PL166061B1 - Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów - Google Patents

Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów

Info

Publication number
PL166061B1
PL166061B1 PL28931791A PL28931791A PL166061B1 PL 166061 B1 PL166061 B1 PL 166061B1 PL 28931791 A PL28931791 A PL 28931791A PL 28931791 A PL28931791 A PL 28931791A PL 166061 B1 PL166061 B1 PL 166061B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
group
dimethoxytriphenylmethyl
catalyst
formula
isopropoxyacetyl
Prior art date
Application number
PL28931791A
Other languages
English (en)
Other versions
PL289317A1 (en
Inventor
Andrzej Grajkowski
Bogdan Uznanski
Wojciech J Stec
Original Assignee
Pan
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Pan filed Critical Pan
Priority to PL28931791A priority Critical patent/PL166061B1/pl
Priority to US07/826,929 priority patent/US5512668A/en
Priority to DE69227793T priority patent/DE69227793T2/de
Priority to AT92301950T priority patent/ATE174341T1/de
Priority to EP92301950A priority patent/EP0506242B1/en
Priority to JP08301892A priority patent/JP3207915B2/ja
Publication of PL289317A1 publication Critical patent/PL289317A1/xx
Publication of PL166061B1 publication Critical patent/PL166061B1/pl

Links

Landscapes

  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)

Abstract

Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów o ogólnym wzorze 1, w którym Z oznacza atom wodoru lub grupę blokującą funkcję 5'-hydroksylową, a B oznacza grupę o wzorze 2, 3, 4, w których R oznacza grupę blokującą funkcję egzoaminową lub atom wodoru, albo B oznacza grupę o wzorze 5, znamienny tym, że związek o wzorze ogólnym 6, w którym Z oznacza grupę blokującą funkcję 5'-hydroksylową, a B oznacza grupę o wzorze 2,3,4 lub 5, w których R oznacza grupę blokującą funkcję egzoaminową poddaje się reakcji ze związkiem o wzorze ogólnym 7, w których X oznacza atom chlorowca, grupę dialkiloaminową, morfolinową, pirolidynową lub piperydynową, korzystnie wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę, ewentualnie usuwa się grupy blokujące i ewentualnie produkt rozdziela się na diastereoizomery

