PL164991B1 - Method of producing polyclonal antibodies specifically reacting with protein of the human tissue inhibitor of plasminogen activator - Google Patents

Method of producing polyclonal antibodies specifically reacting with protein of the human tissue inhibitor of plasminogen activator

Info

Publication number
PL164991B1
PL164991B1 PL30054490A PL30054490A PL164991B1 PL 164991 B1 PL164991 B1 PL 164991B1 PL 30054490 A PL30054490 A PL 30054490A PL 30054490 A PL30054490 A PL 30054490A PL 164991 B1 PL164991 B1 PL 164991B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
fragment
protein
ser
pai
antibodies
Prior art date
Application number
PL30054490A
Other languages
Polish (pl)
Inventor
Maria Swiatkowska
Czeslaw Cierniewski
Andrzej Plucienniczak
Grazyna Plucienniczak
Wojciech J Stec
Andrzej Wilk
Original Assignee
Akad Medyczna
Pan
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Akad Medyczna, Pan filed Critical Akad Medyczna
Priority to PL30054490A priority Critical patent/PL164991B1/en
Publication of PL164991B1 publication Critical patent/PL164991B1/en

Links

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Abstract

Process for producing polyclonal antibodies reacting specifically with the protein of the human tissue plasminogen activator inhibitor, by immunising animals, characterised in that the polypeptide equal to a fragment with formula (Y)a-A-(Z)b, is used for immunisation, where Y denotes amino acid sequence coded by the polylinker fragment, optimally by Glu, Ser, a=0 or 1; Z denotes sequence Glu, Ser and/or sequence coded by the polylinker fragment, b=0, 1 or 2, while A denotes sequence corresponding with fragment Asn172-Thr232 of the human tissue plasminogen activator inhibitor, while blood is taken and antibodies are isolated.

Description

Przedmiotem wynalazku jest sposób wytwarzania przeciwciał poliklonalnych reagujących specyficznie z białkiem ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu (PAI-1) przez immunizację zwierząt, pobranie krwi i izolację przeciwciał.The present invention relates to a method of producing polyclonal antibodies specifically reactive with a human tissue plasminogen activator inhibitor (PAI-1) protein by immunizing animals, collecting blood and isolating antibodies.

Aktywatory plazminogenu (PAI-1) pełnią ważną rolę podczas procesu fibrynolizy, a także w różnych innych procesach fizjologicznych, włączając proces regeneracji, owulacji, implantacji embrionu, różnicowania tkanek, transformacji nowotworowej. Precyzyjna regulacja aktywnościPlasminogen activators (PAI-1) play an important role in the process of fibrinolysis, as well as in various other physiological processes, including regeneration, ovulation, embryo implantation, tissue differentiation, and neoplastic transformation. Precise activity regulation

164 991 aktywatorów plazminogenu stanowi krytyczny element wielu biologicznych systemów. Taka regulacja może odbywać się na poziomie tworzenia i rozpuszczania skrzepu lub na poziomie interakcji aktywatorów plazminogenu z komórkami, czy też przez działanie specyficznych inhibitorów.164,991 plasminogen activators are critical components of many biological systems. Such regulation can take place at the level of clot formation and dissolution, or at the level of interaction of plasminogen activators with cells, or by the action of specific inhibitors.

Większość oznaczeń aktywności PAI jest dwuetapowa, zależy od obecności plazminy i nie odróżnia odmiennych rodzajów inhibitorów. Określenie inhibitorowej aktywności PAI mierzy się ilościowo przez zdolność do hamowania lizy włóknika znakowanego l75J, pośredniczonej aktywacją plazminogenu przez urokinazę (Loskutoff and Edington, Proc. Nat. Acad. Sci., USA, 74, 3903- 3909, 1977). W tej metodzie jedną jednostkę aktywności PAI okreśła się jako ilość białka wymaganą do zredukowania aktywności 21U UK do 50%. W celu oznaczenia ilości PAI używa się metody wiązania aktywatora plazminogenu do inhibitora (Schleef R. R., Wagner N. V., Loskkutoff D. J., J. of Cellular Physiology, 134, 269-274, 1989). Aktywność PAI można oznaczyć również posługując się metodą Verheijena, w której używa się wzrastających stężeń tPA (0-25 IU/ml), 1 (iM plazminogenu, oraz 1 μΜ fibrynogenu degradowanego bromocyjanem. W tych warunkach 1 IU PAI-1 określa ilość inhibitora, która hamuje 1 IU tPA (Verheijen J. H., Mullast D., Chang G. T. G., Kluft C., Wijngards G., Thromb. Haemostasis, 48, 266-269, 1982). W niektórych badaniach określających poziom PAI we krwi stosuje się oznaczenia, w których podstawą jest neutralizacja tPA dodanego do próbek osocza, a mierzy się pozostałą aktywność tPA. Metody te są metodami pośrednimi i nie pozwalają precyzyjnie określić poziomu tego inhibitora.Most PAI activity determinations are two-step, depend on the presence of plasmin and do not distinguish between different types of inhibitors. Determination of the inhibitory activity of PAI is quantified by the ability to inhibit the lysis of 175 J-labeled fibrin mediated by urokinase activation of plasminogen (Loskutoff and Edington, Proc. Nat. Acad. Sci., USA, 74, 3903-3909, 1977). In this method, one unit of PAI activity was defined as the amount of protein required to reduce the 21U UK activity to 50%. The method of binding the plasminogen activator to the inhibitor is used to quantify the amount of PAI (Schleef RR, Wagner NV, Loskkutoff DJ, J. of Cellular Physiology, 134, 269-274, 1989). The activity of PAI can also be determined using the Verheijen method, in which increasing concentrations of tPA (0-25 IU / ml), 1 (µM of plasminogen, and 1 μΜ of fibrinogen degraded by cyanogen bromide) are used. Under these conditions, 1 IU of PAI-1 determines the amount of the inhibitor. which inhibits 1 IU of tPA (Verheijen JH, Mullast D., Chang GTG, Kluft C., Wijngards G., Thromb. Haemostasis, 48, 266-269, 1982). based on the neutralization of tPA added to the plasma samples, and the residual activity of tPA is measured These methods are indirect methods and do not accurately determine the level of this inhibitor.

Ostatnio opracowano metodę enzymoimmunologicznego oznaczania ludzkiego PAI-1 w tekście ELIS A z wykorzystaniem przeciwciał dla tego białka. Test ten polega na tym, że inkubuje się przeciwciała dla PAI-1 z badaną próbką, w której oznacza się ten antygen i po odmyciu nieswoiście związanych białek, inkubuje się kompleks antygen-przeciwciało z przeciwciałami dla PAI-1 związanymi z peroksydazą chrzanową, po czym oznacza się antygen wykrywając znacznik.Recently, an enzyme-immunological method for the determination of human PAI-1 in ELIS A text using antibodies to this protein has been developed. In this test, the antibodies to PAI-1 are incubated with the test sample in which this antigen is determined, and after washing the non-specific bound proteins, the antigen-antibody complex is incubated with the antibodies to PAI-1 bound to horseradish peroxidase, and then the antigen is determined by detecting the label.

Wszystkie te metody wymagają zastosowania rodzimego białka PAI-1, zarówno do uzyskania krzywej wzorcowej, jak i swoistych przeciwciał. PAI-1 występuje w ilościach śladowych w płynach ustrojowych i komórkach, a uzyskanie tego białka metodami klasycznymi przez wyodrębnienie w ilościach wystarczających do przygotowania testu Elisa jest niezwykle skomplikowane i czasochłonne. Z drugiej strony otrzymywane dotychczas ludzkie białko PAI-1 jest niezwykle drogie i niezbyt dostępne.All these methods require the use of the native PAI-1 protein, both for the standard curve and for specific antibodies. PAI-1 is present in trace amounts in body fluids and cells, and obtaining this protein by classical methods by isolating it in amounts sufficient to prepare the Elisa test is extremely complicated and time-consuming. On the other hand, the human PAI-1 protein obtained so far is extremely expensive and not very accessible.

Wszystkie omówione metody otrzymania i oznaczania rodzimego PAI-1 są bardzo skomplikowane, pracochłonne i kosztowne, co zawyża w znacznym stopniu koszty całego testu.All the discussed methods of obtaining and determining the native PAI-1 are very complicated, time-consuming and expensive, which significantly increases the costs of the entire test.

Nieoczekiwanie okazało się, że możliwe jest oznaczenie białka rodzimego PAI-1, w oparciu o metodę, w której stosuje się przeciwciała otrzymane sposobem według wynalazku. Stwierdzono, że można wykorzystać pełną reakcję krzyżową w teście immunologicznym przeciwciał otrzymanych dla fragmentu białka oraz rodzimej cząsteczki PAI-1.Surprisingly, it turned out that it is possible to determine the native PAI-1 protein on the basis of the method in which the antibodies according to the invention are used. It has been found that a complete cross-reactivity can be used in the immunoassay of the antibodies obtained for the protein fragment and the native PAI-1 molecule.

W odróżnieniu od znanych metod oznaczania PAI-1, nieoczekiwanie okazało się, że jeśli zastosuje się przeciwciała otrzymane sposobem według wynalazku, fragment peptydowy, a nie całe białko służy do produkcji swoistych przeciwciał rozpoznających w ten sam sposób zarówno fragment peptydowy, jak i rodzime białko PAI-1. Fragment ten również stosuje się do uzyskania krzywej wzorcowej.In contrast to the known methods of PAI-1 determination, it was surprisingly found that when the antibodies obtained by the method according to the invention are used, the peptide fragment, and not the whole protein, serves to produce specific antibodies that recognize both the peptide fragment and the native PAI protein in the same way. -1. This fragment is also used to obtain the standard curve.

Sposób wytwarzania przeciwciał poliklonalnych reagujących specyficznie z białkiem ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, przez immunizację zwierząt, polega według wynalazku na tym, że do immunizacji stosuje się polipeptyd odpowiadający fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym Y oznacza sekwencję aminokwasów kodowaną przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser; a = 0 lub 1; Z oznacza sekwencję Glu, Ser i/lub sekwencję kodowaną przez fragment polilinkera; b = 0, 1 lub 2; natomiast A oznacza sekwencję odpowiadającą fragmentowi Asn172-Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, pobiera się krew i izoluje przeciwciała.The method of producing polyclonal antibodies specifically reactive with the protein of the human tissue plasminogen activator inhibitor by immunizing the animals consists in that for immunization a polypeptide corresponding to the fragment of formula (Y) aA- (Z) b is used, wherein Y is an amino acid sequence encoded by a polylinker fragment, preferably Glu, Ser; a = 0 or 1; Z represents the sequence Glu, Ser and / or the sequence encoded by the polylinker fragment; b = 0, 1 or 2; and A is the sequence corresponding to the Asn172-Thr232 fragment of the human tissue plasminogen activator inhibitor, blood is drawn and antibodies are isolated.

