KR20140097178A - IL-17 길항제 및 건선성 관절염 (PsA) 반응 또는 비-반응 대립유전자를 이용하여 PsA를 치료하는 방법 - Google Patents

IL-17 길항제 및 건선성 관절염 (PsA) 반응 또는 비-반응 대립유전자를 이용하여 PsA를 치료하는 방법 Download PDF

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Abstract

본 개시내용은 건선성 관절염 (PsA)을 치료하기 위한 신규 예측 방법 및 개인맞춤형 요법에 관한 것이다. 특히, 본 개시내용은 IL-17 길항제로의 치료에 유리한 반응을 갖는 성향이 있는 PsA 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예컨대 세쿠키누맙을 PsA 환자에게 선택적으로 투여함으로써 PsA를 앓는 환자를 치료하는 방법에 관한 것이다. 또한, PsA를 앓는 환자가 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예컨대 세쿠키누맙으로의 치료에 반응할 가능성을 예측하는데 유용한 진단 방법이 본원에 개시되어 있다.

Description

IL-17 길항제 및 건선성 관절염 (PsA) 반응 또는 비-반응 대립유전자를 이용하여 PsA를 치료하는 방법{METHODS OF TREATING PSORIATIC ARTHRITIS (PSA) USING IL-17 ANTAGONISTS AND PSA RESPONSE OR NON-RESPONSE ALLELES}
관련 출원
본 출원은 2011년 11월 21일에 출원된 이라크 특허 출원 번호 370/2011, 및 2012년 4월 16일에 출원된 미국 특허 가출원 번호 61/624,564에 대한 우선권을 주장하며, 이들 둘 다 그 전문이 본원에 참조로 포함된다.
기술 분야
본 개시내용은 건선성 관절염 (PsA)을 앓는 환자를 치료하는데 사용하기 위한 신규 개인맞춤형 요법 및 방법에 관한 것이다.
PsA는 일반적으로 척추관절염 (SpA)으로 지칭되는 병태의 범위에 속하는 면역-매개 만성 염증성 질환이다. SpA는 그의 임상 표현이 다양하지만, SpA를 앓는 개체에서는 공통 환경 및 유전 인자가 의심된다 (문헌 [Turkiewicz and Moreland (2007) Arthritis Rheum 56(4):1051-66; Gladman (2009) Dermatol Ther. 22:40-55]). 상기 후자의 견해는, 이전에 크론병 및 건선 (둘 다 척추관절염과 공존할 수 있는 질환)과 연관되었던 IL23R 변이체가 강직성 척추염 발병에 대한 위험을 부여했다는 대규모 단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP) 스캔 연구에서의 발견에 의해 최근에 확증되었다 (문헌 [Barrett et al (2008) Nat Genet. 40(8):955-62]).
PsA는 건선 및 관절통을 비롯한, 중복된 임상 실체의 범위를 포함하는 빈번한 만성 질환이다 (문헌 [Moll and Wright (1973) Semin Arthritis Rheum 3:55-78]). 건선을 앓는 환자의 약 10 내지 40%는 PsA로 고통받는다. 최근 노력은 표준화된 임상 시험 모집에 대한 보다 엄격한 분류 기준을 정의하는 것을 목표로 해왔다 (문헌 [Taylor et al (2006) Arthritis Rheum 54:2665-73]). PsA는 유의한 이환율 및 장애와 연관되고, 이에 따라 주요 사회경제 부담을 구성한다. 그것은 이전에 생각했던 것보다 더 일반적일 뿐만 아니라, 더 심각하다 (문헌 [Gladman DD (2004) Psoriatic arthritis. In: Harris et al, eds. Kelly`s Textbook of Rheumatology. 7th ed. Philadelphia: Saunders, p. 1154-64]) 환자의 대부분은 연관 관절염이 발생하기 전에 건선을 앓게 될 것이며, 그의 피부 질환에 대해 치료받게 될 것이다. NSAID는 근골격 통증 증상에 사용된다.
전통적 질환 변형 항-류마티스성 약물 (DMARD)은 메토트렉세이트 (MTX), 술파살라진, 시클로스포린, 및 레플루노미드를 포함하며, 이들 약물은 확립된 질환을 부분적으로만 제어하기 때문에 다수의 환자에 대해서는 부적절하다 (문헌 [Mease PJ (2008) Psoriatic Arthritis. In: Klippel et al, eds. Primer on Rheumatic Diseases. 13th ed. New York: Springer Science, p. 170-192]). 몇몇 계열의 증거는 PSA의 발병기전에 대한 우세한 T 세포 관여의 견해를 지지한다. 기억 CD4+ 및 CD8+ 세포는 활성화 마커를 발현하고 올리고클로날 팽창의 특징을 갖는 피부 병변 뿐만 아니라 염증발생 활막에도 존재한다 (문헌 [Curran et al (2004) J Immunol 172:1935-44 1935-44; Tassiulas et al (1999) Hum Immunol 60:479-491]). 임상 시험은 PsA에서의 T 세포 표적화 요법 (시클로스포린 A, CTLA4 Ig, 알레파셉트)의 효능을 입증하였다. TNF 차단 요법 또한 PsA를 앓는 환자의 치료에 성공적으로 도입되었다 (문헌 [Mease PJ et al. (2000) Lancet 356:385-90]). 이들 노력에도 불구하고, 염증 과정의 단순한 파기를 넘어 보다 우수한 질환 관리 및 구조적 손상의 장기간 예방에 대한 PsA를 앓는 환자의 충족되지 않은 임상 요구가 존재한다. 또한, 항-TNF-α 작용제에 대한 불내성 또는 불충분한 반응을 갖는 환자에 대한 현재의 치료 옵션은 제한적이다.
세쿠키누맙 (AIN457)은 인터류킨-17A 활성을 억제하는 고친화도 완전 인간 모노클로날 항-인간 항체이다. 최근의 PsA 개념 증명 (PoC) 연구 (AIN457A2206) (실시예 1)에서, 세쿠키누맙은 PSA를 앓는 환자를 위한 잠재적 치료로 부상하였다. 그러나, 생물학적 치료에 대한 환자 반응은 가변적이고, 그에 내성일 환자에게 약물을 제공하는 것은 피하는 것이 바람직하기 때문에, 선택된 생물학적 치료로부터 이익을 얻을 가능성이 가장 높은 환자를 먼저 확인하는 PsA 치료 방법의 개발에 대한 요구가 존재한다.
본 개시내용의 간단한 개요
몇몇 단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP)이 PsA 질환 상태와 연관되어 있지만 (문헌 [Strange et al (2010) Nat. Genet. 42(11) 985-990; Huffmeier et al. (2010) Nat. Genet 42(11) 996-9; Ellinghaus et al.(2010) Nat. Genet 42(11) 991-5]), 지금까지는 어떠한 바이오마커도 PsA 환자가 특정한 약물, 예를 들어 IL-17 길항제에 반응할 것인지를 예측하는 것으로서 확인되지 않았다. PsA의 치료 동안 IL-17의 길항작용에 유리하게 반응할 가능성이 가장 높은 환자를 확인함으로써 PsA 집단에서 이익을 최대화하고 IL-17 길항작용의 위험을 최소화하는, PsA를 치료하기 위한 신규 예측 방법 및 개인맞춤형 요법이 본원에 제공된다. 이 발견은 부분적으로 하기 결정을 근거로 한다:
1) TRAF3IP2 (TRAF3 상호작용 단백질 2)에 연관된 적어도 하나의 rs240993 "T" 대립유전자 (본원에서 "PsA 비-반응 대립유전자"로 지칭됨)를 보유하는 PsA 환자는 임의의 rs240993 "T" 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자 (즉, rs240993 "C" 대립유전자에 대해 동형접합인 환자)에 비해 감소된 반응을 나타내고;
2) 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자 (본원에서 "PsA 반응 대립유전자"로 지칭됨)를 보유하는 PsA 환자는 임의의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타내며;
3) 적어도 하나의 TNFSF15 (종양 괴사 인자 (리간드) 슈퍼패밀리, 구성원 15) rs4263839 "A" 대립유전자 (본원에서 "PsA 반응 대립유전자"로도 지칭됨)를 보유하는 PsA 환자는 임의의 rs4263839 "A" 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타냄.
본 발명자들은 따라서 적어도 하나의 PsA 비-반응 대립유전자 및/또는 적어도 하나의 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 대상체를 시험하는 것이, IL-17 길항작용에 반응할 가능성이 더 높은 개체를 확인하는 것을 포함하는 다양한 약리유전학적 생성물 및 방법, 및 의사가 PsA를 앓는 환자에게 IL-17 길항제 (예를 들어, 세쿠키누맙)를 처방할지 결정하는 것을 돕는데 유용할 것임을 고려한다. 따라서, 본 개시내용의 하나의 목적은 환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않거나 또는 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 경우, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예컨대 세쿠키누맙의 치료 유효량을 환자에게 투여함으로써 PsA를 치료하는 방법을 제공한다. 본 개시내용의 또 다른 목적은 환자가 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는지 결정함으로써 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예컨대 AINI457 항체 (세쿠키누맙)로의 PsA 치료에 반응할 가능성이 더 높은 환자를 확인하는 방법을 제공하는 것이다. 본 개시내용의 또 다른 목적은 환자가 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재를 갖는지 결정함으로써 PsA 환자가 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예컨대 세쿠키누맙으로의 치료에 반응할 가능성을 결정하는 방법을 제공하는 것이다.
상기 목적 및 발견을 근거로, PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 다양한 방법이 본원에 개시되어 있다. 일부 실시양태에서, 이들 방법은 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 (또는 부재)에 대해 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하고; 그 후에, 환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 경우 또는 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 경우, IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하는 것을 포함한다.
또한, PsA를 앓는 환자가 IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙으로의 치료에 반응할 가능성을 예측하는 다양한 방법이 본원에 개시되어 있다. 일부 실시양태에서, 이들 방법은 PsA 비-반응 대립유전자의 존재에 대해 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하는 것을 포함하며, 여기서 PsA 비-반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 감소된 가능성을 나타낸다. 일부 실시양태에서, 이들 방법은 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하는 것을 포함하며, 여기서 PsA 반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 증가된 가능성을 나타낸다.
바람직한 실시양태에서, IL-17 길항제는 IL-17 결합 분자, 바람직하게는 인간 항체, 가장 바람직하게는 세쿠키누맙이다.
추가의 방법, 용도, 및 키트는 하기 설명 및 첨부된 특허청구범위에 제공된다. 본 개시내용의 발명의 추가의 특징, 이점 및 측면은 하기 설명 및 첨부된 특허청구범위로부터 당업자에게 명백해질 것이다.
도 1은 CAIN457A2206 임상 시험 설계를 나타낸다.
도 2는 높은 연관 불균형 (LD)을 갖는 REV3L 및 TRAF3IP2를 가로지르는 영역을 나타내며, 이는 SNP rs240993이 TRAF3IP2에서의 원인 SNP를 실제로 '태깅'할 수 있음을 시사한다.
용어 "포함하는"은 "비롯한" 뿐만 아니라 "이루어지는"을 포함하고, 예를 들어 X를 "포함하는" 조성물은 X로만 이루어질 수 있거나 또는 추가의 성분, 예를 들어 X + Y를 포함할 수 있다.
용어 "검정하는"은 임의의 통상의 수단에 의해 수행될 수 있는 확인, 스크리닝, 탐색, 시험, 측정 또는 결정 활동을 지칭하는데 사용된다. 예를 들어, 샘플은 ELISA 검정, 노던 블롯, 영상화, 혈청형 결정, 세포형 결정, 유전자 서열분석, 표현형 결정, 반수체형 결정, 면역조직화학, 웨스턴 블롯, 질량 분광측정법 등을 이용함으로써 특정한 유전자 또는 단백질 마커의 존재에 대해 검정될 수 있다. 용어 "검출하는" (등)은 주어진 공급원으로부터 특정한 정보를 추출하는 활동을 의미한다. 용어 "검정하는" 및 "결정하는"은 샘플을 물리적 시험에 적용시킴으로써 하나의 상태에서 또 다른 상태로의 물질 변환, 예를 들어 생물학적 샘플, 예를 들어 혈액 샘플 또는 다른 조직 샘플 변환을 고려한다.
용어 "획득하는"은 임의의 방식, 예를 들어 물리적 개입 (예를 들어, 생검, 혈액 채취) 또는 비-물리적 개입 (예를 들어, 서버를 통한 정보의 전송) 등에 의한 소유물 입수, 예를 들어 습득을 의미한다.
어구 "생물학적 샘플을 검정하는..." 등은 주어진 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 샘플을 (직접적 또는 간접적으로) 시험할 수 있음을 의미하는데 사용된다. 물질의 존재가 한 확률을 나타내고 물질의 부재가 다른 확률을 나타내는 상황에서, 이러한 물질의 존재 또는 부재는 치료 결정을 유도하는데 사용될 수 있음을 이해할 것이다. 예를 들어, 환자의 게놈에서 PsA 비-반응 대립유전자의 실제 존재를 결정함으로써 또는 환자의 게놈에서 PsA 비-반응 대립유전자의 부재를 결정함으로써 환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는지 결정할 수 있다. 이러한 둘 다의 경우에, 환자가 PsA 비-반응 대립유전자의 존재를 갖는지 결정하였다. 특히, 본 개시된 방법은 특정한 개체가 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는지 결정하는 것을 포함한다. 상기 결정은 환자가 rs240993 비-반응 대립유전자, HLA-DRB1*04 대립유전자 또는 rs4263839 반응 대립유전자의 존재를 갖는지 확인함으로써 착수된다. 이들 결정 (즉, 존재 또는 부재) 각각은 이 자체로, 환자의 대립유전자 상태를 제공하여 이들 결정 각각은 특정한 개체가 IL-17 길항작용에 더 유리하게 반응할지 또는 그렇지 않을지의 표시를 동등하게 제공한다.
본원에 개시된 PsA 비-반응 대립유전자 (rs240993 비-반응 대립유전자)에 대해 이형접합 또는 동형접합인 환자는 IL-17 길항작용에 유리하게 반응할 가능성이 더 낮음을 이해할 것이다. 따라서, 감소된 반응성의 표시를 제공하기 위해, 생물학적 샘플은 하나의 PsA 비-반응 대립유전자에 대해서만 검정되면 되지만, 분명히 하기 위해 PsA 비-반응 대립유전자 둘 다에 대해서 검정될 수도 있다. 유사하게, 본원에 개시된 PsA 반응 대립유전자 (HLA-DRB1*04 대립유전자 및 rs4263839 반응 대립유전자)에 대해 이형접합 또는 동형접합인 환자는 IL-17 길항작용에 유리하게 반응할 가능성이 더 높음을 이해할 것이다. 따라서, 증가된 반응성의 표시를 제공하기 위해, 생물학적 샘플은 하나의 PsA 반응 대립유전자에 대해서만 검정되면 되지만, 분명히 하기 위해 PsA 반응 대립유전자 둘 다에 대해서 검정될 수도 있다.
수치 x에 대한 용어 "약"은 문맥상 달리 나타내지 않는 한 +/-10%를 의미한다. 단어 "실질적으로"는 "완전하게"를 배제하지 않고, 예를 들어 Y가 "실질적으로 없는" 조성물에는 Y가 완전하게 없을 수도 있다. 필요한 경우, "실질적으로"라는 단어가 본 개시내용의 정의에서 생략될 수도 있다.
본원에 사용된 "IL-17 길항제"는 (예를 들어, IL-17 수용체에 대한 IL-17의 결합을 차단함으로써) IL-17 기능, 발현 및/또는 신호전달을 길항 (예를 들어, 감소, 억제, 저하, 지연)할 수 있는 분자를 지칭한다. IL-17 길항제의 비제한적인 예는 IL-17 결합 분자 및 IL-17 수용체 결합 분자를 포함한다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제가 사용된다.
"IL-17 결합 분자"는 단독으로 또는 다른 분자와 회합하여 인간 IL-17 항원에 결합할 수 있는 임의의 분자를 의미한다. 관련되지 않은 특이성을 지니지만 완벽하게 동일한 이소형의 항체, 예를 들어 항-CD25 항체가 사용되는 음성 대조군 시험을 참조하여, IL-17이 그의 수용체에 결합하는 것의 억제를 결정하기 위한 결합 검정, 경쟁 검정 또는 생물검정 또는 임의 종류의 결합 검정이 예를 들어 포함되는 표준 방법 (정성적 검정)에 의해 결합 반응을 나타낼 수 있다. IL-17 결합 분자의 비제한적인 예는 소분자, IL-17 수용체 디코이, 및 B-세포 또는 하이브리도마에 의해 생성되는 바와 같은 IL-17에 결합하는 항체 및 키메라, CDR-이식 또는 인간 항체 또는 그의 임의의 단편, 예를 들어 F(ab')2 및 Fab 단편, 뿐만 아니라 단일 쇄 또는 단일 도메인 항체를 포함한다. 바람직하게는, IL-17 결합 분자는 IL-17 기능, 발현 및/또는 신호전달을 길항 (예를 들어, 감소, 억제, 저하, 지연)한다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17 결합 분자가 사용된다.
"IL-17 수용체 결합 분자"는 단독으로 또는 다른 분자와 회합하여 인간 IL-17 수용체에 결합할 수 있는 임의의 분자를 의미한다. 관련되지 않은 특이성을 지니지만 완벽하게 동일한 이소형의 항체, 예를 들어 항-CD25 항체가 사용되는 음성 대조군 시험을 참조하여, IL-17 수용체가 IL-17에 결합하는 것의 억제를 결정하기 위한 결합 검정, 경쟁 검정 또는 생물검정 또는 임의 종류의 결합 검정이 예를 들어 포함되는 표준 방법 (정성적 검정)에 의해 결합 반응을 나타낼 수 있다. IL-17 수용체 결합 분자의 비제한적인 예는 소분자, IL-17 디코이, 및 B-세포 또는 하이브리도마에 의해 생성되는 바와 같은 IL-17 수용체에 대한 항체 및 키메라, CDR-이식 또는 인간 항체 또는 그의 임의의 단편, 예를 들어 F(ab')2 및 Fab 단편, 뿐만 아니라 단일 쇄 또는 단일 도메인 항체를 포함한다. 바람직하게는, IL-17 수용체 결합 분자는 IL-17 기능, 발현 및/또는 신호전달을 길항 (예를 들어, 감소, 억제, 저하, 지연)한다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17 수용체 결합 분자가 사용된다.
본원에 지칭된 용어 "항체"는 전체 항체 및 그의 임의의 항원-결합 부분 또는 단일 쇄를 포함한다. 자연 발생 "항체"는 디술피드 결합에 의해 상호연결된, 적어도 2개의 중쇄 (H) 및 2개의 경쇄 (L)를 포함하는 당단백질이다. 각각의 중쇄는 중쇄 가변 영역 (본원에서 VH로 약칭함) 및 중쇄 불변 영역으로 구성된다. 중쇄 불변 영역은 CH1, CH2 및 CH3의 3개의 도메인으로 구성된다. 각각의 경쇄는 경쇄 가변 영역 (본원에서 VL로 약칭함) 및 경쇄 불변 영역으로 구성된다. 경쇄 불변 영역은 1개의 도메인 CL로 구성된다. VH 및 VL 영역은 프레임워크 영역 (FR)이라 불리는 보다 보존된 영역이 산재되어 있는, 초가변 영역 또는 상보성 결정 영역 (CDR)이라 불리는 초가변성의 영역으로 보다 세분화될 수 있다. 각각의 VH 및 VL은 아미노-말단으로부터 카르복시-말단으로 하기 순서로 배열된 3개의 CDR 및 4개의 FR로 구성된다: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3, FR4. 중쇄 및 경쇄의 가변 영역은 항원과 상호작용하는 결합 도메인을 함유한다. 항체의 불변 영역은 면역계의 다양한 세포 (예를 들어, 이펙터 세포) 및 고전적인 보체 시스템의 제1 성분 (C1q)이 포함되는 숙주 조직 또는 인자에 대한 이뮤노글로불린의 결합을 매개할 수 있다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17에 대한 항체 또는 IL-17 수용체, 바람직하게는 IL-17에 대한 항체, 예를 들어 세쿠키누맙이 사용된다.
본원에 사용된 용어 항체의 "항원-결합 부분"은 항원 (예를 들어, IL-17)에 특이적으로 결합하는 능력을 유지하는 항체 단편을 지칭한다. 항체의 항원-결합 기능은 전장 항체의 단편에 의해 수행될 수 있는 것으로 밝혀져 있다. 용어 항체의 "항원-결합 부분"에 포함되는 결합 단편의 예는 VL, VH, CL 및 CH1 도메인으로 이루어진 1가 단편인 Fab 단편; 힌지 영역에서 디술피드 가교에 의해 연결된 2개의 Fab 단편을 포함하는 2가 단편인 F(ab)2 단편; VH 및 CH1 도메인으로 이루어진 Fd 단편; 항체의 단일 아암(arm)의 VL 및 VH 도메인으로 이루어진 Fv 단편; VH 도메인으로 이루어진 dAb 단편 (문헌 [Ward et al., 1989 Nature 341:544-546]); 및 단리된 CDR을 포함한다. 예시적인 항원 결합 부위는 서열 1-6 및 11-13에 제시된 바와 같은 세쿠키누맙의 CDR (표 3), 바람직하게는 중쇄 CDR3을 포함한다. 또한, Fv 단편의 2개의 도메인인 VL 및 VH는 별도의 유전자에 의해 코딩되지만, 이들을 VL 및 VH 영역이 쌍을 이루어 1가 분자를 형성한 단일 단백질 쇄 (단일 쇄 Fv (scFv)로 공지됨; 예를 들어, 문헌 [Bird et al., 1988 Science 242:423-426; 및 Huston et al., 1988 Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879-5883] 참조)로서 만들어지게 할 수 있는 합성 링커에 의해, 재조합 방법을 사용하여 이들을 연결시킬 수 있다. 이러한 단일 쇄 항체 또한 용어 "항체"에 포함되도록 의도된다. 단일 쇄 항체 및 항원-결합 부분은 당업자에게 공지된 통상적인 기술을 사용하여 수득된다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17에 대한 단일 쇄 항체 또는 항체의 항원-결합 부분 (예를 들어, 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체가 사용된다.
본원에 사용된 "단리된 항체"는 상이한 항원 특이성을 갖는 다른 항체가 실질적으로 없는 항체를 지칭한다 (예를 들어, IL-17에 특이적으로 결합하는 단리된 항체에는 IL-17 이외의 항원에 특이적으로 결합하는 항체가 실질적으로 없음). 본원에 사용된 용어 "모노클로날 항체" 또는 "모노클로날 항체 조성물"은 단일 분자 조성물인 항체 분자의 제제를 지칭한다. 본원에 사용된 용어 "인간 항체"는 프레임워크 영역 및 CDR 영역 둘 다가 인간 기원의 서열로부터 유래된 가변 영역을 갖는 항체를 포함하도록 의도된다. "인간 항체"는 인간, 인간 조직 또는 인간 세포에 의해 생성될 필요는 없다. 본 개시내용의 인간 항체는 인간 서열에 의해 코딩되지 않는 아미노산 잔기 (예를 들어, 시험관 내에서의 무작위 또는 부위-특이적 돌연변이유발에 의해, 항체 유전자의 재조합 동안 생체내 접합부에서의 N-뉴클레오티드 추가에 의해, 또는 생체내 체세포 돌연변이에 의해 도입된 돌연변이)를 포함할 수 있다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제는 인간 항체, 단리된 항체, 및/또는 모노클로날 항체이다.
용어 "IL-17"은 이전에 CTLA8로 공지된 IL-17A를 지칭하고, 다양한 종 (예를 들어, 인간, 마우스, 및 원숭이)으로부터의 야생형 IL-17A, IL-17A의 다형성 변이체 및 IL-17A의 기능성 등가물을 포함한다. 본 개시내용에 따른 IL-17A의 기능성 등가물은 바람직하게는 야생형 IL-17A (예를 들어, 인간 IL-17A)와 적어도 약 65%, 75%, 85%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 심지어 99%의 전체적인 서열 동일성을 갖고, 인간 피부 섬유모세포에 의한 IL-6 생성을 유도하는 능력을 실질적으로 유지한다.
용어 "KD"는 특정한 항체-항원 상호작용의 해리율을 지칭하도록 의도된다. 본원에 사용된 용어 "KD"는 해리 상수를 지칭하도록 의도되고, Ka에 대한 Kd의 비 (즉, Kd/Ka)로부터 구하며 몰 농도 (M)로 표시된다. 항체에 대한 KD 값은 당업계에 잘 확립된 방법을 이용하여 결정할 수 있다. 항체의 KD를 결정하는 방법은 표면 플라즈몬 공명을 이용하거나 또는 바이오센서 시스템, 예컨대 비아코어(Biacore)® 시스템을 이용하는 것이다. 일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 수용체 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 인간 IL-17에 약 100-250 pM의 KD로 결합한다.
용어 "친화도"는 단일 항원 부위에서 항체와 항원 사이의 상호작용의 강도를 지칭한다. 각각의 항원 부위 내에서, 항체 "아암"의 가변 영역은 다수의 부위에서 항원과 약한 비공유 결합력을 통해 상호작용하고; 상호작용이 많을수록 친화도가 강해진다. 예를 들어 ELISA, 웨스턴 블롯 및 RIA를 포함하는, 다양한 종의 IL-17에 대한 항체의 결합 친화도를 평가하기 위한 표준 검정이 당업계에 공지되어 있다. 항체의 결합 동역학 (예를 들어, 결합 친화도)은 또한 당업계에 공지된 표준 검정에 의해, 예를 들어 비아코어 분석에 의해 평가할 수 있다.
본원에 사용된 용어 "대상체" 및 "환자"는 임의의 인간 또는 비인간 동물을 포함한다. 용어 "비인간 동물"은 모든 척추동물, 예를 들어 포유동물 및 비-포유동물, 예컨대 비인간 영장류, 양, 개, 고양이, 말, 소, 닭, 양서류, 파충류 등을 포함한다.
당업계에 공지되어 있고 본원에 기재된 방법론에 따라 결정되는 바와 같이, 이들 IL-17의 기능적 특성 (예를 들어, 생화학적, 면역화학학적, 세포적, 생리학적 또는 다른 생물학적 활성 등) 중 하나 이상을 "억제"하는 항체는, 항체의 부재 하에 (또는 관련없는 특이성의 대조군 항체가 존재하는 경우에) 보이는 것에 비해 특정한 활성에서의 통계적으로 유의한 감소에 관련되는 것으로 이해될 것이다. IL-17 활성을 억제하는 항체는, 예를 들어 측정된 파라미터의 적어도 10%, 적어도 50%, 80% 또는 90%까지의 통계적으로 유의한 감소를 초래하고, 개시된 방법, 용도, 과정, 키트 및 조성물의 특정 실시양태에서, 사용된 IL-17 항체는 IL-17 기능적 활성의 95%, 98% 또는 99% 초과를 억제할 수 있다.
