LV12295B - Paņēmiens fenilacetāta katabolisma fermentus kodējošu gēnu inaktivācijai, iesaistītās plazmīdas un ar tām transformētas kultūras - Google Patents

Paņēmiens fenilacetāta katabolisma fermentus kodējošu gēnu inaktivācijai, iesaistītās plazmīdas un ar tām transformētas kultūras Download PDF

Info

Publication number
LV12295B
LV12295B LVP-98-281A LV980281A LV12295B LV 12295 B LV12295 B LV 12295B LV 980281 A LV980281 A LV 980281A LV 12295 B LV12295 B LV 12295B
Authority
LV
Latvia
Prior art keywords
gene
ala
inactivated
leu
phenylacetate
Prior art date
Application number
LVP-98-281A
Other languages
English (en)
Other versions
LV12295A (lv
Inventor
Jose Manuel Fernandez Canon
Marta Rodriguez Saiz
Bruno Diez Garcia
Jose Luis Barredo Fuente
Alejandro Vitaller Alba
Francisco SALTO MALDONADO
Miguel Angel PENALVA SOTO
Jose Manuel Mingot Ascencao
Original Assignee
Antibioticos, S.A.U.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Antibioticos, S.A.U. filed Critical Antibioticos, S.A.U.
Publication of LV12295A publication Critical patent/LV12295A/lv
Publication of LV12295B publication Critical patent/LV12295B/lv

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0071—Oxidoreductases (1.) acting on paired donors with incorporation of molecular oxygen (1.14)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/14—Fungi; Culture media therefor
    • C12N1/145—Fungi isolates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0012—Oxidoreductases (1.) acting on nitrogen containing compounds as donors (1.4, 1.5, 1.6, 1.7)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P37/00—Preparation of compounds having a 4-thia-1-azabicyclo [3.2.0] heptane ring system, e.g. penicillin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/645—Fungi ; Processes using fungi
    • C12R2001/66—Aspergillus
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/645—Fungi ; Processes using fungi
    • C12R2001/80—Penicillium
    • C12R2001/82—Penicillium chrysogenum

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Claims (27)

