送され、そこで成熟ファージ粒子へのパッ
ケージングが行われる。この■稈にはく+)−複製開始
点に連続する特異的なl’)NA配列(形態形成シグナ
ル)が必要であル(Dotto & Zinder、1
983年)。
1段階と同様にRFに変換される。しかし感染の後1f
l(第3段階)では、5sDNAはファージのコードす
る5sDNA結合蛋白(遺伝子V蛋白)にカバーされR
Fへの変換が妨げられるため、子孫5sDNAが合成さ
れる。5sDNAと遺伝子■蛋白の核蛋白複合体は、宿
主細胞膜へ輸送され、そこで成熟ファージ粒子へのパッ
ケージングが行われる。この■稈にはく+)−複製開始
点に連続する特異的なl’)NA配列(形態形成シグナ
ル)が必要であル(Dotto & Zinder、1
983年)。
本発明者らは、IkeとFfの遺伝子■蛋白の生物学的
機能は相互に交換できないことを見出【ノた。さらに我
々は、ウィルス鎖複製の複製開始点の配向がお互いに反
対の場合、IkeとFfの(」−)−複製間9fl〆1
を含有する組み換えプラスミドは、IkeとFfの遺伝
子■蛋白により複製され得るをさらに見出()た。Ik
e遺伝子■蛋白が存在する場合、Ike(+)−複製開
始点のみが使用され、「f(7)I伝子■蛋白が存在1
′る場合Ffの遺伝子■蛋白が使用される。さらにプラ
スミドがファージ形態形成シグナルを有する場合、プラ
スミドがファージ様粒子に効果的にパッケージされる。
機能は相互に交換できないことを見出【ノた。さらに我
々は、ウィルス鎖複製の複製開始点の配向がお互いに反
対の場合、IkeとFfの(」−)−複製間9fl〆1
を含有する組み換えプラスミドは、IkeとFfの遺伝
子■蛋白により複製され得るをさらに見出()た。Ik
e遺伝子■蛋白が存在する場合、Ike(+)−複製開
始点のみが使用され、「f(7)I伝子■蛋白が存在1
′る場合Ffの遺伝子■蛋白が使用される。さらにプラ
スミドがファージ形態形成シグナルを有する場合、プラ
スミドがファージ様粒子に効果的にパッケージされる。
このシグナルの機能は、同じf)NA鎖上の機能上ファ
ージの(+)−複製開始点の存在に対してシス(cis
)で結合している( Dottoら、1981年)
; (notto & 7inder、 1983年)
。
ージの(+)−複製開始点の存在に対してシス(cis
)で結合している( Dottoら、1981年)
; (notto & 7inder、 1983年)
。
従って組み換λプラスミドで、複製開始点と形態形成シ
グナルの両方を含有するIkeとFfの断片の配向がお
互いに反対の場合、ファージ様粒子にパッケージされる
DNA鎖は、これらのプラスミドを有する細胞をIke
又はFfで感染させて選択し得る。
グナルの両方を含有するIkeとFfの断片の配向がお
互いに反対の場合、ファージ様粒子にパッケージされる
DNA鎖は、これらのプラスミドを有する細胞をIke
又はFfで感染させて選択し得る。
これらの粒子様性質は、本発明の多機能ベクタープラス
ミドの作成に用いられる。
ミドの作成に用いられる。
20一
本発明のプラスミドは、好ましくは1) jJ C9に
基づく。このプラスミドはクローニングのためのいくつ
かの特異な性質を有するため、そのプラスミドの使用が
好ましい(Vieira & He5sino、198
2年)。
基づく。このプラスミドはクローニングのためのいくつ
かの特異な性質を有するため、そのプラスミドの使用が
好ましい(Vieira & He5sino、198
2年)。
本発明の方法ではACCIの例外を除いて、ρUC9中
にflとIke配列が導入されているにもかかわらず、
l acZDNAの全てのクローニング部位は単一であ
る。さらに別の利点は、このプラスミドは比較的サイズ
が小さいこととベクタープラスミドの組み換えクローン
がプラスミドとして増殖できる能力のため、M13mp
シリーズのファージを用いる場合より遥かに多量のDN
A断片が安定的に挿入かつパッケージされることである
( Dent(3ら、1983年)。
にflとIke配列が導入されているにもかかわらず、
l acZDNAの全てのクローニング部位は単一であ
る。さらに別の利点は、このプラスミドは比較的サイズ
が小さいこととベクタープラスミドの組み換えクローン
がプラスミドとして増殖できる能力のため、M13mp
シリーズのファージを用いる場合より遥かに多量のDN
A断片が安定的に挿入かつパッケージされることである
( Dent(3ら、1983年)。
本発明のプラスミド(例えばp K jJ N 9とp
K LJ N 19 )は、1本鎖ファージベクターと
pUCプラスミドの全ての特異な性質を持っているだけ
でなく、その使用を拡張して1つの組み換えプラスミド
の両方のDNA鎖を1本鎖型で別々に得ることが可能に
なることである。この性質は、比較的大きなりNA分子
の配列決定のための散弾銃りn−ニングを使用する際特
に有用である。本発明のプラスミドを用いることにより
、1つのクローンから2倍の配列情報が得られるため、
目的の配列を集めるために必要な時間は大幅に減少でき
る。又は比較的小断片をクローニングすることにより、
両鏡のヌクレオチド配列が同時に決定できる。1つの鎖
の配列解析では決定困難な場合、この方法は特に有効で
ある。
K LJ N 19 )は、1本鎖ファージベクターと
pUCプラスミドの全ての特異な性質を持っているだけ
でなく、その使用を拡張して1つの組み換えプラスミド
の両方のDNA鎖を1本鎖型で別々に得ることが可能に
なることである。この性質は、比較的大きなりNA分子
の配列決定のための散弾銃りn−ニングを使用する際特
に有用である。本発明のプラスミドを用いることにより
、1つのクローンから2倍の配列情報が得られるため、
目的の配列を集めるために必要な時間は大幅に減少でき
る。又は比較的小断片をクローニングすることにより、
両鏡のヌクレオチド配列が同時に決定できる。1つの鎖
の配列解析では決定困難な場合、この方法は特に有効で
ある。
本発明のプラスミドは、クローニング及びDNA配列決
定法(sangerら、1980年)、部位特異的突然
変異誘発(、?oNer & Sm1th、 1982
年)、S1マツピング(Ci I 1bertoら、1
983年)、mRNAクローニング(1leideck
er &Messing 、1983年)、クローン化
DNAの発現(Slocomheら、1982年)、及
び1本鎖ハイブリダイゼーションプローブの産生(旧1
&t4essino 、 1982年)に有効なベクタ
ーである。
定法(sangerら、1980年)、部位特異的突然
変異誘発(、?oNer & Sm1th、 1982
年)、S1マツピング(Ci I 1bertoら、1
983年)、mRNAクローニング(1leideck
er &Messing 、1983年)、クローン化
DNAの発現(Slocomheら、1982年)、及
び1本鎖ハイブリダイゼーションプローブの産生(旧1
&t4essino 、 1982年)に有効なベクタ
ーである。
添付図面において、
第1図は、プラスミドp LJ C9から出発して本発
明のプラスミドpKtJN9を作成J−る方法を示す。
明のプラスミドpKtJN9を作成J−る方法を示す。
第2図は、I)KUN9から本発明のプラスミドpKU
N19を作成する方法を示す。
N19を作成する方法を示す。
第3図は、感染細胞から単離された形質導入粒子中に存
在するl acZ遺伝子のヌクレオチド配列の一部を示
す。こうして得られるl ke9で感染後の1本鎖DN
Aの配列は、マスタープライマーによってのみ決定され
(上側の配T111)、IRlで感染させて得られる粒
子のDNA配列決定には、逆のプライマーを使用しなt
−Jればならない(下側の配列)。
在するl acZ遺伝子のヌクレオチド配列の一部を示
す。こうして得られるl ke9で感染後の1本鎖DN
Aの配列は、マスタープライマーによってのみ決定され
(上側の配T111)、IRlで感染させて得られる粒
子のDNA配列決定には、逆のプライマーを使用しなt
−Jればならない(下側の配列)。
本発明を以下の実験の項で説明するが、これは例示を目
的とするものであり、決して本発明を限定づるものでは
ない。
