JPS62251635A - 連接コロニ−の採取方法 - Google Patents

連接コロニ−の採取方法

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JPS62251635A
JPS62251635A JP9573986A JP9573986A JPS62251635A JP S62251635 A JPS62251635 A JP S62251635A JP 9573986 A JP9573986 A JP 9573986A JP 9573986 A JP9573986 A JP 9573986A JP S62251635 A JPS62251635 A JP S62251635A
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JP
Japan
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colony
colonies
image
center
petri dish
Prior art date
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Pending
Application number
JP9573986A
Other languages
English (en)
Inventor
Isao Kadokura
門倉 功
Kiyoshi Sato
清 佐藤
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Hitachi High Tech Corp
Original Assignee
Hitachi Electronics Engineering Co Ltd
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Publication date
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Publication of JPS62251635A publication Critical patent/JPS62251635A/ja
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  • Sampling And Sample Adjustment (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Abstract

(57)【要約】本公報は電子出願前の出願データであるた
め要約のデータは記録されません。

Description

【発明の詳細な説明】 [産業−1;の利用分野] この発明は、連接コロニーの採取方法に関し、特に、連
接した培養コロニーのうちから求めるコロニーのみをI
K:、確に採取することができるような連接コロニーの
採取方法に関する。
[従来の技術] ・般に、新しい菌種とか、打望なそうな菌種は、試験シ
ャーレ又は試験管の寒天培地等へ移殖されて、培養され
、有雫な菌が見い出されると種々のテストが繰り返され
て、薬、醸造、その他のバイオテクノロジーの分野へと
適用される。
ここで、有申そうな特定の菌のコロニーの目視判定と採
取、そして寒天培地への移殖は、従来、人トによって行
われ、面倒で効率の良くない作業であった。しかし、最
近では、このような欠点を解消するために、X−Yステ
ージを利用してシャーレの培地を順次観察でき、自動移
殖できるようなコロニー自動移殖装置が開発され、使用
されるようになって来ている。
このコロニー自動移殖装置にあっては、各種のコロニー
が混在した状態で繁殖しているソースシャーレの培地か
ら所定のコロニーを選別し、選別に応じたコロニーを自
動的に、かつ、連続的に順次採取してオブジェクト(培
a)ンヤーレ」−の培地に順次移殖するものである。
この場合、同一・のソースシャーレから同時にいくつか
のオブジェクトシャーレへ同一・の条件で移殖が行われ
、いつくかのレプリカ(FM製)が作られ、これらに対
し、それぞれ条件を代えて、状態観測がなされることも
多い。
[発明が解決しようとする問題点コ しかし、前記のような場合に、1つの培養シャーレの中
のコロニー数が多くなると、培養条件によっては、2つ
コロニーが連接するような状態が発生する。
コロニーが連接すると、その採取位置によって、本来採
取すべきコロニーではなく、連接した隣のコロニーを採
取してしまうことにもなり兼ねない。
また、連接した部分又はその近傍でコロニーを採取した
場合は、本来意図したコロニーと相違するものを採取し
てしまうことにもなり、意図するものの採取は難しい。
したがって、連接ルたコロニーを捨てなければならない
ようなことも生じる。
[発明の目的コ この発明は、このような従来技術の問題点を解決するも
のであって、連接コロニーから容易に求めるコロニーを
採取することができる連接コロニーの採取方法を提供す
ることをLl的とする。
[問題点を解決するためのL段コ このような目的を達成するためのこの発明の連接コロニ
ーの採取方法におけるL段は、複数のコロニーが移殖さ
れた培地の映像を画像データとして採取し、この画像デ
ータ又はその表示画像から移殖対象となるコロニーが連
接コロニーであるか否かを判定し、採取対象となるコロ