본원에 사용된 "IL-6을 억제하다"는 1차 인간 피부 섬유모세포로부터의 IL-6 생성을 감소시키는 IL-17 길항제 (예를 들어, 세쿠키누맙)의 능력을 지칭한다. 1차 인간 (피부) 섬유모세포에서의 IL-6 생성은 IL-17에 좌우된다 (문헌 [Hwang et al., (2004) Arthritis Res Ther; 6:R120-128]). 간략하게, 인간 피부 섬유모세포를 Fc 부분을 갖는 다양한 농도의 IL-17 결합 분자 또는 인간 IL-17 수용체의 존재 하에 재조합 IL-17로 자극한다. 키메라 항-CD25 항체인 시뮬렉트(Simulect)® (바실릭시맙)를 음성 대조군으로서 편리하게 사용할 수 있다. 16시간의 자극 후 상청액을 취하고, ELISA에 의해 IL-6에 대해 검정한다. 본원에 개시된 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 상기한 바와 같이 시험할 때, 즉 억제 활성을 인간 피부 섬유모세포에서 hu-IL-17에 의해 유도되는 IL-6 생성에 대해 측정할 때, 전형적으로 약 50 nM 이하 (예를 들어, 약 0.01 내지 약 50 nM)의 IL-6 생성 억제에 대한 IC50 (1 nM 인간 IL-17의 존재 하)을 갖는다. 개시된 방법, 요법, 키트, 과정, 용도 및 조성물의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편) 및 그의 기능적 유도체는 약 20 nM 이하, 보다 바람직하게는 약 10 nM 이하, 보다 바람직하게는 약 5 nM 이하, 보다 바람직하게는 약 2 nM 이하, 보다 바람직하게는 약 1 nM 이하의 상기 정의된 바와 같은 IL-6 생성의 억제에 대한 IC50을 갖는다.
용어 "유도체"는 달리 나타내지 않는 한, 예를 들어 명시된 서열 (예를 들어, 가변 도메인)의 본 개시내용에 따른 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 수용체 항체 또는 그의 항원 결합 단편)의 아미노산 서열 변이체, 및 공유 변형 (예를 들어, PEG화, 탈아미드화, 히드록실화, 인산화, 메틸화 등)을 정의하기 위해 사용된다. "기능적 유도체"는 개시된 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자와 공통되는 정성적 생물학적 활성을 갖는 분자를 포함한다. 기능적 유도체는 본원에 개시된 바와 같은 IL-17 길항제의 단편 및 펩티드 유사체를 포함한다. 단편은, 예를 들어 명시된 서열의 본 개시내용에 따른 폴리펩티드의 서열 내 영역을 포함한다. 본원에 개시된 IL-17 길항제의 기능적 유도체 (예를 들어, 세쿠키누맙의 기능적 유도체)는 바람직하게는 본원에 개시된 IL-17 결합 분자의 VH 및/또는 VL 서열 (예를 들어, 표 3의 VH 및/또는 VL 서열)과 적어도 약 65%, 75%, 85%, 95%, 96%, 97%, 98%, 또는 심지어 99%의 전체적 서열 동일성을 갖는 VH 및/또는 VL 도메인을 포함하고, 인간 IL-17에 결합하는, 또는 예를 들어 IL-17 유도 인간 피부 섬유모세포의 IL-6 생성을 억제하는 능력을 실질적으로 유지한다.
어구 "실질적으로 동일한"은 관련 아미노산 또는 뉴클레오티드 서열 (예를 들어, VH 또는 VL 도메인)이 특정한 참조 서열과 비교하여 (예를 들어, 보존된 아미노산 치환을 통해) 동일하거나 또는 실질적이지 않은 차이를 가질 것임을 의미한다. 실질적이지 않은 차이는 미미한 아미노산 변화, 예컨대 명시된 영역 (예를 들어, VH 또는 VL 도메인)의 5개의 아미노산 서열에서의 1개 또는 2개의 치환을 포함한다. 항체의 경우에, 제2 항체는 동일한 특이성을 갖고, 그의 친화도의 적어도 50%를 갖는다. 본원에 개시된 서열과 실질적으로 동일한 서열 (예를 들어, 적어도 약 85%의 서열 동일성) 또한 본 출원의 일부이다. 일부 실시양태에서, 유도체 IL-17 항체 (예를 들어, 세쿠키누맙의 유도체, 예를 들어 세쿠키누맙 바이오시밀러 항체)의 서열 동일성은 개시된 서열에 대해 약 90% 이상, 예를 들어 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% 또는 그 초과일 수 있다.
천연 폴리펩티드 및 그의 기능적 유도체에 관한 "동일성"은 서열을 정렬하고, 필요하다면 갭을 도입하여, 최대의 동일성 퍼센트를 달성한 후, 어떠한 보존적 치환도 서열 동일성의 부분으로 간주하지 않은 상태에서의 상응하는 천연 폴리펩티드의 잔기와 동일한 후보 서열 내의 아미노산 잔기의 백분율로서 본원에 정의된다. N- 또는 C-말단 확장 또는 삽입은 동일성을 감소시키는 것으로 해석되지 않아야 한다. 정렬을 위한 방법 및 컴퓨터 프로그램은 익히 공지되어 있다. 동일성 퍼센트는 표준 정렬 알고리즘, 예를 들어 문헌 [Altshul et al. ((1990) J. Mol. Biol., 215: 403 410)]에 기재된 BLAST (Basic Local Alignment Search Tool); 문헌 [Needleman et al. ((1970) J. Mol. Biol., 48: 444 453)]의 알고리즘; 또는 문헌 [Meyers et al. ((1988) Comput. Appl. Biosci., 4: 11 17)]의 알고리즘에 의해 결정할 수 있다. 파라미터 세트는 갭 페널티 12, 갭 확장 페널티 4, 및 프레임시프트 갭 페널티 5의 블로섬(Blosum) 62 스코어링 매트릭스일 수 있다. 2개의 아미노산 또는 뉴클레오티드 서열 사이의 백분율 동일성은 또한 PAM120 중량 잔기 표, 갭 길이 페널티 12 및 갭 페널티 4를 사용하는, ALIGN 프로그램 (버전 2.0)에 통합된 문헌 [E. Meyers and W. Miller ((1989) CABIOS, 4:11-17)]의 알고리즘을 사용하여 결정할 수 있다.
"아미노산(들)"은 예를 들어 모든 자연 발생 L-α-아미노산을 지칭하고, D-아미노산을 포함한다. 어구 "아미노산 서열 변이체"는 본 개시내용에 따른 서열과 비교하여 그의 아미노산 서열에서 약간의 차이가 있는 분자를 지칭한다. 예를 들어 명시된 서열의 본 개시내용에 따른 폴리펩티드의 아미노산 서열 변이체는 인간 IL-17에 결합하거나, 또는 예를 들어 IL-17 유도된 인간 피부 섬유모세포의 IL-6 생성을 억제하는 능력을 여전히 갖는다. 아미노산 서열 변이체는 치환 변이체 (본 개시내용에 따른 폴리펩티드에서 적어도 하나의 아미노산 잔기가 제거되고 동일한 위치에서 그의 자리에 삽입된 다른 아미노산을 갖는 것), 삽입 변이체 (본 개시내용에 따른 폴리펩티드에서 특정한 위치에서의 아미노산에 바로 인접하게 삽입된 하나 이상의 아미노산을 갖는 것) 및 결실 변이체 (본 개시내용에 따른 폴리펩티드에서 제거된 하나 이상의 아미노산을 갖는 것)를 포함한다.
용어 "제약상 허용되는"은 활성 성분(들)의 생물학적 활성의 유효성을 방해하지 않는 비독성 물질을 의미한다.
화합물, 예를 들어 IL-17 결합 분자 또는 또 다른 작용제와 관련된 용어 "투여되는"은 환자에 대한 그 화합물의 임의의 경로에 의한 전달을 지칭하기 위해 사용된다.
본원에 사용된 "치료 유효량"은 환자 (예컨대 인간)에 대한 단일 또는 다중 용량의 투여 시, 장애 또는 재발 장애의 치료, 예방, 발병 예방, 치유, 지연, 중증도 감소, 적어도 하나의 증상 개선, 또는 이러한 치료의 부재 시에 예상되는 것을 능가하는 환자의 생존 연장에 효과적인 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)의 양을 지칭한다. 단독으로 투여되는 개별적인 활성 성분 (예를 들어, IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙)에 적용될 때, 상기 용어는 성분 단독을 지칭한다. 조합물에 적용되는 경우에, 상기 용어는 조합하여, 연속으로 또는 동시에 투여되는지에 관계없이, 치료 효과를 생성하는 활성 성분들의 합한 양을 지칭한다.
용어 "치료" 또는 "치료하다"는 질환에 걸릴 위험이 있거나 또는 질환에 걸린 것으로 의심되는 환자 뿐만 아니라 병에 걸렸거나 또는 질환 또는 의학적 상태를 앓고 있는 것으로 진단된 환자의 치료를 비롯한, 예방적 또는 방지적 치료 둘 다 뿐만 아니라 치유적 또는 질환 변형 치료를 지칭하며, 임상적 재발의 억제를 포함한다. 치료는 의학적 장애를 앓고 있거나 또는 궁극적으로 장애에 걸릴 수 있는 환자에게 투여되어, 장애 또는 재발 장애를 예방하거나, 치유하거나, 그의 발병을 지연시키거나, 그의 중증도를 감소시키거나 또는 그의 하나 이상의 증상을 완화시키거나, 또는 이러한 치료의 부재 시에 예상되는 것을 능가하여 환자의 생존을 연장시킬 수 있다.
어구 "치료에 반응하다"는 특정한 치료, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, 세쿠키누맙)의 전달 시, 환자가 상기 치료로부터 임상적으로 의미있는 이익을 나타내는 것을 의미하는데 사용된다. PsA의 경우에, 이러한 이익은 다양한 기준, 예를 들어 ACR20, ACR50, ACR70, DAS28 등에 의해 측정될 수 있다 (실시예 1 참조). 이러한 기준 모두는 PsA 환자가 주어진 치료에 반응하고 있는지에 대한 허용되는 측정치이다. 어구 "치료에 반응하다"는 절대적 반응으로 해석되는 것이 아니라, 비교적으로 해석되는 것으로 의도된다. 예를 들어, PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 환자는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자보다 IL-17 길항제로의 치료로부터 더 적은 이익을 가질 것으로 예측된다. 유사하게, PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자는 PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자보다 IL-17 길항제로의 치료로부터 더 많은 이익을 가질 것으로 예측된다. 이들 PsA 비-반응 대립유전자의 비-보유자 및 PsA 반응 대립유전자의 보유자는 IL-17 길항제로의 치료에 더 유리하게 반응하고, 간단히 IL-17 길항제로의 "치료에 반응한다"라고 말해질 수 있다.
어구 "데이터 취득"은 임의의 이용가능한 수단, 예를 들어 구두로, 전자적으로 (예를 들어, 전자 우편, 디스켓 상 암호화 또는 다른 매체에 의해), 서면 등에 의한 정보 소유물의 획득을 의미하는데 사용된다.
본원에 사용된 어구 "건선성 관절염" 및 그의 약어 "PsA"는 일반적으로 혈청음성 척추관절염 (SpA)으로 지칭되는 상태의 범위에 속하는 면역-매개 만성 염증성 질환을 지칭한다. CASPAR 기준 (문헌 [Taylor et al (2006) Arthritis Rheum 54:2665-73])이 PsA를 앓는 환자를 진단하는데 사용될 수 있다.
환자에 관련하여 본원에 사용된 "선택하는" 및 "선택된"은 특정한 환자가 소정의 기준을 갖는 특정한 환자, 예를 들어 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 (그에 기인하여) 더 넓은 군의 환자로부터 구체적으로 선택됨을 의미하는데 사용된다. 유사하게, "PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는"은 소정의 기준을 갖는 특정한 환자, 예를 들어 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 (그에 기인하여) 더 넓은 군의 환자로부터 구체적으로 선택되는 PsA 환자에게 치료를 제공하는 것을 지칭한다. 유사하게, "선택적으로 투여하는"은 소정의 기준, 예를 들어 특정한 유전적 또는 다른 생물학적 마커를 갖는 특정한 환자를 근거로 하여 (그에 기인하여) 더 넓은 군의 환자로부터 구체적으로 선택되는 PsA 환자에게 약물을 투여하는 것을 지칭한다. 선택하는, 선택적으로 치료하는 및 선택적으로 투여하는이란, 환자에게 PsA 질환을 앓고 있는 것만을 근거로 하여 표준 치료 요법을 전달하는 것이 아니라, 환자의 생물학을 근거로 하여 PsA에 대한 개인맞춤형 요법을 전달하는 것을 의미한다.
본원에 사용된 "예측하는"은 본원에 기재된 방법이, PsA를 앓는 개체가 IL-17 결합 분자로의 치료에 반응하거나 또는 더 유리하게 반응할 가능성을 의료인이 결정할 수 있게 하는 정보를 제공함을 나타낸다. 이것이 100% 정확도로 반응성을 예측하는 능력을 지칭하는 것은 아니다. 대신에, 당업자는 이것이 증가된 확률을 지칭한다는 것을 이해할 것이다.
본원에 사용된 "가능성" 및 "가능성이 있는"은 사건이 어느 정도로 발생할 것 같은지의 측정이다. 이는 "확률"과 상호교환적으로 사용될 수 있다. 가능성은 추정보다는 높지만, 확신보다는 낮은 확률을 지칭한다. 따라서, 합리적인 사람이 상식, 훈련 또는 경험을 이용하여 환경을 고려할 때 사건이 발생할 것 같다고 결론짓는 경우, 그 사건은 가능성이 있다. 일부 실시양태에서, 일단 가능성이 확인되었으면, 환자는 IL-17 결합 분자로 치료될 (또는 치료 계속, 또는 투여량 증가로 치료 진행될) 수 있거나 또는 환자는 IL-17 결합 분자로 치료되지 않을 (또는 치료 중단, 또는 보다 낮은 용량으로 치료 진행될) 수 있다.
어구 "증가된 가능성"은 사건이 발생할 확률의 증가를 지칭한다. 예를 들어, 본원에서 일부 방법은 환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 PsA 환자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 PsA 환자와 비교하여 IL-17 결합 분자로의 치료에 반응할 증가된 가능성 또는 IL-17 결합 분자로의 치료에 더 양호하게 반응할 증가된 가능성을 나타낼지에 대한 예측을 허용한다.
어구 "감소된 가능성"은 사건이 발생할 확률의 감소를 지칭한다. 예를 들어, 본원에서 방법은 환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 PsA 환자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 PsA 환자와 비교하여 IL-17 결합 분자로의 치료에 반응할 감소된 가능성 또는 IL-17 결합 분자로의 치료에 더 양호하게 반응할 감소된 가능성을 나타낼지에 대한 예측을 허용한다.
본원에 사용된 "SNP"는 "단일 뉴클레오티드 다형성"을 지칭한다. 단일 뉴클레오티드 다형성은 게놈 (또는 다른 공유된 서열)의 단일 뉴클레오티드가 생물학적 종의 구성원 또는 개체의 쌍형성 염색체 사이에서 상이한 경우 발생하는 DNA 서열 변이이다. 대부분의 SNP는 오직 2개의 대립유전자를 갖고, 1개는 보통 집단에서 보다 공통적이다. SNP는 유전자의 엑손 또는 인트론, 유전자의 비번역 영역 상류 또는 하류, 또는 순수한 게놈 위치 (즉, 비-전사됨)에 존재할 수 있다. SNP가 유전자의 코딩 영역에서 발생할 때, SNP는 유전자 코드의 중복에 기인하여 침묵할 수 있거나 (즉, 동의성 다형성), 또는 SNP는 코딩된 폴리펩티드의 서열에서의 변화를 유발할 수 있다 (즉, 비-동의성 다형성). 본 개시내용에서, SNP는 그의 단일 뉴클레오티드 다형성 데이터베이스 (dbSNP) rs 숫자, 예를 들어 rs4263839에 의해 확인된다. dbSNP는 미국 국립 인간 게놈 연구소 (NHGRI)와 협력하여 미국 국립 생물 정보 센터 (NCBI)에 의해 개발 및 관리되는 상이한 종내 및 종간 유전자 변이에 대한 무료 공공 자료보관소이다.
다형성 부위, 예컨대 SNP는 보통 관심 집단의 게놈에서 보존된 서열 전후에 존재하고, 따라서 다형성 부위의 위치는 흔히, SNP의 경우에 일반적으로 "SNP 콘텍스트(context) 서열"로서 지칭되는, 다형성 부위를 포괄하는 (예를 들어, 30 내지 60개 뉴클레오티드의) 컨센서스 핵산 서열을 참조하여 만들 수 있다. 본원에 개시된 SNP에 대한 컨텍스트 서열은 www.ncbi.nlm.nih.gov/snp에서 입수가능한 NCBI SNP 데이터베이스에서 찾을 수 있다. 대안적으로, 다형성 부위의 위치는 유전자의 시작, mRNA 전사체, BAC 클론 또는 심지어 단백질 번역을 위한 개시 코돈 (ATG)에 대해 참조 서열 (예를 들어, 진뱅크(GeneBank) 기탁물)에서의 그의 위치에 의해 확인될 수 있다. 당업자는 컨센서스 또는 참조 서열과 비교할 때 개체에서의 하나 이상의 삽입 또는 결실의 존재에 기인하여, 특정한 다형성 부위의 위치가 관심 집단 내 각 개체에서의 참조 또는 콘텍스트 서열 내의 정확하게 동일한 위치에서 발생하지 않을 수 있음을 이해한다. 당업자에게 검출할 다형성 부위에서의 대체 대립유전자의 정체 및 다형성 부위가 발생하는 참조 서열 또는 콘텍스트 서열 중 하나 또는 둘 다를 제공할 때, 당업자가 임의의 주어진 개체에서 다형성 부위에서의 대체 대립유전자를 검출하기 위한 견실하고 특이적이며 정확한 검정을 설계하는 것은 일상적이다. 따라서, 당업자는 참조 또는 콘텍스트 서열 내의 특정한 위치를 참조로 하여 (또는 이러한 서열 내의 개시 코돈에 대해) 본원에 기재된 임의의 다형성 부위의 위치를 구체화하는 것은 단지 편의를 위한 것이고, 임의의 구체적으로 나열된 뉴클레오티드 위치는 문자 그대로 본원에 기재된 임의의 유전자형 결정 방법 또는 당업계에 공지된 다른 유전자형 결정 방법을 사용하여 본 발명의 유전자 마커의 존재 또는 부재에 대해 시험된 임의의 개체 내의 동일한 유전자좌에 동일한 다형성 부위가 실제로 위치하는 모든 뉴클레오티드 위치를 포함함을 이해할 것이다.
실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명자들은 TRAF3IP2 (TRAF3 상호작용 단백질 2)에 연관된 적어도 하나의 rs240993 "T" 대립유전자 (본원에서 "PsA 비-반응 대립유전자"로 지칭됨)를 보유하는 PsA 환자가 임의의 rs240993 "T" 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 감소된 반응을 나타낸다는 것을 결정하였다. rs240993 다형성은 TRAF3IP2의 하류인 REV3L 유전자에 있다. 본원에 사용된 "REV3L"은 DNA 폴리머라제 ζ의 촉매 서브유닛인 ~350-kDa 단백질 (REV3)을 코딩하는 인간 REV3L 유전자 ("REV3"으로도 공지됨)를 지칭한다. 본원에 사용된 "TRAF3IP2"는 TRAF 단백질 (종양 괴사 인자 수용체-연관 인자), 예를 들어 TRAF3 및 TRAF6과 상호작용하여 NF-카파B 또는 준(Jun) 키나제를 활성화하는 단백질인 ACT1 (어댑터 단백질 CIKS로도 공지됨)을 코딩하는 인간 TRAF3IP2 유전자를 지칭한다 (문헌 [Wu et al. (2010) Adv. Exp. Med. Biol. 946:223-35]). 또한 ACT1은 IL-17 신호전달에서 중요한 역할을 한다. 예를 들어, 문헌 [Qian et al. (2007) Nat. Immunol. 8(3)247-56]은, ACT1은 IL-17로의 자극 후에 IL-17R로 동원되고, 성상교세포 및 소화관 상피 세포에서의 ACT1 무효화는 염증-관련 유전자의 IL-17 유도 발현에서의 감소를 유발한다는 것을 밝혀냈다. 문헌 [Zhu et al. (2010) J. Exp. Med. 207(12)2647-2662]에 의한 최근 보고에서는, TRAF3이 IL-17 수용체 (IL-17R) 신호전달의 수용체 근접 음성 조절제라는 것이 보고되었다. 주(Zhu) 등은 TRAF3이 IL-17-유도 NF-카파B 및 미토겐-활성화 단백질 키나제 활성화 및 이후의 염증성 시토카인 및 케모카인 생성을 강력하게 억제했다는 것을 나타내었다.
도 2에 나타낸 바와 같이, 높은 연관 불균형 (LD)를 나타내는 REV3L 및 TRAF3IP2를 가로지르는 영역이 존재하고, 이는 rs240993이 TRAF3IP2에서의 원인 SNP를 '태깅'할 수 있음을 시사한다. 최근 간행물에서, 문헌 [Strange et al (2010) Nat. Genet. 42(11) 985-990]은 염색체 6q21 영역에 있는 rs240993 T 대립유전자가 건선 질환 위험과 연관된다는 것을 보고하였다 (또한 문헌 [Chandran (2012) Clinic Rev Allerg Immunol. DOI: 10.1007/s12016-012-8303-5] 참조). 저자는 상기 염색체 영역 내 4개의 공지된 유전자 중 TRAF3IP2가 IL-17 의존성 NF-카파베타 활성화 및 Th17-매개 염증 반응에서의 그의 관여에 대해 주목할만하다고 언급한다. 특정한 다른 TRAF3IP2 SNP가 또한 PsA 및 건선과 연관되는 것으로 밝혀져 있다 (문헌 [Huffmeier et al. (2010) Nat. Genet 42(11) 996-9; Ellinghaus et al. (2010) Nat. Genet 42(11) 991-5]).
본원에 사용된 "rs240993"은 인간 REV3L 유전자 (진뱅크 등록 번호 NM_002912.3)의 인트론 내에 위치한 T/C/A/G SNP를 지칭한다. rs240993 다형성 부위는 콘티그 NT_025741.15의 위치 15843171인 염색체 위치 111673714 (NCBI 게놈 빌드 37.3; GRCh37.p5)에 위치한다.
본원에 사용된 어구 "PsA 비-반응 대립유전자"는 rs240993 다형성 부위에서의 T 대립유전자 (비코딩 가닥의 경우에, A 대립유전자)를 지칭한다 ("rs240993 비-반응 대립유전자"로도 지칭됨). 개시된 방법, 용도, 및 키트의 일부 실시양태에서, 환자는 적어도 하나의 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는다.
실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명자들은 적어도 하나의 TNFSF15 (종양 괴사 인자 (리간드) 슈퍼패밀리, 구성원 15) rs4263839 "A" 대립유전자 (본원에서 "PsA 반응 대립유전자"로도 지칭됨)를 보유하는 PsA 환자가 임의의 rs4263839 "A" 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타낸다는 것을 결정하였다. "TNFSF15"는 TNF 슈퍼패밀리 리간드 TL1A (VEGI로도 공지됨)를 코딩하는 인간 종양 괴사 인자 (리간드) 슈퍼패밀리 구성원 15 유전자를 지칭한다. TL1A는, 종양 괴사 인자 (TNF) 리간드 패밀리에 속하고 내피 세포에서 풍부하게 발현되는 시토카인이다 (문헌 [Sethi et al. (2009) Adv. Exp. Med. Biol. 647:207-15]). TL1A 발현은 염증성 자극, 예를 들어 TNF 및 IL-1 알파에 의해 유도될 수 있고, 이는 다시 NF-카파B, STAT3, JNK, p38 MAPK 및 p42/p44 MAPK를 포함하는 다중 세포 신호전달 경로를 활성화한다 (문헌 [Sethi et al.]). VEGI는 내피 세포 및 종양 세포의 증식을 억제하고, 수지상 세포의 성숙을 유도하며, 파골세포발생을 유도한다 (문헌 [Sethi et al.]). 활성화 CD4 T 세포 상 사멸 수용체 3 (DR3)에 대한 TL1A의 결합은 인터페론-감마 및 IL-17의 생성으로 T-헬퍼 17 세포의 증식 및 분화를 유도함으로써 염증 반응을 증폭시키는 공-자극 신호를 제공한다 (문헌 [Pappu et al. (2008) J Exp Med 205:1049-62; Meylan et al. (2008) Immunity 29:79-89]). TNFSF15 유전자는 염색체 9 상에서 발견된다.
본원에 사용된 "rs4263839"는 몇몇 세포주에서의 전사 조절과 연관되는 것으로 여겨지는 영역에서의 인간 TNFSF15 유전자의 인트론 내에 위치한 A/G SNP를 지칭한다 (문헌 [Zucchelli et al. (2011) Gut 60(12):1671-1]). rs4263839의 G 대립유전자는 염증성 장 증후군의 증가된 위험 (오즈비(odds ratio) 1.37)과 연관되어 있다 (문헌 [Zucchelli et al.; Barrett et al. (2008) Nat Genet. 40(8):955-62]). rs4263839 다형성 부위는 진뱅크 등록 번호 NG_011488.2에 제시된 인간 TNFSF15 유전자의 위치 6969인 콘티그 NT_008470.19의 위치 46730972인, GRCh37.p5의 위치 117566440에 위치한다.
실시예에 나타낸 바와 같이, 본 발명자들은 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자 (본원에서 "PsA 반응 대립유전자"로도 지칭됨)를 보유하는 PsA 환자가 임의의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타낸다는 것을 결정하였다. "HLA"는 인간 백혈구 항원을 지칭한다. HLA는 염색체 6p21.31 상에 위치하고 반수체형에 좌우되는 약 3.6 Mbp의 영역을 포함한다. HLA 분자는 3개의 유전자 군, HLA 부류 I, HLA 부류 II 및 HLA 부류 III 유전자에 의해 코딩된다. HLA 부류 I 단백질은 유전자 HLA-A, HLA-B, 및 HLA-C에 의해 코딩된다. HLA 부류 II 단백질은 유전자 HLA-DR, HLA-DQ, HLA-DP, HLA-DM, HLA-DOA 및 HLA-DOB에 의해 코딩된다. HLA 부류 II 단백질은 보체계의 일부이다. 다형성 HLA 부류 I 유전자 HLA-A, -B, 및 -C 및 부류 II 유전자 HLA-DR, -DQ 및 -DP는 다양한 단백질 (예를 들어, hla.alleles.org/proteins/class2.html 참조) 및 다양한 항원 (예를 들어, hla.alleles.org/antigens/recognised_serology.html 참조)을 코딩한다.