W sposobie według wynalazku korzystnie stosuje się polipeptyd odpowiadający fragmentowi cząsteczki PAI-1 od 172 do 232 aminokwasu od N-końca o sekwencji:In the method according to the invention, a polypeptide corresponding to a fragment of the PAI-1 molecule from 172 to 232 amino acids from the N-terminus with the sequence:

164 991164 991

172 177 198172 177 198

Asn-Gly-Gln-T rp-Lys—Thr—Pro—Phe—Pro—Asp-Ser Ser-Thr-His-Arg187 192 177Asn-Gly-Gln-T rp-Lys — Thr — Pro — Phe — Pro — Asp-Ser Ser-Thr-His-Arg 187 192 177

Arg-Leu-Phe—His—Lys—Ser—Asp—Gly-Ser Thr-Val-Ser—Val—Pro—Met— 202 207 212Arg-Leu-Phe — His — Lys — Ser — Asp — Gly-Ser Thr-Val-Ser — Val — Pro — Met— 202 207 212

Met-Ala-Glu-Thr-Asn-Lys-Phe-Asn-Tyr-Thr-Glu-Phe-Thr-Thr-ProAsp—Gly—His—Tyr—Tyr—Asp—Ile—Leu-Glu—Leu-Pro—Tyr—His—Gly—Asp—Met-Ala-Glu-Thr-Asn-Lys-Phe-Asn-Tyr-Thr-Glu-Phe-Thr-Thr-ProAsp — Gly — His — Tyr — Tyr — Asp — Ile — Leu-Glu — Leu-Pro— Tyr — His — Gly — Asp—

Thr.Thr.

W sposobie według wynalazku stosuje się polipeptyd otrzymany przez ekspresję zrekombinowanego DNA, korzystnie zsyntetyzowanego chemicznie cDNA o sekwencji:The method according to the invention uses a polypeptide obtained by expressing recombinant DNA, preferably chemically synthesized cDNA with the sequence:

( X ) n AACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT CCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATT(X) n AACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT CCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATT

CAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGAGATCCTGGAACTGCCCAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGAGATCCTGGAACTGCC

ATACCACGGAGACACT(X)m, gdzie X oznacza GAATCT, n przyjmuje wartość 1 lub 0, a m przyjmuje wartość 0, 1 lub 2.ATACCACGGAGACACT (X) m, where X is GAATCT, n is 1 or 0 and m is 0, 1 or 2.

Polipeptyd stosowany w sposobie według wynalazku, otrzymuje się korzystnie przy użyciu zrekombinowanego wektora do klonowania, wytworzonego przez łączenie znanymi metodami wektora z fragmentem DNA kodującym polipeptyd o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie. Wytworzoy w ten sposób fragment polipeptydowy zawiera epitopy antygenowe rozpoznawane przez przeciwciała również w rodzimej cząsteczce PAI-1.The polypeptide used in the method according to the invention is preferably obtained by using a recombinant cloning vector produced by linking the vector by known methods to a DNA fragment encoding a polypeptide of formula (Y) a -A- (Z) b, in which the symbols have the above meanings. The polypeptide fragment generated in this way contains antigenic epitopes recognized by antibodies also in the native PAI-1 molecule.

Stosowany do wytworzenia polipeptydu gen kodujący fragment polipeptydowy odpowiadający fragmentowi ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu można na przykład otrzymać z oligonukleotydowych fragmentów ligowanych in vitro.For example, the gene used to produce the polypeptide encoding a polypeptide fragment corresponding to a fragment of a human tissue plasminogen activator inhibitor can be obtained from in vitro ligated oligonucleotide fragments.

Oligonukleotydowe fragmenty można zsyntetyzować chemicznie na nośniku poprzez kolejne przyłączanie nukleozydów z zablokowanymi grupami czynnymi. Korzystnie do ochrony funkcji aminowej stosuje się grupę izopropoksyacetylową, co przedstawiono w opisie patentowym RP nr 159 234.Oligonucleotide fragments can be chemically synthesized on the support by sequentially adding blocked active group nucleosides. Preferably, an isopropoxyacetyl group is used to protect the amine function, as described in the Polish patent specification No. 159,234.

Fragmenty oligonukleotydowe zsyntetyzowane chemicznie poddaje się enzymatycznej reakcji kinazowania, w trakcie której wprowadza się fosforan na końcach 5' za pomocą kinazy polinukleotydowej i ATP. Kinazowane oligonukleotydy liguje się in vitro w dwuniciowe odcinki ograniczone sekwencjami rozpoznawanymi przez enzymy restrykcyjne. Zligowane odcinki klonuje się w wektorze pomocniczym, stosując właściwe miejsce restrykcyjne polilinkera. Poprawność sekwencji produktów ligowania i klonowania tych fragmentów sprawdza się poprzez sekwencjonowanie metodą Maxama- Gilberta. Można stosować różne wektory pomocnicze, np. plazmidowe lub fagowe, przy czym korzystne są plazmidy, np. pUC19. Sklonowane w wektorze odcinki DNA namnaża się w komórkach gospodarza, którymi mogą być bakterie, drożdże i inne. Wektory z wklonowanymi odcinkami izoluje się, a następnie odcinki odzyskuje się po trawieniu restryktazami na drodze elektroforezy w żelu poliakryloamidowym. Odzyskane odcinki włącza się do wektora ekspresyjnego po trawieniu odpowiednimi enzymami restrykcyj164 991 nymi. Na tym etapie stosuje się różne wektory ekspresyjne, korzystnie plazmidowe lub fagowe. Przykładowo plazmid ekspresyjny pWR450.1. zawiera gen kodujący β-galaktozydazę. Komórki gospodarza, korzystnie bakterii, transformowane zrekombinowanym wektorem, są po namnożeniu źródłem fragmentu białka ludzkiego PAI-1.Chemically synthesized oligonucleotide fragments are subjected to an enzymatic kinase reaction in which phosphate is introduced at the 5 'ends using polynucleotide kinase and ATP. The kinased oligonucleotides are ligated in vitro into double-stranded stretches delimited by restriction enzyme recognition sequences. The ligated segments are cloned into a helper vector using the appropriate polylinker restriction site. The correctness of the sequence of the ligation and cloning products of these fragments is checked by sequencing according to the Maxam-Gilbert method. Various helper vectors, e.g. plasmid or phage vectors, can be used, with plasmids, e.g. pUC19 being preferred. DNA stretches cloned in the vector are multiplied in host cells, which can be bacteria, yeast and others. Vectors with cloned sections are isolated, and the sections are then recovered after digestion with restrictionases by polyacrylamide gel electrophoresis. The recovered segments are incorporated into the expression vector after digestion with the appropriate restriction enzymes. Various expression vectors, preferably plasmid or phage vectors, are used in this step. For example, the pWR450.1 expression plasmid. contains the gene encoding β-galactosidase. Host cells, preferably bacteria, transformed with the recombinant vector, are the source of the human PAI-1 protein fragment after amplification.

Wytworzony tą metodą fragment białka PAI-1 można stosować do otrzymywania przeciwciał sposobem według wynalazku, a także różnymi znanymi metodami oraz do wykreślenia krzywej wzorcowej niezbędnej do ilościowego oznaczania PAI-1.The fragment of the PAI-1 protein produced by this method can be used for the production of antibodies according to the invention as well as by various known methods and for the drawing of a standard curve necessary for the quantification of PAI-1.

Otrzymane sposobem według wynalazku przeciwciała można zastosować do oznaczania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu oraz do otrzymania testu diagnostycznego do oznaczania tego antygenu.The antibodies obtained by the method of the invention can be used to determine the antigen of a human tissue plasminogen activator inhibitor and to obtain a diagnostic test for the determination of this antigen.

Przykładowy sposób oznaczania antygenu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu polega na tym, że badaną próbkę, korzystnie materiału biologicznego kontaktuje się z otrzymanymi sposobem według wynalazku przeciwciałami dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie, po czym oznacza się wytworzony kompleks antygen-przeciwciało.An exemplary method of determining the antigen of a human tissue plasminogen activator inhibitor is that the test sample, preferably of biological material, is contacted with the antibodies obtained by the method according to the invention for the polypeptide corresponding to the fragment of formula (Y) aA- (Z) b, in which the symbols have the above-mentioned symbols. the meaning followed by determining the antigen-antibody complex produced.

W innej przykładowej metodzie najpierw wytwarza się kompleks dwuskładnikowy antygenu PAI-1 w próbce z pierwszym przeciwciałem zdolnym do reagowania ze wspomnianym antygenem, po czym wytwarza się kompleks trójskładnikowy przez skontaktowanie kompleksu dwuskładnikowego z drugim przeciwciałem zdolnym do reagowania ze wspomnianym antygenem, przy czym jako jedno z tych przeciwciał stosuje się otrzymane sposobem według wynalazku przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie. Obecność kompleksu trójskładnikowego wykrywa się za pomocą sygnału tworzonego przez odczynnik dający się oznaczyć analitycznie lub wyznakowanego przeciwciała przeciwimmunoglobulinowego.In another exemplary method, the PAI-1 antigen binary complex in the sample is first produced with a first antibody capable of reacting with said antigen, and then the ternary complex is formed by contacting the binary complex with a second antibody capable of reacting with said antigen, one of which is of these antibodies, the antibodies according to the invention are used for the polypeptide corresponding to the fragment of formula (Y) aA- (Z) b in which the symbols have the above meanings. The presence of the ternary complex is detected by a signal generated by an analytically measurable reagent or a labeled anti-immunoglobulin antibody.

Badaną próbkę, w której wykrywa się i oznacza antygen PAI-1, kontaktuje się i inkubuje z przeciwciałami reagującymi specyficznie z tym antygenem. Utworzenie kompleksu dwuskładnikowego antygen-przeciwciało wykrywa się i oznacza za pomocą środka wykrywającego i sygnalizującego reakcję immunologiczną, jak na przykład przeciwciało reagujące specyficznie z PAI-1 znakowane odczynnikiem dającym się oznaczyć analitycznie.A test sample, in which the PAI-1 antigen is detected and determined, is contacted and incubated with antibodies reactive specifically with the antigen. The formation of a binary antigen-antibody complex is detected and determined by an immunological detection and signaling agent such as, for example, an antibody reactive specifically with PAI-1 labeled with an analytically determinable reagent.