Description

Przedmiotem wynalazku jest sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów o ogólnym wzorze 1, w którym Z oznacza atom wodoru lub grupę blokującą funkcję 5'-hydroksylową, a B oznacza grupę o wzorze 2, 3, 4, w których R oznacza grupę blokującą funkcję egzoaminową lub atom wodoru albo B oznacza grupę o wzorze 5.
Nowe pochodne nukleozydów o wzorze ogólnym 1, w którym Z i B, mają wyżej podane znaczenie znajdują zastosowanie do wytwarzania tiofosforanowych analogów oligodeoksyrybonukleotydów o działaniu terapeutycznym oraz służących do badań nad oddziaływaniem DNA z białkami, których syntezę przedstawiono w opisie patentowym nr P 28*9316 opublikowanym w BUP 24,/92.
Nie opisano dotychczas pochodnych nukleozydów, które miałyby zastosowanie do bezpośredniej syntezy tiofosforanowych analogów oligodeoksyrybonukleotydów.
Sposób według wynalazku polega na tym, że związek o ogólnym wzorze 6, w którym Z oznacza grupę blokującą funkcję 5'-hydroksylową, a B oznacza grupę o wzorze 2, 3, 4 lub 5, w
166 061 których R oznacza grupę blokującą funkcję egzoaminową poddaje się reakcji ze związkiem o wzorze ogólnym 7, w którym X oznacza atom chlorowca, grupę dialkiloaminową, morfolinową, pirolidynową lub piperydynową, korzystnie wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę i ewentualnie usuwa się grupy blokujące w znany sposób. Otrzymany produkt, w razie potrzeby, rozdziela się na diastereoizomery.
Do zabezpieczania grup 5'-hydroksylowych można stosować różne znane grupy blokujące. Korzystne są grupy, takie jak acylowa, 4,4'-dimetoksytrifenylometyIowa, 4-metoksytrifenylometylowa, trifenylometylowa, benzylowa, trialkilosililowa i podobne.
Do ochrony grup egzoaminowych można stosować dowolne grupy znane w chemii nukleotydów, korzystnie grupę izopropoksyacetylową, izobutyrylową, benzoilową fenoksyacetylową, (dialkiloamino)metylenową, (dialkiloamino)etylidenową i podobne.
Reakcję związku o wzorze 6 ze związkiem o wzorze 7 można prowadzić w nieprotonowym rozpuszczalniku organicznym, np. chlorku metylenu. Katalizatorem tej reakcji może być katalizator kwasowy, np. 1-H-tetrazol, lub zasadowy, np. trójetyloamina, gdy X = chlorowiec, a czynnikiem wprowadzającym siarkę, np. siarka elementarna, 1,1-diokso-3H-1,2-benzoditiol-3-on lub dwusiarczki acylowe.
Jak już wspomniano, nowe pochodne nukleozydów są jedynymi związkami umożliwiającymi bezpośrednią syntezę tiofosforanowych analogów oligodeoksyrybonukleotydów. W celu przeprowadzenia stereoselektywnej syntezy tiofosforanowych analogów oligodeoksyrybonukleotydów, związek o wzorze 1, w którym Z, B i R mają powyższe znaczenia, rozdziela się na diastereoizomery (szybciej migrujący i wolnej migrujący) za pomocą chromatografii.
Wynalazek ten ilustrują niżej podane przykłady.
Przykładl . N6-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksyadenozyno-3'-0-(2-tiokso)-1,3,2-oksatiafosfolan.
mmol Ns-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksyadenozyny i 1 mmol 1-H-tetrazolu suszono pod wysoką próżnią w temperaturze 50°C.
Rozpuszczono w bezwodnym chlorku metylenu (3 ml) i dodano mieszając, 2-diizopropyloamino-1,3,2-oksatiafosfolan (1,1 mmol). Mieszanie kontynuowano przez 1 godzinę w temperaturze pokojowej, następnie dodano 10 mmoli siarki elementarnej i mieszano przez noc. Mieszaninę reakcyjną zatężono do sucha i oczyszczono na kolumnie z żelem krzemowym. Wydajność 90%.
δ ppm 31 P NMR 103, 62; 103,58 (CeDe), 85% H3PO4 jako wzorzec zewnętrzy.
Przykład II. N4-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksycytydyno-3'-0-(2-tiokso)-1,3,2-oksatiafosfolan.
Postępując analogicznie jak w przykładzie I otrzymano produkt z wydajnością 88%. δ ppm P NMR 104,38; 104,36 (0^6), 85% H3PO4 jako wzorzec zewnętrzy.
Przykład III. N2-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksyguanozyno-3'-0-(2-tiokso)-1,3,2-oksatiafosfolan.
Postępując analogicznie jak w przykładzie I otrzymano produkt z wydajnością 72%. δ ppm 31 P NMR 103,66; 103,50 (C6D6), 85% H3PO4 jako wzorzec zewnętrzny.
Przykład IV. 5'-O-(4,4,-dimetoksytrifenylometyloy-tymidyno-3'-(0-2-tiokso)-1,3,2-oksatiafosfolan.
Postępując analogicznie jak w przykładzie I otrzymano produkt z wydajnością 92%.
ppm 31P NMR 104,14; 104,12 (C6D6), 85% H3PO4 jako wzorzec zewnętrzy.
Przykład V. Rozdział produktów z przykładów I-IV.
Na kolumnę o wymiarach 200 X 60 mm zawierającą żel krzemionkowy Kiesegel 60 H wprowadza się 1 g produktu. Warunki rozdziału podano w tabeli.
166 061
Tabela
Przykład Eluent Izomer bardziej mobilny Izomer mniej mobilny
I octan etylu 2 300 mg 250 mg
heptan 1 δ ppm 103,58 δ ppm 103,62
II octan etylu 1 350 mg 200 mg
chlorek metylenu 1 δ ppm 104,36 δ ppm 104,38
III octan etylu 8 230 mg 150 mg
chlorek metylenu 2 δ ppm 103,50 δ ppm 103,66
metanol 0,2
IV octan etylu 1,5 350 mg 200 mg
heptan 1 δppm 104,12 δppm 104,14
Czystość izomeryczną sprawdzano za pomocą 31 P NMR.
wzór i
wzór 5
wzór 6
Ρ-Χ wzór 7
Departament Wydawnictw UP RP. Nakład 90 egz. Cena 1,00 zł.