HLA 부류 II 분자는 2개의 막횡단 폴리펩티드, 알파 및 베타 쇄로 이루어진다. 베타 쇄는 알파 쇄와 비교하여 더 다형성이고, HLA 유형 결정은 통상적으로 베타 쇄 상에서 수행된다 (예를 들어, HLA-DRB1 내지 DRB9). HLA 대립유전자 명명은 HLA 시스템의 인자에 대한 2010 WHO 명명 위원회에 따라 행해진다 (문헌 [Marsh et al. (2010) Tissue Antigens 75:291-455; Marsh et al. (2010) Bone Marrow Transplantation 45:846-8]). 몇몇 자릿수가 HLA 대립유전자를 확인하는데 사용된다. 특정한 HLA 유전자좌 (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DR, HLA-DQ 및 HLA-DP)는 항원의 혈청학적 등가물을 할당하는 두 자리 숫자로부터 기호 *에 의해 분리된다 (이 수준은 "유형" 또는 "대립유전자 군"을 설명함). 예로서, HLA-DRB1*04는 HLA-DRB1 유전자좌로부터의 대립유전자 군을 나타낸다. 이러한 "두 자릿수" 해상도는 유사한 항원 (예를 들어, HLA-DR4 혈청학적 항원)을 코딩하거나 또는 높은 서열 상동성을 공유하는 다양한 대립유전자로 구성된 대립유전자 군 (예를 들어, HLA-DRB1 유전자좌로부터의 대립유전자 군)을 나타낸다. 이어서 콜론 및 또 다른 두 자리 또는 세 자리 숫자가 이어지고, 이는 특정한 코딩 단백질을 확인한다 (이 수준은 "하위유형" 또는 "대립유전자 하위유형"을 설명함). 예로서, HLA-DRB1*04:01은 특정한 아미노산 서열을 갖는 HLA-DR 베타 쇄를 코딩하는 HLA-DRB1*04 대립유전자 군 내의 특정한 대립유전자이다. 이러한 "네 자릿수" 해상도는 코딩된 폴리펩티드 산물의 아미노산 서열에서의 차이를 유발하는 대립유전자 군 내의 특정한 게놈 서열 변이를 나타낸다. 대립유전자는 대립유전자의 코딩 영역 내의 동의성 DNA 치환을 나타내거나 또는 비-코딩 영역 내의 DNA 차이를 나타내는 추가의 콜론 및 숫자를 사용하여 추가로 정의될 수 있다 (9 자릿수 수준).
"HLA-DRB1*04 대립유전자 군"은 HLA-DR4 혈청학적 항원을 코딩하거나 또는 높은 서열 상동성을 공유하는 다양한 대립유전자로 구성되는 HLA-DRB1 유전자좌로부터의 대립유전자 군 (또는 유형)을 지칭한다.
"HLA-DRB1*04 대립유전자" 또는 "HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자"는 HLA-DRB1*04 대립유전자 군, 예를 들어 HLA-DRB1*04:01, HLA-DRB1*04:05 등 내의 대립유전자를 지칭한다. 예시적인 HLA-DRB1*04 대립유전자에 대한 비제한적 IMG/HLA 데이터베이스 (EMBL-EBI 데이터베이스의 일부) 참조 번호를 표 1에 나타내며, 그의 서열은 www.ebi.ac.uk/imgt/hla/nomenclature/index.html을 통해 접근가능하다.
Figure pct00001
Figure pct00002
표 1: HLA-DRB1*04 대립유전자에 대한 IMG/HLA 데이터베이스 참조 번호. 이 목록으로 제한되지는 않는다.
이들 서열은 그 전체가 참조로서 본원에 포함된다.
"HLA-DRB1*04 대립유전자의 산물"은 HLA-DRB1*04 대립유전자의 핵산 산물 및 HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물을 포함한다. "HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물"은 HLA-DRB1*04 대립유전자에 의해 코딩되는 폴리펩티드, HLA-DRB1*04 대립유전자에 의해 코딩되는 폴리펩티드의 단편 및 HLA-DR4 혈청학적 항원을 지칭한다. "HLA-DRB1*04 대립유전자의 핵산 산물"은 HLA-DRB1*04 대립유전자의 임의의 DNA (게놈, cDNA 등) 또는 RNA 산물 (예를 들어, 프리-mRNA, mRNA, 마이크로 RNA 등) 및 그의 단편을 지칭한다.
"HLA-DR4 혈청형"은 HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물 (예를 들어, HLA-DR4 혈청학적 항원)을 나타내는 환자의 혈청형을 지칭한다.
본원에 사용된 rs4263839 다형성 부위 ("rs4263839 반응 대립유전자"로도 언급됨) 및 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서 A 대립유전자 (비코딩 가닥의 경우에, T 대립유전자) 둘 다는 종합적으로 "PsA 반응 대립유전자"이다. 개시된 방법, 용도, 및 키트의 일부 실시양태에서, 환자는 적어도 하나의 PsA 반응 대립유전자, 예를 들어 적어도 하나의 rs4263839 반응 대립유전자 및/또는 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖는다.
당업자에 의해 인식되는 바와 같이, 특정한 SNP를 함유하는 핵산 샘플은 상보적 이중 가닥 분자일 수 있고, 따라서 센스 가닥 상의 특정한 부위에 대한 언급은 상보적 안티센스 가닥 상의 상응하는 부위도 지칭한다. 유사하게, 염색체의 한 가닥의 두 카피 상의 SNP에 대해 획득한 특정한 유전자형에 대한 언급은 다른 가닥의 두 카피 상의 동일한 SNP에 대해 획득한 상보적 유전자형과 동등한 것이다. 따라서, 예를 들어 TNFSF15 유전자에 대한 코딩 가닥 상의 rs4263839 다형성 부위에 대한 G/A 유전자형은 비코딩 가닥 상의 다형성 부위에 대한 C/T 유전자형과 동등하다.
본원에 사용된 어구 "후보 PsA 반응 마커"는 표 2에 나타낸 다형성 부위 및 대립유전자를 지칭하며, 이는 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 증가된 (또는 감소된) 가능성을 갖는 환자를 추가로 계층화하는데 사용될 수 있다. 표 2에서의 후보 PsA 반응 마커는 IL-17 결합 분자, 예를 들어 세쿠키누맙에 대한 PsA 환자의 반응을 예측하기 위해 단독으로 또는 개시된 PsA 비-반응 대립유전자 및 PsA 반응 대립유전자와 조합하여 이용될 수 있다는 것이 이해될 것이다. 일부 실시양태에서, 환자로부터의 생물학적 샘플은 PsA 비-반응 대립유전자 및/또는 PsA 반응 대립유전자, 및 임의로 후보 PsA 반응 마커의 존재에 대해 검정된다.
Figure pct00003
표 2: 후보 PsA 반응 마커의 유전자, 대립유전자 및 위치 정보를 나타낸다.
본원에 사용된 "게놈 서열"은 게놈에 존재하는 DNA 서열을 지칭하고, 대립유전자 내에 영역, 대립유전자 그 자체, 또는 관심 대립유전자를 함유하는 염색체의 보다 큰 DNA 서열을 포함한다.
PsA 비-반응 대립유전자, 후보 PsA 반응 마커, 및 PsA 반응 대립유전자의 산물은 핵산 산물 및 폴리펩티드 산물을 포함한다. "폴리펩티드 산물"은 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자에 의해 코딩된 폴리펩티드 및 그의 단편을 지칭한다. "핵산 산물"은 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 임의의 DNA (예를 들어, 게놈, cDNA 등) 또는 RNA (예를 들어, 프리-mRNA, mRNA, miRNA 등) 산물 및 그의 단편을 지칭한다.
"등가 유전자 마커"는 관심 대립유전자와 상호관련된 유전자 마커를 지칭하고, 예를 들어 이는 연관 불균형 (LD)을 나타내거나 또는 관심 대립유전자와 유전적으로 연관된다. 등가 유전자 마커는, 환자로부터의 생물학적 샘플을 PsA 비-반응 대립유전자 및/또는 PsA 반응 대립유전자 그 자체에 대해 직접적으로 규명하는 것이 아니라, 환자가 PsA 비-반응 대립유전자 및/또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는지 결정하는데 사용될 수 있다. 특정한 SNP에 대한 LD를 결정하는 것을 돕는 다양한 프로그램, 예를 들어 하플로블록(HaploBlock) (bioinfo.cs.technion.ac.il/haploblock/에서 이용가능), 하프맵(HapMap), WGA 뷰어가 존재한다. rs4263839와 연관된 LD에 대한 정보는 문헌 [Zucchelli et al. (2011) Gut 60(12):1671-1]에서 찾을 수 있다. HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자 또한, 예를 들어 SNP (단일 뉴클레오티드 다형성), 미세부수체 마커, 또 다른 HLA 대립유전자 (예를 들어, HLA-DQB1 대립유전자) 또는 다른 종류의 유전자 다형성일 수 있는 HLA-DRB*04 대립유전자의 등가 유전자 마커를 검출함으로써 결정될 수 있다. 예를 들어, HLA-DRB1*04 대립유전자 그 자체가 아니라, HLA-DRB1*04 대립유전자와 동일한 반수체 상의 유전자 마커의 존재가 IL-17 결합 분자로의 치료에 반응할 환자의 가능성을 나타낼 수 있다. HLA 부류 II 영역 내의 재조합 및 연관 불균형에 대한 논의는 문헌 [Begovich et al. (1992) J. Immunology 148:249-58]에 제공된다.
용어 "프로브"는 또 다른 물질, 예를 들어 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자와 관련된 물질을 특이적으로 검출하기에 유용한 임의의 물질의 조성물을 지칭한다. 프로브는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 게놈 서열, 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 핵산 산물 (예를 들어, 게놈 DNA 또는 mRNA)과 특이적으로 혼성화하는 올리고뉴클레오티드 (접합된 올리고뉴클레오티드 포함)일 수 있다. 접합된 올리고뉴클레오티드는 수용체 분자 (예를 들어, 항원에 특이적인 항체)에 고도로 특이적인 리간드 (예를 들어, 항원)를 함유하는 발색단 또는 분자에 공유결합된 올리고뉴클레오티드를 지칭한다. 또한, 프로브는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 내의 특정한 영역을 증폭시키기 위한 PCR 프라이머 (예를 들어, 또 다른 프라이머와 함께)일 수 있다. 추가로, 프로브는 이들 대립유전자의 폴리펩티드 산물에 특이적으로 결합하는 항체일 수 있다. 추가로, 프로브는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 등가 유전자 마커를 검출 (예를 들어, 결합 또는 혼성화)할 수 있는 임의의 물질의 조성물일 수 있다. 바람직한 실시양태에서, 프로브는 핵산 서열 (바람직하게는 게놈 DNA)에 특이적으로 혼성화하거나 또는 관심 대립유전자의 폴리펩티드 서열에 특이적으로 결합한다.
어구 "특이적으로 혼성화하다"는 엄격한 혼성화 조건 하의 혼성화를 지칭하는데 사용된다. 엄격한 조건은 당업자에게 공지되어 있고, 문헌 [Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, N.Y. (1989), 6.3.1-6.3.6]에서 찾을 수 있다. 수성 및 비수성 방법은 상기 참고문헌에 기재되어 있고 어느 쪽이든 사용될 수 있다. 엄격한 혼성화 조건의 한 예는 약 45℃에서 6X 염화나트륨/시트르산나트륨 (SSC)에서의 혼성화 후 50℃에서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서의 적어도 한 번의 세척이다. 엄격한 혼성화 조건의 두 번째 예는 약 45℃에서 6X SSC에서의 혼성화 후 55℃에서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서의 적어도 한 번의 세척이다. 엄격한 혼성화 조건의 또 다른 예는 약 45℃에서 6X SSC에서의 혼성화 후 60℃에서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서의 적어도 한 번의 세척이다. 엄격한 혼성화 조건의 추가의 예는 약 45℃에서 6X SSC에서의 혼성화 후 65℃에서 0.2X SSC, 0.1% SDS에서의 적어도 한 번의 세척이다. 매우 엄격한 조건은 65℃에서 0.5 M 인산나트륨, 7% SDS에서의 혼성화 후 65℃에서 0.2X SSC, 1% SDS에서의 적어도 한 번의 세척을 포함한다.
어구 "핵산의 영역"은 핵산의 보다 큰 서열 내의 보다 작은 서열을 나타내는데 사용된다. 예를 들어, 유전자는 염색체의 영역이고, 엑손은 유전자의 영역인 것 등이다.
폴리펩티드와 관련한 용어 "특이적으로 결합하다"는 프로브가 바람직하지 않은 폴리펩티드에 무작위로 결합하는 것이 아니라, 주어진 폴리펩티드 표적 (예를 들어, PsA 비-반응 대립유전자의 폴리펩티드 산물)에 결합하는 것을 의미하는데 사용된다. 그러나, "특이적으로 결합하다"는, 교차 반응성이 주어진 폴리펩티드 표적의 존재 또는 부재의 유용한 측정을 제공하는 프로브의 능력을 방해하지 않는 한, 바람직하지 않은 폴리펩티드와의 일부 교차 반응성을 제외하지 않는다.
용어 "할 수 있는"은 주어진 결과를 달성하는 능력을 의미하는데 사용되며, 예를 들어 특정한 물질의 존재를 검출할 수 있는 프로브는 프로브가 특정한 물질을 검출하는데 사용될 수 있음을 의미한다.
"올리고뉴클레오티드"는, 예를 들어 2-100개 염기의 짧은 서열의 뉴클레오티드를 지칭한다.
본원에 사용된 용어 "생물학적 샘플"은 확인, 진단, 예측, 또는 모니터링의 목적을 위해 사용될 수 있는 환자로부터의 샘플을 지칭한다. 바람직한 샘플은 활액, 혈액, 혈액-유래 생성물 (예컨대 백혈구 연층, 혈청, 및 혈장), 림프, 뇨, 누액, 타액, 모발 구근 세포, 뇌척수액, 협측 면봉 채취물, 분변, 활액, 활막 세포, 객담 또는 조직 샘플을 포함한다. 또한, 당업자는 일부 샘플이 전혈로부터 DNA의 분획화 또는 정제 절차, 예를 들어 단리에 따라 더 용이하게 분석될 것임을 이해할 것이다.
어구 "PsA에 대해 이전에 치료받았음" 및 "이전의 PsA 치료를 받았음" 등은 환자가 이전에, 예를 들어 항-PsA 작용제를 이용하여 PsA 요법을 받았음을, 예를 들어 환자가 이전의 PsA 요법, 항-PsA 작용제 또는 치료 요법에 실패했거나, 불충분한 반응자이거나, 또는 불내성인 것을 의미하는데 사용된다. 이러한 환자는 이전에 NSAID, DMARD (예를 들어, 메토트렉세이트 (MTX)), 코르티코스테로이드 및/또는 생물제제, 예컨대 TNF 알파 길항제 등으로 치료받은 환자를 포함한다. 어구 "PsA에 대해 이전에 치료받은 적이 없음"은 환자가 이전에 PsA 치료를 받지 않았음, 즉 환자가 "경험이 없음"을 의미하는데 사용된다. 본원에 사용된 바와 같이, TNF 알파 길항제로 PsA에 대해 이전에 치료받은 적이 없는 환자는 "TNF알파 길항제 경험이 없음"으로 간주된다. 개시된 방법 및 용도의 일부 실시양태에서, 환자는 이전의 PsA 치료를 받았었다. 개시된 방법 및 용도의 일부 실시양태에서, 환자는 TNF 알파 길항제 경험이 없다.
본원에 사용된 어구 "PsA 작용제"는 PsA 환자를 위해 일반적으로 처방되는 제약, 예를 들어 NSAID (예를 들어, 인도메타신, 나프록센, 술린닥, 디클로페낙, 아스피린, 플루르비프로펜, 옥사프로진, 살살레이트, 디푸니살, 피록시캄, 에토돌락, 메클로페나메이트, 이부프로펜, 페노프로펜, 케토프로펜, 나부메톤, 톨메틴, 콜린성 마그네슘 살리실레이트, COX-2 억제제 [예를 들어, 셀레콕시브]), TNF 알파 길항제 (에타네르셉트, 아달리무맙, 인플릭시맙, 골리무맙), DMARDS (예를 들어, 술파살라진, 메토트렉세이트), 시클로스포린, 레티노이드 및 코르티코스테로이드를 지칭한다. 개시된 방법, 용도의 일부 실시양태에서, PsA 환자의 대립유전자 상태는 임상의가 2개의 대체 요법, 즉 IL-17 길항제 (예를 들어, 세쿠키누맙)로 PsA 환자를 치료하거나 또는 다른 PsA 작용제 (예를 들어, DMARD)로 PsA 환자를 치료하는 하는 것 사이에서 선택하도록 한다.
이전의 PsA 요법에 대한 "실패"라는 용어는 하기를 지칭한다: (1) 의미있는 임상적 이익이 없는 환자 (효능의 1차 결여); (2) 측정가능하고 의미있는 반응을 보이기는 하지만 반응이 보다 양호할 수 있었던 환자, 예를 들어 낮은 PsA 질환 활성 또는 PsA 완화가 달성되지 않은 환자 ("불충분한 반응"으로도 언급됨); (3) 초기의 우수한 반응 후에 악화된 환자 (효능의 2차 상실); 및 (4) 우수한 반응을 보이지만 부작용 때문에 중단된 환자 ("불내성"로도 언급됨). 불충분한 TNF 알파 길항제 반응 (TNF-IR) 또는 TNF 알파 길항제에 대한 불내성을 보이는 환자는 TNF 실패로 간주된다. 불충분한 MTX 반응 (MTX-IR) 또는 TMX에 대한 불내성을 보이는 환자는 MTX 실패로 간주된다. 불충분한 DMARD 반응 (DMARD-IR) 또는 DMARD에 대한 불내성을 보이는 환자는 DMARD 실패로 간주된다. 불충분한 NSAID 반응 (NSAID-IR) 또는 NSAID에 대한 불내성을 보이는 환자는 NSAID 실패로 간주된다. 개시된 방법 및 용도의 일부 실시양태에서, 환자는 이전의 PsA 치료에 대해 실패했거나, 불충분한 반응자이거나, 또는 불내성이다.
IL-17 길항제
개시된 다양한 제약 조성물, 요법, 과정, 용도, 방법 및 키트는 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 수용체 항체 또는 그의 항원 결합 단편)를 이용한다.
한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 초가변 영역 CDR1, CDR2 및 CDR3을 포함하는 적어도 하나의 이뮤노글로불린 중쇄 가변 도메인 (VH)을 포함하고, 상기 CDR1은 서열 1의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2는 서열 2의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3은 서열 3의 아미노산 서열을 갖는다. 한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 초가변 영역 CDR1', CDR2' 및 CDR3'를 포함하는 적어도 하나의 이뮤노글로불린 경쇄 가변 도메인 (VL')을 포함하고, 상기 CDR1'는 서열 4의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2'는 서열 5의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3'는 서열 6의 아미노산 서열을 갖는다. 한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 초가변 영역 CDR1-x, CDR2-x 및 CDR3-x를 포함하는 적어도 하나의 이뮤노글로불린 중쇄 가변 도메인 (VH)을 포함하고, 상기 CDR1-x는 서열 11의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2-x는 서열 12의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3-x는 서열 13의 아미노산 서열을 갖는다.
한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 적어도 하나의 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 적어도 하나의 이뮤노글로불린 VL 도메인을 포함하고, 여기서 a) 이뮤노글로불린 VH 도메인은 (예를 들어, 서열 내에) i) 초가변 영역 CDR1, CDR2 및 CDR3 (상기 CDR1은 서열 1의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2는 서열 2의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3은 서열 3의 아미노산 서열을 가짐); 또는 ii) 초가변 영역 CDR1-x, CDR2-x 및 CDR3-x (상기 CDR1-x는 서열 11의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2-x는 서열 12의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3-x는 서열 13의 아미노산 서열을 가짐)를 포함하고; b) 이뮤노글로불린 VL 도메인은 (예를 들어, 서열 내에) 초가변 영역 CDR1', CDR2' 및 CDR3' (상기 CDR1'는 서열 4의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2'는 서열 5의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3'는 서열 6의 아미노산 서열을 가짐)를 포함한다.
한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 하기를 포함한다: a) 서열 8에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 중쇄 가변 도메인 (VH); b) 서열 10에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 경쇄 가변 도메인 (VL); c) 서열 8에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 서열 10에 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; d) 서열 1, 서열 2 및 서열 3에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인, e) 서열 4, 서열 5 및 서열 6에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; f) 서열 11, 서열 12 및 서열 13에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인; g) 서열 1, 서열 2, 및 서열 3에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 서열 4, 서열 5 및 서열 6에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; 또는 h) 서열 11, 서열 12 및 서열 13에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 서열 4, 서열 5 및 서열 6에 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인.
참조의 용이성을 위해, 카바트(Kabat) 정의를 기초로 하고, X선 분석에 의해, 및 코티아(Chothia) 및 동료들의 접근법을 사용하여 결정된 바와 같은 세쿠키누맙 모노클로날 항체의 초가변 영역의 아미노산 서열을 하기 표 3에 제공한다.
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표 3: 세쿠키누맙 모노클로날 항체의 초가변 영역의 아미노산 서열.
바람직한 실시양태에서, 예를 들어 문헌 ["Sequences of Proteins of Immunological Interest", Kabat E.A. et al, US Department of Health and Human Services, Public Health Service, National Institute of Health]에 기재된 바와 같이, 바람직하게는 불변 영역 도메인은 적합한 인간 불변 영역 도메인을 또한 포함한다. 세쿠키누맙의 VL을 코딩하는 DNA는 서열 9에 제시된다. 세쿠키누맙의 VH를 코딩하는 DNA는 서열 7에 제시된다.
일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 서열 10의 3개의 CDR을 포함한다. 다른 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 8의 3개의 CDR을 포함한다. 다른 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 10의 3개의 CDR 및 서열 8의 3개의 CDR을 포함한다. 코티아 및 카바트 정의 둘 다에 따른 서열 8 및 서열 10의 CDR은 표 3에서 찾을 수 있다.
일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 서열 15의 경쇄를 포함한다. 다른 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 17의 중쇄를 포함한다. 다른 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 15의 경쇄 및 서열 17의 중쇄 도메인을 포함한다. 일부 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 15의 3개의 CDR을 포함한다. 다른 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 17의 3개의 CDR을 포함한다. 다른 실시양태에서, IL-17 길항제는 서열 15의 3개의 CDR 및 서열 17의 3개의 CDR을 포함한다. 코티아 및 카바트 정의 둘 다에 따른, 서열 15 및 서열 17의 CDR은 표 3에서 찾을 수 있다. 세쿠키누맙의 경쇄를 코딩하는 DNA는 서열 14에 제시된다. 세쿠키누맙의 중쇄를 코딩하는 DNA는 서열 16에 제시된다.
초가변 영역은, 임의 종류의 프레임워크 영역과 회합될 수 있지만, 바람직하게는 인간 기원의 것이다. 적합한 프레임워크 영역은 상기 문헌 [Kabat E.A. et al.]에 기재되어 있다. 바람직한 중쇄 프레임워크는 인간 중쇄 프레임워크, 예를 들어 세쿠키누맙 항체의 것이다. 이는 서열 내에서, 예를 들어 FR1 (서열 8의 아미노산 1 내지 30), FR2 (서열 8의 아미노산 36 내지 49), FR3 (서열 8의 아미노산 67 내지 98) 및 FR4 (서열 8의 아미노산 117 내지 127) 영역으로 이루어진다. X선 분석에 의해 결정된 세쿠키누맙의 초가변 영역을 고려하여, 또 다른 바람직한 중쇄 프레임워크는 서열 내에서 FR1-x (서열 8의 아미노산 1 내지 25), FR2-x (서열 8의 아미노산 36 내지 49), FR3-x (서열 8의 아미노산 61 내지 95) 및 FR4 (서열 8의 아미노산 119 내지 127) 영역으로 이루어진다. 유사한 방식으로, 경쇄 프레임워크는 서열 내에서, FR1' (서열 10의 아미노산 1 내지 23), FR2' (서열 10의 아미노산 36 내지 50), FR3' (서열 10의 아미노산 58 내지 89) 및 FR4' (서열 10의 아미노산 99 내지 109) 영역으로 이루어진다.
한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 적어도 a) 서열 내에 인간 중쇄의 초가변 영역 CDR1, CDR2 및 CDR3을 포함하는 가변 도메인 및 불변부 또는 그의 단편을 포함하는 이뮤노글로불린 중쇄 또는 그의 단편 (상기 CDR1은 서열 1의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2는 서열 2의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3은 서열 3의 아미노산 서열을 가짐); 및 b) 서열 내에 인간 경쇄의 초가변 영역 CDR1', CDR2' 및 CDR3'를 포함하는 가변 도메인 및 불변부 또는 그의 단편을 포함하는 이뮤노글로불린 경쇄 또는 그의 단편 (상기 CDR1'는 서열 4의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2'는 서열 5의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3'는 서열 6의 아미노산 서열을 가짐)을 포함하는 인간 항-IL-17 항체로부터 선택된다.
한 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)는 a) 서열 내에 초가변 영역 CDR1, CDR2 및 CDR3을 포함하는 제1 도메인 (상기 CDR1은 서열 1의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2는 서열 2의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3은 서열 3의 아미노산 서열을 가짐); 및 b) 초가변 영역 CDR1', CDR2' 및 CDR3'를 포함하는 제2 도메인 (상기 CDR1'는 서열 4의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR2'는 서열 5의 아미노산 서열을 갖고, 상기 CDR3'는 서열 6의 아미노산 서열을 가짐); 및 c) 제1 도메인의 N-말단 단부 및 제2 도메인의 C-말단 단부에 또는 제1 도메인의 C-말단 단부 및 제2 도메인의 N-말단 단부에 결합된 펩티드 링커를 포함하는 항원 결합 부위를 포함하는 단일쇄 결합 분자로부터 선택된다.
대안적으로, 개시된 방법에 사용하기 위한 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 서열에 의해 본원에 제시된 IL-17 결합 분자의 유도체 (예를 들어, 세쿠키누맙의 PEG화 버전)를 포함할 수 있다. 대안적으로, 개시된 방법에 사용하기 위한 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)의 VH 또는 VL 도메인은 본원에 제시된 VH 또는 VL 도메인 (예를 들어, 서열 8 및 10에 기재된 것)과 실질적으로 동일한 VH 또는 VL 도메인을 가질 수 있다. 본원에 개시된 인간 IL-17 항체는 서열 17에 제시된 것과 실질적으로 동일한 중쇄 및/또는 서열 15에 제시된 것과 실질적으로 동일한 경쇄를 포함할 수 있다. 본원에 개시된 인간 IL-17 항체는 서열 17을 포함하는 중쇄 및 서열 15를 포함하는 경쇄를 포함할 수 있다. 본원에 개시된 인간 IL-17 항체는 a) 서열 8에 나타낸 것과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 가변 도메인 및 인간 중쇄의 불변부를 포함하는 1개의 중쇄; 및 b) 서열 10에 나타낸 것과 실질적으로 동일한 아미노산 서열을 갖는 가변 도메인 및 인간 경쇄의 불변부를 포함하는 1개의 경쇄를 포함할 수 있다. 대안적으로, 개시된 방법에 사용하기 위한 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 본원에 제시된 참조 IL-17 결합 분자의 아미노산 서열 변이체일 수 있다. 이러한 유도체 및 변이체의 모든 경우에, IL-17 길항제는 상기 분자의 약 50 nM 이하, 약 20 nM 이하, 약 10 nM 이하, 약 5 nM 이하, 약 2 nM 이하, 보다 바람직하게는 약 1 nM 이하의 농도에서 약 1 nM (= 30 ng/ml) 인간 IL-17의 활성을 50% 억제할 수 있고, 상기 억제 활성은 인간 피부 섬유모세포에서 hu-IL-17에 의해 유도되는 IL-6 생성에 대해 측정된다.