Środek wykrywający i sygnalizujący reakcję immunologiczną może być obecny podczas inkubowania antygenu z przeciwciałem. Na przykład można bezpośrednio wyznakować przeciwciała kontaktowane z badaną próbkąj po przemyciu produktu reakcji uzyskać sygnał. Środkiem jest wówczas sam znacznik. Środek wykrywający można też dodać dopiero po wytworzeniu kompleksu dwuskładnikowego i usunięciu nieprzereagowanego materiału. Wykrywanie i oznaczanie prowadzi się wówczas następująco.An agent for detecting and signaling an immune response may be present when the antigen is incubated with the antibody. For example, the antibodies contacted with the test sample can be directly labeled and signal is obtained after washing the reaction product. The center is then the marker itself. The detection agent can also be added only after the formation of the two-component complex and removal of unreacted material. Detection and determination then proceed as follows.

Dwuskładnikowy kompleks antygen-przeciwciało po odmyciu kontaktuje się z drugim przeciwciałem reagującym specyficznie z PAI-1, przy czym jako jedno z tych przeciwciał stosuje się przeciwciało dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie. Pozostałym (pierwszym lub drugim) przeciwciałem może być przeciwciało dla całej cząsteczki PAI-1. Otrzymuje się wówczas kompleks trójskładnikowy przeciwciało-antygen-przeciwciało. Drugie przeciwciała mogą być bezpośrednio znakowane odczynnikiem dającym się oznaczyć analitycznie. Alternatywnie, jako środek stosuje się układ dwuskładnikowy zawierający drugie przeciwciała tworzące kompleks trójskładnikowy, który wykrywa się za pomocą przeciwciała przeciwimmunoglobulinowego.After washing, the two-component antigen-antibody complex is contacted with a second antibody specifically reactive with PAI-1, one of these antibodies being the antibody to the polypeptide corresponding to the fragment of formula (Y) aA- (Z) b, in which the symbols have the above given meaning. The residual (first or second) antibody can be the antibody to the entire PAI-1 molecule. The ternary antibody-antigen-antibody complex is then obtained. Second antibodies may be directly labeled with an analytically determinable reagent. Alternatively, the agent is a two-component system containing second antibodies forming a ternary complex that is detected by an anti-immunoglobulin antibody.

Do znakowania można stosować enzym, biotynę, izotop promieniotwórczy, przykładowo 125J lub inne znane odczynniki. Wykrywanie i oznaczanie prowadzi się za pomocą sygnału wytwarzanego przez znacznik.An enzyme, biotin, radioisotope, for example 125 J, or other known reagents can be used for labeling. Detection and determination are carried out by means of the signal produced by the label.

W tak prowadzonym procesie oznaczania lub wykrywania badaną próbkę, oznaczamy antygen lub jedno z przeciwciał, korzystnie pierwsze, unieruchamia się na stałym nośniku, takim jak płytka plastikowa, bibuła nitrocelulozowa lub inne.In such a determination or detection process, the test sample is marked with an antigen or one of the antibodies, preferably the first, is immobilized on a solid support, such as a plastic plate, nitrocellulose paper or other.

Wykrywanie i oznaczanie dogodnie jest prowadzić za pomocą testu diagnostycznego. Przykładowy test diagnostyczny zawiera przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie, ewentualnieDetection and determination is conveniently carried out by a diagnostic test. An exemplary diagnostic test comprises antibodies to a polypeptide corresponding to the fragment of formula (Y) a-A- (Z) b, wherein the symbols have the above meanings, optionally

164 991 unieruchomione na stałym nośniku lub rozpuszczone w fazie ciekłej. Przeciwciała są związane z odczynnikiem dającym się wykryć analitycznie.164,991 immobilized on a solid support or dissolved in the liquid phase. The antibodies are bound to an analytically detectable reagent.

Alternatywnie test diagnostyczny zawiera pierwsze przeciwciała reagujące specyficznie z białkiem ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu oraz układ do wykrywania kompleksu antygen-przeciwciało zawierający drugie przeciwciała zdolne do specyficznego reagowania z ludzkim inhibitorem tkankowego aktywatora plazminogenu i ewentualnie przeciwciała przeciwimmunoglobulinowe, przy czym jednez tych przeciwciał stanowią przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie. Korzystnie pierwsze przeciwciała są związane z fazą stałą lub ciekłą.Alternatively, the diagnostic assay comprises first antibodies reactive specifically with a human tissue plasminogen activator inhibitor protein, and an antigen-antibody complex detection system comprising second antibodies capable of specifically reacting with a human tissue plasminogen activator inhibitor, and optionally anti-immunoglobulin antibodies, one of these antibodies being antibodies to the polypeptide. corresponding to the fragment of formula (Y) a -A- (Z) b, wherein the symbols are as defined above. Preferably the first antibodies are bound to a solid or a liquid phase.

Test może dodatkowo zawierać nośnik stały lub ciekły dla związania próbki zawierającej antygen.The test may additionally contain a solid or a liquid carrier to bind the sample containing the antigen.

Układ do wykrywania kompleksu antygen-przeciwciało zawiera drugie przeciwciała bezpośrednio związane z odczynnikiem dającym się wykryć analitycznie albo też układ ten zawiera trzecie przeciwciała przeciwimmunoglobulinowe związane ze znacznikiem.The system for detecting an antigen-antibody complex comprises second antibodies directly linked to an analytically detectable reagent, or the system comprises third anti-immunoglobulin antibodies bound to a label.

W sposobie i testach do oznaczania ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu można stosować przeciwciała dla polipeptydu odpowiadającego fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie wytworzone różnymi metodami.In the method and assays for determining a human tissue plasminogen activator inhibitor, antibodies to a polypeptide corresponding to a fragment of formula (Y) a-A- (Z) b, wherein the symbols have the above meanings made by various methods.

Celem uproszczenia w opisie i przykładach używane są następujące skróty:For simplicity, the following abbreviations are used in the description and examples:

A: adeninaA: adenine

C: cytozynaC: cytosine

G: guaninaG: guanine

T: tyminaT: thymine

Ala: alaninaAla: alanine

Arg: arginiaArg: arginia

Asn: asparaginaAsn: asparagine

Asp: kwas asparaginowyAsp: aspartic acid

Cys: cysteinaCys: cysteine

Gin: glutaminaGin: glutamine

Glu: kwas glutaminowyGlu: glutamic acid

Gly: glicynaGly: glycine

His: histydynaHis: Histidine

Ile: izoleucynaHow much: isoleucine

Leu: leucytynaLeu: leucitin

Lys: lizynaLys: lysine

Met: metioninaMet: methionine

Phe: fenyloalaninaPhe: phenylalanine

Pro: proiinaPro: proiina

Ser: serynaCheese: serine

Thr: treonmaThr: threonma

Trp: rryptoannTrp: rryptoann

Tyr: yy/rozynaTyr: yy / rosina

Val: waHnaVal: waHna

DNA: kwas deoksyrybonukleinowy cDNA: komplementarny DNADNA: deoxyribonucleic acid cDNA: complementary DNA

Tris-HCl: chlorowodorek trójhydroksymrtrloaminometanuTris-HCl: trihydroxymrtrloaminomethane hydrochloride

EDTA: kwas etylenodwuaminocztrrooctowyEDTA: ethylenediaminetroacetic acid

10xbufor Eco R1 100 mM Tris-HCl pH 7,510x Eco R1 buffer 100 mM Tris-HCl pH 7.5

M NaCI mM β- merkaptoetanolM NaCl mM β-mercaptoethanol

10xbufor do kinazowania 0,7 M Tris HCl pH 7,610x kinase buffer 0.7 M Tris HCl pH 7.6

0,1 MMgCl2 50 mM ditiotreitol0.1 MMgCl2 50 mM dithiothreitol

164 991164 991

10xbufor ligacyjny: 10x ligation buffer: 660 mM Tris-HCl pH 7,6 50 mM MgCl2 50 mM ditiotreitol 10 mM ATP660 mM Tris-HCl pH 7.6 50 mM MgCl 2 50 mM dithiothreitol 10 mM ATP Bufor do ekstrakcji: Extraction buffer: 50 mM Tris-HCl pH 8,0 300 mM octan sodu 0,2% SDS 4 mM EDTA 50 mM Tris-HCl pH 8.0 300 mM sodium acetate 0.2% SDS 4mM EDTA Pożywka LB LB medium 10 g Bacto Trypton 5 g Yeast Extract 5 g NaCl na 1 litr roztworu 10 g Bacto Trypton 5 g of Yeast Extract 5 g of NaCl per liter of solution Bufor TE TE buffer 10 mM Tris-HCl pH 8,0 1 mM EDTA 10 mM Tris-HCl pH 8.0 1mM EDTA Bufor z SDS SDS buffer 10 g Tris-HCl pH 8,0 77 g glicyny 1 g SDS na 1 litr roztworu 10 g Tris-HCl pH 8.0 77 g of glycine 1 g of SDS per liter of solution Bufor do lizy komórek Cell lysis buffer 150 mg Tris 400 mg SDS 1 ml β- merkaptoetanol 2 ml gl ic^i^c^lu 7 ml wody 150 mg of Tris 400 mg of SDS 1 ml of β-mercaptoethanol 2 ml of gl and ic ^ and ^ c ^ lu 7 ml of water Bufor R I Buffer R I 50 mM glukoza 10 mM EDTA 25 mM Tris-HCl pH 8,0 4 mg/ml lizozymu (Pharmacia) 50 mM glucose 10mM EDTA 25 mM Tris-HCl pH 8.0 4 mg / ml lysozyme (Pharmacia) Bufor R II Buffer R II 0,2 M NaOH 1<% SDS 0.2 M NaOH 1 <% SDS Bufor R III Buffer R III 60 ml 5 M octan potasu 11.5 ml kwas octowy lodowaty 28.5 ml H20 60 ml of 5M potassium acetate 11.5 ml glacial acetic acid 28.5 ml of H20

DDT: ditiotreitolDDT: dithiothreitol

PMSF: fluorek kwasu fenylometylosulfonowegoPMSF: phenylmethylsulfonic acid fluoride

SDS: siarczan dodecylu soduSDS: sodium dodecyl sulfate

BSA: albumina surowicy wołu (Bovine Serum Albumin)BSA: Bovine Serum Albumin

PBS: zbuforowany roztwór soli fizjologicznejPBS: buffered saline solution

ATP: trójfosforan adeozynyATP: adosine triphosphate

HPLC: wysokociśnieniowa chromatografia cieczowaHPLC: high pressure liquid chromatography

