PL215513B1 - Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka - Google Patents

Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka

Info

Publication number
PL215513B1
PL215513B1 PL385388A PL38538808A PL215513B1 PL 215513 B1 PL215513 B1 PL 215513B1 PL 385388 A PL385388 A PL 385388A PL 38538808 A PL38538808 A PL 38538808A PL 215513 B1 PL215513 B1 PL 215513B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
formula
group
rna
independently
borate phosphate
Prior art date
Application number
PL385388A
Other languages
English (en)
Other versions
PL385388A1 (pl
Inventor
Joanna Kowalska
Jacek Jemielity
Edward Darżynkiewicz
Maciej Roman Łukaszewicz
Joanna Żuberek
Original Assignee
Univ Warszawski
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Univ Warszawski filed Critical Univ Warszawski
Priority to PL385388A priority Critical patent/PL215513B1/pl
Priority to CA2727091A priority patent/CA2727091C/en
Priority to PCT/US2009/046249 priority patent/WO2009149253A2/en
Priority to AU2009256131A priority patent/AU2009256131B2/en
Priority to EP09759412.1A priority patent/EP2297175B1/en
Priority to US12/996,243 priority patent/US8519110B2/en
Priority to JP2011512643A priority patent/JP5715560B2/ja
Priority to PL09759412T priority patent/PL2297175T3/pl
Priority to ES09759412T priority patent/ES2425781T3/es
Publication of PL385388A1 publication Critical patent/PL385388A1/pl
Publication of PL215513B1 publication Critical patent/PL215513B1/pl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P3/00Drugs for disorders of the metabolism
    • A61P3/08Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis
    • A61P3/10Drugs for disorders of the metabolism for glucose homeostasis for hyperglycaemia, e.g. antidiabetics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H21/00Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
    • C07H21/02Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with ribosyl as saccharide radical
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/67General methods for enhancing the expression
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00Preparation of peptides or proteins
    • C12P21/02Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Diabetes (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Emergency Medicine (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Obesity (AREA)
  • Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)