IL-17의 그의 수용체에 대한 결합의 억제는 WO 2006/013107에 기재된 바와 같은 검정을 포함하는 다양한 검정에서 편리하게 시험할 수 있다. 용어 "동일한 정도로"는 참조 및 유도체 분자가 통계적 기준으로 본원에 언급되는 검정 중 하나 (WO 2006/013107의 실시예 1 참조)에서 본질적으로 동일한 IL-17 억제 활성을 나타냄을 의미한다. 예를 들어, 본원에 개시된 IL-17 결합 분자는 전형적으로, WO 2006/013107의 실시예 1에 기재된 바와 같이 검정될 때, 상응하는 참조 분자의 IC50의 약 10 nM 미만, 보다 바람직하게는 약 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3, 2, 또는 약 1 nM 미만, 바람직하게는 이와 실질적으로 동일한, 인간 피부 섬유모세포에서 인간 IL-17에 의해 유도되는 IL-6 생성에 대한 인간 IL-17의 억제에 대한 IC50을 갖는다. 대안적으로, 사용된 검정은 가용성 IL-17 수용체 (예를 들어 WO 2006/013107의 실시예 1의 인간 IL-17 R/Fc 구축물) 및 본 개시내용의 IL-17 길항제에 의한 IL-17 결합의 경쟁적 억제의 검정일 수 있다.
본 개시내용은 또한 CDR1, CDR2, CDR3, CDR1-x, CDR2-x, CDR3-x, CDR1', CDR2' 또는 CDR3' 또는 프레임워크의 하나 이상의 아미노산 잔기, 전형적으로는 단지 몇 개 (예를 들어, 1-4개)가 예를 들어 돌연변이, 예를 들어 상응하는 DNA 서열의 부위 지정 돌연변이유발에 의해 변화된 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙)를 포함한다. 본 개시내용은 이러한 변화된 IL-17 길항제를 코딩하는 DNA 서열을 포함한다. 특히, 본 개시내용은 CDR1' 또는 CDR2'의 하나 이상의 잔기가 서열 4 (CDR1'의 경우) 및 서열 5 (CDR2'의 경우)에 나타낸 잔기로부터 변화된 IL-17 결합 분자를 포함한다.
본 개시내용은 또한 인간 IL-17에 대한 결합 특이성을 갖는 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙), 특히 IL-17의 그의 수용체에 대한 결합을 억제할 수 있는 IL-17 항체 및 상기 분자의 약 50 nM 이하, 약 20 nM 이하, 약 10 nM 이하, 약 5 nM 이하, 약 2 nM 이하, 보다 바람직하게는 약 1 nM 이하의 농도에서 1 nM (= 30 ng/ml) 인간 IL-17의 활성을 50% 억제할 수 있는 IL-17 항체 (상기 억제 활성은 인간 피부 섬유모세포에서 hu-IL-17에 의해 유도되는 IL-6 생성에 대해 측정됨)를 포함한다.
일부 실시양태에서, IL-17 결합 분자, 예를 들어 IL-17 항체, 예를 들어 세쿠키누맙은 Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하는 성숙 인간 IL-17의 에피토프에 결합한다. 일부 실시양태에서, IL-17 항체, 예를 들어 세쿠키누맙은 Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 성숙 인간 IL-17의 에피토프에 결합한다. 일부 실시양태에서, IL-17 항체, 예를 들어 세쿠키누맙은 2개의 성숙 IL-17 단백질 쇄를 갖는 IL-17 동종이량체의 에피토프에 결합하며, 여기서 상기 에피토프는 하나의 쇄 상에 Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하고 다른 쇄 상에 Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함한다. 이들 에피토프를 정의하기 위해 사용된 잔기 넘버링 스킴은 성숙 단백질 (즉, 23개 아미노산 N-말단 신호 펩티드가 없고 글리신으로 시작하는 IL-17A)의 첫 번째 아미노산인 잔기 1을 기준으로 한다. 미성숙 IL-17A에 대한 서열은 스위스-프롯 엔트리(Swiss-Prot entry) Q16552에 제시되어 있다. 일부 실시양태에서, IL-17 항체는 약 100-200 pM의 KD를 갖는다. 일부 실시양태에서, IL-17 항체는 약 0.67 nM 인간 IL-17A의 생물학적 활성의 시험관내 중화에 대해 약 0.4 nM의 IC50을 갖는다. 일부 실시양태에서, 피하 (s.c.) 투여된 IL-17 항체의 절대 생체이용률은 약 60 - 약 80% 범위를 가지며, 예를 들어 약 76%이다. 일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체, 예컨대 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 수용체 항체)는 약 4주 (예를 들어, 약 23 내지 약 35일, 약 23 내지 약 30일, 예를 들어 약 30일)의 제거 반감기를 갖는다. 일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체, 예컨대 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 수용체 항체)는 약 7-8일의 Tmax를 갖는다.
개시된 방법, 용도, 키트 등에서 사용하기에 특히 바람직한 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 인간 항체, 특히 WO 2006/013107의 실시예 1 및 2에 기재된 바와 같은 세쿠키누맙이다. 세쿠키누맙은 면역-매개 염증성 상태의 치료에 대해 현재 임상 시험 중인 IgG1/카파 이소형의 재조합 고친화도 완전 인간 모노클로날 항-인간 인터류킨-17A (IL-17A, IL-17) 항체이다. 세쿠키누맙 (예를 들어, WO2006/013107 및 WO2007/117749 참조)은 IL-17에 대해 매우 높은 친화도, 즉 약 100-200 pM의 KD 및 약 0.67 nM 인간 IL-17A의 생물학적 활성의 시험관내 중화에 대한 약 0.4 nM의 IC50을 갖는다. 따라서, 세쿠키누맙은 항원을 약 1:1의 몰비로 억제한다. 상기 높은 결합 친화도는 세쿠키누맙 항체가 치료 용도에 특히 적합하게 한다. 또한, 세쿠키누맙은 매우 긴, 즉 약 4주의 반감기를 갖는 것으로 결정되어 있고, 이를 통해 연장된 투여 간격이 가능하며, 이는 만성의 평생 장애, 예컨대 PsA의 치료 시의 예외적인 특성이다.
개시된 방법, 키트 및 용도에 사용하기 위한 다른 바람직한 IL-17 항체는 미국 특허 번호 8,057,794; 8,003,099; 8,110,191; 및 7,838,638 및 미국 공개 특허 출원 번호 20120034656 및 20110027290에 기재된 것이다.
진단 방법 및 전송가능한 형태의 정보의 생산 방법
개시된 방법은 PsA의 치료, 예방, 또는 개선, 뿐만 아니라 IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙으로의 치료에 대한 PsA 환자의 반응의 가능성을 예측하는데 유용하다. 이들 방법은 특히 환자가 환자로부터의 샘플 내에 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 (또는 부재)를 갖는지를 결정하는데 사용된다.
환자로부터의 생물학적 샘플은 임의의 적용가능한 통상의 수단, 예를 들어 웨스턴 블롯, 면역조직화학, 노던 블롯, ELISA, 질량 분광측정법 (예를 들어, SELDI-TOF, LC, 나노-LC, UV-MALDI), 면역고갈 등에 의해 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (및/또는 후보 PsA 반응 마커)의 존재 또는 부재에 대해 검정될 수 있다. 본 발명은 환자로부터의 생물학적 샘플에서 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (및/또는 후보 PsA 반응 마커)의 존재 또는 부재를 평가하는데 사용된 검정의 유형에 의해 제한되지 않는다. 실제로, 환자로부터의 생물학적 샘플에서 환자의 유전자형 상태 또는 mRNA 또는 단백질의 수준 (적용가능한 경우)을 결정하기 위해 사용될 수 있는 임의의 익히 공지된 검정을 본 발명의 목적을 위해 사용할 수 있다.
다수의 생물학적 샘플, 예를 들어 혈액, 활액, 백혈구 연층, 혈청, 혈장, 림프, 분변, 뇨, 누액, 타액, 뇌척수액, 협측 면봉 채취물, 객담 또는 조직이 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (및/또는 후보 PsA 반응 마커)의 존재 또는 부재를 확인하는데 사용될 수 있기 때문에, 본 발명은 또한 생물학적 샘플의 공급원에 의해 제한되지 않는다. 본 발명은 또한 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (및/또는 후보 PsA 반응 마커)의 존재 또는 부재를 확인하는데 사용되는 생물학적 샘플 내 공급원에 의해 제한되지 않는다. 생물학적 샘플로부터 획득한 게놈 DNA를 검정하여 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자를 검출할 수 있거나, 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 산물, 예를 들어 생물학적 샘플로부터 획득한 핵산 산물 (예를 들어, DNA, 프리-mRNA, mRNA, 마이크로 RNA 등) 및 폴리펩티드 산물 (예를 들어, 발현된 단백질)을 검정할 수 있음이 인지될 것이다.
이전에 기재된 바와 같이, 본 발명자들은 하기를 결정하였다: 1) TRAF3IP2에 연관된 적어도 하나의 rs240993 "T" 대립유전자를 보유하는 PsA 환자는 적어도 하나의 rs240993 "T" 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 감소된 반응을 나타내고; 2) 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하는 PsA 환자는 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타내며; 3) 적어도 하나의 TNFSF15 rs4263839 "A" 대립유전자를 보유하는 PsA 환자는 적어도 하나의 rs4263839 "A" 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타냄. rs240993 SNP 및 rs4263839 SNP는 둘 다 인트론에서 발견되므로, 환자의 대립유전자 상태는, 예를 들어 프리-mRNA 또는 게놈 DNA를 규명함으로써 결정될 수 있다. 그러나, HLA-DRB1*04 대립유전자의 존재 또는 부재는 게놈 DNA, RNA 및/또는 혈청학적 단백질을 검정함으로써 결정될 수 있다. 따라서, 당업자는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 핵산 산물 (예를 들어, DNA 또는 RNA), PsA 반응 대립유전자의 폴리펩티드 산물 (HLA-DRB1*04 대립유전자의 경우), 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 등가 유전자 마커를 검정함으로써 대상체가 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (또는 후보 PsA 반응 마커)를 갖는지 확인할 수 있다는 것을 이해할 것이다. 바람직한 실시양태에서, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 게놈 서열을 분석하여 대상체가 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는지 결정한다.
PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (또는 후보 PsA 반응 마커)의 존재 또는 부재는 당업계에서 일반적으로 사용되는 임의의 다양한 유전자형 결정 기술에 의해 검출될 수 있다. 전형적으로, 이러한 유전자형 결정 기술은 관심 다형성 부위 (예를 들어, SNP)를 함유하거나, 또는 이에 인접한 영역에 상보적인 하나 이상의 올리고뉴클레오티드를 이용한다. 특정한 관심 다형성 부위의 유전자형 결정에 사용되는 올리고뉴클레오티드의 서열은 전형적으로 콘텍스트 서열 또는 참조 서열을 근거로 하여 설계된다.
PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (또는 후보 PsA 반응 마커)의 존재 또는 부재를 확인하기 위한 다수의 방법 및 장치가 당업자에게 익히 공지되어 있다. SNP 검출을 위한 DNA (게놈 및 cDNA)는 당업계에 익히 공지된 방법, 예를 들어 페놀/클로로포름 추출, 겐트라 시스템즈(Gentra Systems)로부터의 퓨어진(PUREGENE) DNA® 정제 시스템 (퀴아젠(Qiagen), 캘리포니아주)에 의해 생물학적 샘플로부터 제조할 수 있다. DNA 서열의 검출은 그 영역 내의 센스 또는 안티센스 가닥에 위치한 뉴클레오티드(들)를 검사하는 것을 포함할 수 있다. 환자에서의 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재는 서열-특이적 프로브, 예를 들어 택맨(Taqman), 비콘스(Beacons), 스코피온스(Scorpions)로부터의 가수분해 프로브; 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자 (또는 후보 PsA 반응 마커)를 검출하는 혼성화 프로브를 이용하여 PCR로부터 획득한 DNA (게놈 또는 cDNA)로부터 검출될 수 있다. SNP의 검출을 위해, 서열 특이적 프로브는 그것이 관심 대립유전자에 대한 게놈 DNA 또는 일부 경우에, 관심 RNA와 특이적으로 혼성화되도록 설계될 수 있다. 예를 들어, rs4263839에 대한 서열 특이적 프라이머 및 프로브는 문헌 [Zucchelli et al. (2011) Gut 60:1671-77]에서 찾을 수 있다. SNP에 대한 다른 프라이머 및 프로브는 www.ncbi.nlm.nih.gov/snp에서 이용가능한 NCBI SNP 데이터베이스에서 발견되는 콘텍스트 서열을 기초로 설계될 수 있다. 이들 프로브는 직접적 검출을 위해 표지될 수 있거나 또는 프로브에 특이적으로 결합하는 제2의 검출가능한 분자에 의해 접촉시킬 수 있다. PCR 생성물은 또한 DNA-결합제에 의해 검출될 수 있다. 이어서, 상기 PCR 생성물을 후속적으로 당업계에서 이용가능한 임의의 DNA 서열분석 방법에 의해 서열분석할 수 있다. 대안적으로 대립유전자의 존재 또는 부재는 임의의 서열분석 방법, 예컨대 비제한적으로 생거(Sanger)-기재 서열분석, 파이로시퀀싱 또는 차세대 서열분석 (문헌 [Shendure J. and Ji, H., Nature Biotechnology (1998), Vol. 26, Nr 10, pages 1135-1145])을 이용한 서열분석에 의해 검출될 수 있다. SNP에 대해 최적화된 대립유전자 식별 검정은 어플라이드 바이오시스템즈(Applied Biosystems) (포스터 시티, 미국 캘리포니아주)로부터 구입할 수 있다.
예를 들어 혼성화-기재 방법, 예컨대 동적 대립유전자-특이적 혼성화 (DASH) 유전자형 결정, 분자 비콘을 통한 SNP 검출 (문헌 [Abravaya K., et al. (2003) Clin Chem Lab Med. 41:468-474]), 루미넥스(Luminex) xMAP 기술, 일루미나 골든 게이트(Illumina Golden Gate) 기술 및 상업적으로 입수가능한 고밀도 올리고뉴클레오티드 SNP 어레이 (예를 들어, 아피메트릭스(Affymetrix) 휴먼 SNP 5.0 진칩(GeneChip)은 500,000개 초과의 인간 SNP의 유전자형 결정을 할 수 있는 전-게놈 검정을 수행함), 일루미나로부터의 비드칩(BeadChip) 키트, 예를 들어 휴먼660W-쿼드 및 휴먼 1.2M-듀오; 효소-기재 방법, 예컨대 제한 단편 길이 다형성 (RFLP), PCR-기재 방법 (예를 들어, 테트라-프라이머 ARMS-PCR), 인베이더(Invader) 검정 (문헌 [Olivier M. (2005) Mutat Res. 573(1-2):103-10)]), 다양한 프라이머 연장 검정 (검출 포맷, 예를 들어 MALDI-TOF 질량 분광측정법, 전기영동, 블롯팅 및 ELISA-유사 방법으로 통합됨), 택맨 검정, 및 올리고뉴클레오티드 리가제 검정; 및 다른 증폭후 방법, 예를 들어 단일 가닥 입체형태 다형성의 분석 (문헌 [Costabile et al. (2006) Hum. Mutat. 27(12):1163-73]), 온도 구배 겔 전기영동 (TGGE), 변성 고성능 액체 크로마토그래피, 고해상도 용융 분석, DNA 미스매치-결합 단백질 검정 (예를 들어, 써무스 아쿠아티쿠스(Thermus aquaticus)로부터의 MutS 단백질은 상이한 단일 뉴클레오티드 미스매치에 상이한 친화도로 결합하여, 미스매치의 6개 세트 모두를 구별하기 위한 모세관 전기영동에 사용될 수 있음), SNPLex® (어플라이드 바이오시스템즈로부터 입수가능한 등록된 SNP 검출 시스템), 모세관 전기영동, 질량 분광측정법, 및 다양한 서열분석 방법, 예를 들어 파이로시퀀싱 및 차세대 서열분석 등을 포함하는 익히 공지된 다양한 기술을 특정한 SNP를 규명하는데 적용할 수 있다. SNP 유전자형 결정을 위한 상업용 키트는, 예를 들어 플루이다임 다이나믹 어레이(Fluidigm Dynamic Array)® IFC (플루이다임), 택맨® SNP 유전자형 결정 검정 (어플라이드 바이오시스템즈), 매스어레이(MassARRAY)® iPLEX 골드 (시쿼놈(Sequenom)), 타입-잇 패스트(Type-it Fast)® SNP 프로브 PCR 키트 (퀴아젠) 등을 포함한다.
일부 실시양태에서, 환자에서의 대립유전자 또는 SNP의 존재 또는 부재는 혼성화 검정을 이용하여 검출된다. 혼성화 검정에서, 유전자 마커의 존재 또는 부재는 상보적 핵산 분자, 예를 들어 올리고뉴클레오티드 프로브에 혼성화하는 샘플로부터의 핵산의 능력을 근거로 하여 결정된다. 다양한 혼성화 검정이 이용가능하다. 일부에서, 관심 서열에 대한 프로브의 혼성화는 결합된 프로브를 시각화함으로써, 예를 들어 노던 또는 서던 검정에 의해 직접적으로 검출된다. 이들 검정에서는, DNA (서던) 또는 RNA (노던)를 단리시킨다. 이어서, DNA 또는 RNA를, 드물게도 검정할 임의의 마커 근처가 아닌 게놈 내에서 절단하는 일련의 제한 효소로 절단한다. 이어서, DNA 또는 RNA를, 예를 들어 아가로스 겔 상에서 분리하고, 막으로 이동시킨다. 예를 들어 방사선뉴클레오티드 또는 결합제 (예를 들어, SYBR® 그린)의 혼입에 의해 표지된 프로브 또는 프로브들을 낮은, 중간 또는 높은 엄격도 조건 하에 막과 접촉시킨다. 비결합 프로브를 제거하고, 표지된 프로브를 시각화함으로써 결합의 존재를 검출한다. 일부 실시양태에서, 어레이, 예를 들어 매스어레이 시스템 (시쿼놈, 미국 캘리포니아주 샌디에고)을 사용하여 대상체의 유전자형 결정을 할 수 있다.
HLA 대립유전자 및 대립유전자 영역을 검정, 검출, 측정, 확인 및/또는 결정하는 다양한 방법이 당업계에 공지되어 있다. HLA-유형 결정은 저, 중등 또는 고해상도로 수행할 수 있다. 저해상도 HLA 유형 결정은 두 자릿수 수준 (예를 들어, HLA-DRB1*04)으로 보고되는 대립유전자를 지칭한다. 환자가 네 자릿수 수준으로 유형 결정되었다 하더라도, 한 수준의 모호성이 존재하는 경우에는 중등 해상도 HLA-유형 결정이 발생한다. 이러한 중등 해상도 유형은, 초기 세트의 PCR 프라이머에 의한 시험이 특정한 사람이 가질 수 있는 가능한 유전자형의 목록을 생성시키는 서열-특이적 PCR (SSP) 기재 유형 결정으로부터 생성될 수 있다 (이는 모호하지 않은 유형이 달성되기 전에 대립유전자-특이적 프라이머의 추가의 조합을 추가로 시험하고/거나 클론을 클로닝 및 서열분석하는 것을 필요로 할 수 있음).　 그러나, HLA 유형 결정의 임상 및/또는 연구 목적에 따라, 추가의 실험실 시험은 고-수준 (즉, 네 자릿수) 해상도를 달성할 수 있다.
저해상도 HLA 유형 결정은 항체-기재 혈청학적 시험에 의해 달성할 수 있다. 더 높은 해상도는 분자 (DNA-기재 방법)로 달성할 수 있다. 이러한 HLA-유형 결정 방법은, 예를 들어 DNA 증폭 기술, 예컨대 PCR 및 그의 변형, 직접 서열분석, 루미넥스 xMAP® 기술과 커플링된 서열 특이적 올리고뉴클레오티드 (SSO) 혼성화, 서열 특이적 프라이머 (SSP) 유형 결정, 서열 기재 유형 결정 (SBT)을 포함한다. 전통적인 유전자형 결정 방법 (예를 들어, HLA 유형 결정에서 사용됨) 또한 SNP 유전자형 결정 또는 PsA 비-반응 대립유전자, PsA 반응 대립유전자 및 특정 후보 PsA 반응 마커의 확인에 사용하기 위해 변형될 수 있다. 이러한 전통적인 방법은, 예를 들어 DNA 증폭 기술, 예컨대 PCR 및 그의 변형, 직접 서열분석, 루미넥스 xMAP® 기술과 커플링된 SSO 혼성화, SSP 결정, 및 SBT를 포함한다.
서열-특이적 올리고뉴클레오티드 (SSO) 유형 결정은 PCR 표적 증폭, 비드 상에 고정화된 서열-특이적 올리고뉴클레오티드의 패널에 대한 PCR 생성물의 혼성화, 색 형성에 의한 프로브-결합 증폭 생성물의 검출 후, 데이터 분석을 이용한다. 당업자는 기재된 서열-특이적 올리고뉴클레오티드 (SSO) 혼성화가 상업적으로 입수가능한 다양한 키트, 예컨대 원 람다, 인크.(One Lambda, Inc.) (카노가 파크, 캘리포니아주)에 의해 제공되는 것 또는 루미넥스® 기술 (루미넥스, 코포레이션, 텍사스주)과 커플링된 라이프코즈(Lifecodes) HLA 유형 결정 키트 (텝넬 라이프 사이언시스 코포레이션(Tepnel Life Sciences Corp.)를 이용하여 수행될 수 있음을 이해할 것이다. 랩타입(LABType)® SSO는 HLA 대립유전자를 확인하기 위해 서열-특이적 올리고뉴클레오티드 (SSO) 프로브 및 색-코딩 마이크로구체를 사용하는 역 SSO (rSSO) DNA 유형 결정 솔루션이다. 표적 DNA를 폴리머라제 연쇄 반응 (PCR)에 의해 증폭시킨 다음, 비드 프로브 어레이와 혼성화시킨다. 검정은 96-웰 PCR 플레이트의 단일 웰에서 수행하는데; 따라서 96개의 샘플을 한번에 처리할 수 있다.
서열 특이적 프라이머 (SSP) 유형 결정은 DNA 기재 HLA 유형 결정을 위한 서열 특이적 프라이머를 사용하는 PCR 기재 기술이다. SSP 방법은 표적 서열과 완전히 매칭되는 서열을 갖는 프라이머만이 제어된 PCR 조건 하에 증폭된 생성물을 생성한다는 원리를 기초로 한다. 대립유전자 서열-특이적 프라이머 쌍은 단일 대립유전자 또는 대립유전자의 군에 대해 특이적인 표적 서열을 선택적으로 증폭시키도록 설계된다. PCR 생성물은 아가로스 겔 상에서 시각화될 수 있다. 모든 샘플에 존재하는 비-대립유전자 서열에 매칭되는 대조 프라이머 쌍은 PCR 증폭의 효율을 입증하기 위한 내부 PCR 대조군으로서 작용한다. 당업자는 기재된 서열-특이적 프라이머 유형 결정에 의한 저, 중등 및 고해상도 유전자형 결정이 상업적으로 입수가능한 다양한 키트, 예컨대 올레럽(Olerup) SSP™ 키트 (올레럽, 펜실베니아주) 또는 (인비트로젠(Invitrogen)) 또는 올셋(Allset) 및 ™골드 DQA1 저해상도 SSP (인비트로젠)를 이용하여 수행될 수 있음을 이해할 것이다.
서열 기재 유형 결정 (SBT)은 PCR 표적 증폭 후, PCR 생성물의 서열분석 및 데이터 분석을 근거로 한다.
일부 경우에서, RNA, 예를 들어 성숙 mRNA, 프리-mRNA가 또한 대립유전자 및 SNP의 존재 또는 부재를 결정하는데 사용될 수 있다. 주어진 유전자로부터 전사된 mRNA 서열의 분석은 노던 블롯 분석, 뉴클레아제 보호 검정 (NPA), 계내 혼성화, 역전사-폴리머라제 연쇄 반응 (RT-PCR), RT-PCR ELISA, 택맨-기재 정량적 RT-PCR (프로브-기재 정량적 RT-PCR) 및 SYBR 그린-기재 정량적 RT-PCR을 포함하지만 이에 제한되지 않는 당업계에 공지된 임의의 방법을 이용하여 수행될 수 있다. 한 예에서, mRNA 수준의 검출은, HLA-DRB1*04 대립유전자에 의해 코딩된 mRNA에 혼성화할 수 있는 올리고뉴클레오티드와 단리된 mRNA를 접촉시키는 것을 포함한다. 핵산 프로브는, 전형적으로 예를 들어 전장 cDNA, 또는 그의 일부, 예컨대 길이가 적어도 7, 15, 30, 50, 또는 100개 뉴클레오티드이고, 엄격한 조건 하에 mRNA와 특이적으로 혼성화하기에 충분한 올리고뉴클레오티드일 수 있다. mRNA와 프로브의 혼성화는 해당 마커가 발현된다는 것을 나타낸다. 한 포맷에서는, RNA를 고체 표면에 고정화시키고, 예를 들어 단리된 RNA를 아가로스 겔 상에서 유동시켜 mRNA를 겔로부터 니트로셀룰로스와 같은 막으로 이동시킴으로써 프로브와 접촉시킨다. 증폭 프라이머는 유전자의 5' 또는 3' 영역 (각각 플러스 및 마이너스 가닥, 또는 그 반대)에 어닐링될 수 있는 핵산 분자의 쌍으로서 정의되고, 중간에 짧은 영역을 함유한다. 일반적으로, 증폭 프라이머는 약 10 내지 30개 뉴클레오티드 길이이고, 약 50 내지 200개 뉴클레오티드 길이의 영역을 플랭킹한다. 적절한 조건 하에 적절한 시약을 사용하면, 이러한 프라이머는 이들에 의해 플랭킹된 뉴클레오티드 서열을 포함하는 핵산 분자의 증폭을 허용한다. PCR 생성물은 겔 전기영동 및 DNA-특이적 염색제로의 염색 또는 표지된 프로브에 대한 혼성화를 포함하지만 이에 제한되지 않는 임의의 적합한 방법에 의해 검출될 수 있다.
한 실시양태에서, 환자에서의 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자의 존재는, 예를 들어 PCR-기반 검정 또는 역전사효소 PCR (RT-PCR)을 이용하여 RNA 수준을 측정함으로써 결정된다. 또 다른 측면에서, 경쟁적 주형의 표준화된 혼합물에 의한 정량적 RT-PCR이 이용될 수 있다.
일부 실시양태에서, 환자에서의 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자의 존재 또는 부재는 HLA-DRB*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물을 분석함으로써 결정될 수 있다. HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물 (HLA-DR4 혈청학적 항원)의 검출은 면역세포화학적 염색, ELISA, 유동 세포측정법, 웨스턴 블롯, 분광광도측정법, HPLC, 및 질량 분광측정법을 포함하지만 이에 제한되지 않는 당업계에 공지된 임의의 방법을 이용하여 수행될 수 있다. 일부 실시양태에서, 혈청학-기재 HLA 유형 결정은 환자의 HLA 유형을 결정하기 위해 항원-특이적 혈청을 이용한다.