EDTA: etylenodiaminotetraoctanEDTA: ethylenediaminetetraacetate

Na załączonych rysunkach fig. 1 przedstawia wykres hydrofobowości łańcucha polipeptydowego PAI-1. Fig. 2 przedstawia sekwencję fragmentu genu ludzkiego PAI-1 podzieloną na fragnenty syntetyzowane chemmicznie. Fig. 3 przedstawia schemat konstrukcji fragmentu genu dla PAI-1 sklonowanego w wektorze rekombinacyjnym pUC-19 oraz ekspresyjnym pWR 450. Fig. 4 przedstawia elektroforezę w żelu poliakryloamidowym zawierającym SDS ekstraktów białkowych otrzymanych z komórek E. coli oraz oczyszczonego kompleksu białkowego PAI-1 z β- galaktozydazą: 1 - ciałka inkluzyjne rozpuszczone w zbuforowanym roztworze 6-molowego mocznika, 2 - oczyszczone białko hydrofobowe β-galaktozydaza-fragment peptydowy PAI-1. Fig. 5 przedstawia schemat rozbicia kompleksu białkowego i oczyszczania fragmentu Asn172-Thr232 PAI-1. Przedstawione odcinki β- galaktozydazy przypadają na długość od 4 do 182 aminokwasów. Fragment PAI-1 po rozbiciu kompleksu składa się z 61 aminokwasów.In the accompanying drawings, Figure 1 is a graph of the hydrophobicity of the PAI-1 polypeptide chain. Fig. 2 shows the sequence of the human PAI-1 gene fragment divided into chemically synthesized fragments. Fig. 3 shows a construction diagram of a gene fragment for PAI-1 cloned in the recombinant pUC-19 and expression vector pWR 450. Fig. 4 shows the SDS-polyacrylamide gel electrophoresis of protein extracts obtained from E. coli cells and the purified PAI-1 protein complex from β-galactosidase: 1 - inclusion bodies dissolved in a buffered solution of 6-molar urea, 2 - purified hydrophobic protein β-galactosidase-PAI-1 peptide fragment. Figure 5 shows a scheme for the disruption of the protein complex and the purification of the Asn172-Thr232 fragment of PAI-1. The β-galactosidase stretches shown are 4 to 182 amino acids long. The PAI-1 fragment after disruption of the complex consists of 61 amino acids.

Wynalazek jest bliżej wyjaśniony w przykładach wykonania nieograniczających jego zakresu.The invention is explained in more detail in non-limiting embodiments.

164 991164 991

Przykład I.Example I.

Etap 1.Level 1.

A. Synteza oligonukleotydów.A. Oligonucleotide synthesis.

Syntezę 10 oligonukleotydowych fragmentów (fig. 2) przeprowadza się metodą amidofosforynową na stałym nośniku. Jako nośnik stosuje się szkło o kontrolowanej porowatości, typu LCA-CPG, ze związaną pierwszą jednostką nukleozydową. Jednostka ta ma przyłączoną na końcu 5’-OH deoksyrybozy blokującą grupę kwasolabilną - dimetoksytrityl (DMT), którą usuwa się w środowisku kwaśnym. Odsłonięta w ten sposób grupa 5'-OH jednostki nukleozydowej przyłącza prekursor kolejnej jednostki: 3’-amidofosforyn odpowiedniego nukleozydu. Za pomocą jodu w obecności wody dokonuje się utlenienia grupy fosforynowej do fosforanu. Następnie usuwa się DMT z przyłączonej jednostki - tym samym cykl rozpoczyna się na nowo. W celu usunięcia nieprzereagowanych jednostek z wolnymi grupami 5'-OH stosuje się t. zw. capping, tj. zablokowanie pomyłkowych sekwencji przez acetylowanie bezwodnikiem octowym w obecności aktywatorów. Po utworzeniu żądanego oligonukleotydu odcina się go od złoża i usuwa inne grupy wodnym roztworem amoniaku, oczyszcza elektroforetycznie, następnie odsala metodą HPLC. (Waters C-18 RP, 10 gm). Oligonukleotydy przechowuje się w porcjach po ok. 0,5 OD.The synthesis of 10 oligonucleotide fragments (Fig. 2) is carried out by the phosphoramidite method on a solid support. A controlled pore glass, LCA-CPG type, bonded to the first nucleoside unit is used as the support. This unit has an acid-labile blocking group dimethoxytrityl (DMT) attached to the 5'-OH deoxyribose terminus, which is removed in an acidic environment. The thus exposed 5'-OH group of the nucleoside unit joins the precursor of the next unit: the 3'-phosphoramidite of the corresponding nucleoside. With the help of iodine in the presence of water, the phosphite group is oxidized to phosphate. The DMT is then removed from the attached unit - thereby starting the cycle all over again. To remove unreacted units with free 5'-OH groups, the so-called capping, ie blocking of wrong sequences by acetylation with acetic anhydride in the presence of activators. After formation of the desired oligonucleotide, it is cleaved from the bed and other groups are removed with aqueous ammonia, purified by electrophoresis, then desalted by HPLC. (Waters C-18 RP, 10 gm). Oligonucleotides are stored in aliquots of approx. 0.5 OD.

B. Proces kinazowania i ligacji.B. The kinase and ligation process.

Poszczególne fragmenty nici DNA rozpuszcza się w wodzie destylowanej, tak aby w 5 gl znajdował się 1 gg fragmentu. Miesza się po 5 gl roztworu fragmentów od 1 do 5 (I nić DNA) i od 5 do ΊΟ (II nić DNA). Do mieszaniny fragmentów dodaje się 0,1 objętości buforu do kinazowania (50 mM Tris-HCl, 5 gM MgCk), 5 gl 20 gM ATP, 1 gl kinazy polinukleotydowej B (T4 polinukleotide kinase). Reakcję prowadzi się przez 4 godziny w temperaturze 37°C. Miesza się obie nici i inkubuje przez 20 min. w temperaturze 100°C. Po powolnym ostudzeniu dodaje się do każdej próbki po 0,1 objętości buforu do ligacji, po 1 g l 200 mM ATP, 1 gl ligazy T4. Po dokładnym wymieszaniu reakcję prowadzi się przez 12 godzin w temperaturze 4°C.The individual fragments of the DNA strand are dissolved in distilled water so that there is 1 gg of the fragment in 5 gL. 5 g of the solution of fragments 1 to 5 (1st strand of DNA) and 5 to ΊΟ (2nd strand of DNA) are mixed. 0.1 volumes of kinase buffer (50 mM Tris-HCl, 5 gM MgCk), 5 gM of 20 gM ATP, 1 g of polynucleotide kinase B (T4 polynucleotide kinase) are added to the fragment mixture. The reaction is carried out for 4 hours at 37 ° C. Both strands are mixed and incubated for 20 min. at 100 ° C. After slow cooling, 0.1 volume of ligation buffer, 1 g and 200 mM ATP, 1 g of T4 ligase are added to each sample. After mixing thoroughly, the reaction is run for 12 hours at 4 ° C.

C. Hydroliza enzymami.C. Hydrolysis with enzymes.

Do rozpuszczonego DNA (80 gl) dodaje się 10x 10 gl buforu EcoRi, 2U restryktazy EcoRi (firmy Pharmacia) oraz wody do objętości 100 gl. Mieszaninę inkubuje się w temperaturze 37°C przez 2 godziny. Po tym czasie DNA strąca się etanolem, dodając 3 objętości alkoholu etylowego (99,8%), wymraża się w -20°C przez 5 minut, a następnie odwirowuje się przy 15 tys. obr., przez 5 minut. Osad rozpuszcasięw20 gl buforu TE. W ten sam sposób postępuje się podczas hydrolizy restryktazą Pst I.To the dissolved DNA (80 µl) is added 10 × 10 µl of EcoRi buffer, 2U of EcoRi restrictionase (from Pharmacia) and water to a volume of 100 µl. The mixture is incubated at 37 ° C for 2 hours. After this time, the DNA was precipitated with ethanol by adding 3 volumes of ethyl alcohol (99.8%), frozen at -20 ° C for 5 minutes, and then centrifuged at 15,000. rotate for 5 minutes. The pellet is dissolved in 20 gL of TE buffer. The same is done for the hydrolysis with Pst I-restrictionase.

D. Rozdział elektroforetyczny.D. Electrophoretic separation.

W celu sprawdzenia czy zligowane fragmenty DNA mają odpowiednią długość, rozdziela się je w 8% żelu poliakryloamidowym z SDS w TBE. Rozdział prowadzi się przy napięciu 130 V w ciągu 3 godzin. Żel zabarwia się bromkiem etydyny (o,5 gl/ml - firmy Serva) przez 20 minut w temperaturze pokojowej, następnie płucze się 2x wodą destylowaną. Rozdzielone produkty obserwuje się pod lampą UV. W celu oceny wielkości fragmentów DNA podczas elektroforezy używa się następujących wzorców: pUC trawiony Msp, pUC trawiony Bsp RI. Zligowane fragmenty posiadają oczekiwaną długość. Po elektroforezie sprawdzającej wykonuje się elektroforezę preparatywną i uzyskuje się tą drogą fragment, który następnie liguje się z plazmidem pUC trawionym Eco RI i Pst I w sposób wyżej opisany.In order to check that the ligated DNA fragments are of the correct length, they are separated on an 8% SDS polyacrylamide gel in TBE. The separation is carried out at a voltage of 130 V for 3 hours. The gel is stained with ethidium bromide (0.5 g / ml - by Serva) for 20 minutes at room temperature, then rinsed 2x with distilled water. The separated products are observed under a UV lamp. The following standards were used to estimate the size of the DNA fragments during electrophoresis: pUC digested with Msp, pUC digested with Bsp RI. The ligated fragments are of the expected length. After checking electrophoresis, preparative electrophoresis is performed, and a fragment is obtained this way, which is then ligated with the pUC plasmid digested with Eco RI and Pst I as described above.

E. Przygotowanie kompetentnych komórek.E. Preparation of competent cells.

Z płytki z wysianymi bakteriami DH5, pobiera się jedną kolonię, którą szczepi się na 5 ml pożywki Lb. Bakterie hoduje się w temperaturze 37°C przez 18 godzin. Do 100 ml pożywki LB dodaje się 2 ml otrzymanej hodowli i prowadzi się hodowlę do gęstości optycznej OD 600 = 0,3. Zawiesinę bakterii zwirowuje się (5 tys. obr. 20 min.), a osad bakteryjny schładza się i zawiesza w 50 ml buforu SB i umieszcza w temperaturze 0°C. Zwirowuje się jak wyżej, a osad zawiesza w 1/12 objętości wyjściowej buforem SB. Inkubuje się 20 minut w temperaturze 0°C. Po tym czasie z zawieszonych komórek pobiera się do sterylnych probówek po 200 gl zawiesiny komórek i inkubuje 30 minut w 0°C. Dodaje się 7 gl DTT i plazmidy (20 gl). Inkubuje się w lodzie (0°C) 30 minut, a następnie 45 sekund w 45°C. Ochładza się w lodzie i dodaje 800 glOne colony is picked from the DH5 plate and inoculated onto 5 ml of Lb medium. The bacteria are grown at 37 ° C for 18 hours. 2 ml of the obtained culture are added to 100 ml of LB medium and the culture is cultivated to an optical density of OD 600 = 0.3. The bacterial suspension is centrifuged (5,000 rotations, 20 minutes), and the bacterial pellet is cooled and suspended in 50 ml of SB buffer and placed at 0 ° C. It is centrifuged as above and the pellet is suspended in 1/12 of the original volume in SB buffer. Incubation is made for 20 minutes at 0 ° C. After this time, 200 µl of the cell suspension are withdrawn from the suspended cells into sterile tubes and incubated for 30 minutes at 0 ° C. 7 µl of DTT and plasmids (20 µl) are added. Incubation on ice (0 ° C) for 30 minutes followed by 45 seconds at 45 ° C. It is cooled in ice and added 800 g

164 991 pożywki LB, a następnie inkubuje 1 godzinę w 37°C. Po tym czasie posiewa się na płytki. Wylewa się 200 μΐ mieszaniny ligacyjnej na płytkę i inkubuje się w 37°C przez 18 godzin.164,991 LB media, then incubated for 1 hour at 37 ° C. After this time, it is seeded into plates. 200 µL of the ligation mixture is poured onto the plate and incubated at 37 ° C for 18 hours.