的とするものであり、決して本発明を限定づるものでは
ない。
A、材料と方法
(2)細菌、ファージ及びプラスミド
使用した細菌株は、大腸菌J M 83、(a)80I
ac7 DMl 5、ara 、旧acprO,5
trA1thi ) (Hessing、1979年)
、N4156及びN4156/F’ (polASe
nrl、thy、0VrA) (Ge1lertら、
1977年)である。JM83をIke9とFfの感染
に対し感受性とするために、接合により和合性のある接
合性プラスミドN3とF’ tslac : T n
5をこの株に導入した(Ilennison & Ba
umberg 、1975年)。
ac7 DMl 5、ara 、旧acprO,5
trA1thi ) (Hessing、1979年)
、N4156及びN4156/F’ (polASe
nrl、thy、0VrA) (Ge1lertら、
1977年)である。JM83をIke9とFfの感染
に対し感受性とするために、接合により和合性のある接
合性プラスミドN3とF’ tslac : T n
5をこの株に導入した(Ilennison & Ba
umberg 、1975年)。
機能性f1複製開始点を有するプラスミドの陰性妨害に
対しバクテリオファージIR1(flの誘導体)は耐性
なため、プラスミドp K U N 9のE鎖のパッケ
ージングにIRIを使用した(a)0ttOら、198
1年)。バクテリオファージIke−9はwt Ik
eの変種(にathoonら、1972年) ; (P
eetersら、1985年)であり、このファージで
感染させるとwt Ikeの場合より形質導入粒子が
高収率で得られるため、プラスミドF)KUN9の1鎖
のパッケージングにこのファージを使用した。
対しバクテリオファージIR1(flの誘導体)は耐性
なため、プラスミドp K U N 9のE鎖のパッケ
ージングにIRIを使用した(a)0ttOら、198
1年)。バクテリオファージIke−9はwt Ik
eの変種(にathoonら、1972年) ; (P
eetersら、1985年)であり、このファージで
感染させるとwt Ikeの場合より形質導入粒子が
高収率で得られるため、プラスミドF)KUN9の1鎖
のパッケージングにこのファージを使用した。
プラスミドDIKori−2b(1)はIkeDNA断
片を有し、この上に1本鎖DNAのファ−ジ様粒子への
パッケージングに必要なIkeの複製開始貞と形態形成
シグナルが存在する。プラスミドpEMF3L8、p
LJ C9及びpUC19は既に記載されている( l
1enteら、1983年);(Vieira & H
e5sino、1982年) ; (Yanisch−
Perronら、1985年)。
片を有し、この上に1本鎖DNAのファ−ジ様粒子への
パッケージングに必要なIkeの複製開始貞と形態形成
シグナルが存在する。プラスミドpEMF3L8、p
LJ C9及びpUC19は既に記載されている( l
1enteら、1983年);(Vieira & H
e5sino、1982年) ; (Yanisch−
Perronら、1985年)。
0酵素と生化学品
全ての制限酵素、T4−DNAリガーゼ及びDNAポリ
メラーぜ■(クレノウ断片)は、ベセスダリサーチラボ
ラトリーズ社、二]、−イングランドバイオラボズ社又
はベーリンガーマンハイム社から入手し、Haniat
isら(1982年)の3=緩衝液系又は供給元の指示
する緩衝液で使用した。
メラーぜ■(クレノウ断片)は、ベセスダリサーチラボ
ラトリーズ社、二]、−イングランドバイオラボズ社又
はベーリンガーマンハイム社から入手し、Haniat
isら(1982年)の3=緩衝液系又は供給元の指示
する緩衝液で使用した。
平滑末端を作成するため、1μ9のDNAを、20nH
トリス−1−ICI 、111118.0.75+nH
KCI、5w+HM9CI 、1mHジチオスレイト
−ル(DTT)中1単位のクレノウ[)NAポリメラー
ゼ■と、1100IIの4種のデオキシヌクレオチド三
リン酸で37℃で30分間処理し、セファデックスG−
50スーパーフアインカラムを通して遠心分離し、エタ
ノールで沈澱させた。
トリス−1−ICI 、111118.0.75+nH
KCI、5w+HM9CI 、1mHジチオスレイト
−ル(DTT)中1単位のクレノウ[)NAポリメラー
ゼ■と、1100IIの4種のデオキシヌクレオチド三
リン酸で37℃で30分間処理し、セファデックスG−
50スーパーフアインカラムを通して遠心分離し、エタ
ノールで沈澱させた。
、1. van Boom博士と共同研究者(ライデン
大学、有機化学科)の合成した2つのデオキシオリゴヌ
クレオチド配列決定用プライマー5’ dG−T−A−
A−A−A−C−G−^−C−G−G−C−C−A−G
−T−G3’ (()又はマスタープライマー)と5
′(I^−A−C−A−G−C−T−^−T−G−A−
C−C−A−T3 ’ (+)又は逆ブライマー)を
彼等から人手した。マスター(−)プライマーは、]ド
ジTニック(corlogenic )鎖に対して相補
的であり、逆(+)プライマーはl ac7遺伝子の非
コドジ丁ニック(non−codogenic )鎖に
対して相補的である(第2図参照)。
大学、有機化学科)の合成した2つのデオキシオリゴヌ
クレオチド配列決定用プライマー5’ dG−T−A−
A−A−A−C−G−^−C−G−G−C−C−A−G
−T−G3’ (()又はマスタープライマー)と5
′(I^−A−C−A−G−C−T−^−T−G−A−
C−C−A−T3 ’ (+)又は逆ブライマー)を
彼等から人手した。マスター(−)プライマーは、]ド
ジTニック(corlogenic )鎖に対して相補
的であり、逆(+)プライマーはl ac7遺伝子の非
コドジ丁ニック(non−codogenic )鎖に
対して相補的である(第2図参照)。
使用した他の生化学品の入手元は既に示されている(に
oninos 、 1980年) ; (Peeter
sら、1983年、1985年)。
oninos 、 1980年) ; (Peeter
sら、1983年、1985年)。
(へ)形質転換および、ファージと
形質導入粒子の数のl算
Haniatisら、1982年の記載するHande
l &11ir+a11970年の方法により、大腸菌
をコンピタントにし形質転換させた。必要な場合には、
Ca Cl 2処理10分前に細胞をIke又はFfで
感染させた。
l &11ir+a11970年の方法により、大腸菌
をコンピタントにし形質転換させた。必要な場合には、
Ca Cl 2処理10分前に細胞をIke又はFfで
感染させた。
形質転換した細胞を、適宜100μg/i+lのアンピ
シリンと0.004%のx−galを含有する2YT寒
天平板(ミラー(MiNer)ら、1972年)上に広
げた。
シリンと0.004%のx−galを含有する2YT寒
天平板(ミラー(MiNer)ら、1972年)上に広
げた。
100μlの培養液を1ツペンドルフ遠心分離機で5分
間遠心分離して、感染ファージとアンピシリン耐性形質
導入粒子の数を求めた。次に50Hlの上澄液を別の試
験管に移し、65℃で2分間インキコベートして残存す
る細菌を殺した。次に適当に希釈した液を100 tt
I採り、指数増殖している大腸菌細胞100μm中に
添加して37℃で10分間インキュベートとした。この
混合液をアンピシリン(100119/w+l>含有2
YT寒天平板上に広げ、37℃で一晩インキコベートし
た。元々の培養液中に存在する形質導入粒子の数を求め
るため、生成したアンピシリン耐性1ロ二−の数を用い
た。同様に適当な指示株−りに、連続希釈液を広げて、
感染ファージの数を求めた。
間遠心分離して、感染ファージとアンピシリン耐性形質
導入粒子の数を求めた。次に50Hlの上澄液を別の試
験管に移し、65℃で2分間インキコベートして残存す
る細菌を殺した。次に適当に希釈した液を100 tt
I採り、指数増殖している大腸菌細胞100μm中に
添加して37℃で10分間インキュベートとした。この
混合液をアンピシリン(100119/w+l>含有2
YT寒天平板上に広げ、37℃で一晩インキコベートし
た。元々の培養液中に存在する形質導入粒子の数を求め
