PL236281B1 - Protein sequence, preferably constituting a fragment of antibody, in a specific way interacting with human or mouse vascular endothelial growth factor C, and its application - Google Patents

Protein sequence, preferably constituting a fragment of antibody, in a specific way interacting with human or mouse vascular endothelial growth factor C, and its application Download PDF

Info

Publication number
PL236281B1
PL236281B1 PL415391A PL41539115A PL236281B1 PL 236281 B1 PL236281 B1 PL 236281B1 PL 415391 A PL415391 A PL 415391A PL 41539115 A PL41539115 A PL 41539115A PL 236281 B1 PL236281 B1 PL 236281B1
Authority
PL
Poland
Prior art keywords
vegf
protein
seq
sequence
antibody
Prior art date
Application number
PL415391A
Other languages
Polish (pl)
Other versions
PL415391A1 (en
Inventor
Monika BZOWSKA
Monika Bzowska
Małgorzata Kulesza
Małg Orzata Kulesza
Renata Mężyk-Kopeć
Tomasz KLAUS
Tomasz Klaus
Barbara Wyroba
Joanna Bereta
Original Assignee
Univ Jagiellonski
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Univ Jagiellonski filed Critical Univ Jagiellonski
Priority to PL415391A priority Critical patent/PL236281B1/en
Publication of PL415391A1 publication Critical patent/PL415391A1/en
Publication of PL236281B1 publication Critical patent/PL236281B1/en

Links

Landscapes

  • Peptides Or Proteins (AREA)

Abstract

Zgłoszenie dotyczy nowych sekwencji białkowych, oddziałujących specyficznie z ludzkim i mysim czynnikiem wzrostu śródbłonka naczyniowego C (VEGF-C). W szczególności, sekwencje białkowe stanowiące jednołańcuchowe fragmenty ludzkich przeciwciał (scFv). Zgłoszenie obejmuje sposób wyodrębnienia VEGF-C z roztworu, zwłaszcza z roztworu wodnego, oraz zastosowanie sekwencji białkowych do otrzymywania preparatów białka VEGF-C.The application relates to novel protein sequences that interact specifically with human and murine vascular endothelial growth factor C (VEGF-C). In particular, protein sequences that are single chain human antibody (scFv) fragments. The application includes a method for isolating VEGF-C from a solution, especially an aqueous solution, and the use of protein sequences to prepare VEGF-C protein preparations.

Description

Opis wynalazkuDescription of the invention

Wynalazek dotyczy przeciwciała formatu scFv, stanowiącego inhibitor białka będącego czynnikiem wzrostu śródbłonka naczyniowego C (VEGF-C). W szczególności, sekwencje białkowe według wynalazku stanowią jednołańcuchowe fragmenty ludzkich przeciwciał (scFv). Celem wynalazku jest zapewnienie cząsteczek, które mogą wydajnie i specyficznie wiązać ludzkie i mysie białko VEGF-C. Dodatkowym celem wynalazku jest dostarczenie sposobu wykrywania ludzkiego i mysiego białka VEGF-C oraz oznaczania jego ilości i/lub stężenia.The invention relates to an antibody of the scFv format which is an inhibitor of the vascular endothelial growth factor C protein (VEGF-C). In particular, the protein sequences of the invention are single-chain human antibody fragments (scFv). An object of the invention is to provide molecules that can efficiently and specifically bind human and murine VEGF-C proteins. An additional object of the invention is to provide a method for detecting human and murine VEGF-C protein and determining its amount and / or concentration.

Nowotwory są jedną z głównych przyczyn zgonów na świecie. Skuteczna terapia, związana z chirurgicznym usunięciem czy też naświetlaniem guzów pierwotnych, jest często niemożliwa ze względu na migrację komórek nowotworowych z pierwotnego środowiska do innych narządów i tkanek w organizmie. Do tworzenia przerzutów nowotwory złośliwe wykorzystują zarówno naczynia krwionośne, jak i limfatyczne (Bzowska M et al., Acta Biochim Pol 2013, 60(3):263-75). Do tej pory centrum zainteresowania badaczy stanowiło zjawisko angiogenezy, czyli powstawania nowych naczyń krwionośnych. Stało się ono głównym celem terapii hamujących przerzutowanie nowotworów, choć ich skuteczność okazała się mniejsza od spodziewanej. Jedną z wielu możliwych przyczyn niepowodzenia tego typu terapii jest zaniedbanie wpływu naczyń limfatycznych jako alternatywnej drogi ucieczki komórek nowotworowych z guza pierwotnego (Potente M et al. Cell 2011; 146(6): 873-87). Najbardziej obiecujący cel dla hamowania zjawiska limfangiogenezy stanowi blokada osi sygnałowej pomiędzy białkiem VEGF-C (ang. vascular endothelial growth factor C; czynnik wzrostu śródbłonka naczyniowego C) a jego receptorami VEGFR-2 oraz VEGFR-3 (ang. vascular endothelial growth factor receptor; receptor czynnika wzrostu śródbłonka naczyniowego) (Stacker SA et al. Nat Rev Cancer 2014; 14(3): 159-72). VEGF-C należy do rodziny czynników wzrostu śródbłonka naczyniowego, składającej się z siedmiu białek: VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, VEGF-E, VEGF-F oraz PIGF (ang. placental growth factor, łożyskowy czynnik wzrostu). Odkryte w 1996 roku białko VEGF-C zostało opisane jako niekowalencyjny homodimer, będący ligandem dla VEGFR-2 i VEGFR-3 (Joukov V et al. EMBO J. 1996; 15(7):290-298), choć niektóre doniesienia informują również o występowaniu kowalencyjnie połączonych dimerów VEGF-C (Leppanen V-M et al. Proc. Natl Acad Sci USA 2009; 107(6):2425-2430). Jego powinowactwo względem receptorów regulowane jest przez wielostopniową obróbkę proteolityczną, podczas której siła oddziaływania kolejno powstających form VEGF-C z VEGFR-3 wzrasta. Z kolei VEGFR-2 może rozpoznawać tylko dojrzałą formę VEGF-C (Joukov V et al. EMBO J 1997; 16(13):3898-3911). Sekwencje dojrzałej formy ludzkiego i mysiego białka VEGF-C różnią się tylko dwoma resztami aminokwasowymi (rekordy bazy danych UniProtKB/Swiss-Prot o numerach P97953 i P49767 odpowiednio dla mysiego i ludzkiego VEGF-C). VEGFR-2 i VEGFR-3 to receptory o aktywności kinazy tyrozynowej, które w wyniku związania liganda zostają aktywowane - ulegają dimeryzacji i wzajemnej fosforylacji domen cytoplazmatycznych (Joukov 1996, op. cit.). Pod wpływem oddziaływania VEGF-C z jego receptorami może dochodzić do powstania jedynie homodimerów VEGFR-3 lub heterodimerów VEGFR-2/3 (Nilsson I et al. EMBO J 2010; 29(8):1377-88). Prawdopodobnie ważną rolę w osi sygnałowej pomiędzy VEGF-C a jego receptorami odgrywają również nieposiadające aktywności enzymatycznej neuropiliny, które pełnią funkcję koreceptorów dla VEGFR-2 i VEGFR-3 (Karpanen T et al. FASEB J 2006; 20(9): 1462-72).Cancer is one of the leading causes of death in the world. Effective therapy related to the surgical removal or irradiation of primary tumors is often impossible due to the migration of cancer cells from the primary environment to other organs and tissues in the body. Malignant neoplasms use both blood vessels and lymph vessels to form metastases (Bzowska M et al., Acta Biochim Pol 2013, 60 (3): 263-75). Until now, researchers focused on the phenomenon of angiogenesis, i.e. the formation of new blood vessels. It has become the main target of cancer metastasis inhibiting therapies, although their efficacy has been lower than expected. One of the many possible reasons for the failure of this type of therapy is the neglect of the role of lymphatic vessels as an alternative route for cancer cells to escape from the primary tumor (Potente M et al. Cell 2011; 146 (6): 873-87). The most promising target for inhibiting lymphangiogenesis is the blockade of the signal axis between the VEGF-C protein (vascular endothelial growth factor C) and its receptors VEGFR-2 and VEGFR-3 (vascular endothelial growth factor receptor; vascular endothelial growth factor receptor) (Stacker SA et al. Nat Rev Cancer 2014; 14 (3): 159-72). VEGF-C belongs to the family of vascular endothelial growth factors, consisting of seven proteins: VEGF-A, VEGF-B, VEGF-C, VEGF-D, VEGF-E, VEGF-F and PIGF (placental growth factor). growth factor). Discovered in 1996, the VEGF-C protein was described as a non-covalent homodimer ligand for VEGFR-2 and VEGFR-3 (Joukov V et al. EMBO J. 1996; 15 (7): 290-298), although some reports also report on the presence of covalently linked VEGF-C dimers (Leppanen VM et al. Proc. Natl Acad Sci USA 2009; 107 (6): 2425-2430). Its affinity for receptors is regulated by a multistage proteolytic processing, during which the strength of the interaction of successively emerging forms of VEGF-C with VEGFR-3 increases. In turn, VEGFR-2 can only recognize the mature form of VEGF-C (Joukov V et al. EMBO J 1997; 16 (13): 3898-3911). The sequences of the mature forms of human and murine VEGF-C proteins differ by only two amino acid residues (UniProtKB / Swiss-Prot database records P97953 and P49767 for murine and human VEGF-C, respectively). VEGFR-2 and VEGFR-3 are receptors with tyrosine kinase activity, which, as a result of ligand binding, become activated - they undergo dimerization and mutual phosphorylation of cytoplasmic domains (Joukov 1996, loc. Cit.). Under the influence of VEGF-C interaction with its receptors, only VEGFR-3 homodimers or VEGFR-2/3 heterodimers may be formed (Nilsson I et al. EMBO J 2010; 29 (8): 1377-88). Probably an important role in the signaling axis between VEGF-C and its receptors is played by neuropilins that do not have enzymatic activity, which act as co-receptors for VEGFR-2 and VEGFR-3 (Karpanen T et al. FASEB J 2006; 20 (9): 1462-72 ).