샘플에서 HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물을 검출하기 위한 하나의 방법은 마커 단백질과 특이적으로 상호작용할 수 있는 결합 단백질인 프로브에 의한 것이다. 바람직하게는, 표지된 항체, 그의 결합 부분, 또는 다른 결합 파트너가 사용될 수 있다. 항체는 기원이 모노클로날 또는 폴리클로날일 수 있거나, 또는 생합성으로 제조될 수 있다. 결합 파트너는 또한 자연 발생 분자일 수 있거나, 또는 합성으로 제조될 수 있다. 복합체화된 단백질의 양은 당업계에 설명된 표준 단백질 검출 방법론을 이용하여 결정된다. 면역학적 검정 설계, 이론 및 프로토콜에 관한 상세한 리뷰는 문헌 [Practical Immunology, Butt, W. R., ed., Marcel Dekker, New York, 1984]를 비롯한, 당업계의 많은 문서에서 찾을 수 있다. 표지된 항체로 단백질을 검출하는데 다양한 검정이 이용될 수 있다. 직접 표지는 항체에 부착된 형광 또는 발광 태그, 금속, 염료, 방사선핵종 등을 포함한다. 간접 표지는 당업계에 익히 공지된 다양한 효소, 예컨대 알칼리성 포스파타제, 수소 퍼옥시다제 등을 포함한다. 1단계 검정에서는, HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물이 존재하는 경우, 이를 고정화시키고 표지된 항체와 함께 인큐베이션시킨다. 표지된 항체는 고정화된 표적 분자에 결합한다. 세척하여 비결합 분자를 제거한 후, 표지에 대해 샘플을 검정한다.
단백질 또는 폴리펩티드에 특이적인 고정화된 항체의 사용이 또한 본 개시내용에 의해 고려된다. 항체는 다양한 고체 지지체, 예컨대 자성 또는 크로마토그래피 매트릭스 입자, 검정 장소 (예컨대 마이크로타이터 웰)의 표면, 고체 기판 물질 (예컨대 플라스틱, 나일론, 종이)의 조각 등 상에 고정화될 수 있다. 검정 스트립은 어레이 내 항체 또는 복수개의 항체를 고체 지지체 상에 코팅함으로써 제조될 수 있다. 이어서, 이러한 스트립을 시험 샘플에 침지한 다음, 세척 및 검출 단계를 통해 신속하게 처리하여 측정가능한 신호, 예컨대 착색된 점을 생성할 수 있다.
2단계 검정에서는, HLA-DRB1*04 대립유전자의 고정화된 폴리펩티드 산물을 비표지된 항체와 함께 인큐베이션시킬 수 있다. 이어서, 비표지된 항체 복합체가 존재하는 경우, 이를 비표지된 항체에 특이적인 제2의 표지된 항체에 결합시킨다. 샘플을 세척하고, 표지의 존재에 대해 검정한다. 항체를 표지하는데 사용되는 마커의 선택은 적용에 따라 달라질 것이다. 그러나, 마커의 선택은 당업자에게는 용이하게 결정될 수 있다. 항체는 방사성 원자, 효소, 발색 또는 형광 모이어티, 또는 비색 태그로 표지될 수 있다. 태깅 표지의 선택 또한 원하는 검출 한계에 따라 달라질 것이다. 효소 검정 (ELISA)은 전형적으로 효소-태그부착된 복합체의 효소 기질과의 상호작용에 의해 형성된 착색된 생성물의 검출을 허용한다. 방사성 원자의 일부 예는 32P, 125I, 3H, 및 14P를 포함한다. 효소의 일부 예는 양고추냉이 퍼옥시다제, 알칼리성 포스파타제, 베타-갈락토시다제, 및 글루코스-6-포스페이트 데히드로게나제를 포함한다. 발색 모이어티의 일부 예는 플루오레세인 및 로다민을 포함한다. 항체는 당업계에 공지된 방법에 의해 이들 표지에 접합될 수 있다. 예를 들어, 효소 및 발색 분자는 커플링제, 예컨대 디알데히드, 카르보디이미드, 디말레이미드 등에 의해 항체에 접합될 수 있다. 대안적으로, 리간드-수용체 쌍을 통해 접합될 수도 있다. 일부 적합한 리간드-수용체 쌍은, 예를 들어 비오틴-아비딘 또는 -스트렙타비딘, 및 항체-항원을 포함한다.
한 측면에서, 본 개시내용은 생물학적 샘플에서 HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물을 검출하기 위한 샌드위치 기술의 사용을 고려한다. 상기 기술은 관심 단백질에 결합할 수 있는 2개의 항체를 필요로 하며, 예를 들어 1개는 고체 지지체 상에 고정화되고 1개는 용액 중에 유리되지만, 일부 용이하게 검출될 수 있는 화학적 화합물로 표지된다. 제2 항체에 대해 사용될 수 있는 화학적 표지의 예는 방사성동위원소, 형광 화합물, 및 효소, 또는 반응물 또는 효소 기질에 노출 시 착색 또는 전기화학적 활성 생성물을 형성하는 다른 분자를 포함하지만, 이에 제한되지는 않는다. HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물을 함유하는 샘플을 상기 시스템에 넣었을 때, 폴리펩티드 산물은 고정화된 항체 및 표지된 항체 둘 다에 결합한다. 결과물은 지지체 표면 상의 "샌드위치" 면역 복합체이다. 복합체화된 단백질은, 비결합 샘플 성분 및 과량의 표지된 항체를 세척하여 제거하고, 지지체 표면 상의 단백질과 복합체화된 표지된 항체의 양을 측정함으로써 검출된다. 검출 한계가 우수한 표지를 사용한다면, 샌드위치 면역검정은 고도로 특이적이며, 고감도이다.
바람직하게는, 샘플에서의 HLA-DRB1*04 대립유전자의 폴리펩티드 산물의 존재는 방사성면역검정 또는 효소-연결된 면역검정, 경쟁적 결합 효소-연결된 면역검정, 도트 블롯, 웨스턴 블롯, 크로마토그래피, 바람직하게는 고성능 액체 크로마토그래피 (HPLC), 또는 당업계에 공지된 다른 검정에 의해 검출된다. 단백질 또는 폴리펩티드에 대한 항체의 특이적인 면역학적 결합은 직접적으로 또는 간접적으로 검출될 수 있다.
도트 블롯팅은 프로브로서 항체를 사용하여 원하는 단백질을 검출하기 위해 당업자에 의해 일상적으로 실시된다 (문헌 [Promega Protocols and Applications Guide, Second Edition, 1991, Page 263, Promega Corporation]). 샘플을 도트 블롯 장치를 사용하여 막에 적용한다. 표지된 프로브를 막과 함께 인큐베이션시키고, 단백질의 존재를 검출한다.
웨스턴 블롯 분석은 당업자에게 익히 공지되어 있다 (문헌 [Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 1989, Vol. 3, Chapter 18, Cold Spring Harbor Laboratory]). 웨스턴 블롯에서는, 샘플을 SDS-PAGE에 의해 분리한다. 겔을 막으로 이동시킨다. 막을 원하는 단백질의 검출을 위한 표지된 항체와 함께 인큐베이션시킨다.
세포 유형 결정 또한 HLA-유형 결정에 사용될 수 있다. 대표적인 세포 검정은 HLA 부류 II 유형을 결정하는데 사용되는 혼합 림프구 배양 (MLC)이다. 세포 검정은 혈청형 결정보다 HLA 차이를 검출함에 있어 더 민감하다. 이것은 동종항혈청에 의해 인식되지 않는 작은 차이가 T 세포를 자극할 수 있기 때문이다. 상기 유형 결정은 Dw 유형으로 지정된다. 혈청형 DR4는 세포적으로 DR4 Dw4, Dw10, Dw13, Dw14, Dw15로 정의되었다. HLA 유형 결정을 수행하기 위한 다양한 방법의 리뷰는 문헌 [Howell et al. (2009) J Clin Pathol 2010 63: 387-390]에서 찾을 수 있다. HLA 유형 결정을 위한 키트는, 예를 들어 바이오테스트 아게(Biotest AG) (독일 드라이아이히); 퀴아젠 게엠베하(Qiagen GmbH) (독일); 원 람다 인크. (캘리포니아주 카노가 파크); 텝넬 코포레이션 (코네티컷주 스템포드); 올레럽 (펜실베니아주); 루미넥스 코포레이션 (텍사스주 오스틴); 애보트 몰레큘라 (일리노이주) 등으로부터 입수가능하다.
상기 기재된 검정은 이뮤노블롯팅, 면역확산, 면역전기영동, 또는 면역침전을 포함하지만 이에 제한되지 않는 단계를 포함한다. 일부 실시양태에서, 자동 분석기 (예를 들어, PCR 기계 또는 자동 서열분석 기계)가 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자의 존재 또는 부재를 결정하는데 사용된다.
PsA 비-반응 대립유전자, PsA 반응 대립유전자 또는 후보 PsA 반응 마커는 또한, 예를 들어 또 다른 SNP (단일 뉴클레오티드 다형성), 미세부수체 마커, 또 다른 대립유전자 또는 다른 종류의 유전자 다형성일 수 있는 그의 등가 유전자 마커를 검출함으로써 확인될 수 있다. 예를 들어, PsA 비-반응 대립유전자 그 자체가 아니라, PsA 비-반응 대립유전자와 동일한 반수체형 상의 유전자 마커의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 가능성을 나타낼 수 있다. 동일한 염색체 상의 상이한 유전자좌에서의 2개의 특정한 대립유전자는, 하나의 유전자좌에서의 하나의 대립유전자의 존재가 다른 유전자좌에서의 다른 대립유전자의 존재를 예측하는 경향이 있을 경우에 연관 불균형 (LD) 상태인 것으로 언급된다. 본원에서 연관 변이체로 언급되는 이러한 변이체, 또는 프록시 변이체는 보다 우수한 관심 반응 대립유전자와 높은 LD 상태인 임의의 유형의 변이체 (예를 들어, SNP, 삽입 또는 결실)일 수 있다. 후보 연관 변이체는 현재 공지된 다형성의 대립유전자일 수 있다. 다른 후보 연관 변이체는 다형성을 발견하기 위한 당업계에 익히 공지된 임의의 기술을 사용하여 당업자에 의해 용이하게 확인될 수 있다.
관심 대립유전자와 후보 연관 변이체 사이의 LD의 정도는 당업계에 공지된 임의의 LD 측정법을 사용하여 결정될 수 있다. 게놈 영역 내의 LD 패턴은 임의의 2개의 대립유전자 (예를 들어, 상이한 PS에서의 뉴클레오티드들 사이)가 연관 불균형 상태인지를 결정하기 위해 당업계에 공지된 다양한 기술을 사용하여 적절하게 선택된 샘플에서 경험적으로 용이하게 결정된다 (예를 들어, 문헌 [GENETIC DATA ANALYSIS II, Weir, Sineuer Associates, Inc. Publishers, Sunderland, MA 1996] 참조). 당업자는 어떤 LD 결정 방법이 특정한 집단 샘플 크기 및 게놈 영역에 최적일 것인지를 용이하게 선택할 수 있다. 연관 불균형에 대해 가장 빈번하게 사용되는 측정치 중의 하나는 문헌 [Devlin et al., Genomics, 29(2):311-22 (1995)]에 기재된 공식을 사용하여 계산되는 r이다. "r"은 제1 유전자좌에서의 대립유전자 X가 동일한 염색체 상 제2 유전자좌에서의 대립유전자 Y의 발생을 얼마나 잘 예측하는지에 대한 측정치이다. 이 측정치는 오직 예측이 완벽할 때 (예를 들어, Y인 경우에만 X일 때) 1.0에 도달한다.
바람직하게는, 연관 변이체의 유전자좌는 본원에 개시된 다형성 부위 중 하나를 포괄하는 약 200 킬로베이스, 보다 바람직하게는 100 킬로베이스, 보다 바람직하게는 약 10 kb의 게놈 영역 내에 존재한다. 다른 연관 변이체는, 보다 우수한 반응 대립유전자와의 LD가 적합한 참조 집단에서 측정 시 적어도 0.75, 보다 바람직하게는 적어도 0.80, 훨씬 더 바람직하게는 적어도 0.85 또는 적어도 0.90, 보다 더 바람직하게는 적어도 0.95, 가장 바람직하게는 1.0의 r2 값을 갖는 것이다. 상기 r 측정에 대해 사용된 참조 집단은 일반적인 집단, IL-17 길항제를 사용하는 집단, IL-17 길항제가 효능을 보이는 특정한 상태로 진단된 집단 (예컨대 PsA 환자) 또는 그의 구성원이 동일한 민족 군, 예컨대 백인, 아프리카계 미국인, 히스패닉, 라티노, 북미 원주민 등에 속하는 것으로 자가-확인된 집단, 또는 이들 카테고리의 임의의 조합일 수 있다. 바람직하게는, 참조 집단은 IL-17 길항제로 치료되는 환자 집단의 유전적 다양성을 반영한다.
당업자는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 분석이 다른 유전자 서열 (예를 들어, 후보 PsA 반응 마커)을 분석하면서 별개로 또는 동시에 수행될 수 있음을 인식할 것이다. 예를 들어, 당업자는 하나 초과의 PsA 비-반응 대립유전자, 하나 초과의 PsA 반응 대립유전자, 하나 초과의 후보 PsA 반응 마커 및 그의 임의의 조합에 대한 샘플을 분석할 수 있다. 따라서, 본 개시내용의 한 측면에서, 유전자 산물, 예를 들어 게놈 DNA, cDNA, mRNA, cRNA, 폴리펩티드 및 그의 단편에 대해 서열에서 상응하는 프로브가 공지된 위치에서 특이적으로 혼성화되거나 결합될 수 있는 어레이가 제공된다. 이에 따라, 이러한 어레이를 이용하여 환자로부터의 생물학적 샘플을 PsA 비-반응 대립유전자, PsA 반응 대립유전자 및 후보 PsA 반응 마커에 대해 동시에 분석할 수 있다.
PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재를 결정하는데 필요한 본원에 기재된 임의의 방법을 수행함에 있어서, 이러한 결정은 환자가 관심 마커를 갖는지를 결정하기에 충분한 환자의 유전자 조성에 대한 정보를 함유하는 데이터 저장소를 참고함으로써 이루어질 수 있다. 바람직하게는, 데이터 저장소는 개체에 존재하는 (또는 부재하는) 유전자형을 목록화한다. 데이터 저장소는 개체의 환자 기록, 의료 데이터 카드, 컴퓨터로 접근가능한 파일 (예를 들어, 플랫(flat) ASCII 파일) 또는 적절한 정보 또는 유전자 데이터가 저장될 수 있는 다른 전자적 또는 비-전자적 매체를 포함할 수 있다. 본원에 사용된 의료 데이터 카드는 휴대용 저장 장치, 예컨대 자기 데이터 카드, 스마트 카드 (내장된 처리 장치를 갖고 독일 뮌헨의 지멘스(Siemens)와 같은 공급처에 의해 시판됨) 또는 플래시-메모리 카드이다. 데이터 저장소가 컴퓨터로 접근가능한 파일인 경우, 이러한 파일은 서버, 클라이언트, 하드 디스크, CD, DVD, 개인 휴대 정보 단말기, 예컨대 팜 파일럿(Palm Pilot), 테이프, 집 디스크, 컴퓨터 내부 ROM (읽기 전용 메모리) 또는 인터넷 또는 월드와이드 웹을 포함하는 다양한 매체 상에 위치할 수 있다. 컴퓨터로 접근가능한 파일의 저장을 위한 다른 매체는 당업자에게 명백할 것이다.
전형적으로, 일단 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재가 결정되면, 의사 또는 유전학 고문 또는 환자 또는 다른 연구원은 결과를 통지받을 수 있다. 구체적으로, 결과는 다른 연구원 또는 의사 또는 유전학 고문 또는 환자에게 전달 또는 전송될 수 있는 전송가능한 형태의 정보로 보내질 수 있다. 이러한 형태는 다양할 수 있고, 유형 또는 무형일 수 있다. 시험한 개체에서의 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재에 관한 결과는 설명적인 진술, 도표, 사진, 차트, 영상 또는 임의의 다른 시각적인 형태로 구체화될 수 있다. 예를 들어, 결과를 설명하는데 PCR 생성물의 겔 전기영동의 영상이 사용될 수 있다. 변이체가 개체의 대립유전자의 어느 곳에서 발생하는지를 보여주는 도표 또한 시험 결과를 나타내는데 유용하다. 진술 및 시각적인 형태는 유형 매체, 예컨대 종이, 컴퓨터 판독가능 매체, 예컨대 플로피 디스크, 컴팩트 디스크 등, 또는 무형 매체, 예를 들어 이메일 형태의 전자 매체 또는 인터넷 또는 인트라넷 상의 웹사이트에 기록될 수 있다. 또한, 시험한 개체에서의 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재에 관한 결과는 음향 형태로 기록되어 전화, 팩스, 무선 이동 전화, 인터넷 전화 등에 의해 임의의 적합한 매체, 예를 들어 아날로그 또는 디지털 케이블선, 광섬유 케이블 등을 통해서 전송될 수도 있다. 이러한 모든 형태 (유형 및 무형)가 "전송가능한 형태의 정보"를 구성할 것이다. 따라서, 시험 결과에 대한 정보 및 데이터는 세계 어디에서나 생산되어 다른 지역에 전송될 수 있다. 예를 들어, 유전자형 결정 검정을 해외에서 수행할 때, 시험 결과에 대한 정보 및 데이터는 상기 기재된 바와 같은 전송가능한 형태로 생성되어 보내질 수 있다. 이에 따라, 전송가능한 형태의 시험 결과를 미국으로 불러올 수 있다. 따라서, 본 개시내용은 또한 개체에서의 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대한 전송가능한 형태의 정보를 생산하는 방법을 포함한다. 상기 형태의 정보는 IL-17 길항제로의 치료에 대한 PsA를 앓는 환자의 반응성을 예측하는데 유용하다.
PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 PsA를 앓는 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하는 것을 포함하며, 여기서 a) PsA 비-반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 감소된 가능성을 나타내고; b) PsA 반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 증가된 가능성을 나타내는 것인, PsA를 앓는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 가능성을 예측하는 방법이 본원에 개시된다.
일부 실시양태에서, 방법은 검정 단계 전에 수행되는, 환자로부터의 생물학적 샘플을 획득하는 단계를 추가로 포함한다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 PsA 비-반응 대립유전자의 존재에 대해 검정되며, 추가로 여기서 PsA 비-반응 대립유전자는 rs240993 비-반응 대립유전자이다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정되며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 rs4263839 반응 대립유전자이다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정되며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자이다.
상기 방법의 일부 실시양태에서, 관심 대립유전자의 존재 또는 부재는 핵산 산물, 폴리펩티드 산물, 또는 (경우에 따라) 등가 유전자 마커에 대해 생물학적 샘플을 검정함으로써 검출될 수 있다. 관심 대립유전자는 rs240993 비-반응 대립유전자, HLA-DRB1*04 대립유전자 및/또는 rs4263839 반응 대립유전자일 수 있다. 상기 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 IL13 SNP, IL17A SNP, IL23R SNP, IL12B SNP, TNIP1 SNP, TNFAIP3 SNP, STAT2 SNP, SPATA2 SNP, LCE3A SNP, 및 ERAP SNP, TRAF3IP2 SNP, HLA-C 대립유전자, HLA-B 대립유전자, 예를 들어 HLA-C*0602, rs20541, rs1974226, rs11209026, rs2082412, rs17728338, rs610604, rs2066808, rs2201841, rs495337, rs4085613, rs10484554, rs7747909, rs30187, rs27434, rs27524, rs33980500, rs12188300으로 이루어진 군으로부터 선택된 적어도 하나의 후보 PsA 반응 마커 (표 2)의 존재에 대해 추가로 검정된다.
상기 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 활액, 혈액, 혈청, 분변, 혈장, 뇨, 누액, 타액, 뇌척수액, 백혈구 샘플 및 조직 샘플로 이루어진 군으로부터 선택된다. 상기 방법의 일부 실시양태에서, 관심 대립유전자의 존재 (또는 부재)는 노던 블롯 분석, 폴리머라제 연쇄 반응 (PCR), 역전사-폴리머라제 연쇄 반응 (RT-PCR), 택맨-기재 검정, 직접 서열분석, 동적 대립유전자-특이적 혼성화, 고밀도 올리고뉴클레오티드 SNP 어레이, 제한 단편 길이 다형성 (RFLP) 검정, 프라이머 연장 검정, 올리고뉴클레오티드 리가제 검정, 단일 가닥 입체형태 다형성의 분석, 온도 구배 겔 전기영동 (TGGE), 변성 고성능 액체 크로마토그래피, 고해상도 용융 분석, DNA 미스매치-결합 단백질 검정, SNPLex®, 모세관 전기영동, 서던 블롯, 면역검정, 면역조직화학, ELISA, 유동 세포측정법, 웨스턴 블롯, HPLC, 및 질량 분광측정법으로 이루어진 군으로부터 선택된 기술에 의해 검출된다. 검정은 관심 대립유전자의 존재 또는 부재를 결정하는데 사용될 수 있는 임의의 기계인 "자동 분석기"를 사용하여 수행될 수 있다. 예를 들어, PCR 기계, 자동 서열분석기, 분광계, 농도계, 플레이트 판독기, 섬광 계수기 등이 있다.
IL-17 길항제의 치료 방법 및 용도
개시된 방법은 임상의가 AS 환자에 대한 개인맞춤형 요법을 제공하도록 하는데, 즉 이는 IL-17 길항제로 PsA 환자를 치료할지 또는 다른 PsA 작용제 (예를 들어, NSAID, TNF 알파 길항제, DMARDS 또는 코르티코스테로이드)로 PsA 환자를 치료할지의 결정을 가능하게 한다. 이 방식에서, 임상의는 PsA에 걸린 환자의 전체 집단에서 이익을 최대화하고 IL-17 길항작용의 위험을 최소화할 수 있다. IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는, 특히 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않거나 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 PsA 환자에서 PsA의 치료, 예방, 또는 개선 (예를 들어, 징후 및 증상 & 구조 변화, 추가의 관절 미란 예방, 관절 구조 개선 등)에 유용하다는 것을 이해할 것이다.
IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는, 예를 들어 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않거나 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 PsA 환자에서 PsA를 치료, 개선, 또는 예방하기 위해 시험관 내에서, 생체 외에서 사용되거나, 또는 제약 조성물 내에 혼입되어 개체 (예를 들어, 인간 환자)에 생체내 투여될 수 있다. 제약 조성물은 그의 의도되는 투여 경로와 상용성이도록 제제화될 것이다 (예를 들어, 경구 조성물은 일반적으로 불활성 희석제 또는 식용 담체를 포함함). 투여 경로의 다른 비제한적인 예는 비경구 (예를 들어, 정맥내), 피내, 피하, 경구 (예를 들어, 흡입), 경피 (국소), 경점막 및 직장 투여를 포함한다. 각각의 의도되는 경로와 상용성인 제약 조성물은 당업계에 익히 공지되어 있다.
IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 제약상 허용되는 담체와 조합될 때 제약 조성물로서 사용될 수 있다. 이러한 조성물은, IL-17 길항제 뿐만 아니라, 담체, 다양한 희석제, 충전제, 염, 완충제, 안정화제, 가용화제, 및 당업계에 익히 공지된 다른 물질을 함유할 수 있다. 담체의 특징은 투여 경로에 따라 달라질 것이다. 개시된 방법에서 사용하기 위한 제약 조성물은 특정한 표적 장애의 치료를 위한 추가의 치료제를 또한 함유할 수 있다. 예를 들어, 제약 조성물은 항염증제를 또한 포함할 수 있다. 이러한 추가의 인자 및/또는 작용제는 IL-17 결합 분자와의 상승작용 효과를 생성하고, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)에 의해 야기되는 부작용을 최소화하기 위해 제약 조성물에 포함될 수 있다.
개시된 방법에서 사용하기 위한 제약 조성물은 통상의 방식으로 제조할 수 있다. 한 실시양태에서, 제약 조성물은 동결건조 형태로 제공된다. 즉각적인 투여를 위해, 이를 적합한 수성 담체, 예를 들어 주사용 멸균수 또는 멸균 완충 생리 염수에 용해시킨다. 볼루스 주사가 아닌 주입에 의한 투여를 위해 보다 큰 부피의 용액을 제조하는 것이 바람직한 것으로 간주될 경우에는, 인간 혈청 알부민 또는 환자 자신의 헤파린처리 혈액을 제제화 시 염수 내에 혼입하는 것이 유리할 수 있다. 과량의 이러한 생리학상 불활성인 단백질의 존재는 주입 용액과 함께 사용되는 용기 및 관의 벽으로의 흡착에 의한 항체 손실을 방지한다. 알부민이 사용되는 경우, 적합한 농도는 염수 용액의 0.5 내지 4.5 중량%이다. 다른 제제는 액체 또는 동결건조 제제를 포함한다.
항체, 예를 들어 IL-17에 대한 항체는 전형적으로 비경구 투여를 위해 준비된 수성 형태로 또는 투여 전에 적합한 희석제로 재구성하기 위한 동결건조물로서 제제화된다. 개시된 방법 및 용도의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예를 들어 세쿠키누맙은 동결건조물로서 제제화된다. 적합한 동결건조물 제제는 피하 투여를 허용하는 적은 액체 부피 (예를 들어, 2 ml 이하)로 재구성될 수 있고, 낮은 항체 응집 수준을 갖는 용액을 제공할 수 있다. 제약의 활성 성분으로서 항체의 사용은 제품 헤르셉틴(HERCEPTIN)™ (트라스투주맙), 리툭산(RITUXAN)™ (리툭시맙), 시나기스(SYNAGIS)™ (팔리비주맙) 등을 비롯하여 현재 널리 보급되어 있다. 제약 등급으로 항체를 정제하는 기술은 당업계에 익히 공지되어 있다. 치료 유효량의 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)가 정맥내, 피부 또는 피하 주사에 의해 투여될 때, IL-17 길항제는 비경구로 허용되는 발열원 무함유 용액의 형태일 것이다. 정맥내, 피부, 또는 피하 주사를 위한 제약 조성물은 IL-17 길항제 뿐만 아니라, 등장성 비히클, 예컨대 염화나트륨, 링거액, 덱스트로스, 덱스트로스 및 염화나트륨, 락트산 링거액, 또는 당업계에 공지된 다른 비히클을 함유할 수 있다.
적절한 투여량은 물론, 예를 들어 사용되는 특정한 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편), 대상, 투여 방식 및 치료되는 상태의 특성 및 중증도, 및 환자가 이전에 받은 치료의 특성에 따라 달라질 것이다. 궁극적으로는, 담당 의료인이 각각의 개별 환자를 치료하기 위한 IL-17 길항제의 양을 결정할 것이다. 일부 실시양태에서, 담당 의료인은 낮은 용량의 IL-17 길항제를 투여하고 환자의 반응을 관찰할 수 있다. 다른 실시양태에서는, 대상체에게 투여되는 IL-17 길항제의 초기 용량(들)이 높고, 이어서 재발 징후가 발생할 때까지 하향 적정된다. 보다 높은 용량의 IL-17 길항제가 환자에 대해 최적의 치료 효과가 얻어질 때까지 투여될 수 있고, 상기 투여량은 일반적으로 추가로 증가되지 않는다.
본 개시내용의 치료 방법 또는 용도의 일부를 실시하는데 있어서, 치료 유효량의 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)는 환자, 예를 들어 포유동물 (예를 들어, 인간)에 투여된다. 개시된 방법은 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 (또는 부재)에 따른 PsA 환자의 차등 치료를 제공하는 것으로 이해되지만, 이는 환자가 궁극적으로 IL-17 길항제로 치료되는 것인 경우, 이러한 IL-17 길항제 요법이 부득이하게 단독요법인 것을 배제하지 않는다. 실제로, 환자가 IL-17 길항제로의 치료를 위해 선택되는 경우, IL-17 길항제 (예를 들어, 세쿠키누맙)는 단독으로 또는 PsA 환자를 치료하기 위한 다른 작용제 및 요법과 조합하여, 예를 들어 적어도 하나의 추가의 PsA 작용제, 예컨대 면역억제제, 질환-변형 항류마티스성 약물 (DMARD) (예를 들어, MTX), 통증-조절 약물 (예를 들어, 트라마돌 또는 파라세타몰), 스테로이드 (예를 들어, 프레드니손), 비-스테로이드성 항염증 약물 (NSAID), 시토카인 길항제, 골 동화작용제, 골 흡수억제제, 및 그의 조합물 (예를 들어, 이중 및 삼중 요법)과 조합하여 본 개시내용의 방법에 따라 투여될 수 있다. 하나 이상의 추가의 작용제와 공투여되는 경우, IL-17 길항제는 다른 작용제와 동시에 또는 순차적으로 투여될 수 있다. 순차적으로 투여되는 경우에, 담당 의사는 IL-17 길항제를 다른 작용제와 조합하여 투여하는 적절한 순서 뿐만 아니라, 공-전달을 위한 적절한 투여량을 결정할 것이다.