Description

Przedmiotem wynalazku są nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, cząsteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub białka.
W organizmach eukariotycznych koniec 5' większości matrycowych RNA (mRNA) jest blokowany lub „kapowany”. Kapowane są także pewne inne formy RNA, na przykład krótkie jądrowe RNA (snRNA). Oznacza to, że cząsteczka RNA ma na 5' końcu strukturę kapu, czyli mostek 5'-5'-trifosforanowy pomiędzy dwoma nukleozydowymi ugrupowaniami i 7-metyloguanozynę. Kapowanie mRNA i snRNA wspomaga ich normalne funkcje w komórkach.
Możliwość syntezy kapowanych cząsteczek RNA in vitro jest więc użyteczna, ponieważ pozwala uzyskać cząsteczki RNA zachowujące się odpowiednio w różnych biologicznych zastosowaniach. Takie zastosowania obejmują zarówno prace badawcze, jak i komercyjną produkcję polipeptydów, np. produkcję w układzie translacji bezkomórkowej polipeptydów zawierających w specyficznym miejscu „nienaturalny” aminokwas lub produkcję w hodowlach komórkowych polipeptydów, które ze względu na aktywność i stabilność wymagają potranslacyjnej modyfikacji. W tych drugich układach synteza przebiega w znacznie dłuższym czasie i dlatego otrzymuje się więcej białka.
Najczęściej stosowanym sposobem otrzymywania kapowanego RNA in vitro jest synteza RNA na matrycy DNA za pomocą bakteryjnej lub bakteriofagowej polimerazy RNA w obecności wszystkich czterech trifosforanów rybonukleozydów oraz dinukleotydu kapu, takiego jak m7G(5')ppp(5')G (m7GpppG). Polimeraza inicjuje transkrypcję przez nukleofilowy atak 3'-OH ugrupowania Guo w m7GpppG na α-fosforan następnego transkrybowanego trifosforanu nukleozydu, dając jako początkowy produkt m7GpppGpN. Alternatywny produkt inicjowany przez GTP - pppGpN jest powstrzymywany przez ustalenie stosunku m7GpppG do GTP w transkrypcyjnej mieszaninie reakcyjnej od 5 do 10.
Ilość białka produkowanego przez syntetyczny mRNA wprowadzony do hodowli komórek ssaczych jest ograniczona przez degradację mRNA w naturalnym obiegu. Degradacja mRNA in vivo jest inicjowana głównie przez usunięcie kapu z nienaruszonego mRNA przez specyficzną pirofosfatazę, Dcp 1/2, która rozszczepia wiązanie pomiędzy α i β fosforanami. W publikacji E. Grudzien et al. „Differential inhibition of mRNA degradation pathways by novel cap analogs”, J. Biol. Chem., vol. 281, pp. 1857-1867 (2006) opisano właściwości analogu kapu, w którym grupa metylenowa zastępuje atom
7,3'-O
O pomiędzy grupami α and β fosforanowymi, m27,3'-OGppCH2pG. mRNA kapowane tym analogiem były odporne na hydrolizę in vitro rekombinowanym ludzkim Dcp2.
7,3'-O
Po wprowadzeniu do hodowli komórkowych mRNA kapowane za pomocą m27,3'-OGppCH2pG były 7,3'-O bardziej stabilne niż kapowane za pomocą m2 7,3'-OGpppG.
7,3'-O
Chociaż mRNA kapowane za pomocą m27,3'-OGppCH2pG były bardziej stabilne w hodowlach komórkowych, dawały mniejszą wydajność w procesie translacji, przypuszczalnie ze względu na znacznie
7,3'-O 7,3'-O mniejsze powinowactwo wiązania m2 7,3'-OGppCH2pG do eIF4E in vitro w porównaniu z m2 7,3'-OGpppG. Tak więc, chociaż były bardziej stabilne w hodowlach komórkowych, ta korzyść była dla wydajności syntetyzowanego białka wyrównana przez niższą wydajność translacji.
Poprawę tej sytuacji przedstawiono w publikacji J. Kowalska, et al. „Synthesis and characterization of mRNA cap analogs containing phosphorothioate substitutions that bind tightly to elF4E and are resistant to the decapping pyrophosphatase DcpS” RNA vol. 14, pp. 1119-31 (2008).
Opisano tu syntezę trzech analogów kapu typu ARCA, gdzie O zastąpiono przez S w resztach fosforanowych α, β, lub γ (nazwanych S-ARCA). Każdy z nich zsyntetyzowano w dwu formach izomerycznych, które mogły być rozdzielone chromatograficznie. Stwierdzono, że wszystkie z otrzymanych analogów silnie oddziałują z białkiem eIF4E (nie słabiej niż m7GpppG).
mRNA zakończone analogiem S-ARCA modyfikowanym w pozycji β były odporne na hydrolizę in vitro rekombinowanym ludzkim Dcp2, wydłużały czas półtrwania mRNA w komórkach ssaczych oraz znacznie zwiększały wydajność translacji elektoroporowanego do komórek mRNA. E. Grudzien et al. „Phosphorothioate Cap Analogs Stabilize mRNA and Increase Translational Efficiency in Mammalian Cells” RNA, vol. 13, str. 1745-1755 (2007).
Innym zastosowaniem analogów kapu jest ich użycie w badaniach nad inhibicją translacji zależnej od kapu w systemach bezkomórkowych. Stwierdzono, że analogi kapu efektywnie hamują translację poprzez konkurowanie z mRNA o miejsce wiązania białka eIF4E. [A. Cai et al, „Quantitative assessment of mRNA cap analogues as inhibitors of in vitro translation”. Biochemistry vol. 38, pp. 8538-8547 (1999), E. Grudzien, „Novel cap analogs for in vitro synthesis of mRNAs with high translational efficiency”. RNA vol. 10, pp. 1479-1487(2004).]
PL 215 513 B1
Zdolność analogów kapu do inhibicji translacji ma także potencjalne znaczenie terapeutyczne, gdyż jak wykazano, białko eIF4E jest nadeksprymowane w wielu rodzajach komórek nowotworowych, a jego nadekspresja prowadzi selektywnie do nadekspresji czynników białkowych związanych z nowotworzeniem i metastazą [A. De Benedetti, J. R. Graff „eIF-4E expression and its role in malignancies and metastases” ONCOGENE vol. 23, pp. 3189-3199 (2004)].
Pokazano również, że wyciszenie ekspresji eIF4E za pomocą siRNA lub oligonukleotydów antysensownych [J. R. Graff et al. „Therapeutic suppression of translation initiation factor eIF4E expression reduces tumor growth without toxicity”, J. Clin. Investigation, vol. 117, pp. 2638-2648 (2007)], jak również zahamowanie jego aktywności poprzez ekspresję specyficznego represora, może zahamować proces nowotworzenia [Herbert et al. „Rapid induction of apoptosis by peptides that bind initiation factor eIF4E”. Curr. Biol. vol. 10, pp. 793-796 (2000)].
Syntetyczne analogi kapu stanowią grupę specyficznych inhibitorów eIF4E, mogą zatem znaleźć zastosowanie w leczeniu chorób nowotworowych. Działanie, analogów kapu jako inhibitorów translacji nie zostało jednak do tej pory zademonstrowane in vivo, głównie ze względu na ich nietrwałość w warunkach komórkowych. Rozwiązaniem tego problemu może być synteza analogów modyfikowanych w łańcuchu oligofosforanowym.
Oprócz modyfikacji metylenobisfosfonianowej (zamiana O na CH2) oraz tiofosforanowej (zamiana O na S) znane są również inne modyfikacje, które mogą chronić nukleotydy przed degradacją enzymatyczną. Jedną z nich jest modyfikacja boranofosforanowa, polegająca na zastąpieniu jednego z niemostkowych atomów O w grupie fosforanowej, grupą boranową (BH3-).
Modyfikacja boranofosforanowa jest najczęściej spotykana w chemicznie, bądź enzymatycznie syntetyzowanych oligonukleotydach, ale znane są również przykłady syntezy boranofosforanowych analogów mononukleotydów [Li P, et al. „Nucleoside and oligonucleoside boranophosphates: Chemistry and properties” Chemical Reviews vol. 107, pp. 4746-4796 (2007)], a nawet boranofosforanowych analogów polifosforanów dinukleozydów.
Boranofosforanowe analogi polifosforanów dinukleozydów przedstawiono w opisie zgłoszenia US 2006/0287271. Są nimi zwłaszcza opisane w przykładach diadenozyny i diurydyny użyteczne do leczenia i zapobiegania chorobom modulowanym przez receptory P2Y, jak cukrzyca typu 2 i nowotwór.
Boranofosforanowe analogi nukleotydów wykazują podobieństwo do tiofosforanów, ze względu na budowę przestrzenną, wartości pKa, oraz występowanie P-diastereoizomerii. Jednakże wykazano, że boranofosforany są nawet 10-krotnie bardziej odporne na hydrolizę enzymatyczną niż ich tiofosforanowe odpowiedniki. Są one również bardziej lipofilowe od tiofosforanów, co ułatwia ich przenikanie przez błony biologiczne. Kolejna zaletą analogów boranofosforanowych jest możliwość użycia ich w terapii BNCT (boron neutron capture therapy).
Przedmiotem wynalazku są nowe analogi kapu modyfikowane resztą boranofosforanową. Analogi te mają zastosowanie zwłaszcza jako 5' koniec mRNA, jako inhibitory zależnej od kapu translacji, np. do inhibicji translacji w komórkach nowotworowych, jak również jako reagenty do otrzymywania kapowanego mRNA o zwiększonym czasie życia w warunkach in vivo. W nowych pochodnych połączono BH3 - podstawienie przy różnych resztach fosforanowych z podstawieniem grupą 2' - i/lub 3'-O-alkilową, korzystnie metylową w celu zapewnienia prawidłowej orientacji podczas syntezy RNA in vitro, otrzymując nowe analogi nazywane BH3-analogi kapu lub BH3-ARCA dla analogów wbudowywanych do 5' końca RNA w prawidłowej orientacji. Modyfikacja analogów ARCA (anty-odwrotne analogi kapu, tj. dinukleotydowe analogi kapu modyfikowane na rybozie 7-metyloguanozyny, które są wbudowywane wyłącznie w poprawnej orientacji w procesie translacji in vitro, katalizowanej przez polimerazę RNA) zapewnia precyzyjne umiejscowienie boranofosforanowych grup α, β i γ w miejscach aktywnych białka wiążącego kap zarówno w procesie translacji, jak i usuwania kapu.
Nieoczekiwanie stwierdzono, że nowe 3-BH3-ARCA nie ulegają degradacji w reakcji katalizowanej przez enzym DcpS.
Nowe boranofosforanowe analogi dinukleozydów mają wzór ogólny 1,
PL 215 513 B1
w którym Y1, Y2, Y3, Y4 oznaczają niezależnie O lub BH3, przy czym co najmniej jeden Y oznacza BH3, n wynosi 0 lub 1,
N oznacza grupę o wzorze 6 lub grupę o wzorze 7,
w których
R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3,
X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyl lub podstawiony naftylometyl,
B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4 lub 5,
R3 i R4 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3 lub OCH2CH3 Związki o wzorze 1 mogą być w postaci wolnej lub w postaci soli.
Wynalazek obejmuje także diastereoizomery związków o ogólnym wzorze 1 i mieszaniny diastereoizomerów.
Do związków o ogólnym wzorze 1 należą związki o wzorach 8, 9, 10, 11, 12, i 13,
PL 215 513 B1
PL 215 513 B1
Do przykładowych korzystnych analogów należą związki o wzorze 1, w którym B oznacza grupę o wzorze 2a lub 2b; związki ogólnym wzorze 1, w którym B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4, lub 5, zwłaszcza 2a, 2b, R3 i R4 oznaczają OH, N oznacza grupę o wzorze 6 lub 7, X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyl lub podstawiony naftylometyl, zwłaszcza metyl, a R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, przy czym jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2a, 3, 4, lub 5, wówczas jeden spośród R1 i R2 ma znaczenie inne niż OH.
Przykładami tych korzystnych związków są związki w których N oznacza grupę o wzorze 6, R2 oznacza OH, R1 oznacza H lub CH3, X oznacza metyl, n wynosi 0, a jeden spośród Y1, Y2, Y3 oznacza BH3 o wzorze ogólnym 14 podane w tabeli 1.
Tabela I
OR OH
Ύη .ol z 0 II -o—PI. Y 0 II -o—pI. X N P
N<?· 0“ CH, Wzór 14 y β a OH OH
Związek X Y z R N
m7GpppBH3G (D1) bh3 0 0 H Gua
m7GpppBH3G (D2) bh3 0 0 H Gua
m7GppBH3pG (D1) 0 bh3 0 H Gua
m7GppBH3pG (D2) 0 bh3 0 H Gua
m7GppBH3pm7G 0 bh3 0 H m7Gua
m7GpBH3PpG (D1) 0 0 bh3 H Gua
m7GpBH3ppG (D2) 0 0 bh3 H Gua
m2720GpppBH3G (D1) bh3 0 0 ch3 Gua
m27.2'-°GpppBH3G (D2) bh3 0 0 ch3 Gua
m27.2'-OGppBH3pG (D1) 0 bh3 0 ch3 Gua
rri2720GppBH3pG (D2) 0 bh3 0 ch3 Gua
m272'°GpBH3ppG (D1) 0 0 bh3 ch3 Gua
m272'-°GpBH3PpG (D2) 0 0 bh3 ch3 Gua
Gua oznacza guanozynę o wzorze 2a, a m7Gua oznacza 7-metyloguanozynę o wzorze 2b, w którym X oznacza CH3.
Ze względu na zastosowanie, jako struktury kapu do korzystnych należą β-ΒΗ3- analogi kapu.
Nowe boranofosforanowe analogi dinukleozydów mogą być w postaci wolnej lub w postaci soli na przykład z kationem metali alkalicznych lub metali ziem alkalicznych, NH4+, N(R)3H+, gdzie R oznacza grupę alkilową o 1-6 atomach węgla, np. etylową, butylową i podobne.
Wynalazek dotyczy także zastosowania nowych boranofosforanowych analogów dinukleozydów o ogólnym wzorze 1, w którym symbole mają wyżej podane znaczenie jako inhibitora zależnej od kapu translacji, np. jako inhibitora translacji w komórkach nowotworowych.
Ze względu na zastosowanie do inhibicji zależnej od kapu translacji korzystne są β i γ analogi.
PL 215 513 B1
Przedmiotem wynalazku jest ponadto cząsteczka RNA zawierająca na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o ogólnym wzorze 1, w którym B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4, lub 5, N oznacza grupę o wzorze 6 lub 7, X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyl lub podstawiony naftylometyl, a R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, R3 i R4 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, z tym że, jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2a, 3, 4, lub 5, wówczas jeden spośród R1 i R2 ma znaczenie inne niż OH, natomiast R3 i R4 oznaczają OH, a jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2b, wówczas albo R1 i R2, albo R3 i R4 oznaczają OH, ich diastereoizomery lub mieszaniny diastereoizomerów.
Sposób otrzymywania RNA zawierającego na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o ogólnym wzorze 1, w którym podstawniki mają wyżej podane znaczenie, in vitro, polega według wynalazku na tym, że na polinukleotydowej matrycy w obecności polimerazy RNA poddaje się reakcji ATP, CTP, UTP, GTP oraz wyżej zdefiniowany analog o wzorze 1 w warunkach zapewniających transkrypcję polinukleotydowej matrycy przez polimerazę RNA.
W procesie tym do co najmniej części kopii RNA włącza się wyżej zdefiniowany analog o wzorze 1.
Nowy analog zazwyczaj stosuje się w nadmiarze w stosunku do GTP w zakresie od 2:1 do 50:1.
Sposób otrzymywania peptydu, białka lub peptydowego antygenu in vitro polega według wynalazku na tym, że translacji w układzie bezkomórkowym poddaje się cząsteczkę RNA zawierającą na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o wyżej zdefiniowanym wzorze 1, przy czym cząsteczka RNA ma otwartą ramkę odczytu, a proces prowadzi się w warunkach sprzyjających translacji otwartej ramki odczytu RNA do peptydu, białka lub peptydowego antygenu kodowanego przez otwartą ramkę odczytu
Sposób otrzymywania peptydu, białka lub peptydowego antygenu w hodowli komórkowej polega według wynalazku na tym, że do hodowli komórkowej wprowadza się cząsteczkę RNA zawierającą na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o wyżej zdefiniowanym wzorze 1, przy czym cząsteczka RNA ma otwartą ramkę odczytu, a proces prowadzi się w warunkach sprzyjających translacji otwartej ramki odczytu RNA do peptydu, białka lub peptydowego antygenu kodowanego przez otwartą ramkę odczytu.
Chemiczną syntezę boranofosforanowych analogów kapu przeprowadzono z wykorzystaniem metod podobnych do opracowanych dla syntezy analogów niemodyfikowanych w mostku 5',5'-polifosforanowym [M. Kadokura et al., „Efficient synthesis of γ-methyl-capped guanosine 5'-triphosphate as a 5'-terminal unique structure of U6 RNA via a new triphosphate bond formation involving activation of methyl phosphorimidazolidate using ZnCl2 as a catalyst in DMF under anhydrous conditions”, Tetrahedron Lett., vol. 38, pp. 8359-8362 (1997); J. Stępinski et al, Synthesis and properties of mRNAs containing the novel anti-reverse cap analogues 7-methyl(3'-O-methyl)GpppG and 7-methyl(3'-deoxy)GpppG”, RNA, vol. 7, pp. 1486-1495 (2001), i J. Jemielity et al., „Novel anti-reverse cap analogues with superior translational properties”, RNA, vol. 9, pp. 1108-1122 (2003)], a także analogów kapu modyfikowanych resztą metylenobisfosfonianową [M. Kalek et al. „Enzymatically stable 5' mRNA cap analogs” (2006) Bioorg. Med. Chem. vol. 14, 3223-3230] oraz tiofosforanową [J. Kowalska et al. „Synthesis and characterization of mRNA cap analogs containing phosphorothioate substitutions that bind tightly to elF4E and are resistant to the decapping pyrophosphatase DcpS” (2008) RNA, vol. 14, 1119-1131]. Według tego podejścia dwa mononukleotydy, z których jeden uprzednio zaktywowano w postaci odpowiedniego imidazolidu, są sprzęgane w DMF. Reakcja jest w dużym stopniu ułatwiona przez zastosowanie 8-molowego nadmiaru ZnCl2, który jednocześnie znacząco zwiększa rozpuszczalność reagentów w medium organicznym, zapobiega hydrolizie imidazolowych pochodnych, oraz przyspiesza szybkość reakcji. Inne chlorki metali np. MnCl2, CdCl2, MgCl2 są również zdolne do promowania tworzenia wiązania pirofosforanowego jednak zazwyczaj z mniejszą wydajnością niż ZnCl2 [M. Kadokura et al., „Efficient synthesis of γ-methyl-capped guanosine 5'-triphosphate as a 5'-terminal unique structure of U6 RNA via a new triphosphate bond formation involving activation of methyl phosphorimidazolidate using ZnCl2 as a catalyst in DMF under anhydrous conditions”, Tetrahedron Lett., vol. 38, pp. 8359-8362 (1997)]. Podobną do opisanej metodologię, z kilkoma modyfikacjami, zastosowaliśmy do syntezy różnych analogów kapu zawierających mieszane bezwodnikowe wiązanie fosforano-boranofosforanowe. Najlepsze rezultaty w reakcjach sprzęgania otrzymaliśmy jednak z zastosowaniem MgCl2, a nie ZnCl2. W obecności chlorku cynku reakcje sprzęgania również zachodziły,