VEGF-C pełni istotną rolę w limfangiogenezie, a zatem bierze udział w wielu różnorodnych procesach fizjologicznych i patologicznych takich jak np.: rozwój układu limfatycznego w trakcie embriogenezy, gojenie ran, przewlekłe stany zapalne, choroby autoimmunologiczne czy przerzutowanie nowotworów (Chachaj A i Szuba A [w:] Angiogenesis and Vascularisation Dulak J et al. (eds.); Springer Vienna 2013, pp. 27-66). VEGF-C poprzez aktywację VEGFR-3 stymuluje proliferację oraz migrację komórek śródbłonka limfatycznego, a także dostarcza im sygnał przetrwania (Makinen T et al. EMBO J 2001; 20(17):4762-4773). Ponadto, chociaż głównym pro-angiogennym czynnikiem pozostaje VEGF-A, VEGF-C także może stymulować angiogenezę przez oddziaływanie z heterodimerami VEGFR-2/3 (Nilsson 2010, op. cit.).VEGF-C plays an important role in lymphangiogenesis, and therefore takes part in many different physiological and pathological processes, such as: development of the lymphatic system during embryogenesis, wound healing, chronic inflammation, autoimmune diseases or tumor metastasis (Chachaj A and Szuba A [in:] Angiogenesis and Vascularisation Dulak J et al. (eds.); Springer Vienna 2013, pp. 27-66). VEGF-C, by activating VEGFR-3, stimulates the proliferation and migration of lymphatic endothelial cells and provides them with a survival signal (Makinen T et al. EMBO J 2001; 20 (17): 4762-4773). Moreover, while VEGF-A remains the major pro-angiogenic factor, VEGF-C also can stimulate angiogenesis by interacting with VEGFR-2/3 heterodimers (Nilsson 2010, loc. Cit.).

Głównymi czynnikami pro-limfangiogennymi o kluczowym znaczeniu w przerzutowaniu nowotworów są białka VEGF-C i VEGF-D, które indukują powstawanie nowych naczyń limfatycznych w okolicy guza przez aktywację VEGFR-3 i koreceptora neuropiliny-2 (Karpanen 2006; op. cit.; Mandriota SJ et al. EMBO J 2001; 20(4):672-82; Chen Z et al. Cancer Res 2005; 65(19):9004-9011; Xu Y et al. J Cell Biol 2010; 188(1):115-30). W ten sposób komórki nowotworowe wydzielając VEGF-C zapewniają sobie drogę ucieczki do pobliskiego węzła limfatycznego, z którego mogą rozprzestrzeniać się dalej zarówno drogą limfatyczną, jak i krwionośną (Stacker SA et al. Nat Rev Cancer 2002; 2(8):573-583). ZasadnicząThe main pro-lymphangiogenic factors of key importance in tumor metastasis are the VEGF-C and VEGF-D proteins, which induce the formation of new lymphatic vessels around the tumor by activating VEGFR-3 and the neuropilin-2 coreceptor (Karpanen 2006; op. Cit .; Mandriota) SJ et al. EMBO J 2001; 20 (4): 672-82; Chen Z et al. Cancer Res 2005; 65 (19): 9004-9011; Xu Y et al. J Cell Biol 2010; 188 (1): 115-30). In this way, cancer cells, secreting VEGF-C, provide an escape route to a nearby lymph node, from which they can spread further both through the lymphatic and bloodstream (Stacker SA et al. Nat Rev Cancer 2002; 2 (8): 573-583 ). Essential

PL 236 281 B1 rolę VEGF-C w limfangiogenezie związanej z nowotworami potwierdziły eksperymenty in vivo, w których zablokowanie tego czynnika hamowało przerzutowanie komórek nowotworowych (Chen 2005; op. cit.; Wang F et al. Exp Ther Med 2010; 1(5):899-904).The role of VEGF-C in tumor-associated lymphangiogenesis was confirmed by in vivo experiments in which blocking this factor inhibited metastasis of neoplastic cells (Chen 2005; op. Cit .; Wang F et al. Exp Ther Med 2010; 1 (5) : 899-904).

Ocena obecności i/lub poziomu białka VEGF-C w materiale biologicznym może mieć zatem znaczenie diagnostyczne w medycynie. Opis patentowy US20100317533 ujawnia panel biomarkerów służących do diagnostyki i monitorowania przebiegu choroby nowotworowej; jednym ze składników panelu jest VEGF-C, którego obecność jest związana z potencjałem nowotworu do tworzenia przerzutów. W opisie patentowym US2012231480 został z kolei ujawniony sposób oceny diagnostycznej zmian w obrębie trzustki za pomocą pomiaru poziomu białek VEGF-A i VEGF-C oraz prostaglandyny E2.Thus, the assessment of the presence and / or level of the VEGF-C protein in biological material may be of diagnostic importance in medicine. Patent description US20100317533 discloses a panel of biomarkers for the diagnosis and monitoring of the course of neoplastic disease; one of the panel components is VEGF-C, the presence of which is associated with the metastatic potential of the tumor. The patent specification US2012231480 further discloses a method of diagnostic evaluation of pancreatic lesions by measuring the level of VEGF-A and VEGF-C proteins and prostaglandin E2.

Do oznaczania białka VEGF-C w materiale biologicznym mogą służyć m.in. przeciwciała, a zwłaszcza przeciwciała monoklonalne. Przeciwciało klasy IgG specyficzne względem VEGF-C zostało ujawnione w opisie patentowym US2011143428. Przeciwciała to cząsteczki o stosunkowo dużym rozmiarze, co może ograniczać ich stosowanie analityczne i diagnostyczne. Ponadto, produkcja przeciwciał monoklonalnych jest kosztowna (m.in. wymaga stosowania hodowli komórek eukariotycznych). Wad tych pozbawione są przeciwciała jednołańcuchowe (ang. single-chain variable fragment, scFv), które są ok. 6 razy mniejsze od przeciwciał klasy IgG oraz mogą być wytwarzane z użyciem prokariotycznych systemów ekspresyjnych.The VEGF-C protein in biological material can be determined, among others, by antibodies, especially monoclonal antibodies. A VEGF-C specific IgG antibody is disclosed in US2011143428. Antibodies are molecules of relatively large size, which may limit their analytical and diagnostic use. Moreover, the production of monoclonal antibodies is expensive (e.g. requires the use of eukaryotic cell culture). Single-chain variable fragment (scFv) antibodies, which are about 6 times smaller than IgG class antibodies and can be produced with the use of prokaryotic expression systems, do not have these drawbacks.