るため、生成したアンピシリン耐性1ロ二−の数を用い
た。同様に適当な指示株−りに、連続希釈液を広げて、
感染ファージの数を求めた。
(へ)1本鎖DNAの単離と配列解析
プラスミドp K LJ N 9を有するJM83/N
3/F’ を、培養密度が5×108細胞/1に達する
まで37℃で増殖させた。次に感染倍率20f8で1I
NY&をバクテリオファージIke−9又はIRlで感
染させた。−晩インキユベートした後、培養液1.51
をエツベンドルフ微@遠心機(Fpt+endorf
1icrofuoe)中で5分間遠心分離シ、上澄液
11を新しい試験管に移し、250 tt Iの2.5
M NaC1,20%ポリエチレングリ]−ルー60
0(b)を加え混合した後、混合液を室温で15分間放
置した。■ツペンドルフ微量遠心機で10分間遠心分離
した後、上澄液を除去し沈殿物を100μmのTE(1
0II+Ht−リス−14C1、pH7,6,1w+t
4 Fl’)TA)に溶解し、100μmのTF−飽
和フェノールを用いて65℃で1回、100μmのTE
−飽和フェノール−クロロホルム(1:1)を用いて室
温で1回抽出した。
3/F’ を、培養密度が5×108細胞/1に達する
まで37℃で増殖させた。次に感染倍率20f8で1I
NY&をバクテリオファージIke−9又はIRlで感
染させた。−晩インキユベートした後、培養液1.51
をエツベンドルフ微@遠心機(Fpt+endorf
1icrofuoe)中で5分間遠心分離シ、上澄液
11を新しい試験管に移し、250 tt Iの2.5
M NaC1,20%ポリエチレングリ]−ルー60
0(b)を加え混合した後、混合液を室温で15分間放
置した。■ツペンドルフ微量遠心機で10分間遠心分離
した後、上澄液を除去し沈殿物を100μmのTE(1
0II+Ht−リス−14C1、pH7,6,1w+t
4 Fl’)TA)に溶解し、100μmのTF−飽
和フェノールを用いて65℃で1回、100μmのTE
−飽和フェノール−クロロホルム(1:1)を用いて室
温で1回抽出した。
水層のDNAを2.5倍量のエタノールで沈澱させ、遠
心分mm沈澱物を70%エタノールで1同洗滌してから
、乾燥し20μmの■[に溶解した。
心分mm沈澱物を70%エタノールで1同洗滌してから
、乾燥し20μmの■[に溶解した。
5−10μmの鋳型DNAを用いて(sangerら、
1977年)の記載するジデオキシ法により、DNA配
列解析を行った。ファージTRIでパッケージングが指
令される場合は、逆(+)配列決定用プライマーで配列
を決定し、1ke−9でパッケージされるDNA鎖(I
−鎖)の配列決定には、マスター(−)プライマーを使
用した。このために市販のプライマーを使用することも
できる。
1977年)の記載するジデオキシ法により、DNA配
列解析を行った。ファージTRIでパッケージングが指
令される場合は、逆(+)配列決定用プライマーで配列
を決定し、1ke−9でパッケージされるDNA鎖(I
−鎖)の配列決定には、マスター(−)プライマーを使
用した。このために市販のプライマーを使用することも
できる。
B、プラスミドpKUN9の構築
pUC9 (Vieira & He5sino、 1
982年)はクローニング用にいくつかの好ましい特徴
を有するため、我々はこれをプラスミドpKUN9作成
の親ベクターとして選んだ。β−ガラクシダーゼのα−
ペプチドのコード配列中に存在する短いポリリンカーD
NA内の、種々の制限エンドヌクレアーゼ切断部位に異
種t)NAを挿入できる。これにより、適当な指示平板
のレプリカ平板法を用いることなく組み換えクローンの
直接的同定が可能になる(Messing 、 198
3年)。
982年)はクローニング用にいくつかの好ましい特徴
を有するため、我々はこれをプラスミドpKUN9作成
の親ベクターとして選んだ。β−ガラクシダーゼのα−
ペプチドのコード配列中に存在する短いポリリンカーD
NA内の、種々の制限エンドヌクレアーゼ切断部位に異
種t)NAを挿入できる。これにより、適当な指示平板
のレプリカ平板法を用いることなく組み換えクローンの
直接的同定が可能になる(Messing 、 198
3年)。
プラスミドp U C9は、制限酵素NarIとNde
Iの各々に対する単一の認識配列を含有する。これらの
部位は、1acZ遺伝子(p jJ C9は完全なl
acZ″iII伝子を持たず、プロモーターとオペレー
ターを含む5′断片のみを含有する)とアンピシリン耐
性コード遺伝子の間に、お互いに接近して存在する(第
1図参照)。pEMBLプラスミドの作成にはNarI
部位の使用が成功しているため(Denteら、198
3年)、我々は異種DNAの挿入にプラスミドpUC9
の性質に影響を与えることなく両部位と6使用可能であ
ると予測した。
Iの各々に対する単一の認識配列を含有する。これらの
部位は、1acZ遺伝子(p jJ C9は完全なl
acZ″iII伝子を持たず、プロモーターとオペレー
ターを含む5′断片のみを含有する)とアンピシリン耐
性コード遺伝子の間に、お互いに接近して存在する(第
1図参照)。pEMBLプラスミドの作成にはNarI
部位の使用が成功しているため(Denteら、198
3年)、我々は異種DNAの挿入にプラスミドpUC9
の性質に影響を与えることなく両部位と6使用可能であ
ると予測した。
プラスミドpIKori−2b(11は以下の様にシテ
作成した。プラスミドpLJ R222(Ruethe
rら、1981年)中では、I acZ遺伝子中の小p
V IJ IT断片(複数のクローニング部位を含む
)を、ファージM13+111’)9の1ac2遺伝子
の対応する断片で置き換えた。こうして得られるプラス
ミド(pBP9と呼ぶ)は、l−) U R222中に
存在するクローニング部位以外にSma I(Xma1
)とl−1i n d mの単一部位を有する。
作成した。プラスミドpLJ R222(Ruethe
rら、1981年)中では、I acZ遺伝子中の小p
V IJ IT断片(複数のクローニング部位を含む
)を、ファージM13+111’)9の1ac2遺伝子
の対応する断片で置き換えた。こうして得られるプラス
ミド(pBP9と呼ぶ)は、l−) U R222中に
存在するクローニング部位以外にSma I(Xma1
)とl−1i n d mの単一部位を有する。
次にプラスミドpBP9の3ma 1位のIkeの遺伝
子開領域のAILJI−B断片(807n)をクローン
化した。このプラスミドをpIKOri−2と呼ぶ。最
後にプラスミドp()(ori−2から、Ra1−31
欠失突然変異体(ここではIke挿入体の3′末端は6
621位にある)を得た。このプラスミドpIKori
−2b(11は、このバクテリオファージの1keN能
牲(+)−複製開始点と形態形成シグナルを含有する(
第1図を参照)。
子開領域のAILJI−B断片(807n)をクローン
化した。このプラスミドをpIKOri−2と呼ぶ。最
後にプラスミドp()(ori−2から、Ra1−31
欠失突然変異体(ここではIke挿入体の3′末端は6
621位にある)を得た。このプラスミドpIKori
−2b(11は、このバクテリオファージの1keN能
牲(+)−複製開始点と形態形成シグナルを含有する(
第1図を参照)。
このプラスミドをEC0RIと13amNlで消化し、
クレノウDNAポリメラーゼIで処理して平滑末端を作
成してIke挿人偉人体き、次にあらかじめクレノウD
NAポリメラーゼ■で処理した1)LIC9ONdeI
部位にクローン化した。
クレノウDNAポリメラーゼIで処理して平滑末端を作
成してIke挿人偉人体き、次にあらかじめクレノウD
NAポリメラーゼ■で処理した1)LIC9ONdeI
部位にクローン化した。
1)LJC9のNde■部位にIke断片を挿入した場
合選択可能な表現型の変化は起きないから、p L)
C9のCo l F 1複製開始点はDNAポリメラー
ゼ■の欠如する細胞中では機能を示されないという事実
を利用して組み換えプラスミドを選択した( Bol
1varら、1977年)。この酵素が存在しない細胞
(PolA突然変異体)中では、機能性複製開始点が存
在しない場合はpUC9由来組み換えプラスミドは複製
できない。従ってIkeで感染させたPo1Aを形質転