Claims (7)

  1. Zastrzeżenia patentowe
    1. Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów o ogólnym wzorze 1, w którym Z oznacza atom wodoru lub grupę blokującą funkcję S'-hydroksylową, a B oznacza grupę o wzorze 2, 3,4, w których R oznacza grupę blokującą funkcję egzoaminową lub atom wodoru, albo B oznacza grupę o wzorze 5, znamienny tym, że związek o wzorze ogólnym 6, w którym Z oznacza grupę blokującą funkcję 5'-hydroksylową, a B oznacza grupę o wzorze 2,3,4 lub 5, w których R oznacza grupę blokującą funkcję egzoaminową poddaje się reakcji ze związkiem o wzorze ogólnym 7, w których X oznacza atom chlorowca, grupę dialkiloaminową, morfolinową, pirolidynową lub piperydynową, korzystnie wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę, ewentualnie usuwa się grupy blokujące i ewentualnie produkt rozdziela się na diastereoizomery.
  2. 2. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że Ne-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksyadenozynę poddaje się reakcji z 2-dialkiloamino-1,3,2-oksatiafosfolanem wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę i wytwarza się Ne-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksyadenozyno-3'-0-(2-tiokso)1,3,2-oksatiafosfolan.
  3. 3. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że N4-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksycytydynę poddaje się reakcji z 2-dialkiloamino-1,3,2-oksatiafosfolanem wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę i wytwarza się N-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksycytydyno-3'-0-(2-tiokso)-1,3,2-oksatiafosfolan.
  4. 4. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że N2-izopropoksyacetylo-5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)-2'-deoksyguanozynę poddaje się reakcji z 2-dialkiloamino-1,3,2-oksatiafosfolanem wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę i wytwarza się Na-izopropoksyacetylo-5'-O-(4,4'-dimetoksytrifeny'ometyl0)-2'-d.eoksyguanozyno-3'-O-(2-tiokso)-1,3,2-oksatiafosfolan.
  5. 5. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że 5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)tymidynę, poddaje się reakcji z 2-dialkiloamino-1,3,2-oksatiafosfolanem wobec katalizatora, a następnie z czynnikiem wprowadzającym siarkę i wytwarza się 5'-0-(4,4'-dimetoksytrifenylometylo)tymidyno-3'-0-(2--t iokso^L 1,3,2-oksatiafosfolan.
  6. 6. Sposób według zastrz. 1 albo 2, albo 3, albo 4, albo 5, znamienny tym, że stosuje się katalizator kwasowy.
  7. 7. Sposób według zastrz. 1, znamienny tym, że stosuje się katalizator zasadowy.
PL28931791A 1991-03-06 1991-03-06 Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów PL166061B1 (pl)

Priority Applications (6)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL28931791A PL166061B1 (pl) 1991-03-06 1991-03-06 Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów
US07/826,929 US5512668A (en) 1991-03-06 1992-01-23 Solid phase oligonucleotide synthesis using phospholane intermediates
DE69227793T DE69227793T2 (de) 1991-03-06 1992-03-06 Verfahren und Verbindungen für die Festphase-Synthese von Oligonukleotiden und Analogen
AT92301950T ATE174341T1 (de) 1991-03-06 1992-03-06 Verfahren und verbindungen für die festphase- synthese von oligonukleotiden und analogen
EP92301950A EP0506242B1 (en) 1991-03-06 1992-03-06 Method and compounds for solid phase synthesis of oligonucleotides and oligonucleotide analogs
JP08301892A JP3207915B2 (ja) 1991-03-06 1992-03-06 オリゴヌクレオチドとオリゴヌクレオチド類似体の固相合成のための方法と化合物