Ze stanu techniki znane są przeciwciała scFv specyficznie oddziałujące z białkiem VEGF-C (Rinderknecht M et al. PLoS One 2010; 5(8):e11941). Opisane przeciwciała posiadają jednak szereg ograniczeń. Białko wykorzystane do selekcji przeciwciał scFv pochodziło z organizmu drożdży, bowiem wytwarzane było w układzie wykorzystującym komórki Pichia pastoris. W związku z tym białko to charakteryzowało się m.in. wzorem glikozylacji różnym od występującego w białku VEGF-C obecnym w organizmach ssaków. Co więcej, nie została potwierdzona aktywność biologiczna białka wykorzystanego do selekcji przeciwciał scFv.ScFv antibodies that specifically interact with the VEGF-C protein are known in the art (Rinderknecht M et al. PLoS One 2010; 5 (8): e11941). However, the antibodies described have a number of limitations. The protein used to select the scFv antibodies came from the yeast organism, as it was produced in a system using Pichia pastoris cells. Therefore, this protein was characterized, among others, by a glycosylation pattern different from that of the mammalian VEGF-C protein. Moreover, the biological activity of the protein used to select scFv antibodies has not been confirmed.

Celem wynalazku jest zapewnienie cząsteczek, które mogą wydajnie i specyficznie oddziaływać z aktywnym biologicznie białkiem VEGF-C. Dodatkowym celem wynalazku jest dostarczenie metody oczyszczania, wykrywania i/lub oznaczania ilości białka VEGF-C.The object of the invention is to provide molecules that can efficiently and specifically interact with the biologically active VEGF-C protein. An additional object of the invention is to provide a method for purifying, detecting and / or quantifying VEGF-C protein.

Istotą wynalazku jest przeciwciało formatu scFv, stanowiące inhibitor białka VEGF-C obejmujące sekwencję aminokwasową wybraną z następującej grupy: Sekw. nr 14, Sekw. nr 15, Sekw. nr 16, Sekw. nr 17, Sekw. nr 18, Sekw. nr 19, Sekw. nr 20, Sekw. nr 21, Sekw. nr 22, Sekw. nr 23, Sekw. nr 24, Sekw. nr 25, Sekw. nr 26.The present invention relates to an antibody of the scFv format which is an inhibitor of the VEGF-C protein comprising an amino acid sequence selected from the following group: Seq. No.14, Seq. No.15, Seq. No.16, Seq. No. 17, Seq. No.18, Seq. No.19, Seq. No. 20, Seq. No.21, Seq. No.22, Seq. No. 23, Seq. No. 24, Seq. No.25, Seq. no 26.

Przedmiotem wynalazku jest także sposób wyodrębniania VEGF-C z roztworu, zwłaszcza roztworu wodnego, charakteryzujący się tym, że:The invention also relates to a method for isolating VEGF-C from a solution, in particular an aqueous solution, characterized in that:

(a) kontaktuje się sekwencję białkową według wynalazku z roztworem zawierającym białko VEGF-C w celu uzyskania kompleksu białkowego zawierającego sekwencję białkową według wynalazku i związane z tym przeciwciałem niekowalencyjnie białko VEGF-C;(a) contacting a protein sequence of the invention with a solution containing a VEGF-C protein to obtain a protein complex comprising a protein sequence of the invention and a non-covalently associated VEGF-C protein;

(b) wydziela się z roztworu uzyskany kompleks białkowy;(b) separating the resulting protein complex from the solution;

(c) z uzyskanego kompleksu białkowego oddysocjowuje się białko VEGF-C;(c) the VEGF-C protein is dissociated from the resulting protein complex;

(d) z roztworu po dysocjacji wyodrębnia się białko VEGF-C.(d) the VEGF-C protein is isolated from the dissociated solution.

Korzystnie, gdy w etapie (b) wyżej opisanego sposobu wyodrębnianie VEGF-C z roztworu prowadzi się metodą chromatografii powinowactwa, przy czym jako złoże stosuje się nośnik chromatograficzny zawierający immobilizowaną sekwencję białkową według wynalazku.Preferably, in step (b) of the above-described process, the isolation of VEGF-C from the solution is carried out by affinity chromatography, using a chromatographic medium containing an immobilized protein sequence according to the invention as the medium.

W innym aspekcie, wynalazek także dotyczy sposobu wykrywania obecności VEGF-C w materiale biologicznym, charakteryzującego się tym, że:In another aspect, the invention also relates to a method for detecting the presence of VEGF-C in a biological material, characterized in that:

(a) kontaktuje się sekwencję białkową według wynalazku z materiałem biologicznym w celu uzyskania kompleksu białkowego zawierającego sekwencję białkową według wynalazku i związane z tym przeciwciałem niekowalencyjnie białko VEGF-C;(a) contacting a protein sequence of the invention with biological material to obtain a protein complex comprising a protein sequence of the invention and a non-covalently associated VEGF-C protein;

(b) wykrywa się uzyskany kompleks białkowy za pomocą pośrednich lub bezpośrednich biochemicznych metod detekcji.(b) detecting the obtained protein complex by means of indirect or direct biochemical detection methods.

Przedmiotem wynalazku jest także sposób oznaczania stężenia VEGF-C w roztworze wodnym, zwłaszcza płynie fizjologicznym, charakteryzujący się tym, że:The invention also relates to a method for determining the concentration of VEGF-C in an aqueous solution, in particular in physiological fluid, characterized in that:

(a) kontaktuje się sekwencję białkową według wynalazku z roztworem wodnym zawierającym VEGF-C w celu uzyskania kompleksu białkowego zawierającego sekwencję białkową według wynalazku i związane z tym przeciwciałem niekowalencyjnie białko VEGF-C;(a) contacting a protein sequence of the invention with an aqueous solution containing VEGF-C to obtain a protein complex comprising a protein sequence of the invention and a non-covalently associated VEGF-C protein;

(b) oznacza się stężenie uzyskanego kompleksu białkowego za pomocą pośrednich lub bezpośrednich biochemicznych metod detekcji.(b) the concentration of the resulting protein complex is determined by indirect or direct biochemical detection methods.

PL 236 281 B1PL 236 281 B1

W innym aspekcie, wynalazek także dotyczy zastosowania sekwencji białkowej według wynalazku do otrzymywania preparatów białka VEGF-C.In another aspect, the invention also relates to the use of a protein sequence according to the invention for the preparation of VEGF-C protein preparations.

Wynalazek obejmuje także zastosowanie sekwencji białkowej według wynalazku do wykrywania białka VEGF-C w materiale biologicznym.The invention also includes the use of a protein sequence according to the invention for the detection of a VEGF-C protein in biological material.

Wynalazek obejmuje także zastosowanie sekwencji białkowej według wynalazku do oznaczania stężenia białka VEGF-C w roztworze wodnym.The invention also includes the use of a protein sequence according to the invention for determining the concentration of VEGF-C protein in an aqueous solution.