F. Analiza otrzymanych transformantów.F. Analysis of the obtained transformants.

Po 18 godzinach na płytce z wysianą mieszaniną transformacyjną obserwuje się pojedyncze kolonie. Do dalszej analizy wybiera się 10 kolonii. 5 ml pożywki szczepi się pojedynczymi koloniami i hoduje w 37°C przez 18 godzin, a następnie izoluje plazmidowy DNA. Preparatyka plazmidowego DNA z 5 ml pożywki przebiega w następujący sposób.Single colonies are observed on the plate with the inoculated transformation mixture after 18 hours. 10 colonies are selected for further analysis. 5 ml of medium is inoculated with single colonies and cultured at 37 ° C for 18 hours, followed by isolation of plasmid DNA. Preparation of plasmid DNA from 5 ml of medium is as follows.

Bakterie zawirowuje się (5 minut 5 obr./min.). Osad bakteryjny zawiesza się w 200 μΐ buforu RI i przetrzymuje 5 minut w temperaturze 0°C. Dodaje się 400 μΐ RII (0°C), a następnie 300 μΐ RIII (0°C). Całość zawirowuje się (15 tys. obr./min., 5 minut). Supematant przenosi się znad osadu do nowej probówki i dodaje się 2,5 objętości izopropanolu. Wymraża się w -20°C, zawirowuje, osad płucze 70% etanolem i suszy nad próżnią. Osad rozpuszca się w 200 μΐ TE i dodaje 20 pl roztworu RNazy o stężeniu 1 mg/ml. Inkubuje się 30 minut w 37°C. Dodaje się 200 fil fenolu. Zbiera się fazę wodną i dodaje 200 μ l mieszaniny chloroform/alkohol izoamylowy (24 : 1, v/v). Zawirowuje się, zbiera supematant, czynność powtarza się jeszcze raz. Do fazy wodnej dodaje się 0,1 objętości 3 M octanu sodu (pH = 5,2) oraz 2,5 objętości etanolu i wymraża 30 minut w -20°C. Zawirowuje się (15 tys. obr./min.), a osad przemywa 70% etanolem i suszy. Osad plazmidowego DNA rozpuszcza się w 40 |il buforu TE.The bacteria are swirled (5 minutes 5 rpm). The bacterial pellet is resuspended in 200 µΐ RI buffer and kept for 5 minutes at 0 ° C. 400 µΐ RII (0 ° C) is added followed by 300 µΐ RIII (0 ° C). The whole thing is spinning (15,000 rpm, 5 minutes). The supernatant is transferred from the pellet to a new tube and 2.5 volumes of isopropanol are added. It is frozen at -20 ° C, centrifuged, rinsed with 70% ethanol and dried in a vacuum. The pellet is dissolved in 200 µΐ TE and 20 µl of a 1 mg / ml RNase solution is added. Incubation is 30 minutes at 37 ° C. 200 µl of phenol are added. The aqueous phase is collected and 200 µl of a mixture of chloroform / isoamyl alcohol (24: 1, v / v) are added. The supernatant is swirled, the activity is repeated once more. 0.1 volumes of 3M sodium acetate (pH = 5.2) and 2.5 volumes of ethanol are added to the aqueous phase and frozen for 30 minutes at -20 ° C. It is swirled at (15,000 rpm), and the precipitate is washed with 70% ethanol and dried. The plasmid DNA pellet is dissolved in 40 µl TE buffer.

W celu wybrania klonu zawierającego plazmid pUC 19 z wklonowanym dwuniciowym fragmentem, przeprowadza się analizę otrzymanych dNa plazmidowych przy użyciu enzymów restrykcyjnych EcoRI i Pst I, a produkty trawienia rozdziela się w żelu poliakryloamidowym. Trawienie przeprowadza się jak w punkcie C, a rozdział elektroforetyczny jak w D.In order to select a clone containing the pUC 19 plasmid with the cloned double-stranded fragment, analysis of the obtained plasmid dNa is performed with the restriction enzymes EcoRI and Pst I, and the digests are separated on a polyacrylamide gel. Etching is performed as in point C and electrophoretic separation as in D.

G. Sprawdzenie sekwencji sklonowanych fragmentów.G. Check the sequence of cloned fragments.

W celu upewnienia się czy sekwencja sklonowanego fragmentu jest prawidłowa, fragmenty sekwencjonuje się metodą Maxama i Gilberta (Maxam & Gilbert, Methods in Enzymology, 1980, 65).In order to ascertain whether the sequence of the cloned fragment is correct, the fragments are sequenced by the method of Maxam and Gilbert (Maxam & Gilbert, Methods in Enzymology, 1980, 65).

H. Konstrukcja wektora ekspresyjnego.H. Construction of the expression vector.

Sprawdzony dwuniciowy fragment DNA kodujący polipeptyd Asnm- Thr232, liguje się z wektorem ekspresyjnym pWR.450 trawionym enzymami restrykcyjnymi EcoRI i Pst I. Uzyskuje się zrekombinowany plazmid ekspresyjny pW-PAI-1. Transformowanie komórek bakteryjnych prowadzi się jak w punkcie E.A verified double-stranded DNA fragment encoding the Asnm-Thr232 polypeptide is ligated into the pWR.450 expression vector digested with the restriction enzymes EcoRI and Pst I. A recombinant expression plasmid pW-PAI-1 is obtained. The transformation of bacterial cells is carried out as in point E.

I. Oczyszczanie ciałek inkluzyjnych.I. Purification of inclusion bodies.

Bakterie z kolonii bakteryjnej zawierającej zrekombinowany plazmid przenosi się do probówki zawierającej 1 ml pożywki LB + 5 μ l ampicyliny o stężeniu 100 pg/ml i inkubuje przezBacteria from the bacterial colony containing the recombinant plasmid are transferred to a tube containing 1 ml LB medium + 5 μl ampicillin at a concentration of 100 pg / ml and incubated for

2-5 godzin w temperaturze 37°C, z ciągłym wytrząsaniem. Zawiesinę bakterii namnożonych w tej probówce przenosi się do kolby zawierającej 1 l pożywki LB + 1 ml ampicyliny o stężeniu 100 μg/ml. Hodowlę prowadzi się 14 godzin, w temperaturze 37°C z ciągłym wytrząsaniem. Następnie bakterie zwirowuje się (15 min., 5000 obr./min.) i osad zawiesza się w 200 ml 0,1 M CaCl2 (buforowanym Trisem, pH = 7,5). Po inkubacji przez 20 minut w łaźni lodowej, zawiesinę wiruje się przez 20 minut przy 12000 obr./min. w temperaturze +4°C i osad ponownie zawiesza się w 200 ml 0,1 M CaCl2. Po kolejnej inkubacji przez 2 godziny w łaźni lodowej zawiesinę wiruje się ( w dwóch probówkach wirowniczych) j.w. Osad zawiesza się w 20 ml (do obu probówek dodaje się po 20 ml) buforu fosforanowego, pH 6,2, a następnie dodaje się po 200 μΐ 1 M glicerolu i 400 μΐ 1 % glicerolu do obu probówek. Ogrzewa się je do temperatury pokojowej, dodaje po 40 p1 0,5 M EDTA, pH 8,0 i po krótkiej inkubacji schładza w łaźni lodowej do temperatury około 0°C. Następnie probówki wstawia się na 1 minutę do łaźni o temperaturze 42°C (szok termiczny). Wiruje jak wyżej. Osad po schłodzeniu zawiesza się w 100 ml 100 mM Tris-HCl, pH 8,0, zawierającym 10 mM EDTA, inkubuje przez 5 minut w temperaturze 0°C i odwirowuje. Osad zawiesza się w 35 ml 100mM Tris-HCl, 10 mM EDTA, 1 θ0 mM β-ME, 1 mM PMSF, 1% Triton Χ-100, pH 8,0. Poddaje się go działaniu ultradźwięków - 10 razy po 30 sek., po czym odwirowuje się (20000 obr./min., 30 min., temp. +4°C) otrzymując w ten sposób osad ciałek inkluzyjnych, które następnie przemywa się zawieszając je w 35 ml buforu 50 mM Tris-HCl, pH 7,4, 1 mM PMSF, 1mM EDTA. Po ponownym ich żwirowaniu rozpuszcza się je w 9 M moczniku. W celu pozbycia się reszty zanieczyszczeń (nierozpuszczonych ciałek2-5 hours at 37 ° C with constant shaking. The suspension of bacteria grown in this tube is transferred to a flask containing 1 L of LB medium + 1 ml of ampicillin at a concentration of 100 μg / ml. The cultivation is carried out for 14 hours at 37 ° C with constant shaking. The bacteria are then centrifuged (15 min, 5000 rpm) and the pellet resuspended in 200 ml 0.1 M CaCl2 (Tris buffered, pH = 7.5). After incubating for 20 minutes in an ice bath, the suspension is centrifuged for 20 minutes at 12,000 rpm. at + 4 ° C and the pellet is resuspended in 200 ml 0.1 M CaCl2. After another incubation for 2 hours in an ice bath, the suspension is centrifuged (in two centrifuge tubes) as above. The pellet is suspended in 20 ml (20 ml are added to both tubes) of phosphate buffer, pH 6.2, and then 200 μΐ 1 M glycerol and 400 μΐ 1% glycerol are added to both tubes. They are warmed to room temperature, 40 µL each of 0.5 M EDTA, pH 8.0 is added and, after a short incubation, cooled in an ice bath to about 0 ° C. The test tubes are then placed in a 42 ° C bath (thermal shock) for 1 minute. Whirls as above. After cooling, the pellet is resuspended in 100 ml of 100 mM Tris-HCl, pH 8.0, containing 10 mM EDTA, incubated for 5 minutes at 0 ° C and centrifuged. The pellet is resuspended in 35 ml of 100mM Tris-HCl, 10mM EDTA, 1θ0mM β-ME, 1mM PMSF, 1% Triton Χ-100, pH 8.0. It is subjected to ultrasound - 10 times for 30 seconds, and then centrifuged (20,000 rpm, 30 minutes, temperature + 4 ° C), thus obtaining a sediment of inclusion bodies, which are then washed by suspending them in 35 ml of 50 mM Tris-HCl buffer, pH 7.4, 1 mM PMSF, 1 mM EDTA. After they are centrifuged again, they are dissolved in 9 M urea. In order to get rid of the rest of the impurities (undissolved bodies