  1. LV 12295 IZGUDROJUMA FORMULA 1. Paņēmiens gēnu, kuri kodē fenilacetāta katabolisma fermentus un kuri par šo savienojumu konkurē ar penicilīna biosintēzes fermentiem, inaktivēšanai mikroorganismos, kas raksturojas ar integrējošu transformāciju homologas rekombinācijas ceļā starp vismaz vienu eksogēnu DNS savienojumu un vismaz daļu no inaktivējamā gēna sekvences. 10
  2. 2. Paņēmiens saskaņā ar 1. punktu, kurā transformanta DNS savienojums ir cikliska molekula, kura satur vismaz vienu ekspresēties spējīgu inaktivējamā gēna fragmentu.
  3. 3. Paņēmiens saskaņā ar 1. punktu, kurā transformanta DNS savienojums ir lineāra molekula, kas satur vismaz vienu DNS fragmentu, kas nav ietverts inaktivējamā gēna sekvencē, bet kas satur vismaz vienu transformācijas marķieri, kurš iejaucas tā kodējošajā apgabalā.
  4. 4. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no iepriekšējiem punktiem, kurā transformanta DNS molekula satur, pilnībā vai daļēji, tā gēna sekvences kopiju, kurš jāinaktivē ar mutāciju, labāk ar nolasīšanas sistēmas nobīdes, bezjēdzīgu vai delēcijas mutāciju, kas rezultātā dod minētā gēna funkcijas fenotipa zaudēšanu. 25
  5. 5. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no iepriekšējiem punktiem, kurā mikroorganisms, kurš ir transformācijas, kurā tiek inaktivēts gēns, objekts, ir spējīgs producēt penicilīnu G vai V.
  6. 6. Paņēmiens saskaņā ar 5. punktu, kurā penicilīnu G vai V producējošais mikroorganisms ir sēnīte.
  7. 7. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no 1.-6. punktiem, kurā transformētais mikroorganisms ir Aspergillus nidulans. 35
  8. 8. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no 1 .-6. punktiem, kurā transformētais mikroorganisms ir Penicillium chrysogenum. 2
  9. 9. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no 1.-7. punktiem, kurā izmantotais transformanta DNS savienojums var būt pilnībā vai daļēji ietverts vektorā, labāk plazmīdā pPhacA: :argB.
  10. 10. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no 1.-6. vai 8. punktu, kurā izmantotais transformanta DNS savienojums var būt pilnībā vai daļēji ietverts vektorā, labāk plazmīdā pALP696.
  11. 11. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no 1.-7. vai 9. punktu, kurā gēns. kas tiek inaktivēts, ir attēlots ar SEQ ID Nr.: 1, tā mutētas gēnu sekvences un/vai homologi gēni.
  12. 12. Paņēmiens saskaņā ar 11. punktu, kurā gēns, kas tiek inaktivēts, kodē polipeptīdu, kas attēlots ar SEQ ID Nr.: 2 vai līdzīgām sekvencēm, kas izpauž P450 fenilacetāt—2-hidroksilāzes aktivitāti.
  13. 13. Paņēmiens saskaņā ar jebkuru no 1.-6., 8 vai 10. punktu, kurā gēns. kas tiek inaktivēts, ir attēlots ar SEQ ID Nr.: 3, tā mutētas gēnu sekvences un/vai homologi gēni.
  14. 14. Paņēmiens saskaņā ar 13. punktu, kurā gēns, kas tiek inaktivēts, kodē polipeptīdu, kas attēlots ar SEQ ID Nr.: 4 vai līdzīgām sekvencēm, kas izpauž P450 fenilacetāt—2-hidroksilāzes aktivitāti.
  15. 15. Transformēta Aspergillus nidulans kultūra un no tās atvasināti mutanti, kas iekļauj vismaz vienu eksogēnu DNS savienojumu, kurš sastāv vismaz no viena gēna nošķeltas, nepilnas vai neaktīvas sekvences, kurš kodē fenilacetāta katabolisma fermentu un kurš inaktivē endogēno gēnu pēc tā integrācijas homologās rekombinācijas ceļā.
  16. 16. Transformēta A. nidulans kultūra saskaņā ar 15. punktu, kurā inaktivējamais gēns kodē fermentu, kas ir starpnieks fenilacetāta hidroksilēšanā.