換させるためこの結合混合液を用いて、トランス(tr
ans )で遺伝子■蛋白の供給源を与えた。アンピシ
リン耐性コロニーが得られたため、Ike(+)−複製
開始点はうま<20−ン化されていることを示していた
。いくつかのコロニーのプラスミドDNAを単離し、J
M83株を形質転換させるために使用した。アンピシリ
ンとx−galを含有する平板上で選択した後、いくつ
かの青いコロニーのプラスミドDNAを単離し、制限酵
素消化により解析した。結果はIke断片が両配向でク
ローン化されていることを照明していた。ptJc9の
l acZ遺伝子と同じ配向でIkeの(+)−複製開
始点を含有するプラスミドをpuct−2eと命名した
(第1図参照)。
合選択可能な表現型の変化は起きないから、p L)
C9のCo l F 1複製開始点はDNAポリメラー
ゼ■の欠如する細胞中では機能を示されないという事実
を利用して組み換えプラスミドを選択した( Bol
1varら、1977年)。この酵素が存在しない細胞
(PolA突然変異体)中では、機能性複製開始点が存
在しない場合はpUC9由来組み換えプラスミドは複製
できない。従ってIkeで感染させたPo1Aを形質転
換させるためこの結合混合液を用いて、トランス(tr
ans )で遺伝子■蛋白の供給源を与えた。アンピシ
リン耐性コロニーが得られたため、Ike(+)−複製
開始点はうま<20−ン化されていることを示していた
。いくつかのコロニーのプラスミドDNAを単離し、J
M83株を形質転換させるために使用した。アンピシリ
ンとx−galを含有する平板上で選択した後、いくつ
かの青いコロニーのプラスミドDNAを単離し、制限酵
素消化により解析した。結果はIke断片が両配向でク
ローン化されていることを照明していた。ptJc9の
l acZ遺伝子と同じ配向でIkeの(+)−複製開
始点を含有するプラスミドをpuct−2eと命名した
(第1図参照)。
FTファージf1の機能性(+)−複製開始点+形態形
成シグナルは、ファージ遺伝子開領域をほとんどカバー
するRsa T断片中に含有されていた(NiN &
Petersen 、 1982年)。
成シグナルは、ファージ遺伝子開領域をほとんどカバー
するRsa T断片中に含有されていた(NiN &
Petersen 、 1982年)。
DEMBI−プラスミド中に存在するf I DNA配
列中にも同じ断片が存在する( Denteら、198
3年)。プラスミドpEMBL8(−)をRsa lで
消化した後、fl (+)−複製開始点と形態形成シグ
ナルを含有する514塩基対断片をimt、た。次にこ
の断片を、クレノウDNAポリメラーゼ■で処理してプ
ラント末端を作成したpLJcI−2eのNar1部位
に結合さセタ。
列中にも同じ断片が存在する( Denteら、198
3年)。プラスミドpEMBL8(−)をRsa lで
消化した後、fl (+)−複製開始点と形態形成シグ
ナルを含有する514塩基対断片をimt、た。次にこ
の断片を、クレノウDNAポリメラーゼ■で処理してプ
ラント末端を作成したpLJcI−2eのNar1部位
に結合さセタ。
IRI感染Po1A細胞を形質転換した後、アンピシリ
ン耐性コロニーを得て、プラスミドI)NAを単離し、
JM83株を形質転換するのに使用()た。制限酵素消
化によりいくつかの青いアンピシリン耐性コロニーのプ
ラスミドDNAの解析の結果、全てのプラスミドは同じ
構造を有しており、IkeとIacZ11伝子の配向と
反対の配向でfl(十)−複製開始点を含有していた。
ン耐性コロニーを得て、プラスミドI)NAを単離し、
JM83株を形質転換するのに使用()た。制限酵素消
化によりいくつかの青いアンピシリン耐性コロニーのプ
ラスミドDNAの解析の結果、全てのプラスミドは同じ
構造を有しており、IkeとIacZ11伝子の配向と
反対の配向でfl(十)−複製開始点を含有していた。
このプラスミド(p K U N 9と呼ぶ)の作成と
構造を第1図にしめす。
構造を第1図にしめす。
C,pKUN19の構築
親プラスミドはpuci 9である( Vanisch
−PerrOnら、1985年)。単離後プラスミドを
制限酵素FcoRIどHindl[[で切断しくこの操
作によりIacZ311伝子中のポリ伝力中が切断され
る)、次に制限酵素Ha e T[で切断する(この操
作により種々の部位でp LJ C19プラスミドが切
断される)ことにより不活性化される(第2図参照)。
−PerrOnら、1985年)。単離後プラスミドを
制限酵素FcoRIどHindl[[で切断しくこの操
作によりIacZ311伝子中のポリ伝力中が切断され
る)、次に制限酵素Ha e T[で切断する(この操
作により種々の部位でp LJ C19プラスミドが切
断される)ことにより不活性化される(第2図参照)。
消化後、この断片を、プラスミドr) K tJ N
9を制限酵素Eco R1,Hindl[I、P s
1: Tで消化した得た断片に添加した。これらの酵
素はpKUN9のポリリンカー配列を切断することによ
り不活性化させる。こうして得られる混合液にリガーゼ
を加えた。次に生成した組み換えDNA分子を大腸菌J
M83.l;tJM101株中に形質転換させた( v
an;5ch−perronら、1985年)。形質転
換後、細菌を選択マーカーとしてアンピシリンとX−g
alを含有する2YT寒天上に広げ1= 、いくつかの
青い]日ニーから得たプラスミドの制限酵素切断パター
ンを試験した結果、pUC9に帰因するポリリンカー配
列が、プラスミドpUC19のポリリンカー配列に置き
換えられていることが結論できた。この交換のためベク
タープラスミド1)KLIN 19は、プラスミドpK
UN9に比較して4つの単一の制限酵素切断部位を得た
(N素Sph I 、Xba I、Kpn Ten
5st1)結果、そのクローニングベクターとしての有
用性がさらに増大した。
9を制限酵素Eco R1,Hindl[I、P s
1: Tで消化した得た断片に添加した。これらの酵
素はpKUN9のポリリンカー配列を切断することによ
り不活性化させる。こうして得られる混合液にリガーゼ
を加えた。次に生成した組み換えDNA分子を大腸菌J
M83.l;tJM101株中に形質転換させた( v
an;5ch−perronら、1985年)。形質転
換後、細菌を選択マーカーとしてアンピシリンとX−g
alを含有する2YT寒天上に広げ1= 、いくつかの
青い]日ニーから得たプラスミドの制限酵素切断パター
ンを試験した結果、pUC9に帰因するポリリンカー配
列が、プラスミドpUC19のポリリンカー配列に置き
換えられていることが結論できた。この交換のためベク
タープラスミド1)KLIN 19は、プラスミドpK
UN9に比較して4つの単一の制限酵素切断部位を得た
(N素Sph I 、Xba I、Kpn Ten
5st1)結果、そのクローニングベクターとしての有
用性がさらに増大した。
D、pKLJN9のDNA鎖の選択的かつ効率的パッケ
ージング Ike−9と1111の双方の指令下F 1) K j
J N9の1本鎖DNAが効率的にアンピシリン耐性形
質導入粒子中にパッケージされているという証拠を得る
ため、r) K U N 9を有するJM83(N3/
F′)細胞を5X108細胞/1になるまで増殖させた
後、Ike−9又はIRlで感染させた(感染倍率20
倍)。12時間感染させた後、感染ファージと形質転換
導入粒子の数を求めた。その結果■ke−9とIRlの
両方で感染させた細胞の一1二澄液に存在する形質転換
導入粒子の数は、実質的に感染ファージ粒子の数と同じ
であった。
ージング Ike−9と1111の双方の指令下F 1) K j
J N9の1本鎖DNAが効率的にアンピシリン耐性形
質導入粒子中にパッケージされているという証拠を得る
ため、r) K U N 9を有するJM83(N3/
F′)細胞を5X108細胞/1になるまで増殖させた
後、Ike−9又はIRlで感染させた(感染倍率20
倍)。12時間感染させた後、感染ファージと形質転換
導入粒子の数を求めた。その結果■ke−9とIRlの
両方で感染させた細胞の一1二澄液に存在する形質転換
導入粒子の数は、実質的に感染ファージ粒子の数と同じ
であった。