PsA 환자의 치료를 위해 세쿠키누맙과 조합하기에 유용한 비-스테로이드성 항염증 약물 및 통증 조절제는 프로피온산 유도체, 아세트산 유도체, 에놀산 유도체, 페남산 유도체, 콕스 억제제, 예를 들어 루미라콕시브, 이부프로펜, 페노프로펜, 케토프로펜, 플루르비프로펜, 옥사프로진, 인도메타신, 술린닥, 에토돌락, 케토롤락, 나부메톤, 아스피린, 나프록센, 발데콕시브, 에토리콕시브, MK0966; 로페콕시브, 아세토미노펜, 셀레콕시브, 디클로페낙, 트라마돌, 피록시캄, 멜록시캄, 테녹시캄, 드록시캄, 로르녹시캄, 이속시캄, 메파남산, 메클로페남산, 플루페남산, 톨페남산, 발데콕시브, 파레콕시브, 에토돌락, 인도메타신, 아스피린, 이부프로펜, 피로콕시브를 포함한다. PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 AS 환자의 치료를 위해 IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙과 조합하기에 유용한 DMARD는 메토트렉세이트 (MTX), 항말라리아 약물 (예를 들어, 히드록시클로로퀸 및 클로로퀸), 술파살라진, 레플루노미드, 아자티오프린, 시클로스포린, 금 염, 미노시클린, 시클로포스파미드, D-페니실라민, 미노시클린, 아우라노핀, 타크롤리무스, 미오크리신, 클로람부실을 포함한다. PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 PsA 환자의 치료를 위해 IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙과 조합하기에 유용한 스테로이드 (예를 들어, 글루코코르티코이드)는 프레드니솔론, 프레드니손, 덱사메타손, 코르티솔, 코르티손, 히드로코르티손, 메틸프레드니솔론, 베타메타손, 트리암시놀론, 베클로메타손, 플루드로코티손, 데옥시코르티코스테론, 알도스테론을 포함한다.
PsA 환자의 치료를 위해 IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙과 조합하기에 유용한 생물학적 작용제는 아달리무맙 (휴미라(Humira)®), 에타네르셉트 (엔브렐(Enbrel)®), 인플릭시맙 (레미케이드(Remicade)®; TA-650), 세르톨리주맙 페골 (심지아(Cimzia)®; CDP870), 골리무맙 (심포니(Simponi)®; CNTO148), 아나킨라 (키네레트(Kineret)®), 리툭시맙 (리툭산®; 맙테라(MabThera)®), 아바타셉트 (오렌시아(Orencia)®), 토실리주맙 (로악템라(RoActemra)/악템라(Actemra)®), 인테그린 길항제 (티사브리(TYSABRI)® (나탈리주맙)), IL-1 길항제 (ACZ885 (일라리스(Ilaris)), 아나킨라 (키네레트®)), CD4 길항제, 추가의 IL-17 길항제 (LY2439821, RG4934, AMG827, SCH900117, R05310074, MEDI-571, CAT-2200), IL-23 길항제, IL-20 길항제, IL-6 길항제, TNF 알파 길항제 (예를 들어, TNF 알파 길항제 또는 TNF 알파 수용체 길항제, 예를 들어 페그수네르셉트 등), BLyS 길항제 (예를 들어, 아타시셉트, 벤리스타(Benlysta)®/ 림포스타트-B(LymphoStat-B)® (벨리무맙)), P38 억제제, CD20 길항제 (오크렐리주맙, 오파투무맙 (아르제라(Arzerra)®)), 인터페론 감마 길항제 (폰톨리주맙)를 포함한다.
IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙은 비경구로, 정맥내로, 예를 들어 전주 정맥 또는 다른 말초 정맥으로, 근육내로, 또는 피하로 편리하게 투여된다. 본 개시내용의 제약 조성물을 사용하는 정맥내 (i.v.) 요법의 지속기간은 치료되는 질환의 중증도 및 각각의 개별 환자의 상태 및 개인적인 반응에 따라 달라질 것이다. 본 개시내용의 제약 조성물을 사용하는 피하 (s.c.) 요법이 또한 고려된다. 의료인은 본 개시내용의 제약 조성물을 사용하는 i.v. 또는 s.c. 요법의 적절한 지속 기간 및 요법의 투여 시기를 결정할 것이다.
PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않거나 PsA 반응 대립유전자를 갖는 PsA 환자를 치료하기 위한 바람직한 투여 및 치료 요법 (유도 및 유지 요법 둘 다 포함)은 그 전문이 본원에 참조로 포함되는 PCT 출원 번호 PCT/US2011/064307에 제공되어 있다.
특정 환자, 예를 들어 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)로의 치료에 대해 불충분한 반응을 나타내는 환자에 대해서는 (예를 들어, 유도 및/또는 유지 단계 동안) 용량 증량이 필요할 수 있음이 이해될 것이다. 따라서, 세쿠키누맙의 s.c. 투여량은 약 75 mg 내지 약 300 mg 초과 s.c., 예를 들어 약 80 mg, 약 100 mg, 약 125 mg, 약 175 mg, 약 200 mg, 약 250 mg, 약 350 mg, 약 400 mg 등일 수 있고; 유사하게, i.v. 투여량은 약 10 mg/kg 초과, 예를 들어 약 11 mg/kg, 12 mg/kg, 15 mg/kg, 20 mg/kg, 25 mg/kg, 30 mg/kg, 35 mg/kg 등일 수 있다. 또한, 특정 환자, 예를 들어 IL-17 길항제 (예를 들어, 세쿠키누맙)로의 치료에 대해 유해 사례 또는 유해 반응을 나타내는 환자에 대해서는 (예를 들어, 유도 및/또는 유지 단계 동안) 용량 감소가 필요할 수 있음이 이해될 것이다. 따라서, 세쿠키누맙의 투여량은 약 75 mg 미만 내지 약 300 mg s.c., 예를 들어 약 25 mg, 약 50 mg, 약 80 mg, 약 100 mg, 약 125 mg, 약 175 mg, 약 200 mg, 250 mg 등일 수 있고; 유사하게, i.v. 투여량은 약 10 mg/kg 미만, 예를 들어 약 9 mg/kg, 8 mg/kg, 5 mg/kg, 4 mg/kg, 3 mg/kg, 2 mg/kg, 1 mg/kg 등일 수 있다.
a) PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는 b) PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하는 것을 포함하는, PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
a) HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는 b) HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하는 것을 포함하는, PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
a) rs4263839 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는 b) rs4263839 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하는 것을 포함하는, PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
a) rs240993 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는 b) rs240993 비-반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하는 것을 포함하는, PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, PsA 작용제는 NSAID, TNF 알파 길항제, 술파살라진, 메토트렉세이트, 코르티코스테로이드 및 그의 조합물로 이루어진 군으로부터 선택된다.
a) PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제로의 치료를 위한 PsA를 앓는 환자를 선택하고; b) 그 후에, IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 투여하는 것을 포함하는, IL-17 길항제로 PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
a) PsA 반응 대립유전자 또는 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 PsA를 앓는 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하고; b) 그 후에, i. PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는 ii. PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하는 것을 포함하는, IL-17 길항제로 PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
a) PsA 반응 대립유전자 또는 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 PsA를 앓는 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하고; b) 그 후에, PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 IL-17 길항제로의 치료를 위한 환자를 선택하고; c) 그 후에, IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 투여하는 것을 포함하는, IL-17 길항제로 PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법이 본원에 개시된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자는, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 핵산 산물, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 폴리펩티드 산물, 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 등가 유전자 마커에 대해 생물학적 샘플을 검정함으로써 검출된다. 개시된 방법의 일부 실시양태에서, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자는, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 게놈 서열에 대해 생물학적 샘플을 검정함으로써 검출된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 PsA 비-반응 대립유전자의 존재에 대해 검정되며, 추가로 여기서 PsA 비-반응 대립유전자는 rs240993 비-반응 대립유전자이다. 개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정되며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 rs4263839 반응 대립유전자이다. 개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정되며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자이다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 환자는 이전에 PsA에 대해 치료받지 않았거나 또는 TNF 알파 길항제 경험이 없다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 HLA-C*0602, rs20541, rs1974226, rs11209026, rs2082412, rs17728338, rs610604, rs2066808, rs2201841, rs495337, rs4085613, rs10484554, rs7747909, rs30187, rs27434, rs27524, rs33980500, 및 rs12188300으로 이루어진 군으로부터 선택된 적어도 하나의 후보 PsA 반응 마커의 존재에 대해 추가로 검정된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 생물학적 샘플은 활액, 혈액, 혈청, 분변, 혈장, 뇨, 누액, 타액, 뇌척수액, 백혈구 샘플 및 조직 샘플로 이루어진 군으로부터 선택된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 적어도 하나의 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재는 노던 블롯 분석, 폴리머라제 연쇄 반응 (PCR), 역전사-폴리머라제 연쇄 반응 (RT-PCR), 택맨-기재 검정, 직접 서열분석, 동적 대립유전자-특이적 혼성화, 고밀도 올리고뉴클레오티드 SNP 어레이, 제한 단편 길이 다형성 (RFLP) 검정, 프라이머 연장 검정, 올리고뉴클레오티드 리가제 검정, 단일 가닥 입체형태 다형성의 분석, 온도 구배 겔 전기영동 (TGGE), 변성 고성능 액체 크로마토그래피, 고해상도 용융 분석, DNA 미스매치-결합 단백질 검정, SNPLex® 모세관 전기영동, 서던 블롯, 면역검정, 면역조직화학, ELISA, 유동 세포측정법, 웨스턴 블롯, HPLC, 및 질량 분광측정법으로 이루어진 군으로부터 선택된 기술에 의해 검출된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 투여 단계는 약 10 mg/kg의 IL-17 길항제의 2 또는 3회 용량을 상기 환자에게 정맥내 투여하는 것을 포함하고, 각각의 상기 용량은 격주로 투여된다.
개시된 방법의 일부 실시양태에서, 투여 단계는 약 75 mg 내지 약 300 mg의 IL-17 길항제를 매주, 월 2회 (격주로), 매달, 2개월마다 또는 3개월마다 환자에게 피하 투여하는 것을 포함한다.
IL-17 길항제의 치료 유효량이 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여되는 것을 특징으로 하는, PsA를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제가 본원에 개시된다.
개시된 용도의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제의 치료 유효량은 rs4263839 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여된다.
개시된 용도의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제의 치료 유효량은 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여된다.
개시된 용도의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제의 치료 유효량은 rs240993 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여된다.
a) IL-17 길항제로의 치료를 위한 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 선택되고; b) 그 후에, IL-17 길항제의 치료 유효량이 환자에게 투여되는 것을 특징으로 하는, PsA를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제가 본원에 개시된다.
a) 생물학적 샘플이 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 검정되고; b) IL-17 길항제의 치료 유효량이 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 환자에게 선택적으로 투여되는 것을 특징으로 하는, PsA를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제가 본원에 개시된다.
a) 생물학적 샘플이 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 검정되고; b) IL-17 길항제로의 치료를 위한 PsA 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 선택되고; c) IL-17 길항제의 치료 유효량이 PsA 환자에게 선택적으로 투여되는 것을 특징으로 하는, PsA 환자를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제가 본원에 개시된다.
개시된 용도의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제는 약 10 mg/kg의 3회 용량으로 그를 필요로 하는 PsA 환자에게 정맥내 투여되고, 각각의 3회 용량은 격주로 전달된다.
개시된 용도의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제는 약 75 mg 내지 약 300 mg의 용량으로 매주, 월 2회 (격주로), 매달, 2개월마다 또는 3개월마다 PsA 환자에게 피하 투여 된다.
PsA를 앓는 환자를 치료하는데 사용하기 위한 의약의 제조에 사용하기 위한 IL-17 길항제가 본원에 개시되며, 여기서 환자는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 것을 근거로 하여 치료를 위해 선택되거나 또는 환자는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 것을 근거로 하여 치료를 위해 선택된다.
PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 것을 특징으로 하는 환자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 것을 특징으로 하는 환자에서의 PsA의 치료를 위한 의약의 제조를 위한 IL-17 길항제가 본원에 개시되며, 여기서 의약은 용기를 포함하도록 제제화되고, 각 용기는 단위 용량 당 적어도 약 75 mg 내지 약 150 mg의 IL-17 길항제를 전달하기에 충분한 양의 IL-17 길항제; 또는 단위 용량 당 적어도 약 10 mg의 IL-17 길항제/환자 중량 kg을 전달하기에 충분한 양의 IL-17 길항제를 갖는다. PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 것을 특징으로 하는 환자 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 것을 특징으로 하는 환자에서의 PsA의 치료를 위한 의약의 제조를 위한 IL-17 길항제가 본원에 또한 개시되며, 여기서 의약은 단위 용량 당 약 10 mg의 IL-17 길항제/환자 중량 kg을 정맥내 전달하거나; 또는 단위 용량 당 약 75 mg 내지 약 150 mg의 IL-17 길항제를 피하 전달하기 위한 투여량으로 제제화된다.
환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는지 결정하거나 또는 환자가 적어도 하나의 PsA 반응 대립유전자를 갖는지 결정하는 것을 포함하며, 여기서 환자는 하기 요법: a) 약 10 mg/kg의 IL-17 길항제의 3회 용량을 각각의 상기 용량이 격주로 전달되도록 환자에게 투여하고; a) 그 후에, 약 75 mg 내지 약 300 mg의 IL-17 길항제를 제8주 중에 시작하여, 월 2회, 매달, 2개월마다 또는 3개월마다 환자에게 투여하는 것에 대해 개선된 치료 반응을 갖는 것인, IL-17 길항제를 이용한 PsA의 치료를 위해 환자를 선택하는 시험관내 시험 방법이 본원에 개시된다.
환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는지 결정하거나 또는 환자가 적어도 하나의 PsA 반응 대립유전자를 갖는지 결정하는 것을 포함하며, 여기서 환자는 하기 요법: a) 약 75 mg 내지 약 300 mg의 IL-17 길항제의 5회 용량을 각각의 상기 용량이 매주 전달되도록 환자에게 투여하고; b) 그 후에, 약 75 mg 내지 약 300 mg의 IL-17 길항제를 제8주 중에 시작하여, 월 2회, 매달, 2개월마다 또는 3개월마다 환자에게 투여하는 것에 대해 개선된 치료 반응을 갖는 것인, IL-17 길항제를 이용한 PsA의 치료를 위해 환자를 선택하는 시험관내 시험 방법이 본원에 개시된다.
PsA 환자로부터 획득한 생물학적 샘플에서 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재에 관한 데이터를 취득하고; 선택적으로 환자가 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 경우 치료 유효량의 IL-17 길항제를 환자에게 투여하거나, 또는 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 경우 치료 유효량의 IL-17 길항제를 PsA 환자에게 투여하는 것을 포함하는, PsA 환자를 치료하는 방법이 또한 본원에 개시된다. 어구 "데이터 취득"은 임의의 이용가능한 수단, 예를 들어 구두로, 전자적으로 (예를 들어, 전자 우편, 디스켓 상 암호화 또는 다른 매체에 의해), 서면 등에 의한 정보 소유물의 획득을 의미하는데 사용된다.
상기 방법의 일부는 검정 단계 전에 환자로부터 생물학적 샘플을 획득하는 단계를 추가로 포함한다.
본원에 사용된 어구 "[지정된 용량]을 전달하기에 충분한 양의 IL-17 길항제를 갖는 용기"는 주어진 용기 (예를 들어, 바이알, 펜, 시린지)가 목적하는 용량을 제공하기 위해 사용될 수 있는 부피의 IL-17 길항제 (예를 들어, 제약 조성물의 일부로서)를 그 안에 보유함을 의미하기 위해 사용된다. 예로서, 목적하는 용량이 75 mg이면, 임상의는 25 mg/ml의 농도로 IL-17 항체 제제를 함유하는 용기로부터 3 ml, 37.5 mg/ml의 농도로 IL-17 항체 제제를 함유하는 용기로부터 2 ml, 75 mg/ml의 농도로 IL-17 항체 제제를 함유하는 용기로부터 1 ml, 150 mg/ml의 농도로 IL-17 항체 제제를 함유하는 용기로부터 0.5 ml 등을 사용할 수 있다. 상기 경우 각각에서, 이들 용기는 목적하는 75 mg 용량을 전달하기에 충분한 양의 IL-17 길항제를 갖는다.
본원에 사용된 어구 "[지정된 용량]을 [투여 경로]로 전달하기 위한 투여량으로 제제화된"은 주어진 제약 조성물이 지정된 투여 경로 (예를 들어, s.c. 또는 i.v.)를 통해 목적하는 용량의 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 항체, 예를 들어 세쿠키누맙을 제공하기 위해 사용될 수 있음을 의미하기 위해 사용된다. 예로서, 목적하는 피하 용량이 75 mg이면, 임상의는 37.5 mg/ml의 농도를 갖는 IL-17 항체 제제의 2 ml, 75 mg/ml의 농도를 갖는 IL-17 항체 제제의 1 ml, 150 mg/ml의 농도를 갖는 IL-17 항체 제제의 0.5 ml 등을 사용할 수 있다. 상기 경우 각각에서, 이들 IL-17 항체 제제는 IL-17 항체를 피하 전달하기에 충분한 고농도로 존재한다. 피하 전달은 전형적으로 약 2 ml 미만의 부피, 바람직하게는 약 1 ml 이하의 부피의 전달을 필요로 한다.
키트
본 발명은 또한 환자로부터의 생물학적 샘플 (시험 샘플)에서 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자를 검출하기 위한 키트를 포함한다. 이러한 키트는 PsA를 앓는 환자가 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편)로의 치료에 반응할 가능성을 갖는지 (또는 더 높은 반응성을 갖는지) 예측하는데 사용될 수 있다. 예를 들어, 키트는 생물학적 샘플에서 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 (또는 부재), 그 대립유전자의 산물 및/또는 그 대립유전자의 등가 유전자 마커를 검출할 수 있는 프로브 (예를 들어, 올리고뉴클레오티드, 항체, 표지된 화합물 또는 기타 작용제)를 포함할 수 있다. 키트는 또한 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 가능성의 예측을 제공하기 위한 지침서를 포함할 수 있으며, 여기서 PsA 비-반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 감소된 가능성을 나타내고, PsA 반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 증가된 가능성을 나타낸다.
프로브는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 핵산 산물, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 폴리펩티드 산물, 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 등가 유전자 마커를 코딩하는 핵산의 영역과 (경우에 따라) 특이적으로 혼성화할 수 있다. 예시적인 프로브는 rs240993 또는 rs4263839 다형성 부위와 특이적으로 혼성하거나 HLA-DRB1*04 대립유전자를 인식하는 올리고뉴클레오티드 또는 접합된 올리고뉴클레오티드; 또 다른 프라이머와 함께 rs240993, rs4263839 다형성 부위 또는 HLA-DRB1*04 대립유전자 (예를 들어, DNA, cDNA, mRNA 등으로부터의 것)를 증폭시키기 위한 PCR 프라이머; 개시된 대립유전자에 의해 코딩된 폴리펩티드 산물을 분별할 수 있는 항체 (예를 들어, HLA-DR4 혈청학적 항원에 결합할 수 있는 항체), 프라이머-연장 올리고뉴클레오티드, 대립유전자-특이적 프라이머, 대립유전자-특이적 프라이머의 조합, 대립유전자-특이적 프로브, 및 프라이머 연장 프라이머 등이다. 임의로, 키트는 일반적인 집단에서 나타나는 임의의 대립유전자일 수 있는 내부 대조군 대립유전자를 표적으로 하는 프로브를 함유할 수 있다. 내부 대조군 대립유전자의 검출은 키트의 성능을 보증하도록 설계된다. 개시된 키트는 또한, 예를 들어 완충제, 보존제 또는 단백질 안정화제를 포함할 수 있다. 키트는 또한 검출가능한 작용제를 검출하는데 필요한 성분 (예컨대, 효소 또는 기질)을 포함할 수 있다. 키트는 또한, 검정될 수 있고 함유된 시험 샘플과 비교될 수 있는 대조군 샘플 또는 일련의 대조군 샘플을 함유할 수 있다. 키트의 각 성분은 일반적으로 개별 용기 내에 포함되어 있고, 다양한 용기들 모두는 사용 지침서와 함께 단일 패키지 내에 있다.
이러한 키트는 또한 IL-17 길항제, 예를 들어 IL-17 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편, 예를 들어 세쿠키누맙) 또는 IL-17 수용체 결합 분자 (예를 들어, IL-17 항체 또는 그의 항원 결합 단편) (예를 들어, 액체 또는 동결건조 형태) 또는 IL-17 길항제 (상기 기재됨)를 포함하는 제약 조성물을 포함할 수 있다. 추가로, 이러한 키트는 IL-17 길항제를 투여하기 위한 수단 (예를 들어, 시린지 및 바이알, 미리충전한 시린지, 미리충전한 펜) 및 사용 지침서를 포함할 수 있다. 이들 키트는, 예를 들어 포함된 IL-17 길항제, 예를 들어 세쿠키누맙과 조합하여 전달하기 위한, PsA를 치료하기 위한 추가의 치료제 (상기 기재됨)를 함유할 수 있다.
어구 "투여하기 위한 수단"은 미리충전한 시린지, 바이알 및 시린지, 주사펜, 자동주사기, i.v. 점적백, 펌프 등을 포함하지만 이에 제한되지 않는, 약물을 환자에게 전신 투여하기 위한 임의의 이용가능한 도구를 나타내기 위해 사용된다. 이러한 물품에 의해, 환자가 약물을 자가-투여 (즉, 그 자신을 위해 약물을 투여)할 수 있거나, 또는 의사가 약물을 투여할 수 있다.
일반사항
상기-언급한 방법, 치료 요법, 키트, 용도, 및 제약 조성물에서, 당업자는 더 많은 마커를 분석할 수도 있음을 이해할 것이다. 예를 들어, 임상의는 단일 환자에서 TRAF3IP2 SNP, TNFSF15 SNP, HLA-DRB1*04 대립유전자, 및 이들의 조합을 분석하는 것을 선택할 수 있다는 것이 구상된다. 일부 실시양태에서는, 훨씬 더 많은 바이오마커의 조합, 예를 들어 추가의 유전자 마커 (후보 PsA 반응 마커), 전사 마커 (예를 들어, 혈액, PBMC, 생검 등으로부터 유래한 mRNA/miRNA), 및 단백질 및 세포 마커 (예를 들어, 혈청 또는 분변에서의 단백질 바이오마커 및 Th17 및 Treg 세포)를 분석할 수 있다.
개시된 방법, 치료, 요법, 용도 및 키트의 일부 실시양태에서, IL-17 길항제는 IL-17 결합 분자 또는 IL-17 수용체 결합 분자이다. 개시된 방법, 치료, 요법, 용도 및 키트의 일부 실시양태에서, IL-17 결합 분자 또는 IL-17 수용체 결합 분자는 IL-17 결합 분자이다.
개시된 방법, 치료, 요법, 용도 및 키트의 일부 실시양태에서, IL-17 결합 분자는 a) Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하는 IL-17의 에피토프에 결합하는 IL-17 항체; b) Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 IL-17의 에피토프에 결합하는 IL-17 항체; c) 2개의 성숙 IL-17 단백질 쇄를 갖는 IL-17 동종이량체의 에피토프에 결합하며, 여기서 상기 에피토프는 하나의 쇄 상에 Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하고 다른 쇄 상에 Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 것인 IL-17 항체; d) 2개의 성숙 IL-17 단백질 쇄를 갖는 IL-17 동종이량체의 에피토프에 결합하며, 여기서 상기 에피토프는 하나의 쇄 상에 Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하고 다른 쇄 상에 Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 것인 IL-17 항체 (여기서 IL-17 결합 분자는 약 100-200 pM의 KD 및 약 23 내지 약 35일의 생체내 반감기를 가짐); 및 e) i) PsA 서열 8로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 중쇄 가변 도메인 (VH); ii) PsA 서열 10으로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 경쇄 가변 도메인 (VL); iii) PsA 서열 8로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 PsA 서열 10으로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; iv) PsA 서열 1, 서열 2 및 서열 3으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인; v) PsA 서열 4, 서열 5 및 서열 6으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; vi) PsA 서열 11, 서열 12 및 서열 13으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인; vii) PsA 서열 1, 서열 2 및 서열 3으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 PsA 서열 4, 서열 5 및 서열 6으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; 및 viii) PsA 서열 11, 서열 12 및 서열 13으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 PsA 서열 4, 서열 5 및 서열 6으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인으로 이루어진 군으로부터 선택된 항체를 포함하는 IL-17 항체로 이루어진 군으로부터 선택된다.
개시된 방법, 치료, 요법, 용도 및 키트의 일부 실시양태에서, IL-17 결합 분자는 항체이다.
개시된 방법, 치료, 요법, 용도 및 키트의 일부 실시양태에서, 항체는 세쿠키누맙이다.
본 개시내용의 하나 이상의 실시양태의 세부사항은 상기 수반된 상세한 설명에 기재된다. 본원에 기재된 것과 유사하거나 동등한 임의의 방법 및 물질을 본 개시내용의 실시 또는 시험에서 사용할 수 있지만, 바람직한 방법 및 물질은 이제 설명된다. 본 개시내용의 다른 특성, 목적, 및 이점은 상세한 설명 및 특허청구범위로부터 명백해질 것이다. 명세서 및 첨부된 특허청구범위에서, 단수형은 문맥에서 달리 명백히 설명되지 않는 한, 복수 지시대상을 포함한다. 달리 정의되지 않는 한, 본원에 사용된 모든 전문 과학 용어는 본 개시내용이 속하는 분야의 당업자가 일반적으로 이해하는 것과 동일한 의미를 갖는다. 본 명세서에 언급된 모든 특허 및 공보는 참조로 포함된다. 하기 실시예는 본 개시내용의 바람직한 실시양태를 보다 충분히 예시하기 위해 제시된다. 이들 실시예는 첨부된 특허청구범위에 의해 정의되는 바와 같은, 개시된 특허 내용의 범위를 제한하는 것으로 해석되어서는 결코 안 된다.