PL 215 513 B1 ale towarzyszyły im w znacznej mierze procesy uboczne związane z rozszczepieniem wiązania P-BH3 w środowisku kwaśnym (generowanym przez ZnCl2).
Drogi syntezy prowadzące do otrzymania różnych analogów kapu zawierających modyfikację boranofosforanową w pozycjach α, lub β mostka trifosforanowego przedstawiono odpowiednio na fig. 1, fig. 2, fig. 3 i fig. 4.
Synteza analogów modyfikowanych grupą boranofosforanową w pozycji α przedstawiona jest na fig. 1. W celu dokonania tej syntezy, opracowano najpierw metodę syntezy kluczowego związku pośredniego - 5'-O-boranofosforanu guanozyny. Materiałem wyjściowym do syntezy był 5'-H-fosfonian odpowiedniego nukleozydu, który poddano sililowaniu za pomocą BSA (N,O-bis(trimetylosililo)acetamidu), a otrzymany pośredni bis(trimetylosililo)fosforyn bez izolacji, poddano boranowaniu za pomocą kompleksu BH3 · SMe2. Następcza hydroliza i oczyszczanie za pomocą chromatografii jonowymiennej, prowadziły do pożądanego 5'-O-boranofosforan nukleozydu z wydajnością około 30%. W celu otrzymania analogu kapu m7 GpppBH3G oraz analogu kapu typu ARCA m27,2'-O GpppBH3G, 5'-O-boranofosforan guanozyny sprzęgano odpowiednio z imidazolową pochodną m7GDP lub m27,2'-OGDP w mieszaninie woda/DMF 9:1 w obecności nadmiaru chlorku magnezu. W obu przypadkach pożądany analog kapu powstaje jako mieszanina dwóch P-diastereoizomerów, które można rozdzielić techniką HPLC. Diastereoizomerom przypisano oznaczenia D1 i D2, zgodnie z kolejnością elucji z kolumny RP HPLC.
Synteza analogów modyfikowanych grupą boranofosforanową w pozycji β przedstawiona jest na fig. 2. Sól trietyloamoniową boranofosforanu zsyntetyzowano według zmodyfikowanej procedury opracowanej przez Nahum i wsp [V. Nahum i B. J. Inorg. Chem. vol. 20, 4124-4131 (2004)]. Według oryginalnej procedury, tris(trimetylosililo)fosforyn poddawany jest reakcji boranowania za pomocą kompleksu BH3 · SMe2, następcza solwoliza w metanolu w obecności odpowiedniej zasady (np. NH3. NBu3 etc.), pozwala na otrzymanie boranofosforanu w postaci soli (odpowiednio amonowej, tributyloamoniowej itd.), po uprzednim odparowaniu pozostałych, lotnych składników mieszaniny reakcyjnej. Jednakże, otrzymany przez nas w ten sposób boranofosforan był znacznie (nawet do 20%, jak stwier31 dzono za pomocą 31P NMR) zanieczyszczony fosforanem (III), który w trakcie dalszych eksperymentów okazał się niepożądanym produktem, przeszkadzającym w reakcji sprzęgania. Obecność fosforanu (III) wynikała prawdopodobnie z tego, że tris(trimetylosililofosforyn) częściowo hydrolizuje w warunkach reakcji do bis(trimetylosililo)fosforynu, którego równowaga tautomeryczna przesuniętą jest zdecydowanie w stronę formy H-fosfonianowej i dlatego nie ulega on reakcji boranowania. Rozwiązaniem tego problemu okazało się dodanie do mieszaniny reakcyjnej nadmiaru odczynnika sililującego (BSA), który zapobiegał tworzeniu się bis(trimetylosililo)fosforynu. Otrzymaną sól trietyloamoniową boranofosforanu sprzęgano z nadmiarem imidazolowej pochodnej 5'-monofosforanu guanozyny otrzymując symetryczny 5', 5”-O,O-(2-boranotrifosforan) diguanozyny (GppBH3pG, fig. 2). Związek został następnie poddany działaniu jodku metylu w DMSO, w celu wprowadzenia grupy metylowej w pozycję N7 guanozyny (fig. 2, krok ii). W reakcji tej powstaje mieszanina mono- i dimetylowanego analogu kapu (m7GppBH3pG i m7GppBH3pm7G). Wzajemny stosunek otrzymanych produktów mono- i dimetylowanych, może być kontrolowany poprzez staranne dobranie warunków reakcji. W obecności około 4-krotnego nadmiaru CH3I jako główny produkt powstaje m7GppBH3pG (ok. 70% wydajności HPLC), natomiast przy zastosowaniu większego nadmiaru CH3I (8-10eq.) m7GppBH3pm7G jest produktem przeważającym (ok. 50% w. HPLC). Jednakże, w przypadku tego związku bardziej efektywną, jednoetapową drogą syntezy jest sprzęganie boranofosforanu z imidazolową pochodną 5'-O-monofosforanu
7-metyloguanozyny, pozwalające na wyizolowanie go z 34% wydajnością (fig. 3).
W celu otrzymania modyfikowanego w pozycji β analogu typu ARCA przeprowadzono kilka prób otrzymania kluczowego dla tej syntezy związku pośredniego, 5'-O-(2-boranodifosforanu) 7,2'-O-di7,2'-Ο metyloguanozyny (m2 7 - GDPβΒΗ3). Mimo, iż analiza MS ESI (-) produktów sprzęgania imidazolowej
7,2'-Ο pochodnej m2 7 - GMP-Im z nadmiarem soli trietyloamoniowej boranofosforanu w DMF w obecności MgCI2 wskazywała na powstawanie pożądanego produktu, to jednak związku tego nie udało się wyizolować w zadowalających ilościach. Prawdopodobną przyczyną jest jego zaobserwowana nietrwa772'-Ο łość w roztworach wodnych (hydrolizuje do m2 7 - GMP), uniemożliwiająca oczyszczanie w procesie
772'-Ο chromatografii jonowymiennej. Syntezy dokonano zatem, otrzymując m2 7 - GDPBBH3 w reakcji
772'-Ο m2 7 - GMP-Im z nadmiarem soli trietyloamoniowej boranofosforanu i tak otrzymany związek, bez izolacji, poddano następczej reakcji z nadmiarem imidazolowej pochodnej GMP (fig. 4).
Inne analogi objęte wzorem ogólnym 1 otrzymuje się w reakcjach analogicznych do przedstawionych na fig. 17 27 3 i 4.
PL 215 513 B1
Na załączonych rysunkach fig. 1 do fig. 4 przedstawiają syntezę otrzymanych nowych analogów, fig. 5 pokazuje wydajność translacji, fig. 6 pokazuje inhibicję translacji przez boranofosforanowe analogi kapu, fig. 7 pokazuje inhibicję translacji po 60 minutach preinkubacji analogu kapu w lizacie z retikulocytów króliczych przed startem translacji.
Opisane niżej eksperymenty i przykłady bliżej ilustrują wynalazek.
Syntezy boranofosforanowych analogów kapu
Nukleotydowe związki pośrednie były oczyszczane przy użyciu kolumnowej chromatografii jo3nowymiennej na DEAD-Sephadex A-25 (HCO3- forma) przy użyciu liniowego gradientu wodorowęglanu trietyloamoniowego (TEAB) w dejonizowanej wodzie. W wyniku oczyszczania otrzymywano produkty w postaci soli trietyloamoniowych po uprzednim odparowaniu roztworu z dodatkiem etanolu pod zmniejszonym ciśnieniem. Finalne produkty (analogi kapu) były rozdzielane przez półpreparatywne HPLC, a następnie liofilizowane w wyniku czego otrzymywano produkty końcowe w postaci soli amonowych. Analityczne HPLC wykonywano na aparacie Agilent 1100 Series wyposażonym w kolumnę Supelcosil LC-18-T RP (4.6 x 250 mm, przepływ 1.3 ml/min) stosując 0-25% metanolu w 0.05 M octanie amonu pH 5.9 i detekcję UV przy 260 nm oraz detekcję fluorescencyjną stosując wzbudzanie przy 280 nm i detekcję fluorescencji przy 337nm. Półpreparatywne HPLC przeprowadzano na aparacie Waters 600E Multisolvent Delivery System wyposażonym w kolumnę RP Waters HR-C-18 (19 x 300 mm, przepływ 5.0 ml/min) stosując liniowy gradient metanolu w 0.05 M octanie amonu, pH 5.9, i detekcję 1 31
UV przy 260 nm. Widma H NMR i P NMR były zarejestrowane w temperaturze 25°C na aparacie
Varian UNITY-plus odpowiednio przy 399.94 MHz i 161.90 MHz. Przesunięcia chemiczne w 1H NMR podano w odniesieniu do 3-trimetylosilylo-[2,2,3,3-D4]-propionianu sodu (TSP) w D2O jako wzorca 31 wewnętrznego. Przesunięcia chemiczne w 31P NMR podano w odniesieniu do 20% kwasu fosforowego w D2O jako wzorca zewnętrznego. Widma masowe rejestrowano na aparacie Micromass QToF 1 MS stosując jonizację elektrosprej w trybie jonów ujemnych (ESI (-)).
Rozpuszczalniki oraz inne odczynniki zakupiono z Sigma-Aldrich i używano bez dalszej obróbki chyba, że w tekście zaznaczono inaczej. Acetonitryl i aceton przed użyciem destylowano znad P2O5 i przechowywano nad sitami molekularnymi 4A. GMP i GDP zakupiono z Sigma-Aldrich i przekształ7,2'-Ο cono w sól trietyloamoniową stosując żywicę jonowymienną Dowex 50 WX 8. m2 , - GMP
7,2'-Ο i m2 , - GDP otrzymano stosując metody opisane wcześniej [J. Jemielity et al. „Novel 'anti-reverse' cap analogues with superior translational properties”, RNA, vol. 9, pp. 1108-1122 (2003)]. 2'-O-metyloguanozyna została otrzymana według procedury opisanej wcześniej. [J. Kusmierek et al. „A new route to 2'(3')-O-alkyl purine nucleosides”, Nucleic Acids Res. vol. 1, pp. 73-77, Special Publication
No. 4 (1978).]. 2',3'-O,O-izopropylidenoguanozynę otrzymano według procedury opisanej wcześniej.
7,2'-Ο
Ogólna procedura otrzymywania imidazolowych pochodnych (GMP-Im, m2 , - GMP-Im,
7,2'-Ο
GDP-Im, and m2 , - GDP-Im) [T. Mukaiyama, et al. „Phosphorylation by oxidation-reduction condensation. Preparation of active phosphorylating reagents”, M. Bull. Chem. Soc. Jpn, vol. 44, 2284 (1971)].
Odpowiedni nukleotyd (1 mmol, TEA salt), imidazol (8 mmol), i 2,2'-dithiodipirydyna (3 mmol) zostały zmieszane w DMF (około 10 ml). Następnie dodano trietyloaminę (2 mmol) i trifenylfosfinę (3 mmol) i całość mieszano przez 6-8 h. Produkt wytrącono z mieszaniny reakcyjnej roztworem nadchloranu sodu w bezwodnym acetonie (1 mmol na ładunek ujemny) (50 ml). Po ochłodzeniu do 0°C osad przesączono, i kilkakrotnie przemyto bezwodnym acetonem, a następnie osad suszono nad P4O10. Wydajności 80-100%.
P r z y k ł a d I
5'-H-fosfonian guanozyny [M. Yoshikawa et al. „Studies of phosphorylation. IV. The phosphorylation of nucleosides with phosphorus trihalide”, Bull. Chem. Soc. Jpn, vol. 43, 456-461 (1970)].
2',3'-0,0-izopropylidenoguanozynę (1,3 g, 4,0 mmol) zawieszono w 19,5 ml fosforanu trimetylu i mieszaninę ochłodzono na łaźni lodowej. Następnie dodano PCI3 (1,06 ml, 12,1 mmol) i mieszano na łaźni lodowej do osiągnięcia klarownego roztworu (ok. 60 min). Następnie mieszaninę reakcyjną rozcieńczono wodą (80 ml) i doprowadzono za pomocą stałego NaHCO3 do pH ok. 1,5. Otrzymany roztwór ogrzewano przez 40-60 min w temp. 70°C, pozostawiono do ochłodzenia do temp. pokojowej, doprowadzono do pH ok. 5 za pomocą stałego NaHCO3, rozcieńczono dwukrotnie wodą, po czym naniesiono na kolumnę jonowymienną Sephadex i rozdzielano stosując 0-0,9 M gradient TEAB. Frakcje wymyte przy stężeniu buforu 0,6-0,65 M zawierające 39,5 tys. jednostek optycznych produktu
PL 215 513 B1 połączono, odparowano i wysuszono w eksykatorze próżniowym nad P2O5. Otrzymano 1,34 g (3,0 mmol) soli trietyloamoniowej 5'-H-fosfonianu guanozyny (wydajność 74%).
ESI MS (-) m/z: 346,08 (wartość obliczona dla C10H13N5O7P: 346,06);
1H NMR δ (ppm): 8,08 (1H, s, H8); 6,73 (1H, d, J = 640 Hz, H-P); 5,93 (1H, d, J = ~5,4 Hz, H1'); 4,77 (1H, t, J = ~5,4 Hz); 4,48 (1H, t, J = 3,2 Hz); 4,32 (1H, m, H4'); 4,11 (2H, m, H5' i H5) 31P NMR δ (ppm): 7,07 (1P, dt, J = 640 Hz, J = 6,0 Hz).
5'-O-boranofosforan guanozyny (GMPBH3, sól trietyloamoniowa)
5'-H-fosfonian guanozyny (1,03 g, 2,30 mmol) umieszczono w kolbie okrągłodennej zawieszono w 30 ml suchego acetonitrylu, kolbę zamknięto gumowym septum zaopatrzonym w dwie igły i przez mieszaninę przepuszczano argon przez ok. 30 min. Następnie do zawiesiny dodano za pomocą strzykawki BSA (11,3 ml, 46 mmol) i intensywnie mieszano do momentu otrzymania klarownego roztworu i dodatkowo przez 30 min. Po tym czasie kolbę umieszczono w łaźni lodowej, dodano za pomocą strzykawki 5,7 ml 2M roztworu BH3 · SMe2 w THF (11,5 mmol BH3), po 5 min łaźnię usunięto i kontynuowano mieszanie przez 30 min. Roztwór odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem do oleistej pozostałości, po czym ponownie umieszczono na łaźni lodowej i dodano 60 ml metanolu i 3 ml 2M roztworu NH3 w etanolu i mieszano przez 2h w temp pokojowej. Roztwór odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem do sucha, po czym rozpuszczono w 100 ml wody i przeekstrahowano jednokrotnie 20 ml eteru dietylowego. Resztki eteru z warstwy wodnej odpędzono pod zmniejszonym ciśnieniem i roztwór naniesiono na kolumnę jonowymienną Sephadex i rozdzielano stosując 0-0,9 M gradient TEAB. Z połączonych frakcji zawierających 13,2 tys. j. optycznych produktu po odparowaniu do sucha i liofilizacji otrzymano 410 mg soli trietyloamoniowej 5'-O-boranofosforanu guanozyny (Wydajność 32%).
ESI MS (-) m/z: 360,13 (wartość obliczona dla C10H16N5O7P11B: 360,09) 1H NMR δ (ppm): 8,17 (1H, s, H8); 5,82 (1H, d, J=6,0 Hz, H1'); 4,74 (1H, t, H2'); 4,47 (1H, t, H3'); 4,32 (1H, m, H4'), 4,03 (2H, m, H5' i H5) 31P NMR δ (ppm): 79,05 (1P, ~qq, J= 158 Hz, J= 22,5 Hz).
Synteza m7GpppBH3G
Do GMPBH3 (50 mg, 0,089 mmol, sól TEA) i m7GDP-Im (100 mg, 0,18 mmol, sól Na) w 2,5 ml mieszaniny DMF/H2O (9:1), dodano, niewielkimi porcjami, bezwodny MgCl2 (110 mg, 1,16 mmol), po czym mieszaninę intensywnie wytrząsano do momentu rozpuszczenia reagentów. Następnie roztwór mieszano przez 3 dni w temperaturze pokojowej. Reakcję zakończono dodając roztwór EDTA (430 mg, l, 16 mmol) w 25 ml wody i doprowadzono do pH ok. 6 za pomocą stałego NaHCO3. Produkty oczyszczono za pomocą chromatografii jonowymiennej stosując 0-1,2 M gradient TEAB. Otrzymano 685 jednostek optycznych (λ = 260 nm) diastereomerycznej mieszaniny m7GpppBH3G. Diastereoizomery rozdzielono następnie za pomocą półpreparatywnego HPLC, a zebrane frakcje trzykrotnie zliofilizo7,2'-Ο 7,2'-Ο wano. Wydajność po rozdziale HPLC: m2 , - GpppBH3G (D1) 13,4 mg i oraz m2 , - GpppBH3G (D2) 7,3 mg w postaci soli amonowych (odpowiednio 18% i 9,8%).
ESI MS (-) m/z: 799,22 (wartość obliczona dla C21H31N10O17P3B: 799,12)
D1 = 1H NMR δ (ppm): 8,93 (1H, s. H8 m7G); 7,99 (1H, s, H8 G); 5,79 (1H, d, J=3,2 Hz, Η1' m7G); 5,73 (1H, d, J=6,0 Hz, Η1' G); 4,59 (1H, ~t, H2' G); 4,48 (1H, dd, J=4,4 Hz, J= 3,2 Hz, H2' m7G); 4,40 (1H, m, H3; G); 4,37 (1H, m, H3' m7G); 4,27 (3H, nałożone m, H4', H5', H5); 4,13 (3H, nałożone m, H4', H5', H5); 3,95 (3H, s, CH3); 0,34 (3H, szeroki m, BH3) 31P NMR δ (ppm): 84,07 (1P, m, Pα (Pbhs)); -11,29 (1P, d, J=19,4 Hz, PY); -22,95 (1P, dd, J=19,4 Hz, J=30,0 Hz, Ρβ)
D2: 1H NMR δ (ppm): 8,87 (1H, s, H8 m7G); 7,95 (1H, s, H8 G); 5,79 (1H, d, J=~ 2 Hz, H1'm7G); 5,68 (1H, d, J = 5,4 Hz, Η1' G); 4,62 (1H, ~t, H2' G); 4,50 (1H, ~t, H2' m7G); 4,41 (1H, m, H3' G); 4,37 (1H, m, H3' m7G); 4,25 (3H, nałożone m, H4', H5', H5); 4,15 (3H, nałożone m, H4', H5', H5); 3,93 (3H, s, CH3); 0,34 (3H, szeroki m, BH3) 31PNMR δ (ppm): 84,0 (1Ρ, m, Ρα (Pbh3)); -11,38 (1Ρ, s, Ργ); -22,88 (1Ρ, s, Ρβ).
P r z y k ł a d II
7,2'-Ο
Synteza m2- GpppBH3G
Do zawiesiny GMPBH3 (30 mg, 0,053 mmol, sól TEA) i m2 7,2-°GDP-im (60 mg, 0,11 mmol, sól Na) w 1,5 ml mieszaniny DMF/H2O (9:1), dodano, niewielkimi porcjami, bezwodny MgCI2 (80 mg, 0,85 mmol) po czym mieszaninę intensywnie wytrząsano do momentu rozpuszczenia reagentów. Następnie roztwór mieszano przez 4 dni w temperaturze pokojowej. Reakcję zakończono poprzez dodanie roztworu EDTA (320 mg, 0,85 mmol) w 15 ml wody i doprowadzono do pH ok. 6 za pomocą stałego NaHCO3. Produkty oczyszczono za pomocą chromatografii jonowymiennej stosując 0-1,2 M graPL 215 513 B1 dient TEAB. Otrzymano 520 jednostek optycznych (λ=260 nm) diastereomerycznej mieszaniny
7,2'-Ο m2 , - GpppBH3G. Diastereoizomery rozdzielono następnie za pomocą półpreparatywnego HPLC,
7,2'-Ο zebrane frakcje trzykrotnie zliofilizowano. Wydajność po rozdziale HPLC: m2 , - GpppBH3G (D1) 6,1 mg
7,2'-Ο i oraz m2 , - GpppBH3G (D2) 3,7 mg w postaci soli amonowych (odpowiednio 13,4% i 8%).
ESI MS (-) m/z: 813,15 (wartość obliczona dla C22H33N10O17P311B: 813,13)
D1 = 1H NMR δ (ppm): 9,03 (1H, s, H8 m7G); 8,09 (1H, s, H8G); 5,95 (1H, d, J=2,7 Hz, H1' m7G); 5,84 (1H, d, J=6,0 Hz, H1' G); 4,70 (1H, dd, J=6,0 Hz, J=5,1 Hz, H2' G); 4,56 (1H, ~t, H3' m7G); 4,50 (1H, dd, J=3,5 Hz, 5,1 Hz, H3' G); 4,41 (1H, m, H5' G); 4,34 (2H, m, nałożone H4' m7G, H4'G); 4,27 (2H, m nałożone, H2' m7G, H5G); 4,24 (2H, m, H5', H5 m7G); 4,08 (3H, s, N-CH3); 3,60 (3H, s, O-CH3), 0,40 (3H, m, BH3).
31P NMR δ (ppm): 83,7 (1P, m, Pα (Pbh3)), -11,30 (1P, d, J=19,5 Hz, Ργ); -22,91 (1P, dd, J=19,5 Hz, J=30,0 Hz, Pp)
D2: 1H NMR δ (ppm): 8,98 (1H, s, H8 m7G); 8,06 (1H, s, H8G); 5,96 (1H, d, J=2,7 Hz, H1' m7G);
5,79 (1H, d, J=5,9 Hz, H1' G); 4,61 (1H, ~t, H2' G); 4,50 (1H, ~t, H3' m7G); 4,45 (1H, dd, J=3,5 Hz, 5,1 Hz, H3' G); 4,34 (2H, m (nałożone), H4' m7G, H5' G); 4,26 (3H, m (nałożone), H2' m7G, H4' G, H5G); 4,20 (2H, m, H5', H5 m7G); 4,06 (3H, s, N-CH3); 3,61 (3H, s, O-CH3), 0,40 (3H, m, BH3).
31P NMR δ (ppm): 83,7 (1Ρ, m, Ρα (Pbhs)), - 11,41 (1Ρ, d, J=19,0 Hz, Ργ); -22,87 (1Ρ, dd, J=19,0 Hz, J=32,0 Hz Ρβ).
P r z y k ł a d III
Sól trietyloamoniowa kwasu boranofosforanowego [zmodyfikowana procedura opisana wcześniej przez V. Nahum i B. Fischer w publikacji „Boranophosphate Salts as an Excellent Mimic of Phosphate Salts: Preparation, Characterization, and Properties” J. lnorg. Chem. vol. 20, 4124-4131 (2004)].
Tris(trimetyiosililo)fosforyn (600 pi, 1,8 mmol) umieszczono w kolbie okrągłodennej zawierającej 5 ml suchego acetonitrylu. Kolbę zamknięto gumowym septum zaopatrzonym w dwie igły i przez mieszaninę przepuszczano argon przez ok. 30 min. Następnie za pomocą strzykawki dodano do roztworu BSA (1,5 ml, 5,4 mmol). Po ok. 30 min kolbę umieszczono w łaźni lodowej, dodano za pomocą strzykawki 1,35 mi 2M roztworu BH3 · SMe2 w THF, po 5 min łaźnię usunięto i kontynuowano mieszanie przez 30 min. Roztwór odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem do oleistej pozostałości, po czym ponownie umieszczono na łaźni lodowej i dodano 20 ml metanolu oraz 500 pi (3,6 mmoi) trietyioaminy, po czym mieszano przez 2 h w temp. pokojowej. Roztwór odparowano pod zmniejszonym ciśnieniem do sucha i pozostałość wysuszono w eksykatorze próżniowym nad P2O5. Otrzymano 530 mg (17,8 mmoi) [HN(CH2CH3)3]2HPO3BH3 (wydajność 97%) Tak otrzymaną sól trietyloamoniową boranofosforanu przechowywano w szczelnie zamkniętym naczyniu w temperaturze 4°C i w tej postaci używano do daiszych reakcji.