ニーが連接しているときには、複数の円が相互に連接又
は隣接したものとして、それぞれのコロニーの大きさに
基づきぞれぞれの中心を算出して、この中心を基準とし
てコロニーの一部を採取するというものである。
[作用] このように連接用又は隣接円とみなしてその中心を求め
ることにより、連接コロニーに対してそれぞれの中心を
基をとして、例えば、その中心位置又はこの中心から相
互に影響しないような反対方向に一定距離はなれた位置
を採取位置と決定して、そこからコロニーを採取するこ
とができ、このことにより確実に意図するコロニーのみ
を採取することができる。
[実施例コ 次に、この発明の一実施例について図面を用いて詳細に
説明する。
第1図は、この発明の連接コロニーの採取方法を適用し
た一実施例のコロニー移殖装置の画像処理を中心とした
ブロック図、第2図は、その画像採取のフローチャート
、第3図は、連接コロニーを有するシャーレの説明図、
そして第4図は、その連接コロニーの拡大図である。
、 第1図にお、いて、lは、シャーレ搬送機構であり
、2は、その移殖位置I一部に配置された固体撮像カメ
ラ、3は、その下に配置されたソースシャーレである。
そして、さらにそのドには、ソースシャーレ搬送ライン
4が配置されていて、このソースシャーレ搬送ライン4
には、ソースシャーレ3が載置されている。一方、この
ソースシャーレ搬送ライン4に、1a列にオブジェクト
シャーレ搬送ライン5が配設されていて、その1−には
、複数のオブジェクトシャーレ6.6.・・・が載置さ
れている。
なお、7a−7bは、それぞれソースシャーレ3のh 
3 a + オブジェクト7ヤーレ6のahaのム着脱
機構であり、8は、移殖アーム機構、8aは、そのアー
ムの先端に取付られた移殖針、8bは、アーム移動機構
である。また、9a+  9bは、シャーレ保持機構で
ある。
ここで、同体撮像カメラ2には、2次元イメージセンサ
(X−Yイメージセンサ)と増幅回路とが内蔵されてい
て、これらにより固体撮像カメラ2により得た映像をア
ナログ信壮として発生して、これを画像処理装置10の
A/1〕変換器11へと送出する。
画像処理装置10は、固体撮像カメラ2からの画像信シ
ノーを受けるA/1〕変換器11とこのAl1)変換器
11からのデータを一時的に記憶する1+IQ像データ
バンフγ12とを有していて% t+IIl像データバ
ッファ12のデータは、バス13を介してマイクロプロ
セッサ(MPU)14の制御のもとに、メモリ15へと
転送される。
そして、メモリ15には、画像取込みプロゲラp15a
と連接コロニー判定プログラム15b1円近似プログラ
ム15C1そして連接コロニー採取位置決定プログラム
15dがそれぞれ記憶されている。
ここで、第3図に見るよに、各コロニーには、一定のル
ールに従って番号付けがなされ、画像データとしてメモ
リに記憶され、磁気ディスク記憶装置21に転送されて
記憶される。
すなわち、第3図において、シャーレの酸1一部にある
コロニーC/が基準となるコロニーにであり、このコロ
ニーCIに対し、−・香石側にあるコロニーC2がその
次としての第2番口のコロニー。
同様に、その次となるコロニーがC3,そしてコロニー
C4%このように採って行ったあるコロ÷−CIが1番
11のコロニーであり、Cnが最終位置のコロニーであ
る。
そして、2つ連接したコロニーがR,であり、3つの連
接コロニーがR2である。
ここで、画像処理装置lOは、キーボード16及びベル
ト搬送駆動機構を制御するベルト搬送機構制御部17、
移殖アーム制御部18、画面メモ+319、CRTディ
スプレイ20、そして磁気ディスク記憶装置21とを有
していて、キーボード16と、ベルト搬送機構制御部1
7、移殖アーム制御部18、そして磁気ディスク記憶装
置21とは、それぞれインターフェイス22. 22 
a、バス13とを介してMPU14に接続されている。
MPU14は、キーボード16からの人力データに従っ
て、所定のシャーレの画像データをメモリ15から読出
し、画面メモリ19に転送して所定のコロニー画像をC
RTディスプレイ20に表示する制御を行う。
次に、コロニーを移殖する場合の連接コロニーの採取処
理について第3図及び第4図に従って説明する。
まず、ステップ■でシャーレ番号〜、観測日時等の必要
な情報がキーボード16から人力され、ステップ■で、
固体撮像カメラ2により捉えられたアナログ映像情報が
A/I)変換器11を介して画像データバッファ12に
格納され、この格納された画像データバッフy12の画
像情報を直接又は二値化してメモリ15に取り込む。
次のステップ■では、得た画像データから所定のルール
(第4図の例参照)に従って各コロニーのうち基準とな
るコロニーを決定しく1番IIのコロニーとする)、番
シフ付けを行う。
ステップ■では、連接コロニー判定プログラム15bを
起動して、まず、基準となるコロニー、例えば番号1番
のコロニーが連接コロニーであるか、否かを判定する。
連接コロニーであるか、否かの只体定な判定の仕方とし
ては、例えば、シャーレ画像全体からその重心を算出し
て採るか又は採取の際の視野の中心を設定し、これを画
像データとともに記憶しておき、この重心又は中心にX
−Yの座標の原点をおいたX−Y座標系を設定して、各
コロニーの画像データに基づき、そのコロニーのX方向
及びY方向のピクセル数からX方向及びY方向に平行な
方向の幅を算出する。