  17. 17. Transformēta A. nidulans kultūra saskaņa ar 15. vai 16. punktu, kura gēns, kas tiek inaktivēts, ir phacA, kura sekvence un flankējošie 3 LV 12295 (ierobežojošie) apgabali ir aprakstīti SEQ ID Nr.: 1, tā mutētas gēnu sekvences un homologi gēni.
  18. 18. Transformēta A. nidulans kultūra saskaņā ar 17. punktu, kurā gēns, kas tiek inaktivēts, ir homologs phacA, ar izcelsmi citādu kā A. nidulans, un kura homoloģija ar A. nidulans phacA gēna DNS sekvenci ir pietiekama, lai būtu par starpnieku homologajā rekombinācijā ar A. nidulans endogēno lokusu.
  19. 19. Transformēta A. nidulans kultūra saskaņā ar jebkuru no 15.-18. punktiem, kurā gēns, kas tiek inaktivēts, kodē polipeptīdu, kas attēlots ar proteīna sekvenci SEQ ID Nr.: 2 vai līdzīgām sekvencēm, kas izpauž P450 fenilacetāt—2-hidroksilāzes aktivitāti.
  20. 20. Transformēta kultūra saskaņā ar jebkuru no 15.-19. punktiem, kas atšķiras ar to, ka tā ir A. nidulans tīrkultūra CECT20195, tās mutanti un/vai transformēti atvasinājumi.
  21. 21. A. nidulans phacA gēnu inaktivējoša plazmīda pPhacA: :argB, kā parādīta restrikcijas kartē Fig. 6, un kura ir plazmīdā pUC18, kura satur 6.8 kb (tūkstošus nukleotidu pāru) EcoRI iestarpinājumu, kurš ietver A. nidulans phacA gēnu, kas inaktivēts, iestarpinot 3.2 kb fragmentu, kurš savukārt satur A. nidulans argB gēnu.
  22. 22. Transformēta Penicillium chrysogenum kultūra un no tās atvasināti mutanti, kas satur DNS savienojumu, kas ir gēna nošķelta, nepilna vai neaktīva sekvence, kurš kodē fenilacetāta katabolisma fermentu un kurš inaktivē endogēno gēnu pēc tā integrācijas homologās rekombinācijas ceļā.
  23. 23. Transformēta P. chrysogenum kultūra saskaņā ar 22. punktu, kurā inaktivējamais gēns kodē fermentu, kas ir starpnieks fenilacetāta hidroksilēšanā.
  24. 24. Transformēta P. chrysogenum kultūra saskaņā ar 22. vai 23. punktu, kurā gēns ir phcA, kura sekvence un tā flankējošo (ierobežojošo) apgabalu sekvence ir aprakstītas SEQ ID Nr.: 3, tā mutētas gēnu sekvences un/vai homologi gēni. 4
  25. 25. Transformēta P. chrysogenum kultūra saskaņā ar jebkuru no 22.-24. punktiem, kurā gēns, kas tiek inaktivēts, kodē polipeptīdu, kas attēlots ar proteīna sekvenci SEQ ID Nr.: 4 vai līdzīgām sekvencēm, kas izpauž noteiktu P450 fenilacetāt—2-hidroksilāzes aktivitāti. 5
  26. 26. Transformēta P. chrysogenum kultūra saskaņā ar 24. punktu, kurā gēns ir A. nidulans phacA vai jebkurš cits homologs DNS savienojums, kurš izolēts no citāda avota kā P. chrysogenum, un kura homoloģija ar P. chrysogenum pahA DNS sekvenci ir pietiekama, lai būtu par starpnieku 10 homologajā rekombinācijā ar P. chrysogenum endogēno lokusu.
  27. 27. P. chrysogenum pahA gēnu inaktivējoša plazmīda pALP696, kā parādīta restrikcijas kartē Fig. 7, un kura ir plazmidā pBC KS+, kura satur 7.9 kb SalI iestarpinājumu, kurš ietver P. chrysogenum pahA gēnu, kas 15 inaktivēts, iestarpinot 2.0 kb fragmentu, kurš savukārt satur S. hindustanus bleR gēnu, kas ekspresēts P. chrysogenum gdh promotera vadībā.
LVP-98-281A 1997-04-18 1998-12-18 Paņēmiens fenilacetāta katabolisma fermentus kodējošu gēnu inaktivācijai, iesaistītās plazmīdas un ar tām transformētas kultūras LV12295B (lv)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
ES09700833A ES2125195B1 (es) 1997-04-18 1997-04-18 Procedimiento de inactivacion de genes que codifican para enzimas del catabolismo del fenilacetato, plasmidos que intervienen y cepas transformadas con los mismos.
PCT/ES1998/000101 WO1998048019A1 (es) 1997-04-18 1998-04-17 Procedimiento de inactivacion de genes que codifican para enzimas del catabolismo del fenilacetato, plasmidos que intervienen y cepas transformadas con los mismos