1H NMR δ (ppm): 0,33 (~dq, JB-H = 87,8 Hz, JP-H = 22,3 Hz) 31P NMR δ (ppm): 84,3 (~qq, JP-B = 147 Hz, JP-H = 22,3 Hz).
Synteza GppBH3pG
Imidazlolową pochodną GMP (GMP-Im) (200 mg, 0,46 mmol) oraz sól trietyloamoniową boranofosforanu (70 mg, 0,23 mmoi) w 4 mi DMF i dodano (380 mg, 4 mmoi) bezwodnego MgCi2. Po 1h reakcję zakończono poprzez dodanie roztworu EDTA (1,48 g, 4 mmol) w 40 ml H2O i doprowadzono do pH 6 za pomocą stałego NaHCO3. Produkt oczyszczono za pomocą chromatografii jonowymiennej stosując 0-1,2 M gradient TEAB. Po odparowaniu otrzymano 165 mg (4000 j.opt) GppBH3pG w postaci soli trietyloamoniowej. Wydajność ~65%
ESI MS (-) m/z: 785,12 (wartość obliczona dla C20H29N10O17P3B: 785,10) 1H NMR δ (ppm): 8,11 (1H, s, H8 GA*); 8,09 (1H, s, H8 GB); 5,84 (2H, d, J=5,2 Hz, Η1' GAB); 4,69 (2H, ~t, J=5,1 Hz, H2' GAB); 4,50 (1H, ~t, H3' GAiubB); 4,49 (1H, ~t, H3' GAiubB); 4,31 (2H, m, H4' GAB); 4,24 (4H, m, H5' GAB, H5 GAB). *Indeksy A i B oznaczają protony diastereotopowe.
31P NMR δ (ppm): 75,10 (1Ρ, m, Ρβ(ΡΒΗ3)), -11,20 (1Pa*, ~dt, J=30,2 Hz, J=~5Hz), -11,28 B (1PB*, ~dt, J=30,2 Hz, J=~5Hz). *Indeksy A i B oznaczają jądra diastereotopowe.
Synteza m7GppBH3pG
GppBH3pG (35 mg, 800 j. opt.) rozpuszczono w 1,5 ml DMSO i dodano 20 pi jodku metyiu. Po ~4h rekcje zakończono poprzez dodanie 15 ml H2O i doprowadzono do pH 7 za pomocą stałego NaHCO3. Produkt oczyszczono za pomocą chromatografii jonowymiennej stosując 0-1,2 M gradient TEAB. Zebrano 550 jednostek optycznych diastereomerycznej mieszaniny m7GppBH3pG. Po połączeniu i odparowaniu frakcji zawierających pożądany produkt rozpuszczono je w niewielkiej ilości wody i zamieniono w sól sodową na złożu Dowex. Następnie, diastereoizomery rozdzielono za pomocą
PL 215 513 B1 półpreparatywnego HPLC, zebrane frakcje trzykrotnie zliofilizowano. Wydajność po rozdziale HPLC: m7GppBH3pG (D1) 10,2 mg i oraz m27GppBH3pG (D2) 9,8 mg w postaci soli amonowych (odpowiednio 37,2% i 35,6%).
ESI MS (-) m/z: 799,3 (wartość obliczona dla C21H31N10O17P3B: 799,12).
D1: 1H NMR δ (ppm): 8,02 (1H, s, H8G); 5,89 (1H, d, J=3,0 Hz, H8 m7G); 5,80 (1H, d, J=6,2 Hz, H8G); 4, 68 (1H, ~t, H2' G); 4,51 (1H, ~t, H2' m7G); 4,50 (1H, ~t, H3' G);
4,42 (1H, ~t, H3' G); 4,35 (3H, m (nałożone), H4', H5', H5 G); 4,22 (3H, m (nałożone), H4', H5', H5 m7G), 4,06 (3H, s, CH3), 0,53 (3H, m, BH3);
31P NMR δ (ppm): 75,1 (1P, m, Pp(Pbh3)), - 11,3 (2P, ~d, JPc(-pp = 30,7 Hz, 2 x Pa).
D2: 1H NMR δ (ppm): 8,04 (1H, s, H8G); 5,92 (1H, d, J=3,0 Hz, H8 m7G); 5,82 (1H, d, J=6,2 Hz, H8G); 4, 68 (1H, ~t, H2' G); 4,51 (1H, ~t, H2' m7G); 4,50 (1H, ~t, H3' G);
4,42 (1H, ~t, H3' G); 4,35 (3H, m (nałożone), H4', H5', H5 G); 4,22 (3H, m (nałożone), H4', H5', H5 m7G), 4,06 (3H, s, CH3); 0,53 (3H, m, BH3);
31P NMR δ (ppm): 75,13 (1P, m, Pp(Pbh3)), -11,31 (2P, ~d, Jpa.pp = 30,7 Hz, 2 x Pa).
P r z y k ł a d IV
Synteza m7GppBH3pm7G
GppBH3pG (sól trietyloamoniowa, 50 mg, 570 j. optycznych) rozpuszczono w 1 ml DMSO i dodano 30 μΐ jodku metylu. Po ok. 2h dodano jeszcze 30 μΐ jodku metylu. Po kolejnych dwóch godzinach reakcję zakończono poprzez dodanie roztworu H2O i doprowadzono do pH 7 za pomocą stałego NaHCO3. Produkt oczyszczono za pomocą chromatografii jonowymiennej stosując 0-1,2 M gradient TEAB. Otrzymano 200 j. optycznych produktu, który zamieniono następnie w sól sodową na złożu Dowex. Po wytrąceniu etanolem i wysuszeniu nad P2O5 otrzymano 22 mg soli sodowej m7GppBH3pm7G (~54%).
ESI MS (-) m/z: 813,10 (wartość obliczona dla C22H33N10O17P311B: 813,13) 1H NMR δ (ppm): 9,02 (2H, s, H8 m7G); 6,04 (2H, d, J=3,7 Hz, H2' G); 4,67 (2H, ~t, H2' m7G); 4,53 (2H, ~t, H3' m7G); 4,40 (2H, m, H4' m7G); 4,36 (2H, m, H5' m7G); 4,23 (2H, m, H5 m7G); 4,13 (6H, s, CH3); 0,44 (3H, m, BH3) 31P NMR δ (ppm): 74,90 (1P, m, Pp(PBH3)), -11,33 (1PA*, ~d, JPc-Pp = 31,0 Hz), -11,36 (1PB*, ~d, JPc-Pp = 31,0 Hz). * Indeksy A i B oznaczają protony diastereotopowe.
P r z y k ł a d V
Synteza m7GppBH3pm7G (Wariant II)
Imidazlolową pochodną m7GMP (m7GMP-Im sól sodowa, 225 mg, 0,5 mmol) oraz sól trietyloamoniową boranofosforanu (75 mg, 0,25 mmol) zawieszono w 4 ml DMF i dodano (380 mg, 4 mmol) bezwodnego MgCl2. Po 1h reakcję zakończono poprzez dodanie roztworu EDTA (1,48 g, 4 mmol) w 40 ml H2O i doprowadzono do pH 6 za pomocą stałego NaHCO3. Produkt oczyszczono za pomocą chromatografii jonowymiennej stosując 0-1,1 M gradient TEAB. Po połączeniu i odparowaniu frakcji zawierających pożądany produkt rozpuszczono je w niewielkiej ilości wody i zamieniono w sól sodową na złożu Dowex. Po wytrąceniu etanolem i wysuszeniu w eksykatorze próżniowym nad P2O5 uzyskano 150 mg soli sodowej m7GppBH3pm7G (wydajność 34%). Dane spektralne - jak wyżej.
P r z y k ł a d VI
7,2'-Ο
Synteza m2- GppBH3pG
Do zawiesiny m2 , - GMP-Im (15 mg, 0,03 mmol, sól Na) i PBH3 (30 mg, 1 mmol, sól TEA) w 0,5 ml DMF, dodano, niewielkimi porcjami, bezwodny MgCl2 (40 mg, 0,4 mmol) po czym mieszaninę intensywnie wytrząsano do momentu rozpuszczenia reagentów (1-2 min). Następnie do mieszaniny reakcyjnej dodano GMP-Im (40 mg, 0,09 mmol) oraz 40 mg MgCl2. Reakcję zakończono po ok. 5h poprzez dodanie roztworu EDTA (300 mg, 0,8 mmol) w 10 ml wody i doprowadzono do pH 6 za pomocą stałego NaHCO3. Produkty oczyszczono za pomocą półpreparatywnego HPLC, a zebrane frakcje
7,2'-Ο 7,2'-Ο trzykrotnie zliofilizowano. Otrzymano: m2 , - GppBH3pG (D1) 5,1 mg oraz m2 , - GppBH3pG (D2) 4,8 mg w postaci soli amonowych (wydajność odpowiednio 18 i 17%).
ESI MS (-) m/z: 813,14 (wartość obliczona dla C22H33N10O17P311B: 813,13)
D1: 1H NMR δ (ppm): 9,04 (1H, s, H8 m7G); 8,10 (1H, s, H8G); 5,97 (1H, d, J=2,9 Hz, H1'm7G);
5,80 (1H, d, J=5,9 Hz, H1' G); 4,70 (1H, ~t, H2' G); 4,56 (1H, ~t, H3' m7G); 4,50 (1H, ~t Hz, H3' G);
4,41 (1H, m, H5' G); 4,34 (2H, m, nałożone H4' m7G, H4'G); 4,27 (2H, m nałożone, H2' m7G, H5G);
4,24 (2H, m, H5', H5 m7G); 4,08 (3H, s, N-CH3); 3,59 (3H, s, O-CH3), 0,45 (3H, m, BH3).
31P NMR δ (ppm): 75,12 (1P, m, Pp(PBH3)), -11,09 (2P, ~d, JPc-Pp = 30,7 Hz, 2 x Pc)
PL 215 513 B1
D2: 1H NMR δ (ppm): 9,00 (1H, s, H8 m7G); 8,08 (1H, s, H8G); 5,96 (1H, d, J=2,9 Hz, H1 m7G);
5,81 (1H, d, J=5,9 Hz, H1' G); 4,70 (1H, ~t, H2' G); 4,55 (1H, ~t, H3' m7G); 4,48 (1H, ~t, H3' G); 4,40 (2H, m (nałożone), H4' m7G, H5' G); 4,30 (3H, m (nałożone), H2' m7G, H4' G, H5 G); 4,25 (2H, m, H5', H5 m7G); 4,07 (3H, s, N-CH3); 3,62 (3H, s, O-CH3), 0,45 (3H, m, BH3).
31P NMR δ (ppm): 75,12 (1P, m, Pp(Pbh3)), -11,11 (2P, ~d, JPa-Pp = 30,7 Hz, 2 x Pa)
P r z y k ł a d VII
Wyznaczanie stałych asocjacji z białkiem eIF4E
Pomiary miareczkowania fluorescencyjnego zostały przeprowadzone przy użyciu spektrofluorymetru LS-50B (Perkin Elmer Co.) w buforze 50 mM HEPES/KOH (pH 7,2), 100 mM KCl, 0,5 mM
EDTA, 1 mM DTT w temperaturze 20,0 ± 0,2°C. Jednomikrolitrowe roztwory analogu kapu o zwiększającym się stężeniu były dodawane do 1,4 ml roztworu białka o stężeniu 0,1 μΜ. Intensywności fluorescencji (wzbudzenie przy 280 nm, szerokość spektralna szczeliny 2,2 nm, detekcja przy 337 nm, szerokość szczeliny 4 nm i 290 nm fitr cut-off) zostały skorygowane tak, by uwzględniały rozcieńczenie próbki i efekt filtra wewnętrznego. Równowagowe stałe asocjacji (KAS) zostały wyznaczone poprzez dopasowanie teoretycznej zależności intensywności fluorescencji od całkowitego stężenia analogu kapu, do eksperymentalnych punktów danych, zgodnie z wcześniej opisanym równaniem (A. Niedźwiecka et al. „Biophysical Studies of eIF4E Cap-binding Protein: Recognition of mRNA 5' Cap Structure and Synthetic Fragments of eIF4G and 4E-BP1 Proteins” J. Mol. Biol. (2002) vol. 312, 615-635). Stężenie białka zostało dopasowane jako wolny parametr równania równowagi pokazując ilość „aktywnego” białka. Ostatecznie podane wartości KAS zostały podane jako średnie ważone z 3-10 niezależnych miareczkowań, przy czym wagą były odwrotności kwadratów odchyleń standardowych. Numerycznie, nieliniowe dopasowania metodą najmniejszych kwadratów zostały przeprowadzone przy użyciu programu ORGIN 6.0 (Microcal Software Inc., USA).
Swobodne energie Gibbsa wiązania kapu do eIF4E zostały obliczone z wartości KAS zgodnie z równaniem standardowym AG° = - RT1 nKAS.
Badanie podatności na hydrolizę enzymem DcpS
Ekspresję ludzkiego enzymu DcpS przeprowadzono w Escherichia coli według opisanych
2,2,7 wcześniej procedur (L. Cohen et al. „Nematode m7GpppG and m32,2,7GpppG decapping: Activities in Ascaris embryos and characterization of C. elegans scavenger DcpS (2004), vol. 10, 1609-1624). Białko przechowywano w temp. -80°C w 20 mM buforze Tris, pH 7,5, zawierającym 50 mM KCl, 0,2 mM EDTA, 1 mM DTT, 0,5 mM PMSF oraz 20% glicerol.
Reakcje enzymatyczne prowadzono w temperaturze 30°C, w 50 mM buforze Tris, pH=7,9, zawierającym 20 mM of MgCl2 i 60 mM of (NH4)2SO4. Do 40 μΜ roztworu odpowiedniego analogu kapu w buforze dodawano 5 μΐ enzymu DcpS i inkubowano przez 120 min. Po 10, 30, 60 oraz 120 min od rozpoczęcia reakcji, z mieszaniny reakcyjnej pobierano próbki o objętości 100 μ|, dezaktywowano enzym przez 2 min w 90°C, po czym skład mieszaniny poreakcyjnej analizowano przy użyciu analitycznego HPLC stosując do elucji liniowy gradient metanolu w 0,1 M buforze KH2PO4 (0-50% w ciągu 15 min).
P r z y k ł a d VIII
Wydajność translacji mRNA kapowanych boranofosforanowymi analogami kapu
a. transkrypcja in vitro
Matrycą DNA do transkrypcji in vitro był produkt PCR zawierający sekwencję kodującą lucyferazę świetlika ('firefly luciferase') poprzedzoną bezpośrednio sekwencją 5'UTR mRNA b-globiny króliczej i promotorem dla DNA-zależnej polimerazy RNA SP6 (SP6p-5'UTR^globin-LUCiferase).
Reakcja transkrypcji in vitro prowadzona była standardowo w 50 μΙ mieszaniny reakcyjnej. Skład mieszaniny reakcyjnej (końcowe stężenia): bufor do transkrypcji przez polimerazę SP6-Fermentas, matryca DNA 2 μg (0,04 μg/μl), inhibitor RNaz - RiboLock - Fermentas (2υ/μΙ), ATP/CTP/UTP (2 mM), GTP (0,1 mM), dinukletydowy analog kapu (1 mM) [10-krotny nadmiar kapu w stosunku do GTP pozwala na przyłączenie struktury kapu do 5'-końca mRNA przez polimerazę RNA; poziom GTP jest następnie uzupełniany, aby uzyskać pełnej długości transkrypty]. Mieszanina była inkubowana przez 5 minut w 37°C przed dodaniem polimerazy SP6 - Fermentas (st. końcowe 2U^l). Reakcje prowadzono przez 30 minut w 37°C, a następnie dodano GTP do stężenia 1 mM i kontynuowano reakcję przez kolejne 90 minut.
Po reakcji transkrypcji wytrawiano matrycę DNA dodając do próbki DNazę (RQ1 DNase, RNase-free, Promega) w ilości 1U na 1 μg DNA. Reakcję prowadzono w buforze transkrypcyjnym przez 20 minut w 37°C.
PL 215 513 B1
Transkrypty RNA oczyszczono na złożu Sephadex G-50 ('spin kolumn chromatography'). Stężenie oznaczono spektrofotometrycznie. Wodne roztwory transkryptów przechowywano w -80°C.
b. wydajność translacji kapowanego mRNA w lizacie z retikulocytów króliczych (RRL) Reakcję translacji standardowo prowadzono w objętości 10 ul przez 60 minut w 30°C, dla warunków ustalonych dla kap-zależnej translacji. W skład mieszaniny translacyjnej wchodziły: lizat z retikulocytów króliczych - Promega7 Flexi RRL- (40% w końcowej objętości), mieszanina aminokwasów (0,01 mM), octan magnezu (1.2 mM), octan potasu (170 mM) i mRNA. Reakcja translacji prowadzona była dla 5 stężeń mRNA: 0.25/0.5/1/2 i 4 ng/μΗ Aktywność powstałej lucyferazy mierzono w luminometrze, wyniki naniesiono na wykres i do punktów dopasowano prostą (regresja liniowa). Wydajność translacji charakteryzowano poprzez współczynnik nachylenia dopasowanej prostej7 a wyniki porównywano do mRNA kapowanego in vitro m7GpppG (wydajność translacji = 1).
T a b e l a 2
Wydajność translacji in vitro mRNA lucyferazy kapowanego modyfikowanymi dinukleotydowymi analogami kapu w odniesieniu do m7GpppG-LUC-RNA.
Rodzaj kapu na 5' końcu LUC-RNA Wydajność translacji w odniesieniu do m7GpppG-kapowanego RNA
Numer eksperymentu 1 2 3 4 Średnia (+/- SD)
ApppG— 0734 0755 0753 0748 0748 ( 0709)
m7GpppG— 1 1 1 1 1
m7,3'O-GpppG— 2753 2792 2796 2750 2773 ( 0725)
m7GppBH3pG--- 1766 1742 1714 - 1741 (0726)
m7GppBH3pm7G--- - 2763 2791 2789 2781 (0716)
P r z y k ł a d IX
Inhibicja zależnej od kapu translacji w lizacie z retikulocytów króliczych przez boranofosforanów dinukleotydowe analogi kapu
Reakcję translacji in vitro standardowo prowadzono w objętości 12.5 μl przez 60 minut w 30°C, dla warunków ustalonych dla kap-zależnej translacji. Mieszanina reakcyjna była inkubowana przez 60 minut przed dodaniem inhibitora (kapu) i mRNA lucyferazy. W celu analizy stabilności badanych kapów w lizacie retikulocytów króliczych (rabbit reticulocyte lysate, RRL) dany analog był inkubowany w mieszaninie reakcyjnej przez 60 minut w 30°C, i następnie dodawano mRNA lucyferazy.
W skład mieszaniny translacyjnej wchodziły: lizat z retikulocytów króliczych - Promega7 Flexi RRL - (58% w końcowej objętości), mieszanina aminokwasów (0.01 mM), octan magnezu (1.2 mM), octan potasu (170 mM)> RiboLock inhibitor RNaz (0.32υ/μΟ, analog kapu (1/10 objętości reakcji) i mRNA lucyferazy. mRNA lucyferazy wykapowane m773'O-GpppG zostało otrzymane podczas transkrypcji in vitro. Otrzymane transkrypty m773'O-GpppG_rb-bglobin-UTR_LUC nie były poliadenylowane na końcu 3' RNA. Reakcje przeprowadzono dla zakresu stężeń inhibitora od 0.12 μΜ do 100 μΜ.
Aktywność lucyferazy w poszczególnych próbkach mierzono w luminometrze. Otrzymane wyniki analizowano na wykresie, i wyznaczano wartość IC50 przez dopasowanie do otrzymanych punktów krzywej o wzorze: y = Z/(1+x/IC50)+N (gdzie: y - cała translacja, Z - komponent kap-zależnej translacji, N - komponent kap-niezależnej translacji, x - stężenie inhibitora).
Badania biofizyczne i biochemiczne
Powinowactwo analogów kapu do białkowego czynnika inicjującego translację 4E (eIF4E; ang. eukaryotic initiation factor 4E), zostało wyznaczone metodą miareczkowania fluorescencyjnego. Stwierdzono, że wszystkie z badanych boranofosforanowych analogów kapu charakteryzują się stałymi asocjacji (KAS) nie mniejszymi lub większymi niż ich niemodyfikowane odpowiedniki (tabela 2).
Zbadano także podatność nowych analogów kapu na hydrolizę ludzkim enzymem DcpS. Postęp reakcji enzymatycznych monitorowano, za pomocą wysokosprawnej chromatografii cieczowej (HPLC). Stwierdzono, że wszystkie analogi zmodyfikowane w pozycji β łańcucha trifosforanowego, są odporne na hydrolizę enzymem DcpS (tabela 2).
Wydajność translacji mRNA kapowanych boranofosforanowymi analogami kapu testowano in vitro w lizatach z reticulocytów króliczych (rabbit reticulocyte lysate, RRL). mRNA zakończone boranofosforanowymi analogami kapu wykazują zwiększoną wydajność translacyjną w stosunku
PL 215 513 B1 do niemodyfikowanych mRNA, szczególnie w przypadku analogów mających zdolność do wbudowywania się do mRNA wyłącznie w prawidłowej orientacji (jak np. m7GppBH3pm7G oraz analogi metylowane w pozycji 2'- lub 3'- rybozy w obrębie 7-metyloguanozyny). Ze względu na ich zwiększoną odporność enzymatyczną, efekt ten będzie jeszcze bardziej widoczny in vivo.
Właściwości boranofosforanowych analogów kapu jako inhibitorów zależnej od kapu translacji, również testowano w lizatach z reticulocytów króliczych. Przeprowadzono dwa rodzaje eksperymentów, w których analog kapu dodawany był do RRL bądź razem z mRNA (warunki A), bądź też był preinkubowany w RRL przez 60 min przed dodaniem mRNA. W obu eksperymentach boranofosforanowe analogi kapu były dobrymi inhibitorami translacji (bądź lepszymi bądź porównywalnymi z m7GpppG). Co więcej, w przeciwieństwie do m7GpppG, preinkubacja tychże analogów w RRL nie osłabiała ich właściwości inhibitorowych (tabela 2, fig. 5 i fig. 6), co prawdopodobnie jest związane z ich zwiększoną odpornością na degradację przez enzymy o aktywności pirofosfataz.
T a b e l a 3
Biofizyczne właściwości boranofosforanowych analogów kapu
Analog kapu K.\s kap- eIF4E“ (μΜ1) Podatność na DcpS Względna wydajność translacji w odniesieniu do m7GpppG- kapowanego RNA Wartość IC50 w lizatach z retikulocytów króliczych (warunki A, bez preinkubacji) Wartość IC50 w lizatach z retikulocytów króliczych (warunki B, preinkubacja kapu przez 60 min)
m7GpppG 9.4 ± 0.4 hydrolizowany 1 9,75 ± 2,75 35,1 ± 10,8
m7Gpppm7G 5.0 ± 0.2 hydrolizowany N.B. N.B. N.B.
rr/GpppBmG (Dl) 14.5 ± 0.2 hydrolizowany N.B. N.B. N.B.
m'GpppBH3G (D2) 14.4 ± 0.6 hydrolizowany N.B. N.B. N.B.
m'GppBH3pG (Dl) 44 ±2 odporny 1.41 ±0.26 (dla mieszaniny Dl i D2) 1,70 ±0,60 1,49 ±0,68
m'GppBH3pG (D2) 13.0 ± 0.2 odporny 13 ± 8 3,9 ± 2,78
m7GppBH3pm7G 11.1 ± 0.2 odporny 2.81 ±0.16 9±3 2,66 ± 1,35
°GpppBH3G 10,8 ± 0,3 hydrolizowany N.B. N.B. N.B.
m27 3 ’ °GpPPBH3G 10,2 ± 0,3 hydrolizowany 2.73 ±0.25* N.B. N.B.
PL 215 513 B1