そして、前記X方向又はY方向のいずれか一方の幅がt
め定めた所定値(例えば、同様な連接しないコロニーに
おける最大幅の1.2〜1.5倍の幅のうちの特定値)
以上かにより、連接コロニーか否かを判定する。
ここで、判定対象となるあるコロニー(例えば第3図の
コロニーR/ 、R2) が連接コロニーと判定された
ときには、次のステップ■にて、円近似プログラム15
cを起動して、+1’l記X方向又はY方向のうちいず
れか短い方の幅を基準として、コロニーの画像が内接す
るような円をテンプレートとして、連接コロニーについ
て比較して、第4図に見るように内接する円30.31
まで、前記テンプレートの円の径を増減して、それぞれ
のコロニーの中心o、、o2の座標を求める。
なお、この座標は、前記の改心又は中心にX−Yの座標
の原点をおいたX−Y座標系として求めることができる
次に、ステップ■にてこのコロニ一番号を連接コロニー
とし、かつそれぞれの中心座標を記憶テーブルの形態で
コロニ一番号対応に連接コロニーテーブルとして記憶す
る。
そして、すべてのコロニーが終了していない場合には、
ステップ■に戻り、同様な処理を行う。
なお、終了しているか否かは、コロニーの番号が最終番
号であるか否かにより簡単に判定できる。
ところで、先のステップ■の判定の結果、連接コロニー
でないと判定されたときには、ステップ■へと移行して
、コロニーの番号を更新し、次のコロニーへとその判定
対象を移動させ、ステップ■へと戻って、同様な判定を
する。すべてのコロニーが終rしていない限り、このよ
うな更新の循環をへて、更新すべきコロニーの番号が最
終番号となったときに、処理を終rする。
このようにして作成された連接コロニーテーブルは、移
殖処理のときに連接コロニー採取位置決定プログラム1
5dが起動され、参照されて、移殖対象となっているコ
ロニーが連接コロニーとしてその番りが記憶されている
ときには、その連接コロニーに対して、この記憶テーブ
ルからその中心位置を読出して、この中心に移殖針8a
を位置決めして中心からコロニーの一部を採取するか、
相I′I:に反対方向又は影響しない位置へ所定距離だ
け移殖針の位置を移動させてように設定しておき、その
位置でコロニーを採取するものである。
ところで、この実施例では、画像データから移殖対象と
なるコロニーが連接コロニーであるか否かを判定してい
る。しかしこれは、オペレータがCR7画面を見て、そ
の表示画像からカーソルとか番号指定専により連接コロ
ニーを指定するようにすることができる。
以1−説明して来たが、実施例では、円近似処理により
コロニーに内接する円を求めて、それぞれの中心を求め
るようにしている。しかし、この中心は、先に説明した
小心又は中心にX−Yの座標の原点をおいたX−Y座標
系でのX方向又はY方向の幅からその直径を求め、その
結果として算出してもよ(、円近似による方法に限定さ
れるものではない。
実施例では、連接したコロニーのうち相if、に影響の
ない範囲として中心又はこれより離れた位置を指定して
コロニーの一部を採取するものとしたが、これは、影響
しない位置であればどのような位置であってもよい。ま
た、連接コロニーの中心位置が相t1:に分かっている
のでこれとは逆に連接した部分にあるコロニーを指定し
て採取することも+iJ能である。
[発明の効果] 以11の説明から理解できるように、この発明にあって
は、複数のコロニーが移殖された培地の映像を画像デー
タとして採取し、この画像データ又はその表示画像から
移殖対象となるコロニーが連接コロニーであるか否かを
判定し、採取対象となるコロニーが連接しているときに
は、複数の円が相t1:に連接したものとして、それぞ
れのコロニーの大きさに基づきぞれぞれの中心を算出し
て、この中心をバイ(とじてコロニーの一部を採取する
というものであるので、連接コロニーに対してそれぞれ
の中心を基準として、例えば、その中心位置又はこの中
心から相Uに影響しないような反対方向に一定距離はな
れた位置を採取位置と決定して、そこからコロニーを採
取することができ、このことにより確実に意図するコロ
ニーのみを採取することができる。
【図面の簡単な説明】
第1図は、この発明の連接コロニーの採取方法を適用し
た一実施例のコロニー移殖装置の画像処理を中心とした
ブロック図、第2図は、その画像採取のフローチャート
、第3図は、連接コロニーを有するシャーレの説明図、
そして第4図は、その連接コロニーの拡大図である。 1・・・シャーレ搬送機構、2・・・固体撮像カメラ、
3・・・ソースシャーレ、4・・・ソースシャーレ搬送
ライン、5・・・オブジェクトシャーレ搬送ライン、6
・・・オブジェクトシャーレ、 7a、7b・・・蓋it 脱111 構、・・・ソース
シャーレ、8・・・移殖アーム機構、8a・・・移殖針
、8b・・・アーム移動機構、9 a +  9 bは
、シャーレ保持機構、10・・・画像解析処理装置、1
1・・・A/D変換器、 12・・・画像データバッファ、 13・・・バス、14・・・マイクロプロセッサ(MP
U)、15・・・メモU、15a・・・画像取込みプロ
グラム、15b・・・連接コロニー判定プログラム、1
5c・・・円近似プログラム、 15d・・・連接コニ−採取位置決定プログラム。 特許出願人 11立電rエンジニアリング株式会社代理
人   弁理ト 梶 山 拮 是 弁理1: 山 木 富1・男 第  2  図