실시예
실시예 1: 개념 증명 PSA 시험 CAIN4572206
실시예 1.1 - 연구 설계 CAIN4572206
이는 임상 시험에 대해 현재 지지되는 분류 기준 (CASPAR)을 기초로 한, 활성 PsA로 진단된 환자의 치료를 위한 10 mg/kg AIN457의 다중 용량 (3주 간격으로 2회 주입)의 무작위, 이중-맹검, 위약 대조군, 다기관 개념 증명 연구였다. 시험의 개략도는 도 1에 나타낸다. 하기 기준을 만족하는 중등도 내지 중증 건선성 관절염 환자를 등록하였다: (i) 건선성 관절염의 진단에 대한 CASPAR 기준 (문헌 [Taylor Wet al (2006) Arthritis Rheum 54:2665-73]); 적어도 3곳의 말초 관절의 종창 및 압통이라는 변형 포함, (ii) PGA ≥ 40, (iii) 염증성 통증 ≥ 40; (iv) 질환이 적어도 3개월 동안 최대 허용 용량으로 주어진 적어도 하나의 DMARD 상에서 불충분하게 제어됨; (v) RF ≤ 100 IU 및 음성 CCP ELISA 시험. 효능 평가는 OMERACT 8 컨센서스에 따라 검증된 하기 평가 항목을 기초로 하였다: 1. 말초 관절 포함 (68/68 관절수를 갖는 ACR 반응 기준, 관절수, 즉 78/76 관절수에 포함되는 DIP 관절을 갖는 PsARC (문헌 [Clegg et al (1996) Arthritis Rheum 39:2013-20])); DAS28; 2. 피부 평가 (PASI 스코어) (문헌 [Feldman and Krueger (2005) Ann. Rheum. Dis. 64:ii65-ii68]); 3. 통증 (VAS); 4. 기능: SF36 물리적 성분; 5. VAS에 의한 환자 종합 평가 (PGA); 및 6. HAQ
압통 78-관절수 및 종창 76-관절수
발의 원위지골간 관절 및 손의 수근중수골 관절을 68개 압통 및 66개 종창 관절의 통상의 ACR 관절수에 추가하여, 각각 78개 및 76개 관절수를 생성하였다. 따라서, 압통에 대해 평가되는 관절은 손의 원위지골간, 근위지골간 및 중수지절 관절, 및 발의 중족지절 관절, 수근중수골 및 손목 관절 (별개로 계산함), 팔꿈치, 어깨, 견쇄, 흉쇄, 엉덩이, 무릎, 거경골, 및 중족골 관절을 포함하였다. 엉덩이를 제외한 이들 모두를 종창에 대해 평가한다. 관절 압통 및 종창은 존재 (1) 또는 부재 (0)로 등급을 매긴다. ACR 스코어링 시스템에서의 다른 개별적 요소, 환자 통증의 VAS 스코어, 환자 종합, 의사 종합, 건강 평가 설문지 (HAQ), 및 급성기 반응물인 C-반응성 단백질 (CRP) 또는 적혈구 침강 속도 (ESR)는 그들이 류마티스 관절염의 표준 시험에서 사용되는 방식으로부터 변화시키지 않는다. ACR 20, 50 또는 70 반응을 달성하기 위해서는, 압통 및 종창 관절수, 및 5개의 개별적 요소 스코어 (환자 통증의 VAS 스코어, 의사 및 환자 종합 평가, 장애 측정치 (HAQ) 및 급성기 반응물 (ESR 또는 CRP)) 중 3개에서 각각 20%, 50% 또는 70% 이상 개선되어야 한다.
ACR 및 PsARC에 더하여, DAS28은 압통 및 종창에 대한 하기 28개 관절의 평가에 기초하여 계산한다: 중수지절 I-V (10), 엄지 지골간 (2), 손 근위지골간 II-V (8), 손목 (2), 팔꿈치 (2), 어깨 (2), 및 무릎 (2).
ACR20, ACR50, ACR70 반응자 정의
대상체가 하기 3가지 조건을 만족할 때만 ACR20 반응자로 정의된다: 1. 그들은 (68개 관절을 기준으로 할 때) 압통 관절의 수에서 20% 이상의 개선을 가지고; 2. 그들은 (66개 관절을 기준으로 할 때) 종창 관절의 수에서 20% 이상의 개선을 가지며; 3. 그들은 하기 5개 항목 중 3개에서 20% 이상의 개선을 가진다:
· 환자 종합 평가 (VAS 스케일 0-100으로 측정)
· 의사 종합 평가 (VAS 스케일 0-100으로 측정)
· 통증 (VAS 스케일 0-100으로 측정)
· 장애 (건강 평가 설문지에 의해 측정)
· 급성기 반응물 (CRP에 의해 측정)
ACR50 및 ACR70 반응자는 유사한 방식으로, 각각 50% 이상 및 70% 이상의 개선으로 정의된다.
PsARC 반응자 정의
대상체가 하기 4개 인자 중 2개 (적어도 1개의 인자는 관절수임)에서 개선을 갖고 나머지 인자에서 악화를 갖지 않을 때만 PsARC 반응자로 정의된다:
· 환자 종합 평가 (0-100 VAS 스케일, 개선은 적어도 20 단위 감소로 정의됨)
· 의사 종합 평가 (0-100 VAS 스케일, 개선은 적어도 20 단위 감소로 정의됨)
· 압통 78-관절수 (개선은 적어도 30% 감소로 정의됨)
· 종창 76-관절수 (개선은 적어도 30% 감소로 정의됨)
각각의 4개 반응자 정의를 만족하는 대상체의 비율을 치료군 및 시점에 의해 요약할 것이다. 시간의 경과에 따른 이들 비율의 플롯을 나타낼 것이다.
DAS28 스코어
DAS28 스코어는 하기 식을 이용하여 유도할 것이다:
DAS28 = 0.56*√(압통28) + 0.28√(종창28) + 0.36*loge(CRP + 1) + 0.014*GH + 0.96,
여기서 압통28 = 압통 관절수 (28개 관절을 기준으로 함), 종창28 = 종창 관절수 (28개 관절을 기준으로 함), CRP = C-반응성 단백질 (mg/L 단위로 측정), 및 GH = 환자 종합 평가 (VAS 스케일 0-100으로 측정)이다.
환자의 통증 강도 평가
환자의 통증 평가는 통증 없음 내지 견딜 수 없는 통증 범위의 100 mm VAS를 이용하여 수행하였다. 연구자의 위치에서 스케일의 왼쪽 끝으로부터 mm 단위로 거리를 측정하고 값을 eCRF 상에 입력하였다.
환자의 질환 활성 종합 평가
환자의 질환 활성 종합 평가는 "지난 주에 당신의 전반적 건강에 얼마나 심각하게 영향을 미쳤는가"라고 질문한 후, 심각하지 않음 내지 매우 심각함 범위의 100 mm VAS를 이용하여 수행할 것이다. 연구자의 위치에서 스케일의 왼쪽 끝으로부터 mm 단위로 거리를 측정하고 값을 eCRF 상에 입력하였다.
의사의 질환 활성 종합 평가
의사의 질환 활성 종합 평가는 "질환이 당신의 환자에게 영향을 미치는 모든 방식을 고려할 때, 오늘 그 또는 그녀의 상태가 얼마나 양호한지에 대해 스케일 상에 선을 그리시오"라고 질문한 후, 질환 활성 없음 내지 최대 질환 활성 범위의 100 mm VAS를 이용하여 수행할 것이다. 객관성을 증진시키기 위해서, 의사는 특정 환자에 대한 그 자신의 평가를 수행할 때 그 환자의 질환 활성 종합 평가를 알지 못해야 한다. 이어서, 연구자는 스케일의 왼쪽 끝으로부터 mm 단위로 거리를 측정하고 값을 eCRF 상에 입력하였다.
C-반응성 단백질 (CRP)
이 평가를 위한 혈액은 염증의 존재를 확인하기 위해, 그의 중증도를 결정하기 위해, 그리고 치료에 대한 반응을 모니터링하기 위해 획득할 것이다. 이 시험의 결과는 맹검해제 연구 요원일 수 있기 때문에, 중앙 실험실로부터의 결과는 스크리닝 및 기준선에 대해서만 제공할 것이다. 치료 기간 동안 수집된 샘플로부터의 CRP 결과는 데이터베이스 잠금 후에만 공표하였다.
적혈구 침강 속도 (ESR)
혈액은 염증성 질환을 진단하는데 도움이 되고 질환 활성 및 요법에 대한 반응을 모니터링하는데 사용되는 ESR을 측정하기 위해 획득할 것이다. ESR은 중앙 실험실에 의해 공급되는 표준 키트를 이용하여 국지적으로 측정하였다.
질환 활성 스코어 28 (DAS28) 및 완화된 환자
DAS28은 기재된 바와 같은 평가 스케줄에 따라 수행할 것이다 (문헌 [Aletaha D, Smolen J (2005). Clin.Exp.Rheumatol; 23 (5 Suppl 39):S100-S108; Aletaha et al (2005). Arthritis Rheum.; 52 (9):2625-36]). 완화된 환자 (DAS28 ≤ 2.6)의 백분율을 연구 제6주 및 제24주/말에 결정하였다.
마스트리히트(Mastricht) 강직성 척추염 골부착부 스코어 (MASES)
마스트리히트 강직성 척추염 골부착부 스코어 (MASES) (문헌 [Heuft- Dorenbosch L, et al (2003) Ann Rheum Dis 62:127-32; Gladman DD (2007) Curr Rheumatol Rep 9:455-60])는 맨더(Mander) 지수로부터 개발되었고, 13개 부위의 평가를 포함한다. MASES 지수에 포함되는 골부착부염 부위는 제1 늑골늑연골, 제7 늑골늑연골, 상후 장골극, 상전 장골극, 장골능 (상기 모두 양측에서 평가됨), 제5 요추극 돌기, 근위 아킬레스 (양측)이다.
SPARCC (캐나다 SpA 연구 컨소시엄)
SPARCC (캐나다 SpA 연구 컨소시엄) (문헌 [Maksymowych et al. (2003) J. Rheumatology 30:1356-63])는 18개 골부착부 부위: 내측 및 외측 상완골 상과, 극상근 부착부, 근위 아킬레스, 대전자, 내측 및 외측 대퇴골 관절융기, 족저 근막의 부착부, 슬개골의 사두근 부착부, 슬개골의 하극, 경골 결절을 평가한다.
리즈(Leeds) 지염 기기 (LDI)
리즈 지염 기기 (LDI) (문헌 [Helliwell et al (2005). J Rheumatol 32:1745-50]) 베이식은 지염 이환 손발가락을 정의하기 위해 10%의 최소 차이를 이용하여 이환 손발가락 원주 대 반대쪽 손가락 또는 발가락 원주의 비를 측정한다. 2진법 스코어 (압통에 대해 1, 비-압통에 대해 0)인 LDI의 변형을 이용하여 압통 스코어와 원주의 비를 곱한다. 양측이 포함되는 것으로 간주되면, 그 수를 표에 제공된 데이터와 비교할 것이다. 이 변형은 LDI 베이식으로 지칭되고, 본 연구에 적용될 것이다. LDI는 손발가락 원주를 측정하기 위한 도구 (미국 플로리다주 마이애미 www.rehaboutlet.com으로부터 입수가능함)를 필요로 한다.
건선 영역 및 중증도 지수 (PASI)
PASI (문헌 [Feldman and Krueger (2005) Ann. Rheum. Dis. 64:ii65-ii68])는 4곳의 신체 표면 영역 (두부, 체간부, 및 상지 및 하지) 상 건선의 범위, 및 판상 홍반, 인설 및 두께의 정도를 평가한다. PASI 스코어는 홍반, 인설 및 두께에 의해 침범된 신체 표면 영역의 범위 및 이들 측정치의 중증도를 설명한다. 스코어는 0 (질환 없음) 내지 72 (최대 질환) 범위이다.
실시예 1.2 - 세쿠키누맙은 건선성 관절염의 징후 및 증상을 개선시킨다
CAIN4572206은 건선성 관절염 (PsA)의 치료를 위한 신규 표적인 인터류킨-17A를 억제하는 세쿠키누맙의 예비 효능 및 안전성을 평가하였다. CASPAR 기준을 만족하는 활성 PsA를 앓는 42명의 환자를 2:1로 무작위화하여, 3주 간격으로 제공되는 세쿠키누맙 (10mg/kg) 또는 위약의 2회 주사를 투여하였다. 1차 효능 종점은 활성제 대 위약에서의 제6주에서의 ACR20 반응자 비율이었다 (단측 p <0.01). 35명 (83.3%)의 환자 (세쿠키누맙에 대해 25명, 위약에 대해 10명)가 연구를 완료하였다. 5명의 환자 (세쿠키누맙 4명 및 위약 1명)는 프로토콜 위반으로 인해 효능 분석으로부터 배제되었고, 7명 (세쿠키누맙 3명 및 위약 4명)은 효능 부족 또는 동의 철회로 인해 조기 중단하였다. 인구통계 및 기준선 특징을 파라미터를 포함하는 군 사이에서 균형을 맞췄다: 평균±SD SJC (세쿠키누맙 대 위약): 8.3±5.6 대 9.5±5.4; TJC 23.5±19.4 대 22.6±11.0; DAS28 4.8±1.2 대 4.8±1.2; MASES 3.0±4.1 대 3.4±2.3. 공존 건선, 이전의 TNFi 노출 및 DMARDS와의 공-투약은 각각 세쿠키누맙에 대해 23명, 11명 및 21명의 환자, 및 위약에 대해 11명, 5명 및 10명의 환자에서 존재하였다. 세쿠키누맙 대 위약에 대한 ACR20 반응자는 제6주에 39% 대 23% (P=0.27), 제12주에 39% 대 15%, 제28주에 43% 대 18%였다. 세쿠키누맙 대 위약에 대한 ACR50 및 ACR70 반응자는 제6주에 각각 17% 대 8% 및 9% 대 0%였다. 제6주에서의 CRP 감소는 위약 (기준선 대 제6주에서의 중앙값 [범위]: 6.2 [1.3, 39.7] 대 5.0 [0.8, 29.6])에서보다 세쿠키누맙 (4.9 [0.3, 43.0] 대 3.0 [0.2, 15.2])에서 더 컸다.
유해 사례 (AE)의 전체적 비율은 세쿠키누맙 26명 (93%) 대 위약 11명 (79%)으로 비슷했다. 7건의 심각한 AE가 4명의 세쿠키누맙 환자 및 1명의 위약 환자에서 보고되었다. 감염은 세쿠키누맙에 대한 16명 (57%)의 환자 및 위약에 대한 7명 (50%)의 환자에서 보고되었다. 결론적으로, 일차 종점은 충족되지 않았지만, 환자들은 제28주까지 임상 스코어 및 CRP 수준에서 신속하고 지속적인 개선을 보여주었다. 세쿠키누맙의 안전성 프로파일은 양호하였다. 이들 발견은, CAIN457F2306으로 진행되는 보다 대규모인 PsA에서의 추가의 III상 임상 시험을 보증한다.
실시예 2: 건선성 관절염 시험 CAIN457A2206에서의 약리유전학 (PG) 분석을 위한 물질 및 방법
실시예 2.1: 샘플 및 처리
연구에 참가한 40명의 동의한 환자에서 DNA의 유전자형 결정을 수행하였다. 세쿠키누맙을 투여받은 27명의 환자를 약리유전학 (PG) 분석에 이용하였다.
동의한 환자로부터의 혈액 샘플을 개별적 시험 위치에서 수집한 다음, 코반스(Covance) (스위스 제네바)로 운송하였다. 퓨어진 D-50K DNA 단리 키트 (겐트라(Gentra), 미국 미네소타주 미네아폴리스)를 이용하는 코반스에 의해 각 환자의 게놈 DNA를 혈액으로부터 추출하고 유전자형 결정을 위해 노파르티스(Novartis)로 운송하였다.
PsA 또는 관련 질환의 위험과 연관된 것으로 보고된 14개 SNP, 뿐만 아니라 다른 적응증에서 세쿠키누맙 반응과 연관된 것으로 관찰된 5개 SNP의 유전자형 결정을 수행하였다. 택맨® 유전자형 결정을 ABI 7900HT 서열 검출 시스템 상에서 택맨 어세이즈-바이-디자인(Assays-by-Design) 및 어세이즈-온-디맨드(Assays-on-Demand) (어플라이드 바이오시스템즈, 캘리포니아주 포스터 시티)를 이용하여 수행하였다. 제조업체의 지침에 따라 20 ng 이하의 게놈 DNA를 실험에 사용하였다.
HLA-C*0602 대립유전자를 또한, 그것이 PsA에 대한 주요 유전적 위험 인자인 것을 고려하여 유전자형 결정을 위해 선택하였다. 또한, HLA-DRB1*04 대립유전자 군 (2-자릿수 대립유전자)을, 이전의 류마티스 관절염 시험에서 세쿠키누맙 치료에 대한 차별적 반응과 연관되었었다는 발견에 근거하여 시험에 포함시켰다. 본 연구에서 동의한 환자로부터의 모든 DNA 샘플을 서열-특이적 올리고뉴클레오티드 혼성화 (SSO) 방법으로 시험하였다. 간략하게, SSO 실험은 루미넥스 IS200 기기와 랩타입® HD B 및 DRB1 유형 결정 시험 (원 람다, 인크, 캘리포니아주)을 제조업체의 지침에 따라 이용하여 수행하였다. HLA 유전자형은 HLA 퓨전(Fusion)® 2.0 소프트웨어 (원 람다)를 이용하여 할당하였다.
실시예 2.2: 통계적 분석
모든 변이체는 개별적으로 시험하였는데, 즉 한번에 1개의 변이체만을 모델에 포함시켰다. 모든 HLA 대립유전자는 표준 상가적 효과 코딩을 이용하여 임상 종점에 대해 시험하였다: 개체가 보유하는 HLA 대립유전자의 카피 수에 따라, 개체를 HLA 대립유전자에 대해 0, 1 또는 2로 코딩하였다. 모든 연관성 시험은 상가적 대립유전자 효과에 대한 양측 단일-지점 시험이었다.
혈통은 유전적 연관성 연구에서의 통상적인 혼란 인자이다. A2206에서의 27명의 세쿠키누맙-치료 환자는 모두 백인이다. 분석은 백인 세쿠키누맙-치료 환자 (N=27)만을 포함시켜 실행하였다.
A2206 샘플에서의 유전자 분석에는 세쿠키누맙-치료 환자 (N=27)만을 이용하였다. 귀무 가설은 유전자형 변수에 대한 계수가 0과 동일했다는 것이었고, 상응하는 p-값이 제시되었다. 귀무 가설의 기각은 유전자형이 특정한 임상 종점에 의해 측정되는 바와 같은 세쿠키누맙에 대한 반응의 예측인자였다는 결론을 의미할 것이다.
위약 아암에서는 1명의 환자만 ACR50에 도달하고 2명의 환자만 ACR20에 도달하였다. 그 결과, 위약 아암에서는 분석을 실행하지 않았다.
모든 통계적 시험은 SAS (SAS 인스티튜트 인크.(SAS Institute Inc.), 미국 노스캐롤라이나주 캐리)에서 수행하였다. 제6주/제24주에서의 효능 변수 ACR20, ACR50 및 ACR70은, 의존적 변수로서의 효능 종점, 독립적 변수 (고정 효과)로서의 SNP 또는 HLA 대립유전자 군 유전자형 (상기 코딩된 바와 같은 것)을 사용하고, 랭커스터의 중간-p 보정을 포함하는 로지스틱 회귀 로지스틱 회귀 정확 시험 (SAS 9.2 PROC LOGISTIC)을 이용하여 개별적으로 분석하였다. 제6주/제24주에서의 효능 변수 DAS28은, 의존적 변수로서의 효능 종점, 독립적 변수 (고정 효과)로서의 SNP 또는 HLA 대립유전자 군 유전자형 (상기 코딩된 바와 같은 것), 및 고정 효과 공변량으로서의 기준선 DAS28 스코어 및 성별을 사용하고, ANCOVA 모델 (SAS 9.2 PROC GLM)을 이용하여 개별적으로 분석하였다.
실시예 3: PsA 시험 CAIN457A2206에서의 PG 분석에 대한 결과
실시예 3.1: 세쿠키누맙-치료 환자에서의 세쿠키누맙 효능을 갖는 유전자 변이체의 연관성
19개의 SNP 및 2개의 HLA 대립유전자 군을 포함하는 총 21개의 유전자 다형성을 효능 종점과의 연관성에 대하여 시험하였다. 15개의 유전자 다형성은 PsA 또는 관련 질환과의 강력한 연관성 증거를 보고한 공개문헌을 근거로 하여 분석을 위해 선택하였는데, 그 가설은 질환 SNP가 요법에 대한 차별적 반응을 유발할 수 있는 상이한 질환 하위유형을 확인할 수 있다는 것이었다. 6개의 추가 유전자 다형성은 다른 적응증에서의 세쿠키누맙과 그의 연관성을 근거로 하여 분석을 위해 선택하였다.
21개의 변이체 중에서, SNP rs240993 T 대립유전자는 27명의 세쿠키누맙-치료 환자에서 제24주에 보다 낮은 백분율의 ACR50과의 연관성에 대해 0.015의 명목상 p-값으로 가장 양호한 p 값을 갖는다 (표 7). 이 SNP는 또한 제24주에 ACR70 (p-값=0.021, 표 7) 및 제6주에 DAS28 (p-값=0.057, 표 6)과 연관된다. 적어도 하나의 rs240993 T 대립유전자를 갖는 환자는 임의의 rs240993 T 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 감소된 반응을 나타낸다. SNP rs240993 T 대립유전자의 건선 질환과의 연관성은, 이 SNP를 유전자 TRAF3IP2에 연관시킨 건선 컨소시엄 & 더 웰컴 트러스트 케이스 컨트롤 컨소시엄 2(Psoriasis Consortium & the Wellcome Trust Case Control Consortium 2) (문헌 [Strange et al., 2010])에 의해 확인되었다. TRAF3IP2는 IL17-의존성 NF-κB 활성화 및 Th17-매개 염증 반응에 필수적인 어댑터 단백질인 ACT1을 코딩한다 (문헌 [May et al (2011) Nat Immunol. 12(9):813-5]). 주목해야 할 것은, 이 SNP가 TRAF3IP2의 바로 하류 유전자인 REV3L 유전자의 인트론 영역에 물리적으로 위치한다는 것이다. 도 2에 나타낸 바와 같이, 높은 R 제곱 값 및 낮은 재조합 비율에 의해 나타나는 바와 같은 REV3L 및 TRAF3IP2를 가로지르는 높은 연관 균형 영역이 존재한다. 가설은 rs240993이 TRAF3IP2 유전자에서의 원인 SNP를 태깅할 수 있다는 것이다.
HLA-DRB1*04 대립유전자 군 또한 제24주에 ACR70 (p-값=0.016) 및 ACR50 (p-값=0.050)과의 명목상 유의한 연관성을 나타냈다 (표 7). HLA-DRB1*04 대립유전자 군과 PsA에서의 세쿠키누맙 반응 사이의 연관성은 RA에서 관찰된 것과 동일한 경향에 있다 (그 전문이 본원에 참조로 포함되는 PCT 출원 번호 PCT/US2011/064307). 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하는 환자는 임의의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타낸다.
또한, 종양 괴사 인자-유사 리간드 (TL1A) 유전자의 인트론에서의 SNP rs4263839 A 대립유전자는 제6주에 보다 높은 백분율의 ACR50 (p-값=0.034, 표 6) 및 제24주에 ACR70 (p-값=0.056, 표 7)과 연관된다. 적어도 하나의 rs4263839 A 대립유전자를 보유하는 환자는 임의의 rs4263839 A 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타낸다. rs4263839 G 대립유전자는 염증성 장 질환에 대한 민감성과 연관된 것으로 확인되어 있다 (문헌 [Barrett et al (2008) Nat Genet. 40(8):955-62]). 이 다형성은 또한 16명의 세쿠키누맙-치료 환자 중에서 분변 칼프로텍틴 (S100A8/S100A9) 반응과의 매우 유의한 연관성이 입증되었다 (다중 비교를 위한 본페로니(Bonferroni) 보정 후 순열 시험에서 p=0.00035). 본 발명자들은 부 대립유전자 A의 부재가 크론병을 앓는 환자에서의 악화 (즉, 분변 칼프로텍틴 농도의 증가)와 연관된다는 것을 이전에 결정한 바 있으며 (데이터는 나타내지 않음), 이는 본원에서 PsA 환자에서 관찰된 것과 동일한 경향에 있다. TL1A 유전자는 다양한 자가면역 염증 과정에서 병원성 T 세포를 유도하는 시토카인을 코딩한다 (문헌 [Bayry et al (2010) Nat Rev Rheumatol. 6(2):67-8]).
끝으로, IL17A의 3'UTR 영역에서의 SNP rs7747909는 제6주에 ACR70과 연관된다 (p-값=0.031, 표 6). 그러나, rs7747909와 PsA에서의 세쿠키누맙 반응 사이의 연관성은 류마티스 관절염을 앓는 환자에서 관찰된 것과 반대 방향에 있다 (데이터는 나타내지 않음).
Figure pct00005
표 6은 제6주에서의 ACR20, ACR50, ACR70 및 DAS28에 대한 각 유전자 변이체의 연관성 시험으로부터의 p-값을 나타낸다. (NC: 계산불가능한 OR)
Figure pct00006
표 7은 제24주에서의 ACR20, ACR50, ACR70 및 DAS28에 대한 각 유전적 변이체의 연관성 시험으로부터의 p-값을 나타낸다. (NC: 계산불가능한 OR)
실시예 3.2: 세쿠키누맙-치료 PsA 환자에서의 세쿠키누맙 반응에 대한 (TRAF3IP2에 연관된) SNP rs240993 대립유전자의 효과
27명의 세쿠키누맙-치료 환자 중 9명은 2 카피의 rs240993 주 대립유전자 C를 갖는다. 표 8에 나타낸 바와 같이, 2 카피의 rs240993 주 대립유전자 C를 보유하는 개체는 제24주에 가장 높은 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖고, 그 다음은 이형접합 개체 (1 카피의 T 대립유전자 및 1 카피의 C 대립유전자를 보유하는 개체)이다. 2 카피의 rs240993 부 대립유전자 T (rs240993 비-반응 대립유전자)를 보유하는 환자는 제24주에 가장 낮은 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖는다.
Figure pct00007
표 8은 rs240993 비-반응 대립유전자의 유전자형 군에 의해 분류된, 제24주에 주어진 종점 (ACR20, ACR50, ACR70)에 도달한 세쿠키누맙-치료 환자의 수 및 백분율을 나타낸다.
실시예 3.3: 세쿠키누맙-치료 PsA 환자에서의 세쿠키누맙 반응에 대한 HLA-DRB1*04 대립유전자 군의 효과
27명의 세쿠키누맙-치료 환자 중 5명은 적어도 1 카피의 HLA-DRB1*04 대립유전자 군을 보유한다. 표 9에 나타낸 바와 같이, 적어도 1 카피의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하는 개체는 제24주에 보다 양호한 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖는다. HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 환자는 제24주에 보다 낮은 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖는다.
Figure pct00008
표 9는 HLA-DRB1*04 대립유전자의 유전자형 군에 의해 분류된, 제24주에 주어진 종점 (ACR20, ACR50, ACR70)에 도달한 세쿠키누맙-치료 환자의 수 및 백분율을 나타낸다.
실시예 3.4: 세쿠키누맙-치료 PsA 환자에서의 세쿠키누맙 반응에 대한 (TRAF3IP2에 연관된) SNP rs240993 대립유전자 및 HLA-DRB1*04 대립유전자 군 조합의 효과
27명의 세쿠키누맙-치료 환자 중 12명은 2 카피의 rs240993 부 대립유전자 C 또는 적어도 1 카피의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유한다. 표 10에 나타낸 바와 같이, 2 카피의 rs240993 부 대립유전자 C 또는 적어도 1 카피의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하는 개체는 제24주에 보다 양호한 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖는다. rs240993 CC 유전자형 또는 적어도 1 카피의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 환자는 제24주에 보다 낮은 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖는다.