Claims (13)

1. Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów o wzorze ogólnym 1, w którym Y1, Y2, Y3, Y4 oznaczają niezależnie O lub BH3, przy czym co najmniej jeden Y oznacza BH3, n wynosi 0 iub 1,
N oznacza grupę o wzorze 6 lub grupę o wzorze 7, w których:
R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3 iub OCH2CH3,
X oznacza metyi, etyi, propyi, butyi, benzyi, podstawiony benzyi, naftyiometyi iub podstawiony naftyiometyi,
B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4 lub 5,
R3 i R4 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3 iub OCH2CH3 w postaci wolnej lub w postaci soli, ich diastereoizomery i mieszaniny diastereoizomerów.
2. Nowe boranofosforanowe analogi według zastrz. 1, w których B oznacza grupę o wzorze 2a iub 2b.
3. Nowe boranofosforanowe analogi według zastrz. 1, w których R3 i R4 oznaczają OH, N oznacza grupę o wzorze 6 lub 7, X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyi iub podstawiony naftyiometyl, B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4, lub 5, a R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, przy czym jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2a, 3, 4 lub 5 wówczas jeden spośród R1 i R2 ma znaczenie inne niż OH.
4. Nowe boranofosforanowe analogi według zastrz. 3, w których N oznacza grupę o wzorze 6, R2 oznacza OH, R1 oznacza H iub CH3, X oznacza metyi, n wynosi 0, a jeden spośród Y1, Y2, Y3 oznacza BH3.
5. Nowe boranofosforanowe analogi według zastrz. 1, w których grupa BH3 jest w pozycji β lub γ.
6. Nowe boranofosforanowe analogi dinukleozydów o wzorze ogólnym 1, w którym Y1, Y2, Y3, Y4 oznaczają niezależnie O lub BH3, przy czym co najmniej jeden Y oznacza BH3, n wynosi 0 iub 1,
PL 215 513 B1
N oznacza grupę o wzorze 6 lub grupę o wzorze 7, R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3 lub OCH2CH3, X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyl lub podstawiony naftylometyl, B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4 lub 5, R3 i R4 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3 lub OCH2CH3 do zastosowania jako inhibitory zależnej od kapu translacji.
7. Nowe boranofosforanowe analogi według zastrz. 5 do zastosowania jako inhibitor translacji w komórkach nowotworowych.
8. Cząsteczka RNA zawierająca na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o ogólnym wzorze 1, w którym B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4, lub 5, N oznacza grupę o wzorze 6 lub 7, X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyl lub podstawiony naftylometyl, a R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, R3 i R4 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, z tym że, jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2a, 3, 4, lub 5, wówczas jeden spośród R1 i R2 ma znaczenie inne niż OH, natomiast R3 i R4 oznaczają OH, a jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2 b, wówczas albo R1 i R2, albo R3 i R4 oznaczają OH, jego diastereoizomer lub mieszaninę diastereoizomerów.
9. Cząsteczka RNA według zastrz. 8, zawierająca na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog, w którym grupa BH3 jest w pozycji β.
10. Cząsteczka RNA według zastrz. 8, zawierająca na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog, w którym w których B oznacza grupę o wzorze 2a lub 2b.
11. Sposób otrzymywania in vitro RNA zawierającego na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o ogólnym wzorze 1, w którym B oznacza grupę o wzorze 2a, 2b, 3, 4, lub 5, N oznacza grupę o wzorze 6 lub 7, X oznacza metyl, etyl, propyl, butyl, benzyl, podstawiony benzyl, naftylometyl lub podstawiony naftylometyl, a R1 i R2 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, R3 i R4 oznaczają niezależnie H, OH, OCH3, i OCH2CH3, z tym że, jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2a, 3, 4, lub 5, wówczas jeden spośród R1 i R2 ma znaczenie inne niż OH, natomiast R3 i R4 oznaczają OH, a jeżeli B oznacza grupę o wzorze 2 b, wówczas albo R1 i R2, albo R3 i R4 oznaczają OH, jego diastereoizomer lub mieszaninę diastereoizomerów, znamienny tym, że na polinukleotydowej matrycy w obecności polimerazy RNA poddaje się reakcji ATP, CTP, UTP, GTP oraz związek o wzorze 1 w warunkach zapewniających transkrypcję polinukleotydowej matrycy przez polimerazę RNA.
12. Sposób otrzymywania peptydu, białka lub peptydowego antygenu in vitro, znamienny tym, że translacji w układzie bezkomórkowym poddaje się cząsteczkę RNA zawierającą na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o wzorze 1 według zastrz. 8, przy czym cząsteczka RNA ma otwartą ramkę odczytu, a proces prowadzi się w warunkach sprzyjających translacji otwartej ramki odczytu RNA do peptydu, białka lub peptydowego antygenu kodowanego przez otwartą ramkę odczytu
13. Sposób otrzymywania peptydu, białka lub peptydowego antygenu w hodowli komórkowej, znamienny tym, że do hodowli komórkowej wprowadza się cząsteczkę RNA zawierającą na końcu 5' nowy boranofosforanowy analog o wzorze 1 według zastrz. 8, przy czym cząsteczka RNA ma otwartą ramkę odczytu, a proces prowadzi się w warunkach sprzyjających translacji otwartej ramki odczytu RNA do peptydu, białka lub peptydowego antygenu kodowanego przez otwartą ramkę odczytu.
PL385388A 2008-06-06 2008-06-06 Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka PL215513B1 (pl)

Priority Applications (9)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL385388A PL215513B1 (pl) 2008-06-06 2008-06-06 Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka
CA2727091A CA2727091C (en) 2008-06-06 2009-06-04 Mrna cap analogs
PCT/US2009/046249 WO2009149253A2 (en) 2008-06-06 2009-06-04 Mrna cap analogs
AU2009256131A AU2009256131B2 (en) 2008-06-06 2009-06-04 mRNA cap analogs
EP09759412.1A EP2297175B1 (en) 2008-06-06 2009-06-04 Mrna cap analogs
US12/996,243 US8519110B2 (en) 2008-06-06 2009-06-04 mRNA cap analogs
JP2011512643A JP5715560B2 (ja) 2008-06-06 2009-06-04 mRNA CAP類似体
PL09759412T PL2297175T3 (pl) 2008-06-06 2009-06-04 Analogi czapeczki mRNA
ES09759412T ES2425781T3 (es) 2008-06-06 2009-06-04 Análogos de CAP de ARNm

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL385388A PL215513B1 (pl) 2008-06-06 2008-06-06 Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL385388A1 PL385388A1 (pl) 2009-12-07
PL215513B1 true PL215513B1 (pl) 2013-12-31