Przedmiot wynalazku przedstawiony jest w przykładach realizacji nie ograniczając jego zakresu oraz na rysunku, na którym:The subject of the invention is presented in non-limiting examples of implementation and in the drawing, in which:

fig. 1 ilustruje, że wyselekcjonowane przeciwciała monoklonalne są specyficzne zarówno względem mysiego VEGF-C (A), jak i ludzkiego VEGF-C (B);Figure 1 illustrates that the selected monoclonal antibodies are specific for both murine VEGF-C (A) and human VEGF-C (B);

fig. 2 ilustruje wiązanie antygenu przez wybrane rozpuszczalne przeciwciała scFv anty-Figure 2 illustrates antigen binding by selected soluble anti-scFv

VEGF-C;VEGF-C;

fig. 3 ilustruje, że przeciwciała 1F2, 1F5 oraz 1F6 są specyficzne wyłącznie względem VEGF-C;Figure 3 illustrates that the 1F2, 1F5 and 1F6 antibodies are specific for VEGF-C only;

fig. 4 ilustruje sekwencje aminokwasowe przeciwciał wyodrębnionych z biblioteki fagemido- wej uzbieżnione w postaci MSA (ang. Multi-Sequence Alignment).Fig. 4 illustrates the amino acid sequences of the antibodies isolated from the phagemid library, converged to MSA (Multi-Sequence Alignment).

P r z y k ł a d wykonaniaW episode of performance

Wyodrębnienie fagów wykazujących ekspresję rekombinowanych przeciwciał monoklonalnych formatu scFv specyficznych względem mysiego i ludzkiego białka VEGF-CIsolation of phages showing the expression of recombinant monoclonal antibodies of the scFv format specific for the murine and human VEGF-C protein

Do otrzymania przeciwciał wybrano metodę ekspresji fagowej opartą o wykorzystanie fagemidowej biblioteki ludzkich rekombinowanych przeciwciał formatu scFv Tomlinson I+J. Wykorzystując poliklonalne fagi przeprowadzono trzy rundy selekcyjne na immobilizowanym mysim białku VEGF-C wyprodukowanym przez ssacze komórki (antygenem było więc dojrzałe rekombinowane białko VEGF-Canac). Aktywność biologiczna białka użytego do selekcji została wcześniej potwierdzona metodami biologicznymi z wykorzystaniem hodowli komórek in vitro. W tym celu wykorzystano test tworzenia tubuli na podłożu zawierającym matrigel przez komórki ludzkiego śródbłonka naczyń limfatycznych (ang. immortalized human Lymphatic Endothelial Cells, ihLEC) pod wpływem aktywnego biologicznie białka VEGF-C. W wyniku selekcji na antygenie uzyskano fagi wykazujące na swej powierzchni ekspresję przeciwciał zdolnych do wiązania mysiego rekombinowanego białka VEGF-C (fig. 1A). Mimo, iż selekcję fagów biblioteki przeprowadzono wykorzystując jako antygen mysie białko VEGF-C, potwierdzono, iż przeciwciała ulegające ekspresji na powierzchni wyodrębnionych fagów wiążą również ludzki VEGF-C (fig. 1B). Wyselekcjonowane przeciwciała są zatem specyficzne zarówno względem mysiego, jak i ludzkiego białka VEGF-C.A phage display method based on the use of a phagemid library of human recombinant antibodies of the Tomlinson I + J scFv format was chosen for the production of antibodies. Using polyclonal phages, three selection rounds were carried out on the immobilized murine VEGF-C protein produced by mammalian cells (the antigen was therefore the mature recombinant VEGF-Canac protein). The biological activity of the protein used for selection had previously been confirmed by biological methods using in vitro cell culture. For this purpose, the Immortalized Human Lymphatic Endothelial Cells (ihLEC) assay under the influence of the biologically active VEGF-C protein was used. As a result of selection on the antigen, phages were obtained which expressed on their surface antibodies capable of binding the murine recombinant VEGF-C protein (Fig. 1A). Although the phage selection of the library was performed using the murine VEGF-C protein as the antigen, it was confirmed that antibodies expressed on the surface of the isolated phages also bind human VEGF-C (Fig. 1B). Thus, the selected antibodies are specific for both murine and human VEGF-C proteins.

Uzyskanie rozpuszczalnych przeciwciał formatu scFv wiążących mysi i ludzki VEGF-CObtaining soluble antibodies of the scFv format binding murine and human VEGF-C

Przeciwciało ulegające ekspresji na powierzchni faga filamentowego nie jest rozpuszczalnym białkiem - jest ono produkowane jako białko fuzyjne razem z białkiem pIII, strukturalnym białkiem płaszcza faga. W celu uzyskania ekspresji rozpuszczalnych przeciwciał scFv przeklonowano sekwencję kodującą wybrane przeciwciało do wektora ekspresyjnego pETscFv. Ekspresję rozpuszczalnych przeciwciał anty-VEGF-C uzyskano w bakteriach E. coli Rosetta Blue. Przeciwciała izolowano z obszaru peryplazmatycznego bakterii i oczyszczano wykorzystując metodę chromatografii powinowactwa z użyciem białka A. Na fig. 2 przedstawiono wiązanie wybranych przeciwciał monoklonalnych formatu scFv do antygenu.An antibody expressed on the surface of a filamentous phage is not a soluble protein - it is produced as a fusion protein together with the pIII protein, a phage's structural coat protein. To express the soluble scFv antibodies, the coding sequence of the selected antibody was cloned into the pETscFv expression vector. The expression of soluble anti-VEGF-C antibodies was obtained in E. coli Rosetta Blue bacteria. The antibodies were isolated from the periplasmic region of the bacteria and purified using protein A affinity chromatography. Figure 2 shows the binding of selected scFv monoclonal antibodies to the antigen.

Potwierdzenie specyficzności względem białka VEGF-CConfirmation of the specificity for the VEGF-C protein

Ponieważ białka należące do rodziny VEGF wykazują duże podobieństwo w obrębie sekwencji aminokwasowej, potwierdzono wykorzystując test ELISA, iż uzyskane przeciwciała 1F5, 1F6 i 1F2 rozpoznają i wiążą VEGF-C nie wykazując jednocześnie powinowactwa ani względem VEGF-A, ani względem VEGF-D (fig. 3).Since the proteins belonging to the VEGF family show high similarity in the amino acid sequence, it was confirmed using an ELISA test that the obtained antibodies 1F5, 1F6 and 1F2 recognize and bind VEGF-C while showing no affinity for VEGF-A and VEGF-D (fig. 3).

Uzyskanie sekwencji przeciwciał formatu scFv wiążących mysi i ludzki VEGF-CObtaining the sequence of antibodies of the scFv format binding murine and human VEGF-C

Wektory fagemidowe pIT2 kodujące przeciwciała prezentowane na powierzchni wyodrębnionych fagów zostały poddane sekwencjonowaniu w celu uzyskania sekwencji aminokwasowej kodowanych przeciwciał. Otrzymane sekwencje zostały następnie uzbieżnione w postaci MSA (ang. Multi-Sequence Alignment) i przedstawione na fig. 4. W ich obrębie można wyróżnić regiony CDR, które odpowiadają za wiązanie sekwencji białkowej do antygenu.The pIT2 phagemid vectors encoding the antibodies displayed on the surface of the extracted phages were sequenced to obtain the amino acid sequence of the encoded antibodies. The sequences obtained were then aligned in the form of MSA (Multi-Sequence Alignment) and presented in Fig. 4. Within them, CDR regions can be distinguished that are responsible for the binding of the protein sequence to the antigen.

Poszczególne regiony CDR w sekwencji przeciwciał mogą być traktowane jako fragmenty wymienne, ponieważ jak pokazano na fig. 4 dla sekwencji przeciwciał 1F5 i 1F10 sekwencje CDRH2The individual CDRs in the antibody sequence can be thought of as interchangeable fragments since, as shown in Figure 4 for the 1F5 and 1F10 antibody sequences, the CDRH2 sequences are

PL 236 281 B1 i CDRH3 są identyczne, choć odpowiednie sekwencje CDRL2 i CDRL3 są różne; analogicznie sekwencje 1F5 i 1G4 posiadają identyczny fragment CDRL2, lecz różne fragmenty CDRH2, CDRH3 i CDRL3.PL 236 281 B1 and CDRH3 are identical, although the corresponding CDRL2 and CDRL3 sequences are different; analogously, the 1F5 and 1G4 sequences have identical CDRL2 fragment but different CDRH2, CDRH3 and CDRL3 fragments.