培養上澄液から1本鎖DNAを1l11tLアガロース
ゲル上で分画した場合も同様の結果が得られた。
ゲル上で分画した場合も同様の結果が得られた。
各DNA調製物において、2つの1本鎖DNA分子が大
体等量存在しており、1つはファージDNAにもう1つ
はプラスミドDNAに対応していた。これらのデータか
らl ke−9とIRlの双方の指令下でp K LJ
N 9の1重鎖DNAが効率的にファージ用粒子中に
パッケージされていることが結論できた。
体等量存在しており、1つはファージDNAにもう1つ
はプラスミドDNAに対応していた。これらのデータか
らl ke−9とIRlの双方の指令下でp K LJ
N 9の1重鎖DNAが効率的にファージ用粒子中に
パッケージされていることが結論できた。
1ke−9の遺伝子■蛋白はFfのく+)−複製開始点
のみを含むDNA分子を複製できない(イの逆も真であ
る)という事実は、1ke−9感染細胞中ではI鎖がぞ
してTR1感染細胞中ではF#14が、形質導入ファー
ジ様粒子中に選択的にパッケージされていることを示唆
している。この仮定が正しいという証拠を得るために、
Ike−9及びIR1感染pUC9含有細胞の培養−L
澄液から単離した1本鎖DNA中のI acZ遺伝子の
ヌクレオチド配列を、マスター及び逆配列決定プライマ
ーを用いて決定した((b)(a)参照)。これらのプ
ライマーはl acZ遺伝子の1つの鎖(これはpKU
N9の1及びF鎖の両方に存在するがファージDNA中
には存在しない)のみに相補的であるため、これらのプ
ライマーを使用する配列解析により1本鎖[)NAI製
物中物中KUN9の1つの鎖のみ又は2本の鎖が存在す
るか否かがわかる。第3図に示すように、Ike−9感
染細胞により産生きれる形質導入粒子から単離される1
本鎖DNA中のI ac7遺伝子のヌクレオチド配列は
マスタープラマーを使用する場合のみ求められるが、T
RI感染細胞により産生される形質導入粒子から単離さ
れる1重鎖rlNA中に存在するI acZ遺伝子のヌ
クレオチド配列の解析には逆ブライマーを使用しなけれ
ばならない。同じプライマーをプローブとして用いる1
本鎖DNA調製物のドツトブロン1〜ハイブリダイゼー
シヨンにより同様の結論が得られた。すなわちマスター
プライマーはIke−9によりパッケージされた1重鎖
D”NAとのみハイブリダイゼーションしたが、逆プラ
イマーはIRl組み立てDNAとのみハイブリダイゼー
ションした。
のみを含むDNA分子を複製できない(イの逆も真であ
る)という事実は、1ke−9感染細胞中ではI鎖がぞ
してTR1感染細胞中ではF#14が、形質導入ファー
ジ様粒子中に選択的にパッケージされていることを示唆
している。この仮定が正しいという証拠を得るために、
Ike−9及びIR1感染pUC9含有細胞の培養−L
澄液から単離した1本鎖DNA中のI acZ遺伝子の
ヌクレオチド配列を、マスター及び逆配列決定プライマ
ーを用いて決定した((b)(a)参照)。これらのプ
ライマーはl acZ遺伝子の1つの鎖(これはpKU
N9の1及びF鎖の両方に存在するがファージDNA中
には存在しない)のみに相補的であるため、これらのプ
ライマーを使用する配列解析により1本鎖[)NAI製
物中物中KUN9の1つの鎖のみ又は2本の鎖が存在す
るか否かがわかる。第3図に示すように、Ike−9感
染細胞により産生きれる形質導入粒子から単離される1
本鎖DNA中のI ac7遺伝子のヌクレオチド配列は
マスタープラマーを使用する場合のみ求められるが、T
RI感染細胞により産生される形質導入粒子から単離さ
れる1重鎖rlNA中に存在するI acZ遺伝子のヌ
クレオチド配列の解析には逆ブライマーを使用しなけれ
ばならない。同じプライマーをプローブとして用いる1
本鎖DNA調製物のドツトブロン1〜ハイブリダイゼー
シヨンにより同様の結論が得られた。すなわちマスター
プライマーはIke−9によりパッケージされた1重鎖
D”NAとのみハイブリダイゼーションしたが、逆プラ
イマーはIRl組み立てDNAとのみハイブリダイゼー
ションした。
これらの観察は、p K tJ N 9含有細胞による
感染後はI鎖が、TRIによる感染後は相補的(F鎖)
が効率的かつ選択的にファージ様形質導入粒子中にパッ
ケージされることを結論的に証明している。さらにこの
結果は、これらの粒子から単離される1本鎖DNAは、
ヌクレオチド配列解析に容易に使用できることを証明し
ている。
感染後はI鎖が、TRIによる感染後は相補的(F鎖)
が効率的かつ選択的にファージ様形質導入粒子中にパッ
ケージされることを結論的に証明している。さらにこの
結果は、これらの粒子から単離される1本鎖DNAは、
ヌクレオチド配列解析に容易に使用できることを証明し
ている。
文献
ポリバー(Bolivar、F ) 、ロドリゲス(R
odoriguez、 R,1,、)、グリーン(Gr
eene、 P、J、)、ベララッチ(Betlatc
h、H,C,) 、ハイネツカー(1leinecke
r、 Il、 1.、 )とボイヤー(Boyer、
tl、 W、 )(1977年)ジーン(Gene)第
2巻、95−113頁 チリベルト(Ciliherto、G、 ) 、ラウゲ
イ(RaN(lei、G、 ) 、Dスタンツオ(Co
5tanzo、 F、 )、デンテ(Dente、 L
、 )と]ルテセ(Cortese、 R,)(198
3年)セル(CeN)第32巻、725〜733頁 デイニンガー(Deininger P、L、)(19
83年)アナリテイカルバイオケミストリ−(Anal
、Biochem、 )第135巻、247−263@
デンハルト(Denhardt、D、T、 ) 、ドレ
スラー(Dressler、D、 )とレイ(Ray
、11.S、) FA (1978年)1本鎖DNAフ
ァージ、]−]ルドスブリングハーバー (Co1d
Spring 1larbor)研究所、]−]ルドス
プリングハーバー (Cold St+rinOHar
bor> 、ニー’1−ヨーク デニソン(Dennison、S、 )とバウムバーグ
(Baui+uhero、S、 ) (1975年)、
モル・ジエン・ジエネット(Mo1. gen、 Ge
net、 )第138巻、321−331頁 デンテ(Dente、1.) 、セサレニ(Cesar
eni、G、 )と]ルテセ(Cortese、R,)
(1983年)ヌクレイツクアシッドリサーチ(N
ucl、 Ac1ds Res、)第11巻、1645
−1655頁 ドツト−(Dotto、 G、 P、 )とシンダー(
7inder、N。
odoriguez、 R,1,、)、グリーン(Gr
eene、 P、J、)、ベララッチ(Betlatc
h、H,C,) 、ハイネツカー(1leinecke
r、 Il、 1.、 )とボイヤー(Boyer、
tl、 W、 )(1977年)ジーン(Gene)第
2巻、95−113頁 チリベルト(Ciliherto、G、 ) 、ラウゲ
イ(RaN(lei、G、 ) 、Dスタンツオ(Co
5tanzo、 F、 )、デンテ(Dente、 L
、 )と]ルテセ(Cortese、 R,)(198
3年)セル(CeN)第32巻、725〜733頁 デイニンガー(Deininger P、L、)(19
83年)アナリテイカルバイオケミストリ−(Anal
、Biochem、 )第135巻、247−263@
デンハルト(Denhardt、D、T、 ) 、ドレ
スラー(Dressler、D、 )とレイ(Ray
、11.S、) FA (1978年)1本鎖DNAフ
ァージ、]−]ルドスブリングハーバー (Co1d
Spring 1larbor)研究所、]−]ルドス
プリングハーバー (Cold St+rinOHar
bor> 、ニー’1−ヨーク デニソン(Dennison、S、 )とバウムバーグ
(Baui+uhero、S、 ) (1975年)、
モル・ジエン・ジエネット(Mo1. gen、 Ge
net、 )第138巻、321−331頁 デンテ(Dente、1.) 、セサレニ(Cesar
eni、G、 )と]ルテセ(Cortese、R,)
(1983年)ヌクレイツクアシッドリサーチ(N
ucl、 Ac1ds Res、)第11巻、1645