Family

ID=41398862

Family Applications (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL385388A PL215513B1 (pl) 2008-06-06 2008-06-06 Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka
PL09759412T PL2297175T3 (pl) 2008-06-06 2009-06-04 Analogi czapeczki mRNA

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL09759412T PL2297175T3 (pl) 2008-06-06 2009-06-04 Analogi czapeczki mRNA

Country Status (8)

Country Link
US (1) US8519110B2 (pl)
EP (1) EP2297175B1 (pl)
JP (1) JP5715560B2 (pl)
AU (1) AU2009256131B2 (pl)
CA (1) CA2727091C (pl)
ES (1) ES2425781T3 (pl)
PL (2) PL215513B1 (pl)
WO (1) WO2009149253A2 (pl)

Families Citing this family (275)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8822663B2 (en) 2010-08-06 2014-09-02 Moderna Therapeutics, Inc. Engineered nucleic acids and methods of use thereof
DK4108671T3 (da) 2010-10-01 2025-01-06 Modernatx Inc Modificerede nukleosider, nukleotider og nukleinsyrer samt anvendelser deraf
JP2014511687A (ja) 2011-03-31 2014-05-19 モデルナ セラピューティクス インコーポレイテッド 工学操作された核酸の送達および製剤
US9464124B2 (en) 2011-09-12 2016-10-11 Moderna Therapeutics, Inc. Engineered nucleic acids and methods of use thereof
JP6113737B2 (ja) 2011-10-03 2017-04-12 モデルナティエックス インコーポレイテッドModernaTX,Inc. 修飾型のヌクレオシド、ヌクレオチドおよび核酸、ならびにそれらの使用方法
KR20140102759A (ko) 2011-12-16 2014-08-22 모더나 세라퓨틱스, 인코포레이티드 변형된 뉴클레오사이드, 뉴클레오타이드 및 핵산 조성물
WO2013143555A1 (en) * 2012-03-26 2013-10-03 Biontech Ag Rna formulation for immunotherapy
EP2834259A4 (en) 2012-04-02 2016-08-24 Moderna Therapeutics Inc MODIFIED POLYNUCLEOTIDES
US9254311B2 (en) 2012-04-02 2016-02-09 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of proteins
US9572897B2 (en) 2012-04-02 2017-02-21 Modernatx, Inc. Modified polynucleotides for the production of cytoplasmic and cytoskeletal proteins
US9283287B2 (en) 2012-04-02 2016-03-15 Moderna Therapeutics, Inc. Modified polynucleotides for the production of nuclear proteins
US9597380B2 (en) 2012-11-26 2017-03-21 Modernatx, Inc. Terminally modified RNA
EP2931319B1 (en) 2012-12-13 2019-08-21 ModernaTX, Inc. Modified nucleic acid molecules and uses thereof
CN103254260B (zh) * 2013-02-07 2015-11-11 江西科技师范大学 由核苷氢亚磷酸单酯合成对称双核苷二磷酸二钠盐的方法
US10258698B2 (en) 2013-03-14 2019-04-16 Modernatx, Inc. Formulation and delivery of modified nucleoside, nucleotide, and nucleic acid compositions
US11377470B2 (en) 2013-03-15 2022-07-05 Modernatx, Inc. Ribonucleic acid purification
WO2014152030A1 (en) 2013-03-15 2014-09-25 Moderna Therapeutics, Inc. Removal of dna fragments in mrna production process
US8980864B2 (en) 2013-03-15 2015-03-17 Moderna Therapeutics, Inc. Compositions and methods of altering cholesterol levels
WO2014144767A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Moderna Therapeutics, Inc. Ion exchange purification of mrna
EP3578663A1 (en) * 2013-03-15 2019-12-11 ModernaTX, Inc. Manufacturing methods for production of rna transcripts
DK3019619T3 (da) 2013-07-11 2021-10-11 Modernatx Inc Sammensætninger, der omfatter syntetiske polynukleotider, som koder for crispr-beslægtede proteiner, og syntetiske sgrna'er, og anvendelsesfremgangsmåder
AU2014315287A1 (en) 2013-09-03 2015-03-12 Moderna Therapeutics, Inc. Chimeric polynucleotides
EP3041938A1 (en) 2013-09-03 2016-07-13 Moderna Therapeutics, Inc. Circular polynucleotides
US10023626B2 (en) 2013-09-30 2018-07-17 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding immune modulating polypeptides
EP3052511A4 (en) 2013-10-02 2017-05-31 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotide molecules and uses thereof
EP3052521A1 (en) 2013-10-03 2016-08-10 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotides encoding low density lipoprotein receptor
WO2015101416A1 (en) 2013-12-30 2015-07-09 Curevac Gmbh Methods for rna analysis
EP3540060A1 (en) 2013-12-30 2019-09-18 CureVac AG Methods for rna analysis
SG11201608605QA (en) 2014-06-10 2016-12-29 Curevac Ag Methods and means for enhancing rna production
US10286086B2 (en) 2014-06-19 2019-05-14 Modernatx, Inc. Alternative nucleic acid molecules and uses thereof
EP3169693B1 (en) 2014-07-16 2022-03-09 ModernaTX, Inc. Chimeric polynucleotides
US10407683B2 (en) 2014-07-16 2019-09-10 Modernatx, Inc. Circular polynucleotides
EP3171895A1 (en) 2014-07-23 2017-05-31 Modernatx, Inc. Modified polynucleotides for the production of intrabodies
EP3041948B1 (en) 2014-11-10 2019-01-09 Modernatx, Inc. Alternative nucleic acid molecules containing reduced uracil content and uses thereof
WO2016098028A1 (en) 2014-12-16 2016-06-23 Novartis Ag End capped nucleic acid molecules
WO2016154596A1 (en) 2015-03-25 2016-09-29 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods, compositions and components
WO2016170176A1 (en) 2015-04-22 2016-10-27 Curevac Ag Rna containing composition for treatment of tumor diseases
CA2986310A1 (en) 2015-05-11 2016-11-17 Editas Medicine, Inc. Optimized crispr/cas9 systems and methods for gene editing in stem cells
AU2016262521A1 (en) 2015-05-11 2017-12-14 Editas Medicine, Inc. CRISPR/CAS-related methods and compositions for treating HIV infection and AIDS
WO2016193206A1 (en) 2015-05-29 2016-12-08 Curevac Ag A method for producing and purifying rna, comprising at least one step of tangential flow filtration
WO2016201047A1 (en) 2015-06-09 2016-12-15 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for improving transplantation
EP3317424B1 (en) 2015-07-01 2023-09-06 CureVac Manufacturing GmbH Method for analysis of an rna molecule
EP3350157B1 (en) 2015-09-17 2022-01-05 Modernatx, Inc. Compounds and compositions for intracellular delivery of therapeutic agents
PL3350333T3 (pl) 2015-09-17 2022-03-07 Modernatx, Inc. Polinukleotydy zawierające region stabilizujący ogon
WO2017049286A1 (en) 2015-09-17 2017-03-23 Moderna Therapeutics, Inc. Polynucleotides containing a morpholino linker
AU2016336344A1 (en) 2015-10-05 2018-04-19 Modernatx, Inc. Methods for therapeutic administration of messenger ribonucleic acid drugs
WO2017066797A1 (en) 2015-10-16 2017-04-20 Modernatx, Inc. Trinucleotide mrna cap analogs
ES2914225T3 (es) 2015-10-16 2022-06-08 Modernatx Inc Análogos de cap de ARNm con enlace de fosfato modificado
WO2017066789A1 (en) * 2015-10-16 2017-04-20 Modernatx, Inc. Mrna cap analogs with modified sugar
EP3365447A1 (en) 2015-10-21 2018-08-29 Editas Medicine, Inc. Crispr/cas-related methods and compositions for treating hepatitis b virus
CN109312338B (zh) 2015-10-30 2022-09-27 爱迪塔斯医药公司 治疗单纯疱疹病毒的crispr/cas相关方法及组合物
SI3394030T1 (sl) 2015-12-22 2022-04-29 Modernatx, Inc. Sestave za doziranje sredstev v celice
US11248223B2 (en) 2015-12-23 2022-02-15 Curevac Ag Method of RNA in vitro transcription using a buffer containing a dicarboxylic acid or tricarboxylic acid or a salt thereof
LT3394093T (lt) 2015-12-23 2022-04-25 Modernatx, Inc. Ox40 ligandus koduojančių polinukleotidų naudojimo būdai
EP3400023A1 (en) 2016-01-10 2018-11-14 ModernaTX, Inc. Therapeutic mrnas encoding anti ctla-4 antibodies
PL415967A1 (pl) * 2016-01-29 2017-07-31 Univ Warszawski 5'-tiofosforanowe analogi końca 5' mRNA (kapu), sposób ich otrzymywania i zastosowanie
US20190049414A1 (en) 2016-02-15 2019-02-14 Curevac Ag Method for analyzing by-products of rna in vitro transcription
US11920174B2 (en) 2016-03-03 2024-03-05 CureVac SE RNA analysis by total hydrolysis and quantification of released nucleosides
WO2017162265A1 (en) 2016-03-21 2017-09-28 Biontech Rna Pharmaceuticals Gmbh Trans-replicating rna
WO2017162266A1 (en) 2016-03-21 2017-09-28 Biontech Rna Pharmaceuticals Gmbh Rna replicon for versatile and efficient gene expression
EP3442590A2 (en) 2016-04-13 2019-02-20 Modernatx, Inc. Lipid compositions and their uses for intratumoral polynucleotide delivery
EP4691484A2 (en) 2016-05-04 2026-02-11 CureVac SE Influenza mrna vaccines
US11141474B2 (en) 2016-05-04 2021-10-12 Curevac Ag Artificial nucleic acid molecules encoding a norovirus antigen and uses thereof
CA3022611A1 (en) 2016-05-06 2017-11-09 Juno Therapeutics, Inc. Genetically engineered cells and methods of making the same
CA3024507A1 (en) 2016-05-18 2017-11-23 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding .alpha.-galactosidase a for the treatment of fabry disease
EP3458081A1 (en) 2016-05-18 2019-03-27 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding citrin for the treatment of citrullinemia type 2
US20190298657A1 (en) 2016-05-18 2019-10-03 Modernatx, Inc. Polynucleotides Encoding Acyl-CoA Dehydrogenase, Very Long-Chain for the Treatment of Very Long-Chain Acyl-CoA Dehydrogenase Deficiency
ES2973443T3 (es) 2016-05-18 2024-06-20 Modernatx Inc Polinucleótidos que codifican galactosa-1-fosfato uridililtransferasa para el tratamiento de galactosemia de tipo 1
MA45052A (fr) 2016-05-18 2019-03-27 Modernatx Inc Polynucléotides codant pour jagged1 pour le traitement du syndrome d'alagille
CA3024624A1 (en) 2016-05-18 2017-11-23 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding porphobilinogen deaminase for the treatment of acute intermittent porphyria
EP3458083B1 (en) 2016-05-18 2022-11-02 ModernaTX, Inc. Polynucleotides encoding interleukin-12 (il12) and uses thereof
HRP20221135T8 (hr) 2016-05-18 2023-02-03 Modernatx, Inc. KOMBINACIJE mRNK KOJE KODIRAJU IMUNOMODULIRAJUĆE POLIPEPTIDE I NJIHOVE UPOTREBE
US20200069599A1 (en) 2016-06-14 2020-03-05 Modernatx, Inc. Stabilized formulations of lipid nanoparticles
US12385034B2 (en) 2016-06-24 2025-08-12 Modernatx, Inc. Methods and apparatus for filtration
EP3500295A2 (en) 2016-08-19 2019-06-26 CureVac AG Rna for cancer therapy
IL317855A (en) 2016-10-26 2025-02-01 Acuitas Therapeutics Inc mRNA vaccines with lipid nanoparticles
US11583504B2 (en) 2016-11-08 2023-02-21 Modernatx, Inc. Stabilized formulations of lipid nanoparticles
US11524066B2 (en) 2016-12-23 2022-12-13 CureVac SE Henipavirus vaccine
US11141476B2 (en) 2016-12-23 2021-10-12 Curevac Ag MERS coronavirus vaccine
US11920148B2 (en) 2017-02-22 2024-03-05 Crispr Therapeutics Ag Compositions and methods for gene editing
FI3596041T3 (fi) 2017-03-15 2023-01-31 Yhdiste ja koostumuksia terapeuttisten aineiden antamiseen solun sisään
JP7332478B2 (ja) 2017-03-15 2023-08-23 モデルナティエックス インコーポレイテッド 脂質ナノ粒子製剤
EP3622062A4 (en) 2017-05-10 2020-10-14 The Regents of the University of California DIRECTED EDITING OF CELLULAR RNA BY NUCLEAR ADMINISTRATION OF CRISPR / CAS9
US11421011B2 (en) 2017-05-18 2022-08-23 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding tethered interleukin-12 (IL12) polypeptides and uses thereof
US11485972B2 (en) 2017-05-18 2022-11-01 Modernatx, Inc. Modified messenger RNA comprising functional RNA elements
EP3638678B1 (en) 2017-06-14 2025-12-03 ModernaTX, Inc. Compounds and compositions for intracellular delivery of agents
WO2018231990A2 (en) 2017-06-14 2018-12-20 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding methylmalonyl-coa mutase
EP3638292A1 (en) 2017-06-14 2020-04-22 ModernaTX, Inc. Polynucleotides encoding coagulation factor viii
US10034951B1 (en) 2017-06-21 2018-07-31 New England Biolabs, Inc. Use of thermostable RNA polymerases to produce RNAs having reduced immunogenicity
BR112019028280A2 (pt) 2017-07-04 2020-07-14 Curevac Ag moléculas de ácido nucleico
WO2019036638A1 (en) 2017-08-18 2019-02-21 Modernatx, Inc. METHODS FOR PREPARING MODIFIED RNA
EP3673069A1 (en) 2017-08-22 2020-07-01 CureVac AG Bunyavirales vaccine
AU2018326799A1 (en) 2017-08-31 2020-02-27 Modernatx, Inc. Methods of making lipid nanoparticles
AU2018333530B2 (en) 2017-09-13 2024-05-30 Biontech Cell & Gene Therapies Gmbh RNA replicon for expressing a T cell receptor or an artificial T cell receptor
EP3681993A1 (en) 2017-09-13 2020-07-22 BioNTech RNA Pharmaceuticals GmbH Rna replicon for reprogramming somatic cells
CA3075696A1 (en) 2017-09-13 2019-03-21 Biontech Rna Pharmaceuticals Gmbh Method of enhancing rna expression in a cell
US11692002B2 (en) 2017-11-08 2023-07-04 CureVac SE RNA sequence adaptation
JP7423522B2 (ja) 2017-11-22 2024-01-29 モダーナティエックス・インコーポレイテッド 尿素サイクル異常症の治療のためのオルニチントランスカルバミラーゼをコードするポリヌクレオチド
US11939601B2 (en) 2017-11-22 2024-03-26 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding phenylalanine hydroxylase for the treatment of phenylketonuria
WO2019104195A1 (en) 2017-11-22 2019-05-31 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding propionyl-coa carboxylase alpha and beta subunits for the treatment of propionic acidemia
WO2019115635A1 (en) 2017-12-13 2019-06-20 Curevac Ag Flavivirus vaccine
SG11202005760PA (en) 2017-12-21 2020-07-29 Curevac Ag Linear double stranded dna coupled to a single support or a tag and methods for producing said linear double stranded dna
US11802146B2 (en) 2018-01-05 2023-10-31 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding anti-chikungunya virus antibodies
WO2019193183A2 (en) 2018-04-05 2019-10-10 Curevac Ag Novel yellow fever nucleic acid molecules for vaccination
EP3773745A1 (en) 2018-04-11 2021-02-17 ModernaTX, Inc. Messenger rna comprising functional rna elements
SG11202008225PA (en) 2018-04-17 2020-11-27 Curevac Ag Novel rsv rna molecules and compositions for vaccination
FR3081169B1 (fr) * 2018-05-15 2020-06-19 Messenger Biopharma Substitution de la coiffe des arn messagers par deux sequences d'arn introduites a leur extremite 5'
EP3813874A1 (en) 2018-06-27 2021-05-05 CureVac AG Novel lassa virus rna molecules and compositions for vaccination
US20220184185A1 (en) 2018-07-25 2022-06-16 Modernatx, Inc. Mrna based enzyme replacement therapy combined with a pharmacological chaperone for the treatment of lysosomal storage disorders
MA53545A (fr) 2018-09-02 2021-07-14 Modernatx Inc Polynucléotides codant pour l'acyl-coa déshydrogénase à très longue chaîne pour le traitement de l'insuffisance en acyl-coa déshydrogénase à très longue chaîne
MX2021003015A (es) 2018-09-13 2021-07-15 Modernatx Inc Polinucleotidos que codifican glucosa-6-fosfatasa para el tratamiento de la glucogenosis.
EP3849594A2 (en) 2018-09-13 2021-07-21 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding branched-chain alpha-ketoacid dehydrogenase complex e1-alpha, e1-beta, and e2 subunits for the treatment of maple syrup urine disease
AU2019339430A1 (en) 2018-09-14 2021-04-29 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding uridine diphosphate glycosyltransferase 1 family, polypeptide A1 for the treatment of Crigler-Najjar Syndrome
EP3853202A1 (en) 2018-09-19 2021-07-28 ModernaTX, Inc. Compounds and compositions for intracellular delivery of therapeutic agents
US12090235B2 (en) 2018-09-20 2024-09-17 Modernatx, Inc. Preparation of lipid nanoparticles and methods of administration thereof
MA53734A (fr) 2018-09-27 2021-08-04 Modernatx Inc Polynucléotides codant pour l'arginase 1 pour le traitement d'une déficience en arginase
US11072808B2 (en) * 2018-10-04 2021-07-27 New England Biolabs, Inc. Methods and compositions for increasing capping efficiency of transcribed RNA
CN113166737A (zh) 2018-10-04 2021-07-23 新英格兰生物实验室公司 提高转录的rna的加帽效率的方法和组合物
US12492425B2 (en) 2018-12-21 2025-12-09 CureVac SE Methods for RNA analysis
CA3118034A1 (en) 2018-12-21 2020-06-25 Curevac Ag Rna for malaria vaccines
JP7635131B2 (ja) 2019-01-31 2025-02-25 モデルナティエックス インコーポレイテッド 脂質ナノ粒子の調製方法
SG11202108098QA (en) 2019-01-31 2021-08-30 Modernatx Inc Vortex mixers and associated methods, systems, and apparatuses thereof
WO2020161342A1 (en) 2019-02-08 2020-08-13 Curevac Ag Coding rna administered into the suprachoroidal space in the treatment of ophtalmic diseases
US20220370354A1 (en) 2019-05-08 2022-11-24 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding methylmalonyl-coa mutase for the treatment of methylmalonic acidemia
JP2022532078A (ja) 2019-05-08 2022-07-13 アストラゼネカ アクチボラグ 皮膚及び創傷のための組成物並びにその使用の方法
WO2020254535A1 (en) 2019-06-18 2020-12-24 Curevac Ag Rotavirus mrna vaccine
US20220387628A1 (en) 2019-06-24 2022-12-08 Modernatx, Inc. Messenger rna comprising functional rna elements and uses thereof
MA56539A (fr) 2019-06-24 2022-04-27 Modernatx Inc Arn messager résistant à l'endonucléase et utilisations correspondantes
EP4009955A1 (en) 2019-08-07 2022-06-15 ModernaTX, Inc. Compositions and methods for enhanced delivery of agents
JP2022544412A (ja) 2019-08-14 2022-10-18 キュアバック アーゲー 免疫賦活特性が減少したrna組み合わせおよび組成物
AU2020366209A1 (en) 2019-10-15 2022-05-19 Board Of Regents Of The University Of Nebraska mRNA encoding granulocyte-macrophage colony stimulating factor for treating Parkinson's disease
EP4076647A1 (en) 2019-12-20 2022-10-26 CureVac AG Lipid nanoparticles for delivery of nucleic acids
JP7793525B2 (ja) 2020-02-04 2026-01-05 キュアバック エスイー コロナウイルスワクチン
US12194089B2 (en) 2020-02-04 2025-01-14 CureVac SE Coronavirus vaccine
PL432884A1 (pl) * 2020-02-12 2021-08-16 Uniwersytet Warszawski Nowe analogi kapu końca 5' mRNA, cząsteczka RNA je zawierająca, ich zastosowania i sposób syntezy cząsteczki RNA i peptydu
KR102924173B1 (ko) 2020-04-09 2026-02-06 쑤저우 아보젠 바이오사이언시스 컴퍼니 리미티드 지질 나노입자 조성물
CN113874507A (zh) 2020-04-09 2021-12-31 苏州艾博生物科技有限公司 冠状病毒的核酸疫苗
US11547673B1 (en) 2020-04-22 2023-01-10 BioNTech SE Coronavirus vaccine