Figure pct00009
표 10은 rs240993 T 및 HLA-DRB1*04의 조합 유전자형 군에 의해 분류된, 제24주에 주어진 종점 (ACR20, ACR50, ACR70)에 도달한 세쿠키누맙-치료 환자의 수 및 백분율을 나타낸다.
실시예 3.5: 세쿠키누맙-치료 PsA 환자에서의 세쿠키누맙 반응에 대한 TL1A SNP rs4263839 대립유전자의 효과
27명의 세쿠키누맙-치료 환자 중 14명은 적어도 1 카피의 rs4263839 부 대립유전자 A를 보유한다. 표 11에 나타낸 바와 같이, 2 카피의 rs4263839 부 대립유전자 A (rs4263839 반응 대립유전자)를 보유하는 개체는 제24주에 가장 높은 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖고, 그 다음은 이형접합 개체 (1 카피의 G 대립유전자 및 1 카피의 A 대립유전자를 보유하는 개체)이다. rs4263839 부 대립유전자 A를 보유하지 않는 환자는 제24주에 가장 낮은 ACR20, ACR50 및 ACR70 반응률을 갖는다.
Figure pct00010
표 11은 rs4263839 위험 대립유전자의 유전자형 군에 의해 분류된, 제24주에 주어진 종점 (ACR20, ACR50, ACR70)에 도달한 세쿠키누맙-치료 환자의 수 및 백분율을 나타낸다.
실시예 4: PGx에 대한 결론 및 PsA 시험 CAIN4572206에서의 결론
본 발명자들은 적어도 하나의 rs240993 T 대립유전자를 보유하는 PsA 환자는 적어도 하나의 rs240993 T 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 감소된 반응을 나타내고, 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하는 PsA 환자는 적어도 하나의 HLA-DRB1*04 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타내며, 적어도 하나의 rs4263839 A 대립유전자를 보유하는 PsA 환자는 적어도 하나의 rs4263839 A 대립유전자를 보유하지 않는 PsA 환자에 비해 세쿠키누맙에 대한 개선된 반응을 나타내는 것을 보여주었다. 이들 약리유전학적 발견은 특정 SNP가 환자의 증가된 PsA 질환 발병 가능성과 연관될 수 있다는 사실만을 근거로 해서는 예측할 수 없는 것이었다. 예를 들어, 표 6 및 7에 나타낸 바와 같이, PsA 질환과 연관된 다양한 다른 SNP, 예컨대 rs12188300, rs33980500, rs20541, rs2066808 등은 세쿠키누맙으로의 IL-17 길항작용에 대한 PsA 환자 반응을 예측하지 않았다. 예측불가능 결여의 추가적 예로서, 공유 에피토프 (SE)를 코딩하는 HLA-DRB1 대립유전자가 류마티스 관절염 (RA) 발병에 대한 보다 높은 위험을 부여하는 것은 익히 공지되어 있다 (문헌 [Gonzalez-Gay et al. (2002) Sem. Arthritis. Rheum. 31:355-60; Fries et al. (2002) Arthritis and Rheumatism 46:2320-29; van der Helm-van Mil et al. (2006) Arthritis and Rheum. 54:1117-21]). 그러나, SE의 보유는, 환자가 세쿠키누맙으로의 치료에 유리하게 반응할 증가된 가능성을 예측하는데 SE가 사용될 수 있을지라도 (그 전문이 본원에 참조로 포함되는 PCT 출원 번호 PCT/US2011/064307), RA 환자가 TNF 알파 길항제, 예컨대 에타네르셉트 및 인플릭시맙으로의 치료에 반응할지를 예측하지는 않는다는 것이 일반적으로 받아들여지고 있다 (문헌 [Emery and Dorner (2011) Ann. Rhem. Dis. 70:2063-2070; Potter et al. (2009) Ann. Rheum. Dis. 68:69-74]). 이에 따라, 환자가 특정 질환과 연관된 대립유전자를 보유하는지만을 근거로 해서는 그 환자가 약물에 어떻게 반응할지를 예측할 수 없다.
SEQUENCE LISTING <110> Novartis AG Wang, Amanda Ying <120> METHODS OF TREATING PSORIATIC ARTHRITIS USING IL-17 ANTAGONISTS <130> 55077 <140> Herewith <141> Herewith <150> Iraq 370/2011 <151> 2011-11-21 <150> US 61/624,564 <151> 2012-04-16 <160> 17 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 5 <212> PRT <213> artificial <220> <223> CDR1 = hypervariable region 1 of heavy chain of AIN457 <400> 1 Asn Tyr Trp Met Asn 1 5 <210> 2 <211> 17 <212> PRT <213> ARTIFICIAL <220> <223> CDR2 = hypervariable region 2 of heavy chain of AIN457 <400> 2 Ala Ile Asn Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Gly Ser Val Lys 1 5 10 15 Gly <210> 3 <211> 18 <212> PRT <213> ARTIFICIAL <220> <223> CDR3 = hypervariable region 3 of heavy chain of AIN457 <400> 3 Asp Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Asp Tyr Tyr Ile His Tyr Trp Tyr Phe 1 5 10 15 Asp Leu <210> 4 <211> 12 <212> PRT <213> ARTIFICIAL <220> <223> CDR1' = hypervariable region 1 of light chain of AIN457 <400> 4 Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala 1 5 10 <210> 5 <211> 7 <212> PRT <213> ARTIFICIAL <220> <223> CDR2' = hypervariable region 2 of light chain AIN457 <400> 5 Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr 1 5 <210> 6 <211> 9 <212> PRT <213> ARTIFICIAL <220> <223> CDR3' = hypervariable region 3 of light chain AIN457 <400> 6 Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro Cys Thr 1 5 <210> 7 <211> 381 <212> DNA <213> HOMO SAPIENS <220> <221> CDS <222> (1)..(381) <400> 7 gag gtg cag ttg gtg gag tct ggg gga ggc ttg gtc cag cct ggg ggg 48 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 tcc ctg aga ctc tcc tgt gca gcc tct gga ttc acc ttt agt aac tat 96 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr 20 25 30 tgg atg aac tgg gtc cgc cag gct cca ggg aaa ggg ctg gag tgg gtg 144 Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 gcc gcc ata aac caa gat gga agt gag aaa tac tat gtg ggc tct gtg 192 Ala Ala Ile Asn Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Gly Ser Val 50 55 60 aag ggc cga ttc acc atc tcc aga gac aac gcc aag aac tca ctg tat 240 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr 65 70 75 80 ctg caa atg aac agc ctg aga gtc gag gac acg gct gtg tat tac tgt 288 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 gtg agg gac tat tac gat att ttg acc gat tat tac atc cac tat tgg 336 Val Arg Asp Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Asp Tyr Tyr Ile His Tyr Trp 100 105 110 tac ttc gat ctc tgg ggc cgt ggc acc ctg gtc act gtc tcc tca 381 Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 125 <210> 8 <211> 127 <212> PRT <213> HOMO SAPIENS <400> 8 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr 20 25 30 Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Ala Ala Ile Asn Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr Val Gly Ser Val 50 55 60 Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Val Arg Asp Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Asp Tyr Tyr Ile His Tyr Trp 100 105 110 Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 125 <210> 9 <211> 327 <212> DNA <213> HOMO SAPIENS <220> <221> CDS <222> (1)..(327) <400> 9 gaa att gtg ttg acg cag tct cca ggc acc ctg tct ttg tct cca ggg 48 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 gaa aga gcc acc ctc tcc tgc agg gcc agt cag agt gtt agc agc agc 96 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser 20 25 30 tac tta gcc tgg tac cag cag aaa cct ggc cag gct ccc agg ctc ctc 144 Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 35 40 45 atc tat ggt gca tcc agc agg gcc act ggc atc cca gac agg ttc agt 192 Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 ggc agt ggg tct ggg aca gac ttc act ctc acc atc agc aga ctg gag 240 Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 65 70 75 80 cct gaa gat ttt gca gtg tat tac tgt cag cag tat ggt agc tca ccg 288 Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 85 90 95 tgc acc ttc ggc caa ggg aca cga ctg gag att aaa cga 327 Cys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys Arg 100 105 <210> 10 <211> 109 <212> PRT <213> HOMO SAPIENS <400> 10 Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 1 5 10 15 Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Ser Ser Ser 20 25 30 Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu 35 40 45 Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile Pro Asp Arg Phe Ser 50 55 60 Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Arg Leu Glu 65 70 75 80 Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Tyr Gly Ser Ser Pro 85 90 95 Cys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile Lys Arg 100 105 <210> 11 <211> 10 <212> PRT <213> artificial <220> <223> CDR1-x = hypervariable domain x of heavy chain of AIN457 <400> 11 Gly Phe Thr Phe Ser Asn Tyr Trp Met Asn 1 5 10 <210> 12 <211> 11 <212> PRT <213> artificial <220> <223> CDR2-x = hypervariable domain of heavy chain x of AIN457 <400> 12 Ala Ile Asn Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr 1 5 10 <210> 13 <211> 23 <212> PRT <213> ARTIFICIAL <220> <223> CDR3-x = hypervariable domain x of heavy chain AIN457 <400> 13 Cys Val Arg Asp Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Asp Tyr Tyr Ile His Tyr 1 5 10 15 Trp Tyr Phe Asp Leu Trp Gly 20 <210> 14 <211> 711 <212> DNA <213> homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(708) <400> 14 acc atg gaa acc cca gcg gag ctt ctc ttc ctc ctg cta ctc tgg ctc 48 Thr Met Glu Thr Pro Ala Glu Leu Leu Phe Leu Leu Leu Leu Trp Leu 1 5 10 15 cca gat acc acc gga gaa att gtg ttg acg cag tct cca ggc acc ctg 96 Pro Asp Thr Thr Gly Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu 20 25 30 tct ttg tct cca ggg gaa aga gcc acc ctc tcc tgc agg gcc agt cag 144 Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln 35 40 45 agt gtt agc agc agc tac tta gcc tgg tac cag cag aaa cct ggc cag 192 Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 50 55 60 gct ccc agg ctc ctc atc tat ggt gca tcc agc agg gcc act ggc atc 240 Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile 65 70 75 80 cca gac agg ttc agt ggc agt ggg tct ggg aca gac ttc act ctc acc 288 Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 85 90 95 atc agc aga ctg gag cct gaa gat ttt gca gtg tat tac tgt cag cag 336 Ile Ser Arg Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln 100 105 110 tat ggt agc tca ccg tgc acc ttc ggc caa ggg aca cga ctg gag att 384 Tyr Gly Ser Ser Pro Cys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile 115 120 125 aaa cga act gtg gct gca cca tct gtc ttc atc ttc ccg cca tct gat 432 Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp 130 135 140 gag cag ttg aaa tct gga act gcc tct gtt gtg tgc ctg ctg aat aac 480 Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn 145 150 155 160 ttc tat ccc aga gag gcc aaa gta cag tgg aag gtg gat aac gcc ctc 528 Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu 165 170 175 caa tcg ggt aac tcc cag gag agt gtc aca gag cag gac agc aag gac 576 Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp 180 185 190 agc acc tac agc ctc agc agc acc ctg acg ctg agc aaa gca gac tac 624 Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr 195 200 205 gag aaa cac aaa gtc tac gcc tgc gaa gtc acc cat cag ggc ctg agc 672 Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser 210 215 220 tcg ccc gtc aca aag agc ttc aac agg gga gag tgt tag 711 Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 225 230 235 <210> 15 <211> 236 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 15 Thr Met Glu Thr Pro Ala Glu Leu Leu Phe Leu Leu Leu Leu Trp Leu 1 5 10 15 Pro Asp Thr Thr Gly Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Gly Thr Leu 20 25 30 Ser Leu Ser Pro Gly Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln 35 40 45 Ser Val Ser Ser Ser Tyr Leu Ala Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln 50 55 60 Ala Pro Arg Leu Leu Ile Tyr Gly Ala Ser Ser Arg Ala Thr Gly Ile 65 70 75 80 Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr 85 90 95 Ile Ser Arg Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln 100 105 110 Tyr Gly Ser Ser Pro Cys Thr Phe Gly Gln Gly Thr Arg Leu Glu Ile 115 120 125 Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp 130 135 140 Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn 145 150 155 160 Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu 165 170 175 Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp 180 185 190 Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr 195 200 205 Glu Lys His Lys Val Tyr Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser 210 215 220 Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe Asn Arg Gly Glu Cys 225 230 235 <210> 16 <211> 783 <212> DNA <213> homo sapiens <220> <221> CDS <222> (1)..(780) <400> 16 acc atg gaa ttg ggg ctg agc tgg gtt ttc ctt gtt gct att tta gaa 48 Thr Met Glu Leu Gly Leu Ser Trp Val Phe Leu Val Ala Ile Leu Glu 1 5 10 15 ggt gtc cac tgt gag gtg cag ttg gtg gag tct ggg gga ggc ttg gtc 96 Gly Val His Cys Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val 20 25 30 cag cct ggg ggg tcc ctg aga ctc tcc tgt gca gcc tct gga ttc acc 144 Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr 35 40 45 ttt agt aac tat tgg atg aac tgg gtc cgc cag gct cca ggg aaa ggg 192 Phe Ser Asn Tyr Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly 50 55 60 ctg gag tgg gtg gcc gcc ata aac caa gat gga agt gag aaa tac tat 240 Leu Glu Trp Val Ala Ala Ile Asn Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr 65 70 75 80 gtg ggc tct gtg aag ggc cga ttc acc atc tcc aga gac aac gcc aag 288 Val Gly Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys 85 90 95 aac tca ctg tat ctg caa atg aac agc ctg aga gtc gag gac acg gct 336 Asn Ser Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala 100 105 110 gtg tat tac tgt gtg agg gac tat tac gat att ttg acc gat tat tac 384 Val Tyr Tyr Cys Val Arg Asp Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Asp Tyr Tyr 115 120 125 atc cac tat tgg tac ttc gat ctc tgg ggc cgt ggc acc ctg gtc act 432 Ile His Tyr Trp Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr 130 135 140 gtc tcc tca gcc tcc acc aag ggc cca tcg gtc ttc ccc ctg gca ccc 480 Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro 145 150 155 160 tcc tcc aag agc acc tct ggg ggc aca gcg gcc ctg ggc tgc ctg gtc 528 Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val 165 170 175 aag gac tac ttc ccc gaa ccg gtg acg gtg tcg tgg aac tca ggc gcc 576 Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala 180 185 190 ctg acc agc ggc gtg cac acc ttc ccg gct gtc cta cag tcc tca gga 624 Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly 195 200 205 ctc tac tcc ctc agc agc gtg gtg acc gtg ccc tcc agc agc ttg ggc 672 Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly 210 215 220 acc cag acc tac atc tgc aac gtg aat cac aag ccc agc aac acc aag 720 Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys 225 230 235 240 gtg gac aag aga gtt gag ccc aaa tct tgt gac aaa act cac aca tgc 768 Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys 245 250 255 cca ccg tgc cca taa 783 Pro Pro Cys Pro 260 <210> 17 <211> 260 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 17 Thr Met Glu Leu Gly Leu Ser Trp Val Phe Leu Val Ala Ile Leu Glu 1 5 10 15 Gly Val His Cys Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val 20 25 30 Gln Pro Gly Gly Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr 35 40 45 Phe Ser Asn Tyr Trp Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly 50 55 60 Leu Glu Trp Val Ala Ala Ile Asn Gln Asp Gly Ser Glu Lys Tyr Tyr 65 70 75 80 Val Gly Ser Val Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys 85 90 95 Asn Ser Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Val Glu Asp Thr Ala 100 105 110 Val Tyr Tyr Cys Val Arg Asp Tyr Tyr Asp Ile Leu Thr Asp Tyr Tyr 115 120 125 Ile His Tyr Trp Tyr Phe Asp Leu Trp Gly Arg Gly Thr Leu Val Thr 130 135 140 Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro 145 150 155 160 Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val 165 170 175 Lys Asp Tyr Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala 180 185 190 Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly 195 200 205 Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly 210 215 220 Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys 225 230 235 240 Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys 245 250 255 Pro Pro Cys Pro 260

Claims (38)

  1. a) 건선성 관절염 (PsA) 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는
    b) PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 PsA를 앓는 환자에게 선택적으로 투여하는 것
    을 포함하는, PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법.
  2. 제1항에 있어서,
    a) HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는
    b) HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하는 것
    을 포함하는 방법.
  3. 제1항에 있어서,
    a) rs4263839 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는
    b) rs4263839 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하는 것
    을 포함하는 방법.
  4. 제1항에 있어서,
    a) rs240993 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는
    b) rs240993 비-반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하는 것
    을 포함하는 방법.
  5. 제1항 내지 제4항 중 어느 한 항에 있어서, 다른 PsA 작용제가 NSAID, TNF 알파 길항제, 술파살라진, 메토트렉세이트, 코르티코스테로이드 및 그의 조합으로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인 방법.
  6. a) PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 IL-17 길항제로의 치료를 위한 PsA를 앓는 환자를 선택하고;
    b) 그 후에, IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 투여하는 것
    을 포함하는, IL-17 길항제로 PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법.
  7. a) PsA 반응 대립유전자 또는 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 PsA를 앓는 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하고;
    b) 그 후에,
    i. PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하거나; 또는
    ii. PsA 반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 다른 PsA 작용제의 치료 유효량을 환자에게 선택적으로 투여하는 것
    을 포함하는, IL-17 길항제로 PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법.
  8. a) PsA 반응 대립유전자 또는 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 PsA를 앓는 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하고;
    b) 그 후에, PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 IL-17 길항제로의 치료를 위한 환자를 선택하고;
    c) 그 후에, IL-17 길항제의 치료 유효량을 환자에게 투여하는 것
    을 포함하는, IL-17 길항제로 PsA를 앓는 환자를 선택적으로 치료하는 방법.
  9. 제7항 또는 제8항에 있어서, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자가, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 핵산 산물, PsA 반응 대립유전자의 폴리펩티드 산물, 또는 PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 등가 유전자 마커에 대해 생물학적 샘플을 검정함으로써 검출되는 것인 방법.
  10. 제9항에 있어서, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자가, PsA 비-반응 대립유전자 또는 PsA 반응 대립유전자의 게놈 서열에 대해 생물학적 샘플을 검정함으로써 검출되는 것인 방법.
  11. 제7항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 생물학적 샘플을 PsA 비-반응 대립유전자의 존재에 대해 검정하며, 추가로 여기서 PsA 비-반응 대립유전자는 rs240993 비-반응 대립유전자인 방법.
  12. 제7항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 생물학적 샘플을 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정하며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 rs4263839 반응 대립유전자인 방법.
  13. 제7항 내지 제10항 중 어느 한 항에 있어서, 생물학적 샘플을 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정하며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자인 방법.
  14. 제1항 내지 제13항 중 어느 한 항에 있어서, 환자가 이전에 PsA에 대해 치료받지 않았거나 또는 TNF 알파 길항제 경험이 없는 것인 방법.
  15. 제7항 내지 제14항 중 어느 한 항에 있어서, 생물학적 샘플을 HLA-C*0602, rs20541, rs1974226, rs11209026, rs2082412, rs17728338, rs610604, rs2066808, rs2201841, rs495337, rs4085613, rs10484554, rs7747909, rs30187, rs27434, rs27524, rs33980500, 및 rs12188300으로 이루어진 군으로부터 선택된 적어도 하나의 후보 PsA 반응 마커의 존재에 대해 추가로 검정하는 것인 방법.
  16. 제7항 내지 제15항 중 어느 한 항에 있어서, 생물학적 샘플이 활액, 혈액, 혈청, 분변, 혈장, 요, 누액, 타액, 뇌척수액, 백혈구 샘플 및 조직 샘플로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인 방법.
  17. 제7항 내지 제16항 중 어느 한 항에 있어서, 적어도 하나의 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재가 노던 블롯 분석, 폴리머라제 연쇄 반응 (PCR), 역전사-폴리머라제 연쇄 반응 (RT-PCR), 택맨-기재 검정, 직접 서열분석, 동적 대립유전자-특이적 혼성화, 고밀도 올리고뉴클레오티드 SNP 어레이, 제한 단편 길이 다형성 (RFLP) 검정, 프라이머 연장 검정, 올리고뉴클레오티드 리가제 검정, 단일 가닥 입체형태 다형성의 분석, 온도 구배 겔 전기영동 (TGGE), 변성 고성능 액체 크로마토그래피, 고해상도 용융 분석, DNA 미스매치-결합 단백질 검정, SNPLex®, 모세관 전기영동, 서던 블롯, 면역검정, 면역조직화학, ELISA, 유동 세포측정법, 웨스턴 블롯, HPLC, 및 질량 분광측정법으로 이루어진 군으로부터 선택된 기술에 의해 검출되는 것인 방법.
  18. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 투여 단계가 약 10 mg/kg의 IL-17 길항제의 2 또는 3회 용량을 상기 환자에게 정맥내 투여하는 것을 포함하고, 각각의 상기 용량은 격주로 투여되는 것인 방법.
  19. 제1항 내지 제17항 중 어느 한 항에 있어서, 투여 단계가 약 75 mg 내지 약 300 mg의 IL-17 길항제를 매주, 월 2회 (격주로), 매달, 2개월마다 또는 3개월마다 환자에게 피하 투여하는 것을 포함하는 것인 방법.
  20. IL-17 길항제의 치료 유효량이 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여되는 것을 특징으로 하는, PsA를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제.
  21. 제20항에 있어서, IL-17 길항제의 치료 유효량이 rs4263839 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여되는 것을 특징으로 하는 IL-17 길항제.
  22. 제20항에 있어서, IL-17 길항제의 치료 유효량이 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여되는 것을 특징으로 하는 IL-17 길항제.
  23. 제20항에 있어서, IL-17 길항제의 치료 유효량이 rs240993 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 상기 환자에게 투여되는 것을 특징으로 하는 IL-17 길항제.
  24. a) IL-17 길항제로의 치료를 위한 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자를 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자를 근거로 하여 선택되고;
    b) 그 후에, IL-17 길항제의 치료 유효량이 환자에게 투여되는 것
    을 특징으로 하는, PsA를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제.
  25. a) 생물학적 샘플이 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 검정되고;
    b) IL-17 길항제의 치료 유효량이 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 환자에게 선택적으로 투여되는 것
    을 특징으로 하는, PsA를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제.
  26. a) 생물학적 샘플이 PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재 또는 부재에 대해 검정되고;
    b) IL-17 길항제로의 치료를 위한 PsA 환자가 PsA 반응 대립유전자를 갖는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 또는 PsA 비-반응 대립유전자를 갖지 않는 환자로부터의 생물학적 샘플을 근거로 하여 선택되고;
    c) IL-17 길항제의 치료 유효량이 환자에게 선택적으로 투여되는 것
    을 특징으로 하는, PsA 환자를 치료하는데 사용하기 위한 IL-17 길항제.
  27. IL-17 길항제가 약 10 mg/kg의 3회 용량으로 그를 필요로 하는 PsA 환자에게 정맥내 투여되고, 각각의 3회 용량은 격주로 전달되는 것을 특징으로 하는, 제20항 내지 제26항 중 어느 한 항에 따른 용도.
  28. IL-17 길항제가 약 75 mg 내지 약 300 mg의 용량으로 매주, 월 2회 (격주로), 매달, 2개월마다 또는 3개월마다 PsA 환자에게 피하 투여되는 것을 특징으로 하는, 제20항 내지 제26항 중 어느 한 항에 따른 용도.
  29. PsA 비-반응 대립유전자의 존재 또는 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 PsA를 앓는 환자로부터의 생물학적 샘플을 검정하는 것을 포함하며, 여기서
    a) PsA 비-반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 감소된 가능성을 나타내고;
    b) PsA 반응 대립유전자의 존재는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 증가된 가능성을 나타내는 것인,
    PsA를 앓는 환자가 IL-17 길항제로의 치료에 반응할 가능성을 예측하는 방법.
  30. 제29항에 있어서, 검정 단계 전에 수행되는, 환자로부터 생물학적 샘플을 획득하는 단계를 추가로 포함하는 방법.
  31. 제29항 또는 제30항에 있어서, 생물학적 샘플을 PsA 비-반응 대립유전자의 존재에 대해 검정하며, 추가로 여기서 PsA 비-반응 대립유전자는 rs240993 비-반응 대립유전자인 방법.
  32. 제29항 또는 제30항에 있어서, 생물학적 샘플을 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정하며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 rs4263839 반응 대립유전자인 방법.
  33. 제29항 또는 제30항에 있어서, 생물학적 샘플을 PsA 반응 대립유전자의 존재에 대해 검정하며, 추가로 여기서 PsA 반응 대립유전자는 HLA-DRB1*04 대립유전자 군에서의 대립유전자인 방법.
  34. 제1항 내지 제33항 중 어느 한 항에 있어서, IL-17 길항제가 IL-17 결합 분자 또는 IL-17 수용체 결합 분자인 방법 또는 용도.
  35. 제34항에 있어서, IL-17 결합 분자 또는 IL-17 수용체 결합 분자가 IL-17 결합 분자인 방법 또는 용도.
  36. 제35항에 있어서, IL-17 결합 분자가
    a) Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하는 IL-17의 에피토프에 결합하는 IL-17 항체;
    b) Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 IL-17의 에피토프에 결합하는 IL-17 항체;
    c) 2개의 성숙 IL-17 단백질 쇄를 갖는 IL-17 동종이량체의 에피토프에 결합하며, 여기서 상기 에피토프는 하나의 쇄 상에 Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하고 다른 쇄 상에 Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 것인 IL-17 항체;
    d) 2개의 성숙 IL-17 단백질 쇄를 갖는 IL-17 동종이량체의 에피토프에 결합하며, 여기서 상기 에피토프는 하나의 쇄 상에 Leu74, Tyr85, His86, Met87, Asn88, Val124, Thr125, Pro126, Ile127, Val128, His129를 포함하고 다른 쇄 상에 Tyr43, Tyr44, Arg46, Ala79, Asp80을 포함하는 것인 IL-17 항체 (여기서 IL-17 결합 분자는 약 100-200 pM의 KD 및 약 23 내지 약 35일의 생체내 반감기를 가짐); 및
    e) i) PsA 서열 8로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 중쇄 가변 도메인 (VH);
    ii) PsA 서열 10으로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 경쇄 가변 도메인 (VL);
    iii) PsA 서열 8로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 PsA 서열 10으로 제시된 아미노산 서열을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인;
    iv) PsA 서열 1, 서열 2 및 서열 3으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인;
    v) PsA 서열 4, 서열 5 및 서열 6으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인;
    vi) PsA 서열 11, 서열 12 및 서열 13으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인;
    vii) PsA 서열 1, 서열 2 및 서열 3으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 PsA 서열 4, 서열 5 및 서열 6으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인; 및
    viii) PsA 서열 11, 서열 12 및 서열 13으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VH 도메인 및 PsA 서열 4, 서열 5 및 서열 6으로 제시된 초가변 영역을 포함하는 이뮤노글로불린 VL 도메인
    으로 이루어진 군으로부터 선택된 항체를 포함하는 IL-17 항체
    로 이루어진 군으로부터 선택되는 것인 방법 또는 용도.
  37. 제36항에 있어서, IL-17 결합 분자가 항체인 방법, 용도 또는 키트.
  38. 제37항에 있어서, 항체가 세쿠키누맙인 방법, 용도 또는 키트.
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