−1655頁 ドツト−(Dotto、 G、 P、 )とシンダー(
7inder、N。
lb、)(1983年)ピロロジー(Virolooy
)第130巻、252−256頁 ドツト−(Dotto、 G、 P、 ) 、ホリウチ
(NOriNchi。
)第130巻、252−256頁 ドツト−(Dotto、 G、 P、 ) 、ホリウチ
(NOriNchi。
K、)、!ニーシンダー(7inder、N、D、 >
(1981年)ピロロジー(ViroloOV)第
114巻、463−473頁 ゲラート(GeNert )ら(1977年)、プOシ
ーデイングズオブナショナルアカデミーオブサイエンシ
ーズ(Proc、Natl、Acad、Sci、 )米
国、第74巻、4772−4776頁 グオ(Guo、 L−1f )とウー(IJu、R,)
(1982年)ヌクレイツクアシッドリサーチ(Nu
cleic Ac1dRes、 )第11巻、489L
−4906頁ヒル(NiN、D、F、 )とビータ−セ
ン(petersenG、B、>(1982年)ジャー
ナルオブビロロジ−(,1,Virol、)第44巻、
32−466頁ツー10+、N、 )とメツシンダ(H
essino、J、) (1982年)ジーン(Ge
ne)第17巻、271−277頁 = 40− カスーン(KathoOn、 If、)、アイヤー(r
yer、R,V、)とアイヤー(Iyer、V、 )
(1972年)ピロロジー (v+ro+ogy)第
48巻、145−155頁コニングズ(にonings
、R,N、N、)(1980年)メソツズインエンザイ
モロジー(t4eth、Enzymol、 )第65巻
、795−811頁 マンデ/L/ (Handel、H,)とヒガ(旧ga
、^、)(1970年)ジャーナルオブモレキュラーバ
イオロジー(J、Ho1.Biol、 )第53巻、1
51−161頁 マニアテイス(Haniatis、T、 ) 、フリッ
チ(Fr1tsch、E、F、 )サンプルーフ(Sa
mbrook、J、 )(1982年)モレキュラーク
ローニング(Molecular C1onio) 、
−]−ルドスプリングハーバー(C1od Sprin
g tlarhor) 、ニューヨークメツシンダ(H
essino、J、 ) (1979年)リコンビナ
ントテクニカルプルティン(Recomb i nan
tTechnical BuNetin)第2巻、43
−48頁メツシング(Messing、J、) 、フレ
ア(Crea、 R,)とシーバーブ(Seebero
、P、11. ) (1981年)ヌクレイツクアシッ
ドリサーチ(Nucleic Ac1dRes、 )第
9巻、309−321頁メツシング(Hessin(1
,J、 ) (1983年)メソツズインエンザイモ
ロジー(Heth、EnZVRIOl、 )第101巻
、20−78頁 メイヤー()leyer、 T、 F、 ) 、ゲイジ
ー(Ge1der、 K、 )、クルゾ(Kurz、
C,)とシャクー(SchaNer、If、 )(19
79年)ネーチャー第278巻、365−367頁 メイヤー(Never、 T、 F、 )とゲイジー(
Ge1der、に、)(1982年)ネーチャー第29
6巻、828−832頁 ミラー(旧tier、J、11. ) (1972年)
エクスペリメンツインモレキュラージエニテイツクス(
[xperiIIlents in Ho1ecula
r Genetics ) ml−ルドスプリングハー
バー(Cold Spring 1larbOr)、ニ
ューヨーク オールド(Old、R,44,)とブリムローズ(Pr
imrose、 S、B、) (1982年)遺伝子
操作の原理(Principles of gene
Manipulation ) 、第2版、ブラックウ
エルサイエンティフィックパブリケイションズ(Bla
ckweN sc+enttrtcPublica口o
ns)、ロンドンピ ーターズ(PeeterS、B、P、11.) 、コニ
ングズ(にoninos、R,N、11. )とシエー
ンメーカーズ(Schoervakes、J、G、G、
) (1983年)ジャーナルオブモレキュラーバイ
オロジー(J、Ho1.Biol。)第169巻、19
7−215頁 ビーターズ(Peeters、B、P、11.) 、ピ
ーターズ(Peters、R,H,) 、シエーンメー
カーズ(5choenaiakes、 J、 G、 G
、 )とコニングズ(にoninos )(1985年
)ジャーナルオブモレキ]ラーバイオロジ−(J、 M
o1. Biol、 )第181巻、27−39頁 ルーサー(Ruether、 II、)、ケーネン(に
oenen。
(1981年)ピロロジー(ViroloOV)第
114巻、463−473頁 ゲラート(GeNert )ら(1977年)、プOシ
ーデイングズオブナショナルアカデミーオブサイエンシ
ーズ(Proc、Natl、Acad、Sci、 )米
国、第74巻、4772−4776頁 グオ(Guo、 L−1f )とウー(IJu、R,)
(1982年)ヌクレイツクアシッドリサーチ(Nu
cleic Ac1dRes、 )第11巻、489L
−4906頁ヒル(NiN、D、F、 )とビータ−セ
ン(petersenG、B、>(1982年)ジャー
ナルオブビロロジ−(,1,Virol、)第44巻、
32−466頁ツー10+、N、 )とメツシンダ(H
essino、J、) (1982年)ジーン(Ge
ne)第17巻、271−277頁 = 40− カスーン(KathoOn、 If、)、アイヤー(r
yer、R,V、)とアイヤー(Iyer、V、 )
(1972年)ピロロジー (v+ro+ogy)第
48巻、145−155頁コニングズ(にonings
、R,N、N、)(1980年)メソツズインエンザイ
モロジー(t4eth、Enzymol、 )第65巻
、795−811頁 マンデ/L/ (Handel、H,)とヒガ(旧ga
、^、)(1970年)ジャーナルオブモレキュラーバ
イオロジー(J、Ho1.Biol、 )第53巻、1
51−161頁 マニアテイス(Haniatis、T、 ) 、フリッ
チ(Fr1tsch、E、F、 )サンプルーフ(Sa
mbrook、J、 )(1982年)モレキュラーク
ローニング(Molecular C1onio) 、
−]−ルドスプリングハーバー(C1od Sprin
g tlarhor) 、ニューヨークメツシンダ(H
essino、J、 ) (1979年)リコンビナ
ントテクニカルプルティン(Recomb i nan
tTechnical BuNetin)第2巻、43
−48頁メツシング(Messing、J、) 、フレ
ア(Crea、 R,)とシーバーブ(Seebero
、P、11. ) (1981年)ヌクレイツクアシッ
ドリサーチ(Nucleic Ac1dRes、 )第
9巻、309−321頁メツシング(Hessin(1
,J、 ) (1983年)メソツズインエンザイモ
ロジー(Heth、EnZVRIOl、 )第101巻
、20−78頁 メイヤー()leyer、 T、 F、 ) 、ゲイジ
ー(Ge1der、 K、 )、クルゾ(Kurz、
C,)とシャクー(SchaNer、If、 )(19
79年)ネーチャー第278巻、365−367頁 メイヤー(Never、 T、 F、 )とゲイジー(
Ge1der、に、)(1982年)ネーチャー第29
6巻、828−832頁 ミラー(旧tier、J、11. ) (1972年)
エクスペリメンツインモレキュラージエニテイツクス(
[xperiIIlents in Ho1ecula
r Genetics ) ml−ルドスプリングハー
バー(Cold Spring 1larbOr)、ニ
ューヨーク オールド(Old、R,44,)とブリムローズ(Pr
imrose、 S、B、) (1982年)遺伝子
操作の原理(Principles of gene
Manipulation ) 、第2版、ブラックウ
エルサイエンティフィックパブリケイションズ(Bla
ckweN sc+enttrtcPublica口o
ns)、ロンドンピ ーターズ(PeeterS、B、P、11.) 、コニ
ングズ(にoninos、R,N、11. )とシエー
ンメーカーズ(Schoervakes、J、G、G、
) (1983年)ジャーナルオブモレキュラーバイ