Claims (2)

    【特許請求の範囲】
  1. (1)複数のコロニーが移殖された培地の映像を画像デ
    ータとして採取し、この画像データ又はその表示画像か
    ら移殖対象となるコロニーが連接コロニーであるか否か
    を判定し、採取対象となるコロニーが連接しているとき
    には、複数の円が相互に連接又は隣接したものとして、
    それぞれのコロニーの大きさに基づきぞれぞれの中心を
    算出して、この中心を基準としてコロニーの一部を採取
    することを特徴とする連接コロニーの採取方法。
  2. (2)連接したそれぞれのコロニーは、それぞれに内接
    する円により近似され、その中心が求められることを特
    徴とする特許請求の範囲第1項記載の連接コロニーの採
    取方法。
JP9573986A 1986-04-24 1986-04-24 連接コロニ−の採取方法 Pending JPS62251635A (ja)

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JP9573986A JPS62251635A (ja) 1986-04-24 1986-04-24 連接コロニ−の採取方法

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JP9573986A JPS62251635A (ja) 1986-04-24 1986-04-24 連接コロニ−の採取方法

Publications (1)

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JPS62251635A true JPS62251635A (ja) 1987-11-02

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ID=14145855

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JP9573986A Pending JPS62251635A (ja) 1986-04-24 1986-04-24 連接コロニ−の採取方法

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Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2022034070A (ja) * 2016-11-04 2022-03-02 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー コロニーを選択するためのシステム及び方法

Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2022034070A (ja) * 2016-11-04 2022-03-02 ベクトン・ディキンソン・アンド・カンパニー コロニーを選択するためのシステム及び方法
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