Ponadto, powyższe sekwencje zawierające fragmenty łańcucha ciężkiego oraz fragmenty łańcucha lekkiego mogą być poddane dalszej optymalizacji; w szczególności, można je doprowadzić do postaci pojedynczego łańcucha ciężkiego (ang. camelid heavy chain antibodies), która charakteryzuje naturalnie występujące immunoproteiny (Hamers-Casterman et al. Nature 1993; 363:446-448, Muyldermans S and Lauwereys M. J Mol Recognit 1999; 12:131-140). W takim przypadku do wiązania antygenu nie jest konieczna cała sekwencja białkowa stanowiąca przeciwciało scFv, a jedynie jej fragment (stanowiący pojedynczy łańcuch). Tym samym użycie takiego fragmentu będzie wystarczające dla zachowania zdolności sekwencji białkowej do wiązania antygenu. Zastosowanie takiej strategii optymalizacyjnej względem przeciwciał formatu scFv jest znane z literatury (Rinderknecht M et al., op. cit.).In addition, the above sequences containing heavy chain fragments and light chain fragments can be subjected to further optimization; in particular, they can be converted into a single camelid heavy chain antibodies which characterize naturally occurring immunoproteins (Hamers-Casterman et al. Nature 1993; 363: 446-448, Muyldermans S and Lauwereys M. J Mol Recognit 1999; 12: 131-140). In this case, the entire protein sequence constituting the scFv antibody is not required for antigen binding, only a fragment (single chain) thereof. Thus, the use of such a fragment will be sufficient to preserve the antigen binding ability of the protein sequence. The use of such an optimization strategy for antibodies of the scFv format is known from the literature (Rinderknecht M et al., Loc. Cit.).

Wyselekcjonowane przeciwciała monoklonalne są specyficzne zarówno względem mysiego, jak i ludzkiego VEGF-C, jak przedstawiono odpowiednio na fig. 1A i 1B. Analizę przeprowadzono wykorzystując test ELISA. Płytki opłaszczone antygenami (mysim lub ludzkim VEGF-C) inkubowano z wyodrębnionymi fagami i fagiem niewiążącym VEGF-C, kontrola negatywna kn. Uzyskany wynik potwierdza, że 1) przeciwciała są zdolne do rozpoznania i specyficznego wiązania mysiego białka VEGF-C i ludzkiego białka VEGF-C oraz 2) przeciwciała mogą być stosowane do wykrywania VEGF-C zarówno w próbkach mysich, jak i w materiale ludzkim.The selected monoclonal antibodies are specific for both murine and human VEGF-C as shown in Figures 1A and 1B, respectively. The analysis was performed using an ELISA test. Plates coated with antigens (mouse or human VEGF-C) were incubated with the phage extracted and the non-binding VEGF-C phage, kn negative control. The obtained result confirms that 1) the antibodies are capable of recognizing and specifically binding the murine VEGF-C protein and the human VEGF-C protein, and 2) the antibodies can be used to detect VEGF-C in both murine samples and human material.

Wiązanie antygenu przez wybrane rozpuszczalne przeciwciała scFv anty-VEGF-C ilustruje fig. 2. Analizę przeprowadzono stosując test ELISA. Ekspresję przeciwciał anty-VEGF-C uzyskano w bakteriach E. coli Rosetta blue. Przeciwciała izolowano z obszaru peryplazmatycznego bakterii. Przeciwciała wiązano do antygenu immobilizowanego do płytki przeznaczonej do testów ELISA. Detekcji scFv związanych do antygenu dokonano wykorzystując roztwór białka L-HRP (białko L znakowane peroksydazą chrzanową), ponieważ wiąże się ono z łańcuchem lekkim scFv. kn oznacza przeciwciało niespecyficzne względem VEGF-C. Uzyskany wynik potwierdza, że do wiązania białka VEGF-C są zdolne nie tylko przeciwciała ulegające ekspresji na powierzchni wyselekcjonowanych fagów, ale również odpowiadające im rozpuszczalne przeciwciała, które wyprodukowano wykorzystując bakteryjny system ekspresji oparty o wektor pETscFv.Antigen binding by selected soluble anti-VEGF-C scFv antibodies is illustrated in Figure 2. The analysis was performed using an ELISA assay. Expression of anti-VEGF-C antibodies was obtained in E. coli Rosetta blue bacteria. The antibodies were isolated from the periplasmic area of the bacteria. The antibodies were bound to the antigen immobilized on the ELISA plate. Detection of antigen-bound scFvs was made using a solution of L-HRP (horseradish peroxidase-labeled L protein) as it binds to the scFv light chain. kn denotes an antibody not specific for VEGF-C. The obtained result confirms that not only the antibodies expressed on the surface of the selected phages are able to bind the VEGF-C protein, but also the corresponding soluble antibodies that were produced using the bacterial expression system based on the pETscFv vector.

Wybrane przeciwciała 1F2, 1F5 oraz 1F6 zostały zbadane pod kątem specyficzności oddziaływania z VEGF-C (fig. 3). Analizę przeprowadzono z zastosowaniem testu ELISA. Płytkę pokryto białkiem VEGF-C, VEGF-A i VEGF-D w stężeniu 2 pg/ml. Wszystkie przeciwciała rozcieńczono do stężenia 5 pg/ml w buforze PBS zawierającym 3% albuminy wołowej. Detekcji scFv związanych do antygenu dokonano za pomocą białka L-HRP. K - kontrolne przeciwciała scFv specyficzne dla białka innego niż VEGF-C. Uzyskany wynik potwierdza, że otrzymane przeciwciała scFv są specyficzne wyłącznie względem białka VEGF-C. Białko VEGF-C jest bardzo podobne do innych białek rodziny VEGF (na przykład do VEGF-A lub VEGF-D), a zatem przeciwciała te są bardzo cennym narzędziem służącym do specyficznej detekcji i wybiórczego wiązania VEGF-C.The selected 1F2, 1F5 and 1F6 antibodies were tested for the specificity of their interaction with VEGF-C (Figure 3). The analysis was performed using an ELISA test. The plate was coated with VEGF-C, VEGF-A and VEGF-D proteins at a concentration of 2 pg / ml. All antibodies were diluted to a concentration of 5 µg / ml in PBS buffer containing 3% bovine albumin. Detection of antigen bound scFvs was accomplished with the L-HRP protein. K - control scFv antibodies specific for a protein other than VEGF-C. The obtained result confirms that the obtained scFv antibodies are specific only for the VEGF-C protein. The VEGF-C protein is very similar to other proteins of the VEGF family (for example, VEGF-A or VEGF-D), so these antibodies are a very valuable tool for the specific detection and selective binding of VEGF-C.

Sekwencje przeciwciał (fig. 4) zostały ustalone za pomocą sekwencjonowania wektorów fagemidowych. Jako matryce do sekwencjonowania wykorzystano wyizolowane z bakterii TOP10 fagemidy pIT2 zawierające sekwencje poszczególnych wyselekcjonowanych przeciwciał. W procesie sekwencjonowania wykorzystano startery LMB3 (5’ CAG GAA ACA GCT ATG AC 3’) i pHEN (5’ CTA TGC GGC CCC ATT CA 3’). Do analiz uzyskanych sekwencji wykorzystano programy znajdujące się na platformie internetowej Mobyle@Pasteur (revseq, transeq, needle), ClustalX oraz Jalview.Antibody sequences (Figure 4) were determined by phagemid vector sequencing. As sequencing templates, pIT2 phagemids isolated from TOP10 bacteria, containing the sequences of individual selected antibodies, were used. The sequencing process used LMB3 (5 'CAG GAA ACA GCT ATG AC 3') and pHEN (5 'CTA TGC GGC CCC ATT CA 3') primers. The obtained sequences were analyzed with the use of programs available on the Mobyle @ Pasteur internet platform (revseq, transeq, needle), ClustalX and Jalview.