オロジー(J、Ho1.Biol。)第169巻、19
7−215頁 ビーターズ(Peeters、B、P、11.) 、ピ
ーターズ(Peters、R,H,) 、シエーンメー
カーズ(5choenaiakes、 J、 G、 G
、 )とコニングズ(にoninos )(1985年
)ジャーナルオブモレキ]ラーバイオロジ−(J、 M
o1. Biol、 )第181巻、27−39頁 ルーサー(Ruether、 II、)、ケーネン(に
oenen。
H9)、オツトー(a)tto、に、)とミュラー−ヒ
ル(HueNer−11i11.8) (1981年)
ヌクレイツクアシッドリサーチ(Nucleic Ac
1d、Res、 )第9巻、4087−4098頁 サンガー(Sanger、 F、)、ニツクレン(Ni
cklen、S、)とクールソン(Coulson、A
、R,) (1977年)プロシーデイングズオブナシ
ョナルアカデミーオブサイエンシーズ(Proc、Na
tl、Acad、Sci、 )米国第74巻、5463
−5467頁 サンガー(Sanoer、F、 ) 、クールソン(C
oulson。
ル(HueNer−11i11.8) (1981年)
ヌクレイツクアシッドリサーチ(Nucleic Ac
1d、Res、 )第9巻、4087−4098頁 サンガー(Sanger、 F、)、ニツクレン(Ni
cklen、S、)とクールソン(Coulson、A
、R,) (1977年)プロシーデイングズオブナシ
ョナルアカデミーオブサイエンシーズ(Proc、Na
tl、Acad、Sci、 )米国第74巻、5463
−5467頁 サンガー(Sanoer、F、 ) 、クールソン(C
oulson。
A、R,)、バレル(Barrel、B、G、 ) 、
スミス(Smith、^、J、11. )とルー(R
oe、 B、^、)(1980年)ジャーナルオブモレ
キュラーバイオロジー(J、Ho1.Biol、 )第
143巻、161−178頁スn]ンベ(SIocom
be、P、 ) 、イーストン(Easton、A、
) 、ボズリー(Boselev、 P、 )とブルク
(BNrke、口、C,)(1982年)プロシーデイ
ングズオブナショナルアカデミーオブサイエンシーズ(
Proc、Natl、Acad、Sci、 )米国第7
9巻、5455−5459頁 ピエイラ(Vieira、J、 )とメツシング(Me
ssing。
スミス(Smith、^、J、11. )とルー(R
oe、 B、^、)(1980年)ジャーナルオブモレ
キュラーバイオロジー(J、Ho1.Biol、 )第
143巻、161−178頁スn]ンベ(SIocom
be、P、 ) 、イーストン(Easton、A、
) 、ボズリー(Boselev、 P、 )とブルク
(BNrke、口、C,)(1982年)プロシーデイ
ングズオブナショナルアカデミーオブサイエンシーズ(
Proc、Natl、Acad、Sci、 )米国第7
9巻、5455−5459頁 ピエイラ(Vieira、J、 )とメツシング(Me
ssing。
J、H,) (1982年)ジーン(Gene )第1
9巻、269−276頁 ウオレス(WaNace、R,B、 ) 、ジョンソン
(Johnson、H,J、) 、サツグズ(Sug(
Is、S、V 、 )、ミヨシ(Hiyoshi、に、
) 、ブハット(Bhatt、 R,)とイタクラ(
Itakura、に、 ) (1981年)ジーン(G
ene)第16巻、21−26頁 ヤニツシューペロン(Yanisch−Perron、
C) 、ビエイラ(Vieira、J、)とメツシング
(Messing、 J、 )(1985年)ジーン(
cene)第33巻、103−119頁 シラー(ZoNer、H,J、 )とスミス(Smit
h、H,)(1982年)ヌクレイツクアシッドリサー
チ(Nucleic Ac1ds Res、 )第10
巻、6487−6500頁
9巻、269−276頁 ウオレス(WaNace、R,B、 ) 、ジョンソン
(Johnson、H,J、) 、サツグズ(Sug(
Is、S、V 、 )、ミヨシ(Hiyoshi、に、
) 、ブハット(Bhatt、 R,)とイタクラ(
Itakura、に、 ) (1981年)ジーン(G
ene)第16巻、21−26頁 ヤニツシューペロン(Yanisch−Perron、
C) 、ビエイラ(Vieira、J、)とメツシング
(Messing、 J、 )(1985年)ジーン(
cene)第33巻、103−119頁 シラー(ZoNer、H,J、 )とスミス(Smit
h、H,)(1982年)ヌクレイツクアシッドリサー
チ(Nucleic Ac1ds Res、 )第10
巻、6487−6500頁
第1図は、プラスミドpLIc9から出発して本発明の
プラスミドpKLJN9を構築する方法を示す。 第2図は、p K U N 9から本発明のプラスミド
r)KtJN19を構築する方法を示す。 第3図は、感染IIl胞から単離された形質導入粒子中
に存在する1acZ遺伝子のヌクレオチド配列の一部を
示す。
プラスミドpKLJN9を構築する方法を示す。 第2図は、p K U N 9から本発明のプラスミド
r)KtJN19を構築する方法を示す。 第3図は、感染IIl胞から単離された形質導入粒子中
に存在する1acZ遺伝子のヌクレオチド配列の一部を
示す。
Claims (17)
- (1)ベクタープラスミドにおいて: a)F繊毛を有する大腸菌の繊維状バクテリオファージ
の複製開始点+形態形成シグナル、又はそれらの活性突
然変異体;及び b)N繊毛を有する大腸菌の繊維状バクテリオファージ
の複製開始点+形態形成シグナル、又はそれらの活性突
然変異体を、互いに反対の配向で組み込んでいる出発ベ
クターから作成される、上記ベクタープラスミド。 - (2)a)繊維状バクテリオファージFf(M13、f
d及びf1)又はその突然変異体の複製開始点+形態形
成シグナル、又はそれらの活性突然変異体;及び b)繊維状バクテリオファージIKe又はその突然変異
体の複製開始点+形態形成シグナル、又はそれらの活性
突然変異体を含有する、特許請求の範囲第1項に記載の
ベクタープラスミド。 - (3)pUCプラスミドを出発ベクターとする、特許請
求の範囲第1項又は第2項に記載のベクタープラスミド
。 - (4)プラスミドpUC9を出発ベクターとする、特許
請求の範囲第3項に記載のベクタープラスミド。 - (5)(a)は制限酵素NarIの単一の認識配列に挿
入されており、 (b)は制限酵素NdeIの単一の認識配列に挿入され
ているか、又はこの逆になつている、特許請求の範囲第
4項に記載のベクタープラスミド。 - (6)第1図に示す構造を有するベクタープラスミドp
KUN9。 - (7)第2図に示す構造を有するベクタープラスミドp
KUN19。 - (8)1個の2本鎖DNAが適当な位置に挿入されてい
る、特許請求の範囲第1項から第7項までのいずれか1
項に記載のベクタープラスミド。 - (9)特許請求の範囲第1項から第8項までのいずれか
1項に記載のベクタープラスミドを含有する微生物、特
に大腸菌。 - (10)F−特異的及び/又はN−特異的繊維状バクテ
リオファージによる感染に対して感受性がありかつ、特
許請求の範囲第1項から第8項までのいずれか1項に記
載のベクタープラスミドを含有する大腸菌。 - (11)1個の2本鎖DNAの鎖の1本又は2本を、フ
ァージ様粒子を含有する1本鎖DNAに選択的にパッケ
ージする方法において、F−特異的繊維状バクテリオフ
ァージによる感染に対して感受性がありかつ特許請求の
範囲第8項に記載のベクタープラスミドを含有する大腸
菌を、F−特異的繊維状バクテリオファージで感染され
、インキュベートした後、ファージ様形質導入粒子を単
離するか、及び/又はN−特異的繊維状バクテリオファ
ージによる感染に対して感受性がありかつ特許請求の範
囲第8項に記載のベクタープラスミドを含有する大腸菌
を、N−特異的繊維状バクテリオファージで感染させ、
インキュベートした後、ファージ様形質導入粒子を単離
するか、又はF−特異的かつN−特異的繊維状バクテリ
オファージに対して感受性がありかつ特許請求の範囲第
8項に記載のベクタープラスミドを含有する大腸菌集団
の一部をF−特異的繊維状バクテリオファージで感染さ