WO2021231854A1 (en) 2020-05-14 2021-11-18 Modernatx, Inc. Lnp compositions comprising an mrna therapeutic and an effector molecule
CN116322758A (zh) 2020-05-29 2023-06-23 库尔维科欧洲股份公司 基于核酸的组合疫苗
US20230235298A1 (en) 2020-06-01 2023-07-27 Modernatx, Inc. Phenylalanine hydroxylase variants and uses thereof
EP4157217A1 (en) 2020-06-01 2023-04-05 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles containing polynucleotides encoding glucose-6-phosphatase and uses thereof
EP4162034A1 (en) 2020-06-04 2023-04-12 BioNTech SE Rna replicon for versatile and efficient gene expression
CN116194151A (zh) 2020-06-23 2023-05-30 摩登纳特斯有限公司 包含具有延长的半衰期的mRNA治疗剂的LNP组合物
CA3182994A1 (en) 2020-06-30 2022-01-06 Bo YING Lipid compounds and lipid nanoparticle compositions
US20230295257A1 (en) 2020-07-24 2023-09-21 Strand Therapeutics Inc. Lipid nanoparticle comprising modified nucleotides
EP4172194A1 (en) 2020-07-31 2023-05-03 CureVac SE Nucleic acid encoded antibody mixtures
AU2021328980A1 (en) 2020-08-20 2023-03-09 Suzhou Abogen Biosciences Co., Ltd. Lipid compounds and lipid nanoparticle compositions
US20240066114A1 (en) 2020-08-31 2024-02-29 CureVac SE Multivalent nucleic acid based coronavirus vaccines
CN116368226A (zh) 2020-09-04 2023-06-30 维乎医疗有限公司 用于加帽rna的组合物和方法
EP4229208A4 (en) 2020-10-14 2024-10-30 George Mason Research Foundation, Inc. METHOD FOR THE PRODUCTION OF LIPID DNANOPARTICLES AND COMPOSITIONS THEREOF
US20230406895A1 (en) 2020-11-13 2023-12-21 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding cystic fibrosis transmembrane conductance regulator for the treatment of cystic fibrosis
CA3198538A1 (en) 2020-11-16 2022-05-19 Bakul Subodh BHATNAGAR Enhanced formulation stabilization and improved lyophilization processes
CA3201552A1 (en) 2020-12-09 2022-06-16 Thomas ZIEGENHALS Rna manufacturing
US20240156946A1 (en) 2020-12-22 2024-05-16 CureVac SE Rna vaccine against sars-cov-2 variants
WO2022137133A1 (en) 2020-12-22 2022-06-30 Curevac Ag Rna vaccine against sars-cov-2 variants
WO2022135993A2 (en) 2020-12-22 2022-06-30 Curevac Ag Pharmaceutical composition comprising lipid-based carriers encapsulating rna for multidose administration
KR20230129479A (ko) 2021-01-08 2023-09-08 스트랜드 세러퓨틱스 인코포레이티드 발현 구성체 및 이의 용도
WO2022152141A2 (en) 2021-01-14 2022-07-21 Suzhou Abogen Biosciences Co., Ltd. Polymer conjugated lipid compounds and lipid nanoparticle compositions
WO2022152109A2 (en) 2021-01-14 2022-07-21 Suzhou Abogen Biosciences Co., Ltd. Lipid compounds and lipid nanoparticle compositions
EP4087938A2 (en) 2021-01-27 2022-11-16 CureVac AG Method of reducing the immunostimulatory properties of in vitro transcribed rna
JP2024506908A (ja) 2021-02-12 2024-02-15 モデルナティエックス インコーポレイテッド インビボ療法のためのペイロードを含むlnp組成物
WO2022204371A1 (en) 2021-03-24 2022-09-29 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles containing polynucleotides encoding glucose-6-phosphatase and uses thereof
US20240226025A1 (en) 2021-03-24 2024-07-11 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding methylmalonyl-coa mutase for the treatment of methylmalonic acidemia
WO2022204390A1 (en) 2021-03-24 2022-09-29 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles containing polynucleotides encoding phenylalanine hydroxylase and uses thereof
US20240216288A1 (en) 2021-03-24 2024-07-04 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles containing polynucleotides encoding propionyl-coa carboxylase alpha and beta subunits and uses thereof
US20240189449A1 (en) 2021-03-24 2024-06-13 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles and polynucleotides encoding ornithine transcarbamylase for the treatment of ornithine transcarbamylase deficiency
US20240181038A1 (en) 2021-03-26 2024-06-06 Glaxosmithkline Biologicals Sa Immunogenic compositions
WO2022207862A2 (en) 2021-03-31 2022-10-06 Curevac Ag Syringes containing pharmaceutical compositions comprising rna
US20240175005A1 (en) 2021-03-31 2024-05-30 Modernatx, Inc. PURIFICATION AND RECYCLING OF mRNA NUCLEOTIDE CAPS
AU2022249357A1 (en) 2021-04-01 2023-10-12 Modernatx, Inc. Methods for identification and ratio determination of rna species in multivalent rna compositions
CA3218544A1 (en) 2021-05-03 2022-11-10 Pfizer Inc. Vaccination against bacterial and betacoronavirus infections
CA3171589A1 (en) 2021-05-03 2022-11-03 Moritz THRAN Improved nucleic acid sequence for cell type specific expression
WO2022234416A1 (en) 2021-05-03 2022-11-10 Pfizer Inc. Vaccination against pneumoccocal and covid-19 infections
WO2022234417A1 (en) 2021-05-03 2022-11-10 Pfizer Inc. Immunogenic composition against influenza
US20240269248A1 (en) 2021-05-19 2024-08-15 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding methylmalonyl-coa mutase for the treatment of methylmalonic acidemia
EP4204390A1 (en) 2021-05-24 2023-07-05 Suzhou Abogen Biosciences Co., Ltd. Lipid compounds and lipid nanoparticle compositions
WO2022266083A2 (en) 2021-06-15 2022-12-22 Modernatx, Inc. Engineered polynucleotides for cell-type or microenvironment-specific expression
US20240376445A1 (en) 2021-06-22 2024-11-14 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding uridine diphosphate glycosyltransferase 1 family, polypeptide a1 for the treatment of crigler-najjar syndrome
WO2023287751A1 (en) 2021-07-12 2023-01-19 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding propionyl-coa carboxylase alpha and beta subunits for the treatment of propionic acidemia
US20250090684A1 (en) 2021-07-27 2025-03-20 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding glucose-6-phosphatase for the treatment of glycogen storage disease type 1a (gsd1a)
WO2023007019A1 (en) 2021-07-30 2023-02-02 CureVac SE Cap analogs having an acyclic linker to the guanine derivative nucleobase
US20240342206A1 (en) 2021-07-30 2024-10-17 CureVac SE mRNAS FOR TREATMENT OR PROPHYLAXIS OF LIVER DISEASES
AU2021461416A1 (en) 2021-08-24 2024-02-22 BioNTech SE In vitro transcription technologies
EP4395748A1 (en) 2021-09-03 2024-07-10 CureVac SE Novel lipid nanoparticles for delivery of nucleic acids
US20240398933A1 (en) 2021-09-03 2024-12-05 CureVac SE Novel lipid nanoparticles for delivery of nucleic acids comprising phosphatidylserine
US20250017867A1 (en) 2021-10-01 2025-01-16 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding relaxin for the treatment of fibrosis and/or cardiovascular disease
IL311855A (en) 2021-10-08 2024-05-01 Pfizer Immunogenic lnp compositions and methods thereof
CN116064598B (zh) 2021-10-08 2024-03-12 苏州艾博生物科技有限公司 冠状病毒的核酸疫苗
AR127312A1 (es) 2021-10-08 2024-01-10 Suzhou Abogen Biosciences Co Ltd Compuestos lipídicos ycomposiciones de nanopartículas lipídicas
JP2024536406A (ja) 2021-10-08 2024-10-04 スージョウ・アボジェン・バイオサイエンシズ・カンパニー・リミテッド 脂質化合物及び脂質ナノ粒子組成物
JP2024539089A (ja) 2021-10-18 2024-10-28 バイオエヌテック エスエー 修飾複製可能rnaの機能および関連する組成物を増加させるための変異を決定する方法ならびにそれらの使用
CN118103516A (zh) 2021-10-18 2024-05-28 生物技术欧洲股份公司 修饰的可复制rna和相关组合物及其用途
JP2024540170A (ja) 2021-11-01 2024-10-31 モデルナティエックス インコーポレイテッド インテグリンベータ-6をコードするポリヌクレオチド及びその使用方法
US20240200078A1 (en) 2021-11-18 2024-06-20 Cornell University Microrna-dependent mrna switches for tissue-specific mrna-based therapies
US12186387B2 (en) 2021-11-29 2025-01-07 BioNTech SE Coronavirus vaccine
AU2022410694A1 (en) 2021-12-17 2024-07-04 Pfizer Inc. Polynucleotide compositions and uses thereof
JP2025502599A (ja) 2021-12-23 2025-01-28 スージョウ・アボジェン・バイオサイエンシズ・カンパニー・リミテッド 脂質化合物及び脂質ナノ粒子組成物
WO2023138786A1 (en) 2022-01-21 2023-07-27 BioNTech SE Analysis of rna molecules using catalytic nucleic acids
EP4469091A1 (en) 2022-01-28 2024-12-04 CureVac SE Nucleic acid encoded transcription factor inhibitors
TW202345864A (zh) 2022-02-18 2023-12-01 美商現代公司 編碼檢查點癌症疫苗之mRNA及其用途
JP2025507751A (ja) 2022-03-01 2025-03-21 クリスパー・セラピューティクス・アクチェンゲゼルシャフト アンジオポエチン様3(angptl3)関連状態を処置するための方法および組成物
WO2023180904A1 (en) 2022-03-21 2023-09-28 Crispr Therapeutics Ag Methods and compositions for treating lipoprotein-related diseases
EP4499153A2 (en) 2022-03-25 2025-02-05 ModernaTX, Inc. Polynucleotides encoding fanconi anemia, complementation group proteins for the treatment of fanconi anemia
WO2023196399A1 (en) 2022-04-06 2023-10-12 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles and polynucleotides encoding argininosuccinate lyase for the treatment of argininosuccinic aciduria
WO2023201294A1 (en) 2022-04-14 2023-10-19 Modernatx, Inc. Rna polymerase variants
IL316186A (en) 2022-04-26 2024-12-01 Strand Therapeutics Inc Lipid nanoparticles containing Venezuelan equine encephalitis (VEE) replicon and uses thereof
WO2023213378A1 (en) 2022-05-02 2023-11-09 BioNTech SE Replicon compositions and methods of using same for the treatment of diseases
WO2023215498A2 (en) 2022-05-05 2023-11-09 Modernatx, Inc. Compositions and methods for cd28 antagonism
US20250345407A1 (en) 2022-05-25 2025-11-13 CureVac SE Nucleic acid based vaccine encoding an escherichia coli fimh antigenic polypeptide
US11878055B1 (en) 2022-06-26 2024-01-23 BioNTech SE Coronavirus vaccine
WO2024017479A1 (en) 2022-07-21 2024-01-25 BioNTech SE Multifunctional cells transiently expressing an immune receptor and one or more cytokines, their use and methods for their production
MA71619A (fr) 2022-07-26 2025-05-30 Modernatx, Inc. Polynucléotides modifiés pour la régulation temporelle de l'expression
EP4561602A1 (en) 2022-07-28 2025-06-04 Stemcell Technologies Canada Inc. Polynucleotides encoding linked antigens and uses thereof
CN119654141A (zh) 2022-08-18 2025-03-18 苏州艾博生物科技有限公司 脂质纳米颗粒的组合物
US20250387764A1 (en) 2022-09-15 2025-12-25 Pfizer Inc. Coaxial flow device for nanoparticle preparation and manufacturing equipment including such device
JP2025532591A (ja) 2022-09-15 2025-10-01 ビオンテック・ソシエタス・エウロパエア miRNAを有するトランス増幅RNAベクターを含むシステムおよび組成物
JP2025532686A (ja) 2022-09-26 2025-10-01 グラクソスミスクライン バイオロジカルズ ソシエテ アノニム インフルエンザウイルスワクチン
WO2024084397A1 (en) 2022-10-19 2024-04-25 Pfizer Inc. Vaccination against pneumoccocal and covid-19 infections
US12186389B2 (en) 2022-10-28 2025-01-07 Glaxosmithkline Biologicals Sa Nucleic acid base vaccine against emerging SARS-CoV-2 variants
WO2024097639A1 (en) 2022-10-31 2024-05-10 Modernatx, Inc. Hsa-binding antibodies and binding proteins and uses thereof
WO2024118866A1 (en) 2022-12-01 2024-06-06 Modernatx, Inc. Gpc3-specific antibodies, binding domains, and related proteins and uses thereof
WO2024119117A1 (en) * 2022-12-02 2024-06-06 Prime Medicine, Inc. Modified 5' cap for mrna and methods of use thereof
WO2024130158A1 (en) 2022-12-16 2024-06-20 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles and polynucleotides encoding extended serum half-life interleukin-22 for the treatment of metabolic disease
EP4637717A1 (en) 2022-12-23 2025-10-29 Pfizer Inc. Lipid particle compositions and methods of use thereof
WO2024151811A1 (en) 2023-01-11 2024-07-18 Modernatx, Inc. Personalized cancer vaccines
WO2024154061A1 (en) 2023-01-18 2024-07-25 Pfizer Inc. Compositions and methods for stabilizing rna
WO2024160895A1 (en) 2023-01-31 2024-08-08 CureVac SE Cap analogs with 5'-terminal acyclic guanosine derivative
WO2024160936A1 (en) 2023-02-03 2024-08-08 Glaxosmithkline Biologicals Sa Rna formulation
WO2024165146A1 (en) 2023-02-07 2024-08-15 Biontech Cell & Gene Therapies Gmbh Immune effector cells stably and transiently expressing nucleic acids
WO2024171017A1 (en) 2023-02-13 2024-08-22 Pfizer Inc. Immunogenic composition against influenza
GB202302092D0 (en) 2023-02-14 2023-03-29 Glaxosmithkline Biologicals Sa Analytical method
WO2024178305A1 (en) 2023-02-24 2024-08-29 Modernatx, Inc. Compositions of mrna-encoded il-15 fusion proteins and methods of use thereof for treating cancer
WO2024182301A2 (en) 2023-02-27 2024-09-06 Modernatx, Inc. Lipid nanoparticles and polynucleotides encoding galactose-1-phosphate uridylyltransferase (galt) for the treatment of galactosemia
AU2024233180A1 (en) 2023-03-08 2025-09-25 CureVac SE Novel lipid nanoparticle formulations for delivery of nucleic acids
WO2024197033A1 (en) 2023-03-21 2024-09-26 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding relaxin for the treatment of heart failure
WO2024206329A1 (en) 2023-03-27 2024-10-03 Modernatx, Inc. Nucleic acid molecules encoding bi-specific secreted engagers and uses thereof
WO2024206126A1 (en) 2023-03-27 2024-10-03 Modernatx, Inc. Cd16-binding antibodies and uses thereof
EP4687990A1 (en) 2023-03-30 2026-02-11 Ose Immunotherapeutics Method of synthesis of targeted lipid nanoparticle and uses thereof
WO2024200823A1 (en) 2023-03-30 2024-10-03 Ose Immunotherapeutics Lipid-based nanoparticle targeted at activated immune cells for the expression of immune cell enhancing molecule and use thereof
WO2024216162A1 (en) 2023-04-12 2024-10-17 Strand Therapeutics Inc. Synthetic circuits and uses thereof
KR20250169566A (ko) 2023-04-14 2025-12-03 바이오엔테크 에스이 Hiv 백신
EP4701658A1 (en) 2023-04-27 2026-03-04 GlaxoSmithKline Biologicals S.A. Influenza virus vaccines
EP4701657A1 (en) 2023-04-27 2026-03-04 GlaxoSmithKline Biologicals S.A. Influenza virus vaccines
WO2024229321A1 (en) 2023-05-03 2024-11-07 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding cystic fibrosis transmembrane conductance regulator for the treatment of cystic fibrosis
WO2024230934A1 (en) 2023-05-11 2024-11-14 CureVac SE Therapeutic nucleic acid for the treatment of ophthalmic diseases
EP4464713A1 (en) 2023-05-18 2024-11-20 Siec Badawcza Lukasiewicz - PORT Polski Osrodek Rozwoju Technologii Circular rna analogs, preparation and application thereof
MX2025014990A (es) 2023-06-14 2026-02-03 Pfizer Metodo para estabilizar acido ribonucleico (rna)
WO2025022290A1 (en) 2023-07-21 2025-01-30 Crispr Therapeutics Ag Modulating expression of alas1 (5'-aminolevulinate synthase 1) gene
AU2024299528A1 (en) 2023-07-24 2026-03-12 Strand Therapeutics Inc. Rna-based synthetic circuit for producing engineered immune cells for an extracorporeal cell therapy
AU2024299882A1 (en) 2023-07-25 2026-01-08 Strand Therapeutics Inc. Polynucleotides comprising a micro rna detargeting sensor and uses thereof
WO2025030050A2 (en) 2023-08-03 2025-02-06 Trilink Biotechnologies, Llc Cap analogs and methods of use thereof
WO2025042806A2 (en) 2023-08-21 2025-02-27 Modernatx, Inc. C-met binding antibodies, nucleic acids encoding same, and methods of use
WO2025051381A1 (en) 2023-09-08 2025-03-13 BioNTech SE Methods and compositions for localized expression of administered rna
WO2025057060A1 (en) 2023-09-13 2025-03-20 Pfizer Inc. Immunogenic compositions against influenza
WO2025059290A1 (en) 2023-09-14 2025-03-20 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding phenylalanine hydroxylase for the treatment of phenylketonuria
WO2025072482A1 (en) 2023-09-27 2025-04-03 Modernatx, Inc. Immunoglobulin a protease polypeptides, polynucleotides, and uses thereof
WO2025074292A2 (en) 2023-10-06 2025-04-10 Pfizer Inc. Immunogenic compositions
US20250332245A1 (en) 2023-11-15 2025-10-30 Pfizer Inc. Immunogenic compositions against influenza
WO2025111297A1 (en) 2023-11-21 2025-05-30 Modernatx, Inc. Polynucleotides encoding cystic fibrosis transmembrane conductance regulator for the treatment of cystic fibrosis
WO2025132839A1 (en) 2023-12-21 2025-06-26 Glaxosmithkline Biologicals Sa Influenza virus vaccines
WO2025171182A1 (en) 2024-02-08 2025-08-14 Iovance Biotherapeutics, Inc. Treatment of cancer patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies in combination with cancer vaccine
WO2025181704A2 (en) 2024-02-27 2025-09-04 Crispr Therapeutics Ag Rt editing compositions and methods
WO2025184429A1 (en) 2024-02-28 2025-09-04 Modernatx, Inc. Bromodomain and extra-terminal domain (bet) epigenetic reader decoy
WO2025186726A1 (en) 2024-03-05 2025-09-12 Crispr Therapeutics Ag Modulating expression of agt (angiotensinogen) gene
WO2025186725A2 (en) 2024-03-06 2025-09-12 Pfizer Inc. Improved lnp formulations and uses thereof
WO2025191415A1 (en) 2024-03-11 2025-09-18 Pfizer Inc. Immunogenic compositions comprising conjugated escherichia coli saccharides and uses thereof
US20260061042A1 (en) 2024-03-26 2026-03-05 Pfizer Inc. Polynucleotide compositions and uses thereof
GB202404607D0 (en) 2024-03-29 2024-05-15 Glaxosmithkline Biologicals Sa RNA formulation
WO2025212851A2 (en) 2024-04-03 2025-10-09 Orbital Therapeutics, Inc. mRNA COMPOSITIONS AND USES THEREOF IN VARICELLA ZOSTER VIRUS VACCINES
WO2025217591A1 (en) 2024-04-12 2025-10-16 Strand Therapeutics Inc. Human-derived synthetic regulators and uses thereof
WO2025238563A1 (en) 2024-05-17 2025-11-20 Pfizer Inc. Coaxial mixing device for nanoparticle preparation and manufacturing equipment including such mixing device
WO2025255199A1 (en) 2024-06-05 2025-12-11 Modernatx, Inc. Argininosuccinate synthase 1 and argininosuccinate lyase polypeptides and polynucleotides and uses thereof
WO2026025031A1 (en) 2024-07-26 2026-01-29 Modernatx, Inc. Mrna encoding mageb2 tcer molecule
WO2026044055A1 (en) 2024-08-23 2026-02-26 Modernatx, Inc. Muc16 binding molecules, nucleic acids encoding same, and methods of use