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

Sekwencj eSequence e

Sekwencja nr la: 1D2_CDRH2 AIDSKGSFTV Sekwencja nr Ib: >1D2_CDRH3 EGLRFSequence No. 1a: 1D2_CDRH2 AIDSKGSFTV Sequence No. Ib:> 1D2_CDRH3 EGLRF

Sekwencja nr lc: >1D2_CDRL2 HASHSequence No. 1c:> 1D2_CDRL2 HASH

Sekwencja nr ld: >1D2_CDRL3 GPIDPQSequence no. Ld:> 1D2_CDRL3 GPIDPQ

Sekwencja nr 2a: >1E7_CDRH2 AISAQGTSTLSequence No. 2a:> 1E7_CDRH2 AISAQGTSTL

Sekwencja nr 2b: >1E7_CDRH3 KYHMFSequence No. 2b:> 1E7_CDRH3 KYHMF

Sekwencja nr 2c: >1E7_CDRL2 HASTSequence # 2c:> 1E7_CDRL2 HAST

Sekwencja nr 2d: >1E7_CDRL3 RRAMPTSequence # 2d:> 1E7_CDRL3 RRAMPT

Sekwencja nr 3a: >1F2_CDRH2 SIQAAGPTTDSequence # 3a:> 1F2_CDRH2 SIQAAGPTTD

Sekwencja nr 3b: >1F2_CDRH3 ADWEFSequence # 3b:> 1F2_CDRH3 ADWEF

Sekwencja nr 3c: >1F2_CDRL2 GASVSequence # 3c:> 1F2_CDRL2 GASV

Sekwencja nr 3d: >1F2_CDRL3 ALRVPSSequence # 3d:> 1F2_CDRL3 ALRVPS

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

Sekwencja nr 4a: >1F5_CDRH2 SILDHGQGTQSequence # 4a:> 1F5_CDRH2 SILDHGQGTQ

Sekwencja nr 4b:Sequence No. 4b:

>1F5_CDRH3> 1F5_CDRH3

EGTMLEGTML

Sekwencja nr 4c:Sequence No. 4c:

>1F5_CDRL2> 1F5_CDRL2

RASRRASR

Sekwencja nr 4d: >1F5_CDRL3Sequence # 4d:> 1F5_CDRL3

LRASPRLRASPR

Sekwencja nr 5a: >1F6_CDRH2Sequence No. 5a:> 1F6_CDRH2

SITGHGSTTESITGHGSTTE

Sekwencja nr 5b: >1F6_CDRH3Sequence # 5b:> 1F6_CDRH3

EGAVFEGAVF

Sekwencja nr 5c: >1F6_CDRL2Sequence # 5c:> 1F6_CDRL2

QASSQASS

Sekwencja nr 5d: >1F6_CDRL3Sequence # 5d:> 1F6_CDRL3

TARYFDTARYFD

Sekwencja nr 6a: >1F1O_CDRH2 SILDHGQGTQ Sekwencja nr 6b: >1F1O_CDRH3 EGTMLSequence number 6a:> 1F1O_CDRH2 SILDHGQGTQ Sequence number 6b:> 1F1O_CDRH3 EGTML

Sekwencja nr 6c: >1F1O_CDRL2 YASSSequence # 6c:> 1F1O_CDRL2 YASS

Sekwencja nr 6d: >1F1O_CDRL3 PSVGPKSequence # 6d:> 1F1O_CDRL3 PSVGPK

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

Sekwencja nr 7a: >1G2_CDRH2 DIQPKGTATNSequence # 7a:> 1G2_CDRH2 DIQPKGTATN

Sekwencja nr 7b: >1G2_CDRH3 STNQFSequence # 7b:> 1G2_CDRH3 STNQF

Sekwencja nr 7c: >1G2_CDRL2 PASQSequence # 7c:> 1G2_CDRL2 PASQ

Sekwencja nr 7d: >1G2_CDRL3 QFRNPVSequence # 7d:> 1G2_CDRL3 QFRNPV

Sekwencja nr 8a:Sequence No. 8a:

>1G4_CDRH2> 1G4_CDRH2

SIAAQGSPTASIAAQGSPTA

Sekwencja nr 8b:Sequence No. 8b:

>1G4_CDRH3> 1G4_CDRH3

EGTNFEGTNF

Sekwencja nr 8c:Sequence No. 8c:

>1G4_CDRL2> 1G4_CDRL2

RASRRASR

Sekwencja nr 8d:Sequence No. 8d:

>1G4_CDRL3> 1G4_CDRL3

PASWPPPASWPP

Sekwencja nr 9a: >1G5_CDRH2 SITQGGTLTQ Sekwencja nr 9b: >1G5_CDRH3 PGLAFSequence No. 9a:> 1G5_CDRH2 SITQGGTLTQ Sequence No. 9b:> 1G5_CDRH3 PGLAF

Sekwencja nr 9c: >1G5_CDRL2 GASASequence No. 9c:> 1G5_CDRL2 GASA

Sekwencja nr 9d: >1G5_CDRL3 TSRRPKSequence # 9d:> 1G5_CDRL3 TSRRPK

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

Sekwencja nr lOa: >1G6_CDRH2 TITDSGYQTL·Sequence No. 10a:> 1G6_CDRH2 TITDSGYQTL

Sekwencja nr lOb:Sequence No. 10b:

>1G6_CDRE3> 1G6_CDRE3

EALHFEALHF

Sekwencja nr lOc: >1G6_CDRL2Sequence No. 10c:> 1G6_CDRL2

HASRHASR

Sekwencja nr lOd: >1G6_CDRL3 LPPSPKSequence No. 10 from:> 1G6_CDRL3 LPPSPK

Sekwencja nr lla: >1G8_CDRH2 SITHKGGLTQSequence No. 11a:> 1G8_CDRH2 SITHKGGLTQ

Sekwencja nr llb:Sequence no. Llb:

>1G8_CDRE3> 1G8_CDRE3

EGAPFEGAPF

Sekwencja nr lic: >1G8_CDRL2Sequence no. Lic:> 1G8_CDRL2

AASSAASS

Sekwencja nr lid: >1G8_CDRL3Sequence no. Lid:> 1G8_CDRL3

SY3TPNSY3TPN

Sekwencja nr 12a: >1G1O_CDRH2 TIALDGQRTNSequence No. 12a:> 1G1O_CDRH2 TIALDGQRTN

Sekwencja nr 12b:Sequence No. 12b:

>1G1O_CDRH3> 1G1O_CDRH3

HWAPFHWAPF

Sekwencja nr 12c: >1G1O_CDRL2Sequence No.12c:> 1G1O_CDRL2

TASSTASS

Sekwencja nr 12d:Sequence No. 12d:

>1G1O CDRL3> 1G1O CDRL3

LAQFPPLAQFPP

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

Sekwencja nr 13a:Sequence No. 13a:

>2F10_CDRH2> 2F10_CDRH2

HIMQSGYTTVHIMQSGYTTV

Sekwencja nr 13b:Sequence No. 13b:

>2F10_CDRH3> 2F10_CDRH3

YSPKFYSPKF

Sekwencja nr 13c:Sequence No. 13c:

>2F10_CDRL2> 2F10_CDRL2

VASQVASQ

Sekwencja nr 13d:Sequence No. 13d:

>2F10_CDRL3> 2F10_CDRL3

AQEPPSAQEPPS

Sekwencja nr 14:Sequence No. 14:

>1D2> 1D2

MKYLLPTAAAGLLLIAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS3YAMSWVR QAPGKGLEWVS AlDS KGS FTYYAD SVKGRFTIS RDN S KNT LYLQMNS L RAEDTAYYYCAK EGLRFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYHASHLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQGPIDPQTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLIAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFS3YAMSWVR QAPGKGLEWVS AlDS KGS FTYYAD SVKGRFTIS DAM S KNT LYLQMNS L RAEDTAYYYCAK EGLRFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYHASHLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQGPIDPQTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 15:Sequence No. 15:

>1E7> 1E7

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAP GKGLEWYSAlS AQGT Ξ T L YAD SVKGRFT13 RDN SKNT LY LQMN3 L RAEDT AVYYCAK KYHMFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSIS3YLNWYQQKPGKAPKLLIYHASTLQSGVPSRFSGSG3GTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQRRAMPTTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAP GKGLEWYSAlS AQGT Ξ T L YAD SVKGRFT13 DAM SKNT LY LQMN3 L RAEDT AVYYCAK KYHMFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSIS3YLNWYQQKPGKAPKLLIYHASTLQSGVPSRFSGSG3GTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQRRAMPTTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 16:Sequence No. 16:

>1F2> 1F2

MKYLLPTAAAGLLLLAAOPAMAEYGLLESGGGLYOPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWYR QAPGKGLEWVSSIQAAGPTTDYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK ADWEFDYWGQGTLWVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYGASVLQSGVPTRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQALRVPSTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAOPAMAEYGLLESGGGLYOPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWYR QAPGKGLEWVSSIQAAGPTTDYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK ADWEFDYWGQGTLWVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYGASVLQSGVPTRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQALRVPSTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 17:Sequence No. 17:

>1F5> 1F5

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSILDHGQGTQYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGTMLDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYRASRLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQLRASPRTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSILDHGQGTQYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGTMLDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYRASRLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQLRASPRTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 18:Sequence No. 18:

>1F6> 1F6

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLΞCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSITGHGSTTEYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGAVFDYWGQGTLVTVSSGGGG3GGGGSGGGGSTDIQMTQSP33LSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQTARYPDTFGQGTKVETKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLΞCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSITGHGSTTEYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGAVFDYWGQGTLVTVSSGGGG3GGGGSGGGGSTDIQMTQSP33LSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYQASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQTARYPDTFGQGTKVETKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 19:Sequence No. 19:

>1F1O> 1F1O

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRL3CAASGFTFS3YAMSWYR QAPGKGLEWVSSILDHGQGTQYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGTMLDYWGQGTLVTVS3GGGG3GGGGSGGGGSTDIQMTQSP33LSASVGDRVTITCRAS 03Ι33ΥΕΝΜΥΰ2ΚΡ6ΚΑΡΚΕΕΙΥΥΑ33Ε036νΡ3ΕΡ36303ΘΤ0ΡΤΕΤΙ33Ε0ΡΕ0ΡΑΤΥ YCQQPSVGPKTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRL3CAASGFTFS3YAMSWYR QAPGKGLEWVSSILDHGQGTQYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGTMLDYWGQGTLVTVS3GGGG3GGGGSGGGGSTDIQMTQSP33LSASVGDRVTITCRAS 03Ι33ΥΕΝΜΥΰ2ΚΡ6ΚΑΡΚΕΕΙΥΥΑ33Ε036νΡ3ΕΡ36303ΘΤ0ΡΤΕΤΙ33Ε0ΡΕ0ΡΑΤΥ YCQQPSVGPKTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 20:Sequence No. 20:

>1G2> 1G2

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSDIQPKGTATNYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK STNQFDYWGQGTLVTVSSGGGG3GGGGSGGGG3TDIQITQSP33L3ASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYPASQLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQQFRNPVTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSDIQPKGTATNYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK STNQFDYWGQGTLVTVSSGGGG3GGGGSGGGG3TDIQITQSP33L3ASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYPASQLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQQFRNPVTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 21:Sequence No. 21:

>1G4> 1G4

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSIAAQGSPTAYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNΞLRAEDTAVYYCAK EGTNFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS 03Ι33ΥΕΝΜΥ0ΩΚΡΟΚΑΡΚΕΕΙΥΡΑ3ΚΕ03θνΡ3ΕΚ3Ο303&ΤΟΡΤΕΤΙ33Ε0ΡΕϋΕΑΤΥ YCQQPASWPPTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSIAAQGSPTAYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNΞLRAEDTAVYYCAK EGTNFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS 03Ι33ΥΕΝΜΥ0ΩΚΡΟΚΑΡΚΕΕΙΥΡΑ3ΚΕ03θνΡ3ΕΚ3Ο303 & ΤΟΡΤΕΤΙ33Ε0ΡΕϋΕΑΤΥ YCQQPASWPPTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

PL 236 281 Β1PL 236 281 Β1

Sekwencja nr 22:Sequence No. 22:

>1G5> 1G5

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWYR QAPGKGLEWVS ΞITQGGT LTQYADSVKGRFTIS RDN S KNT LYLQMN 3 LRAEDTAVYYCAK PGLAFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS ς3Ι33ΥΕΝΉΥ2ςΚΡ6ΚΑΡΚΕΕΙΥΰΑ3ΑΕς36νΡ3ΗΡ36363&ΤΏΡΤΕΤΙ33Ε2ΡΕΏΕΑΤΥ YCQQTSRRPKTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWYR QAPGKGLEWVS ΞITQGGT LTQYADSVKGRFTIS DAM S KNT LYLQMN 3 LRAEDTAVYYCAK PGLAFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS ς3Ι33ΥΕΝΉΥ2ςΚΡ6ΚΑΡΚΕΕΙΥΰΑ3ΑΕς36νΡ3ΗΡ36363 & ΤΏΡΤΕΤΙ33Ε2ΡΕΏΕΑΤΥ YCQQTSRRPKTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 23:Sequence No. 23:

>1G6> 1G6

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVS TIT DS GYQT LYADSVKGRFTIS RDN S KNT LYLQMN S LRAEDTAVYYCAK EALHFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRWITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYHASRLQSGVP3RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQLPPSPKTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVS TIT FOR GYQT LYADSVKGRFTIS DAM S KNT LYLQMN S LRAEDTAVYYCAK EALHFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRWITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYHASRLQSGVP3RFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQLPPSPKTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 24:Sequence No. 24:

>1G8> 1G8

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSITHKGGLTQYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGAPFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS GSISSYLNWYGeKPGKAPKLLIYAASSLGSGYPSRFSGSGSGTDFTLTISSLGPEDFATY YCQQSYSTPNTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSSITHKGGLTQYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK EGAPFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS GSISSYLNWYGeKPGKAPKLLIYAASSLGSGYPSRFSGSGSGTDFTLTISSLGPEDFATY YCQQSYSTPNTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 25:Sequence No. 25:

>1G1O> 1G1O

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYANSWVR QAPGKGLEWVS TIALDGQRTNYADSVKGRFTIS RDN S KNTLYLQMN S LRAEDTAVYYCAK HWAPFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYTASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTTSSLQPEDFATY YCQQLAQFPPTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYANSWVR QAPGKGLEWVS TIALDGQRTNYADSVKGRFTIS DAM S S KNTLYLQMN LRAEDTAVYYCAK HWAPFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYTASSLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTTSSLQPEDFATY YCQQLAQFPPTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Sekwencja nr 26:Sequence No. 26:

>2F10> 2F10

MKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSHTMQSGYTTVYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK YSPKFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRWITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYVASQLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQAQEPPSTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHHMKYLLPTAAAGLLLLAAQPAMAEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVR QAPGKGLEWVSHTMQSGYTTVYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAK YSPKFDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSTDIQMTQSPSSLSASVGDRWITCRAS QSISSYLNWYQQKPGKAPKLLIYVASQLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATY YCQQAQEPPSTFGQGTKVEIKRAAAHHHHHH

Claims (8)