164 991 inkluzyjnych) zawiesinę ponownie wiruje się (20000 obr./min., 30 min., temp. +4°C). W supernatancie winna znajdować się główna część białka. Dalsze oczyszczania białka hybrydowego zawierającego fragment PAI-1 przeprowadza się na kolumnie chromatograficznej DEAESephacel. Białka zawarte w ciałkach inkluzyjnych rozpuszczone w 9 M moczniku dializuje się do roztworu 6 M mocznika, 50 mM Tris-HCl, pH 7,5, zawierającego 10 mM EDTA, 1 mM PMSF. Tym samym buforem równoważy się dwie kolumny wypełnione złożem DEAE-Sephacel (o wymiarach 2,5 x 10 cm). Na jedną z nich nanosi się roztwór białek. Część białka, która po przejściu przez kolumnę nie zwiąże się ze złożem, nanosi się (po 2-3-krotnym rozcieńczeniu tym samym buforem) na drugą kolumnę. Czysty koniugat wymywa się ze złoża 0,1 M NaCl.164,991 inclusion), the suspension is centrifuged again (20,000 rpm, 30 min., Temperature + 4 ° C). The supernatant should contain the major part of the protein. Further purifications of the hybrid protein containing the PAI-1 fragment are performed on a DEAESephacel chromatography column. The proteins contained in the inclusion bodies dissolved in 9 M urea are dialyzed into a solution of 6 M urea, 50 mM Tris-HCl, pH 7.5, containing 10 mM EDTA, 1 mM PMSF. The same buffer is used to equilibrate two DEAE-Sephacel columns (2.5 x 10 cm). On one of them a protein solution is applied. The part of the protein which will not bind to the matrix after passing through the column is applied (after 2-3 fold dilution with the same buffer) to the second column. Pure conjugate is eluted from 0.1 M NaCl bed.

J. Rozbicie kompleksu na drodze reakcji chemicznej.J. Disruption of the complex by chemical reaction.

Oczyszczone białko hybrydowe złożone z fragmentu β-galaktozydazy oraz fragmentu Asnr72-Thr232 PAI-1 dializuje się wobec buforu 10 mM Tris-HCl, pH 7,5 w celu usunięcia mocznika, a następnie liofilizuje. Rozszczepienie wiązania Asn-Gly przeprowadza się stosującThe purified hybrid protein consisting of the β-galactosidase fragment and the Asnr72-Thr232 PAI-1 fragment is dialyzed against 10 mM Tris-HCl buffer, pH 7.5 to remove urea, and then lyophilized. Cleavage of the Asn-Gly bond is performed using

M hydroksyloaminę w 6 M chlorowodorku guanidyny, pH 9,3. Reakcję prowadzi się w temperaturze 45°C. Rozbicie koniugatu sprawdzano elektroforetycznie.M hydroxylamine in 6 M guanidine hydrochloride, pH 9.3. The reaction is carried out at a temperature of 45 ° C. The breakdown of the conjugate was checked by electrophoresis.

Produkty powstałe w wyniku tej reakcji analizuje się w żelu poliakryloamidowym po elektroforezie.The products resulting from this reaction are analyzed in a polyacrylamide gel after electrophoresis.

K. Sposób wyodrębniania fragmentu Asnn2-Thr232 (PAI-1) ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu za pomocą HPLC.K. Method for isolation of the Asnn2-Thr232 (PAI-1) fragment of the human tissue plasminogen activator inhibitor by HPLC.

Fragment polipeptydowy odpowiadający fragmentowi AsnmOTh^ (PAI-1) ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu izoluje się z hydrolizatu otrzymanego w sposób, jak opisano w punkcie I, za pomocą HPLC. Rozdział chromatograficzny przeprowadzono na kolumnie semipreparatywnej TSK G3000SW firmy LKB, Szwecja.The polypeptide fragment corresponding to the AsnmOTh1 fragment (PAI-1) of the human tissue plasminogen activator inhibitor is isolated from the hydrolyzate prepared as described in point I by HPLC. The chromatographic separation was performed on a TSK G3000SW semi-preparative column from LKB, Sweden.

Etap 2.Stage 2.

A. Otrzymanie przeciwciał sposobem według wynalazku, przy wykorzystaniu fragmentu polipeptydowego.A. Obtaining antibodies by the method of the invention using a polypeptide fragment.

W celu otrzymania surowicy poliklonalnej dla fragmentu białka ludzkiego PAI-1, immunizuje się tym białkiem króliki. Sródskórnie podaje się na drodze 30-40 iniekcji dawki 50 ig antygenu w 0,5 ml PBS i wymieszanego z 0,5 ml kompletnego adiuwantu Freuda. Po 7 dniach od każdego szczepienia pobiera się krew z żyły usznej królików. Po wykrzepieniu w temperaturze 37°C przez 0,5-1,0 godziny, skrzep oddziela się od ścianek probówki i całość pozostawia w temperaturze 4°C na 12-24 godziny. Następnie surowicę odciąga się do jałowych probówek wirówkowych i wiruje przy 3000 obr/min przez 20 minut. Surowicę inaktywuje się podczas inkubacji przez 30 minut w temperaturze 56°C. Miano poszczególnych próbek surowic określa się metodą radioimmunologiczną, oznaczając ich zdolność do wiązania znakowanego antygenu. Surowice o najwyższym mianie przeciwciał przechowuje się w temperaturze -20°C.In order to obtain a polyclonal serum for a fragment of the human PAI-1 protein, rabbits are immunized with this protein. The intradermal route is 30-40 injections of a dose of 50 µg of antigen in 0.5 ml of PBS and mixed with 0.5 ml of Freud's complete adjuvant. The ear vein of rabbits is blood collected 7 days after each vaccination. After clotting at 37 ° C for 0.5-1.0 hours, the clot is detached from the walls of the tube and left at 4 ° C for 12-24 hours. The serum is then withdrawn into sterile centrifuge tubes and centrifuged at 3000 rpm for 20 minutes. The serum is inactivated by incubation for 30 minutes at 56 ° C. The titer of individual sera samples is determined by radioimmunoassay, determining their ability to bind the labeled antigen. Sera with the highest antibody titer are stored at -20 ° C.

B. Oczyszczanie przeciwciał.B. Purification of antibodies.

Przeciwciała dla fragmentu PAI-1 oczyszcza się z surowicy odpornościowej za pomocą chromatografii powinowactwa. Immunoadsorbent zawiera fragment białka PAI-1 związany ze złożem CNBr-Sepharose 4B (Pharmacia). W celu przygotowania immunoadsorbentu 1 g złoża przemywa się 200 ml roztworu 0,001 mol/l HCl i następnie zawiesza w buforze boranowym (pH 8,3). Natychmiast dodaje się 20 mg fragmentu białka PAI-1 rozpuszczonego w PBS i delikatnie miesza w temperaturze 4°C przez 2 godz. Po odwirowaniu sprawdza się stężenie białka w supernatancie. Złoże zawiesza się następnie w roztworze glicyny (2 mol/l) w buforze boranowym o pH 8,3. Po 1 -godzinnej inkubacji odwirowuje się je (10 min. 4000 obr/min) i przemywa się je x buforem boranowym (pH 8,3), 1 x wodą destylowaną, 3 x buforem boranowym (pH 8,3). Z otrzymanym w ten sposób złożem inkubuje się 15 ml surowicy otrzymanej po immunizacji fragmentem białka PAI-1, delikatnie mieszając przez 12-14 godzin w temperaturze 4°C. Do mieszaniny dodaje się 1 mM PMSF (Sigma) oraz 1 mM chlorku benzamidyny (Biochemical). Po odwirowaniu (10 min., 3000 obr/min) złoże przemywa się buforem (PBS z 1 % Tween 20), a następnie 4 x buforem 1 M ( 1 NaCl 21 % Tween 20 w PBS). Po każdym wirowaniu sprawdza się zawartość białek w supernatancie poprzez pomiar adsorpcji światła przy 400 nm. Następnie złoże umieszcza się w kolumnie (0,7 x 10 cm). Przeciwciała specyficznie związane z unierucho164 991 mionym na złożu białkiem eluuje się roztworem 0,5 mol/l kwasu octowego i zbiera się do probówek zawierających 100 μΐ roztworu 2 mol/l Tris. Frakcje o dużej zawartości białka łączy się i dializuje wobec PBS przez 24 godziny w 4°C.Antibodies to the PAI-1 fragment are purified from the antiserum by affinity chromatography. The immunoadsorbent contains a PAI-1 protein fragment bound to CNBr-Sepharose 4B resin (Pharmacia). To prepare the immunoadsorbent, 1 g of the bed is washed with 200 ml of 0.001 mol / l HCl solution and then suspended in a borate buffer (pH 8.3). 20 mg of the PAI-1 protein fragment dissolved in PBS is immediately added and gently stirred at 4 ° C for 2 h. After centrifugation, the protein concentration in the supernatant is checked. The bed is then suspended in a glycine solution (2 mol / l) in borate buffer pH 8.3. After incubation for 1 hour, they are centrifuged (10 min, 4000 rpm) and washed x with borate buffer (pH 8.3), 1 x with distilled water, 3 x with borate buffer (pH 8.3). The resin obtained in this way is incubated with 15 ml of serum obtained after immunization with the PAI-1 protein fragment, with gentle agitation for 12-14 hours at 4 ° C. 1 mM PMSF (Sigma) and 1 mM benzamidine chloride (Biochemical) are added to the mixture. After centrifugation (10 min, 3000 rpm), the media is washed with buffer (PBS with 1% Tween 20) followed by 4 x 1 M buffer (1 NaCl 21% Tween 20 in PBS). After each centrifugation, the protein content of the supernatant is checked by measuring the light adsorption at 400 nm. The bed is then placed in a column (0.7 x 10 cm). Antibodies specifically bound to the immobilized protein on the bed are eluted with 0.5 mol / L acetic acid and collected in tubes containing 100 µL of 2 mol / L Tris. High protein fractions are pooled and dialyzed against PBS for 24 hours at 4 ° C.