Publications (2)

Publication Number Publication Date
LV12295A LV12295A (lv) 1999-06-20
LV12295B true LV12295B (lv) 1999-10-20

Family

ID=8299010

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
LVP-98-281A LV12295B (lv) 1997-04-18 1998-12-18 Paņēmiens fenilacetāta katabolisma fermentus kodējošu gēnu inaktivācijai, iesaistītās plazmīdas un ar tām transformētas kultūras

Country Status (17)

Country Link
EP (1) EP0922766A1 (lv)
JP (1) JP2000512513A (lv)
KR (1) KR20000016739A (lv)
CN (1) CN1226932A (lv)
AU (1) AU6833398A (lv)
CA (1) CA2258562A1 (lv)
CZ (1) CZ417298A3 (lv)
EE (1) EE9800433A (lv)
ES (1) ES2125195B1 (lv)
HU (1) HUP0000853A2 (lv)
IL (1) IL127367A0 (lv)
LT (1) LT98186A (lv)
LV (1) LV12295B (lv)
PL (1) PL330464A1 (lv)
SK (1) SK170598A3 (lv)
WO (1) WO1998048019A1 (lv)
ZA (1) ZA983216B (lv)

Families Citing this family (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6391583B1 (en) 1998-12-18 2002-05-21 Wisconsin Alumni Research Foundation Method of producing antihypercholesterolemic agents
TWI324181B (en) 2001-04-16 2010-05-01 Martek Biosciences Corp Product and process for transformation of thraustochytriales microorganisms
ES2201913B1 (es) * 2002-07-05 2005-11-01 Jorge Gaztelumendi Lamarca Producto para el consumo humano elaborado a base de pescado y procedimiento de elaboracion.
CN1978651B (zh) * 2005-11-30 2010-11-17 华北制药集团新药研究开发有限责任公司 编码产黄青霉苯乙酸羟化酶的基因及其应用
EP1801221A1 (en) * 2005-12-22 2007-06-27 Sandoz AG Promoter sequences
CN104263729B (zh) 2009-03-16 2020-09-15 帝斯曼知识产权资产有限公司 在网粘菌门微生物中产生蛋白质

Family Cites Families (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4963487A (en) * 1985-01-03 1990-10-16 Massachusetts Institute Of Technology Method for deletion of a gene from a bacteria

Also Published As

Publication number Publication date
CZ417298A3 (cs) 1999-03-17
PL330464A1 (en) 1999-05-24
JP2000512513A (ja) 2000-09-26
AU6833398A (en) 1998-11-13
KR20000016739A (ko) 2000-03-25
LT98186A (lt) 1999-08-25
ES2125195A1 (es) 1999-02-16
SK170598A3 (en) 1999-07-12
CA2258562A1 (en) 1998-10-29
HUP0000853A2 (en) 2000-07-28
LV12295A (lv) 1999-06-20
IL127367A0 (en) 1999-10-28
EE9800433A (et) 1999-06-15
EP0922766A1 (en) 1999-06-16
WO1998048019A1 (es) 1998-10-29
ES2125195B1 (es) 1999-10-01
ZA983216B (en) 1998-10-22
CN1226932A (zh) 1999-08-25

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2983058B2 (ja) 生物学的方法
WO1997006261A2 (en) THE USE OF HOMOLOGOUS amdS GENES AS SELECTABLE MARKERS
JP3095391B2 (ja) クラスター状生合成遺伝子を用いた二次代謝産物生産増加法
JP4339400B2 (ja) 突然変異体を単離する方法、およびその相補的遺伝子をクローン化する新しい方法
US20040091958A1 (en) Recombinant materials for carotenoid production
JP2002526112A (ja) ポリペプチドの生成方法において有用な菌類転写活性化因子
CN100432099C (zh) 转录因子
US5108918A (en) Method for identifying and using biosynthetic genes for enhanced production of secondary metabolites
JP2954601B2 (ja) 二次代謝産物生産増加のための生合成遺伝子又は制御遺伝子の単離法及び使用法
LV12295B (lv) Paņēmiens fenilacetāta katabolisma fermentus kodējošu gēnu inaktivācijai, iesaistītās plazmīdas un ar tām transformētas kultūras
US5453374A (en) Trigonopsis transformant producing D-amino acid oxidase
Nara et al. Development of a transformation system for the filamentous, ML-236B (compactin)—producing fungus Penicillium citrinum
US5516679A (en) Penicillin V amidohydrolase gene from Fusarium oxysporum
CA2379796A1 (en) Pyrf gene and its use
US5882879A (en) Method for influencing β-lactam antibiotic production and for isolation of large quantities of ACV synthetase
US5925515A (en) Direct selection of transformants on acetate-containing media
US5789222A (en) P5C reductase gene from zalerion arboricloa
MXPA98010517A (en) Process for the inactivation of genes which code for enzymes for the catabolism of phenyl acetate, plasmids involved in such process and strains transformed therewith
US5747285A (en) DNA comprising regulatory regions from gene y of penicillium chrysogenum
JP3694928B2 (ja) 担子菌コリオラス属由来プロモーター活性を有するｄｎａ断片
EP0422790A2 (en) Recombinant DNA expression vectors and DNA compounds that encode acyltransferase activity of aspergillus
JPH01157393A (ja) 酵母における安定なゲノム組込みおよび外来コーディング配列の発現
JPH06256396A (ja) アクレモニウム・クリソゲナムからのβ−チューブリン、その製造および使用