Zastrzeżenia patentowePatent claims 1. Przeciwciało formatu scFv, stanowiące inhibitor białka VEGF-C obejmujące sekwencję aminokwasową wybraną z następującej grupy: Sekw. nr 14, Sekw. nr 15, Sekw. nr 16, Sekw. nr 17, Sekw. nr 18, Sekw. nr 19, Sekw. nr 20, Sekw. nr 21, Sekw. nr 22, Sekw. nr 23, Sekw. nr 24, Sekw. nr 25, Sekw. nr 26.1. An antibody of the scFv format which is an inhibitor of a VEGF-C protein comprising an amino acid sequence selected from the following group: Seq. No.14, Seq. No.15, Seq. No.16, Seq. No. 17, Seq. No.18, Seq. No.19, Seq. No. 20, Seq. No.21, Seq. No.22, Seq. No. 23, Seq. No. 24, Seq. No.25, Seq. no 26. 2. Sposób wyodrębniania VEGF-C z roztworu, zwłaszcza roztworu wodnego, znamienny tym, że:2. A method for isolating VEGF-C from a solution, especially an aqueous solution, characterized by: (a) kontaktuje się przeciwciało określone w zastrz. 1 z roztworem zawierającym białko VEGF-C w celu uzyskania kompleksu białkowego zawierającego przeciwciało określone w zastrz. 1 i związane z tym przeciwciałem niekowalencyjnie białko VEGF-C;(a) contacting an antibody according to claim 1; 1 with a solution containing the VEGF-C protein to obtain a protein complex comprising the antibody of claim 1, 1 and a non-covalently associated VEGF-C protein; (b) wydziela się z roztworu uzyskany kompleks białkowy;(b) separating the resulting protein complex from the solution; (c) z uzyskanego kompleksu białkowego oddysocjowuje się białko VEGF-C;(c) the VEGF-C protein is dissociated from the resulting protein complex; (d) z roztworu po dysocjacji wyodrębnia się białko VEGF-C.(d) the VEGF-C protein is isolated from the dissociated solution. 3. Sposób według zastrz. 2 znamienny tym, że w etapie (b) wyodrębnianie prowadzi się metodą chromatografii powinowactwa, przy czym jako złoże stosuje się nośnik chromatograficzny zawierający immobilizowane przeciwciało określone w zastrz. 1.3. The method according to p. 2. A method according to claim 2, characterized in that in step (b) the isolation is performed by affinity chromatography, wherein the medium is a chromatographic medium containing an immobilized antibody according to claim 1. 1. 4. Sposób wykrywania obecności VEGF-C w materiale biologicznym, znamienny tym, że:4. A method of detecting the presence of VEGF-C in biological material, characterized by the fact that: (a) kontaktuje się przeciwciało określone w zastrz. 1 z materiałem biologicznym w celu uzyskania kompleksu białkowego zawierającego przeciwciało określone w zastrz. 1 i związane z tym przeciwciałem niekowalencyjnie białko VEGF-C;(a) contacting an antibody according to claim 1; 1 with biological material to obtain a protein complex containing the antibody according to claim 1, 1 and a non-covalently associated VEGF-C protein; (b) wykrywa się uzyskany kompleks białkowy za pomocą pośrednich lub bezpośrednich biochemicznych metod detekcji.(b) detecting the obtained protein complex by means of indirect or direct biochemical detection methods. 5. Sposób oznaczania stężenia VEGF-C w roztworze wodnym, zwłaszcza płynie fizjologicznym, znamienny tym, że:5. A method for determining the concentration of VEGF-C in an aqueous solution, in particular in physiological fluid, characterized by: (a) kontaktuje się przeciwciało określone w zastrz. 1 z roztworem wodnym zawierającym VEGF-C w celu uzyskania kompleksu białkowego zawierającego przeciwciało określone w zastrz. 1 i związane z tym przeciwciałem niekowalencyjnie białko VEGF-C;(a) contacting an antibody according to claim 1; 1 with an aqueous solution containing VEGF-C to obtain a protein complex containing the antibody of claim 1, 1 and a non-covalently associated VEGF-C protein associated therewith; (b) oznacza się stężenie uzyskanego kompleksu białkowego za pomocą pośrednich lub bezpośrednich biochemicznych metod detekcji.(b) the concentration of the resulting protein complex is determined by indirect or direct biochemical detection methods. 6. Zastosowanie przeciwciała określonego w zastrz. 1 do otrzymywania preparatów białka VEGF-C.6. Use of an antibody according to claim 1 1 for the preparation of VEGF-C protein preparations. 7. Zastosowanie in vitro przeciwciała określonego w zastrz. 1 do wykrywania białka VEGF-C w materiale biologicznym.7. The in vitro use of an antibody according to claim 1 1 for the detection of VEGF-C protein in biological material. 8. Zastosowanie przeciwciała określonego w zastrz. 1 do oznaczania stężenia białka VEGF-C w roztworze wodnym.8. Use of an antibody according to claim 1 1 for determining the concentration of the VEGF-C protein in an aqueous solution.
PL415391A 2015-12-28 2015-12-28 Protein sequence, preferably constituting a fragment of antibody, in a specific way interacting with human or mouse vascular endothelial growth factor C, and its application PL236281B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL415391A PL236281B1 (en) 2015-12-28 2015-12-28 Protein sequence, preferably constituting a fragment of antibody, in a specific way interacting with human or mouse vascular endothelial growth factor C, and its application

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
PL415391A PL236281B1 (en) 2015-12-28 2015-12-28 Protein sequence, preferably constituting a fragment of antibody, in a specific way interacting with human or mouse vascular endothelial growth factor C, and its application

Publications (2)

Publication Number Publication Date
PL415391A1 PL415391A1 (en) 2017-07-03
PL236281B1 true PL236281B1 (en) 2020-12-28

Family

ID=59201259

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PL415391A PL236281B1 (en) 2015-12-28 2015-12-28 Protein sequence, preferably constituting a fragment of antibody, in a specific way interacting with human or mouse vascular endothelial growth factor C, and its application

Country Status (1)

Country Link
PL (1) PL236281B1 (en)

Also Published As

Publication number Publication date
PL415391A1 (en) 2017-07-03

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20260008841A1 (en) Monoclonal antibodies to growth and differentiation factor 15 (gdf-15), and uses thereof for treating cancer cachexia and cancer
RU2651513C2 (en) Novel antibody for diagnosis and/or prognosis of cancer
RU2636345C2 (en) New antibody to cxcr4 and its application for cancer detection and diagnostics
US20070269835A1 (en) Reagent for determining laminin 5 antigen in biological sample and assay method
CN106164672B (en) Cell Surface Prostate Cancer Antigen for Diagnosis
KR20130132739A (en) Recombinant antibody structures binding to and blocking the activity of vascular endothelial growth factor 2(vegfr-2/kdr)
CN107880130A (en) It is a kind of with the anti-carcinoembryonic antigen nano antibody of high-affinity and application
KR20140047127A (en) Use of the antibody i-3859 for the detection and diagnosis of cancer
KR20210114922A (en) Recombinant Antibody of Anti-Human N-Terminal Pro Brain Natriuretic Peptide
JP6707660B2 (en) Anti-podocalyxin-like protein precursor subtype 2 monoclonal antibody, production method and use thereof
CN104837867A (en) Novel monoclonal antibody which is specifically bound to TM4SF5 protein and use thereof
CN120718148A (en) An anti-CD38 nanoantibody and its preparation method and application
Tang et al. Single chain fragment variable antibodies developed by using as target the 3rd fibronectin type III homologous repeat fragment of human neural cell adhesion molecule L1 promote cell migration and neuritogenesis
JP2023515875A (en) Anti-CD123 Antibodies or Anti-Idiotypic Antibodies that Bind Chimeric Antigen Receptors (CAR) and Methods of Using The Same
WO2025025731A1 (en) Diagnostic antibody applicable to immunohistochemistry test of cd228
JP2010254682A (en) Anti-fibronectin fragment monoclonal antibody
CN117964771A (en) Antibody specifically binding MMP7 and application thereof
PL234874B1 (en) Protein sequence, preferably a fragment of antibody, constituting VEGF-C inhibitor and its application
CN112279917A (en) Monoclonal antibody of mouse anti-cell surface glycoprotein CD138 capable of being applied to tumor cell capture
TWI869740B (en) METHOD FOR DETECTING sTNFR2 CONCENTRATION IN VITRO, DETECTION REAGENT AND DETECTION KIT THEREOF
US20230417753A1 (en) Methods and kits for classifying solid cancer-afflicted patients based on relb labelling
CN121008043A (en) Detection methods of AXL-GAS6 complex and its application in patients with myocardial infarction
TW202221036A (en) Anti-human TRPV2 antibody
HK1231096B (en) Monoclonal antibodies to growth and differentiation factor 15 (gdf-15), and uses thereof for treating cancer cachexia and cancer
HK1210950A1 (en) Monoclonal antibodies to growth and differentiation factor 15 (gdf-15)