Family Cites Families (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CA2176498A1 (en) * 1993-11-16 1995-05-26 Lyle John Arnold, Jr. Synthetic oligomers having phosphonate internucleosidyl linkages of undefined chirality mixed with non-phosphonate internucleosidyl linkages
US6060456A (en) * 1993-11-16 2000-05-09 Genta Incorporated Chimeric oligonucleoside compounds
US7074596B2 (en) 2002-03-25 2006-07-11 Board Of Supervisors Of Louisiana State University And Agricultural And Mechanical College Synthesis and use of anti-reverse mRNA cap analogues
US7368439B2 (en) 2005-06-15 2008-05-06 Bar - Ilan University Dinucleoside poly(borano)phosphate derivatives and uses thereof

Also Published As

Publication number Publication date
PL2297175T3 (pl) 2014-01-31
EP2297175B1 (en) 2013-08-07
PL385388A1 (pl) 2009-12-07
CA2727091C (en) 2017-05-09
EP2297175A2 (en) 2011-03-23
CA2727091A1 (en) 2009-12-10
ES2425781T3 (es) 2013-10-17
WO2009149253A2 (en) 2009-12-10
JP2011522542A (ja) 2011-08-04
US8519110B2 (en) 2013-08-27
JP5715560B2 (ja) 2015-05-07
AU2009256131B2 (en) 2013-05-30
EP2297175A4 (en) 2011-06-15
WO2009149253A3 (en) 2010-03-25
AU2009256131A1 (en) 2009-12-10
US20110092574A1 (en) 2011-04-21

Similar Documents

Publication Publication Date Title
PL215513B1 (pl) Nowe boranofosforanowe analogi dinukleotydów, ich zastosowanie, czasteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub bialka
CN101855231B (zh) 信使rna帽的抗-反向硫代磷酸类似物的合成和用途
JP7144050B2 (ja) 5’-ホスホロチオラート mRNA 5’-末端(キャップ)類似体、それを含むmRNA、それらを得る方法およびそれらの使用方法
CA3167563A1 (en) Novel mrna 5&#39;-end cap analogs modified within phosphate residues, rna molecule incorporating the same, uses thereof and method of synthesizing rna molecule or peptide
Rydzik et al. Synthetic dinucleotide mRNA cap analogs with tetraphosphate 5′, 5′ bridge containing methylenebis (phosphonate) modification
EP3484907A1 (en) Novel phosphotriazole mrna 5&#39;-end cap analogs, composition comprising the same, rna molecule incorporating the same, uses thereof and method of synthesizing rna molecule, protein or peptide
Strenkowska et al. Towards mRNA with superior translational activity: synthesis and properties of ARCA tetraphosphates with single phosphorothioate modifications
Johannsen et al. Amino acids attached to 2′-amino-LNA: synthesis and excellent duplex stability
Kowalska et al. Synthesis and properties of mRNA cap analogs containing phosphorothioate moiety in 5′, 5′-triphosphate chain
WO2023199261A1 (en) Rna molecule containing modified cap analogs at the 5 &#39; end, use of rna molecule in in vitro protein or peptide synthesis, rna molecule for use in medicine, and use of modified cap analogs for rna capping
Shipitsyn et al. Synthesis of [bis (Inosine-5′)]-tetraphosphate and [bis (Inosine-5′)]-pentaphosphate Analogues Bearing the Residues of Methylenediphosphonic Acid
HK1242326A1 (en) Synthesis and use of anti-reverse phosphorothioate analogs of the messenger rna cap
HK1242326A (en) Synthesis and use of anti-reverse phosphorothioate analogs of the messenger rna cap
HK1260250A1 (en) 5′-phosphorothiolate mrna 5′-end (cap) analogs, mrna comprising the same, method of obtaining and uses thereof
HK1242326B (zh) 信使rna帽的抗-反向硫代磷酸类似物的合成和用途
PL214850B1 (pl) Cząsteczka RNA, sposób otrzymywania RNA oraz sposób otrzymywania peptydów lub białka
HK1200461B (en) Synthesis and use of anti-reverse phosphorothioate analogs of the messenger rna cap