C. Sprzęganie przeciwciał z peroksydazą.C. Conjugation of antibodies to peroxidase.

Uzyskane w ten sposób przeciwciała dla fragmentu białka PAI-1 sprzęga się z peroksydazą. W tym celu rozpuszcza się 5 mg HRPO w 1 ml świeżo przygotowanego 0,3 M kwaśnego węglanu sodu (NaHCO3). pH 8,1. Następnie dodaje się 0,1 ml 1% FDNB w alkoholu absolutnym. Delikatnie wytrząsa się przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej. Dodaje się 0,04-0,08 M NaJO 4 (rozpuszcz. w wodzie destyl.), delikatnie miesza przez 30 min. w temperaturze pokojowej. Kolor tego roztworu winien stać się zielonożółty. Następnie dodaje się 1,0 ml 0,16 M glikolu etylenowego (rozp. w wodzie dest.) i delikatnie miesza w temperaturze pokojowej przez 1 godzinę. Po zakończeniu inkubacji roztwór dializuje się wobec 0,01 M węglanu sodu, pH 9,5, temperatura 4°C (co najmniej 3 1- litrowe zmiany). Do 3 ml roztworu tak przygotowanego aldehydu peroksydazy (HRPO) dodaje się 5 mg IgG i delikatnie miesza przez 2-3 godziny w temperaturze pokojowej.IgG rozpuszcza się w 1 ml buforu węglanowego przed zmieszaniem lub dodaje w postaci zliofilizowanego proszku wolnego od soli. Po dodaniu IgG wprowadza się 5 mg NaBH4 i pozostawia w 4°C od 3 do 12 godzin. Następnie roztwór dializuje się w 4°C wobec PBS. Jeśli powstaje precypitat, usuwa się go przez wirowanie. Próbkę nanosi się na kolumnę (85 x 1,5 cm), Sephadex G-100, zrównoważoną PBS. Zbiera się frakcje po 1,5 ml i poziom białka w poszczególnych frakcjach oznacza spektrofotometrycznie. Frakcja IgG znakowanych HRPO schodzi w pierwszym szczycie. Roztwory tego koniugatu przechowuje się w obecności albuminy aurowicy wołowej o stężeniu 10 mg/ml w temperaturze -20°C.The thus obtained antibodies to the PAI-1 protein fragment are conjugated to peroxidase. For this purpose, 5 mg of HRPO are dissolved in 1 ml of freshly prepared 0.3 M sodium bicarbonate (NaHCO3). pH 8.1. Then 0.1 ml of 1% FDNB in absolute alcohol is added. It is shaken gently for 1 hour at room temperature. 0.04-0.08 M NaJO 4 (dissolved in distilled water) is added, gently mixing for 30 min. in room temperature. The color of this solution should turn green-yellow. Then 1.0 ml of 0.16 M ethylene glycol (dissolved in distilled water) are added and the mixture is gently stirred at room temperature for 1 hour. After incubation, the solution is dialyzed against 0.01 M sodium carbonate, pH 9.5, temperature 4 ° C (at least 3 1 liter changes). 5 mg of IgG are added to 3 ml of the thus prepared peroxidase aldehyde (HRPO) solution and gently stirred for 2-3 hours at room temperature. IgG is dissolved in 1 ml of carbonate buffer before mixing or added as a salt-free lyophilized powder. After the addition of IgG, 5 mg of NaBH4 are introduced and the mixture is left at 4 ° C for 3 to 12 hours. The solution is then dialyzed at 4 ° C against PBS. If a precipitate is formed, it is removed by centrifugation. The sample is applied to a column (85 x 1.5 cm), Sephadex G-100, equilibrated in PBS. Fractions of 1.5 ml are collected and the protein level in the individual fractions is determined spectrophotometrically. The HRPO labeled IgG fraction comes down in the first peak. Solutions of this conjugate are stored in the presence of bovine serum albumin at a concentration of 10 mg / ml at -20 ° C.

Etap 3.Stage 3.

Opłaszczanie płytki przeciwciałami i wykonanie testu ELISA.Coating the plate with antibodies and performing an ELISA test.

Studzienki w płytce do testu ELISA opłaszcza się przeciwciałami poliklonalnymi dla fragmentu polipeptydowego Asni72-Thr232 białka PAI-1 o stężeniu 10 μg/ml, zawieszonymi w 50 mM buforze fosoforanowym o pH 7,5. Niezwiązane białko odmywa się, a powierzchnię studzienek opłaszcza albuminą surowiczą. Testowane próbki osocza rozcieńcza się przed oznaczeniem 50 mM buforem fosforanowym, pH 7,5, zawierającym 0,15 M NaCl, 10 mM EDTA, 1% Tween 20 i 1% BSA i dodaje się po 200 μl/dołek. Inkubuje się przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Po zakończeniu inkubacji płytki 5-krotnie przemywa się 0,15 M NaCl zawierającym 0,1% Tween 20. Następnie dodaje się 200 μl koniugatu IgG-HRP (przeciwciała poliklonalne dla całej cząsteczki PAI-1 związane z peroksydazą) o stężeniu 5 μg/ml. Inkubuje 2 godziny w tempemaurze pokoóowee i ponowme 5-kromńe przemywa. W celu wy wooama reakqj enzymatycznej dodaje się po 200 μl roztworu substratu (0,4 mg/ml ortofenylodiaminy w 0,05 M buforze cytrynianowym, pH 5,0, zawierającym 0,02% H2O2). Po 6 minutach inkubacji pojawia się zabarwienie i reakcję hamuje się przez dodanie 50 μl 3 M kwasu siarkowego. Adsorbancję mierzy się przy 490 nm.The wells of the ELISA plate are coated with polyclonal antibodies to the polypeptide fragment of the PAI-1 protein Asni72-Thr232 at a concentration of 10 µg / ml, suspended in 50 mM phosphate buffer at pH 7.5. Unbound protein is washed away and the surface of the wells is coated with serum albumin. The test plasma samples are diluted prior to determination with 50 mM phosphate buffer, pH 7.5, containing 0.15 M NaCl, 10 mM EDTA, 1% Tween 20 and 1% BSA, and 200 µl / well are added. Incubate for 2 hours at room temperature. After incubation, the plates are washed 5 times with 0.15 M NaCl containing 0.1% Tween 20. Then 200 μl of IgG-HRP conjugate (polyclonal antibodies for the whole PAI-1 molecule bound to peroxidase) are added at a concentration of 5 μg / ml. . It incubates for 2 hours at room temperature and then rinses 5 times. To promote the enzymatic reaction, 200 μl of substrate solution (0.4 mg / ml of orthophenyldiamine in 0.05 M citrate buffer, pH 5.0 containing 0.02% H2O2) are added. Color appears after 6 minutes of incubation and the reaction is stopped by adding 50 μl of 3M sulfuric acid. Adsorbance is measured at 490 nm.

Przykład II.Example II.

Detekcja antygenu PAI-1 w badanej próbce za pomocą przeciwciał dla fragmentu polipeptydowego odpowiadającego fragmentowi Asn 72- Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu.Detection of the PAI-1 antigen in the test sample using antibodies to the polypeptide fragment corresponding to the Asn 72-Thr232 fragment of the human tissue plasminogen activator inhibitor.

Do unieruchomionego antygenu dodaje się wyznakowane peroksydazą przeciwciała dla fragmentu polipeptydowego odpowiadającego fragmentowi Asnr72-Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu i inkubuje się przez 2 godziny w temperaturze pokojowej. Do wywołania reakcji enzymatycznej stosuje się roztwór substratu - ortofenylodiaminę w 0,05 M buforze cytrynianowym, pH 5,0, zawierającym 0,02% H 2O2. Po 15 minutach inkubacji pojawia się zabarwienie i reakcję hamuje się przez dodanie 50 μΐ 3 M kwasu siarkowego. Adsorbancję mierzy się przy 490 nm. Wynik odczytuje się z krzywej wzorcowej dla standartowego roztworu PAI-1.The peroxidase-labeled antibodies for the polypeptide fragment corresponding to the Asnr72-Thr232 fragment of the human tissue plasminogen activator inhibitor are added to the immobilized antigen and incubated for 2 hours at room temperature. To induce the enzymatic reaction, a substrate solution - orthophenyldiamine in 0.05 M citrate buffer, pH 5.0, containing 0.02% H 2 O 2, is used. Color appears after 15 minutes of incubation and the reaction is stopped by the addition of 50 μΐ 3 M sulfuric acid. Adsorbance is measured at 490 nm. The result can be read from the standard curve for the PAI-1 standard solution.

Przykład III.Example III.

Diagnostyczny zestaw testowy dla oznaczania poziomu ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu składa się z: pojemnika zawierającego zbuforowany roztwór soliThe diagnostic test kit for the determination of the human tissue plasminogen activator inhibitor level consists of: a container containing a buffered saline solution

164 991 fizjologicznej (PBS), pH 7,5, EDTA, Tween 20; pojemniczka z albuminą surowiczą; pojemniczka z przeciwciałami dla fragmentu polipeptydowego odpowiadającego fragmentowi AsnmThr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu; pojemniczka z wyznakowanymi peroksydazą przeciwciałami dla PAI-1; pojemniczka z substratem (ortofenylodiaminą); pojemniczka z buforem cytrynianowym, pH 5,0 i pojemniczka z 3 M kwasem siarkowym.164,991 physiological (PBS), pH 7.5, EDTA, Tween 20; a container with serum albumin; an antibody container for a polypeptide fragment corresponding to the AsnmThr232 fragment of a human tissue plasminogen activator inhibitor; a container with peroxidase labeled antibodies to PAI-1; a container with a substrate (orthophenyldiamine); a container with citrate buffer, pH 5.0 and a container with 3 M sulfuric acid.

GAATCTAACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTTCCAGAATCTAACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTTCCA

GATTGCCGGTCACCTTCTGTGGTAAGGGTCTGTCATCGTGGGTGGCGGCGGACAAGGTGATTGCCGGTCACCTTCTGTGGTAAGGGTCTGTCATCGTGGGTGGCGGCGGACAAGGT

CAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATTCAACTATACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATTCAACTATA

GTTTAGTCTGCCTTCGTGACAGAGACACGGTTACTACGGACTGTGGTTGITTAAGTTGATATGTTTAGTCTGCCTTCGTGACAGAGACACGGTTACTACGGACTGTGGTTGITTAAGTTGATAT

CTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTAC(}ACATCCTGGAACTGCCATACCACGGAGACCTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTAC (} ACATCCTGGAACTGCCATACCACGGAGAC

GACTTAAGTGGTGCGGTCTACCTGTAATGATGCTGTAGGACCTTGACGGTATGGTGCCTCTGGACTTAAGTGGTGCGGTCTACCTGTAATGATGCTGTAGGACCTTGACGGTATGGTGCCTCTG

ACTACT

TCAA7CTTCAA7CT

3' 5'3 '5'

1. CGGTCACCTTCTGTGGTAAGGGTCTGTC1. CGGTCACCTTCTGTGGTAAGGGTCTGTC

2. AlCGTGGGTGGCGGCGGAGAAGGTGTTTAGTCTGCCTTCG dolna nić2. AlCGTGGGTGGCGGCGGAGAAGGTGTTTAGTCTGCCTTCG lower thread

3. TGACAGAGACACOGTTACTACCGACTCTGGTTG3. TGACAGAGACACOGTTACTACCGACTCTGGTTG

4. TTTAACTTGATATGACTTAAGTGGTGCGGTCTAC.CTGTAA4. TTTAACTTGATATGACTTAAGTGGTGCGGTCTAC.CTGTAA

5. TGATGCTGTAGGACCTTG4CGGTATGGTGCCTCTGTGAATCT5. TGATGCTGTAGGACCTTG4CGGTATGGTGCCTCTGTGAATCT

6. TCACAGAGGCACCATACCGTCAAGGTCCTACAGCATCĄTTAC6. TCACAGAGGCACCATACCGTCAAGGTCCTACAGCATCĄTTAC

7. AGGTAGACCGCACCACTTAAGTCATATCAACT7. AGGTAGACCGCACCACTTAAGTCATATCAACT

Θ.TAAACAACCAGAGTCGGTAGTAACCGTGTCTCTGTCACGA górno nićΘ.TAAACAACCAGAGTCGGTAGTAACCGTGTCTCTGTCACGA upper thread

9. AGCCAGACTAAACACCTTCTCCGCCGCCACCCAC9. AGCCAGACTAAACACCTTCTCCGCCGCCACCCAC

10. GATGACAGACCCTTACCACAGAAGGTGACCGGCAATCTAAG.10. GATGACAGACCCTTACCACAGAAGGTGACCGGCAATCTAAG.

Fig. 2Fig. 2

164 991164 991

Eco RIEco RI

PstPst

Fig.3Fig.3

164 991164 991

Fig.4Fig.4

164 991164 991

BETA - CALAKTGZYDAZA : BIAŁKO PAIBETA - CALACTGZYDAASE: PAI PROTEIN

produkty degradacji beta-galaktozydazy białko PAIbeta-galactosidase protein PAI degradation products

oczyszczenie produktów hydrolizypurification of the hydrolysis products

Fig.5Fig 5

164 991164 991

C —ΟΛΛζ-WWW-wwi 1-\wC —ΟΛΛζ-WWW-wwi 1- \ w

Fig.1Fig.1

Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 90 egz. Cena 10 000 złPublishing Department of the UP RP. Circulation of 90 copies. Price: PLN 10,000

Claims (5)

Zastrzeżenia patentowePatent claims 1. Sposób wytwarzania przeciwciał poliklonalnych reagujących specyficznie z białkiem ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, przez immunizację zwierząt, znamienny tym, że do immunizacji stosuje się polipeptyd odpowiadający fragmentowi o wzorze (Y)a-A-(Z)b, w którym Y oznacza sekwencję aminokwasów kodowaną przez fragment polilinkera, korzystnie Glu, Ser; a = 0 lub 1; Z oznacza sekwencję Glu, Ser i/lub sekwencję kodowaną przez fragment polilinkera; b = 0, 1 lub 2; natomiast A oznacza sekwencję odpowiadającą fragmentowi Asn 172-Thr232 ludzkiego inhibitora tkankowego aktywatora plazminogenu, pobiera się krew i izoluje przeciwciała.A method of producing polyclonal antibodies specifically reactive with the protein of a human tissue plasminogen activator inhibitor by immunizing animals, characterized in that a polypeptide corresponding to the fragment of formula (Y) aA- (Z) b is used for immunization, wherein Y is the amino acid sequence encoded via a polylinker fragment, preferably Glu, Ser; a = 0 or 1; Z represents the sequence Glu, Ser and / or the sequence encoded by the polylinker fragment; b = 0, 1 or 2; and A is the sequence corresponding to the Asn 172-Thr232 fragment of the human tissue plasminogen activator inhibitor, blood is drawn and antibodies are isolated. 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że stosuje się polipeptyd o sekwencji: Asn-Gly-Gln-Trp-Lys-Thr—Pra-Phe-Pro-Asp-Ser-Ser-Thr—His-ArgArg-Leu-Phe-His-Lys-Ser—Asp-Gly-Ser—Thr-Val -Ser-Val-Pro-MetMet-Ala-Glu-Thr—Asn-Lys-Phe-Asn-Tyr-Thr-Glu-Phe-Thr-Thr—ProAsp-Gly-His-Tyr-Tyr-Asp-I le-Leu-Glu-Leu-Pro-Tyr-His-Gly-AspThr.2. The method according to p. A method according to claim 1, characterized in that the polypeptide of the sequence: Asn-Gly-Gln-Trp-Lys-Thr-Pra-Phe-Pro-Asp-Ser-Ser-Thr-His-ArgArg-Leu-Phe-His-Lys- is used Ser — Asp-Gly-Ser — Thr-Val -Ser-Val-Pro-MetMet-Ala-Glu-Thr — Asn-Lys-Phe-Asn-Tyr-Thr-Glu-Phe-Thr-Thr — ProAsp-Gly- His-Tyr-Tyr-Asp-I le-Leu-Glu-Leu-Pro-Tyr-His-Gly-AspThr. 3. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że stosuje się polipeptyd otrzymany przez ekspresję zrekombinowanego DNA.3. The method according to p. The method of claim 1, wherein the polypeptide is obtained by expression of recombinant DNA. 4. Sposób według zastrz. 3, znamienny tym, że stosuje się zsyntetyzowany chemicznie cDNA.4. The method according to p. The process of claim 3, wherein a chemically synthesized cDNA is used. 5. Sposób według zastrz. 4, znamienny tym, że stosuje się zsyntetyzowany chemicznie cDNA o sekwencji:5. The method according to p. 4. The method of claim 4, characterized in that a chemically synthesized cDNA with the sequence: ( X ) nAACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT(X) nAACGGCCAGTGGAAGACACCATTCCCAGACAGTAGCACCCACCGCCGCCTCTT CCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATTCCACAAATCAGACGGAAGCACTGTCTCTGTGCCAATGATGGCTGAGACCAACAAATT CAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCCCAACTATACTGAATTCACCACGCCAGATGGACATTACTACGACATCCTGGAACTGCC ATACCACGGAGACACT(X)m, gdzie X oznacza GAATCT, n przyjmuje wartość 1 lub 0, a m przyjmuje wartość 0, 1 lub 2.ATACCACGGAGACACT (X) m , where X is GAATCT, n is 1 or 0, and m is 0, 1 or 2.
PL30054490A 1990-04-25 1990-04-25 Method of producing polyclonal antibodies specifically reacting with protein of the human tissue inhibitor of plasminogen activator PL164991B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL30054490A PL164991B1 (en) 1990-04-25 1990-04-25 Method of producing polyclonal antibodies specifically reacting with protein of the human tissue inhibitor of plasminogen activator

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL30054490A PL164991B1 (en) 1990-04-25 1990-04-25 Method of producing polyclonal antibodies specifically reacting with protein of the human tissue inhibitor of plasminogen activator

Publications (1)

Publication Number Publication Date
PL164991B1 true PL164991B1 (en) 1994-10-31

Family

ID=20060939

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL30054490A PL164991B1 (en) 1990-04-25 1990-04-25 Method of producing polyclonal antibodies specifically reacting with protein of the human tissue inhibitor of plasminogen activator

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL164991B1 (en)

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Rittenhouse et al. Peptide mapping by polyacrylamide gel electrophoresis after cleavage at aspartyl-prolyl peptide bonds in sodium dodecyl sulfate-containing buffers
Schröder et al. Purification of brain tubulin-tyrosine ligase by biochemical and immunological methods.
Hurley et al. Development of radioimmunoassays for free tetra-L-aspartyl-L-lysine trypsinogen activation peptides (TAP)
ES2240979T3 (en) ENZYME FOR THE EXCISION OF THE ANCHOR REGION OF THE POSITIVE GRAM BACTERIA SURFACE PROTEINS.
KR20100040582A (en) Composition for diagnosing arthritis comprising an antibody against aimp1 polypeptide
US6441141B1 (en) Synthetic peptides, antibodies against them and their use
BENGTSSON‐OLIVECRONA et al. Lipoprotein lipases from cow, guinea‐pig and man: Structural characterization and identification of protease‐sensitive internal regions
US5663066A (en) Assay using recombinant histidyl-tRNA synthetase
US5457029A (en) Nuclear antigen La
US5688659A (en) Streptolysin O peptide antigens and methods for the determination of streptolysin antibodies
CA2103551A1 (en) Method for production of an iga binding protein derived from group b streptococci
Michael et al. All eight unassigned reading frames of mouse mitochondrial DNA are expressed.
Kobayashi et al. Identity of urinary trypsin inhibitor-binding protein to link protein
US5789382A (en) Retro-peptide fibroblast growth factor which blocks FGF receptor
PT98589A (en) PREPARATION PROCEDURE OF A PEPTIDE DERIVED FROM HUMAN ALPHA1-MICROGLOBULIN AND ANTIBODIES OF DETERMINATION OF HUMAN ALPHA1-MICROBULIN IN A LIQUID AND TEST TAPE PRODUCTION
ES2216518T3 (en) MONOTIONAL ANTIBODY AND TEST TO DETECT THE N-TERM PROPEPTIDE OF PROCOLAGEN III (PIIINP).
PL165793B1 (en) A method of producing a polypeptide capable of producing antibodies that react specifically with the human tissue plasminogen activator inhibitor protein
PL164952B1 (en) Method of determining and/or detecting the antigen of human tissue inhibitor of plasminogen activator and diagnostic test therefor
CA2488127C (en) Antibodies directed against prothrombin fragment f1+2, the preparation and use thereof
PL164992B1 (en) Method of constructing a recombinet vector for cloning and/or expressing in bacterial host cells the production of polypeptide capable to generate antibodies specifically reacting with protein of the human tisue inhibitor of plasminogen activator
JP2634683B2 (en) Antibodies to fibrin; immunogenic peptides suitable for antibody preparation, methods for determining fibrin, and antibody-based preparations
PL165020B1 (en) Method of determining and/or detecting the antigen of human tissue inhibitor of plasminogen activator and diagnostic test therefor
PL164144B1 (en) Method for making polypeptides, recombined vector and method for its forming, method for making antibodies, method and test for determination of human tissue activator of plasminogen or antibodies for that protein
PL164564B1 (en) Method for making polypeptides, recombined vector and method for its forming, method for making antibodies, method and test for determination of human tissue activator of plasminogen or antibodies for that protein
Miki et al. Mapping of antigenic sites to monoclonal antibodies on the primary structure of the F1-ATPase β subunit from Escherichia coli: Concealed amino-terminal region of the subunit in the F1