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL28931791A PL166061B1 (pl) 1991-03-06 1991-03-06 Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL289317A1 PL289317A1 (en) 1992-11-30
PL166061B1 true PL166061B1 (pl) 1995-03-31

Family

ID=20053946

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL28931791A PL166061B1 (pl) 1991-03-06 1991-03-06 Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL166061B1 (pl)

Also Published As

Publication number Publication date
PL289317A1 (en) 1992-11-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6274725B1 (en) Activators for oligonucleotide synthesis
US5506351A (en) Process for the preparation of 2'-O-alkyl guanosine and related compounds
US5763599A (en) Nucleoside derivatives with photolabile protective groups
JP2542453B2 (ja) 検出可能な1本鎖オリゴヌクレオチドの化学的合成に有用な化合物
JP2511005B2 (ja) インビトロにおけるオリゴヌクレオチド合成法並びにそれに用いる試薬
US6090932A (en) Method of preparation of known and novel 2'-modified nucleosides by intramolecular nucleophilic displacement
EP0090789A1 (en) Chemical DNA synthesis
Gildea et al. The synthesis of 2-pyrimidinone nucleosides and their incorporation into oligodeoxynucleotides
WO1993001204A1 (en) Method and compounds for rna synthesis
AU711814B2 (en) Nucleoside derivatives with photolabile protective groups
Uznanski et al. The isopropoxyacetic group for convenient base protection during solid-support synthesis of oligodeoxyribonucleotides and their triester analogs
PL166061B1 (pl) Sposób wytwarzania nowych pochodnych nukleozydów
US6750335B2 (en) Nucleoside derivatives with photolabile protective groups
Marugg et al. (2‐Cyano‐1, 1‐dimethylethoxy) bis (diethylamino) phosphine: A convenient reagent for the synthesis of DNA fragments
Boryski A Novel approach to synthesis of 2′-deoxy-β-D-ribonucleosedes via transglycosylation of 6-oxopurine ribonucleosides
KR100228606B1 (ko) 올리고뉴클레오티드의 화학적 합성 방법
US5206351A (en) Process for the preparation of 2-amino (2,3,5-tri-o-benzyl-beta-d-arabinofuranosyl)adenine
Nagyvary et al. The synthesis of 5′ thioanalogs of polydeoxyribonucleotides
Ikehara et al. Seven-membered cyclic phosphate: synthesis and properties of S-cycloadenosine 2′ 5′-cyclic phosphate and cordycepin 2′, 5′-cyclic phosphate. Studies of nucleosides and nucleotides. LXIV′ l). Purine cyclonucleosides 25.
JP4814084B2 (ja) ボラノホスフェートモノマーおよびそれを用いたオリゴヌクレオチド誘導体の製造方法
US5231175A (en) Process for the preparation of 3'- or 2'-halo-substituted-2',3'-dideoxynucleosides
Cramer et al. Nucleotides, Part LX, Synthesis and Characterization of New 2′‐O‐Methylriboside 3′‐O‐Phosphoramidites Useful for the Solid‐Phase Synthesis of 2′‐O‐Methyloligoribonucleotides
JPS6284097A (ja) 保護されたオリゴヌクレオチドの製造法
Abdu Nucleophilic Groups Protection of Phosphoramidite for DNA Synthesis
PL193592B1 (pl) Analogi dinukleozydopolifosforanów modyfikowane w łańcuchu polifosforanowym i sposób ich wytwarzania

Legal Events

Date Code Title Description
LAPS Decisions on the lapse of the protection rights

Effective date: 20080306