せ、この集団の別の一部をN−特異的繊維状バクテリオ
ファージで感染させ、インキュベートした後、生成した
ファージ様形質導入粒子を単離することより成る、上記
方法。 - (12)2本鎖DNAの一片のヌクレオチド配列の決定
方法において、特許請求の範囲第11項に記載の方法に
より別々に鎖を得た後、このDNA鎖の2本のそれぞれ
のヌクレオチド配列を公知の方法により決定することよ
り成る、上記方法。 - (13)DNA又はメッセンジャーRNAのクローニン
グ、DNA配列決定、部位特異的突然変異誘発、S1マ
ッピング、クローン化DNAの発現、及び1本鎖ハイブ
リダイゼーシヨンプローブの調製のための、特許請求の
範囲第8項に記載のベクタープラスミドの使用。 - (14)特許請求の範囲第1項に記載のベクタープラス
ミドの構築法において、親ベクターの制限酵素認識配列
で(a)又は(b)をクローン化し、形質転換体を選択
し、親ベクターの別の制限酵素認識配列で(b)又は(
a)をクローン化し、そして形成転換体を選択すること
より成る、上記方法。 - (15)特許請求の範囲第5項に記載のベクタープラス
ミドの構築法において、pUC9の制限酵素Nar I
又は制限酵素Nde I の単一の認識配列で(a)又は
(b)をクローン化し、F−特異的又はN−特異的繊維
状バクテリオファージで感染させた大腸菌のpolA突
然変異体により形質転換体を選択し、次に未使用の単一
の認識配列で、得られた組み変えプラスミドの1つで(
b)又は(a)をクローン化し、そしてN−特異的又は
F−特異的繊維状バクテリオファージで感染された大腸
菌のpolA突然変異体により形質転換体を選択するこ
とより成る、上記方法。 - (16)ベクタープラスミドpKUN9の構築方法にお
いて、プラスミドpUC9を制限酵素NDe I とクレ
ノウDNAポリメラーゼ I で処理して、平滑末端線状
2本鎖DNAを形成させ、この線状DNAを平滑末端線
状2本鎖DNA(これはプラスミドpIKori2b(
1)を制限酵素EcoR I とBamH I で処理し、I
keの(+)複製開始点+形態形成シグナルを有する断
片を単離し、これをクレノウDNAポリメラーゼ I で
処理して作成する)と連結させ、Ike又はその突然変
異体で感染させた大腸菌のpolA突然変異株の形質転
換とアンピシリン耐性コロニーの選択により、pUC9
のNde I 部位にIkeの複製開始点+形態形成シグ
ナルが挿入された形質転換体を選択し、pUC9のla
cZ遺伝子と同じ配向でIkeの(+)複製開始点を含
有する組み換えプラスミドを単離し、このこのプラスミ
ドを制限酵素素Nar I とクレノウDNAポリメラー
ゼ I で処理して、平滑末端線状2本鎖DNAを形成さ
せ、この線状DNAを平滑末端線状2本鎖DNA(これ
はプラスミドpEMBL8を制限酵素Rsa I で処理
し、f1の(+)複製開始点+形態形成シグナルを含有
する断片を単離し、これをクレノウDNAポリメラーゼ
I で処理して作成する)と連結させ、Ff又はその突
然変異体で感染させた大腸菌のpolA突然変異株の形
質転換とアンピシリン耐性コロニーの選択により、pU
C9のNar I 部位にf1の複製開始点+形態形成シ
グナルが挿入された形質転換体を選択することより成る
、上記方法。 - (17)ベクタープラスミドpKUN19の構築法にお
いて、プラスミドpUC19を制限酵素EcoR I 、
HindIIIで処理し次に制限酵素HaeIIで処理して
、この消化生成物を単離し、これを特許請求の範囲第6
項に記載のプラスミドを制限酵素EcoR I 、Hin
dIII及びPst I で消化して得られる断片に添加し、
この混合液にリガーゼを加え、生成したDNA分子を適
当な大腸菌に形質転換し、これをアンピシリンとx−g
alを含有する寒天平板上で選択することより成る、上
記方法。
Applications Claiming Priority (2)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| NL8502061 | 1985-07-17 | ||
| NL8502061A NL8502061A (nl) | 1985-07-17 | 1985-07-17 | Nieuwe vectorplasmiden, hun constructie en toepassing, en micro-organismen waarin ze zijn opgenomen. |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| JPS6219088A true JPS6219088A (ja) | 1987-01-27 |
Family
ID=19846329
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| JP61168975A Pending JPS6219088A (ja) | 1985-07-17 | 1986-07-17 | 新規ベクタ−プラスミド |
Country Status (3)
| Country | Link |
|---|---|
| EP (1) | EP0209204A1 (ja) |
| JP (1) | JPS6219088A (ja) |
| NL (1) | NL8502061A (ja) |
Families Citing this family (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| NL8801805A (nl) * | 1988-07-15 | 1990-02-01 | Rijksuniversiteit | Dna sequencing methode en daarvoor bruikbare primer. |
| EP0354727A3 (en) * | 1988-08-08 | 1990-11-22 | Eli Lilly And Company | Novel single stranded phasmid vectors and methods for transforming streptomyces and other actinomycetes |
| GB2250290A (en) * | 1990-11-21 | 1992-06-03 | Astra Ab | Phasmid vectors |
Family Cites Families (2)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| FR2516094A1 (fr) * | 1981-11-06 | 1983-05-13 | Wellcome Found | Vecteur de clonage recombinant, micro-organisme transforme par ce vecteur, bacteriophage et procede pour produire un polypeptide heterologue |
| JPS6091984A (ja) * | 1983-10-22 | 1985-05-23 | Gakuzo Tamura | 新規プラスミドベクタ− |
-
1985
- 1985-07-17 NL NL8502061A patent/NL8502061A/nl not_active Application Discontinuation
-
1986
- 1986-07-16 EP EP86201252A patent/EP0209204A1/en not_active Withdrawn
- 1986-07-17 JP JP61168975A patent/JPS6219088A/ja active Pending
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| EP0209204A1 (en) | 1987-01-21 |
| NL8502061A (nl) | 1987-02-16 |
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